##fileformat=VCFv4.2
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele fractions of alternate alleles in the tumor">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)">
##FORMAT=<ID=F1R2,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F1R2 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=F2R1,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F2R1 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=PGT,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing haplotype information, describing how the alternate alleles are phased in relation to one another">
##FORMAT=<ID=PID,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing ID information, where each unique ID within a given sample (but not across samples) connects records within a phasing group">
##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification">
##FORMAT=<ID=PS,Number=1,Type=Integer,Description="Phasing set (typically the position of the first variant in the set)">
##FORMAT=<ID=SB,Number=4,Type=Integer,Description="Per-sample component statistics which comprise the Fisher's Exact Test to detect strand bias.">
##GATKCommandLine=<ID=Mutect2,CommandLine="Mutect2  --tumor-sample CAN12_R --panel-of-normals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/HPON.vcf --output /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/08_variant_calling/mutect2/CAN12_R.vcf --max-reads-per-alignment-start 500 --activity-profile-out CAN12_R_activity_profile --assembly-region-out CAN12_R_assembly_region --intervals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/seqCap_VCRome_V2_intervals_list.intervals --interval-set-rule UNION --interval-padding 100 --interval-exclusion-padding 0 --interval-merging-rule ALL --input /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/07_BQSR/BQSR/CAN12_R.bam --read-validation-stringency SILENT --reference /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Reference_genome/ucsc.hg19.fasta  --f1r2-median-mq 50 --f1r2-min-bq 20 --f1r2-max-depth 200 --genotype-pon-sites false --genotype-germline-sites false --af-of-alleles-not-in-resource -1.0 --mitochondria-mode false --tumor-lod-to-emit 3.0 --initial-tumor-lod 2.0 --pcr-snv-qual 40 --pcr-indel-qual 40 --max-population-af 0.01 --downsampling-stride 1 --callable-depth 10 --max-suspicious-reads-per-alignment-start 0 --normal-lod 2.2 --ignore-itr-artifacts false --gvcf-lod-band -2.5 --gvcf-lod-band -2.0 --gvcf-lod-band -1.5 --gvcf-lod-band -1.0 --gvcf-lod-band -0.5 --gvcf-lod-band 0.0 --gvcf-lod-band 0.5 --gvcf-lod-band 1.0 --minimum-allele-fraction 0.0 --genotype-filtered-alleles false --disable-adaptive-pruning false --dont-trim-active-regions false --max-disc-ar-extension 25 --max-gga-ar-extension 300 --padding-around-indels 150 --padding-around-snps 20 --kmer-size 10 --kmer-size 25 --dont-increase-kmer-sizes-for-cycles false --allow-non-unique-kmers-in-ref false --num-pruning-samples 1 --min-dangling-branch-length 4 --recover-all-dangling-branches false --max-num-haplotypes-in-population 128 --min-pruning 2 --adaptive-pruning-initial-error-rate 0.001 --pruning-lod-threshold 2.302585092994046 --max-unpruned-variants 100 --debug-assembly false --debug-graph-transformations false --capture-assembly-failure-bam false --error-correct-reads false --kmer-length-for-read-error-correction 25 --min-observations-for-kmer-to-be-solid 20 --likelihood-calculation-engine PairHMM --base-quality-score-threshold 18 --pair-hmm-gap-continuation-penalty 10 --pair-hmm-implementation FASTEST_AVAILABLE --pcr-indel-model CONSERVATIVE --phred-scaled-global-read-mismapping-rate 45 --native-pair-hmm-threads 4 --native-pair-hmm-use-double-precision false --bam-writer-type CALLED_HAPLOTYPES --dont-use-soft-clipped-bases false --min-base-quality-score 10 --smith-waterman JAVA --emit-ref-confidence NONE --max-mnp-distance 1 --min-assembly-region-size 50 --max-assembly-region-size 300 --assembly-region-padding 100 --active-probability-threshold 0.002 --max-prob-propagation-distance 50 --force-active false --seconds-between-progress-updates 10.0 --disable-sequence-dictionary-validation false --create-output-bam-index true --create-output-bam-md5 false --create-output-variant-index true --create-output-variant-md5 false --lenient false --add-output-sam-program-record true --add-output-vcf-command-line true --cloud-prefetch-buffer 40 --cloud-index-prefetch-buffer -1 --disable-bam-index-caching false --sites-only-vcf-output false --help false --version false --showHidden false --verbosity INFO --QUIET false --use-jdk-deflater false --use-jdk-inflater false --gcs-max-retries 20 --gcs-project-for-requester-pays  --disable-tool-default-read-filters false --max-read-length 2147483647 --min-read-length 30 --minimum-mapping-quality 20 --disable-tool-default-annotations false --enable-all-annotations false",Version="4.1.2.0",Date="March 1, 2022 4:34:34 PM CET">
##INFO=<ID=CONTQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to contamination">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth; some reads may have been filtered">
##INFO=<ID=ECNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of events in this haplotype">
##INFO=<ID=GERMQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not germline variants">
##INFO=<ID=MBQ,Number=R,Type=Integer,Description="median base quality">
##INFO=<ID=MFRL,Number=R,Type=Integer,Description="median fragment length">
##INFO=<ID=MMQ,Number=R,Type=Integer,Description="median mapping quality">
##INFO=<ID=MPOS,Number=A,Type=Integer,Description="median distance from end of read">
##INFO=<ID=NALOD,Number=A,Type=Float,Description="Negative log 10 odds of artifact in normal with same allele fraction as tumor">
##INFO=<ID=NCount,Number=1,Type=Integer,Description="Count of N bases in the pileup">
##INFO=<ID=NLOD,Number=A,Type=Float,Description="Normal log 10 likelihood ratio of diploid het or hom alt genotypes">
##INFO=<ID=OCM,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alt reads whose original alignment doesn't match the current contig.">
##INFO=<ID=PON,Number=0,Type=Flag,Description="site found in panel of normals">
##INFO=<ID=POPAF,Number=A,Type=Float,Description="negative log 10 population allele frequencies of alt alleles">
##INFO=<ID=ROQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to read orientation artifact">
##INFO=<ID=RPA,Number=.,Type=Integer,Description="Number of times tandem repeat unit is repeated, for each allele (including reference)">
##INFO=<ID=RU,Number=1,Type=String,Description="Tandem repeat unit (bases)">
##INFO=<ID=SEQQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not sequencing errors">
##INFO=<ID=STR,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is a short tandem repeat">
##INFO=<ID=STRANDQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality of strand bias artifact">
##INFO=<ID=STRQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles in STRs are not polymerase slippage errors">
##INFO=<ID=TLOD,Number=A,Type=Float,Description="Log 10 likelihood ratio score of variant existing versus not existing">
##INFO=<ID=UNIQ_ALT_READ_COUNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of ALT reads with unique start and mate end positions at a variant site">
##MutectVersion=2.2
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##filtering_status=Warning: unfiltered Mutect 2 calls.  Please run FilterMutectCalls to remove false positives.
##source=Mutect2
##tumor_sample=CAN12_R
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	CAN12_R
chr1	566130	.	C	T	.	.	DP=223;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=724.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,219:0.996:219:0,123:0,89:0,0,142,77
chr1	566206	.	A	G	.	.	DP=347;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=1159.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,330:0.994:331:0,167:1,158:0,1,154,176
chr1	566371	.	A	G	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=109,182;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=292.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,84:0.978:85:1,40:0,42:0,1,13,71
chr1	861437	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:861437_G_A:861437:0,2,0,1
chr1	861439	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:861437_G_A:861437:0,2,0,1
chr1	866319	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	866511	.	C	CCCCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCCT;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	871334	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=194,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	876499	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	880238	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	880390	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,1:4,1,6,0
chr1	883625	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=90.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,9:0,0,8,18
chr1	883666	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:0,7,0,6
chr1	886671	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=166,174;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:3,2:0|1:886671_C_T:886671:0,13,0,2
chr1	886677	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=166,174;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:886671_C_T:886671:0,13,0,2
chr1	887560	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,5:0,0,1,13
chr1	889158	.	GA	CC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	892460	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:4,2,1,1
chr1	892745	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	897730	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.302:23:9,4:7,1:12,4,5,2
chr1	901806	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,5:7,5:13,0,9,1
chr1	902069	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:1,5,1,3
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chr1	906688	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=135,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.346:9:5,1:1,2:0|1:906683_A_ACGGC:906683:1,5,3,0
chr1	906694	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:7,0:1,2:0|1:906683_A_ACGGC:906683:3,6,2,0
chr1	909289	.	C	CTTT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=170,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:0|1:909289_C_CTTT:909289:3,5,1,1
chr1	909290	.	C	CCCT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=170,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:909289_C_CTTT:909289:3,5,1,1
chr1	909292	.	C	CGCCTTCCACCA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=170,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:3,0:0|1:909289_C_CTTT:909289:3,5,1,1
chr1	909309	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=171,204;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,1:4,1:2,3,1,1
chr1	914192	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=159,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,0:2,3:4,0,3,1
chr1	948846	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=53.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr1	948870	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,4:6,6:11,1,9,1
chr1	948921	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,26:0.588:44:12,11:5,13:12,6,20,6
chr1	957879	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=198764920,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:957879_G_A:957879:1,0,0,1
chr1	957881	.	CA	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=198764920,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:957879_G_A:957879:1,0,0,1
chr1	977330	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,8,4
chr1	978603	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr1	980460	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,19,1
chr1	981087	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr1	982941	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,8:0,0,12,5
chr1	982957	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.222:18:5,1:7,0:7,7,4,0
chr1	985266	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	986720	.	T	TGTGGAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.224:11:7,2:1,0:0|1:986720_T_TGTGGAG:986720:2,7,1,1
chr1	986721	.	C	CCACAGTTGTGCTGTG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=165,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.224:11:7,2:2,0:0|1:986720_T_TGTGGAG:986720:2,7,1,1
chr1	988930	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:988930_C_A:988930:0,0,0,1
chr1	988932	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:988930_C_A:988930:0,0,0,1
chr1	1019383	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,4:0,5,3,2
chr1	1021415	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr1	1025656	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=121,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr1	1026801	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:5,3,8,0
chr1	1115809	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0|1:1115809_A_C:1115809:0,5,3,0
chr1	1115810	.	T	TGCC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,0:0|1:1115809_A_C:1115809:0,5,3,0
chr1	1115814	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,1:0|1:1115809_A_C:1115809:0,5,3,0
chr1	1154193	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,1:8,1:10,9,2,0
chr1	1158682	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:12,2:9,0:13,11,1,1
chr1	1159391	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1201742	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=183,173;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr1	1229680	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr1	1235328	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=250,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,0:1,0:2,2,3,0
chr1	1246831	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1247578	.	T	TGGGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,14;RU=G;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	1247600	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=213,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,0:0|1:1247600_G_C:1247600:1,2,2,0
chr1	1247604	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=213,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:1247600_G_C:1247600:1,2,2,0
chr1	1247625	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=259,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	1247943	.	A	ACCCTGCCCTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=CCCTG;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,0:0,1:3,1,1,1
chr1	1254136	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,18,0
chr1	1254953	.	T	TTTTAAAAGTTAGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,33;MFRL=145,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	1257273	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.148:33:17,0:10,0:11,16,6,0
chr1	1257278	.	T	TACCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.363:28:10,3:8,0:3,15,10,0
chr1	1257282	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.428:28:9,1:7,0:1,15,12,0
chr1	1257286	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:10,2:9,0:5,15,7,0
chr1	1268847	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr1	1271623	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=201,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1271623_CA_C:1271623:1,0,0,1
chr1	1271629	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=201,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1271623_CA_C:1271623:1,0,0,1
chr1	1271631	.	CCCCCGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=201,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1271623_CA_C:1271623:1,0,0,1
chr1	1273278	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	1275935	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.587:7:1,0:0,1:1,2,0,4
chr1	1276973	.	G	GACAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,0:0,0,4,1
chr1	1278237	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1284490	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	1288583	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr1	1288823	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr1	1289367	.	CTG	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,17,2
chr1	1289911	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr1	1292119	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,8:0.159:48:12,0:21,0:0|1:1292119_A_C:1292119:6,34,8,0
chr1	1292121	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,8:0.159:48:16,0:21,0:0|1:1292119_A_C:1292119:6,34,8,0
chr1	1292127	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,6:0.152:42:14,1:19,5:0|1:1292119_A_C:1292119:3,33,6,0
chr1	1292131	.	AG	CC	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.159:40:14,1:17,4:0|1:1292119_A_C:1292119:1,33,6,0
chr1	1293764	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,3:0,0,13,0
chr1	1323078	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	1323143	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	1342612	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.543:9:2,1:2,4:2,2,2,3
chr1	1354538	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:4,2:2,4:0,6,1,6
chr1	1361530	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:5,7:4,7:6,3,12,3
chr1	1375292	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1387667	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,17,1
chr1	1417696	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	1420637	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,248;MMQ=40,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,2,3
chr1	1430994	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:5,3,1,1
chr1	1451489	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=18,13;MFRL=176,201;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.552:9:1,0:1,2:1,3,0,5
chr1	1458109	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,163;MMQ=50,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:7,6:6,6:10,3,12,0
chr1	1469394	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:6,2:7,3:6,7,1,5
chr1	1469546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	1470503	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1470503_T_TG:1470503:0,0,1,0
chr1	1470512	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1470503_T_TG:1470503:0,0,1,0
chr1	1475738	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1475738_G_C:1475738:0,1,1,0
chr1	1475743	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1475738_G_C:1475738:0,1,1,0
chr1	1475747	.	CGGAG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1475738_G_C:1475738:0,1,1,0
chr1	1509825	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=286.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,90:0.989:90:0,42:0,47:0,0,55,35
chr1	1510035	.	GGC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr1	1560100	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1563789	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	1564952	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	1572458	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,157;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,21:0.458:46:14,8:11,13:18,7,13,8
chr1	1572939	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,0,17
chr1	1574019	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,153;MMQ=27,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,12:0.255:49:14,7:22,5:3,34,1,11
chr1	1575616	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	1575836	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,137;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:6,3:12,7:4,14,2,8
chr1	1599888	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=153,150;MMQ=27,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.143:47:19,4:19,2:8,33,5,1
chr1	1599940	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=156,111;MMQ=40,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:4,1:5,2:1,8,0,3
chr1	1599974	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=158,160;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,2:2,2:0,8,0,4
chr1	1599981	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=160,159;MMQ=39,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:2,5:2,1:0,4,0,7
chr1	1601015	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=96.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,12:0,0,28,2
chr1	1601052	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=155.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,25:0,21:0,0,32,15
chr1	1601557	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,2:8,0:7,11,0,2
chr1	1635619	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.754:24:3,11:1,6:4,2,15,3
chr1	1639046	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,177;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,0:7,2:3,9,0,2
chr1	1639732	.	C	CATTCTTCATGTGGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=232,207;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr1	1647686	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	1647722	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=35,31;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:4,4:5,2:0|1:1647722_G_T:1647722:9,0,7,0
chr1	1647725	.	GT	AG	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:4,5:5,2:0|1:1647722_G_T:1647722:11,1,7,0
chr1	1647729	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:4,5:6,2:0|1:1647722_G_T:1647722:11,1,7,0
chr1	1647745	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,17:0.487:35:8,9:8,6:0|1:1647745_G_A:1647745:17,1,16,1
chr1	1647753	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,20:0.488:41:11,12:8,8:0|1:1647745_G_A:1647745:20,1,19,1
chr1	1647778	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.408:52:20,12:11,9:22,9,20,1
chr1	1647814	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=121,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,20:0.361:56:21,8:13,11:21,15,11,9
chr1	1647871	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,14:0.255:57:21,7:21,7:18,25,6,8
chr1	1647893	.	C	CTTTCTT	.	.	DP=56;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTCTT;STR;TLOD=59.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,18:0.378:48:20,10:10,5:5,25,10,8
chr1	1647928	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.314:30:11,4:9,5:7,14,3,6
chr1	1647968	.	C	CAT	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=27,35;MFRL=196,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:0|1:1647968_C_CAT:1647968:1,4,1,7
chr1	1647971	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=196,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:1,4:2,4:0|1:1647968_C_CAT:1647968:1,4,1,7
chr1	1647983	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=189,120;MMQ=50,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.571:14:2,4:2,4:0|1:1647983_T_A:1647983:0,6,1,7
chr1	1647990	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=189,121;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0|1:1647983_T_A:1647983:0,4,1,6
chr1	1648002	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=35,31;MFRL=189,170;MMQ=40,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	1650938	.	CGG	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,15:0.500:30:7,6:7,9:0|1:1650938_CGG_C:1650938:3,12,2,13
chr1	1650942	.	A	AAG	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=57.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,15:0.500:30:6,6:8,8:0|1:1650938_CGG_C:1650938:2,13,2,13
chr1	1650960	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.429:26:4,6:8,5:0|1:1650938_CGG_C:1650938:1,14,0,11
chr1	1650967	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:3,5:7,3:0|1:1650938_CGG_C:1650938:1,10,0,8
chr1	1653004	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr1	1653028	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr1	1653885	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,18:0,15:0,0,32,1
chr1	1654013	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,27;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	1654038	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=221,139;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,9,0
chr1	1654058	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=221,138;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.875:14:0,9:1,4:0|1:1654058_C_T:1654058:0,1,12,1
chr1	1654064	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=221,138;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:0,9:1,4:0|1:1654058_C_T:1654058:0,1,13,1
chr1	1654065	.	AGCG	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=221,138;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:0,9:1,5:0|1:1654058_C_T:1654058:0,1,13,1
chr1	1663831	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:5,5:1,2:0|1:1663831_C_T:1663831:6,0,7,0
chr1	1663851	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,11:0.462:24:6,7:5,4:1|0:1663831_C_T:1663831:13,0,10,1
chr1	1663861	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,10:0.440:23:7,6:5,3:1|0:1663831_C_T:1663831:12,1,9,1
chr1	1664019	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,5:0,0,1,16
chr1	1666338	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr1	1669734	.	G	T	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=149,140;MMQ=45,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,33:0.504:66:19,12:11,21:24,9,24,9
chr1	1669748	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=138,156;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=82.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,37:0.512:72:15,22:20,14:24,11,26,11
chr1	1670570	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,182;MMQ=51,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.370:36:13,6:9,7:1,22,0,13
chr1	1685921	.	TCCCTGGGACCGAAGTCGCCCCA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=202,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.589:10:2,2:1,4:2,2,5,1
chr1	1685973	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,0:4,3,2,0
chr1	1686943	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:1686943_T_C:1686943:0,5,0,2
chr1	1686962	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=141,245;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:1686943_T_C:1686943:0,4,0,1
chr1	1687625	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	1688469	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,7:0,0,13,1
chr1	1688513	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:3,8:7,2:9,3,8,2
chr1	1689762	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:19,8:6,6:16,9,11,3
chr1	1696659	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,17,0
chr1	1696879	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:5,4:6,12:1,10,1,15
chr1	1847856	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,2:3,6:6,0,7,1
chr1	1848109	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	1848273	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,0:6,3:10,6,2,1
chr1	1848428	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,1:13,1:17,12,2,0
chr1	1848734	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	1850208	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1855775	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	1857566	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	1858309	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:1,3:2,6:2,1,5,5
chr1	1887091	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:4,0:2,7,0,2
chr1	1887111	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,2:3,1:0,7,0,3
chr1	1895177	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=108,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:8,6,2,0
chr1	1903559	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=139,136;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0,5,0,2
chr1	1903570	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=139,136;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0,3,0,2
chr1	1903576	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:1903576_G_T:1903576:0,3,0,1
chr1	1903579	.	GT	TA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1903576_G_T:1903576:0,3,0,1
chr1	1903580	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	1903586	.	C	CTTG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	1922303	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:4,7:11,4:10,6,7,4
chr1	1956362	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr1	1960926	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	1960962	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1991123	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:0,8,0,4
chr1	2075560	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=147,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,0:0|1:2075560_T_G:2075560:2,0,3,0
chr1	2075570	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:0|1:2075560_T_G:2075560:4,0,6,0
chr1	2075818	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:3,0:8,2:4,11,0,5
chr1	2075822	.	GTC	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,0:8,3:2,15,0,3
chr1	2077409	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:4,0,5,0
chr1	2082458	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=101,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr1	2106840	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	2116865	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:21,3:17,0:25,13,3,0
chr1	2118539	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,16:0,7:0,0,23,1
chr1	2121118	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,13,6
chr1	2235612	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=17,11;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.215:19:2,0:3,0:4,11,0,4
chr1	2286947	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=112.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,6,25
chr1	2305914	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=99,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:4,2,2,3
chr1	2328714	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=75.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,13:0,0,2,20
chr1	2332391	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=91,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,5:4,3:5,6,2,6
chr1	2338126	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,0:0,9,2,2
chr1	2409892	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,1:2,2,3,0
chr1	2420590	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	2422614	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.707:12:3,3:0,3:2,1,7,2
chr1	2431057	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=228,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:2,1,3,1
chr1	2433930	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr1	2435343	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=20,10;MFRL=207,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:1,0,1,0
chr1	2435348	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=35,35;MFRL=192,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:2435343_TC_GG:2435343:1,0,1,0
chr1	2435349	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:0,0,1,0
chr1	2435352	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:0,0,2,0
chr1	2435356	.	CACAGACA	C,CCA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,35,12;MFRL=0,192,207;MMQ=60,60,60;MPOS=14,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,0:0,0,0:0,0,2,0
chr1	2435363	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,0:0,0:1|0:2435343_TC_GG:2435343:0,0,1,0
chr1	2435367	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,35;MFRL=207,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:1,0,1,0
chr1	2435373	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=24,12;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:3,0,1,0
chr1	2435375	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:2,0,1,0
chr1	2441358	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:6,3:9,8:5,11,4,7
chr1	2441392	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.436:19:4,3:5,5:2,9,2,6
chr1	2443212	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	2444226	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.767:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr1	2445406	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:11,8:11,7:14,8,10,5
chr1	2445720	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,57;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr1	2452357	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.370:16:6,3:4,1:2,8,4,2
chr1	2452444	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:1,5:2,2:3,1,4,3
chr1	2458010	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:8,13:7,4:3,12,5,12
chr1	2491205	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	2494330	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,7:5,5:5,6,6,7
chr1	2494785	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	2520500	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,0:0,6,0,2
chr1	2520527	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	2524205	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:2,1:3,2:3,2,1,2
chr1	2524435	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr1	2524457	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	2524485	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	2528133	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=228,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,1,3
chr1	2535573	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,12;MFRL=161,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0,4,0,1
chr1	2535758	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:3,0,2,4
chr1	2537095	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:9,3:2,4:3,8,1,6
chr1	2537838	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr1	2538349	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	2542848	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:0|1:2542848_G_T:2542848:2,1,0,1
chr1	2542849	.	G	GCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:2542848_G_T:2542848:2,1,0,1
chr1	2700372	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=219,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	2702532	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,0:7,2:12,11,0,2
chr1	2938407	.	CAGA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:2,0,6,4
chr1	3312963	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	3347593	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,0:7,2:2,7,0,2
chr1	3347729	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	3383665	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	3385330	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	3386222	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3386222_A_T:3386222:0,0,0,1
chr1	3386224	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3386222_A_T:3386222:0,0,0,1
chr1	3386227	.	A	AGCCAGGAAGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3386222_A_T:3386222:0,0,0,1
chr1	3386231	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3386222_A_T:3386222:0,0,0,1
chr1	3394456	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	3394640	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	3394674	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	3395078	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.660:33:3,12:7,8:4,7,8,14
chr1	3397188	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	3417131	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	3418565	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	3440647	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	3477414	.	GGGCT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCT;STR;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:2,3:5,5:0,7,0,8
chr1	3496328	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,18,2
chr1	3519179	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:2,3,2,5
chr1	3542106	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.950:15:0,7:0,4:0,0,3,12
chr1	3544187	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=117,102;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:2,7:0,3:1,1,4,6
chr1	3544235	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	3545175	.	GTTCTGGGAGCTCCTCCCCC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCTGGGAGCTCCTCCCCC;STR;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.895:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	3555428	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:0,6,0,7
chr1	3555455	.	AA	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr1	3555460	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	3566625	.	AGCAGGCTG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,6:5,5:1,6,0,11
chr1	3598900	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.349:18:8,3:3,2:0|1:3598900_G_A:3598900:8,4,5,1
chr1	3598910	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:8,3:3,3:0|1:3598900_G_A:3598900:7,4,6,1
chr1	3638834	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,3:0,4:0,0,0,10
chr1	3640081	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=232,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3640081_G_A:3640081:0,1,0,1
chr1	3640085	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=232,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:3640081_G_A:3640081:0,1,0,1
chr1	3644349	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	3644374	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr1	3644817	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr1	3645835	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,0:0,5:0|1:3645835_C_A:3645835:0,0,4,2
chr1	3645844	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.906:8:0,0:0,8:0|1:3645835_C_A:3645835:0,0,5,3
chr1	3647962	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	3659606	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	3662254	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,111;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:5,6,0,2
chr1	3672156	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:0,1,1,7
chr1	3673496	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:2,8:3,3:0,5,5,7
chr1	3679139	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:4,0:1,3:0|1:3679139_T_C:3679139:5,0,4,0
chr1	3679146	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:5,0:2,3:0|1:3679139_T_C:3679139:6,1,5,0
chr1	3679307	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr1	3684076	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	3684107	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	3686415	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:5,1:4,7:4,5,3,6
chr1	3698017	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,8:9,4:13,2,11,1
chr1	3698224	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,2:1,6:0,6,0,8
chr1	3703337	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3712721	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	3732103	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	3732172	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	3732782	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	3742257	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=121,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr1	3743109	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,2:0,12:0,0,8,6
chr1	3743151	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:3,3:3,3:6,0,6,1
chr1	3743319	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:10,6:8,8:8,10,8,6
chr1	3743391	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=59,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,7:3,6:2,4,3,10
chr1	3743433	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr1	3745787	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	3746254	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3746585	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:1,7,3,5
chr1	3746589	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=1209,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,7:0,7:1,0,3,11
chr1	3747603	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,20,6
chr1	3761650	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr1	3761772	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,5:3,3:9,1,8,0
chr1	3762002	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=140,134;MMQ=60,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:12,0:3,2:0|1:3762002_C_T:3762002:0,15,0,2
chr1	3762003	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=140,134;MMQ=60,35;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,0:3,2:0|1:3762002_C_T:3762002:0,15,0,2
chr1	3762009	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=142,134;MMQ=60,35;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:11,0:3,2:0|1:3762002_C_T:3762002:0,16,0,2
chr1	3764216	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:3,1:4,3:1,6,1,4
chr1	3768834	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:1,2:3,1,2,0
chr1	3769033	.	AA	TT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	3774130	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:6,2:7,3:0|1:3774130_A_G:3774130:8,7,4,1
chr1	3774138	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:7,2:7,3:0|1:3774130_A_G:3774130:8,7,4,1
chr1	3775454	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	3782608	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	3784454	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,316;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3784454_T_C:3784454:2,0,1,0
chr1	3784464	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,316;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3784454_T_C:3784454:2,0,1,0
chr1	3789194	.	G	GCGGCCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.589:3:1,1:0,1:0|1:3789194_G_GCGGCCC:3789194:0,1,0,2
chr1	3789195	.	T	TGTCCCTGCCGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0|1:3789194_G_GCGGCCC:3789194:0,1,1,4
chr1	3800390	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,1:1,0:0|1:3800390_C_G:3800390:0,3,0,1
chr1	3800398	.	T	TTGAGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3800390_C_G:3800390:0,2,0,1
chr1	3816800	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	4772812	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr1	4829835	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	4832651	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156685662,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	4834420	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr1	4834606	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,1:1,2:0,2,1,3
chr1	5924466	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,51;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:20,2:12,0:20,12,1,1
chr1	5928133	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	5934490	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	5934837	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:1,1:2,2:2,2,0,3
chr1	5935162	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	5935222	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	5937091	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:8,12:11,8:16,3,14,6
chr1	5937391	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.516:23:8,6:3,5:4,7,2,10
chr1	6029086	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=210,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.544:7:0,1:1,2:0,3,3,1
chr1	6046432	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=190,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	6142439	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=201,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr1	6145365	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.258:24:7,3:11,2:4,14,2,4
chr1	6150637	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	6154417	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr1	6155332	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr1	6157282	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,2,1
chr1	6157434	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,2,5
chr1	6162143	.	G	GAAGCTTCGGGGGGTTTGGAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,0:2,3:4,3,2,1
chr1	6170424	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr1	6172875	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	6184192	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:3,1:5,1:1,7,0,3
chr1	6185064	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	6185275	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	6185532	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr1	6188546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr1	6190173	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	6195493	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	6196493	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	6196517	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr1	6196732	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:1,0:0|1:6196732_T_G:6196732:3,4,1,1
chr1	6196737	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:6196732_T_G:6196732:4,3,1,1
chr1	6196739	.	G	GCCAGACCCCAGA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:6196732_T_G:6196732:4,3,1,1
chr1	6196741	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:6196732_T_G:6196732:4,3,1,1
chr1	6196943	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6196943_A_G:6196943:0,1,0,1
chr1	6196951	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6196943_A_G:6196943:0,1,0,1
chr1	6257826	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:2,3,0,4
chr1	6257856	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	6272136	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr1	6272137	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.858:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	6279336	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=116,109;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:17,0:33,3:23,29,0,3
chr1	6279370	.	G	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,19:0.349:55:13,9:22,9:17,19,2,17
chr1	6293647	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:9,3:6,8:5,10,5,6
chr1	6304768	.	A	AGAGCACAGTTTGGGCAGGAGTCAAAGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.387:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	6305303	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6314738	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:7,1:12,1:8,12,2,0
chr1	6453520	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	6517241	.	CAGG	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=142,184;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AGG;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.065:43:23,0:15,2:20,21,0,2
chr1	6522159	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,1:11,1:12,8,2,0
chr1	6529224	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,152;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	6530965	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr1	6533112	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=140,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:13,0:22,2:0|1:6533112_G_C:6533112:13,24,1,1
chr1	6533117	.	C	CTTTTTGGAGATGGG	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=137,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:12,0:20,2:0|1:6533112_G_C:6533112:15,20,1,1
chr1	6579607	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr1	6586070	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr1	6591937	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	6609559	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	6609851	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	6610366	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	6610382	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,9,0
chr1	6610719	.	C	CCACACCAATATGTGTATTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=197,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	6614391	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,0,14
chr1	6614415	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,1:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,0,8
chr1	6615690	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,1,3
chr1	6615695	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,0,3
chr1	6631319	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	6636606	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,1:11,1:10,11,0,2
chr1	6674055	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.472:6:0,1:2,0:0|1:6674055_A_C:6674055:2,1,3,0
chr1	6674064	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=120,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,0:0|1:6674055_A_C:6674055:2,1,1,0
chr1	6674071	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=94,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:0,0:1,0:1,1,2,0
chr1	6681475	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:12,0:21,2:19,14,0,2
chr1	6681744	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr1	6685442	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	6688471	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=214,200;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:7,0,1,1
chr1	6688639	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=174,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.386:24:10,6:4,3:7,8,4,5
chr1	6694207	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr1	6694574	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,4:0,0,10,0
chr1	6695802	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=118.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,23:0,11:0,0,7,27
chr1	6761702	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	7151479	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	7527996	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,2:2,7:0,3,0,9
chr1	7528032	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.658:7:1,2:1,1:0,2,0,5
chr1	7723534	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr1	7725195	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:7725195_T_A:7725195:0,0,0,1
chr1	7725197	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7725195_T_A:7725195:0,0,0,1
chr1	7730879	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	7737651	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,5:0,0,8,1
chr1	7797096	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,4:3,7:2,4,1,10
chr1	7807858	.	C	CCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	7807897	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=238,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	7811215	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:5,4:3,5:6,2,7,3
chr1	7845695	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr1	7861153	.	C	CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=71.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,26:0.710:36:4,16:6,6:9,1,22,4
chr1	7861304	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,31:0.445:70:25,15:13,16:3,36,4,27
chr1	7861345	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.461:37:9,8:11,9:0,20,0,17
chr1	7869915	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=140.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,18:0,23:0,0,33,8
chr1	7870144	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=131.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,6:0,27:0,0,0,34
chr1	7880145	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=127,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:15,1:24,0:0|1:7880145_A_G:7880145:29,10,2,1
chr1	7880153	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.081:47:17,3:25,0:0|1:7880145_A_G:7880145:28,16,2,1
chr1	7880469	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:7,2,4,1
chr1	7889804	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	7890264	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	7897200	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,85;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:11,2:11,0:7,17,1,1
chr1	7906859	.	T	TAAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGA;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	7913430	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,26:0.370:71:20,11:24,15:22,23,11,15
chr1	7913590	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=143,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:1,1,0,3
chr1	7995033	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:10,1,7,1
chr1	7998963	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	8022800	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.277:5:1,1:1,0:0|1:8022800_CTT_C:8022800:3,1,1,0
chr1	8022824	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=12,15;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:1,0:1|0:8022800_CTT_C:8022800:3,1,1,0
chr1	8022827	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,16;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:2,0:0|1:8022827_G_T:8022827:2,2,2,0
chr1	8022832	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:2,0:0|1:8022827_G_T:8022827:3,3,2,0
chr1	8029543	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	8073423	.	CCT	C	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=134,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:12,0:26,2:0|1:8073423_CCT_C:8073423:17,25,1,1
chr1	8073427	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=133,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:12,0:25,2:0|1:8073423_CCT_C:8073423:17,22,1,2
chr1	8073432	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=137,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:13,0:24,3:0|1:8073423_CCT_C:8073423:16,26,1,2
chr1	8073433	.	T	TGAG	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=135,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:13,0:22,3:0|1:8073423_CCT_C:8073423:15,26,1,2
chr1	8073435	.	TT	CC	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:12,0:23,3:0|1:8073423_CCT_C:8073423:14,24,1,2
chr1	8073437	.	CATAT	C	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=34,36;MFRL=138,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:12,0:24,1:0|1:8073423_CCT_C:8073423:15,26,1,2
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chr1	8390495	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,4:0,0,3,6
chr1	8390998	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8390998_T_TG:8390998:0,1,0,1
chr1	8391000	.	A	ATAAGGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8390998_T_TG:8390998:0,1,0,1
chr1	8397803	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,4:5,3:6,0,7,0
chr1	8399620	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,1:10,3:18,7,3,1
chr1	8399662	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:15,2:14,1:19,13,3,0
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chr1	8415235	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr1	8415290	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=208,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr1	8415418	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=116,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8415418_G_A:8415418:1,0,1,0
chr1	8415422	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=116,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:8415418_G_A:8415418:1,0,1,0
chr1	8415682	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:2,2,1,1
chr1	8420087	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:8420087_A_G:8420087:0,2,1,0
chr1	8420091	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:8420087_A_G:8420087:0,2,1,0
chr1	8420248	.	G	GCACA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=205,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:8420248_G_GCACA:8420248:4,0,0,1
chr1	8420252	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=230,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8420248_G_GCACA:8420248:3,0,0,1
chr1	8420254	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=230,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8420248_G_GCACA:8420248:3,0,0,1
chr1	8422676	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr1	8424039	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	8425798	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=219,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	8425900	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:6,6:1,5:4,4,6,5
chr1	8425913	.	G	GGCTATTTTATAATTTGAC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:7,7,1,1
chr1	8601207	.	TAC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:4,1:7,2:11,2,1,2
chr1	9006104	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	9009577	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9009577_CA_TT:9009577:0,1,0,1
chr1	9009590	.	C	CTTGCAGCTGTTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9009577_CA_TT:9009577:0,1,0,1
chr1	9017430	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=200,183;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,0:0,1:0|1:9017430_C_T:9017430:0,3,0,1
chr1	9017443	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=200,183;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:9017430_C_T:9017430:0,3,0,1
chr1	9034815	.	C	CAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	9063602	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr1	9063646	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=182,174;MMQ=52,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	9063649	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=152,224;MMQ=60,44;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:9063649_G_A:9063649:0,4,0,1
chr1	9063654	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=152,224;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:9063649_G_A:9063649:0,4,0,1
chr1	9070155	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:9070155_A_C:9070155:0,0,2,0
chr1	9070159	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.309:7:0,0:1,0:0|1:9070155_A_C:9070155:5,0,2,0
chr1	9073483	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=304,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	9074932	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,0,3
chr1	9171238	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	9307230	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,3:2,0:1,3,0,3
chr1	9633387	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:6,3:3,0:8,1,0,3
chr1	9649139	.	CGCCCGCCAG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	9655874	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=174,260;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	9658465	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,21,1
chr1	9658657	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=163,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,1:11,1:1,23,0,2
chr1	9658707	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	9661061	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,0:0,0,9,0
chr1	9670547	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=257,255;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr1	9714177	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:5,0,9,0
chr1	9714247	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:12,13:9,6:13,9,13,7
chr1	9714538	.	G	GGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,0,1,4
chr1	9714539	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,0,1,4
chr1	9714541	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,0,1,4
chr1	9714543	.	A	ACCCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,0,1,4
chr1	9714544	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,0,1,4
chr1	9770690	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=36,37;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:1,0:2,2:0,4,0,2
chr1	9770720	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=139,100;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:9770720_T_G:9770720:0,4,0,1
chr1	9770724	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=139,100;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:9770720_T_G:9770720:0,4,0,1
chr1	9770732	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=134,100;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:9770720_T_G:9770720:0,3,0,1
chr1	9770736	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=197,100;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:9770720_T_G:9770720:0,2,0,1
chr1	9801335	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:7,0:7,2:0|1:9801335_G_A:9801335:0,15,1,1
chr1	9801341	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,8:0.500:16:3,2:5,6:1|0:9801335_G_A:9801335:1,7,0,8
chr1	9811435	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	10041298	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=105,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:6,2:2,1:6,3,1,3
chr1	10041393	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=206,187;MMQ=40,41;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:10041393_T_A:10041393:0,2,0,2
chr1	10041396	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=206,205;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10041393_T_A:10041393:0,2,0,1
chr1	10041416	.	CTGAG	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10041416_CTGAG_C:10041416:0,0,0,1
chr1	10041421	.	C	CTAAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10041416_CTGAG_C:10041416:0,0,0,1
chr1	10132437	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	10132493	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=126,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.478:7:2,2:1,1:4,0,2,1
chr1	10177680	.	T	TA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.164:25:11,3:9,1:0,21,0,4
chr1	10194985	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,118;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,1:7,1:9,0,2,0
chr1	10342629	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,6:3,1:0,5,1,6
chr1	10357206	.	ATT	A,AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32,34;MFRL=154,116,180;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.94,11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,7,8:0.234,0.330:27:5,5,6:6,2,1:11,1,14,1
chr1	10425092	.	CG	AT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,10;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:0,0,1,0
chr1	10425098	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,10;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:0,0,1,0
chr1	10425106	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:0,0,1,0
chr1	10425110	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,16;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:0,0,1,0
chr1	10425115	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,15;MFRL=169,119;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:1,1,1,0
chr1	10425126	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=36,10;MFRL=173,119;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:1,2,1,0
chr1	10428433	.	G	GGGATTTGGGGATGCTGTCACCAAGTCTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	10435458	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=124,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:11,0:4,2:4,11,1,1
chr1	10435529	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=233,280;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10435529_G_A:10435529:0,1,0,1
chr1	10435530	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=240,280;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:10435529_G_A:10435529:0,2,0,1
chr1	10435531	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=240,280;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:10435529_G_A:10435529:0,2,0,1
chr1	10438572	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=181,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:10438572_G_A:10438572:0,2,0,1
chr1	10438578	.	C	CACCATCAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=207,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10438572_G_A:10438572:0,1,0,1
chr1	10478830	.	C	CAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=161,151;MMQ=58,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.385:10:3,1:3,1:6,0,3,1
chr1	10478857	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=151,166;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:10,0:10,1:12,12,3,0
chr1	10479779	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,1:8,1:7,6,2,0
chr1	10490539	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.406:30:7,2:9,10:0|1:10490539_G_C:10490539:18,0,12,0
chr1	10490550	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,18:0.416:44:11,6:13,11:0|1:10490539_G_C:10490539:21,5,17,1
chr1	10502307	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=187,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:1,6:0,5:5,0,10,1
chr1	10529194	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,9:6,2:7,2,9,2
chr1	10555257	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:4,3:3,5:6,2,7,1
chr1	10596388	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=127.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,11:0,24:0,0,2,33
chr1	10714436	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=227,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,4,1
chr1	10753809	.	G	GGCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=240,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:10753809_G_GGCCC:10753809:1,0,1,0
chr1	10753812	.	CGA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=196,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:1,1:0|1:10753809_G_GGCCC:10753809:1,1,1,0
chr1	10753818	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:0,0:1,0:0|1:10753809_G_GGCCC:10753809:0,1,3,0
chr1	10753822	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,19;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:10753809_G_GGCCC:10753809:1,1,2,0
chr1	11008829	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:6,5,1,1
chr1	11015235	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11015235_G_A:11015235:0,4,0,1
chr1	11015236	.	G	GTCTTTTTATTTTCATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11015235_G_A:11015235:0,4,0,1
chr1	11076816	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=12,18;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr1	11080723	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,10:0,0:0,0,0,10
chr1	11095039	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,1:0,1,0,6
chr1	11105106	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,8:0,7:0|1:11105106_C_T:11105106:0,0,1,16
chr1	11105122	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0|1:11105106_C_T:11105106:0,0,0,15
chr1	11105514	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr1	11105545	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=161,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:11105545_T_A:11105545:1,1,0,1
chr1	11105548	.	T	TTGCAGTGAGCTGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=161,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:11105545_T_A:11105545:1,1,0,1
chr1	11115177	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=19,20;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:11115177_CTTT_C:11115177:0,1,0,1
chr1	11115198	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:11115177_CTTT_C:11115177:0,3,0,1
chr1	11115201	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:11115177_CTTT_C:11115177:0,3,0,1
chr1	11115236	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,16;MFRL=205,193;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:11115236_G_A:11115236:0,1,0,2
chr1	11115238	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=36,32;MFRL=205,193;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:11115236_G_A:11115236:0,1,0,2
chr1	11115807	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.221:15:1,1:8,2:0|1:11115807_CAA_C:11115807:3,9,3,0
chr1	11115814	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.194:17:2,1:10,2:0|1:11115807_CAA_C:11115807:4,10,3,0
chr1	11115819	.	CCAGACA	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.151:22:3,0:10,2:0|1:11115807_CAA_C:11115807:9,10,3,0
chr1	11128001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr1	11128654	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	11129848	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	11133934	.	C	CAAA,CAAAAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,34,32;MFRL=140,178,134;MMQ=48,40,40;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,26,28;RU=A;STR;TLOD=4.38,6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.316,0.416:10:2,0,1:0,3,2:1,2,7,0
chr1	11133956	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=13,32;MFRL=140,120;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.621:30:2,11:1,8:11,0,9,10
chr1	11133962	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=130,125;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:16,0:9,0:13,13,2,0
chr1	11134157	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,3:0,14:0,0,2,15
chr1	11134483	.	T	TCCCCCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	11137778	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	11147918	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=147,49;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:9,2:0|1:11147918_T_G:11147918:13,7,1,1
chr1	11147922	.	GGGA	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=153,49;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:9,2:0|1:11147918_T_G:11147918:13,10,1,1
chr1	11147932	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=149,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:11147918_T_G:11147918:11,12,1,1
chr1	11147933	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=149,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:11147918_T_G:11147918:11,12,1,1
chr1	11147936	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=148,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:8,2:0|1:11147918_T_G:11147918:9,12,1,1
chr1	11184489	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:8,1,2,0
chr1	11187293	.	G	GCTCCTGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=188,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11187293_G_GCTCCTGGC:11187293:0,1,0,1
chr1	11187295	.	G	GGGTTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=188,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11187293_G_GCTCCTGGC:11187293:0,1,0,1
chr1	11187893	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	11269604	.	C	CCTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:11269604_C_CCTT:11269604:0,1,0,1
chr1	11269608	.	TA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11269604_C_CCTT:11269604:0,1,0,1
chr1	11269611	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11269604_C_CCTT:11269604:0,1,0,1
chr1	11269615	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11269604_C_CCTT:11269604:0,1,0,1
chr1	11288633	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	11292666	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr1	11317320	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	11333812	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:5,3,5,3
chr1	11575375	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,7:1,3:5,1,10,0
chr1	11577529	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=113,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,2:8,5,2,0
chr1	11579354	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=21113223,41695003;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,1:0|1:11579354_A_C:11579354:2,0,2,0
chr1	11579358	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=21113223,41695003;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:11579354_A_C:11579354:2,0,2,0
chr1	11579367	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,16;MFRL=21113223,41695003;MMQ=60,42;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:11579354_A_C:11579354:2,0,2,0
chr1	11579372	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=186,83389808;MMQ=60,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:11579354_A_C:11579354:4,0,1,0
chr1	11579470	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:5,1:2,4:3,5,1,4
chr1	11593793	.	T	TGCACACACGCAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=167,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,0:0,2:1,0,3,0
chr1	11593994	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11594400	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:6,2,3,2
chr1	11708736	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,10,6
chr1	11709052	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,34;MFRL=69919332,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:0,1:0,2:2,0,2,1
chr1	11718713	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:2,0:7,4,0,2
chr1	11737082	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=99,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:11737082_CA_C:11737082:0,2,0,1
chr1	11737083	.	AA	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:0,1:1,0:1|0:11737082_CA_C:11737082:0,2,0,1
chr1	11737091	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=93,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:11737082_CA_C:11737082:0,1,0,1
chr1	11740329	.	AGGCGTGAGCCAC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,156;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	11772303	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	11772526	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	11796168	.	CGGGCG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCG;STR;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr1	11807426	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr1	11808706	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	11832100	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	11832311	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=176.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,32:0,17:0,0,17,32
chr1	11832415	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr1	11836441	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	11842144	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	11848879	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	11848900	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11854085	.	TC	AG	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,3:3,7:0,6,1,9
chr1	11854133	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:11854133_G_A:11854133:1,2,0,1
chr1	11854137	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:11854133_G_A:11854133:1,1,0,1
chr1	11854140	.	A	AGTTG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:11854133_G_A:11854133:1,1,0,1
chr1	11854143	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11854133_G_A:11854133:1,0,0,1
chr1	11854146	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11854133_G_A:11854133:1,0,0,1
chr1	11854457	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr1	11854755	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=105.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,15:0,0,21,10
chr1	11887373	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	11894274	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,1:11,1:9,10,2,0
chr1	11917720	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.467:32:10,6:7,8:6,11,4,11
chr1	11918927	.	TCTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,232;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTG;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	11982544	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:5,3:6,0,4,0
chr1	11982676	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.324:41:10,9:18,4:12,16,5,8
chr1	12012808	.	CG	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,1,0
chr1	12014530	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,190;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.195:14:5,2:6,0:0|1:12014530_C_T:12014530:9,3,2,0
chr1	12014533	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=156,190;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.174:16:6,2:6,0:0|1:12014530_C_T:12014530:10,4,2,0
chr1	12018740	.	C	CCTCCCCCACTGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr1	12024378	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,0:2,2:0|1:12024378_G_T:12024378:1,2,1,1
chr1	12024381	.	G	GAGAAGGGAAGTCACAGGCTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:12024378_G_T:12024378:0,1,1,1
chr1	12030954	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	12030957	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	12056440	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	12058802	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:5,4:1,2:5,1,5,1
chr1	12061417	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	12062005	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:7,1:8,0:0|1:12062005_C_G:12062005:14,4,2,0
chr1	12062010	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=16,13;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:4,0:5,0:0|1:12062005_C_G:12062005:16,4,2,0
chr1	12062017	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.384:21:7,3:6,4:0|1:12062005_C_G:12062005:12,1,5,3
chr1	12062205	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:5,4:6,7:3,9,1,10
chr1	12066813	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=101,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	12069798	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:0,3,1,3
chr1	12071680	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	12090001	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr1	12144639	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	12198203	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=207,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr1	12248965	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr1	12251191	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	12251765	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.440:34:9,9:9,4:18,1,13,2
chr1	12251808	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.490:45:11,14:12,8:14,9,17,5
chr1	12254201	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,0:1,3:0,6,1,2
chr1	12261972	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr1	12309291	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:4,4:10,7:10,4,10,1
chr1	12368724	.	ATG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:6,2:2,11,0,2
chr1	12368733	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=144,136;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr1	12409086	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,6:3,5:3,5,4,7
chr1	12418700	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr1	12445302	.	GT	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=58.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.481:50:15,16:10,8:16,10,20,4
chr1	12461852	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	12567232	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	12628431	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:7,2:18,0:11,14,0,2
chr1	12632951	.	G	GCTGAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=96,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12632951_G_GCTGAAAA:12632951:0,2,0,1
chr1	12632957	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=96,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12632951_G_GCTGAAAA:12632951:0,2,0,1
chr1	12639018	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	12776218	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=204,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:2,3:5,0,4,1
chr1	12776344	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:8,2:6,5:6,9,3,4
chr1	12835674	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=101,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.140:25:12,3:9,0:11,11,1,2
chr1	12854021	.	GA	TT	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=171,181;MMQ=25,32;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,1:5,1:0|1:12854021_GA_TT:12854021:9,1,1,1
chr1	12854041	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=158,181;MMQ=25,32;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0|1:12854021_GA_TT:12854021:8,1,1,1
chr1	12854052	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=150,162;MMQ=39,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:9,2:5,1:0|1:12854021_GA_TT:12854021:12,2,1,2
chr1	12854090	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=153,168;MMQ=31,24;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,8:0.214:40:17,6:13,2:0|1:12854090_T_A:12854090:21,11,7,1
chr1	12854097	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=149,169;MMQ=47,24;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,9:0.233:41:18,6:13,3:0|1:12854090_T_A:12854090:21,11,8,1
chr1	12854105	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=152,169;MMQ=47,24;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,9:0.217:44:19,6:15,3:0|1:12854090_T_A:12854090:23,12,8,1
chr1	12855835	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,37;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0|1:12855835_C_G:12855835:0,0,4,13
chr1	12855845	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,36;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0|1:12855835_C_G:12855835:0,0,5,15
chr1	12856010	.	C	G	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=143,131;MMQ=27,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,25:0.320:79:29,10:25,15:0|1:12856010_C_G:12856010:39,15,19,6
chr1	12856030	.	T	C	.	.	DP=111;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,138;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:89,15:0.146:104:48,7:39,7:1|0:12856010_C_G:12856010:52,37,9,6
chr1	12856153	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,169;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.313:33:10,6:13,4:4,19,0,10
chr1	12907199	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=155,163;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr1	12907212	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,162;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:6,0,9,0
chr1	12907313	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=136,144;MMQ=48,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,2:11,0:9,11,0,2
chr1	12907316	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=136,148;MMQ=56,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:8,4:12,2:11,9,1,5
chr1	12907350	.	CA	TG	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=120,149;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,3:9,2:13,9,1,4
chr1	12907370	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=126,149;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:10,3:10,2:0|1:12907370_A_T:12907370:14,12,1,4
chr1	12907379	.	TC	CA	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=126,148;MMQ=60,55;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:13,1:9,2:0|1:12907370_A_T:12907370:14,12,1,3
chr1	12907385	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=117,148;MMQ=52,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:13,1:9,1:0|1:12907370_A_T:12907370:13,12,1,3
chr1	12907777	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=141,167;MMQ=52,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,10:0.234:45:18,6:17,2:0|1:12907777_T_C:12907777:17,18,10,0
chr1	12907781	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=142,167;MMQ=52,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,10:0.239:44:17,7:17,3:0|1:12907777_T_C:12907777:16,18,10,0
chr1	12907798	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=141,145;MMQ=52,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=77.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,21:0.379:56:17,10:15,10:0|1:12907777_T_C:12907777:15,20,19,2
chr1	12907802	.	CC	TT	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=140,146;MMQ=51,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,22:0.371:60:18,9:14,11:0|1:12907777_T_C:12907777:18,20,20,2
chr1	12907829	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=143,135;MMQ=51,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,19:0.289:67:25,9:21,9:35,13,9,10
chr1	12907837	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=147,135;MMQ=51,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,35:0.461:76:21,20:19,15:19,22,29,6
chr1	12908333	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,256;MMQ=51,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr1	12919587	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,163;MMQ=38,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,2:5,2:8,2,2,2
chr1	12921332	.	TG	CA,CG	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=131,113,219;MMQ=55,37,27;MPOS=17,26;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=41.09,9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,14,5:0.341,0.145:39:9,7,3:11,7,2:9,11,11,8
chr1	12921716	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,84;MMQ=24,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.299:24:11,4:6,2:1,16,1,6
chr1	12942842	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=155,151;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.375:24:6,1:7,3:0|1:12942842_G_A:12942842:14,1,9,0
chr1	12942858	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,150;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.308:24:7,2:9,5:0|1:12942842_G_A:12942842:16,1,7,0
chr1	12942862	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=153,151;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.291:22:6,2:9,4:0|1:12942842_G_A:12942842:15,1,6,0
chr1	12954729	.	A	AATAATTAAGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=227,220;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:12954729_A_AATAATTAAGCT:12954729:1,1,0,1
chr1	12954731	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=227,220;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12954729_A_AATAATTAAGCT:12954729:1,1,0,1
chr1	13182899	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,210;MMQ=40,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,0:3,4:10,1,4,0
chr1	13183225	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=156,146;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:13,1:4,2:0|1:13183225_T_C:13183225:8,9,3,0
chr1	13183228	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=156,161;MMQ=27,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:12,1:3,2:0|1:13183225_T_C:13183225:8,9,4,0
chr1	13183237	.	CT	TC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=156,146;MMQ=27,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:11,4:3,2:0|1:13183225_T_C:13183225:6,9,7,0
chr1	13183243	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=156,149;MMQ=33,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:9,4:4,5:0|1:13183225_T_C:13183225:7,9,9,0
chr1	13183248	.	TC	AA	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=154,148;MMQ=27,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:9,4:5,6:0|1:13183225_T_C:13183225:6,8,10,0
chr1	13183439	.	T	C	.	.	DP=113;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,80:0.755:106:14,42:10,37:13,13,41,39
chr1	13183511	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=142,139;MMQ=52,49;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,36:0.457:79:17,15:26,20:0|1:13183511_T_C:13183511:19,24,4,32
chr1	13183528	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=150,148;MMQ=52,45;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,28:0.439:64:14,14:21,11:0|1:13183511_T_C:13183511:18,18,1,27
chr1	13183532	.	CC	TT	.	.	DP=58;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=148,157;MMQ=52,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,22:0.396:56:14,11:19,11:0|1:13183511_T_C:13183511:18,16,0,22
chr1	13183567	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=141,200;MMQ=52,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,10:0.186:57:16,7:28,3:0|1:13183567_C_T:13183567:30,17,0,10
chr1	13183573	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=138,184;MMQ=52,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,9:0.166:58:17,6:30,2:0|1:13183567_C_T:13183567:27,22,0,9
chr1	13183956	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,165;MMQ=27,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:6,1:13,1:0|1:13183956_G_A:13183956:3,16,0,2
chr1	13183966	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=189,139;MMQ=52,27;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,5:0.315:17:5,2:7,3:1|0:13183956_G_A:13183956:2,10,0,5
chr1	13448180	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,37;MFRL=0,196;MMQ=60,24;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:13448180_A_G:13448180:0,0,2,0
chr1	13448184	.	CG	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,24;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:13448180_A_G:13448180:0,0,2,0
chr1	13448199	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,25;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	13933855	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	13936822	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,9:3,1:6,1,8,2
chr1	13937089	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=217,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	14057425	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.620:6:1,2:1,1:2,0,3,1
chr1	14075996	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=147,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,0:8,2:0|1:14075996_G_C:14075996:1,14,3,0
chr1	14076001	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=158,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,0:8,2:0|1:14075996_G_C:14075996:0,12,3,0
chr1	14076005	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,1:7,1:0|1:14075996_G_C:14075996:0,12,3,0
chr1	14076008	.	CGG	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,1:0|1:14075996_G_C:14075996:0,12,2,0
chr1	14107035	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,2:9,0:0|1:14107035_T_A:14107035:14,5,1,1
chr1	14107040	.	A	ACAGTAACTACC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:0|1:14107035_T_A:14107035:14,5,1,1
chr1	14107042	.	T	TGGTAATGGGGAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:9,0:0|1:14107035_T_A:14107035:14,5,1,1
chr1	14108748	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:6,1:3,1:3,6,1,1
chr1	14143137	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=14,20;MFRL=334,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.635:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr1	14149601	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,5:6,5:5,4,6,4
chr1	14149622	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:5,6:6,7:8,3,6,7
chr1	14220186	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,8:5,6:6,2,8,6
chr1	15386851	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,0:5,0:0,7,0,2
chr1	15386856	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,0:3,0:0,5,0,2
chr1	15390215	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=143,245;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:15390215_A_C:15390215:0,3,0,1
chr1	15390217	.	C	CTTCCTTTGCCAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=143,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:15390215_A_C:15390215:0,3,0,1
chr1	15438825	.	ATGTGTGTG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=TG;STR;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:0,1:1,0,4,0
chr1	15497844	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	15541537	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	15578195	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr1	15616183	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:0,1:2,1:0,2,1,2
chr1	15651062	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:6,3:11,6:5,12,4,5
chr1	15653503	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:4,4:1,3:0,6,1,6
chr1	15687059	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,11:0,0,9,11
chr1	15687121	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=123,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:10,13,0,2
chr1	15692506	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=182,122;MMQ=60,58;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.339:4:1,0:2,1:0|1:15692506_G_A:15692506:0,3,0,1
chr1	15692510	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=182,122;MMQ=60,58;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.339:4:0,0:2,1:0|1:15692506_G_A:15692506:0,3,0,1
chr1	15692512	.	AG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=195,122;MMQ=60,58;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:15692506_G_A:15692506:0,2,0,1
chr1	15692521	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=208,122;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:15692506_G_A:15692506:0,3,0,1
chr1	15694127	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0|1:15694127_G_A:15694127:0,1,0,1
chr1	15694131	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15694127_G_A:15694127:0,1,0,1
chr1	15694133	.	GGCCGGGT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15694127_G_A:15694127:0,1,0,1
chr1	15694146	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:15694127_G_A:15694127:0,0,0,1
chr1	15707967	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	15764952	.	CACCTAACCATG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=127,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,2:1,0:5,4,1,1
chr1	15770101	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=176,34891949;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr1	15770124	.	T	TCAGGCAAAAGTCCATAGTGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:15770124_T_TCAGGCAAAAGTCCATAGTGTA:15770124:0,4,0,1
chr1	15770126	.	T	TCTCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:15770124_T_TCAGGCAAAAGTCCATAGTGTA:15770124:0,4,0,1
chr1	15771310	.	G	GAACCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	15772057	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:2,1:0,4:3,0,5,0
chr1	15772933	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	15783117	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	15783553	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,144;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:4,0,4,2
chr1	15789176	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,181;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,6:2,3:3,1,8,1
chr1	15789297	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=117,173;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:4,5:6,5:3,7,5,6
chr1	15789446	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,0:2,1:0|1:15789446_C_G:15789446:0,4,0,2
chr1	15789450	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:0,1:2,0:0|1:15789446_C_G:15789446:0,4,0,2
chr1	15809706	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:4,1,5,1
chr1	15813751	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr1	15813969	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,1,1
chr1	15832383	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr1	15834297	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=113,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:3,0,1,1
chr1	15834491	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,1,2
chr1	15844926	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	15850483	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=227,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	15850553	.	C	CGGGGGCG,CGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,34,0;MFRL=210,198,152;MMQ=60,60,60;MPOS=14,50;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.45,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.392,0.243:6:2,1,0:1,1,0:3,0,2,1
chr1	15863359	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15863359_T_TC:15863359:0,1,0,1
chr1	15863363	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=37,32;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15863359_T_TC:15863359:0,1,0,1
chr1	15890358	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,31;MFRL=201,293;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:15890358_A_G:15890358:1,0,1,0
chr1	15890360	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=201,293;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15890358_A_G:15890358:1,0,1,0
chr1	15890630	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:2,0:0,1:2,1,0,2
chr1	15893862	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	15906725	.	TA	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr1	15909624	.	TGAGTACAG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	15909850	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=85,157;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:1,3,2,5
chr1	15909895	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:1,3,2,5
chr1	15956769	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:8,1,3,0
chr1	15959886	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,2:3,0:8,0,2,0
chr1	15959977	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:12,3:4,3:10,7,4,2
chr1	15964850	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:18,0:7,2:17,8,2,0
chr1	15965025	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=184,188;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	15978236	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,3:11,0:11,9,2,1
chr1	16011005	.	G	GGGC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GGC;STR;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:3,5:7,8:10,0,14,1
chr1	16011192	.	G	GGCGACCCTGCTGCCGCAGGGACTC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.549:16:3,4:4,3:0,7,0,9
chr1	16042724	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:0,0:6,1,0,2
chr1	16043157	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	16045152	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	16047738	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=116,129;MMQ=54,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,1:1,0:0|1:16047738_T_TG:16047738:2,0,1,0
chr1	16047742	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=16,20;MFRL=81,140;MMQ=48,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.628:3:0,1:0,0:1,0,2,0
chr1	16047750	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,18;MFRL=16864672,129;MMQ=54,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:16047738_T_TG:16047738:2,0,1,0
chr1	16047911	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:16047911_T_G:16047911:2,13,0,2
chr1	16047914	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=145,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:9,0:4,2:0|1:16047911_T_G:16047911:2,13,0,2
chr1	16053493	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.475:42:12,10:10,9:14,8,11,9
chr1	16055732	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.335:25:6,2:10,6:0,17,0,8
chr1	16064411	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=82,112;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:9,5:2,3:6,5,3,5
chr1	16065303	.	ACACACT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACACT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	16096893	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,5:2,2:3,0,6,1
chr1	16096934	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr1	16248740	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.217:15:7,1:5,1:10,2,2,1
chr1	16258454	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,1:14,1:4,19,0,2
chr1	16259499	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,2:10,0:8,14,2,0
chr1	16260367	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	16261936	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,4:0.065:75:35,2:35,2:46,25,3,1
chr1	16271170	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=273,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	16273675	.	T	TCCGTTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:16273675_T_TCCGTTGG:16273675:0,3,0,1
chr1	16273677	.	C	CTTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:16273675_T_TCCGTTGG:16273675:0,3,0,1
chr1	16273680	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:16273675_T_TCCGTTGG:16273675:0,3,0,1
chr1	16330722	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:3,4:0,5:3,0,8,1
chr1	16330772	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=137,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,3:8,1:16,4,4,0
chr1	16342350	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	16344730	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	16344759	.	C	CCTCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16344759_C_CCTCCA:16344759:0,1,0,1
chr1	16344763	.	TG	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16344759_C_CCTCCA:16344759:0,1,0,1
chr1	16345619	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	16346009	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=126,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	16352573	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:4,3:0,2:4,1,4,1
chr1	16352937	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.658:15:1,5:3,5:5,0,10,0
chr1	16354280	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	16354394	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=162,144;MMQ=40,24;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:10,3:5,1:14,1,4,0
chr1	16354433	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=163,156;MMQ=45,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:10,4:5,1:0|1:16354433_A_AT:16354433:6,10,0,5
chr1	16354435	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=163,156;MMQ=45,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:10,4:6,1:0|1:16354433_A_AT:16354433:6,10,0,5
chr1	16354441	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=167,156;MMQ=59,27;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:9,4:9,0:4,14,0,5
chr1	16354590	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,4:2,5:1,3,4,5
chr1	16355287	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:5,3,3,4
chr1	16355425	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=187,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr1	16356501	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.538:20:7,4:2,5:6,3,7,4
chr1	16356583	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:11,5:9,3:9,11,2,6
chr1	16358148	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	16358685	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr1	16359051	.	CA	AG	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:7,7:7,2:4,10,5,5
chr1	16359052	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,7,14
chr1	16359106	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:0,6,0,5
chr1	16359123	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	16359827	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	16370899	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr1	16371138	.	A	ATGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=171,237;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16371138_A_ATGC:16371138:0,1,0,1
chr1	16371141	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16371138_A_ATGC:16371138:0,1,0,1
chr1	16372003	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	16372971	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	16373199	.	CCTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,2:0,4,0,3
chr1	16374330	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	16374622	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	16374952	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=163,198;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,0:4,2:4,10,0,3
chr1	16375838	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	16376191	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,5:0,0,19,0
chr1	16376230	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.936:10:0,6:0,3:0|1:16376230_A_AT:16376230:0,0,8,2
chr1	16376232	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0|1:16376230_A_AT:16376230:0,0,8,2
chr1	16376238	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr1	16376278	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,9,14
chr1	16376458	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr1	16378739	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.309:20:8,1:6,4:9,5,3,3
chr1	16380033	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr1	16382086	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr1	16382827	.	CTCT	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:6,0,7,0
chr1	16382831	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,1:3,3:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:5,0,7,0
chr1	16382834	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.573:12:2,3:3,4:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:5,0,7,0
chr1	16382877	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=133.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,16:0,27:0,0,30,15
chr1	16383067	.	G	GCCACTCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=102,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:16383067_G_GCCACTCCT:16383067:0,1,0,1
chr1	16383071	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16383067_G_GCCACTCCT:16383067:0,0,0,1
chr1	16383329	.	T	TC	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,129;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:10,1:15,5:0,26,0,7
chr1	16383336	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=170,124;MMQ=52,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.258:33:10,2:14,6:0,25,0,8
chr1	16383448	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=134.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,25:0,20:0,0,15,30
chr1	16383605	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=183,201;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr1	16383668	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=69.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,19,1
chr1	16383682	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=157,134;MMQ=33,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.256:25:12,5:7,1:14,5,4,2
chr1	16384986	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=196,229;MMQ=39,57;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.249:22:4,2:10,2:0|1:16384986_G_T:16384986:13,4,3,2
chr1	16384998	.	GG	CA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=199,229;MMQ=35,57;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:7,3:12,2:0|1:16384986_G_T:16384986:16,4,3,2
chr1	16385007	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=184,205;MMQ=57,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:5,4:12,1:12,5,5,0
chr1	16385042	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=166,160;MMQ=27,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.210:25:10,2:10,2:18,2,4,1
chr1	16385248	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=145,161;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:10,1:13,1:0|1:16385248_C_T:16385248:2,24,0,2
chr1	16385250	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=145,161;MMQ=60,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,1:13,1:0|1:16385248_C_T:16385248:2,24,0,2
chr1	16385915	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:18,4,2,0
chr1	16385958	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.366:22:7,2:6,3:0,14,8,0
chr1	16385980	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=156,115;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:6,6:9,5:3,12,2,9
chr1	16386008	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=166,157;MMQ=53,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.387:24:6,4:8,5:4,11,2,7
chr1	16388556	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=144,111;MMQ=44,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:6,1:1,4:0|1:16388556_C_T:16388556:5,3,3,3
chr1	16388565	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=146,111;MMQ=48,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.367:17:6,1:4,5:0|1:16388556_C_T:16388556:7,4,3,3
chr1	16388580	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=142,163;MMQ=57,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,3:0.180:20:7,2:10,1:1|0:16388556_C_T:16388556:8,9,2,1
chr1	16388709	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=158,155;MMQ=60,33;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,1:1,4:0,5,0,5
chr1	16388756	.	CACCCAT	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=203,176;MMQ=53,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,3:1,1:1,1,1,3
chr1	16388766	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=136,179;MMQ=45,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,2,3
chr1	16389118	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=9,32;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr1	16389135	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=175,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr1	16390007	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,4,2
chr1	16451869	.	CCG	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16451869_CCG_C:16451869:0,0,0,1
chr1	16451872	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16451869_CCG_C:16451869:0,0,0,1
chr1	16451875	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16451869_CCG_C:16451869:0,0,0,1
chr1	16451879	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16451869_CCG_C:16451869:0,0,0,1
chr1	16451881	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16451869_CCG_C:16451869:0,0,0,1
chr1	16458814	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.755:24:2,10:4,8:3,3,10,8
chr1	16459745	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=116,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,5:2,3:2,4,2,6
chr1	16464936	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:5,7:0,3:0,5,2,8
chr1	16477506	.	G	GCATCACAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr1	16525056	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:4,2,2,1
chr1	16525549	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:8,0,6,0
chr1	16525829	.	G	GTAAGCCTAATAATGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.525:2:0,1:0,0:0|1:16525829_G_GTAAGCCTAATAATGTA:16525829:0,1,0,1
chr1	16525834	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16525829_G_GTAAGCCTAATAATGTA:16525829:0,0,0,1
chr1	16528218	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	16528233	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=129,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr1	16528843	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	16529117	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,6:4,3:0,10,2,8
chr1	16534002	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:8,2:3,4:9,2,4,2
chr1	16534730	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr1	16543175	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	16555585	.	G	GCTCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=159,133;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16555585_G_GCTCT:16555585:0,1,0,1
chr1	16555587	.	A	ACCATCCTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=159,133;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16555585_G_GCTCT:16555585:0,1,0,1
chr1	16555589	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=159,133;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:16555585_G_GCTCT:16555585:0,1,0,1
chr1	16555610	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	16559541	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:0,11,0,6
chr1	16583030	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,3:4,4,4,0
chr1	16621183	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,5:0,1:3,0,6,0
chr1	16693725	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=189,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,1:3,0,3,0
chr1	16725330	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:10,6:9,8:6,13,7,7
chr1	16731626	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:16731626_GT_G:16731626:0,4,0,1
chr1	16731631	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:16731626_GT_G:16731626:0,4,0,1
chr1	16731632	.	G	GTTCAGGGGAGAGGCAGACACCGTAGT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=130,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	16731633	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=128,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:16731626_GT_G:16731626:0,3,0,1
chr1	16731646	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,681;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	16735579	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=128,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:6,4,2,0
chr1	16736546	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:3,5:1,4,2,5
chr1	16775532	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,2:2,1:9,0,3,0
chr1	16775769	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=219,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	16778265	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=83.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,20,5
chr1	16890421	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=167,168;MMQ=49,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,12:0.196:64:19,5:31,7:44,8,9,3
chr1	16890428	.	T	A	.	.	DP=78;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=161,161;MMQ=49,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,9:0.133:73:25,4:39,5:53,11,8,1
chr1	16890441	.	C	T	.	.	DP=100;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=164,126;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,21:0.219:98:33,9:44,12:62,15,15,6
chr1	16890639	.	C	T	.	.	DP=111;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=150,179;MMQ=49,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,19:0.181:108:52,7:37,12:40,49,4,15
chr1	16890644	.	C	T	.	.	DP=114;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=151,169;MMQ=49,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,25:0.232:110:45,16:39,9:40,45,8,17
chr1	16890671	.	TG	CA	.	.	DP=105;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=136,180;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=138.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,38:0.387:99:32,13:29,24:32,29,11,27
chr1	16890760	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=166,110;MMQ=51,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:12,0:11,4:7,16,1,3
chr1	16893884	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=172,177;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.509:45:13,8:8,14:0,22,1,22
chr1	16893943	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=175,192;MMQ=26,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16893943_AAG_A:16893943:0,1,0,1
chr1	16893947	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=175,192;MMQ=26,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16893943_AAG_A:16893943:0,1,0,1
chr1	16895703	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=169,179;MMQ=21,20;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:16,3:27,1:0,43,0,4
chr1	16895764	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=214,150;MMQ=21,20;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr1	16895782	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=196,137;MMQ=22,20;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr1	16895788	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=205,163;MMQ=22,20;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	16907164	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=185,179;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,17:0.222:79:27,11:33,6:51,11,14,3
chr1	16907165	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=186,156;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,12:0.164:77:32,6:32,6:53,12,10,2
chr1	16907204	.	G	A	.	.	DP=121;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=161,164;MMQ=25,23;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,14:0.129:111:38,8:58,6:85,12,13,1
chr1	16907466	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,177;MMQ=20,20;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:22,2:16,2:0,38,0,4
chr1	16908989	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=139,153;MMQ=40,28;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.194:29:13,4:8,1:14,10,4,1
chr1	16909000	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=131,139;MMQ=33,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:12,1:3,4:5,10,1,4
chr1	16914159	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=154,102;MMQ=52,26;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.076:64:31,2:26,1:52,8,4,0
chr1	16914160	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=131,194;MMQ=54,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,15:0.239:65:24,9:23,6:41,9,15,0
chr1	16914168	.	C	G	.	.	DP=90;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=125,178;MMQ=55,29;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=105.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,34:0.384:89:28,13:25,17:43,12,32,2
chr1	16914176	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=130,108;MMQ=40,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,9:0.083:118:55,2:53,7:85,24,8,1
chr1	16914196	.	T	C	.	.	DP=212;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=127,165;MMQ=40,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:181,12:0.066:193:85,9:95,3:123,58,8,4
chr1	16914306	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=160,176;MMQ=27,35;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,11:0.171:68:29,5:26,6:2,55,0,11
chr1	16914339	.	G	C	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=189,169;MMQ=49,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.122:55:24,4:24,2:3,46,0,6
chr1	16915570	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,20;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	16915609	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=149,153;MMQ=20,20;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	16915611	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=153,149;MMQ=20,20;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	16918255	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=189,211;MMQ=23,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.413:8:1,3:2,0:5,0,3,0
chr1	16918605	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=145,258;MMQ=22,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:0|1:16918605_A_C:16918605:2,10,0,2
chr1	16918611	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=231,120;MMQ=35,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,7:0.571:12:1,4:4,3:1|0:16918605_A_C:16918605:0,5,1,6
chr1	17251055	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr1	17256313	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,41;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	17264090	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,171;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:15,2:5,5:15,5,6,1
chr1	17264296	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,172;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:3,2:4,7:1,7,0,9
chr1	17264863	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,127;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,13:0.210:65:34,4:12,9:42,10,10,3
chr1	17265327	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,4:5,1:7,1,5,0
chr1	17265366	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,4:8,0:9,6,5,0
chr1	17266665	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17266665_G_A:17266665:0,1,0,1
chr1	17266674	.	T	TGGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17266665_G_A:17266665:0,1,0,1
chr1	17266677	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=205,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:17266665_G_A:17266665:0,2,0,1
chr1	17270498	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,221;MMQ=58,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,2:7,1:14,0,3,0
chr1	17275072	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=183,164;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	17281128	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:14,0,2,0
chr1	17297289	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	17299014	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	17301672	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	17303589	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,17,9
chr1	17303792	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	17313157	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	17323449	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	17328621	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:11,1:9,11,1,1
chr1	17328731	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,3:7,9:7,4,7,5
chr1	17331886	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:11,3,2,0
chr1	17359676	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,4,14
chr1	17395480	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	17395516	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=148,149;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,2:2,0:5,3,2,0
chr1	17395521	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,8,3
chr1	17396498	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	17398066	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:17398066_G_C:17398066:0,0,0,5
chr1	17398069	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:17398066_G_C:17398066:0,0,0,5
chr1	17401283	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	17402116	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	17402135	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	17402159	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr1	17402347	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	17402418	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	17405916	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr1	17405949	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr1	17410364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	17418883	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:17418883_A_G:17418883:0,0,5,1
chr1	17418894	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:17418883_A_G:17418883:0,0,6,3
chr1	17419066	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr1	17422302	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,1:0,3:0,0,6,0
chr1	17431363	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	17431618	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	17550225	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	17551034	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	17555316	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr1	17563957	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:11,2:9,0:8,15,0,2
chr1	17601083	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr1	17607068	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,6,4
chr1	17660718	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=132,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:27,1:31,2:59,1,3,0
chr1	17660802	.	A	AT,ATT	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=33,31,25;MFRL=131,118,147;MMQ=60,60,57;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=21.34,4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,14,4:0.393,0.129:36:9,9,1:8,5,1:8,10,9,9
chr1	17660858	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=161,151;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:14,2:4,0:0,19,0,2
chr1	17662705	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.497:38:9,11:9,7:8,11,9,10
chr1	17674358	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	17674402	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,5:0,1:1,1,6,1
chr1	17681277	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	17683041	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	17690312	.	G	GCTCC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,1:4,0:0|1:17690312_G_GCTCC:17690312:0,5,0,1
chr1	17690316	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:0,1:4,0:0|1:17690312_G_GCTCC:17690312:0,5,0,1
chr1	17690320	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:17690312_G_GCTCC:17690312:0,3,0,1
chr1	17690322	.	G	GAAATTCTTTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:17690312_G_GCTCC:17690312:0,3,0,1
chr1	17707739	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	17714864	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:3,1,5,0
chr1	17715081	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,33;MFRL=130,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr1	17715135	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	17718671	.	AG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=93.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,18:0,0,7,23
chr1	17718750	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=198,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,0:2,6:0,3,1,5
chr1	17720391	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=117,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	17720439	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr1	17720615	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	17721388	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	17722208	.	C	CTTGTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=89,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	17723476	.	C	CCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,1:2,3:7,0,5,0
chr1	17723739	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr1	17725358	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,2,7
chr1	17736578	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr1	17738570	.	AC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.484:27:8,7:5,5:11,3,8,5
chr1	17752000	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.432:37:14,7:7,8:17,4,12,4
chr1	17764627	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,0:2,2:3,0,3,0
chr1	17907247	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=14,27;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	17914846	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr1	17928678	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=95,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:3,2,2,3
chr1	17930186	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	17944753	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:17944753_C_G:17944753:0,0,1,0
chr1	17944757	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:17944753_C_G:17944753:0,0,1,0
chr1	17945755	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,6:3,3:7,0,8,1
chr1	17945774	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.526:24:5,4:6,5:8,3,12,1
chr1	17948305	.	G	GGGCCACAGCAGGTACT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,1:3,0,3,1
chr1	17949680	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,2:4,5:4,4,2,5
chr1	17975118	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:6,7,2,0
chr1	18023290	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,6:3,3:8,1,7,2
chr1	18023632	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.762:14:2,6:0,2:3,0,4,7
chr1	18691665	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=83,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	18702988	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	18703208	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	18704862	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	18810466	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,2:15,0:14,14,1,1
chr1	18812478	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,4:6,3:13,2,6,1
chr1	18960722	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	18961812	.	G	GTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	18961817	.	G	GGGCTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=182,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	19166221	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:5,2:0|1:19166221_G_T:19166221:5,12,1,1
chr1	19166226	.	G	GAAGTAGTGGTCAGAGTGTTGCCA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:4,2:0|1:19166221_G_T:19166221:5,12,1,1
chr1	19166294	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=141,194;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:4,5,3,4
chr1	19166378	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,0:13,4:14,13,2,2
chr1	19166685	.	A	ACCGGAACTGTTCCTATTTGGCCATC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr1	19200908	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	19202770	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	19202926	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	19204154	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	19204173	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	19208145	.	G	GGGTTGCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr1	19208311	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,4:2,0:4,1,2,2
chr1	19209543	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	19215834	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,7:0,9:0,0,14,5
chr1	19238067	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=191,155;MMQ=46,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	19238556	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:10,12,0,2
chr1	19243452	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:9,8,0,2
chr1	19403173	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=159,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	19408294	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:3,3:4,4:1,7,1,6
chr1	19408380	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr1	19420392	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,1:1,6:7,0,5,2
chr1	19426199	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,0:4,4:1,4,0,4
chr1	19428032	.	G	GGATTC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:19428032_G_GGATTC:19428032:5,1,1,1
chr1	19428034	.	G	GGGGCACAGGGCTGAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=147,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:19428032_G_GGATTC:19428032:5,1,1,1
chr1	19428036	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=147,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:19428032_G_GGATTC:19428032:5,1,1,1
chr1	19430828	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	19430849	.	A	AAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19430849_A_AAC:19430849:0,0,0,1
chr1	19430851	.	TCTA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19430849_A_AAC:19430849:0,0,0,1
chr1	19437242	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,101;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,0:7,4:15,5,4,0
chr1	19440107	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,334;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	19442056	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,38;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:13,6,1,1
chr1	19442076	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,38;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,0:11,2:13,6,1,1
chr1	19448326	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	19448608	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	19453219	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19453219_TT_CA:19453219:0,1,0,1
chr1	19453225	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19453219_TT_CA:19453219:0,0,0,1
chr1	19453227	.	G	GGTCTGGGGCTCTGGGTTCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19453219_TT_CA:19453219:0,0,0,1
chr1	19474975	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=48,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,0:0,6:2,0,5,1
chr1	19476307	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,10;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.207:44:17,0:11,1:20,14,0,10
chr1	19480373	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,4:0.073:66:30,4:32,0:31,31,4,0
chr1	19483209	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=198,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,5:4,6:9,0,11,0
chr1	19486804	.	GAA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=10,18;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,0:0,0:0,4,0,4
chr1	19486839	.	T	TCAGTATCTACTTAAATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr1	19487656	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:1,7,0,4
chr1	19488493	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	19491857	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,1:6,1:3,9,0,2
chr1	19492232	.	G	GTAATTA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:19492232_G_GTAATTA:19492232:5,5,1,1
chr1	19492234	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:6,0:0|1:19492232_G_GTAATTA:19492232:5,5,1,1
chr1	19499835	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:1,7,4,2
chr1	19500729	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	19518659	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,5:4,4:3,2,6,3
chr1	19519887	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	19549343	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:5,2:10,5:4,11,0,7
chr1	19549864	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,3:3,1:8,3,2,2
chr1	19557699	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:7,1,2,0
chr1	19557713	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=138,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:6,1,3,2
chr1	19564650	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=189,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,3:5,1:2,9,1,3
chr1	19566296	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:3,4:11,4:11,3,8,0
chr1	19568972	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:5,1:4,7:2,7,2,7
chr1	19570145	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=118,135;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:9,10,2,0
chr1	19578192	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	19582563	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	19583476	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=180,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:19583476_A_C:19583476:4,0,1,0
chr1	19583479	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=180,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:19583476_A_C:19583476:4,0,1,0
chr1	19583734	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	19595892	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,9:0,14:0,0,7,19
chr1	19597420	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,32:0.451:71:22,14:17,17:20,19,22,10
chr1	19597464	.	AT	GC	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=143,172;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:21,0:21,3:0|1:19597464_AT_GC:19597464:10,33,0,3
chr1	19597467	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=146,172;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.082:47:21,0:16,3:0|1:19597464_AT_GC:19597464:10,34,0,3
chr1	19597482	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=159,167;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:15,0:12,4:1,26,0,4
chr1	19611410	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	19612898	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=122,178;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:19,0:6,2:0|1:19612898_A_G:19612898:5,20,0,2
chr1	19612904	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=122,178;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,0:6,2:0|1:19612898_A_G:19612898:5,20,0,2
chr1	19630893	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,186;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:5,2:4,0:0,11,0,2
chr1	19638309	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,15,5
chr1	19651102	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=232,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,3,1
chr1	19651277	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:0,5,0,4
chr1	19651300	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=204,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr1	19651330	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=212,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	19669235	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:7,2,3,1
chr1	19683301	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	19981791	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,4:1,1,5,3
chr1	20027404	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:3,2,1,5
chr1	20027423	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr1	20027474	.	C	CTCAGCTAATTTTTAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	20066485	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:20066485_G_A:20066485:0,3,0,4
chr1	20066490	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:20066485_G_A:20066485:0,3,0,4
chr1	20067186	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=147,213;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	20073139	.	TGGACG	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,92;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:26,0:9,2:0|1:20073139_TGGACG_T:20073139:12,30,1,1
chr1	20073145	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=135,92;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:30,0:11,2:0|1:20073139_TGGACG_T:20073139:12,30,1,1
chr1	20073156	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.113:33:21,0:9,3:0|1:20073139_TGGACG_T:20073139:5,25,1,2
chr1	20141279	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:3,2,0,2
chr1	20216860	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,13,1
chr1	20221013	.	TCTAAGTCAG	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=111,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.501:10:3,3:1,2:0|1:20221013_TCTAAGTCAG_T:20221013:2,3,0,5
chr1	20221029	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,3:0,2:0|1:20221013_TCTAAGTCAG_T:20221013:0,3,0,5
chr1	20221061	.	A	ATGGTTGTTATGTGTCAAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=170,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:20221061_A_ATGGTTGTTATGTGTCAAG:20221061:0,4,0,1
chr1	20221064	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=170,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:20221061_A_ATGGTTGTTATGTGTCAAG:20221061:0,4,0,1
chr1	20246876	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.512:23:5,2:6,8:4,7,4,8
chr1	20248709	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	20249288	.	C	CACCAAGCGATCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	20250021	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:9,7,2,0
chr1	20411234	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=89,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:1,4,1,1
chr1	20411300	.	GT	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.510:37:5,12:12,7:10,8,12,7
chr1	20411332	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.469:38:10,5:9,11:11,9,6,12
chr1	20490745	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	20501442	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,5:2,3:6,0,7,1
chr1	20519217	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,1:13,1:15,5,1,1
chr1	20649814	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=93,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr1	20657352	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=102,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,2:4,4:8,5,4,2
chr1	20664128	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=186,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:8,1,3,2
chr1	20677344	.	C	CAGAAGGGCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=142,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:2,2:4,0:0|1:20677344_C_CAGAAGGGCA:20677344:3,5,1,1
chr1	20677346	.	C	CATGCTTGGCTGAACACTCTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=142,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:20677344_C_CAGAAGGGCA:20677344:3,5,1,1
chr1	20680760	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=165,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr1	20680778	.	T	TTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	20829808	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:3,3:1,3:0,8,0,11
chr1	20940258	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	20964328	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,11,8
chr1	20966533	.	ACT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:20966533_ACT_A:20966533:0,1,0,1
chr1	20966538	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20966533_ACT_A:20966533:0,1,0,1
chr1	20972048	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,4,5
chr1	20975168	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	20977221	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	20978832	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	20979148	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=126,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.139:19:7,0:9,2:0|1:20979148_C_T:20979148:12,5,0,2
chr1	20979155	.	A	AATTAGGTTTGG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=116,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:9,0:10,1:0|1:20979148_C_T:20979148:13,6,0,2
chr1	20979307	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,7,6
chr1	20980880	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=99.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,18:0,0,9,21
chr1	20987660	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.184:41:9,0:11,0:16,17,8,0
chr1	20987662	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.141:40:11,0:11,0:17,17,6,0
chr1	20992606	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	21030902	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	21040079	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	21043913	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	21043926	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	21044161	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	21050707	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,27;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,0:16,2:8,15,1,1
chr1	21053607	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:2,1:0|1:21053607_C_CAA:21053607:1,2,0,1
chr1	21053610	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,15;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:1,0:0|1:21053607_C_CAA:21053607:1,2,0,1
chr1	21071418	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:16,1:15,1:19,12,2,0
chr1	21099846	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	21102502	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=99,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.584:6:0,0:1,0:1,2,0,3
chr1	21174429	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	21175855	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr1	21179969	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr1	21188871	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	21327637	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,12,0
chr1	21377314	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr1	21494634	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=92,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=168.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,52:0.964:53:0,30:1,19:0,1,10,42
chr1	21571601	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:2,3:6,3:2,7,2,4
chr1	21583925	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr1	21583973	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=115,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.441:23:6,4:7,6:9,4,7,3
chr1	21771724	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=133,159;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:29,0:30,3:27,33,0,3
chr1	21797996	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,16,2
chr1	21799489	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,5,13
chr1	21799823	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,7:0,0,14,2
chr1	21799834	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=161,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,0:12,1,1,1
chr1	21801346	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	21804815	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr1	21805730	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	21805958	.	A	AAACAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=218,153;MMQ=49,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,1:0,0:0|1:21805958_A_AAACAG:21805958:0,2,0,1
chr1	21805962	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=218,153;MMQ=49,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,1:0,0:0|1:21805958_A_AAACAG:21805958:0,2,0,1
chr1	21805978	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	21806447	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	21806620	.	TTTGAGTA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=236,120;MMQ=31,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:21806620_TTTGAGTA_T:21806620:0,1,0,1
chr1	21806630	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=236,120;MMQ=31,43;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21806620_TTTGAGTA_T:21806620:0,1,0,1
chr1	21807405	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,159;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:10,2:6,3:16,0,4,1
chr1	21807521	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,136;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:7,1:5,2:0,12,0,4
chr1	21809828	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	21887290	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=191,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr1	21889541	.	CGGG	C,AGGG	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=32,26,17;MFRL=153,167,155;MMQ=60,60,60;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.71,4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,2,2:0.091,0.091:30:12,0,0:7,1,0:24,2,4,0
chr1	21889547	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=34,17;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=-1073741816;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,0:10,1:23,2,4,0
chr1	21889551	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,0:13,1:26,3,2,0
chr1	21889635	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,22:0,20:0,0,17,26
chr1	21889663	.	G	GTGTGTGTGTGT	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:22,1:14,1:0|1:21889663_G_GTGTGTGTGTGT:21889663:14,24,0,2
chr1	21889665	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:22,1:12,1:0|1:21889663_G_GTGTGTGTGTGT:21889663:14,24,0,2
chr1	21896767	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=101,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:7,1,6,2
chr1	21902998	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.405:8:2,0:2,0:0|1:21902998_A_C:21902998:1,4,3,0
chr1	21903004	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=103,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:3,0:2,0:0|1:21902998_A_C:21902998:1,4,3,0
chr1	21903010	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,18;MFRL=102,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,0:0|1:21902998_A_C:21902998:2,4,2,0
chr1	21929260	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	21929456	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	21934693	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr1	21935467	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,0,10
chr1	21939741	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,4,16
chr1	21940603	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=135,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21940603_CA_TT:21940603:0,3,0,1
chr1	21940610	.	G	GGTACCTCGCCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=147,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:21940603_CA_TT:21940603:0,4,0,1
chr1	21940612	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=147,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:21940603_CA_TT:21940603:0,4,0,1
chr1	21940632	.	C	CAATTTCGTTGTGTGGATTTAAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	21946415	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	21978174	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21978174_A_C:21978174:0,1,1,0
chr1	21978178	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21978174_A_C:21978174:0,1,1,0
chr1	22013561	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	22013771	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr1	22030121	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	22030930	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,37;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22030930_T_C:22030930:0,0,0,1
chr1	22030932	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22030930_T_C:22030930:0,0,0,1
chr1	22030939	.	T	TGAAGTGGGAGATGTAAACCCTTCAGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22030930_T_C:22030930:0,0,0,1
chr1	22033124	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:9,0:3,3:0|1:22033124_A_T:22033124:6,6,0,3
chr1	22033126	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:8,0:3,3:0|1:22033124_A_T:22033124:6,6,0,3
chr1	22033338	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:14,0:9,3:7,19,0,3
chr1	22063149	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,2,19
chr1	22082967	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.715:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr1	22142618	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:22142618_G_GC:22142618:0,3,1,1
chr1	22142619	.	G	GGTGACAGAGAGATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:22142618_G_GC:22142618:0,3,1,1
chr1	22150257	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	22157418	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=178,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr1	22157689	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	22158363	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr1	22158988	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:11,3:16,0:15,12,2,1
chr1	22159156	.	C	CAGGACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22159156_C_CAGGACT:22159156:0,1,0,1
chr1	22159160	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22159156_C_CAGGACT:22159156:0,1,0,1
chr1	22159162	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,27;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:22159156_C_CAGGACT:22159156:0,1,0,1
chr1	22160148	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	22168216	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr1	22174600	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	22183471	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	22183739	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr1	22186234	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	22188320	.	CA	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	22199081	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	22199821	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr1	22200019	.	G	GCCTGGCTATAAAGTGAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	22200835	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	22202109	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	22205130	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=120,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:6,8,2,0
chr1	22205408	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr1	22205466	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,8,2
chr1	22207804	.	ACCCAGGGTGGCAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,1:0,0,7,1
chr1	22208030	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	22211222	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	22213638	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr1	22215088	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,8,2
chr1	22307743	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	22307757	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	22310139	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=186,164;MMQ=40,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,18:0.905:19:0,8:1,9:0|1:22310139_T_G:22310139:0,1,14,4
chr1	22310145	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=186,158;MMQ=40,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.902:18:0,7:1,9:0|1:22310139_T_G:22310139:0,1,13,4
chr1	22310411	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:22310411_A_G:22310411:0,0,0,2
chr1	22310413	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:22310411_A_G:22310411:0,0,0,2
chr1	22310662	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,3:0,14:0,0,13,4
chr1	22310674	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,2:0,14:0,0,11,5
chr1	22313161	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,20:0,15:0,0,6,31
chr1	22313197	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=154,157;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,5:5,5:0,11,0,10
chr1	22315662	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=160,159;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,13:0.304:44:10,8:20,5:0|1:22315662_C_T:22315662:26,5,12,1
chr1	22315666	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=158,159;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,13:0.311:43:8,8:20,5:0|1:22315662_C_T:22315662:25,5,12,1
chr1	22315710	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=160,155;MMQ=39,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:8,2:11,3:1,18,0,5
chr1	22315738	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,0,37
chr1	22328279	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,4:5,7:1,10,2,9
chr1	22329414	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=130,59;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.703:5:0,1:1,1:1,0,4,0
chr1	22329645	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,191;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr1	22333595	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,206;MMQ=56,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:7,1:7,3:0|1:22333595_G_A:22333595:0,14,0,4
chr1	22333597	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=165,220;MMQ=52,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,3:0.220:16:7,0:6,3:1|0:22333595_G_A:22333595:0,13,0,3
chr1	22336120	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr1	22336277	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,20:0,23:0,0,26,19
chr1	22336305	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,25:0.406:62:13,12:21,12:0|1:22336305_C_T:22336305:26,11,14,11
chr1	22336308	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,25:0.406:62:16,13:20,12:0|1:22336305_C_T:22336305:26,11,14,11
chr1	22336371	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=121,141;MMQ=27,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.511:47:13,14:10,10:7,16,7,17
chr1	22408106	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	22408199	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,4:5,2:6,3,5,2
chr1	22817133	.	A	AATTCATTCCCACCCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr1	22817160	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	22827931	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.562:16:2,6:4,3:7,0,7,2
chr1	22832743	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,8,14
chr1	22837586	.	CTT	C,CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33,34;MFRL=0,77,174;MMQ=60,50,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=6.33,6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.432,0.431:4:0,1,2:0,1,0:0,0,4,0
chr1	22837606	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,17;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:0,0:0|1:22837606_G_T:22837606:3,0,2,0
chr1	22837609	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,16;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:1,0:0|1:22837606_G_T:22837606:4,0,2,0
chr1	22837849	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:0,2:3,2:0,3,1,4
chr1	22838560	.	CAAG	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=132,60;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAG;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:9,0:17,1:7,20,0,2
chr1	22848972	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr1	22849003	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:0|1:22849003_A_C:22849003:0,4,0,2
chr1	22849009	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0|1:22849003_A_C:22849003:0,4,0,1
chr1	22924007	.	GGCA	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	22924017	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22924017_G_GC:22924017:1,2,0,1
chr1	22924018	.	G	GGTCT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22924017_G_GC:22924017:1,2,0,1
chr1	22924020	.	CACCCA	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,24;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:22924017_G_GC:22924017:1,2,0,1
chr1	22924029	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:22924017_G_GC:22924017:0,2,0,1
chr1	22924030	.	A	ACCAAGCAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	22925292	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	22927617	.	C	CCG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22927617_C_CCG:22927617:0,0,0,1
chr1	22927619	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22927617_C_CCG:22927617:0,0,0,1
chr1	22987951	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:22987951_TT_CC:22987951:0,2,0,1
chr1	22987957	.	AACC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:22987951_TT_CC:22987951:0,2,0,1
chr1	22987958	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.695:1:0,1:0,0:1|0:22987951_TT_CC:22987951:0,0,0,1
chr1	22987961	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22987951_TT_CC:22987951:0,1,0,1
chr1	23108089	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr1	23189433	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	23191746	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:1,3,3,4
chr1	23232400	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	23236826	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	23239142	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	23240245	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=104,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.125:37:13,2:12,1:18,15,2,2
chr1	23240295	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=140,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.149:51:20,0:16,0:26,18,0,7
chr1	23240380	.	T	TAAAAGCTGGAAGAAGACAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0,8,0,2
chr1	23286503	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,0:3,3:2,7,0,3
chr1	23289568	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	23380198	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr1	23399932	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	23418153	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr1	23418392	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=122,97;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:8,7,3,0
chr1	23520743	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,40;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:16,8,2,0
chr1	23710805	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr1	23713952	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	23724183	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,4:3,7:0,4,0,11
chr1	23735241	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,12:0,0,5,14
chr1	23743923	.	T	TCTCCCCACTAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:12,3:8,0:0|1:23743923_T_TCTCCCCACTAA:23743923:1,19,0,3
chr1	23743924	.	G	GTCATGCTGGGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:12,2:8,0:0|1:23743923_T_TCTCCCCACTAA:23743923:1,19,0,3
chr1	23758134	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr1	23768732	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:5,3:5,2:5,7,3,2
chr1	23779324	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,15;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:23779324_T_G:23779324:0,4,0,1
chr1	23779325	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:23779324_T_G:23779324:0,4,0,1
chr1	23836364	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,16:0.327:50:11,7:22,9:22,12,12,4
chr1	23850835	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,14;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,0:3,1,2,0
chr1	23850846	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:0,0:2,0:1,2,2,0
chr1	24022437	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,8:7,6:2,10,3,11
chr1	24105906	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:4,0:9,0:5,12,2,0
chr1	24106510	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	24119430	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,0:10,0,0,2
chr1	24119435	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:4,3:4,0:8,0,1,4
chr1	24120262	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,14;MFRL=116,105833819;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.250:9:3,0:3,0:5,2,0,2
chr1	24120821	.	T	TGGGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,14;MFRL=92,113;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,6;RU=G;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:2,2,1,0
chr1	24122554	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.215:22:4,0:10,1:4,13,5,0
chr1	24123717	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24123717_A_T:24123717:0,2,0,1
chr1	24123720	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24123717_A_T:24123717:0,2,0,1
chr1	24123722	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24123717_A_T:24123717:0,2,0,1
chr1	24123734	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24123717_A_T:24123717:0,2,0,1
chr1	24125096	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=168,106;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,1:5,0:0|1:24125096_TG_T:24125096:6,2,1,1
chr1	24125098	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=168,106;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:0|1:24125096_TG_T:24125096:6,2,1,1
chr1	24129126	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	24140916	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:24140916_A_G:24140916:0,0,0,1
chr1	24140923	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24140916_A_G:24140916:0,0,0,1
chr1	24143932	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	24151996	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr1	24172346	.	C	CTT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.121:30:10,0:17,3:0|1:24172346_C_CTT:24172346:6,21,0,3
chr1	24172348	.	G	GTAGTTGAGGTAGTTATGGGGGATT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:8,0:17,3:0|1:24172346_C_CTT:24172346:6,21,0,3
chr1	24189767	.	A	AGTTCTCTCTTAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=113,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:24189767_A_AGTTCTCTCTTAAAG:24189767:0,3,0,1
chr1	24189769	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=113,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:24189767_A_AGTTCTCTCTTAAAG:24189767:0,3,0,1
chr1	24192200	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	24288404	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=156,163;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=104.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,36:0.463:78:16,16:26,20:13,29,14,22
chr1	24288432	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=170,166;MMQ=60,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,19:0.347:55:18,11:18,7:8,28,7,12
chr1	24288476	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,33:0.523:63:9,22:21,11:16,14,16,17
chr1	24288529	.	TAAAC	T	.	.	DP=81;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=144,162;MMQ=52,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=133.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,36:0.481:75:14,18:25,18:25,14,20,16
chr1	24289891	.	ATGAATG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.503:16:4,5:4,3:0,8,0,8
chr1	24294249	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=147.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,23:0,21:0,0,17,28
chr1	24294362	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,3:6,3:6,5,4,2
chr1	24298263	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=213,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,2:7,1:4,5,3,0
chr1	24301508	.	C	A	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,131;MMQ=60,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,3:0.041:95:49,2:43,1:31,61,0,3
chr1	24383819	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,11,2
chr1	24388371	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr1	24388417	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,3:5,3,5,2
chr1	24390731	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	24393656	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,12:0,0,2,16
chr1	24400584	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=97.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,26,1
chr1	24400633	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,12:0,19:0,0,15,18
chr1	24408414	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	24408765	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	24421334	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,10,7
chr1	24421804	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	24421875	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,5:0,0,9,8
chr1	24433547	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr1	24434595	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=112,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,2:7,5:5,7,2,5
chr1	24447468	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,26:0.509:51:13,10:12,16:9,16,9,17
chr1	24485518	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=107.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,17:0,14:0,0,19,14
chr1	24485941	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0,0,21,5
chr1	24486216	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=137,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:0,0:0,1,0,3
chr1	24507160	.	C	CCCG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,1:0|1:24507160_C_CCCG:24507160:0,5,2,0
chr1	24507162	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:3,0:2,1:0|1:24507160_C_CCCG:24507160:0,5,2,0
chr1	24507164	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=35,13;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,0:0|1:24507160_C_CCCG:24507160:0,5,2,0
chr1	24507172	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:24507160_C_CCCG:24507160:1,6,2,0
chr1	24507176	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:24507160_C_CCCG:24507160:1,6,2,0
chr1	24663169	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=183,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:24663169_TG_T:24663169:2,6,1,1
chr1	24663173	.	G	GGGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=183,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0|1:24663169_TG_T:24663169:2,6,1,1
chr1	24671287	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:7,2:7,1:13,1,3,1
chr1	24671464	.	ACCCTCCACACCTGTGCC	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTCCACACCTGTGCC;STR;TLOD=92.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.978:30:0,14:0,10:0,0,6,24
chr1	24673866	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	24706329	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,4:3,9:2,7,4,9
chr1	24775967	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.544:44:10,12:9,11:12,8,16,8
chr1	24779873	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,5:1,1:1,1,4,2
chr1	24782719	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.082:35:17,2:12,0:11,22,2,0
chr1	24782810	.	T	TAATACTTCAGG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=191,32;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0,13,1,1
chr1	24784197	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:8,0,3,0
chr1	24795493	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=121,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,1:11,1:13,8,0,2
chr1	24840768	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	24932046	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	24972639	.	G	GTAATTTTTTCTGCCAGCTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:24972639_G_GTAATTTTTTCTGCCAGCTA:24972639:0,4,0,1
chr1	24972642	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:24972639_G_GTAATTTTTTCTGCCAGCTA:24972639:0,4,0,1
chr1	24978892	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.736:9:0,5:1,2:2,0,7,0
chr1	24987302	.	G	GT	.	.	DP=189;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=128,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:116,7:0.052:123:71,5:44,1:36,80,2,5
chr1	24989762	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,6:0,0,4,14
chr1	24996704	.	A	C	.	.	DP=115;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=134,150;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,16:0.126:99:35,0:34,2:25,58,15,1
chr1	24996710	.	A	C	.	.	DP=107;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,11:0.075:100:40,0:38,0:30,59,11,0
chr1	24998126	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:10,0:3,2:3,10,0,2
chr1	25153692	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr1	25254317	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	25648349	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=58.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,14,4
chr1	25678002	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	25678238	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	25679278	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.281:16:8,2:4,2:11,1,4,0
chr1	25689083	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	25717139	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	25717365	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,180;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,4:5,8:6,2,7,5
chr1	25815597	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=208,161;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:25815597_T_C:25815597:4,0,1,0
chr1	25815603	.	GG	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=206,161;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:1,0:0|1:25815597_T_C:25815597:5,0,1,0
chr1	25825048	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	25893242	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	25893462	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:8,12,1,1
chr1	26085048	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr1	26098107	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,12,3
chr1	26098333	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	26107688	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	26109237	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	26110143	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	26135454	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=217,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.641:6:1,0:0,1:2,0,4,0
chr1	26152828	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,75;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,3:9,0:9,13,2,1
chr1	26310394	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=71.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,12:0,8:0,0,16,4
chr1	26310836	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	26357855	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	26357867	.	G	GCTTTCTGGGTTCATCTCTGTCCTCTGGGGACTGGACCACATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	26365549	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	26370136	.	CA	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	26371788	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	26510364	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=144,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	26510380	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:26510380_C_CAA:26510380:0,4,0,1
chr1	26510384	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:26510380_C_CAA:26510380:0,4,0,1
chr1	26511700	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:8,2:4,3:4,8,0,6
chr1	26513743	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=99,46;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,0:9,2:0|1:26513743_G_A:26513743:15,10,1,1
chr1	26513747	.	T	TTA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=99,46;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:10,0:8,2:0|1:26513743_G_A:26513743:15,10,1,1
chr1	26513748	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=99,46;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:14,0:8,2:0|1:26513743_G_A:26513743:14,11,1,1
chr1	26513750	.	GAT	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=114,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:13,0:9,2:0|1:26513743_G_A:26513743:12,11,1,1
chr1	26524706	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=99.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,17:0,9:0,0,24,2
chr1	26526554	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:4,6:2,4:3,3,4,7
chr1	26527255	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=211,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0|1:26527255_G_A:26527255:1,0,4,0
chr1	26527260	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,2:0,1:0|1:26527255_G_A:26527255:2,0,4,0
chr1	26527304	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:2,4:2,5:0|1:26527304_T_C:26527304:4,1,9,1
chr1	26527310	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0|1:26527304_T_C:26527304:4,1,8,1
chr1	26527783	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	26527809	.	AG	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:3,2:6,0,2,0
chr1	26528922	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.368:28:6,9:11,1:15,3,9,1
chr1	26529121	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,1,15
chr1	26566187	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	26583998	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	26594886	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,141;MMQ=60,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:7,2:19,0:26,0,2,0
chr1	26597435	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr1	26601385	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,22,0
chr1	26601429	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:23,1:11,1:29,7,2,0
chr1	26603310	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=152,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:5,3:0,9,0,3
chr1	26608782	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:4,4,3,0
chr1	26609307	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr1	26620846	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	26627478	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,12:0,0,8,19
chr1	26629465	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	26658160	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26658160_T_A:26658160:1,2,0,1
chr1	26658162	.	C	CTCCCAGCCACCTCATAACCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26658160_T_A:26658160:1,2,0,1
chr1	26658179	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr1	26662774	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:2,8:6,1:6,2,8,2
chr1	26662904	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.440:50:19,10:8,11:10,18,7,15
chr1	26664219	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=227,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,0:1,3:0,3,0,3
chr1	26664914	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:12,2:12,8,2,0
chr1	26665991	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=176,155;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:0,7,0,3
chr1	26669699	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.481:4:1,0:1,0:0|1:26669699_A_C:26669699:0,2,2,0
chr1	26669703	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=188,266;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:1,2,1,0
chr1	26669706	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.407:5:2,0:1,0:0|1:26669699_A_C:26669699:1,2,2,0
chr1	26673220	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	26689659	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr1	26689671	.	GCCAA	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=186,34;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:26689671_GCCAA_G:26689671:0,6,1,1
chr1	26689682	.	AG	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=193,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:26689671_GCCAA_G:26689671:0,4,1,1
chr1	26689688	.	C	CTCTT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=193,34;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:26689671_GCCAA_G:26689671:0,4,1,1
chr1	26691286	.	CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,3:6,7:12,3,9,1
chr1	26694059	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr1	26698938	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,54;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:7,0,8,0
chr1	26699103	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.564:21:4,7:5,5:3,6,7,5
chr1	26699157	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:0,11,0,3
chr1	26700795	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,14:0,0,18,16
chr1	26752992	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=144,132;MMQ=52,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.944:34:1,14:0,18:1,0,6,27
chr1	26795291	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=239,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:26795291_G_GGC:26795291:1,0,1,0
chr1	26795295	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=14,34;MFRL=239,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:26795291_G_GGC:26795291:1,0,1,0
chr1	26795299	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,10;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:26795291_G_GGC:26795291:0,1,2,0
chr1	26795301	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:26795291_G_GGC:26795291:0,1,2,0
chr1	26795303	.	CC	GG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,17;MFRL=69,239;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:1,0:1|0:26795291_G_GGC:26795291:1,1,1,0
chr1	26795307	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,12;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:26795291_G_GGC:26795291:2,1,1,0
chr1	26800588	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=159,94;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:9,0:15,3:5,20,0,3
chr1	26801229	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	26856462	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	26879792	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=213,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr1	26881565	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=215,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	26900735	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr1	27153595	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,0:1,2:1,2,1,1
chr1	27175306	.	G	GTCTGTTTTCATCCTCAAATCTTCTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	27175328	.	G	GTCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	27180425	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=272,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:27180425_C_A:27180425:0,1,0,1
chr1	27180426	.	TGCCAAAGACTCAAGTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=272,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:27180425_C_A:27180425:0,1,0,1
chr1	27190821	.	GGT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=150,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=GT;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.488:8:1,2:1,2:1,3,4,0
chr1	27210721	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.460:31:10,5:5,9:6,11,6,8
chr1	27250479	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr1	27428321	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=116,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:2,1:3,6,1,1
chr1	27435976	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27435976_C_G:27435976:0,0,1,0
chr1	27435980	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=153,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27435976_C_G:27435976:1,0,1,0
chr1	27609980	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.822:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	27627999	.	A	ATGAAGG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,0,0,1
chr1	27628002	.	C	CGTG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,11;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,0,0,1
chr1	27628008	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,1,0,1
chr1	27628010	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,30;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,1,0,1
chr1	27628014	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,1,0,1
chr1	27628016	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,1,0,1
chr1	27659965	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	27660033	.	T	TTATACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=210,246;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	27676248	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27676248_T_A:27676248:0,0,0,1
chr1	27676255	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27676248_T_A:27676248:0,0,0,1
chr1	27682440	.	T	TG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:7,4:4,9:10,1,13,0
chr1	27682481	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,29:0.508:57:15,11:13,18:21,7,17,12
chr1	27685108	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:0,8,0,4
chr1	27686063	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr1	27687307	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:11,0:13,2:15,10,2,0
chr1	27688361	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:1,7,1,1
chr1	27690644	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr1	27696011	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr1	27708766	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:3,6,2,0
chr1	27738969	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=201,172;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,2:7,0:12,1,2,0
chr1	27738985	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=168,163;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:16,0,2,0
chr1	27744758	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:15,2:21,0:30,6,2,0
chr1	27876452	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:6,0:4,0:3,8,3,0
chr1	27876482	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,5:4,2:1,5,1,7
chr1	27876599	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=249,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,1:0,3,2,0
chr1	27941485	.	AG	TT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:6,0:1,13,1,1
chr1	27995077	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,7:0,16:0,0,2,26
chr1	28086955	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,24,0
chr1	28120170	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,2:3,2:0,5,0,4
chr1	28120198	.	GG	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0|1:28120198_GG_AT:28120198:0,3,0,1
chr1	28120200	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:28120198_GG_AT:28120198:0,3,0,1
chr1	28128283	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:9,9,1,1
chr1	28169886	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=163,129;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:28169886_GC_G:28169886:0,3,0,1
chr1	28169890	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=163,129;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:28169886_GC_G:28169886:0,3,0,1
chr1	28169894	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=167,129;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28169886_GC_G:28169886:0,2,0,1
chr1	28169896	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=167,129;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28169886_GC_G:28169886:0,2,0,1
chr1	28176984	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0|1:28176984_A_C:28176984:0,1,0,1
chr1	28176986	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28176984_A_C:28176984:0,1,0,1
chr1	28176988	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28176984_A_C:28176984:0,1,0,1
chr1	28176989	.	G	GTCCTTGCAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:28176984_A_C:28176984:0,1,0,1
chr1	28176994	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:28176984_A_C:28176984:0,0,0,1
chr1	28206588	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:8,6:3,6:3,8,5,7
chr1	28209479	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:28209479_A_AGG:28209479:0,0,1,0
chr1	28209488	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=265,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:28209479_A_AGG:28209479:0,3,1,0
chr1	28212001	.	T	TTTGCGGCCATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	28218864	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	28220484	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,1,1
chr1	28224312	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=198,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr1	28233572	.	G	C,GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,19,24;MFRL=223,194,144;MMQ=60,60,60;MPOS=2,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.05,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.255,0.276:9:2,0,0:2,0,1:4,0,1,4
chr1	28261593	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=213,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr1	28261658	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.502:14:3,2:4,4:4,3,4,3
chr1	28268706	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:5,2,7,0
chr1	28268833	.	C	CG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.521:21:3,7:7,3:0|1:28268833_C_CG:28268833:1,9,5,6
chr1	28268835	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.521:21:3,7:6,3:0|1:28268833_C_CG:28268833:1,9,5,6
chr1	28290231	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=57.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0|1:28290231_C_G:28290231:0,0,6,10
chr1	28290256	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=33,18;MFRL=161,56;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:8,0:0|1:28290231_C_G:28290231:3,10,1,1
chr1	28290260	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=171,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:28290231_C_G:28290231:3,9,1,1
chr1	28290261	.	ATGTTGG	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=31,19;MFRL=171,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:7,0:0|1:28290231_C_G:28290231:3,9,1,1
chr1	28290271	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=152,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:28290231_C_G:28290231:0,7,1,1
chr1	28290273	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=152,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:3,0:0|1:28290231_C_G:28290231:0,7,1,1
chr1	28290275	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=166,56;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:28290231_C_G:28290231:0,6,1,1
chr1	28293750	.	G	GTGGTAGTACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	28374815	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,5:4,5:12,0,11,0
chr1	28374836	.	GA	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.135:43:17,1:13,3:26,12,4,1
chr1	28555426	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:6,4:4,6:8,3,8,2
chr1	28555564	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,5:6,6:0,9,0,11
chr1	28559508	.	A	ATAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=146,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,2:1,0:0|1:28559508_A_ATAT:28559508:2,1,1,1
chr1	28559513	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=146,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:28559508_A_ATAT:28559508:2,1,0,1
chr1	28559515	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:28559508_A_ATAT:28559508:1,1,0,1
chr1	28607398	.	G	GTCTGGGTCCTGATCTCCTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	28793041	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,41:0.656:62:14,21:7,19:13,8,27,14
chr1	28800758	.	CT	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=191,201;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	28802518	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:28802518_C_G:28802518:13,0,2,0
chr1	28802520	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:28802518_C_G:28802518:13,0,2,0
chr1	28802581	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.650:38:6,16:7,9:11,2,21,4
chr1	28807191	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=217,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	28817351	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=155,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	28817597	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr1	28818151	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:5,9:2,6:7,0,13,2
chr1	28823073	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,0:6,3:0|1:28823073_G_A:28823073:3,11,2,1
chr1	28823075	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:0|1:28823073_G_A:28823073:3,11,2,1
chr1	28864435	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:1,3:8,8:3,6,6,5
chr1	28897655	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=114,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	28920880	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=164,180;MMQ=40,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28920880_G_A:28920880:0,2,0,1
chr1	28920885	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=164,180;MMQ=40,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28920880_G_A:28920880:0,2,0,1
chr1	28920887	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,30;MFRL=164,180;MMQ=40,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28920880_G_A:28920880:0,2,0,1
chr1	28920904	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=180,147;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28920904_TG_CA:28920904:0,1,0,1
chr1	28920910	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=180,147;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28920904_TG_CA:28920904:0,1,0,1
chr1	28920914	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=219,147;MMQ=44,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:28920904_TG_CA:28920904:1,1,0,1
chr1	28932064	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:28932064_T_G:28932064:0,1,0,1
chr1	28932067	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28932064_T_G:28932064:0,1,0,1
chr1	28932069	.	A	AGAGGAAGAAGGCGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28932064_T_G:28932064:0,1,0,1
chr1	28932070	.	T	TTAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28932064_T_G:28932064:0,1,0,1
chr1	28948534	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,2:0.048:60:24,2:29,0:22,36,0,2
chr1	29010090	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:10,4,0,2
chr1	29016714	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=61,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:1,1:0|1:29016714_T_C:29016714:1,1,0,1
chr1	29016718	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:29016714_T_C:29016714:1,3,0,1
chr1	29016721	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:29016714_T_C:29016714:1,3,0,1
chr1	29037240	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,1:1,2,0,3
chr1	29063559	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,5:0,0,13,1
chr1	29064036	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,2:2,2:9,0,4,0
chr1	29314512	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,182;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:1,0:4,1:0,5,0,1
chr1	29342090	.	GA	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.195:37:10,1:19,6:30,0,7,0
chr1	29345009	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr1	29345027	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr1	29359602	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:11,0:15,3,2,1
chr1	29439016	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:0,4:5,5:1,5,1,8
chr1	29475218	.	CCTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTT;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:3,5,2,0
chr1	29475394	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr1	29475432	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:7,6,0,3
chr1	29475648	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,6,16
chr1	29542435	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	29557224	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,18:0,9:0,0,20,11
chr1	29602368	.	GCTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	29631236	.	C	CTA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,3:7,6:5,7,4,7
chr1	29633778	.	T	TCTGTCTGTCCCTTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:29633778_T_TCTGTCTGTCCCTTTC:29633778:0,2,0,2
chr1	29633779	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:29633778_T_TCTGTCTGTCCCTTTC:29633778:0,2,0,2
chr1	29637136	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=206,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,2:1,2:6,1,4,0
chr1	29638988	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:3,6:6,7:8,1,12,1
chr1	29642681	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.419:45:14,11:11,6:6,20,8,11
chr1	29644184	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	31196255	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr1	31210611	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=31,16;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,0:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210613	.	CCGGGAAT	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210622	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,36;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210625	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=31,34;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210626	.	T	TAGACG	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,31;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210628	.	C	CACA	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=33,30;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210632	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=34,29;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210634	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=31,29;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210641	.	A	ACAAAC	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=30,28;MFRL=198,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,4,0,1
chr1	31210646	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=29,22;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210648	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:0,0:3,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31351684	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31351684_A_C:31351684:0,1,0,1
chr1	31351686	.	C	CTACTCGGGGTCGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31351684_A_C:31351684:0,1,0,1
chr1	31413925	.	AATAAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:0,3:1,0,4,0
chr1	31465300	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,1:15,1:9,13,2,0
chr1	31656918	.	T	TGAATGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	31658202	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=122,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.117:28:12,1:7,1:16,9,0,3
chr1	31733028	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr1	31740653	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=140,61;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:0|1:31740653_G_A:31740653:16,8,1,1
chr1	31740660	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=140,61;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,2:9,0:0|1:31740653_G_A:31740653:13,9,1,1
chr1	31740668	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0|1:31740653_G_A:31740653:0,0,12,16
chr1	31744168	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	31762353	.	T	TGAAAACTAAGTAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	31764693	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	31764713	.	C	CAAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr1	31764930	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr1	31765968	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	31769516	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:5,10,0,2
chr1	31838614	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=214,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	31840426	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	31897493	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,9:0,24:0,0,26,8
chr1	31898132	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,22,6
chr1	31898162	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=101.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,16,14
chr1	31898279	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,3:0,0,4,8
chr1	31898536	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	31898661	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:6,8,1,1
chr1	31899684	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,5:0,0,0,7
chr1	31899704	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	31905730	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	31905889	.	A	ACAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=205,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAG;STR;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,6,0
chr1	31906882	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr1	31907102	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr1	32084904	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:5,4:2,4:4,3,7,2
chr1	32087134	.	C	CAAG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:0|1:32087134_C_CAAG:32087134:5,9,1,1
chr1	32087136	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,2:7,0:0|1:32087134_C_CAAG:32087134:5,9,1,1
chr1	32092331	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:6,3,2,0
chr1	32118160	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=191,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:3,1:4,4:7,0,5,0
chr1	32119347	.	AACAC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=175,197;MMQ=53,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AC;STR;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.581:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr1	32119431	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,6,1
chr1	32122164	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,5:3,1:0,5,0,6
chr1	32124528	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=149,51;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:5,11,1,1
chr1	32124546	.	C	CTTGG	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=33,16;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,1:0|1:32124546_C_CTTGG:32124546:6,12,1,1
chr1	32124550	.	GAGGCC	G	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:32124546_C_CTTGG:32124546:6,12,1,1
chr1	32124557	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:10,2:0|1:32124546_C_CTTGG:32124546:6,13,1,1
chr1	32124560	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:10,2:0|1:32124546_C_CTTGG:32124546:6,12,1,1
chr1	32124565	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,1:0|1:32124546_C_CTTGG:32124546:6,11,1,1
chr1	32126135	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.544:35:8,7:7,12:14,2,14,5
chr1	32127911	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	32128283	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	32134491	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,1:3,4:1,5,0,5
chr1	32136168	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=170.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,17:0,36:0,0,33,20
chr1	32140733	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:2,0,2,4
chr1	32145009	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,10,0
chr1	32146425	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr1	32149893	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32149893_G_A:32149893:0,0,0,1
chr1	32149896	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32149893_G_A:32149893:0,0,0,1
chr1	32155284	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:11,3:7,2:17,2,5,0
chr1	32155911	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:0|1:32155911_G_T:32155911:5,2,3,0
chr1	32155929	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.389:13:6,3:2,1:0|1:32155911_G_T:32155911:6,2,5,0
chr1	32156869	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,3,10
chr1	32160918	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,2:1,3:0,2,0,6
chr1	32161344	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=115,74;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:15,4:10,0:13,12,1,3
chr1	32161668	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:4,0:0,5,1,0
chr1	32193773	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,0:2,5:2,1,3,2
chr1	32201495	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=167,52;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,0:1,2,1,1
chr1	32201509	.	A	AAAGAGTCTAGGTAACTAATGTCTTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=122,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr1	32207297	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=117,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:11,3:6,0:8,9,2,1
chr1	32209765	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:11,7:6,6:12,5,11,2
chr1	32258805	.	AAGAG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=AG;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:6,2:16,2,2,0
chr1	32265177	.	G	GGAATAAGCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:32265177_G_GGAATAAGCTTT:32265177:0,1,0,1
chr1	32265180	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32265177_G_GGAATAAGCTTT:32265177:0,1,0,1
chr1	32266026	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=104,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.591:24:3,9:4,4:6,4,11,3
chr1	32280991	.	GA	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	32381592	.	TA	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.208:46:12,4:23,3:3,34,1,8
chr1	32538782	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	32541401	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=121,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,0:4,1:0|1:32541401_A_C:32541401:1,9,3,0
chr1	32541405	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:4,0:0|1:32541401_A_C:32541401:2,10,2,0
chr1	32541409	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,11;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:4,0:0|1:32541401_A_C:32541401:1,10,2,0
chr1	32541413	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,1:0|1:32541401_A_C:32541401:1,10,2,0
chr1	32541415	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,1:0|1:32541401_A_C:32541401:1,10,2,0
chr1	32557244	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:1,4:1,1:3,0,3,2
chr1	32566187	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:1,1:3,2,0,1
chr1	32568357	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	32635450	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	32658062	.	G	GGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.817:11:0,4:1,4:0,2,0,9
chr1	32667609	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:7,3:2,11:5,4,5,10
chr1	32671827	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.219:39:11,3:19,5:14,17,5,3
chr1	32677889	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:10,1:19,1:0,29,0,2
chr1	32678024	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=203,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:32678024_T_G:32678024:1,1,1,0
chr1	32678033	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:32678024_T_G:32678024:1,0,1,0
chr1	32678043	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,13;MFRL=134,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:32678024_T_G:32678024:2,0,1,0
chr1	32678369	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:2,2:10,0:8,4,0,2
chr1	32741242	.	C	CAGGA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:32741242_C_CAGGA:32741242:2,6,1,1
chr1	32741243	.	T	TCCCTAGA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:32741242_C_CAGGA:32741242:2,6,1,1
chr1	32741245	.	C	CTG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:2,0:0|1:32741242_C_CAGGA:32741242:2,6,1,1
chr1	32742140	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:7,5,2,0
chr1	32757682	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,0:3,0:6,0,3,0
chr1	32757688	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,11;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,0:8,0,2,0
chr1	32832292	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=110,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.415:41:11,7:13,9:12,12,6,11
chr1	32842030	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,4:5,2:3,2,3,3
chr1	32846846	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,3:12,0:8,17,1,2
chr1	33060846	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,2:9,0:3,20,1,1
chr1	33087367	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	33093092	.	TG	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,113;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:21,0:16,3:0|1:33093092_TG_T:33093092:18,19,0,3
chr1	33093094	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=130,113;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:21,0:16,3:0|1:33093092_TG_T:33093092:18,19,0,3
chr1	33116206	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.602:23:4,5:5,9:1,8,3,11
chr1	33117071	.	T	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=233.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,33:0,31:0,0,12,53
chr1	33134774	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,23:0.419:55:18,14:14,8:20,12,13,10
chr1	33134989	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=174.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,26:0,19:0,0,12,36
chr1	33135035	.	AT	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:19,3:20,0:26,15,1,2
chr1	33135223	.	C	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=145,123;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.069:55:34,0:18,2:5,47,1,2
chr1	33135229	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=150,112;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.057:50:28,0:19,2:1,47,0,2
chr1	33138365	.	AC	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:16,0:21,3:16,22,0,3
chr1	33138516	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=121.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,10,24
chr1	33146113	.	CT	C,CTT	.	.	DP=182;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=121,134,162;MMQ=60,54,57;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=12.19,12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:126,12,13:0.077,0.082:151:70,7,3:46,4,7:82,44,15,10
chr1	33149514	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=161,157;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:2,0,1,0
chr1	33149524	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,28;MFRL=197,157;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:3,0,1,0
chr1	33149527	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=197,157;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:3,0,1,0
chr1	33149529	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=197,157;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:3,0,1,0
chr1	33149534	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=197,157;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:3,0,1,0
chr1	33149535	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=197,157;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:3,0,1,0
chr1	33160492	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=127,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:15,0:4,2:10,10,0,2
chr1	33161212	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr1	33233323	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	33235974	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr1	33236493	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr1	33252099	.	TCACATGCATGACTATTCCTAGCC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=234,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.677:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr1	33256884	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=111,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:3,4:8,6:2,10,0,10
chr1	33276424	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr1	33282964	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33282964_T_A:33282964:0,0,0,1
chr1	33282966	.	G	GTTGGCAGAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33282964_T_A:33282964:0,0,0,1
chr1	33293748	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=103,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:0,13:1,8:0,1,0,23
chr1	33318634	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,8,8
chr1	33318811	.	G	GCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.275:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	33330432	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,0,11
chr1	33360341	.	TG	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,33;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:12,0:16,4,1,1
chr1	33361134	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,250;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,3:7,3,3,0
chr1	33402334	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.262:16:2,2:5,2:9,3,4,0
chr1	33409551	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	33430102	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33430102_T_G:33430102:0,0,1,0
chr1	33430104	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33430102_T_G:33430102:0,0,1,0
chr1	33476292	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:11,1,2,0
chr1	33476353	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=138,183;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:6,4:12,1:11,7,1,4
chr1	33476385	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=154,57;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:15,4:17,2:0|1:33476385_C_G:33476385:19,13,1,5
chr1	33476387	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=157,57;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:15,3:16,1:0|1:33476385_C_G:33476385:19,15,1,5
chr1	33476396	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=157,57;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:15,4:16,2:0|1:33476385_C_G:33476385:19,13,1,5
chr1	33476404	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=152,57;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.171:39:18,4:13,1:0|1:33476385_C_G:33476385:22,11,1,5
chr1	33478854	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=9;MBQ=28,29;MFRL=135,128;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:29,1:24,2:41,13,3,0
chr1	33478872	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=136,121;MMQ=60,30;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,4:0.081:60:27,2:26,2:0|1:33478872_G_A:33478872:36,20,4,0
chr1	33478878	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=132,121;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,4:0.078:62:27,2:26,2:0|1:33478872_G_A:33478872:31,27,4,0
chr1	33478888	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=130,110;MMQ=60,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,6:0.094:67:29,3:30,2:0|1:33478872_G_A:33478872:32,29,5,1
chr1	33478900	.	T	A	.	.	DP=74;ECNT=9;MBQ=29,20;MFRL=122,110;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,8:0.126:68:28,5:32,3:31,29,4,4
chr1	33478920	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=9;MBQ=32,20;MFRL=121,114;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,13:0.166:81:33,8:33,5:31,37,3,10
chr1	33478931	.	G	C	.	.	DP=81;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=121,114;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,11:0.138:79:32,4:33,5:29,39,1,10
chr1	33478959	.	C	G	.	.	DP=73;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=122,118;MMQ=60,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,10:0.161:66:29,4:25,6:22,34,1,9
chr1	33478983	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.069:56:27,2:24,1:13,40,1,2
chr1	33557671	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:18,3:21,0:27,12,1,2
chr1	33560338	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,14:0,3:0,0,3,16
chr1	33567592	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,6:3,0:0,4,0,6
chr1	33646807	.	C	CAGCAAGTCACATCTTACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	33741615	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	33760743	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=170.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,25:0,22:0,0,40,8
chr1	33778226	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	33778591	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	33795643	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,188;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,3:11,0:11,12,3,0
chr1	33796855	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=12,33;MFRL=225,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr1	33836796	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	33954331	.	AGAAGGATGTGCAG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=187,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:33954331_AGAAGGATGTGCAG_A:33954331:0,4,0,1
chr1	33954350	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=187,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:33954331_AGAAGGATGTGCAG_A:33954331:0,4,0,1
chr1	33954352	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	33954805	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:5,2,0,3
chr1	33961147	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr1	33985353	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.514:27:9,6:4,7:10,3,8,6
chr1	34006382	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:34006382_C_CCT:34006382:0,1,0,1
chr1	34006385	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34006382_C_CCT:34006382:0,1,0,1
chr1	34008416	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:12,2:7,2:11,8,3,1
chr1	34011710	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=163,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,1:8,2:10,5,2,1
chr1	34033131	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:3,7:2,3:4,2,8,2
chr1	34037317	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=263,108;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,2,0
chr1	34038006	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=208,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.653:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr1	34042810	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=216,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr1	34049389	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:6,3:8,3:9,6,3,3
chr1	34052605	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr1	34070826	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:5,2:8,2,7,0
chr1	34071434	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:5,1,5,1
chr1	34112488	.	T	TTATTTTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34112488_T_TTATTTTA:34112488:0,0,0,1
chr1	34112490	.	G	GTTACTGGGTTCGGGACATGACCCTTCCCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34112488_T_TTATTTTA:34112488:0,0,0,1
chr1	34158472	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:34158472_C_T:34158472:0,0,10,2
chr1	34158482	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0|1:34158472_C_T:34158472:0,0,11,2
chr1	34164286	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	34189917	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr1	34189957	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	34663238	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=257,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,2,2
chr1	35135315	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,23:0.544:42:9,12:10,11:6,13,10,13
chr1	35223248	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,1:10,1:15,9,0,2
chr1	35229015	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.137:24:8,2:12,0:10,11,2,1
chr1	35251545	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,14,9
chr1	35251658	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:5,12,1,1
chr1	35261044	.	CAG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=101.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0,0,7,18
chr1	35321684	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	35331693	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:5,1,0,2
chr1	35334388	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	35350573	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=97,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:4,3,4,0
chr1	35470946	.	A	C,ACT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,31,29;MFRL=208,202,206;MMQ=60,60,60;MPOS=8,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.29,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,0,1:3,1,0:0,3,0,2
chr1	35470947	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=36,31;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:35470947_CAAA_C:35470947:0,4,0,1
chr1	35470948	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:35470948_A_AC:35470948:0,3,0,1
chr1	35470950	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:35470948_A_AC:35470948:0,3,0,1
chr1	35470952	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:35470947_CAAA_C:35470947:0,4,0,1
chr1	35470956	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=208,202;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:0|1:35470947_CAAA_C:35470947:0,3,0,1
chr1	35485285	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=168,187;MMQ=45,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:35485285_TC_T:35485285:0,2,0,1
chr1	35485292	.	CT	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=168,187;MMQ=45,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:35485285_TC_T:35485285:0,2,0,1
chr1	35485300	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35485285_TC_T:35485285:0,1,0,1
chr1	35561401	.	AT	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.107:45:21,3:11,2:37,3,4,1
chr1	35561510	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=311.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,95:0.990:95:0,39:0,55:0,0,20,75
chr1	35563206	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=118.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,21:0,0,6,26
chr1	35576145	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	35824780	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:11,10,2,0
chr1	35826674	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,17;MFRL=179,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:3,0,1,0
chr1	35835939	.	ATT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=204,68;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=29,27;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	35847032	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:10,5:13,8:7,16,4,9
chr1	35858313	.	G	C	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,148;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,4:0.068:71:32,0:33,4:0|1:35858313_G_C:35858313:21,46,0,4
chr1	35858319	.	G	T	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=149,148;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,4:0.071:68:32,0:30,4:0|1:35858313_G_C:35858313:16,48,0,4
chr1	35879555	.	C	CT	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,5:0.071:80:37,2:35,3:67,8,5,0
chr1	35879693	.	AT	A,ATT	.	.	DP=153;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=152,137,94;MMQ=60,60,60;MPOS=12,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.76,3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:85,6,9:0.055,0.062:100:33,5,3:48,1,4:14,71,3,12
chr1	35925861	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,14:0,13:0,0,20,7
chr1	35940307	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	36060035	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=219,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,0:1,2:3,1,1,1
chr1	36186425	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=119,149;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:8,5,2,0
chr1	36205166	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr1	36208669	.	CA	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=157,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,0:15,0,1,1
chr1	36212655	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=205,176;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr1	36212678	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=184,205;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:36212678_C_A:36212678:0,4,0,1
chr1	36212681	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=186,206;MMQ=60,32;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	36212688	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,17;MFRL=207,205;MMQ=60,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:36212678_C_A:36212678:0,3,0,1
chr1	36212690	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=184,205;MMQ=50,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:36212678_C_A:36212678:0,2,0,1
chr1	36212694	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=161,205;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36212678_C_A:36212678:0,1,0,1
chr1	36213712	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	36215172	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,154;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:10,0:20,2:21,9,0,2
chr1	36216835	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	36282417	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=193,127;MMQ=47,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,4:1,1:2,0,7,0
chr1	36307412	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=178,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AT;STR;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.810:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr1	36316401	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=14,14;MFRL=122,160;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:1,1:1,0:4,1,3,0
chr1	36316407	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=134,160;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.272:13:2,0:1,1:7,3,3,0
chr1	36316415	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=145,160;MMQ=60,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,0:4,0:7,6,3,0
chr1	36316418	.	C	CA,CAA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,32,33;MFRL=163,144,145;MMQ=60,60,60;MPOS=10,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=22.79,4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,3:0.649,0.250:13:1,4,0:0,3,2:1,0,6,6
chr1	36316571	.	AG	CA,CG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,36,31;MFRL=0,174,158;MMQ=60,60,60;MPOS=25,15;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.26,84.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,27:0.093,0.877:29:0,1,12:0,1,15:0,0,14,15
chr1	36319021	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,0:7,3:17,0,3,0
chr1	36520477	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,161;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:0,1:7,0:7,0,2,0
chr1	36551336	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,164;MMQ=54,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	36554442	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	36563158	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,5:0,16:0,0,15,6
chr1	36565584	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	36565617	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,20,5
chr1	36602943	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,3,15
chr1	36603867	.	A	AGAAACAATGTTGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	36639103	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:4,1:0,9,0,2
chr1	36641888	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:3,2,1,1
chr1	36643759	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:0|1:36643759_AG_CC:36643759:0,6,3,0
chr1	36643765	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.361:9:1,0:5,1:0|1:36643759_AG_CC:36643759:0,6,3,0
chr1	36762396	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr1	36773819	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=64.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,11,7
chr1	36785074	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.096:40:18,1:17,2:15,22,1,2
chr1	36785270	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:12,8:6,6:16,2,12,2
chr1	36788356	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr1	36883946	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	36884473	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=197,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,1:2,8:4,0,9,0
chr1	36884527	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=144,155;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.329:18:6,2:5,3:11,1,4,2
chr1	36884530	.	G	A,GA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,32,34;MFRL=145,151,143;MMQ=60,60,60;MPOS=11,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=39.66,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,14,3:0.610,0.183:21:2,7,0:2,6,3:4,0,12,5
chr1	36886302	.	A	ATGTGTGTATAATGATATCACTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=271,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	36887702	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,16,2
chr1	36923494	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=100,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.436:18:6,1:4,5:8,2,5,3
chr1	36929673	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:9,3:3,6:12,0,7,2
chr1	36933663	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:17,3:14,0:16,15,3,0
chr1	37271670	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,0:0,0:0|1:37271670_A_C:37271670:0,0,2,0
chr1	37271676	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=107,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:0,1:0,0:0|1:37271670_A_C:37271670:3,0,2,0
chr1	37282884	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=203,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr1	37285555	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	37335458	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	37335485	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,3
chr1	37335494	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,4
chr1	37959450	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=208.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,32:0,32:0,0,20,46
chr1	37959470	.	C	G	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=209.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,30:0,27:0,0,13,44
chr1	37959499	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=191,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.589:39:8,9:7,14:3,13,4,19
chr1	38006359	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	38019931	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	38022452	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.492:24:5,4:7,6:12,0,12,0
chr1	38027215	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:16,0:12,3:18,11,3,0
chr1	38030696	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,6:6,4:5,6,0,11
chr1	38049552	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	38052867	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:2,2:4,2:6,1,4,0
chr1	38082122	.	GC	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,4:0,2:3,1,6,0
chr1	38167345	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=109,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.712:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	38184399	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,1:4,1:12,2,2,0
chr1	38185362	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	38288247	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:7,15,1,1
chr1	38301250	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	38301476	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,7:0,0,1,12
chr1	38301512	.	C	A,G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,28,34;MFRL=197,176,160;MMQ=60,30,40;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,0,1:1,1,0:0,4,0,2
chr1	38301515	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=197,168;MMQ=60,35;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr1	38327982	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,14,6
chr1	38328154	.	GAC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	38341187	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=194,191;MMQ=56,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:38341187_A_G:38341187:4,0,1,0
chr1	38341191	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=194,191;MMQ=56,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:38341187_A_G:38341187:4,0,1,0
chr1	38345896	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	38345940	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38345940_A_C:38345940:0,0,0,1
chr1	38345942	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=215,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:38345940_A_C:38345940:0,1,0,1
chr1	38352545	.	C	CAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,3:14,0:20,9,2,1
chr1	38464639	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,18,10
chr1	38483296	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.211:26:6,3:10,2:13,8,3,2
chr1	38484665	.	G	GTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=164,315;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=T;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,0:3,1:8,0,1,1
chr1	38488506	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.562:12:0,3:4,3:1,4,0,7
chr1	38511708	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:1,13,0,2
chr1	39305403	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr1	39325063	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,17:0,11:0,0,22,6
chr1	39361569	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr1	39361781	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:12,2:11,0:4,21,0,2
chr1	39466626	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,14:0,17:0,0,28,5
chr1	39466786	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=131.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,19:0,0,6,32
chr1	39494687	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	39748826	.	GGT	CTA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,0:8,1:16,6,2,0
chr1	39757799	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	39760818	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,0:5,4:4,7,0,4
chr1	39766041	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr1	39796873	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=226,187;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39796873_A_T:39796873:1,0,1,0
chr1	39796874	.	GGAA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=219,187;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:39796873_A_T:39796873:2,0,1,0
chr1	39796887	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=211,187;MMQ=60,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:39796873_A_T:39796873:3,0,1,0
chr1	39796891	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=211,187;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:39796873_A_T:39796873:3,0,1,0
chr1	39812620	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,0:0,8:0,0,8,1
chr1	39815143	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr1	39815344	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,14:0,0,3,26
chr1	39823032	.	A	AT	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=105.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,45:0.942:47:1,21:1,19:2,0,29,16
chr1	39824718	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=99.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,27,0
chr1	39826391	.	A	ATTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr1	39835817	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,6:0,16:0,0,6,16
chr1	39838290	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=170,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:0|1:39838290_T_C:39838290:2,18,0,2
chr1	39838291	.	A	AC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=170,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:0|1:39838290_T_C:39838290:2,18,0,2
chr1	39838294	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=168,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:39838290_T_C:39838290:2,17,0,2
chr1	39838296	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=168,236;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:9,2:0|1:39838290_T_C:39838290:2,17,0,2
chr1	39838299	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=168,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:0|1:39838290_T_C:39838290:2,15,0,2
chr1	39880892	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=210.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,37:0,27:0,0,50,14
chr1	39881006	.	AT	A,ATT	.	.	DP=66;ECNT=5;MBQ=30,31,18;MFRL=141,129,131;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.95,5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,8,5:0.192,0.150:36:10,5,2:7,3,0:5,18,5,8
chr1	39881040	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,20:0,9:0,0,1,30
chr1	39881094	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=29,35;MFRL=175,195;MMQ=41,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:9,1:1,1:0,10,0,2
chr1	39881132	.	CG	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=233,178;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	39881152	.	C	CATGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	39889677	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=130.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,19:0,22:0,0,22,20
chr1	39893093	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,18,8
chr1	39894839	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=174.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,23:0,25:0,0,44,4
chr1	39895460	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,17,2
chr1	39913351	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=98.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,13:0,0,16,10
chr1	39914363	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,10,6
chr1	39927507	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr1	39927689	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:11,0:16,2:13,15,0,2
chr1	39945756	.	TGAAAGAC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:39945756_TGAAAGAC_T:39945756:0,3,0,1
chr1	39945765	.	CCAGTG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:39945756_TGAAAGAC_T:39945756:0,3,0,1
chr1	39945775	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:39945756_TGAAAGAC_T:39945756:0,2,0,1
chr1	39946801	.	T	TTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39946801_T_TTC:39946801:0,0,0,1
chr1	39946803	.	A	AAATAAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39946801_T_TTC:39946801:0,0,0,1
chr1	39977575	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,259;MMQ=60,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	40026851	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	40028180	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,5:0,6:0,0,1,12
chr1	40035686	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr1	40036847	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr1	40041371	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	40092089	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	40226134	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,174;MMQ=52,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:2,3:2,0:2,3,1,3
chr1	40236321	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	40367169	.	T	TTTAAAAAAATAGAGAGAGGATTCAGAGGGCTCTGACTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,171;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr1	40431215	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:6,0:6,8,2,1
chr1	40432577	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:40432577_C_G:40432577:1,1,0,1
chr1	40432581	.	C	CCCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40432577_C_G:40432577:1,1,0,1
chr1	40432582	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40432577_C_G:40432577:1,1,0,1
chr1	40533266	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0|1:40533266_T_G:40533266:0,0,4,16
chr1	40533287	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,11:0,5:0|1:40533266_T_G:40533266:0,0,0,17
chr1	40536074	.	C	CT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=111.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,22:0,8:0,0,25,5
chr1	40545964	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr1	40555274	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	40556922	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr1	40557656	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr1	40558256	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,11:0,0,0,16
chr1	40559555	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=33,33,33,26;MFRL=124,148,139,114;MMQ=52,60,59,60;MPOS=20,15,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=21,18,19,20;RU=A;STR;TLOD=22.89,18.02,3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,19,15,6:0.291,0.301,0.148:52:2,5,5,3:7,7,5,0:8,4,24,16
chr1	40562744	.	G	A	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,14:0.133:107:44,10:49,3:69,24,11,3
chr1	40562993	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	40703244	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.389:49:13,9:16,9:19,11,11,8
chr1	40737516	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,15:0,0,22,1
chr1	40771374	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.276:9:4,0:2,2:0|1:40771374_A_C:40771374:5,2,1,1
chr1	40771380	.	C	CCGAGAGGCTGGGGTGGCGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:2,2:0|1:40771374_A_C:40771374:5,2,1,1
chr1	40771969	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:40771969_A_C:40771969:0,0,0,1
chr1	40771973	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40771969_A_C:40771969:0,0,0,1
chr1	40771978	.	GG	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40771969_A_C:40771969:0,0,0,1
chr1	40775937	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:0,6,3,1
chr1	40776492	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:40776492_T_C:40776492:0,2,0,1
chr1	40776496	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:40776492_T_C:40776492:0,2,0,1
chr1	40776500	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:40776492_T_C:40776492:0,2,0,1
chr1	40777842	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,8:0,0,0,12
chr1	40778377	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,17,11
chr1	40840270	.	T	TGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.856:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	40840353	.	A	G	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=99,74;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,33:0.390:84:15,11:36,22:16,35,14,19
chr1	40879808	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,15,3
chr1	40881799	.	AC	CG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.347:6:2,0:2,0:0|1:40881799_AC_CG:40881799:0,4,2,0
chr1	40881805	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.245:9:2,0:4,0:0|1:40881799_AC_CG:40881799:1,6,2,0
chr1	40881808	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.245:9:2,0:5,0:0|1:40881799_AC_CG:40881799:1,6,2,0
chr1	40919772	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=206,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40919772_T_C:40919772:2,0,1,0
chr1	40919777	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=221,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:40919772_T_C:40919772:3,0,1,0
chr1	40955156	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr1	40960770	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=139,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,1:11,2:14,11,2,1
chr1	40961437	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,272;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:15,0:12,3:16,11,3,0
chr1	41101572	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr1	41107348	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:10,0:5,0:0|1:41107348_A_C:41107348:6,14,2,0
chr1	41107360	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=89.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,13:0,12:0|1:41107348_A_C:41107348:0,0,10,18
chr1	41107362	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.092:30:14,0:12,0:0|1:41107348_A_C:41107348:8,20,2,0
chr1	41213346	.	CTAGAGCTCAAAG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:41213346_CTAGAGCTCAAAG_C:41213346:1,3,0,1
chr1	41213361	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41213346_CTAGAGCTCAAAG_C:41213346:1,0,0,1
chr1	41213376	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	41235177	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,2,20
chr1	41284096	.	TG	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	41284366	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	41284406	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	41284509	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=225,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:6,1,4,1
chr1	41284520	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=225,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:0|1:41284520_A_G:41284520:6,1,5,0
chr1	41284527	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:5,2:2,3:0|1:41284520_A_G:41284520:7,1,5,0
chr1	41289993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	41290004	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41290004_T_C:41290004:0,1,0,1
chr1	41290008	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41290004_T_C:41290004:0,1,0,1
chr1	41290009	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41290004_T_C:41290004:0,1,0,1
chr1	41290012	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41290004_T_C:41290004:0,1,0,1
chr1	41290014	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:41290004_T_C:41290004:0,1,0,1
chr1	41296695	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,11;MFRL=152,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,0:2,0,2,0
chr1	41296699	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=169,227;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:2,0:3,0,2,0
chr1	41296705	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:0,0:2,0:2,0,2,0
chr1	41298652	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,3,2
chr1	41298858	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41298858_A_C:41298858:0,0,0,1
chr1	41298863	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41298858_A_C:41298858:0,0,0,1
chr1	41298883	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	41449135	.	AC	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:19,0:22,3:13,29,0,3
chr1	41456823	.	C	T,G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,25,18;MFRL=147,140,148;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.39,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.213,0.313:10:2,1,0:1,0,0:2,3,5,0
chr1	41456828	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:4,0:7,3,2,0
chr1	41456830	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=19,15;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.265:12:2,0:2,0:6,3,3,0
chr1	41471699	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.571:33:6,11:8,8:9,5,11,8
chr1	41475085	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:5,6:5,10:9,1,14,2
chr1	41483805	.	GTCC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=183,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TCC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	41540853	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,10:0,12:0|1:41540853_A_T:41540853:0,0,17,6
chr1	41540861	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=112.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.967:27:0,12:0,14:0|1:41540853_A_T:41540853:0,0,20,7
chr1	41618442	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	41828044	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=216,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.513:4:0,0:0,0:0|1:41828044_T_TG:41828044:0,2,0,2
chr1	41828050	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,11;MFRL=216,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.513:4:0,0:1,0:0|1:41828044_T_TG:41828044:0,2,0,2
chr1	41847207	.	TCT	CGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	41847212	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:41847212_T_G:41847212:0,0,1,0
chr1	41847215	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:41847212_T_G:41847212:0,0,1,0
chr1	41949628	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr1	41950312	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,2,17
chr1	41978932	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,4:0.082:57:19,0:27,1:0|1:41978932_A_T:41978932:15,38,4,0
chr1	41978936	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=114,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.067:56:20,0:28,0:0|1:41978932_A_T:41978932:15,38,3,0
chr1	42629040	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr1	42647509	.	CACCTGCCATCGTTGTTCCTGGAGTGCTCACACACACACACACACACACACACACACTCACTCTCTCTCTCTCTCTT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.093:32:1,2:0,0:22,7,3,0
chr1	42654364	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=175,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:4,3:1,0:4,1,2,1
chr1	42654638	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42654638_G_T:42654638:0,2,0,1
chr1	42654648	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42654638_G_T:42654638:0,2,0,1
chr1	42654652	.	AA	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42654638_G_T:42654638:0,2,0,1
chr1	42654659	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42654638_G_T:42654638:0,2,0,1
chr1	42654661	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42654638_G_T:42654638:0,2,0,1
chr1	42776699	.	GA	G,GAA	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,34,32;MFRL=140,171,148;MMQ=60,60,60;MPOS=16,12;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=11.22,9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,8,7:0.142,0.137:56:14,5,5:22,2,0:36,5,12,3
chr1	42915727	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=59,96;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr1	42915753	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	43002199	.	AAG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.194:28:9,1:9,4:14,9,3,2
chr1	43011030	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:10,0,5,0
chr1	43021810	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,4:6,4:10,1,7,1
chr1	43054909	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr1	43076576	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,14;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:2,0,1,0
chr1	43102844	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,8:5,6:8,1,12,2
chr1	43111741	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr1	43124220	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:5,6:9,7:2,12,1,12
chr1	43124859	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:6,7:5,6:9,2,11,2
chr1	43166409	.	GAGA	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.489:50:9,14:17,9:22,4,17,7
chr1	43200855	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=223,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.771:24:1,10:4,9:3,2,1,18
chr1	43213499	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,6:2,2:1,6,0,8
chr1	43228189	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr1	43239395	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,5:3,5:0,4,0,10
chr1	43240998	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.503:30:8,8:6,7:9,6,6,9
chr1	43296354	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	43300663	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,7:4,3:5,2,8,2
chr1	43300921	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	43302971	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr1	43393245	.	G	GGGTGAGAAAT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,9:0,8:0,0,16,4
chr1	43393523	.	G	GGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	43621898	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,0:7,2:16,4,0,2
chr1	43652369	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=80.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,13:0,0,8,14
chr1	43663376	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,4,21
chr1	43672636	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	43675843	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	43680855	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr1	43681184	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	43699935	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr1	43700140	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	43738340	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	43771016	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:8,2:9,9:4,13,3,8
chr1	43771090	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:0,4,1,4
chr1	43773033	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	43774878	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:2,4,0,3
chr1	43777852	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	43782846	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,3,1
chr1	43785180	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:9,6:3,6:5,7,5,7
chr1	43787437	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr1	43804443	.	CAGCT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=37,33;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:43804443_CAGCT_C:43804443:0,4,0,1
chr1	43804449	.	C	CCTGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:43804443_CAGCT_C:43804443:0,4,0,1
chr1	43804464	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=199,169;MMQ=60,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:43804464_C_T:43804464:0,3,0,1
chr1	43804474	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=184,169;MMQ=60,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:43804464_C_T:43804464:0,4,0,1
chr1	43804476	.	C	CCCCAGAGGTGG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=184,169;MMQ=60,31;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:43804464_C_T:43804464:0,4,0,1
chr1	43804480	.	TC	CT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=184,169;MMQ=60,31;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:43804464_C_T:43804464:0,4,0,1
chr1	43812075	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=98,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:0,4:6,1:4,2,4,2
chr1	43814864	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=193,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	43826312	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,4,6
chr1	43855546	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr1	43855578	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	43869235	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:7,3:3,4:7,3,5,2
chr1	43893285	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:7,2,0,2
chr1	43897633	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:1,0:4,2:0,5,1,2
chr1	43901011	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr1	43903589	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:4,1:3,6,0,3
chr1	43905198	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:11,1,2,0
chr1	43905819	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170739782,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	43906138	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:11,8,1,1
chr1	43906329	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:43906329_G_T:43906329:0,2,0,1
chr1	43906331	.	T	TCCC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,33;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:43906329_G_T:43906329:0,2,0,1
chr1	43906334	.	CCAG	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:43906329_G_T:43906329:0,3,0,1
chr1	43906335	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,34;MFRL=207,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:43906335_C_CT:43906335:0,2,0,1
chr1	43906336	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=207,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:43906335_C_CT:43906335:0,2,0,1
chr1	43906337	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=207,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:43906335_C_CT:43906335:0,2,0,1
chr1	43906341	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	43906344	.	A	ACGTTC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:43906329_G_T:43906329:0,3,0,1
chr1	43907092	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:4,5:5,4:5,4,6,4
chr1	43908274	.	C	CAGGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	43908806	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.273:8:2,0:4,0:3,3,2,0
chr1	43909265	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,0:3,4:6,1,3,1
chr1	43912590	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	43917409	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.415:27:8,9:8,2:5,11,3,8
chr1	43919081	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,4:4,2:10,3,6,0
chr1	44044468	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:6,2,5,1
chr1	44057257	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	44057668	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,2:6,6:1,7,1,7
chr1	44057696	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:0,9,0,3
chr1	44064319	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr1	44067859	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr1	44069009	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	44069248	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,106;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:7,1,0,2
chr1	44071853	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	44075123	.	C	CCTCTTCCCAGGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:12,2:6,0:9,9,0,2
chr1	44075227	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr1	44078359	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,17:0.618:27:6,8:4,8:0|1:44078359_T_A:44078359:10,0,15,2
chr1	44078384	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=159.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,23:0,18:0|1:44078359_T_A:44078359:0,0,32,9
chr1	44078602	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	44079411	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr1	44083015	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	44083110	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,5:1,6:1,0,8,4
chr1	44086080	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	44119038	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,1:0,5,1,3
chr1	44125962	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:4,3:4,3:6,2,3,3
chr1	44137163	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,3:3,0:6,1,3,0
chr1	44163720	.	A	AAGTATGTTAACAGAATCCTTGGCAGAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=125,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	44163768	.	T	TTTAATCTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	44304056	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,131;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr1	44386305	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	44386615	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr1	44395786	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	44426025	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,15:0,0,7,23
chr1	44426707	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=32,18;MFRL=147,75;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:6,0:0|1:44426707_G_T:44426707:7,12,0,2
chr1	44426711	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=30,11;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.211:20:7,0:4,0:8,8,0,4
chr1	44426713	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=30,9;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.197:19:7,0:7,0:0|1:44426707_G_T:44426707:8,8,0,3
chr1	44426716	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=28,18;MFRL=163,75;MMQ=60,49;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.135:21:7,0:3,0:0|1:44426716_A_C:44426716:8,11,0,2
chr1	44426719	.	CT	GG,CGT	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=29,13,24;MFRL=163,203,149;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.23,6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,2,3:0.126,0.163:20:6,0,1:3,0,1:7,8,0,5
chr1	44426720	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=26,12;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.208:18:5,0:3,0:0|1:44426716_A_C:44426716:7,8,0,3
chr1	44426724	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=20,13;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.322:17:3,1:3,1:6,6,0,5
chr1	44426730	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=27,13;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.419:16:2,2:3,0:5,4,0,7
chr1	44426948	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,6,17
chr1	44432500	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr1	44447220	.	CCCAGGGGTGTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=234,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr1	44457739	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr1	44457823	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.484:10:1,2:2,0:0|1:44457823_AG_CC:44457823:1,4,5,0
chr1	44457830	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.335:15:3,1:5,0:0|1:44457823_AG_CC:44457823:5,5,5,0
chr1	44457834	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.233:17:7,0:5,0:0|1:44457823_AG_CC:44457823:8,5,4,0
chr1	44474363	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44474363_CT_C:44474363:0,3,0,1
chr1	44474368	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44474363_CT_C:44474363:0,3,0,1
chr1	44474375	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:44474363_CT_C:44474363:0,3,0,1
chr1	44474378	.	T	TCTCTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=206,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:44474363_CT_C:44474363:0,2,0,1
chr1	44474384	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=247,139;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:44474363_CT_C:44474363:0,1,0,1
chr1	44594966	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,0:3,3:5,0,4,0
chr1	44595113	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:6,8:1,11:4,3,10,10
chr1	44596379	.	CCAA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAA;STR;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,3:6,5:10,4,5,4
chr1	44679556	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.505:37:8,9:10,7:8,10,4,15
chr1	44684118	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:12,2:17,0:7,23,1,1
chr1	44685664	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:1,2,0,4
chr1	44686009	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.101:28:13,2:10,0:6,20,0,2
chr1	44686322	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:6,2:3,1:1,9,0,3
chr1	44773973	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=129,72;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,4:6,0:12,4,3,1
chr1	44877843	.	TGA	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:8,2:0|1:44877843_TGA_T:44877843:13,11,0,2
chr1	44877846	.	T	TTG	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:0|1:44877843_TGA_T:44877843:13,11,0,2
chr1	44877851	.	CT	AG	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:9,2:0|1:44877843_TGA_T:44877843:13,11,0,2
chr1	44877856	.	A	AGGGAATAT	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=168,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:11,1:0|1:44877843_TGA_T:44877843:14,12,0,2
chr1	45080030	.	G	GTTCTTCTTAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=223,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	45080061	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	45097931	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,28:0.558:50:10,13:11,15:11,11,19,9
chr1	45120229	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=118,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:7,6,2,0
chr1	45120309	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:7,6,1,1
chr1	45155593	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=158,112;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.219:10:2,0:1,1:3,5,1,1
chr1	45166513	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:10,0,8,0
chr1	45166869	.	A	ACGTGGCCTTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr1	45169711	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=116,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.188:20:6,0:8,2:10,7,2,1
chr1	45191105	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=153,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.112:24:9,0:12,2:0|1:45191105_G_T:45191105:4,18,1,1
chr1	45191110	.	C	CTGATACTTTGAGTACTAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=155,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:45191105_G_T:45191105:3,17,1,1
chr1	45206495	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,6,1
chr1	45223901	.	TATTAGCTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTAGCTG;STR;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	45225921	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,4:1,1:5,2,5,0
chr1	45226424	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=228,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:45226424_T_TAA:45226424:0,2,1,1
chr1	45226425	.	T	TAACAGTCATCTGGGTATTATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=228,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:0|1:45226424_T_TAA:45226424:0,2,1,1
chr1	45227548	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,3:2,5:6,3,7,1
chr1	45241374	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:0,2:2,5:0,2,1,7
chr1	45244255	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.080:73:26,4:42,1:45,23,3,2
chr1	45253091	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=157,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:3,7,1,1
chr1	45266154	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	45266875	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=34,19;MFRL=184,203;MMQ=40,30;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=24,22;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.279:5:0,0:1,0:0|1:45266875_CTT_C:45266875:0,4,0,1
chr1	45266882	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=201,156;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1|0:45266875_CTT_C:45266875:0,4,0,1
chr1	45266904	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=201,203;MMQ=40,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:45266904_TG_CA:45266904:0,4,0,1
chr1	45266907	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=201,203;MMQ=40,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:45266904_TG_CA:45266904:0,4,0,1
chr1	45266912	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=201,203;MMQ=40,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:45266904_TG_CA:45266904:0,4,0,1
chr1	45266918	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=201,203;MMQ=40,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:45266904_TG_CA:45266904:0,4,0,1
chr1	45269973	.	CCAGG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:9,9,0,2
chr1	45271785	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,2:16,0:2,26,0,2
chr1	45297657	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.536:22:5,6:5,6:6,4,4,8
chr1	45362992	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr1	45469397	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,0:15,2:11,10,0,2
chr1	45470130	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	45471362	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,2:4,4:4,0,6,0
chr1	45472798	.	TTGTGTG	T,TTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25,27;MFRL=0,155,0;MMQ=60,60,60;MPOS=2,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=TG;STR;TLOD=6.65,7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.455,0.453:6:0,1,2:0,2,0:0,0,4,2
chr1	45473316	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	45474157	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=117,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,3,1
chr1	45474447	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=195,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45474447_C_G:45474447:0,1,0,1
chr1	45474448	.	CTTGAACG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=214,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:45474447_C_G:45474447:0,2,0,1
chr1	45474458	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=214,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45474447_C_G:45474447:0,2,0,1
chr1	45474462	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=214,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45474447_C_G:45474447:0,2,0,1
chr1	45474750	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=78,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:0|1:45474750_A_T:45474750:4,0,5,3
chr1	45474755	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=78,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.644:12:2,5:2,3:0|1:45474750_A_T:45474750:4,0,5,3
chr1	45475566	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	45476069	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	45479772	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:7,8:6,5:5,8,2,11
chr1	45480733	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,7:0,12:0,0,1,19
chr1	45486272	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,8:6,1:7,4,7,2
chr1	45500107	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,5:5,3:3,10,3,5
chr1	45502026	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,23,14;MFRL=150,134,148;MMQ=60,60,40;MPOS=20,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.90,9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.214,0.477:11:1,3,1:1,0,0:0,3,0,8
chr1	45502046	.	A	AAG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:13,2:3,0:0|1:45502046_A_AAG:45502046:0,17,0,2
chr1	45502047	.	GAC	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:14,2:3,0:0|1:45502046_A_AAG:45502046:0,18,0,2
chr1	45504524	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr1	45524213	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	45794426	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	45796269	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=122.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,17:0,17:0,0,15,19
chr1	45798555	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,11:0,11:0,0,12,10
chr1	45799143	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,2:8,0:7,4,1,1
chr1	45805550	.	A	C	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,11:0.093:81:30,2:23,0:27,43,11,0
chr1	45805566	.	G	C	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=240.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,34:0,31:0,0,29,38
chr1	45805823	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:17,0,1,1
chr1	45887482	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=146,69;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:9,0:9,4:0|1:45887482_T_A:45887482:5,14,1,3
chr1	45887485	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=146,69;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,0:10,4:0|1:45887482_T_A:45887482:5,14,1,3
chr1	46032311	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,5:1,5:3,1,6,4
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chr1	46073618	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=157,201;MMQ=60,27;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:19,2:17,1:27,9,3,0
chr1	46080947	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,6:9,2:5,13,7,1
chr1	46081940	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0,0,17,2
chr1	46081960	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:7,2:4,7:8,4,8,1
chr1	46082431	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.531:17:2,4:5,5:2,6,3,6
chr1	46083706	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=84.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.453:62:14,10:20,18:24,10,20,8
chr1	46085852	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=83,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:0,1:3,1:2,1,2,0
chr1	46085879	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	46086077	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:1,2:5,6:5,1,4,4
chr1	46086913	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=95,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,2,1
chr1	46087879	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:1,0,5,0
chr1	46088753	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,1:4,1:2,10,0,2
chr1	46124663	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=73.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,10:0,0,12,11
chr1	46160260	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:0,9,0,6
chr1	46182597	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=108.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,40:0.532:75:11,34:23,6:22,13,24,16
chr1	46184896	.	AAC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:10,1:11,9,1,1
chr1	46185098	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46185098_T_TC:46185098:0,1,0,1
chr1	46185099	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,28;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:46185098_T_TC:46185098:0,1,0,1
chr1	46185102	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46185098_T_TC:46185098:0,1,0,1
chr1	46193275	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:7,4:5,9:9,3,10,3
chr1	46195211	.	TAAC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:4,3:7,0,3,0
chr1	46206540	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,6:3,5:7,0,11,0
chr1	46207048	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,0:3,2:0,5,0,2
chr1	46269756	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,13;MFRL=94,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.425:12:1,0:3,1:4,3,0,5
chr1	46269759	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=18,19;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:1,0:3,0:0|1:46269759_G_C:46269759:4,6,0,2
chr1	46269761	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=17,15;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.250:13:1,0:3,0:4,6,0,3
chr1	46269763	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,13;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.248:13:3,0:3,0:0|1:46269759_G_C:46269759:4,6,0,3
chr1	46290311	.	GTA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:4,4:1,7,0,7
chr1	46347910	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,1:2,3:4,1,5,0
chr1	46424964	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	46473902	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr1	46487560	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:7,0,4,0
chr1	46491588	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	46498375	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=136,62;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:3,3:5,1:5,4,2,2
chr1	46521517	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.496:20:7,8:3,1:6,4,9,1
chr1	46521559	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,6:5,3:6,6,7,3
chr1	46597496	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:5,2:2,1:6,2,3,0
chr1	46650191	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	46651164	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=106,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:10,2:7,0:6,12,0,2
chr1	46658328	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	46658846	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:8,2:20,0:20,11,1,1
chr1	46659104	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,6:3,1:0,7,3,4
chr1	46659363	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:0,2:7,2:0,8,0,4
chr1	46661603	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.596:40:7,17:8,7:11,5,14,10
chr1	46661810	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	46661812	.	G	GTGCATGGTATCACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	46726574	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=126,43;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:17,1:21,1:17,22,2,0
chr1	46726890	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,10;MFRL=163,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.361:11:4,0:1,0:4,3,4,0
chr1	46782370	.	T	TGGAATGTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,153;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:0,15,0,2
chr1	46806429	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:2,0,6,1
chr1	46806480	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,6:7,6:8,3,8,4
chr1	46810405	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=137,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,3:3,5:6,0,8,0
chr1	46812519	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=171,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	46826587	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	46827214	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr1	46827485	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,2:1,5:2,4,2,5
chr1	46877180	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,5:0,3:1,0,6,3
chr1	47013364	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,16,4
chr1	47014821	.	A	AAAAAG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=218,166;MMQ=36,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAG;STR;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.890:25:0,8:2,10:2,0,17,6
chr1	47040532	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:8,1:6,1:14,1,2,0
chr1	47075932	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	47108828	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr1	47110766	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	47118168	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:3,5:1,3:0|1:47118168_C_T:47118168:6,0,8,0
chr1	47118189	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:6,7:6,3:0|1:47118168_C_T:47118168:11,1,10,1
chr1	47123898	.	TA	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.308:32:11,6:8,3:3,19,0,10
chr1	47124479	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	47138444	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	47154272	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=136,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0|1:47154272_C_T:47154272:0,2,0,4
chr1	47154297	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=220,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1|0:47154272_C_T:47154272:1,2,0,1
chr1	47182206	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:0,6,0,6
chr1	47398743	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,10:0,0,4,15
chr1	47400059	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=274,143;MMQ=40,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,4:0,2:0,1,5,1
chr1	47402487	.	TTGTGTG	T,TTG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,35,33;MFRL=187,203,102652;MMQ=60,60,55;MPOS=11,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=TG;STR;TLOD=5.16,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.342,0.422:5:1,0,1:0,2,1:0,1,0,4
chr1	47403120	.	C	CTCAATTCCTAGGTTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=125,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	47403144	.	AT	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=197,125;MMQ=52,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	47548189	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,174;MMQ=57,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,3:9,1:0,16,1,3
chr1	47571943	.	CT	C,CTT	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=26,20,25;MFRL=179,138,128;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=15.26,7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,11,7:0.371,0.257:28:5,5,2:4,3,2:1,9,5,13
chr1	47607414	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=173,156;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr1	47685455	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr1	47685485	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:10,2,2,0
chr1	47689842	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	47735280	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr1	47753405	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,14:0,0,0,23
chr1	47770786	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	47841038	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	47905555	.	AG	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.635:17:5,1:1,10:4,2,5,6
chr1	47905782	.	CTTT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:1,2:0,1:1,3,0,4
chr1	47906338	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,3,13
chr1	47906425	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	48697226	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:1,2,5,2
chr1	48697733	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,5,20
chr1	48697751	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=196,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:3,4:2,3:1,5,2,6
chr1	48697781	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,4:1,1:1,3,2,3
chr1	48698010	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=115,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr1	48699490	.	T	TCCCTCTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=202,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.313:4:3,1:0,0:0|1:48699490_T_TCCCTCTC:48699490:0,3,0,1
chr1	48699493	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=202,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.317:4:3,1:0,0:0|1:48699490_T_TCCCTCTC:48699490:0,3,0,1
chr1	48701623	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=105,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	48712985	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=104,78;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:21,3:19,0:21,21,2,1
chr1	48713100	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.524:23:6,5:4,7:5,6,6,6
chr1	48918698	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:4,6:6,9:4,6,5,10
chr1	49056695	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=84,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,1:1,2:0,2,0,3
chr1	49100332	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=211,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:0,4,0,4
chr1	49128720	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=212,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	49226954	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:18,2:3,0:19,2,2,0
chr1	49332969	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,5:8,4:1,14,0,9
chr1	50513779	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513782	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513784	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513786	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,14;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513789	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513794	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,12;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513798	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,12;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513802	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50666515	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,3,5
chr1	50886719	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	50957509	.	A	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=237.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,41:0,29:0,0,11,59
chr1	51032698	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:12,0,2,0
chr1	51171589	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,0:1,2:1,5,0,2
chr1	51171615	.	T	TGTGAGACATAAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=104,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.320:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	51253964	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=211,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	51253965	.	G	GCTATAACAGAATACCTGAAACTGGATGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.385:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr1	51753904	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:7,8:4,5:9,4,7,7
chr1	51827088	.	A	ACTTCCAGAAATTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=200,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	51910566	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:17,0:17,3:21,14,3,0
chr1	52179816	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=152,197;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:20,1:16,4:2,40,0,5
chr1	52179818	.	GT	G,GTT	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,32,23;MFRL=192,131,144;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.31,5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,4,5:0.136,0.170:31:9,3,2:10,0,1:0,22,0,9
chr1	52179820	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=152,197;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:22,0:15,4:2,36,0,4
chr1	52242432	.	CT	C,GT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,29,31;MFRL=162,138,149;MMQ=60,60,60;MPOS=8,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.79,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,4,3:0.213,0.148:20:9,1,2:3,2,1:11,2,6,1
chr1	52256665	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:1,14,0,2
chr1	52279650	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=194.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,30:0,29:0,0,38,23
chr1	52293570	.	G	A	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=290.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,87:0.989:87:0,46:0,40:0,0,17,70
chr1	52293638	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,10:0,0,1,20
chr1	52301711	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:7,0,5,0
chr1	52306027	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,41:0.488:84:29,19:14,22:20,23,13,28
chr1	52306063	.	ATCT	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=136.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.976:33:0,14:0,18:0,0,5,28
chr1	52399186	.	T	TACCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	52399192	.	T	TTGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=244,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,0:0,1:0|1:52399192_T_TTGGG:52399192:0,1,0,1
chr1	52399194	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=244,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52399192_T_TTGGG:52399192:0,1,0,1
chr1	52402956	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	52489322	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	52517412	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,11:0,0,13,2
chr1	52820226	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=86.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,21,3
chr1	52824731	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=104,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr1	52825963	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,5:2,0:0,5,1,4
chr1	52827212	.	TTCCTCC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=TCC;STR;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.761:6:1,3:0,2:1,0,2,3
chr1	52859407	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:10,1:1,19,0,2
chr1	52912122	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,1:1,4:1,1,5,6
chr1	52947350	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:3,2:8,2,3,0
chr1	52959245	.	TA	T,TAA	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=150,203,133;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.39,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,5,4:0.090,0.092:48:15,1,1:22,3,3:36,3,7,2
chr1	53072454	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr1	53153925	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53153925_T_G:53153925:0,0,0,1
chr1	53153933	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53153925_T_G:53153925:0,0,0,1
chr1	53267497	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:7,0:8,0:14,6,3,0
chr1	53282148	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:16,5:12,0:29,0,6,0
chr1	53282374	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=159,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:14,0:14,3:0|1:53282374_T_A:53282374:1,27,0,3
chr1	53282383	.	T	TGCTTCCG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,38;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,0:13,3:0|1:53282374_T_A:53282374:0,26,0,3
chr1	53308665	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,3,12
chr1	53320274	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,7,10
chr1	53323492	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	53333116	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	53351686	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=216,183;MMQ=40,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:1,1:0,6,0,2
chr1	53352770	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=247,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53352770_T_A:53352770:0,1,0,1
chr1	53352775	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=247,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53352770_T_A:53352770:0,1,0,1
chr1	53358414	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=161,104;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:53358414_C_T:53358414:2,0,2,0
chr1	53358418	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=164,104;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:53358414_C_T:53358414:3,0,2,0
chr1	53364976	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,2,11
chr1	53372162	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.316:21:4,1:4,1:10,4,7,0
chr1	53372168	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.221:21:9,0:7,0:11,5,5,0
chr1	53372180	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.168:23:9,0:10,0:14,5,4,0
chr1	53387379	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	53407406	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=191,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:2,2:6,2:7,1,4,0
chr1	53413670	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:12,3,2,0
chr1	53513437	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr1	53543112	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	53544324	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=194,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:2,1,0,5
chr1	53559291	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	53569063	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.084:34:17,1:14,1:21,11,1,1
chr1	53571288	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	53662823	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	53686383	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	53699129	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr1	53723190	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=78.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,0,21
chr1	53736613	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	53742506	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	53755151	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	53925237	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:15,2:4,0:9,11,0,2
chr1	53932151	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,140;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:6,3:21,0:27,0,3,0
chr1	53974987	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,3,19
chr1	54269524	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:14,2,1,2
chr1	54284805	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0,20,0,2
chr1	54337011	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.253:14:5,3:3,0:9,2,3,0
chr1	54354486	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=109,98;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr1	54370306	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=106.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,38:0.548:69:11,25:20,12:22,9,26,12
chr1	54375570	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,12,1
chr1	54375701	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr1	54395673	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=34,34,33;MFRL=161,175,134;MMQ=60,60,60;MPOS=22,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.97,9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,6:0.098,0.297:24:8,1,3:7,1,3:15,1,8,0
chr1	54395697	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,10:0.157:56:22,0:14,0:33,13,10,0
chr1	54478017	.	A	AAGCCCCTTCCTGTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=168,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	54478042	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54478042_T_A:54478042:0,1,0,1
chr1	54478050	.	TGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54478042_T_A:54478042:0,1,0,1
chr1	54497937	.	TTG	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:11,0:13,2:6,18,0,2
chr1	54502395	.	G	GA	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=117,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.100:48:22,4:22,0:8,36,2,2
chr1	54514223	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:9,7:5,5:14,0,12,0
chr1	54605319	.	G	GC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,6:0,15:0,0,8,15
chr1	54607157	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,4,14
chr1	54618435	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,4,0
chr1	54640398	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,171;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,1:6,1:3,11,1,1
chr1	54656651	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	54656666	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=198,253;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:54656666_T_A:54656666:0,3,0,1
chr1	54656670	.	C	CAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=198,253;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:54656666_T_A:54656666:0,3,0,1
chr1	54670658	.	CCTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr1	54704567	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr1	54707810	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.118:29:9,0:5,0:13,13,3,0
chr1	54871566	.	ACCGC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCGC;STR;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:0,2:5,0,4,0
chr1	54871709	.	T	TCGCCGC	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=CGC;STR;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.445:29:10,4:4,4:1,15,1,12
chr1	55014099	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,6:0,16:0,0,2,20
chr1	55064898	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:3,1,2,0
chr1	55065029	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:22,2:22,1:22,22,0,3
chr1	55072726	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,1:1,3:7,0,4,0
chr1	55074570	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=13,20;MFRL=168,176;MMQ=44,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:0,0:0,1:0|1:55074570_A_C:55074570:3,0,2,0
chr1	55074575	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,13;MFRL=168,176;MMQ=44,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:1,0:1,0:0|1:55074570_A_C:55074570:3,0,2,0
chr1	55074577	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=9,14;MFRL=168,176;MMQ=44,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:0,0:0,0:0|1:55074570_A_C:55074570:3,0,2,0
chr1	55074583	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=16,15;MFRL=144,176;MMQ=48,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:0,0:1,0:0|1:55074570_A_C:55074570:5,0,2,0
chr1	55074587	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=152,176;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,0:0|1:55074570_A_C:55074570:7,0,2,0
chr1	55074840	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=218,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,1,4
chr1	55075554	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:55075554_A_C:55075554:0,2,0,1
chr1	55075556	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:55075554_A_C:55075554:0,2,0,1
chr1	55075557	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:55075554_A_C:55075554:0,2,0,1
chr1	55075995	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	55078466	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55078466_A_AGG:55078466:0,0,0,1
chr1	55078472	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55078466_A_AGG:55078466:0,0,0,1
chr1	55080612	.	GGTGT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=222,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=GT;STR;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.670:7:0,2:2,2:0|1:55080612_GGTGT_G:55080612:0,2,0,5
chr1	55080629	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=223,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:0,2:0|1:55080612_GGTGT_G:55080612:0,1,0,5
chr1	55085499	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	55085781	.	GTAC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	55088849	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=264,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,1:1,0,2,1
chr1	55096383	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=175,167;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:14,1:11,2:26,0,3,0
chr1	55118566	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr1	55130931	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:10,3:3,5:4,9,4,4
chr1	55130946	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,2:3,2:2,8,2,3
chr1	55130972	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr1	55131012	.	T	TGCACTCCCTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	55134487	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,4:2,8:4,2,8,4
chr1	55134712	.	A	AGGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	55136067	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	55138673	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:6,5:0,1:7,0,6,0
chr1	55139618	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr1	55139877	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=221,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	55151960	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:9,4,2,0
chr1	55199420	.	ATTTTTTTTT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=26,17;RU=T;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.829:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	55223398	.	T	TGGGGGGGGGG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,15;RU=G;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.210:14:5,0:6,1:9,2,0,3
chr1	55253575	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,10:0,0,4,13
chr1	55253594	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=198,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:0,2:4,7:3,1,2,7
chr1	55266845	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr1	55277430	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,239;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr1	55279688	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,6:2,3:0,6,1,8
chr1	55279744	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=226,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	55280583	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:18,3,2,0
chr1	55307640	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr1	55318090	.	C	CTTCCCCGAGGTGTACGACAAGATCTGCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=202,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.387:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	55318108	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=220,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	55319640	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=107,181022251;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55319640_G_T:55319640:1,0,1,0
chr1	55319645	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=107,181022251;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55319640_G_T:55319640:1,0,1,0
chr1	55330966	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,10,4
chr1	55336950	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=290,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	55446664	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:55446664_G_C:55446664:0,0,4,0
chr1	55446671	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:55446664_G_C:55446664:0,0,4,0
chr1	55446697	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	55457815	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	55464790	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	55474108	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.403:20:4,3:8,4:6,6,6,2
chr1	55505533	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=139,64;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:13,0:7,2:0|1:55505533_G_A:55505533:7,13,1,2
chr1	55505546	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,64;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,0:6,1:0|1:55505533_G_A:55505533:4,12,1,2
chr1	55505651	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:3,2,2,3
chr1	55505732	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	55512378	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55512378_C_A:55512378:0,1,0,1
chr1	55512380	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55512378_C_A:55512378:0,1,0,1
chr1	55512382	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55512378_C_A:55512378:0,1,0,1
chr1	55512386	.	GG	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55512378_C_A:55512378:0,1,0,1
chr1	55518316	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,13:0,0,26,5
chr1	55518467	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:12,3:10,7:4,18,2,8
chr1	55524116	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,8:0,0,23,4
chr1	55524375	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55524375_T_C:55524375:0,0,0,1
chr1	55524380	.	GT	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55524375_T_C:55524375:0,0,0,1
chr1	55525400	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	55527323	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,1,11
chr1	55538385	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr1	55538552	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,3:4,8:1,8,1,10
chr1	55538636	.	T	TCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55538636_T_TCCA:55538636:0,0,0,1
chr1	55538638	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55538636_T_TCCA:55538636:0,0,0,1
chr1	55539687	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:55539687_C_G:55539687:0,4,0,1
chr1	55539690	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:55539687_C_G:55539687:0,4,0,1
chr1	55543049	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr1	55546895	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	55555285	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=143.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,24:0,19:0,0,29,14
chr1	55557859	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:55557859_A_ATT:55557859:0,0,0,4
chr1	55557864	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:55557859_A_ATT:55557859:0,0,0,5
chr1	55558661	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	55562125	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=200.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,32:0,25:0,0,53,5
chr1	55563224	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=156,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.104:45:19,4:22,0:39,2,3,1
chr1	55563396	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.414:28:3,6:2,4:4,13,1,10
chr1	55566411	.	TTAGTC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=115.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,26,0
chr1	55567410	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr1	55571953	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=115.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,38:0.470:81:19,19:24,19:12,31,8,30
chr1	55572867	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	55604404	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	55609728	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:14,1:6,2:20,2,3,0
chr1	55614036	.	CAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	55619422	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr1	55619929	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,1:9,1:12,10,2,0
chr1	55625315	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:12,2:4,0:9,7,1,1
chr1	55643837	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	55680540	.	G	GGCC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GCC;STR;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr1	57002613	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.657:36:6,9:6,14:10,2,21,3
chr1	57002815	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.177:20:7,1:7,0:1,16,0,3
chr1	57110998	.	AGGC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGC;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:3,1:7,1:11,0,2,0
chr1	57111169	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr1	57140070	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,22:0.426:52:16,8:14,14:24,6,17,5
chr1	57185818	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:10,5:5,3:11,4,5,3
chr1	57216631	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr1	57216888	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=106,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,2:2,5:0,4,3,5
chr1	57219631	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.389:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr1	57224460	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr1	57224483	.	C	CAATTGCCTTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	57258485	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=193,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr1	57258512	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	57349140	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr1	57351502	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:3,0,1,0
chr1	57395251	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	57395280	.	GGT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:57395280_GGT_G:57395280:0,3,0,1
chr1	57395284	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:57395280_GGT_G:57395280:0,3,0,1
chr1	57409556	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:57409556_C_T:57409556:0,2,0,1
chr1	57409559	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:57409556_C_T:57409556:0,2,0,1
chr1	57477034	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr1	57489137	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,5:1,4:4,2,9,0
chr1	57611047	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=121,27;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,2:9,0:12,13,1,1
chr1	59004979	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr1	59041831	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=184,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.321:10:1,1:4,0:2,5,3,0
chr1	59125894	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:59125894_A_G:59125894:0,0,0,13
chr1	59125899	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:59125894_A_G:59125894:0,0,0,11
chr1	59127024	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,17,4
chr1	59131311	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	59134586	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=330.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,78:0.987:78:0,34:0,34:0|1:59134586_G_C:59134586:0,0,67,11
chr1	59134607	.	C	CAG	.	.	DP=117;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=117,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=461.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,108:0.991:109:1,51:0,49:0|1:59134586_G_C:59134586:0,1,81,27
chr1	59139223	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=88.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,9:0,0,23,2
chr1	59141084	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:10,0,2,0
chr1	59147420	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=129.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:0,27:1,11:1,0,35,3
chr1	59150941	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=180.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,22:0,32:0,0,11,43
chr1	59150997	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=196,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.774:19:2,3:2,10:0,4,0,15
chr1	59156155	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=74.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,1,21
chr1	59158632	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,9:0,0,5,17
chr1	59160724	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.614:8:0,1:1,4:3,0,5,0
chr1	59165838	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	60228310	.	T	TTC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr1	60331495	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=124.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,40:0.604:66:14,20:11,20:23,3,39,1
chr1	60381791	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr1	60392271	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.527:32:3,9:12,7:9,6,10,7
chr1	60463520	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:60463520_T_C:60463520:0,1,0,1
chr1	60463523	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:60463520_T_C:60463520:0,1,0,1
chr1	60466814	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.680:20:4,5:2,6:2,4,5,9
chr1	60466840	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=10,17;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,0:0,2:0,3,0,6
chr1	60466911	.	ACAG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	60505578	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,4,6
chr1	61547750	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	61548379	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=112,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,2:0.045:64:21,2:24,0:44,18,2,0
chr1	61554433	.	C	CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	61743337	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:3,3:3,2:0,6,0,6
chr1	61798127	.	GTTGTCAAATGTCTTGTATTTATGACACTTTGTTTTCTTTTGTTTTTGTTTCCCCAGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTT	G	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,5:0.038:82:15,0:7,3:58,19,3,2
chr1	61870000	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:1,2:7,0:0,8,0,2
chr1	61872215	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=12,32;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=C;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.303:17:2,1:1,3:0|1:61872215_GC_G:61872215:0,12,0,5
chr1	61872228	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.962:22:0,13:0,9:0|1:61872215_GC_G:61872215:0,0,3,19
chr1	61892301	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	62149067	.	CAT	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.065:43:22,2:18,0:40,1,2,0
chr1	62149153	.	C	T	.	.	DP=130;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,9:0.080:120:62,5:48,4:52,59,5,4
chr1	62149230	.	A	AGTAAGTGATATATATATAT	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:22,2:17,0:1,40,0,2
chr1	62149237	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=162.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,24:0,19:0,0,1,43
chr1	62160525	.	T	TTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.734:9:0,5:2,2:0|1:62160525_T_TTA:62160525:0,2,0,7
chr1	62160542	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:62160525_T_TTA:62160525:0,0,0,7
chr1	62175139	.	A	AT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.118:31:15,1:11,1:1,27,0,3
chr1	62231924	.	T	TTGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGA;STR;TLOD=48.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,2:0,0,9,3
chr1	62257036	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:11,3:4,5:10,5,5,3
chr1	62274257	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=165,148;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:29,0:21,2:0|1:62274257_C_T:62274257:2,49,0,2
chr1	62274262	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=168,148;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:24,0:17,2:0|1:62274257_C_T:62274257:1,46,0,2
chr1	62274269	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=167,148;MMQ=60,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.072:40:20,0:15,2:0,38,0,2
chr1	62340855	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:13,5:4,7:14,3,11,1
chr1	62350123	.	GTTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,325;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.739:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	62366878	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=223,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	62380270	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,50:0.457:109:24,23:31,23:20,39,24,26
chr1	62380298	.	G	A	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,49:0.578:85:20,23:14,26:13,23,15,34
chr1	62393394	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:6,2,6,1
chr1	62417950	.	GAA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.145:19:7,1:8,1:14,3,2,0
chr1	62516683	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,99;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,6:7,5:1,10,3,8
chr1	62545085	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:7,7:1,5:8,1,12,0
chr1	62579672	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,0:2,4:5,0,4,0
chr1	62587014	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:3,1:3,3:0,6,0,5
chr1	62594667	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:62594667_G_A:62594667:0,4,0,1
chr1	62594671	.	A	ATGGGGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:62594667_G_A:62594667:0,4,0,1
chr1	62594677	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=225,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	62704134	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:0,5,0,5
chr1	62704153	.	G	GTTTTACATGCATTAAATAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	62729015	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=66,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,0,3
chr1	62733939	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:7,1:6,3:9,4,3,1
chr1	62747262	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.177:22:6,3:12,0:5,13,2,2
chr1	62908932	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,5:0.072:81:42,0:33,5:23,53,1,4
chr1	62912919	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr1	62939634	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=126.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,19:0,0,26,12
chr1	62953183	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr1	62958311	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,6:5,2:11,0,8,0
chr1	62961928	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,20,0
chr1	62973795	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	63001120	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:4,0,9,0
chr1	63027411	.	AG	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=128.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,21:0,14:0,0,4,32
chr1	63044464	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.582:41:6,14:10,10:11,6,19,5
chr1	63044645	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.523:17:0,3:2,3:0,8,2,7
chr1	63050598	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,2:6,3:1,8,0,5
chr1	63070537	.	AGTTAATGTG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.476:17:2,5:7,3:0,9,0,8
chr1	63085483	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=60,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.811:14:1,7:1,5:2,0,12,0
chr1	63090858	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=117,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:4,1,6,0
chr1	63113511	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.500:44:13,14:9,8:2,20,1,21
chr1	63113689	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	63113719	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=174,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr1	63269580	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:7,6:12,3:1,18,0,9
chr1	63270772	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.498:40:11,9:9,10:20,0,19,1
chr1	63270823	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=122;ECNT=3;MBQ=33,35,34,34;MFRL=153,155,146,136;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,16,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.10,16.56,11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:52,7,14,10:0.072,0.143,0.126:83:27,3,7,3:22,4,7,4:45,7,29,2
chr1	63270839	.	C	G	.	.	DP=145;ECNT=3;MBQ=14,18;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,12:0.080:132:29,1:22,1:87,33,11,1
chr1	63271010	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.426:45:12,9:14,10:0,26,0,19
chr1	63285033	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,4:5,5:1,12,1,8
chr1	63294614	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	63871881	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,4:3,0:6,0,4,0
chr1	63872871	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	63885222	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=227,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr1	63912546	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.427:33:12,8:7,6:0,19,1,13
chr1	63912563	.	ACAATT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.424:24:6,4:7,6:1,13,0,10
chr1	63991490	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:1,7,1,6
chr1	63997633	.	A	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=122.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,40:0.578:69:15,22:14,18:13,16,17,23
chr1	63998326	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.212:25:8,3:12,2:20,0,5,0
chr1	63999087	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.573:33:10,8:3,9:13,1,16,3
chr1	63999826	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.381:40:13,5:12,10:10,15,4,11
chr1	63999868	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:12,6:9,7:4,17,2,11
chr1	63999891	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=146,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:10,7:7,5:4,13,1,12
chr1	64021096	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=103.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,37:0.585:63:15,18:11,19:8,18,12,25
chr1	64021109	.	AA	GG	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,2:0.048:60:28,2:25,0:17,41,0,2
chr1	64027617	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64027617_G_T:64027617:0,1,0,1
chr1	64027623	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:64027617_G_T:64027617:0,1,0,1
chr1	64036838	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,28:0.546:51:6,13:17,14:4,19,4,24
chr1	64038107	.	G	T	.	.	DP=147;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=186.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,66:0.504:131:31,32:31,32:31,34,35,31
chr1	64100478	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.422:29:11,7:5,5:14,3,11,1
chr1	64102114	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=218,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	64114105	.	TG	CA,GG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32,34;MFRL=149,173,167;MMQ=60,60,44;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,1,1:2,0,0:4,0,2,0
chr1	64114114	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=155,167;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	64114406	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64114406_CTT_C:64114406:0,0,0,1
chr1	64114409	.	A	ACAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64114406_CTT_C:64114406:0,0,0,1
chr1	64125234	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,2:8,2:7,5,2,2
chr1	64516337	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=132,142;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.135:24:10,1:11,1:13,8,1,2
chr1	64603231	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,1:1,2:0,4,0,4
chr1	64624612	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr1	64624955	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=1592,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	64624957	.	AT	CG,ACCTCAGTGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27,29;MFRL=2969,215,200;MMQ=60,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr1	64643277	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,6:0,0,8,10
chr1	64680667	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=157,138;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,1:12,2:2,21,0,3
chr1	64698411	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	64707243	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,26,1
chr1	64709891	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr1	64726414	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,2,14
chr1	65068638	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,4:0,12:0,0,4,15
chr1	65099701	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.452:20:8,5:3,2:0|1:65099701_G_GT:65099701:9,2,7,2
chr1	65099716	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:36,4:0.094:40:8,0:9,0:1|0:65099701_G_GT:65099701:24,12,4,0
chr1	65099978	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=127.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,3,34
chr1	65138787	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.317:21:8,4:4,2:13,2,6,0
chr1	65141676	.	TTAATAATAA	T,TTAATAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,32,29;MFRL=167,166,152;MMQ=60,60,60;MPOS=19,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=TAA;STR;TLOD=22.12,26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,8:0.362,0.539:16:1,5,6:0,2,2:0,1,0,15
chr1	65255077	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:11,1:8,2:12,7,2,1
chr1	65280599	.	T	TCAGAGGGCCAGGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	65311116	.	GC	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr1	65316675	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	65321388	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.456:20:7,4:4,5:4,7,3,6
chr1	65325970	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:4,8:3,4:0,7,3,9
chr1	65330744	.	G	GACAACAAGAAAATGGTAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	65855195	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,162;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:17,2,2,0
chr1	65867663	.	G	GGTGCTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=221,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	66036501	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr1	66064293	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:0,5:2,3:2,0,7,1
chr1	66074537	.	C	G	.	.	DP=127;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=138,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,6:0.055:124:56,1:62,5:62,56,4,2
chr1	66081738	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,1:11,1:9,8,1,1
chr1	66732445	.	ATTC	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=112,95;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.424:24:6,8:7,2:3,11,2,8
chr1	66732529	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	66829262	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=100.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,13:0,0,5,24
chr1	67098664	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr1	67099952	.	TATCCTTGCTGC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=93,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr1	67101778	.	AAC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	67101802	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	67109410	.	T	TTGTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TG;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.352:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr1	67126114	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:5,2:2,3:7,1,4,1
chr1	67136610	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,3:3,5:3,4,6,2
chr1	67142852	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr1	67145322	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=217,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,12:1,7:1,0,19,2
chr1	67149706	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	67154730	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.815:16:2,7:1,6:3,0,13,0
chr1	67155862	.	TCTC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=115.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,21,7
chr1	67160981	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr1	67194911	.	TTC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=85.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,11:0,10:0,0,16,6
chr1	67396222	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	67423997	.	T	TTTCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	67425311	.	T	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=267.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,39:0,31:0,0,63,8
chr1	67425494	.	A	AT	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=67.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,29:0.837:34:1,10:2,16:0,5,0,29
chr1	67487119	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=79.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,22,0
chr1	67508080	.	CCACT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,0:0,8:0,0,2,6
chr1	67512903	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	67512920	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr1	67516191	.	G	GA	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,6:0.103:60:27,2:23,1:7,47,0,6
chr1	67558949	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.173:44:18,2:19,4:8,29,3,4
chr1	67560897	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr1	67560956	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,11:0,0,18,13
chr1	67562106	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,0,22
chr1	67568824	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	67577367	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=120.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,12:0,22:0,0,3,34
chr1	67580945	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,1:13,2:26,1,3,0
chr1	67591347	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	67591660	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	67633963	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=291,312;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	67648460	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr1	67672765	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=195,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:0,4,0,6
chr1	67721513	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,34;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:9,8,1,1
chr1	67796258	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	67878789	.	C	CT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.156:50:28,1:14,5:42,0,7,1
chr1	67890526	.	A	G	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=318.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,90:0.989:90:0,38:0,51:0,0,72,18
chr1	68151980	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=116.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,13:0,0,32,0
chr1	68152363	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	68173264	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,23,6
chr1	68613933	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,4,5
chr1	68620998	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	68905358	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.584:19:3,5:3,6:0,8,2,9
chr1	68943436	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:7,2:4,4:0|1:68943436_G_A:68943436:7,4,4,4
chr1	68943442	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:7,4:5,5:0|1:68943436_G_A:68943436:7,5,5,4
chr1	68943665	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,7:7,3:3,9,2,8
chr1	68944524	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,6,0
chr1	68944792	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:9,8:9,4:10,8,6,6
chr1	68944891	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.099:38:10,1:23,2:0|1:68944891_A_T:68944891:20,15,1,2
chr1	68944894	.	AT	GC	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:10,1:22,2:0|1:68944891_A_T:68944891:21,14,1,2
chr1	68944899	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=153,134;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:11,0:20,1:0|1:68944891_A_T:68944891:22,12,0,2
chr1	68947318	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,5:0,0,1,12
chr1	68948280	.	A	C	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,34:0.387:88:24,22:30,11:15,39,17,17
chr1	68952564	.	AACACAC	A,AACAC	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31,30;MFRL=152,173,166;MMQ=60,60,60;MPOS=11,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,17,19;RU=AC;STR;TLOD=4.19,7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,4:0.166,0.286:17:6,0,2:1,3,2:10,0,7,0
chr1	68955058	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.549:27:8,9:4,5:12,0,15,0
chr1	68960038	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.594:37:10,13:4,8:15,0,22,0
chr1	68960349	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=154,146;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.600:33:8,10:5,10:3,10,4,16
chr1	68960404	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,12:0.482:25:3,3:9,9:0|1:68960404_A_T:68960404:1,12,1,11
chr1	68960411	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:2,2:10,8:0|1:68960404_A_T:68960404:1,11,1,11
chr1	70034370	.	C	CCAGCCGCGTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.721:16:2,4:2,4:0,4,0,12
chr1	70502380	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=258,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70502380_TAA_T:70502380:0,1,0,1
chr1	70502391	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=258,181;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70502380_TAA_T:70502380:0,1,0,1
chr1	70509780	.	A	AAGAGAGAGC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:8,2:5,0:2,11,1,1
chr1	70555604	.	T	TTGAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	70614105	.	AAAAAC	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:4,2:6,2,5,0
chr1	70614132	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,239;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,2:12,0:15,4,2,0
chr1	70614427	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=218,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	70621490	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:6,10:7,7:2,11,6,11
chr1	70653068	.	A	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,27:0.406:67:19,13:21,14:6,34,3,24
chr1	70710573	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,5:4,1:0,4,0,6
chr1	70728625	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=220,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:0,0:2,0:0,2,0,2
chr1	70742532	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,35,34;MFRL=170,134,64;MMQ=60,60,60;MPOS=26,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=A;STR;TLOD=4.36,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.233,0.263:8:2,1,0:2,1,2:1,3,1,3
chr1	70820688	.	CGCA	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=143,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.054:53:24,1:20,1:31,20,0,2
chr1	70883652	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.161:22:12,3:6,0:10,9,1,2
chr1	70896165	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=213,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr1	71327936	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,1:3,0,3,0
chr1	71334870	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	71335093	.	T	TGGATGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=218,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	71437471	.	T	TA	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=97.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,39:0.591:66:14,20:11,17:9,18,7,32
chr1	71533287	.	A	T	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=142.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,51:0.508:101:28,33:19,18:31,19,33,18
chr1	71536463	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=196,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:71536463_G_C:71536463:4,0,2,0
chr1	71536466	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=196,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:71536463_G_C:71536463:4,0,2,0
chr1	71537943	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.354:37:11,4:13,8:4,20,5,8
chr1	71537980	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:8,7:4,10:3,9,2,15
chr1	71542667	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:7,2:0,14,0,2
chr1	71544069	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=163,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.443:18:6,3:4,3:0|1:71544069_G_A:71544069:9,1,8,0
chr1	71544079	.	CAAG	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,11:0.546:20:4,7:3,4:1|0:71544069_G_A:71544069:9,0,10,1
chr1	72058405	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,3:0,0,9,0
chr1	72242039	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	74507711	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	74575182	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.954:39:1,18:0,20:0,1,14,24
chr1	74575212	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:11,2:11,2:7,20,3,1
chr1	74610233	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.314:13:0,0:8,2:2,7,1,3
chr1	74646514	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr1	74701295	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	74737478	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,229;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr1	74819077	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,4,16
chr1	74901739	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.769:6:0,2:1,2:1,0,4,1
chr1	74946718	.	A	ATTAAGTGAGGGAATGGGAAGAAAAAAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	75006027	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,3,19
chr1	75006076	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr1	75036783	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	75036812	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	75037541	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75037541_A_G:75037541:0,1,0,1
chr1	75037546	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75037541_A_G:75037541:0,1,0,1
chr1	75038228	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,14,12
chr1	75100218	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr1	75172756	.	TA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.162:33:14,3:8,2:17,11,3,2
chr1	75199152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr1	75214390	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,19:0.431:44:12,11:13,7:16,9,15,4
chr1	75614380	.	CTT	C,CT	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=31,35,32;MFRL=128,168,146;MMQ=60,60,60;MPOS=28,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.59,120.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,5,56:0.065,0.750:76:6,3,23:5,2,22:6,9,21,40
chr1	75626420	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	75669619	.	T	TTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTG;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	75679569	.	CT	C,CTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,34,33;MFRL=152,132,212;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=8.04,6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,5,5:0.170,0.167:31:12,1,3:9,4,1:13,8,6,4
chr1	75680433	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=189,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr1	75681351	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,21,0
chr1	75684529	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	75685403	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,5:6,3:14,0,8,0
chr1	75702629	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=145,131;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:12,4:15,0:18,10,4,0
chr1	75766186	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	76190569	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,8:0,17:0,0,4,21
chr1	76194054	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr1	76194229	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr1	76198436	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=201.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,33:0,21:0,0,21,36
chr1	76199345	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=106.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,12:0,17:0,0,3,26
chr1	76205643	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=206.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,23:0,39:0,0,48,14
chr1	76216330	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	76252011	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=170.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,26:0,25:0,0,28,25
chr1	76255883	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	76259677	.	ACCTAAGAGTGAGACTTAACCCACTTTTAAATTGTTCT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.929:10:0,9:0,1:0,0,10,0
chr1	76269372	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	76276353	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr1	76333163	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,12:0,0,21,8
chr1	76346920	.	C	CAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr1	76378360	.	T	TA,TATA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30,32;MFRL=0,160,81;MMQ=60,60,51;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.56,4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,11,2:0.788,0.173:13:0,5,1:0,6,1:0,0,12,1
chr1	76378362	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=88.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,9:0,0,18,4
chr1	76387763	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=125,28;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:0|1:76387763_A_T:76387763:5,4,1,1
chr1	76387768	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=125,28;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,0:3,2:0|1:76387763_A_T:76387763:6,5,1,1
chr1	76387770	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=127,28;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,0:3,1:0|1:76387763_A_T:76387763:5,5,1,1
chr1	77042635	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=98,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	77334268	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.550:43:9,8:10,13:9,10,8,16
chr1	77334292	.	G	GCAGCAA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:7,4:6,4:5,8,0,8
chr1	77515954	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:0|1:77515954_A_T:77515954:9,8,1,1
chr1	77515962	.	C	CTGG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:77515954_A_T:77515954:9,9,1,1
chr1	77620035	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr1	77627096	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,13:0,0,6,19
chr1	77779629	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1,3,0,1
chr1	77883465	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:77883465_T_C:77883465:0,3,0,1
chr1	77883470	.	AAA	TCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:77883465_T_C:77883465:0,3,0,1
chr1	77949160	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	77987583	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:9,3:16,0:15,12,1,2
chr1	78001764	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,1:5,2:1,6,0,3
chr1	78024345	.	C	CTAT	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=290.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,32:0,38:0,0,31,40
chr1	78033981	.	AAAATG	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATG;STR;TLOD=209.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.983:49:0,23:0,25:0,0,40,9
chr1	78045369	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr1	78046606	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,164;MMQ=60,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,2:7,0:9,0,2,0
chr1	78098403	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=124.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,22:0,12:0,0,18,17
chr1	78105067	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=193,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	78184423	.	T	TG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.127:21:11,1:7,1:0|1:78184423_T_TG:78184423:0,19,0,2
chr1	78184428	.	A	AC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:0|1:78184423_T_TG:78184423:0,19,0,2
chr1	78184429	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,1:0|1:78184423_T_TG:78184423:0,19,0,2
chr1	78281002	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr1	78383467	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,4,21
chr1	78391020	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,0,19
chr1	78392479	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,30:0.428:70:15,11:25,18:29,11,19,11
chr1	78399207	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=226.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,32:0,29:0,0,5,58
chr1	78430689	.	A	AG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=119.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,14:0,0,19,14
chr1	78432647	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:12,1:6,2:16,2,3,1
chr1	78435701	.	TA	T,TAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,25,32;MFRL=163,165,146;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.54,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,4,5:0.104,0.131:39:11,3,1:7,0,3:2,28,1,8
chr1	78444781	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=213,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	78471060	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.923:11:0,3:1,6:1,0,0,10
chr1	78478675	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,12,3
chr1	78481640	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	78601465	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.938:12:0,4:0,6:0,0,4,8
chr1	78958633	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:10,0:14,3:0|1:78958633_T_C:78958633:13,11,0,3
chr1	78958637	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:11,0:12,2:0|1:78958633_T_C:78958633:12,12,0,3
chr1	79094081	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,3,11
chr1	79094593	.	A	G	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=236.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,33:0,33:0,0,45,22
chr1	79095339	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0,0,16,0
chr1	79095834	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr1	79102726	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,7:4,6:3,5,7,6
chr1	79106899	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	79107372	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,8:5,6:5,3,10,4
chr1	79115905	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.373:49:13,10:18,8:20,11,18,0
chr1	79124961	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:5,1,7,1
chr1	79128320	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	79128570	.	G	GT	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=377.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,99:0.990:99:0,52:0,43:0,0,54,45
chr1	79128655	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.115:50:21,1:24,4:3,42,0,5
chr1	79129514	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,0:9,3:1,14,1,2
chr1	79355596	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=90.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,30:0.527:57:8,12:18,17:4,23,2,28
chr1	79358743	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.560:7:2,1:1,2:2,1,2,2
chr1	79383458	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:12,6:9,10:6,15,4,12
chr1	79386139	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	79387242	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:7,1:10,1,3,0
chr1	79401927	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:3,5:0,5:3,0,9,1
chr1	79403450	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:8,1,7,0
chr1	79403751	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:10,7:6,9:13,3,12,4
chr1	79404779	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,243;MMQ=60,59;MPOS=-42;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:2,7:6,5:8,0,13,0
chr1	79411951	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,3:8,6:8,5,8,1
chr1	79472244	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.441:34:11,8:7,6:14,5,11,4
chr1	82302600	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:2,4:4,4:5,1,7,1
chr1	82372890	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:6,14,0,2
chr1	82402364	.	TAATC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,1,1
chr1	82402597	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr1	82409541	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:82409541_C_A:82409541:0,3,0,1
chr1	82409543	.	T	TTTATTTTTGAGATGGGATTTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:82409541_C_A:82409541:0,3,0,1
chr1	82415814	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr1	82416220	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,5:5,5:2,10,0,10
chr1	82417552	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,2:4,0,4,0
chr1	82437670	.	ATTTGT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:5,2:3,5:0|1:82437670_ATTTGT_A:82437670:0,8,1,6
chr1	82437682	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.501:14:4,2:3,4:0|1:82437670_ATTTGT_A:82437670:0,7,1,6
chr1	82452565	.	GT	G,GTT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=35,35,35;MFRL=145,151,129;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.52,4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,8,5:0.215,0.135:37:12,6,3:12,2,1:22,2,12,1
chr1	84383239	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,32;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:13,0,2,0
chr1	84394792	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.448:29:8,8:8,4:11,5,10,3
chr1	84641416	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.539:18:2,6:6,4:7,1,6,4
chr1	84765340	.	G	GTA,GTATA	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=32,31,33;MFRL=166,141,138;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=TA;STR;TLOD=9.94,21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,10:0.148,0.345:28:4,3,3:5,2,6:0,13,0,15
chr1	84765359	.	T	TA	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.131:42:17,2:19,3:2,35,0,5
chr1	84765360	.	T	A,TA,TATA	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,33,32,31;MFRL=149,181,199,130;MMQ=60,60,60,40;MPOS=27,28,28;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.24,3.67,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:27,2,2,2:0.113,0.099,0.099:33:11,1,1,1:15,1,1,1:0,27,0,6
chr1	84791239	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	84867563	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:6,0:4,3:0|1:84867563_C_T:84867563:6,4,3,1
chr1	84867569	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.276:16:5,0:6,2:0|1:84867563_C_T:84867563:7,5,3,1
chr1	84867781	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=116,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:84867781_G_C:84867781:0,1,0,1
chr1	84867785	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=116,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:84867781_G_C:84867781:0,1,0,1
chr1	84867788	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=116,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:84867781_G_C:84867781:0,1,0,1
chr1	84876501	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,0:6,5:10,4,5,0
chr1	84946745	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr1	84956161	.	C	CT	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,8:0.118:66:32,3:21,5:7,51,1,7
chr1	84971623	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=11,28;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:1,2:6,0,2,0
chr1	84971626	.	AG	CC,CG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,25,13;MFRL=219,179,155;MMQ=60,60,60;MPOS=6,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.07,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.291,0.238:8:1,0,0:2,2,0:4,0,4,0
chr1	84971629	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=21,10;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.247:9:1,0:4,0:7,0,2,0
chr1	84971646	.	CCCG	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCG;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:6,2:14,0,2,0
chr1	84986213	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr1	85018771	.	G	GA	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,8:0.100:68:31,1:28,6:45,15,6,2
chr1	85029376	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,23:0.407:57:18,12:16,11:31,3,21,2
chr1	85096589	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=156,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:3,2:0,5,0,3
chr1	85096592	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=226,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr1	85096613	.	G	GCATCTGGGC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,12;MFRL=191,137;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:85096613_G_GCATCTGGGC:85096613:0,3,0,1
chr1	85096616	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=191,137;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:85096613_G_GCATCTGGGC:85096613:0,3,0,1
chr1	85096617	.	C	CCTCCTTGA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=191,137;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:85096613_G_GCATCTGGGC:85096613:0,3,0,1
chr1	85096621	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=191,137;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:85096613_G_GCATCTGGGC:85096613:0,3,0,1
chr1	85096623	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=191,137;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:85096613_G_GCATCTGGGC:85096613:0,3,0,1
chr1	85097247	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,4:4,3:8,2,6,1
chr1	85128280	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:7,3:1,2:1,7,0,5
chr1	85131982	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=235,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:0,4,0,7
chr1	85135663	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85135663_A_T:85135663:0,0,0,1
chr1	85135664	.	T	TGCTTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85135663_A_T:85135663:0,0,0,1
chr1	85135665	.	A	AGCCCAGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85135663_A_T:85135663:0,0,0,1
chr1	85331808	.	G	GAGA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=64.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.441:41:4,5:19,11:3,20,3,15
chr1	85488154	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	85506668	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=139,73;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:14,3:14,0:19,10,2,1
chr1	85537522	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr1	85538655	.	A	G,AG,AAAG	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=22,20,23,33;MFRL=239,139,157,158;MMQ=40,40,40,40;MPOS=14,23,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=8.88,16.43,4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,5,9,4:0.206,0.421,0.309:22:1,2,4,1:1,1,3,2:3,1,16,2
chr1	85547945	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr1	85550156	.	A	AAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,5:1,2:1,0,7,0
chr1	85551468	.	A	ATCAGTTTTTCT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=120.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,9:0,0,26,1
chr1	85559118	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:5,0,5,0
chr1	85560313	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=81,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	85561546	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,4,1
chr1	85563444	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=217,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:0,1:2,2:0,6,0,3
chr1	85564138	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr1	85573705	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,4,0
chr1	85589939	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=58.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,4,14
chr1	85592126	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	85595645	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=170.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,21:0,29:0,0,42,8
chr1	85598527	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=49.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,8,9
chr1	85647713	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=117.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,17:0,0,27,5
chr1	85648905	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,3,13
chr1	85724409	.	T	TGATTAGATTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	85724438	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	85741921	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr1	85787114	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0|1:85787114_A_T:85787114:0,0,13,3
chr1	85787118	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0|1:85787114_A_T:85787114:0,0,13,3
chr1	85787323	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	85787334	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	85790633	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	85790634	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:85790634_TG_T:85790634:0,3,0,1
chr1	85790638	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:85790634_TG_T:85790634:0,3,0,1
chr1	85816134	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,13:0,0,15,4
chr1	85817295	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,1,18
chr1	86047311	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=100,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:3,11:5,6:0,8,2,15
chr1	86146672	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	86167957	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=128.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,19:0,0,3,32
chr1	86171692	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:2,3:1,5:4,1,8,0
chr1	86203249	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:11,1:7,2:0,20,0,3
chr1	86203277	.	AT	GC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=195,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.181:16:11,3:2,0:0,13,0,3
chr1	86210343	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=119,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,0:4,5:4,3,5,0
chr1	86210546	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr1	86241399	.	GA	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.146:36:12,1:7,4:2,29,0,5
chr1	86246849	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	86247008	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:2,1:0|1:86247008_A_AG:86247008:0,3,0,1
chr1	86247011	.	A	AGAAAGAAAAAGAAAAGTTAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:86247008_A_AG:86247008:0,3,0,1
chr1	86249063	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	86249357	.	TG	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	86249911	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr1	86252025	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr1	86313536	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	86334316	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:3,4:5,4:4,4,3,6
chr1	86340262	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,29:0.647:44:11,12:4,12:13,2,27,2
chr1	86340880	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=128,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,2:2,5:2,0,7,0
chr1	86340892	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,0:6,4:7,0,3,1
chr1	86355414	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,36;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,0:1,2:0,5,0,2
chr1	86361802	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,5:6,2:0,10,1,6
chr1	86372839	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.674:13:1,5:3,2:3,1,5,4
chr1	86377028	.	C	T	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=110.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,39:0.430:91:23,16:29,23:39,13,32,7
chr1	86435957	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=30,32,31,31;MFRL=127,141,151,147;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,24,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.24,13.02,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:38,4,11,5:0.068,0.161,0.099:58:17,1,6,0:13,3,4,5:6,32,0,20
chr1	86453265	.	CTCT	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCT;STR;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:30,1:16,2:46,6,3,1
chr1	86453409	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,26:0.538:48:10,15:12,11:2,20,3,23
chr1	86488259	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,2:0.050:58:33,1:23,1:25,31,0,2
chr1	86554813	.	G	GA,GAA	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=33,34,33;MFRL=99,139,48;MMQ=60,60,56;MPOS=16,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=A;STR;TLOD=130.13,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,54,4:0.849,0.074:63:2,29,3:3,18,1:4,1,51,7
chr1	86554821	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=325.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,80:0.988:81:0,44:0,34:1,0,64,16
chr1	86554830	.	A	G	.	.	DP=111;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,11:0.109:108:55,10:41,1:75,22,11,0
chr1	86591141	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:7,3:2,6:6,3,9,1
chr1	86611702	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:9,8:8,8:17,0,16,0
chr1	86621992	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.961:24:0,9:0,12:0|1:86621992_C_A:86621992:0,0,16,8
chr1	86621998	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.593:25:2,7:7,8:0|1:86621992_C_A:86621992:5,5,12,3
chr1	86821194	.	A	ACT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr1	86824675	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=191,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:7,2:0,20,0,2
chr1	86848756	.	A	G	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,5:0.075:78:30,5:41,0:45,28,5,0
chr1	86890163	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:86890163_C_CT:86890163:0,1,0,1
chr1	86890166	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86890163_C_CT:86890163:0,1,0,1
chr1	86890931	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.484:35:7,8:11,8:18,0,17,0
chr1	86896541	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,34:0.435:77:18,13:25,16:30,13,19,15
chr1	86897973	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:5,0,8,0
chr1	86906042	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=187,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:86906042_A_T:86906042:0,4,0,1
chr1	86906045	.	T	TTAAAACA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=205,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:86906042_A_T:86906042:0,4,0,1
chr1	86906055	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	86918965	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	86919011	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr1	86939390	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=104.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,23,6
chr1	86959014	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	86959796	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	87036746	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,1:5,6:6,6,3,4
chr1	87045896	.	TCCTACA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.377:30:12,2:3,8:9,10,7,4
chr1	87100226	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	87101245	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:15,9:6,8:17,5,14,3
chr1	87200729	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:4,7:3,5:7,0,10,2
chr1	87333609	.	AAATTTAAATTGAT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:87333609_AAATTTAAATTGAT_A:87333609:0,0,1,0
chr1	87333626	.	TAATATTTGCACATGTTTATGGGGGAA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=95,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:87333609_AAATTTAAATTGAT_A:87333609:2,0,1,0
chr1	87333656	.	ATTTAT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=157,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:87333609_AAATTTAAATTGAT_A:87333609:4,0,1,0
chr1	87458695	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,3:0,0,10,5
chr1	87549858	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=86.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,22,4
chr1	87563668	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr1	87570398	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	87633761	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=73,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr1	89236029	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.970:32:0,19:0,12:0,0,25,7
chr1	89237662	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=251,400;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	89318880	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,8:8,4:10,2,11,1
chr1	89420722	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=246,160;MMQ=58,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:89420722_T_G:89420722:2,0,1,0
chr1	89420729	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=219,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:89420722_T_G:89420722:3,0,1,0
chr1	89430420	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:4,6:11,5:15,0,11,0
chr1	89448539	.	C	G	.	.	DP=106;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=145,194;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,3:0.038:104:48,2:51,1:0|1:89448539_C_G:89448539:45,56,3,0
chr1	89448556	.	A	G	.	.	DP=102;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=143,185;MMQ=60,26;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,4:0.048:102:45,3:44,1:0|1:89448539_C_G:89448539:43,55,4,0
chr1	89448571	.	A	G	.	.	DP=105;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=146,185;MMQ=60,26;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,4:0.048:102:46,3:50,1:0|1:89448539_C_G:89448539:39,59,4,0
chr1	89448896	.	A	T	.	.	DP=81;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=152,225;MMQ=52,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,6:0.085:80:32,3:39,3:0|1:89448896_A_T:89448896:53,21,5,1
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chr1	89520643	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=221,209;MMQ=27,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:0|1:89520636_G_A:89520636:5,1,3,2
chr1	89522512	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:6,5:10,9:13,3,11,3
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chr1	89582976	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=197,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:0,7,0,3
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chr1	89597755	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	89614879	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	89615979	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,9:0,13:0,0,15,7
chr1	89618032	.	C	CGTGCCCCAGACCTGA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:16,2:8,0:10,14,0,2
chr1	89618479	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=201,112;MMQ=60,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:0,1:1,0:0|1:89618479_A_AG:89618479:0,2,0,1
chr1	89618480	.	A	AGAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=201,112;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:0,1:1,0:0|1:89618479_A_AG:89618479:0,2,0,1
chr1	89618483	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=201,112;MMQ=60,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:89618479_A_AG:89618479:0,2,0,1
chr1	89618485	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=201,112;MMQ=60,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:89618479_A_AG:89618479:0,2,0,1
chr1	89650850	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:1,6:3,9:4,0,15,0
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chr1	89652078	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,7:0.178:43:22,1:11,5:0|1:89652071_TC_CT:89652071:22,14,5,2
chr1	89652087	.	CC	TG	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=128,182;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,7:0.163:47:22,3:15,4:0|1:89652071_TC_CT:89652071:25,15,4,3
chr1	89652090	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=128,184;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,8:0.180:48:22,3:14,3:0|1:89652071_TC_CT:89652071:25,15,4,4
chr1	89652094	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=125,167;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,9:0.208:46:19,4:15,3:0|1:89652071_TC_CT:89652071:22,15,4,5
chr1	89652097	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=130,179;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,8:0.184:47:20,5:16,1:0|1:89652097_C_T:89652097:23,16,4,4
chr1	89652102	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=125,167;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,9:0.200:48:22,5:17,3:0|1:89652097_C_T:89652097:22,17,4,5
chr1	89652846	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,1:5,4:1,10,0,6
chr1	89659145	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:3,3:6,1:1,8,0,5
chr1	89726592	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=242,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	89730723	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	89731959	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:5,7:7,9:11,1,16,0
chr1	89733273	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,4:6,2:0,8,1,5
chr1	89845926	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=57.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,11,9
chr1	89847411	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,15:0,17:0,0,14,21
chr1	89847425	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=198,154;MMQ=53,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:5,11:10,10:6,9,9,12
chr1	89847444	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,50;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,15:0,0,12,17
chr1	89849201	.	C	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=249.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,73:0.987:73:0,35:0,38:0,0,47,26
chr1	89849350	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=177.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,13:0,39:0,0,14,38
chr1	89849574	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,11:0,0,14,0
chr1	90058242	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,37;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr1	90179284	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.067:43:23,0:16,2:23,18,0,2
chr1	90401088	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:12,6,2,0
chr1	90401297	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:1,4,1,5
chr1	90478822	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,5:0.067:87:36,0:44,5:8,74,0,5
chr1	90493026	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,32:0.460:70:21,17:15,15:20,18,20,12
chr1	91177998	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:8,4:10,0:10,8,4,0
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chr1	91383683	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=136,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:14,0:20,2:0|1:91383670_T_A:91383670:12,23,1,1
chr1	91447985	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	91728202	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,1,27
chr1	91731756	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	91739208	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	91739414	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	91739457	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=206,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	91781304	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,17,0
chr1	91781576	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:13,6:5,6:9,9,3,9
chr1	91782011	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.511:45:8,13:14,10:4,18,4,19
chr1	91841301	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=64.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,15:0,3:0,0,3,15
chr1	91844815	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:0,4,0,8
chr1	91846362	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=205,221;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr1	91846374	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	91846595	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=49.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,7:0,0,0,14
chr1	91846654	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	91850826	.	C	CA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.549:38:9,12:8,8:2,15,4,17
chr1	91973557	.	T	G	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=38,33;MFRL=112,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=347.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,97:0.981:98:0,45:1,51:0,1,12,85
chr1	91974034	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:7,10:4,8:1,10,0,18
chr1	91978963	.	T	TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=A;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:4,1:0,7,0,3
chr1	91980649	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	91989572	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,16:0,8:0,0,24,0
chr1	92195601	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	92200593	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	92442039	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.321:7:4,1:1,0:0,5,0,2
chr1	92446112	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	92446398	.	T	A	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=319.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,91:0.990:91:0,39:0,51:0,0,33,58
chr1	92447004	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=191.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,29:0,23:0,0,3,49
chr1	92447227	.	GAGC	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AGC;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.072:52:21,0:20,3:18,31,1,2
chr1	92457969	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,18;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,0:0|1:92457969_CAAA_C:92457969:0,2,0,1
chr1	92457980	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:92457969_CAAA_C:92457969:0,4,0,1
chr1	92457983	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1|0:92457969_CAAA_C:92457969:0,4,0,1
chr1	92457985	.	A	ATAATAATT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:92457969_CAAA_C:92457969:0,3,0,1
chr1	92457987	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=215,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:92457969_CAAA_C:92457969:0,3,0,1
chr1	92457989	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,26;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:92457969_CAAA_C:92457969:0,3,0,1
chr1	92568263	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,16:0,5:0,0,6,15
chr1	92606870	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,1:5,1:0,12,0,2
chr1	92646665	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,88;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:19,3:21,0:18,23,3,0
chr1	92649335	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	92709753	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:11,0:15,8,2,0
chr1	92711312	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,73;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:0,19,2,0
chr1	92712266	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,3:0,6:0,0,1,10
chr1	92754806	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:92754806_T_TTC:92754806:0,0,0,1
chr1	92754808	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:92754806_T_TTC:92754806:0,0,0,1
chr1	92763091	.	CA	C,CAA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,35,32;MFRL=158,147,134;MMQ=60,60,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=14.59,9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,9,5:0.242,0.155:36:10,1,2:9,6,1:4,18,4,10
chr1	92852422	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=222,222;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:92852422_A_T:92852422:1,0,1,0
chr1	92852424	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=222,222;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92852422_A_T:92852422:1,0,1,0
chr1	92852430	.	TGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=222,222;MMQ=60,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92852422_A_T:92852422:1,0,1,0
chr1	92944314	.	CAG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=AG;STR;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.777:6:0,2:0,0:0,1,0,5
chr1	92979512	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=119,42;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:6,2:13,0:12,8,1,1
chr1	93071048	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	93131557	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:4,6,1,1
chr1	93159821	.	CA	C,CAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=141,133,123;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.06,7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,5,5:0.168,0.178:31:10,2,3:7,3,2:15,6,9,1
chr1	93160002	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr1	93163633	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	93167610	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=96.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,29,0
chr1	93167854	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr1	93308853	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,7:0,0,25,0
chr1	93309503	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:14,6,2,0
chr1	93426866	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,21,0
chr1	93426869	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,9:0,11:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,23,0
chr1	93426874	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,10:0,11:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,22,0
chr1	93545157	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,1,18
chr1	93580992	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,12:0,0,22,8
chr1	93581024	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=161.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,22:0,21:0,0,29,15
chr1	93583818	.	CTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32,33;MFRL=187,209,164;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=T;STR;TLOD=4.01,20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,11:0.296,0.573:19:1,3,7:1,2,4:2,0,17,0
chr1	93583850	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=13,13;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.173:35:7,0:6,0:28,0,7,0
chr1	93584870	.	CT	C	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,13:0.219:58:22,5:17,8:39,6,10,3
chr1	93584885	.	C	G	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,15:0.242:58:13,2:13,0:24,19,15,0
chr1	93602194	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,13:0,0,25,3
chr1	93620487	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:1,12,0,2
chr1	93621483	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,5:0,0,15,0
chr1	93648816	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	93649732	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	93659350	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=129.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,12:0,26:0,0,0,38
chr1	93676314	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=95.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,20:0,11:0,0,25,7
chr1	93676578	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=157,181;MMQ=50,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	93687528	.	CT	C,CTT	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=161,144,170;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.50,6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,8,6:0.164,0.135:48:13,4,5:15,3,0:4,30,1,13
chr1	93691855	.	GT	G,GTT,GTTTTTTTTTTT	.	.	DP=88;ECNT=3;MBQ=35,34,35,36;MFRL=153,124,142,104;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,23,7;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,15,17,26;RU=T;STR;TLOD=13.94,15.22,6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:22,12,15,5:0.183,0.280,0.099:54:7,8,6,1:14,3,7,1:21,1,25,7
chr1	93691873	.	C	G	.	.	DP=113;ECNT=3;MBQ=20,18;MFRL=86,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,31:0.288:102:24,2:24,0:27,44,30,1
chr1	93691885	.	C	G	.	.	DP=131;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=93,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,16:0.105:125:44,0:35,0:39,70,16,0
chr1	93697961	.	GAT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:20,1,2,0
chr1	93711782	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=156.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,23:0,24:0,0,9,38
chr1	93989786	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:16,3:24,0:34,6,3,0
chr1	93998640	.	AT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=126.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,19:0,19:0,0,7,31
chr1	94018110	.	T	TTTGTTTTGTTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,0:0,0:0|1:94018110_T_TTTGTTTTGTTTG:94018110:0,1,0,1
chr1	94018114	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:94018110_T_TTTGTTTTGTTTG:94018110:0,1,0,1
chr1	94028055	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	94041643	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:22,0:18,3:18,22,0,3
chr1	94312482	.	T	TC	.	.	DP=168;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=533.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,157:0.994:157:0,80:0,75:0,0,72,85
chr1	94312528	.	G	GC	.	.	DP=68;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=267.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,62:0.985:62:0,26:0,33:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,3,59
chr1	94312533	.	G	GC	.	.	DP=63;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=277.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,63:0.985:63:0,26:0,29:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,2,61
chr1	94312542	.	G	GC	.	.	DP=59;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=263.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,59:0.984:59:0,23:0,28:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,59
chr1	94312544	.	G	GC	.	.	DP=58;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=259.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,58:0.983:58:0,24:0,27:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,58
chr1	94312554	.	A	AG	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=232.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.981:52:0,19:0,29:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,52
chr1	94312559	.	CGGCTGGGTCGGGCG	C	.	.	DP=50;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=223.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,20:0,27:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,50
chr1	94312576	.	G	GC	.	.	DP=50;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=223.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,18:0,26:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,50
chr1	94335194	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr1	94341137	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr1	94473802	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,31:0.534:58:8,10:18,20:14,13,14,17
chr1	94476991	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.926:13:0,1:1,11:0,1,0,12
chr1	94487285	.	AAC	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=190.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,24:0,20:0,0,14,30
chr1	94495010	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=164,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:4,0,1,0
chr1	94495930	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	94496602	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=123,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,7:6,2:5,5,7,2
chr1	94502188	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,0:8,2:18,0,2,0
chr1	94502200	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:18,0,2,0
chr1	94528062	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=36,33;MFRL=232,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:0,1,3,0
chr1	94528068	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:1,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:1,1,3,0
chr1	94528072	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=30,35;MFRL=162,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:3,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:6,1,2,0
chr1	94528078	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=29,21;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:5,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:6,2,2,0
chr1	94528080	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:6,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:6,2,2,0
chr1	94528082	.	CAG	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=33,24;MFRL=140,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,1:6,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:8,2,2,0
chr1	94528086	.	A	AACCCCC	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=29,13;MFRL=140,61;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:8,2,2,0
chr1	94544805	.	T	TCA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=CA;STR;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.479:27:9,9:5,2:14,0,11,2
chr1	94549029	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:3,3:0,1:0,3,0,4
chr1	94549083	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	94568491	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr1	94574053	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	94576968	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,3:5,0:6,2,2,1
chr1	94578656	.	GTGGT	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,1:13,1:0|1:94578656_GTGGT_G:94578656:3,22,0,2
chr1	94578662	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,1:12,1:0|1:94578656_GTGGT_G:94578656:2,22,0,2
chr1	94578664	.	AAGAG	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,1:12,1:0|1:94578656_GTGGT_G:94578656:0,22,0,2
chr1	94639337	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,307;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	94667430	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,1:0,0,0,6
chr1	94668046	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	94674295	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=185,136;MMQ=60,38;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,2:15,0:25,0,2,0
chr1	94674296	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,2:13,0:25,0,2,0
chr1	94674306	.	ACC	GTG	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=163,111;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:7,1:11,0:27,0,1,1
chr1	94674311	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=177,111;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:10,2:12,0:25,0,1,1
chr1	94674723	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,2:0,0,7,0
chr1	94674726	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr1	94924046	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=198,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr1	94941376	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,12:0,0,0,26
chr1	94944156	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:31,1:15,2:1,46,0,3
chr1	94964139	.	AT	A,ATT	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,31,32;MFRL=171,162,165;MMQ=60,60,60;MPOS=13,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=10.57,4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,6,5:0.279,0.237:21:6,5,2:4,1,3:10,0,10,1
chr1	94964155	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=18,14;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.354:34:5,4:1,1:16,6,12,0
chr1	94964171	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.132:44:17,0:10,0:26,12,6,0
chr1	94980671	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0,0,18,2
chr1	95286658	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:7,6:9,6:2,14,0,12
chr1	95286675	.	GTCCCAAATGTAAA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:6,4:6,3:1,11,0,7
chr1	95290003	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=193,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:7,0,4,0
chr1	95294246	.	A	AATCTTTAGACAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	95305440	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=108,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:5,8:2,6:6,1,12,2
chr1	95330372	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,23:0.691:33:4,11:5,11:6,4,13,10
chr1	95332864	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.705:25:2,6:5,12:6,1,12,6
chr1	95333068	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	95358096	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:0,7,1,5
chr1	95365129	.	CACA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:0,13,0,2
chr1	95367136	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	95367649	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr1	95367888	.	T	TCACCACTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:95367888_T_TCACCACTGC:95367888:0,0,0,1
chr1	95367893	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:95367888_T_TCACCACTGC:95367888:0,0,0,1
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chr1	97250520	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
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chr1	97981242	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:3,0,5,0
chr1	98386377	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=195,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.383:8:1,0:1,0:0|1:98386377_A_C:98386377:4,1,3,0
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chr1	98386392	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,19;MFRL=153,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,1:1,0:0|1:98386377_A_C:98386377:6,3,2,0
chr1	98511780	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:11,3:8,2:0|1:98511780_T_C:98511780:0,20,2,3
chr1	98511783	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:10,2:9,2:0|1:98511780_T_C:98511780:0,19,2,3
chr1	99150635	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=80.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,15:0,0,3,20
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chr1	99358542	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:3,6:3,6:5,1,9,3
chr1	99358761	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=72,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:0,4,0,7
chr1	99387628	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:0,7,1,1
chr1	99730100	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:3,1,3,0
chr1	100133258	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=121,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,2:0.039:74:25,0:40,1:0|1:100133258_G_A:100133258:31,41,0,2
chr1	100133260	.	G	T	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=120,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,2:0.039:75:25,0:39,2:0|1:100133258_G_A:100133258:32,41,0,2
chr1	100133262	.	TG	CA	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=121,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,2:0.040:72:23,0:41,2:0|1:100133258_G_A:100133258:30,40,0,2
chr1	100152443	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=186.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,24:0,26:0,0,36,14
chr1	100154899	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:3,5:3,6:3,4,6,5
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chr1	100206292	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=146,166;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,2:12,2:18,0,4,0
chr1	100206299	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=146,123;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,2:15,0:22,0,2,0
chr1	100206317	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=145,123;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:15,2:21,0:28,12,2,1
chr1	100206324	.	C	CT	.	.	DP=60;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=136,123;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,3:0.059:57:16,3:24,0:0|1:100206324_C_CT:100206324:34,20,2,1
chr1	100206325	.	AGAG	A	.	.	DP=61;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=134,123;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.060:56:19,3:26,0:0|1:100206324_C_CT:100206324:33,20,2,1
chr1	100316765	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr1	100329889	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	100330237	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	100335883	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,13,1
chr1	100340225	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	100342227	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr1	100343153	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	100345409	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	100346741	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=108.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,20:0,0,11,21
chr1	100353675	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=51,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:1,0,3,7
chr1	100357141	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=93.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,15:0,0,22,7
chr1	100358200	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr1	100366446	.	GTT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.909:6:0,1:0,3:0,0,0,6
chr1	100376448	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,11:0,27:0|1:100376448_G_A:100376448:0,0,1,38
chr1	100376456	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=145.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,11:0,21:0|1:100376448_G_A:100376448:0,0,0,35
chr1	100381109	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.935:10:0,3:0,4:0,0,0,10
chr1	100381869	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=83.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,24,0
chr1	100480759	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,14;MFRL=162,177;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:100480759_G_T:100480759:3,0,1,0
chr1	100480765	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=161,170;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:0,0:3,0:0|1:100480759_G_T:100480759:3,0,2,0
chr1	100533960	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr1	100542702	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,31,35;MFRL=141,148,185;MMQ=60,60,60;MPOS=5,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=T;STR;TLOD=5.15,7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,3,4:0.140,0.151:25:10,0,2:6,3,2:17,1,7,0
chr1	100542718	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=20,10;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.376:40:3,0:10,0:16,8,16,0
chr1	100572364	.	CAT	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=140,156;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:8,1:21,1:0|1:100572364_CAT_C:100572364:33,0,2,0
chr1	100572367	.	G	GCA	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=140,156;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.080:35:8,1:25,1:0|1:100572364_CAT_C:100572364:33,0,2,0
chr1	100572385	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=140,158;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.054:53:14,2:37,0:50,1,2,0
chr1	100572613	.	GTAT	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TAT;STR;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.524:23:8,4:3,8:0,11,0,12
chr1	100573293	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,0:12,2:11,16,0,2
chr1	100588105	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,19;MFRL=154,227;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=21,14;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,0:0,0:0,2,0,1
chr1	100598866	.	GC	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,16:0,0,14,11
chr1	100617887	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,22,2
chr1	100661991	.	A	AGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:0,1:0,3,0,1
chr1	100671866	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:0,2:2,3:0,2,1,6
chr1	100680593	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,0:0,0,0,6
chr1	100715454	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	100732238	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,13;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.539:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr1	100733207	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.889:6:0,2:0,0:0,0,0,6
chr1	100736229	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:19,2:18,1:16,21,3,0
chr1	100750733	.	AGTTTT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=92,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GTTTT;STR;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.880:18:0,4:0,11:1,1,14,2
chr1	100756884	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr1	100817438	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	100818464	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr1	100856469	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	101194965	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=181,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,1:0,1,0,4
chr1	101195012	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=205,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:101195012_A_C:101195012:0,2,0,1
chr1	101195014	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=205,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:101195012_A_C:101195012:0,2,0,1
chr1	101199979	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	101203698	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,30:0,12:0,0,29,14
chr1	101342497	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr1	101372607	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	101377845	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:0,5,1,9
chr1	101456212	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,157;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:1,7,0,2
chr1	101487373	.	AACACAC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=178,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=AC;STR;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.704:7:2,1:0,2:0,2,0,5
chr1	101706145	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:7,0:5,2:0|1:101706145_A_C:101706145:0,12,2,0
chr1	101706149	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,0:0|1:101706145_A_C:101706145:2,12,2,0
chr1	102269870	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:13,3:17,0:20,10,3,0
chr1	102271774	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,0,11
chr1	102462446	.	GTCAGT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr1	103347416	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	103354939	.	C	CTGTGTGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,18;RU=TG;STR;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,1:0,0:0,0,3,0
chr1	103356168	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	103364484	.	AT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:10,3:19,1:28,3,4,0
chr1	103379870	.	A	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,29:0.388:75:22,13:21,14:24,22,18,11
chr1	103380379	.	T	TA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.605:18:4,5:2,6:0,7,1,10
chr1	103380393	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.237:21:7,3:8,2:1,15,0,5
chr1	103381296	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:8,7:4,11:1,11,1,18
chr1	103388990	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:10,6:7,9:0,17,0,15
chr1	103400491	.	GA	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr1	103405793	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=79,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr1	103427381	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=138,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,1:4,1:6,5,2,0
chr1	103427407	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:7,5,1,2
chr1	103428389	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,1,19
chr1	103444497	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,19:0.364:53:18,10:16,9:15,19,9,10
chr1	103455217	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,0,19
chr1	103461508	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=137.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,23:0,17:0,0,19,21
chr1	103463928	.	G	GA	.	.	DP=95;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,5:0.073:69:27,1:27,0:14,50,0,5
chr1	103463976	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=132.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,20:0,16:0,0,0,36
chr1	103467615	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=105.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,10:0,20:0,0,1,29
chr1	103468123	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	103468855	.	TA	T,TAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=144,156,254;MMQ=60,60,60;MPOS=29,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.80,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,4,4:0.157,0.180:25:8,2,1:8,2,2:1,16,0,8
chr1	103471456	.	CCATCAT	C,CCAT	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,34,33;MFRL=0,134,160;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=CAT;STR;TLOD=5.00,93.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,23:0.086,0.888:25:0,1,9:0,1,11:0,0,5,20
chr1	103471734	.	A	AAAATAAAT,AAAATAAATAAAT,AAAATAAATAAATAAAT	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,31,31,31;MFRL=0,110,155,144;MMQ=60,50,40,40;MPOS=11,15,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=7,9,10,11;RU=AAAT;STR;TLOD=4.69,29.74,41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,8,11:0.083,0.391,0.508:21:0,0,6,7:0,2,1,3:0,0,7,14
chr1	103478069	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:17,0:5,2:1,22,0,2
chr1	103483514	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.600:33:11,10:2,10:0,13,0,20
chr1	103487394	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=194,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.836:16:2,9:0,5:0|1:103487394_CT_C:103487394:0,2,1,13
chr1	103487406	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=137,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.167:16:9,2:5,0:1|0:103487394_CT_C:103487394:1,13,0,2
chr1	103487408	.	T	TATTTGGGAGGG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=137,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.167:16:9,2:5,0:1|0:103487394_CT_C:103487394:1,13,0,2
chr1	103496620	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr1	103496805	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,31;MFRL=201,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,1:0,1:0,1,0,3
chr1	103496825	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:103496825_CA_C:103496825:1,2,0,1
chr1	103496831	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:103496825_CA_C:103496825:1,2,0,1
chr1	103548319	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,2:2,2:3,0,4,0
chr1	103573547	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	104094237	.	T	TAAATTAAAAAACCATACTCCCA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAATTAAAAAACCATACTCCCA;STR;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.692:15:2,3:2,2:4,0,11,0
chr1	104116312	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=114.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,41:0.468:88:30,21:16,19:39,8,33,8
chr1	104117921	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,172;MMQ=40,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,33:0.556:60:10,16:13,17:4,23,4,29
chr1	104122193	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=206,194;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:0|1:104122193_C_G:104122193:0,10,0,2
chr1	104122197	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=206,194;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:104122193_C_G:104122193:0,10,0,2
chr1	104122200	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=205,194;MMQ=60,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:5,0:0|1:104122193_C_G:104122193:0,9,0,2
chr1	107691532	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	107867384	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=132,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:10,0:11,2:0|1:107867384_C_T:107867384:9,13,1,1
chr1	107867389	.	C	CTTCCCA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=130,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:107867384_C_T:107867384:8,14,1,1
chr1	107867390	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=130,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,1:0|1:107867384_C_T:107867384:8,14,1,1
chr1	107961159	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,7:7,1:6,2,7,1
chr1	107961196	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,8:4,5:3,6,6,7
chr1	107961348	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=215,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:107961348_T_C:107961348:0,3,0,1
chr1	107961354	.	C	CAAGCAATTGATGATTCCCAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=215,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:107961348_T_C:107961348:0,3,0,1
chr1	107979445	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:2,19,0,2
chr1	108139003	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:3,5:5,5:0,8,1,9
chr1	108160260	.	GA	G,GAA	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=17,18,17;MFRL=125,151,136;MMQ=60,60,60;MPOS=21,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=40.41,6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,24,5:0.522,0.138:42:1,6,0:3,5,1:4,9,3,26
chr1	108292260	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,10:0,0,0,11
chr1	108299775	.	ATGTGTG	A,ATGTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31,30;MFRL=229,191,206;MMQ=60,54,60;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=TG;STR;TLOD=4.83,5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.333,0.406:5:0,2,1:1,0,1:1,0,4,0
chr1	108307642	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=94.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,26,1
chr1	108315305	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	108507209	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=197,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	108507541	.	GGCC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	108697655	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:23,1:8,1:23,9,1,1
chr1	108697845	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr1	108724518	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,15:0,17:0,0,29,4
chr1	108724693	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,0,19
chr1	109170710	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:19,0,2,0
chr1	109170746	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,17:0,0,28,3
chr1	109200108	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:2,9:9,6:5,6,10,5
chr1	109200292	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	109255513	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,20,5
chr1	109260357	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr1	109289236	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	109289290	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.343:29:10,4:9,4:16,3,7,3
chr1	109289371	.	GGTGGCAGAGAGGGGGCTAAAGAGCGTCGT	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,2:0.051:57:17,0:14,2:32,23,1,1
chr1	109289487	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:4,4:9,5:1,13,0,10
chr1	109299453	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.463:39:12,8:9,9:1,20,0,18
chr1	109301250	.	G	C	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=153.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,50:0.537:93:20,17:23,31:1,42,1,49
chr1	109315211	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:11,0,5,0
chr1	109321824	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,3:2,4:5,0,5,2
chr1	109325028	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,3:4,4:9,1,7,0
chr1	109325436	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:9,5:3,11:0,12,0,16
chr1	109338764	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.092:32:12,1:16,1:29,0,3,0
chr1	109338772	.	ACTGTAC	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=166,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:14,0:15,2:0|1:109338772_ACTGTAC_A:109338772:39,0,1,1
chr1	109338781	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:17,0:18,2:0|1:109338772_ACTGTAC_A:109338772:35,0,1,1
chr1	109338784	.	CAATAATAGATGTTTTTAACTAAAAAATGAATTT	C	.	.	DP=81;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=151,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,2:0.036:81:18,0:19,2:0|1:109338772_ACTGTAC_A:109338772:64,15,1,1
chr1	109339414	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.758:10:1,5:0,2:0,2,0,8
chr1	109350198	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=13,32;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.327:10:0,0:1,2:0,7,0,3
chr1	109358958	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:1,5,0,5
chr1	109363075	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=197,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	109363140	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:2,0,7,1
chr1	109366370	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:5,3:3,1:0,9,0,4
chr1	109369791	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:0|1:109369791_G_A:109369791:9,2,0,2
chr1	109369797	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:0|1:109369791_G_A:109369791:8,2,2,2
chr1	109373124	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=182,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109373124_A_C:109373124:4,0,1,0
chr1	109373127	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=182,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:109373124_A_C:109373124:4,0,1,1
chr1	109373129	.	GCCA	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=182,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:109373124_A_C:109373124:4,0,1,1
chr1	109373138	.	GACTCCAATCCACCC	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:2,0:0|1:109373124_A_C:109373124:5,0,1,1
chr1	109373155	.	GGAA	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=175,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:109373124_A_C:109373124:6,0,1,1
chr1	109373160	.	GTA	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=168,57;MMQ=60,60;MPOS=-1073741813;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:109373124_A_C:109373124:7,0,1,1
chr1	109377157	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:0,3,0,3
chr1	109377537	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:9,7:10,11:14,5,12,6
chr1	109391486	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr1	109428249	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=115,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.623:22:6,7:2,6:1,7,3,11
chr1	109456850	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=11729,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr1	109465165	.	ACTT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.395:28:10,6:6,5:7,10,5,6
chr1	109466562	.	TTTTTTTG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTTTG;STR;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:5,7:5,6:10,2,12,1
chr1	109477653	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	109482220	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr1	109482304	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:8,7:7,4:5,10,4,8
chr1	109482826	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:4,5:0,5:0,4,0,10
chr1	109483975	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,3:0,4:6,1,7,0
chr1	109486016	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,3:2,2:10,0,4,1
chr1	109486196	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=170.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,35:0,16:0,0,33,19
chr1	109486240	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=104.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,23:0,13:0,0,12,24
chr1	109493134	.	G	GTTA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTA;STR;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.941:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	109529322	.	T	TAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=126.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,14:0,0,4,25
chr1	109545046	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	109553439	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=201,246;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr1	109553450	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=246,194;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr1	109554402	.	A	ATGT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:3,1:0|1:109554402_A_ATGT:109554402:0,3,0,1
chr1	109554403	.	C	CATCTGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:109554402_A_ATGT:109554402:0,3,0,1
chr1	109554405	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:109554402_A_ATGT:109554402:0,3,0,1
chr1	109554408	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:109554402_A_ATGT:109554402:0,3,0,1
chr1	109554411	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:109554402_A_ATGT:109554402:0,3,0,1
chr1	109714488	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,1:8,1:13,7,2,0
chr1	109734157	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	109734541	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	109735504	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=147.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,19:0,23:0,0,12,30
chr1	109737314	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	109741381	.	GC	TT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=197,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.339:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	109742452	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	109742485	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	109743622	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	109773427	.	CA	C,CAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32,33;MFRL=165,196,129;MMQ=60,60,60;MPOS=4,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=9.00,4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,3:0.285,0.187:18:6,3,0:4,2,3:10,0,8,0
chr1	109773705	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.535:20:1,3:4,7:0,9,1,10
chr1	109773707	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.373:21:3,0:8,5:1,12,0,8
chr1	109773708	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.420:21:1,3:10,5:0,12,1,8
chr1	109778577	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=133,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr1	109779556	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,14:0,0,3,20
chr1	109792735	.	A	ACGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CGC;STR;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,0:0,0,6,2
chr1	109806442	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	109808329	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=53,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:2,5,4,1
chr1	109810332	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=219,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:109810332_CA_C:109810332:0,2,0,1
chr1	109810336	.	TTTGAGAACGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=211,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:109810332_CA_C:109810332:0,3,0,1
chr1	109810350	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=208,80;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:109810332_CA_C:109810332:0,2,0,1
chr1	109810352	.	C	CAGTGACTGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=208,80;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:109810332_CA_C:109810332:0,2,0,1
chr1	109812406	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,1:8,1:6,7,0,2
chr1	109813020	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:4,3:1,1:5,0,4,1
chr1	109813236	.	TTCCCAGTCTTGGGG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:0,6,2,3
chr1	109813276	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=163,98;MMQ=60,60;MPOS=-20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr1	109813510	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:1,0:3,4:4,0,4,1
chr1	109813719	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:1,4,0,3
chr1	109816176	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	109838833	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr1	109839063	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=14,31;MFRL=158,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:0,0:0,2:0,3,0,3
chr1	109839082	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,213;MMQ=48,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr1	109839392	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=118.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,14:0,22:0,0,21,16
chr1	109839575	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,1:15,1:2,19,0,2
chr1	109849424	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,21;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109849424_T_TAC:109849424:1,0,1,0
chr1	109849428	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109849424_T_TAC:109849424:1,0,1,0
chr1	109849431	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,35;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:109849424_T_TAC:109849424:1,0,1,0
chr1	109849434	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:109849424_T_TAC:109849424:1,0,1,0
chr1	109849439	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,12;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:109849424_T_TAC:109849424:1,0,1,0
chr1	109883576	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	109883598	.	C	CTACAAAAAGATTAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=206,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr1	109954610	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,2:3,0:4,11,2,0
chr1	109958035	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	110018148	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	110029309	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:12,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,16,0,2
chr1	110029310	.	A	AAC	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,2:12,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,17,0,2
chr1	110029312	.	G	GGATT	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,2:12,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,17,0,2
chr1	110029315	.	TCG	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,2:11,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,17,0,2
chr1	110029318	.	T	TCA	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:2,2:11,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,16,0,2
chr1	110029319	.	AGG	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:9,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,16,0,2
chr1	110029672	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.239:27:10,1:9,1:0|1:110029672_A_C:110029672:2,19,6,0
chr1	110029678	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.217:30:9,1:11,2:0|1:110029672_A_C:110029672:3,21,6,0
chr1	110029680	.	C	CGG	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.217:30:12,3:9,2:0|1:110029672_A_C:110029672:4,20,6,0
chr1	110029681	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.205:27:11,3:10,1:0|1:110029672_A_C:110029672:4,18,5,0
chr1	110029683	.	CAG	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=34,13;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.198:28:11,0:10,1:0|1:110029672_A_C:110029672:5,18,5,0
chr1	110050172	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:9,9,1,1
chr1	110129582	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=169,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:5,2:5,1:0,10,0,3
chr1	110153005	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.517:21:6,7:4,3:9,1,10,1
chr1	110167980	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=116,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.181:26:10,2:6,0:8,14,4,0
chr1	110168865	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:15,2:22,0:0|1:110168865_G_A:110168865:12,25,1,1
chr1	110168870	.	A	AGGCTCCAGCTCCGCATCCC	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=138,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:15,2:19,0:0|1:110168865_G_A:110168865:11,25,1,1
chr1	110168888	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,7,24
chr1	110169610	.	TG	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=216,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:110169610_TG_AC:110169610:1,1,0,1
chr1	110169616	.	G	GGTAATCACTATTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=216,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:110169610_TG_AC:110169610:1,1,0,1
chr1	110169957	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr1	110171705	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr1	110172346	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr1	110172362	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr1	110201580	.	C	T	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=285.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.989:84:0,51:0,33:0,0,67,17
chr1	110210780	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,17:0,0,12,24
chr1	110211681	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=163,200;MMQ=25,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:8,1:12,3:3,17,0,4
chr1	110211835	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,204;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:9,2:7,1:12,5,4,0
chr1	110212293	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=241,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,1:0,2:0,3,0,4
chr1	110231815	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	110233056	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	110233138	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,93;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.890:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr1	110300504	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.466:39:8,13:12,5:11,10,14,4
chr1	110300750	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110300750_C_A:110300750:0,1,0,1
chr1	110300751	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110300750_C_A:110300750:0,1,0,1
chr1	110300753	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110300750_C_A:110300750:0,1,0,1
chr1	110301041	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,10;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.227:13:5,1:5,0:5,5,0,3
chr1	110301766	.	AGT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,190;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=GT;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.610:8:0,3:2,2:2,1,3,2
chr1	110456866	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.521:42:11,7:9,14:14,6,11,11
chr1	110466466	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,5:2,4:4,2,3,6
chr1	110467354	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,0:5,1:9,4,5,0
chr1	110553741	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,211;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr1	110560915	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:3,0,5,1
chr1	110582192	.	A	AAAAGATAGGCCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110582192_A_AAAAGATAGGCCT:110582192:0,4,0,1
chr1	110582194	.	A	ATCCAGCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110582192_A_AAAAGATAGGCCT:110582192:0,4,0,1
chr1	110587566	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:28,1:25,2:18,35,1,2
chr1	110592048	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,2,2
chr1	110735037	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:6,0,6,0
chr1	110738146	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=16,12;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.465:7:0,1:0,0:0|1:110738146_A_C:110738146:4,0,3,0
chr1	110738152	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=16,13;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.465:7:0,1:1,0:0|1:110738146_A_C:110738146:4,0,3,0
chr1	110738164	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.419:11:1,1:4,1:5,1,5,0
chr1	110740688	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:5,0,5,0
chr1	110765535	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=216,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	110882444	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,15:0,19:0,0,14,20
chr1	110883512	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,189;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:6,11,0,2
chr1	110924211	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=153,164;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:11,3:9,0:20,1,3,0
chr1	110924220	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=153,165;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,2:9,0:22,3,2,0
chr1	110924222	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=153,147;MMQ=60,40;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:16,2:9,0:22,3,3,0
chr1	110924223	.	G	GCA	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=156,142;MMQ=60,50;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:17,2:9,0:24,3,2,0
chr1	110924235	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.458:37:13,10:7,6:18,2,15,2
chr1	110924238	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:24,2:14,0:34,4,2,0
chr1	110949041	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:0|1:110949041_G_A:110949041:2,8,0,3
chr1	110949045	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:0|1:110949041_G_A:110949041:2,9,0,3
chr1	110949049	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:0|1:110949041_G_A:110949041:2,9,0,3
chr1	111434170	.	CTGGTG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:1,2,0,5
chr1	111436857	.	TC	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	111492807	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	111661413	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,37:0.522:71:18,20:15,17:25,9,30,7
chr1	111661528	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=86.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,33:0.496:67:18,14:13,18:8,26,10,23
chr1	111667529	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:111667529_A_ATC:111667529:0,4,0,1
chr1	111667531	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:111667529_A_ATC:111667529:0,4,0,1
chr1	111726026	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:3,0,5,2
chr1	111726213	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.459:50:12,11:15,11:10,17,6,17
chr1	111770423	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,5,18
chr1	111773568	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr1	111773830	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=128.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,14:0,23:0,0,26,11
chr1	111778241	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr1	111778824	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,2:0,1:0,0,0,5
chr1	111784138	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,2:2,2:0|1:111784138_T_C:111784138:0,4,0,5
chr1	111784148	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:111784138_T_C:111784138:0,0,0,6
chr1	111784158	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0|1:111784138_T_C:111784138:0,2,0,3
chr1	111784816	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:6,1,5,0
chr1	111833441	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,4,1
chr1	111833488	.	C	CCT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:1,3,4,1
chr1	111833517	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=136,126;MMQ=60,58;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:2,3,2,2
chr1	111853060	.	A	AGCCAATCTAG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.436:23:8,3:5,7:9,4,4,6
chr1	111854207	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	111854223	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:6,2,2,0
chr1	111854741	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:2,0,4,1
chr1	111854755	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	111857087	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	111861370	.	AA	TT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=232,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr1	111861714	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,22,6
chr1	111889457	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.487:15:5,4:0,3:7,1,5,2
chr1	111890240	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=233,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:111890240_C_T:111890240:1,0,1,0
chr1	111890244	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=233,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:111890240_C_T:111890240:1,0,1,0
chr1	111892905	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:111892905_T_C:111892905:0,0,0,11
chr1	111892909	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0|1:111892905_T_C:111892905:0,4,0,6
chr1	111893788	.	GTTTTT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,15;RU=T;STR;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.696:7:1,1:0,4:1,1,5,0
chr1	111968173	.	G	GTAGGGTGACAAGGGCTCAGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	111989855	.	T	TCAAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0|1:111989855_T_TCAAA:111989855:3,5,0,2
chr1	111989856	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0|1:111989855_T_TCAAA:111989855:3,5,0,2
chr1	111998949	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=220,198;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:111998949_T_A:111998949:0,3,0,2
chr1	111998954	.	G	GGGCCTTGCTCTTGGGGTTAGGCTTTGGCTAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=221,198;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:111998949_T_A:111998949:0,2,0,2
chr1	112020222	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.762:2:0,0:0,1:0|1:112020222_GC_G:112020222:0,0,2,0
chr1	112020233	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.596:3:1,0:0,1:0|1:112020222_GC_G:112020222:1,0,2,0
chr1	112026198	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=199,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr1	112028314	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:2,1:2,1,1,0
chr1	112029325	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr1	112031278	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr1	112032126	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:112032126_T_C:112032126:0,0,2,0
chr1	112032131	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112032126_T_C:112032126:0,0,1,0
chr1	112032205	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr1	112032347	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:0,5,0,5
chr1	112106444	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	112234084	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.405:40:6,3:18,13:3,21,0,16
chr1	112240038	.	CTT	C,CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=152,145,149;MMQ=60,60,60;MPOS=25,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.11,13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,7:0.208,0.405:18:0,3,3:6,1,4:6,1,11,0
chr1	112270410	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	112298829	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	112299223	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,3:11,0:17,4,3,0
chr1	112302219	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:2,5:4,1:0,7,0,6
chr1	112303260	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,5:4,6:2,5,4,7
chr1	112305228	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=222,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0|1:112305228_A_G:112305228:3,0,3,0
chr1	112305236	.	T	TGATGATGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=173,447;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:112305228_A_G:112305228:4,0,1,0
chr1	112305238	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=173,447;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:112305228_A_G:112305228:4,0,1,0
chr1	112305406	.	TAA	T,TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,23,28;MFRL=158,133,149;MMQ=60,60,60;MPOS=15,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.18,11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,7:0.185,0.362:21:4,3,2:2,1,3:3,7,4,7
chr1	112321032	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=118.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.974:38:0,17:0,16:0,0,28,10
chr1	112524680	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:1,2,7,1
chr1	112997144	.	T	TG	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=108,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.072:61:29,0:27,4:21,36,1,3
chr1	113052053	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	113098714	.	C	CAGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:113098714_C_CAGAA:113098714:0,2,0,1
chr1	113098715	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:113098714_C_CAGAA:113098714:0,2,0,1
chr1	113159371	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.145:37:13,2:17,3:31,1,5,0
chr1	113196197	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,5:0,0,12,1
chr1	113196326	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,1:12,2:4,15,0,3
chr1	113202417	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,2,14
chr1	113231994	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.807:3:0,0:0,0:0|1:113231994_A_C:113231994:0,0,3,0
chr1	113231999	.	T	TGCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.796:3:0,1:0,0:0|1:113231994_A_C:113231994:0,0,3,0
chr1	113232003	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:113231994_A_C:113231994:0,1,2,0
chr1	113232007	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:0|1:113231994_A_C:113231994:0,1,2,0
chr1	113232805	.	A	AAGTAGCCCACAAAGCTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	113234456	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr1	113239478	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,1,12
chr1	113242488	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,13,10
chr1	113244084	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:18,1:25,2:23,21,0,3
chr1	113244433	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,1,12
chr1	113246229	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=275,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.855:12:1,4:0,4:1,0,11,0
chr1	113254484	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr1	113255718	.	GTTA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=167,185;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:113255718_GTTA_G:113255718:0,1,0,1
chr1	113255724	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=167,185;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113255718_GTTA_G:113255718:0,1,0,1
chr1	113255726	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=167,185;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113255718_GTTA_G:113255718:0,1,0,1
chr1	113255729	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=167,185;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113255718_GTTA_G:113255718:0,1,0,1
chr1	113456452	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,60;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:11,0:3,2:14,0,2,0
chr1	113456546	.	A	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=231.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,49:0,24:0,0,48,27
chr1	113460676	.	CAATA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,142;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AATA;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.718:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	113636251	.	G	GTGTGTTGTGTATGTGTGTTGTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=164,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr1	113636263	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113636263_C_G:113636263:0,0,0,1
chr1	113636266	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113636263_C_G:113636263:0,0,0,1
chr1	113636924	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,3:0,14:0,0,15,3
chr1	113637047	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:23,3:23,0:19,28,2,1
chr1	113658887	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,18:0,8:0,0,17,10
chr1	113659065	.	ACT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=156.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,20:0,18:0,0,19,20
chr1	114092111	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.174:26:15,2:6,3:20,1,5,0
chr1	114133022	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	114137013	.	C	CAT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=79.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,18,0
chr1	114162393	.	T	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.055:55:17,0:33,3:35,17,2,1
chr1	114196364	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	114224782	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:7,2:0,2:7,0,4,0
chr1	114226705	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr1	114240319	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=85.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,15:0,0,12,15
chr1	114242250	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr1	114247480	.	AT	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114247480_AT_CC:114247480:0,3,0,1
chr1	114247486	.	A	AACTGTTTTGCTGTATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114247480_AT_CC:114247480:0,3,0,1
chr1	114249382	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=107.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,19:0,11:0,0,1,29
chr1	114267347	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr1	114280717	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,9,1
chr1	114309172	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	114339956	.	C	CTAAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=151.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,14:0,0,26,9
chr1	114372332	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,4:1,3:0,1,0,7
chr1	114377093	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,11:0,0,3,14
chr1	114401231	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,5,11
chr1	114401265	.	CT	C,CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,19,28;MFRL=163,183,183;MMQ=51,54,60;MPOS=9,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.37,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.332:6:1,0,1:1,0,1:0,2,0,4
chr1	114401545	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=166,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:16,0,3,0
chr1	114401552	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=164,111;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:10,0:0|1:114401552_A_T:114401552:19,0,2,0
chr1	114401554	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=164,111;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:11,0:0|1:114401552_A_T:114401552:19,0,2,0
chr1	114401904	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,10:0,0,13,2
chr1	114441512	.	A	ATTTTAATTTTGATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	114449874	.	C	CAGACAAAGATGACAGAAAATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=87,291;MMQ=55,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr1	114483366	.	TGTGGATTGAAACGAAAAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,2:6,0:8,2,1,1
chr1	114510633	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114510633_T_TGA:114510633:0,1,0,1
chr1	114510634	.	T	TAGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114510633_T_TGA:114510633:0,1,0,1
chr1	114522052	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,19;MFRL=114,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.407:5:0,0:2,1:3,0,2,0
chr1	114522285	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr1	114523149	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:28,1:19,2:30,17,0,3
chr1	114641685	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr1	114680709	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:114680709_G_GT:114680709:0,2,0,1
chr1	114680710	.	G	GACTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:114680709_G_GT:114680709:0,2,0,1
chr1	114940246	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:10,0:6,2:16,6,6,0
chr1	114940264	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=129,142;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:23,0:18,1:0|1:114940264_G_T:114940264:30,17,2,0
chr1	114940266	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=129,142;MMQ=60,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:19,0:15,1:0|1:114940264_G_T:114940264:30,17,2,0
chr1	114940547	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:16,3:6,0:11,11,3,0
chr1	114940632	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr1	114947935	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	115112597	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.392:49:17,11:13,8:21,9,14,5
chr1	115128087	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,15,0
chr1	115130648	.	A	AGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	115144703	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr1	115144794	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:4,2:10,0:7,7,2,1
chr1	115166347	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:115166347_T_A:115166347:0,4,0,1
chr1	115166348	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:115166347_T_A:115166347:0,4,0,1
chr1	115166350	.	ATTGT	A,TTTGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,32,32;MFRL=0,180,149;MMQ=60,60,60;MPOS=13,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.75,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,1:0.579,0.284:4:0,0,0:0,3,1:0,0,0,4
chr1	115166353	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:115166347_T_A:115166347:0,1,0,1
chr1	115166357	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:115166347_T_A:115166347:0,4,0,1
chr1	115166360	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr1	115223156	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:3,1:0,3:0,3,0,5
chr1	115238016	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.704:10:2,4:0,3:2,1,7,0
chr1	115252447	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.429:7:1,2:3,0:0|1:115252447_A_T:115252447:0,4,0,3
chr1	115252450	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:2,0:0|1:115252447_A_T:115252447:0,4,0,2
chr1	115256669	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	115277207	.	T	TCTAGGTGACAAAG	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.082:33:16,2:14,0:1,30,0,2
chr1	115279344	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:19,2:21,0:41,0,2,0
chr1	115279361	.	T	TA	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,18:0.395:47:13,10:15,7:26,3,18,0
chr1	115280193	.	CA	C,CAA	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=34,35,31;MFRL=165,159,165;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=14.84,11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,13,10:0.205,0.161:60:13,2,4:17,9,3:4,33,3,20
chr1	115317023	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,0:7,2:5,16,0,2
chr1	115398044	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr1	115399884	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,2:8,3:7,4,5,0
chr1	115401136	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=276.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,80:0.988:80:0,43:0,34:0,0,70,10
chr1	115417093	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:3,8:5,6:6,2,12,3
chr1	115438047	.	A	AT	.	.	DP=125;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,9:0.100:98:37,8:49,1:45,44,7,2
chr1	115469133	.	G	GA	.	.	DP=225;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=134,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:179,9:0.037:188:97,4:74,4:126,53,7,2
chr1	115487404	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=219,162;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr1	115527284	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:10,8:10,9:19,1,18,0
chr1	115600081	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:5,1:0,3:4,2,4,0
chr1	115600137	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:10,8:6,2:12,4,8,2
chr1	115601528	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:11,6:11,8:13,9,5,10
chr1	115601615	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr1	115604681	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=185,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.517:21:4,8:6,2:10,0,11,0
chr1	115604798	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,83;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,29:0.408:71:28,12:14,14:20,22,12,17
chr1	115631924	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	115631933	.	G	GGCCCCC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,19;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.453:7:2,0:2,1:0|1:115631933_G_GGCCCCC:115631933:3,1,3,0
chr1	115631937	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=21,34;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.384:6:1,2:0,0:0|1:115631933_G_GGCCCCC:115631933:3,1,2,0
chr1	115631940	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,11;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:115631933_G_GGCCCCC:115631933:1,1,2,0
chr1	115631943	.	CGG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=163,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:1,1:1,0:0|1:115631933_G_GGCCCCC:115631933:1,3,1,0
chr1	116225180	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,3:0,5,1,4
chr1	116228220	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr1	116268231	.	T	TAAGCTATATACATACTAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	116283343	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	116283526	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	116382511	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr1	116383361	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,0:3,0:1,3,0,3
chr1	116386542	.	CGTGTGT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=10,30;MFRL=102,194;MMQ=40,52;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=24,21;RU=GT;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.544:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	116577981	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr1	116609126	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr1	116915991	.	C	CCGGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:116915991_C_CCGGG:116915991:0,0,1,0
chr1	116915992	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:116915991_C_CCGGG:116915991:0,0,1,0
chr1	116915996	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=265,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:116915991_C_CCGGG:116915991:1,0,1,0
chr1	116916000	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:116915991_C_CCGGG:116915991:2,0,1,0
chr1	116916004	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:116915991_C_CCGGG:116915991:2,0,1,0
chr1	116932096	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:11,4,1,1
chr1	116933076	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:11,1:18,1:7,24,0,2
chr1	116940562	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,1:14,1:13,10,1,1
chr1	117122288	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,2:2,1:1,6,1,2
chr1	117142531	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,215;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	117142700	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,233;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:6,15,2,0
chr1	117142736	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=157,199;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,1:12,1:7,19,2,0
chr1	117142855	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=165,186;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,1:6,2:7,7,1,2
chr1	117142868	.	CA	TG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=159,186;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:9,1:4,2:7,6,2,1
chr1	117142977	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,156;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:0,10,0,3
chr1	117146592	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=207,188;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:2,7,0,2
chr1	117146629	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=181,188;MMQ=40,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr1	117150928	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=163,167;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:9,2:5,1:0|1:117150928_C_T:117150928:3,11,1,2
chr1	117150933	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=163,167;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:9,1:5,1:0|1:117150928_C_T:117150928:3,11,1,2
chr1	117156459	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,150;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,21:0.287:75:29,11:22,10:30,24,10,11
chr1	117156490	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,156;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,11:0.179:65:29,6:25,5:26,28,3,8
chr1	117156584	.	TG	CA	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=159,148;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.157:55:24,4:22,3:21,26,0,8
chr1	117156600	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=163,167;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.114:55:24,3:25,2:23,26,0,6
chr1	117158690	.	G	C	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=139,97;MMQ=46,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,9:0.104:92:33,6:48,3:53,30,3,6
chr1	117158972	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,105;MMQ=25,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.121:47:20,2:21,3:17,25,2,3
chr1	117248731	.	A	ATGTGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=159,162;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:4,0:0|1:117248731_A_ATGTGT:117248731:0,12,0,2
chr1	117248735	.	GTTGTA	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=159,162;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:3,0:0|1:117248731_A_ATGTGT:117248731:0,12,0,2
chr1	117487270	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:4,3:3,1:6,1,3,2
chr1	117504259	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:15,0:24,6:17,22,0,6
chr1	117509981	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0|1:117509981_G_A:117509981:1,4,0,4
chr1	117509987	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,1:3,2:0|1:117509981_G_A:117509981:1,4,0,4
chr1	117527645	.	GTCT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCT;STR;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:3,1:1,4:0,4,1,4
chr1	117529642	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:117529642_G_GT:117529642:0,4,0,1
chr1	117529643	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:117529642_G_GT:117529642:0,4,0,1
chr1	117554410	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,2:12,0:22,8,1,1
chr1	117602960	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,20:0,26:0,0,25,23
chr1	117605110	.	G	T	.	.	DP=99;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,6:0.050:93:33,0:35,0:30,57,0,6
chr1	117605121	.	G	T	.	.	DP=74;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.050:70:24,0:14,0:18,48,0,4
chr1	117605129	.	G	T	.	.	DP=71;ECNT=4;MBQ=30,16;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.096:66:19,1:21,0:12,48,0,6
chr1	117605130	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=70;ECNT=4;MBQ=22,28,18;MFRL=152,168,180;MMQ=60,60,50;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,16;RU=T;STR;TLOD=13.21,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,10,2:0.228,0.043:43:10,6,1:14,3,0:2,29,0,12
chr1	117618722	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	117619204	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:11,1,2,0
chr1	117631391	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,8:0,0,9,3
chr1	117634639	.	C	CATCATCTTTGATTCGGGGTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=185,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.388:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr1	117660608	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,16,6
chr1	117663316	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:15,0,0,2
chr1	117690272	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr1	117753455	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:1,5:3,2:2,2,7,1
chr1	117957288	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,16,0
chr1	117984776	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	118065888	.	G	GAAAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.170:15:6,2:7,0:0|1:118065888_G_GAAAA:118065888:6,7,1,1
chr1	118065889	.	G	GAAAGACAGGCAACCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.170:15:6,2:6,0:0|1:118065888_G_GAAAA:118065888:6,7,1,1
chr1	118166750	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.949:18:0,8:0,7:0,0,3,15
chr1	118166792	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.350:4:2,0:1,1:0|1:118166792_T_G:118166792:0,3,0,1
chr1	118166797	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.350:4:2,0:1,1:0|1:118166792_T_G:118166792:0,3,0,1
chr1	118166800	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:118166792_T_G:118166792:0,2,0,1
chr1	118166805	.	T	TAAGACTGAGGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:118166792_T_G:118166792:0,2,0,1
chr1	118167727	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:7,1:6,2:6,8,2,1
chr1	118170466	.	CTG	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=122,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:4,0:5,3:3,6,1,2
chr1	118170496	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=173,65;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:11,2:0|1:118170496_G_A:118170496:4,9,1,1
chr1	118170500	.	A	AACTCATAGAGTTGAACTTTCCTTTAGAAG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=173,65;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:11,2:0|1:118170496_G_A:118170496:4,9,1,1
chr1	118477385	.	T	TCAATAAATCCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118477385_T_TCAATAAATCCAA:118477385:0,1,0,1
chr1	118477386	.	G	GAGCAGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118477385_T_TCAATAAATCCAA:118477385:0,1,0,1
chr1	118486303	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:118486303_T_C:118486303:0,4,0,1
chr1	118486307	.	TG	T,TTTTTTCGAGACAG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,32,33;MFRL=178,115,165;MMQ=60,60,60;MPOS=15,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,1:1,0,0:0,2,0,2
chr1	118486309	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	118486310	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=171,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:118486310_TAC_T:118486310:0,4,0,1
chr1	118486311	.	A	AGTTTCAT	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,29;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:0,1:0|1:118486303_T_C:118486303:0,2,0,1
chr1	118486314	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=176,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:118486310_TAC_T:118486310:0,3,0,1
chr1	118486316	.	TAAGGG	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:118486310_TAC_T:118486310:0,2,0,1
chr1	118486324	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=34,30;MFRL=176,115;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118486310_TAC_T:118486310:0,1,0,1
chr1	118486328	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=176,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118486310_TAC_T:118486310:0,1,0,1
chr1	118495199	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,478;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:13,0,2,0
chr1	118514736	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118514736_G_A:118514736:0,1,0,1
chr1	118514737	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118514736_G_A:118514736:0,1,0,1
chr1	118514741	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118514736_G_A:118514736:0,1,0,1
chr1	118526592	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	118565949	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=116,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:118565949_A_T:118565949:10,8,1,1
chr1	118565956	.	ATC	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=116,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:6,1:0|1:118565949_A_T:118565949:10,8,1,1
chr1	118565965	.	GA	TT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:118565949_A_T:118565949:5,7,1,1
chr1	118579360	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,255;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:16,2:15,0:23,10,2,0
chr1	118623681	.	T	TAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=AC;STR;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:1,2:0,1:1,0,4,1
chr1	118628604	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:8,0:13,3:10,13,0,3
chr1	119466275	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr1	119530133	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=295,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	119923724	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,8:4,4:7,1,9,3
chr1	119927680	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	120254545	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=216,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:4,0,2,0
chr1	120277194	.	TTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TAA;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr1	120284290	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	120293352	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:7,1,8,0
chr1	120293367	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,14,7
chr1	120293568	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:1,7,0,4
chr1	120296033	.	AAC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=AC;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.784:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr1	120296049	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:4,0:2,7,0,3
chr1	120302419	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:2,1,5,1
chr1	120307010	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,1:7,1:11,6,1,1
chr1	120378678	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr1	120380008	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=137.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,22:0,0,5,38
chr1	120384068	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=127,203;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:25,0:23,2:0|1:120384068_C_T:120384068:23,25,1,1
chr1	120384072	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=129,203;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.052:55:22,0:26,2:0|1:120384068_C_T:120384068:27,26,1,1
chr1	120439114	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	120458662	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=180,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:3,0:1,1:2,3,1,1
chr1	120465193	.	G	GGAAGAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	120468028	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,106;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:15,0:17,4:17,17,4,0
chr1	120478285	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	120480394	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr1	120508009	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.184:36:13,0:16,6:30,0,6,0
chr1	120512104	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	120512346	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=139,124;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:9,2:7,17,0,2
chr1	120927081	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=252,148;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.892:25:1,12:1,11:2,0,23,0
chr1	144013853	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=124,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.470:34:6,7:12,8:13,5,13,3
chr1	144013865	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.461:37:7,9:13,8:12,8,12,5
chr1	144620151	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,176;MMQ=23,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:14,2:16,2:4,26,1,3
chr1	144825577	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	144825603	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=204,167;MMQ=25,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:144825603_C_A:144825603:0,1,0,1
chr1	144825611	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:144825603_C_A:144825603:0,0,0,1
chr1	144828454	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	144828845	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=280,188;MMQ=24,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	144852249	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	144852321	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=138,152;MMQ=49,32;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr1	144852545	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=180,170;MMQ=48,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr1	144854047	.	CCC	TGG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=176,142;MMQ=60,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,1:9,1:15,2,2,0
chr1	144854052	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=166,186;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,6:7,3:9,2,9,0
chr1	144854083	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.341:45:16,13:12,2:28,2,15,0
chr1	144854087	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,13:0.269:50:20,8:11,5:0|1:144854087_A_G:144854087:35,2,12,1
chr1	144854095	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=162,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,16:0.298:55:22,11:16,5:0|1:144854087_A_G:144854087:37,2,14,2
chr1	144854245	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,156;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,16:0.309:53:20,10:17,5:1,36,0,16
chr1	144854277	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:3,9:4,7:0,7,0,16
chr1	144854454	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=188,149;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:5,2:4,2:9,1,3,1
chr1	144854491	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=158,185;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:0|1:144854491_T_G:144854491:12,3,3,0
chr1	144854497	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=158,142;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.303:21:7,3:8,3:0|1:144854491_T_G:144854491:11,4,4,2
chr1	144854528	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=145,163;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,9:0.213:45:22,3:12,6:0|1:144854528_A_G:144854528:27,9,7,2
chr1	144854537	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=145,174;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,10:0.204:52:26,4:15,6:0|1:144854528_A_G:144854528:30,12,7,3
chr1	144854581	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=139,140;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,10:0.172:60:29,6:18,3:25,25,9,1
chr1	144854594	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=138,127;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,14:0.230:63:29,10:19,3:15,34,9,5
chr1	144854597	.	TC	CT,CC	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=31,34,32;MFRL=141,127,119;MMQ=60,60,40;MPOS=19,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=71.43,42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,20,13:0.340,0.222:59:16,10,11:9,10,2:7,19,14,19
chr1	144854730	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,149;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:1,9,0,3
chr1	144857068	.	A	T	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,134;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=110.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,42:0.429:98:24,21:32,20:2,54,5,37
chr1	144859720	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=119.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,18:0,15:0,0,31,2
chr1	144860026	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:7,7:3,9:3,7,2,14
chr1	144863505	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=195,193;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0|1:144863505_A_G:144863505:1,4,0,6
chr1	144863528	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=218,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:144863505_A_G:144863505:1,3,0,1
chr1	144863535	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=218,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:144863505_A_G:144863505:1,3,0,1
chr1	144866509	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,3:1,1:3,1,5,0
chr1	144868170	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=148,125;MMQ=60,43;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:10,7:11,8:4,17,6,9
chr1	144868204	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.421:29:10,3:6,9:1,16,1,11
chr1	144868239	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,4:3,6:1,7,1,9
chr1	144871782	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=132,155;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.442:41:12,7:11,11:17,6,14,4
chr1	144871889	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.444:41:10,10:12,8:5,18,8,10
chr1	144871910	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.151:24:10,1:11,2:0|1:144871910_G_A:144871910:2,19,1,2
chr1	144871913	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.151:24:8,0:11,2:0|1:144871910_G_A:144871910:2,19,1,2
chr1	144873794	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=152,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:6,1,7,0
chr1	144873818	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:7,10:7,5:11,3,14,1
chr1	144873840	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,23:0.545:42:9,14:10,9:16,3,19,4
chr1	144873962	.	CT	C	.	.	DP=86;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,39:0.473:83:16,21:27,18:16,28,10,29
chr1	144874038	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=134,153;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:6,5:9,10:2,13,3,12
chr1	144874070	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=176,177;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,3:3,4:1,9,0,7
chr1	144874088	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:5,2:3,3:0,8,1,6
chr1	144874641	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:12,5:5,7:13,4,9,3
chr1	144877366	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,182;MMQ=40,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,2:3,8:1,4,1,9
chr1	144879054	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,12:0.183:69:30,3:27,9:27,30,5,7
chr1	144879264	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,34:0.547:62:15,18:12,15:21,7,21,13
chr1	144879375	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,26:0.489:53:12,13:15,12:8,19,6,20
chr1	144881389	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.407:42:14,8:10,8:24,1,13,4
chr1	144881711	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=218,178;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr1	144882912	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:5,6:4,3:2,7,0,10
chr1	144886063	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,8:4,2:4,2,9,1
chr1	144886092	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,7:6,5:5,4,8,5
chr1	144886409	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:0,5,0,4
chr1	144892089	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=210,220;MMQ=46,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr1	144892149	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.503:32:11,6:4,10:15,1,15,1
chr1	144906120	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,135;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,3:0.048:80:36,2:39,1:31,46,1,2
chr1	144915624	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,185;MMQ=52,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,4:6,1:2,11,0,5
chr1	144916486	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:10,2:2,1:0|1:144916486_T_G:144916486:12,0,3,0
chr1	144916493	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:10,2:2,1:0|1:144916486_T_G:144916486:13,0,3,0
chr1	144917827	.	CA	C	.	.	DP=179;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=157,150;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=241.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,83:0.506:164:34,38:44,43:51,30,56,27
chr1	144917841	.	T	C	.	.	DP=199;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=157,148;MMQ=43,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=242.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,93:0.492:189:40,43:55,49:59,37,59,34
chr1	144919008	.	AC	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.488:35:10,7:7,10:4,14,1,16
chr1	144922109	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=92,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,4:6,2:0,6,1,5
chr1	144922171	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:2,2,2,4
chr1	144923823	.	TAGGAAGAAACGGCA	T	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGAAGAAACGGCA;STR;TLOD=255.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.986:58:0,25:0,26:0,0,12,46
chr1	144923887	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.235:41:10,4:20,5:2,30,1,8
chr1	144930571	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.410:53:15,10:16,9:22,9,16,6
chr1	144930596	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,25:0.449:56:17,17:13,8:18,13,12,13
chr1	144931727	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:2,4:0,3:0,3,0,7
chr1	144946768	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,2:1,6:1,6,0,8
chr1	145016020	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=228.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,62:0.985:62:0,30:0,30:0|1:145016020_T_G:145016020:0,0,12,50
chr1	145016032	.	C	CA	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,12:0.311:40:15,6:13,6:0|1:145016020_T_G:145016020:6,22,0,12
chr1	145016034	.	A	AC	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.086:44:20,1:21,2:0|1:145016020_T_G:145016020:5,36,0,3
chr1	145021024	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:13,1:16,4:29,0,5,0
chr1	145074882	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,3:9,1:17,0,4,0
chr1	145074919	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.167:40:16,2:17,4:27,7,6,0
chr1	145074939	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=77.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,29:0.463:63:11,20:22,9:24,10,22,7
chr1	145075923	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	145103844	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,18:0.365:50:16,8:15,10:30,2,17,1
chr1	145103896	.	G	T	.	.	DP=81;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,14:0.181:80:30,7:35,7:42,24,11,3
chr1	145103928	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,35:0.339:104:38,18:31,17:30,39,16,19
chr1	145104052	.	AGT	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,4:5,5:0,14,0,9
chr1	145104075	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,2:9,1:0,16,0,3
chr1	145109456	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:11,1:18,1,2,0
chr1	145109468	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=90.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,24,0
chr1	145109493	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.296:35:15,6:10,4:23,2,10,0
chr1	145112284	.	CCG	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=171,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:5,1:4,2:0|1:145112284_CCG_C:145112284:11,1,3,0
chr1	145112288	.	G	GCA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=171,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:0|1:145112284_CCG_C:145112284:11,1,3,0
chr1	145112313	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=149,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,3:10,1:13,6,2,2
chr1	145115658	.	TATTTTTAA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:6,1,2,0
chr1	145248811	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=211,221;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,1:4,2:0,11,0,3
chr1	145273473	.	T	C	.	.	DP=182;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,141;MMQ=51,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=97.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:137,41:0.233:178:77,17:59,24:28,109,3,38
chr1	145273520	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=172,184;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,8:0.144:60:25,3:27,5:1,51,0,8
chr1	145281361	.	TC	T	.	.	DP=149;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,138;MMQ=27,33;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=80.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,36:0.269:135:54,19:39,17:65,34,26,10
chr1	145281780	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,175;MMQ=57,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,12:0.283:44:8,3:23,9:6,26,1,11
chr1	145281794	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,157;MMQ=57,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.108:53:15,2:33,3:12,36,1,4
chr1	145282093	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,175;MMQ=57,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,9:0.108:90:32,4:48,5:5,76,0,9
chr1	145290317	.	C	T	.	.	DP=101;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,15:0.159:97:37,10:38,5:77,5,12,3
chr1	145290320	.	C	T	.	.	DP=101;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,25:0.268:95:37,13:33,11:67,3,20,5
chr1	145290346	.	A	G	.	.	DP=152;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=157,160;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=210.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,66:0.472:140:40,33:33,30:59,15,52,14
chr1	145290351	.	A	G	.	.	DP=175;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=157,158;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:144,16:0.105:160:68,8:66,8:115,29,10,6
chr1	145290377	.	T	C	.	.	DP=240;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=147,169;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=144.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:184,52:0.221:236:96,28:84,20:127,57,31,21
chr1	145290398	.	G	A	.	.	DP=276;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=149,133;MMQ=52,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=121.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:212,53:0.202:265:109,31:102,22:132,80,31,22
chr1	145290401	.	T	G	.	.	DP=276;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=146,164;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:246,26:0.098:272:128,11:113,14:147,99,15,11
chr1	145290409	.	G	A	.	.	DP=301;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=144,166;MMQ=52,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:260,26:0.093:286:130,11:113,14:158,102,15,11
chr1	145290498	.	T	G	.	.	DP=235;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=149,131;MMQ=52,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:181,39:0.179:220:102,25:75,14:53,128,12,27
chr1	145290535	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=149,146;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,15:0.136:115:49,9:51,6:16,84,4,11
chr1	145290547	.	C	A	.	.	DP=95;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=151,162;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,12:0.144:88:33,8:42,4:4,72,2,10
chr1	145290553	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,17:0.227:77:22,9:35,8:3,57,0,17
chr1	145290560	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=156,180;MMQ=60,26;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.070:68:23,1:38,3:2,62,0,4
chr1	145290570	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,14:0.246:59:13,8:31,6:1,44,1,13
chr1	145298070	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=156,143;MMQ=36,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,1:6,2:15,2,2,1
chr1	145298089	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=156,207;MMQ=36,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,4:6,0:11,4,3,1
chr1	145298095	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=170,128;MMQ=25,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:5,6:3,2:6,2,7,2
chr1	145415561	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.508:10:4,5:1,0:0|1:145415561_C_CG:145415561:5,0,5,0
chr1	145415562	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,17;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.508:10:4,2:1,0:0|1:145415561_C_CG:145415561:5,0,5,0
chr1	145415568	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=11,35;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.465:11:0,4:0,0:0|1:145415561_C_CG:145415561:6,0,5,0
chr1	145415581	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.365:9:2,2:1,0:0|1:145415561_C_CG:145415561:6,0,3,0
chr1	145456732	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,30,19,17;MFRL=180,174,178,185;MMQ=60,60,60,60;MPOS=10,16,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.42,3.88,5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,3,5:0.138,0.142,0.242:21:1,1,0,1:4,2,1,0:0,10,0,11
chr1	145457039	.	CTCT	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCT;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:21,3:13,0:10,25,2,1
chr1	145475728	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	145507826	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.439:33:9,3:9,7:0,18,0,15
chr1	145510376	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	145522995	.	ATTCGAATTCT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr1	145528444	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,1:4,12,0,2
chr1	145532994	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.669:7:1,1:0,3:0|1:145532994_GT_G:145532994:2,0,4,1
chr1	145533001	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0|1:145532994_GT_G:145532994:2,0,4,1
chr1	145533314	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,0:0,3:1,3,2,1
chr1	145535921	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:1,6:7,3:3,5,4,5
chr1	145538664	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	145539527	.	G	GCATTTGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:145539527_G_GCATTTGT:145539527:1,3,0,1
chr1	145539528	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:145539527_G_GCATTTGT:145539527:1,3,0,1
chr1	145539530	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1|0:145539527_G_GCATTTGT:145539527:1,3,0,1
chr1	145539532	.	GA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:145539527_G_GCATTTGT:145539527:1,2,0,1
chr1	145555823	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,1:8,1:5,15,0,2
chr1	145558565	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,2,17
chr1	145561594	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:6,5:9,4:7,9,4,5
chr1	145562087	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.445:34:8,9:11,6:11,8,13,2
chr1	145585317	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,2:0,16:0,0,14,4
chr1	145586780	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,4:9,6:4,12,8,2
chr1	145587631	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:145587631_G_C:145587631:0,0,3,0
chr1	145587634	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=305,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0|1:145587631_G_C:145587631:1,0,3,0
chr1	145587640	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0|1:145587631_G_C:145587631:2,0,3,0
chr1	145587643	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,21;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.310:7:0,1:3,0:0|1:145587631_G_C:145587631:5,0,2,0
chr1	145587647	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.353:6:2,0:2,0:0|1:145587631_G_C:145587631:4,0,2,0
chr1	145588536	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:7,5:8,4:11,6,6,3
chr1	145588654	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:6,13:8,7:7,7,10,10
chr1	145589491	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	145594220	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:1,3:5,4:1,6,1,6
chr1	145594825	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	145597116	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	145597417	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:3,3:3,3:6,0,7,0
chr1	145598459	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr1	145601861	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,5,11
chr1	145682204	.	AT	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,161;MMQ=56,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	145696694	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,6:2,2:0,4,0,8
chr1	145696721	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=161,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr1	145704373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	145826770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	146466146	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,128;MMQ=24,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	146656292	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,0,19
chr1	146673178	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	146685089	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=112,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr1	146685121	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	146687250	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	146714281	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	146728149	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.454:29:10,6:5,7:11,5,12,1
chr1	146728162	.	T	TA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=111.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,16:0,17:0,0,24,10
chr1	146739068	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,8:7,4:10,0,11,1
chr1	146739277	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr1	146740576	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,7:0,17:0,0,4,21
chr1	146747153	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr1	146747232	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	146756222	.	AAAAC	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAC;STR;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.545:22:5,9:3,3:0,10,0,12
chr1	146758257	.	C	CATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=221,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	146763089	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,15:0,5:0,0,14,6
chr1	146766069	.	C	CAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,13,1
chr1	147087721	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	147090765	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=144,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:17,3:5,0:10,12,1,2
chr1	147096505	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=183,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:2,6,4,3
chr1	147096794	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr1	147096828	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	147096858	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=198,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	147121977	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,12,5
chr1	147131465	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=140.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,20:0,19:0,0,32,9
chr1	147131501	.	A	T	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=74.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,27:0.400:68:18,15:23,12:25,16,16,11
chr1	147131710	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr1	147131945	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr1	147230217	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	147381444	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr1	148009510	.	G	A	.	.	DP=111;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,18:0.177:103:40,7:43,10:29,56,5,13
chr1	148009521	.	A	G	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=149,144;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,16:0.163:102:39,7:45,9:24,62,6,10
chr1	148251814	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,223;MMQ=24,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,3:7,1,4,0
chr1	148252111	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=149,141;MMQ=40,28;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,11:0.173:67:19,8:35,3:25,31,6,5
chr1	148252162	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=145,150;MMQ=47,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.455:42:9,5:12,14:5,18,2,17
chr1	148252164	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=146,150;MMQ=48,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:11,5:22,1:5,29,1,5
chr1	148342066	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,136;MMQ=44,20;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:8,4:10,1:1,18,0,5
chr1	148594466	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,95;MMQ=40,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,3:0.037:106:53,0:49,3:78,25,3,0
chr1	148756432	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=181,135;MMQ=24,23;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:5,1,1,1
chr1	148756448	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=159,184;MMQ=24,24;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:2,1,4,1
chr1	149783886	.	C	T	.	.	DP=155;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,144;MMQ=50,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=239.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,85:0.571:149:30,40:33,45:20,44,32,53
chr1	149859371	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,3:0.058:66:30,1:32,2:10,53,2,1
chr1	149871905	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.540:35:11,7:5,12:11,5,7,12
chr1	149880863	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	149880935	.	C	CCACACACACACA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,10;RU=CA;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:6,1,0,2
chr1	149881172	.	C	CCACA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:149881172_C_CCACA:149881172:0,2,0,1
chr1	149881173	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=137,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:149881172_C_CCACA:149881172:0,2,0,1
chr1	149881174	.	T	TAAGAAGAAGCACAAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:149881172_C_CCACA:149881172:0,2,0,1
chr1	149881183	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=165,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1|0:149881172_C_CCACA:149881172:1,1,1,1
chr1	149882322	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=182,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:4,5,0,2
chr1	149897966	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:3,1:7,6:1,10,0,7
chr1	149900985	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.870:8:0,3:0,4:0,1,7,0
chr1	149902588	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=217,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.592:12:1,6:2,1:5,0,7,0
chr1	149902647	.	G	GA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=110,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:13,2:18,1:21,12,3,0
chr1	149903122	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:7,9:3,0:7,3,8,2
chr1	149904334	.	C	CGTGATCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149904334_C_CGTGATCT:149904334:0,1,0,1
chr1	149904336	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149904334_C_CGTGATCT:149904334:0,1,0,1
chr1	149904337	.	G	GAGCGTGCATTCAGAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149904334_C_CGTGATCT:149904334:0,1,0,1
chr1	149906167	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.509:43:11,14:10,7:9,12,12,10
chr1	149907169	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,18;MFRL=137,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.218:15:5,0:1,0:6,6,2,1
chr1	149907172	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.540:17:3,6:2,3:2,6,6,3
chr1	149907183	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.511:26:5,5:3,8:4,9,6,7
chr1	149907258	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.662:27:2,13:6,5:3,6,3,15
chr1	149907276	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:4,8:3,7:1,6,4,11
chr1	149916632	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:1,0:7,1,2,0
chr1	149943157	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:10,7:11,8:8,13,3,12
chr1	150053389	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:9,4:2,5:8,3,9,1
chr1	150082513	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr1	150122493	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	150128425	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,6:0,0,2,8
chr1	150129267	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr1	150129296	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	150235045	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:6,3:0,13,0,3
chr1	150236314	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=140,153;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:2,0:3,0:7,5,2,0
chr1	150236969	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=128,49;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:9,0:3,2:6,6,1,1
chr1	150236981	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,49;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:150236981_T_C:150236981:6,6,1,1
chr1	150236985	.	C	CGACCCCTGAGGAAGCCAGGGCTCTCTTCT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=128,49;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:150236981_T_C:150236981:6,6,1,1
chr1	150249056	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:6,0:10,2:0|1:150249056_A_C:150249056:7,13,0,2
chr1	150249059	.	G	GTTATATTCCTCT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:9,2:0|1:150249056_A_C:150249056:7,14,0,2
chr1	150253326	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,70;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,3:13,0:6,15,2,1
chr1	150255587	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=214,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	150258838	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:13,9:10,4:19,4,11,2
chr1	150259400	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,3:2,5:0,4,0,9
chr1	150297334	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,34,34;MFRL=155,176,141;MMQ=60,60,60;MPOS=23,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=4.21,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,5:0.142,0.329:15:4,0,3:4,2,1:8,0,7,0
chr1	150297357	.	AG	TT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=18,13;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:5,0:8,0:0|1:150297357_AG_TT:150297357:17,9,2,0
chr1	150297360	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:6,0:9,0:0|1:150297357_AG_TT:150297357:17,9,2,0
chr1	150300727	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,4,1
chr1	150315719	.	AAAAAAAT	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:6,9:3,4:9,1,13,0
chr1	150315724	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.275:19:9,3:6,1:15,0,4,0
chr1	150413358	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:13,5,2,0
chr1	150432802	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=135,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:0,1:4,7:1,3,2,6
chr1	150432871	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150432871_G_A:150432871:0,0,0,1
chr1	150432875	.	T	TTA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150432871_G_A:150432871:0,0,0,1
chr1	150432878	.	T	TTCAAGGTCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150432871_G_A:150432871:0,0,0,1
chr1	150437275	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=219,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150437275_T_TA:150437275:0,1,0,1
chr1	150437278	.	CT	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=219,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150437275_T_TA:150437275:0,1,0,1
chr1	150443793	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:14,1:14,2:9,20,0,3
chr1	150444175	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,2:12,0:6,18,1,1
chr1	150445767	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,4:0.063:76:29,4:43,0:46,26,3,1
chr1	150445819	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,27:0.510:53:11,9:14,17:17,9,7,20
chr1	150463017	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=183,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	150465026	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=175,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.144:20:11,0:7,2:0|1:150465026_G_A:150465026:0,18,1,1
chr1	150465028	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=175,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.144:20:10,0:7,2:0|1:150465026_G_A:150465026:0,18,1,1
chr1	150471496	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:4,11,2,0
chr1	150477061	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:2,2:5,5:5,2,6,2
chr1	150479326	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr1	150479364	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=174,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:150479364_GA_G:150479364:12,0,1,1
chr1	150479367	.	GTT	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:7,2:5,0:0|1:150479364_GA_G:150479364:13,0,1,1
chr1	150479370	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=167,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:7,2:4,0:0|1:150479364_GA_G:150479364:12,0,1,1
chr1	150482738	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:0,6,0,7
chr1	150483840	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	150484395	.	ACC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=220,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	150525546	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.114:32:12,0:16,0:2,27,3,0
chr1	150525550	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.138:33:11,0:16,0:2,27,4,0
chr1	150525555	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.131:32:11,1:17,2:0,28,4,0
chr1	150529322	.	T	TAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	150530548	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:4,9:5,6:7,2,10,6
chr1	150531380	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=207,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,6:2,0:4,0,5,1
chr1	150531730	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=164,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:8,0:4,0:0|1:150531730_T_G:150531730:2,11,2,0
chr1	150531735	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,10;MFRL=119,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:8,0:5,0:0|1:150531730_T_G:150531730:3,12,2,0
chr1	150550019	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,0,14
chr1	150552013	.	TCGC	T	.	.	DP=104;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=159,232;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CGC;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,2:0.038:73:19,0:36,1:15,56,0,2
chr1	150552042	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.468:45:8,7:16,14:1,23,2,19
chr1	150599094	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=187,184;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	150599101	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=187,184;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	150599112	.	A	AACTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=193,184;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	150671045	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,200;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,1:14,1:25,3,1,1
chr1	150671243	.	AC	A	.	.	DP=147;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=221.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,69:0.511:135:34,31:31,37:15,51,9,60
chr1	150676485	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:7,0,1,2
chr1	150676674	.	TAA	T,TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,33,31;MFRL=151,142,149;MMQ=60,60,60;MPOS=20,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=10.05,11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,6,8:0.241,0.315:26:3,1,1:7,5,6:3,9,0,14
chr1	150679358	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr1	150686599	.	TA	T	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,7:0.076:103:50,5:40,2:36,60,4,3
chr1	150720164	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,47;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr1	150730279	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,2:8,2,7,0
chr1	150730556	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=201,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr1	150730557	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=207,200;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	150788637	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:10,0,2,0
chr1	150789884	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:7,5:5,8:4,9,9,5
chr1	150790548	.	A	AAGATTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	150799125	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.259:33:13,6:8,2:3,22,2,6
chr1	150799189	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=187,170;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,2:6,0:0,17,0,2
chr1	150804401	.	GAAA	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=136,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:0,2:0,3,1,1
chr1	150804429	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=114,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:1,1:1,1,0,3
chr1	150804451	.	T	TCCTCTGACTCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	150804484	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	150815017	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=162,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:2,0:0,1:0,4,0,2
chr1	150849071	.	ACC	A,AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29,30;MFRL=0,188,174;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=C;STR;TLOD=16.98,12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,6:0.501,0.438:13:0,5,2:0,2,3:0,0,0,13
chr1	150915017	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:5,2,2,3
chr1	150917697	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr1	150923774	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	150932972	.	G	C,A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,13,25;MFRL=95,186,137;MMQ=43,47,50;MPOS=22,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.22,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.286,0.420:4:0,0,0:0,0,1:1,0,2,1
chr1	150932977	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,15;MFRL=204,95;MMQ=54,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,0:0,1:2,0,2,1
chr1	150934769	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	150935080	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:11,0:18,2:13,17,1,1
chr1	150938571	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr1	150938616	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,16,3
chr1	150939478	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,13;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.226:18:5,0:4,0:11,3,4,0
chr1	150939744	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=237,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:2,3,4,2
chr1	150940357	.	GC	TT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:9,12:7,11:7,10,14,11
chr1	150940490	.	G	GCCCAGCCAGCCGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:150940490_G_GCCCAGCCAGCCGC:150940490:0,2,0,1
chr1	150940493	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:150940490_G_GCCCAGCCAGCCGC:150940490:0,2,0,1
chr1	150941381	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.421:19:4,3:7,4:10,1,5,3
chr1	150958977	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.653:27:7,7:2,10:7,2,14,4
chr1	150960593	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=133,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:1,9:7,3:6,2,9,3
chr1	150970836	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150970836_T_A:150970836:0,0,0,1
chr1	150970845	.	C	CTGTTTCTCAAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150970836_T_A:150970836:0,0,0,1
chr1	150974162	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr1	150981267	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	150990466	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=282,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr1	150997940	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.572:28:2,7:9,9:8,4,11,5
chr1	150998227	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.431:3:1,0:1,1:0|1:150998227_T_A:150998227:0,2,0,1
chr1	150998234	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.431:3:1,0:1,1:0|1:150998227_T_A:150998227:0,2,0,1
chr1	150998240	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150998227_T_A:150998227:0,1,0,1
chr1	150999863	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,1:1,5:0,2,0,6
chr1	151006539	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,26:0,18:0,0,19,25
chr1	151011320	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=134,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,1:15,1:0|1:151011320_G_A:151011320:19,8,2,0
chr1	151011326	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=128,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,3:0.123:30:12,1:15,2:1|0:151011320_G_A:151011320:19,8,2,1
chr1	151019180	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,16:0,0,9,21
chr1	151019251	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=-1073741809;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:3,0:0|1:151019251_C_T:151019251:2,7,0,2
chr1	151019255	.	TCCCC	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=30,21;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:2,0:0|1:151019251_C_T:151019251:1,5,0,2
chr1	151019260	.	AAC	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=185,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:0,0:0|1:151019251_C_T:151019251:1,3,0,2
chr1	151019265	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,35;MFRL=88,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:151019251_C_T:151019251:0,2,0,2
chr1	151019271	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=287935,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:0,0:0|1:151019271_C_A:151019271:1,1,0,3
chr1	151019274	.	CG	GT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=287935,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:1,0:0|1:151019271_C_A:151019271:1,1,0,3
chr1	151026815	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr1	151028234	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=148.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,24:0,19:0,0,11,33
chr1	151039609	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr1	151065918	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=201,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151065918_T_A:151065918:0,1,0,1
chr1	151065920	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151065918_T_A:151065918:0,1,0,1
chr1	151076208	.	TCCAGCAGA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:151076208_TCCAGCAGA_T:151076208:0,2,0,1
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chr1	151076229	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,0:1,1:0|1:151076208_TCCAGCAGA_T:151076208:0,2,0,1
chr1	151090828	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:4,0:7,2:0,11,0,2
chr1	151104950	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=103.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,13:0,15:0,0,35,2
chr1	151109641	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	151111304	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=213,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151111304_C_T:151111304:0,1,0,1
chr1	151111307	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=213,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151111304_C_T:151111304:0,1,0,1
chr1	151114882	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr1	151115186	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr1	151144321	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=220,139;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:151144321_T_TA:151144321:1,2,0,1
chr1	151144325	.	T	TATTTTATTTTATTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=220,139;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:151144321_T_TA:151144321:1,2,0,1
chr1	151144891	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr1	151146186	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	151149601	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=206,122;MMQ=40,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,11:1,9:0,1,1,19
chr1	151188580	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=157,129;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:10,0:3,2:3,10,0,2
chr1	151188607	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=195,137;MMQ=50,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0,10,0,2
chr1	151209297	.	C	CTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,0;MFRL=188,69;MMQ=53,42;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=22,34;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,0:0,0:0,1,0,2
chr1	151210789	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,5:5,4:0,6,1,8
chr1	151211752	.	CT	TA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=144,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:151211752_CT_TA:151211752:0,4,0,1
chr1	151211760	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=144,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:151211752_CT_TA:151211752:0,4,0,1
chr1	151211762	.	TTT	AGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=194,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:151211762_TTT_AGG:151211762:0,2,0,1
chr1	151211767	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=194,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151211762_TTT_AGG:151211762:0,2,0,1
chr1	151211774	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=172,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:151211752_CT_TA:151211752:0,1,0,1
chr1	151212399	.	C	CCTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	151227353	.	G	GTGGTGAAGGTTTCAAATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.381:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	151237589	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=100,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.683:17:3,5:2,7:5,0,6,6
chr1	151239570	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:6,2:5,2:6,5,2,3
chr1	151252821	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=166,154;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:2,0:0|1:151252821_C_T:151252821:0,3,0,1
chr1	151252824	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=166,154;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:151252821_C_T:151252821:0,3,0,1
chr1	151252830	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=188,154;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:151252821_C_T:151252821:0,2,0,1
chr1	151252832	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=188,154;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:151252821_C_T:151252821:0,2,0,1
chr1	151252847	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151252847_T_C:151252847:0,1,0,1
chr1	151252849	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,17;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:151252847_T_C:151252847:0,1,0,1
chr1	151260444	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,1:9,1:15,3,2,0
chr1	151262372	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.381:6:3,1:0,0:0|1:151262372_A_AG:151262372:0,4,0,2
chr1	151262377	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,17;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.439:5:2,0:0,0:0|1:151262372_A_AG:151262372:0,3,0,2
chr1	151262380	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=18,12;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.439:5:1,0:0,0:0|1:151262372_A_AG:151262372:0,3,0,2
chr1	151262384	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	151262390	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.826:4:0,0:0,0:0,0,0,4
chr1	151266714	.	T	TAACAGCATCCATATCCGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr1	151271583	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,0:5,3:2,6,0,3
chr1	151282841	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:1,2:5,8:0,6,0,10
chr1	151314379	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	151337788	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:4,2:0,1:0,4,0,4
chr1	151339353	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:16,3:10,0:9,18,2,1
chr1	151341703	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr1	151341747	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:151341747_G_C:151341747:1,2,0,1
chr1	151341749	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:151341747_G_C:151341747:1,2,0,1
chr1	151345227	.	G	GAGTTTGTAGAGACTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	151373200	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=182.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,27:0,25:0,0,43,12
chr1	151377248	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr1	151380504	.	AAAAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.515:7:1,4:0,0:3,0,4,0
chr1	151380725	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=175,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.297:21:3,0:4,4:1,14,1,5
chr1	151381320	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr1	151384338	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=163,428;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,1:3,0:0,7,0,2
chr1	151384711	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	151384733	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	151395782	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	151396037	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,1,12
chr1	151400942	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0,0,0,12
chr1	151402045	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,17,3
chr1	151497140	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:7,8:7,3:8,6,6,5
chr1	151497376	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chr1	151499635	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,4:4,7:0,7,1,10
chr1	151501737	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	151505097	.	T	TAAACACATTGTATGAGTTAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr1	151508061	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:1,1:1,2:1,1,2,2
chr1	151535020	.	A	ATC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TC;STR;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:5,6:1,1:5,1,7,0
chr1	151542099	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:6,7:12,3:17,1,8,2
chr1	151546679	.	C	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.133:18:8,0:7,0:14,2,2,0
chr1	151546931	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:6,6:12,10:0,18,0,16
chr1	151551320	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:2,4,2,5
chr1	151552301	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr1	151553606	.	G	GGATGAATGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151553606_G_GGATGAATGAC:151553606:0,1,0,1
chr1	151553609	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151553606_G_GGATGAATGAC:151553606:0,1,0,1
chr1	151634803	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr1	151634822	.	TA	GG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	151634833	.	T	TGGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:151634833_T_TGGA:151634833:0,3,0,1
chr1	151634836	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:151634833_T_TGGA:151634833:0,3,0,1
chr1	151681567	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:8,5:6,0:5,9,1,4
chr1	151688308	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=65,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:4,0:1,4,1,0
chr1	151700189	.	C	CCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	151701136	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=59,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:2,2,2,0
chr1	151732700	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	151733335	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:11,3:4,6:9,6,4,5
chr1	151735711	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=10,23;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.740:11:1,0:0,4:0|1:151735711_G_C:151735711:3,0,8,0
chr1	151735714	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=14,21;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.581:14:0,1:0,3:0|1:151735711_G_C:151735711:6,0,8,0
chr1	151735720	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=114,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,0:4,1:0|1:151735711_G_C:151735711:7,1,5,0
chr1	151735721	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=118,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:3,0:5,0:0|1:151735711_G_C:151735711:8,1,5,0
chr1	151735724	.	C	CAAG	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=114,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.304:11:2,0:6,1:0|1:151735711_G_C:151735711:7,1,3,0
chr1	151740479	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr1	151742550	.	GGAGAGA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=171,170;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=GA;STR;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,1:2,3:0|1:151742550_GGAGAGA_G:151742550:4,0,4,0
chr1	151742565	.	GGGAGACCATGGGGAGACGGAGAC	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=153,170;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.425:10:1,1:3,3:0|1:151742550_GGAGAGA_G:151742550:6,0,4,0
chr1	151747043	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,4:3,7:1,6,3,8
chr1	151747733	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:1,6,1,2
chr1	151747799	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,9:0,0,8,2
chr1	151748417	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=157,79;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,0:9,3:2,18,0,3
chr1	151748425	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=38,32;MFRL=79,160;MMQ=54,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:0,8:3,6:0,3,1,13
chr1	151751081	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.596:15:4,6:1,3:0,6,3,6
chr1	151754112	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr1	151774881	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:6,8,2,0
chr1	151780177	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	151783736	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr1	151789588	.	C	CTGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=TG;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.761:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	151789609	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	151810304	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	151811226	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	151820845	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr1	151955803	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:3,2:2,1:0,6,1,6
chr1	152057917	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,345;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:11,2:11,13,1,1
chr1	152079823	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,16,1
chr1	152128121	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,52:0.468:110:29,31:22,13:34,24,35,17
chr1	152187807	.	C	CAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0|1:152187807_C_CAAA:152187807:0,0,0,1
chr1	152187809	.	G	GAACAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:152187807_C_CAAA:152187807:0,0,0,1
chr1	152191469	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,4:6,2:9,7,5,1
chr1	152192219	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=130,141;MMQ=48,34;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:13,3:19,2:14,18,0,5
chr1	152193990	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,6,4
chr1	152195728	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	152280503	.	C	CACGCGGGCAGCGTCAGCTGGTCG	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=144,2034;MMQ=52,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,2:0.049:58:28,2:27,0:26,30,0,2
chr1	152383429	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:152383429_A_AG:152383429:0,1,0,1
chr1	152383431	.	A	ACAGAGAAGTGGCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:152383429_A_AG:152383429:0,1,0,1
chr1	152484719	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=168,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:4,0:0,1:0|1:152484719_C_CA:152484719:0,4,0,1
chr1	152484722	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.347:4:2,1:1,0:1|0:152484719_C_CA:152484719:0,3,0,1
chr1	152484723	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=168,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:4,0:0,1:0|1:152484719_C_CA:152484719:0,4,0,1
chr1	152484725	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.347:4:2,1:1,0:1|0:152484719_C_CA:152484719:0,3,0,1
chr1	152538358	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:4,0,7,1
chr1	152552461	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,27:0.459:59:18,8:14,19:1,31,6,21
chr1	152637150	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:2,3:3,5:2,3,2,6
chr1	152649114	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=224,252;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr1	152681543	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=215.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.986:64:0,29:0,35:0,0,48,16
chr1	152681680	.	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=132.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.974:31:0,15:0,7:0,0,6,25
chr1	152691943	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr1	152692588	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.617:19:4,7:3,4:3,4,11,1
chr1	152692948	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.367:28:10,3:6,7:0|1:152692948_T_A:152692948:6,12,4,6
chr1	152692952	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,10:0.379:27:10,2:7,8:0|1:152692948_T_A:152692948:5,12,4,6
chr1	152733415	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:152733415_C_CT:152733415:0,2,0,1
chr1	152733416	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:152733415_C_CT:152733415:0,2,0,1
chr1	152733420	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:152733415_C_CT:152733415:0,2,0,1
chr1	152734187	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,29:0.597:48:9,7:10,20:7,12,13,16
chr1	152759678	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,5:4,6:11,0,11,0
chr1	152759950	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,136;MMQ=52,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:2,5,2,3
chr1	152785348	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:23,0:13,3:21,15,0,3
chr1	152816076	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.077:42:23,2:16,0:20,19,1,2
chr1	152883278	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:9,1:12,0:0|1:152883278_G_C:152883278:14,9,2,0
chr1	152883279	.	CTGG	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,1:14,0:0|1:152883278_G_C:152883278:14,9,2,0
chr1	152883680	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.459:51:11,10:13,11:9,19,10,13
chr1	152884246	.	GA	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,3:1,1:3,4,3,1
chr1	152884438	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=223,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	152944594	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,11:0,0,19,11
chr1	152957887	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=73,155;MMQ=27,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.845:23:2,10:0,8:2,1,10,10
chr1	152975941	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,17,14
chr1	153004721	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,16,0
chr1	153004778	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=123.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,21:0,16:0,0,35,3
chr1	153004809	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=200.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,37:0,22:0,0,44,17
chr1	153004983	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,6:0,0,5,20
chr1	153066262	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=215,95;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	153122310	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,13:0,6:0,0,20,0
chr1	153122620	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr1	153177696	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=90,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr1	153190590	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,4:3,6:7,0,10,0
chr1	153191399	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:0,5,0,2
chr1	153233488	.	C	CGGCGGT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGCGGT;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.355:9:3,1:1,1:0,6,0,3
chr1	153234602	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=236,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr1	153270362	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr1	153279462	.	TAAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	153283004	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr1	153283179	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.658:36:6,12:6,12:0,12,5,19
chr1	153314347	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	153315467	.	T	TAAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr1	153315784	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	153347130	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:153347130_A_T:153347130:0,1,0,1
chr1	153347134	.	C	CTAACTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:153347130_A_T:153347130:0,1,0,1
chr1	153363054	.	G	GGTATTAGCAAGCAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr1	153391880	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=221,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:0,5,0,7
chr1	153410882	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=151,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.528:6:1,1:0,2:0,3,0,3
chr1	153430249	.	TG	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:6,4:8,9:13,3,12,1
chr1	153509890	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.535:30:6,7:7,9:3,11,6,10
chr1	153535848	.	CA	C,CAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=145,197,171;MMQ=60,60,40;MPOS=11,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.59,6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,5:0.160,0.266:19:4,1,2:5,2,1:9,2,6,2
chr1	153588208	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:6,0,8,0
chr1	153603116	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:19,3:13,0:21,11,1,2
chr1	153604112	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,2:5,1:8,2,3,0
chr1	153609039	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.484:31:7,10:9,5:15,1,11,4
chr1	153615696	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:24,4:21,0:38,7,4,0
chr1	153635425	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:9,1,4,0
chr1	153636462	.	CTACTACTACTAG	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=116,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,14:0.578:24:2,7:4,7:0|1:153636462_CTACTACTACTAG_C:153636462:9,1,14,0
chr1	153636472	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,10:0.695:16:3,5:3,4:1|0:153636462_CTACTACTACTAG_C:153636462:6,0,9,1
chr1	153637617	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:4,0,6,0
chr1	153637885	.	G	GATCATATACT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=200,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:3,1:0,0:0|1:153637885_G_GATCATATACT:153637885:0,3,0,1
chr1	153637886	.	G	GTTTTTGCTTTA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=200,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:3,1:0,0:0|1:153637885_G_GATCATATACT:153637885:0,3,0,1
chr1	153637888	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=200,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:153637885_G_GATCATATACT:153637885:0,3,0,1
chr1	153637899	.	TTTTTTA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.688:1:0,1:0,0:0|1:153637899_TTTTTTA_T:153637899:0,0,0,1
chr1	153637910	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153637899_TTTTTTA_T:153637899:0,0,0,1
chr1	153660492	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.168:26:6,1:10,2:10,12,4,0
chr1	153660514	.	AC	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.537:24:3,4:7,7:2,9,4,9
chr1	153661374	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,2:2,3:3,0,6,0
chr1	153661402	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:2,0:1,0:7,3,4,0
chr1	153665749	.	AC	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,0:11,2:13,9,1,1
chr1	153665919	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:6,1:3,2:1,8,0,3
chr1	153719841	.	T	TG	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,2:0.047:62:28,0:29,2:0|1:153719841_T_TG:153719841:14,46,1,1
chr1	153719844	.	G	GA	.	.	DP=63;ECNT=6;MBQ=32,19;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:28,0:31,1:0|1:153719841_T_TG:153719841:14,47,1,1
chr1	153719848	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:27,0:32,2:0|1:153719841_T_TG:153719841:13,49,1,1
chr1	153719851	.	G	GC	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=32,17;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,2:0.048:60:24,0:27,1:0|1:153719841_T_TG:153719841:9,49,1,1
chr1	153719853	.	C	CTTAG	.	.	DP=58;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:19,0:31,1:0|1:153719841_T_TG:153719841:9,47,1,1
chr1	153719889	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=33,25;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:10,0:17,3:2,25,0,3
chr1	153745262	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:153745262_A_T:153745262:1,1,0,1
chr1	153745263	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:153745262_A_T:153745262:1,1,0,1
chr1	153751116	.	G	GACCTGACT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=260,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:0|1:153751116_G_GACCTGACT:153751116:1,3,1,1
chr1	153751118	.	C	CATAATAGTCACTAGTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=260,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:153751116_G_GACCTGACT:153751116:1,3,1,1
chr1	153751805	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:11,4:7,4:10,8,3,5
chr1	153784678	.	T	TGTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=187,158;MMQ=58,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	153784680	.	T	TGGAAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=152,221;MMQ=56,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:153784680_T_TGGAAAC:153784680:0,3,0,1
chr1	153784683	.	T	TGCATTTGCCTCTGTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=152,221;MMQ=56,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:153784680_T_TGGAAAC:153784680:0,3,0,1
chr1	153790501	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:14,2:15,4:19,10,5,1
chr1	153791209	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:153791209_A_C:153791209:1,0,0,1
chr1	153791210	.	C	CAGATTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153791209_A_C:153791209:1,0,0,1
chr1	153791214	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	153792300	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.228:14:3,0:6,3:1,10,0,3
chr1	153903386	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:5,0:3,0:0|1:153903386_A_G:153903386:3,5,4,0
chr1	153903390	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:2,1:3,1:0|1:153903386_A_G:153903386:3,5,4,0
chr1	153903394	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,0:3,0:0|1:153903386_A_G:153903386:3,7,3,0
chr1	153903399	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:3,1:5,1:0|1:153903386_A_G:153903386:3,11,3,0
chr1	153906111	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,1:10,1:4,12,1,1
chr1	153906397	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=144,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,3:3,3:1,9,3,3
chr1	153907278	.	CCTGCTGCTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=158,0;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=CTG;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:0,3:4,0:1,4,1,2
chr1	153912354	.	A	AGCTGGCTCAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153912354_A_AGCTGGCTCAGC:153912354:0,1,0,1
chr1	153912357	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153912354_A_AGCTGGCTCAGC:153912354:0,1,0,1
chr1	153913699	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,124;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,4:8,3:14,3,5,2
chr1	153920564	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,4:6,1:12,3,5,0
chr1	153927270	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:3,1,6,1
chr1	153930752	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=209,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:0,0:2,1:0|1:153930752_G_C:153930752:2,0,3,0
chr1	153930757	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:0,0:3,1:0|1:153930752_G_C:153930752:3,0,3,0
chr1	153935208	.	C	CACCCTCCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=0,106;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153935208_C_CACCCTCCTCTG:153935208:0,1,0,1
chr1	153935211	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=0,106;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153935208_C_CACCCTCCTCTG:153935208:0,1,0,1
chr1	153935212	.	T	TGGTGCCCATCTGTGTGCTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=0,106;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153935208_C_CACCCTCCTCTG:153935208:0,1,0,1
chr1	153954674	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=111,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,21:0.400:53:17,9:15,12:8,24,5,16
chr1	153963995	.	A	AAG	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.377:35:9,8:12,3:11,11,7,6
chr1	154000022	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=128,105;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.098:39:15,3:20,0:17,19,3,0
chr1	154027381	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31,31,30;MFRL=167,4438,168,206;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,26,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.39,8.05,3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,4,2:0.230,0.396,0.227:9:1,2,2,2:0,0,2,0:0,1,0,8
chr1	154029450	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,3:2,2:7,2,0,5
chr1	154061855	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,18,1
chr1	154072666	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,94;MMQ=60,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:2,12,1,1
chr1	154141908	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,6:6,3:0,9,0,9
chr1	154144024	.	G	GCACAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	154144673	.	GA	G	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.075:64:25,0:19,4:30,30,2,2
chr1	154144891	.	AT	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:24,3:21,2:11,36,1,4
chr1	154178202	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr1	154186918	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.375:38:12,6:11,8:13,11,8,6
chr1	154192463	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.363:19:6,3:6,2:1,11,0,7
chr1	154207834	.	AT	A,ATT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,31,15;MFRL=166,143,154;MMQ=60,60,60;MPOS=16,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.72,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,4,3:0.121,0.106:33:7,1,0:10,2,1:0,26,0,7
chr1	154218639	.	TTCAG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=199,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:8,1,3,0
chr1	154227292	.	GT	G,GTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,36,35;MFRL=165,141,201;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.01,4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,3:0.326,0.265:12:2,1,0:3,3,3:5,0,7,0
chr1	154227670	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0|1:154227670_C_CA:154227670:14,7,1,1
chr1	154227671	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0|1:154227670_C_CA:154227670:14,7,1,1
chr1	154228287	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:6,2:3,3:0,9,1,4
chr1	154243385	.	T	TAAGCTCATAACGCATCTCCCCCATCACAC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.161:26:14,3:6,0:11,12,2,1
chr1	154303430	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:5,11,0,3
chr1	154303705	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=213,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:154303705_C_T:154303705:0,3,0,2
chr1	154303709	.	C	CAGAGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.327:4:1,1:2,0:1|0:154303705_C_T:154303705:0,3,0,1
chr1	154303715	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=203,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:154303705_C_T:154303705:0,4,0,1
chr1	154305010	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	154305190	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,15:0.345:44:12,4:16,9:11,18,4,11
chr1	154310223	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,1:0,2,0,5
chr1	154313625	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=197,0;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr1	154317281	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=75,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:1,3,0,5
chr1	154317418	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:3,2:1,4:4,0,7,0
chr1	154318172	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=204,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:4,1,4,0
chr1	154321072	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	154401972	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=146,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,1:1,3:0,4,1,3
chr1	154407181	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,0:5,2:3,13,0,2
chr1	154407419	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr1	154437896	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	154458932	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	154459197	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	154461480	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	154479657	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr1	154479670	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr1	154492702	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	154493721	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr1	154516827	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:14,3:13,4:20,7,6,1
chr1	154520197	.	C	CATCCTTCCCCATCAAACTTGCTGATACACTCCTACCTTT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=161,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.104:38:15,0:17,3:16,19,2,1
chr1	154523588	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	154528086	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	154557685	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.358:37:12,8:12,5:16,8,10,3
chr1	154562594	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:1,1,1,0
chr1	154562614	.	A	AGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,18;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1,1,1,0
chr1	154562621	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154562621_C_T:154562621:0,0,1,0
chr1	154562625	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154562621_C_T:154562621:0,0,1,0
chr1	154562845	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,1:9,1:13,10,0,2
chr1	154575131	.	A	AAATTGGACATGTAAAGGTGGGCATC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	154580551	.	C	CGTGGGTAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:13,2:9,0:0|1:154580551_C_CGTGGGTAA:154580551:0,22,0,2
chr1	154580556	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=188,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:8,0:0|1:154580551_C_CGTGGGTAA:154580551:0,21,0,2
chr1	154744937	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:6,2:5,4:1,10,0,7
chr1	154832290	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=211,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0|1:154832290_C_T:154832290:0,4,0,7
chr1	154832304	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1|0:154832290_C_T:154832290:0,4,0,4
chr1	154832322	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=135,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1|0:154832290_C_T:154832290:0,1,0,4
chr1	154842199	.	G	GGCTGCTGCTGCT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,18;RU=GCT;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.926:9:0,3:0,4:0,0,2,7
chr1	154926102	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,0:3,0:0|1:154926102_A_C:154926102:0,5,5,0
chr1	154926108	.	CAA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=116,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,2:3,1:0|1:154926102_A_C:154926102:0,8,5,0
chr1	154936832	.	CG	TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=243,175;MMQ=55,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:154936832_CG_TA:154936832:0,2,0,1
chr1	154936835	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=243,175;MMQ=55,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:154936832_CG_TA:154936832:0,2,0,1
chr1	154936849	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=252,233;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154936849_C_T:154936849:0,1,0,1
chr1	154936853	.	A	AATAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=252,233;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:154936849_C_T:154936849:0,1,0,1
chr1	154962220	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=140,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:154962220_T_TA:154962220:0,4,0,1
chr1	154962221	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=140,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:154962220_T_TA:154962220:0,4,0,1
chr1	154962233	.	A	ATTCTCCCAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=228,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	154987697	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,1:6,0:0|1:154987697_A_C:154987697:1,11,2,0
chr1	154987700	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,23;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:5,1:6,0:0|1:154987697_A_C:154987697:2,12,2,0
chr1	154987703	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,0:0|1:154987697_A_C:154987697:1,13,2,0
chr1	154987706	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,11;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,0:0|1:154987697_A_C:154987697:1,12,2,0
chr1	154987709	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=29,18;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:7,0:0|1:154987697_A_C:154987697:2,13,2,0
chr1	154987712	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,0:0|1:154987697_A_C:154987697:2,13,2,0
chr1	154989048	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:11,1:21,2:24,8,3,0
chr1	154996256	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:4,3:11,4:15,1,5,2
chr1	155002562	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.453:16:4,3:3,4:6,3,5,2
chr1	155003954	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	155005084	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr1	155014219	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:13,0:8,2:16,7,2,0
chr1	155019710	.	A	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,28:0.449:63:21,8:12,20:17,18,16,12
chr1	155028496	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=191,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:155028496_A_C:155028496:1,3,1,0
chr1	155028502	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=202,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:155028496_A_C:155028496:1,2,1,0
chr1	155028522	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,2,2
chr1	155041513	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:3,9,0,2
chr1	155057499	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,12:0,0,17,2
chr1	155057942	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=215,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:0,0:1,2:0,6,0,6
chr1	155059035	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,1:1,1:0,7,0,2
chr1	155103860	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:7,1,2,0
chr1	155103915	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,2:9,1:10,12,2,1
chr1	155105882	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=73,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:1,1:4,0,2,0
chr1	155106550	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr1	155108287	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,2:0,11:0,0,7,6
chr1	155108663	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr1	155108900	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.388:29:11,1:2,3:9,8,0,12
chr1	155108910	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=15,17;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.297:23:4,0:2,2:6,10,0,7
chr1	155109218	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=204,163;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.320:15:4,1:6,4:10,0,5,0
chr1	155109528	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=272,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	155142210	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=263.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,60:0.984:60:0,31:0,29:0|1:155142210_A_G:155142210:0,0,54,6
chr1	155142229	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=340.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,84:0.989:84:0,42:0,42:0|1:155142210_A_G:155142210:0,0,66,18
chr1	155154718	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155154718_T_G:155154718:0,0,0,1
chr1	155154727	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155154718_T_G:155154718:0,0,0,1
chr1	155162067	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,9,19
chr1	155167786	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.443:39:9,9:11,8:12,10,11,6
chr1	155170372	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,2:13,0:7,14,0,2
chr1	155171651	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=184,8643790;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155171651_G_C:155171651:1,0,1,0
chr1	155171659	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=184,8643790;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155171651_G_C:155171651:1,0,1,0
chr1	155181843	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	155182164	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,19,9
chr1	155184975	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,8:0,0,2,13
chr1	155205669	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,4:0,0,2,12
chr1	155209360	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,4:3,4:6,3,5,3
chr1	155235769	.	G	GCTGATACCAGTTA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:2,21,0,2
chr1	155257478	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:3,0:3,3,2,0
chr1	155288511	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:15,3:15,0:14,17,1,2
chr1	155291032	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.187:28:10,1:6,0:7,15,6,0
chr1	155294772	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,12:0,0,6,17
chr1	155313047	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	155313465	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.108:25:11,1:12,1:13,10,0,2
chr1	155313501	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,0:16,2:9,16,1,1
chr1	155330298	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,192;MMQ=52,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	155350017	.	AATTCTTTAAGGATTTTTCCATCACC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	155408222	.	TG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,136;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,3:7,0:12,5,3,0
chr1	155686712	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=176,142;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:11,0,2,0
chr1	155686739	.	C	CAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.223:20:6,1:8,1:15,1,2,2
chr1	155695904	.	C	CCGGTGCCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.315:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	155708017	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=144,43;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.126:22:11,2:7,0:0|1:155708017_A_T:155708017:11,9,1,1
chr1	155708030	.	C	CTTAATTACCCAGCTCTTGTTCATCCTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=149,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:10,2:7,0:0|1:155708017_A_T:155708017:9,9,1,1
chr1	155724320	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=151,129;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0|1:155724320_T_TG:155724320:2,2,0,2
chr1	155724326	.	T	TGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=158,129;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:155724320_T_TG:155724320:2,5,0,2
chr1	155736285	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,146;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.107:62:25,2:29,4:22,34,4,2
chr1	155737425	.	AACACAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=192,176;MMQ=39,39;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=AC;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.435:7:3,1:0,1:0,4,0,3
chr1	155744932	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,192;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,4:0.065:74:36,2:32,2:49,21,3,1
chr1	155746340	.	CTT	C,CT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,35,33;MFRL=177,154,154;MMQ=60,60,60;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.89,52.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,21:0.125,0.747:27:1,1,9:2,2,10:0,3,0,24
chr1	155747369	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:7,2:10,1:16,8,1,2
chr1	155753676	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,4,6
chr1	155755239	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr1	155785578	.	CAACT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,18:0,10:0,0,24,4
chr1	155822971	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	155823002	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	155870416	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,5:0,0,2,16
chr1	155880760	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,3,20
chr1	155883864	.	T	TTG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,1:0|1:155883864_T_TTG:155883864:19,0,2,0
chr1	155883867	.	TGC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:0|1:155883864_T_TTG:155883864:20,0,2,0
chr1	155883872	.	AGAAGAGTCACTGAGGGT	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:10,0:11,2:0|1:155883864_T_TTG:155883864:32,2,2,0
chr1	155891518	.	A	AGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:2,1:13,1:0|1:155891518_A_AGG:155891518:7,8,0,2
chr1	155891519	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:2,1:13,1:0|1:155891518_A_AGG:155891518:7,8,0,2
chr1	155899020	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr1	155903408	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,6:0,20:0,0,10,16
chr1	155917880	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=103.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,14:0,17:0,0,2,32
chr1	155928232	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,7,9
chr1	155928242	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,8:0,3:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,3,10
chr1	155928298	.	C	CAGTTCCAAAATCACTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=151,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	155936789	.	CCC	ATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	155948297	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:0,0:2,2:1,2,1,1
chr1	155981489	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	155981587	.	A	ATCATGAAGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=156,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:0|1:155981587_A_ATCATGAAGT:155981587:10,4,1,1
chr1	155981596	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,2:11,0:0|1:155981587_A_ATCATGAAGT:155981587:13,4,1,1
chr1	155990584	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.351:6:1,0:2,0:0|1:155990584_C_A:155990584:3,1,2,0
chr1	155990587	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.308:7:2,0:2,0:0|1:155990584_C_A:155990584:4,1,2,0
chr1	155990591	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.308:7:2,0:3,0:0|1:155990584_C_A:155990584:4,1,2,0
chr1	155990596	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.308:7:2,0:3,0:0|1:155990584_C_A:155990584:4,1,2,0
chr1	156021728	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156021728_T_C:156021728:0,0,0,1
chr1	156021731	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156021728_T_C:156021728:0,0,0,1
chr1	156021732	.	CACT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156021728_T_C:156021728:0,0,0,1
chr1	156028218	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=14,18;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.294:12:1,0:3,1:1,8,0,3
chr1	156051888	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156051888_G_A:156051888:0,1,0,1
chr1	156051889	.	GGTGTGT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156051888_G_A:156051888:0,1,0,1
chr1	156132909	.	GCA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:2,5,2,3
chr1	156146218	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,9,8
chr1	156169610	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr1	156182710	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,7,1
chr1	156195246	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=222,220;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:156195246_A_C:156195246:3,0,1,0
chr1	156195253	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=222,220;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:0|1:156195246_A_C:156195246:3,0,1,0
chr1	156202173	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,6:1,6:1,5,6,6
chr1	156203572	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,1:1,1:0,6,0,3
chr1	156214251	.	CCTCTGGGCCTGCTACTCCCCCATAAATTGAGAAT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156214251_CCTCTGGGCCTGCTACTCCCCCATAAATTGAGAAT_C:156214251:0,0,0,1
chr1	156214289	.	AAAC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156214251_CCTCTGGGCCTGCTACTCCCCCATAAATTGAGAAT_C:156214251:0,0,0,1
chr1	156219450	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,8:0,0,17,1
chr1	156230141	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	156230206	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,8:0,0,13,2
chr1	156231266	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr1	156255833	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	156256135	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,39;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,1:12,1:9,13,1,1
chr1	156261491	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	156264676	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:14,2:15,0:10,19,2,0
chr1	156287403	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	156304782	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=214,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0|1:156304782_A_G:156304782:0,1,0,4
chr1	156304784	.	A	ACAGACCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=211,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:156304782_A_G:156304782:0,4,0,1
chr1	156351066	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	156437348	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:21,3:19,0:39,1,3,0
chr1	156446242	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,15,8
chr1	156496188	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	156498384	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=124,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,0:11,3:7,14,1,2
chr1	156502756	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:7,2,0,2
chr1	156502973	.	A	ACACTCTCTCAGGCTCTGTTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.474:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	156503541	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,11:0,0,13,3
chr1	156505063	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:2,12,1,1
chr1	156509552	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	156510582	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,2:12,0:16,10,2,0
chr1	156520173	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,1:0,11:0,0,1,11
chr1	156526234	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	156531871	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	156532344	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,14,2
chr1	156532908	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,14:0,0,16,13
chr1	156534525	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,3,21
chr1	156534539	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,7:0,0,3,17
chr1	156536123	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=104.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,10:0,12:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,22,2
chr1	156536133	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=123.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.970:30:0,13:0,16:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,25,5
chr1	156536353	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=62.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0,0,1,17
chr1	156539154	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=93.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,15:0,0,17,11
chr1	156539329	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=232,153;MMQ=47,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:156539329_T_G:156539329:1,4,0,2
chr1	156539335	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=203,153;MMQ=44,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:156539329_T_G:156539329:0,4,0,2
chr1	156553762	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	156562008	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,6,15
chr1	156562143	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,5:0,0,11,3
chr1	156563898	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,7,15
chr1	156564922	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,6,1
chr1	156565049	.	A	AAC	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=313.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,40:0,28:0,0,46,28
chr1	156566111	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:6,2:2,4:8,0,6,1
chr1	156593462	.	ACTG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156593462_ACTG_A:156593462:0,3,0,1
chr1	156593465	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:1,1:1,0:1|0:156593462_ACTG_A:156593462:0,2,0,1
chr1	156593468	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156593462_ACTG_A:156593462:0,3,0,1
chr1	156593470	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:156593462_ACTG_A:156593462:0,3,0,1
chr1	156593472	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:156593462_ACTG_A:156593462:0,3,0,1
chr1	156594656	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	156617560	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	156617965	.	CCCGGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=273,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.406:3:0,1:2,0:0|1:156617965_CCCGGGG_C:156617965:0,2,0,1
chr1	156617968	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=348,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:156617965_CCCGGGG_C:156617965:0,1,0,1
chr1	156617974	.	TCTGCAGGA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:156617965_CCCGGGG_C:156617965:0,3,0,1
chr1	156626920	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	156640156	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,3,4
chr1	156640678	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr1	156645003	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:14,3:7,0:15,6,1,2
chr1	156670545	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr1	156675066	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr1	156704328	.	CT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=19,20,28;MFRL=118,140,147;MMQ=53,60,60;MPOS=27,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.77,5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.346,0.342:6:0,1,1:0,0,1:0,2,0,4
chr1	156706559	.	A	C,G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34,24;MFRL=0,151,131;MMQ=60,60,60;MPOS=7,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.58,23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,9:0.250,0.682:12:0,2,6:0,0,3:0,0,3,9
chr1	156707775	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=91.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,22,5
chr1	156713269	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,3:0.060:64:32,3:26,0:0|1:156713269_G_A:156713269:29,32,2,1
chr1	156713274	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,86;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.058:67:34,3:28,0:0|1:156713269_G_A:156713269:30,34,2,1
chr1	156721032	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,3:1,1:4,0,5,0
chr1	156722020	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:7,2:19,0:11,15,0,2
chr1	156752231	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	156785650	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:17,0:13,2:0|1:156785650_T_A:156785650:12,21,1,1
chr1	156785657	.	C	CTACCACTCACT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=141,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:14,0:15,2:0|1:156785650_T_A:156785650:12,22,1,1
chr1	156785762	.	AG	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,13:0,11:0|1:156785762_AG_A:156785762:0,0,19,7
chr1	156785771	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=116.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,11:0|1:156785762_AG_A:156785762:0,0,21,6
chr1	156785779	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=112.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,12:0,10:0|1:156785762_AG_A:156785762:0,0,21,5
chr1	156814385	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,2:12,0:12,13,1,1
chr1	156814478	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,10,11
chr1	156815668	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=21,13;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.256:18:2,0:5,0:9,5,4,0
chr1	156815705	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.369:16:3,1:2,0:9,1,6,0
chr1	156818647	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=15736332,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	156838141	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr1	156844188	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=111,59;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,1:13,1:5,11,0,2
chr1	156875092	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,2,0
chr1	156875097	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,2,0
chr1	156875107	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,2,1
chr1	156875985	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	156876737	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	156877457	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=240.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.987:69:0,36:0,32:0,0,26,43
chr1	156883796	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.191:14:3,2:6,0:6,6,2,0
chr1	156893837	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:4,0:0|1:156893837_G_C:156893837:1,17,2,0
chr1	156893843	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:4,0:0|1:156893837_G_C:156893837:2,20,2,0
chr1	156893847	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:17,2:5,0:0|1:156893837_G_C:156893837:2,21,2,0
chr1	156893850	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,2:5,0:0|1:156893837_G_C:156893837:2,21,2,0
chr1	156894355	.	C	CGGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156894355_C_CGGA:156894355:0,1,1,0
chr1	156894356	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,11;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156894355_C_CGGA:156894355:0,1,1,0
chr1	156894363	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156894355_C_CGGA:156894355:0,1,1,0
chr1	156894367	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=158,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0|1:156894355_C_CGGA:156894355:2,1,1,0
chr1	156909772	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156909772_GC_G:156909772:0,0,0,1
chr1	156909775	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156909772_GC_G:156909772:0,0,0,1
chr1	156914240	.	C	CCATT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CATT;STR;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.634:9:2,3:1,2:0,3,0,6
chr1	156926172	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:2,1:14,0:0|1:156926172_A_G:156926172:13,3,2,0
chr1	156926175	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:1,1:14,1:0|1:156926172_A_G:156926172:13,3,2,0
chr1	156933490	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=300,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156933490_A_T:156933490:0,1,0,1
chr1	156933497	.	T	TAGCTGAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=300,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156933490_A_T:156933490:0,1,0,1
chr1	157062364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr1	157485561	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:6,2:3,7:1,9,7,2
chr1	157485720	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,6,17
chr1	157491173	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	157504747	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	157508801	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=130,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	157508975	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:8,1:14,1:10,12,1,1
chr1	157519210	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=161,134;MMQ=60,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:16,2:26,0:42,0,2,0
chr1	157522016	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr1	157545231	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	157548669	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,9:0,0,8,18
chr1	157557957	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	157566019	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr1	157566211	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=93.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,17:0,9:0,0,3,24
chr1	157646631	.	C	CCTGACAGGA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,36;MFRL=170,113;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:157646631_C_CCTGACAGGA:157646631:0,2,0,1
chr1	157646634	.	G	GTATTTACTTGAGA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=170,113;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:157646631_C_CCTGACAGGA:157646631:0,2,0,1
chr1	157646638	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=128,113;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	157646642	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=128,113;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:157646631_C_CCTGACAGGA:157646631:0,1,0,1
chr1	157646645	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=128,113;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:157646631_C_CCTGACAGGA:157646631:0,1,0,1
chr1	157646647	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=36,30;MFRL=128,113;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:157646631_C_CCTGACAGGA:157646631:0,1,0,1
chr1	157646659	.	AGG	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157646659_AGG_A:157646659:0,0,0,1
chr1	157646664	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=23,30;MFRL=224,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:157646659_AGG_A:157646659:0,1,0,1
chr1	157652929	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.560:41:8,18:10,5:17,1,23,0
chr1	157668378	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:5,10:10,10:4,12,8,14
chr1	157668390	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.477:38:8,7:11,11:7,13,5,13
chr1	157669580	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,6:6,2:2,8,0,8
chr1	157718231	.	C	CAAAT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=212,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=AAAT;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	157718283	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=96.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,13:0,0,21,5
chr1	157718325	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,24:0.641:37:7,16:6,8:10,3,10,14
chr1	157718430	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:4,5:7,9:0,11,3,11
chr1	157718645	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,8:3,2:5,1,6,4
chr1	157718780	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=113,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr1	157718835	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.299:9:1,2:5,0:1,6,0,2
chr1	157737504	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	157740186	.	GTC	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,6:0,12:0|1:157740186_GTC_G:157740186:0,0,14,6
chr1	157740189	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.956:20:0,6:0,12:0|1:157740186_GTC_G:157740186:0,0,14,6
chr1	157802979	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:9,2,5,0
chr1	157806006	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	157811392	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:5,4:10,7:11,5,11,0
chr1	157811585	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,3:3,6:0,3,0,9
chr1	158056299	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr1	158057691	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:3,4,1,4
chr1	158058109	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=108,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.544:33:6,6:8,11:12,3,12,6
chr1	158063222	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr1	158064107	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.168:40:15,0:10,0:20,14,6,0
chr1	158151218	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:9,5:3,2:10,2,2,5
chr1	158153996	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr1	158227367	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,127;MMQ=60,26;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:24,0:18,3:23,20,0,3
chr1	158262497	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:11,2:11,12,1,1
chr1	158262734	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	158298679	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.197:32:11,2:13,3:23,3,5,1
chr1	158325709	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,142;MMQ=41,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,27:0.529:51:16,14:8,13:12,12,15,12
chr1	158368392	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:6,9:12,9:9,9,10,8
chr1	158389659	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:2,3:8,10:7,3,12,1
chr1	158389693	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,25:0.443:57:9,7:21,18:16,16,13,12
chr1	158390315	.	C	CT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=147,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.110:42:19,0:19,4:18,20,1,3
chr1	158435278	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr1	158436299	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:11,5:8,7:4,15,3,10
chr1	158436354	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr1	158517977	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	158549421	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:6,7:7,10:6,7,6,11
chr1	158584091	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.596:15:4,3:1,5:0,6,2,7
chr1	158584103	.	G	GA,GAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=9,18,13;MFRL=160,161,180;MMQ=60,60,60;MPOS=24,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.49,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,2:0.522,0.243:10:1,1,0:0,1,0:0,3,1,6
chr1	158587784	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=157.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,26:0,17:0,0,37,7
chr1	158588916	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	158595824	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=174,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,5:4,1:5,1,6,0
chr1	158595842	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,9:7,2:10,1,10,1
chr1	158606449	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:6,4:3,5:6,3,5,4
chr1	158607788	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	158609300	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=193,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:3,0,4,0
chr1	158614198	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,4:4,1:6,4,3,2
chr1	158624528	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,9:0,0,1,11
chr1	158627254	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,12;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.317:10:3,0:3,0:0,7,3,0
chr1	158639601	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	158644105	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chr1	158647631	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,10:0,0,6,12
chr1	158653164	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=107,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:10,2:17,0:21,6,2,0
chr1	158655162	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr1	158656347	.	C	CAGAG	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=AG;STR;TLOD=57.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.888:19:2,8:0,3:0,2,0,17
chr1	158735475	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=180,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:158735475_GT_G:158735475:7,2,1,1
chr1	158735483	.	CTGGG	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=187,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:158735475_GT_G:158735475:7,2,1,1
chr1	158735488	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=187,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:158735475_GT_G:158735475:7,2,1,1
chr1	158815298	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=200,161;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,2:9,0:11,0,2,0
chr1	158815319	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,161;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,2:13,0:19,0,2,0
chr1	158817474	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr1	158909164	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr1	158913525	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=131.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,28,9
chr1	158986225	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	158987941	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,17,1
chr1	158990412	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	159002222	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	159002301	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=107.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,13:0,18:0,0,29,2
chr1	159002557	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.970:24:0,12:0,12:0|1:159002557_A_G:159002557:0,0,0,24
chr1	159002577	.	TGGATTG	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.963:18:0,7:0,10:0|1:159002557_A_G:159002557:0,0,0,18
chr1	159043091	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:21,1:24,2:26,20,2,1
chr1	159163119	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	159174824	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=131.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,24:0,12:0,0,24,13
chr1	159174877	.	TCCC	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:0,16,0,2
chr1	159174884	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,1:5,2:0,13,0,3
chr1	159174886	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:4,2:0,14,0,2
chr1	159272764	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:4,4:0,9,1,8
chr1	159275706	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=200,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr1	159277542	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.429:35:9,8:11,6:13,7,11,4
chr1	159284542	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:159284542_G_GC:159284542:0,0,0,1
chr1	159284544	.	A	AGTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159284542_G_GC:159284542:0,0,0,1
chr1	159284545	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159284542_G_GC:159284542:0,0,0,1
chr1	159284547	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159284542_G_GC:159284542:0,0,0,1
chr1	159409533	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,9:0,0,20,5
chr1	159409734	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,8,13
chr1	159684186	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:9,5:8,4:10,7,6,3
chr1	159752066	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:3,4:9,10:7,6,6,8
chr1	159783184	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:6,1,1,1
chr1	159799599	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,4:0,0,8,7
chr1	159825061	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=135,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:2,2:1,6,0,4
chr1	159828128	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,4:5,5:1,8,0,9
chr1	159842379	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,6:4,6:1,7,3,9
chr1	159854392	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr1	159856577	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=220,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	159858290	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:4,2:0,2:1,4,0,4
chr1	159863105	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:13,0:6,4:6,13,0,4
chr1	159869820	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,11:0.192:59:17,3:23,0:11,37,11,0
chr1	159869825	.	C	G	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.079:57:16,0:25,0:15,37,5,0
chr1	159869829	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,5:0.063:67:19,0:29,0:18,44,5,0
chr1	159888585	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:12,1:3,1:16,2,0,3
chr1	159889686	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:2,3:2,3:0,4,1,6
chr1	159897126	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,22:0.324:69:20,9:25,13:37,10,16,6
chr1	159897388	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,4:7,1:0,11,0,5
chr1	159897681	.	TAA	T,TA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,20,30;MFRL=0,139,142;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.74,21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,11:0.309,0.648:16:0,2,5:0,1,4:0,0,0,16
chr1	159899193	.	C	CTGTGA	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=132,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.052:55:22,2:26,0:0|1:159899193_C_CTGTGA:159899193:14,39,1,1
chr1	159899195	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=132,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.052:55:22,2:28,0:0|1:159899193_C_CTGTGA:159899193:14,39,1,1
chr1	159902526	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=205,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr1	159906517	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.367:39:11,6:13,8:17,8,5,9
chr1	159907687	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:3,0:5,3:2,6,0,4
chr1	159912993	.	G	GTATTGGT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159912993_G_GTATTGGT:159912993:0,0,0,1
chr1	159912995	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159912993_G_GTATTGGT:159912993:0,0,0,1
chr1	159912997	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=194,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:159912993_G_GTATTGGT:159912993:1,0,0,1
chr1	159913000	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,16;MFRL=194,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:159912993_G_GTATTGGT:159912993:1,0,0,1
chr1	159922369	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	160064592	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr1	160090649	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:2,2:5,2:8,0,4,0
chr1	160090674	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,17,2
chr1	160090681	.	CCCTT	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,10:0,0,18,2
chr1	160093222	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	160093294	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=163,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:160093294_G_T:160093294:0,4,0,1
chr1	160093299	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:160093294_G_T:160093294:0,3,0,1
chr1	160093911	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	160095127	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	160097666	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:160097666_G_A:160097666:0,0,0,6
chr1	160097689	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=201,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:160097666_G_A:160097666:0,3,0,1
chr1	160097690	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=201,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:160097666_G_A:160097666:0,3,0,1
chr1	160098927	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,4,7
chr1	160105830	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0,7,2,0
chr1	160106877	.	C	CAGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.219:7:3,1:2,0:0|1:160106877_C_CAGT:160106877:1,5,0,1
chr1	160106878	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.222:7:3,1:2,0:0|1:160106877_C_CAGT:160106877:1,5,0,1
chr1	160121746	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	160122068	.	A	ACTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=226,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	160124904	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.277:22:7,0:9,0:2,14,6,0
chr1	160128994	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	160137300	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	160140998	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,20,4
chr1	160141285	.	CC	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,7:0,7:0,1,2,12
chr1	160144614	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,1:6,2:0,6,0,3
chr1	160146173	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=235,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr1	160146382	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,1195;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,0:5,2:5,8,2,0
chr1	160147502	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,3:0|1:160147502_T_G:160147502:0,0,0,14
chr1	160147510	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,8:3,1:0|1:160147502_T_G:160147502:0,5,0,9
chr1	160151421	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,3:1,8:3,0,8,3
chr1	160151450	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,12,9
chr1	160151624	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,8:0,5:0,0,5,9
chr1	160160801	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:1,5:5,6:3,4,4,7
chr1	160163446	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,2:0,7:0,0,10,0
chr1	160163449	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:10,0,3,0
chr1	160163509	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,10:3,4:5,1,13,1
chr1	160168368	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=193,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr1	160178356	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr1	160251792	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=115,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:6,4:1,4:4,3,7,1
chr1	160252001	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:3,4:0,5,1,6
chr1	160263124	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.505:37:7,6:11,10:13,5,10,9
chr1	160263286	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.577:14:3,4:3,4:1,5,1,7
chr1	160268981	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.530:49:10,15:13,11:12,11,13,13
chr1	160275425	.	TC	GG	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.089:41:10,1:22,0:0|1:160275425_TC_GG:160275425:31,6,0,4
chr1	160275431	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.101:41:9,0:22,0:0|1:160275425_TC_GG:160275425:31,5,0,5
chr1	160275434	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=391,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=131.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.958:44:0,12:1,23:0,1,31,12
chr1	160295462	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,20:0.389:52:18,12:14,8:8,24,1,19
chr1	160309664	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:9,2,5,2
chr1	160313330	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.405:40:14,3:10,13:3,21,1,15
chr1	160318940	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:2,5:5,7:2,5,4,8
chr1	160318984	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:2,5:0,4,0,5
chr1	160320938	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,5:4,3:9,0,8,0
chr1	160321796	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,112;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,0:8,2:12,3,2,0
chr1	160323903	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.357:20:9,4:3,2:7,6,6,1
chr1	160326778	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,1:14,1:22,3,2,0
chr1	160342162	.	C	CTTAT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTAT;STR;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,3:2,10:4,1,9,5
chr1	160458782	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	160519812	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0|1:160519812_C_CA:160519812:0,0,1,12
chr1	160519815	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:160519812_C_CA:160519812:0,0,1,12
chr1	160535542	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:3,17,0,2
chr1	160582200	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:2,0:3,3:3,2,3,0
chr1	160616768	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.427:38:8,9:13,7:4,18,3,13
chr1	160650913	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr1	160721958	.	G	GT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:25,2:16,1:39,2,3,0
chr1	160722064	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=301.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,87:0.989:87:0,39:0,48:0,0,18,69
chr1	160766179	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr1	160783325	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=278,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	160784606	.	CTCTGCTG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:1,1:1,0:0|1:160784606_CTCTGCTG_C:160784606:0,2,0,1
chr1	160784617	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:160784606_CTCTGCTG_C:160784606:0,1,0,1
chr1	160784622	.	AC	TC,A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28,28;MFRL=0,152,157;MMQ=60,60,60;MPOS=-5,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr1	160784624	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:160784606_CTCTGCTG_C:160784606:0,1,0,1
chr1	160789196	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	160793988	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=140,62;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:14,9,0,2
chr1	160803802	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.399:35:5,5:15,7:11,10,7,7
chr1	160808935	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	160849030	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	160849060	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0|1:160849060_G_A:160849060:0,0,12,3
chr1	160849082	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=78.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0|1:160849060_G_A:160849060:0,0,14,7
chr1	160850280	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr1	160850936	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr1	160852022	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr1	160852046	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr1	160854526	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	160854738	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=105,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:160854738_C_T:160854738:2,2,0,1
chr1	160854741	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=71,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:160854738_C_T:160854738:1,2,0,1
chr1	160854744	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=71,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:160854738_C_T:160854738:1,2,0,1
chr1	160854745	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=105,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:160854738_C_T:160854738:0,2,0,1
chr1	160854747	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=139,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:160854738_C_T:160854738:0,1,0,1
chr1	160920809	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=150,152;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,18:0.731:24:3,11:3,7:0|1:160920809_A_G:160920809:5,1,15,3
chr1	160920813	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=112.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0|1:160920809_A_G:160920809:0,0,20,7
chr1	160924672	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	160969585	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr1	161010774	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	161011016	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=193,147;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:0,0:8,2:8,0,2,0
chr1	161011716	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	161013121	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=126.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,18:0,17:0,0,13,26
chr1	161022380	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr1	161022613	.	G	GAGATGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:161022613_G_GAGATGT:161022613:0,3,0,1
chr1	161022614	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:161022613_G_GAGATGT:161022613:0,3,0,1
chr1	161022639	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr1	161023252	.	TTCTCTCTCTC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=TC;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.722:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	161044056	.	GCAC	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=127,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAC;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.069:54:22,0:24,3:28,23,2,1
chr1	161049358	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr1	161089450	.	C	CTAAACT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr1	161126975	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.664:28:3,10:6,7:7,2,17,2
chr1	161131949	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,19;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.313:15:1,0:2,1:2,9,0,4
chr1	161133468	.	G	GAAAGTCAGCCATTTCACTGGGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.471:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	161134340	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:13,0:10,3:10,13,2,1
chr1	161136843	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:4,7:4,5:9,0,9,3
chr1	161143312	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:9,0,5,0
chr1	161144908	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:18,0:17,2:13,22,1,1
chr1	161144965	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:4,1:12,6:6,10,2,5
chr1	161160872	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr1	161161449	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	161163633	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.572:14:3,6:2,2:1,5,3,5
chr1	161166723	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	161167698	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,3:5,0,6,0
chr1	161167989	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:4,4:6,4:5,6,2,7
chr1	161176137	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,2:3,2:7,2,4,0
chr1	161178901	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:9,0,2,0
chr1	161179877	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,7:3,4:5,1,10,1
chr1	161182281	.	G	GAGAAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	161182293	.	G	GAGAATAATGGAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	161188700	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:16,1:16,1:21,11,2,0
chr1	161192845	.	CCACACACACACA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=143,167;MMQ=54,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=19,13;RU=CA;STR;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.724:8:0,2:1,3:0,2,2,4
chr1	161200586	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,5:2,5:2,1,8,3
chr1	161201350	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=115,166;MMQ=57,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,6:0,2:0|1:161201350_G_T:161201350:0,1,0,9
chr1	161201352	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0|1:161201350_G_T:161201350:0,0,0,9
chr1	161203215	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	161254255	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,3:0.043:91:41,1:46,2:0|1:161254255_A_G:161254255:31,57,0,3
chr1	161254280	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,31:0.545:57:14,16:12,13:0|1:161254255_A_G:161254255:5,21,6,25
chr1	161276434	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.957:20:0,10:0,9:0|1:161276434_A_G:161276434:0,0,18,2
chr1	161276438	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=141,152;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.201:21:7,3:10,0:0|1:161276434_A_G:161276434:15,2,4,0
chr1	161276802	.	A	ACTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	161284108	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=196,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:1,0:9,0,2,0
chr1	161284297	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=74.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,11:0,0,7,15
chr1	161332091	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=33,32,32,32;MFRL=140,142,157,151;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,12,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.42,19.98,14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:40,6,13,12:0.076,0.192,0.171:71:18,4,9,4:21,2,4,4:36,4,27,4
chr1	161475798	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=124,82987;MMQ=60,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,2:13,0:14,14,0,2
chr1	161476204	.	CA	TG	.	.	DP=123;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,155;MMQ=60,51;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=185.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,50:0.429:117:21,23:44,19:36,31,24,26
chr1	161479599	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,37:0.371:100:23,16:39,20:51,12,29,8
chr1	161479745	.	A	G	.	.	DP=141;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,63:0.490:128:40,22:24,38:38,27,35,28
chr1	161496010	.	T	G	.	.	DP=121;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,144;MMQ=57,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=164.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,60:0.530:115:24,28:20,31:26,29,24,36
chr1	161518159	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=201,195;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.233:24:9,1:8,4:19,0,5,0
chr1	161518172	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=193,193;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,4:8,4:13,0,8,0
chr1	161519396	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=153,186;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:13,0,2,0
chr1	161519411	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=140,155;MMQ=33,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:6,7:7,4:13,0,9,2
chr1	161519476	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=165,143;MMQ=52,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.127:53:22,3:24,3:29,18,4,2
chr1	161559327	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=75.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,12:0,0,18,7
chr1	161561287	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,158;MMQ=52,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	161594226	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,14:0,0,25,4
chr1	161594246	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,17:0,16:0,0,25,8
chr1	161594525	.	GT	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,9:0,0,0,16
chr1	161596278	.	C	CAGTTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=156,214;MMQ=30,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:161596278_C_CAGTTCT:161596278:0,4,0,1
chr1	161596280	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=156,214;MMQ=30,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:161596278_C_CAGTTCT:161596278:0,4,0,1
chr1	161596283	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	161599516	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	161599643	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,24;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	161600104	.	A	T	.	.	DP=123;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,119;MMQ=49,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,7:0.059:120:59,2:53,4:76,37,7,0
chr1	161600744	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	161600787	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr1	161600792	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.834:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	161600995	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=182.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,29:0,23:0,0,21,34
chr1	161644976	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=11,31;MFRL=190,150;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.960:27:0,14:0,10:1,0,22,4
chr1	161680159	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:1,8:4,4:7,0,10,2
chr1	161680413	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,1,1
chr1	161680607	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:161680607_G_T:161680607:9,8,1,1
chr1	161680613	.	C	CATTCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,17;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:11,0:4,1:0|1:161680607_G_T:161680607:7,8,1,1
chr1	161681661	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	161721402	.	GT	G,GTT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=34,35,32;MFRL=160,193,184;MMQ=60,60,60;MPOS=18,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.64,5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:40,4,7:0.091,0.136:51:21,1,5:18,3,2:38,2,11,0
chr1	161722272	.	C	A	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,28:0.392:71:28,10:15,16:9,34,4,24
chr1	161722779	.	C	CA,CAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=159,76,147;MMQ=60,56,45;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.51,13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.205,0.351:12:1,2,1:5,0,3:6,0,6,0
chr1	161748056	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,4:6,6:6,5,6,4
chr1	161753802	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.605:36:8,12:6,10:13,1,14,8
chr1	161753841	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.556:43:12,11:7,13:11,8,13,11
chr1	161753917	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.589:22:3,8:5,5:0,9,2,11
chr1	161761276	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:1,6:4,7:3,2,3,10
chr1	161761312	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.788:17:1,7:2,6:1,2,1,13
chr1	161762190	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=195,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:161762190_T_C:161762190:2,0,0,1
chr1	161762192	.	A	AGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=195,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:161762190_T_C:161762190:2,0,0,1
chr1	161789625	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,34:0.605:56:9,11:12,22:8,14,9,25
chr1	161822959	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	161823011	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:7,1:11,3,2,0
chr1	161823197	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	161829973	.	CT	C,CTT	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=33,32,33;MFRL=163,168,169;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.70,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:58,10,5:0.111,0.069:73:32,4,2:22,5,2:52,6,13,2
chr1	161976234	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr1	161976272	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	161976309	.	C	CAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,36;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:161976309_C_CAAT:161976309:0,1,0,1
chr1	161976312	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:161976309_C_CAAT:161976309:0,1,0,1
chr1	162313597	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=132.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,22:0,15:0,0,24,14
chr1	162335052	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	162335387	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=121,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:162335387_TTC_T:162335387:0,1,0,1
chr1	162335397	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:162335387_TTC_T:162335387:0,0,0,1
chr1	162344471	.	A	AATACAGGGCGAGATTGCG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:162344471_A_AATACAGGGCGAGATTGCG:162344471:0,3,0,1
chr1	162344474	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:162344471_A_AATACAGGGCGAGATTGCG:162344471:0,3,0,1
chr1	162344507	.	GTTA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	162345199	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.446:41:9,7:12,11:11,12,5,13
chr1	162348662	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,13:0,4:0,0,13,5
chr1	162351586	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,4:6,7:12,0,11,0
chr1	162352941	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:5,2,6,4
chr1	162367235	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	162381833	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:1,7,3,2
chr1	162470961	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:0,0:0,2,0,2
chr1	162558705	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:0,2,0,6
chr1	162722846	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	162725655	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	162731149	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:20,1:12,1:15,17,1,1
chr1	162742117	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr1	162743418	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr1	162748588	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	162760551	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=148,150;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.645:43:7,10:8,18:15,0,28,0
chr1	162760554	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=179.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,16:0,27:0,0,43,3
chr1	162766476	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=124,149;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:9,9:10,12:8,11,6,15
chr1	162775356	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=192,171;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	162822771	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,9:0,1:0,0,10,0
chr1	162822807	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,5:4,2:11,2,6,1
chr1	163038613	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	163038853	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:0,9,1,8
chr1	163117351	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,2:0,5:0,0,1,9
chr1	163122528	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	163187263	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr1	163297381	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,31:0.387:81:27,19:21,12:13,37,10,21
chr1	163298548	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,5:2,4:5,1,7,2
chr1	163298767	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=16,14;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.187:29:5,0:5,2:4,19,0,6
chr1	163298768	.	T	TA,TAA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,29,21;MFRL=158,154,191;MMQ=60,60,60;MPOS=15,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=7.35,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,7,2:0.376,0.092:19:3,2,0:5,3,1:1,9,0,9
chr1	163307944	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.772:23:3,8:1,10:0,5,3,15
chr1	163309302	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr1	163313695	.	TA	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.096:49:14,0:23,4:2,43,0,4
chr1	163317811	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=85,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr1	164768959	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,2:7,0:12,9,0,2
chr1	164789444	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	165180089	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,16042278;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	165376043	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,6,3
chr1	165376227	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:165376227_C_CCG:165376227:0,0,0,1
chr1	165376231	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:165376227_C_CCG:165376227:0,0,0,1
chr1	165377389	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,11,1
chr1	165378731	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.386:6:0,1:3,1:0|1:165378731_C_T:165378731:4,0,2,0
chr1	165378733	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.386:6:0,1:4,1:0|1:165378731_C_T:165378731:4,0,2,0
chr1	165513456	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:165513456_A_T:165513456:0,0,2,0
chr1	165513463	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:165513456_A_T:165513456:0,0,4,0
chr1	165532921	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:8,5,1,1
chr1	165532930	.	G	GTTAATATCAGGATCCTACT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=114,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,0:7,2:5,6,1,1
chr1	165532983	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.140:34:16,4:12,0:17,13,3,1
chr1	165601365	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	165621129	.	C	CAAAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,33;RU=A;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,1:0,3:0,0,4,3
chr1	165648807	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=112,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:17,0:15,3:11,21,0,3
chr1	165651502	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,1,19
chr1	165652445	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	165712554	.	AG	A	.	.	DP=70;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,7:0.103:63:27,2:20,5:13,43,0,7
chr1	165712555	.	G	A,C	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=32,30,19;MFRL=131,161,160;MMQ=60,60,60;MPOS=4,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.30,12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,11,14:0.184,0.260:57:15,3,0:9,5,2:13,19,0,25
chr1	165712556	.	A	C	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,7:0.107:63:28,0:23,0:13,43,0,7
chr1	165721223	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:3,0,3,1
chr1	165859630	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,5,14
chr1	165865547	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:11,1:5,1:7,10,0,2
chr1	166039953	.	A	AGGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=121,172;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr1	166124134	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	166135442	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=167,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr1	166819618	.	ACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,1:2,0:0|1:166819618_ACAC_A:166819618:0,3,0,1
chr1	166819623	.	GAAAGC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:166819618_ACAC_A:166819618:0,3,0,1
chr1	166819641	.	A	AGTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=236,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:166819641_A_AGTC:166819641:0,1,0,1
chr1	166819642	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=236,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:166819641_A_AGTC:166819641:0,1,0,1
chr1	166819646	.	AA	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=236,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:166819641_A_AGTC:166819641:0,1,0,1
chr1	166826773	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,10:0,0,23,3
chr1	166831404	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,15,3
chr1	166831703	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	166833199	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=95.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,18:0,9:0,0,0,27
chr1	166961951	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:9,0:15,6,2,0
chr1	167024422	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=187,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167024422_A_AG:167024422:0,1,0,1
chr1	167024424	.	C	CTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=187,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167024422_A_AG:167024422:0,1,0,1
chr1	167059575	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	167082869	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	167096982	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:1,6,1,3
chr1	167307356	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:8,1,2,0
chr1	167353258	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.961:20:0,13:0,4:0,0,1,19
chr1	167367193	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:3,2:4,1:4,3,3,1
chr1	167381640	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	167382374	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,15:0,6:0,0,11,10
chr1	167382399	.	AGTGT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=104,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=GT;STR;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.745:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	167385324	.	TAA	T,TA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,30,26;MFRL=159,174,143;MMQ=60,60,60;MPOS=15,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=A;STR;TLOD=7.39,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,3:0.377,0.255:13:2,2,1:1,2,1:0,5,0,8
chr1	167385339	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=173,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,1:4,1:0|1:167385339_A_AG:167385339:0,13,0,2
chr1	167385342	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=174,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,1:4,0:0|1:167385339_A_AG:167385339:0,14,0,2
chr1	167385428	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	167410051	.	A	AAAAAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:167410051_A_AAAAAGG:167410051:1,3,0,1
chr1	167410055	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:167410051_A_AAAAAGG:167410051:1,3,0,1
chr1	167515272	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,4:1,4:3,1,6,2
chr1	167515603	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=178,196;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:167515603_G_A:167515603:0,5,0,2
chr1	167515614	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=209,196;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,1:0|1:167515603_G_A:167515603:0,6,0,2
chr1	167515619	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=232,180;MMQ=59,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr1	167666316	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr1	167734717	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr1	167778843	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr1	167793670	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,5:0,4:3,0,7,2
chr1	167794130	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:2,2:2,4:0,4,0,7
chr1	167806647	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	167814733	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,4:3,3:3,0,7,0
chr1	167823512	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,2:6,0,3,1
chr1	167847584	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	167849318	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:2,4:10,4:10,2,8,0
chr1	167889140	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,5:0.078:67:22,5:39,0:62,0,5,0
chr1	167889145	.	CA	C,CAA	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=34,33,34;MFRL=165,180,160;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=9.76,4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:45,10,5:0.151,0.093:60:15,6,1:30,4,3:45,0,14,1
chr1	167893759	.	G	A	.	.	DP=110;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,42:0.410:104:24,26:30,16:39,23,14,28
chr1	167893778	.	GA	G	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,11:0.109:78:27,8:25,2:21,46,3,8
chr1	167905411	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr1	167906280	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.303:36:6,0:10,0:6,18,0,12
chr1	167962753	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr1	167985057	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=122,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,5:0.065:89:45,5:38,0:24,60,1,4
chr1	167985174	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,2:8,0:4,21,0,2
chr1	167992344	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr1	168154020	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:17,5,1,1
chr1	168161538	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=181,243;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:168161538_C_G:168161538:0,3,0,1
chr1	168161540	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=181,243;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:168161538_C_G:168161538:0,3,0,1
chr1	168165767	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:9,1,2,0
chr1	168200733	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:4,7:7,10:11,0,17,0
chr1	168206118	.	GTTTAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTAA;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	168208308	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.527:30:6,8:8,8:9,5,11,5
chr1	168260571	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:15,2:18,0:23,10,2,0
chr1	168274201	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	168282261	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr1	168510122	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,176;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:10,4:9,3:19,0,7,0
chr1	168511155	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.490:31:6,9:8,6:16,0,14,1
chr1	168511381	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,1:7,1:0|1:168511381_T_A:168511381:2,18,0,2
chr1	168511383	.	A	AACTGGTACC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,1:7,0:0|1:168511381_T_A:168511381:2,19,0,2
chr1	168549422	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=225.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,34:0,32:0,0,19,48
chr1	168550535	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.578:29:8,7:4,9:0,12,0,17
chr1	168665747	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=110,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,1:4,2:4,6,1,2
chr1	168698455	.	GGTCTGACCGTTTT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168698455_GGTCTGACCGTTTT_G:168698455:0,0,0,1
chr1	168698470	.	TATAGCTGCC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168698455_GGTCTGACCGTTTT_G:168698455:0,0,0,1
chr1	168698486	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168698455_GGTCTGACCGTTTT_G:168698455:0,0,0,1
chr1	169080837	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	169094100	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,14:0,23:0,0,26,11
chr1	169101935	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,4:1,3:5,1,6,1
chr1	169138868	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	169200111	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:15,1:8,7:0,23,0,8
chr1	169256524	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,34:0.507:67:20,19:13,15:24,9,23,11
chr1	169268023	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:1,3,1,4
chr1	169272299	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:10,8:10,3:20,0,11,0
chr1	169272451	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0|1:169272451_A_T:169272451:0,0,5,32
chr1	169272453	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.974:37:0,18:0,19:0|1:169272451_A_T:169272451:0,0,5,32
chr1	169279196	.	T	TA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=101,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.596:29:5,12:7,5:9,3,14,3
chr1	169279393	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=196,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:169279393_T_C:169279393:0,3,0,1
chr1	169279402	.	C	CTTTTGTGTTATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=196,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:169279393_T_C:169279393:0,3,0,1
chr1	169345704	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=105,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr1	169351596	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	169388372	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=118,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:10,1:8,0:1,18,1,1
chr1	169388376	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=140,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.145:18:9,2:7,0:0|1:169388376_C_G:169388376:0,16,1,1
chr1	169388381	.	A	ATGTGTCCGTTTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,2:6,0:0|1:169388376_C_G:169388376:0,15,1,1
chr1	169394226	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,0,24
chr1	169435027	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr1	169447008	.	G	C,T,GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=18,19,10,17;MFRL=145,142,131,112;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,22,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=5.11,5.52,6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,4,10,5:0.172,0.313,0.232:24:0,0,0,0:0,0,0,0:0,5,0,19
chr1	169455008	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	169483762	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr1	169487821	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,7:3,1:0,5,0,8
chr1	169494196	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:1,3:0,3,0,5
chr1	169498834	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=102.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,20:0,0,18,14
chr1	169509532	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:7,3:13,0:19,2,3,0
chr1	169510475	.	G	T	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=110,119;MMQ=49,45;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,55:0.501:109:24,21:28,29:27,27,27,28
chr1	169511878	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:14,10:6,11:9,11,10,11
chr1	169513835	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:169513835_AA_CC:169513835:0,2,0,1
chr1	169513838	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:169513835_AA_CC:169513835:0,2,0,1
chr1	169525808	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	169528384	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:6,5:2,5:8,1,7,3
chr1	169541658	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=242,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:169541658_A_AT:169541658:0,1,0,1
chr1	169541659	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=242,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:169541658_A_AT:169541658:0,1,0,1
chr1	169541660	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=103,242;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	169555367	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,257;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	169559326	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.590:20:4,4:4,6:0|1:169559326_G_A:169559326:7,1,11,1
chr1	169559333	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.564:21:5,5:4,7:0|1:169559326_G_A:169559326:8,1,11,1
chr1	169560727	.	T	TA,TAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=157,131,149;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=25.18,25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,11,14:0.409,0.499:27:1,4,5:1,2,7:0,2,1,24
chr1	169564130	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.418:17:4,1:4,5:0,10,1,6
chr1	169564167	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:0,4,0,9
chr1	169580972	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	169599254	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,15:0,17:0,0,27,11
chr1	169665632	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:3,2,3,0
chr1	169672595	.	GAA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,18;MFRL=122,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:1,1:0,0:1,1,1,3
chr1	169678024	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr1	169679472	.	G	GCT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=168,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=54.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:7,12:9,4:16,0,16,0
chr1	169679553	.	C	T	.	.	DP=106;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,46:0.476:97:23,24:27,22:42,9,33,13
chr1	169696754	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:3,5,0,5
chr1	169697076	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=230,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:1,6,2,3
chr1	169697166	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=132,81568440;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	169698789	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,2:4,4:2,9,1,5
chr1	169698825	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	169698886	.	TA	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=199,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:169698886_TA_AG:169698886:0,4,0,1
chr1	169698890	.	A	ACAGAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=199,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:169698886_TA_AG:169698886:0,4,0,1
chr1	169698894	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=199,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:169698886_TA_AG:169698886:0,4,0,1
chr1	169699819	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=56,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,5:2,4:0,2,1,8
chr1	169700961	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:7,1,5,1
chr1	169701108	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,3:6,7:2,8,1,9
chr1	169761617	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=222,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,2:7,6:11,0,8,0
chr1	169763046	.	GAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,28;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.316:8:0,1:0,1:0,6,1,1
chr1	169763139	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	169771676	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=173,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,1:10,1:22,0,2,0
chr1	169772285	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:6,1:11,7:14,3,4,4
chr1	169792642	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:10,5:7,3:2,15,2,6
chr1	169792692	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.593:17:5,3:2,7:2,5,0,10
chr1	169799572	.	C	CTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,3:4,1:0,8,0,4
chr1	169824068	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.632:22:3,4:4,10:0,8,1,13
chr1	169824104	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:0,2,0,7
chr1	169828098	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:7,0,4,0
chr1	169828327	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:11,13:13,7:5,19,11,9
chr1	169828338	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.093:40:17,1:20,2:13,24,1,2
chr1	169831690	.	CTCTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=93,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,4:0,2:4,1,5,1
chr1	169831993	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,1,10
chr1	169835950	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,25,0
chr1	169836175	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.450:36:10,7:9,9:2,18,1,15
chr1	169847683	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	169890933	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,2:4,3:0,5,0,7
chr1	169941761	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:7,5:6,4:1,12,0,10
chr1	169947146	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.540:13:4,5:2,2:6,0,7,0
chr1	169951748	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=173,237;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:10,0,3,0
chr1	169952385	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:5,6:0,2:4,1,6,2
chr1	169993466	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	169993762	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.449:40:12,9:10,8:0,22,1,17
chr1	170004508	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:6,3:10,6:15,1,9,0
chr1	170004707	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=91.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,30:0.704:42:4,12:7,16:1,11,1,29
chr1	170007355	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,8:2,1:10,0,9,0
chr1	170115156	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	170501521	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	170511604	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=86.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,13:0,0,23,2
chr1	170521650	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:1,2,0,4
chr1	170927570	.	CTT	C,CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=134,124,146;MMQ=60,60,60;MPOS=6,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=8.29,19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,13:0.236,0.472:30:5,3,7:2,4,2:7,2,18,3
chr1	170993444	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=GT;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	171061990	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	171072862	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:8,0,4,0
chr1	171077165	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.274:16:5,2:7,1:12,0,4,0
chr1	171077198	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,18:0,0,22,6
chr1	171077372	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=123,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,5:6,4:1,9,1,8
chr1	171083174	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=109,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.435:23:5,5:8,4:8,5,8,2
chr1	171083242	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=127,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:17,5:5,5:10,12,7,3
chr1	171083546	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171083546_G_C:171083546:0,1,0,1
chr1	171083550	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171083546_G_C:171083546:0,1,0,1
chr1	171083551	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171083546_G_C:171083546:0,1,0,1
chr1	171085314	.	A	AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.526:32:7,9:8,8:9,6,12,5
chr1	171115567	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.377:46:16,4:11,13:20,9,11,6
chr1	171115645	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,16:0.350:46:19,8:11,7:9,21,5,11
chr1	171116760	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr1	171227216	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:5,4:9,1,4,4
chr1	171251509	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,5:6,3:1,11,2,6
chr1	171302094	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,2,21
chr1	171303925	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=206.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,35:0,25:0,0,25,38
chr1	171311003	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,1,3
chr1	171491264	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,30,0
chr1	171496868	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=163,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:10,2:18,0:30,0,2,0
chr1	171496875	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.275:31:9,3:12,5:23,0,8,0
chr1	171496895	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=137.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.977:38:0,17:0,20:0,0,33,5
chr1	171504666	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:11,2:16,1:14,13,1,2
chr1	171509058	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr1	171511442	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	171514848	.	T	TTTTA	.	.	DP=140;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TTTA;STR;TLOD=132.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.979:31:0,17:0,11:0,0,0,31
chr1	171519128	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr1	171519158	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=14,14;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.312:10:2,0:1,0:7,0,3,0
chr1	171526570	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,34:0,35:0,0,20,54
chr1	171527322	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,3,13
chr1	171546833	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	171548606	.	G	GAATTGTTCAGCTCCTCACT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=177,595;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:2,0:1,1:1,2,1,0
chr1	171548617	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr1	171548868	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	171607702	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:6,2:8,5:11,3,7,0
chr1	171621834	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr1	171751051	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=80.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,7:0,16:0,0,22,1
chr1	171755071	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=336,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=111.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.944:33:0,11:1,20:0,1,12,20
chr1	171755182	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=126.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,22:0,15:0,0,21,16
chr1	171761458	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	171763549	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,14,13
chr1	171765964	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	171810960	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:1,2,0,2
chr1	172002489	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0|1:172002489_A_AT:172002489:0,2,0,3
chr1	172002503	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:0,0:1|0:172002489_A_AT:172002489:0,3,0,1
chr1	172011059	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr1	172013549	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:21,3:43,0:43,22,1,2
chr1	172038079	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:5,2:5,4:3,7,1,6
chr1	172113808	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,2:11,0:5,14,2,0
chr1	172292355	.	C	CTCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=213,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:2,1,1,0
chr1	172356582	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,157;MMQ=40,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,10:1,5:0,2,0,15
chr1	172376809	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=197,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:5,0,6,0
chr1	172411496	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,52;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,22,12
chr1	172412845	.	C	A	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,42:0.385:109:30,19:36,21:36,31,21,21
chr1	172431210	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	172434375	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=124.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,22:0,14:0,0,29,7
chr1	172502041	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	172577864	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=33,32,34,34;MFRL=130,126,148,147;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,21,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.49,35.42,4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:46,6,21,6:0.058,0.266,0.080:79:21,2,13,6:23,4,6,0:41,5,28,5
chr1	172634734	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	173012997	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:11,4:9,4:19,1,8,0
chr1	173174389	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:2,4:10,0:10,3,4,0
chr1	173490407	.	TAAAAA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,12;RU=A;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,0:4,2:20,3,2,0
chr1	173490547	.	G	GA	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=20,17;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.118:51:16,0:11,1:10,35,1,5
chr1	173490616	.	CTA	C,CTATA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,35,26;MFRL=171,147,184;MMQ=60,60,60;MPOS=30,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=TA;STR;TLOD=4.75,26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,9:0.157,0.527:16:2,0,5:3,2,1:0,5,0,11
chr1	173499244	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:173499244_G_A:173499244:0,1,0,1
chr1	173499245	.	C	CCCCTTAGGTGTATTAACTTCTTTTAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=37,33;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:173499244_G_A:173499244:0,1,0,1
chr1	173721159	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,183;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr1	173794587	.	C	CATT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,181;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=ATT;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.702:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	173797451	.	TC	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:9,2:14,1:0,24,1,2
chr1	173819421	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.431:12:3,1:3,4:6,1,5,0
chr1	173822735	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:2,1:0,9,0,2
chr1	173934311	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:4,3:8,0:1,11,0,4
chr1	173961807	.	AACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,161;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	174417231	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,5:5,3:11,0,6,2
chr1	174417968	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,84;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:8,3:16,0:13,11,3,0
chr1	174670295	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:17,0:14,5:10,21,0,5
chr1	174721492	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,0:16,2:10,19,1,1
chr1	174948082	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.251:17:5,2:8,2:0,13,0,4
chr1	174959086	.	C	CT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.056:51:29,0:17,1:29,20,1,1
chr1	174969271	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,24:0.448:54:10,17:18,7:22,8,21,3
chr1	174983818	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:13,2:5,1:13,5,1,2
chr1	174984064	.	ATTTTC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,139;MMQ=46,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTC;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	175046614	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:6,0:0|1:175046614_G_T:175046614:10,10,0,2
chr1	175046617	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:8,0:0|1:175046614_G_T:175046614:10,11,0,2
chr1	175046620	.	TTC	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:8,0:0|1:175046614_G_T:175046614:10,11,0,2
chr1	175046623	.	GGCCC	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,2:9,0:0|1:175046614_G_T:175046614:10,15,0,2
chr1	175087683	.	A	AT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:16,2:26,1:36,7,3,0
chr1	175092840	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:6,7:10,7:3,13,2,14
chr1	175097271	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=145,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:2,8,0,2
chr1	175097331	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=74,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.669:7:1,2:1,2:0|1:175097331_G_A:175097331:1,1,2,3
chr1	175097349	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=104,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:175097331_G_A:175097331:1,1,1,2
chr1	175105880	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=92,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr1	175105942	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,8:0,6:1,0,11,3
chr1	175116252	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:6,7:6,3:2,10,1,10
chr1	175292672	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	175293424	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=67,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:2,0,7,1
chr1	175306916	.	A	ACCTCACCTGGCTAATTTTTTTTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr1	175323446	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	175336530	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	175360643	.	A	AGAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=180,44;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:175360643_A_AGAG:175360643:0,10,1,1
chr1	175360644	.	T	TGAGAGAAC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=180,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:5,0:0|1:175360643_A_AGAG:175360643:0,10,1,1
chr1	175365663	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.655:24:3,8:5,8:6,2,12,4
chr1	175916267	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=120.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,25,8
chr1	176012807	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=85.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,6:0,18:0,0,24,1
chr1	176105710	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.256:22:4,2:8,3:1,15,0,6
chr1	176153658	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=150.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,24:0,16:0,0,42,0
chr1	176175610	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	176664842	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=106,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,6:4,3:6,3,7,2
chr1	176671937	.	G	GTATTAAAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=176,144;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:176671937_G_GTATTAAAT:176671937:0,2,0,1
chr1	176671940	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=176,144;MMQ=50,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:176671937_G_GTATTAAAT:176671937:0,2,0,1
chr1	176671962	.	C	CACGGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:176671962_C_CACGGA:176671962:0,0,0,1
chr1	176671963	.	T	TGGAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176671962_C_CACGGA:176671962:0,0,0,1
chr1	176681165	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32,33;MFRL=135,189,141;MMQ=60,60,60;MPOS=24,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=TG;STR;TLOD=3.70,6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.176,0.335:11:2,0,0:3,2,3:0,6,0,5
chr1	176734756	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr1	176769358	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:0,1:3,1:0,4,0,2
chr1	176826908	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	176857184	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:8,2:2,0:7,3,2,0
chr1	176857347	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr1	176992755	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=90,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:2,1:0,0:0|1:176992755_AC_A:176992755:2,1,0,1
chr1	176992757	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,32;MFRL=90,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:0,1:0,0:0|1:176992755_AC_A:176992755:2,1,0,1
chr1	177198998	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.472:49:7,14:18,9:15,11,13,10
chr1	177250670	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	177901971	.	G	GTTTATAAGTAGAACATTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:177901971_G_GTTTATAAGTAGAACATTA:177901971:0,3,0,1
chr1	177901973	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:177901971_G_GTTTATAAGTAGAACATTA:177901971:0,3,0,1
chr1	177902388	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr1	177909872	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:177909872_T_G:177909872:0,2,0,1
chr1	177909886	.	T	TCAGTGTTTGAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=10,33;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:0,0:0|1:177909872_T_G:177909872:0,1,0,1
chr1	177915474	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr1	177916865	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,64607875;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.770:2:0,0:0,1:0|1:177916865_G_A:177916865:0,0,2,0
chr1	177916872	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,64607875;MMQ=60,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.785:2:0,1:0,1:0|1:177916865_G_A:177916865:0,0,2,0
chr1	177916889	.	AA	GG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,207;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.750:1:0,1:0,0:0|1:177916865_G_A:177916865:0,0,1,0
chr1	177929379	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,36,1
chr1	177930642	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	177930894	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr1	177933443	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,3,11
chr1	177933510	.	G	GGGCTGGAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177933510_G_GGGCTGGAGA:177933510:0,1,0,1
chr1	177933512	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177933510_G_GGGCTGGAGA:177933510:0,1,0,1
chr1	177935203	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	177937016	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:15,8,2,0
chr1	178389706	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:19,1:28,2:15,32,0,3
chr1	178408780	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr1	178408795	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	178433368	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:4,4:5,2,6,2
chr1	178434963	.	AAAAGAAAGAAAGAG	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.457:40:7,9:7,9:21,1,18,0
chr1	178439953	.	A	AGTTCCAAAATCCCTTCTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	178442190	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,24:0.611:39:5,10:10,14:11,4,19,5
chr1	178492477	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178492477_CAA_C:178492477:2,1,0,1
chr1	178492480	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178492477_CAA_C:178492477:2,1,0,1
chr1	178492484	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:178492477_CAA_C:178492477:2,1,0,1
chr1	178492508	.	A	AACC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=162,286;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178492508_A_AACC:178492508:0,1,0,1
chr1	178492512	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=165,286;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:178492508_A_AACC:178492508:0,2,0,1
chr1	178492514	.	TCTC	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=165,286;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:178492508_A_AACC:178492508:0,2,0,1
chr1	178514203	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=185,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.684:14:1,4:3,4:1,3,4,6
chr1	178514560	.	A	AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=54.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.584:34:8,12:6,8:2,12,3,17
chr1	178745798	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:178745798_CT_C:178745798:0,0,2,0
chr1	178745814	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:178745798_CT_C:178745798:2,0,2,0
chr1	178802682	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=136,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.136:49:22,5:21,1:23,20,1,5
chr1	178822770	.	CT	GG,GT	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=33,22,23;MFRL=157,130,120;MMQ=60,60,53;MPOS=32,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.74,5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,2,2:0.094,0.094:29:9,1,0:12,0,1:16,9,4,0
chr1	178822775	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,19;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:6,0:9,0:17,9,3,0
chr1	178822780	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=33,10;MFRL=144,120;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:9,0:14,0:0|1:178822780_C_A:178822780:21,12,2,0
chr1	178822788	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=151,120;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:12,0:17,0:0|1:178822780_C_A:178822780:21,14,2,0
chr1	178822790	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=148,120;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:13,0:18,0:0|1:178822780_C_A:178822780:20,14,2,0
chr1	178846735	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:21,0:15,2:13,23,0,2
chr1	179019568	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:1,8,0,2
chr1	179035914	.	AA	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,156;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:9,0:12,9,2,0
chr1	179041011	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=176.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,29:0,22:0,0,37,14
chr1	179051300	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	179052006	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr1	179054692	.	T	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=240.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,72:0.987:72:0,31:0,37:0,0,37,35
chr1	179064035	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,0:0,0:0,0,7,0
chr1	179067071	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	179077450	.	T	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,11:0.177:54:18,3:16,4:33,10,0,11
chr1	179078169	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:6,0:4,0:0|1:179078169_A_C:179078169:0,10,5,0
chr1	179078173	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:6,2:4,1:0|1:179078169_A_C:179078169:0,11,5,0
chr1	179078178	.	CAGCAGTGCCACTG	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:5,3:4,2:0|1:179078169_A_C:179078169:0,13,5,0
chr1	179087934	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,2,14
chr1	179089239	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.261:19:7,2:4,2:12,2,4,1
chr1	179089475	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	179089491	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	179095895	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=205,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:0,1:3,1:1,4,0,2
chr1	179198308	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:179198308_A_C:179198308:0,0,2,0
chr1	179198312	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:179198308_A_C:179198308:0,0,2,0
chr1	179198317	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:179198308_A_C:179198308:0,0,2,0
chr1	179304892	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=118,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.451:5:1,2:0,0:1,2,0,2
chr1	179312102	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,6:4,0:2,6,1,5
chr1	179316873	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:10,0:12,3:2,22,0,3
chr1	179319580	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:1,7:3,7:1,3,4,12
chr1	179320404	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=147,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,3:17,0:16,10,2,1
chr1	179320665	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=105,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.660:4:0,1:1,2:1,0,0,3
chr1	179338072	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:16,0:13,3:4,27,0,3
chr1	179348643	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=145,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.080:35:15,0:17,2:0|1:179348643_A_T:179348643:17,16,1,1
chr1	179348646	.	T	TG	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:8,5:9,8:7,10,7,6
chr1	179348649	.	C	CAGGT	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=147,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:13,2:0|1:179348643_A_T:179348643:13,16,1,1
chr1	179348650	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,0:14,2:0|1:179348643_A_T:179348643:13,15,1,1
chr1	179348710	.	TC	CT	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=147,170;MMQ=52,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:5,0:0,13,0,2
chr1	179354304	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr1	179364391	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,4:4,3:0,6,0,7
chr1	179380472	.	GT	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=159.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.984:56:0,25:0,31:0,0,0,56
chr1	179398563	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr1	179401379	.	CT	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,27:0.510:53:13,14:12,12:21,5,22,5
chr1	179401526	.	C	G	.	.	DP=86;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,41:0.482:84:21,22:18,13:14,29,11,30
chr1	179401559	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,27:0.506:53:15,17:10,7:1,25,0,27
chr1	179401564	.	CTT	C,CT	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=34,32,33;MFRL=174,164,177;MMQ=60,60,60;MPOS=16,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=7.51,56.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,24:0.164,0.772:31:1,2,17:0,2,7:0,2,1,28
chr1	179437827	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr1	179452194	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	179462149	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	179494612	.	CTACA	C	.	.	DP=97;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TACA;STR;TLOD=57.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.442:37:10,9:10,7:2,19,1,15
chr1	179494665	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=138.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,16:0,21:0,0,0,40
chr1	179503806	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.801:28:2,14:3,9:4,1,22,1
chr1	179504025	.	AAAG	A	.	.	DP=90;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=116,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAG;STR;TLOD=154.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,41:0.513:80:18,17:14,23:0|1:179504025_AAAG_A:179504025:25,14,28,13
chr1	179504043	.	C	G	.	.	DP=125;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=116,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,59:0.518:114:27,22:27,37:0|1:179504025_AAAG_A:179504025:27,28,41,18
chr1	179504130	.	G	A	.	.	DP=128;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=237.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,78:0.642:121:21,28:22,48:5,38,3,75
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chr1	179528917	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.554:23:2,5:8,6:0,10,0,13
chr1	179528942	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:0,7,0,7
chr1	179545050	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	179605058	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr1	179620253	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	179632727	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	179876900	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=185.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,36:0,17:0,0,37,16
chr1	179972347	.	G	GA	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.057:50:25,0:21,2:26,22,0,2
chr1	179983665	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=63.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0,0,1,19
chr1	179992076	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	179993793	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	180010702	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr1	180022343	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,2,6
chr1	180059811	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	180063063	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:18,1:10,1:24,4,2,0
chr1	180065137	.	ATTTTG	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTTG;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.055:53:25,0:16,3:41,9,3,0
chr1	180080115	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=179.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,28:0,20:0,0,41,7
chr1	180145088	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=80,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.883:23:0,13:2,8:1,1,12,9
chr1	180155376	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr1	180155382	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	180158668	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,2:5,4:9,0,6,0
chr1	180159797	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=271,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	180217656	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=404,253;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	180243625	.	GA	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:180243625_GA_TC:180243625:1,3,0,1
chr1	180243631	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:180243625_GA_TC:180243625:1,3,0,1
chr1	180243646	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=267,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	180257692	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,3,19
chr1	180757056	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:3,13:10,4:1,12,1,16
chr1	180803922	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=265,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,3,2
chr1	180849494	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr1	180853268	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:0,9,0,2
chr1	180885875	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:4,7,1,1
chr1	180897521	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,15,3
chr1	180897569	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.633:20:3,7:4,5:4,3,5,8
chr1	180905448	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,8:4,4:3,6,8,4
chr1	180910133	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.548:5:0,0:1,0:0|1:180910133_A_C:180910133:1,1,3,0
chr1	180910137	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,13;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.702:5:0,0:1,0:0|1:180910133_A_C:180910133:0,1,4,0
chr1	180910140	.	C	CCCG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:180910133_A_C:180910133:0,1,2,0
chr1	180962612	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=200,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:180962612_T_G:180962612:0,1,0,1
chr1	180962614	.	A	AAATGTTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=200,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:180962612_T_G:180962612:0,1,0,1
chr1	181058017	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,1:12,1:19,0,2,0
chr1	181058618	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=182,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:181058618_C_G:181058618:1,0,1,1
chr1	181058643	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:181058618_C_G:181058618:0,0,2,0
chr1	181059988	.	T	TAATTGTTAAACAAACACTGTATCCACATGAAGTCCAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=284,173;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	181479669	.	TG	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:22,3:17,0:27,14,3,0
chr1	181480712	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=112,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:181480712_G_T:181480712:1,3,0,1
chr1	181480715	.	GC	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=112,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:181480712_G_T:181480712:1,2,0,1
chr1	181684605	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr1	181684634	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=207,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	181686216	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=62,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,5:1,1:0,3,5,1
chr1	181687379	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=221,239;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	181688868	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.342:32:11,7:10,2:15,6,7,4
chr1	181706685	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr1	181719679	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,4:0,6,3,6
chr1	181724432	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:0,12:3,3:2,1,8,7
chr1	181725110	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=103,131;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:6,2:4,2:6,4,3,1
chr1	181727030	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr1	181727100	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=168,110;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:7,7,2,0
chr1	181731667	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.339:18:8,5:3,1:10,2,6,0
chr1	181732695	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,44934909;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	181752769	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.215:20:5,1:10,2:14,2,4,0
chr1	181752783	.	T	G,TG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,37,32;MFRL=122,200,117;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.93,10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,6:0.105,0.253:24:5,2,2:10,0,4:11,5,7,1
chr1	181752923	.	AAGCTT	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCTT;STR;TLOD=162.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.977:38:0,20:0,15:0,0,11,27
chr1	181754803	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:6,4:6,6:13,0,10,0
chr1	182354850	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=65.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.571:35:8,12:6,8:15,0,19,1
chr1	182355046	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.675:41:6,15:7,13:1,12,1,27
chr1	182356517	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:182356517_T_A:182356517:0,3,0,1
chr1	182356519	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:182356517_T_A:182356517:0,3,0,1
chr1	182356525	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:182356517_T_A:182356517:0,3,0,1
chr1	182462326	.	C	CACAAGCGTCCTTAAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=135,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	182491107	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,3:2,5:9,0,9,0
chr1	182501933	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,2:6,6:4,7,0,8
chr1	182509292	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:182509292_A_G:182509292:1,0,1,0
chr1	182509302	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,10;MFRL=241,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:182509292_A_G:182509292:3,0,1,0
chr1	182509308	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=241,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:182509292_A_G:182509292:3,0,1,0
chr1	182509580	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=193,111;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:7,0:4,2:0,11,0,2
chr1	182509598	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr1	182517357	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=220,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	182554783	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,2:10,0:15,7,0,2
chr1	182556036	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	182571003	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	182571277	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:10,9:7,8:4,13,2,15
chr1	182573227	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr1	182638763	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:18,3:38,1:27,30,0,4
chr1	182784022	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:0,6,0,4
chr1	182812410	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.247:16:9,2:2,1:12,0,3,1
chr1	182812528	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:5,10,2,0
chr1	182812666	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.269:6:2,0:3,1:1,4,0,1
chr1	182848431	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:20,2:18,1:18,20,3,0
chr1	182854017	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr1	183176994	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.268:17:4,0:5,0:10,3,4,0
chr1	183205523	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=136,127;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.240:15:5,2:4,1:10,2,3,0
chr1	183205576	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,6:0.087:61:26,0:26,0:5,50,6,0
chr1	183205581	.	A	C	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,6:0.091:65:23,1:31,1:6,53,6,0
chr1	183209468	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=151,242;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:21,1:21,2:24,20,0,3
chr1	183230516	.	ATCCGC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	183253959	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.404:28:10,6:5,5:4,13,1,10
chr1	183273751	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:5,1,4,2
chr1	183481943	.	C	CT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.683:10:1,3:1,2:2,1,4,3
chr1	183516440	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	183525452	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	183534935	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,15:0,0,7,23
chr1	183538449	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	183556180	.	C	CAATATAGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=185,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	183617485	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,2:11,0:11,10,2,0
chr1	183711483	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr1	183775638	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,2:5,4:1,4,1,5
chr1	183775704	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr1	183816683	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,5:5,1:13,2,4,2
chr1	183852914	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=93.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,16,9
chr1	183866849	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	183871637	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,7:0,15:0,0,20,2
chr1	183895178	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	183913540	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	183938304	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:183938304_C_A:183938304:2,0,2,0
chr1	183938313	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0|1:183938304_C_A:183938304:2,0,2,0
chr1	183942950	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	183944444	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	184041946	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.095:53:25,0:19,5:35,13,5,0
chr1	184476621	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr1	184537506	.	ACTC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=91.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0,0,17,4
chr1	184567463	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,9:0,0,24,2
chr1	184672179	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:0,3:3,3:0,4,0,6
chr1	184681081	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr1	184681802	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=199,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	184688237	.	CGT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GT;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:4,1:9,1:13,1,2,0
chr1	184695571	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr1	184706212	.	GT	G	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=297.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.989:84:0,43:0,41:0,0,26,58
chr1	184718744	.	G	C	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,9:0.118:82:27,0:13,0:27,46,0,9
chr1	184718750	.	GAAAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=34,18,17,17;MFRL=170,156,166,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,18,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=8.41,32.51,16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,8,19,8:0.173,0.450,0.212:41:2,2,3,0:1,1,0,0:1,5,3,32
chr1	184777177	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:5,6:3,3:8,1,7,2
chr1	185094277	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:0,6,0,7
chr1	185120927	.	GAA	G	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.064:57:16,0:23,3:45,9,3,0
chr1	185137454	.	T	TAAATGATAGAC	.	.	DP=150;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=161.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,45:0.325:139:40,17:51,16:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:53,41,26,19
chr1	185137461	.	A	T	.	.	DP=140;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=146.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,41:0.296:140:45,16:51,21:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:54,45,28,13
chr1	185137464	.	T	TAA	.	.	DP=148;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=63.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,42:0.299:141:45,16:49,20:54,45,28,14
chr1	185137628	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.468:49:17,9:9,13:0,26,0,23
chr1	185153545	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:7,12:6,3:0,14,0,15
chr1	185240474	.	A	G	.	.	DP=205;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=193.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,68:0.346:198:67,30:60,38:58,72,30,38
chr1	185245863	.	TTGG	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGG;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.062:44:18,0:21,2:0,42,0,2
chr1	185267114	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,2:6,1:10,1,3,0
chr1	186007985	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:32,1:25,2:35,24,0,3
chr1	186050579	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=152,248;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	186050615	.	T	TCAGAAAGGCCATATTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186050615_T_TCAGAAAGGCCATATTG:186050615:0,1,0,1
chr1	186050618	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186050615_T_TCAGAAAGGCCATATTG:186050615:0,1,0,1
chr1	186050619	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186050615_T_TCAGAAAGGCCATATTG:186050615:0,1,0,1
chr1	186052024	.	G	A	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=106.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,39:0.430:91:28,23:24,16:33,19,18,21
chr1	186084611	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:186084611_T_A:186084611:0,2,0,1
chr1	186084613	.	C	CCAGGAATAAAGTACAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:186084611_T_A:186084611:0,2,0,1
chr1	186135533	.	T	TTCTAAGTACTTATCCTGTTAAGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	186147517	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:12,2:5,0:0|1:186147517_T_G:186147517:18,0,2,0
chr1	186147521	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:9,2:4,0:0|1:186147517_T_G:186147517:17,0,3,0
chr1	186265948	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,4:2,0:8,0,4,0
chr1	186270894	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:0,5,1,6
chr1	186273994	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,32:0.528:61:14,16:12,15:20,9,23,9
chr1	186277088	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,51;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,19:0,19:0,0,17,21
chr1	186277989	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,29:0.522:55:13,13:11,10:15,11,16,13
chr1	186306247	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,95;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:22,0:15,3:14,23,0,3
chr1	186313249	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,1,13
chr1	186316656	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr1	186326703	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,2:12,0:13,13,1,1
chr1	186329869	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,25:0.667:37:2,13:10,12:10,2,19,6
chr1	186330695	.	TA	T,TAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30,28;MFRL=188,126,133;MMQ=60,60,60;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.97,10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,5:0.241,0.248:21:6,3,3:5,2,2:11,0,9,1
chr1	186352347	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=210,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:0,8:3,5:0,3,0,14
chr1	186357523	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,15,2
chr1	186358588	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=216,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:0,2:2,0,5,0
chr1	186370598	.	T	TTCTG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCTG;STR;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.563:21:7,5:2,6:3,6,2,10
chr1	186413732	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186413732_T_TG:186413732:0,0,0,1
chr1	186413733	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186413732_T_TG:186413732:0,0,0,1
chr1	186413737	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186413732_T_TG:186413732:0,0,0,1
chr1	186645352	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=191,114;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,0:8,3:1,14,0,3
chr1	186645679	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:25,2:16,1:22,19,3,0
chr1	186646068	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:7,0:12,2:1,18,0,2
chr1	186863385	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr1	186863422	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:186863422_TGG_T:186863422:0,3,0,1
chr1	186863427	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:186863422_TGG_T:186863422:0,3,0,1
chr1	186919732	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	186925168	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	186925194	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	186925552	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	186946638	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:186946638_C_T:186946638:0,0,4,0
chr1	186946641	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:186946638_C_T:186946638:0,0,4,0
chr1	190067748	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.191:19:10,3:6,0:0|1:190067748_T_C:190067748:7,9,3,0
chr1	190067753	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:9,3:6,0:0|1:190067748_T_C:190067748:6,9,3,0
chr1	190250762	.	T	G	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=134,152;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,4:0.053:91:35,4:46,0:60,27,4,0
chr1	192335271	.	C	CTAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAT;STR;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	192545099	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,1,13
chr1	192547344	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=34,19;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.189:36:12,0:13,1:9,20,7,0
chr1	192547350	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=123,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.131:34:13,0:12,0:10,20,4,0
chr1	192547357	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=122,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.106:36:14,0:13,0:12,21,3,0
chr1	192778130	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=167,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.166:38:9,1:11,0:28,3,7,0
chr1	192778159	.	A	T	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,35:0.578:62:10,16:8,16:14,13,26,9
chr1	192780498	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.462:50:11,12:16,11:25,2,20,3
chr1	192997336	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=193,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,4:6,6:0,12,0,10
chr1	192998319	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,1:15,1:22,5,2,0
chr1	193051685	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:11,4:7,4:17,1,7,1
chr1	193051902	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr1	193051903	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:193051903_T_C:193051903:0,4,0,1
chr1	193051909	.	T	TCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:193051903_T_C:193051903:0,4,0,1
chr1	193051910	.	T	A,TTAGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30,28;MFRL=157,161,157;MMQ=60,60,60;MPOS=2,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,0:1,1,1:0,3,0,2
chr1	193053675	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=123,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:2,8:1,7:2,1,14,1
chr1	193053762	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=118,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=62.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.668:31:6,10:4,11:6,4,11,10
chr1	193053996	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	193065956	.	T	TAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:193065956_T_TAGC:193065956:0,4,0,1
chr1	193065959	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:193065956_T_TAGC:193065956:0,4,0,1
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chr1	193181512	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,4:0.057:85:41,4:40,0:53,28,4,0
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chr1	196398974	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,0,22
chr1	196461513	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=198.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,29:0,29:0,0,8,51
chr1	196684650	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:196684650_C_A:196684650:1,0,1,0
chr1	196684654	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:196684650_C_A:196684650:1,0,1,0
chr1	196695678	.	A	T	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,3:0.059:65:21,0:38,3:0|1:196695678_A_T:196695678:39,23,1,2
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chr1	196706642	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:10,3:7,5:11,6,6,2
chr1	196763574	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,204;MMQ=52,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:14,2:27,0:41,0,2,0
chr1	197008597	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,6,13
chr1	197020085	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=72,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:197020085_A_T:197020085:0,2,0,1
chr1	197020093	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=72,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:197020085_A_T:197020085:0,2,0,1
chr1	197020095	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=72,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:197020085_A_T:197020085:0,2,0,1
chr1	197026672	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr1	197030201	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,3,11
chr1	197030237	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	197031021	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,9,15
chr1	197053373	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	197055925	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,12,10
chr1	197059221	.	GA	G,GAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=164,198,151;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.35,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,4,4:0.109,0.093:41:4,1,1:14,3,2:6,27,3,5
chr1	197059878	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	197059892	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	197059928	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,12,2
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chr1	197070980	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:11,7,0,2
chr1	197072189	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:18,3:16,0:17,18,3,0
chr1	197098326	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=188.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,64:0.589:109:21,33:21,31:31,14,44,20
chr1	197102745	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:2,2,1,3
chr1	197104149	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=65.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,12:0,7:0,0,18,1
chr1	197109042	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr1	197113073	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=156.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,19:0,26:0,0,40,6
chr1	197141235	.	CTA	C	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TA;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.056:67:32,2:25,1:0|1:197141235_CTA_C:197141235:60,4,3,0
chr1	197141243	.	A	C	.	.	DP=104;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=233.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,70:0.948:74:2,39:2,31:4,0,62,8
chr1	197141253	.	A	C	.	.	DP=135;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:111,6:0.050:117:55,3:55,3:0|1:197141235_CTA_C:197141235:97,14,4,2
chr1	197237654	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,1:10,1:3,22,0,2
chr1	197297540	.	A	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=84.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,32:0.403:80:26,14:21,18:35,13,23,9
chr1	197316435	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,6:0,0,9,0
chr1	197325908	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr1	197397169	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,0:5,3:0,5,0,3
chr1	197482167	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	197510025	.	G	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=201.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,25:0,36:0,0,57,5
chr1	197515777	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr1	197515981	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:1,7,0,7
chr1	197576307	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=63.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,3,15
chr1	197741951	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=78,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,48:0.944:50:1,19:1,28:0,2,38,10
chr1	197742171	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr1	197871802	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	197890422	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr1	198225658	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,7:4,7:0,8,0,14
chr1	198288709	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=194,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	198492490	.	C	CT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:22,1:19,2:25,17,1,2
chr1	198498325	.	AATAT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AT;STR;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.605:8:1,2:2,3:0,3,1,4
chr1	198505830	.	C	T	.	.	DP=138;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=174.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,63:0.491:128:30,28:35,34:38,27,36,27
chr1	198691478	.	AAT	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.089:61:25,5:25,0:55,1,5,0
chr1	198711170	.	CA	C,CAA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=20,33,24;MFRL=167,143,138;MMQ=60,60,60;MPOS=23,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.76,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,4,4:0.113,0.125:32:7,4,2:5,0,1:2,22,0,8
chr1	198717218	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=35,35,34;MFRL=143,120,130;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=T;STR;TLOD=4.47,19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,18:0.087,0.474:35:9,2,3:1,1,10:10,4,16,5
chr1	200008941	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,3:2,4:2,2,3,4
chr1	200014560	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.551:40:10,9:7,13:12,6,15,7
chr1	200014762	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:200014762_A_G:200014762:0,3,0,1
chr1	200014766	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:200014762_A_G:200014762:0,3,0,1
chr1	200080462	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=17,30;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.464:11:0,1:2,3:0|1:200080462_A_AT:200080462:2,4,2,3
chr1	200080464	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.468:11:1,2:4,2:0|1:200080462_A_AT:200080462:2,4,2,3
chr1	200089872	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=191,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr1	200143064	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.627:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr1	200182654	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	200311910	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,2,22
chr1	200312546	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=98,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.929:13:1,3:0,6:0,1,1,11
chr1	200378731	.	TGCC	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCC;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.053:52:20,1:23,1:15,35,0,2
chr1	200523514	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:3,2:9,9:12,0,11,0
chr1	200523518	.	CA	C,CAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,33,35;MFRL=159,242,200;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.28,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,4:0.171,0.186:24:5,0,2:11,4,2:16,0,8,0
chr1	200549590	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:5,4:1,2:0,7,0,6
chr1	200550243	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,141;MMQ=40,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.736:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	200567596	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:0,2:5,1:0,6,0,3
chr1	200569392	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,6,1
chr1	200575794	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,3,1
chr1	200578093	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,3,20
chr1	200583380	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:3,3:6,7:7,2,10,0
chr1	200587936	.	T	TTTAAAAGTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	200594005	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:5,2:7,3:8,4,4,2
chr1	200594240	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	200613388	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.184:23:10,1:9,1:17,2,4,0
chr1	200613472	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.097:54:27,1:22,3:29,20,3,2
chr1	200617465	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=133,218;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:200617465_G_GC:200617465:1,0,1,0
chr1	200617466	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=133,218;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:200617465_G_GC:200617465:1,0,1,0
chr1	200617533	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:3,2,5,2
chr1	200619478	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	200619530	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	200619883	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:200619883_A_ACC:200619883:0,1,0,1
chr1	200619885	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:200619883_A_ACC:200619883:0,1,0,1
chr1	200619888	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:200619883_A_ACC:200619883:0,0,0,1
chr1	200619897	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:200619883_A_ACC:200619883:0,0,0,1
chr1	200635964	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=235,194;MMQ=24,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	200816519	.	TTGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=256,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TG;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr1	200816658	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr1	200818301	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,1:11,1:13,5,2,0
chr1	200843305	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr1	200868607	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.070:47:8,0:22,2:22,22,2,1
chr1	200877786	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr1	200880978	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	200943793	.	CAGGA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGA;STR;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	200944840	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	200960307	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:5,8:8,7:5,8,5,10
chr1	200967490	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=199,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:3,2,3,0
chr1	200968954	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	201009556	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr1	201009897	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	201016271	.	C	CAAT	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,2:13,0:0|1:201016271_C_CAAT:201016271:7,20,1,1
chr1	201016274	.	T	TGG	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=126,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,2:14,0:0|1:201016271_C_CAAT:201016271:7,23,1,1
chr1	201016277	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=132,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,1:13,0:0|1:201016271_C_CAAT:201016271:6,22,1,1
chr1	201016296	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,3:6,5:1,10,2,6
chr1	201020105	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.446:32:9,6:7,8:12,6,9,5
chr1	201020360	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=330,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr1	201021668	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.222:46:18,3:17,2:36,0,0,10
chr1	201031307	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=274,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	201042618	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=116,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:1,0:2,2:2,1,3,0
chr1	201043845	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,5:0,0:0,2,0,5
chr1	201044748	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:1,4:7,4:4,4,3,5
chr1	201052199	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	201079235	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:4,7:0,3:4,0,8,2
chr1	201079458	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:1,3,0,3
chr1	201081324	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr1	201113118	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr1	201115822	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:5,1,4,1
chr1	201116018	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr1	201163191	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=204,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr1	201164930	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,6:3,3:5,2,9,0
chr1	201169554	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=101,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,2:1,3,2,3
chr1	201169601	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=281,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr1	201170772	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	201170824	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr1	201171007	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=94,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	201182779	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=225,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr1	201195119	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:1,3:4,2:1,4,3,3
chr1	201285663	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,14;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.208:19:7,1:5,0:8,7,4,0
chr1	201285909	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=200,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:1,5:0,2:0,1,0,7
chr1	201286614	.	GA	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=213,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=95.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,35:0.926:37:1,18:1,17:2,0,35,0
chr1	201286628	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=190.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,23:0,28:0,0,48,3
chr1	201288007	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr1	201288898	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr1	201289305	.	G	GCCTAGAAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201289305_G_GCCTAGAAAC:201289305:0,1,0,1
chr1	201289310	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201289305_G_GCCTAGAAAC:201289305:0,1,0,1
chr1	201289312	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201289305_G_GCCTAGAAAC:201289305:0,1,0,1
chr1	201291066	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	201292110	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.850:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr1	201293512	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr1	201293970	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	201293985	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	201335899	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr1	201336984	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,3,12
chr1	201336994	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=174,162;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:1,9,0,2
chr1	201337050	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=178,132;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	201338553	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr1	201338586	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	201338896	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,5:0,1:0,0,6,2
chr1	201339043	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	201341175	.	CAGAAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAG;STR;TLOD=96.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,16,6
chr1	201341341	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr1	201353827	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	201368463	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=197,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	201383616	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr1	201383643	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr1	201386916	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,28:0.460:61:21,15:11,13:18,15,14,14
chr1	201437477	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=227,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,4:2,5:3,0,9,0
chr1	201749520	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:6,9:5,6:7,4,13,3
chr1	201754410	.	CTTTT	C,CTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32,34;MFRL=0,188,168;MMQ=60,60,60;MPOS=30,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,16;RU=T;STR;TLOD=3.20,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.399,0.490:6:0,0,2:0,3,1:0,0,5,1
chr1	201757850	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:1,1:2,0:0|1:201757850_A_C:201757850:0,4,0,1
chr1	201757852	.	CA	TT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=37,32;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:1,1:2,0:0|1:201757850_A_C:201757850:0,4,0,1
chr1	201757856	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr1	201763499	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,182;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr1	201772863	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=18,14;MFRL=127,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.742:10:0,0:1,1:0,2,0,8
chr1	201772891	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=283,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	201773566	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.170:15:7,1:6,1:13,0,2,0
chr1	201816639	.	ATCTTTT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:7,3:7,10:17,0,12,2
chr1	201823750	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,0:17,2:22,9,2,0
chr1	201824357	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:3,0:16,2:1,18,0,2
chr1	201824390	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:1,1:5,5:0,6,0,7
chr1	201826340	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=2379480,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr1	201828209	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=218,99;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0,10,0,2
chr1	201837934	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,27,30;MFRL=126,208,141;MMQ=60,60,60;MPOS=21,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=GT;STR;TLOD=4.68,7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.129,0.266:13:2,1,1:5,1,2:2,6,1,4
chr1	201837957	.	G	GTGCGTGCATGTGTTTCAATAAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=165,57;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.164:15:5,0:8,2:1,12,1,1
chr1	201838919	.	TG	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=141,77;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:201838919_TG_CT:201838919:0,4,0,1
chr1	201838923	.	A	ATCTGGAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=135,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201838919_TG_CT:201838919:0,1,0,1
chr1	201838927	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=135,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201838919_TG_CT:201838919:0,1,0,1
chr1	201838930	.	TA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=135,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201838919_TG_CT:201838919:0,1,0,1
chr1	201840059	.	GTTATT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTATT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	201840464	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=99.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,10:0,17:0,0,18,10
chr1	201840504	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,13;MFRL=110,175;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.512:11:2,1:0,0:4,1,0,6
chr1	201844128	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr1	201861016	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:0,7,0,4
chr1	201869093	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:2,0:5,2:2,6,0,2
chr1	201915550	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	201924749	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:1,3:1,3:1,2,2,4
chr1	201926386	.	C	CT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.527:38:12,4:6,15:15,3,15,5
chr1	201952294	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	201952755	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	201969082	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.620:32:5,10:5,9:8,4,8,12
chr1	201970748	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:9,3,6,2
chr1	201970986	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	201973565	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:2,3:6,5:3,5,2,6
chr1	201973630	.	T	TCTCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=227,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:201973630_T_TCTCA:201973630:0,2,1,1
chr1	201973631	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=227,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:201973630_T_TCTCA:201973630:0,2,1,1
chr1	201973633	.	C	CTAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=227,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:201973630_T_TCTCA:201973630:0,2,0,1
chr1	201973692	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	201981005	.	CAAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	201981335	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.493:10:4,3:1,2:0|1:201981335_G_A:201981335:0,5,0,5
chr1	201981354	.	TG	CC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:0|1:201981335_G_A:201981335:0,4,0,5
chr1	201983211	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:11,2:3,22,0,2
chr1	201983242	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:0,10,0,6
chr1	202092046	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	202092810	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=246,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202092810_T_TC:202092810:0,1,0,1
chr1	202092811	.	T	TAGGTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=246,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202092810_T_TC:202092810:0,1,0,1
chr1	202096815	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:6,0,6,0
chr1	202104905	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,49;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:11,0:19,4:15,17,0,4
chr1	202107234	.	A	ACTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:202107234_A_ACTCT:202107234:1,2,0,1
chr1	202107237	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:202107234_A_ACTCT:202107234:1,2,0,1
chr1	202121643	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=204,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	202122840	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,6:5,6:8,0,8,4
chr1	202129895	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=199,197;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:3,3:1,4:1,3,0,8
chr1	202129930	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=199,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr1	202194441	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	202197011	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,7:4,6:7,1,12,1
chr1	202266547	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr1	202266607	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.610:16:5,7:1,3:3,3,8,2
chr1	202273837	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,103;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,0:3,3:1,11,0,3
chr1	202274936	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=82,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,3:2,4:0,2,2,5
chr1	202288383	.	C	CTATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=131,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:202288383_C_CTATT:202288383:0,4,0,1
chr1	202288385	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=131,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:202288383_C_CTATT:202288383:0,4,0,1
chr1	202318316	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=113,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	202386075	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=109,171;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.917:21:1,10:0,10:0,1,4,16
chr1	202396267	.	C	CAG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=156,75;MMQ=52,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:12,2:0|1:202396267_C_CAG:202396267:12,15,1,1
chr1	202396269	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=156,75;MMQ=52,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:15,0:12,2:0|1:202396267_C_CAG:202396267:12,15,1,1
chr1	202457784	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,154;MMQ=50,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:0,3,3,6
chr1	202536848	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:6,9:6,6:11,1,14,1
chr1	202572105	.	GCC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr1	202572106	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.438:5:2,0:2,1:1,3,1,0
chr1	202703053	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=191,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:0,5,0,6
chr1	202710733	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:4,7:2,4:3,3,7,5
chr1	202711778	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:2,9:4,5:4,2,10,4
chr1	202715537	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,34;MFRL=188,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.410:3:0,1:0,0:0|1:202715537_GAA_G:202715537:0,2,0,1
chr1	202715550	.	A	AGCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=188,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:202715537_GAA_G:202715537:0,2,0,1
chr1	202731986	.	C	CCTCAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:3,2:4,3:1,7,0,5
chr1	202861566	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	202861853	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=236,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202861853_C_T:202861853:0,1,0,1
chr1	202861855	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=236,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202861853_C_T:202861853:0,1,0,1
chr1	202863272	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,416;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:18,1,0,3
chr1	202863469	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=190,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:0,10,0,2
chr1	202887295	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:9,9:9,7:14,4,12,4
chr1	202914356	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,6:1,9:0,1,0,15
chr1	202931839	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=225,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,3:0,4:1,1,0,7
chr1	202931958	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr1	202931998	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr1	202933657	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:7,0,9,2
chr1	202978032	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	202985013	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=119,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,2:6,2:9,1,4,0
chr1	202987770	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:4,6:12,7:0,16,0,13
chr1	202987796	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=237,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:1,5:6,2:1,7,0,7
chr1	202990110	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,30,25;MFRL=135,186,168;MMQ=60,60,60;MPOS=26,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=T;STR;TLOD=9.88,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,8,2:0.513,0.077:16:3,4,1:2,4,0:2,4,3,7
chr1	202992217	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,274;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	203012705	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:3,2:0,6,0,4
chr1	203018745	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=207,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:203018745_TC_AA:203018745:1,0,1,0
chr1	203018749	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=207,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:203018745_TC_AA:203018745:1,0,1,0
chr1	203018751	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=207,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:203018745_TC_AA:203018745:1,0,1,0
chr1	203029541	.	GGA	TTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=77,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:203029541_GGA_TTC:203029541:1,3,0,1
chr1	203029545	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=77,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:203029541_GGA_TTC:203029541:1,3,0,1
chr1	203029547	.	TGAGTGG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=77,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:203029541_GGA_TTC:203029541:1,3,0,1
chr1	203045633	.	GGT	ACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:203045633_GGT_ACC:203045633:0,2,0,2
chr1	203045639	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:203045633_GGT_ACC:203045633:0,2,0,2
chr1	203045641	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:203045633_GGT_ACC:203045633:0,2,0,2
chr1	203045643	.	GA	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:203045633_GGT_ACC:203045633:0,2,0,2
chr1	203054520	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:203054520_T_G:203054520:0,0,1,0
chr1	203054523	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:203054520_T_G:203054520:0,0,1,0
chr1	203055101	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.632:28:6,6:4,11:3,7,3,15
chr1	203137784	.	A	ACT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=77.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,9:0,0,14,5
chr1	203144359	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	203144573	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.073:53:24,3:22,0:26,24,3,0
chr1	203144896	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:203144896_T_A:203144896:1,2,0,1
chr1	203144900	.	G	GTCTCACTAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:203144896_T_A:203144896:1,2,0,1
chr1	203144901	.	G	GTTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:203144896_T_A:203144896:1,2,0,1
chr1	203144902	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:203144896_T_A:203144896:0,2,0,1
chr1	203149775	.	A	AATAGAGGCCATAGTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.318:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr1	203152801	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:3,1,4,3
chr1	203153634	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:3,9:0,2:3,0,9,2
chr1	203154267	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:2,0:3,2,2,0
chr1	203154532	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,3:5,6:0,7,1,8
chr1	203317394	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,2:1,5:0,3,0,8
chr1	203468990	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=203,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203468990_G_T:203468990:0,1,0,1
chr1	203468991	.	C	CATT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=203,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203468990_G_T:203468990:0,1,0,1
chr1	203468992	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=203,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203468990_G_T:203468990:0,1,0,1
chr1	203469060	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:203469060_C_T:203469060:0,0,0,1
chr1	203469062	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=45,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:203469060_C_T:203469060:1,0,0,1
chr1	203469064	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=0,182;MMQ=45,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:203469060_C_T:203469060:1,0,0,1
chr1	203679934	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,6:4,7:9,1,10,3
chr1	203709034	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	203709068	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	203740615	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,8:8,1:5,10,1,8
chr1	203741110	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,4:3,0:3,0,4,0
chr1	203803016	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr1	203809332	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,120;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.117:24:6,1:14,1:22,0,2,0
chr1	203819177	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.500:46:10,11:13,12:5,18,2,21
chr1	203821200	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=100.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,17:0,11:0,0,28,0
chr1	204082002	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:2,8:2,4:4,0,11,2
chr1	204083546	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,1:10,1:14,5,2,0
chr1	204085609	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.420:53:12,7:18,15:21,10,14,8
chr1	204094071	.	C	CTCACGGGATCACGTAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=216,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0,2,1,1
chr1	204095280	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:7,2:8,2:2,14,1,3
chr1	204101421	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.418:34:6,7:13,7:9,11,4,10
chr1	204103618	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:3,2:1,6:3,1,8,1
chr1	204115934	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=236,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:3,3,1,2
chr1	204125093	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=253,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr1	204129671	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=111,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:2,3:11,5:11,2,6,2
chr1	204130376	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:8,2:2,4:7,3,5,1
chr1	204159611	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:5,7:1,0:6,0,6,1
chr1	204159781	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=199,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,0:3,0:0|1:204159781_T_G:204159781:5,10,0,2
chr1	204159784	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=199,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:4,0:0|1:204159781_T_G:204159781:6,11,0,2
chr1	204159787	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=198,194;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,8:1,4:2,4,4,8
chr1	204159791	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,17;MFRL=199,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.182:18:7,0:4,0:0|1:204159781_T_G:204159781:6,9,0,3
chr1	204159800	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,18;MFRL=199,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:7,0:3,0:0|1:204159781_T_G:204159781:6,11,0,3
chr1	204216410	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	204216468	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	204216601	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,3,2
chr1	204219559	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	204219850	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	204227046	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:204227046_T_C:204227046:0,4,1,0
chr1	204227049	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:204227046_T_C:204227046:0,4,1,0
chr1	204227053	.	A	C,T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,26,29;MFRL=178,128,109;MMQ=60,60,60;MPOS=3,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:3,1,1:0,0,0:0,3,1,1
chr1	204227055	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:1,3,0,1
chr1	204227056	.	C	CTACTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTAGAGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=119,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.457:5:3,1:0,0:1,3,0,1
chr1	204230581	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,7:0,18:0,0,10,15
chr1	204234196	.	GGT	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=83.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,20:0.922:21:0,10:1,9:0|1:204234196_GGT_G:204234196:0,1,4,16
chr1	204234222	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=95.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.961:24:0,11:0,10:0|1:204234196_GGT_G:204234196:0,0,3,21
chr1	204237518	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:204237518_T_TCC:204237518:0,1,0,1
chr1	204237522	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:204237518_T_TCC:204237518:0,1,0,1
chr1	204237524	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:204237518_T_TCC:204237518:0,1,0,1
chr1	204242731	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,11:0,1:0,0,8,4
chr1	204380404	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=100.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,33:0.596:55:12,15:10,17:6,16,9,24
chr1	204401519	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.191:15:5,1:5,2:0|1:204401519_A_T:204401519:1,11,0,3
chr1	204401524	.	A	AACTTCTGCC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.181:16:5,0:7,2:0|1:204401519_A_T:204401519:1,12,0,3
chr1	204403686	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:19,0:10,2:10,20,1,1
chr1	204409281	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,21:0,1:0,0,17,5
chr1	204413297	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=345.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,79:0.988:79:0,38:0,40:0|1:204413297_C_T:204413297:0,0,25,54
chr1	204413299	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=345.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,79:0.988:79:0,37:0,37:0|1:204413297_C_T:204413297:0,0,25,54
chr1	204415330	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=219,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.691:8:1,1:1,3:0,2,0,6
chr1	204418889	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr1	204418939	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,6:0,0,11,5
chr1	204429838	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	204429865	.	G	GCGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr1	204433093	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr1	204433511	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr1	204434277	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,19,3
chr1	204438018	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:17,0:20,3:26,11,2,1
chr1	204494703	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=117,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:17,0:9,2:15,11,2,0
chr1	204494756	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=116,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.324:12:2,0:6,1:2,6,1,3
chr1	204495595	.	G	T,GT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=14,32,14;MFRL=150,168,143;MMQ=60,40,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.03,8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,11,9:0.217,0.349:31:2,6,1:0,1,2:0,11,1,19
chr1	204512100	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,4:4,6:0,6,0,10
chr1	204515863	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:4,0,5,1
chr1	204516025	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=174,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,5:6,3:2,8,3,5
chr1	204518842	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=205,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:0,4,1,4
chr1	204913627	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=17800032,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:204913627_C_A:204913627:1,0,0,1
chr1	204913633	.	G	GTTTTGCCCTCCAGGGAACAATTGCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=17800032,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:204913627_C_A:204913627:1,0,0,1
chr1	204921054	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	204923887	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:8,1,2,0
chr1	204926980	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,0:2,2:0,4,1,2
chr1	204943285	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr1	204943991	.	CA	TG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:4,5:9,5:0,13,0,10
chr1	204943992	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.959:23:0,9:0,14:0,0,0,23
chr1	204960533	.	A	ATTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:204960533_A_ATTC:204960533:0,1,0,1
chr1	204960535	.	G	GGAGGAGGAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:204960533_A_ATTC:204960533:0,1,0,1
chr1	204960537	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:204960533_A_ATTC:204960533:0,1,0,1
chr1	204978914	.	A	ATGTGTGTGTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	205028883	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:1,2:5,4:0,6,1,5
chr1	205031508	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=172,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:8,1,0,2
chr1	205031672	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:5,9,1,1
chr1	205031744	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=113,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr1	205031769	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	205033374	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,3:4,4:7,0,8,0
chr1	205034488	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=265,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	205038731	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	205039288	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=226,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	205041015	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr1	205041262	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr1	205041542	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=193,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr1	205041789	.	A	ATTACTTCTAACTCTTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=194,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	205042115	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,3:3,6:4,0,9,0
chr1	205042939	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	205057880	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=166,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:8,3:18,0:24,2,2,1
chr1	205063949	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:7,1,2,0
chr1	205065733	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:6,0,7,0
chr1	205070758	.	AT	CA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:23,0:10,2:14,19,0,2
chr1	205083865	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,17:0.305:57:22,10:18,7:36,4,14,3
chr1	205084120	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.387:45:15,9:10,8:7,21,2,15
chr1	205090885	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=47835577,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr1	205129466	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	205130413	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,7:0,0,16,4
chr1	205138321	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:5,7:12,9:9,8,12,4
chr1	205240913	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	205274512	.	T	TGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,880;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,1,0
chr1	205312280	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=169,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	205312767	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	205385498	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr1	205417563	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr1	205417586	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:0,1,0,4
chr1	205561511	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=317,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.785:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr1	205568213	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:5,10:10,6:14,1,14,2
chr1	205568390	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,6:6,9:0,10,2,13
chr1	205568438	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:1,2:1,2:0,3,0,5
chr1	205568442	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=152,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	205585640	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,106;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:11,1:17,2,2,0
chr1	205630893	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	205632726	.	G	GCCCTGGGTCCATGCTAATGGCTAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=118,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	205718991	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.071:73:36,3:27,1:47,21,3,2
chr1	205739396	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr1	205740829	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr1	205743903	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,0:1,0:0,1,3,0
chr1	205743912	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:0|1:205743912_T_G:205743912:2,1,1,0
chr1	205743913	.	C	CGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,11;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=G;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:0|1:205743912_T_G:205743912:2,1,1,0
chr1	205764433	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,4:6,5:9,1,6,3
chr1	205764640	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:2,9:2,8:0,4,4,13
chr1	205766159	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=183,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.717:16:2,5:2,6:0,4,2,10
chr1	205767187	.	G	GT	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,2:0.043:67:28,2:36,0:0|1:205767187_G_GT:205767187:28,37,1,1
chr1	205767188	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,2:0.043:67:29,2:36,0:0|1:205767187_G_GT:205767187:28,37,1,1
chr1	205767189	.	CAGAGG	C	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,2:0.041:70:29,2:36,0:0|1:205767187_G_GT:205767187:28,40,1,1
chr1	205810947	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.372:49:14,10:17,8:16,15,9,9
chr1	205811865	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,7:0,2:0,2,4,6
chr1	205813007	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=277,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205813007_G_T:205813007:1,0,0,1
chr1	205813008	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=277,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205813007_G_T:205813007:1,0,0,1
chr1	205813014	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=277,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205813007_G_T:205813007:1,0,0,1
chr1	205814695	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,5:2,1:0,3,0,6
chr1	205816923	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,242;MMQ=27,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:8,2:15,0,3,0
chr1	205886381	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr1	205888143	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=315,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	205890679	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr1	205892411	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.555:25:7,7:4,3:0|1:205892411_T_C:205892411:10,1,10,4
chr1	205892415	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=52.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,15:0.571:26:6,9:4,4:0|1:205892411_T_C:205892411:10,1,11,4
chr1	205893699	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	205896235	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	205896293	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:7,6:5,7:10,2,11,2
chr1	205896431	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,9:6,2:4,7,2,9
chr1	205896475	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	205897876	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:3,1,8,0
chr1	205901788	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,12,3
chr1	205902242	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,4:7,6:1,12,1,9
chr1	206239317	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	206328647	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,19,0
chr1	206328803	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=54,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.868:20:2,9:0,9:1,1,5,13
chr1	206516159	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=298,280;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	206557403	.	T	TACC	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=151,124;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,4:0.076:63:31,4:26,0:0|1:206557403_T_TACC:206557403:0,59,0,4
chr1	206557405	.	A	AGTAGAGCTCGT	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=151,124;MMQ=25,25;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,4:0.077:63:30,4:28,0:0|1:206557403_T_TACC:206557403:0,59,0,4
chr1	206566293	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=160,173;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,8:0.124:70:27,4:35,4:10,52,0,8
chr1	206567100	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,170;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,3:8,3:0,14,0,6
chr1	206579936	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=154,179;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:10,5:9,15:19,0,20,0
chr1	206623685	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,10,6
chr1	206623866	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	206626779	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	206648378	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr1	206665896	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,15:0,31:0,0,20,26
chr1	206666366	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:5,1:5,1:3,8,0,2
chr1	206670827	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	206757850	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:21,1:24,2:18,29,0,3
chr1	206758077	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	206758091	.	C	CATCAGAGGCCAGGTCCTTTAGGGGTAGGCCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=148,130;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	206760474	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr1	206769047	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.686:26:5,10:2,8:5,3,15,3
chr1	206772753	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	206775897	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=264,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:206775897_C_A:206775897:0,1,0,1
chr1	206775899	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=264,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:206775897_C_A:206775897:0,1,0,1
chr1	206776203	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,3:0,0,12,0
chr1	206858861	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:7,1:5,1:4,14,0,3
chr1	206904137	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	206904464	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:11,8:5,8:12,5,11,6
chr1	206943297	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.435:16:5,3:3,2:2,7,0,7
chr1	206943351	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	206944233	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.491:41:12,12:8,8:13,8,13,7
chr1	206944645	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.736:17:3,9:1,3:2,2,13,0
chr1	206944861	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:1,3,0,6
chr1	207014472	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr1	207039098	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:207039098_A_C:207039098:0,0,1,0
chr1	207039103	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:207039098_A_C:207039098:0,0,1,0
chr1	207039110	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:207039098_A_C:207039098:1,0,1,0
chr1	207040659	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	207071236	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:0,10,1,1
chr1	207083746	.	G	GAAAATTGAGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=210,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:207083746_G_GAAAATTGAGT:207083746:0,3,0,1
chr1	207083747	.	C	CTCAGTTTCACACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=210,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:207083746_G_GAAAATTGAGT:207083746:0,3,0,1
chr1	207135516	.	AC	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:1,0:6,0,3,0
chr1	207235954	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:8,16:11,6:9,10,13,9
chr1	207237096	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.482:44:11,10:10,11:10,13,16,5
chr1	207237228	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.423:12:6,1:1,0:0|1:207237228_T_G:207237228:2,5,0,5
chr1	207237235	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.378:11:3,2:1,0:0|1:207237228_T_G:207237228:2,5,0,4
chr1	207241440	.	AGT	A,AGTGTGTGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31,33;MFRL=161,123,110;MMQ=60,60,54;MPOS=10,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,14;RU=GT;STR;TLOD=5.76,3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.391,0.354:5:1,2,0:0,0,2:1,0,4,0
chr1	207243851	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	207269858	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,11,8
chr1	207300259	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,6,19
chr1	207497811	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	207500032	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=216,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,2:2,2:3,0,5,0
chr1	207504669	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr1	207510596	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	207640345	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=212,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	207641840	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,2:4,3:9,2,4,1
chr1	207642295	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=226,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,2,1
chr1	207653444	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=106,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,3:2,2:2,3,0,5
chr1	207700348	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=204,210;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:207700348_G_A:207700348:0,1,0,2
chr1	207700353	.	T	TCTATAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=204,210;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:207700348_G_A:207700348:0,1,0,2
chr1	207737670	.	GAC	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=194,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.283:19:9,3:4,2:0,14,1,4
chr1	207739127	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,154;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.385:50:16,8:15,11:27,4,17,2
chr1	207753831	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.279:15:7,1:2,2:7,4,1,3
chr1	207760897	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:12,0:0|1:207760897_A_T:207760897:9,16,0,2
chr1	207760899	.	A	AATGATG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,1:13,0:0|1:207760897_A_T:207760897:9,16,0,2
chr1	207784968	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr1	207812791	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=191,148;MMQ=52,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,4:4,4:0,5,1,7
chr1	207850717	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.549:25:2,6:9,6:9,2,11,3
chr1	207851487	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:4,6:1,8:5,0,13,1
chr1	207872507	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,150;MMQ=52,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=116.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,45:0.527:85:19,22:21,21:32,8,39,6
chr1	207881485	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=146,137;MMQ=56,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,22:0.382:58:14,7:18,13:0|1:207881485_TA_T:207881485:24,12,16,6
chr1	207881489	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=146,137;MMQ=56,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,22:0.382:58:15,8:20,12:0|1:207881485_TA_T:207881485:24,12,16,6
chr1	207881491	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=146,146;MMQ=56,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,20:0.362:56:14,8:20,12:0|1:207881485_TA_T:207881485:24,12,14,6
chr1	207891027	.	GT	G	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:32,3:37,0:11,63,3,0
chr1	207940853	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=197,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,3:0,2:4,0,5,0
chr1	207956559	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.658:36:7,15:5,9:11,1,22,2
chr1	207959122	.	CTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=71,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:2,0:0,1:0|1:207959122_CTTTT_C:207959122:0,2,0,1
chr1	207959136	.	T	TAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=71,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,11;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:207959122_CTTTT_C:207959122:0,2,0,1
chr1	208062471	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:6,6:7,4:8,6,5,5
chr1	208063100	.	G	A,GA,GAA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=35,32,34,34;MFRL=105,141,152,159;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,26,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=28.03,10.61,9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,16,7,4:0.372,0.299,0.180:31:1,8,4,1:3,8,2,3:3,1,10,17
chr1	208204919	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,4:2,3:9,0,6,1
chr1	208206946	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	208211850	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:0,6,1,3
chr1	208211887	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	208212129	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,4:1,5:4,0,6,3
chr1	208213125	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr1	208213241	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,3,1
chr1	208213308	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.719:22:3,7:2,9:4,2,13,3
chr1	208216304	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr1	208219164	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	208224579	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.542:40:9,10:9,9:13,5,17,5
chr1	208234228	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	208255877	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	208255899	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=178,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:208255899_CA_TT:208255899:0,3,0,1
chr1	208255904	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=178,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:208255899_CA_TT:208255899:0,3,0,1
chr1	208276399	.	C	CCTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=CT;STR;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	208383713	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:17,1:15,1:21,13,2,0
chr1	209605636	.	TAGCAGCAGCAGC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=AGC;STR;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.459:9:2,4:1,0:0,5,0,4
chr1	209779805	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr1	209792015	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr1	209796267	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=222,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	209804095	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,2,11
chr1	209811829	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.567:19:3,5:5,5:6,2,9,2
chr1	209812063	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	209849002	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=106.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,15:0,0,26,6
chr1	209849399	.	AG	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=119.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.968:28:0,12:0,14:0|1:209849399_AG_A:209849399:0,0,10,18
chr1	209849406	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,12:0,14:0|1:209849399_AG_A:209849399:0,0,10,18
chr1	209849714	.	TA	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=182.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,33:0,32:0,0,43,25
chr1	209905763	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.496:26:6,6:7,6:12,1,12,1
chr1	209905988	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=160,216;MMQ=50,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:13,1:6,2:0,19,0,3
chr1	209906015	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=181,160;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,4:3,1:0,9,0,5
chr1	209950681	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr1	209952865	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:2,6:6,3:3,6,3,6
chr1	209965587	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:13,2:4,4:15,2,4,2
chr1	209969902	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:6,9:11,6:10,8,8,8
chr1	209974554	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,14;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:4,0:1,0:2,4,2,0
chr1	210001543	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,0:2,5:1,5,1,4
chr1	210001586	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	210003388	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:11,1,8,0
chr1	210003402	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=91.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,25,0
chr1	210004199	.	C	G	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=270.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,44:0,30:0,0,31,43
chr1	210004319	.	G	C	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=132,44;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,3:0.049:79:40,3:33,0:37,39,3,0
chr1	210006437	.	GC	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	210008367	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=76.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0|1:210008367_C_G:210008367:0,0,14,6
chr1	210008374	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.499:22:6,5:5,6:0|1:210008367_C_G:210008367:8,3,7,4
chr1	210012102	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	210015568	.	GCT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr1	210016896	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:20,2:9,0:9,21,2,0
chr1	210407338	.	T	TAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,0:5,2:0,13,0,2
chr1	210407339	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.550:17:5,4:3,5:0,8,0,9
chr1	210411266	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=104,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.315:14:3,2:2,2:0|1:210411266_GT_G:210411266:7,3,4,0
chr1	210411281	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,9;MFRL=110,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.297:20:4,0:6,0:0|1:210411266_GT_G:210411266:8,6,6,0
chr1	210414879	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.313:28:7,0:5,4:13,6,3,6
chr1	210577873	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,7:5,1:3,6,3,5
chr1	210577884	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:4,6:4,2:2,7,3,5
chr1	210591742	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	210686570	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,5:3,6:1,5,1,10
chr1	210686614	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=152,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	210856585	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	210856604	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=228,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr1	210970823	.	T	TG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.413:20:6,3:5,5:9,3,7,1
chr1	211276828	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,8:0,0,17,5
chr1	211280724	.	TAA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.939:12:0,3:0,7:0,0,3,9
chr1	211444464	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,0:8,4:13,0,4,0
chr1	211447435	.	CTT	C,CT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,219,184;MMQ=60,60,60;MPOS=20,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=T;STR;TLOD=6.03,83.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,31:0.131,0.844:35:0,1,15:0,3,15:0,0,35,0
chr1	211451393	.	TATC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,4:5,2:8,1,7,0
chr1	211452529	.	TAA	T,TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33,31;MFRL=82,175,156;MMQ=60,58,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.17,27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,15:0.182,0.676:22:1,1,7:1,3,6:2,1,15,4
chr1	211452678	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,28:0.509:55:14,13:10,14:6,21,8,20
chr1	211452728	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=167,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,5:7,4:0,14,0,9
chr1	211545442	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=191,172;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.525:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr1	211545459	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=18,14;MFRL=191,103;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:0,0:0,0:4,0,2,0
chr1	211652755	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	211837028	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,0:11,3:0,23,0,3
chr1	212118366	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	212118391	.	G	GATCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=207,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	212139896	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,0:1,5:0,5,1,4
chr1	212142055	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.409:24:5,3:6,3:2,12,4,6
chr1	212194560	.	GA	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.114:41:14,4:17,0:2,35,0,4
chr1	212217944	.	GA	G,GAA	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=36,35,35;MFRL=161,160,115;MMQ=60,60,57;MPOS=22,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=9.60,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,8,4:0.273,0.124:29:10,1,2:7,7,1:17,0,11,1
chr1	212217963	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=20,16;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.110:43:8,0:12,0:33,4,6,0
chr1	212217971	.	C	CTT	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=109.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,31:0.637:49:5,7:5,7:16,2,25,6
chr1	212217976	.	T	A	.	.	DP=67;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.053:59:24,0:22,0:42,14,3,0
chr1	212220847	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	212236157	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:1,5:6,7:4,3,12,0
chr1	212240063	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:3,0,8,0
chr1	212241714	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.529:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	212241739	.	C	CAGAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:212241739_C_CAGAT:212241739:0,3,0,1
chr1	212241740	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:212241739_C_CAGAT:212241739:0,3,0,1
chr1	212241743	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:212241739_C_CAGAT:212241739:1,3,0,1
chr1	212519369	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=195,178;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:212519369_G_A:212519369:0,2,0,1
chr1	212519375	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=195,178;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:212519369_G_A:212519369:0,2,0,1
chr1	212521639	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	212530192	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,4:2,3:4,0,5,2
chr1	212530659	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.222:20:6,3:8,1:0,16,0,4
chr1	212538786	.	TT	CC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	212587978	.	G	GCCC	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=31,10;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.784:17:3,0:0,0:0,3,14,0
chr1	212587979	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=26,13;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.788:17:3,1:0,2:0,3,14,0
chr1	212587981	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=27,13;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.756:18:3,2:0,4:0|1:212587981_A_C:212587981:0,4,14,0
chr1	212587988	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.545:18:6,4:0,5:0|1:212587981_A_C:212587981:1,7,10,0
chr1	212587994	.	CAT	C	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=32,17;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:11,2:1,1:0|1:212587981_A_C:212587981:5,11,7,0
chr1	212587999	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=31,13;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:13,2:3,0:0|1:212587981_A_C:212587981:5,12,6,0
chr1	212588003	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:14,3:2,1:0|1:212587981_A_C:212587981:7,14,5,0
chr1	212588005	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=32,11;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:15,1:5,0:0|1:212587981_A_C:212587981:9,15,5,0
chr1	212588021	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=9;MBQ=31,10;MFRL=141,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.102:45:19,0:17,0:16,22,5,2
chr1	212615875	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=206,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:1,2:1,1:2,0,4,0
chr1	212619339	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:4,5:7,10:5,6,7,8
chr1	212900434	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr1	212912108	.	ATT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	212969842	.	C	CT,CTT	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=34,34,34;MFRL=167,154,177;MMQ=60,60,60;MPOS=17,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=49.86,13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,24,11:0.598,0.274:41:1,13,6:5,7,3:6,0,30,5
chr1	212969856	.	C	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=19,10;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,17:0.228:61:10,0:10,2:30,14,16,1
chr1	212970375	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr1	213009157	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=184,156;MMQ=40,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr1	213009178	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=169,168;MMQ=40,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.397:11:2,2:4,2:6,1,4,0
chr1	213032568	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,0,13
chr1	213056819	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr1	213056892	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	213062017	.	T	TTTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TTG;STR;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.878:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	213068233	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,15:0,7:0,0,22,0
chr1	213139748	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0,6,0,6
chr1	213140398	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:2,3:4,6:1,5,9,1
chr1	213168513	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:13,10:12,8:6,19,8,10
chr1	213180441	.	GAA	G,GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34,33;MFRL=0,161,113;MMQ=60,60,60;MPOS=15,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=6.04,8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,5:0.385,0.537:8:0,1,2:0,2,2:0,0,7,1
chr1	213181452	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=161,161;MMQ=58,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:213181452_T_C:213181452:3,0,1,0
chr1	213181458	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=161,158;MMQ=58,35;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:213181452_T_C:213181452:3,0,2,0
chr1	213181486	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=194,167;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,1:8,1:14,0,2,0
chr1	213303245	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:213303245_GT_G:213303245:0,1,0,1
chr1	213303247	.	ATATTATGTTTTGG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:213303245_GT_G:213303245:0,1,0,1
chr1	213303261	.	CATG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:213303245_GT_G:213303245:0,1,0,1
chr1	213303272	.	GT	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=199,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	213349664	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	213403990	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=173,168;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,1:0,1:0,7,0,2
chr1	213404014	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=190,222;MMQ=57,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr1	214454774	.	GGGC	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:5,0:8,3:4,10,1,2
chr1	214478459	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,5:0,0,8,0
chr1	214492162	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:3,1,0,2
chr1	214503489	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,16,7
chr1	214531239	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.520:48:13,13:10,12:16,7,21,4
chr1	214551276	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,10:0,15:0,0,20,6
chr1	214557048	.	GCCT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCT;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,2:0,0:4,2,1,1
chr1	214558228	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,219;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr1	214564442	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.492:24:8,7:4,3:1,11,1,11
chr1	214566952	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,14:0,4:0,0,18,0
chr1	214567013	.	CG	C	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=199.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,45:0,26:0,0,53,18
chr1	214637882	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	214638172	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr1	214794191	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:18,0:7,2:12,13,1,1
chr1	214804063	.	TTA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:0|1:214804063_TTA_T:214804063:0,8,0,2
chr1	214804067	.	T	TCTCTCTGTCCATCTCTCTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:214804063_TTA_T:214804063:0,8,0,2
chr1	214815033	.	C	G	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,9:0.127:76:35,7:31,2:29,38,2,7
chr1	214824974	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=177,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:17,1,2,0
chr1	214825289	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:5,4:9,6:0,17,0,10
chr1	214826364	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:10,3:7,3:5,13,0,6
chr1	214828812	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:8,3:3,6:0,11,1,9
chr1	214830205	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr1	214832344	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,108;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:3,0:15,3:4,16,0,3
chr1	215345263	.	GTCTCTC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=TC;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	215368514	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	215753355	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,3,14
chr1	215754380	.	G	GGATCACCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=201,154;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:215754380_G_GGATCACCT:215754380:0,3,0,2
chr1	215754384	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=201,162;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:215754380_G_GGATCACCT:215754380:0,3,0,1
chr1	215754388	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=201,162;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:215754380_G_GGATCACCT:215754380:0,3,0,1
chr1	215781574	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr1	215814142	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,1:6,2:0,10,0,3
chr1	215853748	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.872:5:0,2:0,3:0|1:215853748_GT_G:215853748:0,0,0,5
chr1	215853770	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:215853748_GT_G:215853748:0,2,0,1
chr1	215853771	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:215853748_GT_G:215853748:0,2,0,1
chr1	215853774	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:215853748_GT_G:215853748:0,2,0,1
chr1	215914646	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr1	215914826	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:11,3:9,2:4,16,2,3
chr1	215916728	.	ATGTGTGTGTG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=164,192;MMQ=40,40;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=TG;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:215916728_ATGTGTGTGTG_A:215916728:0,3,0,1
chr1	215916740	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=164,192;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:215916728_ATGTGTGTGTG_A:215916728:0,3,0,1
chr1	215931928	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,4:4,3:10,0,7,0
chr1	215956304	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr1	215963374	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=121,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr1	215972180	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,9,1
chr1	215990410	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=172,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:13,3:12,0:0|1:215990410_G_T:215990410:13,13,2,1
chr1	215990414	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=172,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:11,3:12,0:0|1:215990410_G_T:215990410:14,12,2,1
chr1	216051157	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,7:5,5:2,7,6,6
chr1	216107915	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	216222071	.	G	GTGTGGTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0,12,0,2
chr1	216246675	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	216270618	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=154.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,26:0,18:0,0,1,44
chr1	216497469	.	CCAAT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr1	216500830	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	216538507	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	216595306	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:7,5:8,6:10,6,5,6
chr1	216680376	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:15,0:18,2:14,19,1,1
chr1	216850409	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,1:5,6:8,2,7,0
chr1	217604777	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,1:4,7:0,5,0,8
chr1	217784431	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.444:12:2,4:5,1:0,7,0,5
chr1	217793938	.	T	TTAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAA;STR;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr1	217822135	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr1	217856803	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.373:33:13,8:7,4:2,19,0,12
chr1	217947911	.	T	TCTTGGCAACATGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=203,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	218458557	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	218578737	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=231,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:218578737_C_A:218578737:0,1,0,1
chr1	218578740	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=231,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:218578737_C_A:218578737:0,1,0,1
chr1	218578742	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=231,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:218578737_C_A:218578737:0,1,0,1
chr1	218578743	.	C	CAGGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=231,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:218578737_C_A:218578737:0,1,0,1
chr1	218610662	.	CTT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=108,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:4,0:11,2,2,0
chr1	218610682	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:2,0:6,1:8,5,6,0
chr1	218683417	.	CT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34,31;MFRL=145,161,173;MMQ=60,60,60;MPOS=19,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=10.83,4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,9,4:0.262,0.161:29:7,5,3:8,3,1:15,1,12,1
chr1	219366400	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	219383848	.	A	ACTTTTT	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=202.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,19:0,19:0,0,43,4
chr1	219383867	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=176.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,23:0,26:0,0,39,11
chr1	220145371	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=101.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,33:0.586:56:11,20:12,13:22,1,28,5
chr1	220153332	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	220154246	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.446:15:6,5:2,1:0,8,0,7
chr1	220154659	.	TAAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=189,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.568:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr1	220156090	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=82.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.527:53:14,17:11,11:16,9,20,8
chr1	220156704	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,28:0.516:54:15,9:9,18:0|1:220156704_T_C:220156704:8,18,7,21
chr1	220156729	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,17:0.500:34:9,4:8,11:0|1:220156704_T_C:220156704:4,13,4,13
chr1	220160433	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,11:5,3:13,0,13,1
chr1	220162195	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr1	220178717	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	220191932	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=13,17;MFRL=75,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.547:5:0,1:0,0:0,2,0,3
chr1	220192495	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=211,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,3:0,4:0,3,0,7
chr1	220197545	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=228,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	220205693	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr1	220205943	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	220207017	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,34:0.473:72:21,18:17,16:6,32,9,25
chr1	220208154	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,7:2,3:8,0,10,0
chr1	220231248	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,4:0.063:77:44,1:29,3:19,54,0,4
chr1	220231253	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=9;MBQ=34,27;MFRL=135,111;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,2:0.042:69:44,0:22,2:14,53,1,1
chr1	220231258	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.049:64:37,0:21,3:13,48,0,3
chr1	220231268	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=144,157;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.056:51:29,0:19,2:3,46,0,2
chr1	220231293	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=164,152;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.096:28:10,2:15,0:0|1:220231293_A_G:220231293:0,26,0,2
chr1	220231295	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=32,21;MFRL=164,152;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.096:28:10,1:16,0:0|1:220231293_A_G:220231293:0,26,0,2
chr1	220231299	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=36,17;MFRL=164,152;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.096:28:10,0:16,0:0|1:220231293_A_G:220231293:0,26,0,2
chr1	220231343	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=35,34;MFRL=188,152;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.187:13:4,0:7,2:0|1:220231343_CA_C:220231343:0,11,0,2
chr1	220231347	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=182,152;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.201:12:4,0:6,2:0|1:220231343_CA_C:220231343:0,10,0,2
chr1	220232091	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=191,195;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr1	220232151	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=155,158;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:3,2:12,0:16,0,2,0
chr1	220233219	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:3,1:0,7,0,2
chr1	220269439	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.459:36:10,9:9,6:18,1,15,2
chr1	220275378	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:0,6:7,3:7,0,9,0
chr1	220284258	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:6,13,1,1
chr1	220300035	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,3:5,4:7,3,7,0
chr1	220310347	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:1,4,0,5
chr1	220313680	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=163,188;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0,5,0,2
chr1	220313722	.	TG	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=155,184;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0,4,0,1
chr1	220319007	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:15,2:13,7:6,22,3,6
chr1	220327203	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=164,158;MMQ=60,34;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:220327203_C_T:220327203:4,0,2,0
chr1	220327207	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=164,158;MMQ=60,34;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:220327203_C_T:220327203:4,0,2,0
chr1	220331298	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	220345878	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:4,1:6,0,6,1
chr1	220368534	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:20,4:14,0:17,17,4,0
chr1	220373857	.	C	A	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,31:0.364:86:30,16:22,15:38,17,23,8
chr1	220374047	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.447:29:8,6:8,6:0,16,0,13
chr1	220379361	.	TA	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.114:50:18,3:20,1:8,37,1,4
chr1	220406291	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,6:4,2:0,10,0,8
chr1	220771740	.	TTA	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TA;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.127:52:24,3:17,3:0,46,0,6
chr1	220771832	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr1	220789236	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr1	220789362	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.853:18:2,5:0,10:2,0,1,15
chr1	220808666	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:3,4:1,0:4,0,4,0
chr1	220808921	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	220824115	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:6,3:4,5:2,9,0,8
chr1	220825523	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=112.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,12:0,0,3,29
chr1	220835392	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,0:9,3:10,13,0,3
chr1	220978645	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:6,9:7,9:3,10,3,15
chr1	220982320	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.597:8:0,2:3,1:0,3,0,5
chr1	221055463	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:3,7:10,5:10,3,12,0
chr1	221875661	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,176;MMQ=46,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:1,3:9,0:8,2,4,0
chr1	221876029	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr1	222713395	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=83,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:10,12:7,6:8,9,11,7
chr1	222732027	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.460:26:8,5:6,6:11,3,10,2
chr1	222737568	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=58.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,1,16
chr1	222751034	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr1	222802006	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,10:0,9:0,0,10,9
chr1	222805698	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:1,8,0,2
chr1	222823529	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=204,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.682:14:2,6:2,2:4,0,10,0
chr1	222823738	.	GTT	G,GT	.	.	DP=124;ECNT=3;MBQ=33,34,30;MFRL=146,149,131;MMQ=60,60,60;MPOS=31,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=10.29,14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:74,8,15:0.082,0.142:97:34,0,2:30,7,9:21,53,5,18
chr1	222823742	.	T	TG	.	.	DP=116;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,4:0.055:86:29,2:52,2:17,65,1,3
chr1	222823743	.	T	G	.	.	DP=111;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,47:0.542:86:10,22:29,25:11,28,7,40
chr1	222825525	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,52;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:25,3:32,0:50,9,0,3
chr1	222825717	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,32:0.541:59:9,13:18,19:3,24,5,27
chr1	222825761	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=72.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,4:0,17:0,0,0,21
chr1	222826481	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.543:39:6,8:10,13:7,11,4,17
chr1	222832010	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.500:44:7,12:15,10:21,1,20,2
chr1	222838216	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=253.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,42:0,32:0,0,27,47
chr1	222846847	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:0,25,0,2
chr1	222846868	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=177,178;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0,19,0,2
chr1	222867568	.	C	T	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,3:0.037:106:47,2:54,1:64,39,3,0
chr1	222889091	.	C	T	.	.	DP=160;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:133,12:0.088:145:66,6:63,6:73,60,8,4
chr1	223116472	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:7,7:4,6:0|1:223116472_G_A:223116472:6,5,4,10
chr1	223116474	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:7,6:4,7:0|1:223116472_G_A:223116472:6,5,4,10
chr1	223152868	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,7:0,1:0,0,8,1
chr1	223156382	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=168.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,29:0,19:0,0,22,27
chr1	223156406	.	CT	C,CTT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=21,24,34;MFRL=144,161,0;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.83,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,6,3:0.207,0.092:30:9,2,2:9,3,0:4,17,6,3
chr1	223175830	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:18,2:17,2:20,15,2,2
chr1	223283851	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:4,7:8,11:5,7,12,6
chr1	223285057	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=143,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:12,4:18,0:14,16,4,0
chr1	223400943	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,1:13,1:12,16,2,0
chr1	223532570	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,5:2,5:0,5,0,10
chr1	223533601	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,17:0.322:48:16,1:10,3:26,5,0,17
chr1	223533607	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,15:0.300:49:14,0:11,1:27,7,0,15
chr1	223712834	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,619;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:9,2:1,15,1,1
chr1	223715248	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=62.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,22:0.696:31:3,7:6,15:1,8,8,14
chr1	223716349	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr1	223718275	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:223718275_C_G:223718275:0,1,0,1
chr1	223718277	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:223718275_C_G:223718275:0,1,0,1
chr1	223718281	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:223718275_C_G:223718275:0,1,0,1
chr1	223718518	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=233,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.773:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr1	223722646	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	223722780	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,1,4
chr1	223807207	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:223807207_A_AG:223807207:0,3,0,1
chr1	223807209	.	A	ACAGGAGGCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:1,0:0|1:223807207_A_AG:223807207:0,3,0,1
chr1	223814671	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	223816322	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,13,2
chr1	223816347	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=73.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,13:0,11:0,0,15,9
chr1	223816577	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	223853440	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	223936923	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.244:19:5,2:5,2:0,15,0,4
chr1	223938565	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.441:41:11,11:11,6:16,7,11,7
chr1	223944932	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	223947106	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:12,1:12,1:5,19,1,1
chr1	223951985	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr1	223959796	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr1	223984296	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:2,2:1,6,0,2
chr1	223984306	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.681:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr1	223998177	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:18,0:18,2:0|1:223998177_T_C:223998177:15,23,1,1
chr1	223998180	.	T	TCA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:19,0:16,2:0|1:223998177_T_C:223998177:14,22,1,1
chr1	224008913	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,16,4
chr1	224302154	.	T	TGAG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=112.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,10:0,12:0,0,2,24
chr1	224318151	.	T	TTTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=68.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,6:0,0,13,4
chr1	224321906	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=162,908;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,1:13,1:5,13,1,1
chr1	224321984	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	224345012	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr1	224418834	.	CAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	224424379	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=183,183;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:7,0:0,17,0,2
chr1	224444628	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=146.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,21:0,20:0,0,41,0
chr1	224444901	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,0,27
chr1	224468992	.	T	TACTGAATAAAGACAGAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,210;MMQ=33,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	224477229	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.122:31:14,0:11,3:17,11,0,3
chr1	224492381	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=105.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,13:0,0,25,4
chr1	224495852	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=189.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,22:0,33:0,0,26,29
chr1	224505570	.	T	TAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=154.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,15:0,0,14,23
chr1	224505719	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	224517907	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,4:0,3:0,0,0,10
chr1	224588825	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr1	224619366	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:11,1:19,1:15,16,1,1
chr1	224868596	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:7,1,4,0
chr1	224872443	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:11,5:9,4:12,8,6,3
chr1	224872473	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.462:33:7,8:9,7:11,7,7,8
chr1	225156457	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=109.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,38:0.591:64:13,18:13,20:18,8,28,10
chr1	225226445	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,11:0.161:72:23,7:38,4:36,25,5,6
chr1	225237850	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,16,1
chr1	225311160	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	225346975	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,1:4,1,4,0
chr1	225394645	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.527:53:14,12:11,16:20,5,23,5
chr1	225439988	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,9:5,4:6,5,10,3
chr1	225445589	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:1,1:2,2:3,1,3,0
chr1	225445652	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,3:6,4:9,8,5,2
chr1	225460626	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=209,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.748:6:0,1:1,4:1,0,4,1
chr1	225460897	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=190,190;MMQ=54,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:225460897_G_A:225460897:0,4,0,1
chr1	225460900	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,16;MFRL=191,190;MMQ=48,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:225460897_G_A:225460897:0,3,0,1
chr1	225460901	.	GA	G,AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,28,29;MFRL=190,190,210;MMQ=44,40,59;MPOS=5,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,1:1,1,0:0,2,0,2
chr1	225460903	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=190,210;MMQ=40,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	225460905	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=190,200;MMQ=44,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	225506262	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,19,0
chr1	225512402	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=53.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,7:0,12:0,0,17,3
chr1	225521282	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr1	225539665	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	225546172	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,10,3
chr1	225546419	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr1	225546446	.	C	CTATAAACTG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=191,180;MMQ=51,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:225546446_C_CTATAAACTG:225546446:0,4,0,1
chr1	225546450	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=191,180;MMQ=51,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:225546446_C_CTATAAACTG:225546446:0,4,0,1
chr1	225546453	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=191,180;MMQ=51,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:225546446_C_CTATAAACTG:225546446:0,4,0,1
chr1	225546454	.	C	CATTGG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=192,154;MMQ=51,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	225552624	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=175.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,22:0,30:0,0,5,47
chr1	225552650	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=118.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,14:0,21:0,0,1,34
chr1	225555602	.	TC	GC,GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33,34;MFRL=0,147,156;MMQ=60,60,60;MPOS=22,11;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=93.19,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,26,2:0.876,0.093:28:0,12,0:0,14,2:0,0,16,12
chr1	225562385	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=109.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,18:0,13:0,0,16,15
chr1	225565217	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=173,136;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:10,1:7,1:0,17,0,2
chr1	225565231	.	GTGGA	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:9,3:6,0:0|1:225565231_GTGGA_G:225565231:0,15,0,3
chr1	225565235	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=189,141;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:7,1:5,1:0,12,0,2
chr1	225565239	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,1:6,0:0|1:225565231_GTGGA_G:225565231:0,13,0,2
chr1	225576058	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr1	225577648	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:0,4:1,3:0,1,0,8
chr1	225577663	.	T	TCCCCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.281:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	225600351	.	TA	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.189:38:8,3:14,2:6,24,2,6
chr1	225603103	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,10:0,14:0,0,1,24
chr1	225606997	.	C	T	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,98;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,3:0.044:87:36,1:47,2:37,47,3,0
chr1	225607144	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=195.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,36:0,21:0,0,18,41
chr1	225607375	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:8,3:3,0:11,2,3,1
chr1	225611845	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr1	225685621	.	TAAG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	225702410	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.236:32:13,5:7,1:19,6,0,7
chr1	226016614	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,1:12,1:6,23,1,1
chr1	226016633	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:9,7:3,7:2,10,2,12
chr1	226027096	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:226027096_G_GA:226027096:0,1,0,1
chr1	226027098	.	G	GATGGTGATGGTGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:226027096_G_GA:226027096:0,1,0,1
chr1	226027101	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:226027096_G_GA:226027096:0,1,0,1
chr1	226027129	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226027548	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.501:34:10,6:7,11:13,4,13,4
chr1	226044489	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr1	226048744	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,37;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	226050609	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=101,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,7:2,2:0,4,0,9
chr1	226058862	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,89;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:17,0:27,3:6,39,0,3
chr1	226059643	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:5,1:9,1:12,10,3,0
chr1	226075410	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,197;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	226108200	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.478:37:7,8:12,7:12,7,10,8
chr1	226125543	.	G	GA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=198.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,21:0,40:0,0,12,49
chr1	226127443	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,0,2
chr1	226252232	.	C	T	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=297.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,88:0.989:88:0,35:0,49:0,0,5,83
chr1	226253316	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=140.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,24:0,17:0,0,38,4
chr1	226334578	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr1	226340365	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=243,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:226340365_C_G:226340365:0,3,0,1
chr1	226340369	.	G	GTCTGTTGAAAAATTCTTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=243,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:226340365_C_G:226340365:0,3,0,1
chr1	226438449	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	226550924	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr1	226556094	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	226578099	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=188,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:0,1,4,4
chr1	226595423	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:2,0,1,0
chr1	226595430	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr1	226825341	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,3:2,0:2,0,2,1
chr1	226827379	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.180:15:6,1:6,1:0|1:226827379_A_AG:226827379:2,11,0,2
chr1	226827382	.	C	CG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.180:15:4,1:5,1:0|1:226827379_A_AG:226827379:2,11,0,2
chr1	226827384	.	G	GTTCGTAGGGCTCTGTAGA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.238:11:3,1:5,1:0|1:226827379_A_AG:226827379:1,8,0,2
chr1	227170297	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	227170543	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,5:6,3:6,3,6,2
chr1	227171584	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	227171736	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=36,35;MFRL=181,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:0|1:227171736_G_GT:227171736:4,0,3,0
chr1	227171737	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=224,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:2,2:0,2:0|1:227171737_G_T:227171737:3,0,4,0
chr1	227171738	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=181,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:2,3:0,0:0|1:227171736_G_GT:227171736:4,0,3,0
chr1	227171739	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=224,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:3,2:0,1:0|1:227171737_G_T:227171737:3,0,4,0
chr1	227171933	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr1	227171958	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:0,5,0,5
chr1	227172518	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=106,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:3,2,3,3
chr1	227172903	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr1	227172935	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	227174122	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,36;MFRL=90,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,0:2,3:2,1,3,0
chr1	227174145	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,7,2
chr1	227181923	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr1	227182033	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,15:0,0,16,16
chr1	227182179	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr1	227192579	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,5:0,0,15,0
chr1	227198775	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:7,6:6,8:5,8,5,9
chr1	227204557	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:4,4:8,2:12,0,6,0
chr1	227210888	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	227218069	.	C	CAT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=124.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,12:0,0,28,1
chr1	227222515	.	G	GACAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,9:0,5:0,0,1,14
chr1	227222581	.	A	AAAGGGTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:227222581_A_AAAGGGTGG:227222581:0,3,0,1
chr1	227222582	.	C	CAGAGAGCACTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:227222581_A_AAAGGGTGG:227222581:0,3,0,1
chr1	227239562	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.313:26:13,2:5,5:13,5,7,1
chr1	227239746	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,4:2,6:0,2,0,10
chr1	227288655	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=141.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,18:0,21:0,0,35,6
chr1	227299978	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.531:28:6,9:7,5:11,2,15,0
chr1	227300277	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:3,10:2,5:5,0,14,1
chr1	227327502	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=256,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:227327502_G_A:227327502:0,1,0,2
chr1	227327527	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:227327502_G_A:227327502:0,0,0,2
chr1	227330759	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:9,2:6,4:3,12,2,5
chr1	227387361	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,2:6,5:4,8,0,7
chr1	227400792	.	A	T	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=142.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,50:0.532:94:19,31:25,19:36,8,46,4
chr1	227504613	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=150,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	227834233	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.497:20:6,6:3,4:7,3,6,4
chr1	227834400	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,4:5,7:2,7,5,6
chr1	227841981	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:6,0,9,0
chr1	227920061	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:9,7:13,3:16,6,6,4
chr1	227921175	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,2:14,0:14,10,2,0
chr1	227935355	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.341:10:2,2:3,1:7,0,3,0
chr1	228003967	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:3,7,0,4
chr1	228112121	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=144.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,21:0,17:0,0,7,32
chr1	228284991	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,5:5,1:6,0,6,0
chr1	228289976	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:1,1,1,2
chr1	228345634	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:3,8,2,0
chr1	228400155	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:228400155_A_C:228400155:0,0,1,0
chr1	228400175	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228400155_A_C:228400155:0,0,1,0
chr1	228404368	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,2:0,6,0,5
chr1	228404668	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	228412106	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=94.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,19,9
chr1	228412227	.	TG	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,12:0,0,10,14
chr1	228431235	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	228431930	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	228434602	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	228437603	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,17,2
chr1	228444297	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,105;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	228444318	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,15,4
chr1	228444565	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,23:0,0,15,32
chr1	228456147	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr1	228461408	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr1	228461757	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:5,1:2,4:0,8,1,4
chr1	228464248	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=151.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,16:0,25:0,0,31,11
chr1	228464276	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=172.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,22:0,26:0,0,36,12
chr1	228464842	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	228465370	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=80.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,9:0,0,21,0
chr1	228466750	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr1	228468547	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=202,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:228468547_T_A:228468547:0,3,0,1
chr1	228468549	.	GGCATGGA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=202,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:228468547_T_A:228468547:0,3,0,1
chr1	228468560	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=207,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:228468547_T_A:228468547:0,2,0,1
chr1	228468566	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	228471046	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr1	228476321	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=194,233;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:4,3:1,0:5,1,3,0
chr1	228476532	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.250:41:14,5:17,4:10,21,2,8
chr1	228480964	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	228482010	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=111,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,55:0.624:87:10,20:21,27:0|1:228482010_C_T:228482010:13,19,22,33
chr1	228482028	.	G	C	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:56,23:0.296:79:21,6:33,17:1|0:228482010_C_T:228482010:17,39,8,15
chr1	228495060	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,79;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:16,2:10,0:9,17,0,2
chr1	228497053	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	228505204	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:7,11:8,0:5,10,6,5
chr1	228506661	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,4:7,4:5,4,5,3
chr1	228520880	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,7:3,3:1,3,9,1
chr1	228523442	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,4:2,7:4,0,11,1
chr1	228523447	.	TG	CA,CG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32,31;MFRL=0,146,142;MMQ=60,60,60;MPOS=18,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=35.85,14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,5:0.653,0.300:17:0,5,2:0,7,3:0,0,14,3
chr1	228523618	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,2:3,7:0,5,1,8
chr1	228524919	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:2,1,5,2
chr1	228524961	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.680:26:6,5:2,13:6,2,12,6
chr1	228525627	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.561:14:2,4:4,2:4,2,7,1
chr1	228525898	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	228526486	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:1,3:2,0,5,0
chr1	228526742	.	C	CCACACA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=CA;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	228528232	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:7,0:18,2:14,11,2,0
chr1	228528412	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,7:4,3:6,3,7,3
chr1	228547494	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:7,5:9,8:15,1,10,3
chr1	228548175	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	228554187	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:7,8,3,0
chr1	228558522	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=205,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,2:1,4:0,1,1,6
chr1	228559654	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,4:3,2:4,6,4,2
chr1	228562206	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	228564773	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=136,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr1	228564966	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=139,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	228601638	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=282,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	228601671	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=282,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:228601671_A_C:228601671:0,1,0,1
chr1	228601673	.	A	ACCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=282,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:0,1:0|1:228601671_A_C:228601671:0,1,0,1
chr1	228612838	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,16:0,10:0,0,14,12
chr1	228612869	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:18,2:7,0:10,15,0,2
chr1	228613052	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,1,18
chr1	228645063	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=145.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,22:0,16:0,0,37,1
chr1	228646356	.	C	CGT,CGTGT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=189,125,133;MMQ=60,60,60;MPOS=13,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=GT;STR;TLOD=28.46,17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,13,8:0.497,0.326:26:1,5,5:3,5,2:4,1,19,2
chr1	228646846	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:6,2:12,0:15,5,1,1
chr1	228647697	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=76;ECNT=4;MBQ=31,30,32,31;MFRL=152,152,138,155;MMQ=60,50,60,46;MPOS=12,17,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.17,34.71,8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:21,6,19,7:0.116,0.357,0.137:53:10,3,10,4:9,2,7,3:2,19,9,23
chr1	228647776	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=185,160;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:0|1:228647776_A_C:228647776:0,19,0,3
chr1	228647779	.	GG	CA	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=186,167;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,1:8,0:0|1:228647776_A_C:228647776:0,20,0,2
chr1	228647855	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	228676646	.	TT	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=112,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,0:2,3,1,3
chr1	229385650	.	C	CTTTTT	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=187,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr1	229385669	.	TTC	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=185,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TC;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	229385689	.	TTCC	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,34;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:229385689_TTCC_T:229385689:0,3,0,1
chr1	229385698	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:229385689_TTCC_T:229385689:0,3,0,1
chr1	229385699	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:229385689_TTCC_T:229385689:0,2,0,1
chr1	229385703	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:229385703_C_T:229385703:0,2,0,1
chr1	229385706	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,31;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:229385689_TTCC_T:229385689:0,2,0,1
chr1	229385707	.	CT	TC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=174,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:229385703_C_T:229385703:0,1,0,1
chr1	229387286	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=116,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:3,7,1,1
chr1	229387328	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=176,180;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:229387328_CA_TG:229387328:0,3,0,1
chr1	229387337	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=179,180;MMQ=59,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:229387328_CA_TG:229387328:0,2,0,1
chr1	229387345	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=179,180;MMQ=59,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:229387328_CA_TG:229387328:0,2,0,1
chr1	229422193	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:9,3:7,4:10,6,6,2
chr1	229438530	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=234,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	229461024	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,30:0.526:57:13,15:14,15:12,15,22,8
chr1	229461057	.	G	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:25,0:28,3:35,19,0,3
chr1	229462716	.	T	TATATGTG	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=129,29;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,2:0.031:94:36,2:50,0:31,61,0,2
chr1	229568231	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr1	229580570	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=189,155;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0|1:229580570_A_G:229580570:10,0,2,0
chr1	229580572	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,155;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0|1:229580570_A_G:229580570:10,0,2,0
chr1	229625612	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=191,186;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr1	229662901	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.288:21:3,2:10,4:14,1,6,0
chr1	229663064	.	GAGGAA	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGGAA;STR;TLOD=170.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.980:41:0,26:0,14:0,0,6,35
chr1	229738236	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,9,8
chr1	229746019	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,9:0,0,1,11
chr1	229773172	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,2:1,0:0,9,0,2
chr1	229781532	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,15,4
chr1	229781744	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr1	229783236	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0|1:229783236_T_C:229783236:0,0,11,2
chr1	229783240	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,2:0|1:229783236_T_C:229783236:0,0,10,2
chr1	229795070	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,2,9
chr1	230371883	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	230386341	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr1	230410162	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:16,5:12,7:15,13,10,2
chr1	230410374	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr1	230415025	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,6:2,4:6,2,5,5
chr1	230492809	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:7,13,1,1
chr1	230497940	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	230503684	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr1	230778243	.	AC	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.527:32:3,3:8,8:14,1,17,0
chr1	230778491	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,17:0,17:0,0,0,34
chr1	230795177	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,18,2
chr1	230798864	.	CT	C,CTT	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=143,146,169;MMQ=60,60,60;MPOS=11,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=17.55,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:51,11,4:0.173,0.071:66:22,7,1:27,4,3:42,9,13,2
chr1	230819295	.	ATTC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,1:8,3:8,6,2,2
chr1	230819479	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	230820780	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr1	230822607	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:1,3:3,3:4,0,7,0
chr1	230829139	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,2:8,5:6,9,4,3
chr1	230883466	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.551:16:4,2:2,5:0|1:230883466_C_T:230883466:1,6,3,6
chr1	230883484	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=120,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:5,1:0,5:0|1:230883466_C_T:230883466:1,4,2,4
chr1	230883499	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.429:10:3,1:0,3:0|1:230883466_C_T:230883466:0,6,1,3
chr1	230891248	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr1	230910481	.	CTTTCTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=168546389,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	230914706	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=102,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.479:17:6,2:2,6:0|1:230914706_C_A:230914706:6,3,4,4
chr1	230914729	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,11:0,6:0|1:230914706_C_A:230914706:0,0,8,11
chr1	230915827	.	CGTGTGTGT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=GT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	230923187	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,16,3
chr1	230928512	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	231042705	.	C	T	.	.	DP=105;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,3:0.038:103:48,2:52,1:55,45,3,0
chr1	231042732	.	T	A	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=315.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,91:0.990:91:0,41:0,49:0,0,36,55
chr1	231047310	.	TAC	T	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=18,31;MFRL=95,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=287.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,81:0.980:82:0,37:0,43:0,1,27,54
chr1	231047392	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,17:0,0,1,30
chr1	231057310	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,19:0,13:0,0,1,31
chr1	231060736	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr1	231064611	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr1	231066951	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	231067236	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr1	231067318	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	231069652	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	231081269	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,5:1,8:0,1,0,13
chr1	231081304	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr1	231124055	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.409:42:15,12:10,5:24,1,16,1
chr1	231298699	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=87,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:2,3:2,2:3,1,5,1
chr1	231299470	.	AGCC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCC;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,1:3,1:3,2,1,1
chr1	231337031	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	231359931	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr1	231361110	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,3:5,1:7,0,4,0
chr1	231377081	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,14:0,0,21,11
chr1	231386612	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	231401081	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.084:56:26,4:25,0:27,25,3,1
chr1	231401596	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=119.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,17:0,0,1,31
chr1	231403339	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=198,218;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	231408024	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.717:29:4,6:3,15:6,2,16,5
chr1	231486976	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=103,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.428:7:0,1:3,0:0|1:231486976_G_A:231486976:2,2,3,0
chr1	231486978	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.382:8:1,0:3,0:0|1:231486976_G_A:231486976:3,2,3,0
chr1	231502230	.	TA	T,TAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=142,164,166;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=10.56,5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,4:0.286,0.252:17:5,3,2:3,2,1:1,7,1,8
chr1	231509825	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,2:0.046:63:28,1:33,1:22,39,1,1
chr1	231697030	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.503:30:9,8:5,7:1,14,1,14
chr1	231936016	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	232094729	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr1	232098999	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:0,0:2,3:0,2,1,2
chr1	232144842	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr1	232172374	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:10,8:11,7:20,1,14,1
chr1	232172623	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,22;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:1,1:2,6,0,4
chr1	232534776	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=96276278,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr1	232535030	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,3:0,0,1,11
chr1	232551416	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	232568293	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	232650663	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:7,6,0,2
chr1	232940853	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=143,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:24,2:19,0:29,14,2,0
chr1	232941153	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,37:0.717:51:9,22:5,15:5,9,13,24
chr1	232943329	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:2,1:11,2:4,9,2,1
chr1	232943694	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,35:0.493:71:23,16:13,19:20,16,19,16
chr1	232944569	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=111,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:6,7:1,7:3,4,3,11
chr1	233091295	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=63,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.188:23:8,1:5,2:8,11,4,0
chr1	233113827	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	233119951	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	233134900	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.463:28:8,2:7,10:6,9,8,5
chr1	233135198	.	CTT	C,CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,19,17;MFRL=151,157,168;MMQ=40,40,40;MPOS=5,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=5.03,8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,6:0.308,0.401:16:2,1,0:1,1,2:0,5,0,11
chr1	233137192	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,167;MMQ=53,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:2,1:17,4:19,0,5,0
chr1	233137225	.	CATAA	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=231,151;MMQ=53,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=ATAA;STR;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.869:19:0,6:1,10:2,0,17,0
chr1	233152910	.	A	AAAAGCAAGATTTTGAGTCCTCACAGCTATTCT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=60.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,4:0,5:0,0,1,13
chr1	233225957	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,4:3,0:1,9,0,4
chr1	233225971	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,3:5,0:0|1:233225971_A_C:233225971:1,13,0,3
chr1	233225973	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,3:4,0:0|1:233225971_A_C:233225971:1,12,0,3
chr1	233225976	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,3:4,0:0|1:233225971_A_C:233225971:1,11,0,3
chr1	233353882	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,265;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:22,0:20,3:20,24,3,0
chr1	233362941	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:9,0,2,0
chr1	233372603	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:9,1:11,10,2,0
chr1	233431154	.	T	G	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,5:0.034:106:51,1:41,0:0|1:233431154_T_G:233431154:54,47,1,4
chr1	233431158	.	G	GTGGGCCGCGCTCACC	.	.	DP=109;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=150,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,2:0.027:107:54,2:46,0:0|1:233431154_T_G:233431154:53,52,1,1
chr1	233464441	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=27,15;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.416:6:1,0:1,0:0|1:233464441_G_C:233464441:4,0,2,0
chr1	233464443	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=22,11;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:1,0:0|1:233464441_G_C:233464441:3,1,2,0
chr1	233464446	.	CGG	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:2,2:0|1:233464441_G_C:233464441:3,1,2,0
chr1	233464454	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=11,31;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,0:0,2:0|1:233464441_G_C:233464441:2,1,2,0
chr1	233464457	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=11,21;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,0:0,1:0|1:233464441_G_C:233464441:3,2,2,0
chr1	233464459	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=24,28;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,0:1,2:0|1:233464441_G_C:233464441:3,2,2,0
chr1	233464461	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=24,28;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:1,1:0|1:233464441_G_C:233464441:3,2,2,0
chr1	233464469	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=30,17;MFRL=139,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.275:9:2,1:3,0:0|1:233464441_G_C:233464441:3,4,1,1
chr1	233489499	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=113,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,4:6,2:5,1,6,0
chr1	233489529	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=147,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,6:7,2:8,1,8,0
chr1	233489707	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:8,11:16,7:5,19,6,12
chr1	233490536	.	A	AATGTCTTGGGGATAATCTG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:6,1:2,3:0|1:233490536_A_AATGTCTTGGGGATAATCTG:233490536:7,1,4,0
chr1	233490543	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.409:15:7,1:2,4:0|1:233490536_A_AATGTCTTGGGGATAATCTG:233490536:7,2,5,1
chr1	233490764	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.418:24:5,3:9,6:1,13,1,9
chr1	233490776	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:5,3:9,4:1,14,0,7
chr1	233512313	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=98,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.594:25:1,8:9,7:3,7,2,13
chr1	233749855	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=252,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	233767068	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,51;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:10,12,2,0
chr1	233802824	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=224,190;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:233802824_C_T:233802824:0,3,0,1
chr1	233802828	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,37;MFRL=224,190;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:233802824_C_T:233802824:0,3,0,1
chr1	233802832	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=224,190;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:233802824_C_T:233802824:0,3,0,1
chr1	234040742	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=210,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	234454405	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	234519385	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,2:3,6:6,0,8,0
chr1	234519452	.	C	CT	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=106.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,45:0.904:50:4,22:1,21:4,1,39,6
chr1	234527575	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,10:0,12:0,0,0,23
chr1	234528373	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	234541622	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.450:13:3,3:4,1:6,1,4,2
chr1	234556362	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=81,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,0:4,0,3,0
chr1	234556630	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr1	234556646	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	234561394	.	ATAATT	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,26:0.398:66:17,6:21,20:26,14,22,4
chr1	234561590	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.497:34:7,7:10,9:1,16,0,17
chr1	234563556	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0,10,0,2
chr1	234564864	.	GAA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,8:5,1:12,1,9,0
chr1	234565078	.	GA	G,GAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=149,95,156;MMQ=60,60,60;MPOS=23,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.39,17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,9:0.215,0.456:19:5,1,5:0,3,2:1,5,8,5
chr1	234565176	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:6,6:7,9:11,2,8,8
chr1	234565787	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,4:3,0:4,1,4,0
chr1	234582457	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr1	234584176	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:9,1,2,0
chr1	234584288	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:7,6:8,5:6,9,5,6
chr1	234607055	.	TG	T	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,36:0.606:59:9,19:14,17:3,20,3,33
chr1	234607086	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:6,9:9,7:0,15,0,16
chr1	234607104	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:6,9:4,5:0,10,1,14
chr1	234613860	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:5,0,6,0
chr1	234742799	.	GAT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,1:8,1:14,0,2,0
chr1	234745009	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=200,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:0,5:2,3:3,0,8,0
chr1	235275430	.	G	GA	.	.	DP=134;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:108,5:0.045:113:46,1:42,2:24,84,1,4
chr1	235299492	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.596:28:3,8:7,7:0,11,0,17
chr1	235301496	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=34,34,34,28;MFRL=140,158,120,74;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,26,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.72,16.98,8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:38,7,11,7:0.098,0.187,0.118:63:20,2,7,4:15,3,4,2:11,27,6,19
chr1	235316088	.	TA	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,6:0.113:59:22,2:23,3:2,51,0,6
chr1	235345782	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.384:50:16,4:15,15:9,22,1,18
chr1	235377266	.	CTCT	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.086:37:19,2:12,1:11,23,0,3
chr1	235383715	.	TGA	T	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,2:0.026:113:55,2:44,0:51,60,0,2
chr1	235384838	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:4,3:7,0,5,0
chr1	235507245	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,1:6,1:6,10,0,2
chr1	235582898	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:1,14,1,1
chr1	235594182	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,0,25
chr1	235598973	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr1	235628908	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=132.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,47:0.584:80:15,23:17,23:29,4,42,5
chr1	235647631	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,4:3,11:5,1,10,5
chr1	235652642	.	C	CCACATCCAGTTTTTCCTCTTATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152616244,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	235715523	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=96,205;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:1,4,0,4
chr1	235715556	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=118,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	235747005	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,3:7,2:11,1,5,0
chr1	235747154	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:6,3:4,1:2,9,1,3
chr1	235826307	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:19,2:17,2:18,19,3,1
chr1	235918688	.	C	CAAAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AAAAG;STR;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	235971725	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.159:30:10,0:11,0:4,21,5,0
chr1	235971731	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.113:42:16,0:14,0:10,27,5,0
chr1	235971734	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.094:49:19,0:17,1:12,32,5,0
chr1	235971737	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.104:49:20,0:19,0:11,33,5,0
chr1	235972092	.	CTTG	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,73;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:13,0:14,3:15,13,1,2
chr1	236142253	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.511:18:4,3:3,6:7,2,7,2
chr1	236143117	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,2:9,0:18,6,2,0
chr1	236143302	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.819:14:1,6:1,6:0,2,0,12
chr1	236154365	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,1,2
chr1	236175339	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=118,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:10,4:8,3:6,13,0,7
chr1	236192781	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,50;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,1,1
chr1	236193121	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:236193121_G_C:236193121:0,4,0,1
chr1	236193124	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:236193121_G_C:236193121:0,4,0,1
chr1	236193145	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	236195653	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=174,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:3,4:1,2:4,0,7,0
chr1	236205588	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr1	236342024	.	T	TTGTGGGTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=115,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:236342024_T_TTGTGGGTAC:236342024:0,1,0,1
chr1	236342026	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=115,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:236342024_T_TTGTGGGTAC:236342024:0,1,0,1
chr1	236368391	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.432:21:8,3:4,6:9,3,7,2
chr1	236381897	.	T	A	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=135.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,49:0.594:82:19,22:14,26:11,22,15,34
chr1	236381917	.	T	A	.	.	DP=70;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,33:0.525:63:13,15:16,18:7,23,3,30
chr1	236381987	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.546:20:3,7:4,4:0|1:236381987_A_G:236381987:0,9,1,10
chr1	236381989	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.546:20:5,6:3,4:0|1:236381987_A_G:236381987:0,9,1,10
chr1	236384278	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,3:4,4:2,5,0,8
chr1	236385116	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.539:25:6,7:5,6:12,0,12,1
chr1	236385165	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.622:38:9,11:5,11:13,1,23,1
chr1	236385360	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:7,1:0,8:0,7,2,7
chr1	236385379	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:4,1:0,5:0,4,1,6
chr1	236393654	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,0,21
chr1	236399254	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:13,0:5,2:0|1:236399254_T_TG:236399254:0,19,0,3
chr1	236399256	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=165,127;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,1:0|1:236399254_T_TG:236399254:0,19,0,2
chr1	236413147	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,7:3,4:7,3,10,1
chr1	236413282	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:9,9:4,4:3,11,2,11
chr1	236413362	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=225,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	236415347	.	T	C	.	.	DP=103;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,47:0.472:100:26,23:26,24:22,31,32,15
chr1	236415433	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=90.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,25:0.634:39:6,12:8,13:0|1:236415433_T_G:236415433:0,14,1,24
chr1	236415444	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=76.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.645:29:4,9:6,10:0|1:236415433_T_G:236415433:0,10,0,19
chr1	236433135	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=132.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,17:0,17:0,0,33,1
chr1	236590675	.	CT	C,CTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35,34;MFRL=132,168,178;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.01,3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,2:0.187,0.187:13:4,1,1:4,1,1:8,1,4,0
chr1	236631671	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=191,117;MMQ=58,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:2,1:0,10,0,2
chr1	236702117	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr1	236702153	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=175,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:7,2:3,4:9,2,5,1
chr1	236702447	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:7,2:10,5:0|1:236702447_T_G:236702447:1,19,0,7
chr1	236702450	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.301:28:7,2:12,5:0|1:236702447_T_G:236702447:1,19,0,8
chr1	236702475	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:4,1:10,6:0,14,0,7
chr1	236703767	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	236703832	.	CG	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:9,1:2,3:9,2,3,1
chr1	236704857	.	TTAGTACCATTTATAATTTTTTTATATGTCAATATAAAATATTTAGAAAATATTTTCTAC	T	.	.	DP=136;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:128,8:0.024:136:18,2:15,0:104,24,6,2
chr1	236704888	.	A	AACAGGT	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=108.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,29:0.428:68:20,15:16,8:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:38,1,25,4
chr1	236704891	.	TAAA	T	.	.	DP=83;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=106.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,30:0.378:80:23,16:19,11:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:47,3,24,6
chr1	236704897	.	ATT	A	.	.	DP=86;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=106.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,30:0.369:82:26,17:19,13:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:49,3,24,6
chr1	236706352	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,2:9,2:8,11,0,4
chr1	236706371	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:6,1:6,1:3,10,0,2
chr1	236706780	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	236707007	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=144,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:0,8,0,4
chr1	236707036	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=271,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:0,0:3,4:0|1:236707036_A_T:236707036:0,3,0,4
chr1	236707045	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=271,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:2,3:0|1:236707036_A_T:236707036:0,3,0,3
chr1	236708022	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:7,0,5,0
chr1	236708224	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.506:34:8,10:7,7:5,12,7,10
chr1	236708316	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr1	236711297	.	A	T	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.454:62:24,19:9,9:25,9,23,5
chr1	236711323	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,36:0.469:77:24,22:17,14:26,15,23,13
chr1	236714292	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=9,9;MFRL=127,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.607:5:0,0:0,0:0,2,0,3
chr1	236714335	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr1	236714378	.	C	CAGTGCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=243,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	236717104	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=205,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.529:9:1,1:3,2:0,4,0,5
chr1	236718524	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	236718561	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=189,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:6,1,4,0
chr1	236719259	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.504:20:2,5:7,5:4,6,2,8
chr1	236721452	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	236722489	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	236722511	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:236722511_GCT_G:236722511:0,4,0,1
chr1	236722514	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:236722511_GCT_G:236722511:0,4,0,1
chr1	236723177	.	GC	AA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,7:0,7,2,9
chr1	236724504	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=271.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,47:0,29:0,0,57,21
chr1	236724605	.	G	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=269.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,36:0,41:0,0,16,62
chr1	236727865	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,1:9,1:11,13,2,0
chr1	236729867	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr1	236729965	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,8:5,6:6,3,12,2
chr1	236735064	.	AGAACTCATTCAATAAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAACTCATTCAATAAG;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.426:10:2,3:3,1:0,6,1,3
chr1	236735939	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.505:22:5,4:5,7:6,5,11,0
chr1	236737657	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:0,6,0,8
chr1	236738237	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:0,5,0,6
chr1	236740039	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr1	236744720	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	236746275	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:5,3,5,3
chr1	236748397	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,25:0.672:37:3,14:8,11:9,3,10,15
chr1	236748505	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.346:33:10,0:10,11:8,14,3,8
chr1	236749022	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr1	236749026	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=190,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:8,0,4,0
chr1	236749451	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=104.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,13:0,0,26,0
chr1	236749649	.	T	C	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,42:0.472:89:27,17:20,25:16,31,17,25
chr1	236749817	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,0:8,5:0,13,0,5
chr1	236750616	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.291:21:10,5:5,1:14,1,6,0
chr1	236750709	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,39:0.482:81:17,17:23,20:14,28,20,19
chr1	236750799	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.606:36:9,14:5,8:4,10,1,21
chr1	236751195	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.647:32:4,14:7,7:11,0,20,1
chr1	236755427	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,12:0,15:0,0,3,24
chr1	236755814	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=274.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,66:0.985:66:0,39:0,27:0|1:236755814_G_A:236755814:0,0,50,16
chr1	236755837	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=281.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,69:0.986:69:0,40:0,24:0|1:236755814_G_A:236755814:0,0,38,31
chr1	236755937	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=47.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.943:19:0,9:1,9:0,1,1,17
chr1	236757229	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	236757468	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:8,3:2,4:0,10,0,8
chr1	236757507	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr1	236759060	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.468:26:7,6:6,6:7,7,4,8
chr1	236760368	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=224,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	236761110	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:2,0,7,1
chr1	236766355	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	236766745	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	236767176	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	236767178	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0|1:236767178_AG_A:236767178:3,0,4,0
chr1	236767182	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,3:0.362:9:4,1:2,2:1|0:236767178_AG_A:236767178:6,0,3,0
chr1	236767288	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:12,5:9,10:12,9,7,8
chr1	236882110	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr1	236882303	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,15:0,0,7,23
chr1	236883564	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	236900589	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:236900589_C_CA:236900589:0,2,0,1
chr1	236900590	.	C	CCTTGGCTTCAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:236900589_C_CA:236900589:0,2,0,1
chr1	236902560	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	236902594	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr1	236902865	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	236907847	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=189,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:3,0,4,0
chr1	236910889	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=183,126;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:8,0,3,0
chr1	236911137	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:0,7,0,5
chr1	236912597	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:2,3,0,4
chr1	236923197	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=274,251;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	236924506	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	236926013	.	T	TGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=226,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GA;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	236971998	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:15,0:5,2:12,9,1,1
chr1	236972186	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:1,3,0,5
chr1	236978992	.	T	TTCTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:8,1:1,4:4,6,0,5
chr1	236988593	.	A	AT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,20:0.358:55:16,11:19,9:26,9,13,7
chr1	237001926	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.465:15:3,2:5,4:0,8,0,7
chr1	237013550	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:3,1:8,3:0|1:237013550_AT_A:237013550:12,0,4,0
chr1	237013553	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:4,1:8,3:0|1:237013550_AT_A:237013550:12,0,4,0
chr1	237013914	.	CTGA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=182,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGA;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr1	237037998	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	237038161	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,8:2,4:2,3,2,10
chr1	237048562	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:1,8,0,4
chr1	237057608	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,1:3,5:6,0,6,1
chr1	237060433	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:10,2:5,7:2,14,0,9
chr1	237060945	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,4:6,2:4,10,0,6
chr1	237540615	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=132,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:2,7:5,6:5,2,9,4
chr1	237551376	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr1	237619875	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=103,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.641:6:0,3:1,1:1,1,3,1
chr1	237620049	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,5,6
chr1	237632345	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:10,2:10,0:19,2,2,0
chr1	237632458	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,15324;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,1:14,1:10,14,2,0
chr1	237666734	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:15,0:7,3:13,9,0,3
chr1	237670140	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,7:0,0,2,16
chr1	237675150	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.595:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr1	237711644	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	237729774	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=92,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr1	237730124	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,1:0,9:0,0,0,10
chr1	237730169	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	237732395	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:9,3:4,5:13,0,8,0
chr1	237755200	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr1	237759032	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,0:2,1:0|1:237759032_T_C:237759032:0,2,0,1
chr1	237759036	.	A	ATATACCTGCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:237759032_T_C:237759032:0,2,0,1
chr1	237788862	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	237791424	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:2,6:2,8:1,3,1,14
chr1	237796837	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:5,0,5,1
chr1	237797082	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr1	237797103	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	237802559	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	237804242	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:7,7,1,1
chr1	237813126	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	237813177	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:11,0:3,3:14,0,2,1
chr1	237814898	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	237817514	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,4:6,0,8,1
chr1	237817784	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=223,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,3:4,3:0,4,0,6
chr1	237824286	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,140;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:19,0:17,3:2,34,0,3
chr1	237824332	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr1	237831103	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=219.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,22:0,38:0,0,59,2
chr1	237838065	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:16,3:20,0:18,18,3,0
chr1	237850666	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.883:5:0,1:0,2:0,0,2,3
chr1	237862164	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:7,0,4,0
chr1	237863439	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:2,5:4,0,9,0
chr1	237863790	.	GT	G,GTT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=22,18,27;MFRL=157,104,156;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.23,7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,4:0.155,0.189:24:7,2,2:4,0,1:3,13,1,7
chr1	237865203	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=92.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,22,5
chr1	237872435	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,57;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:1,8,0,2
chr1	237872714	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	237880443	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.387:24:5,6:9,3:12,3,7,2
chr1	237893674	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,2:0,0,3,12
chr1	237896961	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,140;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,3:4,0:8,7,3,0
chr1	237905568	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=88,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr1	237921027	.	T	TTCATCTTGGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:237921027_T_TTCATCTTGGG:237921027:6,7,1,1
chr1	237921029	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:237921027_T_TTCATCTTGGG:237921027:6,7,1,1
chr1	237923053	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:4,4:7,5:9,2,8,1
chr1	237946964	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:11,7:10,7:16,5,7,7
chr1	237947660	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,1:4,1:3,11,1,1
chr1	237951451	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=294.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,81:0.988:81:0,32:0,48:0,0,4,77
chr1	237951482	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:10,9:12,10:0,22,0,19
chr1	237957146	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:5,11:5,6:8,2,15,2
chr1	237957161	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:7,10:8,8:10,5,14,4
chr1	237957309	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,3:3,6:0,5,0,9
chr1	237965131	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:237965131_G_A:237965131:1,0,2,0
chr1	237965133	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=13,31;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:237965131_G_A:237965131:1,0,2,0
chr1	238045995	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=5185118,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	238053118	.	A	ACGCCCCCCCCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:0,0:1,0:0|1:238053118_A_ACGCCCCCCCCCC:238053118:0,1,3,0
chr1	238053123	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:0,0:1,2:0|1:238053118_A_ACGCCCCCCCCCC:238053118:0,1,3,0
chr1	238053524	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,2:0,2:0,2,2,2
chr1	240071318	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:18,3:19,0:25,12,3,0
chr1	240072721	.	G	A,GAA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,31,18;MFRL=158,0,119;MMQ=60,60,60;MPOS=7,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.67,6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,7,6:0.196,0.243:28:2,2,1:6,5,1:3,12,2,11
chr1	240073619	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,5:2,4:2,1,6,4
chr1	240073884	.	GA	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:22,2:17,2:39,4,3,1
chr1	240074554	.	GA	G,GAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=138,116,136;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=5.88,8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,6,7:0.134,0.152:45:15,2,1:5,4,4:15,17,5,8
chr1	240074847	.	TA	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.125:34:14,1:12,3:5,25,0,4
chr1	240076975	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:3,4:4,6:2,6,0,10
chr1	240255203	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	240255568	.	GGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	240351628	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.632:6:1,2:1,1:0,2,0,4
chr1	240370744	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=107,162;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.201:13:6,0:2,0:0|1:240370744_C_G:240370744:5,6,2,0
chr1	240370749	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=107,162;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:5,0:1,0:0|1:240370744_C_G:240370744:5,6,2,0
chr1	240370913	.	TGCCCCCTCTACCCGGAGCGGGAATACCTCCTCC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=105,0;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.256:18:3,2:3,1:3,11,0,4
chr1	240408789	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:6,2,4,2
chr1	240421383	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,0:5,2:0,7,0,2
chr1	240492543	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chr1	240497265	.	A	C	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=254.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.986:71:0,41:0,30:0,0,28,43
chr1	240601269	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	240656797	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:4,6:1,5:0,6,4,7
chr1	240656824	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	240975213	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,3:8,4:14,3,4,3
chr1	240975435	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr1	240979803	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:0,5,0,6
chr1	241519031	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:15,3:5,0:13,7,2,1
chr1	241519098	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,12:0,0,12,12
chr1	241712134	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	241713007	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:6,7,0,2
chr1	241728198	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	241761217	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.091:41:17,3:19,0:20,18,2,1
chr1	241837845	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.193:19:6,3:9,0:16,0,3,0
chr1	241838057	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=97.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,28:0.426:66:20,15:18,13:0|1:241838057_C_T:241838057:4,34,8,20
chr1	241838065	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,26:0.435:60:19,10:15,11:0|1:241838057_C_T:241838057:3,31,7,19
chr1	241847018	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.580:41:5,10:12,13:3,14,3,21
chr1	241886754	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:8,3:6,6:0|1:241886754_T_C:241886754:2,13,1,8
chr1	241886764	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:5,2:4,4:0|1:241886754_T_C:241886754:2,9,0,6
chr1	241907691	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:1,6:8,9:6,3,9,6
chr1	241912834	.	TCTCTGTATGCTCAGGAACAGTCAGAATCTGGGACTTTGGCAGTGGGCAGGAGATGAAGGTGTTGCCGGAGGGGAAAGACTGGAAGGAGGACGAGCACTGCCTACGACGCCTCATTTTC	T	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,8:0.052:102:9,0:7,6:53,41,6,2
chr1	241913062	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.427:19:5,6:6,2:1,10,4,4
chr1	241920499	.	TGTAG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,268;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:1,1:3,0,4,0
chr1	241920562	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:6,3:4,6:7,4,7,2
chr1	241933876	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.462:35:7,12:11,4:15,4,15,1
chr1	241936055	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:3,4:2,4:6,0,6,2
chr1	241951106	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,27:0.596:45:12,17:5,8:14,4,23,4
chr1	241958592	.	GA	TT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=141,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,0:19,2:14,20,0,3
chr1	241958665	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=138,221;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr1	241964559	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,2:4,5:0,5,2,5
chr1	242030151	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,3:0,13:0,0,11,5
chr1	242042690	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	242045383	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:7,0:0,19,0,2
chr1	242048514	.	G	GTAAATATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.412:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr1	242052685	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,1:2,3:5,0,5,0
chr1	242383201	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=142,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	242383510	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	242511556	.	AACAAAG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAAAG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	243327520	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,9:0,0,21,0
chr1	243332884	.	AAG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=81.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,5:0,14:0,0,18,1
chr1	243335902	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	243362331	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	243433654	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	243468093	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,23:0.421:55:16,16:16,7:7,25,2,21
chr1	243480230	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.148:35:13,1:14,3:6,24,2,3
chr1	243493907	.	A	T	.	.	DP=120;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=389.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,116:0.992:116:0,53:0,60:0,0,62,54
chr1	243507680	.	C	CA	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=217.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,24:0,38:0,0,2,60
chr1	243581303	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,0:11,3:14,7,0,3
chr1	244220229	.	CT	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:20,2:19,1:30,11,1,3
chr1	244528127	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:0,8,1,3
chr1	244541859	.	TC	GA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:21,3:15,0:22,15,1,2
chr1	244595962	.	C	CTTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=13,19;MFRL=170,173;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=21,24;RU=T;STR;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:0,3:0,0:0,3,0,9
chr1	244601152	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	244624887	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	244653781	.	AT	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=52.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.467:51:16,8:9,16:0,27,3,21
chr1	244662263	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:22,2:18,1:32,9,2,1
chr1	244735547	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,16:0.486:33:9,8:8,8:0|1:244735547_A_G:244735547:17,0,16,0
chr1	244735556	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=165.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,19:0,21:0|1:244735547_A_G:244735547:0,0,40,2
chr1	244773514	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:5,3,2,0
chr1	244803205	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	245020833	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:2,2:11,0:11,3,2,0
chr1	245020845	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:5,2:16,0:17,7,2,0
chr1	245021291	.	TA	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,8:0.147:56:26,5:19,3:38,10,8,0
chr1	245025697	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.735:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr1	245133539	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr1	245133549	.	GGC	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GC;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,0:2,2:0,8,0,2
chr1	245133623	.	T	TCCTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCTCC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	245180471	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:13,7:12,7:24,1,13,1
chr1	245180639	.	ATT	A,AT	.	.	DP=137;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=144,126,144;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=5.40,121.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,5,59:0.055,0.591:101:18,2,28:17,3,26:11,26,14,50
chr1	245222634	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	245222839	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	245703990	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,6:2,6:5,1,12,0
chr1	245847719	.	G	GCCACACGGACACAGGCTATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=63,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr1	245850233	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,60;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,0:13,3:13,10,1,2
chr1	245861566	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=273,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:245861566_G_A:245861566:0,1,0,1
chr1	245861571	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:245861566_G_A:245861566:0,0,0,2
chr1	245913033	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=200,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:245913033_T_A:245913033:0,2,0,1
chr1	245913037	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=200,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:245913033_T_A:245913033:0,2,0,1
chr1	245913043	.	TGC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=200,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:245913033_T_A:245913033:0,2,0,1
chr1	246021941	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,6,9
chr1	246022071	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	246027024	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,9,0
chr1	246027029	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,9,0
chr1	246027034	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,11,1
chr1	246091432	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=217,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:246091432_G_C:246091432:0,1,0,1
chr1	246091436	.	CA	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=217,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:246091432_G_C:246091432:0,1,0,1
chr1	246489706	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,35;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,0:0,3:0,1,0,3
chr1	246490438	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0|1:246490438_T_C:246490438:0,0,9,1
chr1	246490442	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0|1:246490438_T_C:246490438:0,0,9,1
chr1	246490452	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0|1:246490438_T_C:246490438:3,1,6,0
chr1	246498866	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:1,2,0,2
chr1	246670281	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.761:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	246670284	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,13;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr1	246670287	.	CGA	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.480:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr1	246670300	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=133,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	246670308	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,1:3,0,3,0
chr1	246670333	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	246670587	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	246704563	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.670:4:1,1:0,2:0|1:246704563_C_T:246704563:0,1,0,3
chr1	246704572	.	A	AACTGTGAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:246704563_C_T:246704563:0,1,0,2
chr1	246707816	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:5,7:8,10:10,3,13,4
chr1	246711789	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.289:15:5,3:6,1:11,0,4,0
chr1	246711816	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.654:15:3,5:1,5:5,0,10,0
chr1	246714426	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	246714446	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:9,0,3,0
chr1	246714587	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=122,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.391:44:16,10:11,7:9,18,9,8
chr1	246714631	.	TG	AA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.459:24:8,5:4,4:0|1:246714631_TG_AA:246714631:3,10,1,10
chr1	246714636	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.476:23:8,5:4,5:0|1:246714631_TG_AA:246714631:3,9,1,10
chr1	246720798	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,57;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=292.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,85:0.989:85:0,41:0,44:0,0,31,54
chr1	246727558	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	246754778	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	246754956	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.540:44:10,11:10,11:10,10,17,7
chr1	246797710	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:0|1:246797710_G_T:246797710:6,0,4,0
chr1	246797714	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,2:1,2:0|1:246797710_G_T:246797710:6,0,4,0
chr1	246797974	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	246940790	.	TAAAGA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	247007013	.	TAAATA	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATA;STR;TLOD=62.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.369:47:13,7:14,10:30,0,17,0
chr1	247007042	.	TA	T	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=157.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,59:0.970:60:0,28:1,31:1,0,55,4
chr1	247025531	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.313:23:10,2:5,4:0,16,0,7
chr1	247109014	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.444:45:14,14:11,5:20,5,19,1
chr1	247109168	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:8,4:3,5:0,11,0,10
chr1	247109233	.	C	CCACAGAATCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=199,263;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	247150450	.	CT	AC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=164,196;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,2:5,0:0|1:247150450_CT_AC:247150450:6,9,0,2
chr1	247150454	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=167,196;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,1:5,0:0|1:247150450_CT_AC:247150450:6,8,0,2
chr1	247163187	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,11:0,2:1,0,13,0
chr1	247202032	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:5,0,1,1
chr1	247241795	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.478:41:9,7:12,9:18,3,19,1
chr1	247275192	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=259,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:247275192_AG_A:247275192:1,0,1,0
chr1	247275196	.	TGCGGCTCCCGGAGCGCGAGGCCGCAGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=259,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:247275192_AG_A:247275192:1,0,1,0
chr1	247321252	.	TAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,22,32;MFRL=174,279,160;MMQ=60,49,60;MPOS=27,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.83,3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.323,0.344:6:2,0,1:0,1,1:0,2,0,4
chr1	247322967	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:3,3,8,1
chr1	247420135	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:7,7,0,2
chr1	247464630	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=335,359;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:247464630_C_A:247464630:0,1,0,1
chr1	247464632	.	CCTA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=335,359;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:247464630_C_A:247464630:0,1,0,1
chr1	247486421	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.736:17:2,5:2,7:4,0,9,4
chr1	247597629	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:3,2:5,5:1,7,4,5
chr1	247597656	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr1	247599232	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chr1	247608066	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:13,0:8,2:11,11,2,0
chr1	247611659	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:4,1,3,0
chr1	247615252	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=196,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:3,5,2,4
chr1	247615261	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0,0,4,9
chr1	247655275	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:1,4:12,4:9,5,5,3
chr1	247726822	.	CTTTT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=T;STR;TLOD=63.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:9,7:8,8:16,1,14,3
chr1	247729206	.	CT	C,CTT	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=34,33,34;MFRL=148,116,158;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=11.35,4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,12,6:0.308,0.169:36:10,5,3:5,5,2:16,2,14,4
chr1	247729227	.	C	A	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=28,9;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,10:0.162:50:13,0:13,0:24,16,10,0
chr1	247737493	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,8:3,6:6,3,6,8
chr1	247752019	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,19:0,16:0,0,11,24
chr1	247752161	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:5,2:3,2:5,3,4,1
chr1	247835352	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	247836008	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,12:0,0,12,14
chr1	247921717	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,3,16
chr1	247921789	.	AGTGTGTGT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=GT;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr1	247978087	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr1	247978541	.	AAGG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr1	248004687	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,5,7
chr1	248004775	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr1	248005213	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	248023966	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0,0,19,12
chr1	248024073	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,0,13
chr1	248039294	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,3:7,6:9,3,7,2
chr1	248058797	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	248058845	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr1	248058879	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,12,3
chr1	248059043	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.258:24:6,1:12,0:2,16,6,0
chr1	248059049	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:8,1:13,1:0|1:248059049_A_C:248059049:3,18,5,0
chr1	248059055	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=128,118;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:7,2:13,0:0|1:248059049_A_C:248059049:3,20,4,0
chr1	248059057	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=128,118;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:6,2:14,0:0|1:248059049_A_C:248059049:2,19,4,0
chr1	248059712	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:3,6:5,11:3,5,6,12
chr1	248059856	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	248084434	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=165,143;MMQ=40,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.943:32:0,16:1,13:0,1,4,27
chr1	248084464	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=122,158;MMQ=24,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.800:28:1,8:4,13:4,1,3,20
chr1	248084471	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=158,159;MMQ=25,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:2,6:12,2:0|1:248084471_A_G:248084471:7,10,0,8
chr1	248084473	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=158,159;MMQ=25,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:2,6:11,2:0|1:248084471_A_G:248084471:7,10,0,8
chr1	248084511	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=123,134;MMQ=25,24;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:2,3:12,5:7,7,0,8
chr1	248084604	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:248084604_T_TTA:248084604:0,0,0,2
chr1	248084605	.	G	GGGAAGTTTTAATGCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:248084604_T_TTA:248084604:0,0,0,2
chr1	248084909	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,186;MMQ=24,25;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,1:3,3:0,9,0,4
chr1	248085341	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	248112745	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,30;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr1	248112762	.	TG	CA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,39;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,8:0,0,9,3
chr1	248112771	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,41;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,8:0,0,11,3
chr1	248262644	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:6,1,8,0
chr1	248343639	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:24,1:19,1:0|1:248343639_A_C:248343639:20,26,1,1
chr1	248343640	.	TGG	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:25,1:20,1:0|1:248343639_A_C:248343639:22,26,1,1
chr1	248367150	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:22,3:14,0:16,20,2,1
chr1	248457979	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,53;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,20:0,24:0,0,22,22
chr1	248458689	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	248458717	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,45;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,10:0,0:0,0,8,2
chr1	248458974	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,3:0,0,0,14
chr1	248486895	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,19,1
chr1	248486913	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,21,4
chr1	248512064	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,8,8
chr1	248512094	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,13,15
chr1	248513023	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr1	248513088	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	248525638	.	CA	C	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=300.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.988:75:0,35:0,37:0,0,44,31
chr1	248551419	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:8,13,2,0
chr1	248569282	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	248570440	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,7,14
chr1	248636641	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	248652104	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=201,185;MMQ=27,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	248738133	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,136;MMQ=44,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:10,3:21,3:0,32,0,6
chr1	248789454	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr1	248790495	.	C	CGGGGTACAGAGAGTGTTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	248790498	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	248801944	.	TCAGCACG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.960:20:0,10:0,10:0,0,6,14
chr1	248813135	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr1	248813271	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=140,97;MMQ=60,52;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,5:0.098:58:30,2:22,3:0|1:248813271_C_A:248813271:35,18,2,3
chr1	248813280	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:32,20:0.389:52:17,13:15,7:1|0:248813271_C_A:248813271:17,15,12,8
chr1	248813650	.	CAGA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=231,178;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:1,6:2,0:2,2,3,4
chr1	248814126	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,151;MMQ=45,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.213:31:7,5:16,1:2,23,0,6
chr1	248845097	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,9,10
chr1	248845673	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	248845676	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,33;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	248845677	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	248845681	.	G	GGCA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	248845682	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,16;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	248845688	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=312,136;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	249145072	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,3:1,2:0,1,1,4
chr1	249149486	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=255,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr1	249151921	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.414:14:4,0:1,0:8,0,6,0
chr1	249211350	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:5,8:5,6:2,8,8,6
chr1	249212725	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:6,7:5,4:8,4,9,3
chr1	249212878	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,30:0.582:51:6,11:15,17:9,12,12,18
chr2	45895	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr2	224970	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.540:46:4,13:17,11:5,16,7,18
chr2	234130	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:5,1,4,2
chr2	234350	.	C	CAATCAATTACAGGTGGCTGAAAGACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	242732	.	T	TAAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAC;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr2	243567	.	T	TA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.460:41:7,7:13,9:3,19,2,17
chr2	262553	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:6,5:5,4:10,1,9,0
chr2	264895	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,10:0,0,19,0
chr2	265121	.	ACT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:9,0:14,3:0,24,0,3
chr2	271998	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.391:11:4,1:1,2:4,3,1,3
chr2	275148	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:7,11,2,0
chr2	276908	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:12,1,5,0
chr2	276942	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:17,3:10,3:24,3,6,0
chr2	287666	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	672976	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr2	676177	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,7:3,2:3,4,6,3
chr2	677213	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	906044	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,5,15
chr2	1079130	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:1079130_G_A:1079130:0,0,2,1
chr2	1079132	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:1079130_G_A:1079130:0,0,2,1
chr2	1079143	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr2	1079442	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	1093965	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:10,6:5,4:7,8,8,2
chr2	1099065	.	C	CT	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=33,23;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:5,4:2,3:4,5,4,6
chr2	1099109	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=123,132;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr2	1099175	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1099175_G_A:1099175:0,4,0,1
chr2	1099176	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=190,180;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:1099176_T_C:1099176:0,4,0,1
chr2	1099179	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=190,180;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:1099176_T_C:1099176:0,4,0,1
chr2	1099183	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,28;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1099175_G_A:1099175:0,4,0,1
chr2	1099184	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=190,180;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:1099176_T_C:1099176:0,4,0,1
chr2	1133188	.	G	GCACA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=CA;STR;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:8,0,7,0
chr2	1168756	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:3,0,4,1
chr2	1241592	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	1263235	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:5,2:2,3:2,6,0,6
chr2	1426787	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:8,3,2,0
chr2	1437163	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:8,0,7,1
chr2	1437410	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.727:13:2,3:1,4:1,2,1,9
chr2	1457364	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	1459806	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	1460140	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	1481231	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	1488668	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	1491497	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	1491842	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=68306278,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1491842_C_CAG:1491842:0,2,0,1
chr2	1491843	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=68306278,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1491842_C_CAG:1491842:0,2,0,1
chr2	1491850	.	GA	TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=68306278,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:1491842_C_CAG:1491842:0,2,0,1
chr2	1491864	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=190,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	1642537	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,5,0
chr2	1642539	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,5,0
chr2	1642545	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,5,0
chr2	1652305	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	1667310	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	1677683	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	1688001	.	CTAGTCATTTCAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.691:1:0,1:0,0:0|1:1688001_CTAGTCATTTCAAA_C:1688001:0,0,0,1
chr2	1688018	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1688001_CTAGTCATTTCAAA_C:1688001:0,0,0,1
chr2	1688020	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1688001_CTAGTCATTTCAAA_C:1688001:0,0,0,1
chr2	1696194	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	1842968	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.564:21:4,10:5,2:8,1,11,1
chr2	1844458	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=171,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:2,4:0,2:2,0,7,0
chr2	1844652	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr2	1946914	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.537:28:7,9:5,5:4,9,8,7
chr2	1947077	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,1:11,1:0|1:1947077_C_T:1947077:6,14,0,2
chr2	1947082	.	T	TCTCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:9,1:0|1:1947077_C_T:1947077:4,15,0,2
chr2	1982915	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,1:7,3:5,5,1,3
chr2	1983374	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr2	1983619	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	3196305	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=132,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,2:7,4,0,2
chr2	3200888	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	3212247	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	3212559	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:9,5:4,4:4,10,3,6
chr2	3217869	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:2,2:11,0:12,3,1,1
chr2	3217908	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,11,12
chr2	3341867	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:6,12,0,3
chr2	3342009	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=216,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr2	3356953	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,18:0,0,25,8
chr2	3358458	.	ATTATGAAGTTAGAT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=152.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,14:0,21:0,0,3,32
chr2	3428508	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	3460870	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,2,3
chr2	3460946	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=62,141;MMQ=45,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3460946_T_C:3460946:0,2,0,1
chr2	3460949	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=62,141;MMQ=45,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3460946_T_C:3460946:0,2,0,1
chr2	3460952	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=62,141;MMQ=45,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3460946_T_C:3460946:0,2,0,1
chr2	3460978	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3460978_C_T:3460978:0,0,0,1
chr2	3460984	.	AGTGAATGTTT	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3460978_C_T:3460978:0,0,0,1
chr2	3469278	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	3470186	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,4,19
chr2	3470254	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	3481637	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,0,25
chr2	3481659	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,0,17
chr2	3482796	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	3482912	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr2	3502709	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,11:0,17:0,0,24,4
chr2	3502909	.	A	ACTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.877:14:0,4:1,8:0|1:3502909_A_ACTT:3502909:0,1,0,13
chr2	3502910	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.877:14:0,4:1,8:0|1:3502909_A_ACTT:3502909:0,1,0,13
chr2	3502932	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	3599700	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,6:1,5:3,0,11,0
chr2	3605528	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.349:18:5,1:3,5:0|1:3605528_T_G:3605528:1,11,0,6
chr2	3605538	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:7,1:6,2:0|1:3605528_T_G:3605528:1,13,0,5
chr2	3623540	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:6,10:6,9:1,11,2,17
chr2	3660856	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:8,4:3,7:9,2,9,2
chr2	3673493	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	3718646	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:3718646_G_A:3718646:0,0,2,0
chr2	3718655	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:3718646_G_A:3718646:0,0,2,0
chr2	3718692	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr2	3721632	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=86.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,9:0,11:0|1:3721632_G_A:3721632:0,0,21,0
chr2	3721637	.	ATCTT	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCTT;STR;TLOD=52.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.558:25:2,6:5,8:0|1:3721632_G_A:3721632:9,2,13,1
chr2	3721821	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	3725964	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=202,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr2	3726163	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr2	3749084	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=74,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,3,1
chr2	3749151	.	GGAA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,4:0,0,4,6
chr2	3749267	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=138,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,4:2,0:1,1,2,2
chr2	3756073	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	3774519	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr2	3800496	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:3,4,3,4
chr2	3815250	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,1:2,3:4,0,4,0
chr2	3815477	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:6,5:0,5:5,2,3,7
chr2	3826324	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:0,3:2,0:3,0,3,0
chr2	5834249	.	G	GTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TGA;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	5834751	.	A	AT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=126,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.619:27:6,6:3,10:2,8,8,9
chr2	5834833	.	A	AATCTCGCTTTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=219,159;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr2	5835227	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:11,5:4,2:7,8,4,3
chr2	5835335	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.733:17:4,7:0,5:0|1:5835335_TA_T:5835335:2,2,4,9
chr2	5835352	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=226,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,18:0.832:21:3,10:0,8:0|1:5835335_TA_T:5835335:2,1,6,12
chr2	5835564	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.641:9:1,4:1,2:1,2,3,3
chr2	5835697	.	GTTT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=60,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.460:7:2,1:0,1:2,2,0,3
chr2	5837583	.	C	CACTCTCCCACCCTTCAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.486:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	5838496	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,11:0.242:46:15,0:20,2:33,2,0,11
chr2	5838683	.	TAAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:3,2:1,2:1,3,0,4
chr2	5839811	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:4,3:3,1:1,7,0,4
chr2	5839850	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=202,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5839850_T_C:5839850:0,2,0,1
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chr2	5839861	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:5839850_T_C:5839850:2,2,0,1
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chr2	7001249	.	ACACACACACC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=196,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.691:4:1,2:0,1:0|1:7001233_ACG_A:7001233:1,0,3,0
chr2	7005069	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr2	7005992	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	7017903	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr2	7027323	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr2	7137067	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr2	7154707	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:3,4,5,1
chr2	7154826	.	A	AT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.401:31:6,6:12,7:8,10,6,7
chr2	7164746	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=268,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	7208477	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=227,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr2	8822892	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33,34;MFRL=0,177,129;MMQ=60,60,60;MPOS=26,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=25,22,24;RU=A;STR;TLOD=33.43,5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,3:0.608,0.322:13:0,5,1:0,2,2:0,0,12,1
chr2	8822906	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=129,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:1,5:4,4:5,0,10,1
chr2	8822912	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.776:22:0,8:3,7:5,0,13,4
chr2	8823086	.	TGC	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.074:37:16,1:18,1:5,30,0,2
chr2	8870814	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	8873845	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=205,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr2	8910736	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.654:7:2,3:0,1:2,0,4,1
chr2	8910987	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	8911010	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr2	8916847	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,10,1
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chr2	8943295	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr2	9008512	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,2:8,2:16,0,4,0
chr2	9028160	.	C	CAGTGTGACAATTTTTGTCATTT	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,2:0.038:75:27,2:40,0:0|1:9028160_C_CAGTGTGACAATTTTTGTCATTT:9028160:40,33,0,2
chr2	9028162	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,2:0.039:75:27,1:44,0:0|1:9028160_C_CAGTGTGACAATTTTTGTCATTT:9028160:40,33,0,2
chr2	9419411	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,6:0,6:0|1:9419411_G_A:9419411:0,0,13,2
chr2	9419415	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0|1:9419411_G_A:9419411:0,0,14,2
chr2	9460376	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:5,1:11,1:11,5,3,0
chr2	9463454	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	9496291	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,14:0.295:49:18,6:15,8:9,26,6,8
chr2	9554255	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,4:3,6:8,1,8,2
chr2	9554458	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	9554461	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	9569972	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:7,0,3,0
chr2	9570054	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:16,1:14,1:20,10,2,0
chr2	9571054	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:1,6,0,7
chr2	9572887	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.341:7:3,1:2,0:0,5,0,2
chr2	9576553	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr2	9583822	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.592:13:0,5:5,3:2,3,1,7
chr2	9593064	.	A	G	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,36:0.469:77:14,19:26,17:20,21,19,17
chr2	9616035	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:5,7:10,4:12,4,9,2
chr2	9621663	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.616:3:0,2:1,0:0|1:9621663_CTT_C:9621663:0,1,0,2
chr2	9621666	.	CTGTTTCT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:9621663_CTT_C:9621663:0,1,0,2
chr2	9630231	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=99,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,4,1
chr2	9630244	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=99,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:2,2:3,1,5,1
chr2	9630722	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	9631270	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,99;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:3,11,0,2
chr2	9633137	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:15,6:13,6:4,24,3,9
chr2	9637403	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=97,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:2,5,0,4
chr2	9650350	.	C	CATAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr2	9983591	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=94.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,19,9
chr2	9983716	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.167:38:15,3:14,2:13,19,0,6
chr2	9986076	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=163,158;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,1:4,8:5,0,9,0
chr2	9986162	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:11,1:15,4:10,16,2,3
chr2	9989570	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:8,1:1,2:1,9,0,3
chr2	9991867	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=227,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:2,2,1,3
chr2	10023016	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,2:0,11,0,8
chr2	10044941	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:7,4:4,1:0|1:10044941_G_T:10044941:12,1,4,1
chr2	10044946	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:8,4:5,0:0|1:10044941_G_T:10044941:12,1,4,1
chr2	10045147	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.307:20:11,1:3,4:1,13,2,4
chr2	10051053	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:8,1:14,4:7,15,1,4
chr2	10051792	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,1:5,6:0,7,0,7
chr2	10053412	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,0,4
chr2	10094992	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr2	10105535	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=183,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:0,4,1,5
chr2	10105584	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr2	10126416	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,5,15
chr2	10132126	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,2:3,0:8,2,2,0
chr2	10133284	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:15,4:8,2:21,2,4,2
chr2	10136459	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=124,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:13,1:14,1:13,15,1,1
chr2	10140651	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.248:21:9,1:7,3:14,2,5,0
chr2	10192711	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=196,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10192711_A_T:10192711:0,2,0,1
chr2	10192714	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=196,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10192711_A_T:10192711:0,2,0,1
chr2	10225241	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,8,8
chr2	10226306	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:1,7,0,2
chr2	10264057	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=195,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	10281903	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,2:0,6:0,0,9,0
chr2	10282147	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,7:3,8:0,6,0,15
chr2	10350757	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr2	10563231	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=152,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.104:28:13,0:11,1:15,11,1,1
chr2	10563236	.	G	A,GTGGAATAATATGGTTTGGCT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,29,20;MFRL=166,179,53;MMQ=60,60,60;MPOS=16,1;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=47.40,5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,15,2:0.680,0.111:21:2,10,0:2,5,2:2,2,10,7
chr2	10566792	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,3,2
chr2	10566804	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,6:3,5:4,2,8,3
chr2	10595534	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,9,7
chr2	10762302	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=95.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,16:0,10:0,0,3,23
chr2	10784356	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:22,0,2,0
chr2	10808776	.	C	CAA	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=280.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,25:0,37:0,0,36,29
chr2	10813782	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr2	10912153	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	10915020	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:7,3:5,2:5,7,0,6
chr2	10915090	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,4:5,2:4,1,1,5
chr2	10924524	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	10927345	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,2:4,1:5,1,4,0
chr2	10927660	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=208,261;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	10928710	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr2	10928777	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,1:8,5:11,7,3,3
chr2	10928962	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,3:6,2:9,3,5,0
chr2	10929133	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:5,6:3,6:1,7,1,12
chr2	10929867	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.464:35:6,7:11,9:13,6,9,7
chr2	10930050	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=231,178;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,3:6,0:1,6,0,3
chr2	10931001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:3,0:0,8,0,3
chr2	10932082	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=102,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,2:7,1:2,8,0,3
chr2	10933421	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	10942567	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,1:4,3:6,1,4,0
chr2	10987818	.	G	GGGAATGTGTGAAGACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr2	10994418	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	11280792	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	11300732	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.224:25:13,3:5,2:9,11,4,1
chr2	11300854	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,9:0.345:27:11,4:7,4:0|1:11300854_C_T:11300854:4,14,2,7
chr2	11300869	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:6,5:5,2:0|1:11300854_C_T:11300854:0,11,1,7
chr2	11304471	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.570:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr2	11312181	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=85,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,4:4,4:1,6,2,6
chr2	11312224	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=214,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	11312888	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=54186108,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:11312888_C_T:11312888:0,2,0,1
chr2	11312911	.	AT	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=306,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11312888_C_T:11312888:0,1,0,1
chr2	11312915	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=306,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11312888_C_T:11312888:0,1,0,1
chr2	11352043	.	T	TATTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=234,251;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	11357139	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,138;MMQ=59,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:10,2:6,0:16,0,1,1
chr2	11359031	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:12,6:10,7:21,1,11,2
chr2	11375823	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=158,229;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.175:26:9,4:13,0:20,2,2,2
chr2	11716433	.	C	CA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.367:24:3,4:10,3:10,5,8,1
chr2	11718591	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr2	11738765	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,5:0,0,14,2
chr2	11742458	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=223,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr2	11755315	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,159;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,0:6,2:12,9,0,2
chr2	11755443	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr2	11774324	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,7,10
chr2	11777757	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	11905636	.	GT	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=74.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,21:0,0,22,10
chr2	11905876	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:2,7,1,8
chr2	11907842	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:1,2:10,4:11,0,5,1
chr2	11924950	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	11928594	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=111,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,1:11,0:0|1:11928594_C_G:11928594:6,9,1,1
chr2	11928614	.	G	GTGGTGAAACATGAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,2:11,0:0|1:11928594_C_G:11928594:4,12,1,1
chr2	11931773	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,25:0.424:59:19,16:15,9:32,2,19,6
chr2	11932173	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr2	11936798	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	11943082	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,2:3,5:6,4,5,2
chr2	12858444	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:6,4:14,3:11,9,6,1
chr2	12864696	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.074:51:25,3:23,0:45,3,3,0
chr2	12865048	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	14774094	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=173,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=52.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:7,6:1,13:5,3,12,7
chr2	14779227	.	TAC	T,TACACAC	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31,0;MFRL=145,158,75;MMQ=60,60,60;MPOS=7,50;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=AC;STR;TLOD=3.89,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,3:0.122,0.196:17:3,0,0:7,2,0:11,1,2,3
chr2	15319070	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:8,3:10,2:16,3,4,1
chr2	15359004	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:24,2:18,1:22,21,3,0
chr2	15378717	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:18,3:22,2:18,22,2,3
chr2	15378822	.	G	GAATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,7:0,0,0,15
chr2	15417280	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:15417280_ATT_A:15417280:0,3,0,4
chr2	15417285	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:15417280_ATT_A:15417280:0,3,0,4
chr2	15427173	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,2:4,4:7,2,3,3
chr2	15448311	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:11,4:11,3:17,5,7,0
chr2	15493881	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,3:2,4:0,6,1,6
chr2	15519992	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,5:3,5:0,6,1,9
chr2	15523266	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,24,0
chr2	15523307	.	TA	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=53.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.544:43:9,13:11,10:13,7,18,5
chr2	15533689	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:5,2:6,1:11,0,4,0
chr2	15533734	.	G	GAAATGAAAGCGTATGTCTACAC	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAATGAAAGCGTATGTCTACAC;STR;TLOD=55.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.596:23:4,3:5,1:7,2,13,1
chr2	15533779	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,41:0.618:66:9,26:16,15:17,8,31,10
chr2	15533884	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=64.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,18:0.487:37:10,10:7,7:0|1:15533884_C_A:15533884:4,15,0,18
chr2	15533895	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,16:0.472:34:7,7:9,7:0|1:15533884_C_A:15533884:4,14,0,16
chr2	15533899	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,15:0.485:31:5,7:9,8:0|1:15533884_C_A:15533884:3,13,0,15
chr2	15601287	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,5:2,5:5,0,9,2
chr2	15608013	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr2	15613411	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:7,11,1,1
chr2	15616012	.	G	GA	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.059:48:21,2:22,0:13,33,1,1
chr2	15616013	.	C	G,CAGGGTGGGAGGGAGGTAATGAAAAAGA	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=28,33,20;MFRL=143,154,58;MMQ=60,60,60;MPOS=17,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=74.13,4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,25,2:0.521,0.059:47:12,10,2:8,15,0:4,16,9,18
chr2	15616030	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.554:36:8,7:8,13:3,13,5,15
chr2	15623608	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	15644401	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=221,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr2	15676686	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,2,3
chr2	15676715	.	AACT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	15694164	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=129,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:4,5:7,6:10,1,10,3
chr2	15731998	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr2	15735419	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.616:29:4,7:6,10:0,11,0,18
chr2	15742570	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,7:4,2:10,0,9,0
chr2	15744484	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	15746220	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,7:4,8:4,3,6,9
chr2	15753279	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:10,6:2,12:12,1,17,1
chr2	15753307	.	AT	ATT,A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,32,32;MFRL=142,152,142;MMQ=60,60,60;MPOS=5,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,12;RU=T;STR;TLOD=4.17,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,4,5:0.103,0.112:45:21,3,0:14,1,5:34,2,9,0
chr2	15768876	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,13:0.241:56:25,4:18,9:33,10,7,6
chr2	15840505	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=211,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:1,14:0,10:1,0,19,5
chr2	15840522	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=211,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:1,15:0,11:1,0,18,8
chr2	15841288	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr2	16743453	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr2	16746897	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.432:30:8,4:9,8:10,7,7,6
chr2	17696664	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=136,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,2:5,1:2,12,1,2
chr2	17773524	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,6,19
chr2	17897279	.	CTTCA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCA;STR;TLOD=57.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:3,10:4,5:8,0,15,0
chr2	17919678	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:17919678_A_C:17919678:0,2,0,1
chr2	17919680	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17919678_A_C:17919678:0,2,0,1
chr2	17941423	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr2	17954140	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr2	17954647	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=100.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,0,27
chr2	17962993	.	CAAGTT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:4,7:6,6:5,6,7,6
chr2	18113776	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:18113776_C_CTT:18113776:1,2,0,1
chr2	18113779	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:18113776_C_CTT:18113776:1,2,0,1
chr2	18113784	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:18113776_C_CTT:18113776:2,2,0,1
chr2	18745235	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:4,8,0,2
chr2	18745466	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	20130970	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.386:8:2,2:2,1:5,0,3,0
chr2	20130984	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.469:10:1,0:2,0:5,0,5,0
chr2	20131184	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=58.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,2,16
chr2	20173255	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	20174175	.	GA	G,GAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,34,34;MFRL=151,233,141;MMQ=60,60,60;MPOS=7,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.89,6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,4,6:0.133,0.169:33:8,2,0:15,2,5:23,0,9,1
chr2	20189089	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,6:2,8:0,4,3,11
chr2	20194036	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:14,6:3,2:8,9,6,2
chr2	20202865	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr2	20206167	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	20251075	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20251075_G_C:20251075:0,0,1,0
chr2	20251080	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20251075_G_C:20251075:0,0,1,0
chr2	20251282	.	C	A	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,6:0.077:89:46,3:35,3:33,50,1,5
chr2	20402782	.	G	GAGTATTTGGGTTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=37,34;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:3,1,0,1
chr2	20402786	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=13,12;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:1,0:0,0:0|1:20402786_A_C:20402786:2,1,1,0
chr2	20402792	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.548:5:1,1:1,0:1,1,3,0
chr2	20402796	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=74,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:2,1:1,0:0|1:20402786_A_C:20402786:3,1,1,0
chr2	20402798	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,17;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:20402786_A_C:20402786:2,1,1,0
chr2	20402803	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,13;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:20402786_A_C:20402786:2,1,1,0
chr2	20405050	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	20455179	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=183,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr2	20455190	.	T	A,TAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31,26;MFRL=195,234,171;MMQ=60,60,60;MPOS=1,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.222,0.255:5:2,0,0:1,1,1:1,2,0,2
chr2	20526078	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=126,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.108:25:10,2:13,0:13,10,2,0
chr2	20648933	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.352:18:7,3:4,3:5,7,4,2
chr2	20699667	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,6:0,13:0,0,19,2
chr2	20700900	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	20700905	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr2	20701170	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=282,218;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	20792173	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,15,10
chr2	20822192	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20822192_G_T:20822192:0,1,0,1
chr2	20822194	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20822192_G_T:20822192:0,1,0,1
chr2	20823612	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,1:2,4:5,2,5,0
chr2	20823816	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=150,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:1,0:0,2:0,2,0,3
chr2	20823850	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	20824658	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:1,7,0,4
chr2	20845273	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	20871190	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,6:0,0,4,11
chr2	20884546	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	20884586	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:2,5:2,6:4,0,9,2
chr2	20939706	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=280,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0|1:20939706_T_C:20939706:1,0,4,2
chr2	20939708	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=280,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0|1:20939706_T_C:20939706:1,0,4,2
chr2	21000982	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=144,285;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr2	21001025	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:7,0:13,2,1,2
chr2	21232803	.	TG	CA,CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,164,101;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=37.09,12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,5:0.654,0.299:17:0,6,4:0,6,1:0,0,8,9
chr2	21235475	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	21236482	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr2	21246306	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=226,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	21246577	.	C	CTCAG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=121,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,2:8,0:4,13,1,1
chr2	21363332	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:8,5,1,1
chr2	23608319	.	A	AGCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GCC;STR;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.651:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr2	23698353	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	23746851	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,62;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.231:14:8,0:3,2:8,3,2,1
chr2	23907211	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26,32;MFRL=95,118,155;MMQ=60,60,60;MPOS=15,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=3.87,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.217,0.289:7:2,2,0:1,0,2:3,0,3,1
chr2	23919169	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr2	23925980	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=222,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	23977653	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:16,3:12,0:6,22,0,3
chr2	24009163	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=212,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr2	24021079	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,3:0.043:90:40,2:46,1:50,37,1,2
chr2	24021231	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,27:0.651:41:6,13:8,14:0,14,1,26
chr2	24042550	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	24055110	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:5,0:11,3:0|1:24055110_G_C:24055110:8,10,0,3
chr2	24055114	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:5,0:13,3:0|1:24055110_G_C:24055110:8,11,0,3
chr2	24057029	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24057029_T_TA:24057029:1,0,0,1
chr2	24057033	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24057029_T_TA:24057029:1,0,0,1
chr2	24057037	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24057029_T_TA:24057029:1,0,0,1
chr2	24057043	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24057029_T_TA:24057029:0,0,0,1
chr2	24087621	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.390:36:12,3:10,10:19,3,13,1
chr2	24087857	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:2,2:9,6:1,10,0,8
chr2	24103432	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,164;MMQ=52,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.615:8:2,3:1,1:3,0,5,0
chr2	24108557	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:4,0,4,0
chr2	24110611	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:8,0,7,0
chr2	24110911	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:5,0:2,2:0,11,0,3
chr2	24111311	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=83.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,28:0.536:52:15,15:9,12:7,17,6,22
chr2	24149625	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.067:43:21,1:19,1:27,14,1,1
chr2	24194314	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,5:1,3:0,3,1,7
chr2	24200029	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:24200029_T_A:24200029:0,2,0,1
chr2	24200032	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:24200029_T_A:24200029:0,3,0,1
chr2	24200035	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=210,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:24200029_T_A:24200029:0,2,0,2
chr2	24200042	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=210,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:24200029_T_A:24200029:0,2,0,1
chr2	24200046	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=210,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:24200029_T_A:24200029:0,2,0,1
chr2	24238928	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	24239189	.	T	TCCTGGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCTGGC;STR;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,3:0,3,0,5
chr2	24245659	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=228,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr2	24245799	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=110,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:0|1:24245799_G_A:24245799:6,7,1,1
chr2	24245805	.	G	GTTGAAGTGTCTGCTCACTGGGCT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=119,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:3,0:0|1:24245799_G_A:24245799:6,7,1,1
chr2	24245816	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:0|1:24245816_G_A:24245816:3,6,1,1
chr2	24245818	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:24245816_G_A:24245816:3,6,1,1
chr2	24246175	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:24246175_C_T:24246175:0,0,0,4
chr2	24246179	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0|1:24246175_C_T:24246175:0,2,0,1
chr2	24246180	.	C	CTTGACTCTTGCTGAGGTAGGTAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0|1:24246175_C_T:24246175:0,2,0,1
chr2	24246679	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	24255862	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr2	24255991	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:6,2,6,2
chr2	24272645	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	24302246	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:5,7:2,3:6,1,11,0
chr2	24345196	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,0:1,0,1,1
chr2	24387178	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	24390657	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	24395506	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=203.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,31:0,31:0,0,10,53
chr2	24398281	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	24400769	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,2,6
chr2	24402127	.	C	CAA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=185.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,22:0,21:0,0,4,40
chr2	24413298	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.503:36:2,12:15,6:14,4,16,2
chr2	24413326	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=119,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.083:53:22,0:20,0:34,15,0,4
chr2	24413595	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=189,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:2,4:0,1:0,2,1,5
chr2	24423662	.	CT	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	24432138	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr2	24432667	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,13,5
chr2	24432721	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:4,8,0,2
chr2	24432937	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,1:2,2:0,5,0,3
chr2	24475205	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=116.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.946:34:0,19:0,14:1,0,22,11
chr2	24484150	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	24493517	.	TA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:10,3:23,0:27,7,3,0
chr2	24521493	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr2	24521686	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=18,34;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:0,1:0,5,0,2
chr2	24521766	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	24550867	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=83,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr2	24896389	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=73.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,0,20
chr2	24952730	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24952730_C_T:24952730:0,0,0,1
chr2	24952732	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24952730_C_T:24952730:0,0,0,1
chr2	24952738	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24952730_C_T:24952730:0,0,0,1
chr2	24952740	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24952730_C_T:24952730:0,0,0,1
chr2	25013523	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	25038268	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	25047408	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr2	25048847	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr2	25061880	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,172;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	25095338	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=225,208177314;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	25100738	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:6,1,3,0
chr2	25100902	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,1,2
chr2	25351100	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,107;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,0:11,4:15,7,4,0
chr2	25353360	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:18,2,1,1
chr2	25354769	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=229,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:25354769_T_A:25354769:0,4,0,1
chr2	25354773	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=229,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:25354769_T_A:25354769:0,4,0,1
chr2	25360186	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=95,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:2,1,3,1
chr2	25376681	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=135,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,4:4,1:1,5,2,3
chr2	25376711	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.384:6:2,2:2,0:0|1:25376711_G_T:25376711:1,3,1,1
chr2	25376724	.	TCCTCCCCACCTCC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=137,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:25376711_G_T:25376711:1,2,0,1
chr2	25377176	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,4,15
chr2	25383887	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr2	25458546	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:3,1,5,0
chr2	25463483	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,7:0,0,12,6
chr2	25466888	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr2	25469913	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,15,3
chr2	25551463	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,1:5,1:5,4,4,0
chr2	25610287	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:5,4:3,1:1,8,1,4
chr2	25656880	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=108.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,15:0,14:0,0,6,25
chr2	25875401	.	TAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:5,3:1,0:6,2,3,0
chr2	25967327	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=198,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:25967327_A_T:25967327:1,3,0,1
chr2	25967329	.	A	AGCGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=198,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:25967327_A_T:25967327:1,3,0,1
chr2	25967331	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=198,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:25967327_A_T:25967327:1,3,0,1
chr2	25967332	.	C	CGACGTCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=198,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:25967327_A_T:25967327:1,3,0,1
chr2	25973174	.	G	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:22,0:28,4:30,21,4,0
chr2	25990500	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:18,3:18,0:15,21,3,0
chr2	26022446	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=142,230;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr2	26022473	.	T	TGCTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,251;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	26350136	.	G	T	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=142.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,46:0.553:83:12,22:25,24:3,34,4,42
chr2	26357748	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:5,1,6,1
chr2	26405985	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.932:17:0,7:0,9:0,1,1,15
chr2	26417533	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr2	26420708	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr2	26454996	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,22,3
chr2	26477125	.	G	GACT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACT;STR;TLOD=246.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.984:57:0,21:0,30:0,0,38,19
chr2	26532491	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=131,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr2	26532735	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr2	26533023	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:3,2,4,4
chr2	26534801	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=114,174;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:8,5:8,8:4,12,5,8
chr2	26536299	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.371:22:9,3:4,4:1,13,2,6
chr2	26536555	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	26536694	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=103,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:5,6:7,7:6,6,8,5
chr2	26537499	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,3,13
chr2	26539967	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0|1:26539967_C_T:26539967:0,3,1,1
chr2	26539971	.	A	AAGAGAGAGAGGTTGGACTGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.421:5:0,0:3,1:0|1:26539967_C_T:26539967:0,3,1,1
chr2	26568994	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:3,1:8,1:10,2,2,0
chr2	26587076	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=122,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	26590022	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,1:9,2:14,6,2,1
chr2	26590084	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,5,12
chr2	26590118	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr2	26609469	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	26652671	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	26663187	.	T	TTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=18,31;MFRL=220,180;MMQ=40,41;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=TG;STR;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.840:10:0,3:0,4:1,0,9,0
chr2	26671544	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.584:34:6,11:8,8:9,5,13,7
chr2	26676322	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,18:0,28:0,0,20,27
chr2	26679394	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:6,4:10,6:3,13,2,8
chr2	26689893	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=274,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr2	26693654	.	C	CTTCTTCCTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	26695338	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=119,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:0|1:26695338_C_T:26695338:7,3,4,4
chr2	26695354	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=111,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:5,5:3,4:0|1:26695338_C_T:26695338:3,5,4,6
chr2	26697422	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:7,3:1,3:7,1,5,2
chr2	26697480	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:8,3:8,8:10,6,7,4
chr2	26706486	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,1:12,1:8,10,0,2
chr2	26724725	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.635:20:4,4:3,8:3,4,1,12
chr2	26726752	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=135,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:4,4,1,5
chr2	26739247	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:1,2,4,1
chr2	26741900	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=115,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:10,0:4,11,2,0
chr2	26750645	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:7,5:2,2:8,1,5,2
chr2	26801586	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:6,1,3,0
chr2	26804143	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr2	26818006	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr2	26818021	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr2	26915669	.	GGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=276,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	26951449	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,4:0,1:0,0,2,6
chr2	26997280	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	27154658	.	C	CCAAAGTACAGGCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr2	27157400	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	27163044	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:0,1:0,4,0,2
chr2	27164806	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:1,9:6,6:4,3,12,3
chr2	27165317	.	TAAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	27246394	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=166,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:27246394_G_C:27246394:0,3,0,1
chr2	27246397	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=166,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27246394_G_C:27246394:0,3,0,1
chr2	27249245	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=193,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:0,6,1,4
chr2	27262073	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=169,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr2	27262763	.	GGGA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr2	27263122	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	27276202	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,5:1,0:2,0,5,0
chr2	27276835	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,2:15,0:15,13,2,0
chr2	27279416	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	27279744	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=169,163;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	27279756	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=173,160;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	27280092	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr2	27280127	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=166,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:4,4:1,5:6,0,9,0
chr2	27292651	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,7:3,2:0,6,0,9
chr2	27293150	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.648:35:6,14:6,8:1,11,4,19
chr2	27302165	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	27307769	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr2	27351279	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr2	27354173	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	27354542	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:8,2,1,1
chr2	27355344	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=236,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,2,0
chr2	27355453	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.197:16:7,3:6,0:13,0,2,1
chr2	27355454	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=65,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.947:19:1,10:1,7:0,2,17,0
chr2	27372274	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:27372274_A_AT:27372274:0,1,0,1
chr2	27372276	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27372274_A_AT:27372274:0,1,0,1
chr2	27372568	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,14;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:2,0:1,0:3,0,0,1
chr2	27423966	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,1:9,1:3,13,1,1
chr2	27424496	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	27426824	.	C	CGACGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=133,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27426824_C_CGACGCT:27426824:0,1,0,1
chr2	27426827	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=133,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27426824_C_CGACGCT:27426824:0,1,0,1
chr2	27428147	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	27428173	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,3:1,5:5,0,7,1
chr2	27428815	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=95,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.627:27:5,10:4,7:8,2,16,1
chr2	27435374	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.620:16:2,3:3,7:0,6,0,10
chr2	27439518	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=110.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,36:0.599:60:12,18:11,18:4,20,12,24
chr2	27440722	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.651:27:8,4:1,12:5,4,10,8
chr2	27445976	.	G	GTCACTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=192,277;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	27448145	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	27448171	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,155;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.820:4:0,1:0,0:0,0,0,4
chr2	27449293	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,0:2,2,0,3
chr2	27455281	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr2	27460787	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,2,3
chr2	27461323	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:5,10,2,0
chr2	27463091	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.366:23:4,1:8,4:11,2,3,7
chr2	27463351	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:3,2,6,2
chr2	27465306	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:3,0:6,2:0|1:27465306_T_A:27465306:3,9,1,1
chr2	27465311	.	G	GACTGGGGTGGCTGGGACATAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=144,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:27465306_T_A:27465306:3,10,1,1
chr2	27465880	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	27479472	.	T	TCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	27499796	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=0,154;MMQ=60,47;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27499796_T_TG:27499796:1,0,0,1
chr2	27499801	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=0,154;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27499796_T_TG:27499796:1,0,0,1
chr2	27499806	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:27499796_T_TG:27499796:1,0,0,1
chr2	27521375	.	C	CACGTGCCCATGAAGGATACCTACA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:27521375_C_CACGTGCCCATGAAGGATACCTACA:27521375:2,1,0,1
chr2	27521377	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:27521375_C_CACGTGCCCATGAAGGATACCTACA:27521375:2,1,0,1
chr2	27521383	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:27521383_A_G:27521383:1,1,1,0
chr2	27521385	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:27521383_A_G:27521383:1,1,1,0
chr2	27522330	.	G	GCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:2,1:0,5,0,1
chr2	27535311	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=66.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,11:0,0,7,13
chr2	27550250	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=164,192;MMQ=50,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	27550251	.	GC	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=181,137;MMQ=56,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	27552074	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=133,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.185:24:9,0:11,3:10,10,0,4
chr2	27556924	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.127:37:19,0:14,4:0|1:27556924_A_G:27556924:15,18,3,1
chr2	27556940	.	CC	TG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,84;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:14,2:0|1:27556924_A_G:27556924:8,21,1,1
chr2	27558333	.	GGT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GT;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:7,1:14,1:4,18,0,2
chr2	27591804	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:5,0,5,1
chr2	27597190	.	AT	A,ATT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,32,30;MFRL=143,160,100;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=11.39,5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,11,4:0.248,0.110:42:19,5,2:8,5,1:26,1,13,2
chr2	27598097	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	27659832	.	C	CT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,0:14,1:24,6,1,2
chr2	27664747	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:27664747_CT_C:27664747:0,2,0,1
chr2	27664756	.	AG	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27664747_CT_C:27664747:0,3,0,1
chr2	27666476	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,186;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0,15,0,2
chr2	27676923	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:8,3:12,1:10,12,2,2
chr2	27700586	.	T	TATTTTTATTCCATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	27712638	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr2	27731212	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	27803571	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:20,0:14,2:16,18,2,0
chr2	27805525	.	C	CG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:2,2:9,2:6,5,2,3
chr2	27823771	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	27824168	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr2	27839107	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,6:0,15:0,0,13,8
chr2	27850099	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,166;MMQ=57,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:12,7:9,3:12,9,7,3
chr2	27852113	.	A	AAGGTGGTCTTCCACTGGCTAAACGGCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=154,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr2	27852117	.	A	AGGTCTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	27852118	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	27852150	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr2	27852637	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr2	27855397	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=76.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,10:0,0,23,4
chr2	27857992	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=114.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,15:0,19:0,0,30,9
chr2	27858167	.	C	CTTTT,CTTTTTTTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,19,17;MFRL=128,153,189;MMQ=60,60,60;MPOS=8,-1073741815;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,20,25;RU=T;STR;TLOD=9.70,7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.415,0.406:7:0,0,0:1,0,1:0,1,0,6
chr2	27892013	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=231,124;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr2	27900569	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.500:48:10,12:13,11:19,5,21,3
chr2	27930837	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,12,12
chr2	28084253	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28084253_T_C:28084253:1,0,0,1
chr2	28084256	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28084253_T_C:28084253:1,0,0,1
chr2	28093758	.	CTGAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=239,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28093758_CTGAAAA_C:28093758:0,1,0,1
chr2	28093767	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=239,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28093758_CTGAAAA_C:28093758:0,1,0,1
chr2	28211051	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=173,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28211051_C_CTT:28211051:0,1,0,1
chr2	28211053	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=173,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28211051_C_CTT:28211051:0,1,0,1
chr2	28464373	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	28615803	.	CAGAA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:2,2:0,6,0,5
chr2	28615812	.	GGA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GA;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:1,1:0,8,0,3
chr2	28718897	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	28748857	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,9,11
chr2	28748916	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	28752348	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=226,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	28752498	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	28752555	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,12:0,0,15,3
chr2	28752727	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,8
chr2	28752741	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,5
chr2	28761257	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr2	28761282	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,1,13
chr2	28763374	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr2	28771452	.	CTA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	28771624	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	28771897	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	28795962	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	28802649	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:0,9,0,7
chr2	28804848	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=172,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.295:13:3,1:6,3:9,0,4,0
chr2	28808539	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:9,8:6,5:15,0,12,1
chr2	28812285	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,2:1,6:4,0,6,2
chr2	28812793	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,0:5,2:8,3,2,0
chr2	28812873	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,45;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:9,10,2,0
chr2	28812982	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,5:2,4:0,7,5,4
chr2	28816814	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.237:14:7,2:4,1:11,0,3,0
chr2	28821662	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,10:0,0,0,16
chr2	28824722	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=170,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.373:8:4,0:0,1:3,2,3,0
chr2	28824793	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,8,11
chr2	28840691	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=91,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:2,3:7,4:2,7,2,6
chr2	28847806	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	28849461	.	CCCCGAGCTCCTTGCT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.543:11:2,4:3,1:0,5,1,5
chr2	28849473	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=161,139;MMQ=24,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.682:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	28851517	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,4:7,3:4,6,2,5
chr2	28854816	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=102770138,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr2	28855918	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	28863738	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=179,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,5:2,1:7,1,5,1
chr2	28865968	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:0,6,2,5
chr2	28866002	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=226,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:28866002_C_CCT:28866002:0,4,0,1
chr2	28866004	.	A	AGTTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=246,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:28866002_C_CCT:28866002:0,3,0,1
chr2	28975107	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr2	29011498	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:6,0:15,2,2,0
chr2	29041877	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=168,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.519:23:6,6:5,6:9,2,8,4
chr2	29045323	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=153.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,28:0,16:0,0,0,45
chr2	29052256	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr2	29052275	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=178,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	29052282	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=213,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:29052282_G_T:29052282:0,2,0,1
chr2	29052286	.	T	TGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=195,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29052282_G_T:29052282:0,1,0,1
chr2	29075170	.	T	TGAGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,178;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr2	29087799	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	29145725	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.539:37:8,8:9,12:9,8,10,10
chr2	29152456	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,38:0.522:73:16,16:17,20:18,17,26,12
chr2	29169612	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:0,10,0,3
chr2	29217832	.	C	CAGAGAAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	29222388	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	29225496	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:12,4:1,2:7,7,3,3
chr2	29225691	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29225691_A_T:29225691:0,1,0,1
chr2	29225694	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29225691_A_T:29225691:0,1,0,1
chr2	29225697	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29225691_A_T:29225691:0,1,0,1
chr2	29225700	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29225691_A_T:29225691:0,1,0,1
chr2	29226559	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=99.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.943:33:0,14:1,18:1,0,10,22
chr2	29239942	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.492:35:7,7:8,10:18,0,14,3
chr2	29240005	.	T	C	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=134.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,45:0.495:91:20,24:26,21:29,17,25,20
chr2	29240582	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=184,117;MMQ=60,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:3,4:9,1:11,1,5,0
chr2	29244932	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	29246119	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr2	29246922	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr2	29249903	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr2	29258289	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:6,0,5,0
chr2	29274898	.	A	ACAGAGGGGTGGC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGAGGGGTGGC;STR;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.395:18:3,2:7,2:9,2,5,2
chr2	29287926	.	C	CGCT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCT;STR;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:4,5:2,1:2,4,2,5
chr2	29295389	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:9,3:5,4:4,11,1,6
chr2	29296373	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:4,3,2,4
chr2	29297091	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr2	29366875	.	C	CACAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.535:11:1,2:4,3:1,4,0,6
chr2	29383374	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:1,5:5,5:1,5,0,10
chr2	29386646	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,4:5,8:8,3,9,3
chr2	29390301	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:7,11:5,7:10,3,16,2
chr2	29419591	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr2	29446202	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=75,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:4,1,4,0
chr2	29449819	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,2:3,6:5,1,5,3
chr2	29451783	.	AC	CG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.198:27:6,0:11,0:3,19,5,0
chr2	29498210	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr2	29541104	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	29551161	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr2	29551347	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,0:9,3:8,12,2,1
chr2	29917940	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	30682470	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.402:20:6,2:6,5:5,7,6,2
chr2	30828792	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=160.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,18:0,27:0,0,46,1
chr2	30829034	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=199,184;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:30829034_A_G:30829034:0,11,0,2
chr2	30829036	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=199,184;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:30829034_A_G:30829034:0,11,0,2
chr2	30863314	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=197,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,1:6,1:10,7,1,1
chr2	30959262	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	30961400	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,3:0,0,0,12
chr2	30973913	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	30977073	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	30980940	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=79,118;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:2,4,4,1
chr2	30986989	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,5,7
chr2	30993125	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:7,1:3,1:8,3,0,2
chr2	31009977	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,10,6
chr2	31133939	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=104,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:5,4:14,5:2,17,3,6
chr2	31155043	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:4,2:4,0:2,8,0,2
chr2	31189236	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr2	31401290	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	31410708	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,19:0,0,5,32
chr2	31414245	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=109,55;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,0:14,2:17,11,2,0
chr2	31414288	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=129,133;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:4,0:4,1:3,6,0,4
chr2	31415957	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,13;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:31415957_A_C:31415957:2,0,1,0
chr2	31415967	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:31415957_A_C:31415957:2,0,1,0
chr2	31415971	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,0:0|1:31415957_A_C:31415957:2,0,1,0
chr2	31416245	.	A	ACAGCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31416245_A_ACAGCTG:31416245:0,0,0,1
chr2	31416250	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31416245_A_ACAGCTG:31416245:0,0,0,1
chr2	31424885	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:2,5:2,4:1,3,5,5
chr2	31467079	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=223,233;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	31467351	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	31484334	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	31489613	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=249,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.384:3:1,1:1,0:0|1:31489613_A_AAG:31489613:0,2,0,1
chr2	31489614	.	T	TTGAAATCCTAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=249,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:31489613_A_AAG:31489613:0,2,0,1
chr2	31558993	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:31558993_G_C:31558993:0,4,0,1
chr2	31558994	.	C	CCATTCTCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:31558993_G_C:31558993:0,4,0,1
chr2	31570376	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr2	31571040	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,2:5,0:18,0,2,0
chr2	31571064	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.539:22:7,10:3,1:9,1,12,0
chr2	31571241	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	31572732	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,6:2,1:0,3,0,7
chr2	31588288	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=140,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.492:26:7,5:6,6:11,2,10,3
chr2	31588294	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:12,1:13,2:18,8,2,1
chr2	31589654	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,4:0,4:2,0,8,0
chr2	31590759	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:4,1,3,0
chr2	31600146	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr2	31609448	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,3,11
chr2	31611029	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	31621511	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,2:14,0:14,12,2,0
chr2	31751295	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=118,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:8,10,0,2
chr2	31805880	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,3,5
chr2	32095023	.	TA	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.307:25:1,0:0,1:0,17,0,8
chr2	32117217	.	G	A,GA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=17,26,18;MFRL=157,158,151;MMQ=60,60,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.23,4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,4:0.301,0.281:21:0,2,0:1,3,1:0,9,1,11
chr2	32254852	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=173,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:10,2:0|1:32254852_T_A:32254852:1,24,0,2
chr2	32254858	.	T	TAACCCCAGCAAAACCGGCAAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=175,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:13,0:7,2:0|1:32254852_T_A:32254852:1,20,0,2
chr2	32353659	.	T	TCATCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	32366959	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,2:6,1:14,2,3,0
chr2	32368296	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.398:23:7,3:7,6:14,0,9,0
chr2	32368315	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:10,3:18,0:31,0,3,0
chr2	32368320	.	CA	AG	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=181,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:11,2:20,0:31,0,2,0
chr2	32369901	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=132,176;MMQ=45,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:0,3:1,7:1,0,10,0
chr2	32400294	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:7,1:0,5:7,0,4,2
chr2	32434701	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,3:0,13:0,0,0,17
chr2	32449871	.	ATTTT	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=T;STR;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,3:0,11:0,0,0,15
chr2	32449879	.	T	TAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=A;STR;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,2:0,11:0,0,0,14
chr2	32461493	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr2	32466029	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	32477809	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,168;MMQ=60,35;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	32481793	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=100.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0|1:32481793_AT_A:32481793:0,0,12,11
chr2	32481795	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0|1:32481793_AT_A:32481793:0,0,12,11
chr2	32605449	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32605449_G_A:32605449:0,0,0,1
chr2	32605452	.	C	CCCCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32605449_G_A:32605449:0,0,0,1
chr2	32605455	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32605449_G_A:32605449:0,0,0,1
chr2	32605458	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32605449_G_A:32605449:0,0,0,1
chr2	32667058	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,2,0
chr2	32667061	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,2,0
chr2	32688470	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:12,2:8,1:2,18,1,2
chr2	32690109	.	AT	A	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,12:0.129:93:48,8:28,4:67,14,11,1
chr2	32690253	.	AT	A,ATT	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=30,32,29;MFRL=122,168,151;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,18,20;RU=T;STR;TLOD=5.78,3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,10,7:0.220,0.172:42:10,5,2:12,3,3:6,19,3,14
chr2	32690328	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=153,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,2:8,0:1,10,0,2
chr2	32706563	.	A	G	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=159,137;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:32,0:33,3:10,55,0,3
chr2	32706572	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=159,159;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:29,0:24,3:6,53,0,3
chr2	32706579	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=148.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,22:0,19:0,0,2,41
chr2	32712875	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=137.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,15:0,21:0,0,2,35
chr2	32726707	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:1,0:8,2:9,0,3,0
chr2	32730338	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32730338_A_AC:32730338:0,1,0,1
chr2	32730339	.	A	ACACTCTCATTCACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32730338_A_AC:32730338:0,1,0,1
chr2	32733343	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=27,28;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.848:3:0,0:0,0:0,0,1,2
chr2	32735648	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:10,13,0,2
chr2	32740777	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32740777_T_A:32740777:0,0,0,1
chr2	32740783	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32740777_T_A:32740777:0,0,0,1
chr2	32749880	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=109.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,25,0
chr2	32749890	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=129.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,16:0,10:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,28,1
chr2	32749893	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=151.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,18:0,13:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,33,2
chr2	32749903	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=169.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,22:0,17:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,39,2
chr2	32770823	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,370753;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:29,3:26,0:22,34,3,0
chr2	32820252	.	AT	A	.	.	DP=128;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,4:0.045:91:40,2:46,1:12,75,0,4
chr2	32822729	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr2	32865552	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=194,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32865552_G_C:32865552:0,1,0,1
chr2	32865554	.	T	TTGATTTGTTACTTTTTCTTCGAGCACCGAAGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=203,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.483:3:0,1:1,0:0|1:32865552_G_C:32865552:0,2,0,1
chr2	32891730	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,2:16,0:14,14,1,1
chr2	32959024	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr2	32961691	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	32961745	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=77.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,21,2
chr2	33011955	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	33174043	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.488:24:5,4:7,5:4,8,3,9
chr2	33245903	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr2	33246146	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,5:6,0:4,7,3,2
chr2	33413949	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:0,4,1,4
chr2	33414009	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	33442549	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	33477947	.	C	CCTTTTTTTTGTGAGTCCCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr2	33477964	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	33482673	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=208,143;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:33482673_G_A:33482673:0,4,0,1
chr2	33482676	.	TA	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=208,143;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:33482673_G_A:33482673:0,4,0,1
chr2	33500848	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:6,4:14,8:0|1:33500848_A_G:33500848:9,11,7,5
chr2	33500863	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,19:0.571:33:6,7:7,12:1|0:33500848_A_G:33500848:10,4,12,7
chr2	33540138	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	33540172	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.660:9:0,3:3,3:1,2,6,0
chr2	33585796	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,14:0,25:0,0,12,28
chr2	33586464	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.434:5:1,1:2,1:0|1:33586464_CT_C:33586464:2,1,2,0
chr2	33586481	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,0:0|1:33586464_CT_C:33586464:4,1,2,0
chr2	33614187	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:2,2:3,5:4,1,7,1
chr2	33623387	.	AT	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,11:2,2:6,0,11,2
chr2	33744958	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,13,7
chr2	33759403	.	T	TGTCC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=177,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:9,3:9,0:9,10,1,2
chr2	33764141	.	G	GT,GTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31,34;MFRL=146,143,173;MMQ=60,60,60;MPOS=3,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.17,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,2:0.276,0.175:12:5,1,1:2,2,1:7,0,3,2
chr2	33784076	.	A	ACTGGAGGAGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr2	36583461	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=115,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,3:1,0,3,2
chr2	36605585	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=180,114;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:0,11,0,2
chr2	36668395	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,2:7,5:6,3,4,3
chr2	36669670	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:1,3:2,1:4,0,5,0
chr2	36739553	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr2	36740643	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.395:21:8,8:4,0:10,3,7,1
chr2	36756288	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:14,5:2,3:10,6,4,4
chr2	36779144	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,11,0
chr2	36783215	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=124.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,44:0.643:68:8,17:13,27:5,19,10,34
chr2	36785667	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr2	36943419	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,6:0,0:0,0,8,0
chr2	36970275	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,0:13,2:15,13,1,1
chr2	36994439	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.631:25:2,8:7,8:4,5,6,10
chr2	37000877	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.247:35:12,4:11,4:23,4,8,0
chr2	37010574	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,0,15
chr2	37041476	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=159,181;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr2	37077015	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	37078095	.	A	AT,ATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34,32;MFRL=0,163,181;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=14.10,7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,6:0.475,0.461:12:0,4,3:0,2,3:0,0,12,0
chr2	37085261	.	G	GCCCTCATACGTTCATCGCAGCACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	37096970	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	37111045	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.584:34:11,6:3,14:11,3,14,6
chr2	37152160	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:12,1:26,2:39,0,3,0
chr2	37152166	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=162,152;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:12,2:25,2:39,0,4,0
chr2	37152186	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=152,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:20,2:33,0:0|1:37152186_C_T:37152186:48,8,1,1
chr2	37152194	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=151,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,2:0.044:65:27,2:34,0:0|1:37152186_C_T:37152186:54,9,1,1
chr2	37152195	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=149,166;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,2:0.044:66:28,2:36,0:54,10,2,0
chr2	37152389	.	CA	C,CAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,34,35;MFRL=168,139,155;MMQ=60,60,60;MPOS=29,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.79,5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,4:0.122,0.154:29:9,1,1:13,2,2:1,21,0,7
chr2	37195608	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr2	37234519	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=167,161;MMQ=55,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,1:0,2,0,6
chr2	37248015	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:5,5:4,4:1,8,2,7
chr2	37255015	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,35:0.592:59:9,21:14,14:17,7,30,5
chr2	37264935	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr2	37280763	.	G	GA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.501:43:14,7:7,9:4,18,3,18
chr2	37292128	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,0:12,4:7,21,0,4
chr2	37292890	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:8,2,7,0
chr2	37297329	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,2:2,7:5,2,8,1
chr2	37302556	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	37306343	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,14,11
chr2	37316717	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=134,134;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:4,0:7,3:11,3,3,1
chr2	37336486	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:14,0:13,3:0,28,0,3
chr2	37364220	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,109;MMQ=60,60;MPOS=-1073741808;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:24,2:20,0:11,34,1,1
chr2	37373982	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,16,5
chr2	37402270	.	C	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,20:0.291:70:26,9:24,11:27,23,11,9
chr2	37402373	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,15:0.334:46:8,4:22,11:10,21,3,12
chr2	37406761	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr2	37410537	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:8,3:2,1:7,3,4,0
chr2	37414431	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:5,6:11,2:16,0,8,0
chr2	37414613	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=179,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:5,15,0,2
chr2	37415496	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr2	37428743	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,28:0.462:61:19,18:13,10:30,3,27,1
chr2	37444266	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=153,113;MMQ=60,32;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0,11,0,2
chr2	37444278	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=172,140;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0,11,0,2
chr2	37444288	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=193,140;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,0:3,4:0,8,0,4
chr2	37447465	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=154,123;MMQ=40,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.343:18:7,2:4,4:0|1:37447465_A_G:37447465:12,0,6,0
chr2	37447473	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.944:16:1,8:0,6:1,0,13,2
chr2	37447475	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=154,0;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.475:19:4,3:2,6:0|1:37447465_A_G:37447465:10,0,7,2
chr2	37483719	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr2	37483772	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.299:12:6,2:2,1:8,1,3,0
chr2	37487341	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:6,2:6,1:9,4,1,2
chr2	37518088	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:4,14,0,2
chr2	37586681	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	37595696	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=108,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:7,7:5,4:9,3,7,4
chr2	37599688	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=239,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr2	37599963	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,4:6,1:1,11,0,5
chr2	37599988	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=114,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:1,6,0,4
chr2	38179414	.	CTG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr2	38179449	.	A	ATCCTTTTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	38201174	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=219,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr2	38202543	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=160,151;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38202543_C_T:38202543:0,1,0,1
chr2	38202548	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,151;MMQ=60,30;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38202543_C_T:38202543:0,1,0,1
chr2	38208606	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr2	38218470	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:1,7:4,7:3,2,3,11
chr2	38244826	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:3,6:7,6:2,9,0,12
chr2	38298149	.	CA	TG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,2:16,0:18,9,1,1
chr2	38298150	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,10:0,18:0,0,18,10
chr2	38302544	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr2	38526333	.	A	AT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,8:0.162:52:25,4:19,2:43,1,6,2
chr2	38800658	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38800658_A_ATC:38800658:0,1,0,1
chr2	38800659	.	A	ATTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38800658_A_ATC:38800658:0,1,0,1
chr2	38809162	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:8,4:10,1:9,9,3,2
chr2	38818689	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:13,0:18,4:21,11,0,4
chr2	38829805	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=215,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.609:6:0,1:2,1:2,0,1,3
chr2	38975332	.	G	T,GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,18,17;MFRL=150,174,145;MMQ=60,60,60;MPOS=20,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.72,9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,5:0.176,0.392:15:1,0,0:2,2,2:1,5,1,8
chr2	38975609	.	CG	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	38977287	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:25,0:15,3:16,25,1,2
chr2	38977371	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr2	38977402	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	39025632	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr2	39030074	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=184,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr2	39030155	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=200,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39030155_CT_C:39030155:0,1,0,1
chr2	39030158	.	CCCAAATTTAT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=200,265;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39030155_CT_C:39030155:0,1,0,1
chr2	39041092	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.061:49:31,1:15,2:10,36,0,3
chr2	39042639	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,3:0,0,14,1
chr2	39043388	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:5,1:1,3:0,6,0,4
chr2	39046373	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=188,137;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,1:3,1:0|1:39046373_G_A:39046373:0,9,0,2
chr2	39046375	.	GGT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=189,137;MMQ=60,58;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:3,1:0|1:39046373_G_A:39046373:0,11,0,2
chr2	39050061	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr2	39050141	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:5,2,0,3
chr2	39075356	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=93.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,31:0.696:44:5,16:8,15:13,0,25,6
chr2	39081369	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=163,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:39081369_AGG_A:39081369:0,1,0,1
chr2	39081378	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=163,104;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39081369_AGG_A:39081369:0,1,0,1
chr2	39083656	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=163,156;MMQ=46,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:39083656_T_C:39083656:1,3,0,1
chr2	39083665	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=163,156;MMQ=46,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:39083656_T_C:39083656:1,3,0,1
chr2	39083670	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=163,156;MMQ=44,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:39083656_T_C:39083656:0,3,0,1
chr2	39083672	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=163,156;MMQ=44,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:39083656_T_C:39083656:0,3,0,1
chr2	39090696	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr2	39095428	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:1,11,0,2
chr2	39117117	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,4:4,6:4,5,4,6
chr2	39156309	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0,13,0,2
chr2	39162832	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:5,2,4,0
chr2	39187519	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	39198966	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=200.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,29:0,25:0,0,39,15
chr2	39201073	.	CTA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr2	39213083	.	C	T	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,3:0.037:104:56,3:45,0:48,53,2,1
chr2	39214821	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	39224351	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr2	39224615	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	39233500	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,17,2
chr2	39239572	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	39240584	.	TA	T,TAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26,30;MFRL=150,121,188;MMQ=60,60,60;MPOS=15,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.06,6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,5:0.157,0.207:25:8,0,3:8,4,1:14,2,6,3
chr2	39251375	.	T	TCAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAC;STR;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	39262296	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:13,3:10,0:20,3,3,0
chr2	39281730	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,18,0
chr2	39405856	.	C	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,56;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,2:0.044:65:31,0:31,2:30,33,2,0
chr2	39411882	.	T	TACTTATATAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39411882_T_TACTTATATAC:39411882:0,1,0,1
chr2	39411887	.	G	GTGTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39411882_T_TACTTATATAC:39411882:0,1,0,1
chr2	39411891	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39411882_T_TACTTATATAC:39411882:0,1,0,1
chr2	39414956	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=125,217;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr2	39440727	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	39479122	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	39494469	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	39499366	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:8,5:4,2:11,1,7,0
chr2	39514136	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	39514204	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	39526842	.	A	C	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=315.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,40:0,44:0,0,73,13
chr2	39530136	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,16:0,0,24,0
chr2	39553271	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=151.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,21:0,22:0,0,30,15
chr2	39564620	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=112.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,21:0,10:0,0,28,5
chr2	39570427	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr2	39934378	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr2	39944055	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=193,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:3,0,5,0
chr2	39993167	.	T	C	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,23:0.264:89:33,13:33,10:46,20,20,3
chr2	40006430	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40006430_A_C:40006430:0,0,0,1
chr2	40006442	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40006430_A_C:40006430:0,0,0,1
chr2	40402275	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,17,0
chr2	40402319	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:18,4:16,0:27,8,4,0
chr2	40404839	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr2	40405727	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40405727_T_C:40405727:0,3,0,1
chr2	40405734	.	C	CTGAACACCATTTTTGCATGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:40405727_T_C:40405727:0,2,0,1
chr2	40655563	.	CCACA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=199,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=CA;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr2	42174733	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:4,2:5,1:2,7,1,2
chr2	42552711	.	TTA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:3,3:2,0:0|1:42552711_TTA_T:42552711:0,5,0,3
chr2	42552742	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:42552711_TTA_T:42552711:0,0,0,3
chr2	42719912	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr2	42836516	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr2	42922888	.	AT	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,9:0.164:55:23,4:19,4:40,6,9,0
chr2	42925079	.	TTTC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=64.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr2	42931529	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr2	42935961	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr2	42935979	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,9:0,0,15,4
chr2	42936174	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:16,0:12,2:15,13,1,1
chr2	42950185	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:3,4:5,7:0,8,2,10
chr2	42994505	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr2	42996759	.	AAGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AG;STR;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr2	43015612	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	43015719	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,11,12
chr2	43015814	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,0,8
chr2	43019730	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	43452334	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=274,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	43452618	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:5,5:1,12:3,3,7,10
chr2	43458065	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.152:17:5,0:8,0:5,10,2,0
chr2	43514036	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:9,8:5,4:8,6,10,2
chr2	43625078	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.648:32:4,12:7,9:7,4,15,6
chr2	43657510	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	43735713	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=239,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	43768545	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr2	43778857	.	GAA	G,GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32,35;MFRL=162,168,185;MMQ=60,60,60;MPOS=6,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=4.18,29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,14:0.132,0.521:26:5,2,9:4,1,4:9,0,17,0
chr2	43787576	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:0,5:4,5:0,4,0,10
chr2	43793963	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:2,1:3,2:0,7,0,3
chr2	43797710	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr2	43798792	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr2	43799070	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	43800174	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	43802261	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	43805608	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,8:4,7:6,1,12,3
chr2	43813764	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,18:0.659:27:1,12:7,4:0|1:43813764_A_G:43813764:7,2,14,4
chr2	43813767	.	C	CAATTTCTG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=136,5336199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,2:0.095:29:13,0:11,2:1|0:43813764_A_G:43813764:22,5,0,2
chr2	43871983	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,4,17
chr2	43872032	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=215,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr2	43902511	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	43903066	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,16,15
chr2	43903483	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr2	43905898	.	G	GAGGTGGAGGTGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	43921489	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=104,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr2	43922421	.	CT	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.078:48:21,3:24,0:1,44,0,3
chr2	43927798	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43927798_C_CT:43927798:0,0,0,1
chr2	43927808	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43927798_C_CT:43927798:0,0,0,1
chr2	43927836	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43927836_A_G:43927836:0,0,0,1
chr2	43927837	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43927836_A_G:43927836:0,0,0,1
chr2	43937500	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,4:4,3:0,12,2,6
chr2	43939525	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr2	43947944	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=133,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr2	43947961	.	T	TCCTGAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:43947961_T_TCCTGAAC:43947961:0,3,0,1
chr2	43947964	.	T	TTGACTGACTAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:43947961_T_TCCTGAAC:43947961:0,3,0,1
chr2	43980791	.	T	A	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,3:0.043:91:41,3:47,0:0|1:43980791_T_A:43980791:48,40,3,0
chr2	43980794	.	T	G	.	.	DP=93;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,3:0.043:91:38,3:45,0:0|1:43980791_T_A:43980791:48,40,3,0
chr2	43991357	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=166.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,24:0,22:0,0,39,7
chr2	44010620	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,0:7,3:6,4,3,0
chr2	44036800	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:18,10:6,8:23,1,17,1
chr2	44051926	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,186;MMQ=48,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:4,0,3,0
chr2	44071625	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:3,2,2,1
chr2	44071639	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:2,2,1,2
chr2	44079004	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	44101214	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	44101538	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr2	44101649	.	G	GCC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=C;STR;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:5,2:3,4:0,8,0,6
chr2	44102235	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr2	44104610	.	ACT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	44115910	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=223,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44115910_AG_CA:44115910:0,1,0,1
chr2	44115914	.	GC	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=223,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44115910_AG_CA:44115910:0,1,0,1
chr2	44116836	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,0:8,4:16,3,3,1
chr2	44117578	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.358:46:19,8:9,4:2,27,0,17
chr2	44117640	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=199,178;MMQ=46,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:10,3:4,0:0,15,0,3
chr2	44123672	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr2	44123759	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:4,5:5,7:7,2,9,4
chr2	44145097	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:6,3:10,2,4,1
chr2	44145374	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:11,0:7,5:11,7,4,1
chr2	44152180	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=96,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,3:4,3:6,2,5,1
chr2	44161854	.	G	GA	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.094:51:25,2:21,2:34,13,3,1
chr2	44172444	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,6:8,2:7,5,6,2
chr2	44173422	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,5:5,1:0,5,0,6
chr2	44186431	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	44206924	.	T	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.137:46:23,5:14,0:33,7,6,0
chr2	44445604	.	GT	G,GTT	.	.	DP=155;ECNT=1;MBQ=35,34,34;MFRL=146,141,132;MMQ=60,60,60;MPOS=13,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=19.50,9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:82,18,14:0.135,0.106:114:29,13,9:49,4,2:73,9,25,7
chr2	44471313	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=153,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,2:6,1:16,1,3,0
chr2	44471326	.	CAT	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:12,3:4,0:24,1,2,1
chr2	44502788	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:12,1:3,5:6,11,2,4
chr2	44512954	.	A	AATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	44531484	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:2,7,3,4
chr2	44547705	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:11,0:7,3:0|1:44547705_T_C:44547705:7,11,0,3
chr2	44547710	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:11,0:6,3:0|1:44547705_T_C:44547705:8,11,0,3
chr2	44548613	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,24:0.439:55:17,11:13,12:0,31,1,23
chr2	44556298	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=120,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,3:5,3:1,8,2,4
chr2	44565447	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=208,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:5,0,5,0
chr2	44566521	.	ACAT	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,2:7,0:1,8,0,2
chr2	44566599	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44566599_A_G:44566599:0,1,0,1
chr2	44566602	.	T	TTGGTAGTTTGTGTCTTTCTAGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44566599_A_G:44566599:0,1,0,1
chr2	44569474	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr2	44569700	.	AAAT	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=48.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:11,7:5,7:2,15,1,13
chr2	44569739	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.449:9:0,0:4,2:0,5,0,4
chr2	44931520	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,8:7,2:1,11,3,7
chr2	44942319	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	44942384	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=120,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:3,6:6,3:7,2,9,0
chr2	44993542	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:11,5,2,0
chr2	45647043	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr2	45773816	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=61,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:2,2:2,0,4,1
chr2	45780962	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	45826526	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,6:0,4:1,1,9,1
chr2	45879217	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,14;MFRL=145,145;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:0,0:0|1:45879217_G_C:45879217:4,3,2,0
chr2	45879224	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:4,0:0,1:3,4,3,0
chr2	45879226	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=150,145;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:0,0:0|1:45879217_G_C:45879217:2,4,2,0
chr2	45879231	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=150,145;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:0,1:0|1:45879217_G_C:45879217:2,4,2,0
chr2	45879236	.	GA	CC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=145,145;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:0,0:0|1:45879217_G_C:45879217:1,4,2,0
chr2	45879610	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	46583266	.	T	TGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=13,20;MFRL=142,227;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,12;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0,2,1,0
chr2	46583268	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,0:0,0,1,2
chr2	46603671	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:7,3:7,5:7,8,7,1
chr2	46605138	.	G	GAACACATGGGTCTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:1,16,0,2
chr2	46605954	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=147,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:2,6,0,5
chr2	46739157	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=243,99;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,3:2,4:2,0,5,2
chr2	46808243	.	GGA	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,139;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,27:0.491:55:11,11:15,16:7,21,10,17
chr2	46818992	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,7:4,2:7,5,8,1
chr2	46819815	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr2	46839477	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=268.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,81:0.988:81:0,40:0,38:0,0,20,61
chr2	46839487	.	GA	G,GAA	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=17,17,19;MFRL=163,164,146;MMQ=60,60,60;MPOS=29,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.40,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:45,6,4:0.101,0.085:55:5,0,1:7,1,0:3,42,1,9
chr2	46845849	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=89.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,28,0
chr2	46851183	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,207;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,5:1,0:1,0,3,2
chr2	46988727	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,127;MMQ=56,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,2:6,6:6,4,4,4
chr2	47045267	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:7,3:8,4,3,2
chr2	47045309	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=128,159;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:9,4:6,2:0|1:47045309_C_T:47045309:9,7,2,4
chr2	47045321	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.278:23:9,3:5,3:0|1:47045309_C_T:47045309:7,10,1,5
chr2	47081092	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,145;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	47081231	.	AA	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=84,142;MMQ=53,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47081231_AA_GG:47081231:0,2,0,1
chr2	47081239	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=84,142;MMQ=53,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47081231_AA_GG:47081231:0,2,0,1
chr2	47081248	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=84,142;MMQ=53,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47081231_AA_GG:47081231:0,2,0,1
chr2	47082988	.	T	TGATGAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=148,298;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr2	47083044	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:8,0,3,0
chr2	47085398	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:0,3,0,8
chr2	47133131	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:3,10,2,0
chr2	47221693	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:0,4,1,6
chr2	47233048	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:6,1,7,0
chr2	47233749	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=256,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,2:1,8:0,1,9,1
chr2	47238631	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=206,239;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	47314048	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=180,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr2	47314052	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	47357458	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.375:33:8,6:11,6:1,20,4,8
chr2	47380203	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:3,10,0,5
chr2	47382214	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	47387989	.	CAAAA	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=24,20;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.418:15:1,1:1,4:1,7,1,6
chr2	47388765	.	CA	GG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:3,6:5,2:0|1:47388765_CA_GG:47388765:9,0,8,0
chr2	47388766	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,17:0.943:17:0,10:0,7:1|0:47388765_CA_GG:47388765:0,0,17,0
chr2	47389343	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.241:13:5,0:4,2:10,0,3,0
chr2	47600581	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:7,1:1,1:6,2,2,0
chr2	47612206	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:8,1,3,0
chr2	47694037	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:0,5,0,5
chr2	47710084	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:21,3:18,0:15,24,0,3
chr2	48018314	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.844:10:1,7:0,2:1,0,1,8
chr2	48026480	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:0|1:48026480_A_G:48026480:5,2,0,2
chr2	48026483	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,1:0|1:48026480_A_G:48026480:5,2,0,2
chr2	48030458	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	48030838	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,4,17
chr2	48032874	.	ACTAT	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=106.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.967:24:0,10:0,14:0,0,3,21
chr2	48032937	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr2	48033551	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=135.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,13:0,22:0,0,22,14
chr2	48040904	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,7:0,0,15,3
chr2	48046012	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.460:13:4,3:1,3:3,4,1,5
chr2	48573895	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr2	48586376	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=174,124;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr2	48688258	.	ATTT	A,ATT,ATTTT	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,30,31,31;MFRL=159,173,170,146;MMQ=60,60,60,60;MPOS=9,21,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.70,14.38,12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:36,4,10,11:0.071,0.172,0.178:61:21,2,3,5:12,2,6,4:35,1,24,1
chr2	48722755	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=128,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	48725610	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:6,4:7,13:9,6,12,5
chr2	48734555	.	T	TCCTG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:48734555_T_TCCTG:48734555:0,4,0,1
chr2	48734561	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:48734555_T_TCCTG:48734555:0,4,0,1
chr2	48734562	.	TAACCCC	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:48734555_T_TCCTG:48734555:0,4,0,1
chr2	48734572	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:48734555_T_TCCTG:48734555:0,3,0,1
chr2	48734575	.	AGTTAGGACACTGTCCTGTTTTC	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:48734555_T_TCCTG:48734555:0,4,0,1
chr2	48734576	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	48737113	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:16,2,0,2
chr2	48738388	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,14,0
chr2	48738687	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,0,12
chr2	48844968	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	48873512	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	48906625	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,1,16
chr2	48925746	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	48925986	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr2	48936006	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr2	48941072	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:3,3,4,1
chr2	48952701	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	49003566	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	49216284	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	49244559	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,3:8,1:7,3,3,1
chr2	49381585	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:6,0:1,2:5,3,0,2
chr2	50149358	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,2:7,2:5,15,2,2
chr2	50280338	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,0:2,6:5,0,6,0
chr2	50280583	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,0:8,4:9,8,2,2
chr2	50434759	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr2	50574038	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr2	50693504	.	AAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr2	50693725	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:50693725_T_A:50693725:0,3,0,1
chr2	50693726	.	GCT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:50693725_T_A:50693725:0,3,0,1
chr2	50693752	.	T	TGAACGTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	50758309	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,6:0,0,12,2
chr2	50758657	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	50780219	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	50858107	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,7:0,16:0,0,24,0
chr2	53990532	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:9,0,4,0
chr2	54014303	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	54024626	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,1:9,1:9,4,2,0
chr2	54042132	.	CTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=21,11;RU=T;STR;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.848:10:0,2:0,7:0,1,0,9
chr2	54081735	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:4,1:10,1:8,7,1,1
chr2	54093956	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.416:44:12,9:12,9:11,15,7,11
chr2	54115813	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr2	54117385	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr2	54125185	.	G	GA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:10,0:13,3:1,23,0,3
chr2	54131093	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,2:4,8:8,0,10,0
chr2	54133638	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,2:5,2:7,0,4,0
chr2	54159999	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=215,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr2	54163140	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:12,0,2,0
chr2	54482553	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:6,1:6,4:8,4,3,3
chr2	54482703	.	GGGGCCC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCCC;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.701:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	54483443	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=93.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,6,21
chr2	54494370	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=192.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,15:0,38:0,0,40,13
chr2	54587302	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:2,4:5,5:7,0,8,2
chr2	54839276	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.632:36:6,12:7,11:10,3,12,11
chr2	54844911	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr2	54855137	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	54893237	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:7,6:2,8:0,9,2,12
chr2	55077061	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	55122589	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=70685401,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,4:1,5:0,2,0,9
chr2	55138272	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,3:5,7:0,10,0,10
chr2	55155672	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr2	55155957	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,5:3,5:0,4,0,10
chr2	55176112	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,9:0,0,5,14
chr2	55181079	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:4,2,5,0
chr2	55181351	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=104,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,7:0,5:0,1,3,11
chr2	55181382	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr2	55186229	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr2	55200938	.	C	CAGTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGTT;STR;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,7:4,6:5,3,6,8
chr2	55201038	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr2	55214618	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,16,5
chr2	55214912	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0|1:55214912_C_G:55214912:0,0,0,7
chr2	55214921	.	A	ACTGGTATTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:55214912_C_G:55214912:0,4,0,1
chr2	55214926	.	GT	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:55214912_C_G:55214912:0,4,0,1
chr2	55404925	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=210,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,2,3
chr2	55407935	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr2	55433576	.	G	GTTCAACCATTGTGGAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	55436488	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.674:25:4,6:2,10:6,2,15,2
chr2	55436934	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,0:3,5:1,4,3,2
chr2	55439916	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,1:10,2:11,7,1,2
chr2	55439963	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,2,15
chr2	55449318	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:7,0,6,0
chr2	55460605	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:4,5:8,2:2,10,1,6
chr2	55461369	.	TA	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.068:70:35,2:28,2:16,50,0,4
chr2	55463694	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,6,0
chr2	55471382	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:8,7:18,5:2,24,2,10
chr2	55471407	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,0,23
chr2	55473386	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:0,7:5,4:5,0,10,1
chr2	55473681	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	55489629	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=180,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:1,3,0,3
chr2	55490687	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=203,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	55518742	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,2:0,0,7,0
chr2	55523309	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	55527108	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	55528257	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr2	55544670	.	T	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,3:0.052:75:41,3:28,0:49,23,3,0
chr2	55566531	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	55566538	.	CTATT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	55576634	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,16,6
chr2	55582684	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr2	55589364	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,22,0
chr2	55589434	.	T	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=173.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,24:0,26:0,0,29,22
chr2	55591017	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,255;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,0:0,4:3,1,4,0
chr2	55646286	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0,9,0,2
chr2	55747471	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=117,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr2	55751005	.	CC	AA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,122;MMQ=60,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:0,16,0,3
chr2	55760940	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr2	55764754	.	AATATGAATAC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:4,2:9,7:2,14,0,9
chr2	55765882	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=151,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.228:29:9,2:9,1:19,3,4,3
chr2	55765906	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.122:47:11,1:20,1:15,25,7,0
chr2	55771050	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,32:0.484:66:22,14:12,17:26,8,27,5
chr2	55795557	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:3,3:1,4:0,4,1,7
chr2	55813754	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,44689518;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:15,0:18,2:26,9,2,0
chr2	55844433	.	T	TTGA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:9,0:15,2:2,29,1,1
chr2	55844445	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,2:9,6:1,17,0,8
chr2	55863360	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr2	55867845	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:0,4,1,8
chr2	55873301	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,6:3,3:9,0,7,2
chr2	55883509	.	T	TA	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.187:33:12,2:13,4:1,26,0,6
chr2	55887176	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:2,8:5,6:7,0,14,0
chr2	55889062	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=200.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,36:0,23:0,0,44,15
chr2	55894247	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:2,5,1,3
chr2	55899228	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=112.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,11:0,22:0,0,4,29
chr2	55900231	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,18;MFRL=209,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:0,0:0,0:0,3,0,2
chr2	55914942	.	CAACCCACCCACT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=164,252;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	56102260	.	G	GAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=201,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:4,1:4,2:0,8,0,4
chr2	56149475	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:6,1,5,3
chr2	56216052	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr2	56599673	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=154,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr2	56603118	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,5:3,5:1,7,2,8
chr2	58381785	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:4,9:3,4:7,0,13,0
chr2	58392789	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,7:2,0:3,0,7,0
chr2	58392797	.	TTTA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,7:2,0:3,0,7,0
chr2	58453843	.	GA	G,GAA,GAAA	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=33,33,34,33;MFRL=151,159,148,117;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,22,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,11,13,14;RU=A;STR;TLOD=8.00,34.35,6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:30,8,18,6:0.112,0.301,0.103:62:13,2,9,5:15,6,8,0:27,3,28,4
chr2	59482217	.	T	TGACTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=146,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTC;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	60768978	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=244.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,33:0,35:0,0,59,10
chr2	60773035	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=236,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,3,1
chr2	60997770	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	61007782	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:6,6:7,5:11,2,9,2
chr2	61009909	.	C	T	.	.	DP=149;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=200.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,73:0.521:142:26,32:32,40:21,48,25,48
chr2	61009938	.	AT	A,ATT	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=30,31,16;MFRL=147,168,90;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=9.81,3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,9,7:0.157,0.110:55:12,4,1:11,4,2:3,36,3,13
chr2	61010463	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	61020926	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,2:16,1:3,26,0,3
chr2	61021349	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:6,7:5,4:1,11,0,11
chr2	61118739	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:5,5:6,2:12,0,7,0
chr2	61121492	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=128.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,22:0,14:0,0,31,5
chr2	61128268	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:6,6:3,2:2,9,1,8
chr2	61128285	.	CTTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=17,21;MFRL=160,133;MMQ=55,42;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=23,19;RU=T;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:0,0:1,1:0,6,0,2
chr2	61145498	.	AT	A,ATT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,31,29;MFRL=175,167,219;MMQ=60,60,60;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.67,7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,5,5:0.172,0.192:28:12,2,3:5,2,1:6,12,2,8
chr2	61147617	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:15,3:17,1:31,1,4,0
chr2	61182228	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=169,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,1:2,7,0,2
chr2	61187509	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,16;MFRL=202,0;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:3,1,1,0
chr2	61235855	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,6:3,2:5,1,5,3
chr2	61258832	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:3,6:5,1:5,3,5,3
chr2	61300556	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:14,3:8,1:23,1,3,1
chr2	61304002	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr2	61304377	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr2	61308517	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,24,0
chr2	61308569	.	ATT	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.150:36:15,4:12,1:28,3,4,1
chr2	61315638	.	GTA	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.142:39:17,0:17,5:3,31,0,5
chr2	61385100	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,23:0.923:24:1,13:0,7:0|1:61385100_G_A:61385100:0,1,3,20
chr2	61385105	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,20:0.913:21:1,11:0,7:0|1:61385100_G_A:61385100:0,1,3,17
chr2	61389799	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	61389811	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:61389811_T_A:61389811:1,3,0,1
chr2	61389812	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:61389811_T_A:61389811:1,3,0,1
chr2	61412559	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0,0,12,0
chr2	61413723	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.880:23:1,9:1,11:1,1,7,14
chr2	61415073	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=145,124;MMQ=52,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:22,0:18,3:0|1:61415073_A_C:61415073:13,28,0,3
chr2	61415076	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,124;MMQ=52,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:24,0:16,3:0|1:61415073_A_C:61415073:14,29,0,3
chr2	61417617	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=148.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,21:0,19:0,0,34,7
chr2	61449881	.	GGATGC	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:19,3:12,0:0,31,0,3
chr2	61454318	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=117,141;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,8:0.113:56:23,1:21,6:0|1:61454318_T_C:61454318:17,31,2,6
chr2	61454321	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=117,141;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,8:0.111:57:25,0:21,5:0|1:61454318_T_C:61454318:18,31,2,6
chr2	61456592	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=119,166;MMQ=48,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	61462928	.	GA	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:11,3:31,1:40,7,4,1
chr2	61522123	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=220.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,33:0,33:0,0,40,26
chr2	61538602	.	G	GAAAAGAGAAAGAAAAAGAAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,1:0,3:0,0,8,2
chr2	61552411	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:3,2:8,1,3,0
chr2	61566823	.	AG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:7,0:7,0:0|1:61566823_AG_A:61566823:6,16,0,5
chr2	61566825	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:10,0:11,0:0|1:61566823_AG_A:61566823:6,16,0,5
chr2	61576517	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	61577667	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:7,1:4,2:11,1,2,1
chr2	61610566	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=165,180;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:17,0:12,2:0|1:61610566_A_G:61610566:0,33,0,2
chr2	61610571	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:18,0:9,3:0|1:61610566_A_G:61610566:0,28,0,3
chr2	61610577	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=170,180;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:20,0:11,2:0|1:61610566_A_G:61610566:0,31,0,2
chr2	61622251	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=236.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,34:0,34:0,0,62,6
chr2	61622374	.	TA	T,TAA	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=131,147,152;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=12.49,10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:49,11,10:0.149,0.139:70:20,3,5:25,8,4:7,42,5,16
chr2	61709477	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:6,2:12,0:17,6,2,0
chr2	61709747	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,4:1,0:0,1,0,5
chr2	61713154	.	AAAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,0:1,4:0,4,0,4
chr2	61715958	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=169,152;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:4,2:0,16,0,2
chr2	61715975	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=195,152;MMQ=60,35;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0,12,0,2
chr2	61715993	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=214,173;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:0|1:61715993_C_T:61715993:0,7,0,2
chr2	61715996	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=214,173;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:0|1:61715993_C_T:61715993:0,7,0,2
chr2	61722519	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=107,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.734:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	61726050	.	TA	T,TAA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,31,30;MFRL=150,155,181;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.44,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,6,6:0.132,0.158:37:15,2,2:9,4,4:7,18,3,9
chr2	61729258	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=40,32;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=112.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,27:0.903:29:2,11:0,15:0|1:61729258_A_G:61729258:0,2,6,21
chr2	61729268	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=108.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,7:0,17:0|1:61729258_A_G:61729258:0,0,8,17
chr2	61749690	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,17,1
chr2	61749716	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=116.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,18:0,0,24,11
chr2	62053727	.	C	CCTTTTTTTTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:8,0:12,2:0|1:62053727_C_CCTTTTTTTTT:62053727:2,18,0,2
chr2	62053728	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:8,0:12,2:0|1:62053727_C_CCTTTTTTTTT:62053727:2,18,0,2
chr2	62063093	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=29,28,29,30;MFRL=139,153,156,132;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,20,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,15,16,18;RU=A;STR;TLOD=9.67,49.24,5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,10,29,7:0.148,0.478,0.117:61:11,4,20,3:2,6,9,2:11,4,40,6
chr2	62063341	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,7:0,0,0,17
chr2	62065615	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:2,1:10,2:9,3,3,0
chr2	62066927	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr2	62081217	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr2	62104660	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:5,0:4,3:1,14,1,2
chr2	62107376	.	T	TC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=73.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,19,1
chr2	62110551	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=129,129;MMQ=40,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.727:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr2	62112221	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=27766226,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,5:0,1:0,1,1,7
chr2	62112222	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,2:0,0,1,9
chr2	62449597	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=150,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,0:12,3:11,16,3,0
chr2	62729747	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:5,2,3,2
chr2	63182611	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.522:25:3,8:7,5:12,0,12,1
chr2	63182633	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=168,84;MMQ=60,38;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:12,0:9,1:0|1:63182633_C_A:63182633:33,4,2,0
chr2	63182635	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=33,16;MFRL=167,84;MMQ=60,38;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:18,0:17,0:0|1:63182633_C_A:63182633:36,4,2,0
chr2	63182644	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=168,84;MMQ=60,38;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:14,0:14,1:0|1:63182633_C_A:63182633:36,5,2,0
chr2	63281340	.	ACT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=158,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63281340_ACT_A:63281340:0,1,0,1
chr2	63281345	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=158,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63281340_ACT_A:63281340:0,1,0,1
chr2	63281348	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=158,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63281340_ACT_A:63281340:0,1,0,1
chr2	63380809	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	63401973	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:7,12:3,6:2,8,3,15
chr2	63486429	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=56,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.686:10:2,3:0,4:2,1,4,3
chr2	63540523	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:3,3:3,3:0,7,0,6
chr2	63609017	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,6:4,4:8,3,9,2
chr2	63609323	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63609323_G_T:63609323:0,1,0,1
chr2	63609326	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63609323_G_T:63609323:0,1,0,1
chr2	63665145	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:0,11,0,3
chr2	64085114	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,5:3,4:0,7,1,8
chr2	64113719	.	T	TGCCAATCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	64139798	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=138,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,5:0.058:88:32,2:48,2:27,56,1,4
chr2	64139834	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.459:48:8,9:18,13:4,22,1,21
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chr2	64202251	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=171,148;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:1,0:0,8,0,2
chr2	64331815	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.506:6:1,2:1,1:2,1,3,0
chr2	64682637	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,4:8,0:11,7,0,4
chr2	64683338	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=144,123;MMQ=60,21;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,3:6,0:0|1:64683338_G_A:64683338:9,2,3,0
chr2	64683344	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=133,123;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.219:16:6,3:7,0:0|1:64683338_G_A:64683338:11,2,3,0
chr2	64796847	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:7,5:5,0:0,12,2,4
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chr2	65217391	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:8,4:3,5:0,11,0,9
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chr2	65298646	.	GAAC	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAC;STR;TLOD=57.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.568:28:7,5:5,11:5,7,10,6
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chr2	65481008	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,4:8,5:1,15,0,9
chr2	65488538	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.497:30:3,8:12,6:4,11,2,13
chr2	65495887	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,154;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.515:37:6,13:11,6:7,11,2,17
chr2	65559027	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	65561269	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:6,1,2,0
chr2	65604914	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	65659048	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=113,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr2	65659050	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,1:0,0,3,0
chr2	66662875	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=24,23;RU=T;STR;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	66665146	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	66667186	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,202;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,1:0,0:0,0,0,3
chr2	66739337	.	G	C	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,6:0.081:83:35,4:42,2:42,35,4,2
chr2	66798282	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	67637196	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=104.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,6,25
chr2	67637256	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=175,136;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,0:5,3:0,17,0,3
chr2	68269960	.	CGGGGGGG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=160,217;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=19,12;RU=G;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.285:5:3,1:1,0:0|1:68269960_CGGGGGGG_C:68269960:4,0,1,0
chr2	68269974	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.519:2:1,1:0,0:0|1:68269960_CGGGGGGG_C:68269960:1,0,1,0
chr2	68274510	.	CA	C,CAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,34,34;MFRL=198,237,203;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.42,6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,5:0.152,0.243:21:3,2,3:10,1,2:0,13,1,7
chr2	68415563	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.270:12:1,2:6,1:9,0,2,1
chr2	68444143	.	TAC	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:12,7:16,1:30,0,8,0
chr2	68479204	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:12,2:16,7,2,0
chr2	68511527	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:4,0:6,1,2,0
chr2	68546304	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	68592584	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.492:23:3,5:6,5:2,10,3,8
chr2	68615438	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr2	68620463	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,5:7,2:0,10,0,7
chr2	68772281	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=187,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,3:1,4:5,0,5,2
chr2	69009304	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr2	69043539	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr2	69045158	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,12:0,0,4,15
chr2	69201894	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,7:0,0,2,12
chr2	69298817	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.442:41:14,7:9,11:15,8,15,3
chr2	69317925	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,2,2
chr2	69318129	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	69330118	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=71,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:1,2,0,5
chr2	69351621	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:7,0,2,0
chr2	69409029	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=108.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,10,22
chr2	69420546	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:14,0:8,4:7,15,2,2
chr2	69420591	.	T	TCA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=166,170;MMQ=50,51;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CA;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,1:0,2,0,4
chr2	69420596	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr2	69646584	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:8,0:22,2:28,2,1,1
chr2	69703181	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:69703181_C_A:69703181:0,3,0,1
chr2	69703184	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:69703181_C_A:69703181:0,3,0,1
chr2	69703188	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:69703181_C_A:69703181:0,2,0,1
chr2	69703194	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=260,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:69703181_C_A:69703181:0,1,0,2
chr2	69703196	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:69703181_C_A:69703181:0,2,0,1
chr2	69741753	.	CTGT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=71,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGT;STR;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:2,6:0,4:1,1,9,3
chr2	69771484	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	70031797	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:4,3:6,1:1,10,1,3
chr2	70033711	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr2	70066571	.	CT	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.101:62:22,4:27,2:44,12,5,1
chr2	70068258	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr2	70076954	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:6,4:12,3:0,18,0,7
chr2	70096862	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,6:3,0:3,2,5,1
chr2	70098808	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr2	70121197	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,17:0.282:62:21,8:22,9:15,30,3,14
chr2	70131320	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.421:22:7,6:5,3:12,1,8,1
chr2	70162638	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,1:7,1:1,18,0,2
chr2	70164034	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=256,302;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	70164551	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:70164551_TG_T:70164551:0,4,0,1
chr2	70164553	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:70164551_TG_T:70164551:0,4,0,1
chr2	70164556	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:70164551_TG_T:70164551:0,4,0,1
chr2	70164580	.	C	CAGGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGGG;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.690:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	70188384	.	GCCTCTCCTCT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=163,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:70188384_GCCTCTCCTCT_G:70188384:2,3,1,1
chr2	70188398	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=165,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:70188384_GCCTCTCCTCT_G:70188384:2,4,1,1
chr2	70189331	.	GACAC	G,GAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=17,32,35;MFRL=178,146,206;MMQ=40,60,60;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=AC;STR;TLOD=9.64,4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.476,0.323:7:0,1,1:0,2,1:0,1,2,4
chr2	70316366	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	70377758	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70377758_C_T:70377758:0,0,0,1
chr2	70377760	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70377758_C_T:70377758:0,0,0,1
chr2	70377763	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70377758_C_T:70377758:0,0,0,1
chr2	70377765	.	AG	TT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70377758_C_T:70377758:0,0,0,1
chr2	70486407	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:2,5:4,1:6,0,7,0
chr2	70486475	.	G	GT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.464:35:9,13:10,3:15,4,10,6
chr2	70502811	.	T	TTCTG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,2:4,6:0,10,0,8
chr2	70520846	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,4:4,2:1,10,0,6
chr2	70520875	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:0,10,0,4
chr2	70529242	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=209,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,0,4
chr2	70890787	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,1:11,1:7,19,1,1
chr2	70901785	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:9,4:3,1:0|1:70901785_A_G:70901785:9,4,3,2
chr2	70901788	.	GGT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:9,4:3,1:0|1:70901785_A_G:70901785:9,4,3,2
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chr2	71058811	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,1:6,4:7,3,2,3
chr2	71058835	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.863:20:0,8:2,9:0,2,13,5
chr2	71060733	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	71062833	.	G	GC	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=133.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,16:0,21:0,0,19,19
chr2	71148227	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.190:40:19,1:14,6:20,13,3,4
chr2	71160421	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,1:4,2:1,5,0,3
chr2	71162996	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	71163225	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.298:25:5,3:10,4:1,17,1,6
chr2	71170830	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr2	71185391	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr2	71185577	.	G	GTGTAGTGTGCTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	71190102	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=219,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	71190384	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:2,5,0,2
chr2	71191777	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=230,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	71205976	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:8,10:7,3:0,15,0,13
chr2	71209852	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71209852_G_GT:71209852:0,0,0,1
chr2	71209853	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71209852_G_GT:71209852:0,0,0,1
chr2	71209856	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71209852_G_GT:71209852:0,0,0,1
chr2	71217048	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=225,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:71217048_T_C:71217048:0,1,0,1
chr2	71217055	.	GA	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71217048_T_C:71217048:0,0,0,1
chr2	71217059	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71217048_T_C:71217048:0,0,0,1
chr2	71219049	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,1:11,1:6,11,0,2
chr2	71221962	.	ACCG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCG;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:19,0:9,2:0,29,0,2
chr2	71304821	.	G	GTAACTCATGAAGAGCTGGCTGTGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr2	71305359	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:0,1:3,3:3,0,4,1
chr2	71357417	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.379:41:6,8:14,7:6,20,6,9
chr2	71360723	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=152,174;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=110.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,31:0.552:56:11,17:14,14:0|1:71360723_A_G:71360723:0,25,0,31
chr2	71360735	.	T	TTCC	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,176;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCC;STR;TLOD=94.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,25:0.578:43:6,11:12,10:0|1:71360723_A_G:71360723:0,18,0,25
chr2	71368512	.	G	GAAACA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,1:17,0:0|1:71368512_G_GAAACA:71368512:1,27,0,2
chr2	71368514	.	A	AAAGTGCAGGTAG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,1:16,0:0|1:71368512_G_GAAACA:71368512:1,27,0,2
chr2	71415515	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=13,13;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:0,0:1,0:0|1:71415515_T_C:71415515:2,1,1,0
chr2	71415517	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=10,9;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:1,0:0|1:71415515_T_C:71415515:2,1,1,0
chr2	71415521	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:71415515_T_C:71415515:3,1,1,0
chr2	71415526	.	AT	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,34;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:71415515_T_C:71415515:2,0,1,0
chr2	71415533	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,0;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:71415515_T_C:71415515:2,1,1,0
chr2	71417065	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=97,144;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:0,2:7,2:3,4,1,4
chr2	71417087	.	TC	AA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=125,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:5,0:6,2:4,7,1,1
chr2	71417134	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=125,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:2,7:7,6:4,5,6,7
chr2	71429793	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:0,5,0,6
chr2	71607539	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:5,7:5,10:8,2,9,8
chr2	71620818	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=188,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:2,3:0,1:0,3,0,4
chr2	71627539	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=117.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,39:0.628:62:11,22:11,17:23,0,36,3
chr2	71631014	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=127,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:33,2:26,1:37,24,2,1
chr2	71633389	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.513:29:11,3:3,11:3,11,4,11
chr2	71633417	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:10,5:4,9:0,14,0,14
chr2	71635931	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.364:42:15,9:12,6:13,14,4,11
chr2	71645828	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,5:8,3:4,9,1,7
chr2	71645890	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=176,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr2	71651939	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:2,5:8,6:0,11,0,11
chr2	71658627	.	AG	CA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=168,170;MMQ=60,32;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:16,1:8,1:0,24,0,2
chr2	71661855	.	C	CA	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=86.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,34:0.433:79:26,12:18,22:35,10,26,8
chr2	71747235	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,4:6,4:9,5,7,1
chr2	71747432	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	71747851	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr2	71747899	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	71762310	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,1:1,4:1,5,4,1
chr2	71791169	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=17,12;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.391:11:2,0:1,0:5,2,4,0
chr2	71791172	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.317:14:3,1:1,0:8,2,4,0
chr2	71791175	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.368:14:4,2:2,0:7,2,5,0
chr2	71791181	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,10;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:10,0:5,0:13,2,3,0
chr2	71796865	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	71829821	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr2	71847843	.	G	GATGATGATTGAGGAGAGAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71847843_G_GATGATGATTGAGGAGAGAGA:71847843:0,0,0,1
chr2	71847847	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=222,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71847843_G_GATGATGATTGAGGAGAGAGA:71847843:0,1,0,1
chr2	71871039	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr2	71871236	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=87.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,5,22
chr2	71891361	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr2	71896950	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:71896950_C_T:71896950:0,4,0,1
chr2	71896952	.	T	TACTAAAAACACAAAATTAGCTGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:71896950_C_T:71896950:0,4,0,1
chr2	71896955	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:71896950_C_T:71896950:0,3,0,1
chr2	71901286	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,13,2
chr2	71906171	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr2	71909822	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.658:15:2,6:2,4:0,5,3,7
chr2	71913637	.	T	TTGAACATTGGACTCCAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr2	72692272	.	A	AAG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=96.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,16:0,8:0,0,20,4
chr2	72727071	.	C	G	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,8:0.096:91:36,6:46,2:35,48,4,4
chr2	72741728	.	TAA	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,173;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.389:17:5,1:6,5:11,0,6,0
chr2	72741734	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,29:0.871:34:2,13:3,16:5,0,27,2
chr2	72742083	.	GACACAC	G,GACAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,29,34;MFRL=148,210,192;MMQ=60,60,60;MPOS=14,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=AC;STR;TLOD=6.50,18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,6:0.230,0.554:10:0,0,3:1,2,3:2,0,8,0
chr2	72742258	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,0:5,2:2,11,0,2
chr2	72742355	.	A	AATTAATAGCCTACCAACCAATAAAAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	72958022	.	T	TAAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	73114673	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	73118625	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:10,1:6,14,0,2
chr2	73195491	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=21,25;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.360:6:1,0:1,1:0|1:73195491_CAT_C:73195491:4,0,2,0
chr2	73195497	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,21;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:2,0:1,2:0|1:73195491_CAT_C:73195491:3,0,2,0
chr2	73195502	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,11;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:1,0:1,0:0|1:73195491_CAT_C:73195491:3,0,2,0
chr2	73195508	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=105,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:73195491_CAT_C:73195491:0,2,1,0
chr2	73228800	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=79,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,0:5,3:0|1:73228800_G_T:73228800:0,6,0,3
chr2	73228805	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=79,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,0:4,3:0|1:73228800_G_T:73228800:0,6,0,3
chr2	73339430	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr2	73435786	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=177,72;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr2	73447736	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:1,3:2,1:3,1,4,0
chr2	73447775	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,6:6,4:7,3,8,2
chr2	73448357	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:7,0:10,5,3,0
chr2	73450139	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:11,9:4,7:10,5,12,4
chr2	73455747	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,1:1,7:1,2,1,7
chr2	73460293	.	AGGGCC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGCC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	73461483	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:5,6:5,7:4,7,3,10
chr2	73467676	.	GAA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:9,10:7,4:8,9,4,10
chr2	73471653	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.669:19:4,5:2,8:5,1,12,1
chr2	73477351	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.648:9:1,2:1,3:1,2,6,0
chr2	73490392	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=174,92;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,2:1,3:3,0,1,4
chr2	73490412	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=132,68;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:1,2:0,3,1,2
chr2	73491618	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:1,10,0,2
chr2	73491683	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr2	73493624	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,1:9,1:4,13,0,2
chr2	73613031	.	TGGAGGA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=GGA;STR;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.881:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	73613341	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr2	73649928	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr2	73679487	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,1:13,1:17,3,2,0
chr2	73717769	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.557:25:5,9:6,5:3,8,6,8
chr2	73761881	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,17,1
chr2	73777400	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.459:35:9,4:10,12:9,10,10,6
chr2	73786304	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.081:59:22,2:32,2:0|1:73786304_C_G:73786304:19,36,2,2
chr2	73786305	.	T	TG	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.081:59:22,2:32,2:0|1:73786304_C_G:73786304:19,36,2,2
chr2	73786306	.	T	TGTGTGTGTC	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.082:59:22,2:33,2:0|1:73786304_C_G:73786304:19,36,2,2
chr2	73868689	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:8,1:4,14,0,2
chr2	73957227	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:0,3,0,5
chr2	73994074	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr2	74087290	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,5:4,8:3,6,2,11
chr2	74089266	.	GA	G,GAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=134,146,120;MMQ=60,60,60;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=10.16,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,6,5:0.271,0.206:23:7,2,0:2,3,3:9,3,9,2
chr2	74128361	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,3,0
chr2	74128369	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,3,0
chr2	74128391	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	74128433	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,9,1
chr2	74128678	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	74129474	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,19,4
chr2	74129664	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,6,9
chr2	74129712	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=70.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,16,4
chr2	74129895	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr2	74135380	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr2	74135732	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	74135797	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,5:0,0,11,7
chr2	74140581	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr2	74140789	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,2,15
chr2	74273383	.	T	TC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.574:17:3,3:4,7:5,2,8,2
chr2	74327453	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	74328500	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.194:18:4,0:9,0:0|1:74328500_A_C:74328500:8,7,3,0
chr2	74328504	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.205:17:6,0:8,0:0|1:74328500_A_C:74328500:7,7,3,0
chr2	74450155	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=177,217;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:74450155_A_G:74450155:0,4,0,1
chr2	74450160	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=177,217;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:74450155_A_G:74450155:0,4,0,1
chr2	74450162	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=177,217;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:74450155_A_G:74450155:0,4,0,1
chr2	74450168	.	ACT	GTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=188,217;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:74450155_A_G:74450155:0,4,0,1
chr2	74481884	.	G	GGCTACCAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=127,239;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr2	74481904	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=246,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74481904_G_A:74481904:0,1,0,1
chr2	74481905	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=246,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74481904_G_A:74481904:0,1,0,1
chr2	74481907	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=246,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74481904_G_A:74481904:0,1,0,1
chr2	74482892	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,5:5,4:6,1,7,2
chr2	74589931	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	74596708	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74596708_T_C:74596708:0,0,0,1
chr2	74596712	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74596708_T_C:74596708:0,0,0,1
chr2	74596718	.	C	CGGCTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74596708_T_C:74596708:0,0,0,1
chr2	74597503	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:5,5,2,0
chr2	74601371	.	G	GCCCCCCCCCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,15;RU=C;STR;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,2:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCCC:74601371:1,0,4,0
chr2	74601377	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.829:4:0,1:0,2:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCCC:74601371:0,0,4,0
chr2	74601383	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,1:1,1:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCCC:74601371:2,0,3,0
chr2	74604936	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.279:5:2,0:1,1:0|1:74604936_GC_G:74604936:0,4,0,1
chr2	74604939	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:74604936_GC_G:74604936:0,4,0,1
chr2	74604947	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:74604936_GC_G:74604936:0,4,0,1
chr2	74649920	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,149;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.747:6:0,2:1,1:0|1:74649920_C_CA:74649920:0,1,3,2
chr2	74649921	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=166,149;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.747:6:0,3:1,2:0|1:74649920_C_CA:74649920:0,1,3,2
chr2	74683299	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,123;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:28,3:21,0:30,19,3,0
chr2	74686505	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:24,1:5,5:19,10,4,2
chr2	74687393	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=158,173;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.195:25:13,0:5,0:2,18,5,0
chr2	74720002	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr2	74747111	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,5:5,9:6,2,9,5
chr2	74752954	.	T	TAGTCAGGAACCTATGGAAAACAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	74884611	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=151,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,2:6,2:6,1,4,0
chr2	74900495	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr2	74903065	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	75061873	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	75081606	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	75099381	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.295:21:10,1:5,4:13,2,6,0
chr2	75105798	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=212.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,30:0,30:0,0,44,17
chr2	75107367	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:4,1:4,1:7,1,4,0
chr2	75108744	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,5:2,4:2,0,9,0
chr2	75113572	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,12,10
chr2	75113657	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.653:32:7,13:3,8:7,4,14,7
chr2	75116627	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=255.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,79:0.988:79:0,38:0,38:0,0,31,48
chr2	75196679	.	C	CTCTCTGTGATGATTTAATCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=304,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	75425623	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr2	75881828	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=191,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:2,4:0,2:2,1,5,1
chr2	75882181	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.189:24:5,0:11,0:9,10,5,0
chr2	75919272	.	AATATAT	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=185,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=AT;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,0:0,1:0|1:75919272_AATATAT_A:75919272:0,2,0,1
chr2	75919294	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:75919272_AATATAT_A:75919272:0,3,0,1
chr2	75919296	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:75919272_AATATAT_A:75919272:0,3,0,1
chr2	75928300	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,6:3,4:7,1,8,2
chr2	75933830	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr2	75937888	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=143,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,3:5,0:2,4,2,1
chr2	79255426	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:2,2,0,8
chr2	79314081	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr2	79314094	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:0,3:3,2:0,3,0,6
chr2	79350448	.	C	CCGCATACCAACCTAACTCACTTGTCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	79385941	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=106,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:1,3,0,1
chr2	79385944	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:79385944_G_GA:79385944:0,2,0,1
chr2	79385945	.	G	A,GTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28,29;MFRL=77,134,185;MMQ=60,60,60;MPOS=5,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,0:0,0,1:0,1,0,2
chr2	79385947	.	G	GTCACGAAAGTCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=160,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	79385949	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:79385944_G_GA:79385944:0,2,0,1
chr2	79878664	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,1:8,4:12,1,4,1
chr2	79971536	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.183:23:8,2:11,0:12,7,4,0
chr2	80809027	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	80816472	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,140;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:25,0:27,3:38,14,0,3
chr2	80831404	.	G	GAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	80846147	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	84650856	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.441:9:1,4:4,0:0,5,0,4
chr2	84676163	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=130.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,20:0,17:0,0,4,33
chr2	84676886	.	TAAAAA	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=A;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.670:15:1,6:2,3:1,4,2,8
chr2	84744877	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,3:9,0:13,2,3,0
chr2	84755996	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	84756049	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,12,2
chr2	84756341	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	84806553	.	GCC	AAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	84822715	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	84831767	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	84834063	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,20,4
chr2	84834237	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,10:0,0,0,14
chr2	84838891	.	A	C	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,4:0.055:89:42,0:43,4:45,40,0,4
chr2	84885398	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	84896628	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,149;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:1,9,0,5
chr2	84897361	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr2	84899360	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	84908554	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,1:14,1:14,7,0,2
chr2	84912420	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,2:6,1:15,0,3,0
chr2	84937518	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.168:39:19,6:14,0:12,21,3,3
chr2	84955116	.	A	AAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,170;MMQ=59,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	85066465	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:3,1:4,1:0,10,0,2
chr2	85108252	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr2	85255107	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:14,0:17,2:15,17,0,2
chr2	85273495	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=223,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:85273495_T_G:85273495:0,1,0,1
chr2	85273497	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=223,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:85273495_T_G:85273495:0,1,0,1
chr2	85273500	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85273495_T_G:85273495:0,0,0,1
chr2	85361101	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:7,7:3,2:6,4,4,5
chr2	85510777	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	85534950	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:1,6,0,7
chr2	85550192	.	C	CCG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=187,158;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:10,3:6,0:0|1:85550192_C_CCG:85550192:0,17,0,3
chr2	85550193	.	GAA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=187,158;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:10,2:7,0:0|1:85550192_C_CCG:85550192:0,17,0,3
chr2	85552186	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=184,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	85554885	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=219,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:4,5:1,3:5,0,8,0
chr2	85570942	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=124,145;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:1,4:5,7:2,5,2,9
chr2	85571710	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,14,0
chr2	85573033	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	85576769	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:0,2:2,3:0,3,0,5
chr2	85617058	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,0:0,2:0,1,0,4
chr2	85618138	.	TCAGTGGAGC	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.540:11:1,2:2,4:0|1:85618138_TCAGTGGAGC_T:85618138:1,4,1,5
chr2	85618171	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,2:2,4:0|1:85618138_TCAGTGGAGC_T:85618138:0,4,1,6
chr2	85626454	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=252,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr2	85626469	.	A	AGTACCAGCATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=252,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:85626469_A_AGTACCAGCATG:85626469:0,2,0,1
chr2	85626473	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=252,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:85626469_A_AGTACCAGCATG:85626469:0,2,0,1
chr2	85628492	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=190,213;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,3,0
chr2	85628556	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	85661740	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,21;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	85662017	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:9,3:12,7:20,1,9,1
chr2	85662650	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:3,1,2,2
chr2	85769246	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	85778263	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	85779965	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr2	85783205	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=195,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,6,1
chr2	85788175	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	85806068	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:6,0,6,0
chr2	85806332	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=227,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,4:1,3:1,2,2,5
chr2	85807081	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=194,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.716:19:2,8:3,5:0,5,0,14
chr2	85807083	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.481:21:5,6:6,4:0,11,0,10
chr2	85808871	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:3,3:3,5:1,5,4,5
chr2	85818787	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,7:3,5:7,0,12,0
chr2	85824078	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:8,4:7,5:0|1:85824078_C_T:85824078:6,10,2,7
chr2	85824084	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:8,5:6,5:0|1:85824078_C_T:85824078:6,9,2,8
chr2	85826132	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr2	85826894	.	TCTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.430:19:4,3:7,4:4,7,3,5
chr2	85828641	.	C	CCAAGCCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	85828648	.	C	CTGTGCACCTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	85829102	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.140:31:6,0:9,1:4,23,0,4
chr2	85848747	.	CTT	C,CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20,33;MFRL=127,178,153;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.60,7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.370,0.490:8:0,2,2:1,1,2:0,1,0,7
chr2	85850755	.	A	AT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:23,0:12,3:30,6,0,3
chr2	85863344	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=131,124;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85863344_T_G:85863344:0,1,0,1
chr2	85863350	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=131,124;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85863344_T_G:85863344:0,1,0,1
chr2	85863365	.	TG	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	85866539	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	85866577	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=220,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.505:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	85890753	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,1:8,3:8,3,4,0
chr2	85890771	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,5:0,13:0,0,15,4
chr2	85893902	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85893902_T_C:85893902:0,1,0,1
chr2	85893906	.	GTCTA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:85893902_T_C:85893902:0,2,0,1
chr2	85895263	.	GGCA	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCA;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:17,2:24,2:18,24,1,3
chr2	85923191	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:85923191_G_T:85923191:1,1,0,1
chr2	85923197	.	C	CCAGATCATTTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=222,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:85923191_G_T:85923191:1,2,0,1
chr2	85981761	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr2	86075582	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:7,3:1,1:2,7,1,3
chr2	86258784	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.288:19:5,1:8,4:2,12,0,5
chr2	86259418	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,0;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:25,1:7,2:25,8,1,2
chr2	86259443	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.310:40:21,5:5,7:14,14,7,5
chr2	86266444	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:10,3,2,0
chr2	86275985	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=199,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr2	86292656	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr2	86302103	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	86305123	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=87.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,9,15
chr2	86307884	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr2	86310110	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr2	86310144	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:6,0,6,1
chr2	86315636	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,4:3,3:3,0,6,1
chr2	86316844	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	86332809	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:5,2:2,2:5,2,4,1
chr2	86334199	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:9,10:8,10:17,0,19,1
chr2	86335718	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=282.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,85:0.989:85:0,41:0,40:0,0,20,65
chr2	86344095	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,26:0.643:40:5,13:9,13:14,0,25,1
chr2	86344367	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=105.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,9:0,19:0,0,0,29
chr2	86345971	.	G	GCATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=209,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr2	86348737	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:5,1:2,0:0,7,1,3
chr2	86352010	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	86352308	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	86353088	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=183,173;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,1:2,0:0|1:86353088_CAA_C:86353088:0,10,0,2
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chr2	86355115	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=158,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:18,4:9,0:3,26,3,1
chr2	86357908	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:1,3:4,3:0,5,1,6
chr2	86359405	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:8,1,5,0
chr2	86362204	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr2	86364353	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr2	86364706	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr2	86385886	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	86389099	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,27:0.335:81:31,14:23,12:33,21,16,11
chr2	86398627	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86398627_C_G:86398627:0,0,0,1
chr2	86398628	.	T	TAGGGGGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86398627_C_G:86398627:0,0,0,1
chr2	86400703	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,165;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.576:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr2	86422416	.	T	C	.	.	DP=124;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=129.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,45:0.393:115:34,20:33,24:48,22,18,27
chr2	86437551	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr2	86440873	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	86444252	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.238:44:19,4:15,6:15,19,6,4
chr2	86478980	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	86479035	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr2	86479287	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	86491245	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr2	86509267	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,4:4,1:8,3,4,1
chr2	86509388	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,12:0,0,9,21
chr2	86678124	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr2	86678348	.	AAACAGTAGT	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=158,53536908;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,2:5,0:0|1:86678348_AAACAGTAGT_A:86678348:2,13,0,2
chr2	86678362	.	A	ACT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=158,53536908;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,1:5,0:0|1:86678348_AAACAGTAGT_A:86678348:2,13,0,2
chr2	86678367	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=156,53536908;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:4,0:0|1:86678348_AAACAGTAGT_A:86678348:2,12,0,2
chr2	86683539	.	ATT	A,ATTT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=152,153,141;MMQ=60,60,60;MPOS=27,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,20,23;RU=T;STR;TLOD=6.85,8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,8,10:0.231,0.335:29:5,4,7:4,4,2:9,2,17,1
chr2	86707504	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,2:6,5:1,11,2,5
chr2	86711086	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,2:5,1:7,2,3,0
chr2	86847534	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,66130155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:10,0:18,2:9,22,2,0
chr2	86850022	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,8:2,2:3,6,1,10
chr2	86947783	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,11,0
chr2	86992337	.	T	TAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=112.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,12:0,13:0,0,2,24
chr2	86998659	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	87015633	.	T	TGA	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=297.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,29:0,46:0,0,45,32
chr2	87073743	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.834:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	87080293	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=154,114;MMQ=39,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:16,1:17,1:0,37,0,2
chr2	87080309	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=160,112;MMQ=39,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.144:26:12,1:8,2:0,23,0,3
chr2	87085598	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	87085612	.	GTC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=123,190;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:87085612_GTC_G:87085612:0,4,0,1
chr2	87085618	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=123,190;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:87085612_GTC_G:87085612:0,4,0,1
chr2	87085620	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=123,190;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:87085612_GTC_G:87085612:0,4,0,1
chr2	87205161	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=125,170;MMQ=40,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	87808726	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,12:0,13:0,0,24,2
chr2	88396080	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=142,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:9,3:8,4:16,1,6,2
chr2	88396120	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,14:0.455:31:9,7:8,6:0|1:88396120_G_A:88396120:13,4,9,5
chr2	88396123	.	CC	GT	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,14:0.455:31:9,8:7,6:0|1:88396120_G_A:88396120:13,4,9,5
chr2	88396348	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=245,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:88396348_G_A:88396348:0,2,0,2
chr2	88396358	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,30;MFRL=245,243;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:88396348_G_A:88396348:0,2,0,1
chr2	88402760	.	CGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	88408013	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,5:6,0:5,11,3,2
chr2	88410102	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	88472925	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	88474370	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,16:0,0,4,21
chr2	88474390	.	CTG	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,1:9,1:2,14,0,2
chr2	88485392	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr2	88870632	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr2	88870648	.	A	AGAAACTCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	88882942	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:7,5:15,1:17,5,5,1
chr2	88913273	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,4:2,10:6,1,9,5
chr2	89161547	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	89196757	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:8,9:9,5:11,6,13,1
chr2	89196906	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:5,6:6,6:0,12,2,10
chr2	89246951	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,30:0.472:64:17,16:15,14:18,16,12,18
chr2	89265717	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=181,141;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:8,6:9,8:16,1,13,1
chr2	89292143	.	G	A	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,4:0.059:82:40,1:36,3:33,45,0,4
chr2	89292479	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,0:0|1:89292479_A_T:89292479:0,0,0,5
chr2	89292481	.	CAGGGGATGGGG	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=159,165;MMQ=59,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,3:0,1:0|1:89292479_A_T:89292479:0,2,0,5
chr2	89292493	.	CTGA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=159,190;MMQ=59,55;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:89292479_A_T:89292479:0,2,0,3
chr2	89292502	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=37,30;MFRL=159,190;MMQ=59,55;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:89292479_A_T:89292479:0,2,0,3
chr2	89309424	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:6,11:12,5:14,4,15,1
chr2	89326830	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,177;MMQ=49,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.542:39:9,9:7,12:7,11,9,12
chr2	89399858	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	89567950	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,208;MMQ=60,27;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89567950_G_A:89567950:0,0,1,0
chr2	89567960	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89567950_G_A:89567950:0,0,1,0
chr2	89568139	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,102;MMQ=57,21;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,9:0.162:58:17,3:30,6:25,24,6,3
chr2	89987082	.	CA	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.433:51:17,10:10,11:10,19,5,17
chr2	90077659	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	90108416	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	90108778	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,9:0,0,12,9
chr2	95542271	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=205,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr2	95542416	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=135,147;MMQ=60,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0|1:95542416_A_G:95542416:2,5,3,0
chr2	95542419	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=135,147;MMQ=60,45;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0|1:95542416_A_G:95542416:2,5,3,0
chr2	95542476	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=125,151;MMQ=60,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	95542559	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	95847040	.	TGCG	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCG;STR;TLOD=139.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,15:0,17:0,0,17,18
chr2	95940678	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	95943666	.	C	CTTCAATCCCACTGCCACT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:9,5,1,1
chr2	95945568	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,1:0,0,5,3
chr2	95947085	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr2	95947846	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:4,0:5,1:0|1:95947846_G_C:95947846:2,9,3,0
chr2	95947849	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.233:15:5,1:6,1:0|1:95947846_G_C:95947846:2,10,3,0
chr2	95952177	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr2	95963242	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	96012907	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,9:0,4:0,0,2,11
chr2	96076409	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	96078465	.	AC	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,127;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:20,3:17,0:21,16,0,3
chr2	96260979	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,172;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,7:1,8:0,1,0,16
chr2	96692007	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,120;MMQ=57,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:4,9,1,2
chr2	96698129	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240087;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	96780986	.	C	CTCCTCCTCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCTCCTCT;STR;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,7:0,2:0,0,9,2
chr2	96781986	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	96798429	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,2:6,0:1,12,0,2
chr2	96943069	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=221,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:96943069_A_C:96943069:0,3,0,1
chr2	96943075	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=230,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:96943069_A_C:96943069:0,2,0,1
chr2	96943415	.	G	GCTATCATTCCTTCCTCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=140,65;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:0|1:96943415_G_GCTATCATTCCTTCCTCT:96943415:1,4,1,1
chr2	96943416	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=140,65;MMQ=60,35;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,1:2,0:0|1:96943415_G_GCTATCATTCCTTCCTCT:96943415:1,4,1,1
chr2	96947760	.	T	TTGTGGGATTGGGTGGAAAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	96956315	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	96958933	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:4,0:0,1:1,3,0,1
chr2	96964762	.	G	GGTATTAGCTCTCCCTTACT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=117,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	96994050	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:2,1:10,2:1,14,0,3
chr2	97031876	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=178,158;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	97268023	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,0:13,2:8,16,2,0
chr2	97319534	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=226,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr2	97353725	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr2	97360079	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr2	97400324	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	97474318	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.140:31:11,1:10,1:12,15,4,0
chr2	97494379	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:16,0:7,2:9,14,1,1
chr2	97519314	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:8,9,1,1
chr2	97587023	.	G	GCATCGAAAGAGCGGGGGAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=219,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr2	97587049	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	97595109	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,11:0,0,6,23
chr2	97613658	.	CA	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=130,45;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.087:34:13,0:15,3:0|1:97613658_CA_C:97613658:4,27,2,1
chr2	97613669	.	A	AC	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=131,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.087:34:11,0:16,3:0|1:97613658_CA_C:97613658:2,29,2,1
chr2	97613671	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=134,38;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.126:31:10,1:15,3:2,25,2,2
chr2	97613674	.	G	GAC	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=134,45;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,0:17,2:0|1:97613658_CA_C:97613658:1,26,1,1
chr2	97617212	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.127:47:19,0:16,1:17,23,0,7
chr2	97617227	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=99,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=92.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.938:29:1,14:0,14:0,1,6,22
chr2	97757509	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	97784295	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,0,20
chr2	98128150	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	98128172	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=151.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,13:0,12:0|1:98128172_C_A:98128172:0,0,34,0
chr2	98128183	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=34,35;MFRL=161,163;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.315:36:12,7:12,4:25,0,11,0
chr2	98128194	.	GGT	CAC	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=164.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.974:37:0,19:0,16:0|1:98128172_C_A:98128172:0,0,36,1
chr2	98128228	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=34,31;MFRL=155,175;MMQ=25,26;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:17,2:11,2:24,4,4,0
chr2	98128234	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=30,20;MFRL=161,131;MMQ=25,23;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.223:29:13,5:10,0:20,3,3,3
chr2	98128256	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,15
chr2	98128258	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,15
chr2	98128285	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=148,159;MMQ=25,26;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,3:9,1:0,17,0,4
chr2	98128300	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=150,169;MMQ=26,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,3:6,6:0,12,0,10
chr2	98128313	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=12;MBQ=35,31;MFRL=215,169;MMQ=25,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,5:1,11:0,1,0,18
chr2	98128364	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=29,27;MFRL=252,212;MMQ=25,25;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:1,0,1,7
chr2	98128449	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=207,161;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	98128472	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=161,162;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:3,1:7,0,2,0
chr2	98128515	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=151,151;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:0|1:98128515_C_T:98128515:3,0,7,0
chr2	98128520	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=35,35;MFRL=151,151;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:0|1:98128515_C_T:98128515:4,0,6,0
chr2	98128531	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=151,150;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr2	98128574	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=158,160;MMQ=25,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,7:3,6:1,5,1,12
chr2	98129586	.	GG	AT	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=176,218;MMQ=27,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,5:0.118:49:24,2:20,3:0|1:98129586_GG_AT:98129586:44,0,5,0
chr2	98129589	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=177,218;MMQ=27,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:22,2:17,3:0|1:98129586_GG_AT:98129586:43,0,5,0
chr2	98129603	.	TAA	T	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=177,210;MMQ=27,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.217:44:20,6:14,3:31,4,9,0
chr2	98129631	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=173,194;MMQ=27,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,13:0.211:64:21,8:30,5:31,20,13,0
chr2	98129670	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=12;MBQ=34,31;MFRL=162,143;MMQ=25,25;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,7:0.109:71:30,2:33,5:36,28,7,0
chr2	98129682	.	TG	CA	.	.	DP=72;ECNT=12;MBQ=32,33;MFRL=153,155;MMQ=27,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,19:0.278:70:28,7:21,11:0|1:98129682_TG_CA:98129682:24,27,19,0
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chr2	98171807	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	98173368	.	CA	TG	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=391.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,89:0.989:89:0,34:0,50:0,0,71,18
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chr2	98353847	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	98354139	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	98355990	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
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chr2	98382886	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr2	98413781	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,11:0,0,21,6
chr2	98449796	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=189.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,27:0,29:0,0,45,11
chr2	98451036	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,33,32;MFRL=156,190,127;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.69,11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,2,8:0.080,0.297:27:11,1,5:5,1,3:9,8,9,1
chr2	98750492	.	A	AAAGGCAGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	98795873	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	98797744	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:0,6,0,6
chr2	98844575	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	98872570	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.215:18:3,1:10,3:4,10,3,1
chr2	98872662	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	98887116	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=231,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:4,0,6,1
chr2	98907089	.	GT	G,GTT	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,29,20;MFRL=142,114,120;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.46,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,10,9:0.143,0.136:57:17,4,2:10,5,4:20,18,9,10
chr2	98994309	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:0,2:2,0:0,3,0,2
chr2	98994337	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:98994337_A_G:98994337:0,2,0,1
chr2	98994342	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:98994337_A_G:98994337:0,2,0,1
chr2	99008446	.	C	CGTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=165,35;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr2	99013338	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:1,4,0,4
chr2	99152615	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=116,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:11,6:6,3:16,1,5,4
chr2	99154227	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99154227_C_T:99154227:0,0,1,0
chr2	99154229	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99154227_C_T:99154227:0,0,1,0
chr2	99160508	.	GCA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=98,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr2	99220707	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:0,4:7,8:0,7,1,11
chr2	99232873	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:10,9:12,10:15,7,13,6
chr2	99234601	.	T	A,TTAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31,32;MFRL=192,104,163;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.05,4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,3:0.498,0.205:12:2,2,1:1,3,2:3,0,7,2
chr2	99242248	.	G	T	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,8:0.091:90:37,2:42,5:56,26,7,1
chr2	99272057	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=71.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,7:0,15:0,0,1,23
chr2	99295003	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=103,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr2	99443369	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	99449342	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:11,2,2,0
chr2	99449536	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=9635187,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	99614595	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33,24;MFRL=154,168,180;MMQ=60,60,60;MPOS=28,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=12.09,5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,8,3:0.266,0.120:30:8,5,1:11,3,1:18,1,10,1
chr2	99651963	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=222,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,3:3,8:0,6,0,11
chr2	99720380	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,2:7,3:11,4,4,1
chr2	99721804	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33,35;MFRL=204,136,190;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.59,6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,4:0.243,0.351:12:4,1,3:1,2,1:5,0,7,0
chr2	99725223	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:7,0,3,0
chr2	99725479	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.537:24:6,7:5,6:1,10,2,11
chr2	99787120	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=165,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:6,6:5,1:3,9,3,4
chr2	99802820	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:8,9:3,1:0,11,0,10
chr2	99938942	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=219,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	99939031	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.429:28:5,3:11,8:16,0,11,1
chr2	99976802	.	GA	G	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,3:0.035:112:55,1:43,2:20,89,1,2
chr2	99992784	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=120,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,2:7,2:8,0,4,0
chr2	99993176	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr2	99995458	.	AT	A,ATT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=137,147,187;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=40.40,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,21,5:0.611,0.139:34:2,10,4:6,10,1:8,0,24,2
chr2	99998561	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr2	100006620	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=383,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=103.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.946:35:0,20:1,12:0,1,32,2
chr2	100006904	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.408:15:4,4:3,1:1,8,2,4
chr2	100010685	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,3:4,7:8,2,9,1
chr2	100017906	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	100019496	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,17:0,9:0,0,10,16
chr2	100019612	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	100019646	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=212,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100019646_TC_T:100019646:0,2,0,1
chr2	100019648	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=212,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100019646_TC_T:100019646:0,2,0,1
chr2	100019652	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=212,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100019646_TC_T:100019646:0,2,0,1
chr2	100021184	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,0:3,5:0,4,1,4
chr2	100022617	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr2	100022772	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:10,11:11,6:7,14,13,4
chr2	100029106	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	100050740	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.489:25:5,3:6,9:10,3,10,2
chr2	100055033	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:2,1,5,1
chr2	100068069	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr2	100081317	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=117.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,39:0.470:83:28,25:15,13:0|1:100081317_T_C:100081317:43,1,39,0
chr2	100081323	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=313.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,82:0.989:82:0,55:0,24:0|1:100081317_T_C:100081317:0,0,81,1
chr2	100081561	.	A	AAAGTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	100170706	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=211,163;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr2	100171121	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:5,7,2,0
chr2	100176775	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:7,2:4,4:7,4,6,0
chr2	100454072	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	100915629	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr2	100917109	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:2,2,4,1
chr2	100925509	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:10,1,3,0
chr2	101014363	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=101,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.462:28:7,8:8,4:7,8,8,5
chr2	101014622	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=19,32;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:101014622_C_A:101014622:0,1,0,1
chr2	101014624	.	G	GCAACCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,33;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:101014622_C_A:101014622:0,1,0,1
chr2	101031561	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:5,3:7,11:5,8,5,9
chr2	101521173	.	AT	A,ATT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,34,33;MFRL=147,110,151;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=5.95,4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,8,7:0.233,0.247:29:8,1,3:2,6,2:10,4,12,3
chr2	101541798	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=59.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,12:0,8:0,1,8,12
chr2	101564628	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=38,34;MFRL=97,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,10,0
chr2	101581246	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	101581294	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:101581294_C_CTT:101581294:0,0,1,0
chr2	101581308	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:101581294_C_CTT:101581294:0,0,1,0
chr2	101612047	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=117,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr2	101612051	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.860:5:0,2:0,1:0,0,2,3
chr2	101612362	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=200,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:101612362_C_T:101612362:0,2,0,1
chr2	101612363	.	G	GGACTGCCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=200,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:101612362_C_T:101612362:0,2,0,1
chr2	101619283	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=160.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,22:0,23:0,0,6,39
chr2	101619321	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=127.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,17:0,15:0,0,0,33
chr2	101622696	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	101624471	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,12:0,8:0,0,7,13
chr2	101627343	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=203,195;MMQ=41,43;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	101627852	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,13,1
chr2	101640086	.	GT	G,GTT	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=143,166,148;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=4.61,4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:44,4,5:0.085,0.097:53:24,3,2:17,1,3:31,13,7,2
chr2	101645856	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,187;MMQ=48,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	101650031	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:22,2:10,1:19,15,0,3
chr2	101675808	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	101767526	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=225,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:101767526_C_G:101767526:3,0,1,0
chr2	101767529	.	GCCC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=206,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:101767526_C_G:101767526:4,0,1,0
chr2	101767535	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,17;MFRL=186,219;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,0:0|1:101767526_C_G:101767526:3,0,1,0
chr2	101881539	.	C	CT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.134:27:12,0:11,3:6,18,1,2
chr2	101885656	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.193:22:7,2:11,2:8,10,2,2
chr2	101925026	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,0,22
chr2	101967346	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,9:0,0,18,5
chr2	102000210	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	102000228	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:102000228_A_G:102000228:0,4,0,1
chr2	102000230	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:102000228_A_G:102000228:0,4,0,1
chr2	102000232	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:102000228_A_G:102000228:0,4,0,1
chr2	102018878	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr2	102027050	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,1:9,2:13,1,3,0
chr2	102029548	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,2,7
chr2	102031488	.	A	AGTAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102031488_A_AGTAG:102031488:0,0,0,1
chr2	102031489	.	C	CTGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102031488_A_AGTAG:102031488:0,0,0,1
chr2	102031492	.	C	CGTGAGACAATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102031488_A_AGTAG:102031488:0,0,0,1
chr2	102440583	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,15;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:102440583_T_G:102440583:0,2,0,1
chr2	102440586	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:102440583_T_G:102440583:0,2,0,1
chr2	102440589	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=19,16;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:102440583_T_G:102440583:0,2,0,1
chr2	102440592	.	G	GTGCCT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102440583_T_G:102440583:0,1,0,1
chr2	102440594	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=17,30;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:102440583_T_G:102440583:0,1,0,1
chr2	102440595	.	A	AGGCCC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102440595_A_AGGCCC:102440595:0,1,0,1
chr2	102440596	.	A	AGGCCCCCAGGAG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:102440595_A_AGGCCC:102440595:0,1,0,1
chr2	102480188	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,0:1,2:9,0,2,0
chr2	102503507	.	T	TTTTGGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=153,178;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:1,1:3,1:5,1,2,0
chr2	102781164	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:8,2:4,0:0|1:102781164_C_T:102781164:11,1,2,0
chr2	102781166	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0|1:102781164_C_T:102781164:0,0,14,1
chr2	102785156	.	CG	C	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,10:0.139:59:12,3:16,5:0|1:102785156_CG_C:102785156:8,41,1,9
chr2	102785157	.	G	GT	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,7:0.135:56:19,1:22,5:5,44,3,4
chr2	102785158	.	G	T	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=110.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,49:0.861:59:5,23:4,22:1|0:102785156_CG_C:102785156:1,9,8,41
chr2	102788409	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr2	102792760	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	102954653	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,10:0,0,24,5
chr2	102957348	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	102965571	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.192:19:4,0:7,3:0|1:102965571_C_T:102965571:11,5,0,3
chr2	102965575	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.223:16:3,0:8,3:0|1:102965571_C_T:102965571:8,5,0,3
chr2	102967928	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,16,2
chr2	102968007	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,16:0,0,16,14
chr2	102968075	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,21:0,15:0,0,24,12
chr2	102984624	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	102992408	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.070:68:31,1:29,3:45,19,2,2
chr2	103006448	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	103010912	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=143.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,22:0,22:0,0,32,13
chr2	103039873	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=128.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,14:0,21:0,0,1,34
chr2	103040177	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:103040177_A_T:103040177:0,0,9,0
chr2	103040182	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:103040177_A_T:103040177:0,0,12,0
chr2	103040247	.	T	TG	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=199.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,47:0.980:47:0,31:0,12:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,40,7
chr2	103040249	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=199.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,47:0.980:47:0,28:0,14:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,40,7
chr2	103057892	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	103059613	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr2	103063520	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,5,2
chr2	103120226	.	A	AATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=187,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	103120232	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	103125457	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,6
chr2	103125466	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,2
chr2	103136309	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=125.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,17:0,19:0,0,28,10
chr2	103136446	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,1,16
chr2	103141447	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,5,2
chr2	103141651	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,3,14
chr2	103149162	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	103149182	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	103274010	.	T	TGTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chr2	103281540	.	G	GT,GTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,35,36;MFRL=152,169,163;MMQ=60,60,60;MPOS=28,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=16.47,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,8,2:0.509,0.165:15:2,4,2:3,4,0:5,0,10,0
chr2	103300506	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr2	103311674	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:1,2:2,2:0,3,0,5
chr2	103321113	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,3:7,0:7,11,1,2
chr2	103322496	.	C	CAATGAGAACACTTGGACACA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.355:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	103335512	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,4:7,3:3,6,3,4
chr2	103343234	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:2,7:1,4:3,0,12,0
chr2	103343275	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=90,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.423:14:1,5:4,0:4,4,5,1
chr2	103375056	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	103375071	.	GATCA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	103378581	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	103378599	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=14,18;MFRL=175,167;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.225:7:1,0:1,0:6,0,1,0
chr2	103378604	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=166,194;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:1,1:2,0:5,0,2,0
chr2	103378857	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,4:7,7:1,9,0,11
chr2	103431404	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr2	105665534	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=127,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	105705507	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:8,7:3,4:3,8,5,6
chr2	105705530	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:105705530_A_AT:105705530:3,15,1,1
chr2	105705532	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=136,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:7,0:0|1:105705530_A_AT:105705530:3,14,1,1
chr2	105705534	.	TCTTTTCTTG	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:7,0:0|1:105705530_A_AT:105705530:3,13,1,1
chr2	105710116	.	T	C	.	.	DP=134;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,4:0.039:125:59,0:62,4:42,79,0,4
chr2	105713868	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:105713868_A_G:105713868:0,0,0,3
chr2	105713877	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:105713868_A_G:105713868:0,0,0,3
chr2	105716266	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:0,3,2,4
chr2	105859940	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=93,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:11,0:6,2:5,12,1,1
chr2	105889900	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=123,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr2	105897261	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	105959592	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:1,5,0,5
chr2	105961703	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:9,0,7,0
chr2	105979730	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=182.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,25:0,28:0,0,28,26
chr2	106013216	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=87,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:3,2:3,3:1,6,0,5
chr2	106013248	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr2	106471825	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=273,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:2,0:0,1:1,1,0,3
chr2	106715342	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	106717656	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr2	106780015	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,18,0
chr2	106780055	.	C	CTG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,9:0,14:0,0,24,3
chr2	106782398	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,10:0,0,15,0
chr2	107041680	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,174;MMQ=24,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,9:0.195:49:21,5:19,4:3,37,1,8
chr2	107423395	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	107446430	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	107460474	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	108443567	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,11:0,13:0|1:108443567_G_A:108443567:0,0,6,20
chr2	108443591	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0|1:108443567_G_A:108443567:0,0,2,18
chr2	108443598	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,9:0|1:108443567_G_A:108443567:0,0,2,17
chr2	108487097	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=206,222;MMQ=22,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	108507268	.	T	C	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=270.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,82:0.988:82:0,32:0,50:0,0,20,62
chr2	108608761	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0|1:108608761_C_G:108608761:0,1,0,1
chr2	108608764	.	T	TTAAATCTAAGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:108608761_C_G:108608761:0,1,0,1
chr2	108863650	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,31:0.561:55:16,16:8,14:20,4,21,10
chr2	108868736	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=169,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr2	108910598	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=213,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	108917214	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,4,1
chr2	108921218	.	A	AGAGCAACTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	108921228	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=218,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:2,1:0,0:0|1:108921228_T_TG:108921228:0,2,0,1
chr2	108921230	.	T	TTACAATTATGTCTCTGTCAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=218,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:108921228_T_TG:108921228:0,2,0,1
chr2	108921795	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:2,4,5,1
chr2	108994808	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,4:5,2:5,2,3,3
chr2	109003761	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,6:2,1:2,3,5,2
chr2	109003977	.	G	GTCATTTTCTTCTTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=128,75862646;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	109066234	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:109066234_AT_A:109066234:0,0,0,1
chr2	109066250	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109066234_AT_A:109066234:0,0,0,1
chr2	109088535	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:8,5:12,0:2,18,0,5
chr2	109092247	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,6:0.086:77:32,3:39,3:42,29,3,3
chr2	109113642	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=172,175;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.060:47:33,0:12,2:7,38,0,2
chr2	109113654	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:30,2:7,4:3,34,0,6
chr2	109113658	.	CA	TG	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=181,165;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:30,1:10,1:3,37,0,2
chr2	109123988	.	CT	C	.	.	DP=157;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,149;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,10:0.074:121:49,5:48,4:91,20,9,1
chr2	109292280	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr2	109393522	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	109404474	.	CT	C,CTT	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=149,162,165;MMQ=60,60,60;MPOS=12,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=9.25,6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:54,7,6:0.106,0.099:67:26,4,3:23,2,3:49,5,12,1
chr2	109407894	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	109411248	.	GAATAT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATAT;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	109429146	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,12:0,12:0,0,12,12
chr2	109429434	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,136;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,1:4,1:2,11,0,2
chr2	109492544	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:17,1:9,1:25,2,2,0
chr2	109513321	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,4:0,2:0,0,8,0
chr2	109513786	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	109522720	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	109527087	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0|1:109527087_G_A:109527087:0,0,0,5
chr2	109527094	.	G	GAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:109527087_G_A:109527087:0,4,0,1
chr2	109964431	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	109988215	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	110303633	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,2:12,0:17,8,1,1
chr2	110373568	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,9;MFRL=211,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.384:13:3,0:4,0:7,1,0,5
chr2	110373574	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=211,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.385:13:4,0:3,0:7,1,0,5
chr2	110375592	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=130,61;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.484:17:4,2:2,4:6,3,7,1
chr2	110886686	.	A	AGACCAGAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,4:1,5:2,0,13,0
chr2	110905664	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:3,8:1,8:0,4,2,14
chr2	110919321	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr2	110925982	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.315:11:6,2:2,1:8,0,3,0
chr2	111397237	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr2	111399374	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=248,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111399374_T_A:111399374:0,1,0,1
chr2	111399375	.	T	TGGCCCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,32;MFRL=248,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:111399374_T_A:111399374:0,1,0,1
chr2	111417709	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=183,164;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:111417709_G_A:111417709:0,3,0,1
chr2	111417719	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=183,164;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:111417709_G_A:111417709:0,3,0,1
chr2	111417723	.	A	T,C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,29,28;MFRL=183,164,222;MMQ=40,40,40;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr2	111417728	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,26;MFRL=203,164;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:111417709_G_A:111417709:0,2,0,1
chr2	111417729	.	ACC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=203,164;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:111417709_G_A:111417709:0,2,0,1
chr2	111417730	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=183,222;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	111417733	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=203,164;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:111417709_G_A:111417709:0,2,0,1
chr2	111556743	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,2:8,0:1,9,0,2
chr2	111559246	.	A	ATGGGGATGTTGTCTGTTGTTTCCTTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.205:12:2,0:8,2:3,7,0,2
chr2	111644475	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr2	111644491	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	111721142	.	ATGTGTG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=TG;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.777:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	111806978	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=197,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111806978_C_A:111806978:0,1,0,1
chr2	111806980	.	C	CTTTGTCTTTCTGAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=197,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111806978_C_A:111806978:0,1,0,1
chr2	111851198	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr2	112545736	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=198,203;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,3:13,0:28,1,3,0
chr2	112550170	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=170,97;MMQ=45,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:5,0:20,3:1,24,0,3
chr2	112580212	.	T	TAAAAACAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=167,161;MMQ=24,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:112580212_T_TAAAAACAA:112580212:0,1,0,1
chr2	112580214	.	G	GATCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=167,161;MMQ=24,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:112580212_T_TAAAAACAA:112580212:0,1,0,1
chr2	112582523	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,142;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=83.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,32:0.550:58:10,21:15,10:16,10,24,8
chr2	112592109	.	ACAAGGT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=163,167;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,2:5,1:0|1:112592109_ACAAGGT_A:112592109:12,3,3,1
chr2	112592117	.	CCTAT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=157,167;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.209:22:7,2:8,2:0|1:112592109_ACAAGGT_A:112592109:14,4,3,1
chr2	112605465	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,5,19
chr2	112616059	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,200;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:7,7:1,5:0,8,0,13
chr2	112621498	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=13,25;MFRL=176,173;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.721:8:0,1:0,2:0,2,1,5
chr2	112625575	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=125.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,39:0.592:66:12,21:13,17:17,10,28,11
chr2	112687157	.	A	ATATTTATTTATTTATT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,8;RU=TATT;STR;TLOD=51.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.672:20:4,4:2,7:0,6,0,14
chr2	112702647	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:2,4,1,3
chr2	112705157	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,1:4,5:0,4,0,6
chr2	112705185	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=189,182;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	112725674	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=172,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.203:16:5,0:7,3:12,1,3,0
chr2	112725684	.	A	ATGTG,ATGTGTG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=131,148,172;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,9,10;RU=TG;STR;TLOD=7.65,20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,7:0.234,0.471:14:1,0,3:3,3,2:3,1,9,1
chr2	112740373	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=107,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,2:8,8:8,3,7,3
chr2	112751928	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.737:25:4,7:2,8:2,4,8,11
chr2	112754880	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,9:5,6:9,1,10,5
chr2	112754943	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=82,118;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.734:29:1,11:4,10:2,6,9,12
chr2	112755001	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:0,6,0,7
chr2	112761653	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=205,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr2	112779928	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:8,0:14,2:10,13,0,2
chr2	112813163	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=204,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:2,7:2,1:4,0,8,2
chr2	112813391	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=153.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,20:0,22:0,0,5,38
chr2	112817706	.	C	CTT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=180,144;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:8,3:6,0:0|1:112817706_C_CTT:112817706:0,14,0,3
chr2	112817707	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=183,144;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:8,3:6,0:0|1:112817706_C_CTT:112817706:0,15,0,3
chr2	112817713	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=202,155;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:5,0:0|1:112817706_C_CTT:112817706:0,16,0,2
chr2	112821880	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:0,9,0,5
chr2	112832535	.	CAAT	C	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=199.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,52:0.559:93:16,23:24,28:22,19,18,34
chr2	112847164	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:8,6:2,6:9,1,10,2
chr2	112854563	.	GT	G,GTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,33,35;MFRL=163,138,178;MMQ=60,60,60;MPOS=21,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.87,5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,6,4:0.216,0.165:27:8,4,1:9,2,2:16,1,9,1
chr2	112856165	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=112,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,34:0.671:50:7,19:9,13:9,7,18,16
chr2	112858122	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.544:26:4,7:6,7:12,0,14,0
chr2	112865517	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	112873840	.	A	AGGTATAAGTGGCTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	112945188	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	112990804	.	T	TATAAAGA	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=164.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,44:0.554:79:18,17:17,19:31,4,38,6
chr2	112991609	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=199,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:2,1:0,3:2,0,3,1
chr2	113060848	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.142:47:15,2:26,4:20,21,5,1
chr2	113074775	.	CT	C,CTT	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=32,33,32;MFRL=146,142,140;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=16.30,19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,13,15:0.258,0.360:43:8,7,4:4,2,5:13,2,20,8
chr2	113074790	.	G	T	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,14:0.164:71:31,0:12,1:30,27,14,0
chr2	113082318	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=207,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:10,1:0,14,0,2
chr2	113088520	.	TAA	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,22:0.719:30:3,11:4,10:0|1:113088520_TAA_T:113088520:8,0,17,5
chr2	113088524	.	TTTATTA	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=86.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,22:0.678:32:4,12:4,10:0|1:113088520_TAA_T:113088520:10,0,17,5
chr2	113090047	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,1:3,5:0,6,0,7
chr2	113127809	.	GA	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=138,108;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.211:19:2,3:4,1:3,12,1,3
chr2	113146885	.	T	TACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,277;MMQ=37,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	113300330	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=206,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	113305150	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,4:1,6:0,3,2,8
chr2	113308622	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=66.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,2,16
chr2	113309653	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=147,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	113310175	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=177,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	113310197	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:2,2:1,2:4,0,4,0
chr2	113315735	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:4,2:0,4:0,4,0,6
chr2	113321900	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=104,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,8:6,3:7,2,8,3
chr2	113326281	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr2	113326502	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,14:0,0,6,18
chr2	113331445	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113331445_A_T:113331445:0,2,0,1
chr2	113331447	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113331445_A_T:113331445:0,2,0,1
chr2	113331449	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113331445_A_T:113331445:0,2,0,1
chr2	113343488	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,13,2
chr2	113346512	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	113416827	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:8,1:13,4,2,0
chr2	113479745	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	113480556	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,311;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	113480938	.	G	GCACACA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=198,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=CA;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.685:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr2	113481547	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	113484319	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=145.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,25:0,21:0,0,22,25
chr2	113484353	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,12:0,15:0,0,3,28
chr2	113504204	.	C	CACCAGGAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=202,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:113504204_C_CACCAGGAAA:113504204:0,4,0,1
chr2	113504205	.	T	TGCAAATAAAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=202,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:113504204_C_CACCAGGAAA:113504204:0,4,0,1
chr2	113513504	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=126,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:12,0,8,0
chr2	113514884	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	113532885	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,5:2,7:0,4,2,10
chr2	113540205	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr2	113590467	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,1:3,1:0,3,0,3
chr2	113671303	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=267,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=134.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:1,17:0,21:1,0,34,4
chr2	113671518	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=267,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:1,8:0,8:0,1,0,16
chr2	113765644	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,2:8,0:0|1:113765644_G_T:113765644:3,16,1,1
chr2	113765649	.	C	CTTCAGAGCTGACAGCG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:113765644_G_T:113765644:2,15,1,1
chr2	113765651	.	T	TGAACCA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:113765644_G_T:113765644:2,15,1,1
chr2	113783909	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	113785727	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=38,33;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.569:5:0,0:2,3:0|1:113785727_A_G:113785727:0,2,1,2
chr2	113785734	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=193,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:113785727_A_G:113785727:0,2,0,1
chr2	113785737	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=199,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1|0:113785727_A_G:113785727:0,3,0,1
chr2	113875509	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=97,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:2,2,3,0
chr2	113875631	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,113;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:2,7:1,2:1,2,1,9
chr2	113877538	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,7:3,1:6,0,8,0
chr2	113887262	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:3,4:4,6:1,6,6,4
chr2	113887273	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=192,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:1,2,3,3
chr2	113887294	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr2	113887334	.	G	GGAAGTTCTCTGGGGATTTTGAGAGCTTTGAGTTTGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=190,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	113887338	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	113888793	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=114,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,1,4
chr2	113953336	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:8,0:11,8,1,2
chr2	113953401	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr2	113953657	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,6:2,5:8,1,10,1
chr2	113953952	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=142,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:1,2:1,1:0,2,0,4
chr2	113953973	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=124,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0|1:113953973_A_AT:113953973:0,1,1,4
chr2	113953974	.	GACA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=124,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0|1:113953973_A_AT:113953973:0,1,1,4
chr2	113955074	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,6:2,2:6,2,7,1
chr2	113977862	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	113993253	.	G	GTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=253,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr2	113999736	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:4,0:0,4:1,3,0,5
chr2	114000458	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	114004237	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	114257462	.	C	CAAGGTCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=332,151;MMQ=24,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	114258779	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,165;MMQ=25,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.381:50:14,9:17,9:24,7,12,7
chr2	114340450	.	AGAG	A	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=157,145;MMQ=22,22;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.131:49:14,2:24,4:43,0,6,0
chr2	114340469	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=145,146;MMQ=22,22;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,17:0.208:84:30,5:37,12:67,0,17,0
chr2	114340494	.	G	A	.	.	DP=146;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=134,151;MMQ=22,22;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,43:0.311:139:38,21:57,22:90,6,41,2
chr2	114340511	.	G	A	.	.	DP=203;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=141,126;MMQ=22,22;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:159,29:0.155:188:57,10:98,18:125,34,22,7
chr2	114340663	.	G	A	.	.	DP=183;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=144,147;MMQ=47,23;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,64:0.364:176:52,30:59,33:44,68,23,41
chr2	114340677	.	C	A	.	.	DP=161;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=141,143;MMQ=40,22;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,39:0.264:148:44,14:63,24:36,73,4,35
chr2	114340706	.	A	G	.	.	DP=116;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=146,170;MMQ=52,22;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,24:0.232:104:39,8:41,14:13,67,1,23
chr2	114398940	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=122,158;MMQ=40,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:8,2:16,0:7,17,1,1
chr2	114480812	.	A	AAAC	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=154.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,20:0,14:0,0,0,35
chr2	114486880	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=209,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr2	114486907	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,3:0,13:0,0,16,0
chr2	114492135	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr2	114493315	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,31:0.562:55:13,16:10,14:21,3,27,4
chr2	114493524	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr2	114500473	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:1,5,0,5
chr2	114503773	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	114513386	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=185.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,28:0,25:0,0,45,8
chr2	114689047	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:1,1:3,1:0,7,0,3
chr2	114691809	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:5,1,2,0
chr2	114713169	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,17:0.650:26:1,6:6,9:0|1:114713169_A_G:114713169:9,0,16,1
chr2	114713188	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,23:0.706:32:3,7:5,15:0|1:114713169_A_G:114713169:8,1,21,2
chr2	115919677	.	CT	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	116066984	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	116497479	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=74.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,7,15
chr2	116497528	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	116520249	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116520249_T_TC:116520249:0,1,0,1
chr2	116520250	.	G	GTTCTACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116520249_T_TC:116520249:0,1,0,1
chr2	116525794	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	116525831	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr2	116534922	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr2	116535536	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	116539846	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,11:0,4:0,0,15,1
chr2	116548820	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,23,6
chr2	116593675	.	ATG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=152,180;MMQ=52,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,5:0,4:1,0,9,0
chr2	116593695	.	GAT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=192,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AT;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,3:1,2:3,0,5,0
chr2	116599927	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	118575215	.	C	G	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=264.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,80:0.988:80:0,32:0,46:0,0,32,48
chr2	118578691	.	TA	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=9,31;MFRL=189,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=101.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.977:41:0,23:0,15:0,1,31,9
chr2	118582580	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,128;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:23,0:9,2:17,15,0,2
chr2	118582741	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,1:0,6:1,3,0,7
chr2	118582936	.	A	ATAAAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	118688754	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr2	118694393	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	118704478	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,2,17
chr2	118705570	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	118706879	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr2	118709122	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr2	118753148	.	A	ATC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	118753916	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,493;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:7,3:8,0:6,10,0,3
chr2	118766024	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	118771663	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr2	118771682	.	TGCC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GCC;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.874:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	119732042	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,11,10
chr2	119735163	.	C	CTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:0|1:119735163_C_CTG:119735163:0,5,0,1
chr2	119735165	.	C	CTGCCAGAGAACA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:0|1:119735163_C_CTG:119735163:0,5,0,1
chr2	119739142	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,0:4,0:7,4,3,0
chr2	119739150	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:3,0:7,1:10,6,3,0
chr2	119739269	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=58.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr2	119748135	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.947:14:0,8:0,5:0,0,0,14
chr2	119749477	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.647:32:5,8:6,13:2,9,4,17
chr2	119915060	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	119915074	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	119915132	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr2	120003642	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	120014985	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	120059988	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=120.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,18:0,0,29,4
chr2	120078689	.	T	C	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=183.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,59:0.573:103:28,32:15,27:42,2,54,5
chr2	120125053	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:7,0,3,1
chr2	120125058	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,2:7,0,3,1
chr2	120125363	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:7,1:7,3,0,2
chr2	120125910	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr2	120125936	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	120128482	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,1:2,3:0,4,0,4
chr2	120194651	.	A	AGTGTGC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,8:0,7:0,0,4,12
chr2	120197670	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr2	120199252	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:1,1:0|1:120199252_T_C:120199252:0,2,0,1
chr2	120199258	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:120199252_T_C:120199252:0,2,0,1
chr2	120199262	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:120199252_T_C:120199252:0,2,0,1
chr2	120199263	.	CTTA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=36,28;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:120199252_T_C:120199252:0,2,0,1
chr2	120199267	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:120199252_T_C:120199252:0,2,0,1
chr2	120209689	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr2	120209766	.	G	GAGGTTGGTGAGCAGCGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=182,265;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	120230998	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr2	120231165	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,2,14
chr2	120362407	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,11:1,12:1,0,10,15
chr2	120362897	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=98.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,3,28
chr2	120366057	.	G	GTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.691:1:0,0:0,1:0|1:120366057_G_GTTT:120366057:0,0,1,0
chr2	120366070	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.691:1:0,0:0,0:0|1:120366057_G_GTTT:120366057:0,0,1,0
chr2	120383138	.	CATT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=95,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,4:1,5:1,1,8,2
chr2	120404629	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,0:0,2:0,0,1,4
chr2	120406160	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	120414083	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr2	120635205	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.362:17:7,3:3,2:0,11,0,6
chr2	120643280	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:6,0,7,0
chr2	120689905	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=202,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:3,3:5,3:9,0,6,0
chr2	120703842	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr2	120704164	.	A	AT	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=124.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,36:0.622:58:9,11:13,23:0|1:120704164_A_AT:120704164:5,17,12,24
chr2	120704166	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,36:0.616:58:9,11:13,22:0|1:120704164_A_AT:120704164:5,17,12,24
chr2	120714401	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr2	120718322	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr2	120734737	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:3,2:1,1:0,6,0,5
chr2	120776884	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0,15,0,2
chr2	120776914	.	T	TACA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:120776914_T_TACA:120776914:0,3,0,1
chr2	120776916	.	G	GTCTCTACCCTTTTTGAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:120776914_T_TACA:120776914:0,3,0,1
chr2	120776918	.	T	TTGAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:120776914_T_TACA:120776914:0,3,0,1
chr2	120830627	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:6,7:7,4:14,0,11,0
chr2	120830815	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,21:0,23:0,0,14,31
chr2	120834549	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:9,1,4,0
chr2	120889173	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr2	120918585	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	120922536	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:4,5:1,7,0,8
chr2	121036385	.	TT	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,1,8
chr2	121043403	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,9,4
chr2	121709091	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	121712729	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	121713022	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:121713022_C_G:121713022:0,0,1,1
chr2	121713030	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:121713022_C_G:121713022:0,0,1,1
chr2	121713041	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	121726217	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=10,18;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:121726217_A_G:121726217:1,0,1,0
chr2	121726218	.	T	TGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,30;MFRL=240,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1|0:121726217_A_G:121726217:1,0,1,0
chr2	121726219	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=13,18;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:121726217_A_G:121726217:1,0,1,0
chr2	121726221	.	CC	GG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=13,10;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:121726217_A_G:121726217:1,0,1,0
chr2	121729490	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,9:0,0,17,7
chr2	121729686	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	121740190	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,6,0
chr2	121740194	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,8,0
chr2	121740505	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	121744225	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr2	121989633	.	TT	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121989633_TT_AG:121989633:0,1,0,1
chr2	121989635	.	G	GAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121989633_TT_AG:121989633:0,1,0,1
chr2	121995400	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:8,0:0|1:121995400_T_C:121995400:12,10,2,0
chr2	121995408	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,2:11,0:0|1:121995400_T_C:121995400:14,11,2,0
chr2	121995511	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=85,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,6:1,3:1,4,1,8
chr2	122004596	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	122006700	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,1:7,3:3,12,1,3
chr2	122042750	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	122104703	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,0:9,3:5,10,1,2
chr2	122139915	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:3,15,0,2
chr2	122161850	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	122273187	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,3:4,4:12,0,7,0
chr2	122283313	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	122484966	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.347:47:11,9:20,7:26,5,14,2
chr2	122484990	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,34:0.625:54:12,13:7,21:14,6,24,10
chr2	122485106	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,146;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,4:8,6:1,11,0,10
chr2	122489374	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,5:0,1:2,1,6,0
chr2	122489831	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr2	122514235	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,3:0.048:81:46,1:28,2:0|1:122514235_T_C:122514235:24,54,0,3
chr2	122514247	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=145,131;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,2:0.038:76:37,0:31,2:0|1:122514235_T_C:122514235:10,64,0,2
chr2	122514249	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=146,131;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,2:0.040:73:36,0:31,1:0|1:122514235_T_C:122514235:9,62,0,2
chr2	125204333	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=137,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,1:6,0:0|1:125204333_A_AC:125204333:10,4,1,1
chr2	125204336	.	G	GCCCCAGCTGA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:125204333_A_AC:125204333:10,4,1,1
chr2	125285113	.	A	AAGTCAAAAAAGATTAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	125521453	.	CC	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0|1:125521453_CC_AT:125521453:7,4,0,2
chr2	125521455	.	T	TTTAATGTAAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0|1:125521453_CC_AT:125521453:7,4,0,2
chr2	125521602	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:8,0:12,3,1,1
chr2	125672772	.	TAC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.141:20:8,1:6,1:18,0,2,0
chr2	125672940	.	G	GA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.104:35:12,0:18,3:1,31,0,3
chr2	127447763	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr2	127453479	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.882:6:0,1:0,3:0,0,6,0
chr2	127453818	.	A	AGGAAAACATG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	127808532	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:6,9:3,4:1,8,6,7
chr2	127810006	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:127810006_G_GA:127810006:0,4,0,1
chr2	127810008	.	A	ACGTTAAGTAATTGCCCCAAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:127810006_G_GA:127810006:0,4,0,1
chr2	127811679	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=226,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	127815193	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,19444415;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0,13,1,1
chr2	127821085	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.370:16:5,3:5,1:10,0,4,2
chr2	127821453	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:2,1,6,0
chr2	127821499	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,4:6,1:12,0,5,0
chr2	127828296	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,20;MFRL=168,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:0,0:1,1:4,0,2,0
chr2	127834136	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,4:2,0:7,0,4,0
chr2	127834369	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=208,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:127834369_C_T:127834369:0,2,0,2
chr2	127834384	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=235,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:127834369_C_T:127834369:0,3,0,2
chr2	127944781	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	127950904	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:3,2:1,1:1,3,1,3
chr2	127951458	.	GC	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,5:5,7:3,5,2,10
chr2	128015367	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr2	128046961	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,2:5,0:0|1:128046961_A_T:128046961:6,14,0,2
chr2	128046963	.	C	CTTCTTCTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:6,0:0|1:128046961_A_T:128046961:6,15,0,2
chr2	128050134	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=195,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr2	128081682	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.591:35:6,5:8,14:13,1,18,3
chr2	128087651	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr2	128180404	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=237,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr2	128181028	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	128184875	.	GGAC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128184875_GGAC_G:128184875:0,0,0,1
chr2	128184881	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128184875_GGAC_G:128184875:0,0,0,1
chr2	128184883	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128184875_GGAC_G:128184875:0,0,0,1
chr2	128253571	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.759:27:2,10:4,11:6,0,16,5
chr2	128324125	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	128324391	.	C	CAGTGGCTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,36;MFRL=245,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128324391_C_CAGTGGCTCA:128324391:0,1,0,1
chr2	128324394	.	C	CCTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=37,31;MFRL=245,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128324391_C_CAGTGGCTCA:128324391:0,1,0,1
chr2	128327569	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,5:2,6:0,4,0,11
chr2	128339780	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	128340093	.	C	CGAAGGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=194,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	128342547	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:7,2:1,2:0,8,1,3
chr2	128350551	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:1,1:8,1:0,10,0,2
chr2	128350578	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr2	128351229	.	C	CTCGGCGGCTCTCTGGGGGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:4,8,0,2
chr2	128351294	.	GGGTCCAT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTCCAT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	128354024	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.446:25:8,5:5,6:10,4,6,5
chr2	128363530	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,1:0,6:0,0,2,7
chr2	128364684	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr2	128366272	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:3,2:3,3:6,0,6,0
chr2	128367359	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:1,5:9,2:4,6,4,3
chr2	128377833	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	128377842	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	128378136	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	128382859	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	128389343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	128389360	.	C	CTGAGTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128389360_C_CTGAGTG:128389360:0,3,0,1
chr2	128389362	.	C	CAGGGAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128389360_C_CTGAGTG:128389360:0,3,0,1
chr2	128389422	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	128392300	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,13;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:0,1:2,0:1,3,0,3
chr2	128392688	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=80,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	128393261	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	128393289	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:6,1,3,0
chr2	128394843	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=233,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.545:7:1,1:1,0:2,1,4,0
chr2	128394875	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:8,1,0,2
chr2	128394877	.	C	T,CT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33,33;MFRL=0,154,122;MMQ=60,60,60;MPOS=23,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.28,31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,9:0.214,0.720:11:0,1,5:0,1,4:0,0,8,3
chr2	128396807	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr2	128407499	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	128411898	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=219,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr2	128411934	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,2:0,6:0,0,9,1
chr2	128411950	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	128412341	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,9;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.478:8:2,0:2,0:1,3,4,0
chr2	128431188	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.736:16:2,4:1,8:3,1,10,2
chr2	128460824	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:3,1,3,3
chr2	128461446	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,150;MMQ=47,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:7,7,0,2
chr2	128467473	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	128522637	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=103,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	128528266	.	AAAATAAATAAAT	A,AAAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,165,157;MMQ=60,60,41;MPOS=12,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,8,9;RU=AAAT;STR;TLOD=3.74,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.411,0.406:2:0,0,1:0,1,0:0,0,2,0
chr2	128608271	.	GAA	G,GA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,34,34;MFRL=166,171,164;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.36,77.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,32:0.097,0.807:38:1,1,14:1,2,17:1,2,10,25
chr2	128608290	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=157,171;MMQ=55,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=143.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,36:0.925:38:1,14:0,18:1,1,10,26
chr2	128610747	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	128622693	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=104,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:11,2:17,7,2,0
chr2	128628600	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128628600_A_AGT:128628600:0,1,0,1
chr2	128628603	.	G	GCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128628600_A_AGT:128628600:0,1,0,1
chr2	128699750	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=84,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:4,6:3,3:2,5,1,8
chr2	128708063	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	128744580	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	128753854	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	128757804	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr2	128877837	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	128880899	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,0,22
chr2	128890878	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,2,7
chr2	128915006	.	T	TATGATATTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	128944424	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:8,5:1,3:1,8,0,8
chr2	129075919	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=173,90;MMQ=52,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:3,2:12,2:10,5,2,2
chr2	130739444	.	TGAAGACG	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGACG;STR;TLOD=190.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.981:44:0,18:0,25:0,0,26,18
chr2	130739646	.	TTAAC	T	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=288.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,33:0,28:0,0,20,45
chr2	130739712	.	CT	C,CTT	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=31,33,33;MFRL=161,146,157;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.99,5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,8,6:0.213,0.158:35:8,6,3:11,1,2:9,12,8,6
chr2	130832873	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,137;MMQ=24,24;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,17:0.282:60:16,10:27,5:23,20,13,4
chr2	130872569	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=37,32;MFRL=236,216;MMQ=27,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:130872569_G_T:130872569:3,0,1,0
chr2	130872576	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=236,216;MMQ=27,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:130872569_G_T:130872569:3,0,1,0
chr2	130872658	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr2	130897559	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr2	130901926	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,153;MMQ=49,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr2	130902067	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,152;MMQ=52,40;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:11,1:23,4:12,22,2,3
chr2	130910847	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=216,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	130910967	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=193,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:4,1:2,7,0,2
chr2	130914797	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=271,193;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr2	130930819	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,149;MMQ=39,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:9,7:15,4:18,6,9,2
chr2	130939288	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:14,5:7,5:8,13,5,5
chr2	130940090	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:9,1,7,0
chr2	130941318	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,174;MMQ=52,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:12,5:3,4:10,5,6,3
chr2	130941409	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=167,132;MMQ=56,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.412:44:16,8:9,10:12,14,13,5
chr2	130949303	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,270;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	130949553	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=150,179;MMQ=52,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:15,1:8,2:14,10,0,3
chr2	130949582	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=158,184;MMQ=52,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:15,1:11,1:15,11,0,2
chr2	130949589	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=161,213;MMQ=52,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,1:12,1:15,13,1,1
chr2	130951581	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=141,151;MMQ=51,43;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:8,0:9,4:0|1:130951581_A_G:130951581:14,3,2,2
chr2	130951584	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=137,151;MMQ=51,43;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.237:19:8,0:7,3:0|1:130951581_A_G:130951581:13,2,2,2
chr2	130951599	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=134,151;MMQ=52,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,3:11,0:17,3,3,0
chr2	130951754	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,166;MMQ=27,27;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:2,5:15,3:8,10,1,7
chr2	130952053	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,209;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	130952111	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=217,232;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	131099137	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=150,124;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,2:11,0:0|1:131099137_G_A:131099137:21,0,2,0
chr2	131099139	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,124;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:0|1:131099137_G_A:131099137:21,0,2,0
chr2	131099246	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.145:46:16,4:24,2:18,22,3,3
chr2	131116404	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=235,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr2	131117120	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:1,0:0|1:131117120_G_C:131117120:1,1,1,0
chr2	131117123	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:131117120_G_C:131117120:1,1,1,0
chr2	131117126	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:131117120_G_C:131117120:1,1,1,0
chr2	131117128	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:131117120_G_C:131117120:1,1,1,0
chr2	131119835	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=181,125;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131119835_A_G:131119835:0,1,0,1
chr2	131119838	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=10,35;MFRL=181,125;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:131119835_A_G:131119835:0,1,0,1
chr2	131119842	.	C	CTTGTTATGAAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=181,125;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131119835_A_G:131119835:0,1,0,1
chr2	131119854	.	T	TCCAAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131119854_T_TCCAAA:131119854:0,0,0,1
chr2	131119855	.	T	TGACTTC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131119854_T_TCCAAA:131119854:0,0,0,1
chr2	131119858	.	A	ATTCCT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=210,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131119854_T_TCCAAA:131119854:0,1,0,1
chr2	131130678	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=107,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr2	131232617	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=130,131;MMQ=24,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.669:16:3,3:2,8:2,3,7,4
chr2	131332167	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=215,194;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr2	131334627	.	GTC	ACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=141,149;MMQ=40,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	131403183	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,103;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:8,1,3,2
chr2	131414061	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=179,167;MMQ=60,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,8:6,4:13,0,12,0
chr2	131414073	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=179,162;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,6:8,4:16,0,10,0
chr2	131414176	.	C	T	.	.	DP=125;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=145,141;MMQ=49,45;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=244.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,88:0.721:122:16,54:16,32:14,20,50,38
chr2	131523671	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.311:27:11,3:7,5:10,9,5,3
chr2	131673316	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0,0,6,6
chr2	131673950	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	131675133	.	A	AAGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131675133_A_AAGT:131675133:0,2,0,1
chr2	131675136	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131675133_A_AAGT:131675133:0,2,0,1
chr2	131675137	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131675137_G_A:131675137:0,2,0,1
chr2	131675138	.	G	GAACTTGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131675133_A_AAGT:131675133:0,2,0,1
chr2	131675139	.	G	GTCACTTGAGTCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131675137_G_A:131675137:0,2,0,1
chr2	131688916	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131688916_C_CA:131688916:0,0,0,1
chr2	131688918	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131688916_C_CA:131688916:0,0,0,1
chr2	131688919	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131688916_C_CA:131688916:0,0,0,1
chr2	131805979	.	CG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:4,2:7,2:3,8,2,2
chr2	131810546	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,11:0.151:59:19,1:19,0:32,16,0,11
chr2	131829606	.	GAA	CCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=232,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131829606_GAA_CCC:131829606:0,1,0,1
chr2	131829610	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=232,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131829606_GAA_CCC:131829606:0,1,0,1
chr2	131883519	.	TC	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=85,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr2	131995700	.	C	T	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,173;MMQ=24,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,7:0.075:102:50,3:43,3:76,19,5,2
chr2	132010270	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,312;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	132021475	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,141;MMQ=34,22;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:9,3:7,1:9,7,1,4
chr2	132120501	.	C	CT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=118.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.979:41:0,22:0,19:0,0,28,13
chr2	132121686	.	T	TTCGGCTTCCCCAGCCGCCGCCGCC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCGGCTTCCCCAGCCGCCGCCGCC;STR;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.866:5:0,0:0,3:0,0,0,5
chr2	132240509	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	132248379	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,25:0.672:37:3,11:7,14:5,7,13,12
chr2	132249372	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	132249600	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=159,179;MMQ=40,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:3,3:7,0:0|1:132249600_G_A:132249600:10,0,3,0
chr2	132249605	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=166,179;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,3:6,0:0|1:132249600_G_A:132249600:9,2,3,0
chr2	132249663	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=154,188;MMQ=53,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:5,5:0,2:0,8,0,7
chr2	132250067	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	132250093	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132250093_T_G:132250093:0,0,0,1
chr2	132250104	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132250093_T_G:132250093:0,0,0,1
chr2	132285511	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	132285999	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=164,170;MMQ=57,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:6,9:8,5:12,2,10,4
chr2	132286046	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=152,159;MMQ=33,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.257:37:15,6:12,3:17,11,6,3
chr2	132286061	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=157,156;MMQ=33,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.201:33:14,4:11,2:16,11,4,2
chr2	132290399	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=175,175;MMQ=49,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.585:25:5,8:5,4:2,8,6,9
chr2	132290621	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,167;MMQ=27,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.311:23:7,2:9,4:3,13,3,4
chr2	132905660	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=139,144;MMQ=37,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,7:0.078:101:35,2:54,5:0|1:132905660_G_A:132905660:70,24,7,0
chr2	132905664	.	G	T	.	.	DP=105;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=139,144;MMQ=37,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,7:0.075:105:37,2:59,5:0|1:132905660_G_A:132905660:71,27,7,0
chr2	132905682	.	T	C	.	.	DP=109;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=137,144;MMQ=37,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,7:0.072:109:41,2:57,5:0|1:132905660_G_A:132905660:66,36,7,0
chr2	132905693	.	T	C	.	.	DP=115;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=137,144;MMQ=37,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:108,7:0.068:115:43,2:57,5:0|1:132905660_G_A:132905660:63,45,7,0
chr2	132905703	.	C	G	.	.	DP=114;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=136,143;MMQ=37,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,7:0.068:114:44,2:58,4:0|1:132905660_G_A:132905660:55,52,6,1
chr2	132905706	.	A	G	.	.	DP=107;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=136,143;MMQ=40,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,7:0.073:106:42,0:54,5:0|1:132905660_G_A:132905660:52,47,6,1
chr2	132905741	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=141,146;MMQ=40,24;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,8:0.106:82:39,2:34,6:21,53,0,8
chr2	132912296	.	C	G	.	.	DP=154;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,133;MMQ=50,23;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:140,5:0.039:145:76,1:58,4:76,64,4,1
chr2	132912316	.	G	A	.	.	DP=142;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,133;MMQ=50,23;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:128,7:0.058:135:66,2:57,5:61,67,1,6
chr2	132912398	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,182;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.151:44:19,2:19,4:0,38,0,6
chr2	133014510	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133014510_TG_CA:133014510:0,0,0,1
chr2	133014518	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,23;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133014510_TG_CA:133014510:0,0,0,1
chr2	133014602	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,58;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:133014602_GG_CT:133014602:0,0,1,1
chr2	133014607	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,58;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:133014602_GG_CT:133014602:0,0,1,1
chr2	133014612	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,58;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:133014602_GG_CT:133014602:0,0,1,1
chr2	133014614	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:133014602_GG_CT:133014602:0,0,1,1
chr2	133014616	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,56;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:133014602_GG_CT:133014602:0,0,1,1
chr2	133014721	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,0;MMQ=60,38;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	133014751	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	133402607	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=204,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,6:0,6:3,0,11,1
chr2	133403600	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=106,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:11,4,2,0
chr2	133425912	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=68,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr2	133539460	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.550:9:3,4:1,1:3,1,5,0
chr2	133541092	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:8,3:19,0:17,11,3,0
chr2	133543305	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,0:3,2:0,4,0,3
chr2	133636367	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=151,68;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:4,1,2,2
chr2	135099425	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	135102453	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=64,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:0,1:4,0,5,0
chr2	135160755	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	135199506	.	GGT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.724:5:0,2:1,2:0|1:135199506_GGT_G:135199506:1,0,0,4
chr2	135199512	.	G	GCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,11;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.712:5:0,0:1,0:0|1:135199506_GGT_G:135199506:1,0,0,4
chr2	135308248	.	A	AAGGGTTTTTCTGAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr2	135470735	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:2,2,4,0
chr2	135677471	.	A	AGTTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.373:30:9,6:10,5:7,12,5,6
chr2	135694354	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:5,3:1,4:0|1:135694354_G_C:135694354:6,0,7,0
chr2	135694379	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0|1:135694354_G_C:135694354:0,0,19,2
chr2	135700151	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:7,3:8,4:8,7,5,2
chr2	135703650	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:6,1:2,2:4,4,2,1
chr2	135705558	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	135710322	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=186.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,30:0,21:0,0,8,44
chr2	135745861	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135745861_A_C:135745861:0,0,0,1
chr2	135745866	.	T	TTCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135745861_A_C:135745861:0,0,0,1
chr2	135745867	.	A	ACTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135745861_A_C:135745861:0,0,0,1
chr2	135762980	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,6:4,3:5,1,8,1
chr2	135848503	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:15,0,2,0
chr2	135848786	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	135881656	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:4,1:1,2:7,0,3,0
chr2	135887514	.	AT	A,ATT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,32,31;MFRL=149,164,174;MMQ=60,60,60;MPOS=14,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=12.87,9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,10,6:0.198,0.148:46:17,5,3:9,3,1:23,7,12,4
chr2	135887667	.	A	AT	.	.	DP=134;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,4:0.044:107:49,3:53,1:15,88,0,4
chr2	135920394	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:12,5:4,6:8,9,3,8
chr2	135922290	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:2,4,0,2
chr2	135985544	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:18,2:12,0:11,21,0,2
chr2	135988088	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:7,4:11,1:13,5,3,2
chr2	136148392	.	TG	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=18,30;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:136148392_TG_AA:136148392:2,2,0,1
chr2	136148396	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:136148392_TG_AA:136148392:2,2,0,1
chr2	136148399	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:136148392_TG_AA:136148392:1,2,0,1
chr2	136360062	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:1,0:4,0,3,0
chr2	136373848	.	CAGTTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:6,0:1,11,0,3
chr2	136407445	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=108.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,32,2
chr2	136407479	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=159.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,21:0,29:0,0,36,15
chr2	136418868	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=99,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:7,10:8,3:8,7,11,2
chr2	136467119	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=212.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.986:65:0,41:0,24:0,0,18,47
chr2	136467164	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,13:0,10:0,0,0,24
chr2	136479426	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:15,0,2,0
chr2	136499632	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.175:26:10,0:12,4:0,22,2,2
chr2	136511874	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:4,7,3,4
chr2	136511898	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.357:9:3,0:2,1:0,6,0,3
chr2	136528385	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,136;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:23,0:17,3:2,39,3,0
chr2	136545844	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	136548169	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	136548192	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	136552188	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,3:1,2:7,1,5,0
chr2	136555525	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	136561735	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	136567633	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,14:0,3:0,0,0,17
chr2	136574968	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,2,2
chr2	136587238	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=90,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:3,3,3,3
chr2	136622543	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,6:3,3:6,0,9,1
chr2	136622825	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	136630239	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:3,5:5,1:8,1,5,1
chr2	136633771	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	136633962	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,5:3,2:0,4,0,7
chr2	136664812	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	136664833	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,18;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:4,0,1,0
chr2	136674028	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,2
chr2	136674031	.	T	TAC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136674032	.	T	TCACC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136674034	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136674038	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136674040	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136674043	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136690414	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=11,31;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.585:12:1,5:1,2:0|1:136690414_TA_T:136690414:2,3,3,4
chr2	136690425	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.584:12:2,5:3,2:0|1:136690414_TA_T:136690414:2,3,3,4
chr2	136740900	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	136743143	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:5,3:1,3:1,5,0,6
chr2	136743172	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:2,2:3,0:0,5,0,3
chr2	136873880	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,14;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,0:2,0:1,2,0,1
chr2	137814804	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:2,7:1,8:1,2,5,10
chr2	137872961	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	137990463	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,1:9,2:10,4,2,1
chr2	137999979	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	138030124	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:9,7,2,0
chr2	138030271	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,4:0,3:0,2,0,7
chr2	138033412	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr2	138033428	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,5,0
chr2	138033556	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.169:27:10,0:13,4:13,10,1,3
chr2	138163391	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr2	138169158	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr2	138208631	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	138208662	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=238,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:138208662_G_A:138208662:0,2,0,1
chr2	138208663	.	A	AAAATAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=238,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:138208662_G_A:138208662:0,2,0,1
chr2	138413310	.	T	TGCAGGGATACAGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	138417180	.	ATTAGAAATATC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:8,2:13,4,1,1
chr2	138434130	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=146,79;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,2:2,3:2,6,2,3
chr2	138434220	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	138771760	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	139308397	.	TTC	T,TTCTCTCTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25,32;MFRL=212,197,153;MMQ=60,60,57;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,14;RU=TC;STR;TLOD=5.03,20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,6:0.198,0.510:11:3,1,4:0,0,1:3,0,8,0
chr2	139318332	.	CT	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.164:36:14,4:15,2:29,1,5,1
chr2	139429023	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,1:6,1:9,12,0,2
chr2	139429277	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:139429277_C_CA:139429277:0,2,0,1
chr2	139429278	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:139429277_C_CA:139429277:0,2,0,1
chr2	140992337	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=84.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,17:0,0,21,6
chr2	140997197	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	141027926	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,15:0.326:47:20,4:12,11:11,21,5,10
chr2	141032220	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	141092225	.	GAA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141092225_GAA_G:141092225:0,1,0,1
chr2	141092228	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141092225_GAA_G:141092225:0,1,0,1
chr2	141245333	.	T	TAAAGAAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:141245333_T_TAAAGAAG:141245333:0,3,0,1
chr2	141245334	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:141245333_T_TAAAGAAG:141245333:0,3,0,1
chr2	141245337	.	T	TAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:141245333_T_TAAAGAAG:141245333:0,3,0,1
chr2	141245342	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:141245333_T_TAAAGAAG:141245333:0,2,0,1
chr2	141253408	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	141259528	.	TA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:141259528_TA_CC:141259528:0,1,0,1
chr2	141259531	.	C	CCACAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:141259528_TA_CC:141259528:0,1,0,1
chr2	141259532	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:141259528_TA_CC:141259528:0,1,0,1
chr2	141283603	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr2	141294285	.	GAAAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=141,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:1,2:1,0:1,14,1,1
chr2	141298635	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=152,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.792:17:1,9:2,5:0,3,5,9
chr2	141298674	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:3,1:8,3:0|1:141298674_T_C:141298674:4,7,0,4
chr2	141298682	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:2,1:7,2:0|1:141298674_T_C:141298674:4,7,0,4
chr2	141298728	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141298728_A_T:141298728:0,1,0,1
chr2	141298733	.	T	TATAAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141298728_A_T:141298728:0,1,0,1
chr2	141299317	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,2:3,4:2,1,6,0
chr2	141356372	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,64;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:2,4:8,0:4,6,3,1
chr2	141359287	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	141473505	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,16:0,0,17,6
chr2	141474402	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	141474456	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	141527013	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	141528592	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr2	141533662	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,8:0,0,15,4
chr2	141571440	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	141571456	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.795:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	141598473	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,11,0
chr2	141625630	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.198:36:16,2:11,5:27,2,7,0
chr2	141739813	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=113,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:6,2:4,0:6,4,1,1
chr2	141773533	.	G	GATGTATGCGTTTGCAGTGAGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	141806500	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,127;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,2:2,0:10,2,2,0
chr2	141945949	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	141987087	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,5:1,4:1,2,0,9
chr2	142012027	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr2	142237868	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	142238112	.	T	TGGGTATGACGAAGGA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=144,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:14,1:4,2:2,17,1,2
chr2	142888376	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=176,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	143676141	.	AT	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.398:29:10,6:6,4:16,1,10,2
chr2	143713700	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,0:3,6:5,1,5,1
chr2	143787152	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=170,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:11,1,1,1
chr2	143787161	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,6:0,0,16,2
chr2	143787274	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,14:0,0,6,24
chr2	143913004	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	143973860	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=109.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,16:0,0,31,1
chr2	144193151	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.815:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr2	144244968	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=123,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:9,8,1,1
chr2	144276944	.	G	GGGAGCCAC	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.093:28:13,2:13,0:0|1:144276944_G_GGGAGCCAC:144276944:9,17,0,2
chr2	144276946	.	A	ACATACTGGGCCTAG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.096:28:12,1:13,0:0|1:144276944_G_GGGAGCCAC:144276944:9,17,0,2
chr2	144903385	.	T	TTC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	144903389	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chr2	144903397	.	A	ACCCGATGCTGCCTCGCCTCTGTTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=221,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0,3,0,1
chr2	144936654	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=220,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	145146503	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,26;MFRL=178,87;MMQ=60,34;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,0:2,1:0,5,0,2
chr2	145255431	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=228,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.632:2:1,0:0,1:0|1:145255431_TA_T:145255431:0,1,0,1
chr2	145255438	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=228,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.623:2:1,0:0,1:0|1:145255431_TA_T:145255431:0,1,0,1
chr2	145255440	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=228,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.623:2:1,0:0,1:0|1:145255431_TA_T:145255431:0,1,0,1
chr2	148674797	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:6,9:5,11:10,1,17,3
chr2	148716428	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,38:0.557:68:18,20:12,18:10,20,7,31
chr2	148733548	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	149240657	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	149247563	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=140,69;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:149247563_T_C:149247563:5,7,1,1
chr2	149247567	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=140,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:149247563_T_C:149247563:5,7,1,1
chr2	149247576	.	C	CTCCCCTTATT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=145,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,0:5,2:0|1:149247563_T_C:149247563:6,3,1,1
chr2	149520214	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:9,7:9,6:12,7,13,1
chr2	149633133	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,0:0|1:149633133_T_TG:149633133:0,0,1,0
chr2	149633138	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,0:0|1:149633133_T_TG:149633133:0,0,1,0
chr2	149633142	.	C	CGGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,6;RU=G;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,0:0|1:149633133_T_TG:149633133:0,0,1,0
chr2	149639294	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=106.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,37:0.875:42:2,15:3,22:5,0,31,6
chr2	149639328	.	T	C	.	.	DP=253;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=764.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,242:0.976:247:3,100:2,132:5,0,170,72
chr2	149798213	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:1,8,0,6
chr2	149803357	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=211,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,3:3,0,8,0
chr2	149838132	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:4,0:0,2:0,5,0,2
chr2	149853960	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	150069645	.	CGT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=112,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,1:10,1:2,16,0,2
chr2	150320627	.	TAA	T,TA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,31,32;MFRL=131,169,124;MMQ=60,60,60;MPOS=3,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=14.49,48.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,11,24:0.257,0.613:40:2,3,13:3,6,11:3,2,33,2
chr2	150426399	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	150427516	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,18,0
chr2	150432377	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,3,22
chr2	150433128	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	150435889	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,0:0,0,5,1
chr2	150443689	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=56.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,6,11
chr2	151326521	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:10,2:0|1:151326521_T_C:151326521:20,6,1,1
chr2	151326529	.	T	TGG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=142,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:13,2:0|1:151326521_T_C:151326521:19,6,1,1
chr2	151328284	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=16,18;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.815:8:0,1:0,2:0,1,1,6
chr2	151900223	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr2	151900390	.	TAAAAACAAAAAC	T,TAAAAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30,31;MFRL=0,168,209;MMQ=60,60,60;MPOS=18,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,4,5;RU=AAAAAC;STR;TLOD=11.73,7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.524,0.373:5:0,3,1:0,0,1:0,0,1,4
chr2	152108261	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	152117780	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=114,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,5:8,6:8,3,9,2
chr2	152118338	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:3,1:1,5,0,5
chr2	152139271	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:1,2:5,0,2,0
chr2	152139493	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,20:0.396:51:13,4:18,16:6,25,3,17
chr2	152267072	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.516:18:2,3:4,6:2,7,2,7
chr2	152267672	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,18:0,9:0,0,27,0
chr2	152267721	.	AT	A,ATT	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=30,30,31;MFRL=152,155,146;MMQ=60,60,60;MPOS=16,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=66.63,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,35,4:0.472,0.064:72:19,20,0:13,14,4:27,6,29,10
chr2	152267897	.	G	GT	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,30:0.492:61:22,13:6,12:1,30,0,30
chr2	152273503	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=200,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr2	152289767	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,4:3,1:1,6,0,5
chr2	152292179	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	152293320	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:4,2:2,1:6,0,2,1
chr2	152295141	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,9:4,5:8,0,9,5
chr2	152298562	.	T	TTTTTA,TTTTTATTTTATTTTA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,175,153;MMQ=60,40,40;MPOS=10,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,10;RU=TTTTA;STR;TLOD=23.48,7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,3:0.656,0.288:9:0,3,2:0,3,0:0,0,0,9
chr2	152300286	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	152303171	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	152308309	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152308309_T_TTC:152308309:0,1,0,1
chr2	152308311	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152308309_T_TTC:152308309:0,1,0,1
chr2	152308312	.	T	TTTACCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152308309_T_TTC:152308309:0,1,0,1
chr2	152311768	.	T	TTTTGCCTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:152311768_T_TTTTGCCTTC:152311768:1,1,0,1
chr2	152311769	.	A	ATGGCCTTTATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:152311768_T_TTTTGCCTTC:152311768:1,1,0,1
chr2	152311771	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:152311768_T_TTTTGCCTTC:152311768:1,1,0,1
chr2	152314547	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	152318667	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,153;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr2	152318713	.	TATC	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:11,7:4,4:11,4,10,1
chr2	152322095	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,13,7
chr2	152342481	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:152342481_A_G:152342481:0,0,0,5
chr2	152342487	.	G	GGGAGTGTGAAGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=250,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:2,1:0,0:0|1:152342481_A_G:152342481:0,2,0,1
chr2	152348842	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,5:6,1:8,3,4,2
chr2	152349026	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr2	152350462	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	152353395	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,7:3,3:8,0,10,0
chr2	152354239	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,135;MMQ=54,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.488:31:5,9:10,6:6,10,2,13
chr2	152370233	.	A	AAAAATATTGGGACAAACCCAAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0|1:152370233_A_AAAAATATTGGGACAAACCCAAAT:152370233:0,1,0,1
chr2	152370238	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:152370233_A_AAAAATATTGGGACAAACCCAAAT:152370233:0,2,0,1
chr2	152374800	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,12:0,0,22,7
chr2	152381859	.	G	GTGTGGTCACTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	152382454	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,11:0,11:0,0,15,9
chr2	152383913	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	152388228	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr2	152388415	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,5,9
chr2	152394534	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,0,15
chr2	152402999	.	G	GAATGACTTTATTGAATATGAACTTAATAAATAAATGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=155,90;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr2	152403014	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr2	152404294	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:6,2:9,4:1,14,0,7
chr2	152406241	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,36321096;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:8,0:3,19,0,2
chr2	152411476	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,1:11,1:8,12,1,1
chr2	152421937	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:5,4:2,3:8,0,8,0
chr2	152475938	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:6,0,2,1
chr2	152483577	.	GTAA	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=141,8903;MMQ=52,21;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,2:8,0:0|1:152483577_GTAA_G:152483577:8,7,2,0
chr2	152483582	.	TTTCAG	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=141,8903;MMQ=53,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,2:9,0:0|1:152483577_GTAA_G:152483577:8,9,2,0
chr2	152483592	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,36;MFRL=145,8903;MMQ=53,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:9,0:0|1:152483577_GTAA_G:152483577:8,8,2,0
chr2	152483595	.	GG	AC	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=141,8903;MMQ=52,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:0|1:152483577_GTAA_G:152483577:7,8,2,0
chr2	152483598	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=141,8903;MMQ=52,21;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:8,0:0|1:152483577_GTAA_G:152483577:7,8,2,0
chr2	152499580	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,243;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:3,0,2,3
chr2	152511778	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr2	152520027	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,3:0,7:1,0,8,2
chr2	152522556	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=226,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr2	152522986	.	A	ATACCGCTCAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	152525471	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=190,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	152531781	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,3:6,6:5,5,6,3
chr2	152536180	.	AAG	CCC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,1:0,2:0|1:152536180_AAG_CCC:152536180:3,2,3,0
chr2	152536186	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:1,2:0|1:152536180_AAG_CCC:152536180:4,2,2,0
chr2	152536190	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:2,1:0|1:152536180_AAG_CCC:152536180:5,4,2,0
chr2	152536194	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:152536180_AAG_CCC:152536180:5,4,2,0
chr2	152536427	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=57,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:3,12:5,9:7,1,14,7
chr2	152539370	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,0:0,1:0|1:152539370_T_C:152539370:0,3,0,1
chr2	152539376	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:152539370_T_C:152539370:0,1,0,1
chr2	152539379	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:152539370_T_C:152539370:0,1,0,1
chr2	152551210	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr2	152552029	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,1:3,6:3,0,7,0
chr2	152563346	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,2:2,0:3,0,3,0
chr2	152563588	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	152573902	.	A	AGGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGC;STR;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,4:5,1:6,6,3,2
chr2	152580766	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,10:2,3:4,3,5,8
chr2	152581866	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:5,3:2,2:8,0,5,0
chr2	152584153	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	152671754	.	G	GA	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=116.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,51:0.622:82:18,31:12,14:2,29,3,48
chr2	152684704	.	A	AC	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.664:33:7,7:3,4:7,4,6,16
chr2	152725790	.	CAG	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.114:23:8,1:13,1:4,17,0,2
chr2	152955071	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:3,0:3,7,2,0
chr2	152988610	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,4:4,3:7,0,2,5
chr2	153000337	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:6,5:0,2:5,1,5,2
chr2	153001330	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:7,2:6,0:15,0,2,0
chr2	153001340	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.200:19:8,4:7,0:13,2,2,2
chr2	153001343	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.127:22:12,2:7,0:15,5,1,1
chr2	153001359	.	GAT	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=73.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:6,9:1,12:4,4,12,9
chr2	153004816	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.282:21:6,0:6,4:0,15,0,6
chr2	153192324	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:0,8,0,8
chr2	153415170	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	153415234	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr2	153415244	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	153415376	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr2	153417325	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	153464021	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr2	153473521	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr2	153473794	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,5:3,3:0,3,0,8
chr2	153475263	.	GTA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:6,7:0,4:6,0,11,0
chr2	153476066	.	G	GCCA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr2	153481943	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,8,9
chr2	153483257	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:0,8,0,4
chr2	153492910	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:5,2,2,2
chr2	153514583	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:0,7,0,6
chr2	153519524	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.436:19:5,6:4,2:9,2,8,0
chr2	153519768	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	153520782	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,18:0.361:51:20,8:11,9:9,24,1,17
chr2	153520819	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:9,4:7,6:1,15,0,10
chr2	153535670	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=179.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,20:0,32:0,0,11,42
chr2	153572438	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,18,0
chr2	153576580	.	A	ATTTC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:7,2:1,4:0,8,0,6
chr2	153577013	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,4:6,4:11,2,6,2
chr2	154334687	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr2	155265623	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr2	155306885	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr2	157183211	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr2	157352734	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:6,1:8,2:3,12,0,4
chr2	157370018	.	G	GTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=197,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.389:8:2,2:1,1:0,5,2,1
chr2	157370066	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	157406296	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,14:0,0,8,19
chr2	157425549	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:157425549_C_T:157425549:0,2,0,1
chr2	157425552	.	GAGGGT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:157425549_C_T:157425549:0,2,0,1
chr2	157425561	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:157425549_C_T:157425549:0,2,0,1
chr2	157425801	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr2	157426114	.	ACTGGCAGCAAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=206,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:2,1:1,5,1,3
chr2	157427593	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	157427837	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr2	157427850	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	158140717	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	158165004	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	158275111	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31,30,18;MFRL=174,139,149,145;MMQ=60,60,60,60;MPOS=30,33,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,15,16,18;RU=A;STR;TLOD=3.09,4.82,5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,3,4:0.199,0.271,0.331:11:2,2,2,1:0,0,1,1:1,1,1,8
chr2	158291107	.	TAG	T,TAGAG	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=29,28,29;MFRL=140,125,142;MMQ=60,60,60;MPOS=29,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=AG;STR;TLOD=12.00,25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,7,19:0.180,0.594:33:2,3,3:3,3,11:5,2,25,1
chr2	158395079	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=88.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,23,2
chr2	158400908	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr2	158401137	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,18:0,0,6,24
chr2	158485001	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:158485001_C_CGG:158485001:0,1,1,0
chr2	158485002	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:158485001_C_CGG:158485001:0,1,1,0
chr2	158485004	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158485001_C_CGG:158485001:0,1,1,0
chr2	158637137	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.799:8:1,2:0,2:0,1,0,7
chr2	158655883	.	C	CA,CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,156,178;MMQ=60,60,60;MPOS=14,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=4.84,17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,8:0.285,0.651:11:0,2,4:0,1,4:0,0,11,0
chr2	158962668	.	C	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=137,91;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,7:0.105:73:29,6:36,1:29,37,5,2
chr2	158978178	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:9,8:11,5:0,20,0,13
chr2	159028664	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.380:45:9,8:18,8:16,12,9,8
chr2	159028721	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:4,6:10,6:4,10,1,12
chr2	159028800	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	159077019	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	159201633	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	159214901	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	159459606	.	G	C	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,4:0.043:115:56,2:54,2:55,56,3,1
chr2	159478028	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,179;MMQ=42,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:0,19,0,2
chr2	159498940	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr2	159522879	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr2	159526188	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,1:4,9:6,1,10,0
chr2	159530546	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=186,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,6:0,5:2,0,1,10
chr2	159672168	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr2	159683021	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.882:13:0,8:1,3:1,0,2,10
chr2	160019826	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:28,4:12,1:35,5,5,0
chr2	160019863	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=191.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,35:0,21:0,0,38,18
chr2	160019934	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.065:58:28,3:21,0:12,43,2,1
chr2	160042430	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:5,10:7,3:4,8,4,9
chr2	160055448	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:4,2,4,0
chr2	160074150	.	G	GAGAGTTGATATGTAGTTCCAGTCT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.148:24:9,2:12,1:5,16,1,2
chr2	160075886	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.605:16:0,5:6,5:1,5,2,8
chr2	160082354	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr2	160082364	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=182,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr2	160082384	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr2	160084263	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	160084534	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	160087535	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,9:0,12:0,0,2,20
chr2	160116281	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,22:0.311:72:27,10:22,12:29,21,15,7
chr2	160132196	.	A	AC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=64.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,12:0,8:0,0,0,22
chr2	160136337	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.979:44:0,23:0,21:0|1:160136337_G_A:160136337:0,0,25,19
chr2	160136345	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:23,2:19,3:0|1:160136337_G_A:160136337:24,18,2,3
chr2	160176943	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=179.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,25:0,0,12,35
chr2	160182074	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr2	160188955	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:8,2:11,0,3,0
chr2	160193370	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:1,0,8,0
chr2	160203934	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr2	160229693	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:5,0:10,2:4,11,1,1
chr2	160231108	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	160241936	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr2	160243183	.	TA	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	160255367	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=117,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:9,2:0|1:160255367_T_G:160255367:13,9,0,2
chr2	160255368	.	TTG	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=117,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,1:0|1:160255367_T_G:160255367:12,10,0,2
chr2	160261729	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	160285660	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:13,8:7,7:20,0,15,0
chr2	160303581	.	AATATG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	160304741	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.411:42:11,9:13,8:12,13,10,7
chr2	160585740	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,0,20
chr2	160634564	.	ACC	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=70.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.954:16:0,11:0,5:0,0,0,16
chr2	160634582	.	TAATATC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr2	160637324	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	160640078	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	160663678	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,3,14
chr2	160676427	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,4,13
chr2	160676445	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr2	160688351	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr2	160691978	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=195,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:5,0,4,0
chr2	160698700	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr2	160708645	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:1,2,4,0
chr2	160708933	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.791:12:0,5:0,2:0,2,0,10
chr2	160709922	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,5:0.077:76:34,0:36,5:11,60,0,5
chr2	160711556	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	160714990	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,0:3,4:1,6,0,4
chr2	160729134	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	160729186	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	160735008	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,5:2,6:0,2,4,7
chr2	160737495	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	160737560	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	160746800	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:4,2,2,6
chr2	160840370	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,7,1
chr2	160862094	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr2	160873270	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	160873294	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	160876827	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	160889673	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,0,17
chr2	160918755	.	CGA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.328:12:2,2:2,1:3,5,4,0
chr2	160958349	.	GAA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=54.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr2	160968743	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.922:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	161349727	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.787:2:0,0:0,0:0|1:161349727_T_A:161349727:0,0,2,0
chr2	161349732	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=103,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.606:3:0,1:0,0:0|1:161349727_T_A:161349727:1,0,2,0
chr2	162059969	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=177.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,29:0,20:0,0,44,7
chr2	162060022	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=136,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,3:0.051:76:41,2:32,1:36,37,3,0
chr2	162080591	.	CA	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.095:39:17,2:19,1:0,36,0,3
chr2	162081128	.	AT	A,ATT	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,31,34;MFRL=167,148,187;MMQ=60,60,60;MPOS=17,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.19,3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:42,5,4:0.105,0.092:51:19,3,2:21,1,1:38,4,8,1
chr2	162091836	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=110.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.943:33:0,16:1,16:1,0,28,4
chr2	162175290	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,18,5
chr2	162224193	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	162247772	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr2	162273201	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=153,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,1:6,3:3,5,1,3
chr2	162280117	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=140,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	162280748	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,8:0,0,2,17
chr2	162728996	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=202,268;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr2	162821515	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=209,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:7,0,8,0
chr2	162873188	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=214,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	162877041	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,0:11,2:16,3,2,1
chr2	162881299	.	C	CCATG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,17;MFRL=138,37;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:162881299_C_CCATG:162881299:3,0,1,1
chr2	162881302	.	A	AACCCACCACC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=138,37;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:162881299_C_CCATG:162881299:3,0,1,1
chr2	162881304	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=136,37;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:162881299_C_CCATG:162881299:4,0,1,1
chr2	162881307	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=136,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:1,0:3,2:0|1:162881299_C_CCATG:162881299:4,0,1,1
chr2	162881474	.	A	AATGGCTAGAGCTGTTGTTGTCTATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=152,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr2	162891848	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:1,5,1,7
chr2	162894996	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	162901978	.	TC	AT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:23,4:15,0:37,5,4,0
chr2	163030336	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:6,4:14,3:8,12,1,6
chr2	163039858	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:26,3:35,0:46,15,2,1
chr2	163059420	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:12,7,2,1
chr2	163099691	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:3,1,0,1
chr2	163292149	.	A	ACACAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr2	163292181	.	ACAAAAAC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163292181_ACAAAAAC_A:163292181:0,0,0,1
chr2	163292191	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163292181_ACAAAAAC_A:163292181:0,0,0,1
chr2	163361126	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:26,0:18,3:20,24,0,3
chr2	163694878	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	163694886	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	164468414	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=232,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr2	165358655	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr2	165358672	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,17,0
chr2	165364887	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=226,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr2	165378427	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,4:10,1:17,2,5,0
chr2	165381542	.	C	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,38:0.432:88:28,20:22,17:25,25,23,15
chr2	165557318	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	165578581	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,3:8,1:9,4,3,1
chr2	165586346	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr2	165630100	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	165694012	.	C	CA	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,11:0.172:63:27,4:22,5:18,34,1,10
chr2	165811641	.	TAGGTGACCTGACCTGTTGCA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,140;MMQ=60,51;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:6,2:7,0:12,9,0,2
chr2	166012203	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr2	166018764	.	C	CT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:24,3:13,1:33,6,4,0
chr2	166153499	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=302.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.989:84:0,49:0,32:0,0,67,17
chr2	166170073	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=181,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr2	166170127	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,16,3
chr2	166172317	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=51.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr2	166179650	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr2	166221569	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	166229922	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr2	166231571	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=241,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:166231571_T_TG:166231571:0,1,0,1
chr2	166231572	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=241,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:166231571_T_TG:166231571:0,1,0,1
chr2	166234076	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:8,1,6,2
chr2	166246310	.	A	ACTCTACAGATCAAAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.408:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	166514594	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	166535621	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=68,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:1,5,0,3
chr2	166611086	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=92,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,4:3,3:2,1,7,0
chr2	166621354	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,7:1,4:1,0,11,2
chr2	166740578	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=232,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,1,3
chr2	166758447	.	T	TA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=17,16;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.259:19:5,1:2,1:1,13,1,4
chr2	166764327	.	ATT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=160,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:166764327_ATT_A:166764327:0,4,0,1
chr2	166764331	.	ATCT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=191,89;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:166764327_ATT_A:166764327:0,3,0,1
chr2	166764336	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=191,89;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:166764327_ATT_A:166764327:0,3,0,1
chr2	166764346	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=191,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	166785895	.	TTTA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:166785895_TTTA_T:166785895:0,1,0,1
chr2	166785903	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:166785895_TTTA_T:166785895:0,1,0,1
chr2	166797450	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	166797646	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,11,10
chr2	166799893	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,5:0,0,0,13
chr2	166894209	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=193,195;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:6,3:4,3:11,0,6,0
chr2	166896114	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.131:51:21,0:24,6:6,39,1,5
chr2	166896178	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	166897982	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:166897982_A_T:166897982:1,3,0,1
chr2	166897983	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=17,31;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:1,0:0|1:166897982_A_T:166897982:1,3,0,1
chr2	166897984	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=15,20;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:0,1:1,2,0,1
chr2	166903188	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr2	166930214	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	167060449	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,17,3
chr2	167060980	.	GAAAC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,1,20
chr2	167082978	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,11:0,0,18,0
chr2	167085124	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	167085141	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	167090042	.	G	A,GGCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,154,163;MMQ=60,60,60;MPOS=22,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.38,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,1:0.673,0.220:6:0,0,1:0,5,0:0,0,0,6
chr2	167137119	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:1,3,1,4
chr2	167149693	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,6:1,0:5,1,5,1
chr2	167162277	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.420:15:6,2:1,4:9,0,6,0
chr2	167163372	.	TC	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=211,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:3,3:8,0,6,0
chr2	167163663	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,3:7,4:0,11,0,7
chr2	167168280	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,75;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:7,2:4,0:0|1:167168280_AT_A:167168280:1,12,1,1
chr2	167168287	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:7,1:5,0:0|1:167168280_AT_A:167168280:1,13,1,1
chr2	167261996	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	167262088	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:9,3:2,5:11,0,8,0
chr2	167262353	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,102;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,4:7,10:8,5,6,8
chr2	167263204	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,3:6,7:0,14,0,10
chr2	167284531	.	C	CTGATCATCCTCCAAGGGGTCAAGATTGACACACCCTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=177,202;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr2	167285862	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=203,114;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	167285867	.	G	GGCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	167300262	.	GAC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=86,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AC;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	167321931	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.441:41:13,8:10,10:20,3,14,4
chr2	167328750	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.950:17:0,5:0,10:0|1:167328750_C_T:167328750:0,0,16,1
chr2	167328754	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.350:21:4,3:9,4:0|1:167328750_C_T:167328750:12,2,6,1
chr2	167334234	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:7,6:1,10:2,6,2,14
chr2	168041152	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=103.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,9,19
chr2	168102730	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,0:11,2:5,11,0,2
chr2	168103623	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=162,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,0:12,3:12,11,0,3
chr2	168920072	.	G	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.083:70:32,0:31,5:27,38,0,5
chr2	168986154	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=127.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,18:0,18:0,0,17,19
chr2	168986376	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	168986391	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=197,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:168986391_G_A:168986391:0,4,0,1
chr2	168986393	.	A	AATTGGCACTATTTTATTCGGTGCCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=197,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:168986391_G_A:168986391:0,4,0,1
chr2	169487610	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.808:19:2,10:1,6:0,3,1,15
chr2	169487668	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	169668030	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:7,2,2,0
chr2	169681278	.	T	TTTTGTTTG	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=142,145;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTG;STR;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.423:15:5,3:2,4:0,8,0,7
chr2	169681301	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=145,92;MMQ=60,41;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:14,2:7,0:0,21,0,2
chr2	169681302	.	T	TTTGTTTTCCTTTTC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=145,92;MMQ=60,41;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,2:7,0:0,21,0,2
chr2	169713384	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=150,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169713384_C_T:169713384:0,1,0,1
chr2	169713391	.	A	AGGGTCTCACTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169713384_C_T:169713384:0,1,0,1
chr2	169721377	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:6,2:3,5:0|1:169721377_G_A:169721377:5,4,6,2
chr2	169721381	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,1:3,4:0|1:169721377_G_A:169721377:5,4,6,1
chr2	169727849	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=193,181;MMQ=51,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:16,0,2,0
chr2	169727876	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=170,191;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,2:13,0:24,0,2,0
chr2	169727879	.	G	GA	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=142,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.415:22:4,6:9,3:13,0,9,0
chr2	169728069	.	GAAA	G,GA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=36,18,16;MFRL=166,137,142;MMQ=60,60,60;MPOS=21,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=A;STR;TLOD=24.15,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,16,3:0.715,0.165:21:1,3,0:0,2,0:1,1,3,16
chr2	169763148	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,4:8,0:10,1,4,0
chr2	169764176	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:18,1:7,4:14,12,4,1
chr2	169780366	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr2	169788789	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=193,224;MMQ=40,32;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr2	169788825	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,228;MMQ=40,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,1:8,1:10,0,2,0
chr2	169801488	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.368:47:13,8:16,9:7,23,7,10
chr2	169814647	.	G	GTGAAGGTGACGGCCTAAGGTCCCACGGCCAATCACAGACAGAGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=177,136;MMQ=60,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	169814655	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,35;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr2	169820618	.	AT	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:6,0,6,0
chr2	169826465	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:169826465_A_AC:169826465:1,0,1,0
chr2	169826466	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:169826465_A_AC:169826465:1,0,1,0
chr2	169826469	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169826465_A_AC:169826465:1,0,1,0
chr2	169826479	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:169826465_A_AC:169826465:1,0,1,0
chr2	169836326	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr2	169836333	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:0,0:1,1:2,1,2,0
chr2	169836441	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:1,1:3,6,0,2
chr2	169842809	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1,2,0,3
chr2	170012744	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,251;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:10,5,2,0
chr2	170033152	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0|1:170033152_A_AG:170033152:0,3,0,1
chr2	170033160	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=92,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:170033152_A_AG:170033152:0,2,0,1
chr2	170050472	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	170055255	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:4,0,4,0
chr2	170059190	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr2	170077170	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	170129636	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	170131833	.	C	CCACATAGTAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr2	170134191	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	170139346	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,14,1
chr2	170145733	.	A	ACATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=197,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	170147266	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	170148745	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,2:3,8:5,1,5,5
chr2	170218816	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr2	170218847	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr2	170336024	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr2	170338681	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:8,4:8,2:17,0,6,0
chr2	170344193	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:4,3:6,8:10,0,11,1
chr2	170344686	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=157,68601659;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:18,0:11,2:0,33,0,2
chr2	170344691	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=157,68601659;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:17,0:12,2:0,31,0,2
chr2	170344706	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=177,68601659;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:0,21,0,2
chr2	170349560	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=215,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:170349560_T_G:170349560:0,3,0,1
chr2	170349566	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=215,239;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:170349560_T_G:170349560:0,3,0,1
chr2	170360765	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.598:18:5,3:2,7:3,4,6,5
chr2	170371060	.	ATCTC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TC;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:1,0:2,0,2,0
chr2	170371545	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.408:13:5,4:1,1:0,8,0,5
chr2	170374607	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	170393919	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:170393919_GT_G:170393919:0,0,0,2
chr2	170393922	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=172,217;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170393919_GT_G:170393919:0,1,0,1
chr2	170393925	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=217,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170393919_GT_G:170393919:0,1,0,1
chr2	170393933	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=217,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170393919_GT_G:170393919:0,1,0,1
chr2	170396718	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.347:33:9,10:10,1:1,21,1,10
chr2	170417031	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:8,4:9,11:7,10,8,7
chr2	170419652	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=217,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	170465107	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:7,0,4,0
chr2	170471270	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:7,6:14,16:0,21,1,21
chr2	170488454	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	170489566	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=201,170;MMQ=40,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:12,1,2,0
chr2	170492567	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,16:0,8:0,0,21,4
chr2	170492584	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=152.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,18:0,0,29,13
chr2	170493103	.	T	A	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=295.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,47:0,39:0,0,49,37
chr2	170505684	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=127.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,20:0,16:0,0,31,6
chr2	170510651	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=112,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.404:30:7,7:11,5:4,14,5,7
chr2	170531135	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,13;MFRL=167,77;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:5,0:0|1:170531135_C_A:170531135:16,2,2,0
chr2	170531144	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=22,14;MFRL=151,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:7,0:0|1:170531135_C_A:170531135:16,6,2,0
chr2	170531572	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=253.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,35:0,34:0,0,8,61
chr2	170531614	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:0,16:1,12:0,1,0,28
chr2	170550727	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.497:26:6,9:6,3:10,3,11,2
chr2	170632896	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.439:41:17,10:6,7:18,5,15,3
chr2	170632960	.	C	CA,CAA	.	.	DP=56;ECNT=6;MBQ=32,33,34;MFRL=128,142,170;MMQ=60,60,60;MPOS=28,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=A;STR;TLOD=47.77,3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,19,3:0.430,0.083:45:10,11,1:11,7,2:12,11,12,10
chr2	170632969	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.484:50:12,14:13,10:14,12,13,11
chr2	170633023	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:7,8:7,7:3,11,3,12
chr2	170633067	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,5:2,4:0,7,0,9
chr2	170633103	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	170657374	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr2	170662416	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:1,6,0,3
chr2	170664983	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.354:37:9,4:15,8:12,12,7,6
chr2	170665108	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr2	170665418	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,16:0.293:56:19,9:21,7:10,30,3,13
chr2	170665435	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,15:0.320:48:21,6:12,8:8,25,3,12
chr2	170667911	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,1,4
chr2	170668106	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=141.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,22:0,18:0,0,38,2
chr2	170668813	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,176;MMQ=48,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr2	170676227	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,0,18
chr2	170678476	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.572:24:6,9:4,3:3,7,5,9
chr2	170678591	.	T	TGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=203,308;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:170678591_T_TGA:170678591:0,3,0,1
chr2	170678595	.	TA	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=203,308;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:170678591_T_TGA:170678591:0,3,0,1
chr2	170684224	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	170728897	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.358:37:13,8:11,5:7,17,4,9
chr2	170751886	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:7,2:5,5:1,11,0,7
chr2	170762487	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,9:0,5:0,0,9,6
chr2	170780532	.	CT	C	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,4:0.068:69:26,3:31,1:33,32,4,0
chr2	170780657	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,23:0.387:60:16,7:21,16:9,28,5,18
chr2	170782037	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr2	170782338	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	170783092	.	CAAAAACA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAACA;STR;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.934:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	170783812	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.341:45:13,10:16,5:22,8,11,4
chr2	170789504	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,14:0.288:50:12,6:24,8:18,18,7,7
chr2	170802707	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:9,14:3,4:12,0,18,0
chr2	170802741	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.431:49:18,16:10,5:24,4,19,2
chr2	170850738	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	170863471	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:5,1:1,7:5,2,5,3
chr2	170871976	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr2	170917983	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr2	171055942	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr2	171055969	.	T	TAGAGCAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	171056569	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr2	171070810	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr2	171071369	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=198,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	171071379	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=132,124;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	171071391	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=132,124;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:171071391_G_GA:171071391:0,1,0,1
chr2	171071393	.	C	CAAAAGCCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=132,124;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:171071391_G_GA:171071391:0,1,0,1
chr2	171071397	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:171071391_G_GA:171071391:0,0,0,1
chr2	171092445	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr2	171225841	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,24:0.568:42:7,14:11,10:11,7,14,10
chr2	171225855	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=132,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:19,3:21,0:22,20,3,0
chr2	171239560	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr2	171242865	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr2	171242878	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=190,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr2	171249093	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr2	171256597	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	171257945	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.745:14:2,2:1,7:3,0,8,3
chr2	171260708	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	171319997	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,2,10
chr2	171323280	.	CTGTGTCCTAAGAT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	171356382	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171356382_T_G:171356382:0,1,0,1
chr2	171356385	.	T	TATAGAGGTTTCTGAGACAGGTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171356382_T_G:171356382:0,1,0,1
chr2	171358211	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	171358474	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	171508490	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr2	171570488	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	171572940	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	171654663	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	171786169	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=113.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,36,1
chr2	171786265	.	A	G	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,3:0.048:80:29,1:42,2:27,50,1,2
chr2	171813155	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:171813155_T_C:171813155:0,4,0,1
chr2	171813158	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:171813155_T_C:171813155:0,4,0,1
chr2	171818289	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr2	171850201	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=21,27;MFRL=198,220;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:1,0:1,2:0|1:171850201_G_A:171850201:3,0,3,0
chr2	171850207	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=170,233;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0|1:171850201_G_A:171850201:3,0,2,0
chr2	171850212	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=198,208;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.397:5:1,0:1,1:3,0,2,0
chr2	171850216	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=170,222;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:6,0,2,0
chr2	171862896	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:4,2:2,0:2,4,2,0
chr2	171902604	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	171906775	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,4:1,0:1,3,0,4
chr2	171911712	.	G	C	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=135,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,13:0.174:73:13,0:17,1:17,43,0,13
chr2	171911713	.	CAA	C	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=19,19;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.139:40:6,0:7,2:3,32,0,5
chr2	171912911	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,21,0
chr2	171916371	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	172187261	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,1:2,1:0,11,0,3
chr2	172300076	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:17,8,0,2
chr2	172305175	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.521:15:3,5:4,2:0|1:172305175_C_CT:172305175:7,0,8,0
chr2	172305177	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.521:15:3,5:4,3:0|1:172305175_C_CT:172305175:7,0,8,0
chr2	172329458	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,8:5,5:6,7,3,10
chr2	172333295	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.645:20:4,6:2,7:7,0,13,0
chr2	172336541	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.651:21:3,6:4,7:3,4,10,4
chr2	172378889	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=227,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr2	172379686	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=176,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,2,1
chr2	172398311	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=198,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,4:0,0:1,0,2,2
chr2	172409790	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:4,5:6,1,8,0
chr2	172549248	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=173.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,25:0,22:0,0,39,9
chr2	172582281	.	A	ATTAC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,7:0,10:0,0,3,16
chr2	172582344	.	AAC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr2	172644168	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,0:12,3:4,18,0,3
chr2	172644229	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr2	172683461	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=177,208;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:4,1:7,1:0,13,0,3
chr2	172691464	.	AGGAGTCTTCAC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.520:2:0,1:0,0:1,0,0,1
chr2	172700852	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:2,0:8,2,2,0
chr2	172712480	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr2	172865009	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,2:0,0,0,9
chr2	172930575	.	A	ACTTTATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	172935562	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=153,288;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:12,1,2,0
chr2	172944079	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:172944079_A_AG:172944079:1,0,0,1
chr2	172944080	.	A	ATGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:172944079_A_AG:172944079:1,0,0,1
chr2	172944083	.	A	AAAG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:172944079_A_AG:172944079:1,0,0,1
chr2	172944086	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:172944079_A_AG:172944079:1,0,0,1
chr2	172944091	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:172944079_A_AG:172944079:0,0,0,1
chr2	172944748	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr2	172950804	.	GAGAGAGAAAGAGAAGA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=306,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	173292725	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=193,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:6,3:9,4:1,15,0,7
chr2	173340344	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=134,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,6:0.070:97:40,4:48,2:38,53,1,5
chr2	173356340	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=172,291;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:173356340_G_T:173356340:0,3,0,1
chr2	173356341	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=172,291;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:173356340_G_T:173356340:0,3,0,1
chr2	173368989	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.380:20:4,2:6,4:1,12,2,5
chr2	173429496	.	TTAGG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=283,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAGG;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:1,2,0,6
chr2	173435578	.	C	CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=22,19;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.218:23:3,1:10,1:4,14,0,5
chr2	173600783	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	173659913	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	173825889	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:15,1:6,18,1,1
chr2	173832116	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=141,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,4:8,0:7,7,2,2
chr2	173848200	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:2,3:2,0:5,1,3,0
chr2	173853488	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,2:5,1:3,10,2,1
chr2	173865976	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.647:18:5,7:1,4:5,1,8,4
chr2	173881182	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:1,6,0,4
chr2	173891769	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	174074407	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=67,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr2	174094345	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	174094500	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr2	174104037	.	GAA	G,GA,GAAA,GAAAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33,33,35,34;MFRL=164,193,195,184,208;MMQ=60,60,60,60,51;MPOS=12,14,18,15;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15,16;RU=A;STR;TLOD=3.49,4.77,4.91,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:5,3,3,3,2:0.140,0.184,0.215,0.131:16:5,2,2,1,0:0,0,0,2,1:5,0,10,1
chr2	174104067	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.206:28:12,0:4,0:20,2,6,0
chr2	174123399	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=72,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr2	174131511	.	TA	T,TAAAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32,15;MFRL=129,137,123;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,21;RU=A;STR;TLOD=3.34,9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,7:0.194,0.583:12:2,0,0:1,2,2:1,2,1,8
chr2	174230153	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=131,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,4:0,5:3,2,7,2
chr2	174230394	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,34;MFRL=179,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,3,0,1
chr2	174230399	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230402	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,35;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230405	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=20,35;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230407	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230411	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=27,32;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230413	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=26,28;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230416	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230419	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=179,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,1,0,1
chr2	174230974	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.467:9:3,0:2,4:4,1,4,0
chr2	174230983	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=130,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.566:7:0,2:3,2:2,1,4,0
chr2	174829848	.	G	A	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,6:0.067:101:42,3:53,3:77,18,5,1
chr2	174943685	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,31:0.603:51:12,20:8,10:17,3,27,4
chr2	174943876	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=196,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:1,10,0,3
chr2	175093978	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.457:44:10,10:14,10:19,5,18,2
chr2	175199895	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=200.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,32:0,26:0,0,10,49
chr2	175202199	.	AGCG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCG;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr2	175213722	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=153,249;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:4,1:9,1:0|1:175213722_C_CT:175213722:7,7,0,2
chr2	175213726	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=153,249;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:4,0:10,1:0|1:175213722_C_CT:175213722:7,7,0,2
chr2	175215287	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	175246386	.	GA	G,GAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=150,136,151;MMQ=60,60,60;MPOS=25,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.82,5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,5,7:0.123,0.158:43:11,2,2:15,2,5:25,6,11,1
chr2	175246545	.	CA	C,CAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,35,25;MFRL=178,214,155;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.18,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,6,4:0.157,0.115:36:10,4,1:10,2,1:1,25,0,10
chr2	175262970	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	175264627	.	CTTTTT	C,CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32,33;MFRL=0,160,196;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.43,10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,6:0.337,0.587:9:0,2,4:0,1,1:0,0,8,1
chr2	175264674	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:12,0:18,5,3,0
chr2	175265666	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=93.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.935:28:1,14:0,13:1,0,23,4
chr2	175268763	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr2	175287778	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=86.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,6,20
chr2	175289144	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,23,0
chr2	175292364	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	175292580	.	TTCAAATTTATCAG	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCAAATTTATCAG;STR;TLOD=248.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.985:57:0,23:0,34:0,0,20,37
chr2	175309792	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr2	175318396	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	175324886	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175324886_T_A:175324886:0,1,0,1
chr2	175324891	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175324886_T_A:175324886:0,0,0,1
chr2	175324894	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175324886_T_A:175324886:0,0,0,1
chr2	175324896	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175324886_T_A:175324886:0,0,0,1
chr2	175324902	.	T	TAACTCAAGAAAG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175324886_T_A:175324886:0,0,0,1
chr2	175333632	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:7,3:10,9:12,5,7,5
chr2	175335076	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	175346726	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175346726_A_AT:175346726:0,1,0,1
chr2	175346728	.	G	GCCCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,33;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:175346726_A_AT:175346726:0,1,0,1
chr2	175346729	.	A	AAAACAAAACC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175346726_A_AT:175346726:0,1,0,1
chr2	175346735	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,30;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:175346726_A_AT:175346726:0,1,0,1
chr2	175431707	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:8,0,5,0
chr2	175431990	.	AAGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=AG;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.620:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	175436940	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,8:0,13:0,0,15,7
chr2	175439512	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,17,0
chr2	175439536	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,6:3,5:9,0,11,0
chr2	175439681	.	TA	T,TAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,30,30;MFRL=127,141,129;MMQ=60,60,60;MPOS=14,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.05,12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,11:0.125,0.347:29:8,0,6:5,3,2:2,13,2,12
chr2	175613600	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	175622788	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=212.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,26:0,36:0,0,23,39
chr2	175624107	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.536:11:2,4:0,2:0,5,3,3
chr2	175629021	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:4,6:7,7:10,1,10,3
chr2	175673870	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	175677022	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,6:5,6:11,1,10,2
chr2	175686502	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175686502_C_T:175686502:0,0,1,0
chr2	175686510	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175686502_C_T:175686502:0,0,1,0
chr2	175711162	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=176,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,0:6,3:2,14,1,2
chr2	175711942	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=222,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	175982957	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:6,2,4,1
chr2	176032334	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.451:25:6,6:6,5:12,2,9,2
chr2	176044008	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:5,2:2,4:1,6,1,5
chr2	176046007	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.489:14:3,1:4,4:5,2,7,0
chr2	176959113	.	G	GCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=248,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=CA;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr2	176988290	.	C	CGCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCA;STR;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:1,4:3,0:3,1,2,3
chr2	176988675	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:12,12,2,0
chr2	176994623	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=12,34;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr2	176995960	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=219,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr2	176996023	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=109,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:1,0,8,1
chr2	177014970	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	177034208	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:1,0:4,1:5,4,2,0
chr2	177034215	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:1,0:6,0:6,5,3,0
chr2	177036211	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr2	178098087	.	CA	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=52.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.426:45:8,6:17,12:4,22,1,18
chr2	178301428	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr2	178326838	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,5
chr2	178326847	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,5
chr2	178362572	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,1,14
chr2	178378452	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr2	178417835	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	178494173	.	G	GGGA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGA;STR;TLOD=68.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:9,11:11,6:15,5,8,10
chr2	178528703	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,2:4,6:3,7,2,6
chr2	178534324	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr2	178540293	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=136,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,7:6,1:4,9,6,2
chr2	178545680	.	G	GCTCACCAAAGTATTAGAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=172,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	178545713	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	178545736	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=244,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	178565775	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:0,0:3,3:2,1,4,0
chr2	178565815	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,11,3
chr2	178592332	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr2	178633945	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=201,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr2	178681534	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,1:6,2:6,1,2,1
chr2	178681716	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr2	178682558	.	A	ATATAAAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:1,0:1,3,2,0
chr2	178684878	.	A	AAG	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:5,7:9,5:0|1:178684878_A_AAG:178684878:12,2,14,0
chr2	178684879	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:5,7:9,6:0|1:178684878_A_AAG:178684878:12,2,14,0
chr2	178684921	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=67.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,24:0.454:53:15,15:14,9:17,12,18,6
chr2	178685129	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,3:6,3:0,10,0,6
chr2	178764364	.	A	AAT,AATATATAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,16,32;MFRL=0,196,183;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,13;RU=AT;STR;TLOD=8.60,11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.407,0.398:7:1,1,2:0,0,1:0,1,0,6
chr2	178769992	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	178879287	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	178936434	.	TCCACCAGG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=78,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:178936434_TCCACCAGG_T:178936434:1,1,1,0
chr2	178936445	.	A	ACAATCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:178936434_TCCACCAGG_T:178936434:1,0,1,0
chr2	178990941	.	CAT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,1:6,3:2,10,0,5
chr2	179193118	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=135,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr2	179193150	.	A	AGGCCTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=185,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:179193150_A_AGGCCTT:179193150:0,3,0,1
chr2	179193152	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=185,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:179193150_A_AGGCCTT:179193150:0,3,0,1
chr2	179208974	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:5,9:12,4:9,8,8,5
chr2	179213872	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:4,0,8,0
chr2	179260382	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	179296821	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:11,6:9,7:12,8,8,5
chr2	179300971	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=61.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,17:0.462:37:12,11:6,6:0|1:179300971_G_A:179300971:7,13,9,8
chr2	179300979	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,22:0.561:39:11,12:5,9:0|1:179300971_G_A:179300971:5,12,13,9
chr2	179301046	.	T	TTAAAGAAATGTGGTTCTCTGGAGAAATATTA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.497:20:5,4:5,5:2,8,5,5
chr2	179309165	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,1204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:10,2:16,2:14,13,1,3
chr2	179326004	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,0:9,3:1,10,0,3
chr2	179330468	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr2	179363909	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.322:33:15,5:5,5:19,4,6,4
chr2	179407152	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,4:3,9:3,5,1,12
chr2	179407763	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:2,1:3,2:2,3,2,1
chr2	179422238	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,1:12,1:7,11,0,2
chr2	179434120	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:17,0:11,3:17,12,2,1
chr2	179437598	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,1562;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,3:7,0:12,8,0,3
chr2	179442915	.	A	AAATTTGGTTCGTTATAACCTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	179473247	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=211,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:6,1,0,3
chr2	179476501	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=128,163;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,3:7,0:8,10,3,0
chr2	179494084	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:11,9,1,1
chr2	179510831	.	TTATATA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=TA;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.733:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179511767	.	GTATA	G,GTA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,33,35;MFRL=152,108,124;MMQ=60,60,60;MPOS=5,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=TA;STR;TLOD=5.26,19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,8:0.109,0.270:31:11,0,3:8,3,4:19,1,10,1
chr2	179515655	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=201,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:179515655_G_T:179515655:1,2,0,1
chr2	179515657	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=242,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:179515655_G_T:179515655:1,3,0,1
chr2	179515660	.	G	GCGCCTGCTAAGTAGGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=242,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:179515655_G_T:179515655:1,3,0,1
chr2	179528821	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:15,3:12,0:7,21,1,2
chr2	179546054	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,0:6,1:9,1,2,0
chr2	179548695	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.239:15:2,2:5,1:6,6,2,1
chr2	179549822	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=197,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,1:2,1:6,2,2,0
chr2	179554305	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=105,89;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:6,6:4,2:1,9,3,5
chr2	179557198	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,9:3,1:4,2,6,4
chr2	179563643	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=16,10;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.265:12:1,0:1,0:1,8,0,3
chr2	179565881	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:16,0:17,2:15,18,0,2
chr2	179566038	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr2	179566146	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr2	179572600	.	AA	TG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:179572600_AA_TG:179572600:0,2,0,1
chr2	179572605	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179572600_AA_TG:179572600:0,2,0,1
chr2	179572606	.	AAC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179572600_AA_TG:179572600:0,2,0,1
chr2	179572613	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179572600_AA_TG:179572600:0,2,0,1
chr2	179572629	.	C	CCCAAA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179572629_C_CCCAAA:179572629:0,0,0,1
chr2	179572630	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179572629_C_CCCAAA:179572629:0,0,0,1
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chr2	179583182	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=133,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:11,0:2,2:0|1:179583182_G_C:179583182:5,9,1,1
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chr2	179714675	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:7,0,4,0
chr2	179732980	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=199,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr2	179753245	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=104,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:12,2:3,3:11,4,4,1
chr2	179826241	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,6:5,5:1,5,0,11
chr2	179981276	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,89;MMQ=60,32;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:5,0,2,0
chr2	179988395	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.828:19:2,10:1,5:3,0,14,2
chr2	179989039	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr2	179997177	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr2	180039068	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,20:0,15:0,0,33,2
chr2	180047746	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,10:0,2:0,0,11,1
chr2	180309648	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=170,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:10,12,0,2
chr2	180311207	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:4,0,6,0
chr2	180725481	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	180725655	.	TACAAGTGGGACCTTGAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=202,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:6,1,1,1
chr2	180815528	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr2	180819843	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:0,2,0,6
chr2	180835321	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:8,0:13,2:4,19,1,1
chr2	180835589	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,11:0,0,6,15
chr2	180835859	.	TATTTTTATA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	180837806	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr2	180838584	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,1:4,6:0,10,0,7
chr2	180843126	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr2	180846743	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr2	182322639	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:0,8,0,5
chr2	182343385	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,3:5,1:12,1,4,0
chr2	182344846	.	G	GT,GTT	.	.	DP=126;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=149,145,168;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=179.46,4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,76,6:0.847,0.069:90:3,35,4:5,36,2:7,1,68,14
chr2	182346220	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr2	182350743	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,5,21
chr2	182359613	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	182374328	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.616:21:2,10:5,3:7,1,11,2
chr2	182374534	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=175,226;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:0|1:182374534_A_G:182374534:0,6,1,5
chr2	182374553	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=236,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.400:8:2,2:2,1:1|0:182374534_A_G:182374534:1,4,0,3
chr2	182374567	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=250,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,3:0.500:6:2,2:0,1:1|0:182374534_A_G:182374534:0,3,0,3
chr2	182376546	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=63.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,9:0,0,2,17
chr2	182387133	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:0,8,0,3
chr2	182392143	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=209,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:1,3,1,6
chr2	182399497	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:4,3:0,1:4,0,5,0
chr2	182399685	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,3:3,4:1,5,0,8
chr2	182402790	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,4:5,3:6,0,7,0
chr2	182403792	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr2	182412697	.	T	TGATGATCTTGTTTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	182413602	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	182778704	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=241,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:1,6:1,2:0,2,0,8
chr2	182786920	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,7750265;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:10,9,0,2
chr2	182852729	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	182928555	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=82.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,17:0,6:0,0,5,18
chr2	183066377	.	C	CA,CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,153,142;MMQ=60,60,60;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.53,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.377,0.506:5:0,1,0:0,1,2:0,0,4,1
chr2	183088584	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=108.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,20:0,9:0,0,23,7
chr2	183129148	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.465:24:5,6:8,5:3,10,0,11
chr2	183593451	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.936:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr2	183597318	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=90,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.874:14:0,4:1,6:0,1,0,13
chr2	183616592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	183616748	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr2	183622319	.	AATAAT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAT;STR;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	183627619	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr2	183707223	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,1:16,1:19,10,2,0
chr2	183790559	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,143;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:24,0:18,4:7,35,0,4
chr2	183827018	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr2	183832100	.	CA	C,CAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32,19;MFRL=140,136,123;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.38,6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,5:0.222,0.217:24:6,2,1:2,4,0:1,12,2,9
chr2	183841691	.	GAAA	G,GA,GAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=17,33,34,19;MFRL=133,193,163,144;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,17,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,9,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.23,3.99,43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,2,3,19:0.076,0.110,0.574:32:1,2,1,2:0,0,2,7:1,7,2,22
chr2	183851058	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr2	183859473	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:5,0,3,1
chr2	183998382	.	TTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:183998382_TTAA_T:183998382:0,3,0,2
chr2	183998393	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,1:0|1:183998382_TTAA_T:183998382:0,3,0,2
chr2	184024143	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr2	185463815	.	C	CCT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.875:13:0,4:1,5:0,1,0,12
chr2	185798504	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0,0,0,22
chr2	185802211	.	C	CACA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,3:0,8:0,0,7,5
chr2	185802243	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr2	185803582	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=111,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.378:24:7,5:7,3:6,9,7,2
chr2	186670104	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,18:0,26:0,0,25,20
chr2	186671766	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:3,0:5,4,1,1
chr2	186678241	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.335:28:8,3:10,5:18,1,7,2
chr2	186680041	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,1:5,2:5,2,2,1
chr2	186680282	.	A	AAGGGCCAGATAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=187,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:186680282_A_AAGGGCCAGATAT:186680282:0,2,0,1
chr2	186680285	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=187,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:186680282_A_AAGGGCCAGATAT:186680282:0,2,0,1
chr2	186680296	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=203,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186680296_T_TTA:186680296:0,1,0,1
chr2	186680298	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=203,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186680296_T_TTA:186680296:0,1,0,1
chr2	186692859	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:10,0:12,3:22,1,3,0
chr2	186697876	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,17,7
chr2	187364811	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr2	187364878	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,28:0.569:49:14,16:7,12:16,5,19,9
chr2	187369013	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	187455278	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,1,17
chr2	187465030	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=101,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.211:29:7,1:14,1:0|1:187465030_A_C:187465030:1,22,6,0
chr2	187465037	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=100,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.155:33:8,1:17,1:0|1:187465030_A_C:187465030:1,27,5,0
chr2	187465039	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=99,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.145:31:8,0:16,0:0|1:187465030_A_C:187465030:1,26,4,0
chr2	187490405	.	T	TGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GA;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	187501682	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,16,0
chr2	187503226	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,4:1,7:1,4,1,10
chr2	187532010	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:11,9:6,2:1,16,0,12
chr2	187533741	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=224,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	187540732	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:0,5,0,7
chr2	187559029	.	A	ACAGCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=CAG;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.690:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	187559222	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,0:0,2:0,5,0,2
chr2	187559235	.	TCG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=205,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	187611748	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	187627620	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr2	187692746	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=124,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,0:4,2:12,6,2,0
chr2	187693564	.	TA	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	187698037	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	187701993	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:10,1,2,0
chr2	187702299	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=193,216;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:4,2:0,6,0,2
chr2	187702339	.	GTA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.788:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr2	187709405	.	TA	T,TAA	.	.	DP=132;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=134,142,134;MMQ=60,60,60;MPOS=24,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=4.91,7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:94,5,11:0.051,0.085:110:39,2,5:47,3,4:70,24,12,4
chr2	188216807	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:1,10:3,3:0,4,4,9
chr2	188224057	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=194,238;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	188225262	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,259;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,1:2,3:6,0,4,0
chr2	188243633	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:4,0,6,0
chr2	188245281	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,1:12,1:7,14,1,1
chr2	189162265	.	C	CTTTGT	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=133,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.115:50:16,2:28,2:0|1:189162265_C_CTTTGT:189162265:4,41,2,3
chr2	189162268	.	AG	CT	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=133,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.115:50:14,3:27,1:0|1:189162265_C_CTTTGT:189162265:4,41,2,3
chr2	189162271	.	TACAAA	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=135,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:15,1:23,1:0|1:189162265_C_CTTTGT:189162265:3,39,1,2
chr2	189434711	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:6,1:9,1:13,2,2,0
chr2	189448896	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	189454360	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.552:29:9,7:3,9:11,2,16,0
chr2	189454481	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.128:53:20,0:23,6:8,39,0,6
chr2	189849773	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,5,1
chr2	189855674	.	T	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=137.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,44:0.625:70:14,17:12,27:20,6,34,10
chr2	189857993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	189859434	.	C	CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.145:30:9,2:16,2:24,2,4,0
chr2	189860975	.	AGT	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.235:20:5,1:10,3:2,14,1,3
chr2	189861031	.	T	TACACACACAC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,16;RU=AC;STR;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.401:11:1,0:4,1:3,4,2,2
chr2	189862203	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	189867684	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=130,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:13,3:15,0:20,9,3,0
chr2	189870217	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:1,20,0,2
chr2	189870902	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:8,2,2,0
chr2	189874873	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:3,1:7,0,1,1
chr2	189899541	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	189899572	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	189901295	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr2	189910066	.	ATGTG	A,ATG,ATGTGTG	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,32,31,32;MFRL=176,170,151,193;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,24,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=TG;STR;TLOD=3.48,14.93,4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,7,2:0.118,0.353,0.142:18:4,1,2,1:1,1,3,1:0,7,0,11
chr2	189918060	.	TACGAC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,172;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:9,0:23,0,2,0
chr2	189918787	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr2	189923104	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr2	189923327	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.605:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr2	189923630	.	ATT	A,AT	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=33,32,31;MFRL=149,140,138;MMQ=60,60,60;MPOS=27,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=9.54,116.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,8,56:0.113,0.819:68:1,5,25:3,3,25:0,4,24,40
chr2	189925548	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=158.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,23:0,24:0,0,13,34
chr2	189925629	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=206,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,4:3,5:0,4,0,9
chr2	189926229	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.487:15:3,5:1,2:7,1,5,2
chr2	189927506	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	189933686	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr2	189936687	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:19,9:3,3:20,2,9,3
chr2	189943121	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,4:1,4:3,0,8,0
chr2	189945654	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,2,1
chr2	189948651	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr2	189949786	.	TG	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:5,0,7,0
chr2	189950556	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:1,4,0,4
chr2	189953551	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:7,9:12,5:1,18,1,13
chr2	189964747	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:6,9:8,5:12,2,13,1
chr2	189964891	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,20:0.412:49:12,12:17,8:10,19,6,14
chr2	189964970	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:0,6,0,6
chr2	190313396	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	190313890	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr2	190319990	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	190321967	.	C	CA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=168,126;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.162:22:12,1:6,2:19,0,3,0
chr2	190321977	.	AG	GA	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:15,2:10,1:23,3,3,0
chr2	190321978	.	GA	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=150,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:14,2:5,1:21,5,3,0
chr2	190322196	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=200,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,1:3,2:0,7,0,3
chr2	190323530	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.513:37:11,8:7,11:11,7,15,4
chr2	190327126	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	190327400	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:0,7,0,5
chr2	190339974	.	A	G	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,6:0.080:85:36,6:40,0:55,24,6,0
chr2	190444630	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:9,8:8,5:5,12,3,11
chr2	190445076	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:3,0,4,1
chr2	190535538	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	190541892	.	G	GAGTGCAGGGACGTGATCATGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=227,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	190554688	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=180,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,2:8,1:1,14,0,3
chr2	190570001	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.924:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr2	190585604	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=216,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	190593311	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,6,3
chr2	190603201	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	190611084	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=141.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,16:0,24:0,0,31,9
chr2	190611414	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,0,21
chr2	190636411	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	190640475	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,1,12
chr2	190647108	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr2	190722245	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=75,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,29:0.548:53:13,21:10,8:19,5,20,9
chr2	190925223	.	T	TCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	190926859	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:0,1:4,0,3,0
chr2	191065236	.	TTTTG	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=80.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.614:34:8,11:5,10:6,7,13,8
chr2	191065595	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,9:3,6:2,4,7,8
chr2	191065782	.	A	AGAT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=61.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:4,7:0,7:2,2,7,9
chr2	191067766	.	T	TTC	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:11,8:6,11:12,5,13,8
chr2	191068260	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=257,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	191073721	.	A	AGCTTCTCACCCCCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:191073721_A_AGCTTCTCACCCCCCT:191073721:0,2,0,1
chr2	191073726	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:191073721_A_AGCTTCTCACCCCCCT:191073721:0,2,0,1
chr2	191159232	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chr2	191175639	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	191184524	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=150.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,27:0,17:0,0,10,34
chr2	191301368	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,11,8
chr2	191334424	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	191334459	.	A	ATTTTTAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTTAT;STR;TLOD=60.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,4:0,0,14,1
chr2	191354491	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:12,6:1,7:8,5,10,3
chr2	191354658	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	191374043	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=81,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr2	191383989	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	191390126	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr2	191552121	.	CAAAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=24,20;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.408:3:1,0:0,1:1,1,0,1
chr2	191765206	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	191789227	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=132,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:3,2:6,7:8,1,10,0
chr2	191789238	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,4:6,7:8,1,10,1
chr2	191789377	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=160,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:5,2:0|1:191789377_T_G:191789377:7,16,1,1
chr2	191789380	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=160,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,0:7,2:0|1:191789377_T_G:191789377:7,16,1,1
chr2	191789381	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.115:24:15,1:7,1:1|0:191789377_T_G:191789377:7,15,0,2
chr2	191795063	.	AG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=174,138;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,1,0
chr2	191818243	.	ATG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,4:4,7:6,3,10,1
chr2	191839539	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,3:5,4:10,2,7,0
chr2	191840695	.	GTTC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=189,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:0,3,1,3
chr2	191848312	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	191862786	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:2,6,1,2
chr2	191875035	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:12,4:11,2:14,9,6,0
chr2	191899346	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:3,4:6,5:3,7,1,9
chr2	191923026	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr2	191923064	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,0,10
chr2	191941054	.	G	GA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.249:20:3,0:4,2:1,14,1,4
chr2	192160970	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:1,6,1,5
chr2	192214833	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	192225294	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	192225477	.	G	GTGTTGT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=153,158;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=TGT;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.655:4:1,0:0,1:0,1,0,3
chr2	192226908	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	192250543	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr2	192250568	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,10:0,0,13,3
chr2	192283457	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	192711162	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr2	192820898	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=203,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr2	193056737	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,2,4
chr2	196578313	.	CT	C,CTT	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=31,31,22;MFRL=145,138,123;MMQ=60,60,60;MPOS=23,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=12.48,7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,9,4:0.178,0.107:44:10,4,0:17,5,4:6,25,1,12
chr2	196578326	.	C	CTAAGAG	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=143,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,2:0.053:54:21,0:24,2:7,45,0,2
chr2	196581295	.	T	TGTCTAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,2:0,0,6,0
chr2	196602582	.	A	AAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	196636662	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	196663997	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,16,5
chr2	196664047	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,0:12,3:12,10,1,2
chr2	196681284	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,16,0
chr2	196689261	.	A	ATTTCATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	196718071	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,262;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:25,0:12,3:16,21,3,0
chr2	196756535	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:1,7:0,7:0,1,0,14
chr2	196825238	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:3,11:3,5:2,5,9,8
chr2	196891449	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	196912067	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,16:0,0,26,2
chr2	196916088	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	197010823	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	197021086	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr2	197021141	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=148.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,21:0,22:0,0,34,11
chr2	197065964	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=117.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,15:0,19:0,0,27,8
chr2	197066175	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,4:0,6:0,1,0,11
chr2	197092767	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:9,8:11,2:20,0,10,0
chr2	197106759	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=110.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,18:0,14:0,0,27,7
chr2	197122493	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:6,0,8,0
chr2	197122662	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,0:9,7:3,11,1,6
chr2	197143469	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr2	197157277	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,3:10,0:15,6,3,0
chr2	197171175	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0|1:197171175_C_T:197171175:0,0,11,3
chr2	197171183	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.750:18:1,4:3,10:0|1:197171175_C_T:197171175:2,2,10,4
chr2	197172816	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	197298222	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:197298222_T_C:197298222:0,0,0,8
chr2	197298232	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0|1:197298222_T_C:197298222:0,0,0,7
chr2	197531493	.	CGCTCAAGAACTACTGGCCCAGGAACAAAAAAAAAAAGAAGAGTTGGAGATTGCTACTTCACA	C	.	.	DP=145;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,15:0.031:145:30,5:30,5:54,76,7,8
chr2	197531518	.	CA	C,CAA	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=32,33,30;MFRL=150,163,147;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.38,6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,4,7:0.081,0.124:50:15,2,3:14,2,4:20,19,2,9
chr2	197534692	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,0,17
chr2	197594203	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr2	197595762	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr2	197643863	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:197643863_T_TC:197643863:0,4,0,1
chr2	197643866	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:197643863_T_TC:197643863:0,4,0,1
chr2	197643869	.	T	TTCCCAAGTCCCTTTCCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:197643863_T_TC:197643863:0,4,0,1
chr2	197645397	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,0:5,5:2,7,1,4
chr2	197664521	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	197709173	.	T	TA	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,6:0.116:54:24,6:22,0:42,6,5,1
chr2	197738280	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:34,0:31,3:21,44,0,3
chr2	197762941	.	CA	C,CAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33,33;MFRL=158,139,159;MMQ=60,60,50;MPOS=9,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.44,6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,4:0.172,0.186:24:8,1,1:8,3,2:16,0,7,1
chr2	197777589	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=87.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,10:0,0,22,4
chr2	197786800	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr2	197791356	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.147:29:13,0:12,3:1,24,1,3
chr2	197791434	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=147,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr2	197854433	.	C	CCCTACAAGAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,3:9,0:1,13,0,3
chr2	197863214	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=180.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,30:0,23:0,0,2,51
chr2	197863851	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr2	197870536	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:5,7:4,9:2,7,4,12
chr2	197872727	.	T	TTCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TC;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.822:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr2	197873563	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	197953372	.	TAAGTC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGTC;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr2	197954780	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,5,9
chr2	197986048	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,15,2
chr2	197990509	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	198001443	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr2	198011904	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,9:0,0,0,25
chr2	198257652	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,31;MFRL=128,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr2	198263146	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:12,3:6,2:16,2,4,1
chr2	198264903	.	AAAT	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=70.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,20:0.314:65:21,10:22,9:13,32,4,16
chr2	198265173	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.965:24:0,11:0,12:0,0,1,23
chr2	198266943	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,8:0,0,0,18
chr2	198267243	.	GAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,176;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,1:3,1:6,1,2,0
chr2	198267484	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:4,0:12,2:6,10,0,2
chr2	198267770	.	G	GAA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=149.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,17:0,14:0,0,15,25
chr2	198272719	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=109,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,3:10,0:16,6,3,0
chr2	198283305	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,11,18
chr2	198359027	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,1:5,3:0,10,0,4
chr2	198359315	.	CAGATAACTCAAACTTTTGATCATA	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,17:0.349:50:8,7:6,10:28,5,13,4
chr2	198365043	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,10:0,22:0,0,32,0
chr2	198365248	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.287:11:3,0:1,0:0|1:198365248_T_G:198365248:0,8,0,3
chr2	198365252	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=11,13;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.285:11:2,1:1,0:0|1:198365248_T_G:198365248:0,8,0,3
chr2	198365788	.	C	T	.	.	DP=147;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=118.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,46:0.330:140:50,23:44,23:61,33,26,20
chr2	198413208	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:198413208_G_A:198413208:0,1,0,1
chr2	198413225	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:198413208_G_A:198413208:0,0,0,1
chr2	198498521	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:16,0:8,4:8,16,0,4
chr2	198509058	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr2	198563642	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=67,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	198572076	.	A	ATTC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:5,2:8,6:7,6,4,5
chr2	198643631	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=69,65;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,2,2
chr2	198950968	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	198953816	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=148,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr2	198953832	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:198953832_A_ATG:198953832:0,4,0,1
chr2	198953834	.	T	TAAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=219,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:198953832_A_ATG:198953832:0,3,0,1
chr2	200173684	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr2	200233371	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:3,19,0,2
chr2	200298313	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr2	200813293	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	200820505	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	201171014	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:8,4:10,8:15,3,9,3
chr2	201194279	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr2	201254049	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,8:0,0,8,16
chr2	201277181	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,4:7,3:1,9,0,7
chr2	201303791	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,1336;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:4,2:10,1,2,0
chr2	201331923	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:14,2:18,0,2,0
chr2	201334663	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.122:31:10,0:15,3:16,12,3,0
chr2	201371768	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=86.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,14:0,0,2,24
chr2	201397647	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,15:0.326:47:14,10:17,5:32,0,15,0
chr2	201399917	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.359:37:14,10:9,3:9,15,2,11
chr2	201400685	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr2	201438766	.	T	TCATTGAACCTAATGGAGATTAAAGGTCAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=239,251;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr2	201445152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	201457954	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,243;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,0:10,3:2,14,0,3
chr2	201460104	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:1,7,1,7
chr2	201464295	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	201466954	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,5:0,0,12,2
chr2	201470233	.	ATTTT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=T;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	201473674	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,9,5
chr2	201474179	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=121.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,15:0,18:0,0,6,27
chr2	201478720	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr2	201485398	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:20,3:18,0:30,10,3,0
chr2	201502898	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr2	201502954	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:11,12,2,0
chr2	201505953	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	201515939	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:2,12,1,1
chr2	201521731	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.818:20:1,12:2,4:0,3,1,16
chr2	201534423	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=109,13930330;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:6,12,0,2
chr2	201677317	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	201677454	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=92.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,16,12
chr2	201683695	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=128.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,14:0,21:0,0,1,34
chr2	201719258	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31,33;MFRL=213,0,124;MMQ=54,60,60;MPOS=8,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.17,12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,5:0.272,0.549:8:0,2,2:1,0,2:1,0,5,2
chr2	201719412	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,3:10,0:2,17,0,3
chr2	201724746	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,7:1,2:3,0,9,0
chr2	201736235	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:201736235_A_T:201736235:2,17,0,2
chr2	201736242	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:6,2:0|1:201736235_A_T:201736235:2,13,0,2
chr2	201778717	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=16,9;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.245:27:5,1:1,2:3,17,3,4
chr2	201785925	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0|1:201785925_T_C:201785925:0,2,0,1
chr2	201785929	.	C	CTGGTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:201785925_T_C:201785925:0,2,0,1
chr2	201785942	.	G	GCGTGATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	201857133	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,249;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,0:9,3:1,24,0,3
chr2	202000629	.	TA	CG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,2:16,0:24,5,2,0
chr2	202025131	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	202025764	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	202028714	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=165,92;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:0|1:202028714_C_T:202028714:4,9,1,1
chr2	202028717	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=144,92;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:202028714_C_T:202028714:4,9,1,1
chr2	202070735	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr2	202073781	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=75,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.427:22:3,5:8,2:1,11,10,0
chr2	202134418	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,3:0,2:0,4,0,5
chr2	202139722	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,7:0.124:53:20,0:18,0:17,29,0,7
chr2	202139739	.	CT	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=175,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.218:19:7,3:3,1:0,15,0,4
chr2	202151163	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	202211443	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	202211481	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=214,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202211481_CAT_C:202211481:0,1,0,1
chr2	202211485	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=214,238;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202211481_CAT_C:202211481:0,1,0,1
chr2	202211487	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=214,238;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202211481_CAT_C:202211481:0,1,0,1
chr2	202211490	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202211481_CAT_C:202211481:0,0,0,1
chr2	202211492	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202211481_CAT_C:202211481:0,0,0,1
chr2	202215409	.	C	CAAAACAAAACAAAACAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAACAAAACAAAACAA;STR;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,1:0,4:0,0,11,7
chr2	202245244	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,11:0,0,23,2
chr2	202245944	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.674:7:1,1:1,4:0|1:202245944_TAA_T:202245944:0,2,0,5
chr2	202245953	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr2	202245955	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.672:7:1,0:1,2:0|1:202245944_TAA_T:202245944:0,2,0,5
chr2	202246034	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	202248788	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,13:0,0,22,5
chr2	202248979	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,1,25
chr2	202254288	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr2	202262401	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202262401_A_C:202262401:0,1,0,1
chr2	202262402	.	C	CTTTATTTTAAGTGTATGTATGCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,24;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202262401_A_C:202262401:0,1,0,1
chr2	202264316	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	202272032	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	202285100	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	202323636	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:26,2:14,1:6,36,0,3
chr2	202323641	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=145,166;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:26,0:11,1:5,35,0,2
chr2	202323696	.	GC	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0,13,0,2
chr2	202337730	.	A	G	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=327.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,102:0.991:102:0,53:0,46:0,0,47,55
chr2	202342610	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:10,0:6,5:6,10,0,5
chr2	202342737	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,22,0
chr2	202344179	.	GT	G	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=168.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,69:0.960:71:1,33:1,36:1,1,47,22
chr2	202402250	.	AAC	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=202.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,51:0.964:52:1,28:0,23:0,1,12,39
chr2	202410395	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,2:5,5:0,11,0,7
chr2	202430428	.	ATTT	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=76,215;MMQ=54,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=T;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.308:8:3,0:2,2:0|1:202430428_ATTT_A:202430428:5,1,2,0
chr2	202430450	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,16;MFRL=106,159;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.212:12:4,0:2,0:1|0:202430428_ATTT_A:202430428:8,2,2,0
chr2	202430452	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=19,13;MFRL=111,159;MMQ=60,35;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,2:0.199:13:3,0:2,0:1|0:202430428_ATTT_A:202430428:9,2,2,0
chr2	202430458	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,11;MFRL=119,159;MMQ=60,35;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.157:17:6,0:4,0:1|0:202430428_ATTT_A:202430428:13,2,2,0
chr2	202447009	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr2	202469472	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	202491995	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:11,1,6,0
chr2	202499683	.	C	G	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=153.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,49:0.588:83:14,20:20,29:8,26,12,37
chr2	202501448	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=117,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,4:1,3:5,1,6,1
chr2	202505545	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.340:45:12,6:18,9:25,5,11,4
chr2	202505719	.	AT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,14,30;MFRL=192,109,198;MMQ=60,60,60;MPOS=30,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.26,5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.285,0.283:11:0,0,2:3,1,1:0,5,0,6
chr2	202507982	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.606:6:0,0:2,2:2,0,3,1
chr2	202528830	.	A	AT	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,26:0.370:70:29,16:15,10:19,25,14,12
chr2	202531136	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:1,5,1,1
chr2	202546113	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	202547528	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,2:4,6:5,0,7,1
chr2	202566741	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr2	202569992	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,8,11
chr2	202570232	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,1,15
chr2	202571562	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,2:5,1,6,1
chr2	202572806	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=230,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	202574825	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	202574862	.	A	ATAAAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=174,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	202575907	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	202580370	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=78.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,20,3
chr2	202587653	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=76,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr2	202589148	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:18,1:9,1:13,14,0,2
chr2	202589257	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	202626188	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:12,0:12,11,0,2
chr2	202626561	.	A	AAAGAAAAG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=154,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:8,0:7,3:0|1:202626561_A_AAAGAAAAG:202626561:3,13,2,1
chr2	202626571	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=154,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,0:8,1:0|1:202626561_A_AAAGAAAAG:202626561:2,12,2,1
chr2	202626625	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr2	202630368	.	A	ATACTT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TACTT;STR;TLOD=59.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:5,4:5,11:10,1,4,11
chr2	202630424	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.405:23:6,5:6,4:9,5,6,3
chr2	202632104	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=116,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:5,0:11,2:6,11,1,1
chr2	202688293	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	202700444	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,239;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:19,0:6,3:5,21,0,3
chr2	202712095	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=81.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,18,6
chr2	202899358	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	202901235	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=155,88;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,4:2,3:4,4,5,2
chr2	202902385	.	TA	T,TAA	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=31,32,31;MFRL=143,133,138;MMQ=60,60,60;MPOS=26,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.43,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:76,4,6:0.055,0.072:86:24,4,2:50,0,3:44,32,6,4
chr2	202902870	.	ATTAAAG	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.565:30:7,11:4,6:10,3,11,6
chr2	202955454	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr2	202962310	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=194,186;MMQ=50,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.612:6:0,2:1,2:0,2,0,4
chr2	202962358	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=218,202;MMQ=40,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	202962361	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=202,218;MMQ=60,40;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	202964528	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr2	202964986	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr2	202965222	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	202970726	.	G	GACTTACTGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	202979369	.	G	GACA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr2	203003066	.	G	GGTGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=GT;STR;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,4:2,4:2,3,8,2
chr2	203029951	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:5,1,4,0
chr2	203054932	.	G	GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=80,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.135:26:8,1:9,2:14,9,3,0
chr2	203079025	.	TA	T,TAA	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=130,146,124;MMQ=60,60,60;MPOS=17,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.71,10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,7,10:0.126,0.189:51:15,2,3:15,5,5:30,4,14,3
chr2	203096479	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,0;MMQ=60,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,1,0
chr2	203103035	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:203103035_A_C:203103035:0,0,2,0
chr2	203103038	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:203103035_A_C:203103035:0,0,2,0
chr2	203139738	.	A	AC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=53.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.932:17:0,6:1,10:1,0,16,0
chr2	203152355	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=151,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,8:3,4:6,1,9,3
chr2	203154953	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	203155015	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.622:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr2	203168235	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,26:0.517:50:14,14:10,11:0,24,2,24
chr2	203383843	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	203384712	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	203384776	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr2	203395642	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,1:5,1:4,12,0,2
chr2	203421199	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=92,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:4,3:0,1:1,3,0,4
chr2	203620174	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=172,94;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:7,0,3,0
chr2	203630102	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.535:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	203650558	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	203650825	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=54711750,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	203661779	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	203676382	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=165,175,121;MMQ=48,60,48;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,21;RU=A;STR;TLOD=3.12,7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,6:0.205,0.492:12:0,2,2:2,1,2:2,1,7,2
chr2	203682304	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	203690387	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr2	203693559	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,22,2
chr2	203747522	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:5,3:9,2:2,12,0,5
chr2	203748544	.	A	AT,ATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31,30;MFRL=0,167,137;MMQ=60,60,60;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.91,6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.376,0.503:5:0,1,1:0,1,2:0,0,0,5
chr2	203759178	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,2:13,0:17,1,2,0
chr2	203759227	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:28,3:16,0:30,14,1,2
chr2	203806724	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=57.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,21:0.386:55:12,9:21,12:11,23,3,18
chr2	203836507	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	203880992	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr2	203921270	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=170.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,28:0,20:0,0,13,35
chr2	203921317	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=162,155;MMQ=58,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:16,2:5,1:0|1:203921317_T_C:203921317:0,21,0,3
chr2	203921319	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=163,155;MMQ=59,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:16,1:5,1:0|1:203921317_T_C:203921317:0,22,0,3
chr2	203921336	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=177,165;MMQ=58,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:16,2:3,0:0|1:203921336_C_T:203921336:0,19,0,2
chr2	203921338	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=177,165;MMQ=58,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,1:3,0:0|1:203921336_C_T:203921336:0,19,0,2
chr2	203947911	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	203964456	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=143,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.206:21:9,3:5,1:6,11,1,3
chr2	203964516	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=201,152;MMQ=60,46;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:0|1:203964516_T_C:203964516:0,6,0,2
chr2	203964530	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=168,105;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:203964516_T_C:203964516:0,4,0,1
chr2	203964532	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=168,105;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:203964516_T_C:203964516:0,4,0,1
chr2	203996870	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,14:0,0,3,16
chr2	204002809	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=124.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,13:0,20:0,0,33,0
chr2	204111394	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:204111394_T_C:204111394:0,0,5,0
chr2	204111398	.	GTTAA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:204111394_T_C:204111394:0,0,4,0
chr2	204111443	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	204111705	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,3:0,0,0,9
chr2	204116660	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,5:1,3:3,0,9,0
chr2	204116690	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,16,4
chr2	204116887	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,0,24
chr2	204144935	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=205,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:204144935_T_C:204144935:0,2,0,1
chr2	204144936	.	G	GGGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=205,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:204144935_T_C:204144935:0,2,0,1
chr2	204154677	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=182,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:0|1:204154677_A_T:204154677:0,10,0,7
chr2	204154686	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0|1:204154677_A_T:204154677:0,0,0,17
chr2	204305093	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=90,57;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.372:28:7,6:8,4:11,7,5,5
chr2	204305635	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	204305982	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	204732850	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr2	204735423	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=146,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.122:37:15,2:18,2:16,17,1,3
chr2	204822670	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr2	204824178	.	AGT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:1,1:7,3:7,1,4,0
chr2	205912210	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	205978113	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr2	205978118	.	GTGTGT	G,GGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34,34;MFRL=0,184,153;MMQ=60,60,60;MPOS=24,29;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.25,7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.385,0.515:5:0,1,2:0,1,1:0,0,5,0
chr2	205978347	.	T	TGATTTGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GATTTGA;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr2	206036918	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,4:4,6:5,2,4,6
chr2	206041366	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=15,10;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:0,0:0,1,0,4
chr2	206165549	.	A	AGACTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	206305171	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=127,14606535;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:12,2:8,12,0,2
chr2	206364791	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr2	206418032	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr2	206480351	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,12:0.240:45:13,3:6,1:16,17,11,1
chr2	206480369	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=130,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.058:50:23,1:16,0:26,22,0,2
chr2	206562250	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,11:0,0,17,3
chr2	206592525	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	206605180	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr2	206614646	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=304,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	206631623	.	TTGTCAAATCTCGCAAGAG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	206882503	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.571:33:8,10:6,9:6,8,5,14
chr2	206884595	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	206911191	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=102,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.873:9:0,1:0,7:0,1,7,1
chr2	206911417	.	C	CCGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=101,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	206921763	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	207006825	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:1,3:1,6,0,4
chr2	207008675	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=229,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	207024857	.	T	G	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=18,11;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,17:0.218:71:13,0:13,1:0,54,0,17
chr2	207024886	.	G	GC	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=169.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.983:52:0,22:0,30:0,0,0,52
chr2	207025444	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:10,5:14,6:3,21,4,7
chr2	207027407	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:5,1:7,3:11,2,2,2
chr2	207172957	.	AAA	CTG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,401;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,2:10,0:11,9,1,1
chr2	207452151	.	GT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=107,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=89.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,33:0.927:36:0,13:1,19:1,2,2,31
chr2	207457265	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:2,0,8,0
chr2	207459467	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:10,2:6,14:8,8,11,5
chr2	207516721	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,0,5
chr2	207527608	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=107,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr2	207559640	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:207559640_A_G:207559640:2,2,0,1
chr2	207559641	.	G	T,GAATGGAATGGAATCAAAACGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,10,35;MFRL=123,183,147;MMQ=60,60,60;MPOS=30,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.10,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:1,0,1:2,1,0,2
chr2	207559647	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,10;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1|0:207559640_A_G:207559640:0,2,0,1
chr2	207582852	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	207610454	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=186,163;MMQ=40,58;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:0,2:1,3,0,2
chr2	207625567	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:7,3:3,3:9,1,5,1
chr2	207629846	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,6:6,2:9,1,8,0
chr2	207629904	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.404:45:15,9:12,9:21,6,15,3
chr2	207631382	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:8,1:19,1,2,0
chr2	207651410	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,6:0,2:4,0,7,1
chr2	207653653	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr2	207824548	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	207833848	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr2	207953406	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	208134190	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:208134190_C_CT:208134190:0,1,0,1
chr2	208134192	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:208134190_C_CT:208134190:0,1,0,1
chr2	208134196	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:208134190_C_CT:208134190:0,1,0,1
chr2	208488974	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=106,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:17,1:10,1:12,15,1,1
chr2	208606875	.	CA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32,0;MFRL=145,175,115;MMQ=60,54,40;MPOS=14,50;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=3.21,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.217:6:1,0,0:1,2,0:2,1,3,0
chr2	208615919	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=206,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:208615919_T_TC:208615919:0,1,0,1
chr2	208615921	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=206,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:208615919_T_TC:208615919:0,1,0,1
chr2	208693261	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	208693307	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	208811097	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,11:0,5:0,0,13,3
chr2	208841461	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=118,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:7,0:12,8,1,1
chr2	208865712	.	GAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=121,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:3,1:5,1,2,0
chr2	208986385	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,7:0,0,19,4
chr2	209010891	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:2,4:2,4:1,4,0,8
chr2	209028191	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.557:32:7,5:7,12:12,2,12,6
chr2	209035658	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr2	209035849	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr2	209036605	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	209036712	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,8:0,20:0,0,21,7
chr2	209046100	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr2	209049840	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	209051586	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:1,5:1,2:3,0,6,1
chr2	209101905	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,141;MMQ=49,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,4:0,1,2,7
chr2	209106969	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	209110006	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:1,3:8,0:7,3,3,0
chr2	209113189	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.086:55:28,2:20,2:30,21,3,1
chr2	209113192	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,17:0.301:57:26,8:14,8:23,17,11,6
chr2	209163556	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr2	209168853	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	209168945	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:12,12,0,2
chr2	209182548	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=118,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:8,3,5,0
chr2	209182677	.	CAGTTCAGCAGTGA	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.423:17:6,1:2,6:2,8,1,6
chr2	209189912	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr2	209194696	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	209195491	.	G	GAGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:209195491_G_GAGA:209195491:0,0,0,2
chr2	209195503	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:209195491_G_GAGA:209195491:0,1,0,1
chr2	209195506	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=221,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:209195491_G_GAGA:209195491:0,3,0,1
chr2	209195507	.	T	TTTAATAAATA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=221,158;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:209195491_G_GAGA:209195491:0,3,0,1
chr2	209199945	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	209201739	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr2	209203122	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr2	209204319	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,3:6,1:0,11,0,4
chr2	209209997	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=109.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,20:0,11:0,0,1,33
chr2	209215448	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	209219190	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	209315573	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.652:24:5,10:3,5:2,6,3,13
chr2	209345944	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=148,177;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:1,0:2,3:0,7,0,4
chr2	210560808	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=158,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:210560808_GG_TT:210560808:0,3,0,1
chr2	210560811	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=158,255;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:210560808_GG_TT:210560808:0,3,0,1
chr2	210560815	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=158,255;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:210560808_GG_TT:210560808:0,3,0,1
chr2	210594540	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,13:0,0,14,6
chr2	210594717	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr2	210594768	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	210682485	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:5,3:3,5:7,2,7,1
chr2	210704200	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,2,3
chr2	210704227	.	A	AAAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:210704227_A_AAAC:210704227:0,4,0,1
chr2	210704228	.	T	TGAAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:210704227_A_AAAC:210704227:0,4,0,1
chr2	210704230	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:210704227_A_AAAC:210704227:0,4,0,1
chr2	210714162	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:4,2,7,1
chr2	210745681	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,7:0,0,14,9
chr2	210745855	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr2	210786137	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	210802336	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,2:14,0:11,14,0,2
chr2	210802391	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:3,9,0,2
chr2	210804439	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,172;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	210808045	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	210809729	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=153,231;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,0:1,2:1,3,2,0
chr2	210810468	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	210810528	.	AA	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=126,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,2:3,5:4,0,5,2
chr2	210823765	.	G	GAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,5:2,3:0|1:210823765_G_GAA:210823765:3,2,8,1
chr2	210823772	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:4,6:2,5:0|1:210823765_G_GAA:210823765:4,2,9,2
chr2	210834410	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	210838063	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	210846867	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,6,2
chr2	210860264	.	TTA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,51;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:17,0:9,3:15,12,0,3
chr2	210882171	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,10,3
chr2	210890032	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=185,195;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:210890032_A_G:210890032:0,3,0,1
chr2	210890035	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=185,195;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:210890032_A_G:210890032:0,3,0,1
chr2	210890041	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=185,195;MMQ=60,41;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:210890032_A_G:210890032:0,3,0,1
chr2	211069438	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr2	211163063	.	T	TACAC,TACACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,131,213;MMQ=60,60,52;MPOS=12,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,16,17;RU=AC;STR;TLOD=3.79,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,2,0
chr2	211167132	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr2	211168181	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr2	211168346	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,3,13
chr2	211179864	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	211302627	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:0,8,2,6
chr2	211319824	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:4,0,8,0
chr2	211319943	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,5:2,6:4,5,7,4
chr2	211320041	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=17,16;MFRL=169,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,1:0,0:0,1,1,2
chr2	211320052	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=122,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:211320052_A_AAT:211320052:1,2,0,1
chr2	211320055	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=122,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:211320052_A_AAT:211320052:1,2,0,1
chr2	211340937	.	A	AT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:10,6:9,4:19,0,10,0
chr2	211341156	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=76.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,27:0.620:43:10,14:5,11:1,15,5,22
chr2	211341204	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=58.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,1,15
chr2	211421452	.	A	ATCT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.355:43:15,8:11,6:22,6,12,3
chr2	211456637	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=110,152;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.866:13:1,5:0,6:0|1:211456637_A_G:211456637:1,0,2,10
chr2	211456639	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0|1:211456637_A_G:211456637:0,0,3,10
chr2	211467110	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:211467110_CTTT_C:211467110:0,2,0,1
chr2	211467114	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:211467110_CTTT_C:211467110:0,2,0,1
chr2	211467117	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:211467110_CTTT_C:211467110:0,1,0,1
chr2	211467119	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:211467110_CTTT_C:211467110:0,1,0,1
chr2	211467144	.	T	TGGGATAATGGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	211481257	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=66,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.952:20:0,10:0,9:1,0,6,13
chr2	211502439	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:20,3:32,0:26,26,3,1
chr2	211513118	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	211514995	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr2	211515263	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=231,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:211515263_C_T:211515263:0,1,0,1
chr2	211515268	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=231,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:211515263_C_T:211515263:0,1,0,1
chr2	211515269	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=231,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:211515263_C_T:211515263:0,1,0,1
chr2	211515271	.	GTA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=201,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:211515263_C_T:211515263:0,2,0,1
chr2	211521227	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,32,31;MFRL=129,145,188;MMQ=60,60,60;MPOS=10,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.14,8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.282,0.524:8:0,0,3:1,3,1:0,1,5,2
chr2	211521254	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.151:28:13,0:8,0:11,13,4,0
chr2	211523457	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=97,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,3:1,2:1,3,2,3
chr2	211525420	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr2	211527827	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.756:18:1,3:1,9:4,0,8,6
chr2	211533070	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	212252824	.	AGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=226,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:212252824_AGGG_A:212252824:0,1,0,1
chr2	212252830	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=226,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:212252824_AGGG_A:212252824:0,1,0,1
chr2	212252834	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=226,122;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:212252824_AGGG_A:212252824:0,1,0,1
chr2	212295590	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr2	212488870	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	212530218	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:1,1:7,1:2,7,0,3
chr2	212543691	.	C	CAAAAAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=25,34;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	212543924	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,6:3,6:4,6,3,9
chr2	212569953	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:4,2:15,0:19,0,2,0
chr2	212569983	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=211,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:4,11:3,5:7,0,16,0
chr2	212576743	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:11,4:9,0:0|1:212576743_T_G:212576743:18,3,4,0
chr2	212576751	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:10,4:13,0:0|1:212576743_T_G:212576743:21,3,4,0
chr2	212578379	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr2	212587321	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr2	212589986	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	212615516	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	213872133	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.110:34:16,3:15,0:0|1:213872133_C_T:213872133:15,16,2,1
chr2	213872136	.	T	TGATTCAAGAGG	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=163,39;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:13,1:16,0:0|1:213872133_C_T:213872133:17,18,1,1
chr2	213872138	.	CT	AG	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:14,2:17,0:0|1:213872133_C_T:213872133:19,17,1,1
chr2	213872143	.	TT	AC	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:17,2:17,0:0|1:213872133_C_T:213872133:18,18,1,1
chr2	213872836	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.581:10:1,3:3,2:2,2,1,5
chr2	213886647	.	A	ATTTTATCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTTATCT;STR;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr2	213914343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	214012405	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr2	214174767	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,14,4
chr2	214182100	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr2	214182191	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=209,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	214228959	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr2	214972825	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	215013801	.	G	GTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TA;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.823:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr2	215632164	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,5:1,4:2,0,8,1
chr2	215657182	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:1,2:1,3:0,4,0,6
chr2	215661716	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.574:26:3,9:6,6:10,1,14,1
chr2	215661911	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:0,5,0,7
chr2	215674090	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,4:0,0,7,1
chr2	215674323	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	215797542	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=160,136;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0,5,0,2
chr2	215818604	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:11,2,2,0
chr2	215819853	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=197,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr2	215821549	.	CA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,18,19;MFRL=165,193,88;MMQ=60,60,60;MPOS=17,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.21,3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.402,0.299:7:0,1,0:2,0,0:1,1,0,5
chr2	215831743	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr2	215833415	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:7,3:4,4:11,1,6,1
chr2	215833622	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	215851246	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,18,10
chr2	215862383	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,14:0.254:57:15,6:28,8:28,15,12,2
chr2	215862633	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	215869066	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	215874965	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=196,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr2	215875251	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	215883988	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	215890299	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:215890299_G_T:215890299:0,0,1,0
chr2	215890312	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:215890299_G_T:215890299:0,0,2,0
chr2	215890324	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,0:1,0,4,0
chr2	215890352	.	GTT	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:1,7:0,1:2,0,8,0
chr2	215928972	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:1,1:7,5:1,7,0,6
chr2	215976231	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,16:0,16:0,0,33,0
chr2	216182769	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	216189951	.	CT	GG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,0:6,0:11,7,3,0
chr2	216190691	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr2	216197971	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	216200907	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=108.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,15:0,0,3,29
chr2	216209472	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr2	216211712	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=223,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr2	216235089	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,9,12
chr2	216243832	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,13:0,2:0,0,9,6
chr2	216248305	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	216253039	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	216253063	.	A	ATGACG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=119,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:0,1:4,0:0,5,0,1
chr2	216256344	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr2	216259479	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	216269046	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	216269095	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,12,6
chr2	216271763	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,12,0
chr2	216271812	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,21,5
chr2	216272138	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=239,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr2	216272900	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,6,8
chr2	216274853	.	A	AAC,AACAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30,23;MFRL=0,111,217;MMQ=60,60,60;MPOS=27,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=AC;STR;TLOD=4.97,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.520,0.376:5:0,1,1:0,2,0:0,0,2,3
chr2	216288777	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	216292868	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=98,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,0:10,2:12,4,1,1
chr2	216292881	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=98,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,0:12,2:11,6,1,1
chr2	216292903	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=107,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:3,2:8,1:6,7,2,1
chr2	216811707	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr2	216861273	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	216903894	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=230,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr2	216977644	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	216977701	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,6:5,2:10,2,8,0
chr2	216995591	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:8,7:9,4:14,3,8,4
chr2	217069151	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:4,5:7,12:0,11,2,15
chr2	217280261	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=159,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,0:2,1:0,3,0,2
chr2	217342000	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=177,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr2	217363935	.	CTCCAGGGCCTGCCTGGGT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,0:6,2:16,5,1,1
chr2	217364639	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:6,1,6,0
chr2	218673225	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=207,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr2	218675144	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	218679599	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=215,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:3,0,5,1
chr2	218694510	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:1,6:5,3:0|1:218694510_CT_C:218694510:5,2,9,0
chr2	218694512	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:2,6:4,2:0|1:218694510_CT_C:218694510:5,2,9,0
chr2	218694551	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.539:37:6,10:11,10:7,10,12,8
chr2	218713577	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:15,3,2,0
chr2	218747016	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=110,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,2:13,0:16,5,2,0
chr2	218750453	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr2	218750731	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,3:2,1:0|1:218750731_G_C:218750731:4,1,2,2
chr2	218750734	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=155,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,3:4,1:0|1:218750731_G_C:218750731:5,1,2,2
chr2	218750817	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=104,48;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:13,6:11,4:15,9,9,1
chr2	218757735	.	C	CAGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chr2	218758070	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=205,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr2	218759674	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr2	218941095	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:4,5:4,2:8,0,5,2
chr2	219000079	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,4:8,0:12,8,4,0
chr2	219000992	.	CAAAAAAAAAA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=19,35;MFRL=143,152;MMQ=57,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;RPA=15,5;RU=A;STR;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.230:20:4,3:3,1:0,16,0,4
chr2	219001014	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,139;MMQ=51,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,1:0,11,0,3
chr2	219082119	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=9,32;MFRL=209,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=119.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,35:0.966:37:0,24:0,11:2,0,33,2
chr2	219082330	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr2	219093435	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:13,6,2,0
chr2	219103313	.	CTTTTTT	C,CTTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,67,208;MMQ=60,53,60;MPOS=27,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,16,19;RU=T;STR;TLOD=3.01,7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,6:0.175,0.747:8:0,1,3:0,1,3:0,0,8,0
chr2	219103580	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=119.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,11:0,25:0,0,7,29
chr2	219128543	.	T	TTTTCCTGCCTCTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.307:4:3,1:0,0:0|1:219128543_T_TTTTCCTGCCTCTC:219128543:0,3,0,1
chr2	219128550	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:219128543_T_TTTTCCTGCCTCTC:219128543:0,4,0,1
chr2	219128669	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	219129188	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:3,1,1,0
chr2	219136044	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.197:21:3,2:5,0:17,0,4,0
chr2	219142023	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	219142492	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr2	219142773	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr2	219142786	.	T	TGGTGAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:219142786_T_TGGTGAC:219142786:0,2,0,1
chr2	219142789	.	C	CCAATGTCTCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:219142786_T_TGGTGAC:219142786:0,2,0,1
chr2	219188211	.	G	GTTCCTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	219206435	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	219209393	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	219222012	.	C	CTCTCTCTGTCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=191,141;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	219222491	.	C	CTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=170,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	219222506	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219222506_C_CCA:219222506:0,0,0,1
chr2	219222507	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219222506_C_CCA:219222506:0,0,0,1
chr2	219222733	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:2,7:3,12:3,2,15,4
chr2	219232354	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	219232427	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=221,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr2	219252437	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	219254668	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,0:12,2:12,13,1,1
chr2	219257688	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	219258920	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:19,2:6,0:12,14,1,1
chr2	219259844	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	219266204	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	219267913	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,3:4,5,4,4
chr2	219293113	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=49,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:219293113_CTG_C:219293113:1,2,0,1
chr2	219293116	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=49,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:219293113_CTG_C:219293113:1,2,0,1
chr2	219293119	.	C	CCTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=138,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1|0:219293113_CTG_C:219293113:0,2,1,1
chr2	219293124	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:219293113_CTG_C:219293113:0,1,0,1
chr2	219294080	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,1:13,1:13,10,0,2
chr2	219305404	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr2	219320207	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	219320233	.	GAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,0:1,0,2,2
chr2	219339283	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr2	219350358	.	CAAAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33,33,33;MFRL=0,132,157,130;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,27,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=24,19,20,21;RU=A;STR;TLOD=5.05,4.53,6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,5,4,5:0.307,0.300,0.339:14:0,3,2,4:0,2,2,1:0,0,14,0
chr2	219353195	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	219360754	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:219360754_T_C:219360754:0,2,0,1
chr2	219360764	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:219360754_T_C:219360754:0,2,0,1
chr2	219362927	.	A	ATTCCTGTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=270,250;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	219410896	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	219414434	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=191,177;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:4,1:8,1:12,0,2,0
chr2	219414466	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=176,249;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,1:12,1:24,0,2,0
chr2	219418539	.	T	TTATTAATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=287,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	219433597	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=106.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,16:0,15:0,0,32,2
chr2	219452361	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:15,0:13,3:7,21,0,3
chr2	219480804	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	219498759	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	219501133	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,8:0,0,9,9
chr2	219501328	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,5,8
chr2	219525668	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr2	219529199	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:3,6,0,2
chr2	219529228	.	C	CCACCCGAGGGCTTTCTGTAATATGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0,4,0,1
chr2	219538412	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:16,0:11,2:8,20,2,0
chr2	219557313	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr2	219603954	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=189,276;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:219603954_C_T:219603954:0,2,0,1
chr2	219603970	.	A	AAGTGAAAACCAAAAATTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=189,276;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:219603954_C_T:219603954:0,2,0,1
chr2	219614202	.	TTTTCTTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.690:1:0,1:0,0:0|1:219614202_TTTTCTTTG_T:219614202:0,0,0,1
chr2	219614211	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219614202_TTTTCTTTG_T:219614202:0,0,0,1
chr2	219619202	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr2	219691566	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	219692527	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,4,9
chr2	219692790	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr2	219695598	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=128,126;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:7,8,0,2
chr2	219696014	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,18:0,0,19,11
chr2	219825918	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.169:28:6,0:8,0:13,11,4,0
chr2	219826523	.	AGACCACCC	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.207:17:2,1:9,2:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:13,1,1,2
chr2	219826533	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:3,1:10,2:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:13,1,1,2
chr2	219826536	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,1:11,2:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:14,1,1,2
chr2	219826537	.	G	GTTT	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,1:10,2:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:14,1,1,2
chr2	219826538	.	C	CTCCT	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,1:11,2:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:14,1,1,2
chr2	219826542	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,1:11,1:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:15,1,0,2
chr2	219875748	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	219883930	.	G	GGCTGAAGGAGAACAAGAGCTGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=209,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.484:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	219893180	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr2	219903258	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr2	219903787	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr2	219922073	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	220012576	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	220022176	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr2	220022435	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,1,15
chr2	220028047	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,0:4,2:12,0,2,0
chr2	220028900	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:5,2,4,0
chr2	220033337	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.111:29:9,0:16,0:6,20,3,0
chr2	220033956	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:1,0,8,2
chr2	220034497	.	C	CCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:1,1,4,1
chr2	220034816	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,1:0,0:1,0,0,2
chr2	220040216	.	CA	C,CAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,33,35;MFRL=173,177,139;MMQ=60,60,40;MPOS=12,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=14.22,5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,8,3:0.375,0.189:19:5,5,0:3,3,2:8,0,11,0
chr2	220040235	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=24,10;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:15,0:11,0:32,1,1,2
chr2	220041091	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr2	220041433	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=196,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	220041455	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,2:0,0,10,1
chr2	220043302	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	220045035	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,3:5,6:0,6,2,7
chr2	220046349	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,13,4
chr2	220047393	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	220071803	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr2	220071879	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	220072766	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=186.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.984:57:0,34:0,21:0,0,14,43
chr2	220072852	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,1,10
chr2	220078496	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr2	220081285	.	A	AATCCCTTATTTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:220081285_A_AATCCCTTATTTCC:220081285:1,2,0,1
chr2	220081286	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,0:0,0:1|0:220081285_A_AATCCCTTATTTCC:220081285:1,2,0,1
chr2	220081290	.	T	TTGAAGGTAGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:220081285_A_AATCCCTTATTTCC:220081285:2,1,0,1
chr2	220082365	.	CAA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,97;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:15,1:19,1:27,13,2,0
chr2	220083453	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr2	220088248	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	220088899	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:5,2:11,6,0,2
chr2	220101974	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.600:38:5,14:10,8:8,7,14,9
chr2	220107149	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
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chr2	220107355	.	G	GTAATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:220107349_T_TCATGGGAAAAACCC:220107349:0,3,0,1
chr2	220107730	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	220159675	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:1,1:5,0:9,0,3,0
chr2	220166493	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220166493_G_T:220166493:0,3,0,1
chr2	220166495	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220166493_G_T:220166493:0,3,0,1
chr2	220166497	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220166493_G_T:220166493:0,3,0,1
chr2	220166506	.	TG	AT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220166493_G_T:220166493:0,3,0,1
chr2	220166511	.	G	GCAAAC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	220192359	.	C	CTTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,24;MFRL=240,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220192359_C_CTTG:220192359:0,1,0,1
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chr2	220192363	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=240,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220192359_C_CTTG:220192359:0,1,0,1
chr2	220192364	.	A	AGGGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=240,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220192359_C_CTTG:220192359:0,1,0,1
chr2	220192366	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=240,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220192359_C_CTTG:220192359:0,1,0,1
chr2	220197456	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:1,5,0,3
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chr2	220239534	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr2	220239561	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,3:0,0,11,6
chr2	220246218	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,15,5
chr2	220250322	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,10,4
chr2	220250826	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr2	220250897	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	220251178	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	220251208	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	220264543	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr2	220284717	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	220284779	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,22:0,9:0,0,26,6
chr2	220285545	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220285545_CT_C:220285545:1,0,1,0
chr2	220285551	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220285545_CT_C:220285545:1,0,1,0
chr2	220313730	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220313730_AT_A:220313730:0,0,1,0
chr2	220313732	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220313730_AT_A:220313730:0,0,1,0
chr2	220313742	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=154,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220313730_AT_A:220313730:1,0,1,0
chr2	220316579	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	220330724	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=86,68;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:3,3,0,2
chr2	220341727	.	G	GGAAGTAT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=111,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,1:1,0:0|1:220341727_G_GGAAGTAT:220341727:1,2,0,1
chr2	220341734	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=36,32;MFRL=195,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1|0:220341727_G_GGAAGTAT:220341727:1,0,0,1
chr2	220341737	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,31;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,1:1|0:220341727_G_GGAAGTAT:220341727:1,1,0,1
chr2	220341741	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,30;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:220341727_G_GGAAGTAT:220341727:1,1,0,1
chr2	220341744	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,29;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:220341727_G_GGAAGTAT:220341727:1,1,0,1
chr2	220341747	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=22,26;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:220341747_G_T:220341747:1,1,0,1
chr2	220341751	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,31;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:220341747_G_T:220341747:1,1,0,1
chr2	220343940	.	G	GTAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=166,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr2	220344004	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220344004_G_C:220344004:0,1,0,1
chr2	220344008	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:220344004_G_C:220344004:0,0,0,1
chr2	220350163	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:18,2:26,2:18,26,2,2
chr2	220353650	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:220353650_G_GA:220353650:0,2,0,1
chr2	220353654	.	GC	CT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,33;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:220353650_G_GA:220353650:0,2,0,1
chr2	220353659	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:220353650_G_GA:220353650:0,2,0,1
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chr2	220353665	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220353664_G_T:220353664:0,0,0,1
chr2	220353668	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220353664_G_T:220353664:0,0,0,1
chr2	220354745	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:220354745_T_G:220354745:2,2,0,1
chr2	220354747	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,11;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:220354745_T_G:220354745:2,2,0,1
chr2	220354750	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:220354745_T_G:220354745:2,2,0,1
chr2	220354754	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:220354745_T_G:220354745:1,2,0,1
chr2	220354759	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=14,13;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:220354745_T_G:220354745:0,2,0,1
chr2	220356806	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,7,3
chr2	220361265	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr2	220364750	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:9,8:7,6:7,9,6,8
chr2	220370317	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:7,0:13,3:5,16,0,3
chr2	220379839	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,1:9,1:12,10,1,1
chr2	220400103	.	GG	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220400103_GG_AT:220400103:0,0,0,1
chr2	220400106	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220400103_GG_AT:220400103:0,0,0,1
chr2	220401751	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	220402624	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	220406239	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=188,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	220409701	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	220415595	.	GGA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=169,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GA;STR;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:1,5,2,3
chr2	220415646	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	220416164	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	220416535	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220416535_C_A:220416535:0,0,0,1
chr2	220416537	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220416535_C_A:220416535:0,0,0,1
chr2	220416540	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220416535_C_A:220416535:0,0,0,1
chr2	220416803	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,31:0,14:0,0,33,12
chr2	220416942	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.549:27:8,5:4,9:3,9,2,13
chr2	220416967	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.555:21:4,7:5,2:0,9,2,10
chr2	220419553	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220421417	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:7,11:5,4:6,6,13,2
chr2	220421479	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.648:23:6,10:1,5:2,6,3,12
chr2	220427996	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	220428381	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:0,6:2,2:0,2,2,7
chr2	220431919	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr2	220432709	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=111,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.413:20:10,4:1,4:7,5,3,5
chr2	220432994	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:4,6,0,2
chr2	220435375	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	220437081	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.352:33:8,1:13,7:11,10,4,8
chr2	220466344	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.565:12:2,5:0,2:0|1:220466344_G_GT:220466344:2,3,7,0
chr2	220466360	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=115,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.353:20:6,1:4,0:0|1:220466344_G_GT:220466344:2,11,7,0
chr2	220471116	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,5,5
chr2	220473134	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=318,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220473134_G_A:220473134:1,0,0,1
chr2	220473136	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=318,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220473134_G_A:220473134:1,0,0,1
chr2	220474081	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:6,0:6,5,2,0
chr2	220476645	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	220479153	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:220479153_C_A:220479153:3,1,0,1
chr2	220479155	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:220479153_C_A:220479153:3,1,0,1
chr2	220479156	.	ACCCGC	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,1:2,0:0|1:220479153_C_A:220479153:4,1,0,1
chr2	220479182	.	G	GATT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:220479182_G_GATT:220479182:3,0,0,1
chr2	220479183	.	C	CATTTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:220479182_G_GATT:220479182:3,0,0,1
chr2	220479184	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:220479182_G_GATT:220479182:3,0,0,1
chr2	220480693	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	220492614	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,9;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:220492614_T_G:220492614:0,0,1,0
chr2	220492620	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220492614_T_G:220492614:0,0,1,0
chr2	220492624	.	CT	GG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,0;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:220492614_T_G:220492614:0,0,1,0
chr2	220499336	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr2	220501510	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:6,10,1,1
chr2	220505348	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr2	222290902	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:3,2:4,3:1,6,0,5
chr2	222301357	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	222301713	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,2,1
chr2	222301892	.	A	ATTTATTATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	222301912	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	222307534	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:3,2,5,1
chr2	222320427	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,1,18
chr2	223065870	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,13:0,10:0,0,17,8
chr2	223158601	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:223158601_C_CAG:223158601:0,1,0,1
chr2	223158602	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:223158601_C_CAG:223158601:0,1,0,1
chr2	223161606	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	223162024	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	223169231	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.391:44:10,10:17,7:8,19,7,10
chr2	223169325	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.429:40:17,10:6,7:18,5,7,10
chr2	223169658	.	G	GGCCAAGA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:3,1:9,7:3,9,4,4
chr2	223339533	.	CTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	223493435	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	223505479	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:5,1:6,2:12,1,3,0
chr2	223520905	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	223574708	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr2	223781017	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.327:17:5,2:6,3:7,5,5,0
chr2	223785846	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=195,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,3:1,4:1,3,0,7
chr2	223787496	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:13,2:10,15,0,2
chr2	223787559	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,5:5,6:1,8,1,10
chr2	223787691	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,5:9,0,10,0
chr2	223789080	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=241,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,5:2,0,9,0
chr2	223793471	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:0|1:223793471_C_T:223793471:5,0,6,0
chr2	223793480	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0|1:223793471_C_T:223793471:0,0,14,0
chr2	223797797	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	223799207	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr2	223806189	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=137,162;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.283:5:1,0:2,1:3,1,1,0
chr2	223806194	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:2,1,2,2
chr2	223806207	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,11;MFRL=129,124;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,0:5,0:3,6,2,0
chr2	223918680	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,5:8,1:6,8,1,5
chr2	223919558	.	A	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,29:0.480:60:14,11:17,14:7,24,13,16
chr2	223919674	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	224462249	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:7,1:5,8,1,1
chr2	224629876	.	C	CCATCAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=CAT;STR;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.525:17:5,5:3,4:7,1,8,1
chr2	224743524	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=149,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,0:5,1:2,10,0,3
chr2	224758906	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=85.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,11:0,0,25,0
chr2	224763816	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	224765894	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr2	224770780	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	224777094	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=207.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,51:0.981:51:0,25:0,22:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,9,42
chr2	224777105	.	G	GTGAT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=197.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,47:0.980:47:0,21:0,23:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,6,41
chr2	224862820	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,2:5,2:9,1,3,1
chr2	225244235	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=210,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:3,0,4,0
chr2	225365056	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,2:3,5:8,0,7,0
chr2	225367669	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=92,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.711:29:6,10:2,11:5,3,13,8
chr2	225368321	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=130,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,4:5,4:4,3,6,2
chr2	225376034	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:2,9:4,6:4,2,12,3
chr2	225400185	.	CCTTCAA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=210,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTCAA;STR;TLOD=54.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.792:17:3,7:0,7:3,0,11,3
chr2	225431679	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=145,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.499:28:5,8:9,6:3,11,4,10
chr2	225630435	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.552:36:6,8:10,12:13,3,15,5
chr2	225665074	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	225671007	.	T	TATTAGGTATTATAAG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225671007_T_TATTAGGTATTATAAG:225671007:0,1,0,1
chr2	225671011	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225671007_T_TATTAGGTATTATAAG:225671007:0,1,0,1
chr2	225671013	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225671007_T_TATTAGGTATTATAAG:225671007:0,1,0,1
chr2	225671015	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225671007_T_TATTAGGTATTATAAG:225671007:0,1,0,1
chr2	225671017	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225671007_T_TATTAGGTATTATAAG:225671007:0,1,0,1
chr2	225729757	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=130,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:4,0:7,5:5,6,1,4
chr2	225729849	.	A	AGGGCCTATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	225750359	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=151,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,4:10,0:19,0,3,1
chr2	225761160	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=164,139;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:225761160_G_T:225761160:0,4,0,1
chr2	225761162	.	TT	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=164,139;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:225761160_G_T:225761160:0,4,0,1
chr2	225848390	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:8,1,4,0
chr2	225848579	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:7,8:8,2:4,11,2,8
chr2	225907150	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	226446639	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:16,8,2,0
chr2	227771389	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:8,0,5,1
chr2	227773466	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,9:9,3:13,2,10,2
chr2	227872995	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.449:36:10,8:9,8:12,8,6,10
chr2	227873028	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.480:21:5,6:6,4:3,8,0,10
chr2	227874957	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,4:6,3:11,1,7,0
chr2	227877037	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:1,3,1,1
chr2	227886925	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:7,4:5,5:2,10,3,6
chr2	227890394	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:9,0,2,0
chr2	227892720	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:3,6,1,2
chr2	227895125	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr2	227896652	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=114,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.403:23:10,2:3,7:9,5,7,2
chr2	227912331	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0,6,0,6
chr2	227927189	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=12,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:0,2:0,1,5,0
chr2	227954599	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,2:6,1:7,5,2,1
chr2	227966148	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=103.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,10:0,0,28,3
chr2	227966298	.	T	TA,TAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=157,137,168;MMQ=60,60,60;MPOS=16,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=33.50,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,18,3:0.663,0.137:26:3,9,1:2,7,2:1,4,3,18
chr2	227967601	.	ACAATATTTCAGCAATAGGGAAAG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.934:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	227967830	.	GA	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=37,35;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=128.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,54:0.967:55:1,25:0,24:1,0,38,16
chr2	227973410	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr2	227973623	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,2:0,13:0,0,1,15
chr2	227974090	.	A	AATTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	227974113	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	228004932	.	G	GACATTTCATATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=160,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,2:4,0:1,8,1,1
chr2	228104760	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0,0,14,1
chr2	228104774	.	AC	GG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,126;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:13,4:3,0:13,3,4,0
chr2	228109626	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr2	228109784	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	228112186	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=134.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,15:0,21:0,0,30,6
chr2	228118403	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,6:0,0,4,8
chr2	228119461	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,1:3,8:5,3,1,8
chr2	228122239	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=97,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:4,2:2,5:4,2,6,1
chr2	228131752	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:6,5:3,2:4,5,4,4
chr2	228144706	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	228145543	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:8,3:9,7:17,0,10,0
chr2	228149100	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=121,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:3,1:1,7,1,1
chr2	228149107	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,4:3,0:1,3,1,3
chr2	228158418	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.396:36:12,6:9,8:15,7,11,3
chr2	228159660	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=133,163;MMQ=53,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.615:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	228159677	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=45,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.395:6:1,0:1,0:1,3,2,0
chr2	228169632	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:8,4:3,5:11,0,9,0
chr2	228172623	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:12,2:6,17,0,2
chr2	228194480	.	AG	TT	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,28:0.420:67:14,12:25,16:16,23,10,18
chr2	228194570	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,2,30
chr2	228197368	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr2	228204929	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	228204982	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr2	228207625	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	228211074	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,6:0,0,0,16
chr2	228356182	.	GAAATATTT	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=75.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.480:42:9,12:7,8:22,0,20,0
chr2	228356364	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=182;ECNT=1;MBQ=33,32,33,33;MFRL=124,135,136,90;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,23,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=42.50,105.36,4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,34,70,7:0.256,0.578,0.049:126:6,18,33,5:6,9,35,2:3,12,38,73
chr2	228373404	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,23;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:1,1:0,4,0,2
chr2	228399480	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr2	228477819	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	228493338	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:3,1:0,5,0,3
chr2	228560728	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:5,10:8,8:6,7,11,7
chr2	228560800	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr2	228563815	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=113,169;MMQ=60,29;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:7,8,0,3
chr2	228563995	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,190;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:13,4,2,0
chr2	228567046	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:1,1:2,4:0,3,0,6
chr2	228736313	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,2:7,4:12,2,5,1
chr2	228736341	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:3,11:5,8:5,3,13,6
chr2	228736527	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,2:0,11,0,4
chr2	228741250	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,7:3,4:2,2,1,10
chr2	228750239	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,1,3
chr2	228758456	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=101,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr2	228767618	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr2	228767631	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr2	228777067	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=129,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:11,0:12,8,1,1
chr2	228777070	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,3:11,0:11,8,2,1
chr2	228783479	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:3,9:9,2:8,4,9,2
chr2	228788680	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=118,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:20,1:26,2:14,32,0,3
chr2	228855958	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.330:28:11,5:8,4:8,11,4,5
chr2	228858349	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,75071110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:2,7,0,2
chr2	228860461	.	C	CAGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:228860461_C_CAGGT:228860461:0,2,0,1
chr2	228860463	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:228860461_C_CAGGT:228860461:0,2,0,1
chr2	228860467	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:228860461_C_CAGGT:228860461:0,2,0,1
chr2	228881072	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	228882970	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,5:8,2:2,10,3,4
chr2	228884686	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=90,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.595:35:8,13:6,8:9,5,13,8
chr2	228973660	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=131,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:2,2,1,2
chr2	228996650	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=138,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:3,2,2,1
chr2	228996672	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=138,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:2,3,3,1
chr2	230135711	.	G	GC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=65.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,10:0,9:0,0,12,8
chr2	230411826	.	A	AGCGATAATAACAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr2	230453224	.	A	AAGAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=87,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:230453224_A_AAGAT:230453224:2,1,0,1
chr2	230453225	.	C	CAGGGTACAGCTGCAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=87,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:230453224_A_AAGAT:230453224:2,1,0,1
chr2	230456352	.	TAGGCAGTGTCACCGTTGCCTGAGAGCG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:8,0:9,15,1,1
chr2	230656987	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,2:4,1:0,13,0,3
chr2	230661483	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.098:49:24,1:20,3:10,35,0,4
chr2	230668953	.	T	TA	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:7,1:16,1:6,19,0,3
chr2	230668968	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:3,7:6,10:2,7,2,15
chr2	230668982	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:4,7:4,7:0,8,1,13
chr2	230705516	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:13,0:20,4,2,0
chr2	230705521	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=160,195;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,3:17,0:20,6,3,0
chr2	230841074	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,5:5,4:1,10,1,9
chr2	231034036	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=102,141;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:231034036_T_TC:231034036:0,2,0,1
chr2	231034037	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=204,141;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:231034036_T_TC:231034036:0,3,0,1
chr2	231034046	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=204,141;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:231034036_T_TC:231034036:0,3,0,1
chr2	231077393	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:11,0,3,0
chr2	231077636	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.167:21:7,0:6,2:13,5,0,3
chr2	231077643	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,10;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.266:20:6,1:6,0:11,4,0,5
chr2	231081405	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	231101855	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,4:4,1:4,7,2,3
chr2	231103185	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	231106244	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:1,2,3,5
chr2	231106306	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=207,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	231118186	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,7:3,2:0,7,0,10
chr2	231120255	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	231149108	.	G	A	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=318.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,96:0.990:96:0,37:0,56:0,0,48,48
chr2	231157512	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=63.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.608:31:5,9:7,10:3,9,6,13
chr2	231157527	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,23:0.705:32:2,11:7,11:1,8,6,17
chr2	231174591	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:10,2:13,0:23,0,2,0
chr2	231175592	.	T	TGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,296;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	231175763	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=191,177;MMQ=57,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.768:15:1,4:2,8:3,0,12,0
chr2	231177200	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.298:15:6,1:5,3:11,0,4,0
chr2	231193641	.	C	T,CAAAAACTTAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,32,35;MFRL=101,243,218;MMQ=60,60,60;MPOS=2,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,1,1:2,0,0:1,2,0,2
chr2	231193642	.	T	TGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=124,243;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr2	231193653	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	231226364	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,2:10,0:11,14,1,1
chr2	231226488	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=172,250;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	231258302	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=148,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	231330919	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=125,137;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.321:30:6,3:10,1:13,8,9,0
chr2	231330923	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=115,141;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.219:29:9,0:9,0:14,8,7,0
chr2	231334495	.	TA	T,TAA	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=150,117,64;MMQ=60,60,60;MPOS=13,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=7.14,4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:48,9,7:0.125,0.095:64:16,4,3:27,5,4:27,21,7,9
chr2	231363231	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.090:63:21,0:24,0:17,41,0,5
chr2	231363252	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:7,2:10,2:3,22,2,2
chr2	231405930	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:3,0,1,0
chr2	231683487	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=205,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr2	231738263	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0|1:231738263_C_T:231738263:0,0,3,8
chr2	231738269	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:231738263_C_T:231738263:0,0,3,7
chr2	231738318	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	231740276	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	231860848	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:231860848_A_G:231860848:0,0,1,0
chr2	231860856	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:231860848_A_G:231860848:0,0,1,0
chr2	231861032	.	TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.974:31:0,18:0,13:0,0,26,5
chr2	231864490	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:3,2,2,3
chr2	231864600	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	231865018	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr2	231865047	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,3:2,1:7,1,3,1
chr2	231865269	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.655:7:0,2:2,1:0,2,1,4
chr2	231940295	.	CT	C,CTT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=23,34,25;MFRL=146,159,119;MMQ=60,60,60;MPOS=11,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.15,8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,5,9:0.116,0.189:44:15,3,6:12,2,1:9,21,3,11
chr2	231944373	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.356:43:12,4:16,11:5,23,1,14
chr2	231988403	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.118:36:23,2:9,1:15,17,2,2
chr2	232026275	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:1,6:6,10:0,7,2,14
chr2	232030510	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	232030555	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=252,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr2	232035429	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,2:7,5:4,7,3,4
chr2	232072796	.	ATTTG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,5:6,3:13,1,8,0
chr2	232087385	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,3:6,6:11,0,9,0
chr2	232087474	.	AT	GA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,26:0,22:0,0,20,28
chr2	232104566	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=121,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	232156257	.	AC	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=212,166;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr2	232196472	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.362:17:2,4:8,1:6,5,5,1
chr2	232317263	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=207,203;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr2	232324780	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=190,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr2	232326793	.	C	CTTCTTTAGATGGCTATTTAAAAATACTAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=234,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr2	232326801	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	232574807	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr2	232645701	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=18,13;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.165:28:8,1:3,0:21,2,5,0
chr2	232653481	.	A	ACT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.942:13:0,6:0,6:0,0,2,11
chr2	233028070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	233243660	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,5,8
chr2	233245090	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,145;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:4,2,5,0
chr2	233272162	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=154,219;MMQ=52,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,1:1,1,1,1
chr2	233272528	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:7,4:10,5:2,15,4,5
chr2	233272925	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,113;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr2	233274391	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,198;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,1:16,1:4,26,0,2
chr2	233323177	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	233345390	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=18,13;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.374:19:3,0:3,0:6,6,7,0
chr2	233346398	.	C	CACTGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233346662	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	233347919	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,1,15
chr2	233350000	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr2	233350041	.	A	AGGGCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:233350041_A_AGGGCC:233350041:0,1,0,1
chr2	233350042	.	T	TGGGAGCAGAGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,16;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:233350041_A_AGGGCC:233350041:0,1,0,1
chr2	233350045	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:233350041_A_AGGGCC:233350041:0,1,0,1
chr2	233390937	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=91,135;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,3:2,4:2,1,5,2
chr2	233392020	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=215,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AG;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr2	233398875	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,0,2
chr2	233405445	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:1,2,0,1
chr2	233406204	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=129,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:2,5,0,4
chr2	233408220	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr2	233413098	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233413098_C_G:233413098:0,0,0,1
chr2	233413101	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233413098_C_G:233413098:0,0,0,1
chr2	233413393	.	T	TCCATTTGTTTTCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,1746;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	233415978	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.663:36:4,15:7,9:3,9,9,15
chr2	233421284	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr2	233428927	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,29:0.566:51:12,14:9,15:17,5,22,7
chr2	233429144	.	GTATTTTATTT	G,GTATTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,215,244;MMQ=60,40,60;MPOS=10,33;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,5,6;RU=TATTT;STR;TLOD=7.29,11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.382,0.509:5:0,1,3:0,1,0:0,0,0,5
chr2	233445925	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=195,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:233445925_G_T:233445925:0,1,0,1
chr2	233445934	.	T	TTAGTTCAGTGCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:233445925_G_T:233445925:0,0,0,1
chr2	233445937	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:233445925_G_T:233445925:0,0,0,1
chr2	233470900	.	TC	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=53.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.543:35:4,8:12,11:8,8,9,10
chr2	233470931	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:3,4:10,11:3,10,5,10
chr2	233536926	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	233620927	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:2,0:2,0:3,1,1,0
chr2	233641083	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr2	233652137	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr2	233660704	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,1:6,1:6,0,2,0
chr2	233708806	.	A	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,29:0.395:74:18,12:26,17:24,21,14,15
chr2	233711987	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:4,1,4,0
chr2	233712049	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:17,4:10,8:21,7,8,4
chr2	233712226	.	CACA	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.440:23:8,6:3,2:0|1:233712226_CACA_C:233712226:1,12,1,9
chr2	233712248	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:8,5:4,6:0|1:233712226_CACA_C:233712226:0,12,0,11
chr2	233712296	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=215,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,2:7,4:0,10,0,6
chr2	233721455	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.467:32:7,7:9,7:12,5,12,3
chr2	233740055	.	AAGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=AG;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:2,1:4,0,2,0
chr2	233740227	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,1:8,5:6,7,2,4
chr2	233740908	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	233744428	.	G	GGCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	233746015	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233746015_C_G:233746015:0,0,0,1
chr2	233746017	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233746015_C_G:233746015:0,0,0,1
chr2	233746020	.	A	AATCCTGGCTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233746015_C_G:233746015:0,0,0,1
chr2	233748768	.	C	CCTACTTATCCAGTGTCTTCTCAGAAATCACTAAGGCCAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=157,152;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr2	233750118	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,1,2
chr2	233877986	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:9,3:1,18,0,3
chr2	233925166	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.459:19:4,4:6,2:10,0,8,1
chr2	233925406	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:2,10,0,3
chr2	234072626	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr2	234079301	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:19,2:14,1:6,28,0,3
chr2	234091158	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr2	234091232	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	234093035	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:5,1,7,1
chr2	234104243	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	234107070	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,1:0,2,0,7
chr2	234113301	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=218,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,6:2,0:0,2,0,6
chr2	234178624	.	CTT	C,CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=161,136,174;MMQ=60,60,60;MPOS=19,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=11.06,10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,7,8:0.212,0.258:32:9,2,6:8,5,2:16,1,13,2
chr2	234178781	.	AT	A	.	.	DP=100;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.099:66:27,5:18,1:6,54,1,5
chr2	234178811	.	CA	TG	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,2:0.037:79:54,1:20,1:0|1:234178811_CA_TG:234178811:0,77,0,2
chr2	234178814	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,2:0.037:79:54,1:18,1:0|1:234178811_CA_TG:234178811:0,77,0,2
chr2	234294561	.	T	TTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,6:2,5:2,3,9,2
chr2	234350678	.	AG	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=200,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:234350678_AG_CT:234350678:0,2,0,1
chr2	234350681	.	G	GCCGCACCTCATTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=200,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:234350678_AG_CT:234350678:0,2,0,1
chr2	234356711	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=117,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,0:1,2:2,1,1,1
chr2	234371225	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=189,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.641:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr2	234372767	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:1,2:2,5:3,1,5,2
chr2	234372985	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=114,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:1,1,0,5
chr2	234377246	.	C	CTTGACCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=247,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	234386018	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=86,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,2:0,5:2,1,6,1
chr2	234394329	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,30:0.727:41:5,15:5,15:10,1,29,1
chr2	234396542	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,5:2,6:4,0,9,2
chr2	234397006	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:3,6:4,1:0,7,0,7
chr2	234398195	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,0:2,0:0,4,0,4
chr2	234405374	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:2,2,2,1
chr2	234407160	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.635:39:9,10:5,15:10,4,21,4
chr2	234418725	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:6,9,1,1
chr2	234421283	.	A	AATATTATTTTTCTTAGT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=58.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.550:26:5,6:5,8:1,10,1,14
chr2	234429739	.	T	TTTC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,2:5,5:2,10,1,6
chr2	234438246	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	234442437	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=18,35;MFRL=163,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr2	234442492	.	A	AAGGTTTACTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0|1:234442492_A_AAGGTTTACTCT:234442492:0,1,0,1
chr2	234442494	.	G	GGAACAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234442492_A_AAGGTTTACTCT:234442492:0,1,0,1
chr2	234449462	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr2	234450843	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	234451094	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	234457900	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:7,8:12,4:1,19,0,12
chr2	234469945	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=194,183;MMQ=30,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:14,3:6,0:0,20,0,3
chr2	234469974	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=192,216;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,3:1,0:0,6,0,3
chr2	234590527	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:10,1,4,0
chr2	234637707	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:7,0,4,0
chr2	234638690	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,156;MMQ=57,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:0,8,0,9
chr2	234652717	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,281;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	234668879	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	234676411	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	234688036	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:11,6:12,6:12,11,6,6
chr2	234698579	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:7,8,2,1
chr2	234701602	.	G	GGGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:234701602_G_GGGA:234701602:0,3,0,1
chr2	234701605	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:234701602_G_GGGA:234701602:0,3,0,1
chr2	234701606	.	A	ACCATCACGTGTCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:234701602_G_GGGA:234701602:0,3,0,1
chr2	234701611	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:234701602_G_GGGA:234701602:0,3,0,1
chr2	234701619	.	GG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=100,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	234702449	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:6,1:5,7:0|1:234702449_G_A:234702449:3,9,3,5
chr2	234702459	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,0:7,6:0|1:234702449_G_A:234702449:5,7,1,5
chr2	234703136	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:5,1:4,2:2,9,1,2
chr2	234704495	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:4,1:4,1:4,4,1,2
chr2	234704690	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.550:20:1,6:7,5:6,3,5,6
chr2	234704746	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=288,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr2	234704974	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=78,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:234704974_G_GAA:234704974:1,1,0,1
chr2	234704975	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=78,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:234704974_G_GAA:234704974:1,1,0,1
chr2	234704981	.	G	GCTCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:234704974_G_GAA:234704974:0,0,0,1
chr2	234707341	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	234708570	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr2	234708629	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	234708824	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,4:5,3:7,2,6,2
chr2	234709000	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:1,7,0,7
chr2	234711008	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=79,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	234712652	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr2	234712921	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	234713588	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=249,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:234713588_C_G:234713588:2,0,1,0
chr2	234713591	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=214,118;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:234713588_C_G:234713588:3,0,1,0
chr2	234713812	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	234716272	.	TTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:2,1:4,2,2,0
chr2	234717988	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:234717988_G_T:234717988:0,0,0,1
chr2	234717997	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:234717988_G_T:234717988:0,0,0,1
chr2	234725502	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,10:0,0,8,13
chr2	234727250	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,10,4
chr2	234753008	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	234754506	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,2,12
chr2	234758393	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:3,4:3,5,3,3
chr2	234761225	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,10:0,0,12,13
chr2	234761355	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	234763137	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:8,7:6,2:4,10,7,3
chr2	234763226	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	234846198	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	234890391	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,8:2,4:6,0,12,0
chr2	234891850	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:9,5:3,9:10,2,4,10
chr2	234916831	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	234967539	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,11:0,0,10,19
chr2	234969184	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr2	235962513	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	236433161	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,24:0.407:59:22,11:13,12:15,20,10,14
chr2	236433331	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr2	236617736	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr2	236682914	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=102,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr2	236685731	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,0:6,4:2,8,0,4
chr2	236685762	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=167,166;MMQ=53,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr2	236691858	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	236817336	.	CT	C,CTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34,34;MFRL=178,72,162;MMQ=60,60,60;MPOS=23,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.83,4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,2:0.420,0.246:9:2,1,1:1,2,1:3,0,5,1
chr2	236817357	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:7,0:4,0:14,2,2,0
chr2	236817629	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	236877066	.	AT	A,ATT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32,33;MFRL=155,124,105;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=14.51,7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,8:0.393,0.416:19:2,5,4:1,2,2:3,0,10,6
chr2	236923361	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,7:5,5:12,0,12,0
chr2	236923570	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,95;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:18,0:16,3:7,32,1,3
chr2	236949534	.	C	CCCAGTGTATCCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,20;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,2:1,0:0|1:236949534_C_CCCAGTGTATCCTG:236949534:0,2,1,1
chr2	236949539	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:236949534_C_CCCAGTGTATCCTG:236949534:0,2,0,1
chr2	236949541	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:236949534_C_CCCAGTGTATCCTG:236949534:0,2,0,1
chr2	236957675	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,4,1
chr2	237029104	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=167,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,1:6,6:4,6,3,4
chr2	237105050	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=152,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:3,4:3,4:1,5,3,6
chr2	237105095	.	G	GATGATGATGAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237105095_G_GATGATGATGAT:237105095:0,0,0,1
chr2	237105097	.	GG	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237105095_G_GATGATGATGAT:237105095:0,0,0,1
chr2	237247072	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr2	237276823	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=124,495;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,2:8,0:15,6,2,0
chr2	237308229	.	G	GGTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:237308229_G_GGTGT:237308229:0,1,0,1
chr2	237308230	.	C	CACCTGGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:237308229_G_GGTGT:237308229:0,1,0,1
chr2	237308233	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:237308229_G_GGTGT:237308229:0,1,0,1
chr2	237995735	.	G	GTTGTT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTGTT;STR;TLOD=79.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,21:0.499:42:7,10:13,10:0|1:237995735_G_GTTGTT:237995735:18,3,21,0
chr2	237995744	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=136,147;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:53,3:0.068:56:22,3:31,0:1|0:237995735_G_GTTGTT:237995735:47,6,3,0
chr2	238005370	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:3,4:6,1:9,1,5,0
chr2	238243579	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:8,0:6,3:0,15,0,4
chr2	238244863	.	TGCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCA;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr2	238253930	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,4:2,5:0,2,1,8
chr2	238255120	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,4:5,5:5,3,7,2
chr2	238257127	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:3,2,3,2
chr2	238257213	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=116,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:8,7:5,9:10,3,12,4
chr2	238257353	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=75,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,6:0,1:0,4,1,6
chr2	238257396	.	G	GGTGTGTGTGGCCTCCAGGTGTGTCATGTACCCCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=202,200;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr2	238261112	.	GC	AA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:3,2,5,1
chr2	238261194	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,206;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:7,5,3,0
chr2	238267058	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr2	238269871	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.681:20:4,9:2,4:1,5,4,10
chr2	238341661	.	A	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=193,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.244:18:7,1:6,2:12,2,3,1
chr2	238419543	.	C	CGTGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=GT;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr2	238419611	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:3,2,2,4
chr2	238427142	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:8,5:6,8:9,5,10,3
chr2	238427251	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.483:35:10,8:8,8:7,11,3,14
chr2	238428454	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:238428454_T_C:238428454:0,0,2,0
chr2	238428459	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:238428454_T_C:238428454:0,0,2,0
chr2	238435897	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	238460991	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.212:20:6,3:9,0:9,7,2,2
chr2	238475619	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	238536255	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	238632132	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:9,3:6,0:0|1:238632132_T_A:238632132:17,0,4,0
chr2	238632135	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:9,4:8,0:0|1:238632132_T_A:238632132:17,0,4,0
chr2	238662209	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,36;MFRL=235,181;MMQ=45,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238662209_TG_CA:238662209:0,1,0,1
chr2	238662213	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=235,181;MMQ=45,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238662209_TG_CA:238662209:0,1,0,1
chr2	238662217	.	TT	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=235,181;MMQ=45,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238662209_TG_CA:238662209:0,1,0,1
chr2	238662218	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,36;MFRL=0,235;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:238662209_TG_CA:238662209:0,0,0,1
chr2	238662221	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=233,181;MMQ=53,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:238662209_TG_CA:238662209:0,2,0,1
chr2	238688244	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	238726339	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,64;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:18,1:16,1:19,15,0,2
chr2	238896494	.	C	CA,CAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34,33;MFRL=75,154,127;MMQ=60,60,60;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.42,7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,5:0.553,0.348:14:0,3,1:1,5,3:1,0,13,0
chr2	238903310	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr2	238912120	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr2	238939370	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.558:11:2,4:1,2:1,4,0,6
chr2	238940752	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:9,4:3,1:13,0,5,0
chr2	238944441	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,315;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr2	238978064	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.119:32:9,1:8,0:12,17,0,3
chr2	238982516	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=216,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:238982516_TTC_T:238982516:0,1,0,1
chr2	238982522	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=216,179;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238982516_TTC_T:238982516:0,1,0,1
chr2	238991557	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:4,1:0,2:0|1:238991557_CT_C:238991557:4,0,3,0
chr2	238991560	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,3:2,0:3,0,4,0
chr2	238991562	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:4,1:0,0:0|1:238991557_CT_C:238991557:4,0,3,0
chr2	239002480	.	CTTG	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=71.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,9:0,8:0,0,14,4
chr2	239007806	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	239007850	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr2	239010577	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr2	239025523	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,9,4
chr2	239025755	.	G	GTCCTTGTCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	239036416	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0|1:239036416_T_C:239036416:0,0,1,8
chr2	239036423	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,1:0,5:0|1:239036416_T_C:239036416:0,0,0,7
chr2	239037273	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	239049540	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=204,192;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,2:5,4:6,4,3,3
chr2	239049751	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:2,15,1,1
chr2	239054504	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,4:0,11:0,0,3,12
chr2	239059610	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.782:21:2,9:2,6:3,1,7,10
chr2	239082166	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:3,1,5,0
chr2	239092485	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	239093788	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,4:7,4:16,0,8,0
chr2	239102856	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,5:6,4:12,0,9,0
chr2	239103574	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=114,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:1,5,0,7
chr2	239103614	.	TA	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:239103614_TA_CT:239103614:0,4,0,1
chr2	239103617	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:239103614_TA_CT:239103614:0,4,0,1
chr2	239134138	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:1,2:4,2:1,4,0,4
chr2	239139920	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,5:5,4:1,6,2,7
chr2	239148996	.	CCCGT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCGT;STR;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:3,6:1,3:2,3,7,2
chr2	239155105	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,152;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:4,10,0,2
chr2	239168596	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.228:24:10,1:9,4:18,1,5,0
chr2	239184581	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:2,2:8,2:1,10,0,4
chr2	239234629	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:14,2:0|1:239234629_G_A:239234629:4,21,1,1
chr2	239234638	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=142,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:9,2:0|1:239234629_G_A:239234629:4,16,1,1
chr2	239237953	.	G	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,42:0.599:70:6,17:21,25:1,27,1,41
chr2	239241445	.	AT	A,ATT	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=155,163,141;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=11.65,6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,10,9:0.163,0.148:60:21,9,5:17,1,4:30,11,17,2
chr2	239242719	.	G	GT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.457:16:0,0:2,2:0,9,1,6
chr2	239247174	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr2	239264713	.	G	GTTGAAAAATCA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=144,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,2:12,0:0|1:239264713_G_GTTGAAAAATCA:239264713:2,15,1,1
chr2	239264715	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=144,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,2:11,0:0|1:239264713_G_GTTGAAAAATCA:239264713:2,15,1,1
chr2	239264717	.	A	ATTTTAT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:11,0:0|1:239264713_G_GTTGAAAAATCA:239264713:2,14,1,1
chr2	239264718	.	G	GTTA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,1:10,0:0|1:239264713_G_GTTGAAAAATCA:239264713:2,14,1,1
chr2	240016824	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:5,6:3,9:0,8,0,15
chr2	240029736	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,8:0,0,12,0
chr2	240048437	.	A	ATTGGGTCAGAAAGGTGACAAGGTCTTATAGACCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=134,170;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.383:4:3,1:0,0:0|1:240048437_A_ATTGGGTCAGAAAGGTGACAAGGTCTTATAGACCAT:240048437:0,3,0,1
chr2	240048441	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=145,170;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:240048437_A_ATTGGGTCAGAAAGGTGACAAGGTCTTATAGACCAT:240048437:0,2,0,1
chr2	240048452	.	GGCT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:240048452_GGCT_G:240048452:0,1,0,1
chr2	240048457	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:240048452_GGCT_G:240048452:0,1,0,1
chr2	240055901	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr2	240061394	.	TG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.130:27:11,3:11,0:15,9,2,1
chr2	240066417	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:0,10:1,12:0,1,6,16
chr2	240085403	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	240085702	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:0,0:0|1:240085702_A_C:240085702:0,2,0,1
chr2	240085705	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:240085702_A_C:240085702:0,1,0,1
chr2	240085707	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:240085702_A_C:240085702:0,1,0,1
chr2	240323905	.	T	TG	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=123.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,42:0.566:74:19,20:13,21:17,15,25,17
chr2	240500413	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:2,3:4,5,3,6
chr2	240500437	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:5,4:2,1:5,2,2,4
chr2	240504878	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:0,5,0,7
chr2	240702216	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr2	240721598	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=121,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.673:22:5,8:1,6:2,5,5,10
chr2	240834669	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.812:19:1,8:2,8:2,1,9,7
chr2	240900607	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.361:21:6,3:6,4:6,8,5,2
chr2	240923146	.	TC	CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.410:32:8,6:10,7:7,12,6,7
chr2	240946766	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:4,6:11,4:7,8,4,7
chr2	240954110	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,2:7,1:12,0,3,0
chr2	240958129	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=150,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:0,6,0,3
chr2	240985511	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=200,192;MMQ=24,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	241078784	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,1:5,5:0,7,1,5
chr2	241079382	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=217,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:3,1,3,1
chr2	241375527	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	241390827	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr2	241394518	.	GAA	TCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,18;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:241394518_GAA_TCT:241394518:1,2,0,1
chr2	241394523	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:241394518_GAA_TCT:241394518:1,2,0,1
chr2	241394527	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:241394518_GAA_TCT:241394518:1,2,0,1
chr2	241395353	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241395353_A_G:241395353:0,0,1,0
chr2	241395367	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:241395353_A_G:241395353:0,0,1,0
chr2	241395960	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,5:1,2:1,1,5,2
chr2	241397333	.	CT	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:241397333_CT_AG:241397333:1,0,1,0
chr2	241397338	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,13;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:241397333_CT_AG:241397333:1,0,1,0
chr2	241397342	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241397333_CT_AG:241397333:1,0,1,0
chr2	241420522	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=101,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:7,2:0|1:241420522_A_T:241420522:5,6,1,1
chr2	241420525	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=101,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:2,0:9,2:0|1:241420522_A_T:241420522:5,6,1,1
chr2	241420533	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=81,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:1,1,2,6
chr2	241439326	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:241439326_G_C:241439326:0,0,5,1
chr2	241439329	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:241439326_G_C:241439326:0,0,5,1
chr2	241439337	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:241439326_G_C:241439326:0,0,6,1
chr2	241440020	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	241451326	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=159,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,1,1
chr2	241452198	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr2	241452212	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr2	241492255	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	241512470	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,6:1,3:2,0,9,0
chr2	241531978	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:20,1:9,2:2,28,0,3
chr2	241534381	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	241535830	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:9,0:12,2:6,15,0,2
chr2	241538229	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0,5,0,6
chr2	241555784	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:2,0,3,2
chr2	241631267	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	241657662	.	G	GGAAATGGAGCGGCTCCGGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:241657662_G_GGAAATGGAGCGGCTCCGGGA:241657662:0,1,0,1
chr2	241657665	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:241657662_G_GGAAATGGAGCGGCTCCGGGA:241657662:0,1,0,1
chr2	241659368	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=176,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:1,1:0,2,0,4
chr2	241662141	.	C	CCATTTTTAGTTCTACTTTGACACGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	241663019	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:1,3,1,1
chr2	241674222	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,8:0,0,2,13
chr2	241680644	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241696840	.	ATCC	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TCC;STR;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.901:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr2	241702561	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	241702840	.	AGGAGAAAGGGGAAC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241702840_AGGAGAAAGGGGAAC_A:241702840:0,0,0,1
chr2	241702859	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241702840_AGGAGAAAGGGGAAC_A:241702840:0,0,0,1
chr2	241702861	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241702840_AGGAGAAAGGGGAAC_A:241702840:0,0,0,1
chr2	241712094	.	C	CCCCACGGCGACTGAAGTCATCCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=184,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr2	241712707	.	GGACA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr2	241722613	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	241727429	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=13,14;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:0,0:1,0:0|1:241727429_A_C:241727429:2,1,2,0
chr2	241727435	.	C	CCGGGGGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,1:2,1:0|1:241727429_A_C:241727429:2,1,2,0
chr2	241727436	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=19,25;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,1:1,0:0|1:241727429_A_C:241727429:2,1,2,0
chr2	241808685	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:3,2,2,1
chr2	241808792	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=127,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,1,1
chr2	241813496	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:1,2,3,1
chr2	241814432	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=275,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	241815307	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=88,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,3:1,1,9,0
chr2	241815473	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,0:5,6:1,7,1,5
chr2	241818261	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	241827676	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:2,1:2,0,1,1
chr2	241827696	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr2	241834875	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:3,2,3,0
chr2	241871847	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,4:6,6:5,3,2,8
chr2	241874559	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=197,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0|1:241874559_T_C:241874559:0,2,0,3
chr2	241874577	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=191,187;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:241874559_T_C:241874559:0,2,0,1
chr2	241889171	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:1,4,1,3
chr2	241889937	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=139,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:2,4:9,5:4,7,1,8
chr2	241898824	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=94,114;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:4,8:8,4:10,3,4,8
chr2	241898947	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:2,0:7,2:2,7,0,4
chr2	241903108	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:11,2:11,7,2,0
chr2	241973385	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr2	241973972	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=138,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.374:13:5,1:1,0:6,2,5,0
chr2	241974228	.	G	GAGATACTGAGCACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.304:4:0,1:2,0:1,2,0,1
chr2	241976615	.	CG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,7:5,3:7,3,7,4
chr2	242003558	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr2	242004199	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr2	242004219	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,9,5
chr2	242011081	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:242011081_A_C:242011081:0,0,1,0
chr2	242011104	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:242011081_A_C:242011081:0,0,1,0
chr2	242011112	.	CGAGA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=185,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:242011081_A_C:242011081:0,1,1,0
chr2	242011122	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=185,255;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:242011081_A_C:242011081:0,1,1,0
chr2	242011151	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr2	242011314	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.303:13:6,0:2,0:1,8,4,0
chr2	242021129	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,1:8,5:6,7,2,4
chr2	242026957	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:4,4:5,1:1,8,1,4
chr2	242029359	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.350:35:13,6:10,6:22,1,10,2
chr2	242036871	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,2:3,5:1,7,1,6
chr2	242046737	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,4:7,3:8,5,5,2
chr2	242046993	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=225,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	242047750	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=118,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr2	242063350	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=73,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,4,0
chr2	242072280	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,2,2
chr2	242077298	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	242079233	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	242082480	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr2	242099961	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,11:0,0,1,19
chr2	242142737	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr2	242149073	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	242157735	.	C	CAGAATTAGCCTTGGCCTATGATCCCACAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	242162503	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	242163461	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:6,2:1,1:7,1,4,0
chr2	242168967	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:2,2:6,0:4,5,1,1
chr2	242182145	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=133,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr2	242186391	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:6,1,5,0
chr2	242194583	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,4:4,3:1,7,2,5
chr2	242194597	.	TG	AA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:242194597_TG_AA:242194597:2,8,1,1
chr2	242194601	.	T	TAAGGACACGTTTTTCACC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:242194597_TG_AA:242194597:2,6,1,1
chr2	242259614	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.262:39:16,2:13,7:20,9,6,4
chr2	242263615	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.209:25:9,2:11,3:19,1,5,0
chr2	242265313	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=195,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	242276333	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=205,188;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:242276333_A_AC:242276333:0,4,0,1
chr2	242276336	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=205,191;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:242276336_CT_AA:242276336:0,4,0,1
chr2	242276337	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=206,188;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:242276333_A_AC:242276333:0,3,0,1
chr2	242276342	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,33;MFRL=203,191;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:242276336_CT_AA:242276336:0,3,0,1
chr2	242283094	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=187,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	242285545	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:13,4:7,7:13,7,9,2
chr2	242289663	.	C	CATT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATT;STR;TLOD=68.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.391:49:15,8:14,11:1,29,0,19
chr2	242371254	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=132,145;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:242371254_A_T:242371254:0,3,0,1
chr2	242371256	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=132,145;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:242371254_A_T:242371254:0,3,0,1
chr2	242402087	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,5:3,0:0,7,0,5
chr2	242423044	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=187,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	242433348	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.485:19:7,4:1,5:10,0,8,1
chr2	242594622	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:4,3,4,1
chr2	242605962	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr2	242607483	.	GC	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=169,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	242608183	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr2	242610253	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=86,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,3:1,2:0,4,0,5
chr2	242610773	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,11,14
chr2	242611547	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=77,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:5,2,2,0
chr2	242615462	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr2	242615472	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=94,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr2	242615528	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,1,2
chr2	242617792	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	242617851	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,3:2,0:7,1,2,1
chr2	242641566	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	242643983	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:5,0:0,2:5,0,2,0
chr2	242643998	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:3,2,5,0
chr2	242644173	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=97,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,2:1,3:2,3,0,5
chr2	242648545	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,5:1,2:0|1:242648545_C_T:242648545:2,0,8,0
chr2	242648549	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:0|1:242648545_C_T:242648545:1,0,8,0
chr2	242650832	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=104,54;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:5,0:19,2:17,7,2,0
chr2	242651331	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:6,6:5,11:8,3,16,1
chr2	242662761	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.352:12:5,1:1,2:0,8,0,4
chr2	242664463	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:5,0:5,6,2,1
chr2	242674959	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	242684115	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,6:3,2:5,1,5,3
chr2	242688203	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:3,2,2,1
chr2	242688366	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr2	242694697	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=147,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:242694697_G_C:242694697:2,1,1,0
chr2	242694707	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=142,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:242694697_G_C:242694697:3,1,1,0
chr2	242694711	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=171,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:242694697_G_C:242694697:3,1,1,0
chr2	242707101	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.378:41:9,8:13,7:16,10,13,2
chr2	242755599	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr2	242758475	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,365;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	242801062	.	C	CTCAGCTTTTAGCCCCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	242813241	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,4,7
chr2	242813276	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,0,9
chr2	242815267	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:13,9,0,2
chr2	242836365	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:7,3:8,4,3,2
chr2	242839581	.	A	ATGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=211,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242839581_A_ATGT:242839581:0,1,0,1
chr2	242839583	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=211,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242839581_A_ATGT:242839581:0,1,0,1
chr2	242842568	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.331:31:8,5:13,5:6,15,5,5
chr3	367757	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=70.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,25:0.500:50:13,16:12,9:7,18,6,19
chr3	386247	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	391001	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr3	402069	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,143;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:11,3:18,0:18,12,3,0
chr3	403345	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr3	423904	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=108,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.407:32:7,3:12,9:14,5,8,5
chr3	440088	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr3	1269680	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:5,4:8,4:4,9,3,5
chr3	1320271	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	1337203	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr3	1337259	.	G	GTT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=164,54;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=T;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:1337259_G_GTT:1337259:12,3,1,1
chr3	1337269	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=162,54;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:0|1:1337259_G_GTT:1337259:14,4,1,1
chr3	1337275	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=161,54;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:1337259_G_GTT:1337259:15,3,1,1
chr3	1337279	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=158,54;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:10,2:0|1:1337259_G_GTT:1337259:16,5,1,1
chr3	1339680	.	GGTTTTT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GTTTTT;STR;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.426:17:6,1:3,6:1,9,1,6
chr3	1369105	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr3	1369278	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:4,5:5,2:0,9,2,5
chr3	1413903	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr3	1415195	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	1415811	.	TAAAAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=11071958,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAC;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr3	1427566	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,0,4
chr3	1444243	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr3	2908335	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr3	3030223	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr3	3078840	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,10,5
chr3	3080527	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	3081750	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:4,5,1,3
chr3	3081959	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=210,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.711:11:1,4:1,4:0,3,2,6
chr3	3082003	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr3	3084147	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr3	3095404	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=266,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	3097942	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr3	3118142	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,2:1,5:6,0,7,0
chr3	3137155	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=14,30;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,5:0,3:0,1,0,11
chr3	3170910	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,4,15
chr3	3170947	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	3171502	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	3171713	.	G	GCCTGACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	3188362	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr3	3189059	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=87.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,22,2
chr3	3189398	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:7,9:6,8:0,13,3,15
chr3	3192524	.	A	ATAAC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAC;STR;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,4:4,4:10,2,9,1
chr3	3194107	.	G	GA	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,34:0.453:75:18,13:17,10:33,8,24,10
chr3	3194301	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:16,0:17,4:5,28,0,4
chr3	3197871	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=299.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,39:0,43:0,0,59,27
chr3	3215901	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=120,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.403:23:8,5:5,4:8,6,3,6
chr3	3215954	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr3	3221430	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,9:0,0,1,19
chr3	3886721	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=130,201;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:7,1:4,6:6,5,6,3
chr3	3886847	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:4,3:7,11:3,8,3,11
chr3	3889067	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=180,151,154;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.24,12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,6:0.339,0.535:11:0,0,1:1,4,5:1,0,9,1
chr3	4345849	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr3	4358782	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.121:22:7,2:12,0:0|1:4358782_G_GA:4358782:1,19,0,2
chr3	4358788	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:7,1:12,0:0|1:4358782_G_GA:4358782:1,21,0,2
chr3	4403767	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr3	4403817	.	TT	AC,AT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,31,31;MFRL=0,193,132;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=33.42,42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,11,15:0.414,0.552:26:0,6,8:0,4,7:0,0,20,6
chr3	4403837	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,20,8
chr3	4452737	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	4461698	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	4687470	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	4693937	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,3:0,3:0,5,2,4
chr3	4693943	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0|1:4693943_G_A:4693943:0,4,0,4
chr3	4693953	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:0|1:4693943_G_A:4693943:0,6,0,3
chr3	4693959	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:0|1:4693943_G_A:4693943:0,6,0,3
chr3	4695680	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	4700012	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=199,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:4700012_G_T:4700012:1,3,0,1
chr3	4700018	.	AC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=199,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:4700012_G_T:4700012:1,3,0,1
chr3	4704986	.	C	T,A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31,32;MFRL=222,129,167;MMQ=60,60,60;MPOS=13,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,1:2,1,0:0,3,0,2
chr3	4704991	.	TG	AG,CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29,32;MFRL=222,129,167;MMQ=60,60,60;MPOS=8,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,1:1,1,0:0,3,0,2
chr3	4709007	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,6:1,1:1,1,6,1
chr3	4716708	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr3	4738774	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr3	4776784	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr3	4819151	.	A	AATGCTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	4821374	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr3	4829732	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,27:0.431:62:15,10:20,14:8,27,11,16
chr3	4856180	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,16:0,21:0,0,24,13
chr3	4856234	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.495:40:11,9:9,9:9,11,7,13
chr3	4856650	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:6,0,6,0
chr3	4856993	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	4859725	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=113.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,14:0,19:0,0,30,8
chr3	5023221	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:4,5,1,5
chr3	5241223	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	6903260	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:5,3:4,5:4,5,3,6
chr3	6903297	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,1:5,7:2,4,1,7
chr3	6903601	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr3	7348129	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:6,2:0,2:6,0,4,0
chr3	7456675	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr3	7494245	.	TTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=78,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TG;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.559:5:1,1:1,1:1,1,3,0
chr3	7620168	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,19:0.401:48:13,12:15,7:0|1:7620168_A_G:7620168:10,19,7,12
chr3	7620170	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:45,3:0.080:48:22,0:19,3:1|0:7620168_A_G:7620168:16,29,1,2
chr3	7621093	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,3:0,5,0,7
chr3	7722083	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=221,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	8543713	.	G	GT	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=153.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.981:46:0,25:0,21:0,0,3,43
chr3	8579093	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,7:5,2:3,4,4,5
chr3	8609071	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:5,1,3,1
chr3	8665360	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,0:2,5:0,4,1,5
chr3	8667896	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:3,0:0,1:2,1,1,1
chr3	8669361	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.534:28:5,6:6,8:0|1:8669361_C_A:8669361:9,4,5,10
chr3	8669367	.	TG	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.517:29:6,4:7,9:0|1:8669361_C_A:8669361:9,5,6,9
chr3	8671319	.	C	CTGACTCACCAGTGGTTCACAGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACTCACCAGTGGTTCACAGA;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	8775379	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,4:5,4:8,0,8,0
chr3	8931984	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr3	8932189	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,6:2,6:2,3,5,7
chr3	8955240	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	8983367	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,1:7,0:4,13,0,2
chr3	8988809	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	9000759	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,1:10,1:0,13,0,2
chr3	9005078	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.467:47:11,8:13,13:5,20,3,19
chr3	9005085	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.518:48:11,9:10,15:2,21,5,20
chr3	9032159	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=201,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.763:15:1,4:2,7:3,0,12,0
chr3	9036010	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr3	9069747	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.469:41:10,12:10,7:14,8,12,7
chr3	9088974	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	9089254	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	9102103	.	T	TTTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=173,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:9102103_T_TTTA:9102103:0,2,0,1
chr3	9102106	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=173,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:9102103_T_TTTA:9102103:0,2,0,1
chr3	9102137	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	9406661	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:4,1,7,1
chr3	9406704	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:11,4:9,8:17,3,10,2
chr3	9407022	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,6:7,2:2,10,1,7
chr3	9416380	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,5:7,5:1,8,1,9
chr3	9489767	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	9495385	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=141.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,22:0,18:0,0,35,5
chr3	9593942	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=19,18;MFRL=128,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.367:9:1,0:2,0:0|1:9593942_C_G:9593942:3,3,3,0
chr3	9593950	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,9;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:1,0:4,0:0|1:9593942_C_G:9593942:2,3,3,0
chr3	9593955	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,15;MFRL=128,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.361:9:2,0:4,0:0|1:9593942_C_G:9593942:3,3,3,0
chr3	9691526	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=210,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr3	9730529	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:0,0:2,1:0,3,0,2
chr3	9743398	.	TGGAG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGAG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	9746154	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	9747441	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=202,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:9747441_G_A:9747441:1,1,0,1
chr3	9747443	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=202,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:9747441_G_A:9747441:1,1,0,1
chr3	9757287	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	9758664	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr3	9759884	.	AG	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=90,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:0,0:0|1:9759884_AG_TT:9759884:0,2,0,1
chr3	9759892	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=90,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:0,0:0|1:9759884_AG_TT:9759884:0,2,0,1
chr3	9768461	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr3	9780806	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:8,9,1,1
chr3	9799113	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr3	9803126	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.268:28:7,2:13,5:12,9,5,2
chr3	9831112	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	9831680	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr3	9841989	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:1,4,3,6
chr3	9854865	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:3,3,3,0
chr3	9854913	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:5,3:5,4,2,2
chr3	9857974	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,11;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:9857974_G_T:9857974:0,1,0,1
chr3	9857983	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9857974_G_T:9857974:0,0,0,1
chr3	9857985	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9857974_G_T:9857974:0,0,0,1
chr3	9859456	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:2,2,1,4
chr3	9876301	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	9880697	.	GGCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,3,1
chr3	9918776	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:11,7:4,3:11,4,6,4
chr3	9944636	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=101,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:8,4:10,3:10,8,6,1
chr3	9944832	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=255,91;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr3	9945933	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=201,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	9962157	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=115,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,3:3,1:6,0,5,0
chr3	9969932	.	TGG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:0,3:2,2:1,1,2,3
chr3	9972484	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:0|1:9972484_T_C:9972484:3,0,5,0
chr3	9972493	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:9972484_T_C:9972484:0,0,12,0
chr3	9974460	.	G	GCA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,56;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:19,2:17,0:16,22,0,2
chr3	9975353	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	9988095	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:3,7:8,6:5,8,5,9
chr3	10028286	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,2:16,1:17,17,2,1
chr3	10049334	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.684:11:1,0:2,0:3,0,0,8
chr3	10081106	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr3	10088223	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=162,166;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:20,4:14,2:30,4,6,0
chr3	10088239	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=159,166;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,17:0.273:64:24,6:21,8:0|1:10088239_G_A:10088239:37,10,17,0
chr3	10088242	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=159,166;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,17:0.272:64:24,7:22,9:0|1:10088239_G_A:10088239:37,10,17,0
chr3	10088266	.	G	T	.	.	DP=107;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=150,150;MMQ=60,50;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,36:0.354:102:31,19:35,16:45,21,31,5
chr3	10088404	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=169,139;MMQ=39,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,36:0.457:79:21,17:21,18:0|1:10088404_C_T:10088404:8,35,1,35
chr3	10088407	.	AG	A	.	.	DP=78;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=166,143;MMQ=33,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=129.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,35:0.450:78:23,17:18,14:0|1:10088404_C_T:10088404:8,35,1,34
chr3	10088409	.	TAAG	T	.	.	DP=75;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=166,148;MMQ=33,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=120.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,32:0.429:75:23,17:18,15:0|1:10088404_C_T:10088404:7,36,1,31
chr3	10088422	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=164,149;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=93.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,25:0.406:62:17,13:20,10:0|1:10088404_C_T:10088404:4,33,1,24
chr3	10088443	.	CA	AG	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=169,183;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:8,8:13,6:3,19,0,14
chr3	10088461	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=179,184;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:5,4:11,3:2,14,0,7
chr3	10089499	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=204,232;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:10089499_A_G:10089499:3,0,1,0
chr3	10089509	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=180,217;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:10089499_A_G:10089499:4,0,2,0
chr3	10089549	.	TACTA	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=142,180;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,1:5,2:10,0,3,0
chr3	10089723	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=29,31;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,2:5,5:5,10,1,6
chr3	10089738	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,1:5,2:3,12,1,2
chr3	10089749	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:8,0:3,2:1,10,0,2
chr3	10089772	.	CA	GG	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=35,35;MFRL=125,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:0|1:10089772_CA_GG:10089772:0,8,0,3
chr3	10089775	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=32,36;MFRL=125,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:0|1:10089772_CA_GG:10089772:0,8,0,3
chr3	10089805	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=34,29;MFRL=181,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:10089805_G_T:10089805:0,4,0,1
chr3	10089808	.	GG	TA	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=34,31;MFRL=181,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:10089805_G_T:10089805:0,4,0,1
chr3	10089811	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=181,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:10089805_G_T:10089805:0,4,0,1
chr3	10089815	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=29,33;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0|1:10089815_A_C:10089815:0,1,0,2
chr3	10089818	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=35,28;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:10089815_A_C:10089815:0,1,0,2
chr3	10091252	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=168,183;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:0|1:10091252_A_C:10091252:0,9,0,2
chr3	10091261	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=168,183;MMQ=27,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:4,1:0|1:10091252_A_C:10091252:0,9,0,2
chr3	10091289	.	G	GAGTTGAAATTTTCATTTGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=183,189;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	10103759	.	A	T	.	.	DP=109;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=164,174;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,4:0.047:103:32,2:66,2:99,0,4,0
chr3	10103768	.	C	T	.	.	DP=134;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=159,138;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,3:0.031:124:38,2:82,1:121,0,3,0
chr3	10103769	.	G	A	.	.	DP=135;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=159,136;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,10:0.084:128:33,7:84,3:118,0,10,0
chr3	10103931	.	CT	C,CTT	.	.	DP=113;ECNT=4;MBQ=20,21,20;MFRL=161,138,153;MMQ=60,60,60;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.01,10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,9,9:0.202,0.205:41:7,4,3:9,3,2:0,23,1,17
chr3	10103964	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=169,146;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.085:57:39,3:12,1:0,53,0,4
chr3	10103983	.	G	GGT	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:41,0:10,1:0|1:10103983_G_GGT:10103983:0,53,0,2
chr3	10103985	.	CAA	C	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:42,1:10,1:0|1:10103983_G_GGT:10103983:0,54,0,2
chr3	10106144	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,136;MMQ=57,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,3:16,1:10,19,3,1
chr3	10106459	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,145;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.163:35:14,2:15,3:18,12,5,0
chr3	10109060	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr3	10109070	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.268:5:2,0:2,1:0|1:10109070_C_CA:10109070:0,4,0,1
chr3	10109071	.	C	CACAAAACCAGCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.274:5:2,0:2,1:0|1:10109070_C_CA:10109070:0,4,0,1
chr3	10188141	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,137;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:8,2:17,0:22,4,2,0
chr3	10219510	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr3	10219729	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	10241987	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	10251196	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,10,0
chr3	10258762	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr3	10261284	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=193,131;MMQ=51,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:4,0,1,0
chr3	10261294	.	AC	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr3	10280474	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:15,2:11,0:14,12,1,1
chr3	10319976	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:9,2:11,9,1,1
chr3	10345926	.	A	ATGACATTAACCTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,15;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr3	10353550	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=161,227;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr3	10353626	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=135,156;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:1,5:5,7:3,3,8,4
chr3	10355241	.	T	TCCTTC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=187,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:10355241_T_TCCTTC:10355241:0,4,1,1
chr3	10355244	.	C	CTGAAAGG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=187,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:10355241_T_TCCTTC:10355241:0,4,1,1
chr3	10355245	.	C	CCCCAGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=187,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:10355241_T_TCCTTC:10355241:0,4,1,1
chr3	10355268	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	10370486	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=95,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:3,3:1,6:2,2,8,1
chr3	10382148	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,29;MFRL=81,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.643:6:1,1:0,2:1,1,4,0
chr3	10382234	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,1:15,1:16,9,2,0
chr3	10400636	.	G	GGATGGTGCATCCATTTCCTAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=190,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,1,1
chr3	10420875	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,5:3,2:5,3,7,0
chr3	10429902	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,2:3,2:11,1,4,0
chr3	10452231	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,3:1,1:7,0,4,0
chr3	10858227	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=134,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.131:32:15,2:13,0:14,14,0,4
chr3	10858252	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=18,13;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.284:22:6,1:2,0:5,11,0,6
chr3	10858258	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,13;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.189:23:3,1:6,0:4,14,0,5
chr3	10967712	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:8,4,2,6
chr3	10967828	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:10967828_C_CA:10967828:1,3,0,1
chr3	10967829	.	C	CTCCTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:10967828_C_CA:10967828:1,3,0,1
chr3	10967851	.	CAGGAGGCCAGACGCCACCCTTAGGAG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=198,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:10967851_CAGGAGGCCAGACGCCACCCTTAGGAG_C:10967851:0,3,0,1
chr3	10967880	.	GCTCCCCA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=198,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10967851_CAGGAGGCCAGACGCCACCCTTAGGAG_C:10967851:0,2,0,1
chr3	10975745	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=120,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:9,2:1,3:5,5,4,1
chr3	11059752	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	11300707	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr3	11304202	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:9,3:8,6:7,10,1,8
chr3	11348623	.	GAAACT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr3	11744544	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=115,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr3	11744573	.	A	AAAGATGAGGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:11744573_A_AAAGATGAGGG:11744573:0,1,0,1
chr3	11744574	.	C	CAGATA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11744573_A_AAAGATGAGGG:11744573:0,1,0,1
chr3	11744576	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11744573_A_AAAGATGAGGG:11744573:0,1,0,1
chr3	11744580	.	GA	AT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11744573_A_AAAGATGAGGG:11744573:0,1,0,1
chr3	11744584	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	11831953	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:5,2:4,1:5,4,3,0
chr3	11880816	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=123,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,4:3,6:1,6,1,9
chr3	12045986	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,8,4
chr3	12046013	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,7:0,0,7,9
chr3	12046124	.	AG	GC	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,8
chr3	12046131	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,9
chr3	12046148	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=0,21;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,0:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,5
chr3	12046168	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=0,20;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,4
chr3	12046196	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,2
chr3	12046207	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,1
chr3	12046215	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,1
chr3	12046222	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,22;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,1
chr3	12198868	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:10,2:18,0:19,9,0,2
chr3	12208652	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	12208671	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:4,0,7,0
chr3	12232208	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr3	12458703	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=248,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr3	12458732	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	12537955	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:7,2:0,1:7,0,3,0
chr3	12560763	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:4,1:1,5:0,6,1,5
chr3	12571420	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.220:24:7,2:7,1:2,17,0,5
chr3	12616533	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:0,6,0,5
chr3	12618262	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:7,6:3,10:2,8,3,13
chr3	12626516	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:1,0,1,4
chr3	12650482	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,5:0,0,2,8
chr3	12660291	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	12776410	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12776410_A_ATC:12776410:0,1,0,1
chr3	12776411	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12776410_A_ATC:12776410:0,1,0,1
chr3	12791172	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:4,3:0,3:4,0,7,0
chr3	12845166	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,1:2,1:2,2,0,3
chr3	12849011	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,1:0,6,0,6
chr3	12854626	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:0,7,1,2
chr3	12859456	.	G	GTCAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12859456_G_GTCAAA:12859456:0,0,0,1
chr3	12859458	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12859456_G_GTCAAA:12859456:0,0,0,1
chr3	12869077	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:8,10,1,1
chr3	12875443	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,6:2,2:1,3,3,5
chr3	12944158	.	CA	C,CAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29,14;MFRL=189,167,136;MMQ=60,52,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=14.26,4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,2:0.586,0.249:9:1,3,0:0,1,0:1,0,8,0
chr3	12954868	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,4:2,7:2,0,11,0
chr3	12956531	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:4,0,7,0
chr3	12962101	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,4:1,3:1,7,0,7
chr3	12963827	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr3	12966054	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:7,1:3,0:6,9,4,0
chr3	13361238	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,7:4,4:7,1,9,2
chr3	13377103	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,0:13,2:12,15,1,1
chr3	13383510	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,1:11,1:10,8,2,0
chr3	13383540	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.336:22:3,4:11,3:10,5,2,5
chr3	13395055	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=131,99;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:9,4,2,0
chr3	13395198	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=131,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:13395198_G_A:13395198:1,2,0,1
chr3	13395202	.	ATCAC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=131,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:13395198_G_A:13395198:1,2,0,1
chr3	13395211	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=131,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13395198_G_A:13395198:0,1,0,1
chr3	13413371	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=83.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,29:0.563:51:8,11:14,16:14,8,20,9
chr3	13413537	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:2,12,0,2
chr3	13421150	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:9,7:4,4:7,6,6,5
chr3	13427778	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,68;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,4:12,0:14,14,3,1
chr3	13438830	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:9,0,3,1
chr3	13461478	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	13538326	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:2,14,0,2
chr3	13538370	.	GCAT	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=180,187;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:13538370_GCAT_G:13538370:2,2,0,2
chr3	13538371	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:2,1,0,1
chr3	13538376	.	CT	GG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=177,187;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:13538370_GCAT_G:13538370:2,0,0,2
chr3	13538381	.	C	CGAGGGGGGGGGG	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,14;MFRL=177,187;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,0:1,0:0|1:13538370_GCAT_G:13538370:2,0,0,2
chr3	13538382	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=177,187;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,0:1,1:0|1:13538370_GCAT_G:13538370:2,0,0,2
chr3	13669537	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr3	13670837	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	13678121	.	C	CATTGATAAAACCAGACTCTAAACCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=144,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr3	13916407	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,5:4,3:6,1,8,0
chr3	14174077	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.450:31:5,5:12,8:9,8,7,7
chr3	14183311	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr3	14187345	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	14187699	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=95,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr3	14190237	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:5,6:13,1:8,10,4,3
chr3	14201352	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,8:1,4:0,5,2,10
chr3	14206468	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:2,2,0,1
chr3	14513704	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=133,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:6,0:12,0:17,5,4,0
chr3	14537867	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=193,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:5,1,9,1
chr3	14538072	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:0,7,1,1
chr3	14548494	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.295:38:12,2:15,8:7,20,4,7
chr3	14555367	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	14555739	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:5,2,4,0
chr3	14555758	.	C	CAGTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=36,24;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:3,3:3,3:3,3,4,3
chr3	14561627	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr3	14562039	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,3:7,0:0,17,0,3
chr3	14563121	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=108,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.108:29:6,0:13,0:11,15,3,0
chr3	14563126	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=108,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.169:29:3,0:14,0:9,15,5,0
chr3	14565017	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=230,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	14566916	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=178,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	14702982	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr3	14708918	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=119.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:0,18:1,19:1,0,29,9
chr3	14709058	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,4:6,6:0,9,0,10
chr3	14724724	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14724724_G_C:14724724:0,1,0,1
chr3	14724727	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14724724_G_C:14724724:0,1,0,1
chr3	14724728	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14724724_G_C:14724724:0,1,0,1
chr3	14724734	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14724724_G_C:14724724:0,1,0,1
chr3	14724739	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14724724_G_C:14724724:0,1,0,1
chr3	14725668	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	14755572	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,8,10
chr3	14756726	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=162,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:14756726_C_T:14756726:2,0,1,0
chr3	14756730	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:14756726_C_T:14756726:0,0,2,0
chr3	14756734	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=145,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14756726_C_T:14756726:1,0,1,0
chr3	14763381	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	14768553	.	C	CAGACTGCTTGAACCTAGGAGTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=153,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	14768554	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=82,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	14801550	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr3	14862119	.	G	GGGTGCCGCTCACCCTGTCC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=178,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:11,4,1,1
chr3	14922388	.	C	CAAATTGGTCAATACCCAACAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	14939198	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr3	14942024	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:0,9,1,8
chr3	14942675	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	14949102	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=99,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:10,5:8,6:14,4,10,1
chr3	14949268	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.407:15:3,3:5,2:0,9,0,6
chr3	14960170	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	14963337	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr3	14965466	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:3,0,6,0
chr3	14965507	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr3	14967731	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=136,41;MMQ=60,58;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:2,6,1,1
chr3	14967749	.	A	ACTTAGAGCGTGAGCTCACTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=82,125;MMQ=55,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	15071871	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,0:6,3:6,8,0,3
chr3	15076143	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:3,1,3,0
chr3	15084262	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.406:23:5,6:7,3:12,2,9,0
chr3	15115270	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr3	15115606	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,7:5,5:4,4,4,8
chr3	15116473	.	ACTATGCTGGC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=242,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	15127522	.	CTAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=137,191;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr3	15132102	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:15132102_T_TG:15132102:0,3,0,1
chr3	15132105	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:15132102_T_TG:15132102:0,3,0,1
chr3	15259865	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	15269257	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:3,0:6,3:10,0,3,0
chr3	15288742	.	CTT	C,CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31,33;MFRL=160,217,162;MMQ=60,60,60;MPOS=29,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.88,4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,3:0.143,0.231:15:5,1,2:3,1,1:10,0,5,0
chr3	15300452	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:8,2:20,0:19,9,1,1
chr3	15300504	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:16,0:12,2:14,14,1,1
chr3	15311464	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr3	15345815	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:15345815_A_T:15345815:0,2,0,1
chr3	15345817	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:15345815_A_T:15345815:0,2,0,1
chr3	15345821	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:15345815_A_T:15345815:0,2,0,1
chr3	15455717	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	15466373	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:7,3:0,2:7,0,5,0
chr3	15507761	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr3	15515695	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr3	15515875	.	A	ACCCCTTGCTACTTGTCCCTCCAGTGATCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.667:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	15516910	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr3	15517025	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr3	15518731	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr3	15539976	.	C	CCACACA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=CA;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.434:7:2,0:2,1:3,1,3,0
chr3	15643043	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	15718652	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	15720781	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:9,0:14,5,1,1
chr3	15736385	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,0,12
chr3	15737610	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,14,5
chr3	15749371	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,2,1
chr3	15752830	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=149.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,19:0,20:0,0,3,37
chr3	15756039	.	G	GAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=195,131;MMQ=40,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.794:12:2,6:0,2:2,0,8,2
chr3	15756215	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=153.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,21:0,24:0,0,5,40
chr3	15807725	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr3	16242101	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,5:4,2:4,0,7,0
chr3	16249998	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:4,5:3,5:5,2,9,1
chr3	16343092	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=130.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,21:0,14:0,0,29,6
chr3	16368180	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr3	16399558	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,0:0|1:16399558_T_G:16399558:0,1,0,1
chr3	16399575	.	GGGGGT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16399558_T_G:16399558:0,0,0,1
chr3	16399587	.	G	GCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16399558_T_G:16399558:0,0,0,1
chr3	16399589	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16399558_T_G:16399558:0,0,0,1
chr3	16450872	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.626:27:5,7:4,10:6,4,9,8
chr3	16633688	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,121;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,2:0.044:65:36,1:26,1:20,43,0,2
chr3	16636093	.	TA	T,TAA	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=142,136,116;MMQ=60,60,60;MPOS=26,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=19.24,5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,13,9:0.213,0.147:57:10,6,2:20,6,5:5,30,1,21
chr3	16639754	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,7:4,2:0,6,0,9
chr3	17209153	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,4:6,1:9,0,5,0
chr3	17209195	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.398:22:3,4:10,2:10,3,6,3
chr3	17209361	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:17209361_G_C:17209361:1,17,0,2
chr3	17209363	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:17209361_G_C:17209361:1,17,0,2
chr3	17299980	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:17,1:16,1:26,7,2,0
chr3	17300133	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=168,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,1:3,5:0,10,0,6
chr3	17413531	.	A	AAAACAAAC,AAAACAAACAAACAAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34,29;MFRL=0,89,156;MMQ=60,40,60;MPOS=18,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=4,6,8;RU=AAAC;STR;TLOD=3.53,7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.343,0.519:3:0,0,0:0,1,1:0,0,3,0
chr3	17418001	.	T	TA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:21,2:19,1:31,11,2,1
chr3	17469887	.	ATG	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.286:25:7,3:6,4:18,0,6,1
chr3	17469901	.	GTGTATA	G,GTA	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=34,35,36;MFRL=163,163,172;MMQ=60,60,60;MPOS=28,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.62,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,4,2:0.100,0.063:43:15,1,2:17,3,0:30,7,6,0
chr3	17469903	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.459:36:10,11:10,5:16,4,15,1
chr3	17470081	.	A	AAG	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.088:31:10,1:19,1:0|1:17470081_A_AAG:17470081:0,29,0,2
chr3	17470086	.	CT	GA	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:9,0:19,1:0|1:17470081_A_AAG:17470081:0,29,0,2
chr3	17470114	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=201,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:3,2:4,3:0,7,0,6
chr3	19190358	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:0,9,0,2
chr3	19436587	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=60.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0,0,16,1
chr3	19925807	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	19940877	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr3	19941074	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	19947105	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,6:8,4:10,5,8,2
chr3	19947296	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,0,5
chr3	19956995	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr3	19961966	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,3:9,0:10,5,3,0
chr3	19974932	.	GTCC	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,2:10,0:10,17,1,1
chr3	20017489	.	GG	CC	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,22:0.426:52:17,13:13,9:23,7,20,2
chr3	20113989	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	20114044	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:20114044_T_C:20114044:0,1,0,2
chr3	20114048	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:20114044_T_C:20114044:0,0,0,2
chr3	20141301	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:8,9:8,11:15,1,19,1
chr3	20141356	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,24:0.377:64:21,13:18,10:24,16,14,10
chr3	20143020	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	20153178	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:8,12,1,1
chr3	20156302	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr3	20168875	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,3:6,7:13,1,10,0
chr3	20189528	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.265:21:2,1:9,4:1,15,0,5
chr3	20212189	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:9,10:11,4:12,8,11,3
chr3	20212754	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:12,0:14,3:0,26,0,3
chr3	20212796	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:4,7:7,8:0,11,0,15
chr3	20216049	.	A	AT	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.104:56:24,5:24,1:28,22,4,2
chr3	20219885	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:0,7,0,5
chr3	21462754	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=67,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.924:20:0,8:1,10:0,1,10,9
chr3	21462787	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chr3	21606027	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	23631338	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:9,2:17,0:3,23,1,1
chr3	23986930	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=219,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr3	24001078	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	24164347	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,77;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:13,5,2,0
chr3	24270500	.	G	GA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=86.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,13:0,16:0,0,5,26
chr3	25639973	.	A	AT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.485:27:6,8:8,5:0,14,2,11
chr3	25660094	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,5:5,3:7,3,5,3
chr3	25661557	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr3	25666156	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,30:0.352:86:29,19:27,11:46,10,26,4
chr3	25668397	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=257,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25668397_A_AGT:25668397:0,1,0,1
chr3	25668399	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=257,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25668397_A_AGT:25668397:0,1,0,1
chr3	25671778	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:5,3:1,5:6,0,8,0
chr3	25673835	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.462:35:13,11:5,5:19,0,15,1
chr3	25674091	.	C	A	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,38:0.507:75:20,17:17,21:8,29,4,34
chr3	25775356	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,15,4
chr3	25805879	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	25824706	.	G	GC	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.213:27:5,3:9,3:8,12,7,0
chr3	25824710	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.378:32:7,2:7,6:0|1:25824710_A_C:25824710:5,15,12,0
chr3	25824714	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,10:0.315:33:9,4:11,3:0|1:25824710_A_C:25824710:6,17,10,0
chr3	25824722	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=29,16;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,7:0.172:40:12,0:13,1:0|1:25824722_A_C:25824722:10,23,7,0
chr3	25824726	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,7:0.171:40:14,1:17,3:0|1:25824722_A_C:25824722:10,23,7,0
chr3	25824734	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.123:47:17,0:17,1:16,25,6,0
chr3	25833387	.	T	TTTGGTTACTGTAGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,352;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	25836023	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	27203864	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=254,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr3	27215923	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:8,0:10,4,2,0
chr3	27233498	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,2:5,2:6,0,3,1
chr3	27233716	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,1:4,4:3,8,0,5
chr3	27243119	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:6,2:2,3:1,8,1,4
chr3	27243871	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:5,2,5,0
chr3	27297684	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr3	27297944	.	A	AATACACAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	27326398	.	T	TATGCAGGCCTATGTACTATA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=232,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:2,7,1,1
chr3	27332282	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=111,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,3:4,0:0,4,0,3
chr3	27332297	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:27332297_G_T:27332297:0,3,0,1
chr3	27332300	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:27332297_G_T:27332297:0,3,0,1
chr3	27332308	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:27332297_G_T:27332297:0,3,0,1
chr3	27338552	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=187,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr3	27350384	.	G	T	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=116.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,45:0.522:86:21,23:20,22:26,15,29,16
chr3	27353716	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	27363637	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.627:22:4,8:4,6:8,0,13,1
chr3	27394419	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:0,7,0,6
chr3	27424799	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=131,301;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr3	27427521	.	A	G	.	.	DP=109;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=143.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,49:0.464:106:28,26:28,23:19,38,11,38
chr3	27427601	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=53.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:4,8:9,7:0,15,0,15
chr3	27446285	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.546:33:9,8:5,10:15,0,13,5
chr3	27463207	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,0:8,3:5,13,1,2
chr3	27475351	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,4:5,3:8,1,7,0
chr3	27478796	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=179,191;MMQ=44,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr3	27478834	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,1:4,4:8,2,5,0
chr3	27490194	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,18:0.382:48:13,6:16,12:17,13,9,9
chr3	27763427	.	G	GCGGCGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr3	28304768	.	CT	C	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,6:0.059:104:54,3:40,3:81,17,5,1
chr3	28373462	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	28381887	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:11,9:8,12:13,6,14,7
chr3	28520513	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,0:11,2:1,15,0,2
chr3	28557206	.	CTGTG	C,CTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,24,25;MFRL=123,84,195;MMQ=60,58,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=TG;STR;TLOD=4.81,8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.303,0.511:6:0,0,2:1,1,0:0,1,1,4
chr3	29476428	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:2,9:5,8:2,5,0,17
chr3	29804300	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr3	29804487	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.523:42:11,13:9,9:5,15,5,17
chr3	29804509	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,24:0,11:0,0,5,30
chr3	29977739	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=120.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,3,29
chr3	30032495	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	30045457	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,4,0,1
chr3	30045461	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=29,32;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,4,0,1
chr3	30045463	.	TGTTGTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=174,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.331:4:2,1:1,0:1|0:30045457_T_A:30045457:0,3,0,1
chr3	30045464	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,34;MFRL=186,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045467	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=186,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045471	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=33,24;MFRL=174,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,1,0,2
chr3	30045473	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045475	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045477	.	TT	GG	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045481	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=30,32;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045483	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=27,29;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30713126	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=98,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.357:15:6,4:3,1:8,2,5,0
chr3	30842597	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	30885594	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:30885594_G_A:30885594:3,0,1,0
chr3	30885601	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:30885594_G_A:30885594:3,0,1,0
chr3	31621228	.	T	TAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,3:0,0,9,2
chr3	31638362	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:8,8:8,6:4,12,4,10
chr3	31642037	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr3	31661402	.	T	TAGAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=185,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31661402_T_TAGAGC:31661402:0,1,0,1
chr3	31661403	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=185,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31661402_T_TAGAGC:31661402:0,1,0,1
chr3	31663515	.	A	AGTGTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,2:0,3:0,0,8,0
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chr3	32571823	.	GA	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=19,9;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:2,1:1,0:3,8,1,6
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chr3	32746288	.	GT	G,GTT	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=123,129,153;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=16.79,8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,17,7:0.237,0.120:62:19,10,3:15,6,4:24,14,21,3
chr3	32758761	.	TTG	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=109.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.969:27:0,16:0,10:0,0,4,23
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chr3	32776232	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr3	32779082	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr3	32804188	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:18,1:9,1:19,9,1,1
chr3	32805843	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	32811547	.	G	GTCTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	32811552	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32811552_C_T:32811552:0,1,0,1
chr3	32811556	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32811552_C_T:32811552:0,1,0,1
chr3	32915214	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	32933360	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=262,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	32933370	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.789:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	32996841	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=186,169;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:32996841_C_T:32996841:0,8,0,2
chr3	32996844	.	CA	TT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=186,169;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:4,0:0|1:32996841_C_T:32996841:0,8,0,2
chr3	32996935	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,0:9,3:12,0,3,0
chr3	32996970	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=153,136;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.210:25:4,0:16,4:20,0,5,0
chr3	32997029	.	C	CA	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=18,27;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.504:35:3,2:4,5:4,14,1,16
chr3	32997096	.	GT	G,GTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=126;ECNT=3;MBQ=36,36,36;MFRL=158,159,105;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,22,35;RU=T;STR;TLOD=3.34,4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,11:0.143,0.510:21:5,5,5:0,0,2:5,0,12,4
chr3	32997278	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=273,241;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32997278_T_C:32997278:0,1,0,1
chr3	32997282	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=273,241;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32997278_T_C:32997278:0,1,0,1
chr3	33038928	.	ATG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33038928_ATG_A:33038928:0,0,0,1
chr3	33038933	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33038928_ATG_A:33038928:0,0,0,1
chr3	33060076	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0,20,0,2
chr3	33060081	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:8,0:11,3:0,19,0,3
chr3	33093190	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,15,5
chr3	33114306	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	33171659	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	33175793	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,12:0,3:0,0,3,12
chr3	33175854	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr3	33194138	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	33194150	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr3	33194990	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.445:40:12,9:9,6:11,11,9,9
chr3	33216357	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr3	33249493	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=252,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0|1:33249493_G_A:33249493:0,1,0,1
chr3	33249495	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=252,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33249493_G_A:33249493:0,1,0,1
chr3	33249497	.	G	GCTTCTCCTTCACAACACCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=252,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33249493_G_A:33249493:0,1,0,1
chr3	33255592	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,7,16
chr3	33406293	.	CT	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,185;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,2:0,6,0,3
chr3	33444286	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=68.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,14,7
chr3	33600984	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	33612364	.	TAA	T,TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20,20;MFRL=178,177,180;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=10.69,10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,6:0.334,0.386:17:2,2,1:1,1,2:1,4,0,12
chr3	33626186	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr3	33634085	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	33645812	.	CTTTT	C,CTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,36,20;MFRL=172,159,202;MMQ=60,60,50;MPOS=27,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,14;RU=T;STR;TLOD=3.12,3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.219,0.341:6:0,0,1:1,1,0:0,3,0,3
chr3	33653622	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,2:0,2:0,1,0,4
chr3	33668662	.	ATTAAGT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:4,2:3,4:0,7,0,6
chr3	33725814	.	G	GA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=157,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.181:27:10,3:9,0:17,5,3,2
chr3	33731377	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,70444099;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:12,1:9,1:4,18,1,1
chr3	33840170	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,6:0.115:59:21,4:31,2:46,7,6,0
chr3	33877500	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=205,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:5,1:2,1:8,0,1,1
chr3	33877513	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=139,244;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:5,0:10,3,3,0
chr3	33877516	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=160,95;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,1:5,0:11,3,2,0
chr3	33893929	.	CT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=184,182,156;MMQ=60,60,60;MPOS=15,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,18,20;RU=T;STR;TLOD=6.23,7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,7:0.301,0.504:13:2,2,3:0,1,3:2,0,10,1
chr3	35724256	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	35724493	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	35731725	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	36422111	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:9,1:10,5,2,0
chr3	36524405	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr3	36534540	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr3	36875406	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,3,0,1
chr3	36875413	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,2,0,1
chr3	36875415	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,2,0,1
chr3	36875424	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,0,0,1
chr3	36875426	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,0,0,1
chr3	36875427	.	CACAA	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,0,0,1
chr3	36887973	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr3	36896653	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr3	37048633	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	37053568	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,3:1,5:2,3,1,7
chr3	37062040	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	37067050	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr3	37067075	.	CTATATA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=TA;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	37089263	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37089263_T_G:37089263:0,1,0,1
chr3	37089269	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37089263_T_G:37089263:0,1,0,1
chr3	37107470	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr3	37107835	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:17,0:21,2:11,28,0,2
chr3	37133124	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr3	37144535	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=93.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,5,21
chr3	37150988	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=139.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,17:0,21:0,0,26,12
chr3	37162944	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:11,2:14,0:24,2,2,0
chr3	37163039	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,24:0,16:0,0,15,25
chr3	37170717	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr3	37285152	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.661:25:3,10:4,4:0,8,2,15
chr3	37327629	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,183;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.577:22:3,8:6,3:2,7,2,11
chr3	37343701	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:10,10,2,0
chr3	37360696	.	AT	A,ATT	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=31,24,31;MFRL=150,120,150;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=8.68,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:46,8,6:0.128,0.108:60:16,4,4:22,2,0:3,43,2,12
chr3	37366459	.	C	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,50:0.573:87:17,26:19,24:13,24,20,30
chr3	37370594	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=119,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:7,12,0,2
chr3	37376500	.	C	CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.603:36:6,9:8,12:12,2,21,1
chr3	37396534	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=170,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:6,0,2,1
chr3	37459347	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37459347_A_G:37459347:0,1,0,1
chr3	37459349	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37459347_A_G:37459347:0,1,0,1
chr3	37459351	.	A	ACCCCGCTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37459347_A_G:37459347:0,1,0,1
chr3	37476427	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.317:39:18,4:9,8:12,15,2,10
chr3	37514974	.	G	GCAGTGTCTGTACGCCTTCT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.318:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	37515037	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,32;MFRL=269,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:37515037_A_AG:37515037:0,1,0,1
chr3	37515039	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=269,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37515037_A_AG:37515037:0,1,0,1
chr3	37515042	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=269,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37515037_A_AG:37515037:0,1,0,1
chr3	37550027	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:1,2:3,0:5,0,2,0
chr3	37560676	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr3	37575039	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:37575039_G_A:37575039:0,0,0,3
chr3	37575050	.	C	CATGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=186,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:37575039_G_A:37575039:0,2,0,1
chr3	37583851	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr3	37670876	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=191,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:37670876_G_C:37670876:0,2,0,2
chr3	37670878	.	G	GGGCGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=228,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:37670876_G_C:37670876:0,3,0,1
chr3	37670880	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=228,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:37670876_G_C:37670876:0,3,0,1
chr3	37725269	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37725269_T_A:37725269:0,0,1,0
chr3	37725270	.	GCCCC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=6,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37725269_T_A:37725269:0,0,1,0
chr3	37774304	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=96,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:6,1:1,3:3,4,4,1
chr3	37818805	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=134,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr3	37998566	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,4:2,5:4,4,5,4
chr3	38038533	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=207,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr3	38044143	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	38044592	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	38045975	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=217,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	38047607	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr3	38050852	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=133,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,3:14,0:12,15,2,1
chr3	38061846	.	G	GTGGTTTGCTGAGATTGTTTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:4,1,1,1
chr3	38087024	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=114,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,5:4,7:5,1,8,4
chr3	38087123	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:7,3:5,7:5,7,2,9
chr3	38087239	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=121,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:11,0:1,3:2,11,0,3
chr3	38104353	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr3	38105487	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=209,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.646:9:2,5:1,1:0|1:38105487_CT_C:38105487:0,3,0,6
chr3	38105497	.	T	TTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=138,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.235:10:6,2:1,0:1|0:38105487_CT_C:38105487:0,8,0,2
chr3	38125591	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,2:4,0:7,0,1,1
chr3	38134438	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	38135225	.	CGG	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=118,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:7,2:11,0:0|1:38135225_CGG_C:38135225:3,16,0,2
chr3	38135229	.	T	TCTTGACC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=118,109;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:12,0:0|1:38135225_CGG_C:38135225:3,16,0,2
chr3	38137982	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	38164070	.	CATG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=199,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr3	38164561	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=153,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr3	38167232	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=131,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,3:2,3:1,2,4,2
chr3	38224663	.	ATGGGAAATAACTTGAAG	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.336:4:1,1:0,0:0|1:38224663_ATGGGAAATAACTTGAAG_A:38224663:0,3,0,1
chr3	38224686	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.355:4:3,1:0,0:0|1:38224663_ATGGGAAATAACTTGAAG_A:38224663:0,3,0,1
chr3	38224688	.	TT	AA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:38224663_ATGGGAAATAACTTGAAG_A:38224663:0,3,0,1
chr3	38224691	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:38224663_ATGGGAAATAACTTGAAG_A:38224663:0,3,0,1
chr3	38257567	.	CT	C,CTT	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=133,131,158;MMQ=60,60,60;MPOS=15,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=12.23,6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,9,8:0.225,0.213:39:14,3,4:7,5,4:21,1,16,1
chr3	38291485	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:17,2:22,0:18,21,2,0
chr3	38316511	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,57;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,1:12,1:12,10,1,1
chr3	38348949	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr3	38350543	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0,0,9,8
chr3	38350630	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr3	38354390	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	38355176	.	T	TGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr3	38355509	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	38390020	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,7:0,0,16,3
chr3	38401918	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr3	38402007	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	38406648	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	38406773	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr3	38406793	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr3	38408248	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	38408459	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	38409600	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr3	38411756	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.359:4:3,0:0,1:0|1:38411756_C_T:38411756:0,3,0,1
chr3	38411757	.	ACTCTGC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:38411756_C_T:38411756:0,3,0,1
chr3	38411758	.	C	CACACACACAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=191,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	38414100	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:8,3,1,1
chr3	38416079	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=191,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr3	38524564	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,3:3,4:8,2,7,0
chr3	38524592	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:7,5:3,5:7,3,9,1
chr3	38539095	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,0:1,6:3,1,3,3
chr3	38543024	.	G	GCAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	38592108	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,1:7,1:13,4,1,1
chr3	38597893	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:1,0:0|1:38597893_A_C:38597893:2,1,3,0
chr3	38597897	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:2,0:0|1:38597893_A_C:38597893:3,1,3,0
chr3	38597903	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,0:2,0:3,1,2,0
chr3	38597908	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,14;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,0:2,1,3,0
chr3	38598106	.	C	CAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.318:4:0,0:3,1:0|1:38598106_C_CAG:38598106:0,3,0,1
chr3	38598108	.	G	GTT,GTGGGGTGTGATGGGTGATGCCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33,33;MFRL=169,109,73;MMQ=60,60,60;MPOS=11,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,0:2,1,1:0,2,0,2
chr3	38598110	.	G	GAGGGGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38598106_C_CAG:38598106:0,3,0,1
chr3	38598113	.	C	CAGTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:38598106_C_CAG:38598106:0,2,0,1
chr3	38627153	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,14;RU=GT;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,1:0,0,8,6
chr3	38646423	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:0,3:2,3:0,3,0,6
chr3	38647642	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=116,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr3	38648062	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	38648385	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=260,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38648385_TG_AA:38648385:0,1,0,1
chr3	38648390	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=260,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38648385_TG_AA:38648385:0,1,0,1
chr3	38648394	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=260,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38648385_TG_AA:38648385:0,1,0,1
chr3	38648396	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=260,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38648385_TG_AA:38648385:0,1,0,1
chr3	38648398	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=260,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38648385_TG_AA:38648385:0,1,0,1
chr3	38755394	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=168,84;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0|1:38755394_C_T:38755394:3,0,1,1
chr3	38755399	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=168,84;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:38755394_C_T:38755394:3,0,1,1
chr3	38802750	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=141,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:8,6,1,1
chr3	38926912	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,6:1,0:2,2,0,6
chr3	38926930	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=224,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:1,2,0,5
chr3	38926977	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=224,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	38938299	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.859:9:0,4:1,4:0,1,8,0
chr3	38945560	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,6:3,8:0,9,4,10
chr3	38946872	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr3	38949363	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:7,0,4,1
chr3	38950760	.	C	CACATTTCACTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=195,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	38951753	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	38967100	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=132,164;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:38967100_G_T:38967100:0,2,0,1
chr3	38967103	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=132,164;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38967100_G_T:38967100:0,2,0,1
chr3	38988407	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:16,1:10,1:2,24,0,2
chr3	38991882	.	AGA	TAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:38991882_AGA_TAT:38991882:0,3,0,1
chr3	38991888	.	T	TCTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:38991882_AGA_TAT:38991882:0,3,0,1
chr3	39108453	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=211,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	39110376	.	TA	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.127:46:21,4:15,2:3,37,1,5
chr3	39116127	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=224,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.412:7:0,0:2,0:4,0,3,0
chr3	39121184	.	G	GT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:15,0:23,4:27,11,3,1
chr3	39121306	.	AT	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.095:39:19,2:16,1:13,23,2,1
chr3	39142155	.	CT	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=100,0;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr3	39166484	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	39166509	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	39166743	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	39167905	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	39174462	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr3	39175917	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39175917_A_T:39175917:0,1,0,1
chr3	39175918	.	T	TTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39175917_A_T:39175917:0,1,0,1
chr3	39176502	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39176502_A_AC:39176502:0,0,1,0
chr3	39176509	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39176502_A_AC:39176502:0,0,1,0
chr3	39176516	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39176502_A_AC:39176502:1,0,1,0
chr3	39176520	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=76681810,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:39176502_A_AC:39176502:1,1,1,0
chr3	39176526	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=76681810,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:39176502_A_AC:39176502:1,1,1,0
chr3	39176528	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,13;MFRL=76681810,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:39176502_A_AC:39176502:1,1,1,0
chr3	39178899	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	39178945	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=171,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:4,0:2,2:6,1,2,0
chr3	39179909	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr3	39180162	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,21:0,16:0,0,25,13
chr3	39185968	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	39229333	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,1:12,1:12,10,2,0
chr3	39433147	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,1,13
chr3	39437800	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	39453057	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	39453610	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr3	40085817	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,0:1,2:0,5,2,0
chr3	40208247	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	40208450	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr3	40291982	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:7,1:8,9,1,1
chr3	40352355	.	ATT	A,AT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=120,163,148;MMQ=60,60,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=16.35,60.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,11,29:0.229,0.669:45:0,5,12:4,5,14:4,1,36,4
chr3	40352640	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=102.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,14:0,9:0|1:40352640_A_G:40352640:0,0,0,24
chr3	40352647	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=105.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,16:0,7:0|1:40352640_A_G:40352640:0,0,0,25
chr3	40352884	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	40353425	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=61.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr3	40442574	.	AGAGGTCC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,312;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr3	40498720	.	TACGC	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ACGC;STR;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:10,5:10,3:20,0,8,1
chr3	40498904	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.399:38:13,7:9,8:5,18,5,10
chr3	40498933	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,9:0,0,4,22
chr3	40503520	.	A	ACTGCTG,ACTGCTGCTG,ACTGCTGCTGCTGCTG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30,30,29;MFRL=0,175,167,154;MMQ=60,34,45,27;MPOS=13,4,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,12,13,15;RU=CTG;STR;TLOD=5.49,28.63,17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,9,5:0.141,0.520,0.300:16:0,1,5,1:0,1,4,3:0,0,15,1
chr3	40503809	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:4,2:3,3:0,8,0,5
chr3	40519532	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=98,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:7,8:3,7:2,8,5,10
chr3	40553179	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=180,222;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:3,0:0,0:0,3,0,2
chr3	40557271	.	TTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=TG;STR;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	41274764	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,17,2
chr3	41439790	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	41497115	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	41607701	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	41877473	.	CA	C,AA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=19,36,31;MFRL=136,207,149;MMQ=60,60,60;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.75,6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,3:0.299,0.152:17:1,0,2:3,3,1:0,9,0,8
chr3	41925260	.	CAGAGAAAAAACAAGTGA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr3	41925301	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=91.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,23,2
chr3	41937122	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:26,0:27,3:1,53,0,3
chr3	41938500	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,3,9
chr3	41939993	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=90,121;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,38:0.968:40:0,13:2,24:1,1,9,29
chr3	41942199	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	41952781	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=146.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,13:0,30:0,0,35,10
chr3	41961168	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr3	41977214	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	41977488	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	41996275	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr3	42167160	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=182,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,1,1
chr3	42167189	.	G	GAGTCATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	42226151	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:8,0,7,0
chr3	42234740	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:2,6,1,3
chr3	42243895	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:7,10:11,8:15,4,10,8
chr3	42244321	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	42251577	.	C	CGGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=GGA;STR;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:2,0:2,0,4,0
chr3	42264393	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,3:2,3:5,1,6,0
chr3	42264422	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:8,4:1,2:8,1,5,1
chr3	42265270	.	TCTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:3,1:0,8,0,4
chr3	42305131	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=77.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,6,16
chr3	42568903	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,0:8,2:6,8,0,2
chr3	42573717	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,1:10,1:11,7,0,2
chr3	42597410	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,23:0.386:60:19,13:17,9:18,19,11,12
chr3	42599049	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.256:17:8,3:5,1:13,0,2,2
chr3	42599252	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:5,0:18,2:1,22,0,2
chr3	42610297	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,6:5,2:9,0,8,0
chr3	42633106	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.247:9:1,1:5,0:0,7,2,0
chr3	42660489	.	CTT	C,CT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,34,33;MFRL=163,155,153;MMQ=60,60,60;MPOS=18,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=4.22,10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,6:0.242,0.323:21:5,3,4:2,2,2:8,2,11,0
chr3	42687278	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=64.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,20,0
chr3	42701190	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,0:13,2:7,11,1,1
chr3	42705274	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=120,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.383:6:2,1:1,0:0|1:42705274_A_C:42705274:2,2,2,0
chr3	42705281	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=149,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:2,1:4,0:0|1:42705274_A_C:42705274:5,3,2,0
chr3	42705714	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.251:27:11,0:5,0:8,12,7,0
chr3	42799858	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	42907409	.	TCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:42907409_TCTC_T:42907409:0,4,0,1
chr3	42907415	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:42907409_TCTC_T:42907409:0,3,0,1
chr3	42907416	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:42907409_TCTC_T:42907409:0,3,0,1
chr3	42907422	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:42907409_TCTC_T:42907409:0,3,0,1
chr3	42915878	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,6,5
chr3	42917047	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr3	42947776	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	43021088	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	43122594	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:6,2:14,0:9,12,0,2
chr3	43373696	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,1:8,1:13,7,0,2
chr3	43384947	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,0:17,2:6,21,2,0
chr3	43389552	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,77629;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:6,13,1,1
chr3	43591142	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,2:0,0,9,1
chr3	43607224	.	CAA	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.282:19:3,3:5,1:5,9,3,2
chr3	43618373	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,1:11,1:7,10,1,1
chr3	43642126	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,2,20
chr3	43740960	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,101;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr3	43756577	.	C	CTG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=189,125;MMQ=55,46;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=TG;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.769:6:0,2:1,3:0,1,2,3
chr3	44283525	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,0:0,0,3,0
chr3	44296403	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,1,1
chr3	44329394	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr3	44332176	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr3	44345646	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:0,7,0,6
chr3	44373517	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.341:17:2,1:7,3:0,11,0,6
chr3	44399668	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	44408864	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	44437870	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=200.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,27:0,33:0,0,33,28
chr3	44442136	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44442136_T_TG:44442136:0,3,0,1
chr3	44442139	.	A	ATCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:44442136_T_TG:44442136:0,3,0,1
chr3	44442140	.	A	ATCACCTTTACCAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:44442136_T_TG:44442136:0,3,0,1
chr3	44490318	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=215,275;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.532:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr3	44761729	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:5,6:4,6:5,4,8,5
chr3	44763027	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:8,7,0,2
chr3	44763037	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:4,2:3,4:3,4,5,2
chr3	44778144	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=153,142;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:9,9,2,0
chr3	44803108	.	AAAGACAG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGACAG;STR;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,8:0,1:0,0,4,5
chr3	44803130	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,6:1,0:1,3,4,2
chr3	44815871	.	CT	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.156:35:13,1:16,3:29,1,3,2
chr3	44816952	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	44819565	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=147,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.430:19:6,3:5,5:10,1,8,0
chr3	44826315	.	G	GT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=56.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.934:27:0,12:1,13:1,0,24,2
chr3	44827793	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr3	44846477	.	GA	G,GAAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33,27;MFRL=147,166,0;MMQ=60,60,60;MPOS=23,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=A;STR;TLOD=11.07,6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,7,5:0.296,0.226:23:3,1,2:6,4,0:9,2,6,6
chr3	44846722	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,5:4,7:0,9,1,11
chr3	44854563	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,6:2,1:2,1,3,4
chr3	44869851	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:1,6,0,6
chr3	44879843	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:20,1:13,1:22,12,1,1
chr3	44880014	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr3	44882784	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=207,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,5:0,1:0,3,0,6
chr3	44903434	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:4,0,4,1
chr3	44906746	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	44943104	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.565:37:11,11:5,9:7,9,11,10
chr3	44943503	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44943503_G_A:44943503:0,1,0,1
chr3	44943507	.	GT	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=81,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44943503_G_A:44943503:0,2,0,1
chr3	44952407	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,1:3,4:6,1,4,2
chr3	44952942	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	45017904	.	AG	TT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:2,7:15,3:0,17,0,11
chr3	45127255	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:13,9,1,1
chr3	45132637	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:2,3:1,3:3,0,7,0
chr3	45134822	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,11,7
chr3	45134844	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:5,0:14,2:14,6,1,1
chr3	45137087	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,4:2,7:0,6,4,7
chr3	45267058	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	45461102	.	G	GT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=127.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,24:0,14:0,0,25,15
chr3	45500174	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=203,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr3	45515648	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	45527099	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr3	45530395	.	T	TCCCCCTTTTATTTTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=205,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	45530401	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=187,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr3	45533380	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45533380_A_T:45533380:0,1,0,1
chr3	45533382	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45533380_A_T:45533380:0,1,0,1
chr3	45533385	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45533380_A_T:45533380:0,1,0,1
chr3	45533387	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45533380_A_T:45533380:0,1,0,1
chr3	45533391	.	T	TCCCCCTGACATTTTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45533380_A_T:45533380:0,1,0,1
chr3	45542083	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:1,4,0,5
chr3	45557632	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:14,0:17,2:17,16,1,1
chr3	45559621	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=109,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr3	45583297	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:3,1,3,0
chr3	45637830	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:1,8,1,6
chr3	45677635	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=121.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,14:0,11:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,18,10
chr3	45677638	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=121.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,14:0,12:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,18,10
chr3	45715750	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:45715750_T_G:45715750:0,1,1,0
chr3	45715753	.	C	CCGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:45715750_T_G:45715750:0,3,1,0
chr3	45715755	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:45715750_T_G:45715750:0,4,1,0
chr3	45715767	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=102,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,5:0.500:10:2,4:3,1:1|0:45715750_T_G:45715750:0,5,1,4
chr3	45718327	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,5:5,0:5,0,5,0
chr3	45748429	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:4,2:5,6:0|1:45748429_G_A:45748429:2,10,1,9
chr3	45748435	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:5,4:7,7:0|1:45748429_G_A:45748429:2,10,1,11
chr3	45761115	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.484:27:5,6:9,7:4,10,0,13
chr3	45763635	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,6:6,5:0,10,1,10
chr3	45764544	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	45772742	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=119,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:10,5:10,5:14,6,10,0
chr3	45772772	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.380:40:11,9:14,6:15,10,13,2
chr3	45773732	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:0,2,0,3
chr3	45776875	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.396:13:5,3:3,1:0,8,1,4
chr3	45776900	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr3	45779277	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.091:41:14,3:23,0:21,17,2,1
chr3	45784963	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,1:4,3:0|1:45784963_T_C:45784963:8,0,5,0
chr3	45784972	.	GGT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:0|1:45784963_T_C:45784963:9,0,4,0
chr3	45804391	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:5,6:5,3:7,3,6,3
chr3	45813025	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	45814027	.	GGTGGCTCC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:45814027_GGTGGCTCC_G:45814027:4,3,1,1
chr3	45814042	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:45814027_GGTGGCTCC_G:45814027:4,3,1,1
chr3	45817418	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.949:18:0,4:0,11:0,0,13,5
chr3	45821624	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	45821687	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	45875716	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:8,3:7,0:8,8,3,0
chr3	45977899	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr3	46021328	.	TAGGGAA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGGAA;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:12,2:7,0:1,19,1,1
chr3	46063517	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:46063517_A_G:46063517:1,12,0,2
chr3	46063526	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,1:0|1:46063517_A_G:46063517:0,11,0,2
chr3	46244924	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:9,1:13,1:8,14,0,2
chr3	46245843	.	T	TAGAAAGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	46307871	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,2:14,0:13,8,2,0
chr3	46400550	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:21,3:23,0:22,23,3,0
chr3	46416216	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,20:0.437:46:8,5:18,15:11,15,5,15
chr3	46449581	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=159,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	46450297	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.425:35:12,7:8,6:8,12,9,6
chr3	46484898	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,7:3,4:9,0,8,3
chr3	46487003	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=220,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	46491608	.	G	GGGCTATAAAATTTTATACCAGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.485:3:0,1:1,0:0|1:46491608_G_GGGCTATAAAATTTTATACCAGTTTT:46491608:0,2,0,1
chr3	46491611	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=213,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46491608_G_GGGCTATAAAATTTTATACCAGTTTT:46491608:0,1,0,1
chr3	46491948	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:3,0,3,1
chr3	46501213	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:7,5:6,5:6,8,6,4
chr3	46501284	.	C	CCTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr3	46542488	.	T	TAGACAGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:46542488_T_TAGACAGAC:46542488:0,0,0,1
chr3	46542490	.	T	TGAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46542488_T_TAGACAGAC:46542488:0,0,0,1
chr3	46574256	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,7:6,2:9,3,8,1
chr3	46574418	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,3:6,1:1,12,0,4
chr3	46586622	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.477:38:9,10:9,7:16,4,6,12
chr3	46592895	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=69,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr3	46592987	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=112,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.628:24:4,7:3,8:6,3,4,11
chr3	46593147	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	46620614	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=124,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:5,6:8,5:10,4,9,2
chr3	46726948	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.720:9:1,3:1,2:2,0,7,0
chr3	46904811	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=94,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:3,8,1,1
chr3	46940703	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=196,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	46963502	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:7,1,4,1
chr3	46964920	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:7,5:4,2:2,10,3,4
chr3	46965118	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=125,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:10,14,0,2
chr3	46965197	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr3	46967040	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:2,8,0,5
chr3	47021509	.	CGCGCGCGCGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47033937	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr3	47035900	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=117,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr3	47037670	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=403,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47037670_G_C:47037670:0,1,0,1
chr3	47037674	.	C	CTTTGTTCCGTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47037670_G_C:47037670:0,0,0,1
chr3	47038135	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,5:0,0,4,5
chr3	47041506	.	C	CTCATGCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	47043386	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=190,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	47044122	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr3	47047176	.	A	AG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:3,4:15,4:6,12,4,4
chr3	47050908	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	47059323	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,0,2
chr3	47061183	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:12,4:6,2:13,5,6,0
chr3	47079112	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:8,2,3,1
chr3	47103861	.	GTT	G,GT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=18,33,23;MFRL=122,123,176;MMQ=60,60,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=13.64,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,8,4:0.240,0.144:33:2,1,1:8,7,1:3,18,3,9
chr3	47125916	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=115,122;MMQ=42,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.728:4:0,2:0,0:0,1,0,3
chr3	47129784	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:1,11,0,2
chr3	47142907	.	TCC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:8,10:10,0:17,2,9,1
chr3	47147393	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,130;MMQ=40,44;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	47147691	.	A	AGTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=210,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47147691_A_AGTTC:47147691:0,1,0,1
chr3	47147695	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=210,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47147691_A_AGTTC:47147691:0,1,0,1
chr3	47205502	.	CGCGGCGGCG	C,CGCG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30,30;MFRL=0,227,215;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,7,8;RU=GCG;STR;TLOD=20.26,6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.609,0.298:7:0,1,2:0,3,0:0,0,1,6
chr3	47276968	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,6:3,1:4,0,5,2
chr3	47277458	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	47277885	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,2,1
chr3	47282303	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,3:4,6:4,4,5,4
chr3	47286227	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	47305928	.	TTTTTA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr3	47312635	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAAG;STR;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:1,0:4,4:5,0,4,0
chr3	47316725	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr3	47318747	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,12:0,0,17,12
chr3	47318763	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=135,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,1:9,1:13,12,2,0
chr3	47361074	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=132,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr3	47361082	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=114,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.530:13:2,6:4,1:5,1,6,1
chr3	47363971	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=220,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr3	47376095	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr3	47378313	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:0,18,0,2
chr3	47448214	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=116,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.586:32:9,12:4,6:4,9,10,9
chr3	47449529	.	G	GTGATTAAGCTGACACTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	47451411	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,7:2,3:3,1,6,4
chr3	47451519	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,11;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:2,0:7,0:6,6,4,0
chr3	47451666	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:9,1:3,1:1,11,0,2
chr3	47452118	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:5,7:6,6:4,9,6,8
chr3	47452786	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,230;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr3	47453216	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr3	47454399	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,0,12
chr3	47456225	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr3	47459564	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,4:2,1:4,0,6,0
chr3	47462587	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr3	47539751	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr3	47539969	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	47543389	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:3,0:2,4:0,6,1,3
chr3	47555142	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:2,7:3,4:0,5,0,12
chr3	47614413	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	47618885	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,264;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,1:4,1:4,8,1,1
chr3	47676902	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr3	47680119	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr3	47717178	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=288,237;MMQ=40,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	47752375	.	A	ACAGCCCTGCAATTTAAGTTGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=211,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	47755816	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=167,64;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:3,2:28,0:31,0,1,1
chr3	47755822	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:5,1:25,3:30,1,4,0
chr3	47755827	.	TG	T	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=165,180;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:8,2:33,0:0|1:47755827_TG_T:47755827:41,1,2,0
chr3	47755832	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=156,180;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:7,2:33,0:0|1:47755827_TG_T:47755827:42,2,2,0
chr3	47755845	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.113:50:9,4:35,0:35,10,3,2
chr3	47787531	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:12,3:1,19,0,3
chr3	47823059	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=23,17;MFRL=182,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.204:20:5,0:3,0:0|1:47823059_T_G:47823059:13,3,4,0
chr3	47823063	.	CT	GG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,19;MFRL=177,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.195:21:8,0:3,0:0|1:47823059_T_G:47823059:14,3,4,0
chr3	47823068	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=182,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:5,0:4,1:12,4,4,0
chr3	47823075	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=23,13;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.396:20:4,1:3,0:6,6,8,0
chr3	47823091	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.148:32:8,1:15,0:13,14,5,0
chr3	47860864	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,4:0,3,0,7
chr3	47868810	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:9,2:16,0:25,2,2,0
chr3	47963443	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=136,156;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr3	48019258	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,12:0,0,25,1
chr3	48209486	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr3	48219320	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.870:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr3	48265966	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.249:20:5,1:7,1:8,7,0,5
chr3	48265978	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.322:20:5,1:6,2:6,8,0,6
chr3	48342700	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.507:26:7,6:4,7:8,5,12,1
chr3	48361128	.	A	ACAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,2:6,0:2,11,0,2
chr3	48414197	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr3	48415007	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	48416756	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr3	48419897	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,8,12
chr3	48419915	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=140,103;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,3:4,0:8,8,3,0
chr3	48422360	.	G	GGGGTCCAGCAGGCGCTGGCACATA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=167,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:5,2:3,0:2,6,1,1
chr3	48448364	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=122,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:2,0:0|1:48448364_A_C:48448364:0,2,2,0
chr3	48448370	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,11;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.516:4:0,0:1,0:0|1:48448364_A_C:48448364:1,1,2,0
chr3	48451307	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,13:0.240:57:26,6:10,7:26,18,9,4
chr3	48451656	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:5,1:4,4,1,1
chr3	48491350	.	GAA	G,GAAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34,34;MFRL=174,134,218;MMQ=60,60,60;MPOS=29,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,17;RU=A;STR;TLOD=3.97,3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.216,0.235:9:3,1,0:1,1,2:4,1,4,0
chr3	48510900	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,0;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:18,2:11,0:10,19,0,2
chr3	48511223	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,83;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:25,0:33,3:23,36,1,2
chr3	48594057	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48594057_G_C:48594057:1,0,1,0
chr3	48594061	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48594057_G_C:48594057:1,0,1,0
chr3	48594062	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=11,13;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:48594057_G_C:48594057:1,0,1,0
chr3	48594066	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=146,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:48594057_G_C:48594057:4,0,1,0
chr3	48602523	.	G	GGGC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,11:0,4:0,0,9,7
chr3	48603794	.	A	ATAAAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,3,0,1
chr3	48603795	.	G	GAGT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,3,0,1
chr3	48603798	.	A	ATAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,3,0,1
chr3	48603799	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,3,0,1
chr3	48603800	.	G	GTTTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,3,0,1
chr3	48603803	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,1,0,1
chr3	48613266	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.230:16:0,0:6,0:10,2,4,0
chr3	48613275	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.233:18:5,0:9,0:11,3,4,0
chr3	48620474	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:3,11,1,1
chr3	48623124	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:2,4:2,3:4,1,6,1
chr3	48624611	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=131,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.325:41:18,5:10,8:9,19,8,5
chr3	48624631	.	T	TG	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.090:30:14,2:14,0:0|1:48624631_T_TG:48624631:11,17,0,2
chr3	48624635	.	T	TTGGCACTTGGGCCTCTTGG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,2:14,0:0|1:48624631_T_TG:48624631:11,17,0,2
chr3	48627789	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.512:37:6,8:12,11:5,13,7,12
chr3	48630456	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:5,1,3,0
chr3	48631945	.	A	ACGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=149,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	48631998	.	A	AATGGCGTAAACCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	48664300	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:9,3,2,0
chr3	48678026	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48678026_T_TCA:48678026:0,1,0,1
chr3	48678027	.	G	GATGCTTTTTCTGCATCTAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48678026_T_TCA:48678026:0,1,0,1
chr3	48678030	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48678026_T_TCA:48678026:0,1,0,1
chr3	48681765	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:0,1:5,3:1,5,1,3
chr3	48683071	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:17,2:7,1:10,14,1,2
chr3	48689769	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:48689769_A_C:48689769:1,0,1,0
chr3	48689772	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48689769_A_C:48689769:1,0,1,0
chr3	48691753	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,2:16,0:19,6,2,0
chr3	48691963	.	G	GTCTGCTTGGTGGTCTGTCTGTCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=198,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	48693517	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:48693517_C_A:48693517:0,0,1,0
chr3	48693523	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,179;MMQ=54,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48693517_C_A:48693517:0,2,1,0
chr3	48697393	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,1:11,1:4,17,2,0
chr3	48719638	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	48719951	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,1:9,1:11,6,1,1
chr3	48731487	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:2,1:6,6:6,2,7,1
chr3	48731961	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.528:53:11,14:13,13:4,21,2,26
chr3	48897078	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr3	48897150	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=156,171;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:48897150_AT_GC:48897150:0,3,0,1
chr3	48897161	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=156,171;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:48897150_AT_GC:48897150:0,3,0,1
chr3	48897166	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=156,171;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:48897150_AT_GC:48897150:0,3,0,1
chr3	48897173	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=156,171;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:48897150_AT_GC:48897150:0,3,0,1
chr3	48956862	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr3	49004723	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,3,13
chr3	49011287	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.138:26:9,3:14,0:4,19,1,2
chr3	49044767	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr3	49052785	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49053219	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,7,7
chr3	49060271	.	AA	CC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:14,2:9,1:0|1:49060271_AA_CC:49060271:6,20,0,3
chr3	49060274	.	A	ATCTCCATCCACTGCAG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:16,1:8,1:0|1:49060271_AA_CC:49060271:6,19,0,3
chr3	49069790	.	GCCAGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr3	49070299	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49070499	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,11,0
chr3	49081837	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=113,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:19,2:22,1:33,10,3,0
chr3	49114544	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	49135961	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr3	49137904	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,3:0,0,4,8
chr3	49139966	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr3	49148206	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:11,6,2,0
chr3	49148890	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	49154143	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=187,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:49154143_C_CT:49154143:0,1,0,1
chr3	49154144	.	C	CCATTTCTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=187,240;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:49154143_C_CT:49154143:0,1,0,1
chr3	49156676	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49161698	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,155;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.231:14:6,1:5,1:2,9,2,1
chr3	49162230	.	C	CATCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:49162230_C_CATCT:49162230:4,8,1,1
chr3	49162232	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,1:3,0:0|1:49162230_C_CATCT:49162230:4,8,1,1
chr3	49166069	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr3	49169782	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:4,6:10,14:10,4,13,7
chr3	49227212	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr3	49249325	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:5,15,0,2
chr3	49249334	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,0:5,3:2,15,0,3
chr3	49249381	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr3	49294529	.	C	CTGATAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:49294529_C_CTGATAT:49294529:3,2,0,2
chr3	49294532	.	G	GGAATTGAATTTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:49294529_C_CTGATAT:49294529:3,2,0,2
chr3	49365269	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr3	49395422	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.402:12:2,1:2,0:6,1,5,0
chr3	49395673	.	GGCCGCC	G,GGCC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33,34;MFRL=0,170,177;MMQ=60,40,60;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,4,5;RU=GCC;STR;TLOD=28.47,42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,11:0.411,0.547:19:0,3,7:0,5,3:0,0,4,15
chr3	49450449	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:10,9:9,2:12,7,11,0
chr3	49463287	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:1,1:2,1:3,0,2,1
chr3	49463926	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr3	49548294	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	49570636	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:49570636_G_A:49570636:0,2,1,1
chr3	49570640	.	GCGCC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=119,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:49570636_G_A:49570636:0,1,1,1
chr3	49662864	.	A	AAACTGAATTTTCAGCAACATTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49693438	.	GTAACCCC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=214,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:49693438_GTAACCCC_G:49693438:0,2,0,1
chr3	49693450	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49693438_GTAACCCC_G:49693438:0,1,0,1
chr3	49700788	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:1,2,0,2
chr3	49701222	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,4:7,0:10,8,4,0
chr3	49702341	.	G	GAATGCATTTTCTGAGACAATTACCAGGAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.355:8:4,2:1,0:1,5,1,1
chr3	49713753	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	49719729	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.390:16:7,4:3,2:9,1,5,1
chr3	49720393	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,8:0,4:1,0,5,7
chr3	49722356	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,167;MMQ=50,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:11,5:6,6:9,8,7,5
chr3	49723274	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,100;MMQ=52,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,2:1,1:1,2,2,1
chr3	49726178	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,156;MMQ=27,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:9,8:3,4:0,12,2,10
chr3	49728632	.	C	T	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=117,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,3:0.045:86:39,3:42,0:44,39,2,1
chr3	49736565	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,0:0,3:0,0,1,3
chr3	49739086	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,3,11
chr3	49740981	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=153,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:0|1:49740981_C_G:49740981:1,16,1,1
chr3	49740986	.	AGC	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=160,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:49740981_C_G:49740981:1,16,1,1
chr3	49740989	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=160,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:49740981_C_G:49740981:1,16,1,1
chr3	49744392	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	49750188	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	49753003	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr3	49753788	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,7:0,0,15,7
chr3	49753820	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=132,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:21,3:10,0:15,16,2,1
chr3	49758342	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:3,15,0,2
chr3	49759836	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=148,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.412:10:1,0:4,0:0|1:49759836_A_C:49759836:3,3,4,0
chr3	49759842	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.379:11:1,0:3,0:0|1:49759836_A_C:49759836:3,4,4,0
chr3	49765449	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=170,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49765449_C_A:49765449:1,0,1,0
chr3	49765457	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=170,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:49765449_C_A:49765449:3,0,1,0
chr3	49765462	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=170,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:49765449_C_A:49765449:3,0,1,0
chr3	49765470	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=172,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:49765449_C_A:49765449:4,0,1,0
chr3	49828911	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=136,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.200:27:5,3:14,2:4,17,1,5
chr3	49829476	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=195,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49829476_A_C:49829476:0,1,0,1
chr3	49829478	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=195,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49829476_A_C:49829476:0,1,0,1
chr3	49829480	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=195,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49829476_A_C:49829476:0,1,0,1
chr3	49830016	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=130,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:10,0:11,13,1,1
chr3	49830727	.	G	GTATCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=106,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr3	49836212	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=68,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:1,0:1,1,2,0
chr3	49836218	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=81,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,0:0,2,3,0
chr3	49928162	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=175,169;MMQ=40,57;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr3	49933203	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	49934780	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,1:2,0:0|1:49934780_CTT_C:49934780:3,3,1,1
chr3	49934784	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:1,0:0|1:49934780_CTT_C:49934780:3,4,1,1
chr3	49934785	.	A	ATCT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:49934780_CTT_C:49934780:3,4,1,1
chr3	49934787	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:49934780_CTT_C:49934780:3,4,1,1
chr3	49948260	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:4,13,0,2
chr3	50005475	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=141,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.194:18:7,2:8,1:6,9,2,1
chr3	50005960	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:19,2:20,2:8,31,2,2
chr3	50097216	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,3:4,4:1,3,2,6
chr3	50098985	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,13;MFRL=119,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,0:6,0:19,4,0,2
chr3	50112609	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.477:31:8,4:7,10:11,5,7,8
chr3	50112758	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,1:13,2:4,18,1,2
chr3	50129374	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	50129399	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr3	50148305	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	50155887	.	TGA	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=14,33;MFRL=83,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GA;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.507:6:0,1:1,2:1,2,0,3
chr3	50155969	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=194,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:50155969_A_T:50155969:0,2,0,1
chr3	50155981	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=213,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50155969_A_T:50155969:0,1,0,1
chr3	50222079	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:7,4:7,1:11,3,3,2
chr3	50223977	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=105.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,18:0,0,29,1
chr3	50224225	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,3,14
chr3	50230902	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.589:22:4,8:4,5:3,6,9,4
chr3	50251833	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr3	50255732	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=118,58;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:3,2:7,0:4,7,1,1
chr3	50289635	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:1,1,1,3
chr3	50290656	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.701:5:1,0:0,1:0,1,0,4
chr3	50293597	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=195,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:50293597_A_C:50293597:0,1,2,0
chr3	50293599	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=161,302;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:1,0:0|1:50293597_A_C:50293597:1,1,1,0
chr3	50293601	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=195,302;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:50293597_A_C:50293597:0,1,1,0
chr3	50306752	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr3	50308718	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	50326292	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,4:2,6:3,3,4,6
chr3	50327102	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.398:15:2,4:6,0:5,4,4,2
chr3	50329977	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	50337958	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:14,3:19,0:17,16,2,1
chr3	50339405	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:13,0:7,0:31,1,3,0
chr3	50368955	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:2,3,0,5
chr3	50379841	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:6,1:24,2:17,14,2,1
chr3	50386525	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=250,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50386525_GG_TT:50386525:0,1,0,1
chr3	50386527	.	G	GAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=250,233;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50386525_GG_TT:50386525:0,1,0,1
chr3	50390622	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:4,0,2,0
chr3	50404553	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=178,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	50415095	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=168,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:7,0:10,2:0|1:50415095_A_G:50415095:13,5,1,1
chr3	50415101	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=168,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:6,0:12,2:0|1:50415095_A_G:50415095:15,7,1,1
chr3	50416501	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,2:2,7:2,2,5,4
chr3	50609123	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr3	50645635	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	50645793	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,11,3
chr3	50678001	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr3	50678022	.	T	TCTTCAGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	50683227	.	T	TGC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:8,3:13,0:0|1:50683227_T_TGC:50683227:8,14,3,0
chr3	50683232	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=140,120;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.218:23:7,0:9,1:0|1:50683227_T_TGC:50683227:4,14,5,0
chr3	50684489	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=92.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,11:0,0,22,4
chr3	50685574	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	51246338	.	T	TCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=83,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0|1:51246338_T_TCCC:51246338:0,2,0,1
chr3	51246339	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=83,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0|1:51246338_T_TCCC:51246338:0,2,0,1
chr3	51265348	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:6,1,2,0
chr3	51273711	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr3	51274902	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,3:0,0,11,4
chr3	51393706	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,4,4
chr3	51395571	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	51417610	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.296:10:3,2:4,0:0|1:51417610_CAG_C:51417610:0,7,3,0
chr3	51417616	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.249:9:3,2:4,0:0|1:51417610_CAG_C:51417610:0,7,2,0
chr3	51417617	.	C	CCA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.249:9:3,2:4,0:0|1:51417610_CAG_C:51417610:0,7,2,0
chr3	51426506	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:16,1:9,1:9,17,1,1
chr3	51431679	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:12,2:9,2:12,11,0,4
chr3	51458301	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:10,3:15,0:14,11,2,1
chr3	51474900	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=145,135;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:24,0,2,0
chr3	51474901	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=144,179;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:10,3:12,0:24,0,3,0
chr3	51474908	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=144,179;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.122:26:8,3:13,0:23,0,3,0
chr3	51474917	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=143,151;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:13,2:17,0:26,5,2,0
chr3	51475985	.	TTTCC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51475985_TTTCC_T:51475985:0,0,0,1
chr3	51475991	.	CATAAT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51475985_TTTCC_T:51475985:0,0,0,1
chr3	51476001	.	GG	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51475985_TTTCC_T:51475985:0,0,0,1
chr3	51668102	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,3:3,3:0,3,1,5
chr3	51677960	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:7,12,2,0
chr3	51697493	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=47.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,1,12
chr3	51747231	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:5,2,1,1
chr3	51895850	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,14:0,0,20,4
chr3	51908226	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	51929360	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr3	51930729	.	G	GCACA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=201,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=CA;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.473:6:0,1:3,0:3,0,3,0
chr3	51936949	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:5,0,6,0
chr3	51968838	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=171,256;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr3	51969138	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:3,2:2,3:4,2,5,0
chr3	51972052	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=111,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	51994530	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,351;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.173:19:9,2:7,0:12,4,0,3
chr3	52003514	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.157:38:12,3:14,1:15,17,6,0
chr3	52004149	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:11,13,1,1
chr3	52019503	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=13,13;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.701:4:0,0:0,0:0,1,0,3
chr3	52019544	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=204,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52019544_A_T:52019544:0,3,0,1
chr3	52019546	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,12;MFRL=204,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.342:4:2,0:1,0:0|1:52019544_A_T:52019544:0,3,0,1
chr3	52019553	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=204,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52019544_A_T:52019544:0,3,0,1
chr3	52019554	.	C	CGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=204,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52019544_A_T:52019544:0,3,0,1
chr3	52097642	.	T	TAGACTTCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	52185032	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,56;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,0:10,2:13,7,0,3
chr3	52236762	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=238.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.986:71:0,36:0,33:0,0,28,43
chr3	52237970	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,11:0,0,8,11
chr3	52238656	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52238677	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr3	52242021	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52242021_C_T:52242021:2,0,1,0
chr3	52242026	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52242021_C_T:52242021:2,0,1,0
chr3	52255230	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.059:64:32,3:27,0:44,17,2,1
chr3	52258372	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	52263277	.	G	GTACCTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52263277_G_GTACCTT:52263277:0,2,0,1
chr3	52263279	.	T	TCCCTGCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52263277_G_GTACCTT:52263277:0,2,0,1
chr3	52263281	.	G	GGCTTAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52263277_G_GTACCTT:52263277:0,2,0,1
chr3	52263301	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52263301_C_A:52263301:0,1,0,1
chr3	52263302	.	C	CGGCAA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52263301_C_A:52263301:0,1,0,1
chr3	52263304	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52263301_C_A:52263301:0,1,0,1
chr3	52272945	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	52281840	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=85,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52281840_G_A:52281840:2,1,0,1
chr3	52281843	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=85,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52281840_G_A:52281840:2,1,0,1
chr3	52293312	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=215,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=159.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,48:0.961:49:1,28:0,20:0,1,13,35
chr3	52325759	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,9,3
chr3	52379420	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	52382822	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	52383096	.	AA	CG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=237,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:52383096_AA_CG:52383096:2,2,0,1
chr3	52383100	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=237,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:52383096_AA_CG:52383096:2,2,0,1
chr3	52383110	.	G	GCAAGGGAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=199,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0|1:52383110_G_GCAAGGGAC:52383110:1,1,0,1
chr3	52383116	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=37,25;MFRL=199,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:52383110_G_GCAAGGGAC:52383110:1,1,0,1
chr3	52383120	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52386064	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=97,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,1:4,1:10,7,0,2
chr3	52387078	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	52390555	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	52392772	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:3,10,0,2
chr3	52396944	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	52400509	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,2:13,0:7,14,1,1
chr3	52400740	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr3	52404111	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr3	52415865	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	52420414	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	52420901	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,3,15
chr3	52423028	.	C	CACT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	52429251	.	C	CCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCA;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:52429251_C_CCCA:52429251:0,0,2,0
chr3	52429255	.	GAT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:52429251_C_CCCA:52429251:0,0,2,0
chr3	52429607	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:16,5,0,2
chr3	52431671	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	52432214	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:52432214_G_A:52432214:0,0,0,3
chr3	52432223	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:52432214_G_A:52432214:0,0,0,3
chr3	52436927	.	C	CTCAAGGAGGAGGTAGAGAAGAGGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=187,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0,5,1,1
chr3	52454262	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr3	52487983	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.242:19:5,2:4,1:7,7,5,0
chr3	52489564	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	52489627	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	52489677	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,3:2,8:6,0,11,0
chr3	52505758	.	G	GAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,9:0,0,16,1
chr3	52506282	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr3	52506426	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr3	52510697	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	52512318	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr3	52513940	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr3	52518476	.	T	TGAGGGGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:52518476_T_TGAGGGGGGGGG:52518476:2,0,1,0
chr3	52518478	.	T	TGGG,C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,15,28;MFRL=0,209,195;MMQ=60,60,60;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.95,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,0,1:0,1,0:0,0,3,0
chr3	52518483	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=195,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,0:0,0:1|0:52518476_T_TGAGGGGGGGGG:52518476:1,0,2,0
chr3	52518488	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.750:2:0,1:0,1:1|0:52518476_T_TGAGGGGGGGGG:52518476:0,0,2,0
chr3	52518492	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=15,27;MFRL=223,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.528:2:0,0:0,1:1|0:52518476_T_TGAGGGGGGGGG:52518476:1,0,1,0
chr3	52519677	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=171,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr3	52519854	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,17:0,21:0,0,11,27
chr3	52522659	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr3	52535264	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:3,12,1,1
chr3	52537969	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	52539850	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:7,1:6,2:5,8,3,1
chr3	52544470	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr3	52546487	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr3	52546820	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	52549983	.	GA	CC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,14;MFRL=0,186;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:0,0,1,0
chr3	52549993	.	CGTT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=0,186;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:0,1,1,0
chr3	52549997	.	C	CGGG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,13;MFRL=0,186;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:0,1,1,0
chr3	52550001	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,10;MFRL=58,186;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:0,2,1,0
chr3	52550008	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=87,186;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:1,2,1,0
chr3	52550010	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,11;MFRL=87,186;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:1,2,1,0
chr3	52551265	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,3:0|1:52551265_T_C:52551265:0,0,7,0
chr3	52551284	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:52551265_T_C:52551265:0,0,9,0
chr3	52553625	.	TGTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr3	52554481	.	CCTGGCCTATGGCA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:52554481_CCTGGCCTATGGCA_C:52554481:1,1,0,1
chr3	52554497	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=234,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52554481_CCTGGCCTATGGCA_C:52554481:1,0,0,1
chr3	52554499	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=234,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52554481_CCTGGCCTATGGCA_C:52554481:1,0,0,1
chr3	52555054	.	C	CCGTGGCCTAGGACTTATCCTATAAGGTTCAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52555316	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	52557038	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr3	52557760	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=98,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.276:11:4,0:2,0:0|1:52557760_A_C:52557760:3,5,3,0
chr3	52557766	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=93,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.402:10:2,1:1,0:0|1:52557760_A_C:52557760:1,5,4,0
chr3	52558133	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,14:0,5:0,0,17,2
chr3	52559167	.	CGGGG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=G;STR;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr3	52561779	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	52567617	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52597566	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	52620764	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52677427	.	A	AGAATAAGGCAGAAGTGATGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	52685677	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,2:7,3:10,2,5,0
chr3	52804641	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,13;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:1,0:1,1,1,0
chr3	52814217	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:13,2,2,0
chr3	52817430	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=35,34;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,3,0,1
chr3	52817432	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=35,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,3,0,1
chr3	52817438	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,2,0,1
chr3	52817440	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,2,0,1
chr3	52817443	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,2,0,1
chr3	52817449	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,2,0,1
chr3	52817456	.	GG	CT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	52831935	.	T	TTGATTTCTCAGTTAATGTTAACTGAATGAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.326:8:5,2:0,0:2,4,1,1
chr3	52833899	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:5,0:6,2:0|1:52833899_A_G:52833899:5,8,1,1
chr3	52833909	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=119,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:4,0:7,2:0|1:52833899_A_G:52833899:4,8,1,1
chr3	52835112	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,1:10,1:4,11,0,2
chr3	52847473	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,9:5,2:7,4,4,7
chr3	52853340	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr3	52853401	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:6,8:11,7:13,4,7,8
chr3	52858578	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52867288	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr3	52867595	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr3	52874446	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr3	52874709	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=213,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:52874709_G_T:52874709:0,2,0,1
chr3	52874714	.	ATGTTT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,15;MFRL=213,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:52874709_G_T:52874709:0,2,0,1
chr3	52876942	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:24,0:11,3:20,17,0,3
chr3	52877647	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,5,0
chr3	52877649	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,5,0
chr3	52877720	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,6,5
chr3	52878746	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	52878825	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,4:0,0,13,3
chr3	52889326	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,0:2,0:1,2,3,0
chr3	52889331	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:0,0:2,0:1,2,3,0
chr3	52889339	.	A	ACCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,18;RU=C;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.418:5:1,1:2,0:0,3,2,0
chr3	52960013	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr3	52966320	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:1,13,0,2
chr3	52968801	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	53003020	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,11;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr3	53003021	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	53126672	.	TTGCCCTGGACAAGGC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:3,2:0,5,1,1
chr3	53133526	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=201,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:2,3:0,0:1,2,0,3
chr3	53139813	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,127;MMQ=60,44;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:2,15,0,2
chr3	53154132	.	ATTAACT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	53212574	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	53213538	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr3	53213624	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=159,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.159:35:12,3:18,2:22,8,3,2
chr3	53213815	.	C	CGTGT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=GT;STR;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.930:9:0,4:0,3:0,0,2,7
chr3	53215799	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,1,1
chr3	53217413	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=269,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr3	53219680	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=21,32;MFRL=68,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:53219680_G_A:53219680:1,1,0,1
chr3	53219686	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=68,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:53219680_G_A:53219680:1,1,0,1
chr3	53219688	.	GACC	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,15;MFRL=68,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:53219680_G_A:53219680:1,1,0,1
chr3	53219693	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=17,28;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:53219680_G_A:53219680:0,1,0,1
chr3	53219699	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53219680_G_A:53219680:0,1,0,1
chr3	53219706	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,14;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr3	53220444	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	53220569	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=116,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.543:9:4,1:0,4:4,0,4,1
chr3	53220763	.	GCTCAGAGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	53223291	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	53259989	.	G	GTA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:53259989_G_GTA:53259989:0,2,0,1
chr3	53259992	.	AGC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:53259989_G_GTA:53259989:0,2,0,1
chr3	53259996	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	53259997	.	T	TGTGGGGCGGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:53259989_G_GTA:53259989:0,2,0,1
chr3	53260025	.	G	GCACAGCTTTCTCTTC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	53260716	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	53263200	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=181,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	53263279	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr3	53265581	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,236;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:4,3:3,1:1,6,0,5
chr3	53267133	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr3	53267155	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,13,2
chr3	53324819	.	ATGGCAC	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGCAC;STR;TLOD=235.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,23:0,29:0,0,17,36
chr3	53324915	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,11:0,15:0,0,2,26
chr3	53326072	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53326072_T_G:53326072:0,0,1,0
chr3	53326073	.	G	GGGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53326072_T_G:53326072:0,0,1,0
chr3	53326077	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53326072_T_G:53326072:0,0,1,0
chr3	53326083	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53326072_T_G:53326072:0,0,1,0
chr3	53338368	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:0,4,0,5
chr3	53381327	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	53529126	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:0,0,1,0
chr3	53529128	.	T	TAC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:0,0,1,0
chr3	53529131	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:0,0,1,0
chr3	53529137	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:0,0,1,0
chr3	53529140	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:0,0,1,0
chr3	53529141	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=158,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:1,0,1,0
chr3	53529145	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,12;MFRL=139,235;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:53529126_A_C:53529126:3,0,1,0
chr3	53700622	.	G	GTGGTCTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53700622_G_GTGGTCTA:53700622:0,3,0,1
chr3	53700624	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53700622_G_GTGGTCTA:53700622:0,3,0,1
chr3	53752807	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:53752807_T_A:53752807:0,1,0,1
chr3	53752809	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53752807_T_A:53752807:0,1,0,1
chr3	53752810	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53752807_T_A:53752807:0,1,0,1
chr3	53752812	.	C	CTCTTATTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53752807_T_A:53752807:0,1,0,1
chr3	53758049	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:1,8,3,2
chr3	53766212	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,1:2,1:0,4,0,3
chr3	53774411	.	G	GTGCAGTGGCGTGATCCTAGCTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	53776995	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:4,5:6,5:10,1,9,1
chr3	53779580	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr3	53806803	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:5,1,3,0
chr3	53814197	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	53844021	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=179,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,2:7,0:6,6,1,1
chr3	53845080	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:1,0:1,0:5,1,3,0
chr3	53880684	.	C	CTCCACCATCCCACTCTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:53880684_C_CTCCACCATCCCACTCTCA:53880684:0,2,1,1
chr3	53880686	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:53880684_C_CTCCACCATCCCACTCTCA:53880684:0,2,1,1
chr3	53880789	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	53882663	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:11,3:5,7:8,8,7,3
chr3	53882673	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.425:26:11,4:4,7:9,6,7,4
chr3	53886254	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:6,3:2,0:0,8,0,3
chr3	53889368	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.382:35:12,6:8,7:5,17,4,9
chr3	53890787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	53891097	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=232,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	53892720	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,2:1,1:2,1,4,0
chr3	53899409	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53899409_C_T:53899409:0,0,0,1
chr3	53899410	.	T	TTGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53899409_C_T:53899409:0,0,0,1
chr3	53903988	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:0,4:2,1:2,0,6,0
chr3	53906334	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr3	53910109	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,0:1,4,2,5
chr3	53910122	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,3,9
chr3	53912341	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,17,1
chr3	53921028	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,0,17
chr3	54420721	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=156,132;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:54420721_G_GTT:54420721:1,0,1,0
chr3	54420742	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=14,18;MFRL=156,132;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:54420721_G_GTT:54420721:3,0,1,0
chr3	54420749	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,18;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:54420721_G_GTT:54420721:4,0,1,0
chr3	54420752	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=21,18;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTT:54420721:4,0,1,0
chr3	54420755	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=12,17;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:54420721_G_GTT:54420721:4,0,1,0
chr3	54420758	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=22,17;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTT:54420721:4,0,1,0
chr3	54596815	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr3	54604188	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=172,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr3	54919272	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,3:8,3:10,5,5,1
chr3	54962013	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,3:4,0:2,3,1,2
chr3	55003733	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	55003992	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,2:0,1:0,0,0,5
chr3	55018619	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,142;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:4,3:0,6:4,0,8,1
chr3	55038898	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,6,9
chr3	55041696	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr3	55107512	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:16,0:9,5:18,9,0,5
chr3	55107671	.	A	AGAAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=216,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAG;STR;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:2,3,1,4
chr3	55107944	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:0,6,0,3
chr3	55108055	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:55108055_G_A:55108055:0,0,3,0
chr3	55108064	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:55108055_G_A:55108055:0,0,3,0
chr3	55108188	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:8,8:7,3:7,8,6,6
chr3	55108234	.	CACTGACTGAGATGTTCTCTT	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTGACTGAGATGTTCTCTT;STR;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.940:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	55520969	.	G	GCC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=166,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:4,0:8,6,0,3
chr3	55733390	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.498:40:6,12:14,7:15,5,14,6
chr3	56052839	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=212,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr3	56173775	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=69,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:56173775_G_A:56173775:0,2,0,1
chr3	56173782	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=138,247;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56173775_G_A:56173775:0,1,0,1
chr3	56173787	.	T	TGAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56173775_G_A:56173775:0,0,0,1
chr3	56173788	.	T	TTCTTCCAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56173775_G_A:56173775:0,0,0,1
chr3	56591178	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr3	56591278	.	T	TGGGGTAAGCA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGTAAGCA;STR;TLOD=114.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.971:30:0,14:0,9:0,0,18,12
chr3	56593543	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=219.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,33:0,29:0,0,52,12
chr3	56593680	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=175.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,24:0,23:0,0,6,41
chr3	56597688	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr3	56600531	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	56601175	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=179,244;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	56605404	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=15,31;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=57.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,21:0.922:22:0,12:0,7:0|1:56605404_TA_T:56605404:0,1,1,20
chr3	56605416	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.157:23:14,1:3,2:0|1:56605404_TA_T:56605404:1,19,0,3
chr3	56647537	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:14,6:8,5:22,0,11,0
chr3	56647855	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,116;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,0:4,3:0,13,0,3
chr3	56674190	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr3	56789122	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=118,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,0:3,1:0|1:56789122_A_C:56789122:7,3,0,3
chr3	56789129	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.366:14:3,1:3,0:0|1:56789122_A_C:56789122:6,3,0,5
chr3	56807854	.	TA	T,TAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31,32;MFRL=125,162,164;MMQ=60,60,60;MPOS=7,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=10.36,6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,6,6:0.274,0.258:23:6,2,3:4,4,3:2,9,3,9
chr3	56808956	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=0,185;MMQ=50,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.815:7:0,2:0,4:1,0,6,0
chr3	57131529	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	57137090	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,13,8
chr3	57139833	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,4:6,4:8,0,7,1
chr3	57140108	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.351:21:4,4:9,3:7,7,4,3
chr3	57232525	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:3,1:1,0:0,5,1,1
chr3	57264803	.	T	C	.	.	DP=122;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,75;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,2:0.024:122:65,0:52,2:49,71,1,1
chr3	57264807	.	G	T	.	.	DP=119;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=122,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:108,8:0.069:116:58,0:47,7:39,69,6,2
chr3	57264872	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:4,2:9,6:0,15,1,8
chr3	57276258	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.365:20:4,3:9,4:0,13,0,7
chr3	57276259	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,171;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.303:22:7,0:9,6:1,15,0,6
chr3	57294085	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.523:21:7,5:3,6:3,7,3,8
chr3	57294295	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=103,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr3	57294884	.	CAAATT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATT;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	57330832	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,1:2,6:2,1,6,1
chr3	57335876	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:6,5:1,7:1,6,3,9
chr3	57335885	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:7,1:5,13,0,2
chr3	57394339	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=36,34;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:57394339_G_GC:57394339:0,3,0,2
chr3	57394341	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=-10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:57394339_G_GC:57394339:0,3,0,2
chr3	57394345	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=-12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:1,2:0|1:57394339_G_GC:57394339:0,3,0,2
chr3	57394348	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=-14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:57394339_G_GC:57394339:0,3,0,2
chr3	57394353	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=-16;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:1,0:2,2:0|1:57394339_G_GC:57394339:0,3,0,2
chr3	57407522	.	A	AGTTAGCTCTTCTTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	57414330	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,3,6
chr3	57422824	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:9,8:3,4:0,12,1,12
chr3	57431721	.	AAAATAAAT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=AAAT;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.382:11:4,1:2,3:0|1:57431721_AAAATAAAT_A:57431721:6,1,4,0
chr3	57431740	.	ATAAATAAATAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,9:0.500:18:1,6:3,3:1|0:57431721_AAAATAAAT_A:57431721:8,1,7,2
chr3	57443817	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,20:0,10:0,0,29,3
chr3	57456093	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	57456371	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr3	57457123	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,11:0,4:0,0,16,0
chr3	57469053	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr3	57469097	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,15,5
chr3	57469272	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr3	57484323	.	G	GATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=132,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	57484333	.	T	TTAACAACCCAATTTTCACCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	57488279	.	T	TTTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	57493637	.	CG	TA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=193,137;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	57493642	.	TC	AT,GT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=17,31,34;MFRL=204,182,137;MMQ=60,60,40;MPOS=22,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,0,0:1,1,1:0,3,0,2
chr3	57493649	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=204,160;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	57493651	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:57493651_C_T:57493651:0,4,0,1
chr3	57493653	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:57493651_C_T:57493651:0,4,0,1
chr3	57545154	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:5,8:5,8:3,7,0,16
chr3	57545169	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=119,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,5:3,6:0,6,0,11
chr3	57563120	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0,6,0,6
chr3	57627500	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,2,17
chr3	57632004	.	C	CA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:14,4:13,0:27,1,3,1
chr3	57646399	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,9:0.131:74:10,0:54,9:64,1,9,0
chr3	57658248	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,147;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:17,0:18,2:0,36,0,2
chr3	57846577	.	CA	C	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,8:0.133:65:23,3:33,5:4,53,1,7
chr3	57850505	.	CT	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,9:0.169:57:28,8:17,1:33,15,8,1
chr3	58080505	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,0:3,4:7,0,3,1
chr3	58089585	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:4,0,4,0
chr3	58089594	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:6,0,5,0
chr3	58089851	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=128,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:2,1:3,6:2,3,1,7
chr3	58089877	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr3	58090893	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:21,0:21,2:18,25,1,1
chr3	58092346	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,2,2
chr3	58094157	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,3:2,4:4,2,5,2
chr3	58094852	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,6:2,7:4,0,11,2
chr3	58095466	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr3	58095500	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr3	58104676	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,1:19,2:13,21,1,2
chr3	58111285	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,6:0,1:5,1,5,2
chr3	58112251	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:6,4:3,6:9,1,10,0
chr3	58112556	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr3	58116369	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:0,3:6,7:6,0,10,0
chr3	58118700	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,6:8,2:3,9,1,7
chr3	58120318	.	GGT	G,GGTGT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,29,30;MFRL=145,155,101;MMQ=60,60,60;MPOS=1,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=GT;STR;TLOD=3.33,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,3:0.102,0.127:28:7,1,1:14,2,1:21,1,5,1
chr3	58121626	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	58132808	.	GC	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,3:5,1:0,6,0,4
chr3	58145263	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr3	58155230	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=233,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr3	58179028	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=237,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr3	58183636	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.516:37:7,11:10,8:5,13,9,10
chr3	58186911	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	58194051	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:12,2:11,3:5,18,1,4
chr3	58196639	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=119,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:6,7:2,3:2,6,2,8
chr3	58270943	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:58270943_T_A:58270943:1,3,0,1
chr3	58270945	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:58270943_T_A:58270943:1,3,0,1
chr3	58270963	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr3	58279530	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58279530_G_GCC:58279530:0,1,0,1
chr3	58279534	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58279530_G_GCC:58279530:0,1,0,1
chr3	58279535	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58279530_G_GCC:58279530:0,1,0,1
chr3	58296209	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.659:15:2,6:1,3:2,3,7,3
chr3	58296398	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr3	58302404	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=135,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr3	58303069	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr3	58303307	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	58351656	.	G	C	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,4:0.057:81:24,0:25,1:29,48,0,4
chr3	58351660	.	CT	C,CTTT,CTTTT	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=20,26,19,21;MFRL=160,161,125,147;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,18,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,14,17,18;RU=T;STR;TLOD=6.67,8.73,5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:22,5,7,3:0.121,0.235,0.111:37:9,3,2,0:7,1,1,2:2,20,3,12
chr3	58351672	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=147,126;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:26,3:29,0:14,41,0,3
chr3	58385194	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr3	58413662	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=235,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr3	58414382	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=73,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	58415590	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	58417190	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=182,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr3	58516383	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:3,1:7,6:3,8,0,7
chr3	58520306	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr3	58520859	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	58552834	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	58555386	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=85,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr3	58620193	.	G	GTGTGTGTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58620193_G_GTGTGTGTGT:58620193:0,0,0,1
chr3	58620194	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,0:0,1:0|1:58620193_G_GTGTGTGTGT:58620193:0,0,0,1
chr3	58621935	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	58629529	.	GAGGA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.510:2:1,1:0,0:0|1:58629529_GAGGA_G:58629529:0,1,0,1
chr3	58629536	.	CACA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58629529_GAGGA_G:58629529:0,1,0,1
chr3	58629540	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58629529_GAGGA_G:58629529:0,1,0,1
chr3	58631184	.	G	GAAATA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AAATA;STR;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:1,3:2,0:3,0,3,1
chr3	58641352	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=117,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,7:4,5:1,6,2,10
chr3	59738115	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:59738115_G_A:59738115:0,2,0,1
chr3	59738120	.	G	GAGAC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:59738115_G_A:59738115:0,1,0,1
chr3	59738124	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=17,32;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:59738115_G_A:59738115:0,1,0,1
chr3	59738134	.	AAAATTT	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59738134_AAAATTT_A:59738134:0,0,0,1
chr3	59738142	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59738134_AAAATTT_A:59738134:0,0,0,1
chr3	59738146	.	TT	GG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59738134_AAAATTT_A:59738134:0,0,0,1
chr3	59999690	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,3:4,3:8,0,6,1
chr3	61734539	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=107,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.618:32:4,4:8,16:8,4,13,7
chr3	62257150	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,2:5,0:9,6,1,1
chr3	62261684	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=113,84;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:2,6,0,2
chr3	62357238	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,1:9,1:8,4,1,1
chr3	62423881	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.104:26:9,2:15,0:9,15,1,1
chr3	62431387	.	G	GAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=129,182;MMQ=35,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,1:2,3:4,0,4,0
chr3	62431394	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=157,101;MMQ=60,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:10,1,2,0
chr3	62431415	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=111,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.454:16:5,3:1,3:8,1,7,0
chr3	62484799	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,145;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:8,3,3,0
chr3	62498378	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=208.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,31:0,30:0,0,45,17
chr3	62631553	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr3	62636588	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:23,0:10,3:22,11,2,1
chr3	62636826	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	62647904	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr3	62647928	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr3	62739092	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	63821914	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,7:0,0,15,4
chr3	63898360	.	G	GGCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=GCA;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr3	63981635	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=121,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:13,5:5,5:6,12,1,9
chr3	63999322	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:2,1:0,7,1,3
chr3	64004409	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:7,1:7,10:7,7,8,5
chr3	64142994	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.581:34:9,12:5,7:2,12,7,13
chr3	64518994	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr3	64526717	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	64526942	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,4,12
chr3	64527299	.	AGAAAAC	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=20,33;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:6,0:0|1:64527299_AGAAAAC_A:64527299:2,9,0,2
chr3	64527306	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:64527299_AGAAAAC_A:64527299:0,8,0,2
chr3	64527308	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=37,34;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:64527299_AGAAAAC_A:64527299:0,8,0,2
chr3	64527321	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr3	64527336	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	64527378	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr3	64527465	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr3	64532509	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:6,1:18,1:12,13,1,1
chr3	64592834	.	G	GGAACTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=184,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64592834_G_GGAACTA:64592834:0,1,0,1
chr3	64592837	.	A	AACTATATAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=184,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64592834_G_GGAACTA:64592834:0,1,0,1
chr3	64592838	.	G	GGGAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=184,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64592834_G_GGAACTA:64592834:0,1,0,1
chr3	64608351	.	TCGCTGTGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64608351_TCGCTGTGC_T:64608351:0,1,0,1
chr3	64608360	.	ACG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64608351_TCGCTGTGC_T:64608351:0,1,0,1
chr3	64617699	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=197,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	64640206	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=135.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.971:31:0,14:0,16:0|1:64640206_TA_T:64640206:0,0,23,8
chr3	64640212	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=138.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0|1:64640206_TA_T:64640206:0,0,24,8
chr3	65350557	.	G	GGTGT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=115,160;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=GT;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:17,0:17,1:22,15,2,0
chr3	65350694	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.593:18:3,7:4,2:0,7,0,11
chr3	65361716	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=303,330;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:65361716_G_A:65361716:0,1,0,1
chr3	65361717	.	T	TACCTATTATCTCTCTCTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=303,330;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65361716_G_A:65361716:0,1,0,1
chr3	65416648	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,838;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	65425560	.	T	TCTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=133,181;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CTG;STR;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,1:2,0,4,0
chr3	65464344	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:12,0:14,3:15,11,2,1
chr3	66023592	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	66413203	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr3	66463251	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr3	66465259	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	66465504	.	AAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:2,3:1,5,0,3
chr3	67053677	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:17,1:14,0:18,13,1,1
chr3	67058514	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=157,64902538;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:8,10,1,1
chr3	67426125	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,183;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:7,1,8,0
chr3	67659817	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr3	67660040	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:67660040_G_A:67660040:0,0,1,6
chr3	67660049	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:67660040_G_A:67660040:0,0,1,5
chr3	68587884	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,7:6,4:9,0,8,3
chr3	68782213	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr3	68788363	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:6,5:0,5:0,6,2,8
chr3	69036524	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	69036678	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:8,5:3,5:0|1:69036678_G_C:69036678:6,5,2,8
chr3	69036683	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:9,5:3,5:0|1:69036678_G_C:69036678:6,6,2,8
chr3	69047141	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:9,4:4,5:7,6,5,4
chr3	69058783	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:6,0,7,1
chr3	69059081	.	CAACAA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=19,36;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:0,0:0,3,0,1
chr3	69059086	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	69059095	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=170,159;MMQ=50,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:69059095_A_T:69059095:0,2,0,1
chr3	69059097	.	A	AGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=170,159;MMQ=50,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:69059095_A_T:69059095:0,2,0,1
chr3	69073410	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.609:8:0,3:2,1:0,3,1,4
chr3	69073419	.	GTTT	G,GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32,33;MFRL=0,188,165;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.46,7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.336,0.552:5:0,2,1:0,0,2:0,0,1,4
chr3	69074930	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,2:2,7:0,6,0,9
chr3	69082657	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	69082873	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:0,5,0,7
chr3	69084161	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.406:40:10,7:12,9:15,9,10,6
chr3	69088027	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=97,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:5,1:20,1:13,12,2,0
chr3	69088918	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	69088944	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	69093598	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:7,11:6,4:11,2,13,2
chr3	69104695	.	T	A	.	.	DP=176;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=533.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,162:0.994:162:0,76:0,83:0,0,51,111
chr3	69104752	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=177.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,26:0,25:0,0,0,51
chr3	69106304	.	CC	TG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:8,9:9,6:17,0,14,1
chr3	69112049	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=84.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,12:0,0,25,1
chr3	69112658	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.144:32:8,1:13,1:10,17,0,5
chr3	69112673	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=156,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:13,0:13,2:1,27,0,2
chr3	69113153	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:4,7:7,9:9,2,16,1
chr3	69127133	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:0,7,0,9
chr3	69129386	.	GGGGGTGT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,12;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:1,0:3,0:0|1:69129386_GGGGGTGT_G:69129386:7,0,0,2
chr3	69129397	.	G	GCC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:3,2:3,0:0|1:69129386_GGGGGTGT_G:69129386:6,3,0,3
chr3	69153852	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:69153852_A_C:69153852:0,4,0,1
chr3	69153854	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:69153852_A_C:69153852:0,1,0,4
chr3	69153861	.	TTGCG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0|1:69153852_A_C:69153852:0,3,0,1
chr3	69153869	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:69153852_A_C:69153852:0,3,0,1
chr3	69225588	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr3	69225875	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	69229976	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr3	69230026	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,6:0,0,17,3
chr3	69230061	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,12:0,0,16,13
chr3	69242770	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.843:11:1,7:0,2:1,0,9,1
chr3	69244162	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr3	69245949	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	69246274	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,1114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	69265371	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0,0,8,4
chr3	69267578	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,10:0,0,0,25
chr3	69273656	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	69362722	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr3	70005712	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,8:4,4:2,7,3,9
chr3	71015021	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.396:31:5,7:13,5:13,6,12,0
chr3	71027251	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=143,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr3	71161788	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,36;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,2:9,0:3,8,1,1
chr3	71745633	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:19,1:13,1:16,17,1,1
chr3	72495593	.	T	TAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=201,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,1:0,1:1,1,2,2
chr3	72495777	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=194,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:0,15:1,12:0,1,9,18
chr3	72873591	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,2:13,0:20,8,2,0
chr3	72897583	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=274,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	73004157	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	73016635	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	73024350	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=125.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,21:0,18:0,0,8,33
chr3	73096591	.	A	ATAAT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.577:43:8,7:10,18:0,18,0,25
chr3	73110076	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr3	73112489	.	A	AAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.604:9:1,3:1,3:0,3,0,6
chr3	73112919	.	T	TA	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=76.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,26:0.583:45:9,10:9,14:4,15,4,22
chr3	73112974	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,4:1,3:0,8,1,6
chr3	73437112	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,1,2
chr3	73440108	.	G	GA,GAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33,35;MFRL=117,142,62;MMQ=60,60,60;MPOS=9,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.41,3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.273,0.273:8:1,1,1:2,1,1:4,0,4,0
chr3	73651469	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,6:3,2:2,5,6,2
chr3	73651621	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr3	74315580	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,9:1,5:3,0,14,0
chr3	74344356	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.456:20:5,4:6,5:3,8,3,6
chr3	74350997	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr3	74474166	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,6:0,14:0,0,0,20
chr3	75679820	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=12;MBQ=20,29;MFRL=113,188;MMQ=37,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chr3	75679836	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=34,32;MFRL=191,128;MMQ=25,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr3	75679863	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=12;MBQ=34,34;MFRL=194,134;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:8,0,4,1
chr3	75679872	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=166,196;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,2:7,1:10,1,3,0
chr3	75679876	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=166,158;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:10,1,5,0
chr3	75679891	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=191,137;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:0|1:75679891_G_A:75679891:11,1,6,1
chr3	75679893	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=191,137;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,4:7,3:11,1,6,1
chr3	75679899	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=188,137;MMQ=25,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:4,4:8,3:0|1:75679891_G_A:75679891:11,1,6,1
chr3	75679930	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=144,131;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.413:27:7,6:9,5:0|1:75679930_A_C:75679930:12,4,6,5
chr3	75679937	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=127,171;MMQ=25,48;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.267:28:10,2:11,4:14,7,5,2
chr3	75679938	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=29,33;MFRL=139,131;MMQ=25,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:7,5:12,4:0|1:75679930_A_C:75679930:14,5,5,4
chr3	75679944	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=138,138;MMQ=25,25;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:11,2:14,3:14,12,5,0
chr3	75679958	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=126,147;MMQ=27,48;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,7:0.205:37:13,2:16,5:0|1:75679958_C_T:75679958:19,11,5,2
chr3	75679965	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=131,137;MMQ=29,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,11:0.285:40:8,5:18,4:0|1:75679965_C_A:75679965:19,10,5,6
chr3	75679973	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=28,34;MFRL=127,143;MMQ=27,48;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:12,3:17,5:0|1:75679958_C_T:75679958:19,14,4,4
chr3	75679975	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=125,136;MMQ=48,26;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,14:0.357:40:9,7:16,7:0|1:75679975_C_T:75679975:15,11,7,7
chr3	75679988	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=11;MBQ=27,33;MFRL=125,136;MMQ=48,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,12:0.317:39:11,6:16,6:0|1:75679975_C_T:75679975:16,11,5,7
chr3	75679990	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=133,131;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:15,0:16,3:0|1:75679990_G_A:75679990:19,20,2,1
chr3	75679997	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=32,31;MFRL=128,145;MMQ=27,29;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:10,4:17,1:0|1:75679965_C_A:75679965:13,16,2,4
chr3	75680006	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=30,33;MFRL=138,128;MMQ=27,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,3:16,0:8,18,1,2
chr3	75680010	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=137,139;MMQ=27,48;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:9,2:13,3:8,15,1,4
chr3	75680011	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=139,131;MMQ=25,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:11,0:14,2:0|1:75679990_G_A:75679990:7,21,2,1
chr3	75680081	.	TGTG	T	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=156,179;MMQ=25,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	75713442	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=148,274;MMQ=40,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,1:0|1:75713442_G_A:75713442:7,0,2,0
chr3	75713449	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=145,274;MMQ=40,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:75713442_G_A:75713442:11,0,2,0
chr3	75713457	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=140,299;MMQ=43,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:9,0:6,3:0|1:75713442_G_A:75713442:15,0,3,0
chr3	75713472	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=136,244;MMQ=58,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:16,1:10,4:22,4,5,0
chr3	75713496	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=124,226;MMQ=55,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.107:49:24,1:20,4:33,11,4,1
chr3	75713507	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=120,208;MMQ=55,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,7:0.138:52:24,3:20,4:32,13,5,2
chr3	75713566	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=141,192;MMQ=52,26;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.173:50:26,4:16,4:16,26,7,1
chr3	75713618	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=157,152;MMQ=47,37;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.104:50:19,2:25,3:28,17,5,0
chr3	75713654	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=146,140;MMQ=50,49;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,16:0.176:92:30,5:44,10:47,29,12,4
chr3	75713658	.	AAG	A	.	.	DP=108;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=143,147;MMQ=50,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,9:0.085:106:37,3:53,6:58,39,7,2
chr3	75713669	.	G	A	.	.	DP=116;ECNT=12;MBQ=28,30;MFRL=137,137;MMQ=50,49;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,23:0.221:106:33,9:45,14:50,33,14,9
chr3	75713725	.	C	T	.	.	DP=107;ECNT=12;MBQ=34,28;MFRL=134,143;MMQ=51,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,38:0.371:103:29,17:35,21:23,42,18,20
chr3	75713738	.	T	G	.	.	DP=85;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=138,145;MMQ=52,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,29:0.370:79:19,12:28,16:12,38,10,19
chr3	75713748	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=139,139;MMQ=51,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,8:0.127:69:21,3:31,5:18,43,0,8
chr3	75713751	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=140,150;MMQ=48,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,14:0.250:58:16,7:27,7:11,33,4,10
chr3	75713757	.	AGG	A	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=141,137;MMQ=49,41;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,16:0.354:46:12,5:16,11:0|1:75713757_AGG_A:75713757:5,25,2,14
chr3	75713762	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=12;MBQ=30,35;MFRL=139,142;MMQ=49,41;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=61.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,17:0.375:46:13,5:13,12:0|1:75713757_AGG_A:75713757:5,24,2,15
chr3	75713782	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=140,166;MMQ=56,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.571:33:6,11:8,8:0,14,1,18
chr3	75713794	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=33,34;MFRL=160,168;MMQ=56,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:10,6:7,4:0,17,0,10
chr3	75713858	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=232,212;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:2,2:3,1:6,0,0,3
chr3	75713879	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=186,242;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:12,1,0,2
chr3	75713897	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=186,215;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:14,1,1,1
chr3	75713948	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=154,203;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,1:15,1:0|1:75713948_C_T:75713948:21,4,2,0
chr3	75713958	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=152,203;MMQ=60,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,1:16,1:0|1:75713948_C_T:75713948:22,6,2,0
chr3	75713963	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=150,203;MMQ=60,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,1:15,1:0|1:75713948_C_T:75713948:20,6,2,0
chr3	75714095	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=135,140;MMQ=37,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,11:0.255:45:12,7:22,4:0|1:75714095_G_A:75714095:9,25,0,11
chr3	75714102	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=135,140;MMQ=31,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,9:0.222:43:13,4:19,3:0|1:75714095_G_A:75714095:7,27,0,9
chr3	75714118	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=145,0;MMQ=28,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:7,2:22,3:0|1:75714118_G_A:75714118:4,26,0,5
chr3	75714127	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=158,0;MMQ=28,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:8,2:16,1:0|1:75714118_G_A:75714118:2,22,0,3
chr3	75714139	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=179,140;MMQ=56,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:3,4:10,4:2,11,1,7
chr3	75714185	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=180,204;MMQ=36,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:5,1:0|1:75714185_C_T:75714185:6,2,2,0
chr3	75714202	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=170,206;MMQ=40,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.221:25:10,2:7,3:0|1:75714185_C_T:75714185:18,2,3,2
chr3	75714240	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=161,171;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,12:0.245:51:17,5:21,7:37,2,10,2
chr3	75714242	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=164,164;MMQ=40,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,12:0.236:53:19,3:21,9:0|1:75714242_G_T:75714242:37,4,12,0
chr3	75714251	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=161,163;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,14:0.238:61:25,3:21,11:0|1:75714242_G_T:75714242:43,4,14,0
chr3	75714263	.	CA	TT	.	.	DP=71;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=156,148;MMQ=40,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,14:0.211:69:21,8:31,6:49,6,14,0
chr3	75714298	.	A	G	.	.	DP=133;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=127,129;MMQ=60,37;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,50:0.421:118:30,29:37,21:51,17,49,1
chr3	75714337	.	T	G	.	.	DP=335;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=110,112;MMQ=60,48;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=633.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,206:0.649:318:64,105:44,93:60,52,131,75
chr3	75714345	.	G	T	.	.	DP=366;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=108,122;MMQ=60,52;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:275,80:0.224:355:150,30:118,47:168,107,47,33
chr3	75714379	.	T	G	.	.	DP=273;ECNT=12;MBQ=29,30;MFRL=116,120;MMQ=60,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:242,24:0.092:266:116,13:117,11:108,134,10,14
chr3	75714382	.	G	C,T	.	.	DP=268;ECNT=12;MBQ=31,33,31;MFRL=120,120,118;MMQ=60,60,43;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=154.86,102.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:149,65,37:0.260,0.149:251:86,23,20:59,42,16:63,86,44,58
chr3	75714388	.	G	T	.	.	DP=229;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=120,117;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=90.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:198,30:0.134:228:94,14:81,12:82,116,9,21
chr3	75714391	.	G	T	.	.	DP=205;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=120,128;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=254.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,71:0.357:200:63,38:62,31:0|1:75714391_G_T:75714391:52,77,20,51
chr3	75714394	.	G	T	.	.	DP=200;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=121,130;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=250.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:130,70:0.352:200:56,35:60,31:0|1:75714391_G_T:75714391:51,79,19,51
chr3	75714396	.	T	TG	.	.	DP=187;ECNT=12;MBQ=31,32;MFRL=123,130;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=244.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:118,67:0.364:185:48,33:54,31:0|1:75714391_G_T:75714391:44,74,17,50
chr3	75714422	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=141,123;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,21:0.271:79:25,4:31,17:5,53,7,14
chr3	75714423	.	G	T	.	.	DP=83;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=129,141;MMQ=48,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=94.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,30:0.387:78:19,10:28,20:10,38,1,29
chr3	75714447	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=129,155;MMQ=44,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=162.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,40:0.661:60:10,13:7,25:2,18,1,39
chr3	75714459	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=159,166;MMQ=44,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,13:0.275:49:17,2:15,10:3,33,0,13
chr3	75714465	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=164,171;MMQ=46,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=84.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.479:46:8,12:14,9:2,22,1,21
chr3	75714648	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=162,126;MMQ=50,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.212:26:5,2:16,3:17,4,4,1
chr3	75714663	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=163,126;MMQ=55,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:8,6:19,3:20,7,7,2
chr3	75714674	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=166,140;MMQ=50,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.340:45:14,4:15,11:20,10,11,4
chr3	75714702	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=167,137;MMQ=60,53;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,36:0.563:64:11,12:16,24:17,11,23,13
chr3	75714709	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=161,130;MMQ=60,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.056:69:25,1:37,2:39,27,2,1
chr3	75714788	.	A	C	.	.	DP=86;ECNT=12;MBQ=31,29;MFRL=141,137;MMQ=52,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,3:0.038:84:28,1:50,1:0|1:75714788_A_C:75714788:49,32,0,3
chr3	75714805	.	TG	T	.	.	DP=95;ECNT=12;MBQ=32,33;MFRL=137,142;MMQ=53,41;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=87.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,25:0.280:91:18,12:38,11:0|1:75714805_TG_T:75714805:37,29,15,10
chr3	75714807	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=137,142;MMQ=53,41;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,25:0.283:90:21,14:40,11:0|1:75714805_TG_T:75714805:37,28,15,10
chr3	75714809	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=12;MBQ=30,29;MFRL=138,157;MMQ=52,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,14:0.153:96:31,5:44,6:0|1:75714788_A_C:75714788:45,37,11,3
chr3	75714819	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=12;MBQ=29,31;MFRL=140,168;MMQ=55,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,18:0.181:103:34,7:47,9:0|1:75714788_A_C:75714788:43,42,14,4
chr3	75714824	.	AG	A	.	.	DP=104;ECNT=12;MBQ=31,31;MFRL=139,165;MMQ=55,25;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,15:0.152:103:32,7:49,8:46,42,12,3
chr3	75714825	.	G	A	.	.	DP=102;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=140,153;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,27:0.278:102:30,10:43,15:0|1:75714805_TG_T:75714805:41,34,17,10
chr3	75714831	.	G	A	.	.	DP=109;ECNT=12;MBQ=28,32;MFRL=137,168;MMQ=60,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,18:0.171:109:32,9:54,9:0|1:75714788_A_C:75714788:44,47,15,3
chr3	75714835	.	C	T	.	.	DP=111;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=138,168;MMQ=60,25;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,18:0.168:111:35,9:53,9:0|1:75714788_A_C:75714788:44,49,15,3
chr3	75714840	.	A	G	.	.	DP=122;ECNT=12;MBQ=31,34;MFRL=131,156;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=205.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,54:0.466:116:26,24:35,29:27,35,34,20
chr3	75714843	.	T	A	.	.	DP=128;ECNT=12;MBQ=29,29;MFRL=134,153;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=123.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,35:0.277:128:39,14:46,15:0|1:75714805_TG_T:75714805:49,44,18,17
chr3	75714853	.	G	A	.	.	DP=147;ECNT=12;MBQ=28,30;MFRL=133,153;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,39:0.286:138:41,16:50,22:0|1:75714805_TG_T:75714805:52,47,20,19
chr3	75714895	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=11;MBQ=30,31;MFRL=136,197;MMQ=52,31;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,7:0.067:116:57,3:47,4:45,64,5,2
chr3	75714898	.	G	A	.	.	DP=114;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=142,133;MMQ=53,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,34:0.310:110:44,16:31,17:30,46,20,14
chr3	75714917	.	G	A	.	.	DP=106;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=137,157;MMQ=50,45;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,26:0.262:101:34,14:37,9:0|1:75714917_G_A:75714917:40,35,8,18
chr3	75714929	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=11;MBQ=33,29;MFRL=137,165;MMQ=50,31;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,24:0.245:99:35,13:34,9:0|1:75714917_G_A:75714917:41,34,9,15
chr3	75714935	.	C	A	.	.	DP=101;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=150,147;MMQ=49,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:89,12:0.126:101:42,7:40,5:0|1:75714935_C_A:75714935:46,43,4,8
chr3	75714937	.	G	A	.	.	DP=106;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=148,147;MMQ=49,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,12:0.123:104:45,6:43,5:0|1:75714935_C_A:75714935:47,45,4,8
chr3	75714950	.	C	A	.	.	DP=102;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=137,172;MMQ=49,43;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,23:0.232:99:39,12:36,8:0|1:75714917_G_A:75714917:42,34,10,13
chr3	75714976	.	C	T	.	.	DP=110;ECNT=11;MBQ=34,29;MFRL=155,118;MMQ=43,48;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,50:0.485:103:27,24:25,26:32,21,25,25
chr3	75714980	.	C	A	.	.	DP=107;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=133,175;MMQ=49,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,17:0.168:105:46,5:36,12:45,43,11,6
chr3	75715033	.	T	C	.	.	DP=115;ECNT=11;MBQ=31,33;MFRL=131,129;MMQ=50,28;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,10:0.097:111:41,6:55,4:43,58,8,2
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chr3	75715205	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=33,35;MFRL=192,133;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:8,2:12,4:0|1:75715173_CT_TG:75715173:3,19,1,6
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chr3	75715261	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=27,32;MFRL=197,160;MMQ=60,35;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:3,3:2,3:0|1:75715261_C_T:75715261:0,6,2,6
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chr3	75785942	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=18;MBQ=34,31;MFRL=231,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:1,1:0|1:75785942_G_A:75785942:4,0,3,0
chr3	75785954	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=231,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,0:0|1:75785942_G_A:75785942:4,0,4,0
chr3	75785959	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=18;MBQ=35,31;MFRL=219,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.528:10:3,5:2,0:0|1:75785942_G_A:75785942:5,0,5,0
chr3	75785962	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=18;MBQ=29,34;MFRL=213,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:7,0,3,0
chr3	75785970	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=18;MBQ=34,30;MFRL=203,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.484:11:3,5:3,0:0|1:75785942_G_A:75785942:6,0,5,0
chr3	75785996	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=18;MBQ=35,31;MFRL=158,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,9:2,4:8,0,14,0
chr3	75786019	.	GG	CA,CG	.	.	DP=38;ECNT=18;MBQ=34,33,33;MFRL=157,187,235;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=46.12,8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,13,3:0.341,0.098:38:12,6,2:10,5,1:21,1,16,0
chr3	75786029	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=18;MBQ=32,31;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:16,3:18,2:0|1:75786029_T_A:75786029:33,1,6,0
chr3	75786035	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=18;MBQ=34,34;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,8:0.176:49:18,4:18,4:0|1:75786029_T_A:75786029:38,3,8,0
chr3	75786036	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=18;MBQ=32,34;MFRL=151,217;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.134:49:19,4:19,2:41,2,6,0
chr3	75786041	.	AG	A	.	.	DP=62;ECNT=18;MBQ=32,34;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:27,0:20,5:49,2,5,0
chr3	75786042	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=18;MBQ=33,33;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,29:0.490:59:18,14:10,13:28,2,27,2
chr3	75786059	.	CA	TG,TA	.	.	DP=88;ECNT=18;MBQ=33,31,31;MFRL=152,123,149;MMQ=60,60,60;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=140.71,49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,38,15:0.429,0.176:88:17,19,5:15,14,7:31,4,47,6
chr3	75786071	.	C	A	.	.	DP=105;ECNT=18;MBQ=32,32;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,19:0.187:105:39,5:38,13:0|1:75786071_C_A:75786071:71,15,16,3
chr3	75786073	.	C	G	.	.	DP=108;ECNT=18;MBQ=34,34;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,5:0.055:105:47,0:48,5:82,18,3,2
chr3	75786079	.	CG	TA	.	.	DP=131;ECNT=18;MBQ=32,30;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,26:0.222:118:46,7:42,16:0|1:75786071_C_A:75786071:75,17,20,6
chr3	75786080	.	G	A	.	.	DP=130;ECNT=18;MBQ=28,31;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,48:0.496:100:23,27:28,21:40,12,40,8
chr3	75786132	.	T	C	.	.	DP=184;ECNT=18;MBQ=31,29;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:154,23:0.134:177:72,11:73,12:71,83,10,13
chr3	75786202	.	TG	CA	.	.	DP=126;ECNT=21;MBQ=31,35;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:118,7:0.063:125:53,4:57,3:0|1:75786202_TG_CA:75786202:43,75,2,5
chr3	75786211	.	A	G	.	.	DP=120;ECNT=21;MBQ=29,33;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,25:0.222:114:41,9:43,15:27,62,10,15
chr3	75786221	.	G	A	.	.	DP=104;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,6:0.066:104:50,3:45,3:0|1:75786202_TG_CA:75786202:33,65,2,4
chr3	75786225	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=21;MBQ=32,31;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,36:0.357:101:32,18:30,17:23,42,13,23
chr3	75786243	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,21:0.250:86:32,9:29,11:0|1:75786243_C_T:75786243:18,47,6,15
chr3	75786245	.	T	A	.	.	DP=85;ECNT=21;MBQ=31,28;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,21:0.253:85:33,9:29,12:0|1:75786243_C_T:75786243:18,46,6,15
chr3	75786251	.	GG	AT	.	.	DP=84;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,3:0.046:84:40,1:38,1:25,56,1,2
chr3	75786252	.	G	T	.	.	DP=84;ECNT=21;MBQ=32,30;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,19:0.238:83:31,8:28,10:0|1:75786243_C_T:75786243:20,44,6,13
chr3	75786256	.	T	A	.	.	DP=76;ECNT=21;MBQ=32,30;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,17:0.231:76:28,7:27,9:0|1:75786243_C_T:75786243:17,42,4,13
chr3	75786261	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,20:0.318:64:19,12:22,6:12,32,4,16
chr3	75786278	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=21;MBQ=31,34;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,23:0.453:51:11,10:15,11:0|1:75786278_A_C:75786278:8,20,1,22
chr3	75786288	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=21;MBQ=32,33;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,16:0.354:46:13,7:16,8:0|1:75786288_A_G:75786288:7,23,1,15
chr3	75786298	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=21;MBQ=31,34;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,12:0.310:40:11,5:13,7:0|1:75786288_A_G:75786288:4,24,0,12
chr3	75786302	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:15,1:18,1:3,31,0,2
chr3	75786314	.	CCTACATTCT	C	.	.	DP=31;ECNT=21;MBQ=34,34;MFRL=137,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.394:31:7,3:8,9:0|1:75786278_A_C:75786278:2,17,2,10
chr3	75786337	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.347:21:6,1:8,5:0|1:75786337_G_A:75786337:0,14,2,5
chr3	75786354	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=156,149;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,1:6,4:0|1:75786337_G_A:75786337:0,11,2,3
chr3	75786355	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:3,1:8,2:2,11,0,3
chr3	75786379	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=21;MBQ=31,31;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,2:4,4:1,7,3,3
chr3	75786381	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=21;MBQ=32,33;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:2,4:3,4,1,6
chr3	75786385	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=21;MBQ=28,34;MFRL=186,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,3:1,4,1,5
chr3	75786417	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=25;MBQ=30,32;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:7,8:2,1:0|1:75786417_T_C:75786417:6,5,8,1
chr3	75786430	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=25;MBQ=33,33;MFRL=133,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:11,4:5,0:11,5,4,0
chr3	75786438	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=25;MBQ=34,33;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:8,8:4,3:0|1:75786417_T_C:75786417:8,4,10,1
chr3	75786440	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=25;MBQ=34,33;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:8,7:4,3:0|1:75786417_T_C:75786417:8,4,11,1
chr3	75786450	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=25;MBQ=27,33;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,18:0.575:31:9,12:4,4:0|1:75786417_T_C:75786417:9,4,14,4
chr3	75786453	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=25;MBQ=32,32;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,17:0.529:32:9,13:5,4:0|1:75786417_T_C:75786417:11,4,14,3
chr3	75786469	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=25;MBQ=34,30;MFRL=129,165;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,6:0.152:44:22,6:14,0:0|1:75786469_G_A:75786469:28,10,6,0
chr3	75786476	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=25;MBQ=33,33;MFRL=137,143;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,6:0.143:47:22,6:15,0:0|1:75786469_G_A:75786469:31,10,6,0
chr3	75786490	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=25;MBQ=34,35;MFRL=136,122;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,6:0.130:52:24,5:18,1:0|1:75786469_G_A:75786469:31,15,6,0
chr3	75786499	.	CA	TG	.	.	DP=54;ECNT=25;MBQ=34,32;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.107:54:28,3:18,2:34,15,4,1
chr3	75786500	.	AT	GA,GT	.	.	DP=58;ECNT=25;MBQ=32,29,29;MFRL=135,126,124;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=21.66,76.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,7,21:0.142,0.401:52:13,5,11:9,2,8:16,8,18,10
chr3	75786506	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=25;MBQ=30,33;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,22:0.365:61:20,13:15,8:0|1:75786506_T_C:75786506:28,11,11,11
chr3	75786515	.	GG	AG,AT	.	.	DP=63;ECNT=25;MBQ=30,32,33;MFRL=136,121,160;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=101.70,14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,28,5:0.439,0.093:62:13,14,3:15,11,2:20,9,20,13
chr3	75786518	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=25;MBQ=30,36;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,6:0.106:64:26,4:24,2:0|1:75786469_G_A:75786469:34,24,6,0
chr3	75786521	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=25;MBQ=33,34;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,6:0.104:65:27,3:31,2:0|1:75786469_G_A:75786469:34,25,6,0
chr3	75786533	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=25;MBQ=29,34;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=72.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,23:0.332:70:20,11:25,11:0|1:75786506_T_C:75786506:28,19,13,10
chr3	75786555	.	C	CTG	.	.	DP=70;ECNT=25;MBQ=33,33;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=144.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,38:0.573:66:13,17:14,18:15,13,18,20
chr3	75786572	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=25;MBQ=32,30;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,27:0.406:67:17,11:20,15:0|1:75786572_T_C:75786572:17,23,15,12
chr3	75786597	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=25;MBQ=30,32;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,21:0.367:58:17,9:16,9:0|1:75786572_T_C:75786572:19,18,11,10
chr3	75786607	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=134,146;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=81.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,22:0.371:60:21,10:15,11:0|1:75786572_T_C:75786572:20,18,8,14
chr3	75786610	.	T	A,G	.	.	DP=63;ECNT=25;MBQ=32,33,32;MFRL=132,165,133;MMQ=60,60,57;MPOS=8,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.09,50.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,7,16:0.126,0.268:62:19,3,9:18,4,6:22,17,9,14
chr3	75786618	.	CT	AC	.	.	DP=63;ECNT=25;MBQ=34,28;MFRL=132,143;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.142:61:26,4:22,4:27,26,2,6
chr3	75786619	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=25;MBQ=32,29;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,23:0.359:63:19,12:18,10:22,18,9,14
chr3	75786623	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,13:0.222:61:26,6:20,7:20,28,10,3
chr3	75786628	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,25:0.397:63:19,14:19,10:20,18,12,13
chr3	75786662	.	A	T	.	.	DP=86;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=131,171;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,4:0.057:85:38,2:42,2:0|1:75786662_A_T:75786662:35,46,2,2
chr3	75786670	.	G	A	.	.	DP=90;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,21:0.245:87:42,1:24,20:27,39,9,12
chr3	75786672	.	C	T	.	.	DP=88;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=131,166;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,5:0.067:88:38,3:36,2:0|1:75786662_A_T:75786662:34,49,3,2
chr3	75786681	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=174.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,49:0.652:75:15,23:10,26:11,15,18,31
chr3	75786684	.	G	T	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=132,171;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,6:0.084:81:36,3:34,3:0|1:75786662_A_T:75786662:29,46,3,3
chr3	75786687	.	A	T	.	.	DP=79;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,9:0.125:78:33,6:35,3:27,42,3,6
chr3	75786737	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=31,33;MFRL=118,175;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,21:0.439:48:13,8:12,11:8,19,8,13
chr3	75786740	.	CA	GG	.	.	DP=52;ECNT=27;MBQ=33,32;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,9:0.182:51:15,5:22,3:0|1:75786740_CA_GG:75786740:16,26,2,7
chr3	75786741	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=27;MBQ=31,32;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,13:0.317:42:12,4:16,8:0|1:75786741_A_G:75786741:9,20,6,7
chr3	75786748	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=27;MBQ=33,32;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,7:0.143:54:17,5:25,2:0|1:75786748_C_T:75786748:19,28,1,6
chr3	75786753	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=30,30;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.441:50:14,7:12,14:11,17,9,13
chr3	75786754	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=32,32;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,10:0.194:53:17,5:23,3:0|1:75786740_CA_GG:75786740:18,25,4,6
chr3	75786759	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=32,34;MFRL=118,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,20:0.382:53:15,9:17,11:11,22,10,10
chr3	75786760	.	TC	T	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=31,32;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,8:0.164:53:19,5:24,3:0|1:75786748_C_T:75786748:19,26,2,6
chr3	75786764	.	C	CT	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=29,35;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,8:0.164:53:18,5:23,3:0|1:75786740_CA_GG:75786740:18,27,4,4
chr3	75786773	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=27;MBQ=31,30;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,11:0.226:51:21,4:18,6:0|1:75786741_A_G:75786741:17,23,6,5
chr3	75786784	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=27;MBQ=31,29;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,7:0.154:50:21,2:20,5:0|1:75786740_CA_GG:75786740:17,26,4,3
chr3	75786802	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=27;MBQ=29,33;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,11:0.217:51:15,3:20,4:0|1:75786741_A_G:75786741:18,22,7,4
chr3	75786817	.	CACATTCATT	C	.	.	DP=54;ECNT=27;MBQ=33,35;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,14:0.295:49:13,4:16,9:0|1:75786817_CACATTCATT_C:75786817:24,11,3,11
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chr3	75786832	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=27;MBQ=30,31;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,14:0.275:51:15,5:20,7:0|1:75786741_A_G:75786741:20,17,9,5
chr3	75786833	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=27;MBQ=31,31;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,11:0.214:54:16,4:19,7:22,21,8,3
chr3	75786845	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=27;MBQ=32,33;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=165.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,41:0.711:57:6,19:10,20:1|0:75786817_CACATTCATT_C:75786817:5,11,27,14
chr3	75786854	.	A	T	.	.	DP=67;ECNT=27;MBQ=32,29;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,15:0.237:64:20,5:26,9:27,22,9,6
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chr3	75786888	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=27;MBQ=30,30;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,9:0.115:85:24,4:46,5:0|1:75786888_C_T:75786888:40,36,8,1
chr3	75786892	.	A	C	.	.	DP=93;ECNT=27;MBQ=32,30;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,26:0.284:93:21,10:38,13:0|1:75786866_G_T:75786866:38,29,15,11
chr3	75786894	.	GT	G	.	.	DP=95;ECNT=27;MBQ=33,34;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,9:0.106:92:28,4:51,5:0|1:75786888_C_T:75786888:44,39,8,1
chr3	75786899	.	T	C	.	.	DP=96;ECNT=27;MBQ=31,34;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=108.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,30:0.316:96:20,13:44,15:0|1:75786866_G_T:75786866:36,30,15,15
chr3	75786916	.	C	A	.	.	DP=102;ECNT=27;MBQ=34,31;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,29:0.288:102:24,13:44,15:0|1:75786866_G_T:75786866:39,34,16,13
chr3	75786919	.	A	T	.	.	DP=105;ECNT=27;MBQ=31,32;MFRL=124,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=105.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,30:0.292:104:25,14:44,13:0|1:75786866_G_T:75786866:39,35,16,14
chr3	75786921	.	G	A	.	.	DP=107;ECNT=27;MBQ=33,32;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,11:0.115:102:35,6:49,5:48,43,4,7
chr3	75786942	.	C	A	.	.	DP=117;ECNT=27;MBQ=33,30;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,36:0.314:115:38,17:39,18:38,41,14,22
chr3	75786965	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,22:0.225:100:43,10:34,12:0|1:75786965_C_T:75786965:31,47,7,15
chr3	75786991	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,17:0.231:76:29,6:27,7:0|1:75786965_C_T:75786965:22,37,7,10
chr3	75786993	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=19;MBQ=32,33;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,7:0.111:65:31,2:27,4:20,38,4,3
chr3	75787015	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,18:0.311:59:23,7:18,11:0|1:75787015_C_T:75787015:14,27,6,12
chr3	75787032	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=19;MBQ=31,30;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,15:0.258:60:20,6:21,8:0|1:75787032_T_C:75787032:15,30,6,9
chr3	75787042	.	G	GAAAT	.	.	DP=63;ECNT=19;MBQ=33,35;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,18:0.292:63:25,6:18,9:0|1:75787032_T_C:75787032:15,30,8,10
chr3	75787043	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=19;MBQ=34,32;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,15:0.246:63:21,7:22,7:0|1:75787015_C_T:75787015:20,28,3,12
chr3	75787044	.	A	ACTT	.	.	DP=64;ECNT=19;MBQ=32,30;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,19:0.303:64:26,5:17,11:0|1:75787032_T_C:75787032:16,29,9,10
chr3	75787047	.	G	GACTTATA	.	.	DP=64;ECNT=19;MBQ=34,34;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,16:0.253:64:21,7:22,6:0|1:75787015_C_T:75787015:21,27,4,12
chr3	75787049	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=19;MBQ=33,31;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,9:0.150:64:28,4:22,4:22,33,3,6
chr3	75787057	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,43:0.677:63:14,16:6,24:8,12,17,26
chr3	75787081	.	A	T	.	.	DP=58;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,13:0.228:58:17,7:20,5:0|1:75787015_C_T:75787015:21,24,3,10
chr3	75787098	.	CCT	C	.	.	DP=53;ECNT=19;MBQ=34,29;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,10:0.211:50:18,3:17,7:16,24,4,6
chr3	75787116	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,11:0.228:49:17,4:18,7:0|1:75787015_C_T:75787015:15,23,3,8
chr3	75787127	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,7:0.167:46:17,3:17,3:0|1:75787015_C_T:75787015:13,26,2,5
chr3	75787145	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=19;MBQ=31,28;MFRL=166,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,9:0.249:38:13,6:16,3:0|1:75787145_T_C:75787145:13,16,3,6
chr3	75787159	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=19;MBQ=33,31;MFRL=166,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:14,4:14,1:0|1:75787145_T_C:75787145:15,16,4,3
chr3	75787169	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=19;MBQ=27,31;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.386:42:14,9:11,6:16,10,10,6
chr3	75787174	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=19;MBQ=32,27;MFRL=160,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:20,1:15,2:22,17,3,0
chr3	75787186	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.289:43:13,8:16,3:18,13,8,4
chr3	75787218	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.114:42:21,2:14,1:0|1:75787218_T_A:75787218:19,19,3,1
chr3	75787221	.	CA	TG	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=33,33;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:22,2:12,2:0|1:75787218_T_A:75787218:20,17,3,1
chr3	75787224	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:20,2:11,2:0|1:75787218_T_A:75787218:21,16,3,1
chr3	75787240	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=11;MBQ=31,29;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:25,1:13,1:0|1:75787218_T_A:75787218:20,20,2,1
chr3	75787244	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:23,0:15,1:0|1:75787218_T_A:75787218:20,22,1,1
chr3	75787347	.	TCCC	T	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=C;STR;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:21,3:12,5:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:11,22,5,3
chr3	75787352	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:19,3:11,5:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:10,23,5,3
chr3	75787353	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:17,3:11,5:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:10,23,5,3
chr3	75787372	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,17:0.353:49:16,8:8,7:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:8,24,12,5
chr3	75787382	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,32:0.588:54:13,21:8,10:16,6,10,22
chr3	75787405	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,24:0.438:55:17,14:10,9:0|1:75787405_C_T:75787405:16,15,18,6
chr3	75787416	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,10:0.200:53:25,6:15,4:26,17,7,3
chr3	75787424	.	C	G	.	.	DP=60;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,28:0.468:60:15,16:11,10:0|1:75787405_C_T:75787405:21,11,18,10
chr3	75787427	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,26:0.474:55:14,13:11,12:0|1:75787405_C_T:75787405:18,11,17,9
chr3	75787458	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,11:0.203:57:19,3:22,8:25,21,5,6
chr3	75787464	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,28:0.469:60:13,11:16,16:0|1:75787464_C_T:75787464:19,13,10,18
chr3	75787476	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,10:0.166:64:20,6:33,4:27,27,4,6
chr3	75787486	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=114.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,30:0.456:66:13,12:22,17:0|1:75787464_C_T:75787464:22,14,12,18
chr3	75787516	.	C	G	.	.	DP=60;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=102.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,27:0.452:60:11,12:21,15:0|1:75787464_C_T:75787464:12,21,8,19
chr3	75787519	.	CT	AG	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,28:0.475:59:9,11:21,13:12,19,8,20
chr3	75787620	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=31,34;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:21,3:29,0:27,25,3,0
chr3	75787637	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,23:0.414:56:13,12:19,10:0|1:75787637_C_T:75787637:18,15,15,8
chr3	75787645	.	GAA	G	.	.	DP=63;ECNT=10;MBQ=35,32;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=100.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,28:0.453:62:12,15:20,12:0|1:75787637_C_T:75787637:18,16,19,9
chr3	75787679	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=109.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,28:0.537:52:9,18:9,10:0|1:75787679_T_C:75787679:15,9,17,11
chr3	75787688	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=10;MBQ=31,31;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=117.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,31:0.571:54:12,19:9,12:0|1:75787679_T_C:75787679:14,9,19,12
chr3	75787702	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=10;MBQ=35,34;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,32:0.635:50:12,21:6,10:10,8,16,16
chr3	75787726	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=135,139;MMQ=41,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=170.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,41:0.914:44:2,27:1,11:2,1,22,19
chr3	75787728	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=10;MBQ=29,31;MFRL=139,135;MMQ=60,41;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:28,2:12,1:22,19,2,1
chr3	75787732	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=10;MBQ=33,27;MFRL=134,138;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.305:43:20,8:10,4:17,13,6,7
chr3	75787739	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,33:0,17:0,0,26,24
chr3	75787770	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,11:0.204:57:24,8:19,3:22,24,4,7
chr3	75787794	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=15;MBQ=31,32;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,35:0.632:55:12,19:8,15:6,14,10,25
chr3	75787801	.	TG	CA	.	.	DP=58;ECNT=15;MBQ=31,33;MFRL=139,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,11:0.200:58:26,4:16,7:15,32,1,10
chr3	75787809	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=15;MBQ=30,34;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,9:0.178:54:27,3:18,5:11,34,1,8
chr3	75787869	.	CA	TG	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=32,31;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,27:0.718:37:6,8:4,16:7,3,6,21
chr3	75787876	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=107.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,26:0.711:36:6,8:4,17:8,2,5,21
chr3	75787880	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=27,33;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:10,3:8,10:9,10,3,11
chr3	75787897	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=31,29;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:13,2:8,4:8,13,0,7
chr3	75787927	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=15;MBQ=31,33;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:8,4:3,8:5,7,5,8
chr3	75787949	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,2:6,6:5,7,4,5
chr3	75787962	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:2,2:7,6:6,4,5,5
chr3	75787996	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.150:22:7,1:10,3:14,4,1,3
chr3	75788010	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=15;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,13:0,0,17,6
chr3	75788023	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=30,30;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.427:26:8,4:8,6:11,5,7,3
chr3	75788028	.	G	C,A	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=34,34,31;MFRL=151,148,86;MMQ=60,60,60;MPOS=24,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.12,3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,5,2:0.197,0.096:28:13,2,0:7,3,2:15,6,5,2
chr3	75788068	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=21;MBQ=32,27;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,2:13,1:15,14,0,3
chr3	75788076	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=21;MBQ=30,33;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.408:31:9,8:9,5:8,10,6,7
chr3	75788088	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=21;MBQ=33,33;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.243:32:11,4:14,3:13,12,5,2
chr3	75788115	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=21;MBQ=30,32;MFRL=151,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:4,4:7,7:5,7,8,3
chr3	75788130	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=21;MBQ=32,31;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:12,0:13,4:19,10,4,0
chr3	75788150	.	A	AG	.	.	DP=48;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.163:47:23,1:15,6:24,16,6,1
chr3	75788152	.	T	G,C	.	.	DP=47;ECNT=21;MBQ=29,33,32;MFRL=158,186,186;MMQ=60,60,60;MPOS=18,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=51.39,20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,16,7:0.348,0.160:46:13,8,1:9,8,5:11,12,18,5
chr3	75788156	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=21;MBQ=33,28;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.143:46:22,0:16,5:0|1:75788156_C_T:75788156:24,16,3,3
chr3	75788158	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=21;MBQ=33,33;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.489:45:9,14:14,8:16,7,10,12
chr3	75788165	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=21;MBQ=33,34;MFRL=158,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,6:0.125:53:27,1:18,5:0|1:75788156_C_T:75788156:27,20,3,3
chr3	75788199	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=21;MBQ=31,32;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,11:0.203:57:22,3:22,8:25,21,7,4
chr3	75788217	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:19,4:30,0:30,21,1,3
chr3	75788226	.	CA	AG,GG	.	.	DP=57;ECNT=21;MBQ=33,33,33;MFRL=136,156,141;MMQ=60,60,60;MPOS=24,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=35.82,35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,11,11:0.219,0.214:52:13,2,8:17,9,3:21,9,10,12
chr3	75788245	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.137:49:12,4:29,2:26,17,1,5
chr3	75788258	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=21;MBQ=32,29;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,11:0.218:53:14,5:28,6:23,19,4,7
chr3	75788281	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=21;MBQ=31,30;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,19:0.389:52:14,6:19,12:13,20,9,10
chr3	75788291	.	AT	GA	.	.	DP=65;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,16:0.273:63:18,6:25,10:18,29,6,10
chr3	75788292	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=21;MBQ=31,30;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.251:43:16,3:17,6:11,22,5,5
chr3	75788294	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=21;MBQ=31,28;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,7:0.119:64:23,2:31,5:19,38,5,2
chr3	75788314	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=21;MBQ=32,34;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,10:0.102:66:24,2:29,8:21,35,2,8
chr3	75788316	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=21;MBQ=34,32;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,13:0.215:63:16,6:33,7:16,34,6,7
chr3	75788366	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=118,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,15:0.291:53:12,5:26,10:12,26,3,12
chr3	75788376	.	G	C,GTT	.	.	DP=52;ECNT=6;MBQ=33,31,33;MFRL=115,121,110;MMQ=60,60,60;MPOS=12,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.55,18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,5,6:0.108,0.154:43:12,2,1:20,3,4:8,24,3,8
chr3	75788382	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=122,111;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,7:0.170:45:13,1:23,6:0|1:75788382_C_T:75788382:9,29,1,6
chr3	75788390	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=31,37;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.163:41:13,1:21,5:0|1:75788382_C_T:75788382:8,27,0,6
chr3	75788394	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.179:37:9,1:21,5:0|1:75788382_C_T:75788382:7,24,0,6
chr3	75788411	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:7,2:18,2:5,20,0,4
chr3	75788506	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75788506_GA_G:75788506:0,0,0,1
chr3	75788513	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75788506_GA_G:75788506:0,0,0,1
chr3	75790370	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:5,1:1,4:0|1:75790370_A_C:75790370:5,1,5,1
chr3	75790376	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=33,35;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:5,1:1,5:0|1:75790370_A_C:75790370:5,1,5,1
chr3	75790405	.	TG	AA,AC	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=32,32,31;MFRL=131,156,112;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.92,4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,3:0.192,0.154:21:9,2,1:5,2,1:10,4,6,1
chr3	75790406	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.465:19:8,4:2,5:7,3,5,4
chr3	75790409	.	TG	CT,CA	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=31,34,33;MFRL=131,156,112;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.91,33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,9:0.192,0.385:23:8,2,4:1,2,5:7,3,9,4
chr3	75790444	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:9,4:9,3:10,9,4,3
chr3	75790446	.	GG	TA	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=34,30;MFRL=129,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:7,5:7,5:0|1:75790446_GG_TA:75790446:10,6,4,7
chr3	75790466	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,11:0.444:25:7,6:7,5:0|1:75790446_GG_TA:75790446:7,7,3,8
chr3	75790479	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=124,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:11,3:15,3:9,17,3,3
chr3	75790513	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0|1:75790513_T_C:75790513:0,0,11,20
chr3	75790527	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=120,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,12:0.416:29:9,2:8,10:0|1:75790513_T_C:75790513:7,10,4,8
chr3	75790537	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=112,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.127:29:11,1:14,2:0|1:75790513_T_C:75790513:9,17,1,2
chr3	75790542	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=108,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,14:0.522:27:8,2:4,12:0|1:75790513_T_C:75790513:6,7,5,9
chr3	75790583	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=123,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:0|1:75790513_T_C:75790513:2,3,1,4
chr3	75790585	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=26,34;MFRL=123,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,0:2,4:0|1:75790513_T_C:75790513:2,3,1,4
chr3	75790607	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=103,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,2:0,4:0|1:75790513_T_C:75790513:2,0,2,5
chr3	75790704	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,16:0.567:28:5,9:7,7:0|1:75790704_C_T:75790704:12,0,15,1
chr3	75790717	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,23:0.511:45:10,14:11,9:0|1:75790704_C_T:75790704:20,2,19,4
chr3	75790724	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=152,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,19:0.400:48:17,10:12,9:27,2,15,4
chr3	75790726	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,26:0.519:50:12,15:10,11:0|1:75790704_C_T:75790704:22,2,22,4
chr3	75790730	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,26:0.500:52:14,15:9,11:0|1:75790704_C_T:75790704:24,2,22,4
chr3	75790747	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=82.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,22:0.426:52:16,13:13,9:0|1:75790704_C_T:75790704:24,6,19,3
chr3	75790822	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=115,143;MMQ=40,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,33:0.752:43:3,15:5,10:7,3,17,16
chr3	77147112	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	77526805	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=167,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:0,13,0,2
chr3	77607070	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:2,1,4,1
chr3	77629232	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:11,11,1,1
chr3	77645946	.	CTT	C,CT	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=23,35,29;MFRL=115,151,166;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=13.20,14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,8:0.289,0.415:20:4,4,5:2,2,3:1,5,0,14
chr3	77645954	.	T	TTTTTTC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=156,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.144:18:10,2:6,0:0|1:77645954_T_TTTTTTC:77645954:0,16,1,1
chr3	77645960	.	G	GGC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=152,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.138:19:11,2:6,0:0|1:77645954_T_TTTTTTC:77645954:0,17,1,1
chr3	77645962	.	CCTTCCT	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,2:5,0:0|1:77645962_CCTTCCT_C:77645962:1,16,0,2
chr3	77645969	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,2:3,0:0|1:77645962_CCTTCCT_C:77645962:0,11,0,2
chr3	77651695	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,1:7,1:0,7,0,2
chr3	77666936	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	77684222	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:0,6,1,6
chr3	78656219	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,161;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:8,2:2,15,0,2
chr3	78666765	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr3	78676405	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr3	78676467	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,10:0,0,10,8
chr3	78706491	.	C	CGTTCCTTTCTAAAGACGGGG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=36,29;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.387:4:2,1:1,0:0|1:78706491_C_CGTTCCTTTCTAAAGACGGGG:78706491:0,3,0,1
chr3	78706494	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:78706491_C_CGTTCCTTTCTAAAGACGGGG:78706491:0,2,0,1
chr3	78706505	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=206,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:78706505_GA_G:78706505:0,2,0,1
chr3	78706509	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=206,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:78706505_GA_G:78706505:0,2,0,1
chr3	78706511	.	GT	AC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=206,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:78706505_GA_G:78706505:0,2,0,1
chr3	78706519	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	78708810	.	A	AATAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=AT;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:4,0,2,0
chr3	78709044	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	78717508	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.423:22:6,2:5,7:6,7,4,5
chr3	78737962	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,1:3,6:3,5,1,6
chr3	78796078	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:3,5:3,1:2,4,2,4
chr3	81548209	.	T	TAAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.144:18:10,1:6,1:16,0,1,1
chr3	81699036	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:31,2:29,1:23,37,2,1
chr3	81810516	.	C	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,22:0.346:64:23,10:19,11:27,15,12,10
chr3	81810702	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr3	86010875	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:86010875_G_A:86010875:0,3,0,1
chr3	86010891	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86010875_G_A:86010875:0,1,0,1
chr3	87303058	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	87313353	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=188,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr3	88042501	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:2,5:1,3:2,1,5,3
chr3	88042990	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.644:9:2,1:1,5:0,3,0,6
chr3	88188420	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=144.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,17:0,0,28,14
chr3	88199179	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,17,9
chr3	88199185	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=62.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,11:0,12:0,0,13,10
chr3	89157047	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	89157082	.	C	CCAGCTCTGACCATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	89176419	.	A	AGGATTGAATCATAGTTTTGTGCAATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:4,2:6,0:2,9,0,2
chr3	89456555	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.395:18:6,2:4,4:2,9,3,4
chr3	89480265	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr3	89498619	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	89521602	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:3,2:7,3:7,3,2,3
chr3	89528461	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr3	89528477	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr3	93605126	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=103.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,20:0,8:0,0,27,2
chr3	93692435	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,122;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:22,3:14,0:33,3,3,0
chr3	93754080	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	93754277	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.171:25:6,0:8,0:9,12,0,4
chr3	93754281	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=22,23;MFRL=143,94;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:5,1:6,0:9,15,0,2
chr3	93754286	.	GT	G,GTTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33,23;MFRL=130,200,94;MMQ=60,60,49;MPOS=26,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,18;RU=T;STR;TLOD=9.16,4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,2:0.342,0.120:16:3,4,1:5,1,0:3,6,1,6
chr3	93768420	.	GA	G,CA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=17,17,19;MFRL=156,145,154;MMQ=60,60,60;MPOS=23,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.37,4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,5,4:0.167,0.130:28:0,0,0:0,1,1:0,19,0,9
chr3	93813171	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,5,22
chr3	97367230	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:4,7:0,2:0,4,0,9
chr3	97467361	.	ATCTC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,31255322;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TC;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,0:3,2:3,1,2,0
chr3	97605460	.	AT	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,7:0.151:48:18,4:16,3:33,8,7,0
chr3	97605677	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,7:6,4:0,10,0,11
chr3	97611916	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:6,9:12,8:0,18,0,17
chr3	97619250	.	C	CAACTA	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=154.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,40:0.512:78:18,13:19,21:32,6,31,9
chr3	97660198	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,4:3,4:0,4,1,7
chr3	97666183	.	TCTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTC;STR;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:6,5:7,2:10,3,7,0
chr3	97669543	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	97686127	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,2:9,0:13,6,0,2
chr3	97727727	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,4:1,0:2,0,3,1
chr3	97727753	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,3:2,3:3,1,4,2
chr3	97744611	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr3	97805929	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	97851475	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	97852229	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.407:39:16,6:7,8:6,17,9,7
chr3	97887495	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	97983487	.	TTGTAACCAC	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTAACCAC;STR;TLOD=106.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.968:24:0,10:0,14:0,0,9,15
chr3	98073591	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	98110406	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=56.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,11:0,9:0,0,13,9
chr3	98250862	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,5:5,5:9,5,5,5
chr3	98299707	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr3	98489670	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:12,2,2,0
chr3	98489686	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,8:4,1:7,2,7,2
chr3	98491619	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,4:3,6:8,2,9,1
chr3	98503941	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,2:7,2:0,9,0,4
chr3	98512610	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=124,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:2,4:4,1:1,6,2,3
chr3	98518160	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=271,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:1,3:0,0:1,0,4,0
chr3	98518217	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.340:7:3,2:0,0:5,0,2,0
chr3	98518339	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:8,9:4,8:6,6,8,9
chr3	98536571	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:5,0,5,1
chr3	98541012	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	98541422	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,5:7,5:11,0,10,0
chr3	98541633	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:5,7:8,4:1,12,0,11
chr3	98544123	.	CAA	C,CA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=150,137,122;MMQ=60,60,60;MPOS=15,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=25.52,29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,17,17:0.372,0.436:42:3,7,8:3,7,9:7,1,32,2
chr3	99513418	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.160:35:13,5:17,0:15,15,4,1
chr3	99515002	.	A	ATTGTAGAGACCAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1,2,0,1
chr3	99567161	.	A	G	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,3:0.036:106:54,2:47,1:63,40,3,0
chr3	99648965	.	CTCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=255,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99648965_CTCT_C:99648965:0,1,0,1
chr3	99648973	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=255,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99648965_CTCT_C:99648965:0,1,0,1
chr3	99886662	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:8,5:8,7:5,11,5,7
chr3	100015146	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.457:44:16,9:8,11:3,21,2,18
chr3	100016726	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,1:5,2:13,3,3,0
chr3	100029381	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=131,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:17,0:20,2:17,20,0,2
chr3	100034849	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr3	100053684	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	100086861	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,17,5
chr3	100092526	.	A	AG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=75.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.952:17:0,8:0,9:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,17
chr3	100092528	.	T	TGCA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,17
chr3	100174722	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,41:0.513:80:22,19:16,22:16,23,26,15
chr3	100238573	.	A	ATTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100238573_A_ATTT:100238573:0,1,0,1
chr3	100238574	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100238573_A_ATTT:100238573:0,1,0,1
chr3	100238576	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:100238573_A_ATTT:100238573:0,2,0,1
chr3	100238579	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:100238573_A_ATTT:100238573:0,2,0,1
chr3	100354683	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr3	100354698	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr3	100368692	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr3	100387709	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	100432752	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=145,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,2:1,3:0,1,0,6
chr3	100432791	.	C	CACACATTTCTTCTAGACCTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	100438797	.	CT	C,CTT	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=143,157,176;MMQ=60,60,60;MPOS=16,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=15.59,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:65,12,5:0.146,0.061:82:32,6,3:31,6,2:61,4,16,1
chr3	100463651	.	TTG	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.122:53:19,4:18,2:35,12,5,1
chr3	100467018	.	T	C	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=338.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,102:0.991:102:0,47:0,51:0,0,56,46
chr3	100471567	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=19,36;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr3	100511428	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,1:0|1:100511428_G_A:100511428:5,0,2,0
chr3	100511446	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:1,1:5,2:0|1:100511428_G_A:100511428:6,0,3,0
chr3	100515197	.	AT	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.550:44:11,13:9,11:16,4,20,4
chr3	100523771	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=185,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr3	100567592	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:3,6:6,9:9,0,14,1
chr3	100567799	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr3	100570787	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	100570801	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:100570801_A_AT:100570801:0,4,0,1
chr3	100570802	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:100570801_A_AT:100570801:0,4,0,1
chr3	100570809	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	100581261	.	ATT	A,AT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=16,31,31;MFRL=124,165,151;MMQ=60,60,60;MPOS=25,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=8.08,22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,11:0.240,0.509:21:0,3,1:2,2,9:1,4,3,13
chr3	100593659	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,1:5,10:8,0,11,0
chr3	100594326	.	CGGCATA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,3:5,4:7,5,7,0
chr3	100605206	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	100621426	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,11,4
chr3	100949842	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,13:0,3:0,0,14,2
chr3	101039107	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=90.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,32:0.540:59:13,13:14,19:22,5,22,10
chr3	101046671	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,4:4,7:0,7,2,9
chr3	101051794	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.585:29:3,8:8,9:2,10,1,16
chr3	101060716	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=219,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	101066992	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	101070555	.	A	AT	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,4:0.069:67:28,2:33,2:13,50,0,4
chr3	101085208	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=109,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,3:4,4:4,0,7,0
chr3	101085683	.	TAAAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,3;RU=A;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr3	101177901	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,2:3,3:0,4,1,6
chr3	101212889	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	101219818	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,7:4,4:7,0,11,0
chr3	101231829	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	101232093	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	101304414	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,7:5,4:0,13,0,11
chr3	101370505	.	TAAGCACTCAAATGGCTTAACTCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATGTGTAGTGAGGTGC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	101373480	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,3:2,5:2,1,7,1
chr3	101383853	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,115;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:26,3:19,0:27,21,3,0
chr3	101399910	.	GA	G,GAA	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=33,34,35;MFRL=145,154,214;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=64.32,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,32,3:0.544,0.071:55:11,17,0:9,13,3:19,1,32,3
chr3	101404813	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:6,11:8,3:0,14,0,14
chr3	101443461	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr3	101504624	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	101573361	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,10;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.575:12:2,0:0,1:5,0,7,0
chr3	101574503	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr3	101575882	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr3	101576029	.	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=159.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,14:0,13:0,0,16,20
chr3	101576373	.	T	TTAACGTTGCTCAGAAGTTGCTTCTATGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	101576404	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	105238890	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,14:0.684:20:0,7:6,5:0|1:105238890_CT_C:105238890:6,0,14,0
chr3	105238901	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.536:28:3,8:7,5:0|1:105238890_CT_C:105238890:11,2,14,1
chr3	105252377	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr3	105412286	.	C	CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=65.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr3	105421344	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,1,0
chr3	105423088	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr3	105438806	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	105452751	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	105453034	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr3	105455955	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,16,1
chr3	105470204	.	A	ATGTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TG;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:2,0:8,2:10,0,2,0
chr3	105470455	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,3:0.034:114:39,3:68,0:29,82,1,2
chr3	105495432	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,3:0,14:0,0,1,16
chr3	105588069	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	107435472	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.163:41:19,2:16,4:15,20,2,4
chr3	107447857	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.575:12:3,6:2,1:0,5,1,6
chr3	107451907	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr3	107463456	.	TG	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,30:0.544:55:17,15:8,15:22,3,23,7
chr3	107491758	.	TAGA	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGA;STR;TLOD=104.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,28:0.518:54:12,14:12,14:13,13,7,21
chr3	107519843	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	107770938	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=78.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,0,22
chr3	107776511	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,1,16
chr3	107779796	.	T	TGCTAGACATAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	107882643	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=133.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,19:0,19:0,0,0,38
chr3	107884211	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,12:0,1:0,0,13,0
chr3	107885825	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=156,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,0:13,2:6,17,0,2
chr3	107885875	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:0,5,0,7
chr3	107910327	.	C	CT,CTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34,26;MFRL=0,140,95;MMQ=60,60,60;MPOS=22,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.61,5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.449,0.449:4:0,2,1:0,0,0:0,0,3,1
chr3	107937286	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	107937360	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:9,2:1,8:10,0,10,0
chr3	107937571	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,5:4,1:1,9,0,6
chr3	107938240	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,3:7,7:9,2,9,1
chr3	108070556	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	108072243	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	108072704	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	108081217	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=106,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.675:22:2,7:4,7:4,3,10,5
chr3	108081247	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=115,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.297:31:11,5:10,3:7,15,1,8
chr3	108096227	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,0,16
chr3	108103433	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	108135606	.	TAA	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.962:23:0,9:0,13:0|1:108135606_TAA_T:108135606:0,0,21,2
chr3	108135609	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,22:0.921:23:0,9:1,13:0|1:108135606_TAA_T:108135606:1,0,20,2
chr3	108140148	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	108147295	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,12,2
chr3	108156633	.	A	AAAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAG;STR;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr3	108158574	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr3	108172817	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr3	108174537	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=86.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,10:0,0,18,6
chr3	108179219	.	CAA	C,CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,37,34;MFRL=166,122,139;MMQ=60,60,60;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.72,33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,15:0.230,0.718:21:0,1,7:1,4,7:0,1,0,20
chr3	108189750	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	108211869	.	A	AAAGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAGG;STR;TLOD=46.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,1:0,6:0,0,11,1
chr3	108211895	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=149,138;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:7,3:21,0:26,3,3,0
chr3	108214537	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	108216807	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,7,0
chr3	108216956	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,29;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:9,15,1,1
chr3	108218413	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:11,0:11,8:2,20,0,8
chr3	108224685	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32,34;MFRL=164,65,151;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=A;STR;TLOD=3.05,7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,5:0.165,0.338:14:1,1,1:4,1,1:0,7,0,7
chr3	108272681	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=192,166;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108272681_C_CCT:108272681:0,2,0,1
chr3	108272682	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=192,166;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108272681_C_CCT:108272681:0,2,0,1
chr3	108272686	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=192,166;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108272681_C_CCT:108272681:0,2,0,1
chr3	108276166	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.068:57:33,3:21,0:35,19,1,2
chr3	108285518	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:0,11,0,7
chr3	108295067	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,6:5,7:12,1,12,1
chr3	108308306	.	C	CATGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	108324362	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=222,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:108324362_G_C:108324362:0,2,0,1
chr3	108324365	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=222,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:108324362_G_C:108324362:0,2,0,1
chr3	108327050	.	T	TAAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=89.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,12:0,0,1,20
chr3	108344636	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:5,2:3,2:7,1,4,0
chr3	108347811	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=77,180;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	108355423	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=69.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,23,0
chr3	108355575	.	CTT	C,CT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=20,35,34;MFRL=99,157,147;MMQ=60,60,60;MPOS=27,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=7.70,47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,21:0.166,0.710:30:1,4,6:2,1,14:1,3,2,24
chr3	108356501	.	T	TTTAAGGTAGTA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,8:0,1:0,0,0,11
chr3	108366978	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:6,9:5,3:1,11,0,12
chr3	108394771	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,1:4,5:0,6,0,7
chr3	108403019	.	TG	T,TGG,TGGG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28,30,30;MFRL=144,195,157,194;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,20,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,8,10,11;RU=G;STR;TLOD=5.26,11.21,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:13,3,6,2:0.137,0.251,0.105:24:4,2,3,1:8,0,2,1:12,1,9,2
chr3	108474524	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:5,0,3,1
chr3	108475974	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,2:6,6:8,5,7,1
chr3	108475993	.	G	GGGGGATTA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGATTA;STR;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.536:24:4,5:7,6:8,3,5,8
chr3	108565815	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr3	108635099	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=127,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,3:6,1:1,10,0,4
chr3	108639270	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=85.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,33:0.512:64:15,15:16,16:23,8,20,13
chr3	108705702	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,22:0.483:46:8,8:14,13:0|1:108705702_T_C:108705702:23,1,20,2
chr3	108705715	.	A	AT	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=161.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,49:0.911:53:1,21:3,25:0|1:108705702_T_C:108705702:4,0,46,3
chr3	108754320	.	T	TAA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:2,3:0,0:0,3,0,3
chr3	108754336	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:5,1:0,0:0,5,0,1
chr3	108754340	.	G	GCTGTGAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,1:0,0:0,5,0,1
chr3	108754346	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr3	108776343	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,7,17
chr3	108782158	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	108782160	.	T	C,TGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29,31;MFRL=0,156,155;MMQ=60,60,60;MPOS=27,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.04,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr3	108788461	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,3:3,9:2,4,9,3
chr3	108833147	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr3	109027157	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr3	109027820	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr3	109056417	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.360:22:9,3:5,3:4,10,2,6
chr3	109129115	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=157,182;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.340:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr3	109129147	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=207,143;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109129147_T_C:109129147:0,1,0,1
chr3	109129149	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=207,143;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109129147_T_C:109129147:0,1,0,1
chr3	109129154	.	TCCAA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=207,143;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109129147_T_C:109129147:0,1,0,1
chr3	109129159	.	T	TCGGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=207,143;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109129147_T_C:109129147:0,1,0,1
chr3	110791113	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	110837406	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=82,301;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:110837406_G_GAA:110837406:2,0,1,0
chr3	110837407	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=82,301;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:110837406_G_GAA:110837406:2,0,1,0
chr3	111260975	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	111261242	.	G	GCTGCTGAAATTGATCACCA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGCTGAAATTGATCACCA;STR;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.948:15:0,6:0,8:0,0,0,15
chr3	111312552	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:20,2:30,1:23,30,0,3
chr3	111632132	.	ACCCACTGACCT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,3:4,5:7,2,4,4
chr3	111637904	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,16:0,0,26,4
chr3	111638132	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,0,15
chr3	111639353	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	111658290	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,1:1,2:3,0,2,2
chr3	111658486	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr3	111658514	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:2,2:1,5,1,5
chr3	111659377	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=142.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:1,24:0,17:1,0,31,12
chr3	111664064	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:8,9:7,6:10,5,13,2
chr3	111667883	.	TGCCACAGCTGTGCTGGCGAGCCA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:9,2:6,14,1,1
chr3	111685371	.	T	TGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=160,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=G;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr3	111685397	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:4,6:4,3:6,3,9,0
chr3	111685572	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.674:41:7,13:6,14:6,7,4,24
chr3	111685607	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,5:4,6:1,8,3,8
chr3	111686738	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr3	111705275	.	G	GTTTGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTGT;STR;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.491:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	111710201	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,5:1,3:5,0,8,0
chr3	111719605	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,6:3,3:7,3,7,2
chr3	111730546	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=71,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr3	111730591	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,5:6,3:7,1,6,2
chr3	111730766	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr3	111760771	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=175,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,2:2,1:7,0,3,0
chr3	111763278	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	111766559	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr3	111785208	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	111793316	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,4:1,5:0,6,0,9
chr3	111794365	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.675:22:2,4:4,11:1,6,1,14
chr3	111795976	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,29:0.556:52:13,20:9,8:11,12,13,16
chr3	111799809	.	T	A	.	.	DP=95;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,3:0.043:90:37,3:50,0:42,45,3,0
chr3	111799845	.	A	T	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=275.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,84:0.988:85:1,34:0,48:0,1,34,50
chr3	111805438	.	G	GT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=146.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,18:0,22:0,0,1,39
chr3	111831753	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:8,0:12,10,2,0
chr3	111851817	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr3	111851890	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.377:30:10,6:8,5:13,6,8,3
chr3	111860116	.	G	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,49:0.618:79:9,22:20,26:9,21,10,39
chr3	111860222	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=217,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:0,8,0,4
chr3	111873881	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,0:2,2:0|1:111873881_A_T:111873881:8,4,1,1
chr3	111873887	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:1,2:0|1:111873881_A_T:111873881:6,3,1,1
chr3	111873889	.	A	ATGTGGTCTTT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=161,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0|1:111873881_A_T:111873881:6,2,1,1
chr3	111873890	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=161,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,1:0|1:111873881_A_T:111873881:6,2,1,1
chr3	111898613	.	T	TGACCACTCTAGGTACCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	111901099	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,14:0.277:52:25,10:13,4:15,23,3,11
chr3	111921010	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,7:2,3:7,0,10,0
chr3	111923047	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr3	111936200	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	111981696	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=215,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:0|1:111981696_CA_C:111981696:4,0,7,0
chr3	111981704	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=215,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:1,3:2,5:0|1:111981696_CA_C:111981696:4,0,8,0
chr3	111983197	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=98.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,35:0.461:76:15,18:26,17:4,37,6,29
chr3	111993691	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:2,8:4,6:6,0,14,0
chr3	111993716	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=115.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,17:0,0,32,3
chr3	111996694	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=136,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.061:62:26,2:33,1:17,42,1,2
chr3	111996726	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:9,8:7,9:1,16,5,12
chr3	111996730	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:7,9:8,6:5,11,1,14
chr3	111997791	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=163,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr3	112052173	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	112068503	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:5,5:3,2:9,0,6,1
chr3	112184927	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,16:0,9:0,0,22,3
chr3	112253058	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.814:12:1,6:1,3:2,0,9,1
chr3	112253193	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.731:8:2,2:0,2:0,2,1,5
chr3	112253233	.	AAAG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,1:2,2:0,7,0,3
chr3	112255525	.	GT	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,266;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr3	112267523	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,1,16
chr3	112280218	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	112289320	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr3	112289372	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,13:0,8:0,0,17,4
chr3	112301458	.	C	CCTTAGTAAT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,4:0,0,17,3
chr3	112324534	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:17,2:12,0:14,17,2,0
chr3	112338027	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr3	112538571	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,20,0
chr3	112647613	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr3	112666859	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=69,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:3,2,0,2
chr3	112709828	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,6,1
chr3	112719791	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=18,28;MFRL=107,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.446:9:1,1:0,3:1,4,2,2
chr3	112732286	.	T	TA	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=152,54;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.075:63:14,1:25,1:2,57,0,4
chr3	112732309	.	GTT	G,GT	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=15,30,15;MFRL=161,150,172;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=10.36,20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,18:0.237,0.640:28:0,0,2:1,4,5:0,3,0,25
chr3	112738307	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=259,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:112738307_C_G:112738307:3,0,1,0
chr3	112738309	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=259,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:1,0:0|1:112738307_C_G:112738307:3,0,1,0
chr3	112738318	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0|1:112738307_C_G:112738307:0,0,6,1
chr3	112991196	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,0:0,0,6,0
chr3	112996932	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr3	112997141	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,4:8,2:0,12,1,5
chr3	112998090	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:4,5,6,2
chr3	112999611	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	113002184	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,0:10,0,2,0
chr3	113003273	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:2,6,4,4
chr3	113003595	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.506:18:4,4:4,5:8,1,8,1
chr3	113004421	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.682:13:1,4:2,5:3,1,4,5
chr3	113005753	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:0|1:113005753_T_A:113005753:1,5,1,4
chr3	113005754	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,5:0.452:11:2,2:4,2:1|0:113005753_T_A:113005753:1,5,1,4
chr3	113084964	.	AT	TC	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:21,0:26,3:19,30,0,3
chr3	113098296	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:26,4:21,0:24,25,4,0
chr3	113119301	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	113125966	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr3	113152596	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	113169372	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,0:1,0:1,7,0,2
chr3	113207968	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.440:5:1,1:2,1:0|1:113207968_CT_C:113207968:0,3,0,2
chr3	113207988	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=171,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1|0:113207968_CT_C:113207968:0,4,0,1
chr3	113207991	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,19;MFRL=171,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:1,0:1|0:113207968_CT_C:113207968:0,4,0,1
chr3	113222099	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.262:20:4,3:9,1:3,12,0,5
chr3	113323787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=182,124;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,1:0,2,1,3
chr3	113323793	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=130,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr3	113325945	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,1:6,1:7,7,0,2
chr3	113327017	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:18,1:23,2:16,25,0,3
chr3	113376110	.	TTGC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TGC;STR;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.874:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr3	113377505	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:6,6:4,2:5,7,4,6
chr3	113442198	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr3	113464859	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=123,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:3,6,3,3
chr3	113497507	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.377:17:4,2:4,4:11,0,6,0
chr3	113508499	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.420:12:4,3:2,2:7,0,5,0
chr3	113522544	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.404:52:22,12:9,8:13,18,6,15
chr3	113557787	.	AGCC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	113595156	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=170.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,19:0,27:0,0,0,46
chr3	113619872	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,10:0,0,15,4
chr3	113628031	.	T	TCACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr3	113655096	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	113720624	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	113785085	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.114:50:17,2:27,2:31,14,4,1
chr3	113858350	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,15,7
chr3	113955725	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:15,2:16,0:17,15,1,1
chr3	114070427	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:4,8,2,0
chr3	118621294	.	T	TGGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118621294_T_TGGG:118621294:0,0,1,0
chr3	118621299	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118621294_T_TGGG:118621294:0,0,1,0
chr3	118621304	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118621294_T_TGGG:118621294:0,0,1,0
chr3	118621308	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:118621294_T_TGGG:118621294:0,0,1,0
chr3	118624369	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=215,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,3,2
chr3	118865011	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr3	118866515	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	118870025	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=101,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,5:1,4:3,0,7,2
chr3	118870222	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	118906560	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,12;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr3	118906564	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,30;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:118906564_T_C:118906564:1,0,1,0
chr3	118906567	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,26;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:118906564_T_C:118906564:1,0,1,0
chr3	118906616	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=105,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.598:15:1,3:4,6:4,2,4,5
chr3	118906644	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:4,2:17,0:10,11,1,1
chr3	118909962	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,0,17
chr3	118909987	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr3	118922654	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:2,0,6,0
chr3	118931389	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,16,5
chr3	118935278	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=166,74;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.401:6:2,0:2,2:0|1:118935278_C_T:118935278:0,4,1,1
chr3	118935286	.	CGCACAT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,74;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.466:5:0,0:2,2:0|1:118935278_C_T:118935278:0,3,1,1
chr3	118945614	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,4,1
chr3	119013928	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr3	119084331	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr3	119084334	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:119084334_G_A:119084334:0,3,0,1
chr3	119084338	.	T	TGAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:119084334_G_A:119084334:0,2,0,1
chr3	119120577	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:8,0,5,0
chr3	119128628	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=136.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,13:0,17:0|1:119128628_A_G:119128628:0,0,7,25
chr3	119128634	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=133.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,13:0,16:0|1:119128628_A_G:119128628:0,0,7,24
chr3	119128712	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.880:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	119133635	.	T	TGCTGGGCAATG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr3	119155605	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:11,3:3,5:11,3,4,5
chr3	119157000	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=249,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	119171280	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=128.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,24:0,16:0,0,29,13
chr3	119196334	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr3	119196366	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:119196366_C_A:119196366:0,2,0,1
chr3	119196368	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:119196366_C_A:119196366:0,2,0,1
chr3	119196370	.	G	GAGTAGGTTGCGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:119196366_C_A:119196366:0,2,0,1
chr3	119198873	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=121.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,15:0,19:0,0,26,10
chr3	119199099	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr3	119204063	.	CA	C,CAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,206,199;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=16.39,19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,8:0.446,0.502:15:0,1,4:0,6,4:0,0,15,0
chr3	119204311	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.313:26:10,5:8,2:0,18,0,8
chr3	119210328	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,2:14,0:24,2,2,0
chr3	119211230	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,1:13,1:15,9,2,0
chr3	119211384	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr3	119236017	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,4,0
chr3	119263770	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:9,2:3,4:1,11,0,6
chr3	119325907	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr3	119327604	.	GC	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:7,8:8,6:10,6,9,5
chr3	119328449	.	CAGGCTTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,3:3,3:1,5,0,6
chr3	119334986	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr3	119348345	.	A	ATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.845:3:0,1:0,0:0,0,0,3
chr3	119361250	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:4,2:3,4:7,0,5,2
chr3	119373301	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=136,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:0,5:1,4:2,0,9,0
chr3	119373315	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,7:0,4:2,3,10,2
chr3	119394168	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:2,1:4,3:0,6,0,5
chr3	119459342	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:13,0,0,2
chr3	119501580	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr3	119501780	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:119501780_G_A:119501780:0,0,0,7
chr3	119501798	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:119501780_G_A:119501780:0,0,0,3
chr3	119529113	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr3	119531853	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119531853_G_C:119531853:0,0,0,1
chr3	119531856	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119531853_G_C:119531853:0,0,0,1
chr3	119531858	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119531853_G_C:119531853:0,0,0,1
chr3	119531860	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119531853_G_C:119531853:0,0,0,1
chr3	119533733	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	119533773	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	119533910	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,11:0,0,4,10
chr3	119534153	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:3,1,2,0
chr3	119721171	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	119886548	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	119892121	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,4:1,3:6,0,6,1
chr3	119892413	.	A	AAGGTCAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=75,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:0,1:2,0:0|1:119892413_A_AAGGTCAAC:119892413:1,1,0,1
chr3	119892415	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=75,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:119892413_A_AAGGTCAAC:119892413:1,1,0,1
chr3	119900260	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	119904125	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr3	119904315	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	119905641	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,4:0,1:0,0,0,7
chr3	120067797	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr3	120130874	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,5:3,5:0,7,4,6
chr3	120130883	.	GACACACACACACACATACATGC	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:6,3:1,1:1,7,0,4
chr3	120130899	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr3	120134720	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr3	120134883	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr3	120169437	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	120169641	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	120369575	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,5,0
chr3	120371414	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,13,8
chr3	120389454	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:1,0:2,1:0|1:120389454_T_C:120389454:0,3,0,1
chr3	120389462	.	G	GCCCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:120389454_T_C:120389454:0,3,0,1
chr3	120389463	.	G	GCCTGTGTTCTCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:120389454_T_C:120389454:0,3,0,1
chr3	120389466	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:120389454_T_C:120389454:0,2,0,1
chr3	120413158	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=145.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,21:0,21:0,0,1,41
chr3	120428621	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:5,7:10,5:12,3,10,2
chr3	120833993	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,14:0.577:24:6,8:4,6:0|1:120833993_C_T:120833993:0,10,0,14
chr3	120833994	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,9:0.387:23:8,4:6,3:1|0:120833993_C_T:120833993:0,14,0,9
chr3	120924764	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.355:41:15,5:10,9:22,4,12,3
chr3	120952606	.	T	TGTTTCCCTTTTTACTGCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.243:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr3	120959427	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=173,147;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:0,10,0,2
chr3	121100116	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	121132268	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	121137304	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,2:0.042:69:27,1:36,0:38,29,1,1
chr3	121137976	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,9:0,0,10,12
chr3	121138015	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr3	121155198	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	121186543	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	121195302	.	TAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=AC;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	121202131	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr3	121202433	.	TA	T,TAA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,29,31;MFRL=164,118,103;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=8.85,10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,9,9:0.336,0.399:23:2,6,4:2,3,4:1,4,4,14
chr3	121206883	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,230;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:10,13,0,2
chr3	121207637	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.508:47:12,14:11,9:12,11,14,10
chr3	121212277	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr3	121228833	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr3	121239027	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	121241058	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	121263720	.	C	A	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=272.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,83:0.988:83:0,43:0,39:0,0,36,47
chr3	121339354	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,8:0,0,12,3
chr3	121339520	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr3	121351338	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,1:4,4:3,3,3,3
chr3	121351498	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121351498_C_A:121351498:0,0,1,0
chr3	121351502	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121351498_C_A:121351498:0,0,1,0
chr3	121353254	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr3	121353291	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr3	121377298	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=203,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,1:4,1:0,6,0,2
chr3	121448675	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,2:2,3:10,0,4,1
chr3	121507371	.	CTTTTTA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=168,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	121508830	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr3	121514458	.	TAA	T,TA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31,31;MFRL=0,197,150;MMQ=60,60,60;MPOS=16,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.06,31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,15:0.251,0.712:21:0,3,8:0,3,6:0,0,2,19
chr3	121526099	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=48.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr3	121526381	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:0,7,0,4
chr3	121527903	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:2,0:4,2:0,10,0,3
chr3	121545030	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:1,11,0,2
chr3	121547527	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.470:34:6,9:12,6:2,16,2,14
chr3	121563271	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,2:3,4:10,0,6,0
chr3	121563285	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:7,6:5,5:12,0,9,2
chr3	121576063	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:9,2:0,24,0,2
chr3	121630328	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr3	121634171	.	A	AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:5,6:4,4:2,7,3,7
chr3	121634410	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.491:22:6,4:5,5:9,2,8,3
chr3	121641821	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,2,2
chr3	121643143	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=115,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.460:13:5,3:2,3:7,0,6,0
chr3	121643170	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:3,4:7,5:10,1,9,0
chr3	121643303	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:2,4:6,7:1,8,2,9
chr3	121643337	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr3	121643699	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=1623,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:1,3:0,1,6,0
chr3	121643893	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:3,5:7,12:2,9,3,14
chr3	121646495	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=167,165;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:121646495_C_T:121646495:1,0,3,0
chr3	121646500	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=165,138;MMQ=60,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:121646495_C_T:121646495:3,0,1,0
chr3	121646503	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=139,138;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:121646495_C_T:121646495:4,0,1,0
chr3	121646506	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=139,138;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:121646495_C_T:121646495:4,0,1,0
chr3	121647467	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=116,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr3	121647782	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,4:5,2:5,0,5,1
chr3	121659197	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=175,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,3:1,3:2,0,5,1
chr3	121720514	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	121810427	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=65.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,15:0,8:0,0,18,6
chr3	121836966	.	TGA	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=139.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.976:35:0,9:0,25:0,0,8,27
chr3	121976253	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr3	121981345	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	122000871	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	122086960	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,4:8,5:10,2,9,0
chr3	122087178	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:122087178_A_AGG:122087178:1,1,0,1
chr3	122087179	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:122087178_A_AGG:122087178:1,1,0,1
chr3	122128519	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,2:1,3:5,0,6,0
chr3	122134889	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,7:7,2:1,10,0,9
chr3	122145810	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,9:0,0,17,0
chr3	122146299	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	122168341	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,8:6,2:10,1,10,0
chr3	122247606	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.661:19:3,4:3,7:1,5,3,10
chr3	122259782	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,159;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:6,5:0,1:0,6,0,7
chr3	122259797	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,188;MMQ=59,35;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:8,2:0,0:0,8,0,2
chr3	122269380	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,0:3,4:4,0,4,1
chr3	122437834	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,13:0,0,3,27
chr3	122471407	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.695:25:6,11:1,4:7,1,14,3
chr3	122474284	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.287:15:3,1:4,2:0|1:122474284_TA_T:122474284:4,7,0,4
chr3	122474305	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0|1:122474284_TA_T:122474284:0,0,4,15
chr3	122478032	.	C	CCACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=0,51;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=CA;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.506:4:1,0:1,1:2,0,1,1
chr3	122512624	.	C	CTTTGAATTCACGTTCATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=225,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	122512631	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	122629589	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=170,192;MMQ=50,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,2:1,8:1,0,10,0
chr3	122631270	.	C	CCATTAGGCCAAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr3	122632063	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,389;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	122642401	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	122642415	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=198,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr3	122642590	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,2:0,16:0,0,5,13
chr3	122680171	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0,8,1,2
chr3	122807995	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:4,1,6,0
chr3	122811187	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:6,1:7,3:13,0,4,0
chr3	122821385	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr3	122821478	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	122821671	.	AT	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,11:0,0,6,19
chr3	122829929	.	CGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122829929_CGGG_C:122829929:0,0,0,1
chr3	122829940	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122829929_CGGG_C:122829929:0,0,0,1
chr3	122829942	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122829929_CGGG_C:122829929:0,0,0,1
chr3	122843212	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,3:3,4:3,3,3,5
chr3	122864396	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=111,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,2:6,0:6,6,1,1
chr3	122865136	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=73,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:1,2,0,2
chr3	122873923	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr3	122880118	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:4,0,3,1
chr3	123010276	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,9:4,2:3,9,1,10
chr3	123014877	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	123015094	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	123018963	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,5:0,2:0,0,8,0
chr3	123021838	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	123021870	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=211,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:5,2,2,2
chr3	123021975	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,0:11,2:16,9,1,1
chr3	123037047	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	123039685	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	123046554	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,2:17,0:18,10,2,0
chr3	123047478	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,8:0,0:0,0,8,1
chr3	123047594	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:7,11,1,1
chr3	123047666	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr3	123049707	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,12:0,5:0,0,14,6
chr3	123049938	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr3	123066555	.	A	AAAGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGG;STR;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	123301242	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:8,8:8,5:0,16,0,13
chr3	123303821	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,6:6,5:0,11,0,11
chr3	123337414	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:4,0,5,1
chr3	123338955	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=227,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123338955_AT_A:123338955:1,0,1,0
chr3	123338967	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:2,0:0|1:123338955_AT_A:123338955:3,0,1,0
chr3	123440967	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=86.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,10:0,15:0,0,19,10
chr3	123441179	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr3	123451773	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,8:0,15:0,0,14,9
chr3	123456432	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	123457711	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,12,1
chr3	123458705	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:4,1,1,1
chr3	123458913	.	A	AAATAAAACTCAACATATAAGCATGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:123458913_A_AAATAAAACTCAACATATAAGCATGT:123458913:0,4,0,1
chr3	123458916	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:123458913_A_AAATAAAACTCAACATATAAGCATGT:123458913:0,4,0,1
chr3	123471459	.	T	TTGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	123633612	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr3	123650432	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:1,3:0,7,0,7
chr3	123650447	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=231,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,6:1,3:0,1,0,10
chr3	123650452	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr3	123652476	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr3	123665823	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=145,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.083:45:25,3:17,0:26,16,2,1
chr3	123666192	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr3	123674879	.	TA	T,TAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31,33;MFRL=154,171,181;MMQ=60,60,60;MPOS=24,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.65,7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,6:0.113,0.192:31:11,2,4:11,1,1:16,6,5,4
chr3	124044949	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:4,2:7,10:6,6,9,3
chr3	124113929	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,10:0,0,14,2
chr3	124132263	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr3	124132568	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	124195987	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr3	124209748	.	G	GCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=233,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	124209795	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	124281604	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=192,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr3	124281980	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,0:3,2:0,5,0,3
chr3	124303786	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr3	124351542	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,1:5,1:2,13,0,2
chr3	124352868	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr3	124369640	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=248,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,6:1,8:1,0,11,5
chr3	124378386	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	124380793	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,7,15
chr3	124390796	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:7,8:3,5:1,10,2,11
chr3	124393490	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.412:17:4,3:6,3:2,8,3,4
chr3	124397249	.	A	ATTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=227,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,16;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	124416592	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:9,2:5,16,0,2
chr3	124418846	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=129,140;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.700:14:1,7:2,2:1,3,3,7
chr3	124458816	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr3	124492734	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,6:8,6:5,9,5,7
chr3	124629222	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=224,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.711:8:1,3:1,3:2,0,3,3
chr3	124646705	.	A	AAAG	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=174.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,17:0,20:0,0,5,36
chr3	124692785	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr3	124696807	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:1,2:3,3:0,4,1,4
chr3	124709728	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:14,2:13,2:11,17,1,3
chr3	124721245	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,3:1,1:0,2,0,5
chr3	124728472	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr3	124728626	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,6:6,2:5,5,3,5
chr3	124729193	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr3	124732842	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=193,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	124746049	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr3	124802677	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr3	124854425	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr3	124896861	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,5:0,3:0,0,2,7
chr3	124951171	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.861:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr3	124998098	.	C	CA,CAAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,37,21;MFRL=0,184,137;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.83,49.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,17:0.132,0.832:19:0,0,6:0,2,7:0,0,4,15
chr3	125179732	.	C	CATAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr3	125188265	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,3:12,0:16,6,3,0
chr3	125223456	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=107.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,19,12
chr3	125238792	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	125250610	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	125270985	.	GTATA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TA;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	125297715	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr3	125301711	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=162.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,14:0,31:0,0,40,6
chr3	125651602	.	CT	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,147;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.114:37:13,2:14,2:3,30,0,4
chr3	125695953	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=239,195;MMQ=27,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr3	125769757	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,1:2,4:2,3,4,1
chr3	125775428	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,2:0,5,0,5
chr3	125786695	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=104,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:3,2:0,4:4,0,6,0
chr3	125786760	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr3	125825978	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=105,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,4:3,2,5,4
chr3	125831572	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,2:0,1,3,0
chr3	125843400	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,1:1,3,0,3
chr3	125849031	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=154,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.596:15:0,4:5,5:5,1,7,2
chr3	125849224	.	G	GCCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	125849238	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	125850169	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=271,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr3	125850193	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr3	125850381	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:0,6,0,4
chr3	125850434	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=199,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr3	125850454	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=220,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:125850454_A_C:125850454:0,4,0,1
chr3	125850457	.	GA	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=220,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:125850454_A_C:125850454:0,4,0,1
chr3	125872384	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=94,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:3,0,4,2
chr3	125874388	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	126070619	.	A	AGCCAGGGAAAGTACATTTGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=213,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr3	126126168	.	C	CCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=186,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:126126168_C_CCAA:126126168:0,1,0,1
chr3	126126169	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=186,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:126126168_C_CCAA:126126168:0,1,0,1
chr3	126126172	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=186,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:126126168_C_CCAA:126126168:0,1,0,1
chr3	126137556	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:4,6,1,2
chr3	126137881	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,9;MFRL=21433,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.551:5:1,0:0,0:0,2,3,0
chr3	126138778	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr3	126139084	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:0,4,0,3
chr3	126142496	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:0,4,0,8
chr3	126178390	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr3	126184941	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:6,0,5,1
chr3	126185238	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,32;MFRL=91,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:126185238_C_T:126185238:0,1,0,2
chr3	126185245	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,35;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,2,0,1
chr3	126185250	.	AA	TT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,2,0,1
chr3	126185255	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,1,0,1
chr3	126185258	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,1,0,1
chr3	126185265	.	A	AGGATCAC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,1,0,1
chr3	126185268	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,1,0,1
chr3	126189919	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,1,3
chr3	126207222	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	126218159	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.454:29:5,2:9,10:14,2,10,3
chr3	126219030	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr3	126219086	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr3	126219750	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:126219750_A_C:126219750:0,4,0,1
chr3	126219752	.	ACACAGCCTGGGC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:126219750_A_C:126219750:0,4,0,1
chr3	126219973	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr3	126224480	.	A	AAGGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AGGG;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,1:2,0,3,0
chr3	126226518	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr3	126227185	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr3	126228410	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,9,4
chr3	126236348	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr3	126260888	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=207,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr3	126268953	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,1,17
chr3	126270757	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	126271038	.	A	AGCACC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	126449533	.	A	ATCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,16;MFRL=122,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:1,3,0,1
chr3	126571646	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:126571646_T_A:126571646:0,3,0,1
chr3	126571649	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:126571646_T_A:126571646:0,3,0,1
chr3	126633419	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,7,0
chr3	126723588	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:126723588_G_C:126723588:1,3,0,1
chr3	126723591	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:126723588_G_C:126723588:1,3,0,1
chr3	126724881	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	126739012	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	126741478	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	126746973	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=176,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,1:0|1:126746973_A_C:126746973:0,9,2,0
chr3	126746980	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=176,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,0:0|1:126746973_A_C:126746973:0,13,2,0
chr3	126749229	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:1,18,0,2
chr3	126749334	.	T	TGGGCAAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=214,254;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	126751689	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr3	127298770	.	CT	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,19;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:127298770_CT_GG:127298770:0,2,1,0
chr3	127298779	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:127298770_CT_GG:127298770:0,1,1,0
chr3	127298781	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:127298770_CT_GG:127298770:0,1,1,0
chr3	127335861	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:6,6,1,1
chr3	127336934	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,15:0,5:0,0,7,13
chr3	127339646	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,0:15,2:12,18,0,2
chr3	127390189	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:127390189_A_C:127390189:0,0,1,0
chr3	127390191	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=94,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:0|1:127390189_A_C:127390189:1,0,1,0
chr3	127390195	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,12;MFRL=94,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.533:2:0,0:0,0:0|1:127390189_A_C:127390189:1,0,1,0
chr3	127396220	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	127682211	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:8,0:13,2:10,11,0,2
chr3	127800297	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:4,0:9,2:2,12,0,2
chr3	127983495	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,13,10
chr3	128182997	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	128204919	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:6,1:12,0,0,2
chr3	128292060	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0|1:128292060_G_A:128292060:0,0,6,1
chr3	128292082	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=103,141;MMQ=60,55;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:4,0:0|1:128292060_G_A:128292060:5,7,2,0
chr3	128292318	.	ATC	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:7,2:12,1:9,12,2,1
chr3	128348735	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,17,0
chr3	128351054	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	128351078	.	ACAACCTATATATCAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=202,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	128598469	.	CGT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GT;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	128614133	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:2,3:6,2:6,3,4,2
chr3	128614185	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:10,6:5,0:9,6,2,4
chr3	128618366	.	GGTGTGTGTGTGTGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=13,23;MFRL=306,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=20,13;RU=GT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.512:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr3	128624880	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr3	128627753	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr3	128628877	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,107;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:23,3:23,0:34,14,3,0
chr3	128720466	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	128721050	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	128753132	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:0|1:128753132_A_G:128753132:5,12,1,1
chr3	128753139	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=142,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:10,0:0|1:128753132_A_G:128753132:5,13,1,1
chr3	128755814	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr3	128755953	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr3	128755971	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	128757560	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr3	128758786	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.470:4:0,1:2,0:0|1:128758786_C_CCA:128758786:0,3,0,1
chr3	128758788	.	G	GCCCTATCCCTGCAGCCCCTCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=230,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.485:3:0,0:1,0:0|1:128758786_C_CCA:128758786:0,2,0,1
chr3	128780492	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:3,1,2,0
chr3	128781258	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr3	128840034	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,19,0
chr3	128853622	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr3	128859202	.	C	CTTAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,12,4
chr3	128864520	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,8,0
chr3	128864540	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,10,0
chr3	128877521	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	128974022	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=221,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:1,1:0,3,0,3
chr3	128979692	.	GAGCTCTGTCCCTGCTCT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr3	128984587	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=168,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:4,3:10,0:8,9,1,2
chr3	129020778	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:1,4:4,2:5,1,6,0
chr3	129120743	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr3	129123335	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:129123335_T_TC:129123335:0,3,0,1
chr3	129123337	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:129123335_T_TC:129123335:0,3,0,1
chr3	129123340	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:129123335_T_TC:129123335:0,3,0,1
chr3	129137025	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	129151927	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,19,5
chr3	129152144	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr3	129153036	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,1,17
chr3	129156536	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,12:0,7:0,0,17,3
chr3	129168854	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=120,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.795:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr3	129177346	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	129179623	.	C	CTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	129185641	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	129185661	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr3	129185924	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr3	129188325	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr3	129197108	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr3	129202316	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=93,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=154.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,46:0.924:49:3,23:0,23:2,1,33,13
chr3	129207309	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,0,19
chr3	129210977	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,9,6
chr3	129214511	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	129218944	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=71.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,4,17
chr3	129234259	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	129247551	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	129251263	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,0:0,0,0,4
chr3	129251268	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=122,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.661:4:1,1:0,0:0,1,0,3
chr3	129251273	.	G	GAGCTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=184,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr3	129251275	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=13,12;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:0,1:0,0:0,2,0,3
chr3	129252604	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr3	129266162	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	129275403	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,18,1
chr3	129275619	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	129275644	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=275,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	129277458	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=78,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:129277458_G_T:129277458:0,4,0,1
chr3	129277460	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,16;MFRL=78,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:129277458_G_T:129277458:0,4,0,1
chr3	129277481	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	129278446	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	129279570	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,19:0,21:0,0,23,18
chr3	129279597	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,19:0,16:0,0,15,20
chr3	129281866	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	129282137	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	129284415	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr3	129284637	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr3	129286531	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,10,14
chr3	129289831	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,10:0,0,9,13
chr3	129290187	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,3,6
chr3	129290322	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=21,10;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.286:11:3,0:3,0:0|1:129290322_T_G:129290322:5,3,3,0
chr3	129290326	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=200,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.632:14:1,1:2,1:0|1:129290322_T_G:129290322:3,2,8,1
chr3	129291621	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:6,2:9,0:7,11,0,2
chr3	129294456	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr3	129294503	.	G	GACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:129294503_G_GACA:129294503:1,1,0,1
chr3	129294506	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:129294503_G_GACA:129294503:1,1,0,1
chr3	129303090	.	G	GGAATGGATCGGAATGGAATCCAATGGAATCCACT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=170,101;MMQ=60,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:3,1:1,4,0,1
chr3	129303197	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr3	129303436	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:1,3:0,4,0,6
chr3	129308096	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=215,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr3	129308149	.	A	AGCCG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,0:0,1:0|1:129308149_A_AGCCG:129308149:0,0,3,0
chr3	129308153	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:129308149_A_AGCCG:129308149:0,1,1,0
chr3	129308157	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=110,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:0|1:129308149_A_AGCCG:129308149:0,4,1,0
chr3	129308163	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=110,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:129308149_A_AGCCG:129308149:0,4,1,0
chr3	129308383	.	C	CCCAATCCCTTAGGGAGGAAGCAGCCTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.289:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr3	129694934	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,4:0,11:0,0,1,15
chr3	129800783	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=122,156;MMQ=53,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:12,6:6,5:16,2,8,3
chr3	129800888	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=145,160;MMQ=52,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,10:0.324:32:11,3:11,7:0|1:129800888_G_A:129800888:8,14,8,2
chr3	129800895	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=131,160;MMQ=50,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.406:30:8,3:8,8:0|1:129800888_G_A:129800888:8,10,8,4
chr3	129800934	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=154,160;MMQ=49,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:5,3:6,4:0|1:129800934_C_G:129800934:2,9,0,8
chr3	129800938	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=156,160;MMQ=51,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:3,3:6,5:0|1:129800934_C_G:129800934:2,8,0,8
chr3	129801012	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=170,205;MMQ=51,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr3	129811073	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.426:31:7,5:10,8:0,18,0,13
chr3	129811872	.	GAAAAAA	G,GAA	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=34,34,35;MFRL=145,107,145;MMQ=52,57,55;MPOS=18,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=25,19,21;RU=A;STR;TLOD=3.65,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,5:0.116,0.209:28:8,3,4:11,0,1:19,1,8,0
chr3	129811897	.	ATT	A	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=134,155;MMQ=50,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,13:0.221:54:20,3:10,5:0|1:129811897_ATT_A:129811897:33,8,13,0
chr3	129811902	.	ATC	A	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=134,155;MMQ=47,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,13:0.190:62:23,1:16,5:0|1:129811897_ATT_A:129811897:35,14,13,0
chr3	129811906	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=134,155;MMQ=47,53;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,13:0.190:62:23,1:19,3:0|1:129811897_ATT_A:129811897:35,14,13,0
chr3	129814847	.	CG	C	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=138,146;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.398:33:10,6:9,7:13,7,11,2
chr3	129814862	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=146,138;MMQ=50,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,26:0.600:43:7,13:8,13:10,7,15,11
chr3	129814863	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=135,146;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,18:0.404:45:13,7:13,9:0|1:129814863_G_A:129814863:15,12,11,7
chr3	129814869	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=135,150;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=70.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,20:0.437:46:13,9:13,9:0|1:129814863_G_A:129814863:14,12,13,7
chr3	129814934	.	GC	G	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=52.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.488:41:11,11:10,8:8,13,7,13
chr3	129814960	.	G	GCCTTGATGCCTCT	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=146,148;MMQ=43,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.097:28:8,2:18,0:6,20,0,2
chr3	129815930	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=177,144;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,6:4,2:9,0,8,0
chr3	129815971	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:8,5:3,5:7,4,6,4
chr3	129816169	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	130098687	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,0:16,2:8,18,1,1
chr3	130110650	.	A	ACAGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130110650_A_ACAGG:130110650:0,1,0,1
chr3	130110652	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130110650_A_ACAGG:130110650:0,1,0,1
chr3	130110655	.	T	TATA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130110650_A_ACAGG:130110650:0,1,0,1
chr3	130110659	.	T	TGTGGGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130110650_A_ACAGG:130110650:0,1,0,1
chr3	130114408	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=64.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,0,18
chr3	130117052	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=230,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:130117052_G_A:130117052:0,2,0,1
chr3	130117054	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=230,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:130117052_G_A:130117052:0,2,0,1
chr3	130117056	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=230,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:130117052_G_A:130117052:0,2,0,1
chr3	130122409	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr3	130122572	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:7,1:0,17,0,2
chr3	130132302	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:130132302_T_A:130132302:0,0,4,0
chr3	130132304	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:130132302_T_A:130132302:0,0,4,0
chr3	130132509	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr3	130132851	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr3	130134492	.	T	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=266.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,76:0.987:76:0,33:0,41:0,0,41,35
chr3	130135575	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=132.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,19:0,19:0,0,31,7
chr3	130135588	.	AT	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:21,2:20,1:26,15,2,1
chr3	130137866	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr3	130142587	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	130144984	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=108.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,11:0,0,25,5
chr3	130150874	.	G	GAAAATTATGGATTTGAGAAACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130150874_G_GAAAATTATGGATTTGAGAAACAC:130150874:0,1,0,1
chr3	130150877	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130150874_G_GAAAATTATGGATTTGAGAAACAC:130150874:0,1,0,1
chr3	130158343	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr3	130203024	.	A	AAAACGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:130203024_A_AAAACGC:130203024:0,0,0,1
chr3	130203027	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:130203024_A_AAAACGC:130203024:0,0,0,1
chr3	130286886	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,18,4
chr3	130289617	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	130313017	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	130313219	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.509:43:9,10:12,11:5,16,4,18
chr3	130317341	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,3,10
chr3	130327712	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,3:12,0:17,8,3,0
chr3	130360600	.	TA	T,TAA	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=161,125,133;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=10.05,10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,9,8:0.192,0.185:43:8,4,7:13,2,1:2,24,5,12
chr3	130399509	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.102:57:27,1:24,4:31,21,4,1
chr3	130447530	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,10;MFRL=152,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,0:3,0:0,15,0,3
chr3	130463445	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:10,0:15,6,2,0
chr3	130660392	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:20,2:10,1:28,4,3,0
chr3	130674022	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,1:0,7:0,0,0,9
chr3	130733046	.	CT	C,CTT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30,33;MFRL=118,184,144;MMQ=60,60,60;MPOS=7,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=8.45,4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,7,3:0.263,0.152:24:5,4,1:8,3,1:6,8,7,3
chr3	130737632	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	130748733	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,5:1,0:0,3,0,5
chr3	130828790	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=112.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.949:37:1,16:0,19:0,1,6,30
chr3	130881409	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,15:0,0,3,26
chr3	131186893	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:11,6:14,1:26,0,7,0
chr3	131186907	.	GA	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,14:0.358:40:11,4:6,3:24,2,14,0
chr3	131217208	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr3	131261662	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,1:0,2:0,0,0,8
chr3	131404826	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:1,6:6,9:0,7,0,15
chr3	131415307	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:9,1,2,0
chr3	131418719	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:4,6:1,5:4,1,9,2
chr3	131624097	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=119,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.436:19:8,4:1,4:6,5,7,1
chr3	132063914	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr3	132063977	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	132068876	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	132068925	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	132075472	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr3	132075707	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr3	132075743	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr3	132075746	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr3	132075759	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr3	132086625	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=123,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:8,8,2,0
chr3	132166148	.	AT	A	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,10:0.154:66:33,5:22,5:49,7,10,0
chr3	132169705	.	T	TA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.544:20:3,4:6,7:0,9,0,11
chr3	132173004	.	AT	A	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,13:0.165:72:17,2:23,8:15,44,4,9
chr3	132176310	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr3	132179072	.	GT	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.470:51:14,8:9,15:23,4,20,4
chr3	132179280	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=18,30,17,15;MFRL=188,209,165,163;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,20,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.50,13.61,4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,3,8,3:0.138,0.343,0.162:22:1,1,0,0:3,1,2,0:1,7,0,14
chr3	132186187	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,10:5,4:1,7,1,13
chr3	132196816	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,8:0,8:0,0,12,7
chr3	132197995	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=179,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr3	132198097	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,5:7,3:7,7,4,4
chr3	132198156	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=120,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,4:5,6:2,7,2,8
chr3	132202449	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,3:5,4:1,10,1,6
chr3	132217957	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,5:5,5:5,1,7,3
chr3	132219554	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,8:3,4:8,0,12,0
chr3	132221076	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=169,155,147;MMQ=60,60,60;MPOS=10,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=11.41,6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,4:0.335,0.370:11:2,3,3:1,1,1:3,0,8,0
chr3	132224128	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=122.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,42:0.458:92:26,19:24,23:31,19,29,13
chr3	132244406	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr3	132247160	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:2,5,4,5
chr3	132250027	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=224,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr3	132320802	.	T	TA	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=106,141;MMQ=39,27;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=196.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,82:0.956:87:4,36:1,45:3,2,45,37
chr3	132322262	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=122,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr3	132345482	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	132345723	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=198,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr3	132345739	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	132345762	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,1307;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	132347311	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr3	132363786	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr3	132394556	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=175.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,32:0,16:0,0,21,28
chr3	132394784	.	A	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=105.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,38:0.470:81:19,17:24,21:8,35,10,28
chr3	132401600	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,29:0.411:71:16,17:26,12:22,20,15,14
chr3	132402424	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=182,24;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,0:8,3:0,12,1,2
chr3	132407481	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:8,3:4,2:10,2,5,0
chr3	132413887	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr3	132423164	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:12,2:20,1:15,18,2,1
chr3	132434156	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr3	132438747	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.578:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr3	133108978	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr3	133114858	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:14,2:9,0:9,15,0,2
chr3	133114893	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,3,15
chr3	133185834	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,4:8,4:0,14,0,8
chr3	133191453	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=113.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,1,30
chr3	133331163	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr3	133335787	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:1,5,0,3
chr3	133335960	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,3:4,5:8,1,8,0
chr3	133335977	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:8,1,9,0
chr3	133343047	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=136,174;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:0|1:133343047_T_C:133343047:0,7,0,6
chr3	133343050	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=136,174;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:0|1:133343047_T_C:133343047:0,7,0,6
chr3	133347604	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:10,2:8,10:1,20,4,9
chr3	133356790	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:2,5:3,8:0,5,6,7
chr3	133368199	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=210,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr3	133371522	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:133371522_A_T:133371522:0,2,0,1
chr3	133371531	.	T	TATCACTTCAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:133371522_A_T:133371522:0,2,0,1
chr3	133375785	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr3	133380026	.	A	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,34:0.556:61:7,19:20,15:1,26,0,34
chr3	133467271	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:16,0:9,2:11,16,2,0
chr3	133524591	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=220,269;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	133524717	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.364:47:13,6:17,10:28,2,17,0
chr3	133553527	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr3	133583374	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:133583374_A_C:133583374:6,1,2,0
chr3	133583382	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.314:10:4,2:2,0:0|1:133583374_A_C:133583374:7,0,2,1
chr3	133661684	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:2,2:0,5,0,4
chr3	133667767	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=115,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:7,0:3,2:5,6,1,1
chr3	133673711	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	133692497	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,2:1,5:4,2,7,0
chr3	133894390	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:5,8:4,7:9,0,15,1
chr3	133901733	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,4:4,1:11,1,5,0
chr3	133941470	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:133941470_A_AT:133941470:0,1,0,1
chr3	133941471	.	GATAA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:133941470_A_AT:133941470:0,1,0,1
chr3	133941477	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133941470_A_AT:133941470:0,0,0,1
chr3	133941483	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133941470_A_AT:133941470:0,0,0,1
chr3	133941484	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133941470_A_AT:133941470:0,0,0,1
chr3	133969380	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	133969437	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	134080661	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,1:4,1:2,6,0,2
chr3	134085070	.	GAAGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=103,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGT;STR;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,4:3,1:5,0,4,1
chr3	134085205	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:1,9,4,2
chr3	134214042	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr3	134226159	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=116.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,22:0,15:0,0,11,27
chr3	134256159	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr3	134266148	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chr3	134280395	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,16:0,0,3,24
chr3	134362333	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	134514579	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,12:0,9:0,0,9,12
chr3	134644636	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.374:17:7,4:2,2:10,1,3,3
chr3	134670363	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=161,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:134670363_A_T:134670363:4,15,0,2
chr3	134670365	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=161,212;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:9,2:0|1:134670363_A_T:134670363:4,15,0,2
chr3	134825375	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,0:12,2:9,7,2,0
chr3	134911715	.	T	TGATAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=147,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:134911715_T_TGATAG:134911715:0,3,0,1
chr3	134911716	.	G	GTTAGGATGGTCGAACTGGCCCAT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=147,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	134911720	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=170,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:134911715_T_TGATAG:134911715:0,3,0,1
chr3	134911721	.	G	GTGTATGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=170,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:134911715_T_TGATAG:134911715:0,3,0,1
chr3	134967368	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:4,6:1,7,1,7
chr3	135721309	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:5,3:14,0:8,11,3,0
chr3	135797251	.	G	A	.	.	DP=128;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,72;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,5:0.049:117:54,5:56,0:43,69,4,1
chr3	135821000	.	G	GGTCTCACCATCAACAGCTGGCTTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=156,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr3	136002809	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=205,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	136048935	.	TTTGC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=191,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:136048935_TTTGC_T:136048935:0,3,0,1
chr3	136048941	.	A	AGCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=191,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:136048935_TTTGC_T:136048935:0,3,0,1
chr3	136048955	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	136068226	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:7,4:1,13,0,4
chr3	136082410	.	A	AGGAAGGAGACAGCTTTAAACT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr3	136162109	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:10,1,2,0
chr3	136196071	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,3:0,4:1,0,5,2
chr3	136287710	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.470:47:16,7:8,15:5,20,4,18
chr3	136646968	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:34,1:21,2:27,30,0,3
chr3	136677064	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,2:3,2:2,6,0,5
chr3	137749933	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,2:6,0:5,4,1,1
chr3	137783512	.	A	AAGTGTCATCCTTTGCCCTAG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:12,3:17,0:15,15,1,2
chr3	137783700	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr3	137787282	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	137799291	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	137799498	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr3	137800656	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr3	137803188	.	GGCA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137803188_GGCA_G:137803188:0,0,0,1
chr3	137803193	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137803188_GGCA_G:137803188:0,0,0,1
chr3	137807203	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,33;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:9,2:2,0:8,3,1,1
chr3	137850003	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,3:0,26:0,0,16,16
chr3	137880695	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=164.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,20:0,26:0,0,39,7
chr3	137880740	.	ATCG	A	.	.	DP=123;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,5:0.059:98:40,4:51,1:45,48,4,1
chr3	137880743	.	G	A	.	.	DP=121;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=328.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,114:0.992:114:0,49:0,64:0,0,61,53
chr3	137882377	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr3	137882752	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr3	137886238	.	T	TGCGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137886238_T_TGCGAA:137886238:0,1,0,1
chr3	137886240	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,22;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137886238_T_TGCGAA:137886238:0,1,0,1
chr3	137958438	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,0,10
chr3	137982718	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,4:0,0,1,16
chr3	138009528	.	T	TGGCTTTCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:5,8,0,2
chr3	138025136	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,2:1,6:6,0,8,0
chr3	138025396	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,2:2,1:0,3,0,4
chr3	138037127	.	G	GGGAGTCTCAGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	138091701	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,1:7,3:8,2,4,0
chr3	138116392	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:138116392_T_C:138116392:0,0,0,1
chr3	138116399	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138116392_T_C:138116392:0,0,0,1
chr3	138116401	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138116392_T_C:138116392:0,0,0,1
chr3	138117422	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=161,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,0:12,4:4,19,1,3
chr3	138170788	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr3	138176456	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=127,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:138176456_G_T:138176456:7,15,1,1
chr3	138176461	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:138176456_G_T:138176456:6,14,1,1
chr3	138176482	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,2:9,0:0|1:138176482_A_G:138176482:5,9,1,1
chr3	138176485	.	T	TGCGCTCACCTTCTCA	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,2:8,0:0|1:138176482_A_G:138176482:5,9,1,1
chr3	138176533	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr3	138189031	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:1,3,1,2
chr3	138213849	.	ATTTGT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,5:4,6:7,3,5,6
chr3	138244400	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,9:0,0,5,7
chr3	138248009	.	GA	G,GAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,17,32;MFRL=132,56,140;MMQ=60,60,50;MPOS=13,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=6.77,7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,3:0.317,0.278:12:1,0,1:3,2,1:4,1,3,4
chr3	138251302	.	G	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=178.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,22:0,32:0,0,41,13
chr3	138251447	.	CGGTAT	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTAT;STR;TLOD=162.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.977:38:0,17:0,21:0,0,8,30
chr3	138256252	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	138409992	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:17,0:19,3:2,34,2,1
chr3	138724370	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=29,17;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.156:34:12,2:14,0:16,13,4,1
chr3	138724372	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=31,22;MFRL=152,144;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:13,1:16,0:0|1:138724372_C_G:138724372:18,13,1,2
chr3	138724373	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=29,13;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.127:34:12,0:15,0:15,15,4,0
chr3	138724374	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=29,22;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:12,1:15,1:17,13,2,2
chr3	138724379	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=28,12;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.216:31:7,1:9,0:12,12,5,2
chr3	138724387	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=31,17;MFRL=152,144;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:12,0:10,1:0|1:138724372_C_G:138724372:16,12,1,2
chr3	138724392	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=29,17;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:9,1:6,1:13,11,4,2
chr3	138763308	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=213,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr3	138763343	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=217,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:1,2:2,0:0,4,0,3
chr3	138763627	.	GTGC	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGC;STR;TLOD=98.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,12:0,10:0,0,16,8
chr3	139066902	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	139074638	.	G	GT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.136:37:18,2:13,1:15,17,0,5
chr3	139075938	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:0,9,0,6
chr3	139080056	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,1:11,1:8,13,1,1
chr3	139081275	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:5,4,2,0
chr3	139085686	.	C	CACA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=196,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr3	139085696	.	C	CCAATTCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	139085705	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=202,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139085705_T_C:139085705:1,0,0,1
chr3	139085708	.	C	CAATACTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=202,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139085705_T_C:139085705:1,0,0,1
chr3	139088481	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=165,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	139090736	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,4:2,6:0,4,0,10
chr3	139098357	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:12,8:10,7:0,22,0,15
chr3	139102120	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,13:0,15:0,0,24,4
chr3	139108250	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	139180977	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:19,2:8,0:12,17,1,1
chr3	139181144	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:6,13,0,2
chr3	139195177	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.738:21:1,9:4,6:5,0,12,4
chr3	139236404	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:13,5,2,0
chr3	139257545	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=158,278;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr3	139280064	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:16,1:14,3:19,11,2,2
chr3	140139907	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	140178279	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	140178638	.	CCCT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,7:0,4:0,0,3,9
chr3	140282084	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr3	140285115	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,11:0,18:0,0,1,29
chr3	140397409	.	C	CACACACTCACAGCATGTATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=211,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr3	140419715	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,17,6
chr3	140678384	.	TA	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.271:40:7,3:14,6:1,28,2,9
chr3	140692486	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	140998214	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,16,7
chr3	141006396	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	141277651	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=98.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,32:0.506:63:17,13:14,18:31,0,31,1
chr3	141299334	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.484:35:4,10:14,6:3,15,1,16
chr3	141305037	.	TG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:141305037_TG_AA:141305037:0,2,0,1
chr3	141305040	.	G	GCCCTTACCAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:141305037_TG_AA:141305037:0,2,0,1
chr3	141327593	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,3:3,6:0,3,0,9
chr3	141331222	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=132.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,51:0.458:111:24,26:36,23:15,45,15,36
chr3	141457106	.	C	CGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=231,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=G;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.528:2:1,0:0,1:0|1:141457106_C_CGGG:141457106:1,0,1,0
chr3	141457110	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=11,31;MFRL=207,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:0,0:0,1:0|1:141457106_C_CGGG:141457106:2,0,1,0
chr3	141535558	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,13,6
chr3	141622630	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,199;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.218:20:10,2:4,0:1,15,0,4
chr3	141622680	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=176,123;MMQ=59,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:6,2:0,0:0,6,0,2
chr3	141625999	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,16,4
chr3	141626189	.	C	CGGTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=109,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGTA;STR;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,3:0,1,0,7
chr3	141626200	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=196,161;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr3	141644274	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr3	141724160	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,68;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:9,0,1,1
chr3	141904977	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,12:0,0,22,6
chr3	141905253	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=158.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,13:0,19:0|1:141905253_C_A:141905253:0,0,35,1
chr3	141905259	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=171.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,15:0,22:0|1:141905253_C_A:141905253:0,0,38,1
chr3	141905261	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=171.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.977:39:0,15:0,23:0|1:141905253_C_A:141905253:0,0,38,1
chr3	141917810	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr3	141923491	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.130:44:25,2:11,3:0|1:141923491_G_GA:141923491:30,9,5,0
chr3	141923506	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=202.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,61:0.985:61:0,37:0,19:0|1:141923491_G_GA:141923491:0,0,48,13
chr3	141932531	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr3	141934393	.	CA	C,CAA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,34,32;MFRL=170,232,141;MMQ=60,60,60;MPOS=20,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.02,8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:43,3,7:0.068,0.135:53:27,2,5:15,1,2:43,0,9,1
chr3	142051147	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:2,3:0,6:2,0,9,0
chr3	142094816	.	GCACA	G,GCA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35,32;MFRL=130,172,155;MMQ=60,60,60;MPOS=31,34;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=CA;STR;TLOD=5.19,4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,2:0.196,0.213:11:6,0,1:0,2,1:3,4,0,4
chr3	142119303	.	T	A	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,10:0.098:100:43,0:33,0:75,15,0,10
chr3	142122451	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.525:32:9,8:5,6:15,0,17,0
chr3	142215178	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=106,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,6:1,2:1,0,6,2
chr3	142232555	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,0:14,2:0,27,2,0
chr3	142241691	.	A	AC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,0:9,2:1,19,0,3
chr3	142241692	.	GAA	G,CAA,AAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=17,34,19,34;MFRL=172,188,196,134;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,16,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.25,5.94,5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,4,3:0.146,0.229,0.157:16:0,2,0,0:1,0,1,3:1,6,0,9
chr3	142259706	.	CA	C,CAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=145,116,137;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.05,6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,6:0.179,0.338:17:7,1,3:1,2,3:7,1,8,1
chr3	142272275	.	AAC	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:7,2:1,0:0,8,0,3
chr3	142272314	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=228,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	142277365	.	AAAAT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,152;MMQ=55,52;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AAAT;STR;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.709:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr3	142402827	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:10,0:9,3:20,0,3,0
chr3	142413407	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:9,6:3,7:1,11,5,8
chr3	142443372	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:142443372_T_G:142443372:0,0,1,0
chr3	142443377	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=217,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:142443372_T_G:142443372:1,0,1,0
chr3	142443382	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,10;MFRL=217,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:142443372_T_G:142443372:1,0,1,0
chr3	142443384	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=217,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:142443372_T_G:142443372:1,0,1,0
chr3	142521224	.	CT	C,CTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,34,20;MFRL=162,148,150;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.74,24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,14:0.131,0.497:27:7,0,6:3,3,4:0,10,2,15
chr3	142537283	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:4,10,0,2
chr3	142567327	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:2,7,0,7
chr3	142720348	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	142740061	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=177,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr3	142740255	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:26,0:30,3:23,33,0,3
chr3	142752293	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	142773738	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=158.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,27:0,21:0,0,34,14
chr3	142774062	.	TTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=245,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	142841379	.	T	TCACACACACACACAAACA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.150:39:18,2:15,0:20,13,4,2
chr3	142985622	.	GT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,144;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:14,3:13,0:12,15,0,3
chr3	143214114	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,6:6,3:10,0,9,0
chr3	143214290	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=149,93;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:23,0:32,3:13,43,0,3
chr3	143371003	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	143567207	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=151.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,18:0,23:0,0,6,40
chr3	145788467	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.515:33:11,10:5,7:11,5,14,3
chr3	145788803	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,2:3,1:6,3,3,0
chr3	145790519	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	145803138	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,13:0.424:31:5,7:13,4:0|1:145803138_T_C:145803138:0,18,0,13
chr3	145803142	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.400:28:5,8:12,3:0|1:145803138_T_C:145803138:0,17,0,11
chr3	145804524	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:11,14:6,11:17,0,25,0
chr3	145809750	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,3:3,3:0,5,0,6
chr3	145820684	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:6,5:0,3:1,5,3,5
chr3	145820726	.	G	GTGCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.414:5:1,1:1,1:0|1:145820726_G_GTGCC:145820726:0,3,0,2
chr3	145820729	.	T	TCCAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:145820726_G_GTGCC:145820726:0,3,0,1
chr3	145824478	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,4:3,2:0,11,0,6
chr3	145824504	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=181,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr3	145828256	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr3	145838895	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,5:5,3:5,1,5,3
chr3	145841854	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	145924632	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr3	145938528	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=201,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr3	145938782	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,2:2,8,0,6
chr3	145939755	.	C	CA	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=134,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.344:43:18,8:8,4:21,7,11,4
chr3	145939776	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,23:0.387:60:23,14:14,6:25,12,15,8
chr3	146176075	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=113.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,32,0
chr3	146233935	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:1,1:0,7,0,2
chr3	146251430	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:0|1:146251430_A_G:146251430:0,4,0,8
chr3	146251433	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:0|1:146251430_A_G:146251430:0,4,0,8
chr3	146303750	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:7,6:3,2:10,0,8,0
chr3	146307635	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr3	146311937	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=159,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:4,2:4,3:0,9,2,3
chr3	146312917	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,30:0.535:56:9,12:17,18:4,22,8,22
chr3	146312941	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.527:34:6,8:10,10:1,15,4,14
chr3	146318000	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr3	147108756	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.576:12:2,2:2,4:2,3,3,4
chr3	147113667	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,3:5,6:7,3,6,3
chr3	148545857	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=100,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.666:22:1,7:6,7:3,4,10,5
chr3	148562425	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:9,10:5,6:4,10,8,8
chr3	148562620	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr3	148563493	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr3	148575156	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	148597482	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr3	148597612	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,32:0,30:0,0,24,38
chr3	148711906	.	G	GT	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.115:55:25,3:24,3:45,4,6,0
chr3	148714025	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,1:8,3:11,1,4,0
chr3	148752761	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,5:0.088:65:33,2:27,3:30,30,1,4
chr3	148756825	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr3	148757290	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,1:9,1:12,0,2,0
chr3	148764090	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:4,3:6,8:0,10,1,11
chr3	148788941	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr3	148804090	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.196:33:11,0:15,0:0|1:148804090_T_A:148804090:4,22,7,0
chr3	148804093	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.164:31:11,0:14,0:0|1:148804090_T_A:148804090:4,22,5,0
chr3	148858353	.	A	AAGGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGGT;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr3	148858987	.	CTT	C,CT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,33,33;MFRL=150,149,140;MMQ=60,60,60;MPOS=15,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.03,9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,4,6:0.111,0.199:33:11,2,5:9,2,0:9,14,6,4
chr3	148876404	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:10,1:18,5,1,1
chr3	148879878	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:7,2:2,6:0|1:148879878_A_G:148879878:10,0,8,0
chr3	148879883	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,2:3,6:0|1:148879878_A_G:148879878:10,0,8,0
chr3	148885779	.	AT	A,ATT	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=158,144,125;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.30,57.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,3,38:0.052,0.544:68:14,2,16:13,1,20:3,24,10,31
chr3	148885851	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=174,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.691:24:1,7:6,9:0,7,0,17
chr3	148896430	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,2:7,3:0,9,0,5
chr3	148901406	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.634:14:2,6:3,3:0,5,0,9
chr3	148925418	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:0,6,3,3
chr3	149087714	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,28:0.784:35:4,12:3,15:0,7,5,23
chr3	149192564	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:2,1,7,0
chr3	149238595	.	C	CTTAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.369:25:9,3:7,5:11,5,7,2
chr3	149243715	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:7,0,5,0
chr3	149245675	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.402:46:10,9:12,8:15,13,6,12
chr3	149260145	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:9,2:20,1:18,12,3,0
chr3	149290605	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=119,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr3	149613232	.	ATTTT	A,AT,ATT,ATTT	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=34,34,33,33,32;MFRL=162,157,173,176,139;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=19,22,22,10;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,15,16,17;RU=T;STR;TLOD=4.73,7.76,34.44,12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:1,4,6,18,8:0.096,0.152,0.460,0.243:37:0,1,3,11,6:1,3,3,7,2:1,0,36,0
chr3	149613252	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=13,18;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,9:0.136:61:8,0:7,0:43,9,9,0
chr3	149619799	.	A	AAGTT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=110.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,29:0.454:64:24,8:11,18:25,10,24,5
chr3	149619941	.	T	C	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=136.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,52:0.546:95:15,20:27,30:14,29,20,32
chr3	149686367	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=119,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,6:1,4:0,1,0,10
chr3	150128154	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.474:21:7,4:4,5:9,2,10,0
chr3	150128392	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=199,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr3	150128484	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=233,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr3	150129171	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:150129171_A_AT:150129171:0,1,0,4
chr3	150129173	.	T	TCATTTGTTCTGCAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=213,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:150129171_A_AT:150129171:0,4,0,1
chr3	150270077	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	150276151	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.815:14:2,6:0,5:0|1:150276151_A_AT:150276151:1,1,11,1
chr3	150276153	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.815:14:2,7:0,5:0|1:150276151_A_AT:150276151:1,1,11,1
chr3	150282061	.	CT	C,CTT	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=161,136,116;MMQ=60,60,60;MPOS=16,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.64,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,7,4:0.152,0.109:41:13,3,3:14,3,1:22,8,9,2
chr3	150285664	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=139.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,15:0,0,10,27
chr3	150290393	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=155,159;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150290393_G_A:150290393:0,1,0,1
chr3	150290398	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=155,159;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150290393_G_A:150290393:0,1,0,1
chr3	150290407	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=155,159;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:150290393_G_A:150290393:0,1,0,1
chr3	150290413	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150290393_G_A:150290393:0,0,0,1
chr3	150290417	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150290393_G_A:150290393:0,0,0,1
chr3	150340114	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=143.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,16:0,21:0,0,37,0
chr3	150384807	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr3	150391638	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150391638_C_G:150391638:0,0,1,0
chr3	150391647	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150391638_C_G:150391638:0,0,1,0
chr3	150398810	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr3	150420057	.	C	CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=245,161;MMQ=55,32;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=24,26;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.544:4:0,0:1,0:0,2,0,2
chr3	150460572	.	T	TCTCTCAACCGCCACTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=218,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	150480448	.	CCCG	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCG;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:14,0:20,2:5,33,0,2
chr3	150661472	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr3	150661495	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,15,3
chr3	150690566	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	150804908	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	150876464	.	TG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,23:0,3:0,0,22,4
chr3	150883777	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,9:0,4:0,0,4,10
chr3	150903165	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.100:37:15,1:19,2:21,13,1,2
chr3	150903178	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=146,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:14,0:16,2:18,13,0,2
chr3	150916131	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,141;MMQ=58,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:0,1:2,10:1,1,10,1
chr3	151046604	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=188.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,59:0.969:60:0,23:1,36:1,0,28,31
chr3	151073033	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=216.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,29:0,28:0,0,20,38
chr3	151073818	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=98,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:17,2:19,0:17,19,2,0
chr3	151074925	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr3	151074941	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=64.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,6:0,0,17,2
chr3	151083630	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:18,0:3,3:17,4,3,0
chr3	151085578	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=76.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,9,15
chr3	151102790	.	ACT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.088:31:13,2:13,0:24,5,2,0
chr3	151103070	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr3	151128973	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	151128975	.	CA	GC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,19;MFRL=202,175;MMQ=54,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:151128975_CA_GC:151128975:2,0,1,0
chr3	151128977	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,14;MFRL=175,242;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr3	151128981	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,18;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:151128975_CA_GC:151128975:3,0,1,0
chr3	151128990	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:151128975_CA_GC:151128975:3,0,1,0
chr3	151129173	.	C	CACTCGGCTGCTGCTGAATCTGTCTGAG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,44;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,0:14,3:12,17,1,2
chr3	151131183	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr3	151134104	.	AGCAGCCCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCAGCCTCCCCAGCCCCAGCAGTCCTCGCAGTCCCAGAGTCAGACCCTTGGTCTCCAAGCAAT	A	.	.	DP=160;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:124,36:0.044:160:16,16:14,13:49,75,25,11
chr3	151134121	.	CAG	C	.	.	DP=75;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.104:44:18,0:14,2:0|1:151134121_CAG_C:151134121:6,34,4,0
chr3	151134127	.	CAGCAG	C	.	.	DP=82;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.088:52:18,1:18,1:0|1:151134121_CAG_C:151134121:10,38,4,0
chr3	151134134	.	CT	C	.	.	DP=83;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.093:49:20,1:21,2:0|1:151134121_CAG_C:151134121:10,35,4,0
chr3	151154923	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,5:5,2:5,5,6,1
chr3	151162965	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.534:43:8,15:12,8:7,13,11,12
chr3	151531894	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.588:32:5,9:8,10:12,1,12,7
chr3	151535422	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	151542408	.	AAAAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr3	151545318	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,11,1
chr3	151545321	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,2:0,8:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,12,1
chr3	151545323	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,2:0,9:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,11,1
chr3	151546041	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	152017897	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr3	152554282	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:13,2:10,0:10,15,2,0
chr3	152881442	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=175,166;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.740:6:1,3:0,0:0,1,2,3
chr3	152881444	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=175,166;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.740:6:1,2:0,1:0|1:152881444_A_T:152881444:0,1,2,3
chr3	152881449	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=200,162;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.611:6:1,3:0,0:0|1:152881444_A_T:152881444:0,2,1,3
chr3	152881453	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=175,166;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.792:8:1,4:0,0:0|1:152881444_A_T:152881444:0,1,1,6
chr3	152881852	.	AT	A,ATT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=186,162,225;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.67,5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,5,3:0.191,0.150:24:9,2,2:7,3,1:9,7,4,4
chr3	152883395	.	CT	C,CTT	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=126,149,135;MMQ=60,60,60;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=16.83,5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:50,14,6:0.183,0.090:70:25,6,1:21,7,3:41,9,13,7
chr3	153839959	.	CT	TC	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=200.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,30:0,17:0,0,21,27
chr3	153847555	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=183,131;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:153847555_T_C:153847555:1,14,0,2
chr3	153847558	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=183,131;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:0|1:153847555_T_C:153847555:1,14,0,2
chr3	153847582	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr3	153870511	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=137.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,16:0,22:0,0,34,4
chr3	153970796	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,25,1
chr3	153972500	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr3	153994502	.	TG	CA,CG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,174,166;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=46.48,49.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,16,19:0.450,0.524:35:0,10,12:0,6,7:0,0,34,1
chr3	153995307	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=209,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:6,0,8,0
chr3	154002357	.	A	AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.507:24:5,6:7,4:11,1,10,2
chr3	154007618	.	T	TA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.119:34:12,2:16,2:1,29,0,4
chr3	154007682	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	154010515	.	AACACAC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=AC;STR;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.604:5:1,3:0,0:0,2,0,3
chr3	154010560	.	C	CCGCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=180,199;MMQ=60,50;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	154018690	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,5:4,5:11,0,10,0
chr3	154021063	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=256.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,30:0,43:0,0,64,13
chr3	154024165	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=229,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr3	154802742	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.492:37:7,12:10,6:17,2,18,0
chr3	154834379	.	G	GTA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TA;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.137:19:9,1:8,1:6,11,2,0
chr3	154858158	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:0,6,0,7
chr3	154866453	.	T	C	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=135.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,47:0.479:98:25,18:26,26:11,40,11,36
chr3	154878158	.	GA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.321:29:9,6:11,3:14,6,2,7
chr3	155200133	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:3,5,1,2
chr3	155205993	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.797:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr3	155212325	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,2,13
chr3	155241593	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr3	155241740	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,14:0,0,12,18
chr3	155267621	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=132,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,3:5,0:6,8,1,2
chr3	155271825	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,11,5
chr3	155282974	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=223,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155282974_G_A:155282974:0,1,0,1
chr3	155282977	.	AAA	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=223,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155282974_G_A:155282974:0,1,0,1
chr3	155481609	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,5,17
chr3	155611557	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	155621834	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:14,3:20,0:0,35,0,3
chr3	155633708	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr3	155649472	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,0:2,0,2,0
chr3	155838302	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155838302_T_A:155838302:1,0,1,0
chr3	155838311	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155838302_T_A:155838302:1,0,1,0
chr3	156175167	.	GG	AA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr3	156181651	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.439:16:2,4:7,3:0,9,0,7
chr3	156183307	.	GCCTC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTC;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	156183382	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr3	156260908	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=99,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156260908_T_G:156260908:3,0,1,0
chr3	156260911	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=108,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:156260908_T_G:156260908:4,0,1,0
chr3	156260913	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=108,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:156260908_T_G:156260908:4,0,1,0
chr3	156261110	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.413:20:6,5:5,3:2,10,0,8
chr3	156262232	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=102.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,32:0.524:61:17,12:10,20:5,24,6,26
chr3	156266642	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,15,1
chr3	156266774	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,3:5,1:6,8,0,4
chr3	156266880	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	156271595	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.489:35:8,7:9,10:4,14,3,14
chr3	156271608	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.484:35:9,7:9,9:3,15,1,16
chr3	156271627	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,7:5,8:0,11,0,15
chr3	156413633	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.428:10:3,3:1,1:2,4,0,4
chr3	156421525	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	156421568	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=195,184;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156421568_C_A:156421568:0,1,0,1
chr3	156421574	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=195,184;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156421568_C_A:156421568:0,1,0,1
chr3	156421576	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=195,184;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:156421568_C_A:156421568:0,1,0,1
chr3	156421578	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,43;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156421568_C_A:156421568:0,0,0,1
chr3	156742775	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,7:0,0,0,21
chr3	156867776	.	G	GAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=A;STR;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:10,6:6,7:0,16,4,10
chr3	156868266	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=227,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:156868266_CTT_C:156868266:0,4,0,1
chr3	156868270	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=227,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:156868266_CTT_C:156868266:0,4,0,1
chr3	156870059	.	C	T	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=147.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,54:0.486:111:35,20:21,32:19,38,8,46
chr3	156870816	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.468:45:8,8:16,13:19,5,14,7
chr3	156876574	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:6,0,4,0
chr3	156876803	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,3:1,5:2,3,0,8
chr3	156877276	.	CAA	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.385:50:14,11:17,8:10,21,4,15
chr3	156877357	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=200,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr3	156877530	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=248,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr3	156978919	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:3,1:8,9:8,3,8,2
chr3	156983273	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.790:12:0,3:2,7:2,0,9,1
chr3	157004323	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=72.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,15,5
chr3	157034810	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,2:7,0:15,1,2,0
chr3	157081604	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr3	157082082	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	157146307	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr3	157146336	.	A	AGGAATATGACCCTTAGAAGTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr3	157154768	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:11,17:8,3:12,7,12,8
chr3	157154861	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=95.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,15:0,0,14,16
chr3	157188045	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr3	157318257	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr3	157820400	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr3	157820423	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr3	158072623	.	AT	A,ATT	.	.	DP=154;ECNT=2;MBQ=31,33,33;MFRL=128,118,131;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=11.91,9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:72,20,10:0.149,0.097:102:47,13,4:20,7,6:28,44,19,11
chr3	158072637	.	C	G	.	.	DP=142;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=128,93;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,7:0.065:118:47,1:32,1:38,73,6,1
chr3	158072776	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,4:0,10:0,1,0,15
chr3	158310391	.	CAGTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,4:1,2:0,2,1,5
chr3	158314810	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:0,4:9,9:0,9,0,13
chr3	158318015	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,0,25
chr3	158320597	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=186,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,4:8,5:9,6,6,3
chr3	158362391	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.381:40:11,6:14,9:24,1,14,1
chr3	158362526	.	A	G	.	.	DP=109;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,40:0.384:105:26,18:38,22:23,42,15,25
chr3	158362588	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:5,9:14,8:0,19,0,18
chr3	158372477	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr3	158372502	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr3	158384068	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=84.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,26:0.519:50:15,12:9,14:23,1,24,2
chr3	158384920	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.350:38:12,4:13,9:1,24,0,13
chr3	158386737	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:9,12:9,9:18,0,20,1
chr3	158387487	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr3	158388721	.	C	CAAAGAAA	.	.	DP=184;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAGAAA;STR;TLOD=273.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,73:0.464:157:34,18:49,34:52,32,44,29
chr3	158399757	.	A	AT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:13,7:9,8:21,1,15,0
chr3	158407930	.	CTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34,32;MFRL=158,161,190;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.08,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,4:0.148,0.258:16:5,2,1:5,0,3:9,1,6,0
chr3	158409093	.	C	CA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.498:40:9,12:11,8:19,1,13,7
chr3	158409262	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:6,10:11,11:5,12,1,20
chr3	158415840	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:5,5:11,9:1,15,2,12
chr3	158428809	.	A	AAGGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,249;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AGGC;STR;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr3	158449965	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	158450080	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	158522190	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:12,3:3,6:4,12,2,7
chr3	158524777	.	AT	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.099:58:25,2:25,3:51,2,5,0
chr3	158537415	.	CTTTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=T;STR;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,4:0,2:1,0,5,1
chr3	158537443	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,7,3
chr3	158539294	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,23:0,22:0,0,47,3
chr3	158539486	.	A	G	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=338.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,92:0.990:92:0,40:0,51:0,0,25,67
chr3	158539961	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=116.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,6,28
chr3	158545195	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	158787219	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=89,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:2,5:7,4:4,5,8,1
chr3	158991724	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,6:0,1:0,5,0,7
chr3	160000174	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.083:58:27,0:26,4:53,1,4,0
chr3	160083957	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:2,0:1,1:3,7,0,2
chr3	160130139	.	A	AT	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,4:0.057:85:38,4:41,0:64,17,4,0
chr3	160131236	.	CT	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.167:42:16,3:12,4:30,5,7,0
chr3	160134121	.	A	T	.	.	DP=121;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,6:0.062:110:51,4:51,2:48,56,0,6
chr3	160134208	.	G	GT	.	.	DP=97;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,11:0.182:58:13,1:16,4:10,37,0,11
chr3	160134241	.	CT	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.195:23:7,3:7,1:0,19,0,4
chr3	160137362	.	A	T	.	.	DP=120;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:110,4:0.041:114:49,2:49,2:37,73,2,2
chr3	160137363	.	CT	C,CTT	.	.	DP=119;ECNT=2;MBQ=33,33,26;MFRL=136,162,162;MMQ=60,60,60;MPOS=23,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.20,6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:64,6,8:0.068,0.095:78:34,1,5:24,4,1:12,52,7,7
chr3	160138723	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,139;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:5,2:7,2:1,13,0,4
chr3	160141147	.	G	GT,GTT	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=35,35,29;MFRL=162,157,208;MMQ=60,60,60;MPOS=18,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=6.08,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,5,3:0.123,0.082:45:20,4,2:17,0,1:36,1,8,0
chr3	160141166	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=17,19;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.115:51:9,0:7,1:44,2,5,0
chr3	160142810	.	ATG	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=TG;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:1,2:3,1:0,13,0,5
chr3	160144019	.	G	GA	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,7:0.113:69:17,2:36,1:6,56,1,6
chr3	160149360	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:8,2:6,1:14,0,3,0
chr3	160151385	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,94;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:18,3:23,0:40,3,3,0
chr3	160156367	.	C	CT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:14,3:13,1:16,13,2,2
chr3	160233406	.	CT	C,CTT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=167,168,194;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=10.04,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,7,3:0.262,0.134:26:7,1,3:6,6,0:0,16,2,8
chr3	160249220	.	TA	T,TAA	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=31,31,30;MFRL=146,145,123;MMQ=60,60,60;MPOS=17,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=20.69,4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:42,16,5:0.233,0.082:63:23,9,4:17,6,1:39,3,19,2
chr3	160249234	.	T	A	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,3:0.042:92:36,2:24,1:77,12,3,0
chr3	160249242	.	G	T	.	.	DP=109;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:102,5:0.039:107:41,0:33,1:78,24,5,0
chr3	160395089	.	GA	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:14,1:16,2:31,6,3,0
chr3	160395095	.	A	G,T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,30,27;MFRL=151,77,87;MMQ=60,60,60;MPOS=17,33;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.47,6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,5,4:0.118,0.101:46:10,5,4:27,0,0:32,5,8,1
chr3	160679744	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr3	160955879	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:1,0,8,0
chr3	160955882	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,32,29;MFRL=143,202,168;MMQ=60,60,60;MPOS=26,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=T;STR;TLOD=8.28,5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,4:0.309,0.252:16:2,1,3:2,4,1:6,1,9,0
chr3	160964271	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:4,4:4,1:0,9,0,5
chr3	160967354	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,28:0.439:64:16,14:20,14:9,27,7,21
chr3	161064193	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,6:4,3:0,9,0,9
chr3	161216860	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.540:26:3,5:8,9:12,0,14,0
chr3	161216912	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,14:0.360:40:12,7:12,7:16,10,11,3
chr3	163889384	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.443:25:6,3:7,7:2,12,3,8
chr3	164733721	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,8:0,4:1,0,8,4
chr3	164748663	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=114,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.185:35:13,0:8,1:16,13,0,6
chr3	164748665	.	C	CA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.794:20:1,3:2,4:2,2,3,13
chr3	164751319	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:1,2,0,7
chr3	164758630	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	164760771	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,3:5,5:6,0,7,1
chr3	164766816	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr3	164766835	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	164772957	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr3	164776913	.	C	CAT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=118.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,14:0,0,15,13
chr3	164777677	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr3	164777722	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,1:3,2:5,5,1,2
chr3	164781368	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=170.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,26:0,24:0,0,6,44
chr3	164785338	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	164786413	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr3	164786629	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr3	164787004	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=145,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.099:47:21,0:21,4:6,37,1,3
chr3	164908265	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=127,55;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr3	164908283	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:164908283_TG_CA:164908283:5,3,1,1
chr3	164908287	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:164908283_TG_CA:164908283:5,3,1,1
chr3	164908290	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:164908283_TG_CA:164908283:5,3,1,1
chr3	164908549	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:14,3:20,0:13,23,3,0
chr3	164908642	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:9,0:6,5:2,14,0,5
chr3	167000006	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:12,2:14,1:22,6,1,2
chr3	167006612	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,7:6,1:5,4,8,0
chr3	167045701	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	167068169	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,0:17,2:26,4,0,2
chr3	167078544	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=226.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,61:0.969:62:0,31:1,30:0,1,12,49
chr3	167167286	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=222,172;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:167167286_A_G:167167286:0,1,0,1
chr3	167167290	.	ATTTATTTT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=222,172;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:167167286_A_G:167167286:0,1,0,1
chr3	167170829	.	T	TA	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.101:66:30,4:26,2:1,59,0,6
chr3	167223281	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	167524941	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=214,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:9,1,5,0
chr3	167745703	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,1:2,3:0,5,0,5
chr3	167754573	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:2,6:8,4:9,2,7,3
chr3	167762678	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.492:18:4,2:4,5:0,9,3,6
chr3	168808094	.	T	TGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:168808094_T_TGAC:168808094:0,1,0,1
chr3	168808097	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168808094_T_TGAC:168808094:0,1,0,1
chr3	168810980	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	168818560	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	168819788	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr3	168833559	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=149,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:13,2:0|1:168833559_G_A:168833559:13,10,1,1
chr3	168833563	.	A	ATACTTTGGTTC	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=142,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,0:13,2:0|1:168833559_G_A:168833559:15,13,1,1
chr3	168833565	.	A	ACAGGAC	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:13,0:12,2:0|1:168833559_G_A:168833559:15,12,1,1
chr3	168840571	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,2,9
chr3	168840607	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.827:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr3	168861536	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:7,7,2,0
chr3	169381254	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.107:35:18,3:12,0:0|1:169381254_T_C:169381254:0,32,0,3
chr3	169381257	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:18,1:12,0:0|1:169381254_T_C:169381254:0,32,0,2
chr3	169486144	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,5:0,1,0,11
chr3	169487397	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,10;MFRL=191,205;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,0:0|1:169487397_A_C:169487397:0,6,0,2
chr3	169487399	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,0:1,1:0|1:169487397_A_C:169487397:0,6,0,3
chr3	169492016	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.610:16:3,3:3,6:6,0,9,1
chr3	169500487	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	169525523	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=163,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:0|1:169525523_A_C:169525523:0,8,0,2
chr3	169525525	.	A	ACCACACACAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=163,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:6,1:0|1:169525523_A_C:169525523:0,8,0,2
chr3	169539649	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=98.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,26,1
chr3	169550759	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=89.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,23,3
chr3	169566090	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr3	169654252	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,26:0.502:52:9,10:16,16:5,21,4,22
chr3	169684687	.	G	C	.	.	DP=124;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=198.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,76:0.614:123:25,32:22,39:15,32,23,53
chr3	169684706	.	G	C	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,6:0.098:70:16,0:18,1:13,51,0,6
chr3	169710363	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	169710807	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,2:0.046:62:32,1:28,1:22,38,0,2
chr3	169803231	.	GGAA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.542:11:2,3:3,2:0,5,0,6
chr3	169863241	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=126,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.059:70:30,2:35,1:37,29,3,1
chr3	169896634	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.078:61:21,2:36,2:37,20,3,1
chr3	169896684	.	C	T	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=129,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=157.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,58:0.621:93:24,22:11,34:16,19,22,36
chr3	169981327	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,179;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0|1:169981327_T_C:169981327:0,3,0,1
chr3	169981333	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=183,179;MMQ=60,36;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:169981327_T_C:169981327:0,2,0,1
chr3	169998240	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:7,1:3,2:2,10,0,4
chr3	170078232	.	C	T	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=285.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,88:0.989:88:0,43:0,42:0,0,36,52
chr3	170099218	.	ATTAT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTAT;STR;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr3	170108337	.	C	CGA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=167,157;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,1:3,1:0,12,0,2
chr3	170109112	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,1:8,2:0,16,0,3
chr3	170720299	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:1,0:2,0,5,0
chr3	170723135	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:15,2:16,0:16,15,1,1
chr3	170744452	.	TCTGTCATTGTACTAGTTGGGAGTC	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.055:53:21,2:18,0:14,37,2,0
chr3	170784061	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=109,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:16,3:8,0:18,7,2,1
chr3	170801912	.	TAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.316:7:4,1:0,1:3,2,1,1
chr3	170841568	.	A	ATGTGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=215,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	170846671	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=102,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.231:19:6,0:4,0:11,3,0,5
chr3	170846676	.	CA	C,CAA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=19,19,25;MFRL=151,141,107;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,19,21;RU=A;STR;TLOD=3.62,5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,5:0.407,0.330:14:1,2,3:0,1,0:1,2,1,10
chr3	170857167	.	GCA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=167,196;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=CA;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr3	170857171	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=167,196;MMQ=60,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr3	170857240	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.410:52:14,13:12,7:16,15,8,13
chr3	170879189	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,0,2
chr3	170885097	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,2:4,4:0,9,0,6
chr3	170912469	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,1:3,4:1,7,1,4
chr3	171087469	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,7,15
chr3	171406653	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,0:14,2:14,14,0,2
chr3	171455451	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:4,2:8,3:0,13,0,5
chr3	172003764	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:13,9,1,1
chr3	172046695	.	G	GTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,6:2,4:6,0,10,0
chr3	172046933	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.501:24:7,9:5,3:1,11,1,11
chr3	172059121	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,3:3,2:0,4,0,6
chr3	172224769	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:172224769_GC_G:172224769:0,0,0,2
chr3	172224771	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:172224769_GC_G:172224769:0,0,0,2
chr3	172227199	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr3	172351917	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:1,3,0,3
chr3	172365619	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:4,4:1,1:3,3,5,1
chr3	172480173	.	A	ATT	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,25:0.464:54:15,10:12,15:0|1:172480173_A_ATT:172480173:22,7,15,10
chr3	172480174	.	AC	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,25:0.464:54:16,10:13,15:0|1:172480173_A_ATT:172480173:22,7,15,10
chr3	172520818	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr3	172534428	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:12,3:7,8:17,2,10,1
chr3	172537850	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:10,0,6,0
chr3	172634025	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:172634025_T_TTG:172634025:0,0,2,0
chr3	172634039	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:172634025_T_TTG:172634025:0,0,2,0
chr3	172634054	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:172634025_T_TTG:172634025:1,0,1,0
chr3	172634206	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,2:13,0:0|1:172634206_C_T:172634206:5,16,1,1
chr3	172634208	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:172634206_C_T:172634206:5,16,1,1
chr3	174815037	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,1:10,3:9,19,1,3
chr3	175165201	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	175189406	.	CT	C	.	.	DP=96;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=245.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,31:0,44:0,0,59,18
chr3	175189417	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,33:0.370:89:28,10:28,21:37,19,28,5
chr3	175189447	.	G	A	.	.	DP=116;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,39:0.377:104:31,14:33,25:37,28,23,16
chr3	175521082	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=215,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	176765253	.	G	A	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=430.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,115:0.992:115:0,52:0,58:0|1:176765253_G_A:176765253:0,0,83,32
chr3	176765269	.	T	C	.	.	DP=133;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,56:0.440:128:30,36:40,20:0|1:176765253_G_A:176765253:51,21,39,17
chr3	176769608	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,5:7,2:0,13,0,7
chr3	178545952	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=123,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:6,11:4,4:4,6,9,6
chr3	178785549	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=137.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,24:0,18:0,0,14,28
chr3	178917005	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr3	178919397	.	A	ATTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,14;MFRL=170,199;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.552:5:0,0:0,0:0,2,0,3
chr3	178921253	.	G	GTAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr3	178921564	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0,8,0,2
chr3	178922222	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,3:4,7:6,0,10,0
chr3	178922274	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=74.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.549:49:8,12:14,15:20,2,19,8
chr3	178922430	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:6,8:11,7:0,17,0,15
chr3	178935943	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,170;MMQ=43,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:7,11:5,6:12,0,17,0
chr3	178936082	.	G	A	.	.	DP=196;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,137;MMQ=54,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:151,34:0.184:185:67,17:79,16:82,69,18,16
chr3	178938747	.	A	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,144;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=104.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,38:0.534:71:15,17:17,21:27,6,36,2
chr3	178942431	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=62.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:1,10:7,7:6,2,18,0
chr3	178960607	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=190,167;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.597:20:3,7:4,4:8,0,12,0
chr3	178960766	.	CT	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,145;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=67.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.549:46:12,13:8,12:9,12,5,20
chr3	178962491	.	G	GA	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=23,19;MFRL=147,142;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.310:32:3,2:9,2:3,19,3,7
chr3	178962517	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=129,146;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:5,3:11,4:0,16,1,6
chr3	178984575	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	179083024	.	AT	A	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,9:0.127:60:21,5:22,4:9,42,5,4
chr3	179083079	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:5,9:5,7:0,10,0,16
chr3	179085716	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=185,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.530:30:6,8:8,8:14,0,16,0
chr3	179085722	.	G	GTA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=147,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.655:24:3,7:5,8:8,0,16,0
chr3	179085775	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=98.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,36:0.483:75:20,23:15,12:28,11,27,9
chr3	179092989	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:6,8:11,8:14,4,14,3
chr3	179096508	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,154;MMQ=36,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.956:42:1,21:0,19:1,0,32,9
chr3	179103342	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=207,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,4:1,1:3,0,5,1
chr3	179109735	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:6,3:9,10:14,1,13,0
chr3	179119177	.	T	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,6:0.111:61:30,0:23,6:0,55,0,6
chr3	179122918	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=206,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr3	179291308	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.492:26:5,8:7,5:2,11,0,13
chr3	179298584	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,2:8,2:11,5,1,3
chr3	179301051	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,2:5,6:8,0,8,0
chr3	179305654	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=62,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,5,0
chr3	179399570	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr3	179448066	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.948:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr3	179448383	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:2,1:5,4:3,4,4,1
chr3	179463057	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.484:2:0,0:1,0:0|1:179463057_T_G:179463057:1,0,0,1
chr3	179463063	.	C	CCTGGATTGGGTGGCAGCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179463057_T_G:179463057:1,0,0,1
chr3	179481738	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:1,1:2,2:5,0,3,0
chr3	179481971	.	CTG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=TG;STR;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.858:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr3	179482030	.	T	TCTTAATGAATGTGGGGTGCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,89601616;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr3	180319981	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr3	180320897	.	ATT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,0:8,2:12,6,1,1
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chr3	180360046	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr3	180365043	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.898:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr3	180630565	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,31:0.543:57:17,14:9,17:8,18,8,23
chr3	180693215	.	GT	G,GTT,GTTT	.	.	DP=195;ECNT=1;MBQ=33,33,33,33;MFRL=134,129,136,106;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,18,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=26.12,30.69,9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:58,27,26,12:0.181,0.241,0.098:123:29,18,11,5:26,8,14,7:20,38,24,41
chr3	181431226	.	GA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:10,4:12,1:17,9,2,3
chr3	182546017	.	C	A	.	.	DP=138;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=176.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,64:0.502:127:25,35:38,27:12,51,8,56
chr3	182559786	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=123,185;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:3,3:8,4:3,8,6,1
chr3	182559795	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=125,192;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:8,0:0|1:182559795_GT_G:182559795:5,13,2,0
chr3	182559798	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=125,192;MMQ=60,40;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,0:0|1:182559795_GT_G:182559795:5,13,2,0
chr3	182575631	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:12,4:7,8:15,5,10,2
chr3	182576923	.	T	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,40:0.507:79:15,19:24,21:27,12,33,7
chr3	182583990	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,7:5,7:9,0,14,0
chr3	182587126	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,5:4,3:0,7,0,8
chr3	182590096	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=163,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:17,0,2,0
chr3	182590354	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.442:50:14,12:14,10:1,27,2,20
chr3	182598863	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.604:31:6,7:6,11:0,12,0,19
chr3	182603666	.	A	AT	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=60.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,28:0.534:52:11,14:13,13:24,0,28,0
chr3	182603693	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=86.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,31:0.498:62:15,17:16,13:30,1,29,2
chr3	182631792	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.360:34:9,8:13,4:7,15,2,10
chr3	182665109	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,2:15,0:7,18,0,2
chr3	182735182	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr3	182804385	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
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chr3	182853414	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=166,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
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chr3	182858287	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=88.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,14:0,0,15,14
chr3	182858461	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr3	182870082	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr3	182913092	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.663:33:4,9:6,13:0,11,0,22
chr3	182946002	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr3	182987515	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr3	183013137	.	C	G	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=139,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,5:0.065:88:49,0:34,5:44,39,3,2
chr3	183368891	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.480:42:6,11:15,9:7,15,10,10
chr3	183493624	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:9,1:2,1:11,0,2,0
chr3	183493743	.	CGGA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=97,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GGA;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:5,0:3,2:4,5,0,2
chr3	183493991	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	183516808	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,66038149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:4,13,0,2
chr3	183521942	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:21,4:13,2:10,24,1,5
chr3	183526969	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:10,2:7,5:2,15,3,4
chr3	183535763	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=123,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:6,4:1,5:7,1,9,0
chr3	183558497	.	CT	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.225:22:5,3:6,1:0,17,0,5
chr3	183665062	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:4,1,6,0
chr3	183677501	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:12,8:10,6:19,3,10,4
chr3	183679392	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:12,4:7,0:9,10,2,2
chr3	183679532	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	183682897	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,6:3,0:5,0,6,0
chr3	183689339	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr3	183689610	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.540:46:11,14:10,10:5,16,12,13
chr3	183750942	.	C	CTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=174,139;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr3	183756426	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=138,144;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.284:37:13,6:12,4:14,13,3,7
chr3	183756780	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.347:18:8,4:4,2:1,11,3,3
chr3	183773250	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr3	183776469	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=215,269;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	183822504	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=A;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.822:3:0,0:0,3:0|1:183822504_CA_C:183822504:0,0,3,0
chr3	183822528	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,13;MFRL=130,137;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.489:6:0,0:1,0:0|1:183822504_CA_C:183822504:1,2,3,0
chr3	183822533	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,13;MFRL=136,137;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.432:7:1,0:2,0:0|1:183822504_CA_C:183822504:2,2,3,0
chr3	183822535	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=145,137;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.350:9:2,0:2,0:0|1:183822504_CA_C:183822504:4,2,3,0
chr3	183822539	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=143,137;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.319:10:4,0:3,1:0|1:183822504_CA_C:183822504:4,3,3,0
chr3	183857820	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:6,0:6,3,3,0
chr3	183882461	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=162,337;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:0|1:183882461_T_TG:183882461:6,12,0,2
chr3	183882462	.	T	TACC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=162,337;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:0|1:183882461_T_TG:183882461:6,12,0,2
chr3	183896641	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=91.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,16,10
chr3	183900095	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:7,0:0,12,0,3
chr3	183900680	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=119.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,25:0,8:0,0,8,27
chr3	183900729	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr3	183903935	.	C	CG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	183904232	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr3	183905103	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr3	183906448	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,37;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	183906515	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr3	183907792	.	TG	CC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=208,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	183957112	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	183958945	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:10,3:11,10,3,0
chr3	183994449	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:1,7,1,1
chr3	183995854	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,2,3
chr3	183996213	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,2,1
chr3	184010048	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:7,7:7,5:4,10,2,10
chr3	184020100	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,1:5,6:11,0,7,0
chr3	184022272	.	GCA	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:184022272_GCA_G:184022272:0,5,0,2
chr3	184022280	.	G	GTGTGTGTAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:184022272_GCA_G:184022272:0,4,0,2
chr3	184022282	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:184022272_GCA_G:184022272:0,4,0,2
chr3	184022285	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,2:0|1:184022272_GCA_G:184022272:0,4,0,2
chr3	184026703	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr3	184038874	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:4,5:11,5:0,15,0,10
chr3	184040128	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,21:0.423:50:17,14:12,6:29,0,19,2
chr3	184046355	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr3	184060122	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,234;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184060122_G_C:184060122:0,0,0,1
chr3	184060127	.	AC	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184060122_G_C:184060122:0,0,0,1
chr3	184062644	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=129,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:3,0:3,1:0|1:184062644_G_A:184062644:4,2,1,1
chr3	184062647	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=129,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:3,0:2,1:0|1:184062644_G_A:184062644:4,2,1,1
chr3	184070675	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=250,82;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr3	184071017	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,18:0.613:29:6,9:3,8:0|1:184071017_G_A:184071017:7,4,8,10
chr3	184071019	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,18:0.613:29:7,10:4,8:0|1:184071017_G_A:184071017:7,4,8,10
chr3	184072459	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,4:1,4:0,1,3,6
chr3	184075958	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,2:4,5:7,4,7,0
chr3	184090266	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.476:40:12,10:9,9:21,0,16,3
chr3	184090609	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.083:58:22,3:30,1:18,36,1,3
chr3	184091149	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=77,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,3:5,1:4,1,3,1
chr3	184094183	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	184100961	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	184280169	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.748:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	184293564	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:2,1:1,2:3,0,4,0
chr3	184295008	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr3	184295316	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.760:22:1,9:3,7:0,5,3,14
chr3	184295828	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=110,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr3	184299308	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:9,7:0,6:6,3,10,3
chr3	184429133	.	A	ATCC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TCC;STR;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,4:0,2:0,0,10,1
chr3	184587434	.	A	AAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr3	184616504	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,1,17
chr3	184642587	.	A	ATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,1:1,0,5,0
chr3	184654166	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,1,12
chr3	184658058	.	T	TTA,TTATA,TTATATA	.	.	DP=131;ECNT=1;MBQ=34,33,31,23;MFRL=0,138,154,112;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,21,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,10,11,12;RU=TA;STR;TLOD=29.60,155.67,14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,13,51,9:0.165,0.688,0.126:74:0,6,16,1:1,5,23,5:0,1,5,68
chr3	184675359	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=121.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,13:0,20:0,0,1,33
chr3	184682214	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr3	184700356	.	A	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=216.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,29:0,34:0,0,35,29
chr3	184717703	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	185155430	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.717:13:1,3:3,5:1,3,1,8
chr3	185167941	.	A	AAAGTTTGTTGCAAAGTGTTTATAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	185169030	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,6:1,1:2,0,7,0
chr3	185212593	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr3	185226492	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr3	185232169	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=121,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:4,1,7,0
chr3	185307879	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=202.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,31:0,29:0,0,53,9
chr3	185308069	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr3	185316123	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.489:18:5,3:4,4:8,1,9,0
chr3	185327217	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:185327217_G_T:185327217:0,4,0,1
chr3	185327218	.	C	CCAATTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:185327217_G_T:185327217:0,4,0,1
chr3	185330304	.	TTGA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,24,0
chr3	185339575	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,4,1
chr3	185341970	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	185347459	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	185393286	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=197,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:9,0:2,3:1,10,0,3
chr3	185541057	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.136:38:9,0:8,0:8,24,0,6
chr3	185635634	.	AC	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:8,2:7,1:0,18,0,3
chr3	185766711	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr3	185879296	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	185960414	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=89,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.503:10:2,2:3,3:2,3,0,5
chr3	186015283	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:6,5,0,2
chr3	186015303	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:3,4,0,2
chr3	186276393	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:8,4:6,3:0,14,0,7
chr3	186288814	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,0:0,1:0|1:186288814_G_GA:186288814:0,0,0,1
chr3	186288818	.	G	GAACATCACATACCGGGGCCTTTCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:186288814_G_GA:186288814:0,0,0,1
chr3	186295417	.	A	AT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.458:28:3,7:5,2:15,0,11,2
chr3	186302391	.	A	AGTGTGTGTGTGT,ATTGTGTGTGTGT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,31,30;MFRL=199,175,106;MMQ=60,40,60;MPOS=18,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.33,12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,12:0.340,0.488:16:0,1,3:1,2,4:0,1,4,11
chr3	186302458	.	ATAGAAGAACTCTC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186302458_ATAGAAGAACTCTC_A:186302458:0,1,0,1
chr3	186302477	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186302458_ATAGAAGAACTCTC_A:186302458:0,1,0,1
chr3	186338692	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:6,9,0,2
chr3	186358768	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=161,14701770;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:11,1,2,0
chr3	186360409	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:4,1:2,3:1,6,0,4
chr3	186386664	.	T	TA,TAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33,23;MFRL=0,171,144;MMQ=60,60,60;MPOS=18,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=A;STR;TLOD=10.12,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.595,0.305:7:0,3,0:0,2,1:0,0,7,0
chr3	186393073	.	GGTGTGTGTGTGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=13,35;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,6;RU=GT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.535:2:0,1:0,0:0,1,1,0
chr3	186435583	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr3	186435591	.	T	TCA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=136,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CA;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0,4,1,1
chr3	186435608	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=181,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr3	186438037	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,5:2,9:2,3,5,9
chr3	186442940	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:12,3,1,1
chr3	186445186	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr3	186501502	.	C	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,32:0.465:69:17,9:20,23:5,32,3,29
chr3	186504148	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,4:2,5:1,8,3,6
chr3	186507117	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:13,1:15,1:0,29,0,2
chr3	186507922	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,36:0.587:61:17,24:7,12:10,15,19,17
chr3	186508247	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:9,3:2,5:0,11,0,8
chr3	186509517	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.426:40:12,9:11,7:12,11,9,8
chr3	186515356	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:12,9:10,8:11,11,9,8
chr3	186518806	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:1,1:3,4:4,0,6,0
chr3	186522293	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:8,1:4,4:12,0,5,0
chr3	186571123	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,7:0,0,0,20
chr3	186793647	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,1:1,4,1,4
chr3	186938956	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,4:0,0,2,16
chr3	186961478	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	186965268	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,1:9,3:0,13,0,4
chr3	186967942	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr3	186969624	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=124,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.386:4:2,0:0,1:0|1:186969624_A_C:186969624:0,3,0,1
chr3	186969631	.	T	TGCAGAGCCTTGCCTGGGAAAGGGGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:1,0:0,1:0|1:186969624_A_C:186969624:0,2,0,1
chr3	186980285	.	GGA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GA;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:15,3:13,1:23,8,4,0
chr3	187088903	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:5,6:11,12:3,13,6,12
chr3	187088923	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.386:29:6,2:11,9:7,11,3,8
chr3	187088926	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,9:0,19:0,0,9,19
chr3	187387896	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.401:21:5,3:7,4:7,6,6,2
chr3	187416253	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:3,1,4,1
chr3	187419661	.	G	GCCTGCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,2:0,0,3,1
chr3	187442662	.	G	GCTCCACCTCCTTCCCTGCC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=259,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTCCACCTCCTTCCCTGCC;STR;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.772:10:1,3:1,1:2,0,6,2
chr3	188123819	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr3	188202550	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,0,8
chr3	188202582	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,0,4
chr3	188327612	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,2:7,0:0|1:188327612_G_T:188327612:0,11,1,1
chr3	188327628	.	C	CATTAAATCATAACTGTTATTGCCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=175,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:0|1:188327612_G_T:188327612:0,12,1,1
chr3	188477999	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:17,4:19,0:20,16,3,1
chr3	188590358	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr3	189028117	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:4,3:2,3:6,0,6,1
chr3	189349247	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,5:4,6:8,0,10,1
chr3	189507518	.	C	CAGAG	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.465:39:12,6:9,10:21,0,17,1
chr3	189547652	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:5,7:4,7:9,0,13,1
chr3	189547697	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.404:40:10,7:13,8:14,10,11,5
chr3	189590824	.	GG	CA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=141.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,22:0,11:0,0,2,31
chr3	189604149	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr3	189604160	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,8,4
chr3	189607152	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.251:42:21,7:10,3:17,15,6,4
chr3	189688569	.	C	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=244.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,30:0,41:0,0,53,18
chr3	189690816	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=85,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.790:12:0,2:1,2:1,1,2,8
chr3	189690861	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,2,5
chr3	189692565	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	189702395	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.941:13:0,3:0,8:0,0,3,10
chr3	189705542	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr3	189706661	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:8,5:10,6:15,3,10,1
chr3	189712089	.	GG	AA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,4,10
chr3	189712094	.	A	AAAAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAAC;STR;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.897:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	189837993	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:5,1,3,0
chr3	190147561	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,121;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:9,0:7,2:0,16,0,2
chr3	190282197	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr3	190322271	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.660:10:2,3:1,4:0|1:190322271_T_C:190322271:0,3,0,7
chr3	190322277	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0|1:190322271_T_C:190322271:0,2,0,7
chr3	190338039	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr3	190341241	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr3	190341292	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	190345043	.	TTTTTG	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTTG;STR;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.921:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	190345098	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,7:0,12:0,0,10,9
chr3	190347391	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,11:0,0,1,14
chr3	190578743	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	190936482	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,4,0
chr3	190967718	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr3	190986110	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.476:36:10,7:8,10:17,2,16,1
chr3	190995847	.	T	C	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=172.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,54:0.550:98:20,29:24,25:39,5,45,9
chr3	190999790	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:3,3:4,7:7,1,10,0
chr3	190999872	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,22:0.362:61:20,11:19,10:27,12,16,6
chr3	190999990	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.370:36:11,8:11,5:5,18,3,10
chr3	191074783	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr3	191074796	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=141,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.296:12:3,2:5,1:8,1,3,0
chr3	191075012	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,2,11
chr3	191093384	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:0,9:1,12:1,0,4,17
chr3	191093434	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=125,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,4:1,8:0,1,1,12
chr3	191093475	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=283,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:0,5:0,1,1,6
chr3	191097908	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=240,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=146.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,42:0.956:43:1,26:0,16:1,0,41,1
chr3	191097928	.	GT	G,GTT,GTTT	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=33,29,34,30;MFRL=170,141,125,167;MMQ=60,60,60,60;MPOS=11,21,5;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,14,16,17;RU=T;STR;TLOD=4.85,21.32,3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:21,7,14,5:0.125,0.336,0.106:47:9,5,11,2:11,1,3,2:20,1,21,5
chr3	191097966	.	T	C	.	.	DP=103;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=248.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,98:0.980:99:1,44:0,38:0,1,64,34
chr3	191098121	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=177.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,22:0,27:0,0,2,47
chr3	191098731	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=257.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,34:0,43:0,0,11,67
chr3	191100448	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,19:0,9:0,0,28,0
chr3	191178925	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=123,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:6,1,1,4
chr3	191178962	.	CT	AG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:6,6:6,7:9,3,10,3
chr3	191179296	.	GGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=208,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0|1:191179296_GGT_G:191179296:0,3,0,1
chr3	191179302	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=208,163;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:191179296_GGT_G:191179296:0,3,0,1
chr3	191888452	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=128,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.435:5:0,0:1,0:0,3,0,2
chr3	192635348	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr3	192994543	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=225.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,30:0,30:0,0,40,24
chr3	193016895	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=127.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,31,6
chr3	193023255	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr3	193028548	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=34,20;MFRL=118,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0|1:193028548_G_C:193028548:0,5,1,1
chr3	193028554	.	T	TCC	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:193028548_G_C:193028548:0,4,1,1
chr3	193028556	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=108,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:193028548_G_C:193028548:0,3,1,1
chr3	193028562	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=66,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1|0:193028548_G_C:193028548:0,3,0,1
chr3	193028563	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=108,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:193028548_G_C:193028548:0,3,0,1
chr3	193028564	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=66,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1|0:193028548_G_C:193028548:0,3,0,1
chr3	193028568	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,31;MFRL=77,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:193028548_G_C:193028548:0,2,0,1
chr3	193029535	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=181,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	193044923	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=86.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,1,22
chr3	193062906	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,2,15
chr3	193068800	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,5:3,6:7,0,10,1
chr3	193071888	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.690:7:1,3:1,1:2,0,4,1
chr3	193081206	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=142,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,4:3,0:1,4,2,2
chr3	193081235	.	A	AGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=168,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:193081235_A_AGT:193081235:0,4,0,1
chr3	193081237	.	ATAC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=168,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:193081235_A_AGT:193081235:0,4,0,1
chr3	193081830	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr3	193081864	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:7,5:6,6:13,0,11,0
chr3	193081866	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:5,6:6,6:11,0,13,0
chr3	193120359	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	193120726	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	193153562	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,2,9
chr3	193180510	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:7,3,4,0
chr3	193180661	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0,7,0,2
chr3	193180732	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr3	193188579	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:12,0,2,0
chr3	193210596	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:4,1:4,4:8,0,6,0
chr3	193220219	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:6,1,3,1
chr3	193272442	.	CGTGTGTGT	C,CGTGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=125,156,170;MMQ=60,60,60;MPOS=26,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,15;RU=GT;STR;TLOD=6.65,6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.396,0.391:5:0,2,0:0,0,2:1,0,3,1
chr3	193332420	.	C	CTGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TG;STR;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr3	193336639	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:6,6:6,6:11,2,9,3
chr3	193355074	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=270.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,84:0.977:85:0,48:1,36:0,1,27,57
chr3	193355102	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,25:0.491:51:14,15:12,10:4,22,5,20
chr3	193365057	.	C	CTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	193365974	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:5,6:4,3:1,9,0,9
chr3	193384203	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:12,2:5,8:2,15,1,9
chr3	193385275	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=198,240;MMQ=50,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:193385275_CA_TG:193385275:0,2,0,2
chr3	193385286	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=198,272;MMQ=50,47;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:193385275_CA_TG:193385275:0,2,0,1
chr3	193385289	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=198,272;MMQ=50,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:193385275_CA_TG:193385275:0,2,0,1
chr3	193386462	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=231,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr3	193854148	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=30,30,31,28;MFRL=129,147,118,118;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,19,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=15.87,23.12,6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:30,13,23,15:0.135,0.251,0.166:81:9,5,6,8:15,4,10,4:23,7,33,18
chr3	194080648	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,5:6,6:5,2,7,4
chr3	194080983	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,33:0.533:62:13,15:15,18:15,14,22,11
chr3	194149700	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,20:0.396:51:19,12:12,8:1,30,0,20
chr3	194165579	.	T	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,3:0.058:63:30,0:26,2:0|1:194165579_T_A:194165579:4,56,1,2
chr3	194165585	.	T	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:24,0:27,1:0|1:194165579_T_A:194165579:4,52,0,2
chr3	194168500	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,5:5,8:9,0,13,0
chr3	194168811	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=201,182;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:2,2:0,6,0,2
chr3	194176712	.	C	A	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,35:0.474:74:23,19:16,15:7,32,5,30
chr3	194180743	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:2,1:7,5:1,9,0,6
chr3	194324939	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=158,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,3:7,3:15,2,6,0
chr3	194324982	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.366:47:14,6:13,10:21,9,12,5
chr3	194325006	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,30:0.563:53:11,16:10,14:14,9,16,14
chr3	194325010	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,24:0.436:55:17,12:12,11:16,15,14,10
chr3	194346544	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:194346544_T_A:194346544:0,0,4,0
chr3	194346553	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0|1:194346544_T_A:194346544:0,0,7,0
chr3	194346803	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,0,14
chr3	194346822	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr3	194349027	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,15,0
chr3	194353772	.	C	CCCGCCCGACAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGCCCGACAG;STR;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,7:0,0,15,0
chr3	194354032	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	194362721	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	194369579	.	CC	AA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,7:4,2:0,6,1,8
chr3	194373832	.	TG	CA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=197.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,22:0,22:0,0,15,30
chr3	194379596	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,23,2
chr3	194379646	.	T	TC	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=139.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,48:0.961:49:1,23:0,24:1,0,33,15
chr3	194379903	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,0:14,2:3,22,1,1
chr3	194379905	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=61,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=59.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.882:23:0,9:2,12:1,1,0,21
chr3	194379959	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr3	194386881	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,12:0,0,20,2
chr3	194390713	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=90.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0,0,21,6
chr3	194390869	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,6:0,0,7,7
chr3	194408704	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=204,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr3	194409257	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.304:16:3,3:5,2:5,6,3,2
chr3	194999996	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,24,0
chr3	195012343	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:19,0,2,0
chr3	195022428	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,3,20
chr3	195022931	.	TA	T,TAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=145,168,174;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=5.18,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,4,5:0.112,0.139:37:14,3,2:13,1,3:0,28,1,8
chr3	195053916	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,2:0,8:0,0,0,11
chr3	195063453	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	195102610	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=149,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.055:53:32,1:14,0:46,5,0,2
chr3	195102787	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=127.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,21:0,12:0,0,1,34
chr3	195245805	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=131.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,46:0.427:108:31,25:30,21:38,24,32,14
chr3	195295708	.	G	GGGGGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=101,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGT;STR;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.917:14:0,4:1,7:1,0,13,0
chr3	195300676	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:4,2,8,0
chr3	195447805	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,149;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,2:6,4:13,1,6,0
chr3	195451880	.	AG	GA	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=131,136;MMQ=27,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=164.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,42:0.599:70:12,20:12,21:19,9,27,15
chr3	195452908	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,155;MMQ=49,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:20,5:15,1:21,14,5,1
chr3	195453017	.	GC	G	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=72.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,29:0.410:71:21,21:20,8:13,29,11,18
chr3	195453064	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,32:0.577:55:6,22:16,8:11,12,8,24
chr3	195475989	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=226,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr3	195478169	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.297:18:3,0:5,1:4,9,0,5
chr3	195487810	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:15,1:9,1:17,7,0,2
chr3	195490284	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=207,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr3	195492027	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,3,9
chr3	195506753	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,10:0,17:0,0,7,20
chr3	195508348	.	G	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=126,154;MMQ=52,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.072:63:23,0:33,2:27,31,3,2
chr3	195508747	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,265;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:195508747_AC_A:195508747:0,0,0,1
chr3	195508751	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,265;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:195508747_AC_A:195508747:0,0,0,1
chr3	195508754	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,265;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:195508747_AC_A:195508747:0,0,0,1
chr3	195510060	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=107,162;MMQ=48,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,5:0.088:66:25,1:34,4:25,36,1,4
chr3	195510217	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,40;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	195510700	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=95,84;MMQ=30,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:5,3:12,0:12,5,2,1
chr3	195510749	.	C	CGGAAGTGTCGGTGACATGAAGAGGGGTGGCATGACCTGTGGATACTGA	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=149,128;MMQ=47,38;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:0,7:1,10:1,0,32,6
chr3	195510984	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=113,54;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.086:36:8,2:22,0:0|1:195510984_T_G:195510984:12,21,1,2
chr3	195510986	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=113,54;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.086:36:9,3:24,0:0|1:195510984_T_G:195510984:12,21,1,2
chr3	195512447	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,4:0.086:56:23,2:22,2:0|1:195512447_G_A:195512447:27,25,1,3
chr3	195512476	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=111,138;MMQ=52,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.102:42:18,2:14,1:0|1:195512447_G_A:195512447:21,17,2,2
chr3	195512930	.	G	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,9:0.120:80:37,3:32,5:33,38,5,4
chr3	195513868	.	G	GTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=215,202;MMQ=21,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:195513868_G_GTGT:195513868:0,1,0,1
chr3	195513869	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=215,202;MMQ=21,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:195513868_G_GTGT:195513868:0,1,0,1
chr3	195513872	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=215,202;MMQ=21,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:195513868_G_GTGT:195513868:0,1,0,1
chr3	195515452	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=89,0;MMQ=56,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:14,5:34,0:30,21,3,2
chr3	195515566	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,5:0.093:62:21,2:32,3:0|1:195515566_G_A:195515566:33,24,4,1
chr3	195515572	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,5:0.090:65:23,2:33,3:0|1:195515566_G_A:195515566:37,23,4,1
chr3	195515582	.	G	T	.	.	DP=74;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,6:0.095:71:26,2:33,4:0|1:195515566_G_A:195515566:38,27,5,1
chr3	195515594	.	C	G	.	.	DP=77;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,42:0.562:75:17,18:16,22:17,16,26,16
chr3	195515617	.	G	C	.	.	DP=87;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=119,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,35:0.409:85:24,16:25,16:17,33,17,18
chr3	195516442	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.126:50:23,5:19,0:24,20,5,1
chr3	195517105	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=157,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:14,0:13,2:0|1:195517105_G_C:195517105:10,18,1,1
chr3	195517107	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=157,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:13,0:13,2:0|1:195517105_G_C:195517105:10,18,1,1
chr3	195517518	.	TG	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,7:0.143:54:25,2:18,5:0|1:195517518_TG_T:195517518:17,30,4,3
chr3	195517521	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,7:0.143:54:25,2:20,5:0|1:195517518_TG_T:195517518:17,30,4,3
chr3	195518036	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:9,5:12,9:15,6,8,6
chr3	195594151	.	CCT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:5,4:6,6:3,8,1,9
chr3	195596501	.	T	TAG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AG;STR;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,4:0,6:0,0,1,10
chr3	195596534	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=126,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr3	195596907	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,19,1
chr3	195599085	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,11:0,0,22,3
chr3	195779155	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:0,5:2,1:0,2,0,6
chr3	195780239	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=164,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:6,2:5,0:11,3,2,0
chr3	195782176	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:8,3:3,2:0|1:195782176_CA_TG:195782176:5,8,0,6
chr3	195782184	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:6,2:5,4:0|1:195782176_CA_TG:195782176:3,8,0,6
chr3	195789376	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=199,168;MMQ=44,41;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:4,5:10,7:14,0,12,0
chr3	195789383	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=173,210;MMQ=44,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:8,1:16,1:24,1,2,0
chr3	195789394	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=164,212;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:12,2:21,0:29,5,2,0
chr3	195789414	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.420:48:13,10:15,10:14,14,14,6
chr3	195789428	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=185.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,21:0,32:0,0,29,25
chr3	195789708	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,6:6,5:5,4,5,6
chr3	195798258	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,8:0,0,22,4
chr3	195800999	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:24,0:25,3:14,35,3,0
chr3	195804021	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,29:0.461:63:17,15:17,14:5,29,7,22
chr3	195925103	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr3	195935207	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=165,47;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:2,1,5,0
chr3	195936446	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=189,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:2,2:0,5,0,2
chr3	195937678	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	195943482	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.813:3:0,2:0,1:0|1:195943482_A_C:195943482:0,0,3,0
chr3	195943486	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:0,0,2,0
chr3	195943491	.	CAGG	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:1,0,2,0
chr3	195943495	.	CAAG	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:1,0,2,0
chr3	195943501	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:1,0,2,0
chr3	195943504	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,21;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:1,0,2,0
chr3	195943511	.	CGG	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,12;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,0:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:1,0,1,0
chr3	195968818	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,1:9,1:11,10,1,1
chr3	195975284	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=285,233;MMQ=41,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	195984835	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	196051403	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:7,6:6,6:0,13,1,11
chr3	196054488	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:0,9,1,4
chr3	196096451	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	196118621	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,5:6,0,7,0
chr3	196159274	.	ACCG	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCG;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.058:48:22,2:19,0:6,40,1,1
chr3	196210590	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:6,3:3,2:9,1,5,0
chr3	196210808	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,6:4,3:0,5,1,8
chr3	196215451	.	CA	C,CAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=149,162,117;MMQ=60,60,60;MPOS=14,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=51.04,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,24,3:0.519,0.085:44:11,12,2:6,11,1:15,2,19,8
chr3	196215660	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:2,2:5,4:0,7,1,6
chr3	196229845	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:23,3:19,0:26,16,1,2
chr3	196434364	.	AGTCTG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=249,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr3	196435331	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:3,4:7,1,8,0
chr3	196443803	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:12,4:10,10:10,12,5,9
chr3	196443826	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:7,1:6,5:4,9,2,5
chr3	196532148	.	CT	C,CTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=155,126,151;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.74,5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,4:0.173,0.200:22:10,1,2:2,3,2:13,1,8,0
chr3	196533587	.	TG	CA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:22,0:22,2:11,36,0,2
chr3	196554020	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=184.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,33:0,21:0,0,48,6
chr3	196627335	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=167,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:6,4:1,3:2,6,1,7
chr3	196627361	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=129,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,4:0,0:1,4,0,4
chr3	196657670	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=70.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.959:28:0,8:1,18:1,0,19,8
chr3	196666059	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr3	196674259	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,2,1
chr3	196674916	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=139,193;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:1,2:8,2:5,4,2,2
chr3	196674919	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:4,6,2,0
chr3	196674972	.	CT	TC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,7:0,0,4,5
chr3	196675589	.	AGC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:196675589_AGC_A:196675589:0,0,0,1
chr3	196675593	.	C	CTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:196675589_AGC_A:196675589:0,0,0,1
chr3	196746421	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,1:11,0:0|1:196746421_C_G:196746421:17,0,2,0
chr3	196746427	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,2:12,0:0|1:196746421_C_G:196746421:20,1,2,0
chr3	196746433	.	AC	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:7,2:8,0:17,3,2,0
chr3	196749798	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,17,3
chr3	196750016	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	196754819	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=206,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	196778438	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:4,5:6,8:9,1,11,2
chr3	196793466	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=194,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,4:9,4:14,0,8,0
chr3	196817911	.	AAG	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=93.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,25:0.554:45:9,14:9,11:1,19,2,23
chr3	196846437	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:4,7:7,10:1,10,2,15
chr3	196869518	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,3:3,7:8,0,9,1
chr3	196869688	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,10:0,16:0,0,4,22
chr3	196876600	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=81.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,30:0.463:65:11,18:24,12:20,15,17,13
chr3	197023445	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr3	197402226	.	G	GAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=181,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:197402226_G_GAGT:197402226:1,0,0,1
chr3	197402229	.	G	GGCTGAAGGCAGGATTGCTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=181,260;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:197402226_G_GAGT:197402226:1,0,0,1
chr3	197426202	.	G	T,A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,30,32;MFRL=162,150,99;MMQ=60,60,60;MPOS=2,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,1,0:2,0,1:0,2,0,2
chr3	197426204	.	T	G,TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,29,31;MFRL=162,150,99;MMQ=60,60,60;MPOS=0,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,1,0:2,0,1:0,2,0,2
chr3	197426206	.	G	GTCCTCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:197426206_G_GTCCTCC:197426206:0,3,0,1
chr3	197426208	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:197426206_G_GTCCTCC:197426206:0,3,0,1
chr3	197427707	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,70587391;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:10,2:17,0:19,9,0,2
chr3	197483279	.	A	G	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=245.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,31:0,35:0,0,57,13
chr3	197496984	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=142.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,18:0,21:0,0,37,2
chr3	197500394	.	T	TTTTG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTG;STR;TLOD=45.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.945:12:0,4:0,7:0,0,0,12
chr3	197508667	.	T	G	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.059:65:41,2:20,1:54,8,3,0
chr3	197508671	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=149,79;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,2:0.047:62:36,2:23,0:52,8,1,1
chr3	197544200	.	C	CGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=27,0;MFRL=112,133;MMQ=34,36;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.543:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr3	197544201	.	A	ATTTTGTGTGTGTGTGCG,G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=0,25,32;MFRL=0,133,112;MMQ=60,36,34;MPOS=0,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.69,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.538,0.431:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr3	197544211	.	G	GTATTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=19,33;MFRL=133,112;MMQ=36,34;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:197544211_G_GTATTT:197544211:0,1,0,1
chr3	197544215	.	G	GTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTAACTGGTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=133,112;MMQ=36,34;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:197544211_G_GTATTT:197544211:0,1,0,1
chr3	197544231	.	G	GTATATATATATATATATA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=133,164;MMQ=36,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,18;RU=TA;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	197557635	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=141.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,20:0,19:0,0,36,5
chr3	197562505	.	G	GGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=180,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GT;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	197566084	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:5,3:4,2:9,0,6,0
chr3	197574248	.	T	G	.	.	DP=136;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=155.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,53:0.427:125:35,30:37,22:66,6,49,4
chr3	197574960	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:9,11:3,3:0,12,1,13
chr3	197579499	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:16,2:23,0:16,23,0,2
chr3	197597194	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr3	197597227	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=189,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:197597227_G_A:197597227:0,3,0,1
chr3	197597228	.	A	AAAACG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=189,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:197597227_G_A:197597227:0,3,0,1
chr3	197665599	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=227.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,29:0,36:0,0,26,42
chr3	197672589	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.689:17:3,5:2,7:0,5,1,11
chr3	197702875	.	CT	C,CTT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,35,33;MFRL=146,168,178;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=6.94,6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,5,6:0.125,0.141:44:13,4,2:18,1,4:29,4,11,0
chr3	197710959	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:1,6:7,6:0,8,3,9
chr3	197717568	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=139,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:7,0:8,2:2,13,1,1
chr3	197717643	.	A	ATATT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	197762958	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=215,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	197894800	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,31;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr4	53310	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:13,0:16,2:23,7,2,0
chr4	53498	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,12:0,3:0,0,0,15
chr4	59299	.	C	G	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,8:0.090:98:53,2:36,6:79,11,7,1
chr4	86101	.	G	GC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=64.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,15,6
chr4	86632	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=166,182;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:3,2,1,1
chr4	87277	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=99,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.944:33:1,10:0,22:0,1,18,14
chr4	87313	.	G	GA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=134.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,18:0,26:0,0,16,28
chr4	265975	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:13,2:4,0:0|1:265975_G_T:265975:9,8,1,1
chr4	265978	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:13,2:4,0:0|1:265975_G_T:265975:9,8,1,1
chr4	331693	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,9:0,3:0,0,10,2
chr4	437909	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=121.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,42:0.544:77:16,13:19,29:13,22,15,27
chr4	521068	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:521068_A_T:521068:0,0,0,1
chr4	521090	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:521068_A_T:521068:0,1,0,1
chr4	527852	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:527852_G_T:527852:0,4,0,1
chr4	527854	.	G	GATGTAGAAAGGATGTGTTTGATGGACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:527852_G_T:527852:0,4,0,1
chr4	648715	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:3,4,1,3
chr4	650749	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=101,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:1,5:8,6:5,5,7,4
chr4	654363	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=94,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:8,9,0,2
chr4	658589	.	CA	TG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=166,174;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:10,2:15,0:0|1:658589_CA_TG:658589:23,3,2,0
chr4	658590	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=170,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,3:0.140:26:8,2:15,1:1|0:658589_CA_TG:658589:21,2,2,1
chr4	666385	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=116,133;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:0,0:1,0:1,2,0,3
chr4	755025	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:3,8:6,10:7,2,15,3
chr4	758959	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr4	759733	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	780286	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr4	780549	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=200,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr4	786401	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:5,6:2,4:2,5,3,9
chr4	843619	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=162,262;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,0:0,10,2,0
chr4	843622	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,16;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=C;STR;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:0,0:1,1:1,3,0,5
chr4	844942	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:6,2:1,0:0|1:844942_A_G:844942:0,7,0,2
chr4	844948	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,0:0|1:844942_A_G:844942:0,7,0,2
chr4	845772	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	858874	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr4	860146	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:2,3:2,5:4,0,6,3
chr4	860192	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=105,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.572:31:5,7:8,9:9,4,10,8
chr4	871624	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:6,5:5,7:2,9,0,12
chr4	871675	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr4	875887	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=185,248;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	887878	.	A	AGGAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=235,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:887878_A_AGGAC:887878:0,1,0,1
chr4	887880	.	G	GAAAAATTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=235,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:887878_A_AGGAC:887878:0,1,0,1
chr4	887884	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	906647	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	942006	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:3,6:1,2:0,4,0,9
chr4	946974	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:8,0,1,3
chr4	954311	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	960713	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	980971	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	995708	.	C	CTCTAAAGCCATTCTCTCTCTGGAATTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr4	996325	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	1017537	.	G	GGGGGGGGGGCCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=189,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr4	1019054	.	CCA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=95,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:14,1:5,2:12,11,3,0
chr4	1066674	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,3:6,4:12,1,5,2
chr4	1067542	.	AGAACCCC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=120,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1067542_AGAACCCC_A:1067542:0,1,0,1
chr4	1067553	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=120,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1067542_AGAACCCC_A:1067542:0,1,0,1
chr4	1084701	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	1102050	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,20:0,12:0,0,30,2
chr4	1164277	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,10,9
chr4	1165560	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	1165587	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	1326491	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,102;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,2:10,0:0|1:1326491_CT_C:1326491:8,4,1,1
chr4	1326495	.	AAGTT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=153,102;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,2:11,0:0|1:1326491_CT_C:1326491:12,6,1,1
chr4	1332175	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	1345647	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:9,3:5,5:3,11,1,7
chr4	1348806	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	1348888	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:10,5:2,5:11,1,10,1
chr4	1348900	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,1:9,1:17,4,2,0
chr4	1369069	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	1369093	.	CT	GG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	1374774	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,1,15
chr4	1374789	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,1,14
chr4	1388359	.	TGGAGTGCCCGCCTGCTCATGTGCCCATGTGGAGTGCCCGCCTGCTCACACATGTCGATGC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=80,128;MMQ=60,21;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.401:9:1,3:2,0:3,3,0,3
chr4	1389846	.	G	GTGATAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=118,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1389846_G_GTGATAT:1389846:0,1,0,1
chr4	1389848	.	G	GACAATGAAGTCCAGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=40,35;MFRL=118,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1389846_G_GTGATAT:1389846:0,1,0,1
chr4	1720111	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,1:10,1:10,11,0,2
chr4	1720346	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr4	1725651	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.479:13:0,3:5,3:0,7,0,6
chr4	1729347	.	AT	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,1:8,0,3,0
chr4	1729425	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.432:37:9,7:12,6:14,7,8,8
chr4	1732573	.	GGGGT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.602:18:4,7:1,4:6,1,10,1
chr4	1732727	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=194,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.243:10:5,2:2,0:0|1:1732727_T_TG:1732727:0,8,0,2
chr4	1732731	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=193,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:0|1:1732727_T_TG:1732727:1,8,0,2
chr4	1732734	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=193,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:1,5,0,3
chr4	1732774	.	GG	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=170,275;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:3,0,0,1
chr4	1737109	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr4	1739252	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr4	1746844	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr4	1807583	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:7,2,1,2
chr4	1821178	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:3,5,0,2
chr4	1834536	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:17,1:7,1:19,5,2,0
chr4	1836809	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	1850821	.	ATTTTCAAACCCTG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:11,0:19,4,1,1
chr4	1851022	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=185,128;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:1851022_C_T:1851022:0,10,0,2
chr4	1851028	.	TGC	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=185,128;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,1:0|1:1851022_C_T:1851022:0,10,0,2
chr4	1851052	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=192,200;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:1851052_C_T:1851052:0,3,0,2
chr4	1851054	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=192,200;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:1851052_C_T:1851052:0,3,0,2
chr4	1940139	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=17,10;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.335:12:1,0:1,0:0|1:1940139_C_A:1940139:7,1,3,1
chr4	1940141	.	T	TTA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.408:14:4,1:4,3:0|1:1940139_C_A:1940139:7,1,3,3
chr4	1940143	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=17,30;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.408:14:0,2:1,2:0|1:1940139_C_A:1940139:7,1,3,3
chr4	1940322	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	1957100	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1957100_CT_C:1957100:0,1,0,1
chr4	1957102	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1957100_CT_C:1957100:0,1,0,1
chr4	1957107	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1957100_CT_C:1957100:0,1,0,1
chr4	1957358	.	C	CGAGATTGGAGAATTCCCTGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,536;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr4	1961137	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,2:0,9:0,0,12,0
chr4	2065941	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2065941_G_A:2065941:0,0,0,1
chr4	2065946	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2065941_G_A:2065941:0,0,0,1
chr4	2074839	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	2130804	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=191,217;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,1:2,0,2,0
chr4	2158408	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr4	2176351	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,10:2,4:6,0,12,2
chr4	2176506	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,9:7,5:7,6,1,13
chr4	2176551	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=187,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr4	2176587	.	CT	TC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=184,208;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr4	2178108	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:0,1:2,4:0,2,0,6
chr4	2178127	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	2178149	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	2181016	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:7,6:6,6:10,3,8,4
chr4	2194901	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:13,4:6,5:17,2,7,2
chr4	2195089	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=228,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:0,4,1,5
chr4	2195128	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	2210239	.	A	AGATTTCAAGACTAATGTGTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	2252845	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,2:3,3:5,2,5,0
chr4	2252980	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=16,33;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.547:17:2,5:1,4:3,5,0,9
chr4	2254285	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=111,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:2254285_T_G:2254285:0,2,0,1
chr4	2254303	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=221,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2254285_T_G:2254285:0,1,0,1
chr4	2275718	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr4	2275835	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=106,159;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,6:1,8:1,2,8,6
chr4	2322019	.	C	CAAGGAGATTGGGTG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=158,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:2322019_C_CAAGGAGATTGGGTG:2322019:2,7,1,1
chr4	2322021	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=158,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:7,0:2,2:0|1:2322019_C_CAAGGAGATTGGGTG:2322019:2,7,1,1
chr4	2322039	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr4	2337357	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	2343150	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,1:1,4:2,0,6,0
chr4	2343349	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,5:4,5:2,5,1,9
chr4	2502299	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,6:2,0:4,1,6,0
chr4	2513620	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=115,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:6,4:4,2:9,2,6,0
chr4	2744266	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0,4,0,1
chr4	2822289	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,0:3,3:4,1,3,1
chr4	2829067	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=125,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:12,0:0|1:2829067_A_C:2829067:4,15,1,1
chr4	2829070	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:0|1:2829067_A_C:2829067:4,16,1,1
chr4	2829077	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:6,1:5,2:2,11,0,3
chr4	2829417	.	G	GACCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	2833200	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr4	2833226	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:14,0,2,0
chr4	2833500	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=222,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:1,1,0,3
chr4	2896235	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,179;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,2:2,0:3,0,2,0
chr4	2906799	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:13,2:10,0:7,16,0,2
chr4	2933271	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:2,2,6,1
chr4	2934308	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,10:0,0,11,8
chr4	2935013	.	C	CTAAGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=236,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	2935251	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,7:0,18:0,0,17,10
chr4	2941418	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=215,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,0,5
chr4	2949288	.	G	GTCTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=TC;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:2949288_G_GTCTC:2949288:3,4,1,1
chr4	2949291	.	A	ATGTATGAAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:2949288_G_GTCTC:2949288:3,4,1,1
chr4	2949398	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=12,33;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=-15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:2949398_GGC_G:2949398:0,1,0,2
chr4	2949402	.	C	CCGGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=-1073741843;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:2949398_GGC_G:2949398:0,2,0,2
chr4	2949405	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=-19;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:2949398_GGC_G:2949398:0,2,0,2
chr4	2949407	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=-20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:0|1:2949398_GGC_G:2949398:0,2,0,2
chr4	2951804	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,23:0.420:55:21,16:11,7:15,17,13,10
chr4	2954211	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2954211_T_C:2954211:0,0,0,1
chr4	2954213	.	TA	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2954211_T_C:2954211:0,0,0,1
chr4	2955192	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:7,3:6,3:13,1,5,1
chr4	2956244	.	G	GCTTTTCCCATGGTGTGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=120,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr4	3024009	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,2:4,0:14,0,2,0
chr4	3024044	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.260:25:9,4:9,2:18,1,6,0
chr4	3029588	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr4	3039328	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0|1:3039328_C_G:3039328:0,0,0,1
chr4	3039336	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3039328_C_G:3039328:0,0,0,1
chr4	3040279	.	G	GAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.348:7:1,0:0,1:0,5,0,2
chr4	3131823	.	T	TTTTCCAGATTTGGTCCATTAATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr4	3144441	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=146,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.400:11:1,1:3,3:7,0,4,0
chr4	3149975	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:1,1:2,6:0,3,2,6
chr4	3180021	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.415:39:14,4:9,12:14,9,12,4
chr4	3180260	.	CA	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3180260_CA_AT:3180260:0,0,0,1
chr4	3180265	.	GC	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3180260_CA_AT:3180260:0,0,0,1
chr4	3182189	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,98;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:6,0:11,0,4,0
chr4	3210403	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:3210403_T_A:3210403:3,1,1,0
chr4	3210410	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3210403_T_A:3210403:3,1,1,0
chr4	3230804	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	3230825	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3230825_A_T:3230825:0,3,0,1
chr4	3230827	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3230825_A_T:3230825:0,3,0,1
chr4	3230832	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3230825_A_T:3230825:0,3,0,1
chr4	3231804	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=102,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:1,2,0,2
chr4	3231813	.	GGGCCCATCT	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:2,1:2,0:0|1:3231813_GGGCCCATCT_G:3231813:0,4,0,1
chr4	3231827	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:3231813_GGGCCCATCT_G:3231813:0,4,0,1
chr4	3257699	.	AGGC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr4	3318782	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,13;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.192:17:4,0:4,1:12,2,3,0
chr4	3318912	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,20398934;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0,20,1,1
chr4	3416633	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=146,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:1,6,1,1
chr4	3416651	.	C	CTGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.307:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr4	3416652	.	A	AAGCAAGAGGAGGGAAGGTCTTCCTGGACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=141,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.377:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr4	3444519	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=169,35;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:3444519_G_T:3444519:2,6,1,1
chr4	3444521	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=169,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:3444519_G_T:3444519:2,6,1,1
chr4	3445737	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=98,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:8,2:0,0:0|1:3445737_C_T:3445737:7,1,2,0
chr4	3445745	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=81,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:1,12:0,1:0|1:3445737_C_T:3445737:1,0,12,2
chr4	3446714	.	A	ATAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=151,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:3446714_A_ATAGG:3446714:0,2,0,1
chr4	3446715	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=151,247;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:3446714_A_ATAGG:3446714:0,2,0,1
chr4	3446883	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.576:12:2,4:2,2:5,0,7,0
chr4	3478323	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr4	3487237	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr4	3494404	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	3494419	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	3495283	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:0,10,0,4
chr4	3516588	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:6,1:10,8,0,2
chr4	3516689	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr4	3516742	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	3520734	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:0,9,1,4
chr4	3526642	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:5,7:8,5:6,8,5,7
chr4	3533846	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=191,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:3533846_T_G:3533846:1,0,1,0
chr4	3533849	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:3533846_T_G:3533846:2,0,1,0
chr4	3533852	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:3533846_T_G:3533846:3,0,1,0
chr4	3533855	.	GA	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:3533846_T_G:3533846:3,0,1,0
chr4	3768868	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=167,62;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr4	3768904	.	TAC	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=195,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0|1:3768904_TAC_T:3768904:2,1,1,1
chr4	3768907	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=195,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:3768904_TAC_T:3768904:2,1,1,1
chr4	3768911	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=195,62;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:3768904_TAC_T:3768904:2,1,1,1
chr4	3769789	.	G	GGGGGAGCTTTCCCAGAGACCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGAGCTTTCCCAGAGACCC;STR;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.808:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr4	4190507	.	C	CTTG	.	.	DP=71;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=147,117;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,26:0.375:70:22,18:21,7:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:31,13,22,4
chr4	4190508	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=147,121;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,27:0.384:71:22,18:22,7:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:31,13,23,4
chr4	4190511	.	G	GTCACTTGTTA	.	.	DP=77;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=147,134;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=123.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,33:0.430:77:22,21:21,7:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:31,13,29,4
chr4	4190525	.	CC	TT	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=139,67;MMQ=57,22;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,2:0.035:84:48,2:30,0:56,26,1,1
chr4	4190683	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=126,104;MMQ=60,27;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,13:0.179:73:22,7:36,5:20,40,4,9
chr4	4190723	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=139,167;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:9,1:21,4:3,28,0,5
chr4	4190792	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,0:0,9:0,0,0,9
chr4	4198948	.	GCGTTGC	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.396:41:15,10:9,5:17,8,11,5
chr4	4199823	.	A	ACAGATGCTTAATCAAAGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=124,152;MMQ=46,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr4	4228361	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	4239516	.	C	T	.	.	DP=106;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=148,147;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=114.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,41:0.389:106:32,19:29,17:0|1:4239516_C_T:4239516:48,17,27,14
chr4	4239539	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=145,143;MMQ=60,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,23:0.201:117:43,11:49,12:0|1:4239516_C_T:4239516:65,29,0,23
chr4	4241953	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	4249414	.	AT	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr4	4249483	.	CA	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	4249974	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	4270428	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0,4,0,1
chr4	4281570	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	4283676	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	4285265	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	4285457	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,1,1
chr4	4285467	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=117,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:0,5,1,1
chr4	4285545	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=205,108372106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr4	4317659	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=156,76;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:16,0:14,4:0|1:4317659_G_A:4317659:15,16,1,3
chr4	4317661	.	CA	C	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=157,76;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.130:36:16,0:14,4:0|1:4317659_G_A:4317659:15,17,1,3
chr4	4317777	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.515:12:1,5:3,1:0,6,0,6
chr4	4322275	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr4	4322624	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,0:4,3:5,7,2,1
chr4	4411235	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=114,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,0:1,0,5,0
chr4	4411492	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4411492_C_CCT:4411492:0,1,0,1
chr4	4411493	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4411492_C_CCT:4411492:0,1,0,1
chr4	4411496	.	TCCC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=257,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:4411492_C_CCT:4411492:0,1,0,1
chr4	4411504	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=257,144;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4411492_C_CCT:4411492:0,1,0,1
chr4	4425380	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr4	4425422	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	4436436	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=98,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr4	4861745	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=175,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	5016841	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,13,8
chr4	5018478	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=224,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:5018478_C_T:5018478:2,0,1,1
chr4	5018479	.	TCCTCCCAAC	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=186,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:1,0:0|1:5018478_C_T:5018478:4,0,1,1
chr4	5018491	.	TCC	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=186,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:5018478_C_T:5018478:4,0,1,1
chr4	5018497	.	T	TTA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=186,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:5018478_C_T:5018478:4,0,1,1
chr4	5018702	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	5399876	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=102,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:1,1,4,1
chr4	5418539	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,1,1
chr4	5527008	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.561:28:6,9:6,4:11,1,14,2
chr4	5527249	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:1,13,1,1
chr4	5528115	.	ATT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr4	5570104	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	5617295	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.359:15:3,3:5,2:0,10,0,5
chr4	5630470	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.362:17:2,3:8,3:1,10,1,5
chr4	5642141	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:5642141_C_T:5642141:1,0,3,0
chr4	5642161	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:5642141_C_T:5642141:3,0,3,0
chr4	5642274	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,145;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.430:30:10,6:7,5:9,8,8,5
chr4	5664807	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	5687281	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	5693112	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,2:3,2:1,8,0,4
chr4	5696031	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.584:27:5,9:6,5:6,5,13,3
chr4	5731158	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0|1:5731158_C_T:5731158:1,3,1,3
chr4	5731174	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=191,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:5731158_C_T:5731158:0,4,0,1
chr4	5733068	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr4	5746916	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr4	5747078	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=106,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,5:1,7:0,1,3,9
chr4	5747131	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	5754544	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=114.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,20:0,0,24,13
chr4	5755756	.	T	TTTGGCATCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=251,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	5803669	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:5,1,3,1
chr4	5812195	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,6:5,6:1,9,2,10
chr4	5812778	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,54;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,2,2
chr4	5812817	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr4	5830414	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr4	5830434	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=168,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:4,11,0,2
chr4	5863032	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	5894776	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	5969113	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=161,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,2,2
chr4	5977566	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr4	5981849	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:6,7:1,5:7,0,11,1
chr4	5982108	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:4,2:1,6,2,5
chr4	5982135	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:1,1:1,2:1,1,0,4
chr4	5982158	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	5990162	.	T	TCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5990162_T_TCAC:5990162:0,0,0,1
chr4	5990165	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5990162_T_TCAC:5990162:0,0,0,1
chr4	6062230	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=117,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	6080817	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=106,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,0,3
chr4	6083492	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr4	6087057	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	6107357	.	A	ATGAGGCCTCTGACTGCTTGAAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=178,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1,6,1,1
chr4	6114508	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=85,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:7,4,2,0
chr4	6293595	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.185:19:8,0:8,3:14,2,2,1
chr4	6302452	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=42,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.582:38:8,12:6,10:15,1,19,3
chr4	6302680	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=173,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:3,7:3,2:3,3,8,2
chr4	6303327	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=93,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:2,1,2,3
chr4	6304242	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	6304286	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	6325018	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.748:22:1,6:4,9:2,3,12,5
chr4	6330938	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:6330938_C_G:6330938:2,0,2,1
chr4	6330947	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:6330938_C_G:6330938:2,1,2,1
chr4	6335203	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	6374189	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	6374230	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	6374468	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=190,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr4	6374493	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	6377530	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=119.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,16:0,9:0|1:6377530_C_G:6377530:0,0,19,9
chr4	6377534	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=120.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,19:0,8:0|1:6377530_C_G:6377530:0,0,19,9
chr4	6377713	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0|1:6377713_G_C:6377713:0,1,0,4
chr4	6377717	.	AGAT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:6377713_G_C:6377713:0,4,0,1
chr4	6578487	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	6594827	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	6596515	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	6596552	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	6602516	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr4	6612964	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:2,6,2,5
chr4	6619052	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr4	6623032	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr4	6719092	.	TAGTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,8:0,9:0,0,12,5
chr4	6925396	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:9,11,0,2
chr4	6956134	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:2,11,0,5
chr4	6968942	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr4	6996129	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr4	7002803	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr4	7012338	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,6:3,3:5,1,9,0
chr4	7027041	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr4	7032104	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=122,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.568:21:4,4:4,7:6,3,4,8
chr4	7032180	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr4	7064214	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=22,32;MFRL=180,173;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.806:8:1,4:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,1,1,6
chr4	7064218	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=180,164;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,1,1,5
chr4	7064220	.	TATATA	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=177,164;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,4:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,2,1,5
chr4	7064243	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=180,154;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,3,0,5
chr4	7064277	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=192,180;MMQ=60,46;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	7064300	.	A	ACTG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	7069606	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.371:29:8,4:9,3:18,0,10,1
chr4	7069804	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=220,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,2:4,4:0,10,0,6
chr4	7434988	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	7435013	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=117,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,2,1
chr4	7639974	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:0,1:1,2,3,0
chr4	7663167	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:4,2:4,4:8,1,5,1
chr4	7666229	.	GGC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=178,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:0|1:7666229_GGC_G:7666229:0,4,1,1
chr4	7666232	.	AAC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=178,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:7666229_GGC_G:7666229:0,4,1,1
chr4	7684641	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=106,87;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,1:3,1:2,4,1,1
chr4	7684661	.	CT	AC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=92,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:2,3,1,1
chr4	7691193	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=114,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:3,2,1,1
chr4	7716932	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0,0,15,10
chr4	7717066	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:0|1:7717066_C_T:7717066:0,6,1,1
chr4	7717069	.	A	AAACCTTTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:7717066_C_T:7717066:0,6,1,1
chr4	7727100	.	T	TTGCCCCCGCCGCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7727100_T_TTGCCCCCGCCGCTG:7727100:0,1,0,1
chr4	7727102	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7727100_T_TTGCCCCCGCCGCTG:7727100:0,1,0,1
chr4	7728472	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:5,1,6,0
chr4	7731310	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr4	7735215	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=232,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr4	7738730	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=189,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr4	7738775	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr4	7742101	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7742101_C_G:7742101:0,1,0,1
chr4	7742104	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7742101_C_G:7742101:0,1,0,1
chr4	7817698	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=82,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.765:5:0,1:1,3:0,1,4,0
chr4	7820727	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	7820795	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=99,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,1:3,6:4,2,5,3
chr4	7968888	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=68,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	8006928	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	8009759	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr4	8062638	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr4	8062689	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr4	8062871	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	8079298	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:2,2:5,0,6,0
chr4	8082607	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	8090028	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:5,3:3,3:0,9,2,4
chr4	8099086	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=206,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr4	8099105	.	A	ACG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=206,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr4	8207083	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:2,6:1,2:1,2,4,5
chr4	8207154	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,1:1,2:0,5,0,4
chr4	8211624	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	8214636	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,0,7
chr4	8217829	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:5,1,2,3
chr4	8217902	.	TGAG	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAG;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:14,1:15,1:19,14,2,0
chr4	8221058	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.568:40:8,11:9,10:11,6,13,10
chr4	8228627	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0|1:8228627_G_C:8228627:0,0,17,0
chr4	8228632	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,7:0,10:0|1:8228627_G_C:8228627:0,0,18,0
chr4	8228731	.	TG	CA,CG	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,35,30;MFRL=157,149,139;MMQ=60,60,60;MPOS=20,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.32,95.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,32:0.078,0.870:35:1,0,21:0,2,11:0,1,16,18
chr4	8228943	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,7:2,4:6,2,4,7
chr4	8230456	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	8237096	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,11,0
chr4	8288581	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr4	8288594	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=211,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:8288594_C_CA:8288594:0,3,0,1
chr4	8288595	.	T	TTCATCTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=211,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:8288594_C_CA:8288594:0,3,0,1
chr4	8293356	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=13,31;MFRL=210,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.620:5:0,1:0,2:0,2,0,3
chr4	8293379	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=210,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	8293974	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=101,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr4	8304137	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.547:11:3,6:1,0:3,2,5,1
chr4	8368731	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:14,0:7,3:0|1:8368731_G_A:8368731:8,13,0,3
chr4	8368735	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=135,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:13,0:7,3:0|1:8368731_G_A:8368731:8,14,0,3
chr4	8375448	.	A	AGTAGGTTGGAGAAATTATGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=176,268;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	8391467	.	A	ATCTGTGCTTCC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:2,8,1,1
chr4	8415982	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:7,6:9,4:9,7,8,2
chr4	8456572	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,9:2,4:1,4,5,8
chr4	8582679	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr4	8584448	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	8602793	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:8602793_T_C:8602793:0,0,5,0
chr4	8602798	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:8602793_T_C:8602793:0,0,6,0
chr4	8602816	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,1:0|1:8602793_T_C:8602793:0,0,7,1
chr4	8608979	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=146,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:1,0,2,1
chr4	8613908	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:8613908_G_A:8613908:0,2,1,0
chr4	8613913	.	TGGGCGG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=17,34;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:8613908_G_A:8613908:0,2,1,0
chr4	8620103	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr4	8620325	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	8621167	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.584:32:3,6:10,11:3,10,10,9
chr4	8621194	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,14:0,0,6,17
chr4	8621392	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	9446325	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr4	9485579	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=194,171;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,2:3,0:2,7,1,1
chr4	9486192	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=199,200;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:9486192_G_C:9486192:0,3,0,1
chr4	9486194	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=205,200;MMQ=59,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:9486192_G_C:9486192:0,4,0,1
chr4	9486200	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=205,200;MMQ=59,46;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:9486192_G_C:9486192:0,4,0,1
chr4	9892304	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,61;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:8,3:7,0:6,10,2,1
chr4	9921931	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr4	9982191	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,7:2,5:6,1,11,1
chr4	9998605	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr4	10020564	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:6,6:6,5:12,0,11,1
chr4	10020757	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,3:5,5:0,7,1,7
chr4	10027509	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.482:19:8,6:2,2:9,1,7,2
chr4	10027542	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.641:31:10,10:0,10:8,3,13,7
chr4	10027643	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:0,4,1,7
chr4	10080462	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,2:5,0,3,2
chr4	10084866	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10084866_A_T:10084866:0,1,0,1
chr4	10084867	.	G	GCGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10084866_A_T:10084866:0,1,0,1
chr4	10090178	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr4	10445719	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=134,52;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:11,0:8,3:8,12,0,4
chr4	10447985	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:7,7:9,7:10,6,7,7
chr4	10509699	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr4	10542067	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:4,3,1,1
chr4	10586629	.	C	CTCCCG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:10,1:9,14,0,2
chr4	13370308	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:1,4,1,5
chr4	13462520	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	13578405	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,15,2
chr4	13589212	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr4	13589495	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,0,19
chr4	13605775	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=123,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:9,4:13,2:14,8,4,2
chr4	13615293	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,5,23
chr4	13616295	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.457:31:5,6:11,8:4,13,4,10
chr4	15005715	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:6,4:5,5:1,11,0,9
chr4	15059951	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	15480481	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=118,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,1:13,1:3,17,0,2
chr4	15482477	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:5,8:6,7:1,10,2,13
chr4	15504026	.	G	T	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,4:0.050:81:33,0:40,2:58,19,4,0
chr4	15513147	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr4	15538744	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.577:12:3,3:1,3:0,5,0,7
chr4	15539498	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:7,8:3,1:9,2,9,0
chr4	15568992	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=131,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,27:0.435:62:18,15:16,10:15,20,17,10
chr4	15569018	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,45:0.591:76:14,25:15,17:16,15,24,21
chr4	15569146	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.545:31:9,6:5,11:2,12,2,15
chr4	15575718	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr4	15587897	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,2,18
chr4	15589345	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr4	15603069	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:7,6:9,2:2,14,1,7
chr4	15642515	.	CA	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.261:32:9,5:14,3:1,23,1,7
chr4	15717321	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:4,2,1,4
chr4	15780358	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr4	15842255	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=211,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15842255_TG_AA:15842255:0,1,0,1
chr4	15842259	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=211,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15842255_TG_AA:15842255:0,1,0,1
chr4	15842262	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=218,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:15842255_TG_AA:15842255:0,2,0,1
chr4	15842268	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=218,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:15842255_TG_AA:15842255:0,2,0,1
chr4	15937823	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,2:8,0:0|1:15937823_C_T:15937823:8,16,0,2
chr4	15937825	.	GG	CC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,2:8,0:0|1:15937823_C_T:15937823:7,16,0,2
chr4	15937828	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,2:7,0:0|1:15937823_C_T:15937823:7,16,0,2
chr4	15964040	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr4	15985984	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.400:15:4,4:5,1:1,8,2,4
chr4	15986041	.	C	CATGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:15986041_C_CATGG:15986041:0,3,0,1
chr4	15986042	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	15986044	.	G	GATGCCTGCAAAGCACAGCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:15986041_C_CATGG:15986041:0,3,0,1
chr4	15987348	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr4	15987509	.	T	TTTAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,0;MFRL=29342519,126;MMQ=60,57;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.638:3:0,0:0,0:0|1:15987509_T_TTTAAG:15987509:2,0,0,1
chr4	15987512	.	T	TGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGATAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.921:11:0,1:0,1:0|1:15987509_T_TTTAAG:15987509:0,1,8,2
chr4	15987739	.	A	AGGATTTAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=196,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:15987739_A_AGGATTTAT:15987739:0,4,0,1
chr4	15987740	.	C	CCCTGAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=196,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:15987739_A_AGGATTTAT:15987739:0,4,0,1
chr4	15989191	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr4	15991275	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr4	16002050	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr4	16008231	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:14,8,0,2
chr4	16014998	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr4	16024885	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr4	16025837	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr4	16026983	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=123,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:3,3,1,2
chr4	16172181	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr4	16175930	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,108;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:24,0:17,4:9,32,0,4
chr4	16189991	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.277:29:10,3:10,5:6,15,1,7
chr4	16190073	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr4	16204226	.	GA	G,GAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=18,25,18;MFRL=148,187,148;MMQ=60,60,60;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.95,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,4,3:0.162,0.132:27:3,0,0:5,2,0:1,19,0,7
chr4	16215537	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,2:4,0:3,8,0,2
chr4	16510131	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,5:4,0:9,2,5,0
chr4	16597280	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr4	17494054	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	17503561	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	17506164	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:2,1:11,6:0,13,0,7
chr4	17511076	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:0,0:1,1:0|1:17511076_G_GA:17511076:0,1,0,1
chr4	17511077	.	T	TTCTCCTACCTCAGCTTCCCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17511076_G_GA:17511076:0,1,0,1
chr4	17517242	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr4	17581617	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,4,14
chr4	17581643	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	17585014	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	17590671	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr4	17590694	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr4	17608620	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,2:1,3:0,3,1,4
chr4	17616214	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:6,0,3,1
chr4	17625209	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:10,5:9,6:10,9,6,5
chr4	17634213	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,10:0,0,10,13
chr4	17634255	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:3,6:9,1:0|1:17634255_G_A:17634255:4,8,1,6
chr4	17634256	.	C	CAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:3,6:9,1:0|1:17634255_G_A:17634255:4,8,1,6
chr4	17635556	.	CAAAAT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,1:3,1:0,7,0,2
chr4	17640858	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,2,0
chr4	17649233	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=178,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:3,1:1,6:3,2,4,3
chr4	17649494	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,35;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17649494_T_C:17649494:0,1,1,0
chr4	17649499	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,36;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:17649494_T_C:17649494:0,1,1,0
chr4	17654648	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,2:5,4:0,5,1,5
chr4	17659936	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=163,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:3,1,3,2
chr4	17666297	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.426:7:1,0:1,1:0|1:17666297_G_A:17666297:0,4,1,2
chr4	17666303	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,16;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.632:6:1,0:0,1:0|1:17666297_G_A:17666297:0,2,1,3
chr4	17706928	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	17805379	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=77.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,25:0.764:32:2,11:5,13:1,6,6,19
chr4	17812615	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=130.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,13:0,21:0,0,34,0
chr4	17812796	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.581:42:7,6:10,13:3,14,3,22
chr4	17814110	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,1:4,5:1,5,0,6
chr4	17836232	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr4	17841848	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.476:40:11,9:8,8:2,19,1,18
chr4	17842156	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.648:32:4,10:7,11:11,0,20,1
chr4	17844029	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.558:41:8,12:10,11:2,16,2,21
chr4	17885296	.	A	AAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AC;STR;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,6,1
chr4	17964528	.	TA	T	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,7:0.073:80:37,4:35,3:60,13,5,2
chr4	20255620	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	20259621	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.295:25:12,3:6,4:0|1:20259621_A_AT:20259621:1,17,0,7
chr4	20259622	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.295:25:12,3:6,4:0|1:20259621_A_AT:20259621:1,17,0,7
chr4	20270600	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	20482461	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr4	20482485	.	G	GGTTATTTTGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	20490667	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr4	20533700	.	A	AT	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=134.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,56:0.951:58:1,28:1,27:0,2,14,42
chr4	20541005	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=74.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,18:0.760:23:1,8:3,7:0|1:20541005_AG_A:20541005:5,0,16,2
chr4	20541008	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=74.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,18:0.760:23:2,10:3,8:0|1:20541005_AG_A:20541005:5,0,16,2
chr4	20547838	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	20597522	.	CAGT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=168,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr4	20618822	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,2:4,0:0|1:20618822_G_GA:20618822:3,4,1,1
chr4	20618823	.	T	TATTATG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=151,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:0|1:20618822_G_GA:20618822:3,4,1,1
chr4	20619369	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20619369_A_G:20619369:0,0,0,1
chr4	20619372	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20619369_A_G:20619369:0,0,0,1
chr4	20619373	.	C	CTATATGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20619369_A_G:20619369:0,0,0,1
chr4	20620683	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr4	20706067	.	CT	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,8:0.179:45:16,3:14,4:35,2,6,2
chr4	20714642	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	20715189	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=197,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr4	20715244	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	20733708	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,5:0,7:0,0,7,7
chr4	20736416	.	A	AAAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAC;STR;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr4	21699106	.	CAAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,36;MFRL=206,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AAT;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr4	22414708	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr4	22437978	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:5,1:2,3:7,0,4,0
chr4	22444251	.	CA	C,CAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,35,34;MFRL=163,165,143;MMQ=60,60,60;MPOS=26,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=7.05,5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,5,6:0.184,0.203:28:7,3,6:10,2,0:16,1,11,0
chr4	22449028	.	CA	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.181:47:11,4:25,4:34,4,6,3
chr4	22456621	.	CATT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:22456621_CATT_C:22456621:0,2,0,1
chr4	22456626	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:22456621_CATT_C:22456621:0,2,0,1
chr4	22456630	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:22456621_CATT_C:22456621:0,2,0,1
chr4	22456631	.	TCAAGAACAGCA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=172,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22456621_CATT_C:22456621:0,1,0,1
chr4	23815218	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=275,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	23815522	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=104,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:1,6:12,11:3,10,2,15
chr4	23815541	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,0:16,2:6,17,0,2
chr4	23815553	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:8,0:10,2:0|1:23815553_C_T:23815553:5,13,0,2
chr4	23815555	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:23815553_C_T:23815553:5,13,0,2
chr4	23815924	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	23816242	.	TAA	T,TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32,10;MFRL=0,157,150;MMQ=60,60,60;MPOS=22,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=6.08,16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,8:0.311,0.631:12:0,1,0:0,3,3:0,0,0,12
chr4	23830267	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,4:9,4:1,12,0,8
chr4	24550431	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=118,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr4	24824076	.	GAA	G,GA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,30,35;MFRL=146,122,135;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.37,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,3,3:0.085,0.118:35:10,2,2:15,0,1:26,3,4,2
chr4	24914611	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	25005891	.	CTG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=220,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:1,0:1,1:0|1:25005891_CTG_C:25005891:0,2,0,1
chr4	25005898	.	C	CTCTGTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=220,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:25005891_CTG_C:25005891:0,2,0,1
chr4	25146307	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr4	25160732	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.240:20:9,1:3,4:0,15,1,4
chr4	25160828	.	A	AGCACATGCTCACCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	25262253	.	TATATATATATAC	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,160;MMQ=58,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.296:21:5,2:7,4:0,14,0,7
chr4	25370705	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=119,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:13,4,1,1
chr4	25392728	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=233,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr4	25393889	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,4:1,4:5,0,8,0
chr4	25394078	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,6:3,4:1,7,1,9
chr4	25395909	.	A	AT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.098:48:21,1:22,3:34,10,4,0
chr4	25404553	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:11,15:6,10:10,7,21,4
chr4	25408724	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr4	25417244	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:0,1:2,2:0,2,0,4
chr4	25419889	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,75;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:11,6,0,2
chr4	25673234	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,2:6,0:8,8,1,1
chr4	25674905	.	TCACA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,0,3
chr4	25674911	.	G	GAGGGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,0,3
chr4	25674913	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,0,3
chr4	25759298	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.411:32:6,5:12,8:9,10,5,8
chr4	25759452	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:0,8,0,7
chr4	25767064	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:6,4:9,5:2,13,2,7
chr4	25769041	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr4	25769135	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.464:48:14,15:10,7:15,11,14,8
chr4	25780599	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=184,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr4	25780675	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.533:26:5,8:7,5:7,5,9,5
chr4	25780891	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr4	25784092	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr4	25790067	.	C	CCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,0:0,0:0|1:25790067_C_CCTG:25790067:0,0,0,1
chr4	25790072	.	T	TCAGACCAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25790067_C_CCTG:25790067:0,0,0,1
chr4	25790073	.	T	TGCCTGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25790067_C_CCTG:25790067:0,0,0,1
chr4	25803830	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,3:4,6:6,0,9,0
chr4	25849270	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:13,6,1,1
chr4	25915858	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:8,0,5,0
chr4	26322645	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:9,1:15,2:14,12,2,1
chr4	26322759	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr4	26364300	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	26387959	.	ATT	AT,A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=31,31,29;MFRL=131,158,190;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,9;RU=T;STR;TLOD=135.67,5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,53,4:0.873,0.076:60:1,31,4:2,22,0:2,1,42,15
chr4	26417068	.	GT	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.117:49:17,3:24,1:30,14,2,3
chr4	26417136	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=277.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,84:0.988:84:0,43:0,37:0|1:26417136_T_C:26417136:0,0,47,37
chr4	26417158	.	C	T	.	.	DP=104;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=135,96;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:100,4:0.047:104:49,4:47,0:1|0:26417136_T_C:26417136:59,41,4,0
chr4	26487170	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	26615982	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr4	26685452	.	A	AGAATCTGGAACTTCTGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=203,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	26721578	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,6:1,2:4,1,8,0
chr4	26737063	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=66.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,33:0.730:45:5,16:6,13:6,6,23,10
chr4	27000995	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,3,19
chr4	27019666	.	G	GCCGAGAGTTTGAGACTAGTCAGGGCAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=219,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr4	30725521	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:30725521_A_AG:30725521:1,1,1,0
chr4	30725523	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:30725521_A_AG:30725521:1,1,1,0
chr4	36069661	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=154,91;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:8,1:16,8,1,1
chr4	36109409	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr4	36122737	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.434:23:7,6:6,3:13,0,9,1
chr4	36126393	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr4	36130099	.	TAC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:5,2:3,1:9,1,3,0
chr4	36130127	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.188:44:16,2:20,5:24,12,4,4
chr4	36130375	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:8,2:5,3:0|1:36130375_TA_T:36130375:0,14,1,5
chr4	36130393	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.335:22:7,5:7,2:0|1:36130375_TA_T:36130375:0,15,0,7
chr4	36148837	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,5:7,2:9,0,7,0
chr4	36149025	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:5,5:8,3:1,13,0,8
chr4	36149113	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:9,0,2,2
chr4	36160340	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=67.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,25:0.481:52:13,11:14,14:25,2,24,1
chr4	36162273	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:2,3:5,2:1,6,1,5
chr4	36168706	.	CAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,36;MFRL=203,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=A;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	36211914	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	36216114	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.380:45:12,8:15,8:6,22,4,13
chr4	36340755	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.581:41:7,14:10,10:12,5,10,14
chr4	37432416	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0,3,0,2
chr4	37590570	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:1,6,0,3
chr4	37592659	.	T	TAAGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=187,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	37592674	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	37636750	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:3,2:0,0:1,2,0,3
chr4	37831850	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	37841430	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,5:5,0:7,2,5,0
chr4	37841942	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	37848530	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr4	37850312	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr4	37857166	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	37863045	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,242;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	38119747	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.443:31:9,8:8,3:8,9,9,5
chr4	38134423	.	GTT	G,GT,GTTT,GTTTT	.	.	DP=146;ECNT=2;MBQ=34,34,34,34,34;MFRL=125,151,175,136,153;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=14,17,20,16;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17,18;RU=T;STR;TLOD=4.46,8.07,41.72,10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:35,6,7,32,12:0.052,0.079,0.373,0.133:92:15,2,3,15,7:20,4,4,13,2:22,13,41,16
chr4	38134442	.	C	G	.	.	DP=150;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,39:0.263:137:32,0:39,0:32,66,39,0
chr4	38696378	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,259;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,2:15,0:18,12,2,0
chr4	38698666	.	G	GA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,2:11,0:24,0,3,0
chr4	38798695	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,141;MMQ=52,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,0:16,3:18,9,2,1
chr4	38800346	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,3:11,0:10,14,3,0
chr4	38829280	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:11,12,1,1
chr4	38831150	.	G	GATTTCCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	38916465	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.630:9:2,3:1,1:3,0,6,0
chr4	38937316	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.267:27:9,3:9,2:19,1,5,2
chr4	38937329	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=17,10;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.229:26:2,0:3,1:17,3,6,0
chr4	38942697	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.374:8:2,1:1,2:0,5,0,3
chr4	38944976	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=190,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr4	39064126	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr4	39064162	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,13:0,0,21,11
chr4	39077567	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.418:22:10,6:3,3:13,0,9,0
chr4	39082696	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:12,3:1,0:13,0,2,1
chr4	39104837	.	CTG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr4	39109399	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:7,4:3,6:0,10,0,11
chr4	39109428	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:0,5,0,6
chr4	39114559	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	39116775	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,1:4,7:6,2,3,5
chr4	39122577	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=148,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:1,2,6,0
chr4	39187522	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	39188125	.	GT	AA	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=111,161;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.320:31:4,0:15,6:0|1:39188125_GT_AA:39188125:5,16,10,0
chr4	39188130	.	TC	AA	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=124,145;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,7:0.202:35:6,1:17,1:0|1:39188125_GT_AA:39188125:10,18,7,0
chr4	39188133	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=124,164;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.090:34:7,1:20,0:0|1:39188125_GT_AA:39188125:10,21,3,0
chr4	39188136	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=34,13;MFRL=125,137;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:9,0:22,0:10,22,2,0
chr4	39205365	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr4	39216399	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0|1:39216399_T_G:39216399:0,8,0,2
chr4	39216405	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:4,2:3,0:0|1:39216399_T_G:39216399:0,8,0,2
chr4	39226486	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.229:17:6,1:5,2:11,2,3,1
chr4	39226524	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=142,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.131:41:9,0:20,0:15,20,6,0
chr4	39233984	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=167,196;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39233984_C_T:39233984:0,1,0,1
chr4	39233987	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=167,196;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39233984_C_T:39233984:0,1,0,1
chr4	39233992	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=167,196;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39233984_C_T:39233984:0,1,0,1
chr4	39279671	.	CAA	C,CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=155,170,190;MMQ=60,60,60;MPOS=31,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=7.53,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.334,0.248:9:2,0,1:2,3,1:4,0,5,0
chr4	39279907	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr4	39308187	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,8:3,4:3,1,7,5
chr4	39318706	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr4	39321969	.	CAA	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=121,125;MMQ=54,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.746:16:2,2:2,3:3,1,5,7
chr4	39329102	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:5,1:0,2:5,0,3,0
chr4	39329476	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	39343940	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,5:4,7:6,2,8,4
chr4	39353122	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	39449824	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	39456392	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.967:25:0,11:0,14:0,0,25,0
chr4	39459154	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:7,4:1,2:7,1,5,1
chr4	39459724	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr4	39473040	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	39501722	.	CAAAA	C,CA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=105,174,141;MMQ=60,60,60;MPOS=17,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,15;RU=A;STR;TLOD=8.74,13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,8:0.223,0.422:20:4,2,4:1,3,2:5,2,10,3
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chr4	39506997	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:0,3:6,3:1,5,0,6
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chr4	39510193	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=91,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0|1:39510175_G_A:39510175:8,3,1,1
chr4	39511359	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,2:1,3:5,0,4,1
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chr4	39851058	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,176;MMQ=54,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.450:7:2,1:0,2:4,0,3,0
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chr4	39928382	.	T	G	.	.	DP=78;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,24:0.319:75:32,10:19,13:41,10,21,3
chr4	39928383	.	T	G	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,4:0.063:76:40,2:31,2:60,12,3,1
chr4	39928486	.	TA	T,TAA	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=148,147,154;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.67,4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,5,5:0.113,0.106:48:13,2,4:22,2,1:1,37,0,10
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chr4	40123997	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:3,2:3,1:0,7,0,4
chr4	40246281	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr4	40337908	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr4	40339137	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=101,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr4	40778340	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	40810585	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=98,83;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:1,3:14,0:8,7,2,1
chr4	40947109	.	G	GATCAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=204,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.385:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	41015553	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=110,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr4	41016484	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=186,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:1,1:3,2:0,5,0,3
chr4	41615249	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.895:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr4	41615690	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr4	41615757	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr4	41615759	.	C	CACCACAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:41615759_C_CACCACAA:41615759:0,2,0,1
chr4	41615762	.	T	TCTCAAGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:41615759_C_CACCACAA:41615759:0,2,0,1
chr4	41621358	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:41621358_A_C:41621358:4,13,1,1
chr4	41621360	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:41621358_A_C:41621358:4,13,1,1
chr4	41691669	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:0,12,0,2
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chr4	41699276	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:41699274_A_G:41699274:2,12,0,2
chr4	41699278	.	C	CTCTTCCTGGGGACCAGA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:6,0:0|1:41699274_A_G:41699274:2,12,0,2
chr4	41985272	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.862:19:1,5:1,10:2,0,11,6
chr4	41985867	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:8,2:5,4:3,10,1,6
chr4	41986519	.	GC	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,195;MMQ=48,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:6,2,1,1
chr4	41988385	.	TAC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.953:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr4	42003591	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=179,228;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,4:7,0:15,0,4,0
chr4	42003835	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=143.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,19:0,21:0,0,4,36
chr4	42022464	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,4,7
chr4	42024982	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr4	42025049	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr4	42037381	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=111,244;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,0:4,2:4,4,0,2
chr4	42040947	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=146.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,24:0,18:0,0,43,0
chr4	42069029	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	42119742	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,1:6,1:9,11,1,1
chr4	42402992	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr4	42403561	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	42448742	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr4	42466641	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr4	42526694	.	CTAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=201,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TAA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:3,0,1,0
chr4	42571074	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=165.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,23:0,26:0,0,45,4
chr4	42582047	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=122.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,9:0,23:0,0,1,31
chr4	42592935	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=97,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.840:10:1,5:0,2:0,1,3,6
chr4	42593015	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	42602606	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=121.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,15:0,18:0,0,5,28
chr4	42626659	.	GAAA	G,GA,GAA	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=26,19,18,17;MFRL=182,0,136,148;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,23,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.82,10.36,54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,4,7,28:0.090,0.158,0.608:45:3,0,0,7:0,2,2,3:3,3,5,34
chr4	42627805	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,1,19
chr4	42965159	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,2:6,4:1,11,0,6
chr4	43032612	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=57,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr4	44626846	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr4	44631514	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:9,15:5,1:10,5,6,11
chr4	44631587	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:0,8,1,5
chr4	44652187	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,6:5,2:0,6,0,8
chr4	44680727	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,19:0.429:44:11,9:14,8:23,2,16,3
chr4	44682661	.	CT	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.132:38:13,3:20,2:28,5,5,0
chr4	44684455	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=138.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,21:0,18:0,0,7,32
chr4	44684507	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr4	44685224	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=178.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,20:0,17:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,39,2
chr4	44685225	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=180.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,20:0,18:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,40,2
chr4	44685236	.	AT	A	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=61.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,30:0.621:48:8,10:8,19:17,1,26,4
chr4	44691206	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	44691795	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:1,1,7,0
chr4	44693782	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:7,0:2,2:5,5,2,0
chr4	44696538	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=225.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,28:0,33:0,0,17,44
chr4	44699484	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.396:46:13,8:15,10:11,17,4,14
chr4	44699506	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.388:34:11,4:10,9:4,17,1,12
chr4	44709695	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	44712908	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr4	44713235	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr4	44720248	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.339:33:10,4:11,6:21,1,11,0
chr4	46967332	.	A	AATTAATTAAAATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:46967332_A_AATTAATTAAAATTT:46967332:0,0,0,1
chr4	46967335	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46967332_A_AATTAATTAAAATTT:46967332:0,0,0,1
chr4	46994972	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:0,0:0,1,0,5
chr4	46995366	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.415:15:5,4:3,2:3,6,3,3
chr4	47033770	.	TCG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.486:18:7,4:2,5:4,5,5,4
chr4	47034058	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0|1:47034058_CT_C:47034058:0,3,0,1
chr4	47034060	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:47034058_CT_C:47034058:0,3,0,1
chr4	47034064	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:47034058_CT_C:47034058:0,2,0,1
chr4	47034626	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:3,3,5,3
chr4	47163249	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=12,18;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,0:1,0:3,0,2,0
chr4	47524961	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,2:2,2:1,1,5,0
chr4	47524997	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,1:6,2:9,0,2,1
chr4	47525009	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr4	47527537	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,8:5,5:6,3,12,1
chr4	47538360	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr4	47560859	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=110,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr4	47582387	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=89,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.537:26:3,7:8,6:8,4,11,3
chr4	47592993	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.520:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr4	47666981	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=203,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	47685780	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:6,9,0,2
chr4	47695102	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:6,2:6,1:2,10,3,0
chr4	47746602	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=12,10;MFRL=205,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:0,0:0,0:0,4,0,2
chr4	47746658	.	A	AAGACTATTCTTTCTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	47746661	.	A	ACG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=197,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	47853843	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,19,0
chr4	47857040	.	T	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=273.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,76:0.975:77:0,41:1,33:1,0,44,32
chr4	47886329	.	GT	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.157:40:12,3:19,2:28,6,5,1
chr4	47898491	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr4	47899964	.	T	TA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.091:53:33,1:15,2:40,9,4,0
chr4	47901169	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:0,1:0|1:47901169_A_AG:47901169:0,2,0,1
chr4	47901173	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47901169_A_AG:47901169:0,2,0,1
chr4	47901177	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47901169_A_AG:47901169:0,2,0,1
chr4	47905158	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=94.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,19:0,0,29,1
chr4	47912787	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:13,0:19,4,2,1
chr4	47944029	.	CAA	C,CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33,33;MFRL=59,192,167;MMQ=57,60,60;MPOS=16,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=A;STR;TLOD=5.21,4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.333:6:0,2,0:1,0,2:2,0,4,0
chr4	47944053	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,14;MFRL=132,94;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:2,0:7,1,2,0
chr4	47945455	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,0,19
chr4	47951945	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,14:0,15:0,0,3,26
chr4	47953515	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr4	48073501	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:1,3,6,0
chr4	48076091	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.349:41:18,5:9,9:6,21,4,10
chr4	48078593	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:2,1:0,6,0,4
chr4	48081896	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=78,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.540:9:1,4:2,1:4,0,5,0
chr4	48082095	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:6,5,3,4
chr4	48082208	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	48088419	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr4	48088446	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=228,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,5:0,9:1,0,11,3
chr4	48139565	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr4	48147612	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr4	48148435	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0|1:48148435_G_A:48148435:0,6,0,4
chr4	48148442	.	TCA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:1,0:0|1:48148435_G_A:48148435:1,5,0,2
chr4	48165834	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:48165834_T_C:48165834:0,4,1,1
chr4	48165835	.	T	TGAAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GAAA;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:48165834_T_C:48165834:0,4,1,1
chr4	48165888	.	CTTA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	48169769	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=151.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,24:0,18:0,0,26,16
chr4	48170511	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,1:2,1:8,0,2,0
chr4	48172218	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:5,6:7,6:12,1,12,0
chr4	48173547	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=216,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:0,4,0,7
chr4	48178003	.	A	AAATCAGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AATCAGCC;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,1:1,0,4,0
chr4	48372085	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,2:2,5:0,2,0,7
chr4	48381690	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.280:17:5,3:4,2:9,3,4,1
chr4	48385026	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=96,196;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.433:4:0,1:2,1:0|1:48385026_ATT_A:48385026:0,2,0,2
chr4	48385030	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=96,196;MMQ=60,59;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:48385026_ATT_A:48385026:0,2,0,2
chr4	48385035	.	A	AAAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=96,196;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:48385026_ATT_A:48385026:0,2,0,2
chr4	48486193	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	48491010	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:3,5:7,9:0,10,3,12
chr4	48492434	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	48494708	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	48516970	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	48517352	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr4	48529683	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=17,31,31,32;MFRL=208,77,200,134;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,18,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.12,6.23,17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,4,8:0.135,0.227,0.529:15:0,1,3,3:0,1,1,4:0,1,0,14
chr4	48529733	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	48533148	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=125,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,23:0.437:53:13,12:16,11:19,11,16,7
chr4	48537603	.	T	TACAC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=AC;STR;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.901:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr4	48537633	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:5,2:5,5:9,1,14,1
chr4	48541973	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,1:6,5:8,2,4,2
chr4	48549796	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=143,128;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:7,2:0|1:48549796_A_C:48549796:6,18,0,2
chr4	48549800	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=144,128;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:0|1:48549796_A_C:48549796:3,18,0,2
chr4	48551719	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=668,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48551719_A_C:48551719:0,2,0,1
chr4	48551721	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=668,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48551719_A_C:48551719:0,2,0,1
chr4	48565101	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	48577121	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,10:0,0,19,5
chr4	48582836	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	48583067	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=189,242;MMQ=52,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:48583067_T_A:48583067:0,1,0,1
chr4	48583073	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=189,242;MMQ=52,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48583067_T_A:48583067:0,1,0,1
chr4	48596036	.	TA	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,9:0.157:59:22,4:25,3:10,40,1,8
chr4	48604160	.	C	T	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,41:0.400:103:35,17:26,24:21,41,7,34
chr4	48607938	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,11:0,0,1,17
chr4	48611149	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,3:4,5:0|1:48611149_A_G:48611149:1,9,0,8
chr4	48611153	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0|1:48611149_A_G:48611149:0,0,1,15
chr4	48625204	.	T	TA	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.112:45:21,1:18,2:3,37,1,4
chr4	48625213	.	C	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,30:0,26:0,0,8,48
chr4	48851937	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:8,1:6,6:7,7,5,2
chr4	48894715	.	TATAA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:2,5:8,0,8,0
chr4	48894981	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:0,6,0,7
chr4	48990476	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=111,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.652:9:2,4:0,2:3,0,6,0
chr4	48994138	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr4	49005844	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,2:9,0:12,10,1,1
chr4	49019232	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=122,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:10,11:5,4:13,2,14,1
chr4	52896050	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=129,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:1,6,0,5
chr4	52926865	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=178,165;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52926865_A_G:52926865:1,0,1,0
chr4	52926871	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=147,165;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:52926865_A_G:52926865:3,0,1,0
chr4	52927113	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=224,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.578:12:2,0:2,7:0,5,1,6
chr4	52928352	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=142,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	52938243	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:5,7:8,6:7,6,7,6
chr4	52943045	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=165,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:16,3:15,0:0|1:52943045_T_G:52943045:17,15,3,0
chr4	52943047	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,58;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:17,3:15,0:0|1:52943045_T_G:52943045:17,15,3,0
chr4	52946161	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr4	52951213	.	CTT	C,CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28,30;MFRL=0,161,164;MMQ=60,60,60;MPOS=32,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.94,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.440,0.437:4:0,1,0:0,1,2:0,0,0,4
chr4	52960908	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr4	53494215	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:15,1:17,2:15,18,2,1
chr4	53728824	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	54011424	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:5,1,4,0
chr4	54218672	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=126,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr4	54243905	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr4	54245476	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=213.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,57:0.983:57:0,30:0,27:0|1:54245476_A_T:54245476:0,0,12,45
chr4	54245499	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,17:0.429:40:15,7:8,10:0|1:54245476_A_T:54245476:4,19,1,16
chr4	54255887	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr4	54256640	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,1:4,5:7,2,4,2
chr4	54280705	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.768:15:2,7:0,5:3,0,12,0
chr4	54310188	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,5:5,2:3,4,6,1
chr4	54310340	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr4	54319011	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr4	54324991	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.521:38:6,7:12,11:1,17,1,19
chr4	54327211	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:4,3:8,2:0|1:54327211_T_TA:54327211:2,13,0,6
chr4	54327235	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,10:0.490:20:4,2:6,7:1|0:54327211_T_TA:54327211:0,10,1,9
chr4	54327584	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=90.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,18:0,6:0,0,24,1
chr4	54327826	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:0,8,0,3
chr4	54362150	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	54373464	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.699:28:5,13:3,6:7,1,17,3
chr4	54852693	.	CTTTTA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TTTTA;STR;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.950:13:0,6:0,5:0,0,13,0
chr4	54853201	.	C	CATTCTGTATTTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr4	54853232	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	54876144	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.111:41:13,0:15,1:35,0,6,0
chr4	54880387	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=217,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr4	54915527	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr4	54930269	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=211,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,8:1,9:1,0,17,0
chr4	54930310	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=178,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.222:32:6,1:6,1:24,0,8,0
chr4	54967709	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,0:0,5:1,2,4,1
chr4	55125058	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:1,7,0,8
chr4	55139978	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	55143692	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.102:29:13,2:11,0:7,19,0,3
chr4	55146406	.	T	TTGTAGGTCCCCCAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.866:5:0,2:0,1:0,0,5,0
chr4	55151711	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	55151727	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:55151727_T_TAA:55151727:0,3,0,1
chr4	55151729	.	G	GTATGTAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:55151727_T_TAA:55151727:0,3,0,1
chr4	55151958	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	55156380	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	55156400	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	55161254	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	55161379	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:8,7,2,0
chr4	55161391	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr4	55161517	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	55561697	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=134,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,3:8,0:12,8,1,2
chr4	55599436	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	55946081	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,12,4
chr4	55948108	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,8:0,0,19,5
chr4	55955232	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	55961159	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:5,1:2,2:0,8,0,3
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chr4	55967971	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55967966_C_T:55967966:0,0,1,0
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chr4	55976947	.	TA	T,AA,TAA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=10,29,16,11;MFRL=142,148,144,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,4,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=5.98,3.04,36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,5,5,18:0.149,0.089,0.500:37:0,0,0,2:1,3,2,3:0,9,2,26
chr4	55980239	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:2,3:1,6:2,1,7,3
chr4	56235897	.	CAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=251,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.543:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr4	56235931	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,2:2,5:3,0,4,3
chr4	56236327	.	G	GTTTCTTTTCAGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=176,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56236327_G_GTTTCTTTTCAGT:56236327:0,2,0,1
chr4	56236329	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=176,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56236327_G_GTTTCTTTTCAGT:56236327:0,2,0,1
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chr4	56236336	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=221,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56236327_G_GTTTCTTTTCAGT:56236327:0,1,0,1
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chr4	56315601	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:22,0:20,3:29,14,2,1
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chr4	56329773	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:3,7:7,5:9,1,13,0
chr4	56337041	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=206,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:0,7,0,7
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chr4	56422737	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:19,2:5,0:18,6,2,0
chr4	56428820	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:8,7:3,10:1,10,0,17
chr4	56447146	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=227,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	56448235	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,6:3,1:5,2,6,1
chr4	56458400	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=308,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr4	56465418	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,2,31
chr4	56471404	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,6:5,5:11,2,10,1
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chr4	56471551	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.584:39:8,12:8,10:4,12,6,17
chr4	56473359	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.605:28:8,9:2,8:11,0,16,1
chr4	56475447	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr4	56502317	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	56730304	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=224,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr4	56734701	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=158.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,20:0,26:0,0,11,35
chr4	56736794	.	T	TTTTG	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTTG;STR;TLOD=64.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.576:30:8,8:5,9:13,0,17,0
chr4	56763085	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,2:6,5:0,8,1,6
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chr4	56763167	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:56763157_TGTATATC_T:56763157:0,1,0,1
chr4	56770490	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:13,1:12,2:26,2,3,0
chr4	56835114	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=266,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,2:0,4:1,0,5,1
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chr4	56835398	.	GCCAC	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=178,182;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:9,0:0|1:56835397_A_T:56835397:0,26,0,2
chr4	56835403	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=181,182;MMQ=60,41;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,2:9,0:0|1:56835397_A_T:56835397:0,24,0,2
chr4	56835405	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=180,182;MMQ=60,41;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,2:10,0:0|1:56835397_A_T:56835397:0,25,0,2
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chr4	56858007	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:11,4:2,5:13,0,8,1
chr4	56883987	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=117,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:8,5:5,6:4,9,4,7
chr4	56885581	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.456:33:9,6:8,8:9,9,5,10
chr4	57176964	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:0|1:57176964_CT_C:57176964:0,3,0,5
chr4	57176966	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0|1:57176964_CT_C:57176964:0,4,0,4
chr4	57180473	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,8:3,3:0,7,5,6
chr4	57180616	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,0:3,2:2,3,0,2
chr4	57180701	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=53,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,2:0,3:1,1,1,4
chr4	57189498	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,12,1
chr4	57190303	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=148,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:17,4:15,0:0|1:57190303_G_C:57190303:13,19,2,2
chr4	57190305	.	C	CGGGCCTCTTCTCTTCT	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=148,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:15,4:15,0:0|1:57190303_G_C:57190303:13,19,2,2
chr4	57190306	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=150,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:16,3:15,0:0|1:57190303_G_C:57190303:13,18,2,2
chr4	57190356	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.392:41:11,7:13,7:17,8,12,4
chr4	57193762	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,2:0,9:0,0,12,0
chr4	57204476	.	C	CTTCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=196,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCT;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr4	57208955	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.335:25:11,3:5,5:17,0,8,0
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chr4	57301496	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr4	57319694	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=166,207;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,1:4,1:7,0,2,0
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chr4	57319731	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=148,195;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:5,0:0|1:57319726_G_T:57319726:17,1,2,0
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chr4	62599289	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,5:0,0,4,11
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chr4	62861941	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,8:3,3:6,0,10,1
chr4	62861964	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:4,7:4,4:6,3,9,2
chr4	65145955	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=69.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,8:0,7:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,17
chr4	65145966	.	T	TAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=64.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,8:0,5:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,15
chr4	65146700	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=177.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.981:47:0,24:0,23:0,0,46,1
chr4	65146711	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=189.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,24:0,28:0,0,51,4
chr4	65165661	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,27:0.459:59:12,7:20,20:27,5,21,6
chr4	65165849	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,26:0.599:43:6,9:11,16:0,17,0,26
chr4	65180310	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,3:2,1:4,0,5,0
chr4	65240805	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:7,6:5,4:11,1,11,0
chr4	66189753	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,3:3,0,6,0
chr4	66217408	.	A	ATCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=196,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:66217408_A_ATCT:66217408:0,1,0,1
chr4	66217411	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=196,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:66217408_A_ATCT:66217408:0,1,0,1
chr4	66218728	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.334:43:12,11:16,3:20,9,13,1
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chr4	66231686	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.298:25:7,4:10,3:14,4,5,2
chr4	66233029	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=111,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,2,1
chr4	66270241	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:0,5,0,6
chr4	66286088	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	66286100	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr4	66468046	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr4	66509194	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=146.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,10:0,28:0,0,2,36
chr4	68338441	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,186;MMQ=60,34;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:27,0:24,5:2,49,0,5
chr4	68357814	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr4	68360955	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:3,5:3,6:4,3,5,6
chr4	68384008	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=118,154;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.455:42:14,12:9,7:12,11,6,13
chr4	68384861	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:13,8:7,8:19,1,16,0
chr4	68396525	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:9,4:5,1:10,4,4,1
chr4	68406626	.	TATTA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:3,3:6,1,4,1
chr4	68442968	.	A	G	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=236.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,73:0.974:74:0,34:1,38:0,1,31,42
chr4	68447040	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,2:5,2:9,3,3,1
chr4	68458937	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,4:7,4:8,2,6,2
chr4	68490019	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.489:33:11,8:5,8:1,16,2,14
chr4	68490044	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=143,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,5:6,5:1,12,0,10
chr4	68490650	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,4,1
chr4	68492060	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:11,8:0,6:7,4,11,3
chr4	68496080	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	68497333	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,8:4,6:9,1,14,0
chr4	68499205	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:6,2:0,0:3,6,0,2
chr4	68500056	.	GA	G	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:16,2:17,1:5,43,0,4
chr4	68511775	.	C	CACCTAGCCATCCG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=197,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:68511775_C_CACCTAGCCATCCG:68511775:1,2,0,1
chr4	68511778	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=197,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:68511775_C_CACCTAGCCATCCG:68511775:1,2,0,1
chr4	68511780	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:1,0:0|1:68511775_C_CACCTAGCCATCCG:68511775:0,2,0,1
chr4	68514739	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,8:8,3:12,1,10,1
chr4	68528744	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=196,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr4	68530890	.	GA	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,54;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:19,3:26,1:32,13,3,1
chr4	68539539	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:4,2:4,3:0,8,0,5
chr4	68544318	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:8,7:8,4:2,14,0,11
chr4	68547165	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,6:4,2:12,0,8,0
chr4	68547809	.	A	ATAC	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=167.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,44:0.517:85:25,24:15,18:39,2,37,7
chr4	68547956	.	C	A	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=144,93;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,4:0.058:83:41,0:38,1:11,68,0,4
chr4	68700956	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr4	68780253	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=198,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:2,5:2,3:4,0,9,0
chr4	68780512	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,3:2,3:0,8,0,6
chr4	68788694	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	68829207	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr4	68919617	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:5,4:7,6:9,3,8,3
chr4	68934306	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,1:2,7:5,0,6,2
chr4	68937948	.	A	AAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AT;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	68938002	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:1,0,3,0
chr4	68956422	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=130,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:0,5:1,2:0,1,0,8
chr4	68956433	.	CC	GA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr4	68956445	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=170,287;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68956445_G_C:68956445:0,1,0,1
chr4	68956447	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=170,287;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68956445_G_C:68956445:0,1,0,1
chr4	68964768	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=122,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,1,4
chr4	69057073	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,4:3,1:5,4,4,1
chr4	69083563	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:10,8:12,5:16,6,9,4
chr4	69094926	.	TTAAA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:3,9:9,2:8,7,7,4
chr4	69097150	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	69098006	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.298:31:12,4:9,4:22,0,9,0
chr4	69100396	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=182,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:3,1:0,7,1,3
chr4	69181942	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=204,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,3:7,0:12,0,3,0
chr4	69332537	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr4	69337105	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:1,1:2,0:3,1,2,0
chr4	69340500	.	A	G	.	.	DP=119;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=192.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,64:0.544:118:29,38:23,26:17,37,15,49
chr4	69342169	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.367:47:20,6:10,11:2,28,2,15
chr4	69343353	.	A	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=236.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,33:0,36:0,0,23,48
chr4	69344733	.	G	T	.	.	DP=138;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=430.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,130:0.993:130:0,62:0,67:0,0,49,81
chr4	69362301	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.493:43:8,11:12,10:21,1,21,0
chr4	69434217	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	69681675	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	69682471	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr4	69683953	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=117.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,0,31
chr4	69687964	.	G	A	.	.	DP=123;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=363.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,113:0.992:113:0,49:0,56:0,0,61,52
chr4	69687987	.	C	A	.	.	DP=138;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=457.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,136:0.993:136:0,62:0,73:0,0,52,84
chr4	69795871	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	69796548	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr4	69796838	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,18,3
chr4	69810923	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	69964180	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr4	69964209	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,2:4,0,6,0
chr4	69964234	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.716:16:3,5:1,5:4,0,11,1
chr4	69973044	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:4,7:11,7:0,15,0,14
chr4	69978554	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=180,243;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.264:9:0,0:4,1:2,5,0,2
chr4	70152685	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:0,3,0,4
chr4	70346680	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,6:7,2:1,11,0,8
chr4	70346711	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:0,5,0,7
chr4	70465153	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,2:2,3:1,4,0,5
chr4	70504823	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:11,7:4,6:4,11,5,8
chr4	70505254	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:20,3:23,0:30,13,4,0
chr4	70592790	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr4	70599073	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr4	70620708	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr4	70803380	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,5:3,5:8,0,10,0
chr4	70805829	.	TCACA	T,TCA	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=33,31,33;MFRL=183,163,162;MMQ=60,60,60;MPOS=14,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=CA;STR;TLOD=40.60,4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,12,3:0.647,0.093:21:3,4,1:3,6,2:0,6,0,15
chr4	70805833	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.354:42:10,3:11,8:2,24,0,16
chr4	70805835	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.112:38:12,0:11,3:2,32,0,4
chr4	70810524	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:7,0:15,1,2,0
chr4	70811806	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:5,10:10,7:13,2,15,2
chr4	70824865	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:0,4,0,8
chr4	70824887	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr4	70826810	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr4	70864065	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,3,0
chr4	70865621	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr4	70921164	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:4,1,8,1
chr4	70921337	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:1,4,0,5
chr4	71020205	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr4	71021888	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=135.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,26:0,11:0,0,1,36
chr4	71024010	.	T	TACAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	71027213	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=149.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,20:0,25:0,0,40,5
chr4	71062342	.	C	T	.	.	DP=120;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=129.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,49:0.431:114:37,28:28,21:29,36,24,25
chr4	71067317	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=80.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,0,23
chr4	71110488	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr4	71110505	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr4	71110639	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr4	71110680	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=151,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,1:2,2:0,4,1,3
chr4	71113633	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.382:40:11,5:13,10:1,24,0,15
chr4	71114676	.	TATA	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=ATA;STR;TLOD=53.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.399:41:18,9:5,7:17,8,12,4
chr4	71114702	.	A	AT	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.491:46:15,11:7,11:9,14,16,7
chr4	71115152	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,4:0,0,7,10
chr4	71227802	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=147,168;MMQ=27,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=115.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,34:0.899:37:2,20:1,14:3,0,29,5
chr4	71227998	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,6:0,8:0|1:71227998_A_T:71227998:0,0,1,14
chr4	71228001	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0|1:71227998_A_T:71227998:0,0,1,14
chr4	71232701	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:1,4:6,1:0,7,3,3
chr4	71232742	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=208,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr4	71232778	.	T	TCCCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	71250308	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr4	71250399	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr4	71255370	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,174;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:4,8:5,4:7,2,12,1
chr4	71255593	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=90,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.560:30:5,10:7,6:9,4,9,8
chr4	71275012	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,19,0
chr4	71384579	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr4	71388379	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,15,1
chr4	71388394	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=70.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,19,1
chr4	71394346	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.128:35:15,4:14,0:29,2,4,0
chr4	71394353	.	CA	TG	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=157,145;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:18,2:18,0:35,3,2,0
chr4	71394354	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.138:39:15,5:17,0:31,3,5,0
chr4	71394362	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.090:52:20,3:21,0:43,5,3,1
chr4	71394367	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.136:49:17,7:23,0:37,5,6,1
chr4	71398064	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=164.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,22:0,27:0,0,40,9
chr4	71459041	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:71459041_T_C:71459041:10,7,1,1
chr4	71459050	.	C	CCAAAAGAGTG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:10,2:0|1:71459041_T_C:71459041:12,9,1,1
chr4	71459055	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,1:0|1:71459041_T_C:71459041:11,10,1,1
chr4	71467346	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:8,0:1,15,0,2
chr4	71471985	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,4:8,3:7,6,4,3
chr4	71472426	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.541:35:7,10:9,9:9,7,8,11
chr4	71497661	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=152,129;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:10,0:15,3:3,23,0,3
chr4	71498303	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,33:0.531:62:17,20:12,13:29,0,31,2
chr4	71501674	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,6:5,2:0,9,0,9
chr4	71554619	.	CGAG	C	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GAG;STR;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,5:0.092:62:23,1:29,4:25,32,2,3
chr4	71588432	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=165,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:71588432_A_T:71588432:8,15,1,1
chr4	71588444	.	C	CCATCCCCAGCTGCACCACA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=119,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:5,0:11,2:0|1:71588432_A_T:71588432:7,13,1,1
chr4	71691743	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,5,1
chr4	71691975	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,6:4,5:2,5,2,9
chr4	71698183	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,4,11
chr4	71892513	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=139.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,17:0,0,2,40
chr4	72306239	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr4	72306560	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr4	72316023	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=233,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72316023_G_A:72316023:1,0,1,0
chr4	72316032	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=197,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:72316023_G_A:72316023:3,0,1,0
chr4	72316822	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr4	72317018	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=113,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:17,1:24,1:12,29,0,3
chr4	72319431	.	G	GATTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=219,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:72319431_G_GATTTT:72319431:0,3,0,1
chr4	72319436	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=219,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:72319431_G_GATTTT:72319431:0,3,0,1
chr4	72397710	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	72397964	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,2:1,1:0,1,1,3
chr4	72411967	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	72412029	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=129,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:2,1,7,0
chr4	72413314	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=209,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,3:6,3:7,1,5,1
chr4	72423624	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr4	72429433	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	72429452	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	72618334	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:12,7:5,0:7,10,4,3
chr4	72620865	.	C	CTATTTATT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TATT;STR;TLOD=41.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.930:10:0,2:0,4:0,0,0,10
chr4	72622403	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,8,7
chr4	72634192	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,150;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:5,1:4,1:0,9,0,3
chr4	72634975	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr4	72934632	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=107.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,16:0,0,29,1
chr4	73012683	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=104,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr4	73156676	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:10,1:11,1:14,8,0,2
chr4	73175048	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=169,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:3,0:0,4:3,0,3,1
chr4	73175093	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr4	73205240	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,2:4,0:7,8,0,2
chr4	73414286	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:5,6:2,9:3,4,6,9
chr4	73433122	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:4,6:6,4:7,4,3,7
chr4	73434379	.	GT	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=104.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,29:0,11:0,0,34,6
chr4	73434535	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.200:32:8,4:16,3:0,25,0,7
chr4	73927445	.	AAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,14;MFRL=195,156;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,0:0|1:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927448	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,15;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,0:0,0:1|0:73927445_AAAG_A:73927445:0,0,1,0
chr4	73927452	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=-1073741810;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:73927445_AAAG_A:73927445:0,0,2,0
chr4	73927456	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=14,10;MFRL=195,156;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927459	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=16,18;MFRL=195,156;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927460	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=16,20;MFRL=156,195;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1|0:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927464	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=9,12;MFRL=156,195;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1|0:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927470	.	TCT	GAA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,17;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1|0:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927476	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,17;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.498:2:1,0:0,0:1|0:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73931170	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr4	73933671	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=136,156,119;MMQ=60,60,60;MPOS=19,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=TG;STR;TLOD=20.08,3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,3:0.640,0.245:13:0,7,1:1,2,2:1,0,12,0
chr4	73933919	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=193,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:6,0:3,4:0,10,0,4
chr4	74005613	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:10,7:11,8:14,7,11,4
chr4	74008195	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:1,2:7,0:1,7,0,2
chr4	74010555	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=10,32;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,2:1,0:1,3,0,2
chr4	74014809	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:6,9:10,4:0,16,0,13
chr4	74285204	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:2,1:1,0:10,2,2,0
chr4	74286122	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:0,7,0,3
chr4	74302800	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:8,0,6,0
chr4	74304118	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	74307954	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,52;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,0,2
chr4	74309245	.	C	CACATGCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,2:4,0:0,12,0,2
chr4	74313169	.	T	C	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=312.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,87:0.989:87:0,45:0,38:0,0,36,51
chr4	74352916	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr4	74354469	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,2:3,6:3,6,2,6
chr4	74357851	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,1:4,7:1,7,0,8
chr4	74364992	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.651:15:2,5:1,4:0,5,0,10
chr4	74367706	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr4	74447452	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:6,2:4,6:8,2,6,2
chr4	74448078	.	ATCT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=209,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:5,2:5,5:0,10,0,7
chr4	74450830	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,8:2,2:8,0,10,0
chr4	74451073	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,100;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,16:0.708:22:3,10:2,5:0|1:74451073_A_G:74451073:2,4,5,11
chr4	74451092	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:4,6:3,3:0|1:74451073_A_G:74451073:1,6,1,8
chr4	74453656	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.561:41:7,10:10,13:6,12,9,14
chr4	74453691	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:5,6:6,11:0,11,4,13
chr4	74464285	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=128,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	74464443	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	74486052	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr4	74486264	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	74607160	.	CATAGTCTCCAA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:7,1:25,0,2,0
chr4	74713799	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr4	74713950	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr4	74714003	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,5:4,4:10,0,9,0
chr4	74719259	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,2:2,4:0,4,0,7
chr4	74719925	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	74735244	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=209,202;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr4	74736144	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr4	74847292	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,7:0,0,2,17
chr4	74903137	.	T	TCCCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=223,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	75040944	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr4	75147041	.	C	CGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=GT;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:2,2:2,0:4,0,3,0
chr4	75245343	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr4	75248544	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,1,12
chr4	75673363	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr4	75673455	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	75675706	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,21,0
chr4	76442241	.	TTTTTTG	T,GTTTTTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,15,34;MFRL=193,108,121;MMQ=55,60,60;MPOS=13,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:1,0,1:0,4,0,2
chr4	76525648	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr4	76528916	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,10;MFRL=208,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:76528916_C_A:76528916:2,0,2,0
chr4	76528919	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,24;MFRL=208,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:0,0:0|1:76528916_C_A:76528916:2,0,2,0
chr4	76532615	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76532615_G_A:76532615:0,0,0,1
chr4	76532617	.	C	CTCCAGAACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76532615_G_A:76532615:0,0,0,1
chr4	76573938	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.200:20:6,0:7,4:2,14,0,4
chr4	76649924	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:6,3:13,5:18,1,8,0
chr4	76650026	.	TG	T	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,5:0.052:93:45,3:37,1:48,40,3,2
chr4	76650176	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:8,7:4,9:0,12,0,16
chr4	76678576	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:4,5:9,10:12,1,15,0
chr4	76695810	.	TTCTC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,2:4,7:8,4,9,1
chr4	76721414	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:8,0,8,0
chr4	76721459	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:8,6:5,4:11,2,10,1
chr4	76721705	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=214,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,1:4,1:4,4,1,1
chr4	76722041	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr4	76722422	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,7:6,3:0,9,0,10
chr4	76725245	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,26,1
chr4	76726528	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,2:3,1:0,8,0,3
chr4	76726539	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=175,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:4,1:0,8,0,2
chr4	76727576	.	GT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.607:31:3,9:7,10:12,0,19,0
chr4	76730004	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,18,0
chr4	76730061	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=161.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,29:0,18:0,0,37,10
chr4	76730195	.	A	G	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,38:0.379:100:33,25:28,11:19,43,10,28
chr4	76730258	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=164.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,22:0,0,0,43
chr4	76734266	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:7,2:13,1:20,0,3,0
chr4	76734343	.	C	T	.	.	DP=112;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=119.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,45:0.431:105:25,25:33,20:28,32,23,22
chr4	76785716	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,0,12
chr4	76785723	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,0,10
chr4	76785736	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr4	76788451	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,156;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.136:24:11,2:10,0:20,1,3,0
chr4	76804067	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr4	76805692	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	76805962	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	76805978	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr4	76809319	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr4	76811365	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	76813200	.	GAGGA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	76841962	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,4:14,0:12,16,0,4
chr4	76861137	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:8,2,7,1
chr4	76861859	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	76878956	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,29:0.556:52:16,18:7,11:23,0,28,1
chr4	76878982	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=113.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,37:0.584:63:16,23:10,13:25,1,33,4
chr4	76891385	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,40;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:6,0:2,2:9,0,2,0
chr4	76892452	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr4	76903036	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:4,3:5,4:8,1,6,1
chr4	76924933	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=220,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:0,1,0,4
chr4	76942943	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=235,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr4	76943235	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,4:5,6:0,9,0,11
chr4	76943677	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,2,2
chr4	76943764	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr4	76944491	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:8,6:3,5:7,4,10,1
chr4	76956289	.	C	CAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=65.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:5,5:11,13:7,10,9,9
chr4	76956528	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:4,4:12,7:3,13,3,8
chr4	76957171	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=89,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.764:17:1,6:2,8:0,3,6,8
chr4	76996957	.	CG	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,6:5,5:9,1,11,0
chr4	76996981	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:8,10:10,7:17,1,17,0
chr4	76997157	.	G	GT,GTT,GTTT	.	.	DP=84;ECNT=6;MBQ=29,25,30,14;MFRL=134,132,149,143;MMQ=60,60,60,50;MPOS=21,21,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,16,17,18;RU=T;STR;TLOD=4.92,10.25,8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:22,6,7,8:0.146,0.183,0.192:43:13,2,4,2:5,2,2,1:5,17,5,16
chr4	76997200	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=154,156;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,18:0.500:36:14,16:4,2:0|1:76997200_A_G:76997200:0,18,0,18
chr4	76997219	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=169,168;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.355:29:10,10:3,0:0|1:76997200_A_G:76997200:0,19,0,10
chr4	76997224	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=175,168;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:13,9:2,0:0|1:76997200_A_G:76997200:0,16,0,10
chr4	76997226	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=181,156;MMQ=55,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:15,6:2,0:0,17,0,6
chr4	76997227	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=169,203;MMQ=52,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:19,2:2,0:0,21,0,2
chr4	77020207	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=165,112;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.089:31:14,2:11,0:0|1:77020207_C_CT:77020207:0,29,0,2
chr4	77020208	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,8:0.288:29:12,5:9,2:0|1:77020207_C_CT:77020207:0,21,0,8
chr4	77021551	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=185,164;MMQ=40,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:0,9,0,4
chr4	77021811	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=169,185;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:77021811_C_G:77021811:4,0,1,0
chr4	77021815	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=169,185;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:77021811_C_G:77021811:4,0,1,0
chr4	77025840	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:0,6,2,6
chr4	77028783	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr4	77036593	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:20,3:12,0:16,18,2,1
chr4	77038757	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:7,6:2,5:9,0,7,4
chr4	77065476	.	TA	T,TAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=155,158,184;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=10.70,21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,12:0.228,0.476:25:3,6,5:4,0,4:6,1,11,7
chr4	77189928	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:7,0:8,4:0|1:77189928_A_T:77189928:4,11,1,3
chr4	77189931	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:5,0:8,4:0|1:77189928_A_T:77189928:3,11,1,3
chr4	77192688	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,3:2,5:1,1,6,2
chr4	77199414	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=172,233;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr4	77201332	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	77204500	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.571:35:8,11:6,9:11,4,13,7
chr4	77227856	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	77272926	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:5,8:4,6:5,4,4,11
chr4	77274242	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,20,0
chr4	77288683	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:7,12,1,1
chr4	77288973	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77288973_G_GA:77288973:0,1,0,1
chr4	77288974	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77288973_G_GA:77288973:0,1,0,1
chr4	77288977	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77288973_G_GA:77288973:0,1,0,1
chr4	77303898	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr4	77476964	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77476964_T_C:77476964:0,0,0,1
chr4	77476966	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77476964_T_C:77476964:0,0,0,1
chr4	77476971	.	CTA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77476964_T_C:77476964:0,0,0,1
chr4	77476975	.	C	CAAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77476964_T_C:77476964:0,0,0,1
chr4	77662309	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=215,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr4	77677612	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.149:32:10,0:13,0:15,12,5,0
chr4	77680694	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,1:13,1:16,8,2,0
chr4	77817507	.	C	CAGAAAGCGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	77871016	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,2,1
chr4	77976617	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=187,255;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:2,1:0,0:0,5,0,3
chr4	77987351	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:1,0,5,0
chr4	78082563	.	TATTTAAAATC	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTTAAAATC;STR;TLOD=60.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.572:28:5,4:4,12:9,3,13,3
chr4	78694327	.	TA	T,TAA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,32,31;MFRL=154,215,123;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=17.21,4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,10,6:0.335,0.203:29:2,2,4:10,7,1:0,13,1,15
chr4	78695723	.	C	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:34,3:20,0:35,20,3,0
chr4	78697552	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	78793016	.	AT	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.093:52:24,4:22,1:12,35,1,4
chr4	78806526	.	TAA	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,0:8,2:4,17,1,1
chr4	78806601	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=188,236;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	78815272	.	CT	C,CTT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=147,154,137;MMQ=60,60,60;MPOS=25,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.06,4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,4,4:0.117,0.138:33:9,3,0:16,1,2:24,1,8,0
chr4	78873605	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,7:7,5:9,3,10,2
chr4	78873629	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.456:33:10,8:8,7:11,7,10,5
chr4	78979141	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,1,1
chr4	78979257	.	CGT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.299:11:4,2:3,1:3,5,1,2
chr4	78979301	.	A	AAGGGAAGAATGAAGAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=163,97;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	79173515	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,54545;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	79176325	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr4	79176361	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.942:13:0,10:0,3:0,0,12,1
chr4	79187900	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=200,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,0,2
chr4	79188160	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	79204164	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr4	79204209	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	79205699	.	T	A	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,39:0.563:69:12,24:18,15:11,19,20,19
chr4	79205747	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.531:34:5,12:10,6:1,15,2,16
chr4	79207784	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	79229435	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=94,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,1:2,5:1,3,0,6
chr4	79238448	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	79238496	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=153,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,1,1
chr4	79240196	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,4:6,0:0,7,2,2
chr4	79295418	.	C	CTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr4	79305148	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.452:40:13,11:9,7:20,2,18,0
chr4	79305177	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,33:0.522:63:13,17:17,15:21,9,23,10
chr4	79328729	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr4	79334264	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,4:8,3:4,8,3,4
chr4	79340016	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=256,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	79343111	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.592:13:0,4:4,2:2,3,3,5
chr4	79343213	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=236,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
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chr4	79366655	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=116,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,5:6,4:6,5,6,3
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chr4	79373254	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,16,0
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chr4	79387278	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
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chr4	79391327	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=110,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr4	79394836	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr4	79396695	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,0:10,2:3,13,0,2
chr4	79403146	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,3:4,5:0,8,1,7
chr4	79403682	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.481:31:8,6:8,8:1,15,4,11
chr4	79403781	.	TT	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=219,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr4	79409997	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr4	79421011	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.592:42:10,11:7,14:10,7,11,14
chr4	79434487	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,6:2,1:8,0,7,0
chr4	79434685	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=112,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:3,4:4,2:1,6,0,7
chr4	79436875	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=226,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr4	79436888	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr4	79437178	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.489:26:4,5:9,5:3,10,2,11
chr4	79440425	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr4	79442799	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:1,1:1,3:0,2,0,4
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chr4	79443837	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:4,3,4,2
chr4	79443850	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:2,3,4,0
chr4	79444029	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=125,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr4	79444043	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=176,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr4	79455858	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	79458112	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:2,1,3,1
chr4	79460660	.	A	ATGATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr4	79462311	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr4	79475494	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	79503230	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=152,202;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr4	79512800	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.532:26:8,5:4,8:0,12,2,12
chr4	79516694	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=201,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr4	79531186	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:8,2:2,5:9,2,4,3
chr4	79531308	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:0,4,2,5
chr4	79697892	.	AGGCTC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=99,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:3,3,0,2
chr4	79768294	.	TTA	T,TTATA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=168,136,184;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=TA;STR;TLOD=9.25,3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,4,2:0.130,0.081:33:15,2,2:12,2,0:24,3,4,2
chr4	79780667	.	TTATAATGTGCCCCTAAGTAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=136,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:2,0:8,0,2,0
chr4	79786974	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr4	79792166	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr4	79847634	.	GA	G,GAA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,35,26;MFRL=149,84,151;MMQ=60,60,60;MPOS=18,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.29,5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,5,5:0.134,0.141:35:8,3,1:15,2,2:21,4,8,2
chr4	80828668	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,1,12
chr4	80828740	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	80905851	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr4	80905930	.	G	GA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.203:35:15,5:12,1:18,10,4,3
chr4	80906131	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	80939979	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=86.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,18:0,7:0,0,25,0
chr4	80957195	.	GAA	G,GA,CAA,GAAA	.	.	DP=106;ECNT=1;MBQ=17,18,18,19,18;MFRL=144,145,117,116,145;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=21,26,20,20;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=4.60,10.08,3.83,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:38,3,8,4,5:0.048,0.110,0.057,0.088:58:4,0,1,1,1:2,1,0,0,1:3,35,1,19
chr4	80975372	.	A	T	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=289.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,89:0.989:89:0,47:0,42:0,0,66,23
chr4	80976420	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,12:0,0,12,13
chr4	81123013	.	CGT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,1:4,2:11,1,2,1
chr4	81884610	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=60.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.919:22:0,7:1,12:1,0,20,1
chr4	82013619	.	A	AAAGGAAGG,AAAGGAAGGAAGG	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=0,28,32;MFRL=0,158,162;MMQ=60,40,36;MPOS=1,8;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,14,15;RU=AAGG;STR;TLOD=4.65,6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.431,0.451:5:0,1,1:0,1,1:0,0,0,5
chr4	82056304	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:16,8,2,0
chr4	82065566	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=230,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr4	82088478	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=212,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,3:3,2:0,6,0,5
chr4	82092967	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,2:8,2:3,7,0,4
chr4	82366788	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=135,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.425:12:5,2:2,3:2,5,2,3
chr4	82368633	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:7,8:10,6:14,3,12,2
chr4	82368705	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,1:17,1:8,19,1,1
chr4	82369160	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	82369205	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr4	82369494	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr4	83294641	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=21,10;MFRL=128,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.074:46:23,1:16,0:0|1:83294641_T_G:83294641:21,21,4,0
chr4	83294645	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.072:47:16,3:11,0:0|1:83294641_T_G:83294641:20,23,4,0
chr4	83294649	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=20,9;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.066:46:24,0:16,0:0|1:83294641_T_G:83294641:19,24,3,0
chr4	83347106	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,4:3,5:5,0,9,0
chr4	83347309	.	TAAGA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=175.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,20:0,20:0,0,12,28
chr4	83347859	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,781;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr4	83378264	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=158,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0,4,0,1
chr4	83411197	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,253;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,1:2,0,3,1
chr4	83424089	.	TA	T,TAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30,26;MFRL=132,127,179;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.76,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,5,3:0.186,0.150:24:6,2,1:5,3,1:10,6,4,4
chr4	83558064	.	G	GAGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:4,1:0,0:0,5,0,1
chr4	83602112	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	83626382	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:6,8:2,4:7,1,12,1
chr4	83742336	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,1:1,1:0,4,1,2
chr4	83778378	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	83785778	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,38;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:3,5,1,1
chr4	83788139	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=156.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,21:0,23:0,0,4,41
chr4	83788562	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	83791649	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	83793243	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,11:0,0,9,13
chr4	83800181	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,0,23
chr4	83827822	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=234,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,6:2,3:0,3,0,9
chr4	83852065	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,15,4
chr4	83857108	.	AT	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,6:2,3:5,0,8,1
chr4	83857402	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=163.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,23:0,23:0,0,42,6
chr4	83857613	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:1,11,0,3
chr4	83900260	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	83970297	.	CT	C,CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34,20;MFRL=146,180,174;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.13,4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.266,0.324:10:1,0,2:2,3,0:4,0,4,2
chr4	83989516	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	83989571	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,1:7,2:9,3,3,2
chr4	84015940	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,3:0.053:73:34,0:34,3:18,52,0,3
chr4	84185613	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr4	84189012	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	84193366	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,10:0,0,1,10
chr4	84200317	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,3:5,4:0,6,0,7
chr4	84205618	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.461:35:9,8:6,7:15,4,12,4
chr4	84223461	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr4	84229897	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	84232104	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	84234190	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=203,180;MMQ=47,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr4	84234229	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	84240654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	84240680	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.881:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	84243549	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	84352750	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,5:4,5:8,0,10,0
chr4	84362443	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:13,11:3,5:11,5,13,3
chr4	84364808	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=131,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr4	84367286	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:0,9,0,4
chr4	84368225	.	GCATTGTGGCCAATGCCTGTAATCC	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=212,157;MMQ=46,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.640:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr4	84368276	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,35;MFRL=142,226;MMQ=60,32;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:84368276_AG_GA:84368276:0,1,0,1
chr4	84368280	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,32;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84368276_AG_GA:84368276:0,0,0,1
chr4	84368285	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,32;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84368276_AG_GA:84368276:0,0,0,1
chr4	84368287	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,32;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84368276_AG_GA:84368276:0,0,0,1
chr4	84370091	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.580:41:4,11:13,12:3,14,6,18
chr4	84370124	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,4:3,3:0,3,0,8
chr4	84376725	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:14,0:8,2:0|1:84376725_T_C:84376725:2,20,1,1
chr4	84376730	.	C	CAAAAGGAACCGTCCAAGCT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:6,2:0|1:84376725_T_C:84376725:2,21,1,1
chr4	84376743	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,4:0,0,1,14
chr4	84381035	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:6,4:0,10,0,5
chr4	84382058	.	CA	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=101,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.496:41:10,9:11,10:17,4,17,3
chr4	84383810	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,28:0.482:58:15,13:15,14:15,15,10,18
chr4	84393475	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,32:0.506:63:13,12:18,19:6,25,4,28
chr4	84403491	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	84465613	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.772:20:2,11:2,4:4,0,16,0
chr4	84465855	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr4	84509465	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,1,9
chr4	84519775	.	AT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=33,32,33,33;MFRL=139,172,122,138;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,19,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.05,30.54,5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:33,5,22,8:0.071,0.344,0.106:68:17,3,9,5:15,2,13,2:29,4,27,8
chr4	84525973	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	85555196	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	85555199	.	G	GGCTGTTTGTATATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	85556386	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=126,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr4	85556392	.	CTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:2,1:2,0:4,1,1,0
chr4	85560000	.	TTA	T,TTATA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34,30;MFRL=133,175,166;MMQ=60,60,60;MPOS=27,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=TA;STR;TLOD=10.73,7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,3:0.294,0.256:13:3,3,1:3,1,1:5,1,7,0
chr4	85612737	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:0,1:4,2:4,1,3,0
chr4	85634488	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	85639779	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,2:5,2:0,5,0,4
chr4	85647941	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,1:1,2:7,0,3,0
chr4	85648097	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=160,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.326:10:2,0:4,2:0,7,0,3
chr4	85656350	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	85699579	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:8,7:3,6:11,0,13,0
chr4	85710824	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=12,30;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,7:0,8:1,0,18,2
chr4	85716119	.	G	A	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,4:0.049:99:40,0:52,4:26,69,0,4
chr4	85722718	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	85729647	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:1,12,0,3
chr4	85731549	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:85731549_A_G:85731549:0,0,0,1
chr4	85731551	.	A	ATACATTGAATGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85731549_A_G:85731549:0,0,0,1
chr4	86863166	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,3:7,4:10,0,7,0
chr4	86863206	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=57.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,4:0,16:0,0,19,3
chr4	86863490	.	GTGA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=175,230;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:86863490_GTGA_G:86863490:0,2,0,1
chr4	86863497	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=175,230;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:86863490_GTGA_G:86863490:0,2,0,1
chr4	86915923	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.374:33:6,4:12,8:12,9,9,3
chr4	86921612	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,2:3,4:2,3,2,4
chr4	87610236	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.068:57:27,2:24,1:30,24,2,1
chr4	87674183	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:16,3:6,6:12,10,4,5
chr4	87690982	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:22,1:26,2:26,23,1,2
chr4	87690998	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,22:0.383:58:19,10:17,11:19,17,15,7
chr4	87695731	.	G	GTAAATTAAAAATCTTCTGGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	87728676	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr4	87754419	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:4,2,4,0
chr4	87809515	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	87812586	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=33,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.794:11:0,3:0,5:1,1,7,2
chr4	87928637	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=136,37;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.261:11:3,0:6,2:0|1:87928637_C_CA:87928637:4,5,1,1
chr4	87928642	.	G	GTGCATGTATCCCGCTGTTGTTGTCACTGGTCTCTGAGTCGCA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=131,37;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.267:10:3,0:3,2:0|1:87928637_C_CA:87928637:2,6,1,1
chr4	87968798	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr4	88029482	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr4	88036460	.	G	GAACTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	88048163	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr4	88048315	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.898:6:0,0:0,2:0,0,0,6
chr4	88048328	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	88052219	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,13,11
chr4	88053085	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr4	88056719	.	GT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=71.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.937:30:0,12:0,16:0,1,15,14
chr4	88056925	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:0,6:1,11:0,1,0,17
chr4	88085076	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.302:27:7,3:12,4:9,10,5,3
chr4	88226480	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	88231338	.	GC	AA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=152,152;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.433:9:2,0:2,0:0|1:88231338_GC_AA:88231338:2,3,4,0
chr4	88231350	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=150,156;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.194:17:4,0:7,0:0|1:88231338_GC_AA:88231338:5,9,3,0
chr4	88231429	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.419:48:15,9:12,11:7,21,9,11
chr4	88234874	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	88238448	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	88293769	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chr4	88293992	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,0:0,9:0,0,3,6
chr4	88295786	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,9:0,0,23,0
chr4	88312251	.	GTT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=216,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,0:2,1:0,3,0,2
chr4	88312293	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	88356111	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:4,2,6,1
chr4	88362904	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,5:9,3:18,0,8,0
chr4	88532182	.	AGT	A,AGTGTGT,AGTGTGTGT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,33,20,26;MFRL=109,126,202,155;MMQ=37,60,50,42;MPOS=22,12,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,15,18,19;RU=GT;STR;TLOD=8.92,4.23,3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,4,2,3:0.243,0.216,0.334:11:1,1,1,2:1,3,1,1:0,2,0,9
chr4	88533163	.	TTG	T,TTGTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29,33;MFRL=0,159,189;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=TG;STR;TLOD=5.87,10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.336,0.565:6:0,1,1:0,1,3:0,0,6,0
chr4	88535826	.	G	A	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=105.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,48:0.509:93:24,20:16,16:28,17,18,30
chr4	88536520	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,88;MMQ=60,57;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=201.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,27:0,27:0,0,41,25
chr4	88536868	.	TAGTGACAGCAGCAATAGC	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=120,134;MMQ=31,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.411:45:10,4:4,7:12,15,8,10
chr4	88537737	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,3:4,5:0,8,0,8
chr4	88577573	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=159,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	88577754	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr4	88578310	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,1:6,5:0,10,0,6
chr4	88732453	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,16:0,9:0,0,24,1
chr4	88732639	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=105,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.056:68:27,2:37,1:33,32,1,2
chr4	88732692	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=90,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,34:0.524:65:15,16:14,18:9,22,11,23
chr4	88755828	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr4	88759690	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,14,1
chr4	88901100	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr4	88959381	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,7:2,1:3,0,7,1
chr4	88959745	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr4	88977247	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,2:7,0:13,8,2,0
chr4	88986745	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:0,2:4,1:1,4,2,1
chr4	89015619	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	89015857	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,5:3,3:1,3,2,6
chr4	89016782	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:5,5:8,9:1,12,1,13
chr4	89018565	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.538:26:5,5:7,9:9,3,13,1
chr4	89022362	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:9,4:2,3:7,4,3,4
chr4	89326077	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:18,0:15,2:16,17,1,1
chr4	89349921	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:10,6:5,5:4,11,0,11
chr4	89352469	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:9,2:3,3:6,9,2,3
chr4	89359045	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=204,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0,11,0,2
chr4	89360994	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=196,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr4	89389640	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	89400454	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=143,116;MMQ=60,46;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.395:10:1,0:2,0:5,1,4,0
chr4	89400457	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=143,116;MMQ=60,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:3,0:5,1,4,0
chr4	89400460	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=131,158;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:3,1:7,1,2,0
chr4	89427070	.	CGTT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GTT;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.458:9:4,3:1,1:0,5,1,3
chr4	89575324	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:0,5,0,5
chr4	89583523	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr4	89585235	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,4:2,4:7,0,8,0
chr4	89588689	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:9,2:8,7:0,17,0,9
chr4	89599074	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr4	89599307	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:89599307_C_A:89599307:0,3,0,1
chr4	89599313	.	A	AATTCTCTTTTTTGGTTGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:89599307_C_A:89599307:0,4,0,1
chr4	89618498	.	C	CTCTTCTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,2:11,0:6,11,0,2
chr4	89649659	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,4:4,4:4,1,7,1
chr4	89670962	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:10,2:16,9,2,0
chr4	89671810	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=100,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	89708804	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,36;MFRL=240,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr4	89708850	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	89772341	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,0:0,0:0,1,0,2
chr4	89912345	.	GTAACAA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=120,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr4	89912361	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=238,208;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:89912361_C_CA:89912361:0,4,0,1
chr4	89912362	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=238,208;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:89912361_C_CA:89912361:0,4,0,1
chr4	89912366	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=238,208;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:89912361_C_CA:89912361:0,4,0,1
chr4	89941921	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chr4	89950665	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:13,1:13,2:14,12,3,0
chr4	90036099	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=213,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:90036099_G_A:90036099:0,2,0,2
chr4	90036101	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=213,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:90036099_G_A:90036099:0,2,0,2
chr4	90168882	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:5,7:8,10:12,1,16,1
chr4	90743317	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.771:11:1,6:1,3:0|1:90743317_T_TC:90743317:2,0,8,1
chr4	90743331	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0|1:90743317_T_TC:90743317:2,0,8,1
chr4	90816790	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.589:27:2,7:8,8:1,10,0,16
chr4	90855932	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:9,4:1,5:7,3,7,2
chr4	90874095	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr4	91234040	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=135,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.078:57:28,4:22,0:33,20,2,2
chr4	91234250	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	91549156	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.714:22:1,7:5,9:6,0,15,1
chr4	91760014	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,196;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:15,2:23,1:39,2,3,0
chr4	93511481	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.414:22:5,5:8,4:0,13,2,7
chr4	94032125	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.581:17:5,7:2,3:1,6,2,8
chr4	94547357	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr4	94750058	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:5,5:10,2:14,1,7,0
chr4	94751674	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=199,173;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:1,1:1,4,1,2
chr4	95155348	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr4	95170783	.	CT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:14,1:11,2:26,0,4,0
chr4	95199986	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,2:14,0:10,12,1,1
chr4	95201723	.	GTGTTT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=174,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGTTT;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:10,1,1,1
chr4	95220771	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=144,66;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:11,2:18,1:16,13,1,2
chr4	95255637	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,19,6
chr4	95506214	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=165.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,58:0.566:102:20,31:23,24:6,38,4,54
chr4	95506272	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=184,191;MMQ=60,40;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:29,0:14,2:1,44,0,2
chr4	95508128	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=99,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.440:33:6,6:9,1:9,9,15,0
chr4	95508130	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=97,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.335:39:10,3:10,1:11,14,14,0
chr4	95508281	.	CT	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.173:38:12,4:16,2:4,28,0,6
chr4	95575601	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:4,6,5,3
chr4	95578588	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,22:0,10:0,0,21,11
chr4	95585038	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr4	96127869	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.407:32:7,7:10,4:11,8,7,6
chr4	96256473	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=139,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:3,0,3,1
chr4	96256673	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,20:0,14:0,0,18,16
chr4	96256708	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:17,2:19,1:15,21,2,1
chr4	96470042	.	G	GACAGCGTTTAATGTGGGGCAGGTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,18;MFRL=98,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:1,0:0,0:1,1,0,1
chr4	96762629	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	98761900	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,20,5
chr4	98893334	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,2:0,0,13,0
chr4	98902278	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr4	99027184	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr4	99027218	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr4	99049513	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:8,2:8,0:16,0,2,0
chr4	99055406	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr4	99055480	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=154.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,18:0,25:0,0,38,5
chr4	99064379	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr4	99214537	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.245:33:13,5:9,3:22,3,8,0
chr4	99337881	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,5:0,0,14,4
chr4	99339708	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr4	99399748	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=124,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr4	99408106	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:99408106_T_C:99408106:0,0,0,2
chr4	99408125	.	C	CCCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99408106_T_C:99408106:0,0,0,1
chr4	99408128	.	A	AACAGACGATGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99408106_T_C:99408106:0,0,0,1
chr4	99802300	.	GA	G,TA	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=18,26,10;MFRL=138,155,128;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.35,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:48,9,7:0.127,0.053:64:14,1,0:4,4,0:10,38,1,15
chr4	99808136	.	CTTAAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:3,3:2,3:5,0,6,0
chr4	99964349	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr4	99997885	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,168;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.343:36:10,5:13,7:16,8,6,6
chr4	100009738	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:3,6:11,3:13,1,8,1
chr4	100045500	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:11,6:7,10:18,0,14,2
chr4	100048327	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,19,2
chr4	100048414	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=114,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,34:0.564:60:15,19:11,14:12,14,13,21
chr4	100048506	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=74.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0|1:100048506_G_A:100048506:0,0,5,14
chr4	100048509	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:3,6:3,5:0|1:100048506_G_A:100048506:2,4,2,9
chr4	100052963	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=T;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	100057858	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:4,2:2,2:1,5,0,4
chr4	100062675	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.522:38:6,14:12,5:16,2,16,4
chr4	100065509	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	100128530	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr4	100128753	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:9,4:1,3:0,10,1,7
chr4	100129746	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=204,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:11,0,2,0
chr4	100131746	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=220,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,0:1,4:0,5,0,4
chr4	100134713	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=79.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.961:21:0,8:0,12:0,0,17,4
chr4	100200509	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:4,0,7,0
chr4	100205819	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.483:27:9,4:5,9:0|1:100205819_C_A:100205819:13,1,11,2
chr4	100205829	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,19:0.513:37:13,6:5,13:0|1:100205819_C_A:100205819:16,2,13,6
chr4	100212173	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.619:19:6,5:1,7:0|1:100212173_A_T:100212173:0,7,0,12
chr4	100212197	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=81,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:3,3:0,5:0|1:100212173_A_T:100212173:0,4,0,8
chr4	100239112	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,11,0
chr4	100257929	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,166;MMQ=59,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:12,0:17,2:10,20,1,1
chr4	100258054	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr4	100260667	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=13,13;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr4	100265957	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0,0,11,1
chr4	100266159	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=160,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:12,0:6,17,1,2
chr4	100334243	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,1:8,2:10,4,1,2
chr4	100341643	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:3,4:6,7:8,1,10,2
chr4	100348850	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,10;MFRL=195,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:1,0:1,0:7,0,3,0
chr4	100350594	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,0:3,0,2,0
chr4	100356337	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:4,9:9,7:13,0,14,2
chr4	100356466	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:6,8:6,7:3,9,3,13
chr4	100512350	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,0:5,4:6,2,4,0
chr4	100738035	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=96,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,2:3,2:4,2,1,3
chr4	100784142	.	TTG	T	.	.	DP=202;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:155,15:0.091:170:76,6:67,9:108,47,10,5
chr4	100787123	.	TTATA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=TA;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:0,3:4,1,3,0
chr4	100827622	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,6:2,6:8,0,8,4
chr4	100846061	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=168,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr4	100870182	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.479:42:9,13:12,7:1,21,1,19
chr4	100870375	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,4:0,2:5,0,5,1
chr4	101338217	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,13,1
chr4	101953322	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	102267821	.	AA	CG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=138.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,14:0,0,32,0
chr4	102839362	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,2:0,7:0,0,1,10
chr4	102942761	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=127.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,46:0.572:80:13,17:18,28:0|1:102942761_C_T:102942761:8,26,15,31
chr4	102942765	.	T	TTA	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=69.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:45,25:0.361:70:18,9:27,16:1|0:102942761_C_T:102942761:15,30,4,21
chr4	102946347	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,2:3,2:5,4,3,1
chr4	102946392	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:8,5:8,4:11,6,5,4
chr4	102992517	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,25:0.553:45:9,12:11,12:2,18,5,20
chr4	103174491	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=93,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,2,0
chr4	103189036	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:4,3,5,1
chr4	103228545	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,30,4
chr4	103500260	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,1,0,1
chr4	103500262	.	CTTGCTAG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,1,0,1
chr4	103500274	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,0,0,1
chr4	103500276	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,0,0,1
chr4	103500278	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,0,0,1
chr4	103500283	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,0,0,1
chr4	103505784	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.828:15:1,7:1,4:2,0,10,3
chr4	103514658	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=244.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,36:0,38:0,0,42,35
chr4	103514741	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=209.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,21:0,38:0,0,10,50
chr4	103534560	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=112.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,18:0,0,33,4
chr4	103537503	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=87,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr4	103553447	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=10,18;MFRL=204,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.843:10:0,3:0,1:0,1,0,9
chr4	103557192	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr4	103557219	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	103557247	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103557247_C_T:103557247:0,1,0,1
chr4	103557249	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:103557247_C_T:103557247:0,1,0,1
chr4	103557251	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	103585800	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:0,3:4,3:3,1,6,1
chr4	103647909	.	A	AAAACACAGAAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=178,273;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:103647909_A_AAAACACAGAAAC:103647909:0,4,0,1
chr4	103647913	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,273;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:103647909_A_AAAACACAGAAAC:103647909:0,4,0,1
chr4	103722580	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.074:65:31,2:29,2:50,11,4,0
chr4	103723850	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,114;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0,14,0,2
chr4	103731067	.	CAAAT	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=133.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,35:0.462:76:18,22:20,13:2,39,6,29
chr4	103789810	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:5,15:16,7:17,4,15,7
chr4	103790186	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=195,256;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr4	103806308	.	CTA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:0,3:8,3:8,0,5,1
chr4	103822540	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,186;MMQ=49,22;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,5:0.067:85:42,2:38,3:13,67,0,5
chr4	103826635	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,124;MMQ=52,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,24:0.394:61:16,14:21,9:27,10,15,9
chr4	103826788	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,170;MMQ=49,23;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,3:0.078:49:16,2:27,1:0|1:103826788_T_G:103826788:21,25,0,3
chr4	103826813	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=153,170;MMQ=49,23;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.097:39:12,2:22,1:0|1:103826788_T_G:103826788:9,27,0,3
chr4	103866480	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=145.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,53:0.470:113:28,33:31,20:28,32,30,23
chr4	103870402	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,164;MMQ=40,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.066:59:23,3:28,0:36,20,2,1
chr4	103911159	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=197,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,1,3
chr4	103911191	.	TT	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	104000973	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,4:5,6:2,10,3,7
chr4	104003148	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr4	104003993	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:7,3,3,0
chr4	104061266	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:3,5:5,6:1,7,1,11
chr4	104061351	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=199,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,4:2,1:2,3,5,0
chr4	104063071	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:6,4:3,1:3,6,1,4
chr4	104066176	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=137,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.310:17:9,2:1,3:12,0,5,0
chr4	104066206	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:20,0:8,0:0|1:104066206_C_A:104066206:31,11,2,0
chr4	104066215	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.053:54:26,0:17,0:0|1:104066206_C_A:104066206:35,17,2,0
chr4	104079424	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=139,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:5,1:2,3:4,3,5,0
chr4	104080013	.	TC	T	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.055:71:36,0:31,2:22,46,0,3
chr4	104080079	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:11,0:11,3:0|1:104080079_A_T:104080079:4,19,0,3
chr4	104080083	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:11,0:11,3:0|1:104080079_A_T:104080079:4,19,0,3
chr4	104081708	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,8:3,6:9,0,14,0
chr4	104084765	.	CAAAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=32,24,32,21;MFRL=134,148,0,151;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,28,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=12.36,4.14,8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,5,3,6:0.233,0.141,0.298:21:3,1,0,1:1,4,2,2:4,3,3,11
chr4	104084783	.	GAA	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.092:31:8,0:10,2:0|1:104084783_GAA_G:104084783:8,21,0,2
chr4	104084794	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=-1073741826;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:12,2:0|1:104084783_GAA_G:104084783:3,19,0,2
chr4	104097034	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:11,2:22,0:33,0,2,0
chr4	104577558	.	A	AACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	104577578	.	A	ATTTTTTTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:104577578_A_ATTTTTTTTCTT:104577578:0,1,0,1
chr4	104577579	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:104577578_A_ATTTTTTTTCTT:104577578:0,1,0,1
chr4	104640712	.	AC	GT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.159:29:9,4:12,0:0|1:104640712_AC_GT:104640712:13,12,2,2
chr4	104640716	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:11,4:11,0:0|1:104640712_AC_GT:104640712:13,10,2,2
chr4	104640717	.	G	GGCGCATCGCGC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.177:26:11,4:11,0:0|1:104640712_AC_GT:104640712:12,10,2,2
chr4	105393360	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:5,2:5,0:0|1:105393360_CA_TG:105393360:11,0,2,0
chr4	105393361	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,13:0.932:13:0,6:0,5:1|0:105393360_CA_TG:105393360:0,0,13,0
chr4	106155199	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,1:8,2:8,4,0,3
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chr4	106158999	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,4:5,1:6,3,5,0
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chr4	106160238	.	T	TGTTTTTTTTTG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,145;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.589:27:5,5:6,10:8,3,13,3
chr4	106163224	.	GTTC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,4:4,3:6,1,5,2
chr4	106197000	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:6,1,6,0
chr4	106197750	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=196,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,0,3
chr4	106290829	.	A	ACTTGGGGAAAAAGAGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:1,2:2,1,5,1
chr4	106292121	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=179.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,30:0,18:0,0,3,45
chr4	106307874	.	A	AACC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.274:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr4	106317370	.	T	TATAAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=85.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.571:40:11,9:6,9:16,1,20,3
chr4	106317498	.	CCAAA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAAA;STR;TLOD=83.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.537:41:9,14:9,6:5,14,0,22
chr4	106359209	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr4	106367535	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,2:4,5:3,5,5,2
chr4	106367645	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,0:6,3:0|1:106367645_C_A:106367645:5,10,1,2
chr4	106367649	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.201:18:6,0:6,3:0|1:106367645_C_A:106367645:5,10,1,2
chr4	106370395	.	A	ATTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	106370624	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:13,0:13,2:0,26,0,2
chr4	106378002	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:0,6,1,8
chr4	106394985	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,33;MFRL=179,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr4	106395144	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.550:31:7,11:5,6:3,11,5,12
chr4	106395181	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,6:4,3:0,11,0,9
chr4	106552291	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=244,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	106613390	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=287,225;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	106620983	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,2:7,4:13,0,5,1
chr4	106638697	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,5:5,6:11,0,11,0
chr4	106640543	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:19,3:12,0:29,5,3,0
chr4	106647679	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr4	106759098	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:22,0:19,3:8,33,0,3
chr4	106766496	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr4	106819053	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.407:52:15,11:15,10:22,9,12,9
chr4	106863590	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,2:0.039:73:44,2:27,0:50,21,2,0
chr4	106888263	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,5:0,0,9,0
chr4	107133861	.	CTT	C,CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,35,33;MFRL=169,189,175;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.45,5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,2,3:0.107,0.148:24:9,2,0:10,0,3:19,0,5,0
chr4	107154904	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=214,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:3,4:5,8:0,9,0,12
chr4	107156365	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:7,1,4,1
chr4	107165685	.	TAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32,25;MFRL=220,204,86;MMQ=60,60,60;MPOS=11,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.67,8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.248,0.419:9:2,2,2:1,0,2:3,0,6,0
chr4	107169335	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:22,2:29,0:0|1:107169335_A_C:107169335:46,7,2,0
chr4	107169339	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.053:54:22,2:29,0:0|1:107169335_A_C:107169335:45,7,2,0
chr4	108574816	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:7,0:0,14,0,3
chr4	108608100	.	CTCTAACACT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	108622454	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:4,1:0|1:108622454_G_C:108622454:0,9,0,2
chr4	108622475	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=157,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1|0:108622454_G_C:108622454:0,3,0,3
chr4	108641169	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	108829850	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=134,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:8,9,0,2
chr4	108852871	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	108868515	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:6,4:3,1:9,0,5,0
chr4	108870764	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr4	108911244	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr4	108935768	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.915:10:1,3:0,5:0|1:108935768_CT_C:108935768:0,1,5,4
chr4	108935771	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.909:10:1,4:0,5:0|1:108935768_CT_C:108935768:0,1,5,4
chr4	108944579	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
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chr4	109734959	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,4:3,3:7,0,8,0
chr4	109735133	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,23:0.574:40:4,9:12,12:0|1:109735133_T_C:109735133:3,14,5,18
chr4	109735146	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,17:0.500:34:4,8:13,9:0|1:109735133_T_C:109735133:2,15,2,15
chr4	109735209	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=188,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:0,7:4,3:0,4,0,10
chr4	109740573	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109740573_G_A:109740573:0,1,0,1
chr4	109740575	.	C	CCTAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109740573_G_A:109740573:0,1,0,1
chr4	109740587	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109740587_C_G:109740587:0,1,0,1
chr4	109740590	.	CT	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109740587_C_G:109740587:0,1,0,1
chr4	109745336	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:12,12:12,5:7,17,8,9
chr4	109766290	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,0:5,8:6,2,4,4
chr4	109767453	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	109769832	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	109769899	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:11,2:6,2:13,4,4,0
chr4	109782249	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	109790346	.	C	CAATAAATA	.	.	DP=90;ECNT=2;MBQ=34,37;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=AATA;STR;TLOD=86.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,23:0.593:37:7,7:6,13:0|1:109790346_C_CAATAAATA:109790346:0,14,1,22
chr4	109790373	.	TAAATA	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:31,18:0.373:49:12,10:17,7:1|0:109790346_C_CAATAAATA:109790346:1,30,0,18
chr4	109811003	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:1,1,0,6
chr4	109817962	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=209,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr4	109820446	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,634;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	109862665	.	C	CAGATGGTTTCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.279:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr4	109862677	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109862677_T_C:109862677:0,1,0,1
chr4	109862683	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109862677_T_C:109862677:0,1,0,1
chr4	109931455	.	AC	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=133.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,14:0,15:0|1:109931455_AC_A:109931455:0,0,21,10
chr4	109931457	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=133.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.971:31:0,14:0,17:0|1:109931455_AC_A:109931455:0,0,21,10
chr4	109969183	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.418:24:6,5:8,4:14,0,10,0
chr4	109969337	.	G	T	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,45:0.422:105:30,19:28,18:22,38,20,25
chr4	109969456	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=201,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0,6,1,4
chr4	109971378	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,17:0.339:51:23,11:11,6:6,28,2,15
chr4	110384047	.	G	GCTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTTT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	110446454	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr4	110454881	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.153:26:10,1:12,3:1,21,1,3
chr4	110580084	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	110581324	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:2,3:7,2:9,0,6,0
chr4	110581363	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.333:45:14,6:15,7:24,6,9,6
chr4	110619534	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,8:4,3:2,6,2,9
chr4	110635488	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=162,140;MMQ=60,41;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,0:7,1,4,0
chr4	110670807	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr4	110678819	.	CA	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=138.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,41:0.576:71:10,27:18,14:26,4,32,9
chr4	110678979	.	T	TTTTAA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.970:28:0,9:0,18:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,1,27
chr4	110679002	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,1,19
chr4	110681618	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,17,8
chr4	110688053	.	A	ATAAGTTCCCTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=40,30;MFRL=186,186;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.668:2:1,1:0,0:0|1:110688053_A_ATAAGTTCCCTGG:110688053:0,1,0,1
chr4	110688058	.	A	ACTTCTTGGTGAAAGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110688053_A_ATAAGTTCCCTGG:110688053:0,0,0,1
chr4	110688060	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,186;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:110688053_A_ATAAGTTCCCTGG:110688053:0,0,0,1
chr4	110737549	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr4	110737594	.	T	TGTGGTGTGTGTCTAACAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=139,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:0,0:3,0:0,3,0,1
chr4	110739025	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=117,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr4	110743628	.	AG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=241,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr4	110765361	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,5:0,0,3,12
chr4	110765372	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr4	110786290	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,17,0
chr4	110786517	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,0,24
chr4	110791087	.	ATCT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.417:34:12,6:8,8:12,8,11,3
chr4	111398252	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,1,26
chr4	111412391	.	GTTTT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=16,14;MFRL=160,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:1,0:0|1:111412391_GTTTT_G:111412391:0,3,0,1
chr4	111412408	.	T	TAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=213,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.334:4:1,0:2,1:1|0:111412391_GTTTT_G:111412391:0,3,0,1
chr4	111469321	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=69,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.423:7:3,0:0,1:0|1:111469321_G_T:111469321:2,2,3,0
chr4	111469323	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.379:8:3,0:1,0:0|1:111469321_G_T:111469321:3,2,3,0
chr4	111469340	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:2,3,3,1
chr4	111469557	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111469557_G_GT:111469557:0,1,0,1
chr4	111469558	.	G	GATTAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111469557_G_GT:111469557:0,1,0,1
chr4	111469560	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111469557_G_GT:111469557:0,1,0,1
chr4	111469562	.	T	TACCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,30;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:111469557_G_GT:111469557:0,1,0,1
chr4	111474659	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=183,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:0,5,0,7
chr4	111543323	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	111781650	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,17:0,0,21,6
chr4	111781852	.	T	TAACTTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	113107829	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,1:3,1:11,0,2,1
chr4	113178894	.	ATTTGT	A	.	.	DP=202;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=797.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,181:0.995:181:0,92:0,88:0,0,115,66
chr4	113178966	.	TA	T,TAA	.	.	DP=133;ECNT=2;MBQ=31,32,31;MFRL=148,150,157;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=8.62,9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:77,10,10:0.086,0.105:97:34,3,6:34,6,4:23,54,6,14
chr4	113179077	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=112.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0|1:113179077_C_T:113179077:0,0,3,23
chr4	113179080	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=106.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0|1:113179077_C_T:113179077:0,0,3,21
chr4	113199691	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	113346714	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr4	113346996	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,5:3,3:0,8,1,7
chr4	113347609	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.421:27:4,5:10,3:11,5,6,5
chr4	113350415	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr4	113350441	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,0,0,1
chr4	113350443	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,0,0,1
chr4	113350444	.	GGA	G	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,0,0,1
chr4	113350447	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,0,0,1
chr4	113350453	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,0,0,1
chr4	113350458	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,1,0,1
chr4	113350461	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,1,0,1
chr4	113350462	.	TTTC	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=31,30;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,1,0,1
chr4	113350498	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	113352397	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,12,2
chr4	113356259	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:4,0,9,0
chr4	113356495	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:9,7:3,7:0,13,0,14
chr4	113359883	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=170,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chr4	113362463	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,0,4
chr4	113539196	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:6,2:9,3:14,1,5,0
chr4	113568126	.	TA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.183:40:14,4:10,3:23,10,5,2
chr4	113569135	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:9,9:11,9:10,10,11,7
chr4	113569218	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=157,157;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:15,2:15,0:18,17,3,0
chr4	113570639	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=126.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,19:0,0,31,5
chr4	113578326	.	TTG	T,TTGTG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31,23;MFRL=151,84,95;MMQ=60,58,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=TG;STR;TLOD=3.78,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.165,0.215:14:5,1,0:4,1,1:9,0,4,1
chr4	114028168	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	114267023	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,16,2
chr4	114277676	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,21:0.438:48:14,5:13,15:10,17,7,14
chr4	114280556	.	T	TATTCCTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	114286357	.	ATGTG	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=15,15;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=TG;STR;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.589:5:0,1:0,0:0,2,0,3
chr4	114286437	.	T	TATATAATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114286437_T_TATATAATG:114286437:0,0,0,1
chr4	114286439	.	T	TTCTTTATGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114286437_T_TATATAATG:114286437:0,0,0,1
chr4	114582933	.	T	TA	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.130:48:24,4:17,2:7,35,0,6
chr4	114899667	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,0:8,3:7,6,2,1
chr4	115586972	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.451:15:1,3:6,3:0,8,2,5
chr4	115589159	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	115748918	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr4	115749005	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=119,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:4,5:5,7:4,5,4,8
chr4	115792133	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=160,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.178:26:9,0:11,4:0|1:115792133_A_T:115792133:1,21,0,4
chr4	115792139	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=171,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:8,0:11,1:0|1:115792133_A_T:115792133:1,18,0,4
chr4	119035948	.	T	TC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr4	119064666	.	TG	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:16,0:9,3:24,1,3,0
chr4	119064668	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.830:28:2,13:3,9:4,1,23,0
chr4	119147975	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=207,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr4	119161619	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0,0,9,2
chr4	119174640	.	CT	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=225,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=105.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.956:42:1,22:0,18:1,0,38,3
chr4	119176703	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=106.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,16:0,0,24,4
chr4	119216054	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:6,3,3,0
chr4	119217114	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=55.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr4	119239788	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr4	119256617	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,7:2,5:7,1,11,1
chr4	119609039	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=108.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,19:0,12:0,0,26,5
chr4	119609182	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=125,150;MMQ=58,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.358:9:2,0:3,3:0,6,0,3
chr4	119615544	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,11:0,0,21,0
chr4	119661791	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:8,0:15,2:16,7,1,1
chr4	119665338	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,1:5,3:0|1:119665338_G_A:119665338:0,10,0,4
chr4	119665345	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,0:6,3:0|1:119665338_G_A:119665338:0,10,0,3
chr4	119666217	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=10,22;MFRL=148,76;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.711:5:0,1:0,0:0,1,1,3
chr4	119736598	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,5:4,7:6,2,9,3
chr4	119947961	.	AAAG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=111,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:5,5:6,6:2,11,3,8
chr4	119947985	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,6:5,5:6,5,6,5
chr4	119952179	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:18,3:15,0:25,9,2,1
chr4	120071926	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	120072275	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	120079159	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,6:0,4:5,1,3,7
chr4	120079387	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=237,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,4:4,4:0,5,1,7
chr4	120085380	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:18,6,2,0
chr4	120177522	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:9,11:9,4:12,6,12,3
chr4	120177708	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,5:6,3:1,9,4,4
chr4	120189328	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=195,176;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=A;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.382:12:3,2:5,2:0|1:120189328_C_CA:120189328:8,0,4,0
chr4	120189350	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,11;MFRL=172,184;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.224:30:9,0:4,0:0|1:120189328_C_CA:120189328:16,8,6,0
chr4	120189365	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=34,10;MFRL=133,185;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:16,0:21,0:0|1:120189328_C_CA:120189328:21,21,5,0
chr4	120189369	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=135,185;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,5:0.112:51:21,0:23,0:0|1:120189328_C_CA:120189328:24,22,5,0
chr4	120194718	.	G	GT,GTT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=34,35,30;MFRL=160,140,155;MMQ=60,60,60;MPOS=14,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=T;STR;TLOD=116.27,6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,45,5:0.815,0.104:54:1,24,3:3,20,2:4,0,43,7
chr4	120212425	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.445:23:8,5:4,5:2,11,1,9
chr4	120212514	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr4	120221425	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.697:8:2,3:0,2:2,0,6,0
chr4	120243336	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr4	120446868	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr4	120463856	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	120486559	.	C	G	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=143,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,3:0.047:82:51,0:27,3:0|1:120486559_C_G:120486559:35,44,0,3
chr4	120486567	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,3:0.052:74:43,0:26,1:0|1:120486559_C_G:120486559:32,39,0,3
chr4	120486568	.	A	AGTGGCTCAAGCTGGAGCCG	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,3:0.053:73:42,0:26,1:0|1:120486559_C_G:120486559:32,38,0,3
chr4	120548222	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr4	120549760	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,0:6,1:0|1:120549760_G_C:120549760:5,11,1,1
chr4	120549767	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=170,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:120549760_G_C:120549760:3,10,1,1
chr4	120549769	.	G	GCCATGTGACTTGA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:120549760_G_C:120549760:1,10,1,1
chr4	120981214	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr4	120983086	.	GA	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=175.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,32:0,27:0,0,59,0
chr4	120983259	.	T	C	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=418.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,113:0.992:113:0,61:0,51:0,0,24,89
chr4	121631375	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr4	121702270	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr4	121719575	.	T	TG	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,1:13,1:0|1:121719575_T_TG:121719575:6,18,2,0
chr4	121719580	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:14,0:0|1:121719575_T_TG:121719575:6,18,2,0
chr4	121719582	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:10,0:0|1:121719575_T_TG:121719575:6,18,2,0
chr4	121719584	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:7,3:4,4:3,9,1,6
chr4	121720771	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:5,6:8,11:12,1,14,3
chr4	121720941	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,2:3,9:0,6,0,11
chr4	121720960	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:0,5,0,7
chr4	121737750	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.219:21:10,3:6,1:2,15,1,3
chr4	121738182	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr4	121828519	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr4	121958691	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr4	121961031	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	121961279	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	122059877	.	A	ATTCAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:8,2:11,0:2,18,0,2
chr4	122258063	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.641:26:2,8:7,8:3,6,1,16
chr4	122261785	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:2,3,0,2
chr4	122590883	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,3:1,1,0,5
chr4	122590913	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr4	122599755	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	122681373	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	122723106	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,22:0.452:49:14,9:12,13:5,22,3,19
chr4	122732899	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=80.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,26:0.549:47:14,13:7,12:1,20,0,26
chr4	122735225	.	C	CTTA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,7:2,0:0,5,2,5
chr4	122735257	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr4	122737487	.	CT	C,CTT	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,33,33;MFRL=137,164,174;MMQ=60,60,60;MPOS=13,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.80,21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,15:0.122,0.430:35:6,2,8:9,2,7:14,2,19,0
chr4	122737506	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=21,15;MFRL=145,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.102:52:19,1:12,0:37,9,6,0
chr4	122739121	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=217,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr4	122740454	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	122749436	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,2:2,7:7,3,4,5
chr4	122749541	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:6,7:7,5:11,3,6,6
chr4	122769967	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.537:22:7,7:3,4:8,2,11,1
chr4	122782879	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:0,4,2,4
chr4	122825380	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	123108762	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr4	123140739	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=77.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,3,18
chr4	123175900	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr4	123178320	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	123185682	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	123192830	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:3,19,0,2
chr4	123239472	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:1,13,0,2
chr4	123246971	.	GT	G,GTT	.	.	DP=127;ECNT=4;MBQ=34,34,33;MFRL=156,147,189;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.02,11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:59,8,11:0.098,0.142:78:34,1,2:17,6,4:48,11,16,3
chr4	123246987	.	C	A	.	.	DP=114;ECNT=4;MBQ=16,14;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,12:0.091:107:16,1:25,0:67,28,12,0
chr4	123246992	.	C	A	.	.	DP=127;ECNT=4;MBQ=20,10;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,6:0.034:110:22,0:30,0:71,33,6,0
chr4	123246994	.	C	A	.	.	DP=129;ECNT=4;MBQ=29,10;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,6:0.040:123:33,0:33,0:77,40,6,0
chr4	123277226	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=168,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr4	123280966	.	A	AGAGAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123280966_A_AGAGAG:123280966:0,1,0,1
chr4	123280969	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123280966_A_AGAGAG:123280966:0,1,0,1
chr4	123280971	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123280966_A_AGAGAG:123280966:0,1,0,1
chr4	123280975	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123280966_A_AGAGAG:123280966:0,1,0,1
chr4	123663575	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:12,3:10,1:15,7,4,0
chr4	123666198	.	AC	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=193,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	123748479	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.130:28:12,0:12,3:12,13,1,2
chr4	123854495	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr4	123949556	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=86.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,9,16
chr4	124323738	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=299.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,88:0.989:88:0,46:0,42:0,0,37,51
chr4	124324242	.	CCTT	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=193.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,23:0,23:0,0,25,22
chr4	125592001	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:13,0:13,3:0|1:125592001_C_A:125592001:11,16,0,3
chr4	125592009	.	T	TTCGATTTTCTATCCCTATAGGTTTG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,38;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,0:11,3:0|1:125592001_C_A:125592001:9,16,0,3
chr4	125592024	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:11,0:9,14,0,2
chr4	125593754	.	AAA	TTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0,4,0,1
chr4	125593775	.	T	TGTATTTTATACGCAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=261,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	125593777	.	A	ATTGTGGGATCTTTTTTTAAAAAAATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.660:2:0,1:0,0:1,0,0,1
chr4	125631648	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	126315034	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,19,2
chr4	126315211	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,231;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0,10,0,2
chr4	126335978	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	126336105	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:10,5:6,7:9,7,13,0
chr4	126336990	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,1,13
chr4	126337042	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr4	126337555	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,1:1,0,2,0
chr4	126337867	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=159,176;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:126337867_A_G:126337867:0,4,0,2
chr4	126337871	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=159,153;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:126337867_A_G:126337867:0,4,0,1
chr4	126337874	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=159,153;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:126337867_A_G:126337867:0,4,0,1
chr4	126355609	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr4	126367606	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=109,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.513:29:4,7:10,7:8,6,9,6
chr4	126367720	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:126367720_CCA_C:126367720:0,4,0,1
chr4	126367726	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,1:3,0:0|1:126367720_CCA_C:126367720:0,3,0,1
chr4	126369554	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,275;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr4	126370100	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,4,1
chr4	126373570	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,1:3,5:0,3,2,4
chr4	126389627	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	126400825	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	126400922	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=115,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,1:7,4:10,3,4,1
chr4	126402921	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr4	128554404	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	128565000	.	A	G	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=273.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,82:0.988:82:0,38:0,42:0,0,50,32
chr4	128590234	.	A	ACCATGC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:7,2:15,0:11,11,0,2
chr4	128590404	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	128595254	.	T	TTATTTTGAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATTTTGAA;STR;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:0,4:4,4:3,1,8,1
chr4	128621144	.	CT	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.183:38:15,4:12,3:26,4,5,3
chr4	128621272	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=106.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,14:0,0,0,29
chr4	128627050	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr4	128632023	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr4	128665981	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr4	128715306	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=141,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,3:0.060:63:25,0:33,3:0|1:128715306_G_A:128715306:22,38,1,2
chr4	128715315	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=146,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,3:0.062:61:23,0:30,1:0|1:128715306_G_A:128715306:20,38,1,2
chr4	128719648	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	128751804	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:3,7:3,3:5,1,11,0
chr4	128803159	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr4	128807914	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=177,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr4	128812230	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.340:21:6,5:7,2:12,2,6,1
chr4	128814425	.	AT	A,ATT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=125,140,169;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=11.32,9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,7,7:0.180,0.183:40:14,5,1:11,2,6:25,1,13,1
chr4	128817907	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.139:20:9,1:9,1:17,1,2,0
chr4	128842077	.	CAAACTTACAAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=214,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	128843044	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:17,3:21,0:35,4,3,0
chr4	128923001	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.359:9:2,2:4,1:0|1:128923001_GT_G:128923001:0,6,0,3
chr4	128923006	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,6:0.639:9:2,2:1,4:1|0:128923001_GT_G:128923001:0,3,0,6
chr4	128996166	.	G	GT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=118,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.179:28:11,0:12,4:10,13,1,4
chr4	129012267	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:6,0:12,2:4,14,0,2
chr4	129019575	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=184,235;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr4	129028656	.	G	GTGTTCTCATTGTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	129083340	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.515:39:11,9:7,11:13,6,15,5
chr4	129752955	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:9,11,1,1
chr4	129767588	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:7,7,0,2
chr4	129805520	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=122,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	129805716	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:2,6,2,1
chr4	129878342	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,7:7,0:0,11,0,7
chr4	129920969	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,6:4,5:1,10,3,8
chr4	129924932	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,2:12,2:16,7,4,0
chr4	130023759	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:3,1:7,3,3,0
chr4	138442525	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:5,3:12,5:0|1:138442525_G_A:138442525:12,5,6,2
chr4	138442527	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:5,2:11,5:0|1:138442525_G_A:138442525:12,5,6,2
chr4	138449683	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=118,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,35:0.556:63:14,21:13,14:17,11,21,14
chr4	138449812	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.491:22:6,3:5,4:2,9,0,11
chr4	139103366	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	139140388	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr4	139980254	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,121;MMQ=52,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:22,0:14,4:13,23,0,4
chr4	139981918	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr4	140217010	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr4	140263984	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:22,1:27,2:40,11,3,0
chr4	140270589	.	AT	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.103:41:20,4:16,0:33,4,4,0
chr4	140281584	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=166,7204852;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:5,2:12,0:18,0,2,0
chr4	140308984	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr4	140375296	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr4	140433072	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:140433072_T_A:140433072:0,2,0,1
chr4	140433077	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:140433072_T_A:140433072:0,1,0,1
chr4	140450455	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	140616462	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,3:7,1:1,8,1,3
chr4	140625323	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,3,12
chr4	140651584	.	TCTG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CTG;STR;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.912:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr4	140810637	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.477:32:7,2:8,8:10,6,10,6
chr4	140810638	.	GGCT	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCT;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:7,0:13,2:13,9,1,1
chr4	141317068	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:10,9:7,6:7,10,6,9
chr4	141320130	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.438:37:8,7:10,9:3,18,6,10
chr4	141321425	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	141446510	.	C	CTAAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,3:7,2:13,0,6,0
chr4	141446767	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr4	141448595	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=154;ECNT=1;MBQ=23,21,29,25;MFRL=140,108,141,144;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,20,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.88,26.49,14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:53,9,19,14:0.084,0.198,0.144:95:21,6,11,3:23,3,4,8:24,29,22,20
chr4	141448705	.	TA	T,TAA	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=146,137,204;MMQ=60,60,60;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=10.21,5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:43,8,6:0.139,0.110:57:20,2,5:20,5,1:4,39,3,11
chr4	141458485	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	141483471	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:5,8:8,6:10,3,7,7
chr4	141549393	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr4	141555062	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr4	141578155	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	141677006	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	141868736	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=101.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,12:0,0,25,4
chr4	142054017	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=194,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:0|1:142054017_T_A:142054017:0,2,0,1
chr4	142054020	.	TCC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=194,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:142054017_T_A:142054017:0,2,0,1
chr4	142054025	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=194,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:142054017_T_A:142054017:0,2,0,1
chr4	142155207	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:142155207_T_G:142155207:0,3,0,1
chr4	142155208	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142155207_T_G:142155207:0,3,0,1
chr4	142155210	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142155207_T_G:142155207:0,3,0,1
chr4	142155213	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142155207_T_G:142155207:0,3,0,1
chr4	142155217	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142155207_T_G:142155207:0,3,0,1
chr4	142640538	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,9,4
chr4	142651159	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr4	143003155	.	G	GA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=100.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,10:0,22:0,0,29,6
chr4	143007197	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	143007419	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	143007460	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	143044635	.	T	TGTAGGTGTATCTTTGTGGGCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	143044666	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	143130034	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr4	143130219	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,1,18
chr4	143181730	.	G	T	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,13:0.131:75:24,2:12,0:23,39,0,13
chr4	143181747	.	AT	A	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,19:0.401:46:17,7:10,12:3,24,3,16
chr4	143181748	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,53:0.946:56:1,25:2,26:2,1,5,48
chr4	143191952	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=189,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:143191952_G_A:143191952:1,9,1,1
chr4	143191959	.	A	AAATCAGTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=189,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:143191952_G_A:143191952:1,9,1,1
chr4	143226768	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr4	143226784	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr4	143324036	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr4	143326312	.	AAGAGAG	A,AAG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,150,144;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,7,8;RU=AG;STR;TLOD=7.12,51.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,15:0.167,0.788:18:0,0,5:0,3,10:0,0,12,6
chr4	144124492	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:8,0,6,0
chr4	144378770	.	CA	AC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,14;MFRL=193,225;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:144378770_CA_AC:144378770:4,0,1,0
chr4	144378775	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=193,225;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:144378770_CA_AC:144378770:4,0,1,0
chr4	144378778	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,21;MFRL=193,225;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:144378770_CA_AC:144378770:4,0,1,0
chr4	144447630	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr4	144456124	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=98.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,8:0,19:0,0,3,25
chr4	144466050	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	144466100	.	CTT	C,CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,22,20;MFRL=0,191,204;MMQ=60,60,40;MPOS=26,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=3.34,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.496,0.383:5:0,0,1:0,3,0:0,0,0,5
chr4	144469383	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	144801662	.	C	G,T	.	.	DP=121;ECNT=3;MBQ=33,32,31;MFRL=126,117,135;MMQ=60,51,55;MPOS=16,12;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=173.44,73.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,50,27:0.432,0.241:114:19,28,13:18,22,13:15,22,19,58
chr4	144801671	.	A	C	.	.	DP=102;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=146,117;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=160.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,46:0.452:102:29,22:25,16:16,40,12,34
chr4	144801728	.	CA	TG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=167,160;MMQ=52,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:14,5:8,3:0,22,0,8
chr4	144917514	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=149.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,22:0,22:0,0,20,24
chr4	144918867	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,3:5,6:0,10,0,9
chr4	144920480	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,156;MMQ=55,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,21:0.458:46:18,13:7,8:22,3,18,3
chr4	144920638	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,146;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=93.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,35:0.599:58:16,22:7,11:6,17,5,30
chr4	145037980	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=151.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,28:0,14:0,0,33,9
chr4	145040784	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr4	145040962	.	CA	GT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr4	145040999	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	145041011	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	145041577	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,127;MMQ=51,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,4:3,7:5,0,11,0
chr4	145041686	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr4	145041707	.	CT	AC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,31;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	145041720	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,39;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr4	145041741	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,36;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:145041741_T_G:145041741:0,0,5,3
chr4	145041750	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:145041741_T_G:145041741:0,0,5,4
chr4	145041821	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=170,240210;MMQ=30,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr4	145579907	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr4	146031236	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.254:25:11,3:6,2:16,2,5,2
chr4	146031657	.	C	T	.	.	DP=131;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,3:0.033:118:74,1:41,2:2,113,0,3
chr4	146040996	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:15,2:13,0:30,1,2,0
chr4	146044698	.	C	T	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,142;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,3:0.040:97:47,3:47,0:44,50,1,2
chr4	146046123	.	AT	A	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,6:0.102:66:29,4:30,2:0|1:146046123_AT_A:146046123:53,7,5,1
chr4	146046138	.	T	C	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=266.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,87:0.989:87:0,37:0,32:0|1:146046123_AT_A:146046123:0,0,65,22
chr4	146048554	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr4	146048583	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,14:0,7:0,0,21,0
chr4	146059878	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=215,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:146059878_T_C:146059878:0,2,0,1
chr4	146059880	.	C	CTTATGTGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=215,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:146059878_T_C:146059878:0,2,0,1
chr4	146059884	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=254,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:146059884_GG_AA:146059884:0,1,0,1
chr4	146059887	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,28;MFRL=254,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:146059884_GG_AA:146059884:0,1,0,1
chr4	146059894	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=254,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:146059884_GG_AA:146059884:0,1,0,1
chr4	146061066	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:20,2:24,1:38,6,2,1
chr4	146065006	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,14,0
chr4	146076632	.	TA	T,TAA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,29,32;MFRL=160,192,164;MMQ=60,60,60;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.46,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,3,3:0.103,0.105:34:17,0,2:10,2,1:6,22,2,4
chr4	146080577	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=76.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,22,0
chr4	146086269	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=137.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.953:40:1,25:0,14:1,0,36,3
chr4	146092710	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:11,1:23,0,2,0
chr4	146475243	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,16;MFRL=134,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.655:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr4	146560558	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:15,2:9,0:10,15,0,2
chr4	146744687	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:2,1:0,0:0|1:146744687_G_A:146744687:1,2,0,1
chr4	146744692	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=12,32;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:146744687_G_A:146744687:1,1,0,1
chr4	146744693	.	G	GAGACA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=12,34;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:146744687_G_A:146744687:1,1,0,1
chr4	146744697	.	GT	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:146744687_G_A:146744687:0,1,0,1
chr4	146744701	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:146744687_G_A:146744687:0,1,0,1
chr4	146813642	.	A	AGTTGCATTCCATTGGATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	147104263	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr4	147110652	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:5,0,7,1
chr4	147110891	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,7:5,5:0,11,0,12
chr4	147214029	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:3,1,6,1
chr4	147425114	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,0,21
chr4	147431302	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	147442802	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=138,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.054:53:31,1:20,0:37,14,1,1
chr4	147560457	.	T	TGGC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GGC;STR;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.497:14:1,2:4,3:5,2,5,2
chr4	147561264	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=141,105;MMQ=53,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:147561264_C_T:147561264:0,2,0,1
chr4	147561267	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=141,105;MMQ=53,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:147561264_C_T:147561264:0,2,0,1
chr4	147561269	.	A	ATTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=141,105;MMQ=53,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:147561264_C_T:147561264:0,2,0,1
chr4	147562010	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=164,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:147562010_T_C:147562010:0,1,1,1
chr4	147562016	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=164,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:147562010_T_C:147562010:0,1,1,1
chr4	147562019	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=164,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:147562010_T_C:147562010:0,1,1,1
chr4	147795903	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=106,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,19:0.379:51:13,10:18,9:14,18,9,10
chr4	148463840	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr4	148578917	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.310:17:7,3:4,2:9,3,5,0
chr4	148589677	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	148591769	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr4	148604871	.	C	CG	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,15:0.505:30:3,8:6,4:0|1:148604871_C_CG:148604871:14,1,14,1
chr4	148604884	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=16,15;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,22:0.543:42:0,7:1,0:0|1:148604871_C_CG:148604871:13,7,11,11
chr4	148604886	.	G	A,T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=0,16,26;MFRL=0,126,147;MMQ=60,60,60;MPOS=13,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.31,53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,22:0.413,0.561:34:0,1,10:0,3,5:0,0,17,17
chr4	148743956	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=114.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,37:0.594:62:12,14:13,23:12,13,23,14
chr4	148778685	.	G	GT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=202,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=95.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,38:0.869:43:3,21:2,15:5,0,35,3
chr4	148800299	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	148827697	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,3:0,6:1,0,9,0
chr4	148827747	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr4	148827973	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	148886159	.	AT	A	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,4:0.059:82:37,2:28,2:64,14,3,1
chr4	148985720	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr4	149002637	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:149002637_A_T:149002637:6,12,1,1
chr4	149002641	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:9,2:0|1:149002637_A_T:149002637:4,12,1,1
chr4	149035449	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr4	149073555	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:0,3:4,4:4,0,7,1
chr4	149116035	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	149357168	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:5,3:13,0:8,10,3,0
chr4	151119353	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	151153948	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:13,1:8,10,1,1
chr4	151161470	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr4	151161490	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr4	151161502	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr4	151177340	.	CC	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,0,13
chr4	151177432	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	151231337	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:151231337_C_A:151231337:2,0,1,0
chr4	151231339	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:151231337_C_A:151231337:2,0,1,0
chr4	151231371	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr4	151408800	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr4	151412049	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:8,6:10,5:15,3,6,5
chr4	151505624	.	TC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=74.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.937:28:0,11:1,9:0,1,0,27
chr4	151656589	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	151683003	.	TA	T	.	.	DP=137;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,5:0.054:108:31,3:50,1:18,85,0,5
chr4	151765243	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=181.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,28:0,26:0,0,45,12
chr4	151792401	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,0:5,5:8,0,5,0
chr4	151814316	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:20,1:18,1:7,31,0,2
chr4	151829659	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,10:0,0,1,13
chr4	151850226	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:0,3:1,0:0,3,0,5
chr4	152024167	.	A	AGCAAAGAATAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=195,189;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	152025273	.	G	GCTTAT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTAT;STR;TLOD=233.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,11:0,34:0,0,46,7
chr4	152048936	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	152053408	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,15,2
chr4	152069406	.	TACACACACACACACAC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,9;RU=AC;STR;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr4	152201204	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	152487552	.	G	GCCATTTCTTTACCT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:7,0:5,2:1,13,0,2
chr4	152507998	.	G	GCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CA;STR;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:2,3:3,2:0|1:152507998_G_GCA:152507998:0,5,1,5
chr4	152508014	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0|1:152507998_G_GCA:152507998:0,6,1,4
chr4	152510130	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.410:22:5,4:8,4:3,10,1,8
chr4	152559717	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:152559717_TA_T:152559717:2,0,1,0
chr4	152559734	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:152559717_TA_T:152559717:4,0,1,0
chr4	152583907	.	C	CTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.337:9:1,1:4,2:2,4,1,2
chr4	152592469	.	A	ATTAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTAC;STR;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.351:12:2,3:6,0:0,8,0,4
chr4	152601112	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr4	152609920	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,3:3,2:1,4,0,5
chr4	152609998	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=186,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr4	152681952	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.631:28:5,7:5,10:9,1,17,1
chr4	153249566	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,1,4
chr4	153268227	.	CA	C,AA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,21,16;MFRL=164,134,172;MMQ=60,60,60;MPOS=25,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.17,5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,9,7:0.294,0.134:31:6,1,2:6,4,0:5,10,2,14
chr4	153549731	.	A	ATGAAGTCTTGGGCCTGGGGC	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.100:30:16,2:11,0:12,15,1,2
chr4	153549745	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr4	153549852	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	153565641	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:4,7:10,11:1,13,2,16
chr4	153750918	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,3,19
chr4	153793528	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr4	153831387	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=154,189;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:7,0:15,4:0|1:153831387_T_C:153831387:6,16,0,4
chr4	153831393	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=153,189;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.173:27:7,0:13,4:0|1:153831387_T_C:153831387:6,17,0,4
chr4	153882057	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	153884092	.	GGT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=GT;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.825:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr4	153889204	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=135,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:12,0:6,2:8,10,1,2
chr4	153889237	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=161,64;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:0|1:153889237_A_AT:153889237:3,11,1,2
chr4	153889246	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=161,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,0:8,1:0|1:153889237_A_AT:153889237:3,11,1,2
chr4	153889265	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.703:18:3,6:2,7:2,3,2,11
chr4	153896358	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr4	154125681	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:20,2:18,0:17,22,2,0
chr4	154256178	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:0,14,0,2
chr4	154315340	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:3,0,5,1
chr4	154330064	.	GTA	G,GTATATA,GTATATATA	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,35,35,35;MFRL=183,175,185,172;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,16,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,13,14;RU=TA;STR;TLOD=3.71,9.86,8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:17,2,7,8:0.063,0.202,0.235:34:7,1,2,4:9,1,5,3:17,0,17,0
chr4	154388277	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr4	154471113	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=217,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:3,5:2,3:5,0,9,0
chr4	154476924	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:6,13:11,7:10,7,15,5
chr4	154478300	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,4:4,5:0,8,0,9
chr4	154502520	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=106,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.285:9:3,1:3,1:6,1,1,1
chr4	154502741	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr4	154508948	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=120,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.080:59:24,3:30,1:20,35,3,1
chr4	154524952	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,227;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:9,0,2,0
chr4	154542814	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:8,1,5,0
chr4	154544267	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	154556798	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr4	154557383	.	ATG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr4	154557405	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr4	154624698	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.162:22:10,3:8,0:13,6,2,1
chr4	154625682	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,166;MMQ=52,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.479:19:3,3:7,6:4,6,8,1
chr4	154633734	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=61,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.896:26:0,7:2,17:1,1,6,18
chr4	154641489	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:0,11:1,8:0,1,3,16
chr4	154644454	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	154669733	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	154669993	.	C	CAAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,12;RU=A;STR;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:0,1:1,1:0,1,0,7
chr4	154709480	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=221,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:1,2,3,0
chr4	154709854	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.489:16:6,3:2,3:0|1:154709854_G_A:154709854:4,4,2,6
chr4	154709856	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,6:0|1:154709854_G_A:154709854:0,0,6,10
chr4	155156207	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr4	155161666	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=128.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,19:0,17:0,0,28,11
chr4	155219318	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.420:48:13,11:15,9:16,12,11,9
chr4	155225784	.	AAAACAAAC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AAAC;STR;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.912:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	155244401	.	TTTTG	T	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=59,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTG;STR;TLOD=82.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.855:23:0,7:2,12:1,2,11,9
chr4	155244475	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,3:0,13:0,0,4,14
chr4	155244566	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155244566_G_T:155244566:0,1,0,1
chr4	155244569	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155244566_G_T:155244566:0,1,0,1
chr4	155244571	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155244566_G_T:155244566:0,1,0,1
chr4	155244573	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155244566_G_T:155244566:0,1,0,1
chr4	155244576	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155244566_G_T:155244566:0,1,0,1
chr4	155249431	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr4	155252934	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,4:0,5:0,2,0,9
chr4	155254502	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,79;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,2:6,0:9,9,0,2
chr4	155256177	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.289:26:9,5:8,2:10,9,2,5
chr4	155256187	.	TGA	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:6,0:8,10,0,2
chr4	155256205	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,8,11
chr4	155305491	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,7:3,3:9,0,8,2
chr4	155312411	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=85,150;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:0,6:7,2:2,5,2,6
chr4	155407569	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,10:0,14:0,0,16,8
chr4	155407680	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr4	155410407	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr4	155458728	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	155461687	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr4	155462148	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	155465535	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,12:0,0,30,1
chr4	155466935	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=122.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,23:0,12:0,0,31,4
chr4	155467187	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=104.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,26,6
chr4	155469959	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,1:0,0,10,3
chr4	155487888	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=213,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr4	155489643	.	G	GTAATTTTAAATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,2:11,0:5,8,1,1
chr4	155505241	.	A	AGAAGACAGAGTGCTCCCATTCCCACTTC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAGACAGAGTGCTCCCATTCCCACTTC;STR;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.624:24:7,1:6,4:11,3,6,4
chr4	155505999	.	T	TAATTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155505999_T_TAATTC:155505999:0,0,0,1
chr4	155506003	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155505999_T_TAATTC:155505999:0,0,0,1
chr4	155507590	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=103,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.521:46:13,14:8,7:13,9,12,12
chr4	155508627	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr4	155510224	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	155511897	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	155525970	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=80,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,7:1,1:1,0,8,0
chr4	155533739	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,3:0.052:74:36,2:33,1:36,35,0,3
chr4	155719919	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=79,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr4	156136079	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,0,2
chr4	156274584	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	156276788	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr4	156276841	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr4	156281666	.	ACT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	156283302	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=141.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,19:0,24:0,0,7,37
chr4	156290032	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr4	156294624	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:0,1:4,4:1,3,0,6
chr4	156297060	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:1,4,0,7
chr4	156617994	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,16,4
chr4	156629269	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=185,190;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:14,0,2,0
chr4	156643176	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,14,9
chr4	156725681	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr4	156757789	.	G	GA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:5,8:4,8:7,2,15,2
chr4	156757818	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.587:42:7,12:10,11:13,4,21,4
chr4	156787214	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr4	156787340	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:8,5:7,7:12,3,8,4
chr4	156787390	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=132,118;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:12,2:11,0:0|1:156787390_G_T:156787390:17,7,2,0
chr4	156787396	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=132,118;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:0|1:156787390_G_T:156787390:15,8,2,0
chr4	156826166	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:9,8:9,9:12,6,11,6
chr4	156830242	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156830242_G_A:156830242:0,0,0,1
chr4	156830245	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156830242_G_A:156830242:0,0,0,1
chr4	156832841	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr4	156847230	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,16:0.410:39:11,8:11,6:0|1:156847230_A_G:156847230:9,14,6,10
chr4	156847237	.	AG	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,18:0.432:42:10,8:13,9:0|1:156847230_A_G:156847230:9,15,6,12
chr4	157999375	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=183,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:157999375_G_T:157999375:0,2,0,1
chr4	157999385	.	AACAAAAC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:157999375_G_T:157999375:0,3,0,1
chr4	158242540	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,9,1
chr4	158283954	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:20,1:13,1:24,10,2,0
chr4	159076679	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	159165619	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.270:11:6,3:2,0:0|1:159165619_CA_TG:159165619:0,8,0,3
chr4	159165624	.	CC	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.248:12:7,1:2,0:0|1:159165619_CA_TG:159165619:0,9,0,3
chr4	159568383	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr4	159590922	.	TA	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:12,1:8,3:4,31,0,5
chr4	159605732	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:19,2:24,0:36,7,2,0
chr4	159618695	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,2:3,1,6,1
chr4	159630817	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	159638069	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,168;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,1:11,0,2,0
chr4	159644494	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:159644494_G_C:159644494:0,0,0,9
chr4	159644501	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:159644494_G_C:159644494:0,0,0,8
chr4	159789387	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:11,4,2,0
chr4	159836236	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,6:3,2:5,1,8,0
chr4	159894187	.	T	TTATATTTTGCTGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=157,290;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	159894199	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr4	160189200	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,0:4,2:5,0,1,1
chr4	160225430	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,4:1,1:5,0,5,0
chr4	160251447	.	GTATA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=TA;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	160260209	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr4	160271268	.	GT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=84.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.951:36:1,19:0,15:1,0,28,7
chr4	162307312	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=117,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.463:28:10,7:5,5:10,5,9,4
chr4	162431624	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.502:40:8,9:10,11:0,20,2,18
chr4	162431695	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr4	162459299	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,15,0
chr4	162697014	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,25:0.493:51:9,13:16,12:22,4,21,4
chr4	162841814	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:0,6:0,5:0,2,1,11
chr4	162954926	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=198,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:0,1:2,4:0,2,0,6
chr4	164048335	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:164048335_G_A:164048335:0,12,0,2
chr4	164048337	.	AA	GG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:3,0:0|1:164048335_G_A:164048335:0,12,0,2
chr4	164085514	.	G	A	.	.	DP=106;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,4:0.048:99:43,0:51,4:41,54,3,1
chr4	164087453	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=14,13;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.238:33:3,1:4,0:17,7,9,0
chr4	164087457	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=14,13;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.216:36:6,1:4,0:20,7,9,0
chr4	164087954	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr4	164438523	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	164440461	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:4,2:7,6:12,2,5,4
chr4	164440743	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,10:0,11:0,0,1,20
chr4	164450255	.	A	AT,ATT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31,30;MFRL=0,182,142;MMQ=60,60,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=23.47,6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,4:0.662,0.292:14:0,6,3:0,4,1:0,0,0,14
chr4	164466970	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	165891229	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,255;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165891229_C_T:165891229:0,0,0,1
chr4	165891236	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,255;MMQ=60,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165891229_C_T:165891229:0,0,0,1
chr4	165962745	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.153:36:14,1:7,1:13,18,5,0
chr4	165962750	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.198:33:12,0:7,0:10,17,6,0
chr4	165981764	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=219,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:165981764_T_G:165981764:0,4,0,1
chr4	165981766	.	T	TATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=219,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:165981764_T_G:165981764:0,4,0,1
chr4	166150095	.	A	T	.	.	DP=139;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=158.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,59:0.449:132:40,29:31,29:12,61,3,56
chr4	166215662	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=133,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.245:17:9,2:4,2:2,11,0,4
chr4	166218661	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr4	166243051	.	TAAGA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=217,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGA;STR;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr4	166243082	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,14,1
chr4	166307302	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,28:0.629:44:9,13:7,14:15,1,28,0
chr4	166307373	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.092:63:27,5:30,0:36,22,5,0
chr4	166307407	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,3:0.052:75:32,0:36,3:20,52,1,2
chr4	166403574	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:3,7:3,2:0,6,0,10
chr4	166408782	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146710732,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	166978539	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=187,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:1,3:2,0:1,2,1,2
chr4	166981408	.	T	TA,TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30,31;MFRL=87,163,178;MMQ=60,60,60;MPOS=10,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=5.29,4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.373,0.355:8:0,1,1:2,2,1:0,2,0,6
chr4	167012241	.	GTTT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=T;STR;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0|1:167012241_GTTT_G:167012241:0,0,11,1
chr4	167012250	.	T	TAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=56.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0|1:167012241_GTTT_G:167012241:0,0,11,2
chr4	167012381	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,12:0,0,19,9
chr4	167012480	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,6:0,0,2,18
chr4	167012506	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,0,18
chr4	167012543	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	167020494	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.092:51:24,0:23,4:29,18,3,1
chr4	167656073	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,24:0.431:56:18,15:14,9:31,1,24,0
chr4	168155063	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr4	169086441	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=150.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,20:0,26:0,0,31,17
chr4	169086540	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.886:5:0,4:0,0:0,0,0,5
chr4	169183789	.	A	G	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=277.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,44:0,28:0,0,64,10
chr4	169188927	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=116.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,19:0,14:0,0,13,23
chr4	169190129	.	CAA	C,CA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,32,26;MFRL=157,138,148;MMQ=60,60,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=4.68,35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,17:0.155,0.668:25:1,2,5:2,2,7:1,3,0,21
chr4	169197081	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,19;MFRL=200,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.274:5:0,0:2,0:4,0,1,0
chr4	169213139	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	169232226	.	TA	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.077:62:26,1:25,1:11,47,0,4
chr4	169282232	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:8,3:8,11:12,4,13,1
chr4	169292759	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,27:0.457:59:15,16:17,10:23,9,17,10
chr4	169299676	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:6,6:5,5:0,12,0,11
chr4	169301059	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr4	169315571	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	169317081	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:6,4:10,4:0|1:169317081_C_A:169317081:15,1,7,1
chr4	169317082	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,16:0.654:24:4,6:4,10:1|0:169317081_C_A:169317081:7,1,15,1
chr4	169317279	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.502:26:2,3:8,9:4,9,4,9
chr4	169317284	.	T	TA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.352:30:5,3:13,4:4,15,2,9
chr4	169317343	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,0:12,3:0,19,0,3
chr4	169325282	.	TA	T,TAA	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=144,166,167;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=8.22,22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,7,16:0.142,0.312:51:10,3,6:13,4,6:4,24,1,22
chr4	169327755	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,5:0.089:65:37,4:23,1:39,21,3,2
chr4	169337741	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr4	169351683	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=147,70;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.067:42:20,0:20,2:0|1:169351683_A_T:169351683:16,24,1,1
chr4	169351686	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=147,70;MMQ=60,56;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:20,0:20,2:0|1:169351683_A_T:169351683:16,24,1,1
chr4	169351692	.	G	GACACCCAGTAGAGTA	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=147,70;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:19,0:17,2:0|1:169351683_A_T:169351683:13,25,1,1
chr4	169351717	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=139,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,1:10,1:10,15,0,2
chr4	169374487	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=193,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,5:6,5:0,8,0,10
chr4	169392803	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=223,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:2,1,3,0
chr4	169433326	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.411:22:5,5:7,2:0|1:169433326_TG_CA:169433326:6,7,4,5
chr4	169433333	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.429:21:5,4:7,2:0|1:169433326_TG_CA:169433326:5,7,4,5
chr4	169612461	.	GT	G,GTT	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=33,34,33;MFRL=137,137,137;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.79,7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,5,10:0.117,0.216:41:13,2,4:13,3,6:0,26,2,13
chr4	169612528	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:0,5,0,7
chr4	169630333	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr4	169835048	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,16,2
chr4	169842976	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr4	169846255	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=209,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,11:1,14:1,0,9,16
chr4	169846359	.	GCT	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=130.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.976:35:0,15:0,20:0,0,28,7
chr4	169923363	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=114,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=25,19;RU=A;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:1,0:0,1:1,1,0,3
chr4	169931268	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=135.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.972:32:0,13:0,19:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,6,26
chr4	169931274	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=119.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,10:0,16:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,5,22
chr4	169931288	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,5,13
chr4	169931326	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=168,193;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.544:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr4	170017860	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:3,4,0,3
chr4	170354836	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr4	170354873	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr4	170483153	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	170510679	.	GA	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.231:46:14,4:18,5:2,34,0,10
chr4	170616918	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	170628474	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	170663321	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	170669824	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,10:0,0,19,1
chr4	170913543	.	TGAACATCTATGAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAACATCTATGAA;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr4	170927112	.	C	CGTTGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	170927113	.	A	AAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	170989708	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:12,1,2,1
chr4	172735897	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	173232679	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr4	173232944	.	G	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=244.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,38:0,36:0,0,20,54
chr4	173873170	.	TG	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.940:30:1,18:0,11:1,0,20,9
chr4	173930309	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,6:3,3:4,1,6,3
chr4	173930479	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr4	174238918	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,1:8,1:6,16,0,2
chr4	174294990	.	A	AT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=112.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,14:0,21:0,0,35,1
chr4	174537063	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,29;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=91.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,25,3
chr4	175225386	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:17,3:14,0:29,3,3,0
chr4	175229927	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:14,2:15,3:17,12,1,4
chr4	175414202	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	175414246	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	175443156	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:1,3,3,5
chr4	175443424	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	175580119	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr4	175649861	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=10,33;MFRL=169,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.899:12:0,6:0,4:0,1,2,9
chr4	175649873	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=18,35;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,1:0,3:0,2,0,6
chr4	175688274	.	TACAC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=235,176;MMQ=53,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=AC;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:0|1:175688274_TACAC_T:175688274:0,1,0,2
chr4	175688298	.	C	CACACAGAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=176,235;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:175688274_TACAC_T:175688274:0,2,0,1
chr4	176562080	.	TTT	CAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=309,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176562080_TTT_CAA:176562080:0,1,0,1
chr4	176562087	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=309,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176562080_TTT_CAA:176562080:0,1,0,1
chr4	176562088	.	T	TCAGAAAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=309,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176562080_TTT_CAA:176562080:0,1,0,1
chr4	176733450	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.862:5:0,1:0,2:0|1:176733450_G_T:176733450:0,0,1,4
chr4	176733452	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.866:5:0,1:0,4:0|1:176733450_G_T:176733450:0,0,1,4
chr4	177032932	.	G	GTAAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177032932_G_GTAAGC:177032932:0,1,0,1
chr4	177032935	.	A	AGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177032932_G_GTAAGC:177032932:0,1,0,1
chr4	177049854	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,28:0.460:61:18,14:15,14:28,5,25,3
chr4	177049880	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,38:0.470:81:23,19:20,19:33,10,27,11
chr4	177050057	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,21:0.479:44:7,8:11,13:0|1:177050057_G_A:177050057:3,20,0,21
chr4	177050062	.	CTATCAAATAAAA	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,16:0.416:39:11,5:11,10:0|1:177050057_G_A:177050057:2,21,0,16
chr4	177052925	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,5:6,5:0,14,0,10
chr4	177058580	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=255,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr4	177058741	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:5,7:3,11:4,4,5,14
chr4	177061218	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	177063096	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=82.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,30:0.542:55:9,13:16,16:20,5,24,6
chr4	177071187	.	T	TAGTTTTTCTATTTC	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.079:34:12,2:19,0:14,18,0,2
chr4	177071841	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	177082032	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,35;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:4,2:0,0:2,2,2,0
chr4	177082069	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:3,3:4,3:6,2,4,2
chr4	177083166	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=95.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,14:0,0,26,0
chr4	177084327	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,0:8,2:14,7,2,0
chr4	177093505	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.408:47:16,7:12,12:23,5,18,1
chr4	177100754	.	AT	A,ATT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=145,0,150;MMQ=60,60,60;MPOS=11,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.75,4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.220,0.235:14:2,1,1:4,2,1:1,7,2,4
chr4	177113764	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,4:5,2:11,2,6,0
chr4	177113779	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:11,4:3,4:11,3,7,1
chr4	177116463	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:5,1,5,0
chr4	177142488	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:12,9:8,10:3,17,6,13
chr4	177142776	.	CA	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,1,9
chr4	177143417	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	177143664	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	177241136	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr4	177605081	.	CTCA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCA;STR;TLOD=111.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,20,7
chr4	177608875	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	177650593	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177650593_C_T:177650593:0,0,1,0
chr4	177650614	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177650593_C_T:177650593:0,0,1,0
chr4	177713511	.	G	GACAGTAAAGAGCCGTCCATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	178256759	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:3,1:0,9:3,0,10,0
chr4	178257516	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,4:5,4:0,9,2,6
chr4	178262613	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.465:9:3,3:2,1:5,0,3,1
chr4	178262811	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:1,9,0,2
chr4	178272748	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr4	178274919	.	C	CT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=159,140;MMQ=56,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.653:6:0,2:1,0:0,2,2,2
chr4	178274968	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.578:22:8,7:1,4:0,9,0,13
chr4	178353046	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,0,4
chr4	178355668	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,8:0,17:0,0,5,20
chr4	178357514	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	178361414	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:8,5:6,3:11,4,6,2
chr4	178361621	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	178363378	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,13:0,0,25,0
chr4	178882120	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr4	178897192	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=224,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr4	183267728	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:2,2:0,3:2,0,4,1
chr4	183268174	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	183522021	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr4	183594117	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	183600752	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr4	183601593	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=179,154;MMQ=54,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,1,2
chr4	183601594	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=154,179;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,2,0
chr4	183601666	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=98,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,2:4,4:5,5,4,2
chr4	183650026	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,36;MFRL=223,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr4	183659722	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=151,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,6:6,3:3,9,0,10
chr4	183664593	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:1,4:5,8:1,5,0,12
chr4	183673226	.	T	TA,TAA	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,16,17;MFRL=118,162,123;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=27.32,7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,16,7:0.514,0.213:33:3,2,3:5,6,0:1,9,3,20
chr4	183673247	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=156.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,16:0,22:0,0,1,38
chr4	183674577	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr4	183694858	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=230,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:183694858_A_G:183694858:0,2,0,1
chr4	183694864	.	CA	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=219,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:183694858_A_G:183694858:0,4,0,1
chr4	183694868	.	T	TCTGCTAAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=219,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:183694858_A_G:183694858:0,4,0,1
chr4	183715020	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:12,9,0,2
chr4	183721143	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:7,8,1,1
chr4	183814169	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.631:14:2,3:2,5:2,3,4,5
chr4	184170025	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr4	184171187	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:7,5:5,9:4,8,2,12
chr4	184180920	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=99.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,4,25
chr4	184182001	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,5:0,0,8,4
chr4	184190355	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,1:0,3,1,3
chr4	184190535	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,17:0.400:43:13,5:12,12:18,8,7,10
chr4	184202148	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr4	184236951	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:0,4,0,6
chr4	184366629	.	T	TGCACA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCACA;STR;TLOD=69.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,7:0,0,16,0
chr4	184367558	.	TCTG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,3:0,16:0,0,14,5
chr4	184426526	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=197.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,24:0,34:0,0,16,43
chr4	184427580	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr4	184567431	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.319:25:6,4:8,4:15,2,6,2
chr4	184570723	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.378:22:5,5:8,1:1,13,0,8
chr4	184577177	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	184585015	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=103,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:9,1:15,5:12,13,5,1
chr4	184585134	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:13,1:16,1:12,17,0,2
chr4	184612656	.	TAATAATAAAAGTATGTTTATATCAATATTTTA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.171:26:7,3:10,0:0,22,0,4
chr4	184614376	.	T	TTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,139;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0,14,0,2
chr4	184930308	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,9;MFRL=77,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,0:6,0:4,12,1,1
chr4	184932609	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0,0,2,18
chr4	185312027	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr4	185552135	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr4	185553098	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:15,7:6,10:5,16,5,12
chr4	185556618	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.440:32:9,5:8,8:0,18,1,13
chr4	185559487	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:3,1,5,2
chr4	185578485	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:6,5:7,3:0,13,3,5
chr4	185583092	.	C	CTATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,0,15
chr4	185593699	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:0,8,1,3
chr4	185603582	.	A	AAGCTCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,222;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr4	185612627	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:5,8:4,4:8,3,12,1
chr4	185612953	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chr4	185615888	.	G	GGA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,128;MMQ=60,22;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:19,0:12,2:10,23,0,2
chr4	185631338	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:7,7:4,5:0,11,1,12
chr4	185634144	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:3,3,1,3
chr4	185634171	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:0,0:2,0:0,2,0,2
chr4	185637523	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,8:4,4:9,0,11,1
chr4	185638231	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr4	185650276	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,3:4,1:0,4,0,5
chr4	185652201	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:2,8:9,4:0,15,0,14
chr4	185652223	.	AAC	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:8,3:9,1:0,17,0,4
chr4	185652224	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.559:23:4,9:5,4:0,10,0,13
chr4	185681475	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr4	185687233	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr4	185687687	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	185691716	.	AGGGGGAG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,42;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGGAG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	185691738	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	185694697	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:4,3:6,3:10,0,7,0
chr4	185694877	.	T	TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.257:24:9,1:8,4:13,5,3,3
chr4	185701620	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:185701620_T_C:185701620:0,1,0,3
chr4	185701627	.	C	CATGATATT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,36;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:185701620_T_C:185701620:0,3,0,1
chr4	185701628	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:185701620_T_C:185701620:0,3,0,1
chr4	185701633	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:185701620_T_C:185701620:0,3,0,1
chr4	185701637	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:185701620_T_C:185701620:0,3,0,1
chr4	185724445	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=157,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:1,1:11,1:11,1,1,1
chr4	185940461	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	186097219	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=196,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,0:2,2:0,5,0,4
chr4	186168387	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:9,3:5,8:14,0,11,0
chr4	186272773	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=81,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:2,4,1,1
chr4	186274541	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=205,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,3:1,1:2,0,4,0
chr4	186288457	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:3,1:2,1:1,5,0,2
chr4	186294198	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,2:6,5,1,3
chr4	186320666	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.945:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr4	186321067	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr4	186321447	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	186324841	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	186336583	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	186347055	.	G	A	.	.	DP=94;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=279.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,88:0.989:88:0,43:0,41:0,0,21,67
chr4	186347073	.	G	C	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=230.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,41:0,31:0,0,4,70
chr4	186347092	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=212.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,33:0,32:0,0,1,64
chr4	186350559	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.387:26:8,2:8,7:11,5,5,5
chr4	186361876	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.912:7:0,6:0,0:0,0,0,7
chr4	186366315	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr4	186366382	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	186370676	.	TA	T,TAA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31,31;MFRL=160,144,157;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=8.56,15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,5,11:0.145,0.298:36:5,2,3:15,3,8:20,0,14,2
chr4	186384243	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr4	186423637	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr4	186423655	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:1,5,1,6
chr4	186423661	.	A	AGCGCC	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=197,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:0|1:186423661_A_AGCGCC:186423661:1,9,1,1
chr4	186423663	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=188,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,0:2,1:0|1:186423661_A_AGCGCC:186423661:1,10,1,1
chr4	186423677	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,2:0,2:0,0,0,6
chr4	186423734	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	186427735	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,3:0,1:0,3,2,2
chr4	186427841	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	186444698	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	186444704	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	186456617	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr4	186544675	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:3,1:14,1:11,6,2,0
chr4	186551624	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,9:0,5:0,0,15,0
chr4	186578529	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr4	186997767	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:2,0,2,2
chr4	187000256	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,4:1,0:0,2,0,5
chr4	187003636	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:23,0:16,4:18,22,0,4
chr4	187005376	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr4	187005379	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.387:8:2,1:2,1:0,5,0,3
chr4	187073030	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr4	187075886	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0|1:187075886_T_TA:187075886:0,1,0,1
chr4	187075888	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:187075886_T_TA:187075886:0,1,0,1
chr4	187075889	.	T	TGTCTCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:187075886_T_TA:187075886:0,1,0,1
chr4	187077393	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr4	187078922	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr4	187084602	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:7,0:11,2:16,5,0,2
chr4	187115632	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:5,4:2,1:4,3,2,4
chr4	187115841	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr4	187118040	.	TTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:3,2:7,0,4,0
chr4	187118662	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.485:33:7,8:10,8:10,7,13,3
chr4	187122304	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:11,7:11,8:14,8,7,8
chr4	187122319	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.428:40:11,8:12,9:15,8,8,9
chr4	187130198	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,3:3,6:3,4,3,6
chr4	187130490	.	A	AGGGAAAAAAGAAACCACC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,137479142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	187171355	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	187172280	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=187,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr4	187172353	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.536:13:3,3:3,3:6,0,7,0
chr4	187175722	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,4:5,5:6,2,7,2
chr4	187178300	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,4:3,7:5,1,11,0
chr4	187178599	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,11:0,0,2,20
chr4	187178613	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:2,6:5,3:1,6,1,9
chr4	187195452	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,2:2,9,0,2
chr4	187201834	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	187208795	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:10,0,0,4
chr4	187454848	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,2:9,0:17,6,0,2
chr4	187510226	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=144,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:14,1:23,2:7,30,0,3
chr4	187510280	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:5,3:10,4:5,10,0,7
chr4	187517758	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,25:0.702:35:5,7:5,16:4,6,12,13
chr4	187518196	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:8,11,1,1
chr4	187518976	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.593:25:6,9:4,6:0|1:187518976_C_T:187518976:2,8,2,13
chr4	187518980	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=99.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,14:0,10:0|1:187518976_C_T:187518976:0,0,4,21
chr4	187522528	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:2,10:4,6:2,4,8,8
chr4	187525153	.	A	AGACGGGAAGAAAGGGTATGAAATACGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=117,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.312:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	187530313	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr4	187534542	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr4	187534559	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	187538133	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:5,1,8,0
chr4	187539003	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:7,1,1,1
chr4	187539217	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:3,11:1,3:4,0,9,5
chr4	187540635	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,5:4,5:5,3,5,5
chr4	187540654	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.678:16:3,7:1,4:0,5,4,7
chr4	187540918	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:5,5:0,6:5,0,6,5
chr4	187541761	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.552:22:6,4:2,8:5,5,6,6
chr4	187542316	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=182,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:4,3,2,0
chr4	187542736	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:7,10:4,5:8,3,8,7
chr4	187542940	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=187,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr4	187542970	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=228,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:187542970_A_T:187542970:0,2,0,1
chr4	187542976	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=228,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:187542970_A_T:187542970:0,2,0,1
chr4	187542980	.	GT	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=228,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:187542970_A_T:187542970:0,2,0,1
chr4	187549428	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.540:26:4,5:7,9:7,5,10,4
chr4	187549582	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,1:3,3:3,2,1,4
chr4	187554770	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:9,0,2,0
chr4	187557148	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,4:3,2:7,0,6,0
chr4	187560812	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:6,0,6,0
chr4	187584771	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	188925815	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,63;MMQ=55,46;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,2:4,1,4,2
chr4	189012456	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,2:0,3:0|1:189012456_C_T:189012456:1,0,6,0
chr4	189012458	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0|1:189012456_C_T:189012456:1,0,6,0
chr4	189018281	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:17,3:17,0:19,18,3,0
chr4	189018486	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=97,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,5:4,5:5,2,7,3
chr4	189018597	.	CCATG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=117,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:0|1:189018597_CCATG_C:189018597:0,3,0,1
chr4	189018604	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=117,238;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:189018597_CCATG_C:189018597:0,3,0,1
chr4	189018606	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=117,238;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:189018597_CCATG_C:189018597:0,3,0,1
chr4	189018613	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr4	189022420	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=228,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr4	189026171	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=205,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:2,3,4,3
chr4	189060633	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	189061169	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=129,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:2,3:3,4:1,4,1,7
chr4	189061604	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=144,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:4,2,3,0
chr4	189061675	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.396:18:3,3:8,4:5,6,5,2
chr4	189061855	.	GAAAAAAAAAAGACAAATTTTTCC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.505:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	189063361	.	CGTGTGTGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,10;RU=GT;STR;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,13:0.825:15:0,8:1,4:0|1:189063361_CGTGTGTGTGTGTGTGT_C:189063361:2,0,10,3
chr4	189063392	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,15:0.696:21:4,9:2,6:0|1:189063361_CGTGTGTGTGTGTGTGT_C:189063361:4,2,10,5
chr4	189065055	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:8,0:1,4:4,5,1,4
chr4	189065096	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=212,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:189065096_T_TA:189065096:4,0,0,1
chr4	189065097	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=212,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:189065096_T_TA:189065096:4,0,0,1
chr4	189065099	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=212,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:189065096_T_TA:189065096:4,0,0,1
chr4	189065104	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,4,3
chr4	189065128	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=197,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:4,1,1,3
chr4	190862319	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:13,1:22,1:0|1:190862319_G_A:190862319:2,33,0,2
chr4	190862341	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=193,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.197:37:11,1:19,5:1,29,0,7
chr4	190862342	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=189,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:12,1:21,2:0|1:190862319_G_A:190862319:1,33,0,3
chr4	190873335	.	C	T	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=146,149;MMQ=60,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,4:0.051:93:44,0:45,4:44,45,3,1
chr4	190873347	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=144,145;MMQ=55,23;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,5:0.061:94:42,1:45,4:46,43,3,2
chr4	190873442	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,145;MMQ=58,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,4:0.054:90:40,1:43,3:0|1:190873442_G_A:190873442:29,57,0,4
chr4	190873451	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=147,145;MMQ=60,23;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,4:0.057:85:39,1:40,2:0|1:190873442_G_A:190873442:26,55,0,4
chr4	190874147	.	AT	A	.	.	DP=154;ECNT=13;MBQ=31,32;MFRL=144,143;MMQ=48,23;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:107,23:0.181:130:51,14:47,9:92,15,23,0
chr4	190874157	.	A	G	.	.	DP=164;ECNT=13;MBQ=32,34;MFRL=142,139;MMQ=48,23;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=127.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,43:0.281:155:59,20:47,11:90,22,41,2
chr4	190874160	.	A	T	.	.	DP=192;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=143,122;MMQ=42,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:180,11:0.062:191:83,6:71,5:141,39,10,1
chr4	190874167	.	G	A	.	.	DP=274;ECNT=13;MBQ=34,29;MFRL=145,133;MMQ=43,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=205.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:184,72:0.284:256:92,31:85,35:155,29,40,32
chr4	190874175	.	A	G	.	.	DP=339;ECNT=13;MBQ=30,34;MFRL=145,139;MMQ=43,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=129.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:251,59:0.192:310:126,32:113,27:170,81,53,6
chr4	190874183	.	C	A	.	.	DP=383;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=149,126;MMQ=43,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:319,55:0.145:374:163,31:146,22:232,87,29,26
chr4	190874199	.	T	A	.	.	DP=485;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=140,151;MMQ=42,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=150.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:430,50:0.106:480:209,25:190,22:0|1:190874199_T_A:190874199:282,148,42,8
chr4	190874206	.	T	A	.	.	DP=522;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=139,151;MMQ=42,42;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:449,57:0.114:506:237,30:207,27:0|1:190874199_T_A:190874199:287,162,45,12
chr4	190874234	.	C	T	.	.	DP=595;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=135,137;MMQ=44,43;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:470,65:0.117:535:237,30:221,34:258,212,39,26
chr4	190874240	.	C	G	.	.	DP=566;ECNT=13;MBQ=33,37;MFRL=133,157;MMQ=48,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:547,10:0.020:557:251,7:255,3:0|1:190874240_C_G:190874240:300,247,8,2
chr4	190874242	.	TC	AA	.	.	DP=560;ECNT=13;MBQ=31,34;MFRL=133,157;MMQ=48,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:550,10:0.020:560:249,7:264,3:0|1:190874240_C_G:190874240:305,245,8,2
chr4	190874255	.	A	T	.	.	DP=538;ECNT=13;MBQ=29,31;MFRL=130,126;MMQ=50,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:463,47:0.088:510:228,20:218,26:228,235,27,20
chr4	190874256	.	C	T	.	.	DP=534;ECNT=13;MBQ=28,30;MFRL=129,141;MMQ=50,27;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:492,20:0.040:512:242,11:241,6:251,241,7,13
chr4	190874281	.	G	T	.	.	DP=513;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=130,148;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:498,6:0.012:504:222,3:251,2:187,311,1,5
chr4	190874290	.	T	A	.	.	DP=480;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=132,140;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=146.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:371,68:0.155:439:173,31:193,36:126,245,12,56
chr4	190874315	.	TA	GA,GT	.	.	DP=382;ECNT=8;MBQ=31,34,32;MFRL=151,141,134;MMQ=40,40,40;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=85.96,289.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:213,41,101:0.119,0.289:355:99,13,43:110,27,57:44,169,8,134
chr4	190874352	.	G	C	.	.	DP=183;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=157,143;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:156,19:0.112:175:69,6:85,13:6,150,0,19
chr4	190874367	.	CCA	C	.	.	DP=131;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=165,134;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:104,11:0.102:115:43,7:57,3:0|1:190874367_CCA_C:190874367:8,96,0,11
chr4	190874370	.	CAG	C	.	.	DP=123;ECNT=8;MBQ=34,27;MFRL=155,162;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=85.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,30:0.269:113:39,13:42,16:0|1:190874370_CAG_C:190874370:8,75,0,30
chr4	190874372	.	G	T	.	.	DP=115;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=167,134;MMQ=60,35;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,22:0.223:94:30,12:38,9:0|1:190874367_CCA_C:190874367:8,64,0,22
chr4	190874385	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=175,173;MMQ=60,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,13:0.206:66:21,7:30,5:0|1:190874370_CAG_C:190874370:5,48,0,13
chr4	190876242	.	G	A	.	.	DP=248;ECNT=20;MBQ=33,31;MFRL=142,127;MMQ=60,41;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=545.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,176:0.755:233:27,88:30,86:33,24,145,31
chr4	190876247	.	G	C	.	.	DP=261;ECNT=20;MBQ=34,35;MFRL=129,134;MMQ=43,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:258,3:0.015:261:124,2:125,1:0|1:190876247_G_C:190876247:192,66,3,0
chr4	190876250	.	G	A	.	.	DP=266;ECNT=20;MBQ=34,30;MFRL=127,134;MMQ=43,37;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:263,3:0.015:266:125,2:126,1:0|1:190876247_G_C:190876247:191,72,3,0
chr4	190876256	.	C	T	.	.	DP=275;ECNT=20;MBQ=32,28;MFRL=127,121;MMQ=43,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:245,25:0.089:270:121,9:112,16:172,73,19,6
chr4	190876263	.	A	T	.	.	DP=288;ECNT=20;MBQ=31,27;MFRL=128,111;MMQ=43,33;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:251,25:0.088:276:117,14:122,9:172,79,18,7
chr4	190876268	.	A	G	.	.	DP=294;ECNT=20;MBQ=31,33;MFRL=127,134;MMQ=42,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:270,21:0.075:291:125,10:134,9:0|1:190876268_A_G:190876268:173,97,16,5
chr4	190876269	.	T	C	.	.	DP=295;ECNT=20;MBQ=30,33;MFRL=125,139;MMQ=42,30;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:269,16:0.058:285:123,11:139,5:170,99,13,3
chr4	190876272	.	G	A	.	.	DP=290;ECNT=20;MBQ=33,31;MFRL=126,131;MMQ=42,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:268,22:0.079:290:117,12:135,7:0|1:190876268_A_G:190876268:168,100,16,6
chr4	190876278	.	G	A	.	.	DP=266;ECNT=20;MBQ=33,33;MFRL=125,131;MMQ=41,36;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:248,18:0.071:266:107,7:128,11:0|1:190876278_G_A:190876278:139,109,11,7
chr4	190876287	.	G	A	.	.	DP=248;ECNT=20;MBQ=32,30;MFRL=125,126;MMQ=40,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:231,16:0.068:247:95,9:115,5:0|1:190876268_A_G:190876268:109,122,9,7
chr4	190876293	.	C	A	.	.	DP=235;ECNT=20;MBQ=32,32;MFRL=125,126;MMQ=40,37;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:208,16:0.075:224:93,7:111,8:0|1:190876278_G_A:190876278:80,128,8,8
chr4	190876301	.	C	A	.	.	DP=207;ECNT=20;MBQ=34,30;MFRL=128,124;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:182,21:0.104:203:88,9:86,11:0|1:190876301_C_A:190876301:58,124,6,15
chr4	190876305	.	A	T	.	.	DP=208;ECNT=20;MBQ=30,32;MFRL=128,124;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:186,19:0.094:205:84,9:78,9:0|1:190876301_C_A:190876301:56,130,5,14
chr4	190876307	.	G	A	.	.	DP=189;ECNT=20;MBQ=32,30;MFRL=129,124;MMQ=40,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:179,9:0.053:188:83,6:83,3:0|1:190876268_A_G:190876268:44,135,1,8
chr4	190876319	.	A	T	.	.	DP=148;ECNT=20;MBQ=30,33;MFRL=143,125;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=175.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,60:0.419:144:38,27:41,33:16,68,1,59
chr4	190876322	.	G	C	.	.	DP=144;ECNT=20;MBQ=33,33;MFRL=135,132;MMQ=40,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,12:0.091:141:56,6:64,5:0|1:190876268_A_G:190876268:16,113,1,11
chr4	190876335	.	T	C	.	.	DP=128;ECNT=20;MBQ=32,34;MFRL=142,141;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:116,11:0.093:127:53,4:59,5:0|1:190876335_T_C:190876335:9,107,1,10
chr4	190876343	.	G	A	.	.	DP=114;ECNT=20;MBQ=33,32;MFRL=144,146;MMQ=40,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,8:0.077:114:52,3:49,5:0|1:190876335_T_C:190876335:5,101,0,8
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chr4	190878452	.	TG	CA	.	.	DP=67;ECNT=10;MBQ=29,33;MFRL=182,187;MMQ=43,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.103:66:28,4:29,1:55,5,6,0
chr4	190878463	.	T	G	.	.	DP=75;ECNT=10;MBQ=31,34;MFRL=179,201;MMQ=46,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,16:0.221:75:25,11:30,5:0|1:190878463_T_G:190878463:52,7,15,1
chr4	190878479	.	A	C	.	.	DP=73;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=179,199;MMQ=49,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,3:0.055:70:28,1:36,2:0|1:190878479_A_C:190878479:60,7,3,0
chr4	190878485	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=10;MBQ=34,34;MFRL=180,191;MMQ=51,38;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,12:0.191:66:22,5:30,6:0|1:190878463_T_G:190878463:47,7,11,1
chr4	190878487	.	C	G	.	.	DP=65;ECNT=10;MBQ=34,36;MFRL=179,209;MMQ=49,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,8:0.134:65:22,5:33,3:0|1:190878487_C_G:190878487:49,8,8,0
chr4	190878500	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=10;MBQ=34,29;MFRL=167,191;MMQ=52,29;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,2:0.042:69:26,1:36,1:0|1:190878479_A_C:190878479:56,11,2,0
chr4	190878504	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=165,225;MMQ=58,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,8:0.126:70:25,2:35,6:0|1:190878504_C_T:190878504:50,12,7,1
chr4	190878506	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=154,207;MMQ=60,35;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=91.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,26:0.385:69:15,10:24,15:34,9,23,3
chr4	190878508	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=164,211;MMQ=56,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,3:0.055:70:21,1:31,1:0|1:190878487_C_G:190878487:55,12,3,0
chr4	190878512	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=159,196;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,5:0.103:56:22,0:28,4:0|1:190878504_C_T:190878504:43,8,4,1
chr4	190878541	.	T	TC	.	.	DP=79;ECNT=24;MBQ=31,32;MFRL=145,164;MMQ=57,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:34,2:34,1:44,30,3,0
chr4	190878563	.	C	A	.	.	DP=144;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=150,154;MMQ=40,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:116,22:0.161:138:62,10:50,12:73,43,20,2
chr4	190878567	.	G	C	.	.	DP=146;ECNT=24;MBQ=33,33;MFRL=149,133;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:137,6:0.048:143:71,5:64,1:0|1:190878567_G_C:190878567:93,44,4,2
chr4	190878569	.	T	C	.	.	DP=148;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=151,135;MMQ=40,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:135,13:0.093:148:68,7:61,5:91,44,9,4
chr4	190878571	.	G	A	.	.	DP=155;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=151,134;MMQ=40,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:149,6:0.045:155:71,2:65,4:0|1:190878571_G_A:190878571:100,49,5,1
chr4	190878580	.	A	G	.	.	DP=174;ECNT=24;MBQ=31,35;MFRL=144,167;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:159,7:0.047:166:75,7:83,0:110,49,6,1
chr4	190878583	.	T	C	.	.	DP=178;ECNT=24;MBQ=32,30;MFRL=144,170;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:167,10:0.058:177:78,5:81,3:0|1:190878567_G_C:190878567:119,48,5,5
chr4	190878596	.	G	A	.	.	DP=187;ECNT=24;MBQ=34,30;MFRL=144,134;MMQ=40,26;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:179,8:0.048:187:87,4:87,4:0|1:190878571_G_A:190878571:126,53,6,2
chr4	190878597	.	C	T	.	.	DP=185;ECNT=24;MBQ=34,30;MFRL=144,141;MMQ=40,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,65:0.354:185:58,30:57,34:78,42,53,12
chr4	190878599	.	A	G	.	.	DP=189;ECNT=24;MBQ=33,33;MFRL=144,135;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:163,21:0.118:184:78,11:77,10:118,45,13,8
chr4	190878600	.	TGAAGCAGGGGACATAGAA	T	.	.	DP=268;ECNT=24;MBQ=31,30;MFRL=140,163;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:245,13:0.054:258:83,7:83,6:145,100,7,6
chr4	190878604	.	G	A	.	.	DP=197;ECNT=24;MBQ=33,32;MFRL=143,135;MMQ=40,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:179,5:0.032:184:85,1:82,4:0|1:190878604_G_A:190878604:126,53,4,1
chr4	190878608	.	G	A	.	.	DP=214;ECNT=24;MBQ=33,32;MFRL=142,134;MMQ=40,26;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:186,8:0.046:194:85,4:88,4:0|1:190878571_G_A:190878571:124,62,6,2
chr4	190878625	.	A	G	.	.	DP=256;ECNT=24;MBQ=31,20;MFRL=134,123;MMQ=40,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:250,3:0.016:253:105,1:122,2:0|1:190878604_G_A:190878604:130,120,3,0
chr4	190878626	.	G	A	.	.	DP=249;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=133,135;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:230,7:0.033:237:102,2:121,5:118,112,5,2
chr4	190878654	.	C	G	.	.	DP=278;ECNT=24;MBQ=34,33;MFRL=138,132;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:211,59:0.220:270:87,31:118,28:61,150,16,43
chr4	190878658	.	G	A	.	.	DP=275;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=137,135;MMQ=40,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:261,9:0.036:270:112,2:135,7:68,193,2,7
chr4	190878661	.	A	T	.	.	DP=270;ECNT=24;MBQ=30,33;MFRL=139,134;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=170.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:195,73:0.273:268:88,29:105,43:56,139,11,62
chr4	190878662	.	T	C	.	.	DP=275;ECNT=24;MBQ=32,27;MFRL=139,135;MMQ=40,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:249,23:0.086:272:105,8:131,15:59,190,8,15
chr4	190878700	.	G	A	.	.	DP=144;ECNT=24;MBQ=33,30;MFRL=151,134;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:117,11:0.091:128:52,4:62,7:0|1:190878700_G_A:190878700:19,98,0,11
chr4	190878703	.	G	A	.	.	DP=128;ECNT=24;MBQ=33,28;MFRL=150,134;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:116,11:0.093:127:48,4:59,6:0|1:190878700_G_A:190878700:19,97,0,11
chr4	190878729	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=24;MBQ=31,31;MFRL=152,170;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,14:0.347:41:11,4:14,6:0|1:190878729_A_G:190878729:1,26,0,14
chr4	190878731	.	GG	CA	.	.	DP=43;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=152,172;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,15:0.363:42:10,6:14,5:0|1:190878729_A_G:190878729:1,26,0,15
chr4	190878750	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=24;MBQ=31,33;MFRL=169,189;MMQ=52,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:14,5:15,1:0,31,0,6
chr4	190881826	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=188,225;MMQ=40,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:7,5:11,5:6,12,9,1
chr4	190881871	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=182,176;MMQ=27,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,14:0.255:57:17,5:24,9:25,18,14,0
chr4	190881933	.	A	G	.	.	DP=102;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=162,131;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,34:0.350:98:35,16:28,17:59,5,34,0
chr4	190881969	.	G	A	.	.	DP=173;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=141,131;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=224.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,66:0.383:173:50,34:50,30:0|1:190881969_G_A:190881969:64,43,20,46
chr4	190881992	.	T	C	.	.	DP=193;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=146,142;MMQ=27,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=272.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:118,75:0.390:193:54,30:60,41:0|1:190881969_G_A:190881969:53,65,11,64
chr4	190881997	.	A	G	.	.	DP=194;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=141,144;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=264.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:113,72:0.390:185:50,30:58,40:0|1:190881969_G_A:190881969:45,68,8,64
chr4	190882909	.	T	C	.	.	DP=131;ECNT=24;MBQ=31,32;MFRL=166,161;MMQ=40,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:114,15:0.112:129:54,8:60,7:111,3,9,6
chr4	190882911	.	A	T	.	.	DP=139;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=162,166;MMQ=40,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:121,15:0.116:136:52,9:60,6:0|1:190882911_A_T:190882911:110,11,15,0
chr4	190882917	.	A	G	.	.	DP=152;ECNT=24;MBQ=33,34;MFRL=161,164;MMQ=40,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:133,16:0.112:149:60,9:70,7:0|1:190882911_A_T:190882911:116,17,16,0
chr4	190882925	.	T	C	.	.	DP=174;ECNT=24;MBQ=31,33;MFRL=161,161;MMQ=40,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:143,26:0.155:169:67,9:75,16:117,26,25,1
chr4	190882928	.	G	A	.	.	DP=178;ECNT=24;MBQ=35,31;MFRL=159,162;MMQ=40,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:153,18:0.109:171:66,9:82,9:125,28,17,1
chr4	190882949	.	T	C	.	.	DP=205;ECNT=24;MBQ=30,32;MFRL=156,158;MMQ=40,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:195,10:0.052:205:93,3:96,7:141,54,10,0
chr4	190882971	.	T	C	.	.	DP=171;ECNT=24;MBQ=32,34;MFRL=147,135;MMQ=52,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:164,5:0.035:169:46,2:82,3:0|1:190882971_T_C:190882971:101,63,1,4
chr4	190882973	.	A	G	.	.	DP=148;ECNT=24;MBQ=30,33;MFRL=145,136;MMQ=52,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=83.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:107,36:0.255:143:40,11:61,23:57,50,18,18
chr4	190882977	.	AAAG	A	.	.	DP=176;ECNT=24;MBQ=31,32;MFRL=138,135;MMQ=52,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:166,5:0.035:171:58,2:88,3:0|1:190882971_T_C:190882971:77,89,1,4
chr4	190883026	.	G	T	.	.	DP=218;ECNT=24;MBQ=34,31;MFRL=148,162;MMQ=52,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:195,21:0.100:216:82,9:106,12:69,126,2,19
chr4	190883030	.	G	T	.	.	DP=219;ECNT=24;MBQ=33,33;MFRL=150,168;MMQ=52,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:195,19:0.092:214:87,6:96,13:68,127,1,18
chr4	190883038	.	C	A	.	.	DP=214;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=152,159;MMQ=51,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:207,6:0.032:213:92,2:109,4:0|1:190883038_C_A:190883038:65,142,1,5
chr4	190883039	.	T	C	.	.	DP=214;ECNT=24;MBQ=32,34;MFRL=153,166;MMQ=52,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:197,12:0.058:209:82,8:107,4:64,133,1,11
chr4	190883046	.	G	A	.	.	DP=201;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=155,162;MMQ=52,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:187,10:0.054:197:81,5:95,5:60,127,3,7
chr4	190883051	.	G	A	.	.	DP=179;ECNT=24;MBQ=29,32;MFRL=137,169;MMQ=60,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=224.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,71:0.421:169:44,29:48,36:40,58,10,61
chr4	190883060	.	G	T	.	.	DP=160;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=156,177;MMQ=52,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:157,3:0.024:160:67,1:78,1:0|1:190883038_C_A:190883038:47,110,0,3
chr4	190883073	.	G	A	.	.	DP=149;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=144,172;MMQ=52,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:128,15:0.110:143:58,6:66,8:38,90,1,14
chr4	190883075	.	C	T	.	.	DP=143;ECNT=24;MBQ=28,31;MFRL=145,173;MMQ=52,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:129,10:0.072:139:56,6:67,4:37,92,1,9
chr4	190883080	.	CT	AG	.	.	DP=129;ECNT=24;MBQ=34,31;MFRL=148,171;MMQ=52,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,12:0.099:129:50,6:55,5:30,87,0,12
chr4	190883092	.	CTATT	C	.	.	DP=106;ECNT=24;MBQ=33,35;MFRL=148,165;MMQ=52,27;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,12:0.135:94:38,5:38,7:22,60,0,12
chr4	190883100	.	T	G	.	.	DP=93;ECNT=24;MBQ=32,34;MFRL=153,165;MMQ=52,33;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,7:0.086:90:39,5:43,2:18,65,2,5
chr4	190883110	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=24;MBQ=33,32;MFRL=144,168;MMQ=52,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=51.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,17:0.231:76:26,7:32,10:14,45,0,17
chr4	190883117	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=24;MBQ=33,34;MFRL=159,162;MMQ=51,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,5:0.077:76:31,1:35,4:12,59,0,5
chr4	190883125	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=24;MBQ=32,30;MFRL=161,161;MMQ=52,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,5:0.088:66:27,3:32,2:8,53,0,5
chr4	190883174	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=170,166;MMQ=60,25;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:13,1:11,4:2,23,0,5
chr4	190884118	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=158,139;MMQ=59,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr4	190884127	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=173,136;MMQ=60,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr4	190884177	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,131;MMQ=40,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:19,3:13,0:22,11,0,3
chr4	190905897	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,182;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:0|1:190905897_C_T:190905897:7,0,3,0
chr4	190905922	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=170,157;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,3:0.222:16:8,2:5,1:1|0:190905897_C_T:190905897:13,0,3,0
chr4	190906025	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=153,142;MMQ=60,27;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,11:0.263:44:13,7:17,4:21,12,2,9
chr4	190906052	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=148,160;MMQ=52,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:14,3:14,1:10,19,1,3
chr4	190906057	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=153,136;MMQ=52,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:12,3:13,1:0|1:190906057_G_A:190906057:10,17,0,4
chr4	190906060	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=153,136;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:12,3:10,1:0|1:190906057_G_A:190906057:8,16,0,4
chr4	190906142	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=140,165;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr4	190947451	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,140;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,28:0.708:39:4,12:7,16:11,0,28,0
chr5	163720	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163720_A_C:163720:0,0,0,1
chr5	163722	.	A	ACCGAGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163720_A_C:163720:0,0,0,1
chr5	169361	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	169763	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	172971	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr5	173200	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,3,15
chr5	173258	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	174026	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:9,1,2,0
chr5	174240	.	GC	AA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	182077	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr5	182462	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	194843	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=103,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:9,1:9,11,1,1
chr5	225768	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr5	230980	.	A	G	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=273.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,39:0,37:0,0,47,30
chr5	235531	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:5,1:14,1:1,18,0,2
chr5	254442	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=90.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,29,0
chr5	354051	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,4:0,13:0,0,3,15
chr5	413428	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.876:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr5	413591	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=92.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0|1:413591_G_A:413591:0,0,3,18
chr5	413594	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=92.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0|1:413591_G_A:413591:0,0,3,18
chr5	413639	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
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chr5	423029	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:0,4,0,6
chr5	423906	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	428166	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:0,6:1,6:0,1,1,12
chr5	432905	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.772:19:2,7:1,5:1,3,8,7
chr5	434981	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	434998	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	435001	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	442571	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	443236	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	458151	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:3,6:5,4:3,5,6,5
chr5	465164	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=237,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr5	466811	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr5	473580	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	475621	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:475621_T_TG:475621:0,0,7,0
chr5	475626	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:475621_T_TG:475621:0,0,7,0
chr5	476530	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,3,5
chr5	477634	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	479879	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	479905	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	481610	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	481780	.	C	CCTTAAAGCCACTTGCCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr5	482131	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,13;MFRL=243,174;MMQ=40,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:1,0:0,0:0|1:482131_A_C:482131:1,0,2,0
chr5	482138	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=16,12;MFRL=243,174;MMQ=40,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:0,0:0|1:482131_A_C:482131:1,0,2,0
chr5	482141	.	AA	GC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=16,16;MFRL=243,174;MMQ=40,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:0,0:0|1:482131_A_C:482131:1,0,2,0
chr5	482145	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=13,15;MFRL=174,243;MMQ=36,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:0,0:0,0:2,0,1,0
chr5	482146	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=36,11;MFRL=243,174;MMQ=40,36;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:1,0:0,0:0|1:482131_A_C:482131:1,0,2,0
chr5	482148	.	A	AGGGGGGGGGGGGGG,AGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,13,14;MFRL=0,174,243;MMQ=60,36,40;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=1,15,17;RU=G;STR;TLOD=5.46,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.499,0.335:3:0,0,0:0,0,0:0,0,3,0
chr5	482653	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,9:0,12:0,0,14,7
chr5	491826	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	619022	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr5	619333	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr5	634130	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=153,306;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	635709	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:1,6:5,9:2,4,5,10
chr5	644552	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:6,4:13,8:9,11,3,9
chr5	666244	.	G	GGGGCACAGGCGACTTA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCACAGGCGACTTA;STR;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,4:0,0:0,1,2,2
chr5	666270	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=173,91;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	666323	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	801362	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	843702	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=138,140;MMQ=27,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:5,6:13,4:15,3,9,1
chr5	843723	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=128,121;MMQ=27,45;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.355:42:10,10:17,3:17,10,10,5
chr5	1034818	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,40;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,0:15,2:21,0,1,1
chr5	1035399	.	T	TAATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AATG;STR;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	1035482	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=136.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,21:0,0,23,16
chr5	1036521	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr5	1038526	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	1053396	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr5	1057782	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	1060379	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	1060400	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	1060634	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	1060637	.	T	TTTTCAGTTCCATCTGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1060637_T_TTTTCAGTTCCATCTGTGTG:1060637:0,2,0,1
chr5	1060641	.	CA	TT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1060637_T_TTTTCAGTTCCATCTGTGTG:1060637:0,2,0,1
chr5	1060654	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	1065297	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,2:0|1:1065297_C_T:1065297:0,0,6,0
chr5	1065301	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:1065297_C_T:1065297:0,0,7,0
chr5	1065306	.	ACT	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:1065297_C_T:1065297:0,0,9,0
chr5	1065310	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,5:0|1:1065297_C_T:1065297:0,0,9,0
chr5	1065311	.	GGAGACACAC	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:1065297_C_T:1065297:0,0,9,0
chr5	1065689	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	1073689	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	1076245	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr5	1076996	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1076996_T_A:1076996:0,0,0,1
chr5	1076997	.	C	CCAGGCATACTGCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1076996_T_A:1076996:0,0,0,1
chr5	1078898	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr5	1081668	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:0,7:1,11:1,0,13,5
chr5	1081702	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,17,13
chr5	1085314	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:0,0:2,0:2,0,6,0
chr5	1085318	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,0:3,0:5,0,5,0
chr5	1085653	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1085653_G_A:1085653:0,1,0,1
chr5	1085655	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1085653_G_A:1085653:0,1,0,1
chr5	1085658	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:1085653_G_A:1085653:0,1,0,1
chr5	1085660	.	CC	TT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1085653_G_A:1085653:0,0,0,1
chr5	1093609	.	G	GGGGCGGGGACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCGGGGACT;STR;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	1094389	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr5	1201696	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	1201925	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=177,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr5	1212357	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	1214264	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr5	1219821	.	G	GGCAGCACAAATCCCCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	1221199	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr5	1225687	.	CT	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,6:0,0,7,6
chr5	1225703	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr5	1232255	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=283,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:1232255_AG_CC:1232255:1,0,1,0
chr5	1232261	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=283,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:1232255_AG_CC:1232255:1,0,1,0
chr5	1232491	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr5	1232551	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr5	1232774	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1232774_T_TA:1232774:3,0,1,0
chr5	1232776	.	A	AAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1232774_T_TA:1232774:3,0,1,0
chr5	1232779	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1232774_T_TA:1232774:3,0,1,0
chr5	1232781	.	GTTATTTTGT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.353:4:2,1:1,0:0|1:1232774_T_TA:1232774:3,0,1,0
chr5	1240848	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	1243009	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr5	1280477	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	1318665	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1318665_T_TAA:1318665:0,1,0,1
chr5	1318666	.	G	GGTTCCTGAGAAAGTCAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1318665_T_TAA:1318665:0,1,0,1
chr5	1320722	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr5	1324818	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,1:4,6:5,3,5,2
chr5	1325767	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:6,0,6,0
chr5	1325803	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:3,2:3,5:6,1,5,2
chr5	1334507	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=115,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.431:12:3,3:4,2:1,6,2,3
chr5	1334594	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	1334597	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	1335385	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr5	1344458	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=118,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.410:53:12,12:19,7:18,13,12,10
chr5	1409127	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr5	1411256	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	1416142	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	1421907	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	1432825	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,4:5,1:2,5,1,4
chr5	1432876	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0|1:1432876_G_A:1432876:0,2,0,6
chr5	1432881	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:1,4:0|1:1432876_G_A:1432876:0,2,0,5
chr5	1466813	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr5	1470900	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.363:26:10,6:4,3:10,7,5,4
chr5	1471109	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	1473977	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	1479678	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.824:9:0,5:1,3:1,0,7,1
chr5	1481148	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr5	1483541	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,50;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.120:49:19,5:16,0:29,15,5,0
chr5	1490019	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,6:3,5:0,9,0,11
chr5	1494764	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr5	1501542	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,4:9,2:12,1,6,0
chr5	1501790	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr5	1814369	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr5	1814395	.	TTGTA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTA;STR;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:2,1:5,1,6,1
chr5	1815992	.	G	A	.	.	DP=138;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:122,5:0.046:127:67,1:53,4:57,65,1,4
chr5	1881828	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,2:2,0,7,1
chr5	1882655	.	T	TGCCCCCCCCCCC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.355:12:1,2:6,2:0|1:1882655_T_TGCCCCCCCCCCC:1882655:7,1,4,0
chr5	1882660	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=12,32;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,0:2,2:0|1:1882655_T_TGCCCCCCCCCCC:1882655:8,1,3,0
chr5	1882664	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,1:7,2:0|1:1882655_T_TGCCCCCCCCCCC:1882655:11,1,3,0
chr5	1882669	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,1:4,1:0|1:1882655_T_TGCCCCCCCCCCC:1882655:11,1,3,0
chr5	1882788	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.614:25:1,3:8,5:1,8,4,12
chr5	2749057	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	2755031	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr5	5146200	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	5146223	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:3,2,4,1
chr5	5186415	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.593:8:3,2:0,3:0|1:5186415_GT_G:5186415:0,3,0,5
chr5	5186417	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.593:8:2,2:0,2:0|1:5186415_GT_G:5186415:0,3,0,5
chr5	5187776	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.405:10:3,0:3,3:6,0,4,0
chr5	5200220	.	A	ATCTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,0;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=TC;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr5	5232398	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	5236983	.	TA	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	5240137	.	A	ATCTCCCAGTGGAAAATGGAGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	5303349	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:6,3:7,1:10,5,3,1
chr5	5303614	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr5	5464225	.	A	AGACC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:5464225_A_AGACC:5464225:2,2,0,1
chr5	5464227	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:5464225_A_AGACC:5464225:1,2,0,1
chr5	5476250	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,14;MFRL=218,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,0:0,2,0,2
chr5	6372585	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=171,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.306:17:7,2:4,2:8,4,4,1
chr5	6372710	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,0:6,4:5,12,1,3
chr5	6378614	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,4,13
chr5	6602668	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:4,4:3,5:1,7,0,9
chr5	6604205	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=110,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:3,1,2,1
chr5	6605532	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,7,14
chr5	6607125	.	GAAC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr5	6610039	.	AAT	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:14,2:17,1:3,29,0,3
chr5	6611757	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	6611983	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,1,8
chr5	6617011	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr5	6618186	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr5	6620459	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr5	6623432	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr5	6632875	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,8:4,4:6,5,5,7
chr5	6632909	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,3:2,2:0,9,1,4
chr5	6632942	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:5,2:3,1:0,8,0,4
chr5	7690707	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	7690754	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr5	7743787	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,20:0,22:0,0,20,22
chr5	7782231	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr5	7804883	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7804883_T_G:7804883:0,1,0,1
chr5	7804885	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7804883_T_G:7804883:0,1,0,1
chr5	7804888	.	T	TCCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7804883_T_G:7804883:0,1,0,1
chr5	7804892	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:7804883_T_G:7804883:0,0,0,1
chr5	7835685	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	7859523	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.497:32:7,11:9,4:9,7,10,6
chr5	7861638	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr5	7861840	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7861840_C_T:7861840:0,0,0,1
chr5	7861852	.	T	TTCATAACTGCCTGATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7861840_C_T:7861840:0,0,0,1
chr5	7862926	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:6,3:9,7:12,4,8,2
chr5	7878035	.	TTCGTTTG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:0,1:2,0:2,3,0,1
chr5	7885782	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:5,4:3,2:8,0,6,0
chr5	7893121	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	7896957	.	CT	C	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,7:0.113:69:30,2:22,5:48,14,6,1
chr5	9043142	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr5	9050410	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	9066464	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr5	9066802	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	9201973	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=208,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,1:2,3:4,0,4,0
chr5	9225088	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	9227108	.	AAT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.085:32:15,2:15,0:2,28,0,2
chr5	9629251	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:9629251_A_C:9629251:5,0,1,1
chr5	9629254	.	GCACTT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:9629251_A_C:9629251:4,0,1,1
chr5	9629260	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:9629251_A_C:9629251:4,0,1,1
chr5	9629262	.	T	TGGA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,1:3,0:0|1:9629251_A_C:9629251:4,0,1,1
chr5	10227548	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr5	10227823	.	C	CCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=162,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	10235490	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	10236693	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,9:4,5:5,3,5,9
chr5	10250047	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=105.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.977:36:0,11:0,24:0,0,3,33
chr5	10250430	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=167.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,21:0,28:0,0,39,10
chr5	10250443	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=192.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,25:0,30:0,0,40,15
chr5	10254817	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=151.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,21:0,0,30,13
chr5	10255021	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr5	10256365	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	10258125	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr5	10262740	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,4,18
chr5	10263453	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,1:0,5:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,8
chr5	10263457	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,8
chr5	10263461	.	GGGA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,9
chr5	10264962	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	10282238	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,189;MMQ=50,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,1:12,1:16,0,2,0
chr5	10282479	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	10381840	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:7,1,2,0
chr5	10394911	.	ATT	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=167,155;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.322:7:5,1:0,0:4,1,1,1
chr5	10394930	.	GA	TG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=174,84;MMQ=53,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,2:1,0:1,5,2,0
chr5	10394997	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=191,162;MMQ=56,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0|1:10394997_C_T:10394997:0,7,0,2
chr5	10394999	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=191,162;MMQ=56,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:5,1:2,0:0|1:10394997_C_T:10394997:0,7,0,2
chr5	10397473	.	CT	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.151:39:14,3:17,2:6,27,3,3
chr5	10405809	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.306:16:3,3:6,1:1,10,1,4
chr5	10415850	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	10417589	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	10442496	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	10748231	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,19,0
chr5	10748462	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	10748469	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=187,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr5	10988172	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr5	11082762	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=117,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,1:3,1:2,1,2,1
chr5	11082866	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:13,9,0,2
chr5	11117693	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:7,3:2,5:2,8,1,7
chr5	11159657	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:12,4:11,5:14,9,7,2
chr5	11159945	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,1,4
chr5	11412302	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	11564995	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr5	13714740	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,3:4,0:3,4,0,3
chr5	13729714	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:4,3:3,2:1,7,0,5
chr5	13735892	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=182,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:3,3:7,10:6,4,11,2
chr5	13737700	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=204,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:13737700_A_G:13737700:0,1,1,2
chr5	13737705	.	G	GCCTGGCTCTCTAGAGGAGGAGGAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=102,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:13737700_A_G:13737700:1,1,0,1
chr5	13752462	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=207,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13752462_C_G:13752462:0,1,0,1
chr5	13752465	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=188,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:13752462_C_G:13752462:0,2,0,1
chr5	13763039	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr5	13769257	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:0,5,4,5
chr5	13770757	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	13776487	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:4,0,5,0
chr5	13810149	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=83.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,12:0,0,19,9
chr5	13810441	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	13810451	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:13810451_CAT_C:13810451:0,3,0,1
chr5	13810462	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:13810451_CAT_C:13810451:0,3,0,1
chr5	13817881	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=221,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr5	13820656	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,21;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:13820656_G_A:13820656:0,4,0,1
chr5	13820658	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:13820656_G_A:13820656:0,4,0,1
chr5	13820662	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=167,174;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:13820656_G_A:13820656:0,2,0,1
chr5	13820668	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=23,30;MFRL=159,190;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr5	13820671	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=143,182;MMQ=60,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr5	13820683	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=35,31;MFRL=143,190;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13820683_C_T:13820683:0,1,0,1
chr5	13820687	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=143,190;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13820683_C_T:13820683:0,1,0,1
chr5	13820696	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=143,190;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13820683_C_T:13820683:0,1,0,1
chr5	13820699	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=24,31;MFRL=143,190;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13820683_C_T:13820683:0,1,0,1
chr5	13829608	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,2:1,3:6,2,5,0
chr5	13839695	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr5	13842027	.	CAAAAA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=226,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=A;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.393:6:2,0:1,2:0|1:13842027_CAAAAA_C:13842027:0,4,1,1
chr5	13842052	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=224,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.757:4:1,1:0,2:0|1:13842027_CAAAAA_C:13842027:0,1,1,2
chr5	13845107	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	13845151	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	13850739	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:3,2:10,9:10,3,8,3
chr5	13850750	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.553:25:2,4:9,9:7,4,11,3
chr5	13859743	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:1,7:7,5:0,8,0,12
chr5	13859807	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	13862616	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:3,2,4,0
chr5	13865717	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=229,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:1,2,7,0
chr5	13866450	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:7,1:1,4:0,8,0,6
chr5	13867819	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr5	13868103	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.542:16:4,4:3,5:2,5,3,6
chr5	13871163	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,1:15,1:1,22,0,2
chr5	13871925	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,3:5,6:1,5,0,9
chr5	13882958	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.547:20:7,6:2,5:4,5,6,5
chr5	13885023	.	GCA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:0,1:0,1,3,1
chr5	13911700	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=A;STR;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	13914120	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr5	13914556	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	13914775	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,2,9
chr5	13914796	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	13914819	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr5	13923650	.	TT	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	13931205	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,4:3,5:8,1,6,3
chr5	13931340	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:3,2,1,4
chr5	14369690	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr5	14378068	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=252,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr5	14381174	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=143,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr5	14387489	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,1:2,4:9,1,5,0
chr5	14388793	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=113,130;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.166:25:11,0:7,0:11,10,0,4
chr5	14388797	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=111,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.192:25:9,1:6,1:11,9,0,5
chr5	14390989	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.148:36:15,2:13,3:28,3,5,0
chr5	14394283	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:0,8,1,4
chr5	14405895	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	14420027	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,10:0,0,11,5
chr5	14462816	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,11:0,16:0,0,25,4
chr5	14465620	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=12,21;MFRL=149,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.350:22:3,3:3,1:10,5,7,0
chr5	14472626	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,5:0,0,15,0
chr5	14476915	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=58,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAAG;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.506:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr5	14476968	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,6:6,4:7,5,5,5
chr5	14479938	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr5	14481270	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr5	14481455	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	14485161	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=149,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:6,1:5,2:9,3,3,0
chr5	14497070	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=109,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:12,1:15,1:10,19,1,1
chr5	14601058	.	TTTG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=107,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:14601058_TTTG_T:14601058:1,1,2,0
chr5	14601064	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=186,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,0:0|1:14601058_TTTG_T:14601058:2,1,2,0
chr5	14601071	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:14601058_TTTG_T:14601058:3,1,1,0
chr5	14607339	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr5	14610184	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr5	14678762	.	CT	C,CTT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=149,128,173;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=11.39,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,10,4:0.193,0.089:50:16,3,2:19,6,1:34,2,11,3
chr5	14713075	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=170,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,0:13,3:6,15,1,2
chr5	14751399	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=217,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr5	14871620	.	AGGGGCGAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGCGAC;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.861:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	15928155	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=121,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:15928155_G_A:15928155:0,3,0,1
chr5	15928157	.	C	CAAGACTGAGGATATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=121,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:15928155_G_A:15928155:0,3,0,1
chr5	15937296	.	AGGG	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=201,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:15937296_AGGG_A:15937296:0,3,0,1
chr5	15937300	.	A	AGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=201,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:15937296_AGGG_A:15937296:0,3,0,1
chr5	15937302	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=201,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:15937296_AGGG_A:15937296:0,3,0,1
chr5	15937309	.	A	AACTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=191,109;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:15937296_AGGG_A:15937296:0,2,0,1
chr5	16067596	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:5,9,2,0
chr5	16067919	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16067919_T_C:16067919:0,1,0,1
chr5	16067927	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=220,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:16067919_T_C:16067919:0,2,0,1
chr5	16091210	.	A	AGCAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=88,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:16091210_A_AGCAT:16091210:0,2,0,1
chr5	16091213	.	T	TGGATGTGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=88,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:16091210_A_AGCAT:16091210:0,2,0,1
chr5	16091242	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	16477751	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,15:0,0,22,4
chr5	16478120	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=134.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,21:0,17:0,0,29,9
chr5	16479151	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr5	16508674	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=182.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,38:0,16:0,0,27,27
chr5	16670618	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr5	16676103	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.470:28:8,9:6,4:14,1,13,0
chr5	16679966	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:6,0,6,0
chr5	16681553	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:9,0:20,2:12,17,1,1
chr5	16681966	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,28;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:1,2:6,4:3,4,5,1
chr5	16684109	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=112,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0|1:16684109_T_C:16684109:1,4,0,2
chr5	16684131	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=182,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:3,1:1|0:16684109_T_C:16684109:0,4,0,1
chr5	16690033	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:5,6:0,3:3,2,2,7
chr5	16699512	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=216,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,6:2,1:2,1,6,1
chr5	16699721	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=124,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:16699721_CCA_C:16699721:1,3,0,1
chr5	16699729	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=124,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:16699721_CCA_C:16699721:0,3,0,1
chr5	16699733	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=124,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:16699721_CCA_C:16699721:0,3,0,1
chr5	16711365	.	CA	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=57.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.931:24:1,8:0,13:0,1,8,15
chr5	16711451	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr5	16762646	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,13,6
chr5	16763908	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,9:6,5:2,8,2,12
chr5	16764334	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr5	16766093	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr5	16781940	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:6,0:9,2:0|1:16781940_T_A:16781940:3,12,1,1
chr5	16781944	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:4,2:0|1:16781940_T_A:16781940:2,10,1,1
chr5	16783437	.	T	TAAAC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,4:5,6:7,4,6,4
chr5	16818363	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	16877671	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:16877671_AC_A:16877671:6,1,2,0
chr5	16877673	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:16877671_AC_A:16877671:6,1,2,0
chr5	16877853	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.233:6:2,1:3,0:0|1:16877853_A_AT:16877853:0,5,0,1
chr5	16877856	.	G	GTGTCCCCGCTTAAATCT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:16877853_A_AT:16877853:0,5,0,1
chr5	16877860	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,1:3,0:0|1:16877853_A_AT:16877853:0,5,0,1
chr5	16877870	.	A	AACTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:16877870_A_AACTC:16877870:0,2,0,1
chr5	16877875	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:16877870_A_AACTC:16877870:0,2,0,1
chr5	17276053	.	CCT	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=118,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=CT;STR;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.747:17:1,7:2,6:0|1:17276053_CCT_C:17276053:1,3,3,10
chr5	17276080	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=111,118;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,4:0.239:19:8,1:5,3:1|0:17276053_CCT_C:17276053:3,12,1,3
chr5	17276848	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.802:21:1,7:2,6:4,0,13,4
chr5	17276986	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,1,22
chr5	19571589	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=227,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr5	21760602	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	21783690	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21783690_T_TA:21783690:0,1,0,1
chr5	21783691	.	T	TAGTTTACATTTTCCTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21783690_T_TA:21783690:0,1,0,1
chr5	21783703	.	G	GATCCATGTTTTGATCTGGGAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	23510203	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=68,160;MMQ=42,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=70.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:1,14:1,6:0,2,0,20
chr5	23510220	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=161,169;MMQ=49,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:5,0:0|1:23510220_A_G:23510220:0,18,0,2
chr5	23510222	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=161,169;MMQ=49,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,1:5,0:0|1:23510220_A_G:23510220:0,18,0,2
chr5	23523348	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr5	23527840	.	A	ACC	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=139,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.101:27:11,0:14,2:0|1:23527840_A_ACC:23527840:8,17,0,2
chr5	23527842	.	A	AC	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=139,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.101:27:9,0:13,2:0|1:23527840_A_ACC:23527840:8,17,0,2
chr5	23527919	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,0,11
chr5	24511674	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	26886200	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,23:0.436:53:20,10:10,13:4,26,7,16
chr5	26886261	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:0,13,0,6
chr5	26889902	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,1:3,2:5,2,3,0
chr5	26890727	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26890727_A_C:26890727:0,2,0,1
chr5	26890729	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26890727_A_C:26890727:0,2,0,1
chr5	31297497	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:12,2:17,0:6,23,0,2
chr5	31317812	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,126;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:8,5,2,0
chr5	31322851	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr5	31401447	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,5:3,1:8,0,6,0
chr5	31405880	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,0:2,2:0|1:31405880_T_C:31405880:0,3,0,2
chr5	31405887	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:31405880_T_C:31405880:0,3,0,2
chr5	31407139	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr5	31409115	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:7,0,3,0
chr5	31451752	.	GA	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:18,2:22,1:6,35,0,3
chr5	31472087	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=195,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:0,4:5,4:5,0,7,1
chr5	31472117	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:4,11:5,7:7,2,11,7
chr5	31483596	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=168.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,24:0,28:0,0,43,9
chr5	31483751	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=33,9;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,8:0.120:50:11,0:17,0:0|1:31483751_G_T:31483751:18,24,0,8
chr5	31483752	.	AG	A	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=26,15;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,8:0.121:50:12,0:21,0:0|1:31483751_G_T:31483751:18,24,0,8
chr5	31483753	.	GAA	G,GA	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=26,17,15;MFRL=125,109,161;MMQ=60,60,60;MPOS=18,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.95,7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,11:0.211,0.547:24:1,0,1:2,0,1:2,4,1,17
chr5	31483754	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=105,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,11:0.239:44:11,1:18,3:0|1:31483751_G_T:31483751:18,15,0,11
chr5	31486540	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr5	31508933	.	G	GT,GTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23,33;MFRL=170,120,220;MMQ=60,50,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.87,3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.377,0.376:5:1,1,1:0,0,1:0,1,0,4
chr5	31508945	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=152,172;MMQ=50,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr5	31511106	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,5:5,6:10,1,9,2
chr5	31521324	.	T	TCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=134,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:5,13,0,2
chr5	31529299	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,4
chr5	31529306	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,4
chr5	31532429	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,23,2
chr5	31532685	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr5	31541007	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,21:0.440:48:16,10:10,10:27,0,20,1
chr5	31541013	.	C	CT	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.102:41:20,1:16,2:36,1,4,0
chr5	31541034	.	G	T	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.082:70:33,5:24,0:56,9,5,0
chr5	31541212	.	AGTGTGTGT	A,AGT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32,31;MFRL=0,278,219;MMQ=60,60,55;MPOS=9,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,18,19;RU=GT;STR;TLOD=4.49,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.464,0.438:4:0,0,1:0,2,1:0,0,0,4
chr5	31799522	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=109,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:1,4:6,9:4,3,7,6
chr5	32057651	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	32057910	.	GT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:5,1:9,2:5,10,1,3
chr5	32072509	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	32077795	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32077795_G_T:32077795:0,2,0,1
chr5	32077798	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=184,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32077795_G_T:32077795:0,2,0,1
chr5	32087228	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,13,5
chr5	32087253	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0,0,12,10
chr5	32101400	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=119,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr5	32248077	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,1:5,3:8,0,3,1
chr5	32379210	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=350.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,103:0.991:103:0,47:0,54:0,0,55,48
chr5	32385852	.	C	CCTAACCCTAACCCTAACCCTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=180,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.242:7:1,1:3,0:0,6,0,1
chr5	32388485	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,3:6,2:7,0,5,0
chr5	32395502	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	32415360	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr5	32444286	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=199,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:1,4:2,0:4,0,5,0
chr5	32591804	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:1,0:0,2:0,8,1,2
chr5	32789852	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,0:1,3:1,3,3,1
chr5	32790625	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32790625_G_C:32790625:0,1,0,1
chr5	32790630	.	C	CTACCTCATCAGTATCTACCGGGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32790625_G_C:32790625:0,2,0,1
chr5	33441124	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:4,5:2,6:6,0,8,3
chr5	33455616	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr5	33455815	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,21:0.424:50:12,7:16,13:8,21,7,14
chr5	33456210	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,27:0.502:54:15,10:11,16:18,9,15,12
chr5	33457535	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,4:4,4:5,6,3,5
chr5	33458636	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr5	33458833	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:0,5,0,6
chr5	33460949	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:1,4:4,4:6,0,8,0
chr5	33461226	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:6,5:9,9:11,4,9,5
chr5	33467914	.	G	GGTTCGCTTTTGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	33535138	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=200,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33535138_C_G:33535138:0,1,0,1
chr5	33535139	.	GAC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=200,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33535138_C_G:33535138:0,1,0,1
chr5	33535142	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=200,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33535138_C_G:33535138:0,1,0,1
chr5	33546062	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=195,174;MMQ=49,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:2,0:10,4:12,0,4,0
chr5	33546113	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.554:27:7,7:5,8:11,1,11,4
chr5	33576848	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,0:5,4:4,7,0,4
chr5	33577339	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	33588684	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,8:2,2:5,4,5,5
chr5	33589003	.	G	GCACGCCCCCTAGTGGGTTGGAGTGTCTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=38,33;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.664:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	33615904	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr5	33630839	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,6:5,3:8,0,7,2
chr5	33637596	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr5	33637891	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:0,2:1,6:0|1:33637891_C_A:33637891:0,1,0,9
chr5	33637899	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:0,3:1,5:0|1:33637891_C_A:33637891:0,1,0,9
chr5	33637922	.	G	GTCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:33637922_G_GTCT:33637922:0,3,0,1
chr5	33637925	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:33637922_G_GTCT:33637922:0,3,0,1
chr5	33642112	.	AGCT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=212,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33642112_AGCT_A:33642112:0,1,0,1
chr5	33642118	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=212,246;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33642112_AGCT_A:33642112:0,1,0,1
chr5	33643617	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr5	33648842	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	33648906	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	33649637	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr5	33649807	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr5	33649835	.	A	AAGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	33751454	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,11:0,4:0,0,13,2
chr5	33963731	.	AAAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAC;STR;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	33964210	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,4:0,1:0,0,0,7
chr5	34043319	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34043319_G_GT:34043319:0,1,0,1
chr5	34043321	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34043319_G_GT:34043319:0,1,0,1
chr5	34124422	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=176,192;MMQ=40,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:11,1,2,0
chr5	34124441	.	ATACCTG	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=168,145;MMQ=52,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,0:10,2:0|1:34124441_ATACCTG_A:34124441:26,1,2,0
chr5	34124449	.	GACT	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=168,145;MMQ=52,49;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:15,0:12,2:0|1:34124441_ATACCTG_A:34124441:26,1,4,0
chr5	34124455	.	GTAACTTATAAGAAGAGATA	G	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=160,158;MMQ=52,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:15,0:12,3:0|1:34124441_ATACCTG_A:34124441:44,1,3,0
chr5	34687911	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:5,1:9,10:0,14,1,10
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chr5	35068354	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:9,2:0|1:35068341_C_T:35068341:7,13,1,1
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chr5	35641591	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=219,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,26:0.932:27:0,13:1,13:0|1:35641582_A_C:35641582:1,0,13,13
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chr5	35659355	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
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chr5	35739960	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr5	35740186	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:7,3:7,5:9,5,3,6
chr5	35740449	.	T	TATAGGGTCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=210,273;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	35763895	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	35774185	.	C	CTTCTAGGATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	35792356	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	35799994	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr5	35800310	.	AA	GG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=260,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	35807070	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:8,9:9,5:2,15,1,14
chr5	35807132	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,8:1,1:1,2,4,5
chr5	35807455	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	35857177	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,6:7,4:3,7,1,9
chr5	35857235	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr5	35857262	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr5	35861068	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.530:49:11,15:12,11:10,13,11,15
chr5	35875593	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:4,6:6,0:10,1,6,0
chr5	35876024	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,376;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35876024_AA_CC:35876024:0,0,1,0
chr5	35876029	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=308,376;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35876024_AA_CC:35876024:1,0,1,0
chr5	35876033	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=308,376;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35876024_AA_CC:35876024:1,0,1,0
chr5	35876035	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=308,376;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35876024_AA_CC:35876024:1,0,1,0
chr5	35876038	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=308,376;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35876024_AA_CC:35876024:1,0,1,0
chr5	35876449	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=169,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,5:6,0:3,5,3,3
chr5	35904614	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,5:2,7:6,0,11,1
chr5	35910419	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:13,0,6,0
chr5	35921069	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr5	35921266	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr5	35954614	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,3:4,4:1,6,2,5
chr5	36035727	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr5	36111167	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	36116787	.	TTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	36123065	.	TAA	T,TAAAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=16,21,15;MFRL=141,148,144;MMQ=60,60,60;MPOS=22,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,16;RU=A;STR;TLOD=6.95,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,4,3:0.124,0.086:29:4,2,1:5,0,0:5,17,2,5
chr5	36124428	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,2:11,1:0,24,0,3
chr5	36136349	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=97.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,24,2
chr5	36136675	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	36137620	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr5	36141386	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:2,5:5,3:0,8,0,8
chr5	36142589	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.537:13:3,4:2,2:4,3,5,1
chr5	36142648	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,7:7,2:5,6,6,4
chr5	36168582	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,1,11
chr5	36170455	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:5,7:4,7:3,6,11,3
chr5	36184135	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,194;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:22,2:7,0:1,28,0,2
chr5	36195448	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:7,6:5,6:0,13,0,12
chr5	36201336	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr5	36207424	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	36217764	.	G	GTTAATCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr5	36217997	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,7:5,4:2,11,3,8
chr5	36253937	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr5	36260976	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=162.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,31:0,19:0,0,19,31
chr5	36268218	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,13,0
chr5	36271491	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,8:0,9:0,0,1,16
chr5	36301362	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=134,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0|1:36301362_T_A:36301362:3,0,4,0
chr5	36301369	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=134,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0|1:36301362_T_A:36301362:3,0,4,0
chr5	36301420	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:3,2,7,2
chr5	36629549	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.225:28:13,0:5,0:12,9,7,0
chr5	36683903	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	36686472	.	T	TAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	36985303	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,30:0.425:71:25,18:16,12:20,21,16,14
chr5	37000642	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=125,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:17,2:19,2:18,18,2,2
chr5	37000852	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,6:0.091:75:31,5:38,1:48,21,4,2
chr5	37001074	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:8,7:13,4:16,5,6,5
chr5	37007629	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,2:7,7:0,9,0,9
chr5	37019354	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,4:0,3:2,2,6,1
chr5	37027560	.	G	T	.	.	DP=124;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,12:0.082:112:46,3:42,1:47,53,0,12
chr5	37027576	.	GT	G,GTT	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=30,20,17;MFRL=126,76,138;MMQ=60,60,60;MPOS=15,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=19.05,4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,12,6:0.232,0.114:50:6,8,0:15,1,2:1,31,4,14
chr5	37027598	.	T	TTTCTG	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=141,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:20,2:19,0:2,38,0,2
chr5	37036449	.	GTATA	G,GTA,GTATATA	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=34,35,34,34;MFRL=156,152,139,99;MMQ=60,60,60,60;MPOS=30,21,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,8,9,11;RU=TA;STR;TLOD=7.50,69.70,6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:16,4,27,4:0.080,0.509,0.090:51:4,2,16,2:10,2,10,1:13,3,28,7
chr5	37036492	.	C	T	.	.	DP=139;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:131,3:0.029:134:56,3:67,0:76,55,1,2
chr5	37051861	.	A	AT	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,6:0.112:60:38,2:15,4:43,11,4,2
chr5	37064677	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:10,0,1,1
chr5	37108621	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr5	37115000	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=189,152;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.798:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr5	37139474	.	TA	T	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,25:0.363:68:16,13:21,11:7,36,3,22
chr5	37173930	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.624:11:3,2:0,4:2,2,5,2
chr5	37176091	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,2:5,8:3,8,2,8
chr5	37180362	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=180,153;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,0:0,1:0,11,0,2
chr5	37182902	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,7:3,1:7,2,7,1
chr5	37187489	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,25:0.404:62:18,18:19,6:28,9,22,3
chr5	37196023	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.074:65:25,4:33,0:34,27,4,0
chr5	37199052	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	37224485	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,0:2,4:0,3,1,3
chr5	37247700	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=77.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,17,6
chr5	37247899	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr5	37292239	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=216,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:0,3,0,7
chr5	37307299	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.649:9:1,0:2,6:3,0,6,0
chr5	37331973	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=174,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37331973_G_T:37331973:0,1,1,0
chr5	37331976	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=174,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37331973_G_T:37331973:0,1,1,0
chr5	37349160	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:3,4:3,2:7,0,6,0
chr5	37350390	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,11:5,0:2,7,0,11
chr5	37358310	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=250,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	37364095	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=147,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:11,2:3,2:4,10,2,2
chr5	37364103	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,52;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,0:4,2:0|1:37364103_G_T:37364103:5,11,1,1
chr5	37364105	.	A	AGATACAACATATAAATT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=147,52;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,0:4,2:0|1:37364103_G_T:37364103:5,11,1,1
chr5	37392277	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,10;MFRL=156,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.194:18:4,0:5,0:1,14,0,3
chr5	37605122	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,21;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:0,3:0,1:5,0,8,0
chr5	37724990	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr5	37752497	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	38352476	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:6,3:3,1:0,9,0,5
chr5	38407256	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=84,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr5	38408075	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=154,275;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:38408075_A_C:38408075:1,1,0,1
chr5	38408079	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=154,275;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:38408075_A_C:38408075:1,1,0,1
chr5	38408093	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38408075_A_C:38408075:0,0,0,1
chr5	38490271	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,31:0.499:62:16,11:15,19:18,13,19,12
chr5	38502993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,37;MFRL=255,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	38504303	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:7,1:2,5:1,8,0,7
chr5	38510481	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:38510481_AC_A:38510481:0,0,1,0
chr5	38510486	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:38510481_AC_A:38510481:0,0,1,0
chr5	38512154	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,4:0,6,0,9
chr5	38528969	.	CACACACACACAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:2,3:5,1:1,6,0,4
chr5	38869035	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	38876573	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	38881628	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,7,4
chr5	38886040	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	38886044	.	A	ACACTTCTCTTCCTTAAGTAATTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=240,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.385:4:2,0:1,1:3,0,0,1
chr5	38903923	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr5	38904363	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:38904363_C_T:38904363:0,0,3,1
chr5	38904373	.	C	CATCATTTTTCCTTCACCATGGAGTTCAATCTGACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=148,121;MMQ=60,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:38904363_C_T:38904363:2,0,0,1
chr5	38917574	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr5	38923152	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=179,172;MMQ=56,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr5	38923171	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=230,156;MMQ=40,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr5	38931919	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:1,5:5,7:6,0,11,1
chr5	38932466	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:6,9:2,5:8,0,14,0
chr5	38933645	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	38942329	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=177,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:11,1:22,1,2,0
chr5	38942554	.	AT	A,ATT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,31,30;MFRL=145,170,182;MMQ=60,60,60;MPOS=16,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.22,9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,5:0.225,0.271:19:4,3,3:5,1,1:0,10,0,9
chr5	38942560	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=180,135;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:11,0:7,3:0|1:38942560_T_A:38942560:0,19,0,3
chr5	38942562	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=180,135;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:12,0:6,3:0|1:38942560_T_A:38942560:0,19,0,3
chr5	38945919	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	38953665	.	G	GA	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=147.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,61:0.930:66:4,17:1,14:2,3,10,51
chr5	38954994	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,0,23
chr5	38958750	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:11,9:6,8:12,5,12,5
chr5	38958968	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.911:21:1,10:0,9:0,1,0,20
chr5	38959794	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	38960058	.	TC	CT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:19,0:11,2:11,21,0,2
chr5	38962543	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=166.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,22:0,0,17,28
chr5	38966903	.	A	ATTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=178,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr5	38971912	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,0:0,0,6,0
chr5	38990957	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	39074296	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,23:0.436:53:18,10:12,12:11,19,10,13
chr5	39119222	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	39119236	.	GAT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=238,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	39119561	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=248.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.986:71:0,38:0,29:0,0,67,4
chr5	39124508	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:3,4:2,4:0,5,0,9
chr5	39127960	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr5	39134295	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,5:4,5:7,3,5,5
chr5	39139351	.	G	C	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.054:71:37,0:31,3:23,45,1,2
chr5	39341371	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:17,2:9,0:5,21,0,2
chr5	39342294	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,1:14,1:5,14,1,1
chr5	39342308	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:0,3:4,5:1,3,0,8
chr5	39377132	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=101,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,32:0.590:54:10,23:12,9:12,10,25,7
chr5	39390061	.	C	A	.	.	DP=90;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=296.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,41:0,45:0,0,16,70
chr5	39390121	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=155,75;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.136:19:10,1:5,1:0,17,0,2
chr5	40681254	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=101.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,34:0.549:62:10,15:16,19:11,17,11,23
chr5	40716153	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr5	40746885	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=113,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:9,10:3,6:12,1,13,3
chr5	40777531	.	T	TTA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.428:40:13,8:9,8:18,5,13,4
chr5	40949997	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr5	40950211	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=2573,161;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr5	40962083	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr5	40964816	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.676:26:5,11:3,5:5,3,12,6
chr5	40972646	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=112,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:8,13,0,2
chr5	40979790	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=107,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.539:9:2,2:2,2:2,2,4,1
chr5	40980102	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr5	40981768	.	CCTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=209,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	40998814	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=127,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:2,3:5,2:2,5,1,5
chr5	40998851	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr5	40999900	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,4:7,6:4,6,2,8
chr5	41000243	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:5,0,6,0
chr5	41001023	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	41004396	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr5	41004406	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr5	41004807	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr5	41005791	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr5	41008650	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,3:3,2:7,1,5,0
chr5	41008780	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:5,3:3,6:4,4,6,4
chr5	41009546	.	A	ATCAGAGACCTTCATGGAGCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=168,270;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	41009576	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41009576_A_C:41009576:0,1,0,1
chr5	41009577	.	C	CCTTGAAATTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41009576_A_C:41009576:0,1,0,1
chr5	41010258	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	41032998	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr5	41033883	.	T	TTATC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=162,113;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TATC;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.284:15:8,2:2,0:11,0,4,0
chr5	41033909	.	ATCTATCTATCTATC	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:5,9:4,3:10,4,11,1
chr5	41034058	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=153,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr5	41039000	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	41042284	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:8,5:1,5:4,5,5,5
chr5	41042321	.	AAAGAT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,7:0,1:2,1,3,5
chr5	41045768	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	41045835	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr5	41050999	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	41061715	.	CA	TG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,20:0.685:29:3,11:5,9:0|1:41061715_CA_TG:41061715:8,1,15,5
chr5	41061716	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,28:0.966:29:0,13:1,14:1|0:41061715_CA_TG:41061715:1,0,22,6
chr5	41061871	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.490:19:5,1:1,7:0,10,0,9
chr5	41069973	.	TGAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr5	41070840	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:3,0,7,0
chr5	41142967	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:0|1:41142967_C_T:41142967:6,7,1,1
chr5	41142969	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:41142967_C_T:41142967:6,7,1,1
chr5	41142973	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:41142967_C_T:41142967:6,7,1,1
chr5	41149284	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:7,0,6,0
chr5	41154150	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr5	41158863	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr5	41381901	.	T	TC	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=92.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,37:0.944:39:1,25:1,12:2,0,27,10
chr5	41807543	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr5	41909830	.	CT	C,CTT	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=34,33,26;MFRL=132,141,131;MMQ=60,60,60;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.40,4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:40,5,5:0.104,0.114:50:21,3,0:12,2,2:34,6,9,1
chr5	42713472	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,1:4,2:5,2,3,0
chr5	42718335	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr5	42769632	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.687:30:2,10:7,11:9,0,21,0
chr5	42769647	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.572:40:4,12:13,11:16,1,23,0
chr5	42769844	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.970:28:0,9:0,18:0,0,0,28
chr5	42779686	.	G	GA,GAA	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=34,33,34;MFRL=168,154,178;MMQ=60,60,60;MPOS=18,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=A;STR;TLOD=85.79,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,36,4:0.799,0.104:44:1,13,4:3,15,0:0,4,4,36
chr5	42779736	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.418:32:11,6:5,7:1,18,0,13
chr5	42783581	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,28:0.539:52:12,18:11,10:21,3,21,7
chr5	42799719	.	T	TTTA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=52.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,6:7,6:11,2,14,0
chr5	42799876	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,1:15,1:5,27,0,2
chr5	42800808	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.701:14:1,5:2,5:2,2,8,2
chr5	43122348	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr5	43292483	.	C	CTTACTATGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	43292908	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=111.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,14:0,0,30,5
chr5	43294357	.	TAAGTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	43295958	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:24,0:17,3:17,25,0,3
chr5	43297032	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr5	43298557	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr5	43412532	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	43488180	.	T	TTGATTAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=236,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	43492265	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=109.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,11:0,0,31,0
chr5	43493592	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=131.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.976:36:0,23:0,13:0,0,36,0
chr5	43509198	.	AC	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,141;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:11,2,2,0
chr5	43509462	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,5:0,0,1,6
chr5	43527673	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	43530035	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr5	43533992	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr5	43535754	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,6,17
chr5	43536855	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,23,0
chr5	43536904	.	TA	T	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,7:0.102:62:34,5:14,1:45,10,6,1
chr5	43543219	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,151;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:26,3:20,0:12,34,0,3
chr5	43609272	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,2:5,6:11,2,6,2
chr5	43609343	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=205.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,20:0,39:0,0,37,22
chr5	43612984	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr5	43613137	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:22,0:37,3:23,36,3,0
chr5	45353366	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,75;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:2,9,0,2
chr5	50046139	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr5	50055456	.	C	CT,CTT,CTTT	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,34,32,33;MFRL=203,158,157,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,10,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,17,18,19;RU=T;STR;TLOD=11.03,11.04,16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,8,11,13:0.199,0.301,0.360:38:4,6,7,3:1,2,1,4:4,2,24,8
chr5	50122645	.	GTT	G,GT,GTTT,GTTTT	.	.	DP=120;ECNT=1;MBQ=30,17,33,33,14;MFRL=144,136,136,140,113;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=18,29,20,16;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=3.67,8.51,5.79,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:45,4,10,8,6:0.053,0.118,0.107,0.067:73:13,0,3,4,1:13,1,5,4,0:9,36,9,19
chr5	50679459	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:2,4:3,3:6,0,6,1
chr5	52084365	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	52097183	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr5	52097663	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr5	52193414	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,2,14
chr5	52204943	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr5	52223350	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,3:4,1,8,1
chr5	52235582	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:2,1:6,4:5,3,3,2
chr5	52235802	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,3,15
chr5	52235853	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:0,8,0,4
chr5	52235854	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:0,4,0,8
chr5	52243361	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr5	52322721	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.415:19:6,4:5,2:0,11,0,8
chr5	52344610	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:10,2:7,5:2,15,0,7
chr5	52351377	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:8,7:5,4:10,3,7,4
chr5	52351746	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:5,9:11,8:16,0,15,2
chr5	52351876	.	A	G	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=105.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,37:0.487:76:17,19:21,17:19,20,17,20
chr5	52353959	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=115,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:4,6:6,3:0,10,2,8
chr5	52354001	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr5	52354004	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:52354004_T_A:52354004:0,4,0,1
chr5	52354012	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	52354014	.	A	ATAACAACACCTCCAAG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr5	52354019	.	GC	TT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=202,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52354004_T_A:52354004:0,1,0,1
chr5	52356701	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:8,2:2,8:11,0,6,4
chr5	52358757	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.511:19:1,1:1,8:1,9,4,5
chr5	52363046	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:5,4,0,2
chr5	52365923	.	A	ATT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=T;STR;TLOD=84.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,29:0.508:57:18,12:8,14:19,9,23,6
chr5	52366138	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.636:25:2,8:5,8:0,9,0,16
chr5	52367666	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr5	52367706	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,2:1,3:0|1:52367706_T_C:52367706:5,0,5,0
chr5	52367715	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0|1:52367706_T_C:52367706:6,0,4,0
chr5	52368366	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:7,0,4,0
chr5	52368472	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:7,3:13,4:10,10,3,4
chr5	52368546	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:7,5:4,2:3,8,3,4
chr5	52368565	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr5	52368594	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr5	52369002	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:8,9:8,6:10,7,9,6
chr5	52369086	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=137,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:12,11:8,4:6,14,4,11
chr5	52370174	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:9,8:8,5:14,4,11,2
chr5	52382748	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:4,0,3,3
chr5	52404277	.	T	TTAC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:3,3:7,0,8,0
chr5	52404287	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,4:4,5:8,0,10,0
chr5	52404312	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:5,6:8,9:13,0,15,1
chr5	52781376	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	52781597	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:1,9,1,7
chr5	52781646	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:6,3:2,0:3,6,0,3
chr5	52781902	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=18,23,32;MFRL=113,159,148;MMQ=60,60,60;MPOS=8,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,20,23;RU=A;STR;TLOD=3.62,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,4:0.361,0.255:11:1,2,2:0,0,1:1,2,4,4
chr5	52954280	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,4:4,6:11,0,10,0
chr5	52954514	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,3:6,6:0,11,0,9
chr5	52979097	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,1:5,5:0,7,1,5
chr5	53815219	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,1:5,6:3,3,3,4
chr5	53815240	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,7:3,5:3,1,10,2
chr5	54275119	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:5,3:3,12:6,2,9,6
chr5	54320700	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,1,2
chr5	54459961	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0,0,10,9
chr5	54468921	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	54552380	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:4,1:2,1:1,6,0,2
chr5	54558674	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,6:3,6:5,3,7,5
chr5	54563473	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:7,1,5,2
chr5	54565183	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:3,0,5,0
chr5	54573188	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=133,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr5	54594591	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,175;MMQ=59,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,8:4,4:0,10,0,12
chr5	54641111	.	C	CACTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:0,17,0,2
chr5	54683850	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:13,1:11,1:16,9,1,1
chr5	54693374	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr5	54693402	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr5	54706325	.	T	TTTTAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,6:0,10:0,0,18,2
chr5	54709943	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,17,3
chr5	54710072	.	GT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=17,23;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.569:16:1,4:2,3:1,6,3,6
chr5	54718605	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=180,162;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:0|1:54718605_A_T:54718605:8,0,2,0
chr5	54718611	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=185,162;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:0|1:54718605_A_T:54718605:9,0,2,0
chr5	54718618	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,10:0,1:0|1:54718605_A_T:54718605:0,0,11,0
chr5	54721619	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr5	54721642	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=10,33;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.953:24:0,10:0,9:1,0,20,3
chr5	54737791	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr5	54830295	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr5	54944945	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=148,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:4,5:8,0,7,0
chr5	54944976	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:9,7:5,8:13,1,15,0
chr5	54948586	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:2,1:4,3:0|1:54948586_C_CA:54948586:0,6,0,4
chr5	54948598	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:1,2:3,3:0|1:54948586_C_CA:54948586:0,5,0,6
chr5	54952688	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	54960609	.	A	G	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,43:0.494:87:27,19:16,22:31,13,25,18
chr5	54960687	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,25:0.408:62:16,14:18,11:7,30,3,22
chr5	54964974	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	54965513	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:4,2:5,5:3,6,3,5
chr5	54993829	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,1:4,6:1,6,1,7
chr5	55041943	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,4:3,3:9,0,7,0
chr5	55042163	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:0,5,0,6
chr5	55080998	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr5	55081043	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=164,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:12,3:11,0:21,2,3,0
chr5	55081476	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,6:2,1:8,0,5,2
chr5	55081745	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:55081745_C_T:55081745:0,10,0,2
chr5	55081753	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=190,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:55081745_C_T:55081745:0,7,0,2
chr5	55088589	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:9,2:2,0:3,10,1,1
chr5	55112262	.	C	CT,CTT	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=34,34,34;MFRL=151,137,158;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=T;STR;TLOD=10.56,21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,8,16:0.268,0.502:32:5,4,7:1,3,5:8,0,20,4
chr5	55112289	.	A	C	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=126,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,6:0.079:68:23,0:21,0:36,26,6,0
chr5	55164650	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=133,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,1:6,1:5,7,0,2
chr5	55179052	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr5	55179070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr5	55203138	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=213,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr5	55212379	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	55218112	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr5	55243420	.	TAA	T	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=31,9;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=25,23;RU=A;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.281:20:3,0:6,1:6,8,0,6
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chr5	55243461	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:14,0:13,2:0|1:55243434_A_G:55243434:0,28,0,2
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chr5	55272085	.	G	C	.	.	DP=125;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=189.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,64:0.537:119:25,33:29,29:26,29,28,36
chr5	55398269	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=109.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,11:0,0,26,4
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chr5	55466693	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0|1:55466689_C_A:55466689:0,3,0,6
chr5	55479293	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr5	55528572	.	A	AACAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=AC;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr5	55528815	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=200,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,1,6
chr5	55828998	.	G	GTTCA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=116,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:3,1:0,0:2,1,0,1
chr5	55828999	.	G	GCTC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=120,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.315:4:3,1:0,0:0|1:55828999_G_GCTC:55828999:2,1,0,1
chr5	55829001	.	G	GCAGGTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,32;MFRL=120,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:0,0:0|1:55828999_G_GCTC:55828999:2,1,0,1
chr5	55830865	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	56152416	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,4:4,7:9,3,8,3
chr5	56168907	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr5	56177848	.	TCAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAA;STR;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,0:3,3:3,4,1,2
chr5	56205643	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=199.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,49:0.980:49:0,22:0,25:0|1:56205643_A_G:56205643:0,0,0,49
chr5	56205662	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,21:0.565:37:6,10:9,10:0|1:56205643_A_G:56205643:0,16,0,21
chr5	56206073	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr5	56212595	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:8,4:4,3:11,1,7,1
chr5	56219698	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.650:38:6,15:7,9:10,3,12,13
chr5	56226410	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:6,0,4,0
chr5	56229288	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:0,8,0,7
chr5	56233541	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:6,7:8,7:0|1:56233541_G_A:56233541:2,12,1,14
chr5	56233551	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,16:0.567:28:4,8:7,8:0|1:56233541_G_A:56233541:2,10,1,15
chr5	56234876	.	G	GCCTGATTTTTCAGAGGCACAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr5	56234906	.	A	ATTAAATTTGTGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56234906_A_ATTAAATTTGTGT:56234906:0,0,0,1
chr5	56234908	.	T	TAGGGGCCCAGGGCAATGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56234906_A_ATTAAATTTGTGT:56234906:0,0,0,1
chr5	56246610	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=186,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr5	56526783	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,28:0,21:0,0,16,34
chr5	56526819	.	GT	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.422:29:7,12:10,0:3,14,2,10
chr5	56527224	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	56527247	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	56531761	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,2:4,6:7,0,8,0
chr5	56546749	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,2:1,0,3,1
chr5	56547059	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr5	57750350	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:7,1,4,1
chr5	57753456	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,5:6,5:0,8,0,10
chr5	57754004	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:2,6,0,7
chr5	57754005	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,5:4,3:0,7,2,6
chr5	57754071	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=466,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57754071_T_TG:57754071:1,1,0,1
chr5	57754074	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=466,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57754071_T_TG:57754071:1,1,0,1
chr5	57754132	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	57754808	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.381:27:8,5:8,5:11,6,7,3
chr5	57755843	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr5	57790337	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:7,4:4,6:11,0,11,0
chr5	57913379	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr5	58021809	.	AT	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:28,3:16,1:38,8,3,1
chr5	58271713	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=11,23;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,5:0,4:0,1,2,10
chr5	58284283	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr5	58285813	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr5	58286625	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,12:0,2:0,0,10,4
chr5	58286749	.	A	AGAAAGTACCTTACCTGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr5	58289334	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=88.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,16:0,0,0,24
chr5	58334645	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,7:0,10:0,0,14,4
chr5	58489218	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	59899413	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=109,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:1,1:1,4,0,2
chr5	59940502	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,12:0,6:0,0,17,1
chr5	59995820	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=211,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr5	60062332	.	AAAGATCAAACATTT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAGATCAAACATTT;STR;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.282:23:4,5:7,1:14,3,4,2
chr5	60063576	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,4:6,11:10,0,15,0
chr5	60083275	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr5	60170337	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,2:5,3:7,0,5,0
chr5	60170512	.	TA	T	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=19,30;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,12:0.253:48:8,3:9,7:8,28,4,8
chr5	60170558	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.490:37:9,6:9,12:0,19,0,18
chr5	60170605	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,5:6,5:0,8,0,10
chr5	60186618	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	60186975	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	60199363	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=216,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr5	60240986	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=17,30;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.389:6:1,1:0,1:4,0,2,0
chr5	60241050	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=142,90;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:18,4:10,1:23,5,5,0
chr5	60241274	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60241274_A_T:60241274:1,2,0,1
chr5	60241276	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60241274_A_T:60241274:1,2,0,1
chr5	60241278	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60241274_A_T:60241274:1,2,0,1
chr5	60241281	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60241274_A_T:60241274:1,2,0,1
chr5	60241306	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	60369083	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:2,7:6,7:3,5,2,12
chr5	60394706	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,24:0.528:45:15,7:6,15:21,0,24,0
chr5	60827631	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=198,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:60827631_C_G:60827631:0,2,0,1
chr5	60827637	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60827631_C_G:60827631:0,1,0,1
chr5	60827638	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60827631_C_G:60827631:0,1,0,1
chr5	60827643	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60827631_C_G:60827631:0,1,0,1
chr5	60839907	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,4:3,7:4,3,7,4
chr5	60982694	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=114,213;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:11,7,2,0
chr5	61602209	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=20,21;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.680:4:1,0:0,2:0|1:61602209_T_TC:61602209:1,0,3,0
chr5	61602215	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.863:5:0,0:0,1:0|1:61602209_T_TC:61602209:0,0,5,0
chr5	61602219	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:0,0:1,4:0|1:61602209_T_TC:61602209:0,4,4,0
chr5	61602221	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,0:1,3:0|1:61602209_T_TC:61602209:0,4,4,0
chr5	61602224	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:4,0:1,1:0|1:61602209_T_TC:61602209:0,5,4,0
chr5	61602230	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,0:2,1:0|1:61602209_T_TC:61602209:1,7,3,0
chr5	61669737	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=248,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	61690246	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:10,2:18,1:28,0,3,0
chr5	61715024	.	A	AAAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=211,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:61715024_A_AAAAG:61715024:0,4,0,1
chr5	61715027	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=211,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:61715024_A_AAAAG:61715024:0,4,0,1
chr5	61745737	.	CTT	C,CT	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=136,138,154;MMQ=60,60,60;MPOS=11,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=8.80,101.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,7,43:0.126,0.778:55:1,2,19:2,4,23:2,3,41,9
chr5	61745937	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:0,13,0,2
chr5	61747534	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chr5	61762880	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	61781127	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,23,0
chr5	61785936	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=170.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,19:0,27:0,0,38,10
chr5	61826663	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,2,13
chr5	63513099	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=114,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr5	63513258	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:63513258_A_T:63513258:0,3,0,1
chr5	63513260	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:63513258_A_T:63513258:0,3,0,1
chr5	63513265	.	T	TGAAGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:63513265_T_TGAAGA:63513265:0,2,0,1
chr5	63513266	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:63513265_T_TGAAGA:63513265:0,2,0,1
chr5	63621166	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,98;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,0:8,3:13,8,0,3
chr5	63802636	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=64,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.737:7:0,2:2,2:1,1,5,0
chr5	64023924	.	C	A	.	.	DP=158;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=124,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=184.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,73:0.482:151:41,39:33,32:38,40,36,37
chr5	64023940	.	CT	C,CTT	.	.	DP=131;ECNT=3;MBQ=33,34,34;MFRL=139,125,134;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=7.23,8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:79,8,8:0.078,0.090:95:38,4,3:37,3,4:19,60,7,9
chr5	64023981	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,34:0.451:76:26,20:14,14:6,36,4,30
chr5	64070617	.	A	AAATTATGAC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.516:27:8,11:5,3:7,6,7,7
chr5	64077647	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=197,272;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	64084746	.	CT	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:10,9:13,8:24,0,16,2
chr5	64084762	.	C	G	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.073:65:18,0:20,1:51,10,4,0
chr5	64096046	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:9,10:9,9:11,8,14,6
chr5	64096170	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,17:0.474:36:8,8:11,9:0|1:64096170_G_T:64096170:7,12,3,14
chr5	64096172	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=157,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:33,2:0.080:35:16,0:17,2:1|0:64096170_G_T:64096170:9,24,1,1
chr5	64267431	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:3,0,6,0
chr5	64447777	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=113,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,3:7,4:3,9,3,4
chr5	64466688	.	C	CAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,7;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:64466688_C_CAAAAA:64466688:0,0,0,1
chr5	64466691	.	T	TTCTTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:64466688_C_CAAAAA:64466688:0,0,0,1
chr5	64466694	.	G	GATATTTTAGCAAGTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64466688_C_CAAAAA:64466688:0,0,0,1
chr5	64483759	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	64520684	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr5	64522124	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr5	64747918	.	T	TG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=122.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,17:0,0,29,3
chr5	64755987	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,6:7,4:10,2,10,0
chr5	64766519	.	ATT	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:64766519_ATT_A:64766519:2,0,4,0
chr5	64766523	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:64766519_ATT_A:64766519:2,0,4,0
chr5	64766558	.	AATT	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:1,4:2,1,4,3
chr5	64825102	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:1,3:0,4,0,4
chr5	64838584	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:2,11:6,3:7,1,13,1
chr5	64838758	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=175,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	64847543	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:5,4:8,2:0,14,0,6
chr5	64863320	.	C	T	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,46:0.533:86:15,29:25,17:30,10,38,8
chr5	64863484	.	T	TA	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.316:35:8,5:12,4:1,23,0,11
chr5	64865405	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=206,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:1,5:6,10:7,0,14,1
chr5	64890479	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=181,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,2:3,3:0,6,0,6
chr5	64892966	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,1:16,1:12,11,0,2
chr5	64906617	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=264,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr5	64914025	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,0:10,3:8,16,1,2
chr5	64919991	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=133,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,3:8,3:5,5,4,2
chr5	64920803	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,2:4,7:7,0,9,0
chr5	64933457	.	CA	C,CAA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,34,34;MFRL=158,147,143;MMQ=47,45,60;MPOS=24,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=7.36,10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,6,9:0.175,0.285:32:4,4,5:13,2,3:17,0,13,2
chr5	64942799	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,3:2,6:2,1,9,1
chr5	64942852	.	CT	C,CTT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32,25;MFRL=160,109,0;MMQ=60,60,60;MPOS=21,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=12.74,7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,9,5:0.326,0.199:25:6,4,3:2,2,0:10,1,8,6
chr5	64954159	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.345:15:7,4:2,0:10,0,5,0
chr5	64956428	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=216,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	64960311	.	A	ATC,ATCTC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=207,158,194;MMQ=60,60,60;MPOS=7,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=TC;STR;TLOD=7.64,21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,7:0.253,0.513:13:1,1,3:2,2,4:2,1,7,3
chr5	64968170	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:6,2:5,3:2,10,0,5
chr5	65008946	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=209,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr5	65018321	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr5	65073224	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,18,5
chr5	65288791	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	65308055	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,2:2,5:0,8,1,6
chr5	65309438	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:16,2:25,1:15,26,1,2
chr5	65310477	.	AT	A	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,8:0.082:103:43,2:47,6:81,14,8,0
chr5	65317332	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr5	65372793	.	CT	C,CTT	.	.	DP=171;ECNT=1;MBQ=33,27,23;MFRL=143,117,129;MMQ=60,60,60;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.73,6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:100,10,7:0.060,0.065:117:45,6,5:49,4,2:26,74,3,14
chr5	65458490	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr5	65466045	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,24:0.454:53:14,10:15,14:1,28,0,24
chr5	65466348	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=280,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,2:1,0:3,0,0,3
chr5	65892539	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,13;MFRL=204,279;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:65892539_A_C:65892539:1,0,1,0
chr5	65892544	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=204,279;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:65892539_A_C:65892539:1,0,1,0
chr5	66084676	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,1:3,3:0,9,0,4
chr5	66124759	.	AT	TG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,53;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:10,2:4,18,1,1
chr5	66282444	.	A	ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,7:2,3:0,4,0,10
chr5	66416969	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,35516610;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:2,13,1,1
chr5	66429329	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,18,5
chr5	66462069	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.492:21:3,5:8,5:6,5,4,6
chr5	66478626	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	66478729	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=185,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:3,5:4,5:6,1,7,3
chr5	66480374	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.552:14:3,4:3,2:2,4,4,4
chr5	67569746	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=169,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.728:24:2,9:4,7:4,2,14,4
chr5	67575333	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,4:1,0:4,0,4,0
chr5	67575358	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=178,163;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:6,0:13,0,2,0
chr5	67576330	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.305:17:1,4:9,0:11,1,4,1
chr5	68409094	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,5:5,1:2,11,0,6
chr5	68412048	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.462:26:3,7:11,5:6,8,3,9
chr5	68463014	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:1,2:4,4:3,2,4,4
chr5	68464234	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.622:14:2,5:3,3:0,5,0,9
chr5	68471305	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:14,0:17,3:16,15,0,3
chr5	68485366	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=179,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	68490622	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,128;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:16,0:6,2:0,24,0,2
chr5	68491714	.	T	TAGTCAAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTCAAG;STR;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,6:1,3:0,4,1,8
chr5	68492948	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:23,0:17,4:8,33,0,4
chr5	68498675	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:5,10:10,2:13,2,10,2
chr5	68504225	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=143,81;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:20,0:14,6:7,28,2,4
chr5	68513572	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr5	68513599	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.665:19:0,7:6,5:6,0,13,0
chr5	68524006	.	CT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,34,33;MFRL=164,137,147;MMQ=60,60,60;MPOS=28,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.76,29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,17:0.151,0.464:35:7,1,3:5,4,11:13,0,16,6
chr5	68548351	.	T	TA	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=169,161;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,34:0.744:46:6,23:3,10:0,12,0,34
chr5	68550348	.	CA	C,CAAA,CAAAAAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,19,35,27;MFRL=162,116,157,83;MMQ=60,60,40,60;MPOS=7,27,0;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,17,20,23;RU=A;STR;TLOD=5.63,4.14,5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,6,2,4:0.255,0.140,0.266:17:1,1,1,0:3,2,1,1:4,1,4,8
chr5	68564985	.	TA	T,TAA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,30,32;MFRL=157,145,66;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=14.10,5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,10,5:0.231,0.124:42:13,7,4:13,2,0:27,0,11,4
chr5	68572902	.	C	CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.114:32:17,0:10,2:26,3,2,1
chr5	68581383	.	A	AACTCTTCAAGCACTAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:68581383_A_AACTCTTCAAGCACTAAC:68581383:0,3,0,1
chr5	68581387	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:68581383_A_AACTCTTCAAGCACTAAC:68581383:0,3,0,1
chr5	68581389	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	68596054	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	68602746	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.544:44:10,14:10,10:6,14,5,19
chr5	68616456	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=251,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68616456_A_C:68616456:0,1,0,1
chr5	68616458	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=251,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68616456_A_C:68616456:0,1,0,1
chr5	68616465	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=251,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68616456_A_C:68616456:0,1,0,1
chr5	68667263	.	TCCC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=C;STR;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.853:11:0,5:0,3:0,1,0,10
chr5	68682267	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,3:0.048:81:40,0:33,3:34,44,1,2
chr5	68685037	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,1,1
chr5	68695852	.	CT	C	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=124,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.071:68:34,1:26,3:50,14,3,1
chr5	68696035	.	G	GTTTATTTA	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTA;STR;TLOD=105.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,28:0.877:31:2,14:1,10:0|1:68696035_G_GTTTATTTA:68696035:0,3,1,27
chr5	68696056	.	T	TTTATTTA	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:31,3:0.107:34:17,2:14,1:1|0:68696035_G_GTTTATTTA:68696035:1,30,0,3
chr5	68696064	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,2:0.094:30:11,0:13,1:1|0:68696035_G_GTTTATTTA:68696035:0,28,0,2
chr5	68706252	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,15:0,0,27,2
chr5	68706438	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=129.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,15:0,23:0,0,6,32
chr5	68715741	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.220:39:19,4:11,4:26,5,8,0
chr5	68728482	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=132,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,4:0.055:76:34,3:36,0:42,30,0,4
chr5	68728544	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:7,9:5,8:0,12,0,17
chr5	68737570	.	CA	TG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:17,2:6,0:0,23,0,2
chr5	68862362	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=151,129;MMQ=33,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.377:27:7,4:9,5:16,1,8,2
chr5	68862363	.	TGG	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=144,122;MMQ=35,21;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=G;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.222:26:10,1:9,5:18,2,5,1
chr5	68862365	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=157,132;MMQ=41,29;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.821:26:2,7:1,9:4,0,13,9
chr5	68868255	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,90;MMQ=60,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.898:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	70398831	.	A	C	.	.	DP=93;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,4:0.060:81:51,0:24,4:14,63,0,4
chr5	70398844	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=157,139;MMQ=57,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.062:61:34,2:21,1:5,53,0,3
chr5	70422915	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,35;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70422915_T_G:70422915:0,0,0,1
chr5	70422922	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,99;MMQ=60,35;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70422915_T_G:70422915:0,0,0,1
chr5	70757785	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=19,21;MFRL=178,185;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,14;RU=T;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.204:12:2,0:1,1:0,10,0,2
chr5	70763088	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	70779729	.	T	C	.	.	DP=147;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=137,60;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:131,6:0.050:137:59,6:67,0:63,68,0,6
chr5	70786726	.	G	GAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	70797500	.	TAA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=131,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.292:18:4,4:1,1:5,8,3,2
chr5	70798653	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:70798653_A_ATT:70798653:0,4,0,1
chr5	70798654	.	G	GCTGCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:70798653_A_ATT:70798653:0,4,0,1
chr5	70798658	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:70798653_A_ATT:70798653:0,3,0,1
chr5	70800538	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,38:0.402:95:25,17:29,20:21,36,10,28
chr5	70805272	.	GC	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.353:35:12,5:11,7:16,7,8,4
chr5	70807991	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,9:3,4:8,0,13,0
chr5	70811821	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,2:4,2:11,1,4,0
chr5	70818305	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=132,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.087:60:16,0:24,0:15,40,0,5
chr5	70818329	.	CAAAA	C,CA,CAAA,CAAAAA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=28,36,35,26,30;MFRL=140,147,146,163,130;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=18,21,26,18;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,13,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.08,5.60,4.03,10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:14,2,3,4,7:0.069,0.095,0.137,0.242:30:6,1,3,1,1:7,1,0,1,3:1,13,1,15
chr5	70818877	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,0:1,3:0,1,0,4
chr5	70820235	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70820235_G_T:70820235:0,1,0,1
chr5	70820239	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70820235_G_T:70820235:0,1,0,1
chr5	70820241	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70820235_G_T:70820235:0,1,0,1
chr5	70834833	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,34:0.388:87:20,11:33,20:29,24,23,11
chr5	70837295	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.393:23:7,4:7,3:6,8,4,5
chr5	70840433	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=208,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr5	70852611	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,2:3,6:5,0,8,0
chr5	70860493	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.497:32:9,8:6,7:16,0,16,0
chr5	70888665	.	GT	G,GTT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=35,36,36;MFRL=161,197,194;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=6.18,5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,4:0.193,0.204:20:6,2,2:4,2,2:11,1,8,0
chr5	70888713	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,7:0.142:53:30,2:14,1:34,12,6,1
chr5	70888798	.	C	T	.	.	DP=111;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,3:0.036:109:52,3:54,0:46,60,2,1
chr5	70888913	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=19,11;MFRL=199,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.292:14:4,0:1,1:0,10,0,4
chr5	70888916	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=176,210;MMQ=57,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,1:3,2:0,6,0,5
chr5	70922616	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,3:9,3:4,12,1,5
chr5	70927856	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:5,1,4,0
chr5	70928083	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.613:23:1,4:6,10:0,9,1,13
chr5	70948654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr5	70952506	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.313:10:4,2:3,0:7,0,3,0
chr5	71403273	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	71403306	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	71411718	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	71494055	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,0:8,3:10,9,0,3
chr5	71522125	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	71739546	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr5	71743024	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	71743322	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	71757382	.	AA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71757382_AA_TG:71757382:0,0,0,1
chr5	71757385	.	A	AGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71757382_AA_TG:71757382:0,0,0,1
chr5	72112421	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0|1:72112421_T_C:72112421:0,1,6,1
chr5	72112430	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0|1:72112421_T_C:72112421:0,1,4,1
chr5	72144209	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:8,7:12,6:12,8,5,8
chr5	72168584	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=138,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:7,2:8,1:1,14,0,3
chr5	72183055	.	CCT	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:6,2:10,1:0|1:72183055_CCT_C:72183055:5,12,1,2
chr5	72183059	.	AGTCCAG	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:6,2:10,1:0|1:72183055_CCT_C:72183055:5,13,1,2
chr5	72183069	.	GA	CT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,1:9,1:0|1:72183055_CCT_C:72183055:2,12,1,2
chr5	72183074	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=127,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,1:0|1:72183055_CCT_C:72183055:1,11,1,1
chr5	72185591	.	CT	C,CTT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,34,35;MFRL=145,160,140;MMQ=60,60,60;MPOS=25,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=11.91,8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,8,6:0.196,0.172:38:6,6,3:11,2,3:17,7,14,0
chr5	72192419	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=138,133;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.059:48:27,0:17,2:7,39,0,2
chr5	72192423	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=137,147;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:27,0:16,3:7,36,0,3
chr5	72192425	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=137,151;MMQ=60,35;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.064:45:25,0:15,2:7,36,0,2
chr5	72192431	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=144,128;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:18,0:14,2:0,36,0,2
chr5	72192434	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=140,138;MMQ=60,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:18,0:13,4:0,34,0,4
chr5	72192454	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=153,174;MMQ=58,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,1:5,1:0,13,0,2
chr5	72201058	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=214,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:2,4:0,2:2,0,7,0
chr5	72252034	.	G	GGGC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:3,5:5,7:1,7,0,12
chr5	72347090	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:5,3:1,2:3,4,4,1
chr5	72350042	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.067:71:35,3:32,1:9,58,2,2
chr5	72350290	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,3:5,4:10,0,6,1
chr5	72364673	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr5	72370745	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,2:5,4:0,5,0,6
chr5	72378703	.	AT	A,ATT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=17,24,15;MFRL=152,151,137;MMQ=60,60,60;MPOS=26,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=13.29,3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,10,4:0.419,0.104:25:2,4,0:1,1,0:3,8,2,12
chr5	72742882	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,9:0,0,4,18
chr5	72742891	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,36;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:0|1:72742891_G_A:72742891:1,14,1,1
chr5	72742896	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=141,36;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:72742891_G_A:72742891:1,12,1,1
chr5	72795055	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:14,2:6,1:1,22,0,3
chr5	72798502	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr5	72798724	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr5	72800125	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=123,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.196:45:18,0:12,2:14,22,8,1
chr5	72850282	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,1,5
chr5	72850858	.	A	AAAGGGCAGACATTTTCTGAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:5,0:2,2:0,7,1,1
chr5	72865584	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=258,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72865584_G_T:72865584:0,1,0,1
chr5	72865586	.	GGTTTAAATTT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=258,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72865584_G_T:72865584:0,1,0,1
chr5	72865598	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=258,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72865584_G_T:72865584:0,1,0,1
chr5	72872766	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,16,4
chr5	72872966	.	C	CTTTTGATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=198,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:72872966_C_CTTTTGATG:72872966:0,4,0,1
chr5	72872968	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=198,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:72872966_C_CTTTTGATG:72872966:0,4,0,1
chr5	72873925	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr5	72874801	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr5	72875635	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	72980669	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:9,7,2,1
chr5	72980710	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:10,9,1,1
chr5	73069581	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	73076457	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	73076474	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	73076511	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr5	73090165	.	A	AGTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GTT;STR;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:4,0,6,1
chr5	73091126	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,6:2,1:5,1,7,0
chr5	73142380	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr5	73144845	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,11,7
chr5	73153389	.	TAC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.248:18:8,4:3,0:0|1:73153389_TAC_T:73153389:14,0,4,0
chr5	73153407	.	CACACAT	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,14:0.470:30:8,5:6,9:1|0:73153389_TAC_T:73153389:16,0,13,1
chr5	73160730	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=120,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:4,7:5,2:3,6,4,5
chr5	73163861	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr5	73189145	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:1,8,0,7
chr5	73205463	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr5	73930442	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	73932315	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,5,11
chr5	73985107	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,3,1
chr5	73992406	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr5	73992609	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,2,18
chr5	74009327	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:4,6:3,4:6,2,6,4
chr5	74011541	.	TA	T,AA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,26,20;MFRL=141,152,124;MMQ=60,60,60;MPOS=28,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.44,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,6,5:0.216,0.130:28:9,0,1:4,4,2:3,14,3,8
chr5	74011584	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:16,2:5,0:0,21,0,2
chr5	74021846	.	TACTCAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTCAA;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:2,2:4,3,1,2
chr5	74034245	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,26:0.472:55:11,11:18,14:9,20,9,17
chr5	74054595	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:8,1,8,0
chr5	74054792	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:6,7:7,5:2,11,0,12
chr5	74059623	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:2,2,0,1
chr5	74063154	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=156,121;MMQ=60,57;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:6,1,4,5
chr5	74063250	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=21,35;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,1:2,2:0,4,0,4
chr5	74063268	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:2,0:2,2:0,4,0,3
chr5	74072339	.	G	GA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.500:46:13,10:10,12:22,1,22,1
chr5	74097381	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.381:24:8,4:6,4:9,6,5,4
chr5	74130504	.	C	CTCTCTGTTTTCATCCCTGCCTTTGCAAAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	74130512	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:74130512_A_ACC:74130512:0,0,0,1
chr5	74130513	.	T	TGGTTTGGGTCTCTATTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:74130512_A_ACC:74130512:0,0,0,1
chr5	74134742	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:4,2,3,0
chr5	74326038	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:12,2:18,0:21,9,0,2
chr5	74639576	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr5	74651084	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,5,10
chr5	74655726	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:1,4:5,1:8,0,6,0
chr5	74675076	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=196,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:3,1,3,1
chr5	74685520	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:1,7:4,7:1,4,5,9
chr5	74695939	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr5	74842760	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:15,1:12,2:28,0,3,0
chr5	74842768	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.191:30:14,2:11,3:25,0,5,0
chr5	74842772	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,2:13,2:27,0,4,0
chr5	74848385	.	C	G	.	.	DP=117;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=133,50;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:112,4:0.042:116:53,0:57,4:0|1:74848385_C_G:74848385:46,66,0,4
chr5	74848387	.	A	C	.	.	DP=120;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=133,50;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:112,4:0.042:116:52,0:56,3:0|1:74848385_C_G:74848385:46,66,0,4
chr5	74876961	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=236,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	74877252	.	AC	A	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=144,117;MMQ=60,52;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.081:47:14,0:28,3:0|1:74877252_AC_A:74877252:11,33,0,3
chr5	74877256	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=143,117;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:15,0:29,2:0|1:74877252_AC_A:74877252:11,34,0,3
chr5	74877266	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.470:45:3,9:20,12:4,20,4,17
chr5	74879035	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr5	74880496	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35,32;MFRL=183,207,229;MMQ=52,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.46,3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.250,0.277:8:2,1,2:2,1,0:4,0,4,0
chr5	74889615	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:6,0,2,0
chr5	74986481	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr5	74988369	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,5:0,3:0,1,2,6
chr5	75427518	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr5	75505664	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:3,11,0,2
chr5	75886168	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=221,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	75888788	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,32:0.491:65:15,13:18,18:3,30,6,26
chr5	75907065	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr5	75913305	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=252,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr5	75923141	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:8,0,4,0
chr5	75923393	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:10,8:11,10:4,18,0,19
chr5	75927595	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:9,0,6,0
chr5	75927606	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:4,7:2,7:6,0,14,0
chr5	75927938	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr5	75932768	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr5	75948474	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	75948650	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr5	75948685	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr5	75950193	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	75950707	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr5	75954537	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:5,4:4,7:0,9,2,10
chr5	75960818	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=77.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,8:0,7:0|1:75960818_T_TA:75960818:0,0,16,2
chr5	75960825	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0|1:75960818_T_TA:75960818:0,0,18,3
chr5	75960865	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,17:0,0,20,8
chr5	75964462	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:5,4:2,6:8,0,10,0
chr5	75964683	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,0:17,3:1,33,0,3
chr5	75964702	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:7,8:8,7:0,15,1,14
chr5	75979832	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=270,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75979832_T_A:75979832:0,1,0,1
chr5	75979833	.	A	ACCTCAGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=270,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75979832_T_A:75979832:0,1,0,1
chr5	75996837	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:9,0,6,0
chr5	75997063	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=50.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,14:0.536:26:6,7:5,7:0|1:75997063_A_G:75997063:2,10,2,12
chr5	75997069	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:5,4:5,6:0|1:75997063_A_G:75997063:1,10,2,9
chr5	75998488	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr5	76249536	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr5	76259350	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,0,14
chr5	76332631	.	CAG	TGA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=173,187;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0,12,0,2
chr5	76332644	.	CT	AC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=166,189;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr5	76607841	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=151,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.382:42:14,12:12,3:18,8,12,4
chr5	76607930	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=17,28;MFRL=153,173;MMQ=57,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.481:8:1,2:0,2:0,4,0,4
chr5	76621612	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr5	76707435	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20,29;MFRL=174,140,118;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.44,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.230,0.253:9:1,0,1:4,1,1:5,0,3,1
chr5	76722443	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,1:1,2:0,3,0,3
chr5	76729193	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr5	76736907	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=230,229;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	76747087	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=117.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,40:0.597:67:11,25:15,15:24,3,29,11
chr5	76760495	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=118,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,22:0.426:52:16,12:14,10:28,2,21,1
chr5	76760657	.	G	GA	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=118.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,53:0.583:91:19,22:17,20:4,34,5,48
chr5	76785405	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:7,1:10,5:5,13,2,6
chr5	76787919	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,4,1
chr5	77004031	.	A	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,29:0.420:70:21,10:16,19:40,1,28,1
chr5	77004229	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:11,6:10,7:0,21,0,13
chr5	77004268	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=187,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,1:4,4:0,10,0,5
chr5	77298685	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=114,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.398:28:8,8:9,3:13,4,8,3
chr5	77424062	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	77425028	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,20:0,0,17,19
chr5	77461615	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0,11,0,2
chr5	77745853	.	C	CA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=139.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.977:39:0,17:0,19:0|1:77745853_C_CA:77745853:0,0,9,30
chr5	77745862	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.177:20:9,2:5,1:0|1:77745853_C_CA:77745853:4,13,1,2
chr5	77755035	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=187.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,31:0,23:0,0,38,16
chr5	77784642	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	77784671	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	78251347	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,2:5,5:1,6,3,4
chr5	78265092	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:0|1:78265092_C_T:78265092:0,5,0,7
chr5	78265096	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:0|1:78265092_C_T:78265092:0,4,0,5
chr5	78340062	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr5	78373251	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.339:13:5,3:3,1:9,0,4,0
chr5	78411763	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,7:2,3:0,5,0,10
chr5	78411817	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78411817_G_A:78411817:0,1,0,1
chr5	78411819	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78411817_G_A:78411817:0,1,0,1
chr5	78416416	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,0:3,6:0,4,0,6
chr5	78416973	.	CA	C,CAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,34,34;MFRL=158,146,153;MMQ=60,49,50;MPOS=28,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=8.02,7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,6:0.286,0.326:18:3,2,3:4,3,2:7,0,10,1
chr5	78416992	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=159,162;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.420:22:4,0:3,0:10,2,10,0
chr5	78421780	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,1:6,3:8,0,4,0
chr5	78533584	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=186,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr5	78586123	.	GG	CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=114,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:12,2:6,19,0,2
chr5	78586914	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,3:2,2:5,3,4,1
chr5	78608354	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=20,20,23,20;MFRL=137,156,144,143;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,23,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=T;STR;TLOD=4.68,7.17,23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,3,5,13:0.095,0.153,0.403:33:3,1,0,4:6,2,3,6:3,9,2,19
chr5	78610480	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:78610480_C_A:78610480:1,6,0,2
chr5	78610484	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,0:0|1:78610480_C_A:78610480:3,7,0,2
chr5	78742858	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,1:1,3:8,0,3,1
chr5	78742980	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,4:1,9,0,4
chr5	78936847	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.393:21:7,4:4,3:10,3,2,6
chr5	78952691	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:5,0,7,0
chr5	79024734	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr5	79026371	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,2:6,0:10,3,1,1
chr5	79029008	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,16159291;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,0:9,2:8,10,1,1
chr5	79058981	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr5	79084949	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:1,3,1,5
chr5	79084973	.	T	TTCATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:79084973_T_TTCATC:79084973:1,3,0,1
chr5	79084977	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:79084973_T_TTCATC:79084973:1,3,0,1
chr5	79086903	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=109,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,0:2,7:2,4,1,6
chr5	79283016	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.687:1:0,0:0,0:0|1:79283016_A_T:79283016:0,0,0,1
chr5	79283025	.	GATCAA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79283016_A_T:79283016:0,0,0,1
chr5	79284464	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=140,73;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:15,0:9,3:0|1:79284464_G_C:79284464:10,15,1,2
chr5	79284469	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,73;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:15,0:8,3:0|1:79284464_G_C:79284464:10,16,1,2
chr5	79285898	.	C	CA	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=138,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,5:0.074:78:34,2:38,3:67,6,5,0
chr5	79351544	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
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chr5	79351859	.	GG	AA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=108,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,15:0.500:30:9,12:6,3:0|1:79351852_A_T:79351852:7,8,4,11
chr5	79354147	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:1,2,0,4
chr5	79354184	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,0,3
chr5	79354647	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=210,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,4:0,4,2,4
chr5	79354682	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=184,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr5	79354702	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	79355192	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	79366249	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.573:23:3,7:3,5:2,8,3,10
chr5	79368016	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	79368048	.	TAGA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr5	79375144	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=183,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79375144_T_A:79375144:0,1,0,1
chr5	79375145	.	TGTGTTTTCC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=183,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79375144_T_A:79375144:0,1,0,1
chr5	79375724	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=190,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:8,4:6,6:11,3,8,2
chr5	79443169	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=234,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:1,1,1,5
chr5	79473059	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,18,0
chr5	79551867	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	79616859	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,206;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:27,0:23,3:30,20,0,3
chr5	79735858	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr5	79741018	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	79741304	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr5	79743821	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr5	79747291	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,15:0,0,19,6
chr5	79773028	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	79855876	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,8,9
chr5	79950163	.	C	CTGGCGCGTCCCGCCCAGGT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=101.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,23:0,13:0,0,47,0
chr5	79950512	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr5	79950724	.	G	C,GCCGCAGCGGCCGCAGCGC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32,35;MFRL=134,156,176;MMQ=60,60,60;MPOS=5,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.44,7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,6:0.211,0.629:11:3,1,3:0,1,2:0,3,3,5
chr5	79974646	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	80088461	.	CAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=84.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,20,0
chr5	80388554	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr5	80390225	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,3,7
chr5	80390290	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	80404983	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=284,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:80404983_T_C:80404983:0,2,0,1
chr5	80404989	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=284,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:80404983_T_C:80404983:0,2,0,1
chr5	80409729	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr5	80504282	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr5	80513157	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=168,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,3:3,0:6,4,3,0
chr5	80521485	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,5,15
chr5	80562120	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr5	80600752	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:18,3:27,0:28,17,3,0
chr5	80608266	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	80608545	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr5	80631511	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,1:3,5:9,1,6,0
chr5	80640940	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	80716219	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,2:8,0:13,0,2,0
chr5	80744758	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	80756848	.	TAA	T	.	.	DP=96;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=A;STR;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,9:0.121:75:30,5:24,3:54,12,7,2
chr5	80756854	.	A	AT	.	.	DP=97;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,4:0.061:78:38,2:35,0:58,16,4,0
chr5	80756855	.	A	T,AT	.	.	DP=97;ECNT=3;MBQ=32,30,29;MFRL=144,147,133;MMQ=60,60,60;MPOS=16,7;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=187.52,5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,63,4:0.808,0.061:78:7,31,3:3,30,1:8,3,54,13
chr5	80770337	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,62;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,1:12,1:7,15,1,1
chr5	80785011	.	G	A	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=310.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,91:0.989:91:0,49:0,40:0,0,80,11
chr5	81474225	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr5	81549280	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:1,6,0,4
chr5	81571846	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,30:0.537:56:11,12:14,18:26,0,30,0
chr5	81571896	.	A	G	.	.	DP=112;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=130,137;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,34:0.323:106:37,17:34,16:43,29,22,12
chr5	81572184	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:6,8:5,8:7,4,14,3
chr5	81573992	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.931:13:0,5:0,0:0,0,13,0
chr5	82360944	.	GA	G,AA,CA,TA	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=17,18,30,20,10;MFRL=166,160,126,166,154;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=18,10,17,19;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=8.35,4.17,5.96,5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:37,7,5,7,10:0.107,0.056,0.096,0.076:66:5,1,2,3,0:3,0,3,1,0:5,32,2,27
chr5	82554559	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,149;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,0:8,3:0,15,0,3
chr5	82835724	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.674:25:3,8:4,9:4,4,11,6
chr5	82837631	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:1,4,3,6
chr5	82837896	.	CGAT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:13,2:11,0:0|1:82837896_CGAT_C:82837896:18,8,0,2
chr5	82837901	.	G	GTAAGA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,1:12,0:0|1:82837896_CGAT_C:82837896:16,8,0,2
chr5	82843711	.	T	TATC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:3,0,6,0
chr5	82844004	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	82849120	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	82876284	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.511:45:12,10:10,13:5,17,3,20
chr5	82940510	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr5	82940548	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,0,9
chr5	82969399	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=185,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:82969399_TG_T:82969399:0,1,0,1
chr5	82969404	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=185,124;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:82969399_TG_T:82969399:0,1,0,1
chr5	83476194	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:5,0,8,1
chr5	86629061	.	C	CT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.131:43:19,0:17,3:35,3,4,1
chr5	86644983	.	CT	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:22,2:18,1:39,2,3,0
chr5	86667856	.	G	GA,GAAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,35,36;MFRL=0,172,137;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,13;RU=A;STR;TLOD=23.64,5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,2:0.683,0.197:12:0,5,1:1,4,1:1,0,11,0
chr5	86669964	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:3,0:4,2:8,0,3,0
chr5	86679495	.	TAA	T,TA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,32,33;MFRL=152,146,171;MMQ=60,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=A;STR;TLOD=3.65,11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,4,10:0.121,0.336:31:8,4,5:6,0,4:14,3,10,4
chr5	86679676	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=192,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.432:12:5,2:2,3:0,7,0,5
chr5	86704042	.	GT	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	87494728	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33,32,30;MFRL=179,180,155,129;MMQ=60,60,60,60;MPOS=10,16,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=8.65,16.08,4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,5,9,3:0.211,0.362,0.144:24:4,4,5,2:1,1,4,1:7,0,15,2
chr5	87502325	.	G	A,GAAAA	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=20,31,35;MFRL=130,142,89;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.41,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,18,4:0.299,0.072:42:5,7,2:5,7,1:6,14,3,19
chr5	87503087	.	GACT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:3,1:2,5:0,6,0,6
chr5	87516544	.	G	GAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=64,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=24,26;RU=A;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.666:12:3,1:1,1:3,1,0,8
chr5	87564602	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:14,0:15,4:11,20,0,4
chr5	88027559	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:9,1:15,6,1,1
chr5	89705413	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:5,2,5,2
chr5	89757099	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,2:9,0:10,10,1,1
chr5	89757452	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=167,55;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,4:5,0:1,9,0,4
chr5	89781594	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr5	89814604	.	G	GTGACC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=213,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACC;STR;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,3:3,2:5,0,7,0
chr5	89815312	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.486:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr5	89914925	.	T	G	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,41:0.495:83:21,16:20,25:22,20,24,17
chr5	89918596	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,198;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,1:2,1:0,11,0,2
chr5	89923477	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:8,2:10,5,0,2
chr5	89938587	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.366:25:5,5:10,3:8,8,1,8
chr5	89954184	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr5	89979380	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr5	89981879	.	G	GTTGTAGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:89981879_G_GTTGTAGGC:89981879:0,1,0,1
chr5	89981881	.	T	TTTAGAGTTATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89981879_G_GTTGTAGGC:89981879:0,1,0,1
chr5	89988412	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.408:30:10,9:6,3:12,6,10,2
chr5	89990545	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr5	89993045	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:0,5,0,3
chr5	90001988	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,3:1,4:3,0,7,0
chr5	90002220	.	CT	C,CTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,33,23;MFRL=162,148,132;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.50,8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,6:0.205,0.255:24:7,2,2:6,2,4:4,9,0,11
chr5	90007196	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,0:6,4:0,11,0,4
chr5	90012614	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	90015792	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr5	90020868	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,29:0.484:60:14,11:15,18:7,24,11,18
chr5	90021499	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.466:49:11,11:14,11:2,24,1,22
chr5	90052263	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:4,1,7,0
chr5	90052289	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.478:23:6,2:5,9:11,1,9,2
chr5	90053056	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	90086683	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,99;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:0,1,2,0
chr5	90111593	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	90149446	.	A	AAAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90149446_A_AAAG:90149446:0,0,0,1
chr5	90149448	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90149446_A_AAAG:90149446:0,0,0,1
chr5	90149450	.	C	CTGTTTTCATGTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90149446_A_AAAG:90149446:0,0,0,1
chr5	90445829	.	T	TTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:1,2:3,1:4,0,4,0
chr5	90449031	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr5	90669400	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:90669400_A_T:90669400:0,0,8,0
chr5	90669408	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=134,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0|1:90669400_A_T:90669400:4,0,4,0
chr5	92956623	.	T	TCGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGA;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:4,0,2,0
chr5	92956865	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,1:8,8:2,12,3,6
chr5	93120058	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:13,0:20,3:25,9,1,2
chr5	93294451	.	CA	C,CAA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=132,182,121;MMQ=60,60,60;MPOS=28,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.51,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,3,5:0.108,0.154:33:14,1,2:11,2,3:19,6,7,1
chr5	93388777	.	T	TATAG,TATAGATAG,TATAGATAGATAG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32,31,30;MFRL=136,150,139,105;MMQ=60,60,40,40;MPOS=8,3,1;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,11,12,13;RU=ATAG;STR;TLOD=21.99,9.93,5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,6,3,2:0.356,0.318,0.220:13:2,4,1,1:0,2,2,0:2,0,11,0
chr5	93732142	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:8,7:11,9:10,9,11,5
chr5	93739455	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:4,8,1,2
chr5	93788579	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:5,1:8,3:13,0,4,0
chr5	93905243	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=124,87;MMQ=60,30;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,19:0.257:76:22,10:33,9:29,28,3,16
chr5	93905255	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=126,96;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,9:0.139:70:25,7:33,2:0|1:93905255_C_T:93905255:30,31,1,8
chr5	93905264	.	CC	TT	.	.	DP=68;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=126,96;MMQ=60,31;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,7:0.114:68:24,5:33,2:0|1:93905255_C_T:93905255:29,32,1,6
chr5	93905269	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=131,96;MMQ=60,31;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,5:0.090:65:26,4:29,1:0|1:93905255_C_T:93905255:28,32,1,4
chr5	93905271	.	GT	CC	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=131,96;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,5:0.094:62:27,3:26,1:0|1:93905255_C_T:93905255:27,30,1,4
chr5	93905352	.	T	TGGCCTGTCTTACTAGGTG	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:4,0:1,4,0,1
chr5	93998112	.	G	GTTA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTA;STR;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.415:34:8,7:12,6:3,17,2,12
chr5	94006023	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=129.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.979:42:0,24:0,17:0,0,5,37
chr5	94022491	.	TTTAG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=183,265;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	94022495	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=194,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:94022495_G_T:94022495:0,2,0,2
chr5	94022515	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=215,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:94022495_G_T:94022495:0,3,0,1
chr5	94043353	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr5	94206019	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:11,0,2,0
chr5	94206957	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,19;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,2:3,1:3,1,5,1
chr5	94267796	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0|1:94267796_G_C:94267796:0,3,0,1
chr5	94267797	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:94267796_G_C:94267796:0,3,0,1
chr5	94267799	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:94267796_G_C:94267796:0,3,0,1
chr5	94275689	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=189,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr5	94278129	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=197,149;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,5:1,7:0,5,2,10
chr5	94278154	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=196,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,5:2,4:0,6,1,8
chr5	94728631	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr5	94749903	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:7,5:7,5:2,12,1,9
chr5	94749969	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr5	94842718	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr5	94848178	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,1:12,1:23,4,1,1
chr5	94903575	.	CT	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.194:28:12,2:8,2:18,5,4,1
chr5	94918992	.	AAGAAAAATTTGAAAATTGTAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	95018382	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,5:8,2:9,4,3,4
chr5	95128742	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:6,1:7,3:9,4,3,1
chr5	95152313	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,154;MMQ=60,53;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.478:37:14,5:4,9:8,11,6,12
chr5	95152339	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.171:22:6,0:4,1:6,13,0,3
chr5	95732986	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,4:5,0,8,1
chr5	95735761	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:25,5:18,0:20,23,5,0
chr5	95747963	.	TCTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.564:21:4,6:4,6:8,1,9,3
chr5	95757696	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=64427851,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:95757696_T_TC:95757696:1,0,0,1
chr5	95757698	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=18,33;MFRL=64427851,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:95757696_T_TC:95757696:1,0,0,1
chr5	95757704	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=64427851,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:95757696_T_TC:95757696:1,0,0,1
chr5	96062617	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,5:5,3:0,7,1,7
chr5	96066576	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.651:21:5,6:1,7:4,3,6,8
chr5	96066652	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,0,12
chr5	96071780	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=208,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	96078309	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=116.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,18:0,0,27,9
chr5	96078337	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=70.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.490:49:8,13:17,9:14,11,19,5
chr5	96093386	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=115,168;MMQ=60,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.199:24:12,0:7,0:9,10,0,5
chr5	96093391	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=139,169;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.292:27:9,6:6,2:9,10,0,8
chr5	96101066	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	96112005	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr5	96112083	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.474:21:6,3:5,6:8,3,8,2
chr5	96112284	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0|1:96112284_A_T:96112284:0,6,0,5
chr5	96112295	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0|1:96112284_A_T:96112284:0,6,0,5
chr5	96116112	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:3,2:1,0:3,1,3,0
chr5	96116286	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:0,2,0,8
chr5	96116660	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,7:3,1:9,0,8,0
chr5	96116808	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.470:47:13,11:10,10:11,14,11,11
chr5	96117300	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr5	96117579	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=112,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,2:3,0:2,2,0,2
chr5	96119579	.	A	ACT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,5:0,0,11,1
chr5	96121715	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr5	96122260	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:12,7:7,7:6,13,3,11
chr5	96122281	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:9,5:6,8:3,12,3,10
chr5	96124447	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:96124447_G_C:96124447:0,1,0,4
chr5	96124453	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=191,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0|1:96124447_G_C:96124447:0,2,0,3
chr5	96127905	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,4,18
chr5	96136525	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=132,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:6,6:3,3:8,2,8,1
chr5	96139066	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,5:6,2:8,1,6,1
chr5	96228256	.	C	CACACTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:96228256_C_CACACTG:96228256:0,4,0,1
chr5	96228258	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.297:5:2,1:2,0:0|1:96228256_C_CACACTG:96228256:0,4,0,1
chr5	96230858	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.494:12:3,5:3,1:5,1,6,0
chr5	96230883	.	A	ATT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=T;STR;TLOD=87.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,8:0,0,21,1
chr5	96231069	.	TTCACAATTCTGTGTATCATACTATATGGTGTAAAGAA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=168,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.093:31:12,1:9,0:7,22,0,2
chr5	96232222	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=139.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,18:0,25:0,0,0,46
chr5	96232250	.	G	GAAA	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,13:0,0,0,29
chr5	96232286	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr5	96232345	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr5	96232402	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=119.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,17:0,16:0,0,32,1
chr5	96237413	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,0,13
chr5	96239294	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,4,12
chr5	96244585	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr5	96244638	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,14,5
chr5	96245518	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,3,19
chr5	96253349	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,161;MMQ=58,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:16,0:14,2:1,31,0,2
chr5	96332085	.	TC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=89.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,15:0,0,22,9
chr5	96339102	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr5	96339273	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,6:0,0,2,13
chr5	96339297	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=187,28716627;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:1,8,0,2
chr5	96341750	.	TTATA	T,TTATATA,TTATATATA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,31,30,31;MFRL=122,181,145,185;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,7,7;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,7,10,11;RU=TA;STR;TLOD=4.17,45.06,6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,2,17,3:0.079,0.477,0.102:32:1,0,9,2:9,2,8,1:7,3,19,3
chr5	96342077	.	TAA	T,TA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26,32;MFRL=161,126,163;MMQ=60,60,60;MPOS=5,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=8.20,27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,14:0.279,0.577:25:2,2,6:1,5,7:3,0,15,7
chr5	96360459	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=173,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:96360459_C_A:96360459:0,2,0,1
chr5	96360462	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=173,240;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:96360459_C_A:96360459:0,2,0,1
chr5	96363407	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	96363459	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.581:27:5,6:6,8:5,6,9,7
chr5	96364063	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	96364151	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:15,0:13,11,2,0
chr5	96514982	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	98199048	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	98204372	.	AACCCCAATAGC	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:3,0:1,1:0|1:98204372_AACCCCAATAGC_A:98204372:0,4,0,1
chr5	98204375	.	C	CAGAGA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.323:4:2,1:1,0:1|0:98204372_AACCCCAATAGC_A:98204372:0,3,0,1
chr5	98204376	.	C	CAGGGTCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1|0:98204372_AACCCCAATAGC_A:98204372:0,3,0,1
chr5	98204379	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:2,1:0,0:1|0:98204372_AACCCCAATAGC_A:98204372:0,3,0,1
chr5	98216956	.	CTTTTTT	C,CTTT,CTTTT,CTTTTTTT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32,34,33,33;MFRL=124,129,126,126,76;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=14,24,29,30;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=24,18,21,22,25;RU=T;STR;TLOD=4.98,3.92,5.11,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:2,4,4,5,4:0.126,0.203,0.244,0.283:19:0,1,2,3,2:0,2,2,1,0:2,0,14,3
chr5	98218734	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,1:3,2:15,0,3,0
chr5	98229376	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0,12,0,2
chr5	101592809	.	T	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.445:50:12,8:14,14:21,7,18,4
chr5	101595885	.	T	TGA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GA;STR;TLOD=82.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,9:0,11:0,0,21,1
chr5	101596025	.	TAA	T	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=A;STR;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.475:28:7,8:8,4:0,16,2,10
chr5	101596032	.	AAAAT	A	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,16:0.467:57:22,8:13,8:15,26,0,16
chr5	101596072	.	ATATAT	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATAT;STR;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.483:25:5,6:8,6:0,13,0,12
chr5	101606518	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,0:3,2:0,8,1,2
chr5	101631592	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=199,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,2:1,2:2,0,4,0
chr5	101631890	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=101,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,0:14,2:12,18,1,1
chr5	101724307	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=227,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr5	101724356	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,5:3,6:7,0,10,1
chr5	101726648	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=197.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,30:0,27:0,0,48,10
chr5	101726851	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr5	101755430	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr5	101794167	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:11,6:10,5:10,11,8,3
chr5	101795296	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,6:6,3:10,0,9,0
chr5	101795490	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,5:0,10:0,0,3,19
chr5	101811346	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr5	102262210	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:2,6:2,2:4,0,9,0
chr5	102282472	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,3:4,6:7,1,8,1
chr5	102282589	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,8:6,6:6,8,7,7
chr5	102295723	.	C	T	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,39:0.445:88:28,19:20,20:27,22,15,24
chr5	102310130	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=177,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:1,2,2,7
chr5	102310160	.	T	TTCTGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=124,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr5	102310166	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	102363858	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:4,6:12,11:11,5,12,5
chr5	102364542	.	A	AAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,6:0,0,13,4
chr5	102423576	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=200,705375;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:102423576_A_G:102423576:5,0,2,0
chr5	102423579	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=200,705375;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:0|1:102423576_A_G:102423576:5,0,2,0
chr5	102440588	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:102440588_G_A:102440588:0,2,0,1
chr5	102440591	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:102440588_G_A:102440588:0,2,0,1
chr5	102440593	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,33;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	102440599	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=225,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,0:0,1:0|1:102440599_A_T:102440599:0,1,0,1
chr5	102440601	.	A	ACGTT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=225,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102440599_A_T:102440599:0,1,0,1
chr5	102440604	.	A	ACTTT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=225,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102440599_A_T:102440599:0,1,0,1
chr5	102440606	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=225,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102440599_A_T:102440599:0,1,0,1
chr5	102472560	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:0,3:3,2:0,3,1,4
chr5	102483600	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:5,9:17,8:21,3,15,2
chr5	102484797	.	TAC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.168:29:9,2:10,3:24,0,5,0
chr5	102487110	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,2:8,7:1,12,0,9
chr5	102490521	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,10:5,3:3,8,8,5
chr5	102491539	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,1:0,6:3,0,7,0
chr5	102494751	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr5	102513343	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:5,1,1,2
chr5	102537193	.	GT	G,GTT	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=165,140,165;MMQ=60,60,60;MPOS=12,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.67,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:47,8,4:0.119,0.079:59:26,4,3:21,4,0:40,7,10,2
chr5	102612166	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:8,7:4,7:9,3,6,8
chr5	102613156	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,4:6,8:8,3,8,4
chr5	102614106	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.599:38:12,11:3,11:11,4,16,7
chr5	102614323	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,23:0.521:44:10,14:11,9:0|1:102614323_C_T:102614323:13,8,7,16
chr5	102614327	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=179.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.980:46:0,22:0,21:0|1:102614323_C_T:102614323:0,0,19,27
chr5	102886512	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr5	106723326	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=208,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,4:3,6:3,2,9,1
chr5	107197432	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=123,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:5,8,2,0
chr5	107684324	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	107703446	.	CAAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=90.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,20,1
chr5	108203451	.	G	GT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.218:25:11,2:8,2:19,1,3,2
chr5	108203465	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=18,11;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.174:33:5,1:4,0:19,7,7,0
chr5	108281779	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr5	108281959	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:3,2:3,0:0|1:108281959_G_GA:108281959:3,3,1,1
chr5	108281960	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0|1:108281959_G_GA:108281959:3,3,1,1
chr5	108281962	.	A	AAAATTCTTGACTAATAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,1:2,0:0|1:108281959_G_GA:108281959:3,3,1,1
chr5	108294979	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.353:29:11,3:8,7:8,11,4,6
chr5	108373106	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,12,10
chr5	108382742	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:8,8:3,6:11,0,14,0
chr5	108436014	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=236,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	108516629	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:0,8:1,14:0,1,7,16
chr5	108673063	.	GA	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:10,1:18,2:9,25,0,4
chr5	108673125	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=200,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.680:20:2,10:4,4:1,5,2,12
chr5	108679870	.	T	TTTAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTAA;STR;TLOD=209.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,18:0,21:0,0,40,8
chr5	108691730	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.312:17:4,0:5,0:0|1:108691730_GA_G:108691730:0,12,0,5
chr5	108691738	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,11:0.622:17:4,5:2,3:1|0:108691730_GA_G:108691730:0,6,0,11
chr5	108717157	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:5,1,6,0
chr5	109049507	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=51,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.687:6:0,3:1,1:1,1,1,3
chr5	109155662	.	A	AAATGATGACT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,409;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109155662_A_AAATGATGACT:109155662:0,0,1,0
chr5	109155666	.	G	GAAGAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,409;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109155662_A_AAATGATGACT:109155662:0,0,1,0
chr5	109155669	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,409;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109155662_A_AAATGATGACT:109155662:0,0,1,0
chr5	109202725	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,21:0.449:47:14,8:12,13:7,19,6,15
chr5	109960960	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=108,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:9,13:5,2:8,6,10,5
chr5	109960989	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=107,134;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,10:6,4:4,7,6,8
chr5	109963430	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:8,12:7,6:14,1,17,1
chr5	110092480	.	AT	A,ATT	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=138,121,151;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=4.72,8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:40,4,6:0.087,0.131:50:20,4,2:19,0,4:10,30,2,8
chr5	110092545	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:5,4:10,9:0,16,0,13
chr5	110407507	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	110408705	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,3:2,9:0,5,2,10
chr5	110436301	.	G	A	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=140.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,50:0.495:101:27,25:22,25:40,11,35,15
chr5	110436450	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=220.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,32:0,32:0,0,11,56
chr5	110438000	.	C	CA,CAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31,33;MFRL=143,175,129;MMQ=60,60,60;MPOS=11,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=7.21,6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,3:0.316,0.210:16:3,2,2:5,3,1:7,1,7,1
chr5	110443228	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	110446091	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.874:14:1,4:0,8:0,1,0,13
chr5	110446741	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:2,6,1,5
chr5	110448734	.	A	AATATATATATATATAT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=154,189;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=9,17;RU=AT;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.221:11:5,1:4,0:9,0,2,0
chr5	110448753	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=153,130;MMQ=40,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.763:15:2,7:0,5:3,0,10,2
chr5	110448755	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=189,130;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:2,6:0,5:2,0,10,2
chr5	110448791	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:14,6,0,2
chr5	110454681	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:3,2,5,1
chr5	110461283	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:1,1,5,0
chr5	110679657	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:5,0,6,0
chr5	110712491	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=118,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr5	110730557	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	111500822	.	T	TAAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=108.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,16:0,8:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:0,0,3,22
chr5	111500824	.	T	TAC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=112.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,15:0,8:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:0,0,3,23
chr5	111504403	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:1,6:5,6:5,1,12,0
chr5	111505885	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr5	111506751	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,2:0,3:0,4,0,5
chr5	111519740	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,45:0.548:82:21,28:16,17:18,19,24,21
chr5	111545670	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,106;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:5,7:4,8:5,4,7,9
chr5	111545730	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:2,12,0,2
chr5	111601969	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=147,59;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,5:0.087:67:35,5:25,0:0|1:111601969_C_T:111601969:27,35,2,3
chr5	111601977	.	G	T	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,3:0.051:69:37,2:22,0:0|1:111601969_C_T:111601969:27,39,2,1
chr5	111601981	.	G	GGAAATATACAAGATGAGCTTAGAGCATCTT	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=138,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,3:0.047:76:42,3:26,0:0|1:111601969_C_T:111601969:26,47,2,1
chr5	112111309	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.196:31:15,4:8,3:22,2,6,1
chr5	112116632	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=120.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,17:0,0,4,33
chr5	112163630	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,2:17,0:23,8,1,1
chr5	112163815	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=188,189;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	112178492	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,5:3,6:2,2,1,10
chr5	112197132	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:5,9:9,5:0|1:112197132_G_A:112197132:9,5,8,6
chr5	112197140	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.533:28:5,7:8,7:0|1:112197132_G_A:112197132:8,5,7,8
chr5	112198128	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:4,0,7,2
chr5	112200098	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=118.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,31,0
chr5	112222694	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,5:7,5,5,3
chr5	112222787	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:3,5:10,11:4,9,8,8
chr5	112237982	.	GAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr5	112238300	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	112256814	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,6:0,0,11,7
chr5	112257366	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	112257908	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=96.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,14:0,0,5,23
chr5	112312528	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:1,4:3,4:4,0,9,1
chr5	112312736	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.424:48:11,7:12,12:3,25,1,19
chr5	112321488	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:4,5:6,8:11,0,12,1
chr5	112343544	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr5	112346416	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr5	112346434	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,69;MMQ=60,38;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:13,1,1,1
chr5	112384725	.	GGTCACTGGGCA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTCACTGGGCA;STR;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.393:16:1,1:3,5:4,6,3,3
chr5	112385004	.	CA	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,4:0,5,1,6
chr5	112385035	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr5	112389633	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=117,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,1:4,2:5,10,2,1
chr5	112389688	.	C	CTTAGCAGACCCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=205,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	112389738	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=177,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:112389738_C_T:112389738:0,1,0,1
chr5	112389743	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=177,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:112389738_C_T:112389738:0,1,0,1
chr5	112389747	.	C	A,G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,27,32;MFRL=0,205,177;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr5	112399760	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,1:13,1:10,18,1,1
chr5	112399791	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:4,10:9,2:3,11,6,6
chr5	112399934	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=132,45;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	112403678	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr5	112406718	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr5	112487137	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,11:0,0,5,19
chr5	112676191	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr5	112770027	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.513:14:3,5:2,2:4,3,3,4
chr5	112824039	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:0,8,1,6
chr5	112824048	.	T	TGCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GCC;STR;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr5	112851088	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=144,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:7,6:5,2:4,8,1,7
chr5	112851121	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,5:2,5:0,7,0,10
chr5	112876889	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=180,192;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.620:6:2,1:0,2:0,2,0,4
chr5	112884197	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:4,0,7,0
chr5	112898969	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	112901494	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr5	112915473	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=222,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr5	112926982	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,5:5,4:0,8,0,9
chr5	112927686	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=119,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr5	113698631	.	TGCC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr5	114462589	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr5	114611356	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	114611390	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=192,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:114611390_A_C:114611390:1,3,0,1
chr5	114611393	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=192,253;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:114611390_A_C:114611390:1,3,0,1
chr5	115167595	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=83,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr5	115168264	.	CTTTCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=178,168;MMQ=53,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,4:4,2:6,0,7,0
chr5	115177668	.	G	GAGGC,GAGATTACGAGGC	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,28,29;MFRL=177,144,129;MMQ=60,60,60;MPOS=20,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.53,28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,5,8:0.208,0.302:28:5,3,4:10,2,4:15,0,13,0
chr5	115177706	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=143,0;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.140:33:5,2:11,1:0|1:115177706_A_C:115177706:20,9,4,0
chr5	115177708	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=28,17;MFRL=143,0;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.120:39:7,0:16,0:0|1:115177706_A_C:115177706:24,11,4,0
chr5	115177713	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=144,53;MMQ=52,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.219:43:7,1:19,1:18,15,10,0
chr5	115230688	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,6:5,5:7,0,11,0
chr5	115249078	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,152;MMQ=60,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,12:0.220:57:30,8:13,4:24,21,11,1
chr5	115249271	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,179;MMQ=27,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:7,8:8,2:0,16,0,10
chr5	115298232	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	115323691	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr5	115329539	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.056:69:28,0:38,3:16,50,0,3
chr5	115338704	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr5	115339086	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=78.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,2,21
chr5	115351150	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	115351224	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,289;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	115351498	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr5	115426746	.	T	C	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=323.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,90:0.989:90:0,42:0,46:0,0,70,20
chr5	115428439	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr5	115783553	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:1,0:2,2:0,4,0,3
chr5	115814496	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=119,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,3:2,1:0,2,0,5
chr5	115827356	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	115827407	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,19,7
chr5	115831092	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:6,4:10,2:14,3,4,2
chr5	115831305	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr5	115838117	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr5	115840528	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:4,1:3,3:8,0,3,1
chr5	118176842	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=198,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	118465215	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	118470061	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:9,2:7,13,0,2
chr5	118485908	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,69;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,4:7,0:10,6,3,1
chr5	118500981	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=10,16,30;MFRL=156,133,146;MMQ=60,60,60;MPOS=23,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=A;STR;TLOD=5.21,5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,4:0.267,0.273:17:0,0,1:1,2,2:1,7,1,8
chr5	118556350	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr5	118574877	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	118691693	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=223,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr5	118691737	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.219:15:3,1:8,1:11,1,3,0
chr5	118691888	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:3,4:13,5:1,15,2,7
chr5	118691929	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr5	118728495	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=204,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.552:7:2,3:1,1:2,1,4,0
chr5	118788196	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:6,8:9,5:13,2,12,1
chr5	118809533	.	CCA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,2:2,8:6,2,9,1
chr5	118811313	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:4,0,5,1
chr5	118813240	.	T	C	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=132.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,47:0.469:102:25,16:21,31:9,46,11,36
chr5	118837658	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:2,0,5,1
chr5	118837788	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=140,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,0:6,3:7,11,2,1
chr5	118837796	.	T	TGACGGGGCTGGGCCAGTCC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:7,0:10,14,1,1
chr5	118837833	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,6:5,2:2,10,2,6
chr5	118862971	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,29:0.612:47:10,14:8,15:0,18,1,28
chr5	118867173	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,4:0,2:1,4,0,6
chr5	118965609	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=200,0;MMQ=50,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,1:0,2,2,1
chr5	118965615	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=84,232;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:118965615_C_T:118965615:1,1,0,1
chr5	118965617	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=84,232;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:118965615_C_T:118965615:1,1,0,1
chr5	118965621	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=84,232;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:118965615_C_T:118965615:1,1,0,1
chr5	118965623	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=167,116;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr5	118968423	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=157,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,1:0,3:2,1,3,1
chr5	118969594	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr5	120021819	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,9,12
chr5	121330223	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=117.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,17:0,0,28,8
chr5	121726714	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=206,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr5	121759310	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:121759310_A_T:121759310:0,3,0,1
chr5	121759312	.	C	CACAGACCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:121759310_A_T:121759310:0,3,0,1
chr5	121761323	.	G	GAGAGATTCTAGCCCAACTACTGGCTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=237,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.484:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr5	122131082	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:2,5:5,1:2,6,0,6
chr5	122137708	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.429:47:18,12:9,8:3,24,4,16
chr5	122151706	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:7,2:17,0:9,15,1,1
chr5	122152520	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr5	122161961	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr5	122165207	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:9,1,2,0
chr5	122165209	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:8,1,4,1
chr5	122281709	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.423:27:9,6:7,4:16,0,11,0
chr5	122281721	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=19,10;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.172:38:6,0:6,0:24,6,8,0
chr5	122343366	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=145,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.159:22:8,0:5,0:11,8,3,0
chr5	122359502	.	A	AAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=AC;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,2:0,0,7,0
chr5	122425971	.	A	ACCTCCGCCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCTCCGCCT;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr5	122682154	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr5	122685801	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,2,18
chr5	122713989	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=140.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,27:0,16:0,0,34,9
chr5	122718341	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	122726783	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,14,1
chr5	122729230	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr5	122735032	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:0,8,0,3
chr5	122888781	.	A	AT	.	.	DP=213;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:158,7:0.042:165:80,3:77,2:108,50,5,2
chr5	122911666	.	AC	TT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=141,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:25,3:17,0:10,33,2,1
chr5	122941000	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,76;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr5	123984763	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=102,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,5:4,4:0,8,2,7
chr5	123985484	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=129,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr5	124079728	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:3,0:8,0,3,0
chr5	125802122	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.386:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr5	125805316	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,2:16,0:23,2,2,0
chr5	125809072	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.153:30:16,3:10,1:1,25,0,4
chr5	125809145	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,0,5
chr5	125820276	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr5	125880589	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr5	125886071	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	125887685	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr5	125896918	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,4:3,1:0,8,0,5
chr5	125898834	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr5	125900371	.	T	TAAAATACAAAAATTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:125900371_T_TAAAATACAAAAATTAG:125900371:0,1,0,1
chr5	125900374	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:125900371_T_TAAAATACAAAAATTAG:125900371:0,1,0,1
chr5	125919529	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:1,1:9,2:10,0,3,0
chr5	125936839	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:1,1:1,0:1,6,0,3
chr5	125944219	.	G	GTGTTTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TGTTTT;STR;TLOD=51.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.940:12:0,4:0,6:0,0,0,12
chr5	126145771	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	126156538	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr5	126168563	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=66.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,6:0,12:0,0,0,18
chr5	126171999	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=129.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,15:0,21:0,0,6,30
chr5	126753585	.	G	GAGGTCAGGGGTTAAAGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	126869270	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,3:7,4:9,2,6,1
chr5	126994381	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=225,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:0,1,0,5
chr5	127485599	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	127493679	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:10,0,7,1
chr5	127507316	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:7,2:4,2:10,1,5,0
chr5	127512873	.	A	C	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=146.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,48:0.513:94:26,21:18,27:7,39,10,38
chr5	127514436	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,4:4,7:0,6,0,11
chr5	127522153	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.317:11:2,2:4,1:5,3,3,0
chr5	127613791	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	127640783	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:12,3:6,11:2,17,0,14
chr5	127674749	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=132,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:4,11,0,2
chr5	127680264	.	T	TACGTCCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127680264_T_TACGTCCTG:127680264:0,0,0,1
chr5	127680266	.	A	ATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127680264_T_TACGTCCTG:127680264:0,0,0,1
chr5	127727761	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=120,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:7,3:13,0:5,15,3,0
chr5	127730721	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	127855152	.	GTTAAA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.688:17:3,3:2,8:0,5,0,12
chr5	128321068	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr5	128359247	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	128359297	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr5	128430384	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	128796210	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=160,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:4,2:0|1:128796210_A_T:128796210:1,8,1,1
chr5	128796215	.	T	TGAAGATCTTCA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=160,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:128796210_A_T:128796210:1,8,1,1
chr5	128796217	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=160,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:128796210_A_T:128796210:1,8,1,1
chr5	128796220	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=172,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,2:0|1:128796210_A_T:128796210:1,10,1,1
chr5	128863423	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.081:59:25,4:29,0:49,6,3,1
chr5	128932316	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,91;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:9,3:12,0:8,13,3,0
chr5	129015668	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr5	129072943	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,1,17
chr5	129244122	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:0,7,0,7
chr5	129244133	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr5	129519874	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr5	130515745	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=149,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:5,2:3,0:8,0,3,0
chr5	130726599	.	TAAAATTCTGGG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:3,3:9,0,6,0
chr5	130788698	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:3,0,8,0
chr5	130808198	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=211,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr5	130808373	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.088:42:18,3:21,0:19,20,2,1
chr5	130831365	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,22:0.411:54:16,13:16,9:10,22,6,16
chr5	130939025	.	T	TA	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.156:55:12,2:28,4:5,42,1,7
chr5	130982768	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=87,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.547:31:6,8:6,8:10,4,12,5
chr5	131006082	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=190,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:4,4:2,8:6,0,12,0
chr5	131006356	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,30:0.519:58:11,10:13,20:3,25,6,24
chr5	131006381	.	TA	T,TAA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,31,32;MFRL=187,184,184;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=8.36,5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,4:0.251,0.191:23:2,3,1:5,2,2:0,13,0,10
chr5	131014845	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:35,0:38,3:18,56,0,3
chr5	131066577	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.574:24:4,6:6,7:9,1,12,2
chr5	131322666	.	CCACACACTCACA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=215,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr5	131323807	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:9,2:11,0:9,14,0,2
chr5	131324250	.	C	CTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TG;STR;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,3:3,2,5,2
chr5	131325888	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=194,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr5	131326522	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	131347520	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr5	131396478	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0,3,4,2
chr5	131534499	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,2,1
chr5	131546280	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr5	131553428	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:2,4:8,4:7,5,8,2
chr5	131607402	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.372:30:12,7:6,3:18,1,9,2
chr5	131630852	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:8,1,9,0
chr5	131658085	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,0,16
chr5	131671769	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr5	131719999	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=96.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,11:0,17:0,0,6,23
chr5	131720070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr5	131721174	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.595:40:8,11:8,13:2,14,4,20
chr5	131721204	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,7:6,1:1,8,0,8
chr5	131728198	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,106;MMQ=60,33;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:15,0:23,4:18,21,0,4
chr5	131730052	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr5	131755477	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	131792639	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr5	131796163	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=202,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:3,2:3,1:6,0,2,2
chr5	131796573	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr5	131796609	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=126,237;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	131821520	.	GAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=191,75;MMQ=54,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.543:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr5	131892979	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,8:0,0,21,1
chr5	131915213	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:7,4:4,6:3,8,4,6
chr5	131915848	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,0:0,8,0,2
chr5	131928692	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.430:3:2,1:0,0:0|1:131928692_A_T:131928692:0,2,0,1
chr5	131928694	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.430:3:1,1:0,0:0|1:131928692_A_T:131928692:0,2,0,1
chr5	131928699	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131928692_A_T:131928692:0,1,0,1
chr5	131931550	.	A	ATTTAAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	131995843	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr5	132009710	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr5	132018132	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr5	132018169	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,13,2
chr5	132036252	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=126.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,15:0,21:0,0,33,5
chr5	132042007	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,7:0,0,21,1
chr5	132042041	.	T	TA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:12,7:8,11:19,1,17,1
chr5	132044738	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr5	132046590	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,21:0,11:0,0,30,2
chr5	132069847	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,12:0,0,22,1
chr5	132070242	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	132099633	.	TTGG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	132161123	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	132198287	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	132224667	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=185,162;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:19,0,2,0
chr5	132232531	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:11,2:22,0:13,20,1,1
chr5	132234152	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	132234182	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	132334614	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:5,2:1,6,0,2
chr5	132342361	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr5	132388068	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:1,1,0,5
chr5	132403057	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,1:2,3:8,1,4,0
chr5	132403341	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,2:1,5:0,6,0,7
chr5	132409074	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,2:3,5:0,11,1,6
chr5	132409650	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,3:0,3:6,0,6,0
chr5	132409867	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,1:4,6:0,7,0,7
chr5	132412299	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,1:3,0,4,0
chr5	132428503	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.663:16:3,5:2,4:3,2,7,4
chr5	132437613	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=173,174;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:0,0:0,0:0,1,0,5
chr5	132561277	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr5	132569260	.	GCCT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=200,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,3:2,5:1,4,2,7
chr5	132652422	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132652422_A_C:132652422:0,2,0,1
chr5	132652427	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132652422_A_C:132652422:0,2,0,1
chr5	132652429	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132652422_A_C:132652422:0,2,0,1
chr5	132652431	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132652422_A_C:132652422:0,2,0,1
chr5	132652435	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:132652422_A_C:132652422:0,1,0,1
chr5	133316707	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:3,1:2,6,0,4
chr5	133326914	.	A	ACTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=206,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0|1:133326914_A_ACTC:133326914:0,1,0,1
chr5	133326917	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=206,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133326914_A_ACTC:133326914:0,1,0,1
chr5	133450964	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.415:14:2,0:4,0:7,1,6,0
chr5	133478063	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	133481475	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=155,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,3:4,0:3,9,2,1
chr5	133481510	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:4,7,0,2
chr5	133536849	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,189;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,1:2,1:0,10,0,2
chr5	133537438	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	133537479	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	133561589	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr5	133655048	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,13;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,0:3,8,2,0
chr5	133657610	.	G	GA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.322:34:13,0:9,11:2,21,4,7
chr5	133685845	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=196,178;MMQ=48,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,2:7,1:9,0,3,0
chr5	133685857	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=181,212;MMQ=55,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:12,0,2,0
chr5	133685868	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=178,187;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:13,0,3,0
chr5	133685871	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=178,212;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:7,0:13,0,2,0
chr5	133707164	.	T	TCGG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=206,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CGG;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr5	133707247	.	C	CT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.143:37:14,1:14,3:29,3,5,0
chr5	133738481	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=183,219;MMQ=40,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:133738481_C_T:133738481:2,0,1,0
chr5	133738488	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=183,219;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:133738481_C_T:133738481:2,0,1,0
chr5	133745699	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,122;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,0:14,3:6,15,0,3
chr5	133896744	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=244,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr5	133898136	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.798:13:1,4:1,6:0,2,1,10
chr5	133900111	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:2,1:4,7:6,1,6,2
chr5	133902288	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=59,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,1,2
chr5	133902355	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	133909475	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,1,13
chr5	133944043	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=202,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	133996983	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:16,1:11,1:18,11,3,0
chr5	134010770	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,9:0.129:75:32,7:33,2:39,27,8,1
chr5	134011834	.	C	CT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=156,163;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.292:24:6,1:4,2:1,16,1,6
chr5	134033777	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr5	134099734	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,31963125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,1:8,1:4,16,0,2
chr5	134164284	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=230,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr5	134192096	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=174,150;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:18,0:14,2:0,34,0,2
chr5	134192112	.	CTT	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=184,140;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:17,0:11,2:0,28,0,2
chr5	134192113	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=188,181;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.171:27:14,2:9,2:0|1:134192113_T_C:134192113:0,23,0,4
chr5	134192117	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=177,181;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:12,1:10,2:0|1:134192113_T_C:134192113:0,24,0,4
chr5	134192123	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=188,161;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,1:7,1:0,19,0,4
chr5	134192215	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=226,217;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,3,1
chr5	134192330	.	CAAAT	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AAAT;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:3,2:6,1:9,0,3,0
chr5	134193595	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,2501;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:14,0:14,3:7,22,0,3
chr5	134194789	.	G	GA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.147:45:12,1:12,2:10,29,2,4
chr5	134331921	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=146,67;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:6,3,1,1
chr5	134344497	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr5	134345062	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:2,3:4,0,4,3
chr5	134364406	.	TCCGCGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=148,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCGCGC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr5	134365091	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,0:7,3:0,10,0,3
chr5	134781992	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:3,2,5,0
chr5	134782013	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:3,2,5,1
chr5	134782450	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,4,13
chr5	134782472	.	G	GAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=153,163;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:7,2:3,9,0,2
chr5	134914350	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,3,3
chr5	135170671	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,4:5,5:1,10,1,8
chr5	135178124	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr5	135186075	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	135188214	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,7:0,0,12,1
chr5	135207322	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,49;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:14,8,2,0
chr5	135272670	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=239,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	135276201	.	AGTT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=71.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.501:38:12,5:7,14:14,5,9,10
chr5	135276701	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=78.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,26:0.474:55:15,18:14,8:18,11,16,10
chr5	135277394	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr5	135383136	.	C	CGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,2:1,0:0|1:135383136_C_CGG:135383136:0,3,1,1
chr5	135383137	.	A	AGCCAAGACTCGAGGTAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,2:1,0:0|1:135383136_C_CGG:135383136:0,3,1,1
chr5	135496820	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.344:21:6,5:7,1:0,14,1,6
chr5	135513085	.	T	TC	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=182.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,21:0,24:0,0,22,26
chr5	135567316	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135567316_A_G:135567316:0,1,0,1
chr5	135567318	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135567316_A_G:135567316:0,1,0,1
chr5	135567331	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135567316_A_G:135567316:0,0,0,1
chr5	135610530	.	AAAAAC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAC;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,1:9,1:0,13,0,2
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chr5	136315200	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	136320758	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr5	136476451	.	T	TGCTGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr5	136994047	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr5	136997776	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,22;MFRL=200,161;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,0:0,3,0,4
chr5	136997805	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=36,34;MFRL=257,167;MMQ=60,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:136997805_GA_G:136997805:0,2,0,1
chr5	136997808	.	A	ATTATT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=257,167;MMQ=60,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:136997805_GA_G:136997805:0,2,0,1
chr5	136997809	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=257,167;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:136997805_GA_G:136997805:0,2,0,1
chr5	136997811	.	G	GTAAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=257,167;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	136997816	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=247,167;MMQ=60,36;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr5	137027953	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr5	137034169	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=186,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.592:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr5	137241856	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chr5	137243696	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	137257288	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,13,3
chr5	137259251	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr5	137259281	.	A	AAATGGACAAAAACTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=184,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr5	137281708	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr5	137282031	.	C	A,CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=22,17,24;MFRL=186,155,183;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.80,12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,6,7:0.170,0.345:23:4,0,4:1,1,0:0,10,0,13
chr5	137292052	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=168,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,1,0
chr5	137292133	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=92.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,16:0,16:0,0,28,6
chr5	137295823	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=273.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,76:0.987:76:0,28:0,47:0,0,50,26
chr5	137323117	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=112.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,23:0,8:0,0,28,3
chr5	137342589	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	137347403	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=251,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.899:18:1,8:0,6:1,0,17,0
chr5	137354554	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:5,0:7,2:12,0,2,0
chr5	137354851	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,2,16
chr5	137420376	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	137464887	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=103,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr5	137485292	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,15,1
chr5	137493037	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=253,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	137498740	.	A	AGGAAGAAAGAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.811:8:0,4:1,2:1,0,6,1
chr5	137500665	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,26:0.438:60:15,15:17,11:14,20,6,20
chr5	137500734	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:6,2:17,0:8,15,0,2
chr5	137501415	.	CAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=118,222;MMQ=40,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	137501433	.	AGC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=97,118;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:137501433_AGC_A:137501433:3,1,1,0
chr5	137501436	.	A	ACCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=0,118;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0|1:137501433_AGC_A:137501433:3,2,1,0
chr5	137506434	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	137507104	.	TAA	T,TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=131,137,65;MMQ=60,60,60;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=7.29,8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.336,0.434:9:1,0,1:1,3,2:0,2,2,5
chr5	137513368	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=104,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:3,0:0,1:0|1:137513368_A_AT:137513368:2,1,0,2
chr5	137513369	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=52,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.603:5:2,1:0,2:0|1:137513368_A_AT:137513368:2,0,0,3
chr5	137514374	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,2:3,8:2,6,1,10
chr5	137524834	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:19,0:18,2:6,32,1,1
chr5	137589876	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=97,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.318:10:3,0:1,3:4,3,0,3
chr5	137593489	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:15,5,2,0
chr5	137626513	.	GCA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=162,152;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:137626513_GCA_G:137626513:0,2,0,1
chr5	137626518	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,152;MMQ=60,59;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:137626513_GCA_G:137626513:0,2,0,1
chr5	137626528	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=162,152;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:137626513_GCA_G:137626513:0,2,0,1
chr5	137665405	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:137665405_T_TGG:137665405:0,2,0,1
chr5	137665406	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:137665405_T_TGG:137665405:0,2,0,1
chr5	137665418	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137665418_T_TG:137665418:0,0,0,1
chr5	137665420	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137665418_T_TG:137665418:0,0,0,1
chr5	137665424	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=208,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:137665418_T_TG:137665418:0,1,0,1
chr5	137665427	.	TT	AG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=208,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137665418_T_TG:137665418:0,1,0,1
chr5	137665433	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=204,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:137665418_T_TG:137665418:0,2,0,1
chr5	137682714	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	137708434	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.546:40:8,10:10,11:11,7,17,5
chr5	137728774	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr5	137729134	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,6:1,3:0,4,0,10
chr5	137735754	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr5	137760083	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,0:4,3:0,6,0,4
chr5	137780347	.	G	GCAGGCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr5	137780368	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,3,2
chr5	137780631	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	137802404	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.608:24:4,7:5,5:7,2,14,1
chr5	137844274	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr5	137846155	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr5	137847082	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=201,235;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:0,6:1,4:1,0,9,1
chr5	137847084	.	CACACACAT	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=187,190;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.219:12:3,1:2,1:10,0,2,0
chr5	137847086	.	CACACAT	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=150,230;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:3,2:1,2:7,0,4,0
chr5	137847092	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=88,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:2,6:1,3:3,0,8,1
chr5	137848707	.	AAAAAT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAT;STR;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.731:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr5	137893017	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:9,7:10,8:18,1,15,0
chr5	137897174	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr5	137902868	.	GA	G,GAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=159,171,148;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=19.29,6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,9,5:0.360,0.205:25:3,7,2:6,2,3:0,11,3,11
chr5	137903084	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:5,7:1,8:6,0,14,1
chr5	137906816	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,4:7,5:4,8,5,4
chr5	137909674	.	GAGA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=50.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:8,7:8,7:17,2,12,2
chr5	138208839	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,6:0.105:51:19,1:18,2:0|1:138208839_T_G:138208839:9,36,6,0
chr5	138208842	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,5:0.084:51:20,0:19,0:0|1:138208839_T_G:138208839:9,37,5,0
chr5	138643062	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr5	138658539	.	C	T	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,5:0.049:117:59,5:52,0:58,54,4,1
chr5	138704323	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,2:5,0:9,1,2,0
chr5	138718825	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	138724126	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr5	138725611	.	G	GTAGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138725611_G_GTAGCC:138725611:0,0,0,1
chr5	138725613	.	T	TCAATCTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138725611_G_GTAGCC:138725611:0,0,0,1
chr5	138725614	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138725611_G_GTAGCC:138725611:0,0,0,1
chr5	138725619	.	GA	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138725611_G_GTAGCC:138725611:0,0,0,1
chr5	138755989	.	TATC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ATC;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	138775166	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,11;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.111:29:13,0:12,1:0,26,0,3
chr5	138775173	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.459:24:6,4:6,5:0,13,1,10
chr5	138837504	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:138837504_TTC_T:138837504:0,4,0,1
chr5	138837508	.	C	CTTACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:138837504_TTC_T:138837504:0,4,0,1
chr5	138858192	.	CCAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	138861370	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	139201548	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=115,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:8,0:6,2:7,8,2,0
chr5	139213452	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	139215386	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=197,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:3,1,3,2
chr5	139216901	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=71.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,1,20
chr5	139227629	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:1,1,0,3
chr5	139231494	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=293,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	139251469	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:0,4,0,6
chr5	139260428	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:7,8:2,5:7,2,11,2
chr5	139494846	.	TA	T,TAA	.	.	DP=141;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=134,109,119;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=23.69,6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:71,23,12:0.193,0.094:106:31,13,7:37,10,4:47,24,26,9
chr5	139494992	.	CA	C	.	.	DP=130;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,4:0.045:108:50,2:51,1:23,81,1,3
chr5	139740109	.	C	CACGGTGAAGTGCTCCACTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	139745732	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,1:5,1:7,8,1,1
chr5	139745804	.	CC	GG	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=134,86;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,2:2,0:0|1:139745804_CC_GG:139745804:4,11,0,2
chr5	139745808	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=137,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:12,2:1,0:0|1:139745804_CC_GG:139745804:4,10,0,2
chr5	139745810	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=137,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:13,2:1,0:0|1:139745804_CC_GG:139745804:4,10,0,2
chr5	139745815	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=121,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:12,2:1,0:4,9,0,3
chr5	139747547	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:139747547_G_T:139747547:0,4,0,1
chr5	139747549	.	CA	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:139747547_G_T:139747547:0,4,0,1
chr5	139817996	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=136,145,186;MMQ=60,60,60;MPOS=15,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=5.02,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,2:0.190,0.142:18:7,3,2:5,0,0:10,3,5,0
chr5	139907748	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.404:7:2,0:2,0:2,2,2,1
chr5	139921961	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=137,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr5	139930262	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:20,2:20,1:28,12,3,0
chr5	139931628	.	A	AGT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:7,8:4,7:0|1:139931628_A_AGT:139931628:6,5,5,11
chr5	139931629	.	C	CG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:6,9:4,7:0|1:139931628_A_AGT:139931628:6,5,5,11
chr5	139931776	.	AGG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=152,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,1:6,1:0|1:139931776_AGG_A:139931776:3,7,0,2
chr5	139931779	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=152,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0|1:139931776_AGG_A:139931776:3,7,0,2
chr5	139936980	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,4,3
chr5	139940026	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:20,3:19,0:0|1:139940026_C_A:139940026:20,21,3,0
chr5	139940033	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.081:47:23,3:19,0:0|1:139940026_C_A:139940026:22,22,3,0
chr5	139941318	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,10:0,0,17,9
chr5	139943422	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:6,9,0,2
chr5	140021858	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=90,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,3:4,4:4,2,6,2
chr5	140022436	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:6,4:1,0:6,1,5,0
chr5	140023818	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.527:21:5,7:4,4:0,10,1,10
chr5	140024491	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,1:1,1,3,0
chr5	140027216	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=83,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:0,2:2,0:1,1,1,2
chr5	140033991	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:2,4:8,1:9,1,4,1
chr5	140035656	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:140035656_T_TC:140035656:0,0,0,1
chr5	140035658	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:140035656_T_TC:140035656:0,0,0,1
chr5	140037272	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:4,1:3,5:0,7,2,4
chr5	140048209	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:6,4:8,11:8,6,12,3
chr5	140050907	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=140,114;MMQ=50,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,2:0.038:77:38,1:26,1:0|1:140050907_C_T:140050907:40,35,2,0
chr5	140050926	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=149,125;MMQ=49,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,8:0.100:87:42,4:31,4:0|1:140050907_C_T:140050907:42,37,7,1
chr5	140050940	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=148,139;MMQ=44,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:93,5:0.058:98:53,2:39,3:1|0:140050907_C_T:140050907:51,42,3,2
chr5	140051240	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,121;MMQ=57,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:8,15,1,1
chr5	140051983	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=253,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr5	140054257	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=54.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:3,14:2,4:1,4,13,5
chr5	140059565	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:140059565_T_TTG:140059565:0,0,0,1
chr5	140059567	.	TCC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:140059565_T_TTG:140059565:0,0,0,1
chr5	140073883	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:12,5:8,5:8,12,3,7
chr5	140075011	.	C	CAGTTGATAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,2:4,6:7,0,8,0
chr5	140077699	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,2,22
chr5	140081791	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:0,5,1,6
chr5	140175932	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,34:0.573:59:8,17:17,16:16,9,17,17
chr5	140180737	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	140181094	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,134;MMQ=54,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.317:23:10,2:6,5:9,7,5,2
chr5	140181645	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:8,8,0,3
chr5	140183296	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=293,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	140183325	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	140201264	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	140201420	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:8,1:3,6:7,5,6,1
chr5	140220910	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=111,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:9,4:10,6:14,5,5,5
chr5	140232167	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:3,3:6,4:7,3,8,0
chr5	140232470	.	AT	A	.	.	DP=66;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.131:51:22,3:16,3:12,32,1,6
chr5	140232485	.	T	A	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=166,166;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.059:48:27,0:16,2:0|1:140232485_T_A:140232485:9,37,0,2
chr5	140232487	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=166,166;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:29,0:16,1:0|1:140232485_T_A:140232485:9,37,0,2
chr5	140232524	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=160,121;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,2:5,0:0|1:140232524_TG_CA:140232524:0,17,0,2
chr5	140232526	.	CC	TG	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:6,0:0,15,0,3
chr5	140232527	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=162,121;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:7,2:6,0:0|1:140232524_TG_CA:140232524:0,16,0,2
chr5	140235663	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=79.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,31:0.473:65:13,18:21,10:15,19,13,18
chr5	140264010	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:5,10:10,8:10,5,14,4
chr5	140306793	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,3:8,0:10,8,3,0
chr5	140475803	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,186;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:6,3,1,1
chr5	140480708	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=154,108;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:0|1:140480708_G_T:140480708:3,5,0,2
chr5	140480711	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=168,108;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:6,0:2,2:0|1:140480708_G_T:140480708:3,6,0,2
chr5	140480716	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=154,108;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.253:10:6,0:1,2:0|1:140480708_G_T:140480708:3,5,0,2
chr5	140532478	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=110,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.275:12:4,0:3,2:7,2,0,3
chr5	140532488	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.243:19:6,1:5,3:10,5,2,2
chr5	140532641	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,30:0.608:49:5,14:14,16:8,11,13,17
chr5	140532871	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=201,227;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr5	140554189	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=106,177;MMQ=36,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:3,3,2,0
chr5	140559035	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=175,165;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:18,1:14,3:16,17,4,0
chr5	140559319	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=183,172;MMQ=40,32;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:6,3:5,1:0,13,0,4
chr5	140559320	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=178,188;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,2:6,1:0,13,0,3
chr5	140559532	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=202,205;MMQ=22,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr5	140565046	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=159,90;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr5	140567191	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,201;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,3:2,3:5,0,6,0
chr5	140568026	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0|1:140568026_T_C:140568026:6,2,6,0
chr5	140568034	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0|1:140568026_T_C:140568026:0,0,13,1
chr5	140569353	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	140573439	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=142,149;MMQ=45,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:9,4:8,1:0|1:140573439_G_C:140573439:3,15,1,5
chr5	140573442	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=142,149;MMQ=45,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:9,4:8,2:0|1:140573439_G_C:140573439:3,15,1,5
chr5	140573844	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=217,184;MMQ=26,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr5	140590445	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	140591702	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.462:37:13,7:7,9:4,16,5,12
chr5	140597483	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=119,3628;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.152:44:18,0:20,6:25,13,6,0
chr5	140627129	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=167,206;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	140682757	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:6,11:8,6:7,7,11,6
chr5	140699679	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:6,8:4,10:7,3,9,9
chr5	140710705	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr5	140720954	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:16,13:8,7:10,14,4,16
chr5	140737183	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:7,3:13,3:4,16,0,6
chr5	140742226	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=236,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	140745166	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	140745340	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=100,102;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:5,9,0,2
chr5	140750044	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,16,5
chr5	140754749	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,1:11,1:7,13,1,1
chr5	140765000	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=216,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,2,3
chr5	140772898	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=123,183;MMQ=56,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.411:20:6,6:6,2:7,5,2,6
chr5	140773738	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=112,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.516:31:8,4:6,11:9,6,7,9
chr5	140774363	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:9,15,0,2
chr5	140774940	.	G	GGAACCCACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:140774940_G_GGAACCCACA:140774940:0,3,0,1
chr5	140774941	.	T	TAGATGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:140774940_G_GGAACCCACA:140774940:0,3,0,1
chr5	140774980	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	140778530	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,0:2,4:5,4,0,4
chr5	140782755	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,2:7,1:6,7,2,1
chr5	140784427	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.402:18:6,6:4,1:6,5,5,2
chr5	140785080	.	AAA	GGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:140785080_AAA_GGG:140785080:0,0,0,1
chr5	140785089	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140785080_AAA_GGG:140785080:0,0,0,1
chr5	140789281	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,2:13,0:11,13,2,0
chr5	140797339	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	140803317	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=G;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.511:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr5	140811464	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=105,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:5,1:8,2:8,6,1,2
chr5	140812775	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.257:13:6,2:4,1:2,8,1,2
chr5	140812885	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=220,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140812885_G_C:140812885:0,1,0,1
chr5	140812887	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=220,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140812885_G_C:140812885:0,1,0,1
chr5	140857395	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=161,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:0|1:140857395_G_A:140857395:7,1,1,1
chr5	140857402	.	T	TGGAGTCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=159,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:140857395_G_A:140857395:8,1,1,1
chr5	140857974	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:3,3,2,0
chr5	140858245	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:5,3:5,8:3,8,2,9
chr5	140890770	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:9,2:4,5:1,12,1,6
chr5	140907266	.	T	TAAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=15,0;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=23,28;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr5	140915744	.	C	CATGCTCAGCTAATTTTTTATTATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=0,215;MMQ=56,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	140955777	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,23:0.411:56:18,11:15,11:24,9,17,6
chr5	140957189	.	A	AAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AT;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:1,3:3,2:0,6,0,5
chr5	141005943	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=273,271;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141005943_T_TA:141005943:0,1,0,1
chr5	141005945	.	T	TACACTATTGTGAACCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=273,271;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141005943_T_TA:141005943:0,1,0,1
chr5	141016276	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=149.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,41:0.955:42:0,16:1,24:0|1:141016276_T_C:141016276:1,0,26,15
chr5	141016288	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,14:0.358:40:7,8:18,6:0|1:141016276_T_C:141016276:17,9,9,5
chr5	141018454	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,27:0.528:51:13,16:11,11:8,16,10,17
chr5	141019569	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:4,7:6,7:1,9,3,12
chr5	141033555	.	A	AGTGGTGAACTAC	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:5,2:14,0:10,19,1,1
chr5	141033567	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=117,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.200:22:4,0:6,3:9,9,0,4
chr5	141034001	.	G	GTTTTTTATTAAAAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=230,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:141034001_G_GTTTTTTATTAAAAT:141034001:0,4,0,1
chr5	141034002	.	G	GTTGTGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=230,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:141034001_G_GTTTTTTATTAAAAT:141034001:0,4,0,1
chr5	141049509	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.146:38:14,2:11,1:21,11,0,6
chr5	141304314	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=180,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.658:8:1,2:2,1:0,3,1,4
chr5	141304345	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=180,170;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	141313727	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,3:6,0:18,1,3,0
chr5	141324955	.	C	CCTGCTGCTG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=CTG;STR;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:3,3:3,5:6,1,6,2
chr5	141329183	.	C	CCCCCTGGAGTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:6,2:10,0:0,16,0,2
chr5	141335674	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:3,1,7,2
chr5	141336264	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:5,4,4,3
chr5	141363166	.	TATG	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.420:29:7,4:9,8:1,16,1,11
chr5	141364511	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=128.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,14:0,24:0,0,10,28
chr5	141367202	.	GA	TT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,6:1,4:4,0,10,0
chr5	141382584	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr5	141387336	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,4,1
chr5	141387520	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	141511525	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.215:42:11,4:22,5:1,32,2,7
chr5	141511561	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.575:40:7,10:9,13:0,17,1,22
chr5	141694649	.	C	CAGTTAATAAGGTATCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	142259083	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,3:4,6:1,8,0,9
chr5	142288318	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:8,0,4,0
chr5	142288527	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:0,8,0,6
chr5	142311509	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr5	142393562	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr5	142435748	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr5	142586694	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:4,7:6,6:7,3,11,2
chr5	142680344	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,8:0,0,2,17
chr5	143853684	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=22,16;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:0,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,2,0,1
chr5	143853687	.	G	GTAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,14;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,2,0,1
chr5	143853688	.	G	GACATTATCCTCAGCAAACTA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,2,0,1
chr5	143853690	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,2,0,1
chr5	143853693	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:0,1:1,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,2,0,1
chr5	143853698	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=218,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,1,0,1
chr5	145144419	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr5	145197411	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr5	145199430	.	AG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=95.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,22,3
chr5	145199686	.	GTTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=114,208;MMQ=47,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,7;RU=T;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.801:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr5	145239406	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,2:14,0:0|1:145239406_C_T:145239406:15,14,2,0
chr5	145239414	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,2:15,0:0|1:145239406_C_T:145239406:14,13,2,0
chr5	145252574	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,4:1,4:1,3,0,8
chr5	145427527	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	145439880	.	A	ATGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	145465225	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:145465225_A_T:145465225:0,1,0,1
chr5	145465227	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:145465225_A_T:145465225:0,1,0,1
chr5	145483679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=209,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr5	145483713	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=188,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr5	145502161	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:9,2:7,5:4,12,1,6
chr5	145508340	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.549:27:3,6:9,8:1,11,4,11
chr5	145508457	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:145508457_T_C:145508457:1,0,3,0
chr5	145508471	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0|1:145508457_T_C:145508457:1,0,3,0
chr5	145508688	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,2:5,5:2,10,0,7
chr5	145509573	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.535:43:10,14:9,9:13,7,19,4
chr5	145512367	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=273,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr5	145512378	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=128,273;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:145512378_AAG_A:145512378:3,0,1,0
chr5	145512390	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:0,2:0|1:145512378_AAG_A:145512378:4,0,3,0
chr5	145522912	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr5	145532859	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=243,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:0|1:145532859_T_C:145532859:0,1,0,8
chr5	145532876	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=243,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0|1:145532859_T_C:145532859:0,1,0,6
chr5	145533214	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,46;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:15,1,2,0
chr5	145533418	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,22:0.451:49:10,9:17,13:15,12,11,11
chr5	145538924	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:10,9:6,8:14,2,16,1
chr5	145539123	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,5:2,3:0,4,0,8
chr5	145562143	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:4,6:3,9:0,7,1,14
chr5	145637995	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:5,3:7,6:10,2,10,0
chr5	145640215	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=137,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr5	145643048	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=113,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:1,7:10,3:8,3,6,4
chr5	145647199	.	C	A,G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=18,10,19;MFRL=159,155,154;MMQ=60,60,60;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.63,9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,17,7:0.264,0.142:57:8,0,1:5,0,2:26,7,24,0
chr5	145650704	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=166,177;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:0|1:145650704_C_T:145650704:0,19,0,2
chr5	145650712	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=166,172;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.219:21:9,1:7,3:0|1:145650704_C_T:145650704:0,17,0,4
chr5	145838440	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,22:0.403:55:18,12:15,10:20,13,15,7
chr5	145848074	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=164,146;MMQ=60,28;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:5,0:8,3:0|1:145848074_A_T:145848074:0,14,0,3
chr5	145848082	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=164,146;MMQ=60,28;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:4,0:7,1:0|1:145848074_A_T:145848074:0,14,0,3
chr5	145848083	.	T	TTTATTTTTTTATTTTTTTTA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=170,146;MMQ=60,28;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:4,0:8,1:0|1:145848074_A_T:145848074:0,13,0,3
chr5	145851157	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=123,136;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.314:38:12,0:8,1:14,12,0,12
chr5	145851160	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=129,126;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.223:37:13,2:7,0:14,15,0,8
chr5	145851163	.	A	AT	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=130,130;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.177:39:18,4:9,0:13,19,0,7
chr5	145888687	.	CT	C,CTT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,34,34;MFRL=159,167,163;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.25,5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,3,4:0.154,0.180:23:6,2,2:9,1,1:15,1,5,2
chr5	145888700	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.149:30:10,1:9,0:21,5,3,1
chr5	145890167	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.277:23:10,3:6,3:5,12,2,4
chr5	145972646	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:145972646_GA_G:145972646:2,9,1,1
chr5	145972649	.	GGTC	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:7,2:0|1:145972646_GA_G:145972646:2,9,1,1
chr5	145972656	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:145972646_GA_G:145972646:1,8,1,1
chr5	145972660	.	AT	TG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:0|1:145972646_GA_G:145972646:1,8,1,1
chr5	146030055	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr5	146435163	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	146659014	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=10,36;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr5	146728149	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=123,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:4,4:5,1,3,1
chr5	146793337	.	GT	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=13,29;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr5	146991976	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:146991976_T_C:146991976:0,2,0,1
chr5	146991981	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:146991976_T_C:146991976:0,2,0,1
chr5	147012186	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.606:13:4,2:0,5:5,0,8,0
chr5	147012291	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,35:0.734:47:5,21:7,13:0|1:147012291_G_A:147012291:6,6,14,21
chr5	147012297	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:35,11:0.245:46:20,3:14,7:1|0:147012291_G_A:147012291:12,23,6,5
chr5	147016712	.	AAGAATTTTCTATG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=255,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr5	147019114	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=68,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr5	147019335	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=216,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.655:9:1,1:2,5:0,3,0,6
chr5	147020419	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:0,4,1,4
chr5	147020443	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr5	147444785	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=179,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147444785_A_G:147444785:1,0,1,0
chr5	147444792	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=179,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147444785_A_G:147444785:1,0,1,0
chr5	147444989	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.644:29:7,8:3,11:0|1:147444989_G_A:147444989:3,7,8,11
chr5	147445023	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0|1:147444989_G_A:147444989:0,5,0,5
chr5	147449855	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=85.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,30:0.431:70:22,15:17,15:32,8,26,4
chr5	147450085	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=208,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:1,4,0,7
chr5	147468234	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0,5,0,4
chr5	147468971	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:4,5:4,4:8,0,11,0
chr5	147475488	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,31:0.373:83:26,9:24,19:23,29,4,27
chr5	147475513	.	G	GT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:10,7:4,11:2,12,1,17
chr5	147478785	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.525:36:9,8:8,11:12,5,10,9
chr5	147478981	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	147479991	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr5	147480007	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.373:9:2,1:2,2:6,0,2,1
chr5	147480027	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,1:4,2:8,0,2,1
chr5	147480868	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=102,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.561:39:6,9:11,13:14,3,13,9
chr5	147480955	.	A	G	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,28:0.476:59:10,12:21,16:16,15,13,15
chr5	147481018	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=72.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,29:0.428:68:19,16:19,12:16,23,7,22
chr5	147484465	.	GAA	G,GA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=180,147,172;MMQ=60,60,60;MPOS=12,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=4.20,30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,14:0.110,0.464:30:6,3,4:6,0,10:13,0,17,0
chr5	147491532	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	147493871	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	147497932	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr5	147498523	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=107,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,6:1,4:5,1,9,1
chr5	147498652	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.522:25:6,9:5,4:6,6,4,9
chr5	147498669	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:8,6:6,4:0|1:147498669_G_A:147498669:5,9,0,10
chr5	147498672	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:7,6:6,4:0|1:147498669_G_A:147498669:5,9,0,10
chr5	147504305	.	C	CT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.492:28:10,6:3,5:0|1:147504305_C_CT:147504305:14,0,14,0
chr5	147504315	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,14:0.476:29:11,9:4,5:0|1:147504305_C_CT:147504305:15,0,14,0
chr5	147505227	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:6,7:9,6:11,5,6,7
chr5	147510776	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,7:1,1:3,0,6,2
chr5	147511018	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:147511018_TA_T:147511018:0,0,0,1
chr5	147511020	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:147511018_TA_T:147511018:0,0,0,1
chr5	147511021	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:147511018_TA_T:147511018:0,0,0,1
chr5	147516470	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:1,7:9,7:9,1,14,0
chr5	147554997	.	TTTTTTCC	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=217.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,27:0,24:0,0,21,30
chr5	147555029	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=100.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,15:0,0,2,27
chr5	147693829	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=130,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,3:5,6:0,7,3,6
chr5	147781995	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:15,2:16,0:9,23,1,1
chr5	147785802	.	AT	A,ATT	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=139,164,127;MMQ=60,60,60;MPOS=18,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=13.32,5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,12,8:0.188,0.134:56:19,9,5:13,3,1:29,7,19,1
chr5	147795594	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=155,219;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:17,0:16,4:12,23,0,4
chr5	147795697	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=139,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,0:0,0:0,1,0,4
chr5	147818144	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=330,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147818144_G_T:147818144:0,1,0,1
chr5	147818146	.	T	TGTTTTCTCTTTGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=330,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147818144_G_T:147818144:0,1,0,1
chr5	147902972	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=68,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.404:10:4,1:2,2:0|1:147902972_G_A:147902972:3,3,2,2
chr5	147902980	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=121,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:147902972_G_A:147902972:2,2,0,1
chr5	147902982	.	G	GCGGATATCTGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=121,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:147902972_G_A:147902972:2,2,0,1
chr5	147928130	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr5	148206348	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	148206375	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,2:0,0,13,0
chr5	148207264	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:17,2:12,1:16,14,1,2
chr5	148207633	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,23:0.670:34:6,15:4,6:2,9,7,16
chr5	148207667	.	C	CCG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.663:21:1,6:6,7:0,7,0,14
chr5	148386525	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,29:0.651:44:6,11:9,18:10,5,11,18
chr5	148386561	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=148,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:17,0:18,3:15,20,0,3
chr5	148389763	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,1:7,3:9,2,3,1
chr5	148406386	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=206,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:3,2,4,2
chr5	148521717	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=113,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.280:14:4,2:6,0:0|1:148521717_C_G:148521717:7,3,0,4
chr5	148521720	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=117,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.304:11:1,0:6,0:0|1:148521717_C_G:148521717:7,1,0,3
chr5	148521799	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr5	148580025	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr5	148682188	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	148689735	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr5	148725199	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=201.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,24:0,32:0,0,23,37
chr5	148725225	.	G	GC	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=57.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.467:41:8,9:10,8:2,20,7,12
chr5	148745674	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,1:7,1:0,8,1,1
chr5	148748249	.	C	CTGTCCAAGGGAGTGGTCACAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	148758695	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:8,7:9,10:13,5,14,3
chr5	148876440	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:148876440_AC_A:148876440:1,9,0,2
chr5	148876447	.	AAAAGTT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:148876440_AC_A:148876440:1,8,0,2
chr5	148889428	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:13,2:16,0:20,10,2,0
chr5	148897467	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:10,0:2,17,0,3
chr5	148977613	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:0,6,0,4
chr5	148989312	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0|1:148989312_A_G:148989312:0,2,0,3
chr5	148989320	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0|1:148989312_A_G:148989312:0,2,0,4
chr5	148997686	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=127.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,18:0,23:0,0,34,8
chr5	148997880	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,0:9,2:2,17,0,2
chr5	149006837	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr5	149112300	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.413:44:9,8:17,10:18,8,13,5
chr5	149112312	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.055:52:23,0:24,1:0|1:149112312_T_G:149112312:32,18,2,0
chr5	149112317	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.054:53:26,0:25,2:0|1:149112312_T_G:149112312:31,20,2,0
chr5	149200205	.	C	CTCCCTGCTTCTGAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=82,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	149206219	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.162:30:11,4:13,0:20,6,4,0
chr5	149212469	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:12,10,1,1
chr5	149221892	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.540:35:11,8:5,11:12,4,11,8
chr5	149247403	.	C	CCTTTGACTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	149247419	.	C	CTTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	149263091	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:11,0:7,2:6,13,1,1
chr5	149264028	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.237:40:16,7:15,2:19,12,4,5
chr5	149276373	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr5	149283378	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:149283378_A_AT:149283378:0,3,0,1
chr5	149283381	.	A	ATTCG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:149283378_A_AT:149283378:0,3,0,1
chr5	149294670	.	TCACTGCAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=275,245;MMQ=57,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:149294670_TCACTGCAA_T:149294670:0,1,0,1
chr5	149294684	.	AT	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=275,245;MMQ=57,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149294670_TCACTGCAA_T:149294670:0,1,0,1
chr5	149313685	.	A	ATGGAAATGGGGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=224,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	149384610	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,5:1,1:0,6,0,6
chr5	149427387	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	149439466	.	GCTCCCCT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149439466_GCTCCCCT_G:149439466:0,0,0,1
chr5	149439475	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149439466_GCTCCCCT_G:149439466:0,0,0,1
chr5	149440995	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0|1:149440995_A_AC:149440995:1,0,1,0
chr5	149440996	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,12;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,0:0,0:0|1:149440995_A_AC:149440995:1,0,1,0
chr5	149495253	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	149495274	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=234,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:149495274_T_G:149495274:1,1,0,1
chr5	149495278	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,12;MFRL=234,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:149495274_T_G:149495274:1,1,0,1
chr5	149495287	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=176,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr5	149497099	.	GCGCGCGCGCACACACACA	G,GCACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28,28;MFRL=191,141,207;MMQ=60,40,51;MPOS=24,33;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.34,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,3:0.266,0.521:5:1,1,2:0,0,1:1,0,4,0
chr5	149497177	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=60,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:4,2,5,1
chr5	149513072	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr5	149546426	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr5	149574512	.	G	GACAGGCTGCCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=149,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.244:10:3,1:5,1:0|1:149574512_G_GACAGGCTGCCA:149574512:0,8,1,1
chr5	149574516	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=149,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:4,1:0|1:149574512_G_GACAGGCTGCCA:149574512:0,8,1,1
chr5	149576233	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr5	149576273	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr5	149576528	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=197,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:1,1:4,0:0|1:149576528_C_T:149576528:1,4,0,2
chr5	149576538	.	A	AAAGAAGGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=197,258;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:149576528_C_T:149576528:1,2,0,1
chr5	149576553	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=143,253;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:149576553_CG_C:149576553:2,1,0,1
chr5	149576555	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=143,253;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:149576553_CG_C:149576553:2,1,0,1
chr5	149576559	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=143,253;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:149576553_CG_C:149576553:2,1,0,1
chr5	149578999	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr5	149580819	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr5	149582103	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,6:0,0,5,9
chr5	149584341	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr5	149584969	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	149584981	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	149602222	.	GAC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr5	149602425	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	149602824	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=68,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr5	149610967	.	AAAT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AAT;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr5	149624901	.	G	GCCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=CCT;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.710:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	149627423	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=157,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,2,2
chr5	149627472	.	C	CCACCGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=175,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	149627492	.	G	GGACCACACCGATCAAACCTTATGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	149629683	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	149631413	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=63.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,7,11
chr5	149632955	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,8:3,0:5,1,7,1
chr5	149636073	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	149636109	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr5	149676889	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=126,142;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,1:12,1:19,11,0,2
chr5	149737221	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	149759356	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=141,177;MMQ=60,46;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:1,17,0,2
chr5	149759384	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=158,160;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,1:5,3:0,13,0,4
chr5	149772207	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	149776232	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.409:42:9,9:14,8:15,10,10,7
chr5	149784565	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:0,1:1,0:0|1:149784565_AG_CC:149784565:1,0,2,0
chr5	149784570	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:1,0:0|1:149784570_A_C:149784570:1,0,2,0
chr5	149784574	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:1,0:0|1:149784565_AG_CC:149784565:1,0,2,0
chr5	149784576	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,14;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr5	149784581	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,12;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,0:0,0:0|1:149784570_A_C:149784570:2,0,2,0
chr5	149823785	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	149826572	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	149827098	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=180,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=205.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,68:0.972:69:1,35:0,29:1,0,51,17
chr5	149907742	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:13,3,2,0
chr5	149914401	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=179,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:5,1:3,5:6,2,6,1
chr5	149914631	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	149918777	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=123,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.339:12:2,1:4,0:2,6,4,0
chr5	149932683	.	AT	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=152,165;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:149932683_AT_GG:149932683:3,0,1,0
chr5	149932693	.	GTG	ACA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=174,165;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:149932683_AT_GG:149932683:4,0,1,0
chr5	149932698	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=174,165;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:149932683_AT_GG:149932683:4,0,1,0
chr5	150027538	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:10,8,1,1
chr5	150028109	.	C	CGA	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=110,128;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:24,3:18,0:0|1:150028109_C_CGA:150028109:22,20,2,1
chr5	150028111	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=110,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:24,1:18,0:0|1:150028109_C_CGA:150028109:22,20,2,1
chr5	150031682	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:11,1:3,1:5,9,1,1
chr5	150051246	.	CT	GG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=137,192;MMQ=60,58;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,0:3,8,0,2
chr5	150072693	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=202,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,5:1,4:3,1,5,4
chr5	150080118	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=188,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.234:11:3,2:3,0:0,9,1,1
chr5	150090866	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:10,5:7,12:5,12,3,14
chr5	150110397	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150110756	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:6,0:0|1:150110756_G_C:150110756:0,17,0,2
chr5	150110758	.	GT	AA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:150110756_G_C:150110756:0,17,0,2
chr5	150135952	.	GA	G,GAA	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=33,33,35;MFRL=142,172,78;MMQ=60,60,60;MPOS=12,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.39,5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:72,5,4:0.071,0.059:81:29,3,0:37,2,3:55,17,5,4
chr5	150174892	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr5	150227615	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=185,203;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,2:2,1:3,0,4,0
chr5	150227643	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:0,0:6,0,2,1
chr5	150227652	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.339:9:4,3:2,0:6,0,2,1
chr5	150227654	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:8,1,2,0
chr5	150228318	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:0,4:4,3:0,4,0,8
chr5	150277909	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:11,0,5,0
chr5	150282674	.	A	AT	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.512:47:9,9:10,12:7,16,17,7
chr5	150407456	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:2,0:3,5,0,2
chr5	150413406	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,1:1,6:0,4,0,7
chr5	150415169	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=136,85;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:20,2:12,1:19,13,3,0
chr5	150483095	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:2,6:5,4:7,1,8,2
chr5	150484787	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,33:0.493:67:16,16:17,17:17,17,18,15
chr5	150484889	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.598:35:8,10:5,11:2,12,3,18
chr5	150498981	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:4,1:4,2:0,8,0,4
chr5	150503784	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:6,5:8,2:10,4,7,1
chr5	150506104	.	A	AACACAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=AC;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	150510757	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,3:1,2:4,1,5,0
chr5	150515735	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	150516702	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:150516702_GT_G:150516702:2,0,1,0
chr5	150516713	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,14;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:150516702_GT_G:150516702:4,0,1,0
chr5	150518358	.	AG	GA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:1,3:7,5:1,7,1,9
chr5	150518392	.	G	GGAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAA;STR;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:1,4:1,3,0,6
chr5	150518435	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=260,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	150518892	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:9,7:4,1:11,3,6,2
chr5	150519063	.	C	CGTGGCATGTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=151,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr5	150519096	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr5	150519108	.	A	AGCTGTGTGACCTTAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=68,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	150519670	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,4:6,7:9,1,10,1
chr5	150565770	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr5	150567049	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr5	150578721	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150639409	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,92;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:8,9:5,6:6,7,6,9
chr5	150639439	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,8:7,4:7,7,5,7
chr5	150660769	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:6,5:5,3:0|1:150660769_A_G:150660769:2,9,3,5
chr5	150660794	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:3,3:2,2:0|1:150660769_A_G:150660769:1,5,1,4
chr5	150660830	.	T	TACTCTGTCATCTGGTATACTCTCTGTGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	150663565	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:3,8:2,2:4,1,10,0
chr5	150682975	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=113,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:2,7,0,3
chr5	150683005	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=113,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr5	150704758	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150712767	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:3,0,6,3
chr5	150723806	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=124,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:7,5:3,4:4,6,6,3
chr5	150723913	.	TGATAGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=212,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150723913_TGATAGG_T:150723913:0,1,0,1
chr5	150723920	.	CGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=212,246;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150723913_TGATAGG_T:150723913:0,1,0,1
chr5	150726759	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150838528	.	T	TTCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150886616	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr5	150887184	.	G	GAGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr5	150887200	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:0,3,0,6
chr5	150891663	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0,0,12,2
chr5	150905249	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:150905249_T_G:150905249:2,0,1,0
chr5	150905253	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:150905249_T_G:150905249:2,0,1,0
chr5	150917545	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:1,3,0,3
chr5	150921805	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr5	150934137	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:8,0:15,3:11,12,0,3
chr5	150934284	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	150942969	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,10,9
chr5	150948537	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr5	151049404	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,2,10
chr5	151052659	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr5	151169791	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=204,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr5	151169805	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:18,0,2,0
chr5	151180451	.	AT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,15;MFRL=126,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.649:13:2,1:1,1:2,3,0,8
chr5	151208651	.	AC	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151208651_AC_GT:151208651:0,2,0,1
chr5	151208655	.	G	GACTGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:151208651_AC_GT:151208651:0,2,0,1
chr5	151231233	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,0,0,1
chr5	151231239	.	CGGCT	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,35;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231246	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231249	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231250	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231254	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=13,30;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231255	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231263	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151771817	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=170.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,25:0,26:0,0,30,23
chr5	152870636	.	C	CGAAAAAGAAGCCCAGGTCCAATCATAGATTTGGTGTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	153085668	.	T	TTTTGTTTG,TTTTGTTTGTTTG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,32,25;MFRL=159,155,149;MMQ=40,42,50;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,8,9;RU=TTTG;STR;TLOD=10.37,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.482,0.319:6:1,1,0:0,2,1:0,1,0,5
chr5	153085699	.	A	ACTGTCATCTGCTGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=155,164;MMQ=42,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.240:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr5	153144216	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr5	153174310	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=134,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.224:19:3,1:6,0:0,15,0,4
chr5	153372525	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,15:0.349:44:14,7:14,8:15,14,9,6
chr5	153372743	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	153406644	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr5	153413390	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,30:0.484:62:13,17:19,13:16,16,14,16
chr5	153414545	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr5	153432450	.	A	AT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:5,10:12,8:17,0,17,1
chr5	153434018	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,7:7,1:9,6,6,2
chr5	153435294	.	CA	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153435294_CA_AC:153435294:0,0,0,1
chr5	153435299	.	AG	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153435294_CA_AC:153435294:0,0,0,1
chr5	153435304	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153435294_CA_AC:153435294:0,0,0,1
chr5	153709043	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	153760270	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr5	153765787	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=125,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr5	153783587	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:10,8:7,5:13,4,8,5
chr5	153789078	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,2:4,2:8,1,4,1
chr5	153795274	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,5:6,6:9,0,11,0
chr5	154172384	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=138,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.185:24:5,0:15,4:3,17,2,2
chr5	154190823	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,2:14,1:15,12,3,0
chr5	154190863	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=122,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:12,1:15,1:15,12,0,2
chr5	154193409	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:6,5:8,11:11,3,12,4
chr5	154193735	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr5	154203121	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.462:28:9,2:6,10:3,12,3,10
chr5	154243004	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=140,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:21,0:12,4:6,30,2,2
chr5	154243016	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:21,0:12,2:4,29,1,1
chr5	154243038	.	GCTATTCACAGA	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=161,131;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:10,4:5,0:1,17,0,4
chr5	154243039	.	CTATTCACAGAT	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=168,127;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.225:19:7,3:5,1:1,14,0,4
chr5	154243052	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=174,131;MMQ=60,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,2:5,0:1,15,0,2
chr5	154270739	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=134,137;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:16,4,2,0
chr5	154271391	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	154278888	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,2,17
chr5	154282551	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	154287115	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr5	154291219	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr5	154291496	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr5	154296795	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,4:0,8:0,0,2,11
chr5	154301082	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:154301082_A_C:154301082:0,0,0,1
chr5	154301087	.	T	TCCCAGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154301082_A_C:154301082:0,0,0,1
chr5	154301089	.	C	CTTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,7;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154301082_A_C:154301082:0,0,0,1
chr5	154308282	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	154308307	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	154311235	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	154311576	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	154311661	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:5,1:17,1:19,3,2,0
chr5	154339595	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,113;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:14,4:10,0:15,9,4,0
chr5	154346325	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.453:31:9,5:8,9:5,12,6,8
chr5	154393753	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:17,2:16,0:13,20,2,0
chr5	154395057	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:6,8:7,7:5,8,5,10
chr5	155771421	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.515:9:1,1:3,3:4,0,5,0
chr5	156074654	.	TAAATTGA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=116,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr5	156074656	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.771:2:0,1:0,1:0|1:156074656_A_AG:156074656:0,0,0,2
chr5	156074657	.	A	AGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.771:2:0,1:0,1:0|1:156074656_A_AG:156074656:0,0,0,2
chr5	156074660	.	GAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.771:2:0,1:0,1:0|1:156074656_A_AG:156074656:0,0,0,2
chr5	156381370	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	156390297	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr5	156390317	.	T	TTCTCTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:156390317_T_TTCTCTA:156390317:1,2,0,1
chr5	156390318	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:156390317_T_TTCTCTA:156390317:1,2,0,1
chr5	156456900	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=172,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr5	156464212	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	156464242	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=129,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,2:1,5:7,1,5,2
chr5	156479323	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,4:3,7:8,1,11,0
chr5	156479424	.	A	C	.	.	DP=77;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=330.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.987:77:0,23:0,49:0,0,54,23
chr5	156479426	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,47:0.607:77:12,13:16,31:21,9,33,14
chr5	156479443	.	CTTG	C	.	.	DP=85;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTG;STR;TLOD=134.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,37:0.437:85:18,19:25,18:32,16,27,10
chr5	156479509	.	A	G	.	.	DP=125;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=283.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,110:0.991:110:0,34:0,64:0,0,54,56
chr5	156479557	.	GTTGGAACAGTCGTCA	G,ATTGGAACAGTCGTCA	.	.	DP=163;ECNT=6;MBQ=29,31,25;MFRL=119,149,108;MMQ=60,60,60;MPOS=20,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=155.60,4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:47,46,4:0.419,0.041:97:18,18,0:25,27,4:20,27,20,30
chr5	156479568	.	C	CGTT	.	.	DP=138;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=222.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.990:84:0,30:0,46:0,0,34,50
chr5	156531865	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	156644775	.	T	TC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=79.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,8:0,0,23,0
chr5	156679576	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,14:0,3:0,0,10,7
chr5	156721863	.	T	TC	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=120.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,19:0,20:0,0,16,25
chr5	156742172	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156742172_T_A:156742172:0,2,0,1
chr5	156742175	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156742172_T_A:156742172:0,2,0,1
chr5	156742177	.	A	AGCTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156742172_T_A:156742172:0,2,0,1
chr5	156742179	.	G	GGAGGGGACTAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156742172_T_A:156742172:0,2,0,1
chr5	156747584	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr5	156747614	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr5	156747632	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr5	156747669	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,14,6
chr5	156765981	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	156766037	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr5	156766273	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr5	156817468	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=71,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.481:4:1,0:0,1:0|1:156817468_C_CG:156817468:0,2,2,0
chr5	156817469	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=71,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.481:4:1,0:0,0:0|1:156817468_C_CG:156817468:0,2,2,0
chr5	156817473	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=71,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:1,0:1,0:0|1:156817468_C_CG:156817468:0,2,2,0
chr5	156817477	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,10;MFRL=71,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,1,0
chr5	156887185	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,24:0.567:42:8,13:10,10:11,7,8,16
chr5	156898899	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	156899651	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,1:10,1:4,11,1,1
chr5	156899869	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	156916022	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,232;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:6,1:14,1:19,1,2,0
chr5	156916037	.	C	CAAAAAGAA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAAGAA;STR;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.447:29:6,5:8,4:11,5,12,1
chr5	156917340	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,5:6,4:9,3,7,3
chr5	156918850	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=75,147;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.406:17:6,3:4,2:6,4,3,4
chr5	156936549	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr5	156940458	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=104,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,27:0.684:39:6,18:6,9:5,7,15,12
chr5	156957741	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr5	156991508	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr5	157053271	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	157065829	.	C	CTCTGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=266,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	157075943	.	TAC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.857:8:1,1:0,6:0,1,0,7
chr5	157102063	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=108,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:8,3:3,3:6,5,4,2
chr5	157106785	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,19,1
chr5	157106968	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,21:0.316:67:16,9:30,11:15,31,8,13
chr5	157164889	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr5	157166430	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:6,17,0,2
chr5	157178592	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr5	157180930	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr5	157180959	.	AAAT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAT;STR;TLOD=56.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,11:0,3:0,0,12,2
chr5	157214823	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:10,1:15,1:13,14,0,2
chr5	157241367	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,1,2
chr5	158140222	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr5	158526525	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,9;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.173:42:11,1:12,1:17,16,0,9
chr5	158526534	.	T	TA,TAA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=11,10,20;MFRL=138,145,63;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=14.02,4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,10,5:0.415,0.197:25:2,0,1:2,2,2:0,10,2,13
chr5	158588633	.	GAAAAA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=14,33;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=A;STR;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.724:23:0,8:1,7:0,6,1,16
chr5	158589898	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,25:0.500:50:7,10:18,15:24,1,18,7
chr5	158608880	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,5:8,6:11,0,11,0
chr5	158630629	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:3,1:4,1:0,8,0,2
chr5	158697481	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,26:0.659:39:8,12:5,14:2,11,10,16
chr5	158697716	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,0:3,1:0,6,0,2
chr5	158710419	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.536:54:8,11:16,18:0,25,0,29
chr5	158753845	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:1,12,0,2
chr5	159398792	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:159398792_T_G:159398792:2,0,1,0
chr5	159398797	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:159398792_T_G:159398792:1,0,1,0
chr5	159437466	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:7,0,11,0
chr5	159640652	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr5	159665523	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,17,0
chr5	159665527	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,17,0
chr5	159665534	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,20,0
chr5	159665726	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=104.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.963:24:0,11:0,12:0|1:159665726_C_T:159665726:0,0,2,22
chr5	159665733	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=97.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0|1:159665726_C_T:159665726:0,0,2,20
chr5	159738878	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,1:15,1:8,20,0,2
chr5	159831664	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr5	159835173	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr5	159840688	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr5	159841492	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,4:6,0:1,9,1,3
chr5	159842251	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,1:16,1:8,23,1,1
chr5	159851211	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,6:0,13:0,0,16,3
chr5	160026025	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr5	160043071	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	160044855	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr5	160047265	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr5	160047346	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,142;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,0:11,2:17,6,2,0
chr5	160049355	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr5	160097429	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr5	160097453	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,12,0
chr5	160097632	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr5	160114730	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:3,2:14,0:17,0,2,0
chr5	160761786	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:8,0:12,7,1,1
chr5	160763822	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=105,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.534:9:3,3:1,1:1,3,1,4
chr5	160763836	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=130,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr5	160763850	.	A	AGCATATTTGAATAAATTGAGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=172,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	161302728	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr5	161318132	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=132,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr5	161318152	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr5	161322889	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:5,3:5,4:1,9,0,7
chr5	161322953	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=192,298;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:161322953_G_C:161322953:0,2,0,1
chr5	161322955	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=192,298;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:161322953_G_C:161322953:0,2,0,1
chr5	161322956	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=192,298;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:161322953_G_C:161322953:0,2,0,1
chr5	161322959	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=192,298;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:161322953_G_C:161322953:0,2,0,1
chr5	161495162	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	162866548	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr5	162891894	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:0,4,0,6
chr5	162896856	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:4,3,1,6
chr5	162896918	.	GT	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	162902707	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:6,7:5,4:1,11,1,10
chr5	162909687	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=105.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,38:0.448:85:17,23:30,15:30,17,30,8
chr5	162909716	.	C	T	.	.	DP=124;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,52:0.467:111:21,30:38,20:30,29,30,22
chr5	162909955	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr5	162910199	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:7,4:9,8:4,12,3,9
chr5	162910438	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.486:41:14,9:7,10:1,20,2,18
chr5	162910462	.	T	TTGATATA	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,1:15,1:0|1:162910462_T_TTGATATA:162910462:0,32,0,2
chr5	162910463	.	GCAA	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,0:15,1:0|1:162910462_T_TTGATATA:162910462:0,32,0,2
chr5	162939177	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=131,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:16,1:17,1:16,17,1,1
chr5	162940739	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,7,20
chr5	162944709	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,3:6,6:2,12,1,8
chr5	162945387	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34,34;MFRL=121,195,125;MMQ=60,60,60;MPOS=16,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.53,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.177,0.244:13:3,1,0:5,1,3:1,7,0,5
chr5	167420255	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	167489049	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.344:7:4,1:1,1:0|1:167489049_C_CTT:167489049:5,0,2,0
chr5	167489062	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,10;MFRL=141,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.308:8:1,0:2,0:0|1:167489049_C_CTT:167489049:5,1,2,0
chr5	167553672	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:9,0,10,0
chr5	167622107	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	167625771	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	167631460	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:6,3,0,2
chr5	167638834	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:7,0:0|1:167638834_TG_T:167638834:3,12,0,2
chr5	167638836	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:7,0:0|1:167638834_TG_T:167638834:3,12,0,2
chr5	167638839	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:0|1:167638834_TG_T:167638834:3,13,0,2
chr5	167638842	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:7,0:0|1:167638834_TG_T:167638834:3,13,0,2
chr5	167645315	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:9,6,0,2
chr5	167653364	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,3:0,3:0,6,0,6
chr5	167798585	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,4:2,6:0,4,2,8
chr5	167812452	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=222,270;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:167812452_A_C:167812452:0,2,0,1
chr5	167812454	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=222,270;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:167812452_A_C:167812452:0,2,0,1
chr5	167824840	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=229,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,5:2,2:1,2,2,5
chr5	167833397	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,2:1,5:0,5,0,7
chr5	167837016	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=185,51;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:2,1:2,0:0|1:167837016_CT_C:167837016:2,2,0,2
chr5	167837018	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=185,51;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,0:2,1:0|1:167837016_CT_C:167837016:2,2,0,2
chr5	167848958	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:18,0:23,3:36,5,3,0
chr5	167851168	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr5	167857225	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,4:2,6,3,4
chr5	167858462	.	TCTGGCTGG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=CTGG;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	167868809	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0,0,10,17
chr5	167868844	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=157,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,0:9,2:4,15,0,3
chr5	167868930	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	167891774	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:17,0:8,2:9,16,0,2
chr5	167891862	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:8,8,1,1
chr5	167913603	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	167919623	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	167921047	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=56.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,0,16
chr5	167924189	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=206,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,5:2,4:4,0,8,1
chr5	167984721	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr5	168111122	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:4,6:1,7,0,8
chr5	168175205	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,36;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr5	168187760	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=245,227;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	168188048	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	168189501	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.481:31:6,8:9,5:13,3,11,4
chr5	168189526	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:17,2:18,2:20,15,2,2
chr5	168216489	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,4:0,2:3,0,6,0
chr5	168233413	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.342:15:4,3:6,1:7,3,4,1
chr5	168244256	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:1,1:6,2:5,2,3,1
chr5	168244471	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,2:14,0:0|1:168244471_G_GT:168244471:5,16,0,2
chr5	168244473	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,2:14,0:0|1:168244471_G_GT:168244471:5,16,0,2
chr5	168244506	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:0,5,2,7
chr5	168244543	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,1,4
chr5	168250429	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	168690612	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:13,6:6,10:3,16,2,14
chr5	169031218	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,14:0,0,4,19
chr5	169097505	.	T	TTTTTA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTA;STR;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:2,2:1,0:3,0,4,0
chr5	169126349	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:4,3,3,1
chr5	169129284	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,6:2,4:5,0,10,0
chr5	169129495	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:4,5:1,6:0,6,0,11
chr5	169445897	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,103;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr5	169454831	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:0,2:6,2:0|1:169454831_G_A:169454831:5,1,4,0
chr5	169454833	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:0,2:5,2:0|1:169454831_G_A:169454831:5,1,4,0
chr5	169461399	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:0,1:6,1:4,2,1,2
chr5	169461547	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:5,5:6,7:5,6,6,7
chr5	169468243	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=100,232;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	169472765	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:7,0,7,0
chr5	169496051	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:3,1,3,0
chr5	169503133	.	T	TTAGGGTTAGGGTTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:0,0:1,2,0,1
chr5	169508763	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169508763_CAG_C:169508763:0,0,1,0
chr5	169508769	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169508763_CAG_C:169508763:0,0,1,0
chr5	169508774	.	C	CCCCGGG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:0,0,1,0
chr5	169508775	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,18;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:0,0,1,0
chr5	169508776	.	GTCTA	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:0,0,1,0
chr5	169508783	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,12;MFRL=180,289;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:1,0,1,0
chr5	169508788	.	CAAGGCACTG	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=130,289;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:2,1,1,0
chr5	169508802	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=130,289;MMQ=60,60;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:2,1,1,0
chr5	169533591	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169533591_C_T:169533591:0,3,0,1
chr5	169533592	.	C	CTCTTTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169533591_C_T:169533591:0,3,0,1
chr5	169533614	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=153,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	169675693	.	AT	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=83.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,28:0.433:65:13,14:22,13:20,17,17,11
chr5	169679354	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr5	169680139	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,27:0.491:55:11,12:15,15:20,8,17,10
chr5	169685163	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,8:6,7:3,8,6,9
chr5	169689604	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr5	169695423	.	GCGGCCATCGGTC	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=17,34;MFRL=90,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:2,0,1,0
chr5	169695438	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169695438_T_A:169695438:1,0,1,0
chr5	169695440	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169695438_T_A:169695438:1,0,1,0
chr5	169695441	.	GGGGGC	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:169695438_T_A:169695438:3,0,1,0
chr5	169695446	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	169695447	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:169695438_T_A:169695438:3,0,1,0
chr5	169697707	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.455:29:7,7:8,6:12,4,9,4
chr5	169698002	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:8,1:5,1:0|1:169698002_C_CT:169698002:0,13,0,2
chr5	169698003	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:7,1:5,1:0|1:169698002_C_CT:169698002:0,13,0,2
chr5	170149674	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,9:0,0,15,3
chr5	170159997	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr5	170160749	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	170162666	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr5	170215790	.	TTC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170215790_TTC_T:170215790:0,0,0,1
chr5	170215795	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170215790_TTC_T:170215790:0,0,0,1
chr5	170221185	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,3,1
chr5	170221379	.	CAAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=113,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr5	170336614	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:1,2:3,2:6,0,4,0
chr5	170338163	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:4,7:6,8:2,8,2,13
chr5	170341326	.	TTA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TA;STR;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,1:1,4:0,4,0,5
chr5	170380523	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=232,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr5	170610273	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,33:0.502:66:14,17:17,15:16,17,13,20
chr5	170640827	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr5	170736824	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr5	170815082	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=101,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,0:1,0,0,3
chr5	170837513	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=145,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.471:6:1,3:2,0:2,1,2,1
chr5	170847555	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	171480055	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr5	171488367	.	G	GTACATC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171488367_G_GTACATC:171488367:0,0,0,1
chr5	171488369	.	A	ACTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171488367_G_GTACATC:171488367:0,0,0,1
chr5	171488373	.	AA	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171488367_G_GTACATC:171488367:0,0,0,1
chr5	171491650	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,2:1,0,7,0
chr5	171491682	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,4:4,3:9,1,5,2
chr5	171491697	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:6,3:5,6:10,1,6,4
chr5	171510180	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	171520394	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,1:6,4:6,1,4,1
chr5	171532799	.	C	CTCGTGTTTCCTTCCAGCCTCTCCCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=162,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,1,1
chr5	171534682	.	T	TGCCCACAGGCTGACCGGGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.497:12:3,1:3,1:5,1,6,0
chr5	171554473	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	171554516	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr5	171583809	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,1,1
chr5	171710717	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr5	171785892	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,4:8,6:2,10,2,8
chr5	171809074	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=111,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.077:62:29,4:26,0:38,20,3,1
chr5	172096768	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.527:36:5,15:11,3:8,9,14,5
chr5	172097353	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	172113074	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=161,249;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	172197522	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=348,0;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	172336616	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,5,1
chr5	172336838	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr5	172336858	.	G	GACCAAGACCATGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	172347440	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,7:8,5:8,7,3,9
chr5	172395408	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,5:4,7:5,1,10,2
chr5	172395552	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=130,101;MMQ=52,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:6,9,1,1
chr5	172396394	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=285.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,85:0.989:85:0,36:0,48:0,0,67,18
chr5	172421760	.	ATT	A,AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=168,194,136;MMQ=60,60,60;MPOS=15,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=6.29,14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,9:0.212,0.461:19:3,2,2:1,1,6:3,3,3,10
chr5	172535553	.	AGG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr5	172560793	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:2,1:9,2:2,9,1,2
chr5	172573767	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	172578549	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:1,3:2,1:3,1,4,0
chr5	172585927	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr5	172745283	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	173316729	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=247.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,73:0.987:73:0,40:0,32:0,0,49,24
chr5	173380346	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr5	173383194	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=228,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:1,2:0,3,1,2
chr5	174152100	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,0:0,1,0,5
chr5	174152106	.	G	GCGGTGGCTCACGCCTGTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:174152106_G_GCGGTGGCTCACGCCTGTAA:174152106:0,4,0,1
chr5	174152108	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:174152106_G_GCGGTGGCTCACGCCTGTAA:174152106:0,4,0,1
chr5	174156168	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=103,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:3,4:9,5:8,5,4,5
chr5	174156530	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,224;MMQ=56,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr5	174868700	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	174870633	.	A	AAAATCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:174870633_A_AAAATCT:174870633:0,0,0,1
chr5	174870635	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:174870633_A_AAAATCT:174870633:0,0,0,1
chr5	174870639	.	CA	TT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:174870633_A_AAAATCT:174870633:0,0,0,1
chr5	174936038	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,5:3,2:6,2,3,4
chr5	174943551	.	GA	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=48.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.483:44:9,9:14,12:20,3,18,3
chr5	175387139	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	175394887	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	175517236	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,147;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.142:29:12,1:13,3:25,0,4,0
chr5	175520358	.	C	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,166;MMQ=36,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,7:0.095:81:37,2:37,5:6,68,0,7
chr5	175530166	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,160;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.404:45:12,9:15,9:25,2,17,1
chr5	175721962	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=202,180;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:1,1:8,8:9,0,9,0
chr5	175774865	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,6:1,5:2,1,5,6
chr5	175786437	.	CATT	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=128.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,36:0.529:68:20,17:9,19:11,21,20,16
chr5	175843461	.	CG	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=86.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,12:0,0,0,27
chr5	175916083	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,7:5,3:0,9,0,10
chr5	175933691	.	TGTGTGTGC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTGTGTGC;STR;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:1,1:4,0,4,1
chr5	175956177	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,6,8
chr5	175956271	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=146.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,28:0,14:0,0,33,12
chr5	175992258	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=38,29;MFRL=132,132;MMQ=25,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,3:0,6:2,0,7,2
chr5	175992266	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,10,3
chr5	175998129	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	176002144	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,6,9
chr5	176002873	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	176002926	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr5	176004312	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	176004846	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr5	176004866	.	A	AGT,T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32,32;MFRL=210,149,169;MMQ=60,60,57;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.06,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,1:0.447,0.222:6:2,3,0:0,0,1:1,1,0,4
chr5	176005175	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0|1:176005175_A_C:176005175:0,0,0,9
chr5	176005184	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0|1:176005175_A_C:176005175:0,0,0,7
chr5	176005559	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr5	176012067	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	176026121	.	TCAAAGACCCAGGA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.931:12:0,6:0,6:0|1:176026121_TCAAAGACCCAGGA_T:176026121:0,0,2,10
chr5	176026135	.	TCCTCCTTCCTC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.931:12:0,6:0,6:0|1:176026121_TCAAAGACCCAGGA_T:176026121:0,0,2,10
chr5	176053645	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr5	176056529	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,7:0,0,13,9
chr5	176069831	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr5	176069859	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,3:1,0,0,6
chr5	176069866	.	C	CCCG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr5	176071462	.	C	CCCG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,1:5,1:0|1:176071462_C_CCCG:176071462:1,6,0,2
chr5	176071466	.	C	CTTAAGGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,1:5,1:0|1:176071462_C_CCCG:176071462:1,6,0,2
chr5	176074643	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:2,2,6,1
chr5	176078982	.	GGGT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	176081856	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	176082998	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.411:20:4,4:7,4:9,3,4,4
chr5	176083175	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=132.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,13:0,23:0,0,14,24
chr5	176083997	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr5	176295978	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr5	176304710	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,0:0,4:1,3,0,4
chr5	176305466	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=204,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:6,1:3,4:8,1,4,2
chr5	176305678	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:1,8,0,2
chr5	176306676	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.493:8:2,1:2,2:2,2,4,0
chr5	176308870	.	C	CAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:6,1:4,3:4,6,1,3
chr5	176308956	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr5	176310790	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:2,5,2,1
chr5	176317743	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:6,7:3,6:7,2,6,7
chr5	176332553	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=189,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	176333126	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	176338496	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=231,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	176370402	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:12,15:10,5:12,10,9,11
chr5	176378433	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:7,6:12,4:13,6,9,1
chr5	176396334	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,4:0,2,0,5
chr5	176471591	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr5	176491483	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,2:7,1,7,0
chr5	176516796	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	176517885	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0|1:176517885_G_A:176517885:4,1,3,1
chr5	176517893	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,2:2,1:0|1:176517885_G_A:176517885:4,1,3,1
chr5	176519287	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr5	176520277	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.406:18:4,0:5,0:0|1:176520277_A_C:176520277:2,9,7,0
chr5	176520283	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.403:18:4,3:4,3:0|1:176520277_A_C:176520277:2,9,7,0
chr5	176520287	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,1:5,2:0|1:176520277_A_C:176520277:1,11,6,0
chr5	176520291	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:7,1:5,2:0|1:176520277_A_C:176520277:1,12,5,0
chr5	176520294	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:6,0:6,1:0|1:176520277_A_C:176520277:1,12,5,0
chr5	176522728	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=120,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,4:5,5:5,5,4,5
chr5	176523562	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	176523597	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr5	176523777	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=95,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:176523777_A_T:176523777:0,2,0,1
chr5	176523785	.	TCC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=95,255;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:176523777_A_T:176523777:0,2,0,1
chr5	176523789	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=95,255;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:176523777_A_T:176523777:0,2,0,1
chr5	176639270	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176639270_G_T:176639270:1,0,0,1
chr5	176639277	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176639270_G_T:176639270:1,0,0,1
chr5	176639280	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176639270_G_T:176639270:1,0,0,1
chr5	176675205	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:9,0:4,3:10,3,2,1
chr5	176707544	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:9,2:7,7:9,7,6,3
chr5	176720766	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr5	176729736	.	ACC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=C;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.484:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	176733341	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:6,5:2,4:8,0,9,0
chr5	176733616	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr5	176738936	.	CCGCCCCGCCCCCGGGA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=171,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.527:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	176764730	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,42;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,3:12,0:18,8,3,0
chr5	176765395	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	176798070	.	CGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGCCG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,4;RU=GGGCCG;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.422:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr5	176813404	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,2,3
chr5	176824137	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=216,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr5	176830627	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr5	176831119	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	176831177	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr5	176831980	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	176836644	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,36;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176836644_C_CAA:176836644:0,1,0,1
chr5	176836646	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176836644_C_CAA:176836644:0,1,0,1
chr5	176836649	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176836644_C_CAA:176836644:0,1,0,1
chr5	176857769	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,7:0,17:0,0,25,0
chr5	176858049	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,5:5,5:0,11,0,10
chr5	176868780	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.232:14:5,0:4,1:0|1:176868780_A_C:176868780:1,10,3,0
chr5	176868784	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.233:14:5,0:5,1:0|1:176868780_A_C:176868780:1,10,3,0
chr5	176868787	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.193:17:5,0:5,0:0|1:176868780_A_C:176868780:3,11,3,0
chr5	176885111	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:2,2:5,1:3,4,1,3
chr5	176886539	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,3:6,2:6,0,5,0
chr5	176894681	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,13;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:2,1:1,0:3,3,4,0
chr5	176895817	.	GC	AA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,10:0,0,15,7
chr5	176917764	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=221,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.648:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr5	176929974	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,4:4,0:6,0,4,0
chr5	176930135	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,11:0,0,8,7
chr5	176930171	.	AGAG	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,3:5,8:3,6,4,7
chr5	176931594	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=217,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr5	176931706	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr5	176935215	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	176939051	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	176939688	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr5	176939735	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr5	176940274	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	176940871	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,5,15
chr5	176943680	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,11;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.698:4:0,0:0,0:1,0,3,0
chr5	176950879	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,2:0,0,15,0
chr5	176963349	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr5	177019540	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.500:31:9,6:6,5:10,5,12,4
chr5	177019688	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=107.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,26:0,21:0,0,13,37
chr5	177020677	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.089:32:14,0:14,2:16,14,2,0
chr5	177031602	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	177036043	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	177158602	.	T	TCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=77,79;MMQ=33,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1,3,0,1
chr5	177158612	.	G	A,GTCAACAAAAATAAGC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,28,33;MFRL=69,79,84;MMQ=39,21,27;MPOS=5,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.22,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.248,0.248:5:0,0,0:2,1,1:2,1,0,2
chr5	177158617	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=69,84;MMQ=39,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0|1:177158617_C_T:177158617:2,1,0,1
chr5	177158619	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=69,84;MMQ=39,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0|1:177158617_C_T:177158617:2,1,0,1
chr5	177161998	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,287;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	177164143	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	177166053	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=128.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,24:0,17:0,0,32,9
chr5	177171823	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,101;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.799:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	177422823	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:3,1,7,0
chr5	177465999	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=152,150;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	177466284	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,199;MMQ=39,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,1:6,3:16,0,4,0
chr5	177466530	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=187,182;MMQ=24,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:14,3:8,15:1,21,0,19
chr5	177570759	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr5	177574901	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.389:29:10,7:7,3:13,5,8,3
chr5	177580593	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:30,2:22,1:26,26,2,1
chr5	177580874	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:0,8,1,4
chr5	177639921	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=219,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr5	177642177	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	177642214	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:12,0,2,0
chr5	177656900	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr5	177658625	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,1:0,0:1,0,1,1
chr5	177658883	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr5	177658896	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,0,3
chr5	177665554	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:3,2:4,1,3,0
chr5	177666091	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:3,1:0,0:0|1:177666091_A_C:177666091:0,3,3,0
chr5	177666100	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:4,0:5,0:0|1:177666091_A_C:177666091:3,6,2,0
chr5	177666112	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,5:3,4:2,3,5,5
chr5	177669475	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,26;MFRL=218,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:177669475_T_TG:177669475:0,1,0,1
chr5	177669476	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=218,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:177669475_T_TG:177669475:0,1,0,1
chr5	177673153	.	AGTGCAGGGACCCAGTGAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=222,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,0:1,3:6,0,3,0
chr5	177674431	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr5	177675217	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.592:30:6,9:5,8:8,4,9,9
chr5	177675315	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,134;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,0:5,3:0,10,0,3
chr5	177679506	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,130;MMQ=60,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:5,3,3,0
chr5	177679654	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:1,3,4,4
chr5	177679680	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr5	177684022	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=222,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	177684682	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=115,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	177686815	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=74,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr5	177697417	.	C	CATAGAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:3,2:1,0:0|1:177697417_C_CATAGAG:177697417:2,2,1,1
chr5	177697418	.	C	CTATTTCGAGCATTAAATGAATTTAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:3,2:1,0:0|1:177697417_C_CATAGAG:177697417:2,2,1,1
chr5	177715291	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=181.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,26:0,31:0,0,35,22
chr5	177715302	.	CA	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=137.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,24:0,31:0,0,30,28
chr5	177715477	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=122.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,10:0,25:0,0,19,21
chr5	177717431	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:11,5:13,2:8,18,3,4
chr5	177987770	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.137:32:7,1:11,4:0|1:177987770_G_A:177987770:10,17,3,2
chr5	177987778	.	ACG	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.108:28:10,0:12,2:0|1:177987770_G_A:177987770:7,18,2,1
chr5	178030941	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,10;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:1,0:0,0:1,3,0,2
chr5	178040919	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr5	178140090	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:4,8:9,1:5,8,2,7
chr5	178140598	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:178140598_G_A:178140598:0,4,0,1
chr5	178140604	.	T	TTCATCAGTTTAACTATTAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:178140598_G_A:178140598:0,3,0,1
chr5	178154174	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=167,137;MMQ=60,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,1:1,8,0,3
chr5	178293175	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=169,0;MMQ=60,37;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,2:10,2:18,0,4,0
chr5	178293406	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,126;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.447:34:8,6:10,9:1,18,3,12
chr5	178293873	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,2,1
chr5	178293937	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:4,7:6,4:0|1:178293937_G_A:178293937:10,1,11,0
chr5	178293943	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,12:0.464:26:7,7:7,5:0|1:178293937_G_A:178293937:12,2,11,1
chr5	178369673	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	178408906	.	C	CTCAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:178408906_C_CTCAG:178408906:0,3,0,1
chr5	178408908	.	C	CTCTCAAGTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:178408906_C_CTCAG:178408906:0,3,0,1
chr5	178409856	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=99,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr5	178410265	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	178413681	.	C	CAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	178413816	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=115,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,4,0
chr5	178414050	.	C	CAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:178414050_C_CAAA:178414050:0,1,0,1
chr5	178414051	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:178414050_C_CAAA:178414050:0,1,0,1
chr5	178414055	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:178414050_C_CAAA:178414050:0,1,0,1
chr5	178419104	.	G	GGCCAGGGAGGTTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:3,2:4,0:0|1:178419104_G_GGCCAGGGAGGTTT:178419104:2,5,1,1
chr5	178419106	.	T	TGCAGAGCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:178419104_G_GGCCAGGGAGGTTT:178419104:2,5,1,1
chr5	178455198	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr5	178504199	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.539:24:8,7:3,6:0|1:178504199_G_A:178504199:3,8,2,11
chr5	178504201	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.539:24:7,7:3,3:0|1:178504199_G_A:178504199:3,8,2,11
chr5	178564971	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	178581977	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:1,4,0,5
chr5	178608265	.	CCAGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	178634469	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=16,32;MFRL=208,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.410:3:0,1:0,0:0|1:178634469_T_G:178634469:2,0,1,0
chr5	178634472	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=16,17;MFRL=208,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.415:3:0,0:0,0:0|1:178634469_T_G:178634469:2,0,1,0
chr5	178770759	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=213,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr5	178986978	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:0,3:4,0,4,0
chr5	178986987	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr5	178996435	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=121,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:8,7:1,7:1,8,1,13
chr5	179012968	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	179016518	.	TAAG	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.515:33:10,10:5,7:11,5,15,2
chr5	179016664	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.490:45:7,11:16,11:7,16,6,16
chr5	179021982	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	179036357	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:2,3,2,0
chr5	179043041	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:179043041_C_G:179043041:10,1,2,0
chr5	179043075	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=74.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.962:23:0,10:0,12:0|1:179043041_C_G:179043041:0,0,18,5
chr5	179045142	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,33:0.459:72:24,22:15,11:19,20,12,21
chr5	179048449	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,5:7,5:1,11,1,9
chr5	179050188	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:8,6:9,9:0,17,0,15
chr5	179069309	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,16,4
chr5	179069369	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=149,140;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:15,3:11,0:14,12,3,0
chr5	179070528	.	GGAACTGGGACTTAC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=139,172;MMQ=56,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:179070528_GGAACTGGGACTTAC_G:179070528:0,4,0,1
chr5	179070546	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=124,172;MMQ=52,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:179070528_GGAACTGGGACTTAC_G:179070528:0,3,0,1
chr5	179070548	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=124,172;MMQ=52,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:179070528_GGAACTGGGACTTAC_G:179070528:0,3,0,1
chr5	179071724	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=210,205;MMQ=52,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr5	179071947	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=110,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,14:0.231:63:26,6:22,8:18,31,5,9
chr5	179071958	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,101;MMQ=60,27;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,7:0.131:58:23,3:27,4:18,33,4,3
chr5	179072006	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=120,145;MMQ=54,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:18,1:7,4:10,16,0,5
chr5	179072040	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=125,125;MMQ=52,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:11,1:5,2:4,14,0,3
chr5	179072100	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=226,197;MMQ=45,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.281:5:1,1:1,0:0|1:179072100_T_TA:179072100:0,4,0,1
chr5	179072103	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=226,197;MMQ=45,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:179072100_T_TA:179072100:0,4,0,1
chr5	179136138	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=104,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,4:1,9:0,1,0,13
chr5	179143173	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,1:10,1:14,8,2,0
chr5	179147641	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr5	179150788	.	G	GT	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.191:42:9,4:14,3:4,30,2,6
chr5	179200803	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	179233663	.	A	AGGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GGC;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	179260009	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:4,2,6,3
chr5	179260494	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	179264886	.	C	CAGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179264886_C_CAGG:179264886:0,1,0,1
chr5	179264888	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179264886_C_CAGG:179264886:0,1,0,1
chr5	179264890	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179264886_C_CAGG:179264886:0,1,0,1
chr5	179267783	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr5	179269075	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=141,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr5	179290575	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:13,1:10,1:15,9,1,1
chr5	179305249	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.471:6:2,1:1,0:3,0,2,1
chr5	179334857	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	179405144	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=183,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,2:5,0:6,1,2,0
chr5	179407229	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=64.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr5	179554522	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=202,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr5	179555407	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr5	179563368	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.468:39:10,8:9,10:18,3,17,1
chr5	179563532	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:7,13:7,7:0,14,0,20
chr5	179565000	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:179565000_G_A:179565000:2,2,0,1
chr5	179565002	.	G	GTGTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:179565000_G_A:179565000:2,2,0,1
chr5	179565071	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr5	179663606	.	T	TTACAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=154,270;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0,4,0,1
chr5	179663614	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	179663631	.	C	CTTCTGGTTATTGTCATGGTGATTGTCTACTGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	179728707	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr5	179731695	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=201,239;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	179763054	.	C	CTGTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr5	179763398	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	179765467	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr5	179765510	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:13,4,0,2
chr5	179780292	.	CCTCCGTGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTCCGTGGG;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.789:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	179780340	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	179980302	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,0:0,4:0,0,5,0
chr5	179980527	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,0,17
chr5	179991841	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	179994815	.	CTG	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,1:12,1:24,4,2,0
chr5	179996111	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr5	179998366	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.117:41:11,4:23,0:21,16,4,0
chr5	179998454	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,6:0,11:0,0,1,16
chr5	180037100	.	TG	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:180037100_TG_AA:180037100:0,3,0,1
chr5	180037107	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=199,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:180037100_TG_AA:180037100:0,4,0,1
chr5	180041001	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,2,0
chr5	180041008	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,3,0
chr5	180041208	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,1:0,7:0,0,3,6
chr5	180043864	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:8,0,1,1
chr5	180045700	.	G	GGGTTACCCTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,0:0,0,5,0
chr5	180046209	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	180046426	.	C	CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr5	180047629	.	TGAG	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=116,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAG;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,0:10,1:12,7,1,1
chr5	180047863	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr5	180048316	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr5	180049923	.	GCAC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAC;STR;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr5	180053307	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	180055862	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,3,0
chr5	180055864	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,3,0
chr5	180056044	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr5	180056620	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	180057214	.	T	TGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,10;RU=G;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr5	180057300	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=84,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr5	180057504	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr5	180278159	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:18,2:6,0:20,5,2,0
chr5	180329458	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.474:21:6,8:4,1:7,4,5,5
chr5	180329536	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=195,171;MMQ=56,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr5	180338300	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.470:19:5,4:5,4:7,3,6,3
chr5	180374484	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.424:26:7,5:8,5:11,4,9,2
chr5	180377102	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=112,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:12,1:21,2:13,20,1,2
chr5	180377594	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	180430797	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,146;MMQ=40,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:3,2,6,2
chr5	180432540	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:14,2:17,0:15,17,1,1
chr5	180482303	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=131,261;MMQ=48,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr5	180482390	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=51.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.555:34:8,14:7,5:12,3,13,6
chr5	180482541	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=192,146;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr5	180486224	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	180582980	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=134,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	180622615	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.538:30:5,6:7,10:9,5,12,4
chr5	180625254	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:1,5:5,1:1,5,3,3
chr5	180627250	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=267,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	180650945	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,273;MMQ=60,32;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr5	180650951	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=139,273;MMQ=60,32;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:180650951_G_C:180650951:1,0,1,0
chr5	180650956	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,14;MFRL=139,273;MMQ=60,32;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:180650951_G_C:180650951:1,0,1,0
chr5	180650958	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=139,273;MMQ=60,32;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:180650958_G_C:180650958:1,0,1,0
chr5	180650966	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=22,13;MFRL=133,273;MMQ=60,32;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:180650958_G_C:180650958:2,0,1,0
chr5	180650968	.	C	CCCCCCACAAAAAAGGATG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=133,273;MMQ=60,32;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:180650951_G_C:180650951:2,0,1,0
chr5	180660515	.	C	CCA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:8,0:7,5:0,15,0,5
chr5	180663941	.	GT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:24,0:14,3:36,4,3,0
chr5	180666276	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=224,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:1,2,0,4
chr5	180669136	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=206,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:1,2:3,2:4,0,2,2
chr5	180669370	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,4:7,4:1,9,3,5
chr5	180686958	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:9,10:6,8:13,2,15,3
chr5	180687428	.	CTCT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,4:7,4:7,5,4,4
chr6	292452	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=18,23;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:0,1:0|1:292452_G_C:292452:2,2,2,0
chr6	292456	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:0,1:0|1:292452_G_C:292452:2,2,2,0
chr6	292461	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:0,0:2,2,2,0
chr6	292464	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:0,0:0|1:292464_G_C:292464:3,2,2,0
chr6	292466	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,9;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:4,0:0,0:0|1:292464_G_C:292464:3,2,1,0
chr6	292694	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=209,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr6	311798	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=237,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr6	312029	.	TAATG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:9,1:8,9:1,16,3,7
chr6	335069	.	T	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,24:0.382:63:18,9:21,14:35,4,23,1
chr6	335251	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,15:0.471:32:9,8:8,6:0|1:335251_T_C:335251:1,16,1,14
chr6	335253	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,15:0.471:32:8,8:8,7:0|1:335251_T_C:335251:1,16,1,14
chr6	335268	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,25:0.866:28:1,13:2,9:0,3,1,24
chr6	348051	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.429:10:2,2:2,2:6,0,3,1
chr6	348080	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,15,2
chr6	350940	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.456:22:8,7:4,3:3,9,2,8
chr6	407496	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,22:0.339:66:18,13:24,9:25,19,14,8
chr6	407629	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,19;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,1:0,0:2,1,0,3
chr6	407656	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=231,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:2,2:0,1:0,3,0,3
chr6	497520	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,9,14
chr6	564515	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	572480	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr6	572543	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,4:3,6:5,1,5,5
chr6	572714	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	599042	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=160.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,22:0,23:0,0,35,13
chr6	619358	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:10,0,2,0
chr6	619582	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:619582_A_AG:619582:1,3,0,1
chr6	619583	.	T	TATTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:619582_A_AG:619582:1,3,0,1
chr6	1313157	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=196,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr6	1612419	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=115,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:2,1:1,2:1,5,2,1
chr6	1726623	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:8,9:3,8:8,3,11,6
chr6	2624374	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr6	2675271	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:13,2:6,1:12,8,3,0
chr6	2683439	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0,5,0,2
chr6	2683472	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2683472_G_T:2683472:0,1,0,1
chr6	2683473	.	TGCAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2683472_G_T:2683472:0,1,0,1
chr6	2683483	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2683472_G_T:2683472:0,0,0,1
chr6	2683486	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2683472_G_T:2683472:0,0,0,1
chr6	2685677	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr6	2689217	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:3,7,1,3
chr6	2766465	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:7,0,5,0
chr6	2769205	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr6	2834265	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	2838046	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=237,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	2838248	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:0,7,0,5
chr6	2890614	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:14,8,2,0
chr6	2948965	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,4:0,0,1,8
chr6	2949387	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,5:0,0:0,0,0,7
chr6	2953252	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	2953445	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,4,13
chr6	3006807	.	A	G	.	.	DP=86;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=169.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,55:0.679:81:17,32:7,20:14,12,30,25
chr6	3006821	.	CT	C,CTT	.	.	DP=64;ECNT=4;MBQ=32,32,32;MFRL=141,147,163;MMQ=60,60,60;MPOS=13,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.11,8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,5,5:0.159,0.174:32:9,3,1:11,2,3:5,17,2,8
chr6	3006889	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.212:15:9,3:3,0:0|1:3006889_A_AT:3006889:0,12,0,3
chr6	3006890	.	C	CTGCCTG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.216:15:9,2:3,0:0|1:3006889_A_AT:3006889:0,12,0,3
chr6	3012725	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=55,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.889:11:2,5:0,4:1,1,7,2
chr6	3017310	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	3078266	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	3118947	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr6	3157798	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	3224927	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr6	3225115	.	ATG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=175,147;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3225115_ATG_A:3225115:0,4,0,1
chr6	3225119	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=175,147;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3225115_ATG_A:3225115:0,4,0,1
chr6	3225120	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,21;MFRL=175,147;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3225115_ATG_A:3225115:0,4,0,1
chr6	3225123	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=175,147;MMQ=40,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3225115_ATG_A:3225115:0,4,0,1
chr6	3225232	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,288;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	3226973	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,15;MFRL=176,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.472:10:3,0:2,2:0,5,0,5
chr6	3264101	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:2,1,1,5
chr6	3264582	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=220,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:1,2,0,4
chr6	3284163	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,2:7,5:8,4,4,3
chr6	3287118	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,5,1
chr6	3289983	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:3,1,4,2
chr6	3723764	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	3983531	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:18,0:14,2:8,24,0,2
chr6	3984080	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=185,213;MMQ=30,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3984080_T_G:3984080:0,1,0,1
chr6	3984082	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=185,213;MMQ=30,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3984080_T_G:3984080:0,1,0,1
chr6	4021554	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr6	4033065	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	4037582	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,16,3
chr6	4040922	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:1,0,5,0
chr6	4044297	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=96.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:0,10:1,18:0,1,2,26
chr6	4044344	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	4049920	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:14,1:13,1:20,7,2,0
chr6	4052167	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr6	4052383	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=173.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,25:0,25:0,0,7,44
chr6	4057200	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr6	4057233	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,2:0,13:0,0,13,3
chr6	4057429	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr6	4074612	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=99.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,26,1
chr6	4119553	.	ATTT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,14;MFRL=97,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.249:9:0,0:2,0:2,5,0,2
chr6	4892330	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:3,4,1,1
chr6	4936074	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr6	4937728	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=37,34;MFRL=209,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:0|1:4937728_C_CA:4937728:0,1,4,0
chr6	4937742	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:1,0:0|1:4937728_C_CA:4937728:2,2,3,0
chr6	4937747	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:2,0:2,2:0|1:4937728_C_CA:4937728:2,2,3,0
chr6	4944004	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.598:10:1,1:2,3:0,4,1,5
chr6	4952413	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	4996682	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:4996682_TG_T:4996682:1,3,0,1
chr6	4996684	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:4996682_TG_T:4996682:1,3,0,1
chr6	4996689	.	AT	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:4996682_TG_T:4996682:1,3,0,1
chr6	4996694	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:4996682_TG_T:4996682:0,3,0,1
chr6	5000721	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr6	5000724	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,33,32;MFRL=144,178,164;MMQ=60,60,58;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,20;RU=T;STR;TLOD=3.37,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.262,0.418:7:1,1,0:0,0,3:2,0,5,0
chr6	5086070	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	5109592	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr6	5217010	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=195,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr6	5404958	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=27,32;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.680:13:3,4:0,5:0,4,1,8
chr6	5404986	.	GA	TT	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=28,14;MFRL=163,151;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:5404986_GA_TT:5404986:0,4,0,1
chr6	5404989	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,14;MFRL=160,151;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,0:0|1:5404986_GA_TT:5404986:0,3,0,1
chr6	5404996	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,14;MFRL=155,151;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:5404986_GA_TT:5404986:0,2,0,1
chr6	5404998	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=23,14;MFRL=155,151;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:5404986_GA_TT:5404986:0,2,0,1
chr6	5405016	.	TTTTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,15;MFRL=217,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0,3,0,1
chr6	5405017	.	TTTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=238,151;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:5404986_GA_TT:5404986:0,2,0,1
chr6	5405026	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=23,29;MFRL=238,151;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:5405026_T_A:5405026:0,2,0,2
chr6	5405028	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=14,28;MFRL=238,151;MMQ=60,50;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:0,0:0|1:5405026_T_A:5405026:0,2,0,2
chr6	5545654	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	5831924	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,145;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,3:0,3:3,0,6,0
chr6	5832125	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:2,3:0,4,1,5
chr6	5999464	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	6145998	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:10,1:4,13,0,2
chr6	6167621	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr6	6174786	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,8:0,17:0,0,21,5
chr6	6250967	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.753:5:0,1:0,2:1,0,4,0
chr6	6318945	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6318948	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6318949	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6318951	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6318953	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6318954	.	A	AATTCG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6321128	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr6	6589193	.	G	GGTGGATGGAATGTTGGCCCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6589193_G_GGTGGATGGAATGTTGGCCCAA:6589193:0,0,0,1
chr6	6589196	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6589193_G_GGTGGATGGAATGTTGGCCCAA:6589193:0,0,0,1
chr6	6625333	.	G	GTTCTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:6625333_G_GTTCTGA:6625333:0,0,0,1
chr6	6625335	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6625333_G_GTTCTGA:6625333:0,0,0,1
chr6	6650003	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6650003_G_C:6650003:0,3,0,1
chr6	6650011	.	G	GCAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6650003_G_C:6650003:0,3,0,1
chr6	6650014	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6650003_G_C:6650003:0,3,0,1
chr6	6650020	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:6650003_G_C:6650003:0,3,0,1
chr6	6650022	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6650003_G_C:6650003:0,3,0,1
chr6	7246729	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr6	7330194	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	7368917	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:7,11:10,10:13,4,17,4
chr6	7373249	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,1:0,7:2,0,8,0
chr6	7387236	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.637:17:2,4:3,6:4,2,7,4
chr6	7387433	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=112,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.436:12:1,1:6,4:2,5,1,4
chr6	7387462	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=106,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr6	7390369	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,10:0,0,1,14
chr6	7396836	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr6	7396887	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,3:8,3:10,6,5,1
chr6	7398832	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:8,0,4,0
chr6	7401382	.	AAAAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr6	7413094	.	AT	A,ATT	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=147,165,154;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.48,9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:44,8,9:0.119,0.146:61:25,3,2:16,4,6:38,6,15,2
chr6	7414382	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:8,0,6,0
chr6	7414657	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,6:0,0,1,21
chr6	7555854	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:4,0,3,0
chr6	7567970	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=200,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr6	7568203	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:7568203_GGA_G:7568203:0,0,0,1
chr6	7568207	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:7568203_GGA_G:7568203:0,0,0,1
chr6	7574805	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr6	7575497	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,169;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr6	7578819	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:0|1:7578819_T_G:7578819:1,9,1,4
chr6	7578823	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:4,2:4,3:0|1:7578819_T_G:7578819:1,9,1,5
chr6	7590624	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.414:26:7,7:7,1:1,14,3,8
chr6	7590653	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.522:19:3,7:6,3:0,9,1,9
chr6	7595241	.	AT	A,ATT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31,27;MFRL=154,186,140;MMQ=60,60,60;MPOS=22,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.27,4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,5,5:0.111,0.139:38:14,1,2:13,4,2:28,0,9,1
chr6	7606255	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=106,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,29:0.517:56:12,17:15,12:18,9,24,5
chr6	7883507	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:7,3:0,12,0,3
chr6	8015821	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr6	8016089	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr6	8026577	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,7:0,0,12,5
chr6	8097494	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:7,2:16,0:18,6,1,1
chr6	8428071	.	CAT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=119,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr6	8428137	.	A	AAGT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=101,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,8:3,5:7,1,13,2
chr6	8430049	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=189,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,5,0
chr6	9900599	.	T	TGAG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.391:26:6,6:10,4:11,5,6,4
chr6	9908920	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:2,4:6,0:0,9,0,4
chr6	9939564	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,74;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,0:3,4:2,6,1,3
chr6	10529087	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr6	10529126	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=104,67;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,0:5,3:6,6,2,1
chr6	10626841	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr6	10695136	.	GTTTTTTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=225,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,12;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr6	10724943	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=120,167;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,1:7,2:2,15,1,2
chr6	10729011	.	C	CACAGTTTGCCACTCTGGAAAAAATGTGGAAACGGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=193,172;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr6	10775530	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:8,2:7,0:12,5,1,1
chr6	10802045	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr6	10802101	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=115,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.664:19:4,3:2,9:5,1,10,3
chr6	10874318	.	A	AAGCAGTTTCTGAGAATGATTCC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,1:8,1:8,11,0,2
chr6	10874905	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,10:3,4:3,3,5,9
chr6	10882100	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	10887251	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0|1:10887251_T_C:10887251:0,0,11,0
chr6	10887253	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0|1:10887251_T_C:10887251:0,0,11,0
chr6	10887276	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,12,4
chr6	10891651	.	ATT	A,AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32,33;MFRL=0,191,188;MMQ=60,60,60;MPOS=29,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,19;RU=T;STR;TLOD=8.11,4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,4:0.517,0.403:9:0,3,2:0,2,2:0,0,9,0
chr6	10891673	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=14,18;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:2,1:2,0:12,0,10,0
chr6	10927692	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	10931587	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr6	10955408	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,12,19
chr6	10961649	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.598:20:4,6:3,5:2,6,2,10
chr6	10983971	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,5:3,2:5,1,8,0
chr6	10984101	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=100,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.443:22:7,4:4,4:8,4,5,5
chr6	10990493	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:3,0,4,1
chr6	10995489	.	C	CTGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,1:1,0:0|1:10995489_C_CTGA:10995489:0,2,0,1
chr6	10995490	.	C	CAGAAGATTGTATAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10995489_C_CTGA:10995489:0,2,0,1
chr6	11005842	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	11011074	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=83,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr6	11103888	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:2,1:1,2:3,0,3,1
chr6	11105057	.	G	GTGTATTT	.	.	DP=106;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,57;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,2:0.028:104:48,2:49,0:0|1:11105057_G_GTGTATTT:11105057:51,51,1,1
chr6	11105060	.	T	TTTGGGGCTTAAGAGTAGA	.	.	DP=107;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=128,57;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,2:0.028:104:49,2:44,0:0|1:11105057_G_GTGTATTT:11105057:51,51,1,1
chr6	11185967	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	11192575	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=87,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:2,7:12,5:5,10,8,5
chr6	11538455	.	AGCC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr6	11538534	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:3,2,2,0
chr6	11538564	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:3,3,2,0
chr6	11714639	.	GA	G,GAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,32,33;MFRL=186,149,144;MMQ=60,60,60;MPOS=20,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.28,10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,8:0.156,0.585:13:2,2,3:0,0,4:2,1,8,2
chr6	11714668	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.106:42:16,0:15,0:26,12,4,0
chr6	11714681	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=138,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.091:49:18,0:19,0:29,16,4,0
chr6	11714806	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.386:42:13,9:13,7:8,18,1,15
chr6	11723538	.	AC	GC,GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33,34;MFRL=0,152,127;MMQ=60,60,60;MPOS=12,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.58,25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,9:0.421,0.528:16:0,2,5:0,5,2:0,0,13,3
chr6	11770334	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=120,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.546:13:1,3:3,4:1,5,0,7
chr6	11770398	.	AC	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11770398_AC_TG:11770398:0,1,0,1
chr6	11770401	.	A	AAGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11770398_AC_TG:11770398:0,1,0,1
chr6	12016009	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	12020672	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=157,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,3:9,0:1,19,1,2
chr6	12120090	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.574:26:2,8:8,6:10,1,13,2
chr6	12120445	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,245;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,2:5,0:10,6,1,1
chr6	12123232	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:2,5:2,7:2,2,6,6
chr6	12292772	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,2,11
chr6	12749758	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:12749758_C_A:12749758:0,3,0,1
chr6	12749762	.	C	CCAACACACACCCACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:12749758_C_A:12749758:0,3,0,1
chr6	12749786	.	C	CAAGACAAGGCCTCACACTGTCGCCAGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	12933994	.	CT	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:15,0:27,3:19,23,0,3
chr6	13182685	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	13182995	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr6	13230558	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=172,122;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:4,1:1,0:0|1:13230558_T_A:13230558:1,4,0,1
chr6	13230561	.	A	ACTGC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=172,122;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:3,1:1,0:0|1:13230558_T_A:13230558:1,4,0,1
chr6	13230566	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=172,149;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr6	13230581	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=203,149;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.243:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr6	13278648	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,0,24
chr6	13316909	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,7:2,3:3,2,3,7
chr6	13592135	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:6,7:15,4:5,16,1,10
chr6	13601112	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=123,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.377:19:5,1:6,5:8,4,2,5
chr6	13604852	.	C	CCACATCCTGCTGATTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=173,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	13620877	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr6	13638243	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	13639700	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=212,175;MMQ=50,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:2,0,8,0
chr6	13790955	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,99;MMQ=58,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.215:15:1,2:11,0:11,1,2,1
chr6	13800626	.	TAA	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=A;STR;TLOD=88.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.550:49:12,12:10,15:3,19,1,26
chr6	13814163	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	13814340	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	13814529	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	13978614	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr6	13979526	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr6	14134083	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	15374508	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr6	15374544	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr6	15468722	.	AGGGTGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	15497422	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,3,16
chr6	15511429	.	C	CCCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr6	15513399	.	CGT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GT;STR;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	15513744	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr6	15593240	.	T	C	.	.	DP=131;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=430.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,122:0.992:122:0,60:0,59:0,0,92,30
chr6	15593319	.	GA	G,GAA	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=17,18,32;MFRL=152,140,153;MMQ=60,60,60;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=18.53,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,13,5:0.354,0.168:32:0,3,0:4,3,3:2,12,3,15
chr6	15615712	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=232,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15615712_A_T:15615712:0,1,0,1
chr6	15615714	.	TTCACATTG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=241,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:15615712_A_T:15615712:0,2,0,1
chr6	15651642	.	GA	G,TA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=19,18,10;MFRL=158,170,145;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.72,4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,12,11:0.354,0.199:36:4,4,1:1,1,0:5,8,3,20
chr6	16326788	.	C	CTCATT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:8,10,1,1
chr6	16326790	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=129,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:11,1:6,2:8,9,1,2
chr6	17282949	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	17426720	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,113;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,2:9,0:12,0,2,0
chr6	17426734	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.191:16:3,1:8,2:13,0,3,0
chr6	17426756	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=146,108;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.112:24:9,2:12,0:20,2,1,1
chr6	17539418	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	17541406	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:2,8,0,2
chr6	17541463	.	GATTT	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=110,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	17541469	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=110,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:17541469_T_TAA:17541469:0,2,0,1
chr6	17541475	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=110,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:17541469_T_TAA:17541469:0,2,0,1
chr6	17541478	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=110,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:17541469_T_TAA:17541469:0,2,0,1
chr6	17543036	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:1,3:5,6:6,1,8,1
chr6	17602797	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=203,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr6	17605179	.	AG	GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,2401;MMQ=60,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,2:12,0:13,15,0,2
chr6	17606158	.	GC	CA	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=139,128;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.055:52:20,1:26,1:0|1:17606158_GC_CA:17606158:31,19,2,0
chr6	17606162	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=139,128;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:16,1:27,1:0|1:17606158_GC_CA:17606158:27,18,2,0
chr6	17606169	.	T	A	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=140,128;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,3:0.072:53:20,2:29,1:0|1:17606158_GC_CA:17606158:26,24,2,1
chr6	17606184	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=142,128;MMQ=60,41;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.084:56:21,3:31,1:24,28,2,2
chr6	17608624	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=159,182;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:8,2:0|1:17608624_C_T:17608624:1,16,0,2
chr6	17608634	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=157,182;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:17608624_C_T:17608624:0,10,0,2
chr6	17608637	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=157,182;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:17608624_C_T:17608624:0,10,0,2
chr6	17617026	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=227,166;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	17633061	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr6	17669256	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.328:10:4,0:3,0:0|1:17669256_G_T:17669256:3,4,0,3
chr6	17669262	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.623:6:0,2:2,0:0|1:17669256_G_T:17669256:1,1,0,4
chr6	17675328	.	G	GCCAGGA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:3,8,0,2
chr6	17675386	.	GA	G,GAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33,34;MFRL=181,154,163;MMQ=60,60,60;MPOS=11,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.79,6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.297,0.307:10:1,1,2:3,2,1:4,0,6,0
chr6	17764279	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:8,0,4,0
chr6	17777614	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=99,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.904:16:0,4:1,8:1,1,3,11
chr6	17777654	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,167;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,1:4,4:0,11,0,5
chr6	17779922	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.195:24:3,0:1,0:2,18,1,3
chr6	17781216	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:17781216_A_T:17781216:0,2,0,1
chr6	17781221	.	A	AGTTCCCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:17781216_A_T:17781216:0,2,0,1
chr6	17785948	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	17790191	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:11,6:16,3:5,22,2,7
chr6	17794774	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:2,5:2,3:3,1,4,5
chr6	17799766	.	TG	CA,CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35,28;MFRL=0,177,170;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.82,17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,6:0.385,0.538:10:0,2,4:0,2,2:0,0,0,10
chr6	17805649	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:1,0:0|1:17805649_G_T:17805649:5,1,2,0
chr6	17805651	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:17805649_G_T:17805649:5,1,2,0
chr6	17809165	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:17809165_C_A:17809165:0,2,0,1
chr6	17809170	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:17809165_C_A:17809165:0,2,0,1
chr6	17809199	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	17817235	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	17817519	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:5,6:2,7:0,7,1,12
chr6	17834316	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	17834328	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	17834331	.	G	GATTTGGCTA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=136,172;MMQ=54,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	17834347	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=214,163;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:17834347_C_A:17834347:0,1,0,1
chr6	17834348	.	C	CAGACTATTGATAACTGCTTAAGAGGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,36;MFRL=214,163;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:17834347_C_A:17834347:0,1,0,1
chr6	17855864	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr6	17987661	.	C	G	.	.	DP=123;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,33:0.286:117:42,21:41,12:44,40,17,16
chr6	18122506	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=226,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,0:0,4:0,2,0,4
chr6	18122639	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	18133977	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr6	18134008	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.658:13:0,2:4,5:4,0,6,3
chr6	18134021	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,5:0,15:0,0,11,10
chr6	18139964	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=50.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.962:19:0,9:0,7:0,0,1,18
chr6	18143769	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.632:14:1,2:3,6:4,1,9,0
chr6	18148019	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=130.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,43:0.738:58:8,22:6,21:11,4,35,8
chr6	18148155	.	GA	G,GAA	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=20,34,19;MFRL=141,150,113;MMQ=60,60,60;MPOS=19,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=11.79,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,8,6:0.182,0.118:45:9,3,2:8,3,1:1,30,1,13
chr6	18148247	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:1,5,0,6
chr6	18149318	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:18,1:15,1:10,23,0,2
chr6	18161563	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:6,5,6,0
chr6	18161646	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,3:10,0:3,13,1,2
chr6	18201961	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr6	18208319	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=177,52490574;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,1,1
chr6	18215166	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:2,3,3,0
chr6	18222102	.	C	CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,3:3,2:10,2,5,0
chr6	18226340	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.337:33:12,6:10,4:22,0,11,0
chr6	18236932	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	18256497	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:16,2:24,1:42,0,3,0
chr6	18256507	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:19,3:28,0:47,0,3,0
chr6	18256513	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:21,3:27,0:48,0,3,0
chr6	18258516	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,7:5,4:9,1,9,2
chr6	18399750	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:3,0,3,1
chr6	20110043	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	20128852	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	20144637	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr6	20212469	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:3,5,2,4
chr6	20481678	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr6	20546826	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=191,193;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr6	20546845	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=236,137;MMQ=51,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr6	20548795	.	CT	C,CTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32,33;MFRL=156,81,171;MMQ=60,60,60;MPOS=8,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.32,8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,6:0.150,0.265:23:6,3,3:4,0,2:13,1,9,0
chr6	20739907	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr6	20758704	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr6	20758943	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr6	20781282	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	21065449	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:8,3:7,2:3,12,2,3
chr6	21230987	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21230987_G_A:21230987:1,0,1,0
chr6	21230992	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21230987_G_A:21230987:1,0,1,0
chr6	21231002	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21230987_G_A:21230987:2,0,1,0
chr6	21596241	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=169,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	21596247	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:21596247_GA_G:21596247:0,2,0,1
chr6	21596256	.	A	T,G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30,31;MFRL=181,169,143;MMQ=60,60,60;MPOS=6,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,0:1,0,1:0,1,0,2
chr6	21596257	.	AACG	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:21596247_GA_G:21596247:0,2,0,1
chr6	21596258	.	A	ACAAGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	21597753	.	CTTTTTTTT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=102,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;RPA=19,11;RU=T;STR;TLOD=83.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,25:0.847:30:0,5:1,4:2,3,14,11
chr6	22570064	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=213,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:2,3:2,2:3,1,5,1
chr6	22571662	.	TG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,34;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,2:15,0:18,8,1,1
chr6	24174955	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,6:5,1:14,3,7,0
chr6	24302087	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,18:0,0,14,21
chr6	24353742	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr6	24358356	.	GCACA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=CA;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:4,1:3,1:9,3,2,0
chr6	24403196	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr6	24412431	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,35,33,33;MFRL=168,100,121,171;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,13,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.18,4.64,4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:14,2,4,4:0.097,0.149,0.173:24:7,2,2,3:7,0,1,1:14,0,8,2
chr6	24429424	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	24445718	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.499:12:1,6:5,0:0|1:24445718_A_G:24445718:5,1,4,2
chr6	24445723	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=118,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,7:0.533:13:6,2:0,5:1|0:24445718_A_G:24445718:3,3,6,1
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chr6	24554672	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr6	24556759	.	GGC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr6	24559433	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr6	24578272	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=182,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr6	24580185	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.460:20:5,4:5,5:1,10,0,9
chr6	24583804	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:3,9:4,6:4,3,12,3
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chr6	24596930	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24596930_CT_C:24596930:0,1,0,1
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chr6	24654553	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,244;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr6	24657964	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=86.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,23,0
chr6	24667662	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,1,9
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chr6	24687999	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=163,175;MMQ=53,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=136.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,37:0.927:39:2,24:0,12:0,2,0,37
chr6	24688064	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=226,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	24698215	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,12,10
chr6	24714681	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.841:14:2,6:0,6:0,2,0,12
chr6	24718676	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:2,4:6,1,7,0
chr6	24806594	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=115,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:5,3,2,1
chr6	24806752	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=200,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	24806777	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=267,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	24809853	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr6	24809881	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,0:1,3:5,0,3,0
chr6	24828318	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:2,3:7,1:9,1,3,1
chr6	24828560	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:0,8,1,1
chr6	24832387	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr6	24836161	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:0,8,0,5
chr6	24839746	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,14:0.304:47:17,6:16,8:23,10,10,4
chr6	24875830	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:1,0,4,0
chr6	25084691	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:9,4:10,4:16,5,7,1
chr6	25084718	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.263:35:13,3:13,5:17,9,7,2
chr6	25084839	.	G	GTTCT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,0:17,2:2,23,1,1
chr6	25086958	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0|1:25086958_T_C:25086958:4,0,4,0
chr6	25086968	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,6:0.539:11:3,1:1,5:1|0:25086958_T_C:25086958:5,0,5,1
chr6	25097450	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,37;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,1:10,4:5,17,0,5
chr6	25106745	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:9,8:10,4:6,13,2,10
chr6	25106783	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:5,4:6,1:0,11,0,5
chr6	25110097	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr6	25115176	.	CGTTTTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTTTTT;STR;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:2,6:2,3:6,0,8,1
chr6	25115397	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=229,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr6	25280119	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,8:3,4:1,5,1,11
chr6	25285026	.	C	CT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.343:39:12,6:12,6:26,0,12,1
chr6	25420400	.	TTGA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGA;STR;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:6,4:4,6:5,7,4,6
chr6	25426640	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31,29,32;MFRL=0,127,145,168;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,5,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,14,15,16;RU=T;STR;TLOD=7.31,3.04,21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,4,3,9:0.217,0.202,0.535:16:0,2,0,5:0,2,3,4:0,0,15,1
chr6	25435654	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	25450026	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr6	25450970	.	TCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTCCCTCCCTTCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCC;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.412:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	25471559	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:2,0:0,0:0,3,0,2
chr6	25472787	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:1,6,0,6
chr6	25492296	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr6	25509976	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,4:2,5:0,4,1,8
chr6	25510051	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=219,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:25510051_A_G:25510051:0,1,0,2
chr6	25510058	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=219,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:25510051_A_G:25510051:0,1,0,2
chr6	25510648	.	TA	CA,CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30,31;MFRL=0,163,174;MMQ=60,60,60;MPOS=6,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.07,6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.536,0.363:7:0,3,3:0,1,0:0,0,7,0
chr6	25511008	.	C	CAT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:6,10:10,5:3,13,5,10
chr6	25516126	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr6	25516158	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	25554180	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	25557132	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.298:15:1,0:6,1:1,10,0,4
chr6	25557148	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.374:11:4,0:3,3:0|1:25557148_T_TA:25557148:0,7,0,4
chr6	25557149	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.653:13:2,4:1,4:0|1:25557148_T_TA:25557148:0,4,0,9
chr6	25605091	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,3:0,11:0,0,8,7
chr6	25606520	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,0:5,3:1,11,0,3
chr6	25610203	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:3,1,5,0
chr6	25652568	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr6	25653566	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	25661887	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,23:0.687:33:8,13:2,10:2,8,7,16
chr6	25682262	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr6	25689383	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=189,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr6	25689487	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,0,3
chr6	25726666	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=202,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,4:6,1:5,5,1,4
chr6	25727013	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727013_A_T:25727013:0,0,0,1
chr6	25727017	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727013_A_T:25727013:0,0,0,1
chr6	25727018	.	G	GTCTCGTCCTTTTCACCTCTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727013_A_T:25727013:0,0,0,1
chr6	25727656	.	C	CTGTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727656_C_CTGTA:25727656:0,0,0,1
chr6	25727665	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727656_C_CTGTA:25727656:0,0,0,1
chr6	25727668	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727656_C_CTGTA:25727656:0,0,0,1
chr6	25770239	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=268,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	25770707	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=80,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:2,4,2,8
chr6	25778055	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	25798932	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr6	25801057	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr6	25813150	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,10:0,9:0,0,9,10
chr6	25849620	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:5,4:1,6:5,1,8,3
chr6	25862208	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:25862208_G_C:25862208:0,2,0,1
chr6	25862220	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:25862208_G_C:25862208:2,2,0,1
chr6	25914901	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,2:0,4:0,2,1,5
chr6	25916979	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=105,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:8,2:4,6:4,8,5,3
chr6	25918688	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:12,12:3,9:11,4,15,6
chr6	25924134	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:0,2,1,4
chr6	25924158	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr6	25972411	.	AGT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,1:2,0:0|1:25972411_AGT_A:25972411:0,3,0,1
chr6	25972414	.	AATGTT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:25972411_AGT_A:25972411:0,3,0,1
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chr6	26597384	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.534:37:6,9:11,9:5,12,7,13
chr6	27114892	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,25:0.620:40:3,14:12,11:13,2,19,6
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chr6	27218668	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,13;MFRL=262,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27218664_T_A:27218664:0,1,1,0
chr6	27218671	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,13;MFRL=262,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27218664_T_A:27218664:0,1,1,0
chr6	27218678	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,10;MFRL=262,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27218664_T_A:27218664:0,1,1,0
chr6	27218682	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,13;MFRL=262,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27218664_T_A:27218664:0,1,1,0
chr6	27218684	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,18;MFRL=262,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27218664_T_A:27218664:0,1,1,0
chr6	27220519	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr6	27279774	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,120;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:1,5:3,2:2,2,3,5
chr6	27293049	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	27293697	.	AC	GT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr6	27293719	.	G	GCACCATTGAGCACTGAGTGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=112,119;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	27293723	.	C	CAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27293723_C_CAG:27293723:0,0,0,1
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chr6	28359307	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.317:39:16,5:11,7:15,12,7,5
chr6	28366262	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=239,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
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chr6	28554543	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=11,33;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,0:0,3:0,1,0,3
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chr6	28876961	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=228,161;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:28876957_C_T:28876957:0,2,0,1
chr6	28891458	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:0,5,0,8
chr6	28911802	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:5,8:4,10:1,8,4,14
chr6	28963248	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,6:4,4:4,1,7,3
chr6	29011960	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,4,1
chr6	29068622	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	29068759	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=151.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,16:0,20:0|1:29068759_C_A:29068759:0,0,33,8
chr6	29068766	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,21:0.498:42:12,9:9,11:0|1:29068759_C_A:29068759:18,3,15,6
chr6	29069016	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.382:40:12,8:12,7:12,13,6,9
chr6	29069264	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,6:8,6:9,6,5,7
chr6	29069299	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=134,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,3:9,5:11,7,3,5
chr6	29069337	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=111.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,23:0,9:0,0,19,14
chr6	29079992	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=151,89;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.069:55:26,3:25,0:30,22,2,1
chr6	29080344	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,22:0.594:37:9,11:5,11:0|1:29080344_G_A:29080344:11,4,14,8
chr6	29080349	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=153.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0|1:29080344_G_A:29080344:0,0,25,12
chr6	29080450	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,17:0,0,13,19
chr6	29141632	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=144,166;MMQ=40,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,4:3,2:2,7,1,5
chr6	29141742	.	CA	TG	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=149,95;MMQ=50,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,2:10,0:16,3,1,1
chr6	29141743	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,50;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,18,4
chr6	29141772	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=99.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,13:0,0,23,9
chr6	29142054	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=126.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,18:0,13:0|1:29142054_C_G:29142054:0,0,18,14
chr6	29142064	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=158,132;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,9:0.304:31:9,7:10,2:0|1:29142054_C_G:29142054:10,12,6,3
chr6	29230577	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:14,2:2,1:8,8,1,2
chr6	29230683	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr6	29230806	.	CCCTTAT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0|1:29230806_CCCTTAT_C:29230806:0,0,0,1
chr6	29230815	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29230806_CCCTTAT_C:29230806:0,0,0,1
chr6	29231172	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	29231831	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:9,7:6,5:9,6,5,7
chr6	29274486	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,5:2,1:7,2,4,2
chr6	29323076	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:4,9:4,6:4,4,7,8
chr6	29323259	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr6	29323838	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:2,1,3,4
chr6	29342775	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,4:3,6:3,4,5,5
chr6	29342825	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:3,6,3,4
chr6	29364615	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,4,18
chr6	29364643	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr6	29364787	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,11:0,0,11,8
chr6	29364815	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr6	29364835	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,9:0,0,10,9
chr6	29364838	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=130,129;MMQ=56,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:6,0:3,9:4,5,5,4
chr6	29364951	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,10,7
chr6	29365241	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=124.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,19:0,15:0,0,13,21
chr6	29365423	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr6	29394427	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	29394474	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,2:1,7:2,0,8,1
chr6	29395057	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,4:2,5:5,3,2,7
chr6	29395104	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=104,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,2:1,8:2,1,2,8
chr6	29395499	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,165;MMQ=41,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,3:0,1:1,1,0,4
chr6	29408090	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=210,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:4,2,2,3
chr6	29408270	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0|1:29408270_C_T:29408270:0,5,3,3
chr6	29408275	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,1:1,3:0|1:29408270_C_T:29408270:0,4,3,2
chr6	29408278	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0|1:29408270_C_T:29408270:0,4,3,2
chr6	29408397	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,7:4,1:7,4,7,1
chr6	29408476	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:3,10:3,7:1,5,7,10
chr6	29408528	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:2,7:2,5:1,3,6,6
chr6	29408554	.	AC	CA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:2,3,6,3
chr6	29430170	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=96,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:0,6:7,4:4,3,5,5
chr6	29431628	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,1:2,6:2,2,2,5
chr6	29431698	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=205,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,3:1,2:0,2,1,5
chr6	29454489	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:2,1,4,1
chr6	29455098	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=86,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,2:7,4:9,4,2,4
chr6	29455599	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr6	29523646	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:4,1,6,2
chr6	29523670	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.762:19:2,5:2,9:0|1:29523670_C_A:29523670:2,2,12,3
chr6	29523676	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,16:0.774:20:1,5:2,10:0|1:29523670_C_A:29523670:2,2,13,3
chr6	29527599	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,35;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.799:6:0,2:0,3:0,1,0,5
chr6	29555681	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,7:0,0,19,0
chr6	29555809	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=166.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,25:0,21:0,0,26,20
chr6	29555864	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=131.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,21:0,19:0,0,17,25
chr6	29556759	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,32:0.546:58:14,12:12,17:9,17,15,17
chr6	29571553	.	G	GAGTTCTTGATGTTGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=170,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	29574257	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,2:12,0:8,17,0,2
chr6	29574595	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:0,3:1,0,8,0
chr6	29574631	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=182,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:5,3:2,0:6,1,1,2
chr6	29575003	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr6	29575089	.	G	GGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29575089_G_GGT:29575089:0,0,0,1
chr6	29575091	.	G	GGATCGGAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29575089_G_GGT:29575089:0,0,0,1
chr6	29576393	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,10,12
chr6	29576590	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:29576590_G_A:29576590:0,1,1,1
chr6	29576592	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:29576590_G_A:29576590:0,1,1,1
chr6	29577200	.	G	A,GCAACGTTGGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,32,33;MFRL=179,126,124;MMQ=60,60,60;MPOS=9,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.34,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.285,0.353:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr6	29577201	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:29577201_A_AC:29577201:1,2,0,1
chr6	29577204	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:29577201_A_AC:29577201:0,2,0,1
chr6	29577206	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=179,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29577201_A_AC:29577201:0,1,0,1
chr6	29577218	.	G	GCACAGA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	29578871	.	GTTGTA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=189,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,1:1,0:0|1:29578871_GTTGTA_G:29578871:0,2,0,1
chr6	29578880	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=189,212;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,1:1,0:0|1:29578871_GTTGTA_G:29578871:0,2,0,1
chr6	29580265	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,1:2,0,2,1
chr6	29580285	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:1,0:0|1:29580285_AG_CC:29580285:1,3,2,0
chr6	29580289	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,0:0|1:29580285_AG_CC:29580285:0,3,2,0
chr6	29580291	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,0:0|1:29580285_AG_CC:29580285:0,3,2,0
chr6	29580436	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=145,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:0,3,2,1
chr6	29581011	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,4:10,6:9,6,8,2
chr6	29581041	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.398:28:6,2:11,9:11,6,6,5
chr6	29581110	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,8:0.243:35:11,4:13,4:0|1:29581110_A_G:29581110:6,21,3,5
chr6	29581113	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,8:0.265:32:12,4:11,4:0|1:29581110_A_G:29581110:6,18,3,5
chr6	29590000	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr6	29591864	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:2,3,0,2
chr6	29600054	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=116,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.430:49:9,11:18,9:15,13,12,9
chr6	29600104	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:6,10:6,2:5,8,5,8
chr6	29625001	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,89;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:8,3:6,3:7,8,4,2
chr6	29627313	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:7,5:1,8:4,4,5,8
chr6	29627473	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:2,8,1,5
chr6	29634012	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,8,9
chr6	29635531	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:2,2,1,3
chr6	29638245	.	A	AAGGGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:29638245_A_AAGGGAC:29638245:0,0,0,1
chr6	29638249	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29638245_A_AAGGGAC:29638245:0,0,0,1
chr6	29639047	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,7:4,6:2,7,0,13
chr6	29641613	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,165;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr6	29691140	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,7:4,5:6,0,11,1
chr6	29691303	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,26:0.467:56:18,15:11,11:15,15,9,17
chr6	29691390	.	CT	GC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,4,20
chr6	29691713	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.663:32:4,8:4,13:7,4,11,10
chr6	29691744	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,23:0.728:31:5,12:3,11:7,1,14,9
chr6	29691772	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.322:23:9,4:6,3:12,4,6,1
chr6	29691800	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.452:38:11,8:9,9:15,6,9,8
chr6	29691857	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,10:0.203:52:24,4:16,6:17,25,2,8
chr6	29692305	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	29692729	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.589:22:4,11:4,2:4,5,4,9
chr6	29693011	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=244.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,72:0.987:72:0,38:0,32:0,0,30,42
chr6	29693113	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,25:0.620:40:9,13:5,10:4,11,10,15
chr6	29694044	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:3,2:4,2:3,5,4,0
chr6	29694680	.	AA	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	29794860	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=113,121;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,1:6,7:4,7,3,5
chr6	29794897	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr6	29794906	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr6	29794933	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr6	29795636	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=30,30;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:10,1:5,5:0|1:29795636_G_A:29795636:6,9,2,4
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chr6	29795720	.	A	G,C	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=0,32,32;MFRL=0,169,162;MMQ=60,60,21;MPOS=15,32;POPAF=7.30,7.30;TLOD=45.12,5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,2:0.798,0.150:16:0,7,0:0,5,2:0,0,5,11
chr6	29795724	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=169,162;MMQ=60,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:29795709_A_G:29795709:4,12,2,0
chr6	29795730	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=169,162;MMQ=60,21;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:4,2:0|1:29795709_A_G:29795709:4,11,2,0
chr6	29795738	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=159,162;MMQ=60,21;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:29795709_A_G:29795709:3,7,2,0
chr6	29795740	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=159,162;MMQ=60,21;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:29795709_A_G:29795709:3,7,2,0
chr6	29795742	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=149,162;MMQ=60,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:29795709_A_G:29795709:3,6,2,0
chr6	29795747	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=149,162;MMQ=60,21;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:29795709_A_G:29795709:2,5,2,0
chr6	29795768	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,1,1
chr6	29795809	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=166,212;MMQ=52,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,1:6,2:5,5,2,1
chr6	29795993	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:12,5:10,2:12,10,5,2
chr6	29796103	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:9,2:7,3:0|1:29796103_T_C:29796103:6,10,0,5
chr6	29796115	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:8,1:3,3:0|1:29796103_T_C:29796103:5,6,0,4
chr6	29796126	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:3,1:3,3:0|1:29796103_T_C:29796103:3,5,1,3
chr6	29796152	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=175,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:2,4,3,1
chr6	29796257	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:6,1:0,2:3,3,2,1
chr6	29796306	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,21;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.296:14:8,0:2,3:4,6,1,3
chr6	29796311	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.367:13:3,1:3,1:4,4,0,5
chr6	29796327	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=140,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,0:3,5:4,6,1,4
chr6	29796640	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr6	29796685	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=217,240;MMQ=56,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr6	29797173	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=106,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.232:41:19,6:13,3:19,13,5,4
chr6	29797436	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,85;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.144:39:19,0:13,5:17,17,2,3
chr6	29797459	.	TG	CC	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,71;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.149:30:14,0:10,3:6,20,2,2
chr6	29797553	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:15,8:3,6:8,10,12,2
chr6	29797639	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,15:0.279:54:18,8:18,5:21,18,5,10
chr6	29797696	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.203:32:8,2:16,4:6,20,1,5
chr6	29797782	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:3,0:4,2:0,9,0,2
chr6	29798140	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,142;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.417:36:7,8:14,6:11,10,8,7
chr6	29910225	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=14;MBQ=33,36;MFRL=161,202;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,3:1,2:6,2,6,0
chr6	29910237	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=32,33;MFRL=136,202;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:8,3:2,3:0|1:29910237_C_T:29910237:10,2,6,0
chr6	29910245	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=14;MBQ=34,34;MFRL=129,202;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:10,3:3,3:0|1:29910237_C_T:29910237:11,2,6,0
chr6	29910265	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=14;MBQ=27,31;MFRL=129,198;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.249:22:13,2:4,3:0|1:29910265_G_A:29910265:12,5,5,0
chr6	29910274	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=14;MBQ=28,33;MFRL=129,198;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.161:23:14,1:5,1:0|1:29910265_G_A:29910265:12,8,3,0
chr6	29910276	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=32,28;MFRL=134,143;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:7,9:2,3:7,3,7,6
chr6	29910286	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=107.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,10:0,0,20,10
chr6	29910289	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=22,33;MFRL=126,162;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:16,3:8,1:0|1:29910289_G_C:29910289:17,11,3,1
chr6	29910294	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=14;MBQ=28,32;MFRL=126,154;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:16,3:10,1:0|1:29910289_G_C:29910289:21,11,5,1
chr6	29910302	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=26,30;MFRL=136,154;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.166:40:19,5:14,1:0|1:29910289_G_C:29910289:23,11,5,1
chr6	29910336	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=14;MBQ=32,26;MFRL=144,148;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,9:0.208:46:15,8:21,1:0|1:29910336_C_G:29910336:25,12,4,5
chr6	29910340	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=14;MBQ=31,27;MFRL=140,154;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,10:0.220:48:16,9:19,1:0|1:29910336_C_G:29910336:25,13,5,5
chr6	29910358	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=14;MBQ=33,28;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,11:0.244:46:19,7:16,3:19,16,7,4
chr6	29910371	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=14;MBQ=29,31;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.476:38:11,9:7,9:7,13,10,8
chr6	29910402	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=25;MBQ=32,31;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.232:41:17,5:15,4:10,22,3,6
chr6	29910419	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=25;MBQ=32,30;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:8,8:10,7:4,14,7,11
chr6	29910420	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=25;MBQ=33,34;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.488:37:8,10:6,8:5,14,7,11
chr6	29910429	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=25;MBQ=29,33;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.296:31:9,4:12,4:8,14,2,7
chr6	29910439	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=159,160;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:13,2:12,4:9,18,2,4
chr6	29910444	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=25;MBQ=32,33;MFRL=170,160;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.184:36:14,1:11,4:10,20,2,4
chr6	29910447	.	CAA	C	.	.	DP=34;ECNT=25;MBQ=33,30;MFRL=171,160;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:14,1:13,3:10,20,2,2
chr6	29910451	.	G	GGC	.	.	DP=34;ECNT=25;MBQ=31,33;MFRL=170,160;MMQ=60,47;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:12,1:13,3:9,20,2,2
chr6	29910457	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=25;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=137.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,9:0,16:0,0,12,19
chr6	29910460	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=25;MBQ=30,28;MFRL=169,168;MMQ=48,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.677:29:2,7:4,12:4,5,8,12
chr6	29910468	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=25;MBQ=34,29;MFRL=169,166;MMQ=45,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:4,5:6,7:6,5,5,10
chr6	29910473	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=25;MBQ=34,33;MFRL=168,165;MMQ=42,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,2:8,6:7,7,4,4
chr6	29910478	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=25;MBQ=28,30;MFRL=190,170;MMQ=44,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=81.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.870:21:1,6:1,11:2,0,8,11
chr6	29910482	.	G	T,A	.	.	DP=21;ECNT=25;MBQ=32,30,33;MFRL=190,168,170;MMQ=44,39,40;MPOS=26,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=45.88,25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,12,7:0.542,0.333:21:1,4,2:1,5,5:2,0,8,11
chr6	29910496	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=25;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0,0,8,12
chr6	29910507	.	CA	TG	.	.	DP=24;ECNT=25;MBQ=31,28;MFRL=171,186;MMQ=40,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:1,8:6,7:5,2,9,6
chr6	29910508	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=25;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,13:0,0,15,9
chr6	29910522	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=25;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,10:0,0,15,3
chr6	29910527	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=25;MBQ=34,28;MFRL=181,171;MMQ=40,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.322:20:8,0:6,5:11,3,4,2
chr6	29910557	.	TT	AC	.	.	DP=50;ECNT=25;MBQ=32,31;MFRL=171,168;MMQ=51,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.500:46:10,11:13,12:18,5,16,7
chr6	29910558	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=25;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,22:0,25:0,0,35,13
chr6	29910581	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=25;MBQ=31,34;MFRL=170,164;MMQ=52,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,14:0.208:70:26,7:28,6:38,18,13,1
chr6	29910583	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=25;MBQ=32,31;MFRL=170,164;MMQ=52,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,14:0.205:71:25,7:29,7:38,19,13,1
chr6	29910586	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=25;MBQ=33,34;MFRL=170,164;MMQ=52,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,14:0.205:71:27,7:30,7:38,19,13,1
chr6	29910604	.	C	A	.	.	DP=75;ECNT=25;MBQ=31,31;MFRL=162,158;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,14:0.197:74:30,5:30,8:43,17,10,4
chr6	29910640	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=105.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,37:0.500:74:17,21:19,14:25,12,29,8
chr6	29910679	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=19;MBQ=28,30;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=158.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,60:0.626:95:18,31:17,24:20,15,39,21
chr6	29910716	.	C	G	.	.	DP=89;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,23:0.292:80:30,13:27,9:29,28,9,14
chr6	29910717	.	A	T	.	.	DP=89;ECNT=19;MBQ=32,31;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=241.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,59:0.715:82:13,29:10,26:9,14,30,29
chr6	29910719	.	G	C	.	.	DP=81;ECNT=19;MBQ=34,34;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=239.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,58:0.711:81:13,29:10,27:9,14,30,28
chr6	29910725	.	C	G	.	.	DP=85;ECNT=19;MBQ=29,33;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,22:0.264:85:28,11:30,10:31,32,9,13
chr6	29910730	.	T	A	.	.	DP=78;ECNT=19;MBQ=31,32;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,21:0.275:78:27,11:29,10:28,29,8,13
chr6	29910742	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=19;MBQ=33,33;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,17:0.254:69:23,8:26,8:21,31,6,11
chr6	29910759	.	T	C,A	.	.	DP=59;ECNT=19;MBQ=29,29,31;MFRL=0,160,163;MMQ=60,60,60;MPOS=13,7;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=218.11,21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,51,7:0.839,0.129:59:1,16,5:0,30,1:1,0,19,39
chr6	29910761	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=19;MBQ=35,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=252.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,57:0.967:58:1,22:0,29:1,0,19,38
chr6	29910767	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=19;MBQ=33,28;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.123:55:16,2:31,1:15,34,2,4
chr6	29910770	.	ACCC	A	.	.	DP=53;ECNT=19;MBQ=30,30;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.073:53:16,2:27,1:15,35,1,2
chr6	29910774	.	TG	T	.	.	DP=51;ECNT=19;MBQ=31,30;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:15,2:28,1:14,34,1,2
chr6	29910779	.	G	GCTCC	.	.	DP=52;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:17,2:29,1:13,34,1,2
chr6	29910820	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=19;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=184.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,20:0,16:0,0,6,36
chr6	29910834	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=19;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=130.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,8:0,0,4,26
chr6	29910839	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=194,184;MMQ=46,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:7,10:5,5:4,8,0,16
chr6	29910852	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=19;MBQ=32,35;MFRL=209,191;MMQ=48,47;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,3:9,0:1,21,3,0
chr6	29910861	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=19;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,9:0,0,6,19
chr6	29910947	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=14;MBQ=30,31;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.236:35:14,3:12,4:17,10,6,2
chr6	29910970	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=14;MBQ=33,32;MFRL=182,631;MMQ=60,28;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.285:35:15,5:10,3:19,6,7,3
chr6	29910984	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=32,30;MFRL=179,631;MMQ=60,28;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.311:32:14,6:7,2:16,6,6,4
chr6	29911000	.	T	G,C	.	.	DP=24;ECNT=14;MBQ=0,24,29;MFRL=0,163,179;MMQ=60,34,60;MPOS=4,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.57,70.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,20:0.173,0.789:24:0,2,11:0,0,6:0,0,15,9
chr6	29911003	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=190,179;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.595:21:4,8:3,4:6,3,7,5
chr6	29911030	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=14;MBQ=20,26;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.640:26:1,8:5,4:6,3,9,8
chr6	29911056	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=31,33;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.280:31:10,4:8,5:12,10,4,5
chr6	29911064	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=141.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,16:0,14:0,0,19,14
chr6	29911069	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=31,20;MFRL=171,97;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:13,2:9,6:16,7,4,5
chr6	29911077	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=14;MBQ=20,33;MFRL=96,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,25:0.703:35:3,14:7,10:4,6,18,7
chr6	29911114	.	GG	AC	.	.	DP=35;ECNT=14;MBQ=29,28;MFRL=171,101;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:15,3:8,6:12,11,4,6
chr6	29911119	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=14;MBQ=33,30;MFRL=171,118;MMQ=60,51;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:15,6:8,5:12,11,5,6
chr6	29911149	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=14;MBQ=33,33;MFRL=141,165;MMQ=52,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,31:0.680:45:7,17:6,13:9,5,17,14
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chr6	29911228	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=14;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=187.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.978:43:0,17:0,20:0|1:29911203_A_C:29911203:0,0,22,21
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chr6	29911326	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=14;MBQ=32,32;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,16:0.380:42:15,8:9,6:0|1:29911203_A_C:29911203:6,20,2,14
chr6	29911344	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=14;MBQ=34,29;MFRL=150,146;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.142:33:19,3:8,1:0|1:29911203_A_C:29911203:5,24,0,4
chr6	29911360	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=31,32;MFRL=152,138;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:13,2:8,1:0|1:29911203_A_C:29911203:1,21,0,3
chr6	29911367	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=209,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:6,4:4,3:0|1:29911203_A_C:29911203:0,11,1,6
chr6	29911388	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=14;MBQ=34,30;MFRL=213,173;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:4,1:0|1:29911203_A_C:29911203:0,8,0,2
chr6	29911395	.	AATTGG	A	.	.	DP=9;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=209,173;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,1:0|1:29911203_A_C:29911203:0,7,0,2
chr6	29911419	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=26,32;MFRL=178,268;MMQ=40,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:29911203_A_C:29911203:0,1,0,3
chr6	29911803	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=30,32;MFRL=168,166;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:11,4:4,4:10,5,4,4
chr6	29911837	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=28,32;MFRL=148,153;MMQ=33,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.586:39:8,13:8,10:16,0,19,4
chr6	29911879	.	T	G	.	.	DP=79;ECNT=14;MBQ=31,34;MFRL=124,174;MMQ=39,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,7:0.104:75:38,5:28,2:49,19,5,2
chr6	29911893	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=14;MBQ=29,31;MFRL=118,174;MMQ=51,42;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,7:0.101:77:40,5:26,2:0|1:29911893_C_T:29911893:39,31,5,2
chr6	29911895	.	T	A	.	.	DP=78;ECNT=14;MBQ=29,31;MFRL=119,174;MMQ=51,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,7:0.100:78:44,5:24,2:0|1:29911893_C_T:29911893:39,32,5,2
chr6	29911901	.	C	G	.	.	DP=84;ECNT=14;MBQ=31,27;MFRL=122,174;MMQ=39,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,7:0.093:84:44,5:25,2:0|1:29911893_C_T:29911893:39,38,5,2
chr6	29911912	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=14;MBQ=27,27;MFRL=126,174;MMQ=39,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,7:0.091:79:31,5:20,2:27,45,5,2
chr6	29911921	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=14;MBQ=33,29;MFRL=128,173;MMQ=39,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,6:0.090:76:38,4:23,2:0|1:29911921_C_T:29911921:22,48,4,2
chr6	29911925	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=14;MBQ=34,29;MFRL=150,126;MMQ=40,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=78.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,32:0.507:63:17,20:12,12:9,22,11,21
chr6	29911928	.	C	G	.	.	DP=59;ECNT=14;MBQ=33,30;MFRL=128,175;MMQ=39,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,3:0.066:59:29,2:21,1:0|1:29911921_C_T:29911921:15,41,2,1
chr6	29911930	.	CA	TG	.	.	DP=59;ECNT=14;MBQ=34,32;MFRL=130,175;MMQ=39,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,3:0.067:58:29,2:23,1:0|1:29911921_C_T:29911921:15,40,2,1
chr6	29911951	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=14;MBQ=34,32;MFRL=148,166;MMQ=33,39;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,16:0.395:41:11,7:13,8:0|1:29911951_C_T:29911951:2,23,1,15
chr6	29911957	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=148,166;MMQ=33,39;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,14:0.366:39:11,6:13,7:0|1:29911951_C_T:29911951:2,23,1,13
chr6	29911970	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=156,248;MMQ=39,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:15,0:13,5:0,28,3,2
chr6	29912028	.	AG	A	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=194,189;MMQ=27,39;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:15,3:19,1:0|1:29912028_AG_A:29912028:26,9,0,4
chr6	29912030	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=192,189;MMQ=27,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.119:40:15,3:19,1:0|1:29912028_AG_A:29912028:27,9,0,4
chr6	29912041	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=203,182;MMQ=33,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,29:0.750:38:5,14:4,15:6,3,22,7
chr6	29912086	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=181,151;MMQ=33,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,15:0.296:52:19,8:18,7:36,1,12,3
chr6	29912087	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=7;MBQ=34,28;MFRL=155,178;MMQ=27,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=130.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,35:0.680:51:8,19:8,15:12,4,35,0
chr6	29912098	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=7;MBQ=35,30;MFRL=169,129;MMQ=39,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,13:0.241:56:20,6:21,6:35,8,10,3
chr6	29912108	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=129,173;MMQ=27,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=166.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,46:0.724:63:10,22:7,22:11,6,38,8
chr6	29912204	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=187,169;MMQ=52,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=193.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,55:0.728:75:9,22:11,33:10,10,26,29
chr6	29912227	.	TGGA	T	.	.	DP=95;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=138.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,37:0.427:87:22,25:24,12:32,18,22,15
chr6	29912234	.	C	G	.	.	DP=96;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,29:0.325:90:39,11:21,18:37,24,17,12
chr6	29912280	.	TG	CA,CG	.	.	DP=116;ECNT=4;MBQ=0,33,28;MFRL=0,166,141;MMQ=60,43,59;MPOS=16,13;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.30,256.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,22,84:0.200,0.791:106:0,11,47:0,10,36:0,0,55,51
chr6	29912297	.	A	G	.	.	DP=112;ECNT=21;MBQ=30,28;MFRL=144,165;MMQ=51,45;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,23:0.220:107:35,11:35,11:27,57,17,6
chr6	29912315	.	A	C	.	.	DP=114;ECNT=21;MBQ=31,34;MFRL=153,139;MMQ=49,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=118.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,35:0.321:110:39,16:30,19:31,44,12,23
chr6	29912326	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=21;MBQ=32,31;MFRL=145,141;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=144.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,41:0.382:108:36,21:30,19:27,40,11,30
chr6	29912333	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=147,146;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=274.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,70:0.689:101:17,32:12,34:15,16,21,49
chr6	29912345	.	A	T	.	.	DP=92;ECNT=21;MBQ=31,30;MFRL=144,145;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=111.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,32:0.354:91:30,15:25,12:20,39,10,22
chr6	29912348	.	A	G	.	.	DP=91;ECNT=21;MBQ=29,31;MFRL=146,142;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=238.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,61:0.666:91:19,30:10,26:10,20,18,43
chr6	29912368	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=21;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=320.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,30:0,30:0,0,20,54
chr6	29912373	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=152,142;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,17:0.287:61:18,8:19,9:12,32,3,14
chr6	29912386	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=21;MBQ=33,34;MFRL=151,144;MMQ=55,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,21:0.393:54:14,10:16,11:7,26,7,14
chr6	29912395	.	T	TGG	.	.	DP=56;ECNT=21;MBQ=29,30;MFRL=152,160;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,13:0.254:53:11,7:15,5:11,29,3,10
chr6	29912398	.	A	G,T	.	.	DP=56;ECNT=21;MBQ=32,33,31;MFRL=158,151,160;MMQ=60,54,56;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=53.40,44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,15,13:0.289,0.253:54:9,8,8:15,7,4:8,18,6,22
chr6	29912405	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=153,160;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,15:0.262:59:20,8:22,5:12,32,4,11
chr6	29912413	.	TG	T	.	.	DP=54;ECNT=21;MBQ=28,28;MFRL=159,153;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=111.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,30:0.553:54:8,14:10,7:8,16,8,22
chr6	29912451	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=21;MBQ=33,29;MFRL=165,158;MMQ=60,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:9,8:7,7:3,14,3,13
chr6	29912457	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=21;MBQ=33,33;MFRL=171,154;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:10,7:7,8:3,15,3,12
chr6	29912463	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=21;MBQ=31,30;MFRL=167,122;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:12,3:6,4:2,18,1,6
chr6	29912473	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=21;MBQ=32,34;MFRL=157,134;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,4:3,5:1,8,2,11
chr6	29912477	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=157,134;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,4:3,4:1,8,0,9
chr6	29912493	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=21;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,8:0,0,1,16
chr6	29912502	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=21;MBQ=34,30;MFRL=158,168;MMQ=54,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,3:1,7,0,6
chr6	29912510	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=31,35;MFRL=164,158;MMQ=40,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0,4,1,5
chr6	29912713	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:9,4:1,2:8,2,5,1
chr6	29912754	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,6:4,6:10,2,9,3
chr6	29912766	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:10,7:7,8:13,4,11,4
chr6	29912767	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=183,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:13,5:11,4:18,6,6,3
chr6	29912830	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=16;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.968:27:0,13:0,10:0|1:29912830_T_C:29912830:0,0,12,15
chr6	29912852	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=105.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,9:0,10:0|1:29912830_T_C:29912830:0,0,15,11
chr6	29912856	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=16;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=106.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.967:27:0,13:0,11:0|1:29912830_T_C:29912830:0,0,15,12
chr6	29912885	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=157,167;MMQ=48,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,6:0.152:44:22,5:15,1:0|1:29912885_C_A:29912885:16,22,4,2
chr6	29912890	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=32,34;MFRL=160,167;MMQ=47,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.146:46:23,5:16,1:0|1:29912885_C_A:29912885:16,24,4,2
chr6	29912892	.	CT	AA	.	.	DP=47;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=160,167;MMQ=46,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,6:0.143:47:24,5:16,1:0|1:29912885_C_A:29912885:17,24,4,2
chr6	29912896	.	GG	AA	.	.	DP=48;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=160,167;MMQ=46,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,6:0.140:48:24,5:17,1:0|1:29912885_C_A:29912885:18,24,4,2
chr6	29912900	.	CT	AC	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=160,167;MMQ=46,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,6:0.142:47:22,5:17,1:0|1:29912885_C_A:29912885:18,23,4,2
chr6	29912918	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=161,177;MMQ=44,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,10:0.211:50:21,8:19,2:0|1:29912918_G_A:29912918:20,20,7,3
chr6	29912923	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=33,31;MFRL=162,182;MMQ=43,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,11:0.222:52:19,8:17,3:0|1:29912918_G_A:29912918:20,21,8,3
chr6	29912925	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=16;MBQ=32,31;MFRL=176,146;MMQ=40,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.479:46:15,12:8,10:17,7,8,14
chr6	29912927	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=16;MBQ=34,32;MFRL=164,183;MMQ=42,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,10:0.229:46:19,5:16,2:0|1:29912918_G_A:29912918:18,18,7,3
chr6	29912935	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=205.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.979:46:0,23:0,21:0|1:29912935_C_T:29912935:0,0,29,17
chr6	29912938	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=16;MBQ=33,31;MFRL=166,174;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,14:0.322:44:14,6:15,7:17,13,10,4
chr6	29912944	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=202.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.979:46:0,20:0,23:0|1:29912935_C_T:29912935:0,0,29,17
chr6	29912961	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=16;MBQ=32,32;MFRL=166,189;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,17:0.360:48:16,6:14,11:22,9,13,4
chr6	29913001	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,18:0.267:69:30,6:20,12:26,25,8,10
chr6	29913037	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,14:0.237:61:29,5:18,9:20,27,7,7
chr6	29913042	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=236.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,33:0,25:0,0,26,32
chr6	29913067	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,32:0.646:49:11,15:6,14:7,10,13,19
chr6	29913074	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=248.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,25:0,24:0,0,24,33
chr6	29913078	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=247.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,25:0,28:0,0,23,34
chr6	29913098	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,16:0.293:56:18,5:21,10:17,23,7,9
chr6	29913111	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,22:0.371:60:15,11:23,11:11,27,10,12
chr6	29913171	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=17;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=148.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,18:0,0,12,23
chr6	29913179	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=17;MBQ=33,32;MFRL=169,145;MMQ=40,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:11,6:9,5:8,13,3,8
chr6	29913191	.	TG	CG,CA	.	.	DP=31;ECNT=17;MBQ=20,27,34;MFRL=122,195,144;MMQ=60,40,40;MPOS=11,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=26.33,77.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,10,20:0.289,0.653:31:0,6,12:1,4,8:1,0,10,20
chr6	29913197	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=17;MBQ=31,27;MFRL=160,142;MMQ=40,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:10,6:6,5:6,10,4,7
chr6	29913201	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=17;MBQ=30,34;MFRL=158,157;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:12,3:8,3:8,15,3,5
chr6	29913204	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=17;MBQ=33,35;MFRL=156,171;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:10,6:9,2:9,11,2,6
chr6	29913213	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=17;MBQ=31,31;MFRL=163,161;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:12,4:6,2:7,12,3,3
chr6	29913214	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=17;MBQ=30,31;MFRL=96,170;MMQ=47,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.433:19:6,6:5,2:5,6,2,6
chr6	29913266	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=17;MBQ=33,32;MFRL=169,180;MMQ=40,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:9,8:4,4:2,11,3,9
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chr6	29913275	.	GC	G	.	.	DP=20;ECNT=17;MBQ=32,32;MFRL=151,169;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:11,2:6,1:0|1:29913274_T_C:29913274:3,14,0,3
chr6	29913282	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=17;MBQ=34,32;MFRL=148,164;MMQ=60,26;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:5,0:0|1:29913274_T_C:29913274:2,14,0,2
chr6	29913306	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=17;MBQ=32,29;MFRL=151,189;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:29913274_T_C:29913274:0,9,0,2
chr6	29913310	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=17;MBQ=32,33;MFRL=153,189;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:29913274_T_C:29913274:0,8,0,2
chr6	29913344	.	G	A,C,T	.	.	DP=4;ECNT=17;MBQ=0,32,34,35;MFRL=0,31893,220,181;MMQ=60,60,46,60;MPOS=21,27,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.18,3.43,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,1,1:0.375,0.250,0.250:4:0,1,1,0:0,1,0,1:0,0,0,4
chr6	29913353	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=17;MBQ=31,36;MFRL=181,220;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:29913353_T_C:29913353:0,3,0,1
chr6	29913355	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=17;MBQ=31,33;MFRL=181,220;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:29913353_T_C:29913353:0,3,0,1
chr6	29942857	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	29942889	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,0:0,3:1,0,3,0
chr6	29942927	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,1:2,8:3,0,7,2
chr6	29942983	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.700:25:2,6:5,10:5,2,11,7
chr6	29943005	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:2,5:5,9:6,1,5,9
chr6	29943035	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:3,6:4,11:4,3,9,8
chr6	29943254	.	AGGGCT	A	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,23:0.500:46:9,11:13,12:0|1:29943254_AGGGCT_A:29943254:14,9,10,13
chr6	29943269	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,22:0.500:44:9,10:12,12:0|1:29943254_AGGGCT_A:29943254:12,10,9,13
chr6	29943336	.	GGT	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=331,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0|1:29943336_GGT_G:29943336:1,0,1,9
chr6	29943340	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=331,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0|1:29943336_GGT_G:29943336:1,0,1,9
chr6	30029651	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:8,9:13,1:18,4,9,2
chr6	30030114	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr6	30032495	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:9,11:8,13:6,11,13,12
chr6	30035341	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.652:24:5,5:3,10:1,7,0,16
chr6	30036471	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.618:19:2,1:5,11:3,4,3,9
chr6	30038823	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:4,5:6,0,6,0
chr6	30038830	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:2,1:3,4:6,0,6,0
chr6	30039075	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=223,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,2:0,2,0,4
chr6	30039098	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,33;MFRL=241,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr6	30039240	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,2,2
chr6	30041009	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=85,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:3,9:4,2:5,2,5,7
chr6	30043557	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,1:7,1:1,11,0,2
chr6	30071330	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,4,1
chr6	30071586	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0,15,0,2
chr6	30075803	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,9:2,3:4,1,12,0
chr6	30075843	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,15,7
chr6	30075864	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,7:6,6:9,4,5,8
chr6	30075867	.	TC	GG	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=29,17;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,1:8,0:0|1:30075867_TC_GG:30075867:12,13,3,0
chr6	30075872	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=142,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:10,0:0|1:30075867_TC_GG:30075867:12,13,2,0
chr6	30075877	.	GC	TG	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=142,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:10,2:0|1:30075867_TC_GG:30075867:13,14,2,0
chr6	30076016	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0|1:30076016_C_T:30076016:0,0,0,11
chr6	30076018	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0|1:30076016_C_T:30076016:0,0,0,11
chr6	30076755	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=79,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:3,2,3,1
chr6	30076828	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=97,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:4,3,1,1
chr6	30113878	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,8:5,5:4,4,1,12
chr6	30115379	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,239;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,2:10,0:6,6,2,0
chr6	30121581	.	T	TGGGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:3,1:3,0:0|1:30121581_T_TGGGA:30121581:1,5,1,1
chr6	30121583	.	G	GGGGCCGGGTGGTAAGGGATAGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:30121581_T_TGGGA:30121581:1,5,1,1
chr6	30121854	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,0:10,2:4,14,1,1
chr6	30122154	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,5:0,17:0,0,8,14
chr6	30128678	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30128678_C_G:30128678:1,0,1,0
chr6	30128686	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:30128678_C_G:30128678:1,0,1,0
chr6	30131515	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:2,4,3,3
chr6	30131546	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:5,2,2,6
chr6	30138853	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:5,7:5,4:3,7,1,11
chr6	30154199	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,4,3
chr6	30157375	.	CT	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=208,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30157375_CT_TC:30157375:0,1,0,1
chr6	30157378	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=208,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30157375_CT_TC:30157375:0,1,0,1
chr6	30157654	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	30166266	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.570:16:1,4:4,5:3,4,3,6
chr6	30228230	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,18,5
chr6	30228379	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=100.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,15:0,0,6,23
chr6	30228398	.	CG	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=82.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,3,23
chr6	30228416	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,2,20
chr6	30228879	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=36,31;MFRL=372036,163;MMQ=24,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.884:15:1,7:0,6:0|1:30228879_C_T:30228879:0,1,5,9
chr6	30228881	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=372036,163;MMQ=24,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:1,7:0,7:0|1:30228879_C_T:30228879:0,1,5,9
chr6	30228938	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,10,9
chr6	30229013	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=72,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=116.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,38:0.931:40:0,20:2,16:1,1,20,18
chr6	30229034	.	C	CT	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=72,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=129.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,37:0.914:40:1,21:2,16:1,2,20,17
chr6	30229280	.	CC	AT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=132.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,9:0,19:0|1:30229280_CC_AT:30229280:0,0,13,17
chr6	30229306	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=118.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,13:0,14:0|1:30229280_CC_AT:30229280:0,0,21,9
chr6	30229457	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=204.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,51:0.981:51:0,20:0,25:0|1:30229457_C_T:30229457:0,0,22,29
chr6	30229463	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=188.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.979:44:0,15:0,25:0|1:30229457_C_T:30229457:0,0,15,29
chr6	30229504	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,4,21
chr6	30229990	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chr6	30230085	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=165,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=84.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:0,9:1,17:1,0,8,18
chr6	30230128	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,4:1,4:1,0,4,4
chr6	30231071	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=112.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,20:0,13:0,0,19,15
chr6	30231108	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,15:0,14:0,0,15,16
chr6	30297529	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,8:0,0,4,22
chr6	30309105	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,2:10,1:15,7,3,0
chr6	30309508	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	30313227	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:4,8:9,3:5,8,5,6
chr6	30313245	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:11,0:9,15,2,0
chr6	30314566	.	TC	GA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=163.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,16:0,17:0,0,8,29
chr6	30314598	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.545:31:2,9:12,8:0,14,3,14
chr6	30314607	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,1:7,11:3,11,0,12
chr6	30457732	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=140.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,43:0.562:77:14,24:17,19:13,21,19,24
chr6	30458064	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.526:36:6,10:11,9:12,5,12,7
chr6	30460394	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,15:0.297:50:14,0:12,3:24,11,0,15
chr6	30521137	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=80.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,29:0.703:41:6,13:6,12:6,6,18,11
chr6	30539438	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.647:32:7,10:4,11:0,11,0,21
chr6	30548137	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,194;MMQ=57,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:3,1:2,1:5,0,1,2
chr6	30550370	.	G	GAGATAAGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	30551286	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr6	30552326	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=161,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:30552326_G_A:30552326:0,3,0,1
chr6	30552328	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=161,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:30552326_G_A:30552326:0,3,0,1
chr6	30552334	.	CCC	ATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=161,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:30552326_G_A:30552326:0,3,0,1
chr6	30552937	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=189,126;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	30553871	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:3,0,7,2
chr6	30558477	.	G	GA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=103,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=90.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.855:30:1,15:3,11:1,3,4,22
chr6	30571471	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.742:25:2,10:4,9:5,1,7,12
chr6	30572945	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr6	30573637	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=97,180;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:2,1:0,3:3,0,4,0
chr6	30574194	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.367:33:11,4:9,7:19,2,11,1
chr6	30575603	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=143.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,14:0,27:0,0,24,18
chr6	30575760	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:0|1:30575760_CT_C:30575760:0,1,1,2
chr6	30575775	.	T	TACCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:30575760_CT_C:30575760:1,2,0,1
chr6	30575781	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=140,146;MMQ=57,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:30575760_CT_C:30575760:1,1,0,1
chr6	30576781	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:3,7:1,7:3,1,11,3
chr6	30587847	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,177;MMQ=40,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:0,15,0,2
chr6	30596200	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:13,0:12,1:0|1:30596200_T_A:30596200:9,17,1,1
chr6	30596208	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=134,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:0|1:30596200_T_A:30596200:8,16,1,1
chr6	30596209	.	T	TGCACACACACACCA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:0|1:30596200_T_A:30596200:8,15,1,1
chr6	30596210	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,0:12,1:0|1:30596200_T_A:30596200:8,15,1,1
chr6	30619306	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30619306_C_T:30619306:0,0,0,1
chr6	30619310	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30619306_C_T:30619306:0,0,0,1
chr6	30619315	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30619306_C_T:30619306:0,0,0,1
chr6	30619317	.	T	TTGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30619306_C_T:30619306:0,0,0,1
chr6	30627216	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,2:7,1:8,0,3,0
chr6	30627254	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=139,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,1:14,1:18,5,2,0
chr6	30628082	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.860:5:0,0:0,3:0,0,0,5
chr6	30640394	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=19,23;MFRL=118,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.195:19:4,1:2,1:12,4,3,0
chr6	30645123	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=180,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:0,0:0|1:30645123_A_C:30645123:1,2,1,0
chr6	30645126	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,0:1,1:0|1:30645123_A_C:30645123:1,3,1,0
chr6	30645129	.	C	CGG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:3,0:0,1:0|1:30645123_A_C:30645123:1,3,1,0
chr6	30645136	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:30645123_A_C:30645123:0,3,1,0
chr6	30645138	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:30645123_A_C:30645123:0,3,1,0
chr6	30657015	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr6	30670292	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,4:6,7:6,5,7,4
chr6	30672367	.	CACAACTGTTTCAGGGGTCTTGACAGAGGACCGATTTTTTCTTCCCCTAGTGGTCCGAGATGTGGGCTCAGAGGTGACAGGCTGGTCTGTGGAGGCGGAAGCCTGTAGCTCAGGGGCTGTGGGG	C	.	.	DP=223;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:172,51:0.034:223:22,14:36,32:73,99,25,26
chr6	30672694	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.103:56:14,1:22,1:28,22,3,3
chr6	30679628	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,11:0,14:0,0,13,13
chr6	30711805	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=91.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,17:0,0,14,14
chr6	30857072	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=58.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:2,8:4,9:1,5,3,14
chr6	30858857	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:0,6:3,4:0,3,3,8
chr6	30859333	.	TGAGA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.727:2:0,2:0,0:0|1:30859333_TGAGA_T:30859333:0,0,1,1
chr6	30859342	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30859333_TGAGA_T:30859333:0,0,0,1
chr6	30860386	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30860386_A_T:30860386:0,1,0,1
chr6	30860388	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30860386_A_T:30860386:0,1,0,1
chr6	30864700	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:3,1,2,3
chr6	30864829	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:2,9:5,7:3,4,9,7
chr6	30865115	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr6	30865820	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=69,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr6	30867106	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=29769222,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,1,2
chr6	30876737	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=187,273;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	30877202	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,5:2,5:7,2,6,4
chr6	30877760	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.632:39:7,13:7,10:6,8,17,8
chr6	30878360	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=208,167;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:2,4:1,1:3,0,6,0
chr6	30878579	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=57.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.731:28:4,9:3,9:1,6,8,13
chr6	30878769	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=234,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,1:1,2:1,1,0,3
chr6	30878919	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:0,6:4,0:2,2,5,2
chr6	30879988	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr6	30882634	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:9,4:11,4:8,13,5,3
chr6	30882781	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:1,4,1,2
chr6	30882856	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr6	30883878	.	AAAGCAACC	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGCAACC;STR;TLOD=112.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,16:0,9:0,0,14,12
chr6	30883920	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.355:43:15,10:13,5:17,11,10,5
chr6	30884806	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:8,8:15,2:12,11,4,6
chr6	30887780	.	C	CTGGGGCGGTGCAGGTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGGGGCGGTGCAGGTGA;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	30887966	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:12,4:11,0:7,17,3,1
chr6	30887972	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:5,11:6,6:4,7,8,9
chr6	30887988	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:8,4:7,5:5,10,3,6
chr6	30888161	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=139.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,22:0,18:0|1:30888161_T_C:30888161:0,0,17,24
chr6	30888169	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,9:0.243:39:15,5:15,4:0|1:30888161_T_C:30888161:12,18,2,7
chr6	30889120	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.423:36:9,7:11,8:1,20,1,14
chr6	30890055	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:3,6:9,2:0,12,1,8
chr6	30890206	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.481:15:3,5:3,2:8,0,4,3
chr6	30890431	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr6	30890483	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,6:2,0:8,3,5,1
chr6	30890569	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,2:1,3:3,6,1,4
chr6	30890871	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr6	30892054	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr6	30892322	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=217,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	30892999	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=112,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,1:3,2:3,2,2,2
chr6	30893127	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:1,3,1,2
chr6	30893428	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=106,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,3:4,0:5,4,1,2
chr6	30893728	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,10:0,8:0,0,7,11
chr6	30893831	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=138,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,1:6,3:12,5,2,2
chr6	30899163	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr6	30899377	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:3,2,2,1
chr6	30899624	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:1,3,0,4
chr6	30916645	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=117,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,30:0.660:45:9,16:6,14:10,5,21,9
chr6	30917163	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=134,169;MMQ=51,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.253:16:7,0:5,0:0|1:30917163_A_T:30917163:6,6,0,4
chr6	30917212	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=134,134;MMQ=30,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,17:0.882:20:0,10:0,7:0|1:30917163_A_T:30917163:2,1,9,8
chr6	30918400	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=143,138;MMQ=50,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.459:35:5,7:10,3:13,6,9,7
chr6	30919057	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.663:30:4,12:5,8:6,4,15,5
chr6	30919701	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=77,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.259:28:11,5:9,1:11,10,2,5
chr6	30954245	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.789:25:2,14:2,6:1,4,12,8
chr6	30955681	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	30955963	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=118,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr6	31079339	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,152;MMQ=45,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:9,1:6,3:13,3,0,4
chr6	31083729	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=219,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:7,0,4,0
chr6	31083797	.	ACTT	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=69.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.949:16:0,8:0,7:0|1:31083797_ACTT_A:31083797:0,0,12,4
chr6	31083813	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0|1:31083797_ACTT_A:31083797:0,0,14,5
chr6	31084075	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,15,8
chr6	31084163	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,0,15
chr6	31084170	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:1,4:1,6:1,2,0,10
chr6	31084288	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr6	31084435	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:1,3,0,6
chr6	31084639	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,6:3,1:1,3,6,2
chr6	31084684	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,11,7
chr6	31084787	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:10,3:9,5:0|1:31084787_A_G:31084787:7,13,5,3
chr6	31084792	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,28:0.935:29:1,12:0,14:0|1:31084787_A_G:31084787:1,0,8,20
chr6	31084964	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr6	31085200	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,15:0,0,20,13
chr6	31085269	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=115.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,14:0,19:0,0,6,28
chr6	31085382	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	31088037	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	31088202	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr6	31088232	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:31088232_A_G:31088232:0,0,1,8
chr6	31088241	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:31088232_A_G:31088232:0,0,1,7
chr6	31097301	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr6	31097453	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,5,8
chr6	31105633	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr6	31105891	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,6,12
chr6	31106177	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.218:12:4,1:4,1:2,8,1,1
chr6	31106409	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr6	31106489	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=113,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,2:8,5:10,7,2,5
chr6	31106498	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=112,33;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:8,2:8,12,1,1
chr6	31106643	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=117,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:3,2,5,2
chr6	31107733	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,1,15
chr6	31110671	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr6	31111180	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,13:0,0:0,0,3,10
chr6	31112899	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	31112925	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	31113030	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,9,6
chr6	31113052	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr6	31113106	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0,0,4,8
chr6	31113113	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:4,2:2,4,2,3
chr6	31113214	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,18,5
chr6	31113275	.	AG	GA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=106,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:4,9:9,7:8,5,12,5
chr6	31113476	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=110,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:8,1:10,8,0,2
chr6	31116526	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr6	31118511	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,8,10
chr6	31118565	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,3,16
chr6	31122315	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,13,13
chr6	31124849	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,13,6
chr6	31125067	.	C	CAACT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AACT;STR;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,3:0,0,7,1
chr6	31125158	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=86.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,16,10
chr6	31125407	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=194,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:0,3,1,6
chr6	31125471	.	C	CTCTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr6	31129616	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr6	31129642	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr6	31130502	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	31132414	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,7,9
chr6	31132649	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=199.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,37:0,19:0,0,10,46
chr6	31132689	.	T	TGA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=84.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,12:0,7:0,0,0,20
chr6	31133509	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr6	31133577	.	A	AAAGCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr6	31133943	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,15:0,12:0,0,10,17
chr6	31138371	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=144,163;MMQ=51,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,2,1
chr6	31138377	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr6	31236853	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=160.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,19:0,26:0,0,38,11
chr6	31236998	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=137.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,15:0,23:0,0,17,21
chr6	31237002	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=34,35;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:12,5:16,4:10,18,7,2
chr6	31237014	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=158.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,18:0,15:0|1:31237014_G_A:31237014:0,0,23,13
chr6	31237017	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=161.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.974:37:0,21:0,13:0|1:31237014_G_A:31237014:0,0,24,13
chr6	31237027	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=169.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.978:41:0,21:0,17:0|1:31237014_G_A:31237014:0,0,28,13
chr6	31237048	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=178.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,24:0,23:0,0,34,14
chr6	31237061	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=190.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,27:0,28:0,0,35,20
chr6	31237124	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=179.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,22:0,30:0,0,25,29
chr6	31237162	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=219.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,26:0,31:0,0,30,29
chr6	31237230	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=175,152;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=256.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,58:0.969:59:0,26:1,29:0|1:31237230_A_G:31237230:0,1,27,31
chr6	31237233	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=175,152;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=285.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,65:0.973:66:0,27:0,31:0|1:31237230_A_G:31237230:0,1,28,37
chr6	31237237	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=171,131;MMQ=50,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=101.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,36:0.599:60:9,18:13,18:9,15,17,19
chr6	31237255	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=254.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,62:0.984:62:0,27:0,27:0|1:31237230_A_G:31237230:0,0,26,36
chr6	31237323	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=145.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.974:35:0,13:0,20:0|1:31237323_A_G:31237323:0,0,5,30
chr6	31237333	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=134.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,13:0,16:0|1:31237323_A_G:31237323:0,0,1,30
chr6	31237342	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.448:29:7,4:9,8:1,15,0,13
chr6	31237353	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=79.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,0,25
chr6	31237405	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr6	31237437	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr6	31237660	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=15;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:31237660_A_G:31237660:0,0,9,1
chr6	31237664	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=15;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0|1:31237660_A_G:31237660:0,0,10,1
chr6	31237703	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=171,177;MMQ=50,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:10,3,3,1
chr6	31237723	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=15;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=52.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,2:0,7:0|1:31237723_G_A:31237723:0,0,8,4
chr6	31237727	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=54.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0|1:31237723_G_A:31237723:0,0,8,5
chr6	31237767	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=15;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=83.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,17,2
chr6	31237769	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=96.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,8:0,10:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,18,4
chr6	31237771	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=102.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,9:0,12:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,18,5
chr6	31237773	.	TG	CC	.	.	DP=25;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,11:0,12:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,19,6
chr6	31237776	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=15;MBQ=32,30;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:1,10:8,6:7,2,12,4
chr6	31237786	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=142.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.971:33:0,16:0,15:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,26,7
chr6	31237802	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=15;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=181.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.979:46:0,25:0,19:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,35,11
chr6	31237833	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=15;MBQ=20,28;MFRL=35,130;MMQ=57,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=194.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,63:0.958:65:2,36:0,25:1,1,37,26
chr6	31237858	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=15;MBQ=30,28;MFRL=135,107;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,16:0.208:75:28,6:24,10:30,29,5,11
chr6	31237876	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=15;MBQ=28,32;MFRL=0,132;MMQ=22,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=216.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,60:0.977:61:1,26:0,33:1,0,21,39
chr6	31238126	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=150,210;MMQ=50,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,2:11,2:12,6,3,1
chr6	31238135	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,6:0,7:0|1:31238135_G_A:31238135:0,0,11,4
chr6	31238138	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=79.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,7:0,7:0|1:31238135_G_A:31238135:0,0,13,7
chr6	31238147	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=170,157;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,5:0,7:5,0,6,6
chr6	31238155	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=148,170;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.248:20:6,1:9,2:8,7,5,0
chr6	31238230	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,47;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,14:0,22:0|1:31238230_G_C:31238230:0,0,21,16
chr6	31238234	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=168.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,15:0,22:0|1:31238230_G_C:31238230:0,0,22,17
chr6	31238259	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=141.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,17:0,26:0,0,16,29
chr6	31238297	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=115.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,20:0,0,13,24
chr6	31238308	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=143.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.974:35:0,14:0,19:0|1:31238308_G_C:31238308:0,0,17,18
chr6	31238318	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=154.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.976:38:0,16:0,18:0|1:31238308_G_C:31238308:0,0,23,15
chr6	31238345	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=145,170;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.386:39:14,8:10,6:21,3,10,5
chr6	31238372	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=227.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,53:0.982:53:0,29:0,20:0|1:31238372_C_G:31238372:0,0,40,13
chr6	31238377	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=236.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,56:0.983:56:0,31:0,19:0|1:31238372_C_G:31238372:0,0,42,14
chr6	31238490	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=208.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,66:0.971:67:1,41:0,24:0,1,22,44
chr6	31238492	.	C	A	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=294.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,41:0,23:0,0,22,45
chr6	31238524	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=163.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.976:40:0,23:0,15:0|1:31238524_G_A:31238524:0,0,6,34
chr6	31238535	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=134.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,19:0,12:0|1:31238524_G_A:31238524:0,0,2,30
chr6	31238759	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:31238759_C_T:31238759:0,0,4,0
chr6	31238762	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:31238759_C_T:31238759:0,0,4,0
chr6	31238793	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=197,178;MMQ=59,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr6	31238814	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,15,2
chr6	31238822	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=200,158;MMQ=57,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.661:21:3,7:3,7:6,1,13,1
chr6	31238851	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=131.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,16:0,18:0,0,29,8
chr6	31238875	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=10;MBQ=28,26;MFRL=140,142;MMQ=49,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,8:0.177:49:21,1:14,5:0|1:31238875_G_A:31238875:29,12,5,3
chr6	31238880	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=150,142;MMQ=47,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,8:0.180:48:19,2:16,5:0|1:31238875_G_A:31238875:28,12,5,3
chr6	31238898	.	AC	CG	.	.	DP=52;ECNT=10;MBQ=28,20;MFRL=149,77;MMQ=45,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:15,1:22,1:26,21,2,0
chr6	31238909	.	GT	AG	.	.	DP=48;ECNT=10;MBQ=28,26;MFRL=149,106;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.102:47:21,0:22,4:25,18,1,3
chr6	31238931	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=155,94;MMQ=48,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:10,1:14,2:11,13,1,2
chr6	31238942	.	G	T,A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,32,20;MFRL=0,157,94;MMQ=60,50,45;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=55.36,5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,17,4:0.753,0.206:21:0,6,2:0,11,2:0,0,7,14
chr6	31238957	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=68.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,3,16
chr6	31238983	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr6	31239010	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=32,30;MFRL=178,200;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:11,4:6,1:2,16,1,4
chr6	31239050	.	G	A,T	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=0,31,29;MFRL=0,205,160;MMQ=60,40,40;MPOS=7,29;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=50.73,8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,3:0.751,0.201:17:0,8,1:0,5,2:0,0,6,11
chr6	31239060	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=27,32;MFRL=160,214;MMQ=44,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:3,4:4,1,3,6
chr6	31239090	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=207,172;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:4,2:3,7,2,1
chr6	31239101	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0|1:31239101_G_T:31239101:0,0,5,7
chr6	31239114	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=34,31;MFRL=160,178;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.857:12:1,3:0,6:0|1:31239101_G_T:31239101:0,1,3,8
chr6	31239116	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=34,31;MFRL=160,172;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,1:0,6:0|1:31239101_G_T:31239101:0,1,3,6
chr6	31239141	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=28,25;MFRL=160,212;MMQ=53,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:1,2:0,2,1,1
chr6	31239151	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr6	31239205	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,58;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr6	31239279	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,59;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0|1:31239279_T_C:31239279:0,0,12,2
chr6	31239296	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=97.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,7:0,12:0|1:31239279_T_C:31239279:0,0,20,2
chr6	31239305	.	CT	TG	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=184,177;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.401:22:4,4:8,2:12,1,8,1
chr6	31239306	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,12:0,0,20,2
chr6	31239335	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=172,177;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.420:31:6,6:11,6:17,1,11,2
chr6	31239378	.	T	G	.	.	DP=61;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=136,160;MMQ=21,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=199.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,55:0.966:56:0,26:1,27:1,0,46,9
chr6	31239407	.	G	T	.	.	DP=102;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=187.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,53:0.533:99:24,20:20,25:0|1:31239407_G_T:31239407:34,12,35,18
chr6	31239417	.	C	T	.	.	DP=107;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=190.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,54:0.533:101:25,20:20,29:0|1:31239407_G_T:31239407:33,14,35,19
chr6	31239430	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=447.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,117:0.992:117:0,53:0,53:0,0,77,40
chr6	31239449	.	C	G	.	.	DP=124;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=189.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,64:0.550:116:27,32:25,31:28,24,36,28
chr6	31239577	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=215.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,51:0.981:51:0,25:0,26:0|1:31239577_A_C:31239577:0,0,16,35
chr6	31239585	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=214.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,24:0,18:0|1:31239577_A_C:31239577:0,0,17,33
chr6	31239593	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=186,180;MMQ=50,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.447:45:14,9:11,11:8,17,7,13
chr6	31239613	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=181,174;MMQ=49,29;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,0:12,2:9,23,1,1
chr6	31239614	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=174,185;MMQ=29,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=129.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,31:0.915:33:0,18:2,13:1,1,9,22
chr6	31239622	.	C	A,G	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=0,32,35;MFRL=0,191,174;MMQ=60,48,29;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=130.78,4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,31,2:0.889,0.083:33:0,16,0:0,14,2:0,0,8,25
chr6	31239681	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,7:0,11:0,0,7,16
chr6	31239722	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=60.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr6	31239752	.	C	T,A	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=11,28,23;MFRL=210,182,154;MMQ=60,60,60;MPOS=15,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.78,8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,5:0.598,0.330:15:0,3,2:0,5,1:1,0,12,2
chr6	31239776	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=182,215;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:6,3,6,2
chr6	31239802	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=115.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,13:0,11:0|1:31239802_C_G:31239802:0,0,16,11
chr6	31239821	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=135,166;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:10,8:7,3:12,5,4,8
chr6	31239827	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=125.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,18:0,9:0|1:31239802_C_G:31239802:0,0,15,16
chr6	31239855	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=132.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,12,20
chr6	31239868	.	GT	CC,CT	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=0,33,33;MFRL=0,167,176;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=63.10,14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,21,6:0.734,0.233:27:0,9,4:0,12,2:0,0,9,18
chr6	31239896	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=31,35;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:3,9,0,2
chr6	31322866	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=114,234;MMQ=60,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,1:9,1:6,4,2,0
chr6	31322888	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=101,234;MMQ=60,34;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:4,5,2,0
chr6	31322980	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=203,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,25:0.730:34:3,6:4,13:5,4,14,11
chr6	31323115	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=150,127;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,14:0.250:58:22,7:22,6:0|1:31323115_T_C:31323115:27,17,7,7
chr6	31323128	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=147,139;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,16:0.270:61:21,7:21,5:0|1:31323115_T_C:31323115:27,18,8,8
chr6	31323134	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=147,149;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=62.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,18:0.268:69:24,9:22,6:0|1:31323115_T_C:31323115:32,19,10,8
chr6	31323143	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=138,150;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,13:0.209:65:24,7:26,4:0|1:31323115_T_C:31323115:31,21,6,7
chr6	31323202	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=135,175;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,19:0.227:86:36,10:30,9:40,27,8,11
chr6	31323215	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=140,172;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,20:0.244:84:36,13:25,7:36,28,7,13
chr6	31323233	.	A	G	.	.	DP=105;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=149,151;MMQ=60,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,18:0.186:100:49,6:31,12:38,44,7,11
chr6	31323254	.	G	C	.	.	DP=99;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=146,164;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,14:0.151:97:39,9:42,5:0|1:31323254_G_C:31323254:36,47,2,12
chr6	31323262	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=146,151;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,11:0.133:88:37,6:37,5:0|1:31323254_G_C:31323254:32,45,2,9
chr6	31323296	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=150,129;MMQ=49,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,10:0.179:59:28,4:18,6:25,24,3,7
chr6	31323337	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=150,128;MMQ=60,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,5:0.067:88:30,1:36,4:0|1:31323337_T_C:31323337:42,41,0,5
chr6	31323341	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=150,128;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,5:0.067:87:34,1:44,4:0|1:31323337_T_C:31323337:42,40,0,5
chr6	31324024	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=166,142;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,24:0.410:59:19,14:16,9:24,11,16,8
chr6	31324036	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=142,159;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,16:0.253:65:27,10:19,4:0|1:31324036_T_A:31324036:32,17,8,8
chr6	31324051	.	C	A	.	.	DP=77;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=129,167;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,20:0.266:77:34,12:20,7:0|1:31324036_T_A:31324036:34,23,10,10
chr6	31324064	.	T	A	.	.	DP=83;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=132,171;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,18:0.233:80:29,8:21,8:0|1:31324036_T_A:31324036:31,31,8,10
chr6	31324104	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=7;MBQ=33,25;MFRL=145,146;MMQ=52,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,6:0.098:58:27,2:25,2:16,36,3,3
chr6	31324151	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=142,151;MMQ=44,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=108.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,33:0.875:37:2,22:2,11:0,4,11,22
chr6	31324200	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:9,6:4,3:2,11,2,7
chr6	31324373	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:0|1:31324373_A_G:31324373:8,1,2,1
chr6	31324375	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:0|1:31324373_A_G:31324373:8,1,2,1
chr6	31324516	.	C	A	.	.	DP=84;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,15:0.186:84:39,6:26,9:0|1:31324516_C_A:31324516:48,21,9,6
chr6	31324524	.	GCC	G	.	.	DP=89;ECNT=10;MBQ=34,34;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,16:0.187:89:40,6:27,9:0|1:31324516_C_A:31324516:50,23,9,7
chr6	31324528	.	G	GTT	.	.	DP=89;ECNT=10;MBQ=34,34;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,14:0.165:89:35,6:32,8:0|1:31324516_C_A:31324516:52,23,9,5
chr6	31324531	.	C	T	.	.	DP=90;ECNT=10;MBQ=33,30;MFRL=146,169;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,12:0.141:90:38,4:33,4:0|1:31324516_C_A:31324516:51,27,7,5
chr6	31324536	.	T	G	.	.	DP=90;ECNT=10;MBQ=29,33;MFRL=147,165;MMQ=60,57;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,9:0.109:90:42,5:36,4:0|1:31324516_C_A:31324516:50,31,5,4
chr6	31324547	.	G	C	.	.	DP=94;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=146,166;MMQ=60,46;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,8:0.094:94:43,3:38,4:0|1:31324516_C_A:31324516:51,35,5,3
chr6	31324549	.	T	C	.	.	DP=97;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=146,165;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,7:0.085:92:44,3:37,4:0|1:31324516_C_A:31324516:50,35,4,3
chr6	31324586	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=10;MBQ=27,33;MFRL=147,173;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,13:0.144:95:45,3:33,7:0|1:31324586_C_T:31324586:34,48,1,12
chr6	31324603	.	CT	TC	.	.	DP=93;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=147,182;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,14:0.158:93:41,5:31,9:0|1:31324586_C_T:31324586:34,45,1,13
chr6	31324615	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=10;MBQ=29,31;MFRL=148,182;MMQ=60,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,13:0.165:83:35,4:31,6:0|1:31324586_C_T:31324586:28,42,1,12
chr6	31324641	.	T	A	.	.	DP=71;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=159,187;MMQ=60,46;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,9:0.145:67:28,4:28,5:0|1:31324641_T_A:31324641:23,35,1,8
chr6	31324643	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=157,187;MMQ=60,46;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,9:0.141:69:25,4:28,4:0|1:31324641_T_A:31324641:25,35,1,8
chr6	31324664	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=13;MBQ=31,29;MFRL=148,224;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.115:50:23,1:18,2:0|1:31324641_T_A:31324641:16,29,3,2
chr6	31324666	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=148,227;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.098:49:23,1:20,3:0|1:31324641_T_A:31324641:16,29,3,1
chr6	31324702	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=13;MBQ=28,30;MFRL=160,224;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:18,2:23,3:0|1:31324702_C_T:31324702:10,32,4,1
chr6	31324705	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=162,224;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,5:0.118:49:19,2:22,3:0|1:31324702_C_T:31324702:10,34,4,1
chr6	31324711	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=32,34;MFRL=163,207;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,4:0.106:45:18,1:22,3:0|1:31324702_C_T:31324702:9,32,3,1
chr6	31324742	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=28,35;MFRL=176,148;MMQ=60,38;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,2:10,0:0|1:31324742_T_C:31324742:6,18,2,0
chr6	31324750	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=33,34;MFRL=172,148;MMQ=60,38;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,2:14,0:0|1:31324742_T_C:31324742:8,18,2,0
chr6	31324788	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=31,33;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:8,2:10,2:0|1:31324788_T_C:31324788:12,8,1,3
chr6	31324790	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=32,31;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:6,1:11,2:0|1:31324788_T_C:31324788:12,8,1,3
chr6	31324829	.	GG	CA	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=29,33;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,11:0.364:31:6,5:10,4:0|1:31324829_GG_CA:31324829:12,8,4,7
chr6	31324847	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=34,31;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,11:0.375:30:9,3:10,7:0|1:31324829_GG_CA:31324829:11,8,4,7
chr6	31324921	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,8:0.200:43:13,3:20,4:0|1:31324921_C_T:31324921:15,20,4,4
chr6	31324925	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,8:0.191:45:15,3:19,5:0|1:31324921_C_T:31324921:15,22,4,4
chr6	31324931	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,8:0.200:43:15,3:19,5:0|1:31324921_C_T:31324921:13,22,4,4
chr6	31324953	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.208:41:15,4:18,4:12,21,4,4
chr6	31324996	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=137,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,4:6,0:3,13,1,3
chr6	31379200	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31379920	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,162;MMQ=51,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.680:20:2,4:4,9:4,2,8,6
chr6	31380297	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=117,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,4:1,10:0,1,0,14
chr6	31431063	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,32:0.576:55:17,13:6,17:10,13,16,16
chr6	31431082	.	A	G	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=188.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,32:0,22:0,0,28,28
chr6	31431403	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.625:30:7,7:4,12:10,1,15,4
chr6	31465915	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=94,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.735:16:1,6:2,5:3,1,11,1
chr6	31473546	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=140,164;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:5,8:3,10:3,5,13,5
chr6	31473561	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=152,157;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:4,9:1,10:2,3,15,4
chr6	31473844	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr6	31473957	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,142;MMQ=44,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:5,12:10,6:7,8,8,10
chr6	31474000	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.649:35:5,15:7,8:2,10,13,10
chr6	31475127	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,187;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,4:7,4:12,4,3,5
chr6	31477461	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:3,2:3,1:6,0,4,0
chr6	31477681	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,6:3,8:2,4,6,8
chr6	31477767	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,4:0,2:0,3,0,6
chr6	31497622	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.622:27:6,11:4,6:7,3,13,4
chr6	31509051	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.729:20:3,8:2,7:0,5,1,14
chr6	31525912	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr6	31555189	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,1,6
chr6	31556180	.	GGA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GA;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.236:23:5,3:4,0:18,0,5,0
chr6	31583166	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:9,4:11,4:11,9,5,3
chr6	31594628	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=134.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,20:0,20:0,0,17,23
chr6	31595772	.	GCCTGCTGCCCCA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:3,2:2,3:2,6,2,3
chr6	31595882	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,5,8
chr6	31597700	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr6	31598489	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:8,7:8,9:5,11,5,11
chr6	31601201	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.252:22:7,1:6,0:10,6,6,0
chr6	31601344	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=144.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,16:0,28:0,0,16,28
chr6	31601513	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:31601513_A_G:31601513:0,0,3,1
chr6	31601520	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=233,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:31601513_A_G:31601513:1,1,2,0
chr6	31601843	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=138,71;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.452:9:4,2:1,2:0|1:31601843_T_C:31601843:0,5,0,4
chr6	31601859	.	T	TTTCTAGTCATCTCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=69,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:31601843_T_C:31601843:0,4,0,1
chr6	31602489	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,2,2
chr6	31602967	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,7:0,0,8,12
chr6	31603770	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.563:32:11,9:2,9:6,8,10,8
chr6	31604044	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,6,10
chr6	31606901	.	C	CAAAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAG;STR;TLOD=87.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.847:24:2,8:1,12:3,0,13,8
chr6	31607050	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr6	31609272	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:3,3,6,2
chr6	31611777	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr6	31612787	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:2,4,2,4
chr6	31614102	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	31616366	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	31619576	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,6:5,5:3,4,1,10
chr6	31627449	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,2:7,1:9,1,3,0
chr6	31627523	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=125.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,20:0,0,22,16
chr6	31629953	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr6	31630241	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,10:0,19:0,0,13,18
chr6	31631547	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,3:4,0:13,0,3,0
chr6	31632134	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.677:32:4,9:6,13:5,5,14,8
chr6	31633165	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.418:26:6,6:9,3:13,2,10,1
chr6	31634570	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:10,13:7,8:12,5,15,6
chr6	31634758	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	31637807	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31638747	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=111,142;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.115:33:16,0:13,3:21,9,0,3
chr6	31639129	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr6	31644640	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr6	31644978	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr6	31650809	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=217,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,5:2,5:4,0,6,4
chr6	31655438	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,7:2,2:3,3,5,4
chr6	31657413	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=97.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,13:0,0,12,16
chr6	31657754	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	31659731	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,3:0,11:0,0,1,13
chr6	31669149	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31,32;MFRL=70,108,122;MMQ=60,60,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,8;RU=AC;STR;TLOD=7.80,27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,9:0.236,0.552:16:0,2,4:2,2,4:1,2,5,8
chr6	31671264	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,4:0,7:0,2,0,12
chr6	31675501	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,6:4,5:5,7,5,6
chr6	31675985	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr6	31678028	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	31678451	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31678451_AG_A:31678451:0,0,0,1
chr6	31678474	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=116,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31678451_AG_A:31678451:1,0,0,1
chr6	31680386	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:7,3:15,0:9,13,3,0
chr6	31687008	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.688:30:7,9:1,12:7,2,8,13
chr6	31691096	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=94,131;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:31691096_G_C:31691096:1,2,1,0
chr6	31691098	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=94,131;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:31691096_G_C:31691096:1,2,1,0
chr6	31691293	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=205,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:31691293_G_A:31691293:0,3,0,1
chr6	31691295	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=205,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.340:4:2,0:1,1:0|1:31691293_G_A:31691293:0,3,0,1
chr6	31691300	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=205,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:31691293_G_A:31691293:0,3,0,1
chr6	31691303	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:31691293_G_A:31691293:0,2,0,1
chr6	31691304	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31691293_G_A:31691293:0,2,0,1
chr6	31691657	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:6,6:2,10:3,5,10,6
chr6	31692675	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=174,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.486:8:0,1:4,3:2,2,1,3
chr6	31702005	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:21,0:9,4:17,14,0,4
chr6	31708147	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.519:31:6,8:7,8:15,0,16,0
chr6	31709147	.	C	CTCTGATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr6	31726688	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,5:2,5,4,3
chr6	31729359	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:3,3,2,1
chr6	31731014	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=277,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr6	31734102	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:11,1:17,1:16,13,0,2
chr6	31734385	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=249,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr6	31735632	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31744528	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:4,1:3,0:1,7,0,2
chr6	31745284	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:1,0,6,0
chr6	31749794	.	CC	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=139,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:31749794_CC_AG:31749794:1,2,0,1
chr6	31749797	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=139,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31749794_CC_AG:31749794:1,2,0,1
chr6	31750299	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.163:42:10,0:16,1:11,23,8,0
chr6	31759602	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=21,9;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.384:12:2,0:4,0:7,0,5,0
chr6	31759608	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=14,13;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.405:15:2,0:2,1:8,1,6,0
chr6	31759613	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=15,12;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:3,0:2,0:0|1:31759613_A_C:31759613:11,1,3,0
chr6	31759617	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,0:4,2:0|1:31759613_A_C:31759613:11,1,3,0
chr6	31762587	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,10;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:4,0:2,1:6,0,3,0
chr6	31762843	.	GG	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr6	31773821	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:7,12:2,3:5,4,11,4
chr6	31773975	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0,5,2,1
chr6	31777770	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,3:1,0:5,1,3,0
chr6	31777946	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=85.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,30:0.587:51:12,12:8,18:12,9,17,13
chr6	31778272	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=266.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,44:0,33:0,0,17,61
chr6	31783437	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=197,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr6	31783507	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,23:0.616:37:5,13:9,10:13,1,23,0
chr6	31785228	.	G	C	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,146;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=274.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,93:0.967:101:2,41:0,52:2,6,36,57
chr6	31795949	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,316;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31797587	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=115.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,8:0,23:0,0,29,5
chr6	31797769	.	A	AAAGTT	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGTT;STR;TLOD=167.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,43:0.571:75:15,26:17,16:11,21,13,30
chr6	31797923	.	GTTTTTT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=155,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=24,18;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,1:3,0:2,10,1,1
chr6	31831361	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,0:12,1:27,5,0,2
chr6	31831366	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:15,0:11,3:0|1:31831366_T_G:31831366:30,5,0,3
chr6	31831372	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:18,0:15,2:0|1:31831366_T_G:31831366:35,6,0,3
chr6	31831376	.	G	GCC	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=33,11;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.088:43:19,0:15,1:0|1:31831366_T_G:31831366:34,6,0,3
chr6	31832374	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,18;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.218:15:3,1:2,0:9,3,3,0
chr6	31837250	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	31837277	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,16,1
chr6	31837491	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	31838490	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,11:0,0,8,17
chr6	31838545	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr6	31838713	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr6	31839309	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=157.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,16:0,23:0|1:31839309_C_T:31839309:0,0,7,34
chr6	31839331	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=195,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=123.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,35:0.970:36:0,7:0,10:0|1:31839309_C_T:31839309:0,1,4,31
chr6	31843924	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:5,7,0,2
chr6	31843994	.	G	GAATGGAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr6	31848492	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,3:4,8:8,1,9,2
chr6	31855865	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=147,84;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:5,0:13,3:18,3,0,3
chr6	31856070	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,5,6
chr6	31860337	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr6	31864304	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,7,14
chr6	31864547	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:4,2:5,8:2,7,5,6
chr6	31869178	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	31905209	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=64,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:3,8:5,7:5,3,8,7
chr6	31910640	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr6	31912591	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:21,1:17,3:15,23,1,3
chr6	31913217	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=205,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr6	31913226	.	TCCTC	CCCTC,T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33,32;MFRL=183,127,214;MMQ=60,60,60;MPOS=3,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,1:2,1,0:0,2,0,2
chr6	31913235	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=183,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr6	31914935	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,5,13
chr6	31919578	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	31919896	.	GGGAACAGGCACT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=208,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr6	31921475	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:9,4:3,6:9,3,9,2
chr6	31922254	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr6	31923081	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:10,1:21,1:8,24,2,0
chr6	31928330	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,1:10,1:6,11,2,0
chr6	31928799	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,12,3
chr6	31929014	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=87.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,14,10
chr6	31930441	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,11,1
chr6	31932177	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:5,1:1,1:0,6,0,3
chr6	31933764	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=184,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:31933764_A_C:31933764:2,5,0,2
chr6	31933765	.	T	TGG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=184,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:31933764_A_C:31933764:2,5,0,2
chr6	31933768	.	CAGA	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=184,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:31933764_A_C:31933764:2,5,0,2
chr6	31933775	.	GCA	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=185,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:31933764_A_C:31933764:2,4,0,2
chr6	31933779	.	C	CGA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=185,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:31933764_A_C:31933764:2,4,0,2
chr6	31935928	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr6	31936668	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr6	31936679	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=168,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.571:17:2,4:5,4:5,2,6,4
chr6	31938528	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:12,0:20,2:14,18,0,2
chr6	31948421	.	TCTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,178;MMQ=43,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:6,7:2,3:7,1,7,3
chr6	31962236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,206;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:5,4:5,3,4,0
chr6	31962582	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,228;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr6	31994742	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:31994742_A_G:31994742:0,0,4,0
chr6	31994750	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=183,203;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:31994742_A_G:31994742:2,0,4,0
chr6	31994974	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,134;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,2:5,2:1,10,0,4
chr6	31996363	.	G	GAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,94;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr6	31997401	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=189,212;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:3,2:1,0:5,0,3,0
chr6	31997416	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=14,12;MFRL=188,205;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,0:0,0:4,0,2,0
chr6	32006214	.	CCTG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=198,203;MMQ=27,27;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:8,1,3,0
chr6	32006317	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0|1:32006317_C_T:32006317:0,0,8,14
chr6	32006337	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=199,152;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.335:25:11,4:5,4:0|1:32006317_C_T:32006317:2,15,2,6
chr6	32006597	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr6	32006621	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=175,186;MMQ=53,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr6	32006804	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,3:7,3:9,1,6,0
chr6	32006858	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,18:0,0,27,10
chr6	32006886	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=150,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:6,9:8,8:9,5,11,6
chr6	32007063	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=177,181;MMQ=27,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:3,2,2,4
chr6	32007252	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=157,131;MMQ=27,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.295:18:7,0:4,0:0|1:32007252_A_C:32007252:3,10,5,0
chr6	32007258	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=164,131;MMQ=44,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.280:19:6,2:3,0:0|1:32007252_A_C:32007252:5,9,5,0
chr6	32007264	.	AG	CC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=164,131;MMQ=51,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.252:21:5,2:5,1:0|1:32007252_A_C:32007252:6,10,5,0
chr6	32007624	.	AC	GT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,143;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.359:37:10,6:12,7:8,16,3,10
chr6	32008451	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,184;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:12,3:8,4:14,6,5,2
chr6	32010126	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,212;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,1:4,2:15,0,3,0
chr6	32010272	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,160;MMQ=57,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.371:46:16,9:10,6:15,14,6,11
chr6	32011644	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=208,47;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	32012755	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,147;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr6	32017441	.	T	TGCAATGATCTGTGATTGTGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	32026107	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,7:0,14:0,0,9,17
chr6	32026257	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	32029226	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,162;MMQ=57,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,4:1,11:1,0,15,1
chr6	32029415	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,6,13
chr6	32029849	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,129;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:2,2:0,1:2,0,4,0
chr6	32030284	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	32032743	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:4,3:4,3,2,5
chr6	32035427	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,4:2,4:5,0,8,0
chr6	32035652	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,191;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:11,8,2,0
chr6	32047223	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	32050067	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,6,11
chr6	32064098	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=213,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:1,0,0,2
chr6	32088504	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=157,92;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,2:7,0:0|1:32088504_C_A:32088504:13,0,2,1
chr6	32088508	.	GT	AG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,92;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,2:5,0:0|1:32088504_C_A:32088504:14,0,1,1
chr6	32089142	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,2:5,9:3,5,2,9
chr6	32089217	.	CG	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=190,216;MMQ=53,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	32117282	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.212:19:7,0:5,0:3,12,4,0
chr6	32119898	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,4:0,3:0,0,3,6
chr6	32122386	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,16:0,0,17,7
chr6	32123361	.	CTGTGTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=230,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=TG;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	32123639	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,4:4,8:3,6,10,2
chr6	32147291	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.280:21:9,1:6,5:7,8,2,4
chr6	32147761	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=159.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,30:0,20:0,0,29,22
chr6	32149219	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:4,4:8,2:5,7,6,1
chr6	32150296	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.571:30:4,12:6,5:5,8,11,6
chr6	32151893	.	T	G	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,4:0.030:110:53,2:41,0:59,47,3,1
chr6	32151994	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=145.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,20:0,21:0,0,2,40
chr6	32155249	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=214,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.385:8:1,1:4,2:1,4,1,2
chr6	32157639	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=162,176;MMQ=56,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	32164799	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.513:21:5,7:5,2:2,8,2,9
chr6	32167009	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,6:7,5:0,11,0,11
chr6	32170433	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	32171683	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,4:0,3:2,1,0,7
chr6	32172065	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,14:0,0,21,10
chr6	32178773	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	32183175	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=113,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.580:14:1,3:3,5:2,4,2,6
chr6	32184705	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:8,8:1,3:6,3,9,2
chr6	32185922	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:1,5,1,2
chr6	32187836	.	G	GCC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,2:6,3:14,1,5,0
chr6	32188099	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:1,8,4,3
chr6	32188383	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:2,2:1,1:2,3,2,1
chr6	32190620	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr6	32190871	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,6:6,5:3,8,4,7
chr6	32191620	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,3:2,4:4,4,3,4
chr6	32261771	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,0,17
chr6	32268501	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,9,9
chr6	32270500	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,29:0,15:0,0,1,43
chr6	32290927	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=108.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,16:0,0,10,22
chr6	32290954	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,11:0,0,2,18
chr6	32290967	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,1:12,1:1,19,0,2
chr6	32291270	.	CAG	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=70.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr6	32291359	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=232.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.985:66:0,38:0,27:0,0,28,38
chr6	32292392	.	C	CAACT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,5:0,10:0,0,14,2
chr6	32292560	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.921:9:0,4:0,4:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,0,0,9
chr6	32292571	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,0,0,9
chr6	32298372	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=181.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.982:49:0,22:0,27:0,0,14,35
chr6	32298449	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr6	32299715	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr6	32299873	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,7,11
chr6	32303672	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,2:2,1:0,5,3,0
chr6	32306657	.	GAAAGA	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.478:42:9,11:10,9:19,3,20,0
chr6	32307260	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=76.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,21,0
chr6	32307382	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=202.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,29:0,31:0,0,17,43
chr6	32307446	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=111.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,13:0,0,0,30
chr6	32310967	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,11:0,8:0,0,11,8
chr6	32310986	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,12:0,0,12,16
chr6	32311148	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:32311148_C_G:32311148:0,0,0,4
chr6	32311152	.	G	GCAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:32311148_C_G:32311148:0,3,0,1
chr6	32311154	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:32311148_C_G:32311148:0,3,0,1
chr6	32317471	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0,0,8,2
chr6	32333837	.	T	TTTC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTC;STR;TLOD=117.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,9:0,0,23,6
chr6	32333955	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=196.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,28:0,24:0,0,19,33
chr6	32335777	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr6	32336495	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,15:0,20:0,0,35,0
chr6	32336520	.	AG	A	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=166.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.958:46:1,19:0,26:1,0,37,8
chr6	32336586	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=216.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,59:0.969:60:1,20:0,39:0,1,23,36
chr6	32337630	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.912:20:1,8:0,10:1,0,13,6
chr6	32337686	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=125.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,22:0,16:0,0,22,16
chr6	32337854	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	32337864	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=196,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	32339348	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr6	32363816	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,3,2
chr6	32363844	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,3:4,4:8,2,5,2
chr6	32363955	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:10,7:9,4:11,8,7,4
chr6	32369488	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,3,1
chr6	32370616	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=218,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr6	32370684	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=124,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,3:3,7:4,1,9,1
chr6	32370835	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.629:33:9,9:3,12:6,6,11,10
chr6	32407709	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:5,7:7,8:10,2,13,2
chr6	32410137	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr6	32410159	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:2,3:5,0,7,0
chr6	32410941	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr6	32410987	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,12,10
chr6	32411035	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,16,12
chr6	32411523	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.292:29:10,3:9,5:18,3,6,2
chr6	32411726	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr6	32485524	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:32485524_C_A:32485524:0,0,1,2
chr6	32485539	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,23;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32485524_C_A:32485524:0,0,0,1
chr6	32485547	.	AGTG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,23;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32485524_C_A:32485524:0,0,0,1
chr6	32485641	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=196,159;MMQ=39,26;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32485641_C_T:32485641:0,1,1,0
chr6	32485651	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=20,28;MFRL=196,159;MMQ=39,26;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32485641_C_T:32485641:0,1,1,0
chr6	32485655	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485655_A_G:32485655:0,0,0,1
chr6	32485661	.	AC	GA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485655_A_G:32485655:0,0,0,1
chr6	32485667	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,19;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:32485655_A_G:32485655:0,0,0,1
chr6	32485670	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485655_A_G:32485655:0,0,0,1
chr6	32485853	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,17;MFRL=0,0;MMQ=60,37;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:32485853_C_T:32485853:0,0,1,0
chr6	32485856	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,37;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485853_C_T:32485853:0,0,1,0
chr6	32485861	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,37;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485853_C_T:32485853:0,0,1,0
chr6	32485881	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,0;MMQ=60,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:32485853_C_T:32485853:0,0,1,0
chr6	32485889	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,37;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485853_C_T:32485853:0,0,1,0
chr6	32486238	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	32486278	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	32486291	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32486291_TG_CA:32486291:0,0,4,0
chr6	32486295	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32486291_TG_CA:32486291:0,0,4,0
chr6	32486315	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32486315_C_A:32486315:0,0,4,0
chr6	32486319	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32486315_C_A:32486315:0,0,4,0
chr6	32486324	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:32486315_C_A:32486315:0,0,4,1
chr6	32486332	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:32486315_C_A:32486315:0,0,4,2
chr6	32486344	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr6	32486358	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.864:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr6	32486391	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=258,162;MMQ=40,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:1,0,5,5
chr6	32486484	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=13,32;MFRL=246,162;MMQ=25,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr6	32486491	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,47;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	32486493	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=32,35;MFRL=162,246;MMQ=53,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:32486493_T_G:32486493:0,2,0,1
chr6	32486501	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=35,34;MFRL=246,181;MMQ=25,58;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0|1:32486501_G_C:32486501:0,1,0,3
chr6	32486503	.	CC	TA	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=181,246;MMQ=58,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:32486493_T_G:32486493:0,3,0,1
chr6	32486505	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=35,34;MFRL=246,181;MMQ=25,58;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0|1:32486501_G_C:32486501:0,1,0,3
chr6	32486507	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:32486507_GCA_G:32486507:0,0,0,4
chr6	32486511	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:32486507_GCA_G:32486507:0,0,0,4
chr6	32486517	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:32486507_GCA_G:32486507:0,0,0,4
chr6	32486531	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=233,181;MMQ=43,58;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0|1:32486531_G_A:32486531:0,2,0,3
chr6	32486533	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=233,181;MMQ=43,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,0:0|1:32486531_G_A:32486531:0,2,0,3
chr6	32487054	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=27;MBQ=31,33;MFRL=166,226;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:32487054_T_C:32487054:11,0,2,0
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chr6	32487066	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=27;MBQ=35,32;MFRL=246,168;MMQ=25,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,13:0.778:16:1,6:1,5:0|1:32487066_G_T:32487066:3,0,13,0
chr6	32487068	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=27;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr6	32487074	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=27;MBQ=33,34;MFRL=31257,173;MMQ=25,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=59.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.833:16:1,7:1,7:0|1:32487066_G_T:32487066:2,0,14,0
chr6	32487080	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=27;MBQ=34,31;MFRL=31257,167;MMQ=25,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=68.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.850:18:1,7:1,7:0|1:32487066_G_T:32487066:2,0,16,0
chr6	32487101	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=27;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0|1:32487066_G_T:32487066:0,0,15,3
chr6	32487104	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=27;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0|1:32487066_G_T:32487066:0,0,14,3
chr6	32487114	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=27;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,10:0,6:0|1:32487066_G_T:32487066:0,0,13,5
chr6	32487144	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=27;MBQ=34,31;MFRL=145,153;MMQ=40,26;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:14,4:7,2:12,9,6,0
chr6	32487158	.	G	GCA	.	.	DP=36;ECNT=27;MBQ=32,36;MFRL=151,137;MMQ=33,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:19,1:12,3:0|1:32487158_G_GCA:32487158:17,14,4,0
chr6	32487164	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=27;MBQ=32,32;MFRL=151,161;MMQ=33,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,5:0.146:39:21,1:12,4:0|1:32487158_G_GCA:32487158:17,17,4,1
chr6	32487170	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=27;MBQ=31,32;MFRL=151,155;MMQ=40,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=73.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:13,9:7,10:6,14,15,4
chr6	32487174	.	C	G,T	.	.	DP=41;ECNT=27;MBQ=32,32,31;MFRL=155,151,112;MMQ=27,40,25;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.87,22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,20,7:0.491,0.182:40:6,13,1:5,7,5:11,2,10,17
chr6	32487175	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=27;MBQ=33,31;MFRL=151,155;MMQ=31,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.325:41:14,8:12,5:10,18,11,2
chr6	32487189	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=27;MBQ=33,26;MFRL=161,137;MMQ=32,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,8:0.205:42:19,2:14,6:0|1:32487158_G_GCA:32487158:18,16,4,4
chr6	32487193	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=27;MBQ=33,24;MFRL=161,137;MMQ=33,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:19,2:13,6:0|1:32487158_G_GCA:32487158:17,16,4,4
chr6	32487209	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=27;MBQ=33,34;MFRL=156,159;MMQ=33,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:14,1:10,3:0|1:32487158_G_GCA:32487158:13,14,0,4
chr6	32487211	.	AC	A	.	.	DP=30;ECNT=27;MBQ=28,32;MFRL=156,159;MMQ=33,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:12,1:10,3:0|1:32487158_G_GCA:32487158:12,14,0,4
chr6	32487214	.	TC	CC,CT	.	.	DP=26;ECNT=27;MBQ=32,34,34;MFRL=159,164,161;MMQ=25,37,27;MPOS=17,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=29.06,20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,12,8:0.483,0.339:24:1,6,4:3,6,4:0,4,9,11
chr6	32487215	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=27;MBQ=29,34;MFRL=158,159;MMQ=30,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.197:24:10,1:8,3:0|1:32487158_G_GCA:32487158:8,12,0,4
chr6	32487237	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=27;MBQ=32,30;MFRL=159,154;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,1:10,2:0|1:32487237_C_T:32487237:9,17,2,1
chr6	32487241	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=27;MBQ=32,29;MFRL=161,154;MMQ=27,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.122:31:13,1:12,2:0|1:32487237_C_T:32487237:10,18,2,1
chr6	32487268	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=27;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=128.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,16:0,14:0,0,14,19
chr6	32487277	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=27;MBQ=32,31;MFRL=160,152;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:15,6:11,4:10,19,6,4
chr6	32487294	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=27;MBQ=33,30;MFRL=154,147;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,30:0.562:53:13,14:10,12:8,15,14,16
chr6	32487309	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=27;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,15:0,0,17,25
chr6	32487338	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=126,139;MMQ=30,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:21,0:14,2:9,27,0,2
chr6	32487361	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=121,152;MMQ=33,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,3:2,7,0,8
chr6	32487515	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,321;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	32489724	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=160,144;MMQ=60,26;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:11,5,1,1
chr6	32489749	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.916:9:0,3:0,4:0|1:32489749_G_A:32489749:0,0,5,4
chr6	32489754	.	T	TCC	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,4:0,0,5,4
chr6	32489755	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:32489749_G_A:32489749:0,0,2,4
chr6	32489757	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=184,147;MMQ=24,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,2:0,4:0|1:32489749_G_A:32489749:1,0,2,5
chr6	32489766	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,45;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,2:0|1:32489749_G_A:32489749:0,0,1,4
chr6	32489791	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=30;MBQ=31,31;MFRL=213,192;MMQ=53,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:0|1:32489791_A_G:32489791:0,1,4,5
chr6	32489794	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=30;MBQ=29,33;MFRL=208,192;MMQ=55,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.771:11:2,3:0,6:0|1:32489791_A_G:32489791:0,2,4,5
chr6	32489822	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=30;MBQ=27,33;MFRL=192,208;MMQ=42,55;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:6,13,0,2
chr6	32489835	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=30;MBQ=28,32;MFRL=192,184;MMQ=42,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,3:10,1:0|1:32489835_C_G:32489835:6,11,0,5
chr6	32489839	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=30;MBQ=32,28;MFRL=192,184;MMQ=40,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,4:10,1:0|1:32489835_C_G:32489835:5,12,0,5
chr6	32489844	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=30;MBQ=29,31;MFRL=192,184;MMQ=40,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:5,3:8,1:0|1:32489835_C_G:32489835:3,12,0,5
chr6	32489846	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=30;MBQ=32,31;MFRL=208,192;MMQ=35,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.852:18:0,8:2,7:0|1:32489846_A_T:32489846:1,1,1,15
chr6	32489852	.	AA	GC	.	.	DP=19;ECNT=30;MBQ=31,33;MFRL=208,191;MMQ=35,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,17:0.859:19:0,7:1,9:0|1:32489846_A_T:32489846:1,1,3,14
chr6	32489856	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=30;MBQ=9,29;MFRL=194,188;MMQ=48,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.897:17:0,7:0,7:0|1:32489846_A_T:32489846:1,0,3,13
chr6	32489868	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=30;MBQ=32,36;MFRL=184,132;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:3,10,2,0
chr6	32489871	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=30;MBQ=32,33;MFRL=118,193;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:0|1:32489871_A_G:32489871:2,3,1,7
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chr6	32489881	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=30;MBQ=34,32;MFRL=118,195;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0|1:32489871_A_G:32489871:2,3,1,8
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chr6	32489887	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=30;MBQ=31,32;MFRL=118,191;MMQ=40,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,3:3,6:0|1:32489871_A_G:32489871:2,3,2,7
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chr6	32489927	.	T	A,G	.	.	DP=12;ECNT=30;MBQ=33,32,34;MFRL=154,205,215;MMQ=45,54,25;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=21.27,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,6,2:0.467,0.200:12:1,3,1:3,3,1:1,3,1,7
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chr6	32489933	.	T	A,G	.	.	DP=11;ECNT=30;MBQ=0,30,33;MFRL=0,187,215;MMQ=60,57,25;MPOS=23,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=37.61,6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,2:0.714,0.214:11:0,2,1:0,6,1:0,0,2,9
chr6	32489937	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=30;MBQ=34,34;MFRL=194,187;MMQ=33,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:5,2:2,5,0,5
chr6	32489940	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=30;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr6	32489955	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=30;MBQ=28,29;MFRL=198,150;MMQ=44,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:1,1:4,4:0|1:32489955_T_G:32489955:1,5,1,4
chr6	32489963	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=30;MBQ=28,32;MFRL=192,172;MMQ=33,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,1:3,2:0|1:32489955_T_G:32489955:1,3,0,4
chr6	32489967	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=30;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,1:0,4:0|1:32489967_G_C:32489967:0,0,1,5
chr6	32489976	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=30;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0|1:32489967_G_C:32489967:0,0,0,3
chr6	32489981	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=30;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:32489967_G_C:32489967:0,0,0,3
chr6	32497802	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=21;MBQ=33,35;MFRL=172,183;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:15,3:14,1:0|1:32497802_A_G:32497802:27,2,4,0
chr6	32497815	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=175,175;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.103:37:16,1:17,1:0|1:32497802_A_G:32497802:32,2,3,0
chr6	32497820	.	GC	AG	.	.	DP=39;ECNT=21;MBQ=34,24;MFRL=179,161;MMQ=60,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:16,1:17,0:0|1:32497802_A_G:32497802:35,2,2,0
chr6	32497824	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=171,161;MMQ=60,38;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:16,1:18,1:0|1:32497802_A_G:32497802:36,2,2,0
chr6	32497826	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=21;MBQ=34,32;MFRL=171,161;MMQ=60,38;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:17,1:18,0:0|1:32497802_A_G:32497802:36,2,2,0
chr6	32497847	.	A	C	.	.	DP=65;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=148,158;MMQ=51,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,25:0.389:65:20,8:16,14:32,8,20,5
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chr6	32497856	.	A	T	.	.	DP=76;ECNT=21;MBQ=30,31;MFRL=156,118;MMQ=50,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,10:0.141:76:30,3:34,7:0|1:32497856_A_T:32497856:48,18,9,1
chr6	32497860	.	T	TTGC	.	.	DP=87;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=147,132;MMQ=50,29;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,4:0.056:87:36,0:40,3:0|1:32497852_C_T:32497852:61,22,2,2
chr6	32497863	.	C	G	.	.	DP=93;ECNT=21;MBQ=32,28;MFRL=145,158;MMQ=50,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,21:0.239:90:29,10:34,11:47,22,16,5
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chr6	32497877	.	C	G	.	.	DP=136;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=147,160;MMQ=47,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,25:0.194:132:51,14:52,11:0|1:32497856_A_T:32497856:63,44,14,11
chr6	32497880	.	A	T	.	.	DP=139;ECNT=21;MBQ=31,31;MFRL=152,133;MMQ=47,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:126,13:0.099:139:62,5:56,7:0|1:32497852_C_T:32497852:75,51,6,7
chr6	32497884	.	CC	GT	.	.	DP=156;ECNT=21;MBQ=32,33;MFRL=145,140;MMQ=47,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:142,14:0.095:156:66,7:65,7:0|1:32497852_C_T:32497852:76,66,6,8
chr6	32497896	.	A	G	.	.	DP=175;ECNT=21;MBQ=29,30;MFRL=137,93;MMQ=48,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:170,3:0.023:173:77,1:84,2:88,82,0,3
chr6	32497900	.	A	G	.	.	DP=177;ECNT=21;MBQ=29,32;MFRL=141,118;MMQ=47,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:165,10:0.061:175:76,3:80,7:86,79,1,9
chr6	32497901	.	C	T	.	.	DP=179;ECNT=21;MBQ=28,31;MFRL=136,143;MMQ=45,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=127.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:135,38:0.223:173:61,19:68,17:63,72,22,16
chr6	32497904	.	C	T	.	.	DP=183;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=141,133;MMQ=47,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:163,18:0.103:181:77,8:79,10:0|1:32497852_C_T:32497852:78,85,8,10
chr6	32497905	.	G	T,A	.	.	DP=181;ECNT=21;MBQ=32,31,32;MFRL=130,144,152;MMQ=51,40,47;MPOS=21,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=221.42,117.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:69,74,35:0.416,0.196:178:29,38,18:35,34,15:26,43,58,51
chr6	32497914	.	C	T	.	.	DP=177;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=135,151;MMQ=40,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=120.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:139,37:0.213:176:64,16:66,18:56,83,24,13
chr6	32497917	.	C	A	.	.	DP=172;ECNT=21;MBQ=33,29;MFRL=133,170;MMQ=49,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:137,31:0.182:168:61,12:67,16:59,78,15,16
chr6	32497943	.	A	G	.	.	DP=122;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=121,147;MMQ=39,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=195.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,61:0.545:112:21,30:28,27:19,32,30,31
chr6	32497959	.	GCT	G	.	.	DP=92;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=135,145;MMQ=50,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=112.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,42:0.479:88:19,21:23,20:19,27,19,23
chr6	32497961	.	TT	GC	.	.	DP=89;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,49;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.988:84:0,38:0,41:0,0,37,47
chr6	32497962	.	T	TGC	.	.	DP=83;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=77,146;MMQ=51,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,75:0.955:78:1,34:1,36:0,3,33,42
chr6	32498033	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=172,138;MMQ=49,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=144.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,42:0.782:53:3,16:8,26:3,8,8,34
chr6	32498041	.	CA	TG	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=35,29;MFRL=147,172;MMQ=51,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,11:0.245:47:15,3:20,6:3,33,3,8
chr6	32498067	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=133.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,20:0,0,2,28
chr6	32498094	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr6	32546736	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=158,175;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:32546736_C_CAG:32546736:2,0,2,0
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chr6	32546743	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	32546765	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=32,26;MFRL=171,175;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr6	32546783	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=25,34;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0|1:32546783_T_C:32546783:1,0,5,0
chr6	32546795	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:32546783_T_C:32546783:0,0,5,1
chr6	32546800	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:32546783_T_C:32546783:0,0,6,1
chr6	32546805	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:32546783_T_C:32546783:0,0,8,1
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chr6	32546836	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:32546783_T_C:32546783:0,0,7,5
chr6	32546838	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:32546783_T_C:32546783:0,0,7,5
chr6	32546863	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=145,102;MMQ=48,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:11,1:6,1:0|1:32546863_G_T:32546863:10,8,3,0
chr6	32546866	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,49;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,13,8
chr6	32546879	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=156,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.248:22:10,1:5,4:0|1:32546863_G_T:32546863:8,9,3,2
chr6	32546894	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=102,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,8:4,3:3,2,6,6
chr6	32546912	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=161,115;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:7,1:2,3:0|1:32546912_A_AG:32546912:5,6,2,2
chr6	32546914	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=159,115;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,1:2,3:0|1:32546912_A_AG:32546912:5,5,2,2
chr6	32546931	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=22,29;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:1,3:0|1:32546912_A_AG:32546912:2,2,1,2
chr6	32546935	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:32546912_A_AG:32546912:2,2,0,2
chr6	32547988	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0|1:32547988_T_C:32547988:0,0,14,7
chr6	32547991	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,7:0,13:0|1:32547988_T_C:32547988:0,0,14,7
chr6	32548006	.	AGG	A	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=118.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,9:0,16:0|1:32547988_T_C:32547988:0,0,16,11
chr6	32548031	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=28,22;MFRL=129,129;MMQ=40,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,1:12,0:0|1:32548031_C_T:32548031:8,13,1,1
chr6	32548032	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=26,30;MFRL=129,128;MMQ=34,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:1,9:1,11:1,1,8,12
chr6	32548049	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=152,129;MMQ=40,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,1:8,1:0|1:32548031_C_T:32548031:3,15,1,1
chr6	32548054	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=153,129;MMQ=40,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:8,1:0|1:32548031_C_T:32548031:1,14,1,1
chr6	32548058	.	GAGGAA	G	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=35,35;MFRL=129,153;MMQ=34,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,15:0.842:17:1,6:1,9:0|1:32548058_GAGGAA_G:32548058:1,1,1,14
chr6	32548082	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,6:0|1:32548058_GAGGAA_G:32548058:0,0,0,15
chr6	32548086	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=13;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:32548058_GAGGAA_G:32548058:0,0,0,12
chr6	32548097	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:32548058_GAGGAA_G:32548058:0,0,0,10
chr6	32548118	.	A	ACAAC	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=166,174;MMQ=37,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:32548118_A_ACAAC:32548118:1,3,0,1
chr6	32548119	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=33,34;MFRL=166,174;MMQ=37,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:32548118_A_ACAAC:32548118:1,3,0,1
chr6	32548143	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=173,181;MMQ=37,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,2:0|1:32548143_T_C:32548143:0,1,1,2
chr6	32548146	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=173,181;MMQ=37,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:32548143_T_C:32548143:0,1,1,2
chr6	32548167	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=173,99;MMQ=37,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,3:0,0:0,1,1,2
chr6	32548178	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	32548438	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=20;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,11:0,5:0|1:32548438_A_G:32548438:0,0,17,0
chr6	32548465	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=20;MBQ=32,28;MFRL=152,135;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.114:42:20,0:12,3:0|1:32548438_A_G:32548438:35,3,3,1
chr6	32548470	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=20;MBQ=34,30;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=157.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,39:0.714:54:8,26:5,10:0|1:32548438_A_G:32548438:12,3,37,2
chr6	32548484	.	A	T	.	.	DP=81;ECNT=20;MBQ=32,31;MFRL=142,166;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,6:0.085:80:41,4:24,1:0|1:32548438_A_G:32548438:60,14,6,0
chr6	32548487	.	G	C	.	.	DP=90;ECNT=20;MBQ=33,33;MFRL=145,140;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,31:0.348:90:31,16:22,11:0|1:32548438_A_G:32548438:50,9,26,5
chr6	32548488	.	C	T	.	.	DP=93;ECNT=20;MBQ=32,29;MFRL=138,149;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=104.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,29:0.316:93:38,13:22,11:0|1:32548438_A_G:32548438:53,11,26,3
chr6	32548489	.	C	G	.	.	DP=95;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=145,131;MMQ=59,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,20:0.216:95:40,13:30,6:0|1:32548438_A_G:32548438:64,11,16,4
chr6	32548491	.	A	G	.	.	DP=95;ECNT=20;MBQ=30,34;MFRL=145,136;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=116.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,33:0.354:94:34,22:26,10:0|1:32548438_A_G:32548438:52,9,27,6
chr6	32548497	.	AGAGC	A	.	.	DP=118;ECNT=20;MBQ=31,32;MFRL=143,146;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,12:0.108:118:53,7:30,5:0|1:32548438_A_G:32548438:89,17,10,2
chr6	32548498	.	G	C	.	.	DP=111;ECNT=20;MBQ=34,32;MFRL=149,132;MMQ=54,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=254.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,65:0.654:99:15,44:18,17:0|1:32548438_A_G:32548438:29,5,54,11
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chr6	32548662	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=20;MBQ=33,34;MFRL=159,165;MMQ=50,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,22:0.479:46:11,13:13,7:0|1:32548662_T_C:32548662:1,23,1,21
chr6	32548667	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=20;MBQ=32,33;MFRL=177,152;MMQ=50,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,17:0.429:40:12,7:10,8:0|1:32548661_G_T:32548661:1,22,1,16
chr6	32548669	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=20;MBQ=34,31;MFRL=165,152;MMQ=50,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:12,5:15,2:1,29,1,6
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chr6	32548674	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=20;MBQ=32,32;MFRL=165,153;MMQ=41,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:8,6:8,4:0|1:32548661_G_T:32548661:1,15,1,10
chr6	32548681	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,7:0,9:0|1:32548681_T_C:32548681:0,0,1,20
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chr6	32549284	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,47;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr6	32549296	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
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chr6	32549361	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32549356_TG_CA:32549356:0,0,3,1
chr6	32549376	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32549376_C_G:32549376:0,0,3,0
chr6	32549380	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32549376_C_G:32549376:0,0,3,0
chr6	32549396	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=29,35;MFRL=198,166;MMQ=33,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.662:8:0,1:1,3:0|1:32549396_C_G:32549396:3,0,5,0
chr6	32549398	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=24,31;MFRL=104,166;MMQ=33,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.553:10:1,2:1,3:0|1:32549396_C_G:32549396:5,0,5,0
chr6	32549401	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=152,104;MMQ=39,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.358:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr6	32549402	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=32,34;MFRL=104,152;MMQ=33,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.642:9:0,3:3,3:0|1:32549396_C_G:32549396:3,0,6,0
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chr6	32549475	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=30;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=184.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.980:46:0,23:0,19:0|1:32549464_T_C:32549464:0,0,33,13
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chr6	32557339	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=32,29;MFRL=179,165;MMQ=34,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.849:18:2,8:0,8:0|1:32557319_A_T:32557319:2,0,15,1
chr6	32557365	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=32,34;MFRL=165,169;MMQ=27,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:6,2:11,3:0|1:32557365_A_C:32557365:13,5,5,0
chr6	32557370	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=159,172;MMQ=40,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,1:15,1:0|1:32557370_C_T:32557370:18,5,2,0
chr6	32557374	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=31,32;MFRL=169,157;MMQ=27,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:5,3:10,5:0|1:32557365_A_C:32557365:10,5,8,0
chr6	32557378	.	T	TTGC	.	.	DP=25;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=155,172;MMQ=39,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:6,1:16,1:0|1:32557370_C_T:32557370:18,5,2,0
chr6	32557395	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=15;MBQ=33,34;MFRL=140,154;MMQ=27,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.335:31:8,5:11,5:0|1:32557365_A_C:32557365:16,5,10,0
chr6	32557398	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=31,30;MFRL=146,150;MMQ=27,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.187:30:8,3:15,2:0|1:32557370_C_T:32557370:21,4,5,0
chr6	32557402	.	CC	GT	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=32,33;MFRL=146,136;MMQ=27,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.219:30:8,3:15,2:0|1:32557370_C_T:32557370:20,4,6,0
chr6	32557405	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=15;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=129.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,12:0,17:0,0,26,5
chr6	32557414	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=31,28;MFRL=148,161;MMQ=33,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:16,2:15,2:0|1:32557414_A_G:32557414:29,5,4,0
chr6	32557419	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=32,31;MFRL=148,161;MMQ=33,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:16,2:15,1:0|1:32557414_A_G:32557414:29,5,4,0
chr6	32557422	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=146,122;MMQ=27,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:17,4:12,2:0|1:32557370_C_T:32557370:26,5,7,0
chr6	32557423	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=15;MBQ=29,31;MFRL=144,188;MMQ=33,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.379:35:13,8:7,5:20,2,12,1
chr6	32557435	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=15;MBQ=25,32;MFRL=118,142;MMQ=27,37;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,41:0.936:43:0,28:2,12:2,0,33,8
chr6	32557461	.	A	G	.	.	DP=105;ECNT=25;MBQ=32,27;MFRL=138,120;MMQ=40,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=74.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,22:0.219:103:38,11:39,10:0|1:32557461_A_G:32557461:47,34,12,10
chr6	32557465	.	G	A	.	.	DP=123;ECNT=25;MBQ=33,30;MFRL=140,119;MMQ=45,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,24:0.200:123:44,12:45,11:0|1:32557461_A_G:32557461:58,41,13,11
chr6	32557478	.	CG	AA,AG	.	.	DP=142;ECNT=25;MBQ=30,31,32;MFRL=120,132,147;MMQ=50,40,51;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=70.53,80.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:72,30,34:0.219,0.251:136:35,16,14:34,10,18:38,34,39,25
chr6	32557483	.	T	C	.	.	DP=142;ECNT=25;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=628.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,142:0.993:142:0,68:0,67:0|1:32557461_A_G:32557461:0,0,80,62
chr6	32557487	.	G	A	.	.	DP=146;ECNT=25;MBQ=33,30;MFRL=129,118;MMQ=50,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=74.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:123,23:0.162:146:60,12:59,11:0|1:32557461_A_G:32557461:68,55,12,11
chr6	32557497	.	C	T	.	.	DP=143;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=121,146;MMQ=51,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:130,13:0.097:143:63,8:66,5:0|1:32557461_A_G:32557461:70,60,5,8
chr6	32557504	.	G	A	.	.	DP=141;ECNT=25;MBQ=33,30;MFRL=118,147;MMQ=51,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,24:0.184:134:52,8:54,15:0|1:32557461_A_G:32557461:57,53,12,12
chr6	32557506	.	T	C	.	.	DP=137;ECNT=25;MBQ=32,33;MFRL=140,116;MMQ=51,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=269.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,74:0.552:133:27,33:28,38:0|1:32557461_A_G:32557461:28,31,40,34
chr6	32557544	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=25;MBQ=32,29;MFRL=130,110;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=60.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,18:0.389:47:15,7:12,9:0|1:32557461_A_G:32557461:11,18,5,13
chr6	32557549	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=25;MBQ=32,25;MFRL=124,111;MMQ=40,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.114:41:15,4:20,0:0|1:32557461_A_G:32557461:10,27,1,3
chr6	32557550	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=25;MBQ=31,31;MFRL=131,112;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,19:0.417:46:12,7:11,7:0|1:32557461_A_G:32557461:8,19,4,15
chr6	32557552	.	A	C,T	.	.	DP=43;ECNT=25;MBQ=0,34,30;MFRL=0,131,114;MMQ=60,40,40;MPOS=11,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=95.75,66.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,25,18:0.565,0.413:43:0,10,7:0,11,9:0,0,10,33
chr6	32557568	.	C	CAT	.	.	DP=26;ECNT=25;MBQ=34,37;MFRL=134,132;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:6,5:9,5:0|1:32557461_A_G:32557461:1,15,0,10
chr6	32557572	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=25;MBQ=33,29;MFRL=138,132;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:6,5:8,5:0|1:32557461_A_G:32557461:1,14,0,10
chr6	32557585	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=25;MBQ=29,35;MFRL=138,131;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:5,4:8,5:0|1:32557461_A_G:32557461:1,14,0,9
chr6	32557586	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=25;MBQ=34,35;MFRL=138,132;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:5,4:8,5:0|1:32557461_A_G:32557461:1,14,0,10
chr6	32557592	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=25;MBQ=34,31;MFRL=145,145;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,12:0.481:25:5,3:8,9:0|1:32557461_A_G:32557461:1,12,0,12
chr6	32557595	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=25;MBQ=32,32;MFRL=145,145;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,12:0.481:25:4,2:8,9:0|1:32557461_A_G:32557461:1,12,0,12
chr6	32557600	.	T	TC	.	.	DP=22;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=150,148;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:3,2:7,9:0|1:32557461_A_G:32557461:1,10,0,11
chr6	32557601	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=25;MBQ=32,33;MFRL=169,148;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:3,2:7,9:0|1:32557461_A_G:32557461:1,9,0,11
chr6	32557605	.	AGT	A	.	.	DP=21;ECNT=25;MBQ=31,27;MFRL=169,148;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:3,1:6,7:0|1:32557461_A_G:32557461:1,9,0,11
chr6	32557608	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=25;MBQ=26,33;MFRL=150,158;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:2,1:4,8:0|1:32557461_A_G:32557461:1,8,0,9
chr6	32557610	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=25;MBQ=29,35;MFRL=150,158;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:2,1:4,7:0|1:32557461_A_G:32557461:1,6,0,9
chr6	32557611	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=25;MBQ=28,28;MFRL=163,150;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:0,2:7,4:0|1:32557461_A_G:32557461:0,8,1,6
chr6	32557617	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=25;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0|1:32557461_A_G:32557461:0,0,1,12
chr6	32605132	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=159,168;MMQ=58,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr6	32605178	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=164,201;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:5,4:3,4:0|1:32605178_T_C:32605178:9,0,8,0
chr6	32605189	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=162,167;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,6:4,7:10,0,13,0
chr6	32605207	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=153,168;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.452:29:11,5:5,8:0|1:32605178_T_C:32605178:13,3,12,1
chr6	32605257	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=147,145;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,26:0.464:56:16,17:14,8:21,9,19,7
chr6	32605274	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=147,139;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=111.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,30:0.463:65:16,19:18,8:21,14,20,10
chr6	32605284	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=138,141;MMQ=50,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,37:0.512:72:23,19:11,16:24,11,21,16
chr6	32605295	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=125,132;MMQ=60,48;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,33:0.404:82:20,22:26,11:27,22,21,12
chr6	32605309	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=138,121;MMQ=45,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,37:0.462:80:25,14:13,21:21,22,20,17
chr6	32605336	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=140,138;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,31:0.487:64:12,21:19,10:14,19,9,22
chr6	32605380	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.431:33:9,5:9,8:1,18,0,14
chr6	32605400	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.470:28:6,6:8,7:0,15,0,13
chr6	32605418	.	GG	AC	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,5:7,5:0,11,0,10
chr6	32608998	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,4:1,0:4,0,4,1
chr6	32609042	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.337:27:10,6:7,3:15,3,8,1
chr6	32609056	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:11,8:9,3:15,5,8,3
chr6	32609094	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=9;MBQ=30,31;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,14:0.358:40:16,8:9,6:15,11,6,8
chr6	32609105	.	GT	AC	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.311:46:20,8:12,5:15,17,5,9
chr6	32609126	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=32,34;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.171:33:17,2:8,3:0|1:32609126_T_C:32609126:11,17,1,4
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chr6	32609142	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:15,1:8,1:9,14,0,3
chr6	32609173	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,5:0,0,4,12
chr6	32609371	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	32609647	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=30,34;MFRL=180,160;MMQ=50,35;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0|1:32609647_T_G:32609647:4,0,2,0
chr6	32609652	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=171,160;MMQ=60,35;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0|1:32609647_T_G:32609647:8,0,2,0
chr6	32609654	.	GT	AG	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=171,160;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0|1:32609647_T_G:32609647:8,0,2,0
chr6	32609671	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=171,154;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:6,1:2,2:0|1:32609671_G_A:32609671:8,0,3,0
chr6	32609673	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=35,32;MFRL=171,154;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,1:2,2:0|1:32609671_G_A:32609671:8,0,3,0
chr6	32609696	.	A	AGAAG	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=161,154;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:8,1:4,2:0|1:32609696_A_AGAAG:32609696:12,1,4,0
chr6	32609697	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=161,154;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:8,0:4,3:0|1:32609696_A_AGAAG:32609696:12,1,4,0
chr6	32609722	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=124,126;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.194:27:11,2:11,2:19,3,4,1
chr6	32609746	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=133,136;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.313:46:15,8:15,6:26,6,11,3
chr6	32609855	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=154,173;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:11,1:16,4:16,12,2,3
chr6	32609873	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=158,175;MMQ=52,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.153:41:17,2:18,3:19,16,2,4
chr6	32610008	.	CC	TG	.	.	DP=104;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=129,156;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,24:0.243:101:45,11:30,12:38,39,21,3
chr6	32610047	.	T	C	.	.	DP=95;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,29:0.318:92:34,10:27,18:20,43,3,26
chr6	32610059	.	T	G	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=81.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,28:0.373:76:27,7:19,21:10,38,3,25
chr6	32610099	.	TC	T	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,18:0.464:39:12,7:9,9:0|1:32610099_TC_T:32610099:0,21,0,18
chr6	32610109	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,16:0.486:33:9,8:8,7:0|1:32610099_TC_T:32610099:0,17,0,16
chr6	32610349	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,12:0,3:0,0,13,2
chr6	32610401	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=163,158;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.341:39:16,9:10,3:0|1:32610401_G_A:32610401:17,9,9,4
chr6	32610403	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=163,158;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.341:39:16,9:9,4:0|1:32610401_G_A:32610401:17,9,9,4
chr6	32610436	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,19:0,13:0,0,22,12
chr6	32610461	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,10:0,0,14,11
chr6	32610478	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=155,155;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,8:0.255:33:10,5:12,2:0|1:32610478_C_G:32610478:13,12,1,7
chr6	32610481	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=32,26;MFRL=155,151;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,9:0.276:34:11,5:13,1:0|1:32610478_C_G:32610478:13,12,1,8
chr6	32610487	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=35,33;MFRL=154,165;MMQ=49,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.219:30:11,4:11,2:0|1:32610478_C_G:32610478:12,12,0,6
chr6	32610495	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=152,175;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.242:31:12,5:11,2:0|1:32610478_C_G:32610478:9,15,1,6
chr6	32610535	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=152,184;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:18,4:11,4:6,24,1,7
chr6	32610553	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=144,205;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:17,1:5,1:0|1:32610553_G_A:32610553:4,21,1,1
chr6	32610556	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=144,205;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:16,1:6,1:0|1:32610553_G_A:32610553:4,21,1,1
chr6	32627882	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=19;MBQ=34,28;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	32627923	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=19;MBQ=32,27;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,2:3,0,3,0
chr6	32627956	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=19;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:32627956_C_G:32627956:0,0,8,0
chr6	32627958	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=19;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:32627956_C_G:32627956:0,0,9,0
chr6	32627967	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=19;MBQ=32,27;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:1,2:4,4:0|1:32627967_A_G:32627967:6,0,7,1
chr6	32627969	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:0|1:32627967_A_G:32627967:6,0,7,1
chr6	32627976	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=19;MBQ=34,33;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:2,4:5,4:0|1:32627967_A_G:32627967:7,1,7,1
chr6	32627988	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=19;MBQ=32,34;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.417:22:8,4:3,5:0|1:32627988_A_G:32627988:11,2,8,1
chr6	32627991	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:8,4:3,5:0|1:32627988_A_G:32627988:10,2,8,1
chr6	32627992	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=31,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,8:5,3:8,1,10,2
chr6	32628001	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=19;MBQ=30,32;MFRL=106,0;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:7,4:5,7:0|1:32627988_A_G:32627988:9,3,8,3
chr6	32628022	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=19;MBQ=32,35;MFRL=111,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,12:0.371:33:9,6:12,5:0|1:32628022_A_G:32628022:12,9,7,5
chr6	32628030	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=19;MBQ=34,32;MFRL=121,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,17:0.462:37:9,10:10,6:0|1:32628022_A_G:32628022:10,10,6,11
chr6	32628045	.	CAT	GAT,GGA	.	.	DP=33;ECNT=19;MBQ=0,34,32;MFRL=0,127,110;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=65.92,52.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,19,14:0.556,0.417:33:0,10,8:0,8,6:0,0,13,20
chr6	32628064	.	TC	CG	.	.	DP=29;ECNT=19;MBQ=28,27;MFRL=127,121;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.355:29:8,5:10,5:0|1:32628022_A_G:32628022:6,13,0,10
chr6	32628079	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=35,32;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:3,5:8,3:0|1:32628022_A_G:32628022:2,10,0,8
chr6	32628093	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=19;MBQ=33,31;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:4,5:6,2:0|1:32628022_A_G:32628022:1,9,0,7
chr6	32628127	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:32628127_T_TG:32628127:0,3,0,1
chr6	32628129	.	G	GCTC	.	.	DP=5;ECNT=19;MBQ=35,33;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:32628127_T_TG:32628127:0,3,0,1
chr6	32628505	.	TC	GA	.	.	DP=5;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr6	32628538	.	GG	TA	.	.	DP=15;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,3:2,3:0|1:32628538_GG_TA:32628538:7,2,6,0
chr6	32628543	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=31,31;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,6:4,3:7,0,7,2
chr6	32628549	.	TG	GA	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=31,34;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:6,2:4,4:0|1:32628538_GG_TA:32628538:9,2,7,0
chr6	32628556	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:6,3:5,6:0|1:32628538_GG_TA:32628538:10,2,9,0
chr6	32628568	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=31,35;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:8,3:6,6:0|1:32628568_A_G:32628568:11,3,9,0
chr6	32628571	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=15;MBQ=33,32;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:7,3:7,5:0|1:32628568_A_G:32628568:11,4,9,0
chr6	32628595	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=31,33;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.257:32:10,3:12,4:20,4,8,0
chr6	32628605	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=31,32;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.234:31:7,3:13,3:19,5,5,2
chr6	32628617	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=32,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.304:31:7,5:14,4:16,6,6,3
chr6	32628633	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=15;MBQ=30,33;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:9,6:14,4:13,10,7,5
chr6	32628712	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:7,8:7,6:4,10,2,12
chr6	32628736	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,6:5,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,8,1,8
chr6	32628741	.	C	CTTAA	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:2,6:4,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:0,7,1,8
chr6	32628751	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=15;MBQ=33,30;MFRL=171,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:0,1:5,2:0|1:32628736_CA_TG:32628736:0,5,0,4
chr6	32629022	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.767:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr6	32629064	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=166,152;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0|1:32629064_A_T:32629064:9,0,2,0
chr6	32629066	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=166,152;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,1:4,1:0|1:32629064_A_T:32629064:9,0,2,0
chr6	32629110	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,5:6,3:12,4,7,1
chr6	32629129	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=132,156;MMQ=50,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.635:31:6,11:2,7:8,3,16,4
chr6	32629137	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,13:0.380:35:13,8:5,3:0|1:32629137_T_G:32629137:15,7,8,5
chr6	32629141	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=31,29;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.400:33:14,7:5,4:0|1:32629137_T_G:32629137:14,6,8,5
chr6	32629146	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=34,30;MFRL=154,130;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,11:0.375:30:12,7:5,3:0|1:32629137_T_G:32629137:14,5,6,5
chr6	32629155	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=133,154;MMQ=40,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.665:31:7,13:3,7:4,6,15,6
chr6	32629161	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=154,148;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,9:0.312:30:12,7:8,2:0|1:32629137_T_G:32629137:14,7,4,5
chr6	32629193	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=26,32;MFRL=158,155;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:15,6:10,4:7,18,6,4
chr6	32629239	.	AG	GA	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=158,171;MMQ=55,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:14,0:4,2:0|1:32629239_AG_GA:32629239:1,18,2,0
chr6	32629240	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,5:0,0,3,17
chr6	32629246	.	A	AG	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=170,171;MMQ=59,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:3,2:0|1:32629239_AG_GA:32629239:1,18,2,0
chr6	32629247	.	A	AC,C	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=0,29,30;MFRL=0,165,171;MMQ=60,58,40;MPOS=11,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=83.11,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,20,2:0.840,0.120:22:0,13,0:0,3,1:0,0,3,19
chr6	32629257	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=82.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,14:0,4:0,0,1,18
chr6	32629259	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=158,159;MMQ=55,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.292:15:8,3:3,1:0|1:32629259_T_C:32629259:1,10,0,4
chr6	32629269	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=34,30;MFRL=164,159;MMQ=55,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,3:3,1:0|1:32629259_T_C:32629259:1,9,0,4
chr6	32629297	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=33,35;MFRL=197,184;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,5:0,2:0,3,0,7
chr6	32629314	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=30,30;MFRL=197,184;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:0,3,0,7
chr6	32629320	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=12;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr6	32629328	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=12;MBQ=34,32;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:32629328_G_A:32629328:0,2,0,4
chr6	32629330	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=12;MBQ=36,32;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:32629328_G_A:32629328:0,2,0,4
chr6	32629697	.	T	TCTGCC	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=183,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,0:4,5:5,0,5,0
chr6	32629708	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=140,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,2:1,9:1,0,11,1
chr6	32629718	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:1,2:6,6:0|1:32629718_G_A:32629718:8,0,7,1
chr6	32629737	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.468:17:2,2:6,5:0|1:32629718_G_A:32629718:8,1,6,2
chr6	32629755	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=156,164;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.652:21:3,3:4,10:0|1:32629755_G_A:32629755:5,2,11,3
chr6	32629764	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=140,164;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,15:0.569:26:4,3:7,11:0|1:32629755_G_A:32629755:8,3,12,3
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chr6	32629868	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=160,134;MMQ=60,50;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.556:34:5,9:9,10:5,10,9,10
chr6	32629889	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=21;MBQ=29,32;MFRL=133,166;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,14:0.395:36:9,6:11,8:0|1:32629889_G_A:32629889:10,12,4,10
chr6	32629891	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=21;MBQ=34,32;MFRL=133,166;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,14:0.395:36:8,6:12,6:0|1:32629889_G_A:32629889:10,12,4,10
chr6	32629904	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=151,176;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.357:29:8,5:10,5:7,12,1,9
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chr6	32629936	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=160,133;MMQ=40,44;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.657:33:5,7:6,15:3,8,13,9
chr6	32629955	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=21;MBQ=31,32;MFRL=131,157;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:7,5:10,5:11,6,5,6
chr6	32629963	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=158,134;MMQ=40,40;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.580:29:6,7:6,10:6,6,12,5
chr6	32630028	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=21;MBQ=34,31;MFRL=160,162;MMQ=27,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,6:3,3:2,5,2,7
chr6	32630053	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=21;MBQ=35,34;MFRL=161,156;MMQ=45,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,3:2,6:0,7,1,8
chr6	32630055	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=21;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.919:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr6	32630066	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=21;MBQ=33,28;MFRL=155,162;MMQ=33,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:0,8,0,8
chr6	32630073	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=21;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0|1:32630073_A_C:32630073:0,0,0,13
chr6	32630080	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0|1:32630073_A_C:32630073:0,0,0,11
chr6	32630087	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=21;MBQ=30,29;MFRL=157,169;MMQ=42,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:2,1:0,6,0,4
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chr6	32630099	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=162,157;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0|1:32630093_GA_TG:32630093:0,3,0,4
chr6	32630101	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=21;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:32630073_A_C:32630073:0,0,0,7
chr6	32630112	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=21;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	32632587	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=19;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32632587_A_G:32632587:0,0,1,0
chr6	32632598	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=19;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32632587_A_G:32632587:0,0,1,0
chr6	32632628	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=19;MBQ=32,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:32632628_G_C:32632628:0,1,2,2
chr6	32632635	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=19;MBQ=28,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0|1:32632628_G_C:32632628:0,1,3,2
chr6	32632637	.	TC	GA	.	.	DP=6;ECNT=19;MBQ=31,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0|1:32632628_G_C:32632628:0,1,3,2
chr6	32632647	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=19;MBQ=29,33;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:0,3:0|1:32632628_G_C:32632628:1,2,2,2
chr6	32632650	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=19;MBQ=34,32;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:2,2,1,2
chr6	32632687	.	AT	GG	.	.	DP=10;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:0,2:2,4:0|1:32632687_AT_GG:32632687:3,0,6,1
chr6	32632688	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=19;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.840:3:0,0:0,2:0|1:32632688_T_A:32632688:0,0,3,0
chr6	32632694	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:0|1:32632687_AT_GG:32632687:3,0,6,1
chr6	32632700	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=19;MBQ=31,31;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:0,1:3,5:0|1:32632687_AT_GG:32632687:4,1,8,1
chr6	32632711	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:4,1:10,4:0|1:32632688_T_A:32632688:13,1,5,1
chr6	32632714	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=19;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,18,1
chr6	32632717	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=19;MBQ=34,32;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:1,2:5,8:0|1:32632687_AT_GG:32632687:5,1,12,0
chr6	32632744	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=19;MBQ=33,28;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,4:5,9:8,2,11,2
chr6	32632745	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.429:26:4,4:10,4:0|1:32632745_G_A:32632745:12,3,9,2
chr6	32632770	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=19;MBQ=29,33;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,15:0.372:41:11,7:12,6:0|1:32632745_G_A:32632745:20,6,12,3
chr6	32632781	.	AGA	CCC	.	.	DP=46;ECNT=19;MBQ=32,33;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,18:0.413:44:12,8:13,8:0|1:32632745_G_A:32632745:17,9,14,4
chr6	32632818	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=19;MBQ=30,34;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,17:0.318:54:20,7:17,9:21,16,9,8
chr6	32632832	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=172.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,22:0,24:0,0,23,27
chr6	32632859	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,11:0.342:33:9,3:13,7:0|1:32632859_C_G:32632859:6,16,2,9
chr6	32632864	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,11:0.364:31:6,3:12,8:0|1:32632859_C_G:32632859:4,16,2,9
chr6	32632872	.	A	AGGCCCCGGCCC	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:2,3:6,6:1,7,0,10
chr6	32632878	.	C	CAGCCTGGCCCT	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=34,36;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.394:21:5,2:7,5:0|1:32632878_C_CAGCCTGGCCCT:32632878:0,13,1,7
chr6	32632886	.	C	CTG	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=155,139;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.317:17:4,2:6,3:0|1:32632878_C_CAGCCTGGCCCT:32632878:0,12,0,5
chr6	32632892	.	CCG	C	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=162,154;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.296:15:5,1:6,3:0|1:32632878_C_CAGCCTGGCCCT:32632878:0,11,0,4
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chr6	32709363	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:5,4:8,8:0|1:32709346_T_C:32709346:1,13,1,14
chr6	32709370	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:5,4:6,7:0|1:32709346_T_C:32709346:0,11,0,11
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chr6	32713188	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:0,7,1,6
chr6	32713487	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	32713521	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=142,177;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:12,1,2,0
chr6	32713541	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=142,177;MMQ=60,33;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,2:9,0:0|1:32713541_C_T:32713541:20,5,2,0
chr6	32713545	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=141,177;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:14,2:10,0:0|1:32713541_C_T:32713541:19,5,2,0
chr6	32713565	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=155,177;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:17,2:16,0:27,9,2,0
chr6	32713827	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=133,171;MMQ=54,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,14:0.178:80:32,7:33,6:29,37,1,13
chr6	32713888	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.502:42:6,6:14,15:6,15,7,14
chr6	32714108	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=16;MBQ=31,33;MFRL=137,140;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,3:0.074:52:23,1:25,2:0|1:32714108_C_G:32714108:25,24,3,0
chr6	32714111	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=31,33;MFRL=140,140;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:20,1:22,2:0|1:32714108_C_G:32714108:25,23,3,0
chr6	32714117	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=16;MBQ=34,35;MFRL=143,140;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:22,0:19,2:0|1:32714108_C_G:32714108:22,23,3,0
chr6	32714125	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=16;MBQ=31,27;MFRL=142,104;MMQ=45,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:25,0:24,3:0|1:32714108_C_G:32714108:22,29,3,0
chr6	32714164	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=16;MBQ=31,34;MFRL=137,122;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:18,1:18,5:15,24,2,4
chr6	32714168	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=31,35;MFRL=125,144;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.180:44:18,3:18,5:12,24,3,5
chr6	32714175	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.369:42:10,9:17,6:8,19,3,12
chr6	32714182	.	GA	G	.	.	DP=43;ECNT=16;MBQ=33,35;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.336:37:8,5:16,6:4,21,3,9
chr6	32714210	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:2,3:10,6:0|1:32714210_G_A:32714210:1,11,0,9
chr6	32714219	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=16;MBQ=29,33;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:0,3:8,6:0|1:32714210_G_A:32714210:0,9,0,9
chr6	32714220	.	CCTCAGTA	C	.	.	DP=21;ECNT=16;MBQ=34,34;MFRL=190,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:1,3:8,6:0|1:32714210_G_A:32714210:0,12,0,9
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chr6	32724317	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,2:2,3:0|1:32724305_T_C:32724305:0,5,1,5
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chr6	32725062	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=117,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:7,5:12,7:7,12,3,9
chr6	32725153	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:0,1:7,2:0,7,0,3
chr6	32725517	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=32,34;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,5:6,0,7,2
chr6	32725523	.	T	TC	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=33,33;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,3:3,5:6,0,6,2
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chr6	32725567	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=127,96;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:8,1:12,2:0|1:32725559_C_T:32725559:13,9,2,1
chr6	32725572	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=34,32;MFRL=127,96;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,1:9,2:0|1:32725559_C_T:32725559:12,8,2,1
chr6	32725619	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=114,164;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.347:21:9,4:5,2:0|1:32725619_TG_CA:32725619:7,7,3,4
chr6	32725625	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=111,153;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:10,5:5,3:0|1:32725619_TG_CA:32725619:7,8,3,5
chr6	32725666	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=33,32;MFRL=164,121;MMQ=60,45;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.261:20:9,2:5,2:4,11,0,5
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chr6	32725673	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=28,34;MFRL=170,133;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:7,7:4,3:0|1:32725672_A_AG:32725672:3,8,1,9
chr6	32725682	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=13;MBQ=33,35;MFRL=164,121;MMQ=60,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:10,2:5,1:0|1:32725682_G_C:32725682:4,11,0,3
chr6	32725685	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=31,28;MFRL=167,121;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:10,2:3,1:0|1:32725682_G_C:32725682:3,11,0,3
chr6	32725695	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=13;MBQ=35,30;MFRL=180,145;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:7,1:1,1:0|1:32725682_G_C:32725682:0,8,0,2
chr6	32726577	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr6	32726803	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=76.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,26:0.491:53:13,13:14,13:17,10,20,6
chr6	32726838	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=134,138;MMQ=51,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,30:0.646:46:6,13:10,17:8,8,16,14
chr6	32726967	.	GC	TT	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=32,25;MFRL=191,187;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:6,2:4,0:0|1:32726967_GC_TT:32726967:0,11,0,4
chr6	32726971	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=191,187;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:6,3:4,1:0|1:32726967_GC_TT:32726967:0,11,0,4
chr6	32726972	.	C	CCAT	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=195,187;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:0|1:32726967_GC_TT:32726967:0,10,0,4
chr6	32726974	.	GTGA	G	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=195,187;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:6,3:3,1:0|1:32726967_GC_TT:32726967:0,10,0,4
chr6	32726981	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=174,187;MMQ=60,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:0|1:32726967_GC_TT:32726967:0,6,0,4
chr6	32727002	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=222,187;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:0,6,0,4
chr6	32727004	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=221,188;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,5:0,2:0,3,0,7
chr6	32729381	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr6	32729459	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr6	32729642	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.463:28:7,8:8,4:9,6,8,5
chr6	32729734	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,0:6,6:1,11,0,6
chr6	32781077	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:1,1:3,2,2,0
chr6	32782112	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:5,6:6,1:7,4,5,3
chr6	32782387	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=158,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:1,3:3,8:0,5,6,5
chr6	32784620	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.411:20:4,3:7,5:10,2,7,1
chr6	32784753	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,5:2,6:0,7,3,8
chr6	32784783	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:0,8,0,4
chr6	32790099	.	G	GA	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.084:56:12,0:14,0:19,33,0,4
chr6	32790167	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:9,16:8,9:0,17,0,25
chr6	32796653	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr6	32796751	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=104,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,6:0,1:1,3,3,4
chr6	32796857	.	ACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=224,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	32797115	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=125,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:2,1:8,0,2,0
chr6	32797168	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=127,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.248:17:10,1:3,2:8,5,2,2
chr6	32797297	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,4:3,5:1,8,1,8
chr6	32797684	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:7,4:10,5:11,6,7,2
chr6	32803408	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,7:7,5:10,2,9,3
chr6	32805470	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=113.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,16:0,17:0,0,18,16
chr6	32809223	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:1,0,6,0
chr6	32809848	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,19,4
chr6	32810443	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr6	32811629	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,10,4
chr6	32815080	.	C	CAGACACGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr6	32816958	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	32821447	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr6	32904949	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.139:38:17,4:16,0:25,8,0,5
chr6	32904981	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=128.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,21:0,15:0,0,26,11
chr6	32916540	.	A	ACTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	32916699	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,1:5,3:3,7,1,4
chr6	32916746	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32916746_G_C:32916746:0,2,0,1
chr6	32916748	.	A	AGGGGCTGCTCTCCAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32916746_G_C:32916746:0,2,0,1
chr6	32917544	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,5:5,7:5,6,6,6
chr6	32942302	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:5,12:9,6:6,8,12,6
chr6	32943062	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=139,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.492:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr6	32943086	.	T	TGAGA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=GA;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr6	32943151	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,8:5,3:2,4,10,1
chr6	32943345	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:6,3:8,13:1,13,1,15
chr6	32943979	.	C	CT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=71.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.472:51:16,13:10,11:3,24,5,19
chr6	32944746	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=102,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:1,1,0,3
chr6	32945530	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=159.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,25:0,18:0,0,21,22
chr6	32945698	.	TGAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:2,1:2,4,1,3
chr6	32946133	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.476:40:12,8:9,11:6,15,4,15
chr6	32974934	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.606:36:6,10:8,12:6,8,15,7
chr6	32975014	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=106,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:3,8:9,6:5,8,5,9
chr6	32975257	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:9,8:11,8:11,9,9,7
chr6	32975381	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr6	32975720	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=64,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	32975869	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,3:4,3:7,4,3,3
chr6	32975896	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,5:3,6:2,4,5,6
chr6	32977315	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr6	33036977	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:11,0:18,2:15,14,1,1
chr6	33048380	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr6	33048457	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,8:0,7:0|1:33048457_C_G:33048457:0,0,9,8
chr6	33048459	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0|1:33048457_C_G:33048457:0,0,9,8
chr6	33048461	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,6:0|1:33048457_C_G:33048457:0,0,10,8
chr6	33048466	.	GG	TT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0|1:33048457_C_G:33048457:0,0,10,8
chr6	33048542	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr6	33048599	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0|1:33048599_C_A:33048599:0,0,4,7
chr6	33048602	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0|1:33048599_C_A:33048599:0,0,4,7
chr6	33048606	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:33048599_C_A:33048599:0,0,3,7
chr6	33048628	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=20,33;MFRL=76,124;MMQ=49,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,4:1,3:1,0,2,5
chr6	33048661	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:33048661_A_G:33048661:0,0,4,1
chr6	33048663	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:33048661_A_G:33048661:0,0,4,1
chr6	33048686	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:33048686_G_A:33048686:0,0,3,3
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chr6	33053682	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=109.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,15:0,0,8,25
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chr6	33053728	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0|1:33053723_T_C:33053723:0,0,0,15
chr6	33053736	.	GGT	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0|1:33053723_T_C:33053723:0,0,0,13
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chr6	33053772	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0|1:33053772_G_A:33053772:0,0,0,7
chr6	33053780	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:33053772_G_A:33053772:0,0,0,5
chr6	33053868	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=16;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:33053868_A_G:33053868:0,0,7,0
chr6	33053871	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=16;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0|1:33053868_A_G:33053868:0,0,8,0
chr6	33053877	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=16;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,4:0|1:33053868_A_G:33053868:0,0,10,0
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chr6	33053890	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:33053868_A_G:33053868:0,0,11,0
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chr6	33053906	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=16;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0|1:33053868_A_G:33053868:0,0,14,0
chr6	33053942	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,9:0,15:0,0,22,2
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chr6	33053971	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=220.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,19:0,29:0|1:33053968_T_A:33053968:0,0,29,21
chr6	33053982	.	G	C	.	.	DP=57;ECNT=16;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=243.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,56:0.983:56:0,21:0,33:0|1:33053968_T_A:33053968:0,0,33,23
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chr6	33054071	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=16;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=128.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,16:0,9:0|1:33054046_T_G:33054046:0,0,10,19
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chr6	33054235	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=266.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,61:0.984:61:0,34:0,26:0|1:33054227_G_A:33054227:0,0,45,16
chr6	33054268	.	C	A	.	.	DP=85;ECNT=16;MBQ=34,32;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=255.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,80:0.976:81:1,44:0,32:1,0,47,33
chr6	33054280	.	TG	CA	.	.	DP=91;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=393.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,89:0.978:90:1,51:0,35:1,0,45,44
chr6	33054302	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=16;MBQ=34,33;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=287.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,84:0.966:86:1,49:0,35:1,1,41,43
chr6	33054325	.	G	C	.	.	DP=72;ECNT=16;MBQ=32,34;MFRL=129,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=292.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,68:0.972:69:1,33:0,33:0|1:33054325_G_C:33054325:0,1,30,38
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chr6	33054342	.	T	A	.	.	DP=62;ECNT=16;MBQ=32,31;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=193.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,58:0.968:59:1,23:0,34:0,1,22,36
chr6	33054353	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=16;MBQ=35,31;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=224.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,54:0.965:55:1,19:0,32:0|1:33054353_G_A:33054353:0,1,14,40
chr6	33054355	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=16;MBQ=32,34;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=224.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,54:0.965:55:1,20:0,31:0|1:33054353_G_A:33054353:0,1,14,40
chr6	33054373	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=16;MBQ=0,31;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=164.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,39:0.953:40:0,14:0,23:0|1:33054373_C_T:33054373:0,1,6,33
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chr6	33054400	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=16;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0|1:33054400_T_C:33054400:0,0,0,25
chr6	33054404	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=16;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,12:0,10:0|1:33054400_T_C:33054400:0,0,0,24
chr6	33054410	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=16;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,8:0|1:33054400_T_C:33054400:0,0,0,20
chr6	33054413	.	TT	GA	.	.	DP=21;ECNT=16;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0|1:33054400_T_C:33054400:0,0,0,20
chr6	33054457	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr6	33132338	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	33134102	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	33134392	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,4:0,0,6,10
chr6	33135391	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,26;MFRL=150,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.642:6:0,1:0,2:0,2,1,3
chr6	33135722	.	GC	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	33136575	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,4,18
chr6	33136638	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	33136675	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.625:11:4,4:0,3:0,4,0,7
chr6	33137727	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:5,1:4,5:5,4,3,4
chr6	33138498	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr6	33138677	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=90,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:2,3,0,3
chr6	33138746	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	33138955	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr6	33139328	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,6:0,0,4,8
chr6	33139475	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=105.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,13:0,0,5,24
chr6	33139662	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr6	33140009	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	33140257	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:2,1:2,0:2,2,1,1
chr6	33140265	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=183,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:0,1:2,3,1,1
chr6	33140983	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	33141161	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	33141920	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	33142012	.	AG	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=96,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.506:27:7,5:6,9:5,8,7,7
chr6	33142253	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=70.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.926:24:0,12:1,9:0,1,15,8
chr6	33143756	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:3,9:4,7:7,0,12,4
chr6	33143948	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr6	33144243	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,7,9
chr6	33144373	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr6	33146053	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:1,3,2,4
chr6	33147589	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	33148087	.	A	ACTAACG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:3,0,0,1
chr6	33148878	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:6,6:4,6:6,4,9,4
chr6	33162540	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:4,1,1,6
chr6	33163451	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	33165780	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr6	33166034	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:7,6:3,4:8,3,7,5
chr6	33172905	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr6	33172932	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=75.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,8:0,0,19,5
chr6	33173748	.	CAGAGAGAGAG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,8;RU=AG;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:1,1:2,1:1,2,1,1
chr6	33173842	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:7,4:9,11:16,0,13,2
chr6	33174459	.	A	AC	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.387:39:7,4:13,7:10,14,6,9
chr6	33176749	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:1,8,0,10
chr6	33180045	.	T	TC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=94,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.213:25:6,0:13,4:8,12,0,5
chr6	33218797	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:10,1:8,12,0,2
chr6	33239905	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.395:28:7,8:10,2:5,12,3,8
chr6	33240506	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=66.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:10,10:8,10:3,15,2,18
chr6	33246518	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:7,3:2,2:4,5,2,4
chr6	33254556	.	C	CG	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=131.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,25:0,12:0,0,27,11
chr6	33255067	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,5:5,3:6,1,8,1
chr6	33255103	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,16,5
chr6	33255577	.	C	CATCCTTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,19;MFRL=239,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:33255577_C_CATCCTTGT:33255577:0,1,0,1
chr6	33255579	.	A	AACCCTGCACG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=239,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33255577_C_CATCCTTGT:33255577:0,1,0,1
chr6	33256096	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,11:0,0,9,9
chr6	33256138	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,3:8,3:5,9,5,1
chr6	33256397	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:8,9:12,9:11,9,13,5
chr6	33256471	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr6	33256984	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,1,10
chr6	33258443	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,5,12
chr6	33260186	.	CTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:4,2,3,1
chr6	33260215	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=190,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:8,1,5,0
chr6	33260398	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:33260398_A_G:33260398:0,3,0,1
chr6	33260400	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:33260398_A_G:33260398:0,3,0,1
chr6	33260410	.	T	TTGCCAACCCCAGCTCCCCTGGAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	33261871	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.388:13:5,2:3,2:4,4,2,3
chr6	33269689	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	33272712	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,8:0,0,11,3
chr6	33272855	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,9,15
chr6	33281842	.	GA	TT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:6,1:5,4,0,2
chr6	33283766	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=68.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,12,10
chr6	33288075	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:4,3:2,2:3,3,6,0
chr6	33288244	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:7,2:12,0:5,14,1,1
chr6	33288271	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,4:1,5:0,4,1,9
chr6	33290547	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr6	33290611	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:2,1,1,0
chr6	33359716	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,12:0,0,20,9
chr6	33359820	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,0,20
chr6	33365981	.	GGT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.120:22:6,2:9,0:10,10,0,2
chr6	33373433	.	T	TAGGGCACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33373433_T_TAGGGCACA:33373433:0,0,0,1
chr6	33373439	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33373433_T_TAGGGCACA:33373433:0,0,0,1
chr6	33379941	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,157;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.420:12:5,2:2,3:6,1,5,0
chr6	33382943	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=116.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,21:0,13:0,0,17,17
chr6	33385205	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.654:27:3,9:6,8:7,2,15,3
chr6	33400427	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,14;MFRL=215,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.613:3:0,0:1,0:0|1:33400427_T_A:33400427:0,1,2,0
chr6	33400432	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=37,24;MFRL=215,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:33400427_T_A:33400427:0,1,2,0
chr6	33400437	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=37,12;MFRL=6620087,219;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:33400427_T_A:33400427:0,2,2,0
chr6	33402881	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,14;MFRL=0,125;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:33402881_G_A:33402881:0,1,1,0
chr6	33402884	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,18;MFRL=0,125;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:33402881_G_A:33402881:0,1,1,0
chr6	33402888	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,15;MFRL=0,125;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:33402881_G_A:33402881:0,1,1,0
chr6	33406494	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,11;MFRL=36807972,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,0:0,0:0|1:33406494_A_G:33406494:0,2,2,0
chr6	33406500	.	TT	CG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.354:6:3,0:0,0:0|1:33406494_A_G:33406494:1,3,2,0
chr6	33406583	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=141,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,2:4,0:6,6,2,0
chr6	33406731	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,18;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.484:4:1,0:0,0:1,1,0,2
chr6	33411707	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=176,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.549:5:2,0:0,1:0,2,0,3
chr6	33414626	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,3
chr6	33414637	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,2
chr6	33415795	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33415795_C_CT:33415795:0,1,0,1
chr6	33415798	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33415795_C_CT:33415795:0,1,0,1
chr6	33415801	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33415795_C_CT:33415795:0,0,0,1
chr6	33415803	.	A	AAGTATAAGATACC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33415795_C_CT:33415795:0,0,0,1
chr6	33419555	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=32,10;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.304:13:7,1:2,0:2,7,4,0
chr6	33419614	.	AG	CC	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.482:8:3,3:0,0:0|1:33419614_AG_CC:33419614:0,4,4,0
chr6	33419620	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,1:0,0:0|1:33419614_AG_CC:33419614:1,4,3,0
chr6	33419623	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,1:0,1:0|1:33419623_A_C:33419623:3,4,4,0
chr6	33419629	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:7,2:1,0:0|1:33419623_A_C:33419623:4,4,3,0
chr6	33419634	.	GG	CC	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=144,81;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,1:3,0:0|1:33419614_AG_CC:33419614:6,8,2,0
chr6	33422976	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=166.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,22:0,28:0,0,25,26
chr6	33541507	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,239;MMQ=57,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:12,0,2,0
chr6	33555348	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,1:1,0,3,1
chr6	33555654	.	AAAATAC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=261,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	33555682	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33555682_G_GA:33555682:0,0,0,1
chr6	33555683	.	C	CTCGGAAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33555682_G_GA:33555682:0,0,0,1
chr6	33608379	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr6	33623536	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:4,0:3,0:8,5,3,0
chr6	33623545	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:9,0:13,5,2,0
chr6	33630846	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,1,6
chr6	33631696	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr6	33633527	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	33636660	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	33639760	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=96,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:5,5,5,1
chr6	33641956	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:4,3:1,8:4,2,9,2
chr6	33644768	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,13:0,7:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,16,6
chr6	33644773	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,10:0,7:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,15,6
chr6	33646328	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,8:0,0,10,16
chr6	33646621	.	GGGCGGGGCTGAGGGGTGCTCAGGCATCTTGGGGTGGGGGACCGGAGCAGAGGCTT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.250:14:5,2:3,2:0|1:33646621_GGGCGGGGCTGAGGGGTGCTCAGGCATCTTGGGGTGGGGGACCGGAGCAGAGGCTT_G:33646621:2,7,2,3
chr6	33646656	.	G	GAAGTGAGCCGTAAGCCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=13,35;MFRL=208,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.506:2:0,1:0,0:1|0:33646621_GGGCGGGGCTGAGGGGTGCTCAGGCATCTTGGGGTGGGGGACCGGAGCAGAGGCTT_G:33646621:0,1,0,1
chr6	33647651	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=118,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:6,1:2,1:5,4,1,1
chr6	33647936	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:4,0:2,2:1,6,1,3
chr6	33648228	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr6	33648515	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr6	33650430	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:5,3:0,10,0,3
chr6	33653107	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:6,1:3,3:0|1:33653107_G_A:33653107:6,3,1,3
chr6	33653111	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0|1:33653107_G_A:33653107:0,0,8,6
chr6	33654378	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr6	33659536	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,20:0.389:52:15,14:17,6:12,20,7,13
chr6	33659688	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,258;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:6,8,2,0
chr6	33660411	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	33662936	.	CTGACCCACCCTCTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,250;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	33663451	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,5:1,1:2,1,6,0
chr6	33679239	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.717:9:1,4:1,0:1,1,7,0
chr6	33748831	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=115,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,5:3,1:7,1,3,3
chr6	34008106	.	G	GAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr6	34008457	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,2:12,0:11,14,0,2
chr6	34026938	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,9:0,0:0,0,1,8
chr6	34101334	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34101334_G_T:34101334:0,0,0,1
chr6	34101341	.	G	GCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34101334_G_T:34101334:0,0,0,1
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chr6	34212743	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=107,168;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.881:15:1,6:0,6:0,1,0,14
chr6	34214994	.	G	GTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,3:0,0,0,7
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chr6	34263328	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:0|1:34263313_T_TA:34263313:4,1,2,0
chr6	34385517	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:3,0,7,1
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chr6	34386307	.	CT	AG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:34386300_AGTACCACTCCGTT_A:34386300:0,1,0,1
chr6	34386311	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:34386300_AGTACCACTCCGTT_A:34386300:0,1,0,1
chr6	34386314	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:34386300_AGTACCACTCCGTT_A:34386300:0,2,0,1
chr6	34386317	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:34386300_AGTACCACTCCGTT_A:34386300:0,2,0,1
chr6	34386320	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=226,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34386300_AGTACCACTCCGTT_A:34386300:0,1,0,1
chr6	34498328	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.425:28:8,6:6,3:7,9,1,11
chr6	34574713	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:34574713_A_AG:34574713:0,1,0,1
chr6	34574716	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34574713_A_AG:34574713:0,1,0,1
chr6	34622561	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,6:6,2:2,8,3,6
chr6	34664207	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	34725655	.	G	GTCA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=163.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.977:39:0,23:0,15:0|1:34725655_G_GTCA:34725655:0,0,13,26
chr6	34725658	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=154.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,21:0,13:0|1:34725655_G_GTCA:34725655:0,0,12,24
chr6	34730412	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:18,3:23,0:22,20,3,0
chr6	34735676	.	C	CCTCAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,3:0,0,3,5
chr6	34738203	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr6	34741174	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,1:4,2:4,0,2,1
chr6	34759903	.	T	TGGCGGCGGCGGCGGCGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,11;RU=GGC;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	34759954	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	34760162	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	34791027	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,10:0,19:0,0,20,9
chr6	34802999	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,4,2
chr6	34804204	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr6	34831761	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0|1:34831761_G_T:34831761:4,0,3,0
chr6	34831781	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:7,0:1,0:0|1:34831761_G_T:34831761:8,3,3,0
chr6	34839262	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=202,263;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:34839262_T_A:34839262:2,0,1,0
chr6	34839266	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=202,263;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:34839262_T_A:34839262:2,0,1,0
chr6	34839272	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=202,263;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:34839262_T_A:34839262:2,0,1,0
chr6	34839339	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=206,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr6	34840275	.	T	TGTCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:34840275_T_TGTCCC:34840275:0,3,0,1
chr6	34840277	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:34840275_T_TGTCCC:34840275:0,3,0,1
chr6	34850660	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.497:28:6,8:7,5:11,3,11,3
chr6	34855748	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=216,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:2,2:0,6:1,1,1,7
chr6	34949451	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:6,2,5,0
chr6	34962019	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr6	34962060	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.678:23:6,7:1,8:7,0,13,3
chr6	34985853	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,1:3,2:2,5,1,2
chr6	35027927	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,9:0,22:0,0,20,12
chr6	35047579	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,2:3,2:4,2,4,0
chr6	35047732	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:2,4:5,3:1,6,2,5
chr6	35054893	.	A	AGCTTCTTTTCTTCTTAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	35056443	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,4,10
chr6	35088855	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:12,2:5,1:1,16,0,4
chr6	35104018	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr6	35210185	.	G	GCCCTTGCTTTAGTATAGCAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.665:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	35211016	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,131;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr6	35212003	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=80,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	35216296	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.481:10:2,0:3,3:3,2,4,1
chr6	35254213	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr6	35258539	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:0,3:6,3:0,7,2,4
chr6	35259261	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:4,3,2,1
chr6	35261768	.	A	ACTCTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=178,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	35277347	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	35280586	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=154,233;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.258:6:1,1:2,0:0|1:35280586_C_A:35280586:2,3,0,1
chr6	35280589	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=27,33;MFRL=156,233;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.349:4:1,1:2,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,2,0,1
chr6	35280592	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=35,33;MFRL=115,233;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.424:3:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,1,0,1
chr6	35280595	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=66,233;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.539:2:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,0,0,1
chr6	35280598	.	TCAG	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=66,233;MMQ=60,56;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.539:2:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,0,0,1
chr6	35280603	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=66,233;MMQ=60,56;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.539:2:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,0,0,1
chr6	35280605	.	CATGAGAAGACAAGGGG	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=66,233;MMQ=60,56;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.539:2:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,0,0,1
chr6	35280623	.	TCAGGAGAGGGG	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=128,233;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.424:3:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,1,0,1
chr6	35285720	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,4:4,5:4,4,5,4
chr6	35285731	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:8,1:8,1:7,10,1,1
chr6	35378778	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr6	35393544	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	35420628	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	35423489	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr6	35424188	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr6	35443573	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr6	35448189	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=77.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,6,16
chr6	35452447	.	G	GAGGTATGAAGTCTGGGAAAGGCTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=181,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:3,0:0,9,1,1
chr6	35477152	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr6	35477676	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,0:4,2:0|1:35477676_T_G:35477676:7,9,1,1
chr6	35477685	.	G	GTT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:35477676_T_G:35477676:5,9,1,1
chr6	35477688	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:4,2:0|1:35477676_T_G:35477676:5,9,1,1
chr6	35477690	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:35477676_T_G:35477676:5,9,1,1
chr6	35477692	.	GC	CT	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,1:0|1:35477676_T_G:35477676:4,9,1,1
chr6	35478612	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,2:0,3:0,0,6,2
chr6	35610681	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	35706063	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=141,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:2,0:0,1:2,0,2,0
chr6	35706097	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:2,2:1,1:3,0,5,0
chr6	35706123	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.674:14:2,5:2,1:4,0,7,3
chr6	35761202	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=199,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:1,3:0,2:1,0,5,1
chr6	35762978	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=119,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:20,3:15,0:17,18,3,0
chr6	35810383	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:4,2:6,1:4,10,0,3
chr6	35923325	.	G	GCTGCTGTGGGCTTCATATTCAATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=138,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	35928910	.	TGA	CTC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=153,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:35928910_TGA_CTC:35928910:0,2,0,1
chr6	35928917	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=153,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:35928910_TGA_CTC:35928910:0,2,0,1
chr6	35928918	.	A	AAAAAGGCAGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr6	35928921	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=153,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:35928910_TGA_CTC:35928910:0,2,0,1
chr6	35928923	.	A	ATAAAATTG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=17,31;MFRL=167,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:35928910_TGA_CTC:35928910:0,1,0,1
chr6	35928925	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=167,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35928910_TGA_CTC:35928910:0,1,0,1
chr6	35950075	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=237,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	35965754	.	G	GGGTTATATGGTTCTGTCTCTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr6	35965762	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=18,34;MFRL=208,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:35965762_C_CA:35965762:0,1,0,1
chr6	35965767	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=202,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35965762_C_CA:35965762:0,2,0,1
chr6	35987222	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr6	36040642	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=55.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.526:38:8,9:9,11:8,10,8,12
chr6	36075219	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=108,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:6,3:6,3,6,0
chr6	36098333	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,12,8
chr6	36104803	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	36107172	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,3:3,1:0,4,1,3
chr6	36189887	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,2:0,0,10,1
chr6	36261885	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr6	36287454	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	36290030	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:4,2:5,1,3,0
chr6	36293067	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:8,3,2,0
chr6	36294417	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,18;MFRL=125,50;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,0:5,0:0|1:36294417_C_G:36294417:4,8,6,0
chr6	36294424	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,17;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.298:18:3,0:6,0:0|1:36294417_C_G:36294417:4,9,5,0
chr6	36294429	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,0:4,0:5,8,3,0
chr6	36294915	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	36359682	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=273,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.729:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr6	36446973	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:18,2:16,4:13,21,2,4
chr6	36449333	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=72,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:3,2,2,0
chr6	36452603	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,32,31,15;MFRL=158,163,141,166;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,18,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.37,7.37,5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,5,4:0.146,0.236,0.189:22:0,1,2,0:5,2,1,1:0,10,2,10
chr6	36467791	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,10:0,0,2,13
chr6	36493265	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr6	36569715	.	TTC	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.132:51:16,5:27,2:38,6,2,5
chr6	36569717	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.918:26:0,11:1,13:1,1,17,7
chr6	36652339	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	36690478	.	A	AACT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,17;MFRL=111,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:9,1:6,9,1,1
chr6	36715921	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr6	36720900	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:7,0:2,4:0|1:36720900_T_A:36720900:5,7,0,4
chr6	36720902	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,0:5,3:0|1:36720900_T_A:36720900:5,7,0,4
chr6	36723916	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr6	36742751	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:14,3:4,0:15,3,2,1
chr6	36765877	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:2,2:9,0,0,2
chr6	36766264	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:2,8,1,1
chr6	36767920	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:36767920_T_TG:36767920:0,0,0,2
chr6	36767943	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36767920_T_TG:36767920:0,0,0,1
chr6	36853685	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	36853786	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,2,2
chr6	36853857	.	T	TCGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	36867430	.	G	GAGAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=155,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.262:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr6	36884252	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.073:53:24,2:25,1:28,22,2,1
chr6	36931326	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:24,0:13,4:0|1:36931326_A_T:36931326:14,23,0,4
chr6	36931331	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.108:44:25,0:13,4:0|1:36931326_A_T:36931326:14,26,0,4
chr6	36949527	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr6	36978879	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	36988364	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.558:16:5,4:1,4:5,2,5,4
chr6	36989391	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr6	37249913	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,3:1,2:4,0,4,1
chr6	37280844	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=89,247;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:3,3,0,3
chr6	37348920	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.463:35:10,9:7,7:12,7,11,5
chr6	37411846	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:16,0:10,2:10,18,0,2
chr6	37443220	.	G	GAGATTTCAGCCGCTTTGAGGTCAAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr6	37446841	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	37447075	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr6	37605311	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	37606305	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr6	37611796	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	37614017	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,0:10,3:15,8,3,0
chr6	37614236	.	G	GAATTGATACTGACTTGTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	37614919	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.705:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr6	37614923	.	CAGG	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.292:5:0,0:0,1:3,1,1,0
chr6	37614932	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=115,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,0:5,1:4,2,2,0
chr6	37620129	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	38084569	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,2:1,3:0,6,0,5
chr6	38645223	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,35;MFRL=154,198;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr6	38645227	.	CT	C,CTT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,34,35;MFRL=154,189,198;MMQ=60,60,30;MPOS=18,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=3,2,4;RU=T;STR;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,0:0,1,1:0,1,0,2
chr6	38645237	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=239,194;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0,3,0,2
chr6	38645249	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=239,198;MMQ=60,30;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38645249_GA_G:38645249:0,2,0,1
chr6	38645251	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=239,198;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38645249_GA_G:38645249:0,2,0,1
chr6	38645253	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=239,198;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38645249_GA_G:38645249:0,2,0,1
chr6	38645255	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,28;MFRL=239,198;MMQ=60,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38645249_GA_G:38645249:0,2,0,1
chr6	38670837	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=131,194;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:3,5:4,0:5,3,1,4
chr6	38691291	.	A	AGGTTGCGAAAATTTTCTCTGATTTTGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.259:9:3,2:4,0:0,7,1,1
chr6	38691328	.	GCAA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=189,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAA;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chr6	38702212	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:5,2,2,0
chr6	38702468	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:0,5,0,6
chr6	38723670	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	38729458	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.454:44:11,9:13,10:15,9,15,5
chr6	38738383	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=134,143;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr6	38746090	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,4:2,0:0|1:38746090_A_G:38746090:6,0,6,0
chr6	38746098	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,6:2,0:0|1:38746090_A_G:38746090:5,0,6,0
chr6	38746263	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,26:0.475:55:13,12:15,14:7,22,5,21
chr6	38746294	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:9,7:9,10:1,17,1,16
chr6	38749200	.	ACAAATATATCATAT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:3,4:5,3:0,9,0,7
chr6	38754787	.	GTATA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=265,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=TA;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	38757511	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr6	38771106	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:9,8:6,8:3,13,1,15
chr6	38771168	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr6	38773172	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	38775336	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,2:6,5:7,3,4,3
chr6	38781749	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr6	38781866	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:5,3:13,8:9,9,8,3
chr6	38781931	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:7,2:7,11:5,9,1,12
chr6	38794183	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:2,2:5,8:1,6,0,10
chr6	38820451	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:10,6:8,7:12,6,8,5
chr6	38820599	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:1,7,0,6
chr6	38828424	.	G	GT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:8,6:5,7:3,10,4,9
chr6	38828453	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:5,2:1,5:1,5,0,7
chr6	38843350	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,42072688;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:38843350_A_T:38843350:12,0,1,1
chr6	38843356	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,42072688;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:0|1:38843350_A_T:38843350:13,1,1,1
chr6	38862736	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=221,144;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:38862736_C_T:38862736:0,3,0,1
chr6	38862741	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=221,144;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38862736_C_T:38862736:0,3,0,1
chr6	38879386	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,1:6,2:1,15,0,3
chr6	38897534	.	C	CGAACAGACAGACAAGCTTGGCCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	38899485	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=209,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,5:0,0:2,0,5,0
chr6	38905667	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=138,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr6	38913177	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	38979946	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=125,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,3,0
chr6	39041607	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:39041607_T_C:39041607:0,2,0,1
chr6	39041614	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:39041607_T_C:39041607:0,2,0,1
chr6	39046201	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr6	39077192	.	T	TTCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCC;STR;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,2:5,5:0,6,0,7
chr6	39162206	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr6	39162599	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:3,1:2,3:0,6,0,4
chr6	39278848	.	GCACACACACACACACACACACACACACA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=24,10;RU=CA;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.393:6:3,1:0,1:0,4,0,2
chr6	39283226	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=136,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:0|1:39283226_G_A:39283226:0,8,1,1
chr6	39283228	.	C	CTGGGCAGAGACTTTGGAACA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=136,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:39283226_G_A:39283226:0,8,1,1
chr6	39313618	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:0,8,0,6
chr6	39325078	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,3:3,6:5,3,7,2
chr6	39325224	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=167,215;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.718:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr6	39330135	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:4,4:1,2:4,1,6,1
chr6	39563730	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr6	39682367	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	39828862	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	39832111	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr6	39832363	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr6	39839164	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr6	39846137	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=123,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,6:6,5:6,6,7,4
chr6	39851679	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,4:0,3:1,0,5,2
chr6	39851932	.	CTTTCCTTTCCT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr6	39855427	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr6	39866805	.	A	AACAATGGGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr6	39869066	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=128,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:2,0,2,4
chr6	39869210	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=156,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr6	39876812	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,1:15,1:12,13,1,1
chr6	39895167	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,0;MMQ=60,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,0:3,2:0,8,1,1
chr6	40359674	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.764:9:0,0:0,0:2,0,7,0
chr6	40360724	.	G	GCAAAATCTCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=215,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	40399415	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:40399415_A_C:40399415:3,1,1,0
chr6	40399417	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,11;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:40399415_A_C:40399415:3,1,1,0
chr6	40399446	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr6	41010811	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:12,0:21,3:20,16,0,3
chr6	41036770	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr6	41037778	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,19:0.281:69:22,10:28,9:30,20,16,3
chr6	41037786	.	G	GA	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,5:0.072:81:34,3:42,1:45,31,3,2
chr6	41038845	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.450:29:7,6:8,6:11,5,11,2
chr6	41052002	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	41118095	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:4,5,1,1
chr6	41122113	.	G	GGGTCAGTTGGTTTGTGTTGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=123,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.613:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	41166222	.	T	TCTTAGTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=139,142;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41166222_T_TCTTAGTCTG:41166222:0,1,0,1
chr6	41166225	.	T	TTTAGCAAGCGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=139,142;MMQ=60,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41166222_T_TCTTAGTCTG:41166222:0,1,0,1
chr6	41196095	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,2:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,4,1
chr6	41196104	.	C	CCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,4,1
chr6	41196727	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,11:0,2:0|1:41196727_C_T:41196727:0,0,7,7
chr6	41196733	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:8,1:0,2:0|1:41196727_C_T:41196727:4,4,2,1
chr6	41204329	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,94;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,1:4,5:3,8,3,3
chr6	41250258	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,1:16,1:13,15,1,1
chr6	41309698	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,4,6
chr6	41486990	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,11,0
chr6	41554993	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=188,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr6	41620975	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41620975_A_G:41620975:0,0,1,0
chr6	41620983	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41620975_A_G:41620975:0,0,1,0
chr6	41621022	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=112,128;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:1,1,1,0
chr6	41655005	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	41659064	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:7,5,2,0
chr6	41659304	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=230,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr6	41704772	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,4:2,5:2,6,0,9
chr6	41705612	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:1,3:3,0:0,4,1,2
chr6	41705632	.	CTCAGCCCCTGGA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr6	41710195	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:11,7,0,2
chr6	41712586	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712586_TC_T:41712586:0,2,0,1
chr6	41712590	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,31;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712586_TC_T:41712586:0,2,0,1
chr6	41712596	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712586_TC_T:41712586:0,2,0,1
chr6	41712613	.	T	TCCCCAAC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712613_T_TCCCCAAC:41712613:0,2,0,1
chr6	41712617	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712613_T_TCCCCAAC:41712613:0,2,0,1
chr6	41712620	.	T	TGTTACA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712613_T_TCCCCAAC:41712613:0,2,0,1
chr6	41712622	.	C	CCCTG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,29;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712613_T_TCCCCAAC:41712613:0,2,0,1
chr6	41721682	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=55.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.528:36:10,9:7,8:9,8,9,10
chr6	41748279	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	41754573	.	C	CCTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,4:5,7:4,4,5,6
chr6	41888827	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:8,8:6,5:2,12,2,11
chr6	41895150	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,2:10,1:5,9,1,2
chr6	41899117	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,6156142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:17,2:8,0:15,10,2,0
chr6	41900406	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:2,2,1,4
chr6	41905174	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=213,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,0:2,3:0,4,1,2
chr6	42018212	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:42018212_G_C:42018212:0,0,1,0
chr6	42018217	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=246,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42018212_G_C:42018212:1,0,1,0
chr6	42023618	.	A	ATAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TAC;STR;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,2:3,5:5,1,6,2
chr6	42025058	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:6,0,8,1
chr6	42025318	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=85,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:1,5,0,6
chr6	42036395	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	42045026	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr6	42045171	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,5:2,2:2,0,6,1
chr6	42054380	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,7,5
chr6	42075104	.	GGGTGGGGGTTCCAGCAGCAGGGGAGGT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=105,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.678:7:1,2:0,3:2,0,4,1
chr6	42077870	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	42110171	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=124,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,8:4,5:2,7,1,12
chr6	42146142	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:5,6,0,2
chr6	42152537	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,18;MFRL=110,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.242:11:2,0:3,0:6,3,2,0
chr6	42153609	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	42156550	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	42162575	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	42176120	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:1,5,0,3
chr6	42176544	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:2,4:0,4:3,0,8,0
chr6	42176743	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,5:0,0:0|1:42176743_TG_T:42176743:0,0,0,5
chr6	42176749	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:42176743_TG_T:42176743:0,0,0,5
chr6	42176761	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr6	42176768	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=197,123;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42176768_CA_TG:42176768:0,1,0,1
chr6	42176775	.	TTG	CCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=199,123;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42176768_CA_TG:42176768:0,2,0,1
chr6	42176780	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=199,123;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42176768_CA_TG:42176768:0,2,0,1
chr6	42181773	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:4,7:5,8:9,0,15,0
chr6	42181960	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.450:51:12,9:16,13:11,17,6,17
chr6	42182183	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	42185631	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:0,4,2,6
chr6	42196127	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=147,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,4:3,4:5,3,5,4
chr6	42608123	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr6	42612312	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr6	42612344	.	TCTGGC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:42612344_TCTGGC_T:42612344:0,2,0,1
chr6	42612354	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=194,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42612344_TCTGGC_T:42612344:0,1,0,1
chr6	42615950	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,49;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,5,13
chr6	42626341	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=137.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,23:0,17:0,0,38,3
chr6	42626564	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.491:6:2,3:0,0:2,1,1,2
chr6	42638564	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,5:0,0,0,18
chr6	42641704	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	42644623	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,16:0,0,5,18
chr6	42650766	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr6	42652667	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr6	42658752	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=87.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,11:0,13:0,0,20,4
chr6	42666020	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr6	42797142	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=147,88;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,0:3,3:3,5,0,3
chr6	42824756	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=280,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,5:1,0:1,0,5,0
chr6	42833204	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,1:5,1:0|1:42833204_A_C:42833204:2,17,0,2
chr6	42833209	.	GCCCCGAGACCCCA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCGAGACCCCA;STR;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,6:0.658:9:1,5:2,1:1|0:42833204_A_C:42833204:0,3,0,6
chr6	42853842	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr6	42883911	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:0,10,1,2
chr6	42891022	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,7:5,5:6,6,6,6
chr6	42905788	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:8,1,6,0
chr6	42906241	.	GCT	ATA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr6	42931224	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.574:19:3,4:4,6:5,3,6,5
chr6	42931261	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.502:26:6,6:7,7:9,4,4,9
chr6	42932715	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:2,1:1,1,4,1
chr6	42934500	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=79,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:3,4,1,6
chr6	42935173	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:9,1:11,5,2,0
chr6	42935998	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.673:28:2,12:5,7:3,6,10,9
chr6	42937649	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=138,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:18,2:13,0:11,20,2,0
chr6	42942779	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=106,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,2:0,3:3,3,2,3
chr6	42946340	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.281:5:1,1:3,0:0|1:42946340_G_GA:42946340:2,2,0,1
chr6	42946342	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:42946340_G_GA:42946340:2,2,0,1
chr6	42974698	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:8,3:6,6,0,3
chr6	42975636	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:9,2,2,0
chr6	42993135	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr6	42993166	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:42993166_G_A:42993166:0,4,0,1
chr6	42993168	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:42993166_G_A:42993166:0,4,0,1
chr6	43005345	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr6	43006214	.	A	ACCAGTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,2:6,0:3,5,1,1
chr6	43013434	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=133,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,1:6,3:2,11,2,2
chr6	43014298	.	TT	CC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,15:0,7:0,0,6,17
chr6	43018744	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:16,2:11,0:22,6,2,0
chr6	43030926	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=159,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,2:7,0:0,12,1,1
chr6	43034839	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:3,1:7,1:0|1:43034839_T_TG:43034839:0,11,4,0
chr6	43034844	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:4,1:8,1:0|1:43034839_T_TG:43034839:0,12,4,0
chr6	43038938	.	TAAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=194,156;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr6	43038968	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,14;MFRL=131,156;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:43038968_T_A:43038968:2,1,1,0
chr6	43038972	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,14;MFRL=118,156;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:43038968_T_A:43038968:2,2,1,0
chr6	43038977	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,15;MFRL=118,156;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:43038968_T_A:43038968:2,2,1,0
chr6	43038982	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,15;MFRL=118,156;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:43038968_T_A:43038968:2,2,1,0
chr6	43111445	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	43112382	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=72,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,1,2
chr6	43126766	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=225,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	43181357	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43181357_C_A:43181357:0,0,1,0
chr6	43181366	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=158,313;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43181357_C_A:43181357:1,0,1,0
chr6	43188714	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43188714_C_T:43188714:0,3,0,1
chr6	43188716	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.499:4:1,1:1,1:1|0:43188714_C_T:43188714:0,2,0,2
chr6	43188718	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:43188714_C_T:43188714:0,3,0,1
chr6	43188719	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:43188714_C_T:43188714:0,3,0,1
chr6	43188720	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=171,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43188714_C_T:43188714:0,2,0,1
chr6	43190186	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=108,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:43190186_TGG_T:43190186:1,2,1,0
chr6	43190193	.	G	GTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43190186_TGG_T:43190186:1,0,1,0
chr6	43190200	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=182,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43190186_TGG_T:43190186:0,1,1,0
chr6	43225791	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	43250387	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	43250539	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,53;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:3,2:0|1:43250539_C_T:43250539:7,7,1,1
chr6	43250557	.	C	CTTGCGGCCGTCCCGCACGTGCTGCTTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=139,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:8,0:5,2:0|1:43250539_C_T:43250539:5,9,1,1
chr6	43251080	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,1:12,2:6,16,1,2
chr6	43251880	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	43267831	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=153,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr6	43269029	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=91,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,2,3
chr6	43269037	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=125,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr6	43270097	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr6	43270326	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr6	43273449	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,13;MFRL=221,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.530:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr6	43275706	.	A	ACCGACCTTACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=135,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:43275706_A_ACCGACCTTACC:43275706:1,2,0,1
chr6	43275709	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=135,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43275706_A_ACCGACCTTACC:43275706:1,2,0,1
chr6	43275711	.	C	CTTCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=135,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43275706_A_ACCGACCTTACC:43275706:1,2,0,1
chr6	43306346	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr6	43320055	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,2:2,0,2,1
chr6	43322553	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:36,0:25,3:41,20,0,3
chr6	43323917	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	43399837	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=139.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,17:0,23:0,0,24,17
chr6	43401105	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,3:4,4:0,5,0,7
chr6	43402666	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=264,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43402666_G_T:43402666:0,1,0,1
chr6	43402671	.	GAA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=264,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43402666_G_T:43402666:0,1,0,1
chr6	43406614	.	T	TACACTGCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	43411659	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=104,141;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,2:9,4:8,4,5,1
chr6	43413251	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,19;MFRL=205,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:2,0:0,0:0|1:43413251_C_G:43413251:2,1,1,0
chr6	43413255	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,10;MFRL=205,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:2,0:0,0:0|1:43413251_C_G:43413251:2,1,1,0
chr6	43413258	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=19,12;MFRL=128,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:43413251_C_G:43413251:1,1,1,0
chr6	43413263	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=18,12;MFRL=131,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:43413251_C_G:43413251:2,0,1,0
chr6	43413266	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=131,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:43413251_C_G:43413251:2,0,1,0
chr6	43414216	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	43414234	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	43416995	.	GGGA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=109,168;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,1:3,0:1,2,1,0
chr6	43469445	.	GACACACAC	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=26,22;RU=AC;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.813:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	43469519	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:1,3,0,2
chr6	43470149	.	A	ACAGTTAGAGAAGGGGTC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	43470181	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43470181_C_CT:43470181:1,0,0,1
chr6	43470187	.	G	GCCT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43470181_C_CT:43470181:1,0,0,1
chr6	43470188	.	GAGA	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43470181_C_CT:43470181:1,0,0,1
chr6	43470198	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43470181_C_CT:43470181:1,0,0,1
chr6	43470200	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43470181_C_CT:43470181:1,0,0,1
chr6	43471178	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,0:9,3:10,13,0,3
chr6	43473599	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	43480395	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,4:4,0:3,2,1,3
chr6	43494319	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr6	43497105	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=182,164;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43497105_C_T:43497105:0,1,0,1
chr6	43497107	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=182,164;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43497105_C_T:43497105:0,1,0,1
chr6	43501580	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,8:0,0,10,2
chr6	43533305	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=9,30;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.749:3:0,2:0,0:0,1,2,0
chr6	43538501	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,2,0
chr6	43593660	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:43593660_G_C:43593660:0,3,0,1
chr6	43593662	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:43593660_G_C:43593660:0,3,0,1
chr6	43593665	.	GG	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:43593660_G_C:43593660:0,3,0,1
chr6	43593999	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:17,3:6,0:12,11,2,1
chr6	43594243	.	T	TCCTCCCCTTTCTTCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	43640204	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,2:5,0:0,11,0,3
chr6	43745426	.	C	CCAGCTGCTTGCTCAGTTTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=117,4659;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,0:1,1:1,2,1,0
chr6	43745433	.	GGG	ACA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43745433_GGG_ACA:43745433:0,0,0,1
chr6	43745440	.	G	GAGCAGATGCTTTCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43745433_GGG_ACA:43745433:0,0,0,1
chr6	43746169	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:3,3,6,1
chr6	43748643	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	43749887	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=170,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:43749887_G_C:43749887:0,2,0,1
chr6	43749897	.	GTG	CAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=170,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:43749887_G_C:43749887:0,2,0,1
chr6	44081987	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=204,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr6	44106360	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=233,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44106360_G_A:44106360:0,1,0,1
chr6	44106364	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=233,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44106360_G_A:44106360:0,1,0,1
chr6	44117798	.	G	GTAAGGATGGATTGAAATGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	44134581	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:2,4,2,5
chr6	44134610	.	TTCC	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=131,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCC;STR;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr6	44140818	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:0,10,1,7
chr6	44143974	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=182,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.157:21:7,0:6,0:7,11,3,0
chr6	44143980	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=182,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,1:5,0:7,9,3,0
chr6	44143984	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.319:19:3,0:6,1:4,9,6,0
chr6	44143988	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=178,111;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.149:22:5,0:9,0:7,12,3,0
chr6	44145212	.	C	CCTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CTTT;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	44147250	.	AAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=139,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:3,1:8,2,1,1
chr6	44148582	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:5,0:7,0:0|1:44148582_T_A:44148582:3,11,2,0
chr6	44148588	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:3,0:7,0:0|1:44148582_T_A:44148582:3,9,2,0
chr6	44149113	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr6	44149153	.	CCA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CA;STR;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	44150586	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=154,153;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr6	44150591	.	A	C,G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31,28;MFRL=154,125,153;MMQ=60,60,40;MPOS=11,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,1,1:1,0,0:4,0,2,0
chr6	44150607	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,0:5,0,2,0
chr6	44151765	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	44151767	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=82,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:44151767_TC_T:44151767:0,2,0,1
chr6	44151770	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=82,229;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:44151767_TC_T:44151767:0,2,0,1
chr6	44151804	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	44216544	.	GT	G	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=61.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,17:0.567:30:5,9:7,8:0|1:44216544_GT_G:44216544:3,10,3,14
chr6	44216555	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,17:0.566:30:6,6:7,8:0|1:44216544_GT_G:44216544:3,10,3,14
chr6	44216557	.	A	AGACAGGGTC	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,2:0.090:31:13,2:15,0:1|0:44216544_GT_G:44216544:6,23,0,2
chr6	44216559	.	A	AG	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,2:0.092:30:12,1:15,0:1|0:44216544_GT_G:44216544:6,22,0,2
chr6	44218842	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.075:63:30,2:28,2:26,33,3,1
chr6	44227014	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=116,84;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:7,10,2,0
chr6	44228162	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:2,8:2,7:4,0,13,2
chr6	44233372	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:2,0:0|1:44233372_G_C:44233372:4,4,2,0
chr6	44233378	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=21,13;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,0:0|1:44233372_G_C:44233372:4,4,2,0
chr6	44233383	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,1:1,0:3,4,3,0
chr6	44233389	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,0:3,1:0|1:44233372_G_C:44233372:7,4,2,0
chr6	44241284	.	G	GTTGAACAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	44253617	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	44253749	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,8,8
chr6	44254344	.	C	CGCGGGGTAGCGCGCAGTCCCGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	44268806	.	T	TTGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	44269023	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr6	44270768	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr6	44270936	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,5:0,19:0,0,14,11
chr6	44273546	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=160.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,23:0,23:0,0,12,34
chr6	44274126	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=160,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:4,0:7,3:4,7,2,1
chr6	44274797	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr6	44280812	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	44311042	.	G	GTTATGTGGTATGTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	44311050	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44311050_G_A:44311050:0,0,0,1
chr6	44311052	.	G	GATC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44311050_G_A:44311050:0,0,0,1
chr6	44355682	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr6	44355699	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr6	45165457	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=134,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:12,3:21,0:0|1:45165457_G_T:45165457:24,18,1,2
chr6	45165460	.	C	CAAT	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.096:49:19,3:24,0:0|1:45165457_G_T:45165457:25,20,2,2
chr6	45165465	.	GTAT	G	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=133,150;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,2:0.041:71:23,2:36,0:0|1:45165457_G_T:45165457:50,19,2,0
chr6	45165473	.	A	C	.	.	DP=74;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=129,150;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,2:0.040:72:28,2:35,0:0|1:45165457_G_T:45165457:52,18,2,0
chr6	45390445	.	ACAG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,187;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAG;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:4,0:5,4,1,1
chr6	45513122	.	T	TGTTTTCTCCGTTTTTGGAATC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	45870999	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:0,4,0,5
chr6	45922849	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	46521602	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:2,3,3,7
chr6	46521606	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=143,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:3,9,0,2
chr6	46620985	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,2:10,1:7,10,2,1
chr6	46636556	.	GT	G,GTT	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=31,23,34;MFRL=111,157,165;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.71,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,4,3:0.119,0.106:34:6,1,1:15,1,1:7,20,1,6
chr6	46636568	.	TG	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:11,2:24,0:0|1:46636568_TG_T:46636568:7,29,1,1
chr6	46636571	.	A	AATTTGCATT	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:6,2:19,0:0|1:46636568_TG_T:46636568:7,29,1,1
chr6	46649231	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,4:4,1:3,2,2,3
chr6	46660929	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.243:6:2,0:3,1:4,1,0,1
chr6	46661932	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=196,94;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	46661937	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=202,196;MMQ=51,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.520:4:0,1:1,0:0,2,0,2
chr6	46665778	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=113,25;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:9,5,1,1
chr6	46672207	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,218;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr6	46672215	.	TCACACACA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=155,158;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=CA;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:2,1:5,0,3,0
chr6	46679303	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.489:35:11,7:6,10:7,11,5,12
chr6	46680043	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=132,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:11,2:5,0:10,6,2,1
chr6	46726441	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr6	46761363	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:10,1:11,10,1,1
chr6	46802901	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.340:21:8,2:6,4:14,0,7,0
chr6	46806948	.	G	GTTTGGGGCAGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,152;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	46823695	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=366.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,113:0.991:113:0,62:0,50:0,0,71,42
chr6	46823805	.	A	AG	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=161.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,23:0,22:0,0,0,45
chr6	46826910	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,22,10
chr6	46828670	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr6	46832741	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr6	46834906	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr6	46856263	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:3,11:8,4:6,6,1,14
chr6	46867717	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=59.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,15,3
chr6	46995501	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:2,7,0,4
chr6	46995508	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,2:2,6:0,3,1,8
chr6	47254404	.	GGCCA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=199,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47254404_GGCCA_G:47254404:0,2,0,1
chr6	47254409	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=199,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47254404_GGCCA_G:47254404:0,2,0,1
chr6	47254423	.	A	AAACCAACACATCCAGGACATAAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	47445927	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,12:0,0,20,9
chr6	47522357	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,20,4
chr6	47547070	.	T	TAA,TAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30,32;MFRL=0,186,183;MMQ=60,60,50;MPOS=17,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,16,17;RU=A;STR;TLOD=5.54,5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.444,0.442:4:0,2,1:0,0,1:0,0,4,0
chr6	47547090	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=154,163;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:7,0:9,6,2,0
chr6	47548672	.	C	A	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=217.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,31:0,36:0,0,12,57
chr6	47549629	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,10:0,11:0,0,20,1
chr6	47549883	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=134.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,18:0,0,0,35
chr6	47577064	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr6	47591856	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,14,3
chr6	47624129	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	47626685	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr6	47626941	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=171,197;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47626941_T_G:47626941:0,3,0,1
chr6	47626943	.	G	GATGAGATCCCGCAACTGCATTCAAGCCTGGGTGACAGAGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=171,197;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47626941_T_G:47626941:0,3,0,1
chr6	47626946	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=191,197;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:47626941_T_G:47626941:0,4,0,1
chr6	47626948	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=210,197;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47626941_T_G:47626941:0,3,0,1
chr6	47641307	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,1:0,0,0,6
chr6	47649573	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,7,4
chr6	47649694	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,0:0,6:0,1,5,1
chr6	47653536	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=63.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr6	47653812	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	47653851	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	47654662	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,7:0,0,19,1
chr6	47654817	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,1,18
chr6	47654831	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,1,17
chr6	47654864	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	47661387	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=117.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,29,3
chr6	47678455	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr6	47678678	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,12:0,0,0,19
chr6	47681494	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=73.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,19,3
chr6	47682604	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,11:0,0,19,4
chr6	47749728	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	47791772	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,1:14,1:8,20,0,2
chr6	47847683	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=92,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr6	47869805	.	A	ATCCATCCCTCCATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	49403433	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=176,200;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:49403433_A_AGG:49403433:0,2,0,1
chr6	49403434	.	CTA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=176,200;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:49403433_A_AGG:49403433:0,2,0,1
chr6	49409487	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr6	49409737	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr6	49415351	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.780:25:4,13:1,7:4,1,19,1
chr6	49415383	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.121:42:18,0:11,0:23,14,5,0
chr6	49421241	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr6	49437853	.	ATT	A,AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=165,175,171;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=6.39,31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,14:0.208,0.702:19:0,3,9:1,1,5:1,0,18,0
chr6	49440614	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=137.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,22:0,23:0,0,12,34
chr6	49483298	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,5:3,6:6,0,11,0
chr6	49494126	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,2:14,0:13,5,0,2
chr6	49494359	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,0:15,2:8,19,2,0
chr6	49494459	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:9,10,0,2
chr6	49578876	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,5:4,1:2,8,0,6
chr6	49578958	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,298;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr6	49580033	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:3,0:8,0,2,0
chr6	49582617	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:1,4,1,2
chr6	49660418	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr6	49660694	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:49660694_G_T:49660694:0,4,0,1
chr6	49660697	.	G	GTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:49660694_G_T:49660694:0,3,0,1
chr6	49663465	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,8:8,4:11,1,12,0
chr6	49705182	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=15524273,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	49937257	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr6	50712784	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,1:3,5:3,0,6,0
chr6	50789944	.	CTG	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,2:6,0:3,15,0,2
chr6	51484348	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	51497344	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28,32;MFRL=173,168,86;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.26,3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.248,0.248:9:4,1,2:1,1,0:5,0,4,0
chr6	51524359	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:10,6,2,0
chr6	51611588	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,0:17,2:0|1:51611588_G_T:51611588:13,17,0,2
chr6	51611594	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:15,2:0|1:51611588_G_T:51611588:11,14,0,2
chr6	51613270	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=53,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51613270_G_C:51613270:0,2,1,0
chr6	51613273	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=53,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51613270_G_C:51613270:0,2,1,0
chr6	51618170	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,9,11
chr6	51619808	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	51640751	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr6	51656236	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	51732986	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=182,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:51732986_T_C:51732986:0,2,0,1
chr6	51732987	.	TTAA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=182,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,0:1,1:0|1:51732986_T_C:51732986:0,2,0,1
chr6	51750640	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,3:9,0:18,3,1,2
chr6	51892737	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:4,0:8,2:3,10,0,2
chr6	51900434	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,1:10,2:10,8,2,1
chr6	51914898	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr6	51930886	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.908:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr6	51938242	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,12,10
chr6	51944893	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=237,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	52129493	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=134,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:9,8,2,0
chr6	52129667	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	52137313	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:0,5,1,6
chr6	52138441	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr6	52138765	.	GAAC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0,3,0,2
chr6	52141850	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=123,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,3:5,0:8,3,1,2
chr6	52142582	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	52147363	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,6:5,1:7,0,6,1
chr6	52147692	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr6	52270544	.	TTTG	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,25:0.510:49:17,16:7,9:13,11,13,12
chr6	52270992	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:6,4,4,4
chr6	52271417	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,219;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:0|1:52271417_G_A:52271417:0,12,0,2
chr6	52271419	.	GAT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=167,219;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:4,0:0|1:52271417_G_A:52271417:0,12,0,2
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chr6	52662263	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr6	52697576	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,5:1,2:3,0,7,0
chr6	52697601	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,3:8,1:16,0,4,0
chr6	52697825	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,2,8
chr6	52697834	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,1,8
chr6	52702324	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,11:0,0,10,8
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chr6	52762600	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:12,1:15,2:17,10,1,2
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chr6	52843477	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
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chr6	52958667	.	GT	G,GTT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,34,35;MFRL=163,168,150;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.88,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,7,6:0.150,0.142:44:12,3,1:18,4,4:29,2,11,2
chr6	52962715	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr6	52998834	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr6	52998856	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,5,4
chr6	53134104	.	C	CACAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr6	53134164	.	C	CCTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	53138203	.	TAA	T,TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31,32;MFRL=0,163,144;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.49,10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,5:0.364,0.548:8:0,2,3:0,1,2:0,0,0,8
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chr6	53160383	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr6	53365019	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=13,30;MFRL=109,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=138.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:0,20:0,21:0,1,27,16
chr6	53365404	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=215,199;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	53370628	.	TC	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.114:42:12,0:24,4:17,21,0,4
chr6	53520088	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	53520124	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	53707098	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,137;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:4,4:3,5:0,7,0,10
chr6	53883868	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:8,1:18,3:13,13,2,2
chr6	53986286	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.483:29:10,6:5,8:5,10,8,6
chr6	54013765	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,37;MFRL=170,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr6	54054837	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=153,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr6	54067088	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:0,7,0,5
chr6	54130829	.	CT	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=110,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.284:29:7,3:10,3:6,15,0,8
chr6	54186024	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	54245215	.	GACA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=213,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	54254580	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:7,1:5,5:0|1:54254580_T_G:54254580:9,3,6,0
chr6	54254589	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=132,171;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:8,2:5,6:0|1:54254580_T_G:54254580:10,3,7,1
chr6	54804482	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:7,0,5,0
chr6	54805279	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:2,3,3,0
chr6	55113347	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:1,0,10,0
chr6	55113350	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,7:1,3:1,0,11,0
chr6	55113411	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=119.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,20:0,15:0,0,25,11
chr6	55113664	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,3:0,3,0,4
chr6	55113692	.	CTA	GGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=202,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	55113713	.	T	TTTTAGTATTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=265,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:55113713_T_TTTTAGTATTG:55113713:1,0,0,1
chr6	55113715	.	GCC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=265,229;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55113713_T_TTTTAGTATTG:55113713:1,0,0,1
chr6	55120128	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:17,2:14,0:14,17,0,2
chr6	55198826	.	T	TCCTCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55198826_T_TCCTCC:55198826:0,0,0,1
chr6	55198827	.	AAT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55198826_T_TCCTCC:55198826:0,0,0,1
chr6	55216005	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:3,7:7,3:7,3,10,1
chr6	55266722	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0|1:55266722_C_T:55266722:0,1,1,4
chr6	55266744	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:55266722_C_T:55266722:0,4,0,1
chr6	55381262	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr6	55442033	.	GATAGAAAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	55625272	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.118:31:10,2:18,1:14,14,1,2
chr6	55739711	.	TA	T,TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=133,187,178;MMQ=60,60,60;MPOS=26,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.94,8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,5:0.187,0.319:16:4,0,3:2,3,2:0,8,1,7
chr6	55922584	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,3:9,7:7,5,5,5
chr6	55929429	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:4,2:0,10,1,4
chr6	55966418	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,2,14
chr6	55988837	.	C	CT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.234:34:13,2:11,4:22,4,4,4
chr6	56006843	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=234,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,1:0,1,0,4
chr6	56047438	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.488:25:4,4:7,8:2,11,6,6
chr6	56327849	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:8,4:11,9:8,11,8,5
chr6	56329496	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:13,1:13,1:14,12,0,2
chr6	56334594	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:5,8:6,8:9,2,15,1
chr6	56347072	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=206,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:0,2:2,0:1,3,0,3
chr6	56354490	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	56359034	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr6	56365814	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=238,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr6	56374754	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr6	56381912	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr6	56394173	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	56417239	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,0:4,3:3,9,0,3
chr6	56425284	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr6	56427095	.	C	CTGAGTGTTGAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	56427110	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	56437465	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr6	56437686	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,3:0.046:84:41,0:38,3:45,36,1,2
chr6	56437902	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	56462840	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.948:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr6	56467586	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr6	56468238	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr6	56468537	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr6	56469764	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,3:8,4:9,5,6,2
chr6	56476262	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr6	56476456	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	56481864	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:6,2:5,5,2,1
chr6	56482704	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	56484448	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=169,105;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,0:12,3:8,10,0,3
chr6	56504477	.	TA	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:16,3:22,1:26,16,3,1
chr6	56507135	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr6	56818706	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	57061415	.	ACAAT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAAT;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,1:6,1:3,7,0,2
chr6	57244672	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:13,2:5,3:15,3,5,0
chr6	57244830	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:2,7,0,4
chr6	57244893	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr6	57246773	.	T	TAGG	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGG;STR;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:11,5:14,2:24,1,6,1
chr6	57246785	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.244:39:11,6:18,3:28,2,6,3
chr6	57246815	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,23:0.337:69:18,11:28,12:34,12,12,11
chr6	57246969	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.457:39:9,8:12,8:5,16,3,15
chr6	57246982	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:8,7:10,9:3,15,1,15
chr6	57247022	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:7,3:0,12,0,6
chr6	57372199	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:5,4:3,13:8,0,16,2
chr6	57372361	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.645:43:7,14:8,13:6,9,7,21
chr6	57372365	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.308:40:13,7:14,5:7,21,4,8
chr6	57372374	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:14,1:14,6:6,22,0,7
chr6	57372436	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0,6,0,6
chr6	57393125	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.595:35:6,11:7,10:12,2,15,6
chr6	57393199	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,18:0.345:53:17,9:18,9:11,24,5,13
chr6	57393216	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.527:40:7,9:10,12:6,13,1,20
chr6	57393222	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,9:0.227:42:13,4:20,5:0|1:57393222_A_G:57393222:6,27,1,8
chr6	57393228	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,8:0.219:39:13,3:18,4:0|1:57393222_A_G:57393222:5,26,1,7
chr6	57393278	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0,10,0,2
chr6	57398047	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=153,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr6	57398081	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=28,34;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,0:2,5:8,0,5,0
chr6	57398117	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=10;MBQ=32,30;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.341:39:16,7:10,6:0|1:57398117_T_TA:57398117:22,4,13,0
chr6	57398118	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=10;MBQ=35,30;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.341:39:16,7:10,6:0|1:57398117_T_TA:57398117:22,4,13,0
chr6	57398154	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,28:0.500:56:18,14:9,12:0|1:57398154_T_C:57398154:18,10,23,5
chr6	57398157	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=29,34;MFRL=125,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,27:0.491:55:17,12:7,13:0|1:57398154_T_C:57398154:17,11,22,5
chr6	57398163	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,29:0.500:58:16,13:9,14:0|1:57398154_T_C:57398154:17,12,22,7
chr6	57398186	.	G	GA	.	.	DP=64;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,7:0.131:58:28,2:23,5:27,24,5,2
chr6	57398201	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,34:0.515:66:21,11:11,23:17,15,22,12
chr6	57398226	.	T	A,G	.	.	DP=74;ECNT=10;MBQ=30,28,33;MFRL=139,117,149;MMQ=60,60,60;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.91,70.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,15,24:0.221,0.360:69:15,1,12:11,12,12:15,15,20,19
chr6	57398335	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:0,7,0,11
chr6	57466987	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=222,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.686:10:2,4:0,3:3,0,7,0
chr6	57467279	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0|1:57467279_T_C:57467279:0,4,0,2
chr6	57467282	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:3,1:0|1:57467279_T_C:57467279:0,4,0,2
chr6	57467303	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=295,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,1:1,3:0,1,0,5
chr6	57472255	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=59.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:2,11:7,8:9,0,19,0
chr6	57472299	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,19:0.357:54:14,13:21,6:29,6,18,1
chr6	57472315	.	AG	GA,GG	.	.	DP=74;ECNT=4;MBQ=32,33,34;MFRL=119,141,138;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=68.43,51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,24,18:0.358,0.278:67:11,13,9:14,10,9:17,8,33,9
chr6	57472344	.	A	AT	.	.	DP=108;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,26:0.270:98:36,10:34,16:38,34,14,12
chr6	57472476	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.302:31:13,3:9,6:2,20,0,9
chr6	57472488	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,4:6,3:2,15,0,7
chr6	57472495	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,4:7,1:2,13,0,5
chr6	57472533	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=178,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr6	57498894	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr6	57498944	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,2:3,6:8,2,8,0
chr6	57499042	.	A	AT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,16:0.335:49:19,9:13,7:12,21,9,7
chr6	57512439	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:10,7:6,6:16,0,13,0
chr6	57512476	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,33:0.667:49:8,18:8,15:12,4,25,8
chr6	57512565	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,37:0.628:59:12,15:8,22:10,12,12,25
chr6	57512678	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,36:0.616:58:12,13:10,22:11,11,15,21
chr6	57512711	.	G	A,C	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=32,28,33;MFRL=142,97,131;MMQ=60,60,60;MPOS=8,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=31.26,39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,13,12:0.285,0.265:46:10,3,6:11,10,6:6,15,3,22
chr6	57512718	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.273:42:12,6:15,4:5,26,1,10
chr6	57512775	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=188,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,2:3,2:0|1:57512775_T_G:57512775:0,8,0,4
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chr6	57512787	.	T	TCACCAAGGC	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:0|1:57512775_T_G:57512775:0,6,0,4
chr6	57512788	.	T	TTA	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,2:3,1:0|1:57512775_T_G:57512775:0,6,0,4
chr6	62757987	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	62887031	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	63921361	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	63921873	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=87,164;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.432:26:7,7:7,4:9,6,2,9
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chr6	63922376	.	T	TGG	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:6,0:6,0:0|1:63922376_T_TGG:63922376:0,13,4,0
chr6	63922380	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:5,1:6,1:0|1:63922376_T_TGG:63922376:1,12,4,0
chr6	63922385	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:6,1:6,2:0|1:63922376_T_TGG:63922376:5,12,4,0
chr6	63922389	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:9,0:6,1:0|1:63922376_T_TGG:63922376:6,11,4,0
chr6	63922500	.	ATTTTTTT	A,AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25,25;MFRL=58,131,104;MMQ=59,49,47;MPOS=18,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.08,10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,6:0.219,0.347:18:2,3,0:4,1,5:3,5,2,8
chr6	63922916	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=102,142;MMQ=60,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:3,8,2,3
chr6	63922929	.	A	AAAAT,AAAATAAATAAAT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31,34;MFRL=0,131,137;MMQ=60,50,40;MPOS=20,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,7,9;RU=AAAT;STR;TLOD=11.16,8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.464,0.442:6:0,1,0:0,2,2:0,0,0,6
chr6	63990250	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:6,6,1,1
chr6	63991183	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:63991183_G_A:63991183:0,3,0,1
chr6	63991185	.	C	CTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:63991183_G_A:63991183:0,3,0,1
chr6	63991189	.	GG	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:63991183_G_A:63991183:0,3,0,1
chr6	64288716	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=255,578;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64288716_G_GAA:64288716:1,0,1,0
chr6	64288721	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=255,578;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64288716_G_GAA:64288716:1,0,1,0
chr6	64419024	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.612:8:1,4:2,1:3,0,4,1
chr6	64421443	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:9,2,2,0
chr6	64472270	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr6	64472339	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,1:13,1:22,6,0,2
chr6	64574304	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=168,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:64574304_CA_C:64574304:0,4,0,1
chr6	64574307	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=168,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:64574304_CA_C:64574304:0,4,0,1
chr6	64574315	.	A	AATTAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr6	64694544	.	ATGTGGAAAAGATGTAGGATGTTTGGTTCTGTAATTGGATGTGTTTTAATGTGTTTTTC	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=195,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.390:7:1,0:3,2:0,4,0,3
chr6	64694568	.	G	GTTTTTTACTATTTTGTGTGATTTTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.385:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr6	64694597	.	T	TCTTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.693:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	64708907	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:7,1,6,0
chr6	65016977	.	TGA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GA;STR;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.912:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	65098672	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:19,0:12,3:14,18,2,1
chr6	65098768	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr6	65303005	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:11,5,2,0
chr6	65303290	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	65611952	.	T	TATTA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:7,7:3,5:9,1,12,1
chr6	65612302	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:1,1,4,1
chr6	65655883	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr6	66005740	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=98,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.797:13:2,4:1,5:2,1,8,2
chr6	66005854	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:4,9,0,2
chr6	66005888	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr6	66045077	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	66053835	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr6	66115281	.	G	GAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,18;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=A;STR;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.830:13:1,4:0,0:0,2,3,8
chr6	66200400	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,10:6,3:10,0,13,0
chr6	69666520	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:3,12:9,5:7,5,13,4
chr6	69666747	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr6	69728452	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr6	69759148	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr6	69772817	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr6	69786046	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	70048739	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:6,6:4,4:11,0,9,1
chr6	70411513	.	A	AACACAAAAATTCAGCTAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,1:0|1:70411513_A_AACACAAAAATTCAGCTAAC:70411513:0,2,0,1
chr6	70411516	.	A	AG,T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32,32;MFRL=215,156,195;MMQ=60,60,60;MPOS=3,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,0:1,0,1:0,1,0,2
chr6	70411517	.	T	TAAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=205,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1|0:70411513_A_AACACAAAAATTCAGCTAAC:70411513:0,2,0,1
chr6	70490518	.	A	AGGAGCAGGGAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	70840124	.	AT	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,10:0.176:56:23,7:12,2:20,26,4,6
chr6	70897949	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:22,1:21,1:16,28,0,2
chr6	70944123	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	70944340	.	AAAGAGAACATTGTTAAGTTGTAAACTGACAGACTCTGCAAGGAGCCAGGTGGCTGGATTTAC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:0,0:2,1:0,4,0,1
chr6	70944465	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	70949079	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	70950281	.	AAT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	70962044	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	70963232	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,1,16
chr6	70964745	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=90.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,9,17
chr6	70965125	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr6	70966421	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=206,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,5:1,2:1,0,7,1
chr6	70970299	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,7,3
chr6	70976538	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,7:0,0,2,20
chr6	70981794	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:10,6:6,7:4,12,5,8
chr6	70983644	.	TAATA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,150;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AATA;STR;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.539:13:1,4:3,2:6,0,6,1
chr6	70983888	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:1,2:4,0:0,5,0,3
chr6	70984562	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr6	70990470	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:6,8:1,5:6,1,7,6
chr6	70991003	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr6	71011831	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	71137992	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,2,1
chr6	71185417	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=98,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.695:24:2,7:5,10:5,2,10,7
chr6	71190577	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,4:6,2:9,0,6,0
chr6	71236453	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:0|1:71236453_T_C:71236453:1,0,2,1
chr6	71236469	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71236453_T_C:71236453:0,0,0,1
chr6	71248010	.	G	C	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,3:0.040:98:51,1:44,2:49,46,3,0
chr6	71269459	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,5:7,5:7,6,5,5
chr6	71269632	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,4:6,1:0,8,0,5
chr6	71482975	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,3:0,15:0,0,14,4
chr6	71508369	.	GA	G,GAA	.	.	DP=169;ECNT=1;MBQ=34,35,33;MFRL=136,131,141;MMQ=60,60,60;MPOS=25,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=19.04,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:100,15,5:0.116,0.045:120:47,6,2:36,8,2:74,26,16,4
chr6	71547435	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	71571511	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.578:43:6,10:12,15:13,5,10,15
chr6	71666146	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,9:0,2:0,0,3,8
chr6	72011086	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:7,8:5,7:10,2,11,4
chr6	72889472	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr6	72892257	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,0,19
chr6	73001673	.	AG	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.064:44:28,2:14,0:20,22,2,0
chr6	73102522	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.440:21:6,6:5,3:1,11,3,6
chr6	73843816	.	A	AAGCTCTTTCTTTTAGATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	73935135	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=111,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:6,4:0,6:0,6,2,8
chr6	73951987	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=185,125;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.452:14:3,4:2,2:1,7,2,4
chr6	74104111	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=126,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:10,0:8,3:0|1:74104111_A_C:74104111:7,11,2,1
chr6	74104119	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:8,0:5,1:0|1:74104111_A_C:74104111:6,10,1,1
chr6	74119084	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,2,17
chr6	74155491	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	74171893	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	74183000	.	C	CAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,138;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AGAT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	74189574	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=97.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,10,19
chr6	74228006	.	A	G	.	.	DP=90;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=281.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.989:84:0,34:0,48:0,0,29,55
chr6	74228049	.	A	G	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=251.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.987:70:0,38:0,32:0,0,30,40
chr6	74310231	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=182,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.224:7:3,0:2,1:0,6,0,1
chr6	74345313	.	A	ATAGATTATAATAAAAAACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:74345313_A_ATAGATTATAATAAAAAACT:74345313:0,1,0,1
chr6	74345315	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74345313_A_ATAGATTATAATAAAAAACT:74345313:0,1,0,1
chr6	74351718	.	A	AACATATCCTCCAGGAATCTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.316:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr6	74440315	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	74468574	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr6	74476659	.	G	GT	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=63.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,33:0.460:71:20,12:18,18:31,7,20,13
chr6	74481076	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	74491138	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr6	74493629	.	T	TAATGTTGAATATTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr6	74495257	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr6	74497237	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	74498432	.	TAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,256;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	74502393	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr6	74533420	.	T	TACATGAGTA,A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31,26;MFRL=150,124,300;MMQ=60,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,1:1,0,0:0,1,0,2
chr6	75795122	.	G	GCA,GCACA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26,33;MFRL=150,133,186;MMQ=60,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=CA;STR;TLOD=7.59,18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,6:0.314,0.558:10:0,0,2:1,2,3:0,1,0,9
chr6	75796364	.	GTA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TA;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.792:7:0,0:0,1:0,1,0,6
chr6	75798785	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=183,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	75811880	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	75813440	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:18,0:18,3:30,6,0,3
chr6	75830974	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr6	75833876	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,7,8
chr6	75861717	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=145,38;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:16,0:18,2:13,22,1,1
chr6	75890933	.	T	TA,TAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,31,32;MFRL=85,181,187;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=9.64,4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,3:0.466,0.306:10:0,1,0:1,3,2:0,2,0,8
chr6	75893457	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,6:1,3:0,1,4,5
chr6	75904455	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr6	75947626	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:4,0,4,2
chr6	75950109	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:1,1:2,1:0,4,0,3
chr6	75968720	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr6	76022082	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:76022082_A_G:76022082:3,0,2,0
chr6	76022090	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:76022082_A_G:76022082:3,0,3,0
chr6	76023135	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:7,7,0,2
chr6	76024757	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=148,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:14,0:13,4:11,16,1,3
chr6	76373001	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,3:10,0:5,13,1,2
chr6	76385511	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,6:1,1:3,0,7,0
chr6	76388477	.	GTA	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:23,1:11,1:22,12,0,2
chr6	76405431	.	CA	TG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=171,172;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:7,1:21,1:29,0,2,0
chr6	76405439	.	TG	CA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=171,167;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:7,2:23,0:30,0,2,0
chr6	76419438	.	TG	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=163,202;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	76419443	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=163,202;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.595:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	76421003	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:9,10:7,12:13,3,19,3
chr6	76538403	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.518:15:4,3:3,3:0,7,1,7
chr6	76554593	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=127.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,25:0,14:0,0,27,12
chr6	76557997	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=192,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:11,1,2,0
chr6	76566734	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr6	76583113	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=30,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:2,1,0,4
chr6	76596728	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:2,5,1,4
chr6	76599857	.	G	GA	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,4:0.060:79:39,1:27,0:54,21,1,3
chr6	76607983	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:5,8:9,8:14,0,16,0
chr6	76624741	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=117,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:3,3,0,6
chr6	76656978	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.536:11:5,0:0,6:5,0,3,3
chr6	76713754	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=119,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	76720990	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:4,4:0,7,0,6
chr6	76728583	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.321:10:2,0:3,3:0,7,0,3
chr6	76735065	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	76744298	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:3,3:5,2:8,0,5,1
chr6	76782049	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	78171941	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,9:0,0,13,3
chr6	79577644	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,5,19
chr6	79595167	.	A	ACTTAT	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=437.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,100:0.991:100:0,30:0,63:0,0,46,54
chr6	79664440	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	79664748	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr6	79695003	.	T	TA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:13,1:10,3:24,0,4,0
chr6	79695029	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=147.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,22:0,21:0,0,40,4
chr6	79707209	.	CTTCTTGGTGCGTTGCTG	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=161,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.059:65:23,2:30,0:34,28,1,2
chr6	79707923	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:3,2:5,2:8,0,4,1
chr6	79727119	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:28,1:13,2:18,23,1,2
chr6	79752792	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	79913379	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.814:12:1,3:0,1:0,2,2,8
chr6	79944355	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr6	80228673	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr6	80341279	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:2,5:0,4,0,5
chr6	80341320	.	CG	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	80626375	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,27:0.451:60:14,11:19,16:10,23,10,17
chr6	80631539	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr6	80634848	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	80720487	.	GCAT	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,14:0.428:33:8,7:10,3:0|1:80720487_GCAT_G:80720487:13,6,11,3
chr6	80720491	.	T	TAAAGA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,14:0.428:33:7,7:10,2:0|1:80720487_GCAT_G:80720487:13,6,11,3
chr6	80720733	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=173,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.501:10:2,1:2,4:0|1:80720733_G_A:80720733:0,5,0,5
chr6	80720742	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=169,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:1,1:2,3:0|1:80720733_G_A:80720733:0,4,0,4
chr6	80721497	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:25,1:15,1:24,18,1,1
chr6	80724312	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,25:0.473:53:10,9:18,15:5,23,7,18
chr6	80741328	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:11,10:7,10:2,16,1,19
chr6	80747582	.	TATAATA	T,TATA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29,29;MFRL=154,179,221;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=ATA;STR;TLOD=41.59,5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,11,2:0.435,0.113:24:6,8,0:3,3,2:11,0,13,0
chr6	80749885	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,22:0.411:54:16,9:16,13:26,6,18,4
chr6	80750290	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.640:23:6,6:1,9:0|1:80750290_C_T:80750290:5,3,13,2
chr6	80750292	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.640:23:7,5:1,9:0|1:80750290_C_T:80750290:5,3,13,2
chr6	80751780	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:12,16:8,5:20,1,15,6
chr6	80837239	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,4:4,8:10,1,10,2
chr6	80837253	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.511:27:8,5:5,9:11,2,11,3
chr6	80910622	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr6	80912746	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr6	82461727	.	ACCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG	A,ACCGCCGAAGTCGCCG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29,30;MFRL=0,147,148;MMQ=60,60,57;MPOS=27,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=4,2,3;RU=CCGCCGAAGTCGCCG;STR;TLOD=25.30,11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,3:0.417,0.511:10:0,5,1:0,2,2:0,0,2,8
chr6	82882968	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=225,133;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr6	82882980	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=177,224;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,2:2,0,3,0
chr6	82883238	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr6	82906238	.	G	GCCATCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82906238_G_GCCATCCC:82906238:0,1,0,1
chr6	82906241	.	A	AGCAATCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82906238_G_GCCATCCC:82906238:0,1,0,1
chr6	82906245	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82906238_G_GCCATCCC:82906238:0,1,0,1
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chr6	82922571	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr6	82924390	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:24,3:16,0:28,12,3,0
chr6	82924645	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=88,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr6	82930437	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=132,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.603:13:0,1:1,0:0,5,0,8
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chr6	83075796	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:13,4:17,0:14,16,4,0
chr6	83077073	.	TATAAAG	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAAG;STR;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.382:35:7,3:13,10:2,20,5,8
chr6	83080386	.	C	CTTTG	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=81.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.700:28:5,10:3,8:3,5,2,18
chr6	83754094	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:1,6:0,11:1,0,17,0
chr6	83834957	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=117.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,18:0,16:0,0,6,29
chr6	83835175	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr6	83838973	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=91.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,17,7
chr6	83842055	.	C	CTCT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=89.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,6,16
chr6	83842097	.	CACACACAA	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=120,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr6	83842101	.	CACAA	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.625:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr6	83842104	.	A	ACACATGCCCACTACC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.776:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	83861930	.	TACAC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AC;STR;TLOD=107.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,17:0,8:0,0,24,1
chr6	83863583	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,13,7
chr6	83877496	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr6	83880274	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr6	83896633	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=132.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,37,0
chr6	83898300	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	83947616	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:83947616_C_CAT:83947616:0,1,0,1
chr6	83947618	.	C	CATTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:83947616_C_CAT:83947616:0,1,0,1
chr6	83947622	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:83947616_C_CAT:83947616:0,1,0,1
chr6	84056108	.	AATTTCTGACTCT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	84061864	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=72,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.324:12:6,1:1,1:6,2,0,4
chr6	84266015	.	A	ATTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:84266015_A_ATTG:84266015:0,2,0,1
chr6	84266018	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:84266015_A_ATTG:84266015:0,2,0,1
chr6	84284664	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	84290087	.	TGA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=182,268;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GA;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:5,1:11,0,2,0
chr6	84290137	.	TAAAG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.324:16:7,4:3,1:10,1,2,3
chr6	84290262	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,0:15,2:13,17,0,2
chr6	84292139	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=241,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr6	84317533	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:15,14:6,7:9,12,3,18
chr6	84320246	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:5,1,5,0
chr6	84320467	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=111.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,13:0,18:0,0,0,39
chr6	84368819	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:1,2:0,3:0,3,0,5
chr6	84375377	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	84563410	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=152,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.517:17:5,6:3,1:6,2,6,3
chr6	84563840	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:4,4,1,1
chr6	84603226	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.556:32:8,13:6,4:11,3,14,4
chr6	84603422	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=212,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr6	84627810	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=103.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,38:0.517:73:19,22:16,14:3,32,7,31
chr6	84634210	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=125,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:16,2:24,0:20,20,1,1
chr6	84649734	.	GT	G,GTT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,33,36;MFRL=149,53,113;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.37,3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,4,7:0.088,0.151:43:19,2,4:12,1,3:30,2,9,2
chr6	84650214	.	G	GT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.464:41:8,12:14,7:21,1,19,0
chr6	84650364	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:3,8:6,10:1,8,2,17
chr6	84799185	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:8,2:7,7:4,12,1,8
chr6	84799194	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:7,0:11,2:0|1:84799194_G_GA:84799194:5,15,1,1
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chr6	84799231	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:6,1:0,2:2,5,0,4
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chr6	84835050	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=236,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:84835045_G_T:84835045:0,1,0,1
chr6	84835055	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=236,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:84835045_G_T:84835045:0,1,0,1
chr6	84856409	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,4:2,8:3,3,9,3
chr6	84873080	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,0:0,3:0,2,0,3
chr6	84884867	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,2:2,2:5,0,5,0
chr6	84903225	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,6:3,1:6,1,7,0
chr6	84903394	.	C	G	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=124.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,42:0.559:75:16,25:17,16:12,21,14,28
chr6	84911336	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:6,0,7,0
chr6	84913725	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:84913725_A_C:84913725:10,6,1,1
chr6	84913727	.	TTG	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,1:6,0:0|1:84913725_A_C:84913725:10,6,1,1
chr6	84922681	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.454:33:9,5:8,9:12,6,10,5
chr6	85466607	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.452:20:6,5:5,4:2,9,1,8
chr6	85470108	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,74;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:3,6,0,4
chr6	86195033	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,5:6,3:6,4,6,2
chr6	86251599	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr6	86257229	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,3:2,11:1,4,6,8
chr6	87796233	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr6	87797953	.	AAAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr6	87970171	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:13,0:17,2:11,21,0,2
chr6	88046946	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=202,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:0,5,1,5
chr6	88108048	.	AGAT	A	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=402.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,96:0.990:96:0,50:0,45:0,0,60,36
chr6	88170710	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=101.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,15:0,0,23,6
chr6	88221097	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,0:7,3:13,0,3,0
chr6	88224023	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=210,191;MMQ=44,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr6	88224029	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=191,210;MMQ=40,44;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr6	88224060	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=193,198;MMQ=60,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,0:3,0:6,0,2,0
chr6	88226641	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,4,8
chr6	88255438	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr6	88273971	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,1:0,12:0,0,0,14
chr6	88300013	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	88303967	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr6	88315741	.	TA	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=108.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,12:0,21:0,0,5,29
chr6	88317292	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	88331299	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr6	88331572	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:13,0,2,0
chr6	88366602	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,14:0,0,10,13
chr6	88366771	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	88366788	.	T	TATTATAATTTGATAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=188,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	88375553	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,151;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:7,11,0,2
chr6	89387895	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr6	89511228	.	TAC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,1:11,1:23,0,2,0
chr6	89601706	.	A	ATTAAGAATGATGTTTCTTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr6	89614397	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=129,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:7,2:5,2:12,0,4,0
chr6	89638988	.	TA	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=15,17;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.184:41:5,0:5,3:7,26,2,6
chr6	89790559	.	CTTCA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCA;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr6	89814830	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,8:8,2:6,6,7,3
chr6	89862725	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,1:1,7:5,0,7,1
chr6	89864679	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,7:5,8:0,10,0,15
chr6	89867980	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:5,11:2,6:7,0,17,0
chr6	89868190	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:1,5:6,3:0,7,0,8
chr6	89871759	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,2:7,8:10,1,9,1
chr6	89888443	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	89888839	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	89891582	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	89894968	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr6	89909204	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr6	89913108	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:4,1:5,3:0|1:89913108_C_G:89913108:8,4,4,0
chr6	89913112	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:7,2:5,3:0|1:89913108_C_G:89913108:8,4,5,0
chr6	89913118	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:12,4,2,0
chr6	89913286	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=191,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	89974063	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	89975245	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	89975569	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=172,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr6	89977322	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	89977906	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr6	90045077	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,3:9,1:10,9,3,1
chr6	90326471	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	90340276	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,9,7
chr6	90347394	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,3:6,0:15,2,3,0
chr6	90360655	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90360655_G_A:90360655:0,2,0,1
chr6	90360660	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90360655_G_A:90360655:0,2,0,1
chr6	90361811	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	90365582	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:5,13,0,2
chr6	90371704	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	90371986	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,3:0,11:0,0,1,17
chr6	90381849	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	90385754	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr6	90387233	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	90390338	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:10,5,1,1
chr6	90394798	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90394798_T_A:90394798:0,0,0,1
chr6	90394799	.	CATT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90394798_T_A:90394798:0,0,0,1
chr6	90398197	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr6	90400292	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr6	90405306	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,5:0,0,12,2
chr6	90405993	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	90415764	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=121.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,12:0,22:0,0,29,5
chr6	90423050	.	A	AAGCATGGGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=232,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	90426270	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	90428968	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,1,12
chr6	90432584	.	A	AAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=14,32;MFRL=185,259;MMQ=54,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:0,0:1,1:4,0,1,0
chr6	90432589	.	C	G,A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,18,15;MFRL=217,185,259;MMQ=60,44,43;MPOS=9,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.63,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:1,0,0:1,0,0:3,0,3,0
chr6	90432662	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=90.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,19,9
chr6	90437699	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr6	90450135	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	90452808	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.245:18:3,1:10,2:12,2,2,2
chr6	90453248	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr6	90453492	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr6	90455429	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr6	90459454	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr6	90463149	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,6:1,1:1,0,7,0
chr6	90468465	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr6	90468775	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	90491071	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr6	90604731	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,1:14,2:15,11,2,1
chr6	90605836	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,12:0,0,1,22
chr6	90660299	.	C	CAGTTTGGACAAAGACCTCTCTGAGCCGGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.185:15:7,0:6,2:8,5,1,1
chr6	90660319	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=198,137;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:2,2,6,2
chr6	90661576	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.472:38:11,7:9,10:7,13,9,9
chr6	91256928	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=84,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr6	91263200	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:39,2:32,1:47,27,2,1
chr6	91266349	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,5:4,3:1,4,0,8
chr6	91296420	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr6	93956769	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=200,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr6	93964319	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,1:4,1:6,3,2,0
chr6	93967851	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,8:4,3:7,4,6,5
chr6	94120192	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,5:0,2:2,0,4,3
chr6	96034881	.	A	ATG,ATATG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=214,195,164;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.69,18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,2,7:0.128,0.317:24:8,0,2:7,2,4:12,3,7,2
chr6	96054201	.	G	GGGGCTGCCAACCATCATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:96054201_G_GGGGCTGCCAACCATCATC:96054201:0,3,1,1
chr6	96054206	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:96054201_G_GGGGCTGCCAACCATCATC:96054201:0,3,0,1
chr6	96054210	.	C	CTTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	96653730	.	C	CATTGATGGACA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:5,2:3,0:5,3,1,1
chr6	96654472	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=231,254;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:96654472_A_G:96654472:0,3,0,1
chr6	96654474	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=231,254;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:96654472_A_G:96654472:0,3,0,1
chr6	96654476	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=231,254;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:96654472_A_G:96654472:0,3,0,1
chr6	96654481	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=208,231;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:96654481_G_GGT:96654481:0,1,0,1
chr6	96654486	.	GTA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=208,231;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:96654481_G_GGT:96654481:0,1,0,1
chr6	96655105	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	96656088	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.955:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr6	96656129	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,14:0,0,13,11
chr6	96656148	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=212,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=50.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.911:25:1,10:1,13:1,1,18,5
chr6	96656767	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,6:0,0,13,3
chr6	96656775	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=89,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.908:17:1,7:0,9:1,0,11,5
chr6	96656811	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.417:36:9,8:12,6:11,10,8,7
chr6	96659493	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,4:2,9:4,1,5,8
chr6	96661036	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,6,13
chr6	96661315	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr6	96969694	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:8,5:3,6:8,3,7,4
chr6	96971185	.	G	GT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=126,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.155:23:9,0:8,2:5,15,0,3
chr6	96974386	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.861:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	96976594	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:96976594_G_A:96976594:1,2,0,1
chr6	96976595	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:2,0:0|1:96976594_G_A:96976594:1,2,0,1
chr6	96976598	.	T	TGGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:96976594_G_A:96976594:1,2,0,1
chr6	96982111	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.273:12:6,3:2,0:8,1,3,0
chr6	96996228	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,0:4,6:0,8,0,6
chr6	96996244	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr6	96999220	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,16,0
chr6	96999643	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,5:4,4:12,0,8,1
chr6	97000341	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,1830766;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr6	97001444	.	A	ACCCTTGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr6	97246755	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,63;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:12,1:14,1:14,13,0,2
chr6	97339275	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,0:0,1,0,4
chr6	97562474	.	T	TTGGTGTCTATGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=190,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97562474_T_TTGGTGTCTATGC:97562474:0,1,0,1
chr6	97562476	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=190,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97562474_T_TTGGTGTCTATGC:97562474:0,1,0,1
chr6	97630017	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	97677356	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97677356_T_TG:97677356:0,0,0,1
chr6	97677357	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97677356_T_TG:97677356:0,0,0,1
chr6	97679540	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:0,7:1,3:0,1,2,8
chr6	97679605	.	T	TCAACTTCTCAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr6	97694582	.	A	ATAG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAG;STR;TLOD=104.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.965:24:0,11:0,12:0,0,7,17
chr6	97729256	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:97729256_T_A:97729256:0,2,0,1
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chr6	98472564	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,2:2,4:0,9,0,6
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chr6	98472601	.	T	TTGG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=220,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	99283376	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
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chr6	99353272	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.439:30:8,8:9,4:15,2,9,4
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chr6	99781259	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:8,3,2,0
chr6	99796886	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	99817601	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,9,10
chr6	99817699	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=90,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:0,1:2,1,0,2
chr6	99825227	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.496:26:7,10:6,2:11,2,11,2
chr6	99831542	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:4,1,4,2
chr6	99848994	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:8,5,0,2
chr6	99853849	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr6	99853866	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,13,3
chr6	99883842	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,5,9
chr6	99883979	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=237,207;MMQ=46,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99883979_T_A:99883979:0,1,0,1
chr6	99883985	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=237,207;MMQ=46,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99883979_T_A:99883979:0,1,0,1
chr6	99894360	.	CAAAGA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAGA;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	99935975	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	99951750	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:0,1,0,8
chr6	99951768	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr6	99955243	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr6	99998287	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	99999019	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.467:32:7,4:10,10:0,17,0,15
chr6	100006244	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,5:0,0,9,0
chr6	100016240	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	100016340	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:3,3:3,7:3,4,8,2
chr6	100368759	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr6	100838544	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:11,6,2,0
chr6	100868721	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=99,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.473:42:9,13:12,5:9,13,10,10
chr6	100895344	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	100897639	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	100898062	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100898062_A_C:100898062:0,0,1,0
chr6	100898064	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100898062_A_C:100898062:0,0,1,0
chr6	100898066	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100898062_A_C:100898062:0,0,1,0
chr6	100901535	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,37;MFRL=175,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	100911072	.	ATATGT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr6	100957712	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=212,191;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr6	100958076	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=231,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100958076_C_A:100958076:0,1,0,1
chr6	100958081	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=227,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100958076_C_A:100958076:0,2,0,1
chr6	101037718	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.429:10:2,0:2,4:4,2,3,1
chr6	101054999	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,5:5,8:2,6,1,12
chr6	101078974	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:9,2:3,6:8,4,6,2
chr6	101090377	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	101100528	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr6	101100783	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:0,9,1,4
chr6	101163433	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=97,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,1:2,3:2,6,0,5
chr6	101215223	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,4:0,0,2,13
chr6	101215244	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,7:1,0:0,4,0,7
chr6	101247503	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	101248474	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:101248474_T_C:101248474:0,0,0,2
chr6	101248480	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:101248474_T_C:101248474:0,0,0,2
chr6	101253788	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:0,6,1,2
chr6	101311908	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr6	101312097	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:101312097_C_T:101312097:0,0,1,4
chr6	101312104	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0|1:101312097_C_T:101312097:0,0,1,3
chr6	102133993	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=89,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr6	102134022	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:2,1,6,0
chr6	102307069	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	102376517	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr6	105219748	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=93,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.867:20:1,7:0,11:2,0,17,1
chr6	105232204	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,15:0,6:0,0,18,3
chr6	105232233	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,16:0,8:0,0,21,3
chr6	105232460	.	C	CA,CAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,202,148;MMQ=60,60,60;MPOS=11,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=14.17,5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.636,0.273:8:0,1,1:0,4,1:0,0,0,8
chr6	105244526	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,10,8
chr6	105259111	.	CTTTA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTA;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	105290985	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:105290985_C_G:105290985:3,0,1,0
chr6	105290986	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:105290985_C_G:105290985:3,0,1,0
chr6	105300103	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GC;STR;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,0:0,0,4,0
chr6	105300250	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,10:0,5:0,0,6,9
chr6	105405220	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr6	105526496	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:3,6,1,1
chr6	105577172	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	105577224	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=74.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,14,6
chr6	105577401	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,9:0,13:0,0,4,19
chr6	105595261	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,9,8
chr6	105607753	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=22,35;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105607755	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=13,34;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105607758	.	GT	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105607762	.	G	GTAC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105607766	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=10,26;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105607770	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105609885	.	T	TGGGCTTGGGTAGATG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	105850763	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:4,4:3,2:1,6,1,6
chr6	106534484	.	A	AT	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.114:49:23,1:18,2:7,37,0,5
chr6	106553246	.	C	CATTATAGTCTGTCTTCTCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:2,4,1,1
chr6	106634569	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr6	106727719	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:8,3:1,3:0,9,0,6
chr6	106960447	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.350:15:5,1:4,3:3,7,4,1
chr6	106975415	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:0,6,0,8
chr6	106989212	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	106992592	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,6,15
chr6	106992844	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,5:0,0,0,15
chr6	106999658	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr6	107001456	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=162.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,27:0,23:0,0,7,43
chr6	107003810	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,10:0,0,0,21
chr6	107006347	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:3,2,7,0
chr6	107009119	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr6	107035635	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,5:3,6:4,4,5,6
chr6	107050867	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr6	107069232	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr6	107069258	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:6,2,3,2
chr6	107100009	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=206,270;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:107100009_A_G:107100009:3,0,1,0
chr6	107100018	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=213,270;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:107100009_A_G:107100009:2,0,1,0
chr6	107113916	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,159;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:9,0:1,2:2,8,0,2
chr6	107351457	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	107361476	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr6	107365376	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr6	107365411	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0,0,22,0
chr6	107372242	.	GTTTTC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,4:3,1:7,2,4,1
chr6	107390046	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,15101953;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,0:4,2:3,9,0,2
chr6	107420387	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:13,2,1,2
chr6	107533265	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr6	107811878	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:5,3:10,0:8,7,2,1
chr6	107908460	.	T	TTGTCTTGGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:107908460_T_TTGTCTTGGC:107908460:0,0,0,1
chr6	107908462	.	A	ATACAGGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:107908460_T_TTGTCTTGGC:107908460:0,0,0,1
chr6	108026317	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,6:0,3:0,0,11,0
chr6	108026344	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,5:2,3:4,0,8,0
chr6	108041801	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	108042180	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=155,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:16,2:13,0:7,22,1,1
chr6	108042213	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,4,17
chr6	108093328	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,16,3
chr6	108093580	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	108193148	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr6	108243124	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr6	108277287	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	108279290	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	108370723	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=213,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr6	108487877	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	108489462	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,1,4
chr6	108492570	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,34;MFRL=218,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TC;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr6	108495950	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=197,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	108502144	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:1,14,0,2
chr6	108676779	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=215,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr6	108677003	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	108797968	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr6	108840870	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,6:5,4:5,4,7,3
chr6	108986135	.	TG	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=191,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:2,0:3,2:0|1:108986135_TG_GT:108986135:1,7,0,2
chr6	108986141	.	G	GATGATATGGGCAACTCAACT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=191,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:108986135_TG_GT:108986135:1,7,0,2
chr6	109179351	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,6:5,1:11,0,7,0
chr6	109249206	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,2:3,0,5,0
chr6	109258284	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	109319741	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:11,2:17,8,2,0
chr6	109480681	.	CT	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.149:35:7,2:18,3:10,20,3,2
chr6	109665483	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,5:3,1:1,8,0,6
chr6	109689431	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:7,5:7,6:13,1,10,1
chr6	109740395	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.099:37:16,0:18,3:0|1:109740395_A_T:109740395:23,11,1,2
chr6	109740405	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=137,84;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:15,0:16,2:0|1:109740395_A_T:109740395:23,14,0,2
chr6	109763947	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:6,3:4,4:4,6,2,6
chr6	109764874	.	TGGA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:1,5:3,1,7,1
chr6	109765870	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,4:3,0,4,0
chr6	109767634	.	GGA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,0:0|1:109767634_GGA_G:109767634:0,3,0,2
chr6	109767639	.	GA	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:109767634_GGA_G:109767634:0,3,0,2
chr6	109767919	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:27,3:22,0:26,25,2,1
chr6	109767930	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,26:0.450:58:21,12:11,14:12,20,15,11
chr6	109768861	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.514:21:6,2:4,7:4,6,10,1
chr6	109773806	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.276:20:4,3:8,2:5,10,2,3
chr6	109775436	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=296,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr6	109787596	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,4:6,10:3,8,7,7
chr6	109787789	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=207,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109787789_T_A:109787789:0,1,0,1
chr6	109787791	.	A	AAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=207,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109787789_T_A:109787789:0,1,0,1
chr6	109787793	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=37,30;MFRL=207,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109787789_T_A:109787789:0,1,0,1
chr6	109797304	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,3:4,7:8,0,10,0
chr6	109830318	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=58,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr6	109835646	.	AC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:12,2:5,4:5,13,1,5
chr6	109837859	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:1,7,2,0
chr6	109863238	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:10,4:4,4:11,3,8,0
chr6	109867151	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=118,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:21,0:14,2:16,20,0,2
chr6	109935716	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:0,10,0,6
chr6	109954065	.	C	CATAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=273,186;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=ATAG;STR;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.844:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr6	109962904	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	109995505	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:19,0:25,3:12,32,0,3
chr6	109996751	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:4,0,5,0
chr6	110048489	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.451:11:5,0:1,5:0,6,0,5
chr6	110064780	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=238,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	110081618	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=119,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr6	110085110	.	TTTTTTAAAAGTGTTTA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:4,0:10,2:10,11,1,1
chr6	110085257	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr6	110087848	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr6	110112559	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=110,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr6	110113970	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	110146497	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,1,4
chr6	110301945	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,0:1,1,2,2
chr6	110530266	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,1:8,1,2,0
chr6	110550223	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:7,9:6,9:3,10,0,18
chr6	110643956	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr6	110644112	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	110679062	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	110714584	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	110736610	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	110736860	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	110746351	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,1,5
chr6	110746526	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,11,5
chr6	110752289	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=210,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	110759920	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=122,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,3:11,0:16,2,3,0
chr6	110778128	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:3,2:6,7:6,3,6,4
chr6	110778151	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,2:8,0:11,4,2,0
chr6	110797703	.	CCGCGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	110797821	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	110942653	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,1:5,3:0,5,0,4
chr6	110944196	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	110991549	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr6	110991770	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:1,14,1,1
chr6	110991802	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr6	110991832	.	T	TAGGATTGTTTTATATAGGTATGGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr6	111067438	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:0|1:111067438_A_C:111067438:0,7,0,3
chr6	111067442	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:0|1:111067438_A_C:111067438:0,6,0,3
chr6	111213692	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.352:9:2,1:3,1:0,6,0,3
chr6	111213927	.	T	TC	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=80,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=230.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,101:0.957:106:2,47:3,47:2,3,48,53
chr6	111281581	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.490:29:5,7:8,7:11,4,9,5
chr6	111281584	.	GT	G,GTT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,34,26;MFRL=153,153,113;MMQ=60,60,60;MPOS=15,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=21.23,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,10,4:0.371,0.146:27:6,6,2:6,4,1:10,3,8,6
chr6	111281880	.	A	ATAAATAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAATAT;STR;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:3,1:6,3:1,8,0,4
chr6	111283592	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=118,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.454:62:14,12:20,16:21,13,18,10
chr6	111283718	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.354:37:11,8:13,4:7,17,4,9
chr6	111321037	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,2:4,2:1,7,0,4
chr6	111329221	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:8,9:4,5:11,2,15,1
chr6	111329233	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=155,128;MMQ=60,35;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:24,3:14,0:28,11,3,0
chr6	111499588	.	TTATTTC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATTTC;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:13,0:10,2:18,7,1,1
chr6	111499665	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=173,80;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:9,0:3,2:1,11,1,1
chr6	111499700	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0|1:111499700_A_AAG:111499700:0,2,0,1
chr6	111499702	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:111499700_A_AAG:111499700:0,2,0,1
chr6	111527839	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:10,5:7,3:11,6,5,3
chr6	111527988	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr6	111628597	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=106,139;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.668:33:1,11:8,11:5,6,11,11
chr6	111628626	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=101,139;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.762:27:3,10:3,11:2,4,8,13
chr6	111643757	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,147;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:17,4:14,1:22,9,5,0
chr6	111711232	.	C	CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,4:2,8:8,0,12,0
chr6	111714240	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,14;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:1,0:1,0:0|1:111714240_G_T:111714240:0,4,0,2
chr6	111714245	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:4,2:1,0:0|1:111714240_G_T:111714240:0,5,0,2
chr6	111732843	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=200,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:0,10,0,3
chr6	111896790	.	CAAAAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=A;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:0,1:0,7:0,1,8,2
chr6	111983084	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,0:14,2:4,15,2,0
chr6	111995666	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:7,1,4,2
chr6	112024262	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,1:2,9:0,4,1,9
chr6	112457364	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,337826;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,1:7,1:9,9,1,1
chr6	112466145	.	A	AGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=164,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:2,4,1,1
chr6	112506375	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr6	112506583	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,0,19
chr6	112508769	.	TG	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr6	112535131	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr6	112537497	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr6	112672155	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.529:26:3,7:9,5:3,9,9,5
chr6	112672198	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,4:5,5:2,7,1,8
chr6	114178831	.	C	CGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,32;MFRL=267,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCT;STR;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,4:0,0:1,0,4,0
chr6	114179081	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=188,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:1,0:0|1:114179081_G_A:114179081:0,1,0,1
chr6	114179084	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=188,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114179081_G_A:114179081:0,1,0,1
chr6	114179087	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=188,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114179081_G_A:114179081:0,1,0,1
chr6	114179091	.	AAGGCT	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:114179081_G_A:114179081:0,2,0,1
chr6	114179098	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:114179081_G_A:114179081:0,2,0,1
chr6	114179118	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	114181647	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.488:24:7,4:5,5:11,1,10,2
chr6	114378692	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:7,7,2,0
chr6	116264354	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.350:26:10,6:5,2:2,15,1,8
chr6	116288912	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.447:17:3,2:6,5:0,9,1,7
chr6	116427506	.	CTT	C,CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,20,20;MFRL=143,214,174;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=T;STR;TLOD=3.75,11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,9:0.303,0.611:14:0,0,4:0,2,1:0,1,1,12
chr6	116429623	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,7:3,6:3,3,5,8
chr6	116439220	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:0,6,0,5
chr6	116441229	.	T	TGGG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=85.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,7:0,0,13,7
chr6	116443214	.	C	CCATCAGCTGTAGGGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=249,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:116443214_C_CCATCAGCTGTAGGGAA:116443214:0,2,1,1
chr6	116443217	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=249,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:116443214_C_CCATCAGCTGTAGGGAA:116443214:0,2,0,1
chr6	116575413	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	116599665	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.448:45:12,9:12,11:15,10,10,10
chr6	116601285	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:0,7,0,5
chr6	116720487	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:4,2:5,6:3,7,2,6
chr6	116754456	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr6	116782488	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,6,4
chr6	116836720	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=138,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.695:21:4,8:2,6:5,1,11,4
chr6	116837242	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	116875520	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=244,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116875520_T_C:116875520:0,1,0,1
chr6	116875522	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=244,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116875520_T_C:116875520:0,1,0,1
chr6	116878947	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:6,3:7,7:10,4,10,0
chr6	116901640	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=235,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	116911413	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.195:39:14,4:16,3:30,2,4,3
chr6	116912033	.	CT	C,CTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=171,159,148;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=11.95,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,8,3:0.286,0.132:27:8,4,2:6,3,1:15,1,10,1
chr6	116914112	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,3:2,1:4,1,4,1
chr6	116957044	.	T	TCATACTGCTAGAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0,8,1,1
chr6	116982067	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=204,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.371:14:5,3:2,2:0,9,0,5
chr6	117047837	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=171,287;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0,21,0,2
chr6	117073874	.	AATAT	A,AATATAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32,16;MFRL=0,151,138;MMQ=60,60,53;MPOS=27,33;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,12;RU=AT;STR;TLOD=7.34,9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.377,0.503:5:0,1,0:0,1,1:0,0,0,5
chr6	117083132	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=116,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.449:27:7,8:8,4:6,9,10,2
chr6	117113761	.	A	AGG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:2,5:4,3:0|1:117113761_A_AGG:117113761:1,5,3,5
chr6	117113762	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:2,4:3,3:0|1:117113761_A_AGG:117113761:2,5,3,5
chr6	117113765	.	T	TTCC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.499:14:2,4:5,3:0|1:117113761_A_AGG:117113761:2,5,3,4
chr6	117150008	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:5,3:4,6:7,2,3,6
chr6	117198347	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	117198858	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,188;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr6	117215300	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:0,7,0,7
chr6	117243399	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	117250194	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr6	117250225	.	C	CACACATAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:117250225_C_CACACATAG:117250225:0,4,0,1
chr6	117250227	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:117250225_C_CACACATAG:117250225:0,4,0,1
chr6	117622175	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:117622175_T_C:117622175:10,6,1,1
chr6	117622183	.	G	GCCCCGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:4,2:0|1:117622175_T_C:117622175:9,4,1,1
chr6	117639262	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	117678083	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,3,16
chr6	117681436	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=AC;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr6	117686192	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:1,4:5,9:6,0,11,2
chr6	117686943	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:4,0:1,6,0,2
chr6	117715369	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:2,1,2,1
chr6	117715761	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr6	117724462	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=115,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr6	117724499	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	117725383	.	C	CAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=167,128;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	117725578	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.567:21:5,6:4,6:2,7,7,5
chr6	117730673	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:4,1,4,0
chr6	117735716	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,3:0,0:1,3,1,3
chr6	117746919	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=250,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	117860058	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.691:14:2,3:2,7:1,3,0,10
chr6	117862048	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,8:3,4:4,4,6,6
chr6	117865827	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:2,1:0,3:0,2,0,5
chr6	117996818	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr6	118475798	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=109,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,2:8,3:3,11,2,3
chr6	118556628	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:8,1,10,0
chr6	118635122	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr6	118801174	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,6:5,2:0,12,0,8
chr6	118886615	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,4:3,0:6,0,4,0
chr6	118974042	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	119233019	.	A	AAAGACTGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=220,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	119287903	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,2:2,0,4,0
chr6	119288087	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=150,67;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:22,0:8,3:8,22,1,2
chr6	119296378	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	119327632	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,12:0,0,9,9
chr6	119344020	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	119346010	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr6	119399333	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:5,4,4,2
chr6	119501397	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	119509785	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr6	119510739	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr6	119510777	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=52.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr6	119522353	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:5,0,6,0
chr6	119522553	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:1,6,0,4
chr6	119611934	.	G	GA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:5,7:4,5:0,11,0,16
chr6	119611989	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr6	119623079	.	AT	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr6	119623358	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr6	119627976	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr6	119628029	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=92.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,12:0,0,20,6
chr6	119628198	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr6	119628215	.	A	ATTTATGAAACTTCGCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr6	121436422	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,2,10
chr6	121482295	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	121491472	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	121560155	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr6	121577525	.	G	GAAGATAAAATTTCAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=258,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	121625669	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:13,2:23,2:25,11,3,1
chr6	121626079	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=98.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,0,26
chr6	121632008	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,5,11
chr6	122733496	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:16,0:8,3:25,0,3,0
chr6	122753413	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=186,362;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0,13,0,2
chr6	122753464	.	T	TCCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	122767817	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	122772921	.	A	AATATAT,AATATATAT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=154,138,164;MMQ=60,40,40;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,12,13;RU=AT;STR;TLOD=5.42,20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,9:0.177,0.444:20:2,1,2:6,2,6:0,8,0,12
chr6	122775195	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.445:27:5,3:8,7:15,0,12,0
chr6	123022496	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	123038887	.	CT	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	123039171	.	TGGA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0|1:123039171_TGGA_T:123039171:0,0,0,1
chr6	123039176	.	AG	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123039171_TGGA_T:123039171:0,0,0,1
chr6	123039180	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123039171_TGGA_T:123039171:0,0,0,1
chr6	123101348	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	123122385	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=215,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:0,2:6,1:7,0,3,0
chr6	123318646	.	A	AGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.481:2:1,1:0,0:0|1:123318646_A_AGT:123318646:0,1,0,1
chr6	123318648	.	C	CTTAAAGATGGCGACCCTGGAGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0|1:123318646_A_AGT:123318646:0,1,0,1
chr6	123319382	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	123369910	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr6	123539684	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=240,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr6	123580675	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.591:40:4,11:12,10:14,2,24,0
chr6	123581789	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,2:4,2:11,1,0,4
chr6	123590959	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:15,1:13,1:23,5,2,0
chr6	123591138	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,6:1,3:0,4,0,9
chr6	123592184	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TG;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr6	123594510	.	T	TA	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.539:54:16,10:8,18:8,17,8,21
chr6	123595869	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=87.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,28:0.510:55:12,15:14,13:1,26,5,23
chr6	123658671	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,6:6,4:8,0,10,0
chr6	123703168	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,34:0.515:66:13,16:17,16:30,2,30,4
chr6	123714656	.	GC	TT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=151,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:3,2:4,2:8,0,5,0
chr6	123759967	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=228,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:4,0,6,0
chr6	123819847	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=256,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr6	123833457	.	G	C	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,42:0.443:95:24,20:29,22:23,30,20,22
chr6	123851538	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:10,0,8,0
chr6	123851590	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,11:0.320:35:9,4:14,6:0|1:123851590_G_A:123851590:22,2,10,1
chr6	123851610	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,17:0.367:47:12,7:15,10:0|1:123851590_G_A:123851590:25,5,13,4
chr6	123869769	.	TAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=68,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.846:14:2,5:0,5:1,1,0,12
chr6	123892337	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	124979232	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=118,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:124979232_ACC_A:124979232:1,0,1,0
chr6	124979235	.	C	CAAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=118,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:124979232_ACC_A:124979232:1,0,1,0
chr6	124979689	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr6	125139473	.	TG	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:0,3:4,4:4,0,6,1
chr6	125569405	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:2,3:5,8:6,2,9,2
chr6	125614022	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,0:6,4:5,7,0,4
chr6	126075709	.	AT	A,ATT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,32,31;MFRL=118,133,144;MMQ=60,60,60;MPOS=15,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=8.82,4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,7,4:0.236,0.154:29:6,2,2:9,4,2:2,16,0,11
chr6	126196119	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:15,1:19,1:11,25,1,1
chr6	126242004	.	CG	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr6	126248757	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,2:11,0:0|1:126248757_C_A:126248757:23,9,2,0
chr6	126248766	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:20,2:15,0:0|1:126248757_C_A:126248757:25,13,2,0
chr6	126249755	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.405:12:1,2:5,1:7,0,5,0
chr6	126669479	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr6	127469852	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:7,0:12,4:7,12,1,3
chr6	127471533	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	127647822	.	T	TAACAGAAAAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:1,1:1,0:0|1:127647822_T_TAACAGAAAAAC:127647822:0,2,0,1
chr6	127647827	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:127647822_T_TAACAGAAAAAC:127647822:0,2,0,1
chr6	127647830	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:127647822_T_TAACAGAAAAAC:127647822:0,2,0,1
chr6	127768935	.	A	ATGGTCTCCAACTCCATCCAGGTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=186,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	127768950	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	127770923	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr6	127836627	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=0,195;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:127836627_A_C:127836627:0,1,1,0
chr6	127836634	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=0,195;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:127836627_A_C:127836627:0,1,1,0
chr6	127836641	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,18;MFRL=142,195;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:127836627_A_C:127836627:3,1,1,0
chr6	128176383	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:128176383_A_G:128176383:0,0,0,5
chr6	128176387	.	A	ACATGGACACAGGGAGGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:128176383_A_G:128176383:0,4,0,1
chr6	128297883	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:7,8,1,1
chr6	128297986	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr6	128302180	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	128307118	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	128319895	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:1,3,5,0
chr6	128324241	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	128330249	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,17,7
chr6	128383562	.	G	GA	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,23:0.436:53:8,10:19,11:21,9,17,6
chr6	128386054	.	A	AATTGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=197,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	129370975	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	129380843	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,1:0,2:0|1:129380843_C_CG:129380843:2,0,5,0
chr6	129380844	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.668:7:2,2:0,3:0|1:129380843_C_CG:129380843:2,0,5,0
chr6	129465020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,9:0,0,7,3
chr6	129468288	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	129486913	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	129571330	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,1:7,4:4,8,1,4
chr6	129619048	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=129,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:129619048_G_GCA:129619048:0,4,0,1
chr6	129619052	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=129,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:129619048_G_GCA:129619048:0,4,0,1
chr6	129649350	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr6	129724942	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0|1:129724942_T_A:129724942:5,2,4,0
chr6	129724944	.	CT	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.387:11:3,3:3,1:0|1:129724942_T_A:129724942:5,2,4,0
chr6	129777382	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=208,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	129785391	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr6	129835814	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr6	129837320	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:7,8:1,4:7,1,10,2
chr6	129937431	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:6,19,1,1
chr6	129950417	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=209,148;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:3,0:0,0:4,0,1,0
chr6	129955151	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:2,3:6,3:8,1,7,3
chr6	130164764	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,11:0,17:0,0,1,27
chr6	130164856	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	130370404	.	C	CCT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=117,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=73.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.919:20:0,13:1,5:1,0,13,6
chr6	130371055	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0|1:130371055_C_T:130371055:0,0,0,5
chr6	130371063	.	A	AGTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:130371055_C_T:130371055:0,3,0,1
chr6	130374102	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,15:0,25:0,0,2,41
chr6	130389464	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,5:0.080:72:36,5:30,0:44,23,3,2
chr6	130466413	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr6	130476095	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.118:36:12,2:20,1:17,15,0,4
chr6	130505374	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,5:6,3:0,13,0,8
chr6	130535420	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.579:19:4,6:3,5:7,1,11,0
chr6	130536494	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.592:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr6	130761733	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,1:17,1:11,27,0,2
chr6	131186578	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr6	131191509	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=115,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:12,2:17,0:0|1:131191509_C_T:131191509:13,16,2,0
chr6	131191510	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=107,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:30,2:0.088:32:13,1:16,1:1|0:131191509_C_T:131191509:15,15,0,2
chr6	131197990	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr6	131211616	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,1:0,2:0,0,0,8
chr6	131481394	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=98.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,0,27
chr6	131490472	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr6	131540726	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:6,3:10,2:16,0,5,0
chr6	131900144	.	GC	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,2:4,0,7,0
chr6	131904704	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=201,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:0,6,1,7
chr6	131904719	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=212,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:0,6,2,5
chr6	131910827	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=186,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr6	131923421	.	CT	TC	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=150,61;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.064:44:21,0:21,2:20,22,2,0
chr6	131923428	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=148,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:20,0:21,1:22,20,0,2
chr6	131923464	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,1:14,1:12,17,1,1
chr6	131948469	.	GA	G,GAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35,30;MFRL=179,163,158;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=4.51,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,3:0.286,0.234:14:3,2,1:2,2,2:5,2,7,0
chr6	131948816	.	TA	T,TAA	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=111,141,123;MMQ=60,60,60;MPOS=24,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=18.77,11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:42,19,15:0.219,0.182:76:16,8,6:21,9,6:2,40,3,31
chr6	131958485	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:9,11:6,7:14,1,17,1
chr6	131995209	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	132041605	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	132043349	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr6	132172467	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,37;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr6	132172495	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132172495_G_A:132172495:0,1,0,1
chr6	132172498	.	A	AATTAAGAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132172495_G_A:132172495:0,1,0,1
chr6	132182633	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:132182633_TC_T:132182633:2,0,2,0
chr6	132182635	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:132182633_TC_T:132182633:2,0,2,0
chr6	132190717	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:18,2:4,1:0,23,0,3
chr6	132211745	.	G	GCATTTAAACAAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:132211745_G_GCATTTAAACAAGA:132211745:0,0,0,1
chr6	132211747	.	CGA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132211745_G_GCATTTAAACAAGA:132211745:0,0,0,1
chr6	132211751	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132211745_G_GCATTTAAACAAGA:132211745:0,0,0,1
chr6	132270728	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.725:4:0,1:0,1:0,1,2,1
chr6	132271740	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,1:4,5:0,6,1,5
chr6	132785071	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,0:12,2:20,4,2,0
chr6	132785224	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:8,6:8,4:3,13,0,10
chr6	132860522	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	132860543	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	132860550	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:132860550_A_T:132860550:0,2,0,1
chr6	132860552	.	GCAA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:132860550_A_T:132860550:0,2,0,1
chr6	132860558	.	A	ATCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132860550_A_T:132860550:0,1,0,1
chr6	132910612	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,11:0,25:0,0,10,26
chr6	132967076	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,158;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.133:43:22,5:15,0:20,18,0,5
chr6	133013618	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.246:6:3,1:2,0:0|1:133013618_G_C:133013618:1,4,0,1
chr6	133013620	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:133013618_G_C:133013618:1,4,0,1
chr6	133013622	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:133013618_G_C:133013618:1,4,0,1
chr6	133032759	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	133032797	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:6,0,4,1
chr6	133048213	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr6	133049865	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:7,1,8,0
chr6	133055392	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:10,6:8,3:11,7,6,3
chr6	133055610	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,11:0,4:0|1:133055610_G_T:133055610:0,0,6,11
chr6	133055612	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.353:18:10,2:1,4:0|1:133055610_G_T:133055610:6,6,1,5
chr6	133073845	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:12,0:17,2:4,26,0,2
chr6	133076896	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:2,4:7,2:9,0,7,0
chr6	133105117	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=128,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:31,2:24,1:30,26,3,0
chr6	133108763	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=173,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:1,1:2,1:0,5,0,2
chr6	133135807	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	133136041	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=158.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,22:0,19:0,0,36,7
chr6	133138010	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	133138067	.	ATT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,5:0,6:0,1,9,2
chr6	133138249	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=94.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,0,25
chr6	133138749	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr6	133827148	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr6	133827354	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,4:3,6:1,3,1,9
chr6	133849789	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.354:18:5,3:5,3:10,2,4,2
chr6	133849966	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:4,8:7,7:5,7,2,13
chr6	134350088	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:0|1:134350088_G_T:134350088:15,7,1,1
chr6	134350089	.	T	TTA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:0|1:134350088_G_T:134350088:15,7,1,1
chr6	134494548	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=69.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,15:0,6:0,0,10,11
chr6	134494707	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:6,0:13,1:0|1:134494707_AG_A:134494707:6,19,0,2
chr6	134494708	.	GAA	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=17,19;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:2,0:2,1:3,12,0,3
chr6	134494709	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.106:27:8,0:16,0:0|1:134494707_AG_A:134494707:6,19,0,2
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chr6	135260303	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=193,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,1:2,2:5,0,4,0
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chr6	135286505	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr6	135290355	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=53.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:15,4:9,14:18,6,16,2
chr6	135299959	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:1,3:9,3:0,10,1,5
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chr6	135324051	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:0|1:135324051_T_C:135324051:0,7,0,6
chr6	135324052	.	TTTAAA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:0|1:135324051_T_C:135324051:0,7,0,6
chr6	135371813	.	C	T	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,9:0.102:96:40,5:46,4:32,55,1,8
chr6	135517047	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:15,1:11,1:8,18,1,1
chr6	135749682	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,3:5,3:7,1,6,0
chr6	135763866	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=122.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.977:38:0,21:0,17:0,0,12,26
chr6	135768162	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.163:28:10,1:9,0:0|1:135768162_T_G:135768162:11,13,4,0
chr6	135768164	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,18;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.158:29:8,0:7,0:0|1:135768162_T_G:135768162:12,13,4,0
chr6	135768171	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=123,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.133:25:10,0:8,0:10,12,3,0
chr6	135778856	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,0:5,2:0|1:135778856_A_AT:135778856:1,18,0,2
chr6	135778858	.	GC	TA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:4,2:0|1:135778856_A_AT:135778856:1,19,0,2
chr6	135778860	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:0|1:135778856_A_AT:135778856:1,18,0,2
chr6	135813251	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,16:0,5:0,0,17,4
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chr6	136582194	.	T	TAA,TAAA	.	.	DP=222;ECNT=3;MBQ=29,24,28;MFRL=135,146,135;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.59,70.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:163,6,34:0.033,0.174:203:71,2,15:76,2,9:76,87,21,19
chr6	136582203	.	T	C	.	.	DP=228;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=134.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:177,41:0.191:218:86,23:88,16:80,97,22,19
chr6	136589448	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=137,63;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.201:33:18,2:8,4:7,20,2,4
chr6	136590698	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=142,135;MMQ=60,45;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,14:0.187:78:39,3:22,11:0|1:136590698_C_T:136590698:29,35,3,11
chr6	136590712	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=142,140;MMQ=60,39;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,11:0.150:78:38,3:23,8:0|1:136590698_C_T:136590698:29,38,2,9
chr6	136593183	.	G	C	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,1172;MMQ=60,29;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,5:0.065:90:40,1:45,4:23,62,1,4
chr6	136594292	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=128,626;MMQ=60,59;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,14:0.214:68:27,8:27,6:23,31,7,7
chr6	136594327	.	TGTTGA	T	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=149,2488;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,4:0.091:53:21,2:26,2:0|1:136594327_TGTTGA_T:136594327:12,37,4,0
chr6	136594335	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=150,2488;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:18,2:24,2:0|1:136594327_TGTTGA_T:136594327:9,34,4,0
chr6	136594337	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=150,2488;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.104:46:17,2:24,1:0|1:136594327_TGTTGA_T:136594327:9,33,4,0
chr6	136597004	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,1:4,5:11,0,6,0
chr6	136599949	.	A	AAATCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=247,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:136599949_A_AAATCCC:136599949:0,1,0,1
chr6	136599952	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=247,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:136599949_A_AAATCCC:136599949:0,1,0,1
chr6	136683566	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=51.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.619:29:3,11:6,6:7,4,13,5
chr6	136710669	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=123,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:2,2,1,1
chr6	136710692	.	ATC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,1,0
chr6	136904858	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=119,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:32,0:17,3:16,34,0,3
chr6	136963562	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=205,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,3:6,4:9,0,7,0
chr6	137026266	.	T	G	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,41:0.495:83:27,17:14,24:18,24,22,19
chr6	137147650	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:3,12,0,2
chr6	137166682	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,11:0,17:0,0,25,3
chr6	137193496	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,3:0,2:0,4,0,5
chr6	137295051	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:6,3,0,2
chr6	137325847	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,16:0,0,8,15
chr6	137325901	.	TAAA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.837:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	137330719	.	C	CGCCAAGCATCATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137330719_C_CGCCAAGCATCATG:137330719:0,1,0,1
chr6	137330721	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137330719_C_CGCCAAGCATCATG:137330719:0,1,0,1
chr6	137338276	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr6	137477823	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:6,1,4,0
chr6	137482982	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,2:2,2:0,5,0,5
chr6	137519546	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:16,8,1,1
chr6	137519780	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=215,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr6	137524870	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:0,0:0,3,0,2
chr6	137540335	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,5:5,1:7,0,6,0
chr6	137540370	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,7:0,0,14,4
chr6	137540520	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0|1:137540520_A_G:137540520:0,0,3,16
chr6	137540536	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.530:15:2,2:5,6:0|1:137540520_A_G:137540520:0,7,0,8
chr6	137814705	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=208,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,2:1,0:2,1,1,1
chr6	137815375	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,1:4,1:1,3,1,1
chr6	138195961	.	TCTC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=71,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.951:22:0,11:1,9:1,0,15,6
chr6	138197331	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=105.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,13:0,17:0,0,5,25
chr6	138200243	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=142,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:138200243_G_T:138200243:11,12,1,1
chr6	138200249	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=149,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:0|1:138200243_G_T:138200243:11,11,1,1
chr6	138200253	.	T	TCCA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=149,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:0|1:138200243_G_T:138200243:11,11,1,1
chr6	138202339	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,0:6,1:0|1:138202339_T_G:138202339:0,13,4,0
chr6	138202345	.	C	CGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:6,0:6,0:0|1:138202339_T_G:138202339:0,13,4,0
chr6	138417415	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,2:4,7:10,0,9,0
chr6	138607244	.	G	GGAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	138620000	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=106,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	138628598	.	TAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr6	138632506	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:5,2,6,2
chr6	138632518	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,4:5,6:6,2,8,2
chr6	138745981	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=97,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:0,1:2,0:0|1:138745981_G_GT:138745981:0,2,0,1
chr6	138745985	.	A	ATTTCTGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=97,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:138745981_G_GT:138745981:0,2,0,1
chr6	138751547	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=125,91;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:9,14,0,2
chr6	138751629	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,1:3,6:7,1,2,5
chr6	138752421	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,1:3,1:2,4,2,0
chr6	138752428	.	C	CTGCTTGCCTTAGAACATAGCCATTAATG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.421:5:0,2:2,0:0,3,1,1
chr6	138820271	.	G	GAC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=156,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AC;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.141:18:13,2:2,0:16,0,1,1
chr6	138820289	.	CACACACAG	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACACACAG;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.241:30:14,6:4,1:15,8,7,0
chr6	138820324	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=113,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=107.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,39:0.560:69:17,17:13,16:15,15,20,19
chr6	139097174	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:7,1,2,1
chr6	139134558	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	139134565	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139134565_A_AGT:139134565:0,1,0,1
chr6	139134566	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139134565_A_AGT:139134565:0,1,0,1
chr6	139167579	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=169,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	139170331	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:13,0,2,0
chr6	139186081	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr6	139229743	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr6	139233946	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.389:29:9,6:8,5:10,8,3,8
chr6	139355580	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:2,4,2,6
chr6	139355740	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=74,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.769:8:1,4:1,2:1,1,2,4
chr6	139487394	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,15:0,0,28,6
chr6	139565799	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:17,1:23,1:11,29,0,2
chr6	139591505	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=206,229;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr6	139598061	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,0:1,3:1,3,0,4
chr6	142487263	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,18,0
chr6	142487469	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=163.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,27:0,24:0,0,10,41
chr6	142491463	.	C	CG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=49.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,9:0,0,10,6
chr6	142491584	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr6	142510676	.	GTATT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TATT;STR;TLOD=75.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,7:0,0,0,17
chr6	142725171	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=15,33;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:142725171_A_C:142725171:0,1,0,1
chr6	142725174	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:142725171_A_C:142725171:0,1,0,1
chr6	142725175	.	C	CATTTTGTTAATTGTTTTCTGGTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,36;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:142725171_A_C:142725171:0,1,0,1
chr6	143074440	.	G	GAATGCACAGTGGTGTGGTGAAGGGAGAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.117:25:8,2:13,0:8,15,0,2
chr6	143081715	.	C	CACCACCA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:8,16,0,2
chr6	143081847	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	143090633	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:5,0,6,0
chr6	143093815	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,4:4,6:5,5,6,4
chr6	143654625	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=225,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr6	143784031	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=44.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.545:33:5,12:10,6:14,1,17,1
chr6	143789181	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:2,1,4,0
chr6	143806276	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:7,10:3,3:7,4,9,5
chr6	143825449	.	C	CTCCACTCCACTTCATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	144081609	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.444:36:8,8:12,7:7,13,7,9
chr6	144081753	.	AG	CC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,0:11,0:6,11,0,2
chr6	144081768	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,4:2,6,1,6
chr6	144086394	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=73,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr6	144093352	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:5,3,5,1
chr6	144104469	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.955:40:0,23:1,15:0,1,8,31
chr6	144128095	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27,33;MFRL=160,189,166;MMQ=60,60,60;MPOS=0,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=4.96,7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,3,5:0.167,0.234:20:5,3,2:7,0,3:12,0,8,0
chr6	144128176	.	AT	A	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=144,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,4:0.060:79:46,1:26,3:43,32,3,1
chr6	144165809	.	CT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,32,19;MFRL=134,155,189;MMQ=60,60,60;MPOS=17,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=15.59,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,2:0.540,0.196:12:1,1,0:1,4,0:0,3,1,8
chr6	144178419	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:7,5:6,5:10,3,7,4
chr6	144178656	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,255;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,1:8,1:0,13,0,2
chr6	144207366	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=192,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0,4,0,1
chr6	144509510	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,22:0.390:57:16,13:19,9:17,18,13,9
chr6	144512671	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.840:23:2,7:1,10:0,3,5,15
chr6	144758647	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr6	144814625	.	GTC	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:8,1:3,2:5,10,0,3
chr6	144835040	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,3:8,7:11,5,6,4
chr6	144843091	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.612:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr6	144854295	.	G	GGGAGCT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:18,2:17,0:17,19,0,2
chr6	144872051	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr6	144872272	.	G	GAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=176,141;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=AC;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.482:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr6	145069287	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	145079197	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,2:1,7:0,4,0,9
chr6	145095502	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=125,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:145095502_T_A:145095502:8,12,0,2
chr6	145095505	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:7,2:0|1:145095502_T_A:145095502:8,11,0,2
chr6	145095545	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.511:6:3,1:0,2:1,2,1,2
chr6	145114935	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=106,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,6:4,2:3,2,7,1
chr6	145120682	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:3,9:6,7:2,7,4,12
chr6	145148690	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,17,1
chr6	145157497	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:10,0:17,7,2,0
chr6	145162001	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr6	145946913	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:5,2:6,3:3,9,0,5
chr6	146007166	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=192,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr6	146007223	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,4:4,2:4,2,5,1
chr6	146125466	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr6	146127029	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,6:3,4:5,5,4,6
chr6	146207465	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=64.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,25:0.530:47:7,14:15,11:20,2,23,2
chr6	146207502	.	G	GT	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=81.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,33:0.498:67:16,13:18,18:20,14,24,9
chr6	146207657	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,2:8,7:1,12,1,8
chr6	146216184	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=262,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr6	146243581	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=220,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:3,1:0,1:0,3,0,3
chr6	146244743	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,4:7,7:9,1,9,2
chr6	146256315	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=117,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:4,0:6,0:6,10,0,3
chr6	146262697	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=106,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr6	146268623	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:6,7:7,3:11,2,7,4
chr6	146273403	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,3:6,0:0|1:146273403_C_T:146273403:14,0,3,0
chr6	146273406	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:7,3:5,0:0|1:146273403_C_T:146273403:14,0,3,0
chr6	146480813	.	A	AAGTCTTTGATGCCAGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	146719883	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:6,3:0,0:5,1,3,0
chr6	146720157	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.390:41:14,4:10,10:14,11,7,9
chr6	146975456	.	TTA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TA;STR;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	146987930	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,2:2,6:3,0,7,1
chr6	146993306	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.241:19:6,1:8,3:14,1,4,0
chr6	147006845	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=90,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,8:4,2:5,2,7,3
chr6	147012191	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr6	147022227	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,7:5,5:1,9,2,10
chr6	147036626	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,1,4
chr6	147037984	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr6	147042695	.	A	AGGGAACATGCAATAATAAGATTTTTAGAGGC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,145;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:4,2:0,0:0,4,0,4
chr6	147042728	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=172,217;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:147042728_C_A:147042728:0,4,0,1
chr6	147042733	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=172,217;MMQ=60,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:147042728_C_A:147042728:0,4,0,1
chr6	147047341	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:8,4:3,10:7,4,8,6
chr6	147049641	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr6	147049899	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:0,1,2,8
chr6	147054241	.	A	ATTAATGTAC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=57.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:6,7:6,7:12,0,12,4
chr6	147054410	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:6,8:2,4:0,8,1,11
chr6	147054450	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:4,1:0,3:0,5,0,4
chr6	147062220	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,5:1,4:2,1,7,2
chr6	147073639	.	TATA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,3:4,6:9,1,6,3
chr6	147073713	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:4,17,1,1
chr6	147103358	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:1,7:0,11:0,1,2,16
chr6	147103416	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	147103427	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:2,1:1,0:0|1:147103427_C_T:147103427:0,3,0,1
chr6	147103428	.	T	TGCATTTTTTTAAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:2,1:0,0:0|1:147103427_C_T:147103427:0,3,0,1
chr6	147128553	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,135;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=112.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,43:0.538:80:19,20:17,23:17,20,17,26
chr6	147136073	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,158;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,3:4,6:8,0,9,0
chr6	147635311	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.466:17:6,5:3,2:9,0,7,1
chr6	147635318	.	TAC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,6:7,2:8,2,7,1
chr6	147637282	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,122;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr6	147660433	.	G	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,31:0.443:70:17,18:22,12:21,18,10,21
chr6	148835416	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.787:7:0,2:1,3:0,1,5,1
chr6	148835436	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:8,1:7,3:8,8,3,1
chr6	148835594	.	TAAAAAAAAAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=119,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=28,17;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1,2,0,1
chr6	148835611	.	A	ACG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:148835611_A_ACG:148835611:1,2,0,1
chr6	148835616	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:148835611_A_ACG:148835611:1,2,0,1
chr6	148835618	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=180,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:148835611_A_ACG:148835611:1,3,0,1
chr6	148835622	.	AGG	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,23;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:148835611_A_ACG:148835611:0,3,0,1
chr6	148835628	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:148835611_A_ACG:148835611:0,3,0,1
chr6	148835642	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=205,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	149274907	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,138;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.523:6:2,0:1,2:3,0,2,1
chr6	149275131	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:3,4:4,4:1,6,0,9
chr6	149285719	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,0:5,5:1,8,1,4
chr6	149285768	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=248,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:149285768_T_C:149285768:0,1,0,1
chr6	149285774	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:149285768_T_C:149285768:0,0,0,1
chr6	149340342	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,1:11,1:12,9,2,0
chr6	149340390	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr6	149718650	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr6	149722236	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,115;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,3:0.060:65:26,0:32,3:0|1:149722236_T_C:149722236:46,16,0,3
chr6	149722244	.	C	CCTTTCCATTCTTATTTTTACGGTATTTTATT	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=33,38;MFRL=150,115;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,3:0.055:70:32,0:32,3:0|1:149722236_T_C:149722236:46,21,0,3
chr6	149780695	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=96.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,22,5
chr6	149780737	.	G	GACTA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTA;STR;TLOD=103.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.966:24:0,12:0,6:0,0,11,13
chr6	149782908	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr6	149795342	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,1:3,11:6,2,9,3
chr6	149846372	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.168:29:8,2:9,2:3,21,1,4
chr6	149856910	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.264:6:3,1:2,0:0|1:149856910_T_G:149856910:0,5,0,1
chr6	149856914	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:2,1:2,0:0|1:149856910_T_G:149856910:1,4,0,1
chr6	149856917	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:2,1:3,0:0|1:149856910_T_G:149856910:1,4,0,1
chr6	149893556	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:6,5,1,1
chr6	149901947	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=246,264;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:0,0:1,1:0|1:149901947_G_A:149901947:0,2,0,1
chr6	149901951	.	AATG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=246,264;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:149901947_G_A:149901947:0,2,0,1
chr6	149953835	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr6	149983083	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:12,1:22,1:19,15,1,1
chr6	150052698	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,122;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,1:0,4:2,0,3,2
chr6	150123540	.	C	CTTCTTCTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:2,10,0,2
chr6	150174278	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:6,7:11,8:2,15,2,13
chr6	150209805	.	TAAA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,10;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:0,0:0|1:150209805_TAAA_T:150209805:1,2,0,1
chr6	150209821	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr6	150209828	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:150209805_TAAA_T:150209805:1,3,0,1
chr6	150211123	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:9,8:5,10:6,9,7,11
chr6	150263186	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr6	150341990	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,9:0,4:0|1:150341990_A_G:150341990:0,0,13,1
chr6	150341993	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0|1:150341990_A_G:150341990:0,0,13,1
chr6	150342396	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	150386860	.	T	TATTTTCTTCCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=233,215;MMQ=57,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:150386860_T_TATTTTCTTCCC:150386860:0,2,0,1
chr6	150386861	.	G	GTTCAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=233,215;MMQ=57,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:150386860_T_TATTTTCTTCCC:150386860:0,2,0,1
chr6	150386880	.	T	TCCCTTAACGCCTCATGAATTCACACTGAAGTGAAGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	150387302	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr6	150387312	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr6	150387371	.	G	GAAAAAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150387371_G_GAAAAAA:150387371:0,0,0,1
chr6	150387372	.	G	GGAGGAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150387371_G_GAAAAAA:150387371:0,0,0,1
chr6	150390213	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:1,2:4,1:1,4,0,3
chr6	150569938	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,1:8,2:8,10,0,3
chr6	151054844	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:10,1:7,1:8,11,2,0
chr6	151125710	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:4,2:5,1:9,1,3,0
chr6	151125724	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.441:17:4,4:3,3:9,1,6,1
chr6	151125896	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,6:7,3:0,13,1,8
chr6	151130691	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,7:0,1:0,0,7,3
chr6	151130920	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:151130920_A_G:151130920:0,0,3,6
chr6	151130929	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=111,92;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:0|1:151130920_A_G:151130920:1,5,1,1
chr6	151130944	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=128,92;MMQ=60,26;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:151130920_A_G:151130920:0,4,0,1
chr6	151130946	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=128,92;MMQ=60,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:151130920_A_G:151130920:0,4,0,1
chr6	151142261	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=91.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,10:0,0,24,2
chr6	151152656	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr6	151199071	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr6	151247439	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr6	151258127	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:0,5,1,4
chr6	151259770	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:14,1:3,6:12,5,6,1
chr6	151260002	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=206,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr6	151266504	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,18,0
chr6	151266564	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,18:0.312:59:24,11:16,7:28,13,13,5
chr6	151281567	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,12:0,14:0,0,9,17
chr6	151286224	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,2,12
chr6	151331085	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:10,12,1,1
chr6	151358011	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,14:0,4:0,0,16,2
chr6	151358299	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,8:0,0,2,23
chr6	151358325	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,2,15
chr6	151362895	.	CTTG	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=244,146;MMQ=48,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=207.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,48:0.962:49:0,27:1,19:1,0,23,25
chr6	151362942	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=205.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,31:0,23:0,0,29,25
chr6	151627096	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	151627133	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	151627134	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=154,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:151627134_TG_T:151627134:0,1,0,1
chr6	151627137	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151627134_TG_T:151627134:0,0,0,1
chr6	151674116	.	T	TGAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,7:0,0,11,4
chr6	151694560	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:14,3,2,0
chr6	151742541	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=143.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,21:0,0,0,45
chr6	151775782	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,3:0.050:78:34,0:39,3:18,57,0,3
chr6	151857370	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr6	151857594	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:7,5,2,2
chr6	151859382	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,0:10,2:8,13,0,3
chr6	151869645	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:3,6:10,9:4,9,3,12
chr6	151894278	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr6	151894340	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=125,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,4:6,7:5,6,4,7
chr6	151894716	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:2,1:2,2:0,5,0,3
chr6	151914421	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:3,1:1,1:0,4,0,3
chr6	151917660	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:4,2,5,4
chr6	151917781	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.454:16:4,0:3,7:0,9,0,7
chr6	151939350	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0,5,1,2
chr6	152201875	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,13,5
chr6	152202007	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	152265282	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,4:2,1:8,0,6,0
chr6	152265352	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.418:26:11,6:4,3:13,2,9,2
chr6	152382087	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,3:3,2:3,0,5,1
chr6	152382311	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	152382325	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	152415676	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=184,112;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:1,8,0,2
chr6	152420171	.	C	CTGTAGTTTCTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=223,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	152446316	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0|1:152446316_C_T:152446316:1,0,5,0
chr6	152446320	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0|1:152446316_C_T:152446316:1,0,5,0
chr6	152461048	.	CTGTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=107,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,2:6,1:0|1:152461048_CTGTT_C:152461048:4,3,3,0
chr6	152461061	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:0|1:152461048_CTGTT_C:152461048:3,3,3,1
chr6	152476952	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=60.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,17,0
chr6	152522926	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:9,1,8,0
chr6	152523143	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr6	152534946	.	TT	AA,AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29,29;MFRL=0,160,87;MMQ=60,60,60;MPOS=8,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.46,5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.504,0.376:5:0,1,0:0,2,2:0,0,0,5
chr6	152539572	.	TAA	T,TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33,30;MFRL=154,206,163;MMQ=60,60,60;MPOS=24,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.16,9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,5:0.174,0.385:13:5,0,3:0,2,1:0,6,0,7
chr6	152558111	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	152560916	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0|1:152560916_G_A:152560916:0,0,1,6
chr6	152560926	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:152560916_G_A:152560916:0,4,0,1
chr6	152570415	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,2,15
chr6	152570488	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152570488_G_T:152570488:0,0,0,1
chr6	152570491	.	GC	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152570488_G_T:152570488:0,0,0,1
chr6	152577752	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,2:6,4:8,1,3,3
chr6	152603139	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	152629586	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=121,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:10,9:6,2:14,2,11,0
chr6	152629617	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:11,8:10,4:15,6,10,2
chr6	152629772	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=10,17;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:0,0:0,0:0,1,0,3
chr6	152646993	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr6	152650928	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=147,95;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:10,0:6,4:8,9,0,4
chr6	152660310	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr6	152671475	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,37;MFRL=121,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,1:3,4:2,3,1,4
chr6	152671919	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,2:5,1:1,5,0,6
chr6	152671975	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=209,282;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr6	152673147	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,6:8,4:9,3,8,2
chr6	152673519	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:5,1:2,1:0,7,0,3
chr6	152674583	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,2,0
chr6	152683413	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:9,10:7,3:6,10,7,6
chr6	152688567	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	152690559	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:4,0,5,0
chr6	152697706	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	152698116	.	C	CTAAAAAAAACTACTAAAGAAAGAAAGAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	152711395	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,4:6,6:12,1,8,2
chr6	152717896	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:4,3:10,5:10,4,7,1
chr6	152721029	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=223,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr6	152722228	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:4,3,5,0
chr6	152722561	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0|1:152722561_A_G:152722561:0,1,0,1
chr6	152722564	.	G	GTTTTTATGTGACTTTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:152722561_A_G:152722561:0,1,0,1
chr6	152730216	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:17,3:8,0:13,12,3,0
chr6	152730679	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=192,93;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,4:7,0:9,2,4,0
chr6	152748654	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	152751398	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:9,2:8,0:0,17,0,3
chr6	152751426	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:0,5,0,8
chr6	152772203	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,45;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:10,10,1,1
chr6	152772410	.	GC	TT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr6	153043418	.	C	CCTCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	153296772	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr6	153332926	.	AATAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:4,7:3,3:0,7,0,10
chr6	153345309	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	153345647	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,3:5,5:1,9,2,6
chr6	154412004	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	154414375	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr6	154414563	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0|1:154414563_A_G:154414563:0,0,3,12
chr6	154414573	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0|1:154414563_A_G:154414563:0,0,1,10
chr6	154429085	.	AT	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=132.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.980:43:0,28:0,15:0,0,42,1
chr6	154431393	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	154535444	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:9,11:6,9:2,13,0,20
chr6	154542491	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:1,6,0,3
chr6	154567666	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=191,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr6	154727825	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,14:0,4:0,0,7,11
chr6	154735973	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr6	154736017	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,14;MFRL=209,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,0:0,0:0,3,0,1
chr6	154736022	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=219,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:154736022_G_A:154736022:0,3,0,1
chr6	154736024	.	C	A,G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32,30;MFRL=216,135,219;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,1,0:0,0,1:0,2,0,2
chr6	154736027	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=219,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:154736022_G_A:154736022:0,3,0,1
chr6	154749225	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=83.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:0,13:1,14:0,1,19,8
chr6	154751585	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:6,0:7,2:14,0,2,0
chr6	154762376	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	154762394	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=15,25;MFRL=84,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.762:8:0,1:0,4:1,1,6,0
chr6	154763165	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:2,2,1,1
chr6	155109168	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.194:19:6,1:8,2:1,15,0,3
chr6	155116285	.	TTC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,2:5,5:2,8,0,7
chr6	155124583	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,2:6,0,6,0
chr6	155129784	.	CCTTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:5,3:8,1,4,2
chr6	155148325	.	T	TGG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.127:29:8,1:13,0:6,19,4,0
chr6	155152311	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr6	155451529	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:9,2:11,2:10,11,3,1
chr6	155470190	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	155485535	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	155485554	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr6	155565744	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr6	155566904	.	T	TTAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr6	155571113	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,4,12
chr6	155572986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	155574207	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr6	155575538	.	TC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.371:28:8,5:7,6:8,9,5,6
chr6	155577913	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,6:4,4:2,3,3,7
chr6	155578324	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr6	155579246	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,1:4,1:0,7,1,3
chr6	155581619	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	155596901	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,8,9
chr6	155597134	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:5,6:5,2:5,5,7,2
chr6	155597686	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	155618095	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:13,2,2,0
chr6	155635585	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=100.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,17:0,0,7,23
chr6	155635624	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr6	155635637	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr6	155750035	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.966:25:0,14:0,11:0|1:155750035_C_T:155750035:0,0,10,15
chr6	155750038	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.548:24:4,8:5,5:0|1:155750035_C_T:155750035:4,7,6,7
chr6	155750135	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,2:16,0:12,14,2,0
chr6	155750219	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr6	157100396	.	GCGC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CGC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	157150547	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:19,2:15,0:6,28,1,1
chr6	157222728	.	T	TATC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:157222728_T_TATC:157222728:0,2,0,1
chr6	157222731	.	CTGT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:157222728_T_TATC:157222728:0,2,0,1
chr6	157405761	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	157405930	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,14:0,0,12,20
chr6	157495951	.	ATT	A,AT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,34,31;MFRL=162,174,142;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.11,7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,7:0.079,0.232:32:11,3,5:9,0,2:17,5,7,3
chr6	157496153	.	G	GT	.	.	DP=129;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,5:0.051:100:61,2:33,3:41,54,1,4
chr6	157744588	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:8,7:5,8:1,15,0,15
chr6	158013897	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.411:22:6,5:6,2:8,5,2,7
chr6	158014255	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	158049351	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.276:13:5,1:5,1:9,1,3,0
chr6	158049365	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=18,10;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.255:15:2,0:1,0:9,2,4,0
chr6	158068481	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr6	158074504	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	158288505	.	A	AACTGT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTGT;STR;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:7,6:6,0:11,2,7,0
chr6	158322886	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,0:6,0,4,1
chr6	158327269	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:2,4:8,9:2,8,1,12
chr6	158331150	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=204,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr6	158358654	.	GAAAC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr6	158359813	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=80,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.496:18:2,4:7,4:0|1:158359813_GA_G:158359813:4,5,1,8
chr6	158359817	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=80,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.495:18:2,4:7,4:0|1:158359813_GA_G:158359813:4,5,1,8
chr6	158361823	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr6	158361899	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=105,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:7,3,1,2
chr6	158475941	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:2,2,3,1
chr6	158485668	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,2:8,0:15,8,1,1
chr6	158487406	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,2,1
chr6	158489778	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.464:24:9,4:2,6:6,7,0,11
chr6	158489863	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=237,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	158490779	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,2:5,1:0,5,0,3
chr6	158492545	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,6,1
chr6	158502137	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=183,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,4:4,2:7,2,5,1
chr6	158502590	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0,0,3,15
chr6	158504981	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:5,0,4,2
chr6	158507981	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	158508001	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	158514223	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=164,151;MMQ=60,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:158514223_A_T:158514223:0,2,0,1
chr6	158514230	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=164,151;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:158514223_A_T:158514223:0,2,0,1
chr6	158514234	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=164,151;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:158514223_A_T:158514223:0,2,0,1
chr6	158535720	.	T	TTATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA;STR;TLOD=77.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,4:0,0,10,8
chr6	158567716	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158567716_A_G:158567716:1,0,1,0
chr6	158567722	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158567716_A_G:158567716:1,0,1,0
chr6	158567732	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:158567716_A_G:158567716:1,0,1,0
chr6	158567734	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,28;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:158567716_A_G:158567716:1,0,1,0
chr6	158571655	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr6	158571706	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	158735087	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0|1:158735087_C_T:158735087:0,0,10,5
chr6	158735090	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0|1:158735087_C_T:158735087:0,0,10,5
chr6	158925311	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	158994577	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=97.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,13:0,0,7,22
chr6	159029342	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,7:6,7:11,3,10,4
chr6	159046076	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=90,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:6,2,6,1
chr6	159050889	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=189,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:1,1:3,1:0,5,0,2
chr6	159129476	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=107,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,6:0,4:1,3,0,10
chr6	159146690	.	CTTTTTTTG	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTTTTG;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.216:32:10,4:12,3:5,20,1,6
chr6	159184508	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:14,2:12,1:11,15,1,2
chr6	159188128	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,4:4,4:2,5,1,7
chr6	159190800	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,2:4,4:8,3,6,0
chr6	159192214	.	T	TGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,652158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,1,1
chr6	159204786	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	159206424	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:11,0:15,3:19,7,1,2
chr6	159291343	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:11,0:17,3:8,21,0,3
chr6	159316430	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr6	159404932	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=214,136;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:159404932_G_A:159404932:0,1,0,1
chr6	159404936	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=214,136;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:159404932_G_A:159404932:0,1,0,1
chr6	159404938	.	GGT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159404932_G_A:159404932:0,0,0,1
chr6	159407451	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,258;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:12,0:16,2:5,25,0,2
chr6	159464757	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=173,72;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:10,0:5,1:1,16,1,1
chr6	159590543	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	159636082	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,1:13,1:9,14,1,1
chr6	159653544	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:0,7,0,7
chr6	159654231	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,0:9,2:7,5,0,2
chr6	159655593	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	159657195	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	159659523	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	159659753	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr6	159660779	.	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCACCACCCGCCGCACGA;STR;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.893:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	159660879	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr6	159667972	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:5,5:6,0:3,9,2,3
chr6	159670276	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	159670303	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	159677498	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr6	159682206	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,10,4
chr6	159692321	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,13,1
chr6	159692559	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	160103470	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:12,1,2,0
chr6	160106088	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.665:19:4,9:2,3:0,6,1,12
chr6	160106125	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:2,2:2,1:0,5,0,3
chr6	160114360	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,0:0,2:0,1,0,3
chr6	160157277	.	CT	C,CTT	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=32,31,33;MFRL=127,53,81;MMQ=60,60,60;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.32,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:72,4,8:0.054,0.085:84:40,1,4:30,3,1:51,21,9,3
chr6	160163087	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.427:38:12,12:9,4:20,2,15,1
chr6	160163213	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,25:0.482:52:12,19:13,6:8,19,3,22
chr6	160174456	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.393:23:8,3:6,5:8,6,8,1
chr6	160189746	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	160199687	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:7,9:7,3:7,7,9,3
chr6	160201160	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr6	160201444	.	T	TA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=62.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.600:36:7,9:7,11:13,1,19,3
chr6	160201677	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr6	160202167	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr6	160206362	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,127;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,2:8,0:13,0,2,0
chr6	160207049	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:2,6,1,6
chr6	160208735	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:12,7:9,9:15,6,13,3
chr6	160211554	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,6:7,2:12,1,7,1
chr6	160211591	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:13,1:13,1:16,11,0,2
chr6	160211636	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.232:41:15,4:17,5:13,19,5,4
chr6	160211645	.	GGTT	G	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.244:39:15,4:14,5:11,19,5,4
chr6	160211728	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:0,8,0,7
chr6	160218605	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr6	160219035	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:1,4:3,4:4,0,9,0
chr6	160219169	.	T	TC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,125;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:3,17,0,2
chr6	160221279	.	GCGTGGGCAGCA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGTGGGCAGCA;STR;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:1,1:7,4:9,0,5,0
chr6	160221475	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=120,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,3:1,6:0,1,1,8
chr6	160221690	.	GCTT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,3:2,0,5,0
chr6	160225205	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=205,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,1:2,1:0|1:160225205_G_A:160225205:0,8,0,2
chr6	160225209	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:0|1:160225205_G_A:160225205:0,7,0,2
chr6	160225559	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,7:0,0,12,9
chr6	160229889	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,5:7,9:5,8,3,11
chr6	160232921	.	GTTTTGT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr6	160236976	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:3,0,3,0
chr6	160237489	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	160237662	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=14,20,19;MFRL=157,117,155;MMQ=35,60,57;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=T;STR;TLOD=11.11,7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,4:0.520,0.364:12:0,1,0:0,3,1:0,1,1,10
chr6	160328892	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:7,0:12,4:9,11,4,0
chr6	160453561	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr6	160461793	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:5,3:0,2:1,4,0,5
chr6	160465456	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,6:7,4:9,0,10,0
chr6	160465486	.	TTGTC	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:8,5:4,8:13,0,13,0
chr6	160465753	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	160468383	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=197,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	160471451	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:7,1,2,0
chr6	160479030	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.094:50:23,0:23,4:29,17,2,2
chr6	160479882	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr6	160481537	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=104,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,4:5,3:5,2,7,0
chr6	160483636	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:28,2:11,2:11,29,2,2
chr6	160484487	.	G	GCATTAAGATTTTTTTCC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=154,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:10,0:16,2:13,14,1,1
chr6	160489215	.	CAG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,5:7,2:9,1,6,2
chr6	160505252	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:2,5:4,3:0,6,0,8
chr6	160523640	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,129;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:17,1:27,2:20,24,2,1
chr6	160543316	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=194,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:0,2:2,0:0|1:160543316_C_CT:160543316:0,2,1,1
chr6	160543317	.	C	CCAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=194,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:160543316_C_CT:160543316:0,2,1,1
chr6	160543318	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=194,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:160543316_C_CT:160543316:0,2,1,1
chr6	160543322	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=165,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:160543316_C_CT:160543316:0,3,1,1
chr6	160543325	.	C	CACCCCTGGCCG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=165,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,0:0|1:160543316_C_CT:160543316:0,3,1,1
chr6	160553496	.	G	GTTATAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160553496_G_GTTATAT:160553496:0,0,0,1
chr6	160553500	.	AGG	TTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160553496_G_GTTATAT:160553496:0,0,0,1
chr6	160553506	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160553496_G_GTTATAT:160553496:0,0,0,1
chr6	160560824	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:2,4,3,2
chr6	160560845	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=179,104;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:3,2,1,2
chr6	160560897	.	CTGGTAAGT	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGTAAGT;STR;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:2,2:1,4,2,4
chr6	160575985	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:1,7,3,4
chr6	160663230	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	160666660	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,0:0,6:0,0,0,7
chr6	160670494	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,0,13
chr6	160671500	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	160671793	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr6	160677614	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr6	160769423	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	160868687	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=183,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr6	160868701	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=184,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:5,0,8,0
chr6	160872151	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr6	160966408	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=131,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.433:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	160966409	.	C	CA,T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32,28;MFRL=0,262,237;MMQ=60,60,60;MPOS=16,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.06,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.306,0.373:4:0,0,1:1,1,1:1,0,3,0
chr6	161021998	.	GA	CG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,165;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:0|1:161021998_GA_CG:161021998:11,9,1,1
chr6	161022003	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,165;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,1:9,1:0|1:161021998_GA_CG:161021998:11,10,1,1
chr6	161128922	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=185,187;MMQ=58,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:3,4:9,4:0,12,1,7
chr6	161137663	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=118,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,5:4,6:7,1,6,5
chr6	161137779	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,116;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:2,8:2,3:1,3,4,7
chr6	161139480	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,5:3,8:1,9,2,11
chr6	161139502	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,4:2,5:1,6,0,9
chr6	161143376	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:5,1,4,0
chr6	161143608	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.461:48:13,11:12,10:4,22,7,15
chr6	161152294	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr6	161160083	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr6	161413211	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	161502094	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.742:25:4,15:2,4:4,2,3,16
chr6	161509003	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:1,6,0,3
chr6	161519350	.	CCTG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CTG;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.901:6:0,1:0,4:0,0,3,3
chr6	161531006	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:0,5:5,3:0,5,0,8
chr6	161532855	.	CT	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.497:38:10,7:9,11:12,7,9,10
chr6	161557703	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	161557729	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:161557729_C_CCT:161557729:0,2,0,1
chr6	161557730	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:161557729_C_CCT:161557729:0,2,0,1
chr6	161557731	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:161557729_C_CCT:161557729:0,2,0,1
chr6	161575165	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=203,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr6	161771030	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161771030_G_A:161771030:1,0,0,1
chr6	161771036	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161771030_G_A:161771030:1,0,0,1
chr6	161990339	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:5,1:1,1:4,2,3,0
chr6	161990483	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr6	161990516	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	162475215	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,4:3,3:2,8,1,6
chr6	162622304	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr6	162683845	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=131,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	162683874	.	T	TAGAGTAAATATCTTATTCAGAACACCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=190,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	162683876	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	162864317	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=177,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:2,1,6,0
chr6	163836376	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:1,2:2,2:1,2,0,5
chr6	163899794	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.208:26:6,2:11,2:17,4,4,1
chr6	163899807	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=25,10;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.191:33:10,0:4,0:16,10,7,0
chr6	163899809	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.108:35:11,0:9,0:21,10,4,0
chr6	163956225	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:22,0:12,2:0,34,0,2
chr6	165693624	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:2,4,1,2
chr6	165715006	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=96,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr6	165723166	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr6	165746424	.	T	TGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,248;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:165746424_T_TGGG:165746424:0,0,1,0
chr6	165746429	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,248;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165746424_T_TGGG:165746424:0,0,1,0
chr6	165746446	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=120,248;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr6	165806114	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,4:0,13:0,0,12,5
chr6	165808605	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,18,1
chr6	165809963	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:0,2:5,5:0,5,1,6
chr6	165826899	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=A;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr6	165827194	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,6,17
chr6	165845027	.	AATATACTATATATC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,6:6,8:0,12,0,14
chr6	165846658	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=112,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:8,7:5,9:4,9,4,12
chr6	165863695	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=60.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,9:0,0,15,4
chr6	165989776	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr6	166075362	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,3:0,0,9,0
chr6	166572045	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:2,1,1,2
chr6	166574246	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr6	166574308	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=96,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.563:32:4,11:9,7:9,5,11,7
chr6	166578025	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=90,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:7,5:0,3:6,1,6,2
chr6	166736235	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	166736362	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,25:0.473:53:11,17:17,8:11,17,11,14
chr6	166737980	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=132.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,22:0,16:0,0,31,7
chr6	166741921	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	166743760	.	G	C	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=325.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,93:0.990:93:0,43:0,49:0,0,24,69
chr6	166780478	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=154,922;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr6	166796433	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=99,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr6	166827436	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=88,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:1,4,1,3
chr6	166831694	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:4,7:2,3:5,3,9,1
chr6	166836981	.	G	GACCTGCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=220,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	166862136	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr6	167357368	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,175;MMQ=51,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:5,0:0,14,0,2
chr6	167447489	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.377:14:5,1:3,4:2,7,2,3
chr6	167453519	.	A	AT,ATT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=158,173,149;MMQ=60,60,60;MPOS=16,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=16.20,7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,8,5:0.528,0.306:15:0,3,2:2,5,3:0,2,0,13
chr6	167570528	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.609:18:4,7:2,4:2,5,4,7
chr6	167590454	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=144,128;MMQ=52,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:13,10:7,6:16,4,16,0
chr6	167592464	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr6	167592656	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	167594182	.	A	C,T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33,32;MFRL=0,100,167;MMQ=60,27,27;MPOS=22,27;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.44,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,2:0.724,0.211:11:0,7,0:0,2,2:0,0,10,1
chr6	167594216	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=124,143;MMQ=27,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:6,15:9,5:7,8,10,10
chr6	167704944	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,6:4,3:4,1,7,2
chr6	167728719	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,230;MMQ=55,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:11,2:6,0:13,5,2,0
chr6	167752312	.	G	GTTCCTTCC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=TTCC;STR;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr6	167772755	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr6	167789404	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	167789590	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=117,168;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.830:10:1,5:0,2:0,1,1,8
chr6	167789622	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=180,189;MMQ=21,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	167789633	.	A	AGCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=170,189;MMQ=24,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:167789633_A_AGCT:167789633:0,4,0,1
chr6	167789634	.	A	ACTTGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=170,189;MMQ=24,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:167789633_A_AGCT:167789633:0,4,0,1
chr6	167796182	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	167796415	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr6	168191841	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=245,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168191841_AT_A:168191841:0,1,0,1
chr6	168191845	.	AC	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=245,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168191841_AT_A:168191841:0,1,0,1
chr6	168191852	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=245,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168191841_AT_A:168191841:0,1,0,1
chr6	168272817	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr6	168297684	.	G	GTACTTTGTTTTGTCATTGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.299:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	168298875	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:5,1:13,11:11,7,5,7
chr6	168316118	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,0:0,4:0,1,1,5
chr6	168317994	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:1,3,1,6
chr6	168323664	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:4,5,2,3
chr6	168348504	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:2,1:2,1,3,0
chr6	168349254	.	T	TAAAAGAAAAAAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	168363207	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.068:55:22,0:30,3:20,32,1,2
chr6	168370691	.	G	GATACTGAATAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	168440639	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	168440746	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:2,0:4,3,0,2
chr6	168466504	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr6	168475822	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=182,173;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr6	168479790	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	168708045	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=207,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:4,2:1,2:6,0,4,0
chr6	168708751	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,4,8
chr6	168711107	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:12,9:11,9:12,12,10,8
chr6	168711170	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,6:0,0,2,16
chr6	168928251	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr6	169008813	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.175:28:7,1:9,0:0|1:169008813_C_G:169008813:8,15,5,0
chr6	169008818	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,10;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.152:32:8,0:11,0:0|1:169008813_C_G:169008813:9,18,5,0
chr6	169008821	.	TT	GA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.185:33:9,0:12,0:0|1:169008813_C_G:169008813:8,19,6,0
chr6	169617776	.	CAGGAGGTG	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:0,4:4,3:5,0,7,0
chr6	169617889	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=98.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,37:0.499:74:22,16:14,20:21,16,23,14
chr6	169617934	.	GA	G	.	.	DP=92;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=99,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=167.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,71:0.949:74:0,37:2,30:1,2,47,24
chr6	169620247	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr6	169628169	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=190,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:1,1:2,1,2,1
chr6	169629783	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:1,5:2,1:1,3,2,4
chr6	169634809	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:7,7:3,6:7,3,10,3
chr6	169635010	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=225,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:3,3:0,6,0,3
chr6	169635020	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=213,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:2,6,0,4
chr6	169646211	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr6	169646409	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr6	169857761	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=94,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:1,5,0,6
chr6	169982927	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.596:22:5,7:2,6:6,3,12,1
chr6	170049421	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr6	170065759	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=200,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,1,1
chr6	170068025	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:0,1:2,1:2,1,2,0
chr6	170068058	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:0,1:3,2:3,1,3,0
chr6	170068086	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:2,5:4,1,5,2
chr6	170102513	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=222,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr6	170106419	.	CTT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=70.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.600:33:5,8:7,11:5,8,7,13
chr6	170118085	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=133.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,12:0,25:0,0,0,37
chr6	170144228	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:2,3,3,2
chr6	170155331	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,4:9,6:11,1,8,2
chr6	170159023	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr6	170162515	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:10,3:5,7:10,7,5,5
chr6	170162537	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:5,11:6,7:5,6,9,9
chr6	170169819	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,4:3,5:0,7,3,6
chr6	170176407	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=194,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:7,0,5,1
chr6	170176787	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=105,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:2,1:5,3:3,4,1,4
chr6	170176847	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr6	170179377	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=130,40;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:170179377_T_C:170179377:6,16,1,1
chr6	170179385	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:170179377_T_C:170179377:6,15,1,1
chr6	170179388	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:170179377_T_C:170179377:4,15,1,1
chr6	170179390	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:170179377_T_C:170179377:4,15,1,1
chr6	170181516	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.545:39:6,9:9,12:11,7,14,7
chr6	170592109	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.497:28:5,7:9,6:7,7,7,7
chr6	170592293	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=180,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,0:0,2:1,0,2,1
chr6	170594819	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,1,10
chr6	170595430	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,6:0,15:0,0,2,19
chr6	170597276	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.661:13:1,1:3,6:3,1,7,2
chr6	170627651	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=16,29;MFRL=185,141;MMQ=38,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,52:0.963:54:0,19:0,20:1,1,27,25
chr6	170852784	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:15,0:16,3:15,17,0,3
chr6	170855176	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr6	170855352	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	170858045	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=50.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr6	170871037	.	GCAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.420:12:3,3:4,2:4,3,2,3
chr6	170880684	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=168,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:0,1:3,0:0,3,0,2
chr6	170881389	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34,24;MFRL=161,147,143;MMQ=60,60,60;MPOS=24,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.35,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,3:0.208,0.205:15:1,2,0:7,1,2:1,8,1,5
chr6	170886898	.	T	TATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	170892100	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr6	170892848	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,9:0,0,3,11
chr6	170892919	.	T	TACTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	197535	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr7	538130	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=149,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr7	538277	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,2:3,4:0|1:538277_G_C:538277:2,7,0,6
chr7	538284	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:5,2:2,4:0|1:538277_G_C:538277:1,7,0,6
chr7	538348	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=70,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	540741	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.546:16:3,3:4,4:7,0,9,0
chr7	589969	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,0:0|1:589969_G_C:589969:4,1,2,0
chr7	589974	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:1,0:0|1:589969_G_C:589969:4,1,2,0
chr7	589976	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,0:1,0:0|1:589969_G_C:589969:4,1,2,0
chr7	591125	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:1,10,0,6
chr7	618855	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr7	618869	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,5,4
chr7	619064	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:619064_G_T:619064:0,0,0,1
chr7	619067	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:619064_G_T:619064:0,0,0,1
chr7	619072	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:619064_G_T:619064:0,0,0,1
chr7	619074	.	AA	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:619064_G_T:619064:0,0,0,1
chr7	751220	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=218,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr7	780980	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr7	794471	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=55.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,5,12
chr7	803342	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	803652	.	C	CGGGAAACAGCAGTGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=231,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:803652_C_CGGGAAACAGCAGTGAT:803652:0,1,0,1
chr7	803654	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=231,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:803652_C_CGGGAAACAGCAGTGAT:803652:0,1,0,1
chr7	808899	.	C	CAGGTCCAGAAATGTTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=157,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	813618	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr7	813650	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr7	813867	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	814612	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=64.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,10:0,0,11,8
chr7	825114	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,6:0,0,17,0
chr7	888238	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=218,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.405:10:2,3:4,0:0,6,0,4
chr7	890978	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:5,6:1,0:4,2,5,1
chr7	891184	.	C	CGAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:0,7,0,6
chr7	912755	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr7	939007	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:4,2:5,1:7,4,3,0
chr7	940113	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.747:2:0,1:0,0:0|1:940113_A_C:940113:0,0,2,0
chr7	940120	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,35;MFRL=158,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.593:3:0,1:1,0:0|1:940113_A_C:940113:1,0,2,0
chr7	940125	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=182,267;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:940113_A_C:940113:2,0,1,0
chr7	940128	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,0;MFRL=173,267;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:940113_A_C:940113:3,0,1,0
chr7	940129	.	C	CCCCCGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,0;MFRL=173,267;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:940113_A_C:940113:3,0,1,0
chr7	940258	.	G	GGGCAAAGGCA	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,19:0.475:40:11,8:7,8:0|1:940258_G_GGGCAAAGGCA:940258:16,5,11,8
chr7	940267	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=68.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,19:0.455:42:12,10:9,9:0|1:940258_G_GGGCAAAGGCA:940258:17,6,9,10
chr7	940298	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:11,10:6,5:8,9,2,13
chr7	940501	.	AGAAGGGCC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGGGCC;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr7	940724	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr7	943699	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,0:3,3:7,0,2,1
chr7	943711	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:1,0,8,2
chr7	943998	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr7	944683	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=10,20;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.795:6:0,2:0,3:1,0,4,1
chr7	960450	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=105,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,1:5,6:7,4,3,4
chr7	974905	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr7	1015021	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.410:25:6,4:8,6:15,0,10,0
chr7	1024581	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=63,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr7	1024908	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=138,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:7,8,0,2
chr7	1037382	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,0:3,5:3,5,3,2
chr7	1037467	.	C	CAGGTAACG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=187,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.256:9:3,2:4,0:4,3,1,1
chr7	1131356	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.525:46:11,11:9,13:14,8,14,10
chr7	1132237	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=113,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:5,6,1,1
chr7	1192831	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=94,79;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,0:16,3:17,11,0,3
chr7	1272683	.	G	GAGGCACAGCTCAAACAGTAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157552087;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	1474287	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:6,6:3,7:5,5,8,5
chr7	1513420	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1513420_A_C:1513420:0,0,0,1
chr7	1513422	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1513420_A_C:1513420:0,0,0,1
chr7	1513426	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1513420_A_C:1513420:0,0,0,1
chr7	1513429	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1513420_A_C:1513420:0,0,0,1
chr7	1517931	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,5:4,2:4,1,7,0
chr7	1519892	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=140,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	1519946	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:3,2:1,3:3,1,5,1
chr7	1522157	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	1522175	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	1522211	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:11,6,2,0
chr7	1523559	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr7	1526181	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=149,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr7	1527511	.	GC	TT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:3,4:6,0,1,3
chr7	1527687	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,1,3
chr7	1528947	.	T	TCCCGGGCCCGCCGAGGGGACGTGCGCACTCACTTCAGGCCCTGCTCCCAGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,1:0,0,12,1
chr7	1529201	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:8,0,5,0
chr7	1532631	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,6:3,3:7,3,9,0
chr7	1533556	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,16:0.382:43:7,7:7,9:0|1:1533556_T_C:1533556:7,20,5,11
chr7	1533566	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=57.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,16:0.396:41:12,8:9,8:0|1:1533556_T_C:1533556:5,20,4,12
chr7	1533610	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:4,3:4,4:0,8,0,8
chr7	1534579	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1534579_C_G:1534579:0,0,0,1
chr7	1534584	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1534579_C_G:1534579:0,0,0,1
chr7	1534593	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1534579_C_G:1534579:0,0,0,1
chr7	1535051	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,0:3,3:5,1,2,1
chr7	1538539	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr7	1538614	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=168,269;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr7	1538778	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=162,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:1538778_T_TCC:1538778:0,1,0,1
chr7	1538780	.	T	TCCTCTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=162,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1538778_T_TCC:1538778:0,1,0,1
chr7	1538877	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=191,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,2:1,1:2,0,1,2
chr7	1539799	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,3:0,4:3,1,7,0
chr7	1543476	.	T	TCCCCAAAGAC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCCCAAAGAC;STR;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.549:23:5,2:1,6:0,10,0,13
chr7	1586653	.	A	AGCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GCC;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0|1:1586653_A_AGCC:1586653:2,0,4,0
chr7	1586662	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0|1:1586653_A_AGCC:1586653:2,0,4,0
chr7	1588391	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr7	1589417	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:4,2,3,3
chr7	1590368	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	1590376	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr7	1590443	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=93,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,4,1
chr7	1733360	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=195,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1733360_C_T:1733360:2,2,1,0
chr7	1733364	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=195,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1733360_C_T:1733360:2,2,1,0
chr7	1787003	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,3:2,3:3,1,7,0
chr7	1787236	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=132,179;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,0:1,2:2,4,2,0
chr7	1787519	.	TAA	T,TA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31,32;MFRL=158,123,132;MMQ=60,60,60;MPOS=14,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=9.91,8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,6:0.318,0.327:19:5,4,3:0,2,2:5,2,11,1
chr7	1886805	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	1976556	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:2,6,2,4
chr7	2041638	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr7	2119380	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.436:23:9,8:4,1:7,6,3,7
chr7	2188684	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	2258899	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	2260482	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=102,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:1,1,3,0
chr7	2260499	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=102,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,3:0,2:2,2,5,0
chr7	2264983	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr7	2269552	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	2290372	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=179,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.658:4:1,2:0,0:1,0,2,1
chr7	2290385	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=80,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2290385_GC_AT:2290385:2,1,1,0
chr7	2290388	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=80,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2290385_GC_AT:2290385:2,1,1,0
chr7	2290433	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:6,3:0,0:5,2,3,0
chr7	2290601	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:2,2:4,2:4,2,2,3
chr7	2296493	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,0:0,9:0,0,6,5
chr7	2296696	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=209,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,0:1,3:0,1,1,3
chr7	2349608	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	2400306	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:2,1:4,2:5,1,4,0
chr7	2402821	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=178,162;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:2402821_G_C:2402821:0,4,0,1
chr7	2402826	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=178,162;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:2402821_G_C:2402821:0,4,0,1
chr7	2402831	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=178,162;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:2402821_G_C:2402821:0,4,0,1
chr7	2402834	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=178,162;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:2402821_G_C:2402821:0,4,0,1
chr7	2405885	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr7	2409035	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr7	2412493	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr7	2414142	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr7	2474220	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2474220_A_T:2474220:0,0,0,1
chr7	2474222	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2474220_A_T:2474220:0,0,0,1
chr7	2552986	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:6,2:1,6:2,6,0,8
chr7	2565268	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=134,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,0:6,5:4,6,4,1
chr7	2583622	.	G	GTTGCAGTGAGCTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=91,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	2621567	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=174,213;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:2,0:11,4:13,0,5,0
chr7	2621641	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=142,49;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.087:53:16,4:33,0:38,11,1,3
chr7	2622101	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=125,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,5,0
chr7	2625838	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr7	2626038	.	CCAGGGAATGG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAGGGAATGG;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.511:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	2699556	.	CACCCCGGG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:1,0,0,1
chr7	2699687	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=58.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,5:0,0,6,12
chr7	2771430	.	AAC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=32,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:2771430_AAC_A:2771430:3,1,0,1
chr7	2771434	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=32,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:2771430_AAC_A:2771430:3,1,0,1
chr7	2773035	.	C	CAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.622:16:4,5:2,5:5,1,10,0
chr7	2802173	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,2:6,3:15,0,5,0
chr7	2954801	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	2956880	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,2:4,0:3,1,2,0
chr7	2958987	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:8,2,2,0
chr7	2962459	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	2962753	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr7	2966334	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,2:8,4:10,1,4,2
chr7	2966445	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.631:22:5,7:2,6:4,4,5,9
chr7	2968195	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=232,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	2968361	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	2969795	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=142,261;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:1,2,0,1
chr7	2969806	.	TGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=15,17;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:2969806_TGGG_T:2969806:1,2,0,1
chr7	2969810	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:2969806_TGGG_T:2969806:1,2,0,1
chr7	2978507	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,1:1,0,0,2
chr7	2985361	.	GAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	3179968	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,1,10
chr7	3179973	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,1,9
chr7	3179991	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr7	3180657	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=70.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,16:0,5:0,0,8,13
chr7	3188513	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	3188549	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	3188576	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr7	3188712	.	A	C	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=207.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,15:0,43:0,0,32,30
chr7	3188738	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=146.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.981:47:0,16:0,30:0,0,9,38
chr7	4002204	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr7	4026944	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,13:0,0,5,13
chr7	4050731	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,1:2,1,2,3
chr7	4051677	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	4089103	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,5,8
chr7	4116665	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr7	4116697	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:7,6:3,2:6,4,7,2
chr7	4119285	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr7	4169665	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,1:2,7:7,3,6,2
chr7	4169704	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.453:33:12,1:5,13:11,7,8,7
chr7	4172109	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	4185592	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,2,14
chr7	4189075	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,5,10
chr7	4189123	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr7	4218282	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=207,221;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	4259708	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:7,3,4,0
chr7	4259953	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	4259989	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	4304727	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	4304929	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=179,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:4,0:0,2:0,4,0,3
chr7	4794817	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=191,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr7	4798730	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=197,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr7	4800929	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=203,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr7	4820729	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr7	4821300	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,0,3
chr7	4821352	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr7	4822887	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr7	4825003	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr7	4825945	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:9,4:2,3:10,1,8,0
chr7	4827859	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=134,186;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:7,1:11,4,3,0
chr7	4827884	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:3,6:1,7:2,2,6,7
chr7	4827954	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr7	4828593	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,3:0,2:1,1,1,4
chr7	4828628	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	4829371	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	4829633	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	4830048	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr7	4830078	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.430:16:3,1:6,4:5,4,4,3
chr7	4831061	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,7:0,6:0,1,1,12
chr7	4839163	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr7	4839993	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=153,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,1,2
chr7	4841289	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=214,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr7	4841313	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,10,3
chr7	4841470	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=223,207;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,4:0,2:0,1,5,1
chr7	4841655	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,5,16
chr7	4843171	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.871:6:0,1:0,2:0,0,6,0
chr7	4843213	.	C	CCTGCCAGGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGCCAGGG;STR;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,8,2
chr7	4845147	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	4855805	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr7	4862171	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:2,2,1,5
chr7	4862244	.	T	TGTGCTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4862244_T_TGTGCTC:4862244:0,2,0,1
chr7	4862248	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4862244_T_TGTGCTC:4862244:0,2,0,1
chr7	4862259	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4862259_A_G:4862259:0,0,0,1
chr7	4862269	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4862259_A_G:4862259:0,0,0,1
chr7	4871879	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr7	4874502	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr7	4874729	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,5:5,2:4,4,3,4
chr7	4876210	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=152,72;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr7	4876307	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4876307_C_A:4876307:0,0,0,1
chr7	4876320	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4876307_C_A:4876307:0,0,0,1
chr7	4917798	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	4917841	.	G	GTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=254,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	4946973	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr7	4949682	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4949682_A_AG:4949682:0,1,0,1
chr7	4949685	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4949682_A_AG:4949682:0,1,0,1
chr7	5026170	.	TA	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,200;MMQ=27,33;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,13:0.294:46:20,7:13,6:29,4,11,2
chr7	5112174	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=201,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr7	5232881	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,1,22
chr7	5257490	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr7	5262385	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr7	5269424	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr7	5327680	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,176;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:8,4:10,6:0,18,0,10
chr7	5330865	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,7:1,1:2,2,1,7
chr7	5334469	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=166,162;MMQ=60,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.526:19:6,3:3,6:0|1:5334469_G_T:5334469:8,1,8,2
chr7	5334472	.	C	CCT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=168,162;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.502:20:6,3:3,6:0|1:5334469_G_T:5334469:9,1,8,2
chr7	5334582	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,21:0.425:47:18,10:8,2:13,13,7,14
chr7	5336885	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	5364669	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,17;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.445:5:0,0:0,1:0|1:5364669_A_C:5364669:3,0,2,0
chr7	5364685	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=81,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:5364669_A_C:5364669:3,1,1,0
chr7	5364687	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=81,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:5364669_A_C:5364669:3,1,1,0
chr7	5369522	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,5:0,0,14,3
chr7	5396955	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	5416953	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:1,0:0|1:5416953_T_C:5416953:0,1,2,0
chr7	5416957	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:1,1:0|1:5416953_T_C:5416953:0,2,2,0
chr7	5416962	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,0:0|1:5416953_T_C:5416953:1,2,2,0
chr7	5427950	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,0,2
chr7	5429989	.	CAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,153;MMQ=52,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.478:6:2,1:0,2:2,1,3,0
chr7	5430283	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,2,21
chr7	5529922	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,314;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	5530827	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,12,8
chr7	5545355	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	5567277	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,15:0.206:62:10,0:20,1:38,9,15,0
chr7	5567282	.	C	A	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=145,164;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,11:0.147:64:17,1:23,3:43,10,11,0
chr7	5567596	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.567:35:7,9:8,11:10,5,12,8
chr7	5568366	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.586:39:7,10:9,13:2,14,3,20
chr7	5569327	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:7,3:6,8:8,5,3,8
chr7	5752506	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:1,8,0,4
chr7	5800769	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	5922056	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=202,215;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	5922100	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=121,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.618:19:3,5:3,6:7,0,11,1
chr7	5941209	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr7	5941354	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=149,141;MMQ=27,51;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:5,6:9,7:8,6,8,5
chr7	5941411	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=170,152;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,5:5,6:3,6,2,9
chr7	5942461	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,199;MMQ=58,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0,11,0,2
chr7	5944687	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,135;MMQ=45,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.409:42:17,8:8,9:23,2,13,4
chr7	5944913	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=213,244;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	5965214	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,159;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,30:0.492:61:18,12:13,18:21,10,22,8
chr7	5967738	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,182;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr7	5967801	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=149,167;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.691:24:2,9:5,7:6,1,16,1
chr7	5968053	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,147;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,11:4,1:1,5,0,12
chr7	5983195	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,1,16
chr7	5983678	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,185;MMQ=27,23;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:0,12,0,2
chr7	5984642	.	A	AAATTATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=253,178;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	6006739	.	T	TCTCTCTTATGGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	6022377	.	TT	AA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,175;MMQ=32,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:19,1:21,0:40,2,2,0
chr7	6029674	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=216,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6029674_T_C:6029674:0,2,0,1
chr7	6029681	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=216,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6029674_T_C:6029674:0,2,0,1
chr7	6031773	.	CCAG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	6037057	.	GAA	G,GA	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,17,16;MFRL=108,182,139;MMQ=60,60,60;MPOS=18,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=12.86,10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,11,17:0.324,0.522:33:3,1,1:0,0,2:3,2,4,24
chr7	6038722	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,6:0,0,18,5
chr7	6057469	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=114,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,2:11,1:17,7,1,2
chr7	6062926	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=189,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:2,0:4,1,1,0
chr7	6064495	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=176,199;MMQ=45,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:6064495_A_G:6064495:0,4,0,1
chr7	6064501	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=176,199;MMQ=45,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:6064495_A_G:6064495:0,4,0,1
chr7	6064508	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=176,199;MMQ=45,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:6064495_A_G:6064495:0,4,0,1
chr7	6066057	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0|1:6066057_G_GC:6066057:0,0,7,5
chr7	6066067	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=115,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.492:12:3,2:3,3:0|1:6066057_G_GC:6066057:3,3,2,4
chr7	6071277	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr7	6077163	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,2:3,0:1,5,1,1
chr7	6078376	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr7	6080853	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,3:0,2:0,0,4,8
chr7	6084310	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr7	6085880	.	AAA	TTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	6086951	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	6088339	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=79.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0|1:6088339_T_C:6088339:0,0,17,1
chr7	6088349	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,8:0,13:0|1:6088339_T_C:6088339:0,0,19,2
chr7	6088533	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=75.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,0,22
chr7	6094087	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=154,140;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.230:20:5,3:9,1:16,0,4,0
chr7	6094119	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,103;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:10,2:16,0:25,4,1,1
chr7	6155166	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:6,9:6,5:1,11,3,11
chr7	6185968	.	TAAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	6193362	.	GTGTT	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=153,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGTT;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.065:43:16,2:21,0:24,17,1,1
chr7	6199166	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:2,4,2,3
chr7	6414266	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	6452725	.	C	CTCTTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=132,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr7	6452737	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=185,62;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	6472628	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=203,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:6472628_G_T:6472628:0,3,0,1
chr7	6472631	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=203,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:6472628_G_T:6472628:0,3,0,1
chr7	6472634	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=203,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:6472628_G_T:6472628:0,3,0,1
chr7	6485740	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:5,2:0,3:1,7,0,6
chr7	6487293	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr7	6537655	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr7	6545619	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	6550494	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=89.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,16:0,10:0,0,14,13
chr7	6641635	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr7	6647738	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr7	6730699	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:17,2:17,0:15,19,2,0
chr7	6798624	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=194,136;MMQ=39,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.299:12:1,0:0,0:9,0,3,0
chr7	6845553	.	C	CA	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,142;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=74.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,35:0.542:64:13,22:15,13:28,1,26,9
chr7	7277807	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr7	7398457	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0,0,12,15
chr7	7400239	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	7415217	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr7	7421310	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr7	7472117	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=122,52;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,0:13,2:15,10,0,2
chr7	7480376	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr7	7491873	.	AG	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr7	7528951	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=113.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,22:0,9:0,0,29,2
chr7	7557297	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	7622696	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr7	7628256	.	A	AAGAGAAAAAGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7628256_A_AAGAGAAAAAGC:7628256:0,3,0,1
chr7	7628259	.	CT	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7628256_A_AAGAGAAAAAGC:7628256:0,3,0,1
chr7	7628275	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	7645535	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr7	7916817	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:7916817_A_G:7916817:1,0,2,0
chr7	7916824	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:7916817_A_G:7916817:2,0,3,0
chr7	7917269	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=221,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	8110475	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr7	8125964	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.501:32:8,9:7,7:5,11,4,12
chr7	8126242	.	AACTT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8126242_AACTT_A:8126242:0,0,0,1
chr7	8126248	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8126242_AACTT_A:8126242:0,0,0,1
chr7	8126252	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=223,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8126242_AACTT_A:8126242:0,1,0,1
chr7	8132252	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,6:4,4:5,3,7,3
chr7	8153521	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=123,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:0,0:4,2:3,2,2,0
chr7	8181555	.	C	CCA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=255,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.841:10:1,6:0,2:0,1,0,9
chr7	8196529	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,20:0,29:0,0,25,26
chr7	8196566	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.139:26:12,1:11,2:9,14,1,2
chr7	8196567	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=121,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.726:19:3,6:1,8:3,2,6,8
chr7	10973362	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:1,5,0,5
chr7	10977630	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:1,0:10,4:10,1,4,0
chr7	11021976	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:28,3:27,0:49,6,3,0
chr7	11030274	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr7	11062487	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.471:49:9,11:16,12:14,12,14,9
chr7	11076514	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,5:2,7:6,0,12,0
chr7	11078498	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.447:34:7,5:11,10:6,13,6,9
chr7	11078528	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,6:3,4:1,8,2,8
chr7	11080312	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,3:0.047:82:38,2:38,1:53,26,3,0
chr7	11091200	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,3:3,6:8,1,9,0
chr7	11101394	.	G	GT	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=52.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,39:0.473:82:23,9:16,21:37,6,32,7
chr7	11151137	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,5:3,4:0,5,1,8
chr7	11208989	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:5,3:11,5:12,4,8,0
chr7	11209141	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.479:46:10,9:14,13:3,21,7,15
chr7	11418670	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:4,9:7,4:8,3,12,1
chr7	11418931	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,6:3,5:0,8,4,7
chr7	11419378	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr7	11441358	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	11441562	.	C	CCCCGG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=134,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:11441562_C_CCCCGG:11441562:11,8,0,2
chr7	11441563	.	T	TGTATGATGTTCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=134,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:11441562_C_CCCCGG:11441562:11,8,0,2
chr7	11446843	.	A	ATTACTTAAATTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=182,299;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11446843_A_ATTACTTAAATTT:11446843:2,0,0,1
chr7	11446845	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=182,299;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11446843_A_ATTACTTAAATTT:11446843:2,0,0,1
chr7	11446849	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=182,299;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11446843_A_ATTACTTAAATTT:11446843:2,0,0,1
chr7	11447138	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11447138_G_A:11447138:0,1,0,1
chr7	11447144	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11447138_G_A:11447138:0,0,0,1
chr7	11452204	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr7	11464297	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=79,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:2,1:2,2:3,2,3,1
chr7	11509561	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,1:7,7:8,8,5,3
chr7	11630194	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:6,13,1,1
chr7	11676107	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,2:2,3:5,0,3,2
chr7	12255335	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,3:0.044:81:41,2:35,1:0,78,0,3
chr7	12263799	.	TG	CA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=137.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,23:0,6:0,0,30,1
chr7	12269213	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=97.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,30:0.596:50:8,15:12,15:19,1,30,0
chr7	12269260	.	A	ATGTT	.	.	DP=101;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=290.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,96:0.990:96:0,44:0,50:0,0,71,25
chr7	12270565	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr7	12270583	.	CTTA	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:4,0,8,0
chr7	12270625	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,6:0,0,14,3
chr7	12270770	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=131.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,19:0,19:0,0,13,26
chr7	12270780	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,0:14,2:9,19,0,2
chr7	12270815	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,1,13
chr7	12271452	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=155.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,20:0,29:0,0,36,13
chr7	12271666	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=131,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr7	12271685	.	CCTTAA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:12271685_CCTTAA_C:12271685:0,3,0,1
chr7	12271692	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12271685_CCTTAA_C:12271685:0,2,0,1
chr7	12370702	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr7	12372999	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,5,0
chr7	12373082	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:9,9:10,9:14,5,15,3
chr7	12382637	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:3,0,8,0
chr7	12383967	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:12,5:13,13:14,11,7,11
chr7	12391268	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=113,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.373:22:8,7:6,1:7,7,3,5
chr7	12397075	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:12,3:12,0:13,11,3,0
chr7	12399190	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.572:40:4,7:13,16:15,2,22,1
chr7	12400783	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:8,10:3,6:11,0,13,4
chr7	12400837	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:10,10:8,6:11,7,7,9
chr7	12401021	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:4,3:9,7:6,7,7,3
chr7	12407167	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:0,11,0,7
chr7	12409263	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:9,10:7,10:11,5,9,11
chr7	12409327	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.432:28:9,3:7,9:8,8,5,7
chr7	12409522	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.386:37:7,7:15,7:11,12,11,3
chr7	12409535	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.429:35:7,6:13,8:11,9,9,6
chr7	12410362	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.396:46:15,12:13,6:17,11,8,10
chr7	12414620	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:6,4:5,4:10,1,7,2
chr7	12414725	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.376:27:8,4:8,5:5,12,5,5
chr7	12417362	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr7	12419039	.	TCA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=213,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,3,0
chr7	12420092	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:6,2,2,1
chr7	12433195	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:9,3,5,0
chr7	12433347	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,4:6,1:4,6,2,3
chr7	12443390	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:1,2:2,2:3,0,5,0
chr7	12443542	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,5:3,4:2,4,2,7
chr7	12443621	.	G	GTAGAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12443621_G_GTAGAGT:12443621:0,1,0,1
chr7	12443622	.	C	CTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12443621_G_GTAGAGT:12443621:0,1,0,1
chr7	12617854	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,4:2,5:3,7,4,5
chr7	12644334	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr7	12644348	.	G	GGTGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=GT;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr7	12644363	.	G	GTGTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	12644366	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	12684340	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr7	12684419	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=173,194;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:12684419_T_G:12684419:0,3,0,1
chr7	12684423	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=207,194;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:12684419_T_G:12684419:0,2,0,1
chr7	12727826	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=173,168;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,9:3,3:9,1,12,0
chr7	12729771	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=136,70;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.067:58:33,3:22,0:33,22,2,1
chr7	12729925	.	GT	G,TT,GTT	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=14,29,31,34;MFRL=135,142,66,221;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,12,16;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=18.83,12.39,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,11,7,3:0.331,0.134,0.133:32:2,4,2,1:3,2,5,1:3,8,11,10
chr7	12730250	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.340:7:2,1:1,1:2,3,0,2
chr7	12730281	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:3,2:2,4,1,2
chr7	13978645	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:13978645_C_T:13978645:0,0,5,0
chr7	13978648	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,2:0|1:13978645_C_T:13978645:0,0,5,0
chr7	14028245	.	GA	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:9,1:21,2:27,15,2,1
chr7	14622870	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr7	14737622	.	AAAAG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=217,141;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAAG;STR;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,3:0,6:1,0,7,2
chr7	14775821	.	TG	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,15:0.353:43:12,4:12,11:0|1:14775821_TG_T:14775821:5,23,4,11
chr7	14775823	.	G	GA	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:33,4:0.128:37:14,1:18,2:1|0:14775821_TG_T:14775821:6,27,0,4
chr7	14775824	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,15:0.353:43:13,4:13,11:0|1:14775821_TG_T:14775821:5,23,4,11
chr7	14793478	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.706:21:1,9:4,6:5,1,15,0
chr7	14797180	.	T	TAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.731:15:3,5:1,6:4,0,11,0
chr7	15346196	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:1,5:1,1:0,2,1,6
chr7	15725797	.	ATGGTGG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TGG;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,0:1,1:3,0,1,0
chr7	15726066	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:0,5,0,6
chr7	16131260	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr7	16255602	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr7	16317866	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:16317866_A_G:16317866:0,3,0,1
chr7	16317869	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:16317866_A_G:16317866:0,3,0,1
chr7	16317872	.	TTTTAAGTTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:16317866_A_G:16317866:0,3,0,1
chr7	16317877	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:16317866_A_G:16317866:0,1,0,1
chr7	16317897	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,0:0,1:1|0:16317866_A_G:16317866:0,0,0,1
chr7	16348059	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr7	16348091	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=162,77;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:3,1,5,1
chr7	16572051	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,7:1,1:2,0,8,0
chr7	16572376	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.899:7:0,3:0,4:0|1:16572376_TA_T:16572376:0,0,0,7
chr7	16572399	.	CA	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=155,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:16572376_TA_T:16572376:0,4,0,1
chr7	16572402	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=155,208;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:16572376_TA_T:16572376:0,4,0,1
chr7	16577376	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=227.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.987:69:0,39:0,30:0,0,10,59
chr7	16598655	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:9,5:4,9:3,11,1,13
chr7	16607177	.	TA	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.220:28:11,0:6,3:4,18,0,6
chr7	16640300	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	16640358	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr7	16650427	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr7	16676082	.	T	TA	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=18,9;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.271:37:5,1:8,2:5,22,2,8
chr7	16684247	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	16705132	.	TTG	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=14,29;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.167:21:3,0:4,3:2,16,0,3
chr7	16722392	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.187:24:8,3:11,1:12,8,4,0
chr7	16736479	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	16745589	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr7	16793504	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:1,1:4,1,3,0
chr7	16815786	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,22,2
chr7	16816000	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,19:0,24:0,0,5,38
chr7	16818799	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,1,11
chr7	16834444	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr7	16837404	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	16839501	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	16899342	.	C	CTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:16899342_C_CTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTGAT:16899342:0,0,0,1
chr7	16899344	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:16899342_C_CTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTGAT:16899342:0,0,0,1
chr7	16901185	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	16901523	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=167,158;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr7	16913520	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	17373771	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:0,5,1,4
chr7	17379703	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:17,0:18,3:10,25,0,3
chr7	17854532	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=129,110;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,3:4,2:2,4,2,4
chr7	17854574	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=127,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.307:7:4,0:1,0:2,3,0,2
chr7	17854575	.	GA	AA,GAAA,TT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=17,33,35,34;MFRL=188,182,124,75;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,25,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.77,3.52,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,1,1:0.267,0.294,0.167:5:0,1,1,1:0,1,0,0:0,1,1,3
chr7	17854616	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	17874300	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,5:5,1:7,0,6,0
chr7	17879484	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.519:44:9,10:12,12:12,9,12,11
chr7	17890413	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:6,0,5,1
chr7	17908130	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.527:34:11,6:5,12:0,16,3,15
chr7	17913083	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	17933065	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=151,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:13,2:0|1:17933065_G_A:17933065:1,20,1,1
chr7	17933071	.	TTTAATCA	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:0|1:17933065_G_A:17933065:0,20,1,1
chr7	17933081	.	A	ATT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=167,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:13,2:0|1:17933065_G_A:17933065:0,18,1,1
chr7	17933082	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=167,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,0:12,2:0|1:17933065_G_A:17933065:0,18,1,1
chr7	17933086	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=170,60;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:12,1:0|1:17933065_G_A:17933065:0,15,1,1
chr7	17979793	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr7	18067479	.	ACT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr7	18630208	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=132,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr7	18631098	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30,31;MFRL=129,175,159;MMQ=60,60,40;MPOS=32,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=TG;STR;TLOD=4.18,7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.249,0.377:8:2,0,1:1,2,2:3,0,5,0
chr7	18674435	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:0,7,0,5
chr7	18688033	.	ATG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.484:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr7	18914251	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr7	19184748	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:19184748_C_T:19184748:1,1,0,1
chr7	19184753	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:19184748_C_T:19184748:0,1,0,1
chr7	19738359	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr7	19739947	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr7	19761868	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr7	19813338	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	20180717	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:4,5,1,3
chr7	20199888	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr7	20371395	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr7	20403353	.	AT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=75.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.947:34:0,12:1,20:0,1,5,28
chr7	20406542	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,5:3,3:4,0,8,0
chr7	20418926	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,7:4,4:1,10,4,7
chr7	20430960	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,21,0
chr7	20441450	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:7,0:14,3:14,8,0,3
chr7	20444532	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chr7	20668236	.	T	TTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:5,1:2,2:7,0,3,0
chr7	20687075	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:10,1,2,0
chr7	20698213	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=122,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,2:8,0:11,10,1,1
chr7	20698799	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:20698799_T_A:20698799:0,3,0,1
chr7	20698801	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:20698799_T_A:20698799:0,3,0,1
chr7	20739774	.	AT	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.583:43:8,15:9,10:4,14,1,24
chr7	20768174	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,143;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr7	20778646	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,10,14
chr7	20778773	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr7	20782474	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr7	20802789	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:1,1:4,2:6,0,3,0
chr7	20802924	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:7,16,0,2
chr7	20803003	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:1,3,2,0
chr7	20825263	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr7	20825462	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=39,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:3,1,0,1
chr7	21468222	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=205,246;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr7	21468869	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=C;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	21584820	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr7	21599233	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.353:35:10,5:12,7:15,8,8,4
chr7	21603750	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.416:8:1,1:3,2:3,2,3,0
chr7	21609623	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr7	21645945	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=161,144;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr7	21658855	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,2:7,7:4,9,3,6
chr7	21695649	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr7	21723573	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=101,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:7,1:2,5:4,6,3,3
chr7	21727186	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:3,2:4,9:0,8,1,10
chr7	21765636	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr7	21775210	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr7	21779104	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	21779331	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,4:4,3:1,8,1,6
chr7	21781807	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,1:2,7:0,4,1,7
chr7	21789442	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr7	21805215	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr7	21818486	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr7	21824244	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	21826199	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,14,2
chr7	21847457	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr7	21856390	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr7	21858043	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	21892321	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr7	21907696	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,65302601;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	21908690	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	21923867	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,1:0,0,6,1
chr7	21932317	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	21940557	.	AACTT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTT;STR;TLOD=55.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr7	21941861	.	ATCTT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:10,5:11,6:18,4,7,4
chr7	21945086	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	21945840	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=95,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:3,2,4,3
chr7	21985347	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=184.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,28:0,28:0,0,32,25
chr7	22186700	.	G	GTCTTGAATGCCTGAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,319;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	22197422	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,183;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:8,1,2,0
chr7	22202134	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:1,10,0,2
chr7	22206774	.	GA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:6,1:2,2:7,23,0,3
chr7	22330862	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=10,22;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,1:0,0:0,4,1,1
chr7	22349761	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr7	22355069	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr7	22357488	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr7	22357716	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr7	22357746	.	G	GTAAGATCTGGGATGGCTTCCCTTGGAGGTATCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,190;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	22532321	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,126;MMQ=39,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.598:23:3,4:6,9:2,7,4,10
chr7	22533518	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=232,198;MMQ=40,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr7	22852643	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,5:3,1:10,0,6,0
chr7	22857504	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=197,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:8,4:2,6:10,1,10,0
chr7	22857589	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=104.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,36:0.513:70:20,18:14,17:28,6,21,15
chr7	22862467	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:4,2:1,2:0,7,0,4
chr7	22986925	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=205,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:0,8,0,3
chr7	23000783	.	G	GCTCT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=CT;STR;TLOD=42.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:5,5:5,5:10,0,11,0
chr7	23180292	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	23183701	.	T	TACTGAGTCTAATCCATTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=232,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	23191846	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,0:10,3:0|1:23191846_T_C:23191846:4,16,1,2
chr7	23191852	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:23191846_T_C:23191846:3,16,1,1
chr7	23191856	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:23191846_T_C:23191846:2,17,1,1
chr7	23195555	.	CTTTAT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,8:0,16:0,0,16,9
chr7	23226660	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=154,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.130:25:6,1:8,0:12,10,2,1
chr7	23227632	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.171:31:14,2:8,3:24,2,5,0
chr7	23352512	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,12:0,16:0,0,3,26
chr7	23385730	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr7	23545119	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=30,31,33,31;MFRL=105,135,134,125;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,29,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=20,18,19,21;RU=A;STR;TLOD=5.17,10.14,10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:21,6,10,12:0.118,0.215,0.249:49:10,4,6,6:6,1,2,5:13,8,19,9
chr7	23561363	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=146,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.057:50:20,0:26,2:24,24,0,2
chr7	23719766	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.598:18:3,3:4,7:7,0,10,1
chr7	23719779	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.642:29:4,8:6,9:10,0,19,0
chr7	23724364	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	23737795	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.407:52:17,11:14,10:24,7,18,3
chr7	23741876	.	CT	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.224:38:16,5:12,3:1,29,0,8
chr7	23794029	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.614:42:8,14:8,12:10,6,15,11
chr7	23794139	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=87.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,1,23
chr7	23802579	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,3:6,2:1,5,0,5
chr7	23810605	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,9,4
chr7	23823355	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	23826066	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	23854717	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr7	23854838	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=72.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,11,11
chr7	23872024	.	C	CTTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	24324808	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	24663820	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr7	24718710	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr7	24719050	.	C	CTCTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24719050_C_CTCTGT:24719050:0,1,0,1
chr7	24719051	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24719050_C_CTCTGT:24719050:0,1,0,1
chr7	24720103	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:13,0:17,3:13,17,0,3
chr7	24746026	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=105,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:4,5,1,3
chr7	24747910	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:1,2,0,3
chr7	24756913	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:10,1,0,2
chr7	24758565	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	24758645	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:1,0,2,1
chr7	24784403	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0|1:24784403_C_T:24784403:0,0,1,3
chr7	24784404	.	G	GGTCACCTGGGGCTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,19;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.492:4:2,1:0,0:0|1:24784403_C_T:24784403:0,2,1,1
chr7	24784406	.	T	TGTGAGCCTCAGGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:24784403_C_T:24784403:0,2,1,1
chr7	24789082	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=231,156;MMQ=58,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr7	24844080	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,6:5,3:1,6,0,9
chr7	24859962	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:1,6:6,4:0,7,0,10
chr7	24870576	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,3:0,1,0,4
chr7	24873911	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=104,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.442:43:13,10:11,7:13,11,9,10
chr7	24880473	.	C	CAAAAAGCTTGCCAATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	24888620	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,3:0,7:1,0,7,3
chr7	24901470	.	G	GAATGGAAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=64,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr7	24911526	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:4,3:9,6:4,9,6,3
chr7	25175745	.	T	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,84;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.082:59:30,4:21,0:30,25,4,0
chr7	25194618	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,1:3,4:5,5,3,2
chr7	25194857	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,1:7,11:0,13,1,11
chr7	25197987	.	CAAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,199;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	25264847	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:0,7,2,4
chr7	25266569	.	TTAA	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAA;STR;TLOD=99.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.635:39:6,11:7,14:9,5,11,14
chr7	25268094	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,3:4,7:0,10,0,10
chr7	25989520	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr7	26223294	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:6,8:6,5:9,3,12,2
chr7	26247984	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.329:28:9,1:10,7:18,1,9,0
chr7	26251417	.	CT	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.141:40:17,1:18,4:4,31,1,4
chr7	26251843	.	C	T	.	.	DP=161;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,140;MMQ=60,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=180.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,67:0.450:149:29,31:53,36:19,63,25,42
chr7	26386122	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,2,12
chr7	26386154	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	26400526	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:26400526_T_G:26400526:4,0,1,0
chr7	26400529	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:26400526_T_G:26400526:4,0,1,0
chr7	26576535	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,14,18
chr7	26724279	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,6:3,5:8,0,10,1
chr7	27135314	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,7:0,5:0,0,10,4
chr7	27141055	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	27147451	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=258,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	27169280	.	G	GGCTGCCCAGGATGATGCTCGAGAAGTAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,13;MFRL=221,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr7	27170145	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	27186984	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.249:24:9,2:9,2:13,5,4,2
chr7	27203139	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr7	27222409	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.554:23:5,8:5,3:5,5,8,5
chr7	27224823	.	T	TTAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=226,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27224823_T_TTAC:27224823:0,1,0,1
chr7	27224824	.	G	GTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=226,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27224823_T_TTAC:27224823:0,1,0,1
chr7	27224826	.	C	CAAATTTCTACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=226,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27224823_T_TTAC:27224823:0,1,0,1
chr7	27238691	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	27566053	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr7	27582783	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	27669192	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=203,223;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	27671899	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,8,1
chr7	27687447	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:2,0:0,7,0,2
chr7	27689258	.	TTCAATACATTATTTTCAATAGGGGCAAATAACATTTTTTATTGTAAACATTCATTTAATATTAGCAAG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.139:25:6,0:5,4:3,16,2,4
chr7	27886011	.	C	CATATACGTATACGTGTAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,4:0,0,8,0
chr7	28534501	.	C	CT	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=79,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=108.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,46:0.948:49:0,18:3,27:1,2,33,13
chr7	28997497	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr7	28997560	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=213,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:28997560_TG_CA:28997560:2,0,0,1
chr7	28997565	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=213,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:28997560_TG_CA:28997560:2,0,0,1
chr7	28997566	.	C	CATTACTTTAACTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=213,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:28997560_TG_CA:28997560:2,0,0,1
chr7	28997596	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	29103867	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:29103867_T_C:29103867:0,0,0,6
chr7	29103877	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:29103867_T_C:29103867:0,0,0,4
chr7	29105776	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,2:0,0,0,9
chr7	29111578	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	29111620	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	29132212	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr7	29135921	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29135921_T_TA:29135921:1,0,0,1
chr7	29135922	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29135921_T_TA:29135921:1,0,0,1
chr7	29135924	.	GT	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29135921_T_TA:29135921:1,0,0,1
chr7	29160434	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	29394220	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	29438109	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:0,5,0,3
chr7	29440502	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=221,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	29520042	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr7	29546763	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr7	29606597	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,5:0,0,6,7
chr7	29606896	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=192,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,0,4
chr7	29606976	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr7	29915593	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:10,1:9,7:5,14,1,7
chr7	29923977	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.818:3:0,0:0,2:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,0,3,0
chr7	29923981	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:0,2:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,1,3,0
chr7	29923986	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,23;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,1:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,2,3,0
chr7	29923989	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,22;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:0,1:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,4,2,0
chr7	29923995	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,5,2,0
chr7	29923997	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,11;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,5,2,0
chr7	29976385	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=187,151;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:29976385_G_A:29976385:0,3,0,1
chr7	29976391	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=191,185;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:29976385_G_A:29976385:0,4,0,2
chr7	30054574	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr7	30113604	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.410:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr7	30329453	.	CTGT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=144,98;MMQ=50,42;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGT;STR;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:11,3:12,1:9,15,1,3
chr7	30485703	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:2,1:0|1:30485703_G_GC:30485703:8,4,1,1
chr7	30485710	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,1:1,1:0|1:30485703_G_GC:30485703:9,4,1,1
chr7	30485741	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=91,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.404:30:13,6:4,5:15,3,8,4
chr7	30485949	.	C	CCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	30538373	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,2:7,1:15,0,3,0
chr7	30540172	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=124,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:25,3:18,1:24,19,2,2
chr7	30544360	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,5:6,2:1,9,1,6
chr7	30651938	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr7	30655489	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:10,11:9,11:15,4,15,7
chr7	30662148	.	TGAGA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:30662148_TGAGA_T:30662148:0,3,0,1
chr7	30662153	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:30662148_TGAGA_T:30662148:0,2,0,1
chr7	30662155	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,34;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:30662148_TGAGA_T:30662148:0,2,0,1
chr7	30673512	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=15,16;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:0,1:0,0:0,3,0,3
chr7	30701835	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:11,3:25,2:22,15,3,2
chr7	30701914	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,2:5,9:1,7,1,10
chr7	30728908	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=115,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:2,4:4,3:2,6,2,5
chr7	30739525	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.529:9:3,2:1,1:4,0,5,0
chr7	30805849	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	30805913	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:4,4:0,3:1,3,4,4
chr7	30817998	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=201,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:6,1,4,0
chr7	30830976	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,0:2,5,0,2
chr7	30876432	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr7	30922001	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:30922001_A_T:30922001:0,3,0,1
chr7	30922002	.	C	CAGGTGCTGTGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:30922001_A_T:30922001:0,3,0,1
chr7	30951936	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30951936_G_A:30951936:0,0,0,1
chr7	30951938	.	G	GACAACCTGTTGATTGCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30951936_G_A:30951936:0,0,0,1
chr7	30962213	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=130,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,1:12,3:9,14,1,3
chr7	31011485	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	31018852	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:0,4,1,3
chr7	31117755	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0|1:31117755_T_A:31117755:0,2,1,1
chr7	31117763	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31117755_T_A:31117755:0,2,0,1
chr7	31117765	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31117755_T_A:31117755:0,2,0,1
chr7	31117767	.	TC	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:31117755_T_A:31117755:0,2,0,1
chr7	31120353	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,26;MFRL=240,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr7	31124425	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:13,3:8,0:9,12,3,0
chr7	31125082	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	31132325	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:2,5,0,2
chr7	31135471	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	31378933	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,0:1,4:1,2,0,4
chr7	31592715	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:31592715_G_T:31592715:3,2,2,0
chr7	31592733	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0|1:31592715_G_T:31592715:0,0,4,3
chr7	31594160	.	GCCTTACA	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:13,1:9,2:0|1:31594160_GCCTTACA_G:31594160:3,20,0,3
chr7	31594166	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,21:0.959:21:0,12:0,9:1|0:31594160_GCCTTACA_G:31594160:0,0,3,18
chr7	31594171	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,0:8,2:0|1:31594160_GCCTTACA_G:31594160:2,17,0,3
chr7	31594173	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,1:0|1:31594160_GCCTTACA_G:31594160:2,14,0,2
chr7	31594258	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr7	31681765	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=114.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,15:0,19:0,0,23,12
chr7	31683610	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr7	31683625	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	31691697	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=174.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,22:0,25:0,0,5,44
chr7	31692441	.	T	TTAGTTGCACGTTATAAACTAATAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:4,9,1,1
chr7	31735263	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,2,12
chr7	31735297	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:31735297_T_G:31735297:0,2,0,3
chr7	31735300	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:31735297_T_G:31735297:0,2,0,3
chr7	31735307	.	T	TACAAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=169,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31735307_T_TACAAA:31735307:0,3,0,1
chr7	31735309	.	T	TCAC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=169,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31735307_T_TACAAA:31735307:0,3,0,1
chr7	31735310	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=169,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:31735307_T_TACAAA:31735307:0,3,0,1
chr7	31793261	.	T	TTCTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31793261_T_TTCTTA:31793261:0,1,0,1
chr7	31793265	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31793261_T_TTCTTA:31793261:0,1,0,1
chr7	31862878	.	A	ATCATAACAGTCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,15;MFRL=230,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0,3,0,1
chr7	31876766	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:7,1,4,0
chr7	32527009	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,7:3,0:0,10,1,6
chr7	32528366	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.636:14:4,6:0,3:0,5,0,9
chr7	32593234	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:6,5:0,2:7,0,8,0
chr7	32598524	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.585:15:2,5:3,3:3,3,7,2
chr7	32609565	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr7	32609782	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:20,2:10,0:10,20,1,1
chr7	32613119	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=155,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr7	32615553	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,2:1,5:5,0,6,1
chr7	32772520	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,182;MMQ=46,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr7	32908945	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:4,0,5,2
chr7	32914507	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=253,176;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32914507_T_C:32914507:2,0,1,0
chr7	32914510	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=253,176;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32914507_T_C:32914507:2,0,1,0
chr7	32997461	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32997461_GG_TT:32997461:0,1,0,1
chr7	32997463	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32997461_GG_TT:32997461:0,1,0,1
chr7	32997467	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32997461_GG_TT:32997461:0,1,0,1
chr7	32997471	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32997461_GG_TT:32997461:0,1,0,1
chr7	33014404	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,192;MMQ=52,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:0,5,0,5
chr7	33016120	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr7	33059407	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	33102462	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	33134883	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,172;MMQ=27,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,44:0.834:52:4,29:4,15:0,8,10,34
chr7	33136983	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr7	33138875	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,14,4
chr7	33139147	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	33186065	.	TT	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr7	33192502	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr7	33217071	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	33388618	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	33392380	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	33979638	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=187,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr7	33979664	.	T	TTATA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=174,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=TA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:33979664_T_TTATA:33979664:0,4,0,1
chr7	33979668	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=174,259;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:33979664_T_TTATA:33979664:0,4,0,1
chr7	34101562	.	G	GTTTT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,36;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,19;RU=T;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	34101587	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,0:0|1:34101587_C_A:34101587:4,3,2,0
chr7	34101591	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,0:0|1:34101587_C_A:34101587:4,3,2,0
chr7	34101593	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,0:0|1:34101587_C_A:34101587:4,3,2,0
chr7	34101597	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,16;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,0:0|1:34101587_C_A:34101587:3,4,2,0
chr7	34125622	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=102,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:5,6:7,11:4,8,8,9
chr7	34698210	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:10,1:3,4:3,10,0,6
chr7	34698234	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:1,5,0,6
chr7	34698251	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr7	34874047	.	C	CAT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=105,143;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,1:12,0:6,19,2,0
chr7	34874050	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=97,143;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:5,19,2,0
chr7	34981591	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=196,211;MMQ=57,59;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:1,3,0,4
chr7	34989337	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr7	34989364	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:6,3:5,2:10,1,6,0
chr7	34995075	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:9,4:9,4:0,18,0,8
chr7	35009183	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,146;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.480:44:11,10:11,11:3,20,2,19
chr7	35013220	.	GA	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.096:49:22,1:20,3:12,33,1,3
chr7	35050217	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,153;MMQ=27,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=119.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,38:0.661:57:10,23:8,15:0|1:35050217_A_G:35050217:0,19,4,34
chr7	35050227	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=153,141;MMQ=51,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:33,15:0.319:48:18,6:14,9:1|0:35050217_A_G:35050217:2,31,0,15
chr7	35058177	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,29:0.544:53:10,10:14,18:15,9,13,16
chr7	35241962	.	A	AGGGGGGGGGGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35241962_A_AGGGGGGGGGGC:35241962:0,0,1,0
chr7	35241963	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:35241962_A_AGGGGGGGGGGC:35241962:0,0,1,0
chr7	35241967	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,130;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.717:2:0,0:0,1:0|1:35241962_A_AGGGGGGGGGGC:35241962:0,0,2,0
chr7	35280693	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,5:4,5:0,10,0,10
chr7	35288213	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=92,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	35288276	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:4,1,3,4
chr7	35289889	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr7	35709772	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:2,1,7,0
chr7	35840898	.	G	GC	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=189.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,22:0,30:0,0,26,28
chr7	35930260	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:2,0,6,0
chr7	36324436	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,2:2,4:0,6,1,5
chr7	36338564	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,0:0,4:0|1:36338564_G_A:36338564:0,0,7,0
chr7	36338589	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0|1:36338564_G_A:36338564:0,0,11,0
chr7	36338841	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr7	36366569	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr7	36370499	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr7	36370555	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,9:0,0,15,5
chr7	36373428	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:7,2:11,4,2,0
chr7	36373854	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36373854_T_TGA:36373854:0,1,0,1
chr7	36373855	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36373854_T_TGA:36373854:0,1,0,1
chr7	36397244	.	C	CTTGAGTTCACATCTCAGCTTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=208,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr7	36447349	.	A	ACTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=120.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,15:0,0,14,15
chr7	36447600	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr7	36455556	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:0,5,0,6
chr7	36456603	.	G	GA	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.165:40:18,4:14,2:33,1,6,0
chr7	36456613	.	AC	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.155:40:19,3:15,3:34,0,5,1
chr7	36456614	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=15,33;MFRL=245,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=88.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.978:46:0,25:0,20:0,1,44,1
chr7	36456870	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:6,4:7,8:0,13,0,12
chr7	36458828	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=100.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,17:0,0,22,9
chr7	36460419	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr7	36461442	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.529:34:6,4:10,14:14,2,17,1
chr7	36462205	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=57.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,14,3
chr7	36463335	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	36465192	.	TGC	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=133.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,13:0,15:0,0,30,0
chr7	36465570	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=266.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,37:0,31:0,0,53,22
chr7	36465606	.	CTT	C,CT	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=33,33,33;MFRL=153,154,163;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=9.63,27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,8,19:0.152,0.384:51:9,5,5:13,3,11:10,14,12,15
chr7	36466655	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,15:0.467:32:7,8:9,6:0|1:36466655_C_A:36466655:5,12,4,11
chr7	36466669	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=72,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=100.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,27:0.944:28:1,13:0,12:0|1:36466655_C_A:36466655:1,0,6,21
chr7	36489477	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=135,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:4,2:2,2:0,7,0,4
chr7	36492045	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr7	36492212	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,9:8,4:0,12,1,12
chr7	36552790	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr7	36660351	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.070:54:25,3:26,0:35,16,2,1
chr7	36660502	.	CATGA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=163,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ATGA;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:5,0:8,1:0,14,0,2
chr7	36661423	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,3,15
chr7	36698684	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	36713484	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:12,4,3,0
chr7	36726476	.	CGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=GT;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	36934448	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr7	37272857	.	A	AGAAGTTATTAGACAGGGCAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.480:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	37355590	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr7	37780799	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:10,8:11,3:14,7,6,5
chr7	37890292	.	A	AC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:12,2:10,0:13,9,1,1
chr7	37901581	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,13:0,0,23,6
chr7	37902902	.	TATAAATATTTACTAG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:2,1,1,0
chr7	37903853	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,12,1
chr7	37903904	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=96.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,20:0,7:0,0,27,1
chr7	37904065	.	TAAC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,0,17
chr7	37904099	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr7	37923849	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr7	37924737	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,15,3
chr7	37924879	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,2,11
chr7	37927779	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	37933983	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr7	37934234	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=113.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,19:0,14:0,0,7,27
chr7	37936384	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	37936765	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=232,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37936765_CT_C:37936765:0,1,0,1
chr7	37936768	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=232,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37936765_CT_C:37936765:0,1,0,1
chr7	37947164	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,33:0.606:54:9,18:12,13:8,13,17,16
chr7	37960262	.	AAGGCAGTGGCAGC	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGCAGTGGCAGC;STR;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:1,5:2,4:4,3,7,2
chr7	37989775	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr7	38253923	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,4:2,4:8,2,7,1
chr7	38259354	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr7	38301741	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,2:4,6:11,1,6,2
chr7	38304926	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,153;MMQ=33,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,5:0,1:2,1,6,0
chr7	38305212	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,211;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:1,5,0,3
chr7	38471937	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr7	38500782	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	38501065	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,0,15
chr7	38505014	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,6:0,0,13,1
chr7	38505025	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,18,2
chr7	38505712	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,13,6
chr7	38530568	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr7	38530807	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	38543371	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	38574457	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	38766611	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,2:2,6:2,4,2,6
chr7	38781018	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=130.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,23:0,18:0,0,3,38
chr7	38782905	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	38782951	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,12,0
chr7	38785062	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr7	38813711	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr7	38829482	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:9,6:5,10:1,13,7,9
chr7	38908876	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,9:0,0,4,9
chr7	39125413	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr7	39243750	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=54,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	39247178	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:7,10,1,1
chr7	39379386	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=19,12;MFRL=139,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:1,0:0,0:0|1:39379386_G_C:39379386:2,0,3,0
chr7	39379396	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=16,21;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:0,0:0|1:39379386_G_C:39379386:3,0,2,0
chr7	39379401	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=22,25;MFRL=97,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:0,2:0|1:39379401_A_C:39379401:3,0,3,0
chr7	39379405	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=49,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,1:2,1:0|1:39379386_G_C:39379386:6,0,2,0
chr7	39379416	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=96,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,1:0|1:39379401_A_C:39379401:7,0,2,0
chr7	39379698	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CA;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0,2,1,1
chr7	39472669	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,3:3,1:6,1,4,1
chr7	39472846	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:10,11:3,5:3,10,5,11
chr7	39500352	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=138,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr7	39500374	.	C	CCCGGACTCCGACTCGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr7	39610177	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.656:28:7,4:2,9:4,5,6,13
chr7	39610241	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:0,6,1,5
chr7	39611819	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,2:1,7:5,0,6,3
chr7	40027190	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,8:0.191:45:17,4:20,4:27,10,7,1
chr7	40087320	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:0,2:6,1:6,0,3,0
chr7	40220507	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,0:2,5:7,1,4,1
chr7	40228034	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=158,186;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:4,1:11,3:14,3,4,0
chr7	40228055	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=36,15;MFRL=111,159;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.377:44:8,2:11,6:1,26,17,0
chr7	40229072	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:4,1,6,2
chr7	40234742	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=188,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,1:3,3:1,4,0,5
chr7	40356315	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:6,1,7,0
chr7	42064852	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr7	42088222	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=205.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,30:0,23:0,0,23,33
chr7	42088232	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.534:54:13,16:12,12:7,18,14,15
chr7	42262935	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=283,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.726:5:1,2:0,0:1,0,0,4
chr7	42957465	.	ATT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,14:0,0,0,19
chr7	42974827	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr7	42977195	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr7	42977243	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	43400656	.	CGTGT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=GT;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:2,2:2,0:0,4,0,3
chr7	43485248	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	43519248	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,70;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:20,0:18,3:21,18,1,2
chr7	43547694	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:11,2:15,2:8,18,1,3
chr7	43591955	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:4,8,2,5
chr7	43659182	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,7:3,5:5,1,8,4
chr7	43664477	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,4:0,2:0,3,0,6
chr7	43684803	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=161,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr7	43687296	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.763:15:2,8:1,3:0,3,0,12
chr7	43810695	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:6,11:7,5:8,5,11,5
chr7	43827414	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,259;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,2:1,1:5,0,4,0
chr7	43843403	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:6,0:9,2:4,11,0,2
chr7	43908853	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43908853_G_GC:43908853:0,0,1,0
chr7	43908860	.	GCC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43908853_G_GC:43908853:0,0,1,0
chr7	43908866	.	C	CGGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,10;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43908853_G_GC:43908853:0,0,1,0
chr7	43918953	.	A	AAATCTGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43918953_A_AAATCTGGG:43918953:0,0,0,1
chr7	43918955	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43918953_A_AAATCTGGG:43918953:0,0,0,1
chr7	43918958	.	G	GCACATAATGTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43918953_A_AAATCTGGG:43918953:0,0,0,1
chr7	43921261	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,5:8,3:7,7,4,4
chr7	43982341	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:7,5:11,4:13,5,6,3
chr7	44044907	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr7	44046844	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,177;MMQ=48,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,4:4,3:4,0,6,1
chr7	44047066	.	T	C	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=184,154;MMQ=44,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,69:0.971:71:0,16:1,25:1,1,30,39
chr7	44047211	.	G	GCAATAGCATTATGGGCA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=159,120;MMQ=24,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.317:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	44047219	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=186,130;MMQ=23,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:44047219_G_A:44047219:1,1,0,1
chr7	44047220	.	A	ACTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=186,130;MMQ=23,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:44047219_G_A:44047219:1,1,0,1
chr7	44084292	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr7	44092612	.	CG	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:44092612_CG_GA:44092612:0,1,0,1
chr7	44092615	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:44092612_CG_GA:44092612:0,1,0,1
chr7	44097696	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,12:0,0,22,6
chr7	44146968	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	44147567	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,8,5
chr7	44147583	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,10;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.344:9:1,0:5,0:1,5,3,0
chr7	44147586	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=181,136;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,0:5,0:0|1:44147586_T_A:44147586:3,7,2,0
chr7	44147590	.	C	CCG	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=177,136;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,2:0|1:44147586_T_A:44147586:4,7,2,0
chr7	44147591	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,13;MFRL=177,136;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:6,0:0|1:44147586_T_A:44147586:4,7,2,0
chr7	44147596	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=175,136;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,1:0|1:44147586_T_A:44147586:1,8,2,0
chr7	44147599	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,12;MFRL=166,136;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,0:0|1:44147586_T_A:44147586:2,8,2,0
chr7	44148953	.	C	CCAAGCAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,5406868;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44148953_C_CCAAGCAT:44148953:1,2,1,0
chr7	44148955	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,5406868;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44148953_C_CCAAGCAT:44148953:1,2,1,0
chr7	44151009	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	44152014	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=198,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44152014_A_AT:44152014:1,0,0,1
chr7	44152015	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=198,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44152014_A_AT:44152014:1,0,0,1
chr7	44152119	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,5:0,0,10,1
chr7	44152524	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr7	44152549	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr7	44153780	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.951:19:0,7:0,12:0,0,6,13
chr7	44154865	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,11,3
chr7	44156146	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr7	44156209	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44156209_A_C:44156209:0,1,0,1
chr7	44156213	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44156209_A_C:44156209:0,1,0,1
chr7	44156217	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44156209_A_C:44156209:0,1,0,1
chr7	44178626	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=117,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:3,4,0,2
chr7	44180079	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr7	44180226	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr7	44189321	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr7	44189709	.	C	CTGAGTAATTCATAAAGAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44189709_C_CTGAGTAATTCATAAAGAAG:44189709:0,0,0,1
chr7	44189713	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44189709_C_CTGAGTAATTCATAAAGAAG:44189709:0,0,0,1
chr7	44190468	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	44198669	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=135,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:2,2,1,0
chr7	44228429	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,66;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:6,1,2,0
chr7	44252008	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44252008_G_A:44252008:0,0,0,1
chr7	44252012	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44252008_G_A:44252008:0,1,0,1
chr7	44266077	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,14,4
chr7	44270510	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr7	44270764	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	44272314	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	44274342	.	C	CGCCCTGGGGCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=170,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,2:9,0:3,11,1,2
chr7	44281475	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	44286880	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0|1:44286880_C_CA:44286880:0,1,0,1
chr7	44286883	.	G	GTGGAGCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44286880_C_CA:44286880:0,1,0,1
chr7	44286886	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44286880_C_CA:44286880:0,0,0,1
chr7	44294298	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:1,7,0,2
chr7	44561884	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	44571628	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:5,4:7,0,4,0
chr7	44575965	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,48;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:1,9,0,2
chr7	44606043	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=72,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:3,6,7,1
chr7	44606217	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	44610490	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	44611077	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr7	44611407	.	C	CCCCCAAGACATGCAACTTACCTAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	44612347	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,5,15
chr7	44612425	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=161,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:5,0:7,4:8,4,4,0
chr7	44612454	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,13:0,10:0,0,17,7
chr7	44613103	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,8:0,0:0,0,8,0
chr7	44613611	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	44619302	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	44715730	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:6,5:9,3:9,6,5,4
chr7	44715907	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=156,156;MMQ=54,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:44715907_C_CT:44715907:0,4,0,1
chr7	44715909	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=156,156;MMQ=54,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:44715907_C_CT:44715907:0,4,0,1
chr7	44715913	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=156,156;MMQ=54,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:44715907_C_CT:44715907:0,4,0,1
chr7	44715917	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=156,156;MMQ=54,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:44715907_C_CT:44715907:0,4,0,1
chr7	44715920	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	44734099	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=129,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,1:12,1:12,5,2,0
chr7	44739641	.	AG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr7	44747641	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:44747641_A_T:44747641:1,1,0,1
chr7	44747644	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:44747641_A_T:44747641:1,1,0,1
chr7	44801300	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=112,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:7,9,0,2
chr7	44802400	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44802400_AA_CC:44802400:0,0,1,0
chr7	44802407	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44802400_AA_CC:44802400:0,0,1,0
chr7	44802412	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44802400_AA_CC:44802400:0,0,1,0
chr7	44836449	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=132,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.601:6:1,1:1,0:2,0,0,4
chr7	44839331	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,3:7,2:7,7,3,2
chr7	44840864	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,4:0,14:0,0,10,10
chr7	44875043	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr7	44880684	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	44882961	.	CA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:19,1:16,1:3,34,0,3
chr7	45010371	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,0,3
chr7	45011923	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	45077978	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:10,3:7,6:7,11,4,5
chr7	45113002	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,0:1,2:3,0,1,1
chr7	45122038	.	G	GATGGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:45122038_G_GATGGA:45122038:0,0,0,1
chr7	45122040	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45122038_G_GATGGA:45122038:0,0,0,1
chr7	45122043	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45122038_G_GATGGA:45122038:0,0,0,1
chr7	45122046	.	G	GAC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45122038_G_GATGGA:45122038:0,0,0,1
chr7	45122048	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45122038_G_GATGGA:45122038:0,0,0,1
chr7	45124008	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=199,189;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:5,2,3,0
chr7	45197433	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	45223018	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr7	45697295	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:45697295_C_G:45697295:0,0,8,1
chr7	45697297	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:45697295_C_G:45697295:0,0,8,1
chr7	45725485	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	45743403	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	45747949	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,7:5,5:5,3,9,3
chr7	45753376	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:15,7,1,1
chr7	47319723	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:7,2:8,11:12,3,6,7
chr7	47319852	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.390:34:11,7:9,6:9,12,5,8
chr7	47336893	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=244,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	47408732	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:2,4,1,3
chr7	47436558	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr7	47451295	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=79.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0,0,17,8
chr7	47453540	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:4,1,5,2
chr7	47463842	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,62;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr7	47467864	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:2,2,2,0
chr7	47474839	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:2,4,2,0
chr7	47835814	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	47840510	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,0:0,8:0,0,1,7
chr7	47853498	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr7	47859239	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:1,1:3,1:1,4,0,3
chr7	47869751	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:1,6,1,4
chr7	47878993	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,0:2,5:5,0,5,0
chr7	47884555	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,3:5,2:9,1,5,0
chr7	47886707	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	47898561	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,6:0,0,5,3
chr7	47904737	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:6,0,8,1
chr7	47917018	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:5,0,6,0
chr7	47917328	.	A	AAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	47943934	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=157,130;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr7	47943953	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr7	47944295	.	ACTTT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47944295_ACTTT_A:47944295:0,2,0,1
chr7	47944304	.	GGA	CAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:47944295_ACTTT_A:47944295:0,2,0,1
chr7	47945394	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,7:2,3:5,1,9,1
chr7	47947863	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	47979922	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr7	47979977	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47979977_A_C:47979977:0,0,0,1
chr7	47979978	.	A	ATCTGCACCTTTTTCAGTGCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47979977_A_C:47979977:0,0,0,1
chr7	48005122	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=217,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr7	48017965	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=147,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,3:8,7:9,4,7,3
chr7	48017989	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,4:6,6:5,5,6,4
chr7	48018455	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.376:30:7,2:11,8:3,16,1,10
chr7	48046714	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,185;MMQ=48,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr7	48048724	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:2,2:7,3:0,10,2,3
chr7	48068553	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=189,71;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:0,8,1,2
chr7	48089394	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	48094346	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	48141357	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	48237802	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:4,3:5,5:8,1,8,1
chr7	48237824	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:3,5:5,5:7,3,7,3
chr7	48288001	.	G	GATTTCCAGTTTCATCCA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=136,131;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,1:12,1:5,15,0,2
chr7	48314151	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:13,7:8,8:15,6,9,7
chr7	48317683	.	A	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,25:0.465:54:18,11:10,14:20,9,19,6
chr7	48319381	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:20,0:16,2:18,18,1,1
chr7	48335265	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:7,3:1,3:5,3,6,0
chr7	48412111	.	G	GGTTTTTGCATTTTTCTTTTTTCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=14,33;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.402:3:0,1:0,0:0,2,0,1
chr7	48452254	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=89,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:48452254_G_T:48452254:1,1,0,1
chr7	48452256	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=89,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:48452254_G_T:48452254:1,1,0,1
chr7	48452258	.	A	ATGAATGGATG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48452254_G_T:48452254:1,0,0,1
chr7	48452260	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48452254_G_T:48452254:1,0,0,1
chr7	48452264	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48452254_G_T:48452254:1,0,0,1
chr7	48452272	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	48467355	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,2:1,4:3,3,5,2
chr7	48511297	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr7	48520780	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=119,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:11,3:9,5:6,15,2,7
chr7	48522845	.	CA	GG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=230,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	48684185	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.697:4:1,2:0,0:0,1,3,0
chr7	49951542	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AT;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	50023122	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,2,8
chr7	50023202	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	50070921	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr7	50144059	.	T	TTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.785:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	50175654	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,1:5,2:8,0,2,1
chr7	50175681	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.749:22:3,6:2,10:3,2,12,5
chr7	50179609	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr7	50191216	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:1,3:3,4:0,4,0,8
chr7	50198626	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,10,7
chr7	50468217	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:11,1:8,15,2,0
chr7	50512929	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr7	50514375	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:10,1:9,12,1,1
chr7	50537677	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=151,225;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.402:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr7	50544269	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,5,3
chr7	50547584	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,2:0,9:0,0,6,7
chr7	50547661	.	AGCCCT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCCT;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	50611735	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,9,10
chr7	50663307	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=36,31;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663307_C_T:50663307:0,3,0,1
chr7	50663309	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=36,35;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663309_C_G:50663309:0,3,0,1
chr7	50663313	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,32;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663307_C_T:50663307:0,3,0,1
chr7	50663314	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:50663314_A_G:50663314:0,2,0,1
chr7	50663315	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,31;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663309_C_G:50663309:0,3,0,1
chr7	50663317	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,31;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663307_C_T:50663307:0,3,0,1
chr7	50663319	.	C	CCAATGGGACTGGATAG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663309_C_G:50663309:0,3,0,1
chr7	50663321	.	CAC	TGG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=34,30;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:50663307_C_T:50663307:0,3,0,1
chr7	50663325	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50663314_A_G:50663314:0,2,0,1
chr7	50694429	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	50694457	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr7	50737606	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	50742118	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr7	50799889	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr7	51085127	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	51093013	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,8:0,0,10,15
chr7	51094216	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=105,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr7	51096147	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:6,2,7,1
chr7	51096263	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=162,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.144:25:8,2:14,1:8,14,2,1
chr7	51098567	.	GTCT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=172,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.552:18:3,5:5,4:1,7,4,6
chr7	51153024	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.893:6:0,2:0,4:0|1:51153024_GT_G:51153024:0,0,1,5
chr7	51153027	.	CAATCAAAGTACTTTGTACCTATGAAGTACAAAGA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:51153024_GT_G:51153024:0,0,1,5
chr7	51251900	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:13,3:12,1:5,21,0,4
chr7	53104078	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,3:0,0:1,2,2,2
chr7	54614596	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	54618010	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	54621526	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=125,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:7,7:13,4:19,1,10,2
chr7	55087139	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	55214443	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr7	55219159	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=68,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	55220177	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:3,3:0,5:3,0,7,1
chr7	55221655	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:1,1,4,1
chr7	55228053	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	55238283	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55238283_C_T:55238283:2,2,0,1
chr7	55238284	.	A	ATATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:55238283_C_T:55238283:2,2,0,1
chr7	55241755	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr7	55466371	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:3,3:0,6,0,5
chr7	55468773	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	55468816	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:7,1,3,0
chr7	55496175	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=76,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:5,2:4,4:0|1:55496175_T_C:55496175:3,6,0,6
chr7	55496179	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=143,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.187:14:7,0:4,2:1|0:55496175_T_C:55496175:2,10,1,1
chr7	55496183	.	A	AGTTAT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=143,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.187:14:7,0:5,2:1|0:55496175_T_C:55496175:2,10,1,1
chr7	55496186	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=143,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.187:14:7,0:4,2:1|0:55496175_T_C:55496175:2,10,1,1
chr7	55499058	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	55540791	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0,0,2,17
chr7	55559875	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:6,0,6,0
chr7	55559930	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.448:29:8,7:8,5:13,3,11,2
chr7	55560190	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=144,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0|1:55560190_T_C:55560190:0,5,0,5
chr7	55560198	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=174,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:55560190_T_C:55560190:0,6,0,3
chr7	55560207	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr7	55565247	.	TGGGGGG	T,TGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32,31;MFRL=0,207,160;MMQ=60,60,60;MPOS=33,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,10,12;RU=G;STR;TLOD=3.36,11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.286,0.571:4:0,1,2:0,0,1:0,0,4,0
chr7	55565286	.	AAGG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:3,3:6,2,7,0
chr7	55873152	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=254,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:55873152_G_A:55873152:0,3,0,1
chr7	55873155	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=254,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:55873152_G_A:55873152:0,3,0,1
chr7	55873162	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=249,254;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:55873162_A_T:55873162:0,2,0,1
chr7	55873164	.	A	AGCCGAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=249,254;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:55873162_A_T:55873162:0,2,0,1
chr7	55902358	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=242,165;MMQ=40,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55902358_C_T:55902358:0,1,0,1
chr7	55902366	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=233,165;MMQ=45,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:55902358_C_T:55902358:0,2,0,1
chr7	55902370	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=233,165;MMQ=45,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:55902358_C_T:55902358:0,2,0,1
chr7	55902374	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=194,242;MMQ=43,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:55902374_CG_C:55902374:0,2,0,1
chr7	55902375	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=223,165;MMQ=50,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55902358_C_T:55902358:0,1,0,1
chr7	55902376	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=194,242;MMQ=43,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:55902374_CG_C:55902374:0,2,0,1
chr7	55914417	.	ATTAGAATTGATTATCATTTGCTTAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=215,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	55990940	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=168,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,0:10,3:9,12,1,2
chr7	56082622	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=159.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,9:0,34:0,0,43,0
chr7	56119730	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,7:0,0,0,21
chr7	56122058	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,13,11
chr7	56124146	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=173,202;MMQ=60,38;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:6,0:10,3:0|1:56124146_A_T:56124146:1,15,2,1
chr7	56124154	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=172,206;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:0|1:56124146_A_T:56124146:0,13,1,2
chr7	56131910	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	56136393	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=216,93;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr7	56136439	.	GGT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=181,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	56142519	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr7	56144656	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr7	56150051	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	56155219	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	56156467	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:3,0,0,1
chr7	56183981	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=125,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,0:0|1:56183981_A_C:56183981:0,3,2,0
chr7	56183985	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=125,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:0,0:0|1:56183981_A_C:56183981:0,3,2,0
chr7	56183989	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=109,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:56183981_A_C:56183981:0,2,2,0
chr7	57199906	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=124,92;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.347:24:8,6:7,2:14,2,6,2
chr7	57528997	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,257;MMQ=60,52;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:5,3,3,3
chr7	63529174	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=133893,192;MMQ=48,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:3,6:1,3:4,0,9,0
chr7	63529450	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=133686,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:1,1:0,6,0,3
chr7	63537638	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:1,4:0,5:1,0,8,1
chr7	63673455	.	CT	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,10:0.166:59:19,5:24,5:36,13,7,3
chr7	63673608	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.425:40:10,7:13,9:1,22,2,15
chr7	63673691	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=171,180;MMQ=44,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.620:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr7	63727328	.	T	TCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=41,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr7	63982692	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=134,122;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,2:0.046:63:30,2:28,0:35,26,0,2
chr7	63986854	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:63986854_A_G:63986854:2,2,0,1
chr7	63986856	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:63986854_A_G:63986854:2,2,0,1
chr7	64004817	.	AAC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=110,153;MMQ=52,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=AC;STR;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,2:1,3:0,2,0,6
chr7	64166642	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr7	64166793	.	T	G	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,75;MMQ=60,29;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,6:0.069:98:31,6:58,0:52,40,5,1
chr7	64168292	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=118,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:32,2:17,1:33,19,1,2
chr7	64169061	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr7	64275284	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,14:0,5:0,0,13,6
chr7	64276089	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,7,18
chr7	64291225	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.724:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	64291244	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:2,1:3,1:5,0,3,0
chr7	64291267	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr7	64291510	.	A	AAGGATTTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64291510_A_AAGGATTTTTTT:64291510:0,1,0,1
chr7	64291511	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64291510_A_AAGGATTTTTTT:64291510:0,1,0,1
chr7	64378768	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.476:11:2,1:2,4:0,6,0,5
chr7	64388472	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,27:0.483:56:14,11:15,16:6,23,9,18
chr7	64389067	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,125;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,3:3,1:1,4,1,3
chr7	64389478	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:3,3,0,6
chr7	64438403	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr7	64438983	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=138,250;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:64438983_G_A:64438983:1,3,0,1
chr7	64438984	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=138,250;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:64438983_G_A:64438983:1,3,0,1
chr7	64439938	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr7	64852790	.	TTGTG	T,TTG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32,27;MFRL=138,147,144;MMQ=60,60,60;MPOS=16,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=TG;STR;TLOD=60.77,6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,20,3:0.555,0.126:32:3,12,2:5,7,1:9,0,18,5
chr7	65419353	.	T	TTTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TTA;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.383:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	65425894	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,10:0,0,13,8
chr7	65439879	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,8:0,0,11,10
chr7	65444359	.	T	TGA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=63.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,10,7
chr7	65551821	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr7	65552614	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	65554352	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr7	65554385	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	65556936	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	65599246	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.346:12:2,0:5,4:7,1,4,0
chr7	65599431	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,0,17
chr7	65610399	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:12,3,1,2
chr7	65705972	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,0:8,2:13,10,1,1
chr7	65817473	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,10:0,0,16,10
chr7	66147697	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,3:0,0,7,0
chr7	66147868	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=99,153;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,3:0,5:0,1,1,8
chr7	66262284	.	CTT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=77.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,18,0
chr7	66262308	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,164;MMQ=54,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.843:15:1,7:1,6:2,0,12,1
chr7	66273789	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	66416137	.	TTG	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:7,1:8,2:0,16,1,3
chr7	66420409	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=139,77;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.209:27:10,0:10,5:17,5,5,0
chr7	66453577	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	66459399	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr7	66520726	.	CAA	C,CA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29,33;MFRL=217,174,179;MMQ=60,59,60;MPOS=5,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.67,40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,17:0.163,0.759:21:0,1,12:1,2,4:1,0,20,0
chr7	66532235	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	66770933	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,6:8,7:11,1,13,0
chr7	66774157	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr7	66785029	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=115.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,14:0,21:0,0,13,23
chr7	66785123	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,197;MMQ=51,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:3,8,0,2
chr7	69583231	.	TAA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,10;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:3,1:2,0:3,3,0,3
chr7	70229685	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=122.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,23:0,13:0,0,36,1
chr7	70236446	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	70246826	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	70250043	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr7	70250874	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:9,2,3,1
chr7	70252185	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:15,5:9,6:19,5,9,2
chr7	70880867	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,3:0,4:3,0,6,1
chr7	70885883	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,2,0
chr7	70886107	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr7	71036473	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr7	71135192	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	71142219	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=101,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.625:11:1,2:2,4:2,2,2,5
chr7	71176919	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr7	72093907	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,183;MMQ=40,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:4,11,1,1
chr7	72413389	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,189;MMQ=25,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.277:34:9,7:14,2:11,14,7,2
chr7	72416333	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr7	72416763	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,153;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:27,1:14,2:10,32,0,3
chr7	72419664	.	TACACA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,64;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.335:7:3,2:1,0:0|1:72419664_TACACA_T:72419664:0,5,1,1
chr7	72419671	.	C	CCTTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=144,64;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:72419664_TACACA_T:72419664:0,5,1,1
chr7	72420626	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,190;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:19,0:27,3:11,35,1,2
chr7	72738350	.	C	CG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=55.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,7:0,0,14,3
chr7	72738749	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,42;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=156.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.976:40:0,20:0,20:0|1:72738749_A_G:72738749:0,0,24,16
chr7	72738762	.	CA	TG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=132.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,11:0,15:0|1:72738749_A_G:72738749:0,0,15,16
chr7	72742181	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr7	72742406	.	C	CCTGAGTA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=168,151189;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:72742406_C_CCTGAGTA:72742406:4,16,0,2
chr7	72742408	.	C	CTGGGACTACAGGTGCAT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=168,151189;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:7,2:0|1:72742406_C_CCTGAGTA:72742406:4,16,0,2
chr7	72856466	.	TC	GG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,10;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856470	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856474	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856478	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856482	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856483	.	A	ACAG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856485	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856488	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72857230	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72857230_G_A:72857230:0,0,0,1
chr7	72857234	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72857230_G_A:72857230:0,0,0,1
chr7	72857237	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72857230_G_A:72857230:0,0,0,1
chr7	72861796	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	72891754	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:6,2:4,2:4,7,1,3
chr7	72892843	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:24,3:22,0:21,26,3,0
chr7	72957777	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0|1:72957777_A_G:72957777:8,0,2,0
chr7	72957779	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0|1:72957777_A_G:72957777:8,0,2,0
chr7	72966422	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=143,153;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr7	72992894	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,27:0.465:58:13,13:18,13:19,12,17,10
chr7	72992926	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=21,17;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.294:26:5,1:5,0:8,10,1,7
chr7	73020011	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:7,1:10,1:12,6,0,2
chr7	73020342	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:11,1:2,1:8,6,1,1
chr7	73084471	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=216,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr7	73096993	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,2,1
chr7	73101137	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,25:0.482:52:18,13:9,12:6,21,9,16
chr7	73101223	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,1:11,1:6,15,1,1
chr7	73105144	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	73107003	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=89,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,5:4,2:2,6,3,4
chr7	73112066	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:73112066_G_C:73112066:1,2,0,1
chr7	73112068	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:73112066_G_C:73112066:1,2,0,1
chr7	73112069	.	G	GCACAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:73112066_G_C:73112066:1,2,0,1
chr7	73118033	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=194,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:3,4:1,3:3,2,7,0
chr7	73118175	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:3,0:0|1:73118175_T_G:73118175:0,6,0,2
chr7	73118196	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:73118175_T_G:73118175:0,3,0,3
chr7	73118232	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr7	73118398	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	73118816	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	73123529	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73123529_C_T:73123529:0,0,0,1
chr7	73123542	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73123529_C_T:73123529:0,0,0,1
chr7	73184435	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	73245519	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=202,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr7	73246461	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,4:3,6:5,0,6,4
chr7	73247070	.	G	GTGCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73247070_G_GTGCA:73247070:0,0,0,1
chr7	73247074	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73247070_G_GTGCA:73247070:0,0,0,1
chr7	73247076	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73247070_G_GTGCA:73247070:0,0,0,1
chr7	73254466	.	G	GTTGATGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=193,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr7	73254910	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=208,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.795:6:0,1:0,4:0,1,0,5
chr7	73275501	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:2,3:6,1,5,2
chr7	73275616	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=58,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,0,1
chr7	73279233	.	CAAAA	C,CAAAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35,33;MFRL=183,168,125;MMQ=60,60,40;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,10,15;RU=A;STR;TLOD=3.07,5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,4:0.222,0.544:6:0,0,0:1,1,3:1,0,4,1
chr7	73467650	.	CTGTG	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=19,26;MFRL=112,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=TG;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.647:3:0,1:0,0:0|1:73467650_CTGTG_C:73467650:0,1,0,2
chr7	73467685	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=216,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:73467650_CTGTG_C:73467650:0,4,0,1
chr7	73467696	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1|0:73467650_CTGTG_C:73467650:0,4,0,1
chr7	73470782	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=97.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,8:0,20:0,0,6,23
chr7	73472050	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.425:45:15,8:11,11:5,21,9,10
chr7	73479946	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=176,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.591:5:1,1:0,2:1,1,3,0
chr7	73480163	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:73480163_C_A:73480163:1,1,0,1
chr7	73480165	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73480163_C_A:73480163:1,1,0,1
chr7	73530046	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	73604754	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	73752699	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr7	73790642	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:16,1:11,1:14,17,1,1
chr7	73801019	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	73803567	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=172,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,2:0|1:73803567_C_T:73803567:1,10,0,2
chr7	73803569	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=171,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:73803567_C_T:73803567:1,11,0,2
chr7	73803570	.	G	GTA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=171,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:73803567_C_T:73803567:1,11,0,2
chr7	73803573	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=171,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:3,2:0|1:73803567_C_T:73803567:1,11,0,2
chr7	73803644	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=234,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	73933734	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=133,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:6,2:7,2:11,2,2,2
chr7	73944277	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,155;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,0:2,2:1,7,0,2
chr7	73959173	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.217:18:9,1:4,1:1,13,4,0
chr7	73960026	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,3829130;MMQ=60,43;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:14,0:13,2:19,8,0,2
chr7	74005132	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,0:9,2:14,2,2,0
chr7	74103655	.	TTA	CAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	74105219	.	ATGT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=110.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,10:0,0,25,0
chr7	74120860	.	G	GTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74120860_G_GTTT:74120860:0,1,0,1
chr7	74120861	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74120860_G_GTTT:74120860:0,1,0,1
chr7	74120863	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:74120860_G_GTTT:74120860:0,1,0,1
chr7	74152563	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=307,273;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	74167356	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,2:0,7:0,0,9,1
chr7	74170000	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,297;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74170000_T_TG:74170000:0,0,0,1
chr7	74170001	.	T	TTGTTGTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,297;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74170000_T_TG:74170000:0,0,0,1
chr7	74193668	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=137,150;MMQ=49,25;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:7,8:10,5:11,6,11,2
chr7	74251390	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,0,17
chr7	74251531	.	TGGCAAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=251,234;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74251531_TGGCAAAAA_T:74251531:0,1,0,1
chr7	74251543	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=251,234;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74251531_TGGCAAAAA_T:74251531:0,1,0,1
chr7	74470190	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=224,248;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.313:10:5,1:2,1:2,5,1,2
chr7	74524951	.	CT	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,157;MMQ=27,23;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:24,0:15,4:1,38,0,4
chr7	75048564	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,138;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.660:21:4,5:2,9:6,1,12,2
chr7	75048750	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=148,160;MMQ=54,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.432:31:6,7:11,6:6,12,1,12
chr7	75048804	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=170,184;MMQ=52,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:3,3:9,3:0,13,0,6
chr7	75053572	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,153;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.546:33:5,7:9,11:0,15,1,17
chr7	75055097	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,175;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:5,4:2,6:1,6,0,11
chr7	75070642	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,154;MMQ=47,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:2,0:6,4:4,4,4,0
chr7	75145411	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=148.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,27:0,21:0,0,42,7
chr7	75155143	.	GAA	G,GAAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34,35;MFRL=164,187,170;MMQ=60,58,60;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=3.30,9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,2,6:0.090,0.206:29:8,0,2:13,2,4:21,0,8,0
chr7	75155300	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,167;MMQ=48,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:9,1:5,6:1,14,1,6
chr7	75168562	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	75182965	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=233,133;MMQ=50,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75182965_C_T:75182965:0,2,0,1
chr7	75182967	.	CC	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=233,133;MMQ=50,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75182965_C_T:75182965:0,2,0,1
chr7	75182969	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=233,133;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75182965_C_T:75182965:0,2,0,1
chr7	75182974	.	G	GTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=233,133;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75182965_C_T:75182965:0,2,0,1
chr7	75183403	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:5,2:2,1:5,3,3,0
chr7	75185985	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	75186901	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	75190526	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:8,0,3,0
chr7	75399196	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75399196_TA_T:75399196:0,0,0,1
chr7	75399198	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75399196_TA_T:75399196:0,0,0,1
chr7	75441108	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=146,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.499:12:5,2:1,3:0|1:75441108_C_T:75441108:2,4,4,2
chr7	75441111	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=146,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:5,4:1,3:0|1:75441108_C_T:75441108:2,4,4,3
chr7	75442855	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	75443129	.	C	CTTAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=221,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	75610763	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr7	75612770	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,6:2,1:0|1:75612770_C_G:75612770:5,0,6,1
chr7	75612783	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:0|1:75612770_C_G:75612770:5,1,5,1
chr7	75613998	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr7	75614029	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:3,5:3,2:6,0,7,0
chr7	75614082	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=186,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:5,6:8,7:8,5,10,3
chr7	75614863	.	TG	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,0:3,0,1,2
chr7	75616727	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=136,33;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:7,2:4,0:5,8,1,1
chr7	75616817	.	GGACA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GACA;STR;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr7	75617430	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:2,3,2,2
chr7	75621661	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr7	75633209	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,5:0,0,0,9
chr7	75689846	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=165,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,0:6,2:1,8,1,1
chr7	75692927	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:2,5,1,6
chr7	75693009	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr7	75694079	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=127,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,3,1
chr7	75694345	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:0,6,0,6
chr7	75889370	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=9,17;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:75889370_C_G:75889370:0,1,1,0
chr7	75889376	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,36;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:75889370_C_G:75889370:0,1,1,0
chr7	75889382	.	GCGCGC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75889370_C_G:75889370:0,1,1,0
chr7	75910691	.	CTCTCTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTCTG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	75914934	.	G	GC	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=146.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,21:0,0,25,20
chr7	75933441	.	A	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=149,178;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,12:0.154:70:24,2:20,2:22,36,12,0
chr7	75959499	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=118,40;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:0|1:75959499_C_CA:75959499:2,8,1,1
chr7	75959501	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=118,40;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:75959499_C_CA:75959499:2,8,1,1
chr7	75959509	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.337:10:3,1:3,2:0|1:75959499_C_CA:75959499:2,5,1,2
chr7	76023029	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	76023088	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	76023131	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,2:0,0,6,1
chr7	76026792	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76026792_G_C:76026792:0,0,1,0
chr7	76026796	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76026792_G_C:76026792:0,0,1,0
chr7	76026799	.	TG	AC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76026792_G_C:76026792:0,0,1,0
chr7	76026804	.	CGG	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76026792_G_C:76026792:0,0,1,0
chr7	76026811	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76026792_G_C:76026792:0,0,1,0
chr7	76027235	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr7	76028163	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.411:22:4,3:9,5:3,10,2,7
chr7	76033544	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	76033805	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	76054405	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	76058767	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	76062770	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:2,4:5,6:7,1,6,5
chr7	76069481	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=202,221;MMQ=27,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:0,0:2,1:0|1:76069481_G_A:76069481:2,0,2,0
chr7	76069486	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=215,221;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0|1:76069481_G_A:76069481:1,0,2,0
chr7	76069553	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=166,231;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:23,1:21,2:39,5,0,3
chr7	76069972	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,155;MMQ=52,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:2,5,0,8
chr7	76112487	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=246,160;MMQ=27,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	76133863	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=220,218;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr7	76140449	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,163;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.309:20:6,2:8,3:0,14,0,6
chr7	76142329	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=123,151;MMQ=53,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:10,0,5,1
chr7	76239480	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,8:0,0,17,0
chr7	76239503	.	G	GC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=88.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,11:0,18:0,0,22,9
chr7	76240727	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr7	76240785	.	CA	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,22,8
chr7	76241144	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=170,171;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,5:5,3:11,0,0,8
chr7	76241211	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=195,170;MMQ=27,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,15:0.800:18:2,3:1,7:0|1:76241211_C_T:76241211:0,3,2,13
chr7	76241216	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=219,170;MMQ=31,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,17:0.857:19:1,7:1,9:0|1:76241211_C_T:76241211:0,2,2,15
chr7	76255032	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=134.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,14:0,23:0,0,2,35
chr7	76255452	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,1,15
chr7	76255491	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr7	76883989	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr7	76912016	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,2:16,1:23,11,1,2
chr7	76941547	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:76941547_C_A:76941547:0,2,0,4
chr7	76941549	.	A	AAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:76941547_C_A:76941547:0,2,0,4
chr7	76942959	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr7	76950035	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:6,5:1,4:7,0,8,2
chr7	76955592	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	76958730	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=113.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,10,22
chr7	76984752	.	CAA	C,CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31,35;MFRL=154,109,175;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=4.77,6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,4:0.223,0.237:20:2,3,2:4,2,2:4,7,2,7
chr7	77210927	.	GA	AG,GCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,29,32;MFRL=187,194,161;MMQ=60,60,60;MPOS=5,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:1,1,0:1,0,1:0,4,0,2
chr7	77214964	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:6,0:6,2:0|1:77214964_T_C:77214964:0,12,1,1
chr7	77214971	.	T	TACACTTG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:77214964_T_C:77214964:0,10,1,1
chr7	77214973	.	A	ATTAGT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:77214964_T_C:77214964:0,10,1,1
chr7	77214975	.	C	CTACCT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,1:0|1:77214964_T_C:77214964:0,10,1,1
chr7	77227338	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	77256805	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,7:4,2:3,3,6,3
chr7	77398201	.	G	GAAATTACTAGT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:0,16,0,2
chr7	77402479	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,2:13,0:17,8,2,0
chr7	77469472	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,3:2,5:5,0,8,0
chr7	77539744	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,2,18
chr7	77567008	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.286:22:7,4:8,2:16,0,6,0
chr7	77584159	.	AT	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.162:38:11,2:14,3:19,13,3,3
chr7	77708372	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,153;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:0|1:77708372_C_T:77708372:4,11,0,3
chr7	77708380	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=158,153;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,0:8,3:0|1:77708372_C_T:77708372:3,12,0,3
chr7	77755197	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr7	77756580	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr7	77756724	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	77762457	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	77764591	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	77830410	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.470:39:8,7:10,11:18,3,17,1
chr7	77885844	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,0:4,2:3,9,0,2
chr7	78119199	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr7	78119221	.	G	GAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr7	78119231	.	G	GGCTGGTTGTAGTGGCTCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=199,283;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.383:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	78256643	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	79818171	.	GGT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,1:6,0,2,0
chr7	79828450	.	CTT	C,CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32,31;MFRL=0,205,153;MMQ=60,60,60;MPOS=14,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=4.18,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.375,0.500:5:0,2,1:0,0,2:0,0,5,0
chr7	79833074	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,26:0.413:63:24,8:13,17:13,24,8,18
chr7	79841954	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	80141069	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,10:0,5:0,0,9,6
chr7	80290369	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=78.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,15,7
chr7	80292315	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,1:8,1:15,6,2,0
chr7	80378148	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr7	80378175	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr7	80456708	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:5,2:0,1:5,1,3,0
chr7	80456841	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=149.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,19:0,23:0,0,8,35
chr7	81346660	.	ATC	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=177,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:3,2:3,0:0|1:81346660_ATC_A:81346660:4,3,1,1
chr7	81346665	.	G	GGGTA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=177,68;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:3,1:2,0:0|1:81346660_ATC_A:81346660:4,3,1,1
chr7	81346685	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,4,7
chr7	81350208	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,1,6
chr7	81350223	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	81359116	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	81372156	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	81374477	.	G	GTGAACACTTTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=185,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr7	81374500	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	81381326	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	81381621	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr7	81591826	.	TA	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.089:54:17,2:20,2:7,43,1,3
chr7	81593454	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:7,10:2,7:3,6,4,13
chr7	81596813	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,5:6,4:7,0,9,0
chr7	81603871	.	G	GAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,1:2,1:2,5,0,6
chr7	81641570	.	GA	G,GAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34,25;MFRL=77,134,123;MMQ=60,60,60;MPOS=28,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,16;RU=A;STR;TLOD=3.26,8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.230,0.341:9:1,1,1:1,1,0:1,3,0,5
chr7	81642949	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=186,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,7:5,4:0,12,0,11
chr7	81693755	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,182;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:7,6:10,0:0,17,0,6
chr7	81693768	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.592:13:2,6:3,2:0,5,0,8
chr7	81765862	.	C	CTTAAAAACT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=213,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr7	81765996	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=213,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr7	82388117	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:82388117_T_A:82388117:0,1,0,1
chr7	82388120	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:82388117_T_A:82388117:0,1,0,1
chr7	82388122	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:82388117_T_A:82388117:0,1,0,1
chr7	82388124	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:82388117_T_A:82388117:0,1,0,1
chr7	82474581	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:11,0:15,2:20,7,2,0
chr7	82532115	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr7	82581488	.	T	TTCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCA;STR;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr7	82763804	.	G	T	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.064:73:40,1:26,3:33,35,3,2
chr7	82763813	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.049:61:31,2:24,1:28,30,1,2
chr7	82764235	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=83.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.684:41:8,13:3,15:8,5,19,9
chr7	82784017	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1,2,3,0
chr7	82785732	.	A	ATAGT,AGCCCCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31,29;MFRL=168,112,158;MMQ=60,60,60;MPOS=14,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:2,1,1:0,4,0,2
chr7	82996831	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,3:7,0,6,0
chr7	82997412	.	A	AACAGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	83021799	.	TAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.716:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	83023587	.	TAC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.853:11:1,6:0,4:1,0,8,2
chr7	83026100	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=116,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	83029280	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,9:6,2:7,0,11,0
chr7	83029438	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,30:0.659:45:10,15:5,14:8,7,16,14
chr7	83029639	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:4,1:2,1:0,6,0,3
chr7	83031907	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,15,0
chr7	83034899	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:7,4:0,2:1,6,0,6
chr7	83035177	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	83036363	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=162,166;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:2,1,1,0
chr7	83036367	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=163,164;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:2,0,1,1
chr7	83036602	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr7	83047666	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.414:32:8,6:10,7:19,0,12,1
chr7	83047883	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,1:4,6:0,7,0,7
chr7	83098714	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.776:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	83277699	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.397:13:5,3:3,2:8,0,5,0
chr7	83606353	.	T	TGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GA;STR;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr7	83631376	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,5:1,2:1,4,1,6
chr7	83631414	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=149,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:0,2,0,4
chr7	83631449	.	CAAAG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr7	83643681	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=117,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0|1:83643681_A_T:83643681:1,5,0,2
chr7	83643687	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:83643681_A_T:83643681:0,6,0,2
chr7	83823737	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr7	84644346	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,13,2
chr7	84647477	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=84.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,16:0,8:0,0,23,1
chr7	84670012	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,30:0.554:54:9,17:15,13:13,11,15,15
chr7	84751259	.	TA	T,TAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32,30;MFRL=157,112,156;MMQ=60,60,60;MPOS=25,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.10,4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.227,0.304:10:1,1,2:2,1,0:0,5,0,5
chr7	86394719	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,172;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:5,0:14,2:13,9,2,0
chr7	86522420	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.214:15:3,2:7,1:1,11,0,3
chr7	86556236	.	CAAAAAAAA	C,CAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26,19;MFRL=210,118,153;MMQ=60,60,60;MPOS=32,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,13,17;RU=A;STR;TLOD=3.51,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.337,0.333:3:0,1,0:1,0,0:0,1,0,2
chr7	86556256	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	86567364	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr7	86574455	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr7	86594379	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:2,6,2,1
chr7	86594423	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=89,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr7	86795947	.	TAG	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=69.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.514:35:8,13:5,4:3,14,3,15
chr7	86803994	.	T	TG	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=55.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:8,12:16,8:3,21,2,18
chr7	86811456	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=125,191;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr7	86811525	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,8:4,5:7,2,12,1
chr7	86978347	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=177.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,32:0,19:0,0,46,5
chr7	86998842	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,9:4,5:4,6,1,13
chr7	87005287	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.662:16:3,5:2,4:0,5,0,11
chr7	87006567	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	87011349	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=101.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,13:0,0,19,10
chr7	87022024	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr7	87031690	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=192,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.476:11:2,0:3,5:0,6,0,5
chr7	87032613	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,3,20
chr7	87046896	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr7	87053206	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr7	87053465	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	87056011	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	87056242	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,2:7,0:5,15,1,1
chr7	87060795	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,0:5,2:7,9,0,2
chr7	87069425	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=203,189;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr7	87069758	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	87072840	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=194,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr7	87074281	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:1,1:4,0:0,5,0,1
chr7	87074294	.	GAG	CTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr7	87138511	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	87165697	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:7,0,3,0
chr7	87168749	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	87173667	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	87174066	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	87178626	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr7	87179086	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	87179143	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr7	87180198	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	87369106	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,5:7,0:10,4,4,1
chr7	87485539	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=168,203,154;MMQ=60,60,60;MPOS=13,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,13;RU=A;STR;TLOD=6.59,4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,2:0.208,0.130:20:7,2,1:7,2,1:14,0,6,0
chr7	87526550	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.890:7:0,3:0,2:0,0,6,1
chr7	87529688	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:20,0:19,3:8,31,0,3
chr7	87564277	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,4:8,6:12,0,9,1
chr7	87737592	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:5,4:3,6:6,3,5,5
chr7	87744034	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.464:11:5,3:1,2:0|1:87744034_T_TA:87744034:0,6,1,4
chr7	87744037	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:4,4:1,2:0|1:87744034_T_TA:87744034:0,6,1,5
chr7	87759588	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr7	87763538	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	87825689	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,6:6,1:7,1,8,0
chr7	87840158	.	G	GA	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=101.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,45:0.603:74:15,24:14,21:23,6,32,13
chr7	87848350	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:87848350_C_G:87848350:1,0,0,1
chr7	87848351	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:87848350_C_G:87848350:1,0,0,1
chr7	87848352	.	C	CATCATCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:87848350_C_G:87848350:1,0,0,1
chr7	88424365	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,2:5,4:1,6,0,6
chr7	88424404	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:0,7,0,4
chr7	88847450	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:8,3:5,2:0|1:88847450_TA_T:88847450:10,3,3,2
chr7	88847453	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:8,3:5,2:0|1:88847450_TA_T:88847450:10,3,3,2
chr7	88963213	.	AA	CC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.143:22:11,0:8,0:16,3,0,3
chr7	89792250	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,13,5
chr7	89797251	.	CT	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89797251_CT_GA:89797251:0,1,0,1
chr7	89797259	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89797251_CT_GA:89797251:0,1,0,1
chr7	89797261	.	CG	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=11,28;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:89797251_CT_GA:89797251:0,1,0,1
chr7	89861942	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr7	89867369	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.444:43:13,11:11,8:21,3,15,4
chr7	89867446	.	T	TCTG	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CTG;STR;TLOD=70.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.476:42:12,13:9,4:11,11,11,9
chr7	89901039	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,9:0,3:0,0,5,8
chr7	89927191	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr7	89929110	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,3:3,0:6,0,3,0
chr7	89929325	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=145,146;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.052:55:27,2:21,0:0|1:89929325_G_A:89929325:27,26,2,0
chr7	89929331	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,146;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.054:54:28,2:22,0:0|1:89929325_G_A:89929325:25,27,2,0
chr7	89937027	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.495:8:2,0:2,4:4,0,3,1
chr7	89937210	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0,10,0,2
chr7	89976137	.	GTTC	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTC;STR;TLOD=78.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.443:50:15,9:11,13:8,20,7,15
chr7	89982132	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,167;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.448:29:10,5:6,7:12,4,11,2
chr7	90003694	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:0,1,2,6
chr7	90014111	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	90042857	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,4:4,1:1,6,0,5
chr7	90225928	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr7	90233618	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr7	90339089	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:6,2:12,0:17,2,2,0
chr7	90356175	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr7	90492639	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr7	90584944	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr7	90747315	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr7	90894252	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	90894459	.	A	ACCG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=196,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCG;STR;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:1,0,6,0
chr7	90895968	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.374:11:2,1:4,0:6,1,4,0
chr7	90895977	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.341:12:4,1:3,0:7,1,4,0
chr7	90898870	.	T	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,36:0.599:60:13,21:10,15:12,12,13,23
chr7	90899650	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,1:8,1:18,1,2,0
chr7	90900521	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.484:48:14,11:9,12:13,12,10,13
chr7	91570290	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	91660989	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=179,281;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:91660989_T_C:91660989:0,3,0,1
chr7	91660995	.	CG	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=179,281;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:91660989_T_C:91660989:0,3,0,1
chr7	91669960	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:3,1:5,4:8,0,4,2
chr7	91681941	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=220,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr7	91694487	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:19,0,2,0
chr7	91725917	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=178,151;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr7	91725946	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=166,169;MMQ=60,33;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:12,0,2,0
chr7	91761050	.	GT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:13,4:13,1:24,4,4,1
chr7	91863872	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,9:0.157:61:25,1:27,8:23,29,3,6
chr7	91864134	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,36;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:20,0:10,2:0|1:91864134_A_C:91864134:23,9,1,1
chr7	91864138	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=134,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:22,0:11,2:0|1:91864134_A_C:91864134:24,9,1,1
chr7	91980489	.	G	GACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr7	92016022	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=193,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,1,2
chr7	92020452	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:6,1:7,2:12,1,3,0
chr7	92027187	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr7	92077203	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr7	92100581	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	92119284	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,178;MMQ=54,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr7	92129161	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:0,1:0,0:0,3,1,2
chr7	92135686	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,5:3,3:0,4,0,8
chr7	92136447	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,0:4,6:2,7,0,7
chr7	92140397	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,30:0.464:65:20,14:14,16:8,27,8,22
chr7	92140455	.	CTT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:1,4:3,2:0,5,0,6
chr7	92147584	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=93.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,35:0.499:70:12,13:22,21:6,29,8,27
chr7	92157802	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr7	92166146	.	CT	C,CTT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,32,33;MFRL=154,119,157;MMQ=60,60,60;MPOS=11,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.72,4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,8,5:0.147,0.106:49:18,3,4:15,5,1:28,8,11,2
chr7	92207339	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.489:35:11,8:6,9:17,1,17,0
chr7	92244422	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,19,0
chr7	92244630	.	TATACA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATACA;STR;TLOD=110.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.967:25:0,11:0,14:0,0,1,24
chr7	92247333	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	92355033	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.559:41:7,7:11,16:8,10,8,15
chr7	92355120	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,154;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:2,12,0,3
chr7	92732200	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:13,0:18,3:13,18,0,3
chr7	92764393	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr7	92818503	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,4:7,4:11,3,6,2
chr7	92826772	.	AT	A	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,6:0.097:69:33,1:28,5:32,31,3,3
chr7	92855628	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=73,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,1:4,0,3,0
chr7	92869138	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:7,2,2,0
chr7	92900512	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.251:29:8,6:12,2:17,4,7,1
chr7	93063694	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:93063694_G_C:93063694:0,3,0,1
chr7	93063695	.	C	CAGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:93063694_G_C:93063694:0,3,0,1
chr7	93067334	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:8,4:5,7:13,1,10,2
chr7	93073147	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	93098135	.	T	TAAACAAACAAAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=AAAC;STR;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr7	93116138	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	93116391	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=204,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	93516077	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr7	93518486	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:2,4:8,7:5,5,7,4
chr7	93519390	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0|1:93519390_C_T:93519390:3,0,2,0
chr7	93519400	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=208,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:0,0:2,3:0|1:93519390_C_T:93519390:2,0,3,0
chr7	93519658	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,205;MMQ=60,37;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr7	93519803	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=186,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr7	93551428	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=91.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,12:0,14:0,0,19,7
chr7	93555311	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr7	93623458	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=277,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	94027043	.	CT	C	.	.	DP=135;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,7:0.079:98:41,2:46,5:21,70,1,6
chr7	94030856	.	AT	A,ATT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=145,145,150;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.79,4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,8,4:0.162,0.098:47:16,7,2:16,1,2:28,7,11,1
chr7	94033800	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr7	94034901	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,2:5,1:10,2,3,0
chr7	94038649	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:5,4:6,8:7,5,9,4
chr7	94039032	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,10,10
chr7	94039900	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr7	94040133	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,8:0,0,13,1
chr7	94040287	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,7:0,0,5,13
chr7	94040345	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,14;MFRL=123,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.533:6:2,0:0,1:2,1,0,3
chr7	94043493	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,18,7
chr7	94055933	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr7	94056244	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr7	94056251	.	GAA	G,AAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35,34;MFRL=0,153,166;MMQ=60,60,60;MPOS=17,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.37,5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.636,0.273:8:0,3,1:0,3,1:0,0,8,0
chr7	94146975	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=91.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,11:0,0,11,14
chr7	94157585	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=75,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.542:9:2,3:2,2:2,2,0,5
chr7	94157605	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:4,0:0|1:94157605_A_T:94157605:0,8,1,1
chr7	94157608	.	C	CAGAATAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:94157605_A_T:94157605:0,6,1,1
chr7	94174854	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=136.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,16:0,21:0,0,25,13
chr7	94175073	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	94178749	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:94178749_T_C:94178749:0,0,8,0
chr7	94178761	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0|1:94178749_T_C:94178749:0,0,8,0
chr7	94183953	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,0:8,2:0,15,0,2
chr7	94296075	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,2:6,0:5,13,2,0
chr7	94879662	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	94897801	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	94931675	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94931675_A_AC:94931675:0,3,0,1
chr7	94931676	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94931675_A_AC:94931675:0,3,0,1
chr7	94931678	.	C	CAACA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94931675_A_AC:94931675:0,3,0,1
chr7	94931680	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94931675_A_AC:94931675:0,3,0,1
chr7	94931684	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94931675_A_AC:94931675:0,3,0,1
chr7	94947799	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr7	94953895	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr7	94991632	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:5,0,6,2
chr7	95024046	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:0,7,1,5
chr7	95034821	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:3,2:4,7:1,7,0,9
chr7	95125050	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,3:0,0:0,0,4,1
chr7	95165864	.	T	TTAGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95165864_T_TTAGC:95165864:0,1,0,1
chr7	95165866	.	A	ACAGAGACACCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95165864_T_TTAGC:95165864:0,1,0,1
chr7	95165869	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95165864_T_TTAGC:95165864:0,1,0,1
chr7	95167136	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr7	95167163	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=208,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr7	95216943	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,2108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,0:2,5:3,1,5,0
chr7	95221920	.	A	AGCACAAAACCTTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=124,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:0|1:95221920_A_AGCACAAAACCTTC:95221920:2,14,0,2
chr7	95221927	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=126,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:95221920_A_AGCACAAAACCTTC:95221920:2,16,0,2
chr7	95442420	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=176,247;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.532:4:1,1:0,0:2,0,2,0
chr7	95442425	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=15,14;MFRL=173,321;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:95442425_T_A:95442425:3,0,1,0
chr7	95442428	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=13,14;MFRL=163,321;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:95442425_T_A:95442425:4,0,1,0
chr7	95442431	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=152,261;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:1,0:3,0,2,0
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chr7	95709602	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr7	95709666	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:7,7:8,8:14,1,14,1
chr7	95775848	.	TA	T,TAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24,32;MFRL=154,111,123;MMQ=60,60,60;MPOS=7,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=6.45,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,4:0.223,0.183:23:4,3,2:7,1,1:11,2,8,2
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chr7	96338910	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,3:0,0,7,1
chr7	96338929	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chr7	96635363	.	GGCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=93,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCA;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,2:2,0:2,1,0,2
chr7	96637153	.	GA	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=183,75;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.230:12:7,0:2,2:3,7,1,1
chr7	96747192	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.426:38:11,9:10,7:9,13,5,11
chr7	97365522	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=183,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:13,2:1,2:13,1,4,0
chr7	97481812	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=254,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr7	97486213	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,5:5,3:0,7,1,7
chr7	97488146	.	G	GT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.492:48:14,10:9,14:21,3,16,8
chr7	97488733	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr7	97780581	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	97784061	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,2:6,3:7,3,2,4
chr7	97800993	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=202,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr7	97814274	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,3:9,0:17,1,2,1
chr7	97816327	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.633:22:4,5:3,9:1,7,2,12
chr7	97820868	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97820868_CA_C:97820868:0,0,1,0
chr7	97820891	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,17;MFRL=94,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:97820868_CA_C:97820868:1,1,1,0
chr7	97820899	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=187,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:97820868_CA_C:97820868:2,1,1,0
chr7	97820907	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=187,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:97820868_CA_C:97820868:2,1,1,0
chr7	97821855	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,7:2,2:5,2,5,4
chr7	97822017	.	C	CATCCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0|1:97822017_C_CATCCA:97822017:7,2,0,2
chr7	97822020	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:5,2:3,0:0|1:97822017_C_CATCCA:97822017:7,2,0,2
chr7	97823125	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:5,0,4,1
chr7	97823524	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:7,0:6,4,1,1
chr7	97823629	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:6,4,3,4
chr7	97823879	.	G	GCGATACTTTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	97834917	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=207,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,1,0,1
chr7	97834919	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,35;MFRL=207,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,1,0,1
chr7	97834923	.	AT	GG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,0,0,1
chr7	97834931	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,0,0,1
chr7	97834933	.	GAA	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,0,0,1
chr7	97834938	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,0,0,1
chr7	97841618	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.585:41:7,17:9,7:9,8,18,6
chr7	97846856	.	CGAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr7	97847440	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr7	97851109	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,7:0,18:0,0,1,24
chr7	97852899	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	97862652	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0|1:97862652_T_C:97862652:0,0,3,0
chr7	97862654	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,16;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr7	97862663	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=38,13;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,1:0|1:97862652_T_C:97862652:2,0,3,0
chr7	97862665	.	CT	GC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,9;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,0:0|1:97862652_T_C:97862652:2,0,3,0
chr7	97862670	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=16,32;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:0,3:0|1:97862652_T_C:97862652:3,0,3,0
chr7	97862672	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=16,26;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:0,3:0|1:97862652_T_C:97862652:3,0,3,0
chr7	97862677	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=16,29;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:0,2:0|1:97862652_T_C:97862652:3,0,2,0
chr7	97862679	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=16,29;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:0,2:0|1:97862652_T_C:97862652:3,0,2,0
chr7	97870575	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,0:12,3:6,12,0,3
chr7	97911618	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:4,5:6,4:9,1,7,3
chr7	97920623	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr7	97921834	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr7	97922773	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,5:6,6:12,0,8,3
chr7	97935671	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr7	97935868	.	A	AAGTGGTCAGAGGTGATTGAATTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=230,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.356:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr7	97944744	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:1,2,3,2
chr7	97944933	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.396:8:2,1:3,2:0|1:97944933_A_AT:97944933:0,5,0,3
chr7	97944935	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.453:9:2,1:3,2:0|1:97944933_A_AT:97944933:0,5,0,4
chr7	97944937	.	A	ATAAT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,2:3,2:0|1:97944933_A_AT:97944933:0,4,0,5
chr7	97944986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	97946450	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,166;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.394:15:3,0:6,4:9,0,6,0
chr7	97949650	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:7,10:10,8:5,12,6,12
chr7	97991792	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:7,10:5,8:0,12,0,18
chr7	98445674	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:20,0:15,1:23,13,2,0
chr7	98478974	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,175;MMQ=56,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	98495299	.	G	GTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=186,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=T;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,2:3,1:11,1,3,0
chr7	98495304	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,4:4,1:10,2,5,0
chr7	98500956	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr7	98503707	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,1:1,6:2,0,6,1
chr7	98506669	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,107;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr7	98513300	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:3,3:4,2,3,1
chr7	98548682	.	C	CTGTGTGTGTG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=0,158;MMQ=32,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,22;RU=TG;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.534:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr7	98556962	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.293:39:12,9:14,2:13,15,4,7
chr7	98558880	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:5,1,4,1
chr7	98562372	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:9,12,1,1
chr7	98581030	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.091:46:21,2:20,1:16,26,3,1
chr7	98587990	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr7	98602990	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,4:4,6:3,4,1,9
chr7	98609670	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr7	98630587	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:3,2:8,3:8,3,5,0
chr7	98637916	.	ACG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CG;STR;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,2:1,8:3,0,10,0
chr7	98639904	.	ATT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,247;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.245:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr7	98643397	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,9:0.171:56:21,3:24,6:18,29,2,7
chr7	98648517	.	TGG	T,TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29,28;MFRL=87,145,118;MMQ=60,60,60;MPOS=31,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=G;STR;TLOD=3.61,16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.213,0.574:11:2,1,1:0,1,6:2,0,9,0
chr7	98650099	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,0:3,4:0,7,1,3
chr7	98655223	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,38599946;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:98655223_G_T:98655223:0,0,0,1
chr7	98655225	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,38599946;MMQ=60,44;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:98655223_G_T:98655223:0,0,0,1
chr7	98775483	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:98775483_CT_C:98775483:0,0,3,0
chr7	98775485	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:98775483_CT_C:98775483:0,0,3,0
chr7	98779489	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,5:6,1:5,2,3,3
chr7	98779740	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr7	98782508	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr7	98790607	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:3,4:2,4:5,0,7,1
chr7	98931105	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:5,3:1,2:0,6,0,7
chr7	98936001	.	ATTTT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=127,219;MMQ=40,53;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=25,21;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr7	98951655	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,184;MMQ=52,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:3,1,4,4
chr7	98957078	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,18;MFRL=0,246;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:0,0,1,0
chr7	98957086	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,17;MFRL=111,246;MMQ=60,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:1,0,1,0
chr7	98957094	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,18;MFRL=147,246;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:2,0,1,0
chr7	98957096	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,17;MFRL=147,246;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:2,0,1,0
chr7	98957101	.	AA	GC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,17;MFRL=147,246;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:2,0,1,0
chr7	98957104	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=147,246;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:2,0,1,0
chr7	98991944	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr7	98998012	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=71.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,26:0.574:45:8,13:11,12:8,11,9,17
chr7	99002595	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,4:5,2:4,7,2,4
chr7	99014984	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=174,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr7	99015233	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:99015233_T_G:99015233:0,2,0,1
chr7	99015235	.	A	AACTGTTCTTTAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:99015233_T_G:99015233:0,2,0,1
chr7	99015263	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	99022785	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.727:8:0,2:1,4:2,0,4,2
chr7	99023246	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr7	99026915	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=189,133;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:99026915_G_A:99026915:0,3,0,1
chr7	99026919	.	A	AGGTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=189,133;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:99026915_G_A:99026915:0,3,0,1
chr7	99026923	.	AGGAT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=189,133;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:99026915_G_A:99026915:0,3,0,1
chr7	99032813	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=134,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:0,1,1,2
chr7	99032874	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	99050039	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.554:12:3,1:2,3:3,2,4,3
chr7	99055940	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=123,155;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:6,2:6,1:10,4,3,0
chr7	99056099	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	99057701	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.408:32:13,7:6,5:12,7,9,4
chr7	99092152	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=166,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,3:5,0:4,2,2,1
chr7	99092194	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:2,1,3,1
chr7	99092352	.	T	TTTTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=220,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTTA;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	99118001	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0,10,0,2
chr7	99161485	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=299,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,4:0,1:2,0,5,0
chr7	99161747	.	T	TCCAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=218,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.316:5:1,1:2,0:0|1:99161747_T_TCCAC:99161747:0,4,0,1
chr7	99161750	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=218,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.316:5:2,1:1,0:0|1:99161747_T_TCCAC:99161747:0,4,0,1
chr7	99217424	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.566:26:6,6:5,7:7,4,6,9
chr7	99219179	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.096:50:26,1:20,3:23,23,0,4
chr7	99220083	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=179,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,3:1,0:3,0,2,1
chr7	99226981	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr7	99227172	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:5,3,1,1
chr7	99245914	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:3,5:9,6:8,4,6,5
chr7	99262835	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:10,6:15,12:17,8,13,5
chr7	99264741	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0,12,0,2
chr7	99303094	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:5,1:8,4:10,3,6,0
chr7	99314986	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0,5,0,6
chr7	99315276	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,5:4,6:3,5,1,10
chr7	99332830	.	G	GCCAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=191,256;MMQ=54,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	99361466	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,4:4,5:9,2,7,2
chr7	99361698	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=208,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:99361698_G_A:99361698:0,3,0,1
chr7	99361709	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=239,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:99361698_G_A:99361698:0,2,0,1
chr7	99365943	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,4:6,1:11,2,4,1
chr7	99447339	.	T	TTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=217,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TC;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,2:0,0:0,3,0,2
chr7	99454485	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,1:18,1:10,17,1,1
chr7	99459144	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	99473624	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:8,0,5,0
chr7	99474729	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	99501313	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr7	99514417	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=182,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:3,7:5,3:1,8,3,7
chr7	99521286	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,6:3,6:0,5,0,12
chr7	99662534	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:4,15,0,2
chr7	99672941	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr7	99686615	.	TGGC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:11,0,1,1
chr7	99687972	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,127;MMQ=41,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.644:6:0,2:2,1:2,0,3,1
chr7	99689385	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.390:39:16,9:8,6:7,17,7,8
chr7	99691007	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=90,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:5,4,1,2
chr7	99696370	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:2,9,1,2
chr7	99698790	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr7	99699626	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,31:0.473:67:13,18:14,11:10,26,4,27
chr7	99701640	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,2,1
chr7	99701881	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	99702417	.	G	GCACT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=191,128;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,2:7,0:8,0,3,0
chr7	99703505	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:7,1,7,1
chr7	99704124	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=120,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,2:9,0:4,8,1,1
chr7	99704165	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=91,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:99704165_T_C:99704165:1,2,0,1
chr7	99704166	.	C	CCAAGCCACCTAGCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=91,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:99704165_T_C:99704165:1,2,0,1
chr7	99704796	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,0:2,0,2,0
chr7	99704827	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr7	99707682	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,5:8,2:5,6,3,4
chr7	99707712	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=66,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,4:1,4:1,1,3,5
chr7	99707728	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:3,4,3,3
chr7	99707950	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:1,3,0,3
chr7	99710584	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=205,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr7	99711459	.	TCACC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:3,1:0,0:0|1:99711459_TCACC_T:99711459:2,2,1,0
chr7	99711461	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.808:3:0,1:0,0:0,0,2,1
chr7	99711473	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:99711459_TCACC_T:99711459:2,2,1,0
chr7	99711614	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,4:5,2:7,3,5,1
chr7	99717534	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,43;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:1,5,2,0
chr7	99722419	.	CAGGAGG	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=AGG;STR;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.487:19:1,5:3,4:3,7,5,4
chr7	99755096	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=216,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,0:0,0:0,2,0,5
chr7	99758136	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=82,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,6:4,5:5,3,7,4
chr7	99768924	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,19;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:12,0:13,0:0|1:99768924_T_G:99768924:9,19,3,0
chr7	99768927	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=33,19;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:10,0:12,0:0|1:99768924_T_G:99768924:9,19,3,0
chr7	99768931	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:13,0:0|1:99768924_T_G:99768924:8,16,2,0
chr7	99768939	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.374:24:2,3:12,4:4,11,3,6
chr7	99774607	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99774607_C_G:99774607:0,0,1,0
chr7	99774608	.	C	CGGGGGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,12;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:99774607_C_G:99774607:0,0,1,0
chr7	99780282	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.686:10:1,4:1,3:3,0,6,1
chr7	99796057	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=146,147;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=89.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,31:0.464:67:16,12:20,19:24,12,21,10
chr7	99796072	.	T	C	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=136,143;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,40:0.426:94:24,14:29,24:32,22,24,16
chr7	99797031	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.428:47:13,11:14,9:1,26,6,14
chr7	99797807	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:99797807_T_A:99797807:1,1,1,0
chr7	99797810	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:99797807_T_A:99797807:1,1,1,0
chr7	99797816	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,10;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:99797807_T_A:99797807:1,1,1,0
chr7	99802812	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:2,1,3,2
chr7	99811313	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,4:4,1:6,0,6,0
chr7	99811464	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,2:8,5:6,9,3,4
chr7	99817585	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=137,140;MMQ=57,57;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,38:0.618:61:15,16:6,19:6,17,11,27
chr7	99818137	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:4,4:0,2:2,2,3,3
chr7	99818374	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:2,2,0,3
chr7	99821381	.	C	G	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=234.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,40:0,27:0,0,18,49
chr7	99821470	.	A	G	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=229.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,38:0,36:0,0,54,21
chr7	99917254	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,6:5,4:6,2,9,1
chr7	99956031	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr7	100001978	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,171;MMQ=24,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	100002819	.	GAGTC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	100004394	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=124,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:10,3:9,2:6,13,1,4
chr7	100004446	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,1,17
chr7	100004755	.	T	TTGGATGTCCTCCTCCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:4,0:2,2:6,0,1,1
chr7	100006965	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	100028484	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:4,2:3,5:5,4,4,3
chr7	100030832	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:7,3:0,5:3,4,7,1
chr7	100065527	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:4,4:1,5:4,2,3,6
chr7	100071867	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:100071867_A_C:100071867:0,1,1,0
chr7	100071869	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,13;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,1,0
chr7	100071874	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,13;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:100071867_A_C:100071867:0,1,1,0
chr7	100071877	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,12;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:100071867_A_C:100071867:1,1,1,0
chr7	100071882	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,12;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:100071867_A_C:100071867:1,1,1,0
chr7	100071884	.	GA	CC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:100071867_A_C:100071867:1,1,1,0
chr7	100071891	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:100071867_A_C:100071867:3,1,1,0
chr7	100083078	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:5,11:6,9:1,10,0,20
chr7	100147963	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=156,146;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.221:19:6,0:7,0:0|1:100147963_A_T:100147963:10,5,4,0
chr7	100147970	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=149,142;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.149:22:7,0:10,1:0|1:100147963_A_T:100147963:12,7,3,0
chr7	100175473	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr7	100175505	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:6,0:5,2:5,7,0,2
chr7	100189618	.	TT	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:100189618_TT_AA:100189618:0,4,0,1
chr7	100189619	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:100189619_T_C:100189619:0,3,0,1
chr7	100189621	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:100189618_TT_AA:100189618:0,4,0,1
chr7	100189622	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:100189619_T_C:100189619:0,4,0,1
chr7	100189624	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:100189618_TT_AA:100189618:0,4,0,1
chr7	100192186	.	C	CAAATCACTAAGCCAATAAAAACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	100197594	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=69,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:100197594_A_C:100197594:0,4,1,0
chr7	100197598	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,12;MFRL=69,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:100197594_A_C:100197594:0,4,1,0
chr7	100197866	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.768:24:3,12:2,6:0,5,4,15
chr7	100198609	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=271,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100198609_G_A:100198609:0,1,0,1
chr7	100198611	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=271,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:100198609_G_A:100198609:0,1,0,1
chr7	100200275	.	C	CACAAATATTTCCATAAAACAAATGATACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	100201230	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=17,30;MFRL=97,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:0,1:1,1:0,5,0,2
chr7	100201247	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=99,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr7	100202682	.	C	CCCCCCCCCCCCCTACACTCG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=154,212;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.360:6:1,1:3,1:0,4,2,0
chr7	100212388	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:0,2:5,0:6,0,2,0
chr7	100225031	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,2:6,5:5,5,4,3
chr7	100225797	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=132,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,1:0|1:100225797_A_C:100225797:0,3,2,0
chr7	100225803	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=66,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,0:1,1:0|1:100225797_A_C:100225797:0,4,2,0
chr7	100225806	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=66,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,0:1,0:0|1:100225797_A_C:100225797:0,4,2,0
chr7	100230864	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,2:4,5:6,2,6,1
chr7	100239046	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:5,2:4,0:7,3,2,0
chr7	100240771	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr7	100273961	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=107,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:3,6:9,3:4,8,4,5
chr7	100276112	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,0:9,4:9,7,0,4
chr7	100280896	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr7	100281685	.	AGCTGCT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GCT;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr7	100282538	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:0,3,5,0
chr7	100282591	.	TTGAGCTGGGGCC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:2,3:3,2,6,0
chr7	100284246	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=258,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr7	100284510	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,6:0,0,5,9
chr7	100284913	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,8:0,0:0,0,12,0
chr7	100285688	.	C	CAGACTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:3,0,0,1
chr7	100285812	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=152,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:3,5:9,4:7,5,8,3
chr7	100285888	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=107,138;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,2:1,6:2,1,6,2
chr7	100285974	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,1:0,6:0,0,0,8
chr7	100319340	.	C	CAGCTGTTTCTGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=209,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100319340_C_CAGCTGTTTCTGCA:100319340:0,1,0,1
chr7	100319343	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=209,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100319340_C_CAGCTGTTTCTGCA:100319340:0,1,0,1
chr7	100320759	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.621:24:4,7:4,8:0,9,6,9
chr7	100344359	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=61,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.604:8:0,1:3,4:2,1,0,5
chr7	100345106	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=130,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,5:3,0:5,1,5,0
chr7	100346111	.	C	CTTTAGTAGTCAGGATAGGCCAAGTTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=121,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	100348428	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=120,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:0|1:100348428_C_CA:100348428:4,4,1,1
chr7	100348432	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=120,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:100348428_C_CA:100348428:4,4,1,1
chr7	100357289	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr7	100359797	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,1:2,1:6,4,2,0
chr7	100361391	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.475:21:5,6:6,4:2,9,7,3
chr7	100361580	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,0,3
chr7	100363243	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:100363243_C_T:100363243:0,3,0,1
chr7	100363244	.	CTGCA	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:100363243_C_T:100363243:0,3,0,1
chr7	100363250	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:100363243_C_T:100363243:0,3,0,1
chr7	100363252	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:100363243_C_T:100363243:0,3,0,1
chr7	100363277	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	100364105	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,2:1,1:2,0,3,0
chr7	100364954	.	C	CTACTTCTGAAGTTGGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	100365567	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,4:1,3:2,3,4,3
chr7	100365613	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr7	100366203	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,4:6,6:6,6,8,2
chr7	100366381	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.440:9:2,0:1,0:0|1:100366381_T_G:100366381:0,5,0,4
chr7	100366387	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.440:9:2,0:1,1:0|1:100366381_T_G:100366381:0,5,0,4
chr7	100369381	.	G	GTTTTAAGACATTTAAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr7	100371474	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.645:29:5,8:5,11:0|1:100371474_G_A:100371474:4,6,6,13
chr7	100371476	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,20:0.656:30:5,7:5,11:0|1:100371474_G_A:100371474:4,6,6,14
chr7	100373271	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr7	100383815	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	100385532	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:5,2:4,2:4,6,2,2
chr7	100385536	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:7,0:0|1:100385536_C_A:100385536:5,7,1,1
chr7	100385537	.	G	GAAAAATGGTATAAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:6,0:0|1:100385536_C_A:100385536:5,7,1,1
chr7	100386812	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=124,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,2:5,4:5,4,3,3
chr7	100386900	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr7	100388741	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	100389928	.	GA	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=224,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr7	100390235	.	CACCA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=198,250;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100390235_CACCA_C:100390235:0,1,0,1
chr7	100390242	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=198,250;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100390235_CACCA_C:100390235:0,1,0,1
chr7	100390261	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100390261_G_C:100390261:0,0,0,1
chr7	100390264	.	T	TCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100390261_G_C:100390261:0,0,0,1
chr7	100391644	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr7	100391858	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:2,3,0,4
chr7	100395117	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,0;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,0,2
chr7	100395422	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=274,206;MMQ=60,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100395422_CA_TG:100395422:0,1,0,1
chr7	100395425	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=274,206;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100395422_CA_TG:100395422:0,1,0,1
chr7	100395429	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=274,206;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:100395422_CA_TG:100395422:0,1,0,1
chr7	100395431	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=223,206;MMQ=60,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:100395422_CA_TG:100395422:0,1,0,1
chr7	100395439	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=223,206;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100395422_CA_TG:100395422:0,1,0,1
chr7	100401270	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	100456605	.	G	GTGCATTCAACGAGTCCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:2,1:2,0:1,4,0,1
chr7	100459585	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.453:11:4,4:2,1:1,5,0,5
chr7	100465243	.	G	GCTTACAACTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=227,944;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100465243_G_GCTTACAACTTC:100465243:0,1,1,0
chr7	100465245	.	G	GGCCTGCGTTTCTCCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=227,944;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100465243_G_GCTTACAACTTC:100465243:0,1,1,0
chr7	100465248	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=227,944;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100465243_G_GCTTACAACTTC:100465243:0,1,1,0
chr7	100466091	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:7,0:8,4:9,7,3,1
chr7	100467975	.	C	CCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,3:0,0,9,3
chr7	100470435	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=191,139;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr7	100479008	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:2,5:1,3:1,2,2,8
chr7	100481906	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=106,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.567:7:1,0:0,0:0,3,0,4
chr7	100482222	.	G	GCAAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:100482222_G_GCAAT:100482222:0,1,0,1
chr7	100482223	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100482222_G_GCAAT:100482222:0,1,0,1
chr7	100482227	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100482222_G_GCAAT:100482222:0,0,0,1
chr7	100485620	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.427:7:1,0:1,0:0|1:100485620_C_G:100485620:0,4,3,0
chr7	100485624	.	TC	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.382:8:2,0:3,0:0|1:100485620_C_G:100485620:0,5,3,0
chr7	100485629	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:0|1:100485620_C_G:100485620:0,6,2,0
chr7	100486035	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.415:31:12,6:6,5:12,6,9,4
chr7	100486604	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,72;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.090:32:14,0:11,2:8,22,2,0
chr7	100486696	.	T	TGGGGGGGGG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:5,0:1,0:1,5,2,0
chr7	100487357	.	GCCCCGCCCCTCCCCT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	100488658	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,26:0.539:48:13,20:9,4:10,12,16,10
chr7	100489010	.	C	CAAGGTCTACCTCTTTGACTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	100675376	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=110,86;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,5:6,1:7,4,2,4
chr7	100675512	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:10,6:2,8:9,3,7,7
chr7	100676359	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,2:8,0:12,11,0,2
chr7	100677279	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,171;MMQ=49,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,9:0.222:43:14,6:17,2:0|1:100677279_G_C:100677279:16,18,5,4
chr7	100677285	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,159;MMQ=49,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,10:0.212:50:19,6:19,4:0|1:100677279_G_C:100677279:20,20,5,5
chr7	100677455	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=161,124;MMQ=60,45;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.354:18:7,3:3,3:5,7,6,0
chr7	100677502	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=132,161;MMQ=60,57;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:12,4:16,2:18,11,3,3
chr7	100677516	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=145,121;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,9:0.263:36:14,3:12,6:0|1:100677516_A_G:100677516:15,12,3,6
chr7	100677519	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=141,121;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,9:0.256:37:13,3:12,6:0|1:100677516_A_G:100677516:16,12,3,6
chr7	100677523	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=136,129;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,14:0.405:35:8,5:11,7:0|1:100677523_A_C:100677523:13,8,6,8
chr7	100677526	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=145,132;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,11:0.353:32:9,5:11,5:0|1:100677523_A_C:100677523:12,9,4,7
chr7	100677556	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=136,132;MMQ=40,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,2:8,2:10,11,2,2
chr7	100677816	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=123,170;MMQ=52,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.286:40:11,7:18,4:8,21,5,6
chr7	100678086	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,17:0,10:0,0,12,16
chr7	100678372	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=137,61;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.224:38:17,5:13,3:18,12,5,3
chr7	100678405	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=31,32;MFRL=137,90;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,8:0.237:36:15,6:13,2:0|1:100678405_T_C:100678405:15,13,5,3
chr7	100678407	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=33,24;MFRL=140,90;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.231:37:13,4:12,2:0|1:100678405_T_C:100678405:16,13,5,3
chr7	100678417	.	AA	CC	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=141,90;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,8:0.265:32:12,6:10,2:0|1:100678405_T_C:100678405:13,11,5,3
chr7	100678421	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=30,28;MFRL=99,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.592:30:7,6:5,7:7,5,9,9
chr7	100678426	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=144,140;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:10,3:11,1:0|1:100678405_T_C:100678405:12,12,3,1
chr7	100678433	.	AC	TA	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=145,118;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:8,3:9,0:0|1:100678405_T_C:100678405:12,9,2,1
chr7	100678442	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=32,35;MFRL=146,118;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:7,2:12,0:0|1:100678405_T_C:100678405:9,11,2,1
chr7	100678481	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=29,32;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.138:20:10,0:7,2:0|1:100678481_A_T:100678481:5,13,1,1
chr7	100678483	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.138:20:10,0:8,2:0|1:100678481_A_T:100678481:5,13,1,1
chr7	100678610	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=125,141;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:7,6:1,6:0|1:100678610_A_T:100678610:6,2,6,6
chr7	100678616	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=125,143;MMQ=60,47;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.571:19:7,5:1,6:0|1:100678610_A_T:100678610:6,2,5,6
chr7	100678622	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=125,143;MMQ=60,49;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:7,5:1,7:0|1:100678610_A_T:100678610:6,2,5,7
chr7	100679289	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,77;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:14,3:18,0:18,16,2,1
chr7	100679414	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:6,10:11,8:5,12,12,6
chr7	100679760	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=133,182;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:6,3,0,2
chr7	100679809	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,2:1,5:2,6,4,3
chr7	100680370	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=128,183;MMQ=60,52;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.365:23:11,2:2,6:4,11,3,5
chr7	100681172	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,133;MMQ=57,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:5,5:4,4:5,4,6,4
chr7	100684172	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.438:23:5,5:6,4:5,8,7,3
chr7	100692553	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr7	100694854	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:4,1:0,1:3,1,2,0
chr7	100695058	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr7	100696411	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=99,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,5:3,2:1,3,1,6
chr7	100696799	.	AG	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr7	100696813	.	CCA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=159,154;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100696813_CCA_C:100696813:0,1,0,1
chr7	100696815	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	100696817	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=159,154;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100696813_CCA_C:100696813:0,1,0,1
chr7	100701451	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	100731505	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	100775087	.	A	AAAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAC;STR;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.924:9:0,2:0,5:0,0,9,0
chr7	100776931	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.619:8:0,4:2,1:2,1,5,0
chr7	100780176	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr7	100797827	.	G	GAGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=135,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:1,3,0,1
chr7	100800632	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,3:2,2:0|1:100800632_G_GA:100800632:3,0,5,1
chr7	100800635	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0|1:100800632_G_GA:100800632:3,0,5,1
chr7	100815279	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:11,0,3,0
chr7	100816527	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,12,2
chr7	100818101	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	100839202	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,3,1
chr7	100839373	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:100839373_G_T:100839373:2,2,0,1
chr7	100839375	.	C	CTGGAAGTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:100839373_G_T:100839373:2,2,0,1
chr7	100839378	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:100839373_G_T:100839373:2,2,0,1
chr7	100841389	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	100850048	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:3,4:4,12:5,2,9,7
chr7	100853482	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,10;MFRL=154,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:1,0:2,0:0|1:100853482_T_G:100853482:0,6,4,0
chr7	100853485	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=154,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:4,0:2,0:0|1:100853482_T_G:100853482:0,6,4,0
chr7	100853486	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,11;MFRL=154,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:3,0:1,1:0|1:100853482_T_G:100853482:0,6,4,0
chr7	100853490	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,9;MFRL=154,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.414:10:4,1:2,0:0|1:100853482_T_G:100853482:0,6,4,0
chr7	100856223	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:6,3,0,2
chr7	100861517	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=127,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,10:0.173:49:18,0:16,1:4,35,10,0
chr7	100865847	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.607:16:5,2:1,7:6,0,10,0
chr7	100965096	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=45.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,5:0,8:0,0,0,14
chr7	101183108	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	101188812	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	101188852	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	101196488	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr7	101199257	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	101200669	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,3,3
chr7	101265350	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	101266379	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,1,4
chr7	101267435	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,5,3
chr7	101459386	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=123,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:5,4:3,1:2,6,1,5
chr7	101559470	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:8,0:14,4:10,12,2,2
chr7	101671273	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=111,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr7	101671294	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=112,224;MMQ=50,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:5,3:5,1:0|1:101671294_G_A:101671294:8,2,5,2
chr7	101671302	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=109,182;MMQ=50,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.459:22:5,6:7,3:0|1:101671294_G_A:101671294:9,3,8,2
chr7	101713567	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	101713590	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	101740606	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0|1:101740606_T_G:101740606:0,0,6,1
chr7	101740610	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0|1:101740606_T_G:101740606:0,0,7,1
chr7	101740827	.	T	TTC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,14:0,5:0,0,2,17
chr7	101758584	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,4,11
chr7	101843378	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,1:9,1:0|1:101843378_C_T:101843378:9,11,0,2
chr7	101843388	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:9,1:0|1:101843378_C_T:101843378:10,12,0,2
chr7	101870599	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	101892276	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101892276_T_TGG:101892276:0,1,1,0
chr7	101892287	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101892276_T_TGG:101892276:0,1,1,0
chr7	101917647	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:1,3,1,2
chr7	101925065	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=251,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	101928585	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,1,6
chr7	101957604	.	CC	GG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,18;MFRL=78,301;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:2,2,1,0
chr7	102036769	.	CGGAGACTGCGTATGCG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.865:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	102037956	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr7	102038153	.	CTGTGTG	C,CTG	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,34,20;MFRL=132,131,93;MMQ=60,60,60;MPOS=23,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=TG;STR;TLOD=7.99,5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,3:0.248,0.237:16:4,2,1:3,3,2:0,8,1,7
chr7	102039900	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr7	102046359	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	102046399	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102046399_T_A:102046399:0,1,0,1
chr7	102046401	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102046399_T_A:102046399:0,1,0,1
chr7	102079611	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,317;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.319:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr7	102106706	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:102106706_C_T:102106706:9,12,1,1
chr7	102106716	.	GGGTA	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=143,55;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:11,2:0|1:102106706_C_T:102106706:9,13,1,1
chr7	102106721	.	A	ATT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=143,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:102106706_C_T:102106706:9,13,1,1
chr7	102106724	.	G	GCA	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:9,2:0|1:102106706_C_T:102106706:8,13,1,1
chr7	102106727	.	TGAG	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:102106706_C_T:102106706:6,13,1,1
chr7	102106732	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:102106706_C_T:102106706:5,14,1,1
chr7	102109609	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=101,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,1:1,2:0,2,1,3
chr7	102113093	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,3:4,7:8,0,8,2
chr7	102113565	.	G	GATCACTTGAACCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102113565_G_GATCACTTGAACCA:102113565:0,0,0,1
chr7	102113568	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102113565_G_GATCACTTGAACCA:102113565:0,0,0,1
chr7	102119322	.	T	C	.	.	DP=125;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=150,155;MMQ=40,55;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,44:0.377:117:37,23:34,20:8,65,7,37
chr7	102119339	.	G	T	.	.	DP=119;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=163,154;MMQ=60,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,29:0.243:118:41,14:42,12:10,79,0,29
chr7	102119410	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=195,230;MMQ=27,37;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:2,1:3,2:0,7,0,3
chr7	102136550	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,172;MMQ=52,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,28:0.369:76:19,12:27,14:33,15,28,0
chr7	102136703	.	AGGGGG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=132,211;MMQ=27,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,1:0,0:0,4,0,1
chr7	102136706	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,40;MPOS=-19;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	102136734	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=16,18;MFRL=245,200;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.626:5:0,0:0,0:0,2,0,3
chr7	102137056	.	TGCCCTGG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,138;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr7	102147246	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=141,103;MMQ=57,27;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.169:25:11,1:10,2:11,10,0,4
chr7	102147284	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=138,156;MMQ=40,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:3,7,0,4
chr7	102210253	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,148;MMQ=24,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,10:0.199:53:20,5:23,5:43,0,10,0
chr7	102213000	.	T	C	.	.	DP=108;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=166,162;MMQ=27,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,7:0.070:103:47,4:45,2:9,87,7,0
chr7	102213012	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=173,175;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,11:0.132:82:38,8:33,1:7,64,0,11
chr7	102213065	.	A	T	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=191,200;MMQ=40,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,10:0.164:65:27,7:26,3:4,51,0,10
chr7	102246447	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,196;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:1,9,1,1
chr7	102279670	.	A	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=136,127;MMQ=27,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,7:0.138:56:23,3:23,4:0,49,0,7
chr7	102312080	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=144.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,29:0,18:0,0,0,47
chr7	102398410	.	C	CT	.	.	DP=141;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,131;MMQ=57,39;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,9:0.080:115:57,1:43,6:23,83,1,8
chr7	102417637	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=160,145;MMQ=55,21;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:24,1:19,3:43,0,4,0
chr7	102448664	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=148,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr7	102518909	.	A	AGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:4,1:2,4,2,5
chr7	102553603	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:5,7:8,7:5,8,5,9
chr7	102553672	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:12,3:6,14,0,3
chr7	102574651	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:3,4,4,3
chr7	102574999	.	TGAA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=92,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.602:18:1,4:6,6:4,3,7,4
chr7	102724372	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	102727051	.	CT	C,CTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=175,167,161;MMQ=60,60,60;MPOS=23,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.52,7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,6,5:0.280,0.262:20:7,4,3:1,1,2:9,0,10,1
chr7	102739043	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr7	102739085	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=179,212;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:7,4:14,0:0,21,0,4
chr7	102755702	.	TT	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=192,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:102755702_TT_GC:102755702:0,4,0,1
chr7	102755705	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=192,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:102755702_TT_GC:102755702:0,4,0,1
chr7	102755718	.	G	GCTGTGTGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=208,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102755718_G_GCTGTGTGC:102755718:0,1,0,1
chr7	102755719	.	A	AGGCTGTGTGAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=208,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,1:0,0:0|1:102755718_G_GCTGTGTGC:102755718:0,1,0,1
chr7	102760511	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:5,2:5,4:4,6,4,3
chr7	102760722	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	102944812	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:8,1:7,2:14,2,2,1
chr7	102948040	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,4:2,5:4,0,6,3
chr7	102963234	.	C	CCCTTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,0:0,1:0|1:102963234_C_CCCTTCT:102963234:0,1,0,1
chr7	102963235	.	A	ACATACTCAGGTAATTAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102963234_C_CCCTTCT:102963234:0,1,0,1
chr7	103017354	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,2:12,0:3,22,0,2
chr7	103018016	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr7	103018219	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:0|1:103018219_T_C:103018219:3,7,2,6
chr7	103018231	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=184,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,2:0.142:19:8,0:9,2:1|0:103018219_T_C:103018219:1,16,1,1
chr7	103018238	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=172,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.176:15:6,0:7,2:1|0:103018219_T_C:103018219:1,12,1,1
chr7	103018240	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=172,55;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.176:15:6,0:6,2:1|0:103018219_T_C:103018219:1,12,1,1
chr7	103019613	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr7	103033573	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	103124207	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,3:4,5:4,6,3,5
chr7	103124380	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=152,151;MMQ=43,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:103124380_A_G:103124380:0,6,0,2
chr7	103124394	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=195,147;MMQ=53,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:103124380_A_G:103124380:0,4,0,1
chr7	103130403	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=114,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,0,4
chr7	103132503	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.494:18:3,2:6,6:0,9,2,7
chr7	103138517	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr7	103141147	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=120,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:2,8:5,2:6,2,6,4
chr7	103141437	.	AT	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr7	103155665	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:4,2,2,5
chr7	103155944	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,2:2,2:0,4,0,4
chr7	103155951	.	A	AAAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr7	103162414	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr7	103175965	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr7	103175996	.	T	TATAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=194,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:103175996_T_TATAA:103175996:0,4,0,1
chr7	103176000	.	A	ACC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=194,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:103175996_T_TATAA:103175996:0,4,0,1
chr7	103176002	.	A	AACC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=194,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:103175996_T_TATAA:103175996:0,4,0,1
chr7	103180918	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=120,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr7	103180934	.	A	ATATGGAATTGTCTCTGTATCCCCAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=175,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	103185877	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	103191428	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	103202425	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103202425_AC_A:103202425:0,1,1,0
chr7	103202431	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,14;MFRL=180,56;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:103202425_AC_A:103202425:0,3,1,0
chr7	103202440	.	GAC	TCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=202,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0,4,1,0
chr7	103207234	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr7	103270642	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr7	103294717	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=141,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,1:3,3:1,5,0,4
chr7	103389954	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,3,15
chr7	103417134	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0|1:103417134_G_T:103417134:0,0,0,13
chr7	103417139	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0|1:103417134_G_T:103417134:0,0,0,11
chr7	103557697	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr7	103824679	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=169,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr7	103824722	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=232,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:103824722_C_T:103824722:0,2,0,1
chr7	103824726	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=232,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:103824722_C_T:103824722:0,2,0,1
chr7	103835732	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr7	103838120	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.488:33:10,9:6,7:17,0,15,1
chr7	103838148	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.450:51:16,17:12,5:24,4,19,4
chr7	103844557	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=75.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.526:49:10,15:13,9:20,3,24,2
chr7	103969194	.	CAGG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AGG;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	104703826	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=132,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:21,3:15,0:22,15,2,1
chr7	104719484	.	C	CCTTTTAAAGGGAATTTTTTTCATAAAGGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.318:6:2,1:2,0:1,4,0,1
chr7	104745818	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr7	104747784	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:4,2:10,2:6,11,1,3
chr7	104748406	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.489:6:1,1:2,0:0,3,0,3
chr7	104748407	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,15;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.535:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr7	104748437	.	G	GAGTAGCAAATAAGTCTTATCTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	104758250	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,3:2,2:6,0,5,0
chr7	104783877	.	T	TTCTCTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	104800939	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=109.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,24,8
chr7	104808348	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:7,0:17,0,2,0
chr7	104808386	.	G	GA	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.486:41:12,11:8,9:20,1,18,2
chr7	104844328	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr7	105112489	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:7,0,6,1
chr7	105122891	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.583:5:0,1:2,1:0,2,0,3
chr7	105146593	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=66.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,16:0,0,17,7
chr7	105149051	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=211,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,0:2,2:1,4,0,2
chr7	105192238	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:105192238_TG_CA:105192238:0,4,0,1
chr7	105192242	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:105192238_TG_CA:105192238:0,4,0,1
chr7	105192252	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:105192238_TG_CA:105192238:0,2,0,1
chr7	105250904	.	AG	GA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,11:0,4:0,0,12,3
chr7	105250951	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.300:19:6,3:7,0:0,13,6,0
chr7	105254801	.	AGAG	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GAG;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.118:31:14,1:10,2:23,5,2,1
chr7	105305797	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=137,70;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,0:6,3:5,10,1,2
chr7	105517053	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,31;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:105517053_G_A:105517053:0,1,0,1
chr7	105517056	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:105517053_G_A:105517053:0,1,0,1
chr7	105517059	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:105517053_G_A:105517053:0,0,0,1
chr7	105656471	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,1:7,3:3,10,0,4
chr7	105673231	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=217842,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:105673231_A_C:105673231:0,2,0,1
chr7	105673233	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=217842,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:105673231_A_C:105673231:0,2,0,1
chr7	105673243	.	GAG	CTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:105673231_A_C:105673231:0,0,0,1
chr7	105732429	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr7	105733619	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr7	105752555	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,13,3
chr7	105752820	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.860:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr7	105753082	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	105893681	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:0,7,0,7
chr7	105904150	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:6,4:0,6:0,7,0,10
chr7	105910666	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,22:0.378:59:12,10:24,12:29,8,12,10
chr7	106510076	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	106519943	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,16:0,10:0,0,20,7
chr7	106519955	.	TC	AT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:16,2:13,2:21,9,4,0
chr7	106526776	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:2,13,0,2
chr7	106768839	.	G	GAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	106781445	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr7	106786952	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr7	106836195	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr7	106877003	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:18,2:10,1:11,17,0,3
chr7	106888946	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=14,22;MFRL=154,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,1:1,0:0,8,1,1
chr7	106888967	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:0,8,1,2
chr7	106965009	.	A	G	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=112.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,39:0.498:78:14,12:25,25:5,34,5,34
chr7	106965039	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.447:45:9,5:15,15:0,25,0,20
chr7	107115884	.	A	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:31,3:33,0:35,30,2,1
chr7	107216738	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr7	107217068	.	TG	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.954:16:0,7:0,7:0,0,1,15
chr7	107218033	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	107399583	.	ATC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,0:1,10,0,2
chr7	107414419	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,12:0,0,14,11
chr7	107531832	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr7	107542662	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=211,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr7	107545799	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,7:7,4:10,0,9,2
chr7	107564366	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:6,4:7,3:10,3,5,2
chr7	107564536	.	TGG	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=186,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,0:3,2:0|1:107564536_TGG_T:107564536:5,5,0,2
chr7	107564539	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,3:0.265:13:6,1:3,2:1|0:107564536_TGG_T:107564536:5,5,0,3
chr7	107564542	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,3:0.265:13:5,1:4,2:1|0:107564536_TGG_T:107564536:5,5,0,3
chr7	107564933	.	G	GTCATCATAGTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	107575792	.	GTTTTTTTTTTTTTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=26,12;RU=T;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr7	107577448	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.634:9:1,3:2,2:0|1:107577448_CT_C:107577448:3,0,6,0
chr7	107577456	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=226,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0|1:107577448_CT_C:107577448:5,0,5,0
chr7	107600288	.	A	AGAAGAATATAAATCCAAATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=211,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	107613379	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:3,0:8,0,4,0
chr7	107616385	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=205,108;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.469:4:1,0:0,1:0|1:107616385_G_GC:107616385:0,3,0,1
chr7	107616386	.	T	TGCAGAAAACAGGACTATGGAGGTAGGGCTGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=204,108;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.485:3:1,0:0,1:0|1:107616385_G_GC:107616385:0,2,0,1
chr7	107671478	.	A	ACCCCTCTAATCACCCCCAAGCCCTCTCTAGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr7	107746865	.	GA	G,GAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,35,32;MFRL=147,199,152;MMQ=60,60,60;MPOS=21,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.46,6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,5:0.162,0.219:23:4,2,0:10,2,5:14,0,8,1
chr7	107747081	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,2:6,1:1,7,0,3
chr7	107791018	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:6,1,2,0
chr7	107800092	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	107800953	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:5,4:6,8:4,7,2,11
chr7	107808639	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=188,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr7	107815858	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr7	107820911	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr7	107822198	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,3:8,2:12,0,5,0
chr7	107822396	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:10,6:7,9:5,12,4,11
chr7	107824572	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr7	107834613	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,10:0,0,12,9
chr7	107834624	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,10,10
chr7	107836117	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	107875170	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr7	108131925	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:3,9,0,3
chr7	108137253	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr7	108142919	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=82,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:6,4:5,5:4,8,2,7
chr7	108212110	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=54.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:8,10:3,7:11,0,17,0
chr7	108524444	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.629:3:1,1:0,1:0|1:108524444_C_CA:108524444:1,0,2,0
chr7	108524462	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.252:10:6,0:2,0:0|1:108524444_C_CA:108524444:8,0,2,0
chr7	110764651	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,0:7,2:3,7,0,2
chr7	111372244	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:7,1,4,1
chr7	111372452	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=157,157;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:111372452_A_C:111372452:1,3,0,1
chr7	111372457	.	C	CTTTCGACTGAGGCTAGAGACTGGCACAGTTTTCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=157,157;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:111372452_A_C:111372452:1,3,0,1
chr7	111379582	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=180,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr7	111379634	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr7	111386511	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=234,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	111398635	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:7,0:7,2:13,3,1,1
chr7	111405347	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:17,0:17,3:0,34,0,3
chr7	111418516	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,95;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr7	111512224	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:4,2,3,1
chr7	111634368	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	111644231	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,0:4,4:0|1:111644231_A_G:111644231:0,7,0,4
chr7	111644234	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,0:3,4:0|1:111644231_A_G:111644231:0,7,0,4
chr7	111926896	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.790:7:0,3:0,2:0,1,5,1
chr7	111980069	.	T	TCAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	112095782	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr7	112096043	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.691:24:2,8:5,8:6,1,8,9
chr7	112099136	.	TATA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr7	112101909	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,23:0.365:63:21,9:18,12:35,5,15,8
chr7	112107999	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=98,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:3,4:6,6:7,2,10,0
chr7	112115658	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	112130009	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.578:12:1,4:3,3:0,5,1,6
chr7	112555294	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=154,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:11,0,2,0
chr7	113518502	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr7	113520256	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=218,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr7	113520262	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr7	114210814	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,4:6,5:10,1,9,0
chr7	114271579	.	CCAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAG;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:7,1:7,2:15,0,3,0
chr7	114284882	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:0,0:1,0:0,2,0,1
chr7	114298393	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=75,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:114298393_T_A:114298393:0,2,0,1
chr7	114298398	.	C	CAGAATAGCCAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=75,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:114298393_T_A:114298393:0,2,0,1
chr7	114303472	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=217,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr7	114303491	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.311:10:5,1:2,1:7,0,3,0
chr7	114303617	.	CTT	C,CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,20,20;MFRL=80,153,119;MMQ=60,60,60;MPOS=18,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.71,6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,5:0.206,0.399:13:2,1,0:3,1,3:1,4,1,7
chr7	114562947	.	AT	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.116:50:17,0:24,5:39,6,3,2
chr7	115591099	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,2:7,0:0,7,0,2
chr7	115850675	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.490:37:7,5:11,13:18,1,18,0
chr7	115850835	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=20,11;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,9:0.101:64:12,1:16,1:11,44,0,9
chr7	115850868	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=16,13;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.198:38:8,0:6,0:0,30,0,8
chr7	116140076	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,0,19
chr7	116140275	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr7	116140524	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,4:4,5:4,8,2,7
chr7	116145937	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=125,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr7	116145957	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=206,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,4:3,4:3,0,5,3
chr7	116381121	.	GTTT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:0,1:0,1:0,5,1,1
chr7	116395341	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:12,3,2,0
chr7	116409675	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=40,33;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr7	116421967	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr7	116556097	.	GT	G,GTT	.	.	DP=132;ECNT=2;MBQ=34,34,34;MFRL=138,128,157;MMQ=60,60,60;MPOS=12,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.96,22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:75,10,20:0.081,0.190:105:34,4,11:36,5,8:66,9,27,3
chr7	116556111	.	C	A	.	.	DP=153;ECNT=2;MBQ=19,10;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,38:0.197:142:25,0:24,0:58,46,38,0
chr7	116606301	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=13,20;MFRL=285,205;MMQ=47,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.686:4:0,0:0,2:0,1,0,3
chr7	116607501	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,5,15
chr7	116608490	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=69,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:0|1:116608490_G_A:116608490:1,6,1,1
chr7	116608493	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=52,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:116608490_G_A:116608490:1,5,1,1
chr7	116660803	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr7	116811037	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,9:0,0,8,15
chr7	116862194	.	G	GTCCACCGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr7	116862206	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:116862206_A_T:116862206:0,1,0,1
chr7	116862212	.	G	GTATTGTCTCTCATAATTCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:116862206_A_T:116862206:0,1,0,1
chr7	116862214	.	G	GAGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:116862206_A_T:116862206:0,1,0,1
chr7	116863126	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116863126_CGG_C:116863126:0,1,0,1
chr7	116863130	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:116863126_CGG_C:116863126:0,1,0,1
chr7	116963129	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	117120141	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=111,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:1,3:5,6:2,4,7,2
chr7	117176568	.	AGATT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GATT;STR;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.726:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr7	117188660	.	A	ATG	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TG;STR;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,24:0.778:30:3,12:3,9:6,0,24,0
chr7	117188736	.	C	A	.	.	DP=105;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=145,156;MMQ=40,27;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,27:0.266:103:31,19:44,8:33,43,26,1
chr7	117188750	.	C	T	.	.	DP=106;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=148,156;MMQ=40,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,11:0.107:105:43,8:50,2:44,50,11,0
chr7	117188797	.	A	G	.	.	DP=90;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=156,144;MMQ=40,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,11:0.139:84:37,6:35,5:32,41,0,11
chr7	117188840	.	AGTT	A	.	.	DP=151;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=144,169;MMQ=40,27;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:129,12:0.091:141:57,7:52,5:75,54,2,10
chr7	117188850	.	G	T	.	.	DP=147;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=138,171;MMQ=40,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,23:0.167:140:62,14:52,8:71,46,5,18
chr7	117188877	.	G	T	.	.	DP=152;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=134,175;MMQ=60,27;MPOS=-1;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:135,6:0.048:141:69,3:63,3:68,67,2,4
chr7	117199457	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=127,253;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr7	117235196	.	CAT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,1:4,5:0,8,0,6
chr7	117243826	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=113,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr7	117251765	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,1:11,1:19,7,2,0
chr7	117364726	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:16,3:2,0:7,11,3,0
chr7	117395684	.	GTCA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:117395684_GTCA_G:117395684:0,1,0,1
chr7	117395690	.	ACAGCACTTGGC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=177,194;MMQ=50,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:117395684_GTCA_G:117395684:0,2,0,1
chr7	117395715	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=170,184;MMQ=39,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117395715_T_C:117395715:0,1,0,1
chr7	117395717	.	TA	GG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=170,184;MMQ=39,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117395715_T_C:117395715:0,1,0,1
chr7	117395721	.	AA	GG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=170,184;MMQ=39,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117395715_T_C:117395715:0,1,0,1
chr7	117431086	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:1,0:4,2:4,1,2,0
chr7	117450792	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr7	117824239	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=95.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,17:0,0,14,17
chr7	117825834	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,11:0,0,0,22
chr7	117832138	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr7	117865028	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:5,8:8,7:4,9,7,8
chr7	117867945	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,0:1,4:8,0,4,0
chr7	117867960	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr7	117874476	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:7,6:3,6:6,4,10,2
chr7	117874610	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,5:5,5:7,6,5,5
chr7	117876264	.	A	ATG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=TG;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.684:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	117880076	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:0,2:0,3,0,3
chr7	119915136	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:5,4,0,2
chr7	120428607	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,7:0,0,18,0
chr7	120450658	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,7:0,0,6,14
chr7	120613419	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr7	120739962	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr7	120740225	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=319,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	120764573	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr7	120770437	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	120776080	.	CT	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:13,1:17,1:30,1,3,0
chr7	120776097	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.510:41:8,10:11,8:18,2,20,1
chr7	120884453	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr7	120906485	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,284;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:2,5,0,2
chr7	120965464	.	G	GCACC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CACC;STR;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,3:1,3:4,1,6,1
chr7	121000021	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=161,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,3:1,5:2,0,8,0
chr7	121012196	.	GA	G	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.078:59:26,1:25,3:21,34,1,3
chr7	121012212	.	T	TAGAAACC	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=150,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,2:0.053:54:25,0:22,2:19,33,0,2
chr7	121513699	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr7	121617017	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:0,5,0,5
chr7	121653374	.	GTGA	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGA;STR;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:8,5:8,6:0|1:121653374_GTGA_G:121653374:4,12,5,6
chr7	121653398	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.452:29:8,4:8,8:0|1:121653374_GTGA_G:121653374:4,12,4,9
chr7	121684683	.	CATT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr7	121684718	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	121695157	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,0:7,3:1,12,0,3
chr7	121698827	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,5:3,4:10,0,8,1
chr7	121718127	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=171,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:121718127_G_C:121718127:0,3,0,1
chr7	121718132	.	C	CACAATCATATCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=171,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:121718127_G_C:121718127:0,3,0,1
chr7	121719586	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:4,1:7,5:11,1,5,1
chr7	121719823	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:6,4:5,7:0,12,2,9
chr7	121738926	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=24,25;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.862:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chr7	121758290	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	121942442	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:1,1:1,3:0,3,0,6
chr7	121942832	.	G	GACA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0|1:121942832_G_GACA:121942832:0,0,17,2
chr7	121942847	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=102.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.963:24:0,14:0,8:0|1:121942832_G_GACA:121942832:0,0,19,5
chr7	121943433	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr7	121944527	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr7	121960407	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,3:6,3:1,7,2,4
chr7	121960438	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr7	121965437	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr7	121985541	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:121985541_T_C:121985541:0,0,3,0
chr7	121985556	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:121985541_T_C:121985541:2,1,2,0
chr7	122026329	.	G	GA	.	.	DP=150;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=94.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,50:0.412:122:28,26:39,18:48,24,42,8
chr7	122194751	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=129,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.323:16:7,1:4,4:2,9,1,4
chr7	122757505	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=67.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,20,4
chr7	122769084	.	A	AATCACCTGGACCTGCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	122809111	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	122840098	.	CTG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	123142588	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,4:3,0:7,0,4,0
chr7	123190493	.	A	ACTGGATACCACAAATC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=119.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,6:0,10:0,0,17,10
chr7	123190739	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:123190739_GT_G:123190739:1,2,0,1
chr7	123190740	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=93,171;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:2,0:0,1:1|0:123190739_GT_G:123190739:1,1,0,1
chr7	123190741	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:123190739_GT_G:123190739:1,2,0,1
chr7	123197559	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:4,6:5,2:1,9,2,6
chr7	123256427	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=107,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.583:24:5,10:4,4:3,7,10,4
chr7	123269541	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123269541_T_G:123269541:0,0,0,1
chr7	123269542	.	G	GATTAACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123269541_T_G:123269541:0,0,0,1
chr7	123269976	.	G	GGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=167,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:4,0,4,1
chr7	123296360	.	T	TTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=131,301;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:123296360_T_TTTA:123296360:1,0,0,1
chr7	123296364	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,30;MFRL=131,301;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:123296360_T_TTTA:123296360:1,0,0,1
chr7	123324546	.	AAT	A	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,6:0.081:82:39,2:31,4:71,5,6,0
chr7	123332378	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,3:1,0:4,0,3,0
chr7	123334965	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,0:3,6:0,9,1,5
chr7	123336804	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.402:20:9,6:3,1:0,12,0,8
chr7	124465509	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	124469267	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:8,8:12,7:18,2,12,3
chr7	124475296	.	TAAACA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAACA;STR;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:2,2:4,1,5,0
chr7	124481245	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=210,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:1,6,1,6
chr7	124492038	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:3,3:3,3:0,7,0,6
chr7	124499002	.	AT	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=122,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:3,4:5,2,7,1
chr7	126544012	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	127229298	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:127229298_G_GA:127229298:0,1,0,1
chr7	127229299	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:127229298_G_GA:127229298:0,1,0,1
chr7	127229302	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:127229298_G_GA:127229298:0,1,0,1
chr7	127229304	.	G	GTTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:127229298_G_GA:127229298:0,1,0,1
chr7	127229307	.	CC	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,27;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:127229298_G_GA:127229298:0,1,0,1
chr7	127229312	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,30;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:127229298_G_GA:127229298:0,1,0,1
chr7	127240528	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127240528_A_AT:127240528:0,1,0,1
chr7	127240530	.	G	GCGAAGGCCCTTTGCCCGCCACTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127240528_A_AT:127240528:0,1,0,1
chr7	127240546	.	C	CTGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	127251188	.	T	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,30:0,33:0,0,37,26
chr7	127251739	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.748:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	127253714	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr7	127254457	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr7	127254596	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:9,2:11,0:0|1:127254596_G_GA:127254596:7,13,0,2
chr7	127254597	.	G	GCA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:7,2:11,0:0|1:127254596_G_GA:127254596:7,13,0,2
chr7	127254598	.	T	TTTTGCCAGAA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:7,2:9,0:0|1:127254596_G_GA:127254596:7,13,0,2
chr7	127326917	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=126,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	127347733	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,9:0,0,6,18
chr7	127361269	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,8,0
chr7	127637772	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.079:60:33,0:20,4:40,16,3,1
chr7	127637816	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.558:43:12,14:6,10:12,7,11,13
chr7	127721327	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=132,208;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr7	127725711	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=187,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr7	127957893	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr7	127964848	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=159,169;MMQ=58,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	127976119	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr7	127992437	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	128000091	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	128000133	.	G	GAAAGAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128000133_G_GAAAGAT:128000133:0,0,0,1
chr7	128000134	.	C	CTCCAGAAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128000133_G_GAAAGAT:128000133:0,0,0,1
chr7	128000137	.	T	TCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128000133_G_GAAAGAT:128000133:0,0,0,1
chr7	128041250	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:128041250_A_C:128041250:0,1,0,1
chr7	128041254	.	G	GAACATGCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:128041250_A_C:128041250:0,1,0,1
chr7	128041257	.	C	CTGCCTAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:128041250_A_C:128041250:0,1,0,1
chr7	128137993	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	128141083	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,1,14
chr7	128141136	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	128142023	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr7	128142033	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,9:0,3:0,0,2,11
chr7	128388541	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=66,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	128400006	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=157,192;MMQ=60,38;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:128400006_C_CTT:128400006:0,5,0,2
chr7	128400015	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=153,192;MMQ=60,38;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:128400006_C_CTT:128400006:0,4,0,2
chr7	128400020	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=161,175;MMQ=57,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:128400020_C_A:128400020:0,4,0,1
chr7	128400021	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=165,179;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1|0:128400020_C_A:128400020:0,3,0,2
chr7	128400024	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=170,149;MMQ=50,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:1,0:1|0:128400006_C_CTT:128400006:0,4,0,1
chr7	128409225	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=220,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,6:3,4:0,5,2,8
chr7	128413997	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:128413997_C_G:128413997:0,0,0,1
chr7	128414012	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128413997_C_G:128413997:0,0,0,1
chr7	128414015	.	AA	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128413997_C_G:128413997:0,0,0,1
chr7	128414484	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,3,0
chr7	128415195	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:2,5:2,5:2,2,1,9
chr7	128415860	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=115,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:5,11:4,6:4,5,5,12
chr7	128455767	.	C	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=228,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,68:0.972:69:1,33:0,32:0,1,40,28
chr7	128490095	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=143,50;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:128490095_T_C:128490095:0,2,1,1
chr7	128490104	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=143,50;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:128490095_T_C:128490095:0,2,1,1
chr7	128490105	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=143,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:128490095_T_C:128490095:0,2,1,1
chr7	128490108	.	GG	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=143,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:128490095_T_C:128490095:0,2,1,1
chr7	128498641	.	ACACACACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,162;MMQ=28,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	128505732	.	C	CAAGAGGCGGGGGTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr7	128518623	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,47;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:3,4,1,1
chr7	128518636	.	C	CTGCTTAGAAACAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=125,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:5,3,1,1
chr7	128533514	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,5:0,0,4,4
chr7	128534119	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:128534119_G_T:128534119:6,10,1,1
chr7	128534127	.	T	TCA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=143,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:0|1:128534119_G_T:128534119:4,11,1,1
chr7	128534128	.	T	TGACTCTGCCCAGTACCC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=143,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:8,0:7,2:0|1:128534119_G_T:128534119:4,11,1,1
chr7	128547564	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	128586593	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=119,40;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:10,2:3,0:0|1:128586593_G_C:128586593:4,9,1,1
chr7	128586597	.	AG	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=111,40;MMQ=60,53;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:9,1:3,0:0|1:128586593_G_C:128586593:4,8,1,1
chr7	128587572	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	128629993	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,3:4,5:7,2,7,1
chr7	128630227	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:0,5,0,7
chr7	128785008	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr7	128802270	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=120,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:8,5,2,0
chr7	128804218	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	128845018	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,14:0,15:0,0,23,7
chr7	128845277	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	128845325	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr7	128845907	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr7	128846469	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	128851990	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=153,275;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:128851990_C_G:128851990:1,0,1,0
chr7	128851995	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=171,275;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:128851990_C_G:128851990:2,0,1,0
chr7	128851997	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,11;MFRL=171,275;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:128851990_C_G:128851990:2,0,1,0
chr7	129028857	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.792:12:2,6:0,4:2,0,10,0
chr7	129029391	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr7	129037029	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr7	129045660	.	G	GT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.140:33:15,2:13,1:19,9,3,2
chr7	129046237	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,1:10,1:10,15,1,1
chr7	129066492	.	T	TTATACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr7	129094195	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr7	129096518	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=202,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr7	129096534	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr7	129098313	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	129110452	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,3:5,0:7,0,2,1
chr7	129122659	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:2,2:3,2,3,0
chr7	129125352	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr7	129297447	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,14;MFRL=118,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.637:6:2,1:0,0:1,1,2,2
chr7	129297493	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=185,101;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:129297493_A_AT:129297493:0,4,0,1
chr7	129297494	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=185,101;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:129297493_A_AT:129297493:0,4,0,1
chr7	129297504	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=173,101;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:129297493_A_AT:129297493:0,4,0,1
chr7	129297508	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=173,158;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	129519555	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:0,6,1,5
chr7	129520694	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.662:13:0,6:4,3:4,0,8,1
chr7	129592297	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=21,21;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.642:6:0,1:1,1:1,1,4,0
chr7	129592309	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,0:2,1:0|1:129592309_A_C:129592309:0,3,4,0
chr7	129592311	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:1,0:1,1:0|1:129592309_A_C:129592309:0,4,4,0
chr7	129592315	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:1,1:4,0:0|1:129592309_A_C:129592309:2,4,4,0
chr7	129592321	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,11;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:5,0:0|1:129592309_A_C:129592309:3,4,2,0
chr7	129592510	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=229,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr7	129736880	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:12,11:10,8:8,14,4,15
chr7	129756523	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:2,4,0,8
chr7	129762004	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:3,3:6,2:2,7,0,6
chr7	129764409	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,16:0.377:43:12,5:15,11:3,24,0,16
chr7	129806416	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr7	129806441	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr7	129815269	.	TA	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:3,1,1,0
chr7	129815502	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:129815502_G_A:129815502:1,5,0,2
chr7	129815507	.	A	AGGTAGTCC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:129815502_G_A:129815502:1,5,0,2
chr7	129825148	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.454:29:7,7:8,6:9,7,5,8
chr7	129843689	.	G	GA,GAA	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,34,34;MFRL=143,123,184;MMQ=60,60,60;MPOS=19,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=A;STR;TLOD=46.13,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,24,3:0.418,0.066:57:14,8,1:16,16,2:13,17,11,16
chr7	129843893	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:14,0:2,2:5,11,0,2
chr7	129853482	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=156,114;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:129853482_G_GA:129853482:0,12,0,2
chr7	129853484	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=159,114;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:5,0:0|1:129853482_G_GA:129853482:0,13,0,2
chr7	129853486	.	T	TAGG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=159,114;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,1:6,0:0|1:129853482_G_GA:129853482:0,13,0,2
chr7	129856208	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,53;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:17,2:16,0:16,20,0,2
chr7	129910463	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	129916390	.	A	AAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr7	129929673	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	129940562	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=91,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:129940562_C_A:129940562:2,0,1,0
chr7	129940565	.	TC	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:129940562_C_A:129940562:3,0,1,0
chr7	129986521	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,0:0,6:0,0,0,7
chr7	129987734	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=106,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:4,1:0,2:2,3,0,3
chr7	129987782	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	130002199	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:4,1,3,0
chr7	130002467	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	130007459	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:0,5,0,7
chr7	130008219	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:2,5:6,0:6,2,4,1
chr7	130008531	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:130008531_C_CG:130008531:0,4,0,1
chr7	130008532	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:130008531_C_CG:130008531:0,4,0,1
chr7	130021488	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,4:2,5:5,0,8,1
chr7	130023179	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=232,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:3,0,8,0
chr7	130027633	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:5,1:6,4:7,4,5,0
chr7	130136107	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr7	130136902	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:5,0,8,0
chr7	130137692	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:4,0,4,1
chr7	130138155	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,10,12
chr7	130140766	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:2,1:5,1:2,5,0,2
chr7	130144943	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=193,150;MMQ=58,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:2,3:4,1:0,7,0,4
chr7	130147307	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr7	130148507	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,0:5,6:2,5,2,4
chr7	130148562	.	T	TTCTTAGGAAGTG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr7	130297119	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,1:0,0,1,3
chr7	130298550	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr7	130301891	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:19,1:10,1:16,14,2,0
chr7	130301898	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,2:11,0:13,13,1,1
chr7	130357518	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr7	131012807	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:5,5:2,5:1,6,0,10
chr7	131060277	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.343:47:13,11:18,4:9,22,5,11
chr7	131072056	.	T	TGTTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=173,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr7	131155588	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,4:4,6:7,3,7,3
chr7	131155764	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=197,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr7	131155784	.	GA	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=197,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:131155784_GA_TG:131155784:0,3,0,1
chr7	131155789	.	T	TTCAGTTCTGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=197,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:131155784_GA_TG:131155784:0,3,0,1
chr7	131155793	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=197,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:131155784_GA_TG:131155784:0,3,0,1
chr7	131155796	.	GA	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=197,241;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:131155784_GA_TG:131155784:0,3,0,1
chr7	131190554	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	131191536	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=217,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:3,5:1,2:0,4,0,8
chr7	131191554	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=264,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr7	131195535	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,5:7,7:10,1,6,6
chr7	131195959	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,98;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,31:0.552:56:13,13:12,18:8,17,11,20
chr7	131196234	.	G	GGGGCTGAAATCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	131815220	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:4,4:2,2:4,2,3,4
chr7	131815310	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,6,10
chr7	131815343	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=64.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0,0,3,16
chr7	131817726	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=200,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:131817726_T_G:131817726:2,0,1,0
chr7	131817735	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=200,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0|1:131817726_T_G:131817726:2,0,1,0
chr7	131830080	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=196,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:1,4:5,4:0|1:131830080_G_A:131830080:0,6,0,8
chr7	131830086	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=196,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:1,4:5,4:0|1:131830080_G_A:131830080:0,6,0,8
chr7	131831552	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,1,4
chr7	131832627	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr7	131832836	.	T	TGCATGGGGGATTGGATACTGCTTCTGTGATAGGAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=135,157;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.661:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	131833425	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0|1:131833425_G_A:131833425:0,2,0,4
chr7	131833427	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0|1:131833425_G_A:131833425:0,2,0,4
chr7	131849951	.	G	GGTCTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=158,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:131849951_G_GGTCTCT:131849951:1,3,0,1
chr7	131849953	.	C	CGTCCCTAAAGGCAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=158,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:131849951_G_GGTCTCT:131849951:1,3,0,1
chr7	131849981	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr7	131852984	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:131852984_C_T:131852984:0,0,2,0
chr7	131852989	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0|1:131852984_C_T:131852984:0,0,2,0
chr7	131859496	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	131864407	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,2:2,3:5,0,5,0
chr7	131866817	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=145,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr7	131866833	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=156,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr7	131983036	.	C	CTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:131983036_C_CTTT:131983036:1,3,0,1
chr7	131983038	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:131983036_C_CTTT:131983036:1,3,0,1
chr7	131983040	.	A	ATCCCACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:131983036_C_CTTT:131983036:1,3,0,1
chr7	132192231	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr7	132766584	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr7	132990536	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	133682181	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	133749050	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,29;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:14,8,1,1
chr7	133881919	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30,31;MFRL=0,154,172;MMQ=60,60,60;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=TG;STR;TLOD=5.15,24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.228,0.701:9:0,2,2:0,0,5:0,0,0,9
chr7	133943213	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:133943213_G_C:133943213:0,3,0,1
chr7	133943215	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:133943213_G_C:133943213:0,3,0,1
chr7	133943217	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:133943213_G_C:133943213:0,3,0,1
chr7	133979878	.	GA	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=219,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	134131955	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr7	134133291	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=323,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:0,5:1,3:0,2,1,7
chr7	134135751	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	134136566	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=183,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:134136566_G_A:134136566:0,3,0,1
chr7	134136569	.	GTGGC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=183,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:134136566_G_A:134136566:0,3,0,1
chr7	134136584	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	134212596	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,3:3,6:5,0,6,3
chr7	134217729	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=263,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=90.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.941:32:0,19:1,10:1,0,16,15
chr7	134223127	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	134225788	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr7	134225934	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=174,184;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:134225934_T_C:134225934:0,3,0,1
chr7	134225936	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=174,184;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:134225934_T_C:134225934:0,3,0,1
chr7	134346897	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=203,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:134346897_A_T:134346897:0,1,0,1
chr7	134346899	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=203,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:134346897_A_T:134346897:0,1,0,1
chr7	134346904	.	T	TAAATGGTGGGCAACAGGAGTGCAAAATAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=203,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:134346897_A_T:134346897:0,1,0,1
chr7	134552634	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:0,2,1,7
chr7	134576441	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.534:48:10,13:7,12:5,18,8,17
chr7	134678463	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.562:32:6,10:7,8:2,12,4,14
chr7	134678523	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:0,7,0,4
chr7	134719551	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr7	134730151	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr7	134744060	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,37;MFRL=118,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:2,2:1,4,0,2
chr7	134852399	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr7	134852432	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,13,3
chr7	134871775	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr7	134872003	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	134873355	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr7	134877935	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	134880884	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,9,10
chr7	134882680	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,2:0,0,9,0
chr7	134882693	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr7	134889139	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:7,0:7,4:0|1:134889139_G_A:134889139:4,10,1,3
chr7	134889141	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0|1:134889139_G_A:134889139:0,0,5,12
chr7	134890855	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,0,21
chr7	134925241	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr7	134928033	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=101,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:4,3,7,1
chr7	134930169	.	A	AGAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GAG;STR;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,1:0,0,0,5
chr7	135047703	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	135080323	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:9,0,4,2
chr7	135095270	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=84.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,21,5
chr7	135098181	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,2:7,1:12,2,3,0
chr7	135099901	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.609:29:4,12:7,4:8,3,15,3
chr7	135258573	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=160,158;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.084:33:11,0:19,2:0|1:135258573_G_C:135258573:8,23,0,2
chr7	135258580	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=162,158;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:11,0:18,2:0|1:135258573_G_C:135258573:5,24,0,2
chr7	135261620	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,178;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:7,0,2,0
chr7	135262533	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,5:5,3:12,0,6,2
chr7	135285788	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=103.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,0,27
chr7	135301521	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,0:5,3:0,12,0,3
chr7	135310168	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=275,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:135310168_A_C:135310168:0,1,0,1
chr7	135310171	.	GAAAATTAA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=275,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:135310168_A_C:135310168:0,1,0,1
chr7	135310183	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:135310168_A_C:135310168:0,0,0,1
chr7	135311120	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=66.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,13:0,6:0,0,11,8
chr7	135311167	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr7	135357608	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=137,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:14,0:11,2:0|1:135357608_C_A:135357608:5,22,0,3
chr7	135357612	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:13,0:13,3:0|1:135357608_C_A:135357608:5,22,0,3
chr7	135368805	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,4,0
chr7	135406294	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.098:39:23,1:11,2:12,24,1,2
chr7	135661670	.	T	TCGGCCGGC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:135661670_T_TCGGCCGGC:135661670:0,0,1,0
chr7	135661672	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:135661670_T_TCGGCCGGC:135661670:0,0,1,0
chr7	135661675	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:135661670_T_TCGGCCGGC:135661670:0,0,1,0
chr7	135661679	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:135661670_T_TCGGCCGGC:135661670:0,0,1,0
chr7	135661683	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,25;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:135661670_T_TCGGCCGGC:135661670:2,0,1,0
chr7	135661688	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=115,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:135661670_T_TCGGCCGGC:135661670:3,0,1,0
chr7	136587885	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:6,3,2,1
chr7	136699534	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:15,1,2,0
chr7	136701366	.	TTTG	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTG;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,2:0.052:54:26,0:20,2:35,17,1,1
chr7	136939582	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,6,5
chr7	137082039	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr7	137092745	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.504:14:3,4:4,3:1,6,3,4
chr7	137092781	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:1,7,2,3
chr7	137097050	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	137282547	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:6,0:10,4,2,0
chr7	137284709	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr7	137284712	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,0:3,1:0|1:137284712_T_A:137284712:0,3,0,1
chr7	137284717	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:137284712_T_A:137284712:0,4,0,1
chr7	137284718	.	A	ATGG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:137284712_T_A:137284712:0,4,0,1
chr7	137284757	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137284757_CG_C:137284757:0,1,0,1
chr7	137284760	.	TGGCACAC	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137284757_CG_C:137284757:0,1,0,1
chr7	137339598	.	GAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=90,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.409:3:1,0:0,1:1,1,0,1
chr7	137374773	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=136,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:137374773_CA_C:137374773:1,1,0,1
chr7	137374782	.	AG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=167,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:137374773_CA_C:137374773:1,0,0,1
chr7	137567411	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=195,253;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr7	137586267	.	G	GCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:137586267_G_GCA:137586267:0,1,0,1
chr7	137586272	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137586267_G_GCA:137586267:0,1,0,1
chr7	137586273	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137586267_G_GCA:137586267:0,1,0,1
chr7	137586283	.	CCATGG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	137590369	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=183,147;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:3,0,4,1
chr7	137612913	.	CTGG	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGG;STR;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:7,8:12,3:7,12,7,5
chr7	137773291	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	137773563	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,4:0,0:0,0,0,6
chr7	137776425	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=140,186;MMQ=54,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,0:3,0,2,0
chr7	137782593	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr7	137792420	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr7	137798330	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=241,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	137798593	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	137801413	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,10:0,0,2,13
chr7	137801444	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0,0,2,7
chr7	138200117	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:11,5:4,6:4,11,3,8
chr7	138214076	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:0,5,0,5
chr7	138255847	.	G	GGAGAATC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=198,186;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr7	138258159	.	AATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.708:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr7	138269604	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:24,1:16,1:19,21,0,2
chr7	138279228	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr7	138305743	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:5,5,1,2
chr7	138305782	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,2:4,1:0|1:138305782_T_C:138305782:3,7,3,1
chr7	138305806	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:2,3:3,1:0|1:138305782_T_C:138305782:2,4,4,1
chr7	138314875	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:7,0:9,2:11,6,0,2
chr7	138333933	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=98,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.859:7:1,3:0,2:0,1,0,6
chr7	138356662	.	GG	AC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:138356662_GG_AC:138356662:0,0,6,1
chr7	138356664	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:138356662_GG_AC:138356662:0,0,6,1
chr7	138356730	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,1:0,3:0|1:138356730_T_TG:138356730:0,0,3,2
chr7	138356733	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0|1:138356730_T_TG:138356730:0,0,3,2
chr7	138356956	.	C	CATCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:138356956_C_CATCA:138356956:0,1,0,1
chr7	138356958	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:138356956_C_CATCA:138356956:0,1,0,1
chr7	138356959	.	T	TCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:138356956_C_CATCA:138356956:0,1,0,1
chr7	138363269	.	CTCT	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:138363269_CTCT_C:138363269:2,7,1,1
chr7	138363275	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=36,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:2,0:0|1:138363269_CTCT_C:138363269:2,7,1,1
chr7	138363277	.	ACG	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:138363269_CTCT_C:138363269:1,6,1,1
chr7	138363281	.	A	AACCATT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,0:0|1:138363269_CTCT_C:138363269:1,6,1,1
chr7	138417596	.	TA	T,TAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,22,30;MFRL=0,191,134;MMQ=60,60,60;MPOS=12,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.18,13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,6:0.355,0.504:11:1,0,2:0,2,3:1,0,4,6
chr7	138419085	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	138424285	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:7,2:6,0:9,5,1,1
chr7	138429851	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr7	138434067	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,17;MFRL=114,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:1,0:0,5,0,2
chr7	138453892	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=67,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,1:0,2:1,1,3,0
chr7	138522649	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,0:6,2:12,8,2,0
chr7	138564442	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=188,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138564442_A_C:138564442:0,1,0,1
chr7	138564444	.	TG	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=188,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138564442_A_C:138564442:0,1,0,1
chr7	138564448	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=188,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138564442_A_C:138564442:0,1,0,1
chr7	138564451	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=188,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138564442_A_C:138564442:0,1,0,1
chr7	138589722	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=99,134;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr7	138595834	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:6,2:11,2,2,0
chr7	138595835	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:0,4:3,4:3,0,7,2
chr7	138597036	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr7	138601473	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=115,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:2,3:4,1:4,2,4,1
chr7	138711652	.	C	CCAGAAATTTTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	138713715	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,0,5
chr7	138719231	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr7	138732274	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:4,0,5,1
chr7	138739911	.	T	TTC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=151,42;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,2:6,0:0|1:138739911_T_TTC:138739911:13,4,1,1
chr7	138739915	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=154,42;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:8,0:0|1:138739911_T_TTC:138739911:13,5,1,1
chr7	138739917	.	CA	AG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=156,42;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:8,2:9,0:0|1:138739911_T_TTC:138739911:12,5,1,1
chr7	138749582	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr7	138749736	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:12,2:9,11,0,2
chr7	138758583	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,0:1,3:3,0,4,0
chr7	138764145	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	138793677	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:7,2,5,0
chr7	138794149	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=197,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	138916179	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	138951001	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=133,140;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.237:33:8,0:14,1:16,9,8,0
chr7	138951165	.	TA	T,TAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=164,231,170;MMQ=60,60,60;MPOS=13,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.03,4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,3,4:0.083,0.110:42:12,1,1:19,2,3:3,32,1,6
chr7	139044923	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:0,1:2,0:0|1:139044923_T_TG:139044923:2,0,1,0
chr7	139044924	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:0,0:1,0:0|1:139044923_T_TG:139044923:2,0,1,0
chr7	139044930	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,13;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:0,0:1,0:0|1:139044923_T_TG:139044923:2,0,1,0
chr7	139056296	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0|1:139056296_G_T:139056296:0,1,0,1
chr7	139056297	.	G	GTGTTTGATGAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:139056296_G_T:139056296:0,1,0,1
chr7	139056300	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139056296_G_T:139056296:0,0,0,1
chr7	139056302	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:139056296_G_T:139056296:0,0,0,1
chr7	139083480	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,162;MMQ=60,21;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:8,3:1,13,0,3
chr7	139164345	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=292,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr7	139168063	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	139281808	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0|1:139281808_G_A:139281808:0,0,0,1
chr7	139281810	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139281808_G_A:139281808:0,0,0,1
chr7	139575505	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:0,14,0,2
chr7	139715708	.	GGA	TTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=105,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:2,2,0,1
chr7	139717554	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:34,1:30,2:35,30,2,1
chr7	139737576	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr7	139762273	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:139762273_A_G:139762273:0,0,2,0
chr7	139762275	.	G	GCTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=166,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139762273_A_G:139762273:1,0,1,0
chr7	139762282	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=66,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139762273_A_G:139762273:1,0,1,0
chr7	139820354	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr7	139826652	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:0,9,0,2
chr7	140037053	.	CTT	C,CT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=168,141,134;MMQ=60,60,60;MPOS=30,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.31,66.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,27:0.120,0.753:36:2,2,16:3,2,11:5,0,31,0
chr7	140051063	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,2:3,4:8,2,5,1
chr7	140051091	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=108,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.603:21:5,3:3,8:5,3,9,4
chr7	140051790	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	140051848	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=129,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.494:18:3,2:6,6:6,3,7,2
chr7	140052036	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:140052036_G_A:140052036:0,0,0,1
chr7	140052038	.	G	GCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140052036_G_A:140052036:0,0,0,1
chr7	140052039	.	GGGGA	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140052036_G_A:140052036:0,0,0,1
chr7	140052047	.	G	GTGCCTGTGAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:140052036_G_A:140052036:0,0,0,1
chr7	140069361	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr7	140082363	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,2,18
chr7	140111898	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	140159122	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=199,307;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140159122_T_A:140159122:0,2,0,1
chr7	140159123	.	A	AAAGGCCCTGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=199,307;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140159122_T_A:140159122:0,2,0,1
chr7	140159134	.	G	GTCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=188,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	140159798	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr7	140159827	.	ACCAG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=202,140;MMQ=44,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140159827_ACCAG_A:140159827:0,3,0,1
chr7	140159828	.	C	CTTGAGGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=207,161;MMQ=52,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	140159832	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=202,140;MMQ=44,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:140159827_ACCAG_A:140159827:0,3,0,1
chr7	140218464	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:6,7:6,3:6,7,8,2
chr7	140244560	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.436:19:7,4:2,4:4,7,3,5
chr7	140244627	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=152,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr7	140244665	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=196,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	140255603	.	C	CATGGAAAAGAGGAGTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=204,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	140255623	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	140257907	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr7	140267102	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:140267102_GAA_G:140267102:1,1,0,1
chr7	140267117	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=195,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:140267102_GAA_G:140267102:1,0,0,1
chr7	140379029	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=123,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.198:29:8,0:7,2:9,15,5,0
chr7	140390650	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=104,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.205:16:5,1:5,0:6,7,0,3
chr7	140390720	.	T	TTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTG;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	140394599	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,4:3,4:0,3,1,7
chr7	140396472	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	140434597	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=119,187;MMQ=27,43;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:1,1:0,1:0,1,0,6
chr7	140449071	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,5:5,5:3,3,8,2
chr7	140476936	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:4,4:3,0:1,7,2,2
chr7	140494367	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,0:9,2:0,15,0,2
chr7	140500135	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:11,10:8,5:14,5,12,3
chr7	140507937	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	140550105	.	A	AATCATCTCCTTTATGCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.671:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	140706157	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	141314031	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,3:0.067:55:26,0:25,2:0|1:141314031_A_T:141314031:3,49,0,3
chr7	141314034	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,3:0.065:57:22,0:26,2:0|1:141314031_A_T:141314031:3,51,0,3
chr7	141314050	.	CT	C	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:34,3:0.102:37:19,1:13,2:1|0:141314031_A_T:141314031:2,32,0,3
chr7	141321434	.	ATG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:9,0:14,1,2,0
chr7	141362431	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr7	141374117	.	G	GTTCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141374117_G_GTTCCC:141374117:0,1,0,1
chr7	141374119	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141374117_G_GTTCCC:141374117:0,1,0,1
chr7	141420640	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=132,118;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr7	141420707	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr7	141429486	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=130,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,1:11,2:10,8,0,3
chr7	141429515	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr7	141429526	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=134,129;MMQ=46,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr7	141635538	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr7	141705515	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	141730618	.	CTG	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.767:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr7	141730658	.	G	GCATCTGTTTGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr7	141733994	.	T	TTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TG;STR;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	141738233	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	141759994	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,6:1,2:3,0,8,0
chr7	141760040	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:9,12:10,10:18,1,21,1
chr7	141760228	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=53.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,21:0.460:46:7,9:17,12:4,21,5,16
chr7	141764164	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr7	141795281	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	141796250	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,5,12
chr7	141796323	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=169,143;MMQ=40,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr7	141797549	.	A	AACCTTTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=218,260;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr7	141797564	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,302;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	142457276	.	TGG	CCC	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=147,222;MMQ=60,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,3:0,0:0|1:142457276_TGG_CCC:142457276:5,2,3,0
chr7	142457286	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=28,34;MFRL=74,222;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,3:2,0:0|1:142457276_TGG_CCC:142457276:5,3,3,0
chr7	142457301	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=74,167;MMQ=60,37;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:8,4:3,0:0|1:142457301_A_G:142457301:8,4,4,0
chr7	142457304	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=147,167;MMQ=60,37;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:8,4:3,0:0|1:142457301_A_G:142457301:8,5,4,0
chr7	142457313	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=33,36;MFRL=130,167;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:11,4:5,0:0|1:142457301_A_G:142457301:10,7,4,0
chr7	142457316	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=113,167;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:11,4:5,0:0|1:142457301_A_G:142457301:10,6,4,0
chr7	142457343	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=34,25;MFRL=161,95;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,2:5,0:0|1:142457343_C_T:142457343:10,6,1,1
chr7	142457347	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=35,26;MFRL=161,95;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:0|1:142457343_C_T:142457343:9,6,1,1
chr7	142457473	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=0,230;MMQ=60,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr7	142457480	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=111,162;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr7	142457482	.	CG	AG,TA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,27,30;MFRL=0,162,230;MMQ=60,60,36;MPOS=1,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.250,0.375:5:2,1,2:0,0,0:0,2,0,3
chr7	142457500	.	T	TTTC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=119,222;MMQ=46,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	142457501	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=0,230;MMQ=60,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	142457505	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=111,237;MMQ=50,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	142458371	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=146,126;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:11,9:5,7:14,2,14,2
chr7	142458409	.	C	G	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=113,152;MMQ=49,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,11:0.197:59:30,6:13,4:0|1:142458409_C_G:142458409:23,25,11,0
chr7	142458412	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=113,152;MMQ=49,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,11:0.197:59:32,7:14,4:0|1:142458409_C_G:142458409:23,25,11,0
chr7	142458414	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=113,152;MMQ=49,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,11:0.197:59:28,7:14,4:0|1:142458409_C_G:142458409:23,25,11,0
chr7	142458437	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=124,135;MMQ=52,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,12:0.191:66:29,7:17,3:0|1:142458409_C_G:142458409:23,31,9,3
chr7	142458451	.	A	T	.	.	DP=62;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=136,109;MMQ=60,39;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,13:0.221:60:27,7:20,5:21,26,3,10
chr7	142458511	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=134,146;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,16:0.323:50:19,7:15,8:20,14,2,14
chr7	142458523	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=124,156;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,11:0.273:42:13,6:16,3:0|1:142458523_T_A:142458523:16,15,1,10
chr7	142458526	.	AC	GG	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=129,156;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,11:0.279:41:14,6:14,3:0|1:142458523_T_A:142458523:14,16,1,10
chr7	142458531	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=129,154;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,8:0.225:38:15,4:15,0:0|1:142458523_T_A:142458523:14,16,0,8
chr7	142458666	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=230,184;MMQ=55,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0,5,1,1
chr7	142460187	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=32,30;MFRL=186,217;MMQ=60,41;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:10,0,2,0
chr7	142460200	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=188,169;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,4:5,0:0|1:142460200_A_G:142460200:11,0,5,0
chr7	142460203	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=31,31;MFRL=188,169;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,4:5,1:0|1:142460200_A_G:142460200:11,0,5,0
chr7	142460207	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=188,169;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,4:3,1:0|1:142460200_A_G:142460200:11,0,5,0
chr7	142460212	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=188,141;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:5,6:5,1:0|1:142460200_A_G:142460200:11,0,7,0
chr7	142460226	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=198,151;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:7,10:5,6:12,0,16,0
chr7	142460238	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=35,32;MFRL=176,151;MMQ=60,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:5,12:4,6:9,0,18,0
chr7	142460250	.	TAC	T	.	.	DP=38;ECNT=10;MBQ=31,32;MFRL=158,141;MMQ=60,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=82.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,21:0.612:34:7,12:6,8:0|1:142460250_TAC_T:142460250:12,1,21,0
chr7	142460254	.	TC	T	.	.	DP=42;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=157,141;MMQ=60,41;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=77.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,20:0.585:34:7,12:5,8:0|1:142460250_TAC_T:142460250:13,1,20,0
chr7	142460261	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=10;MBQ=29,31;MFRL=138,167;MMQ=45,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,14:0.325:44:15,9:15,5:25,5,13,1
chr7	142460335	.	A	G	.	.	DP=104;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=148,134;MMQ=60,55;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,51:0.512:99:22,21:23,26:31,17,17,34
chr7	142460339	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=12;MBQ=34,30;MFRL=147,133;MMQ=60,54;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,23:0.242:97:34,12:36,11:37,37,9,14
chr7	142460369	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=142,150;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,26:0.360:73:26,12:21,14:0|1:142460369_G_A:142460369:29,18,4,22
chr7	142460374	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=148,134;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,7:0.107:73:31,2:30,5:0|1:142460374_A_G:142460374:33,33,0,7
chr7	142460379	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=146,134;MMQ=60,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,6:0.095:72:30,1:29,5:0|1:142460374_A_G:142460374:34,32,0,6
chr7	142460388	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=12;MBQ=33,19;MFRL=142,134;MMQ=60,37;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,6:0.101:67:29,1:28,2:0|1:142460374_A_G:142460374:27,34,0,6
chr7	142460394	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=141,155;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,12:0.203:62:24,5:24,6:24,26,1,11
chr7	142460412	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=12;MBQ=30,34;MFRL=146,152;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,7:0.154:50:20,3:20,4:0|1:142460369_G_A:142460369:19,24,1,6
chr7	142460415	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=30,34;MFRL=144,152;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,7:0.157:49:19,3:23,4:0|1:142460369_G_A:142460369:16,26,1,6
chr7	142460428	.	CCAA	C	.	.	DP=42;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=142,167;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:17,3:19,1:11,26,0,4
chr7	142460461	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=33,29;MFRL=160,190;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,1:10,1:0|1:142460461_C_A:142460461:0,21,0,2
chr7	142460463	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=31,36;MFRL=160,190;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,1:9,0:0|1:142460461_C_A:142460461:0,21,0,2
chr7	142460642	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=147,159;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:6,3:11,2:17,1,5,0
chr7	142460660	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=29,33;MFRL=147,143;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.242:31:7,4:15,3:0|1:142460660_T_C:142460660:23,1,7,0
chr7	142460669	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=148,135;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,8:0.225:38:9,3:19,4:0|1:142460660_T_C:142460660:27,3,8,0
chr7	142460671	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=10;MBQ=30,35;MFRL=148,135;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,8:0.225:38:10,3:20,5:0|1:142460660_T_C:142460660:27,3,8,0
chr7	142460690	.	C	CTCTT	.	.	DP=50;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=160,118;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,13:0.274:49:13,5:22,5:29,7,10,3
chr7	142460710	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=148,109;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,23:0.320:73:16,13:34,10:32,18,12,11
chr7	142460744	.	G	C	.	.	DP=81;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=135,118;MMQ=60,47;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,23:0.289:81:18,14:38,9:0|1:142460744_G_C:142460744:32,26,8,15
chr7	142460752	.	C	G	.	.	DP=88;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=132,120;MMQ=60,45;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,22:0.271:83:18,13:37,7:0|1:142460744_G_C:142460744:32,29,8,14
chr7	142460764	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=138,120;MMQ=60,39;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,12:0.160:79:21,7:46,5:35,32,3,9
chr7	142460778	.	TG	CT	.	.	DP=70;ECNT=10;MBQ=28,35;MFRL=132,120;MMQ=60,32;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,4:0.070:69:21,3:41,1:34,31,0,4
chr7	142460865	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,25:0,20:0,0,19,28
chr7	142564156	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:142564156_A_G:142564156:0,0,0,1
chr7	142564161	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:142564156_A_G:142564156:0,0,0,1
chr7	142564168	.	CT	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=154,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:142564156_A_G:142564156:1,0,0,1
chr7	142565720	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,3:6,6:9,0,8,1
chr7	142565850	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.169:23:10,0:7,2:14,5,0,4
chr7	142568653	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:142568653_T_G:142568653:0,2,0,1
chr7	142568663	.	A	AGTGGATTATATGAGACTGTGGCTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=187,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:142568653_T_G:142568653:0,1,0,1
chr7	142572188	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:13,2,2,0
chr7	142574835	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr7	142583330	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr7	142605681	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,3:6,4:12,3,5,2
chr7	142612817	.	A	ATTTTGTATTTTTAGTAGAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr7	142640249	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	142723688	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=121,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:6,0:5,2:5,6,0,2
chr7	142749417	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,6:5,4:3,4,5,5
chr7	142749737	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=124,131;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.570:26:9,7:2,7:5,6,4,11
chr7	142750147	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.476:13:3,3:4,3:3,4,5,1
chr7	142832255	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr7	142836599	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=105,5017629;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:13,8,2,0
chr7	143001971	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,1:6,1:5,13,1,1
chr7	143016995	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	143017960	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr7	143020780	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,5:5,8:2,9,3,10
chr7	143029875	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,1:6,1:9,3,1,1
chr7	143036318	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,17,3
chr7	143036337	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,19,9
chr7	143036548	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr7	143039311	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	143042552	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:1,6:7,1:8,0,7,0
chr7	143043377	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	143043607	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr7	143043890	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:3,1:0,3:4,0,4,0
chr7	143043902	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr7	143047375	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,1:4,0,5,0
chr7	143054309	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr7	143054585	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	143056177	.	C	CTTAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:143056177_C_CTTAG:143056177:0,3,0,1
chr7	143056180	.	C	CTCACCATCGCTCTTCTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:143056177_C_CTTAG:143056177:0,3,0,1
chr7	143078643	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.296:19:3,0:2,1:11,2,6,0
chr7	143078928	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	143079422	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,1,4
chr7	143079806	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.353:35:12,6:10,6:6,17,1,11
chr7	143088650	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=15,16;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.418:17:1,1:2,0:3,7,0,7
chr7	143088867	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr7	143088897	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:3,3:1,4:2,2,2,6
chr7	143092631	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	143098554	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:1,3:6,7:4,3,6,4
chr7	143174892	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	143175345	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:0,5:2,11:2,0,6,10
chr7	143269150	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,241;MMQ=60,23;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143269150_A_G:143269150:0,0,0,1
chr7	143269151	.	A	ATCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,241;MMQ=60,23;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143269150_A_G:143269150:0,0,0,1
chr7	143269154	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:143269150_A_G:143269150:0,0,0,1
chr7	143421884	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=163,104;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr7	143424637	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=177,169;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,8:5,4:0,10,0,12
chr7	143632618	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,144;MMQ=40,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,3:4,2:7,5,3,2
chr7	143633276	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,34;MFRL=128,266;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:143633276_T_C:143633276:1,2,0,1
chr7	143633277	.	TGA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=128,266;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:143633276_T_C:143633276:1,2,0,1
chr7	143633281	.	T	TGGAGAGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=125,266;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:143633276_T_C:143633276:0,2,0,1
chr7	143633297	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	143657473	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:12,4:4,10:9,7,7,7
chr7	143748235	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=144,150;MMQ=52,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.400:38:9,9:13,6:11,12,8,7
chr7	143748257	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.413:33:10,7:9,3:6,13,6,8
chr7	143807674	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,1,2
chr7	143826603	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:2,6:7,8:5,4,8,6
chr7	143826697	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,26:0.586:44:7,18:11,7:10,8,13,13
chr7	143826729	.	ACTT	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=135,144;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=80.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.580:36:4,13:10,8:6,9,12,9
chr7	143882673	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,119;MMQ=23,23;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,3:2,4:4,0,7,0
chr7	143884311	.	G	GCCCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=126,131;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,9;RU=C;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,0:0,2,2,0
chr7	144060802	.	C	T	.	.	DP=150;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=125,135;MMQ=25,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,66:0.462:143:31,25:43,39:34,43,17,49
chr7	144062172	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,267;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:144062172_A_C:144062172:0,0,1,0
chr7	144062178	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=189,267;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:144062172_A_C:144062172:1,0,1,0
chr7	144062181	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=189,267;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:144062172_A_C:144062172:1,0,1,0
chr7	144068163	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,13:0,6:0,0,19,0
chr7	144068214	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=144,151;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.108:53:27,3:21,2:48,0,5,0
chr7	144075992	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	144076915	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr7	144096002	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.517:6:0,0:0,1:3,0,3,0
chr7	144096456	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=207,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr7	144096598	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=190,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr7	144096839	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=109,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:3,2,5,0
chr7	144098896	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	144462951	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,27:0.563:48:10,11:10,16:15,6,22,5
chr7	146997203	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:4,8:1,6:3,2,12,2
chr7	147092615	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=135,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	147259374	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:0,2:8,1:2,6,0,3
chr7	147335933	.	CT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,26,35;MFRL=134,155,145;MMQ=60,60,60;MPOS=31,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=8.84,16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,6,11:0.221,0.380:28:4,3,3:4,3,4:0,11,4,13
chr7	147600604	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=175,261;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr7	147674912	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr7	147674948	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=174,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:5,1:1,2:3,3,2,1
chr7	147674978	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=185,77;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,2:5,2:6,2,3,1
chr7	147844860	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,16;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.568:5:1,1:0,0:1,1,0,3
chr7	147844862	.	CAAA	C,AAAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24,16;MFRL=0,195,166;MMQ=60,60,60;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.11,5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.299,0.568:5:0,2,1:0,0,0:0,0,1,4
chr7	147964091	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,9,5
chr7	148080647	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr7	148106475	.	C	CTT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=114,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:1,9:1,2:0|1:148106475_C_CTT:148106475:1,2,9,2
chr7	148106477	.	C	CTG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=57,113;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.722:16:1,9:2,2:0|1:148106475_C_CTT:148106475:1,3,10,2
chr7	148106490	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=57,131;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,13:0.667:19:3,10:2,3:0|1:148106475_C_CTT:148106475:3,3,9,4
chr7	148106651	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr7	148311115	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	148312382	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,12,4
chr7	148312520	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,4,22
chr7	148463860	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,1,18
chr7	148464675	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,6:0,0,15,2
chr7	148480990	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=65.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,25:0.600:41:8,13:8,9:7,9,10,15
chr7	148483760	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.629:16:2,5:2,5:0,6,0,10
chr7	148484019	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr7	148485603	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=171,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:4,1,3,0
chr7	148487395	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:9,3:4,2:12,1,5,0
chr7	148494794	.	ATTTT	A,AT,ATTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32,31,34;MFRL=153,164,170,191;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,26,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.03,9.76,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,4,5,2:0.289,0.362,0.174:13:1,1,1,1:0,3,4,1:2,0,11,0
chr7	148495860	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:0,3,1,7
chr7	148504716	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=58.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,11,10
chr7	148504854	.	A	AGACTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=110,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTT;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,2:1,0:1,4,0,2
chr7	148506363	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=154,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:6,6:1,8:3,4,7,7
chr7	148511214	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,1:5,1:5,11,0,2
chr7	148543525	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,17,1
chr7	148543693	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=50.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,10:0,13:0,0,4,19
chr7	148544338	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=129,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:15,2:11,0:13,13,1,1
chr7	148700083	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	148700849	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:2,2,5,0
chr7	148702157	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:3,0,4,1
chr7	148702486	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:2,1:1,6:0|1:148702486_A_G:148702486:2,1,0,8
chr7	148702496	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:2,1:2,4:0|1:148702486_A_G:148702486:2,3,0,7
chr7	148705221	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,7:0,0,12,2
chr7	148709391	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,0:8,2:11,7,1,1
chr7	148716320	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:2,6,0,3
chr7	148768133	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=172,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,1:1,2,2,0
chr7	148801038	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:0,7,2,2
chr7	148823366	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,4:4,5:0,12,0,10
chr7	148863414	.	CAGCTCCA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.543:11:4,5:1,1:0,5,0,6
chr7	148873497	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:5,1,7,2
chr7	148903984	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	148904343	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr7	148904624	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr7	148907849	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr7	148936762	.	A	ACGGCGGCGG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=CGG;STR;TLOD=43.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,3:0,3:0,0,10,0
chr7	149174178	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:149174178_G_A:149174178:0,1,0,1
chr7	149174180	.	A	AATGATG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149174178_G_A:149174178:0,1,0,1
chr7	149174182	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149174178_G_A:149174178:0,1,0,1
chr7	149174186	.	AG	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149174178_G_A:149174178:0,1,0,1
chr7	149174190	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149174178_G_A:149174178:0,1,0,1
chr7	149190098	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:4,4:8,5:4,8,2,7
chr7	149191027	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,22,2
chr7	149191569	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,150;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,0:13,3:5,24,0,3
chr7	149256027	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:149256027_TG_CA:149256027:0,4,0,1
chr7	149256032	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:149256027_TG_CA:149256027:0,4,0,1
chr7	149317053	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,190;MMQ=52,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,2:7,4:9,4,5,2
chr7	149317216	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,1:2,8:0,6,0,9
chr7	149318471	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,162;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:10,3:2,1:9,3,2,2
chr7	149318681	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,183;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:1,2:9,1:1,10,0,3
chr7	149426305	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr7	149428858	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,0:12,3:7,20,0,3
chr7	149473373	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:12,0,2,0
chr7	149476666	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,8,9
chr7	149477639	.	C	CAGAACTGTGAGCCAAATAAACCTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	149479434	.	C	CCAGCACCTGCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	149479913	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:149479913_A_C:149479913:0,0,1,0
chr7	149479916	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:149479913_A_C:149479913:0,0,1,0
chr7	149486574	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=86,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr7	149489690	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=121,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,1:4,2,1,1
chr7	149489722	.	A	AGTGTTGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr7	149500013	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:3,0,3,1
chr7	149500472	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	149502540	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:149502540_T_A:149502540:1,2,0,1
chr7	149502543	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:149502540_T_A:149502540:1,2,0,1
chr7	149506211	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,5:0,0,7,8
chr7	149506388	.	C	CTTGGGACTGTAGAAGTTTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr7	149510954	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	149521110	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,0:2,0:0|1:149521110_A_C:149521110:1,3,2,0
chr7	149521117	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,0:0|1:149521110_A_C:149521110:1,4,2,0
chr7	149521119	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,0:0|1:149521110_A_C:149521110:2,5,2,0
chr7	149521122	.	TC	GG	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:2,0:0|1:149521110_A_C:149521110:3,5,2,0
chr7	149521125	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:3,1:0|1:149521110_A_C:149521110:3,5,2,0
chr7	149557687	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=182,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:6,0:13,2:2,17,0,2
chr7	149572842	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	149575725	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	149575747	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	149575850	.	TGTGGGAGTGA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=139,317;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0|1:149575850_TGTGGGAGTGA_T:149575850:0,1,0,1
chr7	149575864	.	GC	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=139,317;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149575850_TGTGGGAGTGA_T:149575850:0,1,0,1
chr7	149575867	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=139,317;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149575850_TGTGGGAGTGA_T:149575850:0,1,0,1
chr7	149575869	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=139,317;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149575850_TGTGGGAGTGA_T:149575850:0,1,0,1
chr7	149576818	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr7	150033882	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr7	150034788	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.452:18:5,5:3,2:5,5,5,3
chr7	150070564	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,120;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:3,7,0,3
chr7	150071156	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr7	150094371	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	150094851	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	150095271	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	150163837	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:4,1:2,7:6,1,7,1
chr7	150168058	.	A	AGAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	150269542	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.578:29:6,7:6,9:3,9,10,7
chr7	150384048	.	A	AAAG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,116;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.485:32:3,10:9,2:17,0,14,1
chr7	150490075	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,4,1
chr7	150490130	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=145,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,5:0,1:3,0,5,1
chr7	150490424	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:3,5,0,2
chr7	150490431	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,6:0,0,2,7
chr7	150490797	.	GGACA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GACA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	150491074	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:21,1:9,1:19,13,2,0
chr7	150491084	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,24:0,14:0,0,20,18
chr7	150493442	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=170,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:2,3,4,2
chr7	150493750	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,0,4
chr7	150498836	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	150499267	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:4,0:0,5:2,2,4,2
chr7	150500455	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr7	150500576	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=195,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:3,6:5,4:2,6,2,8
chr7	150501635	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr7	150555810	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,19,4
chr7	150556198	.	G	GACGTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	150558366	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	150647569	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,37;MFRL=121,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	150647572	.	T	TACCTTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=70,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr7	150647969	.	CC	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr7	150654622	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr7	150696008	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=38,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:1,3:1,2:2,1,3,2
chr7	150698879	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=188,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:1,0,3,3
chr7	150703915	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	150706383	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,5:5,5:0,5,0,10
chr7	150708089	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:5,10,1,1
chr7	150710773	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150710773_A_C:150710773:0,0,1,0
chr7	150710779	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,31;MFRL=247,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0|1:150710773_A_C:150710773:1,0,1,0
chr7	150713902	.	G	GC	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=131.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,18:0,20:0,0,18,20
chr7	150714936	.	AG	CC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:3,1:7,3,2,0
chr7	150720902	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr7	150725722	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr7	150730907	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:10,1:8,1:7,12,0,2
chr7	150731338	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr7	150731698	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=94,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,5:1,2:1,2,5,2
chr7	150732612	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:1,1,1,0
chr7	150747746	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr7	150747944	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:4,0:1,0:0|1:150747944_AG_CC:150747944:1,4,2,0
chr7	150747950	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=160,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:2,0:1,0:0|1:150747944_AG_CC:150747944:1,3,2,0
chr7	150751590	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,4,10
chr7	150752066	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,18:0,0,22,5
chr7	150753769	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:5,8:9,4:7,7,3,9
chr7	150759219	.	CGTGTGTGAGT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	150761548	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	150767184	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=107,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,2:6,4:4,8,1,5
chr7	150772709	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	150775898	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=84,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:1,0:1,1:0|1:150775898_A_C:150775898:0,2,2,0
chr7	150775904	.	AT	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.352:6:2,0:1,0:0|1:150775898_A_C:150775898:1,3,2,0
chr7	150775907	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:150775898_A_C:150775898:1,3,1,0
chr7	150776741	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,291;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:15,3:11,0:5,21,0,3
chr7	150825567	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	150831431	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:4,3:6,0,3,1
chr7	150873134	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	150884266	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,0:3,3,0,2
chr7	150905130	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:16,3:14,0:19,12,2,1
chr7	150905243	.	G	GAATGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=151,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:150905243_G_GAATGAA:150905243:2,2,0,1
chr7	150905247	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=16,25;MFRL=151,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.280:5:0,1:1,0:0|1:150905243_G_GAATGAA:150905243:2,2,0,1
chr7	150916114	.	CAGG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:5,4:2,6:7,0,9,1
chr7	150918586	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.256:13:2,2:6,1:10,0,3,0
chr7	150934882	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:3,3:3,2,2,2
chr7	150937377	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,7:0,0,1,8
chr7	150939193	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:5,2,4,3
chr7	150939359	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,6:0,2:0,0,4,7
chr7	150939396	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr7	150940657	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	150940867	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr7	150945496	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=127,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.516:17:2,1:4,2:6,2,9,0
chr7	151048484	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.519:37:8,12:8,7:16,2,13,6
chr7	151048687	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr7	151049818	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.607:31:4,6:8,13:11,1,17,2
chr7	151053043	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:0,3,1,4
chr7	151064305	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	151074176	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,1:16,1:13,15,2,0
chr7	151078845	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=193,236;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,1:2,2:3,0,3,0
chr7	151106245	.	C	CTGCTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	151127104	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,24:0.532:45:12,9:9,15:19,2,21,3
chr7	151164348	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:3,0:4,5:0,7,0,6
chr7	151168415	.	CAAT	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=62.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.501:34:7,11:9,6:15,2,17,0
chr7	151254175	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr7	151254445	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,1,5
chr7	151267237	.	GA	G,GAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33,35;MFRL=129,48,120;MMQ=60,60,60;MPOS=8,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.76,3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.271,0.270:8:3,1,0:1,1,2:3,1,4,0
chr7	151292395	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=50,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,3,0
chr7	151372819	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151372819_A_C:151372819:0,0,0,1
chr7	151372820	.	G	GATGCTCTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151372819_A_C:151372819:0,0,0,1
chr7	151478602	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr7	151483445	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	151573795	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	151668224	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:151668224_A_AT:151668224:0,0,1,8
chr7	151668225	.	A	AGAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0|1:151668224_A_AT:151668224:0,0,1,8
chr7	151684168	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	151700048	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:17,0:13,2:8,23,0,2
chr7	151802505	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.655:15:1,3:2,6:1,4,0,10
chr7	151818025	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.180:31:12,2:14,3:13,13,3,2
chr7	151818777	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,3,13
chr7	151833823	.	AC	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,247;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	151842397	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=251,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:1,3:0,4,0,3
chr7	151847946	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,1,2
chr7	151856009	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=123,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.079:60:22,2:34,2:27,29,2,2
chr7	151866389	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=216,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.675:4:1,2:0,1:0|1:151866389_GA_G:151866389:0,1,0,3
chr7	151866410	.	A	AAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=216,293;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:151866389_GA_G:151866389:0,3,0,1
chr7	151866413	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=216,293;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:151866389_GA_G:151866389:0,3,0,1
chr7	151873853	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,14:0,0,19,11
chr7	151874498	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.491:33:3,7:11,8:9,8,8,8
chr7	151884607	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=78,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr7	151896573	.	G	GGTTA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTTA;STR;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:5,4:2,3:0,7,0,7
chr7	151902343	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,167;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.522:44:11,10:10,13:1,20,1,22
chr7	151919159	.	GA	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=168,169;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.152:39:8,2:11,2:2,31,0,6
chr7	151921099	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,191;MMQ=49,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.106:54:20,4:28,1:34,15,5,0
chr7	151926935	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=193,178;MMQ=24,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.177:32:15,2:8,1:0|1:151926935_G_A:151926935:26,1,5,0
chr7	151926945	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=176,174;MMQ=24,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.161:41:19,4:16,2:0|1:151926935_G_A:151926935:34,1,6,0
chr7	151926977	.	A	G	.	.	DP=168;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=156,163;MMQ=24,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:119,46:0.281:165:68,23:51,23:113,6,46,0
chr7	151927021	.	C	A	.	.	DP=229;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=136,134;MMQ=24,24;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=317.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:132,90:0.406:222:65,50:61,35:120,12,82,8
chr7	151927023	.	G	C	.	.	DP=233;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=136,130;MMQ=24,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:207,15:0.071:222:109,6:92,9:187,20,14,1
chr7	151927025	.	A	G	.	.	DP=236;ECNT=9;MBQ=30,34;MFRL=134,132;MMQ=24,24;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:178,50:0.221:228:90,24:75,26:158,20,46,4
chr7	151927026	.	T	C	.	.	DP=231;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=132,135;MMQ=24,24;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=252.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:155,74:0.325:229:76,40:76,30:138,17,65,9
chr7	151927067	.	T	C	.	.	DP=379;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=128,113;MMQ=24,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:342,34:0.091:376:172,20:168,14:190,152,19,15
chr7	151927127	.	A	G	.	.	DP=200;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=136,138;MMQ=24,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=116.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:133,57:0.302:190:68,34:63,23:10,123,0,57
chr7	151932808	.	TTA	T	.	.	DP=135;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=161,130;MMQ=45,45;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:123,5:0.043:128:70,5:49,0:112,11,3,2
chr7	151932819	.	T	A	.	.	DP=135;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=172,137;MMQ=60,31;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=120.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,47:0.364:129:49,25:33,20:74,8,42,5
chr7	151932824	.	A	T	.	.	DP=137;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=144,200;MMQ=46,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:107,21:0.169:128:58,15:46,6:98,9,16,5
chr7	151932830	.	A	T	.	.	DP=131;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=153,137;MMQ=45,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,17:0.135:128:66,9:43,7:99,12,15,2
chr7	151932846	.	T	C	.	.	DP=150;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=148,137;MMQ=40,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:124,18:0.128:142:72,9:50,8:100,24,15,3
chr7	151932848	.	T	G	.	.	DP=149;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=146,210;MMQ=40,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:138,5:0.041:143:76,4:58,1:112,26,2,3
chr7	151932908	.	T	C	.	.	DP=157;ECNT=7;MBQ=29,35;MFRL=143,148;MMQ=49,30;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:124,27:0.186:151:70,14:46,13:62,62,1,26
chr7	151932990	.	C	T	.	.	DP=123;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=154,103;MMQ=40,24;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:110,9:0.081:119:65,4:40,5:40,70,3,6
chr7	151933015	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=148,83;MMQ=52,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,6:0.063:106:59,3:37,3:29,71,2,4
chr7	151933033	.	GG	AA	.	.	DP=85;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=160,83;MMQ=60,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:38,2:30,1:20,54,0,3
chr7	151935730	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=159,178;MMQ=52,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.075:64:31,1:27,3:54,6,4,0
chr7	151935798	.	GA	TG	.	.	DP=95;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=145,146;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,11:0.125:93:48,4:32,5:40,42,7,4
chr7	151935853	.	T	C	.	.	DP=105;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=140,178;MMQ=49,24;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,8:0.090:97:45,2:42,6:40,49,0,8
chr7	151935962	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,164;MMQ=34,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.204:32:19,2:7,4:6,20,1,5
chr7	151944961	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=155,179;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.129:52:23,2:23,4:44,2,6,0
chr7	151944981	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=153,225;MMQ=40,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,5:0.094:55:24,2:26,2:49,1,5,0
chr7	151945007	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=155,148;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,36:0.447:81:18,18:26,18:31,14,25,11
chr7	151945071	.	G	GT	.	.	DP=124;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,15:0.136:114:51,7:46,7:64,35,7,8
chr7	151945101	.	G	C	.	.	DP=130;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=144,116;MMQ=51,39;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,10:0.087:123:49,5:64,5:73,40,7,3
chr7	151945140	.	C	T	.	.	DP=178;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=134,143;MMQ=33,50;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:129,48:0.273:177:47,21:82,27:55,74,13,35
chr7	151945167	.	G	T	.	.	DP=151;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=135,152;MMQ=27,48;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,43:0.293:147:42,16:60,23:43,61,6,37
chr7	151945204	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=157,202;MMQ=52,39;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,7:0.124:62:28,3:22,4:17,38,0,7
chr7	151945310	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,161;MMQ=34,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.369:44:14,10:14,6:16,12,8,8
chr7	151949068	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,6:3,2:4,1,5,3
chr7	151962033	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=192,190;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr7	151962055	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=201,191;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:9,0,3,0
chr7	151962068	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=192,182;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,4:3,2:0|1:151962068_T_C:151962068:7,0,6,0
chr7	151962077	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=192,170;MMQ=57,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:3,6:4,4:0|1:151962068_T_C:151962068:7,0,10,0
chr7	151970695	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=154,188;MMQ=40,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.099:58:24,1:28,4:53,0,5,0
chr7	151970729	.	A	T	.	.	DP=129;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=151,161;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,14:0.125:118:45,5:58,9:99,5,13,1
chr7	151970758	.	G	A	.	.	DP=179;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=144,143;MMQ=52,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:163,12:0.073:175:82,6:78,6:116,47,9,3
chr7	151970775	.	C	G	.	.	DP=199;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=140,160;MMQ=52,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:181,7:0.041:188:90,1:83,5:113,68,6,1
chr7	151970797	.	A	T	.	.	DP=200;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=130,147;MMQ=51,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:175,8:0.048:183:91,3:81,5:82,93,4,4
chr7	151970856	.	T	A	.	.	DP=184;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=141,150;MMQ=52,45;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=376.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,127:0.750:169:18,61:23,64:19,23,31,96
chr7	151970859	.	C	T	.	.	DP=172;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=149,180;MMQ=50,34;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:161,4:0.030:165:74,3:81,1:48,113,1,3
chr7	151970871	.	C	T	.	.	DP=151;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=154,165;MMQ=51,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:139,5:0.041:144:68,4:71,1:39,100,3,2
chr7	151970877	.	G	A	.	.	DP=150;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=155,182;MMQ=51,39;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:131,11:0.082:142:65,7:64,4:36,95,5,6
chr7	151970982	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=170,179;MMQ=27,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:11,1:21,1:3,29,0,3
chr7	151971043	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=201,128;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:7,9:2,3:0,9,2,10
chr7	151971052	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=204,202;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.566:19:6,8:2,3:0,8,2,9
chr7	152055766	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,10;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.739:16:1,0:1,2:0,4,0,12
chr7	152055852	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=196,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr7	152345649	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=181,110;MMQ=59,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:152345649_A_C:152345649:2,0,1,0
chr7	152345658	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=181,110;MMQ=59,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:152345649_A_C:152345649:2,0,1,0
chr7	152511598	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,18,0
chr7	152550499	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr7	152550549	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=84,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,4:6,5:6,6,4,5
chr7	154429657	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	154519467	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:6,1,4,0
chr7	154564677	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.539:9:0,0:2,3:0|1:154564677_CA_C:154564677:0,4,1,4
chr7	154564693	.	C	CCT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.271:9:2,0:4,2:1|0:154564677_CA_C:154564677:1,6,0,2
chr7	154564697	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.273:9:2,0:4,2:1|0:154564677_CA_C:154564677:1,6,0,2
chr7	154587507	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,184;MMQ=54,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr7	154664510	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=259,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	154672551	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr7	154672646	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:3,5,2,2
chr7	154672662	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,5:1,2,2,7
chr7	154672679	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,1,8
chr7	154672717	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	154677491	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,21;MFRL=173,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:154677491_T_TGC:154677491:0,2,1,0
chr7	154677495	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=173,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:154677491_T_TGC:154677491:0,2,1,0
chr7	154677500	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=214,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154677491_T_TGC:154677491:0,1,1,0
chr7	154677505	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=214,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154677491_T_TGC:154677491:0,1,1,0
chr7	154677510	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=214,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:154677491_T_TGC:154677491:0,1,1,0
chr7	154679302	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=152,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr7	154681142	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=196,226;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr7	154681257	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:7,2:0|1:154681257_A_T:154681257:4,13,1,1
chr7	154681264	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:5,2:0|1:154681257_A_T:154681257:3,12,1,1
chr7	154681266	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:154681257_A_T:154681257:3,12,1,1
chr7	154681270	.	C	CATGTTTG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=138,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:6,2:0|1:154681257_A_T:154681257:2,12,1,1
chr7	154720259	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	154748908	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,15:0,0,10,14
chr7	154749075	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr7	154755493	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:5,0:6,2:5,8,0,2
chr7	154759671	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	154760174	.	TTGC	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=171,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGC;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr7	154760249	.	C	CATGTTCCTGGGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,36;MFRL=121,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:154760249_C_CATGTTCCTGGGG:154760249:2,1,0,1
chr7	154760252	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=121,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:154760249_C_CATGTTCCTGGGG:154760249:2,1,0,1
chr7	154760266	.	TCTG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:1,1,1,0
chr7	154760312	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr7	154760889	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	154785362	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr7	154860891	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.427:40:12,9:10,7:12,11,9,8
chr7	154863429	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,36;MFRL=219,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154863429_C_CAA:154863429:0,1,0,1
chr7	154863433	.	C	CAAAAAGTTCCATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=219,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154863429_C_CAA:154863429:0,1,0,1
chr7	154863436	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=219,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154863429_C_CAA:154863429:0,1,0,1
chr7	154875780	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	154876273	.	ACC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154876273_ACC_A:154876273:0,0,0,1
chr7	154876278	.	A	AGGAGTTAAATCCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154876273_ACC_A:154876273:0,0,0,1
chr7	155094592	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:8,5:8,3:0|1:155094592_C_T:155094592:4,12,0,8
chr7	155094593	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,15:0.640:23:5,7:3,8:1|0:155094592_C_T:155094592:0,8,4,11
chr7	155095436	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=253,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr7	155151018	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	155151060	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	155151498	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:155151498_A_G:155151498:0,0,1,1
chr7	155151517	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:155151498_A_G:155151498:0,0,0,2
chr7	155151564	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	155174801	.	ATGTGAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTGAG;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:5,1:6,6,2,0
chr7	155295804	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:155295804_G_A:155295804:0,2,0,1
chr7	155295811	.	A	ATAGATGTGATATGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155295804_G_A:155295804:0,1,0,1
chr7	155295815	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155295804_G_A:155295804:0,1,0,1
chr7	155295816	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155295816_A_AC:155295816:0,1,0,1
chr7	155295818	.	A	AAAAACAGTAACTTTAAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155295816_A_AC:155295816:0,1,0,1
chr7	155465438	.	CAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.708:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	155503844	.	G	GT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.254:43:24,6:7,5:29,3,10,1
chr7	155511050	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=137,118;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:17,4:24,0:28,13,0,4
chr7	155530289	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,6:0.120:47:18,0:13,0:0|1:155530289_A_C:155530289:12,29,6,0
chr7	155530303	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,5:0.118:43:18,0:11,0:0|1:155530289_A_C:155530289:8,30,5,0
chr7	155530313	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.093:39:17,1:14,0:0|1:155530289_A_C:155530289:2,34,3,0
chr7	155530315	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=34,17;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.101:36:18,0:15,0:0|1:155530289_A_C:155530289:1,32,3,0
chr7	155530319	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=29,22;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.098:37:16,0:16,1:0|1:155530289_A_C:155530289:1,33,3,0
chr7	155532796	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=219,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	155559125	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	155593408	.	C	CTTAGAAGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:155593408_C_CTTAGAAGTTTT:155593408:0,2,0,1
chr7	155593410	.	C	CTTGGCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:155593408_C_CTTAGAAGTTTT:155593408:0,2,0,1
chr7	155593413	.	G	GCCTTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:155593408_C_CTTAGAAGTTTT:155593408:0,2,0,1
chr7	155593438	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	155595901	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	155599300	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	156685519	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr7	156685545	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr7	156759597	.	ATATAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,1:6,2:4,2,3,0
chr7	156761751	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.665:22:3,6:4,9:4,3,10,5
chr7	156761913	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:3,2,1,7
chr7	156799081	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	156963009	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:11,8,2,0
chr7	156971581	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=218,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr7	156974127	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,3:6,3:10,0,6,0
chr7	157023721	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=148,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,1:1,2:4,0,3,0
chr7	157047091	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=212,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.364:6:1,1:1,0:0|1:157047091_TA_T:157047091:0,4,0,2
chr7	157047101	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=225,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:3,2:0,0:0|1:157047091_TA_T:157047091:0,3,0,2
chr7	157049530	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr7	157049809	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr7	157060193	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	157151234	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,19:0,18:0,0,28,11
chr7	157333542	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,3:2,4:0,9,0,7
chr7	157361564	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=120,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:10,4:0,6:6,4,6,4
chr7	157361734	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	157370645	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:4,2:3,3:8,0,3,2
chr7	157370688	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,9,9
chr7	157406638	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:7,3,2,0
chr7	157873975	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=91,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,25:0.607:41:6,10:9,14:9,7,16,9
chr7	157903478	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr7	157903504	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr7	157903538	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,2:0,0,4,3
chr7	157929294	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr7	157959620	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:3,3,4,0
chr7	157959636	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,3:2,1:4,5,4,0
chr7	158455089	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr7	158457458	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=286,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=116.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.959:38:1,10:0,24:0,1,9,28
chr7	158468437	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	158473339	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr7	158476106	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,2,11
chr7	158476148	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr7	158528158	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr7	158528170	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,10,3
chr7	158529908	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,2:6,0:0,12,0,2
chr7	158552331	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr7	158552922	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:158552922_T_TTG:158552922:0,1,0,1
chr7	158552927	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158552922_T_TTG:158552922:0,1,0,1
chr7	158555706	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,17,0
chr7	158566138	.	TG	CA,CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30,28;MFRL=0,147,150;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.77,30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,10:0.199,0.736:12:0,0,8:0,2,2:0,0,1,11
chr7	158590547	.	G	GA,GAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34,35;MFRL=85,145,164;MMQ=60,41,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=9.74,6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,4:0.445,0.358:11:1,2,0:1,3,3:2,0,8,1
chr7	158590577	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=140,152;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.260:18:7,0:6,0:12,1,5,0
chr7	158591851	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	158591883	.	A	ATAGGACATATGATGAGAATATGAAATTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	158649304	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	158649373	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	158662511	.	T	TTTTAAAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTAAAC;STR;TLOD=96.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,18,4
chr7	158662698	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr7	158711643	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	158715174	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,2:15,0:10,12,2,0
chr7	158715264	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr7	158716333	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,2:13,0:10,19,1,1
chr7	158719253	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr7	158726798	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr7	158726877	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:4,10,0,2
chr7	158727015	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=52.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr7	158727297	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:7,1:2,1:0,10,0,2
chr7	158827401	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr7	158829600	.	ACC	GGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=122,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:2,12,0,2
chr7	158835631	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	158935333	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	158937175	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,51;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.145:25:12,1:10,2:8,14,1,2
chr8	194596	.	C	CT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.481:21:7,6:4,4:8,3,10,0
chr8	401493	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=117,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,2:0,6:0,3,0,8
chr8	417799	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:4,0:9,2:2,12,1,1
chr8	494658	.	GGGCGGC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	494804	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	665858	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,4:7,5:8,4,6,3
chr8	681206	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr8	1497436	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1497436_A_C:1497436:1,1,0,1
chr8	1497438	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1497436_A_C:1497436:1,1,0,1
chr8	1514009	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,14:0,5:0,0,8,11
chr8	1514153	.	TCC	AGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	1624687	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,27;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:17,8,1,1
chr8	1791433	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	1791638	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,4,7
chr8	1791663	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.884:6:0,0:0,6:0|1:1791663_G_A:1791663:0,0,1,5
chr8	1791672	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:1791663_G_A:1791663:0,0,0,4
chr8	1791685	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	1791718	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	1806045	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.783:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr8	1806332	.	G	GGGTCCCC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=165,109;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.335:6:1,0:2,2:0,4,0,2
chr8	1806333	.	A	G,AGGTGG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33,33;MFRL=0,165,109;MMQ=60,60,53;MPOS=25,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.17,4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.634,0.319:6:0,1,0:0,3,2:0,0,0,6
chr8	1806375	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr8	1814588	.	GACACAC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=AC;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.511:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr8	1817286	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:5,3:4,7:6,3,8,2
chr8	1830928	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,1,2
chr8	1846562	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr8	1857591	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:5,4:1,1:3,3,3,3
chr8	1874732	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=245,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr8	1876499	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=143,263;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1876499_GA_G:1876499:4,0,1,0
chr8	1876507	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,18;MFRL=143,263;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:1876499_GA_G:1876499:4,0,1,0
chr8	1876515	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=170,263;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1876499_GA_G:1876499:3,0,1,0
chr8	1876518	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,15;MFRL=170,263;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:1876499_GA_G:1876499:3,0,1,0
chr8	1876568	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,18;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:1876568_C_G:1876568:3,1,1,0
chr8	1876570	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:1876568_C_G:1876568:3,1,1,0
chr8	1876707	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:5,1:3,4:5,4,2,3
chr8	1900855	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,7,3
chr8	1901008	.	C	CGAATGCTTCCAGAAGACCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=193,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0,5,1,1
chr8	1953642	.	CAG	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=148,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:4,2:9,2:1,14,2,3
chr8	2005414	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr8	2005624	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,1:0,0,1,7
chr8	2005676	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr8	2007230	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	2020377	.	G	GATGCTCTCTGCCCTTCGGCCCTGAAAGCCTCCATCGTTTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATGCTCTCTGCCCTTCGGCCCTGAAAGCCTCCATCGTTTC;STR;TLOD=65.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,2:0,4:0,0,10,5
chr8	2024207	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,9,5
chr8	2024405	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=176,217;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:1,1:8,3:1,8,0,4
chr8	2024437	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=264,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,1:2,4:0|1:2024437_C_T:2024437:0,3,0,6
chr8	2024446	.	CG	TA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=264,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,2:2,4:0|1:2024437_C_T:2024437:0,3,0,6
chr8	2027095	.	C	CTTATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2027095_C_CTTATA:2027095:0,1,0,1
chr8	2027096	.	C	CCATACGCCCAAGTTTCTTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2027095_C_CTTATA:2027095:0,1,0,1
chr8	2027764	.	G	GAGAAGACAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=149,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0|1:2027764_G_GAGAAGACAAAAA:2027764:0,3,0,1
chr8	2027766	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=149,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:2027764_G_GAGAAGACAAAAA:2027764:0,3,0,1
chr8	2027769	.	A	AAAAGAAGTGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=149,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:2027764_G_GAGAAGACAAAAA:2027764:0,3,0,1
chr8	2040104	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.657:9:2,1:0,5:1,2,4,2
chr8	2040401	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr8	2040415	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	2044046	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=150,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,2,1
chr8	2044299	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,39;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:7,13,1,1
chr8	2048917	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=217,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:2048917_CTT_C:2048917:0,3,0,1
chr8	2048922	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=217,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:2048917_CTT_C:2048917:0,3,0,1
chr8	2048923	.	GT	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=194,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr8	2048931	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=242,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:2048917_CTT_C:2048917:0,2,0,1
chr8	2053942	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	2054006	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:7,4,1,1
chr8	2054012	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr8	2054171	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,2,14
chr8	2054195	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr8	2054476	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr8	2063920	.	CAT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,9,11
chr8	2064121	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr8	2077072	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr8	2796277	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:6,4:6,4:2,10,1,7
chr8	2799981	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=130,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,2:5,4:4,2,6,1
chr8	2806920	.	G	GAAAGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AAAGA;STR;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr8	2808847	.	A	AAAACGAC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=167,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0|1:2808847_A_AAAACGAC:2808847:0,4,0,1
chr8	2808849	.	TTC	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=167,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.277:5:3,0:1,1:0|1:2808847_A_AAAACGAC:2808847:0,4,0,1
chr8	2808860	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=136,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr8	2808869	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=172,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:2808869_G_A:2808869:0,4,0,1
chr8	2808874	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=172,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:2808869_G_A:2808869:0,4,0,1
chr8	2811708	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr8	2820187	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,2,5
chr8	2820682	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	2824083	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.606:23:5,7:3,7:5,4,9,5
chr8	2836102	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	2857665	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr8	2857710	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	2910020	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr8	2910223	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,10:0,0,1,10
chr8	2954348	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,2:1,2:4,0,4,1
chr8	2964003	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:1,0,9,0
chr8	2965209	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,13:0,0,17,6
chr8	2965244	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,13:0,0,15,11
chr8	2966072	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	2966328	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr8	2967639	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr8	3008905	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,2:3,5:9,0,5,2
chr8	3019592	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr8	3063125	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3063125_A_C:3063125:0,1,0,1
chr8	3063128	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3063125_A_C:3063125:0,1,0,1
chr8	3063132	.	TC	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3063125_A_C:3063125:0,1,0,1
chr8	3072266	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0,10,0,2
chr8	3076942	.	C	CCCTTGATCTCTCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=19,34;MFRL=266,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr8	3076959	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	3087809	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr8	3141586	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	3165207	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:4,1,6,0
chr8	3165356	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,4:1,8:0,3,3,9
chr8	3165777	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	3165814	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr8	3201012	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr8	3201034	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	3205423	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=171,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr8	3205460	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,3:0,2:2,0,2,3
chr8	3224455	.	G	GCACACATTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CACACATTA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr8	3226919	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,4:0,6:0,0,1,10
chr8	3253939	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0|1:3253939_A_G:3253939:0,5,0,3
chr8	3253942	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,2:1,1:0|1:3253939_A_G:3253939:0,5,0,3
chr8	3263758	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=146,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:0,6,1,2
chr8	3263813	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=207,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:0|1:3263813_G_T:3263813:0,2,0,1
chr8	3263821	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=207,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:3263813_G_T:3263813:0,2,0,1
chr8	3266909	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=169,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,2,2
chr8	3351156	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,2:12,0:11,6,2,0
chr8	3351264	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:6,3:0,4:0,6,2,5
chr8	3443799	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=17,19;MFRL=96,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.632:8:0,1:1,1:1,2,1,4
chr8	3443840	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:0,3,0,2
chr8	3474342	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	3565900	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:6,2,6,0
chr8	3566106	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	3855369	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=302,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr8	4277636	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr8	4494811	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr8	4495008	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.120:32:11,1:13,2:19,10,1,2
chr8	4495107	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=57.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,3:0,13:0,0,3,13
chr8	6264130	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr8	6272185	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	6272477	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr8	6272481	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr8	6299532	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr8	6372332	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:6372332_AG_CC:6372332:0,1,1,0
chr8	6372341	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:6372332_AG_CC:6372332:0,1,1,0
chr8	6372344	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:6372332_AG_CC:6372332:0,1,1,0
chr8	6385280	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0|1:6385280_G_A:6385280:0,1,0,1
chr8	6385281	.	C	CCATATATTATACACTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6385280_G_A:6385280:0,1,0,1
chr8	6390027	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr8	6390079	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	6420534	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr8	6478956	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:0|1:6478956_A_G:6478956:2,1,6,1
chr8	6478960	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,4:1,1:0|1:6478956_A_G:6478956:2,1,6,1
chr8	6478986	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=147,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:2,1,4,2
chr8	6479282	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	6566287	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:2,0,5,3
chr8	6582485	.	A	C	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=297.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,87:0.989:87:0,47:0,38:0,0,25,62
chr8	6588392	.	A	AT,ATT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30,24;MFRL=142,163,133;MMQ=60,60,60;MPOS=10,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,18,19;RU=T;STR;TLOD=3.59,6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,6:0.320,0.545:10:0,3,3:1,0,2:0,1,0,9
chr8	6614588	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=161,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr8	6614606	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr8	6669949	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr8	6673377	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr8	6681256	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr8	6690173	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr8	6690215	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,3:2,1:8,2,2,2
chr8	6728198	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=110,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:1,5,1,2
chr8	6735399	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=194,128;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:2,5:1,7:1,3,1,11
chr8	6735423	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr8	6735431	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,2:6,3:0,10,0,5
chr8	6782271	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	6783623	.	T	TGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=170,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6783623_T_TGA:6783623:0,2,0,1
chr8	6783625	.	A	AAAGGAATACT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=170,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6783623_T_TGA:6783623:0,2,0,1
chr8	6783629	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=170,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6783623_T_TGA:6783623:0,2,0,1
chr8	6783650	.	G	GAAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=202,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6783650_G_GAAT:6783650:0,1,0,1
chr8	6783652	.	ACAG	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=202,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6783650_G_GAAT:6783650:0,1,0,1
chr8	6793540	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=46,151;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:2,4:2,3:3,1,4,3
chr8	6793547	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:8,3,1,1
chr8	6793581	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=115,137;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.680:10:0,5:2,1:3,0,5,2
chr8	7191269	.	A	ACAGACAGACCG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,78;MMQ=60,46;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	7308798	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	7340278	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=146,170;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.131:40:18,3:17,1:33,2,5,0
chr8	7340323	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,143;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,26:0.422:62:20,16:16,10:13,23,10,16
chr8	7343806	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,121;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.182:36:15,1:15,5:5,25,1,5
chr8	7686323	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,145;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:8,6:6,5:2,12,2,9
chr8	7698527	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,187;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,2:3,2:2,2,3,1
chr8	7718266	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr8	8176387	.	C	CGGGGCG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGGCG;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,8,0
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chr8	8887542	.	TAAC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,7:3,5:2,8,3,9
chr8	9437839	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:4,2:2,9,2,1
chr8	9563797	.	CTT	C,CT	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=21,34,33;MFRL=169,141,146;MMQ=60,60,60;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.43,59.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,30:0.136,0.719:43:1,4,12:3,3,17:0,6,17,20
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chr8	9593081	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr8	10065325	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=92,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,3,0
chr8	10285825	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.921:15:0,5:0,8:1,0,2,12
chr8	10390320	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr8	10390454	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=149,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:0|1:10390454_C_T:10390454:11,6,1,1
chr8	10390462	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=146,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:10390454_C_T:10390454:11,6,1,1
chr8	10465097	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,6;MMQ=60,57;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.493:28:7,5:7,7:7,7,6,8
chr8	10465748	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=91,107;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.415:25:8,5:4,5:0|1:10465748_T_C:10465748:7,8,6,4
chr8	10465771	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.967:27:0,15:0,11:0|1:10465748_T_C:10465748:0,0,11,16
chr8	10468828	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,1,2
chr8	10470130	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	10474110	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr8	10532355	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr8	10532401	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr8	10583203	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr8	10584212	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:10584212_C_T:10584212:0,0,0,2
chr8	10584226	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=306,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10584212_C_T:10584212:0,1,0,1
chr8	10584229	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=306,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10584212_C_T:10584212:0,1,0,1
chr8	10587773	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:20,1:18,1:18,20,1,1
chr8	10677601	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr8	10683623	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:7,1,2,3
chr8	10689142	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,4:3,7:6,1,8,3
chr8	10690319	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,4,1
chr8	10690543	.	CAGA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:1,5,0,4
chr8	10692158	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,17,3
chr8	10692359	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	10782438	.	C	CAAAGTTCTGGGATTACAGGTGTGAGTGAGCCACTGTGCCAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,19;MFRL=274,182;MMQ=60,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr8	11142389	.	C	CG	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=103.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,13:0,23:0,0,30,9
chr8	11142625	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr8	11162602	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr8	11162623	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	11164012	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=265,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr8	11174484	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,284;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	11177126	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:3,0,4,0
chr8	11177410	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.411:10:0,1:5,2:0,6,0,4
chr8	11188532	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=133,152;MMQ=58,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,4:7,1:0|1:11188532_G_C:11188532:8,5,3,2
chr8	11188540	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=132,151;MMQ=58,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:6,4:7,0:0|1:11188532_G_C:11188532:8,6,3,1
chr8	11189695	.	C	CAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=154,66;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.163:28:11,3:11,0:6,18,3,1
chr8	11301988	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	11400680	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr8	11414440	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr8	11415572	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,4,7
chr8	11415597	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr8	11418766	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,1:6,1,6,1
chr8	11421359	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.554:7:0,2:1,0:0|1:11421359_A_C:11421359:2,1,4,0
chr8	11421363	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:1,2:2,0:0|1:11421359_A_C:11421359:3,1,4,0
chr8	11421366	.	GA	CC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:1,0:3,0:0|1:11421359_A_C:11421359:3,1,4,0
chr8	11606555	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:3,5,1,1
chr8	11612665	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=175,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:11612665_A_AG:11612665:0,4,0,1
chr8	11612667	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=175,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:11612665_A_AG:11612665:0,4,0,1
chr8	11612669	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=175,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:11612665_A_AG:11612665:0,4,0,1
chr8	11612698	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:0,1,1,1
chr8	11629119	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr8	11640611	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr8	11643460	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:13,0,2,0
chr8	11666451	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:2,5,0,5
chr8	11679177	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,4:6,2:12,1,5,1
chr8	11687938	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,3,11
chr8	11689228	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,5:4,1:1,7,0,7
chr8	11695872	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,7:7,5:9,1,12,0
chr8	11705139	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr8	11705342	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:4,5:12,4:7,9,4,5
chr8	11705380	.	A	AAGCCCCAGCTGGGCGAGGC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.345:18:3,1:8,3:2,10,0,6
chr8	11705677	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,3:2,7:0,8,0,10
chr8	11708355	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=105,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.856:19:0,10:2,4:1,1,16,1
chr8	11710235	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:1,0:0|1:11710235_T_G:11710235:0,2,0,1
chr8	11710253	.	G	GACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11710235_T_G:11710235:0,0,0,1
chr8	11710888	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=108,145;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:3,6,2,3
chr8	11831661	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr8	11831948	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=141,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr8	11831971	.	G	GGCTTCCTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,0;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:0,0:3,0:3,0,0,1
chr8	11832199	.	G	GCCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11832199_G_GCCAT:11832199:0,0,0,1
chr8	11832201	.	A	AAGGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11832199_G_GCCAT:11832199:0,0,0,1
chr8	11841931	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:2,2:11,0:10,3,2,0
chr8	11994578	.	TTG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	11996150	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,121;MMQ=48,23;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:2,3,2,1
chr8	12589179	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,5:2,5:8,0,10,0
chr8	12592956	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr8	12600622	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=81.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,21,2
chr8	12863700	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,4,0
chr8	12870139	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=232,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr8	12870160	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=139,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,4:4,1:6,1,4,1
chr8	12870186	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:7,1,3,3
chr8	12878807	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:5,1:6,4:9,2,3,2
chr8	12879539	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:7,6:1,4:4,4,6,4
chr8	12879694	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.405:20:5,5:7,3:4,8,3,5
chr8	12879707	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.372:22:5,4:9,4:6,8,3,5
chr8	12879823	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:5,6:2,4:3,4,4,6
chr8	12880266	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=184,178;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12880266_CA_TG:12880266:0,1,0,1
chr8	12880271	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=184,178;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12880266_CA_TG:12880266:0,1,0,1
chr8	12880274	.	AA	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=184,178;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12880266_CA_TG:12880266:0,1,0,1
chr8	12880453	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,3:4,10:6,0,13,0
chr8	12880460	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:6,0:14,3:20,0,3,0
chr8	12880521	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,23:0.361:64:19,5:22,17:20,21,13,10
chr8	12881609	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=175,208;MMQ=43,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:0,8,0,2
chr8	12881677	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	12882073	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr8	12882696	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:10,2:8,5:11,8,5,2
chr8	12882997	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=194,133;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr8	12883021	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=173,126;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:12883021_CA_TG:12883021:4,0,1,0
chr8	12883027	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=173,126;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:12883021_CA_TG:12883021:4,0,1,0
chr8	12883030	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=173,126;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:12883021_CA_TG:12883021:4,0,1,0
chr8	12885240	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr8	12885317	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:11,4:3,2:6,8,5,1
chr8	12886170	.	TG	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=313,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr8	12886203	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	12950088	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr8	12952174	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,17,0
chr8	12958025	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	13072066	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=111,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.581:3:0,2:0,0:0|1:13072066_C_CT:13072066:0,1,2,0
chr8	13072084	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=111,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.394:5:2,1:0,0:0|1:13072066_C_CT:13072066:1,2,2,0
chr8	13072088	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=111,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:13072066_C_CT:13072066:1,2,1,0
chr8	13258927	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:13258927_G_C:13258927:0,0,10,0
chr8	13258936	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0|1:13258927_G_C:13258927:0,0,11,1
chr8	13259224	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13259224_G_A:13259224:0,1,0,1
chr8	13259226	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13259224_G_A:13259224:0,1,0,1
chr8	13356802	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,8:0,0,5,15
chr8	13356818	.	TT	CG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr8	13357587	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr8	13424583	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,9,10
chr8	13425353	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr8	13965581	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	14022296	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr8	14095250	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr8	14412455	.	G	GTA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=149,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,2:8,0:0|1:14412455_G_GTA:14412455:2,15,1,1
chr8	14412463	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:6,0:0|1:14412455_G_GTA:14412455:0,15,1,1
chr8	15508200	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=207,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,6:1,1:3,1,4,3
chr8	15615179	.	CCT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:5,1,3,0
chr8	15615315	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.572:33:9,8:5,11:7,7,12,7
chr8	15621703	.	C	G	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=142,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:102,4:0.045:106:60,0:42,4:70,32,0,4
chr8	15978063	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,11:0,4:0,0,6,9
chr8	15998415	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=195,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,4:3,0:8,2,4,0
chr8	16007649	.	GTA	G,GTATA,GTATATA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35,34,33;MFRL=0,160,187,164;MMQ=60,51,50,40;MPOS=24,28,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,15,17,18;RU=TA;STR;TLOD=23.77,5.52,4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,8,3,2:0.482,0.268,0.196:13:0,4,2,2:0,4,1,0:0,0,13,0
chr8	16026460	.	C	CATTCCCCTATACTCGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,37;MFRL=232,209;MMQ=60,42;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16026460_C_CATTCCCCTATACTCGG:16026460:0,1,0,1
chr8	16026464	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=232,209;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16026460_C_CATTCCCCTATACTCGG:16026460:0,1,0,1
chr8	16026468	.	TT	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=232,209;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16026460_C_CATTCCCCTATACTCGG:16026460:0,1,0,1
chr8	16859398	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	16935234	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:6,1,5,0
chr8	16939284	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=131.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,38:0.448:85:23,20:21,16:0|1:16939284_G_A:16939284:11,36,8,30
chr8	16939299	.	C	CA	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=110.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,30:0.408:74:19,18:23,12:0|1:16939284_G_A:16939284:7,37,2,28
chr8	16942837	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,9:0,0,5,18
chr8	16942849	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:3,6:0,4:1,2,2,8
chr8	16944532	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=110,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.341:39:10,8:16,5:11,15,7,6
chr8	17042416	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr8	17063335	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:0,9,0,8
chr8	17068013	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.416:20:5,2:5,6:1,11,1,7
chr8	17074640	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:8,6:5,3:12,2,6,3
chr8	17092164	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr8	17125957	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr8	17137687	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.449:42:6,5:17,12:12,11,10,9
chr8	17143830	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,5:2,7:2,1,9,3
chr8	17159812	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr8	17206618	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=162,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:17206618_T_TG:17206618:1,3,0,1
chr8	17206622	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=162,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:17206618_T_TG:17206618:1,3,0,1
chr8	17270763	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,14:0,0,11,19
chr8	17401878	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr8	17406183	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,12:0,0,21,8
chr8	17406367	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.935:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr8	17421279	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr8	17434641	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	17446894	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr8	17503431	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,5:0,10:0,0,15,2
chr8	17532619	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	17579135	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	17612097	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,2:10,1:10,8,0,3
chr8	17612639	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=185,199;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:4,2,6,0
chr8	17742929	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	17797409	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr8	17804665	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:7,10:10,6:13,4,15,1
chr8	17810746	.	T	TCACACAAGTCTTACCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.484:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	17819761	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr8	17827260	.	A	AC	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=76.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,25:0.604:41:10,11:6,14:0,16,1,24
chr8	17829756	.	C	CAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:5,0,5,0
chr8	17849241	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,68;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:17,0:10,2:5,22,1,1
chr8	17868029	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,4:1,6:4,0,9,1
chr8	17868245	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=143,143;MMQ=60,46;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr8	17868273	.	C	CCT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=188,117;MMQ=60,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,2:3,0:0|1:17868273_C_CCT:17868273:1,8,0,2
chr8	17868279	.	CAA	TGG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=188,117;MMQ=60,38;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,1:3,0:0|1:17868273_C_CCT:17868273:1,8,0,2
chr8	17871598	.	T	A	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,31:0.563:55:10,9:11,17:1,23,8,23
chr8	17871602	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=4;MBQ=13,17;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.129:51:5,1:9,0:9,35,0,7
chr8	17871604	.	TA	T	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=12,13;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.277:34:2,2:8,2:0,24,0,10
chr8	17871619	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.500:38:7,7:11,12:0,19,0,19
chr8	17882845	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.175:23:8,2:9,2:14,5,2,2
chr8	17885091	.	T	C	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=122.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,40:0.570:70:18,23:12,17:21,9,29,11
chr8	17916224	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	17916370	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,2:8,0:13,10,2,0
chr8	17918986	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:3,9:5,7:2,6,2,14
chr8	17919031	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=165,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.740:11:0,5:2,4:0,2,0,9
chr8	17920623	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr8	17920807	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr8	17921921	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,2:6,2:5,2,4,1
chr8	17924645	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:6,7:5,3:0|1:17924645_G_T:17924645:10,2,10,0
chr8	17924648	.	CTGTA	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTA;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.120:23:12,1:7,1:1|0:17924645_G_T:17924645:20,1,2,0
chr8	17924660	.	C	CTAAG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,2:0.103:27:14,1:11,1:1|0:17924645_G_T:17924645:24,1,2,0
chr8	17924849	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.560:37:9,11:7,8:1,15,2,19
chr8	17927248	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	17927280	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:17927280_G_T:17927280:0,0,5,2
chr8	17927294	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:17927280_G_T:17927280:0,0,5,2
chr8	17928762	.	T	TATA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	17928920	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr8	17928999	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	18074536	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr8	18074602	.	TT	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=232,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr8	18080644	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,22:0.922:23:1,13:0,8:0|1:18080644_A_T:18080644:0,1,11,11
chr8	18080651	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,16:0,9:0|1:18080644_A_T:18080644:0,0,13,14
chr8	18081226	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18081226_G_A:18081226:0,0,0,1
chr8	18081228	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18081226_G_A:18081226:0,0,0,1
chr8	18081229	.	T	TAACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18081226_G_A:18081226:0,0,0,1
chr8	18393159	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=135,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.435:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr8	18413875	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr8	18413893	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=159,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.792:11:1,4:1,3:0,2,1,8
chr8	18430201	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=185,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,2:2,4:2,4,0,6
chr8	18430219	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=256,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr8	18432578	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr8	18658929	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=80.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0|1:18658929_C_A:18658929:0,0,1,18
chr8	18658950	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=77.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0|1:18658929_C_A:18658929:0,0,1,17
chr8	18661932	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	18666210	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=79.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,14:0,0,20,5
chr8	18793690	.	A	AGACTTTATGGCTAAGTGCTGTGACTCACG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.322:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr8	18793697	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr8	19190491	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,14:0,0,12,10
chr8	19190692	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr8	19192192	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr8	19218625	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	19230955	.	G	GTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TA;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,0:2,0,5,0
chr8	19363029	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=189,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,2:0,1:0,1,1,3
chr8	19681647	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr8	19682545	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	19689633	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,3,18
chr8	19809435	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=109,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.396:31:8,8:9,4:10,9,4,8
chr8	19811023	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TG;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	19813667	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	20003431	.	AT	A,ATT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31,15;MFRL=176,161,156;MMQ=60,60,40;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.01,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,3:0.310,0.249:13:3,2,1:2,1,0:2,4,0,7
chr8	20005439	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,3:1,2:4,0,4,1
chr8	20007125	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=273,147;MMQ=42,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr8	20008152	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:7,6,2,0
chr8	20008155	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=145,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:5,3,3,3
chr8	20008354	.	AA	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20008354_AA_CT:20008354:0,0,0,1
chr8	20008363	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20008354_AA_CT:20008354:0,0,0,1
chr8	20022486	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,4:6,7:3,5,6,5
chr8	20028750	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=229,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr8	20028895	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=127,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:3,1:4,2:7,0,2,2
chr8	20031853	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.414:39:11,7:11,9:16,7,11,5
chr8	20036018	.	GA	G,TG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,28,32;MFRL=126,73,136;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.44,46.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,15:0.185,0.455:30:4,3,5:2,2,10:2,8,3,17
chr8	20038486	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:3,5,0,2
chr8	20054870	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:6,1:11,1,2,0
chr8	20069273	.	A	AAGTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,1:4,7:1,10,0,8
chr8	20069789	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr8	20074092	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr8	20111039	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=211,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20111039_CT_C:20111039:0,1,0,1
chr8	20111041	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=211,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20111039_CT_C:20111039:0,1,0,1
chr8	20112267	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20112267_T_G:20112267:0,0,1,0
chr8	20112269	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20112267_T_G:20112267:0,0,1,0
chr8	20112276	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20112267_T_G:20112267:0,0,1,0
chr8	21550800	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,2:7,1:4,4,1,2
chr8	21563612	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21563612_T_C:21563612:0,0,0,1
chr8	21563614	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:21563612_T_C:21563612:0,1,0,1
chr8	21563620	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21563612_T_C:21563612:0,1,0,1
chr8	21563623	.	C	CTTGCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21563612_T_C:21563612:0,1,0,1
chr8	21777251	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:4,4:5,5:3,6,3,7
chr8	21823866	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,2:8,2:3,14,0,4
chr8	21824547	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr8	21824577	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=234,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:21824577_T_A:21824577:0,2,0,1
chr8	21824581	.	T	TGGTATTGGACAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=234,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21824577_T_A:21824577:0,2,0,1
chr8	21827833	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:7,4:2,9:1,8,2,11
chr8	21827880	.	A	AACAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=AC;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr8	21833965	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:7,8:6,5:6,8,1,12
chr8	21833975	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,2:10,0:8,14,0,2
chr8	21839339	.	A	AC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,83;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:19,0:17,4:18,18,0,4
chr8	21840052	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr8	21842063	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	21843242	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=165,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr8	21843277	.	T	TCCAATCAACTCCATTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=179,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:21843277_T_TCCAATCAACTCCATTC:21843277:0,4,0,1
chr8	21843279	.	A	ATTCCATTCCACTCCACTCTATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=179,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:21843277_T_TCCAATCAACTCCATTC:21843277:0,4,0,1
chr8	21844844	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=210,258;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:21844844_G_T:21844844:0,2,0,1
chr8	21844849	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=210,258;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:21844844_G_T:21844844:0,2,0,1
chr8	21845428	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:4,1:1,8,2,1
chr8	21846526	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=97,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,3:7,3:4,8,2,4
chr8	21857267	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,4:2,0:0,3,0,5
chr8	21890581	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:21890581_T_C:21890581:0,0,2,0
chr8	21890589	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0|1:21890581_T_C:21890581:0,0,2,0
chr8	21891939	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,12,7
chr8	21891968	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=61.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,10,7
chr8	21904212	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=122,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr8	21905772	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,6:4,5:0,8,0,11
chr8	21924743	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr8	21924778	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr8	21924944	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr8	21925214	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	21930014	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=183,89;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:21930014_T_C:21930014:1,2,0,1
chr8	21930026	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=179,89;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:21930014_T_C:21930014:1,2,0,1
chr8	21930031	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=169,89;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:21930014_T_C:21930014:0,4,0,1
chr8	21930037	.	AT	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=186,89;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:21930014_T_C:21930014:0,4,0,1
chr8	21931141	.	CAAAAA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=186,171;MMQ=40,36;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=A;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.633:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr8	21931170	.	AAAAAAAAAAGAG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=169,166;MMQ=40,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.765:6:1,4:0,1:1,0,4,1
chr8	21937667	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr8	21937870	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,14,1
chr8	21955552	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:5,1:3,1:7,3,1,1
chr8	21958333	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr8	21958549	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=222,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr8	21959191	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chr8	21959638	.	AC	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:6,3,6,2
chr8	21959877	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0|1:21959877_T_G:21959877:0,0,1,3
chr8	21959887	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=229,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:21959877_T_G:21959877:2,1,0,1
chr8	21959888	.	G	GATTCTGCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=229,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:21959877_T_G:21959877:2,1,0,1
chr8	21960270	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr8	21960279	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr8	21964802	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,17:0,3:0,0,12,8
chr8	21973970	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=127,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr8	21974032	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	21976872	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=199,138;MMQ=60,53;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.711:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr8	21978761	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,15;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.345:12:3,1:4,0:7,1,0,4
chr8	21984488	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,17;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr8	21985342	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21985342_C_CA:21985342:0,0,0,1
chr8	21985343	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21985342_C_CA:21985342:0,0,0,1
chr8	21985345	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21985342_C_CA:21985342:0,0,0,1
chr8	21985349	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21985342_C_CA:21985342:0,0,0,1
chr8	21998323	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	22006441	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:6,14,0,2
chr8	22020294	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr8	22021037	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:4,3,4,1
chr8	22051496	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr8	22053123	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.411:19:7,4:3,3:2,9,1,7
chr8	22081708	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr8	22104629	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:4,0,7,0
chr8	22104691	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.383:27:12,3:4,6:10,7,5,5
chr8	22105283	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr8	22107986	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.487:29:7,5:7,9:4,11,5,9
chr8	22137192	.	AC	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=163,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr8	22140763	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,1:1,3:0,2,1,3
chr8	22141643	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr8	22147333	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,5:10,2:11,6,6,2
chr8	22162318	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:12,2:11,9,1,1
chr8	22163619	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr8	22165438	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:3,5:5,5:7,1,8,3
chr8	22165595	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=99.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,33:0.607:54:12,18:9,14:6,15,16,17
chr8	22171767	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr8	22171957	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:4,4:1,8,2,7
chr8	22171967	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr8	22172702	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:12,7:3,7:3,12,4,10
chr8	22173892	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,0:6,2:0|1:22173892_G_T:22173892:1,8,1,1
chr8	22173895	.	CCTAAT	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:22173892_G_T:22173892:1,8,1,1
chr8	22173907	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:22173892_G_T:22173892:0,6,1,1
chr8	22173909	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:22173892_G_T:22173892:0,6,1,1
chr8	22175836	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.340:13:2,2:5,2:5,4,0,4
chr8	22210805	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr8	22211756	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,1:0,7:0,0,8,1
chr8	22211914	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr8	22213082	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	22262142	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,10,0
chr8	22262183	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,14,0
chr8	22262228	.	AGCTGCT	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=GCT;STR;TLOD=87.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,6,14
chr8	22262321	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,7,8
chr8	22277040	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:5,3,2,1
chr8	22299024	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.471:6:3,0:0,1:0,3,0,3
chr8	22368832	.	T	TAGGATCAAGGGGACA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22368832_T_TAGGATCAAGGGGACA:22368832:0,0,0,1
chr8	22368835	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22368832_T_TAGGATCAAGGGGACA:22368832:0,0,0,1
chr8	22368837	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22368832_T_TAGGATCAAGGGGACA:22368832:0,0,0,1
chr8	22368839	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:22368832_T_TAGGATCAAGGGGACA:22368832:0,0,0,1
chr8	22389900	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr8	22397067	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.074:64:31,1:29,3:17,43,1,3
chr8	22398414	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=191,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr8	22412321	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,325;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:22412321_C_G:22412321:0,0,1,0
chr8	22412324	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=84,325;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:22412321_C_G:22412321:2,0,1,0
chr8	22412328	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=84,325;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:22412321_C_G:22412321:2,0,1,0
chr8	22412332	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=84,325;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:22412321_C_G:22412321:2,0,1,0
chr8	22421395	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr8	22422150	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr8	22422923	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.479:27:6,6:8,6:0,14,0,13
chr8	22424489	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	22426650	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr8	22428658	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,11:0,1:0,0,0,12
chr8	22438313	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:0,1:3,1:0|1:22438313_T_C:22438313:1,2,0,3
chr8	22438314	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1|0:22438313_T_C:22438313:0,3,1,2
chr8	22438459	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=31,17;MFRL=158,55;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:8,1:0|1:22438459_A_G:22438459:15,8,1,1
chr8	22438476	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=158,55;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:10,2:0|1:22438459_A_G:22438459:15,10,1,1
chr8	22438482	.	TT	CC	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=157,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:11,2:0|1:22438459_A_G:22438459:14,11,1,1
chr8	22438485	.	G	GCAA	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=159,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:0|1:22438459_A_G:22438459:12,10,1,1
chr8	22438487	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=159,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:0|1:22438459_A_G:22438459:12,10,1,1
chr8	22438489	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=159,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:10,2:0|1:22438459_A_G:22438459:12,10,1,1
chr8	22442287	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=108,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:4,1,2,0
chr8	22460204	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:4,4:4,2:0,9,0,6
chr8	22463697	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.433:30:10,6:7,6:1,16,2,11
chr8	22464064	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=93,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,6:0,4:3,0,9,1
chr8	22464390	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.410:25:10,2:4,8:12,3,8,2
chr8	22465385	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr8	22465427	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=190,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:9,2,3,0
chr8	22470710	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr8	22472080	.	AG	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=242,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:22472080_AG_CT:22472080:0,3,0,1
chr8	22472085	.	TCG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=242,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:22472080_AG_CT:22472080:0,3,0,1
chr8	22472089	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=242,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:22472080_AG_CT:22472080:0,3,0,1
chr8	22473465	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,7:5,0:5,4,5,2
chr8	22476735	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,0:9,2:7,11,1,1
chr8	22477131	.	ACAT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAT;STR;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:2,3:4,6:6,3,6,3
chr8	22487388	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr8	22487422	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr8	22502207	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr8	22548303	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:13,5,2,0
chr8	22582274	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=112,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:4,0,8,0
chr8	22785013	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	22785047	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=139,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr8	22862905	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:5,2,4,3
chr8	22863004	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr8	22863017	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr8	22863729	.	G	GTGTGACTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	22865320	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr8	22880162	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr8	22881852	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=214,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr8	22881865	.	G	GGTTTGGAATAATCGCCAGTCTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr8	22885109	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	22885154	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	22886130	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr8	22888407	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr8	22926498	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr8	22960704	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.448:20:5,4:6,4:2,9,4,5
chr8	23004649	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=202,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:23004649_CCA_C:23004649:0,2,0,1
chr8	23004653	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=202,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:23004649_CCA_C:23004649:0,2,0,1
chr8	23049292	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,6,8
chr8	23059280	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=124,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr8	23069574	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:5,1,5,1
chr8	23104195	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:2,1:5,7:7,1,7,1
chr8	23106665	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:3,3:3,0:7,0,3,0
chr8	23112662	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	23112937	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:12,1:16,1:14,14,1,1
chr8	23113908	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.580:15:3,3:3,4:6,0,9,0
chr8	23116392	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=110,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,0:3,5:0,6,0,5
chr8	23116429	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=103,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:1,1,1,2
chr8	23116431	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr8	23116675	.	A	ATTTTTTTTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,0;MFRL=0,137;MMQ=60,35;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=24,34;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.780:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr8	23117643	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,4:2,5:2,0,9,0
chr8	23118155	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,2:5,2:0,10,0,4
chr8	23159604	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:12,2:5,0:9,8,2,0
chr8	23174425	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr8	23177619	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr8	23185977	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.453:18:4,2:5,5:8,2,5,3
chr8	23186007	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0,0,5,9
chr8	23198732	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr8	23294392	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr8	23294412	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr8	23425982	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=133,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr8	23425987	.	AGCGGCTCCTAG	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:23425987_AGCGGCTCCTAG_A:23425987:0,3,0,1
chr8	23425989	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:23425989_C_A:23425989:0,2,0,1
chr8	23425990	.	G	GCTAC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:23425989_C_A:23425989:0,2,0,1
chr8	23425992	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	23426000	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23425987_AGCGGCTCCTAG_A:23425987:0,1,0,1
chr8	23429448	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.852:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr8	23712063	.	TGG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:8,3:7,7,2,1
chr8	24193264	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr8	24193301	.	T	TGCACAAGAAGAAAGTGACCTTTGCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:24193301_T_TGCACAAGAAGAAAGTGACCTTTGCCC:24193301:0,0,0,1
chr8	24193305	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24193301_T_TGCACAAGAAGAAAGTGACCTTTGCCC:24193301:0,0,0,1
chr8	24200743	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0,10,0,2
chr8	24200778	.	T	TGAACTAATCACATAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=62,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr8	24208649	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	24208847	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=133.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,22:0,0,14,25
chr8	24211884	.	A	ATGTC	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTC;STR;TLOD=211.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,24:0,19:0,0,28,22
chr8	24211993	.	ACTAT	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=143.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.975:33:0,15:0,17:0,0,4,29
chr8	24212040	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,6:4,3:0,10,0,9
chr8	24241973	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr8	24333848	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=271,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr8	24339890	.	TT	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=118,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24339890_TT_GA:24339890:0,1,0,1
chr8	24339893	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=118,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24339890_TT_GA:24339890:0,1,0,1
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chr8	24358219	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:2,5:3,4:6,0,9,0
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chr8	24365157	.	TCA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=69.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,5:0,0,0,16
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chr8	25128468	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=255,194;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25128462_A_C:25128462:0,1,0,1
chr8	25128471	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=255,194;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25128462_A_C:25128462:0,1,0,1
chr8	25128474	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=255,194;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25128462_A_C:25128462:0,1,0,1
chr8	25158026	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr8	25158072	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,7:1,2:1,0,8,1
chr8	25166198	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,3,0
chr8	25174495	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr8	25174710	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:25174710_C_T:25174710:0,0,0,4
chr8	25174723	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:25174710_C_T:25174710:0,0,0,3
chr8	25181356	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,17:0,3:0,0,10,10
chr8	25190308	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr8	25202915	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	25203168	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:25203168_G_C:25203168:1,2,0,1
chr8	25203177	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:25203168_G_C:25203168:1,3,0,1
chr8	25203178	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:25203168_G_C:25203168:1,3,0,1
chr8	25203180	.	C	CTTAGAAACTTCTGCTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:25203168_G_C:25203168:1,3,0,1
chr8	25209144	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=207,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr8	25209350	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=70,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,3:4,4:5,6,3,4
chr8	25216620	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr8	25227229	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:25227229_T_G:25227229:0,3,0,3
chr8	25227234	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:25227229_T_G:25227229:0,3,0,3
chr8	25227255	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	25230168	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=139,199;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,4:1,0,2,4
chr8	25230267	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=118,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,1,3
chr8	25231044	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=174,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr8	25231117	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:6,4:1,4:4,3,5,3
chr8	25246777	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr8	25249585	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=189,159;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:25249585_C_T:25249585:0,4,0,1
chr8	25249588	.	TG	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=183,159;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:25249585_C_T:25249585:0,3,0,1
chr8	25249601	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.693:1:0,1:0,0:0|1:25249601_C_CCT:25249601:0,0,0,1
chr8	25249604	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25249601_C_CCT:25249601:0,0,0,1
chr8	25250423	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:8,0:0,4:1,7,0,4
chr8	25257531	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:2,5,1,2
chr8	25258394	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=126,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:25258394_C_T:25258394:2,0,1,0
chr8	25258399	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:25258394_C_T:25258394:3,0,1,0
chr8	25261281	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=133,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:4,1:1,4:0,6,0,5
chr8	25265404	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:25265404_A_C:25265404:0,0,1,0
chr8	25265412	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:25265404_A_C:25265404:0,0,1,0
chr8	25265421	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,19;MFRL=198,177;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:25265404_A_C:25265404:1,0,1,0
chr8	25265424	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=198,177;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:25265404_A_C:25265404:1,0,1,0
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chr8	25323653	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:5,6:10,6:13,2,11,1
chr8	25327571	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,1:1,5:0,2,0,7
chr8	25343245	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:5,2:7,3,5,2
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chr8	25744257	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,5:0,0,11,5
chr8	25766097	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr8	25898565	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=196,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,1:1,5:0,1,1,6
chr8	26249018	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	26265907	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,3,24
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chr8	26441275	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,11:0,0,14,5
chr8	26441562	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr8	26484064	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:3,1,8,1
chr8	26513299	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	26623477	.	C	CTTGTGAAAAGAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.597:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr8	26906309	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	26906433	.	TTAAAG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=87,0;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,1:4,1:4,2,1,1
chr8	27097617	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:11,1:22,1:13,21,0,2
chr8	27097777	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	27098753	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,257;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,1:12,1:7,10,2,0
chr8	27099879	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr8	27151900	.	T	TGAAATCGGAAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27151900_T_TGAAATCGGAAC:27151900:0,0,0,1
chr8	27151905	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27151900_T_TGAAATCGGAAC:27151900:0,0,0,1
chr8	27255080	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.636:14:3,8:1,1:3,2,6,3
chr8	27255325	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.678:20:2,4:4,8:2,4,3,11
chr8	27255368	.	AGCAGCTCTCCTGCAGCCTC	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.690:4:0,2:0,1:0,1,0,3
chr8	27287997	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,4:2,2:2,4,1,5
chr8	27288033	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=133,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,3:0,2:0,5,0,5
chr8	27289963	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=238,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr8	27291557	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0,0,11,3
chr8	27292075	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:8,1,1,1
chr8	27293405	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=151,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.319:7:2,2:3,0:0|1:27293405_T_TC:27293405:0,5,0,2
chr8	27293409	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:0|1:27293405_T_TC:27293405:0,4,0,2
chr8	27293412	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:1,1:3,0:0|1:27293405_T_TC:27293405:0,4,0,2
chr8	27294532	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	27294606	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr8	27294823	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,12,1
chr8	27295109	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr8	27297696	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr8	27297896	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:8,2:13,0:8,15,0,2
chr8	27308961	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr8	27310546	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,11,3
chr8	27315726	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	27319292	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,1,5
chr8	27321597	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	27326838	.	AGG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=G;STR;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,8:4,5:6,1,9,4
chr8	27369334	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,1:0,7:1,0,8,1
chr8	27456253	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	27461772	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=99,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:3,4:0,2:3,0,6,0
chr8	27509153	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr8	27593650	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr8	27598042	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,9:1,6:0,1,4,11
chr8	27637666	.	G	GT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.102:36:13,0:18,3:27,6,3,0
chr8	27641609	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,21:0,11:0,0,9,23
chr8	27650428	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr8	27667793	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr8	27668726	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr8	27680576	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=168.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,26:0,23:0,0,38,11
chr8	27729367	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=170,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr8	27729406	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr8	27767289	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:6,1:8,1:5,9,1,1
chr8	27779545	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	27779811	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr8	27823868	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:5,0,7,0
chr8	27845225	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27845225_AG_A:27845225:0,1,0,1
chr8	27845229	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27845225_AG_A:27845225:0,1,0,1
chr8	27880826	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,4:0,0,11,5
chr8	27886700	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,3:0,1:5,0,4,0
chr8	27903247	.	T	TGCTTTTCAGAAAGGTTGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr8	27915650	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,206;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.247:21:3,0:13,4:16,0,5,0
chr8	27925204	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=104,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:11,6:11,1:7,16,2,5
chr8	27950670	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr8	27957313	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr8	27957556	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr8	27967856	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,13:0,9:0,0,20,2
chr8	28013579	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,5:0,0,0,15
chr8	28016041	.	C	CCCGGG	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=33,19;MFRL=125,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:2,1:1,2:0,3,6,0
chr8	28016044	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=29,13;MFRL=125,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:2,0:0,1:0|1:28016044_T_C:28016044:0,3,6,0
chr8	28016048	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=116,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:1,2:1,2:0|1:28016044_T_C:28016044:3,3,6,0
chr8	28016054	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=30,20;MFRL=117,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:3,1:3,2:0|1:28016044_T_C:28016044:4,3,6,0
chr8	28016061	.	GCT	G	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=28,19;MFRL=125,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,0:3,1:0|1:28016044_T_C:28016044:6,4,3,0
chr8	28016067	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=28,12;MFRL=123,192;MMQ=60,59;MPOS=-1073741827;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,0:0|1:28016044_T_C:28016044:8,4,2,0
chr8	28016069	.	C	CAG	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=32,12;MFRL=123,192;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,0:0|1:28016044_T_C:28016044:8,4,2,0
chr8	28016112	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:12,1:13,5,1,1
chr8	28186607	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	28186896	.	TCT	AGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	28210613	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr8	28341058	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr8	28588904	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,10:0,0,3,12
chr8	28628420	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr8	28645271	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr8	28651296	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=106,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.329:13:5,3:0,0:4,5,3,1
chr8	28692783	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,4,2
chr8	28707622	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.448:11:2,4:3,1:4,2,5,0
chr8	28837492	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:12,0,2,0
chr8	28876221	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:6,0,6,0
chr8	28967641	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=234,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr8	28984042	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,32:0.492:65:14,17:19,14:14,19,14,18
chr8	28984572	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,17,2
chr8	29005093	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr8	29007773	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,2:3,3:11,0,4,1
chr8	29048477	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:9,3:1,5:9,1,8,1
chr8	29053761	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,31,33,31;MFRL=181,121,127,131;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,19,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=A;STR;TLOD=8.89,18.21,12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,6,9,12:0.188,0.346,0.365:29:0,3,2,7:1,3,6,4:0,2,2,25
chr8	29053778	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=132,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.443:36:8,6:12,9:1,19,1,15
chr8	29923732	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr8	29927653	.	CAG	TGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,150;MMQ=60,58;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:29927653_CAG_TGA:29927653:0,3,0,1
chr8	29927659	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,15;MFRL=168,150;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:29927653_CAG_TGA:29927653:0,2,0,1
chr8	29931375	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=145.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,24:0,16:0,0,32,9
chr8	29940271	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=89.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,24,0
chr8	29989399	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=190,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:1,0,4,1
chr8	29996313	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	30001915	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	30464719	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=35,36,33;MFRL=175,118,190;MMQ=60,60,60;MPOS=27,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.08,14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,9:0.075,0.329:27:8,0,2:8,2,6:0,16,0,11
chr8	30469805	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0,0,15,5
chr8	30537223	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=180,190;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:1,0:0,4,0,4
chr8	30539623	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:1,4,0,3
chr8	30541765	.	A	AACAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr8	30546636	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:5,2:2,4:7,0,6,1
chr8	30554006	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:7,5:4,9:3,8,4,10
chr8	30569609	.	GA	G,GAA	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=25,32,19;MFRL=134,146,149;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=11.82,5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,10,6:0.203,0.108:48:10,5,0:7,3,3:9,23,2,14
chr8	30601610	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=216,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0|1:30601610_TC_T:30601610:3,0,4,0
chr8	30601617	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1|0:30601610_TC_T:30601610:4,0,3,0
chr8	30601805	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:12,8:4,6:3,13,3,11
chr8	30609061	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:3,7:5,5:0|1:30609061_T_G:30609061:1,7,0,12
chr8	30609078	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:0|1:30609061_T_G:30609061:0,8,0,4
chr8	30620840	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=56.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,4:0,16:0,0,9,11
chr8	30620964	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	30651335	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,3:6,4:12,0,6,1
chr8	30700339	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:5,5:8,6:9,5,6,5
chr8	30854033	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=242,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr8	30916085	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr8	30922346	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,17,0
chr8	30924557	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,108;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,5:6,5:5,5,4,6
chr8	30933859	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:0,4,0,8
chr8	30958353	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=48.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr8	30977696	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr8	30981971	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,15,0
chr8	30999122	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=104.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,15:0,0,11,21
chr8	31004465	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=213,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:1,6:1,2:2,0,8,0
chr8	31005017	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,10:0,0,0,17
chr8	32617713	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:7,2:3,3:6,5,2,3
chr8	33311091	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,4:1,5:0,3,0,9
chr8	33311123	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=180,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr8	33347907	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr8	33354275	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=176,97;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr8	33354856	.	CAA	C,CAAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,30,19;MFRL=139,135,50;MMQ=60,60,58;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,18;RU=A;STR;TLOD=3.99,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.157,0.202:12:0,1,0:4,1,0:0,8,0,4
chr8	33356191	.	GT	G,GTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33,23;MFRL=138,213,107;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.33,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.337,0.329:6:0,0,1:1,2,0:0,2,1,3
chr8	33361280	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:1,4:4,6:1,4,9,2
chr8	33370098	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:1,4,1,5
chr8	33416303	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.785:7:0,3:1,2:0,1,1,5
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chr8	35402144	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=203,202;MMQ=57,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35402124_T_TA:35402124:0,1,0,1
chr8	35402147	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=203,202;MMQ=57,49;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35402124_T_TA:35402124:0,1,0,1
chr8	35606234	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,0:10,2:3,11,2,0
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chr8	36662680	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=73.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,14:0,7:0,0,20,1
chr8	36666183	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,10,5
chr8	36691189	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=110.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,20:0,12:0,0,9,23
chr8	36698552	.	G	GTTTTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=13,25;MFRL=231,60;MMQ=60,60;MPOS=-1073741814;POPAF=7.30;RPA=22,39;RU=T;STR;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.681:5:0,1:0,0:0,1,1,3
chr8	36767085	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr8	36768525	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:2,1:6,0:4,7,2,0
chr8	36776267	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,1:0,0,8,0
chr8	36780209	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	36788693	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,3,16
chr8	37623700	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:37623700_A_AC:37623700:3,0,1,0
chr8	37623701	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:37623700_A_AC:37623700:3,0,1,0
chr8	37623702	.	AGTGG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:37623700_A_AC:37623700:3,0,1,0
chr8	37623708	.	TG	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:37623700_A_AC:37623700:3,0,1,0
chr8	37623716	.	GT	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:37623700_A_AC:37623700:4,0,1,0
chr8	37672499	.	A	ACT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0|1:37672499_A_ACT:37672499:1,4,1,1
chr8	37672500	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:37672499_A_ACT:37672499:1,4,1,1
chr8	37672502	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:1,0:0|1:37672499_A_ACT:37672499:1,4,1,1
chr8	37686749	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,4:5,0:4,1,3,1
chr8	37691308	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=122,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:9,1:9,6,0,2
chr8	37691711	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	37693145	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:8,3:5,0:7,6,1,2
chr8	37693302	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr8	37693347	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:0,4,1,4
chr8	37695482	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:0,0:1,0:0,2,0,3
chr8	37695491	.	C	CGCGTAGAAAACAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=119,221;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr8	37698533	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:37698533_A_C:37698533:0,0,1,0
chr8	37698537	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37698533_A_C:37698533:0,0,1,0
chr8	37698809	.	CT	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:37698809_CT_AA:37698809:1,0,1,0
chr8	37698813	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,10;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:37698809_CT_AA:37698809:2,0,1,0
chr8	37698819	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,11;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:37698809_CT_AA:37698809:1,1,1,0
chr8	37698821	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:37698809_CT_AA:37698809:1,1,1,0
chr8	37699264	.	C	CTTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37699264_C_CTTGG:37699264:0,1,0,1
chr8	37699265	.	A	AACATGATTGAGATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37699264_C_CTTGG:37699264:0,1,0,1
chr8	37702464	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=191,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:2,4,0,2
chr8	37702596	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=182,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,0:4,3:7,1,2,1
chr8	37706057	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=102,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.408:35:10,5:10,9:15,6,10,4
chr8	37706267	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:0,7,1,5
chr8	37734853	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:18,1:20,1:17,21,2,0
chr8	37964024	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,23;MFRL=173,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,1:0,1:0,3,0,2
chr8	37967844	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=131,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:10,4,2,0
chr8	37967892	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=84,54;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:37967892_G_A:37967892:5,10,2,0
chr8	37967902	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=98,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,0:9,2:0|1:37967892_G_A:37967892:7,12,1,1
chr8	37972568	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:18,0:19,3:0,37,0,3
chr8	37985897	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,11:0,19:0,0,16,15
chr8	37986561	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	38003787	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr8	38027519	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=207,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr8	38110181	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=168,196;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:0,0:2,0:5,0,2,0
chr8	38125396	.	GT	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=42.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:10,6:7,8:9,8,9,5
chr8	38250361	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=169,173;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:38250361_G_C:38250361:7,7,0,2
chr8	38250365	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=169,173;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:0|1:38250361_G_C:38250361:7,7,0,2
chr8	38265795	.	GACT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACT;STR;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.552:18:2,6:6,4:2,6,3,7
chr8	38282294	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=184,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr8	38287556	.	G	GTATGGTAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38287556_G_GTATGGTAGA:38287556:0,0,0,1
chr8	38287559	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38287556_G_GTATGGTAGA:38287556:0,0,0,1
chr8	38314819	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	38370200	.	GAGACACAGAC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=207,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGACACAGAC;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.283:5:1,0:1,1:0,4,0,1
chr8	38373924	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:2,2,5,0
chr8	38646402	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,4:3,7:0,4,0,11
chr8	38684715	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,272;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:10,7,0,2
chr8	38697649	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.628:17:2,5:4,5:6,0,9,2
chr8	38793682	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr8	38809663	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=119.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,16:0,0,22,11
chr8	38827185	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr8	38835456	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr8	38839356	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38839356_G_T:38839356:0,2,0,1
chr8	38839358	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38839356_G_T:38839356:0,2,0,1
chr8	38839360	.	A	AATTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38839356_G_T:38839356:0,2,0,1
chr8	38840591	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,2:6,6:2,8,0,8
chr8	38845638	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,0:2,2:1,5,1,1
chr8	38845644	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=23,31,10;MFRL=153,141,157;MMQ=60,60,60;MPOS=16,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.09,5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.248,0.333:9:2,0,1:0,2,0:0,4,1,4
chr8	38845716	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=172,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,2:2,1:0,3,0,3
chr8	38851204	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,5:4,6:0,8,1,10
chr8	38853983	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,3,22
chr8	38873735	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,1:13,1:5,21,1,2
chr8	38873751	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.112:24:9,1:13,1:4,18,0,2
chr8	38876466	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0|1:38876466_T_C:38876466:0,0,1,13
chr8	38876468	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,6:0|1:38876466_T_C:38876466:0,0,1,13
chr8	38879046	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=159,149;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr8	38884342	.	G	GTTCT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCT;STR;TLOD=118.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,11:0,0,11,16
chr8	38911953	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr8	38940143	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,2:2,1:6,2,3,0
chr8	38959363	.	AT	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:26,3:10,1:39,1,4,0
chr8	38965271	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr8	38975580	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33,32,26;MFRL=162,134,153,163;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,8,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.80,19.22,4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,5,11,4:0.158,0.330,0.140:32:8,2,4,2:3,3,7,0:10,2,14,6
chr8	39027541	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:9,5:2,4:0,11,2,7
chr8	39068890	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr8	39080824	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	39114676	.	GTT	G,GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35,35;MFRL=34180,147,160;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.61,7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.271,0.459:8:1,2,2:1,0,1:2,0,5,1
chr8	39114780	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:10,2:7,14,0,2
chr8	39114949	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	39128387	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,43:0.562:76:21,21:12,22:20,13,23,20
chr8	39128510	.	AT	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=52.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.613:34:6,9:6,12:0,13,0,21
chr8	39487022	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr8	39503079	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=221,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr8	39505826	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,13,1
chr8	39521419	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,7:0,0,6,6
chr8	39525750	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr8	39607105	.	C	CAT,CATGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33,22;MFRL=146,133,187;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.42,12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.305,0.382:11:2,1,1:2,2,1:4,0,7,0
chr8	39618637	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr8	39678723	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:0,6,0,7
chr8	39776289	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,10:0,0,6,11
chr8	39776292	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=129,115;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:5,0:10,2:0|1:39776292_C_A:39776292:4,14,3,0
chr8	39776295	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=35,13;MFRL=132,115;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:7,0:11,1:0|1:39776292_C_A:39776292:7,14,3,0
chr8	39776298	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=132,115;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:6,1:13,2:0|1:39776292_C_A:39776292:7,14,3,0
chr8	39777529	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr8	39779989	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr8	39780922	.	CAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr8	39785321	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr8	39840144	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=126,108;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:39840144_C_T:39840144:7,0,2,0
chr8	39840146	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=126,108;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:39840144_C_T:39840144:7,0,2,0
chr8	39843139	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:12,8:6,13:0,18,0,21
chr8	39871036	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0|1:39871036_A_G:39871036:0,0,9,1
chr8	39871045	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=103,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:0|1:39871036_A_G:39871036:5,2,5,0
chr8	39871298	.	T	TTAA,TAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,33,31;MFRL=0,158,169;MMQ=60,60,60;MPOS=17,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.09,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,1:0.586,0.280:4:0,1,0:0,2,1:0,0,1,3
chr8	39871300	.	C	CTTTCTCT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:1,0:1,1:0|1:39871300_C_CTTTCTCT:39871300:1,2,0,1
chr8	39871301	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=208,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39871300_C_CTTTCTCT:39871300:0,2,0,1
chr8	39871305	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:39871300_C_CTTTCTCT:39871300:0,3,0,1
chr8	39872668	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	39873188	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr8	40011767	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr8	41122639	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:41122639_G_C:41122639:0,0,2,0
chr8	41122641	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41122639_G_C:41122639:0,0,1,0
chr8	41122645	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:41122639_G_C:41122639:0,0,1,0
chr8	41122650	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41122639_G_C:41122639:0,0,1,0
chr8	41122653	.	CGAGGCT	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41122639_G_C:41122639:0,0,1,0
chr8	41122663	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41122639_G_C:41122639:0,0,1,0
chr8	41123075	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=259,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	41348534	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,6:6,2:0,8,0,8
chr8	41393799	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=104,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,4:3,4:7,0,7,1
chr8	41469580	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,0:3,5:3,5,1,4
chr8	41472375	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr8	41476170	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr8	41476401	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,0:8,4:8,10,0,4
chr8	41504961	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,0:0,6:0,0,3,3
chr8	41517958	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=50.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,9:0,0,7,10
chr8	41519054	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,0:1,3:1,2,1,2
chr8	41519070	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:41519070_C_CA:41519070:1,3,0,1
chr8	41519072	.	C	CCATA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:41519070_C_CA:41519070:1,3,0,1
chr8	41519074	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:41519070_C_CA:41519070:1,3,0,1
chr8	41519091	.	AG	CT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:41519091_AG_CT:41519091:0,3,0,1
chr8	41519096	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:41519091_AG_CT:41519091:0,3,0,1
chr8	41519462	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr8	41521298	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=130,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:0|1:41521298_A_G:41521298:6,8,1,1
chr8	41521303	.	GAGTC	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:41521298_A_G:41521298:4,9,1,1
chr8	41521311	.	GA	AT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=145,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:41521298_A_G:41521298:2,8,1,1
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chr8	41555712	.	CA	AT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=199,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:41555704_CT_TC:41555704:0,3,0,1
chr8	41555740	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	41557093	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr8	41559183	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.253:6:4,0:1,1:0|1:41559183_G_GC:41559183:0,5,0,1
chr8	41559184	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=162,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr8	41559191	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:41559183_G_GC:41559183:0,4,0,1
chr8	41571787	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=153,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,0:11,0:11,15,0,3
chr8	41571802	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.584:27:8,6:3,9:6,5,2,14
chr8	41577121	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr8	41580607	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chr8	41580636	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,6:8,1:11,4,4,3
chr8	41583202	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,32;MFRL=188,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr8	41583215	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=188,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr8	41585571	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr8	41585579	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,1,2
chr8	42022586	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:11,2:17,3:13,16,2,3
chr8	42024875	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=174,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,0:12,3:3,16,1,2
chr8	42037924	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,1,4
chr8	42039603	.	TG	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=156,178;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,0:2,2:0,12,0,2
chr8	42045361	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:8,0,3,0
chr8	42049005	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:0,0:2,1:0|1:42049005_G_A:42049005:0,3,0,1
chr8	42049009	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42049005_G_A:42049005:0,3,0,1
chr8	42049011	.	C	CACAGTTCAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:42049005_G_A:42049005:0,3,0,1
chr8	42172017	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,5:0,0,0,19
chr8	42175303	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.941:31:0,14:1,16:1,0,9,21
chr8	42186579	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	42188550	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	42196441	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=90.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,13:0,0,25,1
chr8	42214950	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,2:11,0:4,13,0,2
chr8	42220244	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:4,7:7,3:2,10,0,10
chr8	42294930	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:19,0:22,3:23,18,2,1
chr8	42323207	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr8	42323529	.	C	CAGAGACAATTCCAAGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	42329935	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:3,4,0,2
chr8	42552633	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr8	42706048	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=146,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,0:7,3:8,11,2,1
chr8	42711606	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,4:5,3:0,8,0,8
chr8	42720704	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42720704_G_T:42720704:0,4,0,1
chr8	42720705	.	A	AAAGGCTAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42720704_G_T:42720704:0,4,0,1
chr8	42720708	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:42720704_G_T:42720704:0,4,0,1
chr8	42780832	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.370:14:5,4:2,1:0,9,0,5
chr8	42823443	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=209,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42823443_C_T:42823443:0,3,0,1
chr8	42823444	.	ATGGT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=209,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42823443_C_T:42823443:0,3,0,1
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chr8	48805816	.	A	AG	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=128.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,19:0,16:0,0,12,23
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chr8	48856000	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:48855996_C_CATTCGCACCACCTCCAT:48855996:0,4,0,1
chr8	48856004	.	T	TTAGAGAACAACTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=178,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
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chr8	49643243	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr8	49832790	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,177;MMQ=60,60;MPOS=-1073741818;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.064:45:25,1:14,1:25,18,1,1
chr8	49986670	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,0:9,2:8,12,1,1
chr8	49987910	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr8	49987944	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:49987944_T_C:49987944:0,2,0,1
chr8	49987946	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:49987944_T_C:49987944:0,2,0,1
chr8	51306704	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,3,1
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chr8	52232624	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,3:6,0:1,6,0,3
chr8	52233276	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
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chr8	52233308	.	A	AAC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,4:1,2:0|1:52233308_A_AAC:52233308:3,0,7,0
chr8	52233310	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:0|1:52233308_A_AAC:52233308:3,0,7,0
chr8	52252171	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,6:6,6:12,1,9,3
chr8	52252320	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:1,3,0,2
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chr8	52322165	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:0,0:1,0:0,1,0,3
chr8	52325879	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr8	52361772	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,8:0,0:0,0,0,8
chr8	52412226	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,10,0
chr8	52505257	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=109,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:3,4,1,1
chr8	52732917	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=159,111;MMQ=60,37;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:18,0:10,3:24,4,3,0
chr8	52732972	.	A	AT	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=144,120;MMQ=52,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.119:42:18,0:18,5:22,15,3,2
chr8	52733050	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=97,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,24:0.532:45:10,10:10,14:8,13,8,16
chr8	52733076	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=148,176;MMQ=60,30;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.195:34:13,2:13,4:7,21,5,1
chr8	52733120	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=156,144;MMQ=51,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:26,1:28,2:29,27,3,0
chr8	52733128	.	T	G	.	.	DP=57;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=160,144;MMQ=60,50;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,27:0.474:57:15,13:15,14:12,18,20,7
chr8	52733143	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=157,155;MMQ=50,43;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:21,0:23,2:27,18,2,0
chr8	52733148	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=158,141;MMQ=51,33;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:17,3:26,0:27,16,3,0
chr8	52733228	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=145,133;MMQ=48,33;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.212:45:18,6:18,3:12,24,1,8
chr8	52733231	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=141,121;MMQ=48,27;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.156:49:20,5:18,2:12,30,1,6
chr8	52733242	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=9;MBQ=28,29;MFRL=133,157;MMQ=53,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.115:50:25,1:20,4:15,30,0,5
chr8	52733340	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.860:4:0,3:0,1:0,0,0,4
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chr8	54967505	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,5,0
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chr8	55537538	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:8,3:12,2:14,6,3,2
chr8	56708529	.	T	TG	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=62.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,23:0.375:62:21,11:17,11:27,12,16,7
chr8	56725751	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:1,7,0,6
chr8	56858888	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:6,3:9,0,6,0
chr8	56862946	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=228,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
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chr8	57129943	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:13,0:13,2:16,11,0,2
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chr8	57295200	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.459:50:12,13:15,9:7,20,7,16
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chr8	59062277	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=9,21;MFRL=219,2578;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.751:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr8	59324066	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr8	59343282	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,2:2,8:0,9,1,9
chr8	59345705	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=129,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:4,5:16,5:10,10,9,1
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chr8	59346926	.	ATAT	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.221:23:6,1:8,3:15,3,5,0
chr8	59347143	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=193,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:0,14,0,2
chr8	59404871	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:10,0,5,0
chr8	59412644	.	G	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.080:59:28,4:27,0:20,35,3,1
chr8	59484899	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,7:3,4:1,7,0,11
chr8	59492432	.	T	TAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:59492432_T_TAG:59492432:0,1,0,1
chr8	59492433	.	T	TTCTAGCTAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:59492432_T_TAG:59492432:0,1,0,1
chr8	59492436	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:59492432_T_TAG:59492432:0,1,0,1
chr8	59498190	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.676:29:5,10:4,9:6,3,13,7
chr8	59498614	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:0,6,0,4
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chr8	59499136	.	G	GTC	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=151,60;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,4:0.069:69:23,0:38,4:0|1:59499131_A_C:59499131:21,44,1,3
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chr8	59555731	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:1,0:4,2:0,5,0,3
chr8	59720604	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr8	59739333	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.290:26:7,6:9,1:13,6,7,0
chr8	59764368	.	CAATA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=196,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AATA;STR;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.645:9:2,1:1,4:0,3,0,6
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chr8	61707725	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
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chr8	61714245	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr8	61732521	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	61732618	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=138,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:11,3:20,0:19,13,3,0
chr8	61734295	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr8	61748735	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,2:9,1:9,11,1,2
chr8	61748893	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr8	61750860	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr8	62411925	.	G	GAAAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAT;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr8	62416074	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr8	62438530	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=130.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,23:0,17:0,0,26,14
chr8	62475276	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,14,1
chr8	62475518	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	62479934	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr8	62496421	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr8	62496510	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=175,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:4,3:2,0:4,2,2,1
chr8	62531670	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr8	62550924	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=16,15;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:1,0:3,0:0,14,0,3
chr8	62555416	.	G	A,GA	.	.	DP=87;ECNT=4;MBQ=31,29,30;MFRL=142,118,127;MMQ=60,60,60;MPOS=6,13;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.49,4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,17,6:0.219,0.109:61:15,7,2:18,4,2:35,3,6,17
chr8	62555435	.	G	C	.	.	DP=126;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=118,191;MMQ=60,38;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,4:0.033:124:36,0:49,0:57,63,4,0
chr8	62555450	.	G	T	.	.	DP=147;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=121,150;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:140,6:0.037:146:49,0:66,0:51,89,6,0
chr8	62555482	.	G	GA	.	.	DP=147;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=129,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,8:0.052:126:32,0:60,4:20,98,2,6
chr8	62557195	.	GA	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:9,3:16,1:3,29,0,4
chr8	62563764	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	62602295	.	C	CA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.289:23:5,2:9,4:2,15,0,6
chr8	62626962	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,3:0,0,0,9
chr8	63502459	.	T	TAGGGGGAAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=125,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	63948134	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,4:5,3:6,0,7,0
chr8	63948185	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,1:7,1:8,2,0,3
chr8	63976677	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,0:3,6:4,0,6,0
chr8	63976754	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:5,8:11,8:9,7,9,7
chr8	63978658	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=46.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,7:0,10:0,0,1,16
chr8	64081981	.	AT	A	.	.	DP=128;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,8:0.092:85:34,5:34,3:11,66,3,5
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chr8	66659976	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:24,2:29,1:21,32,2,1
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chr8	67352382	.	T	G	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.071:64:22,1:29,0:23,37,4,0
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chr8	67357644	.	TTGCA	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:6,1:0|1:67357636_G_A:67357636:5,11,0,2
chr8	67357690	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=155,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:0,4,1,3
chr8	67365860	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:0,4:5,4:4,1,6,2
chr8	67478431	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.382:40:15,6:9,9:6,19,2,13
chr8	67478898	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.503:24:8,6:3,6:12,0,10,2
chr8	67479307	.	T	TAGTCTGATGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.668:2:1,1:0,0:0|1:67479307_T_TAGTCTGATGA:67479307:0,1,0,1
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chr8	67492341	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:3,2,6,0
chr8	67492691	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	67514020	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.408:47:14,16:14,2:2,26,4,15
chr8	67514049	.	T	TCTAACATTTGTTACTTCTATC	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:18,2:6,0:1,23,0,2
chr8	67514772	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:1,13,0,3
chr8	67577670	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.453:51:12,10:16,13:14,14,11,12
chr8	67590058	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,116;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,0:8,2:5,18,0,2
chr8	67590151	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=243,179;MMQ=51,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr8	67592249	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr8	67710922	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:0|1:67710922_A_G:67710922:0,6,0,4
chr8	67710925	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,2:3,2:0|1:67710922_A_G:67710922:0,6,0,4
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chr8	67753176	.	CAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=154,176;MMQ=52,51;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:3,2:3,0:6,0,2,0
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chr8	67786897	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:2,6:11,7:1,13,1,12
chr8	67793056	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.487:45:10,7:12,13:23,0,21,1
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chr8	67813633	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,13:0,0,0,19
chr8	67968705	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=127,158;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,2:9,0:0|1:67968705_T_C:67968705:22,3,2,0
chr8	67968709	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=127,154;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:15,2:12,0:0|1:67968705_T_C:67968705:25,3,3,0
chr8	67968715	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:15,4:15,0:0|1:67968705_T_C:67968705:26,5,4,1
chr8	67968719	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=137,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:18,3:16,0:0|1:67968705_T_C:67968705:29,5,2,1
chr8	67969596	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.195:19:5,1:10,2:13,3,3,0
chr8	67970243	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr8	67971452	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=50.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:4,7:5,9:7,2,13,3
chr8	67974280	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,2:5,6:1,8,0,9
chr8	67976754	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.305:15:3,1:3,3:2,9,0,4
chr8	67986464	.	AT	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.080:47:20,1:23,2:43,1,2,1
chr8	67986621	.	TA	CT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:27,0:16,3:2,42,0,3
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chr8	68105617	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=178,123;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:68105605_C_T:68105605:4,0,1,0
chr8	68105621	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=178,123;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:68105605_C_T:68105605:4,0,1,0
chr8	68112810	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	68138191	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=42,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr8	68138467	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=181,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:0,4:2,3:0,2,0,8
chr8	68138508	.	CCT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	68169922	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.576:33:7,9:6,9:11,3,18,1
chr8	68171971	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr8	68208889	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.403:8:1,2:2,1:0,5,0,3
chr8	68211691	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr8	68965521	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:9,2:5,7:2,12,1,8
chr8	68972907	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:8,3:9,7:11,6,4,6
chr8	68981979	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	68984675	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr8	68993013	.	AT	GC	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=275.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,30:0,31:0,0,39,23
chr8	68995404	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=83.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0|1:68995404_C_T:68995404:0,0,19,0
chr8	68995410	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0|1:68995404_C_T:68995404:0,0,19,0
chr8	68995468	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=138.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,23:0,17:0,0,32,10
chr8	68995633	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=130.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,20:0,17:0,0,10,27
chr8	69002965	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=114,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,1:1,3,0,3
chr8	69005741	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,5:1,2:3,0,7,0
chr8	69030880	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:6,4:9,6:11,5,7,3
chr8	69039672	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,1:0|1:69039672_A_G:69039672:4,11,0,2
chr8	69039681	.	TACTA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:8,2:0|1:69039672_A_G:69039672:4,11,0,2
chr8	69104521	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr8	69136871	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:7,3:3,4:5,6,3,4
chr8	69136959	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr8	69143520	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,94;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:4,3:2,4:7,0,5,2
chr8	69143694	.	ACTG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=87,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:1,0:0|1:69143694_ACTG_A:69143694:0,1,0,1
chr8	69143700	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=87,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69143694_ACTG_A:69143694:0,1,0,1
chr8	69351982	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr8	70476251	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:13,3:10,0:11,12,3,0
chr8	70513855	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,1:4,7:8,0,7,1
chr8	70514116	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr8	70516940	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	70539619	.	C	CTATAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=226,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr8	70539911	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,1:5,3:6,0,4,0
chr8	70650507	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:0,11,0,3
chr8	70744632	.	CGA	TCT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,1:5,1:0|1:70744632_CGA_TCT:70744632:7,6,0,2
chr8	70744640	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,1:4,1:0|1:70744632_CGA_TCT:70744632:7,6,0,2
chr8	70744641	.	C	CCACTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,1:5,1:0|1:70744632_CGA_TCT:70744632:7,6,0,2
chr8	70744812	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=293,192;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr8	70744930	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	70964575	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=164,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:70964575_T_A:70964575:0,6,1,1
chr8	70964579	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=164,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:70964575_T_A:70964575:0,6,1,1
chr8	70964584	.	A	ACAGACT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=164,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:70964575_T_A:70964575:0,6,1,1
chr8	70967607	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,1:3,3:4,5,1,3
chr8	71036314	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,58;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,2:0.053:54:28,1:24,1:14,38,2,0
chr8	71071695	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,21,0
chr8	71496112	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=203,172;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:71496112_G_A:71496112:0,4,0,1
chr8	71496116	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=183,172;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:71496112_G_A:71496112:0,2,0,1
chr8	71496119	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=183,172;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:71496112_G_A:71496112:0,2,0,1
chr8	71496128	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=183,172;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:71496112_G_A:71496112:0,2,0,1
chr8	71506634	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr8	71510093	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr8	71512349	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr8	71550058	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=200.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,25:0,31:0,0,34,23
chr8	71550895	.	C	CT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=78.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.976:34:0,18:0,15:0,0,1,33
chr8	71573929	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,2:3,0:12,2,2,0
chr8	71593198	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr8	71593663	.	CTTA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr8	71619094	.	AATT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=303,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr8	71646738	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71646738_T_A:71646738:0,0,0,1
chr8	71646740	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71646738_T_A:71646738:0,0,0,1
chr8	72111678	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:3,1:0,1:0,4,1,1
chr8	72127563	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:9,0,4,0
chr8	72127764	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.433:32:9,10:9,2:1,17,2,12
chr8	72128874	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:6,1,6,0
chr8	72211295	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=88.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,30:0.544:55:13,22:12,8:21,4,27,3
chr8	72211834	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=113,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,5:6,0:6,1,5,0
chr8	72755040	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:1,5:2,4:0,3,0,10
chr8	72935039	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:72935039_C_T:72935039:2,0,2,0
chr8	72935045	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=181,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0|1:72935039_C_T:72935039:2,0,3,0
chr8	72936237	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,1,5
chr8	72946622	.	TA	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.131:45:12,3:24,4:3,35,1,6
chr8	72962985	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=94,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr8	72965973	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,0:3,5:4,4,3,2
chr8	72966002	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,2:4,8:5,3,5,5
chr8	72966124	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,0:5,3:0,6,0,3
chr8	72969263	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=64.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:10,9:11,12:0,21,2,19
chr8	72971527	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:9,0,3,0
chr8	72971570	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.235:32:11,3:12,3:0|1:72971570_C_T:72971570:15,10,7,0
chr8	72971579	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,10:0.291:36:12,5:13,5:0|1:72971570_C_T:72971570:15,11,9,1
chr8	72975801	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.572:19:4,6:4,5:0|1:72975801_T_G:72975801:1,7,3,8
chr8	72975816	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.167:16:8,0:5,2:1|0:72975801_T_G:72975801:1,13,1,1
chr8	72975820	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=138,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.186:14:7,0:5,2:1|0:72975801_T_G:72975801:1,11,1,1
chr8	72975821	.	A	ATTGTAG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=138,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.186:14:7,0:5,2:1|0:72975801_T_G:72975801:1,11,1,1
chr8	73926236	.	T	G	.	.	DP=176;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=194.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,74:0.443:167:36,35:56,38:25,68,23,51
chr8	73951274	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,2:3,6:6,1,8,0
chr8	73951476	.	G	A	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,5:0.058:99:43,1:49,4:23,71,1,4
chr8	73983988	.	TAA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.393:16:4,3:3,2:0|1:73983988_TAA_T:73983988:9,1,4,2
chr8	73983994	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.392:16:6,4:3,2:0|1:73983988_TAA_T:73983988:9,1,4,2
chr8	74203576	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:11,7:4,10:0,15,2,15
chr8	74203722	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:5,3:3,11:8,0,13,1
chr8	74204423	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.443:12:4,3:3,2:5,2,3,2
chr8	74205710	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,3:1,0,5,0
chr8	74233349	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:1,4,0,4
chr8	74585325	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,6:4,7:6,1,12,1
chr8	74791162	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:6,2:4,4:0,10,0,7
chr8	74859123	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr8	74868361	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,2:0.052:55:31,0:18,2:0,53,0,2
chr8	74868373	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.100:58:37,1:15,4:0,53,0,5
chr8	74868374	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,21:0.374:57:20,16:14,5:0,36,0,21
chr8	74888494	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr8	74888803	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	74890961	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=123,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:3,2,6,0
chr8	75262841	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr8	75272287	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr8	75274211	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=78,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:75274211_A_C:75274211:0,2,0,1
chr8	75274214	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=156,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:75274211_A_C:75274211:0,3,0,1
chr8	75275312	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,11:0,0,6,11
chr8	75898122	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	75898501	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:5,5:2,3:0,7,1,8
chr8	75924820	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:0,6,0,9
chr8	75928947	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=62.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,25:0.383:66:24,8:13,17:10,31,9,16
chr8	75944409	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:15,3:14,0:29,4,3,0
chr8	76459726	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=75,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:3,2:0,0:2,1,3,0
chr8	76459916	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:10,1:6,1:1,17,0,2
chr8	76463571	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:3,1:3,1:6,0,3,0
chr8	76465522	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr8	76468139	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,2:7,7:14,0,9,0
chr8	76468282	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,24:0.350:70:20,10:22,14:18,28,8,16
chr8	76468309	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=30,32,33,33;MFRL=138,170,161,186;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,23,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=T;STR;TLOD=22.34,3.50,6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:19,11,3,4:0.255,0.099,0.121:37:8,5,1,1:8,3,2,3:6,13,3,15
chr8	76472560	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:2,5,5,1
chr8	77764347	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:17,3:10,0:13,14,3,0
chr8	77765314	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=105,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:77765314_C_T:77765314:0,1,0,1
chr8	77765323	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=105,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:77765314_C_T:77765314:0,1,0,1
chr8	77766638	.	A	AGTAGC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:8,6,0,2
chr8	77895635	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:3,4,0,2
chr8	79598666	.	GTTTA	G,GTTTATTTA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=36,35,35;MFRL=161,155,154;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=TTTA;STR;TLOD=40.93,24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,11,9:0.471,0.446:21:0,8,6:1,3,3:1,0,18,2
chr8	79601420	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,4:4,3:4,2,7,0
chr8	79710485	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:1,5,0,7
chr8	80576942	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr8	80678865	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,4:0,0,11,3
chr8	80831393	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.734:9:1,4:1,3:0,2,1,6
chr8	81553684	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:8,0:1,3:7,2,1,2
chr8	81553752	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=197,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:81553752_T_TGG:81553752:0,2,0,1
chr8	81553753	.	T	TTAATA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=197,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:81553752_T_TGG:81553752:0,2,0,1
chr8	81892766	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,4,10
chr8	81905314	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr8	82370727	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:2,2:5,0:2,6,0,2
chr8	82391183	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=56.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,4,17
chr8	82392849	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0,0,1,9
chr8	82392918	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	82439221	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:4,1,5,1
chr8	82443387	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,0:0,2:4,1,2,0
chr8	82593907	.	T	TAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=166,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:82593907_T_TAAC:82593907:0,3,0,1
chr8	82593909	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=166,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:82593907_T_TAAC:82593907:0,3,0,1
chr8	82593913	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr8	82607302	.	G	GCAGGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	82626103	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:12,1,2,0
chr8	82627395	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr8	82629447	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=142.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,22:0,19:0,0,33,9
chr8	82644899	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:18,2:20,1:28,11,1,2
chr8	82713850	.	G	GCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr8	82741576	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
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chr8	85686975	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
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chr8	85774738	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:0,4,1,2
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chr8	86022336	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,1:6,3:11,1,3,1
chr8	86048000	.	ATT	A,AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30,31;MFRL=198,118,168;MMQ=60,60,60;MPOS=19,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=9.41,10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,5:0.426,0.434:11:0,3,2:1,2,2:1,0,10,0
chr8	86114525	.	T	TTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	86121311	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr8	86126827	.	C	CAACATT	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=292.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,27:0,34:0,0,34,33
chr8	86158217	.	TTAAAC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr8	86171786	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr8	86171816	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	86180944	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	86250709	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr8	86253982	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr8	86389586	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,0,11
chr8	87060672	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,1:2,2:6,0,3,0
chr8	87076150	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr8	87076291	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:15,3:10,0:18,8,0,3
chr8	87414234	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:18,1:14,2:22,11,0,3
chr8	87414372	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=134,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:37,2:23,1:30,31,2,1
chr8	87443026	.	CCATATATATATA	C	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,23:0.706:32:6,13:1,9:0|1:87443026_CCATATATATATA_C:87443026:0,9,2,21
chr8	87443027	.	CATAT	C,CAT	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=0,19,14;MFRL=0,160,0;MMQ=60,60,42;MPOS=31,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=AT;STR;TLOD=7.29,4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.532,0.380:5:0,0,0:0,0,0:0,0,0,5
chr8	87443040	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=94.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,23:0.750:30:6,13:1,10:0|1:87443026_CCATATATATATA_C:87443026:0,7,2,21
chr8	87443042	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=98.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,24:0.758:31:6,12:1,9:0|1:87443026_CCATATATATATA_C:87443026:0,7,2,22
chr8	87443044	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=91.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,22:0.742:29:6,13:1,9:0|1:87443026_CCATATATATATA_C:87443026:0,7,2,20
chr8	87443058	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=57.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,14:0.682:20:4,10:1,4:0|1:87443026_CCATATATATATA_C:87443026:0,6,0,14
chr8	87455070	.	TAA	T,TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=197,196,153;MMQ=60,60,60;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=10.71,3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,2:0.401,0.223:11:3,1,1:1,4,1:0,4,0,7
chr8	87464945	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:2,13,0,2
chr8	87489562	.	AAC	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=135.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,42:0.531:79:19,22:15,18:11,26,17,25
chr8	87520894	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
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chr8	87567305	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr8	87568644	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	87570665	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:3,4:5,2:0,9,2,4
chr8	87570728	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=232,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr8	87751848	.	GTT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:4,1:3,0:7,0,1,1
chr8	87755677	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,4:1,5:6,0,8,1
chr8	87878846	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:2,4:3,5:2,4,3,6
chr8	87899871	.	T	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,32:0.480:67:15,14:19,18:8,27,5,27
chr8	87917236	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=63,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,2:2,0,4,0
chr8	88218202	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30,32;MFRL=202,187,247;MMQ=60,60,60;MPOS=13,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=T;STR;TLOD=3.89,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.378,0.376:5:1,0,2:0,2,0:1,0,4,0
chr8	88363985	.	GTAT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAT;STR;TLOD=48.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,5:6,8:3,7,2,11
chr8	89068596	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
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chr8	90777510	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:3,0,5,0
chr8	90781953	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,6:5,2:6,0,8,0
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chr8	90955624	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=107,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:0,6,0,5
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chr8	90955675	.	G	GTCCCAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=138,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:90955669_A_AGGGGG:90955669:0,1,0,1
chr8	90958530	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,4:4,3:2,8,2,5
chr8	90967862	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr8	90970862	.	GA	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=86,293;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.484:3:0,0:2,1:1,1,1,0
chr8	90970935	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,4:8,3:9,2,6,1
chr8	91031074	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:10,5:8,9:19,0,14,0
chr8	91063787	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	91064036	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:8,9:16,11:10,14,7,13
chr8	91081246	.	TGA	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=164,40;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:0|1:91081246_TGA_T:91081246:3,5,1,1
chr8	91081254	.	C	CTGTGGAAAGCAG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=174,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,2:0|1:91081246_TGA_T:91081246:2,5,1,1
chr8	91081281	.	G	GGCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=192,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:91081281_G_GGCA:91081281:1,1,0,1
chr8	91081283	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=192,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:91081281_G_GGCA:91081281:1,1,0,1
chr8	91094983	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.404:45:10,14:17,4:4,23,4,14
chr8	91804288	.	C	CTGGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=134,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:91804288_C_CTGGCA:91804288:0,2,0,1
chr8	91804291	.	G	GGCGCGGCCGCAGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:91804288_C_CTGGCA:91804288:0,2,0,1
chr8	91884243	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,10:0.344:30:7,4:13,4:0|1:91884243_A_G:91884243:20,0,10,0
chr8	91884265	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=52.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,18:0.365:50:13,8:18,9:0|1:91884243_A_G:91884243:26,6,14,4
chr8	91929652	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=174,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr8	91940446	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,3:3,2:5,4,5,0
chr8	91953138	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,4:2,5:4,5,3,6
chr8	91963466	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:5,5:8,4:0|1:91963466_CT_C:91963466:4,10,2,7
chr8	91963472	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:5,4:9,4:0|1:91963466_CT_C:91963466:4,10,2,7
chr8	91967658	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,7:2,0:8,1,6,1
chr8	92096992	.	CT	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:22,1:11,2:34,2,3,0
chr8	92213022	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=78.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,27:0.563:48:6,13:14,14:5,16,4,23
chr8	92364100	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,13,8
chr8	92406436	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,5,13
chr8	92407446	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr8	92998447	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:8,6,2,0
chr8	93088151	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=76,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr8	94715965	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=96.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,16:0,0,4,23
chr8	94721974	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,27:0.609:44:9,12:8,15:12,5,16,11
chr8	94730929	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,134;MMQ=52,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:11,2:15,0:20,6,2,0
chr8	94731097	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:3,1:3,2:0,7,0,3
chr8	94731117	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=178,250;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr8	94745804	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=145,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:6,2:7,7,0,2
chr8	94746049	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=193,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:1,3,2,4
chr8	94767979	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=141,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=24,23;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:4,2:1,2:5,0,3,2
chr8	94768009	.	C	A	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,7:0.101:68:20,0:32,1:33,28,5,2
chr8	94828582	.	A	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,7:0.108:67:29,6:30,0:55,5,7,0
chr8	94937549	.	GT	G,GTT,GTTT	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=34,34,34,35;MFRL=163,131,132,106;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,18,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,14,15;RU=T;STR;TLOD=8.61,55.20,6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:17,6,31,7:0.096,0.501,0.115:61:7,4,12,6:9,2,15,1:13,4,31,13
chr8	95158146	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,11:0,5:0,0,14,2
chr8	95182986	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr8	95186295	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
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chr8	95186510	.	GA	G,GAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,17,25;MFRL=0,222,165;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=4.03,3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.379,0.378:5:0,0,1:1,0,0:1,0,1,3
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chr8	95390921	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=229,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,1,6
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chr8	95470697	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=100,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:2,4:4,6:2,5,0,10
chr8	95504224	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr8	95507237	.	AT	A,ATT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=169,145,153;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.81,3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,3:0.248,0.162:21:8,4,2:5,1,1:0,13,0,8
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chr8	95524209	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:10,1:3,9:10,3,10,0
chr8	95541223	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:8,13:6,3:13,1,16,0
chr8	95541302	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.419:48:20,13:5,5:17,11,13,7
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chr8	95777844	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:6,0,2,0
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chr8	95906554	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
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chr8	96069973	.	GT	G,GTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=128,198,156;MMQ=60,60,60;MPOS=12,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.73,7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,6:0.145,0.249:26:5,2,4:9,2,1:14,2,10,0
chr8	96070181	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,1,25
chr8	96260054	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr8	97256341	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,3:5,6:1,8,0,9
chr8	97257982	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr8	97258719	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:0,0:4,4:1,3,1,4
chr8	97269238	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,110;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,0:11,2:5,11,2,0
chr8	97270991	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr8	97274498	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=129,171;MMQ=60,37;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:97274498_C_A:97274498:0,3,0,1
chr8	97274502	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=204,171;MMQ=60,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97274498_C_A:97274498:0,1,0,1
chr8	97321898	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:7,5:8,8:1,14,4,9
chr8	97332661	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=200,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,0,4
chr8	97342582	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	97343326	.	ATCTTGT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTTGT;STR;TLOD=41.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr8	97345590	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	98078520	.	A	AGACATGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	98289739	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,1:8,1:2,21,0,2
chr8	98726067	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98726067_T_TA:98726067:0,1,0,1
chr8	98726069	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98726067_T_TA:98726067:0,1,0,1
chr8	98726073	.	A	ACACTTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:98726067_T_TA:98726067:0,1,0,1
chr8	98731444	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=139,23565798;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.057:50:26,0:20,2:18,30,1,1
chr8	98731451	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:27,0:16,3:13,32,1,2
chr8	98731457	.	T	TCA	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=141,140;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:24,1:16,1:0|1:98731457_T_TCA:98731457:7,34,0,2
chr8	98731458	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:25,0:12,5:6,31,1,4
chr8	98731459	.	ACG	A	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=141,140;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:23,0:16,1:0|1:98731457_T_TCA:98731457:7,34,0,2
chr8	98731482	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:17,2:4,3:2,19,0,5
chr8	98787959	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:98787959_C_CT:98787959:3,0,1,0
chr8	98787961	.	C	CAGCA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=29,30;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:98787959_C_CT:98787959:3,0,1,0
chr8	98787976	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=34,12;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:98787976_G_C:98787976:2,0,1,0
chr8	98787981	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,13;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:98787976_G_C:98787976:2,0,1,0
chr8	98787994	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,21;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,2:1,1,2,1
chr8	98788005	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=32,12;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:1,0:2,2,2,0
chr8	98788011	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=29,13;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.251:6:2,0:1,0:0|1:98788011_T_A:98788011:3,2,1,0
chr8	98788022	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,12;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:98788011_T_A:98788011:1,3,1,0
chr8	98788033	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr8	98837382	.	GTAGGTA	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=148,13232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,1:9,1:0|1:98837382_GTAGGTA_G:98837382:7,14,1,1
chr8	98837391	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=154,13232;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,1:9,1:0|1:98837382_GTAGGTA_G:98837382:7,13,1,1
chr8	98954012	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.927:25:1,11:0,13:0,1,16,8
chr8	98973566	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	99016047	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:99016047_G_GC:99016047:0,2,0,1
chr8	99016048	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:99016047_G_GC:99016047:0,2,0,1
chr8	99016051	.	G	GAGCACACGCAGGCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99016047_G_GC:99016047:0,1,0,1
chr8	99016053	.	T	TCGAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:99016047_G_GC:99016047:0,1,0,1
chr8	99016092	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	99019930	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,336;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	99042921	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=160,140;MMQ=54,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:99042921_C_T:99042921:0,4,0,1
chr8	99042931	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=181,142;MMQ=47,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:99042921_C_T:99042921:0,4,0,2
chr8	99045454	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	99045978	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=372,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr8	99048049	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=206,45;MMQ=60,60;MPOS=-1073741818;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr8	99054796	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr8	99054836	.	C	CAA,CAAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34,33;MFRL=0,77,150;MMQ=60,60,60;MPOS=29,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,14,16;RU=A;STR;TLOD=4.56,23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,9:0.215,0.721:11:0,2,4:0,0,1:0,0,10,1
chr8	99057150	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,7:0,0,13,6
chr8	99057526	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,11:0,2:0,0,8,5
chr8	99114970	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:1,0,3,0
chr8	99118654	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,3:5,3:1,10,0,6
chr8	99135744	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=159,189;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:1,0:8,2:0|1:99135744_C_T:99135744:0,9,0,2
chr8	99135777	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=174,172;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:99135744_C_T:99135744:0,4,0,1
chr8	99135781	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=174,172;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:99135744_C_T:99135744:0,4,0,1
chr8	99140544	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr8	99146605	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	99148629	.	T	TAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr8	99168560	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:13,1:11,7,1,1
chr8	99170399	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:99170399_A_AT:99170399:1,1,0,1
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chr8	99205447	.	A	AAAATGACATATGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=231,285;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr8	99215456	.	CTTTAGGAGACA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.639:6:0,2:1,2:0,2,0,4
chr8	99442645	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=108,71;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.069:56:25,3:26,0:22,31,2,1
chr8	99961558	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=119,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:5,2:7,5,1,1
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chr8	100287517	.	CTTTTT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=21,17;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,13;RU=T;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,1:1,0:1,5,0,2
chr8	100287579	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr8	100519928	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.481:27:5,9:9,3:13,1,11,2
chr8	100821524	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,56;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:6,0,1,2
chr8	100861146	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:7,6:8,7:2,13,2,11
chr8	100899793	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:11,8:5,1:6,11,4,5
chr8	100904277	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.533:32:9,6:5,11:4,11,4,13
chr8	100994126	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.527:21:6,9:3,2:5,5,9,2
chr8	100994389	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=208,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:0,4,1,5
chr8	100999637	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=130,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:5,2,4,0
chr8	101020548	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:6,5:5,3,6,2
chr8	101053980	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:6,0,6,0
chr8	101059662	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:4,4,3,1
chr8	101076178	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=144,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:101076178_C_T:101076178:5,13,0,2
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chr8	101083498	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=211,146;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:101083498_G_A:101083498:2,0,1,0
chr8	101083506	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=198,146;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:101083498_G_A:101083498:3,0,1,0
chr8	101105741	.	C	CA	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,5:0.078:67:27,3:33,2:16,46,1,4
chr8	101117734	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,3:0,1:0,1,0,4
chr8	101203737	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:1,6,2,7
chr8	101206459	.	A	AGAC	.	.	DP=146;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=267.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,72:0.539:134:25,33:34,36:30,32,32,40
chr8	101206531	.	G	A	.	.	DP=94;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,39:0.453:86:21,18:26,20:4,43,8,31
chr8	101232421	.	TCAGTACTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr8	101232701	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=118,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:0,5,0,5
chr8	101253092	.	GT	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.257:37:10,5:10,5:20,7,9,1
chr8	101280911	.	TAAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=231,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr8	101281238	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr8	101281271	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=194,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr8	101539983	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=172,186;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr8	101540001	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=190,157;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:6,0:9,0,3,0
chr8	101596482	.	C	CTTGCTTGCTCTCTCATGATGGAGTCACAAAGGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=123,162;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	101630039	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=154,139;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:101630039_C_T:101630039:0,4,0,1
chr8	101630041	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=154,139;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:101630039_C_T:101630039:0,4,0,1
chr8	101630046	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=181,139;MMQ=50,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:101630039_C_T:101630039:0,4,0,1
chr8	101630048	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=181,139;MMQ=50,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:101630039_C_T:101630039:0,4,0,1
chr8	101630051	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=181,139;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:101630039_C_T:101630039:0,4,0,1
chr8	101717220	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=154,99;MMQ=52,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:17,3:17,2:9,25,1,4
chr8	101717237	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=146,104;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,2:12,2:7,19,0,4
chr8	101717255	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=147,108;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:9,1:15,2:7,17,0,3
chr8	101717267	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=145,114;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:11,0:15,2:8,19,0,2
chr8	101721812	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=169,150;MMQ=60,37;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,3:0.065:59:20,1:30,2:0|1:101721812_G_A:101721812:15,41,1,2
chr8	101721817	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=168,158;MMQ=60,39;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.082:59:23,2:29,2:0|1:101721812_G_A:101721812:16,39,1,3
chr8	101721839	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=173,166;MMQ=40,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:21,1:25,2:13,33,1,2
chr8	101725026	.	C	CA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.272:30:5,3:11,4:6,16,2,6
chr8	101725036	.	G	A,GA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=19,33,18;MFRL=163,114,147;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.00,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,3:0.198,0.206:21:1,3,0:2,1,1:3,10,0,8
chr8	101725251	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,5:6,5:12,2,7,3
chr8	101730036	.	T	TC	.	.	DP=154;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=141,100;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:142,4:0.034:146:84,3:51,1:0|1:101730036_T_TC:101730036:92,50,4,0
chr8	101730043	.	G	C	.	.	DP=157;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=139,94;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:147,5:0.039:152:83,4:53,1:0|1:101730036_T_TC:101730036:94,53,4,1
chr8	101730064	.	G	A	.	.	DP=165;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=135,94;MMQ=60,44;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:153,6:0.043:159:85,5:59,1:74,79,4,2
chr8	101730073	.	T	C	.	.	DP=167;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=134,94;MMQ=60,44;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:155,6:0.043:161:83,5:64,1:66,89,4,2
chr8	101937341	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr8	102585806	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=145,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr8	102676566	.	T	TGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	102678798	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:2,5,4,2
chr8	102678972	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,2:5,1:2,5,1,2
chr8	102701456	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr8	103220351	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=99.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,16:0,0,27,5
chr8	103236414	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=169,142;MMQ=57,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:4,3:1,1:0,8,0,4
chr8	103237283	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:1,3:7,5:2,6,2,7
chr8	103271201	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,6:3,5:8,0,11,0
chr8	103287850	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:4,2,0,2
chr8	103297707	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.447:29:12,4:4,8:9,7,7,6
chr8	103298016	.	GG	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:103298016_GG_TC:103298016:0,2,0,1
chr8	103298021	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:103298016_GG_TC:103298016:0,2,0,1
chr8	103316494	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	103317265	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:2,8:2,2:4,0,9,1
chr8	103338834	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,0:9,3:10,7,0,3
chr8	103372743	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr8	103373304	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:9,6:5,5:13,1,10,1
chr8	103424502	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=133,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.105:45:23,0:16,0:0|1:103424502_T_C:103424502:4,36,5,0
chr8	103424506	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=133,190;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.105:45:23,2:14,1:0|1:103424502_T_C:103424502:4,36,5,0
chr8	103563907	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,2,1
chr8	103572992	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.956:17:0,8:0,9:0,0,7,10
chr8	103573001	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.519:21:4,5:6,5:0|1:103573001_C_G:103573001:3,7,6,5
chr8	103573006	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:4,5:6,5:0|1:103573001_C_G:103573001:3,7,6,5
chr8	103573010	.	CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.361:26:6,4:5,5:8,9,2,7
chr8	103846823	.	A	AAAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,4:1,5:3,0,11,0
chr8	103852064	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=201,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:7,5:3,5:1,9,1,9
chr8	104053254	.	C	CTTCCTCTACCAACTGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr8	104054513	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,1:7,1:13,2,3,0
chr8	104075165	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:4,0,6,0
chr8	104336672	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:5,3:4,9:8,1,13,0
chr8	104388276	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,3:3,1:0,4,0,4
chr8	104414338	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,4:4,2:0,11,0,6
chr8	104415652	.	A	ATTCCAGAGTTTGAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	104426910	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr8	104445009	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr8	104452281	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,3:1,5:2,0,8,0
chr8	104452313	.	C	CAAAG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,11,2
chr8	104452554	.	A	ATAT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.949:15:0,6:0,8:0,0,0,15
chr8	104453603	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr8	104513343	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=111.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,4,29
chr8	104922519	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr8	104930646	.	C	CT,CTT	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=147,133,159;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=50.61,4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,29,3:0.449,0.059:66:19,19,1:13,6,1:24,10,23,9
chr8	104934028	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,2:0,13:0,0,2,13
chr8	104940210	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:5,6:6,3:0,12,0,10
chr8	104973378	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:8,9:4,4:8,4,4,9
chr8	104973463	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:0,4,0,7
chr8	104987771	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,3:0,5:0,4,2,6
chr8	104987823	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr8	105001724	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	105261119	.	T	TTCTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,18;RU=TC;STR;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr8	105261771	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,1:12,1:11,16,2,0
chr8	105263248	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,6:4,4:5,3,3,7
chr8	105263751	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:3,3:3,1,5,0
chr8	105367096	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0,0,17,4
chr8	105459793	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr8	105601176	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.383:19:6,5:4,1:0|1:105601176_A_G:105601176:3,9,1,6
chr8	105601192	.	A	ACGC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGC;STR;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,2:2,1:0|1:105601176_A_G:105601176:0,6,1,2
chr8	105601198	.	A	C,ACGCCGCCGC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,35,28;MFRL=0,181,151;MMQ=60,60,60;MPOS=-1073741814,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.71,20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,5:0.338,0.586:8:0,1,3:0,1,2:0,0,1,7
chr8	106331094	.	G	GGCGGCGGGA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCGGCGGGA;STR;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,6:0,0,11,0
chr8	106814839	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,0:5,2:7,8,1,1
chr8	107670141	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.257:31:12,4:11,2:21,2,8,0
chr8	107695629	.	G	GCTGAAATCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr8	107754583	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=136.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,40:0.950:42:0,19:0,21:0,2,4,36
chr8	108913498	.	T	TCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	108970264	.	T	TCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr8	109214083	.	GT	G,GTT	.	.	DP=137;ECNT=1;MBQ=34,34,34;MFRL=149,158,142;MMQ=60,40,56;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=4.31,4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:104,5,7:0.049,0.058:116:52,3,2:52,2,4:78,26,10,2
chr8	109215368	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=130,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.413:20:5,5:6,3:2,10,0,8
chr8	109240695	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:0,6,0,9
chr8	109247189	.	CAAA	C,CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=15,33,33;MFRL=135,132,138;MMQ=60,60,60;MPOS=5,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,17,18;RU=A;STR;TLOD=6.46,8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,6:0.370,0.496:12:0,3,3:0,1,1:0,1,8,3
chr8	109253929	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=17,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:0,5:0,2:1,0,6,1
chr8	109254003	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=71.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,16,4
chr8	109260776	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr8	109455802	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr8	109455863	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=115,141;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:2,4:8,5:8,2,6,3
chr8	109462215	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:4,2:13,2:0,19,1,3
chr8	109462791	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,1:0,9:0,0,0,10
chr8	109465432	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:10,0:5,3:2,13,0,3
chr8	109468230	.	T	TAGAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=199.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,18:0,24:0,0,1,45
chr8	109488937	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr8	109489215	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0,11,0,2
chr8	109491399	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr8	109498656	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr8	109498717	.	C	CTTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=187,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=T;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:0,4:2,5:2,0,9,3
chr8	109498789	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=115,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,3:0.044:88:41,0:40,3:37,48,1,2
chr8	110100555	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	110406826	.	TGC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:110406826_TGC_T:110406826:0,1,0,1
chr8	110406829	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:110406826_TGC_T:110406826:0,1,0,1
chr8	110424428	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,3,1
chr8	110479055	.	G	T,GCCCATAAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30,33;MFRL=183,228,151;MMQ=60,60,60;MPOS=9,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,0,0:3,1,1:0,3,0,2
chr8	110479057	.	C	CCAGCAGATTGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:110479057_C_CCAGCAGATTGGG:110479057:0,4,0,1
chr8	110479060	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=169,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:3,1:1|0:110479057_C_CCAGCAGATTGGG:110479057:0,4,0,1
chr8	110489407	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	110587602	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:7,4,0,2
chr8	110656815	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:110656815_G_C:110656815:0,1,0,1
chr8	110656817	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:110656815_G_C:110656815:0,1,0,1
chr8	110980372	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:0|1:110980372_T_G:110980372:10,10,0,2
chr8	110980375	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:7,1:0|1:110980372_T_G:110980372:10,10,0,2
chr8	113254038	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=125,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,0:5,2:2,10,0,2
chr8	113254070	.	TGC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=134,203;MMQ=42,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr8	113254071	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.838:4:0,2:0,2:0|1:113254071_G_GCA:113254071:0,0,0,4
chr8	113254073	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=203,134;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:0,1:2,0:0|1:113254071_G_GCA:113254071:0,2,0,1
chr8	113254087	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.754:2:0,1:0,1:0|1:113254071_G_GCA:113254071:0,0,0,2
chr8	113256845	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,4:3,6:0,6,0,10
chr8	113256865	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr8	113266517	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=128,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:22,0:11,2:19,15,1,1
chr8	113267709	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr8	113301548	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr8	113308243	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=110,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:1,3:3,4:0,5,0,7
chr8	113317212	.	CATCT	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr8	113317225	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113317225_C_T:113317225:0,0,0,1
chr8	113317227	.	AA	TG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113317225_C_T:113317225:0,0,0,1
chr8	113317232	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113317225_C_T:113317225:0,0,0,1
chr8	113317236	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113317225_C_T:113317225:0,0,0,1
chr8	113317239	.	C	CTCTAGTCAATAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113317225_C_T:113317225:0,0,0,1
chr8	113323406	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=18,35;MFRL=138,48;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:0,1:2,1:0,5,0,2
chr8	113331099	.	G	GAGATAGGCCCAAATTTATCCATCCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=167,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,2:5,0:3,3,1,1
chr8	113363350	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:0,2:3,4:3,0,7,0
chr8	113363511	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:3,3:8,6:3,8,1,8
chr8	113364574	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,257;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr8	113420495	.	TG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=68.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,7:0,0,17,5
chr8	113485014	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	113516209	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr8	113529233	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=78,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:5,1,5,0
chr8	113585637	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=194,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr8	113585876	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,9;MFRL=133,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.136:30:10,0:11,0:7,19,4,0
chr8	113599196	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=156,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr8	113599207	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=156,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr8	113655643	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:0|1:113655643_A_AC:113655643:6,0,4,0
chr8	113655644	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=180,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:0|1:113655643_A_AC:113655643:6,0,4,0
chr8	113662299	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=253,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr8	113662583	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,6:5,4:2,9,2,8
chr8	113812565	.	T	TTAAAAACCTAAATGCAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,0:0,1:0|1:113812565_T_TTAAAAACCTAAATGCAAA:113812565:0,0,0,1
chr8	113812570	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113812565_T_TTAAAAACCTAAATGCAAA:113812565:0,0,0,1
chr8	113812572	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113812565_T_TTAAAAACCTAAATGCAAA:113812565:0,0,0,1
chr8	114111250	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	116631686	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=129,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,3:14,0:15,15,3,0
chr8	116635872	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,2:3,5:1,8,3,4
chr8	116635942	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=201,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,5:2,1:0,3,0,6
chr8	117668282	.	AA	TC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=142,62;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,0:5,2:2,17,0,2
chr8	117738420	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:0,14,0,2
chr8	117782385	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr8	117860019	.	C	CCTTTTTTTTTCTTTTTTTGAGATGGAGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=239,316;MMQ=60,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr8	117864952	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:8,1:7,1:1,20,0,3
chr8	117868531	.	T	TAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=122,120;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=23,26;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.663:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr8	117950768	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	117955005	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	118159417	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:118159417_C_CT:118159417:0,3,0,1
chr8	118159418	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:118159417_C_CT:118159417:0,3,0,1
chr8	118159427	.	CC	AT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=210,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:118159427_CC_AT:118159427:0,2,0,1
chr8	118159430	.	A	AGAAAATGATATG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=210,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:118159427_CC_AT:118159427:0,2,0,1
chr8	118159433	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=210,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:118159427_CC_AT:118159427:0,2,0,1
chr8	118184783	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:1,5,5,1
chr8	118533312	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.300:38:16,6:11,5:7,20,0,11
chr8	118533382	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,2:5,0:0,12,0,2
chr8	118552023	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=190,298;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr8	119451983	.	ATGT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=107,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr8	119938725	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:7,4,3,1
chr8	119940920	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AG;STR;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,2:3,3:6,0,6,0
chr8	119941173	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr8	120079748	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=191,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,5:3,0:0,7,1,4
chr8	120103530	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr8	120114539	.	C	CTTTTATTTTAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTTATTTTAA;STR;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.526:13:2,1:4,2:6,0,5,2
chr8	120220775	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr8	120428758	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:4,3:2,3,4,2
chr8	120429282	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr8	120580546	.	T	TA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:1,5:5,2:0,13,0,9
chr8	120581676	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=195,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120581676_C_CT:120581676:0,1,0,1
chr8	120581681	.	GG	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=195,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120581676_C_CT:120581676:0,1,0,1
chr8	120582871	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr8	120583148	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=203,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,0:3,3:0,4,0,4
chr8	120592231	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:11,0,2,0
chr8	120594927	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr8	120602908	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0|1:120602908_C_T:120602908:0,0,1,11
chr8	120602914	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,5:0|1:120602908_C_T:120602908:0,0,1,10
chr8	120606023	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.471:36:11,8:7,8:12,7,11,6
chr8	120613747	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,3,17
chr8	120613815	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=197,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr8	120790378	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.485:18:3,3:4,5:0,9,1,8
chr8	120795607	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr8	120797598	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr8	120801805	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	120814020	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,8:0,0,14,4
chr8	120818483	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:5,1,2,2
chr8	120847078	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,11:0,0,18,6
chr8	120847123	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=170.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,25:0,25:0,0,32,18
chr8	120854922	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=156,143;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.082:34:14,2:13,0:0|1:120854922_A_G:120854922:28,4,2,0
chr8	120854925	.	CA	C	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=156,143;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:16,2:17,0:0|1:120854922_A_G:120854922:31,5,2,0
chr8	120854927	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=151,143;MMQ=60,36;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:17,2:18,0:0|1:120854922_A_G:120854922:31,6,2,0
chr8	120854929	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=151,143;MMQ=60,36;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:18,2:19,0:0|1:120854922_A_G:120854922:33,6,2,0
chr8	120854934	.	TA	GT	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=148,143;MMQ=60,36;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:21,2:20,0:0|1:120854922_A_G:120854922:34,8,2,0
chr8	120856021	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr8	120862767	.	T	TA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=97.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,30:0.620:48:9,17:9,11:0,18,2,28
chr8	120865430	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,2:13,0:3,18,0,2
chr8	120886075	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:1,7:11,10:10,2,16,1
chr8	120940867	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=222,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0|1:120940867_G_A:120940867:0,3,0,4
chr8	120940874	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=215,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,1:1,3:0|1:120940867_G_A:120940867:0,2,0,5
chr8	121061961	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,5:2,5:0,5,1,9
chr8	121174837	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.557:43:8,12:10,11:5,14,3,21
chr8	121209000	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr8	121210250	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr8	121211847	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0,6,1,5
chr8	121220395	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	121259843	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,10,5
chr8	121263069	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=147,225;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:121263069_T_C:121263069:0,2,0,1
chr8	121263075	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=178,225;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:121263069_T_C:121263069:0,1,0,1
chr8	121263081	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=178,225;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:121263069_T_C:121263069:0,1,0,1
chr8	121263085	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=178,225;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:121263069_T_C:121263069:0,1,0,1
chr8	121263088	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=178,225;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:121263069_T_C:121263069:0,1,0,1
chr8	121267617	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,5,14
chr8	121290573	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr8	121292407	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	121293142	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33,33;MFRL=79,138,155;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=T;STR;TLOD=12.43,25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,7,11:0.307,0.561:20:0,3,6:1,4,5:1,1,16,2
chr8	121293331	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,6:0,12:0,0,3,17
chr8	121309862	.	A	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=170.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,20:0,29:0,0,7,46
chr8	121313126	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:1,0:6,3:0,8,0,3
chr8	121322335	.	ATC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr8	121326122	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr8	121327673	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr8	121353651	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:2,4,0,5
chr8	121353692	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr8	121383048	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,7:0,0,2,12
chr8	121383082	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr8	121426425	.	AGT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr8	121457670	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:8,1:18,2,2,0
chr8	121469001	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:121469001_A_C:121469001:0,2,0,1
chr8	121469009	.	ATT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:121469001_A_C:121469001:0,2,0,1
chr8	121471361	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,16,0
chr8	121483196	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr8	121502680	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr8	121509825	.	C	CTTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=154.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,18:0,0,2,33
chr8	121530061	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	121530190	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,12:0,21:0,0,20,14
chr8	121530384	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=47.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr8	121531154	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr8	122629534	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,0:0,1:0|1:122629534_G_C:122629534:0,1,0,1
chr8	122629541	.	TC	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:122629534_G_C:122629534:0,1,0,1
chr8	122629546	.	C	CTTGCCTTTTGGTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122629534_G_C:122629534:0,0,0,1
chr8	124027628	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr8	124033785	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=174,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,1:11,1:0,17,1,1
chr8	124096315	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=242,223;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr8	124154737	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.357:9:0,0:1,1:0,6,0,3
chr8	124157166	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=15,23;MFRL=143,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:1,1:0,1:0,5,0,4
chr8	124243987	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124243987_G_C:124243987:0,1,0,1
chr8	124243989	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124243987_G_C:124243987:0,1,0,1
chr8	124357253	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.483:29:9,6:5,7:8,7,5,9
chr8	124360487	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,30:0.508:59:14,14:15,16:15,14,4,26
chr8	124373746	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=145,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,3:5,0:8,2,2,1
chr8	124373942	.	GCAT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=183,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:0,0:0|1:124373942_GCAT_G:124373942:0,3,0,1
chr8	124373946	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=151,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr8	124373952	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=40,27;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:124373942_GCAT_G:124373942:0,1,0,1
chr8	124385024	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=249,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:124385024_G_T:124385024:0,1,0,1
chr8	124385026	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=249,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124385024_G_T:124385024:0,1,0,1
chr8	124385031	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=249,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124385024_G_T:124385024:0,1,0,1
chr8	124385035	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=249,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124385024_G_T:124385024:0,1,0,1
chr8	124385038	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=249,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124385024_G_T:124385024:0,1,0,1
chr8	124442114	.	TGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCC	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,125;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.363:14:3,5:1,0:8,1,5,0
chr8	124442187	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.480:38:11,6:7,10:13,7,13,5
chr8	124448689	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.599:35:10,7:3,14:10,4,10,11
chr8	124448931	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:124448931_G_A:124448931:0,4,0,1
chr8	124448934	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:124448931_G_A:124448931:0,4,0,1
chr8	124449672	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr8	124453543	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.530:27:9,8:4,5:8,5,10,4
chr8	124453619	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:10,11:8,6:6,12,12,5
chr8	124453662	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.640:22:4,6:2,8:3,5,1,13
chr8	124515658	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:12,1:14,1:13,18,0,2
chr8	124525573	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:12,1:8,1:4,20,0,2
chr8	124545375	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:12,1:1,1:11,2,2,0
chr8	124659329	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,2:1,2:0,7,0,4
chr8	124664239	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:7,0:12,8,2,0
chr8	124693444	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,13,4
chr8	124749610	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,6,18
chr8	124749651	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr8	124749704	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	124799406	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,4:4,10:10,0,14,0
chr8	124818447	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:5,5:7,12:5,7,7,10
chr8	124822439	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,3:4,6:12,0,9,0
chr8	124822507	.	CT	C	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.082:57:27,3:20,2:41,11,5,0
chr8	124822519	.	C	A	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=32,9;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,8:0.095:60:15,0:17,1:35,17,8,0
chr8	124968332	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,7:0.127:58:14,3:12,2:16,35,0,7
chr8	124982215	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,3:3,7:9,1,5,5
chr8	124985780	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.677:32:6,17:4,5:1,9,6,16
chr8	125047788	.	A	AGCTACCTTTGTTCTGTTTCATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=197,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.667:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr8	125072709	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr8	125082927	.	GGGATGTGTGTAGGGAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=216,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr8	125083907	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=135,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:125083907_T_A:125083907:3,4,1,1
chr8	125083909	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:125083907_T_A:125083907:3,4,1,1
chr8	125088636	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr8	125113639	.	A	AATTTTTATCGTTTCAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	125384069	.	G	GGGGGGGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	125463098	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr8	125465258	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr8	125465263	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr8	125551364	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:1,4:6,5:5,3,6,3
chr8	125551567	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.603:31:4,10:8,7:2,10,1,18
chr8	125562071	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:17,2:15,2:18,14,0,4
chr8	125568538	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,2:8,0:11,5,2,0
chr8	125570144	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr8	125574925	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	125575323	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr8	125577869	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,8:0,0,20,5
chr8	125601780	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr8	125601964	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=100,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:1,4,1,4
chr8	125603298	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr8	125711670	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:9,0,4,0
chr8	125988507	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,8:7,5:12,1,13,0
chr8	125990008	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=123,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.425:38:9,13:13,3:8,14,4,12
chr8	126030809	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,4:3,8:4,0,12,0
chr8	126049443	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,4:4,5:10,1,8,1
chr8	126056215	.	G	GC	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=129.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,20:0,12:0,0,19,15
chr8	126067985	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,244;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr8	126071380	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:4,0,8,1
chr8	126075991	.	TAAG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	126085363	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:3,4:3,6:6,1,9,3
chr8	126087437	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=212,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr8	126088512	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr8	126090946	.	TGTCTTAATAG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTCTTAATAG;STR;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.526:19:3,6:5,4:8,1,10,0
chr8	126091271	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr8	126094614	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,30:0.470:64:14,15:19,14:26,8,25,5
chr8	126094728	.	TG	CA	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,26:0.403:65:14,13:23,12:6,33,3,23
chr8	126095503	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:11,6:11,6:10,12,3,9
chr8	126095938	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,2:5,3:5,4,4,1
chr8	126163557	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,5:1,6,1,6
chr8	126369898	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr8	126445537	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:4,1,2,1
chr8	126448789	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=217,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr8	128428061	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,13,2
chr8	128429439	.	T	TAAAA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=A;STR;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.753:7:0,0:2,1:0,2,0,5
chr8	128429456	.	G	GAAAGA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAGA;STR;TLOD=61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr8	128429510	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0|1:128429510_G_A:128429510:0,0,0,10
chr8	128429519	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:128429510_G_A:128429510:0,0,0,6
chr8	128972767	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr8	129021262	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=149,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr8	129021307	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=219,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:129021307_T_A:129021307:0,1,0,1
chr8	129021312	.	A	AACCCACGAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=219,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:129021307_T_A:129021307:0,1,0,1
chr8	129162497	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:1,1:7,5:0,8,0,7
chr8	130760954	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=125,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.620:27:3,7:7,10:3,7,6,11
chr8	130761030	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr8	130761644	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr8	130763708	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:2,1,3,1
chr8	130763783	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,5:3,6:5,2,9,2
chr8	130763856	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=118,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:3,4,3,4
chr8	130772718	.	ACC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=177,180;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:130772718_ACC_A:130772718:2,0,1,0
chr8	130772722	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=177,180;MMQ=60,30;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:130772718_ACC_A:130772718:2,0,1,0
chr8	130772724	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=177,180;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:130772718_ACC_A:130772718:2,0,1,0
chr8	130772732	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=177,180;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:130772718_ACC_A:130772718:2,0,1,0
chr8	130772734	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=177,180;MMQ=60,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:130772718_ACC_A:130772718:2,0,1,0
chr8	130772882	.	T	TGCCTGAGTCTTTCCCATA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=94.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.961:22:0,11:0,7:0|1:130772882_T_TGCCTGAGTCTTTCCCATA:130772882:0,0,8,14
chr8	130772905	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:0|1:130772882_T_TGCCTGAGTCTTTCCCATA:130772882:0,7,0,4
chr8	130778106	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	130788548	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:0,1,2,5
chr8	130861671	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,3:4,0:1,9,0,3
chr8	130864558	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:1,8,0,2
chr8	131066928	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:4,9:3,6:6,1,10,5
chr8	131104231	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,14:0.353:40:12,7:11,5:16,10,11,3
chr8	131127797	.	C	CG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=175,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,0:9,3:0|1:131127797_C_CG:131127797:16,1,0,3
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chr8	131127831	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,4:7,4:12,4,7,1
chr8	131181348	.	A	AT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.416:24:5,5:9,4:1,13,0,10
chr8	131192905	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	131193153	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr8	131199416	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr8	131200298	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr8	131792607	.	C	CAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=A;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.289:9:5,1:1,1:7,0,2,0
chr8	131812899	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	131812900	.	G	GTTTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=212,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:131812900_G_GTTTT:131812900:0,2,0,1
chr8	131812903	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=36,32;MFRL=212,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:131812900_G_GTTTT:131812900:0,2,0,1
chr8	131812905	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=232,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:131812900_G_GTTTT:131812900:0,3,0,1
chr8	131812906	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=232,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:131812900_G_GTTTT:131812900:0,3,0,1
chr8	131812909	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=232,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:131812900_G_GTTTT:131812900:0,3,0,1
chr8	131826374	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=104,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:1,8,1,1
chr8	131848465	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:4,2:0,4:4,1,6,0
chr8	131859768	.	TAA	T,TA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=124,121,123;MMQ=60,60,60;MPOS=20,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.19,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,4:0.166,0.206:20:3,2,1:9,1,3:4,9,1,6
chr8	131862132	.	ATCCCTTGCATCG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr8	131897082	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr8	131916318	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr8	131916374	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr8	131922196	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131922196_T_TG:131922196:0,0,0,1
chr8	131922197	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131922196_T_TG:131922196:0,0,0,1
chr8	131922200	.	TT	GG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131922196_T_TG:131922196:0,0,0,1
chr8	131922203	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131922196_T_TG:131922196:0,0,0,1
chr8	132002576	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr8	132952727	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.700:11:2,4:1,4:3,0,7,1
chr8	132966028	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,1:4,0,5,1
chr8	132980709	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr8	132988478	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=185,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr8	132997353	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:3,3:1,6:0,4,0,10
chr8	133008823	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	133015561	.	AAC	A	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,3:0.044:88:36,3:48,0:27,58,1,2
chr8	133023163	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,12:0,2:0,0,3,12
chr8	133041242	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=203,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr8	133046927	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr8	133046977	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=100,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:5,1,3,1
chr8	133053467	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:133053467_T_A:133053467:1,2,0,1
chr8	133053469	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:133053467_T_A:133053467:1,2,0,1
chr8	133053472	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:133053467_T_A:133053467:1,2,0,1
chr8	133053473	.	T	TTCTGGGGAGGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:133053467_T_A:133053467:1,2,0,1
chr8	133053714	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr8	133078169	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:5,5:3,5:5,3,4,6
chr8	133091905	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,2,3
chr8	133101818	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,4,13
chr8	133107893	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,8:0,17:0,0,14,12
chr8	133116251	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr8	133117603	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr8	133152413	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=113,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:0,2:10,0:0|1:133152413_C_G:133152413:6,4,1,1
chr8	133152415	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=113,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:0,2:9,0:0|1:133152413_C_G:133152413:6,4,1,1
chr8	133152417	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,16;MFRL=113,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:0,1:9,0:0|1:133152413_C_G:133152413:6,4,1,1
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chr8	133723313	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,155;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:5,0:10,2:2,13,0,3
chr8	133734455	.	C	CA,CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35,32;MFRL=0,184,238;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=A;STR;TLOD=5.40,5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.412,0.500:7:0,1,1:0,2,2:0,0,0,7
chr8	133740259	.	AGT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=184,127;MMQ=54,56;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=GT;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.728:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr8	133740307	.	T	TGAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,106;MMQ=60,40;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr8	133759318	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=172,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.512:21:7,4:3,5:6,4,2,9
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chr8	133764321	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr8	133769432	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=135,174;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.082:47:10,2:30,1:34,10,3,0
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chr8	133880334	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
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chr8	133885554	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
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chr8	133920624	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr8	133925209	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr8	133960936	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr8	133960991	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.617:14:2,5:3,2:4,1,7,2
chr8	133975406	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr8	133978711	.	C	CTGTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=TG;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr8	133984821	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr8	133995475	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr8	134025781	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:134025781_A_T:134025781:0,0,8,1
chr8	134025783	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0|1:134025781_A_T:134025781:0,0,8,1
chr8	134050678	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr8	134051024	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,188;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr8	134052199	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=218,208;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr8	134060061	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:5,4:2,5:5,2,6,3
chr8	134107223	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr8	134108718	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,8:0,0:0,0,0,8
chr8	134125682	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,10,2
chr8	134146001	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr8	134225067	.	GTCTCAGCAGCCCC	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.244:11:2,2:4,0:0|1:134225067_GTCTCAGCAGCCCC_G:134225067:5,4,2,0
chr8	134225068	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,5:0,0,10,2
chr8	134225083	.	TTTCCCTCTGCCCTCCCC	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:2,1:3,0:0|1:134225067_GTCTCAGCAGCCCC_G:134225067:6,8,2,0
chr8	134225396	.	T	TC	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=105.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,15:0,16:0,0,12,21
chr8	134225434	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,2,19
chr8	134237578	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr8	134251449	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	134261065	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr8	134270548	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,4:7,3:11,3,7,0
chr8	134270762	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=210,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.224:7:5,1:1,0:0,6,0,1
chr8	134274226	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr8	134475710	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=118,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,0:4,6:2,5,2,4
chr8	134477013	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:1,4:4,6:5,0,9,2
chr8	135577530	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.527:13:2,3:4,2:0|1:135577530_G_A:135577530:5,1,7,0
chr8	135577533	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.527:13:2,4:4,1:0|1:135577530_G_A:135577530:5,1,7,0
chr8	135669786	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,13;MFRL=171,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:2,0:2,1:7,1,3,0
chr8	135669793	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.283:17:5,1:2,1:9,3,5,0
chr8	135669800	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.378:16:7,0:3,0:6,4,6,0
chr8	135725058	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr8	136560952	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr8	136561153	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,2:7,4:0,10,1,5
chr8	136561244	.	T	TTTCTTTCTCTTTTTTCGGTCCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=227,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	136657233	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=205,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr8	136659426	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr8	139144932	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:14,4:9,0:0|1:139144932_G_T:139144932:11,13,4,0
chr8	139144942	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,3:0.126:29:16,0:9,3:1|0:139144932_G_T:139144932:14,12,2,1
chr8	139149510	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=16,34;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.891:15:0,9:0,5:0,1,5,9
chr8	139151375	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=192,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,4:1,5:0,1,0,9
chr8	139153374	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.925:10:0,3:0,7:0|1:139153374_G_C:139153374:0,0,10,0
chr8	139153385	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:0|1:139153374_G_C:139153374:6,0,6,0
chr8	139158317	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,5,7
chr8	139164192	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,122;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,3:5,0:2,6,2,1
chr8	139165463	.	CA	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=70.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,27:0.906:29:1,20:0,7:0,2,2,25
chr8	139165557	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	139189502	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	139190957	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr8	139255384	.	GA	TT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139255384_GA_TT:139255384:0,0,0,1
chr8	139255388	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139255384_GA_TT:139255384:0,0,0,1
chr8	139255391	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139255384_GA_TT:139255384:0,0,0,1
chr8	139255394	.	C	CTGAGCCAGTCATTTCAGT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139255384_GA_TT:139255384:0,0,0,1
chr8	139263307	.	C	CACTTAACCACTATAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	139269052	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,2,5
chr8	139277934	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,1:2,7:3,4,4,4
chr8	139278171	.	AG	TT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139278171_AG_TT:139278171:0,0,0,1
chr8	139278175	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139278171_AG_TT:139278171:0,0,0,1
chr8	139278177	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139278171_AG_TT:139278171:0,0,0,1
chr8	139323246	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	139603851	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	139609329	.	C	CTCCAGAATGCAGGGCCCGAGTCCCAAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr8	139614436	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,0:0,13:0,0,2,11
chr8	139617046	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,3:4,7:0,6,2,8
chr8	139618754	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr8	139620267	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=118,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,0,2
chr8	139631650	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:8,4:3,5:9,2,8,1
chr8	139635883	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr8	139635920	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr8	139647262	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,6,12
chr8	139648892	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,10,3
chr8	139661853	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,87;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr8	139668032	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr8	139672602	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr8	139674213	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.951:19:0,3:0,10:0,0,11,8
chr8	139674359	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:139674359_T_C:139674359:0,3,0,1
chr8	139674360	.	A	ACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:139674359_T_C:139674359:0,3,0,1
chr8	139675869	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr8	139676082	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	139688697	.	A	AAAGG,AAAGGAAGG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32,32;MFRL=177,163,160;MMQ=40,60,40;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=1,2,3;RU=AAGG;STR;TLOD=23.42,18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,9,7:0.465,0.366:19:0,5,3:2,4,3:3,0,16,0
chr8	139696635	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr8	139737521	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr8	139767349	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:1,4:3,0:3,1,3,2
chr8	139815286	.	A	AATATGGTCTTGGCGGACTCTCTAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=222,283;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	139889972	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:4,5:5,4:10,0,8,1
chr8	140631385	.	G	GAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=190,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.477:2:1,1:0,0:0|1:140631385_G_GAAA:140631385:0,1,0,1
chr8	140631386	.	G	GAAAAGTGGGCCCAGGGGACC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=12,35;MFRL=190,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.477:2:0,1:0,0:0|1:140631385_G_GAAA:140631385:0,1,0,1
chr8	141231752	.	GTTTGGGACGGGT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:141231752_GTTTGGGACGGGT_G:141231752:0,2,0,1
chr8	141231766	.	TCGCTCTGTCGCA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:141231752_GTTTGGGACGGGT_G:141231752:0,2,0,1
chr8	141231781	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:141231752_GTTTGGGACGGGT_G:141231752:0,2,0,1
chr8	141294032	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=111,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:6,6,2,1
chr8	141297613	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr8	141310486	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	141407698	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=70,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:5,0:0,5:3,2,4,1
chr8	141415673	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=129,85;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:11,3:16,0:20,8,3,0
chr8	141436826	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,6:4,4:0,8,0,10
chr8	141445349	.	AAGAAAACAAAAAACAAAAACC	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAAACAAAAAACAAAAACC;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.303:9:3,1:3,1:1,6,1,1
chr8	141460918	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:8,6:10,3:7,11,3,6
chr8	141468743	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	141557497	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr8	141561393	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr8	141568699	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=127,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:1,5,0,4
chr8	141568725	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:0,5,0,8
chr8	141572497	.	GG	AA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=193,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr8	141583108	.	ATTT	A,AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24,15;MFRL=166,164,187;MMQ=60,50,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.24,7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.303,0.470:6:0,0,1:1,1,0:0,1,0,5
chr8	141669818	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.820:8:1,2:0,5:0,1,1,6
chr8	141685506	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:10,4:2,3:9,3,6,1
chr8	141685641	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr8	141749052	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr8	141754876	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=129,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,0:9,0:6,9,0,2
chr8	141754881	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=133,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.196:17:2,0:8,1:0|1:141754881_A_C:141754881:6,8,0,3
chr8	141754883	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=133,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.196:17:2,0:9,2:0|1:141754881_A_C:141754881:6,8,0,3
chr8	141754888	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.487:12:2,0:4,2:3,3,0,6
chr8	141757009	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,32;MFRL=180,166;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:141757009_T_TG:141757009:0,1,0,2
chr8	141757013	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=214,148;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:141757009_T_TG:141757009:0,2,0,1
chr8	141774282	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,0:2,5:3,0,4,2
chr8	141840739	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,3:4,5:0,5,0,8
chr8	141856843	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr8	142146708	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr8	142161064	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr8	142161666	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr8	142173356	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr8	142176466	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=204,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:142176466_A_T:142176466:0,3,0,1
chr8	142176468	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=204,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:142176466_A_T:142176466:0,3,0,1
chr8	142176507	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,24111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	142178621	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=149,67;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.458:39:14,9:7,7:8,13,14,4
chr8	142178712	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:0,12,0,2
chr8	142178718	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,2:3,4:0,8,0,7
chr8	142185580	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,3,13
chr8	142191032	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	142222230	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=12,11;MFRL=189,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.594:5:0,0:0,0:0|1:142222230_C_G:142222230:1,1,3,0
chr8	142222234	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.511:8:0,1:1,3:0|1:142222230_C_G:142222230:1,3,4,0
chr8	142222237	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,1:3,0:0|1:142222230_C_G:142222230:0,3,4,0
chr8	142222241	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,24;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:2,2:0,3,3,0
chr8	142222261	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr8	142228077	.	AGAGCGGCCCCGCTCCGGT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	142228809	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,17:0,16:0,0,22,11
chr8	142229145	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,2,21
chr8	142229946	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr8	142231944	.	GC	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr8	142238339	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,4:0,9:0,0,1,13
chr8	142367559	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr8	142435113	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,13;MFRL=248,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,0:0|1:142435113_G_C:142435113:2,0,1,0
chr8	142435117	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=248,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,1:0|1:142435113_G_C:142435113:2,0,1,0
chr8	142444780	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr8	142445055	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr8	142445062	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr8	142445095	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,3:0,3:0|1:142445095_C_T:142445095:0,0,4,3
chr8	142445097	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0|1:142445095_C_T:142445095:0,0,4,3
chr8	142457961	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr8	142458053	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr8	142480610	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	142484366	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	142488662	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr8	142489981	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr8	142490644	.	C	CACTAATTCTGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	142505038	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr8	142505056	.	TG	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	142517130	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr8	143356306	.	C	CGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=135,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:143356306_C_CGTGTG:143356306:0,4,0,1
chr8	143356309	.	G	GGCCACAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=135,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:143356306_C_CGTGTG:143356306:0,4,0,1
chr8	143365913	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	143396336	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,16;MFRL=108,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.253:16:2,2:6,0:6,6,4,0
chr8	143412338	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:2,7,1,1
chr8	143413282	.	G	GTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:143413282_G_GTCC:143413282:0,1,0,1
chr8	143413285	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:143413282_G_GTCC:143413282:0,1,0,1
chr8	143558675	.	A	AGGGACCATTGTGGGTTCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=97,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:143558675_A_AGGGACCATTGTGGGTTCTT:143558675:0,1,1,1
chr8	143558682	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=163,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:2,0:0,1:0|1:143558675_A_AGGGACCATTGTGGGTTCTT:143558675:1,1,0,1
chr8	143560895	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:143560895_G_A:143560895:0,0,0,2
chr8	143560898	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:143560895_G_A:143560895:0,0,0,2
chr8	143560996	.	AGCCAGCT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,4:0,0,9,1
chr8	143561206	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	143563087	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr8	143599631	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:143599631_A_G:143599631:0,0,0,5
chr8	143599634	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:143599631_A_G:143599631:0,0,0,5
chr8	143599651	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,36;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	143599655	.	G	GACC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:143599655_G_GACC:143599655:0,3,0,1
chr8	143599658	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:143599655_G_GACC:143599655:0,3,0,1
chr8	143599665	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr8	143603269	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr8	143603318	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr8	143620822	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr8	143625081	.	AG	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=135,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr8	143625150	.	T	TGGTCACCATTTATTTAGACATAAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	143694775	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,1:0,0,6,5
chr8	143746050	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	143746069	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=193,227;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr8	143746087	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CA;STR;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr8	143762724	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr8	143781801	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	143784500	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr8	143784885	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr8	143816750	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=114,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,4:3,2:1,5,1,5
chr8	143845950	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,4:0,11:0|1:143845950_A_G:143845950:0,0,18,0
chr8	143845953	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,5:0,13:0|1:143845950_A_G:143845950:0,0,18,0
chr8	143857265	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,4:0,0,10,2
chr8	143866841	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:143866841_C_A:143866841:2,2,1,0
chr8	143866844	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:143866841_C_A:143866841:2,2,1,0
chr8	143866847	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:143866841_C_A:143866841:2,2,1,0
chr8	143867157	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,0,18
chr8	143867833	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=13,12;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.532:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr8	143867841	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr8	143867845	.	CGCCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr8	143921804	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,7:3,2:6,1,5,4
chr8	143921812	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,10,6
chr8	143921874	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:4,4,3,4
chr8	143956808	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,246;MMQ=60,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	143957856	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,2,5
chr8	143957876	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:3,1:0,0:0|1:143957876_TCC_T:143957876:0,3,0,1
chr8	143957879	.	TGC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:143957876_TCC_T:143957876:0,3,0,1
chr8	143958427	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=94,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:6,0:2,3:5,4,2,1
chr8	143994321	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr8	143994349	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=210,177;MMQ=27,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr8	143994388	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=210,179;MMQ=27,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0|1:143994388_G_C:143994388:0,1,0,3
chr8	143994391	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=210,179;MMQ=27,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:0,0:0|1:143994388_G_C:143994388:0,1,0,3
chr8	143994396	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:143994388_G_C:143994388:0,0,0,2
chr8	143996363	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:143996363_A_G:143996363:0,0,1,5
chr8	143996365	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0|1:143996363_A_G:143996363:0,0,1,5
chr8	144102493	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=156,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr8	144130550	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:10,10:6,4:12,4,11,3
chr8	144239660	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:5,3,1,2
chr8	144295154	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr8	144332012	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=108,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:6,1,6,1
chr8	144332453	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=168,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:8,2:0|1:144332453_A_T:144332453:8,15,1,1
chr8	144332461	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=168,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:144332453_A_T:144332453:8,13,1,1
chr8	144332463	.	A	AGGGTGGATCACAGAGGATGAG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=168,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:9,2:0|1:144332453_A_T:144332453:8,13,1,1
chr8	144391728	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,1,4
chr8	144391796	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=231,133;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:144391796_G_C:144391796:0,1,0,1
chr8	144391801	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=231,133;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:144391796_G_C:144391796:0,1,0,1
chr8	144391805	.	G	GAGCGTGGGCCAAGGCTGTTTCCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=231,133;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:144391796_G_C:144391796:0,1,0,1
chr8	144398396	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=198,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr8	144399833	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=194,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr8	144399856	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,3:0,4:3,0,7,0
chr8	144399885	.	AG	CT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,3:3,0,6,0
chr8	144400089	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:3,4,2,0
chr8	144403292	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:1,2:1,2:2,0,5,0
chr8	144406881	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	144458874	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=216,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:144458874_C_T:144458874:0,2,0,1
chr8	144458883	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:144458874_C_T:144458874:0,2,0,1
chr8	144458885	.	GC	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:144458874_C_T:144458874:0,2,0,1
chr8	144460569	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	144461307	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	144461764	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr8	144462169	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr8	144512602	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,3:1,0:0,1,0,4
chr8	144523018	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	144523323	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr8	144618379	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr8	144621302	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,1:12,1:9,16,0,2
chr8	144641753	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,4,12
chr8	144642151	.	G	GAGGGCAGGGCAGGGC	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=131,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=AGGGC;STR;TLOD=52.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.539:25:6,5:5,4:5,6,2,12
chr8	144642178	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=103.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,17:0,10:0,0,4,23
chr8	144642986	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr8	144643091	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,18;MFRL=223,203;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:144643091_C_G:144643091:1,0,1,0
chr8	144643093	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=21,13;MFRL=223,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:144643091_C_G:144643091:1,0,1,0
chr8	144643100	.	GG	CC	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=13,32;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:144643091_C_G:144643091:2,0,1,0
chr8	144643103	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=31,23;MFRL=228,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr8	144643107	.	GG	CC	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=17,32;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:144643091_C_G:144643091:2,0,1,0
chr8	144643112	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=18,32;MFRL=223,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:144643091_C_G:144643091:3,0,1,0
chr8	144643114	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=16,31;MFRL=223,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:144643091_C_G:144643091:3,0,1,0
chr8	144643118	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=22,30;MFRL=223,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:144643091_C_G:144643091:3,0,1,0
chr8	144643120	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=15,15;MFRL=228,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.696:4:0,0:0,1:1,0,3,0
chr8	144643321	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=119,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,7:5,2:0,7,1,8
chr8	144643815	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=234,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,3:1,0:2,0,3,1
chr8	144644085	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:4,3:4,1:1,7,0,5
chr8	144644583	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,2,1
chr8	144644787	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=254,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr8	144649625	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	144649650	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr8	144649690	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:5,6:1,2:7,0,8,0
chr8	144650503	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=13,31;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,1:0,5:0,1,1,5
chr8	144650925	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr8	144653218	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,1,7
chr8	144654582	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:144654582_C_A:144654582:0,0,1,2
chr8	144654586	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:144654582_C_A:144654582:0,0,1,2
chr8	144656977	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:11,9:11,4:14,8,8,5
chr8	144657269	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,6:6,7:8,5,7,6
chr8	144657479	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr8	144657600	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.576:29:5,6:7,9:10,2,13,4
chr8	144657685	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.148:39:13,2:15,0:17,16,6,0
chr8	144658370	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:7,1:2,1:3,6,0,2
chr8	144658505	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr8	144659608	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr8	144660511	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:144660511_C_CG:144660511:0,2,0,2
chr8	144660513	.	C	CCCGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:144660511_C_CG:144660511:0,2,0,2
chr8	144660523	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr8	144660572	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:144660572_T_G:144660572:0,0,0,1
chr8	144660575	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:144660572_T_G:144660572:0,0,0,1
chr8	144662652	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,10;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:0,0:4,1,3,0
chr8	144662661	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:4,0:0,1:3,2,4,0
chr8	144662666	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:7,0:0,1:0|1:144662666_G_C:144662666:8,3,2,0
chr8	144662669	.	C	CCCAAACCAGGGTG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:10,0:0,1:0|1:144662666_G_C:144662666:8,3,2,0
chr8	144680544	.	G	GCATGATGAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.306:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr8	144681153	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:144681153_G_C:144681153:1,0,1,0
chr8	144681157	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:144681153_G_C:144681153:1,0,1,0
chr8	144681159	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:144681153_G_C:144681153:1,0,1,0
chr8	144681164	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:144681153_G_C:144681153:1,0,1,0
chr8	144688348	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr8	144695499	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:6,5:0,4:1,5,3,6
chr8	144695867	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr8	144696731	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.357:23:1,2:6,0:13,2,8,0
chr8	144698374	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.556:27:7,9:4,6:6,6,7,8
chr8	144732026	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:5,3,4,0
chr8	144735977	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr8	144773918	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=81,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr8	144776713	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr8	144798592	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:6,8:8,5:8,6,9,4
chr8	144800004	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=83,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:0,4,1,8
chr8	144800137	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,2,1
chr8	144800552	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr8	144801347	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr8	144801681	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	144803616	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr8	144808003	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr8	144812273	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,10;MFRL=122,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:144812273_T_G:144812273:1,0,1,0
chr8	144812279	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,13;MFRL=122,228;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:144812273_T_G:144812273:1,0,1,0
chr8	144812281	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,10;MFRL=122,228;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:144812273_T_G:144812273:1,0,1,0
chr8	144812286	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,14;MFRL=122,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:144812273_T_G:144812273:1,0,1,0
chr8	144812298	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,19;MFRL=144,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:144812298_T_G:144812298:2,0,1,0
chr8	144812307	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,13;MFRL=144,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:144812298_T_G:144812298:2,0,1,0
chr8	144812309	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,18;MFRL=144,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:144812298_T_G:144812298:2,0,1,0
chr8	144873779	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,12:0,0,14,7
chr8	144873961	.	G	GAAAGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=63,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:3,1:0,0:0|1:144873961_G_GAAAGA:144873961:1,2,0,1
chr8	144873963	.	T	TCTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=63,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:3,1:0,0:0|1:144873961_G_GAAAGA:144873961:1,2,0,1
chr8	144876174	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=191,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144876174_T_A:144876174:0,1,0,1
chr8	144876175	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=191,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144876174_T_A:144876174:0,1,0,1
chr8	144876181	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=191,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144876174_T_A:144876174:0,1,0,1
chr8	144876183	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=191,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144876174_T_A:144876174:0,1,0,1
chr8	144876185	.	AC	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=191,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144876174_T_A:144876174:0,1,0,1
chr8	144877546	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr8	144887196	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr8	144888677	.	GCAGGGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr8	144889901	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=204,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr8	144890867	.	TCCTCTACCTCCTCCTCCTGAGGACTAC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.290:9:1,1:3,1:0|1:144890867_TCCTCTACCTCCTCCTCCTGAGGACTAC_T:144890867:0,7,0,2
chr8	144890873	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,9:0.916:9:0,2:0,5:1|0:144890867_TCCTCTACCTCCTCCTCCTGAGGACTAC_T:144890867:0,0,1,8
chr8	144893537	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:6,0:2,4:0,9,0,4
chr8	144894353	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=14,13;MFRL=191,237;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:0,0:3,1,1,0
chr8	144894361	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=86,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.320:7:3,0:0,0:3,2,2,0
chr8	144894641	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr8	144911544	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	144917952	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr8	144940117	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr8	144992900	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,6:4,1:2,3,6,1
chr8	144994064	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:4,2,4,2
chr8	144994312	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,1:8,1:4,9,0,2
chr8	144994802	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,2,0
chr8	144998392	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,36;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:144998392_GA_TC:144998392:0,0,1,1
chr8	144998396	.	C	CATTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,36;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:144998392_GA_TC:144998392:0,0,1,1
chr8	144998398	.	T	TGTGTAATCTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:144998392_GA_TC:144998392:0,0,1,1
chr8	145001652	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	145004546	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr8	145006927	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.308:19:3,1:3,0:12,1,6,0
chr8	145006959	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.180:33:14,0:7,0:15,12,6,0
chr8	145011303	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.216:22:8,0:5,1:11,6,0,5
chr8	145049633	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	145066886	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,14,2
chr8	145066965	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:9,2:11,10,0,2
chr8	145096222	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=121,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:3,5,0,2
chr8	145106938	.	GCC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=C;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	145110880	.	G	GTGCAGTACCTGAGCAAGTACCAAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=12,33;MFRL=252,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr8	145138477	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,5:0,4,0,6
chr8	145138568	.	C	CTACTGACCGCATCGTCCGTTCAAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	145161823	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,15,11
chr8	145161896	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,12:0,5:0,0,7,10
chr8	145223191	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr8	145234508	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr8	145245631	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr8	145247168	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=159,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,2,1
chr8	145254159	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr8	145255523	.	C	CCTGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	145540230	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:5,3,4,0
chr8	145557364	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr8	145579943	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=207,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:145579943_C_A:145579943:3,1,1,0
chr8	145579950	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=197,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,0:0|1:145579943_C_A:145579943:4,1,2,0
chr8	145579953	.	TG	AA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=197,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:145579943_C_A:145579943:4,1,2,0
chr8	145580984	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=199,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr8	145618597	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:6,2:0,1:7,0,3,0
chr8	145618862	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=10,32;MFRL=231,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr8	145620296	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:4,4:3,3:3,5,3,5
chr8	145620764	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,5:4,4:5,5,0,10
chr8	145621556	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.650:26:4,7:4,10:5,4,10,7
chr8	145622923	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:2,1,0,2
chr8	145623098	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.429:10:3,2:1,2:0,6,2,2
chr8	145623881	.	C	CCCCAGGT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCCAGGT;STR;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:5,3:2,1:5,2,3,2
chr8	145624640	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr8	145625283	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:7,5:5,5:3,9,5,6
chr8	145625524	.	GCC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=11,33;MFRL=186,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=C;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:145625524_GCC_G:145625524:1,0,0,2
chr8	145625538	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:0,0:0|1:145625524_GCC_G:145625524:1,0,1,2
chr8	145639320	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:2,0,4,1
chr8	145639521	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr8	145652408	.	G	GGT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=143,153;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0|1:145652408_G_GGT:145652408:1,4,0,4
chr8	145652412	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=147,153;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,2:1,2:0|1:145652408_G_GGT:145652408:1,5,0,4
chr8	145652453	.	TGA	CAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=162,133;MMQ=40,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:145652453_TGA_CAG:145652453:0,3,0,2
chr8	145652458	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=177,123;MMQ=43,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:145652453_TGA_CAG:145652453:0,2,0,1
chr8	145654794	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=94,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
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chr8	145665637	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr8	145665699	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr8	145667354	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr8	145667405	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr8	145668042	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr8	145668443	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr8	145668481	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:5,1,4,0
chr8	145677973	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	145690308	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr8	145690348	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	145691915	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=209,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr8	145692812	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=86.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,13:0,0,23,3
chr8	145693900	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr8	145694588	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:145694588_TC_GG:145694588:0,0,2,0
chr8	145694592	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:145694588_TC_GG:145694588:0,0,2,0
chr8	145694599	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=105,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:145694588_TC_GG:145694588:0,1,1,0
chr8	145695067	.	T	TAAGCAACTAGTATGTGCTAGGGAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr8	145697244	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr8	145698490	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:4,2:0|1:145698490_G_C:145698490:6,0,3,0
chr8	145698494	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,0:3,2:0|1:145698490_G_C:145698490:7,0,3,0
chr8	145698498	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:2,0:3,1:0|1:145698490_G_C:145698490:7,0,3,0
chr8	145698758	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=158,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr8	145699601	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,6:0,3:0,0,11,0
chr8	145724275	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr8	145725760	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:145725760_C_A:145725760:0,0,1,0
chr8	145725778	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:145725760_C_A:145725760:0,0,1,0
chr8	145726166	.	C	CTTAATACTAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr8	145730330	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=196,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,0:1,5:1,0,4,1
chr8	145737040	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:4,4,2,3
chr8	145737514	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:2,0:3,1,1,3
chr8	145738767	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=63,124;MMQ=54,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:1,5:0,1:0,1,4,2
chr8	145738801	.	C	CAAAACCACAGCCAAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=146,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr8	145739924	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr8	145741130	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,2:0,6:0,0,11,0
chr8	145750106	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	145750138	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr8	145755794	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:5,0:11,2,2,0
chr8	145756331	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr8	145771211	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr8	145806681	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,7:0,0,3,14
chr8	145830894	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr8	145831061	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=153,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr8	146003060	.	G	GTGTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=248,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:146003060_G_GTGTCT:146003060:0,1,0,1
chr8	146003061	.	A	ACAGCGCTGGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=248,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:146003060_G_GTGTCT:146003060:0,1,0,1
chr8	146003567	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr8	146015387	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.240:27:12,2:9,0:0|1:146015387_A_C:146015387:0,21,6,0
chr8	146015390	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.232:28:10,2:7,0:0|1:146015387_A_C:146015387:0,22,6,0
chr8	146015396	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:10,0:8,1:0|1:146015387_A_C:146015387:0,19,5,0
chr8	146015402	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:8,0:0|1:146015387_A_C:146015387:0,20,2,0
chr8	146017120	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=122,119;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:5,0:2,0:0|1:146017120_T_G:146017120:1,6,2,0
chr8	146017125	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=106,119;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:4,1:4,1:0|1:146017120_T_G:146017120:1,8,2,0
chr8	146033347	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr8	146054434	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=119,47;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,1:10,1:17,3,2,0
chr8	146062982	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=191,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr8	146068594	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=162,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,2:2,2:0,4,0,4
chr8	146068617	.	A	AGATTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=193,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr8	146108019	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,3:13,0:23,6,3,0
chr8	146112354	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=154,161;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:1,19,0,2
chr8	146112371	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=159,79;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:11,0:5,2:0,20,1,1
chr8	146279475	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:12,7,2,0
chr9	17333	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,237;MMQ=60,22;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	117211	.	A	ACTTCGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=203,227;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	117877	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,175;MMQ=25,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,27:0.402:68:18,7:20,20:22,19,23,4
chr9	214706	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,5:3,3:8,1,4,4
chr9	304769	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:0,9,0,3
chr9	316998	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:2,4,4,2
chr9	317195	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr9	325811	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:325811_T_TC:325811:0,0,0,6
chr9	325817	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:325811_T_TC:325811:0,0,0,6
chr9	327938	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	327957	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=127,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr9	328006	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,12,6
chr9	334277	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,35;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:9,11,1,1
chr9	339203	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=243,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr9	340418	.	TG	CG,CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24,33;MFRL=180,335,197;MMQ=60,60,56;MPOS=2,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.222,0.333:6:2,1,2:1,0,0:0,3,0,3
chr9	340421	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=192,197;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,0:0,4,0,2
chr9	370370	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr9	372370	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:372370_T_G:372370:0,1,0,1
chr9	372372	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:372370_T_G:372370:0,1,0,1
chr9	376122	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=178,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:1,0,3,0
chr9	376179	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=242,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr9	376929	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.429:10:1,3:3,1:4,2,3,1
chr9	379965	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	390636	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,3:8,0:1,11,0,3
chr9	396712	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:8,0,5,0
chr9	396749	.	TC	GA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=146,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:5,8:6,5:11,1,9,4
chr9	407155	.	GGTA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=149,181;MMQ=60,52;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:2,0:4,4:0|1:407155_GGTA_G:407155:0,8,0,4
chr9	407157	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.326:7:1,2:4,0:1|0:407155_GGTA_G:407155:0,5,0,2
chr9	421032	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=96,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,30:0.492:61:14,16:17,12:0|1:421032_C_G:421032:15,16,14,16
chr9	421033	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=128,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:57,4:0.079:61:24,4:27,0:1|0:421032_C_G:421032:28,29,1,3
chr9	421980	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:5,1,6,0
chr9	422157	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.442:23:6,7:6,3:4,9,3,7
chr9	432081	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=252,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr9	432140	.	CTT	C,CT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,34,33;MFRL=137,141,111;MMQ=60,60,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=12.22,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,9,3:0.487,0.195:17:3,3,1:1,4,2:3,2,9,3
chr9	432330	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:12,8:13,10:9,16,6,12
chr9	433978	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,3:3,4:3,7,4,4
chr9	439453	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:0,1,0,5
chr9	439467	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=199,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr9	441827	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:4,1,3,0
chr9	446352	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.520:21:6,8:4,3:6,4,5,6
chr9	452003	.	CC	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=150,167;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:3,1,1,0
chr9	452013	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=122,167;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:3,0:1,0:3,1,3,0
chr9	676954	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:7,6:8,7:9,6,9,4
chr9	732302	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=187,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	734665	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:1,2:3,4:4,0,5,1
chr9	734679	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:2,3:5,6:5,2,5,5
chr9	738238	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.417:15:6,3:2,3:8,1,6,0
chr9	740769	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,12;RU=T;STR;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.679:7:0,2:2,3:2,0,3,2
chr9	740972	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr9	741001	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr9	967951	.	C	CCTTTCTCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=116,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CTTTCTCT;STR;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr9	967981	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,12,3
chr9	968150	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,1:4,5:2,4,2,4
chr9	989943	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=116,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr9	1053917	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:1053917_C_CGG:1053917:0,0,0,1
chr9	1053918	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:1053917_C_CGG:1053917:0,0,0,1
chr9	1053923	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1053917_C_CGG:1053917:0,0,0,1
chr9	1057318	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:0,4,0,5
chr9	2056861	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,2:5,6:0,10,0,8
chr9	2060971	.	GA	TT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,100;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.128:22:13,0:5,2:4,16,0,2
chr9	2073514	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,8:3,4:6,1,10,2
chr9	2081739	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=212,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr9	2103950	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.468:25:4,5:1,6:14,0,10,1
chr9	2161949	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,6:1,2:0,2,0,8
chr9	2170512	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,3:8,3:1,10,0,6
chr9	2643496	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,0;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:5,8,0,2
chr9	2643576	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=185,48;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:5,0:8,2,2,0
chr9	2644954	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr9	2645109	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr9	2645557	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr9	2645773	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr9	2651340	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr9	2717676	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:2,1:0,2:0|1:2717676_T_G:2717676:2,0,4,0
chr9	2717698	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0|1:2717676_T_G:2717676:0,0,7,0
chr9	2718914	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	2729545	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:16,0:6,2:8,14,0,2
chr9	2807964	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=178,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:2807964_C_CA:2807964:0,7,1,1
chr9	2807967	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=178,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:2807964_C_CA:2807964:0,7,1,1
chr9	2807969	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,18;MFRL=178,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,0:3,1:0|1:2807964_C_CA:2807964:0,5,1,1
chr9	2807974	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=179,81;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr9	2827161	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,0:8,3:3,13,1,2
chr9	2831149	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=105.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,11,17
chr9	2833267	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,4:0,0:3,0,4,0
chr9	2943518	.	A	ACT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,11,1
chr9	2943755	.	T	TAGCTTTTGTGATTTTTCTCTTTATTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=225,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	2948062	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=202,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr9	2992402	.	CAA	C,CAAAAAAAAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,25,33;MFRL=78,188,138;MMQ=50,50,40;MPOS=6,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,22,31;RU=A;STR;TLOD=3.79,22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,15:0.103,0.758:19:1,1,2:0,0,8:1,1,11,6
chr9	3013104	.	G	GCTCGGTTTTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr9	3013123	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	3014254	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	3053437	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,1,0
chr9	3053438	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=62,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:3053438_A_G:3053438:2,2,0,1
chr9	3053439	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr9	3053443	.	A	C,ATAGGC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,27,29;MFRL=160,0,148;MMQ=60,60,60;MPOS=1,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,0:1,1,1:0,2,1,1
chr9	3053445	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=123,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:3053438_A_G:3053438:1,2,0,1
chr9	3053463	.	C	CATGTA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	3247690	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr9	3330258	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,150;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:12,3,0,2
chr9	3346662	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:1,2:15,0:10,6,1,1
chr9	3879693	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	3932283	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,4:3,2:8,0,6,0
chr9	3932521	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr9	4117713	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	4572480	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr9	4576851	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr9	4646363	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr9	4661853	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:6,6:8,2:13,1,7,1
chr9	4662065	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,6:4,3:0,8,0,9
chr9	4663516	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.447:25:7,6:6,5:6,8,6,5
chr9	4679906	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:6,2:7,2:0,13,0,4
chr9	4701841	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.445:9:3,0:0,4:5,0,4,0
chr9	4719039	.	G	GGTCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTCA;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr9	4719364	.	G	GAAAGTTAGGGTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	4722685	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	4793254	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,13:0,15:0,0,6,29
chr9	4823730	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=187,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4823730_C_CA:4823730:0,1,0,1
chr9	4823732	.	C	CCCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=187,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4823730_C_CA:4823730:0,1,0,1
chr9	4844459	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:9,7:3,4:12,0,11,1
chr9	4844507	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=106.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,20:0,12:0,0,15,17
chr9	4850421	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=107.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,14:0,9:0|1:4850421_C_G:4850421:0,0,8,18
chr9	4850431	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=165,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,15:0.622:24:4,10:4,5:0|1:4850421_C_G:4850421:2,7,6,9
chr9	4850436	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.411:22:7,3:3,4:0|1:4850421_C_G:4850421:5,8,2,7
chr9	4860300	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,4:2,3:2,6,2,5
chr9	5069837	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,2:2,2:4,0,5,0
chr9	5089957	.	T	TAGTCATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	5090934	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.388:34:12,9:9,4:5,16,2,11
chr9	5090966	.	ATTG	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.396:13:3,3:5,2:1,7,0,5
chr9	5335639	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=116,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr9	5339738	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=93.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,36:0.520:69:16,13:16,21:10,23,15,21
chr9	5431844	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,4:11,0:19,1,4,0
chr9	5465479	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:7,1,2,0
chr9	5467955	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,1:5,8:0,8,0,9
chr9	5534649	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5534649_G_C:5534649:0,0,1,0
chr9	5534653	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5534649_G_C:5534649:0,0,1,0
chr9	5656610	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.565:14:4,3:1,3:5,1,6,2
chr9	5720172	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:12,3:10,10:15,7,11,2
chr9	5732532	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:1,3:8,1:0,9,0,4
chr9	5754988	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,6:5,5:0,6,0,11
chr9	5755022	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:0,2:5,6:0,5,0,8
chr9	5762533	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.402:25:8,5:7,3:12,3,7,3
chr9	5765533	.	TGGAGA	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=163,158;MMQ=60,58;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:22,1:17,0:0|1:5765533_TGGAGA_T:5765533:19,26,0,2
chr9	5765541	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=168,158;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:24,1:16,0:0|1:5765533_TGGAGA_T:5765533:21,25,0,2
chr9	5765544	.	AG	TT	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=169,158;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:24,2:17,0:0|1:5765533_TGGAGA_T:5765533:20,24,0,2
chr9	5765552	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.101:39:14,2:18,0:17,18,0,4
chr9	5770047	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=122,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr9	5801121	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,5,0
chr9	5805001	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,2:6,3:10,0,5,0
chr9	5812167	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,68;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:15,3:25,0:12,28,2,1
chr9	5813077	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr9	5923326	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:0,9,0,5
chr9	5924562	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=184,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr9	5929167	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=201.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,31:0,22:0,0,8,45
chr9	5968052	.	T	TTAGTAG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:17,2:10,0:18,10,1,1
chr9	5969517	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	5988333	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr9	6014460	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:17,1:9,1:15,11,1,1
chr9	6254555	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:5,2:0,1:0,5,0,3
chr9	6255881	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=150,201;MMQ=60,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.293:9:5,1:2,0:0|1:6255881_T_G:6255881:7,0,2,0
chr9	6255885	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=129,201;MMQ=60,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.265:10:6,0:2,0:0|1:6255881_T_G:6255881:8,0,2,0
chr9	6330915	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:6,5:5,5:10,1,10,1
chr9	6422764	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=189,189;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0|1:6422764_TG_CA:6422764:0,1,0,1
chr9	6422768	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=189,189;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6422764_TG_CA:6422764:0,1,0,1
chr9	6422771	.	C	CCCTCACAAATCTCAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6422764_TG_CA:6422764:0,0,0,1
chr9	6475319	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr9	6477522	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=193,177;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:0|1:6477522_A_G:6477522:13,0,2,0
chr9	6477524	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=193,177;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:0|1:6477522_A_G:6477522:13,0,2,0
chr9	6477525	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=218,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,6:2,1:8,0,7,0
chr9	6499821	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.545:18:4,3:4,7:5,3,7,3
chr9	6550734	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,7:3,3:4,0,10,0
chr9	6553276	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:11,0,2,0
chr9	6587054	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr9	6605299	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,1:8,2:2,11,0,3
chr9	6749113	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=196,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:16,3:1,0:0,17,0,3
chr9	6849405	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	6849756	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=207,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6849756_G_T:6849756:0,1,0,1
chr9	6849759	.	CA	GC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=104,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:6849756_G_T:6849756:1,1,0,1
chr9	6849762	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=104,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6849756_G_T:6849756:1,1,0,1
chr9	6849765	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=104,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6849756_G_T:6849756:1,1,0,1
chr9	6849768	.	GA	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=104,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6849756_G_T:6849756:1,1,0,1
chr9	6986291	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	6990351	.	GT	G,GTT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,34,35;MFRL=152,175,142;MMQ=60,60,60;MPOS=9,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.84,6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,8,6:0.160,0.144:45:18,4,6:11,4,0:31,0,14,0
chr9	6990548	.	ATTTT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=142;ECNT=1;MBQ=31,20,19,17;MFRL=141,167,136,119;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,24,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=11.46,32.24,5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,11,30,15:0.139,0.465,0.265:63:2,3,4,4:2,4,11,3:4,3,17,39
chr9	7015793	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,1:5,3:7,0,4,0
chr9	7016001	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr9	7076371	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:7,1,6,2
chr9	7174773	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr9	7798518	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,8:0,0,19,3
chr9	7799363	.	ACCCCGCCT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,16;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCGCCT;STR;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.853:9:0,1:0,2:1,0,8,0
chr9	8317999	.	T	TAGAAAAATAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,63;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGAAAAATAA;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.360:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr9	8319806	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,6:6,8:5,5,7,7
chr9	8331548	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=57,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr9	8331582	.	C	CATTCT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:4,1:0|1:8331582_C_CATTCT:8331582:7,3,2,0
chr9	8331584	.	G	GAACTGTAACTAACTTA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:4,1:0|1:8331582_C_CATTCT:8331582:7,3,2,0
chr9	8338847	.	C	CAGAGAGAGAG,CAGAGAGAGAGAGAGAGAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,183,145;MMQ=60,24,47;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,14,18;RU=AG;STR;TLOD=3.50,7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.384,0.544:3:0,1,1:0,0,1:0,0,3,0
chr9	8341983	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:8341983_G_GGT:8341983:0,3,0,1
chr9	8341984	.	A	AAACAGTCAGGGGTGAGATTACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:8341983_G_GGT:8341983:0,3,0,1
chr9	8375953	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,273;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:10,10,2,0
chr9	8436703	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr9	8486355	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,6:3,1:1,4,2,5
chr9	8636915	.	T	TGCAG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:2,0:1,1:0|1:8636915_T_TGCAG:8636915:0,3,0,1
chr9	8636916	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:8636915_T_TGCAG:8636915:0,3,0,1
chr9	8636922	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:8636915_T_TGCAG:8636915:0,2,0,1
chr9	8636923	.	C	A,CTCT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,28,34;MFRL=188,150,168;MMQ=60,60,60;MPOS=4,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,0:0,0,1:0,1,0,2
chr9	8636925	.	A	ATCTGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:8636915_T_TGCAG:8636915:0,2,0,1
chr9	8636926	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr9	12698363	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=219,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr9	12775861	.	T	TGGCGGC,TGGCGGCGGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=19,14,14;MFRL=191,121,193;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,8,9;RU=GGC;STR;TLOD=5.94,43.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,12:0.165,0.731:15:0,0,2:0,0,3:1,0,4,10
chr9	12775889	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=14,32;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.922:15:0,7:0,6:1,0,2,12
chr9	13109023	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:15,0:11,2:10,16,2,0
chr9	13109111	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	13125130	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr9	13125201	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:4,5:0,4:3,1,8,2
chr9	13126470	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:5,4,4,0
chr9	13136194	.	A	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=116,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,0:10,3:5,12,0,3
chr9	13147720	.	A	AATCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr9	13147723	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	13175715	.	TGAG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=122,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:5,3,4,1
chr9	13192320	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,1,11
chr9	13193320	.	G	GAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.279:5:0,0:0,0:0,4,0,1
chr9	13196194	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=164,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:5,1:7,3:6,7,2,2
chr9	13206106	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:1,4:3,1:0,4,0,5
chr9	13217374	.	A	AAGCTGAGTAAGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=168,171;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:13217374_A_AAGCTGAGTAAGT:13217374:0,2,0,1
chr9	13217376	.	C	CTCACCTATCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=168,171;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:13217374_A_AAGCTGAGTAAGT:13217374:0,2,0,1
chr9	13217379	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=168,171;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:13217374_A_AAGCTGAGTAAGT:13217374:0,2,0,1
chr9	13927980	.	C	A	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=132.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,49:0.462:106:28,24:29,23:34,23,33,16
chr9	13928080	.	TATTC	T	.	.	DP=121;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=211.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,56:0.488:115:25,25:34,31:19,40,13,43
chr9	13944434	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:10,2:5,6:8,7,4,4
chr9	14116416	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=138,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:14116416_A_C:14116416:0,4,0,1
chr9	14116419	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,18;MFRL=71,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:14116416_A_C:14116416:0,2,0,1
chr9	14116421	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=15,18;MFRL=71,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:14116416_A_C:14116416:0,2,0,1
chr9	14120655	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=106.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,10:0,21:0,0,7,24
chr9	14125602	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=140,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:12,5,3,0
chr9	14155769	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=141.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,23:0,17:0,0,34,8
chr9	14306944	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr9	14619168	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,1:0,2:0,3,0,3
chr9	14640055	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr9	14658669	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=219,210;MMQ=30,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:3,0,4,0
chr9	14662171	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,6:0,0,10,3
chr9	14662410	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	14722653	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	14737616	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=112,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:6,3:1,8:2,5,2,9
chr9	14747133	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:1,1,0,5
chr9	14756318	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.661:10:0,4:3,3:2,1,6,1
chr9	14756483	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:1,7,0,7
chr9	14759725	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr9	14770825	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=109,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,2:5,5:1,6,0,7
chr9	14775729	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=211,0;MMQ=40,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.798:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr9	14806848	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,6:3,1:0,5,1,6
chr9	14813072	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=115,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:2,3,0,2
chr9	14813109	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=37,36;MFRL=148,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr9	14841633	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=251,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr9	14842557	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:2,3,2,0
chr9	14846122	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=113.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,16:0,0,8,24
chr9	14851617	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr9	15177829	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=162,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:15177829_T_A:15177829:0,3,0,1
chr9	15177835	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=162,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:15177829_T_A:15177829:0,3,0,1
chr9	15177845	.	A	ACACACACACACACACTCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	15190494	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr9	15192720	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr9	15199813	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=70.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,28:0.376:75:26,17:20,11:22,25,14,14
chr9	15203775	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:3,2,3,2
chr9	15447235	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,0:14,3:15,15,0,3
chr9	15458080	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.697:17:1,2:2,5:1,4,0,12
chr9	15471380	.	T	TTAGCTTTAAAAAAATCATCATCATCATC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr9	15486958	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr9	15588698	.	CTTTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=23,18;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0|1:15588698_CTTTTT_C:15588698:0,0,0,1
chr9	15588711	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=237,132;MMQ=43,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:15588698_CTTTTT_C:15588698:0,2,0,1
chr9	15588713	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=237,132;MMQ=43,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:15588698_CTTTTT_C:15588698:0,2,0,1
chr9	15657319	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,265;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:4,0:1,3:0,6,0,3
chr9	15678995	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=190,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr9	15695418	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,0:0,1:0,0,0,3
chr9	15729855	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:1,1:3,0:0,4,0,2
chr9	15784496	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:6,1,5,1
chr9	16204002	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=120,63;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:7,1:6,7,0,2
chr9	16215728	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:2,6:2,1:5,0,5,2
chr9	16419681	.	A	AGAGGAGTAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	16421374	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:0,8,0,2
chr9	16699287	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:16699287_C_T:16699287:0,0,0,2
chr9	16699292	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:16699287_C_T:16699287:0,0,0,2
chr9	16727698	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr9	16738269	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr9	16738307	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0|1:16738307_A_C:16738307:0,0,8,0
chr9	16738312	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:16738307_A_C:16738307:0,0,8,0
chr9	16738338	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr9	16738556	.	C	CTTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=T;STR;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr9	17135434	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:17135434_G_C:17135434:1,0,0,3
chr9	17135443	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:17135434_G_C:17135434:1,0,0,3
chr9	17235576	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:5,0:13,0,2,0
chr9	17235642	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=50.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.646:29:4,8:6,11:5,5,11,8
chr9	17308968	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=100.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,23,0
chr9	17308977	.	TAC	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,2:9,0:21,0,2,0
chr9	17308995	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:17,2:17,1:33,2,3,0
chr9	17309336	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,0,16
chr9	17330558	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr9	17342517	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,10:0,3:0,0,0,13
chr9	17366568	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=202.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,30:0,27:0,0,51,9
chr9	17395102	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr9	17395108	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	17395110	.	C	CTTAAACAAGCCTTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=162,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr9	17409556	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	17457512	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=81.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,12:0,17:0,0,26,3
chr9	17464402	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,15,1
chr9	17464479	.	C	CT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.197:30:10,1:13,5:21,3,3,3
chr9	17466740	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=107,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:7,12,2,0
chr9	17579190	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:17579190_C_G:17579190:0,0,3,0
chr9	17579198	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:17579190_C_G:17579190:0,0,4,0
chr9	17747173	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,5:3,5:2,10,2,8
chr9	17761379	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr9	18574406	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr9	18657558	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=203,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr9	18684836	.	CTG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:0,6,2,3
chr9	18721748	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr9	18753529	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr9	18776780	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	18817246	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,4,9
chr9	18826261	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.856:18:0,9:1,6:0,2,6,10
chr9	18826500	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr9	18887753	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	18889544	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,4:6,6:6,3,5,5
chr9	18889710	.	A	ACTCACCGAGAAGGGCAGTCTCTCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:2,2,0,1
chr9	18950787	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,7:0,0,13,6
chr9	18950980	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr9	19033006	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	19049596	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.665:7:1,3:1,1:2,0,5,0
chr9	19062942	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=209,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr9	19078116	.	CAA	C,CA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=128,151,195;MMQ=60,60,50;MPOS=12,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.48,6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,3,6:0.104,0.184:35:9,2,1:14,1,5:25,1,9,0
chr9	19080445	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,161;MMQ=60,37;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:8,0:13,0,3,0
chr9	19086979	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=245,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr9	19094439	.	CA	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.178:35:8,4:21,1:0,29,0,6
chr9	19123745	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	19126476	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr9	19295941	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	19296311	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=206,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19296311_G_A:19296311:0,1,0,1
chr9	19296312	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=206,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:19296311_G_A:19296311:0,1,0,1
chr9	19296313	.	A	ATGGATTTGGAGACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=206,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19296311_G_A:19296311:0,1,0,1
chr9	19299209	.	CT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,32,33,26;MFRL=149,148,148,101;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,24,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,17;RU=T;STR;TLOD=10.05,4.24,6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:33,8,4,4:0.157,0.102,0.099:49:16,0,3,0:14,5,1,1:20,13,10,6
chr9	19299362	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:7,7:12,10:1,18,1,16
chr9	19334957	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:4,2:3,3:7,4,5,0
chr9	19336169	.	G	GTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=220,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TA;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr9	19357276	.	C	CTTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=171,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTA;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr9	19362019	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0|1:19362019_G_C:19362019:1,6,0,2
chr9	19362038	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=195,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:19362019_G_C:19362019:1,3,0,1
chr9	19369778	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.424:15:4,3:0,3:9,0,6,0
chr9	19550308	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr9	19619509	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr9	20346393	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.271:13:4,3:2,0:8,2,2,1
chr9	20620575	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr9	20720599	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr9	20740355	.	G	GT	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=90.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,44:0.883:49:0,12:5,26:1,4,8,36
chr9	20765097	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr9	20769987	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr9	20778631	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr9	20781695	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr9	20781979	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr9	20862506	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,5:0|1:20862506_G_A:20862506:0,0,12,1
chr9	20862515	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0|1:20862506_G_A:20862506:0,0,11,2
chr9	20866974	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,9,18
chr9	20882117	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr9	20885240	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=205.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,26:0,34:0,0,24,39
chr9	20916828	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,17:0,8:0,0,21,5
chr9	20923579	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr9	20923618	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr9	20949003	.	T	TATTTCATTAAGCATAATGCCTTCAAGGTTCATCCGTGTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,171;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	20950983	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,43797;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,2:14,0:0|1:20950983_T_C:20950983:20,13,1,1
chr9	20950987	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,43797;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:19,2:15,0:0|1:20950983_T_C:20950983:20,14,1,1
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chr9	21186958	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,134;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=117.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,46:0.465:99:23,18:29,28:37,16,26,20
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chr9	21410117	.	ATTCT	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=155.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,17:0,20:0,0,18,19
chr9	21440416	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,5:2,4:2,3,6,3
chr9	21440994	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,163;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:5,10:3,5:8,0,15,0
chr9	21482238	.	AAAT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,2:7,7:5,9,5,4
chr9	21482351	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=224,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:0,4,1,4
chr9	21815585	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,10;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.320:41:8,0:10,0:2,24,0,15
chr9	21815589	.	T	TAA,TAAA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,31,29;MFRL=144,158,164;MMQ=50,60,60;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,16,17;RU=A;STR;TLOD=9.06,25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,7,16:0.282,0.617:25:1,2,4:1,3,6:0,2,0,23
chr9	21816646	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,3:3,0:7,0,3,0
chr9	21861902	.	GT	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.127:38:13,1:19,1:26,8,2,2
chr9	21967162	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,1:5,1:7,0,1,1
chr9	22451971	.	C	CTCTATAGGGAAGTATGGGGTAACTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=179,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.321:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr9	22452002	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=243,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr9	25678887	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=136,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,1,2
chr9	26919607	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=211,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr9	26928298	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,0:13,2:8,21,1,1
chr9	26962121	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=154,190;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:5,1:0|1:26962121_CA_TG:26962121:2,10,0,2
chr9	26962124	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=158,190;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:4,1:0|1:26962121_CA_TG:26962121:1,10,0,2
chr9	26962170	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr9	26988571	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,6:5,4:12,0,10,0
chr9	26998090	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,6:5,8:6,4,8,6
chr9	26999779	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=176,157;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:26999779_T_C:26999779:0,4,0,1
chr9	26999784	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=176,157;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:26999779_T_C:26999779:0,4,0,1
chr9	26999789	.	TGGC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=176,157;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:26999779_T_C:26999779:0,4,0,1
chr9	27047246	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr9	27060722	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=153,45;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:0,9,0,2
chr9	27168704	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr9	27172838	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr9	27173180	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:7,1,3,1
chr9	27180367	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:2,13,0,2
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chr9	27192670	.	A	ATCCCAAGCTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=85,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:27192669_G_A:27192669:1,1,0,1
chr9	27197256	.	CTA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=204,151;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:27197256_CTA_C:27197256:3,0,1,0
chr9	27197260	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=204,151;MMQ=60,47;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:27197256_CTA_C:27197256:3,0,1,0
chr9	27197267	.	TA	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=204,151;MMQ=60,47;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:27197256_CTA_C:27197256:3,0,1,0
chr9	27197673	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr9	27202726	.	AT	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr9	27203134	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.720:16:1,4:3,7:0,4,1,11
chr9	27209078	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=124,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr9	27217822	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	27217829	.	A	AAAGAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGAT;STR;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	27217851	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	27218726	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=134.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,18:0,23:0,0,27,15
chr9	27229099	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,8:0,0,9,3
chr9	27289832	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr9	27290984	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,12:0,0,16,6
chr9	27291133	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:27291133_G_T:27291133:0,0,0,4
chr9	27291140	.	C	CATTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:27291133_G_T:27291133:0,0,0,4
chr9	27296595	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,17,2
chr9	27455095	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,16,1
chr9	27455135	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:7,13:4,5:9,2,12,6
chr9	27455584	.	CG	GA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:0,7,0,5
chr9	27455585	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr9	27455620	.	AGCC	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:27455620_AGCC_A:27455620:0,4,0,1
chr9	27455626	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=91,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:27455620_AGCC_A:27455620:0,4,0,1
chr9	27525022	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr9	27548414	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:27548414_C_A:27548414:1,1,0,1
chr9	27548417	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:27548414_C_A:27548414:1,1,0,1
chr9	27560144	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,5:2,4:7,0,9,0
chr9	27561465	.	A	ATGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=48.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,4:0,0,11,0
chr9	27562293	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr9	27562352	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr9	27950476	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=144,126;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:21,5:12,0:17,16,5,0
chr9	28889060	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	32405639	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:5,8:6,6:1,10,3,11
chr9	32408731	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	32418237	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.355:37:16,6:8,6:7,17,2,11
chr9	32457499	.	AAC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:32457499_AAC_A:32457499:0,2,0,1
chr9	32457503	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:32457499_AAC_A:32457499:0,2,0,1
chr9	32459450	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:7,6:2,3:2,7,5,5
chr9	32485288	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=84,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr9	32485334	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	32487878	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr9	32488237	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=179,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,1:0,3,0,3
chr9	32491240	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr9	32525969	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	32526146	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,7,14
chr9	32526156	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:6,5:4,7:2,8,4,9
chr9	32526233	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	32567170	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:6,1:9,6,1,1
chr9	32567429	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	32568024	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,6:0,11:0,0,16,1
chr9	32568643	.	CAT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=91.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.967:24:0,10:0,14:0,0,4,20
chr9	32635740	.	CAACG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32635740_CAACG_C:32635740:0,0,0,1
chr9	32635745	.	T	TCTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32635740_CAACG_C:32635740:0,0,0,1
chr9	32973777	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr9	32974372	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr9	32974570	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr9	32986030	.	TAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=10,19;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.222:10:0,0:1,1:0|1:32986030_TAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACA_T:32986030:0,8,0,2
chr9	32986032	.	AAAAAAAAACAAAAAAAAAAAC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=122,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,6:0.599:10:3,3:1,3:1|0:32986030_TAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACA_T:32986030:0,4,0,6
chr9	32988108	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:18,1:9,1:17,11,1,1
chr9	33026638	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:9,3:10,8:5,14,2,9
chr9	33036550	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:7,0,3,0
chr9	33038847	.	A	AAGACCATTAGC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,39;MMQ=58,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:6,6,1,1
chr9	33047210	.	C	CAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,150;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.323:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr9	33047398	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,23:0.615:37:8,9:6,14:6,8,5,18
chr9	33048215	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:17,2:15,0:18,15,2,0
chr9	33056971	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=19,20;MFRL=90,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.484:14:2,2:1,3:2,5,1,6
chr9	33056984	.	GAATTA	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=160,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:7,0:4,2:0|1:33056984_GAATTA_G:33056984:3,10,0,2
chr9	33056993	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=162,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:4,1:0|1:33056984_GAATTA_G:33056984:2,10,0,2
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chr9	33071661	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr9	33113362	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:8,0,3,0
chr9	33167268	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr9	33240165	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr9	33245076	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:3,4:6,13:7,2,11,6
chr9	33255397	.	C	CAAGGACAAGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	33255743	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	33264540	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr9	33265194	.	GA	CC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:8,1:6,1:0|1:33265194_GA_CC:33265194:0,14,3,0
chr9	33265200	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:0|1:33265194_GA_CC:33265194:0,13,3,0
chr9	33265204	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=172,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,1:5,1:0|1:33265194_GA_CC:33265194:0,13,2,0
chr9	33270748	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,7:0,0,4,17
chr9	33280749	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.160:37:20,3:10,3:24,7,5,1
chr9	33290657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,0:2,6:0,2,0,6
chr9	33290708	.	C	CATTAGAGACACCTCAACAGCTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=278,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	33310993	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,4,0
chr9	33344252	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr9	33352826	.	C	CAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	33354937	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.471:30:9,5:6,9:5,11,3,11
chr9	33366564	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=110,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:33366564_T_A:33366564:2,0,1,0
chr9	33366568	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=97,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:33366564_T_A:33366564:3,0,1,0
chr9	33385134	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.538:28:3,6:9,9:4,9,5,10
chr9	33385569	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=21,12;MFRL=193,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,0:2,1,2,0
chr9	33385571	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=14,12;MFRL=141,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:33385571_A_C:33385571:3,1,1,0
chr9	33385572	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=26,32;MFRL=141,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:33385571_A_C:33385571:3,1,1,0
chr9	33385583	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=15,29;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:0,2:1,1,3,0
chr9	33385588	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=30,13;MFRL=94,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:3,0:1,4,3,0
chr9	33385667	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=30,34;MFRL=162,211;MMQ=50,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.230:24:8,3:9,2:0|1:33385667_A_G:33385667:11,8,3,2
chr9	33385690	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=121,204;MMQ=50,44;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:9,2:9,2:0|1:33385667_A_G:33385667:11,9,3,1
chr9	33385698	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=30,27;MFRL=123,211;MMQ=56,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:9,1:10,2:0|1:33385667_A_G:33385667:10,11,3,0
chr9	33385709	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=29,29;MFRL=128,204;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:9,2:0|1:33385667_A_G:33385667:8,12,2,0
chr9	33385712	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=33,29;MFRL=121,204;MMQ=60,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:0|1:33385667_A_G:33385667:8,10,2,0
chr9	33385919	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=186,200;MMQ=49,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0|1:33385919_C_A:33385919:4,2,1,1
chr9	33385929	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=178,200;MMQ=49,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:33385919_C_A:33385919:4,3,1,1
chr9	33385956	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=186,16943692;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:33385956_C_G:33385956:3,1,1,1
chr9	33385964	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=191,16943692;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,1:0|1:33385956_C_G:33385956:5,1,1,1
chr9	33386211	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=143,161;MMQ=60,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,10:0.196:54:19,5:24,5:12,32,4,6
chr9	33386226	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=137,161;MMQ=60,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,12:0.265:47:17,6:18,6:8,27,4,8
chr9	33386243	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=154,168;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.233:41:12,4:19,5:6,26,0,9
chr9	33386284	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=193,183;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.387:24:6,5:8,4:4,11,2,7
chr9	33386395	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr9	33386412	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=165,194;MMQ=47,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,0:4,3:8,5,2,1
chr9	33386940	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=184,186;MMQ=48,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.285:26:9,4:9,2:0|1:33386940_G_A:33386940:17,2,6,1
chr9	33386944	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=183,186;MMQ=48,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:8,5:8,2:0|1:33386940_G_A:33386940:18,2,6,1
chr9	33386947	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=180,186;MMQ=51,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:10,5:10,2:0|1:33386940_G_A:33386940:20,2,6,1
chr9	33386951	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=180,182;MMQ=51,35;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,8:0.281:30:10,5:11,3:0|1:33386940_G_A:33386940:20,2,7,1
chr9	33386989	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=160,174;MMQ=53,45;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:15,2:13,2:22,7,4,0
chr9	33391393	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=139,142;MMQ=23,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:1,2:0|1:33391393_T_A:33391393:2,0,4,0
chr9	33391401	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=134,142;MMQ=23,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0|1:33391393_T_A:33391393:4,0,4,0
chr9	33391417	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=139,137;MMQ=48,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,2:3,1:0|1:33391393_T_A:33391393:7,1,3,0
chr9	33391421	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=137,116;MMQ=46,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.229:11:6,0:2,2:1|0:33391393_T_A:33391393:8,1,2,0
chr9	33442998	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,5:2,5:0,6,0,10
chr9	33447596	.	G	GGTTCTGGTCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=227,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr9	33465928	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,0:5,6:1,4,2,4
chr9	33467983	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr9	33524725	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=11,27;MFRL=201,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.910:13:0,3:0,8:0,1,4,8
chr9	33524775	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr9	33537033	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=175,188;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.097:33:18,0:8,3:1,29,0,3
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chr9	33541316	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,139;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,11:0.170:68:21,6:35,5:1,56,1,10
chr9	33558025	.	T	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,152;MMQ=60,33;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,24:0.312:78:28,10:26,14:45,9,23,1
chr9	33558261	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=182,200;MMQ=52,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:18,1:11,1:0|1:33558261_A_T:33558261:0,30,0,2
chr9	33558263	.	TG	CA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=182,200;MMQ=51,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:18,1:11,1:0|1:33558261_A_T:33558261:0,31,0,2
chr9	33571221	.	ATT	A,AT	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=30,30,31;MFRL=177,148,144;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=65.17,78.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,32,37:0.429,0.544:70:1,12,19:0,18,16:1,0,57,12
chr9	33572391	.	A	T	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,106;MMQ=59,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,8:0.089:91:41,4:41,3:17,66,3,5
chr9	33617691	.	TGGATGTAACACG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=207,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:1,0:2,0,3,0
chr9	33629238	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr9	33629249	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr9	33794789	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=130,137;MMQ=60,31;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:9,2:15,6,2,0
chr9	33794809	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=130,129;MMQ=60,33;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:17,0:11,2:0|1:33794809_G_A:33794809:21,7,3,0
chr9	33794811	.	GG	AT	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=130,129;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:12,0:11,3:0|1:33794809_G_A:33794809:21,7,3,0
chr9	33794840	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=119,129;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.125:46:18,0:23,5:22,19,2,3
chr9	33794877	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=111,129;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.185:41:17,1:17,6:10,24,1,6
chr9	33794890	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=125,116;MMQ=60,43;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:13,1:15,4:6,22,1,4
chr9	33794894	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=125,116;MMQ=60,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.284:33:13,1:11,8:5,19,2,7
chr9	33795613	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=9;MBQ=30,28;MFRL=145,86;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:20,0:13,1:0|1:33795613_C_T:33795613:17,20,1,1
chr9	33795622	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=9;MBQ=31,22;MFRL=147,91;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:23,0:14,1:0|1:33795613_C_T:33795613:14,24,2,1
chr9	33795624	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=147,91;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.092:41:21,1:13,1:0|1:33795613_C_T:33795613:14,24,2,1
chr9	33795638	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=146,132;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,5:0.143:40:17,2:12,3:0|1:33795638_C_T:33795638:11,24,2,3
chr9	33795640	.	ACCC	A	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=145,132;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:14,2:11,3:0|1:33795638_C_T:33795638:11,26,2,3
chr9	33795646	.	C	CAA	.	.	DP=36;ECNT=9;MBQ=33,34;MFRL=148,132;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:17,2:13,3:0|1:33795638_C_T:33795638:8,23,2,3
chr9	33795652	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=9;MBQ=31,35;MFRL=145,137;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:15,2:14,2:7,22,1,3
chr9	33795703	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=185,74;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:3,1:0,10,1,1
chr9	33795739	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=208,132;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr9	33796777	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=8;MBQ=30,36;MFRL=132,186;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,3:0.060:65:27,2:33,1:0|1:33796777_A_G:33796777:29,33,3,0
chr9	33796785	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=132,186;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,3:0.064:60:23,2:30,1:0|1:33796777_A_G:33796777:26,31,3,0
chr9	33796799	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=132,186;MMQ=60,39;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.082:47:21,2:22,1:19,25,3,0
chr9	33796827	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=134,137;MMQ=60,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:20,1:11,3:8,24,1,3
chr9	33796858	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=151,165;MMQ=40,28;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:10,2:6,5:1,15,0,7
chr9	33796889	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=185,162;MMQ=58,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:4,3:4,7:0|1:33796889_A_G:33796889:0,8,0,10
chr9	33796896	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=193,165;MMQ=58,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:3,2:2,7:0|1:33796889_A_G:33796889:0,6,0,9
chr9	33796898	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=193,165;MMQ=58,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:2,1:3,7:0|1:33796889_A_G:33796889:0,6,0,9
chr9	33797861	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=147,205;MMQ=54,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,7:0.206:37:10,3:19,4:0|1:33797861_A_G:33797861:23,7,7,0
chr9	33797869	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=144,205;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,5:0.147:39:14,2:18,3:0|1:33797861_A_G:33797861:25,9,5,0
chr9	33797881	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=147,205;MMQ=60,40;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,6:0.134:50:18,2:23,4:0|1:33797861_A_G:33797861:31,13,6,0
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chr9	33797898	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=139,205;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,5:0.111:52:18,2:25,3:0|1:33797861_A_G:33797861:30,17,5,0
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chr9	33798149	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=31,33;MFRL=221,201;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:33798141_TG_CA:33798141:0,3,0,3
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chr9	33798166	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,33;MFRL=186,201;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:33798141_TG_CA:33798141:0,2,0,3
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chr9	33799185	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=137,142;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,12:0.151:84:36,9:32,3:27,45,10,2
chr9	33799186	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=142,104;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,10:0.126:85:43,3:29,7:0|1:33799181_C_T:33799181:32,43,5,5
chr9	33932688	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr9	33948652	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr9	33960778	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=104,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.315:8:3,1:1,1:3,3,2,0
chr9	33989201	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,152;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.780:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr9	34017015	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:11,3:4,0:16,1,3,0
chr9	34251414	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:13,2:9,0:0|1:34251414_A_G:34251414:13,11,1,1
chr9	34251418	.	A	AAACAGGTAGGTGAGGGATAGAAAT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:0|1:34251414_A_G:34251414:13,10,1,1
chr9	34255267	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	34306539	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=186,198;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr9	34370701	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr9	34381192	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr9	34381516	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=215,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:34381516_AC_A:34381516:0,3,0,1
chr9	34381522	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=215,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:34381516_AC_A:34381516:0,3,0,1
chr9	34381524	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=191,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:34381516_AC_A:34381516:0,4,0,1
chr9	34381526	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=191,111;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:34381516_AC_A:34381516:0,4,0,1
chr9	34381537	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=216,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,1:0,2,0,2
chr9	34382599	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=158,175;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:1,0:3,0,3,0
chr9	34458152	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=21,14;MFRL=242,139;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:34458152_TC_AA:34458152:1,0,1,0
chr9	34458158	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,13;MFRL=242,139;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:34458152_TC_AA:34458152:1,0,1,0
chr9	34458167	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,14;MFRL=199,139;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:34458152_TC_AA:34458152:2,0,1,0
chr9	34458170	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,13;MFRL=199,139;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:34458152_TC_AA:34458152:2,0,1,0
chr9	34458174	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,14;MFRL=215,139;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:34458152_TC_AA:34458152:2,1,1,0
chr9	34458180	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,13;MFRL=215,139;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:34458152_TC_AA:34458152:2,1,1,0
chr9	34458185	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,12;MFRL=215,139;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:34458152_TC_AA:34458152:2,1,1,0
chr9	34458188	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=186,139;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:34458152_TC_AA:34458152:3,1,1,0
chr9	34491522	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.126:26:12,2:10,0:14,9,2,1
chr9	34521867	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=86.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,10:0,0,13,12
chr9	34551920	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr9	34552332	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34552332_G_A:34552332:1,0,0,1
chr9	34552335	.	ACA	CTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:34552332_G_A:34552332:1,0,0,1
chr9	34557899	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=124,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.244:18:7,0:6,1:0|1:34557899_T_G:34557899:12,2,0,4
chr9	34557905	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=138,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.251:18:7,0:5,1:0|1:34557899_T_G:34557899:13,1,0,4
chr9	34557908	.	G	GCC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.209:19:6,1:6,0:0|1:34557899_T_G:34557899:11,4,0,4
chr9	34568989	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:34568989_G_T:34568989:0,2,0,2
chr9	34569010	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:34568989_G_T:34568989:0,0,0,2
chr9	34622364	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:10,4:3,4:7,6,5,3
chr9	34622389	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,9:0,10:0,0,13,7
chr9	34623338	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr9	34635598	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	34648418	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,5:5,6:3,7,5,6
chr9	34650556	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	34660202	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=99,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr9	34660948	.	CAGA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=60.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:4,5:3,9:3,4,3,12
chr9	34661980	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.366:30:12,3:6,6:12,7,4,7
chr9	34662540	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:3,2,4,0
chr9	34725112	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=174,121;MMQ=33,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.298:20:4,2:10,2:5,9,2,4
chr9	34725196	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=191,196;MMQ=34,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr9	34726155	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,11,8
chr9	34726182	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,57;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,23:0,14:0,0,21,16
chr9	34726187	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=134,112;MMQ=57,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:21,3:14,0:18,17,3,0
chr9	34726821	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.586:22:3,3:5,9:4,5,7,6
chr9	34727001	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=204,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,1:1,3:1,1,0,4
chr9	34727016	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=204,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr9	34728065	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:5,3,1,5
chr9	34729392	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,154;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.547:22:3,8:6,4:6,4,4,8
chr9	34729434	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=154,146;MMQ=57,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,6:5,1:1,5,2,5
chr9	34729452	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr9	34971604	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:6,7,0,2
chr9	34971727	.	A	ATCAAGGAGCTGGCTCTGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	35042785	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=536,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr9	35059875	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:0,9,1,1
chr9	35060302	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=127,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,5:5,2:8,4,6,1
chr9	35060746	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,3:2,3:3,1,6,0
chr9	35060955	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr9	35061693	.	G	GACAGTACACAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAGTACACAA;STR;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:3,7:0,5:1,2,3,12
chr9	35062972	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.564:19:5,4:3,5:7,1,5,6
chr9	35066579	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,3:1,4:3,0,8,0
chr9	35068201	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr9	35074978	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:8,1:9,10,2,0
chr9	35077203	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.444:23:2,5:9,5:9,4,7,3
chr9	35077441	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,4:3,0:1,6,0,4
chr9	35079361	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=172,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.640:17:1,4:4,7:5,1,10,1
chr9	35089048	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr9	35100002	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=52.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,9:0,6:0,0,13,2
chr9	35100569	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,1:3,3:8,2,4,0
chr9	35101383	.	GCA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:7,7:5,4:8,6,7,4
chr9	35101870	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:5,10:9,7:9,5,10,7
chr9	35102213	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,66;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,2:15,0:8,22,0,2
chr9	35107316	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=193,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=24,18;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr9	35107858	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,10,5
chr9	35295984	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr9	35375069	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,0:3,4:6,0,4,0
chr9	35377772	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,3:2,4:1,9,0,7
chr9	35381504	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr9	35400272	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,9:3,1:2,2,7,3
chr9	35556506	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35556506_C_T:35556506:0,2,0,1
chr9	35556508	.	A	AACCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35556506_C_T:35556506:0,2,0,1
chr9	35556511	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:35556506_C_T:35556506:0,2,0,1
chr9	35556526	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	35557804	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=209,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr9	35560174	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35560174_GC_G:35560174:0,0,0,1
chr9	35560177	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35560174_GC_G:35560174:0,0,0,1
chr9	35563361	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=126,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:1,5:4,7:2,3,3,9
chr9	35606884	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:0|1:35606884_G_A:35606884:4,5,3,4
chr9	35606893	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,2:0.131:21:7,0:8,2:1|0:35606884_G_A:35606884:7,12,1,1
chr9	35608805	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr9	35609578	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr9	35610523	.	CCCCTGCTCTGAGT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTGCTCTGAGT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr9	35612978	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:0,10,2,7
chr9	35616583	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.497:34:5,10:11,5:10,7,13,4
chr9	35650458	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=137.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,19:0,20:0,0,18,21
chr9	35676450	.	C	CTCACTAACCACCCACCCCCAACGCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	35682764	.	A	AG	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=113,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.425:43:15,7:10,11:17,8,10,8
chr9	35683308	.	G	C,GCTGTGTTTTTGTTTTGTTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23,34;MFRL=150,208,115;MMQ=60,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:1,1,1:3,0,0:0,4,0,2
chr9	35700150	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	35705526	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr9	35706712	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=90,120;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,0:1,1,4,0
chr9	35711593	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=124,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,0:7,3:9,5,0,3
chr9	35711806	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr9	35713181	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,13:0,0,13,8
chr9	35724429	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,3,0
chr9	35741619	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,38;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,2:5,0:13,5,1,1
chr9	35744579	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:15,7,1,1
chr9	35801923	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:12,0:9,2:16,5,1,1
chr9	35808149	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,3:15,0:20,9,3,0
chr9	35808334	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,0,13
chr9	35809328	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr9	35810699	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=133,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.131:32:9,0:11,0:16,12,0,4
chr9	35819837	.	A	ACATACTTCTCTCTCATACTTCCCAAGACAT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=186,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:2,1:3,3:0|1:35819837_A_ACATACTTCTCTCTCATACTTCCCAAGACAT:35819837:5,2,7,3
chr9	35819838	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=186,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,10:0.579:17:3,1:3,8:0|1:35819837_A_ACATACTTCTCTCTCATACTTCCCAAGACAT:35819837:5,2,7,3
chr9	35825413	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	35825541	.	TTTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTC;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:12,0,2,0
chr9	35826026	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,2:13,0:11,14,0,2
chr9	35845929	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr9	35846105	.	G	GTTCAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=212,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:1,0:0|1:35846105_G_GTTCAT:35846105:0,2,0,1
chr9	35846107	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=212,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:35846105_G_GTTCAT:35846105:0,2,0,1
chr9	35846109	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=212,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:35846105_G_GTTCAT:35846105:0,2,0,1
chr9	35847236	.	GTTCCACACT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=240,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35847236_GTTCCACACT_G:35847236:0,1,0,1
chr9	35847254	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=240,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35847236_GTTCCACACT_G:35847236:0,1,0,1
chr9	35870001	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr9	35906562	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=181,153;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:35906562_C_T:35906562:0,2,0,1
chr9	35906565	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=181,153;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:35906562_C_T:35906562:0,2,0,1
chr9	35906569	.	CACCCCT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=188,153;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:35906562_C_T:35906562:0,3,0,1
chr9	35906589	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=189,153;MMQ=60,47;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:35906562_C_T:35906562:0,2,0,1
chr9	35957354	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=131,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:11,2:23,0:18,17,1,1
chr9	36058802	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:0,1:6,1:7,0,2,0
chr9	36063688	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr9	36063743	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr9	36087596	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=195,168;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr9	36100570	.	AGC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:0,0:0|1:36100570_AGC_A:36100570:0,2,0,1
chr9	36100574	.	T	TTTATCAGTGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:36100570_AGC_A:36100570:0,2,0,1
chr9	36105264	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:9,6:12,16:11,10,9,13
chr9	36109947	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:6,8:5,7:5,6,8,7
chr9	36110137	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=177,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr9	36169494	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:7,1,5,0
chr9	36204077	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.101:28:16,0:8,2:20,6,1,1
chr9	36218377	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=218,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr9	36223296	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:9,0,4,0
chr9	36233983	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,75;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:12,1:19,4:21,11,1,4
chr9	36276857	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,11:0,0,11,4
chr9	36599322	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,228;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:36599322_G_A:36599322:0,0,2,0
chr9	36599324	.	A	AAATT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=160,228;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:36599322_G_A:36599322:2,0,2,0
chr9	36599326	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=145,228;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0|1:36599322_G_A:36599322:3,0,2,0
chr9	36599330	.	ATC	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,10;MFRL=156,228;MMQ=60,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,0:0|1:36599322_G_A:36599322:4,0,2,0
chr9	36643131	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.453:31:9,5:7,8:1,16,1,13
chr9	36669228	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	37304168	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=119,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,7:1,2:2,0,8,3
chr9	37305481	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=53.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr9	37305551	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=141,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:11,1:9,1:12,9,2,0
chr9	37327735	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=127,66;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:16,0:15,9,2,0
chr9	37426524	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=93.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,8:0,19:0,0,19,9
chr9	37429661	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	37436632	.	CCT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr9	37486603	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.464:48:10,14:14,8:14,12,12,10
chr9	37487751	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=268,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr9	37489298	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:3,5:5,3:4,5,4,4
chr9	37492679	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:11,5:4,6:5,10,6,5
chr9	37493588	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,4,0
chr9	37498295	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr9	37500895	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:8,4:6,2:1,13,2,4
chr9	37501918	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	37503087	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.459:35:16,10:3,6:11,8,7,9
chr9	37503124	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,21:0,9:0,0,15,17
chr9	37503277	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37503277_G_T:37503277:0,0,0,1
chr9	37503281	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37503277_G_T:37503277:0,0,0,1
chr9	37503283	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37503277_G_T:37503277:0,0,0,1
chr9	37503285	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37503277_G_T:37503277:0,0,0,1
chr9	37512734	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:2,7:7,2:0,10,0,9
chr9	37512808	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	37515877	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=104,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.410:25:7,4:7,6:7,8,7,3
chr9	37537557	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=288,115;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,3,5
chr9	37538005	.	C	CCCAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=272,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37538005_C_CCCAAAA:37538005:0,1,0,1
chr9	37538007	.	TT	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=272,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37538005_C_CCCAAAA:37538005:0,1,0,1
chr9	37707392	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr9	37708572	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	37724343	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	37731007	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.658:36:7,7:5,17:10,2,14,10
chr9	37737283	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	37762006	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,1:15,2:13,14,2,1
chr9	37769851	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,121;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:9,1,2,0
chr9	37769865	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=161,156;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:4,2:6,2:10,1,4,0
chr9	37770067	.	T	TGTTTAGGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	37770069	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.699:1:0,1:0,0:0|1:37770069_AT_A:37770069:0,0,0,1
chr9	37770073	.	CCTG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=187,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:37770069_AT_A:37770069:0,2,0,1
chr9	37770078	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=187,155;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:37770069_AT_A:37770069:0,2,0,1
chr9	37770126	.	A	AACTATTCCACCCTTCAGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	37777801	.	AC	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=241,181;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr9	37781891	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,12,0
chr9	37801000	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37801000_A_C:37801000:0,0,1,0
chr9	37801002	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,19;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37801000_A_C:37801000:0,0,1,0
chr9	37801007	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,10;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37801000_A_C:37801000:0,0,1,0
chr9	37801010	.	A	ACC	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,14;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37801000_A_C:37801000:0,0,1,0
chr9	37801014	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37801000_A_C:37801000:0,0,1,0
chr9	37801018	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,12;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37801000_A_C:37801000:0,0,1,0
chr9	37801019	.	AAG	A	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37801000_A_C:37801000:0,0,1,0
chr9	37801025	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37801000_A_C:37801000:0,0,1,0
chr9	37801027	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,12;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37801000_A_C:37801000:0,0,1,0
chr9	37801030	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,12;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37801000_A_C:37801000:0,0,1,0
chr9	37801444	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	37801485	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	37855003	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr9	37855038	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr9	37860258	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr9	37955780	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,174;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:2,2:6,0:9,0,2,0
chr9	38068617	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38068617_A_G:38068617:0,0,0,1
chr9	38068620	.	T	TGCACTGGCGCAATCTCGGCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38068617_A_G:38068617:0,0,0,1
chr9	38398311	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=240,236;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.535:4:1,0:1,1:0,2,0,2
chr9	38398405	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=249,178;MMQ=50,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38398405_A_G:38398405:0,1,0,1
chr9	38398407	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=249,178;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38398405_A_G:38398405:0,1,0,1
chr9	38398409	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=249,178;MMQ=50,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38398405_A_G:38398405:0,1,0,1
chr9	38398414	.	CG	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=249,178;MMQ=50,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38398405_A_G:38398405:0,1,0,1
chr9	38398424	.	GT	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=249,178;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38398405_A_G:38398405:0,1,0,1
chr9	38413432	.	C	CTTCACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=166,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	38413440	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=166,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38413440_T_TC:38413440:0,1,0,1
chr9	38413443	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=166,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38413440_T_TC:38413440:0,1,0,1
chr9	38528727	.	T	TGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38528727_T_TGA:38528727:0,0,0,1
chr9	38528730	.	ATTACTAT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38528727_T_TGA:38528727:0,0,0,1
chr9	38571976	.	T	TTAAA	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=125,140;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,19:0.281:69:25,12:23,7:31,19,16,3
chr9	38575796	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=210,162;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr9	38576999	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,174;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,24:0.438:55:14,15:17,9:31,0,23,1
chr9	38586126	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=165,159;MMQ=45,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:0|1:38586126_C_A:38586126:16,1,2,0
chr9	38586128	.	CT	TC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=171,159;MMQ=49,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:6,0:0|1:38586126_C_A:38586126:17,1,2,0
chr9	38586130	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=153,195;MMQ=56,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,5:5,2:11,1,7,0
chr9	38586131	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=165,159;MMQ=52,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:10,2:7,0:0|1:38586126_C_A:38586126:16,1,2,0
chr9	38603066	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=155,203;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:12,3:6,4:17,1,6,1
chr9	38603131	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=128,146;MMQ=60,37;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,9:0.159:61:33,3:19,6:0|1:38603131_G_A:38603131:29,23,9,0
chr9	38603140	.	A	AT	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=135,144;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,11:0.162:72:37,4:23,6:0|1:38603131_G_A:38603131:32,29,9,2
chr9	38607306	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=186,173;MMQ=33,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.312:19:2,2:10,3:13,0,6,0
chr9	38607333	.	TG	CA,CG	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=29,33,33;MFRL=171,169,186;MMQ=33,27,37;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.52,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,2,2:0.081,0.088:31:12,2,2:15,0,0:26,1,4,0
chr9	38607343	.	CA	TG	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=168,179;MMQ=33,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:18,2:17,0:36,1,2,0
chr9	38615779	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=156,162;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:7,10:7,5:5,9,5,11
chr9	38620024	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:2,3:0,3:3,0,6,0
chr9	38620366	.	TCCGCGATCTCCCCCGCAAC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.542:6:3,0:0,1:0,3,1,2
chr9	39102608	.	C	CACAAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	39118196	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,31;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=239.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,55:0.982:55:0,23:0,28:0|1:39118196_C_A:39118196:0,0,52,3
chr9	39118205	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,31;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=250.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,57:0.983:57:0,25:0,27:0|1:39118196_C_A:39118196:0,0,54,3
chr9	39118207	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,31;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=243.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,55:0.982:55:0,27:0,27:0|1:39118196_C_A:39118196:0,0,52,3
chr9	41323457	.	C	CAGTACCTGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,236;MMQ=60,22;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	43625373	.	T	TCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=191,215;MMQ=22,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:2,7,0,2
chr9	43625382	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,22;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr9	43627428	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	43685388	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=226,165;MMQ=27,40;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43685388_A_AGG:43685388:0,1,0,1
chr9	43685390	.	C	CAGGGACTTGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=37,35;MFRL=226,165;MMQ=27,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43685388_A_AGG:43685388:0,1,0,1
chr9	43849658	.	GC	CT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,14:0.268:54:18,9:20,5:40,0,14,0
chr9	43849874	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,174;MMQ=24,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:12,6:6,3:14,4,7,2
chr9	43853660	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=237,223;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:0,3,1,6
chr9	45727848	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,191;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr9	45728080	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,247;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:45728080_C_T:45728080:2,7,0,2
chr9	45728087	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=173,182;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,6:0.500:12:2,4:4,2:1|0:45728080_C_T:45728080:2,4,1,5
chr9	45733509	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,35;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,6:0,5:0,0,3,11
chr9	45733681	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=107,130;MMQ=23,23;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,36:0.619:58:10,25:11,10:20,2,35,1
chr9	45733796	.	T	G	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=201,137;MMQ=27,23;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=185.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,65:0.958:67:2,29:0,34:0,2,18,47
chr9	45733805	.	GCA	G	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=143,141;MMQ=23,23;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CA;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.075:49:19,2:25,1:6,40,0,3
chr9	46386956	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,29;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr9	46386994	.	CC	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,23;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr9	46387008	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,23;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr9	65505690	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=98,166;MMQ=22,22;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	66553428	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,31;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr9	66553642	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=156,190;MMQ=25,23;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:66553642_G_T:66553642:2,3,1,1
chr9	66553649	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=156,190;MMQ=25,23;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:66553642_G_T:66553642:2,3,1,1
chr9	66553663	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=156,190;MMQ=25,23;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:2,0:2,2:2,3,1,1
chr9	67938651	.	G	C	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=134,135;MMQ=23,22;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:25,1:37,2:30,35,3,0
chr9	67938655	.	TC	CG	.	.	DP=72;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=137,121;MMQ=24,22;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,8:0.123:71:24,3:36,5:28,35,6,2
chr9	67938664	.	A	T,G	.	.	DP=76;ECNT=5;MBQ=29,25,32;MFRL=138,135,113;MMQ=24,22,22;MPOS=5,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.27,13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:68,3,5:0.051,0.076:76:22,1,2:41,1,3:24,44,6,2
chr9	67938672	.	TT	GA	.	.	DP=73;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=141,113;MMQ=24,22;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,4:0.067:72:24,1:38,3:0|1:67938672_TT_GA:67938672:20,48,2,2
chr9	67938686	.	C	A	.	.	DP=63;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=141,113;MMQ=24,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,3:0.062:63:23,1:37,2:0|1:67938672_TT_GA:67938672:14,46,1,2
chr9	67968458	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=142,126;MMQ=23,23;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,9:0.190:49:21,2:17,6:0,40,0,9
chr9	67968476	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=146,156;MMQ=23,23;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,10:5,5:0,10,0,15
chr9	69256741	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr9	69403041	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,198;MMQ=24,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,11:0.141:80:35,6:34,4:62,7,11,0
chr9	69423641	.	T	G	.	.	DP=120;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=145,115;MMQ=23,22;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,32:0.272:118:37,13:48,18:33,53,14,18
chr9	69423721	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=163,193;MMQ=23,23;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.256:33:13,5:12,3:3,22,0,8
chr9	69423755	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=197,219;MMQ=23,31;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,2:10,2:1,19,0,4
chr9	69423792	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=196,231;MMQ=24,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:7,1:0,14,0,2
chr9	70862644	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=321,261;MMQ=25,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70862644_G_A:70862644:0,1,0,1
chr9	70862645	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=321,261;MMQ=25,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70862644_G_A:70862644:0,1,0,1
chr9	70919325	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=146,153;MMQ=27,22;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:10,2:10,3:18,3,5,0
chr9	70919357	.	T	TGTTC	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=146,159;MMQ=25,22;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTTC;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.168:27:10,2:13,2:3,20,0,4
chr9	70919375	.	TAGAA	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=151,154;MMQ=25,22;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAA;STR;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:8,3:11,3:0,19,0,6
chr9	70919413	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=156,154;MMQ=25,22;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.283:19:5,2:9,3:0,14,0,5
chr9	71081138	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:7,3:7,7:5,9,1,10
chr9	71081186	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.638:9:2,1:0,4:0|1:71081186_GT_G:71081186:0,3,1,5
chr9	71081188	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:0|1:71081186_GT_G:71081186:0,3,1,5
chr9	71114312	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:3,3,0,3
chr9	71396620	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:3,2,3,2
chr9	71398925	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:16,0:5,4:9,15,0,4
chr9	71532435	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=184,36;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:6,4,1,1
chr9	71534678	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,3:7,8:5,7,0,11
chr9	71538356	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=107,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr9	71555492	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,12:0,5:0,0,17,0
chr9	71555522	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=81.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,18:0,6:0,0,21,4
chr9	71668197	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,5:0,10:0,0,4,12
chr9	71687755	.	TTTG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=195,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTG;STR;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:1,3,0,3
chr9	71831398	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=59.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,2,15
chr9	71840288	.	GA	TC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,37;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:10,6,1,1
chr9	71849286	.	T	TTTTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,140;MMQ=53,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTTC;STR;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr9	71849509	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,33;MFRL=103,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:71849509_G_T:71849509:2,1,0,1
chr9	71849511	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=103,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:71849509_G_T:71849509:2,1,0,1
chr9	71849513	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:71849509_G_T:71849509:2,2,0,1
chr9	71849514	.	A	ACTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:71849509_G_T:71849509:2,2,0,1
chr9	71852760	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,2:4,2:6,5,4,0
chr9	71854769	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr9	71855122	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,331;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	71866356	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	71867861	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.596:33:5,11:8,7:2,11,5,15
chr9	71986315	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr9	72000674	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	72000704	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,38;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr9	72002911	.	T	TGTTATA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=130.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,13:0,0,11,19
chr9	72047635	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	72064749	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr9	72131861	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	72338180	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,9,3
chr9	72374677	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,17:0,9:0,0,27,0
chr9	72374702	.	T	TGGACGCTTG	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGACGCTTG;STR;TLOD=61.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.499:34:11,10:5,5:17,0,17,0
chr9	72374941	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:1,4:5,7:0,7,0,11
chr9	72435894	.	GA	CC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=106,32;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:0|1:72435894_GA_CC:72435894:6,7,1,1
chr9	72435899	.	T	TTCCTAGTGTA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,32;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:3,0:8,2:0|1:72435894_GA_CC:72435894:6,6,1,1
chr9	72459567	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:1,3,1,4
chr9	72459640	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=221,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr9	72501698	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr9	72723062	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=80,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,2,0
chr9	72755257	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=124,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:0|1:72755257_T_TC:72755257:2,5,1,1
chr9	72755260	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=124,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,1:4,0:0|1:72755257_T_TC:72755257:2,5,1,1
chr9	72783608	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=109,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,2:7,7:6,3,7,2
chr9	72901092	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.517:48:13,11:9,13:1,22,16,9
chr9	72901096	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=171.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,26:0,26:0,0,18,35
chr9	72929768	.	AC	GT	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=133.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,35:0.450:78:20,13:21,22:12,31,10,25
chr9	72930515	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	72933774	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,136;MMQ=52,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,40:0.515:77:17,19:20,18:16,21,25,15
chr9	72933958	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr9	72939125	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.347:47:14,8:16,8:0,31,0,16
chr9	72965438	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr9	72967057	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:14,0,2,0
chr9	73002648	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr9	73164611	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr9	73213610	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	73213644	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,452;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	73234066	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	73235337	.	G	GTATTGATCC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:73235337_G_GTATTGATCC:73235337:1,11,0,2
chr9	73235339	.	A	AGAGCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:8,0:0|1:73235337_G_GTATTGATCC:73235337:1,11,0,2
chr9	73240312	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=67.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,14,4
chr9	73240335	.	TA	T,TAA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,28,28;MFRL=145,135,171;MMQ=60,60,60;MPOS=14,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=10.48,4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,6,3:0.210,0.138:26:9,2,1:8,4,2:14,3,9,0
chr9	73250248	.	T	TTTTTAGGTAAGGGGCTGTGTGGCTGTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0,5,1,1
chr9	73254184	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=151,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr9	73296400	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,16,6
chr9	73391409	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:5,4:3,2:4,4,1,5
chr9	73399229	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=120,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:4,0:4,2:2,6,1,1
chr9	73442724	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,2:3,3:8,3,3,2
chr9	73457832	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,4:1,3:6,0,7,0
chr9	73457861	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.359:21:8,2:4,5:13,1,6,1
chr9	73458045	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.614:6:1,0:1,3:0,2,0,4
chr9	73461558	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.348:12:2,1:5,2:0,8,1,3
chr9	73461592	.	A	ACCTCAGTTTTAAAATCCATAAAATGGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,0,1
chr9	73477853	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=139,94;MMQ=60,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:20,0:17,3:18,19,2,1
chr9	73479441	.	C	CAAAAAAAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,19;MFRL=158,139;MMQ=55,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=16,25;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.792:9:1,1:0,1:1,1,1,6
chr9	74300640	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,2:6,3:6,4,3,2
chr9	74305233	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=120,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:1,2,0,3
chr9	74326961	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,2,2
chr9	74331376	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.659:36:7,10:5,14:9,3,21,3
chr9	74349917	.	CAA	C,CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34,31;MFRL=0,123,164;MMQ=60,60,60;MPOS=16,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.77,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.300,0.299:7:3,1,1:0,1,1:1,2,0,4
chr9	74355185	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	74365373	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=174,199;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:74365373_A_T:74365373:0,4,0,1
chr9	74365379	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=184,199;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:74365373_A_T:74365373:0,3,0,1
chr9	74365385	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=184,199;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:74365373_A_T:74365373:0,3,0,1
chr9	74365388	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=184,199;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:74365373_A_T:74365373:0,3,0,1
chr9	74477617	.	TAAGA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,7:0,4:0,0,0,12
chr9	74533581	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74533581_T_C:74533581:0,0,0,1
chr9	74533583	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74533581_T_C:74533581:0,0,0,1
chr9	74561883	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr9	74586627	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	74587797	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,4:0.072:67:41,3:22,1:11,52,1,3
chr9	74671719	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,58;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,11,10
chr9	74671756	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=145,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:8,6:3,5:6,5,6,5
chr9	74671828	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=15,21;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:0,1:0,1,0,3
chr9	74675343	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr9	74828986	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:74828986_A_AT:74828986:0,4,0,1
chr9	74828988	.	A	ATCTTACCATAAAAGCTAAACTGAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:74828986_A_AT:74828986:0,4,0,1
chr9	74840617	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.068:71:28,2:39,2:36,31,3,1
chr9	74845989	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,4:1,5:4,1,8,1
chr9	74975492	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=148,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:7,1,2,0
chr9	74975711	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,14:0,0,7,16
chr9	75303784	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:75303784_A_G:75303784:0,0,0,1
chr9	75303786	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:75303784_A_G:75303784:0,0,0,1
chr9	75357542	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:75357542_A_G:75357542:0,4,0,2
chr9	75357543	.	GAAACAAAC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=AAAC;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:75357542_A_G:75357542:0,4,0,2
chr9	75366672	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=171,320;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr9	75420448	.	CT	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=110,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:4,2:12,3:1,19,0,7
chr9	75445654	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=20,20,17;MFRL=148,153,151;MMQ=60,60,60;MPOS=15,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.54,7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,5,6:0.201,0.258:26:4,3,1:3,0,1:0,15,0,11
chr9	75521060	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,0,16
chr9	75539077	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr9	75541942	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,15:0,5:0,0,19,1
chr9	75543974	.	T	TAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr9	75544038	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	75554982	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	75782510	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,11:0,12:0,0,5,19
chr9	75783937	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=115.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,14:0,16:0,0,21,10
chr9	77245130	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr9	77245162	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,11,1
chr9	77257805	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=191,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:77257805_G_C:77257805:0,2,0,1
chr9	77257811	.	T	TATTATAATTAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=191,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:77257805_G_C:77257805:0,2,0,1
chr9	77277611	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	77280346	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:8,0,4,0
chr9	77286876	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,3:2,6:1,3,1,8
chr9	77390808	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,1:8,1:15,3,2,0
chr9	77400718	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=206,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr9	77407736	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,2,5
chr9	77442616	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=97,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,5:9,5:9,7,8,2
chr9	77457028	.	GA	G,GAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27,19;MFRL=174,145,195;MMQ=60,60,60;MPOS=14,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=5.41,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,2:0.302,0.185:13:4,3,0:3,1,1:7,0,6,0
chr9	77563175	.	GTTT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=T;STR;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:0,5,0,6
chr9	77642980	.	TCTC	T	.	.	DP=175;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTC;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:123,3:0.030:126:70,1:48,2:62,61,3,0
chr9	77693316	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:1,3,1,4
chr9	77742467	.	CT	C,CTT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=140,158,289;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.47,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,3,2:0.096,0.075:36:14,0,1:17,3,1:29,2,5,0
chr9	77745424	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,3:6,2:6,1,4,1
chr9	77746804	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.646:15:0,6:5,4:1,4,3,7
chr9	77748151	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,2:9,2:14,0,4,0
chr9	78710871	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=151,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:14,0:0|1:78710871_C_T:78710871:13,9,0,2
chr9	78710879	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=148,83;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,0:15,0:0|1:78710871_C_T:78710871:17,11,0,2
chr9	78710884	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=148,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,1:16,0:0|1:78710871_C_T:78710871:17,11,0,2
chr9	78710889	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,19;MFRL=143,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,0:17,0:0|1:78710871_C_T:78710871:17,13,0,2
chr9	78711053	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr9	78711104	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.691:1:0,0:0,1:0|1:78711104_T_TAC:78711104:0,0,0,1
chr9	78711106	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,37;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.691:1:0,0:0,1:0|1:78711104_T_TAC:78711104:0,0,0,1
chr9	78790202	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	78790226	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	78799566	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	78803466	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=102.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,20,8
chr9	78804206	.	G	GAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAT;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	78808320	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:78808320_T_TTC:78808320:0,2,0,1
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chr9	78942887	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:5,0,5,1
chr9	78953405	.	T	TCTATCGCAAGACAGGCAGTCTGTGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	78969071	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=111,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:14,3:18,0:16,16,1,2
chr9	79003381	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:79003381_C_A:79003381:3,0,1,0
chr9	79003389	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:79003381_C_A:79003381:3,0,1,0
chr9	79003413	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr9	79003440	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=63.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,16,3
chr9	79118928	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.508:24:5,3:5,9:1,11,3,9
chr9	79119515	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=175,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,0:1,1:0|1:79119515_G_T:79119515:1,1,0,1
chr9	79119517	.	GAGAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=197,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:79119515_G_T:79119515:2,1,0,1
chr9	79119829	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.344:21:6,5:7,2:11,3,5,2
chr9	79120552	.	C	CAGT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGT;STR;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.481:27:6,3:6,8:10,4,9,4
chr9	79121300	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=241,243;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:1,1,0,2
chr9	79122346	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr9	79240050	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr9	79244027	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=210,129;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:79244027_A_G:79244027:2,0,1,0
chr9	79244036	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=162,129;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:79244027_A_G:79244027:4,0,1,0
chr9	79244055	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=149,65;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:7,0,1,1
chr9	79256917	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.758:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	79259592	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr9	79259850	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr9	79306919	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=107,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:4,4:9,5:9,4,6,3
chr9	79318367	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,5:4,8:6,4,8,5
chr9	79318375	.	GGTGACAGCCTGCAAC	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=97.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,12:0,10:0,0,14,8
chr9	79319050	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	79321871	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,6:0,16:0,0,17,5
chr9	79324044	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,0:16,3:9,20,0,3
chr9	79324135	.	A	ATGACTGTTGCAG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACTGTTGCAG;STR;TLOD=56.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.942:13:0,6:0,6:0,0,6,7
chr9	79324179	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,16:0,0,12,12
chr9	79635253	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	79814799	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,10:0,0,17,0
chr9	79820141	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,16,1
chr9	79820202	.	CT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,32,32;MFRL=146,142,141;MMQ=60,60,60;MPOS=13,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.88,4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,4,4:0.123,0.133:34:14,3,0:12,1,4:26,0,7,1
chr9	79827991	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,0:9,5:1,18,0,5
chr9	79829146	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr9	79835177	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,13,3
chr9	79835312	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,16;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.375:11:1,1:3,0:2,5,1,3
chr9	79841313	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,94;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:12,0,3,0
chr9	79852887	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,6:0,0,17,0
chr9	79865187	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:0,1,1,9
chr9	79891237	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr9	79897218	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.342:12:6,2:1,2:0,8,0,4
chr9	79910407	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:79910407_A_G:79910407:0,0,2,0
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chr9	79954405	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr9	79954410	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=95,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.801:11:0,7:0,2:2,0,9,0
chr9	79954425	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=0,139;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:4,2:6,0:4,7,4,0
chr9	79955305	.	A	AT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=82.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,31:0.917:33:2,16:0,14:2,0,21,10
chr9	79959015	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,20,0
chr9	79968293	.	GT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.262:23:5,3:11,3:15,2,6,0
chr9	79974399	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr9	79983083	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr9	79999547	.	GTGA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TGA;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr9	80022415	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=159.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,18:0,27:0,0,36,10
chr9	80343587	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,3:0,1:1,6,0,4
chr9	80409345	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,6:6,3:9,0,8,1
chr9	80863088	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=194,242;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr9	80919955	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=212,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr9	80921446	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,3:6,4:0,10,1,6
chr9	80923551	.	C	CTGTACATTTAATGTCCATAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	80932515	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr9	80932574	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=110,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:9,3:9,7:13,5,6,4
chr9	80932789	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:0,1:0,4,0,2
chr9	82267732	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr9	82320887	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=164.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,26:0,22:0,0,18,31
chr9	82321646	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,6:7,4:7,2,9,1
chr9	82323588	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:10,1:3,1:3,10,0,2
chr9	82333754	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,129;MMQ=52,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:14,2:4,0:9,10,2,0
chr9	82336764	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,137;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:1,3:3,4:0,4,3,5
chr9	82336873	.	GA	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=237,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82336873_GA_AG:82336873:0,1,0,1
chr9	82336883	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:82336873_GA_AG:82336873:0,0,0,1
chr9	82339968	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:10,1:10,7,2,0
chr9	84207857	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=206,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,2:1,2:3,0,4,0
chr9	84207898	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:4,3:5,0,6,0
chr9	84248904	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=108,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr9	84267021	.	T	TACAC,TACACAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31,27;MFRL=155,175,204;MMQ=60,60,56;MPOS=16,0;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,18,19;RU=AC;STR;TLOD=4.74,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.369,0.364:6:0,0,0:2,2,1:2,0,3,1
chr9	84303250	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,141;MMQ=52,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,0:7,4:0,9,0,4
chr9	84545156	.	T	TATTTTTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	84562845	.	AG	CC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=142,7764;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.224:11:2,2:7,0:0|1:84562845_AG_CC:84562845:4,5,0,2
chr9	84562849	.	C	CCTTCCCTCCTTCTTTCCTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=139,7764;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:84562845_AG_CC:84562845:3,5,0,2
chr9	84605746	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,3:15,0:25,4,3,0
chr9	85597720	.	CAGAG	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AG;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr9	85597752	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:85597752_T_G:85597752:0,3,0,1
chr9	85597754	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:85597752_T_G:85597752:0,3,0,1
chr9	85612119	.	C	CTGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:85612119_C_CTGTT:85612119:0,1,0,1
chr9	85612122	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:85612119_C_CTGTT:85612119:0,1,0,1
chr9	85616132	.	A	AACATGGAAAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=207,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:85616132_A_AACATGGAAAC:85616132:0,2,0,1
chr9	85616134	.	C	CATTGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=207,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:85616132_A_AACATGGAAAC:85616132:0,2,0,1
chr9	85619330	.	T	TTTTATTCTATTA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr9	85619351	.	ATTTAC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=126,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:1,1:5,5:5,1,3,3
chr9	85637434	.	A	AAGGGTGCACTCAGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:85637434_A_AAGGGTGCACTCAGTG:85637434:0,2,0,1
chr9	85637436	.	T	TCGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:85637434_A_AAGGGTGCACTCAGTG:85637434:0,2,0,1
chr9	85677254	.	AGG	A,AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30,31;MFRL=0,120,183;MMQ=60,60,60;MPOS=9,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=G;STR;TLOD=9.25,8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,4:0.455,0.454:8:0,2,0:0,2,4:0,0,8,0
chr9	85905666	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=117,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:1,9,1,5
chr9	85905737	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=225,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr9	85946923	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=291,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr9	85987711	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,26;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0|1:85987711_A_C:85987711:1,0,1,0
chr9	85987713	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85987711_A_C:85987711:1,0,1,0
chr9	85987903	.	G	GTTCGTCCTTTAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=141,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:85987903_G_GTTCGTCCTTTAGT:85987903:1,2,0,1
chr9	85987905	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=141,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:85987903_G_GTTCGTCCTTTAGT:85987903:1,2,0,1
chr9	85987988	.	A	ATCACCATCCCCGTCCCCGGGCTTCCTCGTGGAGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	86243933	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	86276863	.	G	GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:11,0:3,2:2,16,0,3
chr9	86278817	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=63.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,16,2
chr9	86279015	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	86298046	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=142,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr9	86298050	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=133,134;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:86298050_A_G:86298050:0,4,0,1
chr9	86298056	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=133,134;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:86298050_A_G:86298050:0,4,0,1
chr9	86298066	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=149,134;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:2,0:3,1:0,5,0,1
chr9	86457387	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr9	86468715	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,48;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,5,17
chr9	86495289	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=33,14;MFRL=161,209;MMQ=33,51;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:5,0:0|1:86495289_G_T:86495289:3,15,0,2
chr9	86495291	.	AGC	TTT	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=32,14;MFRL=158,209;MMQ=39,51;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:12,0:5,0:0|1:86495289_G_T:86495289:3,14,0,2
chr9	86495295	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=33,14;MFRL=160,223;MMQ=27,45;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:11,0:5,0:0|1:86495295_G_T:86495295:3,16,0,3
chr9	86495299	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=162,209;MMQ=27,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,2:6,0:0|1:86495289_G_T:86495289:3,17,0,2
chr9	86495305	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=159,223;MMQ=33,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:10,2:6,0:0|1:86495295_G_T:86495295:3,15,0,3
chr9	86495307	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=157,215;MMQ=45,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.213:20:9,2:4,0:0|1:86495295_G_T:86495295:3,13,0,4
chr9	86495311	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=35,24;MFRL=156,215;MMQ=39,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.249:17:6,2:3,0:0|1:86495295_G_T:86495295:3,10,0,4
chr9	86498871	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=154,86;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:3,14,0,2
chr9	86568874	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.925:24:1,16:0,7:0,1,0,23
chr9	86584222	.	TA	T,TAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,32,30;MFRL=150,157,142;MMQ=60,43,40;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=9.34,4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,7,5:0.148,0.109:47:12,4,3:22,3,1:33,2,10,2
chr9	86588185	.	ATT	A,AT	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=165,146,139;MMQ=60,60,60;MPOS=23,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.65,17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,5,13:0.082,0.231:59:23,3,6:16,2,7:37,4,16,2
chr9	86592026	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=132.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,16:0,20:0,0,1,35
chr9	86593242	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=17,18;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.246:17:3,0:3,0:1,12,0,4
chr9	86593245	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.236:17:3,0:4,0:1,12,0,4
chr9	86593246	.	TAA	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,10;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.613:12:2,1:1,2:0,5,0,7
chr9	86617961	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=19,19,19,14;MFRL=155,142,189,172;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,8,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,15,16,18;RU=T;STR;TLOD=3.93,10.95,4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,7,4:0.119,0.272,0.229:21:2,0,1,0:0,0,1,0:1,6,0,14
chr9	86618023	.	A	ACAATT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.203:23:11,4:7,0:0|1:86618023_A_ACAATT:86618023:0,19,0,4
chr9	86618025	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.205:23:11,1:8,0:0|1:86618023_A_ACAATT:86618023:0,19,0,4
chr9	86618881	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:1,14,0,2
chr9	86893061	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr9	86894106	.	GT	TA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=231,167;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.364:6:1,0:1,0:0|1:86894106_GT_TA:86894106:4,0,2,0
chr9	86894110	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=231,167;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:1,0:2,0:0|1:86894106_GT_TA:86894106:4,0,2,0
chr9	86894115	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=231,128;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:1,0:2,0:0|1:86894106_GT_TA:86894106:4,0,1,0
chr9	86894329	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=169,162;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:4,13,0,2
chr9	87285595	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr9	87342676	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,1:12,1:13,11,0,2
chr9	87563370	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,4:6,2:5,3,5,1
chr9	87563460	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.553:25:1,7:10,6:4,7,8,6
chr9	88287647	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,237;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr9	88292554	.	T	TATCAAAATCGGGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:88292554_T_TATCAAAATCGGGAA:88292554:0,3,0,1
chr9	88292556	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:88292554_T_TATCAAAATCGGGAA:88292554:0,3,0,1
chr9	88581475	.	CT	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.079:73:33,1:29,4:52,16,4,1
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chr9	88633156	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,2:3,0:0|1:88633150_TTA_T:88633150:8,3,2,0
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chr9	88886830	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,4:3,2:7,0,6,0
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chr9	88924210	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.069:56:27,0:21,3:0|1:88924208_A_T:88924208:18,35,0,3
chr9	88924985	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.756:9:1,4:1,1:0,2,0,7
chr9	88925534	.	ATG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	88925774	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,2:7,4:0,10,0,6
chr9	88934624	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr9	88937696	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=243,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr9	88937851	.	ATTT	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=T;STR;TLOD=70.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,21:0.373:57:18,13:17,8:24,12,12,9
chr9	88956017	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,4:5,1:1,5,0,5
chr9	89763574	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr9	89763851	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:2,5:9,1:1,10,2,4
chr9	90253051	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr9	90256827	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=192,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr9	90258262	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,75;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=19,22;RU=T;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	90262387	.	C	CACAGTGATAGATACAACCATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr9	90262393	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	90313717	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr9	90315136	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=123,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:16,1:9,1:11,15,0,2
chr9	90316710	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,6:0,0,13,7
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chr9	90317850	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=195,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr9	90320954	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	90342675	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,1,12
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chr9	90343801	.	T	TAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=211,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:90343801_T_TAAAAA:90343801:0,3,0,1
chr9	90343802	.	C	CACACCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=211,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:90343801_T_TAAAAA:90343801:0,3,0,1
chr9	90343803	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=211,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:90343801_T_TAAAAA:90343801:0,3,0,1
chr9	90387805	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr9	90388270	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr9	90401638	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,13,0
chr9	90497914	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=124,145;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:4,2:13,0:6,12,0,2
chr9	90498210	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=102,66;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:3,0,2,0
chr9	90501953	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,1:5,2:10,3,2,1
chr9	90503007	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=66,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.525:15:2,5:5,2:6,1,2,6
chr9	90534156	.	T	TTCTTGTCTCCCAGCGTCA	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=52,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCTTGTCTCCCAGCGTCA;STR;TLOD=159.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.980:40:1,6:0,13:0,1,12,27
chr9	90535467	.	T	TTTACTTTTC	.	.	DP=70;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=116,2929752;MMQ=50,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,2:0.043:68:34,2:29,0:0|1:90535467_T_TTTACTTTTC:90535467:23,43,0,2
chr9	90535471	.	C	CCAGTA	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=116,2929752;MMQ=50,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,2:0.041:71:36,2:28,0:0|1:90535467_T_TTTACTTTTC:90535467:23,46,0,2
chr9	90535476	.	CC	AT	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=114,2929752;MMQ=49,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,2:0.043:67:29,2:32,0:0|1:90535467_T_TTTACTTTTC:90535467:19,46,0,2
chr9	90537856	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,27;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,7:0,0,1,18
chr9	90586043	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,10,2
chr9	90588814	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr9	90589016	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr9	91063860	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,0:3,9:5,3,6,3
chr9	91083260	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:1,1:4,1:5,0,3,0
chr9	91150663	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:91150663_T_C:91150663:0,0,0,1
chr9	91150666	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:91150663_T_C:91150663:0,0,0,1
chr9	91262296	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=61,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr9	91262343	.	A	ATGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGG;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:3,1,2,1
chr9	91262597	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:0,3,0,7
chr9	91262618	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr9	91262635	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr9	91610480	.	CA	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.145:30:7,1:16,3:11,15,2,2
chr9	91616520	.	GC	AG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:6,11,0,2
chr9	91619085	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91619085_G_A:91619085:0,0,0,1
chr9	91619088	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91619085_G_A:91619085:0,0,0,1
chr9	91619671	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:13,3:15,0:15,13,1,2
chr9	91628546	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr9	91653257	.	TAAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=21,10;MFRL=148,185;MMQ=59,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.437:3:0,0:1,0:0,2,0,1
chr9	91653267	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=175,131;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.383:3:1,0:1,1:0|1:91653267_A_AC:91653267:0,2,0,1
chr9	91653273	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=175,131;MMQ=60,58;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:91653267_A_AC:91653267:0,2,0,1
chr9	91653276	.	A	AAAACGATGTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=175,131;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:91653267_A_AC:91653267:0,2,0,1
chr9	91653278	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=175,131;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:91653267_A_AC:91653267:0,2,0,1
chr9	91653287	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	91667136	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr9	91680531	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr9	91690082	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=109,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:7,10:11,11:6,12,7,14
chr9	91792888	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	91934787	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr9	91943500	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr9	91949683	.	G	GACTAAGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=157,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr9	91949707	.	A	AGACTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	91977443	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr9	91978539	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	91991681	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.627:19:1,0:5,0:0|1:91991681_G_C:91991681:1,6,12,0
chr9	91991685	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=35,12;MFRL=148,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.543:22:1,2:5,0:0|1:91991681_G_C:91991681:4,6,12,0
chr9	91991692	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.483:23:2,5:5,2:0|1:91991681_G_C:91991681:6,6,11,0
chr9	91991695	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.403:23:4,0:8,0:0|1:91991681_G_C:91991681:8,6,9,0
chr9	91991697	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=28,17;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:4,0:8,0:0|1:91991681_G_C:91991681:9,6,8,0
chr9	91991701	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=31,17;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.345:24:5,0:11,0:0|1:91991681_G_C:91991681:9,7,8,0
chr9	91994433	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:3,7:8,1:6,5,2,6
chr9	92003749	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,5:2,5:5,2,7,3
chr9	92011763	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:5,4:9,9:3,11,5,8
chr9	92020433	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	92219921	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=235,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr9	93606103	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	93627484	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=256,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,3:1,2:0,2,0,6
chr9	93629347	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr9	93636664	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	93639803	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr9	93639846	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,2:6,7:7,5,6,3
chr9	93640120	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0|1:93640120_C_T:93640120:0,4,0,3
chr9	93640131	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=168,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,1:0|1:93640120_C_T:93640120:0,4,0,2
chr9	93641175	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.601:38:6,8:9,15:6,9,3,20
chr9	93641193	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.377:30:7,4:11,7:3,16,2,9
chr9	93641282	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=148,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr9	93657761	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	94118287	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,18;MFRL=142,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.217:17:2,1:6,0:6,8,1,2
chr9	94172239	.	GGGGA	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=159,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:0|1:94172239_GGGGA_G:94172239:2,3,1,1
chr9	94172245	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=159,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:94172239_GGGGA_G:94172239:2,3,1,1
chr9	94172251	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:94172239_GGGGA_G:94172239:2,3,1,1
chr9	94172253	.	TA	GG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:94172239_GGGGA_G:94172239:2,3,1,1
chr9	94485928	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr9	94487459	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr9	94499852	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr9	94794933	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,210;MMQ=43,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr9	94841980	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:94841980_G_T:94841980:0,2,0,1
chr9	94841983	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=166,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:94841980_G_T:94841980:0,2,0,1
chr9	94874651	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	95027491	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95027491_TGA_T:95027491:0,1,0,1
chr9	95027497	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95027491_TGA_T:95027491:0,1,0,1
chr9	95040554	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:18,1:10,1:11,18,0,2
chr9	95060173	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:5,3:10,1:3,19,0,4
chr9	95078419	.	A	AGTTTTCCTAAAACCAAGTGCTTTAG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.123:21:10,2:9,0:4,15,0,2
chr9	95228663	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=120,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.418:24:9,5:5,4:7,7,6,4
chr9	95237024	.	CTCATCA	C,CTCA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,180,155;MMQ=60,60,60;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=TCA;STR;TLOD=7.86,28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,8:0.267,0.678:11:0,1,3:0,2,4:0,0,7,4
chr9	95277145	.	ATCC	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCC;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.138:19:6,0:7,1:13,4,2,0
chr9	95375334	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,0:11,3:11,6,0,3
chr9	95414944	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr9	95480120	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:10,11,1,1
chr9	95491490	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=116,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.497:30:6,10:9,4:11,4,5,10
chr9	95618605	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=173,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.328:15:5,4:3,1:1,9,1,4
chr9	95772548	.	C	CTGGCTGCCCAGAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=121,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:11,4:13,0:11,14,2,2
chr9	95784767	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	95874070	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr9	95874272	.	T	TGTCTGTCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=136,170;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:95874272_T_TGTCTGTCTG:95874272:0,4,0,1
chr9	95874273	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=136,170;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:95874272_T_TGTCTGTCTG:95874272:0,4,0,1
chr9	95992213	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	96000622	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,15:0,0,5,21
chr9	96002324	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.127:21:7,2:11,0:0|1:96002324_G_GT:96002324:0,19,0,2
chr9	96002325	.	A	AATCTCCGGC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:7,2:12,0:0|1:96002324_G_GT:96002324:0,19,0,2
chr9	96015377	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	96024859	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr9	96024883	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=108,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,3:4,4:4,4,7,0
chr9	96025052	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=113,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:3,1:0,2:1,3,0,4
chr9	96025771	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	96026243	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:5,5:2,7:4,3,4,8
chr9	96030230	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,11,9
chr9	96030392	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr9	96031262	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr9	96051179	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:0,11,1,1
chr9	96051461	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,40290080;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	96061269	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	96079784	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=135,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:8,3:3,0:9,2,2,1
chr9	96097747	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=173.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,28:0,29:0,0,40,19
chr9	96392182	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr9	96392371	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,4:4,2:1,9,1,5
chr9	96407822	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	96407848	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr9	96415653	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.604:16:5,2:1,6:1,5,1,9
chr9	96422420	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:2,1,7,0
chr9	96425138	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.289:19:7,2:6,3:10,4,3,2
chr9	96425777	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,7:1,5:4,2,8,4
chr9	96438996	.	TCTACCAC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=113,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:1,0:1,0:0|1:96438996_TCTACCAC_T:96438996:1,1,0,1
chr9	96439007	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:96438996_TCTACCAC_T:96438996:0,0,0,1
chr9	96714981	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:1,3:5,1,3,4
chr9	96715495	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,327;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	97055310	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=172,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:4,4,4,4
chr9	97063725	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,1:0,3,0,3
chr9	97080944	.	GAGA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=109,143;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.482:23:7,10:3,1:8,4,8,3
chr9	97081795	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=205,150;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:1,2:0,1:2,0,2,1
chr9	97191379	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,26:0.627:41:7,8:7,17:14,1,26,0
chr9	97209066	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,8:3,6:7,2,12,2
chr9	97213646	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,156;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:14,3:21,0:35,0,3,0
chr9	97213843	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:6,4:6,8:0,12,0,13
chr9	97216163	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:5,0,9,0
chr9	97218589	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.105:27:10,0:11,2:13,12,1,1
chr9	97221434	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,17:0,6:0,0,13,10
chr9	97321127	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	97321508	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	97325766	.	A	AACTGAGAAAGGCCGGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=170,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:3,5,1,1
chr9	97329737	.	C	CAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr9	97329746	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=179,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,2,0
chr9	97365642	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:11,3:11,8:14,8,9,2
chr9	97365952	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr9	97369083	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:0,1:4,2:3,1,3,1
chr9	97369282	.	T	TGAGAGAGTTCAGCATGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=175,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.258:9:4,2:3,0:0,7,1,1
chr9	97372172	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,25:0.490:51:9,13:17,12:12,14,15,10
chr9	97426330	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=10,17;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.260:15:1,0:1,1:0,11,0,4
chr9	97555237	.	A	ATCCTTTGTTCTCTTTTCATACTTAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:4,2:4,0:0,8,1,1
chr9	97563057	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:23,2:14,0:27,11,1,1
chr9	97822941	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr9	97876997	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:8,12,1,1
chr9	97877088	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:3,3:0,1:0,3,0,5
chr9	97888730	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr9	98009613	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	98209387	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:2,4,3,5
chr9	98221861	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.478:23:6,7:6,4:9,3,8,3
chr9	98221897	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:20,1:11,1:15,16,2,0
chr9	98224360	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr9	98229297	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,3,2
chr9	98229389	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:11,3:7,8:14,4,7,4
chr9	98238951	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=169,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:7,0:15,0,3,0
chr9	98240285	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0|1:98240285_T_A:98240285:5,1,2,0
chr9	98240289	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,2:4,0:0|1:98240285_T_A:98240285:5,1,2,0
chr9	98241231	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,1:10,1:13,3,1,1
chr9	98242925	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=228,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr9	98678164	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr9	98703711	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:2,1:2,2:5,1,3,0
chr9	99006578	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.456:38:7,11:11,6:14,7,11,6
chr9	99013663	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:3,1,5,1
chr9	99015259	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:1,2:0,1:0,2,0,3
chr9	99060612	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr9	99083672	.	G	GATATTTAGCATTAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr9	99084181	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:2,0,7,0
chr9	99086282	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr9	99086550	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	99126794	.	T	TTCTTTTGATGATGTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:4,4,1,1
chr9	99145720	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=185,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.245:6:4,0:1,0:1,4,1,0
chr9	99145724	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.222:7:5,0:1,0:0|1:99145724_T_A:99145724:1,5,1,0
chr9	99145729	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=185,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.241:6:4,0:1,1:0|1:99145724_T_A:99145724:0,5,1,0
chr9	99145732	.	A	ACCCCCCCCCC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=185,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,16;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.239:6:4,0:1,0:0|1:99145724_T_A:99145724:0,5,1,0
chr9	99160369	.	CAAAAAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=35,28;RU=A;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.617:3:0,1:0,1:0|1:99160369_CAAAAAAA_C:99160369:0,1,2,0
chr9	99160407	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=83,173;MMQ=60,40;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,1:0|1:99160369_CAAAAAAA_C:99160369:4,3,2,0
chr9	99233484	.	GCACA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,124;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:13,2:1,0:0,15,0,2
chr9	99250591	.	TTAATA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	99252420	.	T	TTAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=196,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:0,0:1,1:0|1:99252420_T_TTAAA:99252420:0,1,0,1
chr9	99252421	.	G	GGATATTTTTCTCGGATGTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=196,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:0,0:1,1:0|1:99252420_T_TTAAA:99252420:0,1,0,1
chr9	99314012	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=177,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:0,3:4,2:3,2,5,0
chr9	99607343	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:6,2:13,0:2,18,0,2
chr9	99711813	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,0:14,2:15,6,2,0
chr9	99799101	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	99961307	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=199,171;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr9	99961954	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,17:0.328:53:20,9:15,8:17,19,5,12
chr9	99962174	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=165,106;MMQ=40,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:4,13,1,1
chr9	99962210	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=175,189;MMQ=40,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,2:7,6:2,11,1,7
chr9	99962215	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=193,160;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:3,17,0,2
chr9	100054969	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr9	100070435	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,4:5,3:2,8,1,6
chr9	100071728	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,3:5,7:5,4,5,5
chr9	100074446	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,5:7,2:5,7,2,5
chr9	100075702	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	100088971	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=90,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr9	100092348	.	CAA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=96,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.202:18:2,3:4,0:6,9,3,0
chr9	100092515	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,4:9,3:2,12,1,6
chr9	100092968	.	A	AGAGGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=GAG;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	100105902	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=16,10;MFRL=116,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:100105902_G_T:100105902:0,2,0,1
chr9	100105923	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=13,14;MFRL=116,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:100105902_G_T:100105902:0,2,0,1
chr9	100105931	.	C	CTTTCTGAGGCTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=116,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:2,1:0,0:0|1:100105902_G_T:100105902:0,2,0,1
chr9	100116833	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=113,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:7,2,4,0
chr9	100122291	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,4:4,2:4,6,2,4
chr9	100124787	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:1,4,1,4
chr9	100132194	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:2,2:5,3:6,1,4,2
chr9	100132829	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr9	100133093	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.495:22:8,5:3,5:1,10,5,6
chr9	100139161	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:1,5,2,1
chr9	100194406	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,3:2,4:2,7,1,8
chr9	100361864	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=186,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,8:2,2:4,1,9,1
chr9	100413731	.	CTTAT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTAT;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:5,1:2,8,0,2
chr9	100428977	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr9	100437633	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:14,0:12,3:26,0,3,0
chr9	100617479	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr9	100619012	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=213,256;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100619012_G_T:100619012:1,0,0,1
chr9	100619016	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100619012_G_T:100619012:0,0,0,1
chr9	100684645	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr9	100692237	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=54.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,8:0,0,14,1
chr9	100756891	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=88.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,20:0,12:0,0,22,10
chr9	100767530	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr9	100774646	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr9	100777705	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=154,109;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,9:0.172:56:20,3:23,5:0|1:100777705_G_A:100777705:19,28,2,7
chr9	100777710	.	T	A	.	.	DP=59;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=154,109;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,9:0.164:59:24,3:25,6:0|1:100777705_G_A:100777705:18,32,2,7
chr9	100777717	.	CC	TG	.	.	DP=54;ECNT=8;MBQ=33,34;MFRL=154,109;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,9:0.179:54:19,3:22,6:0|1:100777705_G_A:100777705:15,30,2,7
chr9	100777730	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=35,33;MFRL=154,109;MMQ=60,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,9:0.222:43:15,2:19,6:0|1:100777705_G_A:100777705:9,25,1,8
chr9	100777743	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=152,111;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,8:0.205:42:14,0:15,6:0|1:100777705_G_A:100777705:9,25,0,8
chr9	100777754	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=150,113;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:14,0:12,6:0|1:100777705_G_A:100777705:7,21,0,6
chr9	100777774	.	TG	GA	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=154,113;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:11,0:9,2:0|1:100777705_G_A:100777705:2,19,0,3
chr9	100777784	.	TA	T,TAA	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=30,31,20;MFRL=171,160,87;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=7.47,7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,4:0.335,0.372:11:1,2,3:1,2,0:0,3,1,7
chr9	100819070	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,24,4
chr9	100849916	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:4,4,1,1
chr9	100894637	.	CTGG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=107,258;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:100894637_CTGG_C:100894637:0,3,0,1
chr9	100894641	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=107,258;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:100894637_CTGG_C:100894637:0,3,0,1
chr9	100894646	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=186,258;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:100894637_CTGG_C:100894637:0,2,0,1
chr9	100962504	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr9	100962693	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100962693_G_A:100962693:0,0,0,1
chr9	100962697	.	C	CTCAGGAAACTTATAGTCAAGGTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,0:0,1:0|1:100962693_G_A:100962693:0,0,0,1
chr9	100965472	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr9	100972910	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr9	100973178	.	A	AGAGGCCT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAGGCCT;STR;TLOD=40.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr9	100983566	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,2,16
chr9	100991430	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,1:0,18:0|1:100991430_C_A:100991430:0,0,8,14
chr9	100991449	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=164,681;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:0,0:16,2:0|1:100991430_C_A:100991430:5,11,0,2
chr9	100995829	.	T	TGTG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=150,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.154:23:9,3:10,0:0|1:100995829_T_TGTG:100995829:5,15,1,2
chr9	100995831	.	C	CTTAGTTGGCTTGGGCTA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=150,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.154:23:9,1:9,0:0|1:100995829_T_TGTG:100995829:5,15,1,2
chr9	101006210	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:101006210_T_C:101006210:0,0,6,1
chr9	101006216	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:101006210_T_C:101006210:0,0,6,1
chr9	101006377	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=121,51;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.215:15:10,0:2,2:3,9,2,1
chr9	101006379	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:101006379_A_C:101006379:5,10,1,1
chr9	101006383	.	GAAC	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:5,2:0|1:101006379_A_C:101006379:5,10,1,1
chr9	101006390	.	T	TACC	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:101006379_A_C:101006379:5,8,1,1
chr9	101006436	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0|1:101006436_C_A:101006436:0,0,3,5
chr9	101006443	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:101006436_C_A:101006436:0,0,3,5
chr9	101053076	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=140.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,20:0,19:0,0,0,39
chr9	101056009	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr9	101061639	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,17:0,0,1,31
chr9	101068649	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,3:4,9:3,8,1,11
chr9	101133866	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,35;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:3,12,1,1
chr9	101243364	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr9	101258881	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	101304348	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=1191,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr9	101340440	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr9	101470648	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	101494797	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=99,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:1,0:7,2:4,4,1,1
chr9	101533422	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr9	101539601	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=155,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr9	101552955	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,4:2,3:0,3,1,6
chr9	101606549	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr9	101749498	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=110,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,4,0
chr9	101767385	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr9	101785558	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=135,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:3,1,5,0
chr9	101785598	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,0:4,5:6,3,4,1
chr9	101785633	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.369:20:5,3:6,3:5,8,4,3
chr9	101796906	.	T	TCTCCCTC	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTCCCTC;STR;TLOD=145.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,15:0,15:0,0,1,32
chr9	101797670	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=145,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:101797670_A_G:101797670:2,2,0,1
chr9	101797671	.	C	CATTTATAATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=145,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:101797670_A_G:101797670:2,2,0,1
chr9	101798500	.	AG	CC	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=138,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.131:28:12,0:12,0:0|1:101798500_AG_CC:101798500:20,5,0,3
chr9	101798505	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=140,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.216:30:10,0:12,0:0|1:101798500_AG_CC:101798500:20,4,0,6
chr9	101798508	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=130,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.231:28:9,2:9,0:0|1:101798500_AG_CC:101798500:19,3,0,6
chr9	101798514	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=140,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.267:24:8,2:9,1:0|1:101798500_AG_CC:101798500:16,2,0,6
chr9	101804416	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.316:36:15,3:10,8:4,21,7,4
chr9	101810339	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:2,3:5,8:0,8,0,11
chr9	101812072	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.433:49:16,7:11,14:16,12,13,8
chr9	101814626	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr9	101814780	.	TT	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,190;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,0:3,3:0,11,0,3
chr9	101830749	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	101908915	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.401:35:9,6:11,7:4,17,2,12
chr9	101910151	.	ACTTTT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:0,7,1,4
chr9	101911656	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,2:3,2:0,5,0,5
chr9	102067317	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	102068912	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr9	102591042	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	102625834	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr9	102691042	.	CTTCT	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=124,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCT;STR;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.334:40:13,7:10,6:16,11,3,10
chr9	102713580	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,4,14
chr9	102713591	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,6:3,2:2,4,1,7
chr9	102730697	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:8,2:4,3:12,0,5,0
chr9	103015184	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,15,9
chr9	103027271	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,2:3,0:1,11,0,2
chr9	103035408	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,10;MFRL=0,196;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:103035408_G_T:103035408:1,0,0,1
chr9	103035412	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,13;MFRL=0,196;MMQ=60,56;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:103035408_G_T:103035408:1,0,0,1
chr9	103035420	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=0,196;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:103035408_G_T:103035408:1,0,0,1
chr9	103035427	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,196;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:103035408_G_T:103035408:0,0,0,1
chr9	103035430	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,196;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:103035408_G_T:103035408:0,0,0,1
chr9	103108941	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:8,8:12,6:19,1,9,5
chr9	103114793	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,11:2,2:0,6,1,12
chr9	103204673	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:103204673_C_G:103204673:0,3,0,1
chr9	103204680	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:103204673_C_G:103204673:0,3,0,1
chr9	103275675	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.279:12:4,0:2,2:0|1:103275675_CT_C:103275675:0,9,0,3
chr9	103275692	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0|1:103275675_CT_C:103275675:0,0,0,13
chr9	104071842	.	T	TCTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	104124664	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	104153017	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=159,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.104:51:19,1:20,1:36,10,0,5
chr9	104189680	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr9	104239493	.	A	C,AAAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35,31;MFRL=81,140,218;MMQ=60,60,60;MPOS=30,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.01,6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,2:0.417,0.291:8:2,2,2:0,2,0:0,2,0,6
chr9	104302639	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:19,3:11,1:13,17,2,2
chr9	104306988	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr9	104340175	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=230,227;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	104385711	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,1:5,8:2,6,4,5
chr9	104432293	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr9	104433436	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr9	104449225	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:4,0:6,4,2,0
chr9	105405557	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=224,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:105405557_A_ACC:105405557:0,1,0,1
chr9	105405560	.	TTG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=224,260;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:105405557_A_ACC:105405557:0,1,0,1
chr9	105757558	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr9	105757756	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr9	105765610	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr9	106857908	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=193,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.516:17:5,6:3,1:0,8,0,9
chr9	106864570	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=211,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,0,3
chr9	106885332	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,3:8,3:9,0,6,0
chr9	106894211	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,1:6,4:11,2,5,0
chr9	106894379	.	C	A	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,4:0.057:85:30,4:49,0:41,40,4,0
chr9	106896874	.	T	TATATTATAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATATTATAA;STR;TLOD=53.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,7:3,5:0,5,1,12
chr9	107266503	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,2:0,2:4,1,4,0
chr9	107266943	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,2,10
chr9	107457759	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr9	107510145	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,4:3,0:0,5,0,5
chr9	107510178	.	AGGGGC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=197,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGC;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr9	107531361	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr9	107547622	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,1:3,0,4,0
chr9	107548566	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr9	107550639	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr9	107553185	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:5,2,4,3
chr9	107564466	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,4:4,5:0,8,0,9
chr9	107566877	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr9	107580842	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=357,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr9	107581848	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:7,0:13,3,2,0
chr9	107585016	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	107588033	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=170.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,22:0,27:0,0,34,16
chr9	107589134	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	107591478	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr9	107593182	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,16,8
chr9	107593319	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:19,2:16,1:23,12,2,1
chr9	107593430	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=12,34;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.542:7:0,0:0,4:0,3,0,4
chr9	107599390	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,32591707;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr9	107599438	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	107599713	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,2:9,0:9,7,1,1
chr9	107602813	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,7:0,0,4,11
chr9	107621046	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:107621046_G_GC:107621046:0,1,0,1
chr9	107621048	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:107621046_G_GC:107621046:0,1,0,1
chr9	107621050	.	TC	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:107621046_G_GC:107621046:0,1,0,1
chr9	107621057	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:107621046_G_GC:107621046:0,1,0,1
chr9	107624117	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=15,14;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:1,0:0,0:0|1:107624117_G_T:107624117:1,4,0,2
chr9	107624123	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:2,0:2,0:0|1:107624117_G_T:107624117:0,4,0,2
chr9	107651526	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:1,5,0,4
chr9	108147627	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,3:0,0,9,1
chr9	108230545	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,26:0.504:52:10,12:14,14:13,13,11,15
chr9	108234163	.	GTT	G,GT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=36,33,34;MFRL=184,170,117;MMQ=60,60,60;MPOS=17,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.42,6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,3:0.192,0.188:17:7,2,1:3,1,1:10,1,5,1
chr9	108234207	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:13,10:11,9:13,11,9,11
chr9	108296915	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,0:5,6:0,7,0,6
chr9	108296931	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr9	108397495	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:6,8:7,7:7,6,8,7
chr9	109689485	.	T	TGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,16;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.259:9:2,0:4,0:0,7,2,0
chr9	109690844	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=136,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:7,3,0,2
chr9	109697986	.	C	CTTAGGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109697986_C_CTTAGGTG:109697986:0,1,0,1
chr9	109697987	.	C	CTAGGTGTGCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109697986_C_CTTAGGTG:109697986:0,1,0,1
chr9	109734425	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:11,1:10,1:10,11,1,1
chr9	110047132	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,20,4
chr9	110047316	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,3:3,2:0,10,1,4
chr9	110064265	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:6,0,4,0
chr9	110080967	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:0|1:110080967_A_G:110080967:4,0,6,0
chr9	110080976	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:0|1:110080967_A_G:110080967:4,0,6,0
chr9	110086149	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:13,8:12,6:20,5,12,2
chr9	110087029	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=205,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr9	110093970	.	CA	C,CAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=139,173,126;MMQ=60,60,60;MPOS=20,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=10.66,14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,9:0.298,0.510:17:1,3,1:2,2,6:1,2,8,6
chr9	110248222	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,2:4,0:0,10,1,2
chr9	111618712	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr9	111637331	.	CC	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	111641627	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr9	111659242	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=93,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,1:15,1:11,16,1,1
chr9	111665758	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	111670513	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=155,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,4:5,4:8,1,7,1
chr9	111670707	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,2:5,7:1,6,1,8
chr9	111678428	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:3,4:2,6:5,0,8,3
chr9	111688767	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,2:2,6:6,0,6,2
chr9	111712910	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=59.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,6:0,0,6,13
chr9	111712924	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,4:4,2:0,6,2,5
chr9	111746607	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:2,3:2,9:4,0,9,3
chr9	111775502	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:8,5:12,6:20,0,11,0
chr9	111775817	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	111782670	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:8,6:12,5:16,4,9,2
chr9	111798751	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr9	111800234	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr9	111808470	.	CAGCA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCA;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,0:4,2:9,3,1,1
chr9	111812825	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=83.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,10:0,0,20,5
chr9	111843055	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=90.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,24,1
chr9	111870727	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=93,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:5,0:0|1:111870727_A_C:111870727:10,5,2,0
chr9	111870731	.	AC	CA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=91,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,2:4,0:0|1:111870727_A_C:111870727:13,7,2,0
chr9	111870734	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=91,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:10,1:8,0:0|1:111870727_A_C:111870727:13,7,2,0
chr9	111881927	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr9	111899928	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,3,8
chr9	111936732	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr9	111936788	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,1:5,5:9,1,4,2
chr9	111945049	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,10,12
chr9	111945166	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr9	111962418	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=242,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr9	112018104	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=123,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:6,0:0|1:112018104_C_G:112018104:5,13,0,2
chr9	112018106	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=126,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:0|1:112018104_C_G:112018104:5,14,0,2
chr9	112025473	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,0,21
chr9	112170701	.	T	TAAAC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAC;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr9	112170752	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.384:3:0,1:2,0:0|1:112170752_G_A:112170752:0,2,0,1
chr9	112170754	.	G	GTGTGGCCTTCATCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:112170752_G_A:112170752:0,2,0,1
chr9	112172477	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=138,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,4:2,1:3,4,3,2
chr9	112189429	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=201,280;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,0:2,1:0|1:112189429_A_C:112189429:0,3,0,1
chr9	112189433	.	A	ACTTGAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=201,280;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:112189429_A_C:112189429:0,3,0,1
chr9	112189438	.	GA	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=201,280;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:112189429_A_C:112189429:0,3,0,1
chr9	112191075	.	C	CAGTGTACATTGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	112211178	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=15,15;MFRL=142,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.394:21:4,0:1,0:0|1:112211178_T_A:112211178:4,9,0,8
chr9	112211181	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=22,18;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.501:20:2,0:2,0:0|1:112211178_T_A:112211178:4,6,0,10
chr9	112211182	.	C	CA,CAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,19,26;MFRL=138,170,175;MMQ=60,60,60;MPOS=5,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,17,18;RU=A;STR;TLOD=3.79,5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,4:0.222,0.227:19:5,0,2:4,0,0:3,8,0,8
chr9	112219474	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:9,3:6,6:5,10,5,4
chr9	112225531	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr9	112225774	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:0,5,0,3
chr9	112642756	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,4:3,0:5,1,4,0
chr9	112687306	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:7,9:9,9:10,6,12,6
chr9	112898327	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	112899361	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,11:0,0,5,10
chr9	112900785	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=247,131;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,1:2,7:0,4,2,6
chr9	112918531	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr9	112918581	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,15,1
chr9	112918815	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,3:3,1:0,5,0,5
chr9	112930863	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr9	112969896	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112969896_G_A:112969896:0,0,0,1
chr9	112969897	.	C	CACAGAAATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112969896_G_A:112969896:0,0,0,1
chr9	113006606	.	T	TATATAC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATATAC;STR;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,1:0,7:0,2,0,8
chr9	113006985	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.504:26:6,7:6,6:11,2,11,2
chr9	113018600	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,13;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:113018600_G_C:113018600:2,0,2,0
chr9	113018603	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,19;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:113018600_G_C:113018600:2,0,2,0
chr9	113018606	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,21;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:113018600_G_C:113018600:2,0,2,0
chr9	113018609	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,13;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:113018600_G_C:113018600:2,0,2,0
chr9	113018610	.	T	TACC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,21;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:113018600_G_C:113018600:2,0,2,0
chr9	113018616	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,13;MFRL=172,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:113018600_G_C:113018600:4,0,1,0
chr9	113018617	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=172,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:113018600_G_C:113018600:4,0,1,0
chr9	113091650	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113091650_A_AG:113091650:0,0,0,1
chr9	113091651	.	A	ATACT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113091650_A_AG:113091650:0,0,0,1
chr9	113091653	.	A	ATGATCAATAATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113091650_A_AG:113091650:0,0,0,1
chr9	113100012	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,3:1,3:4,3,6,0
chr9	113128844	.	GAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,16;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:0,1:0,0:0,4,0,3
chr9	113137562	.	TTCTGAG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:5,6:9,5:15,1,10,1
chr9	113137745	.	T	TAAAAAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=25,31;RU=A;STR;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.728:13:2,1:0,1:1,2,2,8
chr9	113139489	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr9	113141815	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr9	113151713	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,2:1,4:7,0,4,2
chr9	113163239	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,5:2,9:2,5,7,7
chr9	113166792	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,5:4,5:4,8,3,7
chr9	113171262	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=86,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr9	113174025	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:4,2:4,7:1,8,1,8
chr9	113190008	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:13,7,1,1
chr9	113192279	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:0,4,1,3
chr9	113192656	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:25,2:13,1:24,14,2,1
chr9	113194127	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr9	113194686	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:3,2,4,0
chr9	113213726	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr9	113231384	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,35;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr9	113231397	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:113231397_A_T:113231397:0,3,0,1
chr9	113231398	.	CAGGAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:113231397_A_T:113231397:0,3,0,1
chr9	113231405	.	CACTG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=222,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113231405_CACTG_C:113231405:0,2,0,1
chr9	113231416	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=276,92;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113231405_CACTG_C:113231405:0,1,0,1
chr9	113233630	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=132,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:12,3:11,0:19,4,2,1
chr9	113233956	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	113234618	.	CAG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,5:3,2:3,6,1,6
chr9	113238662	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=11597646,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113238662_G_T:113238662:1,1,0,1
chr9	113238669	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=11597646,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113238662_G_T:113238662:1,1,0,1
chr9	113238672	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=11597646,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113238662_G_T:113238662:1,1,0,1
chr9	113238679	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=23195115,209;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113238662_G_T:113238662:1,0,0,1
chr9	113243438	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=193,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr9	113244867	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=168,163;MMQ=38,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr9	113244868	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=158,177;MMQ=40,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr9	113510164	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	113547001	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr9	113547322	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	113638082	.	G	GCTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.293:5:2,1:2,0:0|1:113638082_G_GCTTT:113638082:0,4,0,1
chr9	113638083	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:113638082_G_GCTTT:113638082:0,4,0,1
chr9	113638085	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:113638082_G_GCTTT:113638082:0,4,0,1
chr9	114090689	.	A	ATATACATAGTCCCAAAACTTATCAGTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=190,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr9	114090705	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,14;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:114090705_T_G:114090705:0,1,0,1
chr9	114090714	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,31;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:114090705_T_G:114090705:0,1,0,1
chr9	114090717	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,28;MFRL=221,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:114090705_T_G:114090705:0,2,0,1
chr9	114090721	.	CTTTCAT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:114090705_T_G:114090705:0,3,0,1
chr9	114124456	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,2:1,0:1,0,3,1
chr9	114124469	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=64,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:114124469_C_A:114124469:3,1,1,0
chr9	114124484	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,13;MFRL=205,169;MMQ=50,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:114124469_C_A:114124469:0,2,1,0
chr9	114124491	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=251,127;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,1:2,0:0|1:114124491_C_A:114124491:0,2,0,1
chr9	114124495	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,27;MFRL=251,127;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:114124491_C_A:114124491:0,2,0,1
chr9	114125835	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:5,1,5,0
chr9	114135701	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:114135701_G_A:114135701:1,17,0,2
chr9	114135703	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:114135701_G_A:114135701:1,17,0,2
chr9	114137553	.	T	TAGACAGAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr9	114170785	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:4,2:2,1:6,1,2,2
chr9	114185588	.	A	ACCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:114185588_A_ACCC:114185588:0,3,0,1
chr9	114185589	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:114185588_A_ACCC:114185588:0,3,0,1
chr9	114185591	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:114185588_A_ACCC:114185588:0,3,0,1
chr9	114185594	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:114185588_A_ACCC:114185588:0,3,0,1
chr9	114185598	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=37,26;MFRL=209,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114185588_A_ACCC:114185588:0,1,0,1
chr9	114326557	.	TTTATTA	T,TTTA	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=147,151,167;MMQ=60,60,60;MPOS=12,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=TTA;STR;TLOD=21.69,36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,10:0.353,0.563:19:1,4,5:0,4,5:0,1,1,17
chr9	114341236	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=127,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.470:10:3,0:1,0:3,2,0,5
chr9	114348232	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:11,0,2,0
chr9	114348513	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,0:2,5:0,6,0,5
chr9	114356593	.	AG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=203,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr9	114356659	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	114359624	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=195,167;MMQ=58,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:2,7:2,6:3,1,11,2
chr9	114423879	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=210,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:3,2:1,1:5,0,3,0
chr9	114454580	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,8,11
chr9	114467450	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.725:16:3,8:1,4:4,0,12,0
chr9	114467697	.	CTT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:0|1:114467697_CTT_C:114467697:0,10,0,4
chr9	114467701	.	CTCT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:3,3:5,1:0|1:114467697_CTT_C:114467697:0,10,0,4
chr9	114469078	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr9	114480602	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:0,5,0,6
chr9	114484592	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	114484682	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,3:0,0,8,4
chr9	114484837	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:7,8:6,3:4,9,3,8
chr9	114486219	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr9	114486268	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:114486268_TAA_T:114486268:0,1,0,1
chr9	114486273	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:114486268_TAA_T:114486268:0,1,0,1
chr9	114486278	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:114486268_TAA_T:114486268:0,1,0,1
chr9	114489887	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:2,2:14,7:14,2,7,2
chr9	114510272	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:3,0,5,0
chr9	114520478	.	T	TA	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:33,1:23,2:28,31,2,1
chr9	114521630	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:0,7,0,4
chr9	114537978	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr9	114543400	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,0,20
chr9	114659643	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr9	114659661	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:2,1:0,0:0,2,0,3
chr9	114688807	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:7,4:1,4:0,8,0,9
chr9	114820662	.	CGAA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:5,2:6,4,1,1
chr9	114840964	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,0:6,4:8,12,0,4
chr9	114873997	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:26,3:18,0:25,21,2,1
chr9	114904698	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:6,15,1,1
chr9	114919707	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=214,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr9	114989616	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr9	114990841	.	T	TTATACTATA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr9	114993790	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:0,9,0,9
chr9	114997288	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr9	115024695	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:7,1,2,3
chr9	115024971	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=292,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr9	115030570	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	115038100	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.383:16:5,2:4,3:8,2,3,3
chr9	115060100	.	A	AC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,6:3,6:3,1,11,1
chr9	115092624	.	T	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.520:48:11,13:11,11:21,2,24,1
chr9	115142330	.	CG	C,CGGGG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33,32;MFRL=153,156,187;MMQ=60,60,60;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,11;RU=G;STR;TLOD=58.94,14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,20,7:0.697,0.264:28:1,13,2:0,7,5:1,0,27,0
chr9	115142507	.	A	G	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=326.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,97:0.990:97:0,38:0,55:0,0,36,61
chr9	115216222	.	GATTA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	115337046	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=102,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:9,2:14,10,2,0
chr9	115567015	.	A	ATG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	115593027	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:17,3:10,0:18,10,3,0
chr9	115593239	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr9	115598447	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr9	115598780	.	T	TTACATGAAACATCTCTATGGCAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=251,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	115631173	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr9	115804903	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=207,375;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr9	115811835	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:1,5,0,5
chr9	115920099	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:4,9:9,4:3,10,4,9
chr9	115934022	.	A	AACCTGGATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,1:2,1:2,3,0,2
chr9	115936903	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr9	115946500	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:7,1,2,1
chr9	115946892	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr9	115950706	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,4:10,0:9,8,3,1
chr9	115952895	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:1,3,1,6
chr9	115956501	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=175,142;MMQ=40,35;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0,15,0,2
chr9	115956524	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=201,165;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:0,11,0,2
chr9	115969433	.	T	TAGA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:10,5:7,3:16,1,8,1
chr9	115983693	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,321;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	116044905	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,29,34,34;MFRL=160,152,165,177;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,16,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.64,5.76,5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,4,4:0.128,0.190,0.198:21:6,1,1,3:2,1,3,1:9,1,11,0
chr9	116053115	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,2,0
chr9	116060068	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=186,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:4,4,6,1
chr9	116080964	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116080964_C_CCT:116080964:0,1,0,1
chr9	116080965	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116080964_C_CCT:116080964:0,1,0,1
chr9	116091336	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=68,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:116091336_C_T:116091336:1,1,0,1
chr9	116091339	.	C	CCCGCATTAGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=55,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:116091336_C_T:116091336:1,1,0,1
chr9	116091342	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=68,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:116091336_C_T:116091336:1,1,0,1
chr9	116091343	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:116091336_C_T:116091336:0,0,0,1
chr9	116094353	.	CATGTTGTTAATTTTGTTAGGCACAATAGTATG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=189,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.243:11:4,1:4,1:0,9,0,2
chr9	116116483	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr9	116116626	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,12:0,13:0,0,8,18
chr9	116123093	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	116124523	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr9	116130510	.	ATC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,3:3,6:5,3,5,4
chr9	116132364	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,4:5,6:7,2,7,3
chr9	116152211	.	TG	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=238,286;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	116153891	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:1,3,1,5
chr9	116183301	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr9	116190531	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:3,5:5,5:2,6,0,11
chr9	116191169	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:6,5:3,7:6,3,11,1
chr9	116191667	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,2:7,7:7,5,4,5
chr9	116224171	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=51.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.666:28:7,9:1,10:2,7,6,13
chr9	116241707	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,14,6
chr9	116245283	.	CTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:7,0,1,1
chr9	116246535	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,3:1,11:0,1,7,8
chr9	116247994	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:1,4,1,7
chr9	116264014	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	116267829	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=86.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,4,20
chr9	116269520	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr9	116269892	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,30:0.413:73:18,15:25,15:13,30,11,19
chr9	116270813	.	C	CTTTTA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=139,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,0:6,2:0|1:116270813_C_CTTTTA:116270813:3,3,1,1
chr9	116270816	.	T	TCCAAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:116270813_C_CTTTTA:116270813:3,5,1,1
chr9	116270817	.	G	GTCTTCA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=107,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:116270813_C_CTTTTA:116270813:3,5,1,1
chr9	116276932	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,2:7,1:5,8,1,2
chr9	116277032	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr9	116279880	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=93,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.492:33:9,8:6,8:6,11,4,12
chr9	116291390	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr9	116346118	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.567:43:11,8:7,11:7,11,10,15
chr9	116346236	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.511:17:3,5:5,1:5,3,3,6
chr9	116356430	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=78.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.678:41:7,18:5,9:4,9,10,18
chr9	116356858	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.641:9:1,4:1,1:0,3,0,6
chr9	116764835	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	116770883	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=187,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:116770883_G_A:116770883:0,4,0,1
chr9	116770886	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=187,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:116770883_G_A:116770883:0,4,0,1
chr9	116778519	.	CT	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=59,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr9	116857656	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=9,33;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr9	116858625	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,9,4
chr9	116859769	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr9	116859852	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=92,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.602:16:2,7:4,2:3,3,7,3
chr9	116860516	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:0,3:1,1:0,3,0,7
chr9	116860653	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	116861660	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=349,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:116861660_G_A:116861660:0,1,0,1
chr9	116861662	.	AT	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=349,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:116861660_G_A:116861660:0,1,0,1
chr9	116945454	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr9	116967952	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=104,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr9	116968491	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:21,2:18,1:19,20,2,1
chr9	116971812	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,95;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:7,3,3,0
chr9	116997994	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,1:0,6,0,3
chr9	117026581	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr9	117033096	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr9	117051409	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=15,24;MFRL=174,205;MMQ=50,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:0,0:2,0,2,0
chr9	117051411	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=17,12;MFRL=200,184;MMQ=40,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:0,0:1,0,3,0
chr9	117051415	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=20,14;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:3,0,1,0
chr9	117051418	.	A	C,ACC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=14,12,14;MFRL=148,205,200;MMQ=60,60,40;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.17,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.429,0.286:4:0,0,0:0,0,0:1,0,3,0
chr9	117051423	.	CAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:3,0,1,0
chr9	117051424	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=14,32;MFRL=200,205;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr9	117051431	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0,0,4,0
chr9	117051436	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=21,29;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:1,1:0,1:0,1,3,0
chr9	117051441	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=30,28;MFRL=148,174;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr9	117054542	.	C	T,A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30,31;MFRL=0,186,247;MMQ=60,60,60;MPOS=11,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.51,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.546,0.286:3:0,0,1:0,2,0:0,0,0,3
chr9	117054543	.	T	TGAAAGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=208,247;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:117054543_T_TGAAAGA:117054543:0,3,0,1
chr9	117054544	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=208,247;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:117054543_T_TGAAAGA:117054543:0,3,0,1
chr9	117054547	.	A	ATAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=208,247;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:117054543_T_TGAAAGA:117054543:0,3,0,1
chr9	117064306	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=100,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:3,1,4,4
chr9	117066823	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=42562686,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr9	117073006	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	117086226	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=136,131;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:1,4:5,4:6,0,6,2
chr9	117086271	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:5,10:6,9:6,5,12,8
chr9	117104374	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:4,11,2,0
chr9	117108118	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,0:3,1:8,4,3,0
chr9	117108324	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,0:0|1:117108324_A_G:117108324:1,2,0,2
chr9	117108329	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:117108324_A_G:117108324:1,1,0,2
chr9	117121840	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,14,1
chr9	117122202	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,4:6,5:5,5,5,4
chr9	117126823	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,176;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.108:53:26,0:22,5:24,24,0,5
chr9	117143281	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,17;MFRL=0,160;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.405:5:2,1:0,0:0|1:117143281_AG_A:117143281:0,3,2,0
chr9	117143285	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=19,13;MFRL=0,160;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.309:7:1,0:1,0:0|1:117143281_AG_A:117143281:1,4,2,0
chr9	117143616	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=162,139;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:7,0:3,3:0|1:117143616_G_A:117143616:1,10,3,0
chr9	117143618	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=162,139;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,0:4,3:0|1:117143616_G_A:117143616:1,10,3,0
chr9	117168551	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	117350095	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:4,6:4,3:6,2,8,2
chr9	117396237	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr9	117399263	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:1,5:8,3:7,2,6,2
chr9	117405645	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr9	117405656	.	A	AGGCAAGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	117568049	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr9	117792583	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr9	117803185	.	A	AACAC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=AC;STR;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,4:1,3:1,0,11,3
chr9	117810649	.	TGGGTTCCTGAAAGTGTGAATTCCTG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:1,0:8,2:3,8,1,1
chr9	117827212	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117827212_G_C:117827212:0,1,0,1
chr9	117827215	.	A	AGTTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117827212_G_C:117827212:0,1,0,1
chr9	117827217	.	GGGGTC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117827212_G_C:117827212:0,1,0,1
chr9	117836188	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	117838243	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=114,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,1:1,1:7,1,1,1
chr9	117838482	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=177,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:117838482_T_G:117838482:0,2,0,1
chr9	117838488	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=177,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:117838482_T_G:117838482:0,2,0,1
chr9	117838491	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:117838482_T_G:117838482:0,3,0,1
chr9	117838494	.	A	ATATTC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:117838482_T_G:117838482:0,3,0,1
chr9	117838496	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:117838482_T_G:117838482:0,3,0,1
chr9	117844239	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,0,4
chr9	117846450	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr9	117846677	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,0:13,2:12,13,1,1
chr9	117848394	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr9	117849314	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,2:2,8:4,1,8,2
chr9	117849641	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	117853103	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:3,5:8,8:6,6,8,5
chr9	118164375	.	CT	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.222:32:13,4:9,1:22,3,4,3
chr9	118969686	.	T	TTATTTAAATAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,1:0,0,6,1
chr9	118982170	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=140,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:118982170_C_A:118982170:2,0,1,0
chr9	118982172	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=140,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:118982170_C_A:118982170:2,0,1,0
chr9	118997714	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:6,0:6,2:3,10,0,2
chr9	119033608	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:11,5,2,0
chr9	119097053	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	119097065	.	A	ATTGGCTGCATGGTGGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=214,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,0,1
chr9	119109410	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:8,0:14,3:14,8,0,3
chr9	119129826	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	119158992	.	A	ATTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.717:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	119463314	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:13,6:5,8:11,7,9,5
chr9	119463650	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=201,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr9	119582872	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr9	119770551	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=86.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,4,22
chr9	119903506	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	119903807	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	120177179	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	120466929	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr9	120471058	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr9	120475936	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,5:4,6:1,5,2,9
chr9	120476547	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:10,0:6,2:6,11,1,1
chr9	122075574	.	C	CTGGGG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:11,1:7,1:4,14,0,2
chr9	123152099	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.380:27:8,4:9,6:6,11,2,8
chr9	123156761	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:6,0,5,1
chr9	123170733	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr9	123170832	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:123170832_A_T:123170832:0,0,0,1
chr9	123170838	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=205,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:123170832_A_T:123170832:0,1,0,1
chr9	123170840	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=205,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:123170832_A_T:123170832:0,1,0,1
chr9	123171656	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	123177262	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:16,2,2,0
chr9	123230069	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=197,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:123230069_G_A:123230069:4,0,1,0
chr9	123230080	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:123230069_G_A:123230069:3,0,1,0
chr9	123280950	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr9	123291036	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr9	123313246	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr9	123370345	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,0,2
chr9	123374639	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:1,0:5,3:5,1,3,0
chr9	123421879	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,0:1,6:0,3,1,5
chr9	123476381	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	123540541	.	TA	T,TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33,32;MFRL=166,142,153;MMQ=60,60,60;MPOS=24,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.23,5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.212,0.284:11:3,1,2:3,1,1:6,0,4,1
chr9	123550027	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr9	123586616	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,15;MFRL=124,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.339:4:1,0:1,0:0|1:123586616_A_T:123586616:2,1,1,0
chr9	123586626	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,23;MFRL=184,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:123586616_A_T:123586616:1,1,1,0
chr9	123586630	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,13;MFRL=184,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:123586616_A_T:123586616:1,1,1,0
chr9	123629215	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.115:33:10,0:16,3:13,17,1,2
chr9	123632829	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.498:20:3,2:7,8:5,5,3,7
chr9	123676396	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr9	123676482	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,2:2,3:4,3,2,3
chr9	123676694	.	GC	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	123715225	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=226,180;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr9	123715236	.	CAG	TTA,CTAG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=35,32,34;MFRL=230,164,195;MMQ=60,60,40;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:2,1,1:0,3,0,2
chr9	123715237	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=232,213;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr9	123715240	.	CG	C,TG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,28,31;MFRL=232,230,180;MMQ=60,60,50;MPOS=6,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.250,0.375:5:1,0,0:1,1,2:0,2,0,3
chr9	123715242	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=226,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr9	123715245	.	AT	GG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=226,195;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr9	123715246	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=232,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr9	123723711	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,1:4,1:8,5,2,0
chr9	123734287	.	GAAAC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:1,4,0,4
chr9	123737018	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:3,4:5,5:7,1,7,3
chr9	123737040	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,5:3,7:6,2,10,3
chr9	123751800	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	123758425	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,17,0
chr9	123776209	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,0:9,3:10,6,3,0
chr9	123780005	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr9	123787697	.	TACAC	T,TACACACACAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32,30;MFRL=0,191,141;MMQ=60,60,60;MPOS=24,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,18;RU=AC;STR;TLOD=3.21,11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.250,0.625:5:0,0,0:0,1,1:0,0,5,0
chr9	123800094	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=114.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,13:0,20:0,0,34,0
chr9	123857085	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,9,0
chr9	123874943	.	G	GGAAAACATTTTTTAAATTAAAAATCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr9	123888242	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=78.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,6:0,16:0,0,4,18
chr9	123907540	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:14,3:16,0:18,13,3,0
chr9	123908345	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr9	123912890	.	T	TGTCAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	123922400	.	CT	C,CTT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,35,33;MFRL=175,172,141;MMQ=60,60,60;MPOS=21,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.51,4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,3,4:0.112,0.145:31:12,3,2:12,0,2:22,2,7,0
chr9	123927477	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr9	123928486	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=130.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,14:0,18:0,0,3,31
chr9	123928569	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	123929710	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,4:1,8:1,0,12,0
chr9	123937601	.	TT	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	123939336	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=57.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,14,3
chr9	123943884	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr9	123945505	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.384:6:1,1:2,0:3,1,2,0
chr9	123955756	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=186.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,45:0.979:45:0,22:0,23:0|1:123955756_G_A:123955756:0,0,2,43
chr9	123955765	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=158.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,17:0,18:0|1:123955756_G_A:123955756:0,0,0,36
chr9	124045579	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.637:6:0,1:2,2:0,2,0,4
chr9	124045957	.	ATT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=85.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0|1:124045957_ATT_A:124045957:0,0,9,11
chr9	124045960	.	CATTCATTCATTCAT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,7:0,11:0|1:124045957_ATT_A:124045957:0,0,9,11
chr9	124046830	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=54.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,13:0,6:0,0,14,5
chr9	124047185	.	A	C	.	.	DP=85;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,5:0.047:81:24,0:30,0:39,37,5,0
chr9	124047189	.	A	C	.	.	DP=89;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,2:0.034:86:30,1:34,0:43,41,2,0
chr9	124047246	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=186.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,21:0,29:0,0,10,43
chr9	124064491	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=100,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr9	124073176	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr9	124083655	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:14,0:7,2:13,9,0,2
chr9	124088768	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	124089173	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,2:6,5:0,8,0,7
chr9	124091332	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:124091332_G_T:124091332:1,2,0,1
chr9	124091338	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:124091332_G_T:124091332:1,2,0,1
chr9	124632735	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:9,0,7,0
chr9	124906723	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,9:0,0,1,14
chr9	124910582	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,5:0,3:0,0,2,8
chr9	124929006	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	124929211	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,10:0,0,9,12
chr9	124967119	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=171,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:0,11,0,3
chr9	124972042	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr9	124976152	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=201,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr9	124976514	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=14,13;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:124976514_A_C:124976514:1,0,1,0
chr9	124976516	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=21,14;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:124976514_A_C:124976514:1,0,1,0
chr9	124976519	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,10;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:124976514_A_C:124976514:1,0,1,0
chr9	124976525	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=28,13;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:124976514_A_C:124976514:1,0,1,0
chr9	124976532	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,20;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:124976514_A_C:124976514:0,0,2,0
chr9	124976538	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,22;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:124976514_A_C:124976514:0,0,2,0
chr9	124976541	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,20;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:124976514_A_C:124976514:0,0,2,0
chr9	124976545	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,19;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:124976514_A_C:124976514:0,0,2,0
chr9	124976547	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,14;MFRL=206,217;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1|0:124976514_A_C:124976514:1,0,1,0
chr9	125133553	.	T	TCTTCTTGTATAATCAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	125140206	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:6,5:4,2:6,4,5,3
chr9	125144134	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	125145743	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,2,1
chr9	125154853	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=183,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:1,1,1,1
chr9	125154924	.	G	GTTTCTCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=290,270;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr9	125239253	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:0,1:1,1:2,0,3,0
chr9	125273858	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:12,2:3,0:9,6,1,1
chr9	125282393	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	125315376	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr9	125315418	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=122,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,4:2,3:2,1,6,1
chr9	125316455	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,4:8,2:5,7,0,6
chr9	125330678	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,3:1,7:0,4,4,6
chr9	125377505	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,10,9
chr9	125378014	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,0:1,3:0,3,0,3
chr9	125391770	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:3,5:6,1:2,7,0,6
chr9	125391875	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:1,2,1,3
chr9	125437756	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,4:2,6:5,0,7,3
chr9	125486602	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,137;MMQ=46,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:7,10,1,1
chr9	125511990	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=124,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.272:13:3,1:5,1:8,2,2,1
chr9	125512575	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,17,10
chr9	125551282	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:5,6,2,0
chr9	125585307	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=130,127;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:20,2:11,0:0|1:125585307_C_A:125585307:20,13,2,0
chr9	125585312	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=131,127;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:22,2:11,0:0|1:125585307_C_A:125585307:21,13,2,0
chr9	125620105	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr9	125637648	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,11:0,0,4,22
chr9	125655308	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=188,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.490:10:4,2:1,3:0,5,1,4
chr9	125659520	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr9	125673051	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr9	125747038	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr9	125760863	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=77.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,16,5
chr9	125761051	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,1,14
chr9	125861695	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr9	125861888	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr9	125865539	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:125865539_G_C:125865539:1,3,0,1
chr9	125865542	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:125865539_G_C:125865539:1,3,0,1
chr9	125865544	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:125865539_G_C:125865539:1,3,0,1
chr9	125875138	.	A	AAGGGGC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGGGGC;STR;TLOD=70.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,6:0,0,12,4
chr9	125898643	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:6,1:7,6:12,1,4,3
chr9	125909982	.	TT	GG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,10;MFRL=183,149;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:4,0,1,0
chr9	125932152	.	C	CAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=AT;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:5,0,4,0
chr9	126028808	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.503:34:5,12:11,4:9,8,10,7
chr9	126118517	.	AGCAGAGC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAGAGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	126135715	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	126139065	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=134,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,3:1,2:0,2,5,1
chr9	126144190	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:7,7:1,6:4,4,12,1
chr9	126145907	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr9	126146138	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=126,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.543:9:3,3:1,2:2,2,1,4
chr9	126146197	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	126202551	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	126217128	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:1,2:1,5,1,2
chr9	126520020	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,3:8,0:7,4,2,1
chr9	126776444	.	T	TGGG	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,8:0.170:46:18,5:19,3:0|1:126776444_T_TGGG:126776444:2,36,8,0
chr9	126776445	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,8:0.171:46:18,2:19,1:0|1:126776444_T_TGGG:126776444:2,36,8,0
chr9	126783282	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	126783658	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:126783658_G_T:126783658:0,0,0,1
chr9	126783664	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126783658_G_T:126783658:0,0,0,1
chr9	126783671	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:126783658_G_T:126783658:0,0,0,1
chr9	127064217	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:3,3:8,0:5,6,1,2
chr9	127074972	.	G	GGACGACTGGCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=154,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:127074972_G_GGACGACTGGCC:127074972:0,1,0,1
chr9	127074978	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=172,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:127074972_G_GGACGACTGGCC:127074972:0,2,0,1
chr9	127083725	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:4,2,5,0
chr9	127176289	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr9	127177736	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,5:2,2:0,3,2,5
chr9	127214279	.	C	CGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0|1:127214279_C_CGGGGGGGG:127214279:0,0,3,0
chr9	127214283	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:127214279_C_CGGGGGGGG:127214279:0,0,1,0
chr9	127214287	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:127214279_C_CGGGGGGGG:127214279:0,0,1,0
chr9	127214291	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,0:0,0:0|1:127214279_C_CGGGGGGGG:127214279:0,0,1,0
chr9	127220952	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.597:23:2,6:7,7:2,7,5,9
chr9	127263093	.	C	CAACCTAAATTCTTCTCTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr9	127549553	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=181,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:127549553_T_C:127549553:1,2,1,1
chr9	127549554	.	ATC	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=181,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0|1:127549553_T_C:127549553:1,2,1,1
chr9	127549559	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=181,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:127549553_T_C:127549553:1,2,1,1
chr9	127561559	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:9,6:10,11:12,7,10,7
chr9	127566378	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,4:7,2:11,2,5,1
chr9	127566412	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:13,5,2,0
chr9	127572190	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,1:9,1:7,9,1,1
chr9	127572710	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	127619553	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr9	127619625	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,2:1,7:0,1,6,4
chr9	127619922	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,1,4
chr9	127637215	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,9:0,13:0,0,19,4
chr9	127642999	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=187,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr9	127644882	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr9	127651591	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=181,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:127651591_G_C:127651591:1,2,0,1
chr9	127651596	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=181,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:127651591_G_C:127651591:1,2,0,1
chr9	127651600	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=186,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:127651591_G_C:127651591:1,1,0,1
chr9	127661521	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:127661521_T_C:127661521:0,0,2,1
chr9	127661526	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:127661521_T_C:127661521:0,0,2,1
chr9	127700855	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,0:8,2:10,3,2,0
chr9	127733926	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr9	127757310	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,5,16
chr9	127951072	.	CAAT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AAT;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:9,1:11,3:19,1,4,0
chr9	127975583	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	127982775	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,2:0,0,5,5
chr9	128064242	.	CTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,12;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:0,0:2,0,0,1
chr9	128065175	.	G	GCTCCTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=138,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:3,0:0,1:0|1:128065175_G_GCTCCTGT:128065175:0,3,0,1
chr9	128065177	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=138,173;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128065175_G_GCTCCTGT:128065175:0,3,0,1
chr9	128118096	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:16,3:24,0:13,29,2,1
chr9	128124845	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr9	128201098	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	128206717	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=240,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:2,0:0,4:3,0,4,0
chr9	128284006	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:10,2:8,0:0|1:128284006_T_A:128284006:10,8,1,1
chr9	128284009	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=124,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:0|1:128284006_T_A:128284006:8,8,1,1
chr9	128305538	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=101,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:128305538_GT_G:128305538:0,4,0,1
chr9	128305541	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=101,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:128305538_GT_G:128305538:0,4,0,1
chr9	128327891	.	A	C	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=304.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,83:0.988:83:0,42:0,39:0,0,75,8
chr9	128328020	.	CA	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=25,24;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.688:7:0,0:0,2:0,2,0,5
chr9	128711809	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	128723221	.	GA	TC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,1:0|1:128723221_GA_TC:128723221:0,0,0,6
chr9	128723223	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0|1:128723221_GA_TC:128723221:0,0,0,6
chr9	128723226	.	A	ACTCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:128723221_GA_TC:128723221:0,0,0,5
chr9	128723228	.	TGGA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,1:0|1:128723221_GA_TC:128723221:0,0,0,5
chr9	128724304	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr9	129097817	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr9	129143242	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	129143315	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr9	129154431	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=145,166;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:18,4:12,0:12,18,4,0
chr9	129154448	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=145,166;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.112:34:18,2:11,0:12,18,4,0
chr9	129158002	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.970:32:0,13:0,15:0,0,4,28
chr9	129377855	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:2,4,2,5
chr9	129455372	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:4,0,5,1
chr9	129458092	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,5:5,6:5,4,8,3
chr9	129597074	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:6,2,2,0
chr9	129599148	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129599148_C_T:129599148:0,0,0,1
chr9	129599152	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,245;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129599148_C_T:129599148:0,0,0,1
chr9	129599156	.	GTGGAT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,245;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129599148_C_T:129599148:0,0,0,1
chr9	129600117	.	CT	C,CTT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,19,20;MFRL=176,120,187;MMQ=60,60,60;MPOS=9,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.42,4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,5,4:0.202,0.193:23:7,0,3:6,2,0:10,4,4,5
chr9	129644607	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.542:37:6,15:10,5:8,9,5,15
chr9	129646763	.	G	GT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.119:30:7,2:12,0:6,21,0,3
chr9	129647010	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:13,1:12,1:12,15,1,1
chr9	129740101	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr9	129796818	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=156,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,0:11,2:4,18,1,1
chr9	129812434	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:0|1:129812434_T_C:129812434:0,16,0,2
chr9	129812441	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:129812434_T_C:129812434:0,12,0,2
chr9	129815294	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=225,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:129815294_G_A:129815294:0,2,0,1
chr9	129815303	.	TTA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=185,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:129815294_G_A:129815294:0,1,0,1
chr9	129815309	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=185,146;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:129815294_G_A:129815294:0,1,0,1
chr9	129831455	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr9	129854199	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr9	129930892	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr9	129946445	.	AGT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=201,183;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129946445_AGT_A:129946445:0,1,0,1
chr9	129946448	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=201,183;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129946445_AGT_A:129946445:0,1,0,1
chr9	129979250	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,71;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.225:19:9,0:5,3:2,13,1,3
chr9	130075672	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr9	130104615	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=141,139;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:16,0:8,3:7,17,0,3
chr9	130127691	.	C	CT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:8,1:8,2:2,14,0,3
chr9	130149403	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:4,1,5,0
chr9	130152986	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=128.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,42:0.568:74:13,24:18,18:15,17,19,23
chr9	130155331	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=103,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:10,7:6,5:13,3,10,2
chr9	130162151	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=132,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:6,2,1,1
chr9	130164818	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:130164818_T_C:130164818:0,0,2,0
chr9	130164821	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=130,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.637:3:0,1:0,0:0|1:130164818_T_C:130164818:1,0,2,0
chr9	130164825	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=17,13;MFRL=130,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.637:3:0,0:0,0:0|1:130164818_T_C:130164818:1,0,2,0
chr9	130166382	.	CG	GG,GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31,32;MFRL=0,154,203;MMQ=60,60,60;MPOS=11,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.87,14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,5:0.364,0.550:8:0,1,5:0,2,0:0,0,0,8
chr9	130198100	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	130198342	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr9	130206295	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=83,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr9	130210111	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=93.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,15:0,12:0,0,16,11
chr9	130211854	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=18,13;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.312:24:3,0:5,0:11,5,8,0
chr9	130213110	.	G	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,16:0.288:57:23,9:17,7:17,24,6,10
chr9	130213508	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,24:0.431:56:17,12:15,12:24,8,21,3
chr9	130216951	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,2:2,1:0,4,2,2
chr9	130219669	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,3:2,6:2,4,6,3
chr9	130219743	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr9	130236243	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,2:3,2:2,4,1,3
chr9	130241374	.	G	GCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	130241822	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	130242109	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:6,0,6,1
chr9	130243612	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=210,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:130243612_A_G:130243612:0,2,0,1
chr9	130243615	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=210,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:130243612_A_G:130243612:0,2,0,1
chr9	130251689	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr9	130251835	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=102,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr9	130253655	.	C	CAAGGGGACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	130257507	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=186,199;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr9	130257527	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=192,191;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:6,1,2,0
chr9	130258160	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr9	130263386	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,0,2
chr9	130264990	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.494:23:4,1:2,2:7,5,1,10
chr9	130269210	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:4,11,1,1
chr9	130269786	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr9	130286150	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:0,1,1,6
chr9	130341095	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:4,2:6,0,2,0
chr9	130341112	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=161,111;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:1,2:9,0:8,2,2,0
chr9	130341359	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr9	130413851	.	CCT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:5,1:13,0,2,0
chr9	130425614	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,3:10,0:8,9,2,1
chr9	130476695	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:8,10:7,6:8,7,8,8
chr9	130477260	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	130477768	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.355:11:2,1:5,1:6,1,4,0
chr9	130485618	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:9,5:3,2:4,8,3,4
chr9	130486384	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=117,245;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:0|1:130486384_C_T:130486384:7,3,3,1
chr9	130486385	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=117,245;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:0|1:130486384_C_T:130486384:7,3,3,1
chr9	130488494	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,1:0,5:3,0,5,1
chr9	130489189	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	130489814	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130489814_GA_G:130489814:0,1,0,1
chr9	130489817	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130489814_GA_G:130489814:0,1,0,1
chr9	130489821	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130489814_GA_G:130489814:0,1,0,1
chr9	130491998	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	130493724	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr9	130494811	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	130495504	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=114,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,2:6,1:11,4,2,1
chr9	130495633	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=128,115;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:7,7:5,2:7,5,6,5
chr9	130495890	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=152,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	130504328	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:130504328_A_T:130504328:1,0,0,1
chr9	130504331	.	CGGAGGGCGG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:130504328_A_T:130504328:1,0,0,1
chr9	130524817	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	130548589	.	G	GC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.453:18:5,5:5,3:0,10,0,8
chr9	130570611	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=63,233;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:3,5,2,0
chr9	130570969	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:6,14,0,2
chr9	130571225	.	A	ATTTT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=-1073741814;POPAF=7.30;RPA=20,24;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.534:10:0,1:0,1:0,4,2,4
chr9	130572123	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=253,290;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:130572123_A_G:130572123:1,0,2,0
chr9	130572128	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=253,290;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:130572123_A_G:130572123:1,0,2,0
chr9	130575637	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=200,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:1,1:4,0:0|1:130575637_A_C:130575637:3,4,2,0
chr9	130575642	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=200,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:3,1:4,0:0|1:130575637_A_C:130575637:3,4,2,0
chr9	130578404	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr9	130586662	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,2:13,0:14,9,2,0
chr9	130588203	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:1,7,0,5
chr9	130605316	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	130630233	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=69.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,20,0
chr9	130630584	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr9	130649111	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr9	130657020	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=203,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.878:10:0,5:1,4:1,0,1,8
chr9	130670652	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,14,4
chr9	130670882	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.266:18:6,3:3,0:6,7,0,5
chr9	130670903	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,10:0,3:0,0,1,12
chr9	130672221	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,12:0,6:0,0,16,2
chr9	130678736	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=32,17;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,0:3,0:4,6,0,5
chr9	130678739	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=26,13;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:4,0:4,0:0|1:130678739_A_T:130678739:4,8,0,3
chr9	130678744	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=17,13;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.197:18:3,1:3,0:0|1:130678739_A_T:130678739:4,11,0,3
chr9	130678749	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=20,13;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:4,0:3,0:0|1:130678739_A_T:130678739:3,11,0,3
chr9	130678753	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=17,9;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.220:16:2,0:2,0:0|1:130678739_A_T:130678739:3,10,0,3
chr9	130678755	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=21,10;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.297:15:4,0:5,0:0|1:130678755_A_C:130678755:3,8,0,4
chr9	130678760	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=14,13;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:0,0:0,0:0|1:130678755_A_C:130678755:1,8,0,4
chr9	130710726	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr9	130710791	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	130715817	.	AT	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.309:10:3,0:2,0:3,4,3,0
chr9	130715823	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:4,0:6,8,2,0
chr9	130715922	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,11:0,0,6,21
chr9	130854083	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr9	130854127	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr9	130861039	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr9	130868831	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	130869499	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,8:0,5:0,0,10,4
chr9	130886906	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr9	130889657	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,37;MFRL=186,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr9	130889705	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr9	130913608	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.573:31:6,10:7,7:12,1,14,4
chr9	130914170	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.616:21:3,11:4,2:6,2,12,1
chr9	130914434	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr9	130932373	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:2,6,1,3
chr9	130932396	.	AAC	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr9	130938595	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=55,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:3,1,1,0
chr9	130940630	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:3,1,6,1
chr9	130940822	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr9	130942972	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr9	130950327	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,18;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,0:1,1:0,4,0,4
chr9	130981064	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	130982416	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,2:6,4:1,6,0,6
chr9	130984430	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:8,6:4,2:9,3,7,2
chr9	131001692	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr9	131007001	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,6:3,2:5,1,5,3
chr9	131010065	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:8,0,2,0
chr9	131019625	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:131019625_C_CA:131019625:0,2,0,1
chr9	131019626	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:131019625_C_CA:131019625:0,2,0,1
chr9	131030171	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,16;MFRL=114,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.494:6:2,0:1,0:0|1:131030171_C_G:131030171:0,3,3,0
chr9	131030174	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:1,0:0|1:131030174_T_G:131030174:0,4,3,0
chr9	131030176	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,19;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.309:7:4,0:1,0:0|1:131030171_C_G:131030171:1,4,2,0
chr9	131030182	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:1,0:0|1:131030174_T_G:131030174:0,4,3,0
chr9	131030834	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131030834_GC_G:131030834:0,1,0,1
chr9	131030838	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131030834_GC_G:131030834:0,1,0,1
chr9	131030841	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131030834_GC_G:131030834:0,1,0,1
chr9	131030844	.	AGA	GCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131030834_GC_G:131030834:0,1,0,1
chr9	131040842	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=92,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.301:16:3,1:5,4:7,4,4,1
chr9	131041056	.	G	GT,GTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31,33;MFRL=166,144,206;MMQ=60,60,60;MPOS=30,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.46,3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.299,0.257:11:5,2,0:0,0,2:0,5,0,6
chr9	131047005	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=166,139;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr9	131104964	.	AT	A,ATT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,30,33;MFRL=160,134,144;MMQ=45,40,47;MPOS=10,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.70,7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,3,6:0.110,0.186:33:11,2,2:12,1,4:7,17,5,4
chr9	131186943	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,17;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:131186943_C_G:131186943:0,3,0,1
chr9	131186950	.	T	TGTCACCCTGTGCTTCAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:131186943_C_G:131186943:0,3,0,1
chr9	131186952	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:131186943_C_G:131186943:0,3,0,1
chr9	131186979	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=114,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:131186979_A_T:131186979:0,2,0,1
chr9	131186984	.	G	GCTCATT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=114,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:131186979_A_T:131186979:0,2,0,1
chr9	131244022	.	GAG	TTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:131244022_GAG_TTC:131244022:0,2,0,1
chr9	131244030	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:131244022_GAG_TTC:131244022:0,2,0,1
chr9	131244031	.	A	AGATTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:131244022_GAG_TTC:131244022:0,2,0,1
chr9	131244034	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:131244022_GAG_TTC:131244022:0,2,0,1
chr9	131245231	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=173,187;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,2:1,0:0|1:131245231_A_G:131245231:0,7,0,2
chr9	131245233	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=173,187;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:1,0:0|1:131245231_A_G:131245231:0,7,0,2
chr9	131245249	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=187,204;MMQ=57,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr9	131245267	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=220,147;MMQ=57,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:131245267_C_CA:131245267:0,4,0,1
chr9	131245269	.	G	GTTCAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=220,147;MMQ=57,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:131245267_C_CA:131245267:0,4,0,1
chr9	131247176	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:5,3:3,2:2,7,0,5
chr9	131247256	.	G	GAGGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=208,291;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	131247626	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:2,5:5,4:3,4,7,2
chr9	131250085	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	131250111	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr9	131250366	.	TT	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=190,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	131277769	.	CTTATTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:0,1:4,2,3,0
chr9	131298582	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=161,197;MMQ=60,32;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:1,2:9,0:12,0,2,0
chr9	131298590	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:6,0,8,0
chr9	131300440	.	A	AAATGATAAACTGCTAAGGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	131303522	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr9	131337389	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr9	131337661	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	131340306	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr9	131346479	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr9	131347165	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=143.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.973:34:0,18:0,15:0|1:131347165_G_A:131347165:0,0,11,23
chr9	131347169	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=131.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,14:0,13:0|1:131347165_G_A:131347165:0,0,9,21
chr9	131353989	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	131374165	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr9	131375701	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,11:0,0,8,14
chr9	131380010	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:9,3:11,1:4,16,1,3
chr9	131388643	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr9	131389002	.	T	TGGCCGCTGCCCTGTCCTTCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,7049193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131389002_T_TGGCCGCTGCCCTGTCCTTCA:131389002:0,0,1,0
chr9	131389006	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,7049193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131389002_T_TGGCCGCTGCCCTGTCCTTCA:131389002:0,0,1,0
chr9	131392522	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:5,0,6,1
chr9	131392553	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr9	131398343	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr9	131399314	.	G	GGTGGGAGAATAGTTTTCAAATCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=126,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:2,5,1,1
chr9	131399323	.	A	ACAGAGGGAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr9	131403096	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,14:0,2:0,0,8,8
chr9	131453331	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr9	131454120	.	C	T	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=358.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,107:0.991:107:0,46:0,59:0,0,72,35
chr9	131455903	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=130.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,23:0,16:0,0,23,16
chr9	131456385	.	GTA	G,GTATA,GTATATA	.	.	DP=151;ECNT=1;MBQ=33,34,33,34;MFRL=144,139,142,162;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,21,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=8,7,9,10;RU=TA;STR;TLOD=17.67,217.22,5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,7,68,4:0.070,0.730,0.050:94:6,1,29,1:8,5,36,3:0,15,1,78
chr9	131457080	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	131468251	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=96,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr9	131475951	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr9	131477544	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr9	131479023	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chr9	131482071	.	GCTGGGTGTGCTGCTCTACGAGATGCTGGTGGGTGAGGTGAGTGCTGGAGCCTGTTTCCTGGGCCTCTGGGT	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=98,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.081:49:17,2:11,1:0|1:131482071_GCTGGGTGTGCTGCTCTACGAGATGCTGGTGGGTGAGGTGAGTGCTGGAGCCTGTTTCCTGGGCCTCTGGGT_G:131482071:21,24,1,3
chr9	131482147	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=102,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.342:11:5,1:2,1:0|1:131482071_GCTGGGTGTGCTGCTCTACGAGATGCTGGTGGGTGAGGTGAGTGCTGGAGCCTGTTTCCTGGGCCTCTGGGT_G:131482071:6,1,1,3
chr9	131482467	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr9	131502440	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr9	131502460	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,9:0,2:0,0,0,11
chr9	131505092	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	131549561	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,6:5,5:8,1,11,0
chr9	131550722	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr9	131553768	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr9	131566469	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=263,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr9	131568363	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr9	131570178	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr9	131570183	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr9	131570220	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=209,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131570220_G_GA:131570220:0,1,0,1
chr9	131570222	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=209,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131570220_G_GA:131570220:0,1,0,1
chr9	131583170	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr9	131585205	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr9	131585216	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr9	131585994	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr9	131587240	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr9	131589234	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr9	131591014	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:7,0:19,2,2,0
chr9	131598339	.	GCCA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=115,160;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:5,4,0,2
chr9	131599008	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	131599300	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=199,209;MMQ=60,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr9	131600111	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr9	131600689	.	C	CAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	131603050	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:131603050_GC_G:131603050:1,3,0,1
chr9	131603052	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:131603050_GC_G:131603050:1,3,0,1
chr9	131603056	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:131603050_GC_G:131603050:1,3,0,1
chr9	131603071	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr9	131678606	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:6,6,1,2
chr9	131743701	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34,28;MFRL=145,164,144;MMQ=60,60,54;MPOS=19,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=4.58,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.365,0.311:7:2,2,2:0,1,0:0,2,0,5
chr9	131772389	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=131.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,21:0,0,18,21
chr9	131772907	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.284:38:14,5:11,2:6,21,11,0
chr9	131772912	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.122:43:17,0:15,0:11,26,6,0
chr9	131772919	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=32,9;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.104:40:18,0:18,0:8,28,4,0
chr9	131772922	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=32,21;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.114:41:16,2:15,0:6,31,4,0
chr9	131772927	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.117:41:17,1:16,0:6,31,4,0
chr9	131784726	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr9	131798891	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr9	131804333	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr9	131804396	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:14,3:10,0:17,9,3,0
chr9	131811718	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:8,6,1,1
chr9	131823649	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	131825446	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=15,13;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.575:7:0,1:0,0:3,0,4,0
chr9	131825450	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=21,13;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.293:8:1,0:2,0:0|1:131825450_A_C:131825450:6,0,2,0
chr9	131825453	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:1,0:3,1:0|1:131825450_A_C:131825450:6,1,2,0
chr9	131825457	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.509:8:0,0:3,0:3,1,4,0
chr9	131825462	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,11;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.279:8:1,0:2,0:5,1,2,0
chr9	131825607	.	CT	GG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,0:0|1:131825607_CT_GG:131825607:0,4,0,2
chr9	131825615	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,15;MFRL=50,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:131825607_CT_GG:131825607:0,2,0,2
chr9	131825619	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=12,22;MFRL=99,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,0:0|1:131825607_CT_GG:131825607:0,1,0,2
chr9	131825625	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=99,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:131825607_CT_GG:131825607:0,1,0,2
chr9	131830200	.	A	AGTGTGGGGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.417:5:1,2:1,0:0|1:131830200_A_AGTGTGGGGT:131830200:2,1,1,1
chr9	131830202	.	C	CTGGTCCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:0|1:131830200_A_AGTGTGGGGT:131830200:2,1,1,1
chr9	131832322	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=167,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:131832322_T_G:131832322:0,2,0,1
chr9	131832335	.	CTGGG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=167,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:131832322_T_G:131832322:0,2,0,1
chr9	131832341	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,24;MFRL=175,207;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131832322_T_G:131832322:0,1,0,1
chr9	131857630	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	131857757	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:12,5,2,0
chr9	131862073	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr9	131862705	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr9	131866388	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr9	131871144	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr9	131871435	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr9	131872847	.	GCGCCGC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=CGC;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr9	131882740	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:131882740_T_A:131882740:2,0,1,0
chr9	131882744	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,19;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:131882740_T_A:131882740:3,0,1,0
chr9	131882746	.	GG	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:131882740_T_A:131882740:4,0,1,0
chr9	131882761	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr9	131882927	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:8,16,0,2
chr9	131885524	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=233,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	131896999	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	131898880	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,3,11
chr9	131899846	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,7:0,16:0,0,18,6
chr9	132084885	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr9	132381749	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	132382253	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr9	132395245	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr9	132396281	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,3:0,0,15,0
chr9	132396655	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr9	132401824	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr9	132404304	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr9	132571111	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr9	132584944	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,0:14,2:15,9,2,0
chr9	132593057	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=173,151;MMQ=49,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:12,1,2,0
chr9	132595849	.	A	AT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.178:24:9,3:11,1:10,10,2,2
chr9	132596106	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	132620458	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0|1:132620458_C_A:132620458:0,0,0,11
chr9	132620464	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:132620458_C_A:132620458:0,0,0,10
chr9	132620707	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr9	132623917	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,5:0,0,5,14
chr9	132625417	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr9	132625602	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=110.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,13:0,21:0,0,14,20
chr9	132627480	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:0,3:1,0,7,0
chr9	132627723	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr9	132630231	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	132630664	.	TGAC	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAC;STR;TLOD=131.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,22:0,9:0,0,10,21
chr9	132630822	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	132632162	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=51.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,2,15
chr9	132632859	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=118,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.488:13:1,0:3,1:1,6,0,6
chr9	132635653	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,17,1
chr9	132635944	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr9	132636031	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:132636031_A_G:132636031:0,0,0,2
chr9	132636033	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:132636031_A_G:132636031:0,0,0,2
chr9	132640726	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=128.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,7,30
chr9	132652677	.	G	GGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GA;STR;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr9	132652942	.	G	GGGC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=46,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:132652942_G_GGGC:132652942:3,1,0,1
chr9	132652947	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=128,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:132652947_G_GT:132652947:1,1,0,1
chr9	132652948	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,16;MFRL=46,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:132652942_G_GGGC:132652942:3,1,0,1
chr9	132652951	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=113,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:132652947_G_GT:132652947:0,1,0,1
chr9	132652953	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132652947_G_GT:132652947:0,0,0,1
chr9	132652954	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:132652947_G_GT:132652947:0,0,0,1
chr9	132658044	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr9	132678195	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:10,6:8,5:14,4,11,0
chr9	132689671	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr9	132720720	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=160,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:5,2:8,0,3,0
chr9	132720770	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.439:25:6,4:8,6:12,2,8,3
chr9	132720911	.	TAAAC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=221,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:0,3:5,2:0,5,0,5
chr9	132816398	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr9	132838063	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,17;MFRL=158,145;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.540:7:1,1:1,1:0,3,1,3
chr9	132838092	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=164,145;MMQ=40,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr9	132841808	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	132841843	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr9	132845723	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr9	132845986	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=69,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:0,2,0,7
chr9	132848653	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr9	132861672	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,6:0,2:3,0,8,0
chr9	132862830	.	AA	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	132863035	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=148,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr9	132866883	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr9	132866906	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr9	132887249	.	TAA	T,TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32,30;MFRL=0,160,190;MMQ=60,60,60;MPOS=20,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.75,6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.375,0.500:5:0,1,1:0,1,2:0,0,0,5
chr9	132887285	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,1,3
chr9	132891113	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=219,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0|1:132891113_G_A:132891113:0,3,0,3
chr9	132891115	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:132891113_G_A:132891113:0,0,0,6
chr9	132897231	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	132962801	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr9	132962816	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,2:0,0,10,1
chr9	132963115	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0|1:132963115_T_G:132963115:0,0,10,0
chr9	132963129	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0|1:132963115_T_G:132963115:0,0,11,0
chr9	132963350	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=177.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,29:0,19:0,0,6,45
chr9	132980035	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,8:0,1:0,0,11,0
chr9	132980145	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=125,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:12,8,1,1
chr9	132985111	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,0,11
chr9	132985258	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:132985258_GC_G:132985258:0,0,3,0
chr9	132985262	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:132985258_GC_G:132985258:0,0,3,0
chr9	133028196	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:2,1:0|1:133028196_G_A:133028196:3,0,2,0
chr9	133028204	.	CGGCAGT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGCAGT;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:133028196_G_A:133028196:3,0,2,0
chr9	133057105	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=116,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:0,0:2,3:1,1,3,1
chr9	133058082	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr9	133224090	.	T	TGTGCTGAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr9	133342270	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=218,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr9	133346379	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr9	133346983	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr9	133355874	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	133355902	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=232,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr9	133355935	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133355935_C_CA:133355935:0,0,0,1
chr9	133355936	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133355935_C_CA:133355935:0,0,0,1
chr9	133355940	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133355935_C_CA:133355935:0,0,0,1
chr9	133355941	.	GCGACCTT	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133355935_C_CA:133355935:0,0,0,1
chr9	133472120	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=125,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:2,7,0,3
chr9	133488447	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,5:0,4:0,3,0,9
chr9	133488494	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr9	133489835	.	C	CTTTTCCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	133498017	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=120,135;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:7,2:4,1:0|1:133498017_C_CA:133498017:11,0,3,0
chr9	133498024	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=141,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,4:0.247:18:9,4:5,0:1|0:133498017_C_CA:133498017:14,0,3,1
chr9	133498229	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.597:10:2,2:2,4:0,4,0,6
chr9	133510010	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:133510010_T_G:133510010:3,0,1,0
chr9	133510021	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1|0:133510010_T_G:133510010:1,0,3,0
chr9	133510023	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,35;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:133510010_T_G:133510010:4,0,1,0
chr9	133553993	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,5:0,0,9,8
chr9	133554065	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,4,13
chr9	133556758	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,0:3,1:3,3,1,1
chr9	133710722	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:133710722_G_GC:133710722:0,0,3,0
chr9	133710740	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:133710722_G_GC:133710722:0,0,4,0
chr9	133710804	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:133710804_T_C:133710804:0,0,6,2
chr9	133710819	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0|1:133710804_T_C:133710804:0,0,8,3
chr9	133710852	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,16;MFRL=166,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:6,0:7,1:0|1:133710852_A_C:133710852:11,5,1,1
chr9	133710854	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=168,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:9,2:0|1:133710852_A_C:133710852:12,5,1,1
chr9	133754047	.	C	CTTTATAAATTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=209,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	133779730	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr9	133779756	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr9	133805501	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	133914321	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr9	133914580	.	TG	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr9	133936334	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	133936381	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	133942624	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	133942660	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	133944522	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,5:0,3:0,0,1,10
chr9	133946774	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	133946849	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr9	133962853	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=145.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,30:0,13:0,0,26,17
chr9	133963101	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr9	133967240	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr9	133987060	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr9	133987068	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=149,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0|1:133987068_G_GC:133987068:1,3,1,1
chr9	133987075	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=149,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:133987068_G_GC:133987068:1,3,1,1
chr9	133987077	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=149,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:133987068_G_GC:133987068:1,3,1,1
chr9	133987079	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=149,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,0:0|1:133987068_G_GC:133987068:1,3,1,1
chr9	133995729	.	CAG	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,6:0.152:44:17,5:21,1:0|1:133995729_CAG_C:133995729:2,36,6,0
chr9	133995739	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.069:42:15,0:22,1:0|1:133995729_CAG_C:133995729:2,38,2,0
chr9	134064345	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,19,0
chr9	134076950	.	C	CA,CAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33,33;MFRL=153,164,174;MMQ=60,60,40;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=23.30,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,11,3:0.584,0.189:18:1,5,1:3,6,1:4,0,14,0
chr9	134103810	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:134103810_T_A:134103810:0,0,0,1
chr9	134103811	.	G	GTTTCAAAAAATAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:134103810_T_A:134103810:0,0,0,1
chr9	134105939	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,4:0,0,10,0
chr9	134108716	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=211,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:134108716_C_CCA:134108716:3,0,1,0
chr9	134108718	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=211,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:134108716_C_CCA:134108716:3,0,1,0
chr9	134108719	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=211,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:134108716_C_CCA:134108716:3,0,1,0
chr9	134140113	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=130,176;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:3,2:2,0:1,4,0,4
chr9	134305433	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=162,222;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr9	134323240	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr9	134340500	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,1:6,1:0,16,0,2
chr9	134342939	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=109,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:7,1,8,0
chr9	134346087	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	134348807	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	134348818	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	134349152	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr9	134354022	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=19,27;MFRL=103,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:0,1:0|1:134354022_T_C:134354022:1,0,0,1
chr9	134354024	.	G	GCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=103,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:134354022_T_C:134354022:1,0,0,1
chr9	134354028	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=103,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:134354022_T_C:134354022:1,0,0,1
chr9	134357039	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=112,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:3,2,4,0
chr9	134358657	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr9	134358719	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:7,14:10,1:12,6,12,3
chr9	134360015	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr9	134361581	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr9	134361627	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr9	134381487	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=95,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,8:0,5:1,0,11,2
chr9	134381856	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,2:10,3:8,14,0,5
chr9	134382673	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	134384277	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,13,2
chr9	134384492	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=236,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr9	134384497	.	T	TTTGTTTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=224,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr9	134384500	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	134384506	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=200,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:134384506_G_A:134384506:0,2,0,1
chr9	134384508	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=200,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:134384506_G_A:134384506:0,2,0,1
chr9	134385552	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:0,2,3,3
chr9	134385599	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr9	134386659	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=244,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr9	134386675	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr9	134386903	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr9	134387539	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,0,2
chr9	134388562	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=108,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:1,1:1,3:2,1,3,1
chr9	134394163	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr9	134395628	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr9	134397624	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr9	134398534	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr9	134406131	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr9	134459679	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,12;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:1,0:5,1,3,0
chr9	134463039	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,1:1,1:4,0,2,0
chr9	134465410	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr9	134467578	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.561:25:5,6:5,8:1,10,2,12
chr9	134477579	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,1,4
chr9	134479293	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=162,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr9	134504504	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,1:11,1:20,4,2,0
chr9	134518607	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:8,4:10,5:12,6,7,2
chr9	134952790	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=86.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,22,4
chr9	135073309	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=220,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0|1:135073309_G_A:135073309:5,0,4,0
chr9	135073315	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=220,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:0|1:135073309_G_A:135073309:5,0,5,0
chr9	135117178	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	135139901	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,211;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,0,2
chr9	135144723	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=199,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr9	135147290	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=167,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:135147290_G_C:135147290:0,3,0,1
chr9	135147292	.	CGG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=167,259;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:135147290_G_C:135147290:0,3,0,1
chr9	135150616	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,1:7,8:10,0,9,0
chr9	135150834	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:0,10,0,3
chr9	135152543	.	TA	T,TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30,32;MFRL=181,0,116;MMQ=60,60,60;MPOS=13,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.51,4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.366,0.357:8:2,1,1:0,2,2:0,2,1,5
chr9	135153668	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,5:3,7:1,7,0,12
chr9	135158619	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,4:2,1:2,3,4,1
chr9	135161766	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=174,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,2:1,0,4,2
chr9	135163643	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,50;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,2:0.028:103:46,1:55,1:0|1:135163643_G_A:135163643:32,69,0,2
chr9	135163661	.	G	A	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:86,3:0.043:89:41,0:44,3:1|0:135163643_G_A:135163643:30,56,0,3
chr9	135173454	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.599:18:6,3:1,7:5,2,9,2
chr9	135173758	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,5:3,0:0,5,0,6
chr9	135187128	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,1:2,1:5,1,1,1
chr9	135211584	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=37,28;MFRL=116,122;MMQ=57,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr9	135218047	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,3:6,7:9,4,9,1
chr9	135218268	.	GTAAATAAATAAAAATT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=198,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	135221597	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr9	135221954	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=201,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	135251241	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr9	135271987	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	135273507	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr9	135273759	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr9	135278266	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:135278266_G_A:135278266:0,0,0,1
chr9	135278273	.	C	CCG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=192,146;MMQ=40,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:135278266_G_A:135278266:0,1,0,2
chr9	135278274	.	A	AGTCTTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=192,146;MMQ=40,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:135278266_G_A:135278266:0,1,0,2
chr9	135374764	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:4,3:1,2:6,0,5,0
chr9	135388799	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,0,17
chr9	135412913	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr9	135470176	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr9	135500944	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=119,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,1:1,0,2,0
chr9	135517304	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	135522454	.	AAAGT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:0,2,3,3
chr9	135526546	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,34,33;MFRL=123,185,160;MMQ=60,60,60;MPOS=28,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=T;STR;TLOD=4.60,6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,7:0.124,0.335:19:3,1,0:6,1,6:0,10,2,7
chr9	135536489	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=46,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr9	135536540	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=88,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,2:5,5:5,5,3,4
chr9	135562800	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr9	135601354	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:2,3,0,2
chr9	135603027	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:135603027_GC_G:135603027:0,1,0,1
chr9	135603030	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:135603027_GC_G:135603027:0,1,0,1
chr9	135668240	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	135739226	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:0,5,0,5
chr9	135764081	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	135765261	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:3,6:8,7:7,4,12,1
chr9	135765482	.	T	TTACTTTGGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=222,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:135765482_T_TTACTTTGGG:135765482:0,2,0,1
chr9	135765485	.	A	AGCTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:135765482_T_TTACTTTGGG:135765482:0,3,0,1
chr9	135765486	.	A	AGAAGCCAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:135765482_T_TTACTTTGGG:135765482:0,3,0,1
chr9	135773005	.	A	ATGATGCCTGTTACTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,16;MFRL=188,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:1,3,0,1
chr9	135776034	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:6,0:2,3:6,2,3,0
chr9	135786584	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=218,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr9	135786599	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr9	135862592	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr9	135862632	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=92,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,6:2,3:3,2,7,2
chr9	135895966	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,37;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	135941973	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr9	135946121	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,114;MMQ=60,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:11,2:7,2:1,17,0,4
chr9	135977583	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0|1:135977583_C_T:135977583:0,0,1,10
chr9	135977586	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0|1:135977583_C_T:135977583:1,5,0,5
chr9	135978153	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr9	135979751	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr9	135984211	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:13,2:8,0:10,12,2,0
chr9	136029645	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=59,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:1,2,1,3
chr9	136029746	.	T	TAAAGAACAGAAAAATCAAATTAACAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	136037845	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:2,2:2,2:0,4,2,3
chr9	136081829	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:3,4:3,3:1,6,0,7
chr9	136083801	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,175;MMQ=59,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,0:7,3:9,1,3,0
chr9	136101666	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:2,3,0,5
chr9	136131289	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:1,4,0,6
chr9	136131783	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.729:9:2,0:0,6:0|1:136131783_C_T:136131783:1,1,0,7
chr9	136131785	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,1:0,6:0|1:136131783_C_T:136131783:1,1,0,7
chr9	136132707	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr9	136132957	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	136133582	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr9	136135137	.	GCTTCTGTCCACAC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:1,2:5,1,4,0
chr9	136135195	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=-4;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,2:7,1:5,5,3,0
chr9	136201470	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,1:0,1:0,0,2,2
chr9	136208616	.	A	ATATCCACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:136208616_A_ATATCCACT:136208616:0,4,0,1
chr9	136208618	.	A	AACAGTTAGGCCCCTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:136208616_A_ATATCCACT:136208616:0,4,0,1
chr9	136211248	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr9	136211283	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	136227352	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136227352_C_CA:136227352:0,0,0,1
chr9	136227353	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136227352_C_CA:136227352:0,0,0,1
chr9	136232758	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr9	136233464	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	136234124	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=109.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,15:0,0,19,13
chr9	136260696	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr9	136304446	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:8,4:7,0:8,7,3,1
chr9	136311017	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	136325160	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr9	136339302	.	C	CATTTTCTGACTGTTGACACTCCTCCACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136339302_C_CATTTTCTGACTGTTGACACTCCTCCACT:136339302:0,0,0,1
chr9	136339305	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136339302_C_CATTTTCTGACTGTTGACACTCCTCCACT:136339302:0,0,0,1
chr9	136344053	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=205,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.546:7:1,0:0,2:0|1:136344053_AG_CC:136344053:2,1,4,0
chr9	136344060	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=16,22;MFRL=205,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.546:7:1,1:0,1:0|1:136344053_AG_CC:136344053:2,1,4,0
chr9	136344064	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=205,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.546:7:3,0:0,0:0|1:136344053_AG_CC:136344053:2,1,4,0
chr9	136344066	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=205,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:0,2:0|1:136344053_AG_CC:136344053:2,3,2,0
chr9	136385437	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,10:0,8:0|1:136385437_A_G:136385437:0,0,4,15
chr9	136385453	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0|1:136385437_A_G:136385437:0,0,3,13
chr9	136389751	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:0,2:3,0,3,0
chr9	136390015	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	136401606	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr9	136405042	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	136409580	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:6,4:4,1:5,5,4,2
chr9	136412346	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.530:9:2,3:2,0:0,4,0,5
chr9	136412382	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr9	136421024	.	T	TGAACATAAGCTGTCATTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr9	136426443	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=107,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,2:0,0:0,2,1,2
chr9	136433701	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=151,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.693:8:0,0:1,0:0|1:136433701_T_C:136433701:2,0,6,0
chr9	136433708	.	TC	T,CC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,30,12;MFRL=103,105,187;MMQ=60,60,60;MPOS=6,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.89,8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,6:0.340,0.490:10:0,0,0:0,3,0:1,0,9,0
chr9	136433714	.	TG	CC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=105,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.401:10:2,0:3,0:0|1:136433701_T_C:136433701:6,0,4,0
chr9	136433718	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=105,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.342:9:2,0:4,0:0|1:136433701_T_C:136433701:6,0,3,0
chr9	136439803	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,5:4,5:4,2,9,1
chr9	136509509	.	AT	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,34;MFRL=156,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:136509509_AT_CC:136509509:1,3,0,1
chr9	136509514	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.429:5:0,1:3,1:1|0:136509509_AT_CC:136509509:1,2,0,2
chr9	136509517	.	CTTCGT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:136509509_AT_CC:136509509:0,2,0,1
chr9	136509529	.	AG	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=179,110;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:136509509_AT_CC:136509509:0,1,0,1
chr9	136513136	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=149,268;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:1,0:0,0:0|1:136513136_T_G:136513136:1,2,0,1
chr9	136513140	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=15,35;MFRL=149,268;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:1,0:0,1:0|1:136513136_T_G:136513136:1,2,0,1
chr9	136513172	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=17,36;MFRL=268,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr9	136516926	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:136516926_C_T:136516926:0,4,1,0
chr9	136516928	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:136516926_C_T:136516926:0,3,1,0
chr9	136517519	.	A	ACCTCAGAGAGCTGCAGACCAGACCCCCG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	136522187	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:6,2:1,1:6,2,2,1
chr9	136535677	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.406:37:10,8:12,6:17,5,11,4
chr9	136536633	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,2,1
chr9	136536679	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,4:7,4:7,5,6,2
chr9	136561303	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr9	136561567	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr9	136570005	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr9	136573648	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	136594864	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr9	136594951	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=188,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:136594951_A_C:136594951:0,1,1,1
chr9	136594955	.	CAGCCATCCGGCCCACAGCA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,20;MFRL=188,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:1,2:0|1:136594951_A_C:136594951:0,3,1,1
chr9	136594976	.	TTGCCCACA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=188,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:136594951_A_C:136594951:0,3,1,1
chr9	136596397	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr9	136599315	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr9	136629256	.	CTG	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr9	136629278	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=139,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:5,0:0,2:2,4,1,1
chr9	136629298	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:136629298_A_G:136629298:0,3,0,1
chr9	136629300	.	G	GCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:136629298_A_G:136629298:0,3,0,1
chr9	136637177	.	A	ACACACGGCCCCGGCGGTCACTGCGTGAGGGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.719:13:1,3:2,1:2,1,2,8
chr9	136637242	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:0,3,0,4
chr9	136640086	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:8,1,1,1
chr9	136640226	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr9	136641235	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	136641313	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr9	136648535	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=14,33;MFRL=280,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,2:0,2:1,0,4,0
chr9	136648565	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,0:2,4:5,0,4,0
chr9	136648576	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=128,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,2:1,7:5,0,9,0
chr9	136648611	.	A	AG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.346:18:4,3:8,3:12,0,6,0
chr9	136651065	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:136651065_A_T:136651065:0,1,0,1
chr9	136651072	.	CGTGT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136651065_A_T:136651065:0,0,0,1
chr9	136651078	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136651065_A_T:136651065:0,0,0,1
chr9	136652465	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=116,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr9	136653436	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:8,2,3,1
chr9	136654497	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr9	136654553	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr9	136804211	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,15,3
chr9	136898627	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr9	136905270	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=161,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:0|1:136905270_T_TA:136905270:3,7,1,1
chr9	136905275	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=161,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:136905270_T_TA:136905270:3,7,1,1
chr9	136905280	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=174,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:136905270_T_TA:136905270:2,6,1,1
chr9	136905474	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,1:1,0:0,2,0,2
chr9	136907108	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.683:17:4,6:1,5:3,2,1,11
chr9	136915649	.	G	GCATGAGGGCTGTTGGTGAGACCCGGAATCAGCCCACCAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=96,178;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.384:4:2,0:0,0:1,2,0,1
chr9	137004907	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=227,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,2,1
chr9	137007240	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=205,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr9	137013582	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	137017051	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.598:15:5,3:0,6:4,2,6,3
chr9	137019511	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,4,1
chr9	137293761	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr9	137299912	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=221,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr9	137299949	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=213,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr9	137320855	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr9	137321156	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr9	137328286	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.592:15:4,4:1,4:6,0,7,2
chr9	137328442	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.464:28:9,7:6,5:11,4,6,7
chr9	137620474	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr9	137623601	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	137642787	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr9	137644611	.	C	CCCCTGGCCACCCTCCTGGGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=211,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	137645604	.	C	CCG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137645604_C_CCG:137645604:0,0,1,0
chr9	137645605	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:137645604_C_CCG:137645604:0,0,1,0
chr9	137645611	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:137645604_C_CCG:137645604:0,0,1,0
chr9	137645617	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=230,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:137645604_C_CCG:137645604:1,0,1,0
chr9	137653858	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=114,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:5,1:8,2:6,8,1,2
chr9	137687038	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:1,3:5,6:2,4,5,4
chr9	137688780	.	GCCTGTCCCCTCCAAAACCCA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.516:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr9	137701098	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:5,3:5,4,2,1
chr9	137702035	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:5,9:6,5:8,3,10,4
chr9	137702065	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.407:47:12,10:15,7:19,9,11,8
chr9	137702197	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,5:6,4:0,10,0,9
chr9	137702209	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,3:7,4:0,10,0,7
chr9	137702226	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:0,6,1,5
chr9	137702249	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=194,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:0,4,1,7
chr9	137704616	.	GTGTC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,0;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr9	137707942	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,0:8,5:0,14,0,5
chr9	137708803	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,5:1,0:3,1,4,1
chr9	137709780	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=126,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr9	137714027	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	137715150	.	AT	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr9	137717610	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:5,1:5,4:9,1,4,2
chr9	137734232	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=233,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr9	137772792	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr9	137774545	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=232,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr9	137803188	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr9	137968230	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=240,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	137968919	.	G	GAA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=128.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,10,20
chr9	137968996	.	GCA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:0,1:2,3,1,1
chr9	137979231	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr9	137980061	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:0,4,0,4
chr9	137982127	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=109,130;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:1,3:6,5:6,1,7,2
chr9	137982231	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=84,185;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:5,1:5,0:5,5,0,2
chr9	137982232	.	T	TGTTTG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,22;MFRL=84,185;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.204:13:5,1:5,0:5,6,0,2
chr9	137987959	.	T	TCCAGAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	137987962	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	138011291	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	138379546	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138379546_G_A:138379546:0,0,1,0
chr9	138379555	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138379546_G_A:138379546:0,0,1,0
chr9	138387483	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr9	138391299	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:10,8:10,13:11,9,10,11
chr9	138391517	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,4:5,5:5,3,7,2
chr9	138415201	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,4:2,4:1,4,0,8
chr9	138415238	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr9	138438189	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=148,111;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.506:10:2,1:3,4:0|1:138438189_G_T:138438189:0,5,0,5
chr9	138438190	.	AAGGCTGGCTTCTGACCCCGTGCTCCC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,111;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.506:10:2,1:2,4:0|1:138438189_G_T:138438189:0,5,0,5
chr9	138439005	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=146,106;MMQ=53,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:10,7:4,4:11,3,7,4
chr9	138440525	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=144,154;MMQ=60,48;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.689:11:1,1:2,6:0|1:138440525_C_G:138440525:3,0,4,4
chr9	138440527	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=144,154;MMQ=60,48;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.689:11:0,1:2,6:0|1:138440525_C_G:138440525:3,0,4,4
chr9	138454301	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=62,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr9	138516531	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=81.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,8,14
chr9	138516570	.	CTTTTTTTTTTTTT	C,CTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,35,35,20;MFRL=0,80,162,211;MMQ=60,22,60,24;MPOS=33,23,3;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=23,10,16,39;RU=T;STR;TLOD=3.65,3.37,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,1,1,1:0.331,0.254,0.283:3:0,0,1,1:0,1,0,0:0,0,0,3
chr9	138516587	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=170,162;MMQ=24,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr9	138516607	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=191,80;MMQ=32,22;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:138516607_C_G:138516607:0,4,0,1
chr9	138516612	.	GA	AT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,26;MFRL=191,80;MMQ=32,22;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:138516607_C_G:138516607:0,4,0,1
chr9	138518114	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr9	138557256	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr9	138586309	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	138590138	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr9	138590347	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=104,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.568:28:7,10:5,6:4,8,4,12
chr9	138594228	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:19,2:9,0:10,19,0,2
chr9	138594266	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:0,5,0,7
chr9	138606581	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:138606581_C_CGG:138606581:0,1,0,1
chr9	138606586	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,28;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:138606581_C_CGG:138606581:0,1,0,1
chr9	138642098	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=125,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr9	138642912	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr9	138645716	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:6,0,2,0
chr9	138646990	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=100,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:5,1,2,1
chr9	138651482	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.237:11:4,1:2,1:8,1,2,0
chr9	138656838	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr9	138656862	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,2:1,1:3,0,3,1
chr9	138657053	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:2,2:2,1:1,4,1,2
chr9	138657109	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr9	138660852	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=223,98;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:138660852_T_C:138660852:0,1,0,1
chr9	138660856	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=223,98;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:138660852_T_C:138660852:0,1,0,1
chr9	138660861	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=223,98;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:138660852_T_C:138660852:0,1,0,1
chr9	138660864	.	A	ACCCT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=223,98;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:138660852_T_C:138660852:0,1,0,1
chr9	138660868	.	C	CAAAA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=223,98;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:138660852_T_C:138660852:0,1,0,1
chr9	138660869	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=223,98;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:138660852_T_C:138660852:0,1,0,1
chr9	138660871	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=223,98;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:138660852_T_C:138660852:0,1,0,1
chr9	138662273	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:2,3:5,6:6,2,6,3
chr9	138662309	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,5,9
chr9	138662391	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr9	138662661	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr9	138664522	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:1,3,6,1
chr9	138667320	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:0,3,1,5
chr9	138667356	.	C	CTCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=132,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138667356_C_CTCTCTG:138667356:0,1,0,1
chr9	138667358	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=132,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:138667356_C_CTCTCTG:138667356:0,1,0,1
chr9	138671316	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,3:7,0:2,8,1,2
chr9	138675790	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:138675790_C_G:138675790:0,0,3,0
chr9	138675801	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:138675790_C_G:138675790:0,0,2,0
chr9	138675977	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,3:1,0:0,1,1,3
chr9	138678012	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,14;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:138678012_T_A:138678012:0,0,2,0
chr9	138678017	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=111,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:138678012_T_A:138678012:1,0,2,0
chr9	138678021	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,0:0|1:138678012_T_A:138678012:0,0,3,0
chr9	138678023	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,17;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:0,0:0|1:138678012_T_A:138678012:4,0,2,0
chr9	138678026	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,0:0|1:138678012_T_A:138678012:4,1,2,0
chr9	138679863	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	138679895	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr9	138679911	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.409:13:1,4:5,1:6,2,5,0
chr9	138680039	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,1,3
chr9	138683790	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:138683790_T_C:138683790:0,1,0,3
chr9	138683798	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:138683790_T_C:138683790:0,1,0,3
chr9	138703476	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,1:3,6:0,4,0,7
chr9	138706844	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:4,2:2,0:6,0,3,0
chr9	138707727	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr9	138714215	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:9,10,2,0
chr9	138757088	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:2,6:11,5:11,2,9,2
chr9	138774901	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:16,1:11,1:12,15,2,0
chr9	138829991	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138829991_C_T:138829991:0,0,1,0
chr9	138829997	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:138829991_C_T:138829991:2,0,1,0
chr9	138836941	.	GCCT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=110,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.620:11:1,3:3,4:3,1,5,2
chr9	138838140	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,10:0,0,8,12
chr9	138838163	.	G	GC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=122,108;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,0:10,1:10,6,0,2
chr9	138852814	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr9	138903671	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr9	138904997	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,67;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr9	138905867	.	C	CACGCATTGTATGATCTGATTTATAGGAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=109,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr9	139008671	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,2:4,0:1,17,0,2
chr9	139089679	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	139091460	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=124,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr9	139092398	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:0,5:3,1:3,0,4,3
chr9	139110516	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,2:6,0:7,13,0,2
chr9	139137322	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr9	139232951	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	139244189	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:10,0:6,2:3,14,0,2
chr9	139257411	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,7:5,7:7,1,11,3
chr9	139258462	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr9	139262343	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	139265969	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139265969_G_GA:139265969:0,0,0,1
chr9	139265970	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139265969_G_GA:139265969:0,0,0,1
chr9	139265974	.	G	GGCTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139265969_G_GA:139265969:0,0,0,1
chr9	139270826	.	C	CCGTATCTGCTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=202,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:10,1,1,1
chr9	139272304	.	C	CTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:139272304_C_CTA:139272304:3,0,0,1
chr9	139272313	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:139272304_C_CTA:139272304:4,0,0,1
chr9	139275204	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,2:3,2:4,1,4,0
chr9	139276680	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr9	139277994	.	CGCT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=130,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GCT;STR;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.740:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr9	139299673	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:0,9,0,6
chr9	139299718	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=186,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:139299718_T_A:139299718:0,3,0,1
chr9	139299721	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=186,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:139299718_T_A:139299718:0,3,0,1
chr9	139299723	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,31;MFRL=186,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:139299718_T_A:139299718:0,3,0,1
chr9	139299725	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:139299725_TG_T:139299725:0,3,0,1
chr9	139299726	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,26;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:139299718_T_A:139299718:0,2,0,1
chr9	139299729	.	CCAGA	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,28;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:139299725_TG_T:139299725:0,3,0,1
chr9	139299735	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:139299725_TG_T:139299725:0,2,0,1
chr9	139301583	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,5:5,5:8,1,9,1
chr9	139302015	.	TAA	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,9;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.414:8:1,0:0,0:1,4,0,3
chr9	139302088	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=224,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr9	139302094	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	139302200	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:5,0,2,1
chr9	139305007	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:139305007_C_T:139305007:0,0,2,0
chr9	139305024	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:139305007_C_T:139305007:0,0,3,0
chr9	139305041	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:139305007_C_T:139305007:0,0,3,0
chr9	139305140	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:2,4,1,1
chr9	139306957	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:18,3:14,0:24,8,3,0
chr9	139309192	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=201,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139309192_C_T:139309192:0,1,0,1
chr9	139309195	.	T	TCAAGCTTTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=201,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139309192_C_T:139309192:0,1,0,1
chr9	139309197	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=201,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139309192_C_T:139309192:0,1,0,1
chr9	139312972	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.445:16:4,3:4,2:0|1:139312972_G_T:139312972:7,2,6,1
chr9	139312996	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:6,6:4,3:0|1:139312972_G_T:139312972:7,3,7,2
chr9	139316744	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	139325641	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr9	139327599	.	G	GCGCCCACCCCTCCAGCCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=213,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.389:8:3,1:2,1:1,4,0,3
chr9	139328659	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=167,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139328659_G_A:139328659:0,1,0,1
chr9	139328666	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=167,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139328659_G_A:139328659:0,1,0,1
chr9	139333049	.	GCCCT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCT;STR;TLOD=70.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,11:0,5:0,0,14,2
chr9	139339459	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=143,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr9	139341612	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,1:2,2:5,2,3,0
chr9	139342079	.	GGCAGC	G	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=147,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:10,2:16,0:0|1:139342079_GGCAGC_G:139342079:7,24,1,1
chr9	139342085	.	TTG	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=144,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,2:13,0:0|1:139342079_GGCAGC_G:139342079:5,20,1,1
chr9	139342092	.	GTCTTGGGCATCGAGGTT	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=147,48;MMQ=60,60;MPOS=-14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,2:13,0:0|1:139342079_GGCAGC_G:139342079:3,20,1,1
chr9	139342112	.	AGGTGGGGG	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=14,25;MFRL=158,48;MMQ=60,60;MPOS=-33;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:1,0:0|1:139342079_GGCAGC_G:139342079:2,11,1,1
chr9	139342115	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=15,18;MFRL=190,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.496:12:2,1:0,2:2,4,0,6
chr9	139354097	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,2,0
chr9	139357548	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:3,6,1,1
chr9	139360354	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr9	139360547	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:1,5,1,7
chr9	139399045	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr9	139399070	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr9	139402663	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,0,2
chr9	139402908	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr9	139403268	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr9	139403554	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=13,25;MFRL=140,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.795:6:0,3:0,2:0,1,0,5
chr9	139403560	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=178,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.290:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr9	139405261	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr9	139410177	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr9	139410424	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr9	139411622	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr9	139411714	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr9	139411880	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr9	139412197	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,7:0,0,14,2
chr9	139562993	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr9	139565150	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.460:33:8,6:8,9:5,13,4,11
chr9	139565285	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:0,2:2,1:0,2,3,1
chr9	139566823	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr9	139572068	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:0|1:139572068_C_G:139572068:0,2,0,4
chr9	139572084	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=154,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:139572068_C_G:139572068:0,3,0,1
chr9	139572086	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=15,30;MFRL=189,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:139572068_C_G:139572068:0,2,0,1
chr9	139572093	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=189,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:139572068_C_G:139572068:0,2,0,1
chr9	139572094	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=189,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:139572068_C_G:139572068:0,2,0,1
chr9	139616840	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:139616840_G_A:139616840:0,2,0,1
chr9	139616846	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:139616840_G_A:139616840:0,2,0,1
chr9	139617379	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	139639532	.	CGGCCCACGCACCACACAGCTCCCAACGTGGGCCCCGAGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.831:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	139642961	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr9	139649666	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=139,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:1,6,0,3
chr9	139656618	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,17,0
chr9	139656670	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,20:0,10:0,0,18,12
chr9	139685722	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr9	139686247	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.540:26:7,9:4,5:3,9,2,12
chr9	139686289	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,1:2,4:2,5,3,2
chr9	139686299	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,0:2,3:3,2,2,2
chr9	139686357	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,9,9
chr9	139686556	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=71,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,2,3
chr9	139690738	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:7,0,7,0
chr9	139693452	.	CCCTGGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTGGGG;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr9	139694276	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:0,3,0,5
chr9	139694993	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr9	139697061	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=116,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:2,2:1,3:3,0,5,1
chr9	139699964	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0|1:139699964_T_C:139699964:0,3,0,2
chr9	139699965	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=164,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1|0:139699964_T_C:139699964:0,4,0,1
chr9	139701983	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr9	139730129	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:3,0,4,0
chr9	139731958	.	C	CAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=242,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr9	139734218	.	C	CCCCCCCAGCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,1:0.197:8:4,0:2,1:0,7,1,0
chr9	139734514	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr9	139749926	.	AG	CC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=183,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:1,1:0|1:139749926_AG_CC:139749926:1,4,2,0
chr9	139749934	.	AG	CC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=183,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:1,1:0|1:139749926_AG_CC:139749926:0,5,2,0
chr9	139750964	.	G	GCTCCCACT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=150,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.094:29:13,2:14,0:8,19,0,2
chr9	139752815	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	139754888	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139754888_G_A:139754888:0,0,1,0
chr9	139754897	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139754888_G_A:139754888:0,0,1,0
chr9	139754944	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:2,0,1,0
chr9	139754949	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:139754949_GTT_G:139754949:3,0,1,0
chr9	139754952	.	G	GCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:139754949_GTT_G:139754949:3,0,1,0
chr9	139757858	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,0:15,3:10,20,1,2
chr9	139815068	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	139837990	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,2:7,3:3,7,0,5
chr9	139839904	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,27:0.752:36:1,8:5,13:0,9,8,19
chr9	139840471	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.473:25:6,5:7,5:5,8,6,6
chr9	139840859	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr9	139847570	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr9	139863732	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	139863777	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	139864593	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=151,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr9	139875318	.	C	CCATT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=CATT;STR;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.906:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr9	139878828	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=232,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr9	139879067	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,12:0,6:0,0,6,12
chr9	139879113	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=200,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:4,5:1,3:3,2,5,3
chr9	139887042	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:3,0:2,3:3,2,3,0
chr9	139902786	.	GA	CC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	139903351	.	C	CGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:139903351_C_CGG:139903351:0,0,1,0
chr9	139903360	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:139903351_C_CGG:139903351:0,0,1,0
chr9	139904037	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:2,5:2,3:3,2,4,4
chr9	139904197	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.346:9:3,1:2,0:0|1:139904197_A_C:139904197:1,5,3,0
chr9	139904204	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.290:11:4,1:4,0:0|1:139904197_A_C:139904197:2,6,3,0
chr9	139904208	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.268:12:4,1:4,1:0|1:139904197_A_C:139904197:2,7,3,0
chr9	139904212	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,0:0|1:139904197_A_C:139904197:3,7,2,0
chr9	139906218	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=191,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:139906218_G_T:139906218:2,0,0,1
chr9	139906221	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=191,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:139906218_G_T:139906218:2,0,0,1
chr9	139906224	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=191,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:139906218_G_T:139906218:2,0,0,1
chr9	139906227	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,21;MFRL=191,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:139906218_G_T:139906218:2,0,0,1
chr9	139906513	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,4:0,0:0,2,2,2
chr9	139906686	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr9	139908265	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr9	139909176	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,2:11,0:13,11,1,1
chr9	139910648	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,6,13
chr9	139912178	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:3,2:5,4:3,5,2,5
chr9	139912216	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,533;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:5,3:12,0:11,6,0,3
chr9	139912390	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=159,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.278:18:4,0:5,0:8,5,5,0
chr9	139918788	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:1,1:2,1:0,4,1,1
chr9	139927706	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=92,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:139927706_G_C:139927706:7,9,1,1
chr9	139927710	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=84,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:4,2:0|1:139927706_G_C:139927706:5,9,1,1
chr9	139927714	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=86,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:139927706_G_C:139927706:4,8,1,1
chr9	139943549	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	139944496	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=199.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,49:0.981:49:0,18:0,26:0|1:139944496_T_C:139944496:0,0,19,30
chr9	139944509	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=170.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,16:0,23:0|1:139944496_T_C:139944496:0,0,13,28
chr9	139945051	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	139946804	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,3,3
chr9	139946806	.	G	GAGAGGTCCTCCTTATGGTTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.487:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr9	139960045	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,116;MMQ=60,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:15,4,2,0
chr9	139960178	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr9	139960894	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr9	139964287	.	T	TGGGAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,70;MMQ=60,36;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,0:0,1:0|1:139964287_T_TGGGAA:139964287:0,0,0,1
chr9	139964288	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,70;MMQ=60,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,0:0,1:0|1:139964287_T_TGGGAA:139964287:0,0,0,1
chr9	139964292	.	C	CAGCACTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,70;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139964287_T_TGGGAA:139964287:0,0,0,1
chr9	139964295	.	G	GAGAGTGGCACA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,70;MMQ=60,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:139964287_T_TGGGAA:139964287:0,0,0,1
chr9	139973186	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr9	139973629	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0,0,9,14
chr9	139973634	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=184,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.147:25:10,0:7,1:0|1:139973634_A_C:139973634:4,17,4,0
chr9	139973644	.	CG	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=180,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:8,0:0|1:139973634_A_C:139973634:6,16,2,0
chr9	139973649	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=179,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,2:10,0:0|1:139973634_A_C:139973634:9,15,2,0
chr9	139973652	.	A	G,ACCC	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=0,31,13;MFRL=0,179,220;MMQ=60,60,60;MPOS=14,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=89.45,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,23,2:0.857,0.107:25:0,11,0:0,12,0:0,0,11,14
chr9	139973656	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=179,220;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,1:11,0:0|1:139973634_A_C:139973634:9,16,2,0
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chr9	139990906	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
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chr9	139994102	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr9	139995361	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr9	139996195	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.710:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr9	140001341	.	G	GAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr9	140001978	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr9	140002501	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr9	140002754	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr9	140005383	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:5,3,1,1
chr9	140006491	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,4,10
chr9	140040156	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.906:9:0,0:0,2:0,0,9,0
chr9	140051041	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr9	140055703	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.491:47:15,8:9,15:15,9,9,14
chr9	140055793	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:12,1:24,2:16,20,1,2
chr9	140055876	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,5,12
chr9	140055952	.	G	GCAAGGAAGCAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=157,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140055952_G_GCAAGGAAGCAA:140055952:0,3,0,1
chr9	140055954	.	T	TAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=157,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140055952_G_GCAAGGAAGCAA:140055952:0,3,0,1
chr9	140057924	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:140057924_G_C:140057924:0,0,2,0
chr9	140057928	.	G	GGCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:140057924_G_C:140057924:0,0,2,0
chr9	140057933	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:140057924_G_C:140057924:0,0,1,0
chr9	140057937	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=121,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:140057924_G_C:140057924:1,0,1,0
chr9	140057944	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,32;MFRL=121,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:140057924_G_C:140057924:1,0,1,0
chr9	140057970	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr9	140069922	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=193,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr9	140076325	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140076325_G_A:140076325:1,0,0,1
chr9	140076332	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140076325_G_A:140076325:0,0,0,1
chr9	140086634	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,3:14,0:19,8,3,0
chr9	140108915	.	CTG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=181,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,2:1,2,0,3
chr9	140110274	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,1,3
chr9	140127148	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:8,5:3,9:2,10,6,8
chr9	140130767	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,11;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:1,0:0|1:140130767_A_C:140130767:1,1,1,0
chr9	140130774	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:140130767_A_C:140130767:1,1,1,0
chr9	140130787	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	140138788	.	CAGAT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:1,2:7,6:1,8,0,8
chr9	140139994	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:140139994_T_A:140139994:4,5,1,1
chr9	140139996	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:140139994_T_A:140139994:4,5,1,1
chr9	140146651	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr9	140147094	.	C	CCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr9	140157429	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,3:0,6:0,0,11,0
chr9	140157460	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,3:0,13:0,0,14,2
chr9	140158650	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr9	140158871	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr9	140160940	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.353:16:2,1:1,0:1,9,0,6
chr9	140161634	.	GGGGCT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0|1:140161634_GGGGCT_G:140161634:0,0,12,5
chr9	140161641	.	AGGTGGG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=68.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0|1:140161634_GGGGCT_G:140161634:0,0,12,5
chr9	140161871	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,12:0,0,0,19
chr9	140174663	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=229,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:140174663_A_ATC:140174663:1,1,0,1
chr9	140174665	.	G	GTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=229,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:140174663_A_ATC:140174663:1,1,0,1
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chr9	140175980	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=98,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:2,3,2,0
chr9	140176712	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=171,152;MMQ=60,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:0|1:140176712_A_G:140176712:0,11,0,2
chr9	140176715	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=171,152;MMQ=60,47;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:3,0:0|1:140176712_A_G:140176712:0,11,0,2
chr9	140202194	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr9	140242629	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:8,1:15,1:9,14,2,0
chr9	140246050	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr9	140249253	.	AG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr9	140260953	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=125,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:9,2,0,2
chr9	140268129	.	GTTT	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr9	140268142	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:140268142_T_G:140268142:0,4,0,1
chr9	140268144	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:140268142_T_G:140268142:0,4,0,1
chr9	140277936	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,3:0,5:0,4,0,8
chr9	140289696	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr9	140320792	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:7,6:13,5:10,10,6,5
chr9	140322404	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr9	140322640	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:1,4,0,6
chr9	140322645	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:0,7,1,4
chr9	140323906	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr9	140329671	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:3,2,2,2
chr9	140331833	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,1,11
chr9	140332837	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr9	140343857	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:10,4,1,1
chr9	140344204	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,1:0,3,0,4
chr9	140344328	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:3,5:9,0:12,0,5,1
chr9	140348820	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.403:24:5,0:5,2:8,6,10,0
chr9	140348831	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.368:26:8,2:8,0:5,11,10,0
chr9	140356374	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr9	140357848	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:0|1:140357848_G_C:140357848:3,1,4,1
chr9	140357857	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=172,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:1,0:3,0:0|1:140357848_G_C:140357848:3,3,2,0
chr9	140392494	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr9	140396075	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=189,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:1,3,2,0
chr9	140396212	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=89,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.288:27:8,2:10,3:5,14,3,5
chr9	140399983	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr9	140435087	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=99,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:2,1:2,2:3,1,4,0
chr9	140483076	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,1:1,3:3,2,5,0
chr9	140605334	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=155,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:4,0,4,0
chr9	140605355	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chr9	140672316	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr9	140686492	.	CT	C,CTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32,33;MFRL=141,136,234;MMQ=60,60,60;MPOS=17,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=6.40,4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,4,3:0.172,0.137:26:14,2,1:5,2,2:15,4,3,4
chr9	140728787	.	T	TTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=89,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr9	140733065	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr9	140850231	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,4:3,7:0,8,3,8
chr9	140850311	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:140850311_G_T:140850311:0,2,0,1
chr9	140850316	.	C	CTTTAATTTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140850311_G_T:140850311:0,1,0,1
chr9	140938183	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:2,3:4,5:5,1,6,3
chr9	140948197	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=12,12;MFRL=7731023,211;MMQ=44,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:140948197_G_C:140948197:1,1,1,0
chr9	140948205	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=7731023,211;MMQ=44,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:140948197_G_C:140948197:1,1,1,0
chr9	140948212	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,12;MFRL=7731023,211;MMQ=44,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:140948197_G_C:140948197:1,1,1,0
chr9	140948214	.	C	CTGCAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=7731023,211;MMQ=44,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:140948197_G_C:140948197:1,1,1,0
chr9	140954005	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:140954005_A_C:140954005:1,0,1,0
chr9	140954011	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=60,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:1,0:0,0:0|1:140954005_A_C:140954005:2,0,1,0
chr9	141015902	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=112,134;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,0:3,0:4,5,2,0
chr9	141016320	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:1,6,2,4
chr9	141107536	.	G	GGCA	.	.	DP=149;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=140,121;MMQ=58,55;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=GCA;STR;TLOD=60.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,25:0.331:75:22,13:27,11:33,17,18,7
chr10	94066	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=134,229;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,0:14,4:1,26,2,2
chr10	94083	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=153,134;MMQ=40,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,2:7,2:0,13,0,4
chr10	94103	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=162,138;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:0,9,0,2
chr10	94135	.	G	GGAGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=179,152;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr10	94136	.	C	T,CAATGACGGT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,30,32;MFRL=0,179,152;MMQ=60,40,40;MPOS=7,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.20,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.633,0.246:5:0,2,1:0,2,0:0,0,0,5
chr10	94545	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr10	95074	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,3:0,0,8,1
chr10	95096	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=154,181;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,3:4,5:8,0,7,1
chr10	95226	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=122.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,7:0,19:0|1:95226_A_T:95226:0,0,8,21
chr10	95229	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,7:0,19:0|1:95226_A_T:95226:0,0,8,19
chr10	226073	.	GTA	CAT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=162,129;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:226073_GTA_CAT:226073:2,17,0,2
chr10	226079	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=145,205;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,3:0.199:18:5,0:10,3:1|0:226073_GTA_CAT:226073:2,13,0,3
chr10	226086	.	C	CAAGCCAAAGCATATACACCACAAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=148,129;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:4,0:8,2:0|1:226073_GTA_CAT:226073:2,14,0,2
chr10	282897	.	C	T	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=290.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,90:0.989:90:0,46:0,40:0,0,20,70
chr10	285479	.	G	GTGT,GTGTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,129,133;MMQ=60,60,60;MPOS=12,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.45,10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,4:0.551,0.393:10:0,3,2:0,3,2:0,0,1,9
chr10	292927	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,4,14
chr10	292958	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:2,2:6,0:0,8,2,0
chr10	294565	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	294953	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=178.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,24:0,28:0,0,26,26
chr10	329182	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:4,2:3,2:6,1,3,1
chr10	329188	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:0|1:329188_G_T:329188:3,1,6,1
chr10	329191	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:0|1:329188_G_T:329188:3,1,5,1
chr10	370977	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	371001	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	375570	.	GGGAGCTCAGCAAGGCT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGAGCTCAGCAAGGCT;STR;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.889:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	387060	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr10	394714	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,3,11
chr10	395266	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr10	395439	.	G	GGATCTCTGAGTGCTCGCTAAGTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=139,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1,2,0,1
chr10	395463	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr10	410825	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	412449	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	428503	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	429903	.	GAAA	G,GAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25,28;MFRL=0,161,159;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.02,4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.379,0.498:4:0,2,1:0,0,1:0,0,4,0
chr10	436848	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr10	468748	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	530644	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	861110	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	875287	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:3,2:7,7:10,0,8,2
chr10	890817	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=63,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:890817_G_T:890817:2,0,1,0
chr10	890822	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=63,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:890817_G_T:890817:2,0,1,0
chr10	910225	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,2:9,8:3,13,1,9
chr10	1042023	.	A	AAAC	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=114.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,18:0,0,12,23
chr10	1043058	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,9,0
chr10	1045114	.	A	AATG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=200,141;MMQ=60,37;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:10,1:4,1:0|1:1045114_A_AATG:1045114:0,14,0,2
chr10	1045118	.	GCAT	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=200,141;MMQ=60,37;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:3,1:0|1:1045114_A_AATG:1045114:0,14,0,2
chr10	1055055	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr10	1065458	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,3,1
chr10	1068802	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr10	1070461	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,1:2,4:5,0,5,0
chr10	1070479	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:9,0:14,2,2,0
chr10	1087449	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=18,14;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:0,0:2,0:0|1:1087449_G_C:1087449:0,5,0,2
chr10	1087454	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=170,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:1,2:3,0:0|1:1087449_G_C:1087449:0,4,0,2
chr10	1087478	.	ATCGGCCACCGTAAC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:1087478_ATCGGCCACCGTAAC_A:1087478:0,3,0,1
chr10	1087496	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=207,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1087478_ATCGGCCACCGTAAC_A:1087478:0,2,0,1
chr10	1088746	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,4:2,9:0,6,1,12
chr10	1120547	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,5:2,8:0,4,4,9
chr10	1170304	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:4,4:0,7,1,5
chr10	1230874	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:13,2:10,0:14,10,2,0
chr10	1263076	.	C	T,G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31,13;MFRL=0,131,104;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=23.92,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,2:0.693,0.224:9:0,3,0:0,4,0:0,0,3,6
chr10	1279598	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,13,3
chr10	1577017	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=170,182;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr10	1577067	.	G	GC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=157,160;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,4:3,7:7,0,8,3
chr10	1577218	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:4,3:4,5:3,5,1,7
chr10	1779349	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	3124516	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,13,3
chr10	3143054	.	CAAAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.808:8:0,3:1,4:1,0,6,1
chr10	3145885	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr10	3145906	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,16,3
chr10	3147501	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:1,0,9,1
chr10	3147508	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr10	3147518	.	GG	CC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=167,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:2,1:8,2:10,3,3,0
chr10	3154339	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:2,3:2,2,4,1
chr10	3154534	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:2,5:3,2:1,4,0,8
chr10	3155217	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	3155237	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	3155263	.	TG	CG,CT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29,32;MFRL=0,135,68;MMQ=60,60,60;MPOS=13,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.12,11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.400,0.500:7:0,1,1:0,2,3:0,0,6,1
chr10	3155428	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	3155540	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,6:0,0,14,6
chr10	3155753	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr10	3155768	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=313,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr10	3155770	.	G	A,GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31,32;MFRL=0,313,0;MMQ=60,60,60;MPOS=24,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.22,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,0:0,0,1:0,0,1,1
chr10	3155790	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	3160904	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=176,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:5,9:3,2:7,1,9,3
chr10	3160917	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,8:0,0,15,8
chr10	3161131	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr10	3162033	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr10	3167465	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr10	3174499	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,10,1
chr10	3178076	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr10	3179663	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr10	3179842	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr10	3180951	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr10	3183747	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:8,8:2,3:9,2,11,0
chr10	3185798	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr10	3186458	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,10,7
chr10	3187749	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	3187924	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr10	3190265	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr10	3190298	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,9,6
chr10	3190499	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr10	3199555	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr10	3201010	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	3201097	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=166.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,22:0,24:0,0,41,5
chr10	3202065	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,16,5
chr10	3202140	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0,0,7,14
chr10	3205851	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr10	3208557	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,9:0,0,11,9
chr10	3208581	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr10	3208583	.	A	AGAGGAATGGCACGCTAGGGAAGGC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr10	3214995	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr10	4872769	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,2:2,1:10,0,3,0
chr10	4872887	.	C	A	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,31:0.450:69:20,18:18,11:0|1:4872887_C_A:4872887:23,15,27,4
chr10	4872911	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,29:0.423:69:21,18:16,9:0|1:4872887_C_A:4872887:21,19,24,5
chr10	4875591	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=52.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.477:40:9,13:12,6:10,11,8,11
chr10	4875664	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:2,8:9,2:3,8,3,7
chr10	4877817	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:0|1:4877817_T_G:4877817:5,2,6,0
chr10	4877819	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:2,2:5,4:0|1:4877817_T_G:4877817:5,2,6,1
chr10	4877828	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0|1:4877817_T_G:4877817:6,2,4,2
chr10	4877831	.	TTTG	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0|1:4877817_T_G:4877817:6,2,4,2
chr10	4881823	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=209,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr10	4881846	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=197,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:3,0,4,0
chr10	4881935	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,7:5,6:9,1,9,4
chr10	4882095	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr10	4884075	.	C	CGACTACAGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:1,0:1,2,0,1
chr10	4884642	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.615:24:4,10:5,5:5,4,9,6
chr10	4884721	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,6:4,7:4,5,3,10
chr10	4884784	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=174,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr10	4884800	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr10	4887935	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:4,4:4,1:6,3,3,2
chr10	4889475	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:1,1:7,9:0,8,1,9
chr10	4889525	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:4,4,0,4
chr10	4889640	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:11,7:5,7:11,5,10,4
chr10	4889662	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.420:31:10,7:8,5:13,5,9,4
chr10	4889726	.	C	CA	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.417:41:14,6:10,9:5,19,10,7
chr10	4889770	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:7,6:10,5:3,14,2,9
chr10	4889806	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:1,6,0,3
chr10	5005761	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr10	5014545	.	T	TA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=187,168;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=66.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,28:0.658:42:5,13:9,14:2,12,3,25
chr10	5014678	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,221;MMQ=40,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,1:10,1:20,1,2,0
chr10	5014992	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,165;MMQ=25,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:6,3:9,8:1,14,1,10
chr10	5032240	.	G	GA	.	.	DP=78;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=143,169;MMQ=33,28;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.071:68:31,1:31,2:42,22,2,2
chr10	5032284	.	C	T	.	.	DP=114;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=156,133;MMQ=27,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=142.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,56:0.498:112:29,29:24,25:17,39,21,35
chr10	5032286	.	C	G	.	.	DP=115;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=137,155;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=129.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,55:0.488:112:29,28:24,24:21,36,17,38
chr10	5037696	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=161,123;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:5,4:7,4:5,7,4,4
chr10	5037715	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=161,218;MMQ=27,26;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:9,2:15,4:4,20,1,5
chr10	5037718	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=144,166;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.497:30:4,7:11,7:2,13,3,12
chr10	5037732	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=162,218;MMQ=27,26;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:8,2:15,4:1,22,1,5
chr10	5037913	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,115;MMQ=51,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:13,3:17,0:27,3,3,0
chr10	5041375	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=183,217;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:5,10:4,8:0,9,6,12
chr10	5045834	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=210,203;MMQ=27,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,2:6,1:3,12,1,2
chr10	5140980	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.350:38:14,3:11,10:20,5,10,3
chr10	5141451	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:6,2:22,0,1,1
chr10	5144399	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,0:12,2:5,23,0,2
chr10	5144599	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr10	5144638	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=183,168;MMQ=40,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr10	5144657	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=168,183;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr10	5147909	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,8:2,3:0,5,0,11
chr10	5196273	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,22,2
chr10	5196479	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr10	5199816	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:12,1:5,1:14,3,2,0
chr10	5200013	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=128,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.512:10:0,4:4,1:1,4,0,5
chr10	5200076	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=206,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,2:0,3,0,6
chr10	5200739	.	T	TAGG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,4:0,9:0,0,14,2
chr10	5201979	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=117,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:6,0,7,0
chr10	5202104	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr10	5202241	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:0,8,1,2
chr10	5203579	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=156,272;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr10	5203944	.	AC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,2:5,5:2,10,1,6
chr10	5242256	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,135;MMQ=40,36;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:13,0:25,3:20,18,3,0
chr10	5242346	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=88.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,7:0,19:0,0,1,25
chr10	5260553	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	5260812	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr10	5416196	.	GG	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=66,129775442;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:5416196_GG_TT:5416196:0,4,1,0
chr10	5416202	.	G	GACAGCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=66,129775442;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:5416196_GG_TT:5416196:0,4,1,0
chr10	5435602	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=152,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.495:24:7,4:5,7:8,4,9,3
chr10	5436260	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.657:33:2,10:9,12:2,9,8,14
chr10	5436291	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=130,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:9,0:16,2:5,20,0,2
chr10	5446632	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr10	5446858	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=185,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr10	5446869	.	TAAAGCAGTATAGCTTC	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=185,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5446869_TAAAGCAGTATAGCTTC_T:5446869:0,1,0,1
chr10	5446882	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	5446888	.	TTTA	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=185,78;MMQ=60,60;MPOS=-15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5446869_TAAAGCAGTATAGCTTC_T:5446869:0,1,0,1
chr10	5446895	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=-22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5446869_TAAAGCAGTATAGCTTC_T:5446869:0,0,0,1
chr10	5446897	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5446869_TAAAGCAGTATAGCTTC_T:5446869:0,0,0,1
chr10	5495157	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr10	5498248	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	5541326	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,2:8,2:10,8,2,2
chr10	5568236	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:2,1:4,2:2,4,2,1
chr10	5682641	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr10	5682855	.	TG	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	5683717	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=164,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:3,2:4,3:5,2,4,2
chr10	5691135	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=95,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,0:2,2:0,2,0,3
chr10	5693379	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr10	5766337	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=209.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,32:0,28:0,0,57,4
chr10	5766597	.	TAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	5784509	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,5,14
chr10	5788110	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.790:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	5788601	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=133,63;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:15,0:7,3:8,15,0,3
chr10	5788608	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,7,17
chr10	5790563	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,2:8,0:7,1,2,0
chr10	5790758	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:8,1:9,1:7,10,2,0
chr10	5804455	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,19,0
chr10	5804474	.	G	T,GTTTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,31,35;MFRL=117,161,140;MMQ=60,60,51;MPOS=11,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.42,4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,14,3:0.657,0.215:19:2,5,3:0,9,0:1,1,13,4
chr10	5810379	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=153,16548696;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:0|1:5810379_C_CA:5810379:0,10,1,1
chr10	5810381	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=153,16548696;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,1:0|1:5810379_C_CA:5810379:0,10,1,1
chr10	5827074	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=106.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,18:0,0,28,2
chr10	5837038	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	5853922	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.095:56:8,1:21,1:11,39,0,6
chr10	5853923	.	TAAA	T,TAA,TAAAA	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=30,32,30,30;MFRL=151,166,170,151;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,23,28;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,14,16,18;RU=A;STR;TLOD=3.79,16.55,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:16,2,11,8:0.060,0.299,0.215:37:3,0,2,2:10,2,5,3:3,13,0,21
chr10	5922186	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	5924942	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	5926079	.	AT	CC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	5948226	.	G	GAGTGTGTGGTAGTAGGATAAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=134,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:2,2:2,0:0|1:5948226_G_GAGTGTGTGGTAGTAGGATAAT:5948226:2,2,1,1
chr10	5948230	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=134,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:5948226_G_GAGTGTGTGGTAGTAGGATAAT:5948226:2,2,0,1
chr10	5948232	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=134,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:5948226_G_GAGTGTGTGGTAGTAGGATAAT:5948226:2,2,0,1
chr10	5952854	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr10	5956300	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:15,1:6,1:2,19,0,2
chr10	5957270	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr10	5960209	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	5966192	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr10	5978411	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,13,2
chr10	5978978	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:7,0,7,0
chr10	5979264	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,158;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,0:14,2:11,15,2,0
chr10	5991145	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:7,1,2,0
chr10	5995172	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=102,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:11,2:9,14,2,0
chr10	5995230	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=123,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.109:26:11,0:9,2:10,14,0,2
chr10	6005674	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=120,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:6,6:9,5:12,3,9,2
chr10	6054912	.	AT	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.454:42:10,12:13,6:5,18,8,11
chr10	6054951	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:5,8:5,1:0,11,0,10
chr10	6061277	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,11:0,4:0,0,15,1
chr10	6061479	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,6:10,2:4,13,3,5
chr10	6061499	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,8:6,2:2,7,3,7
chr10	6061781	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=98.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,21,8
chr10	6063383	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr10	6063674	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr10	6066195	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:7,13:10,3:14,4,15,2
chr10	6156118	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=120.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,17:0,21:0,0,3,35
chr10	6257148	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.293:11:3,2:4,0:8,0,3,0
chr10	6258015	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	6258796	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	6258840	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	6259239	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr10	6261704	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=135,48;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr10	6261751	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr10	6268422	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr10	6273170	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=122,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:2,0:4,1,2,0
chr10	6472962	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr10	6484115	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6484115_T_TG:6484115:0,1,0,1
chr10	6484118	.	AG	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:6484115_T_TG:6484115:0,1,0,1
chr10	6527270	.	A	AGGATGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=180,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:6527270_A_AGGATGT:6527270:0,6,1,1
chr10	6527272	.	CAT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=180,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,0:0|1:6527270_A_AGGATGT:6527270:0,6,1,1
chr10	6528132	.	GCA	TGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr10	6531552	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=75,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,4:5,1:0,6,0,5
chr10	6540396	.	T	G	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,3:0.060:64:21,3:33,0:0|1:6540396_T_G:6540396:38,23,3,0
chr10	6540403	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:63,3:0.058:66:26,3:36,0:1|0:6540396_T_G:6540396:36,27,3,0
chr10	7230524	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=212,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,0:2,0,4,0
chr10	7318803	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr10	7423960	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,756;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	7605067	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:8,6:3,7:4,7,7,6
chr10	7605077	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.586:22:6,6:3,6:3,6,8,5
chr10	7605101	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,15,11
chr10	7614992	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=174,140;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:13,0,2,0
chr10	7615021	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=134,199;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,2:11,0:0|1:7615021_G_T:7615021:15,5,2,0
chr10	7615025	.	GC	AT	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=134,199;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:10,0:0|1:7615021_G_T:7615021:15,7,2,0
chr10	7615028	.	A	ATC	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=136,198;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:11,2:10,0:0|1:7615021_G_T:7615021:16,7,2,1
chr10	7615029	.	GTA	G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=134,198;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:11,3:12,0:0|1:7615021_G_T:7615021:16,8,2,1
chr10	7615195	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:2,2:1,5,0,4
chr10	7615228	.	G	GGCTCCTCTGGTTGAGAAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr10	7618491	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7618491_CCT_C:7618491:0,1,0,1
chr10	7618495	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7618491_CCT_C:7618491:0,1,0,1
chr10	7683826	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=212,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:3,0,1,2
chr10	7683873	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:4,2,4,0
chr10	7683991	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,5:6,3:7,7,5,3
chr10	7684120	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=211,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	7697504	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	7697743	.	T	TAAGCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	7745492	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=101,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,5:1,3:3,3,1,7
chr10	7769101	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,0:3,3:2,6,1,2
chr10	7769604	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=80.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,18,3
chr10	7773976	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,3,13
chr10	7776831	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=222,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr10	7785017	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,6:3,2:9,0,8,0
chr10	7788495	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:4,0,8,0
chr10	7808065	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=149,64;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:7,2:7,0:0|1:7808065_A_C:7808065:4,12,1,1
chr10	7808066	.	T	TGCGTGCCAAGGAGCTGGGGGCCAAAGA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,64;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:7,2:9,0:0|1:7808065_A_C:7808065:4,12,1,1
chr10	7811393	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=169,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:7811393_A_G:7811393:0,3,0,1
chr10	7811396	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=169,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:7811393_A_G:7811393:0,3,0,1
chr10	7811399	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=169,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:7811393_A_G:7811393:0,3,0,1
chr10	7811407	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	7816776	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:3,3,4,2
chr10	7820704	.	A	AAACAAC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=AAC;STR;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.670:13:2,4:2,3:4,0,9,0
chr10	7821007	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=208,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr10	7821081	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	7822358	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=297,276;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7822358_T_A:7822358:0,1,0,1
chr10	7822364	.	T	TTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=297,276;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:7822358_T_A:7822358:0,1,0,1
chr10	7829759	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr10	7830319	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,0:0,0,0,6
chr10	7866268	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=179.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,27:0,22:0,0,35,14
chr10	7866617	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7866617_G_GT:7866617:0,0,0,1
chr10	7866619	.	AAA	GCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7866617_G_GT:7866617:0,0,0,1
chr10	8007559	.	GT	CC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr10	8100488	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.230:13:6,0:2,0:0|1:8100488_G_C:8100488:3,7,3,0
chr10	8100492	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:5,2:3,1:0|1:8100488_G_C:8100488:1,8,4,0
chr10	8100497	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:6,1:3,1:0|1:8100488_G_C:8100488:2,8,4,0
chr10	8111409	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,0:7,3:12,1,3,0
chr10	8115668	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8115668_TA_T:8115668:1,0,1,0
chr10	8115692	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=19,18;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:0,0:0|1:8115668_TA_T:8115668:3,0,1,0
chr10	11047508	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=173,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:11047508_A_T:11047508:0,2,0,1
chr10	11047511	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=173,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11047508_A_T:11047508:0,2,0,1
chr10	11047512	.	G	GTTATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=173,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:11047508_A_T:11047508:0,2,0,1
chr10	11207364	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.586:3:1,0:0,0:0|1:11207364_T_G:11207364:0,1,2,0
chr10	11207370	.	CT	GG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=86,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:2,0:0,0:0|1:11207364_T_G:11207364:1,1,2,0
chr10	11207377	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=16,12;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:11207364_T_G:11207364:2,0,1,0
chr10	11207383	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:11207364_T_G:11207364:4,0,1,0
chr10	11290997	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,5:3,6:5,0,11,0
chr10	11299603	.	TCA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=206,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:0,0:4,0,3,0
chr10	11299629	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr10	11316909	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr10	11316987	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.402:30:10,6:8,5:14,4,9,3
chr10	11330525	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=154,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr10	11330548	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr10	11330576	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=183,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr10	11356093	.	T	TTTTG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,12:0,10:0,0,17,6
chr10	11356160	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=96,120;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,5:3,6:2,7,1,10
chr10	11360673	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=99,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,1:9,2:11,4,2,1
chr10	11361240	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11361240_C_CA:11361240:0,1,0,1
chr10	11361241	.	C	CCATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11361240_C_CA:11361240:0,1,0,1
chr10	11367780	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.379:26:9,3:7,7:12,4,8,2
chr10	11505217	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr10	11532758	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=114.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,17:0,14:0,0,34,0
chr10	11532831	.	C	T	.	.	DP=135;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=131,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:119,4:0.039:123:65,3:49,1:74,45,4,0
chr10	11789250	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	11789290	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr10	11789511	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr10	11797342	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=133,169;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.650:4:0,0:0,1:0|1:11797342_AG_A:11797342:0,1,3,0
chr10	11797344	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=133,169;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.650:4:0,0:1,0:0|1:11797342_AG_A:11797342:0,1,3,0
chr10	11797347	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=133,169;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.650:4:0,0:1,0:0|1:11797342_AG_A:11797342:0,1,3,0
chr10	11797619	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	11797675	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=208,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr10	11912332	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr10	11978499	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr10	12020981	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:7,0,6,0
chr10	12046455	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr10	12077085	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.515:39:9,12:9,8:16,3,16,4
chr10	12123666	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr10	12126490	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr10	12126787	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0,7,1,1
chr10	12133410	.	C	CAAAAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,27;RU=A;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.761:2:0,0:0,2:0|1:12133410_C_CAAAAAAAA:12133410:0,0,2,0
chr10	12133430	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=172,181;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:12133410_C_CAAAAAAAA:12133410:2,0,2,0
chr10	12140030	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr10	12159647	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,6,5
chr10	12162338	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=150,162;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.188:26:9,2:8,2:0,21,0,5
chr10	12162363	.	CA	TG	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=176,129;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.163:23:14,1:4,2:0,20,0,3
chr10	12162789	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,4:3,2:7,3,2,4
chr10	12185091	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:1,2:2,4:3,0,1,5
chr10	12197259	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	12198832	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,4:4,6:7,0,9,1
chr10	12203197	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr10	12206193	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr10	12215870	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=130,143;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:2,3:1,2:0,3,0,6
chr10	12226870	.	GA	G,GAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33,26;MFRL=175,0,150;MMQ=60,60,60;MPOS=12,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.17,4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,3,4:0.142,0.174:24:6,3,0:10,0,2:12,5,5,2
chr10	12227067	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	12240640	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:3,6:5,8:8,0,14,0
chr10	12240691	.	GT	G,GTT	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=34,34,34;MFRL=159,134,62;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=45.69,6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,23,4:0.503,0.112:43:4,13,0:12,10,4:14,2,22,5
chr10	12280346	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=225,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr10	12288347	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	12595147	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=202,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.650:6:1,3:0,1:2,0,4,0
chr10	12595443	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	12866356	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr10	12870714	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	12940377	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,20,4
chr10	12940432	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,17:0,11:0,0,17,12
chr10	12940455	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,16:0,16:0,0,19,13
chr10	13152504	.	GTT	G,GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=19,20,31;MFRL=182,121,145;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.37,29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,12:0.183,0.716:16:0,1,6:0,1,1:0,1,0,15
chr10	13154661	.	T	TGTGAGTTTTTCTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=117,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:1,8,1,1
chr10	13167860	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,24,0
chr10	13175682	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr10	13178697	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr10	13212884	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:3,2,3,0
chr10	13214812	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:3,4:4,6:0,7,0,11
chr10	13224886	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=92,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:2,1,5,0
chr10	13225119	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr10	13233471	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=56,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr10	13237015	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr10	13264281	.	C	CTGTCTGGGAGGTGAGGAGCGTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	13271513	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:1,0:3,0,2,0
chr10	13271615	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=88,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:20,3:16,0:14,22,0,3
chr10	13275514	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=69.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,15,6
chr10	13275676	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,3:0,6:0,0,6,5
chr10	13275691	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,5:1,2:2,2,5,2
chr10	13320411	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr10	13323031	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:0|1:13323031_T_C:13323031:7,11,1,1
chr10	13323036	.	C	CGCACTTAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=153,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:13323031_T_C:13323031:5,10,1,1
chr10	13337673	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=198,153;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13337673_CA_TG:13337673:0,1,0,1
chr10	13337678	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=198,153;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13337673_CA_TG:13337673:0,1,0,1
chr10	13337683	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=198,153;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13337673_CA_TG:13337673:0,1,0,1
chr10	13337685	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=198,153;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13337673_CA_TG:13337673:0,1,0,1
chr10	13340293	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:4,8:7,6:0,12,1,13
chr10	13340304	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:9,2:0|1:13340304_T_C:13340304:0,21,0,2
chr10	13340314	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:13340304_T_C:13340304:0,15,0,2
chr10	13340339	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=193,193;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr10	13341378	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:8,1:4,6:7,6,5,2
chr10	13341579	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=205,243;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr10	13341900	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	13370315	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,14:0,5:0,0,19,0
chr10	13378181	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	13378412	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,34;MFRL=207,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:13378412_T_G:13378412:0,1,0,1
chr10	13378418	.	A	AAG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=182,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:13378412_T_G:13378412:0,2,0,1
chr10	13378420	.	G	GATACT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=182,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:13378412_T_G:13378412:0,2,0,1
chr10	13378421	.	G	GTTCAGTTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=182,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:13378412_T_G:13378412:0,2,0,1
chr10	13378445	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	13494594	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,25:0.506:50:7,15:15,9:11,14,17,8
chr10	13534851	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,1:4,6:4,3,2,5
chr10	13538984	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:13538984_A_AT:13538984:0,0,0,1
chr10	13538987	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:13538984_A_AT:13538984:0,0,0,1
chr10	13541724	.	T	TAAAAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:4,4:8,5:9,3,9,2
chr10	13633835	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=119,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,30:0.462:66:16,17:13,12:24,12,24,6
chr10	13633914	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=9;MBQ=29,20;MFRL=138,77;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,5:0.079:65:19,3:35,1:30,30,2,3
chr10	13633925	.	A	AG	.	.	DP=61;ECNT=9;MBQ=21,21;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.123:46:15,2:20,3:15,25,3,3
chr10	13633928	.	GT	G,GTT	.	.	DP=68;ECNT=9;MBQ=33,33,31;MFRL=158,146,135;MMQ=60,60,60;MPOS=24,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=5.76,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,8,3:0.211,0.079:33:10,2,0:9,6,3:7,15,4,7
chr10	13633929	.	T	G	.	.	DP=66;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,17:0.327:49:14,6:15,9:16,16,3,14
chr10	13633930	.	T	G	.	.	DP=66;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=139,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,7:0.128:53:24,2:18,5:20,26,1,6
chr10	13633942	.	T	TG	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=156,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:18,2:25,0:0|1:13633942_T_TG:13633942:15,29,0,2
chr10	13633944	.	GCC	G	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=154,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:15,2:18,0:0|1:13633942_T_TG:13633942:14,31,0,2
chr10	13633947	.	ATGGCTC	A	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=30,31;MFRL=147,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:12,2:20,0:0|1:13633942_T_TG:13633942:13,32,0,2
chr10	13658335	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr10	13693883	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:11,8:9,6:12,8,8,6
chr10	13708147	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:19,2:6,0:19,6,1,1
chr10	13717076	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=190,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,2:1,1:0,2,0,4
chr10	13743251	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr10	13743517	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=128,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr10	13749104	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=153,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:0|1:13749104_A_T:13749104:4,10,1,1
chr10	13749107	.	GGA	CTC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=142,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,2:0|1:13749104_A_T:13749104:4,9,1,1
chr10	13749111	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=142,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,2:0|1:13749104_A_T:13749104:3,8,1,1
chr10	13749112	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=153,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:13749104_A_T:13749104:3,7,1,1
chr10	13780008	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	13782109	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0|1:13782109_G_A:13782109:5,0,2,0
chr10	13782110	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,5:0.670:7:1,3:1,2:1|0:13782109_G_A:13782109:2,0,5,0
chr10	13782124	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0|1:13782109_G_A:13782109:0,0,11,1
chr10	13782605	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:1,4:1,4,1,6
chr10	13838604	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=135,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:1,3,2,5
chr10	13838659	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=192,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr10	14050182	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:14050182_T_G:14050182:0,4,0,1
chr10	14050184	.	T	TGGAGGGTAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:14050182_T_G:14050182:0,4,0,1
chr10	14563097	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr10	14882040	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.488:43:13,9:9,12:9,13,9,12
chr10	14882060	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.553:29:6,7:4,8:8,5,6,10
chr10	14885598	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,7:4,4:4,4,2,9
chr10	14891904	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	14943176	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,27:0.451:60:20,17:13,9:14,19,13,14
chr10	14974843	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=104,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:2,6:4,5:2,4,8,3
chr10	14976290	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,183;MMQ=60,44;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,0:7,2:10,0,2,0
chr10	15014418	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:15014418_C_G:15014418:0,0,5,0
chr10	15014440	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0|1:15014418_C_G:15014418:0,0,7,0
chr10	15014698	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0|1:15014698_C_T:15014698:0,0,0,6
chr10	15014702	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0|1:15014698_C_T:15014698:0,0,0,7
chr10	15106379	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:8,1,4,3
chr10	15106515	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,3:4,2:0,8,1,5
chr10	15107717	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:13,2:14,0:1,27,1,1
chr10	15120865	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,5:4,5:5,2,7,3
chr10	15138906	.	G	GAGGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr10	15151324	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=214,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr10	15151344	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,16;MFRL=201,195;MMQ=46,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:15151344_CA_TG:15151344:0,2,0,1
chr10	15151349	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=201,195;MMQ=46,36;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:15151344_CA_TG:15151344:0,2,0,1
chr10	15151354	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=201,195;MMQ=46,36;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:15151344_CA_TG:15151344:0,2,0,1
chr10	15154974	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=103.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0,0,5,26
chr10	15255627	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:13,3,2,0
chr10	15290894	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	15573205	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr10	15590372	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=44.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr10	15600271	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr10	15648243	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:6,2:5,3:11,1,3,2
chr10	15685983	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	15686306	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:15686306_A_T:15686306:0,0,0,1
chr10	15686311	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15686306_A_T:15686306:0,0,0,1
chr10	15701093	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:6,6:7,6:1,12,0,12
chr10	15713507	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:6,0,6,0
chr10	15713541	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,16,3
chr10	15713667	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=93,172;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.904:18:1,9:0,7:0,1,4,13
chr10	15729923	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr10	15761527	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	16547116	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,1:12,1:5,16,0,2
chr10	16556620	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=164,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:0|1:16556620_A_C:16556620:3,15,1,1
chr10	16556625	.	C	CCTTA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=164,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:6,2:0|1:16556620_A_C:16556620:3,15,1,1
chr10	16736977	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	16737165	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.660:3:0,0:1,1:0|1:16737165_G_GAA:16737165:1,0,2,0
chr10	16737166	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.725:4:0,2:1,1:0|1:16737165_G_GAA:16737165:1,0,2,1
chr10	16794490	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:4,1,5,1
chr10	16876922	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=26,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	16878204	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,19,2
chr10	16883132	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	16945905	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=76.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,21,0
chr10	16948177	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=111.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,27,3
chr10	16948350	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,165;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.084:34:12,0:19,2:15,17,0,2
chr10	16949447	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr10	16949778	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	16962079	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:8,0:20,3:14,14,0,3
chr10	16967401	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,28:0,23:0,0,12,39
chr10	16967445	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=97.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,10:0,0,4,22
chr10	16967447	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=166,170;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:11,4:4,6:2,14,2,8
chr10	16967681	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,173;MMQ=50,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:13,9,2,0
chr10	16975078	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:5,5,2,3
chr10	16979593	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:4,2,4,4
chr10	17024404	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	17026010	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr10	17032281	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,15,0
chr10	17032559	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,1:0,3:0|1:17032559_A_C:17032559:0,0,0,5
chr10	17032561	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:17032559_A_C:17032559:0,0,0,5
chr10	17032601	.	A	AAAAATATCTTAAAGGTCATTCCATC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=76,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr10	17110595	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.466:41:10,10:11,9:17,5,13,6
chr10	17113456	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:10,8:11,14:12,9,15,7
chr10	17126552	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr10	17141952	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	17142242	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:2,9,0,2
chr10	17146667	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr10	17157630	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,11:0,0,4,17
chr10	17164760	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr10	17171265	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,2,17
chr10	17194118	.	A	AAAAGTCACC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:2,6,0,2
chr10	17195428	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr10	17199419	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,6:0,16:0,0,15,7
chr10	17199871	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,498;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	17202380	.	A	AC	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.121:37:11,0:22,3:0|1:17202380_A_AC:17202380:10,23,0,4
chr10	17202381	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=19,32;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.121:37:4,1:11,2:0|1:17202380_A_AC:17202380:10,23,0,4
chr10	17203598	.	AAAAGT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,13:0,0,0,22
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chr10	17204246	.	TAA	T,TA	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,20,28;MFRL=127,118,136;MMQ=60,60,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.29,21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,14:0.179,0.541:21:2,2,6:2,0,5:0,4,3,14
chr10	17204247	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=19,31;MFRL=110,127;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.942:26:0,14:1,9:0,2,4,20
chr10	17204248	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.639:25:4,11:4,6:1,7,3,14
chr10	17210822	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,3,7
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chr10	17243480	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr10	17271400	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:1,4:4,0,7,0
chr10	17279211	.	G	GT	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,6:0.089:70:28,1:34,4:54,10,2,4
chr10	17645700	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,3:9,6:9,8,3,6
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chr10	17726648	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=198,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:2,10:5,8:7,0,18,0
chr10	17737158	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,1:11,1:6,18,0,2
chr10	17750968	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.407:35:14,8:6,6:3,18,2,12
chr10	17869601	.	A	AGTGTCTGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:17869601_A_AGTGTCTGT:17869601:0,0,0,1
chr10	17869604	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,261;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17869601_A_AGTGTCTGT:17869601:0,0,0,1
chr10	17869605	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,261;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17869601_A_AGTGTCTGT:17869601:0,0,0,1
chr10	17869610	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,261;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17869601_A_AGTGTCTGT:17869601:0,0,0,1
chr10	17905703	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=168,140;MMQ=27,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:20,3:22,1:9,34,2,2
chr10	17951300	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=132,133;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.258:15:6,3:5,1:3,8,0,4
chr10	18198213	.	A	AT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,139;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.737:16:2,3:2,8:0,4,2,10
chr10	18198368	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=256,254;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:18198368_C_CA:18198368:0,1,0,1
chr10	18198369	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=256,254;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:18198368_C_CA:18198368:0,1,0,1
chr10	18254688	.	C	CTTTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18254688_C_CTTTG:18254688:0,1,0,1
chr10	18254689	.	C	CTCTCAGAATATGAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18254688_C_CTTTG:18254688:0,1,0,1
chr10	18254693	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18254688_C_CTTTG:18254688:0,1,0,1
chr10	18254696	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,26;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0|1:18254688_C_CTTTG:18254688:0,1,0,1
chr10	18266783	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr10	18267096	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr10	18270208	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,5:4,2:6,1,8,0
chr10	18270422	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr10	18276586	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr10	18280054	.	C	CTTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=212,68;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=T;STR;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,2:1,2:5,0,2,2
chr10	18280083	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=146,168;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,0:6,0:13,4,3,0
chr10	18289821	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr10	18292035	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=62,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr10	18691018	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr10	18816633	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	18828663	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0|1:18828663_G_T:18828663:0,0,5,6
chr10	18828669	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,3:0|1:18828663_G_T:18828663:0,0,5,6
chr10	18836957	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	18840919	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=213,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:2,1:2,2:0,4,0,4
chr10	18875109	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=201,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	18898701	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr10	18898729	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,5:6,6:9,1,11,1
chr10	18898960	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr10	18903605	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	18931512	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,12:0,0,2,21
chr10	18931580	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=208,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr10	18937579	.	A	AAAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr10	18940157	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:13,2:7,1:4,17,1,2
chr10	18957647	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,1,2
chr10	18962966	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.240:22:9,4:8,0:8,9,2,3
chr10	18964097	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.464:39:12,10:9,8:16,5,14,4
chr10	19492566	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	19492832	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,11:0,0,4,16
chr10	19493144	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr10	19493415	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,11:0,5:0,0,0,17
chr10	19571941	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.550:20:6,5:2,6:8,1,9,2
chr10	19620285	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:9,2:4,1:12,2,3,0
chr10	19620559	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr10	19620601	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=195,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	19641277	.	A	AGCAGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr10	19641289	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19641289_G_C:19641289:0,1,0,1
chr10	19641293	.	A	AGAACAAGGTAGAGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:19641289_G_C:19641289:0,1,0,1
chr10	19676384	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	19678286	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	19678602	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr10	19739419	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=109,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:2,0:10,2:0|1:19739419_G_A:19739419:5,8,1,1
chr10	19739426	.	T	TTTACTTTTTTAAAAGAAAATA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=125,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:8,2:0|1:19739419_G_A:19739419:4,7,1,1
chr10	19739459	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,1:0,11:0,0,1,11
chr10	19856548	.	G	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=136,83;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.082:58:30,0:23,3:23,31,0,4
chr10	19896830	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr10	20105936	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	20106026	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=182,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr10	20290956	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,0:3,4:1,6,0,4
chr10	20500743	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:1,8,0,3
chr10	20534333	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,5:3,3:6,2,5,4
chr10	21074724	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,4:7,6:8,3,5,5
chr10	21098879	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=115,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:0,0:1,4,1,2
chr10	21108377	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,15:0.435:35:13,8:6,7:0|1:21108377_C_T:21108377:10,10,8,7
chr10	21108395	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:31,2:0.086:33:17,2:13,0:1|0:21108377_C_T:21108377:15,16,0,2
chr10	21134086	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=213,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr10	21141469	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,7:0,0:0,0,4,4
chr10	21147370	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr10	21148584	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=119.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,22:0,13:0,0,36,2
chr10	21157492	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr10	21157763	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=195,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:1,4:0,6:0,1,0,11
chr10	21176945	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,19,1
chr10	21177156	.	GA	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=46.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.526:38:9,13:8,7:5,13,5,15
chr10	21185821	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr10	21188197	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr10	21250782	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=204,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:21250782_G_T:21250782:0,4,0,1
chr10	21250787	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=206,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:21250782_G_T:21250782:0,3,0,1
chr10	21250791	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=204,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21250782_G_T:21250782:0,2,0,1
chr10	21784647	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr10	21806019	.	AGGC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GGC;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:4,1:5,1:17,0,2,0
chr10	21807469	.	G	GA,GAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,33,21;MFRL=153,159,0;MMQ=60,60,60;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,16;RU=A;STR;TLOD=6.87,5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,2:0.334,0.215:12:2,1,0:1,2,1:3,3,5,1
chr10	21807779	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,35,34;MFRL=128,151,142;MMQ=60,60,60;MPOS=24,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=T;STR;TLOD=7.73,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.377,0.227:11:1,2,2:2,2,0:4,1,3,3
chr10	21875205	.	CT	C,CTT	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=149,164,157;MMQ=60,60,60;MPOS=13,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=13.42,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:45,11,5:0.179,0.093:61:25,6,5:14,5,0:37,8,16,0
chr10	21962230	.	T	TGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,0:0|1:21962230_T_TGGGGG:21962230:0,0,1,0
chr10	21962238	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21962230_T_TGGGGG:21962230:0,0,1,0
chr10	22193422	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=187.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,28:0,25:0,0,45,8
chr10	22193463	.	C	G	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=124,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,3:0.045:86:45,1:36,2:52,31,2,1
chr10	22218003	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,1:5,1:10,4,2,0
chr10	22607160	.	G	GT	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.053:71:36,2:32,1:14,54,2,1
chr10	22618172	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,193;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:7,2,2,0
chr10	22676732	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.295:12:6,1:3,2:7,2,3,0
chr10	22826093	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=78.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,17,6
chr10	22828833	.	AGAGAGAGG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr10	22828861	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=105,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:3,3:10,0:14,5,2,1
chr10	22830719	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,10:0,0,16,5
chr10	22856884	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:22856884_T_A:22856884:0,4,0,2
chr10	22856891	.	GG	AC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:22856884_T_A:22856884:0,3,0,1
chr10	22856893	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=196,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:22856884_T_A:22856884:0,2,0,1
chr10	22896779	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,10:0,0,17,4
chr10	23220883	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:7,0,6,1
chr10	23250949	.	G	GCTCTGTCGCCC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,165;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.124:26:7,0:12,1:0|1:23250949_G_GCTCTGTCGCCC:23250949:7,17,0,2
chr10	23250950	.	A	AGGCTGGAGTGCAGTGGC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=129,165;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.125:25:7,1:12,0:0|1:23250949_G_GCTCTGTCGCCC:23250949:7,16,0,2
chr10	23257481	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=204,192;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:23257481_T_A:23257481:0,4,0,1
chr10	23257484	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=204,192;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:23257481_T_A:23257481:0,4,0,1
chr10	23257490	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=204,192;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:23257481_T_A:23257481:0,4,0,1
chr10	23297301	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.480:42:14,7:6,13:7,15,4,16
chr10	23297336	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,3:3,9:1,9,2,10
chr10	23303092	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:8,1:2,1:4,6,1,1
chr10	23393226	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,0:4,6:0,5,0,6
chr10	23408259	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,3:13,0:14,7,3,0
chr10	23493285	.	AG	TT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23493285_AG_TT:23493285:0,0,0,1
chr10	23493289	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23493285_AG_TT:23493285:0,0,0,1
chr10	23493290	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23493285_AG_TT:23493285:0,0,0,1
chr10	23730496	.	G	GT	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.096:60:25,4:27,1:24,31,4,1
chr10	24498302	.	A	AGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:24498302_A_AGT:24498302:0,2,0,1
chr10	24498303	.	A	AAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:24498302_A_AGT:24498302:0,2,0,1
chr10	24784014	.	TAAAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.257:6:3,1:1,0:5,0,1,0
chr10	24810930	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	24817139	.	A	ACCTCTCGCTAAAATCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	24831574	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.263:27:11,4:9,3:9,11,6,1
chr10	24878129	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,20,3
chr10	24880712	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,1:5,7:1,6,4,4
chr10	24883773	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=94,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:2,5:0,5:2,0,10,0
chr10	24884779	.	GA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:6,7:7,5:9,4,5,7
chr10	24889901	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,4:6,3:0,12,0,7
chr10	24890828	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=118.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,38:0.569:67:14,17:13,21:28,1,37,1
chr10	24909040	.	G	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=135,140;MMQ=57,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.082:58:26,2:27,2:18,36,2,2
chr10	25140411	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,3:0,0,0,6
chr10	25140413	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=199,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:2,0:0,1:0,5,0,1
chr10	25231171	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=150,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:0,1:2,0:2,0,1,1
chr10	25273295	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:3,1,0,1
chr10	25273311	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,0:0,1,1,2
chr10	25304972	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=208,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:2,0:0,7,0,2
chr10	25464309	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr10	25755734	.	CAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr10	25877859	.	TAAAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr10	25878149	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	25885804	.	C	CTGTGGCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25885804_C_CTGTGGCTG:25885804:0,1,0,1
chr10	25885805	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25885804_C_CTGTGGCTG:25885804:0,1,0,1
chr10	26243710	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr10	26310403	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,3:4,1:4,2,4,0
chr10	26310410	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,1:2,3:5,0,2,2
chr10	26310650	.	C	CTCCCCTACTCCCCCCACTAGATCGTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=162,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:26310650_C_CTCCCCTACTCCCCCCACTAGATCGTG:26310650:2,2,0,1
chr10	26310654	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=162,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:26310650_C_CTCCCCTACTCCCCCCACTAGATCGTG:26310650:2,2,0,1
chr10	26310679	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr10	26355862	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:26355862_G_T:26355862:0,0,7,0
chr10	26355872	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:26355862_G_T:26355862:0,0,6,0
chr10	26355906	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr10	26355992	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr10	26356014	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr10	26356037	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr10	26356066	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr10	26357625	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	26357747	.	CG	TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,14,3
chr10	26357820	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,3,18
chr10	26359180	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,9:0,0,14,8
chr10	26359200	.	T	TA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=87.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,11:0,0,19,8
chr10	26385222	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,3,0
chr10	26417531	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	26436287	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	26443646	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr10	26446141	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:5,0,8,0
chr10	26457585	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr10	26463569	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:0,6,0,6
chr10	26463587	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr10	26490260	.	C	G	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,11:0.106:111:51,6:47,5:49,51,5,6
chr10	26490362	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:16,2:5,1:0,21,0,3
chr10	26506999	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.450:29:9,5:6,7:0,16,0,13
chr10	26575221	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=129,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr10	26781157	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr10	26781388	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,7:2,2:0,2,1,8
chr10	26802633	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=193,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.830:9:0,3:1,4:0,1,1,7
chr10	26825150	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.426:12:4,1:2,2:0|1:26825150_AG_A:26825150:3,4,0,5
chr10	26825152	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,9;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.426:12:4,0:3,0:0|1:26825150_AG_A:26825150:3,4,0,5
chr10	26851429	.	T	TACTGCTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=226,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:26851429_T_TACTGCTG:26851429:0,1,0,1
chr10	26851433	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=226,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26851429_T_TACTGCTG:26851429:0,1,0,1
chr10	26991188	.	CG	GT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26991188_CG_GT:26991188:0,0,0,1
chr10	26991195	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,36;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26991188_CG_GT:26991188:0,0,0,1
chr10	26991200	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26991188_CG_GT:26991188:0,0,0,1
chr10	26991203	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26991188_CG_GT:26991188:0,0,0,1
chr10	26991211	.	A	ATGTG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26991188_CG_GT:26991188:0,0,0,1
chr10	26991214	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26991188_CG_GT:26991188:0,0,0,1
chr10	26994150	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,5:4,6:7,0,11,0
chr10	26994345	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:8,8:14,5:2,20,1,12
chr10	26998502	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,13;MFRL=177,245;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:3,1,1,0
chr10	27009334	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr10	27031392	.	AGATT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,1:1,3:3,1,4,0
chr10	27035478	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=260,236;MMQ=40,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr10	27037745	.	GAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr10	27044769	.	A	ACACAGTAAAATCAAAACCTATATCTCGAGAAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,106;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	27065976	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.616:27:6,8:4,7:9,1,13,4
chr10	27066142	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:16,3:23,0:12,27,2,1
chr10	27311388	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:5,1:9,3:14,0,4,0
chr10	27322053	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27322053_G_T:27322053:1,0,1,0
chr10	27322058	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27322053_G_T:27322053:1,0,1,0
chr10	27322060	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27322053_G_T:27322053:1,0,1,0
chr10	27322065	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,14;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27322053_G_T:27322053:1,0,1,0
chr10	27326057	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,4:2,5:5,0,8,1
chr10	27328977	.	TTGTAGTACATTAACCTTGTCTTCCATTTTTTTAATTTTTACTGTAAGTA	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,110;MMQ=60,60;MPOS=-50;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,8:0.067:53:12,5:12,3:16,29,6,2
chr10	27332992	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.091:53:26,2:22,2:49,0,4,0
chr10	27333121	.	TA	T,TAA	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=20,31,15;MFRL=134,123,128;MMQ=60,60,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=18.97,33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,12,20:0.173,0.303:67:12,4,5:9,7,4:2,33,2,30
chr10	27371623	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=219,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,2:2,6:3,0,8,0
chr10	27371647	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=215,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:1,3:6,5:7,0,8,0
chr10	27375377	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr10	27375586	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=190,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr10	27382240	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr10	27400861	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,7:2,0:4,0,6,1
chr10	27405310	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr10	27405331	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr10	27405357	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=177,126;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:27405357_C_G:27405357:0,5,0,2
chr10	27405360	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=177,126;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,1:0|1:27405357_C_G:27405357:0,5,0,2
chr10	27409555	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:1,6,0,4
chr10	27442247	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:2,1:3,1:1,4,1,2
chr10	27444303	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr10	27444328	.	CT	AC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr10	27444344	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:4,0,6,0
chr10	27454111	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:4,9:1,4:2,3,2,11
chr10	27454502	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:27454502_A_T:27454502:0,2,1,1
chr10	27454507	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:27454502_A_T:27454502:0,2,1,0
chr10	27456003	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr10	27475494	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:1,4,0,5
chr10	27497074	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr10	27499671	.	AGC	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=178,166;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:27499671_AGC_A:27499671:11,0,2,0
chr10	27499675	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=178,166;MMQ=60,46;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:27499671_AGC_A:27499671:11,0,2,0
chr10	27504667	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=184,197;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr10	27506854	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr10	27508837	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:27508837_T_C:27508837:0,0,0,8
chr10	27508847	.	CAAGTAAT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:27508837_T_C:27508837:0,4,0,1
chr10	27508857	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:27508837_T_C:27508837:0,4,0,1
chr10	27508859	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:27508837_T_C:27508837:0,4,0,1
chr10	27508861	.	AA	CC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:27508837_T_C:27508837:0,4,0,1
chr10	27523967	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:1,3:2,0:3,0,4,0
chr10	27524147	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:14,0:10,18,0,3
chr10	27529549	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.589:40:6,10:10,10:14,2,17,7
chr10	27529565	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=174.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,24:0,25:0,0,36,13
chr10	27692062	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr10	27692099	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=140,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:2,0:2,2:5,0,1,1
chr10	27700887	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,7:0,8:0,0,1,15
chr10	27702042	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:2,1,5,0
chr10	27702256	.	G	GC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.485:23:7,6:5,4:5,7,5,6
chr10	27703225	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:27703225_C_G:27703225:0,3,0,1
chr10	27703227	.	G	GCCGGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:27703225_C_G:27703225:0,3,0,1
chr10	27822619	.	TTC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr10	28024153	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=113,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:7,5,4,1
chr10	28032100	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,12;MFRL=181,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:28032100_A_C:28032100:4,0,1,0
chr10	28032103	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=19,12;MFRL=181,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:28032100_A_C:28032100:4,0,1,0
chr10	28032136	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,3:0,0,7,1
chr10	28151583	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,1:10,1:0|1:28151583_A_C:28151583:2,20,0,2
chr10	28151584	.	A	AGATCATGGAGTTGTTCCTTT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,1:11,1:0|1:28151583_A_C:28151583:2,20,0,2
chr10	28151586	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,1:0|1:28151583_A_C:28151583:2,17,0,2
chr10	28151604	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.346:10:2,1:4,2:0,7,0,3
chr10	28225780	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=125,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,0:12,2:9,10,0,2
chr10	28233120	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,6:1,0:5,0,5,1
chr10	28233732	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,1:4,2:8,5,2,1
chr10	28233931	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:0|1:28233931_G_A:28233931:2,6,0,4
chr10	28233933	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,1:4,3:0|1:28233931_G_A:28233931:2,6,0,4
chr10	28345336	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr10	28345370	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:2,2:3,3:5,0,6,0
chr10	28347615	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr10	28872481	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=19,28,29,19;MFRL=133,203,156,147;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,23,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.00,6.31,5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,2,4,4:0.144,0.261,0.237:16:0,0,2,1:2,2,1,0:0,6,0,10
chr10	28879838	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.489:43:7,7:15,14:0,22,0,21
chr10	28903400	.	G	GTCTTCTTTAAAACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,1:0,0,4,0
chr10	28970366	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:13,2:4,0:7,10,0,2
chr10	28970562	.	T	TATCCAGCTAAAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=220,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:28970562_T_TATCCAGCTAAAC:28970562:0,1,0,1
chr10	28970564	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=220,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28970562_T_TATCCAGCTAAAC:28970562:0,1,0,1
chr10	28970566	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=220,229;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28970562_T_TATCCAGCTAAAC:28970562:0,1,0,1
chr10	29137085	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr10	29162324	.	TAC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AC;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	29580735	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,3:0,2:0|1:29580735_C_T:29580735:0,0,6,2
chr10	29580743	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:29580735_C_T:29580735:0,0,6,2
chr10	29581440	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,127;MMQ=52,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:5,3:8,8:9,4,6,5
chr10	29747155	.	GCTC	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,3:10,5:13,4,5,3
chr10	29747221	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,146;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.309:27:9,2:10,6:6,13,3,5
chr10	29747618	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	29754535	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,138;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.372:41:12,5:14,10:16,10,14,1
chr10	29759174	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,4:2,4:6,1,7,1
chr10	29760209	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:3,6:3,4:0,6,2,9
chr10	29769647	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,4:2,9:1,2,4,9
chr10	29770551	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.395:39:11,6:10,9:16,8,5,10
chr10	29776289	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,37;MFRL=167,144;MMQ=55,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,2:0,2:0,4,0,4
chr10	29777558	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=131,145;MMQ=52,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,1:6,10:8,2,8,3
chr10	29779718	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,244;MMQ=52,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:9,0,2,0
chr10	29782306	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=134,136;MMQ=55,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:6,6:4,5:2,8,3,8
chr10	29783813	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,140;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,4:6,4:10,1,5,3
chr10	29783984	.	GAAACT	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=143,184;MMQ=33,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=62.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.419:41:10,11:14,6:17,7,1,16
chr10	29784004	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=182,140;MMQ=40,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.501:46:10,8:12,15:5,18,13,10
chr10	29784188	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=189,161;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:0|1:29784188_A_G:29784188:0,7,0,3
chr10	29784190	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=189,161;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:5,2:0|1:29784188_A_G:29784188:0,7,0,3
chr10	29801838	.	C	CTCCATGCTTCAAGACACAGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=170,141;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr10	29801887	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	29812602	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,5:4,7:6,4,7,5
chr10	29818604	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,4:2,1:3,1,4,1
chr10	29818827	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0|1:29818827_C_T:29818827:0,4,1,6
chr10	29818832	.	GCT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=188,152;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,1:4,1:0|1:29818827_C_T:29818827:0,9,0,2
chr10	29818837	.	C	CGT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=195,152;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:29818827_C_T:29818827:0,8,0,2
chr10	29820070	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	29833998	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=114,153;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:29833998_A_G:29833998:1,4,1,1
chr10	29834003	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=114,153;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:29833998_A_G:29833998:2,4,1,1
chr10	29834095	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=132,251;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:29834095_G_A:29834095:0,1,0,2
chr10	29834105	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=132,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29834095_G_A:29834095:0,1,0,1
chr10	29834114	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=132,270;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29834095_G_A:29834095:0,1,0,1
chr10	29839513	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=130,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:4,2:6,2:4,6,3,1
chr10	29840164	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	29844067	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=145,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr10	30317073	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:12,15:3,7:7,9,9,13
chr10	30605176	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=192,110;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:6,0:4,2:0|1:30605176_T_G:30605176:0,10,1,1
chr10	30605185	.	TGC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=225,110;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,0:3,1:0|1:30605176_T_G:30605176:0,11,1,1
chr10	30611614	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr10	30615638	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr10	30629082	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr10	30629136	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr10	30629386	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=171,155;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:7,0:2,3:0,9,0,4
chr10	30629434	.	CTATTT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	30728268	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:9,0:11,2:12,8,2,0
chr10	30747180	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,186;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,0:7,3:10,7,3,0
chr10	30748498	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=203,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr10	30915637	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,70;MMQ=60,33;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:9,1,1,1
chr10	30915882	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=140,176;MMQ=49,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.266:43:14,6:18,5:14,18,0,11
chr10	30915930	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=136,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.186:25:7,2:12,2:3,18,0,4
chr10	30915944	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=139,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,1:11,1:1,16,0,2
chr10	30918486	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,159;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,2:4,1:0|1:30918486_G_A:30918486:6,4,3,0
chr10	30918492	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=149,159;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:8,2:5,1:0|1:30918486_G_A:30918486:8,5,3,0
chr10	30918661	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=137,202;MMQ=60,32;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,1:6,1:0|1:30918661_A_G:30918661:4,13,0,2
chr10	30918666	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=142,202;MMQ=60,32;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,1:6,0:0|1:30918661_A_G:30918661:4,14,0,2
chr10	31134557	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	31138817	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.526:49:15,10:8,14:17,6,14,12
chr10	31803516	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr10	31813130	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=210,160;MMQ=54,44;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:0,1:1,0:0,2,0,2
chr10	32097851	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=126,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:3,3:5,2:8,0,5,1
chr10	32099547	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.505:6:2,1:0,2:3,0,3,0
chr10	32106851	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,1,13
chr10	32115133	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr10	32128611	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:9,4:4,1:3,10,1,4
chr10	32143208	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	32307534	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.929:11:0,5:0,5:0|1:32307534_T_TA:32307534:0,0,3,8
chr10	32307536	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.929:11:0,5:0,5:0|1:32307534_T_TA:32307534:0,0,3,8
chr10	32311969	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr10	32323591	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,22:0.425:52:15,13:14,8:23,7,21,1
chr10	32327037	.	TAA	T,TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30,31;MFRL=159,110,143;MMQ=58,60,60;MPOS=2,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.13,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,3:0.259,0.237:15:0,2,3:8,2,0:4,4,5,2
chr10	32327826	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:9,0:12,2:0|1:32327826_G_C:32327826:0,21,0,2
chr10	32327828	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:0|1:32327826_G_C:32327826:0,21,0,2
chr10	32328389	.	A	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=109.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,36:0.554:65:10,12:18,23:2,27,3,33
chr10	32575773	.	T	TA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.118:31:12,3:15,0:2,26,0,3
chr10	32575793	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:11,3:4,6:1,14,0,9
chr10	32742256	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=206.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,25:0,29:0,0,49,6
chr10	32742257	.	AT	A	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:20,2:23,2:37,8,4,0
chr10	32751901	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=115.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,20:0,14:0,0,24,10
chr10	32781030	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr10	32806972	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,3,13
chr10	32832214	.	G	A	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=314.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,96:0.990:96:0,48:0,44:0,0,63,33
chr10	33015782	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=103.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,13:0,19:0,0,4,28
chr10	33015855	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr10	33093858	.	TAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr10	33165226	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=149.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,30:0,15:0,0,38,8
chr10	33165422	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr10	33197506	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr10	33208720	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,21,0
chr10	33471761	.	GCACA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=CA;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr10	33483561	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,5:3,6:7,0,10,1
chr10	33484577	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr10	33486667	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:2,3:3,4:0,6,0,7
chr10	33491552	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:7,3:5,2:7,6,4,1
chr10	33510614	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.453:11:2,2:4,2:3,3,5,0
chr10	33538278	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr10	33619562	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr10	34408745	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	34420607	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	34619946	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr10	34661555	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr10	34666864	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr10	34673257	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=209,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:34673257_GT_G:34673257:0,1,0,1
chr10	34673262	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=209,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34673257_GT_G:34673257:0,1,0,1
chr10	35103759	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=10,21;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:35103759_G_T:35103759:1,0,1,0
chr10	35103760	.	T	TGCCC	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=17,33;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:35103759_G_T:35103759:1,0,1,0
chr10	35103765	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:35103765_G_C:35103765:0,0,2,0
chr10	35103768	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:35103765_G_C:35103765:0,0,2,0
chr10	35103771	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=27,35;MFRL=76,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:35103765_G_C:35103765:0,2,2,0
chr10	35103777	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=30,24;MFRL=76,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:35103759_G_T:35103759:0,2,2,0
chr10	35103781	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=26,35;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:0|1:35103759_G_T:35103759:1,2,1,0
chr10	35103785	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=27,34;MFRL=76,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:35103765_G_C:35103765:0,2,2,0
chr10	35103788	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=32,22;MFRL=76,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:35103759_G_T:35103759:0,2,2,0
chr10	35103793	.	CGG	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=27,34;MFRL=129,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:35103759_G_T:35103759:2,2,1,0
chr10	35314130	.	TA	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.457:34:8,6:6,7:1,17,6,10
chr10	35320383	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,2:5,5:4,4,6,1
chr10	35321414	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:9,5:6,8:10,5,7,6
chr10	35322024	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:2,1:4,0,2,0
chr10	35324076	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,18,4
chr10	35328088	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,2:2,0:0,3,0,3
chr10	35338590	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.572:33:6,12:8,7:10,4,14,5
chr10	35343525	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr10	35343550	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=168,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.278:5:3,1:1,0:0|1:35343550_T_TC:35343550:0,4,0,1
chr10	35343553	.	AG	TC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=168,243;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.281:5:2,1:1,0:0|1:35343550_T_TC:35343550:0,4,0,1
chr10	35360310	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=191,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,1:6,3:0,8,0,4
chr10	35437239	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,2:7,1,6,0
chr10	35464778	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=127,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.433:21:5,4:7,5:4,8,5,4
chr10	35477428	.	T	TTGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35477428_T_TTGGA:35477428:0,1,0,1
chr10	35477431	.	G	GTTTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35477428_T_TTGGA:35477428:0,1,0,1
chr10	35484949	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=121,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,8:2,5:4,3,8,5
chr10	35894666	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr10	35897102	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35897102_C_T:35897102:0,1,0,1
chr10	35897104	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35897102_C_T:35897102:0,1,0,1
chr10	35897106	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35897102_C_T:35897102:0,1,0,1
chr10	35897109	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35897102_C_T:35897102:0,1,0,1
chr10	35897111	.	AT	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35897102_C_T:35897102:0,1,0,1
chr10	35897602	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=126,42;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.218:21:10,0:4,4:0|1:35897602_A_G:35897602:4,13,2,2
chr10	35897616	.	CC	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,94;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:3,0:3,2:0|1:35897602_A_G:35897602:0,10,0,2
chr10	35929140	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:1,4,1,2
chr10	36811687	.	GGT	G,GGTGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,35,34;MFRL=154,198,194;MMQ=60,60,60;MPOS=25,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,6,8;RU=GT;STR;TLOD=5.83,8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.272,0.364:8:2,1,1:1,1,1:3,0,4,1
chr10	36812251	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,26:0.435:60:14,18:20,8:10,24,14,12
chr10	36813180	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,30:0.674:44:7,10:7,20:0|1:36813180_T_A:36813180:1,13,6,24
chr10	36813198	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=165.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.976:40:0,14:0,23:0|1:36813180_T_A:36813180:0,0,3,37
chr10	36813218	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,17:0.563:30:5,7:8,10:0|1:36813180_T_A:36813180:0,13,0,17
chr10	37431272	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.170:22:9,0:6,3:1,18,0,3
chr10	37433975	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=141,134;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.171:25:8,2:12,1:9,12,1,3
chr10	37434048	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,177;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.195:14:6,1:5,1:2,10,0,2
chr10	37434077	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=168,177;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:1,6,0,2
chr10	37441072	.	T	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,25:0.419:60:12,14:23,10:13,22,12,13
chr10	37451568	.	G	T	.	.	DP=90;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=145,81;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,6:0.071:86:40,0:38,5:46,34,1,5
chr10	37451644	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=144,154;MMQ=52,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=83.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,32:0.484:66:14,19:20,12:14,20,12,20
chr10	37505192	.	C	T	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,42:0.488:86:24,26:19,15:28,16,29,13
chr10	38120285	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=130,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,2:3,6:0,7,0,8
chr10	38122115	.	A	ACAACAAAACAGTAAGTGTAGAAAATGGAGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	38126705	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:38126705_C_G:38126705:0,0,0,2
chr10	38126708	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:38126705_C_G:38126705:0,0,0,2
chr10	38145142	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,0:4,2:7,0,2,0
chr10	38246132	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1,3,0,1
chr10	38246545	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr10	38306128	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,210;MMQ=52,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:6,0,1,1
chr10	38385441	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,14,1
chr10	38682076	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,165;MMQ=52,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:5,1:4,1:0|1:38682076_C_T:38682076:2,8,0,3
chr10	38682079	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=154,165;MMQ=52,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:6,0:4,1:0|1:38682076_C_T:38682076:2,8,0,3
chr10	42905431	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=205,149;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr10	42905510	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:2,8:8,3:9,1,8,4
chr10	42920886	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:4,4,0,2
chr10	42922557	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=191,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:10,0,2,0
chr10	42922595	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,2:3,3:7,0,6,0
chr10	42922618	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=22,23;RU=A;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.765:9:2,1:0,2:2,0,2,5
chr10	42922656	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=105,142;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:29,3:32,0:16,49,3,0
chr10	42928759	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=152,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,1:10,1:0|1:42928759_G_T:42928759:11,8,1,1
chr10	42928764	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=152,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,1:11,1:0|1:42928759_G_T:42928759:9,8,1,1
chr10	42928790	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=160,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,1:12,1:11,13,1,1
chr10	42928814	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=159,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,1:10,1:8,16,1,1
chr10	43127326	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,141;MMQ=47,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,6:5,5:8,2,10,1
chr10	43132232	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr10	43232419	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=264,141;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,3,0
chr10	43232450	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,153;MMQ=52,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:5,3:6,1,2,1
chr10	43280057	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=T;STR;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr10	43280103	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=190,187;MMQ=47,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr10	43281089	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,24:0.371:65:22,11:19,12:21,20,6,18
chr10	43281109	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:28,2:29,1:22,35,1,2
chr10	43287307	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=162,167;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43287307_T_TA:43287307:0,1,0,1
chr10	43287308	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=162,167;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43287307_T_TA:43287307:0,1,0,1
chr10	43287311	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=162,167;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43287307_T_TA:43287307:0,1,0,1
chr10	43291861	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,6:7,8:13,0,14,0
chr10	43292830	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:3,4:2,3:3,2,7,1
chr10	43316170	.	A	G	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,139;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=82.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,29:0.377:78:19,15:28,14:8,41,3,26
chr10	43325664	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,138;MMQ=52,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:7,4:10,3:13,4,7,0
chr10	43595836	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	43596212	.	C	CTTTCTTGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr10	43601749	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	43604390	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=211,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	43607756	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=210,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:43607756_G_A:43607756:0,2,0,3
chr10	43607759	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=210,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,2:0|1:43607756_G_A:43607756:0,2,0,3
chr10	43622217	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.720:15:0,9:3,2:1,3,5,6
chr10	43659536	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr10	43671378	.	GTT	G,GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,36,33;MFRL=132,217,149;MMQ=60,60,60;MPOS=19,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.23,8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,5:0.166,0.382:14:3,1,2:3,1,3:6,1,7,0
chr10	43694363	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:1,0,5,0
chr10	43698084	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=137,252;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,1,0
chr10	43698094	.	C	CCG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=137,252;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,0:0,1,1,0
chr10	43698240	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=252,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr10	43932479	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr10	43971696	.	T	TAGTATCACGGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	43977219	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=246,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.584:2:0,1:0,0:0|1:43977219_GGA_G:43977219:0,1,0,1
chr10	43977223	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=246,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.584:2:1,1:0,0:0|1:43977219_GGA_G:43977219:0,1,0,1
chr10	44053585	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr10	44340865	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.479:27:6,5:7,7:6,8,8,5
chr10	44341072	.	CATTGATT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=96,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.382:19:4,3:7,4:1,11,0,7
chr10	44868856	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	44868864	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=166,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	44871346	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:11,4:7,8:17,1,10,2
chr10	44874253	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr10	45423282	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:6,0,4,0
chr10	45427548	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=110,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.404:18:9,4:1,3:4,7,1,6
chr10	45473552	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=213,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr10	45478092	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=108,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:7,6:2,3:4,5,4,5
chr10	45479544	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=111,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:45479544_G_T:45479544:0,4,0,1
chr10	45479546	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=111,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:45479544_G_T:45479544:0,4,0,1
chr10	45499886	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:0|1:45499886_TC_T:45499886:7,0,6,3
chr10	45499897	.	A	AAAAATT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.548:18:3,5:5,4:0|1:45499886_TC_T:45499886:8,0,7,3
chr10	45500020	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:45500020_A_T:45500020:2,21,0,2
chr10	45500027	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:7,1:0|1:45500020_A_T:45500020:1,20,0,2
chr10	45869748	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:4,3:5,0,6,0
chr10	45869895	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0|1:45869895_A_G:45869895:0,6,0,2
chr10	45869900	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,0:0|1:45869895_A_G:45869895:0,5,0,2
chr10	45877899	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:4,2,2,1
chr10	45891215	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=220,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr10	45907790	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,7:2,2:0,6,2,7
chr10	45924023	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr10	45924110	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=148,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:15,4:3,0:7,11,2,2
chr10	45924256	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr10	45938901	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:9,1:16,1:11,15,1,1
chr10	45939136	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr10	45984725	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,2:10,0,4,1
chr10	46122447	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.403:40:11,10:12,5:10,14,11,5
chr10	46245557	.	T	C	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,140;MMQ=25,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,45:0.523:86:22,21:18,23:29,12,29,16
chr10	46246300	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=94.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,11:0,20:0,0,11,22
chr10	46248788	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,3,5
chr10	46282636	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46282636_G_C:46282636:0,0,0,1
chr10	46282637	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,243;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46282636_G_C:46282636:0,0,0,1
chr10	46282638	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,243;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46282636_G_C:46282636:0,0,0,1
chr10	46960084	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr10	46963738	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	46965887	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,0:2,2:1,5,1,2
chr10	46968762	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr10	46969496	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr10	46998795	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,5:3,3:9,0,7,1
chr10	46999591	.	C	CATGAGGGAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATGAGGGAG;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,4,1
chr10	46999596	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr10	46999604	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr10	47000600	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr10	47000618	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=152,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47000618_T_C:47000618:0,3,0,1
chr10	47000619	.	T	TCTCCATGCCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=152,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47000618_T_C:47000618:0,3,0,1
chr10	47087608	.	TG	CA,CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34,29;MFRL=0,161,144;MMQ=60,60,60;MPOS=25,15;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.85,8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.377,0.507:5:0,1,0:0,1,3:0,0,4,1
chr10	47756004	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=118.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,27:0,11:0,0,38,2
chr10	47756145	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=97.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,15:0,18:0,0,0,34
chr10	47909792	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,23;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	47911451	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=68.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,17:0,6:0,0,18,5
chr10	48048921	.	AGGTAAGAATACGGAC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=210,210;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:1,1:2,0:0|1:48048921_AGGTAAGAATACGGAC_A:48048921:0,3,0,1
chr10	48048941	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=218,210;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48048921_AGGTAAGAATACGGAC_A:48048921:0,2,0,1
chr10	48373517	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,0:5,2:5,7,1,1
chr10	48373663	.	CCT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.592:15:3,6:2,2:5,1,7,2
chr10	48386104	.	GCGC	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=174,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr10	48386110	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=93,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr10	48386118	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=186,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48386118_A_G:48386118:0,2,0,1
chr10	48386120	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=186,93;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48386118_A_G:48386118:0,2,0,1
chr10	48386121	.	A	AATGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=186,93;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48386118_A_G:48386118:0,2,0,1
chr10	48389111	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,425;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:3,1,0,2
chr10	48390292	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=126,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,2:15,0:9,23,2,0
chr10	48414570	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	48426798	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,3:1,8:0,1,1,10
chr10	48428956	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:3,4,1,1
chr10	48429650	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr10	48438734	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,15;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.548:5:2,1:0,0:1,1,1,2
chr10	49383976	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,140;MMQ=25,25;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.352:18:5,4:6,2:2,10,1,5
chr10	49389150	.	A	AGCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=212,179;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	49392575	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=85,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:3,4:3,6:5,2,8,2
chr10	49419898	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	49440346	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr10	49450443	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	49632498	.	CT	C,TT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,34,28;MFRL=163,130,146;MMQ=60,60,60;MPOS=10,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.51,5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,3,3:0.149,0.149:23:7,3,2:8,0,1:15,2,6,0
chr10	49643152	.	T	TTTGTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49643152_T_TTTGTG:49643152:0,0,0,1
chr10	49643153	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49643152_T_TTTGTG:49643152:0,0,0,1
chr10	49658248	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=71.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,16:0,6:0,0,16,8
chr10	49661341	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,6:0,0,9,8
chr10	49662174	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,161;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:5,11,2,0
chr10	49663184	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr10	49667713	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,8,4
chr10	49668010	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	49687556	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr10	49687594	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr10	49763418	.	GAGGAGTGTCACGA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr10	49763618	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=106,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,0:2,4:0,5,1,3
chr10	49763677	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=193,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	49790972	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:4,1,4,1
chr10	49929491	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr10	49931705	.	C	CCTCTCTAACGTTTATGGAGCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=37,35;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	49939139	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,2:8,2,6,0
chr10	49944249	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr10	49983890	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,2:4,3:0,4,0,5
chr10	49985110	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr10	49997881	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:0,3:4,2:4,1,4,1
chr10	49998707	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=167,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:49998707_C_T:49998707:3,0,1,1
chr10	49998712	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=167,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:49998707_C_T:49998707:3,0,1,1
chr10	50011460	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr10	50025396	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:2,3,4,2
chr10	50025411	.	TCCA	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=134,70;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.233:10:4,1:3,0:0|1:50025411_TCCA_T:50025411:4,4,1,1
chr10	50025441	.	TGGG	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,11;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,0:0|1:50025411_TCCA_T:50025411:2,3,0,1
chr10	50025446	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,2,1
chr10	50028308	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.430:49:14,8:13,12:10,18,7,14
chr10	50031145	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:1,1,2,1
chr10	50031212	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.539:7:1,4:2,0:2,1,2,2
chr10	50034635	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	50034833	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:6,7:5,9:6,5,6,11
chr10	50034986	.	TGGTGGTCCATG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:0,1:0,4,0,2
chr10	50036974	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,29;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:50036974_G_T:50036974:1,0,0,1
chr10	50036977	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,29;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50036974_G_T:50036974:1,0,0,1
chr10	50036979	.	G	GCGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,29;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50036974_G_T:50036974:1,0,0,1
chr10	50036981	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,22;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50036974_G_T:50036974:1,0,0,1
chr10	50038720	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,9:0,6:1,0,13,2
chr10	50038878	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.516:37:3,13:13,6:8,10,8,11
chr10	50040562	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	50040610	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,4:0,6:0,0,7,4
chr10	50075216	.	A	AAAAAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AAAAT;STR;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.874:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr10	50075461	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	50081508	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:1,4:3,0,4,1
chr10	50085267	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	50121784	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.589:10:1,2:2,3:4,0,4,2
chr10	50151356	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,1219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:4,0,1,1
chr10	50167915	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr10	50167952	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr10	50227870	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr10	50531904	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=137,39;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.180:14:4,2:8,0:1,11,1,1
chr10	50531931	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:1,3,1,7
chr10	50535622	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=208,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50535622_G_A:50535622:0,2,0,1
chr10	50535624	.	C	CAGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,36;MFRL=208,234;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50535622_G_A:50535622:0,2,0,1
chr10	50535625	.	C	CTCTGGCTGGGAGGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=208,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50535622_G_A:50535622:0,2,0,1
chr10	50535628	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=208,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50535622_G_A:50535622:0,2,0,1
chr10	50680933	.	T	TA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:14,3:19,0:25,8,2,1
chr10	50684390	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,0:1,7,0,2
chr10	50691009	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr10	50691360	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr10	50701156	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,11:0,0,16,5
chr10	50732139	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,100;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:4,2,3,2
chr10	50820345	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr10	50822192	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr10	50822226	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr10	50824117	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,2,0
chr10	50828506	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	50828626	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,1:7,5:5,3,2,4
chr10	50833752	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50833752_G_GT:50833752:0,1,0,1
chr10	50833753	.	C	CATCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50833752_G_GT:50833752:0,1,0,1
chr10	50863083	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:5,5:3,1:7,1,7,0
chr10	50863565	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	50887651	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	50887904	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=116,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr10	50901809	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,12,3
chr10	50902469	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	50902684	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,1,13
chr10	50944009	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	50944647	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	50947918	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=233,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr10	50947919	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=178,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:50947919_C_A:50947919:0,3,0,1
chr10	50947921	.	G	GAAACAAAGATC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=203,233;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:50947919_C_A:50947919:0,2,0,1
chr10	50953778	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr10	50953830	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,6:2,3:4,1,8,1
chr10	50955201	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=118,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:6,0:3,2:4,7,1,1
chr10	50960166	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,2:1,2:1,0,3,2
chr10	50960354	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	50960648	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,4,1
chr10	50964761	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	50966421	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50966421_G_C:50966421:0,0,1,0
chr10	50966427	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50966421_G_C:50966421:0,0,1,0
chr10	51224983	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,22;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51224983_A_C:51224983:0,0,1,0
chr10	51224992	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,22;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51224983_A_C:51224983:0,0,1,0
chr10	51549496	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=130,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:4,2:2,2:3,3,4,1
chr10	51573288	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=182,162;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.089:42:11,1:27,2:39,0,3,0
chr10	51573343	.	CA	C,CAA	.	.	DP=122;ECNT=4;MBQ=32,31,33;MFRL=147,156,165;MMQ=60,60,60;MPOS=11,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=4.37,7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:74,6,8:0.062,0.092:88:24,1,1:48,5,5:68,6,12,2
chr10	51573381	.	G	A	.	.	DP=204;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:191,4:0.025:195:54,0:123,4:79,112,0,4
chr10	51573393	.	G	A	.	.	DP=243;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:225,4:0.021:229:69,1:142,2:78,147,0,4
chr10	51582695	.	TTTGC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=209,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:51582695_TTTGC_T:51582695:3,0,1,0
chr10	51582706	.	T	TGGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=208,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:51582695_TTTGC_T:51582695:2,0,1,0
chr10	51584597	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:6,6:3,8:5,4,9,6
chr10	51620231	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51620231_A_G:51620231:0,0,1,0
chr10	51620238	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51620231_A_G:51620231:0,0,1,0
chr10	51620278	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=212,235;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr10	51620499	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,149;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,31:0.640:48:7,15:10,16:1,16,0,31
chr10	51623014	.	G	GA	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=154,144;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.162:42:10,2:22,4:35,1,6,0
chr10	51623024	.	A	C	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=150,151;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.374:49:13,7:17,10:30,1,18,0
chr10	51623052	.	C	CT	.	.	DP=130;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=145,149;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=139.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,53:0.414:128:37,25:27,21:63,12,45,8
chr10	51623061	.	G	A	.	.	DP=157;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=145,153;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=247.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,72:0.475:152:43,41:34,29:64,16,59,13
chr10	51838359	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,166;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:3,2:2,3:0,5,0,6
chr10	51838579	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,305;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51838579_G_C:51838579:0,0,0,1
chr10	51838581	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,305;MMQ=60,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51838579_G_C:51838579:0,0,0,1
chr10	51853786	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=172,154;MMQ=25,25;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:12,2:20,1:0,32,0,3
chr10	51853793	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=186,156;MMQ=25,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:8,5:12,9:0,20,0,14
chr10	51974685	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,125;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr10	52070947	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr10	52086939	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:8,7:7,3:13,2,8,3
chr10	52103630	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:23,0:15,2:20,19,0,2
chr10	52502788	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,10:0.176:55:27,5:17,2:13,32,0,10
chr10	52502803	.	C	CGT	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GT;STR;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.366:29:7,7:9,2:1,17,0,11
chr10	52576068	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr10	52751088	.	C	CGCT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,4:0,10:0,0,14,2
chr10	53667443	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	53814229	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,2:2,2:7,0,3,1
chr10	53814383	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr10	53822653	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:2,5:8,0:3,7,1,4
chr10	53893539	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr10	53921754	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,0:1,2:4,4,0,2
chr10	54050079	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=103,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:5,1:1,5:2,5,0,6
chr10	54076271	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,5,5
chr10	54528266	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr10	54528298	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr10	54530554	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54530554_A_C:54530554:0,1,0,1
chr10	54530556	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54530554_A_C:54530554:0,1,0,1
chr10	54530558	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54530554_A_C:54530554:0,1,0,1
chr10	54530564	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54530554_A_C:54530554:0,1,0,1
chr10	54531461	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr10	55587197	.	AGGC	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:3,1:11,1:12,9,1,1
chr10	55591313	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:5,2:2,3:1,6,1,5
chr10	55626367	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,36;MFRL=84,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,5:4,5:4,3,10,0
chr10	55626625	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,4:7,3:3,12,2,5
chr10	55663198	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,3:1,0:0|1:55663198_A_C:55663198:0,4,0,4
chr10	55663202	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0|1:55663198_A_C:55663198:0,4,0,4
chr10	55719652	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=136,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:2,3:4,0:0,7,0,3
chr10	55779909	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr10	55913089	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=149,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,2:3,0:1,6,2,0
chr10	55943184	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr10	55973889	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	55996761	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,10:0,0,0,15
chr10	56076975	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr10	56077209	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr10	56089263	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	58118769	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58118769_CA_C:58118769:0,0,0,1
chr10	58118774	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58118769_CA_C:58118769:0,0,0,1
chr10	58118777	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58118769_CA_C:58118769:0,0,0,1
chr10	58119976	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr10	59956041	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,139;MMQ=52,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,2:6,12:11,3,11,3
chr10	59956556	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr10	59958956	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=134.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,21:0,18:0,0,34,5
chr10	59997644	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr10	60027122	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=208.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,38:0,26:0,0,59,9
chr10	60029163	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	60036815	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,11:0,0,16,1
chr10	60123486	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,2:7,4:0,8,0,6
chr10	60127639	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,3:12,0:15,3,3,0
chr10	60127838	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr10	60273121	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=65.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,5,14
chr10	60273155	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr10	60273189	.	ACGGC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGGC;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.776:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	60548276	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr10	60558125	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr10	60563062	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=102,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr10	60996453	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr10	61005244	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0,0,12,14
chr10	61005432	.	A	AATCTTATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	61007534	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr10	61007592	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	61014056	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr10	61023975	.	A	AAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=169,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:61023975_A_AAAT:61023975:0,2,0,1
chr10	61023978	.	G	GTTGGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=169,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:61023975_A_AAAT:61023975:0,2,0,1
chr10	61111975	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr10	61122268	.	T	TTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,5:0,0,3,8
chr10	61424140	.	AAA	GGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	61432576	.	A	G	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,4:0.060:80:34,3:39,1:0|1:61432576_A_G:61432576:47,29,1,3
chr10	61432578	.	C	CCTGTCACAATCTTCAGTGGCTTCA	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,4:0.060:80:34,3:41,1:0|1:61432576_A_G:61432576:47,29,1,3
chr10	61443808	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,3:3,2:6,1,4,1
chr10	61552774	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,131;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.929:25:0,11:1,9:1,0,19,5
chr10	61718325	.	T	TAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=133,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:11,1:5,0:8,11,0,2
chr10	61719232	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=76.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,15,9
chr10	61802342	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr10	61802353	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr10	61802374	.	AA	TT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,15:0,6:0,0,18,3
chr10	61802550	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=97.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.961:24:0,12:0,11:0|1:61802550_A_T:61802550:0,0,4,20
chr10	61802561	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,11:0,10:0|1:61802550_A_T:61802550:0,0,3,20
chr10	61802577	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=60.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0|1:61802550_A_T:61802550:0,0,2,12
chr10	61815335	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	61815879	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=278,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	61819049	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,8,2
chr10	61823106	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	61823109	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	61846688	.	TT	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr10	61868709	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:13,0:13,3:13,16,0,3
chr10	61868716	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:9,5:7,7:6,10,6,6
chr10	61956008	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:61956008_A_AC:61956008:0,7,1,1
chr10	61956011	.	C	CTTTCTTTGGCTGAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:3,0:0|1:61956008_A_AC:61956008:0,7,1,1
chr10	61956013	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,1:4,0:0|1:61956008_A_AC:61956008:0,7,1,1
chr10	62444165	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,2:3,2:6,0,3,1
chr10	62444965	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=219.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,36:0,31:0,0,20,50
chr10	62540063	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,0,14
chr10	62551815	.	GC	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:6,5:13,6:5,16,2,9
chr10	62551889	.	AA	GT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=140.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,16:0,0,21,11
chr10	62553763	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=215.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,33:0,26:0,0,9,50
chr10	62634621	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	63170292	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,24:0.458:53:16,18:11,6:14,15,15,9
chr10	63422754	.	G	GGGGCCGACCCCGGCA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=101,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=201.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,48:0.962:49:0,21:1,16:1,0,34,14
chr10	63699895	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,14:0,0,23,8
chr10	63700228	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,0,14
chr10	63700245	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr10	63760087	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.278:12:2,0:4,2:1,8,0,3
chr10	63818920	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.902:12:0,2:1,9:1,0,9,2
chr10	63851599	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,1:11,1:8,12,2,0
chr10	63851679	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=131,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:9,0:3,2:13,0,0,2
chr10	63851990	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr10	63943986	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=237,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,5:2,4:3,0,9,0
chr10	63944176	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,1,16
chr10	63944188	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:1,5:5,4:0,6,1,9
chr10	63964653	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,4:5,2:4,3,4,2
chr10	63974941	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=179,172;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr10	63974950	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr10	63976912	.	TAGCTTC	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:7,8:6,9:10,3,12,5
chr10	63977011	.	GAAAAA	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,13;RU=A;STR;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.894:6:0,0:0,2:0,0,0,6
chr10	63977069	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr10	63978077	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr10	63982984	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=234,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=203.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,59:0.968:60:0,22:1,37:1,0,40,19
chr10	64005711	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=179.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,30:0,22:0,0,53,2
chr10	64022582	.	TA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.196:31:15,2:8,4:7,18,1,5
chr10	64136751	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	64148125	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,8,3
chr10	64148369	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr10	64159333	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,7,8
chr10	64937398	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,2:5,0:8,0,2,0
chr10	64944317	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=115,143;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:0,3:0,1:0,1,4,0
chr10	64946222	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=224,161;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:64946222_A_G:64946222:0,4,0,1
chr10	64946229	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=224,161;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:64946222_A_G:64946222:0,4,0,1
chr10	64946235	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=221,161;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:64946222_A_G:64946222:0,3,0,1
chr10	64946237	.	TA	CG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=221,161;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:64946222_A_G:64946222:0,3,0,1
chr10	64953311	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr10	64953959	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:6,0,6,0
chr10	64960536	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=266,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr10	64975342	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:9,7:13,2:16,6,6,3
chr10	65225244	.	GA	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,5,3
chr10	65225450	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=226,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr10	67680309	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:14,0:19,2:0|1:67680309_T_C:67680309:17,20,0,2
chr10	67680318	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:17,0:20,2:0|1:67680309_T_C:67680309:19,18,0,2
chr10	68686484	.	AT	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=235,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr10	68688308	.	TCCCC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=233,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	69281585	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.524:13:3,6:3,1:6,0,5,2
chr10	69571495	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=222,256;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	69583206	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr10	69583239	.	AA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=183,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:69583239_AA_TG:69583239:0,3,0,1
chr10	69583242	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=183,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:69583239_AA_TG:69583239:0,3,0,1
chr10	69597786	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=139,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,1:2,4:1,6,1,4
chr10	69597810	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=152,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:69597810_G_A:69597810:0,2,0,1
chr10	69597812	.	C	CTTATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=152,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:69597810_G_A:69597810:0,2,0,1
chr10	69647332	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr10	69648569	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr10	69651125	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,7:7,0:10,1,6,1
chr10	69666598	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.331:31:9,6:12,4:14,7,4,6
chr10	69692330	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,6:4,5:9,2,10,1
chr10	69714726	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=137,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.336:19:5,1:7,5:8,5,3,3
chr10	69714851	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=179,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:0|1:69714851_A_T:69714851:4,15,2,0
chr10	69714854	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,2:11,0:0|1:69714851_A_T:69714851:4,15,2,0
chr10	69750788	.	GA	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=100.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,40:0.893:44:1,19:2,16:2,2,25,15
chr10	69751871	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,36;MFRL=172,180;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:69751871_C_G:69751871:3,0,1,0
chr10	69751873	.	CC	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=172,180;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:69751871_C_G:69751871:3,0,1,0
chr10	69751877	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=172,180;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:69751871_C_G:69751871:3,0,1,0
chr10	69785435	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,4:5,3:1,9,0,8
chr10	69793644	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr10	69799072	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=136,145;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:1,2:2,1,4,0
chr10	69799110	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.148:31:11,0:13,0:18,9,0,4
chr10	69881103	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr10	69926097	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,9,14
chr10	69926132	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=146,60;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,0:8,0:8,11,1,1
chr10	69926156	.	C	CAACAT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=140,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:5,0:8,7,1,1
chr10	69926334	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,16:0,10:0,0,20,7
chr10	69934467	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	69935059	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=78.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,16,8
chr10	69935235	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,6:1,10:1,0,1,15
chr10	69954280	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:8,2:10,0:7,11,1,1
chr10	69954290	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,8:0,0,7,11
chr10	69954291	.	C	CTCACTAAACATTTTCTAAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,2:9,0:6,10,1,1
chr10	69955140	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,15,5
chr10	69959097	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,11,5
chr10	69959345	.	GCTGGGA	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr10	69959397	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr10	69961501	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	70045198	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,2:5,0:0|1:70045198_C_A:70045198:0,9,1,1
chr10	70045200	.	C	CTG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:70045198_C_A:70045198:0,9,1,1
chr10	70045201	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=97,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,7:0.616:11:2,3:2,4:1|0:70045198_C_A:70045198:1,3,0,7
chr10	70056600	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr10	70066654	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:1,8,0,2
chr10	70098813	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	70138420	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=159,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,0:14,2:9,17,2,0
chr10	70174707	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=145.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,26:0,15:0,0,36,5
chr10	70182390	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,0:11,2:5,12,0,2
chr10	70182520	.	GA	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.151:40:13,4:12,1:18,16,4,2
chr10	70197044	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr10	70210007	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.660:4:0,1:0,1:0,1,1,2
chr10	70231951	.	A	AAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=169,154;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:10,1:1,1:0|1:70231951_A_AAG:70231951:0,11,0,2
chr10	70231953	.	ACC	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=169,154;MMQ=60,45;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:1,1:0|1:70231951_A_AAG:70231951:0,11,0,2
chr10	70243437	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:70243437_G_A:70243437:0,2,0,1
chr10	70243439	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:70243437_G_A:70243437:0,2,0,1
chr10	70266546	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	70332066	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:3,0,6,2
chr10	70441327	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70441327_CAT_C:70441327:0,1,0,1
chr10	70441330	.	GAT	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70441327_CAT_C:70441327:0,1,0,1
chr10	70441335	.	A	ATCTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70441327_CAT_C:70441327:0,1,0,1
chr10	70441336	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70441327_CAT_C:70441327:0,1,0,1
chr10	70441340	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:70441327_CAT_C:70441327:0,1,0,1
chr10	70497482	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	70502426	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	70506892	.	C	CT	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:25,2:17,1:35,7,3,0
chr10	70506902	.	CT	C	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=127,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,6:0.108:58:24,2:20,3:39,13,4,2
chr10	70516950	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	70525591	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr10	70531217	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=174.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,14:0,35:0,0,3,47
chr10	70532672	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=199,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,2:0,1:3,0,3,0
chr10	70549579	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=113.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,40:0.489:82:20,20:21,20:21,21,17,23
chr10	70646466	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,240;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	70695696	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	70696908	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr10	70716106	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=192.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,28:0,25:0,0,11,43
chr10	70734599	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr10	70765393	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=221,172;MMQ=60,41;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr10	70857078	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:6,3:2,0:0|1:70857078_G_A:70857078:0,8,0,3
chr10	70857080	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:6,2:2,0:0|1:70857078_G_A:70857078:0,8,0,3
chr10	70884013	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=313.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,91:0.989:91:0,48:0,43:0,0,53,38
chr10	70922159	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=204.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,25:0,33:0,0,28,31
chr10	70945840	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=113.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,12:0,21:0,0,5,30
chr10	70946097	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,20;MFRL=237,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:70946097_A_G:70946097:1,0,1,0
chr10	70946101	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,14;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:70946097_A_G:70946097:2,0,1,0
chr10	70946113	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:70946097_A_G:70946097:4,0,1,0
chr10	70946119	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,16;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:70946097_A_G:70946097:4,0,1,0
chr10	70951346	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,14,0
chr10	70955056	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,6,17
chr10	70958327	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr10	70968804	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,3:1,6:0,2,3,8
chr10	70992664	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=231,138;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:1,0,1,3
chr10	70992912	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,6:0,3:0,0,3,8
chr10	70992949	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:70992949_T_A:70992949:0,0,0,5
chr10	70992970	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:70992949_T_A:70992949:0,0,0,3
chr10	70998738	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:7,0,6,0
chr10	71010026	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr10	71025608	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:4,0,0,1
chr10	71048620	.	AT	GC	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:71048620_AT_GC:71048620:0,6,0,2
chr10	71048623	.	AC	GT	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,0:0|1:71048620_AT_GC:71048620:0,6,0,2
chr10	71048636	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:71048636_G_A:71048636:0,3,0,1
chr10	71048638	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:71048636_G_A:71048636:0,3,0,1
chr10	71048643	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=164,167;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:71048643_A_T:71048643:0,2,0,1
chr10	71048646	.	GA	CG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=164,167;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:71048643_A_T:71048643:0,2,0,1
chr10	71055283	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:1,0:6,0,3,0
chr10	71055289	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,3:1,0:6,0,3,0
chr10	71060696	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0|1:71060696_G_A:71060696:0,0,2,12
chr10	71060707	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0|1:71060696_G_A:71060696:0,0,1,11
chr10	71060734	.	CT	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr10	71142420	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,8,13
chr10	71144702	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr10	71151970	.	T	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,7:0.092:65:25,1:27,1:49,9,0,7
chr10	71152091	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,2,19
chr10	71158268	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	71164655	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:2,1:7,8:5,4,8,2
chr10	71167119	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr10	71174989	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	71244832	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr10	71264325	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	71267412	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0|1:71267412_T_G:71267412:0,1,0,3
chr10	71267417	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0|1:71267412_T_G:71267412:0,1,0,3
chr10	71583757	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr10	71627478	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,2:5,0:9,2,2,0
chr10	71634889	.	CA	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=128,60;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:17,0:13,2:18,13,2,0
chr10	71634969	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:5,5:6,7:3,9,1,11
chr10	71634986	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:1,7,0,7
chr10	71647298	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,1:3,2:3,7,1,2
chr10	71649309	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	71655443	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr10	71658512	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,8:0,0,7,12
chr10	71664661	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,175;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:2,2,1,0
chr10	71665676	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	71681530	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=222,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr10	71681766	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=125,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr10	71697516	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr10	71703979	.	G	GAAGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:71703979_G_GAAGA:71703979:1,1,0,1
chr10	71703981	.	A	ACTGAATAATTTACTCCTATTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:71703979_G_GAAGA:71703979:1,1,0,1
chr10	71703995	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr10	71705516	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.236:24:7,0:3,1:7,11,6,0
chr10	71718494	.	TACA	T,CACA,TGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGACA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,32,33,32;MFRL=151,120,165,146;MMQ=60,60,60,34;MPOS=12,3,6;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.29,3.29,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,1,1,1:0.222,0.222,0.222:5:0,0,1,1:2,1,0,0:0,2,0,3
chr10	71718496	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=165,146;MMQ=60,34;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:71718496_C_G:71718496:0,3,0,1
chr10	71718498	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=151,146;MMQ=60,34;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:1,0:0|1:71718496_C_G:71718496:0,4,0,1
chr10	71718499	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=156,120;MMQ=47,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:71718499_A_T:71718499:0,2,0,1
chr10	71718508	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71718499_A_T:71718499:0,0,0,1
chr10	71849772	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=125,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.695:7:1,2:0,3:2,0,5,0
chr10	71851526	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=119,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:14,0:14,9,1,1
chr10	71868763	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.615:24:6,8:3,6:5,4,11,4
chr10	71871498	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	71874962	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr10	71880190	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:6,2:1,3:8,0,5,0
chr10	71903622	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:5,4:9,5:8,6,3,6
chr10	71917620	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:10,0:5,13,2,1
chr10	71969062	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:3,5:5,3:1,7,3,5
chr10	71970259	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr10	71990196	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.346:27:10,2:7,7:4,14,2,7
chr10	72014693	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,19;MFRL=199,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:72014693_C_G:72014693:2,0,1,0
chr10	72014700	.	TC	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=199,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:72014693_C_G:72014693:2,0,1,0
chr10	72061079	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr10	72136291	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,0:5,2:4,8,0,2
chr10	72164132	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=179,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:4,0:9,1,2,0
chr10	72179746	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,10:0,0,14,11
chr10	72195323	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=211,241;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:0,1:2,0:0|1:72195323_GC_G:72195323:1,1,0,1
chr10	72195325	.	TCCTGC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=174,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:72195323_GC_G:72195323:1,2,0,1
chr10	72195335	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=194,241;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:72195323_GC_G:72195323:2,2,0,1
chr10	72201219	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr10	72291304	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,3:0,0:0,0,1,3
chr10	72294324	.	GGA	TTC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,2:5,0:1,15,0,2
chr10	72294452	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:72294452_A_C:72294452:0,1,2,0
chr10	72294460	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:72294452_A_C:72294452:0,3,2,0
chr10	72294463	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,0:0|1:72294452_A_C:72294452:0,3,1,0
chr10	72298216	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=185,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr10	72298631	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr10	72306967	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=173,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr10	72306978	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=163,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,2:1,4:2,0,5,1
chr10	72326318	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=70,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:1,4:2,1,4,2
chr10	72360038	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	72360059	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	72360387	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.426:37:8,6:13,7:19,2,15,1
chr10	72432498	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr10	72432521	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	72492212	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	72493876	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr10	72496375	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr10	72498776	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:72498776_C_CAA:72498776:0,0,0,1
chr10	72498778	.	G	GAAAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72498776_C_CAA:72498776:0,0,0,1
chr10	72498782	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72498776_C_CAA:72498776:0,0,0,1
chr10	72504920	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:4,1,3,1
chr10	72532238	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.402:28:11,4:5,7:9,8,5,6
chr10	72533910	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,5:0,1:0,0,8,0
chr10	72535107	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=161,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr10	72620134	.	CT	C	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,12:0.157:71:30,6:26,6:26,33,7,5
chr10	72635143	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=T;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,3:1,2:4,1,3,2
chr10	72636450	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr10	72643671	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr10	72643889	.	A	ATTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,248;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	73045284	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	73047593	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr10	73103904	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,2:3,3:5,0,4,1
chr10	73104056	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr10	73104130	.	T	TGCTGATATTAATGTTAATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=187,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	73111258	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	73121645	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	73199501	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	73270982	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,8,10
chr10	73270995	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,5,9
chr10	73330454	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr10	73330584	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.389:21:6,5:7,3:9,4,4,4
chr10	73406599	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr10	73439076	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	73439101	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	73439341	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	73455273	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr10	73455308	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr10	73494159	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr10	73494288	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr10	73499561	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,0,3
chr10	73501374	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,14,1
chr10	73511397	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr10	73515103	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr10	73533220	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:7,7:7,5:0,15,0,13
chr10	73537388	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,13,1
chr10	73537614	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:7,9:6,6:5,8,8,7
chr10	73544277	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
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chr10	73551132	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:73551131_G_GAGTTGGAAAA:73551131:0,1,0,1
chr10	73569898	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=105,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:73569898_A_T:73569898:2,1,0,1
chr10	73569906	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=105,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:73569898_A_T:73569898:2,1,0,1
chr10	73569909	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=105,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:73569898_A_T:73569898:2,1,0,1
chr10	73571581	.	C	CCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,1:0,0,4,5
chr10	73578704	.	AAGTCTC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=38.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr10	73594358	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,1:0,0:0,0,0,3
chr10	73848105	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,3:5,1:0,9,0,4
chr10	73862032	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:3,2,3,0
chr10	73964282	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=168,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:73964282_G_A:73964282:1,8,1,1
chr10	73964285	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=165,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:73964282_G_A:73964282:1,9,1,1
chr10	73964287	.	TT	CA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=161,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,1:0|1:73964282_G_A:73964282:1,10,1,1
chr10	73964291	.	G	GTCCATATATCTTT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=165,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:73964282_G_A:73964282:1,9,1,1
chr10	73970451	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,6:3,1:4,0,7,0
chr10	73972897	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:7,0:12,3,3,0
chr10	73992657	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=203,264;MMQ=50,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,1:1,0:2,0,1,0
chr10	74096266	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.230:15:9,0:2,0:0|1:74096266_T_G:74096266:6,6,3,0
chr10	74096276	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:9,0:1,0:0|1:74096266_T_G:74096266:6,6,2,0
chr10	74100642	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.404:22:5,3:8,4:5,8,5,4
chr10	74127853	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	74182917	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr10	74234817	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,3,1
chr10	74293584	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=151,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,3:2,2:0|1:74293584_A_T:74293584:0,4,0,5
chr10	74293601	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:74293584_A_T:74293584:0,3,0,2
chr10	74293629	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:74293629_T_C:74293629:0,2,0,1
chr10	74293631	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:74293629_T_C:74293629:0,2,0,1
chr10	74619172	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=177,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:8,0:3,3:0|1:74619172_T_C:74619172:0,11,0,3
chr10	74619180	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=177,151;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:74619172_T_C:74619172:0,11,0,2
chr10	74660039	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,216;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.748:2:0,0:0,0:0|1:74660039_A_AC:74660039:0,0,2,0
chr10	74660042	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,216;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.748:2:0,0:0,0:0|1:74660039_A_AC:74660039:0,0,2,0
chr10	74660052	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,216;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.748:2:0,0:0,0:0|1:74660039_A_AC:74660039:0,0,2,0
chr10	74671611	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=112,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:1,7,0,6
chr10	74700957	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,2:6,0:13,8,0,2
chr10	74714503	.	C	CTCATACCTCTTCCAAACTTGCAGTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=183,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr10	74882007	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,2:12,1:11,11,3,0
chr10	74885281	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:2,6,1,4
chr10	74886486	.	GGTGGAA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:0|1:74886486_GGTGGAA_G:74886486:6,6,1,1
chr10	74886495	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:74886486_GGTGGAA_G:74886486:6,5,1,1
chr10	74896743	.	A	T,ATTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30,32;MFRL=0,143,152;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.87,3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.538,0.341:3:0,1,1:0,1,0:0,0,0,3
chr10	74896777	.	G	GAGTTGTGACAATTGCGTTGGCTTTGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr10	74928066	.	TGAG	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GAG;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.153:43:7,2:16,2:28,9,3,3
chr10	75008848	.	TTAA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=201,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.492:4:0,2:2,0:0|1:75008848_TTAA_T:75008848:2,0,0,2
chr10	75008854	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=201,193;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.492:4:0,1:2,0:0|1:75008848_TTAA_T:75008848:2,0,0,2
chr10	75029397	.	GCC	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=20,32;MFRL=103,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:75029397_GCC_G:75029397:3,3,1,1
chr10	75029400	.	C	CGATG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=20,29;MFRL=103,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:75029397_GCC_G:75029397:3,3,1,1
chr10	75029403	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=20,31;MFRL=103,41;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:75029397_GCC_G:75029397:3,3,1,1
chr10	75029405	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=20,32;MFRL=103,41;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:75029397_GCC_G:75029397:3,3,1,1
chr10	75029412	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=20,27;MFRL=106,41;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:75029397_GCC_G:75029397:4,4,1,1
chr10	75029414	.	GTA	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=106,41;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:75029397_GCC_G:75029397:4,4,1,1
chr10	75135833	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.309:20:8,3:4,3:12,2,6,0
chr10	75187483	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,2:5,1:2,10,2,1
chr10	75258558	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=103,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:9,6:4,7:6,8,7,6
chr10	75279809	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0|1:75279809_AG_A:75279809:1,2,0,2
chr10	75279813	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:75279809_AG_A:75279809:0,2,0,2
chr10	75302457	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	75413511	.	G	GAGCGAGGTCCATACCGCTGCACAGTGAGGACAAGCTGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	75519322	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,0:1,3:7,0,2,1
chr10	75525999	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:3,3,2,3
chr10	75529706	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:0|1:75529706_G_A:75529706:7,6,1,1
chr10	75529710	.	G	GTCTTCAAAATATCTGCATCTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:7,1:0|1:75529706_G_A:75529706:7,6,1,1
chr10	75532848	.	GCCAGGACTCCAGGTGTCCAGGACTCCAGGTGT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=238,200;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=CCAGGACTCCAGGTGT;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.518:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr10	75542013	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=152,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.263:18:6,0:3,1:1,12,0,5
chr10	75542017	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.445:18:4,0:1,0:2,8,0,8
chr10	75549247	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,1:9,1:3,8,0,2
chr10	75551148	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:15,2:16,0:10,21,1,1
chr10	75553538	.	C	CTTATGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:75553538_C_CTTATGAT:75553538:0,0,0,1
chr10	75553539	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:75553538_C_CTTATGAT:75553538:0,0,0,1
chr10	75562161	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=95,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,1:4,2:2,2,2,1
chr10	75564660	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=15,28;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.367:20:2,3:2,1:3,10,2,5
chr10	75567630	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:6,1:13,1:14,8,0,2
chr10	75567687	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.109:30:10,1:17,1:13,14,1,2
chr10	75574956	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.492:49:12,8:12,16:13,12,14,10
chr10	75602387	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	75607168	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,5:3,2:1,9,0,7
chr10	75612881	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,8:2,4:3,1,8,4
chr10	75672607	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33,35;MFRL=127,136,168;MMQ=60,60,60;MPOS=30,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=A;STR;TLOD=3.04,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.334,0.333:3:1,0,1:0,1,0:1,0,2,0
chr10	75673541	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=157,46;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:17,0:22,3:11,29,0,3
chr10	75673731	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=77,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:3,3:2,4:1,4,6,2
chr10	75676287	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr10	75842152	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,16,2
chr10	75843100	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,10,2
chr10	75867193	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=224,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr10	75885817	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=74,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:4,0,4,0
chr10	75889760	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.471:9:0,2:3,2:1,4,0,4
chr10	75896601	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=128,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,3:5,1:0,6,0,4
chr10	75910955	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:12,8:11,2:22,1,10,0
chr10	76158177	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:5,5:11,1:13,3,6,0
chr10	76349020	.	CT	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:14,1:17,3:19,14,1,3
chr10	76429870	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr10	76719679	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=220,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr10	76729632	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=210,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,3:2,5:0,5,0,8
chr10	76780396	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:11,13,0,2
chr10	76780633	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	76781905	.	GGAA	G	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=139,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GAA;STR;TLOD=97.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,29:0.447:65:14,8:17,19:28,8,23,6
chr10	76790248	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=114,67;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:6,0:11,0:4,14,2,0
chr10	76803567	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:2,1:7,3:7,3,2,2
chr10	76868735	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=16,24;MFRL=113,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.157:22:4,1:5,1:10,9,3,0
chr10	76979218	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:11,13:6,7:0,17,1,19
chr10	76989295	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,2:3,3:10,1,5,0
chr10	76990837	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,230;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,1:5,3:0,12,0,5
chr10	77159842	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,35;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:77159842_G_C:77159842:1,1,1,0
chr10	77159845	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=125,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:77159842_G_C:77159842:1,1,2,0
chr10	77159848	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=146,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:1,0:1|0:77159842_G_C:77159842:2,2,1,0
chr10	77159854	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=146,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:1,1:1|0:77159842_G_C:77159842:2,2,1,0
chr10	77162966	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:1,6:5,1:6,1,6,1
chr10	77312184	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,5,2
chr10	77807027	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,12:0,0,9,10
chr10	77807092	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,3,9
chr10	77807110	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=156,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr10	77818594	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr10	77818640	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77818640_A_AT:77818640:0,1,0,1
chr10	77818641	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77818640_A_AT:77818640:0,1,0,1
chr10	78637433	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=203,144;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:3,0:7,0,3,0
chr10	78669819	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=117,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.127:22:10,1:7,1:9,11,1,1
chr10	78729669	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:2,1:4,0,2,0
chr10	78778734	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,5,9
chr10	78799312	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:12,8,2,0
chr10	78839127	.	A	AGTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=GT;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	78868165	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	78880918	.	C	CTTTCATCACAATGACATTATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	79552107	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr10	79552151	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=126,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,4:0,2:3,2,6,0
chr10	79553673	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=175,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:79553673_T_C:79553673:1,0,2,0
chr10	79553688	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:79553673_T_C:79553673:1,0,2,0
chr10	79554723	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.182:22:5,0:8,1:8,10,0,4
chr10	79566503	.	GG	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=119,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:4,0,0,1
chr10	79567794	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr10	79584178	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=69,109;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:1,1,3,4
chr10	79584315	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79584315_T_C:79584315:0,0,0,1
chr10	79584318	.	TG	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:79584315_T_C:79584315:0,0,0,1
chr10	79588620	.	GCTCCAGC	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=122,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:9,8:7,3:9,8,8,3
chr10	79590726	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,24;MFRL=228,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr10	79593762	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,1,1
chr10	79595417	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	79595462	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:79595462_C_T:79595462:4,0,1,0
chr10	79595467	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:79595462_C_T:79595462:4,0,1,0
chr10	79595473	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,1:1,2:3,0,4,0
chr10	79613382	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	79614189	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=186,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr10	79739949	.	GCC	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=156,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:2,0:0|1:79739949_GCC_G:79739949:4,5,1,1
chr10	79739953	.	T	TGG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:79739949_GCC_G:79739949:5,5,1,1
chr10	79739958	.	TC	AG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:4,0:0|1:79739949_GCC_G:79739949:5,4,1,1
chr10	79789132	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,76;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:11,2:10,0:10,11,1,1
chr10	80030005	.	C	CTAGCATAGGTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=234,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	80037648	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,0:4,5:7,1,4,1
chr10	80961519	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	81053475	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr10	81058293	.	C	CTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,2:5,0:6,10,0,2
chr10	81060474	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr10	81108956	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:5,2:0,6,0,5
chr10	81111401	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:1,9,0,2
chr10	81203791	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:9,3:2,0:9,2,3,0
chr10	81204896	.	A	ACGGTGGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CGGTGGGG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr10	81274890	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,111;MMQ=51,23;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:3,13,0,2
chr10	81318545	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	81318820	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=65.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,9:0,0,2,20
chr10	81319267	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr10	81371554	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=167,122;MMQ=52,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,0:11,3:19,2,2,1
chr10	81838954	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,1:5,1,0,9
chr10	81838959	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,5:4,3:5,1,0,9
chr10	81838964	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=11,17;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:0,1:4,1:5,4,0,5
chr10	81838967	.	G	GGGGGGGGC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,2:2,2:4,4,0,5
chr10	81850472	.	AAT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AT;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr10	81901924	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:81901924_G_A:81901924:7,4,1,1
chr10	81901927	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:81901924_G_A:81901924:7,4,1,1
chr10	81902029	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr10	81904638	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=123,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:0,1:2,2:2,0,2,2
chr10	81916357	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr10	81919003	.	G	T,C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34,34;MFRL=175,122,201;MMQ=60,60,60;MPOS=9,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.18,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.246,0.245:5:3,1,1:0,0,0:0,3,0,2
chr10	81923205	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=112,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,4:8,2:4,6,1,5
chr10	81923961	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr10	81925792	.	ACG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CG;STR;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,2:0,0,4,0
chr10	82034675	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=147,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr10	82036414	.	C	CTGGGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr10	82040346	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr10	82043786	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=168,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:82043786_A_C:82043786:5,6,1,1
chr10	82043791	.	G	GTTAGTTTTAGA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=168,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:82043786_A_C:82043786:5,6,1,1
chr10	82095804	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=210,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr10	82112457	.	T	TCCTCTCCAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=222,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	82182296	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=104,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:4,9,0,2
chr10	82191643	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr10	82249108	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:8,3:3,3:1,10,0,6
chr10	82264423	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:9,4:3,8:12,0,12,1
chr10	82348579	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=206,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:1,1:2,0:0|1:82348579_C_T:82348579:0,3,0,1
chr10	82348580	.	C	CGTCAGGAAGACTGGTTTAGATG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=206,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:1,1:2,0:0|1:82348579_C_T:82348579:0,3,0,1
chr10	82363300	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:9,0,4,1
chr10	82363404	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:3,5:3,4,3,4
chr10	82363405	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:3,4,3,4
chr10	82394019	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=117,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.399:16:5,6:5,0:8,2,6,0
chr10	82394351	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,15;MFRL=189,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:82394351_C_A:82394351:0,2,0,1
chr10	82394359	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=224,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:82394351_C_A:82394351:0,1,0,1
chr10	82394361	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=224,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:82394351_C_A:82394351:0,1,0,1
chr10	84745353	.	A	AATTTAGCGCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	84745356	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	85936342	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=223,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,6:0,1:1,4,2,5
chr10	85936375	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:85936375_C_G:85936375:0,4,0,1
chr10	85936377	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:85936375_C_G:85936375:0,4,0,1
chr10	85936379	.	G	GTCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:85936375_C_G:85936375:0,4,0,1
chr10	85957681	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr10	85958739	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,2,0
chr10	85960274	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85960274_A_C:85960274:0,0,0,1
chr10	85960296	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85960274_A_C:85960274:0,0,0,1
chr10	85962650	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr10	85978809	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr10	85979081	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:85979081_TAA_T:85979081:0,4,0,1
chr10	85979084	.	A	ACCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:85979081_TAA_T:85979081:0,4,0,1
chr10	85994142	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:9,3:4,4:5,8,1,6
chr10	85994231	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=199,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	86004736	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	86004873	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.664:22:4,8:3,6:6,1,9,6
chr10	86185654	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=108.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,22:0,10:0,0,11,21
chr10	87361961	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr10	87489238	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:8,0:10,4,2,1
chr10	88024443	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr10	88024553	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr10	88126056	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	88203208	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	88213604	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=76.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,11:0,0,1,20
chr10	88220866	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr10	88230874	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,6:0,0,5,14
chr10	88256943	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr10	88281344	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.954:19:0,11:0,6:0|1:88281344_C_G:88281344:0,0,11,8
chr10	88281346	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.954:19:0,13:0,5:0|1:88281344_C_G:88281344:0,0,11,8
chr10	88428631	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	88445385	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr10	88458996	.	TTCTCTC	T,TTCTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31,30;MFRL=110,194,140;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=TC;STR;TLOD=8.33,5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.408,0.368:6:0,2,2:1,1,0:1,0,5,0
chr10	88486006	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=111,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,1:6,1:4,15,0,2
chr10	88703284	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:11,8,1,1
chr10	88718436	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr10	88730106	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=201,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:2,2,3,2
chr10	88730177	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=217,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:6,1,5,0
chr10	88730374	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:8,8:7,5:3,12,2,11
chr10	88768253	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.408:30:4,7:13,5:4,14,3,9
chr10	88768657	.	C	T	.	.	DP=135;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=171.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,61:0.488:125:36,30:26,31:26,38,23,38
chr10	88820592	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:10,7:3,6:10,3,5,8
chr10	88834217	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.077:62:25,1:33,3:58,0,4,0
chr10	88834240	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,4:0.043:97:33,1:54,2:77,16,3,1
chr10	88834244	.	CA	C,CAA	.	.	DP=125;ECNT=3;MBQ=33,32,33;MFRL=127,166,118;MMQ=60,60,60;MPOS=12,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=19.79,9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:68,17,13:0.163,0.120:98:25,5,4:29,10,6:50,18,23,7
chr10	88917974	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	88935590	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=158.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,22:0,22:0,0,41,3
chr10	88935620	.	CTT	C	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=146,155;MMQ=57,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=110.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,33:0.436:76:22,11:20,21:30,13,29,4
chr10	88935718	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=154,207;MMQ=40,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,3:0.048:81:30,2:47,1:22,56,3,0
chr10	88940096	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,145;MMQ=40,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:5,6:10,6:4,11,3,9
chr10	89264593	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr10	89419638	.	C	CGCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GCT;STR;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr10	89469083	.	CAT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=36,37;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.151:17:4,1:9,1:1,14,0,2
chr10	89473069	.	TAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=203,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:1,0:0|1:89473069_TAAA_T:89473069:0,3,1,0
chr10	89473094	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,15;MFRL=180,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:89473069_TAAA_T:89473069:0,4,1,0
chr10	89473097	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=180,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:89473069_TAAA_T:89473069:0,4,1,0
chr10	89473100	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=180,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:89473069_TAAA_T:89473069:0,4,1,0
chr10	89473102	.	ACG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=180,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:89473069_TAAA_T:89473069:0,4,1,0
chr10	89481377	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,2:4,7:9,0,8,1
chr10	89514517	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:14,2:6,0:14,6,0,2
chr10	89536250	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0,20,0,2
chr10	89550147	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=128,53;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:21,0:22,3:25,18,1,2
chr10	89552375	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,17;MFRL=138,145;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,1:3,2,2,0
chr10	89653686	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr10	89690952	.	T	TTTATC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.496:12:2,2:4,4:0,6,0,6
chr10	89720633	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.236:27:9,3:8,2:18,3,5,1
chr10	89720907	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,157;MMQ=58,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.546:33:6,6:8,12:2,13,0,18
chr10	90034899	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=231,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr10	90074140	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:5,4:3,0:0|1:90074140_G_A:90074140:8,0,4,0
chr10	90074145	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,3:3,0:0|1:90074140_G_A:90074140:8,0,3,0
chr10	90365290	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	90431541	.	AAC	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:15,2:13,1:24,9,3,0
chr10	90433548	.	T	TGGGTGGAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr10	90484243	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,17,5
chr10	90484420	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=176.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,19:0,22:0|1:90484420_C_A:90484420:0,0,4,38
chr10	90484422	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=176.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,18:0,20:0|1:90484420_C_A:90484420:0,0,4,38
chr10	90534759	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr10	90568182	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr10	90574222	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr10	90672902	.	A	AAAATGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=173,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,2:2,0:0|1:90672902_A_AAAATGC:90672902:4,2,1,1
chr10	90672904	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=173,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:90672902_A_AAAATGC:90672902:4,2,1,1
chr10	90674434	.	A	AAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=AT;STR;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr10	90697869	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=128,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,18:0.356:51:17,5:15,12:14,19,8,10
chr10	90767395	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,12,4
chr10	90774047	.	AA	CC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=149,55;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:9,0:4,1:0|1:90774047_AA_CC:90774047:8,7,1,1
chr10	90774050	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=149,55;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:5,2:0|1:90774047_AA_CC:90774047:10,7,1,1
chr10	90774062	.	A	AGTGTCTTTTAAC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=148,55;MMQ=60,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:90774047_AA_CC:90774047:9,7,1,1
chr10	90774064	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=148,55;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.145:18:8,0:8,2:0|1:90774047_AA_CC:90774047:9,7,1,1
chr10	90774222	.	A	AACACCTGAAATACACCTAATTAGAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr10	90966393	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.500:40:11,10:9,10:13,7,14,6
chr10	90975649	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:9,8:7,10:10,6,12,6
chr10	90985067	.	CGCCCTCTCGCGGA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=166,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.504:6:1,1:1,1:0,3,0,3
chr10	90988250	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	91065835	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:15,0:17,3:12,21,0,3
chr10	91099941	.	G	GTTAGATGTATTAAATGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=180,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr10	91099943	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	91137826	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:0,8:1,9:1,0,14,3
chr10	91152593	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,0,4
chr10	91172465	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91172465_G_A:91172465:0,0,1,0
chr10	91172475	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,246;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91172465_G_A:91172465:0,0,1,0
chr10	91172482	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,35;MFRL=0,246;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91172465_G_A:91172465:0,0,1,0
chr10	91172484	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,35;MFRL=0,246;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91172465_G_A:91172465:0,0,1,0
chr10	91172486	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,35;MFRL=0,246;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91172465_G_A:91172465:0,0,1,0
chr10	91172490	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,36;MFRL=0,246;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91172465_G_A:91172465:0,0,1,0
chr10	91172498	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,246;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91172465_G_A:91172465:0,0,1,0
chr10	91172500	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:91172465_G_A:91172465:0,0,1,0
chr10	91172663	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	91174674	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr10	91371445	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,2:2,7:2,4,1,8
chr10	91371693	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,2:6,0:2,11,0,2
chr10	91371844	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr10	91404832	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=193,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr10	91469771	.	CT	GG	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=137,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.154:43:11,2:20,1:5,32,6,0
chr10	91469780	.	AC	TA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=132,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.197:42:12,1:16,0:3,31,8,0
chr10	91470660	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=197,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:6,1,5,1
chr10	91470953	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=216,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr10	91473887	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:7,9:5,5:8,4,3,11
chr10	91474699	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=71,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.699:10:3,2:0,4:2,1,7,0
chr10	91477066	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:10,5:4,4:14,0,9,0
chr10	91479085	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr10	91483908	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=84.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,28:0.637:44:4,14:9,14:1,15,0,28
chr10	91483916	.	G	GT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.179:31:8,2:12,3:0,26,0,5
chr10	91486078	.	ATAT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAT;STR;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:9,5:11,7:13,7,7,5
chr10	91497902	.	C	CTAAAAG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr10	91497910	.	G	GTA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:91497910_G_GTA:91497910:1,3,0,1
chr10	91497917	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:91497910_G_GTA:91497910:1,2,0,1
chr10	91497918	.	ATAAAAACC	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:91497910_G_GTA:91497910:1,2,0,1
chr10	91497930	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=264,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:91497910_G_GTA:91497910:1,3,0,1
chr10	91497932	.	GA	TT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=264,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:91497910_G_GTA:91497910:1,3,0,1
chr10	91497938	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=35,32;MFRL=264,164;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:91497910_G_GTA:91497910:1,3,0,1
chr10	91503750	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.369:36:10,7:10,5:1,22,0,13
chr10	91518388	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:5,0,5,1
chr10	91528441	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:7,5:6,4:11,2,10,0
chr10	91532432	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,27:0.491:55:14,7:14,20:18,10,16,11
chr10	92678748	.	AAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AT;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	93000211	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:6,5:9,3:12,3,5,3
chr10	93390158	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr10	93579003	.	CT	C,CTT	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=154,124,121;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.89,35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,5,26:0.075,0.377:67:18,4,11:17,0,9:33,3,26,5
chr10	93579117	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=20,35,24,20;MFRL=155,175,151,157;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,24,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=7.86,23.25,4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:28,6,14,4:0.111,0.270,0.086:52:10,2,5,2:9,4,7,1:6,22,9,15
chr10	93588201	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,17:0.563:30:6,5:7,12:0|1:93588201_G_C:93588201:1,12,1,16
chr10	93588208	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,17:0.545:31:6,6:8,11:0|1:93588201_G_C:93588201:1,13,1,16
chr10	93601285	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=309,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:0,1,0,9
chr10	93617306	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:8,6:7,5:4,11,5,7
chr10	93702405	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr10	93713405	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr10	93716899	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr10	93719497	.	GTATATATATA	G,GTA,GTATA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24,33,23;MFRL=0,166,170,159;MMQ=60,41,60,40;MPOS=18,7,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,10,11,12;RU=TA;STR;TLOD=10.52,22.49,4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,5,9,3:0.286,0.480,0.184:17:0,3,5,1:0,1,2,1:0,0,17,0
chr10	93722199	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr10	93767797	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,21:0,12:0,0,35,0
chr10	93771192	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=216.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,32:0,30:0,0,8,56
chr10	93776240	.	C	CT,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20,20;MFRL=173,136,130;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=7.50,8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,6:0.409,0.428:13:1,3,0:1,1,4:1,1,3,8
chr10	93786488	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,2:11,0:5,11,1,1
chr10	93788516	.	A	ATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr10	93851714	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,18:0,6:0,0,7,17
chr10	93999057	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=80,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:3,1,5,1
chr10	94266346	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:94266346_A_G:94266346:0,4,0,1
chr10	94266347	.	A	AGACG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:94266346_A_G:94266346:0,4,0,1
chr10	94366347	.	AT	A,ATT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=164,236,168;MMQ=60,60,60;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.22,22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,14:0.127,0.480:28:8,2,7:3,1,6:11,0,17,0
chr10	94392513	.	A	ATAATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=134,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAATT;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr10	94409800	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,0:2,4:1,4,0,4
chr10	94608189	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=262,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,0:1,1:0|1:94608189_C_CG:94608189:1,0,1,0
chr10	94608195	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:94608189_C_CG:94608189:0,0,1,0
chr10	94608201	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94608189_C_CG:94608189:0,0,1,0
chr10	94608206	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:94608189_C_CG:94608189:0,0,1,0
chr10	94688059	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=114,155;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:16,5,2,0
chr10	94774082	.	CT	C,CTT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=144,180,155;MMQ=60,60,60;MPOS=14,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.67,4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,4,4:0.108,0.123:37:14,1,3:10,3,1:6,23,0,8
chr10	94816807	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=58.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,10:0,0,1,17
chr10	94826081	.	TCCTGCCG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCTGCCG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr10	95083204	.	ATTTC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTC;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	95095600	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=207,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr10	95097537	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,5:4,5:6,0,5,5
chr10	95099822	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=59,143;MMQ=47,45;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr10	95099849	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=118,138;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,2,1
chr10	95107315	.	C	CAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=114,99;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=20,24;RU=A;STR;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,0:2,1:4,0,0,5
chr10	95113491	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=190,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	95115339	.	A	AAAAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAAT;STR;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,1:1,0:2,0,5,0
chr10	95121135	.	CCA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:4,0,4,0
chr10	95132905	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=197,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:2,2:0,1:0,3,1,2
chr10	95152624	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,4:6,6:6,3,9,1
chr10	95156872	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr10	95161291	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=138,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:95161291_C_CT:95161291:6,4,1,1
chr10	95161292	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=138,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:95161291_C_CT:95161291:6,4,1,1
chr10	95161299	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=131,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:95161291_C_CT:95161291:6,3,1,1
chr10	95161301	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=131,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:0|1:95161291_C_CT:95161291:5,3,1,1
chr10	95162496	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:2,4:8,5:10,0,9,0
chr10	95162525	.	TC	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=44.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.511:36:7,7:8,11:16,2,17,1
chr10	95162777	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=63,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr10	95163809	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:6,5:8,3:9,6,7,1
chr10	95164040	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	95164060	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=238,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr10	95168715	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,4:3,0:0,8,0,4
chr10	95185956	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,0:1,2:1,7,2,0
chr10	95216741	.	TAAAG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:95216741_TAAAG_T:95216741:0,0,0,1
chr10	95216747	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:95216741_TAAAG_T:95216741:0,0,0,1
chr10	95216749	.	G	GGGCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:95216741_TAAAG_T:95216741:0,0,0,1
chr10	95241999	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr10	95266683	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.655:9:1,2:1,4:2,1,5,1
chr10	95275060	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	95276673	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr10	95276901	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,5:0.075:77:30,5:41,0:37,35,2,3
chr10	95278829	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:2,3:2,1:0|1:95278829_A_G:95278829:0,4,0,5
chr10	95278841	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0|1:95278829_A_G:95278829:0,5,0,3
chr10	95279653	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	95287608	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=150,180;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:12,0,2,0
chr10	95287643	.	G	GA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.371:30:12,5:6,5:18,1,9,2
chr10	95346879	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	95346938	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	95372568	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=111,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:11,1:21,1:19,13,0,2
chr10	95372764	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:5,0,2,0
chr10	95388914	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:4,2:2,1:7,0,3,0
chr10	95389041	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,3:1,3:4,3,4,2
chr10	95389083	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=165,224;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,2:3,1:4,6,1,2
chr10	95389124	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:2,2:1,7,0,3
chr10	95394455	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr10	95395245	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=142,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.788:12:1,5:1,5:0|1:95395245_C_T:95395245:2,0,5,5
chr10	95395247	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0|1:95395245_C_T:95395245:0,0,8,6
chr10	95400054	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr10	95419032	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr10	95658258	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr10	95721367	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr10	95791445	.	AAATTGTGTACCACTACCTGGGGGTGAGGAGAAGCAAAAGAAAAACTATGTGGCATATACCTGTAAACTGATGG	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.075:40:8,0:6,3:20,17,1,2
chr10	96044734	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:1,6,0,7
chr10	96100272	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:96100272_G_A:96100272:0,2,0,1
chr10	96100275	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:96100272_G_A:96100272:0,2,0,1
chr10	96100280	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,27;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:96100272_G_A:96100272:0,2,0,1
chr10	96100281	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:96100272_G_A:96100272:0,2,0,1
chr10	96108988	.	TA	T,TAA	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,28,29;MFRL=151,99,169;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.91,5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:42,7,5:0.108,0.098:54:19,4,2:22,3,3:32,10,10,2
chr10	96118008	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr10	96201839	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=218,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.611:8:0,2:2,1:0,3,0,5
chr10	96256980	.	G	T	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=149,152;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.069:52:16,0:20,0:5,43,0,4
chr10	96256984	.	CT	C,CTT	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=20,24,19;MFRL=153,146,151;MMQ=60,60,49;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.17,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,5,5:0.104,0.115:41:12,2,2:11,3,0:1,30,0,10
chr10	96256993	.	T	TA	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=150,144;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:25,0:21,2:0|1:96256993_T_TA:96256993:1,46,0,2
chr10	96256999	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=151,144;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:22,0:16,2:0|1:96256993_T_TA:96256993:1,43,0,2
chr10	96271298	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr10	96314104	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:1,6:2,4:0,3,2,8
chr10	96322404	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=100,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:11,9:6,5:12,5,8,6
chr10	96334578	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=215,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr10	96341336	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr10	96353201	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,5,1
chr10	96353420	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,10;MFRL=131,148;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.343:12:1,0:3,0:0|1:96353420_G_T:96353420:0,8,0,4
chr10	96353422	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:0,3:2,1:0|1:96353420_G_T:96353420:0,3,0,5
chr10	96356571	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,4:3,5:7,0,9,0
chr10	96448040	.	CT	C	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.118:47:19,1:22,4:5,37,0,5
chr10	96448129	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=170,251;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr10	96495232	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=20,32;MFRL=60,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.756:10:2,3:0,5:1,1,3,5
chr10	96495237	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:96495237_A_T:96495237:3,7,1,1
chr10	96495239	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:96495237_A_T:96495237:3,7,1,1
chr10	96495241	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:96495237_A_T:96495237:3,6,1,1
chr10	96495244	.	A	AATTTCC	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:96495237_A_T:96495237:3,6,1,1
chr10	96522365	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr10	96535124	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=136,151;MMQ=56,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,11:3,1:6,2,9,3
chr10	96748743	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,125;MMQ=60,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,0:9,3:7,12,0,3
chr10	96796861	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.583:41:8,12:8,11:12,5,16,8
chr10	96802598	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr10	96818119	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:7,6:2,2:5,4,8,1
chr10	96818362	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=203,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr10	96827119	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:2,5:6,2:1,7,1,6
chr10	96827178	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:1,5,4,2
chr10	96954511	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	96966954	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:7,4:3,3:6,4,6,1
chr10	96967260	.	T	TGTTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=194,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr10	96970361	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr10	96972600	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:4,2:0|1:96972600_T_A:96972600:10,7,1,1
chr10	96972605	.	TGGGGCCCA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:4,2:0|1:96972600_T_A:96972600:11,8,1,1
chr10	96974518	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,5:2,1:4,0,6,0
chr10	96974552	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,7:4,2:4,1,8,1
chr10	96974803	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr10	96979775	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0,5,0,6
chr10	96979830	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=221,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	96985198	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=262,146;MMQ=60,42;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr10	97023630	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.359:31:12,4:8,6:15,5,11,0
chr10	97023633	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=141,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:14,0:13,3:21,6,2,1
chr10	97023895	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr10	97082645	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:97082645_T_TC:97082645:0,4,0,1
chr10	97082650	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.302:5:4,0:0,1:0|1:97082645_T_TC:97082645:0,4,0,1
chr10	97082680	.	G	GGGATGCTATATATGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=226,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	97096562	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:8,1:2,13,0,3
chr10	97101532	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	97110879	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	97115172	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=65,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:1,1,6,0
chr10	97115300	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=152,101;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.188:30:10,0:13,5:22,3,0,5
chr10	97115447	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:18,4:19,0:10,28,4,0
chr10	97117036	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr10	97127577	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	97131915	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:97131915_A_C:97131915:0,1,0,1
chr10	97131918	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:97131915_A_C:97131915:0,1,0,1
chr10	97143933	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=134,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.472:15:2,4:6,3:4,4,6,1
chr10	97154682	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr10	97154698	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr10	97158713	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,2,1
chr10	97174674	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97174674_CA_TG:97174674:0,0,0,1
chr10	97174679	.	TT	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97174674_CA_TG:97174674:0,0,0,1
chr10	97174683	.	A	AATGTATAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97174674_CA_TG:97174674:0,0,0,1
chr10	97366746	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	97366773	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr10	97366775	.	CTG	ATG,C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,30,34;MFRL=154,144,116;MMQ=60,60,60;MPOS=3,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:2,1,1:0,3,0,2
chr10	97366779	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:97366779_T_TC:97366779:0,4,0,1
chr10	97366783	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:97366779_T_TC:97366779:0,3,0,1
chr10	97366786	.	T	TCATCTTAC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:97366779_T_TC:97366779:0,3,0,1
chr10	97369939	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr10	97370942	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr10	97373966	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	97381077	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=13,28;MFRL=213,149;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr10	97381102	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=13,32;MFRL=202,107;MMQ=50,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:97381102_G_T:97381102:0,2,0,1
chr10	97381108	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=202,107;MMQ=50,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:97381102_G_T:97381102:0,2,0,1
chr10	97385014	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr10	97388162	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,7,14
chr10	97440159	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr10	97440394	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr10	97583183	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:97583183_G_A:97583183:0,4,0,1
chr10	97583186	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:97583183_G_A:97583183:0,4,0,1
chr10	97583188	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:97583183_G_A:97583183:0,4,0,1
chr10	97583190	.	G	GACCCCCAAC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:97583183_G_A:97583183:0,4,0,1
chr10	97583194	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:97583183_G_A:97583183:0,4,0,1
chr10	97604406	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr10	97681679	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=155,165;MMQ=40,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:5,2:24,0:0|1:97681679_G_A:97681679:30,0,2,0
chr10	97681687	.	GG	AA	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=158,167;MMQ=48,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.097:39:5,3:28,0:0|1:97681679_G_A:97681679:35,1,2,1
chr10	97681714	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,28:0.486:58:10,11:20,17:18,12,20,8
chr10	97684234	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,3:6,6:0,14,0,9
chr10	97763873	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.502:24:5,7:7,5:10,2,10,2
chr10	97772358	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:11,6:6,11:12,5,9,8
chr10	97772369	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=139,49;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:17,1:17,1:21,13,2,0
chr10	97772496	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,1,19
chr10	97779106	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:8,3:4,3:1,11,1,5
chr10	97816420	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,6:6,9:9,1,15,0
chr10	97920099	.	T	TC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=99.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,19:0,0,13,17
chr10	97922576	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,5:3,1:5,0,5,1
chr10	97956902	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr10	97975167	.	GTATA	G,GTA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34,34;MFRL=150,149,184;MMQ=60,60,60;MPOS=23,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=TA;STR;TLOD=7.82,26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,9:0.175,0.440:20:6,2,2:2,1,7:1,7,0,12
chr10	97983526	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr10	97987095	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	97987144	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr10	97987290	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,1:7,1:3,8,2,0
chr10	98006857	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr10	98082517	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=91.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,15:0,0,1,26
chr10	98084231	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	98087140	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr10	98088387	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr10	98088540	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:9,4,0,2
chr10	98095794	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr10	98105618	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:2,0,4,0
chr10	98108220	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	98109442	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.752:16:0,8:2,4:3,1,9,3
chr10	98111279	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=190,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:4,1:1,9,0,3
chr10	98114899	.	TC	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=152,186;MMQ=60,40;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:98114899_TC_GT:98114899:3,0,1,0
chr10	98114904	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=152,186;MMQ=60,40;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:98114899_TC_GT:98114899:3,0,1,0
chr10	98127809	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=121,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.454:22:8,5:4,4:8,4,9,1
chr10	98138640	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr10	98144312	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,11:0,0,13,5
chr10	98144599	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=199,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:98144599_G_T:98144599:0,2,0,1
chr10	98144600	.	C	CATTTAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=199,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:98144599_G_T:98144599:0,2,0,1
chr10	98188577	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:98188577_TC_T:98188577:1,2,0,1
chr10	98188579	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:98188577_TC_T:98188577:1,2,0,1
chr10	98188584	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:98188577_TC_T:98188577:1,2,0,1
chr10	98188589	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:98188577_TC_T:98188577:1,2,0,1
chr10	98188592	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:98188592_GC_G:98188592:1,1,0,1
chr10	98188596	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:98188592_GC_G:98188592:1,1,0,1
chr10	98192549	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:14,1,2,0
chr10	98240035	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:98240035_A_T:98240035:0,0,7,1
chr10	98240045	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=418,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:0|1:98240035_A_T:98240035:2,0,6,1
chr10	98287094	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=121.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,17:0,17:0,0,20,14
chr10	98311190	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr10	98312891	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr10	98319367	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr10	98321928	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr10	98380074	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,3:1,4:4,0,7,0
chr10	98380363	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr10	98383329	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr10	98386433	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr10	98392872	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr10	98416533	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,6:3,2:5,0,7,1
chr10	98790674	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:2,0:3,3:0,5,0,4
chr10	98791265	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr10	98797351	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr10	98797402	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=148,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:3,0,1,1
chr10	98803206	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=113,83;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:14,0:13,3:10,17,2,1
chr10	98816299	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=210,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr10	98817927	.	T	TCCGTACAGGTGATGGCACTGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	98819953	.	G	GTTCCCGCTCAGAGGAGAA	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:2,2:0|1:98819953_G_GTTCCCGCTCAGAGGAGAA:98819953:0,6,1,1
chr10	98819955	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=24,28;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,0:1,1:0|1:98819953_G_GTTCCCGCTCAGAGGAGAA:98819953:0,6,1,1
chr10	98819970	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:1,0:0|1:98819970_G_C:98819970:0,5,0,1
chr10	98819974	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=-45;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:98819970_G_C:98819970:0,5,0,1
chr10	98819975	.	ATC	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=-46;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0|1:98819970_G_C:98819970:0,5,0,1
chr10	98819980	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,26;MFRL=118,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:98819970_G_C:98819970:0,4,0,1
chr10	98819985	.	CT	GA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:98819970_G_C:98819970:0,3,0,1
chr10	98820314	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=173,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr10	98825940	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	98989454	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:1,1,5,0
chr10	98995076	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,7:2,4:0,6,2,10
chr10	99019084	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=200,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:8,0,0,2
chr10	99019144	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=112,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:10,1,8,0
chr10	99019177	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,11:0,21:0,0,20,13
chr10	99025611	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=223,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,0:3,3:4,1,4,0
chr10	99080246	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=58.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,13:0,4:0,0,4,13
chr10	99130899	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,2:15,0:2,25,0,2
chr10	99133694	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=188,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr10	99156166	.	A	AATACTGCATGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=139,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.484:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	99198505	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.126:35:17,0:10,2:17,14,0,4
chr10	99198507	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=14,32;MFRL=183,119;MMQ=40,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.716:12:1,1:0,6:0,4,1,7
chr10	99216432	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr10	99219404	.	TG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,6:7,7:12,1,12,1
chr10	99220088	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	99225738	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,7:4,1:3,3,3,5
chr10	99240142	.	A	ATGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=213,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.484:2:1,1:0,0:0|1:99240142_A_ATGT:99240142:0,1,0,1
chr10	99240143	.	A	ACAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=213,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,1:0,0:0|1:99240142_A_ATGT:99240142:0,1,0,1
chr10	99337901	.	G	GGGC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99337901_G_GGGC:99337901:0,0,1,0
chr10	99337905	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99337901_G_GGGC:99337901:0,0,1,0
chr10	99337910	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99337901_G_GGGC:99337901:0,0,1,0
chr10	99337914	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=231,180;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:99337901_G_GGGC:99337901:1,0,1,0
chr10	99337919	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,13;MFRL=231,180;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:99337901_G_GGGC:99337901:1,0,1,0
chr10	99343349	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:17,3:23,0:22,18,3,0
chr10	99349899	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=94,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:99349899_A_T:99349899:7,8,1,1
chr10	99349904	.	G	GACATCAAAC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=90,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:0|1:99349899_A_T:99349899:6,8,1,1
chr10	99359406	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=170,100;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:3,2:1,0:4,0,2,1
chr10	99376491	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=117,53;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:7,1:6,1:7,9,2,0
chr10	99416758	.	C	CTCAACA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:99416758_C_CTCAACA:99416758:1,4,0,2
chr10	99416760	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:99416758_C_CTCAACA:99416758:1,4,0,2
chr10	99426975	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:2,2:6,4:0,8,0,6
chr10	99433297	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,3,1
chr10	99433422	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=122,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:11,0:10,11,1,1
chr10	99437822	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr10	99498234	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=188,207;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:3,4,5,0
chr10	99510068	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr10	99510284	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr10	99511148	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=91,17634558;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:10,5,0,2
chr10	99516955	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=120,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.281:22:6,2:10,3:9,7,6,0
chr10	99517355	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,1:1,4:2,1,5,0
chr10	99518874	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:0,2:2,2:3,0,5,0
chr10	99518901	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:5,0,5,0
chr10	99519097	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,2:3,6:0,8,0,8
chr10	99624126	.	CT	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	99642517	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:7,7,2,0
chr10	99655838	.	TGG	ACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=140,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	99682981	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	99995773	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=64,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:2,2,2,0
chr10	100003785	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=105,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:6,1,5,0
chr10	100013563	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=131,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:2,6,1,1
chr10	100022446	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr10	100157354	.	CAGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=266,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	100174763	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=115,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,2:9,0:11,11,2,0
chr10	100179863	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,0:11,2:16,8,0,2
chr10	100182100	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,13;MFRL=100,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,0:0|1:100182100_T_A:100182100:0,3,2,0
chr10	100182105	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=100,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,0:0|1:100182100_T_A:100182100:0,3,2,0
chr10	100182171	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,0:2,6:4,1,4,3
chr10	100190264	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr10	100193679	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr10	100193883	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr10	100195001	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:7,0:13,4,2,0
chr10	100195583	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:1,5,1,7
chr10	100242345	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:6,4:3,3:7,4,8,0
chr10	100401738	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,16;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:100401738_C_A:100401738:0,2,0,1
chr10	100401739	.	A	AAATC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100401739_A_AAATC:100401739:0,2,0,1
chr10	100401741	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100401739_A_AAATC:100401739:0,2,0,1
chr10	100401743	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:100401738_C_A:100401738:0,2,0,1
chr10	100481475	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=120,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.580:15:2,3:4,4:3,3,5,4
chr10	101090783	.	A	AAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=227,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	101120787	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=98,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr10	101124157	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:3,0:1,2:5,0,2,0
chr10	101137063	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr10	101147720	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,1:2,1:1,6,0,2
chr10	101163189	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,18;MFRL=142,58;MMQ=60,55;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,0:1,0:0|1:101163189_C_G:101163189:3,0,2,0
chr10	101163193	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=139,58;MMQ=60,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:2,0:2,0:0|1:101163189_C_G:101163189:4,0,2,0
chr10	101163200	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=139,58;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:2,0:3,0:0|1:101163189_C_G:101163189:4,2,2,0
chr10	101163205	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=21,32;MFRL=142,58;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:0,2:3,0:0|1:101163189_C_G:101163189:5,2,2,0
chr10	101163208	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=142,58;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:3,0:4,0:0|1:101163189_C_G:101163189:5,2,2,0
chr10	101163210	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,14;MFRL=142,58;MMQ=60,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:1,0:4,0:0|1:101163189_C_G:101163189:5,2,2,0
chr10	101165872	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:2,5,3,1
chr10	101180622	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,268;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	101372411	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	101373729	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=137,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr10	101439252	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr10	101448510	.	G	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.101:57:22,3:30,2:20,32,2,3
chr10	101462193	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	101474499	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=225,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:3,2:2,0:0,6,0,2
chr10	101487331	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:101487331_G_A:101487331:0,2,0,1
chr10	101487334	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:101487331_G_A:101487331:0,2,0,1
chr10	101487339	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:101487331_G_A:101487331:0,2,0,1
chr10	101487340	.	T	TCCAGTACTCAGCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:101487331_G_A:101487331:0,2,0,1
chr10	101487343	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:101487331_G_A:101487331:0,2,0,1
chr10	101487345	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:101487331_G_A:101487331:0,2,0,1
chr10	101489233	.	AAAAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=98,154;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr10	101492241	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=239,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,4:2,6:0,5,1,9
chr10	101510109	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:4,1,2,0
chr10	101515316	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=199,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:5,0,4,2
chr10	101544493	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:1,4,2,3
chr10	101551902	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	101553259	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,3:5,4:12,1,6,1
chr10	101554329	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,212;MMQ=58,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr10	101554331	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=158,210;MMQ=59,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,0:2,2:0,8,0,3
chr10	101559026	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,56;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:9,0:13,9,2,0
chr10	101569997	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr10	101590619	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:3,2,1,4
chr10	101591944	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr10	101595996	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:7,6:5,7:5,7,8,5
chr10	101603522	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=125,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,5:6,3:10,1,7,2
chr10	101605550	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,5:3,2:1,10,3,4
chr10	101606857	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:101606857_A_T:101606857:3,18,1,1
chr10	101606861	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,4:7,6:2,11,2,8
chr10	101606866	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:101606857_A_T:101606857:3,17,1,1
chr10	101610533	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:4,5:1,3:3,3,2,6
chr10	101610565	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:2,4,2,3
chr10	101610627	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=197,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,1:2,3:0,4,0,4
chr10	101611294	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:5,8:5,8:6,4,10,6
chr10	101654696	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,1:7,5:8,2,3,3
chr10	101668927	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=200,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr10	101668986	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=172,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr10	101715543	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,323;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:10,6,2,0
chr10	101808734	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=174,209;MMQ=50,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr10	101823543	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	101825160	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr10	101835927	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:101835927_G_T:101835927:0,4,0,1
chr10	101835930	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:101835927_G_T:101835927:0,4,0,1
chr10	101841153	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr10	101841474	.	TAGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=170,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101841474_TAGC_T:101841474:0,1,0,1
chr10	101841481	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=170,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101841474_TAGC_T:101841474:0,1,0,1
chr10	101950765	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,0:8,3:2,12,0,3
chr10	101953275	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=191,272;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr10	101953705	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr10	101980459	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,3,18
chr10	101985797	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:9,1:5,3:2,16,0,4
chr10	102016268	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr10	102027407	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0,0,3,11
chr10	102046067	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,311;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:102046067_A_C:102046067:0,0,0,1
chr10	102046069	.	CA	GG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,311;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102046067_A_C:102046067:0,0,0,1
chr10	102054452	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr10	102054894	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:1,3:8,5:4,6,3,5
chr10	102056928	.	G	GTCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=197,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:102056928_G_GTCTT:102056928:0,3,0,1
chr10	102056930	.	ATGGC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=200,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:102056928_G_GTCTT:102056928:0,2,0,1
chr10	102088906	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	102089552	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr10	102116208	.	ATCCCC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr10	102222825	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr10	102238953	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr10	102239829	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,1,3
chr10	102248950	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=130,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,1:3,3:5,0,4,0
chr10	102249865	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.089:37:19,1:6,1:13,21,0,3
chr10	102257629	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=175,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,0:0,2,0,1
chr10	102275755	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=180,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:6,2:1,0:8,0,2,0
chr10	102275780	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,3:0,3:6,0,4,2
chr10	102289078	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=124,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.644:9:2,3:1,3:2,1,6,0
chr10	102295629	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=157,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:3,0,2,0
chr10	102295657	.	TT	GG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=172,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr10	102296461	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr10	102300320	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:2,0,4,0
chr10	102506070	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,3:8,2:5,6,3,2
chr10	102506103	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,2:6,3:3,5,1,4
chr10	102584597	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr10	102673063	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,2:0,5:0,2,0,7
chr10	102685952	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:102685952_A_C:102685952:1,6,0,2
chr10	102685955	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:102685952_A_C:102685952:1,6,0,2
chr10	102685969	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=195,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:102685969_C_G:102685969:0,4,0,1
chr10	102685971	.	A	AAAGGTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=195,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:102685969_C_G:102685969:0,4,0,1
chr10	102689217	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,17:0.321:54:21,11:16,6:8,29,6,11
chr10	102689504	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:9,3:3,5:12,0,8,0
chr10	102703978	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,8:0,1:0|1:102703978_C_T:102703978:0,0,0,13
chr10	102703981	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0|1:102703978_C_T:102703978:0,0,0,13
chr10	102705058	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:4,3:1,6:6,0,8,2
chr10	102707668	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=208,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102707668_TG_T:102707668:0,1,0,1
chr10	102707670	.	ATGAACC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=208,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102707668_TG_T:102707668:0,1,0,1
chr10	102707681	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=208,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102707668_TG_T:102707668:0,1,0,1
chr10	102732813	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:2,1,4,2
chr10	102733407	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:9,3:2,6:3,8,1,8
chr10	102734778	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:4,3:3,3:1,7,2,4
chr10	102738551	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:6,4,3,2
chr10	102740271	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr10	102746231	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:5,0,6,1
chr10	102750621	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,27:0.518:52:9,8:15,18:0|1:102750621_C_T:102750621:11,14,14,13
chr10	102750623	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,27:0.518:52:9,8:13,17:0|1:102750621_C_T:102750621:11,14,14,13
chr10	102753001	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=162,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:16,0:9,3:17,9,2,1
chr10	102762256	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:7,0,5,0
chr10	102771634	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=130,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.513:12:0,0:2,0:2,4,6,0
chr10	102771640	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=114,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.535:11:2,0:3,1:1,4,6,0
chr10	102780467	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:102780467_G_GAA:102780467:0,2,0,1
chr10	102780469	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:102780467_G_GAA:102780467:0,2,0,1
chr10	102780499	.	G	GCTGCCCAGGCTAGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	102789672	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:102789672_T_A:102789672:2,0,1,0
chr10	102789676	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:102789672_T_A:102789672:2,0,1,0
chr10	102789683	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=37,17;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:102789672_T_A:102789672:2,0,1,0
chr10	102789702	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:102789672_T_A:102789672:2,1,1,0
chr10	102792142	.	CA	GG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,19;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.194:19:2,1:10,0:0|1:102792142_CA_GG:102792142:12,4,3,0
chr10	102792148	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,17;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.210:19:4,0:9,0:0|1:102792142_CA_GG:102792142:9,6,4,0
chr10	102792150	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=22,17;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.170:22:4,0:5,0:0|1:102792142_CA_GG:102792142:13,6,3,0
chr10	102792153	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=26,17;MFRL=163,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.132:21:5,0:9,0:0|1:102792142_CA_GG:102792142:13,6,2,0
chr10	102792295	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,9:0,17:0,0,7,20
chr10	102796774	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr10	102797259	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,3:3,1:1,11,0,4
chr10	102822754	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	102824249	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:102824249_TG_T:102824249:8,5,0,2
chr10	102824252	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,0:3,2:0|1:102824249_TG_T:102824249:8,5,0,2
chr10	103221870	.	CAGG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr10	103281634	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0|1:103281634_C_G:103281634:0,0,6,16
chr10	103281676	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:103281634_C_G:103281634:0,0,1,7
chr10	103290938	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:3,10:9,7:12,0,15,2
chr10	103298239	.	C	CCCAGAAAAGGAAAGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr10	103368751	.	T	TAATAACTTCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr10	103369071	.	AAGG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:3,2:5,0,0,4
chr10	103530401	.	ACGTTACAGAGCCCC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103530401_ACGTTACAGAGCCCC_A:103530401:0,0,0,1
chr10	103530418	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103530401_ACGTTACAGAGCCCC_A:103530401:0,0,0,1
chr10	103563470	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:11,2:6,8:12,5,4,6
chr10	103572913	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:7,8:6,7:0,13,1,14
chr10	103588734	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	103609704	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,0:2,3:1,4,0,3
chr10	103717493	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.844:10:0,3:1,6:0,1,0,9
chr10	103750219	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=214,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:4,1,4,0
chr10	103751774	.	CCTT	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,43;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,0:10,2:0|1:103751774_CCTT_C:103751774:9,13,1,1
chr10	103751779	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,43;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:0|1:103751774_CCTT_C:103751774:9,13,1,1
chr10	103751836	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:2,2:8,1:2,8,0,3
chr10	103771457	.	GA	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.151:43:12,3:16,0:26,11,3,3
chr10	103772741	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103772741_C_A:103772741:0,0,0,1
chr10	103772749	.	TTGGCGACAAGG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103772741_C_A:103772741:0,0,0,1
chr10	103785008	.	G	GGGCCTAAGGAAATGATGTTGTTGCTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=145,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:2,4,1,1
chr10	103799758	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,5:8,6:8,5,9,2
chr10	103871334	.	TCA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=175,125;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,1:0|1:103871334_TCA_T:103871334:0,10,0,2
chr10	103871339	.	T	TGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=175,125;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:5,1:0|1:103871334_TCA_T:103871334:0,10,0,2
chr10	103904763	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,11,7
chr10	103906409	.	AT	CC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,13;MFRL=146,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:103906409_AT_CC:103906409:1,1,1,0
chr10	103906413	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,14;MFRL=146,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:103906409_AT_CC:103906409:1,1,1,0
chr10	103906417	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,13;MFRL=146,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:103906409_AT_CC:103906409:1,1,1,0
chr10	103906422	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:103906422_A_C:103906422:1,1,2,0
chr10	103906425	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=145,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:1,0:0|1:103906422_A_C:103906422:2,1,2,0
chr10	103906428	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,17;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,1:0|1:103906422_A_C:103906422:2,0,2,0
chr10	103920172	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,2:3,2:1,5,1,3
chr10	103922063	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,0:1,6:0,4,0,6
chr10	103991381	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr10	104126352	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,140;MMQ=50,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr10	104127171	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr10	104128954	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=117.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,12:0,22:0,0,26,9
chr10	104138996	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr10	104140506	.	TC	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:104140506_TC_CT:104140506:0,4,0,1
chr10	104140511	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:104140506_TC_CT:104140506:0,4,0,1
chr10	104140512	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:104140506_TC_CT:104140506:0,4,0,1
chr10	104140985	.	G	GCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=219,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr10	104155958	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:11,0,3,0
chr10	104156911	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=221,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:1,1,1,2
chr10	104157727	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=41,32;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=102.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.939:31:0,13:1,16:1,0,26,4
chr10	104157744	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:14,3:17,0:24,9,2,1
chr10	104158972	.	CAA	C,CAAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32,34;MFRL=0,172,241;MMQ=60,60,44;MPOS=7,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,20;RU=A;STR;TLOD=5.83,5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.375,0.476:4:0,0,1:0,2,1:0,0,4,0
chr10	104158991	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=15,13;MFRL=172,241;MMQ=60,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:0,0:0|1:104158991_T_A:104158991:2,0,2,0
chr10	104158992	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=13,14;MFRL=307,172;MMQ=40,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,0:0,0:1|0:104158991_T_A:104158991:1,0,2,0
chr10	104160620	.	G	GGA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:4,2:6,1:4,6,0,3
chr10	104160625	.	A	AAT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:3,1:7,1:0|1:104160625_A_AAT:104160625:5,7,0,2
chr10	104160627	.	GGGCC	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,1:7,1:0|1:104160625_A_AAT:104160625:6,5,0,2
chr10	104160634	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=-1073741827;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.208:13:2,1:8,1:0|1:104160625_A_AAT:104160625:7,4,0,2
chr10	104161410	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	104161724	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:3,0,3,1
chr10	104161967	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr10	104164488	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:1,5,2,6
chr10	104184189	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:2,3:8,1:4,7,3,1
chr10	104230930	.	TTCGGTGCTGGG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:0,4:1,1:0,2,3,2
chr10	104231234	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr10	104232716	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:6,2:14,5:11,9,4,3
chr10	104232765	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=166,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:1,12,1,1
chr10	104232785	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:5,2:0,9,0,2
chr10	104232787	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=200,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,0:4,1:0,8,0,2
chr10	104232809	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=206,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr10	104241683	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.412:17:5,2:5,4:3,7,5,2
chr10	104250278	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,3,2
chr10	104264107	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.449:37:9,8:11,5:8,12,7,10
chr10	104268858	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.627:14:3,6:2,2:0|1:104268858_AG_A:104268858:3,2,7,2
chr10	104268860	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=134,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.626:14:3,6:2,3:0|1:104268858_AG_A:104268858:3,2,7,2
chr10	104356822	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr10	104359350	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr10	104378750	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,4:6,4:6,6,3,5
chr10	104386934	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:15,7:4,5:14,5,10,2
chr10	104387019	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:9,5:7,2:6,10,1,6
chr10	104389932	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr10	104404335	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,6:3,0:8,0,6,0
chr10	104414528	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:4,1:6,10,0,2
chr10	104445545	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr10	104445837	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=185,185;MMQ=50,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr10	104445841	.	T	TGTTTTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=180,185;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chr10	104449586	.	CA	C,CAA	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=34,34,34;MFRL=139,166,158;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.22,5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,4,5:0.091,0.123:45:13,2,1:22,2,3:36,0,8,1
chr10	104449606	.	CAT	C	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.061:62:17,1:26,2:36,23,1,2
chr10	104459079	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr10	104474046	.	CCCT	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CCT;STR;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:8,3:6,3:1,13,0,6
chr10	104474107	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr10	104486304	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	104486334	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	104486974	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr10	104489011	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr10	104492707	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,3,15
chr10	104493444	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	104572276	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr10	104592675	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:2,3,4,1
chr10	104595248	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	104629465	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr10	104633053	.	A	ATTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=T;STR;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,5:3,1:1,4,0,6
chr10	104636855	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=218,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr10	104650251	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=239,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr10	104687242	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=87,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:104687242_C_T:104687242:0,4,0,1
chr10	104687247	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=174,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:104687242_C_T:104687242:0,3,0,1
chr10	104687255	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=105,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:104687242_C_T:104687242:0,2,0,1
chr10	104687266	.	CG	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=210,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	104836047	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:4,2:6,2:4,7,1,3
chr10	104836940	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,1,4
chr10	104836989	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	104849461	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,7:0.147:52:23,3:21,4:0|1:104849461_C_T:104849461:21,24,3,4
chr10	104849468	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,24:0.476:50:12,12:13,9:1|0:104849461_C_T:104849461:12,14,13,11
chr10	104850620	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=237,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:1,2,2,0
chr10	104850632	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr10	104850833	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=203,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:104850833_T_C:104850833:0,1,0,1
chr10	104850836	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:104850833_T_C:104850833:0,1,0,1
chr10	104850837	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=203,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:104850833_T_C:104850833:0,1,0,1
chr10	104851285	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,26:0.430:61:16,12:18,14:18,17,13,13
chr10	104855656	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=128.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,44:0.569:77:19,22:14,20:25,8,36,8
chr10	104855670	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=164.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,55:0.555:99:23,26:20,28:26,18,43,12
chr10	104857205	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr10	104857218	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=206,185;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,1,2
chr10	104857234	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=206,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr10	104866476	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:8,1:16,3:9,18,1,3
chr10	104934709	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:3,2:0,1:2,2,0,3
chr10	105005683	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.572:8:1,2:1,2:2,1,5,0
chr10	105007471	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,8:1,1:3,1,7,2
chr10	105007630	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:14,0:9,5:5,18,0,5
chr10	105038079	.	CGCGCG	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105038079_CGCGCG_C:105038079:0,0,0,1
chr10	105038086	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105038079_CGCGCG_C:105038079:0,0,0,1
chr10	105038088	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105038079_CGCGCG_C:105038079:0,0,0,1
chr10	105038090	.	TCTTCC	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105038079_CGCGCG_C:105038079:0,0,0,1
chr10	105038098	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105038079_CGCGCG_C:105038079:0,0,0,1
chr10	105038102	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	105108455	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:2,1,3,1
chr10	105110740	.	A	AGGAGGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=0,97;MMQ=36,52;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGAGGC;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,1,2
chr10	105144986	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105144986_A_G:105144986:0,0,1,0
chr10	105144995	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105144986_A_G:105144986:0,0,1,0
chr10	105154089	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,6:7,3:10,3,5,4
chr10	105179214	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr10	105197765	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:9,4,2,0
chr10	105201565	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=90.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,9:0,10:0|1:105201565_G_A:105201565:0,0,15,6
chr10	105201577	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=107.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,14:0,11:0|1:105201565_G_A:105201565:0,0,18,8
chr10	105202221	.	T	TCATC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:105202221_T_TCATC:105202221:0,2,0,1
chr10	105202224	.	G	GAACA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:105202221_T_TCATC:105202221:0,2,0,1
chr10	105202250	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:105202250_T_G:105202250:0,0,0,1
chr10	105202255	.	C	CTCATAT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:105202250_T_G:105202250:0,0,0,1
chr10	105202256	.	G	GTCAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:105202250_T_G:105202250:0,0,0,1
chr10	105202259	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:105202250_T_G:105202250:0,0,0,1
chr10	105204453	.	CT	GC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=114,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr10	105204454	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.892:8:0,4:0,3:0,0,2,6
chr10	105206874	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,10,4
chr10	105215016	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr10	105218252	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,11,11
chr10	105218359	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,9,11
chr10	105254090	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,1:3,1:9,3,2,0
chr10	105349816	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=207,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr10	105349896	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=168,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,1,1
chr10	105362104	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:6,3:3,5:6,4,3,6
chr10	105362996	.	G	GGAATTACCCCCTAGTGATGGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:6,0:1,2:1,6,1,1
chr10	105382405	.	G	GTTGCAGTGAGCTGAGATTGCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105382405_G_GTTGCAGTGAGCTGAGATTGCAC:105382405:0,0,0,1
chr10	105382409	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105382405_G_GTTGCAGTGAGCTGAGATTGCAC:105382405:0,0,0,1
chr10	105428453	.	CAG	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AG;STR;TLOD=110.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.971:30:0,13:0,15:0,0,8,22
chr10	105428530	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,0:3,6:0,5,0,6
chr10	105452684	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr10	105614884	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,23,0
chr10	105615074	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,5:5,1:0,6,0,6
chr10	105615105	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr10	105652076	.	T	TACAAATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	105657316	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,9,7
chr10	105658588	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:6,1,4,0
chr10	105727656	.	AAG	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=119.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,18:0,0,8,23
chr10	105752331	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=72,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:3,1,2,0
chr10	105768158	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.895:16:0,8:1,6:0,1,0,15
chr10	105781532	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,0,18
chr10	105793173	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	105794133	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	105796399	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr10	105796449	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	105796738	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr10	105796819	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr10	105796831	.	A	AAAGT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:105796831_A_AAAGT:105796831:1,5,1,1
chr10	105796834	.	G	GTTCTGAGCCAAGGGTTTTGGC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=161,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:4,1:3,0:0|1:105796831_A_AAAGT:105796831:2,5,1,1
chr10	105797378	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,13:0,0,19,2
chr10	105799599	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr10	105800887	.	G	GCTTCCCTGCTGCCTCCTCCTGAGC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,1:7,1:2,15,1,1
chr10	105805436	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr10	105810371	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.439:25:2,3:12,7:8,6,7,4
chr10	105810400	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,7:0,16:0,0,11,12
chr10	105814826	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,5,13
chr10	105815454	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr10	105816685	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr10	105819352	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,1:10,1:8,7,2,0
chr10	105821136	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,4,2
chr10	105821294	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr10	105831714	.	GCA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,0:3,3:5,1,3,0
chr10	105883957	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.144:25:8,0:13,3:0,22,0,3
chr10	105885525	.	CTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.273:8:0,2:2,0:0,6,0,2
chr10	105906173	.	GA	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:105906173_GA_TT:105906173:1,2,0,1
chr10	105906176	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:105906173_GA_TT:105906173:1,2,0,1
chr10	105926396	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,49;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:16,0:8,3:14,10,0,3
chr10	105991884	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=54.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,13,4
chr10	106124660	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,4:6,4:0,14,0,8
chr10	106159305	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,53;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	106160731	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	106602496	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr10	106675585	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:4,3,8,1
chr10	106737026	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=201,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr10	106907320	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr10	106907586	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr10	106916819	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr10	106923973	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr10	106960790	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	107015572	.	G	GTGCCT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=107,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.171:15:5,1:8,1:0|1:107015572_G_GTGCCT:107015572:4,9,0,2
chr10	107015574	.	G	GCCTGTTTTGAAACAGAC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=107,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,1:0|1:107015572_G_GTGCCT:107015572:4,9,0,2
chr10	107022304	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=155,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:107022304_C_CAG:107022304:0,1,0,1
chr10	107022306	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=155,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:107022304_C_CAG:107022304:0,1,0,1
chr10	108371571	.	A	AGTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GTTT;STR;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.863:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	108432828	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,819;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	108439103	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr10	108466412	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr10	108469102	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=168,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:0|1:108469102_G_C:108469102:7,10,1,1
chr10	108469108	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=160,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,0:7,1:0|1:108469102_G_C:108469102:7,11,1,1
chr10	108469160	.	A	AATTGTGTTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr10	108469161	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr10	108536331	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=131,36;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:13,8,1,1
chr10	111625108	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr10	111630749	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=142,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:111630749_G_A:111630749:0,1,0,1
chr10	111630754	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=142,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:111630749_G_A:111630749:0,1,0,1
chr10	111630757	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111630749_G_A:111630749:0,0,0,1
chr10	111631593	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=134,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:6,2:4,7,1,1
chr10	111631665	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,1:4,3:1,3,0,4
chr10	111633025	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr10	111646147	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,5:5,1:1,6,0,6
chr10	111647738	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr10	111667664	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	111878510	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0,8,1,5
chr10	111886089	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr10	111892246	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111892246_T_G:111892246:0,1,0,1
chr10	111892249	.	CT	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111892246_T_G:111892246:0,1,0,1
chr10	112004562	.	CT	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.281:27:7,4:12,4:0|1:112004562_CT_C:112004562:19,0,8,0
chr10	112004579	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=20,10;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:31,9:0.208:40:7,0:9,0:1|0:112004562_CT_C:112004562:22,9,9,0
chr10	112039780	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:15,1:15,1:9,21,0,2
chr10	112044553	.	G	GTTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTC;STR;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,8,0
chr10	112054908	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,12:0,0,22,0
chr10	112266771	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:7,5:11,8:10,8,5,8
chr10	112266822	.	GC	AT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,16:0,0,9,15
chr10	112327678	.	C	CA	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=221.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.984:57:0,27:0,27:0,0,0,57
chr10	112328838	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,2,20
chr10	112333333	.	C	CTGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	112342467	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,0:10,3:0,23,0,3
chr10	112342480	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=147,156;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,2:9,2:0,14,0,4
chr10	112356331	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr10	112360315	.	GTT	G,GT	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=30,30,36;MFRL=121,0,115;MMQ=60,60,60;MPOS=18,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=3.86,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,5,7:0.139,0.204:35:7,3,4:7,1,2:9,14,8,4
chr10	112362019	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	112540896	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.173:24:5,1:7,0:9,11,4,0
chr10	112590810	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,13:0,0,12,12
chr10	112635876	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,3:0.041:75:39,0:29,3:11,61,0,3
chr10	112764594	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	112839579	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,7,10
chr10	112839756	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:5,5:7,1:5,7,2,5
chr10	113913222	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=178,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr10	113915574	.	CA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33,33;MFRL=111,185,159;MMQ=60,60,60;MPOS=25,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.93,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.312,0.411:7:1,1,3:1,1,0:1,1,5,0
chr10	113917085	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:3,3,1,5
chr10	113920652	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,0,3
chr10	113921354	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr10	113923595	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,2:2,6:2,7,2,6
chr10	114043596	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr10	114046230	.	T	TATTTATGCTGGTCGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr10	114059330	.	TCTCTGTTTTC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCTGTTTTC;STR;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr10	114061979	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr10	114164426	.	TTC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:6,2:13,1:13,6,2,1
chr10	114181683	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=102.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,14:0,0,22,8
chr10	114185237	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:22,2:33,1:21,35,0,3
chr10	114192285	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:9,5:7,2:0,16,1,6
chr10	114193060	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.524:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr10	114194313	.	T	TCTGCTTACAAGG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr10	114197982	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,21,0
chr10	114200355	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,18,5
chr10	114297897	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr10	114297999	.	T	G	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:35,3:25,0:39,22,3,0
chr10	114574944	.	C	CCCCAAACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr10	114724473	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:1,3:4,1:0,5,0,5
chr10	114849353	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:1,6,0,3
chr10	114905721	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,13;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,0:4,1:0|1:114905721_CA_C:114905721:2,8,3,0
chr10	114905727	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.191:18:5,0:6,1:0|1:114905721_CA_C:114905721:3,12,3,0
chr10	114905732	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:7,0:8,0:0|1:114905721_CA_C:114905721:3,12,3,0
chr10	114910667	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr10	115312811	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr10	115327179	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr10	115327399	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,1:1,3:0,1,0,6
chr10	115335843	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr10	115338305	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=90,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr10	115338615	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=212,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr10	115343831	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr10	115343852	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.592:8:2,3:1,1:2,1,3,2
chr10	115344084	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,181;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,0:2,3:0,8,0,3
chr10	115348726	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=159,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.653:24:4,11:4,4:7,1,11,5
chr10	115349397	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr10	115355293	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	115355328	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=178,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr10	115373851	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,3,1
chr10	115391415	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=202,1546;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,4,0
chr10	115392919	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:5,3:9,8:5,9,3,8
chr10	115393929	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:5,4:5,3:2,8,3,5
chr10	115401031	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	115401081	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,4:5,2:7,0,4,2
chr10	115401264	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:1,9,0,2
chr10	115405615	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:4,3:7,7:4,7,5,6
chr10	115405664	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,2:0,6:0,2,3,5
chr10	115405703	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=18,17;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:0,0:0,4,1,2
chr10	115412686	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr10	115413695	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr10	115413901	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:0,4:8,4:0,8,0,8
chr10	115481018	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,6:2,1:0,5,0,7
chr10	115608651	.	TAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,69;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,1:4,1:7,0,2,0
chr10	115608921	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=172,81;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,1:10,2:7,10,1,2
chr10	115664850	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr10	115805214	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=293,276;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr10	115805528	.	G	GT	.	.	DP=75;ECNT=6;MBQ=33,36;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.100:44:13,3:23,1:10,30,2,2
chr10	115805535	.	TTTTC	T	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=138,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.062:45:18,0:24,2:0|1:115805535_TTTTC_T:115805535:12,31,0,2
chr10	115805544	.	C	CA	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=137,69;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:10,0:16,2:0|1:115805535_TTTTC_T:115805535:11,28,0,2
chr10	115805547	.	T	TTG	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=139,69;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:12,0:20,2:0|1:115805535_TTTTC_T:115805535:10,26,0,2
chr10	115805559	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=21,22;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;RPA=22,16;RU=T;STR;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.776:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr10	115805595	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,1:8,1:4,7,0,2
chr10	115806713	.	A	AGTAAGCCCCCACC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=238,238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.486:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr10	115904180	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:11,1:15,1:26,0,2,0
chr10	115962812	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=48583798,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:1,1,4,3
chr10	115963126	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.894:16:0,6:1,9:0,1,8,7
chr10	115963813	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr10	115964736	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr10	115966147	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	115973032	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:115973032_TG_T:115973032:2,0,2,0
chr10	115973040	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:115973032_TG_T:115973032:2,0,2,0
chr10	115980324	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,3,1
chr10	115985784	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:9,0,4,2
chr10	115986023	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=91,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:115986023_T_C:115986023:0,2,0,1
chr10	115986025	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=91,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:115986023_T_C:115986023:0,2,0,1
chr10	115986065	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	115991124	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	115991227	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.569:14:3,5:3,3:2,4,7,1
chr10	116008464	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=118,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,4:2,6:6,3,5,5
chr10	116008497	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,13:0,0,8,16
chr10	116014827	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=92,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:2,6,1,7
chr10	116044587	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=99,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr10	116045796	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:4,3,1,1
chr10	116045851	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=164,51;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:7,2:0|1:116045851_T_G:116045851:7,7,1,1
chr10	116045857	.	CATA	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=164,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:6,2:0|1:116045851_T_G:116045851:7,7,1,1
chr10	116045862	.	A	ACG	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=165,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:4,2:0|1:116045851_T_G:116045851:7,6,1,1
chr10	116045864	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=174,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:116045851_T_G:116045851:6,5,1,1
chr10	116058933	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr10	116060194	.	A	AG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=92.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,17:0,0,16,13
chr10	116061306	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr10	116068176	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,10,5
chr10	116075228	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr10	116075271	.	T	TCC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=C;STR;TLOD=48.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,6:0,0,10,3
chr10	116091555	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:11,9:2,8:9,4,10,7
chr10	116100320	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:5,0,3,0
chr10	116158758	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116158758_G_T:116158758:0,1,0,1
chr10	116158761	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116158758_G_T:116158758:0,1,0,1
chr10	116164088	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	116196143	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,16;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.489:6:0,0:0,1:0,3,0,3
chr10	116197499	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr10	116203911	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr10	116209970	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:6,2:9,1:1,21,0,4
chr10	116209978	.	A	AAC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.472:26:7,5:7,7:1,13,0,12
chr10	116210018	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:0,6,0,4
chr10	116222749	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=65.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.632:36:7,14:6,9:10,3,14,9
chr10	116225365	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr10	116245066	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:3,2,4,1
chr10	116245229	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:116245229_C_CT:116245229:0,2,0,1
chr10	116245230	.	C	CCTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:116245229_C_CT:116245229:0,2,0,1
chr10	116245231	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:116245229_C_CT:116245229:0,2,0,1
chr10	116304958	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr10	116593175	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.470:19:4,5:6,3:1,9,1,8
chr10	116596071	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr10	116603766	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:116603766_A_T:116603766:0,0,0,1
chr10	116603767	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:116603766_A_T:116603766:0,0,0,1
chr10	116603769	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:116603766_A_T:116603766:0,0,0,1
chr10	116605103	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,5:4,2:7,3,6,1
chr10	116606173	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=238,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,1:1,2,2,1
chr10	116925447	.	TGA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:116925447_TGA_T:116925447:0,3,0,1
chr10	116925450	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:116925447_TGA_T:116925447:0,3,0,1
chr10	116925452	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:116925447_TGA_T:116925447:0,3,0,1
chr10	116931101	.	C	CTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=87.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,8:0,0,9,11
chr10	117045858	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=140,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:3,9,0,2
chr10	117075111	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:10,8,0,2
chr10	117309098	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr10	117486910	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:0,1,1,3
chr10	117971225	.	AAT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=193,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117971225_AAT_A:117971225:0,1,0,1
chr10	117971228	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=193,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:117971225_AAT_A:117971225:0,1,0,1
chr10	117971234	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:117971225_AAT_A:117971225:0,0,0,1
chr10	118031376	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr10	118031619	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr10	118116872	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,160;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:13,0:12,2:12,14,2,0
chr10	118187399	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0|1:118187399_T_G:118187399:0,0,10,0
chr10	118187405	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0|1:118187399_T_G:118187399:0,0,10,0
chr10	118231360	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=160.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,21:0,16:0|1:118231360_G_A:118231360:0,0,15,23
chr10	118231363	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=157.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.974:37:0,16:0,15:0|1:118231360_G_A:118231360:0,0,14,23
chr10	118231406	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=56.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.661:27:3,9:5,9:1,8,5,13
chr10	118310807	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:118310807_A_C:118310807:0,2,0,1
chr10	118310811	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118310807_A_C:118310807:0,1,0,1
chr10	118310815	.	A	ACCCAGTTCTGATG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118310807_A_C:118310807:0,1,0,1
chr10	118351414	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=172,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:0,2,2,1
chr10	118351425	.	A	ACAGCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=176,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr10	118351492	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=248,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:118351492_C_CTT:118351492:0,1,0,1
chr10	118351496	.	AGA	CTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=248,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118351492_C_CTT:118351492:0,1,0,1
chr10	118357490	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr10	118359548	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,12:0,0,13,10
chr10	118368493	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr10	118368736	.	GG	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118368736_GG_CA:118368736:0,0,0,1
chr10	118368740	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118368736_GG_CA:118368736:0,0,0,1
chr10	118380511	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,20:0,16:0,0,13,25
chr10	118380629	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr10	118383463	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,7:0,0,12,4
chr10	118394551	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	118396277	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.252:17:6,0:5,4:5,8,2,2
chr10	118396278	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:0,8:2,7:0,2,8,8
chr10	118398046	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr10	118404620	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:0,1,1,5
chr10	118427645	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr10	118436068	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr10	118451810	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:118451810_A_G:118451810:0,0,4,1
chr10	118451812	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0|1:118451810_A_G:118451810:3,0,1,1
chr10	118620777	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr10	118633548	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,11,1
chr10	118635837	.	A	AAACCAAACTACAATGTCTGACTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=224,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	118646129	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=223,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:0|1:118646129_G_C:118646129:0,7,0,4
chr10	118646143	.	T	TCTGGTAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:118646129_G_C:118646129:0,4,0,1
chr10	118719584	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr10	118891915	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:9,4:14,7:11,13,6,5
chr10	119001151	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	119014023	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr10	119014931	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,4:0|1:119014931_C_T:119014931:0,0,0,11
chr10	119014948	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0|1:119014931_C_T:119014931:0,0,1,9
chr10	119026401	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,15,2
chr10	119027123	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr10	119029515	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,1:0,4:3,0,5,0
chr10	119029744	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,6,21
chr10	119042761	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr10	119043295	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.611:29:5,6:6,11:8,3,11,7
chr10	120070709	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,32:0.559:57:13,18:12,14:20,5,27,5
chr10	120070843	.	G	GA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=245,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=83.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.952:37:1,9:0,15:0,1,3,33
chr10	120445794	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr10	120488934	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0|1:120488934_CA_C:120488934:0,1,0,1
chr10	120488939	.	CAAG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120488934_CA_C:120488934:0,1,0,1
chr10	120488946	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120488934_CA_C:120488934:0,1,0,1
chr10	120488948	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120488934_CA_C:120488934:0,1,0,1
chr10	120513953	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.306:26:8,0:3,0:8,10,0,8
chr10	120513955	.	G	GAGTGGAATGGAGTGGTGT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:11,2:10,0:7,15,0,2
chr10	120792297	.	G	GCTA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTA;STR;TLOD=136.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,16:0,14:0,0,22,10
chr10	120792657	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=177,151;MMQ=46,41;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:8,0:17,3:25,0,3,0
chr10	120792684	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,47;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,9:0,26:0|1:120792684_A_G:120792684:0,0,35,0
chr10	120792703	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=186.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,45:0.979:45:0,15:0,25:0|1:120792684_A_G:120792684:0,0,42,3
chr10	120793384	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.326:16:4,2:5,3:4,7,2,3
chr10	120793873	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr10	120795795	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,0:8,2:2,14,0,3
chr10	120797933	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:12,0:20,3:3,29,0,3
chr10	120801553	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,9:6,5:6,4,12,2
chr10	120801943	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:15,3:9,0:15,9,2,1
chr10	120803746	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr10	120810153	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.131:51:15,3:30,3:15,30,2,4
chr10	120817450	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr10	120820224	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr10	120832872	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr10	120867694	.	TA	T	.	.	DP=73;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,7:0.139:52:22,3:15,4:11,34,2,5
chr10	120867718	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:30,0:14,3:3,43,1,2
chr10	120867723	.	GC	AT,AC	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=32,33,28;MFRL=157,157,181;MMQ=60,40,60;MPOS=28,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.70,5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:42,2,3:0.060,0.076:47:31,0,0:11,2,3:3,39,1,4
chr10	120867734	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=159,123;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:26,0:10,3:1,35,0,3
chr10	120867764	.	AGGTC	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=199,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.219:16:9,3:4,0:0|1:120867764_AGGTC_A:120867764:0,13,0,3
chr10	120867772	.	A	AGGTG	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=199,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:9,1:2,0:0|1:120867764_AGGTC_A:120867764:0,13,0,3
chr10	120877248	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,179;MMQ=46,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.793:11:1,5:0,3:0,2,0,9
chr10	120914692	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=162,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,3:3,9:5,7,4,8
chr10	120917269	.	A	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=224.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,34:0,34:0,0,25,43
chr10	120917616	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:2,5,0,4
chr10	120917691	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=181,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr10	120917693	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,18;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:120917693_G_GAT:120917693:0,4,0,1
chr10	120917694	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,16;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:120917693_G_GAT:120917693:0,4,0,1
chr10	120917695	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=181,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr10	120917698	.	G	GGCTTGCAAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	120919179	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=96,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.539:30:9,10:3,6:9,5,10,6
chr10	120922017	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr10	120923780	.	C	CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.731:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr10	120928938	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr10	120933901	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0|1:120933901_T_C:120933901:0,0,26,1
chr10	120933914	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=164,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.119:31:17,2:11,1:0|1:120933901_T_C:120933901:28,0,2,1
chr10	120936701	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr10	121140511	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:9,1:5,8:0|1:121140511_A_G:121140511:0,14,0,9
chr10	121140534	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:5,1:3,3:0|1:121140511_A_G:121140511:0,9,0,4
chr10	121196062	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=214,261;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr10	121199189	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,7:0,0,10,9
chr10	121201626	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr10	121212363	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	121214461	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,10;MFRL=97,82;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:3,0:0,0:0|1:121214461_T_G:121214461:2,2,2,0
chr10	121214467	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=97,82;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.352:6:2,0:1,0:0|1:121214461_T_G:121214461:2,2,2,0
chr10	121287019	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	121337166	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:10,2:13,1:13,10,3,0
chr10	121338401	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr10	121347839	.	TTTTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTC;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.508:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr10	121429762	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	121432054	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,1:8,1:6,14,0,2
chr10	121435955	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,13,1
chr10	121557940	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:4,0,2,0
chr10	121566030	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:26,0:21,3:7,40,0,3
chr10	121571507	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:3,5:6,7:1,8,3,9
chr10	121582556	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.385:21:5,3:8,4:8,5,8,0
chr10	121658470	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	121678110	.	T	TTTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=236,305;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTTG;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	121678887	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121678887_G_A:121678887:0,0,1,0
chr10	121678896	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121678887_G_A:121678887:0,0,1,0
chr10	121685448	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr10	121691567	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr10	122216790	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	122334561	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,2:1,0:3,0,2,0
chr10	122358876	.	TGA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,1:4,4:4,3,1,4
chr10	122648617	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:16,1:17,1:19,15,2,0
chr10	123239047	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:5,6:5,3:8,2,8,1
chr10	123243197	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.441:23:4,7:8,3:10,3,6,4
chr10	123246863	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:9,1:20,1:17,12,0,2
chr10	123247037	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:123247037_C_T:123247037:0,4,0,2
chr10	123247044	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:123247037_C_T:123247037:0,0,0,5
chr10	123247669	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=154,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr10	123278435	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0|1:123278435_A_C:123278435:0,1,0,1
chr10	123278439	.	C	CTCTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:123278435_A_C:123278435:0,1,0,1
chr10	123279745	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr10	123298158	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,36:0.494:73:23,14:13,21:10,27,12,24
chr10	123661859	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.196:16:10,3:1,0:13,0,2,1
chr10	123673206	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr10	123681962	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=180.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,25:0,24:0,0,10,40
chr10	123718826	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,2:8,3,3,1
chr10	123719835	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,28:0.617:45:7,12:10,16:15,2,23,5
chr10	123720032	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:0,8,0,6
chr10	123724701	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:1,2:1,2:0|1:123724701_AC_A:123724701:3,0,5,0
chr10	123724705	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0|1:123724701_AC_A:123724701:3,0,5,0
chr10	123724767	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,23,2
chr10	123730649	.	A	AACCCCTAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	123842065	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	123969987	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:11,2:18,0:9,23,2,0
chr10	123970569	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,1:2,5:2,2,3,3
chr10	124008959	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=197,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr10	124009261	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=220,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,4:1,4:0,4,0,8
chr10	124034528	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:13,8:9,7:13,9,12,3
chr10	124034703	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,54;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:2,2:1,4,0,2
chr10	124036494	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,4:4,3:2,8,1,6
chr10	124036543	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr10	124049606	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124049606_A_AG:124049606:0,0,0,1
chr10	124049608	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124049606_A_AG:124049606:0,0,0,1
chr10	124091921	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,4:0,10:0,0,12,2
chr10	124097427	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=102,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr10	124152936	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.757:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr10	124157385	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.489:43:7,6:15,15:19,3,18,3
chr10	124166276	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=195,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:1,1:0|1:124166276_T_C:124166276:0,2,0,1
chr10	124166277	.	T	TCTGGAAAGTAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=195,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:124166276_T_C:124166276:0,2,0,1
chr10	124175273	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	124175278	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr10	124183690	.	T	TC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.220:20:11,2:5,2:16,0,4,0
chr10	124183691	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.270:20:10,3:5,2:15,0,5,0
chr10	124183715	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=134,106;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:13,0:6,0:32,5,2,0
chr10	124183732	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.983:53:0,29:0,14:0,0,37,16
chr10	124214448	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:8,7:1,3:5,4,3,7
chr10	124214595	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124214595_G_C:124214595:0,0,0,1
chr10	124214598	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124214595_G_C:124214595:0,0,0,1
chr10	124214600	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124214595_G_C:124214595:0,0,0,1
chr10	124214602	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124214595_G_C:124214595:0,0,0,1
chr10	124214607	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124214595_G_C:124214595:0,0,0,1
chr10	124216384	.	C	CTA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=135.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,18:0,0,23,13
chr10	124248513	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=117,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:12,0:10,13,1,1
chr10	124266500	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	124269568	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.281:18:2,1:7,0:9,4,5,0
chr10	124271589	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr10	124271625	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:4,0:0,5,1,0
chr10	124320194	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr10	124325409	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,14,2
chr10	124325569	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,9:0,0,6,15
chr10	124325631	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr10	124329580	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:124329580_C_A:124329580:0,0,5,0
chr10	124329583	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:124329580_C_A:124329580:0,0,6,0
chr10	124329672	.	TC	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,4,11
chr10	124329746	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,9,10
chr10	124329776	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=162,155;MMQ=51,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:1,6,1,4
chr10	124329801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr10	124331722	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,14,1
chr10	124331944	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0|1:124331944_C_T:124331944:0,0,0,11
chr10	124331957	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,6:0|1:124331944_C_T:124331944:0,0,0,13
chr10	124331963	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0|1:124331944_C_T:124331944:0,0,0,11
chr10	124333308	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr10	124335866	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	124341351	.	C	CGACAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,260;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124341351_C_CGACAT:124341351:0,0,0,1
chr10	124341354	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,260;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124341351_C_CGACAT:124341351:0,0,0,1
chr10	124399467	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	124399985	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	124458090	.	TCC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=182,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:0,1:0|1:124458090_TCC_T:124458090:0,1,0,1
chr10	124458093	.	A	ATACG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=182,215;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124458090_TCC_T:124458090:0,1,0,1
chr10	124458996	.	G	GTCAGTTCCTAAGGGTGTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr10	124595886	.	AA	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr10	124598466	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:7,1,2,0
chr10	124711589	.	CTTTTAA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.480:44:10,10:12,11:0,23,0,21
chr10	124742586	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:0,5,0,6
chr10	124746801	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=137,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:5,1:9,2,2,0
chr10	124747108	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,1296;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	124810736	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124810736_G_T:124810736:0,0,0,1
chr10	124810746	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124810736_G_T:124810736:0,0,0,1
chr10	124812487	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	124812685	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=105,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.892:14:0,5:1,5:0,1,2,11
chr10	124896634	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,1:10,1:7,7,2,0
chr10	124907875	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:14,3:4,2:13,6,3,2
chr10	124920171	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr10	125426565	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr10	125426627	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	125521721	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=53.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,1,15
chr10	125521749	.	A	AGAGGGTAAAATTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=173,154;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.387:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr10	125521751	.	C	G,CCAGAGGGTAAAATTAGGTCCAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34,34;MFRL=0,173,154;MMQ=60,60,51;MPOS=15,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.12,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.513,0.326:3:0,0,0:0,2,1:0,0,0,3
chr10	125526689	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr10	125558525	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	125780752	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=G;STR;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0|1:125780752_CG_C:125780752:0,0,10,0
chr10	125780759	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0|1:125780752_CG_C:125780752:0,0,11,1
chr10	125780958	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,0,16
chr10	125801761	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr10	125801809	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,5:3,5:3,3,7,3
chr10	126086730	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr10	126086761	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,36;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:126086761_C_CA:126086761:0,3,0,1
chr10	126086766	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:126086761_C_CA:126086761:0,3,0,1
chr10	126090499	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,137;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr10	126093991	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.409:27:8,5:8,5:14,2,9,2
chr10	126100523	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=100.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,38:0.449:85:18,13:28,25:28,19,21,17
chr10	126150338	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	126150388	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=251,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr10	126185451	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr10	126185618	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chr10	126185707	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr10	126205726	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,1:2,1:11,0,2,0
chr10	126370638	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=181,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:11,0:10,3:12,9,1,2
chr10	126384610	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr10	126395123	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr10	126451082	.	G	GGGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	126505062	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr10	126660781	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	126671673	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=1809478,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr10	126673560	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=171,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:5,0:0|1:126673560_GA_G:126673560:0,15,1,1
chr10	126673569	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=185,51;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:6,0:0|1:126673560_GA_G:126673560:0,16,1,1
chr10	126678023	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=141,120;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:0,1:4,1:6,0,2,0
chr10	126678063	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=33,34;MFRL=143,144;MMQ=27,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,1:13,1:14,8,2,0
chr10	126678065	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=34,30;MFRL=137,149;MMQ=27,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,0:13,1:16,9,1,1
chr10	126678075	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=140,131;MMQ=27,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.123:29:12,1:12,2:15,11,2,1
chr10	126678092	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=31,17;MFRL=137,60;MMQ=27,22;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.100:32:16,0:11,1:12,17,0,3
chr10	126678102	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=32,31;MFRL=143,106;MMQ=27,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.218:30:10,3:10,3:0|1:126678102_G_A:126678102:5,19,1,5
chr10	126678112	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=32,34;MFRL=142,106;MMQ=27,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:9,3:10,3:0|1:126678102_G_A:126678102:4,17,1,5
chr10	126678122	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=34,34;MFRL=142,138;MMQ=27,26;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.117:23:12,1:9,1:0|1:126678122_GT_G:126678122:5,16,0,2
chr10	126678128	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=30,32;MFRL=140,138;MMQ=27,26;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,1:7,1:0|1:126678122_GT_G:126678122:5,17,0,2
chr10	126678133	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=31,18;MFRL=142,120;MMQ=27,31;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:8,1:8,1:5,14,0,4
chr10	126678148	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=32,29;MFRL=146,120;MMQ=27,31;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:6,1:6,2:2,11,0,4
chr10	126681215	.	CG	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=127,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,16:0.658:24:6,7:1,9:0|1:126681215_CG_C:126681215:5,3,13,3
chr10	126681219	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,9:0.341:27:7,6:11,3:1|0:126681215_CG_C:126681215:14,4,5,4
chr10	126681688	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr10	126681868	.	C	G	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=146,69;MMQ=60,31;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,7:0.092:83:40,2:36,5:35,41,1,6
chr10	126682435	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=129,0;MMQ=60,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:15,1:6,1:0|1:126682435_T_C:126682435:8,14,1,2
chr10	126682443	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=129,0;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:12,1:7,4:0|1:126682435_T_C:126682435:8,13,1,4
chr10	126682463	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=124,45;MMQ=60,32;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,1:9,1:8,15,1,1
chr10	126682468	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=129,0;MMQ=60,42;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:14,1:6,4:8,12,1,4
chr10	126682485	.	CT	TG	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=131,0;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:8,1:6,4:0|1:126682485_CT_TG:126682485:7,9,1,4
chr10	126682493	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=129,0;MMQ=60,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:6,1:5,4:0|1:126682485_CT_TG:126682485:7,8,1,4
chr10	126683071	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=146,134;MMQ=49,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,9:0.185:52:20,5:22,4:0|1:126683071_G_C:126683071:28,15,9,0
chr10	126683075	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=16;MBQ=31,33;MFRL=145,134;MMQ=46,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,9:0.178:54:24,5:21,4:0|1:126683071_G_C:126683071:28,17,9,0
chr10	126683087	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=16;MBQ=31,33;MFRL=149,134;MMQ=46,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,11:0.226:51:18,5:22,6:21,19,11,0
chr10	126683092	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=143,174;MMQ=46,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,3:0.067:57:24,2:26,1:0|1:126683092_G_A:126683092:32,22,2,1
chr10	126683099	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=144,174;MMQ=45,31;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,3:0.070:55:26,2:23,1:0|1:126683092_G_A:126683092:27,25,2,1
chr10	126683103	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=16;MBQ=28,25;MFRL=152,123;MMQ=45,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,13:0.245:55:21,7:20,5:18,24,10,3
chr10	126683111	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=16;MBQ=33,27;MFRL=145,143;MMQ=51,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.113:51:24,3:22,2:21,25,4,1
chr10	126683123	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=16;MBQ=32,33;MFRL=154,121;MMQ=52,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,11:0.210:55:23,5:21,5:19,25,6,5
chr10	126683132	.	A	T	.	.	DP=69;ECNT=16;MBQ=31,32;MFRL=146,130;MMQ=57,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,11:0.182:64:26,4:26,7:19,34,8,3
chr10	126683146	.	C	A	.	.	DP=67;ECNT=16;MBQ=34,32;MFRL=144,129;MMQ=54,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,13:0.210:65:23,4:26,9:0|1:126683146_C_A:126683146:21,31,9,4
chr10	126683151	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=16;MBQ=32,32;MFRL=144,122;MMQ=52,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,8:0.139:59:23,4:27,4:29,22,1,7
chr10	126683152	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=16;MBQ=31,31;MFRL=144,125;MMQ=52,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,12:0.187:68:26,3:25,8:0|1:126683146_C_A:126683146:24,32,8,4
chr10	126683162	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=16;MBQ=32,32;MFRL=143,128;MMQ=52,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,8:0.138:60:22,4:30,4:32,20,1,7
chr10	126683178	.	GCAAGTAGGGGTCATAAAATATGACGCTGAATC	G	.	.	DP=103;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=143,119;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,6:0.073:94:19,1:26,5:47,41,4,2
chr10	126683190	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=16;MBQ=33,29;MFRL=142,137;MMQ=55,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,5:0.110:52:22,2:22,3:0|1:126683190_C_A:126683190:33,14,0,5
chr10	126683197	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=16;MBQ=30,32;MFRL=137,137;MMQ=55,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,5:0.102:56:23,2:25,3:0|1:126683190_C_A:126683190:35,16,0,5
chr10	126686619	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=29,31;MFRL=159,132;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:12,2:10,1:0|1:126686619_G_T:126686619:14,8,3,0
chr10	126686629	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=163,128;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:16,1:11,2:0|1:126686619_G_T:126686619:17,10,4,0
chr10	126686648	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=159,132;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:17,2:12,3:14,15,4,1
chr10	126686665	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=33,34;MFRL=154,128;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.171:39:14,2:18,4:0|1:126686665_G_T:126686665:14,19,3,3
chr10	126686672	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=154,128;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.171:39:14,2:17,3:0|1:126686665_G_T:126686665:12,21,3,3
chr10	126686682	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=9;MBQ=30,31;MFRL=152,114;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:14,0:21,3:0|1:126686665_G_T:126686665:14,23,1,3
chr10	126686687	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=154,114;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:13,0:19,3:12,21,1,3
chr10	126686690	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=154,114;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:14,0:19,3:13,21,1,3
chr10	126686692	.	CC	TG	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=154,114;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:15,0:19,3:0|1:126686665_G_T:126686665:13,21,1,3
chr10	126686827	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr10	126691471	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=29,29;MFRL=192,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr10	126691575	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=29,34;MFRL=168,79;MMQ=60,26;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:6,1:9,4:0|1:126691575_T_C:126691575:8,8,2,3
chr10	126691577	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=168,79;MMQ=60,26;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:7,1:9,4:0|1:126691575_T_C:126691575:8,8,2,3
chr10	126691580	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=27,34;MFRL=162,40;MMQ=60,26;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,1:9,3:9,8,1,3
chr10	126691595	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=155,79;MMQ=60,26;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:12,1:9,2:0|1:126691595_G_A:126691595:10,12,1,2
chr10	126691598	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=33,29;MFRL=149,79;MMQ=60,26;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:11,1:10,2:0|1:126691595_G_A:126691595:11,13,1,2
chr10	126691605	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=33,29;MFRL=169,79;MMQ=60,38;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:8,4:7,5:7,10,6,7
chr10	126691608	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=169,82;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:11,6:5,4:8,13,5,5
chr10	126691617	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=33,26;MFRL=166,38;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.133:30:14,1:8,2:10,16,3,1
chr10	126691631	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=30,26;MFRL=170,91;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.404:30:9,6:7,5:5,13,7,5
chr10	126691634	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=166,88;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:10,6:7,5:6,12,6,5
chr10	126691660	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=32,29;MFRL=167,93;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.358:21:7,5:6,2:4,10,2,5
chr10	126715201	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:3,1,3,1
chr10	126715692	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:8,2:3,4:4,7,2,5
chr10	126715923	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr10	126716346	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:0,2,1,2
chr10	126727602	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=145,88;MMQ=60,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.367:28:10,4:8,6:0|1:126727602_T_A:126727602:4,14,6,4
chr10	126727604	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=145,88;MMQ=60,33;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.367:28:8,4:6,6:0|1:126727602_T_A:126727602:4,14,6,4
chr10	126727614	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=143,95;MMQ=55,36;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.254:29:10,3:12,4:7,15,2,5
chr10	126727630	.	T	C,G	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,27,35;MFRL=156,95,109;MMQ=52,36,28;MPOS=18,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.38,15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,7,6:0.299,0.272:23:5,3,2:5,4,4:0,10,7,6
chr10	126727659	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=148,110;MMQ=52,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,1:8,3:1,11,0,4
chr10	126727690	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=165,139;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr10	127421901	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr10	127426430	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,16,0
chr10	127426588	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,16:0,0,6,26
chr10	127426835	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=86.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,16:0,9:0,0,17,8
chr10	127429979	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=260,273;MMQ=49,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127429979_C_T:127429979:0,1,0,1
chr10	127429990	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=260,273;MMQ=49,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127429979_C_T:127429979:0,1,0,1
chr10	127430003	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=260,273;MMQ=49,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127429979_C_T:127429979:0,1,0,1
chr10	127436048	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.532:21:4,6:4,5:10,0,10,1
chr10	127436411	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr10	127441533	.	TGGTGA	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr10	127441563	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr10	127441573	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr10	127460753	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:4,0,4,3
chr10	127462525	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	127483396	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr10	127483573	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,4:3,6:0,6,2,8
chr10	127484617	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,37;MFRL=129,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,2:4,1:15,1,3,0
chr10	127484653	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=113,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.224:31:15,1:8,3:11,13,7,0
chr10	127491648	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr10	127500718	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:6,0,5,0
chr10	127504660	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	127522476	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:13,0:11,2:11,16,0,2
chr10	127522572	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr10	127524612	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:7,0,3,0
chr10	127529756	.	T	TTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TG;STR;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:4,0:3,4:6,1,5,1
chr10	127548587	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,8:0,0,4,18
chr10	127585090	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:127585090_C_A:127585090:1,2,2,0
chr10	127585097	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:127585090_C_A:127585090:1,2,2,0
chr10	127585099	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:127585090_C_A:127585090:1,2,2,0
chr10	127585112	.	TC	CC,CT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,34,34;MFRL=76,199,121;MMQ=60,60,60;MPOS=27,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.250,0.297:4:1,0,0:1,1,1:1,1,2,0
chr10	127585150	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:4,3,1,1
chr10	127585179	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=119,138;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:5,2,2,1
chr10	127685091	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,11:0,0,20,7
chr10	127693432	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,2:0,11:0,0,9,4
chr10	127697165	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,2,17
chr10	127706028	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr10	127708428	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr10	127708468	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=204,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,0:3,2:0,4,0,3
chr10	127724763	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,1:3,1:3,3,2,0
chr10	127724778	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:0,3:2,1:0,2,2,3
chr10	127727768	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr10	127727808	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=180,193;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr10	127786969	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,19:0,9:0,0,21,7
chr10	127843740	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr10	127843756	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:6,2:2,1:8,0,4,0
chr10	127843921	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=116,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:2,9,0,7
chr10	127967660	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	128114325	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr10	128209769	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,3:0,4:0,0,8,1
chr10	128209797	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,6:0,0,7,2
chr10	128209959	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr10	128785927	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.208:12:4,0:5,2:0|1:128785927_G_C:128785927:0,10,0,2
chr10	128785933	.	T	TTTGTCAAGTTTTGTCTGGTTAGAGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:128785927_G_C:128785927:0,9,0,2
chr10	128788633	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr10	128795248	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	128806888	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr10	128810642	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.521:46:14,13:7,10:12,10,11,13
chr10	128810669	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.472:30:9,10:6,4:6,10,4,10
chr10	128821616	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.657:30:5,6:5,14:2,8,2,18
chr10	128821636	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.713:26:3,6:4,12:1,6,2,17
chr10	128822873	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr10	128822886	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:3,4:2,2:5,0,5,1
chr10	128830592	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:10,6:4,7:6,8,4,9
chr10	128836112	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=35,16;MFRL=98,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:2,0:0,3,0,2
chr10	128836121	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=107,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:128836121_T_TG:128836121:0,3,0,2
chr10	128836130	.	T	TTCTTTTTCATTCTCTGGTGTC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=107,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:128836121_T_TG:128836121:0,3,0,2
chr10	128836148	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=95,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:128836148_A_G:128836148:0,4,0,1
chr10	128836150	.	T	TTAGCGGGTTGTAAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=95,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:128836148_A_G:128836148:0,4,0,1
chr10	128840842	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,11:0,0,19,5
chr10	128904597	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:10,2:7,0:2,16,0,2
chr10	128923890	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,1,0
chr10	128923954	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	128952265	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr10	128974621	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr10	129046407	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,2,16
chr10	129172574	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr10	129209237	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=164,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:129209237_G_A:129209237:0,2,0,1
chr10	129209244	.	G	GTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129209237_G_A:129209237:0,1,0,1
chr10	129217983	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=104,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr10	129224344	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr10	129237580	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=174,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:0,1:0,1,1,1
chr10	129242555	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,5:1,2:1,4,0,7
chr10	129249511	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr10	129249662	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,9:0,0,5,13
chr10	129249676	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:4,8,0,3
chr10	129249693	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr10	129249701	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr10	129347571	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:3,4,6,1
chr10	129681917	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:1,4:5,3:5,1,7,1
chr10	129845625	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=85,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:4,2,3,1
chr10	129846010	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:11,6:6,10:12,6,11,6
chr10	129854369	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,5,6
chr10	129861497	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,0:4,6:0,5,0,6
chr10	129864515	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:5,5:8,1:1,12,0,6
chr10	129870510	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,3:6,4:0,8,1,6
chr10	129871748	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,0:4,2:0,5,1,1
chr10	129878051	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:129878051_G_A:129878051:0,2,0,1
chr10	129878054	.	GG	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:129878051_G_A:129878051:0,2,0,1
chr10	129899482	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:4,1,4,1
chr10	129899629	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.445:43:16,11:8,8:14,10,11,8
chr10	129901722	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,17:0.529:32:5,12:10,5:0|1:129901722_G_A:129901722:8,7,5,12
chr10	129901726	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=130,165;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:5,10:9,5:0|1:129901722_G_A:129901722:8,8,5,12
chr10	129902158	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,113;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.434:35:6,3:13,12:5,15,6,9
chr10	129902368	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=190,95;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:4,6:5,3:3,7,5,4
chr10	129904477	.	C	T	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,38:0.424:89:34,19:17,17:30,21,23,15
chr10	131265434	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,27;MFRL=138,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:131265434_A_C:131265434:1,0,1,0
chr10	131265436	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=138,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:131265434_A_C:131265434:1,0,1,0
chr10	131265442	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:131265442_A_C:131265442:0,0,1,0
chr10	131265449	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131265442_A_C:131265442:0,0,1,0
chr10	131265451	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:131265442_A_C:131265442:0,0,1,0
chr10	131639094	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=107,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:3,1,3,0
chr10	131671874	.	G	GGAGGGTAGAAACATACATAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=194,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	131755493	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:7,9:7,4:6,8,8,5
chr10	131934628	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr10	131958422	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr10	131958960	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=167,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr10	133754030	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr10	133757521	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=147,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:13,0:12,4:10,15,1,3
chr10	133761344	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:4,2:2,6,0,2
chr10	133784546	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	133918466	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr10	133951505	.	C	CTGTTAAGATT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:133951505_C_CTGTTAAGATT:133951505:0,0,1,0
chr10	133951506	.	C	CCGGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:133951505_C_CTGTTAAGATT:133951505:0,0,1,0
chr10	133951510	.	CC	AA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133951505_C_CTGTTAAGATT:133951505:0,0,1,0
chr10	133951515	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133951505_C_CTGTTAAGATT:133951505:0,0,1,0
chr10	133951704	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:133951704_C_T:133951704:2,1,1,0
chr10	133951718	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:133951704_C_T:133951704:2,1,1,0
chr10	133955569	.	C	CCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CG;STR;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr10	133958541	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,13,2
chr10	133961494	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr10	133961564	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,1,10
chr10	133966630	.	CGGG	C,CCCGGGCTCCTGGAGAGGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31,35;MFRL=176,163,152;MMQ=60,60,60;MPOS=5,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.20,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.245:5:1,1,1:1,0,0:0,3,0,2
chr10	133980657	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=197,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,0:0,2:0,3,0,2
chr10	134008519	.	GGTGGC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=251,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr10	134010435	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr10	134013990	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr10	134016115	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr10	134021740	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr10	134022517	.	A	ACCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,0;MFRL=64,188;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=C;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:2,2,1,0
chr10	134036053	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:134036053_G_A:134036053:0,0,3,0
chr10	134036057	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:134036053_G_A:134036053:0,0,3,0
chr10	134036073	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,0:0,2:0,0,4,0
chr10	134036193	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,5:0,3:0,0,4,5
chr10	134038647	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=186,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr10	134038715	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,14,1
chr10	134039132	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:3,5,2,5
chr10	134040290	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,1,1
chr10	134144082	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=190,150;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:134144082_A_G:134144082:0,4,0,1
chr10	134144100	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=222,150;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:1,0:3,1:0|1:134144082_A_G:134144082:0,4,0,1
chr10	134150422	.	T	TGTCTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:134150422_T_TGTCTGG:134150422:0,3,0,1
chr10	134150424	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:134150422_T_TGTCTGG:134150422:0,3,0,1
chr10	134150428	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:134150422_T_TGTCTGG:134150422:0,2,0,1
chr10	134151034	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,7:0,0,18,3
chr10	134151288	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr10	134157920	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr10	134165291	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr10	134210943	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	134259360	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:134259360_T_G:134259360:0,2,0,1
chr10	134259366	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:134259360_T_G:134259360:0,2,0,1
chr10	134351762	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	134594454	.	G	GAACATCAGGGTTTTGTGGGGGCAGAGAGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	134595583	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=133,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:11,7,2,0
chr10	134621877	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,2:9,5:15,3,5,2
chr10	134622507	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,1:1,5:0,5,0,6
chr10	134623855	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	134624225	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134624225_G_A:134624225:0,0,0,1
chr10	134624232	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134624225_G_A:134624225:0,0,0,1
chr10	134628342	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=180,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.269:15:5,1:5,0:4,7,4,0
chr10	134647453	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	134648735	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.803:3:0,0:0,1:0,0,3,0
chr10	134664688	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:134664688_T_C:134664688:3,3,1,1
chr10	134664689	.	G	GTTCCAGCAGGAGCCGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:134664688_T_C:134664688:3,3,1,1
chr10	134664875	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr10	134672609	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,7:2,6:3,3,4,9
chr10	134712601	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:2,4,0,5
chr10	134730022	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:3,1:6,0,4,0
chr10	134730204	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:7,2:2,5:4,5,3,4
chr10	134735672	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,7:5,2:3,4,4,5
chr10	134738398	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:14,1:11,13,1,1
chr10	134740365	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:6,10:4,4:0|1:134740365_T_C:134740365:8,3,14,0
chr10	134740387	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:6,6:5,5:0|1:134740365_T_C:134740365:8,3,11,0
chr10	134750604	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr10	134752007	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr10	134755061	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,3:10,0:22,4,3,0
chr10	134755241	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=105,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:4,5,3,3
chr10	134755298	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=161,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr10	134916258	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr10	134941744	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:134941744_G_A:134941744:1,0,1,0
chr10	134941751	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:134941744_G_A:134941744:0,0,1,0
chr10	134997480	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,3:2,2:3,1,0,5
chr10	135011257	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=93,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr10	135011324	.	ACAGC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr10	135020315	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr10	135076523	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr10	135076758	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr10	135077121	.	C	CGTCAGCCCCGTGGGGAGGCCGTGCCACT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=53.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,2:0,0,13,0
chr10	135077311	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr10	135081684	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,0,20
chr10	135082874	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	135083812	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr10	135084232	.	C	CAGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,7:0,0,10,2
chr10	135084601	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr10	135086203	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr10	135086676	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr10	135086766	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=217,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,2:6,4:5,3,4,2
chr10	135087188	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,10;MFRL=238,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:135087188_T_G:135087188:0,1,1,0
chr10	135087191	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=238,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135087188_T_G:135087188:0,1,1,0
chr10	135087194	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=238,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:135087188_T_G:135087188:0,1,1,0
chr10	135087198	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=238,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135087188_T_G:135087188:0,1,1,0
chr10	135087204	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=238,170;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135087188_T_G:135087188:0,1,1,0
chr10	135090183	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	135096784	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr10	135103311	.	C	CGCCCGCTGCGCCGCGGACGCCAAGTCCCT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,9:0,9:0,0,24,2
chr10	135105983	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr10	135106246	.	T	TAGACTTGGAGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=159,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr10	135111618	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:1,8,0,5
chr10	135141091	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135141091_G_C:135141091:0,0,1,0
chr10	135141094	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135141091_G_C:135141091:0,0,1,0
chr10	135141096	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135141091_G_C:135141091:0,0,1,0
chr10	135141572	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr10	135142391	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:135142391_T_TGG:135142391:1,0,0,1
chr10	135142393	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:135142391_T_TGG:135142391:1,0,0,1
chr10	135142396	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:135142391_T_TGG:135142391:1,0,0,1
chr10	135160950	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr10	135170651	.	A	AC	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=16,14;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:2,0:5,0:0|1:135170651_A_AC:135170651:19,0,2,0
chr10	135170655	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=12,33;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:3,1:5,1:0|1:135170651_A_AC:135170651:20,0,2,0
chr10	135170659	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.121:23:7,1:5,1:0|1:135170651_A_AC:135170651:20,1,2,0
chr10	135170663	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=23,10;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:7,0:0|1:135170651_A_AC:135170651:20,1,2,0
chr10	135171364	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	135178087	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,6:0,0,10,3
chr10	135179458	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	135194890	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr10	135197376	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr10	135202594	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,4,21
chr10	135204799	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=85.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,16,9
chr10	135204853	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:18,2:11,0:15,14,0,2
chr10	135205009	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr10	135209105	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr10	135209850	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:0,1,0,3
chr10	135211892	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,18,3
chr10	135212950	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=177,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr10	135212997	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:3,2,5,1
chr10	135215762	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=110,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,2:1,0:0,1,1,2
chr10	135237060	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr10	135340866	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,2:0,0,4,2
chr10	135350490	.	A	AGATGGGTGGAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GATGGGTGGAT;STR;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.852:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr10	135351174	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr10	135351362	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,10,10
chr10	135352509	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0|1:135352509_T_A:135352509:0,0,4,12
chr10	135352514	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0|1:135352509_T_A:135352509:0,0,3,12
chr10	135369054	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr10	135369367	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr10	135371466	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,4,11
chr10	135438929	.	T	G	.	.	DP=75;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=145,135;MMQ=52,26;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,6:0.096:70:37,2:27,4:42,22,3,3
chr10	135438951	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=145,119;MMQ=52,29;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,10:0.143:75:34,4:27,6:0|1:135438951_G_A:135438951:39,26,5,5
chr10	135438955	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=145,115;MMQ=52,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,10:0.145:74:32,4:29,6:0|1:135438951_G_A:135438951:38,26,5,5
chr10	135438967	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=144,122;MMQ=52,27;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,11:0.162:72:30,3:28,8:0|1:135438967_C_T:135438967:32,29,4,7
chr10	135438977	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=144,113;MMQ=52,31;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,9:0.154:63:27,3:23,6:0|1:135438967_C_T:135438967:24,30,4,5
chr10	135440270	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=125,137;MMQ=27,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,14:0.321:44:12,7:17,6:2,28,3,11
chr10	135440278	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=123,136;MMQ=27,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:7,10:15,9:1,21,0,19
chr10	135440305	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=136,151;MMQ=27,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:8,10:10,10:0,18,0,21
chr10	135440311	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=30,35;MFRL=159,149;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:13,6:12,8:0,25,0,14
chr10	135440328	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=170,174;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:10,4:12,2:0|1:135440328_C_G:135440328:0,23,0,6
chr10	135440329	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=171,174;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:13,1:8,5:0,22,0,6
chr10	135440333	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=174,179;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,4:7,4:0,16,0,8
chr10	135440335	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=177,176;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:11,3:8,2:0|1:135440328_C_G:135440328:0,20,0,5
chr11	180116	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,192;MMQ=47,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.513:21:4,5:6,4:7,3,11,0
chr11	193194	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=89,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr11	193979	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:1,0:0,4,0,3
chr11	194498	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,1:7,1:7,10,0,2
chr11	197557	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr11	206080	.	G	GCTGATAAGCTACT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=202,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr11	206089	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	207254	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	207275	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr11	207359	.	C	CGGCCACAGCCGCCTCAGACGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGCCACAGCCGCCTCAGACGT;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	207400	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	209002	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	209894	.	ACCC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=C;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	214163	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0|1:214163_G_A:214163:0,0,6,0
chr11	214169	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:214163_G_A:214163:0,0,7,0
chr11	250759	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=164,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr11	280673	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr11	280816	.	AT	TC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,13:0,0,14,15
chr11	281880	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	292798	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr11	293001	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.932:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr11	299586	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	308178	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.384:24:7,6:6,3:0|1:308178_T_C:308178:10,5,8,1
chr11	308180	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.384:24:8,5:6,3:0|1:308178_T_C:308178:10,5,8,1
chr11	314873	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,169;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.544:44:11,9:9,15:16,4,22,2
chr11	320836	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:1,2:10,4:1,10,1,6
chr11	372157	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,108;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,3:0,5:0,1,4,5
chr11	379598	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=121,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:3,1:0,1:3,1,2,0
chr11	380774	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,0:1,0,3,0
chr11	396546	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:1,1:3,1:4,1,2,0
chr11	396701	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.691:8:1,3:1,1:1,1,0,6
chr11	397706	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr11	397732	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	400382	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:3,8,0,2
chr11	403545	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=261,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr11	403939	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr11	404468	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:9,8:7,7:13,3,13,2
chr11	406615	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	407364	.	C	CATGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATGGG;STR;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr11	409720	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	409815	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:6,2,4,0
chr11	420928	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:7,0,0,2
chr11	428385	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,10,9
chr11	433995	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr11	441806	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	450683	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,6:3,4:1,4,0,10
chr11	479245	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	502217	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=213,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr11	550028	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr11	551204	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:10,8:6,5:6,10,5,8
chr11	552547	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,10:0,0,12,14
chr11	552756	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	552787	.	TG	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	554299	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	556457	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr11	556521	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	557342	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	557617	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,7:4,6:4,5,5,8
chr11	557801	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=221,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr11	558290	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,1:3,3:1,3,1,3
chr11	559278	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,2:3,0:10,2,2,0
chr11	560551	.	G	GGGCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGCT;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,2,1
chr11	561703	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=210,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,1:1,2:2,1,3,0
chr11	561957	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=139,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr11	563149	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr11	606607	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr11	606644	.	C	CCTGCCCTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=247,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr11	606656	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	608502	.	CGGACGCGCTCTG	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGACGCGCTCTG;STR;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.441:14:4,4:3,2:5,3,3,3
chr11	609288	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:6,0:2,5:3,5,4,2
chr11	612843	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	612967	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:3,2:4,1,4,1
chr11	613165	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,4:6,1:7,5,4,1
chr11	613192	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,3:7,2:8,6,2,3
chr11	613208	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,4:6,1:8,7,1,4
chr11	615103	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=181,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,0:1,3:4,1,2,1
chr11	618172	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:0,6,0,4
chr11	621030	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=71,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr11	621052	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=141,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr11	639374	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	644748	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.745:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	674454	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:674454_G_T:674454:0,0,7,0
chr11	674458	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0|1:674454_G_T:674454:0,0,8,0
chr11	674499	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,10:0,1:0,0,9,2
chr11	674690	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,0:3,2:2,7,0,2
chr11	688091	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr11	688118	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=37,34;MFRL=184,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr11	691652	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:691652_C_CTG:691652:0,0,0,1
chr11	691654	.	A	AGGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:691652_C_CTG:691652:0,0,0,1
chr11	691655	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:691652_C_CTG:691652:0,0,0,1
chr11	698807	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:4,2:7,1:6,5,1,3
chr11	700247	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr11	700526	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.851:5:0,0:0,3:0,0,5,0
chr11	702923	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.428:17:3,3:7,4:6,4,5,2
chr11	703070	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.352:23:8,4:7,2:10,5,5,3
chr11	703175	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:6,8:6,4:7,6,2,10
chr11	710516	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,19;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,1:3,0:0|1:710516_C_T:710516:1,5,1,1
chr11	710519	.	C	CTG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=156,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:3,0:0|1:710516_C_T:710516:1,7,1,1
chr11	710521	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=150,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:3,0:0|1:710516_C_T:710516:1,6,1,1
chr11	710558	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=223,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr11	721748	.	G	GAGGGGTTCTTGTGCGCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr11	723429	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=181,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr11	758897	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:8,0:11,2,2,0
chr11	763614	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=255,228;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:763614_A_C:763614:1,0,0,1
chr11	763617	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=255,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:763614_A_C:763614:1,0,0,1
chr11	774982	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr11	775191	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr11	795076	.	G	GAATACCTAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	795083	.	G	GAAAGTGATAGAAGATATA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:795083_G_GAAAGTGATAGAAGATATA:795083:0,0,0,1
chr11	795084	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:795083_G_GAAAGTGATAGAAGATATA:795083:0,0,0,1
chr11	795087	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:795083_G_GAAAGTGATAGAAGATATA:795083:0,0,0,1
chr11	795113	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	800485	.	TC	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,3:2,1:4,1,3,2
chr11	801631	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=16,20;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.493:10:1,3:1,1:0,5,1,4
chr11	801711	.	G	GACAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=230,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:801711_G_GACAAT:801711:0,2,0,1
chr11	801712	.	G	GCAGAGAGAAAAAGAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=230,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:801711_G_GACAAT:801711:0,2,0,1
chr11	802115	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=195,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:802115_A_G:802115:2,1,1,2
chr11	802125	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:802115_A_G:802115:0,0,3,3
chr11	802902	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=152,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,1:4,4:3,8,0,5
chr11	804212	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:4,9,3,3
chr11	822622	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr11	828784	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.926:11:0,4:0,5:0,0,4,7
chr11	829585	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=212,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr11	830044	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	830601	.	T	TGGTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGTC;STR;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:0,3:4,1:4,1,1,3
chr11	831122	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:1,0,5,0
chr11	836008	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=243,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr11	836023	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=243,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr11	836227	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,6:5,3:7,3,3,6
chr11	836309	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=121,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:6,1:8,1:5,11,1,1
chr11	837582	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:6,2:3,6:3,7,2,6
chr11	838110	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:4,10:3,5:2,5,7,8
chr11	840319	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.393:13:4,1:4,4:6,2,5,0
chr11	840363	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:6,6:3,6:4,5,7,5
chr11	842543	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.656:33:7,16:4,5:5,6,3,19
chr11	862652	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,10,11
chr11	865447	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	865503	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,4:0,0,9,4
chr11	866044	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	866498	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr11	870524	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,9:0,4:0,1,2,11
chr11	883384	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=222,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:883384_G_A:883384:0,1,0,1
chr11	883399	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:883384_G_A:883384:0,0,0,1
chr11	900894	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	900929	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr11	902939	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=107,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:4,1:0,2:3,1,3,1
chr11	903070	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr11	903110	.	C	CCTCACAGCAAGCCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:903110_C_CCTCACAGCAAGCCCA:903110:0,1,0,1
chr11	903113	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:903110_C_CCTCACAGCAAGCCCA:903110:0,1,0,1
chr11	904911	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=83,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr11	977322	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	985547	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr11	992691	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=88.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.966:28:0,20:0,5:0,0,7,21
chr11	1003642	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	1008161	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,6:0,0,1,13
chr11	1009588	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=180,171;MMQ=49,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:1009588_CA_TG:1009588:1,3,1,0
chr11	1009589	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,4:0.841:4:0,1:0,2:1|0:1009588_CA_TG:1009588:0,0,1,3
chr11	1009599	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=171,168;MMQ=57,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,5:0.750:6:1,2:0,2:1|0:1009588_CA_TG:1009588:1,0,2,3
chr11	1009622	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=184,190;MMQ=44,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,6:0.863:8:0,2:2,3:1|0:1009588_CA_TG:1009588:1,1,5,1
chr11	1009890	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	1010694	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr11	1013958	.	C	CAAACCGTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=169,29;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:4,4,1,1
chr11	1016609	.	C	G	.	.	DP=76;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=122,74;MMQ=60,34;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,8:0.118:74:39,3:27,5:40,26,4,4
chr11	1016640	.	G	A	.	.	DP=121;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=124,122;MMQ=60,35;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,21:0.180:120:60,10:33,7:0|1:1016640_G_A:1016640:53,46,12,9
chr11	1016654	.	T	C	.	.	DP=135;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=124,134;MMQ=60,34;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:127,6:0.051:133:67,3:51,2:66,61,5,1
chr11	1016655	.	G	A	.	.	DP=136;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=124,122;MMQ=60,34;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:112,23:0.174:135:63,8:44,12:0|1:1016640_G_A:1016640:60,52,12,11
chr11	1016662	.	G	A	.	.	DP=150;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=124,177;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:134,13:0.093:147:69,7:54,6:67,67,11,2
chr11	1016665	.	C	T	.	.	DP=159;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=122,128;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=161.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,48:0.325:149:59,25:41,22:48,53,29,19
chr11	1016704	.	C	A	.	.	DP=180;ECNT=19;MBQ=32,29;MFRL=125,129;MMQ=60,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:160,15:0.090:175:70,5:84,10:99,61,5,10
chr11	1016707	.	TC	CT	.	.	DP=179;ECNT=19;MBQ=31,34;MFRL=129,191;MMQ=60,26;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:172,4:0.028:176:66,3:85,1:104,68,3,1
chr11	1016713	.	TG	CG,CA	.	.	DP=181;ECNT=19;MBQ=29,32,35;MFRL=124,191,129;MMQ=60,26,25;MPOS=19,10;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.45,14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:155,6,7:0.041,0.043:168:68,4,1:79,2,4:101,54,5,8
chr11	1016722	.	T	G	.	.	DP=187;ECNT=19;MBQ=29,31;MFRL=120,148;MMQ=60,35;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:164,22:0.122:186:69,13:77,7:0|1:1016722_T_G:1016722:102,62,16,6
chr11	1016724	.	A	G	.	.	DP=189;ECNT=19;MBQ=32,33;MFRL=122,148;MMQ=60,35;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:160,22:0.124:182:74,13:83,8:0|1:1016722_T_G:1016722:100,60,16,6
chr11	1016756	.	G	A	.	.	DP=246;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=128,153;MMQ=45,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:228,10:0.045:238:103,5:117,5:131,97,10,0
chr11	1016770	.	G	A	.	.	DP=260;ECNT=19;MBQ=33,33;MFRL=129,187;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:248,5:0.023:253:114,1:119,4:0|1:1016770_G_A:1016770:153,95,0,5
chr11	1016773	.	G	T	.	.	DP=254;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=130,187;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:249,5:0.023:254:119,1:120,3:0|1:1016770_G_A:1016770:152,97,0,5
chr11	1016776	.	C	T	.	.	DP=269;ECNT=19;MBQ=30,31;MFRL=131,129;MMQ=40,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=288.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:143,111:0.437:254:68,52:73,57:81,62,66,45
chr11	1016779	.	G	A	.	.	DP=273;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=130,122;MMQ=40,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:257,14:0.055:271:124,4:121,9:0|1:1016779_G_A:1016779:148,109,7,7
chr11	1016787	.	A	T	.	.	DP=309;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=128,183;MMQ=43,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:303,6:0.022:309:139,2:145,4:0|1:1016770_G_A:1016770:162,141,1,5
chr11	1016789	.	T	A	.	.	DP=321;ECNT=19;MBQ=29,32;MFRL=128,120;MMQ=43,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:302,19:0.062:321:131,5:132,14:0|1:1016779_G_A:1016779:163,139,9,10
chr11	1016800	.	G	A	.	.	DP=354;ECNT=19;MBQ=32,31;MFRL=127,120;MMQ=47,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:335,19:0.056:354:133,7:146,12:0|1:1016779_G_A:1016779:165,170,10,9
chr11	1016802	.	T	A	.	.	DP=362;ECNT=19;MBQ=28,32;MFRL=127,120;MMQ=48,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:341,19:0.055:360:136,7:138,11:0|1:1016779_G_A:1016779:164,177,10,9
chr11	1016809	.	G	T	.	.	DP=378;ECNT=19;MBQ=32,27;MFRL=126,114;MMQ=48,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:363,11:0.030:374:165,7:171,2:169,194,3,8
chr11	1016810	.	G	T	.	.	DP=386;ECNT=19;MBQ=32,29;MFRL=125,129;MMQ=48,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:355,28:0.075:383:159,13:169,12:160,195,13,15
chr11	1016818	.	A	G	.	.	DP=414;ECNT=19;MBQ=31,33;MFRL=125,152;MMQ=49,42;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:361,34:0.088:395:163,15:179,17:152,209,10,24
chr11	1016819	.	G	T	.	.	DP=414;ECNT=19;MBQ=33,31;MFRL=125,131;MMQ=48,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:353,45:0.114:398:162,24:180,21:147,206,17,28
chr11	1016822	.	A	C	.	.	DP=425;ECNT=19;MBQ=31,33;MFRL=125,123;MMQ=50,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:399,19:0.048:418:172,12:192,7:163,236,10,9
chr11	1016833	.	G	T	.	.	DP=389;ECNT=42;MBQ=33,33;MFRL=123,148;MMQ=57,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:369,12:0.034:381:149,6:210,5:0|1:1016833_G_T:1016833:157,212,3,9
chr11	1016834	.	G	A	.	.	DP=384;ECNT=42;MBQ=33,31;MFRL=126,116;MMQ=57,56;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=269.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:272,105:0.280:377:121,33:139,71:114,158,47,58
chr11	1016836	.	AG	GA	.	.	DP=431;ECNT=42;MBQ=32,35;MFRL=124,141;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:418,13:0.032:431:146,6:204,6:0|1:1016833_G_T:1016833:166,252,3,10
chr11	1016842	.	T	G	.	.	DP=426;ECNT=42;MBQ=30,33;MFRL=126,108;MMQ=60,51;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:380,37:0.087:417:151,11:191,25:133,247,10,27
chr11	1016853	.	G	C	.	.	DP=397;ECNT=42;MBQ=33,30;MFRL=126,148;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:383,14:0.038:397:158,6:206,7:0|1:1016833_G_T:1016833:117,266,3,11
chr11	1016869	.	AG	CA,TG,TA,GG	.	.	DP=339;ECNT=42;MBQ=32,30,31,32,32;MFRL=132,105,130,160,155;MMQ=60,60,60,60,27;MPOS=11,20,28,13;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=94.81,434.42,46.78,39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:104,38,137,22,15:0.120,0.437,0.071,0.047:316:43,12,62,7,7:56,23,58,13,8:24,80,49,163
chr11	1016881	.	CT	TG	.	.	DP=278;ECNT=42;MBQ=34,31;MFRL=131,156;MMQ=60,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:268,10:0.039:278:110,3:125,7:0|1:1016833_G_T:1016833:58,210,1,9
chr11	1016887	.	G	A	.	.	DP=247;ECNT=42;MBQ=33,31;MFRL=137,104;MMQ=57,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:235,12:0.052:247:101,5:122,6:0|1:1016887_G_A:1016887:47,188,3,9
chr11	1016890	.	GG	AG,AA	.	.	DP=246;ECNT=42;MBQ=33,31,31;MFRL=132,141,156;MMQ=60,45,40;MPOS=14,6;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=97.04,25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:195,37,10:0.154,0.044:242:81,14,3:98,22,7:43,152,6,41
chr11	1016894	.	G	A	.	.	DP=230;ECNT=42;MBQ=33,31;MFRL=130,142;MMQ=60,52;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=261.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:140,81:0.363:221:61,34:71,45:32,108,11,70
chr11	1016900	.	G	T	.	.	DP=206;ECNT=42;MBQ=32,31;MFRL=137,155;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:199,7:0.038:206:75,3:99,3:0|1:1016833_G_T:1016833:40,159,2,5
chr11	1016905	.	A	T	.	.	DP=191;ECNT=42;MBQ=31,31;MFRL=134,148;MMQ=50,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:185,6:0.036:191:73,3:96,3:0|1:1016833_G_T:1016833:41,144,2,4
chr11	1016906	.	G	T	.	.	DP=188;ECNT=42;MBQ=33,31;MFRL=138,106;MMQ=49,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:182,6:0.037:188:70,4:88,2:0|1:1016887_G_A:1016887:44,138,1,5
chr11	1016910	.	G	A	.	.	DP=165;ECNT=42;MBQ=33,31;MFRL=137,143;MMQ=48,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:126,34:0.216:160:55,13:60,19:38,88,3,31
chr11	1016912	.	G	A	.	.	DP=157;ECNT=42;MBQ=33,31;MFRL=139,105;MMQ=42,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:153,4:0.031:157:60,1:74,1:0|1:1016887_G_A:1016887:40,113,1,3
chr11	1016914	.	G	T	.	.	DP=145;ECNT=42;MBQ=32,32;MFRL=140,137;MMQ=43,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:120,25:0.177:145:48,14:66,8:0|1:1016914_G_T:1016914:35,85,2,23
chr11	1016916	.	A	G	.	.	DP=145;ECNT=42;MBQ=31,33;MFRL=139,157;MMQ=42,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:139,6:0.048:145:56,3:73,3:0|1:1016833_G_T:1016833:37,102,2,4
chr11	1016918	.	C	T	.	.	DP=144;ECNT=42;MBQ=33,30;MFRL=136,165;MMQ=44,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,23:0.168:141:49,10:60,12:30,88,9,14
chr11	1016924	.	G	A	.	.	DP=133;ECNT=42;MBQ=33,28;MFRL=141,155;MMQ=42,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:128,5:0.044:133:50,3:71,2:0|1:1016833_G_T:1016833:35,93,2,3
chr11	1016928	.	C	G	.	.	DP=129;ECNT=42;MBQ=33,33;MFRL=125,148;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=317.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,83:0.655:126:14,33:26,41:21,22,18,65
chr11	1016933	.	C	T	.	.	DP=123;ECNT=42;MBQ=29,31;MFRL=152,143;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,25:0.208:123:39,10:53,10:0|1:1016914_G_T:1016914:38,60,1,24
chr11	1016944	.	GG	TT	.	.	DP=114;ECNT=42;MBQ=33,32;MFRL=147,136;MMQ=40,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:104,10:0.095:114:39,4:56,5:0|1:1016944_GG_TT:1016944:39,65,1,9
chr11	1016947	.	C	T	.	.	DP=113;ECNT=42;MBQ=33,32;MFRL=147,161;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:108,5:0.052:113:40,2:61,2:0|1:1016833_G_T:1016833:38,70,1,4
chr11	1016954	.	G	C	.	.	DP=120;ECNT=42;MBQ=33,28;MFRL=152,150;MMQ=41,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,10:0.090:120:41,4:58,3:0|1:1016944_GG_TT:1016944:44,66,1,9
chr11	1016957	.	T	G	.	.	DP=115;ECNT=42;MBQ=31,33;MFRL=139,164;MMQ=42,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:102,13:0.120:115:38,4:50,7:44,58,1,12
chr11	1016959	.	T	C	.	.	DP=114;ECNT=42;MBQ=31,26;MFRL=139,166;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,7:0.069:114:44,3:57,2:0|1:1016959_T_C:1016959:44,63,0,7
chr11	1016961	.	G	A	.	.	DP=113;ECNT=42;MBQ=33,31;MFRL=143,150;MMQ=43,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,8:0.078:113:42,4:54,3:0|1:1016944_GG_TT:1016944:43,62,1,7
chr11	1016963	.	G	T	.	.	DP=115;ECNT=42;MBQ=34,30;MFRL=138,166;MMQ=45,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:108,7:0.068:115:43,2:55,3:0|1:1016959_T_C:1016959:41,67,0,7
chr11	1016967	.	G	C	.	.	DP=117;ECNT=42;MBQ=33,35;MFRL=139,161;MMQ=45,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:112,5:0.050:117:46,1:57,4:0|1:1016833_G_T:1016833:41,71,0,5
chr11	1016968	.	T	G	.	.	DP=118;ECNT=42;MBQ=30,33;MFRL=138,166;MMQ=48,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:111,7:0.067:118:42,2:57,4:0|1:1016959_T_C:1016959:42,69,0,7
chr11	1016970	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=42;MBQ=33,27;MFRL=139,150;MMQ=50,38;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,8:0.075:118:44,3:58,3:0|1:1016944_GG_TT:1016944:41,69,1,7
chr11	1016972	.	GGTGT	G	.	.	DP=128;ECNT=42;MBQ=33,35;MFRL=134,145;MMQ=56,43;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=GT;STR;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:122,6:0.054:128:46,1:57,4:0|1:1016833_G_T:1016833:47,75,0,6
chr11	1016976	.	T	G	.	.	DP=120;ECNT=42;MBQ=29,34;MFRL=129,178;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,9:0.086:114:44,3:47,6:0|1:1016914_G_T:1016914:44,61,1,8
chr11	1016978	.	T	A,G,TAGAC	.	.	DP=120;ECNT=42;MBQ=29,32,34,32;MFRL=121,192,189,145;MMQ=60,40,40,43;MPOS=23,24,-2147483648;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=12.59,42.38,15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:89,5,15,6:0.048,0.130,0.056:115:37,2,6,1:38,2,8,5:35,54,5,21
chr11	1016984	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=42;MBQ=33,33;MFRL=133,128;MMQ=60,46;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,5:0.051:115:47,0:56,5:0|1:1016833_G_T:1016833:37,73,0,5
chr11	1016987	.	G	C	.	.	DP=117;ECNT=42;MBQ=34,36;MFRL=129,128;MMQ=60,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:112,5:0.050:117:46,0:59,5:0|1:1016833_G_T:1016833:41,71,0,5
chr11	1016988	.	ATGT	A	.	.	DP=127;ECNT=42;MBQ=31,31;MFRL=125,193;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:123,4:0.039:127:42,2:63,1:0|1:1016959_T_C:1016959:44,79,0,4
chr11	1016989	.	T	C	.	.	DP=122;ECNT=42;MBQ=31,28;MFRL=127,128;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,5:0.053:110:41,0:55,5:0|1:1016833_G_T:1016833:39,66,0,5
chr11	1016991	.	T	G	.	.	DP=121;ECNT=42;MBQ=29,33;MFRL=114,189;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,15:0.133:113:35,5:50,9:36,62,5,10
chr11	1016995	.	T	C	.	.	DP=122;ECNT=42;MBQ=29,28;MFRL=123,193;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:115,3:0.033:118:39,2:52,1:0|1:1016959_T_C:1016959:44,71,0,3
chr11	1017029	.	T	G	.	.	DP=125;ECNT=42;MBQ=31,33;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=208.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,72:0.603:120:14,31:29,37:21,27,27,45
chr11	1017069	.	G	A	.	.	DP=122;ECNT=42;MBQ=29,31;MFRL=129,136;MMQ=60,56;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,37:0.314:119:35,14:44,23:42,40,16,21
chr11	1017084	.	G	A	.	.	DP=151;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,37:0.257:146:43,17:63,20:54,55,20,17
chr11	1017110	.	C	T	.	.	DP=151;ECNT=13;MBQ=28,31;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:116,31:0.215:147:43,13:63,17:0|1:1017110_C_T:1017110:59,57,17,14
chr11	1017112	.	GT	CC	.	.	DP=151;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:116,31:0.215:147:46,13:63,17:0|1:1017110_C_T:1017110:59,57,17,14
chr11	1017113	.	T	C	.	.	DP=147;ECNT=13;MBQ=29,28;MFRL=123,137;MMQ=60,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,18:0.156:117:37,5:48,12:0|1:1017113_T_C:1017113:49,50,10,8
chr11	1017135	.	G	A	.	.	DP=134;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=126,129;MMQ=60,48;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:127,7:0.059:134:46,1:67,5:0|1:1017113_T_C:1017113:64,63,3,4
chr11	1017154	.	T	G	.	.	DP=125;ECNT=13;MBQ=31,34;MFRL=131,154;MMQ=60,32;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:123,2:0.024:125:42,0:65,2:0|1:1017113_T_C:1017113:62,61,0,2
chr11	1017158	.	G	T	.	.	DP=126;ECNT=13;MBQ=34,32;MFRL=130,154;MMQ=60,32;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:124,2:0.023:126:46,0:68,2:0|1:1017113_T_C:1017113:61,63,0,2
chr11	1017173	.	G	A	.	.	DP=134;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=131,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,26:0.207:125:43,8:54,16:48,51,15,11
chr11	1017183	.	G	T	.	.	DP=125;ECNT=13;MBQ=34,31;MFRL=134,122;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,38:0.313:121:38,14:42,22:49,34,14,24
chr11	1017220	.	T	C	.	.	DP=147;ECNT=13;MBQ=29,30;MFRL=129,135;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,49:0.347:142:38,23:39,25:0|1:1017220_T_C:1017220:55,38,21,28
chr11	1017231	.	A	G	.	.	DP=159;ECNT=13;MBQ=32,34;MFRL=116,138;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=190.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:104,54:0.344:158:45,24:53,25:0|1:1017220_T_C:1017220:64,40,21,33
chr11	1017239	.	CG	TA	.	.	DP=161;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=124,149;MMQ=57,37;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:132,21:0.141:153:59,9:66,12:76,56,4,17
chr11	1017240	.	G	A	.	.	DP=161;ECNT=13;MBQ=29,31;MFRL=116,140;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,57:0.351:155:42,27:51,28:57,41,24,33
chr11	1017280	.	G	T	.	.	DP=206;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=123,147;MMQ=56,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:182,19:0.098:201:71,8:104,10:0|1:1017280_G_T:1017280:85,97,16,3
chr11	1017294	.	A	T	.	.	DP=227;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=116,144;MMQ=52,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:210,17:0.076:227:74,8:113,8:0|1:1017280_G_T:1017280:97,113,15,2
chr11	1017297	.	G	GTT	.	.	DP=227;ECNT=9;MBQ=33,20;MFRL=120,64;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:224,3:0.017:227:84,0:127,2:0|1:1017297_G_GTT:1017297:113,111,2,1
chr11	1017300	.	G	T	.	.	DP=229;ECNT=9;MBQ=33,20;MFRL=121,64;MMQ=52,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:221,3:0.017:224:79,0:127,3:0|1:1017297_G_GTT:1017297:112,109,2,1
chr11	1017302	.	G	C	.	.	DP=230;ECNT=9;MBQ=33,34;MFRL=112,145;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:176,46:0.210:222:58,19:105,26:71,105,37,9
chr11	1017307	.	G	A	.	.	DP=233;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=123,102;MMQ=52,52;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:191,29:0.133:220:69,8:118,21:94,97,16,13
chr11	1017317	.	G	T	.	.	DP=259;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=110,134;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=176.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:202,54:0.212:256:67,22:118,27:0|1:1017317_G_T:1017317:78,124,40,14
chr11	1017325	.	A	C	.	.	DP=271;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=116,113;MMQ=52,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:189,68:0.263:257:68,23:105,42:92,97,26,42
chr11	1017337	.	TC	CA	.	.	DP=268;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=112,126;MMQ=60,43;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:192,67:0.261:259:59,30:98,32:0|1:1017317_G_T:1017317:73,119,39,28
chr11	1017381	.	G	C	.	.	DP=303;ECNT=11;MBQ=32,34;MFRL=115,104;MMQ=60,47;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:261,30:0.106:291:90,9:161,21:0|1:1017381_G_C:1017381:78,183,6,24
chr11	1017384	.	G	C	.	.	DP=285;ECNT=11;MBQ=32,34;MFRL=114,104;MMQ=60,47;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:255,30:0.108:285:86,8:151,18:0|1:1017381_G_C:1017381:77,178,6,24
chr11	1017386	.	C	T	.	.	DP=278;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=114,104;MMQ=60,45;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:244,27:0.103:271:83,9:143,16:0|1:1017381_G_C:1017381:71,173,5,22
chr11	1017421	.	G	T	.	.	DP=161;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=135,111;MMQ=60,54;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=195.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:97,64:0.389:161:32,31:60,24:0|1:1017421_G_T:1017421:32,65,15,49
chr11	1017440	.	C	T	.	.	DP=133;ECNT=11;MBQ=28,30;MFRL=136,121;MMQ=60,48;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=147.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,42:0.318:133:37,17:50,14:0|1:1017421_G_T:1017421:35,56,12,30
chr11	1017443	.	C	G	.	.	DP=131;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=136,120;MMQ=60,48;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=134.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,38:0.293:131:37,15:51,17:0|1:1017421_G_T:1017421:36,57,12,26
chr11	1017457	.	CAG	C	.	.	DP=116;ECNT=11;MBQ=33,27;MFRL=128,282;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:109,5:0.052:114:39,3:58,1:0|1:1017457_CAG_C:1017457:53,56,2,3
chr11	1017458	.	AGG	A	.	.	DP=116;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=132,114;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=85.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,26:0.241:110:30,10:47,13:40,44,13,13
chr11	1017463	.	TTCTGGTGCCTGTACTGGTGTGGTTGGGGGTGATGCTGGTGGTAGAAGTTGAGGTGACTTCAGGATGGTGTGTGGAGGAAGTGTGTGAATGTAGGGATGTAGAGGTTTTGGCCGTGCTAAATGAGCTTCGGGATTGGCTG	T,TGTGCCTGTACTGGTGTGGTTGGGGGTGATGCTGGTGGTAGAAGTTGAGGTGACTTCAGGATGGTGTGTGGAGGAAGTGTGTGAATGTAGGGATGTAGAGGTTTTGGCCGTGCTAAATGAGCTTCGGGATTGGCTG	.	.	DP=348;ECNT=11;MBQ=28,28,30;MFRL=119,114,218;MMQ=60,57,41;MPOS=-2147483648,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=78.69,12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:315,27,6:0.080,0.020:348:27,12,4:41,11,1:159,156,17,16
chr11	1017469	.	TGCCTGTACTGGTGTGGTTGGGGGTGATGCTGGTGGTAGAAGTTGAGGTGACTTCAGGATGGTGTGTGGAGGAAGTGTGTGAATGTAGGGATGTAGAGGTTTTGGCCGTGCTAAATGAGCTTCGGGATTGGCTGGTC	T	.	.	DP=347;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=120,154;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:316,7:0.022:323:27,4:41,1:0|1:1017457_CAG_C:1017457:162,154,3,4
chr11	1017608	.	ACTGGTGGTCACTGTCATTGGTGGG	A,AG	.	.	DP=216;ECNT=11;MBQ=29,32,32;MFRL=116,96,218;MMQ=60,60,41;MPOS=-2147483648,-2147483648;POPAF=7.30,7.30;TLOD=77.71,13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:185,25,6:0.119,0.032:216:61,12,4:62,13,2:107,78,16,15
chr11	1017789	.	A	C	.	.	DP=262;ECNT=37;MBQ=31,33;MFRL=133,128;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=203.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:174,75:0.302:249:77,32:92,41:80,94,29,46
chr11	1017845	.	C	G	.	.	DP=198;ECNT=37;MBQ=29,32;MFRL=146,140;MMQ=60,43;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=186.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:126,58:0.317:184:59,27:59,25:0|1:1017845_C_G:1017845:48,78,27,31
chr11	1017858	.	A	G	.	.	DP=190;ECNT=37;MBQ=31,28;MFRL=144,128;MMQ=60,43;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=198.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:127,57:0.312:184:59,28:56,18:0|1:1017845_C_G:1017845:47,80,26,31
chr11	1017863	.	G	A	.	.	DP=182;ECNT=37;MBQ=33,30;MFRL=140,124;MMQ=60,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:177,3:0.022:180:85,2:73,0:0|1:1017863_G_A:1017863:83,94,1,2
chr11	1017875	.	A	G	.	.	DP=197;ECNT=37;MBQ=32,32;MFRL=134,124;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:194,3:0.020:197:101,2:83,1:0|1:1017863_G_A:1017863:102,92,1,2
chr11	1017883	.	C	A	.	.	DP=204;ECNT=37;MBQ=33,30;MFRL=143,112;MMQ=60,43;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=199.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:132,67:0.338:199:66,38:59,29:69,63,40,27
chr11	1017891	.	GCA	G	.	.	DP=219;ECNT=37;MBQ=34,34;MFRL=121,176;MMQ=54,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:210,5:0.028:215:105,2:91,2:0|1:1017891_GCA_G:1017891:122,88,0,5
chr11	1017893	.	A	G	.	.	DP=217;ECNT=37;MBQ=31,30;MFRL=120,124;MMQ=55,45;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:197,10:0.049:207:107,4:85,6:113,84,6,4
chr11	1017894	.	T	TGC	.	.	DP=219;ECNT=37;MBQ=31,34;MFRL=120,176;MMQ=53,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:214,5:0.027:219:105,2:90,2:0|1:1017891_GCA_G:1017891:123,91,0,5
chr11	1017898	.	T	G	.	.	DP=226;ECNT=37;MBQ=29,35;MFRL=120,176;MMQ=52,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:215,5:0.027:220:105,3:91,2:0|1:1017891_GCA_G:1017891:126,89,0,5
chr11	1017900	.	G	T	.	.	DP=224;ECNT=37;MBQ=33,31;MFRL=123,112;MMQ=52,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:198,25:0.115:223:104,12:83,12:0|1:1017900_G_T:1017900:115,83,12,13
chr11	1017911	.	TG	CT	.	.	DP=213;ECNT=37;MBQ=32,33;MFRL=121,120;MMQ=50,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:189,19:0.094:208:95,15:85,4:102,87,12,7
chr11	1017921	.	C	A,T	.	.	DP=204;ECNT=37;MBQ=33,33,33;MFRL=121,112,118;MMQ=50,44,42;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=40.03,43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:168,14,15:0.075,0.077:197:83,4,7:80,9,8:79,89,14,15
chr11	1017929	.	C	G	.	.	DP=200;ECNT=37;MBQ=34,32;MFRL=119,123;MMQ=48,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:185,8:0.046:193:88,2:89,6:0|1:1017929_C_G:1017929:74,111,3,5
chr11	1017932	.	CA	TG	.	.	DP=202;ECNT=37;MBQ=34,33;MFRL=122,116;MMQ=49,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=125.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:158,38:0.197:196:64,19:74,18:53,105,17,21
chr11	1017935	.	A	G,C,T	.	.	DP=194;ECNT=37;MBQ=32,32,30,31;MFRL=119,122,116,123;MMQ=50,40,40,25;MPOS=7,18,17;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=86.81,103.39,20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:126,27,32,8:0.142,0.167,0.045:193:56,13,16,2:69,12,12,5:45,81,24,43
chr11	1017939	.	G	C	.	.	DP=193;ECNT=37;MBQ=33,34;MFRL=122,116;MMQ=48,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:159,31:0.167:190:64,16:88,14:53,106,13,18
chr11	1017941	.	G	T	.	.	DP=188;ECNT=37;MBQ=33,31;MFRL=121,109;MMQ=43,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:167,21:0.116:188:72,6:90,12:0|1:1017941_G_T:1017941:53,114,10,11
chr11	1017945	.	A	G	.	.	DP=190;ECNT=37;MBQ=31,34;MFRL=121,112;MMQ=42,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:184,5:0.031:189:74,1:101,3:0|1:1017900_G_T:1017900:56,128,0,5
chr11	1017955	.	C	T	.	.	DP=182;ECNT=37;MBQ=28,34;MFRL=122,139;MMQ=43,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:170,9:0.055:179:64,4:92,5:45,125,0,9
chr11	1017956	.	G	A	.	.	DP=179;ECNT=37;MBQ=31,32;MFRL=127,124;MMQ=44,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:166,13:0.077:179:65,2:86,10:0|1:1017929_C_G:1017929:40,126,4,9
chr11	1017963	.	G	A	.	.	DP=156;ECNT=37;MBQ=32,31;MFRL=135,123;MMQ=40,49;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:131,25:0.165:156:46,11:79,13:0|1:1017941_G_T:1017941:21,110,11,14
chr11	1017964	.	G	T	.	.	DP=155;ECNT=37;MBQ=33,31;MFRL=134,121;MMQ=40,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:146,9:0.063:155:56,2:86,7:26,120,2,7
chr11	1017968	.	T	A	.	.	DP=147;ECNT=37;MBQ=32,31;MFRL=137,128;MMQ=40,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:121,26:0.181:147:37,12:72,12:0|1:1017941_G_T:1017941:16,105,10,16
chr11	1017981	.	T	A	.	.	DP=131;ECNT=37;MBQ=31,31;MFRL=139,127;MMQ=40,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,25:0.201:127:26,12:59,12:0|1:1017941_G_T:1017941:11,91,10,15
chr11	1017988	.	G	T	.	.	DP=128;ECNT=37;MBQ=32,31;MFRL=137,148;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,29:0.241:120:34,9:53,18:21,70,7,22
chr11	1017989	.	G	T	.	.	DP=128;ECNT=37;MBQ=32,32;MFRL=137,153;MMQ=40,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:113,5:0.044:118:39,3:68,2:0|1:1017989_G_T:1017989:28,85,0,5
chr11	1018001	.	A	C	.	.	DP=105;ECNT=37;MBQ=31,27;MFRL=136,149;MMQ=40,35;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,6:0.067:100:35,2:55,4:0|1:1018001_A_C:1018001:26,68,1,5
chr11	1018009	.	TC	CA	.	.	DP=91;ECNT=37;MBQ=29,32;MFRL=135,155;MMQ=42,38;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,4:0.054:91:28,2:41,2:0|1:1017989_G_T:1017989:28,59,0,4
chr11	1018012	.	T	G	.	.	DP=87;ECNT=37;MBQ=31,31;MFRL=136,157;MMQ=43,36;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,3:0.046:85:34,2:45,1:0|1:1017989_G_T:1017989:27,55,0,3
chr11	1018015	.	A	T	.	.	DP=88;ECNT=37;MBQ=31,31;MFRL=129,153;MMQ=44,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,6:0.078:88:34,2:40,2:0|1:1018001_A_C:1018001:26,56,1,5
chr11	1018024	.	CC	GA	.	.	DP=71;ECNT=37;MBQ=33,33;MFRL=103,138;MMQ=45,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,21:0.314:68:23,6:22,14:0|1:1018024_CC_GA:1018024:17,30,11,10
chr11	1018025	.	C	A	.	.	DP=71;ECNT=37;MBQ=28,31;MFRL=103,169;MMQ=46,24;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,4:0.092:51:20,2:19,1:0|1:1018001_A_C:1018001:18,29,1,3
chr11	1018031	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=37;MBQ=33,31;MFRL=90,147;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,22:0.343:65:19,9:21,13:17,26,9,13
chr11	1018042	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=37;MBQ=31,33;MFRL=88,136;MMQ=56,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,18:0.279:66:24,7:22,10:0|1:1018024_CC_GA:1018024:16,32,10,8
chr11	1018048	.	A	G,T	.	.	DP=69;ECNT=37;MBQ=31,33,32;MFRL=81,120,192;MMQ=60,60,27;MPOS=16,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=75.22,4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:45,22,2:0.319,0.042:69:22,7,2:21,9,0:16,29,10,14
chr11	1018059	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=37;MBQ=33,32;MFRL=81,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,23:0.369:63:19,9:18,13:0|1:1018024_CC_GA:1018024:9,31,10,13
chr11	1018237	.	GT	AG	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=88,148;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,3:0.043:90:35,1:45,2:40,47,2,1
chr11	1018374	.	T	A	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=227.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,34:0,32:0,0,31,35
chr11	1018523	.	A	G	.	.	DP=117;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=110,128;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,18:0.167:111:43,10:50,8:36,57,6,12
chr11	1018566	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=130,77;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.099:62:33,1:23,2:21,35,6,0
chr11	1019194	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr11	1020778	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	1027221	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	1036573	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,4:0,0,3,6
chr11	1082605	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:7,0:2,4:6,3,2,2
chr11	1086574	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1086574_G_A:1086574:0,1,0,1
chr11	1086576	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1086574_G_A:1086574:0,1,0,1
chr11	1086577	.	T	TGGTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1086574_G_A:1086574:0,1,0,1
chr11	1087786	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	1091987	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	1093512	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=80,88;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:4,2:5,1:6,4,3,1
chr11	1093600	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=63,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.617:22:5,7:1,6:6,3,6,7
chr11	1093710	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,6:0,0,6,11
chr11	1093945	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,36323828;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	1095082	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,1:0,0,7,1
chr11	1098637	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr11	1101864	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:3,3:1,2:2,2,2,4
chr11	1103425	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	1103786	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr11	1151787	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1151787_C_CA:1151787:0,0,0,1
chr11	1151789	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1151787_C_CA:1151787:0,0,0,1
chr11	1158190	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	1159133	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	1159150	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr11	1248197	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	1248491	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr11	1248716	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=237,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:1248716_T_G:1248716:0,2,0,1
chr11	1248731	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=237,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1248716_T_G:1248716:0,2,0,1
chr11	1250384	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	1250603	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	1253136	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr11	1253401	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,6:7,6:3,7,7,5
chr11	1253856	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:0,3:1,0,4,1
chr11	1253942	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr11	1253969	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=145,51;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,2:4,4:0|1:1253969_A_G:1253969:3,6,2,4
chr11	1253976	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:5,3:4,4:0|1:1253969_A_G:1253969:3,7,2,5
chr11	1253980	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=145,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:0|1:1253969_A_G:1253969:2,7,1,4
chr11	1254008	.	C	CCTG	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.265:9:3,1:3,1:0|1:1254008_C_CCTG:1254008:0,7,0,2
chr11	1254011	.	A	AAGCCCAGCCCCTTTCCCT	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0|1:1254008_C_CCTG:1254008:0,7,0,2
chr11	1254940	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr11	1255089	.	CCCCTG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCCTG;STR;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.833:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	1258175	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,1:5,1:3,2,1,1
chr11	1258192	.	AT	TC	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=148,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.365:9:0,1:6,1:0|1:1258192_AT_TC:1258192:4,2,2,1
chr11	1258197	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:0|1:1258192_AT_TC:1258192:4,2,2,1
chr11	1258199	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:0|1:1258192_AT_TC:1258192:4,2,2,1
chr11	1258217	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,3:6,2:0|1:1258217_T_G:1258217:9,2,4,1
chr11	1258226	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:5,3:7,1:0|1:1258217_T_G:1258217:9,4,4,0
chr11	1258240	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,3:8,0:9,6,4,0
chr11	1258283	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=31,24;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:7,2:5,9,2,2
chr11	1260145	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=124,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,1:10,1:5,11,1,1
chr11	1260157	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=129,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:4,1:11,1:0|1:1260157_G_C:1260157:1,14,1,1
chr11	1260160	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=141,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:2,1:8,1:0|1:1260157_G_C:1260157:2,14,1,1
chr11	1260163	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=129,88;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,1:10,1:0|1:1260157_G_C:1260157:2,15,1,1
chr11	1260175	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=159,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:3,1:7,1:1,12,1,1
chr11	1260632	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=201,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:1,1,3,1
chr11	1261640	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	1262907	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,4:5,3:2,4,3,4
chr11	1263523	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:1,3,2,6
chr11	1263776	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:7,4:1,1:7,1,4,1
chr11	1264691	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=65,89;MMQ=48,36;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.744:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr11	1264823	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,8:0,0,16,3
chr11	1265987	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=120,158;MMQ=52,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.447:34:14,10:4,5:8,11,6,9
chr11	1267325	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,33;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr11	1267917	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,29;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr11	1267960	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,3:0,0,3,5
chr11	1268608	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,7:0,0,6,15
chr11	1268637	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=160,134;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.287:18:9,1:4,3:8,5,4,1
chr11	1268955	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=219,178;MMQ=24,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,5:1,4:0,2,7,2
chr11	1269835	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,141;MMQ=60,33;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,1:0,0,5,3
chr11	1271218	.	GCCA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,110;MMQ=27,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCA;STR;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:10,6:4,1:11,4,5,5
chr11	1271321	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,163;MMQ=53,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:1,14:0,3:0,1,5,12
chr11	1272039	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=134,124;MMQ=48,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.479:48:19,15:5,7:18,7,15,8
chr11	1272226	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=200.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,53:0.982:53:0,30:0,23:0|1:1272226_A_C:1272226:0,0,24,29
chr11	1272245	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,29:0.474:61:15,16:17,12:0|1:1272226_A_C:1272226:13,19,9,20
chr11	1272709	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.705:15:4,5:0,5:2,2,3,8
chr11	1272754	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=138,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:2,1,1,3
chr11	1273730	.	T	TTCCACAGGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr11	1273833	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	1279325	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:3,8:5,1:3,5,4,6
chr11	1279486	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr11	1280301	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.753:5:0,1:0,2:0,1,1,3
chr11	1280366	.	C	CTTCTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	1281134	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr11	1281475	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,10;MFRL=177,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:2,0:3,0:4,1,1,0
chr11	1284227	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,8,1
chr11	1288792	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=160,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr11	1411501	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr11	1457238	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:3,3:4,6:6,2,6,3
chr11	1462162	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr11	1464883	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr11	1464903	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	1466456	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,2,1
chr11	1467020	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,1:10,1:6,8,2,0
chr11	1471081	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=16;MBQ=27,12;MFRL=129,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,1:0|1:1471081_G_C:1471081:1,2,3,0
chr11	1471087	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=16;MBQ=21,32;MFRL=134,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:1,1:0|1:1471081_G_C:1471081:1,1,3,0
chr11	1471091	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=16;MBQ=28,31;MFRL=157,248;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.360:6:0,0:2,1:0|1:1471091_AG_CC:1471091:2,2,2,0
chr11	1471094	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=16;MBQ=28,10;MFRL=139,247;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:1471091_AG_CC:1471091:1,2,1,0
chr11	1471098	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=16;MBQ=30,18;MFRL=139,247;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:1471091_AG_CC:1471091:1,2,1,0
chr11	1471102	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=16;MBQ=22,13;MFRL=139,247;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:1471091_AG_CC:1471091:1,2,1,0
chr11	1471105	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=20,14;MFRL=191,247;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:1471091_AG_CC:1471091:1,1,1,0
chr11	1471113	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=16;MBQ=20,32;MFRL=129,247;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:1471091_AG_CC:1471091:1,2,1,0
chr11	1471118	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=16;MBQ=23,13;MFRL=129,247;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:1471091_AG_CC:1471091:1,2,1,0
chr11	1471132	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=32,33;MFRL=152,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1471132_T_G:1471132:0,2,0,1
chr11	1471135	.	CA	AT	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=35,31;MFRL=152,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1471132_T_G:1471132:0,2,0,1
chr11	1471140	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=32,33;MFRL=152,253;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1471132_T_G:1471132:0,2,0,1
chr11	1471141	.	G	GGCGCCT	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=34,33;MFRL=152,253;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1471132_T_G:1471132:0,2,0,1
chr11	1471147	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=33,26;MFRL=152,253;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1471132_T_G:1471132:0,2,0,1
chr11	1471150	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=35,32;MFRL=152,253;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1471132_T_G:1471132:0,2,0,1
chr11	1471154	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=29,34;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	1472050	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:5,11:12,7:5,12,7,11
chr11	1472475	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr11	1472673	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=122,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:1,3:4,2:2,4,1,4
chr11	1475706	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=76,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,3:6,0:4,2,2,1
chr11	1578307	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	1579018	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=72.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,12,11
chr11	1619328	.	TCCCCCACAGCTGGAGCTGCAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACGGCCGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=167,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.276:11:2,0:0,0:6,3,1,1
chr11	1628844	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,10,6
chr11	1628948	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,5:0,0,4,7
chr11	1651652	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,2:3,3,2,3
chr11	1719010	.	G	GGCTTTCT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,1:0|1:1719010_G_GGCTTTCT:1719010:3,12,1,1
chr11	1719014	.	T	TTGGGC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:4,0:9,2:0|1:1719010_G_GGCTTTCT:1719010:3,12,1,1
chr11	1775186	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=174,145;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,0:0|1:1775186_T_G:1775186:1,3,2,0
chr11	1775190	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=174,145;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:1775186_T_G:1775186:1,3,2,0
chr11	1775196	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,3,0
chr11	1775202	.	AG	CC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,3,0
chr11	1775215	.	GG	CC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=159,150;MMQ=60,36;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:1775186_T_G:1775186:0,4,1,0
chr11	1776339	.	T	TCACTGTGTCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=253,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	1857258	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:3,6,0,2
chr11	1874266	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	1888073	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=184,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1888073_A_C:1888073:0,1,0,1
chr11	1888077	.	C	CATCACACAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=184,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1888073_A_C:1888073:0,1,0,1
chr11	1890810	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,6:0,17:0,0,25,1
chr11	1890990	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,7:0,11:0,0,5,18
chr11	1891035	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,0:2,0:0,2,0,4
chr11	1891722	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,1:4,6:4,0,4,3
chr11	1901467	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=103,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr11	1902635	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr11	1905292	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=102,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:1,2,0,2
chr11	1905553	.	GGTCT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GTCT;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,0:8,2:3,14,1,1
chr11	1905653	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.791:12:2,4:0,6:1,1,6,4
chr11	1907940	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,20,8
chr11	1911705	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,261;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:5,1:5,1:3,8,1,1
chr11	1944202	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr11	1947575	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,6:6,4:10,0,9,1
chr11	1950302	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr11	1950906	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:1950906_T_G:1950906:0,0,4,0
chr11	1950923	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:1950906_T_G:1950906:2,0,2,0
chr11	1950925	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0|1:1950906_T_G:1950906:0,0,4,0
chr11	1956212	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	1959707	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:7,9,0,2
chr11	1976988	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	1983701	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	2005704	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:2005704_G_A:2005704:8,5,0,2
chr11	2005705	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:2005704_G_A:2005704:8,5,0,2
chr11	2005709	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:4,0:0|1:2005704_G_A:2005704:7,5,0,2
chr11	2154257	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.273:26:6,0:9,3:16,3,1,6
chr11	2156536	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr11	2161536	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=129,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,0:2,2:0|1:2161536_A_T:2161536:2,4,1,1
chr11	2161540	.	T	TTTCAGAG	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,18;MFRL=129,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:4,0:2,1:0|1:2161536_A_T:2161536:2,4,1,1
chr11	2161603	.	C	CT,CTTCCTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31,34;MFRL=200,176,105;MMQ=60,60,60;MPOS=4,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:3,1,1:0,0,0:0,3,0,2
chr11	2161606	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr11	2161622	.	C	CGGCCACCAG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=214,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2161622_C_CGGCCACCAG:2161622:0,1,0,1
chr11	2161624	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=214,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2161622_C_CGGCCACCAG:2161622:0,1,0,1
chr11	2169110	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=229,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr11	2170537	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=116,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:2,4,0,2
chr11	2182004	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr11	2182224	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=172,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr11	2187071	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr11	2187388	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:2187388_G_A:2187388:0,3,0,1
chr11	2187389	.	A	AGGTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:2187388_G_A:2187388:0,3,0,1
chr11	2187398	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	2187855	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr11	2187924	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=142,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:4,4,2,1
chr11	2188566	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	2189022	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:2189022_C_CG:2189022:0,0,1,0
chr11	2189024	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:2189022_C_CG:2189022:0,0,1,0
chr11	2189027	.	CT	AA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:2189022_C_CG:2189022:1,1,1,0
chr11	2189032	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:2189022_C_CG:2189022:1,2,1,0
chr11	2189185	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:5,2:1,2:1,5,2,2
chr11	2290900	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,9;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.726:5:1,1:0,0:0|1:2290900_T_G:2290900:1,0,4,0
chr11	2290901	.	G	GGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=18,27;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.726:5:0,2:0,0:0|1:2290900_T_G:2290900:1,0,4,0
chr11	2290905	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.726:5:0,3:0,0:0|1:2290900_T_G:2290900:1,0,4,0
chr11	2321650	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=214,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr11	2321781	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:19,5,2,0
chr11	2323528	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	2330077	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,4,9
chr11	2330479	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr11	2337012	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	2411573	.	GT	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2411573_GT_AA:2411573:1,0,1,0
chr11	2411583	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:2411573_GT_AA:2411573:1,0,1,0
chr11	2424565	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:9,1:13,1:16,6,2,0
chr11	2432820	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr11	2434684	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=162,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:6,0,6,0
chr11	2434840	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.592:30:3,8:9,9:3,9,5,13
chr11	2438936	.	G	GGGGGGCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.670:4:1,0:0,3:0|1:2438936_G_GGGGGGCC:2438936:0,1,3,0
chr11	2438940	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,1:0|1:2438936_G_GGGGGGCC:2438936:0,2,2,0
chr11	2438943	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=130,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:2438936_G_GGGGGGCC:2438936:1,2,1,0
chr11	2438949	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=130,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,0:0|1:2438936_G_GGGGGGCC:2438936:1,2,1,0
chr11	2438963	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr11	2439542	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr11	2439621	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=197,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr11	2439651	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=223,243;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:2439651_G_T:2439651:0,1,1,1
chr11	2439672	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=170,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:2439651_G_T:2439651:1,0,1,1
chr11	2439876	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:1,2:8,3:0,9,0,5
chr11	2441646	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=197,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,2,4
chr11	2441686	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr11	2444094	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,36;MFRL=134,38;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr11	2542605	.	TA	GG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	2549329	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=190,29222736;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=G;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr11	2610101	.	C	CTA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:2610101_C_CTA:2610101:3,5,1,1
chr11	2610103	.	G	GAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:3,0:0|1:2610101_C_CTA:2610101:3,5,1,1
chr11	2610104	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=124,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:3,0:0|1:2610101_C_CTA:2610101:3,5,1,1
chr11	2683357	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr11	2797320	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	2905204	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr11	2920922	.	G	GCTTTCTGGGGCTTCTCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	2929552	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr11	2930594	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	2937828	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=173,79;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,3:5,0:10,1,3,0
chr11	2938257	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=102,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.396:41:12,8:9,8:10,15,8,8
chr11	2938300	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=43.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,4:0,0,1,13
chr11	2939392	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,1,12
chr11	2940492	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,19,5
chr11	2946281	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:8,3,2,0
chr11	3026576	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=139,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:23,3:13,0:25,11,2,1
chr11	3038595	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=194,197;MMQ=55,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr11	3038597	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=173,239;MMQ=47,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr11	3038601	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=149,218;MMQ=49,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr11	3038615	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=182,218;MMQ=47,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr11	3063374	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,3:6,1:4,8,3,1
chr11	3110976	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr11	3122770	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr11	3128774	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr11	3128915	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	3129142	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	3129200	.	GCCCCAC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCAC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	3250034	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,18;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,1:0,0:4,3,0,2
chr11	3381799	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=197,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:0,1:0|1:3381799_A_C:3381799:2,0,0,1
chr11	3381807	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3381799_A_C:3381799:3,0,0,1
chr11	3381811	.	A	ATACTTAGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3381799_A_C:3381799:3,0,0,1
chr11	3381813	.	AGT	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3381799_A_C:3381799:3,0,0,1
chr11	3381843	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr11	3382069	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=204.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,25:0,32:0,0,10,48
chr11	3383112	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=187,169;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3383112_T_C:3383112:0,2,0,1
chr11	3383116	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=187,169;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:3383112_T_C:3383112:0,2,0,1
chr11	3383124	.	AG	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=184,169;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:3383112_T_C:3383112:0,1,0,1
chr11	3392351	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:3392351_T_C:3392351:0,0,1,6
chr11	3392357	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0|1:3392351_T_C:3392351:0,0,1,7
chr11	3392745	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=55.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,15,2
chr11	3392972	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,3:0,0,0,15
chr11	3394894	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	3398760	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,5:0,0,7,2
chr11	3398795	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr11	3400334	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,3,18
chr11	3660816	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	3661180	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=221,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:3,4,0,2
chr11	3661585	.	A	ATGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGG;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr11	3663011	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr11	3663134	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:3663134_G_T:3663134:0,4,0,1
chr11	3663136	.	A	AGACTCTGTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:3663134_G_T:3663134:0,4,0,1
chr11	3663140	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:3663134_G_T:3663134:0,4,0,1
chr11	3682726	.	T	TAACTCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,164;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	3697535	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:10,0:14,10,2,0
chr11	3700980	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:3700980_AT_A:3700980:1,3,0,1
chr11	3700983	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:3700980_AT_A:3700980:1,3,0,1
chr11	3700986	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:3700980_AT_A:3700980:1,3,0,1
chr11	3829419	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,169;MMQ=25,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:3,0,6,0
chr11	3844311	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,4:0,0,0,12
chr11	3846551	.	ACAACAGTGTACACCATCTTTGCCATCCTGGAGTACACTGTTGTCTTAAC	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,7:0.086:50:9,3:10,1:30,13,3,4
chr11	4104060	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,17:0,6:0,0,17,6
chr11	4104087	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.928:25:1,16:0,8:1,0,16,8
chr11	4104745	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,2,14
chr11	4116335	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=82.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,0,22
chr11	4123228	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,1:6,1:13,2,2,0
chr11	4123345	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,3,17
chr11	4133317	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,4,14
chr11	4139450	.	CTT	C,CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35,35;MFRL=0,175,174;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=8.16,13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,6:0.357,0.563:10:0,2,4:0,2,2:0,0,10,0
chr11	4148453	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0,8,1,1
chr11	4150238	.	G	GTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=196,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.578:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr11	4159324	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	4389587	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	4409511	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=75,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:4,5:2,2:4,2,5,3
chr11	4411002	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,1:2,5:0,2,1,5
chr11	4510587	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=170,145;MMQ=60,51;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,3:6,4:6,4,2,5
chr11	4566377	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr11	4592706	.	T	TAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:3,2:0|1:4592706_T_TAC:4592706:4,6,1,1
chr11	4592708	.	C	CAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,10:0.787:12:0,6:2,3:1|0:4592706_T_TAC:4592706:1,1,4,6
chr11	4592923	.	CAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	4593334	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr11	4594739	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	4615234	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,6:7,2:11,0,6,2
chr11	4621485	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,12,2
chr11	4622159	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	4624394	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr11	4624432	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr11	4662087	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	4704068	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=275,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4704068_A_ATT:4704068:0,1,0,1
chr11	4704069	.	CCCCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=275,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4704068_A_ATT:4704068:0,1,0,1
chr11	4825527	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=113,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:6,3,3,2
chr11	4869906	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:3,3:6,3:8,2,3,3
chr11	4870261	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:8,4:11,14:12,7,13,5
chr11	4870298	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.500:38:7,3:12,16:7,12,8,11
chr11	4881753	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=118,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:1,15,0,3
chr11	4944753	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,201105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,2:12,0:13,12,2,0
chr11	4975900	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	4977026	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	5013421	.	G	GT,GTT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,34,27;MFRL=131,162,113;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=25.74,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,12,4:0.411,0.133:30:5,5,3:9,6,1:10,4,12,4
chr11	5013423	.	T	TG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.406:29:8,5:9,7:13,4,8,4
chr11	5020117	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	5020172	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,4:0,3:5,0,6,1
chr11	5020189	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,6:4,1:9,1,6,1
chr11	5068137	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,2:5,10:4,4,8,4
chr11	5068177	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=131,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:4,4:9,8:6,7,8,4
chr11	5141876	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,3:1,4:7,1,7,0
chr11	5141902	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr11	5172786	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,19:0,0,23,14
chr11	5172795	.	A	AC	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=83,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.565:35:8,8:7,8:8,7,13,7
chr11	5247791	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,3:0,0,14,3
chr11	5269582	.	AG	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=90.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,9:0,9:0|1:5269582_AG_A:5269582:0,0,15,6
chr11	5269584	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=90.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,10:0,10:0|1:5269582_AG_A:5269582:0,0,15,6
chr11	5269586	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=90.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.959:21:0,10:0,10:0|1:5269582_AG_A:5269582:0,0,15,6
chr11	5269799	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:5269799_A_C:5269799:0,0,0,5
chr11	5269806	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=190,233;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:5269799_A_C:5269799:0,1,0,2
chr11	5274452	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=196,210;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr11	5289861	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=178,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:5289861_T_TTA:5289861:0,3,0,1
chr11	5289862	.	G	GGTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=178,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:5289861_T_TTA:5289861:0,3,0,1
chr11	5289907	.	A	AAAACCCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=125,197;MMQ=29,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	5344499	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	5344552	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:5344552_C_T:5344552:0,0,6,0
chr11	5344561	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0|1:5344552_C_T:5344552:0,0,6,0
chr11	5344592	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:6,1,6,1
chr11	5344772	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,14,5
chr11	5411395	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=121,128;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.607:11:3,5:1,0:3,1,4,3
chr11	5475431	.	T	TCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=66.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,6,9
chr11	5509927	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:8,1,2,0
chr11	5510800	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,156;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:17,4:14,0:23,9,4,0
chr11	5510928	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr11	5566489	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=92,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.684:20:3,6:3,8:4,2,12,2
chr11	5566789	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=213,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr11	5603136	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:5,4:4,3:1,8,2,5
chr11	5603163	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr11	5631479	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,4,19
chr11	5653417	.	AT	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	5654056	.	T	TCC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=213,219;MMQ=40,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:3,0:0,1:0|1:5654056_T_TCC:5654056:0,3,0,1
chr11	5654065	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=213,219;MMQ=40,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:5654056_T_TCC:5654056:0,3,0,1
chr11	5654072	.	T	TGAACCACTAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=213,219;MMQ=40,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:5654056_T_TCC:5654056:0,3,0,1
chr11	5654075	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=246,219;MMQ=40,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:5654056_T_TCC:5654056:0,2,0,1
chr11	5655150	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr11	5662319	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr11	5663575	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,1:2,4:4,2,5,0
chr11	5663920	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr11	5664172	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=191,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr11	5664356	.	T	TATATA,TATATATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33,31;MFRL=0,169,171;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.10,6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,1,2:0,0,0:0,0,3,0
chr11	5664974	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr11	5687316	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=18,18;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,0:2,0:2,9,0,3
chr11	5687333	.	A	AGAAAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.270:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr11	5717959	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	5719667	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=263.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,74:0.974:75:1,36:0,37:0,1,36,38
chr11	5719835	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=180,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,7:5,4:0,7,0,11
chr11	5719848	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:0,3,0,8
chr11	5729604	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr11	5729946	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr11	5730248	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:5,1,3,0
chr11	5776623	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,10:0,11:0,0,10,11
chr11	5777023	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	5842356	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:12,10:7,6:10,9,12,4
chr11	5842628	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,12742408;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	5877909	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr11	5877979	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr11	6007272	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,9:0,0,14,10
chr11	6024345	.	G	GAAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:1,12,0,2
chr11	6129837	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,19:0,17:0,0,18,18
chr11	6221214	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,12,7
chr11	6239748	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=196,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:6239748_A_C:6239748:2,0,1,0
chr11	6239754	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=196,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:6239748_A_C:6239748:4,0,1,0
chr11	6239757	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=196,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:6239748_A_C:6239748:4,0,1,0
chr11	6243843	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr11	6243963	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,11,3
chr11	6243982	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,16,4
chr11	6281108	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	6292065	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=236,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr11	6292773	.	A	ATTCTGGGTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	6340525	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,5:0,0,0,17
chr11	6341684	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr11	6411935	.	TGCTGGC	T,CGCTGGC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29,30;MFRL=0,214,190;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.53,14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,5:0.478,0.429:9:0,4,3:0,0,2:0,0,5,4
chr11	6415392	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=109,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:5,1,4,1
chr11	6416959	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=184,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:4,4:2,1:2,4,3,2
chr11	6417004	.	CTAG	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAG;STR;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:1,4,4,2
chr11	6424856	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,4:8,4:6,6,2,6
chr11	6452815	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,1,3
chr11	6471928	.	A	ATGATCAGGTTACATAAATGGCCAAACC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr11	6471947	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6471947_G_A:6471947:1,0,0,1
chr11	6471950	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6471947_G_A:6471947:1,0,0,1
chr11	6471952	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6471947_G_A:6471947:1,0,0,1
chr11	6477443	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,4:1,1:3,4,2,3
chr11	6487023	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	6499215	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr11	6499373	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:8,1:9,9,2,0
chr11	6500309	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr11	6503127	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,0:1,5:2,2,1,4
chr11	6519363	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	6524045	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:5,10,2,0
chr11	6524213	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:6524213_A_AT:6524213:0,4,0,1
chr11	6524215	.	C	CCACACAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:6524213_A_AT:6524213:0,3,0,1
chr11	6524240	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	6530347	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.596:30:7,6:4,11:5,7,5,13
chr11	6541580	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,2,12
chr11	6555093	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.201:26:10,0:9,2:2,19,5,0
chr11	6555478	.	G	GTCTTTCAACACAAAGCACATGCAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=216,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	6560141	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	6567895	.	C	CTGCCCTACTGCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr11	6568667	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,4:7,4:5,4,4,4
chr11	6569541	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.193:27:12,0:9,4:10,12,3,2
chr11	6579539	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	6585502	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	6587252	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,9:6,5:0,14,0,14
chr11	6588228	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,13,7
chr11	6593215	.	G	GGTTATTTAC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,2:10,0:0|1:6593215_G_GGTTATTTAC:6593215:7,8,0,2
chr11	6593308	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:6593215_G_GGTTATTTAC:6593215:0,4,0,1
chr11	6593309	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:1,1:1|0:6593215_G_GGTTATTTAC:6593215:0,4,0,1
chr11	6621516	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr11	6629530	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,6:4,4:6,2,6,4
chr11	6630028	.	TC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=63.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,10:0,11:0,0,8,13
chr11	6631300	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,4:1,6:2,3,2,8
chr11	6632349	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:1,4:2,4:1,2,5,3
chr11	6632857	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,2:2,0,7,0
chr11	6633154	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=241,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6633154_A_G:6633154:0,1,0,1
chr11	6633156	.	G	GATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=241,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6633154_A_G:6633154:0,1,0,1
chr11	6637504	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,4:5,6:10,2,8,2
chr11	6637518	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:0,11:1,11:1,0,15,7
chr11	6637758	.	TTG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:6637758_TTG_T:6637758:1,0,1,0
chr11	6637765	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,16;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:6637758_TTG_T:6637758:1,0,1,0
chr11	6637776	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=144,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:6637758_TTG_T:6637758:3,0,1,0
chr11	6638506	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=127,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.539:17:3,1:3,8:6,2,8,1
chr11	6646108	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,4:4,7:2,5,1,10
chr11	6647622	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,37;MFRL=139,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr11	6647978	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr11	6648937	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr11	6654118	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:16,0:27,4:26,17,1,3
chr11	6654613	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,4:6,5:7,4,6,3
chr11	6655332	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:3,2,2,0
chr11	6703892	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr11	6807243	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,251;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr11	6890901	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=154,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr11	6890939	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:6890939_C_T:6890939:0,0,8,1
chr11	6890946	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,5:0|1:6890939_C_T:6890939:0,0,10,1
chr11	6891113	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,20:0,0,17,21
chr11	6891985	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr11	6898758	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,3:5,3:6,4,2,4
chr11	6913290	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,3:4,7:6,6,8,2
chr11	6943254	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr11	6962962	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6962962_A_T:6962962:0,1,0,1
chr11	6962971	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6962962_A_T:6962962:0,1,0,1
chr11	7061062	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:6,6:7,5:0,13,0,11
chr11	7063844	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:12,3:27,0:11,28,3,0
chr11	7065289	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr11	7070866	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,3:1,0:3,3,1,2
chr11	7091474	.	ATC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:3,1,1,0
chr11	7487951	.	CA	C,CAA,CAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,35,34,34;MFRL=182,158,140,173;MMQ=60,50,40,40;MPOS=12,18,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,15,17,18;RU=A;STR;TLOD=3.46,5.95,7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,4,5:0.178,0.317,0.381:12:1,2,2,3:0,0,2,2:1,0,11,0
chr11	7570840	.	CT	C,CTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=21,24,20;MFRL=167,157,147;MMQ=60,60,60;MPOS=25,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=6.89,6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,7:0.252,0.316:20:1,3,3:4,2,1:0,8,1,11
chr11	7614282	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr11	7614377	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.092:52:22,4:24,0:35,13,4,0
chr11	7614492	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:9,10:12,11:7,14,7,15
chr11	7614531	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:7,8:6,8:0,13,0,16
chr11	7618725	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	7649640	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:8,4:1,1:0,9,1,4
chr11	7650607	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,2:2,1:4,0,3,0
chr11	7662771	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=162,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:9,2:11,1:14,7,1,2
chr11	7663726	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr11	7669823	.	G	GTCCCTGTGAGCTGGATCTGGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.259:9:3,0:3,2:1,6,1,1
chr11	7670353	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:3,4:8,5:6,5,8,3
chr11	7670943	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.707:22:3,9:3,6:1,5,0,16
chr11	7672272	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=208,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:1,3,0,3
chr11	7674282	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:7,6,1,1
chr11	7686584	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:6,2:4,9:5,5,8,3
chr11	7686596	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,2:4,7:7,5,6,3
chr11	7686602	.	G	GTGTT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTT;STR;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.498:22:7,2:4,6:5,6,7,4
chr11	7686810	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr11	7687669	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=130,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.537:28:5,4:7,11:4,9,9,6
chr11	7689633	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	7712661	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=102,248;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,1:2,2:1,4,1,2
chr11	7716490	.	C	CCACTGCCTTTTAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=134,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr11	7716503	.	A	ACTACAGTGACAAGGCTAACTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	7717219	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.866:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr11	7720159	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	7720426	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	7721743	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr11	7723171	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr11	7723378	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:2,4,0,5
chr11	7723683	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,17:0,6:0,0,19,4
chr11	7847523	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr11	7960045	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	7960184	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:15,1:9,1:15,9,1,1
chr11	7961005	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:10,13,1,1
chr11	7961146	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	8013821	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	8061100	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=157,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr11	8061351	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,31;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:8061351_G_T:8061351:0,1,0,1
chr11	8061353	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:8061351_G_T:8061351:0,1,0,1
chr11	8111540	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:5,0,6,1
chr11	8115762	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,5,10
chr11	8117228	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,4,29
chr11	8118185	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0|1:8118185_C_G:8118185:0,0,5,3
chr11	8118200	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0|1:8118185_C_G:8118185:0,0,6,4
chr11	8119063	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,1,12
chr11	8122234	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	8123005	.	CTCTG	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=87,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTG;STR;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:10,5:6,7:9,7,5,7
chr11	8132728	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr11	8284838	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	8284981	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	8284995	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	8434972	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,4:0,0:5,0,4,0
chr11	8435077	.	CA	TC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.535:26:10,7:2,4:9,3,10,4
chr11	8494843	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:0,1:9,1:0,10,0,3
chr11	8496516	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr11	8641501	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	8642207	.	A	ATGCCTGCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:8642207_A_ATGCCTGCT:8642207:0,4,0,1
chr11	8642208	.	A	ATAACCAGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:8642207_A_ATGCCTGCT:8642207:0,4,0,1
chr11	8642218	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	8644530	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	8660223	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:2,9:8,5:6,4,8,7
chr11	8661751	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=72,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:4,1:0,3:2,2,3,1
chr11	8662090	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr11	8664454	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr11	8664537	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=132,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:1,1:10,0:0|1:8664537_T_G:8664537:9,2,0,2
chr11	8664541	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=132,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.195:13:1,1:9,0:0|1:8664537_T_G:8664537:9,2,0,2
chr11	8664742	.	T	TTGTCTGGGATCTTTTTGAGACTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=268,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	8669657	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0|1:8669657_G_C:8669657:1,3,1,1
chr11	8669659	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=139,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0|1:8669657_G_C:8669657:1,3,1,1
chr11	8670172	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	8719111	.	C	CTTAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=108,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:8,0:7,1:0|1:8719111_C_CTTAA:8719111:9,8,1,1
chr11	8719113	.	T	TAAAATG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=108,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:9,0:6,2:0|1:8719111_C_CTTAA:8719111:9,8,1,1
chr11	8720598	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:8720598_C_CA:8720598:1,3,0,1
chr11	8720600	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:8720598_C_CA:8720598:1,3,0,1
chr11	8724345	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=216,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr11	8734112	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,97;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:10,6,2,0
chr11	8734310	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:8734310_G_GAA:8734310:0,1,0,1
chr11	8734311	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:8734310_G_GAA:8734310:0,1,0,1
chr11	8735662	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	8934101	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr11	8938787	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,22:0,8:0,0,24,6
chr11	8946950	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	8970083	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr11	8977691	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:8977691_C_G:8977691:0,0,4,1
chr11	8977707	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:8977691_C_G:8977691:0,0,5,2
chr11	8977902	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=103,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	9005036	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=123.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,13:0,23:0,0,20,16
chr11	9051385	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,19,0
chr11	9072140	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,6:0,1:0,0,8,0
chr11	9081926	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr11	9096189	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr11	9100950	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:8,0:9,2:0|1:9100950_A_C:9100950:8,10,1,1
chr11	9100955	.	C	CACTTT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:10,2:0|1:9100950_A_C:9100950:9,13,1,1
chr11	9100958	.	A	AAC	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:0|1:9100950_A_C:9100950:9,13,1,1
chr11	9100961	.	T	TTTCCACCAA	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=141,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:0|1:9100950_A_C:9100950:8,12,1,1
chr11	9167399	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr11	9171775	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,4:4,3:3,6,1,7
chr11	9173996	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,68;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:8,1:4,14,1,1
chr11	9192380	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=143,107;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9192380_A_T:9192380:1,0,0,1
chr11	9192381	.	A	ACACACATGTACCTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=143,107;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9192380_A_T:9192380:1,0,0,1
chr11	9199650	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:8,7:10,6:13,5,9,4
chr11	9305177	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,3:1,2:0,5,0,5
chr11	9308133	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=121,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,2:8,0:6,9,1,1
chr11	9309405	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr11	9310169	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:0,5,0,8
chr11	9316937	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,8:0,0,4,13
chr11	9406400	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:7,0:7,2:0,16,0,3
chr11	9450790	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:0|1:9450790_G_A:9450790:0,17,1,1
chr11	9450795	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=165,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:5,2:0|1:9450790_G_A:9450790:0,15,1,1
chr11	9450800	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=167,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:9450790_G_A:9450790:0,14,1,1
chr11	9457722	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr11	9459367	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,178;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,2:13,0:17,11,2,0
chr11	9459592	.	GTTTTTTTTTTTTTTT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=19,34;MFRL=171,263;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=32,17;RU=T;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:0,2:1,0:2,3,2,1
chr11	9459655	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=138,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,0:14,2:15,13,0,2
chr11	9522567	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,1:4,6:8,0,7,0
chr11	9715628	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr11	9734945	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr11	9735192	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=76.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,28:0.460:61:15,12:18,16:12,21,14,14
chr11	9746137	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr11	9746201	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,7:0,0,18,1
chr11	9749552	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=51.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0|1:9749552_CT_C:9749552:0,0,11,1
chr11	9749554	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0|1:9749552_CT_C:9749552:0,0,11,1
chr11	9751051	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,19;MFRL=176,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.291:11:4,0:4,1:0,8,0,3
chr11	9751089	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=178,163;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,7:1,2:0,6,0,9
chr11	9759713	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,2:6,3:9,0,3,2
chr11	9759918	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	9801925	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=98,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:1,1,3,0
chr11	9802952	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	9805929	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,103;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,2:6,1:14,4,1,2
chr11	9806914	.	T	TACTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=ACTG;STR;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:1,3:3,0:0,4,0,4
chr11	9812236	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=122.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,19:0,0,2,33
chr11	9834356	.	A	ACTCTGTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=246,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	9853777	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr11	9861009	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr11	9875353	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	9917620	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	10014090	.	T	TG	.	.	DP=77;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,2:0.040:73:38,0:29,2:0|1:10014090_T_TG:10014090:33,38,1,1
chr11	10014091	.	C	A	.	.	DP=76;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,3:0.040:74:39,1:29,2:0|1:10014090_T_TG:10014090:33,38,1,2
chr11	10014100	.	A	T	.	.	DP=71;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,2:0.041:71:36,0:29,2:0|1:10014090_T_TG:10014090:28,41,1,1
chr11	10014102	.	G	T	.	.	DP=71;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,2:0.041:71:36,0:24,2:0|1:10014090_T_TG:10014090:28,41,1,1
chr11	10014109	.	TG	AA	.	.	DP=65;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:34,0:23,2:0|1:10014090_T_TG:10014090:23,38,1,1
chr11	10024239	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,73;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:9,3:17,0:10,17,0,3
chr11	10215598	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,4:5,1:0,5,0,5
chr11	10514910	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:3,2:9,0:8,5,2,0
chr11	10518289	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr11	10522983	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr11	10526060	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr11	10601931	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:5,7:5,3:10,1,9,1
chr11	10603582	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,2:2,1:1,2,0,4
chr11	10631247	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.636:30:4,8:5,11:9,2,16,3
chr11	10645289	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,1,1
chr11	10649161	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr11	10650329	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:4,6:3,8:3,4,8,6
chr11	10791983	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:1,4,2,4
chr11	10795803	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	10797276	.	CTTTCTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTCTT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	10820663	.	TAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.922:10:0,3:0,4:1,0,2,7
chr11	10823576	.	C	CACACTCCTAAAATAGTTTCATGTTTTAATAGCAAATGAAATCACATATATTGCAGAATTTAACATTTGTTGCCTAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=101,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=61.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.938:16:0,1:0,0:2,0,12,2
chr11	10823815	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,13:0,15:0,0,20,8
chr11	10824540	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr11	10825093	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.535:28:8,9:5,6:6,7,6,9
chr11	10828490	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.893:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr11	11292635	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:4,1,2,0
chr11	11292859	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=135,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:1,2:4,3:0|1:11292859_G_T:11292859:2,3,2,4
chr11	11292864	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=135,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:1,2:4,5:0|1:11292859_G_T:11292859:2,3,2,5
chr11	11314538	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.281:16:6,1:4,3:9,3,3,1
chr11	11348794	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr11	11348828	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr11	11354393	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	11398698	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr11	11470510	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	11905993	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,25:0.419:60:14,13:21,12:25,10,18,7
chr11	11944265	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.424:38:10,6:12,10:18,4,14,2
chr11	11969414	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr11	11969635	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.163:35:16,4:13,1:4,26,1,4
chr11	11969971	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,25:0.616:40:7,14:8,9:15,0,25,0
chr11	11972054	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=212,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr11	11976361	.	CTGTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=140,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:3,0:8,1,2,0
chr11	11977573	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.525:42:7,14:12,8:16,4,18,4
chr11	11989899	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	12029887	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	12234704	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr11	12243380	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	12265688	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=117,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.427:31:6,7:11,6:4,14,1,12
chr11	12277293	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,0:15,3:7,19,0,3
chr11	12279991	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:5,2,2,1
chr11	12284163	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12284163_CAG_C:12284163:0,1,0,1
chr11	12284166	.	T	TTTTCTCCTCTTCATCATCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12284163_CAG_C:12284163:0,1,0,1
chr11	12313887	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,7:0,0,2,11
chr11	12315891	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,7,2
chr11	12316368	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12316368_C_T:12316368:0,0,0,1
chr11	12316374	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12316368_C_T:12316368:0,0,0,1
chr11	12316377	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12316368_C_T:12316368:0,0,0,1
chr11	12316380	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12316368_C_T:12316368:0,0,0,1
chr11	12345459	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr11	12379792	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	12380053	.	T	TAATTTTTCTATTTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=257,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.475:2:0,0:1,1:0|1:12380053_T_TAATTTTTCTATTTTTA:12380053:0,1,0,1
chr11	12380054	.	G	GTAGAGGTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=257,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12380053_T_TAATTTTTCTATTTTTA:12380053:0,1,0,1
chr11	12495623	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	12526066	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:1,6,0,2
chr11	12530111	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,11;MFRL=112,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,0:2,6,2,0
chr11	12530118	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=119,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,0:3,0:2,7,2,0
chr11	12534808	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,7:0,0,7,5
chr11	12535485	.	CACAGGCTCCTGCACTA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=194,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,3,2
chr11	12903443	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,2:5,4:4,8,2,4
chr11	12903622	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr11	12946497	.	T	TATTTTCTTGGTAAGTGGGC	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:17,4:12,0:13,18,2,2
chr11	12951623	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr11	12951926	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr11	13393844	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:12,8,1,1
chr11	13398129	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	13399791	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,6:2,2:4,0,8,0
chr11	13402850	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:13402850_T_A:13402850:0,3,0,1
chr11	13402853	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:13402850_T_A:13402850:0,3,0,1
chr11	13427489	.	G	GAGCTGGGAGGACAATAAATGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=219,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	13514263	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,6:5,1:8,2,4,3
chr11	13514417	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=177,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.607:16:2,4:4,5:1,5,1,9
chr11	13514505	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	13716530	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=129,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.675:32:3,7:7,12:1,9,1,21
chr11	13729639	.	GA	AT	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=34,29;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:1,1,0,3
chr11	13729704	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=181,165;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr11	13729706	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=181,184;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:2,0:2,1:0|1:13729706_CAA_C:13729706:0,4,0,1
chr11	13729707	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=191,146;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr11	13729711	.	GCAGCCAGGCC	G,CCAGCCAGGCC	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,33,32;MFRL=191,184,131;MMQ=60,40,40;MPOS=-2147483648,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.40,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.300,0.250:4:1,0,0:1,1,1:0,2,0,2
chr11	13729717	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,26;MFRL=191,131;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:13729717_A_T:13729717:0,2,0,1
chr11	13729719	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=191,131;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:13729717_A_T:13729717:0,2,0,1
chr11	13729723	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=185,184;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:13729706_CAA_C:13729706:0,3,0,1
chr11	13729727	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,50;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	13733401	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.523:46:12,11:9,13:9,13,11,13
chr11	13736186	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.529:17:5,4:3,5:6,2,6,3
chr11	13984720	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,5:3,4:0,7,0,10
chr11	13984749	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr11	14004410	.	TC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,72;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,0:11,4:14,7,1,3
chr11	14101493	.	G	GC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=73.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0,0,15,10
chr11	14278049	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr11	14315915	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,3:7,4:13,0,7,0
chr11	14315918	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=193,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.445:21:6,1:6,7:12,0,9,0
chr11	14316128	.	T	TA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.154:28:18,0:6,3:2,22,0,4
chr11	14316287	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:8,5:3,5:10,1,11,0
chr11	14317451	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:14317451_A_C:14317451:0,3,0,1
chr11	14317458	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:14317451_A_C:14317451:0,3,0,1
chr11	14480292	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	14480309	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=161,217;MMQ=22,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:14480309_CT_C:14480309:1,0,0,1
chr11	14480319	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=194,217;MMQ=41,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:14480309_CT_C:14480309:1,1,0,1
chr11	14486615	.	A	ACCTTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=202,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0|1:14486615_A_ACCTTCC:14486615:0,2,0,1
chr11	14486619	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=201,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:14486615_A_ACCTTCC:14486615:0,3,0,1
chr11	14486621	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=201,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:14486615_A_ACCTTCC:14486615:0,3,0,1
chr11	14491205	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=106,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:14491205_A_G:14491205:1,1,0,1
chr11	14491210	.	A	ACCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=106,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:14491205_A_G:14491205:1,1,0,1
chr11	14497269	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,13,1
chr11	14501296	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,11:0,0,0,18
chr11	14502541	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=147,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:11,0:0|1:14502541_C_G:14502541:9,15,0,2
chr11	14502544	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:12,0:0|1:14502541_C_G:14502541:10,15,0,2
chr11	14502545	.	A	AAAATCTCCCTG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:12,0:0|1:14502541_C_G:14502541:10,15,0,2
chr11	14504774	.	CCACA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=CA;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	14512060	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr11	14516003	.	TT	AA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=209,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:0,7:2,2:0,2,2,7
chr11	14516004	.	T	TAAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr11	14520561	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,16;MFRL=219,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,0:0|1:14520561_C_A:14520561:0,1,0,1
chr11	14520578	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=219,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14520561_C_A:14520561:0,1,0,1
chr11	14532338	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,19:0,7:0,0,26,0
chr11	14535078	.	CAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:2,2:1,0:3,0,2,1
chr11	14539315	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,28,30,29;MFRL=151,162,150,180;MMQ=60,60,60,60;MPOS=10,11,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=A;STR;TLOD=6.63,11.41,24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,4,7,13:0.152,0.246,0.495:27:1,0,4,7:1,4,3,4:3,0,12,12
chr11	14539336	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.110:46:17,0:18,1:24,17,5,0
chr11	14539341	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.116:44:14,0:16,1:23,16,5,0
chr11	14540671	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,0,25
chr11	14852490	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,0,22
chr11	14899895	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=190,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr11	15134137	.	AGTGTGT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,221;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=GT;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.786:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	15170644	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr11	15170807	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=179,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr11	15198772	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=67,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:1,3:3,0:1,4,0,4
chr11	15257273	.	C	CTTGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.477:2:1,0:0,1:0|1:15257273_C_CTTGT:15257273:0,1,0,1
chr11	15257277	.	G	GTACCAGTACCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:1,0:0,1:0|1:15257273_C_CTTGT:15257273:0,1,0,1
chr11	15257280	.	C	CTATTTTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15257273_C_CTTGT:15257273:0,1,0,1
chr11	16117684	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,9;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.404:16:3,0:3,0:4,5,0,7
chr11	16133557	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	16760244	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:7,0,5,1
chr11	16811391	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=110,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:10,3:15,0:18,9,2,1
chr11	16837874	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=173,66;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	16837901	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=163,131;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:16837901_G_GA:16837901:0,3,0,1
chr11	16837902	.	C	CACATCTCCCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=163,131;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:16837901_G_GA:16837901:0,3,0,1
chr11	16837906	.	A	ACCCACTGACACAGAACAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=163,131;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:16837901_G_GA:16837901:0,3,0,1
chr11	17035487	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:1,0,2,3
chr11	17036012	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=172,171;MMQ=40,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr11	17111197	.	AGT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr11	17113483	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr11	17126670	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,17,0
chr11	17134206	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.190:30:4,0:9,0:8,17,0,5
chr11	17153459	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:14,0:13,2:24,3,1,1
chr11	17156715	.	GC	AT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,129;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:11,0:16,4:9,18,0,4
chr11	17167170	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:5,2:8,7:11,2,8,1
chr11	17190127	.	TAAAAAC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAAAC;STR;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:2,2:5,3:8,0,5,0
chr11	17408404	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr11	17409937	.	AC	GG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=215,151;MMQ=56,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr11	17415190	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr11	17417504	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr11	17418809	.	G	GAGAAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr11	17436865	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=101,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:1,4,3,5
chr11	17436936	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr11	17436951	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr11	17438416	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,1:0,7,4,0
chr11	17438422	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=110,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:4,2:1,7,4,0
chr11	17438426	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=110,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:5,0:1,7,4,0
chr11	17452580	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=207,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr11	17491571	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=109,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr11	17515833	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=116,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.547:22:4,6:5,6:7,3,8,4
chr11	17515970	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=106,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:2,7,0,3
chr11	17516029	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr11	17518348	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,37926978;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,2:11,0:2,18,0,2
chr11	17519697	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=125,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:6,3:1,4:3,4,6,1
chr11	17519864	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	17523474	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.467:17:3,3:6,4:5,4,3,5
chr11	17523584	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,0:5,1:0|1:17523584_C_A:17523584:4,11,1,1
chr11	17523586	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=122,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:5,2:0|1:17523584_C_A:17523584:4,12,1,1
chr11	17523596	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=122,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:4,2:0|1:17523584_C_A:17523584:2,12,1,1
chr11	17523598	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=122,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:17523584_C_A:17523584:2,10,1,1
chr11	17531146	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,1:2,2:1,3,1,2
chr11	17532102	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:0,1:4,3:0,4,0,5
chr11	17533635	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:1,2:0,7,1,6
chr11	17537918	.	TC	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17537918_TC_GA:17537918:0,1,0,1
chr11	17537922	.	A	ACTTGGAGACACGGTTGGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17537918_TC_GA:17537918:0,1,0,1
chr11	17542583	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0|1:17542583_C_T:17542583:0,4,0,3
chr11	17542586	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0|1:17542583_C_T:17542583:0,4,0,3
chr11	17545091	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:1,1:3,5:1,3,2,5
chr11	17546079	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:20,2:14,0:21,13,0,2
chr11	17548015	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:0,1,1,4
chr11	17548239	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,3:2,3:5,1,4,2
chr11	17548401	.	CG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:4,3:5,4,2,3
chr11	17548507	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,3:3,3:3,2,2,4
chr11	17548661	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=165,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:0,0:5,1:0|1:17548661_C_T:17548661:0,5,0,1
chr11	17548663	.	GC	TT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=158,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:0,0:2,1:0|1:17548661_C_T:17548661:0,4,0,1
chr11	17548692	.	CATGGAGTACTGCCCTGCTCCCCCGCCCTCCCTCCCTCCCACCGTT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.804:6:0,2:0,2:0,1,2,3
chr11	17553105	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr11	17554914	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:17554914_G_C:17554914:0,0,0,2
chr11	17554916	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:17554914_G_C:17554914:0,0,0,2
chr11	17554926	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17554926_G_GAA:17554926:0,1,0,1
chr11	17554928	.	C	CTGAGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17554926_G_GAA:17554926:0,1,0,1
chr11	17569885	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	17574567	.	GT	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=131,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:17574567_GT_CA:17574567:2,0,1,0
chr11	17574571	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=131,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:17574567_GT_CA:17574567:2,0,1,0
chr11	17574575	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=141,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:17574567_GT_CA:17574567:3,0,1,0
chr11	17574588	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr11	17578593	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	17578694	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=104,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:3,2:2,0:4,2,2,0
chr11	17578774	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,2:2,7:4,5,7,2
chr11	17580050	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:1,3,2,1
chr11	17591961	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=110,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,1,4
chr11	17598187	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:0|1:17598187_G_A:17598187:0,2,1,2
chr11	17598191	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,3:0,0:0|1:17598187_G_A:17598187:0,2,1,2
chr11	17612972	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=127,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,2:2,7:5,2,6,3
chr11	17615556	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=205,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:1,4:0,1:2,0,5,0
chr11	17627538	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=180,25860729;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:6,1:3,7,1,1
chr11	17627603	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=115,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.360:4:3,1:0,0:0|1:17627603_T_C:17627603:3,0,1,0
chr11	17627613	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=126,80;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.399:6:3,2:1,0:0|1:17627603_T_C:17627603:4,0,2,0
chr11	17632237	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0|1:17632237_A_T:17632237:1,2,0,1
chr11	17632239	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:17632237_A_T:17632237:1,2,0,1
chr11	17632241	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:17632237_A_T:17632237:1,2,0,1
chr11	17656442	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=121,50;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:3,2:0|1:17656442_A_C:17656442:4,9,1,1
chr11	17656449	.	C	CTAGGTTCCTTGGAT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=124,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:17656442_A_C:17656442:5,11,1,1
chr11	17656456	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=121,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:5,1:0|1:17656442_A_C:17656442:5,10,1,1
chr11	17663579	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,0:1,1:1,1,0,2
chr11	17742611	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr11	17981047	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,4:3,6:6,2,5,5
chr11	18017327	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:9,1,0,2
chr11	18017517	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,1,2
chr11	18029704	.	C	CAGCATTTTCCTCTTCTTATAAAAACA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.311:6:3,1:0,0:0,5,0,1
chr11	18044304	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	18047255	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,4:1,3:4,3,2,5
chr11	18054777	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.449:36:7,6:12,10:19,1,14,2
chr11	18057775	.	A	ACAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	18105302	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:4,0:4,4:0,8,1,4
chr11	18111692	.	A	AT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.591:32:9,13:4,6:9,4,15,4
chr11	18127558	.	C	CCGG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CGG;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr11	18159254	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,96;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,3:5,2:7,5,1,4
chr11	18267135	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=204,175;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr11	18267373	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=170,174;MMQ=45,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,7:4,4:11,0,10,1
chr11	18267431	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=146,132;MMQ=27,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,10:0.121:89:36,4:34,6:0|1:18267431_C_T:18267431:66,13,9,1
chr11	18267434	.	AAC	GGT	.	.	DP=96;ECNT=6;MBQ=29,35;MFRL=146,119;MMQ=27,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,11:0.125:94:38,4:37,6:0|1:18267431_C_T:18267431:70,13,9,2
chr11	18267463	.	A	G	.	.	DP=138;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=146,119;MMQ=27,33;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:119,13:0.100:132:58,6:55,6:0|1:18267463_A_G:18267463:79,40,10,3
chr11	18267471	.	A	G	.	.	DP=130;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=130,155;MMQ=27,27;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,35:0.289:121:39,20:45,13:51,35,20,15
chr11	18267478	.	G	A	.	.	DP=118;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=138,119;MMQ=27,33;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,11:0.100:117:54,3:46,3:0|1:18267463_A_G:18267463:57,49,7,4
chr11	18267651	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=212,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:8,5:2,6:0,10,1,11
chr11	18288350	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,176;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr11	18308088	.	C	CAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=A;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr11	18312953	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.435:37:11,6:9,9:14,7,11,5
chr11	18314429	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.492:23:5,8:4,3:9,3,9,2
chr11	18314579	.	C	CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=T;STR;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,6:3,1:0,5,0,7
chr11	18317699	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:0,3,0,8
chr11	18333059	.	T	TTA	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=161,144;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.211:43:17,4:15,4:1,33,0,9
chr11	18333060	.	T	TA	.	.	DP=83;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.233:44:16,4:12,4:1,33,1,9
chr11	18333061	.	T	A	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,11:0.212:44:17,2:15,2:2,31,0,11
chr11	18379446	.	CA	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.238:35:13,3:13,5:19,8,7,1
chr11	18379629	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:6,6:10,12:3,13,4,14
chr11	18424590	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,1,3
chr11	18428637	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,6:0,8:1,0,14,0
chr11	18456235	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr11	18487454	.	TAG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18487454_TAG_T:18487454:0,1,0,1
chr11	18487457	.	G	GTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18487454_TAG_T:18487454:0,1,0,1
chr11	18503159	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:5,7:3,3:7,2,7,3
chr11	18524206	.	A	AATATGTGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18524206_A_AATATGTGT:18524206:0,1,0,1
chr11	18524209	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18524206_A_AATATGTGT:18524206:0,1,0,1
chr11	18524210	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18524206_A_AATATGTGT:18524206:0,1,0,1
chr11	18524211	.	G	GAACT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18524206_A_AATATGTGT:18524206:0,1,0,1
chr11	18531028	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,3:2,2:7,0,5,0
chr11	18536215	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,5:2,4:6,1,6,3
chr11	18537800	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	18541207	.	CTGGA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,2:4,3:0,10,1,5
chr11	18548195	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	18579974	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	18586344	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr11	18591986	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:18591986_CT_C:18591986:0,4,0,1
chr11	18591989	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:18591986_CT_C:18591986:0,4,0,1
chr11	18600394	.	T	TTGGAATGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.218:11:5,2:3,0:0,9,1,1
chr11	18610250	.	TCTTCCGGACTTG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18610250_TCTTCCGGACTTG_T:18610250:0,0,0,1
chr11	18610268	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18610250_TCTTCCGGACTTG_T:18610250:0,0,0,1
chr11	18610271	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18610250_TCTTCCGGACTTG_T:18610250:0,0,0,1
chr11	18610273	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18610250_TCTTCCGGACTTG_T:18610250:0,0,0,1
chr11	18631527	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,9:2,2:1,5,4,8
chr11	18728826	.	C	CTTTAACCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=185,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	18729597	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,1,3
chr11	18730895	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	18732119	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr11	18732426	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,6:0,0,1,8
chr11	18733579	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,13,0
chr11	18735396	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	18735753	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr11	18736234	.	A	ACCTGGGGATGCATCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=184,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:18736234_A_ACCTGGGGATGCATCT:18736234:0,4,0,1
chr11	18736236	.	G	GAGTGTGAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=184,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:18736234_A_ACCTGGGGATGCATCT:18736234:0,4,0,1
chr11	18736247	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	18736269	.	G	GCTTGGAAGGT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	18736942	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	18738603	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	18743286	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr11	18745744	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,2:15,0:10,16,0,2
chr11	18751520	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=203,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:18751520_T_TGC:18751520:0,1,0,1
chr11	18751523	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=203,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18751520_T_TGC:18751520:0,1,0,1
chr11	18764113	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	18765030	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=84,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr11	18793360	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	19169259	.	AT	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=157,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,0:8,3:0,13,0,3
chr11	19197365	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr11	19252427	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=202,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr11	19253694	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,145;MMQ=58,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,4:5,0:10,0,4,0
chr11	19253704	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,3:4,0:11,0,3,0
chr11	19256250	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr11	19256605	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:6,8:4,3:3,7,4,7
chr11	19259115	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=218,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,0:1,2:0,3,0,3
chr11	19261797	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,1:7,6:0,11,0,7
chr11	19372616	.	G	GGA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=99.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,2,21
chr11	19955322	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.137:24:8,2:12,0:12,9,2,1
chr11	19955755	.	T	TGGGATGGTTGTATTG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:5,3:8,0:0|1:19955755_T_TGGGATGGTTGTATTG:19955755:2,12,1,2
chr11	19955756	.	C	CTGCTGG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=127,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:5,2:9,0:0|1:19955755_T_TGGGATGGTTGTATTG:19955755:2,12,1,2
chr11	19955757	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=127,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:4,1:9,0:0|1:19955755_T_TGGGATGGTTGTATTG:19955755:2,12,1,2
chr11	19970507	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:6,5:9,5:8,7,5,5
chr11	20070225	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr11	20072722	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr11	20072779	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr11	20072957	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.337:12:3,0:3,1:1,7,0,4
chr11	20072970	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:0,0:0,1:0,5,0,3
chr11	20072975	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:0,0:1,1:0,5,0,3
chr11	20075573	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr11	20101508	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr11	20101704	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,15,8
chr11	20101744	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,8,14
chr11	20101769	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=152,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,3:3,6:2,5,1,8
chr11	20112373	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	20112417	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,3,2
chr11	20112649	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	20122392	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	20127046	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr11	20178551	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr11	20181539	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,1:15,1:14,17,0,2
chr11	20398034	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr11	20403825	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,6:0,6:0,1,2,10
chr11	20403904	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	20404506	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,5:1,4:1,0,10,1
chr11	20404757	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr11	20409169	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr11	20411199	.	TAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	20411418	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:20411418_G_C:20411418:0,0,0,13
chr11	20411424	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0|1:20411418_G_C:20411418:0,0,0,10
chr11	20411450	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:20411450_C_CT:20411450:0,1,0,1
chr11	20411452	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:20411450_C_CT:20411450:0,1,0,1
chr11	20411455	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:20411450_C_CT:20411450:0,1,0,1
chr11	20419028	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	20429454	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=130.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,24:0,13:0,0,31,7
chr11	20473655	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=79.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0,0,18,4
chr11	20515555	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=191.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,26:0,30:0,0,14,42
chr11	20648418	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr11	20649448	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr11	20673867	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,8:0,10:0,0,12,8
chr11	20676455	.	C	CATTTTATATCACCAACG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:7,1:8,1:2,13,2,1
chr11	20699394	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	20940775	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=169,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:8,7:10,3:18,0,7,3
chr11	20959429	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,6:1,3:1,5,0,9
chr11	20959482	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr11	20968852	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:2,1:8,4:9,1,5,0
chr11	20981894	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	20981938	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,34;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr11	21135086	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:6,2,4,0
chr11	21392487	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,3:6,2:3,4,1,4
chr11	21581665	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=113,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr11	21581790	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,1:6,2:8,7,1,2
chr11	21592507	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:0,5,2,3
chr11	21592577	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr11	21596604	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=155,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:7,5:2,9:3,6,4,10
chr11	21596638	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=187,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:4,4:3,5:0,7,2,7
chr11	21596669	.	T	TGTTTGTTTGTTTTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=142,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	22239661	.	T	TCTCACACACACACACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.814:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	22249035	.	C	CCAACATTTACCTGGCAATTTGG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=160,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:3,0:4,2,1,1
chr11	22261326	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=372,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22261326_C_CAG:22261326:0,1,0,1
chr11	22261327	.	T	TGGTGTAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=372,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22261326_C_CAG:22261326:0,1,0,1
chr11	22292053	.	TACTTCTTTCTG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr11	22297606	.	ATT	A,AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31,30;MFRL=0,197,146;MMQ=60,60,60;MPOS=14,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.29,35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,14:0.166,0.787:17:0,2,8:0,1,6:0,0,17,0
chr11	22363396	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr11	22364744	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=135,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr11	22364758	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=249,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr11	22387170	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:7,0:7,2:4,10,1,1
chr11	22696609	.	T	TAATTTGGTCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0|1:22696609_T_TAATTTGGTCC:22696609:0,1,0,1
chr11	22696615	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:22696609_T_TAATTTGGTCC:22696609:0,1,0,1
chr11	22707331	.	C	CTTCTTTGTTTGGGCTCTTTTCAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,2:7,0:2,10,0,2
chr11	22747745	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	22851409	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr11	24750842	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:1,5,0,3
chr11	24759664	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=182,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr11	24784922	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:4,7:7,5:0,11,1,12
chr11	24998240	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=1165357,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.471:6:2,1:1,0:1,2,0,3
chr11	25099056	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=202,200;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:0,2,0,6
chr11	25100229	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:2,3:0,4:0,2,1,7
chr11	26353951	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:2,2:0,3,2,4
chr11	26547348	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0|1:26547348_G_A:26547348:0,0,0,13
chr11	26547353	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,6:0|1:26547348_G_A:26547348:0,0,0,13
chr11	26552679	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	26552696	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:26552696_T_A:26552696:0,0,2,0
chr11	26552702	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:26552696_T_A:26552696:0,0,5,0
chr11	26558841	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=231,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr11	26563464	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,12,2
chr11	26563652	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr11	26574740	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	26574782	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=193,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.814:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr11	26581203	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr11	26584625	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr11	26586673	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,63;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,2:9,0:20,3,0,2
chr11	26586801	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,10:0,0,12,11
chr11	26587133	.	T	C	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=40,29;MFRL=114,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=285.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,89:0.957:92:0,42:3,44:3,0,48,41
chr11	26621334	.	TATTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26621334_TATTTG_T:26621334:0,1,0,1
chr11	26621342	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26621334_TATTTG_T:26621334:0,1,0,1
chr11	26621344	.	GTATTT	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26621334_TATTTG_T:26621334:0,1,0,1
chr11	26621352	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26621334_TATTTG_T:26621334:0,1,0,1
chr11	26621359	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26621334_TATTTG_T:26621334:0,1,0,1
chr11	26621361	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26621334_TATTTG_T:26621334:0,1,0,1
chr11	26645894	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	26669167	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr11	26692594	.	T	TTGTGTGTGTGTG,TTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,33,33;MFRL=114,147,114;MMQ=60,40,36;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,14,15;RU=TG;STR;TLOD=5.03,4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,2:0.262,0.256:14:1,1,2:8,1,0:6,4,4,0
chr11	26692631	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=80,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.471:47:7,7:16,14:11,14,7,15
chr11	26695152	.	C	CCAGATGCCAGTGGCAAGAGGCACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	27362881	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:6,7:8,2:14,0,9,0
chr11	27401743	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	27401879	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:17,0:7,2:8,16,1,1
chr11	27401940	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	27412535	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	27412782	.	CTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.841:10:0,3:1,5:0,1,1,8
chr11	27414087	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=146,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:3,1:6,0:0|1:27414087_G_T:27414087:2,11,2,0
chr11	27414089	.	AG	TC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=153,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,0:8,0:0|1:27414087_G_T:27414087:2,12,2,0
chr11	27523164	.	T	TGAAGTTAAAATTTCAGGC	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=92,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAGTTAAAATTTCAGGC;STR;TLOD=109.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,33:0.946:34:0,14:1,7:0|1:27523164_T_TGAAGTTAAAATTTCAGGC:27523164:0,1,5,28
chr11	27523186	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,11:0,12:0|1:27523164_T_TGAAGTTAAAATTTCAGGC:27523164:0,0,4,25
chr11	27681174	.	C	CTG	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.508:47:8,13:14,11:7,16,4,20
chr11	27681176	.	C	G,CTGTGTG	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=0,33,34;MFRL=0,154,103;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=74.64,11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,25,7:0.517,0.441:32:0,13,2:0,10,4:0,0,6,26
chr11	27681197	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:5,0:6,3:0|1:27681197_C_T:27681197:1,10,0,3
chr11	27681199	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,0:6,3:0|1:27681197_C_T:27681197:1,10,0,3
chr11	27681201	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:4,0:5,1:0|1:27681197_C_T:27681197:1,10,0,3
chr11	28045367	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:15,6:7,5:8,14,4,7
chr11	28045430	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.938:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr11	28104348	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,6:2,0,9,0
chr11	30253641	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr11	30352473	.	C	CAG	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=238.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,31:0,22:0,0,47,8
chr11	30358032	.	CCT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=198,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.408:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr11	30601733	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.563:26:6,10:3,5:11,0,14,1
chr11	30902893	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,2:0,10:0,0,1,11
chr11	30904974	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,2:6,4:8,4,2,4
chr11	30905128	.	G	GGGAATGTGTAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=124,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	30922081	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr11	30928081	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.274:19:10,1:3,3:12,2,4,1
chr11	30928316	.	T	TATATCTGTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	30930393	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr11	31327766	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:4,1:5,10:7,2,10,2
chr11	31447908	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.947:14:0,10:0,4:0,0,7,7
chr11	31447933	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.915:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chr11	31455205	.	G	GCTCTGTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	31484817	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.349:41:12,5:15,9:14,13,4,10
chr11	31648811	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	31653956	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,3,12
chr11	31785013	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,0:17,2:0|1:31785013_T_C:31785013:15,10,0,2
chr11	31785015	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,0:17,2:0|1:31785013_T_C:31785013:15,10,0,2
chr11	31811629	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.229:15:6,0:6,0:0|1:31811629_C_A:31811629:1,11,0,3
chr11	31811643	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,9;MFRL=135,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.686:8:1,1:1,1:0|1:31811629_C_A:31811629:0,2,0,6
chr11	31811645	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=135,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.694:8:1,2:0,4:0|1:31811629_C_A:31811629:0,2,0,6
chr11	31812215	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	31824460	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=166,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31824460_GA_G:31824460:0,1,0,1
chr11	31824464	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=166,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31824460_GA_G:31824460:0,1,0,1
chr11	32113057	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr11	32118925	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr11	32122003	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr11	32122020	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,11,3
chr11	32122268	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	32125855	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr11	32608473	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr11	32615352	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,3:0,0,10,0
chr11	32622213	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=200,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,4:7,4:10,1,5,3
chr11	32623419	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:9,3:7,12:6,10,2,13
chr11	32624405	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.525:44:13,16:7,7:10,11,7,16
chr11	32632689	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:10,4,2,0
chr11	32674627	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=119,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr11	32674844	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32674844_T_C:32674844:0,2,0,1
chr11	32674846	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32674844_T_C:32674844:0,2,0,1
chr11	32674855	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32674844_T_C:32674844:0,2,0,1
chr11	32674856	.	T	TAAATCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32674844_T_C:32674844:0,2,0,1
chr11	32697291	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=224,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr11	32949750	.	C	CCTTCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=209,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	32953222	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr11	32953694	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:12,1:4,3:7,9,1,3
chr11	32975333	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr11	32979705	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	33050100	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr11	33054562	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0,0,1,18
chr11	33054596	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr11	33054754	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	33054794	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr11	33055078	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr11	33065547	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	33078643	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,10,2
chr11	33079445	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,8:0,0:0,0,7,1
chr11	33079751	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	33080496	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,11:0,0,21,7
chr11	33090222	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,3:12,0:12,5,3,0
chr11	33106616	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,12,3
chr11	33106908	.	C	CTTTATAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	33113910	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,9:0,1:0,0,0,10
chr11	33117987	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:0,6,0,8
chr11	33118529	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,3:0,3:0,0,0,8
chr11	33124761	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,6:5,0:0,8,0,6
chr11	33307937	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,93,176;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.96,8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,5:0.444,0.485:10:0,3,0:0,1,3:0,0,7,3
chr11	33360886	.	AT	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=100.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,14:0,0,25,6
chr11	33362656	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,3:0.044:88:41,1:42,2:28,57,0,3
chr11	33362723	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,14:0,15:0,0,0,30
chr11	33368741	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.486:6:2,0:0,0:0|1:33368741_C_A:33368741:3,0,3,0
chr11	33368750	.	TC	AA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,14;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.383:8:3,0:1,0:0|1:33368741_C_A:33368741:5,0,3,0
chr11	33369360	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=160,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:15,1:13,1:17,12,0,2
chr11	33370884	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,0,13
chr11	33374613	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,1:4,2:14,1,3,0
chr11	33374626	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=17,19;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:2,0:1,0:11,1,3,0
chr11	33581537	.	GCCACATACTA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr11	33689549	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=180,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:9,9,1,1
chr11	33689658	.	G	GACTGTGGGAACCCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=151,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:4,7,1,1
chr11	33773161	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0,0,1,6
chr11	33773167	.	A	AATGATGTCATCTGTCAAGCAGCAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=157,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:2,0:2,2:0|1:33773167_A_AATGATGTCATCTGTCAAGCAGCAT:33773167:0,4,1,1
chr11	33773171	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=157,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:33773167_A_AATGATGTCATCTGTCAAGCAGCAT:33773167:0,4,0,1
chr11	34074240	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:8,6:11,12:0,19,0,18
chr11	34093349	.	AT	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=152.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,23:0,31:0,0,21,33
chr11	34101201	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:17,2:8,0:13,12,1,1
chr11	34107785	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=124.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,15:0,20:0,0,13,23
chr11	34140122	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34140122_G_A:34140122:0,1,0,1
chr11	34140123	.	G	GAAAGCTTCTTTTAATCAAAATCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34140122_G_A:34140122:0,1,0,1
chr11	34145499	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=128,168;MMQ=49,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:34145499_C_T:34145499:0,3,0,1
chr11	34145505	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=151,168;MMQ=49,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:34145499_C_T:34145499:0,4,0,1
chr11	34149199	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr11	34154641	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.926:24:1,10:0,12:0,1,11,12
chr11	34154766	.	GC	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr11	34158411	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr11	34158431	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr11	34160883	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,12;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.348:9:5,0:1,1:6,0,0,3
chr11	34176214	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	34188758	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=121,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.314:10:4,0:3,2:6,1,3,0
chr11	34188981	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.611:11:3,4:1,2:0|1:34188981_CA_TG:34188981:0,4,0,7
chr11	34188982	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,11:0.919:11:0,7:0,4:1|0:34188981_CA_TG:34188981:0,0,0,11
chr11	34189564	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0|1:34189564_A_G:34189564:0,0,1,5
chr11	34189572	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=158,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:34189564_A_G:34189564:1,2,0,1
chr11	34189574	.	C	CCAGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=158,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:34189564_A_G:34189564:1,2,0,1
chr11	34226041	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr11	34460472	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,16,0
chr11	34460541	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=132.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,14:0,26:0,0,24,17
chr11	34460711	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr11	34511701	.	C	CTCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:34511701_C_CTCAA:34511701:0,0,0,1
chr11	34511703	.	G	GTGAGGAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34511701_C_CTCAA:34511701:0,0,0,1
chr11	34514941	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr11	34527152	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=110,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr11	34680053	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr11	34904399	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=206.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,32:0,29:0,0,10,51
chr11	34905145	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr11	34909827	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=60.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,10:0,2:0|1:34909827_GA_G:34909827:0,0,13,1
chr11	34909833	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,12:0,2:0|1:34909827_GA_G:34909827:0,0,14,1
chr11	34909910	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=147,166;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:14,0:6,2:11,10,2,0
chr11	34909926	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,21:0,9:0,0,14,16
chr11	34910217	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	34910397	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,1,11
chr11	34910433	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr11	34911967	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr11	34912013	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,10,2
chr11	34916484	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,13,0
chr11	34916710	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr11	34937697	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr11	34937884	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=97.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,4,23
chr11	34937901	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,1,18
chr11	34937931	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr11	34938115	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	34953088	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.942:12:0,2:0,6:0,0,3,9
chr11	34978892	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,19,7
chr11	34979160	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:3,3:4,2:0,8,0,5
chr11	34982146	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0|1:34982146_T_G:34982146:0,0,1,19
chr11	34982148	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0|1:34982146_T_G:34982146:0,0,1,19
chr11	34988405	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,197;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:1,0:1,5,0,3
chr11	35198032	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	35198108	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:11,5:8,4:18,1,8,1
chr11	35201810	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:16,7:7,11:18,6,11,7
chr11	35218445	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,5:4,6:3,6,0,11
chr11	35222681	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:4,8:9,7:3,10,8,8
chr11	35223158	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr11	35223260	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=123,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:7,0:14,2:0|1:35223260_A_G:35223260:16,7,1,1
chr11	35223265	.	GAA	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=124,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,0:14,2:0|1:35223260_A_G:35223260:18,8,1,1
chr11	35223268	.	G	GACC	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=123,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:6,0:16,2:0|1:35223260_A_G:35223260:17,8,1,1
chr11	35223274	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=125,47;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:5,0:17,2:0|1:35223260_A_G:35223260:17,7,1,1
chr11	35244044	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0|1:35244044_G_C:35244044:0,0,0,16
chr11	35244058	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=171,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.472:13:3,1:3,5:0|1:35244044_G_C:35244044:0,7,0,6
chr11	35287000	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=120,119;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.402:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr11	35302523	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:3,15,0,2
chr11	35323200	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr11	35323214	.	A	AACCACTTATCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=166,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	35327825	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,2:2,4:0,4,1,5
chr11	35334032	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:5,3:2,5:0,7,1,8
chr11	35338893	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:2,1,5,1
chr11	35473416	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=142,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:14,1:3,1:13,4,2,0
chr11	35473551	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=232,165;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35473551_A_G:35473551:0,1,0,1
chr11	35473553	.	CT	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=165,232;MMQ=55,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:35473551_A_G:35473551:0,1,0,1
chr11	35473558	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=232,165;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35473551_A_G:35473551:0,1,0,1
chr11	35473560	.	A	AGGAGGCCCTCTCCTTCTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=232,165;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35473551_A_G:35473551:0,1,0,1
chr11	35515895	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=210,159;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35515895_G_GT:35515895:0,1,0,1
chr11	35515905	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	35515912	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=159,210;MMQ=48,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	35515918	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=210,159;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35515895_G_GT:35515895:0,1,0,1
chr11	35515920	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=210,159;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35515895_G_GT:35515895:0,1,0,1
chr11	35642247	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.321:10:2,3:4,0:4,3,2,1
chr11	35706780	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:5,9:6,4:11,0,11,2
chr11	36057626	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr11	36251046	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,326;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	36298555	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:4,1,4,2
chr11	36300148	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,1:8,1:7,10,0,2
chr11	36311014	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr11	36424988	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=127,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr11	36453506	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=126,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:5,0:2,7,1,2
chr11	36459091	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=179,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:0,0:2,3:0,3,1,2
chr11	36459130	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr11	36483818	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=13,26;MFRL=256,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:36483818_C_G:36483818:1,0,1,0
chr11	36483822	.	TT	GG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=17,17;MFRL=256,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:36483818_C_G:36483818:1,0,1,0
chr11	36483826	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=16,17;MFRL=256,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr11	36483829	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr11	36483832	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,17;MFRL=268,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,0:0|1:36483818_C_G:36483818:2,0,1,0
chr11	36514290	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=198,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr11	36518824	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,3:6,2:0,8,3,2
chr11	36601096	.	CT	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.270:32:10,4:13,5:12,11,6,3
chr11	43356931	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,4:0,12,1,8
chr11	43413157	.	TTTGCG	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGCG;STR;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.260:36:15,8:11,1:8,19,0,9
chr11	43413158	.	TTGCG	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=122,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,26:0.817:32:2,18:4,8:2,4,4,22
chr11	43413159	.	TGCG	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,23:0,11:0,0,7,28
chr11	43425527	.	AC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=188,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:10,2:2,4:9,3,6,0
chr11	43472630	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=206,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:43472630_A_T:43472630:3,0,1,1
chr11	43472652	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=206,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0|1:43472630_A_T:43472630:5,0,0,1
chr11	43472654	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=206,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0|1:43472630_A_T:43472630:5,0,0,1
chr11	43472895	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr11	43515304	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.535:26:9,6:3,7:5,7,8,6
chr11	43702581	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,1:2,6:0,10,0,7
chr11	43702615	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	43876435	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:2,5:5,4:0|1:43876435_A_G:43876435:0,7,1,8
chr11	43876467	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=194,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:43876435_A_G:43876435:0,4,0,1
chr11	43876813	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=187,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:1,3,0,4
chr11	43876829	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=208,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:3,2:0,0:0,3,0,3
chr11	43905440	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,3:2,6:6,0,9,0
chr11	43908330	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=81,115;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr11	43940566	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.813:6:1,0:0,5:0,1,2,3
chr11	43940602	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:3,2,1,2
chr11	43964898	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0,3,0,2
chr11	44071743	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,0:3,4:1,4,0,4
chr11	44089161	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr11	44097235	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=188,275;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:44097235_T_TC:44097235:0,1,0,1
chr11	44097236	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=188,275;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44097235_T_TC:44097235:0,1,0,1
chr11	44098985	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	44104701	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	44104885	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,6,22
chr11	44135894	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:44135894_T_A:44135894:0,4,0,1
chr11	44135898	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:44135894_T_A:44135894:0,4,0,1
chr11	44135900	.	AT	TG	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=31,32;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:44135894_T_A:44135894:0,4,0,1
chr11	44135905	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:44135894_T_A:44135894:0,4,0,1
chr11	44135906	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=30,29;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:44135894_T_A:44135894:0,4,0,1
chr11	44135918	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=29,34;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:44135918_G_T:44135918:0,2,0,1
chr11	44135920	.	G	GATTCTCCTATGATCAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=33,35;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:44135918_G_T:44135918:0,2,0,1
chr11	44135924	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:44135924_G_T:44135924:0,0,0,1
chr11	44135925	.	G	GTTAT	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44135924_G_T:44135924:0,0,0,1
chr11	44135926	.	C	CTTTA	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44135924_G_T:44135924:0,0,0,1
chr11	44146257	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:3,0,6,0
chr11	44219286	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=209,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr11	44286345	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:44286345_T_A:44286345:1,0,1,0
chr11	44286354	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:44286345_T_A:44286345:1,0,1,0
chr11	44286359	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:44286345_T_A:44286345:2,0,1,0
chr11	44286368	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:44286345_T_A:44286345:2,0,1,0
chr11	44286692	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=164,83;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,3:9,0:15,3,3,1
chr11	44297253	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,17817330;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	44297274	.	G	GTGCTAAGCACA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44297274_G_GTGCTAAGCACA:44297274:0,0,0,1
chr11	44297278	.	AG	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44297274_G_GTGCTAAGCACA:44297274:0,0,0,1
chr11	44639921	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr11	44931421	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:4,0:5,3:3,7,0,3
chr11	44940912	.	A	AATATTATAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44940912_A_AATATTATAT:44940912:1,1,0,1
chr11	44940913	.	G	GGAGTCAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44940912_A_AATATTATAT:44940912:1,1,0,1
chr11	44940915	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44940912_A_AATATTATAT:44940912:1,1,0,1
chr11	44948388	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=194,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:0,6,0,3
chr11	44950784	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr11	44952585	.	G	GAGCCTGATGAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	44959083	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=123.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,12:0,26:0,0,23,17
chr11	45203504	.	G	GTGGTTTGGGTTGGTTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=127,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	45203997	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45203997_TC_T:45203997:0,1,0,1
chr11	45203999	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45203997_TC_T:45203997:0,1,0,1
chr11	45246254	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.097:28:11,0:13,2:0|1:45246254_T_C:45246254:10,16,0,2
chr11	45246259	.	C	CTGCCATGCCGCTCCTCCTCGGAGAGT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,37;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:10,0:14,2:0|1:45246254_T_C:45246254:8,17,0,2
chr11	45265941	.	AG	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=190,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr11	45672261	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:5,9:2,9:5,2,10,9
chr11	45827350	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr11	45832295	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr11	45868850	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,3,10
chr11	45877529	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,11,9
chr11	45877688	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	45918367	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,14;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,1:0,0:4,0,4,0
chr11	45918523	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.580:29:7,11:5,6:6,6,6,11
chr11	45923579	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:11,2:17,0:13,16,1,1
chr11	45925993	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=113,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,1:11,1:16,6,2,0
chr11	45926445	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr11	45926867	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,5:4,2:0,4,0,7
chr11	45931766	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=144,217;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:45931766_T_G:45931766:1,1,1,0
chr11	45931767	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=144,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45931766_T_G:45931766:1,1,1,0
chr11	45931772	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=203,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1,2,1,0
chr11	45931777	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,10;MFRL=168,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:45931766_T_G:45931766:2,2,1,0
chr11	45931788	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=168,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:45931766_T_G:45931766:2,2,1,0
chr11	45932556	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:45932556_G_A:45932556:0,2,0,1
chr11	45932560	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:45932556_G_A:45932556:0,2,0,1
chr11	45944985	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,36;MFRL=65,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr11	45944994	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr11	45945817	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=116,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr11	45945969	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	45959669	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr11	46001229	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr11	46105688	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr11	46332504	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr11	46332706	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	46339112	.	C	CACTCACAAAACCACACACAAATG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	46342081	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr11	46342259	.	A	AG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=89.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,13:0,15:0,0,19,9
chr11	46391453	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.189:30:6,0:5,0:15,8,7,0
chr11	46430188	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,1:10,1:17,7,2,0
chr11	46454938	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=197,177;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:46454938_C_T:46454938:2,0,1,0
chr11	46454948	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=197,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:46454938_C_T:46454938:2,0,1,0
chr11	46456444	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:6,3:8,5:10,4,3,5
chr11	46565495	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.545:31:7,7:7,10:11,3,14,3
chr11	46568611	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:13,0,2,0
chr11	46625530	.	A	AAACACCATGTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=336,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	46689505	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	46701034	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:2,2,0,3
chr11	46722731	.	TC	CC,GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27,32;MFRL=0,161,159;MMQ=60,60,60;MPOS=12,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.10,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.625,0.250:5:0,3,0:0,1,1:0,0,1,4
chr11	46722741	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr11	46726700	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=203,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:1,1:3,0,2,2
chr11	46744925	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr11	46751059	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:2,4,1,1
chr11	46760756	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,7,13
chr11	46776697	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	46784408	.	GGATAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=223,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:1,3,0,1
chr11	46802094	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	46812227	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	46822686	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr11	46840119	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,1:0,0,0,5
chr11	46842773	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:4,5,1,1
chr11	46889713	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	46897253	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,2,5
chr11	46897995	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,5:0,1:0,0,5,3
chr11	46898771	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,6,14
chr11	46907798	.	A	ATTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=196,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr11	46907827	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr11	46908116	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,0:1,1:0|1:46908116_A_ATT:46908116:0,1,0,1
chr11	46908118	.	G	GGCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46908116_A_ATT:46908116:0,1,0,1
chr11	46908120	.	T	TGTTTTAATAAAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46908116_A_ATT:46908116:0,1,0,1
chr11	46908125	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46908116_A_ATT:46908116:0,1,0,1
chr11	46911457	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,17,2
chr11	46911704	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr11	46912117	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=202,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:46912117_G_GA:46912117:0,1,0,1
chr11	46912118	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=202,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:46912117_G_GA:46912117:0,1,0,1
chr11	46917884	.	T	TTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=94,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:46917884_T_TTA:46917884:1,3,0,1
chr11	46917886	.	C	CTACCTTTGATCTTTGACATTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=94,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:46917884_T_TTA:46917884:1,3,0,1
chr11	46917983	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	47074068	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:17,1:26,1:12,33,1,1
chr11	47074117	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,1:8,1:0,22,0,2
chr11	47188523	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	47189845	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47189845_C_G:47189845:0,0,0,1
chr11	47189846	.	A	AGCTACCTGAGTGTGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47189845_C_G:47189845:0,0,0,1
chr11	47189848	.	C	CCTGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47189845_C_G:47189845:0,0,0,1
chr11	47196954	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:0,11,0,2
chr11	47198475	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:47198475_G_GA:47198475:0,13,0,2
chr11	47198476	.	G	GGTGGGTTATGTTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:47198475_G_GA:47198475:0,13,0,2
chr11	47204175	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,11,7
chr11	47238665	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,0,15
chr11	47254600	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=90,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr11	47289944	.	C	CCTA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=136,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:3,8,2,1
chr11	47297479	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,2:14,0:20,8,1,1
chr11	47298201	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=113,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr11	47303401	.	C	CTTTTTTTTTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=146,249;MMQ=48,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,21;RU=T;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	47304014	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,52;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:15,2:14,0:16,13,1,1
chr11	47313985	.	TCCAGTGC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:47313985_TCCAGTGC_T:47313985:2,0,1,0
chr11	47313996	.	AGACTGAATCG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=147,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:47313985_TCCAGTGC_T:47313985:2,1,1,0
chr11	47331116	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,12,14
chr11	47353874	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=135,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr11	47353875	.	G	GAGAGTCTGCACCCTCTTCCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=187,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	47353877	.	G	GAGATGGGA,GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32,31;MFRL=171,203,99;MMQ=60,60,60;MPOS=3,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr11	47360307	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47360307_T_C:47360307:0,0,0,1
chr11	47360316	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47360307_T_C:47360307:0,0,0,1
chr11	47360326	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47360307_T_C:47360307:0,0,0,1
chr11	47362431	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	47364762	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	47371484	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,4:0,0,11,1
chr11	47380340	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	47380593	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=89.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,15:0,0,5,22
chr11	47397366	.	CACCTT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:47397366_CACCTT_C:47397366:0,3,0,1
chr11	47397375	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47397366_CACCTT_C:47397366:0,1,0,1
chr11	47397379	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47397366_CACCTT_C:47397366:0,1,0,1
chr11	47431966	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.430:9:0,1:5,1:1,4,0,4
chr11	47436531	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr11	47446091	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:8,7:3,6:8,3,6,7
chr11	47446292	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr11	47446863	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr11	47447346	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,8:4,2:8,0,10,0
chr11	47460404	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:3,6,1,1
chr11	47463230	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	47463483	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr11	47496827	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:3,2:4,2:7,1,3,1
chr11	47504382	.	T	TGTC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:7,3:14,0:0|1:47504382_T_TGTC:47504382:9,14,2,1
chr11	47504384	.	T	TTCTACTAAACTTTGGGAAATCTAGC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,60;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:9,3:13,0:0|1:47504382_T_TGTC:47504382:9,14,2,1
chr11	47505869	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=201,201;MMQ=48,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr11	47587577	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=50.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr11	47601977	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	47611316	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,9:0,2:0,0,12,0
chr11	47640429	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=121,131;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:2,2:4,8:4,3,5,5
chr11	47656386	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=150,183;MMQ=40,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr11	47656403	.	CAAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=179,147;MMQ=50,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr11	47711550	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:47711550_T_A:47711550:2,0,1,0
chr11	47711553	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:47711550_T_A:47711550:2,0,1,0
chr11	47711563	.	GG	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:47711550_T_A:47711550:4,0,1,0
chr11	47758099	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,204;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,1:9,1:12,0,2,0
chr11	47772401	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr11	47776047	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,12:0,0,18,4
chr11	47776283	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=212,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,0:2,2:0,2,0,3
chr11	47786969	.	AACTGCAGTCAGATTCCAGACCAG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=195,202;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,1:5,2:0|1:47786969_AACTGCAGTCAGATTCCAGACCAG_A:47786969:0,10,0,3
chr11	47786999	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=189,202;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,1:5,1:0|1:47786969_AACTGCAGTCAGATTCCAGACCAG_A:47786969:0,9,0,3
chr11	47808171	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	47813436	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=140.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,18:0,22:0,0,33,7
chr11	47814280	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr11	47814492	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.102:30:13,3:13,0:8,19,1,2
chr11	47814544	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=137,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:1,12,1,1
chr11	47814547	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=137,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:1,10,1,1
chr11	47828558	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr11	47834346	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr11	47837408	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:9,7:5,2:13,1,8,1
chr11	47837638	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=73.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,0,21
chr11	47840864	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.737:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr11	47843178	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,2:9,1:14,0,3,0
chr11	47843180	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=168,179;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,1:10,1:15,0,2,0
chr11	47857253	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.606:23:4,9:4,5:6,3,3,11
chr11	47858497	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,87;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:8,0:8,4:8,9,0,4
chr11	48142528	.	ATT	A,AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,27,32;MFRL=193,143,127;MMQ=60,60,60;MPOS=15,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.57,14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,10:0.217,0.481:21:3,1,5:3,4,5:6,0,12,3
chr11	48142732	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:12,1:15,1:11,18,0,2
chr11	48157599	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,42;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,2:11,0:15,8,1,1
chr11	48157855	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:48157855_C_T:48157855:0,3,0,1
chr11	48157857	.	C	CTGGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:48157855_C_T:48157855:0,3,0,1
chr11	48157869	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=123,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	48157930	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	48161320	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,2:3,0:1,9,1,1
chr11	48166267	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:5,2,2,4
chr11	48170870	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr11	48171793	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr11	48184971	.	CCTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0|1:48184971_CCTTT_C:48184971:0,0,8,1
chr11	48184983	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0|1:48184971_CCTTT_C:48184971:0,0,10,3
chr11	48238302	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr11	48266582	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	48267589	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	48285981	.	CCTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr11	48286231	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr11	48286234	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:3,3,5,0
chr11	48286256	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr11	48346423	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=32,35;MFRL=98,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:48346423_A_G:48346423:0,1,3,0
chr11	48346427	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=14;MBQ=33,34;MFRL=130,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:0,1:0|1:48346423_A_G:48346423:0,2,3,0
chr11	48346450	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=14;MBQ=30,33;MFRL=117,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,3:4,2:0|1:48346423_A_G:48346423:6,2,5,1
chr11	48346458	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=14;MBQ=32,34;MFRL=106,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:0|1:48346423_A_G:48346423:7,2,5,1
chr11	48346487	.	TC	T	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=31,32;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:11,3:8,2:15,5,3,2
chr11	48346513	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=30,34;MFRL=127,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:10,3:8,2:0|1:48346513_T_C:48346513:16,5,2,3
chr11	48346523	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=33,32;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:12,5:7,1:0|1:48346513_T_C:48346513:15,5,2,4
chr11	48346535	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=33,32;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.296:25:12,4:6,1:0|1:48346513_T_C:48346513:14,4,3,4
chr11	48346541	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=14;MBQ=29,32;MFRL=158,63;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:11,5:6,2:0|1:48346513_T_C:48346513:15,5,5,3
chr11	48346547	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=14;MBQ=32,31;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.333:31:13,6:6,2:0|1:48346513_T_C:48346513:14,7,6,4
chr11	48346551	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=14;MBQ=32,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.333:31:14,5:6,4:0|1:48346513_T_C:48346513:14,7,6,4
chr11	48346579	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.394:31:15,6:4,6:0|1:48346579_C_A:48346579:14,5,9,3
chr11	48346588	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=33,33;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,14:0.441:32:13,6:5,6:0|1:48346579_C_A:48346579:12,6,10,4
chr11	48346604	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=33,34;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,20:0.489:41:11,12:6,8:0|1:48346579_C_A:48346579:14,7,15,5
chr11	48346615	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.514:37:12,12:5,7:12,6,14,5
chr11	48346660	.	TTTGCTGATC	T	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,19:0.385:50:16,13:13,4:0|1:48346660_TTTGCTGATC_T:48346660:17,14,14,5
chr11	48346681	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,22:0.397:56:16,13:15,7:0|1:48346660_TTTGCTGATC_T:48346660:18,16,14,8
chr11	48346729	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=134,94;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,30:0.574:52:12,20:10,10:8,14,11,19
chr11	48346924	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,13:0.378:35:10,5:11,8:0|1:48346924_T_C:48346924:9,13,3,10
chr11	48346932	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=118,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,14:0.405:35:9,4:10,9:0|1:48346924_T_C:48346924:10,11,3,11
chr11	48346961	.	AA	TG	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=73.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:8,9:11,10:9,11,10,9
chr11	48346999	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=127,166;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.584:34:6,8:8,11:6,8,12,8
chr11	48347100	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:3,12:5,5:2,6,10,7
chr11	48347124	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,14:0.536:26:4,8:7,6:0|1:48347124_A_G:48347124:7,5,8,6
chr11	48347130	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,14:0.577:24:5,7:5,7:0|1:48347124_A_G:48347124:7,3,7,7
chr11	48347140	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:6,4:4,6:0|1:48347124_A_G:48347124:8,3,7,4
chr11	48347142	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:6,4:4,6:0|1:48347124_A_G:48347124:9,2,7,4
chr11	48347144	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:6,4:4,7:0|1:48347124_A_G:48347124:9,2,7,4
chr11	48347342	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=175,109;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,3:3,5:0|1:48347342_G_A:48347342:1,7,3,5
chr11	48347346	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=175,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:0|1:48347342_G_A:48347342:1,7,3,5
chr11	48347358	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=175,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:0|1:48347358_C_T:48347358:1,7,2,4
chr11	48347363	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,3:3,2:0|1:48347358_C_T:48347358:1,6,2,4
chr11	48347392	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr11	48347419	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr11	48366812	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr11	48366829	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr11	48366895	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:11,3:4,3:9,6,4,2
chr11	48367050	.	T	TAG	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:5,4:4,6,2,6
chr11	48367073	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0,0,9,11
chr11	48367097	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=31,34;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:4,4:5,3:2,8,4,3
chr11	48367133	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=27,32;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:6,3:7,6:0|1:48367133_C_A:48367133:2,13,7,3
chr11	48367136	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=27,28;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:7,3:6,7:0|1:48367133_C_A:48367133:2,12,7,3
chr11	48367155	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=122,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:6,2:7,6:0|1:48367155_T_A:48367155:2,12,5,3
chr11	48367159	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=34,31;MFRL=122,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:7,4:7,6:0|1:48367155_T_A:48367155:2,12,7,3
chr11	48367163	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=32,34;MFRL=122,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:7,4:7,6:0|1:48367155_T_A:48367155:2,12,7,3
chr11	48367170	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:6,4:4,7:0|1:48367155_T_A:48367155:0,10,7,4
chr11	48367190	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=29,32;MFRL=109,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.542:22:5,4:5,7:0|1:48367190_A_T:48367190:2,8,7,5
chr11	48367195	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=34,30;MFRL=120,178;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:6,4:5,6:0|1:48367190_A_T:48367190:4,7,7,5
chr11	48367387	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.483:29:7,4:8,10:2,13,6,8
chr11	48367419	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,21:0.686:30:6,10:2,9:0|1:48367419_G_A:48367419:2,7,11,10
chr11	48367424	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=28,34;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=81.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,21:0.686:30:6,10:2,10:0|1:48367419_G_A:48367419:2,7,11,10
chr11	48367455	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=137,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.731:24:4,10:2,8:1,5,10,8
chr11	48367469	.	TG	CA	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=151,208;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.723:16:2,6:2,6:0|1:48367469_TG_CA:48367469:0,4,5,7
chr11	48367474	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=151,208;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.688:14:2,5:1,5:0|1:48367469_TG_CA:48367469:0,4,3,7
chr11	48367499	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=186,207;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:0,2,1,5
chr11	48367511	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=264,207;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr11	48373632	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr11	48373770	.	T	A	.	.	DP=70;ECNT=10;MBQ=29,32;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,21:0.310:69:19,13:27,8:24,24,12,9
chr11	48373797	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=10;MBQ=34,31;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,16:0.279:59:16,11:24,5:0|1:48373797_C_T:48373797:14,29,9,7
chr11	48373805	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=56.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,16:0.279:59:16,10:20,5:0|1:48373797_C_T:48373797:16,27,8,8
chr11	48373815	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,10:0.208:51:17,5:21,5:0|1:48373797_C_T:48373797:15,26,4,6
chr11	48373817	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,12:0.236:53:17,5:22,5:0|1:48373797_C_T:48373797:15,26,5,7
chr11	48373820	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,10:0.208:51:16,5:22,5:0|1:48373797_C_T:48373797:15,26,5,5
chr11	48373827	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=141,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,12:0.241:52:15,5:20,6:0|1:48373797_C_T:48373797:13,27,7,5
chr11	48373833	.	GA	AG	.	.	DP=49;ECNT=10;MBQ=34,33;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,11:0.235:49:14,5:20,6:0|1:48373797_C_T:48373797:11,27,7,4
chr11	48373885	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=10;MBQ=29,32;MFRL=133,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,17:0.391:44:13,4:14,11:0|1:48373885_A_G:48373885:11,16,7,10
chr11	48373900	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=141,87;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,17:0.400:43:11,6:12,11:0|1:48373885_A_G:48373885:11,15,3,14
chr11	48373976	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=169,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:3,3:8,2:0|1:48373976_T_G:48373976:0,11,1,5
chr11	48373986	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.454:17:2,5:7,3:0|1:48373976_T_G:48373976:0,9,1,7
chr11	48374000	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=170,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.534:12:2,3:4,3:0,6,0,6
chr11	48374031	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0|1:48374031_G_A:48374031:0,5,0,4
chr11	48374041	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=169,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:0,1:0|1:48374031_G_A:48374031:0,3,0,3
chr11	48510777	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,51;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,11,9
chr11	49170334	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr11	49176057	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	49179698	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=229,224;MMQ=40,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr11	49192667	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=167.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,29:0,19:0,0,47,1
chr11	49192905	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,1:0,4:0,0,0,10
chr11	49195090	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=152,178;MMQ=51,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,6:0,8:0,1,2,12
chr11	49195129	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr11	49196555	.	TA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:12,3:15,0:3,27,0,3
chr11	51412453	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	51516000	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,51;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,9,13
chr11	55033273	.	C	CA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=169,173;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.528:20:1,3:5,3:0,10,1,9
chr11	55035809	.	AT	A,ATT	.	.	DP=90;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=148,124,140;MMQ=60,60,42;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.21,9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:56,11,8:0.132,0.112:75:29,6,5:25,5,2:54,2,17,2
chr11	55035862	.	T	C	.	.	DP=140;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=186.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,69:0.511:135:31,41:34,27:41,25,38,31
chr11	55035985	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:13,9:4,7:0,17,1,15
chr11	55136411	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=285,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55136411_C_CA:55136411:0,1,0,1
chr11	55136413	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=285,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55136411_C_CA:55136411:0,1,0,1
chr11	55339545	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.318:10:4,1:3,2:6,1,2,1
chr11	55339652	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:9,5:5,5:6,9,5,5
chr11	55339676	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:5,8:5,5:7,4,5,8
chr11	55339702	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=99,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:7,6:5,3:7,5,4,5
chr11	55339798	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=89,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.461:24:8,4:4,7:0|1:55339798_C_T:55339798:5,8,3,8
chr11	55339801	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=89,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.462:24:9,4:4,7:0|1:55339798_C_T:55339798:5,8,3,8
chr11	55339829	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,6:0,0,6,7
chr11	55406845	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55406845_A_G:55406845:0,0,0,1
chr11	55406848	.	G	GCTCTGTAGTTGCACCATGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55406845_A_G:55406845:0,0,0,1
chr11	55433005	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=112,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,2:3,0:8,3,0,2
chr11	55433040	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,9:1,1:6,0,4,6
chr11	55578940	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:5,0,2,2
chr11	55595315	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=135,119;MMQ=40,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:15,3:5,0:10,10,1,2
chr11	55606208	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,3,1
chr11	55652809	.	A	AAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=93,191;MMQ=40,24;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:55652809_A_AAG:55652809:2,0,1,0
chr11	55652818	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=93,191;MMQ=40,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:55652809_A_AAG:55652809:2,0,1,0
chr11	55656437	.	AT	A	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,7:0.110:60:28,4:19,3:37,16,5,2
chr11	55656483	.	T	A	.	.	DP=101;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=287.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,99:0.990:99:0,39:0,44:0,0,46,53
chr11	55657320	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=173,191;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,6:5,1:11,0,7,0
chr11	55657368	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=167,138;MMQ=57,29;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.187:38:11,3:10,2:26,5,7,0
chr11	55657372	.	AT	A	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=159,165;MMQ=48,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:14,1:13,3:34,5,3,1
chr11	55657394	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=184.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.978:44:0,22:0,18:0|1:55657394_A_G:55657394:0,0,30,14
chr11	55657399	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=178.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.978:42:0,21:0,21:0|1:55657394_A_G:55657394:0,0,25,17
chr11	55734972	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=204,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr11	55860780	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,8:0,15:0,0,15,9
chr11	55873368	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,41;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,10:0,0,6,19
chr11	55889790	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr11	55944048	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:6,2:3,10:9,0,8,4
chr11	56000066	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=118,146;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.567:19:2,3:6,7:4,4,5,6
chr11	56057973	.	ATGCAGGACAGAGCTAAAATTGGAGACGTGT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,242;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:8,0:14,2:16,14,2,0
chr11	56127746	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,8:0,0,8,7
chr11	56128524	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,12,8
chr11	56128553	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,105;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:5,8,2,0
chr11	56128772	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=225,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	56143125	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:21,4:14,3:27,8,2,5
chr11	56143156	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=13;MBQ=34,31;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,32:0.579:55:15,15:7,13:0|1:56143156_C_T:56143156:16,7,18,14
chr11	56143158	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,32:0.579:55:16,18:6,14:0|1:56143156_C_T:56143156:16,7,18,14
chr11	56143198	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=33,33;MFRL=136,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,5:0.133:43:15,5:21,0:0|1:56143198_C_T:56143198:23,15,4,1
chr11	56143204	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=33,33;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:12,3:20,0:0|1:56143198_C_T:56143198:23,14,2,1
chr11	56143207	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=13;MBQ=33,33;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:15,3:19,1:0|1:56143198_C_T:56143198:21,16,2,2
chr11	56143216	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=142,147;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.146:46:16,3:20,2:0|1:56143198_C_T:56143198:20,20,3,3
chr11	56143225	.	CT	TC	.	.	DP=53;ECNT=13;MBQ=32,31;MFRL=146,141;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,7:0.151:50:18,3:21,2:0|1:56143198_C_T:56143198:17,26,3,4
chr11	56143250	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,11:0.214:54:21,5:19,6:0|1:56143250_G_A:56143250:12,31,4,7
chr11	56143252	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=13;MBQ=32,31;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,11:0.211:55:23,5:19,6:0|1:56143250_G_A:56143250:12,32,4,7
chr11	56143255	.	T	TGA	.	.	DP=59;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,12:0.213:59:23,5:20,6:0|1:56143250_G_A:56143250:12,35,4,8
chr11	56143257	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=13;MBQ=34,31;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,12:0.213:59:25,6:19,6:0|1:56143250_G_A:56143250:12,35,4,8
chr11	56143259	.	AGT	A	.	.	DP=58;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,12:0.217:58:24,5:21,6:0|1:56143250_G_A:56143250:12,34,4,8
chr11	56143357	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=22;MBQ=34,31;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:4,1:9,3:0|1:56143357_G_A:56143357:6,7,1,3
chr11	56143360	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=22;MBQ=33,31;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:3,1:9,3:0|1:56143357_G_A:56143357:6,7,1,3
chr11	56143370	.	GT	AG	.	.	DP=14;ECNT=22;MBQ=34,32;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:2,1:8,2:0|1:56143357_G_A:56143357:5,5,1,3
chr11	56143375	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=22;MBQ=30,32;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,1:6,2:0|1:56143357_G_A:56143357:4,5,0,3
chr11	56143378	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=22;MBQ=32,31;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:0|1:56143357_G_A:56143357:4,5,0,3
chr11	56143381	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=22;MBQ=32,31;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,1:6,2:0|1:56143357_G_A:56143357:5,4,0,3
chr11	56143434	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=22;MBQ=36,35;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,4:1,2,4,2
chr11	56143489	.	AT	GA	.	.	DP=18;ECNT=22;MBQ=31,34;MFRL=162,73;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:4,3:6,2:0|1:56143489_AT_GA:56143489:6,6,2,3
chr11	56143501	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=22;MBQ=32,31;MFRL=165,80;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:6,3:5,2:0|1:56143489_AT_GA:56143489:6,5,3,3
chr11	56143508	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=22;MBQ=30,31;MFRL=169,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,3:6,2:0|1:56143489_AT_GA:56143489:7,6,3,2
chr11	56143510	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=22;MBQ=31,32;MFRL=167,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:6,3:5,2:0|1:56143489_AT_GA:56143489:6,6,3,2
chr11	56143528	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=22;MBQ=30,28;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,4:6,1:0|1:56143489_AT_GA:56143489:5,4,5,1
chr11	56143534	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=22;MBQ=31,33;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:0|1:56143489_AT_GA:56143489:4,4,4,1
chr11	56143537	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=22;MBQ=32,31;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,4:5,1:0|1:56143489_AT_GA:56143489:4,4,4,1
chr11	56143539	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=22;MBQ=30,33;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,4:5,1:0|1:56143489_AT_GA:56143489:4,4,4,1
chr11	56143543	.	TT	CC	.	.	DP=13;ECNT=22;MBQ=32,33;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:0|1:56143489_AT_GA:56143489:4,4,4,1
chr11	56143556	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=22;MBQ=31,31;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:1,6:6,3:0|1:56143489_AT_GA:56143489:4,3,7,2
chr11	56143559	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=22;MBQ=33,33;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:1,6:6,3:0|1:56143489_AT_GA:56143489:5,3,8,2
chr11	56143561	.	AA	GG	.	.	DP=19;ECNT=22;MBQ=31,34;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:2,7:6,3:0|1:56143489_AT_GA:56143489:6,3,8,2
chr11	56143564	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=22;MBQ=34,32;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:3,6:6,3:0|1:56143489_AT_GA:56143489:6,3,10,2
chr11	56143570	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=22;MBQ=30,34;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:4,8:5,3:0|1:56143489_AT_GA:56143489:7,3,9,2
chr11	56143592	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=22;MBQ=32,32;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.227:23:10,3:8,1:15,3,4,1
chr11	56143690	.	C	A	.	.	DP=69;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,15:0.228:68:26,4:26,11:0|1:56143690_C_A:56143690:32,21,6,9
chr11	56143696	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,13:0.200:68:25,3:25,8:0|1:56143690_C_A:56143690:33,22,5,8
chr11	56143699	.	T	G	.	.	DP=62;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=121,180;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,11:0.187:62:21,3:26,8:0|1:56143690_C_A:56143690:29,22,5,6
chr11	56143716	.	TG	CA	.	.	DP=61;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=135,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,8:0.143:61:25,2:24,3:0|1:56143690_C_A:56143690:27,26,3,5
chr11	56143723	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,5:0.103:56:24,2:24,3:0|1:56143690_C_A:56143690:26,25,2,3
chr11	56143725	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,5:0.107:54:25,2:23,2:0|1:56143690_C_A:56143690:26,23,2,3
chr11	56143729	.	CC	TG	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=136,157;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:23,2:22,0:0|1:56143690_C_A:56143690:26,22,1,2
chr11	56143957	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:0,3:4,1:0|1:56143957_T_C:56143957:0,4,0,5
chr11	56143966	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=211,171;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:0|1:56143957_T_C:56143957:0,3,0,5
chr11	56143977	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr11	56310488	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=101,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:8,4,2,0
chr11	56380008	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,4:5,4:7,4,8,0
chr11	56432119	.	TGTCA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:56432119_TGTCA_T:56432119:0,2,0,1
chr11	56432127	.	GT	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:56432119_TGTCA_T:56432119:0,2,0,1
chr11	56467833	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:9,0,4,0
chr11	56468020	.	TG	CG,CA	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=32,29,34;MFRL=165,172,190;MMQ=60,60,48;MPOS=18,12;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.58,11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,4:0.327,0.238:18:5,4,4:3,1,0:6,2,6,4
chr11	56468044	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=197,166;MMQ=60,53;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.734:13:2,6:0,2:0|1:56468044_T_G:56468044:3,0,7,3
chr11	56468047	.	AC	GT	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=197,149;MMQ=60,49;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.734:13:3,8:0,2:0|1:56468044_T_G:56468044:3,0,6,4
chr11	56468048	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,49;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.884:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr11	56468111	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=168,140;MMQ=46,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.424:17:6,4:2,3:3,7,7,0
chr11	56468155	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=29,33;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:14,4:10,0:15,10,0,4
chr11	56468198	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=29,34;MFRL=171,140;MMQ=60,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:9,4:7,6:0|1:56468198_A_G:56468198:10,6,7,4
chr11	56468200	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=171,140;MMQ=60,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:9,4:7,6:0|1:56468198_A_G:56468198:10,6,7,4
chr11	56468202	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=166,142;MMQ=60,49;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,10:0.379:27:9,4:7,6:0|1:56468198_A_G:56468198:11,6,7,3
chr11	56468212	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=28,30;MFRL=176,134;MMQ=60,49;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.428:26:9,5:4,6:0|1:56468198_A_G:56468198:9,6,7,4
chr11	56468403	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,13:0.467:28:8,9:7,4:0|1:56468403_G_A:56468403:8,7,10,3
chr11	56468416	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.406:30:8,7:9,3:0|1:56468403_G_A:56468403:8,10,9,3
chr11	56468440	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:12,4:6,1:8,10,4,1
chr11	56468448	.	AA	GT	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=64.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,17:0.500:34:9,12:6,3:0|1:56468448_AA_GT:56468448:5,12,11,6
chr11	56468452	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=65.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,17:0.530:32:7,12:8,5:0|1:56468448_AA_GT:56468448:4,11,11,6
chr11	56468493	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.526:36:8,11:9,8:5,12,10,9
chr11	56468554	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,25:0.591:42:7,11:9,12:0|1:56468554_A_C:56468554:9,8,12,13
chr11	56468560	.	TA	CG	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,24:0.544:44:8,11:11,12:0|1:56468554_A_C:56468554:11,9,11,13
chr11	56468694	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.186:23:10,1:9,2:0|1:56468694_C_T:56468694:1,18,1,3
chr11	56468699	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.203:21:9,1:8,1:0|1:56468694_C_T:56468694:1,16,1,3
chr11	56468704	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,1:6,1:0|1:56468694_C_T:56468694:1,15,0,2
chr11	56468720	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:3,1:0|1:56468694_C_T:56468694:0,11,0,2
chr11	56508619	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr11	56510243	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=119,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr11	56757021	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=89.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,11:0,16:0,0,15,13
chr11	56954985	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr11	57003648	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:2,12,0,2
chr11	57069878	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr11	57089203	.	GGCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.615:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr11	57094155	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.166:24:9,1:6,1:17,3,4,0
chr11	57098512	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=187,273;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57098512_G_GT:57098512:0,1,0,1
chr11	57098513	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=187,273;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57098512_G_GT:57098512:0,1,0,1
chr11	57098515	.	T	TTCGCTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=187,273;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57098512_G_GT:57098512:0,1,0,1
chr11	57106214	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:0,4,0,6
chr11	57114233	.	C	CGCTGCTTGTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=204,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57114233_C_CGCTGCTTGTTG:57114233:0,1,0,1
chr11	57114235	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=204,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57114233_C_CGCTGCTTGTTG:57114233:0,1,0,1
chr11	57116105	.	A	AACCCCAAGCGTCGCTGAGTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,2:0,0:3,2,1,1
chr11	57117316	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=118,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:14,2:2,0:13,4,1,1
chr11	57117385	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,3:1,1:1,8,0,4
chr11	57118161	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=154,191;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:57118161_A_C:57118161:1,0,1,0
chr11	57118166	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,34;MFRL=184,154;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:0,0:0,1:3,0,1,0
chr11	57118172	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,34;MFRL=161,154;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,1:1|0:57118161_A_C:57118161:2,0,1,0
chr11	57135663	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr11	57137296	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=160,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr11	57137424	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,6:4,3:3,3,2,7
chr11	57137538	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	57146092	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,0:1,4:5,0,3,1
chr11	57147292	.	A	ACATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=89,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr11	57147353	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr11	57148053	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.927:12:0,8:0,3:0,0,10,2
chr11	57182006	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=186,146;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:57182006_G_A:57182006:1,0,2,0
chr11	57182007	.	AGCG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=194,146;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:57182006_G_A:57182006:2,0,2,0
chr11	57182012	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=194,146;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:57182006_G_A:57182006:2,0,2,0
chr11	57182014	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=194,146;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:1,0:1,0:0|1:57182006_G_A:57182006:2,0,2,0
chr11	57184218	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	57243571	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.247:37:12,0:7,1:22,5,10,0
chr11	57243588	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=164.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.980:49:0,26:0,17:0,0,41,8
chr11	57258617	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0|1:57258617_T_C:57258617:0,0,6,0
chr11	57258623	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=213,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:57258617_T_C:57258617:8,0,2,0
chr11	57265400	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr11	57268170	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,2,3
chr11	57310307	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,6:7,4:4,11,5,5
chr11	57313266	.	AC	CG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=108,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:57313266_AC_CG:57313266:0,1,1,0
chr11	57313270	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=108,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57313266_AC_CG:57313266:0,1,1,0
chr11	57313274	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,35;MFRL=108,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57313266_AC_CG:57313266:0,1,1,0
chr11	57313278	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,13;MFRL=108,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:57313266_AC_CG:57313266:0,1,1,0
chr11	57313283	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,35;MFRL=108,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57313266_AC_CG:57313266:0,1,1,0
chr11	57313285	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,12;MFRL=158,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:57313266_AC_CG:57313266:1,1,1,0
chr11	57313292	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,12;MFRL=158,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:57313266_AC_CG:57313266:1,1,1,0
chr11	57313469	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,2:5,3:3,8,1,4
chr11	57317640	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=53,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,5:0,3:0,2,0,8
chr11	57320044	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr11	57321811	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=177,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr11	57369730	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=73,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr11	57379170	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,2:1,3,3,2
chr11	57381700	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr11	57414387	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,2:0,6:4,0,7,1
chr11	57457765	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:13,3:19,0:21,13,3,0
chr11	57460224	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr11	57461225	.	GTC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:7,3,2,0
chr11	57461473	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=14,26;MFRL=186,178;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,0:0,3:0,2,0,4
chr11	57479731	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	57505520	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.430:18:1,2:3,4:0,10,1,7
chr11	57509429	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr11	57511565	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=117,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:57511565_T_TG:57511565:0,2,1,0
chr11	57511569	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=117,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:57511565_T_TG:57511565:0,2,1,0
chr11	57511573	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=123,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:57511565_T_TG:57511565:1,2,1,0
chr11	57513551	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,7:5,3:5,4,7,3
chr11	57563960	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:5,0:14,2:11,8,1,1
chr11	57563991	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.266:32:7,3:16,5:14,10,5,3
chr11	57564246	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:2,6:4,5:3,3,7,4
chr11	57799469	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=218,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57799469_G_A:57799469:0,1,0,1
chr11	57799471	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=218,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57799469_G_A:57799469:0,1,0,1
chr11	57947209	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=143,91;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:0|1:57947209_C_A:57947209:9,6,2,0
chr11	57947212	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=143,91;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:0|1:57947209_C_A:57947209:9,6,2,0
chr11	57958512	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,1:10,1:24,1,2,0
chr11	57958685	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,169;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,3:11,0:6,17,0,3
chr11	57958987	.	TTCC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=223,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57958987_TTCC_T:57958987:0,1,0,1
chr11	57958992	.	A	AGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=223,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57958987_TTCC_T:57958987:0,1,0,1
chr11	57958998	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,25;MFRL=223,174;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57958987_TTCC_T:57958987:0,1,0,1
chr11	57995330	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,8:2,4:5,0,12,0
chr11	58035797	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,6:3,4:0,6,1,9
chr11	58125533	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	58170794	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:2,7,1,5
chr11	58190747	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=188,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr11	58378382	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	58380192	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,20,33,33;MFRL=0,109,162,193;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,13,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,11,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.36,11.80,11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,6,6:0.175,0.392,0.387:15:0,2,4,2:0,1,2,4:0,0,13,2
chr11	58380215	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.145:24:5,0:5,0:15,6,3,0
chr11	58381686	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,7:0,0,11,4
chr11	58478026	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr11	58478039	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=56.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,15,1
chr11	58478302	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:58478302_T_C:58478302:0,3,0,1
chr11	58478306	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:58478302_T_C:58478302:0,3,0,1
chr11	58605922	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr11	58893982	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58893982_A_G:58893982:0,0,0,1
chr11	58893984	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58893982_A_G:58893982:0,0,0,1
chr11	58956767	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:8,1:20,2:8,20,1,2
chr11	58972416	.	G	GTCCTGC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,0:1,1:0|1:58972416_G_GTCCTGC:58972416:0,4,0,1
chr11	58972417	.	A	ACTTTG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,0:2,1:0|1:58972416_G_GTCCTGC:58972416:0,4,0,1
chr11	58972419	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,0:2,1:0|1:58972416_G_GTCCTGC:58972416:0,4,0,1
chr11	58972445	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58972445_G_A:58972445:0,1,0,1
chr11	58972447	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58972445_G_A:58972445:0,1,0,1
chr11	58972451	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58972445_G_A:58972445:0,1,0,1
chr11	59132882	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	59189405	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	59190282	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:7,2:14,0:8,13,1,1
chr11	59210550	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	59211188	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr11	59245736	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=32,14;MFRL=154,88;MMQ=60,54;MPOS=-1073741810;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:9,0:0|1:59245736_C_T:59245736:6,7,0,2
chr11	59245737	.	TCCCC	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=30,16;MFRL=154,88;MMQ=60,54;MPOS=-1073741811;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:10,0:0|1:59245736_C_T:59245736:6,7,0,2
chr11	59245743	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=148,88;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:6,0:0|1:59245736_C_T:59245736:4,7,0,2
chr11	59245746	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=144,88;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,1:7,0:0|1:59245736_C_T:59245736:3,8,0,2
chr11	59245748	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=151,88;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:0,2:6,0:0|1:59245736_C_T:59245736:2,8,0,2
chr11	59245752	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=145,88;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,2:9,0:0|1:59245736_C_T:59245736:2,8,0,2
chr11	59272052	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,30;MFRL=195,179;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr11	59369401	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	59419147	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:59419147_A_C:59419147:0,4,0,1
chr11	59419156	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:59419147_A_C:59419147:0,3,0,1
chr11	59423525	.	TAA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=12,30;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.300:11:2,3:1,0:2,6,1,2
chr11	59424063	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,1:12,1:6,18,0,2
chr11	59560523	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:11,1,3,0
chr11	59577510	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	59610422	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:0,0:3,0,4,0
chr11	59629066	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:8,1:14,1:14,8,1,1
chr11	59807960	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=143,47;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:10,9,0,2
chr11	59807978	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,6:7,2:5,5,3,5
chr11	59830103	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:8,5:2,8:7,3,4,9
chr11	59837721	.	T	TTATGAAAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.361:20:9,0:4,6:4,9,5,2
chr11	59858036	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr11	59860178	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=229,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr11	59940396	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:59940396_A_G:59940396:0,0,3,0
chr11	59940400	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0|1:59940396_A_G:59940396:0,0,4,0
chr11	59940403	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0|1:59940396_A_G:59940396:0,0,4,0
chr11	59940407	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:59940396_A_G:59940396:0,0,3,0
chr11	59940495	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,2:13,0:0|1:59940495_A_G:59940495:12,8,2,0
chr11	59940497	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,2:14,0:0|1:59940495_A_G:59940495:12,8,2,0
chr11	59942815	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr11	59943109	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,9:0,3:0,0,1,13
chr11	60073702	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,2,24
chr11	60152468	.	A	ATTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=T;STR;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr11	60152531	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,10:0,0,20,5
chr11	60163958	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	60268679	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,2,20
chr11	60309947	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,5:0,12:0,0,15,2
chr11	60474636	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	60561613	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:0,5,0,4
chr11	60567275	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr11	60610056	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,5:2,3:2,5,2,6
chr11	60617646	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr11	60617834	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:2,5,0,3
chr11	60617855	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=208,128;MMQ=60,29;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,2,0
chr11	60666116	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:4,6:7,8:5,6,1,13
chr11	60670846	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:8,0,4,0
chr11	60695375	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=141,272;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr11	60700950	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr11	60700991	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.574:14:1,5:3,2:4,2,6,2
chr11	60702625	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr11	60703260	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr11	60706864	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:1,2:3,0,3,0
chr11	60774043	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:5,4,2,0
chr11	60775007	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.420:29:10,4:7,8:13,4,10,2
chr11	60775227	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=222,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:1,3,1,2
chr11	60776334	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr11	60778650	.	C	CGTGT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=GT;STR;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.792:7:0,1:1,3:0,1,0,6
chr11	60783108	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:0|1:60783108_C_T:60783108:9,0,4,0
chr11	60783126	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:60783108_C_T:60783108:0,0,11,2
chr11	60783135	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0|1:60783108_C_T:60783108:0,0,9,2
chr11	60784934	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=134,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.283:9:4,2:0,0:3,4,2,0
chr11	60785038	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:1,2,0,4
chr11	60785352	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=95,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,6:4,5:4,7,3,8
chr11	60882655	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	60885625	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=191,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:60885625_A_C:60885625:1,1,2,0
chr11	60885628	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,31;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:0,1:0|1:60885625_A_C:60885625:2,1,2,0
chr11	60885630	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:0,0:0|1:60885625_A_C:60885625:2,1,2,0
chr11	60886519	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	60891310	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr11	60971152	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,143;MMQ=54,31;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:14,1:11,1:3,23,0,2
chr11	60974895	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,194;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:4,1,6,0
chr11	61032442	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=235,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:61032442_G_A:61032442:3,0,0,1
chr11	61032461	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=235,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:61032442_G_A:61032442:2,0,0,1
chr11	61039319	.	A	ATACTTTAAAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=152,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr11	61068476	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,83;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0,11,2,0
chr11	61077979	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61077979_C_G:61077979:0,1,0,1
chr11	61077980	.	A	AAGGTGAAATGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61077979_C_G:61077979:0,1,0,1
chr11	61093077	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:9,2:0|1:61093077_G_A:61093077:14,6,1,1
chr11	61093086	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,2:0.124:22:10,0:10,2:1|0:61093077_G_A:61093077:13,7,1,1
chr11	61100308	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	61106525	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,8:0,12:0,0,15,6
chr11	61110169	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr11	61113858	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=147,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:4,0:4,1,2,0
chr11	61120691	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=221,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:61120691_A_T:61120691:0,1,0,1
chr11	61120694	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=221,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:61120691_A_T:61120691:0,1,0,1
chr11	61120696	.	TGC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=221,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:61120691_A_T:61120691:0,1,0,1
chr11	61120704	.	GG	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=221,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:61120691_A_T:61120691:0,1,0,1
chr11	61123965	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,18,2
chr11	61123976	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=130,93;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.177:22:11,0:7,2:16,2,4,0
chr11	61165731	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0|1:61165731_C_CA:61165731:0,0,5,10
chr11	61165741	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,10:0,2:0|1:61165731_C_CA:61165731:0,0,3,10
chr11	61183554	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:2,0,8,0
chr11	61183701	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:5,2:2,1:3,5,3,0
chr11	61205434	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr11	61205676	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=149,199;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:1,2:2,1:0,3,0,4
chr11	61253200	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	61253973	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,10:0,0,16,6
chr11	61254155	.	T	TCATTTAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:61254155_T_TCATTTAAAA:61254155:0,1,0,1
chr11	61254158	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61254155_T_TCATTTAAAA:61254155:0,1,0,1
chr11	61254376	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	61257365	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:6,2,2,0
chr11	61295690	.	GG	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,1,0
chr11	61491097	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	61491109	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	61496512	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=106,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.240:17:2,2:9,1:0|1:61496512_G_C:61496512:2,11,3,1
chr11	61496514	.	CCCCAT	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=106,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.240:17:2,1:9,1:0|1:61496512_G_C:61496512:2,11,3,1
chr11	61496524	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.248:13:2,0:5,1:0|1:61496512_G_C:61496512:1,9,2,1
chr11	61505696	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	61533564	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,14;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:61533564_T_A:61533564:1,1,1,0
chr11	61533568	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=22,28;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:61533564_T_A:61533564:1,1,1,0
chr11	61533573	.	C	CCG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:61533564_T_A:61533564:1,1,1,0
chr11	61533576	.	GCT	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,18;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:61533564_T_A:61533564:1,1,1,0
chr11	61533581	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,12;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:61533564_T_A:61533564:1,0,1,0
chr11	61533584	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=12,12;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:61533564_T_A:61533564:1,0,1,0
chr11	61533589	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=18,12;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:61533564_T_A:61533564:2,0,1,0
chr11	61543499	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=49.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr11	61543961	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr11	61546021	.	A	AGTATGGAGGTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=66,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr11	61547068	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=101,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:1,3,1,3
chr11	61547237	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr11	61548559	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr11	61549025	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr11	61551927	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	61560081	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr11	61569830	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr11	61570783	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr11	61572248	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=125,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,0:13,3:7,19,1,2
chr11	61607911	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:9,9,2,0
chr11	61615543	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	61615803	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:0,9:1,9:1,0,11,13
chr11	61624414	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,3:0,11:0,0,11,4
chr11	61641211	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr11	61645967	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:3,3,7,1
chr11	61646004	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,10:8,2:10,5,9,3
chr11	61647427	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr11	61658629	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:4,2,5,3
chr11	61671956	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr11	61672381	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,11:0,0,7,8
chr11	61674221	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:61674221_T_TC:61674221:1,0,0,1
chr11	61674222	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61674221_T_TC:61674221:1,0,0,1
chr11	61674223	.	T	TTCTGGGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61674221_T_TC:61674221:1,0,0,1
chr11	61675021	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:6,2:3,0:4,6,1,1
chr11	61722486	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	61724514	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,1:0,0,0,9
chr11	61725599	.	A	ATCCTCCTCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,8;RU=TCC;STR;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.850:4:0,1:0,2:0,0,2,2
chr11	61726861	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:61726861_C_A:61726861:2,0,1,0
chr11	61726862	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:61726861_C_A:61726861:2,0,1,0
chr11	61726871	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:61726861_C_A:61726861:0,0,6,0
chr11	61730036	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.970:32:0,13:0,7:0,0,19,13
chr11	61895541	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	61896215	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr11	61897197	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61897197_C_T:61897197:0,0,1,0
chr11	61897208	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:61897197_C_T:61897197:0,0,1,0
chr11	61906299	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr11	61913196	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,18:0,29:0,0,16,34
chr11	61914056	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,15,0
chr11	61919515	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:61919515_C_G:61919515:0,0,1,2
chr11	61919530	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61919515_C_G:61919515:0,0,0,1
chr11	61960763	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr11	61960809	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,8,7
chr11	61960827	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,4:0,0,7,9
chr11	62010667	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,15534246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	62037865	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	62040486	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:62040486_G_A:62040486:8,5,1,1
chr11	62040493	.	GAA	CTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:62040486_G_A:62040486:8,7,1,1
chr11	62040501	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:6,1:0|1:62040486_G_A:62040486:8,8,1,1
chr11	62105391	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	62105441	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:1,1,6,2
chr11	62123989	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,1:2,6:1,3,0,7
chr11	62156783	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,18;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:62156783_A_AC:62156783:1,3,0,1
chr11	62156787	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,15;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:62156783_A_AC:62156783:1,3,0,1
chr11	62156806	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:62156806_C_T:62156806:0,2,0,1
chr11	62156809	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:62156806_C_T:62156806:0,2,0,1
chr11	62156811	.	CT	TG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,30;MFRL=188,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	62156812	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=174,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62156806_C_T:62156806:0,1,0,1
chr11	62156815	.	CTGCGT	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=36,34;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:62156806_C_T:62156806:0,2,0,1
chr11	62156823	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=17,29;MFRL=174,201;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:62156806_C_T:62156806:0,1,0,1
chr11	62158924	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr11	62186542	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=123,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,5:3,1:5,5,3,3
chr11	62186688	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=118,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.564:3:0,1:1,1:0|1:62186688_T_TC:62186688:0,1,0,2
chr11	62186691	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=118,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.563:3:0,1:1,0:0|1:62186688_T_TC:62186688:0,1,0,2
chr11	62186695	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:62186688_T_TC:62186688:0,2,0,1
chr11	62186700	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=162,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62186688_T_TC:62186688:0,1,0,1
chr11	62186702	.	G	GGGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=162,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62186688_T_TC:62186688:0,1,0,1
chr11	62189958	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:62189958_A_T:62189958:0,1,0,1
chr11	62189959	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:62189958_A_T:62189958:0,1,0,1
chr11	62201458	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr11	62289841	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:23,0:22,3:25,20,0,3
chr11	62291712	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=208,1174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:62291712_C_T:62291712:0,10,2,0
chr11	62291735	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=172,1174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:5,0:0|1:62291712_C_T:62291712:4,11,2,0
chr11	62291738	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=172,1174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:0|1:62291712_C_T:62291712:4,9,2,0
chr11	62291740	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=184,1174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:0|1:62291712_C_T:62291712:4,9,2,0
chr11	62291742	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=184,1174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:62291712_C_T:62291712:4,9,2,0
chr11	62296921	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,126;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:18,2:22,1:12,28,2,1
chr11	62334908	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,45;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,4:0,0,6,8
chr11	62338378	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=109,244;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:4,1,4,0
chr11	62345932	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62345932_A_T:62345932:0,0,1,0
chr11	62345936	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=148,160;MMQ=60,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:62345932_A_T:62345932:2,0,1,0
chr11	62345941	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=154,160;MMQ=60,36;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:62345932_A_T:62345932:3,0,1,0
chr11	62345943	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=154,160;MMQ=60,36;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:62345932_A_T:62345932:3,0,1,0
chr11	62356778	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=162,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:62356778_A_C:62356778:0,3,0,1
chr11	62356783	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=162,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:62356778_A_C:62356778:0,3,0,1
chr11	62361949	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.397:20:5,1:3,0:4,8,8,0
chr11	62365619	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr11	62368962	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,5:1,4:1,6,0,9
chr11	62369018	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	62369881	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.909:8:0,1:0,4:0|1:62369881_G_A:62369881:0,0,4,4
chr11	62369884	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0|1:62369881_G_A:62369881:0,0,4,4
chr11	62370155	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,12,5
chr11	62374352	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,17;MFRL=135,152;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:1,0:1,0:1,2,2,0
chr11	62375615	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=155,208;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:62375615_C_T:62375615:3,0,1,0
chr11	62375618	.	TC	GG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,10;MFRL=155,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:62375615_C_T:62375615:3,0,1,0
chr11	62375624	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=13,19;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:0,1:0,0:2,0,2,0
chr11	62375626	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=21,13;MFRL=154,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:62375615_C_T:62375615:4,0,1,0
chr11	62375630	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=21,25;MFRL=155,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:3,0,1,0
chr11	62375640	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=123,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:62375615_C_T:62375615:4,0,1,0
chr11	62375852	.	A	AAGCCAGGGAGCTCTAATGGTAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	62376394	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=18,12;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:1,0:0,0:2,2,4,0
chr11	62380732	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr11	62381703	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=58.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr11	62389316	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=16,13;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.396:26:4,0:3,0:13,2,11,0
chr11	62389360	.	G	T	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,5:0.081:71:29,5:37,0:33,33,3,2
chr11	62394297	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,7:2,3:7,3,8,2
chr11	62394881	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	62397177	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr11	62400016	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	62401716	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,21,0
chr11	62402456	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=108,78;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:6,2:5,9,0,2
chr11	62414695	.	GC	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,75;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.169:21:12,3:5,0:0|1:62414695_GC_G:62414695:9,9,2,1
chr11	62414700	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=139,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.183:20:10,3:6,0:0|1:62414695_GC_G:62414695:8,9,2,1
chr11	62433464	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=14,31;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:62433464_T_G:62433464:0,2,1,0
chr11	62433468	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:62433464_T_G:62433464:0,2,1,0
chr11	62458275	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr11	62459994	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,4:3,0:0,6,0,4
chr11	62460066	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=121,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr11	62462015	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=135,73147;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:0|1:62462015_T_C:62462015:12,12,2,0
chr11	62462022	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=132,73147;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:0|1:62462015_T_C:62462015:11,12,2,0
chr11	62488916	.	T	TG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.479:26:4,3:7,6:4,9,1,12
chr11	62489267	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:3,7:3,7:5,1,9,5
chr11	62490219	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:7,9:9,7:10,6,5,11
chr11	62520626	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:7,6:4,7:5,6,4,9
chr11	62521408	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:3,2:3,3,3,1
chr11	62532608	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=105,0;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.156:21:10,2:8,0:0|1:62532608_C_T:62532608:14,4,1,2
chr11	62532609	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=97,138;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,2:0.129:21:12,1:7,1:1|0:62532608_C_T:62532608:13,6,2,0
chr11	62532905	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62532905_A_AT:62532905:0,0,0,1
chr11	62532907	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:62532905_A_AT:62532905:0,0,0,1
chr11	62533261	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=163,192;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.355:6:1,1:2,1:0,4,1,1
chr11	62559351	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=124,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.547:44:9,14:9,9:10,10,11,13
chr11	62564009	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,4:4,6:3,8,4,7
chr11	62564903	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=92,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:7,2:0|1:62564903_G_T:62564903:4,16,1,1
chr11	62564910	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=77,64;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:62564903_G_T:62564903:4,14,1,1
chr11	62564914	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=64,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,0:5,3:4,13,1,2
chr11	62564916	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=62,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:9,0:1,4:2,9,2,3
chr11	62564924	.	A	C,G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,35,20;MFRL=110,129,64;MMQ=60,33,60;MPOS=19,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.30,6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.202,0.187:12:6,0,0:1,2,2:1,7,1,3
chr11	62565908	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32,30;MFRL=239,185,167;MMQ=60,54,60;MPOS=17,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=5.46,7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.253,0.396:9:1,0,2:2,2,2:3,0,5,1
chr11	62565923	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:4,1:6,1:11,3,2,0
chr11	62571540	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	62600642	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=152,82;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:0|1:62600642_G_T:62600642:2,17,1,1
chr11	62600646	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=152,82;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:0|1:62600642_G_T:62600642:2,17,1,1
chr11	62600648	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=146,82;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:10,2:0|1:62600642_G_T:62600642:1,17,1,1
chr11	62600656	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=161,82;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:62600642_G_T:62600642:0,13,1,1
chr11	62600659	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=161,82;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:62600642_G_T:62600642:0,12,1,1
chr11	62601867	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=137,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0|1:62601867_A_C:62601867:0,8,2,0
chr11	62601871	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=135,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,1:0|1:62601867_A_C:62601867:1,9,2,0
chr11	62601875	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=135,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:3,0:5,0:0|1:62601867_A_C:62601867:1,9,2,0
chr11	62652063	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.367:47:17,6:13,11:5,25,3,14
chr11	62677534	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=202,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:3,3,0,2
chr11	62747145	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr11	62748839	.	C	CAAAGGCCAGGCAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:62748839_C_CAAAGGCCAGGCAT:62748839:0,2,0,1
chr11	62748842	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:62748839_C_CAAAGGCCAGGCAT:62748839:0,2,0,1
chr11	62751721	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=2898862,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:0,1:1,1,2,3
chr11	62752182	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=243,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr11	62763361	.	C	CAATTCAACCAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=1448618,210;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.381:3:0,1:2,0:0|1:62763361_C_CAATTCAACCAA:62763361:0,2,0,1
chr11	62763363	.	G	GCCACAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,19;MFRL=1448618,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:62763361_C_CAATTCAACCAA:62763361:0,2,0,1
chr11	62847352	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:4,3:5,0:8,2,1,2
chr11	62848367	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,12,3
chr11	62848664	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr11	62848995	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,21,3
chr11	62850684	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:9,6:6,2:12,3,6,2
chr11	62886319	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:3,0,7,0
chr11	62951064	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	62995875	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr11	63058051	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=120,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:10,1:17,1:10,17,2,0
chr11	63064970	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,7,4
chr11	63066903	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr11	63067138	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,1:0,12:0,0,2,11
chr11	63069715	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr11	63078420	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:7,1:13,0,2,0
chr11	63231118	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.220:11:4,0:5,2:1,8,1,1
chr11	63278621	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=210,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr11	63357919	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	63381350	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	63381434	.	T	TGCCCC	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=117,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.549:7:0,4:2,0:0|1:63381434_T_TGCCCC:63381434:1,2,4,0
chr11	63381437	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=117,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.548:7:1,4:2,0:0|1:63381434_T_TGCCCC:63381434:1,2,4,0
chr11	63381444	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=90,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,3:1,0:0|1:63381444_G_C:63381444:0,2,5,0
chr11	63381447	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=117,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.490:6:1,2:2,0:0|1:63381434_T_TGCCCC:63381434:1,2,3,0
chr11	63381448	.	AG	CA	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=33,17;MFRL=90,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0,2,2,0
chr11	63381454	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=117,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,1:2,1:0|1:63381444_G_C:63381444:2,3,4,0
chr11	63381458	.	CG	C,GG	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=30,16,18;MFRL=117,139,199;MMQ=60,60,60;MPOS=6,0;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.07,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,1,1:0.202,0.202:7:3,0,0:2,0,0:2,3,2,0
chr11	63410985	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:5,8:6,3:1,10,4,7
chr11	63413962	.	AAAAT	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAT;STR;TLOD=86.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,25:0.448:56:10,15:16,10:24,7,17,8
chr11	63438836	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,27:0.467:58:18,12:11,13:19,12,13,14
chr11	63486513	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:15,4,2,0
chr11	63668557	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	63673522	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,10;MFRL=114,93;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.211:26:10,0:3,0:17,3,6,0
chr11	63673603	.	CTG	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=112,48;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.675:12:0,5:4,3:1,3,1,7
chr11	63675716	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:5,2:8,0:7,7,2,0
chr11	63675760	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=135,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:2,7,0,2
chr11	63676313	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.552:7:1,2:2,1:3,0,2,2
chr11	63679918	.	GCT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,1:10,1:5,13,0,2
chr11	63680045	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=232,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,3,2
chr11	63680297	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:0,6:1,5:1,0,6,6
chr11	63680493	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=207,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:63680493_A_T:63680493:0,1,0,1
chr11	63680496	.	T	TTCTCTGTCTCTTACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=207,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63680493_A_T:63680493:0,1,0,1
chr11	63681648	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:0,3,3,3
chr11	63682312	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0|1:63682312_G_C:63682312:0,0,6,6
chr11	63682315	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0|1:63682312_G_C:63682312:0,0,6,5
chr11	63682317	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.585:10:2,5:1,1:0|1:63682312_G_C:63682312:2,2,3,3
chr11	63682318	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.916:11:0,8:0,3:0|1:63682312_G_C:63682312:0,0,6,5
chr11	63682319	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.585:10:2,5:2,1:0|1:63682312_G_C:63682312:2,2,3,3
chr11	63683741	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=207,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:63683741_T_C:63683741:2,0,1,0
chr11	63683745	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=207,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:63683741_T_C:63683741:2,0,1,0
chr11	63683750	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:63683741_T_C:63683741:1,0,1,0
chr11	63713239	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr11	63719621	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:2,0,5,0
chr11	63720086	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,1,16
chr11	63886066	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=33,33,33,32;MFRL=124,110,140,155;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,22,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.60,42.85,4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:24,6,24,4:0.095,0.406,0.083:58:14,5,11,3:8,1,11,1:6,18,10,24
chr11	63918902	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,10;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr11	63962067	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,84;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:16,2:10,0:11,15,2,0
chr11	63963378	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr11	63964657	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=220,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,3:1,4:7,0,8,0
chr11	63965526	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,10;MFRL=140,174;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.147:22:2,0:9,0:0,19,0,3
chr11	63965532	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=19,10;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.176:22:1,0:7,0:0,18,0,4
chr11	63965534	.	C	CTT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=164,167;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.391:25:3,2:10,5:0,15,0,10
chr11	63967770	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,3:2,3:2,3,1,6
chr11	63978659	.	G	GTTTTGGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=256,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr11	63979051	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=12,13;MFRL=225,223;MMQ=60,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:63979051_A_C:63979051:1,0,1,0
chr11	63979059	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,14;MFRL=225,223;MMQ=60,47;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:63979051_A_C:63979051:1,0,1,0
chr11	63979064	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,224;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr11	63979069	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=170,223;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:63979051_A_C:63979051:2,0,1,0
chr11	63988053	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.538:18:1,0:1,1:8,0,10,0
chr11	63990505	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.435:23:7,1:6,8:7,6,8,2
chr11	63994692	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:63994692_T_C:63994692:0,0,0,3
chr11	63994696	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:63994692_T_C:63994692:0,0,0,3
chr11	63996700	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,27;MFRL=207,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.709:4:0,2:0,0:0|1:63996700_A_C:63996700:1,0,3,0
chr11	63996705	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=187,237;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.517:4:0,1:1,0:0|1:63996700_A_C:63996700:2,0,2,0
chr11	63999529	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	64004557	.	AAGAGAGAGAGAGAG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,12;RU=AG;STR;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.871:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr11	64004906	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=60,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.401:10:3,1:1,0:0|1:64004906_A_C:64004906:4,2,4,0
chr11	64004912	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=119,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.328:10:3,0:2,0:0|1:64004906_A_C:64004906:5,2,3,0
chr11	64010064	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,1:2,1:2,4,0,4
chr11	64011614	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TG;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	64023752	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr11	64024056	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=69,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr11	64026219	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,3:0,1:2,1,0,4
chr11	64026685	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:0,8,1,3
chr11	64027562	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=98,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:1,2:3,4:2,2,4,2
chr11	64029164	.	G	GCCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:5,0:9,2:3,13,1,1
chr11	64029175	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.469:14:2,1:2,0:2,5,0,7
chr11	64029643	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:64029643_C_CA:64029643:0,2,0,1
chr11	64029644	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:64029643_C_CA:64029643:0,2,0,1
chr11	64030944	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr11	64033555	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:6,0,6,1
chr11	64070940	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,1,1
chr11	64082437	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr11	64083252	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=11;MBQ=31,34;MFRL=163,151;MMQ=60,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,4:0.080:60:27,2:20,2:0|1:64083252_T_C:64083252:37,19,4,0
chr11	64083269	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=159,123;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,6:0.101:67:30,2:27,4:0|1:64083252_T_C:64083252:43,18,6,0
chr11	64083276	.	A	T	.	.	DP=68;ECNT=11;MBQ=32,29;MFRL=157,123;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,6:0.100:68:32,2:26,4:0|1:64083252_T_C:64083252:44,18,6,0
chr11	64083290	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=157,128;MMQ=60,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,7:0.104:75:35,2:29,5:0|1:64083252_T_C:64083252:51,17,7,0
chr11	64083293	.	G	T	.	.	DP=81;ECNT=11;MBQ=28,31;MFRL=158,154;MMQ=60,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,8:0.108:81:36,1:30,5:0|1:64083252_T_C:64083252:54,19,8,0
chr11	64083295	.	CGGG	C	.	.	DP=83;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=158,154;MMQ=60,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,8:0.106:83:38,3:32,5:0|1:64083252_T_C:64083252:54,21,8,0
chr11	64083300	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=11;MBQ=28,31;MFRL=157,154;MMQ=60,31;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,8:0.107:82:37,3:32,4:0|1:64083252_T_C:64083252:53,21,8,0
chr11	64083318	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=156,131;MMQ=60,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,10:0.126:85:39,3:31,5:0|1:64083252_T_C:64083252:49,26,8,2
chr11	64083320	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=11;MBQ=31,29;MFRL=156,131;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,10:0.125:86:42,4:32,6:0|1:64083252_T_C:64083252:50,26,8,2
chr11	64083328	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=154,131;MMQ=60,36;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,10:0.125:86:39,4:33,6:0|1:64083252_T_C:64083252:47,29,8,2
chr11	64083331	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=11;MBQ=30,33;MFRL=149,131;MMQ=60,36;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,10:0.125:86:40,3:34,4:0|1:64083252_T_C:64083252:44,32,8,2
chr11	64085074	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,5:0,0,0,12
chr11	64085938	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	64088435	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,6,5
chr11	64088557	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=120,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.243:31:9,3:14,4:12,12,2,5
chr11	64107893	.	G	GCCACGCCCTTAACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr11	64108539	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:4,4,2,3
chr11	64108662	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.264:21:9,2:3,1:5,11,5,0
chr11	64108833	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:11,2:19,0:8,22,0,2
chr11	64111794	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,4:5,5:6,4,7,2
chr11	64119681	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:5,6:10,1:8,7,0,7
chr11	64119801	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr11	64120435	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr11	64121278	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:11,2:3,0:7,7,0,2
chr11	64124980	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.614:11:3,1:1,6:1,3,1,6
chr11	64127881	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr11	64135541	.	GTC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:3,1,4,0
chr11	64135561	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.223:10:3,0:3,0:5,3,2,0
chr11	64137875	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:4,5:5,8:2,7,5,8
chr11	64137933	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,0:0|1:64137933_T_G:64137933:0,2,0,1
chr11	64137937	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:64137933_T_G:64137933:0,2,0,1
chr11	64137955	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64137933_T_G:64137933:0,0,0,1
chr11	64138048	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	64138905	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:3,2:3,3:0,8,0,5
chr11	64326795	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	64360433	.	AA	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr11	64365943	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=209,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:6,0,6,0
chr11	64367048	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:64367048_A_C:64367048:0,0,1,0
chr11	64367050	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64367048_A_C:64367048:0,0,1,0
chr11	64367056	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:64367048_A_C:64367048:0,0,1,0
chr11	64368428	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=254,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,0:3,2:0,3,1,2
chr11	64368440	.	TC	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=214,3209718;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:64368440_TC_CA:64368440:0,3,0,1
chr11	64368449	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=214,3209718;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:64368440_TC_CA:64368440:0,3,0,1
chr11	64368451	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=214,3209718;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:64368440_TC_CA:64368440:0,3,0,1
chr11	64368453	.	AG	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=214,3209718;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:64368440_TC_CA:64368440:0,3,0,1
chr11	64402695	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:4,2,4,3
chr11	64415903	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	64418145	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=153,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:2,1:0|1:64418145_G_T:64418145:0,3,0,1
chr11	64418147	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=153,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:64418145_G_T:64418145:0,3,0,1
chr11	64418148	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=153,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:64418145_G_T:64418145:0,3,0,1
chr11	64418152	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=14,31;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:0|1:64418145_G_T:64418145:0,4,0,1
chr11	64418155	.	T	TTCAG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=14,31;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:0,1:0|1:64418145_G_T:64418145:0,4,0,1
chr11	64418160	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:64418145_G_T:64418145:0,4,0,1
chr11	64465403	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=138,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr11	64497161	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr11	64497189	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.904:18:1,9:0,8:0,1,11,6
chr11	64503179	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	64503496	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr11	64503543	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	64507315	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	64507680	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr11	64507799	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr11	64514884	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=183,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr11	64519177	.	G	GGCAGCAAACTTCAACTTGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=141,526;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0,5,1,0
chr11	64520942	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr11	64521193	.	AAC	GTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr11	64521288	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,14;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:64521288_T_A:64521288:0,2,1,0
chr11	64521302	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=102,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.246:6:3,0:2,1:0|1:64521288_T_A:64521288:0,5,1,0
chr11	64522066	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	64525216	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,6:0,0,12,4
chr11	64525644	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	64527179	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=185,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,0:6,3:12,2,2,1
chr11	64534945	.	GCC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64534945_GCC_G:64534945:0,1,0,1
chr11	64534949	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64534945_GCC_G:64534945:0,1,0,1
chr11	64535357	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr11	64535849	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr11	64536866	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,10,5
chr11	64543937	.	CAA	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=64.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.515:33:7,6:9,9:12,4,15,2
chr11	64563934	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr11	64566771	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	64569297	.	A	AATCCTGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	64572018	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr11	64572749	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,37;MFRL=171,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	64573765	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:15,0:10,2:17,9,1,1
chr11	64594086	.	G	GGGTGGA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:1,1:1,0:0|1:64594086_G_GGGTGGA:64594086:2,1,0,1
chr11	64594091	.	T	TTCTTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:64594086_G_GGGTGGA:64594086:2,1,0,1
chr11	64594093	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:64594086_G_GGGTGGA:64594086:2,1,0,1
chr11	64594490	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr11	64597574	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr11	64598944	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr11	64601897	.	TCACCGCTCA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=178,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:3,1,0,1
chr11	64601933	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr11	64602757	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:64602757_T_C:64602757:2,0,2,1
chr11	64602782	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=102,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:2,1:1,1:1|0:64602757_T_C:64602757:4,1,2,0
chr11	64605689	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr11	64606765	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr11	64606910	.	C	CCTGCTCCCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:1,4:7,3:5,3,6,1
chr11	64627351	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.626:9:1,1:2,3:2,1,6,0
chr11	64668488	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:13,8,1,1
chr11	64668644	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0,4,0,1
chr11	64668654	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr11	64669417	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	64670172	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=11,12;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr11	64674676	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr11	64674835	.	A	ATACTAAGCCGGGTGATCTTGAACGAGT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:4,0:6,5,1,1
chr11	64678013	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=208,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr11	64695185	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=148,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.339:4:1,1:2,0:0|1:64695185_GAA_G:64695185:3,0,1,0
chr11	64695216	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=148,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:0,0:3,0:0|1:64695185_GAA_G:64695185:5,0,1,0
chr11	64695987	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=201,157;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr11	64699210	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=120,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:1,0:2,0:0|1:64699210_A_C:64699210:4,1,2,0
chr11	64699215	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=108,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:2,0:0|1:64699210_A_C:64699210:3,1,2,0
chr11	64699222	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=120,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,0:4,0:0|1:64699210_A_C:64699210:5,2,2,0
chr11	64700409	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,1:4,1:0|1:64700409_G_A:64700409:1,15,0,2
chr11	64700415	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:11,0:2,1:0|1:64700409_G_A:64700409:0,14,0,2
chr11	64700553	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64700553_G_T:64700553:1,0,0,1
chr11	64700554	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64700553_G_T:64700553:1,0,0,1
chr11	64700556	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64700553_G_T:64700553:1,0,0,1
chr11	64700561	.	AGAGG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64700553_G_T:64700553:1,0,0,1
chr11	64715330	.	CTT	C,CT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=19,20,20;MFRL=148,190,169;MMQ=60,60,60;MPOS=24,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=5.65,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,3:0.253,0.210:16:2,1,0:1,2,3:1,8,0,7
chr11	64715343	.	TTTTTTG	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,0:10,1:2,19,1,1
chr11	64726968	.	ATCTG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=196,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64726968_ATCTG_A:64726968:0,1,0,1
chr11	64726973	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=196,117;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64726968_ATCTG_A:64726968:0,1,0,1
chr11	64794918	.	T	TG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=57.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.571:33:6,10:8,9:14,0,19,0
chr11	64799789	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=212,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,1:2,1:1,2,1,2
chr11	64799894	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,3,1
chr11	64802267	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr11	64803216	.	C	CCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64803216_C_CCCT:64803216:0,1,0,1
chr11	64803217	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64803216_C_CCCT:64803216:0,1,0,1
chr11	64807294	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,3:5,3:4,7,0,6
chr11	64815417	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=14,13;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:64815417_A_C:64815417:2,0,2,0
chr11	64815425	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,0:0|1:64815417_A_C:64815417:4,1,3,0
chr11	64815432	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,0:2,1:0|1:64815417_A_C:64815417:5,1,3,0
chr11	64815436	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,0:1,0:0|1:64815417_A_C:64815417:5,1,3,0
chr11	64815447	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=22,13;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,0:0|1:64815417_A_C:64815417:7,1,2,0
chr11	64820654	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:5,3:1,0:4,3,3,0
chr11	64826067	.	TT	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=233,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	64851453	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr11	64852676	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,1:7,2:6,10,0,3
chr11	64863969	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,2:2,2:3,2,1,4
chr11	64875614	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	64876390	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:4,8,3,4
chr11	64876740	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=251,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr11	64879121	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	64881116	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=62,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:2,0,0,2
chr11	64882281	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:17,0:18,4:18,17,3,1
chr11	64883864	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr11	64884052	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,13,6
chr11	64884402	.	C	CTGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=158,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64884402_C_CTGGG:64884402:1,0,0,1
chr11	64884404	.	CAGAAG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=177,259;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:64884402_C_CTGGG:64884402:2,0,0,1
chr11	64884420	.	G	GTGTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=179,259;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,0,1
chr11	64896237	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=201,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,0,4
chr11	64897453	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:3,1:3,3:7,0,2,2
chr11	64897636	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:14,10,1,1
chr11	64898357	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr11	64955369	.	GA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.163:28:7,0:13,4:19,5,4,0
chr11	64972354	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=203,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr11	64977424	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:5,2:5,1:4,6,3,1
chr11	64977644	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr11	64977936	.	A	AGTTCCTCTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr11	64977937	.	A	G,AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32,30;MFRL=0,144,144;MMQ=60,60,60;MPOS=16,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.16,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.625,0.250:5:0,3,0:0,1,1:0,0,0,5
chr11	65003812	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	65004301	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	65046347	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:0|1:65046347_C_T:65046347:5,11,0,2
chr11	65046351	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,1:8,1:0|1:65046347_C_T:65046347:5,13,0,2
chr11	65046354	.	C	CAAAACAGGTTAATA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:8,1:0|1:65046347_C_T:65046347:3,12,0,2
chr11	65055388	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=187,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:65055388_CA_AG:65055388:0,4,0,1
chr11	65055395	.	GT	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=188,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:65055388_CA_AG:65055388:0,4,0,1
chr11	65055396	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:65055388_CA_AG:65055388:0,3,0,1
chr11	65061709	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:16,2:10,0:8,19,0,2
chr11	65113780	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=122,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:0|1:65113780_C_A:65113780:9,13,1,1
chr11	65113784	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:65113780_C_A:65113780:10,13,1,1
chr11	65125175	.	G	GACCCCTCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	65147294	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr11	65161176	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	65178620	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,5:0,1:0,0,7,1
chr11	65303567	.	GCT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:3,8,1,1
chr11	65314810	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	65315563	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:3,9,0,2
chr11	65320780	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr11	65320984	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:4,6,1,1
chr11	65321231	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	65338953	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:7,7,0,2
chr11	65339261	.	TT	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=182,286;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:65339261_TT_AA:65339261:0,3,0,1
chr11	65339264	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=197,286;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:65339261_TT_AA:65339261:0,2,0,1
chr11	65349037	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,2:3,2:2,4,2,3
chr11	65349063	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,3,7
chr11	65357697	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr11	65359625	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr11	65373312	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=103,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,2:15,0:10,18,0,2
chr11	65373621	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	65380778	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:5,1:7,4,0,2
chr11	65383755	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=220,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr11	65384863	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,1:11,1:13,8,0,2
chr11	65394322	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr11	65414579	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	65421972	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,156;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:1,0:13,2:2,13,1,1
chr11	65422284	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.149:22:7,1:10,1:12,7,0,3
chr11	65423082	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr11	65425803	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:10,3,1,1
chr11	65480596	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr11	65480764	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,19;MFRL=166,266;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.405:3:1,0:0,0:2,0,1,0
chr11	65480768	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=14,27;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.600:5:0,2:0,1:2,0,2,1
chr11	65480791	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr11	65481166	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,26:0,16:0,0,18,26
chr11	65546857	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.356:29:11,6:7,3:8,11,1,9
chr11	65547120	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:3,2,0,3
chr11	65601644	.	GGTGGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=140,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.204:18:8,1:5,2:0,15,0,3
chr11	65617113	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	65617981	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,2:5,0:6,10,0,2
chr11	65623347	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr11	65625705	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=12,17;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:2,0:1,1:0,15,0,4
chr11	65629932	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,13:0,10:0|1:65629932_T_C:65629932:0,0,9,15
chr11	65629934	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0|1:65629932_T_C:65629932:0,0,9,15
chr11	65630698	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,4,10
chr11	65631879	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:65631879_C_A:65631879:0,0,4,2
chr11	65631881	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:65631879_C_A:65631879:0,0,4,2
chr11	65634518	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.223:20:9,2:7,2:6,10,2,2
chr11	65635559	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr11	65637273	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr11	65637984	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=112.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,14:0,0,24,7
chr11	65639374	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr11	65647260	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr11	65647796	.	CT	C,CTT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,29,23;MFRL=145,114,136;MMQ=60,60,60;MPOS=24,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.80,4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,8,5:0.152,0.119:44:18,5,4:10,2,0:8,23,4,9
chr11	65651144	.	C	CTGCCCGCGTGTTCTGTGCTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=209,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	65651830	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr11	65652684	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=105,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.753:6:0,0:1,2:0|1:65652684_T_G:65652684:1,0,0,5
chr11	65652687	.	G	GC,GCCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=17,12,12;MFRL=105,201,144;MMQ=60,59,60;MPOS=13,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.10,3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,3:0.260,0.498:5:0,0,0:0,0,0:1,0,0,4
chr11	65652688	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=105,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.746:6:0,0:1,0:0|1:65652684_T_G:65652684:1,0,0,5
chr11	65655259	.	G	GCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr11	65661415	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	65684855	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	65686967	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:6,1:9,8:6,9,5,4
chr11	65744275	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	65744597	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr11	65746519	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,13;MFRL=130,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.160:34:12,0:13,1:4,24,6,0
chr11	65767153	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,8:0,11:0,0,6,13
chr11	65767215	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	65770658	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=141.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,21:0,17:0,0,38,0
chr11	65770686	.	CT	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:22,3:24,0:44,7,3,0
chr11	65780702	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr11	65780874	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=125,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:4,2:0|1:65780874_A_T:65780874:6,4,1,1
chr11	65780879	.	C	CTATTTT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=127,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:65780874_A_T:65780874:6,5,1,1
chr11	65780880	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=127,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:65780874_A_T:65780874:6,5,1,1
chr11	65780882	.	A	ACTTGTTGCCCT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=127,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:65780874_A_T:65780874:6,5,1,1
chr11	65811208	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,1,4
chr11	65827994	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=188,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr11	65831275	.	T	TAGAATAAAACCCAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	65983522	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr11	66001418	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=118,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:1,5,2,3
chr11	66002681	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=200,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:2,4:4,4:7,0,7,1
chr11	66006798	.	C	CTGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66006798_C_CTGG:66006798:0,0,0,1
chr11	66006799	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66006798_C_CTGG:66006798:0,0,0,1
chr11	66006802	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66006798_C_CTGG:66006798:0,0,0,1
chr11	66006805	.	A	AGGAGTGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66006798_C_CTGG:66006798:0,0,0,1
chr11	66010633	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr11	66029130	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	66031450	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,4:0,4:0,0,4,6
chr11	66031660	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:4,1,0,6
chr11	66033301	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:7,8:10,8:12,5,11,5
chr11	66036293	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=226,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,0:1,2:0,1,0,5
chr11	66043742	.	CCTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr11	66046030	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=169,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:66046030_G_A:66046030:1,1,0,1
chr11	66046039	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,26;MFRL=200,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:66046030_G_A:66046030:1,0,0,1
chr11	66046043	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,30;MFRL=200,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:66046030_G_A:66046030:1,0,0,1
chr11	66046044	.	TGGGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,16;MFRL=200,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:66046030_G_A:66046030:1,0,0,1
chr11	66050712	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,6:2,1:3,2,5,2
chr11	66050948	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr11	66052832	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:5,3,5,3
chr11	66062367	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	66082215	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:5,0,5,0
chr11	66084579	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	66101974	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0|1:66101974_C_T:66101974:0,0,7,9
chr11	66101978	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.378:14:5,2:3,3:0|1:66101974_C_T:66101974:3,6,2,3
chr11	66102807	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:5,0,5,1
chr11	66103046	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,9,3
chr11	66106331	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,0:11,3:4,19,0,3
chr11	66108894	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr11	66109189	.	TGCC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr11	66113878	.	TT	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:2,1,0,1
chr11	66131662	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,10;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:66131662_TC_GG:66131662:0,1,1,0
chr11	66131666	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,12;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:66131662_TC_GG:66131662:0,1,1,0
chr11	66131674	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:66131662_TC_GG:66131662:1,1,1,0
chr11	66131679	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=17,29;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:66131662_TC_GG:66131662:1,1,1,0
chr11	66131906	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr11	66133311	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=139,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr11	66134085	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	66138894	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr11	66192261	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,1:11,2:11,7,3,0
chr11	66203674	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	66236431	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,3:6,4:0,10,1,6
chr11	66240882	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=104,139;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:3,3:6,0:5,4,0,4
chr11	66254678	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=214,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr11	66255515	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=191,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr11	66255562	.	T	TCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66255562_T_TCC:66255562:0,0,0,1
chr11	66255566	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66255562_T_TCC:66255562:0,0,0,1
chr11	66255567	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66255562_T_TCC:66255562:0,0,0,1
chr11	66258916	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.414:22:4,2:8,6:3,10,2,7
chr11	66260112	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	66262606	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,9,5
chr11	66262806	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,3,2
chr11	66278059	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr11	66283257	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:7,10:3,4:7,3,11,3
chr11	66288733	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:5,5:4,4:6,3,8,2
chr11	66293779	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr11	66298485	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.101:28:11,2:10,0:10,16,2,0
chr11	66318937	.	C	CCCCAGTTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr11	66318972	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr11	66321538	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=135,139;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:4,7,0,2
chr11	66321658	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:66321658_C_CAG:66321658:0,3,0,1
chr11	66321661	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:66321658_C_CAG:66321658:0,3,0,1
chr11	66321680	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:66321658_C_CAG:66321658:0,1,0,1
chr11	66324583	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,3:0,2:2,0,3,2
chr11	66327552	.	G	GTAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,1,1
chr11	66328852	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=125,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,2:4,1:1,5,1,2
chr11	66333072	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,3:2,0,4,2
chr11	66333643	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,0:2,2:4,0,2,0
chr11	66335548	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,8:8,5:4,8,4,9
chr11	66384143	.	C	A	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,32:0.465:69:19,14:15,16:27,10,24,8
chr11	66411626	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.473:22:5,7:3,2:5,7,0,10
chr11	66458696	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,3:2,8:3,0,8,4
chr11	66469032	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,13,11
chr11	66481264	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr11	66482945	.	G	GCACACCGCCACCTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=154,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:66482945_G_GCACACCGCCACCTCT:66482945:0,3,0,1
chr11	66482953	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=154,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:66482945_G_GCACACCGCCACCTCT:66482945:0,3,0,1
chr11	66483265	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,36;MFRL=97,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.595:5:1,1:0,2:1,1,3,0
chr11	66512290	.	G	GGGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GGC;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr11	66605882	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,1:10,1:10,9,2,0
chr11	66617186	.	CG	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,1:7,2:4,12,0,3
chr11	66626093	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	67051904	.	C	CAATCTTTTTCTTTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=228,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	67052466	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,7,12
chr11	67052493	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=188,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:9,1:11,1:8,14,0,2
chr11	67058846	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,211;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:67058846_AG_A:67058846:0,0,1,0
chr11	67058851	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,211;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:67058846_AG_A:67058846:0,0,1,0
chr11	67058861	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=202,211;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:67058846_AG_A:67058846:1,0,1,0
chr11	67066623	.	G	GAGAGTTTCCAAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:67066623_G_GAGAGTTTCCAAGA:67066623:0,0,0,1
chr11	67066625	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67066623_G_GAGAGTTTCCAAGA:67066623:0,0,0,1
chr11	67067120	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:6,2:16,0:5,18,1,1
chr11	67067377	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:11,0:6,16,2,0
chr11	67075973	.	C	CTCCCCACCT	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=34,18;MFRL=158,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:3,1:1,0:0|1:67075973_C_CTCCCCACCT:67075973:0,4,1,1
chr11	67075978	.	GGC	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=158,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:67075973_C_CTCCCCACCT:67075973:0,4,1,1
chr11	67075985	.	C	CATTAG	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=158,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0|1:67075973_C_CTCCCCACCT:67075973:0,4,1,1
chr11	67075986	.	C	CAGAG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=158,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:67075973_C_CTCCCCACCT:67075973:0,4,0,1
chr11	67075988	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,26;MFRL=158,55;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:67075973_C_CTCCCCACCT:67075973:0,4,0,1
chr11	67076055	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	67076810	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr11	67079453	.	AG	TT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67079453_AG_TT:67079453:0,0,0,1
chr11	67079457	.	C	CTTACCCAATCTTCCTCCCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67079453_AG_TT:67079453:0,0,0,1
chr11	67160933	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=152,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:5,2,5,0
chr11	67163092	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,1:1,2:3,0,3,0
chr11	67171851	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr11	67186438	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr11	67191644	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:12,0:10,10,2,0
chr11	67196026	.	G	GGGGT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.270:22:9,2:5,2:0|1:67196026_G_GGGGT:67196026:11,5,6,0
chr11	67196030	.	TTGA	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=157,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,0:4,0:0|1:67196026_G_GGGGT:67196026:14,6,3,0
chr11	67196038	.	GA	TT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:7,0:0|1:67196026_G_GGGGT:67196026:15,8,2,0
chr11	67206234	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=127,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,4:2,2:2,2,6,1
chr11	67223086	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=217,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:4,2,3,3
chr11	67262282	.	C	CGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,7:0,0:0|1:67262282_C_CGA:67262282:0,0,8,0
chr11	67262289	.	G	GCGAGTGGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,9:0,0:0|1:67262282_C_CGA:67262282:0,0,9,1
chr11	67263767	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr11	67267962	.	C	CCTAGATGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67267962_C_CCTAGATGA:67267962:1,0,0,1
chr11	67267964	.	T	TTTTTCATA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67267962_C_CCTAGATGA:67267962:1,0,0,1
chr11	67267967	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:67267962_C_CCTAGATGA:67267962:0,0,0,1
chr11	67289333	.	CACCCGATG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.766:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr11	67289555	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	67290665	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=33,13;MFRL=132,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,0:2,0:0|1:67290665_G_C:67290665:3,2,2,0
chr11	67290669	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=25,13;MFRL=132,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,0:0|1:67290665_G_C:67290665:3,2,2,0
chr11	67290674	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,14;MFRL=132,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,0:3,0:0|1:67290665_G_C:67290665:4,3,2,0
chr11	67290676	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,11;MFRL=135,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:5,0:0|1:67290665_G_C:67290665:7,3,2,0
chr11	67290678	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,17;MFRL=138,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:6,0:0|1:67290665_G_C:67290665:8,4,2,0
chr11	67290682	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,23;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,1:8,0:0|1:67290665_G_C:67290665:13,8,2,0
chr11	67351529	.	A	AG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=78.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.953:18:0,6:0,10:0|1:67351529_A_AG:67351529:0,0,17,1
chr11	67351540	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.956:20:0,8:0,11:0|1:67351529_A_AG:67351529:0,0,18,2
chr11	67376198	.	G	GATGGTTAATTTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=211,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	67376978	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,60;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:6,9,0,3
chr11	67396512	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.517:19:5,4:4,6:1,8,0,10
chr11	67399735	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr11	67431038	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	67431110	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr11	67432656	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr11	67433510	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:67433510_AG_CC:67433510:1,0,1,0
chr11	67433514	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:67433510_AG_CC:67433510:1,0,1,0
chr11	67433708	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr11	67433758	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr11	67763047	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,143;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=C;STR;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,1:0|1:67763047_GC_G:67763047:0,0,0,6
chr11	67763060	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=104,148;MMQ=54,42;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.728:9:1,4:1,3:0|1:67763047_GC_G:67763047:2,0,1,6
chr11	67763224	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,161;MMQ=52,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:0,7,1,6
chr11	67765163	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	67782947	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=82,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,20:0.463:43:12,12:9,6:8,15,8,12
chr11	67782954	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=30,10;MFRL=131,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.104:36:21,0:9,0:0|1:67782954_A_C:67782954:13,20,0,3
chr11	67782958	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=133,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:13,0:9,2:0|1:67782954_A_C:67782954:11,23,0,3
chr11	67782963	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.192:33:15,0:6,0:8,18,0,7
chr11	67786064	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,7,6
chr11	67786398	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr11	67786764	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr11	67789293	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=86.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,15:0,8:0,0,7,17
chr11	67790006	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr11	67790278	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,10;MFRL=179,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,0:0|1:67790278_C_T:67790278:0,2,0,1
chr11	67790294	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=204,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:67790278_C_T:67790278:0,1,0,1
chr11	67790303	.	A	AATCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=204,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:67790278_C_T:67790278:0,1,0,1
chr11	67793448	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=142,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr11	67793509	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,4:6,0:10,1,2,2
chr11	67795353	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr11	67795378	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	67799926	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=225,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr11	67800494	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr11	67804074	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:8,2:10,4:2,16,1,5
chr11	67804156	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=225,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr11	67808928	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=181,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:67808928_C_A:67808928:0,2,0,1
chr11	67808938	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=193,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:67808928_C_A:67808928:0,1,0,1
chr11	67810341	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.382:14:3,3:4,2:7,2,4,1
chr11	67811154	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:0,12,0,3
chr11	67811262	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,1,3
chr11	67837771	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr11	68131167	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,3:0,0,7,3
chr11	68133035	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,153;MMQ=60,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:8,0,6,0
chr11	68133251	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr11	68157299	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,5:1,0:3,0,4,1
chr11	68174359	.	A	AACGAACTCCCCAGTGGAAGATC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	68183984	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=185,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,0:3,3:5,6,1,2
chr11	68192518	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	68196961	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr11	68325968	.	CT	GG,TT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=19,18,24;MFRL=148,237,189;MMQ=60,60,60;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.26,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.346,0.321:6:0,0,0:0,0,1:2,0,4,0
chr11	68325976	.	C	G,T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,19,15;MFRL=127,238,198;MMQ=60,60,60;MPOS=15,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.26,9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.400:7:2,0,0:0,0,0:1,1,5,0
chr11	68338491	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr11	68452985	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	68506162	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:6,3:2,3:6,3,3,3
chr11	68527600	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr11	68530318	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	68548018	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=112,232;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr11	68548260	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr11	68566647	.	GAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=A;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:68566647_GAAA_G:68566647:0,0,3,1
chr11	68566651	.	A	ACGCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0|1:68566647_GAAA_G:68566647:0,0,3,1
chr11	68566839	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=119,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.797:8:1,5:0,2:0,1,2,5
chr11	68658686	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	68664103	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,6:3,3:3,5,5,4
chr11	68671104	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=220,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,5,1
chr11	68671280	.	G	GCCGCCGCCATCTTC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:5,4:8,7:8,6,6,5
chr11	68675512	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=223,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:2,3:0,1:2,0,7,0
chr11	68700701	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr11	68705876	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	68706935	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr11	68773740	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	68821648	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=211,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr11	68825037	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=89.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,8:0,15:0,0,15,10
chr11	68834968	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	68838028	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,2,2
chr11	68838999	.	CGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:68838999_CGGG_C:68838999:0,0,0,1
chr11	68839004	.	GGGC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:68838999_CGGG_C:68838999:0,0,0,1
chr11	68840014	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=393,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chr11	68845867	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=213,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr11	68846098	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,7,10
chr11	68846519	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr11	68853033	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	68853504	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=202,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:2,1:0,2,0,2
chr11	68855483	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	69063312	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.089:31:10,0:19,2:10,19,1,1
chr11	69458659	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:13,2:16,1:12,19,2,1
chr11	69465870	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.133:37:10,0:12,0:16,16,5,0
chr11	69588020	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,0:2,5:7,0,5,0
chr11	69588729	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	69625511	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr11	69924835	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.564:10:3,2:1,0:1,3,0,6
chr11	69924917	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr11	69934225	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,35;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.387:4:2,0:0,1:2,1,0,1
chr11	69954412	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr11	69957917	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:1,2:5,2:4,2,2,2
chr11	69957940	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr11	69962642	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr11	69970412	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,9,6
chr11	69970637	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	69998470	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,4:0,6:3,5,5,5
chr11	69999122	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr11	69999252	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,2,14
chr11	70001976	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0|1:70001976_A_G:70001976:0,0,7,0
chr11	70001986	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=14,34;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:1,0:0|1:70001976_A_G:70001976:4,0,1,0
chr11	70001990	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:70001976_A_G:70001976:4,0,1,0
chr11	70002184	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr11	70002185	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.670:6:0,2:1,2:0,2,0,4
chr11	70002987	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,8:3,4:7,3,8,4
chr11	70007484	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,4:3,2:0,5,0,7
chr11	70007865	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr11	70049523	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.436:16:5,4:4,3:9,0,7,0
chr11	70171782	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,167;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,1:1,2:0,7,0,3
chr11	70179549	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:19,2,2,0
chr11	70184537	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:0,4,3,5
chr11	70189805	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=124,49;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:12,8,2,0
chr11	70194334	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.522:19:7,3:2,7:8,1,8,2
chr11	70200594	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	70208350	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,4,7
chr11	70253389	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,5:6,3:7,4,6,2
chr11	70253586	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,4:3,1:3,4,3,2
chr11	70260609	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:0,3:4,1:4,0,4,0
chr11	70281277	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,0:1,2:1,5,0,2
chr11	70349061	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr11	70544921	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,2:1,2:0,3,1,4
chr11	70544937	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr11	70644655	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=152,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:0,1,3,5
chr11	70672585	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:5,6,1,1
chr11	70798895	.	CG	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:3,1:5,3:0|1:70798895_CG_C:70798895:5,4,4,0
chr11	70798902	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=106,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:3,1:6,4:0|1:70798895_CG_C:70798895:5,4,5,0
chr11	70805818	.	T	TTCATAAAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70805818_T_TTCATAAAC:70805818:0,0,0,1
chr11	70805819	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70805818_T_TTCATAAAC:70805818:0,0,0,1
chr11	70805823	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70805818_T_TTCATAAAC:70805818:0,0,0,1
chr11	70805826	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70805818_T_TTCATAAAC:70805818:0,0,0,1
chr11	70829858	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,3,1
chr11	70830030	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=123,56;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,0:4,2:0|1:70830030_G_A:70830030:7,7,1,1
chr11	70830035	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=120,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:3,2:0|1:70830030_G_A:70830030:7,8,1,1
chr11	70830044	.	C	CCAGAACTG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=123,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:3,1:0|1:70830030_G_A:70830030:7,7,1,1
chr11	71146952	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	71149856	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr11	71155265	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,2:2,5:0,3,3,5
chr11	71164471	.	G	A	.	.	DP=128;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=158.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,60:0.503:119:30,31:27,28:24,35,21,39
chr11	71164475	.	C	G	.	.	DP=121;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=157.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,55:0.470:117:33,28:28,27:20,42,19,36
chr11	71174553	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,3:3,3:2,5,0,6
chr11	71174589	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr11	71183645	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr11	71184498	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.356:7:3,2:1,0:2,3,1,1
chr11	71185357	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,2:6,1:7,1,3,0
chr11	71192551	.	C	CTCTTTATTATTTTTCTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr11	71193135	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:0,4,1,4
chr11	71208522	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=115,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.362:12:4,3:3,1:5,3,3,1
chr11	71209521	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:1,7:6,2:4,4,4,5
chr11	71238453	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=154,160;MMQ=45,43;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,5:3,2:4,6,5,2
chr11	71249386	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,5,8
chr11	71259997	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.429:23:7,2:6,6:1,12,2,8
chr11	71260047	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.533:15:2,5:5,3:4,3,2,6
chr11	71277647	.	CCGCT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,33;MFRL=248,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGCT;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	71277672	.	CC	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:71277672_CC_AG:71277672:0,2,0,1
chr11	71277675	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:71277672_CC_AG:71277672:0,2,0,1
chr11	71277679	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:71277672_CC_AG:71277672:0,2,0,1
chr11	71302451	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,137;MMQ=51,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:18,0:9,2:25,2,2,0
chr11	71302658	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,38;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	71302685	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:71302685_G_C:71302685:0,0,1,7
chr11	71302700	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,4:0|1:71302685_G_C:71302685:0,0,0,7
chr11	71304932	.	TTCG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	71510632	.	G	A	.	.	DP=148;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,147;MMQ=50,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:140,5:0.039:145:79,2:57,3:69,71,3,2
chr11	71668305	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:13,6:9,4:10,12,2,8
chr11	71668362	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=76.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,2,19
chr11	71712175	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	71714526	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0|1:71714526_G_C:71714526:0,0,10,6
chr11	71714528	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0|1:71714526_G_C:71714526:0,0,10,6
chr11	71714875	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=167,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.233:14:5,1:5,1:11,0,2,1
chr11	71715215	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:71715215_C_G:71715215:0,0,3,4
chr11	71715218	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,2:0,4:0|1:71715215_C_G:71715215:0,0,3,4
chr11	71723575	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=207,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:71723575_T_C:71723575:0,3,0,1
chr11	71723579	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=207,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:71723575_T_C:71723575:0,3,0,1
chr11	71727422	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=16,31;MFRL=93,155;MMQ=54,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.935:18:0,7:0,9:1,0,14,3
chr11	71728908	.	AGTCAAC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr11	71729656	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	71730467	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr11	71730715	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr11	71733519	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr11	71734211	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	71740378	.	A	AAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	71807767	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.665:13:1,7:3,1:3,1,6,3
chr11	71810072	.	CCATGTCCTGAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:3,1,1,0
chr11	71850156	.	C	CTA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,3:6,4:5,12,1,6
chr11	71850589	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:3,3:7,9:8,3,9,3
chr11	71932120	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr11	71932414	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=177,240;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:2,4,1,2
chr11	71939905	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,3:6,6:2,5,2,7
chr11	71940633	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.625:27:1,5:8,11:3,7,4,13
chr11	71941381	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,3:2,7:3,3,8,2
chr11	71941812	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=78,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:3,2,2,1
chr11	71943649	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=141,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:2,1:3,0:0|1:71943649_A_C:71943649:4,3,2,0
chr11	71943652	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=141,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.265:9:2,0:2,0:0|1:71943649_A_C:71943649:4,3,2,0
chr11	71944743	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=108,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:5,6,2,0
chr11	71945554	.	T	TGG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:5,1:2,0:0|1:71945554_T_TGG:71945554:0,8,2,0
chr11	71945558	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0|1:71945554_T_TGG:71945554:0,8,2,0
chr11	71945564	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:0|1:71945554_T_TGG:71945554:0,9,2,0
chr11	71946087	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr11	71946333	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:3,6:14,3:7,10,2,7
chr11	71948483	.	GC	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:14,2:0|1:71948483_GC_G:71948483:15,15,1,1
chr11	71948508	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,0:12,2:0|1:71948483_GC_G:71948483:14,14,1,1
chr11	72005283	.	A	ATG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=193,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TG;STR;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,5:0,2:0,2,7,0
chr11	72005346	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.438:13:3,0:3,0:0,7,6,0
chr11	72290541	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=18,26;MFRL=51,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.417:4:0,1:1,1:0|1:72290541_T_TC:72290541:0,2,2,0
chr11	72290547	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,11;MFRL=51,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.417:4:0,0:2,0:0|1:72290541_T_TC:72290541:0,2,2,0
chr11	72290551	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,17;MFRL=102,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.347:5:0,0:2,1:0|1:72290541_T_TC:72290541:0,3,2,0
chr11	72290556	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=106,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.296:6:0,1:3,1:0|1:72290541_T_TC:72290541:1,3,2,0
chr11	72291883	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,8:0,0:0,0,5,3
chr11	72292353	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=44.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,2:0,8:0,0,13,0
chr11	72292860	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr11	72293039	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,2,14
chr11	72293079	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr11	72295203	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:72295203_G_C:72295203:0,0,4,0
chr11	72295208	.	CTAT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.712:5:0,0:0,2:0|1:72295203_G_C:72295203:1,0,4,0
chr11	72295213	.	A	AAAAACCCCCCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,0:1,0,3,0
chr11	72296039	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	72296700	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr11	72296761	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72296761_A_G:72296761:0,0,0,1
chr11	72296763	.	AC	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72296761_A_G:72296761:0,0,0,1
chr11	72307528	.	TCACACACACACACA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,106;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,9;RU=CA;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:1,2:1,0:6,0,1,1
chr11	72326210	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,8:0,4:0,0,3,11
chr11	72342074	.	G	GCCCCCCCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=190,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=4,12;RU=C;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.484:8:1,1:3,3:3,1,4,0
chr11	72396800	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,4,15
chr11	72396990	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,8,1
chr11	72399607	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr11	72407739	.	A	AGAACCAAAGAATTCAGCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	72407770	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	72407977	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	72412595	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	72412675	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr11	72414189	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	72421116	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=199,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:72421116_G_A:72421116:0,2,0,1
chr11	72421118	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=199,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:72421116_G_A:72421116:0,2,0,1
chr11	72466897	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	72532621	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	72533355	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	72538141	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr11	72552410	.	GC	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=135,305;MMQ=60,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,0:1,0:0|1:72552410_GC_AA:72552410:3,1,1,0
chr11	72552414	.	ATGC	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=144,305;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,1:1,0:0|1:72552410_GC_AA:72552410:3,1,1,0
chr11	72552419	.	G	GCCTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=144,221;MMQ=60,35;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,0:3,1,2,0
chr11	72554407	.	A	AGGG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,1:4,5:0,9,1,5
chr11	72598704	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	72945203	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr11	73009547	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=32,26;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:6,0:1,13,0,2
chr11	73009549	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=161,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:8,1:5,1:1,13,0,3
chr11	73009558	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=173,225;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:5,1:0|1:73009558_T_C:73009558:0,12,0,2
chr11	73009566	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=173,225;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,1:0|1:73009558_T_C:73009558:0,10,0,2
chr11	73009575	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=188,118;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,2:4,0:0|1:73009575_CA_TG:73009575:0,9,0,2
chr11	73009580	.	AA	CG	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=188,118;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:73009575_CA_TG:73009575:0,9,0,2
chr11	73009582	.	G	GGTGGATCACCT	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=188,118;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:5,0:0|1:73009575_CA_TG:73009575:0,8,0,2
chr11	73009613	.	C	CACCCAAATAAGGTGGAGGG	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=198,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73009613_C_CACCCAAATAAGGTGGAGGG:73009613:0,2,0,1
chr11	73009616	.	C	CAGGATG	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=21,35;MFRL=198,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:73009613_C_CACCCAAATAAGGTGGAGGG:73009613:0,2,0,1
chr11	73009656	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	73020152	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	73022572	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,3:5,6:4,4,5,4
chr11	73067924	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73067924_A_AC:73067924:0,0,0,1
chr11	73067925	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73067924_A_AC:73067924:0,0,0,1
chr11	73073782	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	73075663	.	A	ATACC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr11	73118604	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:7,2:10,14,2,0
chr11	73362766	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=103,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,2:2,3:2,0,3,2
chr11	73367052	.	G	GATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	73390718	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:20,1:10,1:16,15,2,0
chr11	73390772	.	GAA	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=67.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:5,8:3,9:3,6,6,11
chr11	73427431	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,8:4,3:1,7,1,10
chr11	73429958	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=13,16;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.401:17:0,0:2,3:0,10,1,6
chr11	73441772	.	A	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,18:0.352:52:18,8:16,10:30,4,16,2
chr11	73498933	.	T	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=74.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,29:0.428:68:20,15:19,14:28,11,23,6
chr11	73571145	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73571145_TC_T:73571145:0,1,0,1
chr11	73571146	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:73571146_C_CTT:73571146:0,0,0,1
chr11	73571149	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73571145_TC_T:73571145:0,1,0,1
chr11	73571150	.	C	CTTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=192,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73571146_C_CTT:73571146:0,1,0,1
chr11	73610110	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr11	73638388	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:3,0:15,3:7,11,1,2
chr11	73676143	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=145,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:73676143_T_C:73676143:1,3,0,1
chr11	73676146	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=145,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:73676143_T_C:73676143:1,3,0,1
chr11	73676149	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=145,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:73676143_T_C:73676143:1,3,0,1
chr11	73676154	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	73714972	.	TCACCACGTCCACCGGGGAGGC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:3,2:9,0:10,9,1,1
chr11	73715673	.	G	GCATTCTATTATCTTCCAATTAAATCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=215,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.298:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	73718114	.	T	TGCTGCCTGCCACCCCCTCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr11	73789570	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,2:12,0:18,11,2,0
chr11	73789777	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr11	73796608	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr11	73814454	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,6:0.091:72:30,4:35,2:33,33,4,2
chr11	73833957	.	C	CTGTCTGGCAAGTGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	73849754	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,1:3,2:8,0,3,0
chr11	73882660	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=250,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,2,0
chr11	73980866	.	C	CTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=213,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:73980866_C_CTAA:73980866:0,3,0,1
chr11	73980869	.	C	CTTGGCTATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=213,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:73980866_C_CTAA:73980866:0,3,0,1
chr11	73980872	.	C	CATACTCGGAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=125,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	73984657	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,0:1,1:0,6,0,2
chr11	74000180	.	TAA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.129:27:14,0:10,3:7,17,2,1
chr11	74015416	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,0:9,3:7,15,0,3
chr11	74022429	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:1,1,3,0
chr11	74047683	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=87,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,3:3,5:1,2,6,2
chr11	74053485	.	G	GAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,1:7,0,2,0
chr11	74054346	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:3,3:2,2:5,0,6,0
chr11	74057931	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	74085407	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=149,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:5,3:12,0:12,5,2,1
chr11	74085420	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.547:22:6,5:3,7:8,2,5,7
chr11	74303841	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.397:26:9,6:5,4:0,16,0,10
chr11	74345550	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=72,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:4,0,8,0
chr11	74407676	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,1:4,4:0,9,1,5
chr11	74408384	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr11	74412597	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:11,5,2,0
chr11	74441796	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr11	74547232	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.547:20:4,3:5,8:4,5,9,2
chr11	74562067	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=143,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:0,4:3,3:3,0,8,0
chr11	74562161	.	AC	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,69;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:16,0:8,5:14,11,2,3
chr11	74641436	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,11;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.650:4:1,1:0,0:1,0,0,3
chr11	74660292	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=190,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:3,2,4,0
chr11	74660504	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=185,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,5:2,3:0,6,0,8
chr11	74676794	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=99,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:6,2:0,2:4,2,4,0
chr11	74717618	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	74800717	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=115,29434905;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,0:16,2:5,23,0,2
chr11	74862356	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=44,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0,4,5,1
chr11	74862391	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr11	74877004	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr11	74880151	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	74880856	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr11	74883577	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=110,185;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:1,3,0,4
chr11	74883644	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=220,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:74883644_T_A:74883644:0,4,0,1
chr11	74883647	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=220,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:74883644_T_A:74883644:0,4,0,1
chr11	74904640	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74904640_C_G:74904640:0,0,0,1
chr11	74904642	.	TAAAGGCAAGCC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74904640_C_G:74904640:0,0,0,1
chr11	74977185	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:4,2:4,1,5,1
chr11	74978640	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=13,17;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:74978640_C_A:74978640:1,0,1,0
chr11	74978647	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:74978640_C_A:74978640:1,0,1,0
chr11	74978651	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74978640_C_A:74978640:0,0,1,0
chr11	74978654	.	CGCGG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74978640_C_A:74978640:0,0,1,0
chr11	74985187	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,103;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:15,3:7,0:7,15,0,3
chr11	74988512	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=174,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:2,0:6,0:9,3,0,3
chr11	74995226	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr11	75111937	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:0,16,0,2
chr11	75152907	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	75160213	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr11	75167704	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr11	75173812	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=115,72;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:0,1:2,0:0|1:75173812_A_C:75173812:2,2,2,0
chr11	75173816	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=115,72;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:2,0:0|1:75173812_A_C:75173812:2,2,2,0
chr11	75188569	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	75428958	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr11	75501672	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.402:10:3,0:1,0:3,3,4,0
chr11	75501852	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr11	75508406	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:2,1:0,0:0|1:75508406_C_G:75508406:0,2,0,1
chr11	75508407	.	CCTCCAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:2,1:0,0:0|1:75508406_C_G:75508406:0,2,0,1
chr11	75902571	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	75917334	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,2,2
chr11	76169154	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr11	76183944	.	C	CCTAAGAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr11	76183979	.	GTCCCTA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=228,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	76207199	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=194,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,7:1,0:6,0,7,0
chr11	76234185	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.390:29:9,3:8,8:10,8,10,1
chr11	76237725	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=194,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:0,7:1,3:0,1,0,10
chr11	76246874	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr11	76255669	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:18,0:19,3:22,15,0,3
chr11	76372564	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	76506572	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	76509143	.	T	TGTGG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=153,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:76509143_T_TGTGG:76509143:6,5,1,1
chr11	76509144	.	C	CCACTG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=153,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:76509143_T_TGTGG:76509143:6,5,1,1
chr11	76637730	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr11	76637785	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	76687448	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr11	76701491	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:13,3:10,0:21,2,3,0
chr11	76701657	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,15:0,0,6,23
chr11	76751584	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	76751603	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	76795839	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr11	76825401	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.485:19:3,2:5,7:3,7,4,5
chr11	76830223	.	G	GTATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=156,43079021;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:76830223_G_GTATC:76830223:0,4,1,0
chr11	76830225	.	G	GGCCCTTGAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=156,43079021;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:76830223_G_GTATC:76830223:0,4,1,0
chr11	76833154	.	C	CAGAAATGTGCTGTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=154,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	76853783	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.466:22:6,5:4,5:8,4,4,6
chr11	76858765	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=16,19;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,0:0|1:76858765_C_G:76858765:1,0,1,0
chr11	76858768	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=12,13;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,0:0|1:76858765_C_G:76858765:1,0,1,0
chr11	76858772	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=21,13;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,0:0|1:76858765_C_G:76858765:1,0,1,0
chr11	76858777	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76858765_C_G:76858765:0,0,1,0
chr11	76858783	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76858765_C_G:76858765:0,0,1,0
chr11	76858785	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,18;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr11	76866955	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=131,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:6,2,2,0
chr11	76870449	.	G	GGGGGCGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,0:0|1:76870449_G_GGGGGCGCC:76870449:0,0,1,0
chr11	76870453	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76870449_G_GGGGGCGCC:76870449:0,0,1,0
chr11	76870457	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:76870449_G_GGGGGCGCC:76870449:0,1,1,0
chr11	76891450	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:4,2,4,0
chr11	76892655	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=190,57;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr11	76918322	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:4,2,4,0
chr11	76919865	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr11	76924130	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr11	76924874	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=32122236,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,3,0
chr11	76925075	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	76944015	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr11	76954788	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:0|1:76954788_T_TA:76954788:5,4,2,3
chr11	76954812	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,3:4,1:0|1:76954788_T_TA:76954788:4,2,2,2
chr11	76954833	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,3:2,3:0|1:76954788_T_TA:76954788:1,3,2,4
chr11	76954898	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr11	76979465	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=127,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,6:2,1:5,1,5,2
chr11	76979889	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=162,86;MMQ=60,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr11	76979900	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=157,86;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr11	77051683	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=106,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.575:31:7,7:6,11:8,5,13,5
chr11	77090211	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr11	77090518	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=9,36;MFRL=274,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.530:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr11	77335982	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=75.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,29,4
chr11	77411980	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,0:14,3:12,17,0,3
chr11	77436526	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=209,69;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:5,0:0,2:6,0,2,0
chr11	77531810	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr11	77583379	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=124,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,3:5,2:1,7,2,4
chr11	77605501	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,6:0,0,0,23
chr11	77614770	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,0,17
chr11	77639646	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,140;MMQ=55,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:2,23,0,2
chr11	77652131	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,7:0,0,16,0
chr11	77667206	.	AC	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=196,184;MMQ=60,58;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:0,11,0,2
chr11	77671281	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr11	77705734	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.728:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr11	77775145	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,42;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:9,9,1,1
chr11	77781173	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr11	77784124	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,3:0.049:79:46,3:27,0:45,31,1,2
chr11	77790863	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr11	77811990	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	77824907	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:4,0:3,1:7,0,2,0
chr11	77824932	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,0:5,0:12,7,3,0
chr11	77825275	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:6,1,5,0
chr11	77832076	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr11	77838373	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.537:5:0,2:2,0:2,0,2,1
chr11	77850517	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.461:28:10,4:3,5:9,6,10,3
chr11	77909126	.	AGGCT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr11	77917166	.	G	GAGTGCAGTGGCATGATCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=183,131;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr11	77918756	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=196,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77918756_C_A:77918756:0,1,0,1
chr11	77918758	.	G	GACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=196,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77918756_C_A:77918756:0,1,0,1
chr11	77918760	.	A	ACACTCACTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=196,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77918756_C_A:77918756:0,1,0,1
chr11	77920930	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,22:0.413:54:22,12:8,10:21,11,15,7
chr11	77924656	.	TTCTAAG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTAAG;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:1,1:2,1:4,1,2,0
chr11	77930259	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	77930499	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:2,2:3,3:1,4,0,5
chr11	77931313	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77931313_G_A:77931313:1,0,1,0
chr11	77931319	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77931313_G_A:77931313:1,0,1,0
chr11	77931346	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr11	78128775	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=36,16;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:2,1:4,1:0,6,1,7
chr11	78128797	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:2,1:5,3:0,7,0,7
chr11	78189558	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.518:48:11,11:12,13:3,20,4,21
chr11	78204073	.	CACAGAT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,2:1,3:2,0,3,2
chr11	78282548	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,189;MMQ=60,31;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:0,7,0,3
chr11	78381649	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:0,1:2,0:0|1:78381649_T_TG:78381649:0,2,0,1
chr11	78381650	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:0,1:2,0:0|1:78381649_T_TG:78381649:0,2,0,1
chr11	78381653	.	T	TAGATGTGGCGGGTTTTAGGGG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:0,1:2,0:0|1:78381649_T_TG:78381649:0,2,0,1
chr11	78381678	.	C	T,A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,34,32;MFRL=0,211,147;MMQ=60,60,60;MPOS=23,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.47,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr11	78381680	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,31;MFRL=211,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:78381680_G_T:78381680:0,1,0,1
chr11	78381683	.	T	TGCTTGTAAATATGCTAAAAACA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=211,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:78381680_G_T:78381680:0,1,0,1
chr11	78482251	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr11	78489793	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0|1:78489793_C_A:78489793:0,0,0,8
chr11	78489798	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:78489793_C_A:78489793:0,0,0,8
chr11	82443417	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,2:1,2:9,0,4,0
chr11	82560312	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr11	82560346	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:82560346_T_A:82560346:0,2,0,1
chr11	82560347	.	A	ATGGAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:82560346_T_A:82560346:0,2,0,1
chr11	82560858	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr11	82561151	.	G	GAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=A;STR;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,4:0,0,1,10
chr11	82561339	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr11	82564294	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=218.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,63:0.956:65:0,32:2,30:2,0,26,37
chr11	82595975	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr11	82596005	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=204,247;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:82596005_A_AG:82596005:0,3,0,1
chr11	82596007	.	A	AGGATC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=204,247;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:82596005_A_AG:82596005:0,3,0,1
chr11	82596009	.	ATG	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=204,247;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:2,0:0|1:82596005_A_AG:82596005:0,3,0,1
chr11	82641157	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr11	82641364	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,3:3,5:2,5,0,8
chr11	82645477	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr11	82872530	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.480:44:12,8:9,13:3,20,4,17
chr11	82874970	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0,8,1,1
chr11	82878393	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:3,3:7,3:0,10,5,2
chr11	82880454	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:4,13,0,2
chr11	82892837	.	TAC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=203,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr11	82893347	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.382:26:7,4:9,4:15,1,10,0
chr11	82895634	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr11	82895657	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr11	82905679	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:8,1,3,0
chr11	82909464	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,1:7,1:13,0,2,0
chr11	82973045	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,1,15
chr11	82976874	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,3:7,0:8,0,3,0
chr11	83180169	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr11	83183676	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,7,3
chr11	83585614	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=187,199;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:0,7,0,5
chr11	83641334	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:9,1,2,0
chr11	83810113	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr11	83878075	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,14:0,4:0,0,5,13
chr11	83962251	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.454:62:16,14:17,14:21,13,20,8
chr11	83984340	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,14;MFRL=174,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:83984340_G_T:83984340:1,2,0,1
chr11	83984346	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=174,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:83984340_G_T:83984340:1,2,0,1
chr11	83984362	.	A	AAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=37239088,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.406:3:0,0:2,1:0|1:83984340_G_T:83984340:0,2,0,1
chr11	84822798	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=91.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,2,22
chr11	85346865	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=21,21;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:2,1:1,10,0,2
chr11	85346920	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=197,283;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr11	85374467	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr11	85396991	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:20,5,2,0
chr11	85415888	.	AT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=54.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.511:39:12,12:7,7:15,4,16,4
chr11	85428440	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=186,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:9,0,2,0
chr11	85428657	.	T	TAAGGACAAACAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:85428657_T_TAAGGACAAACAG:85428657:0,4,0,1
chr11	85428659	.	C	CCCCCATAGCCCGGTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:85428657_T_TAAGGACAAACAG:85428657:0,4,0,1
chr11	85428691	.	TT	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85428691_TT_AC:85428691:0,1,0,1
chr11	85428694	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85428691_TT_AC:85428691:0,1,0,1
chr11	85597421	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr11	85606307	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=24,22;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.392:11:5,0:1,4:6,1,4,0
chr11	85623607	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr11	85627039	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.313:21:8,1:5,5:12,3,5,1
chr11	85630411	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.562:37:3,7:13,13:9,7,11,10
chr11	85692342	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr11	85718641	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.469:47:14,15:11,7:6,19,2,20
chr11	85718663	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:13,11:6,5:2,17,0,16
chr11	85737502	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=283,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr11	85956479	.	G	GATTGTTTTGTCATTCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	85966177	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr11	85977117	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=223.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,38:0,28:0,0,49,18
chr11	85979636	.	CGT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=GT;STR;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.870:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr11	86111700	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:7,1,8,0
chr11	86111814	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=128,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:12,0:11,3:0|1:86111814_G_T:86111814:11,17,1,2
chr11	86111816	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=128,72;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:13,0:15,3:0|1:86111814_G_T:86111814:11,17,1,2
chr11	86119396	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr11	86123357	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr11	86123556	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=128,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.417:29:7,5:9,6:4,13,7,5
chr11	86133784	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,5,11
chr11	86152477	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.522:31:8,5:5,11:3,12,5,11
chr11	86157263	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	86161271	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:10,1,2,0
chr11	86209196	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86209196_G_T:86209196:0,1,0,1
chr11	86209197	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86209196_G_T:86209196:0,1,0,1
chr11	86209200	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86209196_G_T:86209196:0,1,0,1
chr11	86270684	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr11	86518981	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:6,0:14,4,0,2
chr11	86522333	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86522333_G_T:86522333:0,1,0,1
chr11	86522335	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86522333_G_T:86522333:0,1,0,1
chr11	86782716	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr11	86868347	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:8,8:17,4:24,2,12,0
chr11	86868361	.	GT	G,GTT	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=35,35,36;MFRL=142,115,174;MMQ=60,60,60;MPOS=12,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=31.55,4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,18,3:0.433,0.092:40:4,7,3:15,10,0:18,1,20,1
chr11	86947577	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.585:15:2,2:4,6:6,0,9,0
chr11	87013252	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr11	87032215	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr11	87847063	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr11	87908563	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,3:4,3:0,10,1,5
chr11	88033661	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:5,1,8,1
chr11	88045583	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:12,4:5,4:14,3,6,2
chr11	88059683	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr11	88068004	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:2,3:3,0,3,0
chr11	88068052	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,2:3,2:9,0,3,1
chr11	88068329	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	88242341	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,366;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	88338165	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	88386300	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:6,3:2,0:7,1,2,1
chr11	88386595	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=213,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:88386595_C_CA:88386595:0,1,0,1
chr11	88386597	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=11,30;MFRL=213,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:88386595_C_CA:88386595:0,1,0,1
chr11	88912036	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88912036_C_CT:88912036:0,0,0,1
chr11	88912038	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88912036_C_CT:88912036:0,0,0,1
chr11	89070705	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,162;MMQ=27,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,2:1,6,0,5
chr11	89073436	.	AC	GG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	89106487	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=208,179;MMQ=55,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,0:10,0:21,0,2,0
chr11	89155216	.	T	TTAGCCAGGCAGG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.096:28:13,2:6,0:1,25,0,2
chr11	89223616	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr11	89224326	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=86.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,30:0.535:56:15,16:11,14:12,14,13,17
chr11	89224453	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:0,5,0,8
chr11	89403728	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,185;MMQ=54,53;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,8:8,4:0,12,0,12
chr11	89407164	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,198;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.274:30:8,4:12,3:22,0,7,1
chr11	89413867	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,29:0.428:68:24,16:15,13:13,26,3,26
chr11	89444754	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=178,130;MMQ=52,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:0,4:4,6:0,4,0,10
chr11	89706703	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=192,155;MMQ=27,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,0:1,1:1,0,2,0
chr11	89819110	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,26;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr11	89867872	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr11	89868692	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:2,1,4,0
chr11	89880469	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr11	89883595	.	GTT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.558:10:4,3:0,3:4,0,6,0
chr11	89885647	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr11	89892601	.	CT	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=235,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	89896041	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:4,9:5,7:9,0,16,0
chr11	89896457	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr11	89902276	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=163,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr11	89903334	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.365:44:18,9:10,6:7,21,3,13
chr11	89909096	.	ATGTGTG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=TG;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,0:0,1:2,1,1,0
chr11	89914894	.	TAAAAA	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=A;STR;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,31:0.738:42:4,13:1,15:0,11,5,26
chr11	89914940	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:6,8:4,1:0,11,0,9
chr11	89916053	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:3,1,3,3
chr11	89916080	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,4:3,5:5,2,6,3
chr11	89935586	.	G	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,21:0.333:64:17,9:26,12:25,18,15,6
chr11	89935908	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.620:35:11,8:2,12:13,0,21,1
chr11	89935926	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.092:52:28,0:20,4:42,6,4,0
chr11	89936093	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,29:0.637:45:10,8:6,20:0,16,8,21
chr11	89938615	.	AAG	A	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=125.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,37:0.409:91:32,26:21,10:33,21,24,13
chr11	89948505	.	GTA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:8,10:10,2:0,19,0,12
chr11	89951367	.	GA	G,TA	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=17,17,10;MFRL=151,134,128;MMQ=60,60,60;MPOS=22,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=57.37,5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,30,8:0.551,0.108:55:0,8,0:1,0,0:2,15,4,34
chr11	92088642	.	GAT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:92088642_GAT_G:92088642:0,0,0,1
chr11	92088647	.	T	TTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:92088642_GAT_G:92088642:0,0,0,1
chr11	92088648	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:92088642_GAT_G:92088642:0,0,0,1
chr11	92088654	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:92088642_GAT_G:92088642:0,0,0,1
chr11	92258181	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr11	92495409	.	T	TATACATTCAAGTTTTTTAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr11	92497990	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=67,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr11	92534043	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:0,2:0,2,2,3
chr11	92564767	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	92570790	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:4,2:6,6:8,2,9,0
chr11	92570812	.	TC	AA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=111,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:3,6:4,8:6,2,11,4
chr11	92577031	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,3:3,6:7,0,9,0
chr11	92577070	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:11,4:5,7:9,7,10,1
chr11	92577659	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=103,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.650:21:3,7:4,6:3,4,7,7
chr11	92590448	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.964:24:0,10:0,13:0|1:92590448_A_G:92590448:0,0,13,11
chr11	92590454	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:92590448_A_G:92590448:10,8,2,0
chr11	92592554	.	G	GAAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:92592554_G_GAAT:92592554:0,0,0,1
chr11	92592556	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:92592554_G_GAAT:92592554:0,0,0,1
chr11	92592559	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:92592554_G_GAAT:92592554:0,0,0,1
chr11	92623608	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=113,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr11	92702962	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=186,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr11	92715081	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:1,1:1,2:2,0,4,0
chr11	92901411	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,0:8,3:0,10,0,3
chr11	93103419	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr11	93118515	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr11	93122326	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.526:36:8,10:9,9:3,14,3,16
chr11	93122355	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,4:5,5:0,12,0,9
chr11	93148371	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr11	93170909	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=64,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.576:5:2,0:0,3:0|1:93170909_T_TC:93170909:0,2,0,3
chr11	93170925	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=137,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.626:6:2,1:0,3:0|1:93170909_T_TC:93170909:0,2,0,4
chr11	93212459	.	GTA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:93212459_GTA_G:93212459:0,0,0,1
chr11	93212463	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:93212459_GTA_G:93212459:0,0,0,1
chr11	93400052	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	93412774	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,0,13
chr11	93417334	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:0,0:0,4,0,2
chr11	93428779	.	A	ATGGAAACTTGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	93431555	.	G	GGTTACAGAAGGCCTAATTTAAATCC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,1:8,1:10,4,0,2
chr11	93436181	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:93436181_A_G:93436181:0,3,0,1
chr11	93436183	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:93436181_A_G:93436181:0,3,0,1
chr11	93463145	.	AT	A,ATT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=168,81,155;MMQ=60,60,60;MPOS=24,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.52,15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,8:0.185,0.574:13:2,2,5:1,0,3:2,1,7,3
chr11	93463332	.	A	G	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=235.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,32:0,32:0,0,29,37
chr11	93480708	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	93487008	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr11	93494878	.	AAG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=188,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.558:7:2,1:1,3:0|1:93494878_AAG_A:93494878:0,3,2,2
chr11	93494890	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:93494878_AAG_A:93494878:1,3,0,1
chr11	93521405	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	93524043	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=257,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:93524043_C_T:93524043:0,1,0,1
chr11	93524046	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,30;MFRL=257,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:93524043_C_T:93524043:0,1,0,1
chr11	93524050	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=257,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:93524043_C_T:93524043:0,1,0,1
chr11	93527219	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,1,16
chr11	93527282	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,1:0,9:0,0,0,10
chr11	93534929	.	T	TGA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,9:0,10:0|1:93534929_T_TGA:93534929:0,0,21,0
chr11	93534930	.	TTC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0|1:93534929_T_TGA:93534929:0,0,21,0
chr11	93534990	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:11,6:12,11:20,4,12,5
chr11	93754508	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=253,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr11	93797747	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:93797747_A_C:93797747:0,3,0,1
chr11	93797756	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:93797747_A_C:93797747:0,3,0,1
chr11	93797758	.	T	TTCTCAACAACTAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:93797747_A_C:93797747:0,3,0,1
chr11	93797759	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:93797747_A_C:93797747:0,3,0,1
chr11	93801012	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	93803717	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,16:0,7:0,0,9,14
chr11	93806416	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr11	93806705	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=136,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr11	93808607	.	A	AAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0,0,0,10
chr11	93808619	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,2:6,2:0,7,0,4
chr11	93844034	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr11	93886838	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	93913458	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=97,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,1:4,7:3,4,1,7
chr11	94038960	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=126,104;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:8,2:7,11,0,2
chr11	94113938	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,14;MFRL=113,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:94113938_C_A:94113938:0,1,0,1
chr11	94113955	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=113,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:94113938_C_A:94113938:0,1,0,1
chr11	94113960	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94113938_C_A:94113938:0,0,0,1
chr11	94113963	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94113938_C_A:94113938:0,0,0,1
chr11	94170484	.	TTC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:0,2,0,7
chr11	94203868	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:0,4:3,1:0,3,0,6
chr11	94225807	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,3,1
chr11	94277730	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr11	94281335	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.653:24:5,8:3,8:4,4,6,10
chr11	94281413	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=119,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.791:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr11	94282240	.	TGTGATGATGTATGCCAAG	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:20,0:14,2:22,17,1,1
chr11	94308355	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr11	94310747	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	94320179	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	94326627	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr11	94328645	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr11	94337220	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,2:7,2:7,4,1,3
chr11	94354019	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.397:10:4,2:2,2:5,1,4,0
chr11	94501849	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr11	94587076	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr11	94602324	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:3,2:5,0:8,5,2,0
chr11	94696474	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=202,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr11	94699391	.	TACACACACAC	T,TACACACACACACAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32,31;MFRL=0,247,180;MMQ=60,57,40;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,16,23;RU=AC;STR;TLOD=3.53,3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.335,0.459:2:0,0,0:0,1,1:0,0,2,0
chr11	94699507	.	A	AT	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=149.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,20:0,24:0,0,25,22
chr11	94704037	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr11	94704092	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0|1:94704092_T_A:94704092:0,0,23,2
chr11	94704094	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=111.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0|1:94704092_T_A:94704092:0,0,23,2
chr11	94704689	.	A	AAC,AACAC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30,32;MFRL=0,169,156;MMQ=60,60,60;MPOS=27,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=AC;STR;TLOD=8.30,7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.461,0.451:6:0,2,2:0,1,1:0,0,0,6
chr11	94705163	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=239,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,2:1,4:5,0,6,0
chr11	94731053	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:94731053_G_A:94731053:6,0,0,2
chr11	94731055	.	AGGCGTC	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:94731053_G_A:94731053:6,1,0,2
chr11	94731064	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:94731053_G_A:94731053:6,1,0,2
chr11	94800902	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,10,8
chr11	94801633	.	A	AT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=131.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,20:0,21:0,0,14,27
chr11	94803327	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=151,145;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:94803327_C_T:94803327:0,5,0,2
chr11	94803330	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,145;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,0:0|1:94803327_C_T:94803327:0,5,0,2
chr11	94803525	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,8,0
chr11	94803531	.	C	CAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,8,0
chr11	94861491	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=115,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr11	94908591	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr11	94908658	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.438:37:8,9:12,7:15,6,11,5
chr11	95512787	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:15,0:18,3:19,16,0,3
chr11	95519243	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.413:44:12,12:14,6:20,6,14,4
chr11	95520695	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,152;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr11	95523835	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:11,2:4,7:11,5,6,3
chr11	95546372	.	T	TAAAGTTTTTCAGAATATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	95569326	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:7,3:10,10:13,4,10,3
chr11	95571347	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,2:5,5:4,9,2,5
chr11	95578212	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,223;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:8,11,2,0
chr11	95595387	.	CTACA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=201,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:5,3,2,3
chr11	95712897	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:4,4:6,1:8,2,5,1
chr11	95713024	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.622:35:5,16:8,6:8,5,13,9
chr11	95713175	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,1:6,4:0,8,0,5
chr11	95825374	.	TTGCTGCTGC	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=66,141;MMQ=48,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=TGC;STR;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.806:12:0,6:0,1:0,2,7,3
chr11	95825386	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,66;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,2:6,0:11,8,0,2
chr11	96092376	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=114,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,4:5,4:1,8,0,8
chr11	96106661	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.490:49:10,9:13,14:4,21,4,20
chr11	96125435	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,4:7,3:7,6,3,4
chr11	96126288	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29,34,25;MFRL=0,125,125,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,25,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=19,17,18,20;RU=T;STR;TLOD=3.59,9.08,4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,6,5:0.168,0.418,0.363:14:0,2,2,2:0,0,3,0:0,0,9,5
chr11	99427091	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=190,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr11	99690212	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr11	99827810	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr11	99931861	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr11	99941322	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr11	100168289	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr11	100168320	.	T	TC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,12:0,0,16,10
chr11	100169829	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr11	100226773	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr11	100226883	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.454:22:8,3:4,6:5,7,5,5
chr11	100641200	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:1,7,1,7
chr11	100730213	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=69.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,18,1
chr11	100784127	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,8:0,0,18,4
chr11	100804088	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	100807130	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	100814409	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr11	100814609	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr11	100814700	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr11	100819098	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=64.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.962:21:0,14:0,6:0,0,21,0
chr11	100819305	.	T	C	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=276.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,38:0,39:0,0,15,63
chr11	100820555	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.937:12:0,10:0,2:0,0,8,4
chr11	100820725	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr11	100830579	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,11:0,0,13,5
chr11	100830780	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	100863327	.	G	GCTGACTGGCAGGTTGATC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=185,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,1,1
chr11	100863595	.	T	TGTCTGTGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTCTGTGG;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.871:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr11	101918686	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=92,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:0,1:5,4:0,5,1,4
chr11	102056722	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:0,2:3,0:4,1,1,2
chr11	102080325	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.550:11:1,0:4,1:2,3,0,6
chr11	102098354	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:0,2:3,2:0,3,0,5
chr11	102199589	.	TTA	T	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TA;STR;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.370:28:8,7:8,3:17,1,9,1
chr11	102199608	.	TA	T	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.377:38:12,6:5,8:14,10,14,0
chr11	102199611	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.407:37:14,6:8,9:12,10,14,1
chr11	102199622	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,15:0.331:46:15,0:10,1:16,15,14,1
chr11	102207024	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr11	102207851	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr11	102221277	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:9,11,2,0
chr11	102234518	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,108;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0,7,1,1
chr11	102269738	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.624:6:0,3:2,0:0|1:102269738_G_T:102269738:0,2,1,3
chr11	102269743	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.624:6:0,3:2,0:0|1:102269738_G_T:102269738:0,2,1,3
chr11	102272460	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:0,2:0,3,1,5
chr11	102272839	.	C	A	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=175.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,65:0.660:98:14,25:19,40:16,17,22,43
chr11	102323377	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	102391569	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	102391604	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	102398448	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,1:6,1:6,9,2,0
chr11	102448256	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	102449951	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,8:0,0:0,0,0,8
chr11	102465275	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:6,0,2,0
chr11	102573396	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	102584023	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr11	102584466	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=60.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:1,13:0,8:0,1,15,7
chr11	102584607	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,6:0,0,2,15
chr11	102585532	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=127,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.622:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr11	102586262	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:102586262_G_T:102586262:0,3,0,1
chr11	102586267	.	G	GAAGGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:102586262_G_T:102586262:0,3,0,1
chr11	102592049	.	T	TTG,TTGTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30,30;MFRL=0,142,139;MMQ=60,60,60;MPOS=6,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=TG;STR;TLOD=7.11,26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,10:0.253,0.691:13:0,2,2:0,1,6:0,0,13,0
chr11	102592590	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	102595666	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr11	102641452	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:5,0,4,0
chr11	102642716	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr11	102647310	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr11	102649543	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,745;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr11	102649575	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=214,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102649575_G_A:102649575:0,1,0,1
chr11	102649581	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=251,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:102649575_G_A:102649575:0,1,0,1
chr11	102649856	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr11	102661099	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:10,3:8,8:17,1,10,1
chr11	102661595	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr11	102663476	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,3:5,0:0|1:102663476_A_AG:102663476:0,6,0,3
chr11	102663482	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,3:5,0:0|1:102663476_A_AG:102663476:0,6,0,3
chr11	102663522	.	GC	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=273,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:102663522_GC_AA:102663522:0,1,0,1
chr11	102663526	.	A	AAAGAAAGAAAGGGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=273,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102663522_GC_AA:102663522:0,1,0,1
chr11	102666037	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,6:5,3:0|1:102666037_A_G:102666037:3,6,1,8
chr11	102666043	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0|1:102666037_A_G:102666037:0,0,5,12
chr11	102668702	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,2:1,4:1,1,5,2
chr11	102707339	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr11	102709520	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102709520_C_T:102709520:0,0,0,1
chr11	102709521	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102709520_C_T:102709520:0,0,0,1
chr11	102710967	.	G	GCTGCTTCAAGCAGGATTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr11	102711338	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr11	102713465	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.594:37:11,9:3,13:10,5,13,9
chr11	102737944	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr11	102738793	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,3:0|1:102738793_G_GT:102738793:0,0,1,5
chr11	102738795	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:102738793_G_GT:102738793:0,0,1,5
chr11	102822733	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:4,2,4,1
chr11	102824826	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0,0,24,3
chr11	102825091	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,7:0,0,3,19
chr11	103006457	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,0:14,2:17,9,1,1
chr11	103013954	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=105.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0,0,30,0
chr11	103022842	.	G	GTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:0,5:1,3:1,0,7,1
chr11	103026040	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:1,9:1,5:2,0,14,0
chr11	103029373	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr11	103029516	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=156.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,44:0.959:45:0,24:1,19:0,1,12,32
chr11	103033914	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr11	103044038	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr11	103047241	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:103047241_CT_C:103047241:0,1,0,1
chr11	103047245	.	CAACTTATCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:103047241_CT_C:103047241:0,1,0,1
chr11	103048526	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,0:12,3:7,15,1,2
chr11	103050028	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr11	103052558	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,25:0.482:52:15,12:12,13:11,16,9,16
chr11	103060309	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	103062371	.	TTG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.325:13:3,3:5,1:0,9,1,3
chr11	103074349	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr11	103086381	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	103086399	.	G	GTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr11	103091546	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr11	103092968	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103092968_C_T:103092968:0,0,0,1
chr11	103092981	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:103092968_C_T:103092968:0,0,0,1
chr11	103104930	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=82.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,13:0,0,1,24
chr11	103112358	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	103123999	.	G	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,29:0.461:63:18,17:16,12:19,15,19,10
chr11	103182820	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:103182820_AT_A:103182820:0,1,0,2
chr11	103182833	.	G	GGGAAAAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:103182820_AT_A:103182820:0,2,0,1
chr11	103182835	.	C	CTCTCAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:103182820_AT_A:103182820:0,2,0,1
chr11	103187438	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,5:1,2:0,4,0,7
chr11	103192039	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	103229110	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=239,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr11	103270607	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,6:1,3:0,3,2,7
chr11	103306594	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr11	103780610	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:0,4,0,4
chr11	103814453	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:0,5,0,3
chr11	103818344	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,1:2,4:2,0,5,1
chr11	103870755	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.543:20:7,5:2,4:0|1:103870755_G_C:103870755:8,1,10,1
chr11	103870761	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.497:20:7,6:3,4:0|1:103870755_G_C:103870755:9,1,9,1
chr11	103871039	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr11	104866384	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr11	104866461	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=122,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,2:4,4:6,3,4,2
chr11	104870945	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.538:28:5,8:7,7:12,1,14,1
chr11	104871322	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=245,229;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr11	104872824	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:20,0:14,3:17,19,1,2
chr11	104872981	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,6,14
chr11	104877717	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:6,1,2,0
chr11	104877803	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:2,5:6,4:7,1,7,2
chr11	104879686	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.265:12:4,3:5,0:1,8,1,2
chr11	104893836	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=125,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,1:5,1:7,7,1,1
chr11	104893897	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,45;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:9,2:3,0:5,7,0,2
chr11	104971210	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,172;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.256:33:11,5:14,2:21,4,6,2
chr11	104972190	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.611:34:7,15:6,6:1,12,2,19
chr11	105483017	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:14,1:4,1:13,6,2,0
chr11	105782501	.	A	AATAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=AT;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr11	105845126	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:10,7,1,1
chr11	105845365	.	ATT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:105845365_ATT_A:105845365:0,1,0,1
chr11	105845369	.	CTT	ACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:105845365_ATT_A:105845365:0,1,0,1
chr11	105880239	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:0|1:105880239_T_G:105880239:16,1,2,0
chr11	105880243	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,2:6,0:0|1:105880239_T_G:105880239:15,1,2,0
chr11	105880554	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:16,2:13,0:13,16,1,1
chr11	105929911	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	105948518	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:11,0:20,2:16,15,2,0
chr11	106579204	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.605:26:6,5:4,10:8,2,11,5
chr11	106849520	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=136,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr11	106849543	.	A	AAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=359,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	106888608	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=193,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr11	107197536	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr11	107197606	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr11	107197869	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	107200674	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:6,4,0,2
chr11	107207394	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:12,3:10,1:9,17,1,3
chr11	107286893	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,6,10
chr11	107304541	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr11	107304575	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr11	107312175	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=190,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr11	107326340	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr11	107328544	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,2:4,10:0,12,2,10
chr11	107381765	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,4,9
chr11	107402995	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,5:0,0,16,1
chr11	107403202	.	TAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	107462977	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr11	107578721	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,5,9
chr11	107686778	.	A	ATTAGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr11	107904646	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,5:7,8:4,9,2,11
chr11	107925303	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,6:4,2:7,0,7,1
chr11	107925327	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=106.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,14:0,0,26,6
chr11	107925557	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.444:43:12,11:12,8:11,13,10,9
chr11	107948858	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.296:31:14,5:8,3:20,2,9,0
chr11	107969299	.	AG	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,10:0.192:45:15,1:13,0:2,33,0,10
chr11	107969300	.	GT	G,TT	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=15,14,24;MFRL=162,165,153;MMQ=60,60,60;MPOS=18,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.67,9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,11,11:0.587,0.245:24:0,2,7:0,1,4:0,2,1,21
chr11	108004927	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,1:10,3:17,1,4,0
chr11	108006047	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,34;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr11	108012510	.	A	AAAGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr11	108013093	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=174,49458445;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr11	108014799	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,5:4,1:3,7,1,5
chr11	108029797	.	T	TAGGAAGGTGTTTAAAGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	108059000	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	108060016	.	T	TA	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:18,1:17,1:0|1:108060016_T_TA:108060016:17,18,0,2
chr11	108060017	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:18,1:17,1:0|1:108060016_T_TA:108060016:17,18,0,2
chr11	108060024	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=117,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:17,0:13,3:11,19,0,3
chr11	108098459	.	TAA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=160.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,16:0,20:0,0,15,21
chr11	108098651	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,0:8,4:0,15,0,4
chr11	108100105	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=189,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,0:0,2:0,2,0,7
chr11	108114661	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.202:29:11,3:11,3:21,2,5,1
chr11	108115727	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=209,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,2:7,0:5,7,0,2
chr11	108129657	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr11	108141701	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr11	108141955	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:3,2:2,1:3,3,3,0
chr11	108143182	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,25,4
chr11	108151707	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	108163323	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:8,3:8,0:16,0,4,0
chr11	108196712	.	CATT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ATT;STR;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr11	108218196	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	108224697	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr11	108225483	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,10:0,0,13,2
chr11	108225661	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,6:0,0,1,7
chr11	108256718	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr11	108345515	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,8:0,0,14,3
chr11	108352160	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	108369173	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	108380171	.	A	ACTGGGAGAATTTGAGCTTAATGACTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,321;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	108382452	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,1:13,2:12,10,1,2
chr11	108410008	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=204,269;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:108410008_CTT_C:108410008:0,2,0,1
chr11	108410011	.	A	AGAGCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=204,269;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:108410008_CTT_C:108410008:0,2,0,1
chr11	108410013	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=231,269;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:108410008_CTT_C:108410008:0,1,0,1
chr11	108535792	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr11	108590709	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr11	108722851	.	C	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=264.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,76:0.987:76:0,40:0,35:0,0,56,20
chr11	109296012	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=188,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:5,4,2,1
chr11	109964257	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr11	110023628	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,4:8,6:7,4,7,3
chr11	110036502	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:110036502_C_T:110036502:0,3,0,1
chr11	110036503	.	A	ACCCGAGGAGAAGACTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:110036502_C_T:110036502:0,3,0,1
chr11	110103924	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=213,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr11	110106746	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr11	110118364	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr11	110126197	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,5:3,7:0,10,0,12
chr11	110128925	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,35,35;MFRL=151,140,193;MMQ=60,60,60;MPOS=29,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=A;STR;TLOD=3.06,5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,4:0.129,0.213:19:5,2,2:4,0,2:2,11,0,6
chr11	110128994	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=37,34;MFRL=208,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr11	110150486	.	TAA	T,TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31,31;MFRL=166,186,134;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.93,6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.401:7:1,2,2:1,0,1:0,2,0,5
chr11	110306727	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:10,0:1,4:1,10,1,3
chr11	110479845	.	T	TCATATACTGATTGGCCATTTGCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=107,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	111152263	.	ACT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:1,0:0,5,0,3
chr11	111156836	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr11	111229470	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0|1:111229470_T_C:111229470:0,0,5,3
chr11	111229483	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=98,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:0,4:4,2:0|1:111229470_T_C:111229470:3,1,4,2
chr11	111249819	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr11	111487106	.	C	G,CAGAATTATG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32,35;MFRL=186,157,190;MMQ=60,60,60;MPOS=13,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.35,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,1:0.449,0.217:6:0,2,1:1,1,0:0,2,0,4
chr11	111612465	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	111623088	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,4,2
chr11	111636203	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr11	111637117	.	T	TCCCGCCCCGCGCCCAGGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCCGCCCCGCGCCCAGGC;STR;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,2:0,0:0,0,0,4
chr11	111657292	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=184,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr11	111741104	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=105,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.222:33:8,0:13,2:16,10,0,7
chr11	111742145	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	111747427	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr11	111749265	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:1,5:6,3:6,1,8,0
chr11	111754417	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=220,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr11	111779743	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:111779743_A_C:111779743:0,0,0,1
chr11	111779751	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:111779743_A_C:111779743:0,0,0,1
chr11	111795148	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:3,2,2,2
chr11	111848361	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,17,0
chr11	111851506	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,1:12,1:11,13,1,1
chr11	111853106	.	G	GC	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=127.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,21:0,18:0,0,21,20
chr11	111857711	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=144,121;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:1,8,0,2
chr11	111857734	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=150,141;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:111857734_A_G:111857734:0,4,0,1
chr11	111857741	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=150,141;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:111857734_A_G:111857734:0,4,0,1
chr11	111857745	.	C	A,CAT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,30,34;MFRL=156,141,144;MMQ=60,24,60;MPOS=9,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,1:0,1,0:0,3,0,2
chr11	111857747	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=149,144;MMQ=53,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:111857747_G_A:111857747:0,4,0,1
chr11	111857748	.	GCA	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=149,144;MMQ=53,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:111857747_G_A:111857747:0,4,0,1
chr11	111857749	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=141,187;MMQ=46,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	111889635	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=164,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:4,5:6,1,8,0
chr11	111889654	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,17,1
chr11	111897028	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=14,14;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.349:12:0,0:2,0:2,6,0,4
chr11	111897050	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:1,2:3,3:0,4,1,6
chr11	111908162	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.556:27:0,9:11,6:7,5,9,6
chr11	111916001	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	111933088	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=115,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:7,0,5,0
chr11	111943977	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=193,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr11	112020916	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:8,3:4,4:5,7,3,4
chr11	112024222	.	AT	A,ATT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=165,182,176;MMQ=60,60,60;MPOS=10,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.88,6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,3:0.198,0.224:15:5,1,2:4,2,1:8,1,6,0
chr11	112041128	.	TTTTGTCCTG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,4:4,0:9,1,3,1
chr11	112064431	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr11	112065483	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,3:7,3:4,6,2,4
chr11	112071294	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,6:4,0:5,1,6,0
chr11	112071570	.	AA	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	112072930	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=170,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:2,6:4,4:0,7,2,8
chr11	112073010	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=189,146;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:112073010_C_G:112073010:0,2,0,1
chr11	112073014	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=189,146;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:112073010_C_G:112073010:0,2,0,1
chr11	112087101	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	112087149	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=232,35903722;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr11	112832276	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=G;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.620:9:2,3:1,3:2,1,6,0
chr11	112832307	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=20,33;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.851:15:0,7:1,5:2,0,11,2
chr11	112832339	.	GC	G	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=130.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,19:0,10:0|1:112832339_GC_G:112832339:0,0,20,10
chr11	112832353	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=20,34;MFRL=52,117;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,31:0.917:33:0,17:2,9:0|1:112832339_GC_G:112832339:1,1,20,11
chr11	112832358	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=138.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,12:0,0,20,12
chr11	112832391	.	ATT	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.260:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr11	113073066	.	T	TTTTTGTTTTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=180,103;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTTG;STR;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.552:7:2,2:0,1:3,0,3,1
chr11	113085244	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=68,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:0,2,1,6
chr11	113103138	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=119,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr11	113103173	.	G	GGCCTCTGCTTCCTTATTATTAAATTCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,13;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr11	113111501	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,14:0,20:0,0,20,17
chr11	113113515	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,8,4
chr11	113196157	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=223,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr11	113209428	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,6:7,4:13,2,9,1
chr11	113215256	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=309,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:113215256_GA_G:113215256:0,1,0,1
chr11	113215258	.	CTTGAAGG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=309,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:113215256_GA_G:113215256:0,1,0,1
chr11	113222885	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.596:30:6,7:5,10:5,7,6,12
chr11	113230836	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	113233059	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr11	113239082	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,0:3,2:4,0,3,0
chr11	113239392	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=216,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113239392_G_GC:113239392:0,1,0,1
chr11	113239395	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=216,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113239392_G_GC:113239392:0,1,0,1
chr11	113264272	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.558:23:7,4:3,8:4,6,8,5
chr11	113266702	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	113281397	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr11	113283459	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=118,95;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:9,8:8,8:5,12,6,10
chr11	113283477	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,9:0,0,8,12
chr11	113283519	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=73,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.559:10:1,1:2,0:3,1,0,6
chr11	113283636	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	113283688	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	113287511	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,4,1
chr11	113558845	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr11	113560705	.	G	GCCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=207,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113560705_G_GCCCT:113560705:0,1,0,1
chr11	113560706	.	A	AACTCCTCCCTGACCCGTCCTCCTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=207,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113560705_G_GCCCT:113560705:0,1,0,1
chr11	113560896	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.709:1:0,0:0,0:0|1:113560896_CTG_C:113560896:0,0,1,0
chr11	113560902	.	TC	GG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,10;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:113560896_CTG_C:113560896:0,0,1,0
chr11	113560906	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:113560896_CTG_C:113560896:0,0,1,0
chr11	113560912	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=16,27;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:113560896_CTG_C:113560896:1,0,1,0
chr11	113560915	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=79,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:113560896_CTG_C:113560896:2,0,1,0
chr11	113560918	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:113560896_CTG_C:113560896:2,1,1,0
chr11	113560920	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:113560896_CTG_C:113560896:2,1,1,0
chr11	113560924	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,12;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:113560896_CTG_C:113560896:2,1,1,0
chr11	113561481	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	113563726	.	T	TGC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0|1:113563726_T_TGC:113563726:1,0,4,0
chr11	113563730	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=16,23;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:0,1:0|1:113563726_T_TGC:113563726:1,0,4,0
chr11	113563733	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,0:0,0:0|1:113563726_T_TGC:113563726:1,0,4,0
chr11	113563741	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:0,1:2,1,3,0
chr11	113563745	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:1,1:0|1:113563726_T_TGC:113563726:5,1,2,0
chr11	113566205	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:113566205_C_T:113566205:0,0,0,4
chr11	113566207	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:113566205_C_T:113566205:0,0,0,4
chr11	113568038	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:13,2:7,1:15,5,2,1
chr11	113570490	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr11	113576932	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,14,6
chr11	113609213	.	CTGCCTAT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	113609854	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr11	113618470	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr11	113618968	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=69.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,14,6
chr11	113644261	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr11	113680018	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr11	113688647	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:113688647_G_A:113688647:0,3,0,1
chr11	113688650	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=91,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:113688647_G_A:113688647:0,4,0,1
chr11	113688658	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=91,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:113688647_G_A:113688647:0,4,0,1
chr11	113705135	.	ATT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=189,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113705135_ATT_A:113705135:0,1,0,1
chr11	113705138	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=189,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:113705135_ATT_A:113705135:0,1,0,1
chr11	113705141	.	T	TTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113705135_ATT_A:113705135:0,0,0,1
chr11	113725116	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=210,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113725116_A_T:113725116:0,1,0,1
chr11	113725119	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=210,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113725116_A_T:113725116:0,1,0,1
chr11	113725168	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=246,192;MMQ=48,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr11	113802600	.	CA	TG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,13:0.425:31:9,5:9,8:0|1:113802600_CA_TG:113802600:7,11,5,8
chr11	113802601	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,30:0.968:30:0,13:0,16:1|0:113802600_CA_TG:113802600:0,0,12,18
chr11	113815204	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=167,162;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0|1:113815204_T_C:113815204:5,0,2,0
chr11	113815210	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=167,106;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,3:5,0:0|1:113815204_T_C:113815204:5,0,3,0
chr11	113815215	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=167,102;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:0|1:113815204_T_C:113815204:7,0,2,0
chr11	113815221	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=159,98;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:5,0:0|1:113815204_T_C:113815204:9,1,1,1
chr11	113815223	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=148,98;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:3,2:6,0:0|1:113815204_T_C:113815204:8,2,1,1
chr11	113815227	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=148,98;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:3,2:7,0:0|1:113815204_T_C:113815204:8,2,1,1
chr11	113815354	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:6,3:5,2:4,8,2,3
chr11	114113160	.	T	TGATAAATAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	114118112	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,0:11,2:2,15,0,2
chr11	114393314	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr11	114398627	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=164,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.452:13:1,2:6,2:0,7,1,5
chr11	114442103	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:3,2,0,2
chr11	114442265	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	114451129	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	114465526	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr11	114550334	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr11	114568942	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,27:0.587:46:6,10:11,15:6,13,15,12
chr11	114576807	.	A	ATTTAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TTTAT;STR;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr11	115049311	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr11	115085467	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=108,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.250:38:21,5:8,4:8,21,6,3
chr11	115088647	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,3:8,3:6,9,1,5
chr11	116628401	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:3,0,7,0
chr11	116629153	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr11	116629734	.	T	TA,TAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=174,127,146;MMQ=60,60,60;MPOS=28,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,16;RU=A;STR;TLOD=10.08,4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,2:0.431,0.246:10:1,2,2:3,2,0:4,0,6,0
chr11	116631391	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,2:1,0:2,0,2,0
chr11	116631690	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:4,9:4,3:0|1:116631690_G_A:116631690:0,8,2,10
chr11	116631707	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0|1:116631690_G_A:116631690:0,0,2,16
chr11	116634039	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=149,284;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:116634039_C_A:116634039:1,2,0,1
chr11	116634041	.	C	CATAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=149,284;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:116634039_C_A:116634039:1,2,0,1
chr11	116640768	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,188;MMQ=40,32;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr11	116643689	.	C	CG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr11	116650622	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,35;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:116650622_G_GA:116650622:0,4,0,1
chr11	116650625	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:116650622_G_GA:116650622:0,4,0,1
chr11	116650626	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=144,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:116650626_G_T:116650626:0,3,0,1
chr11	116650628	.	G	GAATTGGAAGCTGCCTGCA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:116650622_G_GA:116650622:0,3,0,1
chr11	116650629	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,36;MFRL=144,208;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:116650626_G_T:116650626:0,3,0,1
chr11	116650640	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:116650640_T_C:116650640:0,1,0,1
chr11	116650642	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:116650640_T_C:116650640:0,1,0,1
chr11	116654435	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=194,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,1,4
chr11	116657590	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr11	116691511	.	GGACA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GACA;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,2:1,0,3,1
chr11	116692694	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	116693756	.	CT	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=145,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:116693756_CT_AA:116693756:3,0,1,0
chr11	116693760	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:116693756_CT_AA:116693756:2,0,1,0
chr11	116694005	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr11	116703640	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=53.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr11	116703671	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:0,5,1,6
chr11	116707684	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr11	116708020	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:8,3,2,0
chr11	116708123	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,3:14,0:17,12,3,0
chr11	116720089	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=310,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr11	116729096	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:19,2:21,1:32,12,1,2
chr11	116732512	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,1:0,10:0,0,8,4
chr11	116732856	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr11	116734545	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.557:32:2,10:12,7:5,9,5,13
chr11	116747025	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:8,7:4,7:5,7,3,11
chr11	116824884	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr11	117030581	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr11	117030624	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.727:13:2,3:1,7:3,0,7,3
chr11	117034388	.	CAAAAAA	C,CAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33,36;MFRL=244,163,149;MMQ=57,60,60;MPOS=16,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,12,15;RU=A;STR;TLOD=4.47,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,1:0.399,0.199:7:2,0,1:1,2,0:3,0,3,1
chr11	117034619	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=111.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,10,24
chr11	117049993	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:7,2,0,2
chr11	117052069	.	GTCTCT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:3,0,1,0
chr11	117059347	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr11	117059552	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,2:3,3:1,6,1,4
chr11	117074229	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,2:1,0:1,4,0,3
chr11	117074244	.	G	GAATTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=200,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0,4,0,1
chr11	117090545	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:0|1:117090545_T_C:117090545:0,7,0,6
chr11	117090558	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0|1:117090545_T_C:117090545:0,0,0,10
chr11	117095361	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,7:0,0,14,8
chr11	117097931	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:2,3,6,2
chr11	117097952	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:6,1:1,3:6,1,1,4
chr11	117100594	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr11	117109270	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	117110417	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr11	117151014	.	A	AGTTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GTTT;STR;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:0,3:4,3:0,4,0,6
chr11	117152302	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,14;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,0:10,2,2,1
chr11	117152540	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr11	117161454	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117161454_T_TCC:117161454:0,1,0,1
chr11	117161457	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117161454_T_TCC:117161454:0,1,0,1
chr11	117163685	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:13,0,0,2
chr11	117163765	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=102.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,13:0,0,17,13
chr11	117209268	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:2,5:4,2:6,2,7,1
chr11	117232492	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr11	117241760	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr11	117251521	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	117253669	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:117253669_G_T:117253669:2,2,0,1
chr11	117253672	.	T	TCATGATATTGATTCTTCCTACCCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:117253669_G_T:117253669:2,2,0,1
chr11	117257876	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=204,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr11	117261488	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:9,4:2,8:7,4,9,3
chr11	117263874	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=132,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr11	117266504	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.245:6:3,1:1,0:0,5,0,1
chr11	117266921	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0|1:117266921_G_T:117266921:0,0,1,1
chr11	117266926	.	G	GCCAAGAAAGAGCATAAAATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:117266921_G_T:117266921:0,0,1,1
chr11	117280724	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,1:6,2:0,9,0,3
chr11	117299015	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:1,10:0,19:1,0,26,3
chr11	117299039	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.503:32:8,6:6,9:11,5,14,2
chr11	117306291	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	117308183	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr11	117308564	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:117308564_T_A:117308564:1,0,1,0
chr11	117308568	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:117308564_T_A:117308564:2,0,1,0
chr11	117321477	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=177,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117321477_G_C:117321477:0,1,0,1
chr11	117321479	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=177,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117321477_G_C:117321477:0,1,0,1
chr11	117321481	.	GGGA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=177,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117321477_G_C:117321477:0,1,0,1
chr11	117321489	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=177,81;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117321477_G_C:117321477:0,1,0,1
chr11	117332208	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,2:11,0:0|1:117332208_T_A:117332208:7,7,1,1
chr11	117332214	.	CG	GC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=111,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,2:10,0:0|1:117332208_T_A:117332208:7,10,1,1
chr11	117332352	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr11	117375849	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:117375849_T_C:117375849:0,1,0,1
chr11	117375855	.	G	GCAGAGGCCAGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:117375849_T_C:117375849:0,1,0,1
chr11	117392155	.	G	GGGTTAGACATGCCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	117395481	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:3,1,5,1
chr11	117403235	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,3:2,5:1,2,5,3
chr11	117651301	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:8,2:12,2:13,8,3,1
chr11	117691519	.	CG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=143,46;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.274:9:6,1:1,1:0|1:117691519_CG_C:117691519:2,5,2,0
chr11	117691524	.	CTCCTT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=167,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:7,1:2,1:0|1:117691519_CG_C:117691519:5,5,2,0
chr11	117773110	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0|1:117773110_G_C:117773110:0,0,0,5
chr11	117773116	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=149,274;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1|0:117773110_G_C:117773110:0,4,0,1
chr11	117774291	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr11	117776471	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr11	117780744	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=104,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr11	117784434	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,3,0
chr11	117789312	.	CGGGCTGGAGATGCCT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGCTGGAGATGCCT;STR;TLOD=56.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.948:14:0,6:0,7:0,0,7,7
chr11	117799923	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr11	117800083	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr11	117869869	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.671:25:4,10:3,5:5,3,6,11
chr11	117948080	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=121,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:2,7:8,3:3,8,2,8
chr11	117965646	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr11	117988223	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr11	117988539	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=194,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:3,2,4,0
chr11	118037564	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr11	118037813	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=103,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr11	118067426	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,5:1,1:3,0,5,1
chr11	118067621	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=201,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:0,2,0,6
chr11	118071097	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr11	118074117	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr11	118081468	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=115,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.665:10:3,2:0,4:0,3,0,7
chr11	118100699	.	CAT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,3:5,5:1,8,0,8
chr11	118108003	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,0,16
chr11	118134785	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,6:2,6:4,3,8,4
chr11	118182801	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=90.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,21,6
chr11	118184406	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.809:3:0,0:0,0:0|1:118184406_A_C:118184406:0,0,3,0
chr11	118184411	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:2,0:0,0:0|1:118184406_A_C:118184406:2,0,3,0
chr11	118184418	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=131,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,1:1,0:0|1:118184418_A_C:118184418:5,0,3,0
chr11	118184420	.	A	AGGGGGGGGGGCCG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=131,209;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,0:1,0:0|1:118184418_A_C:118184418:5,0,3,0
chr11	118210106	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:8,5:4,1:9,3,5,1
chr11	118211353	.	G	GTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr11	118215075	.	AGGCT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGCT;STR;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:2,8:4,1:7,1,9,0
chr11	118221474	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=193,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr11	118243700	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=153,79;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:0|1:118243700_TA_T:118243700:1,0,2,0
chr11	118243725	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,16;MFRL=145,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:1,0:0,0:0|1:118243700_TA_T:118243700:2,0,2,0
chr11	118245971	.	C	CTGTGTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=160,135;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=TG;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.592:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr11	118246021	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr11	118250524	.	A	AATTCCAACAATGTCCAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=203,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr11	118250535	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=197,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:118250535_T_A:118250535:0,1,0,1
chr11	118250542	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=197,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:118250535_T_A:118250535:0,1,0,1
chr11	118362414	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	118365168	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:2,2:1,7,0,2
chr11	118368822	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.623:21:4,7:2,6:0,8,4,9
chr11	118370231	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr11	118372316	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,165;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,4:0,0:5,0,4,0
chr11	118378432	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=191,166;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:118378432_T_C:118378432:0,8,0,2
chr11	118378434	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=191,166;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:118378432_T_C:118378432:0,8,0,2
chr11	118380007	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31,21;MFRL=148,198,199;MMQ=60,60,60;MPOS=26,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.69,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.271,0.270:8:2,0,0:1,2,1:0,4,0,4
chr11	118405343	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	118422411	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=140,181;MMQ=50,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:118422411_C_A:118422411:2,0,1,0
chr11	118422417	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=129,187;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:118422411_C_A:118422411:2,0,2,0
chr11	118422420	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=170,187;MMQ=60,45;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,0:0|1:118422411_C_A:118422411:5,0,2,0
chr11	118422446	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=34,12;MFRL=44,187;MMQ=60,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:6,0:0|1:118422411_C_A:118422411:8,6,2,0
chr11	118516619	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=168,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr11	118520825	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:0|1:118520825_T_C:118520825:6,11,1,1
chr11	118520831	.	T	TTGCA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:0|1:118520825_T_C:118520825:5,11,1,1
chr11	118520833	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:118520825_T_C:118520825:5,11,1,1
chr11	118520838	.	ACA	TTC	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:8,1:0|1:118520825_T_C:118520825:5,13,1,1
chr11	118529017	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,20,17
chr11	118529044	.	C	CG	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=147.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,18:0,16:0|1:118529044_C_CG:118529044:0,0,18,18
chr11	118529052	.	G	GAGT	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=150,113;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.083:33:18,2:13,0:0|1:118529052_G_GAGT:118529052:17,14,0,2
chr11	118529054	.	G	GATGTCATGCGGAGAGGTGA	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=150,113;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:18,1:13,0:0|1:118529052_G_GAGT:118529052:17,14,0,2
chr11	118529069	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=137.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,16:0,14:0|1:118529044_C_CG:118529044:0,0,11,20
chr11	118529078	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.972:33:0,18:0,14:0|1:118529044_C_CG:118529044:0,0,13,20
chr11	118529419	.	C	CCTCAGTGTGCTCACCTGCA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=174,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.240:10:3,2:5,0:2,6,1,1
chr11	118529595	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:5,1,5,1
chr11	118529810	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr11	118625609	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:0,5,0,6
chr11	118651809	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,4:7,8:6,6,9,3
chr11	118764407	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:7,10,1,1
chr11	118842736	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:118842736_G_C:118842736:0,0,1,0
chr11	118842738	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118842736_G_C:118842736:0,0,1,0
chr11	118849922	.	T	TGGATGTGGGTTTTTTGTTGTTGTTGCG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	118851138	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr11	118852081	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	118868842	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr11	118882100	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr11	118883880	.	AT	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:24,2:14,2:38,3,4,0
chr11	118884009	.	AT	A,ATT	.	.	DP=88;ECNT=4;MBQ=24,31,31;MFRL=125,158,132;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=14.80,5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,9,10:0.233,0.265:36:8,2,5:3,4,1:8,9,8,11
chr11	118884092	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=183,242;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,2:7,0:0|1:118884092_G_A:118884092:0,23,0,2
chr11	118884097	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=189,242;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,2:7,0:0|1:118884092_G_A:118884092:0,23,0,2
chr11	118884106	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=191,242;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:7,0:0|1:118884092_G_A:118884092:0,22,0,2
chr11	118886222	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:9,1:13,1:9,14,1,1
chr11	118889114	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	118890953	.	GA	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=152,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:118890953_GA_CC:118890953:0,2,0,1
chr11	118890956	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=152,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:118890953_GA_CC:118890953:0,2,0,1
chr11	118898435	.	AC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=54.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,10:0,6:0,0,7,9
chr11	118919206	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0,0,8,4
chr11	118920453	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,10,4
chr11	118926681	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr11	118926720	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr11	118939939	.	T	TC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,7:0,0,12,5
chr11	118942638	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=199,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118942638_A_C:118942638:0,1,0,1
chr11	118942654	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=199,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:118942638_A_C:118942638:0,1,0,1
chr11	118944675	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,1:2,2:3,1,4,0
chr11	118949083	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	118949116	.	CT	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	118949799	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:8,8:3,5:10,2,12,1
chr11	118952033	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,1:8,1:8,8,0,2
chr11	118952371	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=112,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,2:2,0:1,4,1,1
chr11	118955679	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:3,4:5,11:8,0,13,2
chr11	118958869	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:6,0,3,0
chr11	118959732	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=248,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr11	118963291	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,0,4
chr11	118970875	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0|1:118970875_T_C:118970875:0,0,9,0
chr11	118970878	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=203,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:4,5:1,2:0|1:118970875_T_C:118970875:5,0,6,1
chr11	118971251	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	118973112	.	AA	GC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=127.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,10:0,0,4,25
chr11	118983434	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,109;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:3,1,4,2
chr11	118984287	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr11	118986702	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=16,18;MFRL=261,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:118986702_T_G:118986702:1,0,2,0
chr11	118986704	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=261,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:118986702_T_G:118986702:1,0,2,0
chr11	118986706	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=12,29;MFRL=261,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:118986702_T_G:118986702:1,0,2,0
chr11	118986711	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=101,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:118986702_T_G:118986702:1,2,2,0
chr11	118986717	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=105,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:0,0:0|1:118986702_T_G:118986702:2,2,2,0
chr11	118986722	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,12;MFRL=101,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,0:0|1:118986702_T_G:118986702:1,2,2,0
chr11	118986725	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,12;MFRL=101,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:118986702_T_G:118986702:1,2,1,0
chr11	118986972	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:1,4,1,4
chr11	119002439	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:0|1:119002439_A_G:119002439:0,3,0,2
chr11	119002450	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:119002439_A_G:119002439:0,4,0,1
chr11	119002452	.	T	TTCCACTTTAGATAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:119002439_A_G:119002439:0,4,0,1
chr11	119003322	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.489:18:6,5:3,2:5,4,2,7
chr11	119004009	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=185,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:0,1,0,4
chr11	119004026	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=187,216;MMQ=40,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr11	119005088	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,14:0,0,8,21
chr11	119025133	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:119025133_G_C:119025133:0,2,0,1
chr11	119025136	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:119025133_G_C:119025133:1,2,0,1
chr11	119025137	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:119025133_G_C:119025133:1,2,0,1
chr11	119025142	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:119025133_G_C:119025133:1,2,0,1
chr11	119027378	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:3,5:5,3:4,6,4,5
chr11	119027738	.	G	GACATCAAAATCT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=105,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.275:9:2,2:5,0:0|1:119027738_G_GACATCAAAATCT:119027738:0,7,1,1
chr11	119027740	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=105,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.275:9:2,2:4,0:0|1:119027738_G_GACATCAAAATCT:119027738:0,7,1,1
chr11	119027743	.	G	GAAT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=82,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:119027738_G_GACATCAAAATCT:119027738:0,6,1,1
chr11	119027745	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=105,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:4,0:0|1:119027738_G_GACATCAAAATCT:119027738:0,7,1,1
chr11	119031120	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:1,3,0,1
chr11	119031841	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	119043745	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,2:1,0:0,3,1,2
chr11	119054488	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr11	119061220	.	C	CATTGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=222,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:119061220_C_CATTGT:119061220:0,1,0,1
chr11	119061224	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=222,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:119061220_C_CATTGT:119061220:0,1,0,1
chr11	119063908	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=45,133;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,2,5
chr11	119145705	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr11	119146659	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=107.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,20:0,12:0,0,28,4
chr11	119148573	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=92.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,5,23
chr11	119155618	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.567:12:3,2:2,4:5,0,7,0
chr11	119158749	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,136;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,0:7,5:1,11,0,5
chr11	119181170	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=113,106;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,4:4,4:5,3,4,4
chr11	119181200	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=113,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:0|1:119181200_A_C:119181200:4,5,1,1
chr11	119181202	.	GT	TG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=113,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:5,0:0|1:119181200_A_C:119181200:4,5,1,1
chr11	119181674	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=189,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,6:2,1:2,1,3,4
chr11	119181712	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=193,245;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:6,3,2,0
chr11	119185133	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,2:4,5:7,0,7,0
chr11	119205735	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=210,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr11	119205830	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:10,7:4,8:10,4,12,4
chr11	119208111	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	119214771	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr11	119217254	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr11	119217311	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	119227844	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr11	119228547	.	TGA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GA;STR;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:3,1:2,5,3,0
chr11	119229394	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	119290034	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr11	119291480	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	119291688	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr11	119509625	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	119548435	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.109:26:10,0:10,2:11,13,2,0
chr11	119986182	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=248,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr11	120097498	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr11	120097754	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,17;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:120097754_C_G:120097754:0,3,0,1
chr11	120097761	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,17;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:120097754_C_G:120097754:0,2,0,1
chr11	120097763	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,15;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:120097754_C_G:120097754:0,2,0,1
chr11	120097766	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,17;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:120097754_C_G:120097754:0,2,0,1
chr11	120097785	.	C	CAAGA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=35,35;MFRL=198,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120097785_C_CAAGA:120097785:0,1,0,1
chr11	120097789	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=198,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120097785_C_CAAGA:120097785:0,1,0,1
chr11	120097793	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=198,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120097785_C_CAAGA:120097785:0,1,0,1
chr11	120097795	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=198,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120097785_C_CAAGA:120097785:0,1,0,1
chr11	120099655	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,11;MFRL=173,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:120099655_A_C:120099655:1,0,1,0
chr11	120099658	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:120099655_A_C:120099655:0,0,1,0
chr11	120099679	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr11	120117251	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=185,170;MMQ=60,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr11	120117257	.	G	GTTCTGATT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=170,163;MMQ=24,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:120117257_G_GTTCTGATT:120117257:0,1,0,1
chr11	120117259	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=170,163;MMQ=24,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120117257_G_GTTCTGATT:120117257:0,1,0,1
chr11	120117260	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=163,170;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120117260_T_G:120117260:0,1,0,1
chr11	120117265	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,11;MFRL=0,170;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:120117260_T_G:120117260:0,0,0,1
chr11	120175681	.	TC	AA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:0,1:0|1:120175681_TC_AA:120175681:3,0,3,0
chr11	120175684	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,1:0,1:0|1:120175681_TC_AA:120175681:3,0,3,0
chr11	120175690	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=156,190;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:0,0:0|1:120175681_TC_AA:120175681:5,0,2,0
chr11	120175693	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=156,190;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:5,1:0,0:0|1:120175681_TC_AA:120175681:5,0,2,0
chr11	120176310	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr11	120188153	.	GAAAGC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=205,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120188153_GAAAGC_G:120188153:0,1,0,1
chr11	120188161	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120188153_GAAAGC_G:120188153:0,0,0,1
chr11	120207832	.	TGAGTTGGACTTTTGTGTCCCTGACG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,0:4,2:7,0,1,1
chr11	120278634	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=210,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	120295092	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=143,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,2:14,0:12,16,1,1
chr11	120322127	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=194,169;MMQ=60,35;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr11	120322152	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=166,141;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr11	120348128	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.530:4:1,1:0,1:0|1:120348128_GT_G:120348128:1,1,2,0
chr11	120348148	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.338:7:1,0:3,0:0|1:120348128_GT_G:120348128:3,2,2,0
chr11	120690372	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr11	120690662	.	AGT	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:120690662_AGT_A:120690662:0,3,0,1
chr11	120690666	.	CAGT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:120690662_AGT_A:120690662:0,3,0,1
chr11	120690671	.	TTGTTG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:120690662_AGT_A:120690662:0,2,0,1
chr11	120690679	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:120690662_AGT_A:120690662:0,2,0,1
chr11	120690682	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:120690662_AGT_A:120690662:0,2,0,1
chr11	120707644	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	120823528	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr11	120831520	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	120916352	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,5:4,6:7,0,11,0
chr11	120984506	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:120984506_C_CCT:120984506:0,2,0,1
chr11	120984509	.	A	AACATTGACGTTTGTGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:120984506_C_CCT:120984506:0,2,0,1
chr11	120984519	.	GA	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	121008343	.	G	GTCTGCTCCCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=98,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr11	121033105	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr11	121037530	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	121037554	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=337,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr11	121175278	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr11	121340672	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:3,1,1,0
chr11	121360884	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=276,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr11	121367557	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=140,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr11	121393212	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	121403345	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr11	121415963	.	A	AG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=129,33;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:10,7,1,1
chr11	121416187	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=220,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr11	121416199	.	G	GTGGAGCCAGGCTGGGGGCGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.379:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr11	121421432	.	AT	GG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=158,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:0|1:121421432_AT_GG:121421432:0,9,1,1
chr11	121421435	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=158,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:121421432_AT_GG:121421432:0,9,1,1
chr11	121424911	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,237;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr11	121428101	.	GTGCCCCAAGAGGGGTAAGTGT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:6,0:5,17,0,2
chr11	121445084	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,3,10
chr11	121460664	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,1:1,6:0,1,7,1
chr11	121475798	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr11	121478060	.	T	TTGGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr11	121483401	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,16:0,0,24,4
chr11	121489416	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	121492037	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	121493001	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr11	121493072	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr11	122650172	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,5:2,1:5,2,5,1
chr11	122709178	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:6,1,2,0
chr11	122720710	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,1:3,0,3,0
chr11	122738062	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,5:0,1:1,0,6,1
chr11	122775227	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr11	122795782	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,3:1,2:0,2,1,4
chr11	122805731	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,0:4,3,0,2
chr11	122827184	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:13,4:8,0:18,4,4,0
chr11	122830214	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr11	122852199	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=120,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.178:21:7,0:5,3:7,11,0,3
chr11	122928934	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=97,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.586:7:2,4:0,0:2,1,4,0
chr11	123065773	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	123454976	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=131,37;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:5,1,1,1
chr11	123454978	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:4,1,2,1
chr11	123455106	.	G	GGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	123465619	.	T	TCCCTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=217,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr11	123465632	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=267,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123465632_A_C:123465632:0,1,0,1
chr11	123465634	.	GC	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=267,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123465632_A_C:123465632:0,1,0,1
chr11	123465637	.	C	CAGACCAGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=267,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123465632_A_C:123465632:0,1,0,1
chr11	123477240	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr11	123479611	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr11	123485631	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:0,6,0,4
chr11	123504959	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr11	123598941	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=117,135;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:9,2:5,4:7,7,2,4
chr11	123624477	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:9,0:15,2:14,10,1,1
chr11	123624840	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=140,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:9,0:6,2:0|1:123624840_G_T:123624840:10,7,1,1
chr11	123624845	.	G	GTCACCAGCTGTTACTGTATTGA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=140,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:0|1:123624840_G_T:123624840:10,5,1,1
chr11	123624868	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=168,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:9,3,2,0
chr11	123676022	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=206,155;MMQ=46,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:123676022_A_C:123676022:2,0,1,0
chr11	123676025	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=206,155;MMQ=46,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:123676022_A_C:123676022:2,0,1,0
chr11	123777536	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:2,2,4,3
chr11	123778173	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,1:3,2:0,5,0,3
chr11	123810476	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:16,1:16,1:15,17,1,1
chr11	123811344	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	123847473	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=94,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.487:8:2,4:2,0:1,3,1,3
chr11	123901343	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=188,171;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123901343_G_A:123901343:0,1,0,1
chr11	123901348	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=188,171;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123901343_G_A:123901343:0,1,0,1
chr11	123901350	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=188,171;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123901343_G_A:123901343:0,1,0,1
chr11	123993874	.	C	CTGGTGTATATTTCCTAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:123993874_C_CTGGTGTATATTTCCTAAA:123993874:0,0,0,1
chr11	123993876	.	AGT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:123993874_C_CTGGTGTATATTTCCTAAA:123993874:0,0,0,1
chr11	123993882	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123993874_C_CTGGTGTATATTTCCTAAA:123993874:0,0,0,1
chr11	124005798	.	C	CACCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1,3,0,1
chr11	124016740	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,3:5,1:0,6,0,4
chr11	124095319	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,1:1,2:6,0,3,0
chr11	124095459	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,94471;MMQ=60,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,0:11,2:11,13,2,0
chr11	124120338	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr11	124134686	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=175,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr11	124179656	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=205,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr11	124179835	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,6:5,8:5,5,8,6
chr11	124180082	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:9,5:4,8:7,6,6,7
chr11	124252312	.	TCC	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:24,2:20,0:29,15,0,2
chr11	124266912	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,173;MMQ=59,57;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,27:0.527:51:9,12:15,14:10,14,16,11
chr11	124293767	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=78,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:1,1,5,1
chr11	124294236	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,6:3,4:4,2,8,2
chr11	124294303	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:11,1:4,0:0|1:124294303_G_T:124294303:8,7,0,2
chr11	124294307	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,18;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:11,1:4,0:0|1:124294303_G_T:124294303:8,7,0,2
chr11	124294349	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:9,11:10,5:8,12,7,9
chr11	124294377	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:5,7:11,6:6,10,8,5
chr11	124493199	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr11	124494780	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=97.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,18:0,0,29,6
chr11	124517920	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=144,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr11	124609901	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,14;MFRL=176,151;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:1,0:0,0:0|1:124609901_A_C:124609901:0,1,2,0
chr11	124609908	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=176,151;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:1,1:0,1:0|1:124609901_A_C:124609901:0,1,2,0
chr11	124609911	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=176,115;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124609901_A_C:124609901:0,1,1,0
chr11	124609914	.	CACCACACAGA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,12;MFRL=155,115;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:124609901_A_C:124609901:0,2,1,0
chr11	124609928	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=133,115;MMQ=60,45;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:2,0:0,0:0|1:124609901_A_C:124609901:0,3,1,0
chr11	124615473	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr11	124619769	.	A	ATGGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	124631927	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.373:33:7,5:13,6:19,2,10,2
chr11	124669697	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr11	124669710	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:124669710_G_C:124669710:0,0,1,0
chr11	124669712	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:124669710_G_C:124669710:0,0,1,0
chr11	124669714	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:124669710_G_C:124669710:0,0,1,0
chr11	124669718	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:124669710_G_C:124669710:0,0,1,0
chr11	124739332	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=178,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.319:11:2,1:3,2:5,3,1,2
chr11	124749660	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=121,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,1:11,1:17,9,2,0
chr11	124749693	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.197:27:9,1:9,0:7,15,5,0
chr11	124754934	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:2,5,1,2
chr11	124757172	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,140;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:124757172_T_G:124757172:0,0,2,0
chr11	124757178	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=181,140;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:124757172_T_G:124757172:1,1,2,0
chr11	124764258	.	C	CTAGAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=220,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:124764258_C_CTAGAG:124764258:0,2,0,1
chr11	124764260	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=220,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:124764258_C_CTAGAG:124764258:0,2,0,1
chr11	124766591	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr11	124790582	.	A	ATCACTGCCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr11	124856951	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr11	124862995	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=89,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr11	124947476	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,1,1
chr11	124949665	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:9,8:3,5:4,10,6,8
chr11	124949669	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=135,41;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:15,0:9,0:10,16,0,2
chr11	124949690	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=132,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,2:5,0:5,12,1,1
chr11	124951467	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr11	124954652	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr11	124955775	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=127,56;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr11	124955977	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:4,4,2,2
chr11	124958122	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	124967487	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,16,8
chr11	124967678	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr11	124972208	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=186,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr11	125281795	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,0:6,5:1,9,0,5
chr11	125298871	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr11	125298890	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:2,3,4,2
chr11	125351472	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:3,5:0,3:1,2,4,5
chr11	125365285	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=124,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.515:29:9,5:5,9:4,10,6,9
chr11	125442503	.	CTT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:7,1:9,0:2,14,0,2
chr11	125445292	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:8,10,0,2
chr11	125445394	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr11	125446070	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:8,0,4,0
chr11	125452300	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,3,9
chr11	125452313	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=110,176;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:0,6,2,4
chr11	125472234	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,156;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:28,3:16,0:26,18,3,0
chr11	125478209	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.505:14:3,6:4,1:2,5,0,7
chr11	125479496	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,5:3,4:1,5,3,6
chr11	125479579	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:125479579_T_C:125479579:0,3,0,1
chr11	125479583	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:125479579_T_C:125479579:0,3,0,1
chr11	125482682	.	G	GCATCATTGCCCGTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:125482682_G_GCATCATTGCCCGTCC:125482682:0,2,0,1
chr11	125482684	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=129,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr11	125482693	.	T	TCTATACGTCCCCAGGCTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1|0:125482682_G_GCATCATTGCCCGTCC:125482682:0,1,0,1
chr11	125497466	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:6,6:7,7:9,5,9,4
chr11	125514573	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr11	125547660	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,3:3,2:9,2,4,1
chr11	125616483	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,6:0,0,14,3
chr11	125616502	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,4:5,1:9,6,5,0
chr11	125617376	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr11	125618725	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:125618725_A_AT:125618725:0,2,0,1
chr11	125618726	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:125618725_A_AT:125618725:0,2,0,1
chr11	125618728	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr11	125618729	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=191,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125618725_A_AT:125618725:0,1,0,1
chr11	125647712	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr11	125648321	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=204,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr11	125708198	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr11	125708293	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:3,7,2,0
chr11	125763581	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=210,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:4,0,2,0
chr11	125763610	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:4,5:0,1:4,0,6,0
chr11	125765528	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:4,3:2,5:2,4,5,4
chr11	125766173	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,9:0,17:0,0,6,20
chr11	125766204	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=69.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0|1:125766204_G_C:125766204:0,0,2,14
chr11	125766207	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0|1:125766204_G_C:125766204:0,0,2,13
chr11	125770605	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,0:0,0,0,6
chr11	125770618	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr11	125778074	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=90,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.459:9:1,1:3,3:3,2,3,1
chr11	125788428	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,10;MFRL=213,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:125788428_TC_GG:125788428:1,0,1,0
chr11	125788432	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=213,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.515:2:1,1:0,0:0|1:125788428_TC_GG:125788428:1,0,1,0
chr11	125788438	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,33;MFRL=224,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:125788428_TC_GG:125788428:2,0,1,0
chr11	125791035	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	125791353	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=240,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:125791353_C_G:125791353:0,2,0,1
chr11	125791357	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=210,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:125791353_C_G:125791353:1,2,0,1
chr11	125791362	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=210,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:125791353_C_G:125791353:1,2,0,1
chr11	125791365	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=210,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:125791353_C_G:125791353:1,2,0,1
chr11	125791367	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=210,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:125791353_C_G:125791353:1,2,0,1
chr11	125831560	.	A	AGGCACCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=275,425;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr11	125848261	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,3:6,4:4,8,1,6
chr11	125864326	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr11	125864972	.	AAAC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAC;STR;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.550:9:1,2:2,3:0,4,0,5
chr11	125867039	.	TATATAA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0|1:125867039_TATATAA_T:125867039:2,0,5,0
chr11	125867053	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.885:6:0,3:0,3:0|1:125867039_TATATAA_T:125867039:0,0,6,0
chr11	125893448	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=130,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:125893448_GA_G:125893448:0,2,0,1
chr11	125893452	.	G	GAAGGCAGAGACTTTGAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1|0:125893448_GA_G:125893448:0,2,0,1
chr11	125893454	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=130,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:125893448_GA_G:125893448:0,2,0,1
chr11	125893457	.	T	TAAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1|0:125893448_GA_G:125893448:0,2,0,1
chr11	126074192	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,5:1,0:1,2,1,4
chr11	126074298	.	T	TGGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126074298_T_TGGA:126074298:0,0,0,1
chr11	126074300	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126074298_T_TGGA:126074298:0,0,0,1
chr11	126080757	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=155.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,20:0,23:0,0,32,11
chr11	126080776	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.510:47:14,10:8,14:19,4,14,10
chr11	126081336	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=46.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chr11	126131993	.	TC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,115;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,0:16,2:12,12,0,2
chr11	126132138	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr11	126145931	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr11	126146210	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.281:8:3,0:2,2:0|1:126146210_G_GT:126146210:6,0,0,2
chr11	126146212	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.281:8:3,0:3,1:0|1:126146210_G_GT:126146210:6,0,0,2
chr11	126146244	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr11	126160687	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr11	126163691	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr11	126176376	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr11	126213341	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=128,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr11	126215513	.	ACT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:126215513_ACT_A:126215513:0,3,0,1
chr11	126215518	.	G	GAAAATAACTGAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:126215513_ACT_A:126215513:0,3,0,1
chr11	126215547	.	G	GCAAGAGGCCCAGTGTGGCAGGGCCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=356,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:126215547_G_GCAAGAGGCCCAGTGTGGCAGGGCCT:126215547:0,1,0,1
chr11	126215550	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=356,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:126215547_G_GCAAGAGGCCCAGTGTGGCAGGGCCT:126215547:0,1,0,1
chr11	126276788	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr11	126301476	.	C	CACACTTTGTCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	126305279	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	126310299	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr11	126315024	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:2,1:1,5:1,3,1,5
chr11	126333241	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.807:13:0,5:2,6:1,1,0,11
chr11	126343130	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:126343130_T_G:126343130:0,0,1,0
chr11	126343135	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:126343130_T_G:126343130:0,0,1,0
chr11	126343138	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:126343130_T_G:126343130:0,0,1,0
chr11	126343141	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,18;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:126343130_T_G:126343130:0,0,1,0
chr11	126343146	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:126343130_T_G:126343130:0,0,1,0
chr11	126343147	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:126343130_T_G:126343130:0,0,1,0
chr11	126343151	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:126343130_T_G:126343130:0,0,1,0
chr11	126391115	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	128333610	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128333610_C_CA:128333610:0,1,0,1
chr11	128333619	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128333610_C_CA:128333610:0,1,0,1
chr11	128333621	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128333610_C_CA:128333610:0,1,0,1
chr11	128350071	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr11	128355859	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr11	128391937	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:0,6,0,9
chr11	128638216	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr11	128652012	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr11	128675401	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	128679200	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=126,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,5:0,5:0,1,0,10
chr11	128679211	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr11	128680276	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:0,0:0,1:1,0,2,0
chr11	128680490	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,1:9,1:12,11,1,1
chr11	128772452	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=136,91;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:7,4:5,1:3,9,5,1
chr11	128773413	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,2:6,3:2,6,2,3
chr11	128782012	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr11	128782110	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	128786294	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.297:25:8,5:9,2:13,5,2,5
chr11	128839217	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:11,2:3,0:8,7,2,0
chr11	128840146	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:5,1:15,1:9,13,2,0
chr11	128846547	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:1,7:8,5:0,9,1,12
chr11	128932128	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,4:5,2:11,1,3,3
chr11	129306904	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=102,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:10,3:11,0:9,13,3,0
chr11	129312660	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr11	129321026	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=70,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:4,0,3,2
chr11	129321066	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,5:2,4:4,2,7,2
chr11	129727148	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr11	129743012	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr11	129746554	.	T	TCA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr11	129746555	.	G	GAGTTA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=154,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.599:10:2,3:2,3:4,0,4,2
chr11	129747345	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129747345_G_GCA:129747345:0,1,0,1
chr11	129747347	.	T	TGGCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129747345_G_GCA:129747345:0,1,0,1
chr11	129747349	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129747345_G_GCA:129747345:0,1,0,1
chr11	129752991	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,5:1,1:4,2,5,1
chr11	129753900	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:8,0,4,0
chr11	129753945	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=116,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.513:29:10,6:4,8:9,5,11,4
chr11	129754103	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr11	129754627	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=133,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:3,1,9,0
chr11	129754644	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0,0,10,2
chr11	129780608	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=123,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr11	129785816	.	AAACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=200,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr11	129793305	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr11	129799450	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	129990587	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,5:7,5:9,1,9,1
chr11	129997817	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,0:2,5:0,4,0,5
chr11	129998900	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,10,5
chr11	130007304	.	GA	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=189,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:130007304_GA_TT:130007304:0,1,0,1
chr11	130007308	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=252,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:130007304_GA_TT:130007304:0,1,0,1
chr11	130007313	.	G	GTCTATTTTTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=252,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:130007304_GA_TT:130007304:0,1,0,1
chr11	130010479	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr11	130011882	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:5,9,2,0
chr11	130012008	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:130012008_G_A:130012008:0,3,0,1
chr11	130012010	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:130012008_G_A:130012008:0,3,0,1
chr11	130012013	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:130012008_G_A:130012008:0,3,0,1
chr11	130012015	.	G	GTATTAGCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:130012008_G_A:130012008:0,3,0,1
chr11	130013148	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=237,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.433:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr11	130030038	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr11	130060612	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=187,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr11	130064223	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr11	130064647	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=34,30;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:2,2,1,1
chr11	130064669	.	GAGCA	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=33,34;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:130064669_GAGCA_G:130064669:0,3,0,1
chr11	130064676	.	T	TATAC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:130064669_GAGCA_G:130064669:0,3,0,1
chr11	130064679	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:130064669_GAGCA_G:130064669:0,3,0,1
chr11	130064684	.	CG	TA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:130064669_GAGCA_G:130064669:0,3,0,1
chr11	130064687	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=34,30;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:130064669_GAGCA_G:130064669:0,3,0,1
chr11	130064689	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=34,28;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:130064669_GAGCA_G:130064669:0,3,0,1
chr11	130064691	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:130064669_GAGCA_G:130064669:0,3,0,1
chr11	130064705	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr11	130066372	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=133,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,2,1
chr11	130068554	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:0,5,1,9
chr11	130069790	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr11	130131789	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:130131789_G_GCC:130131789:0,1,0,1
chr11	130131790	.	ATG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:130131789_G_GCC:130131789:0,1,0,1
chr11	130131796	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130131789_G_GCC:130131789:0,1,0,1
chr11	130278924	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	130284344	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr11	130286766	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr11	130331907	.	T	TGGGCCGGCCCCCAAATCACCCCACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr11	130584085	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130584085_C_A:130584085:0,1,0,1
chr11	130584089	.	ATA	TCG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130584085_C_A:130584085:0,1,0,1
chr11	130584128	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:130584128_C_T:130584128:0,0,0,1
chr11	130584133	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:130584128_C_T:130584128:0,0,0,1
chr11	130773076	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr11	130775782	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr11	130776437	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr11	130776454	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr11	130776524	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:5,4,2,2
chr11	130776556	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=140,166;MMQ=59,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,4:4,3:5,5,2,5
chr11	130776613	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:3,5,0,5
chr11	130776646	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr11	131531000	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,16:0,0,1,29
chr11	131531015	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,0,25
chr11	132179950	.	CA	C,CAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,34,32;MFRL=171,195,110;MMQ=60,45,60;MPOS=27,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,19;RU=A;STR;TLOD=4.93,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,4:0.334,0.348:12:1,1,1:2,3,1:3,1,6,2
chr11	132180148	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:10,0:6,2:3,15,0,2
chr11	132184394	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr11	132184695	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:132184695_A_T:132184695:0,1,0,1
chr11	132184701	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:132184695_A_T:132184695:0,1,0,1
chr11	132184703	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,16;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:132184695_A_T:132184695:0,1,0,1
chr11	132184704	.	G	GGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:132184695_A_T:132184695:0,1,0,1
chr11	132306153	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr11	132527247	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:7,2:2,10,0,2
chr11	133712321	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=197,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:2,0:0,2,2,0
chr11	133712327	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=153,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:2,2,2,0
chr11	133712331	.	TA	AC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=153,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,0:3,0:4,2,2,0
chr11	133712348	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,8,3
chr11	133712473	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,4,11
chr11	133715153	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:133715153_G_C:133715153:0,0,0,6
chr11	133715157	.	C	CAGTCCCAGAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0|1:133715153_G_C:133715153:0,3,0,1
chr11	133715160	.	T	TGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:133715153_G_C:133715153:0,3,0,1
chr11	133715163	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:133715153_G_C:133715153:0,3,0,1
chr11	133788869	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr11	133788992	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr11	133789021	.	G	GAGATTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr11	133792021	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,6,5
chr11	133792168	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=82,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:2,2:0,0:1,1,0,3
chr11	133792369	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr11	133794810	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:2,4,0,2
chr11	133796732	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=62,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:4,0,4,0
chr11	133801262	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr11	133806176	.	GAAGC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133806176_GAAGC_G:133806176:0,1,0,1
chr11	133806182	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=172,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133806176_GAAGC_G:133806176:0,1,0,1
chr11	133807376	.	TG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133807376_TG_CT:133807376:0,1,0,1
chr11	133807379	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133807376_TG_CT:133807376:0,1,0,1
chr11	134009860	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr11	134010722	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr11	134014673	.	C	CCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:3,1:1,3:4,0,4,1
chr11	134018980	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:8,1:1,3:6,3,3,1
chr11	134031836	.	C	CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr11	134064675	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,2:8,4:1,12,0,6
chr11	134072804	.	T	TA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,2:9,2:2,16,2,2
chr11	134073154	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=152,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.460:33:3,2:14,13:4,14,1,14
chr11	134073183	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:8,0:15,3:0,23,0,3
chr11	134093724	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.349:29:8,4:11,5:15,4,7,3
chr11	134093888	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:9,6:6,2:0,15,0,8
chr11	134104770	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:8,1,5,0
chr11	134118382	.	C	CA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.382:25:4,3:6,2:2,13,1,9
chr11	134128936	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.149:24:10,3:11,0:10,11,1,2
chr11	134131112	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:7,10,1,1
chr11	134147371	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:0,2,2,3
chr11	134151364	.	CC	AA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,199;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,1:8,3:3,15,0,6
chr11	134152030	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr11	134158805	.	C	CTAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=112,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:134158805_C_CTAG:134158805:2,2,0,1
chr11	134158807	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=112,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:134158805_C_CTAG:134158805:2,2,0,1
chr11	134158817	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=330,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr11	134162213	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	134176970	.	C	CTTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=6,10;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,0:5,2,2,0
chr11	134177205	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=118,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr11	134180874	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr11	134182375	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr11	134182856	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr11	134188851	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=187,154;MMQ=60,44;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.507:10:3,2:1,2:0,5,1,4
chr11	134188925	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=160,150;MMQ=50,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr11	134188930	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=170,150;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134188930_G_A:134188930:0,1,0,1
chr11	134188934	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=170,150;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134188930_G_A:134188930:0,1,0,1
chr11	134201864	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr11	134214380	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=129,115;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,24:0.688:34:6,6:4,13:0,10,7,17
chr11	134214445	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=217,155;MMQ=58,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr11	134214863	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,229;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr11	134234406	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=203,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,0:1,1:0,2,0,2
chr11	134238518	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr11	134240142	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr11	134241094	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr11	134243672	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:5,4,0,2
chr11	134251777	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr11	134252964	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr11	134253812	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	248071	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:2,1:2,2,1,2
chr12	271022	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	271048	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=33,16;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.389:8:2,1:3,0:0|1:271048_C_A:271048:2,3,3,0
chr12	271051	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,9;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.389:8:2,0:3,0:0|1:271048_C_A:271048:2,3,3,0
chr12	271055	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.389:8:2,1:2,0:0|1:271048_C_A:271048:2,3,3,0
chr12	271061	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=29,13;MFRL=137,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,0:3,0:0|1:271048_C_A:271048:4,4,2,0
chr12	271064	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,0:5,0:0|1:271048_C_A:271048:5,4,2,0
chr12	274572	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr12	274647	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,9,7
chr12	274839	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr12	275065	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,4,11
chr12	301843	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,6:0,13:0,0,2,17
chr12	310023	.	TGA	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:310023_TGA_T:310023:0,0,0,1
chr12	310028	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:310023_TGA_T:310023:0,0,0,1
chr12	310031	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:310023_TGA_T:310023:0,0,0,1
chr12	310033	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:310023_TGA_T:310023:0,0,0,1
chr12	310035	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:310023_TGA_T:310023:0,0,0,1
chr12	319111	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,5:0,0,4,13
chr12	319125	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,3,11
chr12	319229	.	T	TGGAAACACC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=264,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:319229_T_TGGAAACACC:319229:0,1,0,1
chr12	319230	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=264,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:319229_T_TGGAAACACC:319229:0,1,0,1
chr12	319233	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=264,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:319229_T_TGGAAACACC:319229:0,1,0,1
chr12	330315	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	333193	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=203,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,1,2
chr12	333521	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:2,0:4,2,2,0
chr12	333529	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,1:2,0:5,3,2,0
chr12	347068	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,10,4
chr12	351711	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,2:0,5:0,0,5,3
chr12	395435	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=211,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0|1:395435_A_AAC:395435:0,3,0,1
chr12	395438	.	A	AGAGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=211,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:395435_A_AAC:395435:0,3,0,1
chr12	395441	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=37,26;MFRL=211,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:395435_A_AAC:395435:0,3,0,1
chr12	405005	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,2:15,0:2,26,0,2
chr12	442563	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=214,106;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:442563_C_T:442563:2,0,0,1
chr12	442569	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=214,106;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:442563_C_T:442563:2,0,0,1
chr12	442570	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=214,106;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:442563_C_T:442563:2,0,0,1
chr12	442573	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=214,106;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:442563_C_T:442563:2,0,0,1
chr12	442582	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=203,106;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:442563_C_T:442563:3,0,0,1
chr12	464254	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr12	495217	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0|1:495217_G_T:495217:0,0,0,6
chr12	495226	.	C	CCTCCAATCTCCCTCATCAGCTTACCCAAGACCTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=176,166;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:495217_G_T:495217:0,3,0,1
chr12	498267	.	CGGGG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=17,29;MFRL=200,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=G;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:1,0:0|1:498267_CGGGG_C:498267:0,2,0,1
chr12	498282	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=179,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:498267_CGGGG_C:498267:0,3,0,1
chr12	539999	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,259;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:539999_C_T:539999:0,0,0,1
chr12	540009	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=300,259;MMQ=40,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:539999_C_T:539999:0,1,0,1
chr12	540994	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:9,9:8,8:14,3,14,4
chr12	550013	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	550028	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:550028_G_GA:550028:0,3,0,1
chr12	550034	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:550028_G_GA:550028:0,3,0,1
chr12	550036	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:550028_G_GA:550028:0,3,0,1
chr12	550038	.	TA	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:550028_G_GA:550028:0,3,0,1
chr12	550204	.	GTA	TGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	550911	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=185,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.626:3:0,0:1,1:0|1:550911_CTT_C:550911:1,0,2,0
chr12	550929	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=17,11;MFRL=185,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.621:3:0,0:0,0:0|1:550911_CTT_C:550911:1,0,2,0
chr12	653413	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=204,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:653413_C_A:653413:1,0,1,0
chr12	653419	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:653413_C_A:653413:0,0,1,0
chr12	653424	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:653413_C_A:653413:0,0,1,0
chr12	653984	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:2,1,5,0
chr12	655707	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr12	658871	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,1:3,4:10,0,5,0
chr12	661772	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:1,6:5,4:0,6,0,10
chr12	662934	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,2:16,0:12,11,2,0
chr12	666943	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,5:1,2,0,6
chr12	668507	.	T	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=116,69;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,5:0.090:65:26,5:32,0:0|1:668507_T_A:668507:29,31,3,2
chr12	668511	.	C	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=109,69;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,5:0.091:64:25,4:31,0:0|1:668507_T_A:668507:28,31,3,2
chr12	772673	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,3:1,2:1,1,0,7
chr12	862641	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,3:5,3:8,0,6,0
chr12	863517	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:1,5,1,5
chr12	936468	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,2:2,8:0,10,3,7
chr12	939136	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:14,0,2,0
chr12	968400	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.416:39:13,5:9,11:16,7,10,6
chr12	970296	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.152:26:8,1:10,3:13,9,2,2
chr12	987533	.	C	CT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:5,4:4,2:1,12,3,5
chr12	989269	.	TAATAGTTGAGTGTCAGAATAACTAGCAATA	T,TATAGTTGAGTGTCAGAATAACTAGCAATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28,28;MFRL=0,172,180;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.36,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr12	989800	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr12	991009	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:5,5:5,3:6,5,5,3
chr12	993092	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=217,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:993092_G_C:993092:0,3,0,1
chr12	993094	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=217,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:993092_G_C:993092:0,3,0,1
chr12	993097	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=220,152;MMQ=45,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:0,0:0|1:993092_G_C:993092:1,3,0,1
chr12	993101	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=220,152;MMQ=45,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:993092_G_C:993092:1,3,0,1
chr12	994680	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:6,4,2,0
chr12	995291	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:5,3:3,1:1,7,0,4
chr12	998365	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,5:7,5:5,8,3,7
chr12	998393	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:7,10,1,1
chr12	999762	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,3:0,7:0,1,0,10
chr12	1003837	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.402:35:10,10:11,3:5,16,3,11
chr12	1022452	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr12	1023692	.	G	GGAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:5,0:0|1:1023692_G_GGAT:1023692:5,6,1,1
chr12	1023694	.	C	CAAAAGTGTAGTAGGGAAGGAGGAGTCTCA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:0|1:1023692_G_GGAT:1023692:5,6,1,1
chr12	1025773	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:12,1,2,0
chr12	1040373	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=188,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.820:7:0,3:0,2:1,0,3,3
chr12	1219286	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr12	1224972	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.571:19:3,6:4,4:0|1:1224972_A_C:1224972:8,0,11,0
chr12	1224980	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:4,6:4,6:0|1:1224972_A_C:1224972:8,0,12,0
chr12	1289718	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr12	1292399	.	CTA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,1:6,1:10,1,2,0
chr12	1372114	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	1740548	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:4,2,3,1
chr12	1741841	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=147,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,1:7,1:9,13,1,1
chr12	1863728	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr12	1902766	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	1908954	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=94,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:3,0:0|1:1908954_C_G:1908954:1,2,0,1
chr12	1908956	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=94,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:2,0:0|1:1908954_C_G:1908954:1,2,0,1
chr12	1908957	.	A	AATGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=83,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:1908954_C_G:1908954:0,2,0,1
chr12	1909243	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr12	1910299	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,12:0,0,9,12
chr12	1919543	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr12	1920710	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr12	1920957	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=67.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,0,16
chr12	1940774	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=237,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	1955890	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr12	1965328	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:5,6,0,2
chr12	1987442	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=9,32;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:0,1:0,1,3,0
chr12	1987504	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:10,6,2,0
chr12	1993337	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr12	1994090	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:2,1:2,1:0,5,3,0
chr12	1995042	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:7,0,3,0
chr12	1995403	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,11:0,0,15,12
chr12	1995622	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	2016550	.	A	ATTGTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr12	2017289	.	G	GCCGTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2017289_G_GCCGTGTC:2017289:0,1,0,1
chr12	2017290	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2017289_G_GCCGTGTC:2017289:0,1,0,1
chr12	2018987	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=165,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr12	2055266	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr12	2058245	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,4:3,5:5,3,6,3
chr12	2061506	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:2,1:6,0,3,0
chr12	2107036	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.326:38:16,5:9,7:23,3,10,2
chr12	2113348	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr12	2229476	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:7,11:5,5:7,5,12,4
chr12	2613521	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=239,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:5,4:2,2:8,0,5,1
chr12	2659044	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr12	2659082	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr12	2676633	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	2677029	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,2:2,0:0|1:2677029_T_G:2677029:0,3,0,3
chr12	2677039	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:2,0:0|1:2677029_T_G:2677029:0,3,0,3
chr12	2690702	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	2692186	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	2706720	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,9:0,1:0,0,2,9
chr12	2719791	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:6,14,1,1
chr12	2742933	.	CGTCTATT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,2:12,0:5,16,0,2
chr12	2757719	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=136,55;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,0:2,0:0,4,2,0
chr12	2757721	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:2,0:1,4,1,0
chr12	2757756	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	2757769	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr12	2757782	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	2760708	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.886:7:0,2:0,2:0,0,6,1
chr12	2760970	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	2774668	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	2778082	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=160,55;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:12,2:0|1:2778082_C_A:2778082:16,5,1,1
chr12	2778091	.	GC	TT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=161,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:14,2:0|1:2778082_C_A:2778082:18,8,1,1
chr12	2778094	.	TGCAGC	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=155,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:9,0:16,2:0|1:2778082_C_A:2778082:18,10,1,1
chr12	2791130	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0|1:2791130_C_T:2791130:0,0,11,4
chr12	2791132	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0|1:2791130_C_T:2791130:0,0,11,4
chr12	2795019	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=148,201;MMQ=60,21;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:11,1:18,2:10,21,0,3
chr12	2795043	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=148,206;MMQ=60,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.158:27:9,1:12,2:3,20,0,4
chr12	2795255	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr12	2909145	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.538:35:8,13:8,5:11,5,12,7
chr12	2910237	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,6:3,6:4,0,10,2
chr12	2926543	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr12	2926556	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr12	2927127	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:10,6,2,0
chr12	2930645	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:0,5:3,0:4,0,4,1
chr12	2930825	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:8,7,0,2
chr12	2932177	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr12	2937013	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,3,1
chr12	2937030	.	T	TCTCTTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:4,0,0,1
chr12	2970607	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	2973666	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:0,3:6,4:0,7,4,3
chr12	2981499	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=171,201;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:2981499_GGT_G:2981499:0,2,0,1
chr12	2981504	.	A	ACG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=174,201;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:2981499_GGT_G:2981499:0,3,0,1
chr12	2981513	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=196,201;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:2981499_GGT_G:2981499:0,2,0,1
chr12	2994710	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=127,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,22:0.442:50:14,10:13,11:0|1:2994710_T_C:2994710:14,14,13,9
chr12	2994727	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.459:19:5,2:3,4:0|1:2994710_T_C:2994710:6,4,7,2
chr12	3039319	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr12	3040479	.	T	TGAAAAAAGCACCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	3047466	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,6:5,7:0,8,2,11
chr12	3049938	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,2,1
chr12	3121334	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,1:6,1:10,6,2,0
chr12	3127650	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:3127650_A_C:3127650:0,0,1,0
chr12	3127652	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:3127650_A_C:3127650:0,1,1,0
chr12	3127655	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:3127650_A_C:3127650:0,1,1,0
chr12	3129740	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr12	3130938	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr12	3131206	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	3131238	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	3147080	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:3,0,5,0
chr12	3149483	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,15:0,8:0,0,18,5
chr12	3310335	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,1:5,5:3,5,3,3
chr12	3310482	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=104,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:6,5:9,2:3,12,3,4
chr12	3678745	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=99,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:2,4:10,2:4,8,2,4
chr12	3702219	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	3724415	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:11,0,2,0
chr12	3724444	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:3,1,6,0
chr12	3736734	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:1,4,3,3
chr12	3736745	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,3:4,4:2,3,4,3
chr12	3751046	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,4:0,1:0,0,1,5
chr12	3768705	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.353:14:8,3:1,0:4,5,2,3
chr12	3789551	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,1:1,2,0,3
chr12	3931216	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:10,10,1,1
chr12	4383158	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	4385140	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=147,283;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,1,0
chr12	4430547	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	4446116	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=208,247;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:3,0,5,0
chr12	4553332	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=40,30;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.913:20:1,14:0,5:0,1,8,11
chr12	4614545	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,2,3
chr12	4627517	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr12	4645448	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	4655670	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,9:4,2:0,11,0,11
chr12	4657203	.	A	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=123.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,40:0.547:73:14,16:19,24:30,3,36,4
chr12	4657773	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr12	4702107	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:2,1,5,0
chr12	4705409	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:9,11,1,1
chr12	4708150	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr12	4714008	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr12	4716513	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:7,6:7,2:5,9,3,6
chr12	4725134	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	4735734	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,14:0.357:40:12,8:14,5:0|1:4735734_T_C:4735734:14,12,5,9
chr12	4735737	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,25:0.634:39:8,11:6,14:1|0:4735734_T_C:4735734:5,9,14,11
chr12	4736086	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:4,2,1,1
chr12	4763650	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:16,4:10,2:6,20,1,5
chr12	4763892	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:4,1,4,0
chr12	4768103	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,2:6,1,6,0
chr12	4768354	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,2:5,8:2,5,1,9
chr12	4771682	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:14,6:2,10:9,7,13,3
chr12	4779087	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:0,5,0,6
chr12	4794586	.	G	GCATTTATTGAGCTAATCGTGGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr12	4796271	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:5,6:6,6:6,6,5,8
chr12	4853806	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,0:1,3:2,1,1,3
chr12	4870363	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:2,2:3,1:1,5,1,2
chr12	4870398	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	4874805	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=292,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:4874805_T_TG:4874805:0,3,0,1
chr12	4874808	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=292,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:4874805_T_TG:4874805:0,3,0,1
chr12	4874809	.	T	TGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=292,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:4874805_T_TG:4874805:0,3,0,1
chr12	4881766	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:1,2:4,3:0|1:4881766_C_T:4881766:2,4,1,4
chr12	4881775	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:0|1:4881766_C_T:4881766:2,4,1,4
chr12	4921301	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,6:3,3:7,1,4,5
chr12	4922291	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=119,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr12	5020467	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,0:0|1:5020467_C_G:5020467:0,0,2,0
chr12	5020474	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:5020467_C_G:5020467:0,0,2,0
chr12	5020969	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=182,82;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,0:9,3,0,2
chr12	5025094	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,8:0,17:0,0,15,11
chr12	5154165	.	C	CATAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=183,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,2:0,0:2,3,1,1
chr12	5687155	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:9,2,0,2
chr12	5721962	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr12	5722204	.	TACC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=186,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ACC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr12	5756795	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	5756824	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	5757029	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr12	5841701	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,3:6,0:6,7,1,2
chr12	5841841	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr12	5848485	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:18,4:8,0:16,10,2,2
chr12	5860114	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=128,73;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:14,0:10,3:6,19,1,2
chr12	5860131	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=161,73;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,0:11,3:4,19,1,2
chr12	5860179	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr12	5908841	.	CTAAG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,37;MFRL=240,154;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5908841_CTAAG_C:5908841:0,1,0,1
chr12	5908848	.	A	ATAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=240,154;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5908841_CTAAG_C:5908841:0,1,0,1
chr12	5908851	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=240,154;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5908841_CTAAG_C:5908841:0,1,0,1
chr12	6030154	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6030154_G_A:6030154:0,0,1,0
chr12	6030165	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:6030154_G_A:6030154:0,0,2,0
chr12	6060960	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,4:5,4:8,3,7,1
chr12	6061491	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,2:3,2:5,0,4,0
chr12	6062853	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr12	6078616	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,6:2,2:0,6,0,8
chr12	6085513	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:0,5,0,7
chr12	6094845	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:0,1:6,3:1,5,0,4
chr12	6101087	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:13,2:12,11,0,2
chr12	6103384	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:2,6,0,2
chr12	6103410	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:6103410_C_T:6103410:1,3,0,1
chr12	6103418	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:6103410_C_T:6103410:2,2,0,1
chr12	6103421	.	AAA	GCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:6103410_C_T:6103410:2,2,0,1
chr12	6125716	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,137;MMQ=40,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,4:5,4:7,2,6,2
chr12	6127943	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	6134715	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,172;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.337:36:17,2:7,9:11,13,10,2
chr12	6134949	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,211;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr12	6134987	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:5,1:0,1:3,2,0,2
chr12	6135265	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=140,148;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr12	6138410	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	6144056	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=152,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6144056_C_CT:6144056:0,1,0,1
chr12	6144060	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=152,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6144056_C_CT:6144056:0,1,0,1
chr12	6144063	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=152,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6144056_C_CT:6144056:0,1,0,1
chr12	6145529	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=135,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr12	6161963	.	G	GAGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr12	6181708	.	G	GCTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,327;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6181708_G_GCTT:6181708:0,0,0,1
chr12	6181709	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,327;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6181708_G_GCTT:6181708:0,0,0,1
chr12	6230288	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	6232426	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,1,4
chr12	6309629	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=176,111;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:11,3:6,0:17,1,3,0
chr12	6334768	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:6334768_C_A:6334768:0,3,1,0
chr12	6334787	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:6334768_C_A:6334768:0,1,1,0
chr12	6344600	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,13,4
chr12	6422272	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr12	6422988	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr12	6427003	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:3,1:3,1:0|1:6427003_A_C:6427003:7,4,2,0
chr12	6427005	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:4,0:4,0:0|1:6427003_A_C:6427003:7,4,2,0
chr12	6427903	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.250:20:6,0:7,1:4,11,5,0
chr12	6439255	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr12	6458084	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=112,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:3,7:7,2:6,5,5,4
chr12	6458274	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,7:3,2:4,3,7,2
chr12	6463862	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,10,1
chr12	6483463	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,1:5,4:10,0,5,0
chr12	6486570	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6486570_T_C:6486570:0,0,0,1
chr12	6486571	.	C	CACTGCCCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6486570_T_C:6486570:0,0,0,1
chr12	6486575	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6486570_T_C:6486570:0,0,0,1
chr12	6500105	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:2,1:4,4:1,6,1,4
chr12	6575191	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr12	6579565	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr12	6579757	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,4,15
chr12	6601980	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,14:0,18:0,0,26,7
chr12	6604418	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,5,17
chr12	6620495	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr12	6623382	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:6623382_A_G:6623382:0,0,4,2
chr12	6623389	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:6623382_A_G:6623382:0,0,4,2
chr12	6624139	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	6631265	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=187,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr12	6635567	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0,0,8,10
chr12	6636325	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	6638666	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr12	6640443	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr12	6640669	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=153,150;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:2,1:0,0:0|1:6640669_CTT_C:6640669:0,4,0,2
chr12	6640676	.	TT	AA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=150,153;MMQ=43,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,4:0.627:6:1,3:1,1:1|0:6640669_CTT_C:6640669:0,2,0,4
chr12	6640677	.	T	TAAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=A;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0|1:6640669_CTT_C:6640669:0,0,0,5
chr12	6643904	.	TG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,1:9,1:18,0,2,0
chr12	6658089	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	6687020	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:3,2,3,2
chr12	6691542	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	6697667	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,178;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr12	6709791	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:5,3:10,9:5,10,2,10
chr12	6710408	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:11,2,2,0
chr12	6747578	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr12	6753721	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:18,3:23,0:11,31,1,2
chr12	6756240	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:6756240_A_G:6756240:0,0,1,2
chr12	6756248	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=236,257;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:6756240_A_G:6756240:0,2,1,0
chr12	6756272	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=235,257;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:6756240_A_G:6756240:0,1,1,0
chr12	6762026	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr12	6772206	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,11;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.284:37:13,0:6,1:7,19,11,0
chr12	6777069	.	TTGC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=204,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TGC;STR;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.638:6:1,3:1,1:2,0,2,2
chr12	6804902	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	6806421	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=119,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,1:6,1:10,5,1,1
chr12	6839626	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=108,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.122:30:12,0:14,3:7,20,2,1
chr12	6861043	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,10:0,12:0,0,21,3
chr12	6879202	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=95.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,18:0,0,14,17
chr12	6879279	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,11:0,0,9,12
chr12	6879662	.	T	TGGGGGGCCCTCTGGGGCCGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.768:11:1,1:3,0:3,2,0,6
chr12	6909380	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:1,7,1,3
chr12	6909388	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr12	6909442	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,3,2
chr12	6928586	.	CA	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr12	6934804	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=117,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,1:3,5:3,3,5,1
chr12	6935977	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:8,5:7,8:6,9,7,6
chr12	6940578	.	G	GGAAAATCACTCACTAAGTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=269,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.457:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr12	6940596	.	C	CAAATCTTATAAAACGGCCCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	6942650	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,10;MFRL=224,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:6942650_T_G:6942650:3,0,1,0
chr12	6942652	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,19;MFRL=224,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:6942650_T_G:6942650:3,0,1,0
chr12	6942661	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,17;MFRL=200,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:6942650_T_G:6942650:4,0,1,0
chr12	6942667	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,11;MFRL=200,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:6942650_T_G:6942650:4,0,1,0
chr12	6942672	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=13,32;MFRL=267,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.758:5:0,2:0,1:0|1:6942650_T_G:6942650:1,0,4,0
chr12	6946545	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	6948692	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,22639512;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	6965805	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr12	6969750	.	C	CCCCACAGATCACTTGCTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	6973832	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=284,169;MMQ=40,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6973832_G_A:6973832:3,0,1,0
chr12	6973836	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=284,169;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:1,0:0|1:6973832_G_A:6973832:3,0,1,0
chr12	6979010	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	7014962	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:8,3:4,4:12,1,7,0
chr12	7015915	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,0:2,6:0,2,0,6
chr12	7016449	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,6:4,5:8,3,9,2
chr12	7023006	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.304:10:3,0:4,3:4,3,2,1
chr12	7023300	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:0,3:4,1:0,5,0,4
chr12	7026893	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr12	7026932	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=109,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr12	7044647	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	7044739	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,2:7,0:7,3,2,0
chr12	7045891	.	ACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;RPA=15,8;RU=CAG;STR;TLOD=50.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.661:20:2,5:3,8:3,4,5,8
chr12	7049999	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:6,5:0,5:5,1,9,1
chr12	7050257	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,22;MFRL=107,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.486:4:0,1:1,0:1,1,0,2
chr12	7053362	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.316:36:12,5:12,6:11,14,3,8
chr12	7054859	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=96.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0,0,26,0
chr12	7065281	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,6:3,4:6,2,8,2
chr12	7065406	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,7:3,4:1,5,4,7
chr12	7065576	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.310:29:6,3:13,4:12,8,7,2
chr12	7073184	.	CCT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:1,3:5,0,7,0
chr12	7076236	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr12	7077218	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:2,0:3,0:1,5,0,3
chr12	7080210	.	A	AG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=134.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,12:0,19:0|1:7080210_A_AG:7080210:0,0,17,15
chr12	7080212	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=134.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,13:0,19:0|1:7080210_A_AG:7080210:0,0,17,15
chr12	7087711	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,3:6,4:4,3,4,3
chr12	7090096	.	GCT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=232,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:6,0,4,1
chr12	7090168	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:15,0:17,3:20,13,0,3
chr12	7090193	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.415:39:10,6:13,10:15,8,10,6
chr12	7090659	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr12	7172665	.	C	CAAAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=207,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	7175872	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:2,4:8,6:0,10,0,10
chr12	7177712	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=105,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:6,1:5,3:8,3,4,1
chr12	7178006	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=75,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:7178006_TTC_T:7178006:1,3,0,1
chr12	7178010	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=75,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:7178006_TTC_T:7178006:1,3,0,1
chr12	7178019	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,0,3
chr12	7188214	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:24,3:13,0:19,18,3,0
chr12	7244956	.	A	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,20:0.346:59:15,11:16,9:0|1:7244956_A_T:7244956:14,25,8,12
chr12	7244962	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,17:0.317:55:16,7:19,9:0|1:7244956_A_T:7244956:13,25,7,10
chr12	7277203	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=22,12;MFRL=64,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.381:6:1,0:0,0:0|1:7277203_A_C:7277203:4,0,2,0
chr12	7277206	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=64,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.381:6:2,1:0,1:0|1:7277203_A_C:7277203:4,0,2,0
chr12	7277214	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=64,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,1:1,1:0|1:7277203_A_C:7277203:5,1,2,0
chr12	7277236	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr12	7283328	.	G	GCCTGTGTCCCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:7283328_G_GCCTGTGTCCCT:7283328:3,0,0,1
chr12	7283330	.	G	GCCACCGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:7283328_G_GCCTGTGTCCCT:7283328:3,0,0,1
chr12	7285815	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr12	7287886	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,6:0,9:1,0,13,3
chr12	7287914	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,11:0,0,15,3
chr12	7294835	.	C	CTAATTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:7294835_C_CTAATTA:7294835:0,4,0,1
chr12	7294837	.	C	CCTAAATAAACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:7294835_C_CTAATTA:7294835:0,4,0,1
chr12	7310768	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,266;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:7310768_G_A:7310768:0,2,0,1
chr12	7310776	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=178,266;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7310768_G_A:7310768:0,1,0,1
chr12	7344367	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr12	7360612	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:24,1:21,1:20,25,1,1
chr12	7362204	.	G	GCTGAGTCGGTGGAGTAATGTGCAGAGTTTGAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=230,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.799:4:1,1:0,0:1,0,3,0
chr12	7457217	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr12	7470534	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,3:0,0,14,1
chr12	7470566	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:6,6:5,4:8,3,11,0
chr12	7519826	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,2:5,4:4,3,3,3
chr12	7525865	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr12	7526307	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr12	7527794	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	7528684	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7528684_A_AT:7528684:0,2,0,1
chr12	7528685	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7528684_A_AT:7528684:0,2,0,1
chr12	7528702	.	C	CCAAATAAACTCTCCTTAAAAACT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	7549091	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	7585971	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.425:33:9,7:10,6:17,2,11,3
chr12	7596855	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	7638020	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr12	7803562	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr12	7805467	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr12	7805505	.	C	CATA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,36;MFRL=130,312;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:7805505_C_CATA:7805505:1,1,0,1
chr12	7805507	.	T	TCA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=130,312;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:7805505_C_CATA:7805505:1,1,0,1
chr12	7805508	.	CTTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=312,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr12	7805512	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=130,312;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.434:3:0,1:1,0:0|1:7805505_C_CATA:7805505:1,1,0,1
chr12	7805515	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7805505_C_CATA:7805505:1,0,0,1
chr12	7805518	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7805505_C_CATA:7805505:1,0,0,1
chr12	7805520	.	TA	AG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7805505_C_CATA:7805505:1,0,0,1
chr12	7807138	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr12	7843373	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	7868677	.	CA	TG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,2:15,0:26,0,2,0
chr12	7868685	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=154,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,1:11,1:25,0,2,0
chr12	7868777	.	A	AT	.	.	DP=140;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=311.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,110:0.984:111:1,58:0,49:1,0,68,42
chr12	7868865	.	C	CT,CTT,CTTT	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=33,35,33,13;MFRL=232,139,146,90;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,23,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,13,14,15;RU=T;STR;TLOD=18.39,40.00,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,12,20,6:0.273,0.508,0.134:41:3,4,10,0:0,8,10,2:0,3,7,31
chr12	7868930	.	A	AAAAAAATATG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,2:7,0:0,12,0,2
chr12	7869701	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=43.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr12	7945559	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,30:0.471:64:21,18:12,12:16,18,18,12
chr12	7945829	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=105.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,17:0,13:0,0,12,19
chr12	7945871	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:2,8:5,1:0,9,0,9
chr12	7947017	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:11,9:6,6:16,1,9,6
chr12	7947304	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,120;MMQ=54,39;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,12:0.242:52:19,7:19,5:19,21,2,10
chr12	7966823	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=127,158;MMQ=60,26;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:2,1,4,0
chr12	7966908	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=127,154;MMQ=52,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:7,1:12,4:9,10,2,4
chr12	7970347	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,51;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr12	7970721	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr12	7979996	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=155,161;MMQ=47,38;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:8,0:18,4:26,0,4,0
chr12	7980035	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=201,148;MMQ=32,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=101.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.945:33:1,14:0,17:1,0,24,8
chr12	7981562	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=207,162;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr12	7984447	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=194,188;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr12	7985460	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,1:2,7:1,8,1,7
chr12	8075685	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:0,4,0,7
chr12	8085547	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.488:31:7,8:8,7:14,2,13,2
chr12	8088766	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	8196445	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr12	8197621	.	T	TTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:8197621_T_TTA:8197621:0,4,0,1
chr12	8197624	.	T	TAATCCTCGCAACAACCTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:8197621_T_TTA:8197621:0,4,0,1
chr12	8197654	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=247,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	8203080	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=192,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,4:1,7:1,0,9,2
chr12	8203273	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	8276432	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr12	8288098	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	8289300	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr12	8289532	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr12	8329574	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,153;MMQ=24,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.928:25:1,14:0,9:0,1,6,18
chr12	8329700	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,25:0,0,28,19
chr12	8329833	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,1,20
chr12	8374770	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,14:0,0,14,18
chr12	8374781	.	C	CACG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=120.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,14:0,0,12,17
chr12	8375427	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	8376181	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr12	8376205	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr12	8376535	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	8608583	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr12	8612389	.	G	GGCATAATTTTCCTTCTGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	8617982	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr12	8693240	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,2:0|1:8693240_C_A:8693240:0,0,13,0
chr12	8693245	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=61.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,4:0,2:0|1:8693240_C_A:8693240:0,0,15,0
chr12	8693419	.	T	TTCTC	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=100,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TC;STR;TLOD=82.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.890:24:0,9:2,13:1,1,2,20
chr12	8757481	.	G	A	.	.	DP=100;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=112,122;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,37:0.391:95:36,13:21,23:32,26,20,17
chr12	8757521	.	T	TAA	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.091:48:14,0:22,1:9,35,0,4
chr12	8757522	.	C	CA,A	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=19,19,33;MFRL=147,151,121;MMQ=60,60,60;MPOS=15,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=37.33,6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,19,5:0.658,0.094:33:0,5,2:4,4,3:1,8,1,23
chr12	8765447	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,0:0,7:0,0,0,8
chr12	8807982	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.293:24:10,4:7,3:14,3,3,4
chr12	8982250	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=74,198;MMQ=44,54;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.405:3:1,1:1,0:1,1,1,0
chr12	8982488	.	T	TAGATACCTAGTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,30;MFRL=207,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr12	8988777	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=39,35;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,10:1,5:1,0,14,1
chr12	8990206	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=142,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:8,2:4,0:0|1:8990206_G_A:8990206:1,11,1,1
chr12	8990208	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=142,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:7,1:2,0:0|1:8990206_G_A:8990206:1,11,1,1
chr12	8990210	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=123,209;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:1,9,0,2
chr12	8994212	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	8995694	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,2:0,1:3,0,2,1
chr12	8995966	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:8,4:2,1:3,8,0,5
chr12	8998181	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=157,205;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.247:9:5,0:2,1:0,7,0,2
chr12	8998218	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=157,156;MMQ=52,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr12	9000367	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=40,33;MFRL=81,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.472:4:3,1:0,0:0|1:9000367_C_CTT:9000367:0,3,0,1
chr12	9000368	.	AGGG	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=81,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:0|1:9000368_AGGG_A:9000368:0,1,0,1
chr12	9000372	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=128,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9000367_C_CTT:9000367:0,1,0,1
chr12	9000373	.	A	AGGTCTGGCTTTTGGGGGGC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=128,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9000367_C_CTT:9000367:0,1,0,1
chr12	9000375	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=128,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9000367_C_CTT:9000367:0,1,0,1
chr12	9000378	.	AA	GT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=81,128;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:9000368_AGGG_A:9000368:0,1,0,1
chr12	9004667	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr12	9007492	.	AT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31,16;MFRL=123,134,137;MMQ=60,60,40;MPOS=28,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.97,11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,5:0.256,0.529:9:1,2,1:1,0,1:1,1,0,7
chr12	9013755	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,13:0,3:0,0,9,7
chr12	9021053	.	C	CGTGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=GT;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.823:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr12	9021309	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:9021309_G_C:9021309:0,4,0,1
chr12	9021311	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:9021309_G_C:9021309:0,4,0,1
chr12	9021313	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:9021309_G_C:9021309:0,4,0,1
chr12	9021316	.	T	TAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	9027194	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:9027194_T_C:9027194:0,4,0,1
chr12	9027196	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:9027194_T_C:9027194:0,4,0,1
chr12	9027198	.	G	GCTTTGTATTTTGTCCTTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=170,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:9027194_T_C:9027194:0,3,0,1
chr12	9027200	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=170,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:9027194_T_C:9027194:0,3,0,1
chr12	9027205	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:9027205_C_CA:9027205:0,1,0,1
chr12	9027209	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9027205_C_CA:9027205:0,1,0,1
chr12	9027714	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,131;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0,8,0,2
chr12	9098995	.	G	GAAC	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=119.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,10:0,16:0,0,7,23
chr12	9099098	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	9142392	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=224,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	9223242	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=140,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,4:4,4:0,5,0,8
chr12	9242623	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,20:0.467:43:8,16:15,4:8,15,6,14
chr12	9246176	.	CTATGG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=155,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:3,8,1,1
chr12	9253629	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=170,146;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:9253629_T_C:9253629:3,0,1,0
chr12	9253632	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=170,146;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:9253629_T_C:9253629:3,0,1,0
chr12	9253640	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=141,146;MMQ=60,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:9253629_T_C:9253629:4,0,1,0
chr12	9253894	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr12	9258821	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:8,2:5,3:7,7,3,2
chr12	9260280	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=202,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,1:1,4:0,2,1,4
chr12	9260298	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,0:2,1:0|1:9260298_A_T:9260298:0,3,0,1
chr12	9260300	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:9260298_A_T:9260298:0,4,0,1
chr12	9268473	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.420:29:8,4:8,8:1,16,3,9
chr12	9302326	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=189,157;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:9302326_A_AAC:9302326:0,4,0,1
chr12	9302328	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=189,157;MMQ=60,30;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:9302326_A_AAC:9302326:0,4,0,1
chr12	9310959	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr12	9311265	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr12	9316907	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr12	9322280	.	T	TACATTCCCACTAAAAATCTAGAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	9334728	.	G	GAGTGAGACAAAATGGTCATA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTGAGACAAAATGGTCATA;STR;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr12	9352908	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=124,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:5,1:1,1:3,3,2,0
chr12	9353828	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr12	9353875	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,7:1,2:1,0,8,1
chr12	9392205	.	T	C	.	.	DP=164;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=127,132;MMQ=45,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=204.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,71:0.478:149:37,34:39,35:20,58,13,58
chr12	9571496	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=154,160;MMQ=40,36;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:2,8,0,2
chr12	9571547	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr12	9571599	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=161,249;MMQ=53,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:2,3:2,2:1,3,1,5
chr12	9571619	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=238,203;MMQ=59,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr12	9571851	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr12	9572085	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=136,169;MMQ=44,58;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:14,0:17,2:25,9,0,2
chr12	9572244	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	9572788	.	C	CGCACCTGGAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr12	9572871	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=146,177;MMQ=25,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,5:4,6:5,3,3,8
chr12	9572944	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=164,149;MMQ=43,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr12	9573262	.	TAAGG	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AAGG;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.739:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	9573297	.	G	GAAATAACACTTTCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,120;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9573297_G_GAAATAACACTTTCT:9573297:0,0,0,1
chr12	9573298	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9573297_G_GAAATAACACTTTCT:9573297:0,0,0,1
chr12	9574119	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr12	9574344	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,6,3
chr12	9577027	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,195;MMQ=60,37;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,3,1
chr12	9577310	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr12	9577992	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,173;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,3:3,0:9,0,2,1
chr12	9578570	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=166,182;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,2:6,3:4,5,5,0
chr12	9578589	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,50;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.860:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr12	9578619	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=160,178;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,1:3,2:0,5,0,3
chr12	9580203	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=229,145;MMQ=27,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=94.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,28:0.880:31:3,12:0,16:2,1,23,5
chr12	9581856	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=221,183;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr12	9582244	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=134,156;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:4,2:8,3:5,7,1,4
chr12	9583167	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,192;MMQ=52,25;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:9,1,2,0
chr12	9583430	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,240;MMQ=60,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	9584916	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=224,205;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:3,0,5,0
chr12	9585178	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,31;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.792:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	9585487	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=141,112;MMQ=27,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr12	9586636	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=147,167;MMQ=57,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:8,3:6,2:13,3,5,0
chr12	9590505	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=149,163;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.752:21:0,8:4,8:5,0,16,0
chr12	9590651	.	A	ACTGAGTAAC	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=142,106;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGAGTAAC;STR;TLOD=61.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,18:0.327:55:17,5:20,9:10,27,5,13
chr12	9590828	.	CCC	TGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	9596091	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	9596193	.	CC	GG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=263,225;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr12	9751035	.	C	CAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=72.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,8:0,0,15,2
chr12	9754221	.	A	AAAAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAC;STR;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.921:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr12	9840773	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	9906067	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,26:0.563:46:8,13:12,13:14,6,19,7
chr12	9980243	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr12	9994445	.	GTGT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=64.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,8,7
chr12	10015082	.	G	A	.	.	DP=132;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=423.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,126:0.992:126:0,58:0,66:0,0,63,63
chr12	10015177	.	A	G	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=293.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,79:0.988:79:0,35:0,44:0,0,9,70
chr12	10051433	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr12	10131684	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:6,5:11,11:5,14,6,10
chr12	10131865	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=206,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr12	10137645	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=190,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:0,2,1,7
chr12	10150961	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=147,125;MMQ=60,57;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=154.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,56:0.586:95:21,25:18,29:0|1:10150961_G_A:10150961:11,28,17,39
chr12	10150974	.	A	G	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=273.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,70:0.973:71:0,31:1,35:0|1:10150961_G_A:10150961:0,1,17,53
chr12	10151762	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr12	10168246	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.109:43:24,2:15,2:12,27,3,1
chr12	10205443	.	T	TTGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:10205443_T_TTGTC:10205443:0,4,0,1
chr12	10205445	.	A	ACTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:10205443_T_TTGTC:10205443:0,4,0,1
chr12	10215582	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr12	10217326	.	C	CTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=126.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,11:0,0,24,7
chr12	10241829	.	G	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,26:0.407:64:15,12:23,13:11,27,9,17
chr12	10251385	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.731:24:3,12:3,6:3,3,12,6
chr12	10312648	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,1,4
chr12	10312691	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	10312878	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr12	10312914	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr12	10313075	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,5,12
chr12	10313134	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	10313358	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,7:0,13:0,0,17,3
chr12	10319396	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=125,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.145:46:19,3:20,3:19,21,3,3
chr12	10460543	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr12	10461883	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	10525644	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=195,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:4,0,8,0
chr12	10525878	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.482:15:3,3:3,4:0,8,1,6
chr12	10532434	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,2,15
chr12	10560824	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,14,0
chr12	10561913	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr12	10571091	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=222,171;MMQ=27,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,51:0.963:52:1,31:0,18:0|1:10571091_T_G:10571091:0,1,11,40
chr12	10571106	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=184.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.978:43:0,24:0,17:0|1:10571091_T_G:10571091:0,0,8,35
chr12	10571158	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0|1:10571158_C_T:10571158:0,0,0,20
chr12	10571177	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=72.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0|1:10571158_C_T:10571158:0,0,0,17
chr12	10571514	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	10571536	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,24;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	10571716	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,193;MMQ=21,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,2:1,1:1,0,0,3
chr12	10572544	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,287;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:10572544_T_C:10572544:0,0,3,0
chr12	10572566	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=266,256;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:10572544_T_C:10572544:1,0,1,0
chr12	10573211	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=94,233;MMQ=27,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr12	10586535	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=165,237;MMQ=39,27;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,3:0.059:66:20,1:42,2:0|1:10586535_T_G:10586535:20,43,0,3
chr12	10586550	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=164,242;MMQ=39,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:11,1:31,1:0|1:10586535_T_G:10586535:12,32,0,2
chr12	10586956	.	C	G	.	.	DP=71;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=187,167;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=107.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,31:0.451:69:16,16:18,13:38,0,31,0
chr12	10586961	.	T	C	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=174,181;MMQ=40,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,17:0.240:72:27,7:27,8:55,0,17,0
chr12	10586978	.	A	AT	.	.	DP=112;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=174,162;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=125.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,47:0.470:100:20,26:30,19:52,1,47,0
chr12	10586989	.	AT	A	.	.	DP=131;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=158,171;MMQ=40,33;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,23:0.187:126:49,12:47,11:103,0,21,2
chr12	10587158	.	A	T	.	.	DP=198;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,139;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=214.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,81:0.438:185:55,40:48,39:13,91,7,74
chr12	10587250	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=202,209;MMQ=40,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,6:8,6:1,14,0,12
chr12	10588647	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,146;MMQ=27,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,4:5,5:1,10,2,7
chr12	10599347	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=180,244;MMQ=30,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:9,4:16,0:0,26,0,4
chr12	10602077	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,1:7,5:0,12,0,6
chr12	10602624	.	TTTTAAG	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=88.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.482:50:13,10:12,14:1,25,0,24
chr12	10746385	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.353:22:7,2:7,3:9,5,6,2
chr12	10746679	.	C	CCTGGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=168,273;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10746679_C_CCTGGT:10746679:0,1,0,1
chr12	10746682	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=168,273;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10746679_C_CCTGGT:10746679:0,1,0,1
chr12	10746684	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=168,273;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10746679_C_CCTGGT:10746679:0,1,0,1
chr12	10759032	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.612:42:6,11:10,14:0,16,1,25
chr12	10760380	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=120,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:2,1,4,0
chr12	10763176	.	C	CAAA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=241,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=24,27;RU=A;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.738:5:1,1:0,2:1,0,3,1
chr12	10763236	.	G	C	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,36:0.378:96:24,18:34,18:32,28,14,22
chr12	10780205	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,13:0,6:0,0,13,6
chr12	10782115	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,12,10
chr12	10783812	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:13,10,2,0
chr12	10786757	.	T	TGAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAA;STR;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr12	10786797	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr12	10856845	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	11000934	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,0:4,3:7,2,3,0
chr12	11035533	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,206;MMQ=60,31;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr12	11083677	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	11126428	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=146,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr12	11138683	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.556:27:4,7:7,8:7,5,9,6
chr12	11138716	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:5,3:19,0:17,7,2,1
chr12	11149532	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,6:7,2:10,3,7,1
chr12	11149769	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:7,10:11,3:7,11,8,5
chr12	11150540	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:11150540_CA_C:11150540:0,1,0,4
chr12	11150551	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:11150540_CA_C:11150540:0,0,0,4
chr12	11174219	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=203,156;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0|1:11174219_C_A:11174219:6,1,3,0
chr12	11174223	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=203,156;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0|1:11174219_C_A:11174219:6,1,3,0
chr12	11174261	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=15;MBQ=34,27;MFRL=149,136;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:6,1:7,2:0|1:11174261_C_G:11174261:10,3,3,1
chr12	11174264	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=15;MBQ=34,24;MFRL=140,121;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:6,1:6,4:0|1:11174261_C_G:11174261:9,3,4,1
chr12	11174271	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=131,139;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:7,1:5,4:0|1:11174261_C_G:11174261:9,3,4,2
chr12	11174276	.	GT	AT,AC	.	.	DP=19;ECNT=15;MBQ=27,32,31;MFRL=125,144,156;MMQ=60,60,55;MPOS=22,10;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=23.10,17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,8,5:0.469,0.273:17:2,5,1:2,3,4:4,0,8,5
chr12	11174282	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=15;MBQ=30,34;MFRL=149,156;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:8,1:6,4:0|1:11174261_C_G:11174261:11,4,3,2
chr12	11174286	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=140,156;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,0:6,4:10,4,3,2
chr12	11174302	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=15;MBQ=34,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:9,3:5,3:8,6,2,4
chr12	11174327	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.396:31:9,5:9,7:9,10,6,6
chr12	11174372	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=15;MBQ=33,34;MFRL=144,129;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,12:0.260:48:11,5:22,6:0|1:11174372_C_G:11174372:25,11,7,5
chr12	11174380	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=15;MBQ=32,30;MFRL=144,121;MMQ=60,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,11:0.267:43:11,5:21,5:0|1:11174372_C_G:11174372:23,9,5,6
chr12	11174390	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=148,129;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,12:0.289:43:9,5:20,6:0|1:11174372_C_G:11174372:22,9,5,7
chr12	11174397	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=15;MBQ=28,29;MFRL=147,131;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,13:0.297:45:10,7:20,6:0|1:11174372_C_G:11174372:22,10,4,9
chr12	11174416	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=15;MBQ=32,34;MFRL=152,134;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:9,4:20,4:15,14,1,7
chr12	11174466	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=186,177;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:14,1:19,2:15,18,0,3
chr12	11174476	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=186,157;MMQ=60,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:18,0:18,2:0|1:11174476_G_A:11174476:20,19,0,2
chr12	11174478	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=188,157;MMQ=60,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:17,0:18,2:0|1:11174476_G_A:11174476:20,18,0,2
chr12	11182998	.	CA	TC	.	.	DP=62;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=144,148;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,16:0.283:58:22,9:16,6:34,8,13,3
chr12	11183035	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=142,143;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,7:0.100:78:33,3:31,2:38,33,1,6
chr12	11183042	.	C	G	.	.	DP=79;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=143,148;MMQ=60,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,6:0.087:78:38,3:31,3:38,34,1,5
chr12	11183046	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=142,148;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,12:0.160:79:35,8:28,4:0|1:11183046_C_T:11183046:40,27,2,10
chr12	11183052	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=12;MBQ=28,28;MFRL=142,148;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,10:0.139:77:33,7:28,2:0|1:11183046_C_T:11183046:37,30,0,10
chr12	11183066	.	A	T	.	.	DP=84;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=143,153;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,13:0.165:83:37,6:30,5:0|1:11183046_C_T:11183046:32,38,0,13
chr12	11183107	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=12;MBQ=31,29;MFRL=154,166;MMQ=40,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,7:0.125:62:31,1:20,5:0|1:11183107_T_C:11183107:19,36,0,7
chr12	11183114	.	AT	GC	.	.	DP=62;ECNT=12;MBQ=31,32;MFRL=154,166;MMQ=40,37;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,7:0.125:62:30,2:20,5:0|1:11183107_T_C:11183107:21,34,0,7
chr12	11183121	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=154,166;MMQ=40,37;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,7:0.121:64:28,2:24,5:0|1:11183107_T_C:11183107:20,37,0,7
chr12	11183123	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=12;MBQ=31,34;MFRL=154,166;MMQ=40,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,7:0.121:64:30,2:24,4:0|1:11183107_T_C:11183107:21,36,0,7
chr12	11183133	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=12;MBQ=31,34;MFRL=159,186;MMQ=40,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,3:0.062:63:32,1:25,2:0|1:11183107_T_C:11183107:26,34,0,3
chr12	11183142	.	T	G	.	.	DP=68;ECNT=12;MBQ=31,32;MFRL=157,186;MMQ=40,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,3:0.057:68:31,1:31,2:0|1:11183107_T_C:11183107:30,35,0,3
chr12	11183496	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=139,145;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:22,1:15,1:0|1:11183496_T_C:11183496:24,17,2,0
chr12	11183506	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=137,148;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:28,1:17,2:0|1:11183496_T_C:11183496:27,21,3,0
chr12	11183512	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.393:44:16,10:10,7:16,11,11,6
chr12	11183541	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=131,142;MMQ=60,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,5:0.088:66:35,2:25,3:35,26,5,0
chr12	11183676	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,31:0.390:80:22,14:25,15:0|1:11183676_C_T:11183676:21,28,17,14
chr12	11183697	.	C	A	.	.	DP=74;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=165,138;MMQ=60,48;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,25:0.342:74:23,12:23,12:0|1:11183676_C_T:11183676:21,28,11,14
chr12	11183708	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=154,164;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,10:0.161:66:28,5:22,4:27,29,3,7
chr12	11183722	.	A	C	.	.	DP=65;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=165,151;MMQ=60,42;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,23:0.363:64:21,11:17,12:0|1:11183676_C_T:11183676:24,17,4,19
chr12	11183752	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=165,180;MMQ=60,42;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,19:0.355:54:19,8:16,11:25,10,5,14
chr12	11183832	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=150,148;MMQ=60,41;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,33:0.512:64:15,9:16,22:14,17,14,19
chr12	11199734	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr12	11214066	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=15;MBQ=30,33;MFRL=143,132;MMQ=60,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,3:0.053:73:36,1:28,2:0|1:11214066_T_C:11214066:37,33,3,0
chr12	11214074	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=143,132;MMQ=60,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,3:0.053:74:35,1:23,2:0|1:11214066_T_C:11214066:40,31,3,0
chr12	11214080	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=143,132;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.058:67:38,1:21,2:0|1:11214066_T_C:11214066:34,30,3,0
chr12	11214082	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=15;MBQ=30,32;MFRL=144,132;MMQ=60,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.058:67:38,1:23,2:0|1:11214066_T_C:11214066:32,32,3,0
chr12	11214091	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=15;MBQ=33,20;MFRL=144,132;MMQ=60,31;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,5:0.084:69:35,2:23,3:0|1:11214066_T_C:11214066:29,35,3,2
chr12	11214101	.	C	G	.	.	DP=65;ECNT=15;MBQ=29,20;MFRL=144,114;MMQ=60,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,3:0.060:65:35,2:23,1:0|1:11214066_T_C:11214066:28,34,1,2
chr12	11214133	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=15;MBQ=33,34;MFRL=138,130;MMQ=60,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,6:0.097:61:28,3:26,3:0|1:11214133_C_T:11214133:20,35,1,5
chr12	11214137	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=138,132;MMQ=60,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,5:0.094:62:29,2:27,3:0|1:11214133_C_T:11214133:23,34,1,4
chr12	11214145	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=15;MBQ=32,31;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,23:0.414:56:16,11:17,12:13,20,5,18
chr12	11214153	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=15;MBQ=34,30;MFRL=140,143;MMQ=60,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,6:0.116:58:24,2:25,3:0|1:11214153_C_T:11214153:19,33,2,4
chr12	11214156	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=15;MBQ=34,30;MFRL=141,146;MMQ=60,31;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,7:0.125:62:24,4:25,3:0|1:11214153_C_T:11214153:23,32,3,4
chr12	11214161	.	TG	CA	.	.	DP=58;ECNT=15;MBQ=31,33;MFRL=151,153;MMQ=60,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,5:0.100:58:24,3:21,2:0|1:11214153_C_T:11214153:24,29,3,2
chr12	11214167	.	G	C	.	.	DP=56;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=156,153;MMQ=60,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,5:0.109:53:23,2:24,2:0|1:11214153_C_T:11214153:20,28,3,2
chr12	11214199	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=15;MBQ=33,34;MFRL=165,153;MMQ=60,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:26,3:20,0:23,24,3,0
chr12	11214212	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.407:52:18,12:13,9:18,13,7,14
chr12	11214264	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=13;MBQ=33,32;MFRL=151,153;MMQ=53,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:19,3:20,0:22,18,1,2
chr12	11214273	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=13;MBQ=32,34;MFRL=141,177;MMQ=53,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:20,4:18,0:21,17,2,2
chr12	11214299	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=31,34;MFRL=146,171;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.143:61:29,8:22,0:29,24,4,4
chr12	11214324	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=13;MBQ=35,33;MFRL=133,165;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,5:0.100:58:33,4:20,1:0|1:11214324_C_T:11214324:20,33,3,2
chr12	11214326	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=34,34;MFRL=132,165;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,5:0.095:61:33,4:20,1:0|1:11214324_C_T:11214324:21,35,3,2
chr12	11214330	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=13;MBQ=34,33;MFRL=133,162;MMQ=60,35;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,6:0.108:63:31,4:22,2:0|1:11214324_C_T:11214324:22,35,4,2
chr12	11214336	.	A	T	.	.	DP=66;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=131,158;MMQ=60,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,7:0.121:64:30,4:25,2:0|1:11214324_C_T:11214324:21,36,5,2
chr12	11214351	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=13;MBQ=34,32;MFRL=133,136;MMQ=60,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,8:0.152:57:23,4:24,4:0|1:11214351_G_C:11214351:15,34,8,0
chr12	11214360	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=132,129;MMQ=60,35;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,10:0.177:60:22,3:26,4:0|1:11214351_G_C:11214351:16,34,8,2
chr12	11214363	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=13;MBQ=31,33;MFRL=133,126;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,9:0.168:58:21,5:26,4:0|1:11214351_G_C:11214351:15,34,7,2
chr12	11214368	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=13;MBQ=32,34;MFRL=133,126;MMQ=60,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,9:0.179:54:17,5:25,4:0|1:11214351_G_C:11214351:16,29,7,2
chr12	11214386	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=13;MBQ=31,28;MFRL=150,125;MMQ=60,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,14:0.263:55:17,8:23,5:0|1:11214386_T_G:11214386:16,25,8,6
chr12	11214392	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=13;MBQ=33,25;MFRL=151,125;MMQ=60,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,14:0.268:54:15,6:22,6:0|1:11214386_T_G:11214386:16,24,8,6
chr12	11214535	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=141,171;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.185:41:16,3:18,4:17,17,0,7
chr12	11243929	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=136,211;MMQ=60,31;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:19,3:19,0:21,19,1,2
chr12	11243947	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=136,211;MMQ=60,31;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:19,3:23,2:17,25,1,4
chr12	11243960	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=140,211;MMQ=60,31;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.115:50:21,3:23,2:19,26,1,4
chr12	11244067	.	A	ATT	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=29,32;MFRL=144,136;MMQ=52,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:19,1:12,1:0|1:11244067_A_ATT:11244067:13,19,2,0
chr12	11244070	.	TCC	T	.	.	DP=35;ECNT=12;MBQ=31,32;MFRL=139,136;MMQ=52,33;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:18,1:13,1:0|1:11244067_A_ATT:11244067:14,19,2,0
chr12	11244091	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=12;MBQ=34,30;MFRL=130,131;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:16,3:11,3:0|1:11244091_C_T:11244091:14,14,5,1
chr12	11244096	.	TG	CA	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=135,134;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,7:0.195:39:16,3:11,3:0|1:11244091_C_T:11244091:15,17,5,2
chr12	11244102	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=137,134;MMQ=60,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,8:0.213:40:18,4:14,4:0|1:11244091_C_T:11244091:15,17,6,2
chr12	11244117	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=12;MBQ=30,29;MFRL=137,145;MMQ=52,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,8:0.195:44:18,5:17,3:0|1:11244117_A_G:11244117:19,17,4,4
chr12	11244126	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=144,145;MMQ=52,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:18,5:15,2:0|1:11244117_A_G:11244117:16,17,4,4
chr12	11244149	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=12;MBQ=33,29;MFRL=155,133;MMQ=51,28;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.473:40:12,11:9,7:5,16,9,10
chr12	11244166	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=12;MBQ=33,29;MFRL=134,172;MMQ=28,45;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:9,9:6,7:6,11,5,11
chr12	11244169	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=163,136;MMQ=40,33;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:9,7:5,7:6,12,5,9
chr12	11244190	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=169,131;MMQ=51,34;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,3:9,2:9,9,1,5
chr12	11244194	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=131,167;MMQ=34,51;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:3,8:3,9:1,5,8,9
chr12	11244369	.	GC	AT	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=141,96;MMQ=60,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,1:10,1:0|1:11244369_GC_AT:11244369:15,10,2,0
chr12	11244378	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=141,96;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:13,1:11,1:0|1:11244369_GC_AT:11244369:17,10,2,0
chr12	11244390	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=156,152;MMQ=60,45;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:12,2:10,4:11,11,2,4
chr12	11244432	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=154,145;MMQ=60,38;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.259:33:12,4:11,4:11,14,1,7
chr12	11244435	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=154,177;MMQ=60,38;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:15,2:13,3:11,17,0,5
chr12	11244591	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=133,146;MMQ=60,32;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.236:36:13,5:15,3:14,14,8,0
chr12	11244602	.	TT	CA	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=147,146;MMQ=60,32;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:16,3:14,3:21,12,6,0
chr12	11244634	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=149,145;MMQ=60,27;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.208:46:22,8:15,1:28,9,8,1
chr12	11244687	.	G	C	.	.	DP=65;ECNT=15;MBQ=33,34;MFRL=137,143;MMQ=55,31;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,17:0.273:63:24,11:22,5:21,25,5,12
chr12	11244721	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=15;MBQ=34,33;MFRL=137,145;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,7:0.145:53:22,4:23,3:0|1:11244721_G_C:11244721:20,26,1,6
chr12	11244723	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=138,145;MMQ=60,27;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,7:0.140:55:22,2:21,2:0|1:11244721_G_C:11244721:21,27,1,6
chr12	11244725	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=15;MBQ=35,30;MFRL=145,145;MMQ=27,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=141.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,45:0.884:50:1,22:1,22:0,5,19,26
chr12	11244730	.	AA	GG	.	.	DP=47;ECNT=15;MBQ=32,31;MFRL=142,143;MMQ=60,31;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.082:47:20,1:19,1:0|1:11244721_G_C:11244721:19,25,0,3
chr12	11244744	.	GT	AC	.	.	DP=40;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=146,195;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:20,2:14,1:15,19,0,3
chr12	11244793	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=130,146;MMQ=60,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.171:39:13,3:19,3:0|1:11244793_C_T:11244793:15,18,4,2
chr12	11244797	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=130,146;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.171:39:15,2:18,3:0|1:11244793_C_T:11244793:14,19,4,2
chr12	11244805	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=15;MBQ=32,30;MFRL=118,148;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.170:39:13,3:17,3:0|1:11244805_A_T:11244805:15,18,4,2
chr12	11244814	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=118,148;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,5:0.150:38:13,1:18,3:0|1:11244805_A_T:11244805:14,19,4,1
chr12	11244846	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=32,34;MFRL=118,207;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:11,0:12,3:0|1:11244846_A_G:11244846:7,16,1,3
chr12	11244849	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=15;MBQ=33,33;MFRL=118,207;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:11,0:10,3:0|1:11244846_A_G:11244846:7,16,1,3
chr12	11244855	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=31,34;MFRL=107,261;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:12,0:7,3:0|1:11244846_A_G:11244846:6,14,0,3
chr12	11244871	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=118,261;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,0:5,3:0|1:11244871_G_A:11244871:2,11,0,3
chr12	11244878	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=15;MBQ=30,33;MFRL=124,261;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,0:5,3:0|1:11244871_G_A:11244871:1,11,0,3
chr12	11285802	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:4,0,7,1
chr12	11285925	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:23,0:21,3:24,20,1,2
chr12	11338534	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.799:3:0,0:0,0:0|1:11338534_G_A:11338534:0,0,2,1
chr12	11338539	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.799:3:0,1:0,1:0|1:11338534_G_A:11338534:0,0,2,1
chr12	11338589	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,1:1,1:3,5,1,1
chr12	11338613	.	CA	GG	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,7:0,0,11,11
chr12	11420333	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,31;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr12	11420375	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,5:0,6:0,0,8,6
chr12	11421721	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	11461470	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,36;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr12	11461836	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr12	11462391	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=157,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.139:20:9,2:8,0:5,13,1,1
chr12	11506893	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,18:0,15:0,0,28,7
chr12	11547326	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=187,62932;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:9,0,2,0
chr12	11803220	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:11803220_A_C:11803220:0,0,0,4
chr12	11803228	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11803220_A_C:11803220:0,0,0,1
chr12	12022903	.	GGTGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTGA;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:1,2,1,0
chr12	12037318	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr12	12240309	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.356:29:8,3:10,7:7,12,3,7
chr12	12247594	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,4:0,14:0,0,10,10
chr12	12247616	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,12,7
chr12	12264829	.	A	G	.	.	DP=119;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=133,119;MMQ=39,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,5:0.051:111:46,2:60,3:82,24,4,1
chr12	12312169	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,16;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,0:0,1,0,5
chr12	12397654	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=255,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr12	12397668	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:12397668_T_A:12397668:0,0,1,5
chr12	12397670	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:12397668_T_A:12397668:0,0,1,5
chr12	12482876	.	CCTG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	12483380	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:19,3:25,0:20,25,2,1
chr12	12483713	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,4:7,3:5,4,1,6
chr12	12483927	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr12	12495959	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr12	12618427	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,2:6,0,2,1
chr12	12618578	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=145,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:12,1:20,1:14,18,2,0
chr12	12618715	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr12	12630761	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=189,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,1:12,1:9,16,0,2
chr12	12765181	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:10,1:19,1:12,17,0,2
chr12	12790724	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=161,169;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.292:14:5,3:5,1:0,10,0,4
chr12	12790737	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=161,185;MMQ=50,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,2:2,4:0,6,0,6
chr12	12790741	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=188,146;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,0:0,9,0,2
chr12	12814988	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:12,2:10,10,2,0
chr12	12870695	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:2,1,5,0
chr12	12879057	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.526:40:10,7:8,14:12,7,11,10
chr12	12966967	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,11:0,0,29,0
chr12	12977517	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,2:12,0:12,15,1,1
chr12	12978837	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,2:2,0:3,0,3,0
chr12	13142174	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr12	13215685	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr12	13248445	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:9,0,2,1
chr12	13364426	.	C	CA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,2:12,1:20,11,3,0
chr12	13366599	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:8,10:6,5:7,7,9,6
chr12	13529068	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr12	13529227	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:7,2:2,3:6,4,3,2
chr12	13529401	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	13720272	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	13720287	.	A	AAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr12	13768354	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=13,30;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.936:18:0,8:0,9:1,0,17,0
chr12	13769664	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	14590981	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	14599904	.	C	T,CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20,33;MFRL=113,54,150;MMQ=60,60,60;MPOS=7,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.22,13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,6:0.289,0.584:11:0,2,1:1,0,5:0,1,6,4
chr12	14599919	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=103,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.321:22:5,0:8,1:3,12,7,0
chr12	14628773	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=101.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,12:0,18:0,0,28,3
chr12	14664097	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	14688817	.	G	GCAGATTTTAAAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	14689449	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,5,1
chr12	14720554	.	GGCA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	14720583	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr12	14769468	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	14774249	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	14774849	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	14775214	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr12	14781503	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr12	14781678	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.607:21:5,5:2,1:1,7,2,11
chr12	14794172	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:0|1:14794172_A_T:14794172:2,7,0,2
chr12	14794176	.	TAC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:5,2:0|1:14794172_A_T:14794172:2,9,0,2
chr12	14804994	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.913:21:1,14:0,6:0,1,3,17
chr12	14822855	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr12	14827463	.	AATC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr12	14832647	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:17,1:9,1:15,12,1,1
chr12	14834421	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=90.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0|1:14834421_GA_G:14834421:0,0,5,16
chr12	14834427	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0|1:14834421_GA_G:14834421:0,0,5,16
chr12	14927389	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,6:1,4:4,0,7,3
chr12	14928470	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.539:26:5,8:7,6:6,6,1,13
chr12	14930055	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr12	14947675	.	TA	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=55.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,25:0.511:49:8,9:14,12:0,24,2,23
chr12	14954392	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:3,3:5,2:0,8,0,6
chr12	15034996	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr12	15073831	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:5,5,3,1
chr12	15090837	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr12	15131995	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	15650397	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=203,134;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:15650397_C_T:15650397:0,4,0,1
chr12	15650403	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=203,134;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:15650397_C_T:15650397:0,4,0,1
chr12	15650405	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=202,134;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:15650397_C_T:15650397:0,2,0,1
chr12	15650409	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=202,134;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:15650397_C_T:15650397:0,2,0,1
chr12	15652330	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=149.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,24:0,18:0,0,37,5
chr12	15656832	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr12	15661441	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:6,2,4,0
chr12	15702007	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:11,10:5,7:12,4,14,3
chr12	15704425	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.620:6:1,2:1,1:2,0,4,0
chr12	15731724	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr12	15731744	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:4,1,7,1
chr12	15734800	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=176,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:1,4,0,5
chr12	15742313	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=215,196;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.839:13:0,0:2,11:1,1,11,0
chr12	15748020	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr12	15803742	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:8,0:5,3:13,0,3,0
chr12	15803992	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,1,14
chr12	15815063	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:3,13,1,1
chr12	15818880	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,16:0,17:0,0,1,33
chr12	15822229	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	15822244	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	16047173	.	A	ACC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=189,146;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:10,2:11,0:0|1:16047173_A_ACC:16047173:0,21,0,2
chr12	16047174	.	TTA	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,146;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:10,1:11,0:0|1:16047173_A_ACC:16047173:0,21,0,2
chr12	16050808	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.532:30:7,3:7,13:9,5,13,3
chr12	16052742	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	16055926	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr12	16185463	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=65.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,5:0,0,10,6
chr12	16704246	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:3,11,1,1
chr12	16713487	.	AT	A,ATT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,29,32;MFRL=149,128,134;MMQ=60,60,60;MPOS=28,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.19,15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,8:0.171,0.404:20:4,2,4:4,0,4:0,9,2,9
chr12	16713545	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=191,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr12	18234461	.	TAA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	18237657	.	T	TCACTGCTCTCACACTAGCAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:18237657_T_TCACTGCTCTCACACTAGCAG:18237657:0,3,0,1
chr12	18237659	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:18237657_T_TCACTGCTCTCACACTAGCAG:18237657:0,3,0,1
chr12	18237661	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:18237657_T_TCACTGCTCTCACACTAGCAG:18237657:0,3,0,1
chr12	18237688	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	18435398	.	GCCC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=C;STR;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:3,7,3,6
chr12	18443955	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:5,5:10,6:3,13,2,9
chr12	18474014	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:16,2:28,0:8,36,0,2
chr12	18499777	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,9,18
chr12	18641324	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:18641324_G_C:18641324:0,0,2,0
chr12	18641326	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:18641324_G_C:18641324:0,0,2,0
chr12	18720057	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr12	18747387	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:2,5:8,4:11,0,5,4
chr12	18747528	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.442:50:10,13:18,9:6,22,8,14
chr12	18762450	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr12	18793583	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:0,6,1,7
chr12	18801017	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	18837272	.	GATTACATTTGTTCTCC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=118,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr12	19282670	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr12	19283135	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	19406863	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=172.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,29:0,20:0,0,42,7
chr12	19410474	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.243:22:5,2:8,1:6,11,0,5
chr12	19418588	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr12	19418874	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr12	19427362	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=112,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:1,0:0,1:2,0,1,0
chr12	19428009	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	19498670	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:7,1:18,2:25,0,3,0
chr12	19512563	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	19626311	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=143,199;MMQ=38,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.591:5:0,2:2,0:0|1:19626311_AT_A:19626311:0,2,0,3
chr12	19626314	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=199,143;MMQ=40,38;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.410:5:1,0:1,2:1|0:19626311_AT_A:19626311:0,3,0,2
chr12	19626315	.	ATTT	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=143,199;MMQ=38,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.589:5:0,2:2,1:0|1:19626311_AT_A:19626311:0,2,0,3
chr12	19626318	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,14:0.939:14:0,2:0,10:1|0:19626311_AT_A:19626311:0,0,3,11
chr12	19626322	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0|1:19626311_AT_A:19626311:0,0,2,13
chr12	19626326	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0|1:19626311_AT_A:19626311:0,0,2,13
chr12	19626330	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=145,199;MMQ=50,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.447:7:1,2:3,1:0|1:19626311_AT_A:19626311:0,4,0,3
chr12	19646943	.	CTGGTGTATTTCA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:3,2:2,4:0,8,0,6
chr12	19670944	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,38:0.591:64:11,19:15,19:20,6,31,7
chr12	20709682	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=135,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,4:0.054:89:42,2:42,2:12,73,0,4
chr12	20709733	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=38,32;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=129.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.951:38:0,18:1,19:0,1,0,37
chr12	20766685	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	20766705	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20766705_G_A:20766705:0,0,0,1
chr12	20766707	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20766705_G_A:20766705:0,0,0,1
chr12	20766711	.	TCAAC	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20766705_G_A:20766705:0,0,0,1
chr12	20766717	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20766705_G_A:20766705:0,0,0,1
chr12	20766721	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20766705_G_A:20766705:0,0,0,1
chr12	20782905	.	C	CAGACT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:11,6,1,1
chr12	20783099	.	AC	CC,CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35,34;MFRL=0,195,161;MMQ=60,60,60;MPOS=19,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.15,19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,6:0.389,0.548:10:0,2,3:0,2,3:0,0,0,10
chr12	20786787	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr12	20786813	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr12	20787783	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:1,1:3,0,3,1
chr12	20799754	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:17,3:10,0:18,9,3,0
chr12	20801855	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=62.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:0,12:1,5:0,1,7,10
chr12	20801860	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=157,172;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:6,3:3,0:0|1:20801860_T_TG:20801860:1,8,2,4
chr12	20801861	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=157,172;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,5:2,0:0|1:20801860_T_TG:20801860:1,8,2,4
chr12	20803323	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,5,1
chr12	20803549	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr12	20870029	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:11,3,1,1
chr12	20876162	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:12,4:16,0:10,18,2,2
chr12	20889942	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	20893052	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr12	20893108	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:2,1,8,1
chr12	20893354	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	20903520	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr12	20903865	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,0:3,5:0,9,0,5
chr12	20968828	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	21008165	.	T	TAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=163,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:21008165_T_TAC:21008165:0,3,0,1
chr12	21008167	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=163,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:21008165_T_TAC:21008165:0,3,0,1
chr12	21011296	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr12	21011310	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr12	21011581	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr12	21013948	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=131.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,21:0,16:0,0,30,8
chr12	21014139	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	21014163	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	21015610	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr12	21028093	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr12	21036270	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr12	21051489	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=132.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,19:0,0,1,35
chr12	21168758	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,2:0,9:0,0,1,11
chr12	21175691	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr12	21175703	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr12	21175719	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,16,0
chr12	21176118	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:18,1:17,3:27,9,1,3
chr12	21176135	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=179.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,27:0,20:0,0,30,19
chr12	21176247	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,20:0,0,2,28
chr12	21207346	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,14:0,0,22,7
chr12	21220333	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,1,4
chr12	21220349	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr12	21331599	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,28:0.454:62:10,12:22,15:0|1:21331599_T_C:21331599:10,24,12,16
chr12	21331621	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:49,3:0.073:52:23,0:22,3:1|0:21331599_T_C:21331599:13,36,0,3
chr12	21331987	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,3:3,5:1,6,0,8
chr12	21332048	.	A	ACGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	21375331	.	AATAT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,152;MMQ=40,41;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AT;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:1,2:0,3,0,4
chr12	21445306	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:21445306_A_C:21445306:0,4,0,1
chr12	21445314	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:21445306_A_C:21445306:0,4,0,1
chr12	21445316	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:21445306_A_C:21445306:0,4,0,1
chr12	21457434	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.341:39:13,7:13,6:12,14,8,5
chr12	21590557	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=148,195;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr12	21590621	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=141,195;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.377:30:4,5:14,6:11,8,9,2
chr12	21590788	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=190,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:0,8,0,6
chr12	21593404	.	G	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=203.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,30:0,25:0,0,9,46
chr12	21598195	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:11,8:3,4:14,0,12,0
chr12	21598264	.	C	T	.	.	DP=94;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=125.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,44:0.489:90:26,21:20,23:35,11,31,13
chr12	21605157	.	A	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=148.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,45:0.624:72:18,27:8,18:0,27,0,45
chr12	21608011	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:6,8:5,12:11,0,20,0
chr12	21608043	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.490:47:16,11:8,12:22,2,21,2
chr12	21608891	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,5:2,1:7,0,6,0
chr12	21609127	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,11:0,0,0,15
chr12	21613867	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:7,6:7,5:13,1,11,0
chr12	21613923	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.476:48:12,9:13,12:21,4,19,4
chr12	21614141	.	CAATTT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.669:28:1,6:8,13:0,9,0,19
chr12	21614903	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=120,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:6,1,5,0
chr12	21615664	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,4:9,4:8,6,5,3
chr12	21621419	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,21:0.367:58:18,14:18,7:30,7,16,5
chr12	21623122	.	T	G	.	.	DP=127;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,162;MMQ=45,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=134.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,52:0.431:121:36,34:31,18:43,26,41,11
chr12	21623282	.	T	TAA,TAAAA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,15,15;MFRL=165,163,174;MMQ=33,33,33;MPOS=7,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=1,3,5;RU=A;STR;TLOD=4.46,8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,6:0.151,0.236:29:5,0,0:9,0,1:7,13,0,9
chr12	21623284	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,166;MMQ=30,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:4,8:10,5:7,9,0,16
chr12	21624309	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:5,0,7,0
chr12	21628320	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0|1:21628320_C_T:21628320:0,0,10,0
chr12	21628336	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0|1:21628320_C_T:21628320:0,0,11,0
chr12	21628791	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	21628812	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	21629987	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:21629987_T_C:21629987:0,0,0,7
chr12	21629993	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:21629987_T_C:21629987:0,0,0,8
chr12	21639385	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.493:47:9,14:11,7:22,2,17,6
chr12	21639526	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=17,18;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.191:23:2,1:3,0:2,17,0,4
chr12	21639528	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=17,17;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:1,0:0,0:0,9,0,10
chr12	21659973	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:0,3,0,7
chr12	21661241	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,6:6,1:13,0,7,0
chr12	21661508	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=141.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,20:0,20:0,0,8,33
chr12	21679858	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,154;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:6,2:8,9,0,2
chr12	21680609	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=99.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,13:0,18:0,0,21,11
chr12	21684029	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=89.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,17:0,7:0,0,25,1
chr12	21692166	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.492:16:4,5:4,3:5,3,6,2
chr12	21693243	.	AT	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr12	21693417	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=171,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:9,3:11,0:7,13,2,1
chr12	21699491	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	21711111	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:7,7:3,3:6,4,7,3
chr12	21712545	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:3,4:5,6:8,1,9,1
chr12	21712574	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.490:41:9,8:11,12:14,7,13,7
chr12	21712728	.	GACATTCTTTGAAATT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=180,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACATTCTTTGAAATT;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.505:6:2,2:0,1:0,3,0,3
chr12	21713308	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:8,5:1,2:6,3,4,3
chr12	21727315	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	21788684	.	G	GAACAACCTGCTCCTGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	21788726	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21788726_C_T:21788726:0,0,0,1
chr12	21788729	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21788726_C_T:21788726:0,0,0,1
chr12	21788739	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,30;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21788726_C_T:21788726:0,0,0,1
chr12	21789968	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr12	21791272	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,28:0,14:0,0,33,9
chr12	21791410	.	TAA	T,TA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30,31;MFRL=64,164,131;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.72,36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,16:0.224,0.666:24:1,3,5:1,2,10:1,1,1,21
chr12	21791455	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr12	21794865	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,17,0
chr12	21796814	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr12	21799803	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:6,1,4,0
chr12	21799999	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	21807432	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr12	21807640	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=117.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,21:0,13:0,0,0,34
chr12	21807687	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr12	21807705	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=198,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr12	21919526	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21919526_C_CT:21919526:0,0,0,1
chr12	21919527	.	A	AAGTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21919526_C_CT:21919526:0,0,0,1
chr12	21926600	.	C	CCTTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,19;MFRL=376,251;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:21926600_C_CCTTCA:21926600:0,1,0,1
chr12	21926601	.	G	GCCTGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=376,251;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21926600_C_CCTTCA:21926600:0,1,0,1
chr12	21968839	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=165,98;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:4,13,0,2
chr12	22005003	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,2:5,1,5,2
chr12	22005510	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	22016004	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:1,0:0,1:1,6,0,5
chr12	22017486	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr12	22035873	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:3,6:3,0:0|1:22035873_C_T:22035873:0,7,0,6
chr12	22035883	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,5:0.461:11:6,2:0,3:1|0:22035873_C_T:22035873:0,6,0,5
chr12	22047122	.	G	GACAATTT	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=148,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:9,2:12,0:4,18,0,2
chr12	22047151	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,2,15
chr12	22047174	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:1,6:1,3:0,2,0,10
chr12	22063737	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,17,7
chr12	22063749	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=97.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,12:0,16:0,0,20,9
chr12	22063971	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,3:4,2:0,6,0,6
chr12	22068849	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.459:18:1,5:7,3:1,9,0,8
chr12	22078838	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=135,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,6:1,1:3,2,7,0
chr12	22078906	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=148,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:15,4,2,0
chr12	22606738	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr12	22625135	.	TA	T,TAA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,28,30;MFRL=175,186,157;MMQ=60,60,60;MPOS=12,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=7.41,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,6,4:0.138,0.104:44:17,4,2:17,1,1:32,2,9,1
chr12	22796994	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr12	22797057	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=218,173;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:10,0,0,2
chr12	23687481	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23687481_A_ATT:23687481:0,1,0,1
chr12	23687482	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23687481_A_ATT:23687481:0,1,0,1
chr12	23689301	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.806:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr12	23696116	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=54.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr12	23757245	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:4,5:4,3:8,0,9,0
chr12	23893753	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,1:2,3:4,0,3,1
chr12	23998888	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,15,6
chr12	24737061	.	GC	AA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,0;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,4:8,5:5,6,3,6
chr12	24970966	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.468:26:8,8:5,4:6,8,4,8
chr12	24985637	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,2:5,1:11,1,3,0
chr12	24985653	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:5,6:1,8:5,1,13,1
chr12	24994923	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr12	25031449	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr12	25047462	.	G	GAGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	25054891	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=248,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr12	25147300	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	25232482	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,36;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:25232482_C_CA:25232482:0,4,0,1
chr12	25232486	.	T	TCAAATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:25232482_C_CA:25232482:0,4,0,1
chr12	25232491	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:25232482_C_CA:25232482:0,4,0,1
chr12	25240964	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:7,5:4,2:7,4,6,1
chr12	25240988	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:9,10:4,6:9,4,10,6
chr12	25242758	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,6:4,1:2,6,1,6
chr12	25242776	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,5:2,0:1,8,1,4
chr12	25249785	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:6,0,6,0
chr12	25255034	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr12	25261511	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:11,6,0,2
chr12	25261735	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr12	25261770	.	A	AGAATG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=71,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.669:2:0,1:1,0:0|1:25261770_A_AGAATG:25261770:1,0,0,1
chr12	25261774	.	T	TAAGAG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25261770_A_AGAATG:25261770:0,0,0,1
chr12	25261777	.	A	ATT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25261770_A_AGAATG:25261770:0,0,0,1
chr12	25261778	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25261770_A_AGAATG:25261770:0,0,0,1
chr12	25264745	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,1:3,1:10,4,2,0
chr12	25267687	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,1:8,1:13,8,2,0
chr12	25272027	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,5,1
chr12	25274593	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	25299921	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,10,3
chr12	25302481	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr12	25307267	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=153,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:17,6,0,2
chr12	25311333	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=213,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr12	25311489	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:1,5,2,4
chr12	25343703	.	TTTCC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.672:13:4,5:0,4:0,4,0,9
chr12	25380071	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	25673079	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	25679932	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr12	25699523	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr12	25702183	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr12	25702522	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=214,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr12	25702544	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=186,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr12	25705804	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:8,6:4,2:9,3,6,2
chr12	25706134	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=219,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr12	26217990	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.532:24:4,5:7,6:8,3,8,5
chr12	26218162	.	CG	GT	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,3:0.054:74:31,3:32,0:28,43,3,0
chr12	26231843	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	26231898	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr12	26275177	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,18;MFRL=224,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:26275177_T_C:26275177:0,3,0,1
chr12	26275181	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,19;MFRL=224,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:26275177_T_C:26275177:0,3,0,1
chr12	26275183	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,10;MFRL=224,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:26275177_T_C:26275177:0,3,0,1
chr12	26275187	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=224,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:26275177_T_C:26275177:0,3,0,1
chr12	26275189	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=249,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26275177_T_C:26275177:0,2,0,1
chr12	26276509	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=148,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26276509_C_A:26276509:1,0,0,1
chr12	26276512	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=148,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26276509_C_A:26276509:1,0,0,1
chr12	26384070	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:0,14,0,2
chr12	26552042	.	G	GGTAAAGAGCACTTTCCTTTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=171,255;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	26592288	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:10,5:6,2:2,14,0,7
chr12	26596618	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,12:0,10:0,0,1,21
chr12	26628357	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:3,1:7,1:0,11,0,3
chr12	26639346	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,1:0,0,0,8
chr12	26731573	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr12	26752897	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr12	26775303	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:25,2:8,1:10,23,2,1
chr12	26807079	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26807079_C_T:26807079:0,0,0,1
chr12	26807081	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26807079_C_T:26807079:0,0,0,1
chr12	26809177	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,6:0,0,21,2
chr12	26812245	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:0,1,2,4
chr12	26816831	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=205,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr12	26834804	.	T	TACTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,4:0,0,15,2
chr12	26835427	.	ATG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:2,0,11,0
chr12	26848410	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr12	26848663	.	A	AT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=141.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,21:0,19:0,0,1,39
chr12	26869047	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=125,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:10,7:4,2:11,3,9,0
chr12	26869233	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr12	26875235	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr12	27059149	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr12	27059224	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,16,2
chr12	27059422	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	27066350	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,21,2
chr12	27067602	.	GTC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=230,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:27067602_GTC_G:27067602:0,2,0,1
chr12	27067612	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=230,122;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:27067602_GTC_G:27067602:0,2,0,1
chr12	27075705	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	27081566	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	27109412	.	CAT	C,CATAT,CATATAT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,33,34,34;MFRL=119,170,168,168;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,22,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=AT;STR;TLOD=4.31,26.15,11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,10,7:0.092,0.390,0.265:27:4,3,7,4:3,0,3,2:7,0,18,2
chr12	27128594	.	G	GT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,14:0.356:40:10,9:16,5:5,21,3,11
chr12	27143579	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr12	27143632	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=223,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr12	27152666	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	27175640	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	27234878	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr12	27234914	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,2:7,4:7,4,5,1
chr12	27455167	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=116,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,29:0.500:58:12,8:17,21:7,22,4,25
chr12	27461486	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:5,1:0,12,0,2
chr12	27461984	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr12	27468313	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,26:0.500:52:11,13:15,13:7,19,6,20
chr12	27533367	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,4:4,8:1,5,1,11
chr12	27543223	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:0|1:27543223_TCC_T:27543223:0,3,0,1
chr12	27543226	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27543223_TCC_T:27543223:0,3,0,1
chr12	27543238	.	G	GACCATC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	27553741	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:1,7,0,8
chr12	27553788	.	G	GTT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:27553788_G_GTT:27553788:0,3,0,1
chr12	27553794	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr12	27553798	.	TTC	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:27553788_G_GTT:27553788:0,3,0,1
chr12	27623490	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr12	27625823	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:1,4,0,5
chr12	27625879	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27625879_G_A:27625879:0,0,0,1
chr12	27625887	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27625879_G_A:27625879:1,0,0,1
chr12	27628742	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=206,235;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	27786484	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=185,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	27799154	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr12	27800576	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr12	27800906	.	A	AGCTCTGGCCAGAACC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=227,208;MMQ=51,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	27811649	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:7,0,7,0
chr12	27813754	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,18,2
chr12	27813903	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=114.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,13:0,19:0,0,3,29
chr12	27813961	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	27813973	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:27813973_C_T:27813973:0,0,0,7
chr12	27813981	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:27813973_C_T:27813973:0,0,0,6
chr12	27820302	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr12	27826780	.	T	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,32:0.477:67:16,18:19,14:3,32,9,23
chr12	27832347	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:5,3:6,3:11,0,7,0
chr12	27841925	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=137,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr12	27849795	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=147,102;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:0|1:27849795_CA_TG:27849795:3,4,4,3
chr12	27849796	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,14:0.936:14:0,6:0,8:1|0:27849795_CA_TG:27849795:0,0,7,7
chr12	27908087	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,2:8,1:17,1,3,0
chr12	28122485	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	28412398	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.781:10:0,2:2,6:0,2,3,5
chr12	28603316	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=119,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:14,1:22,1:21,15,1,1
chr12	29423583	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:1,7,1,8
chr12	29462224	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr12	29486745	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:4,7:3,2:3,4,4,5
chr12	29496224	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,2:2,1:4,5,1,2
chr12	29519957	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:29519957_C_A:29519957:0,0,0,1
chr12	29519961	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:29519957_C_A:29519957:0,0,0,1
chr12	29524365	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=198,219;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr12	29586810	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=210,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.613:11:2,4:2,1:0,4,1,6
chr12	29598373	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr12	29598399	.	T	TGATTTCTGGGAGATTCCCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=192,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr12	29642542	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr12	29642573	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0,0,9,3
chr12	29650702	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	29673702	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:0,5,0,4
chr12	29689288	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=139,153;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:4,8,0,2
chr12	29736523	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr12	29920745	.	G	GTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TA;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr12	29920790	.	C	CACAT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr12	29921074	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	30787228	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:2,4,0,8
chr12	30814043	.	CTATTA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=110,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:0,2:1,0,4,0
chr12	30814259	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=65,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr12	30818081	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,1:0,8:2,0,9,0
chr12	30822205	.	T	TAAGAACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:30822205_T_TAAGAACA:30822205:0,3,0,1
chr12	30822207	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:30822205_T_TAAGAACA:30822205:0,3,0,1
chr12	30822209	.	G	GCATAGCATGAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:30822205_T_TAAGAACA:30822205:0,3,0,1
chr12	30827086	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:5,4:10,7:0,15,0,11
chr12	30837303	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:19,0:20,4:20,20,2,2
chr12	30866856	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0|1:30866856_A_AG:30866856:0,3,0,1
chr12	30866857	.	A	AAAGGAATGTGTGTGTTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0|1:30866856_A_AG:30866856:0,3,0,1
chr12	30878859	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=115,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:3,1,4,0
chr12	30887820	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,139;MMQ=60,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:2,0:5,2:10,0,2,0
chr12	30903903	.	CTG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:4,1:6,0,2,0
chr12	31132479	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:8,4:6,8:7,7,9,3
chr12	31135905	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr12	31237026	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=157,173;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.408:47:12,13:15,6:8,20,11,8
chr12	31237700	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,153;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:5,4:7,4:0,12,0,9
chr12	31237978	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=133,208;MMQ=50,25;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,6:0.104:65:30,3:27,3:39,20,6,0
chr12	31238075	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,140;MMQ=31,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,28:0.444:63:19,12:16,15:12,23,10,18
chr12	31238121	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=165,160;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.350:26:12,6:5,2:4,13,1,8
chr12	31240925	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,144;MMQ=49,50;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:7,0:8,6:2,13,3,3
chr12	31240960	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:3,1:6,3:1,8,0,5
chr12	31242271	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:4,5:10,4:8,6,7,2
chr12	31242314	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,17:0.346:49:17,10:15,5:23,9,12,5
chr12	31242440	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=133,148;MMQ=52,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:3,5:11,6:6,10,5,6
chr12	31242450	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=146,143;MMQ=50,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:13,1:0|1:31242450_C_A:31242450:7,16,2,0
chr12	31242452	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=146,143;MMQ=50,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:12,0:0|1:31242450_C_A:31242450:7,16,2,0
chr12	31242718	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=192,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,1:7,2:0|1:31242718_T_C:31242718:11,0,3,0
chr12	31242725	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=192,204;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,1:6,3:0|1:31242718_T_C:31242718:10,0,4,0
chr12	31244592	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=194,185;MMQ=50,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr12	31244846	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,169;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:2,2:7,4:0,10,0,6
chr12	31245741	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,172;MMQ=50,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:5,0:7,4:9,3,4,1
chr12	31247480	.	T	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,180;MMQ=55,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,8:0.120:73:28,4:33,4:46,19,1,7
chr12	31247819	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,150;MMQ=57,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,1:10,1:0,14,0,2
chr12	31250804	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,146;MMQ=52,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.349:21:7,3:6,4:14,0,6,1
chr12	31250942	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,149;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:6,13:9,4:3,12,3,14
chr12	31253734	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,178;MMQ=60,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:15,1:18,3:1,32,0,4
chr12	31254701	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=185,195;MMQ=40,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr12	31254752	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=101,194;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,4:2,3:1,1,6,1
chr12	31255263	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,134;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.399:33:9,8:8,5:11,9,4,9
chr12	31255772	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,137;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,6,0
chr12	31256164	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=139,157;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:9,0,7,0
chr12	31256219	.	CA	TG	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=118,144;MMQ=55,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.445:43:14,12:10,7:14,10,13,6
chr12	31256342	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=175,178;MMQ=27,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:8,5:2,1:1,9,0,6
chr12	31256368	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=180,176;MMQ=38,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr12	31435556	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:3,2:9,1:15,0,2,1
chr12	31435608	.	A	AT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=132,165;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:8,2:10,1:11,11,2,2
chr12	31542191	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:6,0,4,0
chr12	31545103	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr12	31545381	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr12	31545682	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr12	31551350	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr12	31552488	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,141;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,2:5,0:6,0,2,0
chr12	31568221	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr12	31576553	.	TTG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=107,108;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:10,6,0,2
chr12	31577378	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,1:3,0,3,0
chr12	31586007	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr12	31600400	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr12	31605498	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=205,186;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31605498_A_G:31605498:0,3,0,1
chr12	31605499	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=205,186;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31605498_A_G:31605498:0,3,0,1
chr12	31632449	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=211,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr12	31633188	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=308,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31633188_A_AG:31633188:0,1,0,1
chr12	31633189	.	A	ACGGATTTGGTGTTTCAGGAGGGCCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=308,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31633188_A_AG:31633188:0,1,0,1
chr12	31648723	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,2:6,6:9,3,7,1
chr12	31648728	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.421:22:7,2:6,6:10,3,8,1
chr12	31815233	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=99,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,0,2
chr12	31850220	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:10,1,5,0
chr12	32138924	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr12	32138974	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	32260229	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=58,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,0:2,4:1,3,5,0
chr12	32446835	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,27;MFRL=238,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,0:0,3:1,0,4,0
chr12	32458639	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:11,9,1,1
chr12	32459099	.	A	AGATTGGGTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=258,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	32480327	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=862,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr12	32490369	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr12	32490850	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	32491626	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr12	32491969	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	32530385	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr12	32530580	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,2,10
chr12	32754350	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,2:6,0:6,6,0,2
chr12	32755058	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=98,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.374:19:8,5:4,2:7,5,6,1
chr12	32764276	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=160,160;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0,11,0,2
chr12	32777416	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.665:13:4,5:0,1:0,4,0,9
chr12	32777495	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=291,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:1,2:0,0:0|1:32777495_T_C:32777495:0,1,0,2
chr12	32777497	.	TGGG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=291,229;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:32777495_T_C:32777495:0,1,0,2
chr12	32777502	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=291,239;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32777495_T_C:32777495:0,1,0,1
chr12	32778039	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,2:4,5:0,7,0,8
chr12	32793164	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:1,0,7,0
chr12	32863824	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,2,1
chr12	32866399	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0|1:32866399_G_A:32866399:0,4,0,4
chr12	32866403	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0|1:32866399_G_A:32866399:0,4,0,4
chr12	32871481	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	32884541	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=607,265;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32884541_A_ATG:32884541:1,0,0,1
chr12	32884543	.	GGT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=607,265;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32884541_A_ATG:32884541:1,0,0,1
chr12	32884741	.	A	AAAAAAAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=225,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAAAAC;STR;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:3,2:0,1:3,0,2,1
chr12	32886672	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.372:44:14,7:11,9:16,12,8,8
chr12	32890161	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,2:6,3:0,8,1,5
chr12	32896365	.	GA	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,4:8,3:4,8,2,5
chr12	32903635	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:6,0,5,2
chr12	32908237	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.477:33:10,7:7,6:9,8,8,8
chr12	32945495	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,2:6,3:4,4,2,4
chr12	32945721	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:3,3,0,3
chr12	32945769	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr12	32948969	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.446:16:4,3:5,3:0|1:32948969_CA_C:32948969:7,2,7,0
chr12	32948971	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.446:16:3,4:4,3:0|1:32948969_CA_C:32948969:7,2,7,0
chr12	32974245	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,5:4,4:4,1,8,1
chr12	33535510	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr12	33579035	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,4:7,0:12,0,4,0
chr12	34178732	.	TA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.489:43:10,13:11,8:21,1,21,0
chr12	39071247	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,6:5,4:3,7,4,6
chr12	39087687	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,3,16
chr12	39124173	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr12	39242340	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,9:6,3:7,1,11,1
chr12	39719754	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:0,1,0,5
chr12	39735413	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,0:1,2:0|1:39735413_T_C:39735413:4,4,0,2
chr12	39735415	.	GA	TC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0|1:39735413_T_C:39735413:4,4,0,2
chr12	39735420	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,1:0|1:39735413_T_C:39735413:4,4,0,2
chr12	39756878	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:8,6:3,3:10,1,6,3
chr12	39760295	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,0:7,2:6,15,1,1
chr12	39760747	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=96,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:1,1,3,0
chr12	39997867	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,2:0,2:0,3,0,4
chr12	40034699	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.434:28:6,5:10,7:13,3,10,2
chr12	40037727	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=192.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,26:0,29:0,0,17,39
chr12	40040059	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,5:7,5:14,0,10,0
chr12	40040331	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=216,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:1,1:1,3:0,3,0,4
chr12	40040355	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=228,247;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	40040525	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=212,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr12	40044027	.	A	AT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:20,1:17,2:25,14,3,1
chr12	40077028	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr12	40345185	.	G	GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.300:24:5,3:7,0:2,15,2,5
chr12	40442111	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	40619301	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,23,3
chr12	40619542	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr12	40626230	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=45.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr12	40626285	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	40629595	.	GTTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.770:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr12	40645148	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,3:0.058:66:29,3:34,0:31,32,0,3
chr12	40657537	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:6,0,8,0
chr12	40657771	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:3,1:1,3:1,4,0,4
chr12	40671989	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.665:28:7,10:2,8:6,3,10,9
chr12	40681057	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	40681142	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:2,1:5,3:6,1,3,1
chr12	40689162	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr12	40702846	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.398:12:3,4:4,1:7,0,5,0
chr12	40703087	.	C	CGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GT;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.485:6:2,1:1,1:0,3,0,3
chr12	40709185	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:0,10,0,5
chr12	40713759	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,26:0.436:60:13,12:21,14:28,6,18,8
chr12	40714009	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:5,5:7,5:3,10,2,8
chr12	40714785	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=208,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:6,4:0,7:6,0,11,0
chr12	40716015	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:6,2,2,6
chr12	40745248	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr12	40748394	.	AGCCT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:40748394_AGCCT_A:40748394:0,2,0,1
chr12	40748395	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.764:2:0,2:0,0:1|0:40748394_AGCCT_A:40748394:0,0,0,2
chr12	40753044	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.813:9:0,3:1,4:1,0,6,2
chr12	40753303	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr12	40757104	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=217,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	40757114	.	A	ACATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	40757186	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=204,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:0,6:4,0:4,0,6,0
chr12	40758948	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	40761358	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr12	40761663	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr12	40787385	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=159,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	40806082	.	T	TCACGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:40806082_T_TCACGCC:40806082:0,1,0,1
chr12	40806083	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:40806082_T_TCACGCC:40806082:0,1,0,1
chr12	40815530	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,6:1,1:3,0,7,0
chr12	40815548	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,15,0
chr12	40823538	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40823538_C_G:40823538:0,0,0,1
chr12	40823540	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40823538_C_G:40823538:0,0,0,1
chr12	40823544	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40823538_C_G:40823538:0,0,0,1
chr12	40826116	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.531:34:9,10:6,8:16,0,18,0
chr12	40827479	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr12	40830583	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.339:21:8,2:6,4:3,11,0,7
chr12	40830599	.	CGTGTGT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=GT;STR;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.512:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr12	40835596	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=188,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr12	40838146	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,5:8,3:11,5,5,3
chr12	40839467	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:0,8,0,5
chr12	40839521	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=190,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr12	40854079	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:40854079_A_T:40854079:5,6,1,1
chr12	40854081	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:40854079_A_T:40854079:5,6,1,1
chr12	40857214	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr12	40859036	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=136.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.954:41:0,10:1,30:0,1,13,27
chr12	40868879	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:5,3:6,3:9,2,4,2
chr12	40903100	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,2:8,7:6,10,2,7
chr12	40904696	.	GG	AA	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=141,149;MMQ=60,41;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:17,1:10,1:0|1:40904696_GG_AA:40904696:12,15,0,2
chr12	40904699	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=145,149;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:16,1:9,1:0|1:40904696_GG_AA:40904696:14,15,0,2
chr12	40904702	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=143,149;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:17,1:10,1:0|1:40904696_GG_AA:40904696:13,15,0,2
chr12	40904718	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=33,20;MFRL=148,149;MMQ=60,41;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,1:7,0:0|1:40904718_C_T:40904718:8,11,0,2
chr12	40904725	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=33,34;MFRL=156,149;MMQ=60,41;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,1:8,1:0|1:40904718_C_T:40904718:9,10,0,2
chr12	40904730	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=32,34;MFRL=156,149;MMQ=60,41;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,1:7,1:0|1:40904718_C_T:40904718:8,9,0,2
chr12	40904742	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=181,149;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:0|1:40904742_T_A:40904742:8,7,0,2
chr12	40904746	.	TG	CT	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=187,149;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:0|1:40904742_T_A:40904742:7,6,0,2
chr12	40904752	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=33,14;MFRL=189,149;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:6,0:0|1:40904742_T_A:40904742:7,7,0,2
chr12	40904843	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=186,218;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:3,2:0,3:1,3,2,4
chr12	40927164	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=136,155;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:40927164_A_T:40927164:1,3,0,1
chr12	40927165	.	A	AGCTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=82,155;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:40927164_A_T:40927164:1,2,0,1
chr12	40927167	.	A	ACTACAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=82,155;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:40927164_A_T:40927164:1,2,0,1
chr12	40927890	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr12	40928587	.	CAA	C,CA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=19,19,18;MFRL=152,114,149;MMQ=60,60,60;MPOS=22,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,19,20;RU=A;STR;TLOD=3.03,10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,6,9:0.198,0.351:27:0,1,0:3,1,4:1,11,1,14
chr12	40929482	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	40938944	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,3:8,9:2,10,1,11
chr12	40942463	.	GTT	G,GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=129,149,162;MMQ=60,60,60;MPOS=14,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=8.41,11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,6:0.377,0.457:13:1,3,2:1,2,3:0,2,0,11
chr12	40944344	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,0:16,2:8,22,0,2
chr12	40944366	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:40944366_G_A:40944366:4,15,0,2
chr12	40944368	.	CTACATGAACTT	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:10,1:0|1:40944366_G_A:40944366:6,17,0,2
chr12	40950883	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:4,4:4,9:7,1,12,1
chr12	40951380	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=150,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.353:7:2,0:2,2:0|1:40951380_G_C:40951380:2,3,1,1
chr12	40951391	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=169,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:2,1:0|1:40951380_G_C:40951380:0,3,1,2
chr12	40951394	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=160,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:40951380_G_C:40951380:0,4,0,1
chr12	40951395	.	A	AAAGAATAAAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=160,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:40951380_G_C:40951380:0,4,0,1
chr12	40951950	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.428:26:8,3:6,7:0|1:40951950_G_A:40951950:5,10,6,5
chr12	40951961	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,12:0.433:28:9,3:6,7:0|1:40951950_G_A:40951950:5,11,5,7
chr12	40952934	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr12	40957272	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,2:3,0:9,1,1,1
chr12	40957450	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr12	40963674	.	T	TGTTTGTTATGGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=214,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	41312365	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:6,0,6,0
chr12	41327427	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=189,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:3,3:5,4,1,2
chr12	41330531	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	41333045	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:0|1:41333045_C_T:41333045:4,0,6,0
chr12	41333052	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:0|1:41333045_C_T:41333045:4,0,6,0
chr12	41337435	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=200.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,27:0,32:0,0,37,22
chr12	41387110	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=246,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0,1,0,7
chr12	41463689	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	41946453	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,17:0,8:0,0,19,6
chr12	41961535	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,3:1,1:3,1,3,1
chr12	42481545	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,5:9,2:13,1,7,0
chr12	42481803	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	42499538	.	TT	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr12	42499690	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=161,189;MMQ=60,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:14,2:8,1:0|1:42499690_T_C:42499690:16,9,3,0
chr12	42499692	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=161,189;MMQ=60,34;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:15,2:10,1:0|1:42499690_T_C:42499690:17,9,3,0
chr12	42499694	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=161,189;MMQ=60,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:14,1:10,1:0|1:42499690_T_C:42499690:18,9,3,0
chr12	42499701	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=161,203;MMQ=60,29;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,0:12,1:0|1:42499690_T_C:42499690:17,11,2,0
chr12	42499814	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:12,0:21,3:19,15,2,1
chr12	42503325	.	TA	T,TAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,10,20;MFRL=109,82,135;MMQ=60,60,60;MPOS=5,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,19,21;RU=A;STR;TLOD=3.47,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,4:0.295,0.244:18:4,0,1:1,2,1:3,5,4,6
chr12	42503505	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=9,32;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=105.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.955:40:0,21:0,18:0,1,5,34
chr12	42717961	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr12	42717973	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=173,134;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:42717973_G_A:42717973:0,3,0,1
chr12	42717979	.	TCC	ATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=173,134;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:42717973_G_A:42717973:0,3,0,1
chr12	42718013	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=196,197;MMQ=56,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr12	42726620	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,26:0.717:36:3,13:6,13:0,10,0,26
chr12	42749072	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:5,3:4,7,2,5
chr12	42768646	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,3:5,2:7,3,5,0
chr12	42768660	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=134,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.435:19:4,0:2,0:6,5,8,0
chr12	42781422	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=199,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr12	42839836	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.978:42:0,18:0,21:0,1,30,11
chr12	42840115	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=424,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42840115_CA_TT:42840115:1,0,0,1
chr12	42840121	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,30;MFRL=424,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42840115_CA_TT:42840115:1,0,0,1
chr12	42840125	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=37,32;MFRL=424,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42840115_CA_TT:42840115:1,0,0,1
chr12	42840126	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=424,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42840115_CA_TT:42840115:1,0,0,1
chr12	42853520	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr12	42854489	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42854489_G_T:42854489:0,1,0,1
chr12	42854493	.	T	TAAACAAATAGGTGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:42854489_G_T:42854489:0,1,0,1
chr12	42858265	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:0|1:42858265_A_C:42858265:5,12,1,1
chr12	42858275	.	G	GCAGCCCTCT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:42858265_A_C:42858265:7,14,1,1
chr12	42863473	.	G	GGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=162,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:1,0:0|1:42863473_G_GGT:42863473:1,2,1,1
chr12	42863475	.	A	AAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,0:0|1:42863473_G_GGT:42863473:1,2,1,1
chr12	43769280	.	C	CAGTGTATTTTGGGAAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=158,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:6,9,1,1
chr12	43777335	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,1:0,2:4,0,3,0
chr12	43819298	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr12	43821305	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=147,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:43821305_C_T:43821305:1,3,1,1
chr12	43821308	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=147,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:43821305_C_T:43821305:1,3,1,1
chr12	43821309	.	G	GATTCCAATGAAGGA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=147,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:2,0:2,1:0|1:43821305_C_T:43821305:1,3,1,1
chr12	43824316	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	43826277	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24,26;MFRL=156,156,83;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.44,4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.248,0.257:9:3,1,2:2,0,0:0,5,0,4
chr12	43833508	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,180;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:11,9,0,2
chr12	43833914	.	A	AGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	43846272	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr12	43847683	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=108,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:6,2:0,2:4,2,3,1
chr12	43847929	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=193,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:1,1,0,3
chr12	43847941	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr12	43895894	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=260,82;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr12	43945603	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	44132250	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,4:6,4:0,9,1,7
chr12	44139805	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr12	44171602	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,2:6,3:1,7,0,6
chr12	44338153	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,4,18
chr12	45004796	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	45004824	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	45059237	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,16:0,8:0,0,23,1
chr12	45170006	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	45444238	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr12	45444264	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr12	45444529	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:1,1:7,0:0|1:45444529_T_G:45444529:7,8,2,0
chr12	45444532	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,17;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:1,0:7,0:0|1:45444529_T_G:45444529:6,7,3,0
chr12	45695735	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr12	45803109	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:8,8,0,2
chr12	46125008	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:16,3:17,2:17,16,2,3
chr12	46215163	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,26:0.391:67:19,17:21,9:40,1,26,0
chr12	46230257	.	TT	CC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=211,213;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr12	46230279	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=207,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr12	46230295	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=192,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:3,0:9,0,2,0
chr12	46230835	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	46298202	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:11,0:2,2:0|1:46298202_G_A:46298202:4,9,0,2
chr12	46298204	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:10,0:2,2:0|1:46298202_G_A:46298202:4,9,0,2
chr12	46298214	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=182,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:7,0:1,3:1,7,1,2
chr12	46298241	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=196,233;MMQ=45,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr12	46298259	.	AGGTC	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=176,94;MMQ=43,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:0|1:46298259_AGGTC_A:46298259:0,2,0,1
chr12	46298265	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=156,94;MMQ=45,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.518:2:1,1:0,0:0|1:46298259_AGGTC_A:46298259:0,1,0,1
chr12	46316822	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:16,2:10,1:18,10,2,1
chr12	46317004	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr12	46349944	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,19528308;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:2,0:7,2:5,4,1,1
chr12	46367903	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,27:0.484:56:15,13:13,14:23,6,20,7
chr12	46367939	.	G	T	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,24:0.378:64:21,13:17,11:20,20,9,15
chr12	46759017	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:4,6:10,7:1,13,1,12
chr12	46759057	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,2:6,6:0,12,0,8
chr12	46760557	.	C	CTAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=106,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAA;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:2,0,2,0
chr12	47162211	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=107,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,1,2
chr12	47163306	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr12	47170887	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr12	47173662	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=126.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,20:0,0,16,22
chr12	47178307	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=50.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,8:0,0,10,5
chr12	47471393	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:6,10:8,8:8,6,12,6
chr12	47629195	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:8,5,1,1
chr12	48091522	.	AACAGGG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:6,3:7,5:8,6,3,5
chr12	48104746	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr12	48107142	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=126,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:10,3:14,0:9,15,1,2
chr12	48110325	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.699:18:4,4:1,8:0,5,0,13
chr12	48110608	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,14:0.517:27:6,7:6,6:0|1:48110608_A_G:48110608:13,0,13,1
chr12	48110613	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.483:27:8,6:6,6:0|1:48110608_A_G:48110608:14,0,12,1
chr12	48131953	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=112,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:3,0:4,1:3,9,3,0
chr12	48132451	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:8,5:2,4:6,5,8,1
chr12	48134634	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=168,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:7,0,4,2
chr12	48134695	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:4,2:5,1:6,5,1,2
chr12	48134880	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	48141472	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=145,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0|1:48141472_C_T:48141472:0,1,0,3
chr12	48141475	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=145,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,2:1,0:0|1:48141472_C_T:48141472:0,1,0,3
chr12	48141510	.	G	GGCCAGAGAGGCGGCGAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48141510_G_GGCCAGAGAGGCGGCGAT:48141510:0,0,0,1
chr12	48141518	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,33;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48141510_G_GGCCAGAGAGGCGGCGAT:48141510:1,0,0,1
chr12	48141519	.	G	GATGCTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48141510_G_GGCCAGAGAGGCGGCGAT:48141510:1,0,0,1
chr12	48142151	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr12	48152257	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.263:21:6,2:5,0:0|1:48152257_A_C:48152257:5,10,6,0
chr12	48152261	.	AA	CC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.215:25:8,0:7,0:0|1:48152257_A_C:48152257:6,13,6,0
chr12	48152432	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr12	48172778	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,1:2,4:7,1,4,1
chr12	48172820	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=141,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,3:9,0:16,4,3,0
chr12	48174340	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=129,195;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.336:14:4,1:5,1:3,6,0,5
chr12	48174344	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,0:5,2:0|1:48174344_T_C:48174344:3,10,0,2
chr12	48174345	.	TTTTTTC	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,0:5,2:0|1:48174344_T_C:48174344:3,10,0,2
chr12	48177906	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,5:4,4:7,3,7,2
chr12	48179347	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=203,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr12	48179478	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=201,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr12	48180320	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr12	48185165	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=183,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:48185165_G_A:48185165:0,6,0,2
chr12	48185167	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=183,73;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:48185165_G_A:48185165:0,6,0,2
chr12	48185356	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr12	48187119	.	TC	AG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=21,14;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:48187119_TC_AG:48187119:1,0,2,0
chr12	48187123	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,14;MFRL=125,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:0,0:0|1:48187119_TC_AG:48187119:1,0,3,0
chr12	48187126	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=23,12;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:0,0:0|1:48187119_TC_AG:48187119:2,1,2,0
chr12	48187130	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,13;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,1:0|1:48187119_TC_AG:48187119:1,1,3,0
chr12	48187133	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=23,28;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:1,1:0|1:48187119_TC_AG:48187119:1,1,3,0
chr12	48187137	.	T	C,A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,12,14;MFRL=197,121,160;MMQ=60,60,60;MPOS=4,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.92,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:1,0,0:2,0,0:2,1,3,0
chr12	48187140	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=31,14;MFRL=197,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,0:0|1:48187119_TC_AG:48187119:2,1,3,0
chr12	48188772	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48188772_G_T:48188772:0,0,0,1
chr12	48188774	.	A	ATCAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48188772_G_T:48188772:0,0,0,1
chr12	48188776	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48188772_G_T:48188772:0,0,0,1
chr12	48190044	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.542:35:10,8:5,10:8,8,5,14
chr12	48190166	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,0:2,5:0,4,1,4
chr12	48191083	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=185,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48191083_G_C:48191083:1,0,1,0
chr12	48191087	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=196,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:0,0:1,0:0|1:48191083_G_C:48191083:2,0,1,0
chr12	48191092	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=185,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:48191092_T_A:48191092:3,0,1,0
chr12	48191097	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=185,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:48191092_T_A:48191092:3,0,1,0
chr12	48191099	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,13;MFRL=185,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:48191092_T_A:48191092:3,0,1,0
chr12	48191819	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.618:14:3,1:2,6:4,1,9,0
chr12	48192062	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=106,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr12	48192084	.	A	ACATGCACCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48192084_A_ACATGCACCC:48192084:0,0,0,1
chr12	48192088	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48192084_A_ACATGCACCC:48192084:0,0,0,1
chr12	48195939	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	48238837	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr12	48240338	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	48249521	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:16,2:18,0:12,23,0,2
chr12	48249571	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:13,3:13,0:9,17,1,2
chr12	48251533	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	48272895	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr12	48358279	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr12	48359527	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr12	48360620	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	48360947	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.509:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr12	48367829	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=89,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:3,0,3,3
chr12	48368178	.	T	TGGGGGTCTGGAGGAGGAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:48368178_T_TGGGGGTCTGGAGGAGGAAG:48368178:0,3,0,1
chr12	48368182	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:48368178_T_TGGGGGTCTGGAGGAGGAAG:48368178:0,2,0,1
chr12	48373718	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr12	48374513	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr12	48374826	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,5:0,2:0,1,0,7
chr12	48375475	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,16,3
chr12	48375947	.	A	ACCTAAAACCTAAATTCCTTTTCTTCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=161,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr12	48375965	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,0:0|1:48375965_C_T:48375965:0,0,0,5
chr12	48375968	.	C	CAAGAACTAGCAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr12	48375975	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:48375965_C_T:48375965:0,0,0,4
chr12	48376443	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48376443_A_AC:48376443:0,0,0,1
chr12	48376447	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48376443_A_AC:48376443:0,0,0,1
chr12	48377805	.	T	C,TGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29,21;MFRL=0,189,185;MMQ=60,60,60;MPOS=18,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.15,6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,1,1:0,0,1:0,0,3,0
chr12	48377809	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.758:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr12	48377970	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=204,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,9:1,9:0,1,3,15
chr12	48378933	.	CAA	C,CGGTAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=37,31,27;MFRL=213,134,167;MMQ=60,60,60;MPOS=7,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,1:1,0,0:0,2,0,2
chr12	48378938	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=213,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48378938_T_G:48378938:0,2,0,1
chr12	48378941	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=213,134;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48378938_T_G:48378938:0,2,0,1
chr12	48379810	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr12	48379856	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	48380031	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	48386553	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr12	48386577	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,11:0,0,14,0
chr12	48388995	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=104,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:3,3:4,3:5,2,6,0
chr12	48398002	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,16,8
chr12	48398080	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,5,9
chr12	48442821	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,16;MFRL=154,352;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:9,0:8,0:7,12,4,0
chr12	48465559	.	TC	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:11,3:11,9:0,22,0,12
chr12	48468588	.	CA	C,CAA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,31,19;MFRL=141,179,166;MMQ=60,60,60;MPOS=11,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=7.30,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,3:0.237,0.200:17:1,2,1:5,1,0:1,9,0,7
chr12	48468652	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr12	48516464	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	48524199	.	C	T	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,4:0.050:97:45,2:45,2:56,37,2,2
chr12	48527059	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,4:0,11:0,0,12,5
chr12	48527123	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:17,0:15,3:20,12,0,3
chr12	48528125	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,3:5,7:0,7,3,7
chr12	48531514	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:14,2:8,0:15,7,2,0
chr12	48537624	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=160.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,23:0,22:0,0,13,33
chr12	48538979	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=157.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,25:0,22:0,0,32,17
chr12	48539183	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.393:8:1,1:1,1:0,5,0,3
chr12	48543253	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:18,0:9,2:20,7,1,1
chr12	48543352	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=117,221;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:6,14,2,0
chr12	48738555	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr12	48739353	.	AA	CG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48739353_AA_CG:48739353:0,0,0,1
chr12	48739356	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48739353_AA_CG:48739353:0,0,0,1
chr12	48739358	.	AT	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48739353_AA_CG:48739353:0,0,0,1
chr12	48741219	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	48880381	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,10:0,0,17,1
chr12	48880550	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr12	48882856	.	TT	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=245,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48882856_TT_AC:48882856:0,1,0,1
chr12	48882859	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=245,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48882856_TT_AC:48882856:0,1,0,1
chr12	48884535	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr12	48888763	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	48919556	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,12:0,0,11,15
chr12	49054491	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=304,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	49063146	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=224,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:49063146_AT_A:49063146:0,1,0,1
chr12	49063150	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=224,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49063146_AT_A:49063146:0,1,0,1
chr12	49063152	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=224,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49063146_AT_A:49063146:0,1,0,1
chr12	49063154	.	GGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=224,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49063146_AT_A:49063146:0,1,0,1
chr12	49073358	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=219,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr12	49091972	.	G	A,GAA	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=28,31,33;MFRL=119,132,36;MMQ=60,60,60;MPOS=10,13;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.20,17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,11,12:0.238,0.528:27:2,4,4:0,5,5:2,2,9,14
chr12	49093729	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	49110248	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:1,2:0,5:2,0,7,0
chr12	49110481	.	G	GTCTTAACGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:4,10,0,2
chr12	49162945	.	T	TTATC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	49166155	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=122,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:14,0:5,3:13,6,1,2
chr12	49172102	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=134,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:49172102_C_G:49172102:1,13,1,1
chr12	49172109	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=136,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:6,2:0|1:49172102_C_G:49172102:0,12,1,1
chr12	49172115	.	A	ACACAG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=130,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,1:0|1:49172102_C_G:49172102:0,11,1,1
chr12	49219386	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr12	49221622	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.439:25:8,6:6,4:7,7,5,6
chr12	49231448	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=144,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:6,0:7,0:1,13,0,2
chr12	49237621	.	AC	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=180,186;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,2:7,0:11,0,2,0
chr12	49239394	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,0:14,2:8,20,0,2
chr12	49298059	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,5,1
chr12	49310724	.	GA	AG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=168,45;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:3,1,4,0
chr12	49310787	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,5:5,5:8,2,9,1
chr12	49312432	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,2,1
chr12	49312540	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,7:5,5:10,1,9,3
chr12	49318804	.	CG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=110,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.347:10:2,1:2,1:0|1:49318804_CG_C:49318804:5,2,3,0
chr12	49318809	.	CGG	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=110,172;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:1,0:5,1:0|1:49318804_CG_C:49318804:6,3,2,0
chr12	49319036	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr12	49333896	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=177,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:3,4:6,2:2,7,3,6
chr12	49362779	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,12,1
chr12	49398862	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.732:17:2,3:2,7:1,3,7,6
chr12	49416046	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.502:18:3,5:5,3:5,4,8,1
chr12	49421179	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49421179_G_C:49421179:0,0,0,1
chr12	49421201	.	ACATT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=215,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49421179_G_C:49421179:1,2,0,1
chr12	49422795	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:4,4:1,3:2,4,3,4
chr12	49424616	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:1,2,4,2
chr12	49436724	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr12	49439659	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr12	49442356	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr12	49444985	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=98,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:5,0:9,0:18,1,2,0
chr12	49445028	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=102,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,17:0.342:50:11,7:22,9:23,10,9,8
chr12	49460896	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	49494515	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=152,155;MMQ=50,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:1,1:2,1:1,7,0,2
chr12	49497643	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr12	49498130	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	49498751	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	49500398	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,5:0,3:0,0,9,1
chr12	49521672	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,32:0.550:58:12,19:14,13:26,0,31,1
chr12	49522745	.	A	G	.	.	DP=91;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=134.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,44:0.556:79:12,17:23,27:3,32,4,40
chr12	49522786	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.482:48:9,13:15,10:1,24,0,23
chr12	49523194	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,2:14,0:16,15,2,0
chr12	49523523	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,3:6,5:0,9,0,8
chr12	49579627	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=173,191;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,9:0.217:44:12,2:22,5:0|1:49579627_C_T:49579627:26,9,5,4
chr12	49579639	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=157,179;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,12:0.245:51:15,4:24,8:0|1:49579627_C_T:49579627:29,10,8,4
chr12	49582819	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:8,8:8,7:7,9,5,10
chr12	49689597	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	49690337	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:0,6,2,3
chr12	49691567	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:2,3,0,3
chr12	49718118	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=161,269;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49718118_CA_C:49718118:0,1,0,1
chr12	49718121	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=161,269;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49718118_CA_C:49718118:0,1,0,1
chr12	49720600	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr12	49721122	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.363:22:6,6:7,0:6,8,2,6
chr12	49723581	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:8,1:5,2:14,0,3,1
chr12	49724755	.	A	AGCATGAGATTGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	49724955	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr12	49742649	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=95,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:5,2:6,1:5,7,3,0
chr12	49883371	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr12	49893815	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.867:12:0,6:1,3:1,0,10,1
chr12	49916459	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:9,1,6,1
chr12	49933109	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	49937317	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	49948180	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=202,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:49948180_C_G:49948180:3,1,0,1
chr12	49948182	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=202,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:49948180_C_G:49948180:3,1,0,1
chr12	49948197	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:3,1,0,2
chr12	49993156	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	50027910	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:2,10,1,1
chr12	50030506	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=153,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,2:14,0:0|1:50030506_C_T:50030506:15,12,2,0
chr12	50030515	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=148,80;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:10,3:14,0:0|1:50030506_C_T:50030506:13,11,2,1
chr12	50040811	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.831:7:0,1:1,5:0,1,0,6
chr12	50041243	.	G	GGTCAGAAGGCTAGAGGAGATGAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	50042235	.	GCT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	50043209	.	G	GAACGTCTTTTTTTCACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:50043209_G_GAACGTCTTTTTTTCACA:50043209:2,1,0,1
chr12	50043211	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,30;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.338:4:0,1:1,0:0|1:50043209_G_GAACGTCTTTTTTTCACA:50043209:2,1,0,1
chr12	50045326	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr12	50152601	.	CT	C,CTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,20,33;MFRL=194,141,182;MMQ=60,60,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.30,4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.269,0.364:8:1,1,3:2,1,0:0,3,1,4
chr12	50155400	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr12	50155434	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,1:5,4:3,4,3,2
chr12	50187579	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:4,4:3,4:1,7,1,7
chr12	50189807	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,3,0
chr12	50189834	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr12	50197690	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	50197880	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=208,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr12	50232422	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:6,2:16,0:11,12,1,1
chr12	50264267	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=154,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,2:10,0:16,1,1,1
chr12	50290728	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr12	50291735	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.725:20:2,5:3,8:4,1,12,3
chr12	50297670	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr12	50349090	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr12	50349123	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.940:15:0,7:0,4:0,0,15,0
chr12	50349143	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,6:0,0,14,0
chr12	50349411	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	50356156	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:50356156_T_G:50356156:0,2,0,1
chr12	50356165	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:50356156_T_G:50356156:0,2,0,1
chr12	50356174	.	TGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50356156_T_G:50356156:0,1,0,1
chr12	50368013	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	50386015	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0,0,20,6
chr12	50393372	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr12	50400144	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:10,0,3,0
chr12	50452529	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:7,2,0,2
chr12	50473660	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,12:0,0,13,6
chr12	50473910	.	G	GATATACAAATATCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=127,99;MMQ=57,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr12	50473929	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=40,32;MFRL=127,127;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.648:2:1,1:0,0:0|1:50473929_G_GT:50473929:0,1,0,1
chr12	50473931	.	G	GTGACGAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=127,127;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.648:2:0,1:0,0:0|1:50473929_G_GT:50473929:0,1,0,1
chr12	50473934	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,127;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50473929_G_GT:50473929:0,0,0,1
chr12	50473936	.	C	CTGGCCAGGCTGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50473929_G_GT:50473929:0,0,0,1
chr12	50475311	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=126,31;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:10,0:2,2:7,6,1,1
chr12	50482211	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:3,0,7,0
chr12	50483608	.	T	TACCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.251:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr12	50484013	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,8:1,2:5,1,7,3
chr12	50499506	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,10;MFRL=117,106;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:50499506_T_C:50499506:1,1,0,1
chr12	50499509	.	G	GCCTATGAAAGTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=117,106;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50499506_T_C:50499506:1,1,0,1
chr12	50499511	.	C	CAGAAAGGTGGTTATGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=117,106;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50499506_T_C:50499506:1,1,0,1
chr12	50501886	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:15,0:11,3:11,16,1,2
chr12	50529936	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr12	50535722	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,197;MMQ=40,47;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=19,13;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.248:6:2,0:3,1:5,0,1,0
chr12	50535955	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,4:4,4:0,8,0,8
chr12	50599709	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:6,0,7,0
chr12	50616346	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr12	50616369	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=197,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr12	50627900	.	C	G	.	.	DP=131;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,15:0.127:124:52,7:56,8:72,37,12,3
chr12	50627994	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,35,33,32;MFRL=150,164,182,156;MMQ=60,41,40,52;MPOS=19,13,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.15,7.97,20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,2,5,11:0.087,0.176,0.372:29:5,1,2,5:3,1,2,5:1,10,1,17
chr12	50642314	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr12	50744094	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr12	50744119	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:6,6:5,4:7,4,6,4
chr12	50744171	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.331:24:9,4:7,2:10,6,4,4
chr12	50746348	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,46;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,12:0,20:0,0,23,14
chr12	50747711	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=107,61;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,2:0.039:74:39,0:31,2:29,43,0,2
chr12	50750040	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr12	50754461	.	GAA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	50824232	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=112,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:4,2,2,1
chr12	50829263	.	T	TTATTC	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=182.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,16:0,19:0,0,38,5
chr12	50834374	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:21,0:22,4:2,42,0,4
chr12	50855195	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	50856326	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50856326_C_CG:50856326:0,0,1,0
chr12	50856327	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50856326_C_CG:50856326:0,0,1,0
chr12	50856330	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:50856326_C_CG:50856326:0,1,1,0
chr12	50856335	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:50856326_C_CG:50856326:0,2,1,0
chr12	50856340	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=91,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:50856326_C_CG:50856326:2,2,1,0
chr12	50899023	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	51034721	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr12	51053889	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	51076844	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	51088979	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=193,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:1,2:3,2:5,0,3,1
chr12	51089572	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr12	51089616	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=109.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,15:0,0,26,7
chr12	51100445	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:12,2:10,1:1,21,0,3
chr12	51128832	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:11,6:9,13:17,5,13,7
chr12	51135167	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr12	51138687	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=209,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr12	51203226	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,10,5
chr12	51203371	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:1,5:6,1:1,6,0,6
chr12	51203376	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:1,3:4,1:0,5,0,6
chr12	51319346	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr12	51323641	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr12	51382232	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr12	51386530	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=115,151;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.919:10:0,3:0,6:1,0,3,6
chr12	51392897	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:2,2:5,0,2,0
chr12	51399050	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr12	51461425	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,5:0,0,13,1
chr12	51461793	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr12	51467596	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr12	51493638	.	TTCTA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=149,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51493638_TTCTA_T:51493638:0,1,0,1
chr12	51493645	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=149,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51493638_TTCTA_T:51493638:0,1,0,1
chr12	51493647	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=149,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51493638_TTCTA_T:51493638:0,1,0,1
chr12	51504661	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:15,2,1,1
chr12	51504799	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr12	51512637	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	51584443	.	T	TCCTTCACCCCCCAGGCCATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=285,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	51585304	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr12	51585335	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:6,1:0,1:4,2,2,0
chr12	51585599	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0|1:51585599_T_G:51585599:0,5,1,2
chr12	51585601	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=159,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,0:2,3:0|1:51585599_T_G:51585599:0,5,1,2
chr12	51681846	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr12	51692878	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=11,33;MFRL=223,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr12	51693357	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=139,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,2,1
chr12	51722311	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr12	51735022	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,14:0,18:0,0,20,15
chr12	51737675	.	T	TGCAGGTGTGTGTGTTGTGTAGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr12	51748326	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr12	51749502	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=236,148;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,0:0|1:51749502_C_T:51749502:6,0,2,0
chr12	51749509	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=224,142;MMQ=60,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:5,2:2,1:0|1:51749502_C_T:51749502:7,0,3,0
chr12	51752897	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr12	51759305	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:6,4:3,5:3,6,6,4
chr12	51846090	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=149,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,3:0,7,0,5
chr12	51846115	.	G	GAGGAAAAATAGTGCTTTGTCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.315:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr12	51851126	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr12	51852511	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=92,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,7:0,1,0,11
chr12	51863643	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:6,6:0,10,0,8
chr12	51888998	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=205,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr12	51890721	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=188,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr12	51890747	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:3,2:10,1:11,3,3,0
chr12	52094924	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:10,0:18,6,2,0
chr12	52099153	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr12	52100566	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	52156255	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,4:0,0,6,1
chr12	52159424	.	ATTTTTTTGTTTGGGTT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=81,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,1:0,0:1,2,1,0
chr12	52159438	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr12	52162895	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=103,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:1,2,2,3
chr12	52163789	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,2,7
chr12	52180534	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,2:3,0:2,12,2,0
chr12	52180632	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=113,146;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.315:4:2,1:1,0:0|1:52180632_G_GT:52180632:0,3,0,1
chr12	52180639	.	C	CATAAGCCAATGAGA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=36,35;MFRL=113,146;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52180632_G_GT:52180632:0,3,0,1
chr12	52180642	.	T	TCAC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=113,146;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52180632_G_GT:52180632:0,3,0,1
chr12	52180643	.	T	TGAA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=113,146;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52180632_G_GT:52180632:0,3,0,1
chr12	52180650	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=91,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52180650_A_C:52180650:0,2,0,1
chr12	52180651	.	ATTC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,29;MFRL=91,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52180650_A_C:52180650:0,2,0,1
chr12	52180657	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,25;MFRL=91,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52180650_A_C:52180650:0,2,0,1
chr12	52184271	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,16:0,5:0,0,12,9
chr12	52200028	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,14:0,5:0,0,16,3
chr12	52200378	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=130,159;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,2:9,0:0|1:52200378_C_A:52200378:10,16,2,0
chr12	52200380	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=130,159;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:17,2:8,0:0|1:52200378_C_A:52200378:10,16,2,0
chr12	52201001	.	G	GAGCGCTTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,2:6,1:3,15,1,2
chr12	52215664	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	52281920	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:5,1,4,0
chr12	52283302	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.462:15:4,2:3,3:0,8,2,5
chr12	52285209	.	C	CTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TA;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	52307145	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr12	52345465	.	GGC	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=156,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GC;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:7,0:9,2:20,0,2,0
chr12	52345497	.	TGCG	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCG;STR;TLOD=119.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.973:32:0,15:0,15:0,0,26,6
chr12	52369300	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,4:3,2:6,4,2,4
chr12	52404618	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:2,3,6,0
chr12	52566808	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=173,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,0:9,1,1,1
chr12	52574780	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=73,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:6,5:2,1:0|1:52574780_A_G:52574780:3,5,1,5
chr12	52574797	.	C	CCATTTTCAGTCAGATTGTCTTCCTAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,3:0.304:11:5,3:2,0:1|0:52574780_A_G:52574780:1,7,2,1
chr12	52627007	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:0,5:4,4:4,0,8,1
chr12	52627215	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr12	52631394	.	C	CAT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=78.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.956:21:0,11:0,9:0|1:52631394_C_CAT:52631394:0,0,3,18
chr12	52631409	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:6,4:3,1:0|1:52631394_C_CAT:52631394:0,9,0,5
chr12	52635241	.	G	A,C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,185,130;MMQ=60,60,60;MPOS=18,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.85,41.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,13:0.340,0.617:20:0,3,5:0,3,8:0,0,14,6
chr12	52635443	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,0,14
chr12	52679937	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0,0,9,1
chr12	52680008	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=95.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,16:0,0,24,4
chr12	52680671	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,1:2,0:0|1:52680671_G_A:52680671:0,3,0,1
chr12	52680673	.	T	TAAGAATCAC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:52680671_G_A:52680671:0,3,0,1
chr12	52680676	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:52680671_G_A:52680671:0,3,0,1
chr12	52680680	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:52680671_G_A:52680671:0,3,0,1
chr12	52680681	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:52680671_G_A:52680671:0,3,0,1
chr12	52680685	.	GTC	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=163,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52680671_G_A:52680671:0,2,0,1
chr12	52680690	.	CAACT	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,27;MFRL=163,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:52680671_G_A:52680671:1,2,0,1
chr12	52680697	.	TCAATTAAGAACAGA	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=180,120;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:0,1:1,0:0|1:52680671_G_A:52680671:3,0,0,1
chr12	52681282	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=93,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr12	52681533	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,4,18
chr12	52681714	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr12	52681733	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr12	52681968	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr12	52699213	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:5,3:8,11:2,11,3,11
chr12	52700100	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,1,26
chr12	52702247	.	C	CAAAGCCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=172,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:4,0:1,8,1,1
chr12	52708978	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr12	52709032	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr12	52710198	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:8,0,5,0
chr12	52710246	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:8,1:11,8:15,4,6,3
chr12	52711375	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,4,0
chr12	52711416	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr12	52711450	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr12	52711624	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,3:4,5:2,3,3,5
chr12	52711776	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=101,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:3,3,0,4
chr12	52712898	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:17,7:4,7:19,2,11,3
chr12	52713199	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr12	52754863	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr12	52755189	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=110,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:3,2,6,1
chr12	52760732	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.629:36:9,12:4,9:13,0,23,0
chr12	52772085	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=166,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0|1:52772085_G_GA:52772085:1,3,1,1
chr12	52772090	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=166,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:3,0:0|1:52772085_G_GA:52772085:1,3,1,1
chr12	52773774	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=131,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	52774370	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=208,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:2,4:1,3,0,5
chr12	52774403	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=201,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:52774403_G_GC:52774403:0,2,0,1
chr12	52774405	.	G	GCGCGAGTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=201,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:52774403_G_GC:52774403:0,2,0,1
chr12	52774993	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:4,4:6,2:3,8,1,5
chr12	52775034	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:2,4,1,5
chr12	52775062	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,3:6,4:6,4,1,6
chr12	52775395	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=199,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr12	52776679	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,12,0
chr12	52776895	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:0,5,1,7
chr12	52777578	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:52777578_C_T:52777578:4,6,1,1
chr12	52777580	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:52777578_C_T:52777578:4,6,1,1
chr12	52777606	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=72,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:2,5,0,2
chr12	52778772	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,21,0
chr12	52779391	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.351:9:4,0:1,1:0,6,0,3
chr12	52788928	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,3:3,3:3,2,5,2
chr12	52789691	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:0,1:0|1:52789691_A_C:52789691:3,0,0,3
chr12	52789693	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:52789691_A_C:52789691:3,0,0,3
chr12	52790664	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:5,0:5,2:7,4,2,0
chr12	52795001	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,0,2
chr12	52797617	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,4,0
chr12	52824302	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:8,5:4,8:11,1,11,2
chr12	52824562	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr12	52827534	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,1:8,3:10,1,4,0
chr12	52827740	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.471:49:12,8:14,15:9,17,6,17
chr12	52843666	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,164;MMQ=50,34;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,2:11,4:7,13,3,3
chr12	52845801	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,177;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:13,5:6,4:15,5,7,2
chr12	52845952	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,4:3,6:0,9,0,10
chr12	52862770	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,5:4,5:10,1,10,1
chr12	52863091	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,1:9,3:7,5,3,1
chr12	52863160	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=155,146;MMQ=56,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:2,4:9,7:8,4,9,2
chr12	52865592	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,155;MMQ=55,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,4:5,1:0,8,0,5
chr12	52865837	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,154;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:7,1,6,0
chr12	52866145	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,163;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,2:5,6:0,7,0,8
chr12	52866930	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,155;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,7:4,0:8,1,6,1
chr12	52867375	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,191;MMQ=25,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,1:6,2:9,4,4,0
chr12	52881428	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,6:5,5:7,0,10,1
chr12	52882094	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:2,7:3,7:5,0,13,1
chr12	52882292	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,207;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,11:0.236:49:20,6:17,5:18,20,5,6
chr12	52882410	.	T	TGAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAA;STR;TLOD=61.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,10:0,4:0,0,0,14
chr12	52883888	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=207,190;MMQ=40,26;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:2,2,1,1
chr12	52883947	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=173,240;MMQ=33,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr12	52884283	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=211,154;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr12	52884557	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=175,196;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,5:5,4:3,10,2,7
chr12	52886424	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,136;MMQ=50,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.444:41:8,12:14,6:17,6,13,5
chr12	52938535	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr12	52939407	.	AGAG	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=66.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:5,9:9,8:3,11,3,14
chr12	52939994	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=214,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr12	52940224	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:12,0:10,3:4,18,2,1
chr12	52941784	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:2,4:1,4:0,3,1,7
chr12	52942998	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr12	52943144	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=186,143;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:1,3,0,6
chr12	52943155	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr12	52944060	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr12	52960993	.	C	CACACCTGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52960993_C_CACACCTGT:52960993:0,3,0,1
chr12	52960996	.	T	TCCCAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52960993_C_CACACCTGT:52960993:0,3,0,1
chr12	52960999	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52960993_C_CACACCTGT:52960993:0,3,0,1
chr12	52964417	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:6,2,6,1
chr12	52964704	.	C	CCACACTTTTAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52964704_C_CCACACTTTTAA:52964704:0,3,0,1
chr12	52964707	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52964704_C_CCACACTTTTAA:52964704:0,3,0,1
chr12	52964718	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	52966137	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=177,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr12	52966144	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr12	52966368	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=154,136;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,16:0.515:31:8,6:7,10:0|1:52966368_C_T:52966368:7,8,6,10
chr12	52966390	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,15:0.457:33:11,5:6,9:0|1:52966368_C_T:52966368:9,9,4,11
chr12	52979741	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.695:21:5,6:1,8:3,3,9,6
chr12	52984593	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=52,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:0,4:3,2,5,1
chr12	52992881	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:10,2:8,0:5,14,0,2
chr12	52992995	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=207,275;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr12	53011768	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:4,0,1,0
chr12	53043636	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,1:4,5:4,0,5,1
chr12	53043665	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=121,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:3,1:7,1:10,3,3,0
chr12	53045623	.	A	AGCC	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=101,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,15:0.387:39:12,5:9,7:0|1:53045623_A_AGCC:53045623:14,10,7,8
chr12	53045626	.	T	TGCCGCCTCCAAAGCC	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=101,133;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,21:0.467:45:14,8:10,7:0|1:53045623_A_AGCC:53045623:14,10,9,12
chr12	53071338	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr12	53071382	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=128,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,7:3,4:4,4,9,2
chr12	53073471	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:8,0,6,1
chr12	53084872	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:3,4:2,5:5,0,9,1
chr12	53089460	.	GACCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr12	53096913	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	53165621	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:5,6:3,5:6,3,7,4
chr12	53165865	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,4:4,6:9,0,9,1
chr12	53167313	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	53184491	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=179,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr12	53185184	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=125,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:2,7,1,1
chr12	53188209	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	53189130	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,9354;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:14,0,2,0
chr12	53201413	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr12	53202380	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr12	53207321	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr12	53207583	.	C	CCACCAAAGCCACCAGTGCCGAAACCAGCTCCGAAGCCGCCGG	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,111;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=190.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,44:0.979:52:2,14:2,7:3,5,30,14
chr12	53217056	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,2:7,3:1,7,0,5
chr12	53295058	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.581:12:3,3:0,3:0|1:53295058_G_C:53295058:0,5,2,5
chr12	53295063	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:1,4:1,3:0|1:53295058_G_C:53295058:0,4,2,5
chr12	53295079	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=237,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.666:7:0,2:2,3:0|1:53295079_G_A:53295079:0,2,1,4
chr12	53295081	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=237,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.666:7:0,2:2,2:0|1:53295079_G_A:53295079:0,2,1,4
chr12	53295109	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=287,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr12	53295551	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr12	53298835	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	53400178	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr12	53416251	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=140.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,21:0,22:0,0,27,16
chr12	53421507	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr12	53421571	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:15,2:22,0:25,12,2,0
chr12	53421746	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr12	53432088	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,18,2
chr12	53432936	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr12	53433486	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,17,17
chr12	53434105	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,190;MMQ=25,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr12	53449735	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=239,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr12	53451547	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:0|1:53451547_G_T:53451547:9,5,2,0
chr12	53451548	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.166:16:8,2:4,0:1|0:53451547_G_T:53451547:9,5,2,0
chr12	53452263	.	CCAGGTGGCAGG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAGGTGGCAGG;STR;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:1,3:1,3:4,2,2,4
chr12	53455713	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=206,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0,5,2,4
chr12	53457269	.	AG	CC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=169,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:5,2:3,2:0|1:53457269_AG_CC:53457269:0,8,5,0
chr12	53457275	.	AG	CC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,2:3,3:0|1:53457269_AG_CC:53457269:0,9,5,0
chr12	53457281	.	GG	CC	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:6,1:4,3:0|1:53457269_AG_CC:53457269:1,9,5,0
chr12	53457287	.	GG	CC	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:6,1:4,1:0|1:53457269_AG_CC:53457269:4,7,3,0
chr12	53468333	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:5,0,3,0
chr12	53473001	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,14;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.442:7:2,0:1,1:0|1:53473001_T_A:53473001:4,0,3,0
chr12	53473008	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.397:8:2,0:1,1:0|1:53473001_T_A:53473001:5,0,3,0
chr12	53473017	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:5,0:0,0:0|1:53473001_T_A:53473001:8,0,3,0
chr12	53509829	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=146,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:15,2:6,1:17,5,1,2
chr12	53515254	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:53515254_C_T:53515254:0,4,0,1
chr12	53515256	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:53515254_C_T:53515254:0,4,0,1
chr12	53515259	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:53515254_C_T:53515254:0,4,0,1
chr12	53517552	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,5:6,6:5,3,7,4
chr12	53554036	.	ACATCGTAGAACTTGTCCTGCTGGAAAAGGTAGCTGGCCTGGGAC	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=154,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.115:27:9,2:8,0:0|1:53554036_ACATCGTAGAACTTGTCCTGCTGGAAAAGGTAGCTGGCCTGGGAC_A:53554036:10,13,3,1
chr12	53554083	.	ATGGCAGCGCTTGAGCAGGTTCTGTGTGGGGGTGAGGAGATTGTCAGACCCTACCC	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=154,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,2:7,0:0|1:53554036_ACATCGTAGAACTTGTCCTGCTGGAAAAGGTAGCTGGCCTGGGAC_A:53554036:9,14,1,1
chr12	53565653	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,3:3,1:5,0,4,1
chr12	53566251	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=117,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:5,6,2,0
chr12	53608029	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=142,216;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:12,3:5,0:0|1:53608029_G_A:53608029:10,8,0,3
chr12	53608038	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=125,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:13,3:8,0:0|1:53608029_G_A:53608029:9,12,0,3
chr12	53613822	.	G	C	.	.	DP=93;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,9:0.093:91:40,1:28,3:0|1:53613822_G_C:53613822:35,47,9,0
chr12	53613832	.	G	C	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,7:0.070:98:41,0:43,1:0|1:53613822_G_C:53613822:36,55,7,0
chr12	53662735	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:3,1:0,1:2,1,3,0
chr12	53664148	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.709:19:2,9:3,2:5,0,11,3
chr12	53670711	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr12	53671549	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:6,3:3,7:7,2,9,1
chr12	53673424	.	T	TTGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:0|1:53673424_T_TTGG:53673424:1,0,4,0
chr12	53673425	.	A	ACCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:0|1:53673424_T_TTGG:53673424:1,0,4,0
chr12	53673615	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=179,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:0|1:53673615_C_CT:53673615:0,5,1,1
chr12	53673617	.	C	CCA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=179,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:0|1:53673615_C_CT:53673615:0,5,1,1
chr12	53673619	.	T	TGC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=179,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:0|1:53673615_C_CT:53673615:0,5,1,1
chr12	53676814	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr12	53677072	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,13,7
chr12	53677089	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,16,9
chr12	53682169	.	T	TTTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=186,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53682169_T_TTTAC:53682169:0,1,0,1
chr12	53682171	.	G	GAGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=186,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53682169_T_TTTAC:53682169:0,1,0,1
chr12	53682267	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:5,1,4,0
chr12	53684619	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:7,8:8,3:9,6,6,6
chr12	53684852	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=180,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:53684852_CA_TG:53684852:0,6,0,2
chr12	53684858	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=180,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:53684852_CA_TG:53684852:0,6,0,2
chr12	53690169	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:53690169_C_CT:53690169:0,3,0,1
chr12	53690175	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:53690169_C_CT:53690169:0,3,0,1
chr12	53690177	.	TT	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:53690169_C_CT:53690169:0,3,0,1
chr12	53690188	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	53691962	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,7:0,0,3,8
chr12	53692955	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,4:0,0,8,0
chr12	53693532	.	AA	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,11:0,4:0,0,14,2
chr12	53702371	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,2,5
chr12	53708011	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,17,1
chr12	53714290	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,11,3
chr12	53714496	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr12	53714509	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr12	53819752	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53819752_A_C:53819752:0,1,0,1
chr12	53819755	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53819752_A_C:53819752:0,1,0,1
chr12	53819757	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53819752_A_C:53819752:0,1,0,1
chr12	53823135	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	53823168	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=203,187;MMQ=48,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53823168_G_T:53823168:1,0,1,0
chr12	53823171	.	GA	AT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=182,187;MMQ=54,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:53823168_G_T:53823168:2,0,1,0
chr12	53823183	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=175,187;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:53823168_G_T:53823168:2,0,1,0
chr12	53839822	.	T	TCCCTCTCCC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=167,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:9,2:4,0:4,10,1,1
chr12	53861636	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.375:21:4,3:9,5:1,12,2,6
chr12	53862701	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr12	53876164	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=145,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53876164_G_GA:53876164:1,0,0,1
chr12	53876173	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53876164_G_GA:53876164:0,0,0,1
chr12	53877562	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,7,12
chr12	53926423	.	GAA	G,GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,27,25;MFRL=144,156,188;MMQ=60,60,60;MPOS=28,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.93,3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.249,0.252:9:0,0,0:1,1,1:0,5,0,4
chr12	54066244	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=214,183;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54066244_G_A:54066244:1,0,1,0
chr12	54066252	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=214,183;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54066244_G_A:54066244:1,0,1,0
chr12	54109927	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	54117592	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:2,1:2,4,0,3
chr12	54339052	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:2,2,0,4
chr12	54349142	.	GGGCGGCGGCGGTGGCGAC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	54350412	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,3:3,0:0,5,0,4
chr12	54367765	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54367765_G_T:54367765:0,0,0,1
chr12	54367767	.	CGAGAG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54367765_G_T:54367765:0,0,0,1
chr12	54367779	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54367765_G_T:54367765:0,0,0,1
chr12	54367781	.	AGG	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54367765_G_T:54367765:0,0,0,1
chr12	54428371	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=327,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr12	54448167	.	TCC	GGG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=113,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.305:27:12,0:6,4:2,17,8,0
chr12	54448575	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,7:2,3:5,0,10,0
chr12	54449007	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=145,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.114:31:14,0:13,0:0|1:54449007_T_C:54449007:1,27,3,0
chr12	54449008	.	G	GGC	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=145,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.115:31:12,1:12,0:0|1:54449007_T_C:54449007:1,27,3,0
chr12	54449014	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=138,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:13,2:0|1:54449007_T_C:54449007:1,25,2,0
chr12	54575800	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,6:2,2:6,0,7,1
chr12	54577787	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54577787_A_T:54577787:0,0,0,1
chr12	54577788	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54577787_A_T:54577787:0,0,0,1
chr12	54577790	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54577787_A_T:54577787:0,0,0,1
chr12	54646042	.	A	ATAGTCTTATGGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	54651471	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.751:21:3,4:1,12:1,4,1,15
chr12	54676165	.	GT	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:15,2:15,1:11,21,2,1
chr12	54676874	.	G	GT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:21,0:19,2:23,19,1,2
chr12	54677980	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.405:40:14,9:10,7:17,7,14,2
chr12	54686187	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=140,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,1:9,1:12,4,1,1
chr12	54687232	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=211,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr12	54764370	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=185,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,0:1,6,2,0
chr12	54764618	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	54764962	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	54767981	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr12	54802090	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	54805753	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=110,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:0|1:54805753_G_T:54805753:0,4,1,4
chr12	54805765	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=110,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:0|1:54805753_G_T:54805753:0,4,1,3
chr12	54812703	.	CGCG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:2,0:3,1:2,3,3,0
chr12	54893343	.	G	GAAGGACTAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=216,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr12	54893347	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=201,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	54910837	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr12	54911768	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:0,6,0,8
chr12	54920566	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:6,6:1,5:4,4,3,8
chr12	54920591	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr12	54925871	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	54932788	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr12	54960941	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:54960941_CAA_C:54960941:0,0,0,1
chr12	54960947	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:54960941_CAA_C:54960941:0,0,0,1
chr12	54963506	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr12	54963508	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr12	54976681	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54976681_CCT_C:54976681:0,1,0,1
chr12	54976685	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54976681_CCT_C:54976681:0,1,0,1
chr12	54977925	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr12	55249002	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,4:4,1:3,8,0,5
chr12	55250549	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=123,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:5,8:4,11:6,3,15,4
chr12	55354876	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr12	55356258	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:2,3:9,2:5,6,5,0
chr12	55356419	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.431:26:8,7:6,4:10,5,7,4
chr12	55367178	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=91.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,21:0,5:0,0,23,3
chr12	55368368	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr12	55368441	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	55422672	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=192,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.817:14:2,8:0,4:1,1,9,3
chr12	55422966	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:4,2:6,1:4,6,0,3
chr12	55423843	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=272,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55423843_C_G:55423843:0,1,0,1
chr12	55423844	.	ACTC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=272,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55423843_C_G:55423843:0,1,0,1
chr12	55423848	.	T	TGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=272,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55423843_C_G:55423843:0,1,0,1
chr12	55523667	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=73,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:7,0:10,2:0|1:55523667_CT_C:55523667:10,9,0,2
chr12	55523671	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=73,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:0|1:55523667_CT_C:55523667:11,9,0,2
chr12	55524400	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=144,46;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,0:13,2:0|1:55524400_T_A:55524400:8,10,1,1
chr12	55524406	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=148,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:13,2:0|1:55524400_T_A:55524400:7,10,1,1
chr12	55524409	.	CTCCTGACAG	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=144,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:3,0:11,2:0|1:55524400_T_A:55524400:7,13,1,1
chr12	55524424	.	CT	AA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=151,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:55524400_T_A:55524400:5,11,1,1
chr12	55725479	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,1:11,1:17,7,2,0
chr12	55758832	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	55794264	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr12	55820958	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,18;MFRL=201,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:3,0:0,0:0,3,0,3
chr12	55944926	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr12	55945119	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,13,13
chr12	56076064	.	TGG	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=206,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:2,0:0|1:56076064_TGG_T:56076064:4,3,1,1
chr12	56076068	.	G	GTATCT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=206,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:56076064_TGG_T:56076064:4,3,1,1
chr12	56076071	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=182,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:0|1:56076064_TGG_T:56076064:3,3,1,1
chr12	56076078	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=182,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:56076064_TGG_T:56076064:0,4,0,1
chr12	56086849	.	C	CACTTGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=60,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr12	56086906	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,1:3,0:0|1:56086906_A_C:56086906:2,4,2,0
chr12	56086912	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,0:3,0:0|1:56086906_A_C:56086906:4,4,2,0
chr12	56086915	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,11;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:4,0:4,0:0|1:56086906_A_C:56086906:4,4,2,0
chr12	56086918	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:4,0:0|1:56086906_A_C:56086906:4,4,2,0
chr12	56088647	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,85;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,2:2,0:2,6,2,0
chr12	56090307	.	A	ATACCTTTTTCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	56091108	.	A	AGGTTCCCCGTGTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,0:4,2:2,6,1,1
chr12	56091415	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:2,0:3,1:4,1,0,1
chr12	56091709	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,67;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,0:11,3:11,9,2,1
chr12	56095302	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=195,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:3,0:0,2:0|1:56095302_A_T:56095302:0,4,0,2
chr12	56095307	.	T	TTAGAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=196,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:56095302_A_T:56095302:0,3,0,1
chr12	56095308	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=166,243;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1|0:56095302_A_T:56095302:0,2,0,1
chr12	56095310	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=166,243;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:0,0:1|0:56095302_A_T:56095302:0,2,0,1
chr12	56115778	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr12	56117570	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	56120096	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=177,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,2,1
chr12	56120118	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=25,22;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:56120118_CTTT_C:56120118:0,0,0,1
chr12	56120143	.	T	TAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56120118_CTTT_C:56120118:0,0,0,1
chr12	56213978	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.396:10:4,4:2,0:5,1,3,1
chr12	56220974	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,34,35;MFRL=95,174,241;MMQ=50,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.26,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.422,0.251:5:0,2,0:0,0,1:1,1,3,0
chr12	56236043	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,12,0
chr12	56236318	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr12	56335107	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:5,4:8,9:5,8,8,5
chr12	56345643	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56345643_G_A:56345643:0,1,0,1
chr12	56345646	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56345643_G_A:56345643:0,0,0,1
chr12	56346057	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:8,3:2,0:8,2,3,0
chr12	56380950	.	GT	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.285:24:9,5:6,2:3,14,1,6
chr12	56381006	.	G	GTGATCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=168,149;MMQ=60,50;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:8,3:1,0:0,9,0,3
chr12	56384687	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr12	56386000	.	G	GTAGGGAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=106,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,2:7,0:5,10,0,2
chr12	56398454	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,11:0,0,5,12
chr12	56417403	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=102.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,15:0,0,25,5
chr12	56426577	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr12	56428344	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr12	56436346	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:56436346_C_A:56436346:0,0,0,1
chr12	56436347	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=252,190;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:56436346_C_A:56436346:0,1,0,1
chr12	56437362	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=73,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:56437362_A_AT:56437362:0,2,0,1
chr12	56437365	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=73,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:56437362_A_AT:56437362:0,2,0,1
chr12	56437368	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=73,223;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:56437362_A_AT:56437362:0,2,0,1
chr12	56437376	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=73,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:56437362_A_AT:56437362:0,2,0,1
chr12	56477694	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:5,5:3,5:3,5,2,9
chr12	56487717	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr12	56492195	.	CAA	C,CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35,34;MFRL=179,138,125;MMQ=60,60,50;MPOS=26,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.57,4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,2:0.214,0.216:11:2,0,1:5,2,1:6,1,4,0
chr12	56492739	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=66,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:0,2:2,0:1,3,0,3
chr12	56493332	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=191,101;MMQ=53,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:56493332_CTT_C:56493332:2,0,1,0
chr12	56493337	.	CCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=191,101;MMQ=53,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:56493332_CTT_C:56493332:2,0,1,0
chr12	56493371	.	CCG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CG;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:3,0,1,0
chr12	56493822	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.476:11:1,3:3,2:3,3,1,4
chr12	56503156	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,2:3,1:0,11,0,3
chr12	56504143	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.446:20:3,3:7,6:11,0,9,0
chr12	56532015	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=168,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,0:8,4:11,7,1,3
chr12	56532282	.	C	CTCGAGGGCTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	56547612	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,14;MFRL=136,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:1,0:2,0:5,0,1,0
chr12	56551339	.	C	CAAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=A;STR;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.490:26:6,3:6,8:0,13,5,8
chr12	56552259	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=151,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:0,0:0,1,1,1
chr12	56552621	.	T	TCTGAAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56552621_T_TCTGAAAA:56552621:0,0,0,1
chr12	56552623	.	T	TGTGTCCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56552621_T_TCTGAAAA:56552621:0,0,0,1
chr12	56564056	.	CTTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr12	56565392	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	56575742	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,14,3
chr12	56607910	.	CAAACATACACTCATTGCCAAGA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	56624957	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr12	56625045	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,4:0,0,10,6
chr12	56628834	.	G	GTTGCTTTACGAGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	56629276	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr12	56639411	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56639411_G_T:56639411:0,0,0,1
chr12	56639414	.	A	ATTAGGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56639411_G_T:56639411:0,0,0,1
chr12	56647013	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=190,272;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,1:5,0:6,0,0,2
chr12	56650742	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,19,4
chr12	56711929	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,168;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:10,0,2,0
chr12	56713533	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:5,15,0,2
chr12	56717466	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr12	56726518	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr12	56726885	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:14,1:8,2:10,13,1,2
chr12	56742710	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,5,0
chr12	56742944	.	T	TCTTTC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:6,0:0|1:56742944_T_TCTTTC:56742944:8,5,1,1
chr12	56742945	.	A	AATCACTCT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=145,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:6,0:0|1:56742944_T_TCTTTC:56742944:8,5,1,1
chr12	56812228	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	56814563	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.517:21:3,6:7,4:7,3,5,6
chr12	56814570	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,3:3,7:4,6,7,3
chr12	56814653	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:4,5,2,1
chr12	56815281	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:5,5:2,2:2,6,2,5
chr12	56816595	.	CTA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:2,2:0,0:0|1:56816595_CTA_C:56816595:1,2,4,0
chr12	56816603	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.335:13:2,2:1,0:0|1:56816595_CTA_C:56816595:6,3,4,0
chr12	56816607	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=139,13207824;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:56816595_CTA_C:56816595:6,3,2,0
chr12	56816814	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	56816978	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr12	56818922	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr12	56818982	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	56821998	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=102,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:4,4:5,1:7,3,4,1
chr12	56822641	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr12	56822937	.	TTC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56822937_TTC_T:56822937:0,0,0,1
chr12	56822945	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56822937_TTC_T:56822937:0,0,0,1
chr12	56824163	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	56826060	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:56826060_A_AT:56826060:3,0,0,1
chr12	56826061	.	G	A,GGGCTGCACCACACACTCACCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32,34;MFRL=0,196,75;MMQ=60,60,60;MPOS=13,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.08,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,1:0.571,0.286:4:0,1,1:0,2,0:0,0,3,1
chr12	56826063	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:56826060_A_AT:56826060:3,0,0,1
chr12	56826715	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,178;MMQ=40,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr12	56827974	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,9:0,0,11,8
chr12	56844970	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr12	56845296	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:56845296_T_C:56845296:0,0,0,12
chr12	56845303	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:56845296_T_C:56845296:0,0,0,10
chr12	56863431	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=219,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:56863431_T_C:56863431:0,1,0,1
chr12	56863437	.	GCCT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=219,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56863431_T_C:56863431:0,1,0,1
chr12	56863444	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=219,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56863431_T_C:56863431:0,1,0,1
chr12	56866940	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.243:23:5,3:13,2:17,1,3,2
chr12	56866962	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.500:38:8,5:11,14:12,7,13,6
chr12	56866968	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=135,110;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:14,2:30,0:29,16,1,1
chr12	56869577	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr12	56915782	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,4:0,0:0,0,6,0
chr12	56980776	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:9,1:4,1:0|1:56980776_A_T:56980776:1,12,0,2
chr12	56980778	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:4,1:0|1:56980776_A_T:56980776:1,12,0,2
chr12	56999202	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=218,267;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:56999202_A_T:56999202:0,4,0,1
chr12	56999204	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,33;MFRL=218,267;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:0|1:56999202_A_T:56999202:0,4,0,1
chr12	57000466	.	ATCT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCT;STR;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:1,8:9,7:2,8,4,12
chr12	57003850	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,0:10,2:9,3,1,1
chr12	57008775	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr12	57034015	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.563:7:2,3:1,0:0,3,0,4
chr12	57065713	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,16:0,0,1,32
chr12	57106810	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,8:0,0,17,6
chr12	57108203	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:0,6:1,9:1,0,4,11
chr12	57109792	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,16:0,26:0,0,25,19
chr12	57109931	.	A	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=175.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,20:0,28:0,0,37,32
chr12	57125650	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57125650_C_A:57125650:0,0,0,1
chr12	57125652	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57125650_C_A:57125650:0,0,0,1
chr12	57132186	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr12	57140506	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr12	57176089	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr12	57317903	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=166,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr12	57324239	.	C	CTG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.204:12:4,1:6,1:0|1:57324239_C_CTG:57324239:0,10,0,2
chr12	57324240	.	A	ATGATTTCTGTGTGGTTCATCTCACC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.208:12:4,1:6,1:0|1:57324239_C_CTG:57324239:0,10,0,2
chr12	57328094	.	C	CTGGATT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=153,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57328094_C_CTGGATT:57328094:0,1,0,1
chr12	57328097	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=153,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57328094_C_CTGGATT:57328094:0,1,0,1
chr12	57328099	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=153,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:57328094_C_CTGGATT:57328094:0,1,0,1
chr12	57328101	.	G	GCTCTAGTAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57328094_C_CTGGATT:57328094:0,0,0,1
chr12	57390177	.	TC	AA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:13,2:8,2:10,14,2,2
chr12	57409655	.	A	AAACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:57409655_A_AAACC:57409655:0,0,0,1
chr12	57409658	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57409655_A_AAACC:57409655:0,0,0,1
chr12	57424133	.	T	TCACTGGCTTTTCTAATATC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=118,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr12	57466535	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:13,4:13,0:21,5,3,1
chr12	57483240	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:57483240_G_GA:57483240:0,1,0,1
chr12	57483242	.	C	CCATGAAAAGTCTTGTTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57483240_G_GA:57483240:0,1,0,1
chr12	57483245	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:57483240_G_GA:57483240:0,1,0,1
chr12	57486647	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:3,6:9,5:10,2,9,2
chr12	57492895	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=276,263;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr12	57500681	.	T	TGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57500681_T_TGA:57500681:0,0,0,1
chr12	57500683	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57500681_T_TGA:57500681:0,0,0,1
chr12	57500684	.	C	CGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57500681_T_TGA:57500681:0,0,0,1
chr12	57548050	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,2:0.045:64:30,1:31,1:36,26,1,1
chr12	57561248	.	TG	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:57561248_TG_T:57561248:11,9,1,1
chr12	57561250	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:9,2:0|1:57561248_TG_T:57561248:11,9,1,1
chr12	57578092	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,19;MFRL=185,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:57578092_C_G:57578092:0,1,1,0
chr12	57578094	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=158,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:57578092_C_G:57578092:2,1,1,0
chr12	57578100	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=158,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:57578092_C_G:57578092:2,1,1,0
chr12	57581028	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,4:0,0,12,2
chr12	57584819	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:2,2:0,1:0,2,0,4
chr12	57587839	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr12	57589225	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	57589865	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr12	57590735	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	57593894	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	57594892	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,2:9,0:7,11,2,0
chr12	57597113	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:6,4:2,5:6,3,6,3
chr12	57602815	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,5:0,0,9,0
chr12	57605168	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr12	57606386	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr12	57610715	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,11;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:1,0:4,0:0|1:57610715_A_C:57610715:10,0,3,0
chr12	57610717	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,11;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:3,1:4,0:0|1:57610715_A_C:57610715:10,0,3,0
chr12	57627717	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:2,3,3,1
chr12	57642945	.	T	TTCTTCC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TCTTCC;STR;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:1,2,1,4
chr12	57643267	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=192,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr12	57691990	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,0:2,3:0,8,1,2
chr12	57692048	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=209,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57692048_A_G:57692048:0,2,0,1
chr12	57692053	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=209,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57692048_A_G:57692048:0,2,0,1
chr12	57693060	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	57704005	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr12	57843014	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	57843450	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,0:10,2:15,7,1,1
chr12	57843838	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:57843838_T_G:57843838:0,1,0,1
chr12	57843840	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57843838_T_G:57843838:0,1,0,1
chr12	57858414	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=100,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,2:1,6:3,0,4,4
chr12	57858835	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr12	57859092	.	G	GCCTTTTTAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr12	57859932	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr12	57865594	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:6,5,0,2
chr12	57865928	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	57867726	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr12	57869241	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,4,5
chr12	57869447	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:5,8,2,0
chr12	57869476	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:5,5:4,2:0|1:57869476_G_A:57869476:8,4,3,4
chr12	57869486	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:7,7:4,2:0|1:57869476_G_A:57869476:8,4,5,4
chr12	57869500	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,15:0,7:0,0,13,9
chr12	57869530	.	CA	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.473:30:9,12:7,2:8,8,9,5
chr12	57870121	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr12	57870155	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr12	57870463	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:5,2:6,3:3,8,1,4
chr12	57870648	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=234.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,30:0,33:0,0,47,20
chr12	57873042	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.463:37:6,9:13,8:5,15,5,12
chr12	57873071	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=175,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:14,0:12,3:9,17,1,2
chr12	57882366	.	AAC	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.055:52:26,1:22,1:34,16,1,1
chr12	57882764	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.134:37:18,1:12,2:27,5,4,1
chr12	57883801	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:7,2:2,7:1,8,0,10
chr12	57905687	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr12	57906675	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:15,1:18,1:13,21,1,1
chr12	57918634	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:2,5:5,5:2,6,3,7
chr12	57919107	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,27:0.538:50:14,14:7,13:14,9,12,15
chr12	57920262	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,2:4,5:3,1,5,2
chr12	57922363	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:7,6:10,11:8,9,9,8
chr12	57926472	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:9,6:5,11:10,4,9,8
chr12	57929702	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=182,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr12	57940749	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,12:0,0,20,0
chr12	57958313	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:8,2:10,5:5,14,1,6
chr12	57961444	.	CTTT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=149,175;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:1,0:5,1:2,7,0,3
chr12	57970226	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57970226_A_C:57970226:0,0,0,1
chr12	57970227	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57970226_A_C:57970226:0,0,0,1
chr12	57970231	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57970226_A_C:57970226:0,0,0,1
chr12	57970469	.	T	TAAAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=184,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57970469_T_TAAAAC:57970469:1,0,0,1
chr12	57970471	.	G	GACAAAATTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=37,32;MFRL=184,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57970469_T_TAAAAC:57970469:1,0,0,1
chr12	57975155	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=78,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr12	57975570	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	57977003	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:1,5,1,5
chr12	57977040	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr12	58000378	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,4,21
chr12	58003922	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr12	58005861	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:58005861_A_T:58005861:0,4,0,1
chr12	58005869	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:58005861_A_T:58005861:0,4,0,1
chr12	58005872	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:58005861_A_T:58005861:0,4,0,1
chr12	58007937	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=212,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:2,3:2,2,0,3
chr12	58008952	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	58010163	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,16,3
chr12	58022074	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr12	58023012	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	58088033	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.059:48:17,0:29,1:26,20,1,1
chr12	58090069	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,3:16,0:18,11,3,0
chr12	58090214	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,10;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:58090214_A_T:58090214:0,2,0,1
chr12	58090234	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58090214_A_T:58090214:0,0,0,1
chr12	58112044	.	AG	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,58;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:16,0:19,2:18,17,0,2
chr12	58124772	.	TGGGGTCCTTGG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	58125438	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,5:6,2:3,8,1,6
chr12	58127766	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr12	58127967	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=222,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:1,2,2,4
chr12	58135659	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=112.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,14:0,18:0,0,26,6
chr12	58139729	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,3:7,3:1,9,1,5
chr12	58142491	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=154,169;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,1:0,0:0,4,0,2
chr12	58177388	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=138,88;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,0:9,2:0|1:58177388_T_G:58177388:11,14,1,1
chr12	58177395	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=35,19;MFRL=145,88;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:7,1:0|1:58177388_T_G:58177388:7,15,1,1
chr12	58177400	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=160,88;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:6,2:0|1:58177388_T_G:58177388:2,17,1,1
chr12	58217737	.	GGGTC	G	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=33,27;MFRL=154,89;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.236:19:7,2:6,2:0|1:58217737_GGGTC_G:58217737:12,3,2,2
chr12	58217744	.	T	TTC	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=32,26;MFRL=146,89;MMQ=60,59;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:6,2:6,2:0|1:58217737_GGGTC_G:58217737:12,2,2,2
chr12	58217762	.	GC	AC,AT	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=33,31,25;MFRL=145,56,96;MMQ=60,60,45;MPOS=23,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.28,16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,2,6:0.100,0.241:26:9,0,2:9,2,4:13,5,2,6
chr12	58217770	.	G	T,C	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=32,34,30;MFRL=137,56,111;MMQ=60,60,34;MPOS=24,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.23,8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,2,3:0.097,0.133:27:12,0,0:10,2,3:15,7,0,5
chr12	58217780	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=27,32;MFRL=136,104;MMQ=60,53;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:11,1:8,5:13,6,0,6
chr12	58217795	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=34,32;MFRL=131,104;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:12,0:8,4:0|1:58217795_G_A:58217795:12,8,0,4
chr12	58217800	.	CG	AA	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=31,32;MFRL=136,104;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:12,0:6,4:0|1:58217795_G_A:58217795:13,9,0,4
chr12	58217804	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=131,104;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:14,0:6,4:0|1:58217795_G_A:58217795:15,7,0,4
chr12	58217811	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=31,30;MFRL=126,104;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:13,0:6,4:0|1:58217795_G_A:58217795:16,7,0,4
chr12	58217814	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=126,104;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:13,0:6,4:0|1:58217795_G_A:58217795:13,7,0,4
chr12	58217816	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=124,104;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:12,0:6,3:0|1:58217795_G_A:58217795:13,7,0,4
chr12	58217821	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=30,32;MFRL=125,104;MMQ=60,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,1:0|1:58217795_G_A:58217795:12,7,0,2
chr12	58220809	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=124,0;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,3:9,3:13,5,3,4
chr12	58220816	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=124,0;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:9,4:7,4:0|1:58220816_A_G:58220816:12,6,4,4
chr12	58220819	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=96,0;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,1:10,1:14,9,1,1
chr12	58220823	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=124,0;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,9:0.345:27:8,4:9,4:0|1:58220816_A_G:58220816:11,7,5,4
chr12	58220841	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=119,0;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,9:0.345:27:9,5:9,4:0|1:58220841_C_T:58220841:10,8,5,4
chr12	58220844	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=123,0;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:9,5:8,4:0|1:58220841_C_T:58220841:9,8,5,4
chr12	58220872	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=149,0;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:8,1:6,8,1,2
chr12	58335626	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,3:4,10:3,6,5,8
chr12	60164955	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,5:2,4:6,0,9,0
chr12	62147483	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=152,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:62147483_G_A:62147483:3,12,1,1
chr12	62147486	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=158,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:8,2:0|1:62147483_G_A:62147483:4,13,1,1
chr12	62147494	.	ATAT	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=159,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:62147483_G_A:62147483:3,15,1,1
chr12	62261077	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.434:11:4,3:2,1:4,2,3,2
chr12	62261146	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:8,2:6,0:10,7,2,0
chr12	62696477	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr12	62715412	.	CTGTAT	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.401:33:9,2:10,11:5,15,3,10
chr12	62777565	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:5,0,8,1
chr12	62778065	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,12:0,0,7,12
chr12	62783816	.	ATAT	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:62783816_ATAT_A:62783816:0,2,0,1
chr12	62783822	.	AATAG	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=219,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:62783816_ATAT_A:62783816:1,2,0,1
chr12	62783827	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,35;MFRL=351,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:62783816_ATAT_A:62783816:1,1,0,1
chr12	62783830	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=351,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:62783816_ATAT_A:62783816:1,1,0,1
chr12	62783837	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=577,187;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62783816_ATAT_A:62783816:1,0,0,1
chr12	62783843	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,577;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	62785524	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.612:34:8,11:5,10:13,0,21,0
chr12	62797926	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr12	62861111	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=105,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:2,1:4,1:2,4,3,0
chr12	62888729	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	62892905	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=162,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0,12,0,2
chr12	62918780	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr12	62928747	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=72.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.934:27:0,17:1,9:0,1,2,24
chr12	62931083	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:3,3:8,9:0,12,1,11
chr12	62943371	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,13:0,0,17,0
chr12	62954246	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:8,2:8,1:13,4,3,0
chr12	62954968	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,194;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr12	62959137	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=129,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:5,2:9,4:5,10,2,4
chr12	62965149	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=205,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,4,1
chr12	62972210	.	GT	G,GTT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=35,35,35;MFRL=152,146,156;MMQ=60,60,60;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.01,8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,8,7:0.151,0.151:49:20,5,2:14,2,5:31,3,14,1
chr12	62997643	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr12	63087893	.	C	CCATGTCCTGCTCCTTCAGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=209,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	63225977	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:7,13,1,1
chr12	63328557	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.263:21:10,2:3,3:7,9,2,3
chr12	63964640	.	GA	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=144,157;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.187:41:4,1:9,1:1,32,1,7
chr12	64011062	.	A	G	.	.	DP=119;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,154;MMQ=52,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=165.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,56:0.496:113:23,31:34,25:36,21,36,20
chr12	64017804	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,145;MMQ=59,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=97.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,34:0.515:66:20,16:12,18:16,16,20,14
chr12	64020310	.	T	TAAAA	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=138,130;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,14;RU=A;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.259:30:14,4:8,3:5,17,3,5
chr12	64020321	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=34,23;MFRL=138,118;MMQ=60,46;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.241:34:16,4:9,4:5,21,3,5
chr12	64020330	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=35,13;MFRL=141,118;MMQ=60,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:16,0:10,0:0|1:64020330_C_A:64020330:3,25,2,0
chr12	64020332	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=33,17;MFRL=138,118;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:16,1:8,0:0|1:64020330_C_A:64020330:2,24,2,0
chr12	64020334	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=146,118;MMQ=60,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:16,0:8,1:0|1:64020330_C_A:64020330:2,22,2,0
chr12	64038369	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr12	64041195	.	C	CATAATAATA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=160,148;MMQ=60,38;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=ATA;STR;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.260:24:9,4:9,1:0|1:64041195_C_CATAATAATA:64041195:1,17,1,5
chr12	64041219	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=175,169;MMQ=46,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:35,2:0.077:37:21,0:14,2:1|0:64041195_C_CATAATAATA:64041195:2,33,0,2
chr12	64055347	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=180,181;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.757:10:1,1:1,1:0,2,1,7
chr12	64061745	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	64062184	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	64383670	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,12:0,0,12,11
chr12	64472914	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:1,6,1,1
chr12	64521567	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr12	64588536	.	T	TGCATCTATGGACTGCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	64668659	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=99,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:4,5:3,3:4,3,7,1
chr12	64669018	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,1:7,6:12,0,7,0
chr12	64671412	.	C	CTA,CTATA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34,32;MFRL=218,173,134;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=TA;STR;TLOD=17.73,9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,4:0.514,0.359:11:1,3,1:0,3,3:1,0,8,2
chr12	64678416	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,1:6,4:8,5,1,4
chr12	64746833	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,5:2,4:1,8,2,7
chr12	64816682	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,178;MMQ=40,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,0:5,3:8,1,3,0
chr12	64823969	.	GAAGTTTAAAATTCTGTTAGAA	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=161,118;MMQ=52,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:10,0:18,2:17,21,1,1
chr12	64838752	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=223,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr12	64858100	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,3:0,8:1,0,10,1
chr12	64879165	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:2,1,6,0
chr12	65004387	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr12	65078479	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,137;MMQ=59,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:10,0,2,0
chr12	65133349	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=225,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65133349_A_C:65133349:0,1,0,1
chr12	65133354	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=225,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65133349_A_C:65133349:0,1,0,1
chr12	65133357	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=225,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65133349_A_C:65133349:0,1,0,1
chr12	65133359	.	CCA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=225,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65133349_A_C:65133349:0,1,0,1
chr12	65134536	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr12	65460368	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr12	65609675	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,2:4,3:12,0,7,0
chr12	65609707	.	G	GT	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,22:0.408:54:15,7:12,10:24,8,14,8
chr12	65612499	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.543:29:6,7:7,7:0,13,1,15
chr12	65633880	.	GTGAT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGAT;STR;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.478:19:4,4:6,5:4,6,7,2
chr12	65639615	.	ATTTT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=115,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.501:30:7,2:6,12:5,10,2,13
chr12	65762703	.	ACC	A,AC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,23,16;MFRL=0,107,119;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=C;STR;TLOD=9.06,26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,14:0.293,0.667:20:0,1,1:0,2,3:0,0,0,20
chr12	65856899	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,17,1
chr12	65856928	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=126,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,2:10,0:12,7,1,1
chr12	66517828	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr12	66522628	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,34,33;MFRL=149,161,166;MMQ=60,60,60;MPOS=24,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,16,18;RU=A;STR;TLOD=3.61,17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,3,14:0.099,0.442:34:9,1,6:7,2,6:15,2,16,1
chr12	66531694	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,2:0,0,9,1
chr12	66539589	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.407:52:20,13:11,8:24,7,16,5
chr12	66547323	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:66547323_G_A:66547323:0,8,0,2
chr12	66547328	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=181,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,0:3,1:0|1:66547323_G_A:66547323:0,8,0,2
chr12	66597644	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:2,5:6,7:5,4,4,8
chr12	66698438	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=231,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr12	66698461	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr12	66698954	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr12	66704483	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=163,131;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:66704483_C_T:66704483:0,3,0,1
chr12	66704487	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=163,131;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:66704483_C_T:66704483:0,3,0,1
chr12	66717692	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr12	66717716	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr12	66743060	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,0:9,2:1,17,1,1
chr12	66771108	.	ATT	A,AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31,33;MFRL=174,148,156;MMQ=40,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=10.39,13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,6:0.394,0.477:12:1,3,0:0,2,6:0,1,1,10
chr12	66771121	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=62,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,5:2,6:1,1,0,11
chr12	66786073	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,6,1
chr12	66786091	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr12	66786341	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr12	66786644	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr12	66849408	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr12	66856667	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,2,1
chr12	66856944	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,37;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	66909389	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:10,4:2,5:7,5,4,5
chr12	67696052	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr12	67701103	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:1,1:4,0,3,0
chr12	68042982	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,6:2,2:0,6,0,8
chr12	68054141	.	GA	G,GAA	.	.	DP=132;ECNT=1;MBQ=33,30,32;MFRL=142,152,144;MMQ=60,60,60;MPOS=16,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=10.48,6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:73,10,12:0.092,0.123:95:21,5,3:26,2,5:44,29,11,11
chr12	68054877	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.224:24:8,1:7,3:16,3,3,2
chr12	68619604	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr12	68646696	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=215,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.412:3:0,0:2,1:0|1:68646696_C_T:68646696:0,2,0,1
chr12	68646698	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=215,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.412:3:0,0:2,1:0|1:68646696_C_T:68646696:0,2,0,1
chr12	68646703	.	A	ACCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=215,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:68646696_C_T:68646696:0,2,0,1
chr12	68688939	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr12	68708761	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,26:0,15:0,0,39,3
chr12	68715417	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,6:2,4:1,8,0,10
chr12	68719216	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=171.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,35:0,18:0,0,34,20
chr12	68719308	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.452:42:9,9:14,9:8,15,5,14
chr12	69042454	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=118,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.443:26:9,7:4,3:13,1,12,0
chr12	69080728	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.536:13:3,3:3,4:4,2,7,0
chr12	69082669	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:8,0,3,1
chr12	69082805	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.478:50:13,12:13,11:10,16,11,13
chr12	69083237	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=180,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:3,0,8,0
chr12	69090573	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr12	69090754	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr12	69096398	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:5,2:7,0,6,0
chr12	69096626	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=15,16;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.302:14:0,1:1,0:0,10,0,4
chr12	69109617	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	69119617	.	G	GGTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=100,130;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,6:3,1:5,4,2,5
chr12	69125513	.	GG	TT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=129,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,6:5,4:2,7,0,11
chr12	69125578	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=197,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr12	69141678	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.440:32:7,8:11,6:18,0,12,2
chr12	69214081	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=30,31,31;MFRL=144,156,148;MMQ=60,60,60;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=T;STR;TLOD=20.98,4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:40,15,3:0.245,0.065:58:14,7,3:19,8,0:38,2,18,0
chr12	69214094	.	C	G	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=18,19;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:12,0:12,0:55,10,3,0
chr12	69218038	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr12	69218096	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,11;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.487:8:2,0:2,1:0,4,4,0
chr12	69218103	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,0:2,2:2,4,4,0
chr12	69229838	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr12	69250481	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr12	69250548	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	69252871	.	T	TAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:69252871_T_TAAAAA:69252871:0,4,0,1
chr12	69252872	.	T	TAAAAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:69252871_T_TAAAAA:69252871:0,4,0,1
chr12	69252884	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	69633379	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=155.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,24:0,25:0,0,49,2
chr12	69646914	.	G	A	.	.	DP=210;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=306.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,106:0.520:204:47,55:46,50:43,55,47,59
chr12	69646939	.	GT	G	.	.	DP=172;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:128,5:0.044:133:61,3:60,2:42,86,1,4
chr12	69651700	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:4,7:2,4:2,5,2,9
chr12	69652336	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	69653146	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr12	69667075	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	69744104	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:0,7,0,6
chr12	69753830	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=84.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,13:0,0,4,22
chr12	69753847	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,9:0,0,1,20
chr12	69759551	.	AT	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=157.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.984:54:0,27:0,26:0,0,30,24
chr12	69764388	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr12	69764850	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr12	69964956	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr12	69980028	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,16,7
chr12	69980141	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr12	69981862	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr12	69982129	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,1:6,3:1,7,0,4
chr12	69985771	.	CTT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:6,4:4,5:9,1,9,0
chr12	69986788	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.517:29:3,6:11,9:4,10,7,8
chr12	69991568	.	AAT	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AT;STR;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,2:3,7:0,8,3,6
chr12	69991627	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr12	69991660	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=189,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:2,4:2,1,4,1
chr12	70005011	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr12	70065126	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.905:13:0,4:1,8:1,0,11,1
chr12	70066831	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70066831_T_TGA:70066831:0,1,0,1
chr12	70066834	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70066831_T_TGA:70066831:0,1,0,1
chr12	70066837	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70066831_T_TGA:70066831:0,1,0,1
chr12	70066839	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70066831_T_TGA:70066831:0,1,0,1
chr12	70066843	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70066831_T_TGA:70066831:0,1,0,1
chr12	70070942	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
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chr12	70189115	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=162,104;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:17,0:9,3:9,18,0,3
chr12	70206894	.	ATAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAG;STR;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,1:2,5:0,2,0,6
chr12	70209121	.	ATC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=94,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TC;STR;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:3,2:4,3,4,1
chr12	70740194	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=216,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr12	70794186	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,2:2,5:0,5,1,6
chr12	70915347	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:6,5:4,7:1,9,2,10
chr12	70933687	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,6:2,5:5,4,8,3
chr12	70933758	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=139,33354379;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.105:27:12,1:10,1:13,12,0,2
chr12	70949087	.	GG	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr12	70963386	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=138,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr12	70963770	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr12	70964713	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=179,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr12	70964750	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,3:1,1:2,0,4,0
chr12	70964914	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:11,2:9,14,1,1
chr12	70965902	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=187,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr12	70990120	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70990120_T_A:70990120:0,1,0,1
chr12	70990123	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70990120_T_A:70990120:0,1,0,1
chr12	70990127	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70990120_T_A:70990120:0,1,0,1
chr12	71002893	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,3:7,7:9,6,4,6
chr12	71003424	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,2,1
chr12	71016506	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	71078135	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr12	71314120	.	G	GTGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=200,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:71314120_G_GTGC:71314120:1,5,1,1
chr12	71314123	.	A	ATGATCTATGCATGGCGTTATGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=200,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:71314120_G_GTGC:71314120:1,5,1,1
chr12	71523043	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=124,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.610:8:0,1:2,3:3,0,5,0
chr12	71523199	.	TAA	T,TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30,33;MFRL=145,131,155;MMQ=60,60,60;MPOS=12,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=19.78,6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,9,4:0.436,0.216:20:1,5,1:5,4,3:1,6,0,13
chr12	71526414	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=251,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:2,0,9,2
chr12	71526677	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=298,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr12	71531663	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr12	71531889	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,3:6,7:7,4,5,5
chr12	71532099	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	71960329	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr12	71960533	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr12	71960584	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,1:0,0,8,4
chr12	71978320	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=167,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:2,2:0|1:71978320_T_C:71978320:8,2,1,1
chr12	71978325	.	A	ACC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=163,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:2,2:0|1:71978320_T_C:71978320:9,2,1,1
chr12	71978328	.	C	CACCCCACCCT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=160,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:71978320_T_C:71978320:8,1,1,1
chr12	72004883	.	A	AC	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.252:25:9,0:9,0:9,10,0,6
chr12	72004884	.	GAAA	G,AAAA	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=33,18,33;MFRL=146,118,162;MMQ=60,60,60;MPOS=16,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.94,11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,6:0.298,0.249:16:2,1,2:2,0,4:3,3,1,9
chr12	72004899	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=152,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:6,1:9,1:0|1:72004899_AG_A:72004899:1,16,2,0
chr12	72004904	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=163,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,1:12,0:0|1:72004899_AG_A:72004899:1,16,2,0
chr12	72013753	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=136,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:18,1:15,2:19,14,1,2
chr12	72014002	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.087:43:19,3:19,0:24,16,1,2
chr12	72019989	.	T	TAC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=103,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=AC;STR;TLOD=50.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:1,7:0,9:1,0,16,1
chr12	72023329	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	72026872	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	72028607	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,0:0,3:0,0,0,7
chr12	72030252	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=122.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,21:0,12:0,0,27,7
chr12	72038586	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:12,0,2,0
chr12	72094530	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=100,147;MMQ=52,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.515:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr12	72163723	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:0,2:3,0:0,4,0,4
chr12	72289934	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=160,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:72289934_GT_G:72289934:0,1,0,1
chr12	72289936	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=160,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:72289934_GT_G:72289934:0,1,0,1
chr12	72289945	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=239,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:72289934_GT_G:72289934:0,2,0,1
chr12	72289954	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=219,211;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:72289934_GT_G:72289934:0,3,0,1
chr12	72338425	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=124,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:8,9,0,2
chr12	72388374	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,2,14
chr12	72955901	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:6,6:3,13:8,1,17,2
chr12	72956100	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,5:4,6:0,8,0,11
chr12	72956570	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,8:5,6:10,0,14,0
chr12	72956613	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,27:0.574:47:8,13:11,14:15,5,21,6
chr12	72962288	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:0,3:5,2:5,0,5,1
chr12	72969198	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:10,7:7,11:7,10,6,12
chr12	73012573	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=164,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr12	73012649	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=159,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.346:17:6,3:4,1:11,0,5,1
chr12	74933853	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.851:14:0,1:1,10:0,2,2,10
chr12	74934634	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=160.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,16:0,19:0|1:74934634_G_A:74934634:0,0,11,26
chr12	74934637	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=154.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,13:0,21:0|1:74934634_G_A:74934634:0,0,10,25
chr12	75435999	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr12	75687185	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:2,3:3,9:0,5,1,11
chr12	75692400	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,2:5,0:9,0,2,0
chr12	75692755	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:1,6,1,6
chr12	75693520	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,14:0.600:23:5,7:3,6:0|1:75693520_C_T:75693520:9,0,14,0
chr12	75693531	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:7,9:4,6:0|1:75693520_C_T:75693520:11,0,16,0
chr12	75693547	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=163,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.133:35:20,3:11,1:0|1:75693520_C_T:75693520:30,1,3,1
chr12	75693751	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:11,10:4,7:1,14,0,17
chr12	75720167	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:8,1:14,2,2,0
chr12	75884330	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=192,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:75884330_A_C:75884330:0,1,2,0
chr12	75884331	.	C	CGGGGGGGGGGGGCGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=192,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:75884330_A_C:75884330:0,1,2,0
chr12	75895619	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:2,14:5,5:7,0,9,10
chr12	75900382	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.420:12:4,4:2,0:1,6,0,5
chr12	75900702	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.552:36:8,13:8,7:4,12,7,13
chr12	76424937	.	TTGC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGC;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr12	76442907	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:7,10:3,5:10,0,15,0
chr12	76444510	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:0,5,0,10
chr12	76449900	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,49;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=272.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,80:0.988:80:0,43:0,34:0,0,30,50
chr12	76453861	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,12,1
chr12	76453873	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:7,1,7,1
chr12	76461137	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=119,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,1:8,1:5,4,2,0
chr12	76461145	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,7,3
chr12	76462612	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:8,0,5,0
chr12	76762923	.	A	AAAT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=171.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,19:0,17:0,0,39,0
chr12	76763092	.	G	GA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=128,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.541:24:1,3:0,4:0,11,1,12
chr12	76765402	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,3:3,6:0,7,0,9
chr12	76767065	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.911:13:0,7:1,5:1,0,12,0
chr12	76769209	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	76780051	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,31,29;MFRL=117,134,133;MMQ=60,60,60;MPOS=28,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=5.44,26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,16:0.103,0.601:28:3,2,5:6,1,7:1,8,6,13
chr12	76786349	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=99.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,23,4
chr12	77199250	.	AACTTG	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=154.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,15:0,21:0,0,1,35
chr12	77202798	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=197.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,27:0,25:0,0,50,2
chr12	77209613	.	GT	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.255:37:12,4:5,5:18,9,9,1
chr12	77235768	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=97.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,20:0,9:0,0,14,15
chr12	77239420	.	AAAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAT;STR;TLOD=61.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr12	77253236	.	CT	C,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35,34;MFRL=216,166,143;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.13,6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,3:0.351,0.284:11:2,3,1:2,1,1:4,0,7,0
chr12	77254207	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.863:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr12	77254222	.	C	CCAGAAATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr12	77417768	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.382:6:1,0:2,0:0|1:77417768_C_G:77417768:1,3,2,0
chr12	77417771	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.382:6:1,0:2,0:0|1:77417768_C_G:77417768:1,3,2,0
chr12	77417777	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,19;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.337:7:1,0:3,1:0|1:77417768_C_G:77417768:2,3,2,0
chr12	77424135	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr12	77426776	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr12	77427865	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,0:0,3:0|1:77427865_A_T:77427865:1,4,0,3
chr12	77427870	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0|1:77427865_A_T:77427865:1,4,0,3
chr12	77438607	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,3:2,3:0,8,0,6
chr12	78225374	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,7,18
chr12	78334053	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=248,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:1,5:0,4:1,0,8,1
chr12	78334194	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,3:2,5:3,4,2,6
chr12	78511755	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr12	78531207	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	78534233	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	78540174	.	TA	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=67.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,31:0.516:60:15,15:11,15:2,27,2,29
chr12	78542594	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=84.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,24:0.521:46:9,13:13,10:0|1:78542594_T_G:78542594:17,5,21,3
chr12	78542602	.	A	AT	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=85.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,27:0.527:51:10,12:12,14:0|1:78542594_T_G:78542594:17,7,21,6
chr12	78562687	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr12	78569059	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr12	78570914	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:6,2,2,1
chr12	78582362	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr12	78582566	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr12	78590946	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	78590983	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr12	78592502	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=126,119;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:6,0:0|1:78592502_G_T:78592502:5,8,0,2
chr12	78592540	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=148,94;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:78592502_G_T:78592502:1,3,0,1
chr12	78592543	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=153,94;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:78592502_G_T:78592502:0,3,0,1
chr12	79611509	.	AA	TT,ATATCAAGGCCCGAGAGAGGAGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32,32;MFRL=200,73,133;MMQ=60,60,60;MPOS=3,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,1:1,1,0:0,2,0,2
chr12	79611512	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=189,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	79611536	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=189,210;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	79685913	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:5,4:7,4:4,9,1,7
chr12	79747441	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:1,4:7,4:4,5,2,6
chr12	79747487	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,0:0,6:0,2,0,6
chr12	79812924	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	80083617	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,51;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:4,2:6,5,0,2
chr12	80190650	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=192.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,24:0,30:0,0,28,26
chr12	80191079	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=139,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:29,3:15,0:18,27,3,0
chr12	80203831	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr12	80216060	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=130,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr12	80266523	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr12	80645799	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,11,2
chr12	80647155	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	80648399	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=97.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,13:0,0,0,27
chr12	80648410	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,1:12,1:0,22,0,2
chr12	80648777	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=127,100;MMQ=60,43;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:8,1,2,0
chr12	80655692	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	80661189	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr12	80663825	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr12	80665397	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr12	80672064	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:5,3:2,7:0,7,0,11
chr12	80707236	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,6:4,2:5,0,7,1
chr12	80712307	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,17,1
chr12	80712472	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:2,13,1,1
chr12	80717419	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:80717419_A_ATT:80717419:3,0,1,0
chr12	80717428	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=172,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:80717419_A_ATT:80717419:4,0,1,0
chr12	80730268	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,0:13,3:16,4,2,1
chr12	80730561	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.658:27:3,8:6,10:9,0,14,4
chr12	80730664	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.398:46:13,7:13,11:9,19,8,10
chr12	80733057	.	C	CAACGAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=291,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	80746234	.	G	GAAT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=84.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,12:0,6:0,0,2,17
chr12	80750741	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr12	80765683	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:80765683_TG_T:80765683:0,0,3,0
chr12	80765685	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:80765683_TG_T:80765683:0,0,3,0
chr12	80765741	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr12	80765933	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0|1:80765933_C_G:80765933:0,3,0,2
chr12	80765945	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:80765933_C_G:80765933:0,0,0,5
chr12	80862469	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.481:27:6,8:8,5:12,2,9,4
chr12	80878174	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:80878174_T_A:80878174:0,0,4,0
chr12	80878181	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.878:6:0,4:0,2:0|1:80878174_T_A:80878174:0,0,6,0
chr12	80889165	.	T	TTTG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TTG;STR;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.875:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr12	80890325	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,9:0,0,6,15
chr12	80899829	.	A	C	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=156,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,3:0.057:67:37,0:26,3:37,27,0,3
chr12	80899901	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,39:0.625:62:9,19:14,20:7,16,24,15
chr12	80900058	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,4:0,7,0,7
chr12	80900335	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr12	80900348	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr12	80900495	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,5:5,0:0,7,0,5
chr12	80933465	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr12	80933734	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.309:24:6,3:10,4:0,17,0,7
chr12	80933785	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr12	80935300	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr12	81063264	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:3,3:1,0:3,2,0,3
chr12	81063271	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=179,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:1,3,0,1
chr12	81066851	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:8,0,4,0
chr12	81112882	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:81112882_A_C:81112882:0,1,0,3
chr12	81112890	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:81112882_A_C:81112882:0,2,0,1
chr12	81205198	.	GTA	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=131,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.289:15:7,2:4,2:10,1,3,1
chr12	81205298	.	A	ATGC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=143,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:10,2:0|1:81205298_A_ATGC:81205298:16,10,0,2
chr12	81205299	.	A	AGAGTCAGGATC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=143,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:15,0:10,2:0|1:81205298_A_ATGC:81205298:16,10,0,2
chr12	81226332	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:0|1:81226332_G_T:81226332:7,13,0,2
chr12	81226342	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:0|1:81226332_G_T:81226332:4,15,0,2
chr12	81226348	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:6,0:10,2:0|1:81226332_G_T:81226332:4,13,0,2
chr12	81226432	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0|1:81226432_G_A:81226432:0,0,5,12
chr12	81226436	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,5:0,8:0|1:81226432_G_A:81226432:0,0,4,12
chr12	81226461	.	T	TTTA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=145,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:81226461_T_TTTA:81226461:0,2,0,1
chr12	81226465	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=145,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:81226461_T_TTTA:81226461:0,2,0,1
chr12	81528621	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=108,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,2:8,0:13,9,1,1
chr12	81533078	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr12	81624964	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr12	81647065	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=155.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,23:0,26:0,0,38,12
chr12	81647471	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	81655861	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr12	81657155	.	GTT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:16,2:12,0:9,19,0,2
chr12	81751773	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=197,281;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr12	81833787	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,52;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:7,6,1,1
chr12	82147665	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr12	82747128	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:9,8:8,5:0,17,1,12
chr12	82751062	.	TATC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.478:19:5,5:3,4:0,10,0,9
chr12	82751955	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,6:5,7:10,0,11,2
chr12	82752633	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:2,2:1,3:3,0,5,1
chr12	82828426	.	T	TATAAG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATAAG;STR;TLOD=144.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,11:0,16:0,0,21,12
chr12	82832418	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr12	82850427	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr12	83358930	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=147.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,18:0,22:0,0,2,39
chr12	83455727	.	T	TTGCAGAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=199,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	83525962	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:6,5:3,4:8,1,8,2
chr12	85257445	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr12	85266609	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:4,3:0,5,0,6
chr12	85266822	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=219,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr12	85277561	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,6:6,7:2,8,5,8
chr12	85277592	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,2:6,5:2,6,1,6
chr12	85277608	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:3,4,1,4
chr12	85277610	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:0|1:85277610_G_A:85277610:1,4,3,4
chr12	85277615	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:0|1:85277610_G_A:85277610:1,4,3,4
chr12	85279196	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:9,4:5,5:11,3,8,1
chr12	85279860	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,2:7,4:1,12,0,6
chr12	85285920	.	TAAAA	T,TAAAAAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31,31;MFRL=148,148,166;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,20;RU=A;STR;TLOD=3.07,4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.221,0.340:6:1,0,0:1,1,1:0,3,0,3
chr12	85515519	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=104,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,4:1,1:3,2,5,0
chr12	85695268	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=186,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:85695268_T_TC:85695268:0,3,0,1
chr12	85695270	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=186,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:85695268_T_TC:85695268:0,3,0,1
chr12	85695272	.	T	TTCTTTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=186,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:85695268_T_TC:85695268:0,3,0,1
chr12	85695287	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	86229880	.	GAC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.162:17:4,1:10,1:13,2,2,0
chr12	86268097	.	GC	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,6:0,0:1,0,6,0
chr12	86270329	.	AT	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.079:60:24,1:29,3:53,3,4,0
chr12	88379543	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:6,0,7,1
chr12	88379566	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,18,3
chr12	88383052	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,1:5,2:8,9,1,2
chr12	88453608	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	88454594	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=70.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,23,2
chr12	88457905	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:7,1:0|1:88457905_G_A:88457905:0,12,0,2
chr12	88457910	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:88457905_G_A:88457905:0,10,0,2
chr12	88473049	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,0,16
chr12	88474192	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=161,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:7,2:0|1:88474192_G_C:88474192:2,21,1,1
chr12	88474196	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=161,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:5,2:0|1:88474192_G_C:88474192:2,22,1,1
chr12	88474200	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=158,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:4,2:0|1:88474192_G_C:88474192:1,19,1,1
chr12	88474202	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=160,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:14,0:4,2:0|1:88474192_G_C:88474192:0,18,1,1
chr12	88474230	.	CC	GG	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=184,128;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:3,0:0|1:88474230_CC_GG:88474230:0,11,0,2
chr12	88474237	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=184,128;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:0,0:0|1:88474230_CC_GG:88474230:0,7,0,2
chr12	88478316	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr12	88481492	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,125;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:5,3:22,0:28,0,3,0
chr12	88483173	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,1:7,1:2,14,1,1
chr12	88483272	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	88496838	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr12	88510750	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,158;MMQ=42,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,2:4,0,3,2
chr12	88522711	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:10,2:3,1:11,2,1,2
chr12	88522823	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,3,15
chr12	88547277	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,9:0,0,5,16
chr12	88548195	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,2:6,0:0,19,0,2
chr12	88553975	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=120,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,2:0.048:60:19,0:39,2:0|1:88553975_G_A:88553975:21,37,1,1
chr12	88554002	.	AG	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=120,67;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:43,4:0.101:47:14,0:26,4:1|0:88553975_G_A:88553975:16,27,1,3
chr12	88560128	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=166,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.082:47:24,3:17,0:0|1:88560128_A_T:88560128:29,15,3,0
chr12	88560131	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:25,3:18,0:0|1:88560128_A_T:88560128:30,15,3,0
chr12	88899137	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr12	88900246	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr12	88909492	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:88909492_T_G:88909492:0,3,0,1
chr12	88909497	.	T	TCCCCAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:1,1:0|1:88909492_T_G:88909492:0,1,0,1
chr12	88910307	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=185,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:1,4,0,2
chr12	88926290	.	CA	C,CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25,32;MFRL=193,158,176;MMQ=60,60,60;MPOS=10,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.00,16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,7:0.322,0.540:12:1,1,3:0,3,2:0,1,2,9
chr12	89853387	.	C	CA,CAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,33,33;MFRL=138,129,166;MMQ=60,60,60;MPOS=28,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,18,19;RU=A;STR;TLOD=3.09,5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.308,0.462:11:1,0,2:2,3,1:2,1,7,1
chr12	89853408	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=142.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,21:0,19:0,0,27,13
chr12	89864047	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr12	89866054	.	TAGAAAGAAGA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAAGAAGA;STR;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr12	89866111	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=187,271;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89866111_A_C:89866111:0,1,0,1
chr12	89866113	.	CTCTACA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=187,271;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89866111_A_C:89866111:0,1,0,1
chr12	89917037	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:3,4:4,5:2,5,2,7
chr12	89984958	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,0:16,2:6,24,0,2
chr12	90015579	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr12	90024349	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=129,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,9:0.130:74:41,5:21,4:31,34,4,5
chr12	91348746	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=147,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,0:5,0:4,11,0,2
chr12	91502039	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:10,2:7,0:6,12,1,1
chr12	91547046	.	ATGCCATC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=224,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	91547055	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=210,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:91547055_A_G:91547055:0,1,0,1
chr12	91547060	.	CTAAAAGACACACAGTTTCA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=210,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:91547055_A_G:91547055:0,1,0,1
chr12	91550784	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:2,1:4,4:6,0,5,0
chr12	91572415	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=176,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr12	92539344	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=140.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,13:0,26:0,0,6,47
chr12	92539378	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=242,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=169.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,52:0.964:53:0,20:1,32:0,1,0,52
chr12	92818482	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:6,8:6,9:8,4,9,8
chr12	92821860	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,11,9
chr12	93131203	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,1:2,4:5,2,6,0
chr12	93131349	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:6,5:5,4:4,7,3,7
chr12	93170519	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr12	93206878	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,5:4,6:2,6,1,10
chr12	93236196	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,31:0.500:62:17,20:14,11:25,6,29,2
chr12	93236402	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,14:0.469:30:11,6:4,8:0|1:93236402_C_T:93236402:0,16,0,14
chr12	93236419	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=208,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,7:0.250:30:16,4:7,3:0|1:93236402_C_T:93236402:1,22,0,7
chr12	93247775	.	G	GATA	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=ATA;STR;TLOD=126.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,36:0.434:83:26,21:20,14:5,42,5,31
chr12	93772066	.	GAGC	G	.	.	DP=303;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AGC;STR;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:220,10:0.047:230:103,4:106,6:95,125,6,4
chr12	93863162	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,2,17
chr12	93873073	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=184,180;MMQ=48,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93873073_T_G:93873073:1,0,1,0
chr12	93873076	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=184,180;MMQ=48,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93873073_T_G:93873073:1,0,1,0
chr12	93894823	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,13,2
chr12	93966856	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	94072918	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=124,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:94072918_A_G:94072918:0,2,0,1
chr12	94072927	.	TTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=247,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:94072918_A_G:94072918:0,1,0,1
chr12	94072934	.	T	TGTTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=173,247;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	94072936	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=247,173;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:94072918_A_G:94072918:0,1,0,1
chr12	94562875	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:6,4:4,4:11,0,8,0
chr12	94563134	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,1:1,3:0,7,0,4
chr12	94575157	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,5:3,6:9,0,11,0
chr12	94603300	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,3:7,5:12,4,8,0
chr12	94620285	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr12	94648493	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.953:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr12	94648945	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.504:28:6,4:6,10:12,2,14,0
chr12	94649103	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0,0,0,18
chr12	94653227	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.481:15:5,4:1,3:0,8,3,4
chr12	94654320	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,261;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:94654320_G_C:94654320:0,0,1,0
chr12	94654325	.	CT	AG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,15;MFRL=0,261;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:94654320_G_C:94654320:0,0,1,0
chr12	94654331	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=21,16;MFRL=128,261;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:94654320_G_C:94654320:1,0,1,0
chr12	94654334	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,13;MFRL=138,261;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:94654320_G_C:94654320:2,0,1,0
chr12	94654336	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,30;MFRL=138,261;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:94654320_G_C:94654320:2,0,1,0
chr12	94654338	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=138,261;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:94654320_G_C:94654320:2,0,1,0
chr12	94654340	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,14;MFRL=138,261;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:94654320_G_C:94654320:2,0,1,0
chr12	94673509	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	94688232	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,14,12
chr12	94697469	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.379:9:4,1:1,2:6,0,3,0
chr12	94697490	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=14,19;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.344:8:0,0:0,1:0|1:94697490_C_G:94697490:5,0,3,0
chr12	94697492	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=18,19;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.721:8:0,0:0,0:2,0,6,0
chr12	94697501	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=16,17;MFRL=169,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:0,0:0|1:94697490_C_G:94697490:7,0,2,0
chr12	94697507	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=25,37;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:2,1:0,0:4,0,1,0
chr12	94697509	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=31,18;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:3,0:1,0:4,0,1,0
chr12	94697525	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,1:2,1:7,3,2,0
chr12	94698880	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,5:4,0:6,0,5,0
chr12	94761701	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,4:4,6:5,7,3,7
chr12	95397552	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr12	95422108	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,3,1
chr12	95425033	.	ATAAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=269,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr12	95453774	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,14;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:95453774_A_T:95453774:1,0,1,0
chr12	95453780	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:95453774_A_T:95453774:1,0,1,0
chr12	95453784	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:95453774_A_T:95453774:1,0,1,0
chr12	95488339	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=117,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.455:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr12	95500635	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=199,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:6,0,2,0
chr12	95500698	.	CAA	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=A;STR;TLOD=47.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,14:0.364:39:12,8:12,6:0|1:95500698_CAA_C:95500698:19,6,10,4
chr12	95500727	.	C	G	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,30:0.427:70:21,13:18,15:0|1:95500698_CAA_C:95500698:20,20,13,17
chr12	95546663	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.516:21:4,5:6,5:5,5,8,3
chr12	95602529	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr12	95602569	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:5,2,6,1
chr12	95611141	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.278:15:9,2:2,1:0,11,0,4
chr12	95650846	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,37;MFRL=198,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr12	95651093	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:1,2,0,6
chr12	95660320	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:8,1:5,11,0,2
chr12	95668437	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,15:0,5:0,0,20,1
chr12	95676053	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr12	95702385	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:0,1:4,2:0,4,0,4
chr12	95897997	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,0,23
chr12	96076415	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	96076645	.	AACTTG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=184,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:0|1:96076645_AACTTG_A:96076645:0,3,0,1
chr12	96076652	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=184,190;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:96076645_AACTTG_A:96076645:0,3,0,1
chr12	96076655	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=184,190;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:96076645_AACTTG_A:96076645:0,3,0,1
chr12	96076668	.	A	AAGGCCCCATCTTATAACAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:96076668_A_AAGGCCCCATCTTATAACAT:96076668:0,1,0,1
chr12	96076671	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:96076668_A_AAGGCCCCATCTTATAACAT:96076668:0,1,0,1
chr12	96104138	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	96104508	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	96253003	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr12	96254880	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.537:26:4,8:7,6:9,3,14,0
chr12	96259897	.	ATTTG	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=130,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=91.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.545:44:7,16:13,7:0,20,4,20
chr12	96259951	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,7:1,4:0,4,0,11
chr12	96263376	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,3:5,3:0,9,0,6
chr12	96263437	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr12	96263439	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	96263453	.	TTAAAGG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr12	96292280	.	G	GAAAC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAAC;STR;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.248:17:8,2:5,2:6,7,2,2
chr12	96330311	.	GA	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.478:36:9,10:10,7:6,13,0,17
chr12	96354455	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:0,4,0,5
chr12	96356048	.	A	AAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	96356060	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=134,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr12	96356280	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.893:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr12	96359426	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,12,1
chr12	96360350	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=230,270;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr12	96361530	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,10;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.243:22:9,0:6,0:3,13,6,0
chr12	96371894	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=190,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:1,4,0,3
chr12	96374554	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=157,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.555:16:3,0:3,8:0|1:96374554_G_A:96374554:4,3,5,4
chr12	96374563	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:2,0:4,8:0|1:96374554_G_A:96374554:3,3,5,4
chr12	96374672	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=113,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,0:7,2:3,6,0,2
chr12	96379675	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:1,0:6,1,2,0
chr12	96379806	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,11,8
chr12	96387829	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,2:7,8:8,4,2,8
chr12	96388055	.	A	AGAAAATGTTCCCTCAGCTGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,268;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	96415842	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,13:0,6:0,0,19,0
chr12	96617599	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:3,0:3,5:0,7,2,3
chr12	96653501	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr12	96694162	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=118.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,23:0,8:0,0,8,23
chr12	96694165	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.302:27:13,0:1,1:6,13,0,8
chr12	96694172	.	CT	C,CTT	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=30,17,19;MFRL=145,153,186;MMQ=60,60,57;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=3.50,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,4,2:0.196,0.119:25:12,0,0:3,1,0:6,13,0,6
chr12	96694260	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=195,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr12	96704958	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:2,3:6,0:2,7,0,3
chr12	97051632	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr12	97051927	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:3,3,2,1
chr12	97079041	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.944:14:0,6:0,6:0|1:97079041_C_G:97079041:0,0,0,14
chr12	97079043	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,6:0,6:0|1:97079041_C_G:97079041:0,0,0,14
chr12	97085107	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr12	97098415	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=86.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,24,0
chr12	97303682	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.562:35:6,8:8,11:3,12,3,17
chr12	97306603	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=15,14;MFRL=126,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.218:17:3,0:1,0:1,13,0,3
chr12	97311376	.	CTT	C,CT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=184,170,180;MMQ=60,60,60;MPOS=9,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=9.37,33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,7,17:0.249,0.601:28:1,3,10:3,4,7:4,0,24,0
chr12	97311496	.	G	C	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,6:0.073:94:42,5:46,1:25,63,0,6
chr12	97311526	.	T	TA	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,23:0.427:54:11,7:19,16:1,30,1,22
chr12	97314001	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	97331238	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:97331238_GC_G:97331238:0,3,0,1
chr12	97331240	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:97331238_GC_G:97331238:0,3,0,1
chr12	97331243	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:97331238_GC_G:97331238:0,3,0,1
chr12	97339388	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr12	98921574	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr12	98925650	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,4,26
chr12	98938295	.	G	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.417:53:17,14:13,7:8,23,6,16
chr12	98938416	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=236,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.747:6:0,2:1,1:0,1,0,5
chr12	98991842	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=30.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,5:3,5:0,8,1,9
chr12	99007356	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=131,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,0:0,4:1,0,4,0
chr12	99043207	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:6,5:6,8:11,1,12,1
chr12	99059900	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:6,7:0,4:6,0,10,1
chr12	99116919	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:8,0,9,0
chr12	99117397	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=37,36;MFRL=114,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:4,1:0,0:4,0,2,0
chr12	99117426	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.318:10:3,0:3,0:2,5,3,0
chr12	99166805	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,2:7,4:10,6,3,3
chr12	99175840	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,2:7,1:9,3,2,1
chr12	99447139	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,1:1,2:0,1,0,4
chr12	99478626	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=79,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,3:1,5:2,0,6,2
chr12	99478889	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	99640680	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	99898491	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99898491_A_C:99898491:0,1,0,1
chr12	99898494	.	A	ACAAAAAAGTCTCTAGCTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99898491_A_C:99898491:0,1,0,1
chr12	100041939	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:3,3:4,1:0|1:100041939_AT_A:100041939:5,3,2,3
chr12	100041942	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,2:4,2:0|1:100041939_AT_A:100041939:5,3,2,3
chr12	100219207	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr12	100451443	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.487:31:4,6:11,9:8,8,7,8
chr12	100476705	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=172,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,0,2
chr12	100496478	.	CTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=132,97;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:3,2:2,0:5,1,2,0
chr12	100604223	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=176,153;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:100604223_A_T:100604223:0,3,0,1
chr12	100604229	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=176,153;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:100604223_A_T:100604223:0,3,0,1
chr12	100604248	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=205,153;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	100709313	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.445:19:7,3:3,5:11,0,7,1
chr12	100814008	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=115,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr12	101473109	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:0,3:0,1,1,5
chr12	101510371	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	101551268	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=234,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	101552211	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101552211_T_A:101552211:0,1,0,1
chr12	101552212	.	A	AAAGTCAGCACTCAAGCTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101552211_T_A:101552211:0,1,0,1
chr12	101552216	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101552211_T_A:101552211:0,1,0,1
chr12	101596103	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=157,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:2,0:1,1:0|1:101596103_A_C:101596103:0,4,0,1
chr12	101596108	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=157,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:3,0:0,1:0|1:101596103_A_C:101596103:0,4,0,1
chr12	101596117	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=277,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	101674053	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.210:22:5,0:10,4:7,11,2,2
chr12	101685422	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	101705760	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr12	101727118	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,2:6,0:6,3,1,1
chr12	101746042	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=153,123;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.104:29:18,0:8,3:0,26,0,3
chr12	101746063	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=173,123;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:14,1:6,2:0,20,0,3
chr12	101775069	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr12	101776805	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.120:35:14,3:16,0:12,19,3,1
chr12	101777489	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,8:0,0,2,17
chr12	101779964	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr12	101795009	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	101870804	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,4:5,4:0,11,0,8
chr12	102023405	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=172,268;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:0,1,0,3
chr12	102041757	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:4,7:2,10:6,0,15,2
chr12	102041967	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr12	102041998	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:102041998_C_G:102041998:0,1,0,1
chr12	102042000	.	G	GGGTAGGAGGTGAGGTTCTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:102041998_C_G:102041998:0,1,0,1
chr12	102042985	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=236,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr12	102045231	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,2:6,4:1,8,0,6
chr12	102046394	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr12	102046595	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr12	102046874	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=395,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:1,1:2,0,4,0
chr12	102047050	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=178,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr12	102047094	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=25604816,266;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr12	102053675	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,5:2,3:0,7,1,7
chr12	102057166	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr12	102060668	.	T	TACAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=AC;STR;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,1:0,0,0,6
chr12	102067500	.	C	CAAGCAGCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	102078094	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=220,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	102107797	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:12,0,2,0
chr12	102122900	.	AT	A	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,4:0.053:92:46,3:38,1:62,26,1,3
chr12	102128682	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:17,2:11,1:14,16,2,1
chr12	102147050	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr12	102151113	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,6:2,4:1,5,3,7
chr12	102154900	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=181,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:1,2:4,6:2,3,4,5
chr12	102160151	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=180,184;MMQ=60,23;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:102160151_G_C:102160151:0,4,0,2
chr12	102160154	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=180,184;MMQ=60,23;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,1:0|1:102160151_G_C:102160151:0,4,0,2
chr12	102182228	.	AAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr12	102224491	.	AGCC	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCC;STR;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.527:21:4,6:5,5:2,8,0,11
chr12	102433811	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr12	102433824	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:102433824_G_GC:102433824:0,4,0,1
chr12	102433825	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:102433824_G_GC:102433824:0,4,0,1
chr12	102468734	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=110,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.316:11:3,2:3,1:6,2,3,0
chr12	102559708	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,4:6,5:0,7,0,9
chr12	102576307	.	CT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=168,159,152;MMQ=60,60,60;MPOS=17,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.98,9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,6:0.323,0.323:18:5,2,5:1,4,1:6,0,10,2
chr12	102589675	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.601:33:3,10:10,10:11,2,17,3
chr12	102872155	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.829:7:0,3:1,2:1,0,6,0
chr12	103233082	.	T	TGTATAAATTGAACAAGAGCTTGCACCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	103240630	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:1,5:5,5:5,1,7,4
chr12	103249164	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr12	103249174	.	G	GAGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:103249174_G_GAGA:103249174:0,2,0,1
chr12	103249175	.	T	TCGAGGCCATCCTGGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:103249174_G_GAGA:103249174:0,2,0,1
chr12	103249178	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:103249174_G_GAGA:103249174:0,2,0,1
chr12	103271193	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0,0,11,1
chr12	103352171	.	CGCA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=GCA;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr12	103695960	.	GG	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=157,67;MMQ=56,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:4,2:0|1:103695960_GG_AT:103695960:6,4,1,1
chr12	103695963	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=157,67;MMQ=56,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:3,1:0|1:103695960_GG_AT:103695960:6,4,1,1
chr12	103988219	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:11,12,2,0
chr12	103988237	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.144:32:16,4:12,0:11,17,2,2
chr12	103988369	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:103988369_T_C:103988369:0,2,0,1
chr12	103988373	.	A	AGAACTGCCAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:103988369_T_C:103988369:0,2,0,1
chr12	104015999	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr12	104044241	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,4:5,1:10,2,5,0
chr12	104048573	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:104048573_T_C:104048573:0,0,0,1
chr12	104048574	.	T	TGCAGGGTGTCG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:104048573_T_C:104048573:0,0,0,1
chr12	104056737	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:6,5:5,2:7,4,4,4
chr12	104071158	.	TTCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TC;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:2,1,2,0
chr12	104071270	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:8,3,0,2
chr12	104077109	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:1,0:4,2:0,6,0,3
chr12	104099544	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,5:5,4:1,7,1,8
chr12	104111687	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr12	104123899	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,3:10,0:14,3,3,0
chr12	104124061	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:4,6:3,4:1,6,1,9
chr12	104131378	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=17,24;MFRL=152,177;MMQ=54,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.352:7:1,0:0,1:5,0,2,0
chr12	104131402	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=151,132;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.206:18:5,2:7,1:7,7,4,0
chr12	104131609	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:3,3:0,3:0,4,1,5
chr12	104133138	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,130;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:9,5:6,0:13,3,5,0
chr12	104133305	.	CTGTGTGTGTGTGTG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=249,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=23,16;RU=TG;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.569:2:1,1:0,0:0|1:104133305_CTGTGTGTGTGTGTG_C:104133305:0,1,0,1
chr12	104133361	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=179,121;MMQ=60,60;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104133305_CTGTGTGTGTGTGTG_C:104133305:0,1,0,1
chr12	104140517	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,1,3
chr12	104144426	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=144,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:3,2,4,2
chr12	104147207	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	104149022	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	104149251	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,3,4
chr12	104149520	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr12	104156208	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,1:3,8:2,5,2,7
chr12	104190707	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,1:11,1:10,8,0,2
chr12	104192506	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr12	104324182	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr12	104324230	.	AGGGGTGG	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGTGG;STR;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.575:19:1,5:5,6:7,1,7,4
chr12	104335750	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=48.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr12	104341015	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=176.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.981:52:0,21:0,30:0,0,46,6
chr12	104341103	.	C	T	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=321.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,97:0.991:97:0,44:0,52:0,0,47,50
chr12	104345412	.	C	CA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=206,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=56.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.921:22:1,14:0,6:0,1,1,20
chr12	104359898	.	GGC	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GC;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:0,13,0,2
chr12	104359932	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr12	104373728	.	G	GA	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,12:0.187:62:21,4:28,8:29,21,6,6
chr12	104376506	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:7,0:17,3:26,0,3,0
chr12	104376529	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=160,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:12,2:29,1:39,3,3,0
chr12	104388032	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:0,3:6,0:7,0,3,0
chr12	104388291	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,1,16
chr12	104476264	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,10:0,0,22,3
chr12	104480860	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=203,242;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr12	104480870	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=196,253;MMQ=50,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr12	104515153	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,0:2,1:0|1:104515153_A_AC:104515153:0,3,0,1
chr12	104515155	.	G	GTTTTCTAGAGTGGTTGTACCATTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:104515153_A_AC:104515153:0,3,0,1
chr12	104516953	.	CA	C,CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35,35;MFRL=128,201,157;MMQ=60,60,48;MPOS=20,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.13,6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,3:0.188,0.269:12:2,1,1:5,1,2:7,0,5,0
chr12	104707151	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:0,6,1,7
chr12	104707180	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr12	104709559	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:7,8:11,8:9,9,8,8
chr12	104712858	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.306:18:6,4:7,1:1,12,0,5
chr12	104714847	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.376:23:6,6:8,3:10,4,8,1
chr12	104720043	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.084:57:25,4:27,0:48,5,4,0
chr12	104720238	.	A	ATTTTTTTTTT	.	.	DP=99;ECNT=4;MBQ=14,33;MFRL=135,139;MMQ=55,54;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=22,32;RU=T;STR;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.561:31:3,4:2,0:4,9,5,13
chr12	104720297	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=162,186;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,7:0.121:63:36,6:17,1:0,56,0,7
chr12	104720300	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=163,158;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,7:0.129:60:33,4:16,1:0|1:104720300_A_G:104720300:0,53,0,7
chr12	104720305	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=164,158;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.069:56:35,2:16,0:0|1:104720300_A_G:104720300:0,53,0,3
chr12	104995800	.	A	AT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.450:25:8,3:6,8:2,12,1,10
chr12	105260159	.	TACACAC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=93,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=AC;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.396:6:0,1:2,1:3,1,2,0
chr12	105260365	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,1:2,0,1,4
chr12	105321734	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:6,0,8,1
chr12	105380072	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,4:6,2:6,2,6,0
chr12	105380311	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr12	105388181	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,11;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.485:6:2,1:1,0:2,1,3,0
chr12	105388515	.	GC	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:105388515_GC_AA:105388515:0,4,0,1
chr12	105388521	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:105388515_GC_AA:105388515:0,3,0,1
chr12	105388526	.	GAA	TTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:105388515_GC_AA:105388515:0,3,0,1
chr12	105418294	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,2:9,7:1,11,0,10
chr12	105432081	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	105433607	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:4,3:3,6:0,8,0,9
chr12	105434300	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,7:1,4:5,0,11,0
chr12	105445780	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=67,186;MMQ=53,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr12	105508241	.	ACAT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAT;STR;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.383:32:10,2:9,10:1,19,2,10
chr12	105534025	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr12	105536430	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr12	105538270	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,34,14;MFRL=167,165,204;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.68,3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.208,0.239:14:2,1,0:2,2,1:0,8,0,6
chr12	105538665	.	G	GT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.530:43:7,11:13,11:6,14,6,17
chr12	105540322	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.266:24:6,2:12,4:0,18,1,5
chr12	105543326	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=160.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,19:0,23:0,0,42,0
chr12	105556485	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr12	105569979	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0|1:105569979_G_A:105569979:0,4,0,3
chr12	105569985	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=202,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0|1:105569979_G_A:105569979:0,3,0,3
chr12	105582245	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr12	105591569	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=126,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=61.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:7,11:8,9:8,7,10,10
chr12	105623073	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	105629865	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr12	106461760	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=219,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr12	106461788	.	T	TAACAGGCAGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=209,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:106461788_T_TAACAGGCAGG:106461788:0,4,0,1
chr12	106461791	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=209,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:106461788_T_TAACAGGCAGG:106461788:0,4,0,1
chr12	106461793	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=209,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:106461788_T_TAACAGGCAGG:106461788:0,4,0,1
chr12	106500160	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:0,2:3,0,2,0
chr12	106632873	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:2,6,1,1
chr12	106633240	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	106633478	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:2,10,2,0
chr12	106704795	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr12	106708278	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr12	106717224	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,5:1,6:4,1,10,1
chr12	106717490	.	TTTAAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTAAA;STR;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.678:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr12	106740069	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:18,2:8,0:19,8,2,0
chr12	106826149	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:7,3:22,0:14,15,3,0
chr12	106895168	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:9,3:4,13,1,2
chr12	106895302	.	A	ACTTCAAATAAATAAATGAATGAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:106895302_A_ACTTCAAATAAATAAATGAATGAC:106895302:0,0,0,1
chr12	106895304	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:106895302_A_ACTTCAAATAAATAAATGAATGAC:106895302:0,0,0,1
chr12	106977002	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:106977002_C_G:106977002:0,0,1,0
chr12	106977005	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:106977002_C_G:106977002:0,0,1,0
chr12	106977007	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:106977002_C_G:106977002:0,0,1,0
chr12	106977009	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:106977002_C_G:106977002:0,0,1,0
chr12	107002558	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=102,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:2,1:2,1:3,3,2,0
chr12	107002707	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=105,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,0:7,2:0,10,1,1
chr12	107078562	.	A	AAAG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=42.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,6:3,5:6,1,8,3
chr12	107109304	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,2:9,0:12,10,2,0
chr12	107126948	.	C	CGTCTCTAAAAAACT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:107126948_C_CGTCTCTAAAAAACT:107126948:0,3,0,1
chr12	107126953	.	CC	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:107126948_C_CGTCTCTAAAAAACT:107126948:0,2,0,1
chr12	107126956	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:107126948_C_CGTCTCTAAAAAACT:107126948:0,2,0,1
chr12	107144635	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:107144635_A_AT:107144635:1,1,0,1
chr12	107144636	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:107144635_A_AT:107144635:1,1,0,1
chr12	107237612	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:1,1,6,0
chr12	107372520	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,2:5,0:0,10,0,2
chr12	107393931	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:7,1:10,2:0,19,0,3
chr12	107398862	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.255:17:3,1:8,3:10,3,3,1
chr12	108003911	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	108013792	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	108042960	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:6,7:3,6:9,1,11,2
chr12	108045392	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,1:5,1:7,0,0,2
chr12	108086896	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:2,6:3,6:0,5,0,12
chr12	108097635	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:108097635_T_C:108097635:0,3,0,1
chr12	108097637	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:108097635_T_C:108097635:0,3,0,1
chr12	108098587	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.402:25:7,4:8,5:0,15,0,10
chr12	108104329	.	TAAAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=11,32;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr12	108135911	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	108136893	.	CTCTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=109,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr12	108146071	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=283,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr12	108150786	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:108150786_A_C:108150786:0,1,0,1
chr12	108150788	.	T	TTCCACA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:108150786_A_C:108150786:0,1,0,1
chr12	108150790	.	A	ATTGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:108150786_A_C:108150786:0,1,0,1
chr12	108150791	.	C	CTTTTCAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:108150786_A_C:108150786:0,1,0,1
chr12	108168947	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.231:33:13,3:10,4:23,3,5,2
chr12	108170002	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,2:1,5:3,1,6,1
chr12	108600237	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	108603807	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:108603807_G_C:108603807:0,0,1,0
chr12	108603811	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:108603807_G_C:108603807:0,0,1,0
chr12	108642142	.	T	TGCAGTAAAGGCCACTTGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=189,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	108686118	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=188,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,0:6,4:5,6,2,2
chr12	108912108	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=111,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:108912108_G_A:108912108:1,2,1,0
chr12	108912115	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:108912108_G_A:108912108:1,3,1,0
chr12	108918330	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0,2,0,7
chr12	108919168	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr12	108919390	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,1:7,4:6,9,1,4
chr12	108919424	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=135,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:3,10,0,2
chr12	108924904	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:6,2,6,1
chr12	108925003	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:8,6,2,0
chr12	108931779	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.549:11:2,4:2,2:4,1,6,0
chr12	108932053	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr12	108932916	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr12	108943028	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr12	108956610	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	108986031	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,3:0,1:0,5,0,4
chr12	109016785	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	109017408	.	T	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=25,18;MFRL=98,150;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,8:0.108:64:23,1:16,1:25,31,5,3
chr12	109041156	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:11,2:10,0:23,0,0,7
chr12	109041165	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.223:32:12,1:11,4:25,0,0,7
chr12	109041171	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.277:34:12,2:10,2:25,0,0,9
chr12	109041175	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.167:34:12,0:10,2:23,5,0,6
chr12	109072234	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:109072234_C_T:109072234:0,3,0,1
chr12	109072235	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:109072234_C_T:109072234:0,3,0,1
chr12	109185968	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.192:18:10,2:4,1:7,8,2,1
chr12	109185979	.	C	CCAG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=134,144;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:8,2:4,0:7,5,1,1
chr12	109194626	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:16,0:13,3:14,16,1,2
chr12	109198831	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,2:13,0:17,8,2,0
chr12	109221034	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:17,0:13,2:22,8,1,1
chr12	109283175	.	CT	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,226;MMQ=60,36;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:109283175_CT_TG:109283175:3,0,1,0
chr12	109283178	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=166,226;MMQ=60,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:109283175_CT_TG:109283175:3,0,1,0
chr12	109283181	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=166,226;MMQ=60,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:109283175_CT_TG:109283175:3,0,1,0
chr12	109309601	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:109309601_G_GT:109309601:2,1,0,1
chr12	109309604	.	GC	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:109309601_G_GT:109309601:2,1,0,1
chr12	109331162	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.517:11:1,2:4,1:1,4,0,6
chr12	109510086	.	GT	G	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,9:0.135:57:13,3:27,5:17,31,5,4
chr12	109511144	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr12	109520492	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,0:13,2:11,13,1,1
chr12	109520883	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0,18,0,2
chr12	109536397	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.069:56:18,2:35,1:25,28,1,2
chr12	109540752	.	A	ATTTTTTTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,0;MFRL=131,121;MMQ=60,40;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=22,31;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:0,0:1,0:1,1,0,3
chr12	109541171	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:6,1,5,1
chr12	109547568	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=169,58;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr12	109547586	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:0,2:1,3:0,1,5,1
chr12	109605794	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,2:11,0:14,12,1,1
chr12	109612035	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,0:4,2:1,7,0,2
chr12	109617181	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	109637188	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,3:0,2:1,1,5,0
chr12	109670468	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr12	109670657	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	109671701	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,5:0,3,1,5
chr12	109671738	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,1:5,3:4,4,3,2
chr12	109675029	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,12,13
chr12	109683575	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=122,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,3:1,6,4,3
chr12	109685355	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,14;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:9,0:22,0,2,0
chr12	109685545	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0,0,7,19
chr12	109691991	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=101.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,12:0,0,24,4
chr12	109701959	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	109703291	.	C	CTTCACCTT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=139,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:1,0:0|1:109703291_C_CTTCACCTT:109703291:5,4,1,1
chr12	109703293	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,18;MFRL=146,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,1:0,0:0|1:109703291_C_CTTCACCTT:109703291:5,5,1,1
chr12	109703294	.	A	AAGGCTG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=146,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,2:0,0:0|1:109703291_C_CTTCACCTT:109703291:5,5,1,1
chr12	109703326	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=139,44;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,1:0,1:1,6,1,1
chr12	109704177	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	109723049	.	C	CGTGTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=GT;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr12	109725274	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.194:21:9,1:2,1:4,13,0,4
chr12	109725601	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	109831296	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=161,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.320:7:4,0:1,2:0,5,1,1
chr12	109831318	.	T	TCCTGCTCCAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	109831351	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	109834171	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=124,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:9,4,0,2
chr12	109834486	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	109835691	.	C	CACTTATCAGTAAATTGGACATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=178,242;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	109845778	.	C	CATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,3:3,1:0,5,0,5
chr12	109847969	.	CA	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=177,169;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:18,1:12,1:1,30,0,2
chr12	109847973	.	A	AG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=175,179;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:18,1:11,2:1,29,0,3
chr12	109853306	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.465:24:4,6:8,5:7,6,6,5
chr12	109853462	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:2,8,0,5
chr12	109858921	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=116,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:109858921_T_C:109858921:0,3,0,1
chr12	109858925	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=116,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:109858921_T_C:109858921:0,3,0,1
chr12	109863721	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TC;STR;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,4,0
chr12	109872732	.	ATGGT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=125,218;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:3,0,1,0
chr12	109872749	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=125,218;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:109872749_T_C:109872749:3,0,1,0
chr12	109872751	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=125,218;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:109872749_T_C:109872749:3,0,1,0
chr12	109874230	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:4,3:1,3:6,0,6,0
chr12	109883254	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,0:1,2:4,1,2,0
chr12	109907303	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,4:7,6:8,3,9,1
chr12	109928998	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,58;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:2,0:11,3:0,13,0,3
chr12	109936211	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,0:4,4:0,4,0,4
chr12	109949134	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=95,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:5,9:9,3:5,9,4,8
chr12	109959389	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.554:16:5,3:2,6:0,7,0,9
chr12	109964102	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:4,2,1,1
chr12	109971215	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:1,1,3,0
chr12	110029008	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:0,5:3,2:2,2,5,2
chr12	110029186	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=83,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr12	110221631	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=160,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr12	110222321	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:110222321_A_AG:110222321:0,3,0,1
chr12	110222324	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:110222321_A_AG:110222321:0,3,0,1
chr12	110231497	.	A	ATGGAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:2,10,0,2
chr12	110231717	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.429:24:6,3:5,7:9,5,10,0
chr12	110234572	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110234572_G_GC:110234572:0,0,0,1
chr12	110234574	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110234572_G_GC:110234572:0,0,0,1
chr12	110234577	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110234572_G_GC:110234572:0,0,0,1
chr12	110236801	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	110238567	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=180,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:110238567_G_T:110238567:0,3,0,1
chr12	110238568	.	GGGCAGGGGACGGTCA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=180,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:110238567_G_T:110238567:0,3,0,1
chr12	110238585	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=180,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:110238567_G_T:110238567:0,3,0,1
chr12	110238590	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=180,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:110238567_G_T:110238567:0,3,0,1
chr12	110296489	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,1:11,1:13,11,1,1
chr12	110350895	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=110,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:7,2:2,10,0,2
chr12	110421484	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.103:34:16,3:13,0:13,18,1,2
chr12	110427638	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.271:13:4,0:4,3:4,6,0,3
chr12	110437636	.	A	AAAGGGTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr12	110449805	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,2:13,1:22,4,3,0
chr12	110454085	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,40145975;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:10,0,2,0
chr12	110467301	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=170,47;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:2,0:11,2:0|1:110467301_G_T:110467301:5,9,1,1
chr12	110467307	.	TGAAGA	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=160,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:2,0:9,2:0|1:110467301_G_T:110467301:6,9,1,1
chr12	110467314	.	TTTCCC	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:3,0:12,2:0|1:110467301_G_T:110467301:10,10,1,1
chr12	110467320	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:0|1:110467301_G_T:110467301:10,10,1,1
chr12	110467324	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=158,47;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:13,2:0|1:110467301_G_T:110467301:11,10,1,1
chr12	110467328	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=144,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:0|1:110467301_G_T:110467301:11,8,1,1
chr12	110468662	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=200,147;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	110566736	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.069:56:27,3:25,0:36,17,2,1
chr12	110570264	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,35,34;MFRL=170,149,173;MMQ=56,50,40;MPOS=18,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=A;STR;TLOD=4.32,5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,4:0.156,0.263:15:3,0,0:6,2,4:9,0,6,0
chr12	110834057	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=102,174;MMQ=60,55;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.187:23:7,0:7,0:11,8,4,0
chr12	110834061	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=97,87;MMQ=60,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:8,0:8,0:12,8,2,0
chr12	110873127	.	CTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=166,147;MMQ=46,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:1,2:0,7,1,3
chr12	110905869	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,15,2
chr12	110911024	.	CT	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.091:41:26,2:9,1:0,38,0,3
chr12	110937445	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=157,72;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:0,0:8,3:0,8,0,4
chr12	110944299	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,1:2,1:1,1,3,0
chr12	110950775	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,0:0,3,0,3
chr12	110956739	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,1:11,1:8,12,2,0
chr12	111087889	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=192,123;MMQ=60,40;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr12	111087901	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=192,145;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:8,0,3,0
chr12	111087918	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=184,93;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:8,0,2,1
chr12	111180399	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.158:21:6,1:10,0:18,0,3,0
chr12	111290871	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr12	111318940	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:4,4,1,1
chr12	111746127	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=177,45;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:111746127_G_A:111746127:2,6,1,1
chr12	111746139	.	T	TTCAAGTGATC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=142,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:0|1:111746127_G_A:111746127:1,8,1,1
chr12	111772279	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=120,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,0:9,1:0|1:111772279_A_C:111772279:0,14,2,0
chr12	111772286	.	AG	CC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:3,0:9,2:0|1:111772279_A_C:111772279:0,13,2,0
chr12	111785423	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,0:0|1:111785423_C_G:111785423:1,3,3,0
chr12	111785426	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,1:0|1:111785423_C_G:111785423:1,3,3,0
chr12	111785429	.	CAGA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=149,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:111785423_C_G:111785423:2,3,2,0
chr12	111785437	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=149,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:111785423_C_G:111785423:2,3,2,0
chr12	111856126	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	111884608	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.458:35:12,6:6,9:13,6,5,11
chr12	112037000	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	112097210	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	112306512	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=33,34,34,34;MFRL=156,163,138,0;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,23,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.49,20.94,4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:33,5,14,5:0.087,0.241,0.092:57:16,2,3,3:12,3,11,0:29,4,21,3
chr12	112309041	.	G	GTCCA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:0|1:112309041_G_GTCCA:112309041:0,17,0,2
chr12	112309046	.	TTCTA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:112309041_G_GTCCA:112309041:0,18,0,2
chr12	112515954	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.172:33:13,3:14,2:26,2,5,0
chr12	112572537	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:2,2:4,8:3,4,3,7
chr12	112610374	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	112610714	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr12	112622375	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=137,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,6:3,5:6,1,8,3
chr12	112638688	.	CGT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=GT;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.836:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr12	112642490	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,10;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:112642490_G_T:112642490:0,2,0,1
chr12	112642492	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:112642490_G_T:112642490:0,2,0,1
chr12	112642493	.	T	TAAAAAAAAAACAAACAAGCAGAAAGCAACAAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:112642490_G_T:112642490:0,2,0,1
chr12	112642494	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:112642490_G_T:112642490:0,2,0,1
chr12	112654755	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=148,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:7,0:0|1:112654755_C_G:112654755:9,6,1,1
chr12	112654760	.	G	GTCA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=144,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:8,0:0|1:112654755_C_G:112654755:12,5,1,1
chr12	112654761	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=144,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:9,0:0|1:112654755_C_G:112654755:12,5,1,1
chr12	112685781	.	T	TACACAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=AC;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	112692019	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=219,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,2:4,0:0,8,0,2
chr12	112711687	.	G	GGAGCACACATCTTTGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	112712857	.	CACCCT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr12	112720995	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,1:18,1:13,14,0,2
chr12	112893675	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=159,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,1:6,3:12,0,4,0
chr12	113313656	.	G	GTTTTCAGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113313656_G_GTTTTCAGT:113313656:0,0,0,1
chr12	113313659	.	T	TTTTGGTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113313656_G_GTTTTCAGT:113313656:0,0,0,1
chr12	113349099	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr12	113354535	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr12	113376320	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=232,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,5,1
chr12	113376543	.	C	CCAAAGGG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAAAGGG;STR;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,2:5,2:0,6,0,4
chr12	113385918	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=58,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.568:17:3,3:3,4:2,5,4,6
chr12	113388445	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:6,0,5,0
chr12	113398921	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:5,5:11,6:5,11,5,6
chr12	113405181	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:6,0,4,0
chr12	113407849	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=93,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.445:16:5,2:4,5:0|1:113407849_G_T:113407849:3,6,2,5
chr12	113407856	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=93,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:2,3:4,5:0|1:113407849_G_T:113407849:2,5,2,6
chr12	113435293	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.370:9:2,2:3,1:4,2,3,0
chr12	113435545	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=158,71;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,0:4,4:1,6,1,3
chr12	113444418	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.570:19:4,9:4,2:1,7,3,8
chr12	113445605	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,5:9,2:9,5,4,3
chr12	113448228	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr12	113530896	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,12:0.478:25:6,6:7,5:0|1:113530896_G_A:113530896:10,3,12,0
chr12	113530899	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,13:0,13:0|1:113530896_G_A:113530896:0,0,23,3
chr12	113531245	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,33;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr12	113531254	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr12	113531295	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:113531295_T_C:113531295:0,0,5,2
chr12	113531305	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.908:9:0,3:0,3:0|1:113531295_T_C:113531295:0,0,5,4
chr12	113533050	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr12	113539822	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr12	113541940	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,14,8
chr12	113544874	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr12	113553408	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr12	113568822	.	GGC	G	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=167,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:113568822_GGC_G:113568822:0,6,1,1
chr12	113568826	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=34,20;MFRL=167,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:113568822_GGC_G:113568822:0,6,1,1
chr12	113568831	.	GT	TG	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=33,23;MFRL=178,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,1:0|1:113568822_GGC_G:113568822:0,5,1,1
chr12	113568838	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=253,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:113568838_GC_G:113568838:0,3,0,1
chr12	113568840	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=253,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:113568838_GC_G:113568838:0,3,0,1
chr12	113568843	.	GACAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=243,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:113568838_GC_G:113568838:0,4,0,1
chr12	113568850	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=232,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:113568838_GC_G:113568838:0,3,0,1
chr12	113568856	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=232,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:113568838_GC_G:113568838:0,3,0,1
chr12	113592980	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=206,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr12	113603518	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=158,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.490:20:3,4:7,4:3,7,5,5
chr12	113610374	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=184,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,2:0,0:0,4,2,0
chr12	113612863	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=37,36;MFRL=191,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr12	113616883	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,2:13,0:11,10,1,1
chr12	113645509	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.394:26:8,2:7,8:11,5,4,6
chr12	113704209	.	A	ATTTCTTCCTTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=281,239;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	113707751	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=194,160;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:3,0:0,1:0|1:113707751_T_C:113707751:0,3,0,1
chr12	113707756	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=194,160;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:113707751_T_C:113707751:0,3,0,1
chr12	113728893	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	113731110	.	AC	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=151,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,2:0|1:113731110_AC_GT:113731110:1,10,1,1
chr12	113731117	.	GC	CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:0|1:113731110_AC_GT:113731110:1,12,1,1
chr12	113770738	.	G	GAAATATACACAATTATTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	113770768	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,335;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	113807049	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr12	113826500	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:3,3:0,3:0,4,1,5
chr12	113835070	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.221:22:7,1:7,0:4,13,5,0
chr12	113835075	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=28,13;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.274:18:4,0:4,0:4,9,5,0
chr12	113835078	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,9;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.291:21:9,0:4,0:6,9,6,0
chr12	113835084	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:11,1:5,1:7,12,6,0
chr12	113835090	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=30,9;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:9,0:5,0:8,14,6,0
chr12	113835093	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:9,0:6,0:7,10,5,0
chr12	113837002	.	T	TTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.530:13:2,2:4,5:1,5,1,6
chr12	113866044	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr12	113871947	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=155,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:1,2:2,0:3,0,1,2
chr12	113872001	.	CC	GG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=17,18;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:1,0:0|1:113872001_CC_GG:113872001:2,1,1,0
chr12	113872008	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=17,18;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:1,0:0|1:113872001_CC_GG:113872001:2,1,1,0
chr12	114260945	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:114260945_AG_CC:114260945:1,0,1,0
chr12	114260950	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,12;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:114260945_AG_CC:114260945:1,0,1,0
chr12	114260953	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:114260945_AG_CC:114260945:1,0,1,0
chr12	114260956	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,17;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:114260945_AG_CC:114260945:1,0,1,0
chr12	114260959	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:114260945_AG_CC:114260945:2,0,1,0
chr12	114260961	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,18;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:114260945_AG_CC:114260945:2,0,1,0
chr12	114260963	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,18;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:1,0:0|1:114260945_AG_CC:114260945:2,0,1,0
chr12	114282640	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:2,3,0,2
chr12	114296587	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:2,3,8,0
chr12	114296745	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:0,1:3,1:0,4,0,2
chr12	114356357	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr12	114362621	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr12	114362632	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr12	114377686	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=279,278;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	114380260	.	A	AGTGCAGTTTGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114380260_A_AGTGCAGTTTGC:114380260:0,0,0,1
chr12	114380266	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114380260_A_AGTGCAGTTTGC:114380260:0,1,0,1
chr12	114380269	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114380260_A_AGTGCAGTTTGC:114380260:0,1,0,1
chr12	114380270	.	G	GGGCACAGGGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114380260_A_AGTGCAGTTTGC:114380260:0,1,0,1
chr12	114383559	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=195,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,6,0
chr12	114393028	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=159,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:5,4:9,16:6,8,7,13
chr12	114793240	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	114832510	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	114837508	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=188,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:114837508_AT_A:114837508:0,1,0,1
chr12	114837516	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=188,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:114837508_AT_A:114837508:0,1,0,1
chr12	115109972	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=130,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:11,8,1,1
chr12	115114036	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	115118997	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr12	116412921	.	AT	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,1:1,0,5,0
chr12	116418785	.	T	TGGCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=190,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:116418785_T_TGGCAA:116418785:0,1,0,1
chr12	116418787	.	G	GACACAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=190,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:116418785_T_TGGCAA:116418785:0,1,0,1
chr12	116434826	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:14,1:18,1:19,13,1,1
chr12	116445450	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=18,19;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,14;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.108:25:3,0:4,0:0|1:116445450_CAAAAAA_C:116445450:2,21,0,2
chr12	116445472	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:8,2:21,0:0|1:116445450_CAAAAAA_C:116445450:1,29,0,2
chr12	116445475	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:8,2:21,0:0|1:116445450_CAAAAAA_C:116445450:1,29,0,2
chr12	116456991	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,2:9,2:17,1,4,0
chr12	116549320	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=117,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.272:13:6,2:1,0:6,4,3,0
chr12	116586414	.	CTATATA	C,CTA,CTATA,CTATATATA	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=26,33,33,23,25;MFRL=155,163,157,149,163;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=13,14,18,22;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=11,8,9,10,12;RU=TA;STR;TLOD=3.31,80.70,26.36,6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:6,2,27,13,3:0.042,0.481,0.249,0.081:51:4,1,10,4,1:1,1,14,7,2:0,6,1,44
chr12	117013730	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr12	117191948	.	C	CCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	117290601	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr12	117365809	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:8,2:10,1:17,1,3,0
chr12	117383320	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr12	117402755	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	117423264	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,0,12
chr12	117426616	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.056:69:34,2:32,1:39,27,3,0
chr12	117448196	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:8,1:9,10,1,1
chr12	117465358	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr12	117465857	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,9,6
chr12	117593782	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr12	117681180	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:17,2:14,0:10,21,0,2
chr12	117696820	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,3:7,0:14,4,3,0
chr12	117705774	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr12	117718473	.	G	GGGTAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr12	117718686	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,4:0,6:1,0,2,8
chr12	118020045	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr12	118199012	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=16,13;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.282:22:3,0:4,1:3,13,0,6
chr12	118199041	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=174,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.226:18:4,0:6,1:5,9,0,4
chr12	118463653	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.883:5:0,3:0,0:0,0,3,2
chr12	118464688	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr12	118473054	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=118,158;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.338:15:8,3:2,1:7,3,3,2
chr12	118476079	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.447:29:9,6:7,6:12,4,9,4
chr12	118480874	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=196,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:2,0:1,1:2,1,1,1
chr12	118508796	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:11,3:4,3:11,4,4,2
chr12	118509086	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	118509138	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:8,2:9,3:0|1:118509138_A_G:118509138:15,3,5,0
chr12	118509148	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:10,3:9,5:0|1:118509138_A_G:118509138:15,5,8,0
chr12	118509157	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,9:0.303:31:12,3:10,6:0|1:118509138_A_G:118509138:17,5,9,0
chr12	118511412	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr12	118520240	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=97,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,3:1,2:2,2,1,4
chr12	118627823	.	T	TCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118627823_T_TCC:118627823:0,0,0,1
chr12	118627824	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118627823_T_TCC:118627823:0,0,0,1
chr12	118627827	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118627823_T_TCC:118627823:0,0,0,1
chr12	118627832	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118627823_T_TCC:118627823:0,0,0,1
chr12	118673483	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,17;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:0,0:0,6,0,3
chr12	118673542	.	ATGC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=204,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:118673542_ATGC_A:118673542:0,2,0,1
chr12	118673547	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=226,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118673542_ATGC_A:118673542:0,1,0,1
chr12	118673564	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118673564_T_G:118673564:0,0,0,1
chr12	118673566	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118673564_T_G:118673564:0,0,0,1
chr12	118673568	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118673564_T_G:118673564:0,0,0,1
chr12	118673569	.	T	TAACCCAGGA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118673564_T_G:118673564:0,0,0,1
chr12	118681158	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:5,1,4,0
chr12	118818151	.	G	GGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	118821800	.	CT	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.209:27:15,3:6,1:18,4,3,2
chr12	119419603	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr12	119419632	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:1,2:2,2:4,0,4,1
chr12	119560042	.	C	CAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	119594324	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:23,0:20,2:0|1:119594324_C_T:119594324:20,23,0,2
chr12	119594329	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:21,0:16,2:0|1:119594324_C_T:119594324:21,23,0,2
chr12	119773107	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=99,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr12	119773164	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=232,224;MMQ=30,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr12	119937983	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0,0,1,12
chr12	119938010	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr12	119954617	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=222,284;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119954617_A_T:119954617:0,1,0,1
chr12	119954618	.	G	GTCTCTTACTGTTATACCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=222,284;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:119954617_A_T:119954617:0,1,0,1
chr12	119958068	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr12	120031881	.	C	CCGAAACACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120031881_C_CCGAAACACT:120031881:0,1,0,1
chr12	120031884	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120031881_C_CCGAAACACT:120031881:0,1,0,1
chr12	120067727	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	120078577	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr12	120156408	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr12	120158203	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr12	120171982	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:16,3:8,0:16,9,3,0
chr12	120171995	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,9:0,0,18,9
chr12	120220282	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr12	120220506	.	TAAGAGAGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=209,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	120221636	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr12	120221890	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,2:9,0:3,9,0,2
chr12	120270528	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr12	120288164	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=99,217;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:120288164_T_A:120288164:1,3,0,1
chr12	120288168	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=99,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:120288164_T_A:120288164:1,3,0,1
chr12	120288178	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=208,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr12	120288179	.	T	A,TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32,31;MFRL=198,223,217;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,0:0,1,1:0,1,0,2
chr12	120518874	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=242,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	120536799	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,0:3,1:0|1:120536799_A_C:120536799:0,5,5,0
chr12	120536803	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,1:3,1:0|1:120536799_A_C:120536799:0,5,5,0
chr12	120536809	.	GA	CC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.386:11:1,0:4,1:0|1:120536799_A_C:120536799:2,5,4,0
chr12	120536814	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=96,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.418:10:1,0:5,1:0|1:120536799_A_C:120536799:2,4,4,0
chr12	120546136	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:7,4:4,5:0|1:120546136_G_A:120546136:10,1,11,0
chr12	120546145	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:7,4:5,8:0|1:120546136_G_A:120546136:11,1,12,0
chr12	120565691	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:14,2:13,0:13,14,2,0
chr12	120575021	.	G	GAAACCCTTGTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:5,4,1,1
chr12	120576265	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:3,3:0,2:0,3,0,6
chr12	120580823	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=202,304;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr12	120586193	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr12	120589160	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr12	120591251	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	120602078	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=165,244;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr12	120606149	.	CCCCAGAGCTG	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:120606149_CCCCAGAGCTG_C:120606149:0,8,0,2
chr12	120606161	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,1:5,0:0|1:120606149_CCCCAGAGCTG_C:120606149:0,7,0,2
chr12	120606163	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=100,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,5:0.757:6:1,1:0,4:1|0:120606149_CCCCAGAGCTG_C:120606149:0,1,0,5
chr12	120608031	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,9:5,2:4,4,6,5
chr12	120608063	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=152,32;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,1:11,1:9,8,0,2
chr12	120614093	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr12	120616572	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:5,13,0,2
chr12	120628027	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=169,167;MMQ=53,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.510:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr12	120628046	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=161,161;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.413:11:2,1:2,1:4,2,5,0
chr12	120628060	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=122,164;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,1:6,1:6,7,4,0
chr12	120628265	.	TTGAG	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:120628265_TTGAG_T:120628265:0,10,0,2
chr12	120628271	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:120628265_TTGAG_T:120628265:0,10,0,2
chr12	120628275	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=168,202;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:120628265_TTGAG_T:120628265:0,8,0,2
chr12	120628289	.	G	GAAGTGTGTTTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.322:5:1,1:2,0:0|1:120628289_G_GAAGTGTGTTTT:120628289:0,4,0,1
chr12	120628291	.	A	AAGAGGCAGAGGCTTGAGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:120628289_G_GAAGTGTGTTTT:120628289:0,3,0,1
chr12	120636549	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,5:7,7:7,5,2,10
chr12	120651885	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=218,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:1,0:1,1:0|1:120651885_A_C:120651885:1,3,2,0
chr12	120651888	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=218,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:120651885_A_C:120651885:1,3,2,0
chr12	120651893	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,13;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:0,0:0|1:120651885_A_C:120651885:1,2,2,0
chr12	120651898	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,11;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,0:0|1:120651885_A_C:120651885:1,2,2,0
chr12	120651955	.	G	GGAGCCTGGAAA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=135,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:5,3,1,1
chr12	120750239	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=98,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,0:2,7:2,0,6,1
chr12	120791042	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:8,0,7,1
chr12	120791197	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=103,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.506:36:6,12:10,6:9,9,6,12
chr12	120796703	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=250,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr12	120800823	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,12,7
chr12	120884081	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:11,1:20,1:12,19,0,2
chr12	120897652	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=105.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,19:0,0,29,1
chr12	120902007	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr12	120907147	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr12	120934257	.	G	A	.	.	DP=90;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=130,114;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,3:0.047:82:34,2:42,1:38,41,2,1
chr12	120934273	.	ATG	A	.	.	DP=80;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=131,119;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,3:0.053:73:31,2:36,1:30,40,1,2
chr12	120934289	.	T	C	.	.	DP=85;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=131,236;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,2:0.036:82:32,2:37,0:0|1:120934289_T_C:120934289:36,44,0,2
chr12	120934296	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=133,236;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,2:0.035:85:33,2:41,0:0|1:120934289_T_C:120934289:38,45,0,2
chr12	120934298	.	CT	TG	.	.	DP=84;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=138,236;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,2:0.035:83:34,2:45,0:0|1:120934289_T_C:120934289:36,45,0,2
chr12	120942749	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:4,0:16,2:11,9,2,0
chr12	120947948	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr12	120998481	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr12	121004564	.	CA	C,CAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,35,33;MFRL=162,146,134;MMQ=60,56,40;MPOS=26,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,19;RU=A;STR;TLOD=5.74,8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,5:0.238,0.274:20:2,4,2:7,1,3:9,1,10,0
chr12	121004605	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=112,124;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:17,0:17,1:21,21,2,0
chr12	121017810	.	TG	CA,CG,TAAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,34,27,30;MFRL=191,215,137,175;MMQ=60,60,60,40;MPOS=4,-1,5;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.07,3.07,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,1,1,1:0.182,0.182,0.182:7:4,1,0,0:0,0,1,1:0,4,0,3
chr12	121017819	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=215,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr12	121094141	.	TGAAGAAGGGGTCTA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	121097622	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr12	121125380	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=158,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.166:20:7,0:3,0:2,15,0,3
chr12	121131891	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,4:4,4:2,3,6,2
chr12	121132100	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr12	121133037	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=116,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,2:6,4:0,8,0,6
chr12	121151062	.	CTCTCTTG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:2,7:9,4:9,3,8,3
chr12	121157851	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,3:1,4,1,5
chr12	121175984	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=117,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr12	121203994	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,0,2
chr12	121206055	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:2,3:1,0:3,0,2,1
chr12	121220375	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:9,0,3,0
chr12	121221628	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,2:6,5:0,10,1,6
chr12	121222411	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=82.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,28:0.491:57:15,12:14,16:9,20,6,22
chr12	121248584	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.429:35:8,7:12,7:14,6,10,5
chr12	121426545	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr12	121426901	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=164,271;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:1,4,0,3
chr12	121426933	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=80,297;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr12	121434630	.	C	CTCATTCAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=TCAT;STR;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.432:14:5,4:3,2:6,2,6,0
chr12	121437114	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:8,5:5,6:11,3,9,2
chr12	121437221	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:7,5:7,5:5,11,3,8
chr12	121442199	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,3:8,3:4,6,2,4
chr12	121444026	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=127,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:3,0:3,4:6,0,4,0
chr12	121592823	.	C	CCTCCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:121592823_C_CCTCCTG:121592823:0,4,0,1
chr12	121592827	.	AG	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:121592823_C_CCTCCTG:121592823:0,4,0,1
chr12	121592845	.	C	CTCTCCCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	121603053	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	121603118	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=143,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0|1:121603118_T_C:121603118:5,0,4,1
chr12	121603122	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=143,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,0:2,1:0|1:121603118_T_C:121603118:5,0,4,1
chr12	121603825	.	ATGTT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=89,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGTT;STR;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,3:2,5:2,1,8,0
chr12	121603856	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=115,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,4:4,9:5,3,10,3
chr12	121615283	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:8,2:5,3:3,10,0,5
chr12	121618278	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,21,21;MFRL=166,165,138;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=6.90,17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,8:0.277,0.504:15:0,4,4:2,0,3:0,3,0,12
chr12	121622641	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,1:4,2:0,12,0,3
chr12	121659999	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,0:0,2:0,2,0,2
chr12	121690548	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=122,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.417:22:8,5:5,3:0|1:121690548_T_C:121690548:3,10,4,5
chr12	121690555	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=122,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.417:22:6,5:4,4:0|1:121690548_T_C:121690548:3,10,4,5
chr12	121706533	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr12	121711768	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr12	121764799	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	121773499	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:6,11,0,2
chr12	121773552	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr12	121785795	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	121789887	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	121789927	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=68,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,5:2,3:2,1,6,2
chr12	121867854	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:15,2:6,0:18,3,2,0
chr12	121879111	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	121882098	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr12	121883318	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	121947848	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=263,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:121947848_G_T:121947848:0,1,0,1
chr12	121947871	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=187,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121947848_G_T:121947848:0,1,0,1
chr12	122064773	.	CCCGCCA	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGCCA;STR;TLOD=64.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,32:0.961:34:1,16:1,16:2,0,29,3
chr12	122079406	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:6,7,1,1
chr12	122097043	.	G	GCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=CA;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,0:0,0,3,0
chr12	122097092	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.495:22:6,5:5,4:8,3,8,3
chr12	122186268	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=116.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,16:0,18:0|1:122186268_C_T:122186268:0,0,24,10
chr12	122186276	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=131,70;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:15,0:14,3:0|1:122186268_C_T:122186268:20,9,1,2
chr12	122231368	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr12	122231573	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	122246272	.	T	TGGGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,6;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,1,0
chr12	122255168	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,1:4,1:9,4,0,2
chr12	122257852	.	T	TAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	122281575	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	122284715	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr12	122292755	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=191,121;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:122292755_G_T:122292755:0,3,0,1
chr12	122292758	.	T	TCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=191,121;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:122292755_G_T:122292755:0,3,0,1
chr12	122292769	.	C	CTGCCCTGCATG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=191,121;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr12	122296784	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.357:11:2,2:5,0:3,4,0,4
chr12	122359172	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.497:30:5,8:10,6:14,1,15,0
chr12	122359397	.	G	GGAGGAGGAGGAGAAA	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=149,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=165.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,39:0.868:44:1,12:0,17:4,1,18,21
chr12	122359403	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=118,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:19,4:22,0:19,24,3,1
chr12	122361929	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr12	122386807	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:2,0:4,4:7,0,3,1
chr12	122389557	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	122391963	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr12	122394921	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=188,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:7,0,3,0
chr12	122437594	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:2,2:0,1:2,0,2,2
chr12	122439369	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr12	122468756	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:0,5,0,7
chr12	122492978	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr12	122612325	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	122612350	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	122613599	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr12	122614060	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr12	122614209	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	122614387	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr12	122616739	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=170,172;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr12	122616749	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=156,282;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:12,0,2,0
chr12	122658383	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=90.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,12:0,0,16,10
chr12	122668965	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr12	122669300	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:2,5,0,2
chr12	122672311	.	G	GAGGTGCACTGACCATGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=159,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,1:3,0:0|1:122672311_G_GAGGTGCACTGACCATGA:122672311:5,2,1,1
chr12	122672316	.	GC	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=151,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:122672311_G_GAGGTGCACTGACCATGA:122672311:4,2,1,1
chr12	122675838	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr12	122676182	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	122684966	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr12	122689060	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=256,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	122692027	.	A	AGTTACTTTAATTATTTGGGAAGGACTTCTCATATTTAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	122758531	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,57;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,1:10,1:12,1,2,0
chr12	122762759	.	TGAGG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,1,0
chr12	122801368	.	A	C	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,3:0.055:70:39,3:28,0:27,40,0,3
chr12	122817507	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.350:24:7,5:7,3:15,1,6,2
chr12	122838956	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.539:20:4,3:5,8:9,0,7,4
chr12	122839917	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=149,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:0|1:122839917_G_C:122839917:1,10,1,1
chr12	122839920	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=153,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:0|1:122839917_G_C:122839917:0,10,1,1
chr12	122839923	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=153,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:2,2:7,0:0|1:122839917_G_C:122839917:0,10,1,1
chr12	122862560	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=221,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr12	122964708	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:6,4:8,4:12,2,5,3
chr12	122966016	.	TA	T,TAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=143,103,154;MMQ=60,60,60;MPOS=13,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.92,19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,12:0.142,0.459:25:4,0,4:6,3,7:10,0,15,0
chr12	122983460	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:8,8:8,4:3,13,2,10
chr12	122991478	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=131,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,1:3,3:0,4,1,3
chr12	122993011	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,7:6,2:5,4,1,8
chr12	123001737	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:10,4:2,4:11,2,8,0
chr12	123003317	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr12	123024326	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,10;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:6,0:6,0:2,15,0,4
chr12	123024332	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,1:4,0:0,14,0,3
chr12	123024406	.	GGAAC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=223,286;MMQ=60,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:123024406_GGAAC_G:123024406:0,4,0,1
chr12	123024412	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=223,286;MMQ=60,30;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:123024406_GGAAC_G:123024406:0,4,0,1
chr12	123026536	.	T	TG	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=156,137;MMQ=60,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:15,3:20,1:35,2,4,0
chr12	123026537	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=155,144;MMQ=60,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:16,2:22,0:38,2,2,0
chr12	123026539	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=155,133;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:19,1:20,1:38,2,2,0
chr12	123026545	.	AAT	A	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,3:0.078:49:18,1:23,1:0|1:123026545_AAT_A:123026545:40,6,3,0
chr12	123026546	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=153,133;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:16,2:24,0:36,5,2,0
chr12	123026548	.	G	GCA	.	.	DP=52;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.079:48:21,1:24,2:0|1:123026545_AAT_A:123026545:39,6,3,0
chr12	123057652	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:7,11:3,4:6,4,7,9
chr12	123061637	.	T	TATCTATGTTAGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=136,252;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr12	123061656	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=197,136;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123061656_G_T:123061656:0,1,0,1
chr12	123061660	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=253,136;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:123061656_G_T:123061656:0,2,0,1
chr12	123061661	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=253,136;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:123061656_G_T:123061656:0,2,0,1
chr12	123065304	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=187,254;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:0,10,0,2
chr12	123065311	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=199,249;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:123065311_T_C:123065311:0,6,0,2
chr12	123065313	.	CC	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=199,249;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:123065311_T_C:123065311:0,6,0,2
chr12	123067587	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0,6,1,5
chr12	123071365	.	AT	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=193,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr12	123078808	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:6,0:12,2,3,0
chr12	123087819	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.478:8:3,3:1,1:0,4,1,3
chr12	123107165	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.294:14:4,1:6,3:2,8,1,3
chr12	123200099	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr12	123201445	.	TAA	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,131;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.915:7:0,1:0,1:0,0,0,7
chr12	123201508	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=53.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr12	123201539	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	123214299	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=132,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr12	123214325	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr12	123214402	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=197,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr12	123246766	.	ATT	A,AT	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=154,130,131;MMQ=60,60,60;MPOS=13,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.04,73.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,3,36:0.048,0.461:78:25,1,19:12,1,17:6,33,11,28
chr12	123265952	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr12	123281967	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr12	123282532	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	123285883	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:19,2:10,2:16,13,1,3
chr12	123297718	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	123333065	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr12	123335483	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,4,8
chr12	123335488	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,6:2,2:0,3,4,4
chr12	123335527	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,1:0,0,2,8
chr12	123339344	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:123339344_A_G:123339344:0,0,5,0
chr12	123339358	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:123339344_A_G:123339344:0,0,3,0
chr12	123339712	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr12	123339976	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:9,1:3,16,0,2
chr12	123340453	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=59.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,14,3
chr12	123341289	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:123341289_A_C:123341289:0,0,0,9
chr12	123341297	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:123341289_A_C:123341289:0,0,0,9
chr12	123341833	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr12	123341863	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	123342628	.	CCTCTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	123343363	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,10;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:3,0,1,0
chr12	123343571	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0|1:123343571_T_G:123343571:0,0,9,4
chr12	123343572	.	G	GGC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0|1:123343571_T_G:123343571:0,0,9,4
chr12	123344910	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr12	123345347	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=90.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,8,18
chr12	123345360	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,11:0,0,7,16
chr12	123345736	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:123345736_C_G:123345736:0,0,2,8
chr12	123345756	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:123345736_C_G:123345736:0,0,4,6
chr12	123352179	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	123433137	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr12	123460823	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	123466111	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr12	123471402	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	123473254	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,21,7
chr12	123477224	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,13;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:1,0:3,0:4,3,0,4
chr12	123477230	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:1,0:3,0:2,3,0,3
chr12	123488908	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:5,2,6,0
chr12	123489102	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr12	123645803	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,25:0,20:0,0,17,28
chr12	123647725	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,2,17
chr12	123651162	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,16,1
chr12	123679161	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=158,150;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.304:8:3,0:1,0:0|1:123679161_G_C:123679161:0,6,0,2
chr12	123679169	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=10,16;MFRL=165,150;MMQ=56,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.309:8:1,0:0,0:0|1:123679161_G_C:123679161:0,6,0,2
chr12	123679171	.	A	ATT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=156,163;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:0,2:1,1:0,1,0,4
chr12	123682985	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:123682985_T_A:123682985:0,0,0,1
chr12	123682987	.	C	CTGTATGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:123682985_T_A:123682985:0,0,0,1
chr12	123694542	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=186,141;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:123694542_C_T:123694542:4,0,1,0
chr12	123694547	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=186,160;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:123694542_C_T:123694542:4,0,2,0
chr12	123694562	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=162,160;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:123694562_C_T:123694562:8,0,2,0
chr12	123694565	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,36;MFRL=162,160;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:123694562_C_T:123694562:8,0,2,0
chr12	123694724	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=54.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr12	123699200	.	GTTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	123703074	.	CT	C,CTT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,34,25;MFRL=151,177,133;MMQ=60,60,60;MPOS=26,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.30,7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,3,5:0.147,0.222:24:10,1,4:6,2,1:2,14,1,7
chr12	123703103	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,7:0,0,0,18
chr12	123746357	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,5:0,0,6,11
chr12	123749902	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:3,13,0,2
chr12	123749906	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,1:7,1:2,12,0,2
chr12	123749910	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:2,14,0,2
chr12	123789052	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:17,3:20,1:37,1,3,1
chr12	123794022	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr12	123794450	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,15:0,5:0,0,0,20
chr12	123801672	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	123805508	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:123805508_C_CGG:123805508:0,0,0,1
chr12	123805509	.	AAT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:123805508_C_CGG:123805508:0,0,0,1
chr12	123806159	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.489:47:16,9:8,13:15,9,14,9
chr12	123808170	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=233,203;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123808170_G_T:123808170:1,0,1,0
chr12	123808176	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=233,203;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123808170_G_T:123808170:1,0,1,0
chr12	123810662	.	A	AC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr12	123812207	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,12:0,6:0,0,9,9
chr12	123812611	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr12	123812629	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr12	123813493	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr12	123815700	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:123815700_G_A:123815700:0,0,2,0
chr12	123815702	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:123815700_G_A:123815700:0,0,2,0
chr12	123816007	.	T	TATGTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	123832710	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr12	123832746	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	123875394	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr12	123879666	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=96,128;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.519:25:5,12:6,1:0|1:123879666_A_G:123879666:5,7,8,5
chr12	123879668	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=96,128;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.519:25:5,12:7,1:0|1:123879666_A_G:123879666:5,7,8,5
chr12	123880862	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,15,1
chr12	123880923	.	CTT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=125,0;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,2:6,2:2,8,1,3
chr12	123892323	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=252,214;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr12	123907797	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=209,162;MMQ=43,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:4,1:2,0:0,6,0,2
chr12	123944345	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=121,147;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:2,2:6,0:6,3,2,0
chr12	123968751	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=138,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.245:17:7,0:6,0:12,1,1,3
chr12	123968757	.	GACGTCCTCGGGTGGGCGATGGGT	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=140,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:5,1:7,1:19,1,0,3
chr12	123970438	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,110;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,0:5,3:1,5,0,3
chr12	123983941	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:6,0,3,3
chr12	124008073	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:2,4:5,1:7,1,3,2
chr12	124008261	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=260,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124008261_TCA_T:124008261:0,1,0,1
chr12	124008266	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=260,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124008261_TCA_T:124008261:0,1,0,1
chr12	124017984	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,14;MFRL=168,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.206:12:4,0:6,0:0|1:124017984_C_G:124017984:2,8,1,1
chr12	124017996	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=160,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.206:12:4,1:6,0:0|1:124017984_C_G:124017984:1,9,1,1
chr12	124017997	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=160,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.206:12:4,2:6,0:0|1:124017984_C_G:124017984:1,9,1,1
chr12	124017999	.	CCG	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=160,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.206:12:4,1:5,0:0|1:124017984_C_G:124017984:1,9,1,1
chr12	124069111	.	GGGC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GGC;STR;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr12	124074831	.	CAA	C,CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,34,33;MFRL=173,215,161;MMQ=60,60,40;MPOS=28,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=4.24,5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.194,0.234:13:1,0,1:4,2,2:5,3,5,0
chr12	124074851	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=149,191;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.206:24:4,0:13,0:9,10,5,0
chr12	124081094	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:6,2:2,0:9,0,2,0
chr12	124086620	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr12	124090605	.	ACT	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=136.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,18:0,16:0,0,19,15
chr12	124099704	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:11,5:5,4:12,4,6,3
chr12	124099925	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:3,3:3,4:0,6,1,6
chr12	124101041	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:10,5:9,5:14,5,8,2
chr12	124102216	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=158,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr12	124102433	.	CGTTTTCAGATAGAATGCCTA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.484:19:3,5:6,4:0,10,0,9
chr12	124104460	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=204,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,5:1,2:3,0,7,0
chr12	124106353	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:12,2:18,0:16,15,2,0
chr12	124107401	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124107401_T_TA:124107401:0,0,0,1
chr12	124107404	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124107401_T_TA:124107401:0,0,0,1
chr12	124109263	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=236,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:1,2:2,1,4,2
chr12	124139597	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=118,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:3,2:5,1:1,7,0,4
chr12	124158080	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,5,1
chr12	124158450	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:1,2:0|1:124158450_T_C:124158450:0,1,0,5
chr12	124158455	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,2:0|1:124158450_T_C:124158450:0,1,0,4
chr12	124171323	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr12	124171658	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,1,1
chr12	124172555	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:3,1,2,1
chr12	124172731	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,11:0.444:25:9,3:5,8:0|1:124172731_G_A:124172731:12,2,5,6
chr12	124172746	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:4,1:3,6:0|1:124172731_G_A:124172731:12,0,4,4
chr12	124177289	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:3,5,0,5
chr12	124179739	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.465:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr12	124181820	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr12	124192318	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:9,5:2,0:0,11,0,5
chr12	124197099	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=151,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr12	124197280	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.507:8:1,3:3,1:1,3,0,4
chr12	124209332	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=123,99;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:6,5:5,3:0|1:124209332_T_C:124209332:3,8,3,5
chr12	124209352	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=123,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:5,4:3,3:0|1:124209332_T_C:124209332:2,8,2,5
chr12	124218437	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,2:3,3:4,3,6,0
chr12	124220055	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,4:6,0:7,1,3,1
chr12	124257388	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,1:8,1:12,5,2,0
chr12	124257535	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:124257535_GT_G:124257535:0,4,0,1
chr12	124257541	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:124257535_GT_G:124257535:0,4,0,1
chr12	124258887	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	124267638	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr12	124268458	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr12	124274758	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr12	124281454	.	G	GAAGTCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,165;MMQ=40,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr12	124281467	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=209,170;MMQ=40,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr12	124315343	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,49;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	124319864	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	124325977	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=156.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,19:0,28:0,0,21,27
chr12	124326012	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:25,1:21,1:10,36,0,2
chr12	124330440	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:1,3:3,4:2,2,5,4
chr12	124330644	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=150,76;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:3,8,2,1
chr12	124343620	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,2,1
chr12	124356172	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	124363724	.	GTGTC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGTC;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr12	124371618	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,0,2
chr12	124383108	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=186,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124383108_G_T:124383108:1,0,1,0
chr12	124383114	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,16;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:124383108_G_T:124383108:2,0,1,0
chr12	124387566	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:6,0:2,2:8,1,2,0
chr12	124401329	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	124414314	.	TGACCGGGGA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:124414314_TGACCGGGGA_T:124414314:0,4,0,1
chr12	124414327	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=163,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:124414314_TGACCGGGGA_T:124414314:0,2,0,1
chr12	124500011	.	TCG	AAC	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=90,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:124500011_TCG_AAC:124500011:0,2,0,1
chr12	124500018	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=90,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:124500011_TCG_AAC:124500011:0,2,0,1
chr12	124500020	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=12,15;MFRL=90,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:124500011_TCG_AAC:124500011:0,2,0,1
chr12	124500031	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,14;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:124500031_A_T:124500031:0,0,0,1
chr12	124500038	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,10;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:124500031_A_T:124500031:0,0,0,1
chr12	124500041	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124500031_A_T:124500031:0,0,0,1
chr12	124500046	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124500031_A_T:124500031:0,0,0,1
chr12	124500048	.	A	ACTT	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124500031_A_T:124500031:0,0,0,1
chr12	124500050	.	T	TGAGTGCCAGGCACTG	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124500031_A_T:124500031:0,0,0,1
chr12	124810174	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr12	124810968	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124810968_C_T:124810968:0,0,0,1
chr12	124810978	.	G	GTTTCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:124810968_C_T:124810968:0,0,0,1
chr12	124811855	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr12	124813772	.	C	CGAGGCGGG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=137,250;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr12	124813794	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=177,141;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:124813794_C_G:124813794:0,3,0,1
chr12	124813798	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=157,141;MMQ=50,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:124813794_C_G:124813794:0,2,0,1
chr12	124813803	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=157,141;MMQ=50,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:124813794_C_G:124813794:0,2,0,1
chr12	124813806	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=157,141;MMQ=50,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:124813794_C_G:124813794:0,2,0,1
chr12	124813810	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=22,35;MFRL=157,141;MMQ=50,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:124813794_C_G:124813794:0,2,0,1
chr12	124815504	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,2,1
chr12	124820013	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=114,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr12	124821413	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:6,6:5,5:0|1:124821413_G_A:124821413:4,7,2,9
chr12	124821416	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=139,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:6,6:5,4:0|1:124821413_G_A:124821413:4,7,2,9
chr12	124832474	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:0,6,0,7
chr12	124832492	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr12	124838772	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr12	124848137	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr12	124859045	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=163.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,26:0,28:0,0,32,25
chr12	124882834	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr12	124885249	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:0,1:2,2:0,2,0,4
chr12	124885302	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124885302_T_G:124885302:0,0,0,1
chr12	124885303	.	G	GCCCTTCGTCAGGAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124885302_T_G:124885302:0,0,0,1
chr12	124887058	.	G	GGCT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,58;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=GCT;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr12	124915091	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	124934459	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:0,4,0,5
chr12	124968359	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr12	124968412	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	124971022	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:3,2,2,2
chr12	125263204	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	125271971	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,0:8,3:6,14,1,2
chr12	125434434	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr12	125434716	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:3,2:5,2:5,4,3,1
chr12	125435127	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:1,6:2,3:0,3,2,8
chr12	125435388	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=111,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,3:8,4:1,9,2,5
chr12	125436897	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	125438336	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,4,0
chr12	125438414	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=166,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.432:26:4,6:8,4:14,1,10,1
chr12	125438516	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,17:0.383:45:15,11:12,4:0|1:125438516_T_C:125438516:14,14,8,9
chr12	125438523	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,20:0.409:49:15,10:13,8:0|1:125438516_T_C:125438516:13,16,7,13
chr12	125438549	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.503:38:9,9:9,10:4,15,5,14
chr12	125444975	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=110,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:7,4:6,4:8,6,3,5
chr12	125450126	.	CC	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr12	125451277	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr12	125451487	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=181,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:0,7,0,6
chr12	125451532	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,0,4
chr12	125451589	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,2,1
chr12	125451838	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr12	125453232	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:125453232_A_G:125453232:0,0,0,1
chr12	125453235	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:125453232_A_G:125453232:0,0,0,1
chr12	125456004	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr12	125457151	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,1:2,5:1,5,3,3
chr12	125461797	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	125465291	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=149,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr12	125465388	.	T	TAACTCCTCTTCCTCCTCCAGTTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	125466987	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr12	125497055	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.514:35:10,6:6,12:16,1,15,3
chr12	125509502	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:4,1,5,1
chr12	125550271	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.169:44:7,0:10,2:0,35,0,9
chr12	125558481	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.072:40:17,2:19,0:0|1:125558481_T_G:125558481:20,18,2,0
chr12	125558483	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.072:40:17,2:18,0:0|1:125558481_T_G:125558481:20,18,2,0
chr12	125587706	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr12	125591720	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,1:7,2:7,9,1,2
chr12	125619308	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,2,2
chr12	125833964	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,12,2
chr12	125834095	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,11:0,0,12,10
chr12	125900095	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,114;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,27:0.637:42:8,15:6,12:12,3,16,11
chr12	129028708	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:129028708_G_C:129028708:0,3,0,1
chr12	129028712	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:129028708_G_C:129028708:0,3,0,1
chr12	129100970	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr12	129178435	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:4,6:9,6:6,7,4,8
chr12	129181701	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr12	129189556	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr12	129189591	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr12	129299696	.	A	AAGACAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129299696_A_AAGACAC:129299696:0,0,0,1
chr12	129299698	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129299696_A_AAGACAC:129299696:0,0,0,1
chr12	129442131	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,0:5,4:4,5,0,4
chr12	129467385	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=227,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:129467385_G_A:129467385:1,0,1,0
chr12	129467389	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=227,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:129467385_G_A:129467385:1,0,1,0
chr12	129559029	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:6,6,0,2
chr12	129559654	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=279,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:129559654_A_AGT:129559654:0,1,0,1
chr12	129559659	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,34;MFRL=279,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:129559654_A_AGT:129559654:0,1,0,1
chr12	129559663	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=279,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:129559654_A_AGT:129559654:0,1,0,1
chr12	129559665	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=279,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:129559654_A_AGT:129559654:0,1,0,1
chr12	129563005	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	129566284	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:0,1:1,3:1,2,4,0
chr12	129568960	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr12	130649316	.	CT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34,22;MFRL=154,82,134;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.235,0.250:9:2,0,0:3,2,1:2,3,1,3
chr12	130650284	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:130650284_T_A:130650284:0,4,0,1
chr12	130650289	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:130650284_T_A:130650284:0,4,0,1
chr12	130827271	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,5:2,8:1,6,0,13
chr12	130830906	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=81,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:5,1:3,4:6,3,2,3
chr12	130831187	.	TAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130831187_TAAG_T:130831187:0,1,0,1
chr12	130831194	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130831187_TAAG_T:130831187:0,1,0,1
chr12	130831707	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	130832597	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr12	130834602	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr12	130838987	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,2:0,0:3,0,2,0
chr12	130839645	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr12	130840248	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=131,91;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:14,0:6,2:0|1:130840248_T_C:130840248:6,15,1,1
chr12	130840254	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=131,91;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:17,0:6,2:0|1:130840248_T_C:130840248:6,19,1,1
chr12	130883554	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,0:1,3:6,0,3,0
chr12	130921679	.	G	GCCCTATTTTCGGGAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=61,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr12	130922879	.	A	AGCCCC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=106,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.320:10:2,0:4,3:1,6,3,0
chr12	130922884	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.355:13:4,0:3,4:0|1:130922884_T_C:130922884:2,7,4,0
chr12	130922889	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.331:14:5,0:4,4:0|1:130922884_T_C:130922884:2,8,4,0
chr12	130935710	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0,0,6,4
chr12	131285663	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr12	131311629	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr12	131356725	.	GCGGGA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:131356725_GCGGGA_G:131356725:0,2,0,1
chr12	131356735	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:131356725_GCGGGA_G:131356725:0,2,0,1
chr12	131356737	.	TC	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=11,29;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:131356725_GCGGGA_G:131356725:0,2,0,1
chr12	131359298	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:11,4:3,6:2,12,2,8
chr12	131360360	.	G	T	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=104.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,44:0.447:99:34,22:19,22:27,28,22,22
chr12	131439239	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,9,10
chr12	131466419	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,2:6,6:10,1,6,2
chr12	131471608	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr12	131471699	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:3,2:5,4:5,3,5,2
chr12	131471956	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	131475738	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131475738_TG_T:131475738:0,1,0,1
chr12	131475741	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131475738_TG_T:131475738:0,1,0,1
chr12	131485014	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.666:16:3,7:2,3:0|1:131485014_T_C:131485014:0,5,4,7
chr12	131485025	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=167,166;MMQ=59,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.666:13:3,5:0,3:0|1:131485014_T_C:131485014:0,4,2,7
chr12	131485097	.	C	CTAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=238,179;MMQ=46,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.473:4:1,2:1,0:0|1:131485097_C_CTAA:131485097:0,2,0,2
chr12	131485100	.	AT	CG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=238,179;MMQ=46,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.473:4:0,1:1,0:0|1:131485097_C_CTAA:131485097:0,2,0,2
chr12	131485104	.	GGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=223,226;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131485097_C_CTAA:131485097:0,1,0,1
chr12	131488928	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr12	131490632	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=131,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,3:5,3:2,4,2,5
chr12	131498946	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr12	131569234	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr12	131569264	.	G	GTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131569264_G_GTGA:131569264:0,1,0,1
chr12	131569266	.	T	TATTCCCAGCACAGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0|1:131569264_G_GTGA:131569264:0,1,0,1
chr12	131593306	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:6,0:7,3:0|1:131593306_T_C:131593306:10,5,1,2
chr12	131593312	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=107,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:7,0:7,1:0|1:131593306_T_C:131593306:10,4,1,2
chr12	131602843	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,0:2,2:8,0,2,0
chr12	131603031	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.769:24:4,9:1,9:2,3,5,14
chr12	131620738	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:0,5,0,5
chr12	131622833	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr12	131623850	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=211,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr12	132209932	.	ATG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:3,3:2,5:5,0,7,1
chr12	132210049	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.093:35:15,2:17,0:13,19,1,2
chr12	132212912	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=158,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:132212912_CA_C:132212912:6,8,1,1
chr12	132212915	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=158,69;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:132212912_CA_C:132212912:6,8,1,1
chr12	132212924	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=158,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:132212912_CA_C:132212912:6,10,1,1
chr12	132239856	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr12	132241229	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr12	132323082	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:132323082_A_G:132323082:0,0,3,1
chr12	132323089	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:132323082_A_G:132323082:0,0,3,1
chr12	132323294	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr12	132391586	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=219,166;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0|1:132391586_TG_CA:132391586:0,2,0,1
chr12	132391593	.	T	TCG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=219,166;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:132391586_TG_CA:132391586:0,2,0,1
chr12	132391595	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=219,166;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:132391586_TG_CA:132391586:0,2,0,1
chr12	132398247	.	C	CA	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=142,157;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.163:32:8,0:14,4:13,14,3,2
chr12	132398254	.	AAC	A	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.230:36:9,4:18,5:13,14,5,4
chr12	132398255	.	AC	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.471:34:4,9:13,8:7,10,9,8
chr12	132398256	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,17:0,26:0,0,18,25
chr12	132403266	.	AGGGTGTGTG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGTGTGTG;STR;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.614:8:0,2:3,3:0,3,0,5
chr12	132404212	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	132414769	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr12	132528915	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=218,140;MMQ=60,57;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr12	132537859	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	132539500	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.188:26:11,4:6,1:7,14,3,2
chr12	132562215	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=246,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:132562215_G_GCC:132562215:0,2,0,1
chr12	132562216	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=246,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:132562215_G_GCC:132562215:0,2,0,1
chr12	132562219	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=246,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:132562215_G_GCC:132562215:0,2,0,1
chr12	132598995	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:6,3:2,7:8,0,8,2
chr12	132624434	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=130,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:7,4:2,4:4,5,5,3
chr12	132625105	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,0,4
chr12	132625282	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=203,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr12	132625361	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:5,1,5,2
chr12	132625643	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr12	132626357	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=162,210;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:12,2,2,0
chr12	132632684	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:15,3:8,0:7,16,2,1
chr12	132635779	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr12	132635946	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132635946_C_G:132635946:0,0,0,1
chr12	132635949	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132635946_C_G:132635946:0,0,0,1
chr12	132635989	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr12	132636400	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=186,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0|1:132636400_G_A:132636400:0,3,0,3
chr12	132636410	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:132636400_G_A:132636400:0,4,0,1
chr12	132636411	.	C	CTGACCAACAT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:132636400_G_A:132636400:0,4,0,1
chr12	132636414	.	C	CAAAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:132636400_G_A:132636400:0,4,0,1
chr12	132636417	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:132636400_G_A:132636400:0,4,0,1
chr12	132682300	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,12;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:132682300_G_C:132682300:0,1,1,0
chr12	132682305	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=155,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:132682300_G_C:132682300:2,1,1,0
chr12	132682311	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=155,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:132682300_G_C:132682300:2,1,1,0
chr12	132682313	.	GG	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=155,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:132682300_G_C:132682300:2,1,1,0
chr12	132683862	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr12	132685826	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,0:1,6:2,3,2,4
chr12	132685837	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr12	132688279	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=209,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr12	132834448	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr12	133067343	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr12	133067473	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=173,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr12	133084973	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	133104461	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,4:3,2:4,1,4,3
chr12	133158632	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr12	133158881	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:133158881_A_C:133158881:0,4,1,0
chr12	133158884	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:133158881_A_C:133158881:0,4,1,0
chr12	133195579	.	CGCGGGGCGCGGGGT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCGGGGCGCGGGGT;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.804:2:0,1:0,0:0|1:133195579_CGCGGGGCGCGGGGT_C:133195579:0,0,0,2
chr12	133195625	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:133195579_CGCGGGGCGCGGGGT_C:133195579:0,0,0,2
chr12	133196733	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=139,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,2,1
chr12	133196773	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=139,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,3,0
chr12	133197018	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr12	133198002	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.796:3:0,0:0,0:0|1:133198002_T_G:133198002:0,0,3,0
chr12	133198006	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,114;MMQ=60,55;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:133198002_T_G:133198002:0,0,2,0
chr12	133198021	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,0:3,1,2,1
chr12	133201545	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:8,10,0,2
chr12	133202215	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=199,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:0,3:4,1:4,1,3,1
chr12	133208886	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.519:15:5,3:2,3:6,1,3,5
chr12	133210985	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:13,5:8,10:1,20,3,12
chr12	133214517	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:133214517_G_A:133214517:0,0,1,0
chr12	133214522	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:133214517_G_A:133214517:0,0,1,0
chr12	133214768	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:1,5,0,5
chr12	133218724	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr12	133220321	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr12	133225446	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr12	133226159	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:133226159_T_C:133226159:0,2,1,0
chr12	133226167	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:133226159_T_C:133226159:0,2,1,0
chr12	133226196	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=86,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:1,2:1,1:1,1,4,0
chr12	133233705	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.543:15:3,7:2,1:7,0,6,2
chr12	133234389	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=109,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,3:5,0:4,1,3,0
chr12	133237841	.	T	TCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=255,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133237841_T_TCCC:133237841:0,1,0,1
chr12	133237843	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=255,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133237841_T_TCCC:133237841:0,1,0,1
chr12	133238076	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:2,3,3,1
chr12	133245149	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,0,2
chr12	133249139	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr12	133250118	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr12	133250260	.	GCCCACAGGAAGGTAACTGTCCCTCTTCA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,0:4,2:2,7,1,1
chr12	133250342	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	133252796	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=105,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:1,4,3,4
chr12	133253310	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr12	133254083	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,1:4,7:6,4,4,4
chr12	133254404	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	133256904	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,0:2,5:0,4,0,5
chr12	133277983	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr12	133291679	.	A	ATCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr12	133294163	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.768:11:2,5:0,2:0,2,3,6
chr12	133295501	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=194,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr12	133310976	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=164,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:13,0:5,3:16,3,2,1
chr12	133311944	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:3,1,6,1
chr12	133324385	.	TAAAG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAG;STR;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:5,3:1,2:6,1,5,0
chr12	133324589	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:4,7,0,3
chr12	133349893	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:3,3:4,3:1,6,1,5
chr12	133353682	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:1,5,2,3
chr12	133360880	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:133360880_G_C:133360880:0,0,0,1
chr12	133360885	.	GA	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:133360880_G_C:133360880:0,0,0,1
chr12	133360894	.	C	CTGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:133360880_G_C:133360880:0,0,0,1
chr12	133367906	.	A	ATACACAATAGCAGCGAATGAACCTTCGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=170,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.668:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr12	133372395	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:3,2,1,1
chr12	133373375	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr12	133374905	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr12	133383923	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr12	133418069	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=131,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:6,2:2,2:5,3,4,1
chr12	133428354	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:14,2:8,10,0,2
chr12	133438274	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=184,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,1:4,0:0,6,0,2
chr12	133509562	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr12	133563333	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,2:2,4:7,0,6,0
chr12	133563489	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,270;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:21,1:9,1:10,21,0,2
chr12	133625276	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr12	133633459	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,27,0
chr12	133633536	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=99.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,32:0.528:61:9,16:18,16:15,14,20,12
chr12	133657934	.	A	AATAT,AATATAT,AATATATAT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,30,31,16;MFRL=0,146,141,162;MMQ=60,60,57,50;MPOS=24,26,16;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,13,14,15;RU=AT;STR;TLOD=8.78,15.93,3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,4,6,2:0.313,0.442,0.186:12:0,2,2,0:0,2,2,0:0,0,1,11
chr12	133657965	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=165,162;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:5,2:1,2:0,6,1,3
chr12	133657994	.	C	CACTGTTATTTAGGCTGGAGTGCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,36;MFRL=275,238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr12	133658056	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr12	133659977	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,5:5,3:11,0,6,2
chr12	133733204	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=162,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:4,3,0,2
chr13	19600069	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.959:20:0,11:0,8:0,0,17,3
chr13	19600126	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=172.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,27:0,27:0,0,23,31
chr13	19600326	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=153.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,21:0,24:0,0,28,17
chr13	19601129	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,10:0,0,2,12
chr13	19601182	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	19752624	.	C	CTTGGTATCCAGGTATCTCCTCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19752624_C_CTTGGTATCCAGGTATCTCCTCAT:19752624:0,0,0,1
chr13	19752627	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=347,141;MMQ=48,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19752624_C_CTTGGTATCCAGGTATCTCCTCAT:19752624:0,1,0,1
chr13	19753438	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr13	19756026	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	20000630	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr13	20000702	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	20004762	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0,0,0,20
chr13	20004798	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr13	20006777	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	20039289	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr13	20041323	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,7:0,10:0,0,14,3
chr13	20041563	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr13	20048218	.	AAAATAAATAAATAAATAAATAAAT	A	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=122,157;MMQ=39,52;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,5;RU=AAAT;STR;TLOD=203.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,47:0.902:52:2,15:3,32:2,3,4,43
chr13	20049601	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=183,203;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:19,0,2,0
chr13	20067081	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,104;MMQ=33,37;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:3,8,0,2
chr13	20208129	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,17:0.247:59:6,1:9,1:6,36,0,17
chr13	20216439	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:9,1:3,15,1,1
chr13	20235939	.	G	GCC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:12,4:9,4:8,13,3,5
chr13	20237170	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,80139688;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:9,3,0,2
chr13	20240743	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,37;MFRL=149,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,0,2
chr13	20277289	.	C	A	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=33,11;MFRL=138,153;MMQ=59,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,5:0.049:89:42,0:26,0:71,13,5,0
chr13	20325625	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=166,129;MMQ=37,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,1,3
chr13	20398669	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,4:5,4:7,4,7,1
chr13	20409628	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:15,1:18,1:26,7,2,0
chr13	20608354	.	T	TTTTCTTGAGGTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,3:0,0,9,4
chr13	20656138	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,22:0.875:25:2,11:0,10:3,0,21,1
chr13	20657188	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=188.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.982:52:0,28:0,24:0|1:20657188_T_G:20657188:0,0,15,37
chr13	20657201	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,129;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:22,0:21,3:0|1:20657188_T_G:20657188:2,41,0,3
chr13	20762956	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr13	21006205	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:3,0,6,1
chr13	21006475	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr13	21148425	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=183,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,0:10,3:20,0,3,0
chr13	21148462	.	AAT	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:17,1:24,2:37,4,3,0
chr13	21156999	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr13	21170193	.	G	GTAAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TAAAA;STR;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.556:14:4,2:2,5:5,1,8,0
chr13	21200071	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	21212739	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=99,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:0,4,0,4
chr13	21311977	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.553:16:2,8:5,1:2,5,4,5
chr13	21358061	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,1:5,7:4,8,1,7
chr13	21364788	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.506:2:1,1:0,0:0|1:21364788_CT_C:21364788:0,1,0,1
chr13	21364792	.	TGAAAATAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21364788_CT_C:21364788:0,1,0,1
chr13	21364807	.	CCCT	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21364807_CCCT_C:21364807:0,0,0,1
chr13	21364815	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21364807_CCCT_C:21364807:0,0,0,1
chr13	21364817	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21364807_CCCT_C:21364807:0,0,0,1
chr13	21396431	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:3,10,0,2
chr13	21396511	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=211,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr13	21401400	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,5:2,0:0,5,1,4
chr13	21416945	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr13	21429981	.	T	TTTTCACATTAAAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr13	21555544	.	CT	GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=127,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:0|1:21555544_CT_GA:21555544:4,2,3,0
chr13	21555554	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=127,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:1,3:5,2:0|1:21555544_CT_GA:21555544:4,3,5,0
chr13	21562506	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	21714651	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=266,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr13	21714920	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr13	21715094	.	CG	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:5,1:12,1:6,12,0,2
chr13	21729734	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=175,204;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr13	21729736	.	AG	GT,GG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34,35;MFRL=166,193,204;MMQ=60,60,30;MPOS=21,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,1,1:2,0,0:3,0,2,0
chr13	21729952	.	T	TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=10,29;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.866:12:0,3:0,3:0,1,3,8
chr13	21732028	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr13	21732049	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,10;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,0:2,2,2,0
chr13	21746453	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr13	21751005	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	21751528	.	A	AC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=58.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,8,14
chr13	21751834	.	T	C	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=135,49;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,4:0.058:84:48,0:20,4:35,45,2,2
chr13	21751846	.	C	G	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:39,0:20,3:17,44,1,2
chr13	21752371	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21752371_T_A:21752371:0,0,0,1
chr13	21752373	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21752371_T_A:21752371:0,0,0,1
chr13	21752491	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=227,193;MMQ=57,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21752491_G_A:21752491:2,1,1,0
chr13	21752496	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=227,193;MMQ=57,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21752491_G_A:21752491:2,1,1,0
chr13	21752744	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=200,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21752744_G_C:21752744:0,3,0,1
chr13	21752747	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=200,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:21752744_G_C:21752744:0,3,0,1
chr13	21753083	.	CA	GG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,250;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,2:14,0:20,1,2,0
chr13	21753255	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,1,28
chr13	21950934	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr13	21987707	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	22033162	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=86.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,21,3
chr13	22067502	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:1,5,0,3
chr13	22096843	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr13	22113605	.	TTTC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=211,196;MMQ=60,46;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:2,2:0,9,0,3
chr13	22113614	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=208,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0,10,0,2
chr13	22113669	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr13	22178258	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr13	22178308	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	22255167	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.465:34:15,8:3,6:16,2,13,3
chr13	22255301	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.419:41:15,8:9,9:2,22,1,16
chr13	22275583	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,9:0,0,7,19
chr13	23808732	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.428:18:6,5:3,3:9,1,6,2
chr13	23853468	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr13	23894744	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=218,121;MMQ=47,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.823:9:0,4:1,4:0|1:23894744_T_G:23894744:1,0,6,2
chr13	23894746	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=218,104;MMQ=47,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:0,4:1,4:0|1:23894744_T_G:23894744:1,0,6,3
chr13	23894748	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=218,121;MMQ=47,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,4:1,5:0|1:23894744_T_G:23894744:1,0,7,3
chr13	23894750	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=218,122;MMQ=47,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.875:14:0,5:1,5:0|1:23894744_T_G:23894744:1,0,10,3
chr13	23894752	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=218,122;MMQ=47,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.875:14:0,6:1,7:0|1:23894744_T_G:23894744:1,0,10,3
chr13	23898454	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr13	23904880	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:9,0:18,2:14,14,0,2
chr13	24200794	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr13	24234517	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:0,4:2,4:3,0,6,2
chr13	24242023	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	24242166	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.381:16:7,3:3,2:4,6,1,5
chr13	24242801	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,8,3
chr13	24243330	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr13	24384129	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr13	24410278	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr13	24410517	.	A	AAAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=176,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0|1:24410517_A_AAAAG:24410517:0,3,0,1
chr13	24410518	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=176,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:24410517_A_AAAAG:24410517:0,3,0,1
chr13	24470860	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=184,195;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr13	24470913	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=141,120;MMQ=60,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:16,0:17,4:27,6,4,0
chr13	24796915	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,8:3,1:6,0,9,0
chr13	24825945	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:5,9:8,5:8,6,10,4
chr13	24845130	.	CCT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:5,1:11,0:1,17,0,3
chr13	24869025	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr13	24869048	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,2:0,3:0,2,1,4
chr13	24890385	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,16822252;MMQ=60,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	25005446	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,22,0
chr13	25009288	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:4,3:3,8:0|1:25009288_C_T:25009288:6,1,8,3
chr13	25009297	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0|1:25009288_C_T:25009288:0,0,14,5
chr13	25015967	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=69.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,14,8
chr13	25016632	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr13	25016677	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0|1:25016677_T_C:25016677:0,0,21,1
chr13	25016687	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=120.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,18:0,11:0|1:25016677_T_C:25016677:0,0,28,2
chr13	25016853	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=153,125;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,9:0.199:48:20,3:19,6:4,35,2,7
chr13	25016870	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=104.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,2,29
chr13	25017678	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:25017678_C_CCA:25017678:0,0,2,0
chr13	25017682	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:25017678_C_CCA:25017678:0,0,2,0
chr13	25017959	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr13	25020757	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:6,4:5,5:0|1:25020757_T_C:25020757:10,1,10,0
chr13	25020782	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,17:0.529:32:7,10:7,7:0|1:25020757_T_C:25020757:13,2,15,2
chr13	25020910	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=122.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,17:0,21:0,0,11,27
chr13	25021135	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=156,143;MMQ=39,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:3,11:8,3:11,0,13,2
chr13	25021144	.	GTCT	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=152,156;MMQ=59,39;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=51.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:14,4:6,11:18,4,13,2
chr13	25021323	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=166,127;MMQ=60,45;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.325:35:13,7:10,4:4,20,1,10
chr13	25021358	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=157,166;MMQ=50,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:3,1:6,3:1,9,0,4
chr13	25021401	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=190,90;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,1:4,5:0,5,1,5
chr13	25026521	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=47,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:7,1,4,2
chr13	25027697	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,6:5,2:9,1,5,3
chr13	25027744	.	AT	GC,GT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30,30;MFRL=0,155,127;MMQ=60,60,60;MPOS=14,12;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=20.71,48.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,17:0.327,0.640:26:0,6,8:0,3,9:0,0,12,14
chr13	25027897	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr13	25029066	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr13	25029083	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr13	25029128	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,7:3,1:5,0,5,3
chr13	25029218	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.403:23:6,4:7,5:9,5,6,3
chr13	25029295	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,7:6,3:7,6,5,5
chr13	25029314	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:8,9:6,4:8,6,3,10
chr13	25029401	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr13	25034089	.	TC	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=115,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:7,0:6,8,2,0
chr13	25049812	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,151;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr13	25064748	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=179,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:7,0,3,1
chr13	25066470	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr13	25072200	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=175,151;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.408:15:6,2:2,3:8,1,6,0
chr13	25073399	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=35,34,35,36;MFRL=174,147,177,141;MMQ=60,43,60,60;MPOS=5,24,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=14.46,13.33,5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:22,9,9,7:0.175,0.191,0.148:47:14,5,8,4:8,4,1,3:21,1,23,2
chr13	25264931	.	C	CTCCGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	25266524	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	25266546	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=134,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,1,1
chr13	25275978	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	25281116	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:3,3:2,4:5,1,6,1
chr13	25285768	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	25341365	.	A	AATC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=ATC;STR;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:0,1:3,2:1,2,2,1
chr13	25355965	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr13	25363477	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.490:36:12,9:6,8:16,2,13,5
chr13	25363776	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr13	25370255	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr13	25373432	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	25374449	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=103,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr13	25374604	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:12,8,1,1
chr13	25374614	.	A	ATAGTATCTCTGTGCTTTTTGT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=123,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:11,8,1,1
chr13	25374636	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=119,115;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,5:6,6:8,4,6,5
chr13	25376420	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=198,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr13	25378373	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,5,0
chr13	25399677	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=168,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr13	25399702	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr13	25399752	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr13	25404743	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,3,23
chr13	25433265	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:13,0:11,2:8,18,1,1
chr13	25442889	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=147,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:1,1:3,0:0,4,0,2
chr13	25442921	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	25444651	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,0:4,2:3,1,3,0
chr13	25457595	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	25458650	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=146,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:0,7,0,4
chr13	25458685	.	A	ACCTTTAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=275,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr13	25459562	.	TCTTA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,1:0,3:0,2,2,3
chr13	25466763	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,14;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,0:0,1:6,0,5,0
chr13	25466774	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:2,5:1,4:3,0,9,0
chr13	25478293	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=235,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25478293_A_AT:25478293:0,1,0,1
chr13	25478294	.	C	CAATAAACGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=37,35;MFRL=235,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25478293_A_AT:25478293:0,1,0,1
chr13	25670703	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=153,171;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,1:17,1:15,15,2,0
chr13	25670712	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=150,174;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:14,2:16,1:0|1:25670712_C_G:25670712:18,13,3,0
chr13	25670717	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=150,174;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:15,2:17,1:0|1:25670712_C_G:25670712:20,15,3,0
chr13	25670723	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=149,174;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:19,2:18,1:0|1:25670712_C_G:25670712:22,18,3,0
chr13	25670730	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=150,174;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:18,2:18,1:0|1:25670712_C_G:25670712:20,17,3,0
chr13	25670753	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=143,202;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:18,1:19,1:21,16,2,0
chr13	25670803	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=145,174;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:16,1:16,2:14,18,2,1
chr13	25670813	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=149,174;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:14,1:14,2:10,18,2,1
chr13	25670814	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,0:15,2:12,20,0,2
chr13	25670851	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=156,159;MMQ=60,39;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:10,3:17,3:13,14,3,3
chr13	25670868	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=158,149;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:9,2:13,3:0|1:25670868_G_A:25670868:12,11,2,3
chr13	25670873	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=156,144;MMQ=60,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:11,3:12,1:0|1:25670868_G_A:25670868:14,10,1,3
chr13	25670877	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=156,144;MMQ=60,32;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:12,3:12,1:0|1:25670868_G_A:25670868:14,10,1,3
chr13	25670907	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=140,163;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.194:29:11,3:12,2:14,10,1,4
chr13	25670919	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=145,153;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:9,3:10,3:9,10,2,4
chr13	25670953	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=31,30;MFRL=149,173;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.225:29:13,1:9,4:0|1:25670953_G_A:25670953:8,15,2,4
chr13	25670955	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=149,173;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.225:29:14,1:8,5:0|1:25670953_G_A:25670953:8,15,2,4
chr13	25670978	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=140,181;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:14,0:13,4:0|1:25670978_C_T:25670978:9,18,3,1
chr13	25670981	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=139,184;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:14,0:13,3:0|1:25670978_C_T:25670978:10,19,2,1
chr13	25670984	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=27,32;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.442:32:10,5:8,9:9,9,3,11
chr13	25670988	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=33,30;MFRL=139,178;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:15,0:10,4:0|1:25670978_C_T:25670978:10,16,2,3
chr13	25671008	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=143,143;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:11,0:9,3:0|1:25671008_C_T:25671008:6,18,1,2
chr13	25671015	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=32,34;MFRL=143,143;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:9,0:12,3:0|1:25671008_C_T:25671008:6,18,1,2
chr13	25671027	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=33,35;MFRL=137,139;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:6,12,0,2
chr13	25671271	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=135,139;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,7:0.135:57:26,6:21,1:0|1:25671271_A_G:25671271:21,29,3,4
chr13	25671272	.	AG	A	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=135,146;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,8:0.150:58:27,6:22,1:0|1:25671271_A_G:25671271:21,29,4,4
chr13	25671274	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=135,146;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,8:0.150:58:27,5:21,2:0|1:25671271_A_G:25671271:21,29,4,4
chr13	25671292	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=136,168;MMQ=60,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,9:0.192:50:25,7:16,2:17,24,4,5
chr13	25671310	.	TTATGA	T	.	.	DP=57;ECNT=8;MBQ=29,23;MFRL=136,153;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,7:0.138:56:23,5:22,1:0|1:25671310_TTATGA_T:25671310:24,25,2,5
chr13	25671320	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=136,153;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,7:0.143:54:25,6:22,1:0|1:25671310_TTATGA_T:25671310:24,23,2,5
chr13	25671332	.	CA	C	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=147,168;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.143:40:16,3:19,2:19,16,1,4
chr13	25671369	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=149,168;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:9,3:13,2:9,14,0,5
chr13	25671742	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=147,198;MMQ=60,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0|1:25671742_G_A:25671742:3,4,2,1
chr13	25671755	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=156,198;MMQ=60,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0|1:25671742_G_A:25671742:4,3,2,1
chr13	25671759	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=156,198;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:3,1:0|1:25671742_G_A:25671742:4,3,2,1
chr13	25671786	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=152,206;MMQ=60,32;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr13	25673329	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:25,0:31,3:22,35,0,3
chr13	25673492	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	25716093	.	GA	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25716093_GA_TC:25716093:0,0,0,1
chr13	25716096	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25716093_GA_TC:25716093:0,0,0,1
chr13	25716101	.	GGCTTTATCCTT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25716093_GA_TC:25716093:0,0,0,1
chr13	25840504	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:0,1:3,0:0|1:25840504_C_CT:25840504:0,3,0,1
chr13	25840507	.	C	CTGTTTAGAGAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:0,1:3,0:0|1:25840504_C_CT:25840504:0,3,0,1
chr13	25840512	.	AT	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:25840504_C_CT:25840504:0,3,0,1
chr13	25840515	.	T	TAGCTA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:25840504_C_CT:25840504:0,2,0,1
chr13	25840523	.	T	TTTTCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	25841842	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr13	25848404	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	25886932	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr13	25887036	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,0:5,4:9,2,1,3
chr13	25893363	.	GTTTATA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTATA;STR;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr13	25899091	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=106,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr13	25905416	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr13	25912931	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,2:11,0:1,14,0,2
chr13	26108400	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=188,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:0,7,1,5
chr13	26125731	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr13	26127890	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=76,108;MMQ=59,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr13	26128128	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr13	26144896	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=108,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,2:3,0:10,3,1,1
chr13	26153962	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=172,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:11,3,2,0
chr13	26273538	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr13	26411317	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:3,1,3,3
chr13	26436641	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr13	26535625	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr13	26535835	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,38;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:4,17,1,1
chr13	26586775	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=144,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:2,1:0,0:0,2,0,2
chr13	26967477	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.475:9:2,1:3,2:4,1,3,1
chr13	26974562	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,12,1
chr13	26975823	.	G	GAAGAAGCTAGGTGTGTCCACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr13	27239314	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27239314_G_GC:27239314:0,1,0,1
chr13	27239315	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27239314_G_GC:27239314:0,1,0,1
chr13	27239318	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27239314_G_GC:27239314:0,1,0,1
chr13	27239322	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27239314_G_GC:27239314:0,1,0,1
chr13	27239324	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27239314_G_GC:27239314:0,1,0,1
chr13	27246216	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,35;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.530:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr13	27257155	.	G	GGGGACAGCCCCACCCATGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27257155_G_GGGGACAGCCCCACCCATGGC:27257155:0,1,0,1
chr13	27257157	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27257155_G_GGGGACAGCCCCACCCATGGC:27257155:0,1,0,1
chr13	27333424	.	AGTT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=223,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27333424_AGTT_A:27333424:0,1,0,1
chr13	27333428	.	CCA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=223,126;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27333424_AGTT_A:27333424:0,1,0,1
chr13	27827811	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	27829310	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,12,3
chr13	27845284	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr13	28133956	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.367:16:7,3:1,3:8,2,4,2
chr13	28136989	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=256,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	28197436	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0,4,1,5
chr13	28494225	.	ACTCCCGG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CTCCCGG;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,0:5,2:12,1,1,1
chr13	28519354	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,4:4,9:9,1,9,4
chr13	28519709	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.859:3:0,2:0,0:0,0,1,2
chr13	28537234	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:4,2,5,1
chr13	28537242	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,4:4,3:5,1,5,2
chr13	28537537	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr13	28542699	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr13	28562508	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=148,148;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:28562508_T_C:28562508:2,0,1,0
chr13	28562518	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=192,148;MMQ=60,41;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:28562508_T_C:28562508:2,0,1,0
chr13	28562521	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=192,148;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:28562508_T_C:28562508:2,0,1,0
chr13	28589662	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr13	28602226	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.822:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	28602292	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=130,73;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,1,1
chr13	28607989	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,2:6,3:8,1,5,0
chr13	28608459	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.566:23:3,4:6,9:6,4,7,6
chr13	28609651	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,4:2,4:6,1,5,3
chr13	28609825	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=82,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr13	28609846	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=171,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr13	28609991	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=122,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0|1:28609991_T_C:28609991:4,0,4,0
chr13	28609997	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,1:3,2:0|1:28609991_T_C:28609991:4,0,4,0
chr13	28610183	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,5:5,2:4,7,2,5
chr13	28622356	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,1:0,0,8,0
chr13	28771465	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:8,1:16,1:7,17,1,1
chr13	28794290	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr13	28830436	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.413:20:7,5:4,3:8,4,5,3
chr13	28834625	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.536:37:11,9:6,10:6,11,8,12
chr13	28835527	.	T	TC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=110.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,20:0,9:0,0,23,7
chr13	28854736	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=208,108;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:28854736_TC_T:28854736:0,3,0,1
chr13	28854738	.	ACCCAGGCT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=208,108;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:28854736_TC_T:28854736:0,3,0,1
chr13	28883150	.	C	CCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:28883150_C_CCTG:28883150:0,0,0,1
chr13	28883151	.	TAA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:28883150_C_CCTG:28883150:0,0,0,1
chr13	28886113	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	28891545	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	28893484	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=216,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr13	28893759	.	A	AAGCCTTCTTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=63,286;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr13	28895524	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr13	28919653	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=107,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:0|1:28919653_G_T:28919653:8,10,1,1
chr13	28919669	.	A	AAATGTGAG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=97,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:10,0:0|1:28919653_G_T:28919653:7,9,1,1
chr13	28942840	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=165,134;MMQ=44,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.379:13:3,1:2,0:3,5,0,5
chr13	28958955	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr13	28959261	.	C	CCAGCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=224,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	28963744	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	28980036	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.780:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr13	29004400	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	29041007	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr13	29041776	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:29041776_T_C:29041776:0,0,1,3
chr13	29041794	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:29041776_T_C:29041776:0,0,0,3
chr13	29041826	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr13	29278063	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=40,32;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr13	29278281	.	A	AGAATAAAGTTAGAGTTTTTATGAGTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=188,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr13	29278303	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29278303_C_A:29278303:0,1,0,1
chr13	29278306	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29278303_C_A:29278303:0,1,0,1
chr13	29291886	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr13	29599454	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=160,42;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,2:8,0:4,5,1,1
chr13	29675131	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr13	29855822	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=174,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.568:12:3,1:2,5:3,2,4,3
chr13	29898881	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:29898881_A_G:29898881:0,0,2,4
chr13	29898889	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:29898881_A_G:29898881:0,0,2,4
chr13	29933699	.	TGG	TGAGGCAGG,T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32,32;MFRL=174,177,182;MMQ=60,60,60;MPOS=6,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.52,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.332,0.332:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr13	29933702	.	G	GTACCTTTCC,GATTTTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33,34;MFRL=177,182,174;MMQ=60,60,60;MPOS=1,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.53,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.334,0.327:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr13	29933704	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr13	29933706	.	G	GGTTCTATATGTATTTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0,3,0,1
chr13	30054280	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=92,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,7:6,4:4,3,7,4
chr13	30071310	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	30072695	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,1:3,4:0,5,1,4
chr13	30075342	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:2,1:7,7:2,9,1,7
chr13	30077088	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr13	30090404	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chr13	30091516	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr13	30097307	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	30098215	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,15,0
chr13	30098226	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr13	30346188	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,13:0,10:0,0,18,5
chr13	30351248	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=70.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,8:0,0,19,2
chr13	30351266	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.641:26:4,9:5,7:7,2,15,2
chr13	30521745	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=137,75;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.352:12:3,2:5,0:7,1,2,2
chr13	30521773	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=94,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.180:15:3,0:5,0:8,5,2,0
chr13	30524614	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=119,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30524614_C_T:30524614:0,1,0,1
chr13	30524616	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=119,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30524614_C_T:30524614:0,1,0,1
chr13	30524619	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30524614_C_T:30524614:0,0,0,1
chr13	30524622	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30524614_C_T:30524614:0,0,0,1
chr13	30524623	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30524614_C_T:30524614:0,0,0,1
chr13	30804730	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=126,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:7,0:1,3:0|1:30804730_GC_G:30804730:3,7,1,2
chr13	30804736	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=126,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:7,0:1,3:0|1:30804730_GC_G:30804730:3,7,1,2
chr13	30804797	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=116,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:2,1:0,0:0,2,0,2
chr13	30805627	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,3,15
chr13	31036642	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.390:39:16,8:8,7:18,6,13,2
chr13	31036851	.	TA	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,6:0.086:67:26,1:34,5:17,44,1,5
chr13	31205694	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31205694_G_A:31205694:0,1,0,1
chr13	31205699	.	AT	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31205694_G_A:31205694:0,1,0,1
chr13	31205704	.	CATG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31205694_G_A:31205694:0,1,0,1
chr13	31231513	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:3,1:2,2:7,0,3,0
chr13	31309830	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:5,7:8,8:1,12,4,11
chr13	31318308	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:1,2:2,2,1,4
chr13	31480720	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	31513931	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,1,6
chr13	31526981	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:9,0:17,3:7,20,0,3
chr13	31531195	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr13	31715455	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr13	31722620	.	TAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:1,1:2,3:0,6,0,4
chr13	31725374	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr13	31725732	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,3:5,8:7,3,10,1
chr13	31728703	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.784:21:2,8:2,9:4,0,16,1
chr13	31729889	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=186,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr13	31789169	.	CTT	C,CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26,33;MFRL=141,206,176;MMQ=60,60,60;MPOS=17,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.91,5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.377,0.377:5:1,0,0:0,1,2:1,0,3,1
chr13	31796969	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	31821088	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=107,160;MMQ=60,46;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:3,1:1,1:3,1,3,1
chr13	31821240	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.365:31:8,6:11,5:3,17,1,10
chr13	31821256	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.626:30:5,9:6,10:2,9,3,16
chr13	31850989	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr13	31903834	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0|1:31903834_G_T:31903834:0,0,3,11
chr13	31903841	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0|1:31903834_G_T:31903834:0,0,2,11
chr13	31903873	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:31903873_G_T:31903873:0,2,0,1
chr13	31903875	.	T	TCTAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:31903873_G_T:31903873:0,2,0,1
chr13	32340193	.	T	TA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=239,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=67.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.936:28:1,12:0,15:0,1,5,22
chr13	32355693	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	32360691	.	T	TA,TAA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30,29;MFRL=178,113,150;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.82,30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,15:0.230,0.700:20:1,2,5:0,2,9:1,0,17,2
chr13	32360714	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:16,4:21,0:30,9,4,0
chr13	32366801	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=115,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:9,3:3,1:8,4,2,2
chr13	32371651	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr13	32698544	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,4:1,7:0,5,1,10
chr13	32705785	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:2,3:4,0:6,0,3,1
chr13	32708993	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:8,1,2,0
chr13	32721615	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr13	32758834	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:7,2:9,8:7,9,4,6
chr13	32759350	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	32761791	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,2:14,0:7,14,0,2
chr13	32814073	.	G	GGAGTGTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr13	32823882	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr13	32825913	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr13	32825941	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr13	32826186	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr13	32828553	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,17:0,8:0,0,6,19
chr13	32841292	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,0:6,0:0|1:32841292_T_G:32841292:5,4,3,0
chr13	32841295	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.361:12:1,0:6,0:0|1:32841292_T_G:32841292:4,4,4,0
chr13	32890572	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,25:0.491:51:12,12:14,13:16,10,21,4
chr13	32905094	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.078:62:23,2:35,2:44,14,3,1
chr13	32905219	.	A	ATT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:2,0:4,1:0,12,0,2
chr13	32905265	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr13	32907535	.	CT	C,CTT	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=33,34,26;MFRL=128,181,140;MMQ=60,60,60;MPOS=22,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=7.03,13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,6,9:0.119,0.185:51:14,3,0:17,3,6:8,28,1,14
chr13	32915410	.	CAATT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:4,3:7,3:0,11,0,6
chr13	32973008	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	32981546	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=169,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr13	33018194	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,0:15,2:8,20,0,2
chr13	33095620	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:8,9:9,12:1,16,3,18
chr13	33232334	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.396:38:10,4:13,10:22,1,13,2
chr13	33232769	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:9,4:5,4:0,14,0,8
chr13	33309563	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr13	33315183	.	TC	T	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.087:41:17,2:14,1:30,8,3,0
chr13	33315186	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=204,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=143.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,41:0.919:44:2,18:1,20:0|1:33315186_C_T:33315186:3,0,33,8
chr13	33315188	.	G	T,GT	.	.	DP=60;ECNT=7;MBQ=34,32,35;MFRL=140,204,170;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.64,18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,3,15:0.072,0.321:45:8,2,6:15,0,6:20,7,15,3
chr13	33315189	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=7;MBQ=36,30;MFRL=204,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=155.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,46:0.927:49:2,19:1,24:0|1:33315186_C_T:33315186:3,0,35,11
chr13	33315203	.	C	G,A	.	.	DP=67;ECNT=7;MBQ=33,19,10;MFRL=144,165,157;MMQ=60,60,60;MPOS=17,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=26.60,4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,15,10:0.261,0.141:59:14,0,1:11,3,0:12,22,25,0
chr13	33315206	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,23:0.360:65:15,10:12,8:29,13,14,9
chr13	33315210	.	A	T	.	.	DP=83;ECNT=7;MBQ=29,15;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,19:0.222:79:27,0:20,1:31,29,19,0
chr13	33320054	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr13	33329953	.	TG	T	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,6:0.071:91:39,5:44,1:73,12,6,0
chr13	33329954	.	G	T	.	.	DP=115;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,44:0.408:106:27,23:31,21:55,7,38,6
chr13	33332208	.	CT	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.132:51:22,2:14,4:35,10,6,0
chr13	33332241	.	C	G	.	.	DP=122;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,8:0.063:117:43,0:41,0:57,52,8,0
chr13	33332648	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr13	33333876	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr13	33344241	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:4,2:1,4:6,0,6,0
chr13	33349241	.	T	TGTTTTTA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.484:2:1,0:0,1:0|1:33349241_T_TGTTTTTA:33349241:1,0,0,1
chr13	33349247	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33349241_T_TGTTTTTA:33349241:1,0,0,1
chr13	33590851	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr13	33627829	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr13	33686065	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=112,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,5:4,1:4,6,1,5
chr13	33739629	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr13	34398150	.	A	G	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=123.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,44:0.453:97:21,23:32,20:9,44,11,33
chr13	34409242	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.359:23:4,4:9,2:0|1:34409242_T_C:34409242:7,8,7,1
chr13	34409251	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:5,6:14,2:0|1:34409242_T_C:34409242:8,11,8,1
chr13	35618991	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr13	35806549	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	35926497	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,2:2,5:1,5,2,5
chr13	36006595	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36006595_A_C:36006595:0,0,0,1
chr13	36006597	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36006595_A_C:36006595:0,0,0,1
chr13	36141009	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:10,6:0,3:9,1,7,2
chr13	36220379	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,3:2,3:4,2,5,1
chr13	36224051	.	TACTGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTGGG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr13	36244971	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	36382285	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr13	36397031	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=118,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:2,3:0,2:1,2,0,5
chr13	36402475	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr13	36428595	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr13	36521433	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr13	36521460	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr13	36747798	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr13	36747834	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,2:3,0:9,0,2,0
chr13	36748952	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=116,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:11,7,1,1
chr13	36788529	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:6,1,6,0
chr13	36788758	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr13	36801579	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:36801579_A_G:36801579:0,0,0,4
chr13	36801587	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:36801579_A_G:36801579:0,0,0,4
chr13	36805289	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,3:3,2:9,0,4,1
chr13	36822711	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,5:2,0:4,0,4,2
chr13	36822849	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr13	36822884	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	36827896	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=215,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:6,1,6,0
chr13	36828092	.	G	GTTTTGTAAGCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=204,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:1,1:3,0:0,4,4,0
chr13	36940028	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr13	37012356	.	C	CCCAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=157,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37012356_C_CCCAAA:37012356:0,1,0,1
chr13	37012357	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=157,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37012356_C_CCCAAA:37012356:0,1,0,1
chr13	37012358	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=157,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37012356_C_CCCAAA:37012356:0,1,0,1
chr13	37270111	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,7:6,6:8,1,10,3
chr13	37271428	.	GCA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:0,2:2,3,4,1
chr13	37271449	.	AAT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AT;STR;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.592:8:2,3:0,2:1,2,2,3
chr13	37271609	.	A	AT,ATT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31,33;MFRL=146,164,198;MMQ=60,60,60;MPOS=11,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=T;STR;TLOD=15.79,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,2:0.541,0.194:12:1,6,0:2,1,2:0,3,6,3
chr13	37271707	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.699:18:3,6:2,6:4,1,2,11
chr13	37393737	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=129,0;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:15,2:17,0:19,14,0,2
chr13	37401917	.	GT	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.517:40:9,9:10,12:1,18,3,18
chr13	37423032	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	37524255	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr13	37526560	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=53.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr13	37563689	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,95;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:8,0:11,3:7,13,0,3
chr13	37563791	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	37569200	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,2,14
chr13	37581051	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr13	37584838	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	37598110	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=192,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr13	37598113	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr13	37598550	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:17,2:6,0:7,16,0,2
chr13	37614928	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr13	37625601	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,18:0,0,28,7
chr13	37625770	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr13	37678884	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:11,9:6,4:6,11,5,8
chr13	38138730	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,1,12
chr13	38144050	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38144050_C_CAT:38144050:0,0,0,1
chr13	38144053	.	G	GTCTAGCACCCAAAAATTTATTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38144050_C_CAT:38144050:0,0,0,1
chr13	38144901	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr13	38148893	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr13	38152935	.	C	CAAAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,23;RU=A;STR;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.867:5:0,1:0,2:0|1:38152935_C_CAAAA:38152935:0,0,3,2
chr13	38152959	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,6:0,6:0|1:38152935_C_CAAAA:38152935:0,0,10,4
chr13	38153130	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0,0,13,8
chr13	38153351	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr13	38154161	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=123,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:1,6,1,7
chr13	38154189	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr13	38158195	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=113,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:8,14,1,1
chr13	38164445	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr13	38166357	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,8:0,12:0,0,2,19
chr13	38172867	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:5,5:7,10:6,6,3,12
chr13	38225639	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=211,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr13	38237872	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=72.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,5,15
chr13	38320594	.	TAA	T,TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31,17;MFRL=0,136,168;MMQ=60,60,60;MPOS=14,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.27,5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.407,0.485:6:0,1,1:0,1,0:0,0,0,6
chr13	38924263	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=197.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.984:57:0,33:0,24:0,0,19,38
chr13	38932194	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.758:27:3,8:3,12:5,1,20,1
chr13	38932207	.	TA	T	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,25:0.881:29:2,11:2,14:3,1,24,1
chr13	39262057	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,9:0,0,1,14
chr13	39263258	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,361;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	39263714	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr13	39338612	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr13	39357195	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,3:1,5:5,3,7,1
chr13	39420833	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.072:40:21,0:16,2:8,30,0,2
chr13	39430314	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.436:42:11,11:11,7:13,11,6,12
chr13	39452934	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=70,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,3:1,2:2,3,5,0
chr13	39542531	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr13	39586133	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	39586343	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=161.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,46:0.959:47:0,24:1,22:0,1,25,21
chr13	39587166	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=204.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,27:0,28:0,0,32,28
chr13	39587763	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:4,5:10,3:9,5,4,4
chr13	39596403	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr13	39600511	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=143,94;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:4,13,2,1
chr13	39603380	.	C	CAATG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.755:14:2,6:1,5:0|1:39603380_C_CAATG:39603380:2,1,10,1
chr13	39603384	.	TAAAAAA	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=127,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=22,16;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.210:20:7,2:4,1:10,6,3,1
chr13	39603385	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,7:0.397:18:3,4:3,1:1|0:39603380_C_CAATG:39603380:7,4,5,2
chr13	39603388	.	AA	GT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,7:0.396:18:5,4:6,1:1|0:39603380_C_CAATG:39603380:7,4,5,2
chr13	39605866	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:7,6:2,2:0,10,0,8
chr13	39608335	.	T	TA	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.096:51:20,3:15,1:5,40,2,4
chr13	39611211	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr13	39613198	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:39613198_T_TG:39613198:0,0,3,0
chr13	39613199	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0|1:39613198_T_TG:39613198:0,0,3,0
chr13	39613215	.	C	CGGG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=185,241;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,0:8,1,2,0
chr13	39618174	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,1:1,4:6,0,5,0
chr13	39618371	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=114,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:4,5:5,3:2,8,0,9
chr13	39622075	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	40229744	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr13	40229842	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=200,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:4,1,2,0
chr13	40230043	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,30:0.452:66:15,21:21,7:16,20,10,20
chr13	40233404	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=145,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr13	40233691	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	40239139	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.402:47:14,8:14,9:27,1,19,0
chr13	40254100	.	A	AT	.	.	DP=165;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=135.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,69:0.516:133:30,36:34,32:33,31,43,26
chr13	40261945	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:3,3:5,3:2,7,0,6
chr13	40264066	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=169,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,0:2,6:0,6,0,6
chr13	40268685	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:12,8:12,8:24,0,17,0
chr13	40293288	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr13	40298620	.	CTT	C,CT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,32,33;MFRL=150,140,152;MMQ=60,60,60;MPOS=14,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=7.05,12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,6,11:0.184,0.347:32:5,4,7:4,2,3:13,2,17,0
chr13	40298638	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=52.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,25:0.499:50:15,14:5,7:21,4,16,9
chr13	40298805	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.959:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr13	40325310	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,7:1,2:0,3,0,9
chr13	41240358	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	41373524	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0,13,0,2
chr13	41373538	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0,11,0,2
chr13	41373552	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=208,135;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr13	41515286	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:11,6:9,9:14,6,11,4
chr13	41517985	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,31:0.486:64:17,17:15,13:22,11,22,9
chr13	41523876	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:7,2:4,5:11,0,6,2
chr13	41525586	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,1:4,5:2,5,1,5
chr13	41639425	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.838:3:0,2:0,0:0,0,1,2
chr13	41707024	.	G	GATTGCAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=161,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr13	41791440	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,4:4,5:0,8,0,9
chr13	41807950	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:1,2,5,0
chr13	41814556	.	A	ATTCC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=170,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.367:6:1,2:1,0:0|1:41814556_A_ATTCC:41814556:1,3,1,1
chr13	41814558	.	G	GCCACTAAGCGTGGCCCTCGGTTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=170,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.367:6:1,1:3,0:0|1:41814556_A_ATTCC:41814556:1,3,1,1
chr13	41890894	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41890894_T_C:41890894:2,0,1,0
chr13	41890899	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41890894_T_C:41890894:2,0,1,0
chr13	41893105	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr13	41902939	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,16,9
chr13	41905453	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=74.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,30:0.408:74:19,13:23,17:25,19,17,13
chr13	41946533	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr13	41949785	.	T	TTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr13	41949804	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr13	42044508	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr13	42144853	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=116,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,1:4,5:0,5,2,4
chr13	42161891	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr13	42185696	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.748:14:1,7:2,3:2,1,9,2
chr13	42189232	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chr13	42259433	.	A	AGTCAACACCACTGTTATTAATACCACCACCACCATCACCACT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=158,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.304:6:1,1:3,0:0,5,0,1
chr13	42259437	.	T	TACTGGCGAGACTCTAGGATA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr13	42275473	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	42306133	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	42335222	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:5,8:2,7:5,2,11,4
chr13	42357924	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,4,0
chr13	42358100	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr13	42358102	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:42358102_A_C:42358102:0,2,0,1
chr13	42358103	.	A	ATCTGTTGCACGCTTTCATGACACTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:42358102_A_C:42358102:0,3,0,1
chr13	42361743	.	T	TAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=259,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=AC;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.793:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr13	42407738	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr13	42465490	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr13	42481712	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,10:0,18:0,0,23,5
chr13	42701739	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,1,9
chr13	42748331	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:2,1:0,6,0,2
chr13	42764439	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42764439_T_C:42764439:0,0,1,0
chr13	42764447	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42764439_T_C:42764439:0,0,1,0
chr13	42773953	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:9,8,2,0
chr13	42780148	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,35;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.602:5:1,2:0,1:0|1:42780148_CT_C:42780148:1,1,3,0
chr13	42780168	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.304:11:4,0:2,0:0|1:42780148_CT_C:42780148:3,5,3,0
chr13	42783012	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	42793298	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:0,3:5,4:5,0,7,0
chr13	42793329	.	CTTGTT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGTT;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,0:6,2:8,1,1,1
chr13	42793566	.	T	TACATTTATAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	42793766	.	AGGTTTTTC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:8,3:4,5:13,2,6,2
chr13	42794004	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,5:1,5:0,3,0,10
chr13	42803341	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,3,10
chr13	42869720	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr13	42882762	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr13	42891912	.	A	ACTGAGAAGATAGGAGGGGACACC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.487:3:0,1:0,0:0,2,0,1
chr13	43155168	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	43155443	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,15:0.331:46:14,5:16,9:12,19,5,10
chr13	43358176	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:6,1,6,1
chr13	43474371	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,19,0
chr13	43537287	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,12,1
chr13	43566099	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.471:30:11,7:4,7:14,2,13,1
chr13	43566373	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,0,17
chr13	43597706	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr13	43597932	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=204,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,1,2
chr13	43660044	.	C	CATT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:5,5:3,5:0,8,0,10
chr13	43681427	.	GA	G,AA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=18,26,31;MFRL=147,130,140;MMQ=60,60,60;MPOS=19,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.63,17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,11:0.173,0.518:19:1,0,6:1,2,5:0,5,4,10
chr13	43788031	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:43788031_C_T:43788031:0,0,2,0
chr13	43788039	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:43788031_C_T:43788031:1,0,1,0
chr13	43839494	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,16:0,4:0,0,16,4
chr13	43843775	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43843775_C_CCT:43843775:0,3,0,1
chr13	43843776	.	A	ACT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43843775_C_CCT:43843775:0,3,0,1
chr13	43843779	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43843775_C_CCT:43843775:0,3,0,1
chr13	43872419	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr13	43872451	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr13	43918835	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:8,15,0,2
chr13	43930337	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr13	43935405	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr13	44434281	.	TAATG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,2:0,3,0,4
chr13	44948313	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr13	44948319	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,9;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,0:0,0,0,3
chr13	45010283	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=159.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,18:0,26:0,0,2,42
chr13	45010616	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:7,10:6,4:12,1,14,0
chr13	45517486	.	AAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:0,1:3,0,2,0
chr13	45578633	.	G	GGGCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,288;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	45589161	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,4:0.057:85:39,0:41,4:41,40,2,2
chr13	45594656	.	A	AACCCGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr13	45914957	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.562:36:8,14:5,6:5,11,9,11
chr13	45976349	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,6:4,1:8,0,6,1
chr13	45985583	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=177,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,9:4,1:3,5,4,6
chr13	45985608	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=201,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,4:3,0:0,6,0,4
chr13	46050519	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr13	46077301	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr13	46083980	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:5,15,1,1
chr13	46085864	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr13	46099243	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=175,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,4:6,7:0,10,2,9
chr13	46104130	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr13	46108846	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:4,10,1,1
chr13	46108853	.	TG	CA,CG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,35,27;MFRL=0,143,195;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=26.07,12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,6:0.537,0.403:14:0,4,4:0,3,1:0,0,6,8
chr13	46115908	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr13	46124290	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=84,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr13	46137837	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.590:34:7,12:5,8:11,3,9,11
chr13	46142683	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=261,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:46142683_T_TCC:46142683:0,1,0,1
chr13	46142686	.	ACAT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=261,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46142683_T_TCC:46142683:0,1,0,1
chr13	46148943	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr13	46149116	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=141,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0,6,0,2
chr13	46149144	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:46149144_G_A:46149144:1,2,0,1
chr13	46149145	.	A	AAGGCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:46149144_G_A:46149144:1,2,0,1
chr13	46149148	.	T	TACCCAAAGGCTAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:46149144_G_A:46149144:1,2,0,1
chr13	46154856	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=174,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:46154856_T_A:46154856:0,4,0,1
chr13	46154860	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=174,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:46154856_T_A:46154856:0,4,0,1
chr13	46357707	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,88;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:10,7,0,2
chr13	46544206	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	46550061	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr13	46619026	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr13	46619071	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:7,2,4,2
chr13	46627677	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr13	46629990	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:46629990_A_AG:46629990:2,1,0,1
chr13	46629994	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:46629990_A_AG:46629990:2,1,0,1
chr13	46629995	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,1:0,0:0,1,1,1
chr13	46632226	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr13	46653103	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:0,0:0|1:46653103_G_T:46653103:0,1,0,1
chr13	46653104	.	C	CTACATCCTATCATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:46653103_G_T:46653103:0,1,0,1
chr13	46728924	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:4,8:6,6:6,4,8,6
chr13	46836201	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	46919762	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr13	46919786	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr13	46930536	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:15,9:3,6:15,4,10,5
chr13	46942081	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	47127666	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.488:41:5,8:15,11:21,0,20,0
chr13	47256071	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=TG;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr13	47261970	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.580:24:5,7:4,6:3,7,11,3
chr13	47266832	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr13	47273458	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:5,2,3,0
chr13	47279375	.	C	CT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.469:35:8,5:11,10:8,11,3,13
chr13	47297352	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,6:0,0,14,5
chr13	47297524	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,162;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr13	47302934	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr13	47345469	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr13	47349671	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:2,4:2,4:4,0,7,2
chr13	47365388	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,16,0
chr13	47365450	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=119.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,15:0,20:0,0,29,6
chr13	47408892	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	47466781	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr13	48523567	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:4,6:6,9:9,2,15,0
chr13	48528178	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=171,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:8,0,8,0
chr13	48563008	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,3:3,1:5,6,2,2
chr13	48563216	.	A	AGTTGTCTTTACCTGCCTCAGTGTGTTGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	48571213	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr13	48575292	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.498:48:12,10:12,13:11,13,16,8
chr13	48664556	.	T	TA	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,10:0.178:51:13,6:14,2:5,36,1,9
chr13	48667771	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,0:9,3:3,21,1,2
chr13	48669064	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=202,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr13	48828102	.	A	AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=15,16;MFRL=145,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.245:14:3,0:0,0:0,11,0,3
chr13	48919358	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr13	48921884	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=185.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,25:0,25:0,0,39,11
chr13	48947469	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,22,0
chr13	48953655	.	C	CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.649:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr13	48953816	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=131,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.065:60:24,0:31,3:22,35,2,1
chr13	48953824	.	GC	AT	.	.	DP=57;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=139,98;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,2:0.053:57:24,0:27,2:18,37,1,1
chr13	48953830	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=145,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:21,0:19,3:12,31,1,2
chr13	48953836	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=146,114;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,1:13,1:6,26,0,2
chr13	48953841	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=151,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:16,0:8,5:3,21,0,5
chr13	48953853	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=151,142;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:12,0:8,2:1,20,0,2
chr13	48954093	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=26,25;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:48954093_TA_T:48954093:0,0,1,0
chr13	48954122	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=142,245;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:48954093_TA_T:48954093:3,0,1,0
chr13	48954159	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr13	48954282	.	C	CT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.167:34:13,4:16,0:22,7,5,0
chr13	48955659	.	C	CAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=192,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr13	48955676	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr13	49033747	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr13	49034022	.	ATTC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=204,140;MMQ=30,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.923:23:0,11:0,11:0,1,3,19
chr13	49039094	.	C	CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=24,26;RU=T;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.744:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr13	49051012	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr13	49281554	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:5,2,2,3
chr13	49580225	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0|1:49580225_G_C:49580225:1,0,2,0
chr13	49580230	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:49580225_G_C:49580225:1,0,2,0
chr13	49649373	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:25,3:29,0:42,12,3,0
chr13	49684436	.	CAA	C,CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34,26;MFRL=162,128,115;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.28,3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,4:0.144,0.209:18:7,0,3:3,2,0:10,2,5,1
chr13	49749766	.	A	AGAATTTTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=222,175;MMQ=58,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:49749766_A_AGAATTTTGC:49749766:0,2,0,1
chr13	49749768	.	A	ACTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=222,175;MMQ=58,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:49749766_A_AGAATTTTGC:49749766:0,2,0,1
chr13	49852430	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr13	49865748	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr13	49885216	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr13	49913930	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:3,7:9,5:2,10,3,9
chr13	49951310	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,2:4,1:0,10,0,3
chr13	50116062	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=238,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50116062_T_TGG:50116062:0,1,0,1
chr13	50116063	.	A	AGTGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=238,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50116062_T_TGG:50116062:0,1,0,1
chr13	50126212	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	50134014	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=224,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr13	50205832	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=219,178;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50205832_G_C:50205832:0,1,0,1
chr13	50205835	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=219,178;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50205832_G_C:50205832:0,1,0,1
chr13	50236172	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	50244041	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,4:0,1:1,1,1,4
chr13	50275515	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr13	50276679	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,5:1,6:0,4,0,11
chr13	50299648	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:2,3,4,2
chr13	50510199	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr13	50510401	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr13	50586785	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:13,4,2,0
chr13	50587654	.	CT	C	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=136,168;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.291:34:5,2:5,2:11,13,3,7
chr13	50587718	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=138,180;MMQ=40,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.950:37:1,32:0,3:0,1,0,36
chr13	50589928	.	CA	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.499:30:6,9:9,6:7,8,7,8
chr13	50590292	.	T	TCTC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.500:40:8,10:11,10:11,9,11,9
chr13	50590999	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.627:19:1,5:3,4:2,5,6,6
chr13	50592700	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr13	50594659	.	G	GTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50594659_G_GTC:50594659:0,0,0,1
chr13	50594661	.	TAG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50594659_G_GTC:50594659:0,0,0,1
chr13	50594665	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50594659_G_GTC:50594659:0,0,0,1
chr13	50594672	.	A	AATAACCTGATGTGT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50594659_G_GTC:50594659:0,0,0,1
chr13	51484356	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,348;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	51530414	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:5,13:11,5:16,0,17,1
chr13	51590472	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr13	51825548	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.402:30:8,7:10,4:15,3,12,0
chr13	51948522	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.201:38:17,2:12,1:10,21,7,0
chr13	51948524	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.134:40:16,4:9,1:11,23,6,0
chr13	51948528	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:14,4:10,1:9,22,7,0
chr13	51953541	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,13,3
chr13	51956122	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,9,4
chr13	51969383	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr13	51969696	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	51969708	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=160,236;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51969708_ATC_A:51969708:0,1,0,1
chr13	51969712	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=160,236;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51969708_ATC_A:51969708:0,1,0,1
chr13	51969714	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=160,236;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51969708_ATC_A:51969708:0,1,0,1
chr13	52277693	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=205.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,29:0,33:0,0,39,23
chr13	52293532	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,2:0,5:0,0,2,6
chr13	52333955	.	TTTAACCCAAATCA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=115.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,25:0,2:0,0,1,26
chr13	52345637	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr13	52345698	.	GC	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	52364312	.	CCCCAGCT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=148,259;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52364312_CCCCAGCT_C:52364312:0,2,0,1
chr13	52364315	.	C	CACCCG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,36;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:52364312_CCCCAGCT_C:52364312:0,1,0,1
chr13	52364318	.	C	CACCTCCACACCCGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:52364312_CCCCAGCT_C:52364312:0,1,0,1
chr13	52364324	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=39,32;MFRL=159,259;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52364312_CCCCAGCT_C:52364312:0,1,0,1
chr13	52364325	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=38,29;MFRL=159,259;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52364312_CCCCAGCT_C:52364312:0,1,0,1
chr13	52365407	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.314:16:2,4:6,1:1,10,1,4
chr13	52373814	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr13	52511362	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr13	52511606	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr13	52516560	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:6,4:7,0:6,7,4,0
chr13	52516671	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=129,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:5,3,3,4
chr13	52520704	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr13	52524560	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr13	52539256	.	G	GACTCTTGGCAGAAACTCTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	52542796	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr13	52548690	.	A	ACTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=224,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:2,0:2,2:0|1:52548690_A_ACTT:52548690:3,1,1,1
chr13	52548692	.	T	TCAGCCTTATC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=224,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:2,0:2,1:0|1:52548690_A_ACTT:52548690:3,1,1,1
chr13	52585548	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr13	52585591	.	T	TCGGCG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGGCG;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr13	52602919	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,13,4
chr13	52603775	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=213.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.984:62:0,33:0,27:0,0,31,31
chr13	52606304	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,332;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	52606339	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=216,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52606339_T_C:52606339:1,0,1,0
chr13	52606340	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=216,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52606339_T_C:52606339:1,0,1,0
chr13	52649974	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:7,2:5,1:2,13,1,2
chr13	52663491	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,7:0,5:0,1,0,12
chr13	52684801	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	52701490	.	A	ACTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr13	52701637	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr13	52707240	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0,0,11,1
chr13	52710044	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,3,15
chr13	52710058	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr13	52717950	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr13	52718050	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.953:16:0,9:0,7:0,0,8,8
chr13	52725571	.	A	ACATCATCATCATCATCACCATCACCAAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr13	52725604	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52725604_G_C:52725604:0,0,0,1
chr13	52725608	.	A	AGTAGCTGGGATTATAGGTAAAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52725604_G_C:52725604:0,0,0,1
chr13	52989863	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr13	53009048	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr13	53009114	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=198,168;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53009114_T_C:53009114:0,1,0,1
chr13	53009119	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=198,168;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53009114_T_C:53009114:0,1,0,1
chr13	53010400	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:6,0:14,2:15,7,2,0
chr13	53029770	.	CGCGGTGGCGGTGGCGGTG	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=215,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=GCGGTG;STR;TLOD=64.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,35:0.832:45:3,15:3,19:0,10,2,33
chr13	53030565	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr13	53036398	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr13	53048307	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	53217149	.	CTG	TCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=147,186;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53217149_CTG_TCA:53217149:0,1,0,1
chr13	53217156	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=147,186;MMQ=52,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53217149_CTG_TCA:53217149:0,1,0,1
chr13	53217158	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=147,186;MMQ=52,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53217149_CTG_TCA:53217149:0,1,0,1
chr13	53217161	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,33;MFRL=147,186;MMQ=52,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:53217149_CTG_TCA:53217149:0,1,0,1
chr13	53227301	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,6:0,9:0,0,1,15
chr13	53232489	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,17,6
chr13	53239754	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.234:27:10,3:9,3:21,0,6,0
chr13	53240884	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,18,1
chr13	53250312	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:9,0,3,0
chr13	53254082	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=84.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,12:0,12:0,0,18,6
chr13	53254296	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=147.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,20:0,21:0,0,11,31
chr13	53277639	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:53277639_G_A:53277639:0,0,3,0
chr13	53277646	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:53277639_G_A:53277639:0,0,3,0
chr13	53287023	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr13	53287062	.	G	GCTGTTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53287062_G_GCTGTTT:53287062:0,0,0,1
chr13	53287063	.	A	ACAACTTTCCCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53287062_G_GCTGTTT:53287062:0,0,0,1
chr13	53287064	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53287062_G_GCTGTTT:53287062:0,0,0,1
chr13	53313174	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:5,4,0,2
chr13	53419139	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=93,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:0,4,0,7
chr13	53419794	.	G	GATGTGGCCTCAATCAGTGACTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=101,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr13	53608479	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.411:32:8,10:11,3:10,9,11,2
chr13	55014796	.	C	CTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,22;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	55014824	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,227;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55014824_C_A:55014824:0,0,1,0
chr13	55014827	.	TC	GG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,227;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55014824_C_A:55014824:0,0,1,0
chr13	55014832	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,227;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55014824_C_A:55014824:0,0,1,0
chr13	55015509	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=188,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr13	55015516	.	C	CTTTCAAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr13	60348387	.	T	TA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.088:31:17,0:12,1:6,23,0,2
chr13	60385060	.	A	ATTAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,1,9
chr13	60582651	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,15,9
chr13	60590299	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.952:18:0,6:0,12:0|1:60590299_C_T:60590299:0,0,4,14
chr13	60590307	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:4,1:7,3:0|1:60590299_C_T:60590299:1,11,0,4
chr13	60971452	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:60971452_A_C:60971452:0,3,1,0
chr13	60971455	.	A	AACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:60971452_A_C:60971452:0,3,1,0
chr13	60971461	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60971452_A_C:60971452:0,3,1,0
chr13	60971465	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,12;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:60971452_A_C:60971452:0,3,1,0
chr13	61985478	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:7,5,0,2
chr13	61988107	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr13	66879160	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66879160_T_G:66879160:0,0,0,1
chr13	66879163	.	G	GTTGGGGCACGGCCATGGGCCAAGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66879160_T_G:66879160:0,0,0,1
chr13	67802512	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=132,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:9,3:7,0:7,9,2,1
chr13	70281723	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=89,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:4,3,2,1
chr13	70293715	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.547:24:4,6:6,7:3,8,1,12
chr13	70535355	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr13	70550028	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr13	70681305	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,3,1
chr13	72131340	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=73,119;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr13	72440040	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,10;MFRL=94,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:72440040_C_A:72440040:1,0,1,0
chr13	72440046	.	CGA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=94,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:72440040_C_A:72440040:1,0,1,0
chr13	72440050	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,14;MFRL=94,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:72440040_C_A:72440040:1,0,1,0
chr13	72440052	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,14;MFRL=94,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:72440040_C_A:72440040:1,0,1,0
chr13	72440055	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=47,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:72440040_C_A:72440040:1,1,1,0
chr13	72440658	.	TGCCGCC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=GCC;STR;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.834:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr13	73302157	.	CT	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=128.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,20:0,24:0,0,16,28
chr13	73309029	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,3:4,7:7,1,9,1
chr13	73309067	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.384:37:10,8:13,6:20,3,12,2
chr13	73317585	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,5:4,2:13,0,6,1
chr13	73346411	.	G	GGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,32;MFRL=215,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:73346411_G_GGTT:73346411:1,1,0,1
chr13	73346414	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=215,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73346411_G_GGTT:73346411:1,1,0,1
chr13	73366704	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.929:25:0,10:1,13:0,1,2,22
chr13	73409508	.	TA	T,TAA	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,30,10;MFRL=142,154,154;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=12.72,5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,10,5:0.211,0.130:43:10,3,0:10,4,1:2,26,1,14
chr13	73491108	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,5:1,3:7,0,8,0
chr13	73638125	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	75861174	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,5:3,2:0,4,2,5
chr13	75880384	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr13	75880667	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr13	75884216	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,16:0,0,17,16
chr13	75884290	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:7,5:9,5:6,11,2,8
chr13	75894015	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr13	75898596	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr13	75915250	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,2:1,1:6,2,2,1
chr13	75923536	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr13	75936519	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,10,3
chr13	75936636	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.555:34:9,8:6,11:5,10,6,13
chr13	76055397	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr13	76135028	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,7:3,7:2,6,4,10
chr13	76140814	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr13	76169234	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	76197520	.	T	G	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,2:0.048:60:40,0:16,2:5,53,0,2
chr13	76197530	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.056:51:36,0:13,2:0,49,0,2
chr13	76287432	.	ATG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr13	76335196	.	GAT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr13	76370755	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.475:21:4,3:6,7:11,0,10,0
chr13	76378737	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,5:6,2:0,9,0,7
chr13	76379596	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:3,6:8,3:10,3,7,2
chr13	76382277	.	TGGGAGGCCATCC	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,0:13,2:12,15,1,1
chr13	76395278	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=244,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:1,1,6,2
chr13	76398089	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=230,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr13	76409366	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,4:6,2:9,5,4,2
chr13	76416960	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=123,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:3,1,5,2
chr13	76417101	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=128,181;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr13	76419421	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr13	77522725	.	GACTT	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=100,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTT;STR;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:5,8:8,7:7,6,6,9
chr13	77522805	.	C	CCTCCACCTTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr13	77527707	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:7,0,4,2
chr13	77581677	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:10,8,2,0
chr13	77589725	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=198,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,4:1,8:1,4,3,9
chr13	77629930	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr13	77635245	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:5,9:3,3:9,0,11,1
chr13	77644708	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:5,1:11,1,2,0
chr13	77644861	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:5,0:0|1:77644861_AG_A:77644861:3,8,0,2
chr13	77644863	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:6,0:0|1:77644861_AG_A:77644861:3,8,0,2
chr13	77653140	.	TCCTGATTGACCCCAC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr13	77663138	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,5:1,4:0,3,0,10
chr13	77699596	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.435:35:9,10:10,5:8,12,6,9
chr13	77724828	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=225,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr13	77725106	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr13	77732208	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.424:24:9,7:5,3:4,10,3,7
chr13	77732333	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,2:0,0:0,1,1,2
chr13	77740448	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:4,4:8,2,7,1
chr13	77740709	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:0,10,0,3
chr13	77780715	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:3,0,6,0
chr13	77785513	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0,19,0,2
chr13	77792099	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.259:24:9,2:8,4:2,16,1,5
chr13	77818100	.	C	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,21:0.305:61:17,4:22,10:22,18,0,21
chr13	77835520	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.656:15:2,4:3,4:0,5,1,9
chr13	77835588	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr13	77836133	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:8,1,5,0
chr13	77852856	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,1:4,3:9,2,3,1
chr13	78143646	.	A	AATTGTGAGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=178,77247;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:3,0:0,6,2,0
chr13	78178451	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr13	78183087	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	78183167	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,21,0
chr13	78191824	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,6,18
chr13	78211402	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	78327329	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=154,400;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,1:12,1:19,7,2,0
chr13	79894736	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=96.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,25,4
chr13	79894860	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.213:19:2,1:8,1:7,8,0,4
chr13	79894877	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=19,27;MFRL=139,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.614:8:1,2:0,1:0,3,0,5
chr13	79911336	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:4,5:2,5:5,1,6,4
chr13	79915389	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr13	79916792	.	T	TA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=168.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,25:0,25:0,0,43,11
chr13	79916973	.	A	T	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=235.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,72:0.987:72:0,37:0,34:0,0,16,56
chr13	79916994	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,26:0.563:46:12,13:8,13:2,18,2,24
chr13	79929326	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=99.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,14:0,0,24,8
chr13	79932617	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,0,15
chr13	79940150	.	CTG	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=140.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,14:0,0,32,0
chr13	79940811	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=160.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,17:0,26:0,0,24,21
chr13	79943166	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,5:0,6:0,0,0,12
chr13	79945196	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=123,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:19,2:20,1:16,25,3,0
chr13	79946071	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr13	79946072	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.586:13:2,5:2,2:0,6,0,7
chr13	79946104	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr13	79952843	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=185,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:7,1:19,2:26,0,3,0
chr13	79952854	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=183,133;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:7,2:23,0:32,0,2,0
chr13	79952951	.	C	G	.	.	DP=104;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,4:0.052:93:39,2:50,2:37,52,1,3
chr13	80055642	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.459:18:4,5:4,3:4,6,3,5
chr13	80107645	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=192,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,6:1,1:0,5,0,7
chr13	80910851	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr13	82264343	.	A	G	.	.	DP=142;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=87,123;MMQ=54,45;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=138.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,54:0.398:136:46,28:36,25:51,31,32,22
chr13	88328058	.	A	AG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,172;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:12,0:12,4:7,17,0,4
chr13	88329793	.	ACGG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CGG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:3,0,1,0
chr13	88331241	.	T	TTGTA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTA;STR;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:3,6:6,2:3,6,3,5
chr13	92051201	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	92101213	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=200,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:0,3,0,6
chr13	92346183	.	A	AAATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr13	92408505	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr13	94679921	.	TTTTTTCCTCCTCTTTATCCTTCTTA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:2,1:5,2,2,0
chr13	94938785	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr13	94938808	.	GAT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	95105021	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95105021_A_G:95105021:0,1,0,1
chr13	95105023	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95105021_A_G:95105021:0,1,0,1
chr13	95114483	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=131,172;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.254:9:3,0:2,1:0,7,0,2
chr13	95114501	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=149,172;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr13	95235524	.	TA	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr13	95243292	.	C	CTCCTTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=123,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr13	95254382	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	95275576	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	95279505	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr13	95363884	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:0,2:8,1:1,7,1,3
chr13	95673791	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,7:7,4:7,3,9,2
chr13	95673939	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.797:8:0,3:1,2:0,1,0,7
chr13	95714858	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	95714891	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr13	95715147	.	AAAAAG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:4,3:4,0:1,7,1,2
chr13	95715148	.	AAAAG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.777:11:2,5:0,4:1,1,1,8
chr13	95725359	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr13	95727780	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,9,11
chr13	95735604	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr13	95829870	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr13	95838867	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:10,1:1,1:11,0,2,0
chr13	95839203	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,3:3,0:0,5,1,2
chr13	95858704	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr13	95858797	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,3:10,0:9,12,2,1
chr13	95859974	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr13	95862860	.	AGAGT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr13	95862896	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=147,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr13	95899354	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:0,5:1,12:0,1,5,12
chr13	95900071	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	95953405	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,8:0,17:0,0,25,0
chr13	96230079	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,168;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr13	96230279	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:3,2,0,6
chr13	96239724	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	96258410	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr13	96293523	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,4:6,5:6,3,4,5
chr13	96361680	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=216,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr13	96410115	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr13	96410136	.	G	GCCTGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=215,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr13	96438247	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,3:0.050:78:29,0:44,3:37,38,2,1
chr13	96438295	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,3:0.047:83:33,0:47,3:27,53,0,3
chr13	96505738	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:4,2,4,0
chr13	96505970	.	TTCC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:0|1:96505970_TTCC_T:96505970:0,3,0,1
chr13	96505978	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:96505970_TTCC_T:96505970:0,3,0,1
chr13	96506817	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=137,270;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	96508470	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,185;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.095:60:35,2:19,2:34,21,2,3
chr13	96540141	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=229.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.982:52:0,32:0,18:0|1:96540141_T_C:96540141:0,0,39,13
chr13	96540143	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=229.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.982:52:0,34:0,18:0|1:96540141_T_C:96540141:0,0,39,13
chr13	96599271	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:4,4:5,5:3,6,9,1
chr13	96599433	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,2,3
chr13	96599445	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr13	96636170	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,10:6,2:2,11,2,10
chr13	96684330	.	ACCCCT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=250,255;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr13	97485373	.	A	ACCCAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:97485373_A_ACCCAG:97485373:1,0,0,1
chr13	97485378	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:97485373_A_ACCCAG:97485373:1,0,0,1
chr13	97485381	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:97485373_A_ACCCAG:97485373:1,0,0,1
chr13	97986448	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr13	98087096	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr13	98622187	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:98622187_A_C:98622187:0,0,0,3
chr13	98622202	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=183,167;MMQ=56,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:98622187_A_C:98622187:0,2,0,1
chr13	98622207	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=183,167;MMQ=56,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:98622187_A_C:98622187:0,2,0,1
chr13	98634737	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:4,1:5,1,2,1
chr13	98637917	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0|1:98637917_CT_C:98637917:0,0,0,12
chr13	98637931	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0|1:98637917_CT_C:98637917:0,0,0,14
chr13	98655020	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:8,2:8,10,0,2
chr13	98658358	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr13	98658621	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=177,175;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98658621_T_G:98658621:0,1,0,1
chr13	98658625	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=167,175;MMQ=40,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:98658621_T_G:98658621:0,2,0,1
chr13	98658629	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=177,175;MMQ=40,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:98658621_T_G:98658621:0,3,0,1
chr13	98658635	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=177,175;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:98658621_T_G:98658621:0,3,0,1
chr13	98666560	.	AT	CC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=224,177;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr13	98670641	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr13	98896756	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=144,94;MMQ=60,31;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:15,4,0,2
chr13	98896776	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=145,125;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:4,3,2,2
chr13	99043224	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr13	99061556	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,4:0,0,13,0
chr13	99076965	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,1:1,4:0,2,1,4
chr13	99076998	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	99083624	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	99093094	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,2,4
chr13	99098318	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,7:0,3:2,0,8,2
chr13	99098470	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:4,6:0,1:0,4,4,4
chr13	99098882	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,4,1
chr13	99105389	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=89,113;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,3:5,7:5,1,7,3
chr13	99112754	.	TT	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr13	99113976	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:3,1,2,1
chr13	99115927	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr13	99127252	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=209,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,5:2,4:1,1,1,8
chr13	99127496	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.389:26:6,3:9,6:7,9,6,4
chr13	99134626	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,4:5,5:0,13,0,9
chr13	99338512	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:5,9,0,2
chr13	99361130	.	T	TATA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	99361959	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=155,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:3,6,3,2
chr13	99362023	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=166,41;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:8,7,0,2
chr13	99364295	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr13	99447005	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr13	99448424	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:20,1:28,2:27,21,0,3
chr13	99448441	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.392:49:14,7:16,12:14,16,13,6
chr13	99449579	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,7,3
chr13	99449755	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:0,3,2,4
chr13	99459891	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,6:2,3:6,0,8,1
chr13	99461532	.	GTTTTT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,5;RU=T;STR;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:3,3:8,0,8,0
chr13	99462593	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	99505632	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:10,0,3,2
chr13	99512838	.	TT	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99512838_TT_CC:99512838:0,0,0,1
chr13	99512845	.	TGCCA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99512838_TT_CC:99512838:0,0,0,1
chr13	99515857	.	AAAAC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAAC;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.160:16:6,1:7,1:0,14,0,2
chr13	99520099	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.330:15:4,1:5,3:8,2,4,1
chr13	99520119	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.130:25:6,0:14,0:13,9,3,0
chr13	99534048	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr13	99536031	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr13	99536215	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:99536215_C_T:99536215:0,0,0,5
chr13	99536220	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:99536215_C_T:99536215:0,0,0,4
chr13	99537202	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr13	99537217	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,12:0,0,18,5
chr13	99537942	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,5:4,4:5,2,5,4
chr13	99538711	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,9,0
chr13	99538935	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr13	99540394	.	TA	CG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,0:1,4:6,0,4,0
chr13	99540395	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.914:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr13	99540406	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,0:1,5:5,0,5,0
chr13	99540500	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,5:1,0:0,2,3,2
chr13	99550351	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=79,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr13	99555444	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	99556808	.	CAAAT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr13	99566730	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr13	99573424	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=132,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:99573424_T_C:99573424:0,3,0,1
chr13	99573428	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=132,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:99573424_T_C:99573424:0,3,0,1
chr13	99573430	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=132,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:99573424_T_C:99573424:0,3,0,1
chr13	99578218	.	A	AAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99578218_A_AAT:99578218:0,0,0,1
chr13	99578219	.	CGTG	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99578218_A_AAT:99578218:0,0,0,1
chr13	99578226	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99578218_A_AAT:99578218:0,0,0,1
chr13	99578228	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:99578218_A_AAT:99578218:0,0,0,1
chr13	99578265	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	99630024	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,1:9,1:16,7,2,0
chr13	99853912	.	CAGTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr13	99896159	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,31809096;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:17,2:21,0:16,22,1,1
chr13	99948458	.	T	TATGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	99966513	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.328:16:4,0:2,0:4,7,0,5
chr13	99970429	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,5:0,12:0,0,0,17
chr13	99992527	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.570:12:2,1:3,0:0|1:99992527_A_T:99992527:2,3,6,1
chr13	99992536	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:5,0:0|1:99992527_A_T:99992527:6,5,2,0
chr13	99992539	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,1:4,0:0|1:99992527_A_T:99992527:7,5,2,0
chr13	99992541	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:5,0:0|1:99992527_A_T:99992527:7,5,2,0
chr13	100181915	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr13	100515161	.	A	AGACTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTT;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,3:0,0,6,1
chr13	100517195	.	CTG	C,CTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34,20;MFRL=157,0,114;MMQ=60,60,60;MPOS=23,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,6,13;RU=TG;STR;TLOD=8.43,6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,2:0.199,0.176:14:6,2,1:3,1,0:1,8,3,2
chr13	100518400	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	100523386	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:0,5,0,6
chr13	100537221	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr13	100537232	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,7:0,0,10,3
chr13	100537376	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr13	100623338	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr13	100637102	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr13	100755044	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:8,0,4,0
chr13	100809682	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=182,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:100809682_T_G:100809682:0,2,0,1
chr13	100809684	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=182,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:100809682_T_G:100809682:0,2,0,1
chr13	100921056	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr13	100921082	.	TTTCATTCATTCA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=TTCA;STR;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.563:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr13	101020695	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=128.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,18:0,15:0,0,35,0
chr13	101077862	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,214;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:11,3,2,0
chr13	101143785	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:101143785_G_A:101143785:9,0,2,0
chr13	101143791	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,2:3,0:0|1:101143785_G_A:101143785:8,0,2,0
chr13	101264623	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=90,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:6,6:5,4:0|1:101264623_C_T:101264623:6,5,9,1
chr13	101264633	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=93,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:7,7:5,5:0|1:101264623_C_T:101264623:8,4,9,3
chr13	101287365	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,6:8,3:10,6,2,7
chr13	101288992	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=80,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.556:34:5,8:10,11:2,13,4,15
chr13	101289969	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:2,7,1,4
chr13	101289999	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:101289999_A_T:101289999:0,3,0,1
chr13	101290007	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:101289999_A_T:101289999:0,1,0,1
chr13	101290014	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101290014_A_AT:101290014:0,0,0,1
chr13	101290017	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101290014_A_AT:101290014:0,0,0,1
chr13	101294377	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	101315155	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr13	101315175	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr13	101320874	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,1:7,1:11,6,0,2
chr13	101321067	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr13	101721029	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.777:7:0,2:1,4:1,0,4,2
chr13	101748103	.	A	AGGAGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	101755480	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr13	101757043	.	GG	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:101757043_GG_TA:101757043:0,3,0,1
chr13	101757046	.	A	ATTCACTGTCACAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:101757043_GG_TA:101757043:0,3,0,1
chr13	101757050	.	C	CAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr13	101795373	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr13	101795422	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,14:0,5:0,0,13,6
chr13	101797306	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=208,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr13	101828783	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:101828783_A_T:101828783:0,0,0,1
chr13	101828786	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:101828783_A_T:101828783:0,0,0,1
chr13	101828787	.	GTATAATA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:101828783_A_T:101828783:0,0,0,1
chr13	101844246	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,2:3,1,2,1
chr13	101890040	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,4:2,0:8,0,4,0
chr13	101944752	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=215,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,1,2
chr13	102106193	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	102106276	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr13	102220193	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,0,4
chr13	102344867	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr13	102366742	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,5:5,5:6,1,10,0
chr13	102368056	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=99.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,11:0,18:0,0,1,28
chr13	103257064	.	CAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=222,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AT;STR;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:1,3:2,0,5,0
chr13	103257297	.	AT	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.158:25:5,2:13,2:2,19,0,4
chr13	103271206	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,6:4,1:1,9,0,7
chr13	103279589	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:0,4:6,1:0,6,0,6
chr13	103286280	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr13	103286474	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=116,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,5:3,4:3,5,0,9
chr13	103290535	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,2,0
chr13	103290574	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:2,3,2,0
chr13	103292580	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=213,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr13	103292810	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr13	103295485	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr13	103295551	.	CTTCT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTCT;STR;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.334:22:5,3:7,4:9,6,5,2
chr13	103296819	.	C	CAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr13	103301537	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,5:0,0,1,12
chr13	103303746	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:16,1:10,1:9,18,2,0
chr13	103316113	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=199,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr13	103328579	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:8,7:13,5:20,1,11,1
chr13	103328619	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,26:0.491:53:14,14:13,12:20,7,18,8
chr13	103328660	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=89.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,33:0.523:63:11,17:19,16:19,11,15,18
chr13	103330718	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,1:1,2:0,6,0,3
chr13	103338526	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,2:13,0:0|1:103338526_G_T:103338526:14,13,2,0
chr13	103338529	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,2:14,0:0|1:103338526_G_T:103338526:15,13,2,0
chr13	103346841	.	A	ACCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:103346841_A_ACCTTT:103346841:0,2,0,1
chr13	103346843	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:103346841_A_ACCTTT:103346841:0,2,0,1
chr13	103386116	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr13	103390849	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:0|1:103390849_A_G:103390849:4,12,0,2
chr13	103390854	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=136,215;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:7,2:9,0:0|1:103390849_A_G:103390849:5,12,0,2
chr13	103400306	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:9,11,0,2
chr13	103400532	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:4,4:1,3:3,3,4,4
chr13	103400729	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,10,10
chr13	103402522	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,14:0,0,15,14
chr13	103402772	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	103410710	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=175,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:6,0,7,0
chr13	103411337	.	G	GGATTCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=200,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr13	103441632	.	TC	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=189,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr13	103445609	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=43.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,4:0,0,12,1
chr13	103473497	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,3:3,1:3,7,0,4
chr13	103474031	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,8,2
chr13	103484060	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,8,13
chr13	103491172	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,2:4,2:0,11,1,3
chr13	103491876	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.511:18:3,9:4,0:7,2,9,0
chr13	103506362	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr13	103514091	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,15:0,0,0,24
chr13	103518769	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=130.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,29:0,8:0,0,7,30
chr13	103698630	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr13	103705133	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:103705133_CCT_C:103705133:0,1,0,1
chr13	103705139	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:103705133_CCT_C:103705133:0,1,0,1
chr13	103705145	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:103705133_CCT_C:103705133:0,1,0,1
chr13	106125088	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=105,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr13	107209378	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.489:37:12,10:6,8:15,4,13,5
chr13	108183631	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr13	108518515	.	TGCCGCCGCC	T,TGCCGCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=14,32,33;MFRL=247,162,244;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,3,5;RU=GCC;STR;TLOD=7.12,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.336,0.335:4:0,0,1:0,2,0:0,1,0,3
chr13	108518852	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=97,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:4,3,1,3
chr13	108882343	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=133,231;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,0:3,3:5,4,0,3
chr13	108882748	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.437:32:7,5:11,8:7,11,6,8
chr13	108883981	.	GC	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.501:30:8,5:7,10:6,9,4,11
chr13	108884819	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:3,3,3,3
chr13	108939239	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.173:34:19,2:8,4:0|1:108939239_G_C:108939239:3,25,1,5
chr13	108939247	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=153,112;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.098:30:17,0:8,3:0|1:108939239_G_C:108939239:1,26,0,3
chr13	108939250	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=151,132;MMQ=55,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:8,2:1,23,0,2
chr13	108939290	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=33,26;MFRL=166,158;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:4,3:4,0:0|1:108939290_G_A:108939290:0,8,0,3
chr13	108939292	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=166,158;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:4,2:4,0:0|1:108939290_G_A:108939290:0,8,0,3
chr13	108939319	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=193,183;MMQ=31,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108939319_T_A:108939319:0,2,0,1
chr13	108939327	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:108939319_T_A:108939319:0,0,0,1
chr13	108959080	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=240,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr13	109472849	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr13	109496903	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=133,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr13	109496917	.	A	AGGGTATGCTGTGTGCATAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=161,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr13	109496928	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr13	109550561	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	109700757	.	A	AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.130:28:17,0:6,1:1,24,0,3
chr13	109772909	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=229,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:109772909_C_T:109772909:0,1,0,1
chr13	109772914	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=229,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:109772909_C_T:109772909:0,1,0,1
chr13	109772915	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=229,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:109772909_C_T:109772909:0,1,0,1
chr13	109779906	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	109793363	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.329:10:3,0:1,0:0|1:109793363_G_C:109793363:6,1,3,0
chr13	109793367	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=17,13;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.303:11:3,0:1,1:0|1:109793363_G_C:109793363:7,1,3,0
chr13	109793379	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.384:8:1,0:2,0:0|1:109793363_G_C:109793363:5,0,3,0
chr13	110435302	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr13	110436949	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110436949_G_T:110436949:0,0,0,1
chr13	110436970	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=168,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:110436949_G_T:110436949:1,0,0,1
chr13	110813523	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.499:12:3,2:3,4:0|1:110813523_C_T:110813523:6,0,4,2
chr13	110813532	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:0|1:110813523_C_T:110813523:7,1,4,2
chr13	110817171	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr13	110818598	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:10,9:5,4:10,5,10,3
chr13	110819457	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:0|1:110819457_A_G:110819457:5,0,3,0
chr13	110819460	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:0|1:110819457_A_G:110819457:5,0,3,0
chr13	110819625	.	A	ACTGGAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,2:5,0:0,6,1,1
chr13	110824974	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=112,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr13	110828891	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:2,8:4,7:2,4,3,12
chr13	110828922	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,6:6,0:4,4,1,5
chr13	110831451	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=246,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr13	110833564	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:7,0,7,0
chr13	110833751	.	CAA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.163:23:7,1:7,1:1,19,0,3
chr13	110838646	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.374:9:3,1:1,2:6,0,3,0
chr13	110838703	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:6,6:1,7:2,5,8,5
chr13	110839428	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=122,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr13	110844721	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr13	110845314	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr13	110850770	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr13	110857823	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=116.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,14:0,20:0,0,20,14
chr13	110859690	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr13	110866097	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=133,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:5,4,2,0
chr13	111076987	.	CA	C,CAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31,32;MFRL=0,225,150;MMQ=60,60,60;MPOS=16,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,15;RU=A;STR;TLOD=5.19,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.515,0.329:3:0,1,0:0,1,1:0,0,3,0
chr13	111077400	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr13	111077450	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr13	111082157	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	111082308	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:9,3:13,1:9,15,1,3
chr13	111090909	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=173,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0|1:111090909_T_C:111090909:2,2,3,0
chr13	111090924	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:0|1:111090909_T_C:111090909:1,2,5,0
chr13	111092038	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,3:2,1:5,0,4,0
chr13	111098110	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr13	111098338	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr13	111099057	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr13	111099122	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr13	111101952	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:1,1:4,1:6,0,2,0
chr13	111102865	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=1677,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr13	111109960	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,4:0,0,5,5
chr13	111110418	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,10:0,1:0,0,7,4
chr13	111110666	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:111110666_T_C:111110666:0,0,0,4
chr13	111110674	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:111110666_T_C:111110666:0,0,0,4
chr13	111111023	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:111111023_T_C:111111023:0,0,5,0
chr13	111111043	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,2:0|1:111111023_T_C:111111023:0,0,5,0
chr13	111114554	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:4,8,3,5
chr13	111117668	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr13	111117745	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,9:0,0,11,3
chr13	111118450	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,1:5,6:1,7,1,6
chr13	111119292	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=37,31;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:3,6:2,1:0|1:111119292_G_A:111119292:5,0,7,0
chr13	111119296	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0|1:111119292_G_A:111119292:0,0,12,0
chr13	111120477	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,5:4,1:5,2,6,0
chr13	111121465	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,5,0
chr13	111121483	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr13	111121717	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr13	111132490	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr13	111132701	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,78;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:4,1:8,1:1,12,0,2
chr13	111134858	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,0:4,4:5,1,2,2
chr13	111137167	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr13	111143538	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,2:9,0:8,6,0,2
chr13	111143755	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr13	111153934	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	111154058	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0|1:111154058_T_A:111154058:0,0,16,3
chr13	111154061	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0|1:111154058_T_A:111154058:0,0,16,3
chr13	111154159	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:0|1:111154159_C_T:111154159:1,6,0,6
chr13	111154160	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,7:0.500:14:3,5:4,2:1|0:111154159_C_T:111154159:1,6,1,6
chr13	111155428	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr13	111155711	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:6,3:2,8:5,3,10,2
chr13	111156153	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,8:6,7:8,2,8,7
chr13	111156411	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:2,0,4,1
chr13	111159054	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr13	111160630	.	A	AGCG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=119,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr13	111160634	.	G	GATGTAGGGCTTGATCTCGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=107,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:0,2:2,0:0,3,0,2
chr13	111164198	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr13	111176559	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	111274467	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	111276727	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr13	111290880	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=130,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:2,3,1,3
chr13	111293988	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr13	111298287	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,1:1,3:2,2,4,0
chr13	111299653	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	111319884	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr13	111531885	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr13	111532288	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.438:32:12,6:6,7:9,9,9,5
chr13	111563052	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,15:0.323:47:22,5:10,9:13,19,7,8
chr13	111932610	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:0,0:2,0:7,4,3,0
chr13	111933098	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=174,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr13	111938483	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:7,3:1,1:5,3,3,1
chr13	111953903	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,3,17
chr13	111953977	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=138,194;MMQ=60,46;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr13	111953994	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:111953994_C_T:111953994:0,0,0,1
chr13	111953998	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111953994_C_T:111953994:0,0,0,1
chr13	111954000	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,46;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111953994_C_T:111953994:0,0,0,1
chr13	111955465	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,3:0,12:0,0,2,13
chr13	111980478	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,12,4
chr13	112278338	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,2:2,3:7,1,4,1
chr13	112297403	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr13	112723485	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.158:27:11,1:12,2:11,12,2,2
chr13	112723759	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:3,1:2,1:1,6,0,2
chr13	112725791	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,16,6
chr13	113032915	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr13	113032962	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,2:7,3:5,6,5,0
chr13	113153114	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr13	113158577	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr13	113200139	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=123,97;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.161:28:16,0:8,4:13,11,1,3
chr13	113210370	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:5,1:12,3,1,1
chr13	113333684	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=161,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,1:2,3:4,1,2,2
chr13	113439586	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.515:23:6,6:5,5:2,9,3,9
chr13	113485695	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,2:8,0:13,2,2,0
chr13	113510460	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr13	113512331	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=237,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr13	113525952	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr13	113535024	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=158,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113535024_C_T:113535024:0,2,0,1
chr13	113535033	.	G	GCCTGTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113535024_C_T:113535024:0,2,0,1
chr13	113563690	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=137,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr13	113634091	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr13	113639671	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:3,0,2,1
chr13	113639862	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:113639862_G_A:113639862:0,0,0,6
chr13	113639869	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:113639862_G_A:113639862:0,0,0,5
chr13	113639872	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:113639862_G_A:113639862:0,0,0,5
chr13	113699297	.	AG	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=285,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:113699297_AG_TC:113699297:0,1,0,1
chr13	113699301	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=285,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113699297_AG_TC:113699297:0,1,0,1
chr13	113708697	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:0,8,2,6
chr13	113739125	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,1:2,0,5,0
chr13	113739518	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:5,3:1,6,1,4
chr13	113742777	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:2,2,0,4
chr13	113742805	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,2,4
chr13	113744139	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr13	113745611	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr13	113748868	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:12,2:9,0:14,10,0,2
chr13	113749350	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,112;MMQ=60,60;MPOS=-1073741816;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:4,5,1,1
chr13	113749475	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr13	113792893	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=119.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,18:0,16:0,0,1,33
chr13	113801843	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr13	113817290	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,14;MFRL=106,138;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,0:0|1:113817290_A_AC:113817290:2,1,2,0
chr13	113817293	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=15,23;MFRL=106,138;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:1,1:2,1,2,0
chr13	113817296	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,25;MFRL=53,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:1,2:1,1,3,0
chr13	113817302	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,16;MFRL=106,138;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,0:0|1:113817290_A_AC:113817290:2,1,2,0
chr13	113817309	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,13;MFRL=117,138;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,0:0|1:113817290_A_AC:113817290:2,3,2,0
chr13	113818817	.	T	C,TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,225,120;MMQ=60,60,60;MPOS=26,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.89,4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.498,0.402:7:0,2,2:0,2,1:0,0,6,1
chr13	113832490	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:16,2,0,2
chr13	113833499	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr13	113852425	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,15,2
chr13	113854715	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,7,2
chr13	113862801	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr13	113882221	.	C	CAAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=167,139;MMQ=50,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.521:4:0,0:1,2:0|1:113882221_C_CAAA:113882221:1,1,2,0
chr13	113882238	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=130,139;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,1:0|1:113882221_C_CAAA:113882221:3,3,2,0
chr13	113882242	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,14;MFRL=143,139;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:3,0:0|1:113882221_C_CAAA:113882221:5,3,2,0
chr13	113888201	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,12:0,0,15,7
chr13	113889474	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,4,17
chr13	113891075	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr13	113899613	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,117;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.178:24:13,0:7,4:2,18,1,3
chr13	113900197	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr13	113907420	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,107;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:16,3:22,0:17,21,3,0
chr13	113917767	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=94.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,17:0,0,21,6
chr13	113978969	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr13	113999238	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr13	114018038	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr13	114083421	.	A	AAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=94,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AG;STR;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:3,4,0,3
chr13	114150358	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,0,4
chr13	114150402	.	A	AACATGGGCTGTTGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=208,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr13	114150433	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	114152919	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:114152919_A_G:114152919:0,0,0,2
chr13	114152928	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114152919_A_G:114152919:0,0,0,1
chr13	114154208	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,5:3,0:5,1,5,0
chr13	114155965	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr13	114155982	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr13	114157724	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr13	114157952	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.394:15:3,3:6,1:0,9,0,6
chr13	114164526	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=141,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:8,6:6,6:9,6,7,6
chr13	114188291	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:8,0,7,0
chr13	114193878	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr13	114201742	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=167,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,1,4
chr13	114202575	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:3,3:2,1:5,0,3,1
chr13	114202592	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:4,3:4,2:8,1,3,2
chr13	114240067	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=76,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:1,1:0,3:1,1,4,0
chr13	114240277	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:5,0:2,2:0|1:114240277_T_C:114240277:0,7,0,2
chr13	114240281	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:0|1:114240277_T_C:114240277:0,7,0,2
chr13	114240284	.	T	TTTCTCTA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:114240277_T_C:114240277:0,7,0,2
chr13	114288971	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:5,6:4,6:1,8,1,12
chr13	114322470	.	G	GAGATACTTGCATTGGTAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=228,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr13	114502416	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,3:6,4:2,11,4,3
chr13	114503875	.	GCCTGCGGGAGGTGAGGGGCACCGGGGACCCCCATATCTACACCTGCGGGAGGTGAGGGGCGCTGGGGACCCCCGTATCTACA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.527:42:1,12:6,13:4,12,13,13
chr13	114507836	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr13	114524056	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,2:2,2:0,4,0,5
chr13	114537517	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:2,3:5,3:6,1,6,0
chr13	114538460	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:2,0:0,6:2,0,6,1
chr13	114542858	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:7,1:0,4:4,3,2,3
chr13	114751021	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,20;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,0:0,1:1,0,2,0
chr13	114751162	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:1,8,1,1
chr13	114751359	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr13	114765025	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:18,2:11,0:22,7,2,0
chr13	114773126	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr13	114774813	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr13	114778593	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr13	114780638	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=195,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.628:6:1,4:1,0:0|1:114780638_G_C:114780638:2,0,3,1
chr13	114780648	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:0,1:0|1:114780638_G_C:114780638:1,0,3,2
chr13	114784435	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:0,7,0,4
chr13	114787031	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr13	114792842	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=68.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,14,5
chr13	115002305	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:3,8:2,10:3,2,6,12
chr13	115002439	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=202,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:115002439_G_A:115002439:0,3,0,1
chr13	115002446	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=202,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:115002439_G_A:115002439:0,3,0,1
chr13	115002449	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=202,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:115002439_G_A:115002439:0,3,0,1
chr13	115004524	.	AT	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=66.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.525:48:14,16:9,9:6,17,5,20
chr13	115004555	.	TGCATCTCTTAAATATGTGTGA	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.391:34:9,8:9,5:0,21,0,13
chr13	115010254	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr13	115010330	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.541:20:4,4:5,6:6,3,8,3
chr13	115012590	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.569:7:0,3:1,1:0,3,0,4
chr13	115015966	.	C	CAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=114,144;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.568:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr13	115024696	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr13	115027462	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,5:5,6:2,7,0,11
chr13	115037613	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,8:2,6:4,0,13,1
chr13	115047700	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr13	115064542	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=193,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,1:5,6:0,10,0,7
chr13	115092834	.	T	TGGCTTTTAAGGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:115092834_T_TGGCTTTTAAGGA:115092834:0,0,0,1
chr13	115092836	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:115092834_T_TGGCTTTTAAGGA:115092834:0,0,0,1
chr14	19553963	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=245,249;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr14	19574244	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=102.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,20:0,15:0,0,0,35
chr14	20007701	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,109;MMQ=25,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.561:14:4,3:2,5:1,5,6,2
chr14	20215501	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=213,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr14	20216493	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,100;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,2,0
chr14	20216560	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,29;MFRL=169,68;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	20249456	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:5,3:11,5:0,16,1,7
chr14	20295510	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr14	20296384	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.250:29:12,3:9,3:6,16,2,5
chr14	20296632	.	T	TCTCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	20344373	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.800:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	20345313	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=162,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	20389811	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:20389811_T_A:20389811:0,2,0,1
chr14	20389816	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20389811_T_A:20389811:0,1,0,1
chr14	20389828	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	20404735	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=139,99;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr14	20404736	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=99,139;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr14	20404767	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=99,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,2,1
chr14	20501962	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,0:0,7:0,0,7,0
chr14	20502236	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=118,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,8:4,6:4,6,7,7
chr14	20528448	.	TCATAGATTTGCTCACTGAC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.671:19:3,4:2,8:0,6,1,12
chr14	20528505	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=-3;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:1,2,0,6
chr14	20529177	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:8,5:7,9:3,12,1,13
chr14	20586650	.	CA	AA,AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,33,30;MFRL=176,222,109;MMQ=60,50,60;MPOS=17,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.43,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.429,0.286:4:0,2,1:1,0,0:0,1,0,3
chr14	20586652	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=176,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr14	20586663	.	GAATAT	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=150,320;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:20586663_GAATAT_G:20586663:0,2,0,1
chr14	20586669	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=176,320;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20586663_GAATAT_G:20586663:0,1,0,1
chr14	20586673	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=176,320;MMQ=60,40;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:20586663_GAATAT_G:20586663:0,1,0,1
chr14	20666175	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.537:22:7,7:3,5:4,6,5,7
chr14	20666556	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=180,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:5,3:1,6,3,2
chr14	20666587	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,0:0,3:0,1,0,4
chr14	20666623	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=205,235;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr14	20691777	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr14	20691888	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,8:7,6:7,5,9,5
chr14	20691962	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.679:23:4,4:3,11:5,2,13,3
chr14	20760066	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=140,235;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr14	20760349	.	GC	AA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,2:0|1:20760349_GC_AA:20760349:0,3,0,3
chr14	20760356	.	C	CTGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=214,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:20760349_GC_AA:20760349:0,4,0,1
chr14	20760357	.	A	AGCCCACTTGAAGGTTGAGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=214,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:20760349_GC_AA:20760349:0,4,0,1
chr14	20763446	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr14	20763824	.	T	TA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.286:23:7,5:8,0:15,2,5,1
chr14	20764031	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,6:2,5:0,3,1,10
chr14	20764094	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	20767618	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:1,2,2,3
chr14	20767706	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	20770036	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.454:42:11,9:12,10:10,13,9,10
chr14	20794509	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:4,5:5,4:10,0,9,0
chr14	20813289	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=157.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,58:0.527:110:28,28:24,30:17,35,14,44
chr14	20813672	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:4,3:3,3:0,8,0,6
chr14	20819303	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:4,3:8,12:4,8,5,10
chr14	20820537	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.630:17:2,6:4,4:3,3,3,8
chr14	20820596	.	G	GAGGGCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:20820596_G_GAGGGCA:20820596:0,4,0,1
chr14	20820599	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:20820596_G_GAGGGCA:20820596:0,4,0,1
chr14	20824415	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,6:4,1:8,0,7,0
chr14	20825321	.	T	TTTCAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.715:12:2,6:1,3:0|1:20825321_T_TTTCAC:20825321:0,3,1,8
chr14	20825323	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:2,6:1,1:0|1:20825321_T_TTTCAC:20825321:0,3,1,8
chr14	20825965	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,4:7,2:2,9,0,6
chr14	20836923	.	GCACA	G,GCA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28,27;MFRL=157,81,144;MMQ=60,60,60;MPOS=17,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=CA;STR;TLOD=4.92,6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.254,0.336:9:2,2,2:1,0,1:2,2,5,0
chr14	20841705	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:11,2:14,1:16,9,2,1
chr14	20842556	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr14	20846106	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20846106_A_C:20846106:0,0,1,0
chr14	20846112	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20846106_A_C:20846106:0,0,1,0
chr14	20846118	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20846106_A_C:20846106:0,0,1,0
chr14	20846123	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20846106_A_C:20846106:0,0,1,0
chr14	20846125	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20846106_A_C:20846106:0,0,1,0
chr14	20846132	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20846106_A_C:20846106:0,0,1,0
chr14	20846521	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.544:15:3,3:2,5:4,3,7,1
chr14	20850978	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=195,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	20851840	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=125,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:4,2:6,6:6,4,2,6
chr14	20852015	.	G	GTTGGAGTAGTAAGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	20853367	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20853367_T_TG:20853367:0,0,0,1
chr14	20853369	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20853367_T_TG:20853367:0,0,0,1
chr14	20854615	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:2,3,2,0
chr14	20854871	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20854871_G_C:20854871:0,1,0,1
chr14	20854874	.	CAAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20854871_G_C:20854871:0,1,0,1
chr14	20869819	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr14	20876344	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:18,0:9,1:20,17,0,3
chr14	20876594	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	20916958	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:1,6,1,6
chr14	20916987	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:3,3,2,3
chr14	20917349	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,3:16,0:15,12,2,1
chr14	20917442	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,8:3,2:0,9,1,9
chr14	20920043	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr14	20920340	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,2,2
chr14	20920360	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,6:2,1:2,2,6,2
chr14	20923731	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.618:29:6,9:4,9:11,0,15,3
chr14	21024605	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr14	21024619	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,6,5
chr14	21108803	.	AA	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=191,145;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr14	21109278	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:2,6:9,6:4,7,8,4
chr14	21109859	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=189,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,2:6,4:4,3,0,6
chr14	21168796	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.632:36:4,13:9,10:1,12,5,18
chr14	21215692	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=194,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:2,0,8,0
chr14	21215728	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:3,4:5,1,4,2
chr14	21250676	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,3:6,3:2,8,1,5
chr14	21359808	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:5,4:2,2:7,1,7,0
chr14	21458131	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,5,3
chr14	21458320	.	CCCCG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr14	21463430	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,7:0,0,6,20
chr14	21463474	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr14	21468156	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,2,2
chr14	21488046	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,13,3
chr14	21488672	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:2,1:12,0:6,8,2,0
chr14	21490125	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,6,4
chr14	21542879	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=228,977;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:1,6,3,0
chr14	21544842	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:3,2:1,4,0,3
chr14	21548793	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21548793_C_CCA:21548793:1,0,1,0
chr14	21548794	.	T	A,C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,14,14;MFRL=0,151,153;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,0,0:0,0,2,0
chr14	21548798	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=12,13;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:21548793_C_CCA:21548793:1,0,1,0
chr14	21548799	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,0:0,0:1|0:21548793_C_CCA:21548793:0,0,1,0
chr14	21548802	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,13;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:21548793_C_CCA:21548793:2,0,1,0
chr14	21548803	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,12;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1|0:21548793_C_CCA:21548793:1,0,1,0
chr14	21548813	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,0:1|0:21548793_C_CCA:21548793:4,0,1,0
chr14	21555087	.	AAATC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,2:4,0:8,0,2,0
chr14	21555577	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	21556963	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,8:0,0,11,5
chr14	21560752	.	GGAGGCT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAGGCT;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.615:3:0,1:0,1:0,1,2,0
chr14	21561513	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	21570273	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=124,112;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:6,7:7,9:7,6,9,7
chr14	21571208	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr14	21623162	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:10,0:11,8,0,2
chr14	21624197	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=224,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr14	21624230	.	T	TTTAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	21699069	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:11,7:8,5:17,3,10,2
chr14	21702046	.	C	CA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:12,3:13,1:21,6,4,0
chr14	21702445	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=201,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.628:14:2,2:3,7:0,5,0,9
chr14	21763066	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=214,171;MMQ=46,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr14	21778717	.	AAAT	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAT;STR;TLOD=99.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,28:0.427:66:20,16:14,12:26,12,24,4
chr14	21798610	.	GA	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=183,155;MMQ=50,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr14	21798645	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=184,229;MMQ=24,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	21816368	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:10,1:10,2:11,9,2,1
chr14	21821821	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.436:39:11,4:11,12:16,6,11,6
chr14	21828520	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:7,4:10,6:13,4,6,4
chr14	21829404	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,1:1,7,1,7
chr14	21831112	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,2:4,3:3,7,3,2
chr14	21831692	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:2,3:4,4:1,6,1,6
chr14	21833147	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:4,2:10,9:7,7,6,5
chr14	21836400	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,6:6,6:8,4,6,6
chr14	21859536	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr14	21861211	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,2:7,6:13,1,8,0
chr14	21864124	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:2,6:0,7,0,7
chr14	21869705	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=206,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr14	21871396	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=208,264;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21871396_A_T:21871396:0,1,0,1
chr14	21871399	.	TAA	GCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=208,264;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21871396_A_T:21871396:0,1,0,1
chr14	21874068	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr14	21882376	.	TTTTGAAGAATCAGCCAAGGCTGACAACCCCAGTAA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.191:20:2,3:6,0:16,1,2,1
chr14	21899992	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,0:10,2:12,11,1,1
chr14	21930596	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:8,1:10,6:6,12,2,5
chr14	21936762	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.365:20:4,3:7,3:12,1,6,1
chr14	21943109	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=182,100;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,1:8,1:1,14,0,2
chr14	21944955	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:12,7:6,5:11,7,6,6
chr14	21960354	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=173,144;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:12,0,2,0
chr14	21960424	.	TG	T	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,15:0.264:54:24,10:14,5:30,9,10,5
chr14	21960425	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,27:0.418:62:20,19:13,8:27,8,19,8
chr14	21967133	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=113,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.421:24:6,5:7,4:9,5,8,2
chr14	21967916	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=147.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,25:0,16:0,0,22,21
chr14	21968619	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,4:4,7:4,2,9,2
chr14	21970091	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:0,8,1,7
chr14	22037876	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=113,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:4,2:3,2:6,2,4,0
chr14	22037905	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=121,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:10,3:4,4:9,5,6,1
chr14	22103089	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	22997408	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:9,8:2,9:10,1,14,3
chr14	23058084	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=103.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,19:0,0,4,26
chr14	23072897	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:18,2:12,0:15,15,1,1
chr14	23079730	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=114,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:3,5,3,0
chr14	23235697	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,17,2
chr14	23239512	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr14	23239880	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr14	23249292	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:1,2,1,4
chr14	23299009	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	23302565	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr14	23302585	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,5:0,1:0,0,7,1
chr14	23303293	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr14	23311020	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:4,0,0,1
chr14	23311042	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:23311042_CT_C:23311042:1,0,3,0
chr14	23311044	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,0:0|1:23311042_CT_C:23311042:1,0,3,0
chr14	23312678	.	C	CGGGCCATTCCTGTTGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=179,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.477:2:0,1:1,0:0|1:23312678_C_CGGGCCATTCCTGTTGT:23312678:0,1,0,1
chr14	23312681	.	G	GCCCCACGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=179,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23312678_C_CGGGCCATTCCTGTTGT:23312678:0,1,0,1
chr14	23312718	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,359;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	23312863	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,4:1,6:5,0,9,1
chr14	23314663	.	TGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=214,241;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr14	23314675	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr14	23342735	.	CTTTTT	C,CTTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=17,31,23;MFRL=180,234,179;MMQ=50,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,14;RU=T;STR;TLOD=3.17,5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,4:0.194,0.463:7:1,0,3:0,1,0:0,2,0,5
chr14	23352464	.	TGCACACGCACAC	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=GCACAC;STR;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.315:27:5,5:11,3:12,7,8,0
chr14	23373607	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=18,21;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:1,1:0,4,0,2
chr14	23391533	.	C	CACAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=118,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:1,2,1,4
chr14	23391692	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=140,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:5,6:3,2:7,1,6,2
chr14	23391913	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.455:51:18,13:8,10:21,7,15,8
chr14	23393204	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:5,2,2,0
chr14	23394007	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,4,1
chr14	23394069	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,8:5,5:8,3,7,6
chr14	23395529	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,4:4,6:3,4,1,9
chr14	23396680	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:5,12:7,5:12,0,15,2
chr14	23396916	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=189,120;MMQ=51,43;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr14	23416463	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=123,0;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:20,0:26,2:20,26,0,2
chr14	23416476	.	GGC	G	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=125,0;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:16,0:24,2:0|1:23416476_GGC_G:23416476:16,26,0,2
chr14	23416479	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=125,0;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:14,0:23,2:0|1:23416476_GGC_G:23416476:16,26,0,2
chr14	23416485	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=112,0;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:13,0:22,2:0|1:23416476_GGC_G:23416476:12,24,0,2
chr14	23417317	.	CAAAT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=131,244;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr14	23424186	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=164,151;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.441:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr14	23424213	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:11,1,2,0
chr14	23444381	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23444381_C_T:23444381:0,0,0,1
chr14	23444382	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23444381_C_T:23444381:0,0,0,1
chr14	23444387	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23444381_C_T:23444381:0,0,0,1
chr14	23459156	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	23495610	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,1:4,2:1,7,0,3
chr14	23496860	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:3,0:5,0,3,0
chr14	23497094	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,175;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.161:17:7,1:5,1:1,14,0,2
chr14	23502961	.	AT	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23502961_AT_GC:23502961:0,0,0,1
chr14	23502965	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23502961_AT_GC:23502961:0,0,0,1
chr14	23502970	.	CAGCACAT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23502961_AT_GC:23502961:0,0,0,1
chr14	23511357	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr14	23517581	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:3,11,1,1
chr14	23523740	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr14	23531507	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=222,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:1,2,1,3
chr14	23562720	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.071:55:23,0:24,3:23,29,0,3
chr14	23567868	.	CT	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.214:31:11,5:10,1:10,15,0,6
chr14	23568018	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr14	23568097	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=177,147;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:5,0,2,0
chr14	23568126	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:9,0,2,0
chr14	23568887	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=192,210;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:3,0:0|1:23568887_A_G:23568887:4,3,0,2
chr14	23568891	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=192,210;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:5,0:0|1:23568887_A_G:23568887:4,3,0,2
chr14	23568893	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=192,210;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:5,0:0|1:23568887_A_G:23568887:4,3,0,2
chr14	23569291	.	C	CCACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	23569360	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	23607246	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr14	23609916	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	23612489	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	23634451	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=320753,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr14	23712596	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=189,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.193:17:8,0:3,0:2,12,0,3
chr14	23727902	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.678:4:0,1:1,1:0|1:23727902_CTT_C:23727902:0,1,0,3
chr14	23727919	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=39,34;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:23727902_CTT_C:23727902:0,1,0,3
chr14	23727952	.	A	AGTTCTTGTCAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	23729188	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,6:8,5:1,12,2,9
chr14	23729750	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=151,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:2,2:5,1:7,0,4,0
chr14	23731855	.	C	CT,CTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,31,25;MFRL=172,138,153;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=T;STR;TLOD=26.09,4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,13,3:0.532,0.149:24:4,10,0:2,2,2:4,4,11,5
chr14	23732091	.	AT	GC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,5:5,8:7,2,8,5
chr14	23732252	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:0,6,0,3
chr14	23732261	.	T	TAGTGTTCACCAAGG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr14	23732267	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=144,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr14	23733978	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=193,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr14	23744826	.	TTCC	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TCC;STR;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,4:7,6:3,6,1,9
chr14	23746466	.	A	AACACACAAAAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	23777099	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,14,6
chr14	23815872	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=218,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:23815872_G_GTT:23815872:1,0,1,1
chr14	23815875	.	GGTGGC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=229,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,0:0|1:23815872_G_GTT:23815872:2,0,1,1
chr14	23816094	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	23816978	.	A	AGTTTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=112,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:23816978_A_AGTTTC:23816978:0,3,0,1
chr14	23816980	.	T	TGACGATGGCCGTCTAGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=112,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:23816978_A_AGTTTC:23816978:0,3,0,1
chr14	23816998	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	23830042	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:3,2:0|1:23830042_T_C:23830042:3,2,1,2
chr14	23830048	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=126,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:23830042_T_C:23830042:2,2,1,1
chr14	23853629	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr14	23854272	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,5:1,2:0,2,1,6
chr14	23854324	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr14	23854341	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	23855844	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=117,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:0,0:2,1:2,1,0,3
chr14	23855849	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=117,124;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,0:2,1:1,2,1,1
chr14	23857351	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=108,0;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:0,2:6,1,1,1
chr14	23868285	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,1,4
chr14	23872666	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=84,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,5:3,2:7,7,3,5
chr14	23874117	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr14	23874131	.	C	CTCCTGTCATTAACATCTGGTACTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=201,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr14	23885997	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=155,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr14	23888323	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr14	23889478	.	GGACCCCTCCACT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=185,227;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23889478_GGACCCCTCCACT_G:23889478:0,1,0,1
chr14	23889487	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:23889478_GGACCCCTCCACT_G:23889478:0,0,0,1
chr14	23889495	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=185,227;MMQ=60,39;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23889478_GGACCCCTCCACT_G:23889478:0,1,0,1
chr14	23889497	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=185,227;MMQ=60,39;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23889478_GGACCCCTCCACT_G:23889478:0,1,0,1
chr14	23894322	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	23895083	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,192;MMQ=52,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:3,5,0,3
chr14	23896847	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:8,2,2,0
chr14	23898884	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	23901582	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:5,0,5,1
chr14	23938813	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,12,1
chr14	23940081	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,21:0.524:40:8,11:11,9:0|1:23940081_A_G:23940081:15,4,18,3
chr14	23940086	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=172.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,20:0,21:0|1:23940081_A_G:23940081:0,0,34,8
chr14	23940089	.	AC	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,22:0.479:46:7,13:13,9:0|1:23940081_A_G:23940081:17,7,18,4
chr14	23945366	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,3:5,10:2,8,3,10
chr14	23945708	.	T	TAAGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23945708_T_TAAGG:23945708:0,0,0,1
chr14	23945710	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23945708_T_TAAGG:23945708:0,0,0,1
chr14	23945712	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:23945708_T_TAAGG:23945708:0,0,0,1
chr14	23947374	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr14	24029723	.	T	TTCTGTGGACAACGTCAAACAGGGAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=240,239;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	24112517	.	A	ATTTTATAGTACAGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24112517_A_ATTTTATAGTACAGTG:24112517:0,1,0,1
chr14	24112521	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24112517_A_ATTTTATAGTACAGTG:24112517:0,1,0,1
chr14	24435248	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=169,202;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.095:31:14,1:12,1:0|1:24435248_C_CT:24435248:3,26,0,2
chr14	24435250	.	C	CA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=168,202;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.096:30:14,1:13,0:0|1:24435248_C_CT:24435248:3,25,0,2
chr14	24436381	.	GA	G	.	.	DP=169;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=104.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,59:0.394:150:30,26:40,31:67,24,46,13
chr14	24470100	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=152,168;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:14,0:13,0:27,0,2,0
chr14	24473478	.	TA	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.448:31:9,9:8,5:17,0,14,0
chr14	24512997	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=110,151;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr14	24516556	.	CT	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=189,225;MMQ=58,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr14	24520218	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,152;MMQ=40,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:2,3:8,3:0,10,0,6
chr14	24522821	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr14	24522938	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.548:33:4,10:9,7:11,4,11,7
chr14	24523594	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr14	24525634	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr14	24525782	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr14	24526287	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr14	24531641	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=104,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,2:3,6:4,3,6,2
chr14	24538702	.	C	CCACCCGTCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=107,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:24538702_C_CCACCCGTCA:24538702:0,3,0,1
chr14	24538705	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:24538702_C_CCACCCGTCA:24538702:0,4,0,1
chr14	24538707	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:24538702_C_CCACCCGTCA:24538702:0,4,0,1
chr14	24538735	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	24543873	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,14:0,6:0,0,15,5
chr14	24544879	.	T	TTGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr14	24545346	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.294:13:3,2:3,1:3,6,4,0
chr14	24545352	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:3,4:3,1:1,7,6,0
chr14	24545375	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr14	24567676	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,0:8,2:5,8,0,2
chr14	24607107	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	24607883	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,3:6,0:8,7,2,1
chr14	24619948	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:13,2:9,0:2,20,0,2
chr14	24624591	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,0:0|1:24624591_T_A:24624591:2,6,2,0
chr14	24624595	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:1,1:0|1:24624591_T_A:24624591:3,6,2,0
chr14	24624741	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,8:6,6:10,4,4,10
chr14	24626695	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:9,13,0,2
chr14	24634961	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=159,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:24634961_A_G:24634961:3,1,1,0
chr14	24634965	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=159,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:24634961_A_G:24634961:3,1,1,0
chr14	24635443	.	C	CCTTTTA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=149,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:5,1:0,0:0|1:24635443_C_CCTTTTA:24635443:2,4,1,1
chr14	24635447	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=149,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:0|1:24635443_C_CCTTTTA:24635443:2,4,1,1
chr14	24642037	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,10;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:3,0:7,0:0|1:24642037_A_C:24642037:1,9,0,3
chr14	24642043	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:2,0:3,0:0|1:24642037_A_C:24642037:1,6,0,3
chr14	24642048	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:1,0:1,0:0|1:24642037_A_C:24642037:1,2,0,3
chr14	24646406	.	G	GGAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GAA;STR;TLOD=57.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr14	24647015	.	A	AGCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:1,2,0,1
chr14	24647957	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,5:3,1:1,8,0,6
chr14	24649835	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,8:1,5:3,1,6,7
chr14	24651072	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=165,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:24651072_C_A:24651072:1,2,0,1
chr14	24651077	.	CG	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=165,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:24651072_C_A:24651072:1,2,0,1
chr14	24651082	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=165,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:24651072_C_A:24651072:1,2,0,1
chr14	24651083	.	G	GGCAGCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=165,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:24651072_C_A:24651072:1,2,0,1
chr14	24651094	.	C	CTGTCTGTCATCTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=204,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	24652107	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:1,3:3,1:1,3,2,2
chr14	24656251	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,3:3,5:6,4,5,4
chr14	24656743	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:6,13,0,2
chr14	24656890	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:12,8:9,6:12,9,7,7
chr14	24657846	.	T	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.085:54:24,0:18,1:35,14,0,5
chr14	24661286	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=200,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr14	24662548	.	T	TGCTCCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=224,270;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr14	24686480	.	TTTG	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TTG;STR;TLOD=43.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.666:20:0,7:7,6:0,7,1,12
chr14	24710819	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr14	24735624	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.480:21:5,3:6,7:6,5,6,4
chr14	24736157	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr14	24737135	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=105,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,0:12,2:13,13,0,2
chr14	24737203	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,6:3,3:0,3,1,8
chr14	24738379	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=93,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:3,4:7,4:3,8,5,4
chr14	24739363	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.645:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr14	24740272	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:10,7:5,3:11,4,5,5
chr14	24760515	.	GCCCTGGAGCTCAGGAT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,12;MFRL=197,256;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:3,0:0,0:0,3,0,1
chr14	24765622	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:5,2:3,8:9,0,10,0
chr14	24765684	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=72.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,26:0.553:47:15,11:5,15:14,7,15,11
chr14	24769849	.	A	AGAGGAGGAG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=GAG;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.689:8:2,2:0,2:1,1,5,1
chr14	24771137	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,0:0,7:0,0,6,1
chr14	24771728	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr14	24772238	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,1:11,1:18,6,2,0
chr14	24772922	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,15:0,6:0,0,16,6
chr14	24776769	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr14	24780989	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=185,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.316:10:4,0:2,0:0|1:24780989_A_C:24780989:1,6,3,0
chr14	24780996	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,21;MFRL=179,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.217:15:4,1:3,0:0|1:24780989_A_C:24780989:4,8,3,0
chr14	24781000	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=166,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:3,0:0|1:24780989_A_C:24780989:5,9,2,0
chr14	24781004	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=168,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:10,0:5,0:0|1:24780989_A_C:24780989:6,9,2,0
chr14	24788432	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:9,10,2,0
chr14	24793600	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=154.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,19:0,26:0,0,24,22
chr14	24793647	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:7,4:7,6:0,14,1,9
chr14	24795115	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr14	24795231	.	CCA	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:24795231_CCA_C:24795231:0,0,7,2
chr14	24795237	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:24795231_CCA_C:24795231:0,0,8,2
chr14	24795258	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr14	24799024	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,1:2,3:8,0,4,0
chr14	24799287	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=100,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:3,1,0,3
chr14	24799578	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr14	24801956	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:6,2:5,6:1,11,0,8
chr14	24802263	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr14	24803956	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	24806229	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr14	24808168	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=184,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,2,1
chr14	24837668	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=114,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:4,2:4,2:1,7,0,5
chr14	24838621	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr14	24843620	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=95,117;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,2:6,6:5,4,4,4
chr14	24843699	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=20,29;MFRL=59,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:2,1:0,3:1,1,2,3
chr14	24843703	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=120,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:3,0:0|1:24843703_C_A:24843703:2,4,1,1
chr14	24843705	.	G	GTT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=114,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:24843703_C_A:24843703:2,3,1,1
chr14	24843706	.	GGA	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=114,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:24843703_C_A:24843703:2,3,1,1
chr14	24845154	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=127,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:5,1,3,1
chr14	24846757	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr14	24846961	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=76,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:7,2:3,4:1,9,2,5
chr14	24877161	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=142,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,5:4,1:3,3,3,3
chr14	24882359	.	C	CATGTGAGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24882359_C_CATGTGAGAT:24882359:0,2,0,1
chr14	24882360	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24882359_C_CATGTGAGAT:24882359:0,2,0,1
chr14	24882469	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr14	24884323	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:24884323_A_T:24884323:0,1,0,1
chr14	24884324	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:24884323_A_T:24884323:0,1,0,1
chr14	24884328	.	AAGC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24884323_A_T:24884323:0,1,0,1
chr14	24885606	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:3,1,2,6
chr14	24898083	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=201,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.118:36:18,3:14,0:21,11,2,2
chr14	24898355	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr14	24900209	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr14	24901844	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,3,13
chr14	24905533	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,10:0,0,16,2
chr14	24905548	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,4:0,12:0,0,13,3
chr14	24909281	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr14	24909731	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr14	24910210	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr14	24910846	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr14	24910876	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,11:0,0,19,5
chr14	24910973	.	TT	GA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,11:0,0,8,20
chr14	24911527	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=16,35;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.221:17:2,3:4,0:10,4,3,0
chr14	24911852	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,19,0
chr14	24975509	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	25078914	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr14	25102228	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,20:0.431:46:12,12:14,6:13,13,10,10
chr14	25281843	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr14	26941471	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.450:25:5,6:7,5:14,0,11,0
chr14	27064856	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=12,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27064856_G_A:27064856:1,0,0,1
chr14	27064858	.	G	GATGCCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=12,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:27064856_G_A:27064856:1,0,0,1
chr14	29238428	.	CCTTTT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:6,5:6,9:4,8,7,8
chr14	30047580	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr14	30067065	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	30098349	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=165.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,19:0,24:0,0,7,36
chr14	30102025	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr14	31050215	.	A	T	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=281.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.989:84:0,41:0,42:0,0,61,23
chr14	31077080	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.483:35:5,8:13,8:16,2,16,1
chr14	31097345	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr14	31107517	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.511:35:7,11:10,6:0,17,0,18
chr14	31143287	.	A	ATTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=174,114;MMQ=60,60;MPOS=-10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:31143287_A_ATTTT:31143287:0,4,0,1
chr14	31143289	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=174,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:31143287_A_ATTTT:31143287:0,4,0,1
chr14	31177207	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:21,0:8,2:14,15,1,1
chr14	31188414	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	31191611	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,5:0,2:2,0,8,0
chr14	31191668	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr14	31344406	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	31348237	.	G	GCTTTCCACATATACTGACTGAAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=72,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr14	31348246	.	ACCTGTG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=274,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	31380215	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=62.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,9:0,0,18,4
chr14	31388368	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,1:8,1:1,18,0,2
chr14	31404277	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:9,7:7,7:15,1,13,1
chr14	31424790	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.191:14:6,1:5,1:9,3,2,0
chr14	31483761	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:4,4:9,0,6,0
chr14	31484019	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=9,19;MFRL=224,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr14	31535603	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,1,14
chr14	31538984	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr14	31549745	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:7,1,8,1
chr14	31581822	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:8,3:5,1:0|1:31581822_A_AT:31581822:0,13,0,4
chr14	31581837	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=170,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:31581822_A_AT:31581822:0,14,0,2
chr14	31581839	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:3,0:0|1:31581822_A_AT:31581822:0,13,0,2
chr14	31582276	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,24:0.676:35:7,10:4,14:8,3,16,8
chr14	31602666	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.343:30:9,3:11,7:8,12,2,8
chr14	31625994	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34,34,34;MFRL=145,121,146,150;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,22,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.35,4.67,4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,3,3:0.186,0.250,0.281:11:3,1,2,3:0,1,1,0:3,0,8,0
chr14	31778080	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=137,144;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.261:16:2,2:10,2:12,0,4,0
chr14	31778094	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=19,26;MFRL=144,127;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.216:22:1,2:8,1:15,3,3,1
chr14	31778474	.	A	AACCACCATTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=315,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr14	31782082	.	AA	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,118;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr14	31782394	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:9,1:7,9:3,13,1,9
chr14	31790608	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=176,173;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:12,0,2,0
chr14	31792896	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:10,5:6,9:13,3,8,6
chr14	31793053	.	GAT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr14	31819047	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,16,8
chr14	31819966	.	TTTTG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TTTG;STR;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.903:7:0,2:0,3:0,0,0,7
chr14	31828076	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=90.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0,0,17,9
chr14	31841123	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,5:8,1:2,11,3,3
chr14	31841162	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr14	31858025	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,16,9
chr14	31858209	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr14	32142544	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=31,32,32,29;MFRL=143,157,169,119;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,18,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.49,7.48,4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:54,3,6,9:0.050,0.091,0.100:72:22,2,2,3:18,1,4,3:24,30,9,9
chr14	32295772	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	32296018	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	32562225	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:6,5,0,2
chr14	32563640	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,2,18
chr14	33015082	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=207,109;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:3,4,1,4
chr14	33016291	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	33046471	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr14	33068608	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:12,4:4,5:15,2,8,1
chr14	33165182	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=85,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:5,5:8,3:9,5,6,2
chr14	33242863	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr14	34029235	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,10;MFRL=140,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.479:8:1,0:1,0:3,1,4,0
chr14	34243477	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	34263034	.	TAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	34395148	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.388:34:8,9:11,3:5,16,5,8
chr14	34396100	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,6:1,5:6,0,9,2
chr14	34398319	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=112,31;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:15,0:4,2:0|1:34398319_T_C:34398319:8,11,1,1
chr14	34398328	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=115,31;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,0:4,2:0|1:34398319_T_C:34398319:6,10,1,1
chr14	34398331	.	A	ACGATCT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=115,31;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:0|1:34398319_T_C:34398319:6,10,1,1
chr14	34985645	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=110,152;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:6,8:4,4:8,3,7,5
chr14	34993834	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:34993834_A_G:34993834:0,0,1,0
chr14	34993837	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:34993834_A_G:34993834:0,0,1,0
chr14	34993843	.	CT	GA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:34993834_A_G:34993834:0,0,1,0
chr14	34993863	.	A	G,ATGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,21,30;MFRL=0,134,129;MMQ=60,40,40;MPOS=7,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.56,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.432,0.424:2:0,1,1:0,0,0:0,0,2,0
chr14	34998705	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr14	35037008	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.458:33:11,9:7,6:5,13,3,12
chr14	35045136	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.440:12:4,1:3,3:0,7,0,5
chr14	35045153	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=174,152;MMQ=41,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:3,1:0,12,0,2
chr14	35062166	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=178,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:3,2:0,1:3,0,4,0
chr14	35066771	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:7,0:11,3:10,9,2,1
chr14	35072491	.	C	CA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.177:23:5,1:13,2:17,2,3,1
chr14	35074765	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.535:15:3,2:4,6:7,0,7,1
chr14	35075022	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr14	35182348	.	GA	G	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=17,18;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.389:40:2,1:2,2:4,20,2,14
chr14	35182406	.	GATA	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=203,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATA;STR;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.593:20:3,6:5,6:2,6,1,11
chr14	35222623	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	35223956	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,1:0|1:35223956_A_G:35223956:1,0,4,0
chr14	35223971	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=95,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0|1:35223956_A_G:35223956:4,0,4,1
chr14	35227831	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr14	35227880	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr14	35228090	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,2,1
chr14	35230906	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:3,6:4,4:6,1,9,2
chr14	35242700	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,5:3,2:0|1:35242700_C_T:35242700:9,0,7,0
chr14	35242709	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,6:0.390:15:7,5:2,1:1|0:35242700_C_T:35242700:9,0,6,0
chr14	35242828	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=194.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,34:0,23:0,0,25,34
chr14	35243006	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	35243030	.	T	TGAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=228,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	35245748	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:0,7,0,6
chr14	35262195	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=211,170;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:0,9,0,2
chr14	35295143	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	35295427	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr14	35331287	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:19,2:17,0:19,17,2,0
chr14	35331453	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,2:17,0:0|1:35331453_C_T:35331453:7,18,1,1
chr14	35331462	.	A	AGACTGGAG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,2:13,0:0|1:35331453_C_T:35331453:7,14,1,1
chr14	35343629	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:8,0,8,0
chr14	35468893	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:0,1,2,6
chr14	35476673	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=115.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,14:0,19:0,0,0,34
chr14	35477785	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=138.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,15:0,24:0,0,37,3
chr14	35478090	.	CT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=19,20,28;MFRL=148,164,200;MMQ=24,60,40;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,19,21;RU=T;STR;TLOD=4.11,5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,5:0.286,0.533:9:0,2,1:0,0,1:0,1,2,6
chr14	35478151	.	GGT	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=174,125;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:6,2:0,0:0|1:35478151_GGT_G:35478151:0,6,0,2
chr14	35478155	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=174,125;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:0|1:35478151_GGT_G:35478151:0,6,0,2
chr14	35478156	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=174,125;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,1:0,0:0|1:35478151_GGT_G:35478151:0,6,0,2
chr14	35482797	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=195,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr14	35483882	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	35488309	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:0,8,0,3
chr14	35497285	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:3,3:7,0,7,0
chr14	35498443	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=121,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr14	35515606	.	TGG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=119.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,10:0,18:0,0,26,3
chr14	35550467	.	G	GT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,10:0.212:45:8,5:14,1:2,33,2,8
chr14	35565856	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.446:36:9,7:10,8:6,14,6,10
chr14	35576458	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.367:47:15,7:15,10:27,3,15,2
chr14	35578990	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:5,2,3,0
chr14	35593477	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.180:15:7,1:3,0:2,11,1,1
chr14	35596092	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=188,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr14	35739903	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	35761573	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,2:3,5:11,0,7,0
chr14	35761640	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.389:44:16,5:10,11:20,7,14,3
chr14	35777358	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,4:5,1:0,11,0,5
chr14	35782300	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:2,4:6,2:1,7,1,6
chr14	35783706	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:8,6:9,8:0,17,0,14
chr14	35871093	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,8:2,2:7,0,10,0
chr14	35873587	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,10;MFRL=180,300;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:35873587_T_G:35873587:1,0,1,0
chr14	35873591	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=180,300;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:35873587_T_G:35873587:1,0,1,0
chr14	36096255	.	GA	G,GAA,GAAA	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=29,24,27,30;MFRL=172,102,151,0;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,17,8;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,14,16,17;RU=A;STR;TLOD=4.14,24.17,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,6,17,5:0.129,0.506,0.148:36:5,3,6,4:1,2,5,0:6,2,16,12
chr14	36103679	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr14	36104708	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,119;MMQ=40,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.075:63:30,3:27,1:38,21,3,1
chr14	36121087	.	CA	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=78.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.938:29:1,16:0,11:1,0,6,22
chr14	36231816	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=93.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,11:0,0,25,1
chr14	36231929	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,9:0.159:60:16,7:34,2:13,38,2,7
chr14	36334030	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:10,0,6,0
chr14	36334905	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.372:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr14	36339547	.	C	CT	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,7:0.115:67:34,4:25,3:54,6,7,0
chr14	36768276	.	TG	CA,CG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,140,156;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=61.41,29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,21,12:0.609,0.364:33:0,8,5:0,10,7:0,0,28,5
chr14	36789775	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,5:0,3:0|1:36789775_A_T:36789775:0,0,4,5
chr14	36789795	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0|1:36789775_A_T:36789775:0,0,3,11
chr14	37051427	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:4,2,4,1
chr14	37051634	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:3,0:1,4,0,3
chr14	37131343	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:37131343_G_GA:37131343:0,3,0,1
chr14	37131346	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:37131343_G_GA:37131343:0,3,0,1
chr14	37132048	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,3:7,0,7,0
chr14	37135753	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:7,7:13,8:13,7,10,5
chr14	37194681	.	AAAAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AAAT;STR;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	37203617	.	T	TTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TA;STR;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr14	37203642	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,9,1
chr14	37344229	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr14	37344275	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr14	37641659	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr14	37891965	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:5,0,8,0
chr14	38016044	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:4,2:1,2:5,1,2,2
chr14	38061635	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=230,263;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:38061635_C_A:38061635:1,1,1,0
chr14	38061638	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=218,263;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38061635_C_A:38061635:1,0,1,0
chr14	38061642	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=218,263;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38061635_C_A:38061635:1,0,1,0
chr14	38064215	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,1,2
chr14	38286961	.	A	AAGAGAAAAGAATGAAAAGAAAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.666:2:1,1:0,0:0|1:38286961_A_AAGAGAAAAGAATGAAAAGAAAAAAT:38286961:0,1,0,1
chr14	38286965	.	GT	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38286961_A_AAGAGAAAAGAATGAAAAGAAAAAAT:38286961:0,1,0,1
chr14	38682319	.	AACACAC	A,AAC,AACAC	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=16,31,18,16;MFRL=175,166,140,190;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,28,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,14,15,16;RU=AC;STR;TLOD=6.54,3.47,7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,3,3,3:0.192,0.104,0.255:15:1,1,0,1:1,1,1,0:0,6,0,9
chr14	38682324	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.180:26:14,0:5,1:1,20,0,5
chr14	38682353	.	C	CATATA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=176,173;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,1:10,1:0,21,0,2
chr14	39502539	.	G	GA	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=70.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,33:0.545:60:8,20:18,13:9,18,8,25
chr14	39502626	.	A	AAATAGAAC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.312:17:3,4:8,1:0,12,0,5
chr14	39511952	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=62.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:9,10:6,11:11,4,20,1
chr14	39512122	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.503:30:3,7:11,8:3,12,0,15
chr14	39532704	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	39543814	.	T	TAAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	39554893	.	TACAC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=61,260;MMQ=44,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=AC;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,1:0,0:2,0,1,0
chr14	39562362	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=128,147;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,2:8,0:8,4,2,0
chr14	39565403	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:0,5,0,3
chr14	39583481	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,2:7,1,7,0
chr14	39587348	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr14	39591613	.	G	GT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,3:10,1:19,0,4,0
chr14	39602849	.	CT	C,TT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35,29;MFRL=0,185,83;MMQ=60,60,59;MPOS=20,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.01,4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.251,0.325:7:3,1,2:0,1,0:3,0,3,1
chr14	39605542	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=102,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,0:0,6:3,1,5,1
chr14	39620936	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,21:0.374:57:16,10:16,10:25,11,17,4
chr14	39623481	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:7,14,1,1
chr14	39623533	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:4,3:3,2:1,7,0,5
chr14	39645863	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=204,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr14	39716777	.	A	AAGCAATCTTCCCACCTCAGCCTCCAGGGCTCC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.135:21:8,1:11,0:5,14,1,1
chr14	39748480	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.446:45:11,12:14,8:18,7,15,5
chr14	39773435	.	A	AT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:4,4:16,4:20,0,9,0
chr14	39773639	.	G	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,28:0.509:55:14,11:12,16:2,25,0,28
chr14	39784010	.	A	ATGTGTG	.	.	DP=98;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=125.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,37:0.434:85:29,21:17,16:0|1:39784010_A_ATGTGTG:39784010:11,37,10,27
chr14	39784012	.	A	G	.	.	DP=92;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,37:0.436:85:29,15:18,12:0|1:39784010_A_ATGTGTG:39784010:11,37,10,27
chr14	39784014	.	A	G	.	.	DP=81;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,31:0.395:79:28,17:18,13:0|1:39784010_A_ATGTGTG:39784010:11,37,5,26
chr14	39784042	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=152,169;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.392:26:9,3:7,5:0|1:39784042_A_G:39784042:1,15,0,10
chr14	39784044	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=152,184;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.359:23:7,3:6,4:0|1:39784042_A_G:39784042:1,14,0,8
chr14	39784965	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:3,4:4,7:0,8,1,10
chr14	39788501	.	CT	C,CTT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,35,31;MFRL=131,149,167;MMQ=60,60,60;MPOS=11,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.62,3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,3:0.128,0.138:26:7,1,1:12,2,2:6,14,0,6
chr14	39788539	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,36;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,0:7,2:0,11,0,2
chr14	39796048	.	GT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=85.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,28,1
chr14	39817022	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=36,20,23;MFRL=134,160,159;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,20,22;RU=T;STR;TLOD=3.59,3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.203,0.374:9:1,1,2:0,0,1:1,3,1,4
chr14	39817042	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=134,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:2,7:3,2:2,4,0,9
chr14	39818222	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=106.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,13:0,0,6,24
chr14	39868646	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,3,1
chr14	39900672	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	42355771	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	44973638	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr14	45513743	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	45600088	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	45658646	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=200,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:45658646_T_C:45658646:0,2,0,1
chr14	45658648	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=200,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:45658646_T_C:45658646:0,2,0,1
chr14	45665836	.	G	GTCTGAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	45693721	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,1:5,2:11,5,2,1
chr14	45701834	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=177,144;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:5,2:18,2:23,0,4,0
chr14	45701857	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:4,3:23,0:27,0,3,0
chr14	45711988	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:7,7:8,4:6,9,6,5
chr14	47121018	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:4,2:2,4:1,5,0,6
chr14	47121110	.	C	CACCACATGTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	47314938	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.644:43:6,13:9,15:13,2,22,6
chr14	47315127	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:2,4:7,6:1,8,4,6
chr14	47530841	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0|1:47530841_A_C:47530841:0,0,0,6
chr14	47530845	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0|1:47530841_A_C:47530841:0,0,0,5
chr14	47613364	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,4:3,3:6,2,2,5
chr14	47687187	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,7:0,0,18,2
chr14	47770841	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr14	50050396	.	GA	G,GAA	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=17,34,17;MFRL=130,136,131;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=10.59,8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,7,6:0.139,0.128:52:4,2,1:6,4,1:7,32,4,9
chr14	50065717	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=157.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,20:0,24:0,0,25,20
chr14	50069274	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=217,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:50069274_A_G:50069274:0,2,0,1
chr14	50069276	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=217,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50069274_A_G:50069274:0,2,0,1
chr14	50069282	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	50089988	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:3,0:6,3:8,7,0,3
chr14	50094913	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr14	50100515	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=82,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50100515_C_T:50100515:0,2,0,1
chr14	50100520	.	T	TGAGGGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=82,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50100515_C_T:50100515:0,2,0,1
chr14	50100522	.	C	CCGGCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=82,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50100515_C_T:50100515:0,2,0,1
chr14	50100593	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,349;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	50146553	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.258:13:2,1:6,0:0,10,0,3
chr14	50175792	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	50199337	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=117,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,1:1,0,6,0
chr14	50199375	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=9,35;MFRL=274,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.889:11:0,6:0,4:1,0,8,2
chr14	50241258	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,18,4
chr14	50244835	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=128.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,17:0,20:0,0,37,0
chr14	50245268	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:50245268_G_C:50245268:1,3,0,1
chr14	50245270	.	GGGGT	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=183,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:50245268_G_C:50245268:1,2,0,1
chr14	50245277	.	G	GCA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50245268_G_C:50245268:0,0,0,1
chr14	50245282	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:50245268_G_C:50245268:0,1,0,1
chr14	50245285	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,25;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50245268_G_C:50245268:0,1,0,1
chr14	50245289	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=37,31;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50245268_G_C:50245268:0,1,0,1
chr14	50251888	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=96.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,17:0,0,23,6
chr14	50266091	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:50266091_GA_G:50266091:0,0,5,0
chr14	50266095	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:50266091_GA_G:50266091:0,0,5,0
chr14	50280601	.	CA	TG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,1:10,1:21,0,3,0
chr14	50280612	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=180,172;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:11,2:14,0:30,0,2,0
chr14	50280823	.	CT	C,CTT	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=32,33,34;MFRL=166,183,125;MMQ=60,49,54;MPOS=11,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.73,7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,6,5:0.123,0.116:47:15,3,0:14,3,4:7,29,0,11
chr14	50298153	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	50299051	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.788:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr14	50300310	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	50319327	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=114.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,31,0
chr14	50319499	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=131.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,16:0,21:0,0,8,30
chr14	50362674	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:11,9:9,6:11,9,6,9
chr14	50459609	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,0:2,7:1,3,1,6
chr14	50459673	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	50579480	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=106,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr14	50585574	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,17:0.637:26:2,9:5,7:0|1:50585574_C_CA:50585574:0,9,1,16
chr14	50585589	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,16:0.600:26:3,7:7,7:0|1:50585574_C_CA:50585574:0,10,1,15
chr14	50600995	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:4,3:9,7:1,12,0,10
chr14	50605267	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.478:19:7,3:3,5:10,0,6,3
chr14	50605507	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=136,233;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.627:10:3,4:0,2:1,3,0,6
chr14	50611845	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=160.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,24:0,24:0,0,38,11
chr14	50612401	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr14	50612414	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr14	50623657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.873:5:0,0:0,5:0|1:50623657_G_A:50623657:0,0,5,0
chr14	50623679	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.917:9:0,1:0,8:0|1:50623657_G_A:50623657:0,0,9,0
chr14	50623683	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,3:0,6:0|1:50623657_G_A:50623657:0,0,11,0
chr14	50623685	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:4,1:3,4:7,1,5,0
chr14	50626820	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:50626820_AAT_A:50626820:0,3,0,1
chr14	50626826	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:0,0:0|1:50626820_AAT_A:50626820:0,3,0,1
chr14	50626836	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr14	50641347	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr14	50649088	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr14	50649141	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:7,1,6,1
chr14	50670965	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=159.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,25:0,19:0,0,32,13
chr14	50697878	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:2,1:0,5:2,1,6,0
chr14	50713679	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr14	50732042	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=132,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:8,1,4,0
chr14	50734472	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,60;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,0:5,3:12,3,3,0
chr14	50745123	.	A	ATTACTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.481:27:8,2:5,6:14,0,13,0
chr14	50750577	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:3,3,5,1
chr14	50750779	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr14	50789578	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr14	50792273	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:1,4:6,2:7,1,3,3
chr14	50808802	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr14	50808965	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,5:1,4:0,7,0,9
chr14	50809690	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=105,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,6:3,1:2,4,4,3
chr14	50824945	.	T	TATTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr14	50824954	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	50844367	.	G	GA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=118.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,23:0,15:0,0,28,11
chr14	50844856	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr14	50856927	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:3,8:4,8:3,4,9,7
chr14	50862669	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=159,71;MMQ=43,38;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50862669_G_A:50862669:0,4,0,1
chr14	50862672	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=159,71;MMQ=43,38;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50862669_G_A:50862669:0,4,0,1
chr14	50862673	.	CGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=159,71;MMQ=43,38;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50862669_G_A:50862669:0,4,0,1
chr14	50862678	.	A	AGAG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=159,71;MMQ=43,38;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50862669_G_A:50862669:0,4,0,1
chr14	50862706	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=245,178;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50862706_C_G:50862706:0,1,0,1
chr14	50862709	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=245,178;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50862706_C_G:50862706:0,1,0,1
chr14	50895475	.	TA	T,TAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=158,156,168;MMQ=60,60,60;MPOS=30,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.05,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,4,4:0.128,0.125:33:9,1,0:10,2,3:0,25,0,8
chr14	50910421	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=134,68;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:19,5,2,0
chr14	50910814	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:50910814_T_A:50910814:1,3,0,1
chr14	50910817	.	T	TGGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:50910814_T_A:50910814:1,3,0,1
chr14	50910842	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	50915644	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr14	50915647	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50915647_A_C:50915647:0,1,0,1
chr14	50915651	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50915647_A_C:50915647:0,1,0,1
chr14	50915654	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50915647_A_C:50915647:0,1,0,1
chr14	50929508	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr14	50943034	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.215:23:7,1:9,2:5,13,0,5
chr14	50949196	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=68.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.965:23:0,12:0,11:0,0,0,23
chr14	50971446	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr14	51057727	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr14	51058234	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,14:0,4:0,0,15,3
chr14	51060452	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	51062236	.	TTC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TC;STR;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr14	51062455	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr14	51087263	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=98,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:4,2,9,1
chr14	51096610	.	G	GTTCTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=67.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,10:0,0,16,1
chr14	51096644	.	G	GAAT	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.543:44:9,14:11,8:15,5,22,2
chr14	51107452	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,19:0,10:0,0,19,10
chr14	51196142	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr14	51206021	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=125.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,22:0,14:0,0,25,11
chr14	51208236	.	T	TGTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr14	51219500	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=9,11;MFRL=233,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.508:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr14	51221672	.	AG	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=185,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr14	51224741	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,0:8,2:9,7,0,2
chr14	51227074	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	51228682	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,2,13
chr14	51228723	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=119,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr14	51233194	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:51233194_GT_G:51233194:0,2,0,1
chr14	51233197	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:51233194_GT_G:51233194:0,2,0,1
chr14	51233198	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:51233194_GT_G:51233194:0,2,0,1
chr14	51233202	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:51233194_GT_G:51233194:0,2,0,1
chr14	51233205	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:51233194_GT_G:51233194:0,2,0,1
chr14	51237701	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:4,3:3,4:1,7,4,3
chr14	51288533	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=82,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:51288533_AG_CC:51288533:2,0,1,0
chr14	51288541	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:51288533_AG_CC:51288533:2,1,1,0
chr14	51288546	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:51288533_AG_CC:51288533:2,1,1,0
chr14	51289872	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.336:10:3,2:2,1:0|1:51289872_TG_T:51289872:7,0,3,0
chr14	51289874	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,7:0.664:10:2,3:1,4:1|0:51289872_TG_T:51289872:3,0,7,0
chr14	51347107	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr14	51353493	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr14	51355517	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:4,5:1,7:5,0,10,2
chr14	51387703	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:13,1:9,15,2,0
chr14	51390891	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr14	51443968	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:2,1:0,3:2,1,4,0
chr14	51475794	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr14	51710508	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr14	51710551	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:3,1,5,1
chr14	51713792	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:7,0:12,3,3,0
chr14	51716161	.	GT	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.574:35:7,11:6,9:9,6,13,7
chr14	51716188	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,29:0.501:58:14,13:13,14:12,17,16,13
chr14	51720979	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=208,256;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,3:4,0:12,0,3,0
chr14	52167756	.	C	CT	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,4:0.053:91:35,2:46,2:50,37,3,1
chr14	52175047	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr14	52194407	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr14	52433439	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr14	52433459	.	T	TGGGTATGCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.381:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr14	52465340	.	GTTTTTTAAA	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:12,2:0|1:52465340_GTTTTTTAAA_G:52465340:0,23,0,2
chr14	52465359	.	CT	GG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:7,1:0|1:52465340_GTTTTTTAAA_G:52465340:1,13,0,2
chr14	52468641	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:0,4:5,7:0,5,0,12
chr14	52471017	.	G	GAAAT	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAT;STR;TLOD=224.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.983:52:0,30:0,20:0,0,9,43
chr14	52472620	.	AAGTC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,286;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGTC;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr14	52474721	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:1,7:7,3:3,5,1,9
chr14	52477835	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr14	52478315	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,10,9
chr14	52478341	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,1:9,0:13,9,0,2
chr14	52494072	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:2,9:3,4:2,3,3,10
chr14	52495375	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr14	52505375	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr14	52505771	.	TT	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr14	52505781	.	C	CCAGGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=219,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr14	52505791	.	G	GTTTTATGTTTTCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=232,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr14	52509101	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr14	52509483	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr14	52509501	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr14	52949584	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=170,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:2,1,2,4
chr14	53100760	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr14	53110384	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0|1:53110384_T_C:53110384:0,0,0,15
chr14	53110401	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0|1:53110384_T_C:53110384:0,5,0,4
chr14	53133036	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,2:8,4:9,0,6,0
chr14	53174923	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=228,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr14	53177729	.	TGAGTGTTTGGCTTCTAAATATTAAACTCTCGTTA	T	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,22:0.330:71:11,11:10,11:42,7,18,4
chr14	53180739	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr14	53190675	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:12,6:7,10:15,4,12,4
chr14	53194419	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=50.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr14	53213128	.	AT	A,ATT	.	.	DP=124;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=137,143,191;MMQ=60,60,60;MPOS=26,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.71,7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:80,6,7:0.063,0.082:93:41,3,2:37,3,5:52,28,12,1
chr14	53226374	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=161,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:1,1:3,0:0|1:53226374_C_G:53226374:4,1,1,1
chr14	53226389	.	T	TCTTCTATGTCATTGGCTG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:0|1:53226374_C_G:53226374:4,2,1,1
chr14	53235542	.	C	CT	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,6:0.109:61:22,1:28,4:0|1:53235542_C_CT:53235542:47,8,5,1
chr14	53235545	.	A	T	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=105.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,38:0.527:72:16,14:17,24:0|1:53235542_C_CT:53235542:29,5,32,6
chr14	53245000	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:28,0:17,3:43,2,3,0
chr14	53250296	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:12,7:9,8:1,20,0,15
chr14	53325090	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.546:22:4,7:5,5:6,4,7,5
chr14	53326454	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:8,3:2,3:2,8,1,5
chr14	53327064	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:4,1,1,4
chr14	53345266	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,6:3,4:7,3,6,4
chr14	53513439	.	GA	G,GAA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,31,31;MFRL=138,137,152;MMQ=60,60,60;MPOS=19,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=8.34,6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,7,7:0.199,0.197:34:13,5,1:5,2,6:18,2,10,4
chr14	53513477	.	CAA	C	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=110,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=131.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,36:0.543:66:19,18:8,17:16,14,22,14
chr14	53513725	.	TAG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:2,5:9,8:0,13,0,13
chr14	53525122	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=135,161;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:6,2:17,0:0|1:53525122_T_C:53525122:22,1,2,0
chr14	53525124	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=135,161;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:5,2:17,0:0|1:53525122_T_C:53525122:22,1,2,0
chr14	53525173	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.509:45:10,11:12,10:15,7,13,10
chr14	53525392	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=96,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,6:1,8:0,1,1,13
chr14	53525405	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=121,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:0,4:5,6:1,4,0,11
chr14	53619480	.	T	TGCCGCC	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=GCC;STR;TLOD=127.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,31:0.729:42:3,13:8,16:11,0,29,2
chr14	54418944	.	G	GACCAGCTACTGCTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=156,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:2,0:0,4,1,1
chr14	54418986	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	54875591	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,4:0,15:0,0,0,19
chr14	54944881	.	TA	T,TAA	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=31,23,30;MFRL=139,146,151;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.04,12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:45,6,13:0.095,0.194:64:17,1,4:19,2,5:5,40,0,19
chr14	54976598	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,2:2,2:4,0,4,0
chr14	55215500	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=125,1540;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:4,2:10,0:13,4,0,2
chr14	55241938	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=210,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:55241938_G_C:55241938:0,2,0,1
chr14	55241941	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=210,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:55241938_G_C:55241938:0,2,0,1
chr14	55424013	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr14	55429909	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:55429909_G_A:55429909:1,0,0,1
chr14	55429913	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55429909_G_A:55429909:0,0,0,1
chr14	55429916	.	GA	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=4921,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:55429909_G_A:55429909:0,1,0,1
chr14	55429921	.	C	CCAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=4921,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	55475244	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:8,1,4,0
chr14	55493350	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr14	55493408	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,16:0,11:0,0,19,8
chr14	55514783	.	C	CTCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55514783_C_CTCTA:55514783:0,0,0,1
chr14	55514784	.	G	GCTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55514783_C_CTCTA:55514783:0,0,0,1
chr14	55604174	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:1,17,1,1
chr14	55611734	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr14	55612006	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr14	55625285	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:24,3:25,0:28,21,3,0
chr14	55819994	.	G	GT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.206:32:9,1:11,4:12,14,3,3
chr14	55878636	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	55902542	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=197.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,24:0,32:0,0,41,16
chr14	55902711	.	A	AAAGAATTATGAAATCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr14	55907025	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	55907172	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,21,4
chr14	56085812	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr14	56100160	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr14	56103882	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:5,10:4,6:9,0,16,0
chr14	56104095	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.219:21:7,2:7,2:0,17,0,4
chr14	56108033	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr14	56114641	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:9,2:14,1:24,0,3,0
chr14	56114652	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:13,2:15,0:28,0,2,0
chr14	56115693	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=181,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:8,2:2,0:0,10,0,2
chr14	56126456	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,7,16
chr14	56138569	.	G	C	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=127,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:21,1:28,2:24,28,1,2
chr14	56138618	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,1:15,1:5,23,0,2
chr14	56139518	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=195,170;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr14	56142480	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr14	56755425	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr14	56763896	.	G	GCAAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=206,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56763896_G_GCAAGA:56763896:0,1,0,1
chr14	56763899	.	A	AATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=206,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56763896_G_GCAAGA:56763896:0,1,0,1
chr14	57046829	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=173,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:1,4,2,4
chr14	57070501	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,9:0,0,24,1
chr14	57072203	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr14	57082648	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.313:23:9,2:5,3:9,7,5,2
chr14	57092038	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,20,0
chr14	57101682	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=154.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,16:0,28:0,0,16,29
chr14	57114285	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	57735454	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:57735454_T_G:57735454:0,0,0,1
chr14	57735459	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:57735454_T_G:57735454:0,0,0,1
chr14	57749740	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,6:0.066:104:50,5:46,1:35,63,2,4
chr14	57876265	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr14	57948380	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr14	57948463	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57948463_G_A:57948463:0,0,0,1
chr14	57948467	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57948463_G_A:57948463:0,0,0,1
chr14	57957654	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0|1:57957654_T_C:57957654:0,0,8,1
chr14	57957664	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0|1:57957654_T_C:57957654:0,0,7,1
chr14	58048142	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:2,4:7,5:2,8,3,6
chr14	58048167	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=203,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,2:6,5:0,7,0,7
chr14	58056257	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	58060852	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,37;MFRL=148,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:1,3,0,2
chr14	58471699	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:4,5:5,1:9,1,6,0
chr14	58478873	.	GA	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,27:0.533:50:9,13:14,14:9,14,9,18
chr14	58478979	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,3:5,5:0,12,0,8
chr14	58478990	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,3:4,4:0,10,0,7
chr14	58563694	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,91;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0,9,0,2
chr14	58600107	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	58600141	.	GGGGGGA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=178,310;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58600141_GGGGGGA_G:58600141:0,1,0,1
chr14	58600153	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,310;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.687:1:0,1:0,0:0|1:58600141_GGGGGGA_G:58600141:0,0,0,1
chr14	58604811	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.596:32:6,7:5,12:7,6,11,8
chr14	58666882	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr14	58669660	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,9:0,0,2,13
chr14	58674823	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,35,34;MFRL=170,179,159;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=5.62,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,3:0.173,0.165:19:2,2,3:8,1,0:0,13,0,6
chr14	58690427	.	TA	T,TAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=175,145,159;MMQ=60,60,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=5.73,4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,3,3:0.147,0.143:24:7,2,2:11,1,1:9,9,4,2
chr14	58724817	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr14	58737766	.	A	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=183.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,29:0,24:0,0,13,40
chr14	58771632	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=235.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,39:0,24:0,0,49,14
chr14	58813040	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=180,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr14	58825825	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.436:9:4,2:1,1:5,0,2,2
chr14	58825858	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.112:38:13,0:16,0:19,15,4,0
chr14	58831995	.	AAG	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AG;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:13,1:20,2:12,23,1,2
chr14	58869510	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,2,10
chr14	58875135	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32,34;MFRL=147,163,176;MMQ=60,60,60;MPOS=6,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=A;STR;TLOD=6.97,15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,8:0.248,0.551:13:1,3,3:1,0,5:2,0,11,0
chr14	58917225	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr14	58920240	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,14:0,0,0,24
chr14	58923395	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=134.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,19:0,19:0,0,36,3
chr14	58932772	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,6:0,0,2,14
chr14	58934371	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr14	58949144	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	58953746	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,13,5
chr14	58954588	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr14	59114336	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,0:15,3:9,17,0,3
chr14	59114393	.	TGTTA	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=129,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:6,3:3,3:0|1:59114393_TGTTA_T:59114393:2,7,4,2
chr14	59114399	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:6,2:2,3:0|1:59114393_TGTTA_T:59114393:2,6,4,2
chr14	59730422	.	AAGG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr14	59730453	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:2,0:1,3:1,2,1,2
chr14	59787325	.	GT	G,GTT	.	.	DP=157;ECNT=1;MBQ=32,33,34;MFRL=142,109,140;MMQ=60,60,60;MPOS=19,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.12,11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:67,8,13:0.065,0.141:88:24,5,4:31,3,5:14,53,7,14
chr14	59789586	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,11:0,0,17,6
chr14	59790813	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.420:15:4,0:3,6:5,4,4,2
chr14	59798473	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr14	59805130	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.356:26:10,5:6,2:0|1:59805130_C_CA:59805130:10,7,5,4
chr14	59805132	.	G	GTAAGCTCCAAGCAAGTAACTCCAA	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=128,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,14:0.455:31:11,5:5,3:0|1:59805130_C_CA:59805130:10,7,9,5
chr14	59805217	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,5:1,4:0,2,0,11
chr14	59805229	.	G	GGTTCCATGTGAAC	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0,10,0,2
chr14	59805236	.	T	TTTGTTTTGAG	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=174,103;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0,5,0,1
chr14	59805244	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=167,103;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr14	59834048	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr14	59834371	.	GCC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,1,0
chr14	59950910	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	60072023	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	60072283	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,149;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr14	60574448	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:7,9:7,6:8,6,8,7
chr14	60575105	.	G	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,4:0.062:78:33,0:41,4:46,28,0,4
chr14	60575512	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,1:8,1:4,6,2,0
chr14	60575801	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,1:7,5:9,4,3,3
chr14	60575831	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.569:26:7,5:4,9:6,5,9,6
chr14	60576195	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=150,144;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:19,1:6,1:0,25,0,2
chr14	60576215	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,2:5,0:0|1:60576215_G_A:60576215:0,16,0,2
chr14	60576217	.	G	GATGCGGTCTCA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,1:4,0:0|1:60576215_G_A:60576215:0,16,0,2
chr14	60576241	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=199,165;MMQ=60,58;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,4:0,0:0,3,0,4
chr14	60581673	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,140;MMQ=48,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:1,7:0,4:0,1,10,2
chr14	60592030	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr14	60611585	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:6,0,5,2
chr14	60611648	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.419:24:11,4:3,5:9,5,2,8
chr14	60611675	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=120,132;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:13,3:5,7:9,9,2,8
chr14	60616042	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:2,3,8,0
chr14	60616912	.	G	GGC	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=20,15;MFRL=124,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.517:33:5,6:4,2:8,8,5,12
chr14	60616914	.	CAA	C,AAA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=19,26,34;MFRL=186,144,134;MMQ=60,60,60;MPOS=19,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.15,57.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,18:0.155,0.517:25:1,1,7:1,0,9:0,5,5,15
chr14	60622944	.	A	AAAAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAG;STR;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:0,3,0,7
chr14	60759306	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:60759306_G_T:60759306:0,0,0,1
chr14	60759317	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:60759306_G_T:60759306:0,0,0,1
chr14	60759318	.	A	ACCCTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:60759306_G_T:60759306:0,0,0,1
chr14	60921673	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=99,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,7:0,5:1,0,12,0
chr14	60928167	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=164,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,2:13,2:18,8,2,2
chr14	60928201	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=153.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,17:0,29:0,0,36,12
chr14	60935281	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,4:6,4:1,11,0,8
chr14	60944959	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,16,6
chr14	60945203	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr14	60978071	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr14	61278729	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:9,0:24,2:21,13,1,1
chr14	61445945	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.510:29:7,8:7,5:11,3,12,3
chr14	61445967	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,15:0,19:0,0,24,12
chr14	61447940	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=126,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:4,0,7,0
chr14	61449167	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,18,0
chr14	61451589	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	61482669	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,1:5,1:9,7,2,0
chr14	61482778	.	AA	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=172,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr14	61482790	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61482790_C_A:61482790:0,1,0,1
chr14	61482791	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61482790_C_A:61482790:0,1,0,1
chr14	61482793	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61482790_C_A:61482790:0,1,0,1
chr14	61482795	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=159,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61482790_C_A:61482790:0,1,0,1
chr14	61497058	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr14	61497147	.	A	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=208.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,27:0,32:0,0,34,27
chr14	61497285	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=13,27;MFRL=216,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.953:24:0,15:0,8:0,1,0,23
chr14	61747644	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr14	61952124	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0|1:61952124_G_C:61952124:0,0,13,0
chr14	61952133	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0|1:61952124_G_C:61952124:0,0,15,0
chr14	61952429	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr14	61997393	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=237,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr14	61997406	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr14	61997410	.	C	CAGTGAGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr14	62208005	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr14	62211578	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,27,26;MFRL=0,149,160;MMQ=60,60,60;MPOS=31,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=GT;STR;TLOD=6.95,13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,6:0.302,0.640:10:0,3,3:0,1,2:0,0,0,10
chr14	62213553	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr14	62213848	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,7:3,3:0,6,2,9
chr14	62233569	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:5,5:4,4:8,1,10,0
chr14	62233806	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:2,8:3,2:2,3,4,6
chr14	62234159	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=197,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:0,2:3,1:0,4,1,2
chr14	62542176	.	CT	TG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=124,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:1,0:0|1:62542176_CT_TG:62542176:0,5,0,1
chr14	62542179	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=143,255;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,1:0,0:0|1:62542176_CT_TG:62542176:0,4,0,1
chr14	62542181	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=120,255;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:62542176_CT_TG:62542176:0,4,0,1
chr14	62547469	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr14	62550877	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr14	62567094	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr14	63179333	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,7:7,2:5,4,9,0
chr14	63269317	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,6:2,3:0,3,3,6
chr14	63417295	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	63447799	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,3:9,1:9,4,2,2
chr14	63483728	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,105;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr14	63735739	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	63779846	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=77.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,7:0,18:0,0,7,18
chr14	63784335	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:6,2:3,3:6,3,3,3
chr14	63784407	.	A	AG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=82.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,13:0,8:0,0,19,4
chr14	63851138	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:16,1:12,1:16,12,0,2
chr14	63862087	.	A	ATGGTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=162,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:63862087_A_ATGGTGT:63862087:0,1,0,1
chr14	63862092	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=162,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:63862087_A_ATGGTGT:63862087:0,1,0,1
chr14	64066394	.	AC	GT	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=162,89;MMQ=60,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:6,0:0|1:64066394_AC_GT:64066394:13,7,2,0
chr14	64066398	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=181,89;MMQ=60,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:8,0:0|1:64066394_AC_GT:64066394:14,7,2,0
chr14	64066402	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=167,89;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,2:8,0:0|1:64066394_AC_GT:64066394:14,7,2,0
chr14	64066424	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=181,89;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,2:7,0:0|1:64066424_T_C:64066424:10,9,2,0
chr14	64066431	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=181,89;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:8,0:0|1:64066424_T_C:64066424:10,10,2,0
chr14	64375985	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr14	64416814	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	64421392	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,17,0
chr14	64428154	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr14	64443258	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,34,29;MFRL=152,131,157;MMQ=60,60,60;MPOS=26,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,18,21;RU=T;STR;TLOD=7.01,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,4:0.248,0.243:15:6,0,1:1,4,1:7,0,5,3
chr14	64443278	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.269:36:9,0:11,1:11,15,10,0
chr14	64443322	.	A	C	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=126,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,6:0.059:81:25,0:30,0:33,42,6,0
chr14	64450686	.	AC	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=237,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:64450686_AC_GT:64450686:0,3,0,1
chr14	64450697	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=237,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:64450686_AC_GT:64450686:0,3,0,1
chr14	64465829	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=157,119;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0|1:64465829_A_C:64465829:0,5,0,2
chr14	64465837	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=157,119;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:64465829_A_C:64465829:0,5,0,2
chr14	64465854	.	A	ATCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:64465854_A_ATCT:64465854:0,2,0,1
chr14	64465856	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:64465854_A_ATCT:64465854:0,2,0,1
chr14	64486890	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:9,0:4,3:0|1:64486890_G_A:64486890:0,14,0,3
chr14	64486896	.	GCA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=177,176;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,1:0|1:64486890_G_A:64486890:0,12,0,2
chr14	64489679	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,0,13
chr14	64491663	.	GT	CA	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=136,84;MMQ=60,56;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,4:0.063:77:39,4:29,0:39,34,4,0
chr14	64491695	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=255.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,43:0,34:0,0,33,45
chr14	64496872	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.787:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	64519035	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr14	64519066	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:10,2:8,12,1,1
chr14	64520416	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0,0,0,20
chr14	64532107	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr14	64537295	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr14	64537657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr14	64542872	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=91.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,0,26
chr14	64561938	.	C	CACCTCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	64565582	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,7:6,4:0,10,1,10
chr14	64591968	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:1,1:0,3,0,3
chr14	64596806	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=129,52;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,3:15,0:10,16,0,3
chr14	64598936	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr14	64608729	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:12,3:17,0:13,16,3,0
chr14	64613008	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:11,3:15,1:0,26,0,4
chr14	64633984	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.447:25:7,6:6,5:9,5,7,4
chr14	64669771	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	64676098	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:3,3:7,3:10,1,5,1
chr14	64679609	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.353:23:8,4:7,3:7,8,5,3
chr14	64680848	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr14	64681193	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	64685212	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=74,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:1,5:1,6:0,2,2,9
chr14	64685826	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr14	64686207	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=208,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr14	64688175	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr14	64689831	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr14	64691320	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,1,6
chr14	64691643	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.503:18:4,7:4,2:9,0,9,0
chr14	64691644	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.624:16:2,8:3,2:6,0,10,0
chr14	64694195	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=125,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,5:1,3:3,0,6,2
chr14	64855041	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=232,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,3,1
chr14	64879183	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:12,2:0|1:64879183_T_C:64879183:18,9,0,2
chr14	64879192	.	T	TA	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=133,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:15,0:16,2:0|1:64879183_T_C:64879183:18,15,0,2
chr14	64879194	.	G	GTGAAAAACATAAATTTAGA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=133,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.080:35:16,0:13,1:0|1:64879183_T_C:64879183:18,15,0,2
chr14	64879365	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=185,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64879365_T_C:64879365:0,1,0,1
chr14	64879367	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=185,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64879365_T_C:64879365:0,1,0,1
chr14	64882553	.	T	TGGATTATTACTGAGGAACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=213,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64882553_T_TGGATTATTACTGAGGAACC:64882553:0,1,0,1
chr14	64882557	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=213,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64882553_T_TGGATTATTACTGAGGAACC:64882553:0,1,0,1
chr14	64909151	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr14	64916374	.	AG	CC,AACCTAGGCAATACCATTCAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32,33;MFRL=192,132,183;MMQ=60,40,60;MPOS=23,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,1,1:2,0,0:1,2,0,2
chr14	64916378	.	GA	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr14	64937251	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=171,192;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:8,3:12,0,3,0
chr14	64937307	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=18,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=A;STR;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.728:12:0,3:0,2:0,3,2,7
chr14	64937995	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=243,271;MMQ=40,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	64990700	.	G	GT	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,12:0.171:74:28,5:25,4:30,32,5,7
chr14	65009534	.	C	CT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=77.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,17:0,12:0,0,31,3
chr14	65031534	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,5,9
chr14	65031572	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr14	65032226	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,8:0,0,4,14
chr14	65055056	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=135,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.478:2:1,1:0,0:0|1:65055056_A_AG:65055056:0,1,0,1
chr14	65055057	.	T	TGTGTTTGCTAGAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=135,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.485:2:1,1:0,0:0|1:65055056_A_AG:65055056:0,1,0,1
chr14	65199100	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,112;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:7,0:18,2:14,11,2,0
chr14	65199481	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.421:29:8,5:8,6:13,4,9,3
chr14	65207729	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=154,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:6,2,1,1
chr14	65209680	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,5:2,1:4,2,4,2
chr14	65209712	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:8,2:9,0:8,10,1,1
chr14	65216242	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=187,261;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr14	65237933	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=134,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65237933_T_TG:65237933:0,1,0,1
chr14	65237936	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=134,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65237933_T_TG:65237933:0,1,0,1
chr14	65237939	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=134,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65237933_T_TG:65237933:0,1,0,1
chr14	65237943	.	C	CTGGGTTTGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=134,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65237933_T_TG:65237933:0,1,0,1
chr14	65245863	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=111,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.961:26:0,8:0,15:1,2,18,5
chr14	65246006	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr14	65246040	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr14	65246055	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=214,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:65246055_CAG_C:65246055:0,4,0,1
chr14	65246060	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=189,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:65246055_CAG_C:65246055:0,3,0,1
chr14	65246062	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=189,164;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:65246055_CAG_C:65246055:0,3,0,1
chr14	65246350	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	65250939	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,10:0,0,16,10
chr14	65262425	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	65267469	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=89.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0,0,13,14
chr14	65267901	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	65268167	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr14	65268510	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:9,7:6,7:4,11,4,10
chr14	65270272	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,11,4
chr14	65271634	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr14	65271650	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr14	65271898	.	TAC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	65398783	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr14	65409509	.	G	GTTTTGGCCCCAGGGTGGTGGTTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	65417211	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr14	65417225	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=222,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65417225_A_C:65417225:0,1,0,1
chr14	65417226	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=222,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65417225_A_C:65417225:0,1,0,1
chr14	65417227	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=222,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:65417225_A_C:65417225:0,1,0,1
chr14	65418265	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,5:6,3:7,3,6,2
chr14	65472874	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,1:4,0,3,0
chr14	65543102	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr14	65550816	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr14	65568215	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=275.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,80:0.988:80:0,44:0,36:0,0,68,12
chr14	65568304	.	GA	G	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.086:61:4,0:5,2:7,49,1,4
chr14	66200177	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,12:0,0,0,18
chr14	66953308	.	GTC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TC;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.622:6:2,2:0,2:0,2,4,0
chr14	66953534	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:0,3,0,6
chr14	66955053	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:66955053_G_A:66955053:0,2,0,1
chr14	66955055	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:66955053_G_A:66955053:0,1,0,1
chr14	66955057	.	G	GGAGTCAAAAATTACTCCAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:66955053_G_A:66955053:0,1,0,1
chr14	66955803	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:4,10:5,4:6,3,4,11
chr14	66957887	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	66964784	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=145,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.618:34:6,9:2,10:9,4,17,4
chr14	67389728	.	TC	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	67589042	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=151,107;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:17,3:19,0:12,26,3,0
chr14	67671482	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:6,5:4,4:0|1:67671482_C_CT:67671482:2,8,4,5
chr14	67671483	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:6,5:4,4:0|1:67671482_C_CT:67671482:2,8,4,5
chr14	67671485	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:5,5:4,3:0|1:67671482_C_CT:67671482:2,8,4,5
chr14	67746103	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:16,1:20,1:18,19,2,0
chr14	67790332	.	AAT	A,AATAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30,28;MFRL=175,180,195;MMQ=60,60,60;MPOS=10,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=AT;STR;TLOD=8.10,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,2:0.308,0.229:10:3,1,1:2,2,1:5,0,5,0
chr14	67807242	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=13,32;MFRL=82,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:0,1:0,3:0,2,1,3
chr14	67814219	.	C	CT,CTT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=36,21,19;MFRL=167,144,138;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=T;STR;TLOD=14.67,4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,5:0.618,0.314:15:0,4,1:1,2,1:0,1,5,9
chr14	67814260	.	CG	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=156,152;MMQ=60,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:4,0:0,11,0,2
chr14	67817234	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr14	67819567	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	67858961	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr14	67940666	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,4:1,3:0,3,0,7
chr14	68008718	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr14	68028586	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	68029594	.	C	CTCTTCAAGAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=207,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr14	68038697	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr14	68039027	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	68042255	.	A	G,AT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,33,29;MFRL=0,175,165;MMQ=60,60,60;MPOS=25,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.33,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.632,0.247:5:0,1,1:0,3,0:0,0,0,5
chr14	68042280	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=248,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:68042280_A_T:68042280:0,1,0,1
chr14	68042282	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=248,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:68042280_A_T:68042280:0,1,0,1
chr14	68042284	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=248,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:68042280_A_T:68042280:0,1,0,1
chr14	68042288	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=248,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:68042280_A_T:68042280:0,1,0,1
chr14	68042496	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr14	68044005	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr14	68044063	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=155,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr14	68045753	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	68045840	.	C	CTTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr14	68045935	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr14	68047564	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,21;MFRL=84,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:68047564_C_A:68047564:2,0,1,0
chr14	68047566	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=84,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:68047564_C_A:68047564:2,0,1,0
chr14	68047569	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=84,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:68047564_C_A:68047564:2,0,1,0
chr14	68047574	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,10;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:68047564_C_A:68047564:3,0,1,0
chr14	68047576	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,16;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:68047564_C_A:68047564:3,0,1,0
chr14	68053977	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,3,19
chr14	68059534	.	T	A,G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,30,33;MFRL=160,190,184;MMQ=60,36,43;MPOS=32,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,0,0:1,1,1:0,4,0,2
chr14	68059541	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=163,184;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr14	68059542	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=160,190;MMQ=60,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr14	68060375	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	68060694	.	A	ACAGCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr14	68060763	.	T	TTTATG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68060763_T_TTTATG:68060763:0,1,0,1
chr14	68060765	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68060763_T_TTTATG:68060763:0,1,0,1
chr14	68060770	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68060763_T_TTTATG:68060763:0,1,0,1
chr14	68066949	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr14	68113293	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	68115001	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	68141079	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:0,0:2,1:8,1,4,0
chr14	68156842	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,1:0,0,8,0
chr14	68191368	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr14	68220585	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	68236522	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	68238687	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr14	68241648	.	CAAAAA	C,CAA,CAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34,30,33;MFRL=0,166,155,149;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,15,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,11,13,14;RU=A;STR;TLOD=5.45,9.98,5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,5,3:0.234,0.406,0.290:10:0,0,1,0:0,2,3,3:0,0,8,2
chr14	68242898	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr14	68242922	.	A	ACTTGGTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=293,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:68242922_A_ACTTGGTTG:68242922:1,2,0,1
chr14	68242923	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=293,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:68242922_A_ACTTGGTTG:68242922:1,2,0,1
chr14	68244202	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,17,0
chr14	68246876	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr14	68248281	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr14	68252852	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:6,3:4,5:7,3,7,2
chr14	68252976	.	A	AGAAAAAGCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=129,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr14	68273430	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr14	68274020	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr14	68944321	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,4:4,1:9,0,5,0
chr14	68944343	.	CTT	C,CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33,32;MFRL=153,63,142;MMQ=60,60,60;MPOS=28,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.22,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,3:0.141,0.200:17:4,1,3:5,1,0:12,0,5,0
chr14	68963746	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=243,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr14	69262441	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=134.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,24:0,18:0,0,43,0
chr14	69349528	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=148,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr14	69376658	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr14	69392264	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,13,6
chr14	69392445	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:0,6,1,5
chr14	69392469	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=151,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:69392469_GG_AA:69392469:1,3,0,1
chr14	69392472	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=151,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:69392469_GG_AA:69392469:1,3,0,1
chr14	69392473	.	T	TCA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=147,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:69392469_GG_AA:69392469:1,2,0,1
chr14	69392474	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=147,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:69392469_GG_AA:69392469:1,2,0,1
chr14	69392478	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=147,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:69392469_GG_AA:69392469:1,2,0,1
chr14	69445616	.	C	CGGGGCTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GGGGCTG;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:4,0,5,0
chr14	69445646	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,10:0,0,15,0
chr14	69529031	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:8,0,4,1
chr14	69558678	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr14	69676541	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.727:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr14	69695792	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=175.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,31:0,21:0,0,12,40
chr14	69697289	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:5,7:3,2:2,6,0,10
chr14	69704662	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,3:3,5:2,7,2,6
chr14	69727194	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr14	69791308	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr14	69791992	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=163,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,5:5,0:6,2,5,0
chr14	69798284	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=80,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,1,3
chr14	69799806	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.500:44:11,10:11,12:10,12,14,8
chr14	69847221	.	G	GGCCC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.607:8:2,2:1,3:0|1:69847221_G_GGCCC:69847221:1,2,5,0
chr14	69847225	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=102,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.465:11:1,2:1,2:0|1:69847221_G_GGCCC:69847221:2,4,5,0
chr14	69847229	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=120,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.338:13:5,1:1,2:0|1:69847221_G_GGCCC:69847221:3,6,4,0
chr14	69988954	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,18,2
chr14	69992873	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr14	69994473	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr14	69995112	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:1,6,3,1
chr14	70418885	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=108,98;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:6,2:0|1:70418885_A_T:70418885:10,8,0,2
chr14	70418889	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=107,98;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,0:7,2:0|1:70418885_A_T:70418885:10,9,0,2
chr14	70419090	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr14	70442350	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr14	70480215	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr14	70480294	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=262,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:70480294_C_T:70480294:0,1,0,1
chr14	70480296	.	G	GCCTAAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=262,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70480294_C_T:70480294:0,1,0,1
chr14	70496919	.	CTTT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:8,3:1,0:8,1,2,2
chr14	70515779	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	70530706	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr14	70634087	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,11:0,12:0,0,14,10
chr14	70635161	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=110,375;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,2:7,4,2,0
chr14	70635224	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=146,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:70635224_G_T:70635224:0,2,0,1
chr14	70635228	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=146,203;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:70635224_G_T:70635224:0,2,0,1
chr14	70795772	.	T	TAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:8,1,3,0
chr14	70809476	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.225:29:7,4:16,1:0|1:70809476_A_G:70809476:3,20,0,6
chr14	70809496	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:3,3:9,4:0|1:70809476_A_G:70809476:0,12,0,7
chr14	70855383	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=135,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:70855383_A_G:70855383:0,3,0,1
chr14	70855384	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=135,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:70855383_A_G:70855383:0,3,0,1
chr14	70989354	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:7,0:0|1:70989354_T_A:70989354:11,9,0,2
chr14	70989357	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:9,0:0|1:70989354_T_A:70989354:12,9,0,2
chr14	71052383	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:5,2:12,0:17,1,2,0
chr14	71109276	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	71197521	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=104,88;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0|1:71197521_G_A:71197521:2,1,0,1
chr14	71197523	.	G	GCCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=104,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:71197521_G_A:71197521:2,1,0,1
chr14	71197525	.	C	CGTTGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=104,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:71197521_G_A:71197521:2,1,0,1
chr14	71197526	.	A	AAAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=104,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:71197521_G_A:71197521:2,1,0,1
chr14	71201305	.	T	TCTGTCACCAGGTTGAAGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	71202650	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,11:0,0,8,9
chr14	71208996	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	71216863	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr14	71227913	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:1,3,0,4
chr14	71227947	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr14	71374537	.	G	GCGGCGGCGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGGCGGCGA;STR;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr14	71485692	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr14	71495606	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0,15,0,2
chr14	71524529	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr14	71540388	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:12,1:14,2:12,14,3,0
chr14	71542879	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:0,2:2,2:2,1,3,1
chr14	71575627	.	G	GGGCAACAAGAGTGAAACTTCGT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,1:9,1:12,10,0,2
chr14	71576379	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0,12,0,2
chr14	72172013	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:5,12,1,1
chr14	72200564	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=177,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:72200564_AT_A:72200564:0,3,0,1
chr14	72200568	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=177,103;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:72200564_AT_A:72200564:0,3,0,1
chr14	72201985	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,4:5,6:5,2,7,3
chr14	72925171	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr14	72932563	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,3:3,6:0,4,0,9
chr14	72939495	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr14	72944943	.	T	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=243.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,72:0.987:72:0,30:0,41:0,0,35,37
chr14	72977064	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr14	73029032	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	73198506	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,9:4,4:4,4,9,4
chr14	73360819	.	T	TTGTC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTC;STR;TLOD=85.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,8:0,10:0,0,5,15
chr14	73404795	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr14	73408355	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr14	73408369	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr14	73409613	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	73412739	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr14	73413965	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,1,16
chr14	73423156	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:11,6,2,0
chr14	73444535	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=202,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr14	73448469	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=108,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.359:9:6,0:0,1:0|1:73448469_T_G:73448469:6,0,0,3
chr14	73448476	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.303:11:7,0:1,1:0|1:73448469_T_G:73448469:8,0,0,3
chr14	73448640	.	GTAGAGAGCTCCGCAC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=96,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:0,3:4,2:1,3,2,3
chr14	73448692	.	A	ATTATTAAAATCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=167,217;MMQ=60,60;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr14	73566331	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,6:6,6:11,3,10,2
chr14	73570000	.	G	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=119,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,4:0.073:66:27,4:33,0:24,38,4,0
chr14	73572606	.	AAG	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.121:30:8,0:13,3:9,18,1,2
chr14	73577875	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=124,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.180:14:6,0:6,2:2,10,1,1
chr14	73577905	.	C	CATCCTAGATTTATTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=126,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr14	73653468	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=141,191;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:9,0,2,0
chr14	73653478	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,152;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:4,2:3,0:8,0,2,0
chr14	73712922	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=198,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr14	73716853	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=206,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73716853_C_A:73716853:0,1,0,1
chr14	73716856	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=206,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73716853_C_A:73716853:0,1,0,1
chr14	73719334	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr14	73720547	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:10,7,0,2
chr14	73721775	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr14	73726151	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=261,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,2,3
chr14	73728957	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	73730290	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr14	73732302	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	73743367	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=115,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:5,8:12,3:8,9,8,4
chr14	73753766	.	CTTG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:0,1:3,0:3,0,1,0
chr14	73945644	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=211,193;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr14	73957682	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=207,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr14	73957981	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr14	73958375	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=207,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:0,6:5,2:4,1,8,0
chr14	73960136	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,2:4,0:1,11,1,1
chr14	73961841	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:3,0,5,1
chr14	73962017	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:23,3:17,0:22,18,3,0
chr14	73969697	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:8,1:3,2:4,7,2,1
chr14	74121531	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,0:0,2:1,2,0,2
chr14	74156027	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:3,2:9,0:13,1,1,1
chr14	74156316	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=292,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr14	74185923	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	74186280	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=98,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:74186280_G_GT:74186280:0,1,0,1
chr14	74186284	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=98,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74186280_G_GT:74186280:0,1,0,1
chr14	74186285	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=98,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74186280_G_GT:74186280:0,1,0,1
chr14	74192149	.	G	GATCTGATTAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	74192165	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	74193427	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,6,10
chr14	74196981	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	74203690	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:5,6:4,6:3,6,7,5
chr14	74205198	.	GCAGCCGCC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:3,0,2,0
chr14	74205878	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.358:20:5,1:7,5:4,9,4,3
chr14	74206658	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:2,4,2,3
chr14	74349227	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,145;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,3:0.056:70:41,0:24,3:9,58,0,3
chr14	74360526	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=134,48;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:17,2:13,1:18,14,1,2
chr14	74404454	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,5:5,2:1,7,1,6
chr14	74407814	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=185,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74407814_T_TC:74407814:0,3,0,1
chr14	74407817	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=185,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74407814_T_TC:74407814:0,3,0,1
chr14	74407820	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=212,226;MMQ=54,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:74407814_T_TC:74407814:0,2,0,1
chr14	74407832	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=212,226;MMQ=54,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:74407814_T_TC:74407814:0,2,0,1
chr14	74407834	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=212,226;MMQ=54,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:74407814_T_TC:74407814:0,2,0,1
chr14	74422329	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr14	74428286	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0,0,1,17
chr14	74443192	.	A	AGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=95,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	74453706	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr14	74454813	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,6,11
chr14	74512698	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr14	74531485	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.427:31:8,8:9,5:10,8,9,4
chr14	74537885	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,14,3
chr14	74538706	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:7,1:3,6:4,7,1,6
chr14	74551113	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:0,19,0,2
chr14	74564468	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.361:22:4,4:9,1:10,4,5,3
chr14	74564605	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,2:4,6:0,7,3,5
chr14	74665543	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,7:6,3:7,1,8,2
chr14	74726515	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr14	74753278	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr14	74753586	.	ACC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:74753586_ACC_A:74753586:0,3,0,1
chr14	74753589	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:74753586_ACC_A:74753586:0,3,0,1
chr14	74753592	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:74753586_ACC_A:74753586:0,3,0,1
chr14	74754788	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr14	74756737	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.205:22:8,4:10,0:9,9,2,2
chr14	74757276	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,357;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	74766352	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,11,11
chr14	74874540	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr14	74874707	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,3,9
chr14	74876501	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr14	74975415	.	C	CAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:4,2:2,0:0|1:74975415_C_CAT:74975415:3,5,1,1
chr14	74975417	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=138,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:3,2:2,0:0|1:74975415_C_CAT:74975415:3,5,1,1
chr14	74983491	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,1:0|1:74983491_GT_G:74983491:3,2,2,1
chr14	74983495	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0|1:74983491_GT_G:74983491:3,2,2,1
chr14	74989433	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:74989433_T_C:74989433:1,1,1,0
chr14	74989437	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:74989433_T_C:74989433:1,1,1,0
chr14	74995760	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:15,2:5,0:11,9,1,1
chr14	75002775	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=91,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr14	75016482	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr14	75131694	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=198,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr14	75137490	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:26,2:18,0:22,22,2,0
chr14	75138024	.	C	CGTTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.610:8:1,3:1,1:3,0,5,0
chr14	75140707	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:6,1:9,3,2,0
chr14	75181481	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,34,33,33;MFRL=144,125,167,171;MMQ=60,60,60,60;MPOS=32,22,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.66,13.62,8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:25,3,9,8:0.072,0.188,0.181:45:12,2,6,6:10,1,3,1:22,3,20,0
chr14	75201710	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,6:1,7:0,3,1,12
chr14	75282873	.	ATT	A,AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=165,157,166;MMQ=60,60,60;MPOS=19,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.30,4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.248,0.334:9:2,2,3:0,0,0:4,0,5,0
chr14	75287730	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,34,34,35;MFRL=162,149,158,163;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,19,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.54,13.94,12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:21,4,9,9:0.095,0.209,0.211:43:7,1,5,5:12,3,4,2:20,1,20,2
chr14	75301951	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,6:2,4:3,2,8,2
chr14	75355767	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=112.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,19:0,17:0,0,24,14
chr14	75356070	.	A	ATT,T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,32,33;MFRL=118,161,129;MMQ=60,60,40;MPOS=19,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.97,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,8,5:0.581,0.126:17:1,5,2:2,1,2:2,2,7,6
chr14	75356103	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,0,26
chr14	75356152	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=177,172;MMQ=56,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:10,4:4,1:0,16,0,5
chr14	75359441	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,12,0
chr14	75360934	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=138,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75360934_G_GT:75360934:1,0,1,0
chr14	75360935	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=138,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75360934_G_GT:75360934:1,0,1,0
chr14	75360955	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=138,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:3,0,1,0
chr14	75361177	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr14	75365062	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=157.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,18:0,30:0,0,22,27
chr14	75367693	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,2:5,0:4,1,2,0
chr14	75367740	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,13,2
chr14	75373626	.	C	CTGAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr14	75386530	.	T	TGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=G;STR;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,0:1,0,3,0
chr14	75415194	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,8:0,0,14,8
chr14	75415353	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,1:0,3,0,2
chr14	75416000	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr14	75470446	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,0,13
chr14	75474536	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:4,1:8,1:2,11,0,2
chr14	75485489	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,14,1
chr14	75489446	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,6:0,0,12,0
chr14	75489632	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=106.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,15,15
chr14	75489856	.	GGTACAAATTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=103,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr14	75497442	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=210,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:75497442_G_A:75497442:0,9,0,2
chr14	75497443	.	T	TCAAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=210,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:75497442_G_A:75497442:0,9,0,2
chr14	75505016	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=83.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,18,6
chr14	75506549	.	CATATATATATATATATAT	C,CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,185,163;MMQ=60,60,60;MPOS=21,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,9,10;RU=AT;STR;TLOD=3.85,9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.333,0.552:5:0,0,3:0,2,0:0,0,5,0
chr14	75551254	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=106.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,14:0,19:0,0,21,12
chr14	75551442	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,0,18
chr14	75553655	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr14	75572559	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr14	75580152	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,5:0,6:0,1,0,11
chr14	75587351	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,2,12
chr14	75587373	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=157,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.246:6:3,1:2,0:0|1:75587373_C_A:75587373:0,5,0,1
chr14	75587377	.	AAC	TGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=159,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:75587373_C_A:75587373:0,4,0,1
chr14	75590949	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=94,172;MMQ=60,60;MPOS=-1073741810;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:13,2:5,0:5,14,0,2
chr14	75601782	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	75745626	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr14	75747258	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,27:0.509:53:16,12:10,15:23,3,22,5
chr14	75747407	.	AG	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=165.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,21:0,30:0,0,5,46
chr14	75747843	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr14	76045220	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76045220_T_C:76045220:0,0,1,0
chr14	76045223	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76045220_T_C:76045220:0,0,1,0
chr14	76129511	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:10,8,2,0
chr14	76173860	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	76198818	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.743:17:1,5:2,7:0,4,0,13
chr14	76201482	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr14	76201565	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:9,9,0,2
chr14	76232398	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,14,0
chr14	76238254	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,0:0,2:0,1,0,3
chr14	76368497	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:11,0:8,2:13,7,1,1
chr14	76432136	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	76452227	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.233:21:4,1:5,0:6,10,0,5
chr14	76524970	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:5,1:6,4,4,0
chr14	76524982	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:4,0:5,0:8,6,2,0
chr14	76525553	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr14	76542856	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=127,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr14	76543004	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:2,0:12,2:8,7,0,2
chr14	76548783	.	GGACCTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr14	76549545	.	GAC	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:17,0:13,3:21,10,0,3
chr14	76549752	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:4,2,4,1
chr14	76668180	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,38;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:12,2:19,0:7,25,1,1
chr14	76906157	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr14	76948567	.	G	GGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:76948567_G_GGT:76948567:0,1,0,1
chr14	76948568	.	A	AGAATTCATGCCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:76948567_G_GGT:76948567:0,1,0,1
chr14	76949157	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	76966991	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=178,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr14	77229539	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr14	77274227	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,2:6,2:10,1,4,0
chr14	77275630	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:5,1,3,5
chr14	77292992	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr14	77304334	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:3,0:4,3:2,7,0,3
chr14	77311296	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:0,1,1,5
chr14	77319773	.	G	GGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=91,179;MMQ=40,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,22;RU=GT;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.521:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr14	77332408	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=83,87;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.487:45:9,6:13,14:15,8,16,6
chr14	77336428	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=140,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chr14	77492351	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,1:3,6:2,9,4,3
chr14	77493761	.	TTGCTGC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=125,123;MMQ=40,51;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TGC;STR;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.691:4:0,0:0,3:0,1,0,3
chr14	77572202	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,144;MMQ=60,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,0:11,3:4,14,0,3
chr14	77576055	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr14	77600344	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr14	77605953	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,1:6,8:5,3,2,7
chr14	77685383	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	77686303	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr14	77704974	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr14	77705773	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:8,4:8,7:12,4,8,3
chr14	77705865	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.247:13:3,0:7,0:3,7,0,3
chr14	77705870	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=16,19;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:0,1:3,0:3,7,0,2
chr14	77705889	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,1:1,0:1,3,0,2
chr14	77719645	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=110,45;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,2:7,0:0|1:77719645_CAG_C:77719645:8,4,1,1
chr14	77719648	.	CCCGAGGAGGAGG	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=110,45;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:6,0:0|1:77719645_CAG_C:77719645:10,5,1,1
chr14	77719664	.	TC	CA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=110,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:77719645_CAG_C:77719645:7,5,1,1
chr14	77719668	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=109,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,3:7,0:5,5,2,1
chr14	77737307	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	77750057	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr14	77751729	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	77753074	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:12,11:5,9:10,8,15,6
chr14	77755221	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr14	77757743	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.480:3:1,0:1,1:0|1:77757743_G_T:77757743:1,1,1,0
chr14	77757745	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.480:3:1,0:0,1:0|1:77757743_G_T:77757743:1,1,1,0
chr14	77795638	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=214,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,1:0,3,0,3
chr14	77843920	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:9,13:8,7:8,9,10,11
chr14	77846770	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,2:10,0:11,8,1,1
chr14	77872977	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=250,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr14	77880493	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,2:5,4:5,6,1,5
chr14	77880524	.	CTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=138,178;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr14	77901758	.	G	GA,GAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,33,37;MFRL=151,138,0;MMQ=60,60,60;MPOS=5,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.67,3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.551,0.260:7:1,1,2:0,3,0:0,1,3,3
chr14	77902361	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr14	77914752	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=94,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.596:5:1,3:0,0:2,0,3,0
chr14	77919587	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=118,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,2:3,6:5,1,8,0
chr14	77925886	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:5,2,3,0
chr14	77928476	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:3,3:11,4:8,6,5,2
chr14	77928525	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.443:32:2,4:15,10:9,9,9,5
chr14	77930878	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr14	77931009	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,26:0.657:39:8,8:4,17:7,6,8,18
chr14	77932017	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr14	77934394	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr14	77934758	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.481:31:7,6:9,8:11,5,12,3
chr14	77934941	.	T	TCTG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=142,93;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:77934941_T_TCTG:77934941:0,11,0,2
chr14	77934947	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=142,93;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:77934941_T_TCTG:77934941:0,11,0,2
chr14	77934954	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=136,93;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:77934941_T_TCTG:77934941:0,12,0,2
chr14	77941865	.	G	GAGGGCCCTACC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr14	77950739	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,4:6,1:4,7,3,2
chr14	77978621	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:6,7:12,5:14,4,7,5
chr14	77984573	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr14	77987958	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr14	78018614	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr14	78021789	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:12,2:10,6:12,11,4,4
chr14	78023519	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=138,207;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr14	78036658	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr14	78036935	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:0,4,0,5
chr14	78146403	.	A	ATAAATAACCTCTAAAGCCCTTTGTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=224,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.666:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr14	78170896	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr14	78174473	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr14	78187209	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=189,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,6:1,2:1,6,0,8
chr14	78189469	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=142,164;MMQ=60,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0|1:78189469_G_C:78189469:4,1,2,0
chr14	78189474	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=17,34;MFRL=142,162;MMQ=60,55;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,3:2,0:0|1:78189469_G_C:78189469:4,1,3,0
chr14	78189718	.	CA	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr14	78221522	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=200,299;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	78285461	.	GT	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=73.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.969:27:0,17:0,10:0,0,7,20
chr14	78325675	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr14	78325698	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=169,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr14	78353368	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr14	78365612	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,7:6,5:0,10,2,10
chr14	78374201	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.162:23:8,3:9,0:11,9,3,0
chr14	78398137	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78398137_A_C:78398137:0,0,0,1
chr14	78398141	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78398137_A_C:78398137:0,0,0,1
chr14	78398143	.	C	CTTATATTTCAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78398137_A_C:78398137:0,0,0,1
chr14	79175616	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:4,6,0,2
chr14	79181046	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr14	79276732	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=188,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.428:9:2,1:3,3:0|1:79276732_AC_A:79276732:0,5,1,3
chr14	79276733	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,11:0.922:11:0,3:0,7:1|0:79276732_AC_A:79276732:0,0,1,10
chr14	80669639	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30,31,31;MFRL=156,151,109,143;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,22,29;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.96,3.79,6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,3,4,4:0.144,0.194,0.253:19:0,2,4,4:7,0,0,0:3,5,4,7
chr14	81025522	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=124.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,21:0,16:0,0,33,4
chr14	81046810	.	A	AACGAGTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACGAGTT;STR;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr14	81297385	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=217,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr14	81366349	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:5,15,0,2
chr14	81371088	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0,1,5,0
chr14	81371209	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,8:5,5:5,9,7,7
chr14	81382845	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,6:5,8:7,2,5,9
chr14	81382858	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,1:11,1:9,16,0,2
chr14	81574661	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=180,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr14	81574687	.	T	TTCTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TC;STR;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.937:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr14	81574845	.	T	TTTTTTCTTTTTAC,TTTTTTTCTTTTTAC,TTTTTTTTCTTTTTAC	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=32,32,32,32;MFRL=0,121,137,134;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,13,3;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.83,23.65,8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,5,15,6:0.184,0.545,0.219:27:1,3,11,3:0,2,4,3:0,1,8,18
chr14	81574854	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=114,122;MMQ=60,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:8,0:0|1:81574854_A_C:81574854:7,16,0,2
chr14	81574856	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=113,122;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,2:9,0:0|1:81574854_A_C:81574854:7,17,0,2
chr14	81574860	.	TGGAG	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=113,122;MMQ=60,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:9,0:0|1:81574854_A_C:81574854:7,17,0,2
chr14	81667852	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr14	81686908	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=131,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:10,0:9,0:12,20,0,3
chr14	81686938	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=115,141;MMQ=40,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=72.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,9:0,10:0,1,1,19
chr14	81993037	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.168:22:11,3:6,0:19,0,3,0
chr14	86089777	.	ATATC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr14	86093921	.	T	TAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AC;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.495:14:3,2:4,3:3,4,5,2
chr14	88406404	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	88407716	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=265,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.621:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr14	88407734	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,1:0,0,6,3
chr14	88407875	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,19:0,11:0,0,11,19
chr14	88407888	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.606:23:3,8:5,6:4,5,6,8
chr14	88407917	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:4,5,2,7
chr14	88411803	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr14	88414283	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=62.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,2:0,15:0,0,0,17
chr14	88417095	.	GA	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=103.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,41:0.935:43:1,12:1,24:0,2,2,39
chr14	88417161	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,0,22
chr14	88429916	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,0:0,3,0,2
chr14	88454691	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:5,2,5,2
chr14	88454910	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:6,4:4,5:0,11,0,10
chr14	88652027	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=146,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.132:28:8,1:17,2:0|1:88652027_G_C:88652027:13,12,0,3
chr14	88652030	.	T	TCCTCCCCTC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=145,81;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.136:27:8,0:16,2:0|1:88652027_G_C:88652027:12,12,0,3
chr14	88658764	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=58,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,0:6,6:1,5,0,6
chr14	88729931	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=116,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr14	88792884	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr14	88792904	.	G	GCCTCCCAAGTAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr14	88852031	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr14	88862663	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=204,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:88862663_A_C:88862663:0,2,0,1
chr14	88862668	.	T	TGATGTGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=216,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:88862663_A_C:88862663:0,1,0,1
chr14	88894143	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:6,9:7,7:0,13,1,15
chr14	88895669	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,7:0,12:0,0,17,3
chr14	88946449	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:1,7:5,3:5,1,9,1
chr14	88983673	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr14	89016855	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	89037482	.	C	CAT,CATT	.	.	DP=160;ECNT=1;MBQ=33,34,32;MFRL=125,130,150;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=107.57,3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:77,47,3:0.430,0.033:127:31,16,2:43,21,1:16,61,4,46
chr14	89042180	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,8:3,1:3,2,7,2
chr14	89063167	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,8,12
chr14	89087278	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33,10;MFRL=160,172,178;MMQ=60,60,60;MPOS=14,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,18;RU=A;STR;TLOD=3.61,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.315,0.369:7:1,0,1:1,2,0:0,2,0,5
chr14	89087498	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=129,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,0:7,2:13,7,0,2
chr14	89089149	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.799:13:1,4:1,7:0,2,0,11
chr14	89094243	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	89105287	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,5:2,2:0,3,0,7
chr14	89129304	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,3:6,2:10,0,5,0
chr14	89129450	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:4,16,0,2
chr14	89131019	.	T	TACATGGACCAGAGTTTAGCTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	89202612	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=205,157;MMQ=60,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr14	89202619	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=198,195;MMQ=60,32;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr14	89202623	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=205,157;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:89202623_G_A:89202623:4,0,1,0
chr14	89202632	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=159,157;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:89202623_G_A:89202623:4,0,1,0
chr14	89202634	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=159,157;MMQ=60,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:89202623_G_A:89202623:4,0,1,0
chr14	89202995	.	C	CTAGACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89202995_C_CTAGACA:89202995:0,1,0,1
chr14	89202997	.	AGT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:89202995_C_CTAGACA:89202995:0,2,0,1
chr14	89203001	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:89202995_C_CTAGACA:89202995:0,2,0,1
chr14	89647238	.	A	AAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AG;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:1,0:0,2:0,1,0,4
chr14	89747473	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	90263525	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr14	90456188	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:3,9:9,6:1,11,0,15
chr14	90485729	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:10,1:18,2:16,12,3,0
chr14	90499389	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=166,67;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr14	90528967	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,1:5,2:0,5,0,3
chr14	90651425	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	90651447	.	G	GTTGCTGGTTAATGATGTCACCTTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	90722824	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr14	90723000	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,6:0,17:0,0,9,15
chr14	90723059	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr14	90729565	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=77.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,12:0,0,22,0
chr14	90729931	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=150.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,33:0,7:0,0,33,7
chr14	90729984	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=143.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,37:0,21:0,0,33,25
chr14	90730265	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,14:0,9:0,0,5,18
chr14	90735838	.	G	GATGTTTTCCA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=138,112;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,2:7,0:0|1:90735838_G_GATGTTTTCCA:90735838:14,8,0,2
chr14	90735841	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=138,112;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,2:8,0:0|1:90735838_G_GATGTTTTCCA:90735838:15,9,0,2
chr14	90735844	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=138,112;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:16,2:10,0:0|1:90735838_G_GATGTTTTCCA:90735838:15,11,0,2
chr14	90752908	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr14	90754538	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,14,1
chr14	90770210	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr14	90863489	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,4:0,0,13,0
chr14	90866346	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:6,3,5,0
chr14	90870410	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=120,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	91110461	.	G	GT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=134,64;MMQ=60,56;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:19,0:14,2:20,14,0,2
chr14	91252545	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.492:24:5,6:7,3:8,4,7,5
chr14	91282666	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:91282666_G_GC:91282666:0,1,0,1
chr14	91282671	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:91282666_G_GC:91282666:0,1,0,1
chr14	91360733	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,3:3,4:4,2,6,3
chr14	91365646	.	GAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:1,4:1,0:2,1,4,0
chr14	91367097	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=102,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.277:5:2,0:2,1:0|1:91367097_G_C:91367097:1,3,0,1
chr14	91367099	.	A	C,ATG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,33,27;MFRL=102,126,181;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:2,1,1:1,3,0,2
chr14	91367107	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1|0:91367097_G_C:91367097:1,3,0,1
chr14	91372719	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=195,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr14	91409615	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=215,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.365:6:0,1:2,1:0,4,0,2
chr14	91639611	.	AT	A,ATT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,31,32;MFRL=130,125,62;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.71,6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,6,4:0.239,0.226:20:4,3,4:2,2,0:6,4,8,2
chr14	91639651	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=127,101;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:17,0:22,3:19,22,3,0
chr14	91666018	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=108,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr14	91681921	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:1,2,0,4
chr14	91701281	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:8,6:13,6:12,9,4,8
chr14	91744249	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=163,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,0:12,3:15,10,2,1
chr14	91747917	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:3,11,1,1
chr14	91749595	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr14	91763637	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:9,3:5,6:9,5,7,2
chr14	91772264	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=84,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr14	91791240	.	CAA	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,2:5,0:0|1:91791240_CAA_C:91791240:4,8,1,1
chr14	91791246	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=153,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:7,0:0|1:91791240_CAA_C:91791240:3,8,1,1
chr14	91792320	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.513:37:8,8:10,11:7,11,7,12
chr14	91874956	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,1,1
chr14	91882983	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,0:1,0,2,0
chr14	91883267	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=16,32;MFRL=309,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.888:11:0,5:0,3:0,1,1,9
chr14	91925027	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=205,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,2:3,6:5,0,8,0
chr14	91927717	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=79.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,28:0.579:48:10,13:10,15:10,10,17,11
chr14	91928301	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr14	91928992	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=105,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.435:12:2,3:4,2:5,2,5,0
chr14	91929281	.	CTTAAT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=151,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTAAT;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr14	91929312	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:91929312_T_A:91929312:0,2,0,1
chr14	91929314	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:91929312_T_A:91929312:0,2,0,1
chr14	91937143	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr14	91942318	.	C	CA	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:9,15:11,6:11,9,6,15
chr14	91942342	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=102.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,23:0,9:0,0,9,23
chr14	91942407	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr14	91957235	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	92040589	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=213,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:1,2:0,5,0,5
chr14	92074545	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:5,0,7,0
chr14	92102759	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:7,4:12,8:10,9,6,6
chr14	92140428	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,5:2,1:8,0,6,0
chr14	92171111	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,7:7,2:0,11,1,8
chr14	92185731	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:9,0,1,1
chr14	92264068	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:1,2:2,7:4,0,8,1
chr14	92264079	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.479:14:3,3:3,4:0|1:92264079_AT_A:92264079:7,0,6,1
chr14	92264080	.	TAA	T,TA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,31,30;MFRL=0,165,171;MMQ=60,60,60;MPOS=18,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.42,7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,6:0.272,0.647:8:0,0,4:0,2,1:0,0,7,1
chr14	92264081	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.528:14:3,2:2,4:0|1:92264079_AT_A:92264079:7,0,6,1
chr14	92268531	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr14	92336775	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.493:27:7,8:4,5:1,13,2,11
chr14	92343764	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr14	92409333	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=105,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:9,5:2,4:5,6,5,4
chr14	92440886	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.385:37:13,7:9,6:22,1,14,0
chr14	92441075	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,3:0.036:109:52,1:53,2:31,75,3,0
chr14	92441129	.	GAA	G,CAA	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=18,17,19;MFRL=150,223,162;MMQ=60,60,60;MPOS=25,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.26,4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,2,6:0.072,0.164:31:4,0,1:3,0,2:6,17,0,8
chr14	92454622	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:24,3:21,0:40,7,3,0
chr14	92466484	.	AAC	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.082:33:15,1:15,1:1,30,0,2
chr14	92478198	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,1:1,7:0,2,2,6
chr14	92562967	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,163;MMQ=40,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr14	92582472	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=106,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:2,0,4,2
chr14	92583781	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,6:4,8:10,0,14,0
chr14	92584021	.	C	CTTTT	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=T;STR;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.357:20:5,3:6,3:0,13,0,7
chr14	92584025	.	GT	G	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:12,1:10,2:0,25,0,3
chr14	92584064	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,6:6,3:0,10,0,9
chr14	92584067	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=167,175;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:5,2:0,16,0,2
chr14	92584075	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=167,175;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.241:19:8,1:5,3:0,15,0,4
chr14	92588155	.	ATTTT	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=41.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.455:29:8,8:3,5:3,13,0,13
chr14	92588192	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:0,8,0,6
chr14	92588219	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr14	92627668	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=173,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0|1:92627668_T_A:92627668:0,2,0,3
chr14	92627670	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=187,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1|0:92627668_T_A:92627668:0,4,0,1
chr14	92627672	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=187,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1|0:92627668_T_A:92627668:0,4,0,1
chr14	92627674	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=187,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1|0:92627668_T_A:92627668:0,4,0,1
chr14	92627676	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=187,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1|0:92627668_T_A:92627668:0,4,0,1
chr14	92905817	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,5:0,0,2,11
chr14	92922713	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,2,1
chr14	92923020	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr14	92923032	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr14	92952958	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:5,4:3,8:7,2,10,2
chr14	92958502	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,3:6,7:7,7,7,3
chr14	92958612	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:4,5:3,4,1,7
chr14	92959940	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=186,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,8:4,5:4,5,6,7
chr14	92960025	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr14	93043718	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:8,0:9,4,0,2
chr14	93107590	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=84,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:9,4:1,1:7,4,3,2
chr14	93118229	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=203,197;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr14	93154537	.	TGGC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr14	93170901	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=287,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,3,0
chr14	93180141	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.258:14:1,1:3,0:9,2,3,0
chr14	93182466	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:1,4,3,0
chr14	93276806	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr14	93285962	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=190,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,1:4,7:6,0,8,0
chr14	93290856	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,23:0.428:54:16,9:14,11:0|1:93290856_T_C:93290856:23,8,17,6
chr14	93290859	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,24:0.430:56:17,11:15,12:0|1:93290856_T_C:93290856:24,8,18,6
chr14	93303850	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=189,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:4,2:5,0:0|1:93303850_T_TG:93303850:2,7,1,2
chr14	93303851	.	TTTTG	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=22,35;MFRL=100,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTG;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:4,0:0,3:1,3,0,3
chr14	93303854	.	TG	CT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.232:11:4,2:4,0:0|1:93303850_T_TG:93303850:2,7,0,2
chr14	93399050	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=205,250;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr14	93401316	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=244,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr14	93412609	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	93429060	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,8:0,0,10,7
chr14	93460380	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:9,1:2,15,0,2
chr14	93649501	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,3:4,6:6,1,5,4
chr14	93686590	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,14;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.350:9:3,0:2,0:3,3,3,0
chr14	93693422	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr14	93727977	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=107,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:8,2,3,0
chr14	93954192	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	93962691	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=148.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,18:0,25:0,0,35,9
chr14	93994870	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:5,8:3,6:4,4,11,3
chr14	93998806	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr14	94008753	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr14	94038435	.	G	GGATTTGTGGTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94038435_G_GGATTTGTGGTC:94038435:0,3,0,1
chr14	94038437	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:94038435_G_GGATTTGTGGTC:94038435:0,3,0,1
chr14	94063949	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	94097287	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,4:0,8:0,0,4,9
chr14	94109829	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr14	94149070	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:0,3:4,4:1,3,1,6
chr14	94154918	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=13,29;MFRL=193,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr14	94160611	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=53,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.598:10:1,2:2,4:3,1,6,0
chr14	94245452	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=112,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr14	94419888	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:0,4,0,5
chr14	94420902	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,93;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr14	94423294	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:4,4,3,5
chr14	94423327	.	T	TGACA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GACA;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:0,2:5,1:0,5,1,2
chr14	94466081	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr14	94467507	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,3:4,3:6,4,6,0
chr14	94503664	.	CG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=195,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr14	94563193	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,3:3,3:3,0,7,0
chr14	94563438	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr14	94578162	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:1,1,1,3
chr14	94581285	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,4:6,6:3,8,2,8
chr14	94582130	.	T	TGGCCATGGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:3,2:2,0:2,3,3,0
chr14	94582926	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,1,3
chr14	94594768	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	94595989	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=122,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:4,7:1,3:0,5,0,10
chr14	94700138	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,15:0,0,2,25
chr14	94707192	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,2:10,1:1,23,0,3
chr14	94711136	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr14	94711822	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=229,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,2:0,2:2,0,4,0
chr14	94722748	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr14	94722764	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr14	94731910	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,7:7,3:0,11,0,10
chr14	94732107	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=170.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,28:0,19:0,0,40,8
chr14	94733474	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr14	94750292	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.649:26:6,8:2,9:5,4,13,4
chr14	94756750	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,3:3,3:3,0,3,3
chr14	94756794	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,6,5
chr14	94776401	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	94776441	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	94847550	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94847550_C_G:94847550:0,0,0,1
chr14	94847551	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94847550_C_G:94847550:0,0,0,1
chr14	94847554	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94847550_C_G:94847550:0,0,0,1
chr14	94914455	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr14	94929660	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:2,3,0,3
chr14	94930984	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr14	94931016	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr14	94933377	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr14	94936107	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,3:3,3:7,2,5,1
chr14	95029892	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=145,53;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:95029892_G_A:95029892:3,4,1,1
chr14	95029895	.	CA	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=145,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.283:9:2,0:4,2:0|1:95029892_G_A:95029892:3,4,1,1
chr14	95029899	.	A	ACAGG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:0|1:95029892_G_A:95029892:3,5,1,1
chr14	95033275	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=110,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:5,2,3,0
chr14	95057270	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,7:5,4:3,10,3,8
chr14	95058360	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=109,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,4:0,0:0,1,4,0
chr14	95058631	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr14	95078677	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,5,2
chr14	95078885	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=201,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:95078885_A_G:95078885:0,1,0,1
chr14	95078886	.	G	GTGCCTTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=201,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:95078885_A_G:95078885:0,1,0,1
chr14	95085707	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=165,126;MMQ=40,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:3,2:8,7:3,8,5,5
chr14	95088801	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=117,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.474:25:2,3:11,7:7,6,6,6
chr14	95556747	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr14	95566108	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,2:0,6:0,0,8,2
chr14	95571635	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:4,1:4,0:2,15,0,3
chr14	95581961	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,3:2,1:8,1,2,2
chr14	95593159	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=157,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:0,1:0|1:95593159_CAA_C:95593159:0,2,0,1
chr14	95593177	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=157,214;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:95593159_CAA_C:95593159:0,2,0,1
chr14	95593185	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,35;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr14	95670804	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=153,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:2,1:1,4,1,2
chr14	95670886	.	AT	GG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=213,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr14	95675883	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=154,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:0,0:7,2:0,7,0,2
chr14	95884323	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,2,8
chr14	95898351	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,6:3,1:4,2,6,1
chr14	95898486	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,7:1,2:2,3,3,6
chr14	95898487	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=165,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:2,9:0,3:1,1,4,8
chr14	95899773	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:0,7,1,7
chr14	95911008	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr14	95916228	.	G	GGCCC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:2,0:7,4:0|1:95916228_G_GGCCC:95916228:7,3,4,0
chr14	95916232	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:1,0:5,4:0|1:95916228_G_GGCCC:95916228:7,6,4,0
chr14	95916236	.	CAG	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=114,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:4,0:10,4:0|1:95916228_G_GGCCC:95916228:12,9,4,0
chr14	95916243	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.184:29:7,0:11,3:15,9,5,0
chr14	95918548	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:4,1:5,1,1,1
chr14	95923421	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:95923421_CA_C:95923421:0,0,1,0
chr14	95923444	.	CT	AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,14;MFRL=133,148;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:95923444_CT_AA:95923444:2,1,1,0
chr14	95923447	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,14;MFRL=133,148;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:95923421_CA_C:95923421:2,1,1,0
chr14	95923452	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,13;MFRL=133,148;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:95923444_CT_AA:95923444:2,1,1,0
chr14	95923470	.	ACTGTC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:2,2,1,0
chr14	95923749	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,14;MFRL=232,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:95923749_C_G:95923749:0,1,0,1
chr14	95923756	.	GGTGTGTGTGT	G,TGTGTGTGTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33,14;MFRL=0,232,127;MMQ=60,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,0:0,0,0,2
chr14	95923774	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=232,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95923749_C_G:95923749:0,1,0,1
chr14	95932223	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr14	95932599	.	GG	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:95932599_GG_CT:95932599:0,3,0,1
chr14	95932603	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=112,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:95932599_GG_CT:95932599:0,2,0,1
chr14	96131432	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,5:0,12:0,0,7,10
chr14	96134684	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=221,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,6:1,1:0,2,3,4
chr14	96134756	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,1,3
chr14	96135857	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,1:0,13:0,0,12,2
chr14	96137806	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:96137806_AG_A:96137806:0,3,0,1
chr14	96137808	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:96137806_AG_A:96137806:0,3,0,1
chr14	96152728	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr14	96157694	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.557:9:2,2:1,3:0|1:96157694_T_A:96157694:1,3,2,3
chr14	96157698	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:96157694_T_A:96157694:0,0,2,6
chr14	96703347	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,3:1,0:2,1,3,0
chr14	96756045	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,0:14,2:14,12,0,2
chr14	96757361	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=219,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr14	96761514	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,2:3,5:1,6,2,6
chr14	96761557	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=114,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,2,3
chr14	96770952	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33,19,31;MFRL=143,142,192,120;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,27,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=21.62,4.29,4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,10,3,3:0.464,0.179,0.178:19:2,7,0,0:0,3,1,2:0,3,0,16
chr14	96773280	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=214,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:2,0:0,1:0|1:96773280_G_A:96773280:0,2,0,1
chr14	96773287	.	T	TCCCAGCCCTGCTCTTCCTCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=214,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:96773280_G_A:96773280:0,2,0,1
chr14	96779533	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:9,2:7,0:4,12,1,1
chr14	96779865	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr14	96783464	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:7,4:7,4:12,2,6,2
chr14	96783727	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=209,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr14	96794877	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=201,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.333:12:4,2:3,2:5,3,2,2
chr14	96795997	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,6:4,5:0,6,1,10
chr14	96798551	.	GAA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:8,0:1,2:10,0,2,0
chr14	96800846	.	GA	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.155:36:14,3:12,2:2,29,0,5
chr14	96813703	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr14	96848581	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:96848581_C_A:96848581:1,0,1,0
chr14	96848583	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:96848581_C_A:96848581:1,0,1,0
chr14	96858667	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr14	96875317	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,5:5,6:1,8,1,10
chr14	96912999	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:8,0:3,2:1,10,0,2
chr14	96916228	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.614:26:1,7:5,7:2,8,2,14
chr14	96916232	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:3,0:0,8:0,3,0,15
chr14	96945044	.	G	GGCAGGCAGTCAGTTGCATAACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	96953482	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:96953482_TCA_T:96953482:0,3,0,1
chr14	96953486	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:96953482_TCA_T:96953482:0,3,0,1
chr14	97003499	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=208,1280;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,3:10,0:0,15,0,3
chr14	97022168	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:19,0,3,0
chr14	97026967	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:15,1:8,2:23,2,3,0
chr14	99182526	.	TGGATGCATC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:5,2:8,1,3,0
chr14	99640615	.	A	AGACGCTAAAGGGCCTTGTTATCATGGAAGCCATGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=185,58;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr14	99737651	.	TGCCGCC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=GCC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	99865548	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99865548_C_T:99865548:0,1,0,1
chr14	99865550	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99865548_C_T:99865548:0,1,0,1
chr14	99865559	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99865559_T_C:99865559:0,0,0,1
chr14	99865560	.	TTTTG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99865559_T_C:99865559:0,0,0,1
chr14	99961830	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=40,33;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:1,9:0,7:0,1,7,10
chr14	100002473	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,2,7
chr14	100118873	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:100118873_G_T:100118873:1,1,0,1
chr14	100118878	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:100118873_G_T:100118873:1,1,0,1
chr14	100119238	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=203,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,2:1,1:0,2,0,3
chr14	100126052	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr14	100166300	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,2,4
chr14	100172899	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	100192685	.	G	GGGGCTGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCTGCT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	100317376	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,3,1
chr14	100317472	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr14	100332060	.	A	AAACAAGAAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100332060_A_AAACAAGAAT:100332060:0,0,0,1
chr14	100332064	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=255,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:100332060_A_AAACAAGAAT:100332060:0,1,0,1
chr14	100332066	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=255,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100332060_A_AAACAAGAAT:100332060:0,1,0,1
chr14	100363671	.	GA	CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=10044076,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:1,1,1,2
chr14	100376715	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,0:3,2:1,6,0,2
chr14	100384032	.	TTGTG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=TG;STR;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.859:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr14	100384232	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=168,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:1,6,0,3
chr14	100387242	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr14	100402326	.	ATTG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=111,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:5,2,3,0
chr14	100404067	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr14	100404351	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	100405757	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr14	100592959	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr14	100599164	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr14	100613145	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,2:11,0:0|1:100613145_A_T:100613145:9,8,2,0
chr14	100613150	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:10,0:0|1:100613145_A_T:100613145:8,9,2,0
chr14	100792093	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=175,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:3,3:0,4:2,1,4,4
chr14	100792220	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr14	100795121	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.403:15:6,3:1,2:0|1:100795121_C_T:100795121:1,8,2,4
chr14	100795139	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,12:0.718:16:1,7:3,3:1|0:100795121_C_T:100795121:2,2,1,11
chr14	100795674	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	100801423	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr14	100803364	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr14	100813077	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr14	100847707	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:3,3:3,4:0,7,5,3
chr14	101004575	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=129,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	101198417	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,13,6
chr14	101200412	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	101200445	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr14	101201273	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	101340805	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=103,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,2:3,1:7,3,3,0
chr14	101347037	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.593:20:4,3:4,9:3,5,1,11
chr14	101350670	.	C	CTCT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=51.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,5:4,8:2,7,7,6
chr14	101488574	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=180,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:101488574_T_A:101488574:0,2,0,1
chr14	101488583	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=198,262;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101488574_T_A:101488574:0,1,0,1
chr14	101488585	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=198,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:101488574_T_A:101488574:0,1,0,1
chr14	101492548	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=222,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr14	101496145	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr14	101498483	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	101512972	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:101512972_C_T:101512972:0,6,0,2
chr14	101512974	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:0|1:101512972_C_T:101512972:0,6,0,2
chr14	101514371	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr14	101514950	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:2,5,1,3
chr14	101518760	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:8,4:4,6:8,5,3,8
chr14	101518910	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:1,6,1,3
chr14	101531798	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,48;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:9,8,2,0
chr14	102228198	.	GGGC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,6:5,0:8,1,6,0
chr14	102252330	.	T	C	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=294.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,83:0.989:83:0,38:0,43:0,0,71,12
chr14	102461691	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=165,191;MMQ=46,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,6:5,6:0,9,0,12
chr14	102461720	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,155;MMQ=35,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:11,0:5,3:0,16,0,3
chr14	102476130	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=148,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.195:24:10,2:9,2:15,5,3,1
chr14	102483731	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:10,2:15,0:14,12,2,0
chr14	102486378	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,1:7,1:4,11,0,2
chr14	102507065	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,1:2,9:3,6,2,8
chr14	102516147	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,1:1,2:3,4,0,3
chr14	102548224	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr14	102548384	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,16:0,7:0,0,23,1
chr14	102549839	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr14	102550069	.	T	TAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.279:24:12,1:2,1:11,6,3,4
chr14	102551160	.	ATCT	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,116;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TCT;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.065:58:34,1:19,2:34,21,1,2
chr14	102551795	.	T	TTAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAA;STR;TLOD=74.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr14	102552773	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=133.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,12:0,17:0|1:102552773_A_G:102552773:0,0,2,29
chr14	102552775	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=133.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,14:0,16:0|1:102552773_A_G:102552773:0,0,2,29
chr14	102676274	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102676274_G_T:102676274:0,1,0,1
chr14	102676276	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102676274_G_T:102676274:0,1,0,1
chr14	102676281	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=15,30;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:102676274_G_T:102676274:0,1,0,1
chr14	102676283	.	G	GAGAGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102676274_G_T:102676274:0,1,0,1
chr14	102808554	.	CGTGGA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0|1:102808554_CGTGGA_C:102808554:0,0,0,9
chr14	102808562	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:102808554_CGTGGA_C:102808554:0,0,0,9
chr14	102816413	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:3,4:5,4:0|1:102816413_A_G:102816413:1,8,1,7
chr14	102816417	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.527:17:4,5:4,4:0|1:102816413_A_G:102816413:0,8,1,8
chr14	102891646	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,3,14
chr14	102894559	.	G	GTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=180,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=22,24;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.447:10:2,2:3,2:5,0,1,4
chr14	102894593	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=180.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,30:0,22:0,0,20,39
chr14	102901335	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:1,0:4,4:2,4,0,4
chr14	102904572	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=228,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:102904572_C_G:102904572:0,2,0,1
chr14	102904574	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=228,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:102904572_C_G:102904572:0,2,0,1
chr14	102904577	.	T	TATCTGTGGACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=158,298;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	102918686	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr14	102931688	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	102964408	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:5,0,3,3
chr14	102973402	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	103177420	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,2:7,10:0,12,0,12
chr14	103192774	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:103192774_CTTT_C:103192774:3,0,1,0
chr14	103192801	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,14;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.251:6:0,0:3,0:0|1:103192774_CTTT_C:103192774:4,1,1,0
chr14	103397055	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr14	103400111	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.234:14:2,0:7,0:8,3,0,3
chr14	103400117	.	TC	GG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:1,0:7,2:9,6,0,2
chr14	103400121	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.220:15:2,0:7,0:8,4,0,3
chr14	103434530	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr14	103440282	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0,0,13,1
chr14	103570812	.	A	ATCTCCAAGCTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=224,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	103595997	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,13,0
chr14	103596488	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr14	103596609	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr14	103597565	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr14	103599938	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr14	103802527	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:8,4:7,7:0,15,1,10
chr14	103802918	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:0,0:4,3:4,0,3,0
chr14	103805894	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:103805894_G_T:103805894:6,0,2,0
chr14	103805899	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:103805894_G_T:103805894:6,0,2,0
chr14	103805947	.	ATTG	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:5,3,5,1
chr14	103806219	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,4:2,0:0,5,0,4
chr14	103915215	.	GTGTT	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,16:0.436:37:7,8:13,8:0|1:103915215_GTGTT_G:103915215:21,0,16,0
chr14	103915225	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,17:0.421:41:8,6:15,9:0|1:103915215_GTGTT_G:103915215:22,2,17,0
chr14	103915242	.	GT	G	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.129:44:18,1:17,4:33,6,5,0
chr14	103918182	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr14	103923414	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,8:4,5:9,1,13,0
chr14	103928657	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr14	103933341	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr14	103934488	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,10:0,0,4,17
chr14	103946636	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,12,0
chr14	103964807	.	AT	A,ATT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,33,32;MFRL=132,187,132;MMQ=60,60,60;MPOS=11,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.75,21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,3,13:0.124,0.458:28:6,1,5:4,2,7:11,1,15,1
chr14	103964832	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.086:55:19,0:10,0:34,17,4,0
chr14	103987857	.	T	TAGCAGTTCGATCTCAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	103988325	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=29,10;MFRL=248,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.509:6:1,0:2,0:0|1:103988325_G_C:103988325:2,1,3,0
chr14	103988326	.	G	GCCCCC	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=248,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,9;RU=C;STR;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.509:6:1,1:2,2:0|1:103988325_G_C:103988325:2,1,3,0
chr14	103988335	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=27,12;MFRL=211,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.509:6:1,0:1,0:0|1:103988325_G_C:103988325:2,1,3,0
chr14	103988338	.	CGG	C	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.451:7:2,1:1,1:0|1:103988325_G_C:103988325:2,2,3,0
chr14	103988344	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=28,32;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:1,2:0|1:103988325_G_C:103988325:4,2,3,0
chr14	103988348	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=27,32;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,1:2,2:0|1:103988325_G_C:103988325:6,2,3,0
chr14	103988349	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=32,12;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,1:2,0:0|1:103988325_G_C:103988325:6,2,3,0
chr14	103988356	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=27,31;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:0|1:103988325_G_C:103988325:6,2,3,0
chr14	103988358	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=28,31;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,1:1,2:0|1:103988325_G_C:103988325:6,2,3,0
chr14	103988361	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=30,13;MFRL=159,209;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,0:1,0:0|1:103988325_G_C:103988325:6,1,2,0
chr14	103996733	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=190,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr14	104028196	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:2,3:8,1:8,2,3,1
chr14	104029507	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=199,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104029507_G_GGA:104029507:0,1,0,1
chr14	104029511	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=199,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:104029507_G_GGA:104029507:0,1,0,1
chr14	104038246	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=144,210;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr14	104040414	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr14	104053764	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,2:5,10:0,12,0,12
chr14	104129352	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:3,4:0,9,0,9
chr14	104135966	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:1,8,1,4
chr14	104136469	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr14	104136633	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,3:2,3,3,4
chr14	104136663	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=190,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:104136663_T_C:104136663:0,2,0,1
chr14	104136666	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=190,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:104136663_T_C:104136663:0,2,0,1
chr14	104136669	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=190,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:104136663_T_C:104136663:0,2,0,1
chr14	104136673	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=190,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:104136663_T_C:104136663:0,2,0,1
chr14	104136675	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=190,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:104136663_T_C:104136663:0,2,0,1
chr14	104139570	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr14	104143928	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr14	104145625	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:104145625_GT_G:104145625:0,0,2,0
chr14	104145642	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:104145625_GT_G:104145625:1,0,2,0
chr14	104151400	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.560:30:7,10:6,6:3,10,3,14
chr14	104165927	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,3:6,2:1,5,2,3
chr14	104193099	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,8:0,0,9,8
chr14	104193296	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:104193296_T_TG:104193296:0,0,0,2
chr14	104193299	.	T	TTTTTAGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:104193296_T_TG:104193296:0,0,0,2
chr14	104195415	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.422:36:9,12:12,3:10,11,7,8
chr14	104195610	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr14	104198881	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=219,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr14	104198903	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,1:0,2:2,1,5,0
chr14	104201620	.	C	CCGAGGAACAAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr14	104202304	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr14	104203938	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr14	104209088	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:9,10,1,1
chr14	104212624	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,14;MFRL=238,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.516:4:1,0:0,0:0|1:104212624_A_C:104212624:2,0,2,0
chr14	104212628	.	T	TGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=296,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,19;RU=G;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.632:3:1,0:0,2:0|1:104212624_A_C:104212624:1,0,2,0
chr14	104212949	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr14	104216293	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,1,25
chr14	104219578	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.537:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr14	104220530	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=112,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:10,8:5,7:7,8,7,8
chr14	104220649	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=201,246;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0,4,0,1
chr14	104251276	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,5:1,0:0,2,1,4
chr14	104381318	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr14	104381589	.	GAT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=154,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:104381589_GAT_G:104381589:0,3,0,1
chr14	104381594	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=154,209;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:104381589_GAT_G:104381589:0,3,0,1
chr14	104394835	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=90.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,16:0,0,20,7
chr14	104394850	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.538:35:4,9:12,9:9,7,10,9
chr14	104422116	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,5:7,6:2,9,2,9
chr14	104429453	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,9,8
chr14	104433239	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,1:1,1:1,3,0,2
chr14	104465037	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,5,11
chr14	104470698	.	GTTTATTTATTTA	G,GTTTATTTA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33,32;MFRL=215,135,156;MMQ=60,60,60;MPOS=29,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,6,8;RU=TTTA;STR;TLOD=23.06,10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,3:0.483,0.357:10:1,2,2:0,4,1:0,1,0,9
chr14	104470763	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr14	104473253	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,0:2,4:0,7,0,4
chr14	104481016	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	104482524	.	C	CTTGACACAGTTGATTGCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=227,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr14	104484587	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=178,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr14	104491113	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:104491113_A_AT:104491113:0,4,0,1
chr14	104491118	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:104491113_A_AT:104491113:0,3,0,1
chr14	104498472	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr14	104498530	.	ATCTTT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=207,225;MMQ=60,55;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCTTT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr14	104500427	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,12,15
chr14	104501443	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	104516087	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,1:2,7:1,5,0,8
chr14	104518453	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=191,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr14	104561998	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,1,2
chr14	104563874	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=49,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:3,3:0,1:3,1,4,0
chr14	104569801	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr14	104570904	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr14	104571820	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=84,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:0|1:104571820_C_G:104571820:1,5,0,3
chr14	104571826	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:104571820_C_G:104571820:0,0,1,8
chr14	104573690	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,1,13
chr14	104575466	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr14	104578753	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:10,3:2,0:10,2,2,1
chr14	104618824	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=32,20;MFRL=250,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:104618824_A_T:104618824:0,1,1,1
chr14	104618825	.	G	GTC	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=32,20;MFRL=250,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:104618824_A_T:104618824:0,1,1,1
chr14	104618829	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=33,29;MFRL=250,63;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:104618824_A_T:104618824:0,1,1,1
chr14	104618832	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=32,35;MFRL=250,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:104618824_A_T:104618824:0,1,0,1
chr14	104618835	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=31,34;MFRL=250,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:104618824_A_T:104618824:0,1,0,1
chr14	104618836	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=250,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:104618824_A_T:104618824:0,1,0,1
chr14	104618838	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=250,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:104618824_A_T:104618824:0,1,0,1
chr14	104618841	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=16,32;MFRL=250,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:104618824_A_T:104618824:0,1,0,1
chr14	104618846	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=250,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:104618824_A_T:104618824:0,1,0,1
chr14	104618848	.	TG	GC	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=250,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:104618824_A_T:104618824:0,1,0,1
chr14	104624342	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.371:16:4,3:6,1:2,8,1,5
chr14	105054709	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.725:8:0,3:1,2:0,2,0,6
chr14	105063253	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr14	105172546	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:1,4:2,3:1,2,1,7
chr14	105173862	.	ACCCCAC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=94,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCCCAC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr14	105177351	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,4:0,9:0,0,8,6
chr14	105178089	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:105178089_T_C:105178089:0,0,0,8
chr14	105178098	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:105178089_T_C:105178089:0,0,0,8
chr14	105179081	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr14	105179463	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr14	105179668	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=190,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:2,1:2,2:2,3,1,2
chr14	105180484	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr14	105209378	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=115,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,3:2,4:7,2,4,3
chr14	105225924	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	105238820	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:1,3,1,6
chr14	105240195	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=21,13;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.386:13:1,1:3,0:8,0,5,0
chr14	105240209	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=16,12;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.420:12:0,0:3,1:7,0,5,0
chr14	105258892	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr14	105269498	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=144,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:5,5:6,11:8,3,11,5
chr14	105270484	.	G	GT	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=60,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.565:10:0,3:2,3:2,2,5,1
chr14	105270485	.	G	T,GT	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=27,14,35;MFRL=178,0,179;MMQ=60,60,60;MPOS=9,24;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.17,13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,6:0.384,0.558:10:1,0,3:0,1,2:1,0,6,3
chr14	105344293	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=84,97;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:5,0:1,3:0|1:105344293_C_T:105344293:3,3,2,1
chr14	105344318	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=110,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:2,2,0,2
chr14	105344331	.	G	GGTTCAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:105344293_C_T:105344293:2,1,0,1
chr14	105344347	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr14	105344872	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr14	105349877	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=121,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:105349877_C_T:105349877:1,0,0,2
chr14	105349886	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=121,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:105349877_C_T:105349877:1,0,0,2
chr14	105349891	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=121,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:105349877_C_T:105349877:1,0,0,2
chr14	105349897	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:105349877_C_T:105349877:1,1,0,2
chr14	105351637	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=180,162;MMQ=60,52;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:7,1,2,0
chr14	105351673	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.428:14:5,2:3,3:6,2,4,2
chr14	105352391	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=196,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:105352391_G_A:105352391:0,1,1,1
chr14	105352393	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=196,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:105352391_G_A:105352391:0,1,1,1
chr14	105352394	.	C	CATTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=196,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:105352391_G_A:105352391:0,1,1,1
chr14	105352884	.	CGCAGGA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=203,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,1,0
chr14	105353824	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,3:6,0:2,8,1,2
chr14	105356137	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=122,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:3,2,0,6
chr14	105359306	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,1:0,2:6,1,3,0
chr14	105359827	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr14	105360746	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:1,2,1,2
chr14	105404370	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=130,72;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:13,0:7,3:17,3,2,1
chr14	105406278	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	105410784	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.406:37:10,9:12,5:9,13,7,8
chr14	105415597	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=173,143;MMQ=49,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:11,8:7,6:9,9,5,9
chr14	105415643	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=130,162;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.473:28:10,9:3,4:4,11,6,7
chr14	105421107	.	C	CTGTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105421107_C_CTGTT:105421107:0,1,0,1
chr14	105421109	.	C	CTCTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105421107_C_CTGTT:105421107:0,1,0,1
chr14	105421113	.	G	GTATT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105421107_C_CTGTT:105421107:0,1,0,1
chr14	105421114	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,35;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105421107_C_CTGTT:105421107:0,1,0,1
chr14	105421116	.	C	CTGTCTTTTTAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,35;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105421107_C_CTGTT:105421107:0,1,0,1
chr14	105421122	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:105421107_C_CTGTT:105421107:1,1,0,1
chr14	105455525	.	G	GAACTGACAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=99,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr14	105457771	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr14	105612885	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,3:4,2:1,5,2,4
chr14	105615026	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr14	105618729	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	105622056	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr14	105644151	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,2,0
chr14	105715543	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	105717448	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=219,261;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr14	105722726	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr14	105722976	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=132,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr14	105847240	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:1,1,5,1
chr14	105851161	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=15,10;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:0,0:2,0:0|1:105851161_G_C:105851161:4,0,4,0
chr14	105851167	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=30,12;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.546:7:0,0:2,0:0|1:105851161_G_C:105851161:1,2,4,0
chr14	105851173	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.546:7:0,1:2,2:0|1:105851161_G_C:105851161:1,2,4,0
chr14	105851176	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=34,13;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.537:7:0,0:2,0:0|1:105851176_T_A:105851176:0,3,4,0
chr14	105851180	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,12;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.391:10:0,0:3,1:0|1:105851176_T_A:105851176:0,6,4,0
chr14	105851183	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.391:10:1,0:5,0:0|1:105851176_T_A:105851176:0,6,4,0
chr14	105851187	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=32,13;MFRL=172,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,0:0|1:105851176_T_A:105851176:0,7,2,0
chr14	105851374	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.445:21:3,2:6,7:2,10,1,8
chr14	105886314	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:105886314_G_C:105886314:0,0,1,0
chr14	105886322	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:105886314_G_C:105886314:0,0,1,0
chr14	105886327	.	GA	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:105886314_G_C:105886314:0,0,1,0
chr14	105905126	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	105912126	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,30;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0,3,0,1
chr14	105924538	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr14	105924786	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr14	105927320	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,0:8,2:1,13,0,2
chr14	105930522	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,253;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:19,2:9,0:0,29,0,2
chr14	105930923	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr14	105931585	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr14	105935721	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr14	105936100	.	A	ACCTTGGCTGGTGGCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,2:0,0,9,0
chr14	105936271	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,2:12,0:10,9,1,1
chr14	105945605	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	105945891	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,8:0,7:0,0,5,12
chr14	105953474	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,27,0
chr14	105957477	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:3,1:6,4,0,2
chr14	105995853	.	GTGGCCGTGC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,14;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,0,1
chr14	105996126	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr14	106050432	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=202,148;MMQ=39,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr14	106067618	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr14	106090741	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=202,223;MMQ=25,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr14	106090743	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=223,202;MMQ=40,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr14	106090767	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=212,149;MMQ=43,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,2:2,2:0|1:106090767_C_T:106090767:5,1,4,0
chr14	106090774	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=201,164;MMQ=45,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,3:3,1:0|1:106090767_C_T:106090767:6,3,5,1
chr14	106090783	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=201,146;MMQ=45,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.373:14:5,3:4,2:0|1:106090767_C_T:106090767:6,3,4,1
chr14	106109493	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,276;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr14	106110330	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr14	106170666	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=173,177;MMQ=45,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr14	106170671	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=177,171;MMQ=27,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,0:2,4:2,0,4,0
chr14	106170722	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,33;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr14	106174221	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:2,6:7,4:0,9,2,8
chr14	106174518	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr14	106174654	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,108;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr14	106206543	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,185;MMQ=24,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:9,3:5,2:4,10,0,5
chr14	106207763	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=306,177;MMQ=24,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,4:0,3:1,0,7,1
chr14	106207805	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=127,229;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,2,0
chr14	106207822	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=131,230;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:0,5,6,0
chr14	106209031	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:6,0,6,0
chr14	106234293	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,208;MMQ=24,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:106234293_A_G:106234293:0,3,1,1
chr14	106234314	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=140,196;MMQ=24,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,2:0,1:0|1:106234293_A_G:106234293:0,1,1,2
chr14	106235567	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=138,122;MMQ=60,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:8,2:4,4:0|1:106235567_G_A:106235567:11,1,6,0
chr14	106235569	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=138,122;MMQ=60,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,2:2,4:0|1:106235567_G_A:106235567:11,1,6,0
chr14	106235966	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=151,169;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,4:4,6:3,4,7,3
chr14	106236000	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=161,133;MMQ=49,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.544:24:6,4:3,8:8,3,10,3
chr14	106237105	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,12:0,0,4,24
chr14	106237811	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr14	106303573	.	AGG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,29;MFRL=149,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:1,1:0|1:106303573_AGG_A:106303573:0,2,0,1
chr14	106303578	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=149,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:106303573_AGG_A:106303573:0,2,0,1
chr14	106303581	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=149,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:106303573_AGG_A:106303573:0,2,0,1
chr14	106303583	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=149,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0|1:106303573_AGG_A:106303573:0,2,0,1
chr14	106303699	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.643:15:3,3:2,5:4,1,10,0
chr14	106303948	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,5,3
chr14	106304899	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=13,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.700:4:0,2:0,0:0,1,0,3
chr14	106307054	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=162,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr14	106318248	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,9:5,5:6,3,11,3
chr14	106318440	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0|1:106318440_T_C:106318440:0,0,8,1
chr14	106318450	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0|1:106318440_T_C:106318440:0,0,8,1
chr14	106322388	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr14	106329919	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,1:2,5:6,0,6,0
chr14	106330320	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,16,3
chr14	106330370	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=191.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,32:0,22:0,0,40,15
chr14	106346795	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr14	106346990	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.653:12:3,6:0,1:0,4,0,8
chr14	106347420	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.508:47:17,9:6,14:8,15,11,13
chr14	106347467	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=100.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,14:0,0,6,21
chr14	106349827	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=124,151;MMQ=41,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.654:29:4,9:5,10:2,8,4,15
chr14	106349884	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=197,9289;MMQ=60,33;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,1:5,1:0|1:106349884_G_A:106349884:0,12,0,2
chr14	106349889	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=197,9289;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:5,1:0|1:106349884_G_A:106349884:0,12,0,2
chr14	106349893	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=198,9289;MMQ=60,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,1:3,1:0|1:106349884_G_A:106349884:0,11,0,2
chr14	106350623	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,7:1,3:3,0,10,0
chr14	106354325	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:7,1,6,2
chr14	106354334	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,10:0,5:0,0,12,3
chr14	106354343	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,7:6,4:6,4,7,4
chr14	106354353	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=106,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.433:32:10,5:7,7:11,7,7,7
chr14	106354531	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=59,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr14	106356922	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=212,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,1:0,4:3,0,5,0
chr14	106356974	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:4,1,3,1
chr14	106357202	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr14	106357446	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:5,4:8,4:0|1:106357446_G_A:106357446:12,2,9,1
chr14	106357467	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:7,6:8,10:0|1:106357446_G_A:106357446:12,4,13,4
chr14	106357470	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:8,6:8,11:0|1:106357446_G_A:106357446:12,4,13,4
chr14	106357527	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,20:0.409:49:14,7:15,12:13,16,7,13
chr14	106357644	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=135,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,4:3,6:0,6,0,10
chr14	106357673	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:2,2:0,5,0,4
chr14	106359259	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr14	106359285	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=177,149;MMQ=51,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr14	106359327	.	GC	AG	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=149,155;MMQ=36,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,4:0,2,6,3
chr14	106359348	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=167,149;MMQ=40,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:3,1:5,4,0,2
chr14	106359388	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=173,149;MMQ=40,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:4,5,0,2
chr14	106360231	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,1:3,4:8,0,5,0
chr14	106360281	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:7,4:7,9:12,2,11,2
chr14	106360292	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:6,4:10,11:14,2,13,2
chr14	106361376	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:8,0,8,0
chr14	106361418	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,23,2
chr14	106361515	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,28:0.484:58:18,17:12,11:15,15,10,18
chr14	106361561	.	GC	AT	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=179.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,24:0,15:0|1:106361561_GC_AT:106361561:0,0,15,26
chr14	106361564	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=176.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.976:40:0,22:0,16:0|1:106361561_GC_AT:106361561:0,0,15,25
chr14	106361605	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=134,161;MMQ=45,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,6:5,4:1,9,0,10
chr14	106361616	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=29,34;MFRL=134,161;MMQ=50,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:4,5:4,4:0|1:106361616_A_C:106361616:0,8,0,9
chr14	106361619	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=134,161;MMQ=50,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.520:17:4,5:4,4:0,8,0,9
chr14	106361624	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=134,161;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:4,5:4,3:0|1:106361616_A_C:106361616:0,8,0,9
chr14	106361653	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=145,161;MMQ=45,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr14	106363962	.	TGAAACTCAGG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:106363962_TGAAACTCAGG_T:106363962:0,1,0,1
chr14	106363978	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:106363962_TGAAACTCAGG_T:106363962:0,0,0,1
chr14	106368526	.	C	T	.	.	DP=117;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=128,124;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,16:0.145:115:52,13:43,3:0|1:106368526_C_T:106368526:51,48,4,12
chr14	106368542	.	T	C	.	.	DP=97;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=128,126;MMQ=60,41;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,10:0.111:97:49,7:35,2:0|1:106368526_C_T:106368526:41,46,3,7
chr14	106368544	.	G	C	.	.	DP=97;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=128,126;MMQ=60,41;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,10:0.111:97:49,7:31,2:0|1:106368526_C_T:106368526:41,46,3,7
chr14	106368551	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=129,126;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,8:0.108:81:40,6:26,2:0|1:106368526_C_T:106368526:35,38,3,5
chr14	106368604	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=138,159;MMQ=40,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=129.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,31:0.915:33:2,17:0,12:0|1:106368604_A_G:106368604:0,2,0,31
chr14	106368614	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=138,165;MMQ=40,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,30:0.912:32:2,17:0,12:0|1:106368604_A_G:106368604:0,2,0,30
chr14	106369335	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr14	106369395	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:6,8:9,3:12,3,11,1
chr14	106369534	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:1,13:0,9:0,1,4,18
chr14	106370370	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:8,6:10,10:10,8,10,6
chr14	106375638	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr14	106375721	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=214,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,6,0
chr14	106375847	.	G	GGCAGGTGCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.375:3:1,0:1,1:0|1:106375847_G_GGCAGGTGCT:106375847:2,0,0,1
chr14	106375855	.	CT	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:106375847_G_GGCAGGTGCT:106375847:1,0,0,1
chr14	106376144	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,4:4,6:10,0,10,0
chr14	106376354	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,4,17
chr14	106378962	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,5:4,3:12,0,7,1
chr14	106379020	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.459:48:12,10:13,11:14,12,10,12
chr14	106380171	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.534:28:7,9:6,6:0|1:106380171_C_T:106380171:8,5,10,5
chr14	106380174	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=111.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0|1:106380171_C_T:106380171:0,0,18,10
chr14	106385233	.	AC	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0|1:106385233_AC_GT:106385233:0,0,3,0
chr14	106385245	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:106385233_AC_GT:106385233:0,0,3,0
chr14	106387171	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=124,140;MMQ=50,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.565:27:4,7:5,8:2,10,0,15
chr14	106388588	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr14	106452628	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,19,0
chr14	106471353	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=14;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=313.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,92:0.990:92:0,45:0,46:0,0,51,41
chr14	106471388	.	C	A	.	.	DP=92;ECNT=14;MBQ=33,30;MFRL=55,145;MMQ=41,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=278.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,88:0.968:90:1,32:1,49:1,1,45,43
chr14	106471410	.	T	C	.	.	DP=114;ECNT=14;MBQ=31,30;MFRL=140,92;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:100,11:0.106:111:44,3:52,5:0|1:106471410_T_C:106471410:43,57,7,4
chr14	106471417	.	G	A	.	.	DP=116;ECNT=14;MBQ=29,31;MFRL=140,106;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,14:0.127:116:43,4:52,10:0|1:106471410_T_C:106471410:41,61,7,7
chr14	106471426	.	G	T	.	.	DP=124;ECNT=14;MBQ=32,29;MFRL=143,106;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,18:0.151:124:43,6:58,10:0|1:106471410_T_C:106471410:39,67,10,8
chr14	106471437	.	G	T	.	.	DP=137;ECNT=14;MBQ=33,29;MFRL=145,111;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,24:0.188:131:46,9:56,13:0|1:106471410_T_C:106471410:35,72,11,13
chr14	106471509	.	C	A	.	.	DP=83;ECNT=14;MBQ=33,25;MFRL=159,118;MMQ=40,34;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,8:0.117:74:31,4:32,4:0|1:106471509_C_A:106471509:39,27,1,7
chr14	106471515	.	C	A	.	.	DP=71;ECNT=14;MBQ=33,29;MFRL=159,109;MMQ=40,29;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,6:0.095:71:24,0:32,2:0|1:106471509_C_A:106471509:40,25,1,5
chr14	106471522	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=14;MBQ=33,33;MFRL=161,109;MMQ=40,32;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:25,0:28,2:0|1:106471509_C_A:106471509:39,17,0,2
chr14	106471528	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=14;MBQ=34,32;MFRL=109,159;MMQ=32,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=231.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,53:0.948:55:0,23:2,27:0|1:106471528_C_A:106471528:0,2,35,18
chr14	106471534	.	A	C,G	.	.	DP=60;ECNT=14;MBQ=0,34,34;MFRL=0,109,166;MMQ=60,32,40;MPOS=6,18;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.25,254.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,58:0.048,0.937:60:0,0,28:0,2,30:0,0,38,22
chr14	106471547	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=14;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=255.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,60:0.984:60:0,30:0,29:0|1:106471528_C_A:106471528:0,0,41,19
chr14	106471580	.	GC	TT	.	.	DP=78;ECNT=14;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=330.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,75:0.987:75:0,31:0,38:0|1:106471580_GC_TT:106471580:0,0,45,30
chr14	106471595	.	T	C	.	.	DP=85;ECNT=14;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=349.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,83:0.988:83:0,40:0,41:0|1:106471580_GC_TT:106471580:0,0,52,31
chr14	106478074	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=149,225;MMQ=27,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:7,0,2,0
chr14	106478311	.	A	ACCACTG	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=168,139;MMQ=43,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=92.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.916:26:0,10:2,11:0,2,8,16
chr14	106478334	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=140,187;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.389:24:5,6:8,3:0,15,9,0
chr14	106478354	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=170,185;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:3,8:8,5:0,12,13,0
chr14	106478355	.	CC	GT	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=186,169;MMQ=39,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:8,4:6,7:13,1,0,11
chr14	106478442	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=148,220;MMQ=51,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,0:15,2:0|1:106478442_G_A:106478442:24,9,0,2
chr14	106478445	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=148,220;MMQ=51,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:14,0:16,2:0|1:106478442_G_A:106478442:24,9,0,2
chr14	106478464	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=201,151;MMQ=40,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=167.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,51:0.963:52:0,26:1,24:0,1,31,20
chr14	106478513	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=163,144;MMQ=31,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,49:0.927:52:2,22:1,26:2,1,25,24
chr14	106478637	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=78.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,3,21
chr14	106494080	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=155,167;MMQ=60,38;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,6:0.109:62:27,3:25,3:0|1:106494080_A_C:106494080:53,3,6,0
chr14	106494099	.	T	C	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=141,167;MMQ=60,38;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,6:0.074:93:38,3:42,3:0|1:106494080_A_C:106494080:71,16,6,0
chr14	106494112	.	T	C	.	.	DP=109;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=131,167;MMQ=60,38;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:103,6:0.063:109:41,2:39,3:0|1:106494080_A_C:106494080:74,29,6,0
chr14	106518738	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,141;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,21:0.453:47:11,8:13,13:16,10,15,6
chr14	106518930	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,218;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:0,8,0,4
chr14	106573311	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=132,183;MMQ=55,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.217:44:19,5:16,4:27,8,7,2
chr14	106573352	.	A	T	.	.	DP=59;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=140,157;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,13:0.233:58:22,5:21,8:0|1:106573352_A_T:106573352:22,23,13,0
chr14	106573354	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=134,157;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,13:0.226:60:23,5:20,8:0|1:106573352_A_T:106573352:24,23,13,0
chr14	106573357	.	GT	TA	.	.	DP=59;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=133,157;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,13:0.229:59:23,5:20,8:0|1:106573352_A_T:106573352:23,23,13,0
chr14	106573364	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=132,147;MMQ=52,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,12:0.255:49:17,5:17,6:0|1:106573352_A_T:106573352:14,23,11,1
chr14	106573559	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=130,155;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.490:47:15,13:9,10:21,3,19,4
chr14	106622428	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,38;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr14	106667902	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,2:0,0,3,4
chr14	106668098	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr14	106668130	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr14	106668156	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,21;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:106668156_CCA_C:106668156:0,0,0,1
chr14	106668160	.	C	CATT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:106668156_CCA_C:106668156:0,0,0,1
chr14	106691620	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr14	106725145	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=224,210;MMQ=57,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:3,1:0,0:4,0,2,0
chr14	106780996	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,160;MMQ=40,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:20,2:17,1:14,23,1,2
chr14	106790937	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=173,127;MMQ=51,20;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr14	106790979	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=128,127;MMQ=45,22;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:4,0:0|1:106790979_G_T:106790979:6,2,2,0
chr14	106790984	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=128,127;MMQ=45,23;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:2,3:6,0:0|1:106790979_G_T:106790979:6,2,2,1
chr14	106791006	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,43;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,12,10
chr14	106791009	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=27,29;MFRL=132,127;MMQ=46,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,3:9,0:10,8,1,2
chr14	106791044	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=136,127;MMQ=47,23;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:15,3:9,0:0|1:106791044_G_A:106791044:14,10,0,3
chr14	106791048	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=136,127;MMQ=47,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:15,3:9,0:0|1:106791044_G_A:106791044:14,10,0,3
chr14	106791056	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=137,127;MMQ=43,22;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:5,0:0|1:106791044_G_A:106791044:12,11,0,2
chr14	106791065	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=30,31;MFRL=136,127;MMQ=40,22;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:17,2:7,0:0|1:106791044_G_A:106791044:14,10,0,2
chr14	106805282	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=141,204;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:11,0:13,2:20,5,1,1
chr14	106805299	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=129,171;MMQ=60,31;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:17,2:16,2:25,9,4,0
chr14	106805343	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=9;MBQ=29,35;MFRL=115,144;MMQ=60,32;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.152:44:16,3:19,3:22,16,6,0
chr14	106805380	.	GT	TG	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=118,124;MMQ=60,31;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:18,4:15,4:0|1:106805380_GT_TG:106805380:14,19,5,3
chr14	106805386	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=9;MBQ=34,33;MFRL=138,125;MMQ=60,31;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,9:0.256:37:14,4:12,5:0|1:106805380_GT_TG:106805380:14,14,5,4
chr14	106805402	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=9;MBQ=30,34;MFRL=144,125;MMQ=60,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.293:39:13,4:14,7:10,18,5,6
chr14	106805439	.	TA	CG	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=148,163;MMQ=47,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.315:30:10,6:9,3:4,17,4,5
chr14	106805440	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,11:0,0,8,21
chr14	106805481	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=149,218;MMQ=40,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:8,2:0,1:0|1:106805481_G_A:106805481:3,6,1,2
chr14	106805485	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=28,30;MFRL=149,218;MMQ=40,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:7,2:1,1:0|1:106805481_G_A:106805481:3,6,1,2
chr14	106805508	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr14	106805695	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=130,160;MMQ=40,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:19,2:9,3:13,15,1,4
chr14	106805729	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=146,161;MMQ=60,53;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:17,1:7,3:4,21,0,4
chr14	106805772	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr14	106815662	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr14	106816057	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,183;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr14	106845308	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,156;MMQ=60,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,4,0
chr14	106877551	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr14	106877591	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=198,143;MMQ=60,32;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:12,1,2,0
chr14	106877622	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=146,164;MMQ=43,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,3:5,7:11,1,8,2
chr14	106877637	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=156,107;MMQ=60,31;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:9,4:11,2:17,4,4,2
chr14	106926146	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=139,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:5,3,6,1
chr14	106926323	.	A	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=88.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,30:0.608:49:9,13:10,17:8,11,19,11
chr14	106993722	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr14	107012852	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr14	107034705	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:107034705_G_A:107034705:6,1,2,0
chr14	107034707	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:107034705_G_A:107034705:6,1,2,0
chr14	107034807	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.179:18:6,1:9,2:10,5,2,1
chr14	107034846	.	TC	GT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:12,2:7,2:0|1:107034846_TC_GT:107034846:8,12,2,2
chr14	107034854	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:14,2:7,3:0|1:107034846_TC_GT:107034846:7,14,4,3
chr14	107034863	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:14,2:7,3:0|1:107034846_TC_GT:107034846:7,14,4,2
chr14	107034869	.	AG	CA	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:13,1:7,3:0|1:107034846_TC_GT:107034846:6,15,3,1
chr14	107034873	.	GA	CC	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.162:29:12,1:8,3:0|1:107034846_TC_GT:107034846:8,17,3,1
chr14	107035002	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,2:11,2:8,12,2,3
chr14	107035020	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:11,2:10,4:10,11,2,4
chr14	107035038	.	GG	AT	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=35,29;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:12,3:6,5:0|1:107035038_GG_AT:107035038:10,8,4,4
chr14	107035042	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=34,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:12,3:7,5:0|1:107035038_GG_AT:107035038:10,9,4,4
chr14	107035064	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=34,31;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:10,2:7,4:0|1:107035064_G_A:107035064:10,9,3,3
chr14	107035066	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=34,30;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:10,2:7,4:0|1:107035064_G_A:107035064:10,9,3,3
chr14	107035068	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=34,32;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:10,2:5,4:0|1:107035064_G_A:107035064:8,9,3,3
chr14	107035163	.	GA	CC	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=35,36;MFRL=116,150;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:10,0:6,3:0|1:107035163_GA_CC:107035163:8,8,1,2
chr14	107035168	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=30,27;MFRL=87,150;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:9,0:7,3:0|1:107035163_GA_CC:107035163:7,12,1,2
chr14	107035182	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=109,161;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:9,1:5,2:0|1:107035163_GA_CC:107035163:6,11,0,3
chr14	107035206	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=12;MBQ=35,32;MFRL=127,150;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:0|1:107035206_CA_TG:107035206:2,8,0,3
chr14	107035212	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=125,156;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0|1:107035206_CA_TG:107035206:1,8,0,2
chr14	107049049	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,159;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:1,6:8,3:9,0,9,0
chr14	107082637	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,3:0,4:4,0,5,2
chr14	107083588	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=140,153;MMQ=40,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,12:0.162:78:29,5:33,7:0|1:107083588_G_A:107083588:51,15,11,1
chr14	107083591	.	A	C	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=140,153;MMQ=40,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,12:0.162:78:30,5:33,7:0|1:107083588_G_A:107083588:51,15,11,1
chr14	107083602	.	C	G	.	.	DP=91;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=136,153;MMQ=40,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,12:0.142:88:35,5:41,7:54,22,11,1
chr14	107083633	.	T	C	.	.	DP=111;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=148,135;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=182.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,66:0.622:106:18,36:21,29:24,16,38,28
chr14	107083725	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,146;MMQ=40,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,20:0.179:114:54,7:37,13:0|1:107083725_C_T:107083725:42,52,10,10
chr14	107083740	.	A	C	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=141,138;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=130.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:38,46:0.547:84:18,27:19,18:1|0:107083725_C_T:107083725:12,26,18,28
chr14	107095285	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,23;MFRL=0,182;MMQ=60,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.767:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr14	107095297	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=175,176;MMQ=43,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,2:0,2,3,1
chr14	107095319	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=31,33;MFRL=183,172;MMQ=42,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,2:2,6:1,3,5,3
chr14	107095326	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=172,183;MMQ=40,42;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,2:6,2:5,3,1,3
chr14	107095338	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,8:0,0,7,6
chr14	107095356	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=183,167;MMQ=42,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:1,3,3,2
chr14	107095376	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=28,31;MFRL=173,138;MMQ=40,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr14	107095398	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=34,26;MFRL=138,180;MMQ=25,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,0:5,3:0|1:107095398_G_A:107095398:6,0,0,3
chr14	107095402	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=33,34;MFRL=138,180;MMQ=25,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,0:5,3:0|1:107095398_G_A:107095398:6,0,0,3
chr14	107095419	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=11;MBQ=32,35;MFRL=122,177;MMQ=25,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,1:4,3:5,0,0,4
chr14	107095423	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=175,120;MMQ=40,25;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:2,5,3,0
chr14	107095478	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=126,147;MMQ=40,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,1:1,0:0|1:107095478_C_G:107095478:3,4,2,0
chr14	107095486	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=123,172;MMQ=35,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:0|1:107095478_C_G:107095478:3,3,2,1
chr14	107095569	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=111,138;MMQ=24,40;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:107095569_C_T:107095569:2,1,0,1
chr14	107095570	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=111,138;MMQ=24,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:107095569_C_T:107095569:2,1,0,1
chr14	107095601	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=114,166;MMQ=24,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:2,2:2,1:2,2,0,3
chr14	107095616	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=166,114;MMQ=27,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr14	107113640	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr14	107113780	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=174,151;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:2,3:6,0:0|1:107113780_G_A:107113780:6,3,3,0
chr14	107113785	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=161,151;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:2,3:8,0:0|1:107113780_G_A:107113780:7,3,3,0
chr14	107113801	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=161,145;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,3:9,1:10,4,4,0
chr14	107114009	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,7:0,0,8,9
chr14	107114045	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,143;MMQ=41,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:15,0:11,2:19,13,0,2
chr14	107114193	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=126,138;MMQ=40,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.950:38:1,20:0,15:0,1,16,21
chr14	107114225	.	CA	TG	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=146,147;MMQ=60,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,2:11,0:0|1:107114225_CA_TG:107114225:7,17,1,1
chr14	107114231	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=147,147;MMQ=60,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:0|1:107114225_CA_TG:107114225:4,16,1,1
chr14	107114249	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=147,167;MMQ=60,26;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:0|1:107114249_A_G:107114249:2,11,1,1
chr14	107114252	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=33,36;MFRL=150,167;MMQ=60,26;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,1:6,1:0|1:107114249_A_G:107114249:2,12,1,1
chr14	107114254	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=150,167;MMQ=60,26;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,1:7,1:0|1:107114249_A_G:107114249:2,12,1,1
chr14	107114310	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=186,167;MMQ=60,38;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:1,6,2,2
chr14	107130971	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,21;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:107130971_C_T:107130971:0,0,1,0
chr14	107130977	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:107130971_C_T:107130971:0,0,1,0
chr14	107131394	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0|1:107131394_G_A:107131394:0,0,15,0
chr14	107131396	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,5:0,10:0|1:107131394_G_A:107131394:0,0,18,0
chr14	107131410	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0|1:107131394_G_A:107131394:0,0,20,1
chr14	107169846	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr14	107170029	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.123:46:27,0:13,5:19,22,0,5
chr14	107170055	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=150.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,24:0,12:0|1:107170055_G_A:107170055:0,0,16,20
chr14	107170062	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,22:0,9:0|1:107170055_G_A:107170055:0,0,14,23
chr14	107170398	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,6,16
chr14	107170410	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,13:0,0,4,17
chr14	107178748	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,32;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,6,2
chr14	107178770	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=106.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,15:0,7:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,23,1
chr14	107178773	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,15:0,9:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,24,1
chr14	107178775	.	A	AG	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=114.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,15:0,9:0|1:107178748_A_G:107178748:0,0,24,2
chr14	107178795	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=156.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,22:0,0,36,3
chr14	107178832	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=224.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,30:0,36:0,0,46,20
chr14	107179106	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,170;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:2,2:7,8:4,5,3,8
chr14	107198866	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=162,167;MMQ=40,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:0,7:0,2:2,0,8,1
chr14	107198874	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=114,143;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:1,3:8,1,3,0
chr14	107198901	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=114,147;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:7,2:2,7:5,4,8,1
chr14	107282836	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=32,32;MFRL=155,152;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:13,2:8,3:0|1:107282836_T_A:107282836:10,11,5,0
chr14	107282846	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=34,33;MFRL=155,146;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:12,2:7,3:0|1:107282836_T_A:107282836:11,9,6,0
chr14	107282852	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=14;MBQ=32,27;MFRL=163,139;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:10,4:9,2:0|1:107282836_T_A:107282836:12,10,6,1
chr14	107282859	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=33,30;MFRL=171,136;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,9:0.312:30:10,3:11,5:0|1:107282836_T_A:107282836:11,10,7,2
chr14	107282872	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=31,33;MFRL=175,135;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:9,4:13,6:13,9,8,2
chr14	107282909	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=14;MBQ=31,32;MFRL=183,130;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.393:31:8,6:11,6:11,8,8,4
chr14	107282926	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=31,31;MFRL=172,128;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.406:30:8,7:9,5:0|1:107282926_A_T:107282926:10,8,6,6
chr14	107282935	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=14;MBQ=31,31;MFRL=170,122;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:5,6:10,5:0|1:107282926_A_T:107282926:8,8,4,7
chr14	107282973	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=14;MBQ=33,29;MFRL=172,128;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:11,4:12,6:13,11,0,10
chr14	107282988	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=14;MBQ=33,33;MFRL=174,126;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,8:0.243:35:10,3:15,5:0|1:107282988_C_G:107282988:17,10,0,8
chr14	107282994	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=14;MBQ=33,34;MFRL=177,134;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,7:0.216:35:12,1:15,5:0|1:107282988_C_G:107282988:18,10,0,7
chr14	107282996	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=14;MBQ=34,31;MFRL=177,127;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:12,1:14,5:0|1:107282988_C_G:107282988:18,10,0,6
chr14	107283002	.	AC	GG	.	.	DP=34;ECNT=14;MBQ=31,31;MFRL=177,127;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:10,1:14,5:0|1:107282988_C_G:107282988:19,9,0,6
chr14	107283008	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=14;MBQ=32,32;MFRL=177,168;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:13,0:14,2:0|1:107282988_C_G:107282988:19,9,0,3
chr15	20588563	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=190,129;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.424:17:6,4:3,3:7,3,5,2
chr15	20588781	.	A	ATACAAAGCATGGTACAGGAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=208,145;MMQ=60,33;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.478:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr15	20657666	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,189;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr15	20657855	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=145,120;MMQ=37,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,2:6,4:2,5,1,5
chr15	21051138	.	TATTAAATGTTGCC	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,130;MMQ=24,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.387:50:13,12:10,7:25,6,16,3
chr15	22853947	.	A	ATGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=230,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:22853947_A_ATGG:22853947:0,1,0,1
chr15	22853948	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=230,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:22853947_A_ATGG:22853947:0,1,0,1
chr15	22867111	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.426:7:0,0:1,2:0,4,0,3
chr15	22929878	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=137,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:11,2:10,11,1,1
chr15	22929905	.	CA	GG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:1,7,2,4
chr15	22929906	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,6:0,7:0,0,3,10
chr15	22933528	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=94,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:10,5:10,2:8,12,1,6
chr15	22933691	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:1,2:2,2,3,2
chr15	22933773	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=150,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:9,5,1,1
chr15	22939080	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=224,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,2:2,0:9,0,2,0
chr15	22939192	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,29:0.519:56:12,10:13,19:17,10,17,12
chr15	22940670	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,1:5,3:12,1,3,1
chr15	22940866	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,2:4,3:2,10,0,5
chr15	22955307	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	22956098	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=129,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr15	22960938	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,2:1,7:0,1,1,8
chr15	23000272	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr15	23012533	.	A	AGCCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=192,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23012533_A_AGCCTT:23012533:0,1,0,1
chr15	23012535	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=192,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23012533_A_AGCCTT:23012533:0,1,0,1
chr15	23021113	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	23931344	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,13;MFRL=151,242;MMQ=53,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:0,0:1,1,3,0
chr15	23931348	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=151,242;MMQ=53,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,0:0,0:1,1,3,0
chr15	23931355	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=197,121;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.309:7:2,0:2,1:1,4,2,0
chr15	24922208	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:3,3:4,3:6,1,6,1
chr15	24922230	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=147,104;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:7,1,3,2
chr15	24924729	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,2,0
chr15	24924752	.	ATCCAC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=126,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:2,1:1,1,0,2
chr15	24925129	.	GGTTTGTTTGTTT	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=GTTT;STR;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.740:12:2,8:0,1:0,3,0,9
chr15	24925228	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=202,201;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr15	24925755	.	TTGTGTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=TG;STR;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr15	24926963	.	T	TGATAGATAGATAGATAGATA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,184;MMQ=52,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,12;RU=GATA;STR;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.637:6:1,1:1,1:2,0,4,0
chr15	24928536	.	A	AT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,171;MMQ=50,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:10,1:16,1:21,6,2,0
chr15	25223324	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:25223324_C_G:25223324:3,0,1,0
chr15	25223326	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:25223324_C_G:25223324:3,0,1,0
chr15	25925195	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	25926131	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.150:22:9,2:7,0:12,7,0,3
chr15	25926325	.	T	TAAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAC;STR;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	25940323	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=152,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:25940323_TC_T:25940323:0,1,0,1
chr15	25940330	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25940323_TC_T:25940323:0,0,0,1
chr15	25958797	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,8:0,0:0,0,8,2
chr15	25967085	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr15	25971311	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	26026139	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:5,0,5,0
chr15	26793360	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26793360_A_C:26793360:0,0,0,1
chr15	26793362	.	GCCATCACATGTTGCATGTTTTAC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26793360_A_C:26793360:0,0,0,1
chr15	26825634	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=196,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26825634_C_CA:26825634:1,0,0,1
chr15	26825636	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=196,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26825634_C_CA:26825634:1,0,0,1
chr15	27188335	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27188335_T_A:27188335:0,0,1,0
chr15	27188353	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:27188335_T_A:27188335:0,0,2,0
chr15	27777649	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=169,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	28116275	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr15	28116934	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,1:3,1:5,1,3,0
chr15	28200408	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr15	28211758	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	28212057	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr15	28212064	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr15	28228644	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr15	28272962	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	28356859	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr15	28357230	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr15	28357248	.	T	TCAACACTGAGAGCCAAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr15	28359701	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=104,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr15	28359744	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr15	28361764	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr15	28377196	.	C	CCT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=76.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,8:0,0,18,1
chr15	28377772	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr15	28419497	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=118.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,15:0,0,33,1
chr15	28419526	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=150,171;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:33,2:21,0:44,10,3,0
chr15	28419566	.	T	C	.	.	DP=92;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=160,153;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,12:0.146:87:42,7:33,5:49,26,12,0
chr15	28419619	.	C	T	.	.	DP=99;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=163,141;MMQ=40,50;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,28:0.305:93:28,14:37,14:47,18,20,8
chr15	28499608	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=132,152;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,5:8,0:5,6,5,0
chr15	28516084	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr15	28517261	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=165,194;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,3:4,5:9,0,8,0
chr15	28517280	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=180,130;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,0:8,3:17,0,3,0
chr15	28517282	.	TG	GC	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=32,35;MFRL=165,184;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:0|1:28517282_TG_GC:28517282:11,0,8,0
chr15	28517287	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=165,157;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:5,3:5,5:0|1:28517282_TG_GC:28517282:11,0,10,0
chr15	28517291	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=160,148;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:5,2:4,6:0|1:28517282_TG_GC:28517282:11,0,10,0
chr15	28517295	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=157,140;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:4,2:5,7:0|1:28517282_TG_GC:28517282:14,0,9,0
chr15	28517303	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=144,144;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,14:0.469:30:7,2:7,9:0|1:28517282_TG_GC:28517282:14,2,13,1
chr15	28517305	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=31,30;MFRL=144,138;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=52.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,14:0.469:30:9,2:6,11:0|1:28517282_TG_GC:28517282:14,2,13,1
chr15	28517310	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=137,130;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.483:27:8,3:6,10:0|1:28517282_TG_GC:28517282:12,2,11,2
chr15	28517492	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.229:46:21,8:13,2:13,23,3,7
chr15	28519406	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=127,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,2:1,0:7,0,2,0
chr15	28632736	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,168;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.870:21:2,8:0,11:2,0,19,0
chr15	29346108	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:10,3,1,1
chr15	29347139	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,29;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	29385204	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	29386593	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,3,15
chr15	29399108	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,34;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:29399108_C_CCT:29399108:0,2,0,1
chr15	29399109	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:29399108_C_CCT:29399108:0,2,0,1
chr15	29399111	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:29399108_C_CCT:29399108:0,2,0,1
chr15	29399117	.	C	CAGAGAACAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=249,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	29400379	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	29415560	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0|1:29415560_G_A:29415560:0,0,8,7
chr15	29415568	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=152,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:0|1:29415560_G_A:29415560:7,7,1,1
chr15	29418573	.	AT	GC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,9:0,0,14,13
chr15	29418745	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,2,13
chr15	29444130	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	29544523	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:7,6:3,6:10,0,12,1
chr15	29674089	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:0|1:29674089_CAA_C:29674089:2,2,0,2
chr15	29674093	.	C	CTGGAGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:29674089_CAA_C:29674089:2,2,0,2
chr15	29674095	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:29674089_CAA_C:29674089:2,2,0,2
chr15	29674097	.	A	AAGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:29674089_CAA_C:29674089:2,2,0,2
chr15	29998002	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	30001328	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr15	30008889	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,131;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,8:1,4:2,3,7,5
chr15	30011132	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:18,0:20,2:23,16,0,2
chr15	30011918	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=214,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr15	30012975	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	30018553	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=195,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,3:2,6:2,0,7,2
chr15	30020106	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,4:4,3:9,1,5,2
chr15	30033645	.	GA	G,GAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33,18;MFRL=142,128,162;MMQ=60,60,60;MPOS=25,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.64,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,3,4:0.095,0.109:38:7,1,1:18,2,0:5,26,1,6
chr15	30053782	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=164,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:9,0:14,3:24,2,1,2
chr15	30054068	.	C	CCTTGTGTGTCACAGCCCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=222,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	30663407	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=206,257;MMQ=27,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:11,2,1,2
chr15	30665280	.	TCA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,158;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.402:35:11,11:9,3:2,19,1,13
chr15	30927867	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,136;MMQ=52,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0,8,0,6
chr15	31220709	.	TTGTGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=225,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=TG;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	31235005	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr15	31235357	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr15	31244263	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr15	31245880	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr15	31269235	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr15	31295151	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.333:40:19,5:8,8:17,10,10,3
chr15	31320703	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:4,7:4,9:1,7,3,13
chr15	31339506	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,0:13,3:0,21,0,3
chr15	31362352	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,5:5,2:5,3,4,3
chr15	31776210	.	TGGC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	31779595	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=255,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,6:1,1:3,1,4,3
chr15	31793841	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31793841_C_T:31793841:2,0,0,1
chr15	31793846	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=12,31;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:31793841_C_T:31793841:2,0,0,1
chr15	31818630	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	31818707	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31818707_T_A:31818707:0,1,0,1
chr15	31818709	.	CG	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31818707_T_A:31818707:0,1,0,1
chr15	31823108	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=194,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr15	31862437	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:5,5:1,9:0,6,1,13
chr15	31862448	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,0,19
chr15	31947300	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,141;MMQ=40,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,5:0.090:64:28,1:30,4:30,29,3,2
chr15	32393486	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.693:14:1,3:2,4:0|1:32393486_C_CT:32393486:2,2,5,5
chr15	32393502	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=90,127;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,2:0.095:29:13,0:10,1:1|0:32393486_C_CT:32393486:11,16,2,0
chr15	32393660	.	A	AAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:0,4,0,6
chr15	32393663	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr15	32450062	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	32450828	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,192;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,1:0,5:0,3,0,6
chr15	32460350	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,176;MMQ=27,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:0,7,0,5
chr15	32915796	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=127,142;MMQ=45,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,29:0.437:67:20,14:17,15:9,29,3,26
chr15	32926076	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.527:32:6,9:9,7:15,0,17,0
chr15	32976935	.	G	GGTGTTTTCT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=170,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:0|1:32976935_G_GGTGTTTTCT:32976935:1,8,0,2
chr15	32976936	.	A	AGACATCCATCATC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=170,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:0|1:32976935_G_GGTGTTTTCT:32976935:1,8,0,2
chr15	33022990	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.138:48:20,2:22,4:20,22,3,3
chr15	33024567	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,3:5,8:7,0,6,5
chr15	33066582	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,8:2,2:1,4,2,8
chr15	33200804	.	C	CAA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,22;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.763:6:0,2:1,2:1,0,5,0
chr15	33200867	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	33200870	.	G	GCTAGGATTCAGACCGACAGGGACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=222,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	33202823	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=197,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:0,8,0,3
chr15	33218561	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=103,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr15	33256544	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=10,28;MFRL=136,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr15	33359093	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.370:30:11,5:8,5:15,4,7,4
chr15	33765761	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,1:0,1:0,3,1,2
chr15	33822969	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	33873657	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	33876517	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr15	33876543	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr15	33893769	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,2:4,6:0,5,2,6
chr15	33893828	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=72,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr15	33920662	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:6,2,5,1
chr15	33923314	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=77,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr15	33925364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	33927764	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr15	33928500	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:4,3,3,0
chr15	33936797	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:3,0:0,2:0,4,0,2
chr15	33941272	.	G	GCAGCACCC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=158,32;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:33941272_G_GCAGCACCC:33941272:3,3,1,1
chr15	33941276	.	T	TTCACTAACACACCA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=158,32;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:33941272_G_GCAGCACCC:33941272:3,3,1,1
chr15	33951910	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,2:3,5:4,6,4,3
chr15	33952326	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=224,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr15	33962559	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=92,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:3,1,3,1
chr15	33990250	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,1,17
chr15	33990294	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:3,0:2,2:0,6,1,1
chr15	34014913	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,8:3,2:7,2,9,1
chr15	34016274	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr15	34021276	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=210,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr15	34030864	.	A	ACCTGTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=130,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:1,1:1,0:0|1:34030864_A_ACCTGTT:34030864:0,2,0,1
chr15	34030867	.	T	TTTTTCCCTTCTTTCCTTC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=143,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:2,1:1,0:0|1:34030864_A_ACCTGTT:34030864:0,3,0,1
chr15	34030871	.	TAG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=143,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:34030864_A_ACCTGTT:34030864:0,3,0,1
chr15	34030875	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:34030864_A_ACCTGTT:34030864:0,2,0,1
chr15	34030878	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:34030864_A_ACCTGTT:34030864:0,2,0,1
chr15	34040496	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:1,6,0,5
chr15	34060740	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr15	34064043	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	34094048	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,25:0.427:59:19,11:14,14:22,12,21,4
chr15	34094201	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:8,9:4,6:0,12,1,14
chr15	34099822	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:4,8:9,5:3,10,4,9
chr15	34103272	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:2,2:5,5:1,6,1,6
chr15	34111876	.	A	AAAAT,AAAATAAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33,31;MFRL=165,180,172;MMQ=60,36,33;MPOS=10,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=AAAT;STR;TLOD=3.19,10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,3:0.255,0.525:5:0,0,1:1,1,1:1,0,4,0
chr15	34112906	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=104,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,0:3,4:3,1,3,1
chr15	34113054	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=128,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.653:6:1,1:0,3:1,1,2,2
chr15	34113454	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr15	34113592	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,4:4,4:2,5,3,5
chr15	34117877	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,3:14,0:12,11,3,0
chr15	34117983	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=252,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:34117983_GA_G:34117983:0,3,0,1
chr15	34117987	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=252,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:34117983_GA_G:34117983:0,3,0,1
chr15	34117990	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=252,170;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:34117983_GA_G:34117983:0,3,0,1
chr15	34118575	.	G	GCCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr15	34118994	.	C	CAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,3,11
chr15	34133155	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.203:16:9,1:4,2:0|1:34133155_G_A:34133155:0,13,0,3
chr15	34133157	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=129,128;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,1:5,1:0|1:34133155_G_A:34133155:0,14,0,2
chr15	34133178	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=129,160;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:34133178_A_G:34133178:0,6,0,2
chr15	34133190	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=133,142;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:34133178_A_G:34133178:0,3,0,1
chr15	34133193	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,24;MFRL=151,142;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:34133178_A_G:34133178:0,2,0,1
chr15	34133199	.	ACT	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=156,133;MMQ=50,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:34133199_ACT_A:34133199:0,2,0,1
chr15	34133205	.	ACC	GGT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34133199_ACT_A:34133199:0,1,0,1
chr15	34135826	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	34136971	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	34137292	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr15	34146886	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr15	34146922	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,15:0,5:0,0,13,8
chr15	34151870	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,97;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:4,2:15,0:6,13,1,1
chr15	34156284	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:0,3:5,7:5,0,8,3
chr15	34156312	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:0,3:9,10:6,3,8,5
chr15	34163333	.	T	TTTCTTTCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr15	34380216	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,33,32,31;MFRL=138,170,56,154;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,16,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=8.33,35.96,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,6,18,3:0.137,0.429,0.087:42:7,3,8,2:8,3,10,1:12,3,16,11
chr15	34397559	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:4,2:11,0:8,8,2,0
chr15	34397866	.	AAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=16,30;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:0,3:2,2:3,3,2,3
chr15	34398408	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=169,175;MMQ=60,50;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0|1:34398408_C_T:34398408:0,3,0,4
chr15	34398427	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=178,162;MMQ=51,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1|0:34398408_C_T:34398408:0,4,0,1
chr15	34398429	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=148,162;MMQ=51,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:34398408_C_T:34398408:0,3,0,1
chr15	34434467	.	CT	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=53.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,29:0.639:45:6,15:9,14:15,1,24,5
chr15	34446955	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:0,2,1,6
chr15	34455953	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=223,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:34455953_A_G:34455953:0,4,0,1
chr15	34455960	.	A	G,C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,34,36;MFRL=198,147,247;MMQ=60,60,60;MPOS=9,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,1:1,1,0:0,3,0,2
chr15	34455961	.	A	ATGTACACACG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=191,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,1:2,0:1|0:34455953_A_G:34455953:0,4,0,1
chr15	34455964	.	T	C,TGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,34,32;MFRL=198,147,247;MMQ=60,60,60;MPOS=5,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr15	34455967	.	A	ACATATAC,ACAC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,27,27;MFRL=198,147,247;MMQ=60,60,60;MPOS=2,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr15	34517741	.	C	T	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=118,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,4:0.044:92:47,3:40,0:37,51,2,2
chr15	34520134	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=196,306;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:34520134_C_CT:34520134:0,2,0,1
chr15	34520138	.	TT	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=196,306;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:34520134_C_CT:34520134:0,2,0,1
chr15	34520869	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:34520869_G_A:34520869:0,4,0,1
chr15	34520871	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:34520869_G_A:34520869:0,4,0,1
chr15	34520875	.	GT	AC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=173,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:34520869_G_A:34520869:0,2,0,1
chr15	34520878	.	TTTGAG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=173,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:34520869_G_A:34520869:0,2,0,1
chr15	34520887	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=123,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=23,17;RU=T;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.505:2:0,0:1,1:1|0:34520869_G_A:34520869:0,1,0,1
chr15	34520889	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:34520869_G_A:34520869:0,0,0,1
chr15	34520891	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:34520869_G_A:34520869:0,0,0,1
chr15	34521940	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.645:18:2,4:4,6:3,3,6,6
chr15	34534493	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=247,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34534493_CA_C:34534493:0,1,0,1
chr15	34534495	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=247,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34534493_CA_C:34534493:0,1,0,1
chr15	34534499	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=247,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34534493_CA_C:34534493:0,1,0,1
chr15	34537435	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr15	34537617	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,2:1,3:2,4,0,5
chr15	34538160	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:1,10,0,2
chr15	34543055	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,5:3,2:8,0,7,0
chr15	34543298	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:0,1:1,5:0,1,1,7
chr15	34610964	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=234,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr15	34628570	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,28:0.484:58:18,12:11,16:25,5,23,5
chr15	34634324	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.454:42:13,7:10,12:4,19,1,18
chr15	34635369	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:4,7:8,3:1,11,0,10
chr15	34640959	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	34643103	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr15	34648408	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=253,56;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr15	34652008	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=180,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34652008_A_C:34652008:0,1,0,1
chr15	34652011	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=180,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34652008_A_C:34652008:0,1,0,1
chr15	34652012	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=180,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34652008_A_C:34652008:0,1,0,1
chr15	34654339	.	T	TTCTCTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=50,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=TC;STR;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr15	34655092	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=133,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:0,3,0,8
chr15	34655936	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.164:20:6,0:9,0:0|1:34655936_A_C:34655936:2,15,3,0
chr15	34655942	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.143:23:5,1:8,0:0|1:34655936_A_C:34655936:2,18,3,0
chr15	34656524	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,1:3,2:3,7,1,3
chr15	34678807	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,172;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:4,6:3,6:5,2,7,5
chr15	35083251	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr15	35083508	.	TCACACACACACACACA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=186,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=23,15;RU=CA;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.471:3:1,0:0,1:0|1:35083508_TCACACACACACACACA_T:35083508:0,2,0,1
chr15	35083544	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:35083508_TCACACACACACACACA_T:35083508:0,4,0,1
chr15	35084215	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=189,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr15	35149313	.	T	TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.453:8:0,2:2,0:0,4,0,4
chr15	35168056	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr15	35189944	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr15	35196492	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr15	35230924	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	35230934	.	A	ATAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr15	35231125	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35231125_G_T:35231125:0,1,0,1
chr15	35231126	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35231125_G_T:35231125:0,1,0,1
chr15	35261649	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	35274817	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=162,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,0:15,2:6,17,0,2
chr15	35274829	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=172,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:5,0:15,2:7,15,0,2
chr15	35664406	.	TA	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.165:38:13,3:9,3:0,32,0,6
chr15	35674120	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=108,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.082:59:34,0:21,4:18,37,1,3
chr15	35834547	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:5,7:4,3:9,0,11,0
chr15	36937606	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=55.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr15	36946441	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr15	36949952	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,8:0,0,16,2
chr15	37100697	.	CCGGAAGCA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=89,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:37100697_CCGGAAGCA_C:37100697:0,2,0,1
chr15	37100709	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=89,251;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:37100697_CCGGAAGCA_C:37100697:0,2,0,1
chr15	37100711	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=89,251;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:37100697_CCGGAAGCA_C:37100697:0,2,0,1
chr15	38228696	.	C	CTACCTGGTGAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:38228696_C_CTACCTGGTGAG:38228696:0,3,0,1
chr15	38228698	.	A	AGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:38228696_C_CTACCTGGTGAG:38228696:0,3,0,1
chr15	38228700	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=175,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:38228696_C_CTACCTGGTGAG:38228696:0,3,0,1
chr15	38228711	.	G	GATGTGTCTGGCTTCTTGGGCAATGTTTAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	38545454	.	TC	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=125,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.247:13:4,0:5,0:1,9,3,0
chr15	38617062	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=107.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,35:0.621:56:13,18:8,17:4,17,4,31
chr15	38617113	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,13:0,6:0|1:38617113_C_T:38617113:0,0,1,20
chr15	38617115	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=90.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0|1:38617113_C_T:38617113:0,0,1,20
chr15	38631840	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	38631920	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,3:9,4:10,4,7,0
chr15	38631930	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,16:0,0,16,7
chr15	38632148	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr15	38641773	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:38641773_G_GTT:38641773:0,0,0,4
chr15	38641774	.	A	AAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:38641773_G_GTT:38641773:0,0,0,4
chr15	38641777	.	G	GTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:38641773_G_GTT:38641773:0,0,0,4
chr15	38776612	.	G	GAACCTCAAT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38776612_G_GAACCTCAAT:38776612:0,0,0,1
chr15	38776613	.	G	GCTTC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38776612_G_GAACCTCAAT:38776612:0,0,0,1
chr15	38776615	.	G	GGGCTAGCT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38776612_G_GAACCTCAAT:38776612:0,0,0,1
chr15	38776667	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,17;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:2,0,1,0
chr15	38776677	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,18;MFRL=116,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:38776677_A_G:38776677:3,0,1,0
chr15	38776683	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=34,17;MFRL=93,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,0:1,0:0|1:38776677_A_G:38776677:4,0,1,0
chr15	38776686	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=41,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,0:6,0,2,0
chr15	38786990	.	G	GAAAGAAAAATAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38786990_G_GAAAGAAAAATAGA:38786990:0,1,0,1
chr15	38786992	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38786990_G_GAAAGAAAAATAGA:38786990:0,1,0,1
chr15	38786994	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38786990_G_GAAAGAAAAATAGA:38786990:0,1,0,1
chr15	38804020	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	38808408	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:16,1:15,1:26,6,2,0
chr15	38988760	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,3:0,4:2,1,6,1
chr15	38988975	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:1,7,1,7
chr15	38990803	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	39545320	.	GT	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=72.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,38:0.795:47:1,17:4,16:4,5,14,24
chr15	39546537	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.491:14:3,2:3,3:5,2,3,4
chr15	39873973	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:4,1,3,1
chr15	39875755	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.747:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	39875762	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=93,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,0:1,0:0|1:39875762_A_C:39875762:2,0,1,0
chr15	39875767	.	A	AGCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,0:0|1:39875762_A_C:39875762:3,0,1,0
chr15	39875768	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,0:0|1:39875762_A_C:39875762:3,0,1,0
chr15	39879747	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:2,6,1,7
chr15	39882712	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=93,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:15,0:11,4:17,10,4,0
chr15	39884667	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr15	39885533	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=196,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:4,0,5,0
chr15	39887493	.	A	AACTGAT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:12,6:4,6:9,7,8,5
chr15	39887649	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,6:1,1:1,3,1,6
chr15	40005793	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:0,1:0,0:0,5,1,1
chr15	40030440	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr15	40034090	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:7,12,0,2
chr15	40062825	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,2:5,5:1,7,1,6
chr15	40062838	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:0,7,0,6
chr15	40062855	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:0,9,0,5
chr15	40062884	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=207,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr15	40231625	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr15	40253886	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=245,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr15	40254155	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr15	40259504	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	40259519	.	CTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=164,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.275:5:2,1:0,0:3,1,1,0
chr15	40268998	.	G	GGACGAC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=GAC;STR;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:5,2:2,3:3,4,5,2
chr15	40269126	.	T	TTTCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTCC;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	40270214	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr15	40278192	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	40282625	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,1,8
chr15	40284523	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	40285120	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	40293457	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	40300214	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:5,8:5,4:9,2,11,1
chr15	40308710	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,7516846;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:9,1,1,1
chr15	40313083	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,12,6
chr15	40322552	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,17,7
chr15	40324481	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.488:31:8,5:7,10:5,11,9,6
chr15	40324837	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	40328575	.	G	C	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=232.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.987:77:0,39:0,35:0,0,34,43
chr15	40328788	.	GCC	AGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	40330629	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:2,2:3,3,1,5
chr15	40330693	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr15	40384099	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.413:19:1,1:2,3:3,8,4,4
chr15	40453307	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,2:0,0,8,0
chr15	40453497	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,27:0.480:57:9,15:17,12:7,23,10,17
chr15	40457431	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:4,5:4,5:2,6,2,9
chr15	40491952	.	A	G	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=123.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,44:0.448:99:30,21:23,23:10,45,11,33
chr15	40494498	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=205,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,2:2,6:3,0,8,0
chr15	40494952	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr15	40494960	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,3:3,6:0,6,0,9
chr15	40500986	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr15	40509600	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr15	40557268	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr15	40558744	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	40565055	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.932:13:0,2:0,7:0,0,12,1
chr15	40565762	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.082:35:18,1:12,1:9,24,1,1
chr15	40582713	.	TAG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=113,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr15	40589830	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=147,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:1,2:4,2:1,5,1,3
chr15	40590235	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:2,1:0|1:40590235_C_T:40590235:0,3,0,1
chr15	40590241	.	AG	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40590235_C_T:40590235:0,3,0,1
chr15	40590244	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40590235_C_T:40590235:0,3,0,1
chr15	40595414	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr15	40595627	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,0,4
chr15	40630913	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.412:24:12,4:2,4:10,4,10,0
chr15	40632302	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	40648590	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:11,0:7,4:0|1:40648590_T_A:40648590:0,18,0,4
chr15	40648597	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:11,0:7,4:0|1:40648590_T_A:40648590:0,18,0,4
chr15	40655977	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=126,52;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,0:11,3:4,14,0,3
chr15	40656353	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr15	40657962	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,23;MFRL=141,73;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,1:1,0:0,3,0,2
chr15	40659886	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:5,14,0,2
chr15	40703609	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr15	40903814	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr15	40907698	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,0,13
chr15	40942715	.	GT	G,GTT	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=34,33,34;MFRL=158,137,174;MMQ=60,60,60;MPOS=10,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.27,9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,4,7:0.139,0.228:32:9,1,2:10,3,4:16,5,10,1
chr15	40942730	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=33,10;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.625:39:5,0:5,3:6,8,25,0
chr15	40942732	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.206:46:11,0:17,0:26,10,10,0
chr15	40951461	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=68,207;MMQ=42,54;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr15	40998305	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:12,7:2,5:13,2,13,0
chr15	41029226	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=209,136;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41029226_A_T:41029226:1,0,1,0
chr15	41029235	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=166,136;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41029226_A_T:41029226:2,0,1,0
chr15	41029239	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=166,136;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41029226_A_T:41029226:2,0,1,0
chr15	41030865	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr15	41030873	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=235,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:0,0:0|1:41030873_T_A:41030873:0,1,0,1
chr15	41030875	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=235,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41030873_T_A:41030873:0,1,0,1
chr15	41030876	.	A	ACTCCAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=235,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41030873_T_A:41030873:0,1,0,1
chr15	41043660	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:16,1:13,1:18,13,0,2
chr15	41043846	.	T	TTCACTTGCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	41063409	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,2:11,0:12,7,0,2
chr15	41065890	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:7,0,7,0
chr15	41071867	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,36;MFRL=76,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:0,2:1,1:0,4,0,3
chr15	41102488	.	G	GAAGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41102488_G_GAAGTT:41102488:0,1,0,1
chr15	41102490	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41102488_G_GAAGTT:41102488:0,1,0,1
chr15	41102900	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.403:35:8,7:12,6:9,12,6,8
chr15	41108278	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,3:5,1:4,7,2,2
chr15	41137217	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=157,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:3,1,0,1
chr15	41146383	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	41146581	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:2,2,1,2
chr15	41146880	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr15	41146945	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	41148199	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:2,2,3,2
chr15	41149096	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.250:19:10,0:1,1:7,7,5,0
chr15	41165739	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=224,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:1,1,0,3
chr15	41193274	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	41224276	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=201,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41224276_G_T:41224276:1,0,1,0
chr15	41224280	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	41224284	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=201,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41224276_G_T:41224276:1,0,1,0
chr15	41229557	.	T	TGCCGGCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=213,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.481:4:0,1:2,0:0|1:41229557_T_TGCCGGCC:41229557:2,0,2,0
chr15	41229561	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,33;MFRL=213,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.481:4:0,1:1,0:0|1:41229557_T_TGCCGGCC:41229557:2,0,2,0
chr15	41229712	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=105,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:17,1:11,1:12,16,1,1
chr15	41275305	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,17;MFRL=217,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr15	41313064	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr15	41346092	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=83.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,19,4
chr15	41346312	.	CCTTTGGCT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	41350768	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=111,234;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr15	41364283	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=9,17;MFRL=208,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:0,0:0,1,0,3
chr15	41476101	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr15	41476856	.	C	CTTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=19,29;MFRL=185,219;MMQ=60,32;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr15	41476875	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=185,221;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.656:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr15	41482410	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=71,182;MMQ=58,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:41482410_T_C:41482410:1,1,0,2
chr15	41482415	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=71,168;MMQ=58,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41482410_T_C:41482410:1,1,0,1
chr15	41483631	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:41483631_T_TA:41483631:0,0,4,0
chr15	41483636	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0|1:41483631_T_TA:41483631:0,0,4,0
chr15	41487873	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	41487934	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=139,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr15	41508829	.	CA	C,CAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35,35;MFRL=143,137,156;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.15,4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.175,0.233:14:4,0,1:4,2,2:8,1,5,0
chr15	41570909	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,3:1,5:6,0,7,1
chr15	41571139	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:1,6,0,4
chr15	41571186	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=176,151;MMQ=49,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:0,8,0,3
chr15	41571686	.	C	CAATACCTGGGAGAAAACCAGTAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.374:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr15	41605632	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=134,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr15	41605653	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	41663896	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.523:27:6,5:7,8:3,10,1,13
chr15	41672441	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.411:10:3,3:3,0:0,6,0,4
chr15	41689232	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.327:41:10,4:17,9:9,19,3,10
chr15	41750096	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=118,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.599:15:0,5:5,4:0,6,0,9
chr15	41750157	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=149,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr15	41757131	.	AGT	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=GT;STR;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.512:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr15	41766966	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0,0,2,15
chr15	41772693	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr15	41786510	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	41794454	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr15	41796498	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,1:1,7:4,3,4,4
chr15	41797573	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.366:17:4,0:4,6:8,3,6,0
chr15	41799711	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:2,5:1,4:3,0,7,3
chr15	41805115	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr15	41812834	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:4,2:10,0:3,13,2,0
chr15	41814172	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr15	41816190	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr15	41817367	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	41819283	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr15	41819716	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,12,13
chr15	41819896	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr15	41828892	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41828892_T_TGC:41828892:0,0,0,1
chr15	41828895	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41828892_T_TGC:41828892:0,0,0,1
chr15	41853719	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:11,1,2,0
chr15	41856543	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr15	41863800	.	CA	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,0:12,3:14,11,0,3
chr15	41864751	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:7,8,1,1
chr15	41865309	.	TGTACGAATTCTGGAGGACTCGAGGGTGGGAGACAGCAGCAGGTGCCAAGAGGAGCTAGCTGATGGTCGGCTCCTGCCTGGGACAGTATCTGCTATGCATGGGGGTAGCTTGGGAGCAAAGATGCAAAGATGTCCTGGCTCTTGTGGGCCTGTGAGCATGGCAGAAGGCTGACTCTCTCCCTCAATGCCCCTTGTAG	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,155;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.132:51:5,3:7,3:23,22,4,2
chr15	41865525	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.299:30:12,3:9,4:13,8,7,2
chr15	41870131	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=198,174;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:10,2,2,0
chr15	41991036	.	AT	A,ATT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,29,31;MFRL=172,130,179;MMQ=60,60,60;MPOS=14,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=11.59,7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,11,5:0.341,0.208:27:6,7,2:3,4,3:8,3,13,3
chr15	42000429	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:2,15,0,2
chr15	42003316	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:11,3:3,3:6,8,3,3
chr15	42032211	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.517:33:7,9:8,8:7,9,8,9
chr15	42040737	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=184,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:42040737_A_AG:42040737:2,0,1,0
chr15	42040739	.	GCA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=184,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42040737_A_AG:42040737:2,0,1,0
chr15	42040742	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=184,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42040737_A_AG:42040737:2,0,1,0
chr15	42040744	.	A	AAACT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=184,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42040737_A_AG:42040737:2,0,1,0
chr15	42042816	.	G	GTCTAATGGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	42046568	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr15	42059521	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	42059539	.	C	CCCATCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	42105509	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=102,35;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,2:14,0:13,11,1,1
chr15	42109975	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr15	42111753	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,4:0,0,5,2
chr15	42114414	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr15	42115426	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,8,6
chr15	42120365	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,2:14,0:11,10,2,0
chr15	42127443	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	42127734	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,15,3
chr15	42128568	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr15	42128855	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	42129112	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=173,84;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,0:5,2:4,6,0,2
chr15	42129158	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr15	42129176	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr15	42129373	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	42133502	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr15	42133838	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,5:4,4:1,11,2,7
chr15	42133885	.	TG	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr15	42134371	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr15	42134523	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr15	42134652	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr15	42134839	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,1,11
chr15	42136977	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr15	42137282	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr15	42137773	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr15	42138645	.	C	CAAG,CTTTCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35,33;MFRL=185,201,141;MMQ=60,60,60;MPOS=4,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,1,1:2,0,0:1,2,0,2
chr15	42138650	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr15	42139038	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr15	42139765	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,16;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:6,0:3,2:1,8,4,0
chr15	42143227	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,3:2,6:3,6,4,5
chr15	42143251	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,3:2,6:4,6,5,4
chr15	42144332	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr15	42144967	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:4,0:8,0,2,0
chr15	42145010	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,11;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.211:22:11,0:5,0:9,8,5,0
chr15	42145427	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.388:11:2,1:3,0:0|1:42145427_A_C:42145427:5,2,4,0
chr15	42145433	.	AG	CC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=133,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:2,2:6,0:0|1:42145427_A_C:42145427:10,2,4,0
chr15	42145439	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,19;MFRL=123,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:2,0:7,1:0|1:42145427_A_C:42145427:10,4,3,0
chr15	42146189	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	42147663	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=187,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr15	42153758	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,34;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42153758_C_CTT:42153758:0,1,0,1
chr15	42153760	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=189,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:42153758_C_CTT:42153758:0,2,0,1
chr15	42153765	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=189,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:42153758_C_CTT:42153758:0,2,0,1
chr15	42153777	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=190,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42153777_T_C:42153777:0,1,0,1
chr15	42153783	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,16;MFRL=190,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:42153777_T_C:42153777:0,1,0,1
chr15	42155812	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr15	42159888	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42159888_G_T:42159888:0,2,0,1
chr15	42159889	.	C	CTAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42159888_G_T:42159888:0,2,0,1
chr15	42162496	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=164,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,1:0|1:42162496_G_GC:42162496:3,6,1,1
chr15	42162499	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=164,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:42162496_G_GC:42162496:3,6,1,1
chr15	42166500	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr15	42171877	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr15	42174594	.	GCGC	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,14;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:42174594_GCGC_G:42174594:1,0,0,1
chr15	42174600	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42174594_GCGC_G:42174594:1,0,0,1
chr15	42174602	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,14;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:42174594_GCGC_G:42174594:1,0,0,1
chr15	42174605	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,13;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:42174594_GCGC_G:42174594:1,0,0,1
chr15	42174607	.	GTCCC	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42174594_GCGC_G:42174594:1,0,0,1
chr15	42174614	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,30;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42174594_GCGC_G:42174594:1,0,0,1
chr15	42174617	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42174594_GCGC_G:42174594:1,0,0,1
chr15	42175507	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr15	42179521	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:12,2:10,0:5,19,1,1
chr15	42185439	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr15	42235173	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	42279598	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=220,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr15	42285035	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=135,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:6,2:11,1:6,12,2,1
chr15	42285254	.	C	CATATTGGAAGGAAGAGATATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=199,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.668:2:0,1:0,0:0|1:42285254_C_CATATTGGAAGGAAGAGATATA:42285254:0,1,0,1
chr15	42285255	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=199,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.668:2:0,1:0,0:0|1:42285254_C_CATATTGGAAGGAAGAGATATA:42285254:0,1,0,1
chr15	42289522	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	42292532	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr15	42297092	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=82.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,13:0,0,18,6
chr15	42298133	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr15	42305769	.	GC	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:42305769_GC_AT:42305769:0,0,2,0
chr15	42305773	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:42305769_GC_AT:42305769:0,0,2,0
chr15	42305852	.	A	AGAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr15	42305998	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	42342929	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:0,7,0,3
chr15	42362821	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr15	42363265	.	C	CCTTCCCACCTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=189,589;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr15	42363769	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr15	42364637	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	42364652	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	42373432	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	42374601	.	A	ATCAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TCAT;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.791:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	42376070	.	CCACACACACAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=118,267;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42376070_CCACACACACAA_C:42376070:0,1,0,1
chr15	42376082	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=118,267;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42376070_CCACACACACAA_C:42376070:0,1,0,1
chr15	42376085	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42376070_CCACACACACAA_C:42376070:0,0,0,1
chr15	42436345	.	G	GTGTGTGTGTTTATTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=138,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.350:4:2,1:1,0:0|1:42436345_G_GTGTGTGTGTTTATTTTA:42436345:1,2,0,1
chr15	42436346	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=138,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.350:4:2,0:1,0:0|1:42436345_G_GTGTGTGTGTTTATTTTA:42436345:1,2,0,1
chr15	42436599	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=183,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr15	42437711	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=221,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.725:9:0,3:2,3:2,0,7,0
chr15	42442067	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.568:7:1,0:1,1:1,2,0,4
chr15	42453851	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:4,2,3,1
chr15	42457111	.	GC	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=229,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr15	42458479	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,1,1
chr15	42492228	.	GAG	TCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=92,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:42492228_GAG_TCC:42492228:0,2,0,1
chr15	42492233	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=92,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:42492228_GAG_TCC:42492228:0,2,0,1
chr15	42519118	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr15	42519136	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	42520829	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,11,0
chr15	42523341	.	T	TC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=92.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,13:0,0,21,8
chr15	42528676	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr15	42531768	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr15	42553218	.	AT	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=116,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=91.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,34:0.856:39:0,18:5,16:0,5,1,33
chr15	42553219	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,33:0.862:37:1,14:3,19:0,4,0,33
chr15	42560312	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	42564369	.	CA	TG	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=304.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,32:0,37:0,0,5,64
chr15	42568630	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=190.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,26:0,31:0,0,17,40
chr15	42579822	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr15	42580106	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr15	42584909	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,10:0,0,18,7
chr15	42603083	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	42614214	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:9,2:9,15,1,1
chr15	42619508	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,20:0,11:0,0,26,5
chr15	42630673	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,5:5,3:2,7,1,7
chr15	42633045	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=162,134;MMQ=50,49;MPOS=-1073741808;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr15	42633049	.	CCG	TGA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=153,124;MMQ=57,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:42633049_CCG_TGA:42633049:0,3,0,1
chr15	42633050	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=162,143;MMQ=50,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr15	42633051	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=157,153;MMQ=59,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr15	42633057	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=170,139;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr15	42633060	.	TT	AC,GT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,29,31;MFRL=0,124,153;MMQ=60,40,40;MPOS=16,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr15	42633067	.	AA	CA,TG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,32,31;MFRL=0,124,153;MMQ=60,40,40;MPOS=9,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr15	42633068	.	AATT	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:42633049_CCG_TGA:42633049:0,0,0,1
chr15	42646771	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:10,2:4,0:0|1:42646771_A_G:42646771:1,13,0,2
chr15	42646773	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:10,1:4,0:0|1:42646771_A_G:42646771:1,13,0,2
chr15	42678266	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,38;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	42678480	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,1,6
chr15	42684875	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=143,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:5,3:3,1:5,3,2,2
chr15	42685009	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42685009_T_G:42685009:0,1,0,1
chr15	42685019	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42685009_T_G:42685009:0,1,0,1
chr15	42693885	.	GGAC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:7,5,0,2
chr15	42694944	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr15	42695278	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=234,71;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42695278_C_CCA:42695278:0,1,0,1
chr15	42695279	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,36;MFRL=234,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42695278_C_CCA:42695278:0,1,0,1
chr15	42695282	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=234,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42695278_C_CCA:42695278:0,1,0,1
chr15	42695285	.	C	CCAGGTCCTTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=234,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:42695278_C_CCA:42695278:0,1,0,1
chr15	42695289	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42695278_C_CCA:42695278:0,0,0,1
chr15	42701688	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	42704105	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr15	42709630	.	A	AATGGAACAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=172,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:42709630_A_AATGGAACAAG:42709630:0,3,0,1
chr15	42709633	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=172,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:42709630_A_AATGGAACAAG:42709630:0,3,0,1
chr15	42714233	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	42738690	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,149;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:9,1:20,0,2,0
chr15	42740961	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,1339;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42740961_T_C:42740961:0,0,1,0
chr15	42740965	.	T	TGAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,1339;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42740961_T_C:42740961:0,0,1,0
chr15	42742117	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,2:15,0:16,13,2,0
chr15	42820451	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,7,3
chr15	42851464	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0,0,13,1
chr15	43018203	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=127,133;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:2,0:1,0:3,1,4,0
chr15	43018205	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,13;MFRL=127,133;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:1,1:0|1:43018205_G_A:43018205:3,1,4,0
chr15	43018208	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=127,133;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:2,0:1,2:0|1:43018205_G_A:43018205:3,1,4,0
chr15	43018301	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:0|1:43018301_G_A:43018301:9,14,1,1
chr15	43018306	.	GCTAACTCCACAGAGC	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=97,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:0|1:43018301_G_A:43018301:10,14,1,1
chr15	43027971	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=191,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:43027971_G_C:43027971:2,0,1,1
chr15	43027974	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=191,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:43027971_G_C:43027971:2,0,1,1
chr15	43027976	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=191,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:43027971_G_C:43027971:2,0,1,1
chr15	43028154	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:22,0:20,3:28,14,0,3
chr15	43109385	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr15	43244699	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=171,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0|1:43244699_A_G:43244699:0,4,0,2
chr15	43244713	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=195,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:43244699_A_G:43244699:0,4,0,1
chr15	43244717	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=184,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:43244699_A_G:43244699:0,3,0,1
chr15	43244721	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=184,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:43244699_A_G:43244699:0,3,0,1
chr15	43256121	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr15	43322113	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:2,3:6,4:9,0,6,1
chr15	43328663	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,21:0.447:47:14,10:12,10:22,4,20,1
chr15	43330175	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,1,12
chr15	43330533	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr15	43348679	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:0,9,0,3
chr15	43352041	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:3,5,0,8
chr15	43360287	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr15	43398108	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=139,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:7,1,4,0
chr15	43430749	.	CT	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.104:34:10,0:13,3:22,9,3,0
chr15	43453056	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr15	43476774	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=181,58;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr15	43478511	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:1,3,0,6
chr15	43498893	.	T	TTCCACACTCATGCTCATGAAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=218,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.322:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr15	43498919	.	C	CAAATGTAACCCTCAACTTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=245,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr15	43512858	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	43531307	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:3,1,0,1
chr15	43531554	.	G	GTTTTGGTGACAGACTCACATAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	43568999	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,2,1
chr15	43577070	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,2:13,0:16,9,1,1
chr15	43628071	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=193,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:43628071_T_C:43628071:0,4,0,1
chr15	43628077	.	G	GCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=193,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:43628071_T_C:43628071:0,4,0,1
chr15	43628078	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=193,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:43628071_T_C:43628071:0,4,0,1
chr15	43628080	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=193,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:43628071_T_C:43628071:0,4,0,1
chr15	43637985	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=194,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr15	43643901	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr15	43663737	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.419:5:0,1:2,0:0,3,0,2
chr15	43701946	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr15	43724646	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=172,122;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.293:22:8,4:7,2:5,11,5,1
chr15	43724955	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=91,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:43724955_G_C:43724955:0,2,0,1
chr15	43724957	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=91,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:43724955_G_C:43724955:0,2,0,1
chr15	43724959	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43724955_G_C:43724955:0,1,0,1
chr15	43724963	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43724955_G_C:43724955:0,1,0,1
chr15	43730486	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=116,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,6:4,6:4,4,8,4
chr15	43739684	.	C	CT	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=111,126;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.145:41:17,0:13,2:0|1:43739684_C_CT:43739684:17,18,0,6
chr15	43739686	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=84,126;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.160:39:13,0:8,4:0|1:43739684_C_CT:43739684:17,16,0,6
chr15	43739703	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,14;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,1:10,0:2,19,3,0
chr15	43773036	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:8,2:1,6:9,1,9,0
chr15	43784000	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr15	43816917	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=129,229;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:8,2:5,1:10,4,1,2
chr15	43819956	.	A	ACCTG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=171,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,1:4,0:0|1:43819956_A_ACCTG:43819956:8,5,1,1
chr15	43819959	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=173,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:6,0:0|1:43819956_A_ACCTG:43819956:9,5,1,1
chr15	43819960	.	G	GCCTCTT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=175,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:7,0:0|1:43819956_A_ACCTG:43819956:8,5,1,1
chr15	43850941	.	A	ACTAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	43892937	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,123;MMQ=55,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:3,1:12,1:4,12,0,2
chr15	43896943	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,187;MMQ=27,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:14,2:10,3:14,11,3,2
chr15	43903198	.	T	TTTG,TTGTGTGTG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,28,13;MFRL=186,115,162;MMQ=60,39,40;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.88,6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,9,2:0.265,0.420:13:1,2,0:0,5,0:0,2,2,9
chr15	43923623	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=223,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:10,0,2,0
chr15	43925134	.	TT	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=194,186;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:43925134_TT_AG:43925134:0,3,0,2
chr15	43925140	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=15,34;MFRL=200,186;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:43925134_TT_AG:43925134:0,1,0,2
chr15	43925147	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=265,201;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:43925134_TT_AG:43925134:0,1,0,1
chr15	43927353	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=163,156;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:2,3:8,1:0,12,0,4
chr15	43927370	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=166,155;MMQ=40,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:4,5:0,8,0,8
chr15	43927424	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=186,154;MMQ=40,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43927424_T_A:43927424:0,1,0,1
chr15	43927425	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=186,154;MMQ=40,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43927424_T_A:43927424:0,1,0,1
chr15	43927426	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=186,154;MMQ=40,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43927424_T_A:43927424:0,1,0,1
chr15	43927430	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=186,154;MMQ=40,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43927424_T_A:43927424:0,1,0,1
chr15	43931906	.	G	C	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=125,148;MMQ=57,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,32:0.440:73:24,19:16,13:24,17,15,17
chr15	43940894	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=190,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,1,2
chr15	43988525	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,115;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.509:41:12,9:8,11:15,5,17,4
chr15	44053617	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=72.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.596:40:9,10:7,14:11,5,15,9
chr15	44053751	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:11,1:14,1:3,22,0,2
chr15	44055385	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,136;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,0:13,2:12,15,1,1
chr15	44062874	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,212;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,3:1,0:0,5,0,4
chr15	44065652	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=169,230;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44065652_CA_TG:44065652:0,1,0,1
chr15	44065656	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=169,230;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44065652_CA_TG:44065652:0,1,0,1
chr15	44065661	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=169,230;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44065652_CA_TG:44065652:0,1,0,1
chr15	44066586	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:8,11,1,1
chr15	44068160	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,2:6,3:6,4,2,3
chr15	44090251	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=142,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:4,2:0,6,0,3
chr15	44090527	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:3,2:16,0:18,1,2,0
chr15	44090543	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=163,92;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:4,3:15,0:17,3,2,1
chr15	44090743	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:17,0:13,3:12,19,0,3
chr15	44091351	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,7:0,0,10,10
chr15	44119313	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,2:8,2:5,9,1,3
chr15	44211868	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,3:1,2:2,0,6,0
chr15	44216559	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=218,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr15	44751458	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:0,12,0,2
chr15	44778936	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.486:18:4,2:5,5:1,8,5,4
chr15	44778956	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr15	44811329	.	GT	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,6:0.108:61:27,2:24,4:51,4,6,0
chr15	44829394	.	TGGC	T	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.073:51:17,1:9,1:15,33,1,2
chr15	44859547	.	CA	C,CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=268,116,208;MMQ=42,50,40;MPOS=23,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,19;RU=A;STR;TLOD=3.26,3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.361,0.246:5:1,2,0:1,0,1:2,0,3,0
chr15	44914151	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:5,2:3,1:0,8,0,3
chr15	45028919	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,35,34;MFRL=131,155,145;MMQ=60,60,60;MPOS=17,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.69,27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,11:0.159,0.694:15:1,0,7:1,2,2:0,2,4,9
chr15	45048757	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	45059390	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr15	45060014	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	45250515	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=122,171;MMQ=52,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:0,1:0|1:45250515_G_T:45250515:3,0,3,0
chr15	45250518	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=122,171;MMQ=52,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:45250515_G_T:45250515:3,0,3,0
chr15	45250755	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,171;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0,1,0,10
chr15	45253674	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:17,3:12,0:22,7,5,0
chr15	45353230	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr15	45357409	.	AT	TG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=170,163;MMQ=59,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:5,4:7,1:10,2,5,1
chr15	45357410	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,9:0,0,16,4
chr15	45361011	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr15	45361046	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28,33;MFRL=0,176,160;MMQ=60,27,33;MPOS=1,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,17,19;RU=T;STR;TLOD=5.35,8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.336,0.581:7:0,2,1:0,1,3:0,0,6,1
chr15	45364647	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,267;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	45364706	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr15	45387550	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	45389463	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=134,185;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:10,3,2,0
chr15	45391566	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,6,7
chr15	45392291	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=134,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:10,8,2,0
chr15	45396408	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,220;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:15,9,1,1
chr15	45398965	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr15	45399467	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr15	45399694	.	G	GAATCATT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=176,62;MMQ=43,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr15	45400164	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr15	45402940	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=201.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,30:0,31:0,0,26,39
chr15	45405701	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	45408691	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:45408691_C_G:45408691:0,0,3,2
chr15	45408699	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:45408691_C_G:45408691:0,0,3,2
chr15	45408710	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr15	45408933	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr15	45409013	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr15	45409271	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr15	45412593	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=188,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:45412593_AG_A:45412593:0,1,0,1
chr15	45412597	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=188,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:45412593_AG_A:45412593:0,1,0,1
chr15	45412701	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=184,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	45424286	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:2,4:1,3:0,4,0,7
chr15	45430290	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:45430290_G_GGC:45430290:1,0,0,1
chr15	45430303	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45430290_G_GGC:45430290:1,0,0,1
chr15	45433646	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,2:6,4:0,7,0,6
chr15	45439910	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr15	45442767	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr15	45446028	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=208,177;MMQ=40,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr15	45446084	.	CAA	C,CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,34,32;MFRL=154,119,175;MMQ=50,60,60;MPOS=22,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.05,5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.282,0.359:11:2,2,2:1,0,1:3,1,5,2
chr15	45453032	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=125,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:4,4:4,3:2,7,5,2
chr15	45453237	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr15	45454259	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45454259_C_CTG:45454259:0,1,0,1
chr15	45454261	.	C	CTTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:45454259_C_CTG:45454259:0,2,0,1
chr15	45454265	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45454259_C_CTG:45454259:0,2,0,1
chr15	45454266	.	T	TTTATCCTGCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45454259_C_CTG:45454259:0,2,0,1
chr15	45456194	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,1,7
chr15	45457127	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.404:15:5,1:4,4:3,6,0,6
chr15	45555479	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:45555479_A_G:45555479:1,3,0,1
chr15	45555487	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=169,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:45555479_A_G:45555479:1,2,0,1
chr15	45555488	.	C	CTGTTTTTTGAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=169,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:45555479_A_G:45555479:1,2,0,1
chr15	45565067	.	A	AGCTTGAAGTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr15	45567529	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	45656239	.	CC	GG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:45656239_CC_GG:45656239:0,4,0,1
chr15	45656243	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:45656239_CC_GG:45656239:0,4,0,1
chr15	45656252	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:45656239_CC_GG:45656239:0,3,0,1
chr15	45669055	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr15	45669094	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=230,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr15	45694579	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:3,7:8,6:7,4,10,3
chr15	45694610	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.623:38:6,13:8,10:9,5,15,9
chr15	45706739	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=221,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,5:1,0:2,0,4,1
chr15	45777344	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,1:2,2:5,1,2,2
chr15	45814497	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:4,0:3,9,2,0
chr15	45848230	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=33,33,34,27;MFRL=175,145,129,155;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,24,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=T;STR;TLOD=9.18,7.00,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,5,5,5:0.184,0.201,0.175:26:6,2,4,2:4,3,1,3:10,1,12,3
chr15	45848250	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=20,16;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.127:37:6,0:10,1:0|1:45848250_C_A:45848250:21,12,4,0
chr15	45848252	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=18,15;MFRL=139,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.097:37:5,1:12,0:22,12,3,0
chr15	45848254	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.127:37:11,1:11,1:0|1:45848250_C_A:45848250:21,12,4,0
chr15	45848257	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.094:38:11,0:13,0:22,13,3,0
chr15	45884236	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	45897771	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=14,33;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.426:19:1,0:0,4:0,11,0,8
chr15	45951064	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=131,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.506:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr15	45968535	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr15	45980713	.	CTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=196,186;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr15	48053334	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:4,10:5,6:2,7,7,9
chr15	48056735	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:4,2:1,0:5,0,2,1
chr15	48059137	.	CTT	C,CT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,34,33;MFRL=168,166,196;MMQ=60,60,60;MPOS=20,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.46,21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,3,11:0.116,0.373:30:12,2,7:2,1,4:16,0,14,0
chr15	48061008	.	G	GGCCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0|1:48061008_G_GGCCT:48061008:0,2,0,1
chr15	48061012	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:48061008_G_GGCCT:48061008:0,2,0,1
chr15	48061014	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:48061008_G_GGCCT:48061008:0,2,0,1
chr15	48061016	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48061008_G_GGCCT:48061008:0,1,0,1
chr15	48443699	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=180.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,53:0.962:55:1,25:0,28:2,0,33,20
chr15	48450517	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.768:8:1,4:0,2:0,2,0,6
chr15	48459667	.	G	GCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chr15	48460786	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr15	48460927	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,13:0,14:0,0,11,17
chr15	48539026	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0|1:48539026_A_T:48539026:0,0,10,1
chr15	48539043	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:48539026_A_T:48539026:0,0,11,1
chr15	48541700	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr15	48561834	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,12,2
chr15	48594848	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=153,238;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr15	48634319	.	TA	T,TAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,33,30;MFRL=160,144,150;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=7.48,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,7,3:0.274,0.153:23:6,1,2:6,6,1:0,13,0,10
chr15	48703312	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:22,3:17,0:12,29,2,1
chr15	48720526	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=135.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,20:0,19:0,0,27,12
chr15	48729648	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	48736684	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	48764968	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=248,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48764968_A_C:48764968:0,1,0,1
chr15	48764970	.	A	ATCCGGAATGCCCCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=248,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48764968_A_C:48764968:0,1,0,1
chr15	48779540	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,3:9,0:11,7,3,0
chr15	48779723	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	49073296	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr15	49083577	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=194,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:0,7,2,5
chr15	49118087	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr15	49149828	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr15	49254960	.	T	TAGCTCCGGAGGCTCGGTCGGGAACAAGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=175,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.268:10:1,0:5,2:4,4,1,1
chr15	49255208	.	CG	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:2,2,1,1
chr15	49288880	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	49292258	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0|1:49292258_G_A:49292258:0,0,0,1
chr15	49292266	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49292258_G_A:49292258:0,0,0,1
chr15	49292268	.	TCGCAGC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49292258_G_A:49292258:0,0,0,1
chr15	49305087	.	CAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=201,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:49305087_CAAA_C:49305087:0,3,0,1
chr15	49305094	.	A	ACC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=201,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49305087_CAAA_C:49305087:0,3,0,1
chr15	49325081	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=234,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr15	49325289	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:11,5:11,7:7,15,4,9
chr15	49422885	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,3:6,4:5,3,5,2
chr15	49423098	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=212,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr15	49426048	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:10,5:9,9:5,14,3,11
chr15	49462638	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr15	49575879	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:11,0:17,2:17,12,1,1
chr15	49620809	.	GTGA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGA;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.100:27:8,1:14,1:11,14,2,0
chr15	49663405	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=180,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr15	49716845	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:1,2,0,4
chr15	49860546	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:1,2,2,6
chr15	49867122	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,18,1
chr15	49867148	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=103.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,11:0,17:0,0,26,2
chr15	49867323	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=153.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,18:0,24:0,0,8,36
chr15	49869141	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	49926993	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,156;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:8,0:4,12,0,3
chr15	49935503	.	CT	C,CTT,CTTTTTTTTTTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33,34,0;MFRL=116,142,160,166;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,30,50;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=19,18,20,29;RU=T;STR;TLOD=3.04,3.49,7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,3,3:0.180,0.216,0.204:16:3,0,1,0:1,3,2,0:4,3,6,3
chr15	50152729	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,13;MFRL=212,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0,4,1,0
chr15	50158695	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=99,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:1,4:4,3:2,3,0,7
chr15	50489677	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr15	50489759	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,5:3,4:3,4,5,4
chr15	50497354	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr15	50518087	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=276,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	50518146	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:8,0,6,0
chr15	50521265	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=45.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr15	50526030	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:2,2,3,3
chr15	50526249	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=100,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr15	50555544	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=133,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:4,5,0,5
chr15	50555561	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:4,9,0,2
chr15	50570999	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.681:13:1,6:3,2:0,4,0,9
chr15	50601811	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,4:2,9:3,0,13,0
chr15	50731213	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=193,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr15	50731390	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=196,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr15	50773850	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=134,160;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.096:50:26,1:19,3:26,20,1,3
chr15	50776640	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.890:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr15	50781963	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.452:40:14,8:8,10:21,1,18,0
chr15	50782434	.	GT	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.133:42:19,3:16,2:37,0,5,0
chr15	50782446	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=17,19;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.156:42:4,1:3,0:35,1,6,0
chr15	50784955	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,115;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,1:14,1:19,7,2,0
chr15	50785054	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,118;MMQ=52,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,3:14,0:11,15,0,3
chr15	50789527	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr15	50821945	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,5:3,8:8,1,12,1
chr15	50822178	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr15	50854029	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:4,3:2,4:0,7,0,8
chr15	50868187	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,44;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,2,0
chr15	50873170	.	A	AGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:50873170_A_AGTT:50873170:0,2,0,1
chr15	50873172	.	C	CTGGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:50873170_A_AGTT:50873170:0,2,0,1
chr15	50878509	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:5,0,3,0
chr15	50878574	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:8,2,1,2
chr15	50888619	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=98.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,9:0,19:0,0,1,28
chr15	50899309	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,169;MMQ=43,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:0,0:2,2:2,0,3,0
chr15	50899616	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=197,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr15	50901929	.	TA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,23:0.665:34:7,12:3,10:5,6,10,13
chr15	50903591	.	T	TAACGACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,289;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr15	50904989	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:2,7,0,2
chr15	50911865	.	AT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=55.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.582:41:6,12:9,12:17,0,24,0
chr15	50916575	.	GATTTAC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=157,258;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	50924995	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr15	50926516	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:8,8:4,10:10,2,17,1
chr15	50926523	.	AAAATAAAT	A,AAAAT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,33,32;MFRL=114,142,173;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,4,5;RU=AAAT;STR;TLOD=8.38,35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,3,11:0.105,0.372:30:10,1,6:6,2,5:13,3,13,1
chr15	50941108	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr15	50941131	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=192,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr15	50950141	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr15	51039891	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=199,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.622:24:5,8:3,7:0,9,0,15
chr15	51041763	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:8,3:6,0:14,0,4,0
chr15	51041774	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:20,0,2,0
chr15	51201158	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr15	51204364	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=104.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.972:30:0,19:0,11:0,0,4,26
chr15	51204394	.	C	CT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.966:24:0,14:0,9:0,0,1,23
chr15	51207818	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,12:0,0,3,19
chr15	51350655	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	51502986	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,4:5,2:9,3,2,4
chr15	51503147	.	C	CTGGAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=179,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:5,0:6,6,1,1
chr15	51503345	.	AAC	TTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=176,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51503345_AAC_TTG:51503345:0,1,0,1
chr15	51503352	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=176,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51503345_AAC_TTG:51503345:0,1,0,1
chr15	51510702	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,1:8,4:11,3,4,1
chr15	51510868	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,3:2,3:1,8,1,5
chr15	51519945	.	A	AAAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=116,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,7:6,4:5,5,9,5
chr15	51520206	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	51529265	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=205,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr15	51669750	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr15	51675880	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:5,6:0,5:5,0,12,0
chr15	51675932	.	ATT	A,AT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,32,33;MFRL=148,166,136;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=10.62,19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,8,12:0.246,0.396:31:5,3,7:6,5,4:10,1,15,5
chr15	51689624	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,1:3,1:3,0,3,0
chr15	51745848	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:17,2:8,0:3,23,0,2
chr15	51748610	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.621:24:6,5:2,9:0,9,0,15
chr15	51750652	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=117,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr15	51750846	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,3:3,5:8,3,3,5
chr15	51751091	.	TAGCAGC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AGC;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	51758345	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.579:22:7,6:2,7:8,1,12,1
chr15	51770456	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,7:6,8:7,3,14,1
chr15	51783959	.	T	TAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=140,40;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.420:5:1,0:2,2:0|1:51783959_T_TAA:51783959:1,2,1,1
chr15	51783964	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=142,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:1,0:3,2:0|1:51783959_T_TAA:51783959:1,3,1,1
chr15	51783967	.	T	TTGTTCCTTTCC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=142,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:0,0:2,2:0|1:51783959_T_TAA:51783959:1,3,1,1
chr15	51806850	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	51837922	.	C	CACACACACACACACA	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:35,2:19,1:25,29,0,3
chr15	51857220	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,26:0.519:50:7,13:17,13:23,1,26,0
chr15	51914778	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,2,21
chr15	51981577	.	TATATATGCATATGCATGGGG	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=131,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:2,9,0,2
chr15	51981597	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=13,31;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.801:6:0,2:0,2:0|1:51981597_G_T:51981597:0,1,0,5
chr15	51981627	.	T	TGCCTGTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=114,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:51981597_G_T:51981597:0,2,0,1
chr15	51981629	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=194,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:51981597_G_T:51981597:0,3,0,1
chr15	51991454	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:8,0,5,0
chr15	52017345	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,28:0.580:48:9,13:11,15:3,17,6,22
chr15	52029726	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	52060657	.	CT	C,CTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,35,20;MFRL=128,144,151;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.85,11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,9:0.199,0.404:21:4,1,4:4,2,2:2,6,1,12
chr15	52066122	.	T	TCCATTTTGATCTGTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	52185937	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr15	52185961	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.626:10:1,4:2,3:3,0,6,1
chr15	52186158	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=120,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr15	52239672	.	GCACA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=196,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:52239672_GCACA_G:52239672:0,1,0,1
chr15	52239680	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=196,211;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52239672_GCACA_G:52239672:0,1,0,1
chr15	52242245	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52242245_A_C:52242245:0,0,0,1
chr15	52242249	.	GAACCCA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52242245_A_C:52242245:0,0,0,1
chr15	52242256	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52242245_A_C:52242245:0,0,0,1
chr15	52246665	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.381:27:11,8:5,2:11,6,8,2
chr15	52246742	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:10,12,0,2
chr15	52252799	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr15	52257874	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=182,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr15	52351007	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:9,13:6,5:2,13,3,15
chr15	52401951	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=67,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr15	52402210	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:1,3,1,5
chr15	52420491	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,3:4,2:0,9,2,3
chr15	52439779	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=138,157;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:3,3:1,1:0,7,1,5
chr15	52486306	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0,5,0,6
chr15	52488530	.	GC	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=117,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:8,1:6,0:0|1:52488530_GC_G:52488530:11,7,2,1
chr15	52488532	.	GTTCGT	G	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=29,24;MFRL=115,101;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:10,1:8,2:0|1:52488530_GC_G:52488530:12,7,2,1
chr15	52488543	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:8,1:9,2:0|1:52488530_GC_G:52488530:11,7,2,1
chr15	52488544	.	C	CGAACG	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:6,1:9,2:0|1:52488530_GC_G:52488530:11,7,2,1
chr15	52488546	.	TTG	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=110,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:4,0:8,2:0|1:52488530_GC_G:52488530:10,6,2,1
chr15	52488551	.	A	ACC	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=111,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:52488530_GC_G:52488530:10,3,2,0
chr15	52503895	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,3:3,1,3,1
chr15	52504142	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr15	52505563	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	52506940	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,16;MFRL=201,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:52506940_T_TA:52506940:0,2,0,1
chr15	52506944	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=201,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:52506940_T_TA:52506940:0,2,0,1
chr15	52506951	.	TGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=209,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:52506940_T_TA:52506940:0,3,0,1
chr15	52506955	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=209,141;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:52506940_T_TA:52506940:0,3,0,1
chr15	52513295	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:15,3,2,0
chr15	52515678	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr15	52516993	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,4,0
chr15	52539151	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=129,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,1:12,1:10,10,1,1
chr15	52553007	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	52569261	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.503:34:8,10:8,7:14,3,14,3
chr15	52571270	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,14;MFRL=212,312;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.520:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr15	52571773	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,2:4,5:5,5,3,4
chr15	52640990	.	TA	T,TAA	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=146,163,138;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.68,61.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,29:0.117,0.776:37:0,3,13:3,1,11:3,0,25,9
chr15	52664566	.	G	GTTCCTTGGGTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	52667450	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:5,2,2,1
chr15	52668822	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:1,3:1,2:0,3,0,5
chr15	52671784	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=131,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr15	52675261	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr15	52675381	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:17,0:9,2:7,19,1,1
chr15	52675406	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:52675406_G_A:52675406:3,16,1,1
chr15	52675409	.	G	GAT	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=135,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:5,2:0|1:52675406_G_A:52675406:3,16,1,1
chr15	52675410	.	G	GGAAACATTATAAAA	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:6,2:0|1:52675406_G_A:52675406:3,15,1,1
chr15	52675420	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:6,2:4,0:0|1:52675420_T_TA:52675420:1,9,0,2
chr15	52675421	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:52675420_T_TA:52675420:1,9,0,2
chr15	52681573	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,12:0,0,5,21
chr15	52681643	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr15	52689631	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,12,15
chr15	52702699	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=114,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,5:4,2:1,4,0,7
chr15	52708370	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:18,7,1,1
chr15	52708502	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.629:33:10,6:2,14:5,7,3,18
chr15	52708534	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.584:27:9,5:2,10:1,10,1,15
chr15	52725334	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:12,10:8,9:14,6,14,5
chr15	52820904	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr15	52876874	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.435:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr15	52892477	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr15	52893391	.	TA	T,TAA	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,32,32;MFRL=153,154,138;MMQ=60,60,60;MPOS=25,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.27,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,3,3:0.087,0.095:38:6,2,1:26,1,1:6,26,2,4
chr15	52897478	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,2:0,5,0,8
chr15	52904046	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,27;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr15	52970173	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:7,0:4,2:11,1,0,9
chr15	53230662	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	53905779	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr15	53905820	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.722:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr15	53998314	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	54005126	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:13,0:0,24,0,2
chr15	54008845	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,7:0,15:0,0,8,14
chr15	54008889	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=125,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.312:17:5,3:7,2:4,8,2,3
chr15	54025231	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,2:8,0:0|1:54025231_C_CA:54025231:8,14,0,2
chr15	54025234	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,1:10,0:0|1:54025231_C_CA:54025231:8,14,0,2
chr15	54630552	.	T	TTGTC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGTC;STR;TLOD=48.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:6,6:7,6:10,3,10,3
chr15	54685448	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=181,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:0,6,0,7
chr15	54685463	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr15	54792428	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,0:3,2:0,7,0,2
chr15	54838894	.	AAT	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,3:12,0:28,3,2,1
chr15	54841874	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,2:2,4:2,5,3,3
chr15	54915975	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,5:0,4:1,2,6,3
chr15	55611433	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.553:29:5,7:7,9:10,3,15,1
chr15	55613405	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr15	55621889	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:5,9:10,6:11,4,11,4
chr15	55710365	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=121.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,40:0.491:82:20,19:20,21:0|1:55710365_T_C:55710365:12,30,6,34
chr15	55710369	.	T	A	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=282.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,75:0.987:75:0,34:0,38:0|1:55710365_T_C:55710365:0,0,16,59
chr15	55731572	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=142,171;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:2,0:3,0,2,0
chr15	55759193	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=40,33;MFRL=121,146;MMQ=48,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=178.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,50:0.965:51:1,24:0,23:0,1,19,31
chr15	55881111	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr15	55929285	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,6:2,1:3,0,7,0
chr15	55974742	.	T	TTTTATTTATTTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=TTTA;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	56032519	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr15	56032732	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.526:40:6,16:12,5:8,11,8,13
chr15	56032975	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr15	56035010	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=76.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,9:0,14:0,0,13,10
chr15	56122664	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,12,1
chr15	56125135	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr15	56125182	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	56130286	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=130.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,20:0,0,25,13
chr15	56141131	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,0:4,3:0,11,0,3
chr15	56152598	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=62.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,15,5
chr15	56161919	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr15	56243792	.	TAA	T,TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,31,32;MFRL=113,155,134;MMQ=60,60,60;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=4.42,11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,11:0.238,0.578:18:3,3,7:0,1,4:1,2,4,11
chr15	56387494	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:10,2:9,2:7,12,4,0
chr15	56434956	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=71,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,2:1,4:1,0,5,2
chr15	56435176	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:56435176_C_A:56435176:0,2,0,1
chr15	56435178	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56435176_C_A:56435176:0,2,0,1
chr15	56535247	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:56535247_G_C:56535247:0,0,2,0
chr15	56535251	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=113,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:56535247_G_C:56535247:2,0,2,0
chr15	56535254	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=139,250;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,0:0|1:56535247_G_C:56535247:3,0,2,0
chr15	56535261	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=163,250;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:56535247_G_C:56535247:6,0,2,0
chr15	56535499	.	G	GACAGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=238,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	56657581	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr15	56719785	.	T	C	.	.	DP=122;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=159.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,58:0.491:118:38,34:22,23:0|1:56719785_T_C:56719785:35,25,35,23
chr15	56719797	.	G	T	.	.	DP=121;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=439.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,116:0.992:116:0,67:0,44:0|1:56719785_T_C:56719785:0,0,60,56
chr15	56720715	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,1:0,5,0,4
chr15	56721264	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr15	56721406	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,7,16
chr15	56739234	.	CAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	56946296	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=113.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,17:0,14:0,0,29,2
chr15	56981703	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,1,15
chr15	57355865	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,55;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,0:2,3:8,0,3,0
chr15	57523542	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	57524857	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,20:0,6:0,0,28,0
chr15	57526248	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.489:47:10,12:14,11:10,14,14,9
chr15	57535704	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:16,2:11,0:9,18,0,2
chr15	57555523	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr15	57732743	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr15	57744311	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=228,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr15	57744582	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	57746071	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:0,7,0,6
chr15	57817050	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr15	57835868	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:7,3:1,1:5,3,4,0
chr15	57835903	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=119,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:7,3:3,3:6,5,4,3
chr15	57836823	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr15	57838258	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,13:0,15:0,0,23,5
chr15	57910444	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,2,20
chr15	57925990	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:0,5,0,8
chr15	57930016	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:1,9,0,2
chr15	57931839	.	CTCACA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	57953564	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr15	57967285	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=116,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.534:11:2,3:2,3:0,5,0,6
chr15	57976523	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	57976583	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr15	57976769	.	G	GAGAAAGACAGAGACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	58001656	.	AG	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,1:11,2:0,25,0,3
chr15	58247563	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	58253062	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr15	58253106	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	58253269	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	58256296	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr15	58257847	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr15	58287400	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,0:5,0:2,10,0,3
chr15	58465171	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr15	58465483	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,1:0,3:0,0,0,6
chr15	58476066	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:58476066_A_T:58476066:3,0,1,0
chr15	58476067	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:58476066_A_T:58476066:3,0,1,0
chr15	58476092	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr15	58834793	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:14,1:11,13,2,0
chr15	58837910	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr15	58840450	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr15	58853109	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,22:0,24:0,0,27,22
chr15	58853212	.	GAC	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=114.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.968:27:0,14:0,12:0|1:58853212_GAC_G:58853212:0,0,3,24
chr15	58853218	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=117.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0|1:58853212_GAC_G:58853212:0,0,3,25
chr15	58974349	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,2:6,1:8,2,3,0
chr15	59094494	.	CT	C,CTT	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=159,153,148;MMQ=60,60,60;MPOS=13,14;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=12.79,34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,9,25:0.160,0.432:57:8,5,14:14,3,5:20,3,28,6
chr15	59144199	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr15	59144239	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=214,270;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:59144239_C_A:59144239:0,1,0,1
chr15	59144241	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,22;MFRL=214,270;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:59144239_C_A:59144239:0,1,0,1
chr15	59144257	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:59144257_AG_A:59144257:0,0,0,1
chr15	59144260	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:59144257_AG_A:59144257:0,0,0,1
chr15	59144262	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:59144257_AG_A:59144257:0,0,0,1
chr15	59146745	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:4,9,0,2
chr15	59185929	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr15	59359348	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:2,2,0,1
chr15	59399501	.	CT	C,CTT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30,30;MFRL=135,76,127;MMQ=60,60,60;MPOS=18,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.88,4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,6,5:0.199,0.189:27:9,3,3:2,1,1:11,5,9,2
chr15	59415901	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,1:0,1:0,2,0,3
chr15	59429625	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:10,1:16,1:14,13,1,1
chr15	59464039	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	59464322	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=145,157;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:59464322_G_A:59464322:0,1,0,1
chr15	59464326	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=145,157;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:59464322_G_A:59464322:0,1,0,1
chr15	59464332	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=175,157;MMQ=50,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:59464322_G_A:59464322:0,2,0,1
chr15	59464338	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=175,157;MMQ=50,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:59464322_G_A:59464322:0,2,0,1
chr15	59500970	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:1,4,3,2
chr15	59515434	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,3,15
chr15	59524056	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr15	59548475	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=99.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,19,8
chr15	59664668	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:59664668_C_G:59664668:1,0,1,0
chr15	59664670	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:59664668_C_G:59664668:1,0,1,0
chr15	59664672	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,11;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:59664668_C_G:59664668:1,0,1,0
chr15	59750930	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,0:5,3:0,6,0,3
chr15	59750960	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr15	59752246	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:7,7:9,8:7,9,8,7
chr15	59784648	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	59806473	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:10,0:9,3:19,1,2,1
chr15	59911892	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,10:0,0,6,9
chr15	59912378	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:6,0:1,2:2,6,1,1
chr15	59912625	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,6:0,13:0,0,19,1
chr15	59931429	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:9,8:12,9:6,15,4,13
chr15	59944300	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=144,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr15	59960261	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.453:62:19,16:15,12:19,15,24,4
chr15	59961570	.	TA	T,TAA	.	.	DP=106;ECNT=2;MBQ=31,32,31;MFRL=151,121,122;MMQ=60,60,60;MPOS=30,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.13,7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:70,3,8:0.045,0.094:81:33,0,1:37,3,6:10,60,1,10
chr15	59961646	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:8,7:7,4:0,15,1,10
chr15	59964798	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=82,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=147.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.972:42:0,21:1,17:1,0,33,8
chr15	59964987	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=72.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,27:0.599:45:8,13:9,14:0,18,3,24
chr15	59970298	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:0,5,0,7
chr15	59972370	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,11;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:59972370_A_C:59972370:1,0,1,0
chr15	59972375	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=115,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:59972370_A_C:59972370:2,0,1,0
chr15	59972380	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.411:5:1,2:1,0:0|1:59972370_A_C:59972370:3,0,2,0
chr15	59972382	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.411:5:1,2:1,0:0|1:59972370_A_C:59972370:3,0,2,0
chr15	59974525	.	CA	C,CAA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,34,33;MFRL=141,148,159;MMQ=60,60,50;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.04,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,2:0.182,0.135:19:6,1,1:7,2,1:14,0,5,0
chr15	59974566	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=108,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.527:46:10,12:9,8:17,5,21,3
chr15	59974613	.	A	G	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,6:0.076:90:47,6:35,0:47,37,6,0
chr15	59974777	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=203,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.424:12:2,3:4,1:0,7,0,5
chr15	59981719	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr15	60297360	.	CT	GC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=125,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,2:4,0:0|1:60297360_CT_GC:60297360:6,7,1,1
chr15	60297363	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:60297360_CT_GC:60297360:5,7,1,1
chr15	60298221	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	60641495	.	AA	GC,ATTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33,31;MFRL=219,133,184;MMQ=60,36,60;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr15	60641497	.	A	AAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=176,184;MMQ=48,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr15	60643302	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=115,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr15	60643853	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:11,9:3,4:14,0,13,0
chr15	60644726	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:12,2:11,1:0,23,0,3
chr15	60648214	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:15,7:9,9:8,16,7,10
chr15	60649266	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr15	60649421	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:1,8,0,2
chr15	60678298	.	T	A	.	.	DP=101;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=317.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,94:0.990:94:0,48:0,45:0,0,16,78
chr15	60678328	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=170.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,21:0,28:0,0,2,48
chr15	60678350	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,0,29
chr15	60715800	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.308:40:10,5:15,7:23,5,10,2
chr15	60728246	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,1:5,9:11,1,10,0
chr15	60747254	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:9,4,2,0
chr15	60748755	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=164,164;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:60748755_T_A:60748755:3,0,1,0
chr15	60748759	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=164,164;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:60748755_T_A:60748755:3,0,1,0
chr15	60748763	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=164,164;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60748755_T_A:60748755:3,0,1,0
chr15	60758944	.	A	AGCCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=185,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:60758944_A_AGCCTC:60758944:0,1,0,1
chr15	60758946	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:60758944_A_AGCCTC:60758944:0,1,0,1
chr15	60803806	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=130,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,0:10,2:11,13,0,2
chr15	60824108	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,13:0,5:0,0,2,16
chr15	60850320	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	62211450	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,18,1
chr15	62228696	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	62239304	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	62243090	.	A	AATAT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AT;STR;TLOD=185.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.979:42:0,15:0,23:0,0,41,1
chr15	62256244	.	TG	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=278,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr15	62270765	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr15	62361601	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=216,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:62361601_G_GT:62361601:0,1,0,1
chr15	62361604	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=216,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:62361601_G_GT:62361601:0,1,0,1
chr15	62361609	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62361601_G_GT:62361601:0,0,0,1
chr15	62456358	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	62939440	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	62967342	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr15	62967395	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr15	62967554	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,4:0,9:0,1,1,12
chr15	62986451	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:6,2,3,0
chr15	62989789	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=168,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr15	62993466	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.456:31:12,8:5,6:2,15,5,9
chr15	62994428	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr15	62994928	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,4:5,7:9,1,8,3
chr15	63004025	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,5:2,1:2,0,6,0
chr15	63004295	.	T	TTGTTTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:2,4,0,2
chr15	63009733	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.574:24:7,9:3,4:9,1,12,2
chr15	63014548	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=104,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.476:36:13,8:5,9:11,8,8,9
chr15	63030398	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,5,1
chr15	63044637	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,0,21
chr15	63054439	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,7:0,5:0,0,13,1
chr15	63063141	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:0,1:2,0,2,0
chr15	63075920	.	CTGTGTGTG	C,CTG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31,33;MFRL=119,145,113;MMQ=60,60,60;MPOS=23,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,9,10;RU=TG;STR;TLOD=6.87,30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,10:0.181,0.654:15:0,1,4:0,1,6:2,0,11,2
chr15	63076162	.	G	GACAGCATATCTTTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr15	63131237	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr15	63349096	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,1:1,2:1,0,3,1
chr15	63349132	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:2,3,4,0
chr15	63351687	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr15	63358047	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.386:10:2,0:4,0:2,4,4,0
chr15	63363401	.	C	CATTTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=105.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,15:0,0,7,20
chr15	63413973	.	T	TGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63413973_T_TGCC:63413973:0,0,1,0
chr15	63413978	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63413973_T_TGCC:63413973:0,0,1,0
chr15	63413983	.	CGT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:63413973_T_TGCC:63413973:0,0,1,0
chr15	63413989	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:63413973_T_TGCC:63413973:0,0,1,0
chr15	63447932	.	TAA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.116:23:8,1:4,0:3,18,0,2
chr15	63449629	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=142,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,4:13,0:5,16,1,3
chr15	63547859	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,10:0,0,0,16
chr15	63554820	.	ATG	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=165,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.079:35:18,0:11,2:0|1:63554820_ATG_A:63554820:29,4,2,0
chr15	63554824	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=100.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,33:0.921:35:0,17:2,13:1|0:63554820_ATG_A:63554820:2,0,29,4
chr15	63578709	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=166,196;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.318:4:1,0:1,0:0|1:63578709_C_CT:63578709:2,1,1,0
chr15	63578726	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=18,16;MFRL=166,196;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:0,0:0|1:63578709_C_CT:63578709:2,1,1,0
chr15	63578729	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=16,19;MFRL=166,196;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:0,0:0|1:63578709_C_CT:63578709:2,1,1,0
chr15	63578868	.	T	TGAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:6,2:1,0:2,5,1,1
chr15	63631169	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:1,6,0,5
chr15	63848805	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=92.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,16:0,0,23,4
chr15	63893446	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,22616036;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	63907940	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,6:3,0:4,2,4,3
chr15	63908799	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	63916624	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	63922752	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,19:0,25:0,0,27,18
chr15	63930798	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,0:2,3:2,3,2,1
chr15	63935149	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.440:39:10,6:11,11:20,2,14,3
chr15	63937657	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.455:29:5,4:10,9:11,5,11,2
chr15	63948618	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63948618_T_TC:63948618:0,0,0,1
chr15	63948619	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63948618_T_TC:63948618:0,0,0,1
chr15	63958762	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,0,11
chr15	63966513	.	CAA	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=141,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.088:41:10,1:18,2:27,11,1,2
chr15	63966997	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,4:0.073:66:27,2:34,2:28,34,0,4
chr15	63984772	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,0:6,4:2,12,1,3
chr15	63998863	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,4:5,2:4,1,6,0
chr15	63998914	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=35,34,34;MFRL=176,175,163;MMQ=60,60,60;MPOS=24,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=T;STR;TLOD=57.59,6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,23,4:0.576,0.126:37:7,13,3:3,10,1:10,0,27,0
chr15	64011104	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.678:16:2,5:2,6:1,4,3,8
chr15	64017798	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=124,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr15	64019758	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:1,2:4,0,4,0
chr15	64020073	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,6:0,17:0,0,0,23
chr15	64039050	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:6,1,6,1
chr15	64039879	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:4,1,3,1
chr15	64050300	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0,0,12,0
chr15	64056437	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:1,5,1,3
chr15	64218141	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:7,1:9,2:13,4,2,1
chr15	64275645	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=238,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr15	64367745	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:2,2:4,3:0|1:64367745_T_C:64367745:1,5,1,5
chr15	64367748	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:2,1:4,4:0|1:64367745_T_C:64367745:1,5,1,5
chr15	64367775	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr15	64381148	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=222,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr15	64410484	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,0:2,6:0,4,0,6
chr15	64418221	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr15	64419304	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr15	64428657	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,5:5,5:1,10,2,8
chr15	64448365	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,8:0,14:0,0,5,18
chr15	64668897	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:6,3:14,0:14,6,1,2
chr15	64673330	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=200,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,3:1,2,1,3
chr15	64706259	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr15	64716364	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,1:11,2:12,14,0,3
chr15	64737103	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr15	64972770	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=65,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:64972770_G_C:64972770:2,0,1,0
chr15	64972776	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:64972770_G_C:64972770:4,0,1,0
chr15	64972782	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:64972770_G_C:64972770:4,0,1,0
chr15	64973611	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:0,1:2,2:0,2,2,2
chr15	64983848	.	T	TCCTGTGTATGAATCACACTTTTCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=233,149;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr15	65041786	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	65054533	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr15	65054562	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	65054571	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	65108652	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	65108707	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=334,264;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr15	65110362	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:1,2,2,2
chr15	65110391	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,4,1
chr15	65113493	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,3:3,3:5,5,1,5
chr15	65113764	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=136,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=24,18;RU=T;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.600:5:0,2:0,0:0,2,0,3
chr15	65153595	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr15	65204216	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr15	65268719	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=211,152;MMQ=55,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.194:24:4,0:15,4:20,0,4,0
chr15	65268756	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=168,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:11,3:25,0:36,0,3,0
chr15	65268933	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:7,8:8,11:0,15,0,20
chr15	65268979	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr15	65273399	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:1,4,0,3
chr15	65295300	.	CAAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0|1:65295300_CAAAAA_C:65295300:0,0,1,0
chr15	65295329	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=212,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:65295300_CAAAAA_C:65295300:1,0,1,0
chr15	65295349	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:4,0,4,0
chr15	65297187	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,4:14,0:23,7,4,0
chr15	65312603	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=24,10;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.117:46:11,0:13,0:16,24,0,6
chr15	65312614	.	CA	C,AA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=26,20,16;MFRL=114,143,157;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.58,6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,9,7:0.321,0.205:27:4,0,0:4,5,0:3,8,2,14
chr15	65344035	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	65350743	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr15	65350968	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=84.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.957:26:0,12:0,13:0,1,16,9
chr15	65357491	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr15	65370407	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	65449169	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,17,4
chr15	65477364	.	AC	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,5:0.097:59:18,3:19,2:23,31,3,2
chr15	65477368	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=114.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,40:0.659:60:10,22:10,18:4,16,21,19
chr15	65490577	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:8,10,2,0
chr15	65490901	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,3:0,0,5,9
chr15	65500092	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=129,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.122:23:6,2:11,0:8,13,0,2
chr15	65563457	.	GATAAT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=165,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr15	65621643	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:2,1,1,0
chr15	65622018	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	65624228	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	65624259	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr15	65625774	.	GGATGGGT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,12;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr15	65678112	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:8,0,3,1
chr15	65678366	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=122,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:9,2:7,0:15,1,0,3
chr15	65684802	.	G	GTTGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	65744293	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=124,115;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:8,0:2,0:4,9,3,0
chr15	65744301	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=86,119;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.182:17:10,0:2,0:4,10,3,0
chr15	65744309	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=124,117;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,0:4,0:7,14,2,0
chr15	65756072	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:3,1,5,0
chr15	65759620	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:2,2:1,5:0,4,2,5
chr15	65771454	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.665:19:3,7:3,5:0,6,0,13
chr15	65782451	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,3:4,0,5,0
chr15	65790322	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,0:7,2:7,14,1,1
chr15	65804986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr15	65871698	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.450:13:3,2:4,2:7,0,6,0
chr15	65888223	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr15	65897661	.	G	GGGGTGGTGCAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr15	65899420	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=210,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr15	65917800	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,52;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:11,10,0,2
chr15	65931908	.	A	ACTGAGGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=70,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,3:0,1:2,0,5,0
chr15	65936883	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:1,5:3,2:1,3,0,9
chr15	65942657	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,4,1
chr15	65944191	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr15	65956602	.	TAAA	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=A;STR;TLOD=59.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,17:0.353:49:16,12:14,5:29,3,16,1
chr15	65959729	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:4,1,8,0
chr15	65960195	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	65960548	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=181,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:1,2:2,1:0,5,0,3
chr15	65982677	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr15	65994034	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:14,14:7,7:20,1,19,2
chr15	65994602	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,179;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:9,2,4,0
chr15	65998371	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:5,5:3,2:7,2,6,1
chr15	66007972	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,4:0,0,4,12
chr15	66008000	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=197,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr15	66010379	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:0,3,0,6
chr15	66025010	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	66030364	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:66030364_T_C:66030364:0,0,0,2
chr15	66030374	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=195,261;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:66030364_T_C:66030364:0,1,0,1
chr15	66030384	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=195,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:66030364_T_C:66030364:0,1,0,1
chr15	66031024	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,25:0.533:47:6,12:15,13:19,3,23,2
chr15	66044655	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=108,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,0:4,4:3,3,3,1
chr15	66198552	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr15	66208422	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=181,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,0:0,2:1,0,3,0
chr15	66249807	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	66257236	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:3,2,3,1
chr15	66386798	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:7,8:12,6:8,11,9,5
chr15	66386853	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=99.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0,0,6,24
chr15	66601254	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr15	66604032	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	66604282	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,156;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:7,2:2,15,0,2
chr15	66612818	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr15	66624155	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=196,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr15	66633745	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=147,160;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:66633745_G_T:66633745:0,4,0,1
chr15	66633747	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=147,160;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:66633745_G_T:66633745:0,4,0,1
chr15	66641307	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:9,3:10,3:18,1,6,0
chr15	66641322	.	GT	CA	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=146,174;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.096:44:17,4:20,1:30,9,5,0
chr15	66643979	.	C	CT,CTT	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=20,20,20;MFRL=181,140,168;MMQ=60,60,50;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=T;STR;TLOD=17.00,5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,11,4:0.590,0.251:18:1,6,1:1,3,1:0,3,3,12
chr15	66644014	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=184,173;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:12,2:5,0:0|1:66644014_C_T:66644014:0,17,0,2
chr15	66644015	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=184,173;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:12,1:4,0:0|1:66644014_C_T:66644014:0,17,0,2
chr15	66645341	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr15	66727597	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,12:0,0,5,19
chr15	66735551	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr15	66779734	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=172,185;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:66779734_T_C:66779734:0,4,0,1
chr15	66779742	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=172,185;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:66779734_T_C:66779734:0,4,0,1
chr15	66792761	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,2,16
chr15	66793480	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr15	66793677	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr15	66794037	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr15	66794298	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:0,0:1,1:0,7,0,2
chr15	66795937	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,0,20
chr15	66801309	.	GCT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,10:0,2:0,0,0,12
chr15	66806308	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr15	66806517	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr15	66813585	.	C	CAGCAATTAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=210,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:66813585_C_CAGCAATTAG:66813585:0,1,0,1
chr15	66813589	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=210,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:66813585_C_CAGCAATTAG:66813585:0,1,0,1
chr15	66813626	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	66813629	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	66815908	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	66821174	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,7:0,0,18,2
chr15	66824526	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=105.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,11:0,20:0,0,28,3
chr15	66824553	.	TC	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=132,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:18,0:25,2:32,12,2,0
chr15	66842376	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,3:0.047:83:39,0:40,3:53,27,1,2
chr15	66995573	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,7:0.098:58:24,1:17,1:10,41,7,0
chr15	67008737	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:6,5:4,4:10,2,6,3
chr15	67073851	.	T	TTG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=183,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:2,2:1,0:0|1:67073851_T_TTG:67073851:0,3,1,1
chr15	67073854	.	T	TGGGGCCACTTGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=183,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:67073851_T_TTG:67073851:0,3,1,1
chr15	67073857	.	T	TGGGCTCCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=183,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:67073851_T_TTG:67073851:0,3,0,1
chr15	67457265	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,0:5,2:7,5,0,2
chr15	67457485	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr15	67459265	.	TCTTCGC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=177,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:67459265_TCTTCGC_T:67459265:0,2,0,1
chr15	67459274	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:67459265_TCTTCGC_T:67459265:0,1,0,1
chr15	67459279	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:67459265_TCTTCGC_T:67459265:0,1,0,1
chr15	67482695	.	AA	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=10,16;MFRL=246,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:0|1:67482695_AA_TG:67482695:1,0,1,0
chr15	67482699	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,10;MFRL=246,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:0|1:67482695_AA_TG:67482695:1,0,1,0
chr15	67482702	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,10;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:67482695_AA_TG:67482695:0,0,1,0
chr15	67482705	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,18;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:67482695_AA_TG:67482695:0,0,1,0
chr15	67482707	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:67482695_AA_TG:67482695:0,0,1,0
chr15	67482709	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,19;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:67482695_AA_TG:67482695:0,0,1,0
chr15	67501782	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,5,5
chr15	67501977	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	67713869	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:16,2:8,0:12,12,2,0
chr15	67768151	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr15	67768242	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=212,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,0:0,3,0,2
chr15	67782440	.	AGGAAAT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:4,3:3,3:2,5,2,4
chr15	67885144	.	GATGTGAAGAA	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,18:0.502:36:7,8:7,10:0|1:67885144_GATGTGAAGAA_G:67885144:17,1,17,1
chr15	67885155	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,18:0.515:35:9,8:7,10:0|1:67885144_GATGTGAAGAA_G:67885144:16,1,17,1
chr15	67933892	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,6:5,6:0,9,0,12
chr15	67984705	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,3:1,6:4,0,9,0
chr15	68041070	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:68041070_A_G:68041070:0,0,0,4
chr15	68041073	.	T	TAGTGTGTTGTGTGGGGTGTGTGGTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=224,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:68041070_A_G:68041070:0,3,0,1
chr15	68121620	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	68122509	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr15	68346549	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	68445912	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,17,1
chr15	68475930	.	CT	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.084:57:23,2:22,2:50,3,3,1
chr15	68492028	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.721:16:2,4:2,7:3,1,4,8
chr15	68500835	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	68501928	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr15	68603625	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,12:0,4:0,0,13,3
chr15	68605067	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr15	68609567	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=14,23;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.592:3:0,1:0,0:1,0,2,0
chr15	68618961	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr15	68624175	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr15	68624641	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr15	68631740	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	68649587	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,10,15
chr15	68656960	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	68656985	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:68656985_A_C:68656985:0,0,2,0
chr15	68656990	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:68656985_A_C:68656985:0,0,2,0
chr15	68656995	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:68656985_A_C:68656985:0,0,2,0
chr15	68657001	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:68656985_A_C:68656985:1,0,2,0
chr15	68657005	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:0|1:68656985_A_C:68656985:3,0,2,0
chr15	68661707	.	G	GGCGCAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr15	68724262	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	68937441	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr15	69007656	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,2,9
chr15	69011389	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:69011389_A_G:69011389:0,0,4,0
chr15	69011394	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:69011389_A_G:69011389:0,0,4,0
chr15	69011918	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:1,5,0,3
chr15	69076650	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=77,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr15	69076656	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=89,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.624:6:1,0:1,1:0|1:69076656_A_C:69076656:2,0,4,0
chr15	69076660	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=18,13;MFRL=89,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.624:6:0,0:1,1:0|1:69076656_A_C:69076656:2,0,4,0
chr15	69076663	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=17,32;MFRL=154,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:1,0:1,1:5,0,1,0
chr15	69076666	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,15;MFRL=163,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:4,0,1,0
chr15	69080062	.	A	ACCCGCCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=13,13;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:69080062_A_ACCCGCCC:69080062:2,0,2,0
chr15	69080064	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:69080062_A_ACCCGCCC:69080062:2,0,2,0
chr15	69080069	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=112,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:0,0:0|1:69080062_A_ACCCGCCC:69080062:5,0,2,0
chr15	69112971	.	G	GCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=101,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CA;STR;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:1,1,7,1
chr15	69327873	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.423:7:0,0:2,0:2,2,0,3
chr15	69327998	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr15	69329623	.	GA	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr15	69347593	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr15	69349087	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr15	69548046	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:69548046_TA_T:69548046:0,0,2,0
chr15	69548061	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=218,204;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:69548046_TA_T:69548046:2,0,1,0
chr15	69676944	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr15	69692511	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69692511_C_A:69692511:0,1,0,1
chr15	69692513	.	G	GATCATGTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69692511_C_A:69692511:0,1,0,1
chr15	69696038	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:8,0:12,3:8,13,0,3
chr15	69696249	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr15	69709686	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chr15	69715487	.	TC	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.116:31:10,2:18,1:19,9,2,1
chr15	69715488	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,12:0,20:0,0,21,11
chr15	69732483	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.820:7:0,2:0,3:0,1,0,6
chr15	69732736	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,16,5
chr15	69747675	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,6,13
chr15	70344616	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	70344800	.	C	CTAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=124,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.325:7:3,2:2,0:0|1:70344800_C_CTAA:70344800:2,3,1,1
chr15	70344801	.	G	GACTGATACTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=124,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.325:7:3,1:2,0:0|1:70344800_C_CTAA:70344800:2,3,1,1
chr15	70347303	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr15	70347362	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr15	70349744	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:5,1:5,1:8,2,2,0
chr15	70350457	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:3,3:5,2:6,2,3,2
chr15	70351788	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,110;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:4,4,5,1
chr15	70366862	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,1:6,2:10,5,2,1
chr15	70368571	.	A	ATGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGC;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	70368577	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:70368577_A_C:70368577:0,1,0,1
chr15	70368580	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,34;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.512:2:0,1:1,0:0|1:70368577_A_C:70368577:0,1,0,1
chr15	70368582	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,34;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:70368577_A_C:70368577:0,1,0,1
chr15	70368584	.	C	CTGGGTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=36,34;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:70368577_A_C:70368577:0,1,0,1
chr15	70388449	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,2:0,0,6,1
chr15	70388471	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,3:2,0:8,2,3,0
chr15	70388477	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,1:4,0:10,3,2,0
chr15	70388620	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:2,2,0,1
chr15	70957020	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:11,7:11,9:14,8,9,8
chr15	70963356	.	TA	T,TAA	.	.	DP=124;ECNT=1;MBQ=31,32,29;MFRL=134,151,119;MMQ=60,60,60;MPOS=25,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=10.01,7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:85,9,13:0.086,0.100:107:40,6,5:40,3,6:62,23,15,7
chr15	71124505	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:2,7,3,4
chr15	71125093	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=132,143;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.271:24:8,1:9,5:6,12,1,5
chr15	71175296	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr15	71185837	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.653:30:3,10:7,8:10,0,20,0
chr15	71185853	.	CTT	C,CT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,33,33;MFRL=170,158,117;MMQ=60,60,60;MPOS=24,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=40.96,6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,17,4:0.625,0.194:25:1,9,3:3,8,1:3,1,21,0
chr15	71276480	.	GCAA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAA;STR;TLOD=144.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,21:0,12:0,0,21,12
chr15	71276573	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,162;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:17,0:10,2:5,22,0,2
chr15	71535458	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.480:21:6,5:5,5:3,8,3,7
chr15	71548937	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,6:7,3:10,4,7,2
chr15	72023422	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=86.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,22,4
chr15	72037610	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr15	72050163	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	72050436	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:5,10:8,5:5,8,7,9
chr15	72050508	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:0,1:6,2:0,6,0,3
chr15	72104806	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,2:10,0:7,15,0,2
chr15	72105928	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,4,5
chr15	72143693	.	TGAAGGCCTAAAAACAGTAAGAGCAGAAACTAAGACTAAATATCCCCCCTTATACAGTGTATCTTCCTCCCAGACACTATGAAGCAAA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.144:28:10,1:6,4:3,17,2,6
chr15	72147004	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:72147004_CTG_C:72147004:0,1,0,1
chr15	72147007	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:72147004_CTG_C:72147004:0,1,0,1
chr15	72172798	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,4:3,7:4,6,4,7
chr15	72172986	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=273,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr15	72191266	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,10,16
chr15	72227837	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,4:6,1:4,6,0,5
chr15	72252189	.	TAAA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	72252498	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr15	72292115	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr15	72302667	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.649:35:6,8:6,15:12,0,22,1
chr15	72431883	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr15	72433386	.	C	CTCCTGACCGTGCAGCACGGGTTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	72433395	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	72454729	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,2,8
chr15	72462165	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr15	72462350	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr15	72492779	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr15	72543140	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,18;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.822:3:0,0:0,0:0|1:72543140_C_G:72543140:0,0,3,0
chr15	72543144	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.812:3:0,1:0,0:0|1:72543140_C_G:72543140:0,0,3,0
chr15	72543149	.	CTCA	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=26,13;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.575:5:1,1:1,0:0|1:72543140_C_G:72543140:2,0,3,0
chr15	72543155	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:1,0:0|1:72543140_C_G:72543140:3,0,2,0
chr15	72543160	.	CACTG	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,1:4,1:0|1:72543140_C_G:72543140:5,4,2,0
chr15	72543167	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=33,23;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,1:5,0:0|1:72543140_C_G:72543140:5,5,2,0
chr15	72543640	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:72543640_T_A:72543640:0,1,0,1
chr15	72543656	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72543640_T_A:72543640:0,0,0,1
chr15	72545876	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr15	72546765	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,10,2
chr15	72548765	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:9,0,5,0
chr15	72556799	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr15	72556847	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:4,1,2,1
chr15	72558307	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,0:10,3:12,4,2,2
chr15	72559243	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:0,6,2,3
chr15	72559862	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,0:14,3:9,16,2,1
chr15	72581602	.	G	GAGAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=118,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:1,2,1,1
chr15	72637795	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,15,5
chr15	72638892	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:1,15:0,6:1,0,12,9
chr15	72641683	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.473:3:1,1:0,0:0|1:72641683_AC_A:72641683:0,2,0,1
chr15	72641684	.	CAAAGCAAGACAAGTGTATTCATAAACA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=307,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.519:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr15	72641688	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:72641683_AC_A:72641683:0,0,0,1
chr15	72641691	.	A	AAATACAAAATTTGATTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:72641683_AC_A:72641683:0,0,0,1
chr15	72642905	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,10:7,4:8,4,7,7
chr15	72691085	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,1:7,1:7,10,2,0
chr15	72864578	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.665:7:1,2:1,2:0,2,0,5
chr15	72875521	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr15	72879653	.	A	ATTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=51.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr15	72958248	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,182;MMQ=24,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,1:10,2:15,2,2,1
chr15	72987636	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:4,1:8,1:0,17,0,4
chr15	73004739	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=216,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr15	73020170	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	73028367	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=179,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:73028367_C_G:73028367:0,6,0,2
chr15	73028375	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0|1:73028367_C_G:73028367:0,0,0,8
chr15	73029068	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,3:2,4:5,1,5,2
chr15	73044594	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	73047881	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:3,9:7,3:7,3,8,4
chr15	73048529	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr15	73048556	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=142,197;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:3,6:4,2:6,2,4,4
chr15	73409213	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,97;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.400:12:3,0:2,3:2,5,1,4
chr15	73414985	.	C	CAAA	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=A;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:20,0:13,2:0|1:73414985_C_CAAA:73414985:17,18,1,1
chr15	73414989	.	C	CT	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:20,0:13,2:0|1:73414985_C_CAAA:73414985:17,20,1,1
chr15	73414991	.	C	CAA	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:20,0:14,2:0|1:73414985_C_CAAA:73414985:18,20,1,1
chr15	73414993	.	TC	T	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:20,0:15,1:0|1:73414985_C_CAAA:73414985:17,19,1,1
chr15	73415018	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:17,2:14,0:15,16,0,2
chr15	73415236	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=201,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:73415236_C_CTT:73415236:0,3,0,1
chr15	73415237	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=201,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:73415236_C_CTT:73415236:0,3,0,1
chr15	73415241	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=201,228;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:73415236_C_CTT:73415236:0,3,0,1
chr15	73428204	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.649:3:0,1:1,0:1,0,1,1
chr15	73528937	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	73541513	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr15	73545714	.	ATT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:73545714_ATT_A:73545714:1,0,2,0
chr15	73545732	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:0,0:0|1:73545714_ATT_A:73545714:1,0,3,0
chr15	73551250	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr15	73552520	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:5,0,2,0
chr15	73562842	.	A	ATTACCTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:73562842_A_ATTACCTTCTT:73562842:0,1,0,1
chr15	73562843	.	G	GCCCT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,33;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:73562842_A_ATTACCTTCTT:73562842:0,1,0,1
chr15	73562844	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=36,30;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:73562842_A_ATTACCTTCTT:73562842:0,1,0,1
chr15	73562889	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=265,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73562889_G_A:73562889:0,1,0,1
chr15	73562891	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=265,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73562889_G_A:73562889:0,1,0,1
chr15	73562892	.	A	AAGTAG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=265,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73562889_G_A:73562889:0,1,0,1
chr15	73562896	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=265,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73562889_G_A:73562889:0,1,0,1
chr15	73566942	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr15	73567137	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=77,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,3:0,1:0,2,0,4
chr15	73580950	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr15	73580985	.	A	ATTGTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73580985_A_ATTGTC:73580985:0,2,0,1
chr15	73580986	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73580985_A_ATTGTC:73580985:0,2,0,1
chr15	73581444	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,3,1
chr15	73595089	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,1:5,2:0,10,0,3
chr15	73614934	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.547:46:12,16:7,9:13,8,15,10
chr15	73616635	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,0,16
chr15	73635748	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:9,5,1,1
chr15	73852153	.	G	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.107:62:31,2:24,4:32,24,4,2
chr15	74000839	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.388:13:4,3:4,2:4,4,1,4
chr15	74032179	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=2776809,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=AT;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr15	74032234	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,2,1
chr15	74032969	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=112,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:9,1:4,1:5,9,0,2
chr15	74033033	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=104,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:0,1,0,10
chr15	74173972	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,1,0
chr15	74176453	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	74178966	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:6,2:2,1:2,6,0,3
chr15	74179024	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr15	74181330	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=84,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:3,2,2,0
chr15	74219546	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	74239307	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr15	74241749	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,4:6,9:12,1,12,1
chr15	74244278	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	74277666	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=197,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,4:6,7:6,1,9,2
chr15	74284406	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,17:0,7:0,0,24,0
chr15	74284459	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.107:40:13,1:21,2:30,6,3,1
chr15	74317362	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,0,19
chr15	74365264	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:74365264_T_G:74365264:0,0,0,7
chr15	74365266	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=163,185;MMQ=24,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0|1:74365264_T_G:74365264:0,4,0,3
chr15	74367358	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr15	74367388	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:74367388_C_G:74367388:0,0,0,1
chr15	74367390	.	C	CTGCTTTCCCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74367388_C_G:74367388:0,0,0,1
chr15	74426760	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=201,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:74426760_C_G:74426760:1,2,1,0
chr15	74426766	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=201,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:74426760_C_G:74426760:1,2,1,0
chr15	74426768	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=201,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:74426760_C_G:74426760:1,2,1,0
chr15	74426778	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,17;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:74426760_C_G:74426760:3,1,1,0
chr15	74473023	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	74473073	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:3,2,5,1
chr15	74473302	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:0,3:2,2,1,3
chr15	74474838	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr15	74477216	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr15	74483415	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	74487846	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=120,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:2,2,4,1
chr15	74488252	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=142,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr15	74488303	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:3,0,1,0
chr15	74494684	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=238,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:1,3:0,3,0,6
chr15	74528985	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr15	74529130	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr15	74529219	.	G	GATTTGACCGATTTGCTTTTATGCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	74536285	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=104,175;MMQ=40,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.706:5:0,1:1,2:1,0,3,1
chr15	74536400	.	TAAG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=82.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,8,12
chr15	74558926	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	74572242	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr15	74572917	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr15	74588024	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	74610951	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=113,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.225:18:7,0:4,0:4,10,4,0
chr15	74610967	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=113,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.173:19:10,0:5,0:7,9,3,0
chr15	74622457	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=51,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,2:1,8:2,0,8,2
chr15	74623272	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr15	74623302	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=145,95;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:2,3,1,2
chr15	74623582	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=134,91;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:0|1:74623582_G_C:74623582:8,6,0,2
chr15	74623584	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=134,91;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:4,2:0|1:74623582_G_C:74623582:8,6,0,2
chr15	74628442	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=193,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74628442_G_T:74628442:0,1,0,1
chr15	74628446	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=193,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74628442_G_T:74628442:0,1,0,1
chr15	74635505	.	AGT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1,2,1,0
chr15	74636226	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,2:9,0:10,9,0,2
chr15	74637345	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=223,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.757:5:0,0:0,0:1,0,4,0
chr15	74710593	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr15	74711168	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:3,3,1,1
chr15	75014717	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,1:7,10,2,0
chr15	75044238	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:8,6:5,9:1,12,2,13
chr15	75044674	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:75044674_GCA_G:75044674:0,3,0,1
chr15	75044682	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:75044674_GCA_G:75044674:0,3,0,1
chr15	75111216	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=191,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:75111216_G_A:75111216:0,2,0,1
chr15	75111221	.	CAC	TGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=191,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:75111216_G_A:75111216:0,2,0,1
chr15	75111226	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=213,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:75111216_G_A:75111216:0,1,0,1
chr15	75111230	.	A	AGCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75111216_G_A:75111216:0,0,0,1
chr15	75113460	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:6,6:13,8:9,10,6,8
chr15	75114322	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,265;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr15	75115895	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:2,1:5,2,3,0
chr15	75129973	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=216,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:2,2,0,1
chr15	75130573	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.429:35:11,7:9,6:11,9,9,6
chr15	75132490	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	75140854	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr15	75146816	.	GCC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,0,1
chr15	75183935	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:1,5:7,5:1,7,1,9
chr15	75185670	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:6,5:9,9:3,12,3,11
chr15	75249497	.	T	TC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=180,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.164:20:6,1:10,0:0|1:75249497_T_TC:75249497:3,14,3,0
chr15	75249503	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=188,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.156:21:7,1:9,1:0|1:75249497_T_TC:75249497:4,14,3,0
chr15	75249513	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.137:24:7,0:8,0:0|1:75249497_T_TC:75249497:7,14,3,0
chr15	75249515	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.144:23:7,0:9,1:0|1:75249497_T_TC:75249497:7,13,3,0
chr15	75249873	.	G	GAAAATGGAATGAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.242:7:1,1:4,0:0,6,0,1
chr15	75308837	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr15	75309187	.	CCCTCCCCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	75311036	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=228,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr15	75311040	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=169,253;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr15	75582732	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=150,159;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0,4,0,1
chr15	75586367	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=218,203;MMQ=24,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:0,5,0,2
chr15	75630562	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=198,223;MMQ=51,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,4:5,3:12,1,3,4
chr15	75630635	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=160,179;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:0,6,1,4
chr15	75648535	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:13,0:5,2:14,4,1,1
chr15	75650466	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=191,371;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,0,2
chr15	75650972	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=88,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr15	75651022	.	C	CCCACATGCTGCCCAGCCCATA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,13:0,3:0,0,11,8
chr15	75653378	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr15	75664570	.	AA	TT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,3:0,10:0,0,0,15
chr15	75703965	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:24,3:22,0:22,25,3,0
chr15	75809583	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=126,7838285;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:10,6,2,0
chr15	75890612	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	75890689	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,6,1
chr15	75897441	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:23,3:11,0:27,7,3,0
chr15	75902434	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	75909933	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=155,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.204:26:10,2:10,3:3,18,0,5
chr15	75909959	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,1:9,1:1,21,0,2
chr15	75913430	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr15	75967814	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	75970261	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=152,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:75970261_G_T:75970261:0,1,0,1
chr15	75970265	.	A	AGGGAAACAGAGACAAAGTGAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=152,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:75970261_G_T:75970261:0,1,0,1
chr15	75980112	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,9:0,0,13,8
chr15	75981658	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=128,113;MMQ=60,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:1,4,2,1
chr15	76136194	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=203,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr15	76175828	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=195.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,20:0,35:0,0,1,54
chr15	76182949	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr15	76183191	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,7:4,3:7,0,8,2
chr15	76191644	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr15	76191852	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr15	76197071	.	A	ATCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	76222139	.	AG	GT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=175,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0|1:76222139_AG_GT:76222139:5,0,3,0
chr15	76222140	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,8:0.898:8:0,4:0,4:1|0:76222139_AG_GT:76222139:0,0,8,0
chr15	76248427	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.835:3:0,1:0,1:0|1:76248427_GT_G:76248427:0,0,0,3
chr15	76248448	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:76248427_GT_G:76248427:0,4,0,1
chr15	76248451	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:76248427_GT_G:76248427:0,4,0,1
chr15	76462286	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=126,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr15	76484211	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,230;MMQ=60,53;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76484211_A_C:76484211:0,0,1,0
chr15	76484216	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,230;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76484211_A_C:76484211:0,0,1,0
chr15	76484222	.	AT	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=233,230;MMQ=60,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:76484211_A_C:76484211:1,0,1,0
chr15	76484535	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr15	76518346	.	C	CCCTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr15	76576060	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=97.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,30:0.539:56:9,16:15,14:21,5,26,4
chr15	76584686	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.366:17:5,3:5,3:11,0,6,0
chr15	76630690	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	76632907	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr15	76634237	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=229,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:76634237_G_T:76634237:0,1,0,1
chr15	76634245	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76634237_G_T:76634237:0,0,0,1
chr15	76673627	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr15	76957958	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=220.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,31:0,29:0,0,55,5
chr15	77064389	.	TGAA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	77085740	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr15	77224408	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	77234101	.	CT	C,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28,21;MFRL=153,192,195;MMQ=60,60,60;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.57,4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,3:0.199,0.265:12:3,2,1:4,0,2:2,5,0,5
chr15	77241568	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr15	77310636	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr15	77322989	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:77322989_G_A:77322989:0,4,0,1
chr15	77322992	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:77322989_G_A:77322989:0,4,0,1
chr15	77322993	.	C	CTCTAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:77322989_G_A:77322989:0,4,0,1
chr15	77323009	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	77328108	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr15	77344793	.	TA	AA,AC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31,27;MFRL=144,116,141;MMQ=60,60,60;MPOS=17,31;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=37.44,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,15,2:0.518,0.093:28:7,5,0:4,10,2:9,2,6,11
chr15	77345133	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:10,1:26,1:19,18,2,0
chr15	77406396	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,328;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr15	77471105	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=62,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:2,1:2,4:4,0,5,1
chr15	77770897	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr15	77908192	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	78294163	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,31;MFRL=217,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr15	78295885	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,1:4,1:2,4,0,3
chr15	78301264	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	78301508	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,2:3,1:1,3,1,2
chr15	78301528	.	TCT	AGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:78301528_TCT_AGA:78301528:1,2,0,1
chr15	78301533	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:78301528_TCT_AGA:78301528:1,2,0,1
chr15	78301536	.	A	ACT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:78301528_TCT_AGA:78301528:1,2,0,1
chr15	78305091	.	G	GAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr15	78305718	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr15	78398230	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=94,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,2:3,5:3,3,3,5
chr15	78401534	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:0,2:2,0:0|1:78401534_T_TC:78401534:0,2,0,3
chr15	78401540	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,0:0|1:78401534_T_TC:78401534:0,3,0,3
chr15	78416211	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78416211_T_C:78416211:0,0,0,1
chr15	78416214	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78416211_T_C:78416211:0,0,0,1
chr15	78423596	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.693:7:0,4:1,1:1,1,1,4
chr15	78454795	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	78457242	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr15	78458485	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.920:23:1,9:0,11:0,1,15,7
chr15	78463890	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,3,10
chr15	78472157	.	TCA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=CA;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.886:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	78473309	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	78474517	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	78500306	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:78500306_C_T:78500306:0,1,1,0
chr15	78500310	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=94,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:78500306_C_T:78500306:0,3,1,0
chr15	78500318	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,14;MFRL=94,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:78500306_C_T:78500306:0,3,1,0
chr15	78557005	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	78557086	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	78558509	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	78563103	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr15	78572359	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr15	78580719	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=108,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:15,1:15,1:9,21,1,1
chr15	78581892	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr15	78581938	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,7:4,6:7,3,12,1
chr15	78587910	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr15	78636044	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	78732124	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:4,3,2,0
chr15	78758853	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,10:0,0,2,27
chr15	78758902	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr15	78770836	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr15	78777312	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,3,19
chr15	78786410	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,14:0,0,16,8
chr15	78807231	.	C	CCTCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=CT;STR;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,1:0,0,7,0
chr15	78807252	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,2:0,0,7,0
chr15	78834689	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr15	78836631	.	CTGA	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGA;STR;TLOD=83.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,10:0,7:0,0,3,16
chr15	78836719	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=166,208;MMQ=41,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78836719_A_G:78836719:0,1,0,1
chr15	78836721	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=166,208;MMQ=41,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78836719_A_G:78836719:0,1,0,1
chr15	78839110	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,21;MFRL=203,157;MMQ=41,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.829:9:0,1:0,5:0,1,0,8
chr15	78841198	.	T	C	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=121.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,46:0.503:92:22,18:19,27:25,21,20,26
chr15	78841220	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=81,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=290.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,81:0.957:84:2,38:0,41:1,2,36,45
chr15	78893708	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=146,175;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,3:7,0:11,8,3,0
chr15	78909452	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,5:0,10:0,0,7,8
chr15	78909480	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr15	78909539	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	78911261	.	TG	CA,CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33,28;MFRL=0,125,115;MMQ=60,60,60;MPOS=6,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.51,9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.333,0.558:6:0,2,2:0,0,1:0,0,2,4
chr15	79051754	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=220,80;MMQ=48,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0|1:79051754_C_T:79051754:1,0,1,1
chr15	79051759	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:79051754_C_T:79051754:0,0,2,1
chr15	79054900	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,6,8
chr15	79054911	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=182,117;MMQ=48,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:1,4:0,6:0|1:79054911_A_G:79054911:0,1,4,6
chr15	79054919	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=182,128;MMQ=48,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,2:0,4:0|1:79054911_A_G:79054911:0,1,2,5
chr15	79056526	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr15	79057949	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	79059670	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=72.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,18,2
chr15	79059691	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=120.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,9:0,14:0|1:79059691_G_A:79059691:0,0,25,2
chr15	79059695	.	CG	TC	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=144.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.971:33:0,12:0,17:0|1:79059691_G_A:79059691:0,0,29,4
chr15	79059703	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=120.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,10:0,15:0|1:79059691_G_A:79059691:0,0,24,4
chr15	79063474	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr15	79065380	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr15	79065562	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=148.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.979:41:0,22:0,19:0,0,24,17
chr15	79066932	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr15	79088883	.	ACCC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=93,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=C;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	79088888	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=47,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:79088888_C_CAT:79088888:0,2,0,1
chr15	79088891	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=112,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:79088888_C_CAT:79088888:2,2,0,1
chr15	79165441	.	G	T	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=138.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,50:0.517:97:18,24:26,25:14,33,23,27
chr15	79172744	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr15	79172766	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.694:24:1,11:6,6:7,0,17,0
chr15	79173005	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.544:44:8,11:12,13:1,19,0,24
chr15	79220087	.	C	CTCAT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=194,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:4,0:0|1:79220087_C_CTCAT:79220087:5,5,1,1
chr15	79220089	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=194,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:79220087_C_CTCAT:79220087:5,5,1,1
chr15	79220091	.	GGC	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=194,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:79220087_C_CTCAT:79220087:5,5,1,1
chr15	79220095	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=194,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:4,0:0|1:79220087_C_CTCAT:79220087:5,5,1,1
chr15	79231518	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,9:0,14:0,0,1,33
chr15	79231523	.	G	GA	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=19,18;MFRL=50,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,25:0.841:29:1,1:0,5:0,4,0,25
chr15	79231616	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr15	79237180	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,3:0,0,8,1
chr15	79254480	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr15	79264097	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr15	79273098	.	CC	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	79277247	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	79277298	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr15	79277608	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr15	79288011	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr15	79291262	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr15	79310018	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:79310018_A_C:79310018:0,0,1,0
chr15	79310021	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79310018_A_C:79310018:0,0,1,0
chr15	79310027	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79310018_A_C:79310018:0,0,1,0
chr15	79324419	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr15	79502096	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=106,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:6,1,6,0
chr15	79589174	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,8,7
chr15	79590314	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.533:11:4,3:1,3:5,0,4,2
chr15	79606408	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr15	79750410	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,100;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:5,5,0,2
chr15	80215448	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0|1:80215448_C_T:80215448:3,0,1,0
chr15	80215450	.	T	TGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=193,154;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.597:3:1,1:0,1:1|0:80215448_C_T:80215448:1,0,2,0
chr15	80215455	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,20;MFRL=0,166;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:80215448_C_T:80215448:0,0,2,0
chr15	80215458	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=35,12;MFRL=193,139;MMQ=60,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1|0:80215448_C_T:80215448:1,0,1,0
chr15	80215459	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:80215448_C_T:80215448:0,0,1,0
chr15	80215465	.	G	C,A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,12,13;MFRL=0,193,139;MMQ=60,60,24;MPOS=3,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,0,0:0,0,2,0
chr15	80215469	.	GG	CA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=27,12;MFRL=178,139;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:1,0:1|0:80215448_C_T:80215448:2,2,1,0
chr15	80215472	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=26,14;MFRL=163,139;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.324:4:1,0:2,0:1|0:80215448_C_T:80215448:1,2,1,0
chr15	80216770	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=169,147;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:80216770_T_G:80216770:0,4,0,1
chr15	80216773	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,35;MFRL=169,147;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:80216770_T_G:80216770:0,4,0,1
chr15	80216775	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=169,147;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:80216770_T_G:80216770:0,4,0,1
chr15	80216778	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=34,33;MFRL=169,147;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:80216770_T_G:80216770:0,4,0,1
chr15	80216799	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=257,182;MMQ=50,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr15	80216803	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=29,36;MFRL=202,292;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:80216803_T_C:80216803:0,2,0,1
chr15	80216805	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=222,237;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr15	80216810	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,35;MFRL=222,292;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80216803_T_C:80216803:0,1,0,1
chr15	80216821	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=222,292;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80216803_T_C:80216803:0,1,0,1
chr15	80259955	.	TGTAA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr15	80259964	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr15	80413994	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr15	80414173	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,3,10
chr15	80445292	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=195,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr15	80445547	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.387:4:1,1:2,0:0|1:80445547_G_A:80445547:0,3,0,1
chr15	80445549	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.387:4:1,1:2,0:0|1:80445547_G_A:80445547:0,3,0,1
chr15	80445552	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.387:4:1,1:2,0:0|1:80445547_G_A:80445547:0,3,0,1
chr15	80450328	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:1,3:6,0,5,1
chr15	80450389	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,6:4,3:6,6,5,4
chr15	80452075	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,6:6,3:7,6,7,2
chr15	80452268	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.795:11:1,4:0,5:0,2,1,8
chr15	80452886	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr15	80454745	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=190,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:2,4:0,5,0,6
chr15	80460524	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr15	80460582	.	T	TATATTCTTG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=20,31;MFRL=82,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr15	80460591	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=36,10;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:80460591_C_A:80460591:0,1,1,0
chr15	80460596	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=35,16;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:80460591_C_A:80460591:0,1,1,0
chr15	80460605	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=35,14;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:80460591_C_A:80460591:0,1,1,0
chr15	80460607	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,14;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:80460591_C_A:80460591:0,1,1,0
chr15	80460610	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,13;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:80460591_C_A:80460591:0,1,1,0
chr15	80460613	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,13;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:80460591_C_A:80460591:0,1,1,0
chr15	80470040	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr15	80472431	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr15	80762526	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:6,2,2,0
chr15	80767251	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=161,300;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:80767251_T_G:80767251:2,0,1,0
chr15	80767253	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=161,300;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:80767251_T_G:80767251:2,0,1,0
chr15	80806183	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,4,0
chr15	80845136	.	CT	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:3,6:3,5:1,5,2,9
chr15	80855585	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:5,11,1,1
chr15	80867480	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,2:5,6:1,8,1,7
chr15	80869282	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=104,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,4:5,1:4,7,1,4
chr15	80869337	.	G	GGCTTCCT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:4,0:0|1:80869337_G_GGCTTCCT:80869337:0,12,1,1
chr15	80869339	.	A	AAATGGT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=153,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:0|1:80869337_G_GGCTTCCT:80869337:0,12,1,1
chr15	80987718	.	GGCCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCCA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr15	80988184	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	81176721	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.529:30:8,7:6,8:5,9,4,12
chr15	81179926	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,1075;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	81180981	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.749:18:1,8:3,5:3,1,13,1
chr15	81187286	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:9,2:16,1:27,2,3,0
chr15	81199236	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr15	81225676	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:5,1:16,1:11,11,1,1
chr15	81234741	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr15	81295132	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	81295702	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,120;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:10,0:4,3:1,13,0,3
chr15	81296129	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=21,35;MFRL=179,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,1:6,2:4,11,1,2
chr15	81427705	.	CT	CTTT,C,CTT	.	.	DP=105;ECNT=2;MBQ=31,25,31,35;MFRL=150,191,108,167;MMQ=60,50,60,60;MPOS=17,25,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,15,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.33,12.06,4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:38,2,13,5:0.049,0.199,0.091:58:21,0,8,3:7,1,4,1:7,31,5,15
chr15	81427753	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=172,160;MMQ=43,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:30,3:9,1:0,41,0,4
chr15	81430343	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=195,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:4,0,8,0
chr15	81592448	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=202,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,1,1
chr15	81593818	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.461:28:6,8:8,3:5,10,4,9
chr15	81600995	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,22:0,14:0,0,15,21
chr15	81605563	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,180;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:9,3,0,2
chr15	81611773	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=130,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,0:13,2:16,9,1,1
chr15	81611784	.	C	CAAAGAAA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:14,10,1,1
chr15	81631681	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	81651651	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,19,1
chr15	82335444	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	82337750	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,14;MFRL=149,143;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:82337750_T_A:82337750:1,1,1,0
chr15	82337753	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,13;MFRL=150,143;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:82337750_T_A:82337750:0,1,1,0
chr15	82337756	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,18;MFRL=150,146;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0,1,2,0
chr15	82337758	.	C	CCG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=149,143;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:82337750_T_A:82337750:1,1,1,0
chr15	82337762	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=21,34;MFRL=149,143;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:82337750_T_A:82337750:1,1,1,0
chr15	82337766	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,33;MFRL=149,143;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.405:3:1,1:1,0:0|1:82337750_T_A:82337750:1,1,1,0
chr15	82337769	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,12;MFRL=149,143;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.405:3:1,0:0,0:0|1:82337750_T_A:82337750:1,1,1,0
chr15	82337773	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,12;MFRL=149,143;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:82337750_T_A:82337750:1,1,1,0
chr15	82431219	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr15	82517458	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,157;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,24:0.457:53:13,13:14,11:28,1,23,1
chr15	82517649	.	TA	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,159;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=49.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,24:0.449:54:9,12:15,10:2,28,1,23
chr15	82523358	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr15	82523405	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr15	82530630	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.790:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr15	82532963	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr15	82544927	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,16,0
chr15	82545214	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=61.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,1,19
chr15	82563853	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,4:2,7:6,0,11,0
chr15	82563991	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=213.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,29:0,32:0,0,21,40
chr15	82575493	.	TAATA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=206,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr15	83215134	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=96,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.657:18:1,3:4,8:3,3,11,1
chr15	83215251	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,104;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.361:42:15,3:11,10:11,16,6,9
chr15	83218479	.	T	TGAAGGTTTAATGTTGTAAGTAAGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	83221392	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr15	83240293	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr15	83330873	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:3,4:5,4:9,0,6,2
chr15	83378248	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr15	83431101	.	A	AAAGTCTGTACGAGGTGTGTGGGGAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:83431101_A_AAAGTCTGTACGAGGTGTGTGGGGAGG:83431101:0,1,0,1
chr15	83431104	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:83431101_A_AAAGTCTGTACGAGGTGTGTGGGGAGG:83431101:0,1,0,1
chr15	83441049	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr15	83449089	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=163,149;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.325:13:3,2:3,1:0,9,0,4
chr15	83449142	.	AA	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=201,172;MMQ=52,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:83449142_AA_TG:83449142:0,8,0,2
chr15	83449146	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=201,172;MMQ=52,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,1:1,0:0|1:83449142_AA_TG:83449142:0,8,0,2
chr15	83521036	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,3:0,0,1,9
chr15	83523368	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,5,2
chr15	83543958	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr15	83658832	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=272,232;MMQ=31,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,2:0,2,0,5
chr15	83686759	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:5,7:9,4:14,0,11,0
chr15	83698826	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=113,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:5,2,5,1
chr15	83725224	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:12,9,1,1
chr15	83735926	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	83795672	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=218,253;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:83795672_C_T:83795672:0,2,0,1
chr15	83795680	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=224,253;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:83795672_C_T:83795672:0,1,0,1
chr15	83795683	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=224,253;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:83795672_C_T:83795672:0,1,0,1
chr15	83795693	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,253;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:83795672_C_T:83795672:0,0,0,1
chr15	83795699	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,253;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:83795672_C_T:83795672:0,0,0,1
chr15	83805209	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.181:36:12,4:17,2:26,4,5,1
chr15	84255937	.	C	CAGGGTTTATTGTTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr15	84257351	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr15	84324441	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,5:0,3:0,0,7,2
chr15	84373319	.	C	CAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr15	84442240	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.242:13:5,1:4,1:10,0,2,1
chr15	84473325	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.409:8:3,2:1,1:5,0,3,0
chr15	84473531	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:12,7:8,12:0,20,0,19
chr15	84527687	.	A	AATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:84527687_A_AATT:84527687:0,3,0,1
chr15	84527688	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:84527687_A_AATT:84527687:0,3,0,1
chr15	84554018	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr15	84554054	.	G	GAGAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0|1:84554054_G_GAGAC:84554054:0,2,0,1
chr15	84554055	.	T	TGAGACGTGCTTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0|1:84554054_G_GAGAC:84554054:0,2,0,1
chr15	84568504	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.396:31:5,5:13,7:4,15,1,11
chr15	84611630	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:2,2:3,1:4,1,3,1
chr15	84657643	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,183;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:5,4:2,0:0,7,0,5
chr15	84706461	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:2,2,4,1
chr15	85166419	.	CG	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85166419_CG_AA:85166419:0,0,0,1
chr15	85166422	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85166419_CG_AA:85166419:0,0,0,1
chr15	85166997	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=201,131;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:0,15,0,2
chr15	85186637	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	85186876	.	ACTTGGCTCCGTGTTCCAT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTGGCTCCGTGTTCCAT;STR;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.452:23:9,4:3,6:5,8,5,5
chr15	85201419	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr15	85341317	.	G	GGTGGCTGGGCTGGTGACCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=199,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr15	85370875	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=154,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:85370875_G_T:85370875:1,2,0,1
chr15	85370876	.	C	CATTCTCCAAAGATTATTCCATTTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=154,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:85370875_G_T:85370875:1,2,0,1
chr15	85382193	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:7,3:3,5:5,5,4,4
chr15	85400693	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=100,62;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:85400693_T_G:85400693:1,1,1,1
chr15	85400696	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=100,62;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:85400693_T_G:85400693:1,1,1,1
chr15	85400699	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=100,62;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:85400693_T_G:85400693:1,1,1,1
chr15	85400711	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=142,62;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:85400711_G_T:85400711:2,0,1,1
chr15	85400713	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=173,62;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:85400711_G_T:85400711:2,1,1,1
chr15	85400716	.	T	TAGAAAA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=173,62;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:85400711_G_T:85400711:2,1,1,1
chr15	85411480	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=139,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,3:3,0:7,6,1,2
chr15	85411663	.	C	CATCCCTAATATGAACAGCTTTTCCCAAGATCACAGATCAAGACT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,107;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	85430969	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:5,3:8,1:11,3,3,1
chr15	85431144	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:3,3:5,2:0,9,0,5
chr15	85438118	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	85438311	.	C	CTTG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=91.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,12:0,9:0,0,6,16
chr15	85448906	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,2,9
chr15	85461862	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=102,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:0|1:85461862_G_A:85461862:3,4,1,1
chr15	85461882	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=60,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:85461862_G_A:85461862:1,1,0,1
chr15	85461895	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:85461862_G_A:85461862:1,3,0,1
chr15	85461897	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:85461862_G_A:85461862:1,3,0,1
chr15	85487960	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.836:8:0,2:1,5:1,0,6,1
chr15	85488298	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr15	85607485	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=142,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:85607485_A_G:85607485:3,0,1,0
chr15	85607507	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=91,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:85607485_A_G:85607485:4,0,1,0
chr15	85632747	.	A	AGACGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:85632747_A_AGACGG:85632747:0,4,0,1
chr15	85632751	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:85632747_A_AGACGG:85632747:0,3,0,1
chr15	85664308	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	85664322	.	CT	GG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85664322_CT_GG:85664322:0,0,0,1
chr15	85664325	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85664322_CT_GG:85664322:0,0,0,1
chr15	85664330	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85664322_CT_GG:85664322:0,0,0,1
chr15	85664333	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85664322_CT_GG:85664322:0,0,0,1
chr15	85679719	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	86028827	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,144;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:9,0,2,0
chr15	86087212	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,9:0,11:0,1,4,16
chr15	86198561	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	86198810	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:7,0:12,2:9,10,2,0
chr15	86253768	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr15	86253911	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr15	86259252	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86259252_A_C:86259252:0,0,0,1
chr15	86259253	.	A	AGAGTCTTGCTCTGACACCCAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86259252_A_C:86259252:0,0,0,1
chr15	86261438	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=175,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,2:9,0:0|1:86261438_G_A:86261438:0,13,0,2
chr15	86261441	.	TT	AA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=175,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:9,0:0|1:86261438_G_A:86261438:0,13,0,2
chr15	86278174	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr15	86278479	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr15	86278756	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=183,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:6,2:5,0:0|1:86278756_CT_C:86278756:11,0,2,0
chr15	86278770	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=57,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,9:0.772:11:2,4:0,5:1|0:86278756_CT_C:86278756:2,0,9,0
chr15	86278771	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.912:10:1,4:0,5:0|1:86278756_CT_C:86278756:1,0,7,2
chr15	86284817	.	T	TGGCTGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	86286958	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=124,99;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:9,3:15,0:16,10,0,3
chr15	86697816	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=83,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:1,3:1,3:1,2,0,6
chr15	86768264	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.548:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr15	86807929	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:11,2:7,0:13,5,1,1
chr15	86808167	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	86940622	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,10,13
chr15	87089459	.	T	TCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr15	87217488	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=102,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.838:14:1,1:0,10:1,1,7,5
chr15	87217721	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr15	88423423	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr15	88423463	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=212,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,6:0,4:1,1,7,3
chr15	88429012	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=470,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:88429012_G_GGC:88429012:0,2,0,1
chr15	88429015	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=470,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:88429012_G_GGC:88429012:0,2,0,1
chr15	88429017	.	GT	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=470,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:88429012_G_GGC:88429012:0,2,0,1
chr15	88472702	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=178,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:88472702_A_C:88472702:0,2,0,1
chr15	88472704	.	AT	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=178,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:88472702_A_C:88472702:0,2,0,1
chr15	88472710	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=175,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:88472702_A_C:88472702:0,1,0,1
chr15	88726586	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	89007832	.	T	TGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89007832_T_TGG:89007832:0,0,1,0
chr15	89007833	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:89007832_T_TGG:89007832:0,0,1,0
chr15	89007835	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:89007832_T_TGG:89007832:0,0,1,0
chr15	89170065	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89170065_T_A:89170065:0,0,0,1
chr15	89170066	.	G	GCAGGACCACA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:89170065_T_A:89170065:0,0,0,1
chr15	89170069	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89170065_T_A:89170065:0,0,0,1
chr15	89173538	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=13,19;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.239:28:4,1:2,2:1,21,0,6
chr15	89195526	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,6,18
chr15	89195599	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=78,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:89195599_C_T:89195599:0,2,0,1
chr15	89195602	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=78,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:89195599_C_T:89195599:0,2,0,1
chr15	89379348	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:5,1,4,0
chr15	89385151	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=73,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr15	89386543	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=74.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,12:0,14:0,0,18,8
chr15	89390434	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,6:1,3:6,0,8,1
chr15	89390595	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.217:24:11,4:8,0:9,10,3,2
chr15	89398105	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.431:33:5,7:13,7:12,7,9,5
chr15	89398605	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,4,1
chr15	89402012	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr15	89424581	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=71,1086;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:4,0,2,0
chr15	89444760	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr15	89449137	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.538:35:9,7:7,11:7,9,5,14
chr15	89450087	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr15	89731347	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr15	89736623	.	G	GACAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr15	89754954	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	89758552	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr15	89804111	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:8,13:8,4:1,15,5,12
chr15	89805189	.	C	CTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:2,3:6,5:0,8,0,8
chr15	89811543	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=169,195;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.642:9:0,2:3,4:3,0,6,0
chr15	89816742	.	TAAAA	T,TAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,9,10;MFRL=197,168,141;MMQ=60,60,60;MPOS=14,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,20,22;RU=A;STR;TLOD=3.22,3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.229,0.392:8:2,0,0:1,0,0:0,3,0,5
chr15	89826496	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,1:4,6:3,5,1,6
chr15	89828441	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:7,3:3,4:5,5,3,5
chr15	89844688	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.379:24:6,2:9,6:3,12,1,8
chr15	89858602	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:3,3:3,5,4,4
chr15	89859932	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:1,0:7,4:7,1,4,1
chr15	89860786	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr15	89862341	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:8,11:5,6:4,9,4,13
chr15	89862366	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:8,9:3,7:2,9,4,13
chr15	89863928	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr15	89864316	.	G	GCTAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,3:1,0:2,1,1,2
chr15	89865073	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:6,10:4,7:5,5,9,8
chr15	89867154	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=104,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,2:5,2:2,6,1,4
chr15	89876236	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr15	90020032	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,0:7,6:7,9,0,6
chr15	90026485	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:8,1:3,3:3,8,1,3
chr15	90128910	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:14,11:7,4:15,6,11,4
chr15	90129188	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr15	90129227	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr15	90135196	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr15	90135432	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,9:0,10:0,0,5,15
chr15	90138670	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=193,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.951:39:0,19:1,18:1,0,24,14
chr15	90138926	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr15	90144851	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr15	90144894	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr15	90144944	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,16,6
chr15	90159575	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,4:7,2:9,1,5,1
chr15	90161355	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,17:0,6:0,0,18,6
chr15	90169331	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:3,4:1,7:0,4,1,10
chr15	90172133	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,5:1,0:2,0,5,0
chr15	90173734	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr15	90174955	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,2:0,2:2,3,2,2
chr15	90174956	.	A	AAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=172,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:3,4,1,1
chr15	90177157	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:1,0,3,6
chr15	90188514	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr15	90190048	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.375:20:3,1:6,6:10,3,6,1
chr15	90192905	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr15	90195765	.	AA	GG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr15	90211047	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr15	90226530	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	90245298	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,11:0,0,5,17
chr15	90248819	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,22:0,24:0,0,19,29
chr15	90255443	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr15	90270567	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.832:16:2,8:0,4:0,2,2,12
chr15	90273070	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	90274639	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr15	90294118	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	90328551	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=115.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,20:0,0,26,11
chr15	90328774	.	A	AAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr15	90333616	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr15	90333654	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=187,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,2,1
chr15	90334345	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:6,5:3,8:0,9,1,12
chr15	90335379	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:6,0,6,0
chr15	90335788	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=194,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,0:4,4:1,6,0,4
chr15	90336373	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr15	90340719	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,1:0|1:90340719_G_A:90340719:0,0,9,1
chr15	90340725	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0|1:90340719_G_A:90340719:0,0,9,2
chr15	90414622	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,5:9,4:17,0,9,0
chr15	90446479	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:13,0:14,0:0|1:90446479_T_G:90446479:8,26,2,0
chr15	90446481	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:16,0:14,0:0|1:90446479_T_G:90446479:7,27,2,0
chr15	90446485	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=124,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:17,1:14,0:6,26,2,0
chr15	90454119	.	CTATTTACCCAGCCCTGAGAAGGCTGGG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:0,3:0,3,0,3
chr15	90455888	.	A	ACC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,14;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:90455888_A_ACC:90455888:0,0,1,0
chr15	90455892	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:90455888_A_ACC:90455888:0,0,1,0
chr15	90455895	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:90455888_A_ACC:90455888:0,0,1,0
chr15	90455899	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90455888_A_ACC:90455888:0,0,1,0
chr15	90455907	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90455888_A_ACC:90455888:0,0,1,0
chr15	90455940	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	90628145	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=110,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:90628145_G_A:90628145:1,3,0,1
chr15	90628150	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=110,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:90628145_G_A:90628145:1,2,0,1
chr15	90628153	.	G	GAACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=110,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:90628145_G_A:90628145:1,2,0,1
chr15	90628154	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=110,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:90628145_G_A:90628145:1,2,0,1
chr15	90633956	.	A	ACT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr15	90634684	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr15	90634941	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr15	90762951	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=109,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:2,0:0,2:2,0,3,0
chr15	90764202	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:2,5:5,2:6,2,5,3
chr15	90764203	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=120,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:6,2:4,3:6,4,5,1
chr15	90764219	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.409:23:6,5:6,4:7,7,6,3
chr15	90764348	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,9:0,0,5,19
chr15	90764357	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.293:22:9,2:6,4:3,13,1,5
chr15	90764359	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=77.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,9:0,0,4,18
chr15	90765093	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	90766754	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr15	90768156	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr15	90770981	.	C	CAGCCCTTATACTAGTCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=235,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr15	90771060	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr15	90773782	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=115.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,13:0,22:0,0,9,30
chr15	90774447	.	TAGAG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=AG;STR;TLOD=50.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0,0,8,4
chr15	90775397	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,15:0,6:0,0,20,3
chr15	90794188	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr15	90798953	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:7,0,1,2
chr15	90799282	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=214,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr15	90800293	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:4,1:10,0,2,1
chr15	90801248	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:3,2:1,1:5,0,3,0
chr15	90801584	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr15	90809522	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,88;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:29,2:31,1:40,20,2,1
chr15	90809633	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=116.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,18:0,0,4,31
chr15	90897885	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:8,9:7,6:11,4,9,6
chr15	90931457	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr15	90969335	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr15	90969568	.	AAG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:90969568_AAG_A:90969568:0,0,0,1
chr15	90969574	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:90969568_AAG_A:90969568:0,0,0,1
chr15	90969575	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:90969568_AAG_A:90969568:0,0,0,1
chr15	90982482	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:2,1,5,0
chr15	90983706	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,6:1,0:3,0,3,3
chr15	90984724	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:10,2:12,1:21,2,3,1
chr15	90999351	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.276:12:2,1:7,1:8,1,2,1
chr15	91009147	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,3:5,3:5,1,7,0
chr15	91009177	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,2:6,6:7,1,8,0
chr15	91009192	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,3:6,6:8,1,6,3
chr15	91009381	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:2,4:2,4:0,4,1,8
chr15	91009484	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,20,2
chr15	91017232	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=139.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,20:0,20:0,0,19,21
chr15	91017274	.	T	TTTC	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTC;STR;TLOD=144.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,23:0,9:0,0,14,21
chr15	91043183	.	ACTGT	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.826:3:0,1:0,1:0|1:91043183_ACTGT_A:91043183:0,0,2,1
chr15	91043192	.	ATGTT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.785:7:0,2:0,3:1,0,3,3
chr15	91043197	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.785:7:0,2:1,3:0|1:91043183_ACTGT_A:91043183:1,0,3,3
chr15	91073464	.	GCGGCCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr15	91083186	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:2,0,8,0
chr15	91169138	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=145,70;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:15,0:21,2:19,21,0,2
chr15	91185131	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,300;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,1:9,1:8,4,2,0
chr15	91304138	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=190,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:4,6,0,2
chr15	91328379	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:91328379_G_T:91328379:0,1,0,1
chr15	91328381	.	A	AAAACGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:91328379_G_T:91328379:0,1,0,1
chr15	91347302	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr15	91420417	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=122,70;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:11,2:12,12,0,2
chr15	91421614	.	T	TGTTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:91421614_T_TGTTTG:91421614:0,0,0,1
chr15	91421616	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:91421614_T_TGTTTG:91421614:0,0,0,1
chr15	91428589	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr15	91428607	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=34,23;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:91428607_C_G:91428607:0,2,1,0
chr15	91428609	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=34,19;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:91428607_C_G:91428607:0,2,1,0
chr15	91428611	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=34,10;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:91428607_C_G:91428607:0,2,1,0
chr15	91428613	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=32,10;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:91428607_C_G:91428607:0,2,1,0
chr15	91428617	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=30,10;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:91428607_C_G:91428607:2,2,1,0
chr15	91428619	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=32,18;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:91428607_C_G:91428607:2,2,1,0
chr15	91428621	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,10;MFRL=208,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:91428607_C_G:91428607:2,2,1,0
chr15	91428636	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr15	91430617	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr15	91430644	.	C	CCACAAATTTTAGGGATCATATTGTATGATTGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=204,201;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.380:4:2,1:1,0:0|1:91430644_C_CCACAAATTTTAGGGATCATATTGTATGATTGA:91430644:0,3,0,1
chr15	91430648	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=204,201;MMQ=60,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.380:4:2,1:1,0:0|1:91430644_C_CCACAAATTTTAGGGATCATATTGTATGATTGA:91430644:0,3,0,1
chr15	91433265	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=221,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr15	91434994	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	91437363	.	C	CTCGCTCCCTTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=293,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:91437363_C_CTCGCTCCCTTCT:91437363:0,1,0,1
chr15	91437366	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=293,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:91437363_C_CTCGCTCCCTTCT:91437363:0,1,0,1
chr15	91437369	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=293,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:91437363_C_CTCGCTCCCTTCT:91437363:0,1,0,1
chr15	91454837	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr15	91455960	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=211,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:0,1:0,1:1,0,0,2
chr15	91456298	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=196,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:91456298_T_C:91456298:0,4,0,1
chr15	91456303	.	T	TAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=200,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:91456298_T_C:91456298:0,2,0,1
chr15	91475788	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	91479054	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=223,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,2,1
chr15	91482935	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.568:22:4,2:5,6:4,5,10,3
chr15	91483531	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,5:8,3:9,4,3,5
chr15	91483620	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:16,0:15,9,2,0
chr15	91491206	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr15	91492877	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:4,3,2,5
chr15	91493306	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	91493589	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr15	91544539	.	CAAAA	C,CAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35,34;MFRL=0,139,96;MMQ=60,60,45;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,17;RU=A;STR;TLOD=3.52,4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.334,0.506:3:0,0,0:0,1,2:0,0,3,0
chr15	91557213	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,144;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:5,2:0,0:0,6,0,2
chr15	91795134	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:12,1:15,1:9,18,1,1
chr15	91795758	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr15	91795807	.	AACAATAGTTC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:2,1:0,0:0|1:91795807_AACAATAGTTC_A:91795807:0,2,0,1
chr15	91795820	.	GTC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:91795807_AACAATAGTTC_A:91795807:0,1,0,1
chr15	91795823	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:91795807_AACAATAGTTC_A:91795807:0,1,0,1
chr15	91795825	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:91795807_AACAATAGTTC_A:91795807:0,1,0,1
chr15	91810899	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:16,1:10,1:2,24,0,2
chr15	91811749	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=114,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,3:7,4:7,6,5,2
chr15	91811892	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=130,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.683:10:0,2:2,4:1,2,1,6
chr15	91825123	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:1,4,0,6
chr15	92397106	.	AGCG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=207,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCG;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,1:3,0:4,0,2,0
chr15	92647645	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,12:0,0,2,16
chr15	92690464	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	92937268	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:92937268_G_T:92937268:0,0,6,0
chr15	92937276	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:92937268_G_T:92937268:0,0,4,0
chr15	92977670	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr15	92988257	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	93015321	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr15	93016128	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,5:4,0:4,1,4,1
chr15	93043545	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:4,3:6,5:8,2,3,6
chr15	93198513	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,5:4,3:7,0,8,0
chr15	93198671	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,24:0,18:0,0,13,29
chr15	93198678	.	TTGGAGC	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGAGC;STR;TLOD=105.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.967:24:0,13:0,9:0,0,7,17
chr15	93198784	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr15	93444462	.	TA	T	.	.	DP=218;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:177,24:0.119:201:83,11:78,12:94,83,7,17
chr15	93488939	.	C	G,T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=17,19,30;MFRL=149,135,166;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.72,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,2:0.274,0.136:20:2,2,2:1,0,0:12,1,7,0
chr15	93492153	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:22,1:13,1:23,14,2,0
chr15	93496874	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr15	93510828	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,1:0,0:0,4,0,2
chr15	93510841	.	T	TAATA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.273:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr15	93521604	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr15	93521651	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,5:0,0,4,11
chr15	93521659	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,10;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.468:16:4,0:4,0:4,4,0,8
chr15	93522312	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,7:0,1:0,0,7,2
chr15	93543956	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr15	93552330	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr15	93552349	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:2,2:5,1:6,1,3,0
chr15	93567526	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr15	93595599	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	93595800	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr15	93616283	.	A	AAGG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:4,5:9,0:0,13,0,7
chr15	94858686	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=59,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,5:3,2:4,0,7,0
chr15	94883599	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=193,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,1:6,3:1,10,0,4
chr15	94945121	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.504:20:3,5:6,5:8,2,7,3
chr15	94945324	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr15	94945698	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.417:22:5,5:6,4:0|1:94945698_A_G:94945698:10,3,5,4
chr15	94945704	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,12:0.566:21:4,5:4,7:1|0:94945698_A_G:94945698:5,4,9,3
chr15	94945719	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0|1:94945698_A_G:94945698:0,0,13,10
chr15	95019834	.	C	CAGATAGAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,213;MMQ=55,30;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=AGAT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr15	95022165	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,0:14,2:21,7,2,0
chr15	96877695	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:12,6,2,0
chr15	98508736	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr15	98513086	.	CTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=189,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:3,0:0,1:4,1,1,0
chr15	98995052	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr15	98995081	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,4:0,8:1,0,10,2
chr15	99192745	.	TTTTC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,2:5,5:7,0,7,0
chr15	99192754	.	CTTTTTTTTT	C,CTTTTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,34,34;MFRL=120,136,161;MMQ=56,60,50;MPOS=26,-2147483648;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,15,20;RU=T;STR;TLOD=9.82,9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,4:0.393,0.506:11:0,2,1:1,3,3:1,0,10,0
chr15	99251356	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr15	99456253	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr15	99456553	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr15	99465685	.	A	ATTTCTTGTTTTTGTCAGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99465685_A_ATTTCTTGTTTTTGTCAGGT:99465685:0,1,0,1
chr15	99465689	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:99465685_A_ATTTCTTGTTTTTGTCAGGT:99465685:0,1,0,1
chr15	99467942	.	GGT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,3:4,4:1,5,2,8
chr15	99473606	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr15	99478493	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr15	99478505	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=47.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,5:0,0,13,1
chr15	99511793	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,11:0,9:0|1:99511793_C_G:99511793:0,0,12,10
chr15	99511804	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=67.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,10:0,5:0|1:99511793_C_G:99511793:0,0,7,9
chr15	99646107	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr15	99670641	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,2:5,0:7,3,1,1
chr15	99670989	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,186;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,1:4,3:10,3,4,0
chr15	99671015	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=145,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,0:12,1:18,7,1,1
chr15	99701857	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr15	99761885	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr15	99796089	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=123,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr15	99828109	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:15,0:18,2:10,23,1,1
chr15	100243487	.	GT	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=92.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,14:0,0,30,1
chr15	100246834	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr15	100251015	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:4,3:4,1:4,4,2,2
chr15	100269309	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,9,2
chr15	100271253	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=192,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr15	100514525	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr15	100514561	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr15	100533218	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr15	100594006	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	100693032	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr15	100794346	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,1:6,1:6,8,2,0
chr15	100794363	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,6,9
chr15	100801603	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr15	100801698	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,9,8
chr15	100802495	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0|1:100802495_G_A:100802495:0,0,20,0
chr15	100802499	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,14:0,6:0|1:100802495_G_A:100802495:0,0,21,0
chr15	100821426	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr15	100821647	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr15	100871329	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr15	100942843	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr15	100996038	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr15	101009530	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,11:0,0,20,3
chr15	101019529	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr15	101019700	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:1,6,0,2
chr15	101024719	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=76,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr15	101041896	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,6:0,9:0,0,7,9
chr15	101109341	.	A	AAG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=178,221;MMQ=60,58;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,0:0,1:0|1:101109341_A_AAG:101109341:3,0,2,0
chr15	101109358	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=178,221;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:2,0:0|1:101109341_A_AAG:101109341:3,0,2,0
chr15	101109392	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr15	101109818	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.397:21:4,3:7,5:5,8,4,4
chr15	101109864	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,1:13,1:0|1:101109864_G_C:101109864:10,12,1,1
chr15	101109873	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,1:16,1:0|1:101109864_G_C:101109864:13,11,1,1
chr15	101109893	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.357:25:5,2:11,5:13,3,7,2
chr15	101112342	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr15	101114482	.	AAC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr15	101120963	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,5:7,5:6,8,3,7
chr15	101427770	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:12,1:21,1:22,11,2,0
chr15	101440988	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:0,7,0,3
chr15	101448783	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr15	101523661	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr15	101529118	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr15	101548950	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr15	101550858	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,9:0|1:101550858_G_T:101550858:0,0,10,7
chr15	101550861	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,7:0,8:0|1:101550858_G_T:101550858:0,0,10,7
chr15	101561980	.	CGTGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,13;RU=GT;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr15	101569467	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=142,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr15	101569523	.	A	AGAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr15	101588923	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,1:1,3:0,6,0,4
chr15	101589765	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr15	101591846	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr15	101591857	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr15	101593051	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=203,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr15	101593341	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=242,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:101593341_C_CAA:101593341:0,1,0,1
chr15	101593342	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=242,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:101593341_C_CAA:101593341:0,1,0,1
chr15	101597266	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr15	101601564	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr15	101606261	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,4:5,1:2,7,2,3
chr15	101606889	.	GC	AA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:5,8:4,4:6,4,5,10
chr15	101718097	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:2,4,4,1
chr15	101718106	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,5:5,5:4,4,3,7
chr15	101718190	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,4:4,1:6,2,2,3
chr15	101718529	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:5,1,4,2
chr15	101718950	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,27:0.431:63:17,16:17,10:24,12,16,11
chr15	101791262	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr15	101791359	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:1,2,4,3
chr15	101812905	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:10,0,2,0
chr15	101827759	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=174,143;MMQ=55,41;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr15	101832055	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,5:1,0:2,0,5,0
chr15	101862690	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:2,2,8,0
chr15	101871941	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,3:0,9,1,7
chr15	101910769	.	A	AAGCCTCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=189,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:101910769_A_AAGCCTCTT:101910769:0,3,0,1
chr15	101910771	.	G	GGGCAGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=189,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:101910769_A_AAGCCTCTT:101910769:0,3,0,1
chr15	101929632	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr15	101929825	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr15	101970308	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=95.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.971:30:0,9:0,20:0,0,8,22
chr15	101970323	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.620:22:4,4:4,8:1,7,0,14
chr15	101970336	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,4:3,7:0,5,0,11
chr15	102191869	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=189.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,29:0,26:0,0,38,18
chr15	102192034	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,0,21
chr15	102197284	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=156,148;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:6,1:1,12,0,2
chr15	102197890	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=101,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,3:0,0:3,1,3,0
chr15	102211654	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=135.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,17:0,19:0,0,35,1
chr15	102255246	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.433:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr16	64432	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=124,169;MMQ=48,38;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,0:13,2:10,14,0,2
chr16	97354	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,2:1,0:3,0,2,0
chr16	97610	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:0,6,1,2
chr16	103423	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,20,0
chr16	103449	.	C	CG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=95.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,11:0,14:0,0,24,2
chr16	103923	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=114,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:1,1,3,0
chr16	104054	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,0:0|1:104054_T_C:104054:4,2,0,2
chr16	104060	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=127,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,1:2,0:0|1:104054_T_C:104054:4,1,0,2
chr16	105444	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.545:31:11,9:3,8:7,7,10,7
chr16	108796	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=44.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,6:0,0,2,12
chr16	110165	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.852:5:0,0:0,1:0,0,4,1
chr16	111247	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=208,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:3,2,2,1
chr16	112513	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr16	113826	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=155,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.274:9:1,2:6,0:0|1:113826_C_CA:113826:6,1,1,1
chr16	113829	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=178,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:6,0:0|1:113826_C_CA:113826:7,2,1,1
chr16	113831	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=178,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:0|1:113826_C_CA:113826:7,2,1,1
chr16	113883	.	G	GCC	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=72.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,5:0,11:0|1:113883_G_GCC:113883:0,0,9,8
chr16	113886	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=74.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0|1:113883_G_GCC:113883:0,0,10,8
chr16	113924	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.361:23:6,1:9,7:6,9,6,2
chr16	113970	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,3:7,4:2,8,2,5
chr16	114474	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=121,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:5,0:7,2:6,7,0,2
chr16	133280	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr16	136885	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:136885_G_A:136885:0,3,0,1
chr16	136887	.	G	GACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:136885_G_A:136885:0,3,0,1
chr16	136888	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,28;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr16	138772	.	A	AG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=69.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,16,3
chr16	139636	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	160668	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:160668_T_C:160668:0,0,0,4
chr16	160678	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=169,156;MMQ=46,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:160668_T_C:160668:0,3,0,1
chr16	173526	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:7,14,0,2
chr16	188303	.	AGAGGAGGACGGAGCCGGAGGCGGAGGGGGCCT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=203,183;MMQ=60,47;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAGGAGGACGGAGCCGGAGGCGGAGGGGGCCT;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.432:8:1,2:1,0:0,6,0,2
chr16	230578	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	230603	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	240646	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=169,144;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:0|1:240646_T_G:240646:0,9,0,3
chr16	240651	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=169,153;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,1:0|1:240646_T_G:240646:0,9,0,2
chr16	256231	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=167,223;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:256231_C_CA:256231:0,2,0,1
chr16	256233	.	GTC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=202,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:256231_C_CA:256231:0,2,0,1
chr16	256234	.	T	TATCTCCCATTTTCCTGAGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=181,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:256231_C_CA:256231:0,1,0,1
chr16	304565	.	G	GGGGT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.106:38:14,1:17,2:10,24,4,0
chr16	304572	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:13,1:16,0:7,24,3,0
chr16	312253	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr16	313202	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	313406	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,1,2
chr16	333146	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=237,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr16	335373	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,2,3
chr16	337017	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,6:5,1:5,2,6,1
chr16	338332	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=231,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr16	339415	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=118,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:3,1:5,3,2,1
chr16	339672	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr16	347225	.	C	CTCTCTGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=194,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:347225_C_CTCTCTGG:347225:3,4,1,1
chr16	347226	.	A	AAAATCACTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=194,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:3,0:0|1:347225_C_CTCTCTGG:347225:3,4,1,1
chr16	347326	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=246,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr16	359953	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,2:5,3:10,2,3,2
chr16	364733	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=216,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	417405	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,3:13,0:13,11,0,3
chr16	419283	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr16	425393	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:7,4,0,2
chr16	454861	.	CTTG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=163,145;MMQ=60,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:454861_CTTG_C:454861:3,0,1,0
chr16	454866	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=163,145;MMQ=60,36;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:454861_CTTG_C:454861:3,0,1,0
chr16	454868	.	C	CAAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=163,145;MMQ=60,36;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:454861_CTTG_C:454861:3,0,1,0
chr16	454885	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=148,156;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr16	456239	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	456483	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	524898	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=197,127;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr16	539088	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:539088_T_TAA:539088:0,0,0,2
chr16	539093	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:539088_T_TAA:539088:0,0,0,2
chr16	570369	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	602046	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=191.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,28:0,30:0,0,31,28
chr16	602801	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=212,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,1:0,0:0|1:602801_T_G:602801:0,1,3,0
chr16	602806	.	CA	GG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=199,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:0,1:0|1:602801_T_G:602801:2,1,3,0
chr16	619572	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:619572_G_T:619572:0,0,0,1
chr16	619574	.	AGCCTCTGGGCTGG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:619572_G_T:619572:0,0,0,1
chr16	628849	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:2,8,0,2
chr16	684999	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=119,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	700208	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.234:34:10,0:9,1:6,19,9,0
chr16	706279	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	706825	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:6,16,0,2
chr16	707295	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	712127	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	716292	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:4,6,1,1
chr16	726031	.	GGGGA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGGA;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr16	727789	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=218,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:727789_G_C:727789:0,2,0,1
chr16	727794	.	G	GATTCGTTTGCATGATAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=218,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:727789_G_C:727789:0,2,0,1
chr16	744948	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=14,33;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:744948_A_C:744948:1,0,1,0
chr16	744951	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=21,12;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:744948_A_C:744948:1,0,1,0
chr16	744956	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=9,12;MFRL=188,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:744948_A_C:744948:1,0,1,0
chr16	744959	.	GAT	CCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=9,12;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:744948_A_C:744948:2,0,1,0
chr16	744967	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:744948_A_C:744948:3,0,1,0
chr16	744970	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,10;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:744948_A_C:744948:4,0,1,0
chr16	767451	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	774859	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr16	775141	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:0,9,2,0
chr16	775858	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=148,49;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:12,2:0|1:775858_A_C:775858:7,11,1,1
chr16	775864	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=141,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:9,2:0|1:775858_A_C:775858:7,10,1,1
chr16	775865	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=141,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:775858_A_C:775858:7,10,1,1
chr16	784377	.	C	CTGGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:784377_C_CTGGT:784377:0,0,0,1
chr16	784380	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:784377_C_CTGGT:784377:0,0,0,1
chr16	784383	.	C	CCAGCTGGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,34;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:784377_C_CTGGT:784377:0,1,0,1
chr16	813778	.	A	ATCCCATCCCCCG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	815628	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	837310	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:5,0,6,1
chr16	837446	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:7,0:3,11,0,2
chr16	843236	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:10,8,2,0
chr16	845901	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr16	847761	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=102,136;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:10,1:14,1:0|1:847761_G_T:847761:10,15,0,2
chr16	847763	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=102,136;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,1:11,1:0|1:847761_G_T:847761:10,15,0,2
chr16	847767	.	T	TGTGTGTG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=98,136;MMQ=60,59;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,1:7,1:0|1:847761_G_T:847761:10,14,0,2
chr16	943107	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr16	943130	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,5:0,0,0,7
chr16	1020757	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:14,8,1,1
chr16	1129666	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,1:9,1:2,10,2,0
chr16	1244877	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	1251562	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr16	1256986	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,10;MFRL=133,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,0:1,0:0|1:1256986_T_G:1256986:2,0,2,0
chr16	1256993	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,22;MFRL=133,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:0,1:0|1:1256986_T_G:1256986:2,0,2,0
chr16	1257731	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=62,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,6:1,2:2,2,6,2
chr16	1257940	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr16	1258178	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=161,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:0|1:1258178_G_A:1258178:0,4,1,1
chr16	1258180	.	A	AATCACAATG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=161,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:1258178_G_A:1258178:0,4,1,1
chr16	1260329	.	C	CTTCCTTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	1261119	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	1261377	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:2,4:9,0:7,4,3,1
chr16	1269947	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.342:13:1,1:5,1:6,3,4,0
chr16	1272298	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=107,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,2:2,6:2,4,5,3
chr16	1272397	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,120;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:1272397_G_C:1272397:0,0,0,1
chr16	1272400	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,120;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1272397_G_C:1272397:0,0,0,1
chr16	1272402	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,120;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1272397_G_C:1272397:0,0,0,1
chr16	1272415	.	C	CCTAGTCCTGGCCCTGCAGGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	1273638	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	1275135	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr16	1278599	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,5:0,0,13,0
chr16	1278609	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=170,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,1:3,5:11,0,6,0
chr16	1280054	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,9;MFRL=111,132;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.660:4:0,0:1,1:1,0,0,3
chr16	1280059	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=111,132;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.660:4:0,0:1,1:1,0,0,3
chr16	1291114	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=197,199;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr16	1306196	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr16	1306203	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0|1:1306203_T_G:1306203:0,0,3,0
chr16	1306211	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,0:0|1:1306203_T_G:1306203:0,0,2,0
chr16	1306268	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=175,188;MMQ=40,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:5,2,3,0
chr16	1306355	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=170,148;MMQ=60,48;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,2:3,6:1,3,6,2
chr16	1306377	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=175,148;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,3:4,7:2,3,6,4
chr16	1306559	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.665:7:2,0:0,5:2,0,3,2
chr16	1308333	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:4,1,3,1
chr16	1364140	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,15:0,0,14,14
chr16	1364281	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,17:0,0,22,15
chr16	1370303	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:1370303_T_C:1370303:0,0,0,6
chr16	1370309	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:1370303_T_C:1370303:0,0,0,7
chr16	1370729	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,0,17
chr16	1370752	.	C	CAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr16	1374656	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr16	1374818	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr16	1388672	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:1,1:3,1:0,5,0,2
chr16	1388888	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr16	1390809	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	1391112	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,13;MFRL=216,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.367:19:2,0:6,0:5,7,7,0
chr16	1393020	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr16	1394430	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0,3,6,0
chr16	1394551	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	1395420	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr16	1397518	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.871:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr16	1398077	.	C	CCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	1398215	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	1398268	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	1451519	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,2:5,0,4,0
chr16	1451537	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=15,12;MFRL=128,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.296:11:2,0:1,0:6,2,3,0
chr16	1451547	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=21,10;MFRL=135,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:2,0:5,0:0|1:1451547_T_G:1451547:7,2,2,0
chr16	1451549	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=32,13;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:2,0:2,0:4,2,4,0
chr16	1451552	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,10;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,0:4,0:5,2,3,0
chr16	1451560	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=31,17;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.364:11:2,0:4,0:3,4,4,0
chr16	1451563	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=31,17;MFRL=134,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:2,0:4,0:0|1:1451547_T_G:1451547:7,5,2,0
chr16	1451743	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	1476465	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	1484338	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	1484392	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr16	1486598	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr16	1492879	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.476:8:1,0:1,0:0|1:1492879_A_C:1492879:4,0,4,0
chr16	1492882	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,11;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.476:8:1,0:3,0:0|1:1492879_A_C:1492879:4,0,4,0
chr16	1493030	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,1:2,3:0,5,2,3
chr16	1497324	.	GA	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1497324_GA_CC:1497324:0,0,1,0
chr16	1497329	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1497324_GA_CC:1497324:0,0,1,0
chr16	1497339	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1497324_GA_CC:1497324:0,0,1,0
chr16	1498473	.	G	GTGTCTTTTAGACGTGGACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr16	1498480	.	A	ATATAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	1499377	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,3:4,5:0,6,0,8
chr16	1503856	.	CA	AG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,2:2,0:0|1:1503856_CA_AG:1503856:6,3,1,1
chr16	1503859	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,1:2,0:0|1:1503856_CA_AG:1503856:6,3,1,1
chr16	1507778	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,5:1,8:0,1,4,9
chr16	1510567	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr16	1511552	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,5:0,0,6,6
chr16	1515162	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	1549343	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr16	1555642	.	CGTGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GTGG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	1570428	.	G	GGTCCCAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	1573810	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr16	1573890	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:2,2,1,4
chr16	1716010	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=245,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,3:1,0:2,0,3,0
chr16	1741797	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=242,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:1741797_G_T:1741797:2,0,1,0
chr16	1741816	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=242,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1741797_G_T:1741797:2,0,1,0
chr16	1793287	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	1814964	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:7,0,3,0
chr16	1815946	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:2,0,7,0
chr16	1817093	.	CCCTGAGCAGAGGTGGGGCCTGGCCAGG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr16	1817397	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	1817754	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr16	1817768	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	1817935	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	1818152	.	CT	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr16	1818680	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,8,6
chr16	1818909	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=221,236;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:1818909_C_T:1818909:0,2,0,1
chr16	1818913	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=219,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1818909_C_T:1818909:0,1,0,1
chr16	1825768	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.269:38:19,7:9,2:18,10,5,5
chr16	1826302	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr16	1827132	.	C	CACT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:1827132_C_CACT:1827132:4,4,1,1
chr16	1827133	.	G	GAAGTTCA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:1827132_C_CACT:1827132:4,4,1,1
chr16	1836663	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,3:3,2:1,2,3,2
chr16	1836709	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=193,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:2,3:0,3:1,1,3,3
chr16	1837900	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr16	1838781	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=100,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr16	1859730	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr16	1859850	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.607:13:1,3:3,4:2,3,3,5
chr16	1872479	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr16	1873087	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr16	1877175	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.617:21:3,7:4,6:8,0,13,0
chr16	1878275	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.453:13:3,5:4,1:7,0,5,1
chr16	1878924	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.352:23:6,4:9,3:0,15,0,8
chr16	1878977	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=232,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr16	1879013	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=205,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr16	1887887	.	AT	A	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,28:0.422:66:17,11:20,16:6,32,5,23
chr16	1887937	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:10,2:3,7:0,13,1,8
chr16	1889189	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,2:1,3,4,1
chr16	1894852	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:9,4:3,5:8,4,5,4
chr16	1895030	.	TC	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr16	1903377	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	1904239	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:1,9,1,5
chr16	1907652	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	1907701	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr16	1907946	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.438:16:2,3:7,3:1,8,0,7
chr16	1910373	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr16	1912139	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,2:0,4,0,5
chr16	1917998	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=215,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr16	1961551	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	1962127	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=135,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:7,2:10,1:7,13,1,2
chr16	1962132	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=176,100;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.558:23:4,6:4,5:4,6,4,9
chr16	1994743	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=190,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,2:2,2:0|1:1994743_G_A:1994743:6,1,6,0
chr16	1994749	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=190,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:6,4:1,2:0|1:1994743_G_A:1994743:6,1,6,0
chr16	1994931	.	C	CAAGAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,2:1,7,0,7
chr16	2004570	.	T	TGCC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=113,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.218:21:11,3:5,0:0|1:2004570_T_TGCC:2004570:2,15,4,0
chr16	2004574	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=113,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.219:21:10,3:5,0:0|1:2004570_T_TGCC:2004570:2,15,4,0
chr16	2004718	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr16	2009852	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=238,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr16	2011064	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr16	2011082	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=170,74;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr16	2011126	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr16	2013314	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=110.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,12:0,0,5,25
chr16	2013316	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.501:28:8,8:6,6:3,11,1,13
chr16	2014424	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.556:34:9,10:6,9:3,12,4,15
chr16	2014528	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=172,195;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,2:0,3:0,4,1,5
chr16	2014591	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=167,120;MMQ=56,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,2,1
chr16	2023937	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	2025678	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr16	2030127	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,1,2
chr16	2030863	.	ATGGGAGGCAGTCCAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=128,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.562:7:1,4:1,0:3,0,4,0
chr16	2048644	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:10,8,1,1
chr16	2086421	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.431:26:6,4:8,7:10,5,7,4
chr16	2111779	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,2:1,0,5,0
chr16	2126060	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=137,70;MMQ=60,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:12,1:11,0:0|1:2126060_T_A:2126060:20,7,2,1
chr16	2126070	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=137,70;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:17,2:14,0:0|1:2126060_T_A:2126060:23,10,2,1
chr16	2131648	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,0:11,2:14,9,0,2
chr16	2138218	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=196,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:1,4,4,1
chr16	2142280	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,36;MFRL=243,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.429:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr16	2142966	.	C	CTATTGAAGCACAGTCGCG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=120,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:5,4,1,1
chr16	2154478	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	2158570	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=191,178;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.586:13:3,1:2,4:2,3,4,4
chr16	2162740	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	2162839	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2162839_T_C:2162839:0,0,1,0
chr16	2162842	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2162839_T_C:2162839:0,0,1,0
chr16	2201794	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,28191838;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,2:13,0:9,14,1,1
chr16	2203456	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr16	2221300	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr16	2222613	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:4,2:5,0:7,3,0,4
chr16	2222617	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.226:14:5,1:5,0:7,4,0,3
chr16	2223863	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=158,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:2223863_C_T:2223863:0,5,0,1
chr16	2223867	.	C	CAGGTCTCTGTGGCTCACAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,36;MFRL=158,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:2223863_C_T:2223863:0,5,0,1
chr16	2230476	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr16	2233586	.	CTCTG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCTG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr16	2239402	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.612:21:4,4:5,3:3,6,0,12
chr16	2246483	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	2256047	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.635:6:0,3:2,1:1,1,2,2
chr16	2256326	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=206,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr16	2256461	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,4:7,5:10,3,7,2
chr16	2259766	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=209,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr16	2259865	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr16	2285117	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:2,6,0,2
chr16	2287520	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=14,11;MFRL=121,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.741:5:0,0:0,1:1,0,4,0
chr16	2297028	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:2297028_T_A:2297028:0,4,0,1
chr16	2297035	.	G	GTTTGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:2297028_T_A:2297028:0,4,0,1
chr16	2297038	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:2297028_T_A:2297028:0,4,0,1
chr16	2305539	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,2:3,6:7,0,8,0
chr16	2313283	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=127,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:10,0:7,15,0,2
chr16	2338363	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	2349371	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=160,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:5,1,2,1
chr16	2373786	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=179,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.783:7:1,2:0,3:0,1,1,5
chr16	2375961	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	2499039	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=202,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2499039_G_T:2499039:1,0,0,1
chr16	2499041	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=202,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2499039_G_T:2499039:1,0,0,1
chr16	2499043	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=190,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:2499039_G_T:2499039:1,1,0,1
chr16	2499046	.	T	TTTAAGTCTTTAATTCATTTAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=177,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2499039_G_T:2499039:0,1,0,1
chr16	2499930	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=143,73;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:10,0:3,2:0|1:2499930_G_A:2499930:6,7,1,1
chr16	2499932	.	GC	CA	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=143,73;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:3,2:0|1:2499930_G_A:2499930:6,7,1,1
chr16	2499936	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=143,73;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:2499930_G_A:2499930:5,8,1,1
chr16	2499938	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=143,73;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:2,2:0|1:2499930_G_A:2499930:5,8,1,1
chr16	2499954	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=151,118;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,1:2,1:2,8,0,2
chr16	2514649	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=197,238;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:3,4,0,2
chr16	2523565	.	C	CAGCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=186,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2523565_C_CAGCCT:2523565:0,1,0,1
chr16	2523567	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=186,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2523565_C_CAGCCT:2523565:0,1,0,1
chr16	2549820	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:2,5:3,7:5,0,11,1
chr16	2550429	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=167,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:8,1:0|1:2550429_T_G:2550429:1,13,1,1
chr16	2550433	.	C	CCT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=170,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:5,0:8,2:0|1:2550429_T_G:2550429:1,15,1,1
chr16	2550440	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=170,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:6,0:8,2:0|1:2550429_T_G:2550429:1,15,1,1
chr16	2564079	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,12;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.083:39:12,0:20,0:21,15,3,0
chr16	2747857	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,3:7,3:9,1,5,1
chr16	2752578	.	C	CATCCTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=231,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:2752578_C_CATCCTCT:2752578:0,1,0,1
chr16	2752580	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=231,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2752578_C_CATCCTCT:2752578:0,1,0,1
chr16	2808363	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:2,5:4,0,5,0
chr16	2809548	.	TGTGGTG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=GTG;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,0:11,2:13,11,1,1
chr16	2811828	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=113,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:4,2:2,7,0,2
chr16	2812890	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.607:18:3,7:3,4:5,2,8,3
chr16	2819374	.	G	GGTGGTTCTTTTCTTGGCTGGGTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=251,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	2821988	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=77.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,10:0,0,18,3
chr16	2825594	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr16	2827225	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=206,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr16	2834826	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr16	2835189	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	2836027	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,11,2
chr16	2836600	.	T	TCTCCTCTCTTCTCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr16	2848429	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=174,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr16	2854907	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=138,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:9,5:5,7:10,4,8,4
chr16	2868641	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr16	2880614	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:3,0,4,2
chr16	2880870	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=172,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr16	2903845	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr16	2903936	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=143,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:7,5,0,2
chr16	2979640	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=244,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr16	2987074	.	G	GCTCTGAGAGCTGGTGTCCGCTGCTCCTCCCCTCCCATTTCTC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,0;MFRL=150,183;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTCTGAGAGCTGGTGTCCGCTGCTCCTCCCCTCCCATTTCTC;STR;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.887:12:4,0:1,0:6,0,5,1
chr16	2988113	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=147,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr16	2998629	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:2,7:0,5:0,2,9,3
chr16	3016122	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:1,0:4,0:0|1:3016122_A_C:3016122:5,4,2,0
chr16	3016125	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:2,0:6,0:0|1:3016122_A_C:3016122:5,4,2,0
chr16	3016129	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,11;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:2,0:6,0:0|1:3016122_A_C:3016122:7,4,2,0
chr16	3016133	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:2,0:5,0:0|1:3016122_A_C:3016122:7,5,2,0
chr16	3016137	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:3,0:6,1:0|1:3016122_A_C:3016122:8,6,2,0
chr16	3016536	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=249,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:2,1:0,0:0|1:3016536_A_C:3016536:1,1,0,1
chr16	3016538	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=249,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:2,1:0,0:0|1:3016536_A_C:3016536:1,1,0,1
chr16	3016540	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=249,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,1:0,0:0|1:3016536_A_C:3016536:1,1,0,1
chr16	3016542	.	G	GAAACCACCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=238,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0|1:3016536_A_C:3016536:1,0,0,1
chr16	3016885	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr16	3021116	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:2,1,2,2
chr16	3073780	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	3077710	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:1,1:2,2:0,5,0,4
chr16	3077757	.	C	CATTCTGGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr16	3085174	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=84,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3085174_C_T:3085174:0,1,0,1
chr16	3085175	.	C	CAGGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=84,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3085174_C_T:3085174:0,1,0,1
chr16	3085178	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=84,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3085174_C_T:3085174:0,1,0,1
chr16	3096880	.	C	CAAATCCACACTCAGGGTCACTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	3097562	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:4,1:0,1:0|1:3097562_A_C:3097562:0,4,3,0
chr16	3097567	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:6,0:0,0:0|1:3097562_A_C:3097562:0,6,3,0
chr16	3097572	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:6,2:0,0:0|1:3097562_A_C:3097562:0,7,2,0
chr16	3106994	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr16	3117937	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=113,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.281:41:11,5:17,6:13,17,7,4
chr16	3140612	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=233,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	3274606	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:3274606_A_C:3274606:0,2,0,1
chr16	3274607	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=149,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:2,1:0,0:1|0:3274606_A_C:3274606:0,2,0,1
chr16	3274608	.	T	TACTC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3274606_A_C:3274606:0,2,0,1
chr16	3274611	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=149,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1|0:3274606_A_C:3274606:0,2,0,1
chr16	3274613	.	GC	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=107,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:3274606_A_C:3274606:0,1,0,1
chr16	3274616	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=107,242;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1|0:3274606_A_C:3274606:0,1,0,1
chr16	3293438	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:5,13,2,0
chr16	3294154	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.556:9:3,4:1,1:4,0,5,0
chr16	3296616	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0,5,1,2
chr16	3298865	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr16	3405875	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr16	3440394	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,2:0,11:0,0,8,5
chr16	3452448	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=141,83;MMQ=60,42;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:3,2:0|1:3452448_CT_C:3452448:2,7,0,2
chr16	3452453	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=22,17;MFRL=83,138;MMQ=52,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:0,0:4,1:0,4,0,3
chr16	3452458	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=141,83;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:0|1:3452448_CT_C:3452448:1,8,0,2
chr16	3452467	.	TTC	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=152,83;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:3452448_CT_C:3452448:0,8,0,2
chr16	3454512	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=134,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:8,1:10,10,0,2
chr16	3455079	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=199,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr16	3458219	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	3458609	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,7:1,4:2,4,4,7
chr16	3458968	.	C	CTTAGTGATACTGGAAGACTTTGTCTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=210,127;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3458968_C_CTTAGTGATACTGGAAGACTTTGTCTCT:3458968:0,2,0,1
chr16	3458973	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=210,127;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:3458968_C_CTTAGTGATACTGGAAGACTTTGTCTCT:3458968:0,2,0,1
chr16	3491029	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,220;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr16	3534892	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr16	3550977	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:0,3:2,1:2,0,4,1
chr16	3576581	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3576581_AT_A:3576581:0,1,0,1
chr16	3576585	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3576581_AT_A:3576581:0,1,0,1
chr16	3576589	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3576581_AT_A:3576581:0,1,0,1
chr16	3598173	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:3598173_T_C:3598173:2,1,0,1
chr16	3598182	.	C	CACATAGTCACA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3598173_T_C:3598173:2,1,0,1
chr16	3598184	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3598173_T_C:3598173:2,1,0,1
chr16	3598186	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3598173_T_C:3598173:2,1,0,1
chr16	3599655	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr16	3602227	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr16	3611610	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	3613526	.	G	GCCGGCTCCCTGCTGGCCCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=121,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:3613526_G_GCCGGCTCCCTGCTGGCCCA:3613526:3,4,0,2
chr16	3613528	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=121,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,2:0|1:3613526_G_GCCGGCTCCCTGCTGGCCCA:3613526:3,4,0,2
chr16	3634746	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=104,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,3:2,3:5,1,6,0
chr16	3644655	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=159,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:3644655_G_A:3644655:0,3,0,1
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chr16	3644664	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3644655_G_A:3644655:0,2,0,1
chr16	3656482	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,15:0,8:0,0,20,3
chr16	3706043	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr16	3707409	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr16	3708280	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=131,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,0:9,3:6,15,1,2
chr16	3708282	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=99,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.369:13:1,4:4,0:1,7,1,4
chr16	3708318	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:9,2:1,0:0,10,0,2
chr16	3712940	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=117,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,2:4,0:5,4,0,2
chr16	3726160	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr16	3738961	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr16	3790300	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr16	3819261	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=122,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:18,1:9,1:21,7,1,1
chr16	3900364	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:11,2:3,0:7,7,0,2
chr16	3929797	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=188,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.338:12:4,1:4,1:2,6,4,0
chr16	4015729	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr16	4016676	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=169,113;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.241:19:6,0:7,4:6,9,3,1
chr16	4027423	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr16	4027688	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:1,4,2,4
chr16	4038952	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:5,0,5,1
chr16	4039141	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	4042049	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	4042251	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,1:3,7:4,4,2,6
chr16	4042371	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=163,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:6,6,1,1
chr16	4042449	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr16	4043562	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:1,1:0|1:4043562_A_T:4043562:0,2,0,1
chr16	4043567	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4043562_A_T:4043562:0,2,0,1
chr16	4043570	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4043562_A_T:4043562:0,2,0,1
chr16	4043572	.	C	CCCAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4043562_A_T:4043562:0,2,0,1
chr16	4165432	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:4165432_T_C:4165432:0,0,0,6
chr16	4165439	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:0|1:4165432_T_C:4165432:0,2,0,3
chr16	4242093	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr16	4242451	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,0:3,2:7,6,1,1
chr16	4253089	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr16	4253130	.	CG	TA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=150,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,5:3,0:3,4,3,2
chr16	4254479	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=163,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,0:1,3:3,0,4,0
chr16	4254523	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:2,2,5,1
chr16	4390298	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,0:5,1:12,1,0,2
chr16	4414727	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=192,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.789:8:1,2:0,1:0,1,5,2
chr16	4415410	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr16	4415455	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=97,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:0,4:1,0,5,2
chr16	4432029	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr16	4433607	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr16	4475868	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr16	4484328	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr16	4484613	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr16	4494549	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr16	4496973	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,9:0,0,6,12
chr16	4500544	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,5,6
chr16	4516092	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	4516172	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:10,1:15,2,2,0
chr16	4519140	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr16	4519548	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr16	4524060	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=59.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,9:0,0,15,4
chr16	4559576	.	G	GTTCA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:0|1:4559576_G_GTTCA:4559576:8,12,0,2
chr16	4559577	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:4559576_G_GTTCA:4559576:8,13,0,2
chr16	4559580	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:13,0:0|1:4559576_G_GTTCA:4559576:8,13,0,2
chr16	4559791	.	C	CTCCCTCCACCCTCAGTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr16	4562512	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr16	4621725	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	4625126	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr16	4630222	.	G	GTGATACAGGAGATAGGAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	4641814	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=70.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,5:0,16:0,0,0,21
chr16	4664833	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr16	4675116	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=14,29;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.932:28:0,10:0,10:0,1,0,27
chr16	4700318	.	CAA	C,CA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,34,33;MFRL=125,177,198;MMQ=60,40,60;MPOS=23,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=A;STR;TLOD=4.14,10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,5:0.264,0.642:9:1,2,3:0,1,2:1,0,8,0
chr16	4700338	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,10;MFRL=132,178;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,0:4,0:9,3,4,0
chr16	4707432	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr16	4714639	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:2,3:1,4:2,1,8,0
chr16	4715012	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=234,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:4,0,7,0
chr16	4718388	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:0,3,1,7
chr16	4718412	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:2,1:0,5,0,1
chr16	4718418	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:4718418_A_T:4718418:0,4,0,1
chr16	4718420	.	A	ACAATCTTTCCTTT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:4718418_A_T:4718418:0,4,0,1
chr16	4718424	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=132,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:4718418_A_T:4718418:0,3,0,1
chr16	4718437	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=36,34;MFRL=154,255;MMQ=35,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4718437_CA_C:4718437:0,1,0,1
chr16	4718439	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,34;MFRL=154,255;MMQ=35,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4718437_CA_C:4718437:0,1,0,1
chr16	4723451	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr16	4730080	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:15,0:10,14,0,2
chr16	4733984	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	4747136	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:7,1:1,1:4,5,0,2
chr16	4747495	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	4786456	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr16	4787899	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:4,8,1,1
chr16	4795097	.	GGGGCACTCC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:4795097_GGGGCACTCC_G:4795097:0,2,0,1
chr16	4795101	.	C	CCCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:4795097_GGGGCACTCC_G:4795097:0,1,0,1
chr16	4795108	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4795097_GGGGCACTCC_G:4795097:0,0,0,1
chr16	4795112	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4795097_GGGGCACTCC_G:4795097:0,0,0,1
chr16	4796595	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=199,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,1:0,1:1,3,0,2
chr16	4796871	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr16	4797109	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr16	4802370	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	4802386	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	4812209	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,4:3,3:5,3,4,3
chr16	4812435	.	C	CATATGAGTGAGAAAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:4812435_C_CATATGAGTGAGAAAAT:4812435:0,3,0,1
chr16	4812436	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:4812435_C_CATATGAGTGAGAAAAT:4812435:0,3,0,1
chr16	4815501	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:12,8:4,6:16,0,13,1
chr16	4828239	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr16	4833421	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,3:4,4:5,0,6,1
chr16	4833669	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=221,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr16	4834165	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=199,249;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4834165_C_T:4834165:1,0,0,1
chr16	4834168	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=199,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4834165_C_T:4834165:1,0,0,1
chr16	4835733	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=178,178;MMQ=46,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr16	4835778	.	T	TAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=89,158;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.235:6:0,0:2,1:2,3,1,0
chr16	4836155	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr16	4861120	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=20,14;MFRL=72,114;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:3,0:8,1:6,9,3,0
chr16	4861124	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=20,23;MFRL=90,160;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:6,0:10,2:7,11,3,0
chr16	4861130	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,13;MFRL=100,143;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.112:25:6,0:10,0:0|1:4861130_G_A:4861130:9,14,2,0
chr16	4861134	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=95,143;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:12,1:0|1:4861130_G_A:4861130:9,15,2,0
chr16	4861136	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=95,143;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:11,0:0|1:4861130_G_A:4861130:9,15,2,0
chr16	4871413	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:9,1:14,9,1,1
chr16	4896150	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.083:58:23,4:30,0:37,17,4,0
chr16	4910582	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	4924568	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:6,2:8,5,2,0
chr16	4933301	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	4935515	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=201,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	4936118	.	G	GTGGCAGGAGGATGCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4936118_G_GTGGCAGGAGGATGCAT:4936118:0,1,0,1
chr16	4936122	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4936118_G_GTGGCAGGAGGATGCAT:4936118:0,1,0,1
chr16	4938280	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	4940387	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	4940989	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:4940989_A_C:4940989:0,0,0,12
chr16	4940994	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:4940989_A_C:4940989:0,0,0,12
chr16	4943375	.	TGGAG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGAG;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr16	4945221	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	4945257	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=116,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr16	4948936	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	4949137	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:1,3:3,2:2,3,1,4
chr16	4952598	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	4953831	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:4953831_G_C:4953831:0,0,1,0
chr16	4953835	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:4953831_G_C:4953831:0,0,1,0
chr16	4953841	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:4953831_G_C:4953831:0,0,1,0
chr16	4953850	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=201,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:4953831_G_C:4953831:1,0,1,0
chr16	4953855	.	CTC	GGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,17;MFRL=101,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:4953831_G_C:4953831:1,1,1,0
chr16	5009232	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=223,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr16	5009433	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,3:0,4:0,3,0,7
chr16	5038116	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:5038116_A_C:5038116:0,0,2,0
chr16	5038119	.	CACCT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=131,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:0,0:0|1:5038116_A_C:5038116:2,1,2,0
chr16	5038126	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=131,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:5038116_A_C:5038116:2,1,2,0
chr16	5038129	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=131,178;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:5038116_A_C:5038116:2,1,2,0
chr16	5041778	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	5046417	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:3,5:7,3:4,7,1,8
chr16	5046787	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr16	5047139	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	5050554	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr16	5053646	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	5056135	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5056135_G_T:5056135:0,0,0,1
chr16	5056137	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5056135_G_T:5056135:0,0,0,1
chr16	5056138	.	G	GAAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5056135_G_T:5056135:0,0,0,1
chr16	5061085	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr16	5075748	.	A	AGAAGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:5075748_A_AGAAGG:5075748:0,1,0,1
chr16	5075749	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:5075748_A_AGAAGG:5075748:0,1,0,1
chr16	5075750	.	T	TGGGTTGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:5075748_A_AGAAGG:5075748:0,1,0,1
chr16	5077395	.	TGGGAGGA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGAGGA;STR;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.882:5:0,2:0,0:0,0,0,5
chr16	5077794	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,6,3
chr16	5078161	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:5,18,1,1
chr16	5078219	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:6,0:0|1:5078219_A_C:5078219:0,16,2,0
chr16	5078224	.	CAGA	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:0|1:5078219_A_C:5078219:0,16,2,0
chr16	5078228	.	CGG	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=172,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:6,0:0|1:5078219_A_C:5078219:0,15,2,0
chr16	5078841	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr16	5094570	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr16	5112642	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr16	5122072	.	G	GGTCT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTCT;STR;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:4,10:3,2:0,8,2,11
chr16	5123270	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,4:4,4:1,8,0,8
chr16	5125365	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,13,4
chr16	5127853	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr16	5127966	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=164,99;MMQ=30,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:5127966_C_A:5127966:0,4,0,1
chr16	5127967	.	A	ACGGAGAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=164,99;MMQ=30,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:5127966_C_A:5127966:0,4,0,1
chr16	5128902	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=192,202;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.517:33:2,5:13,12:0,16,0,17
chr16	5143647	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=199,162;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:1,10,0,8
chr16	7101976	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:2,1,4,1
chr16	7657373	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,8:5,6:1,12,4,10
chr16	7703785	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CT;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr16	7726691	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr16	7726725	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:3,3,5,0
chr16	7743345	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:13,2:12,0:16,11,0,2
chr16	7758948	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	7759164	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,13:0,4:0,0,7,11
chr16	7760846	.	TAAAA	TAA,T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21,31;MFRL=0,164,108;MMQ=60,54,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,10;RU=A;STR;TLOD=6.83,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,1,0:0,0,1:0,0,1,2
chr16	8619750	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr16	8620096	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	8728772	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr16	8728953	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,8:0,14:0,0,6,17
chr16	8728999	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=187,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,3:7,4:4,5,4,3
chr16	8729002	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=190,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,0:8,2:7,6,1,1
chr16	8732882	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr16	8733071	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr16	8735120	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr16	8736150	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr16	8736246	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr16	8736499	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr16	8738350	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,15,0
chr16	8738398	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=106.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,9:0,20:0,0,18,11
chr16	8738427	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=184.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,13:0,38:0,0,27,24
chr16	8738622	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr16	8738641	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr16	8829715	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr16	8839988	.	G	GGTATGAGATTAATGTAGTAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr16	8840025	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr16	8841847	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	8842128	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	8851767	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	8858580	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,11,3
chr16	8862211	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:8862211_C_CTA:8862211:0,3,0,1
chr16	8862212	.	C	T,CTGTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30,34;MFRL=0,170,203;MMQ=60,60,60;MPOS=9,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.97,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,1:0.589,0.286:4:0,1,1:0,2,0:0,0,0,4
chr16	8862213	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:8862211_C_CTA:8862211:0,3,0,1
chr16	8862232	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.728:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	8862592	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr16	8898811	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	8904877	.	T	TATG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATG;STR;TLOD=53.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,10:0,3:0,0,12,1
chr16	8905054	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:0,5,1,4
chr16	8948974	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr16	8949187	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:1,4,1,4
chr16	8949220	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr16	8952248	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,7:0,2:0,0,4,7
chr16	8987926	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=132,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:17,1:12,1:11,20,1,1
chr16	8988386	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.629:6:1,0:1,4:0|1:8988386_CG_C:8988386:2,0,4,0
chr16	8988391	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.400:8:0,1:5,2:1|0:8988386_CG_C:8988386:5,0,3,0
chr16	8989403	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr16	8992342	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:4,7:4,6:5,3,10,3
chr16	8992554	.	T	TTTGTTGATTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	8992868	.	AC	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	8995156	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=191,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr16	8995167	.	A	AAGGTGAGTCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr16	8995174	.	A	ACCAGTATCCTCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	8996377	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:0,5:5,3:0,5,1,7
chr16	9000277	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,0:13,2:20,5,2,0
chr16	9004564	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr16	9009286	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,25:0.406:62:17,9:20,15:25,12,21,4
chr16	9010446	.	A	AC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=110.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,11:0,0,6,23
chr16	9010826	.	TAA	T,TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26,31;MFRL=166,0,167;MMQ=60,60,60;MPOS=5,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=5.01,6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.311,0.374:9:3,3,2:0,0,1:1,2,6,0
chr16	9013035	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=147,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:0,9,1,3
chr16	9014350	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr16	9014928	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	9015252	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr16	9017061	.	T	TACAACGATGTGGGGGTTTGTAGTTGCATCATTTAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=77.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.951:20:1,3:0,2:1,1,15,3
chr16	9024282	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:2,3:3,11:0,5,0,14
chr16	9186735	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=62.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.630:30:5,12:5,6:11,0,18,1
chr16	9186749	.	GT	G,GTTT	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=33,33,32;MFRL=132,98,72;MMQ=60,60,58;MPOS=18,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,16;RU=T;STR;TLOD=8.41,4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,9,2:0.203,0.084:35:15,5,0:8,4,2:18,6,8,3
chr16	9186766	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=27,18;MFRL=117,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,5:0.084:59:16,0:15,0:31,23,5,0
chr16	9856968	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,0,3
chr16	9934689	.	AAG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,137;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AG;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr16	9935046	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:9935046_C_CA:9935046:1,2,0,1
chr16	9935048	.	G	GATTAGTCTCCCC,T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34,32;MFRL=116,152,177;MMQ=60,60,60;MPOS=6,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,1:2,1,0:1,1,0,2
chr16	9935049	.	A	ACTTC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,17;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:9935049_A_ACTTC:9935049:1,2,0,1
chr16	9935051	.	G	GTCTGCCTGTTTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,33;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:9935049_A_ACTTC:9935049:1,2,0,1
chr16	9935053	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=177,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:9935046_C_CA:9935046:1,2,0,1
chr16	9943529	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:3,2:0,0:4,0,2,0
chr16	10524656	.	GGAC	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAC;STR;TLOD=75.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,21:0.394:54:18,8:12,12:14,19,6,15
chr16	10567751	.	CTT	C,CT	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=33,32,32;MFRL=143,134,155;MMQ=60,60,60;MPOS=19,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=7.00,9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,6,7:0.127,0.179:44:18,4,3:4,1,3:26,5,12,1
chr16	10567768	.	C	A	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,13:0.175:72:17,3:16,2:46,13,12,1
chr16	10575603	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:11,0,0,2
chr16	10631945	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=192,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:1,6,2,3
chr16	10631985	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr16	10637418	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.474:21:4,4:7,5:7,4,6,4
chr16	10637445	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:9,5:5,6:8,6,6,5
chr16	10637608	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=208,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr16	10783088	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=220,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr16	10841219	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=179,242;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10841219_A_T:10841219:0,2,0,1
chr16	10841224	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=179,242;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10841219_A_T:10841219:0,2,0,1
chr16	10851675	.	G	GGTAACTTGAAATATTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=150,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,0,1
chr16	10855341	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:3,5:5,4:2,6,3,7
chr16	10855776	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr16	10865707	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=187,113;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:10865707_G_A:10865707:1,2,0,1
chr16	10865709	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=187,113;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:10865707_G_A:10865707:1,2,0,1
chr16	10865714	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=174,113;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10865707_G_A:10865707:0,1,0,1
chr16	10989374	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	10992715	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=198,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,1:6,2:1,8,2,2
chr16	10995850	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,3:1,2:2,0,4,1
chr16	10995933	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr16	10996101	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	10996682	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:1,2,1,3
chr16	10998681	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:7,2:11,9,0,2
chr16	11001680	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:3,2,0,3
chr16	11002927	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr16	11003101	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:2,2:9,6:0,11,0,8
chr16	11010150	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr16	11012234	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:5,2,7,1
chr16	11015933	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr16	11062936	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=211,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr16	11114006	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=118,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:5,1,2,2
chr16	11136048	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=121,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:0,2:2,0,2,1
chr16	11214655	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr16	11250413	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	11260440	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=120,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr16	11260468	.	C	CATTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=37,35;MFRL=165,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11260468_C_CATTT:11260468:0,1,0,1
chr16	11260472	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=165,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11260468_C_CATTT:11260468:0,1,0,1
chr16	11260476	.	A	ATAGGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=165,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11260468_C_CATTT:11260468:0,1,0,1
chr16	11260478	.	A	ATCCTTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=165,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11260468_C_CATTT:11260468:0,1,0,1
chr16	11272170	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr16	11272623	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	11349403	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	11367154	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr16	11369855	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	11370197	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,3:10,0:10,8,1,2
chr16	11444403	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=172,191;MMQ=40,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,5:1,5:1,0,9,1
chr16	11444430	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr16	11444454	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=73,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,22:0.854:25:0,6:1,13:1,2,19,3
chr16	11444469	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=143.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,13:0,22:0,0,25,11
chr16	11650325	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.618:32:8,12:4,8:11,1,15,5
chr16	11772488	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:20,3:14,0:17,17,3,0
chr16	11772600	.	T	TTCTGA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,9:0,0,5,18
chr16	11773743	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,0,12
chr16	11794472	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,0:9,4:1,14,0,4
chr16	11828018	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr16	11850150	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:12,7:6,9:7,11,6,10
chr16	11859034	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=72.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,1,19
chr16	11862388	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:1,6,0,2
chr16	11933827	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,0:9,2:6,12,0,2
chr16	11940764	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=174,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr16	11945231	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,7:0,19:0,0,13,13
chr16	11945298	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,19;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,0:13,1:0|1:11945298_G_GA:11945298:10,12,1,1
chr16	11945300	.	CCGCTGG	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:9,0:13,2:0|1:11945298_G_GA:11945298:10,17,1,1
chr16	11945310	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:15,1:0|1:11945298_G_GA:11945298:8,15,1,1
chr16	11980878	.	G	GTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,16;MFRL=257,237;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr16	11990323	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr16	12136954	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,5,11
chr16	12142130	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.861:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr16	12142172	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,11:0,1:0|1:12142172_T_G:12142172:0,0,11,2
chr16	12142175	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=60.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0|1:12142172_T_G:12142172:0,0,12,2
chr16	12223637	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:7,4:6,1:5,8,2,4
chr16	12371915	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:8,5:3,8:3,8,2,11
chr16	12450163	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:1,3,2,5
chr16	12618465	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr16	12618743	.	T	TAGG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=69,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.362:6:1,2:3,0:0|1:12618743_T_TAGG:12618743:1,3,1,1
chr16	12618746	.	T	TAACTCTCTGTTGAATGCTTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:12618743_T_TAGG:12618743:1,2,1,1
chr16	12618750	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=75,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12618743_T_TAGG:12618743:1,1,0,1
chr16	12759027	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr16	13297242	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:2,1,3,1
chr16	13328814	.	ACT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=CT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	14026007	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,13,5
chr16	14031520	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,16,0
chr16	14234708	.	T	TGATTTACTTTAGCTTCAGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14234708_T_TGATTTACTTTAGCTTCAGC:14234708:0,0,0,1
chr16	14234712	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14234708_T_TGATTTACTTTAGCTTCAGC:14234708:0,0,0,1
chr16	14530726	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr16	14646054	.	G	GGCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=234,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	14649643	.	TAGAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14649643_TAGAAAA_T:14649643:0,1,0,1
chr16	14649652	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14649643_TAGAAAA_T:14649643:0,1,0,1
chr16	14649654	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14649643_TAGAAAA_T:14649643:0,1,0,1
chr16	14675943	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:0,2:5,3:6,0,5,0
chr16	14680062	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=186,175;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:3,1:6,1:10,0,2,0
chr16	14680088	.	TC	CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=186,152;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.128:22:6,1:12,0:20,0,2,0
chr16	14698145	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:6,1:5,1:0,12,0,2
chr16	14700254	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr16	14738525	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	14742498	.	GA	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=181,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:14742498_GA_TC:14742498:0,2,0,1
chr16	14742501	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=181,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:14742498_GA_TC:14742498:0,2,0,1
chr16	14758646	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=149,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:14758646_C_T:14758646:9,0,2,0
chr16	14758653	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=149,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:7,0:0|1:14758646_C_T:14758646:11,0,2,0
chr16	14957070	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=192,183;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:2,2,4,2
chr16	14969372	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	14975449	.	TGCCATGGAAGCG	T	.	.	DP=80;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=161,122;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,3:0.049:80:34,1:26,2:0|1:14975449_TGCCATGGAAGCG_T:14975449:72,5,2,1
chr16	14975463	.	T	TTC	.	.	DP=75;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=158,122;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,3:0.052:75:39,1:30,2:0|1:14975449_TGCCATGGAAGCG_T:14975449:69,3,2,1
chr16	14975467	.	C	CTCT	.	.	DP=74;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=153,121;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,3:0.053:74:38,0:30,2:0|1:14975449_TGCCATGGAAGCG_T:14975449:69,2,3,0
chr16	14975468	.	CAGAA	C	.	.	DP=80;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=150,121;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,3:0.049:80:37,0:28,3:0|1:14975449_TGCCATGGAAGCG_T:14975449:75,2,3,0
chr16	14975474	.	GACTGCAGCA	G	.	.	DP=83;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=140,121;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,3:0.048:82:39,0:31,3:0|1:14975449_TGCCATGGAAGCG_T:14975449:77,2,3,0
chr16	14983155	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=195,149;MMQ=25,25;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.080:47:31,2:8,1:0,44,0,3
chr16	14988984	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=229,219;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,4:9,2:0,12,0,6
chr16	15091589	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=141;ECNT=1;MBQ=34,35,34,32;MFRL=144,122,138,140;MMQ=57,50,48,50;MPOS=26,17,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=T;STR;TLOD=14.35,106.45,13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:32,11,57,13:0.094,0.514,0.112:113:17,7,27,2:15,4,25,11:30,2,70,11
chr16	15092116	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=212,209;MMQ=57,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:13,0,5,0
chr16	15092331	.	G	T	.	.	DP=132;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=148,79;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,3:0.034:114:69,1:40,2:12,99,1,2
chr16	15092340	.	T	C	.	.	DP=115;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=152,153;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,3:0.035:112:63,1:37,1:4,105,0,3
chr16	15092348	.	A	C	.	.	DP=103;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=155,158;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,7:0.081:96:62,2:27,5:0,89,1,6
chr16	15092352	.	T	A	.	.	DP=94;ECNT=8;MBQ=31,29;MFRL=159,195;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,5:0.068:86:49,1:23,4:0,81,1,4
chr16	15092358	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=160,148;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,3:0.048:81:52,2:24,1:0,78,0,3
chr16	15092364	.	CA	TG	.	.	DP=74;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.055:71:44,3:23,0:0,68,0,3
chr16	15092370	.	GG	CA,TG	.	.	DP=69;ECNT=8;MBQ=32,35,32;MFRL=165,145,168;MMQ=60,60,50;MPOS=11,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.38,3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:63,3,2:0.056,0.042:68:37,3,2:22,0,0:0,63,0,5
chr16	15092376	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,9:0.163:59:31,7:18,2:0,50,0,9
chr16	15100202	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=182,180;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,5:7,4:11,0,9,0
chr16	15116521	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,135;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,2:8,1:14,3,3,0
chr16	15120411	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,214;MMQ=52,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:11,2:2,0:13,0,2,0
chr16	15135071	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	15156971	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=151,163;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:6,6:2,3:9,0,8,1
chr16	15159022	.	C	CA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,130;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.290:24:4,4:12,2:15,2,5,2
chr16	15168760	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=112,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr16	15178612	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,115;MMQ=52,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.150:51:32,4:12,3:11,33,0,7
chr16	15187912	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:11,12:2,3:14,0,13,2
chr16	15501658	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:5,2,1,1
chr16	15596142	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,17,3
chr16	15609365	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=181,198;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	15694484	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=59,177;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,11:3,1:6,0,9,3
chr16	15705046	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr16	15705605	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:1,2:8,5:1,8,0,7
chr16	15716945	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,1:9,2:9,12,1,2
chr16	15718591	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,0:4,6:7,0,6,0
chr16	15724113	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:5,0,5,1
chr16	15727459	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=200,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.543:15:2,4:5,4:7,0,7,1
chr16	15729455	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:11,1,2,0
chr16	15732912	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:5,0,6,1
chr16	15758744	.	CT	C,CTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20,26;MFRL=136,147,135;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.61,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.269,0.313:10:2,2,0:1,0,2:1,3,1,5
chr16	15761084	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=157,83;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:14,3,1,1
chr16	15761100	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:6,3:9,0:12,4,0,3
chr16	15771601	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=215,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr16	15771892	.	G	GAAGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	15809163	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr16	15813945	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr16	15838940	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	15843899	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	15844190	.	T	TGAGCACCTGCCAGGTTCCCAGCACTGAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:2,3,1,1
chr16	15844227	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15844227_A_C:15844227:0,0,1,0
chr16	15844231	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15844227_A_C:15844227:0,0,1,0
chr16	15853596	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=103,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,3:3,8:1,5,5,6
chr16	15892465	.	T	TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,212;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:1,1:2,1:3,1,2,0
chr16	15967532	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=195,251;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr16	16108282	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr16	16110253	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	16161976	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	16184232	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	16200756	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,3,13
chr16	16205141	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:16205141_A_G:16205141:0,0,3,0
chr16	16205143	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:16205141_A_G:16205141:0,0,3,0
chr16	16205161	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:16205141_A_G:16205141:0,0,3,0
chr16	16205167	.	G	GTGGGGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TGGGGC;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.770:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	16205449	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr16	16205501	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr16	16215814	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=127,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:13,2:5,1:12,6,2,1
chr16	16218641	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=108,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:12,1:16,4,2,0
chr16	16219596	.	G	GAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr16	16232201	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:5,0,2,1
chr16	16232433	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr16	16244174	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:1,8:5,1:0,7,0,9
chr16	16244660	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=96,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,5:5,6:3,6,4,7
chr16	16248681	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:2,3,4,2
chr16	16251435	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	16255195	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr16	16255205	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=211,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr16	16255240	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=141,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr16	16256767	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr16	16267079	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	16271271	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,45;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:7,5,1,1
chr16	16278948	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=90,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr16	16280921	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	16284265	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:16284265_T_C:16284265:0,1,2,1
chr16	16284272	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:16284265_T_C:16284265:0,0,2,2
chr16	16291858	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=52.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr16	16291871	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,13,7
chr16	16291952	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:9,2:12,0:11,11,1,1
chr16	16306169	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=169,150;MMQ=27,27;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.309:17:3,1:2,1:1,11,0,5
chr16	16326595	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	16349624	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,142;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:16,0:0,24,0,2
chr16	17221423	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	17221755	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr16	17232460	.	T	TCTCAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17232460_T_TCTCAAAA:17232460:0,1,0,1
chr16	17232464	.	CC	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=77,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:17232460_T_TCTCAAAA:17232460:0,2,0,1
chr16	17451987	.	CT	C,CTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,27,22;MFRL=117,195,173;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.09,8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,6:0.190,0.479:12:2,2,3:2,0,2:0,4,0,8
chr16	18532017	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=184,202;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:7,0,4,0
chr16	18532238	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,151;MMQ=25,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:11,4:8,3:0,19,0,7
chr16	18540982	.	C	CAAAAAAAATCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=217,221;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	18799547	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=236,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:18799547_AC_A:18799547:0,4,0,1
chr16	18799552	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=236,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:18799547_AC_A:18799547:0,4,0,1
chr16	18799554	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=236,170;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:18799547_AC_A:18799547:0,4,0,1
chr16	18804737	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.452:24:7,4:5,5:0,13,0,11
chr16	18804753	.	CTT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:0,1:3,2:0,6,0,4
chr16	18823192	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:8,8:2,4:3,7,2,10
chr16	18826810	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,113;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:16,3:23,0:24,15,3,0
chr16	18827524	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	18839496	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=116,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:9,7:7,4:5,12,3,9
chr16	18849858	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.615:24:5,6:4,9:5,4,11,4
chr16	18858727	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.303:18:6,2:6,3:9,4,5,0
chr16	18860472	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,0:6,3:8,1,3,0
chr16	18865935	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.373:25:8,5:7,4:15,1,9,0
chr16	18882659	.	GA	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=167,164;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.441:37:7,10:12,7:20,0,17,0
chr16	18908104	.	A	AAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=235,180;MMQ=52,22;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AT;STR;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,4:4,2:4,0,7,0
chr16	19041491	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr16	19046960	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=74,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:5,2,5,2
chr16	19049378	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=120,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,1:4,4:2,6,0,5
chr16	19051520	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr16	19056769	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=72,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.569:19:4,4:4,6:0|1:19056769_G_A:19056769:6,2,7,4
chr16	19056786	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:5,2:9,1:0|1:19056769_G_A:19056769:8,6,2,1
chr16	19079095	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr16	19083221	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr16	19128797	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.441:39:10,13:11,4:10,12,8,9
chr16	19129404	.	TTA	T	.	.	DP=106;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,4:0.055:85:42,3:33,1:75,6,4,0
chr16	19129786	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=170,165;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.642:14:2,7:3,2:5,0,9,0
chr16	19130798	.	GT	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,7:0.168:46:19,4:16,2:22,17,4,3
chr16	19131048	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:2,1:3,2:5,4,3,1
chr16	19132290	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=152,106;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:15,0:11,4:7,20,0,4
chr16	19132720	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:16,1:10,1:8,18,0,2
chr16	19183957	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=219,137;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr16	19195507	.	T	TATTTCTGC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr16	19278496	.	TCG	CAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	19320226	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	19320260	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,0:1,1:4,0,2,0
chr16	19320271	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:0,0:4,0:6,0,2,0
chr16	19455318	.	AATGGATGG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=ATGG;STR;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,3:0,1:1,0,4,0
chr16	19455615	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr16	19455643	.	T	TCGTCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:19455643_T_TCGTCC:19455643:0,3,0,1
chr16	19455646	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:19455643_T_TCGTCC:19455643:0,3,0,1
chr16	19455647	.	G	GAATTATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:19455643_T_TCGTCC:19455643:0,3,0,1
chr16	19460842	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=78.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,13:0,10:0,0,17,6
chr16	19471665	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=172.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,29:0,17:0,0,13,34
chr16	19481220	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,36;MFRL=162,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:19481220_CTT_C:19481220:0,1,0,1
chr16	19481234	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=246,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1|0:19481220_CTT_C:19481220:0,1,0,2
chr16	19481243	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=205,246;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19481220_CTT_C:19481220:0,2,0,1
chr16	19483318	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,188;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr16	19503598	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=72,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:0,5:5,2:4,1,1,6
chr16	19505730	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:2,2,0,5
chr16	19505751	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:1,1:2,3:0,3,0,5
chr16	19508573	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19508573_A_G:19508573:0,1,0,1
chr16	19508583	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=37,30;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19508573_A_G:19508573:0,1,0,1
chr16	19509333	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,14:0,0,3,16
chr16	19516300	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,3:12,0:14,10,3,0
chr16	19518945	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=126,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.436:19:4,4:5,4:10,1,7,1
chr16	19522101	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,7:0,3:6,0,7,3
chr16	19543756	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,252;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:17,3,2,0
chr16	19557243	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=180,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:19557243_A_C:19557243:1,3,1,0
chr16	19557247	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:19557243_A_C:19557243:0,3,1,0
chr16	19557252	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=14540,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:19557243_A_C:19557243:0,2,1,0
chr16	19580699	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr16	19592888	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.193:22:13,3:4,0:9,9,2,2
chr16	19619602	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.304:14:5,0:3,4:4,6,0,4
chr16	19628229	.	C	CATTTCTCTACCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	19640144	.	TG	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=186,127;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr16	19745155	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:19745155_T_C:19745155:0,4,0,1
chr16	19745159	.	A	AGAGCATAGGAATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:19745155_T_C:19745155:0,4,0,1
chr16	19883082	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr16	20322425	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr16	20322439	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr16	20327175	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=98,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,3:1,1:1,1,3,1
chr16	20327283	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:8,0:13,8,1,1
chr16	20331498	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	20335158	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=128,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:4,6,0,2
chr16	20352336	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=149,194;MMQ=57,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:20352336_C_A:20352336:4,0,1,0
chr16	20352345	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=135,194;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:20352336_C_A:20352336:4,0,1,0
chr16	20352532	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=51,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:1,2,1,5
chr16	20355521	.	G	GAATGAGGAGTGACTGCTTAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=189,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr16	20357398	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,6,1
chr16	20357711	.	A	ACTCCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:20357711_A_ACTCCT:20357711:0,2,0,1
chr16	20357713	.	A	ACCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:20357711_A_ACTCCT:20357711:0,2,0,1
chr16	20357721	.	G	GTAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=219,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	20376734	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr16	20376755	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,7,3
chr16	20386115	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr16	20395868	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	20395908	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:3,0,5,0
chr16	20481010	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,145;MMQ=52,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:19,1:24,4:21,22,2,3
chr16	20488803	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=133.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,24:0,19:0,0,11,32
chr16	20498079	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,0,13
chr16	20635415	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=143,79;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:20635415_C_T:20635415:8,7,1,1
chr16	20635417	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,79;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:6,1:0|1:20635415_C_T:20635415:8,10,1,1
chr16	20635424	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=144,79;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:0|1:20635415_C_T:20635415:7,15,1,1
chr16	20651810	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,2:11,1:18,8,2,1
chr16	20750137	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,9,0
chr16	20753123	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	20792188	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,15:0,0,3,20
chr16	20796363	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,1:10,1:10,11,2,0
chr16	20796508	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr16	20809879	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,2:8,0:15,10,2,0
chr16	20810730	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,0,17
chr16	20824697	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	20860897	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr16	20871425	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,0:12,2:12,13,1,1
chr16	20970457	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr16	20974740	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:3,1:4,1:4,4,0,3
chr16	20986506	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:12,1,3,0
chr16	20990844	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=123,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.350:14:5,0:4,0:2,7,0,5
chr16	21030897	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	21035826	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:1,1,3,0
chr16	21049378	.	G	GCACTTAATGAGAGAGAATGGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=178,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr16	21049388	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	21086971	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=194,146;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:21086971_T_C:21086971:0,3,0,2
chr16	21086973	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=183,192;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:21086971_T_C:21086971:0,4,0,1
chr16	21086976	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=193,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:21086971_T_C:21086971:0,4,0,1
chr16	21115963	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	21133313	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,1:10,1:12,11,2,0
chr16	21136477	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr16	21145648	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=122,188;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,1:2,1:3,3,1,1
chr16	21147885	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:1,1,0,4
chr16	21185384	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:2,3:6,9:6,3,8,4
chr16	21185529	.	G	GGT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=196,211;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:3,0:4,2:0|1:21185529_G_GGT:21185529:0,7,0,2
chr16	21185531	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=196,211;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:21185529_G_GGT:21185529:0,7,0,2
chr16	21185535	.	AG	TC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=196,211;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:21185529_G_GGT:21185529:0,5,0,2
chr16	21185568	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:21185568_T_G:21185568:0,2,0,2
chr16	21185570	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:21185568_T_G:21185568:0,2,0,2
chr16	21245047	.	T	TCTG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,1:7,0:0|1:21245047_T_TCTG:21245047:6,4,2,0
chr16	21245049	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:0|1:21245047_T_TCTG:21245047:6,4,2,0
chr16	21245051	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:0|1:21245047_T_TCTG:21245047:6,4,2,0
chr16	21286927	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=137,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:8,6:4,2:4,8,3,5
chr16	21289626	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	21327388	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=116,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21327388_A_C:21327388:0,1,0,1
chr16	21327389	.	C	CAAGGATTGGTCCCTTGTGCCTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=116,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21327388_A_C:21327388:0,1,0,1
chr16	21397273	.	CTGTGTGTGTGTG	C,CTGTGTGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36,34;MFRL=0,127,170;MMQ=60,27,48;MPOS=29,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,8,13;RU=TG;STR;TLOD=3.55,6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,0,2:0,1,0:0,0,1,2
chr16	21654492	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:3,0:2,0:0,6,0,2
chr16	21689791	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr16	21698909	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:18,0:7,3:20,5,0,3
chr16	21698988	.	CTT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,1:2,1:2,1,1,1
chr16	21728129	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	21985398	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	21991811	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr16	21992122	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	22111907	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr16	22128052	.	TT	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	22128153	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr16	22137665	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:1,1:1,0:0|1:22137665_T_TA:22137665:0,3,0,1
chr16	22137666	.	G	GCTCCACAAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:1,1:2,0:0|1:22137665_T_TA:22137665:0,3,0,1
chr16	22137668	.	A	AGGGGCATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0|1:22137665_T_TA:22137665:0,3,0,1
chr16	22149612	.	CTG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	22151593	.	TGGAG	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=92,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,0:0|1:22151593_TGGAG_T:22151593:0,4,1,1
chr16	22151602	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:22151593_TGGAG_T:22151593:0,3,1,1
chr16	22151606	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:22151593_TGGAG_T:22151593:0,3,0,1
chr16	22161136	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,9,13
chr16	22261900	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,4:3,4:3,1,5,3
chr16	22278183	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:7,1:2,8,0,2
chr16	22325339	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,2:3,1:3,1,2,1
chr16	22328094	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr16	23079353	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr16	23085282	.	C	CCTTTCAGATTTTTGACCAGGAGTCACT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.657:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr16	23097031	.	A	AGATCTGAGTACTCCGCCTTCCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=249,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	23221183	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr16	23221238	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr16	23379205	.	TA	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:8,2,2,0
chr16	23390201	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	23391547	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=116,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr16	23391642	.	T	TTACA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23391642_T_TTACA:23391642:0,0,0,1
chr16	23391644	.	CCG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23391642_T_TTACA:23391642:0,0,0,1
chr16	23391648	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23391642_T_TTACA:23391642:0,0,0,1
chr16	23391650	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23391642_T_TTACA:23391642:0,0,0,1
chr16	23400494	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr16	23453758	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	23486197	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=107.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,13:0,0,29,1
chr16	23490353	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	23506940	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr16	23521643	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	23521780	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	23535680	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=119.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,15:0,0,21,12
chr16	23540798	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,13,5
chr16	23541223	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,2,7
chr16	23569105	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.480:10:2,0:1,1:2,3,0,5
chr16	23573687	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=155,165;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:3,2:5,0:0,10,0,5
chr16	23625463	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr16	23677111	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr16	23692405	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=114,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,4:3,9:3,6,0,13
chr16	23693581	.	TAAGG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=219,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	23712448	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,4:4,4:3,4,0,8
chr16	23713395	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=108,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr16	23718262	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,1:3,3:4,2,3,1
chr16	23721601	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=133,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr16	23767696	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=126,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.366:8:3,1:2,0:0|1:23767696_A_C:23767696:3,2,3,0
chr16	23767700	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,11;MFRL=126,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.364:8:3,0:2,0:0|1:23767696_A_C:23767696:3,2,3,0
chr16	23768727	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr16	23768802	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,11:0,11:0,0,8,14
chr16	23847747	.	TGCGCCCTCC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCGCCCTCC;STR;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr16	24104328	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	24105669	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:4,5:2,0:0,7,1,4
chr16	24135112	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=128,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,0:2,5:4,2,3,2
chr16	24202615	.	A	G,AGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34,32;MFRL=214,159,176;MMQ=60,60,60;MPOS=32,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.09,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:2,0,1:1,2,0:0,3,0,3
chr16	24357998	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,2:0,0,4,3
chr16	24373216	.	ACAG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24373216_ACAG_A:24373216:0,0,0,1
chr16	24373221	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24373216_ACAG_A:24373216:0,0,0,1
chr16	24564879	.	GTA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=68.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,3,16
chr16	24574645	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.623:27:5,8:4,8:2,8,7,10
chr16	24574691	.	CTTT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.219:14:6,1:2,2:9,2,3,0
chr16	24574712	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=16,14;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.273:19:5,1:1,0:10,4,5,0
chr16	24578458	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,4,3
chr16	24581776	.	G	GCTTTGTGATGTGTGCATTCATCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=219,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0|1:24581776_G_GCTTTGTGATGTGTGCATTCATCTC:24581776:0,1,0,1
chr16	24581779	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=219,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24581776_G_GCTTTGTGATGTGTGCATTCATCTC:24581776:0,1,0,1
chr16	24582896	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:13,5:27,0:32,8,5,0
chr16	24801737	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,10,8
chr16	24805040	.	A	ACATAGAAACC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	24807165	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,11:0,0,17,6
chr16	24816492	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,1,23
chr16	24820823	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.887:5:0,1:0,1:0,0,1,4
chr16	24831727	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,6,14
chr16	24835168	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr16	24883416	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:17,3:13,0:27,5,3,0
chr16	24886886	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,2:0|1:24886886_TG_T:24886886:0,0,4,1
chr16	24886893	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:24886886_TG_T:24886886:0,0,4,1
chr16	24902194	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,4:0,15:0,0,14,5
chr16	24918530	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr16	24919245	.	C	CAGGGA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,1:6,4:5,5,3,2
chr16	24959009	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	24975425	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:5,0,6,0
chr16	24980020	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,63;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.100:57:31,0:20,5:27,25,1,4
chr16	25180610	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	25182042	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.105:35:14,0:18,3:12,20,1,2
chr16	25258688	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=219,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:25258688_T_A:25258688:0,2,0,1
chr16	25258694	.	A	AGGGTAGAGGGAATATAGGCATTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=219,243;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:25258688_T_A:25258688:0,2,0,1
chr16	25264196	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,0:4,3:4,0,3,0
chr16	25264233	.	CA	TG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=133,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:5,0:9,2:11,3,1,1
chr16	25264234	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=130,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:2,3:8,0:9,2,2,1
chr16	25264242	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.225:18:3,4:11,0:9,5,3,1
chr16	25264440	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=230,232;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr16	27080306	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr16	27080319	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:2,2:6,2:2,7,0,4
chr16	27215380	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=186.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.983:58:0,30:0,27:0,0,39,19
chr16	27221867	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,2:5,0:8,9,1,1
chr16	27227168	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr16	27236403	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr16	27238034	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,5:0,7:0,0,10,4
chr16	27244548	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	27246703	.	A	ACTCCACTATATGCCATTCCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	27356359	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr16	27367166	.	C	CCCAGGACTCACTTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:27367166_C_CCCAGGACTCACTTG:27367166:6,3,1,1
chr16	27367168	.	T	TGATGCTGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=161,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:5,0:0|1:27367166_C_CCCAGGACTCACTTG:27367166:6,3,1,1
chr16	27441359	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,2,1
chr16	27445659	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:1,1:0|1:27445659_A_C:27445659:8,1,2,0
chr16	27445666	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:3,0:0|1:27445659_A_C:27445659:8,1,2,0
chr16	27456613	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,8:6,1:4,6,3,6
chr16	27473860	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,41;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr16	27476548	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,2,1
chr16	27483256	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=126,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:2,3:5,7:4,4,2,8
chr16	27506825	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:0,2:3,0:0,4,0,3
chr16	27510117	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,0:0,0,0,4
chr16	27518564	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=199,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27518564_A_C:27518564:0,1,0,1
chr16	27518565	.	TTGG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=199,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27518564_A_C:27518564:0,1,0,1
chr16	27561584	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=193,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr16	27709825	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr16	27713103	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:0,3,0,9
chr16	27715377	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr16	27733042	.	C	CCACTCCCTAATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=245,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	27752314	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr16	27763266	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:27763266_C_G:27763266:0,0,0,1
chr16	27763269	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27763266_C_G:27763266:0,0,0,1
chr16	27777831	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	27856221	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,1,1
chr16	27974418	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr16	28116085	.	C	CACTTTTTTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	28123226	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:4,2:7,7:5,6,6,4
chr16	28132951	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:7,0:1,3:6,2,2,1
chr16	28157351	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0,0,17,1
chr16	28167914	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=230,264;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:28167914_C_A:28167914:0,1,0,1
chr16	28167926	.	AAT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=237,264;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:1,1:0|1:28167914_C_A:28167914:0,2,0,1
chr16	28181306	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	28403239	.	C	CTCCTTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,258;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	28481650	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,165;MMQ=24,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:5,0,6,0
chr16	28507644	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:4,2,4,4
chr16	28507898	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,825;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.143:23:12,2:8,0:12,8,0,3
chr16	28508447	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr16	28508716	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=147.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,20:0,22:0,0,36,7
chr16	28509923	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	28513530	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=228,256;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr16	28549316	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.504:20:7,7:2,3:7,3,9,1
chr16	28596984	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:8,0:5,3:5,8,1,2
chr16	28601812	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=190,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,4:2,5:3,1,2,7
chr16	28603796	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,120;MMQ=60,29;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,2:5,1:0,13,0,3
chr16	28604548	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,2:7,0:8,4,2,0
chr16	28604686	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:12,9:3,6:7,8,9,7
chr16	28607070	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=152,164;MMQ=52,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.476:36:6,7:12,10:11,8,10,7
chr16	28617057	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=188,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.267:27:5,3:15,3:20,0,7,0
chr16	28617128	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=153,154;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,10:0.207:51:21,6:20,4:21,20,4,6
chr16	28617308	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=190,140;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr16	28617346	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=85,145;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr16	28617552	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=137,179;MMQ=53,39;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.149:22:8,2:11,0:5,14,2,1
chr16	28617574	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,197;MMQ=58,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,2:10,1:3,15,1,2
chr16	28617595	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=134,197;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:0,8,1,2
chr16	28618047	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=130,109;MMQ=60,32;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.248:26:7,4:11,2:14,6,5,1
chr16	28618065	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=128,136;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,9:0.303:31:8,4:13,3:0|1:28618065_A_T:28618065:13,9,7,2
chr16	28618068	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=130,136;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,9:0.286:33:7,5:15,4:0|1:28618065_A_T:28618065:15,9,7,2
chr16	28618071	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=130,136;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,9:0.286:33:8,5:16,4:0|1:28618065_A_T:28618065:15,9,7,2
chr16	28618237	.	TA	CG	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:10,5:16,7:17,9,8,4
chr16	28618238	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,12:0,23:0,0,25,12
chr16	28618278	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.068:62:25,1:30,2:36,22,2,2
chr16	28618446	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,158;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,3:10,1:2,15,0,4
chr16	28619520	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=196,183;MMQ=60,58;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:5,3:10,0,3,0
chr16	28619565	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:18,3:21,0:39,2,3,0
chr16	28631314	.	T	TTGTG,TTGTGTG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31,31;MFRL=0,69,140;MMQ=60,60,60;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,11,12;RU=TG;STR;TLOD=3.85,43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,15:0.148,0.808:17:0,2,7:0,0,6:0,0,15,2
chr16	28631360	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=112.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.974:33:0,15:0,18:0,0,26,7
chr16	28734477	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,180;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:9,1:11,5:21,0,6,0
chr16	28734945	.	G	GCTCCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=230,190;MMQ=21,21;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:3,1:0,0:0|1:28734945_G_GCTCCT:28734945:0,3,0,1
chr16	28734948	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=230,190;MMQ=21,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:28734945_G_GCTCCT:28734945:0,3,0,1
chr16	28837203	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=187,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.482:15:5,3:1,4:1,7,0,7
chr16	28837515	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.278:15:5,0:6,3:10,1,2,2
chr16	28842178	.	TGGA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=83,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:28842178_TGGA_T:28842178:0,2,0,1
chr16	28842185	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=83,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:28842178_TGGA_T:28842178:0,2,0,1
chr16	28844068	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,3:1,5:5,0,7,1
chr16	28844284	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,4:6,3:0,9,0,8
chr16	28844365	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=201,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,0:6,2:5,2,0,2
chr16	28846840	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=125,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,5:6,2:8,1,6,1
chr16	28846866	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.428:21:4,5:7,2:6,6,5,4
chr16	28847099	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,17;MFRL=135,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:5,0:6,1:0|1:28847099_A_AC:28847099:3,10,1,1
chr16	28847102	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=135,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:6,0:7,2:0|1:28847099_A_AC:28847099:3,10,1,1
chr16	28847104	.	T	TAG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:28847099_A_AC:28847099:3,11,1,1
chr16	28847109	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=135,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,1:0|1:28847099_A_AC:28847099:2,11,1,1
chr16	28847246	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=189,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr16	28847309	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=23,33;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:1,3:0,0:0|1:28847309_A_C:28847309:1,2,4,0
chr16	28847313	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,1:0,1:0|1:28847309_A_C:28847309:1,3,4,0
chr16	28847318	.	AG	CC	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:28847309_A_C:28847309:3,3,2,0
chr16	28847321	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,0:0|1:28847309_A_C:28847309:3,2,2,0
chr16	28847323	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,18;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:0|1:28847309_A_C:28847309:3,2,2,0
chr16	28855522	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.321:13:4,2:4,0:4,5,4,0
chr16	28855727	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=121,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,4:7,5,4,4
chr16	28856889	.	ATACATAACCTCCTCCAAT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.248:6:3,1:1,0:0,5,0,1
chr16	28856900	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=79,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr16	28857645	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.833:22:1,12:2,6:0,3,4,15
chr16	28883327	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:2,1:7,4:2,7,1,5
chr16	28883841	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=194,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,2,2
chr16	28890131	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,5:5,8:3,8,4,9
chr16	28890475	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.166:26:10,1:12,0:0|1:28890475_A_C:28890475:0,22,4,0
chr16	28890482	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.188:23:7,1:10,1:0|1:28890475_A_C:28890475:0,19,4,0
chr16	28890941	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,13;MFRL=86,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:0,1:1,1,0,5
chr16	28893724	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr16	28898617	.	A	ATCCACCTGT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=138,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:28898617_A_ATCCACCTGT:28898617:1,8,0,2
chr16	28898622	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=138,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,2:6,0:0|1:28898617_A_ATCCACCTGT:28898617:1,8,0,2
chr16	28898684	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,0:2,3,1,1
chr16	28905598	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=147,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:9,1:9,16,1,1
chr16	28912274	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	28913787	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.662:7:1,3:1,1:0,2,0,5
chr16	28914838	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=285,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28914838_C_T:28914838:0,1,0,1
chr16	28914847	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,31;MFRL=285,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:28914838_C_T:28914838:0,1,0,1
chr16	28919902	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=184,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,0:1,2:4,0,2,0
chr16	28925978	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,2:5,7:7,1,8,1
chr16	28925989	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,9;MFRL=152,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.201:16:6,0:7,0:0|1:28925989_T_G:28925989:8,5,3,0
chr16	28925994	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,9;MFRL=152,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.201:16:5,0:7,0:0|1:28925989_T_G:28925989:8,5,3,0
chr16	28925997	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=152,249;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.201:16:4,0:5,0:0|1:28925989_T_G:28925989:8,5,3,0
chr16	28994161	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.708:5:1,0:0,0:0,1,4,0
chr16	28997490	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=117,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:11,0:12,2:0|1:28997490_T_A:28997490:12,12,1,1
chr16	28997498	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=121,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,0:10,1:0|1:28997490_T_A:28997490:10,12,1,1
chr16	29676378	.	C	CT	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=115,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.175:43:19,3:10,5:12,23,3,5
chr16	29676520	.	C	CGT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29676520_C_CGT:29676520:0,0,0,1
chr16	29676521	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:29676520_C_CGT:29676520:0,0,0,1
chr16	29676523	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29676520_C_CGT:29676520:0,0,0,1
chr16	29677823	.	GCTCTCT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=CT;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr16	29679926	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr16	29679989	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr16	29680036	.	T	TGGGATTATAGGTGTGAGCCA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGATTATAGGTGTGAGCCA;STR;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:6,2:2,1:7,1,4,2
chr16	29680165	.	T	TA	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=133,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:10,3:3,1:3,11,0,4
chr16	29680256	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:29680256_T_G:29680256:0,0,0,4
chr16	29680280	.	GT	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=231,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29680256_T_G:29680256:1,0,0,1
chr16	29680389	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:4,9:12,11:16,0,20,0
chr16	29680519	.	G	T	.	.	DP=214;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:184,19:0.055:203:88,2:53,0:92,92,0,19
chr16	29680524	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=199;ECNT=3;MBQ=22,20,20,23;MFRL=138,137,126,141;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,26,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.77,24.14,14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:76,7,20,17:0.056,0.157,0.132:120:35,3,11,6:25,3,7,7:27,49,13,31
chr16	29680579	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=152,115;MMQ=60,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.094:61:45,5:10,0:0,56,0,5
chr16	29680700	.	T	TAAGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=233,211;MMQ=58,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:29680700_T_TAAGA:29680700:0,2,0,1
chr16	29680703	.	G	GACTGATTTTTGTATTTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=233,211;MMQ=58,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:29680700_T_TAAGA:29680700:0,2,0,1
chr16	29680721	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29680721_CA_TG:29680721:0,0,0,1
chr16	29680727	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=185,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29680721_CA_TG:29680721:1,0,0,1
chr16	29681028	.	CT	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=289,228;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr16	29681197	.	CA	C,CAA,CAAA	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=33,30,32,34;MFRL=142,137,136,136;MMQ=60,60,60,60;MPOS=8,12,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,11,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.23,54.65,10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,4,27,8:0.081,0.562,0.156:50:3,1,13,5:8,2,8,1:5,6,24,15
chr16	29681418	.	GA	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:29681418_GA_TG:29681418:0,0,0,1
chr16	29681422	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29681418_GA_TG:29681418:0,0,0,1
chr16	29681424	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=303,207;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:29681418_GA_TG:29681418:0,1,0,1
chr16	29681429	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=303,207;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29681418_GA_TG:29681418:0,1,0,1
chr16	29681433	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=303,207;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29681418_GA_TG:29681418:0,1,0,1
chr16	29811319	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr16	29817998	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr16	29818898	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.185:19:6,2:10,1:15,1,2,1
chr16	29819881	.	CCCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:1,2:2,2,2,2
chr16	29831010	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,13;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:4,0:8,0:3,11,4,0
chr16	29842024	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29842024_T_TGA:29842024:1,0,0,1
chr16	29842025	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29842024_T_TGA:29842024:1,0,0,1
chr16	29842427	.	C	CCCCGCCGAAGTTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	29842430	.	C	CACATCCATCAGCTAATTAGATGCTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	29853483	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=185,164;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:29853483_T_C:29853483:0,1,0,1
chr16	29853492	.	TG	CA,AG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,35,31;MFRL=0,164,185;MMQ=60,40,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr16	29853496	.	GT	AA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=164,185;MMQ=40,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:29853496_GT_AA:29853496:0,1,0,1
chr16	29853497	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:29853483_T_C:29853483:0,0,0,1
chr16	29853499	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=164,185;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:29853496_GT_AA:29853496:0,1,0,1
chr16	29853501	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=185,164;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:29853483_T_C:29853483:0,1,0,1
chr16	29859067	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	29883758	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=143,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,2:11,1:8,9,2,1
chr16	29884096	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	29896979	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:11,4:11,0:6,16,3,1
chr16	29906499	.	CAAAAA	C,CAAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35,26;MFRL=0,239,173;MMQ=60,30,49;MPOS=25,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,16,22;RU=A;STR;TLOD=3.21,5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.250,0.575:3:0,1,0:0,0,1:0,0,3,0
chr16	29906523	.	TGTCC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=211,155;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:2,1,1,0
chr16	29907260	.	T	TCTCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:29907260_T_TCTCA:29907260:0,3,0,1
chr16	29907264	.	T	TCCACCCCCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:29907260_T_TCTCA:29907260:0,3,0,1
chr16	29907280	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29907280_T_C:29907280:0,1,0,1
chr16	29907281	.	C	CAAAAACAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29907280_T_C:29907280:0,1,0,1
chr16	29912501	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr16	29934754	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=146,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:0,2:1,3:0,1,0,6
chr16	29937081	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=128,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.758:8:1,1:0,3:1,1,6,0
chr16	29974984	.	ATT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=176,157;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:29974984_ATT_A:29974984:0,6,0,2
chr16	29974987	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=176,157;MMQ=60,55;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:29974984_ATT_A:29974984:0,6,0,2
chr16	29979247	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=178,158;MMQ=50,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:0,0:3,2:0|1:29979247_C_CA:29979247:4,0,2,0
chr16	29979268	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,14;MFRL=145,158;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:1,0:0|1:29979247_C_CA:29979247:6,0,2,0
chr16	29979271	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=145,158;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,0:2,0:0|1:29979247_C_CA:29979247:6,0,2,0
chr16	29993108	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=91.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,11:0,0,12,13
chr16	29994736	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr16	29994922	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr16	29995041	.	AAGTCTAG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:29995041_AAGTCTAG_A:29995041:1,2,0,1
chr16	29995053	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=99,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:29995041_AAGTCTAG_A:29995041:1,1,0,1
chr16	29998692	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,116;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,2:3,10,0,2
chr16	30000901	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,7:0,13:0,0,8,15
chr16	30007664	.	CA	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:15,0:24,2:25,16,0,3
chr16	30016450	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,10;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,0:0|1:30016450_T_G:30016450:1,0,1,0
chr16	30016455	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=106,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:30016450_T_G:30016450:2,0,1,0
chr16	30016457	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=106,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:30016450_T_G:30016450:2,0,1,0
chr16	30016465	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=124,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:30016450_T_G:30016450:4,0,1,0
chr16	30017895	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,13,6
chr16	30018720	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	30020703	.	G	GACTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=193,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr16	30078492	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr16	30078994	.	GCCTCCGGACGTGAGGTTTGAGATGGAAGTGGAGGA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.093:31:9,2:15,0:6,23,0,2
chr16	30096468	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	30097945	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,336;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:6,5,2,0
chr16	30098189	.	GTGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TGA;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr16	30106894	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=161,275;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:30106894_A_C:30106894:0,1,0,1
chr16	30106898	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=161,275;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30106894_A_C:30106894:0,1,0,1
chr16	30106904	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=161,275;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:30106894_A_C:30106894:0,1,0,1
chr16	30199940	.	G	GAGCATCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=278,198;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.612:2:0,1:0,0:0|1:30199940_G_GAGCATCT:30199940:0,1,0,1
chr16	30199942	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,29;MFRL=278,198;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.610:2:0,1:0,0:0|1:30199940_G_GAGCATCT:30199940:0,1,0,1
chr16	30199946	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=17,27;MFRL=278,198;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.612:2:0,1:0,0:0|1:30199940_G_GAGCATCT:30199940:0,1,0,1
chr16	30211983	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=15,14;MFRL=93,194;MMQ=43,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:0,0:0,0:0|1:30211983_T_A:30211983:1,1,2,0
chr16	30211992	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,19;MFRL=93,194;MMQ=43,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:1,0:0,0:0|1:30211983_T_A:30211983:1,1,2,0
chr16	30211996	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,17;MFRL=93,201;MMQ=43,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:30211983_T_A:30211983:1,1,1,0
chr16	30212004	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,16;MFRL=116,201;MMQ=40,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:30211983_T_A:30211983:0,2,1,0
chr16	30212008	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,17;MFRL=116,201;MMQ=40,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:30211983_T_A:30211983:0,2,1,0
chr16	30366039	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,6:3,5:2,6,2,9
chr16	30386262	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=169,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.513:6:1,1:1,2:0|1:30386262_C_T:30386262:0,3,0,3
chr16	30386279	.	T	TCAGTCTTTCTTTGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=167,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:30386262_C_T:30386262:0,4,0,1
chr16	30386281	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=167,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:30386262_C_T:30386262:0,4,0,1
chr16	30390314	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr16	30391209	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=154,101;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:6,0:9,2,1,1
chr16	30391219	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=159,101;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:10,2,1,1
chr16	30393771	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:1,5:4,1:4,1,5,2
chr16	30408908	.	G	GGTGTTTCACCAGATCTGACA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,1:11,1:5,12,0,2
chr16	30435663	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:6,9,1,1
chr16	30456444	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=143,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:31,0:14,3:23,23,1,2
chr16	30492666	.	TAA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,84;MMQ=50,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.514:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr16	30495412	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr16	30495657	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	30500761	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=202,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:1,2,0,4
chr16	30505512	.	CA	TG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.394:31:9,3:10,9:0|1:30505512_CA_TG:30505512:14,5,8,4
chr16	30505513	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=95,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,32:0.941:33:0,12:1,19:1|0:30505512_CA_TG:30505512:1,0,21,11
chr16	30507972	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=213,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr16	30510571	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,2:5,4:6,4,3,3
chr16	30516492	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr16	30516531	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:4,2,2,1
chr16	30518144	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,0:2,2:2,7,1,1
chr16	30522152	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr16	30528505	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=216,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,0:0,1:0|1:30528505_C_CTT:30528505:0,1,0,1
chr16	30528508	.	T	TAAGTTTCTGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=216,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30528505_C_CTT:30528505:0,1,0,1
chr16	30532861	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:11,1:4,1:3,12,0,2
chr16	30536918	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.680:20:3,10:3,3:5,1,13,1
chr16	30566747	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:1,0:4,1,2,1
chr16	30616438	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,2:13,0:0|1:30616438_C_G:30616438:7,13,2,0
chr16	30616445	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,2:13,0:0|1:30616438_C_G:30616438:7,13,2,0
chr16	30665449	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,133;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.441:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr16	30675652	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,13;MFRL=91,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.235:17:5,1:4,0:0|1:30675652_A_C:30675652:6,7,4,0
chr16	30675655	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,11;MFRL=91,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.222:18:7,0:5,0:0|1:30675652_A_C:30675652:6,8,4,0
chr16	30675662	.	GA	CC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,16;MFRL=95,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:7,1:5,0:0|1:30675652_A_C:30675652:6,10,2,0
chr16	30675665	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=91,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:9,1:5,0:0|1:30675652_A_C:30675652:5,10,2,0
chr16	30676679	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,153;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:9,5,0,2
chr16	30680312	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=184,248;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:30680312_A_C:30680312:0,1,2,0
chr16	30680316	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=184,248;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:30680312_A_C:30680312:0,1,2,0
chr16	30680319	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,0;MFRL=184,225;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:30680312_A_C:30680312:0,1,1,0
chr16	30712060	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr16	30718459	.	AGT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GT;STR;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr16	30718873	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,3:8,3:7,6,5,1
chr16	30724221	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr16	30732226	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,2:4,0:5,8,0,2
chr16	30734146	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=181,237;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30734146_A_AT:30734146:0,1,0,1
chr16	30734149	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=181,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30734146_A_AT:30734146:0,1,0,1
chr16	30762640	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr16	30768492	.	GCTCTGGC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCTGGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	30770267	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr16	30770950	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:2,1:10,5:8,4,6,0
chr16	30772040	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr16	30773822	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	30775692	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:2,12,1,1
chr16	30785194	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	30938811	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,4:0,12:0,0,7,10
chr16	30960605	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	30977799	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr16	30980902	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,12:0,13:0,0,22,4
chr16	30983080	.	TGA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GA;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	30990697	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,1:12,2:1,22,0,3
chr16	30992557	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.309:7:0,1:5,0:0,5,0,2
chr16	30997726	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:6,2,1,1
chr16	31004688	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:5,5,2,0
chr16	31004830	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=117,39;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:6,0:1,2:2,5,1,1
chr16	31008134	.	G	GTTGTCTTATGGCACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=186,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:0,1:3,0:2,1,0,1
chr16	31008141	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr16	31021575	.	AACCTCCGATCTCATCCTTCGCCCCCACGTCCCAGCACCTCCCCCACTCCATCCCCACGCGCTCCCCCAATATTGGGGTCCCGCCCCCCCATTCTCCCC	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.079:38:1,0:2,2:18,17,2,1
chr16	31045621	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=159,49;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,2:9,0:0|1:31045621_C_T:31045621:6,19,1,1
chr16	31045636	.	T	TCACCAC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=160,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,2:9,0:0|1:31045621_C_T:31045621:4,20,1,1
chr16	31088347	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,168;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,10:4,4:3,4,6,8
chr16	31093892	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr16	31093922	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr16	31094861	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr16	31095633	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,1:0,2:0,3,0,4
chr16	31097574	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr16	31104854	.	CCCGA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr16	31104878	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=304,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr16	31131614	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.369:38:14,6:10,7:13,11,7,7
chr16	31138445	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:5,4,3,5
chr16	31141993	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:0,5:4,3:2,2,4,4
chr16	31142271	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	31142381	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	31143993	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:1,2:3,2,3,1
chr16	31151521	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.641:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	31153780	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	31159981	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,1:0|1:31159981_C_A:31159981:11,7,1,1
chr16	31159988	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:31159981_C_A:31159981:11,9,1,1
chr16	31191482	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=134.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,23:0,16:0,0,21,18
chr16	31195279	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr16	31195759	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=19,22;MFRL=131,138;MMQ=57,50;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.351:7:1,1:1,1:1,4,0,2
chr16	31202387	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,1:1,0:0|1:31202387_T_G:31202387:5,0,0,2
chr16	31202390	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,1:0|1:31202387_T_G:31202387:5,0,0,2
chr16	31202698	.	AT	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.196:33:13,2:9,3:15,12,5,1
chr16	31273129	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr16	31336519	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr16	31339625	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=234,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr16	31341024	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	31342608	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr16	31371193	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr16	31374120	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.228:21:7,0:2,0:6,10,0,5
chr16	31388639	.	A	AC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.244:14:4,1:7,0:0|1:31388639_A_AC:31388639:3,8,0,3
chr16	31388640	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=19,33;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.252:14:3,1:2,2:0|1:31388639_A_AC:31388639:3,8,0,3
chr16	31390922	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:5,9:6,8:6,5,14,3
chr16	31393308	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=101,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr16	31405736	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr16	31415004	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=189,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,1,4
chr16	31418869	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=104,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.533:24:4,6:7,6:7,4,9,4
chr16	31419300	.	CT	C,CTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,32,33;MFRL=151,179,144;MMQ=60,60,60;MPOS=18,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.49,7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.230,0.307:10:2,2,2:2,0,1:0,5,0,5
chr16	31419699	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:31419699_A_T:31419699:4,0,1,0
chr16	31419703	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.428:5:2,0:1,2:1|0:31419699_A_T:31419699:3,0,2,0
chr16	31419704	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:31419699_A_T:31419699:4,0,1,0
chr16	31422429	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.939:31:1,16:0,13:0,1,21,9
chr16	31425962	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:1,3,0,5
chr16	31427678	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	31439170	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.606:23:2,9:6,5:1,8,0,14
chr16	31439239	.	G	GCCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:31439239_G_GCCC:31439239:0,0,0,1
chr16	31439243	.	GACC	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31439239_G_GCCC:31439239:0,0,0,1
chr16	31439248	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31439239_G_GCCC:31439239:0,0,0,1
chr16	31439253	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31439239_G_GCCC:31439239:0,0,0,1
chr16	31439256	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31439239_G_GCCC:31439239:0,0,0,1
chr16	31476255	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:2,1:4,0:4,2,2,0
chr16	31476458	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,52;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,2:7,4:6,3,5,1
chr16	31477421	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	31487254	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=59,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	31488916	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr16	31494631	.	C	CAAGGCAGACAGATCCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr16	31504867	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,424;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:13,2:12,0:14,14,0,2
chr16	31505004	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:8,0:7,2:11,5,2,0
chr16	31512178	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr16	31519048	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr16	31519112	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=160,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:4,5,1,1
chr16	31724836	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.510:40:10,7:6,13:1,19,1,19
chr16	31734070	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:16,0:26,4:10,32,1,3
chr16	31770696	.	G	GA	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=57.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,27:0.500:54:13,13:14,13:9,18,9,18
chr16	31770723	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,26:0.507:51:13,11:12,14:8,17,5,21
chr16	31895721	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	33647367	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,125;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.546:33:5,14:9,4:7,8,9,9
chr16	33647656	.	A	ACAAGTTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=181,266;MMQ=26,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,1:2,0:0|1:33647656_A_ACAAGTTCT:33647656:3,1,0,1
chr16	33647658	.	A	ACCTTAATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,266;MMQ=26,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:33647656_A_ACAAGTTCT:33647656:3,1,0,1
chr16	33965407	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=16;MBQ=33,35;MFRL=149,199;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr16	33965447	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=16;MBQ=34,34;MFRL=148,183;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:33965447_G_C:33965447:2,0,1,0
chr16	33965452	.	TC	CG	.	.	DP=4;ECNT=16;MBQ=30,34;MFRL=148,185;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:33965447_G_C:33965447:2,0,2,0
chr16	33965456	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=16;MBQ=29,31;MFRL=146,172;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,2:1,0,4,0
chr16	33965481	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=16;MBQ=30,34;MFRL=146,185;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0|1:33965481_T_C:33965481:4,1,4,0
chr16	33965487	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=16;MBQ=34,31;MFRL=149,185;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,2:2,2:0|1:33965481_T_C:33965481:6,1,4,0
chr16	33965533	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=16;MBQ=32,32;MFRL=154,135;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.647:29:6,12:4,6:0|1:33965533_A_C:33965533:7,3,15,4
chr16	33965538	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=161,131;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,18:0.655:27:5,12:4,6:0|1:33965533_A_C:33965533:6,3,15,3
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chr16	33965554	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=16;MBQ=31,29;MFRL=161,130;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=119.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,29:0.714:40:6,18:5,9:7,4,19,10
chr16	33965560	.	TT	AC,AT	.	.	DP=42;ECNT=16;MBQ=34,30,31;MFRL=146,125,152;MMQ=60,59,45;MPOS=19,29;POPAF=7.30,7.30;TLOD=138.18,4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,33,2:0.756,0.067:42:4,20,1:1,9,1:4,3,22,13
chr16	33965582	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=16;MBQ=33,30;MFRL=127,152;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:24,1:15,1:0|1:33965542_C_T:33965542:22,21,1,1
chr16	33965589	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=16;MBQ=35,31;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=166.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,41:0.894:45:3,19:1,18:2,2,17,24
chr16	33965591	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=32,29;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=152.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,38:0.812:46:4,16:3,16:0|1:33965591_A_C:33965591:4,4,15,23
chr16	33965593	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=30,33;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=144.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,34:0.814:41:3,17:2,16:0|1:33965591_A_C:33965591:3,4,11,23
chr16	33965626	.	AT	GC	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=31,30;MFRL=153,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.822:26:2,10:2,12:1,3,5,17
chr16	33965642	.	TGA	T	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=31,30;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,17:0.720:23:3,8:3,7:0|1:33965642_TGA_T:33965642:1,5,2,15
chr16	33965646	.	G	GCA	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=31,32;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=68.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,17:0.750:22:3,9:2,7:0|1:33965642_TGA_T:33965642:0,5,2,15
chr16	33965647	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,17:0.720:23:3,9:3,7:0|1:33965642_TGA_T:33965642:1,5,2,15
chr16	33965652	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=29,27;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,18:0.731:24:3,9:3,6:0|1:33965642_TGA_T:33965642:1,5,1,17
chr16	33965655	.	C	CG	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=27,27;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=72.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,18:0.827:21:2,10:1,7:0|1:33965642_TGA_T:33965642:0,3,1,17
chr16	33965673	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=36,31;MFRL=188,178;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.706:15:2,7:2,3:0|1:33965673_C_T:33965673:0,4,0,11
chr16	33965677	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=214,178;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:3,8:2,3:0|1:33965673_C_T:33965673:0,5,0,11
chr16	33965682	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=214,178;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:3,8:2,3:0|1:33965673_C_T:33965673:0,5,0,11
chr16	33965689	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=214,178;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:4,7:2,3:0|1:33965673_C_T:33965673:0,6,0,11
chr16	46615789	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,103;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:13,1:10,2:13,10,0,3
chr16	46652088	.	CA	C,CAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,34,30;MFRL=155,168,186;MMQ=60,60,60;MPOS=21,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=11.68,6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,7,4:0.206,0.141:33:8,3,1:14,4,2:21,1,9,2
chr16	46652286	.	T	TA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.148:29:6,1:13,2:1,24,0,4
chr16	46714529	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=86.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,8:0,0,21,2
chr16	46715191	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr16	46743355	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr16	46743675	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	46744756	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr16	46755213	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr16	46764482	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr16	46943874	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	47005827	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,55;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:0|1:47005827_T_C:47005827:14,6,1,1
chr16	47005840	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:6,2:0|1:47005827_T_C:47005827:11,12,1,1
chr16	47005843	.	A	AC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:7,2:0|1:47005827_T_C:47005827:11,12,1,1
chr16	47117735	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,1:7,1:1,11,0,2
chr16	47163362	.	CA	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47163362_CA_GC:47163362:0,0,0,1
chr16	47163366	.	CT	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47163362_CA_GC:47163362:0,0,0,1
chr16	47294613	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:2,6,5,3
chr16	47347780	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr16	47399670	.	CT	C,CTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=147,130,154;MMQ=60,60,60;MPOS=20,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=11.21,5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,8,4:0.341,0.190:23:6,6,3:4,2,1:11,0,12,0
chr16	47462851	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr16	47486712	.	GAT	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:23,1:26,3:4,48,0,4
chr16	47486817	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=242,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr16	47495199	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=171,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr16	47630539	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr16	47684644	.	G	GTGTGTGTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr16	47684686	.	TATTA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr16	47694736	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=155,121;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:9,0:16,4:2,23,0,4
chr16	47727354	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,1:6,2:6,7,1,2
chr16	47730456	.	A	ACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=193,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:2,1:0,0:0|1:47730456_A_ACC:47730456:0,2,0,1
chr16	47730458	.	TAG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=193,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:1,1:0,0:0|1:47730456_A_ACC:47730456:0,2,0,1
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chr16	48212661	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,16;MFRL=46164065,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48212656_C_CCTGAGTTCTCTTCATGGG:48212656:0,1,0,1
chr16	48249321	.	G	GACAGGCAGGGCCATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=99,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr16	48311157	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	48333493	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:6,0:5,3:11,0,3,0
chr16	49412407	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:7,0:9,4,2,0
chr16	49557482	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr16	49670551	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:4,6,2,0
chr16	49672151	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	49764948	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:0,1,0,8
chr16	49856551	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,1:0,0:0|1:49856551_A_C:49856551:0,3,2,0
chr16	49856556	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:3,0:0,0:0|1:49856551_A_C:49856551:0,3,2,0
chr16	49856691	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr16	50059279	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	50059314	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	50059500	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr16	50067479	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=180,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:3,2:2,0:0,6,0,2
chr16	50067905	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr16	50069228	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr16	50102618	.	G	GAAAT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAT;STR;TLOD=84.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,9:0,0,18,2
chr16	50109478	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:6,1,4,0
chr16	50112971	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=211,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr16	50117828	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:1,4:2,0:3,0,4,0
chr16	50117847	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:7,0:4,0:8,3,2,0
chr16	50120122	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=168,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.498:18:2,2:7,7:6,3,5,4
chr16	50251590	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.500:40:7,10:13,10:4,16,5,15
chr16	50251671	.	G	GTCTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=191,179;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,15;RU=TC;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,2:1,3:0,2,0,7
chr16	50261735	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=83.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,18,6
chr16	50327439	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=113,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,2:1,6:0,3,2,6
chr16	50327456	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,6:0,0,1,10
chr16	50327462	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:0,4,1,4
chr16	50328483	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr16	50335150	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,17;MFRL=173,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.560:14:2,1:1,3:1,5,0,8
chr16	50338723	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr16	50341085	.	T	TGACTTTACTATTCCTGCCATAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:1,2,1,1
chr16	50345778	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,257;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr16	50346139	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50346139_C_T:50346139:0,1,1,0
chr16	50346143	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50346139_C_T:50346139:0,1,1,0
chr16	50346748	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr16	50348325	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:50348325_C_T:50348325:2,5,0,2
chr16	50348331	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:4,2:0|1:50348325_C_T:50348325:2,6,0,2
chr16	50353710	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=199,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr16	50353794	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:8,3,2,1
chr16	50354039	.	CAAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=A;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr16	50355996	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=49.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:5,9:5,7:0,10,1,15
chr16	50367633	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,5:0,9:0,0,0,21
chr16	50383878	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,122;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.279:10:3,0:2,2:6,2,0,2
chr16	50388657	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=185.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,22:0,31:0,0,49,5
chr16	50401908	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=190,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:5,0:2,0:0|1:50401908_T_G:50401908:8,0,2,0
chr16	50401915	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=182,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:1,0:0|1:50401908_T_G:50401908:10,0,2,0
chr16	50402240	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr16	50402569	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.536:44:8,7:12,13:20,0,24,0
chr16	50402610	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=30,11;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.111:38:9,0:16,0:0|1:50402610_C_G:50402610:19,15,4,0
chr16	50402612	.	G	GC	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=27,11;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.089:47:10,0:13,0:0|1:50402610_C_G:50402610:20,23,4,0
chr16	50402616	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,4:0.082:51:16,2:18,1:0|1:50402610_C_G:50402610:20,27,4,0
chr16	50402618	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.085:49:16,2:16,1:0|1:50402610_C_G:50402610:18,27,4,0
chr16	50655687	.	GGA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr16	50659564	.	ACTGC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50659564_ACTGC_A:50659564:0,1,0,1
chr16	50659570	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50659564_ACTGC_A:50659564:0,1,0,1
chr16	50659573	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50659564_ACTGC_A:50659564:0,1,0,1
chr16	50707235	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:50707235_T_TAA:50707235:3,0,1,0
chr16	50707247	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:50707235_T_TAA:50707235:3,0,1,0
chr16	50733374	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,3:6,4:3,5,5,2
chr16	50745199	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=134,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,6:0,3:0,3,6,3
chr16	50745233	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:4,3,1,1
chr16	50750483	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:5,3:6,0:8,4,2,1
chr16	50759547	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	50785890	.	AACATATATATACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACATATATATACAC;STR;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr16	50788429	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,259;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,1:8,1:0,13,0,2
chr16	50815180	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,63;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:13,4,0,2
chr16	50816436	.	G	GGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=214,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GT;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr16	50820672	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=202,145;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,2:6,2:12,0,4,0
chr16	50826462	.	G	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=169,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,21:0.392:54:13,11:20,10:32,1,19,2
chr16	50827601	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,8:0,0,1,15
chr16	51171493	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=117,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr16	51175643	.	T	TGCC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCC;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.265:20:7,3:8,2:8,7,3,2
chr16	52473512	.	T	TTGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TGC;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,2:0,0:0,1,2,0
chr16	52480229	.	T	TCTCACCTGCTTTTGTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	52497872	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,2:6,5:12,3,5,2
chr16	52502571	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:4,3:0,5,0,3
chr16	53265501	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,84;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:14,5,2,0
chr16	53281451	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=165,67375;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:53281451_G_A:53281451:1,8,0,2
chr16	53281455	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=165,67375;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:53281451_G_A:53281451:1,8,0,2
chr16	53301111	.	T	TAAGAAATAGATTCCAA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=173,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:4,0:1,2:0|1:53301111_T_TAAGAAATAGATTCCAA:53301111:5,0,1,1
chr16	53301113	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=173,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:4,0:1,2:0|1:53301111_T_TAAGAAATAGATTCCAA:53301111:5,0,1,1
chr16	53301115	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=173,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:53301111_T_TAAGAAATAGATTCCAA:53301111:5,0,1,1
chr16	53301118	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=168,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:53301111_T_TAAGAAATAGATTCCAA:53301111:6,0,1,1
chr16	53476804	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=110.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,3,30
chr16	53493346	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr16	53493465	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:25,1:3,1:15,13,1,1
chr16	53496439	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.206:21:12,2:5,1:14,3,4,0
chr16	53496598	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=120.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,24:0,13:0,0,2,36
chr16	53499599	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr16	53503934	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0|1:53503934_G_A:53503934:0,0,12,10
chr16	53503943	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0|1:53503934_G_A:53503934:0,0,15,8
chr16	53513033	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr16	53513055	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,8,8
chr16	53524308	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr16	53526551	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,18:0,0,22,5
chr16	53690471	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,145;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:16,1:8,1:6,18,0,2
chr16	53699003	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	54318102	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr16	54319571	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	54319994	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,12:0,0,2,15
chr16	54966365	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	55360208	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:6,0,4,0
chr16	55364324	.	C	CAGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=168,257;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:55364324_C_CAGGG:55364324:0,4,0,1
chr16	55364326	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=168,257;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55364324_C_CAGGG:55364324:0,4,0,1
chr16	55364328	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=168,257;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55364324_C_CAGGG:55364324:0,4,0,1
chr16	55515695	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:6,6:8,9:13,1,14,1
chr16	55517981	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:7,0:3,3:4,7,2,2
chr16	55518101	.	G	GTGATAGCATTAGGAGAAATACCTAATGTTGATGAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,14;MFRL=212,140;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:1,3,0,1
chr16	55527276	.	C	CCTTATGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=181,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr16	55527283	.	TTCG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr16	55530762	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:55530762_G_T:55530762:0,0,3,0
chr16	55530772	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:55530762_G_T:55530762:0,0,2,0
chr16	55536622	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr16	55536687	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:4,2,3,0
chr16	55536727	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.598:18:3,6:4,5:4,3,5,6
chr16	55536763	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,1:8,4:3,7,1,4
chr16	55539191	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:6,0,6,0
chr16	55562257	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr16	55583139	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr16	55583149	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:0,3:4,0,7,1
chr16	55728081	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr16	55729353	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	55731735	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	55733589	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=105,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,5:1,8:0,1,3,10
chr16	55736169	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,1:11,1:16,3,1,1
chr16	55844924	.	TA	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.202:36:10,2:9,3:8,21,1,6
chr16	55866894	.	T	TA	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,148;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,22:0.383:58:21,11:15,11:16,20,16,6
chr16	55886715	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr16	55909163	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:2,3,0,5
chr16	56362725	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,2,4
chr16	56374959	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=153,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:56374959_A_ATT:56374959:0,3,0,1
chr16	56374961	.	TCC	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=153,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:56374959_A_ATT:56374959:0,3,0,1
chr16	56374965	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,32;MFRL=153,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:56374959_A_ATT:56374959:0,3,0,1
chr16	56374967	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=160,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56374959_A_ATT:56374959:0,2,0,1
chr16	56374971	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=160,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56374959_A_ATT:56374959:0,2,0,1
chr16	56374973	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=34,27;MFRL=160,92;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:56374959_A_ATT:56374959:0,2,0,1
chr16	56374989	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56374989_C_T:56374989:0,0,0,1
chr16	56374994	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:56374989_C_T:56374989:0,1,0,1
chr16	56374998	.	G	GCACA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,29;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56374989_C_T:56374989:0,1,0,1
chr16	56377689	.	A	AAGACCCCCTTCTCCCGAGTCTAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,2:6,0:4,3,1,1
chr16	56377828	.	T	TAGACCAATGGAACAGAATAGAGAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=57,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:6,2,1,1
chr16	56401294	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr16	56436824	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr16	56441862	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=115.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,14:0,0,34,3
chr16	56442066	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=178.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,18:0,34:0,0,5,48
chr16	56468561	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr16	56501806	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,2:8,5:11,2,5,2
chr16	56504724	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:4,5:10,9:0,14,3,11
chr16	56508760	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,1:8,0:10,5,2,0
chr16	56518860	.	A	AAACAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=194,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:56518860_A_AAACAG:56518860:0,1,0,1
chr16	56518864	.	C	CTGGTAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=194,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56518860_A_AAACAG:56518860:0,1,0,1
chr16	56535026	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:56535026_T_G:56535026:0,0,0,2
chr16	56535028	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:56535026_T_G:56535026:0,0,0,2
chr16	56535033	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56535026_T_G:56535026:0,0,0,1
chr16	56643014	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,1:5,1:1,9,0,2
chr16	56660906	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,145;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,5:1,8,0,10
chr16	56667165	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	56667614	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr16	56673143	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:2,3:5,6:0|1:56673143_A_G:56673143:7,0,9,0
chr16	56673148	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.601:18:1,3:5,8:0|1:56673143_A_G:56673143:7,0,11,0
chr16	56673290	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:4,1:2,6,0,2
chr16	56686002	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:56686002_G_C:56686002:0,0,0,3
chr16	56686005	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:56686002_G_C:56686002:0,0,0,3
chr16	56686030	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	56686380	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr16	56686818	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr16	56686852	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,9,6
chr16	56702000	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:0,7,1,4
chr16	56704955	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:2,1:0,5,0,2
chr16	56716982	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr16	56792360	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=189,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr16	56832519	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,2:10,1:3,19,1,2
chr16	56855549	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:1,4,1,3
chr16	56857563	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=185,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr16	56864398	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,6:5,0:6,1,6,0
chr16	56866196	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,4:3,1:7,4,5,0
chr16	56872824	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,1:6,7:10,2,8,0
chr16	56873613	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=189,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr16	56878542	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:3,5,2,3
chr16	56899489	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=248,255;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56899489_T_A:56899489:0,1,0,1
chr16	56899491	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=248,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56899489_T_A:56899489:0,1,0,1
chr16	56899495	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=248,255;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56899489_T_A:56899489:0,1,0,1
chr16	56900931	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=229,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr16	56906754	.	G	GCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,31;MFRL=129,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:56906754_G_GCAC:56906754:0,1,0,1
chr16	56906758	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=129,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56906754_G_GCAC:56906754:0,1,0,1
chr16	56917953	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,2:4,7:8,1,5,4
chr16	56920861	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:2,0:5,2,2,0
chr16	56921829	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.486:21:4,6:5,4:5,6,8,2
chr16	56926793	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:2,1,4,0
chr16	56926828	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:1,0,8,0
chr16	56926845	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,19;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,1:1,0:4,0,3,0
chr16	56926854	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,0:2,0:5,1,3,0
chr16	56928519	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=101,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,4:7,7:5,7,3,8
chr16	56928556	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,0:5,9:1,8,2,7
chr16	56936438	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=0,127;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56936438_G_C:56936438:1,0,0,1
chr16	56936441	.	G	GCTCACCCGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=0,127;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56936438_G_C:56936438:1,0,0,1
chr16	56974229	.	TTTC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=191,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	57003723	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	57003977	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.830:3:0,1:0,2:0|1:57003977_T_C:57003977:0,0,0,3
chr16	57003980	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:57003977_T_C:57003977:0,0,0,3
chr16	57004889	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=182,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,7:4,1:7,2,4,4
chr16	57007451	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,11:0,2:0,0,1,12
chr16	57007484	.	A	ATGTTTGTTGCTTGCTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.374:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr16	57015463	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr16	57017474	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,1:0,0,9,3
chr16	57057619	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr16	57057654	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr16	57060731	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:15,1:12,2:18,9,3,0
chr16	57062177	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,2:2,1:2,1,4,0
chr16	57067681	.	A	AAATACGTGTGTTTGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr16	57068048	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:2,1,3,1
chr16	57070004	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.419:17:7,2:3,5:7,3,4,3
chr16	57071232	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	57074451	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr16	57075379	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:3,7:8,2:8,3,8,2
chr16	57077342	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=17,18;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:0,0:1,0:8,0,2,0
chr16	57077345	.	TC	AA,AC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=21,13,13;MFRL=154,175,141;MMQ=60,60,60;MPOS=8,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.09,5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.356,0.206:11:2,0,0:1,0,0:5,0,6,0
chr16	57077351	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,0:2,2:5,0,7,0
chr16	57079443	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,1:3,3:1,6,0,4
chr16	57095625	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	57099059	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:57099059_T_G:57099059:0,0,1,0
chr16	57099064	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:57099059_T_G:57099059:0,0,1,0
chr16	57099066	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:57099059_T_G:57099059:0,0,1,0
chr16	57099068	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:57099059_T_G:57099059:0,0,1,0
chr16	57103854	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr16	57108462	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=146,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.225:19:9,1:1,0:9,6,4,0
chr16	57111364	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=208,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr16	57111809	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:4,4:3,7:5,2,8,4
chr16	57111825	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,14,8
chr16	57144920	.	TG	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr16	57153639	.	C	CAAAGATAAATTAAGCAATATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=209,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:57153639_C_CAAAGATAAATTAAGCAATATT:57153639:0,4,0,1
chr16	57153641	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=209,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:57153639_C_CAAAGATAAATTAAGCAATATT:57153639:0,4,0,1
chr16	57171233	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr16	57206637	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:9,7:3,2:9,3,8,1
chr16	57206662	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:12,12:7,9:13,6,18,3
chr16	57247109	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57247109_A_AG:57247109:0,1,0,1
chr16	57247111	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57247109_A_AG:57247109:0,1,0,1
chr16	57255363	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr16	57292545	.	A	ACTTTTTACAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=99,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr16	57449172	.	GA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,14;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,0,1
chr16	57466539	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,14:0.469:30:4,8:9,6:0|1:57466539_A_G:57466539:0,16,0,14
chr16	57466549	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.542:22:4,6:6,4:0|1:57466539_A_G:57466539:0,10,0,12
chr16	57481305	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	57486613	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr16	57494402	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr16	57499782	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=177,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:2,3:1,3:3,0,7,0
chr16	57499841	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=125,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,5:7,4:6,4,7,2
chr16	57503213	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:3,2:5,5:2,6,3,5
chr16	57503574	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=119,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,2:12,0:20,3,2,0
chr16	57503773	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr16	57507777	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr16	57507991	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,2:4,0:1,6,1,1
chr16	57508960	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:4,3:3,1:0,7,0,5
chr16	57509164	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	57595999	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,2:4,5:5,4,5,2
chr16	57601982	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,6:5,1:6,5,4,3
chr16	57624516	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.558:41:4,11:14,12:7,11,15,8
chr16	57624762	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr16	57625470	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:7,2:4,5:11,2,6,1
chr16	57687314	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	57689230	.	G	GGTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=GT;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr16	57690606	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,1,8
chr16	57691265	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr16	57693247	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	57695604	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:2,2,3,0
chr16	57697532	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	57710093	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,11,5
chr16	57736047	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr16	57738740	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	57739034	.	T	TATCTTCACAGCAAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=222,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	57756564	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	57758508	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	57778488	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=199,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr16	57789978	.	G	GATAGATAAATGGCACTCTAGGAAAGAGTGAAAAATAACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	57794888	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr16	57795394	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,3:0,5:0,0,1,9
chr16	57798110	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:4,3:1,4:1,5,4,3
chr16	57803911	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	57803942	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57803942_A_AT:57803942:0,1,0,1
chr16	57803943	.	C	CTCCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57803942_A_AT:57803942:0,1,0,1
chr16	57803945	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57803942_A_AT:57803942:0,1,0,1
chr16	57805048	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr16	57805078	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,12,4
chr16	57805176	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,12:0,0,12,10
chr16	57806030	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr16	57832045	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.484:14:2,0:2,2:0,7,0,7
chr16	57931729	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:15,1:12,2:17,10,2,1
chr16	57937895	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,4:3,1:1,7,1,4
chr16	57938644	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=115,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,0:9,3:12,7,3,0
chr16	57938656	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,19;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:13,0:13,0:0|1:57938656_G_C:57938656:24,7,0,2
chr16	57938660	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:14,0:16,1:0|1:57938656_G_C:57938656:27,7,0,2
chr16	57938664	.	AG	CC	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:17,0:18,2:0|1:57938656_G_C:57938656:28,7,0,2
chr16	57950178	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=187,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr16	57951394	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,4:6,1:0,11,2,3
chr16	57954268	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,27;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.479:9:0,2:2,2:4,1,3,1
chr16	57954407	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr16	57974052	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	57974240	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr16	57984483	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	57991123	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	57991317	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr16	57992269	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=98,153;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:6,6,2,0
chr16	57998345	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,6,1
chr16	58010607	.	G	GCTCCAATTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58010607_G_GCTCCAATTA:58010607:0,1,0,1
chr16	58010608	.	G	GACGATGAGATTATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58010607_G_GCTCCAATTA:58010607:0,1,0,1
chr16	58010611	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58010607_G_GCTCCAATTA:58010607:0,1,0,1
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chr16	58021395	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr16	58032486	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,6:0,0,1,7
chr16	58032503	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58032503_G_A:58032503:0,3,0,1
chr16	58032507	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58032503_G_A:58032503:0,3,0,1
chr16	58032508	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,33;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58032503_G_A:58032503:0,3,0,1
chr16	58032512	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:58032503_G_A:58032503:0,3,0,1
chr16	58032518	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,27;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:58032503_G_A:58032503:0,3,0,1
chr16	58032520	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58032503_G_A:58032503:0,2,0,1
chr16	58032522	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58032503_G_A:58032503:0,2,0,1
chr16	58036347	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	58043978	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=111,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:12,3:2,0:9,5,2,1
chr16	58051178	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	58199670	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:0,7,1,7
chr16	58201759	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr16	58286763	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=143,125;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:0|1:58286763_C_T:58286763:6,9,0,2
chr16	58286768	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=146,125;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:58286763_C_T:58286763:6,8,0,2
chr16	58296463	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=160,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:3,4,2,1
chr16	58296493	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=164,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:58296493_A_C:58296493:2,2,0,1
chr16	58296497	.	T	TTCCTTTCCCTTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=164,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58296493_A_C:58296493:1,1,0,1
chr16	58296545	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	58301360	.	CTT	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=82.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.586:39:9,13:6,10:10,6,15,8
chr16	58312357	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:3,1,6,1
chr16	58313566	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:2,2:4,1,3,0
chr16	58318713	.	GAGTGA	G,AAGTGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=16,15,32;MFRL=196,147,159;MMQ=60,60,60;MPOS=7,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:0,0,0:0,1,0,2
chr16	58318716	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=13,32;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:58318716_T_A:58318716:0,1,0,1
chr16	58318717	.	G	GGAAACCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=16,33;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:58318716_T_A:58318716:0,1,0,1
chr16	58318719	.	G	GCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr16	58327742	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:0,1,2,6
chr16	58327808	.	C	CTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=209,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	58528812	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.533:26:4,6:8,7:7,5,7,7
chr16	58538348	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	58538526	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:11,0:13,8,1,1
chr16	58538662	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr16	58540595	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr16	58541929	.	G	GCAGCCTCGACCTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.595:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr16	58543331	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=238,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr16	58549341	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	58550300	.	A	AAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr16	58552228	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr16	58557209	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,2:2,0,7,1
chr16	58558989	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=59,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:1,3:2,0,6,0
chr16	58566304	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,3:6,4:1,12,1,6
chr16	58571185	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	58573901	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:1,6,0,6
chr16	58573946	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr16	58577314	.	AG	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=129,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,5:0.142:38:19,1:10,2:0|1:58577314_AG_A:58577314:20,13,0,5
chr16	58577315	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=27,19;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,21:0.696:31:3,7:3,0:1|0:58577314_AG_A:58577314:6,4,7,14
chr16	58577316	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=129,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,13:0.339:40:17,4:9,2:0|1:58577314_AG_A:58577314:20,7,0,13
chr16	58580213	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:10,12:5,9:12,3,15,6
chr16	58580519	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=216,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:5,1,3,2
chr16	58580530	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=216,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:5,1,4,1
chr16	58585178	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.408:6:1,0:1,1:0,4,0,2
chr16	58589112	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=122,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr16	58594340	.	ATT	A,AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30,16;MFRL=232,243,190;MMQ=60,60,60;MPOS=20,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.53,7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.334,0.419:9:0,1,0:2,1,0:0,2,0,7
chr16	58608436	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr16	58621042	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,5:2,3:5,2,7,1
chr16	58621603	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:2,5:2,2:5,0,7,0
chr16	58703966	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,4:4,2:5,6,2,4
chr16	58704861	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:1,4:3,2:3,1,7,0
chr16	58705934	.	CAAAGG	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=168,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,1:0|1:58705934_CAAAGG_C:58705934:4,0,2,0
chr16	58705944	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,0:1,2:0|1:58705934_CAAAGG_C:58705934:4,0,2,1
chr16	58705945	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0|1:58705934_CAAAGG_C:58705934:4,0,2,1
chr16	58709824	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=G;STR;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr16	58750803	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:58750803_A_ATT:58750803:0,0,0,1
chr16	58750804	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:58750803_A_ATT:58750803:0,0,0,1
chr16	58750808	.	G	GTCACCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58750803_A_ATT:58750803:0,0,0,1
chr16	58750809	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58750803_A_ATT:58750803:0,0,0,1
chr16	61854908	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:0|1:61854908_G_T:61854908:10,9,1,1
chr16	61854916	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:0|1:61854908_G_T:61854908:10,9,1,1
chr16	64982033	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	65005462	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr16	65016285	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr16	65025658	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=147.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,20:0,21:0,0,31,11
chr16	65025849	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr16	66413195	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:15,7:4,3:13,6,7,3
chr16	66424235	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr16	66432303	.	GACCACCCC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACCACCCC;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr16	66432423	.	TC	CC,CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,121,143;MMQ=60,60,60;MPOS=9,18;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.46,33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,12:0.441,0.521:22:0,4,3:0,5,8:0,0,12,10
chr16	66514601	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,1:11,1:11,15,0,2
chr16	66563012	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=212,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:66563012_GG_TT:66563012:0,3,0,1
chr16	66563016	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=212,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:66563012_GG_TT:66563012:0,3,0,1
chr16	66563020	.	C	CACACT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=212,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:66563012_GG_TT:66563012:0,3,0,1
chr16	66565378	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=99,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:9,2:0|1:66565378_GA_G:66565378:8,9,1,1
chr16	66565382	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=99,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:0|1:66565378_GA_G:66565378:8,9,1,1
chr16	66643458	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,1:8,1:2,7,0,2
chr16	66646389	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr16	66646591	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr16	66757728	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,24;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.615:6:0,2:0,0:0,2,0,4
chr16	66759682	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,12,1
chr16	66761762	.	CATATGCCACAAATGG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=206,165;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:66761762_CATATGCCACAAATGG_C:66761762:0,4,0,1
chr16	66761784	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=-23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:66761762_CATATGCCACAAATGG_C:66761762:0,3,0,1
chr16	66762847	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	66766340	.	C	CAAAGAACCAAGAGAAAATAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:5,6,1,1
chr16	66769909	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=50.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr16	66776657	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	66789125	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr16	66793226	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr16	66801241	.	CA	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.364:22:3,3:9,5:14,0,8,0
chr16	66801259	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=19,10;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.230:31:4,0:6,0:21,2,8,0
chr16	66811033	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=98,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.410:3:1,1:1,0:0|1:66811033_A_T:66811033:2,0,1,0
chr16	66811035	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=98,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.410:3:1,1:1,0:0|1:66811033_A_T:66811033:2,0,1,0
chr16	66812969	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:66812969_A_T:66812969:0,0,0,1
chr16	66812970	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:66812969_A_T:66812969:0,0,0,1
chr16	66812973	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66812969_A_T:66812969:0,0,0,1
chr16	66812975	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66812969_A_T:66812969:0,0,0,1
chr16	66842794	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr16	66851224	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	66855546	.	T	TAATGTTGGCAAGGATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0|1:66855546_T_TAATGTTGGCAAGGATG:66855546:0,0,0,1
chr16	66855549	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66855546_T_TAATGTTGGCAAGGATG:66855546:0,0,0,1
chr16	66861853	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,195337;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:0,1:5,1:5,0,1,1
chr16	66861966	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr16	66885652	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,11:0,0,4,16
chr16	66886559	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr16	66918359	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=186,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.190:14:5,0:5,2:7,5,0,2
chr16	66946545	.	G	GATTGGGAGCCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=165,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,2:3,0:0|1:66946545_G_GATTGGGAGCCA:66946545:5,3,1,1
chr16	66946547	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=165,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,1:4,0:0|1:66946545_G_GATTGGGAGCCA:66946545:5,3,1,1
chr16	67165105	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=118,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.447:15:5,0:3,0:6,2,7,0
chr16	67166376	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,0;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,2:0.047:62:37,2:23,0:33,27,0,2
chr16	67196674	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,2:2,7:5,0,9,0
chr16	67197196	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	67199396	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,19;MFRL=146,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:1,0:0|1:67199396_G_C:67199396:2,1,4,0
chr16	67199398	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=146,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,0:0,1:0|1:67199396_G_C:67199396:2,1,4,0
chr16	67199399	.	C	CCGG	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=146,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,0:1,2:0|1:67199396_G_C:67199396:2,1,4,0
chr16	67199402	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.537:9:3,2:1,2:0|1:67199396_G_C:67199396:3,1,4,1
chr16	67199406	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=138,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.489:8:3,1:1,2:0|1:67199396_G_C:67199396:3,1,3,1
chr16	67201194	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67201194_A_T:67201194:0,0,0,1
chr16	67201196	.	CCC	TTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67201194_A_T:67201194:0,0,0,1
chr16	67221050	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr16	67221140	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,5:2,2:1,1,5,2
chr16	67236357	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=251,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:67236357_A_T:67236357:0,2,0,1
chr16	67236359	.	G	GCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=251,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:67236357_A_T:67236357:0,2,0,1
chr16	67236362	.	C	CCAGGTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=251,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:67236357_A_T:67236357:0,2,0,1
chr16	67236364	.	C	CCG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=251,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:67236357_A_T:67236357:0,2,0,1
chr16	67236366	.	T	TTAGTGGCCCAGGGCTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=194,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:67236357_A_T:67236357:0,1,0,1
chr16	67236946	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:67236946_A_ATG:67236946:0,1,0,1
chr16	67236948	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:67236946_A_ATG:67236946:0,1,0,1
chr16	67237339	.	T	TGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:2,2:0,2,2,0
chr16	67237343	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:2,1:0|1:67237343_A_C:67237343:0,2,3,0
chr16	67237347	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,22;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:2,1:0|1:67237343_A_C:67237343:0,2,3,0
chr16	67237353	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:67237343_A_C:67237343:0,2,2,0
chr16	67242080	.	G	GGTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr16	67262533	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=203,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,1:9,1:3,9,1,1
chr16	67264519	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:6,0:14,3,1,1
chr16	67270623	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67270623_C_T:67270623:0,2,0,1
chr16	67270630	.	T	TGGTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=170,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:67270623_C_T:67270623:0,1,0,1
chr16	67273407	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:67273407_A_ATT:67273407:0,2,0,1
chr16	67273410	.	T	TATCAGATTTCTCAGTTTTTAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=127,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:67273407_A_ATT:67273407:0,2,0,1
chr16	67300016	.	TGAG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GAG;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,1:7,1:10,6,2,0
chr16	67314005	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:8,7,1,1
chr16	67315127	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=162,129;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.323:10:4,3:3,0:3,4,0,3
chr16	67315128	.	C	T,CT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=19,31,20;MFRL=168,99,135;MMQ=60,60,57;MPOS=3,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.01,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,3:0.354,0.265:12:1,3,3:0,2,0:1,3,4,4
chr16	67316582	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=194,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,1:4,1:5,4,1,1
chr16	67316600	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=181,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.606:11:2,3:2,2:4,0,5,2
chr16	67321946	.	T	TTGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=225,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,0:2,1:3,0,0,1
chr16	67324957	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr16	67328442	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=147,43;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:4,1,0,2
chr16	67335898	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:67335898_A_AAT:67335898:0,1,0,1
chr16	67335900	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:67335898_A_AAT:67335898:0,1,0,1
chr16	67354808	.	GAGA	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67354808_GAGA_G:67354808:0,0,0,1
chr16	67354812	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67354808_GAGA_G:67354808:0,0,0,1
chr16	67354815	.	ACG	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67354808_GAGA_G:67354808:0,0,0,1
chr16	67354820	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67354808_GAGA_G:67354808:0,0,0,1
chr16	67354823	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67354808_GAGA_G:67354808:0,0,0,1
chr16	67380438	.	G	GGTGTATTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=11,33;MFRL=267,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:67380438_G_GGTGTATTA:67380438:0,1,0,1
chr16	67380439	.	C	CATTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=267,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:67380438_G_GGTGTATTA:67380438:0,1,0,1
chr16	67381494	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:2,6:10,2:1,11,2,6
chr16	67425097	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:67425097_A_C:67425097:0,1,0,1
chr16	67425098	.	C	CTTTGAAATAAATGTATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:67425097_A_C:67425097:0,1,0,1
chr16	67470293	.	GGA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=102,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:67470293_GGA_G:67470293:3,1,0,1
chr16	67470296	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=102,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:67470293_GGA_G:67470293:3,1,0,1
chr16	67470335	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	67516508	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:19,2,2,0
chr16	67577409	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:67577409_G_A:67577409:0,2,0,1
chr16	67577413	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:67577409_G_A:67577409:0,2,0,1
chr16	67579036	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	67682056	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=165,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:4,0:1,1:1,4,1,2
chr16	67682058	.	GGATGACCGGCAGGGCGGACTGGAGGGCGGGAC	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:3,1:3,4,0,2
chr16	67682095	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,0:1,0,0,2
chr16	67683110	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.250:13:5,2:4,0:1,9,3,0
chr16	67683626	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=137,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr16	67685740	.	TA	CT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=156,32;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:67685740_TA_CT:67685740:5,2,1,1
chr16	67685743	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=156,32;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:67685740_TA_CT:67685740:5,2,1,1
chr16	67685747	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=165,32;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:67685740_TA_CT:67685740:4,2,1,1
chr16	67685750	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=165,32;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:67685740_TA_CT:67685740:4,2,1,1
chr16	67691477	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:7,3:2,5:7,2,6,2
chr16	67691645	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:4,5,4,3
chr16	67691668	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:4,6:9,4:9,5,5,5
chr16	67699948	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.477:40:11,12:10,7:19,2,15,4
chr16	67761200	.	CTAA	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TAA;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:10,1:20,1:18,14,1,1
chr16	67763818	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.646:12:0,3:3,5:3,1,6,2
chr16	67805990	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.256:32:8,0:12,0:12,11,0,9
chr16	67857658	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=159,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,0:2,3:2,6,1,2
chr16	67861134	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=170,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr16	67863451	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:2,6,1,2
chr16	67865023	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=178,53;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,0:0,2:2,0,2,0
chr16	67867853	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	67876367	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,18;MFRL=222,360;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:67876367_C_G:67876367:1,0,1,0
chr16	67876374	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=17,18;MFRL=210,360;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:67876367_C_G:67876367:2,0,1,0
chr16	67876377	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,18;MFRL=210,360;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:67876367_C_G:67876367:2,0,1,0
chr16	67876382	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,32;MFRL=210,360;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:67876367_C_G:67876367:2,0,1,0
chr16	67876389	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,17;MFRL=210,360;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:67876367_C_G:67876367:2,0,1,0
chr16	67876823	.	ACAG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=16,30;MFRL=163,156;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CAG;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.458:9:1,1:1,3:1,4,2,2
chr16	67979573	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=105,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67979573_G_A:67979573:2,0,0,1
chr16	67979582	.	T	TGATTGTGCCACTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=210,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:67979573_G_A:67979573:3,0,0,1
chr16	67985706	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:3,1,6,1
chr16	67997446	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:4,4,0,2
chr16	67997799	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=110,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.413:7:1,1:3,0:2,2,3,0
chr16	68011776	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:5,2:6,0:10,1,2,0
chr16	68012323	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,0:13,3:12,11,0,3
chr16	68024995	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=124,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,2:5,4:6,5,4,2
chr16	68025801	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,10:0,0,9,7
chr16	68109495	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,0:2,1:0|1:68109495_A_G:68109495:0,2,0,1
chr16	68109496	.	A	ACATCAAGGACAAGCACTTTCCATTATGAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.384:4:0,0:2,1:1|0:68109495_A_G:68109495:0,3,0,1
chr16	68109497	.	T	TCAGCATTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:68109495_A_G:68109495:0,2,0,1
chr16	68109500	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:68109495_A_G:68109495:0,2,0,1
chr16	68119555	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,2,1
chr16	68155860	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:3,2:0,0:2,1,2,0
chr16	68160289	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=212,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:1,1,3,0
chr16	68224582	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	68248396	.	G	GAGCTGTGTTCGC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.159:16:7,2:7,0:1,13,1,1
chr16	68260462	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr16	68288983	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,3:1,5:0,1,0,8
chr16	68289313	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,2:4,7:1,6,2,7
chr16	68289372	.	G	GTTTTTCGAGATCATCCCATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=205,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr16	68289915	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:4,2:4,0:0,8,0,3
chr16	68328586	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:13,8,2,0
chr16	68336360	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.429:28:13,4:3,7:7,9,10,2
chr16	68373954	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=113,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr16	68387373	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,8859860;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr16	68387496	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=100,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.509:22:3,7:6,4:4,7,3,8
chr16	68391011	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,1:6,1:13,3,1,1
chr16	68391189	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr16	68395094	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:2,0:0,2:2,0,2,1
chr16	68397776	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:1,3,1,2
chr16	68592554	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68592554_G_GGC:68592554:0,1,0,1
chr16	68592555	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:68592554_G_GGC:68592554:0,2,0,1
chr16	68597998	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:68597998_T_C:68597998:10,4,1,1
chr16	68598007	.	A	G,ACAC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,32,20;MFRL=0,155,59;MMQ=60,60,60;MPOS=19,3;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=49.28,5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,15,2:0.800,0.150:17:0,6,0:0,9,2:0,0,11,6
chr16	68598009	.	A	AGGTCACACACAG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=155,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:68597998_T_C:68597998:10,5,1,1
chr16	68711944	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	68711999	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=116,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,3:2,1:9,1,3,1
chr16	68712217	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr16	68716179	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	68718747	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:0|1:68718747_A_T:68718747:0,1,1,1
chr16	68718749	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:1,1:0|1:68718747_A_T:68718747:0,1,1,1
chr16	68718752	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68718747_A_T:68718747:0,1,0,1
chr16	68718754	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68718747_A_T:68718747:0,1,0,1
chr16	68718756	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68718747_A_T:68718747:0,1,0,1
chr16	68718758	.	CGT	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,33;MFRL=174,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:68718747_A_T:68718747:0,3,0,1
chr16	68718761	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=174,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,1:0|1:68718747_A_T:68718747:0,3,0,1
chr16	68718764	.	GGTAC	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=204,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:68718747_A_T:68718747:0,2,0,1
chr16	68721340	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	68721470	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,12,2
chr16	68721533	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,3:9,4:9,5,4,3
chr16	68729112	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr16	68729765	.	C	CAGCCCAGCCCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.240:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr16	68729785	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr16	68732256	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:3,7,0,2
chr16	68835897	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	68845791	.	T	TTCCTAGGAGATTGGCATGTGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=147,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr16	68863590	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.552:25:7,6:4,7:6,5,7,7
chr16	69143481	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,2:2,6:1,4,6,2
chr16	69149224	.	T	TTTTGGCCTGCATCACGGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	69154282	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr16	69155051	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr16	69155309	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:14,7:6,9:15,5,13,3
chr16	69201050	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.371:16:6,3:4,1:2,8,2,4
chr16	69350035	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.396:23:6,4:7,4:7,7,5,4
chr16	69350069	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:11,6:7,5:13,5,8,3
chr16	69354682	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,6,15
chr16	69356612	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:1,2:2,3:0,3,1,5
chr16	69356695	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.795:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr16	69366649	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,1:10,2:9,8,2,1
chr16	69373851	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,5:6,6:10,2,10,2
chr16	69373894	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.341:45:20,6:9,9:17,13,9,6
chr16	69377338	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,255;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,0:9,2:12,4,0,2
chr16	69390702	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.484:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr16	69395434	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr16	69400894	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:19,2:20,1:32,9,3,0
chr16	69419394	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,3:2,1:2,2,1,4
chr16	69458779	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:7,6:9,3:1,16,2,7
chr16	69492973	.	A	AT,ATT	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=157,147,153;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=T;STR;TLOD=47.37,5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,25,6:0.544,0.141:47:8,15,4:8,10,2:16,0,29,2
chr16	69752011	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:9,2,1,1
chr16	69752464	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,1,7
chr16	69783587	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=235,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:2,0:0,2:0,3,0,2
chr16	69786225	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,133;MMQ=52,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:16,2:17,0:17,17,1,1
chr16	69942608	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr16	69951847	.	C	CCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr16	69965024	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0,0,16,3
chr16	69965195	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:1,15,0,2
chr16	69965396	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28,33,32;MFRL=136,149,134,164;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,14,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.82,7.14,8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,4,4,4:0.165,0.228,0.214:20:2,2,3,2:6,2,1,1:8,0,10,2
chr16	69965592	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr16	69967093	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=58.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,3,15
chr16	69969712	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	69973127	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	69996953	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=141,171;MMQ=25,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:14,1:9,2:18,5,2,1
chr16	69996985	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=145,133;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.209:36:14,4:15,3:13,16,4,3
chr16	70162581	.	TC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=178,161;MMQ=57,57;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:11,4:4,9:17,0,13,0
chr16	70162911	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,148;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.390:39:17,8:7,7:20,4,12,3
chr16	70166225	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,156;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:6,4:18,5:4,20,1,8
chr16	70170004	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,172;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:70170004_C_A:70170004:0,0,1,0
chr16	70170016	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,179;MMQ=21,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0|1:70170004_C_A:70170004:1,0,2,0
chr16	70173012	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,197;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr16	70176317	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.206:22:7,1:5,1:2,15,0,5
chr16	70176321	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=19,21;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.342:14:3,3:1,1:1,8,1,4
chr16	70177577	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=157,193;MMQ=34,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,2:6,2:4,8,0,4
chr16	70177618	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=152,217;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:1,6,0,2
chr16	70177648	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=152,193;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:0,3,1,6
chr16	70182325	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	70182489	.	ACTTCCCTTCC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=CTTCC;STR;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.581:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr16	70187270	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,1:5,2:11,0,2,1
chr16	70187550	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,2,2
chr16	70190360	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=87,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,5:6,0:5,6,3,2
chr16	70211370	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,166;MMQ=25,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:0,6,0,7
chr16	70287289	.	G	GTCAA	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=154,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.179:14:6,0:5,2:0|1:70287289_G_GTCAA:70287289:3,9,0,2
chr16	70287290	.	G	GTCCCCCA	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=154,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,0:5,2:0|1:70287289_G_GTCAA:70287289:3,9,0,2
chr16	70287292	.	G	GTC	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=154,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:70287289_G_GTCAA:70287289:3,9,0,2
chr16	70287294	.	G	GCAC	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=154,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:70287289_G_GTCAA:70287289:3,9,0,2
chr16	70287295	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=154,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:3,2:0|1:70287289_G_GTCAA:70287289:3,9,0,2
chr16	70287300	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=142,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:70287289_G_GTCAA:70287289:2,9,0,2
chr16	70287303	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=142,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:3,2:0|1:70287289_G_GTCAA:70287289:2,9,0,2
chr16	70287990	.	T	TACCAGCTGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:70287990_T_TACCAGCTGG:70287990:0,4,0,1
chr16	70287992	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:70287990_T_TACCAGCTGG:70287990:0,4,0,1
chr16	70287993	.	C	CAGCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:70287990_T_TACCAGCTGG:70287990:0,4,0,1
chr16	70292798	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr16	70316738	.	G	GGAAGATGCTCAAAGGGAGATGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=167,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:0,2:3,0:0|1:70316738_G_GGAAGATGCTCAAAGGGAGATGC:70316738:0,3,1,1
chr16	70316740	.	A	AAGGAAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=167,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,0:0|1:70316738_G_GGAAGATGCTCAAAGGGAGATGC:70316738:0,3,1,1
chr16	70333359	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=164,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:70333359_G_A:70333359:0,3,0,1
chr16	70333361	.	G	GTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:70333359_G_A:70333359:0,3,0,1
chr16	70333363	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=164,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:70333359_G_A:70333359:0,3,0,1
chr16	70333368	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=193,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:70333359_G_A:70333359:0,2,0,1
chr16	70348770	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:6,2:13,0:12,7,0,2
chr16	70358676	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:70358676_T_TG:70358676:0,3,0,1
chr16	70358678	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=153,185;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1|0:70358676_T_TG:70358676:0,3,0,1
chr16	70358681	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=153,185;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1|0:70358676_T_TG:70358676:0,3,0,1
chr16	70358683	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:70358676_T_TG:70358676:0,2,0,1
chr16	70363125	.	C	CAAAAAAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,156;MMQ=35,30;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=21,29;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.566:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr16	70400857	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr16	70422231	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,3:0,13:0,0,11,5
chr16	70504425	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	70505173	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:7,3,0,2
chr16	70507194	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	70513648	.	AT	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=155,275;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:70513648_AT_CA:70513648:0,3,0,1
chr16	70513651	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=155,275;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:70513648_AT_CA:70513648:0,3,0,1
chr16	70514828	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	70515600	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,11,1
chr16	70516109	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,0,11
chr16	70531754	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr16	70543083	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:10,5:4,6:12,2,11,0
chr16	70562724	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:10,1,2,0
chr16	70680850	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,22;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,3,1
chr16	70690393	.	TA	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr16	70693872	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,5:6,1:9,1,5,1
chr16	70710762	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,10;MFRL=109,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.451:9:2,0:3,0:0|1:70710762_T_G:70710762:2,3,4,0
chr16	70710772	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=18,13;MFRL=109,359505;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:2,0:0|1:70710762_T_G:70710762:5,4,2,0
chr16	70710780	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,19;MFRL=132,359505;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:6,1:0|1:70710762_T_G:70710762:5,5,2,0
chr16	70710782	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,13;MFRL=132,359505;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:5,0:0|1:70710762_T_G:70710762:5,5,2,0
chr16	70710785	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=134,359505;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:9,0:0|1:70710762_T_G:70710762:6,7,2,0
chr16	70710788	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=25,18;MFRL=134,359505;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:8,1:0|1:70710762_T_G:70710762:6,7,2,0
chr16	70710950	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=195,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr16	70714584	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	70714944	.	GAGAGAAAGTGAGCTTCTT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	70732483	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.806:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	70796515	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.369:17:5,4:5,2:0|1:70796515_G_A:70796515:4,7,4,2
chr16	70796535	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:4,3:5,3:0|1:70796515_G_A:70796515:4,6,3,3
chr16	70816893	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr16	70883570	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,5:3,6:4,1,11,0
chr16	70883943	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:0,2:6,1:0,6,0,3
chr16	70884524	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,19:0.571:33:2,11:12,8:0|1:70884524_C_G:70884524:5,9,7,12
chr16	70884534	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,19:0.556:34:2,10:13,8:0|1:70884524_C_G:70884524:6,9,7,12
chr16	70884647	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,1:1,5:0,1,0,6
chr16	70889147	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.456:33:8,8:10,6:7,11,6,9
chr16	70891640	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,15:0.315:48:10,6:23,7:25,8,11,4
chr16	70891778	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.595:38:6,8:9,12:3,12,4,19
chr16	70893911	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:7,0,6,2
chr16	70893924	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:8,7:6,1:11,3,7,2
chr16	70894087	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=103,147;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,9:0.144:68:24,4:28,5:25,34,2,7
chr16	70894123	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=118,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.480:48:10,13:15,9:6,19,5,18
chr16	70894880	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr16	70896015	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=49.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:11,6:2,8:7,6,10,7
chr16	70896033	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.249:32:15,3:9,3:11,13,4,4
chr16	70896975	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,2:3,3:7,4,4,1
chr16	70897039	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,3:3,5:4,5,2,6
chr16	70900048	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:7,6:4,9:7,4,13,2
chr16	70900332	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=194,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr16	70902559	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=107.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,29:0.536:54:9,10:15,19:0|1:70902559_C_T:70902559:7,18,9,20
chr16	70902568	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=133,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,27:0.560:48:8,7:11,16:0|1:70902559_C_T:70902559:6,15,9,18
chr16	70902683	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,1:6,3:5,5,1,3
chr16	70905912	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:7,3:5,7:11,1,9,1
chr16	70908118	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=198,663;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr16	70908684	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=112,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.543:31:5,4:9,12:8,6,12,5
chr16	70908736	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=112,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:8,6:8,13:6,10,8,12
chr16	70913130	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=275,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr16	70913386	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:8,9:3,3:2,9,6,6
chr16	70913467	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.549:31:10,15:3,2:12,2,12,5
chr16	70913501	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.442:41:15,13:8,5:17,6,11,7
chr16	70916816	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:4,3:15,5:1,20,1,7
chr16	70916819	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.676:29:1,5:7,14:0,9,2,18
chr16	70916849	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.679:16:0,3:3,8:0,5,1,10
chr16	70916896	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=230,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,2,2
chr16	70917725	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=155,141;MMQ=60,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,1:11,1:17,0,2,0
chr16	70917747	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=152,106;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.134:24:4,2:14,0:0|1:70917747_C_T:70917747:18,3,3,0
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chr16	70917753	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:6,2:15,4:16,5,5,1
chr16	70917785	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.536:43:10,12:9,11:9,11,17,6
chr16	70917855	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.642:43:5,12:10,14:7,8,9,19
chr16	70926214	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,5:4,4:11,0,8,1
chr16	70926334	.	G	C	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,19:0.263:74:25,6:30,13:24,31,13,6
chr16	70926445	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:5,6:6,11:0,11,0,17
chr16	70926472	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=162,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,2:5,1:0,11,0,3
chr16	70928259	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=17,33;MFRL=116,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:0,4:0,3:1,0,8,0
chr16	70928307	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.711:26:3,7:4,7:5,2,14,5
chr16	70928314	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.448:32:7,6:10,8:14,4,9,5
chr16	70930002	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,0:6,5:0,6,0,5
chr16	70930060	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr16	70934994	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,6:6,2:6,10,1,7
chr16	70935158	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,2:2,6:0,4,5,3
chr16	70937482	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.177:24:14,1:6,2:18,2,4,0
chr16	70937994	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.726:16:1,8:3,4:0,4,2,10
chr16	70942103	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr16	70942114	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:4,0,6,0
chr16	70942432	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,6:0,6:3,0,7,5
chr16	70942460	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,8:1,4:5,0,8,4
chr16	70942688	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.556:43:11,13:8,11:6,13,6,18
chr16	70942816	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr16	70952392	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr16	70952401	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr16	70954434	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,2:4,1:13,1,3,0
chr16	70954452	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:12,3:3,2:13,2,4,1
chr16	70954513	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,16:0.359:45:17,11:11,4:18,11,13,3
chr16	70954571	.	CT	TA	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.434:51:18,13:11,9:11,18,10,12
chr16	70954606	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.404:45:18,13:8,5:6,21,7,11
chr16	70954691	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=180,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,2:6,1:10,5,1,2
chr16	70954703	.	GGCGCTCCTTCTCCGT	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.554:18:5,5:1,5:6,2,7,3
chr16	70954774	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:9,4:2,6:6,5,9,1
chr16	70954809	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:14,4:4,12:10,8,9,7
chr16	70954915	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=187.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,31:0,24:0,0,26,29
chr16	70954945	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.442:41:15,9:8,9:12,11,8,10
chr16	70955192	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,2:1,2:0,6,0,4
chr16	70970096	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:0,4,1,7
chr16	70972595	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.414:22:2,6:10,2:5,8,6,3
chr16	70972620	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.564:21:5,3:3,7:5,4,3,9
chr16	70972701	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:5,3:1,2:2,4,1,5
chr16	70975565	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,2:6,1:9,6,2,1
chr16	70977647	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	70977695	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=170,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,2,1
chr16	70986275	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=113,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:10,6:3,5:13,0,11,0
chr16	70986480	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,30:0.544:55:13,20:11,10:11,14,13,17
chr16	70986605	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=211,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0,7,1,3
chr16	70989299	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,1:4,6:9,1,4,3
chr16	70989335	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,4:5,7:6,5,7,4
chr16	70995768	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	70995845	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=97.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,32:0.807:39:3,17:4,15:4,3,24,8
chr16	70996115	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,0:1,2:1,4,0,2
chr16	70998603	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:6,3,7,2
chr16	70998808	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.514:35:11,10:6,8:4,13,5,13
chr16	71004695	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:1,10,0,5
chr16	71004731	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr16	71007459	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,1:4,2:0,10,0,3
chr16	71007657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr16	71008169	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:5,9:12,11:7,10,5,15
chr16	71008301	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=207,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr16	71008389	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.799:18:3,9:0,5:3,0,15,0
chr16	71008417	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,23:0.725:31:6,13:2,8:8,0,23,0
chr16	71008454	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=132,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:22,1:22,1:38,7,2,0
chr16	71015290	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=62.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:7,12:13,9:12,8,13,8
chr16	71015482	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,7:2,4:1,5,5,6
chr16	71015555	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=203,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:0,3,1,3
chr16	71019064	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=104,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,1:5,4:5,2,4,1
chr16	71025394	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=223,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr16	71025872	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=270,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr16	71025948	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:5,11:6,5:11,0,13,3
chr16	71026076	.	C	G	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,27:0.452:60:15,10:18,16:16,17,8,19
chr16	71026098	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=127,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,23:0.445:52:12,8:17,15:9,20,6,17
chr16	71026137	.	TA	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:6,5:14,6:4,17,3,10
chr16	71054032	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:0,3:3,0:2,1,4,0
chr16	71054061	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.491:21:6,6:1,3:7,4,9,1
chr16	71054178	.	T	C	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=130.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,50:0.590:84:14,23:20,23:13,21,32,18
chr16	71061495	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:13,11:3,5:12,4,14,3
chr16	71065560	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,1:5,4:7,2,5,0
chr16	71065868	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,4:1,5:0,5,0,9
chr16	71095987	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=238,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr16	71096248	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:5,7:9,5:7,7,4,8
chr16	71096309	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr16	71098649	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.590:42:10,11:7,13:10,7,12,13
chr16	71101200	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:3,3:6,1:5,4,2,2
chr16	71101270	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=155,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.338:19:4,2:7,4:7,6,1,5
chr16	71101320	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=155,1689167;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:3,2:0,9,1,1
chr16	71103084	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr16	71103114	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,5:4,4:9,1,9,0
chr16	71103269	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=96.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,39:0.570:68:16,18:13,20:14,15,13,26
chr16	71103393	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:3,3:3,9,1,2
chr16	71103419	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,5:5,1:2,5,1,6
chr16	71113780	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,8:3,0:5,0,6,2
chr16	71122408	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,172;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,25:0.448:56:17,15:14,10:31,0,25,0
chr16	71127652	.	TATAAG	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:4,8:1,1:7,0,9,0
chr16	71127700	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.518:33:7,12:8,5:14,2,11,6
chr16	71127850	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.648:32:5,12:6,9:1,10,6,15
chr16	71127919	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,5:2,4:1,5,0,9
chr16	71149536	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,4:5,5:7,1,9,0
chr16	71149782	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:0,7,0,6
chr16	71163452	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,2:2,3:2,1,5,0
chr16	71163579	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:9,7:8,6:8,9,7,6
chr16	71163606	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.256:41:15,2:16,8:18,13,5,5
chr16	71170981	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=205,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:3,1,1,1
chr16	71186740	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,1:6,1:2,4,0,2
chr16	71196410	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.678:29:0,7:9,13:5,4,17,3
chr16	71209718	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71209718_A_T:71209718:0,0,0,1
chr16	71209720	.	TACTTAC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71209718_A_T:71209718:0,0,0,1
chr16	71218926	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr16	71220668	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,5:6,7:7,4,9,3
chr16	71220880	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=90,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr16	71319539	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.363:23:8,5:6,3:4,11,6,2
chr16	71319646	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,8:0,11:0,0,14,5
chr16	71406001	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	71406024	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	71417783	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	71419595	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr16	71423814	.	T	TCTTCACTTTTTGCCATAAGTAAAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	71509685	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0,0,7,12
chr16	71603912	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr16	71607384	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,8:0,13:0,0,15,6
chr16	71660115	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	71668800	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	71674455	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,1:4,1:5,8,0,2
chr16	71690401	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr16	71692816	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=229,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr16	71701248	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:1,0,1,7
chr16	71718366	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,9,7
chr16	71724369	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr16	71736702	.	G	GTATTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATTTT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	71772784	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=170,219;MMQ=60,60;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:71772784_G_GA:71772784:4,0,2,0
chr16	71772795	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.905:8:0,2:0,4:0|1:71772784_G_GA:71772784:0,0,8,0
chr16	71784025	.	G	GGATCTCCAAAAGGGAGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=238,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr16	71784148	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,159;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:9,6,2,0
chr16	71792696	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,20:0,6:0,0,18,8
chr16	71799347	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.916:21:0,7:1,13:1,0,18,2
chr16	71804956	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	71805160	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr16	71805204	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:71805204_G_GT:71805204:0,3,0,1
chr16	71805208	.	AA	TC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:71805204_G_GT:71805204:0,3,0,1
chr16	71805234	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=37,32;MFRL=243,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71805234_C_A:71805234:0,1,0,1
chr16	71805236	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,31;MFRL=243,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71805234_C_A:71805234:0,1,0,1
chr16	71805242	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=243,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71805234_C_A:71805234:0,1,0,1
chr16	71808270	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=171,175;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:4,3:16,0:20,0,3,0
chr16	71808301	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=148,124;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:11,2:29,0:35,5,2,0
chr16	71808309	.	AG	A	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=134,124;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,2:0.049:59:13,2:27,0:47,10,2,0
chr16	71808507	.	GA	G,CA,GAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=17,20,20,18;MFRL=142,116,162,116;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,17,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.37,10.85,4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,5,6,3:0.235,0.217,0.163:21:0,3,3,1:0,1,0,0:0,7,2,12
chr16	71885457	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=116,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,0:7,3:11,8,1,2
chr16	71887282	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:16,0:10,2:8,18,0,2
chr16	71894121	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,0:15,2:8,14,2,0
chr16	71950293	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr16	71955270	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:1,6:5,7:2,4,5,8
chr16	71955426	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr16	71956511	.	AATGCCC	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATGCCC;STR;TLOD=114.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.970:27:0,13:0,14:0,0,11,16
chr16	71956588	.	GTATA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=233,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=TA;STR;TLOD=52.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:1,5:0,7:0,1,1,12
chr16	71963924	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:2,1:6,3:7,2,4,0
chr16	71967783	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,2:3,7:6,0,6,3
chr16	71968091	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=216,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	71981374	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=125,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,1:2,1:2,0,1,2
chr16	71981414	.	C	CTTTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,1:0,6:0,1,4,3
chr16	71983664	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr16	71983929	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:3,4,3,8
chr16	71986764	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,7:0,9:0,0,14,3
chr16	71986946	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,10,19
chr16	71986995	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=161,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:4,8:9,4:3,10,2,10
chr16	71987044	.	CAA	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,36;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr16	71987960	.	A	C,AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35,34;MFRL=0,80,158;MMQ=60,53,60;MPOS=19,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.46,10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,5:0.277,0.633:7:0,2,2:0,0,3:0,0,7,0
chr16	71988106	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,5,8
chr16	72001987	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72001987_G_A:72001987:0,1,0,1
chr16	72001988	.	A	ATCGCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72001987_G_A:72001987:0,1,0,1
chr16	72001992	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72001987_G_A:72001987:0,1,0,1
chr16	72001996	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:72001987_G_A:72001987:0,1,0,1
chr16	72003732	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:5,2:6,1,6,0
chr16	72003952	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=118,188;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:3,4,3,4
chr16	72007457	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=158,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:72007457_A_C:72007457:0,2,0,1
chr16	72007461	.	AAACACCAATGAAC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=158,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:72007457_A_C:72007457:0,2,0,1
chr16	72011040	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	72011450	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	72012072	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr16	72012380	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr16	72016158	.	T	TTTTGTTTAAGACTTCTGCATCTATGTTTAACAGTGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,172;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.321:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr16	72018099	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr16	72027092	.	TT	AC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=133,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:16,6,0,2
chr16	72027319	.	TAATC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=205,261;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	72046232	.	G	GAAGTCAGTGTGCCCTCTGCCAATATTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.671:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	72050838	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.538:10:1,2:0,0:5,0,5,0
chr16	72050885	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,18,4
chr16	72054984	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0,0,13,7
chr16	72057282	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,5,4
chr16	72088467	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=183,124;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.844:21:0,8:2,10:3,0,11,7
chr16	72088652	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.472:51:9,8:17,16:1,26,1,23
chr16	72088675	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,13:0,18:0,0,1,30
chr16	72097279	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,310;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72097279_T_C:72097279:0,0,0,1
chr16	72097289	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,310;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72097279_T_C:72097279:0,0,0,1
chr16	72107692	.	CGT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=194,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	72108093	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:9,10:7,6:16,0,15,1
chr16	72110872	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,144;MMQ=57,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,1:12,1:13,12,0,2
chr16	72124495	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,12:0,0,23,0
chr16	72130203	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,5,15
chr16	72131740	.	ACT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=48.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr16	72132713	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr16	72133211	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr16	72135067	.	A	G	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=117.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,45:0.507:89:26,27:15,17:25,19,27,18
chr16	72135319	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	72137196	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72137196_T_A:72137196:0,0,0,1
chr16	72137199	.	GCA	TTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72137196_T_A:72137196:0,0,0,1
chr16	72138577	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr16	72139396	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr16	72139537	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr16	72141718	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr16	72142072	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	72142317	.	G	GTGTAAATCTGCCTAATGTCCGAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=141,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.407:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr16	72142595	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,12,3
chr16	72142895	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	72146441	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr16	72157000	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	72158920	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr16	72164642	.	CCATG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr16	72164660	.	T	TTTTGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=130,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72164660_T_TTTTGGG:72164660:0,1,0,1
chr16	72164663	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=130,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72164660_T_TTTTGGG:72164660:0,1,0,1
chr16	72170417	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,190;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:5,8,0,2
chr16	72205021	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr16	72845721	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:72845721_A_C:72845721:0,3,1,0
chr16	72845723	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:72845721_A_C:72845721:0,3,1,0
chr16	72845727	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=207,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:72845721_A_C:72845721:1,3,1,0
chr16	72845731	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:72845721_A_C:72845721:1,2,1,0
chr16	72923767	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=163,45;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:11,0:1,2:0|1:72923767_A_G:72923767:5,7,1,1
chr16	72923772	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=153,45;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:0,2:0|1:72923767_A_G:72923767:6,7,1,1
chr16	72923777	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=147,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:14,0:0,2:0|1:72923767_A_G:72923767:6,8,1,1
chr16	72923784	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=123,45;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:10,0:0,2:0|1:72923767_A_G:72923767:5,6,1,1
chr16	72991286	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=104,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr16	72992221	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:6,9:9,5:10,5,10,4
chr16	74339629	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=189,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74339629_T_C:74339629:0,3,0,1
chr16	74339637	.	G	GAAAGACAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=189,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:74339629_T_C:74339629:0,3,0,1
chr16	74425358	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,28;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	74425548	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,14:0,6:0|1:74425548_A_G:74425548:0,0,10,10
chr16	74425569	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=91,146;MMQ=60,55;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.900:18:0,11:1,3:0|1:74425548_A_G:74425548:1,0,9,8
chr16	74443433	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,163;MMQ=27,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:13,3:10,1:18,5,5,0
chr16	74443789	.	T	TG	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,95;MMQ=49,49;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,15:0.243:60:16,8:26,7:27,18,10,5
chr16	74443882	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,160;MMQ=25,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,1:8,3:0,13,0,4
chr16	74444384	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,150;MMQ=43,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,20:0.329:62:22,10:19,10:39,3,19,1
chr16	74445003	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,197;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:7,3:10,5:3,15,0,8
chr16	74445522	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,193;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,1:7,3:12,3,4,0
chr16	74445689	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=193,169;MMQ=33,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr16	74445710	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=175,153;MMQ=40,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,2,1
chr16	74447656	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,173;MMQ=50,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:7,2:13,2:0,21,0,4
chr16	74487114	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:9,13,0,2
chr16	74493752	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=279,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr16	74501831	.	T	TGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=18,30;MFRL=160,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr16	74503860	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr16	74504005	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	74511492	.	GAGATA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=241,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74511492_GAGATA_G:74511492:0,1,0,1
chr16	74511500	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=241,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74511492_GAGATA_G:74511492:0,1,0,1
chr16	74566092	.	ATAT	AAT,A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=30,32,32;MFRL=0,164,145;MMQ=60,60,60;MPOS=26,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=25.96,17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,14,11:0.440,0.465:26:0,7,4:1,7,7:0,1,0,25
chr16	74566094	.	AT	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,26:0.680:38:5,12:7,14:4,8,0,26
chr16	74660174	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	74666634	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	74706298	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr16	74709737	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr16	74712905	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr16	74719571	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=223,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74719571_G_T:74719571:0,1,0,1
chr16	74719572	.	C	CAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=223,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74719571_G_T:74719571:0,1,0,1
chr16	74719573	.	GG	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=161,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:74719571_G_T:74719571:0,1,0,1
chr16	74752942	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:2,2:4,3,0,2
chr16	74760292	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr16	74761372	.	C	CGACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr16	74908439	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	74921661	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.294:21:8,3:7,2:9,6,1,5
chr16	74922015	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,160;MMQ=43,51;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.728:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr16	74926520	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr16	74927507	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=126,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:1,6:0,2:0,1,7,1
chr16	74937828	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:5,2,4,1
chr16	74938083	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr16	74942865	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=139,123;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:5,7,2,0
chr16	74942882	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=128,121;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:3,4,3,0
chr16	74942973	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=124,220;MMQ=27,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr16	74943890	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=54.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,12:0,3:0,0,0,15
chr16	74983725	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=138,75;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:9,0:15,3:0|1:74983725_G_A:74983725:4,22,1,2
chr16	74983730	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=144,75;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:13,0:16,3:0|1:74983725_G_A:74983725:4,25,1,2
chr16	74985487	.	A	ATCTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=73,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:74985487_A_ATCTC:74985487:1,1,0,1
chr16	74985490	.	GT	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=73,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:74985487_A_ATCTC:74985487:1,2,0,1
chr16	74985516	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr16	74999617	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=155,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0|1:74999617_A_C:74999617:5,1,2,0
chr16	74999625	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=155,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:0,1:5,0:0|1:74999617_A_C:74999617:5,1,2,0
chr16	75127494	.	AG	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:16,0:12,3:14,16,0,3
chr16	75140402	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=155,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:6,3:11,0:11,6,3,1
chr16	75140416	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=155,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:9,0:6,3:0|1:75140416_T_C:75140416:9,6,0,3
chr16	75140422	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=160,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:10,0:5,3:0|1:75140416_T_C:75140416:9,6,0,3
chr16	75140480	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:5,11,1,1
chr16	75146351	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.216:15:4,0:8,2:4,8,3,0
chr16	75146584	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:6,7,0,2
chr16	75146711	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:2,4,1,2
chr16	75148604	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr16	75186727	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr16	75200595	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=118,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr16	75204325	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=242,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr16	75238621	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,778;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75238621_T_C:75238621:0,0,1,0
chr16	75238622	.	C	CAGAGGCAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,778;MMQ=60,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75238621_T_C:75238621:0,0,1,0
chr16	75240883	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	75252820	.	AGC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	75263974	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr16	75267673	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,197;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:75267673_T_A:75267673:0,0,1,0
chr16	75267676	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75267673_T_A:75267673:0,0,1,0
chr16	75267687	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=0,197;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:75267687_T_G:75267687:0,0,1,0
chr16	75267693	.	CTC	GGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75267687_T_G:75267687:0,0,1,0
chr16	75267702	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,17;MFRL=128,197;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:75267687_T_G:75267687:1,0,1,0
chr16	75269046	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr16	75269958	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CA;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	75270721	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	75276295	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	75339131	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	75445906	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	75481497	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.474:36:14,11:5,6:12,7,12,5
chr16	75498320	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,11,2
chr16	75564975	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:6,2:4,2:0|1:75564975_T_C:75564975:0,11,0,4
chr16	75564977	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:7,1:4,2:0|1:75564975_T_C:75564975:0,11,0,4
chr16	75565047	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr16	75634323	.	GCAACT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:75634323_GCAACT_G:75634323:0,3,0,1
chr16	75634331	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.350:4:3,1:0,0:0|1:75634323_GCAACT_G:75634323:0,3,0,1
chr16	75634332	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:75634323_GCAACT_G:75634323:0,3,0,1
chr16	75665791	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=120,158;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.239:11:5,2:4,0:3,6,0,2
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chr16	76495842	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,17:0,11:0,0,18,10
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chr16	76555193	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:7,0:11,2:2,16,0,2
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chr16	76572142	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,145;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.078:36:22,2:12,0:0|1:76572138_A_AC:76572138:17,17,2,0
chr16	76587647	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	76592313	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	77242083	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr16	77242284	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,11:0,0,7,8
chr16	77246305	.	G	GA,GTAGGCTATGTGTTTTGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20,20;MFRL=131,46,50;MMQ=60,60,60;MPOS=3,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.99,6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.231,0.231:10:4,2,2:2,0,0:2,4,2,2
chr16	77246307	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=128,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:2,0:3,5,1,1
chr16	77246847	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=96,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:2,1,1,3
chr16	77317970	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:4,9,0,2
chr16	77325391	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=81,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr16	77325401	.	A	ACAAATAATCAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:77325401_A_ACAAATAATCAT:77325401:0,3,0,1
chr16	77325403	.	G	GTACAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:77325401_A_ACAAATAATCAT:77325401:0,3,0,1
chr16	77327226	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr16	77389762	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,3:0,1:3,1,4,0
chr16	77393207	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=125,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,1:4,2:2,2,2,1
chr16	77398081	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=116,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.280:41:15,5:14,6:15,15,9,2
chr16	77398335	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:77398335_G_T:77398335:0,1,0,1
chr16	77398337	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:77398335_G_T:77398335:0,1,0,1
chr16	77398339	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:77398335_G_T:77398335:0,1,0,1
chr16	77401684	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=225,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr16	77756613	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr16	77769647	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr16	77775676	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=115,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:11,2:4,0:11,4,2,0
chr16	77850966	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=113,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,6:8,7:3,9,5,8
chr16	77850999	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=94,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,6:5,4:2,7,2,8
chr16	77859041	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=277,223;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr16	77859051	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=165,250;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr16	78133671	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:9,0,7,0
chr16	78142209	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr16	78142308	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,4:6,3:11,1,5,2
chr16	78143607	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=208,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:3,1:1,6:4,0,6,2
chr16	78148794	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr16	78148830	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,5:4,3:5,0,7,1
chr16	78149067	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.456:35:9,10:10,5:8,11,5,11
chr16	78198192	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=83.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:1,17:0,10:0,1,8,20
chr16	78420775	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:5,10:1,4:4,2,10,4
chr16	79245465	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr16	79628536	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,0:0,3:0,0,1,3
chr16	80574886	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=250.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,38:0,30:0,0,54,16
chr16	80577098	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,6:0,0,10,4
chr16	80638523	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=196,198;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:80638523_T_A:80638523:0,6,0,2
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chr16	81015392	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=126,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:23,3:8,0:21,11,3,0
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chr16	81050817	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	81051054	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=172,139;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:0|1:81051054_A_G:81051054:1,4,0,2
chr16	81051058	.	CG	TC,TG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,33,31;MFRL=197,115,163;MMQ=60,40,53;MPOS=34,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:1,1,1:0,4,0,2
chr16	81051063	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=172,139;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0|1:81051054_A_G:81051054:0,3,0,2
chr16	81051101	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr16	81051327	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=205.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,36:0,24:0,0,49,12
chr16	81053682	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:0,4:1,0:0,1,4,0
chr16	81056111	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr16	81060124	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=115.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,38:0.613:62:8,17:15,21:16,8,24,14
chr16	81062151	.	CTT	C,CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32,31;MFRL=193,138,173;MMQ=60,60,60;MPOS=14,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=9.10,6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,4:0.272,0.257:17:2,4,4:5,1,0:6,2,8,1
chr16	81066339	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,1:1,5:0,5,0,6
chr16	81074904	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,26:0.540:48:10,8:12,18:20,2,24,2
chr16	81077485	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,156;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,6:5,3:5,3,6,3
chr16	81094760	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr16	81118289	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr16	81121119	.	CT	AA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=168,230;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:2,0:5,0,1,0
chr16	81121145	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,7:0,0,12,1
chr16	81145675	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr16	81145737	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr16	81145755	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=100,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr16	81151163	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	81161473	.	G	GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.498:16:5,4:3,3:1,7,3,5
chr16	81161712	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0|1:81161712_TA_T:81161712:0,0,0,2
chr16	81161722	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:81161712_TA_T:81161712:0,0,0,1
chr16	81164274	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr16	81164343	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	81167314	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:5,2:6,5:2,10,1,6
chr16	81167342	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr16	81173030	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr16	81181180	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:3,0:0,2:0,4,0,2
chr16	81183266	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr16	81183325	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:3,2,5,3
chr16	81185326	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr16	81190708	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,6:0,0,3,13
chr16	81190790	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr16	81193156	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr16	81193433	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=124,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:1,5,0,4
chr16	81194528	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:0,5:6,2:1,6,1,6
chr16	81199572	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr16	81213422	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:1,2,1,3
chr16	81219329	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr16	81222672	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	81224175	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr16	81224234	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:12,4:5,3:13,4,4,3
chr16	81224423	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	81232743	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	81236242	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:4,7,1,1
chr16	81241249	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=80,32220889;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:81241249_T_A:81241249:0,2,1,1
chr16	81241269	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=160,32220889;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:81241249_T_A:81241249:0,1,0,2
chr16	81242085	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=111,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,1:4,2:7,3,3,0
chr16	81254052	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr16	81272625	.	AT	A,ATT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,18,23;MFRL=125,139,157;MMQ=60,60,60;MPOS=15,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.45,10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,7,6:0.362,0.366:18:2,3,2:1,0,1:1,4,1,12
chr16	81295901	.	A	AGAACTGCAGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr16	81295915	.	A	ACAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr16	81301460	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:3,1,4,0
chr16	81319201	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:13,1:13,1:19,7,2,0
chr16	81320830	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr16	81321048	.	T	TATGAGCAGTTCTTCTCTTTTGTTATTTAGTGTTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr16	81396287	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr16	81398520	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	81528953	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=193,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr16	81529174	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,5:3,6:4,3,2,9
chr16	81712240	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=194,236;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:81712240_G_GCC:81712240:0,1,1,0
chr16	81712252	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=173,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:81712240_G_GCC:81712240:0,2,1,0
chr16	81712257	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=173,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:81712240_G_GCC:81712240:0,2,1,0
chr16	81725438	.	C	CATTCCATTCCATT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=113,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:8,2:15,0:10,14,0,2
chr16	81726863	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr16	81733442	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,67;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:4,11,0,2
chr16	81736324	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=497,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=193.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,61:0.969:62:0,32:1,21:0,1,13,48
chr16	81819820	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,1,17
chr16	81891998	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,9:0,0,1,18
chr16	81892041	.	GGGA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,2:0,6:0|1:81892041_GGGA_G:81892041:0,0,0,10
chr16	81892048	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:81892041_GGGA_G:81892041:0,0,0,9
chr16	81892645	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=205,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr16	81892708	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.853:11:0,4:1,6:1,0,9,1
chr16	81902797	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,9,6
chr16	81902990	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=119,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr16	81904374	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:81904374_A_AT:81904374:0,0,1,0
chr16	81904375	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:81904374_A_AT:81904374:0,0,1,0
chr16	81904433	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr16	81929538	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:2,5:9,3:3,8,4,4
chr16	81939150	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:2,3:4,0:2,4,1,3
chr16	81953081	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,5:3,8:5,2,9,4
chr16	81953368	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr16	81973474	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr16	82069055	.	C	CCCCCATCAGCGGCACAGTCACACGGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=135,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:4,2:1,0:4,1,1,1
chr16	82131578	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr16	82131623	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=185,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,2,1
chr16	82182832	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	82197885	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:82197885_T_C:82197885:0,2,0,1
chr16	82197887	.	TCC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:82197885_T_C:82197885:0,2,0,1
chr16	82197893	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:82197885_T_C:82197885:0,2,0,1
chr16	83065898	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:83065898_C_T:83065898:0,0,0,1
chr16	83065901	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:83065898_C_T:83065898:0,0,0,1
chr16	83065902	.	A	AAGATGAGATCACCCTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0|1:83065898_C_T:83065898:0,0,0,1
chr16	83159197	.	GAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr16	83813888	.	T	TGGGGTAAATGAACGGGGCATTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr16	83816828	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=159,46;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:6,0,5,1
chr16	83841560	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,24,0
chr16	83941958	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=210,158;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr16	83982960	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	83983050	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=91,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:12,3,1,1
chr16	83983071	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,10,8
chr16	83984706	.	CCT	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CT;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.193:34:13,5:11,1:24,4,4,2
chr16	83992785	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,7:0,6:0,0,14,0
chr16	83992816	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=17,19;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:2,0:0|1:83992816_C_G:83992816:7,6,2,0
chr16	83992821	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=124,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.406:14:3,0:4,0:1,7,6,0
chr16	83992824	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,10;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.316:15:5,0:5,0:3,7,5,0
chr16	83992826	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,18;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.151:18:3,0:8,0:0|1:83992816_C_G:83992816:9,7,2,0
chr16	83994485	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=172,289;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:4,0,0,1
chr16	83994569	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr16	84014769	.	C	CCTG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:0|1:84014769_C_CCTG:84014769:1,9,0,2
chr16	84014771	.	A	ACCTCCCACCT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,2:4,0:0|1:84014769_C_CCTG:84014769:1,10,0,2
chr16	84014773	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,0:0|1:84014769_C_CCTG:84014769:1,10,0,2
chr16	84024060	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=16,14;MFRL=140,179;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.211:13:2,0:2,0:9,2,2,0
chr16	84030970	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.508:2:1,1:0,0:0|1:84030970_C_A:84030970:0,1,0,1
chr16	84030972	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:84030970_C_A:84030970:0,1,0,1
chr16	84030975	.	TTGGGAC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:84030970_C_A:84030970:0,1,0,1
chr16	84050061	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr16	84050148	.	A	AGAAATAGCTAATGTAGATG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:3,4,1,1
chr16	84050804	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=105,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:12,11,0,2
chr16	84056325	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr16	84075563	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:0,1:5,2:4,1,1,2
chr16	84088169	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:11,1:2,1:7,7,1,1
chr16	84093062	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:1,5,2,7
chr16	84093121	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=196,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:84093121_T_C:84093121:0,1,0,1
chr16	84093124	.	GC	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=196,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:84093121_T_C:84093121:0,1,0,1
chr16	84093131	.	C	CCCTCCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=196,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:84093121_T_C:84093121:0,1,0,1
chr16	84101240	.	C	CACATTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,3:5,2,5,3
chr16	84101875	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=138,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr16	84102135	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr16	84104478	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr16	84121078	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.470:8:2,1:1,2:1,3,1,3
chr16	84124593	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.446:25:2,1:5,1:2,11,0,12
chr16	84124604	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.545:18:2,1:2,3:0,8,0,10
chr16	84125397	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:13,0:21,2:17,18,2,0
chr16	84132628	.	G	GAC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=98.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,10:0,0,22,1
chr16	84135453	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,7:0,13:0,0,0,20
chr16	84163126	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=102,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:2,1:10,4:8,4,3,2
chr16	84193285	.	AC	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.108:34:11,0:19,2:17,14,1,2
chr16	84203612	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=102,92;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:6,8:3,1:4,5,3,6
chr16	84206065	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:84206065_T_C:84206065:0,0,0,1
chr16	84206067	.	GAT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:84206065_T_C:84206065:0,0,0,1
chr16	84208446	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=211,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr16	84209815	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.679:23:5,9:2,6:2,5,11,5
chr16	84211483	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=166,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:2,5,0,4
chr16	84214837	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:2,5,1,1
chr16	84215314	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=115,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.243:31:9,4:14,2:16,7,5,3
chr16	84217062	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr16	84224956	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=200,242;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:1,3,1,1
chr16	84256103	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,1,1
chr16	84256422	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,1:7,3:7,2,3,1
chr16	84328752	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:84328752_G_T:84328752:0,0,2,5
chr16	84328756	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:84328752_G_T:84328752:0,0,2,5
chr16	84351828	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:1,1,5,2
chr16	84357925	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr16	84358103	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.568:13:2,3:3,5:0,5,3,5
chr16	84358121	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,1,9
chr16	84358139	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr16	84455961	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,5,0
chr16	84456705	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr16	84459512	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr16	84472972	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=151,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:2,4:3,1,3,2
chr16	84473004	.	C	CTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=177,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,2:2,4:6,0,3,3
chr16	84473137	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,14:0,5:0,0,5,14
chr16	84473195	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr16	84473207	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=195,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:84473207_G_A:84473207:0,4,0,1
chr16	84473211	.	TCTA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=195,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:84473207_G_A:84473207:0,4,0,1
chr16	84474614	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=180,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:1,5,1,5
chr16	84474634	.	G	GGAGTGCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,259;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr16	84476022	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:0,1:2,0:2,0,1,1
chr16	84476200	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=168,108;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,6:2,7:3,3,6,7
chr16	84476224	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=108,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.467:17:3,5:6,2:4,5,2,6
chr16	84476297	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=147,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:84476297_G_C:84476297:0,1,0,2
chr16	84476301	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:84476297_G_C:84476297:0,0,0,2
chr16	84485749	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=219,258;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr16	84485775	.	G	GTCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=185,323;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:84485775_G_GTCT:84485775:0,2,0,1
chr16	84485780	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=185,323;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:84485775_G_GTCT:84485775:0,2,0,1
chr16	84485781	.	G	GGGCTGTAGGAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=185,323;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:84485775_G_GTCT:84485775:0,2,0,1
chr16	84485785	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=185,323;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:84485775_G_GTCT:84485775:0,2,0,1
chr16	84486867	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,15,12
chr16	84486903	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=127,183;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.381:35:8,8:13,5:14,8,8,5
chr16	84492683	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=103,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:2,1,3,0
chr16	84493032	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:2,2:4,1:0,6,1,3
chr16	84493080	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=195,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr16	84494168	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr16	84494450	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=166,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,0:3,3:0,4,1,2
chr16	84495509	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,5:1,2:2,3,2,5
chr16	84495761	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:0|1:84495761_G_C:84495761:0,4,3,3
chr16	84495770	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,5:0.500:10:3,3:2,2:1|0:84495761_G_C:84495761:2,3,0,5
chr16	84497186	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:5,4:3,4:9,0,7,1
chr16	84513463	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,9:0,0,17,1
chr16	84514341	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:1,6,1,5
chr16	84520173	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	84600595	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr16	84690467	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=225,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr16	84690506	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=163,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,0:4,2:10,3,2,0
chr16	84766970	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.597:35:6,13:7,7:12,2,17,4
chr16	84773795	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,8:0,0,16,0
chr16	84797631	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.274:26:11,1:5,5:15,4,5,2
chr16	84801758	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,5:1,6:5,0,11,0
chr16	84808900	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr16	84812671	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,3:0.049:79:41,2:34,1:36,40,2,1
chr16	84872051	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr16	84884327	.	GGGATGTGTTTGCT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=122,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:5,2:1,6,1,1
chr16	84902549	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=113,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:7,8:5,8:4,8,6,10
chr16	84906098	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:6,5:7,9:6,7,5,9
chr16	84906820	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr16	84907450	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr16	84907499	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:0,2:1,1,2,0
chr16	84907593	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:15,0:11,2:10,16,0,2
chr16	84907670	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr16	84911195	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=208,178;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr16	84911219	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=190,178;MMQ=42,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:84911219_G_A:84911219:0,2,0,1
chr16	84911227	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=229,178;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:84911219_G_A:84911219:0,1,0,1
chr16	84911230	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=229,178;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:84911219_G_A:84911219:0,1,0,1
chr16	84922859	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:4,0:4,4:7,2,3,1
chr16	85011480	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:4,5:6,3:9,2,8,0
chr16	85011622	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=115,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,27:0.491:55:15,16:13,11:13,15,8,19
chr16	85023855	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=49,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:2,0,4,0
chr16	85105554	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,4:8,5:0,15,0,10
chr16	85116312	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.730:16:2,6:1,3:0,4,0,12
chr16	85120364	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr16	85120609	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr16	85133872	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.493:16:4,1:4,6:2,6,2,6
chr16	85135968	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr16	85141571	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:85141571_G_A:85141571:3,1,0,1
chr16	85141573	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:85141571_G_A:85141571:3,1,0,1
chr16	85145816	.	T	TGCCCCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85145816_T_TGCCCCC:85145816:0,0,1,0
chr16	85145821	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85145816_T_TGCCCCC:85145816:0,0,1,0
chr16	85145823	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85145816_T_TGCCCCC:85145816:0,0,1,0
chr16	85145828	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:85145816_T_TGCCCCC:85145816:1,0,1,0
chr16	85145836	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=15,35;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:0,0:0|1:85145816_T_TGCCCCC:85145816:1,0,1,0
chr16	85682245	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=49,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:85682245_T_A:85682245:0,2,0,1
chr16	85682253	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:85682245_T_A:85682245:0,1,0,1
chr16	85691294	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	85699527	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=217,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,2:0,1:1,0,4,0
chr16	85704584	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.455:33:8,7:8,6:10,8,11,4
chr16	85712373	.	G	GTTAGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=212,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr16	85743732	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr16	85775175	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr16	85813231	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr16	85813526	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr16	85813963	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr16	85814899	.	T	TAGTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr16	85814995	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr16	85838503	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr16	85838532	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,14,5
chr16	85838804	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	85839543	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr16	86544151	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	86544210	.	ACGG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=211,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CGG;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,2:3,0:4,0,2,0
chr16	86575460	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr16	86575821	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=157,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:3,0:6,3:0|1:86575821_T_C:86575821:1,9,1,2
chr16	86575830	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=157,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:86575821_T_C:86575821:1,9,1,1
chr16	86575832	.	CGAGAATCAG	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=157,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:86575821_T_C:86575821:1,9,1,1
chr16	86575843	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=157,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,1:0|1:86575821_T_C:86575821:1,9,1,1
chr16	86585905	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr16	86588655	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	86603225	.	GAAA	G,GAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29,33;MFRL=202,172,161;MMQ=60,60,60;MPOS=13,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.80,18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,9:0.234,0.590:14:0,2,5:2,0,2:2,0,9,3
chr16	86614222	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:3,0:0,2:4,0,2,0
chr16	86615269	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.418:24:6,4:8,5:7,7,5,5
chr16	87376623	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr16	87376644	.	CCTCCCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=70,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr16	87377455	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr16	87435704	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=189,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:8,2:19,1:29,0,4,1
chr16	87435712	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=179,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:8,3:25,2:34,0,4,1
chr16	87436720	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=104.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,16:0,16:0,0,15,17
chr16	87436764	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=132.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,20:0,17:0,0,16,22
chr16	87449021	.	CTCTGAGAACAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:87449021_CTCTGAGAACAA_C:87449021:0,1,0,1
chr16	87449035	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=18,28;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:87449021_CTCTGAGAACAA_C:87449021:0,1,0,1
chr16	87449037	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:87449021_CTCTGAGAACAA_C:87449021:0,1,0,1
chr16	87451143	.	T	TTC	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,37;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:15,0:15,2:15,15,1,1
chr16	87452546	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr16	87452584	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr16	87452610	.	TGGAGAG	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=146,163;MMQ=46,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:87452610_TGGAGAG_T:87452610:0,4,0,1
chr16	87452618	.	AATG	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=196,150;MMQ=50,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:87452618_AATG_A:87452618:0,2,0,1
chr16	87452619	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=185,163;MMQ=50,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:87452610_TGGAGAG_T:87452610:0,2,0,1
chr16	87452624	.	G	GCCA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=228,150;MMQ=40,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:87452618_AATG_A:87452618:0,1,0,1
chr16	87457560	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr16	87677791	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr16	87730153	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=105,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	87742129	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	87748198	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,6,13
chr16	87764281	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,94;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,0:4,2:2,3,0,2
chr16	87782182	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr16	87788698	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr16	87788756	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,11:0,0,22,8
chr16	87870312	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	87871366	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr16	87871582	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	87872488	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr16	87874107	.	TATATG	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,13:0,0,9,18
chr16	87874182	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr16	88008712	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:3,2:8,7:11,1,9,3
chr16	88012150	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=215,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:2,2:1,4:4,0,5,1
chr16	88039895	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=215,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr16	88060989	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr16	88066655	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=158,166;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,18:0.396:46:14,7:9,9:0|1:88066655_A_G:88066655:25,3,16,2
chr16	88066659	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,163;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,18:0.388:47:17,7:12,11:0|1:88066655_A_G:88066655:26,3,16,2
chr16	88105648	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=188,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr16	88495786	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr16	88496474	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:13,0:11,2:7,18,1,1
chr16	88500340	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:1,5,1,3
chr16	88520188	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88520188_G_T:88520188:0,0,0,1
chr16	88520190	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88520188_G_T:88520188:0,0,0,1
chr16	88520192	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88520188_G_T:88520188:0,0,0,1
chr16	88599695	.	GGA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:88599695_GGA_G:88599695:0,0,2,2
chr16	88599700	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:88599695_GGA_G:88599695:0,0,3,2
chr16	88599702	.	CTGG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:88599695_GGA_G:88599695:0,0,3,2
chr16	88620148	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,2,1
chr16	88643457	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr16	88644005	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,20,7
chr16	88664758	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr16	88675529	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr16	88678038	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:0,1,0,9
chr16	88694303	.	AT	TC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,153;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:18,3:9,0:24,4,3,0
chr16	88695300	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,1,12
chr16	88695332	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:88695332_G_C:88695332:0,0,0,9
chr16	88695338	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:88695332_G_C:88695332:0,0,0,8
chr16	88697487	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,6:0,0,7,1
chr16	88705496	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,3,2
chr16	88710019	.	GCCCT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCCT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	88713473	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	88713501	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	88714559	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	88719877	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr16	88721012	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr16	88722752	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	88723824	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,0:2,2:5,0,2,0
chr16	88729573	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,2:7,3:0,9,0,5
chr16	88752693	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr16	88766168	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.284:14:4,1:6,1:4,6,0,4
chr16	88776297	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr16	88776499	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:7,1,3,4
chr16	88777995	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:7,6:5,4:10,2,10,1
chr16	88778133	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=160,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:4,6:6,4:2,8,4,6
chr16	88778167	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=105,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr16	88778192	.	CCGGT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr16	88778764	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=134,68;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:10,1:22,1:14,18,0,2
chr16	88778831	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:5,0:5,5:1,9,0,5
chr16	88779839	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	88780472	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr16	88780518	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr16	88780634	.	AGGTGTG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTGTG;STR;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr16	88780685	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr16	88780923	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr16	88781419	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr16	88783374	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr16	88783414	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:1,2:5,0:2,4,3,1
chr16	88783449	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,7,7
chr16	88786967	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr16	88788477	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr16	88789666	.	G	GCCTGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=194,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCTGCT;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr16	88792895	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,2:1,1:1,4,0,3
chr16	88793090	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,2:0,3:0|1:88793090_A_G:88793090:0,0,7,0
chr16	88793103	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:88793090_A_G:88793090:0,0,6,0
chr16	88800176	.	G	A,T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31,32;MFRL=197,179,214;MMQ=60,60,60;MPOS=27,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.19,5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.248,0.376:5:0,0,2:2,1,0:0,2,0,3
chr16	88800186	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=207,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0,4,0,1
chr16	88800372	.	GTCC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TCC;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,1:0,0:2,0,1,0
chr16	88800477	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=74,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,7:2,2:1,5,5,4
chr16	88872556	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	88904097	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,3:5,2:11,4,4,1
chr16	88909294	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:88909294_TGG_T:88909294:0,1,0,1
chr16	88909299	.	A	ACATTCTCTGCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:88909294_TGG_T:88909294:0,1,0,1
chr16	88927377	.	G	GAATGATCACAAGCACTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:88927377_G_GAATGATCACAAGCACTA:88927377:1,3,0,1
chr16	88927382	.	CA	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:88927377_G_GAATGATCACAAGCACTA:88927377:1,3,0,1
chr16	88930705	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=142,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,3:4,0:10,0,3,0
chr16	89167066	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr16	89167075	.	C	CCCCAGGAGGCTCCCGGGAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	89167094	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	89167792	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr16	89168911	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr16	89168935	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr16	89168981	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr16	89169205	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0|1:89169205_C_G:89169205:0,0,2,5
chr16	89169219	.	CCT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:89169205_C_G:89169205:0,0,0,6
chr16	89178457	.	G	GTGCCTGCTCATCTTCCCACCGAGTGCTTCCTTTCCTCCGCCGCCGTGGGTCTC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,0;MFRL=117,70;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.922:12:0,0:1,0:2,0,5,5
chr16	89180664	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr16	89180883	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,1:0,0,1,6
chr16	89180935	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,45;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr16	89187378	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr16	89254412	.	AGGGTGGGAGGGGAGGGT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=201,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr16	89257780	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,2:4,0:7,5,2,0
chr16	89260030	.	TGGGTGG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=116,17837793;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.610:3:1,2:0,0:0|1:89260030_TGGGTGG_T:89260030:0,1,1,1
chr16	89260036	.	G	GCCCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.692:1:0,1:0,0:1|0:89260030_TGGGTGG_T:89260030:0,0,0,1
chr16	89260042	.	GG	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,17837793;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:89260030_TGGGTGG_T:89260030:0,0,1,1
chr16	89261521	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=109,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89261521_T_C:89261521:0,1,0,1
chr16	89261524	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=109,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:89261521_T_C:89261521:0,1,0,1
chr16	89287613	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr16	89288418	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr16	89291945	.	A	AT	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=97,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=135.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,54:0.887:61:1,31:5,22:4,3,36,18
chr16	89291948	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=288.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,65:0.985:65:0,33:0,30:0|1:89291948_C_T:89291948:0,0,42,23
chr16	89291951	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=294.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,67:0.986:67:0,35:0,30:0|1:89291948_C_T:89291948:0,0,42,25
chr16	89293423	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=201,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:2,3,1,3
chr16	89294381	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,4,10
chr16	89345408	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,2:4,6:5,0,8,0
chr16	89349710	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=136,79;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:12,1:7,18,0,2
chr16	89351663	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,0:17,2:9,16,2,0
chr16	89357173	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:8,1:11,1:15,5,1,1
chr16	89371839	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,0:5,3:0,6,0,3
chr16	89577046	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=158,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,0:6,3:0,8,0,3
chr16	89590667	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.610:10:1,1:1,5:1,3,1,5
chr16	89597057	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:8,0,3,1
chr16	89597221	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=117,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:4,4:8,5:3,10,5,4
chr16	89598259	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=119,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:3,3:10,0:7,6,2,1
chr16	89629218	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr16	89645167	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,174;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.630:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr16	89645437	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr16	89650371	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr16	89653032	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr16	89653257	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=262,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr16	89653540	.	CCCT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:89653540_CCCT_C:89653540:0,1,0,2
chr16	89653545	.	AGTCCG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:89653540_CCCT_C:89653540:0,0,0,2
chr16	89653552	.	GGCCCCGCCCCGCC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:89653540_CCCT_C:89653540:0,0,0,2
chr16	89656251	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,3:1,6:3,1,7,3
chr16	89657499	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,0:3,0:3,6,0,3
chr16	89696993	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:89696993_G_A:89696993:0,3,0,1
chr16	89696994	.	G	GTGACCCTGCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:89696993_G_A:89696993:0,3,0,1
chr16	89696998	.	C	CTTGGTCTTGTAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.486:2:0,1:1,0:1|0:89696993_G_A:89696993:0,1,0,1
chr16	89696999	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:89696993_G_A:89696993:0,3,0,1
chr16	89703797	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:2,2,4,2
chr16	89720409	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,12:0,0,3,14
chr16	89724144	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,2:3,4:0,11,0,6
chr16	89724572	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr16	89735923	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr16	89758973	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr16	89759970	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=114,243;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89759970_G_A:89759970:0,1,0,1
chr16	89759971	.	G	GTAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=114,243;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89759970_G_A:89759970:0,1,0,1
chr16	89759975	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=114,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89759970_G_A:89759970:0,1,0,1
chr16	89759980	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89759970_G_A:89759970:0,0,0,1
chr16	89760552	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=78.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,14:0,0,15,9
chr16	89760712	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr16	89774396	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=127,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:9,5:1,2:2,8,1,6
chr16	89774411	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,4:0,0,2,12
chr16	89775422	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:4,2:1,3:1,4,1,5
chr16	89775429	.	C	CCCCG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=129,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCCG;STR;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr16	89778202	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:0|1:89778202_G_GC:89778202:6,0,3,0
chr16	89778219	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=14,21;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:0,0:0,3:0|1:89778202_G_GC:89778202:6,0,3,0
chr16	89778224	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr16	89779139	.	AGCT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=116,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCT;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr16	89782828	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=141,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:0|1:89782828_C_A:89782828:12,3,2,0
chr16	89782833	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=141,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,2:8,0:0|1:89782828_C_A:89782828:11,6,2,0
chr16	89782989	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,9,8
chr16	89795797	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:8,2:5,5:1,12,0,7
chr16	89795813	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,2:2,4:0,8,0,6
chr16	89800058	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr16	89800529	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=221,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr16	89804335	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:8,2:7,3:8,7,2,3
chr16	89805261	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=118,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:4,3,6,0
chr16	89805794	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:3,5:2,2:6,0,7,0
chr16	89806343	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:89806343_C_A:89806343:6,1,1,1
chr16	89806347	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:0|1:89806343_C_A:89806343:7,1,2,1
chr16	89807131	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:7,7:9,6:14,2,12,1
chr16	89809171	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=44,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.571:10:1,4:3,0:2,2,4,2
chr16	89809319	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=95,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,9:3,1:2,3,5,5
chr16	89813194	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:9,4:3,2:6,6,6,1
chr16	89815262	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=263,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:89815262_C_CT:89815262:0,1,0,1
chr16	89815264	.	AC	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=263,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89815262_C_CT:89815262:0,1,0,1
chr16	89816314	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=283,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:0,3,2,4
chr16	89816333	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:2,2:1,3:0,3,2,4
chr16	89816367	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr16	89816407	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr16	89818443	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr16	89828484	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,5:4,3:0,5,2,6
chr16	89831243	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=111,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chr16	89831520	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:0,5,1,6
chr16	89831558	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr16	89836507	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr16	89839637	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=207,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr16	89845110	.	AT	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr16	89845194	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,2,4
chr16	89845287	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:3,3:4,6:5,3,5,4
chr16	89849480	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=118,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,26:0.483:54:12,14:15,12:7,21,11,15
chr16	89858024	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,77136087;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr16	89858525	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:0,5,0,7
chr16	89859015	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:0,2:9,2:0,9,0,4
chr16	89859035	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr16	89862434	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=202,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:0,2,1,3
chr16	89869752	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr16	89874628	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,9:2,5:6,1,14,0
chr16	89877269	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:1,3,2,5
chr16	89920957	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:4,1,4,2
chr16	89921119	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:0,1:5,3:0|1:89921119_A_C:89921119:2,3,1,3
chr16	89921126	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:0,1:4,3:0|1:89921119_A_C:89921119:2,3,1,3
chr16	89921128	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:0,1:5,2:0|1:89921119_A_C:89921119:2,3,1,3
chr16	89921155	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr16	89922485	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.506:16:2,3:4,5:5,2,9,0
chr16	89927265	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=226,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr16	89930087	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=185,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:9,5:8,1:12,6,1,5
chr16	89950901	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,7:2,3:8,0,9,1
chr16	89961593	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:89961593_A_G:89961593:0,2,0,2
chr16	89961597	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,1:0,0:0|1:89961593_A_G:89961593:0,2,0,2
chr16	89967217	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr16	89970573	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:12,0:1,2:10,3,2,0
chr16	89972532	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=228,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr16	89985595	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=190,374;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,0,2
chr16	89999938	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:10,1:9,8,0,2
chr16	90002290	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=197,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:0,7,0,7
chr16	90020685	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=156,78;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:9,0:12,4:8,13,2,2
chr16	90021569	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr16	90021685	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:0,1,3,4
chr16	90025640	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr16	90030794	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr16	90038369	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,4:0,1:2,1,1,4
chr16	90038647	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:13,6:8,8:15,6,8,6
chr16	90075226	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=92,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,1:2,4:1,1,4,1
chr16	90076284	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:14,0,2,0
chr16	90076472	.	T	TG	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.077:42:28,0:11,3:8,31,0,3
chr16	90093969	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr16	90095561	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.437:34:6,8:10,3:11,8,5,10
chr16	90095949	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,3:6,9:4,6,10,2
chr16	90096067	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.395:33:9,7:10,5:0|1:90096067_G_A:90096067:11,9,8,5
chr16	90096080	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=155,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,3:0.117:32:14,1:14,2:1|0:90096067_G_A:90096067:14,15,2,1
chr16	90097979	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr16	90103659	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=108,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,21:0.462:46:12,13:11,8:16,9,14,7
chr16	90106746	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:1,1:10,3:9,2,1,3
chr16	90108832	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr16	90110279	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:5,2:1,5:0|1:90110279_C_T:90110279:2,4,3,4
chr16	90110289	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:0|1:90110279_C_T:90110279:2,3,2,4
chr16	90124871	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,138;MMQ=58,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:13,4:11,13:15,9,8,9
chr16	90129970	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:1,4:5,5:6,0,8,1
chr16	90133385	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=165,116;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:17,0:12,3:3,27,1,2
chr16	90133393	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=165,136;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:16,0:10,3:3,23,0,3
chr16	90133403	.	CC	TG	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,23;MFRL=163,175;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,0:8,1:1,22,0,2
chr16	90133404	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=169,138;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:14,0:4,4:1,17,0,4
chr16	90133412	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=169,158;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,0:5,2:1,19,0,2
chr16	90133434	.	ACA	GTG	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=183,158;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.304:13:6,2:3,1:0,9,0,4
chr16	90141285	.	CT	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=144,158;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.134:39:19,4:13,1:29,5,5,0
chr16	90141288	.	T	C,TA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,33,32;MFRL=132,172,142;MMQ=60,44,60;MPOS=-1073741811,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.17,31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,2,16:0.068,0.449:36:13,2,8:4,0,8:15,3,16,2
chr16	90141477	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr17	11830	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr17	13905	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=96,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:3,4,5,0
chr17	63783	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:63783_C_A:63783:1,3,0,1
chr17	63785	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:63783_C_A:63783:1,3,0,1
chr17	65351	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,10161847;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	65609	.	TG	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,17;MFRL=151,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr17	65632	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	69590	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	131458	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	131516	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,2,4
chr17	131709	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.617:19:4,4:3,7:2,5,0,12
chr17	170989	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=192,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr17	177357	.	G	GTTGGTAATTGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:177357_G_GTTGGTAATTGC:177357:1,3,0,1
chr17	177359	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr17	177361	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:177357_G_GTTGGTAATTGC:177357:1,3,0,1
chr17	260403	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,0:0,0:0,2,0,2
chr17	260423	.	C	CAGCAGGGCTGGAGAGGAGTAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=146,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr17	295585	.	TA	T,TAA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,31,29;MFRL=156,133,163;MMQ=60,60,60;MPOS=15,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=8.19,4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,7,4:0.181,0.123:37:18,3,3:8,4,0:26,0,10,1
chr17	423051	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=86,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:3,5:6,12:4,5,10,7
chr17	440410	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=119,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:8,10,0,2
chr17	440487	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr17	440497	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr17	463843	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr17	489432	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:8,3:7,0:15,1,3,0
chr17	504978	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.618:19:5,6:2,6:5,2,9,3
chr17	505162	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,7:0,0,3,11
chr17	531568	.	G	GAGTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	602469	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	617993	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.471:23:4,4:8,5:0,12,0,11
chr17	636266	.	A	AGGGCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=185,259;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGCC;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr17	636320	.	T	TCTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:3,0,10,0
chr17	641335	.	T	TTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:641335_T_TTTG:641335:0,0,2,1
chr17	641336	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:641335_T_TTTG:641335:0,0,2,1
chr17	643729	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:12,7:3,2:13,4,8,1
chr17	648797	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:6,3,2,0
chr17	673009	.	A	AGAGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=157,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:4,1:0|1:673009_A_AGAGG:673009:8,0,1,1
chr17	673011	.	A	AAAGTGAGTGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=157,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,0:4,2:0|1:673009_A_AGAGG:673009:8,0,1,1
chr17	674770	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:674770_G_C:674770:0,0,0,1
chr17	674773	.	T	TCTCCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:674770_G_C:674770:0,0,0,1
chr17	680299	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=181,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr17	686296	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.649:9:1,1:0,5:2,1,4,2
chr17	686589	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.696:18:3,6:1,3:1,4,5,8
chr17	686639	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=176,129;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:5,0:0,16,0,2
chr17	704201	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:0,2:3,4:3,0,2,6
chr17	706862	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=77,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr17	707071	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,19;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:707071_A_C:707071:1,2,0,1
chr17	707074	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,18;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:707071_A_C:707071:1,2,0,1
chr17	725727	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=117,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.472:15:7,2:1,5:2,6,1,6
chr17	909451	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:2,2:3,5:0,5,1,7
chr17	910636	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	914117	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=13,22;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.234:16:2,0:2,3:4,9,0,3
chr17	916446	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,2:3,8:0,6,1,9
chr17	916466	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:0,5,0,6
chr17	953480	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	953737	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=190,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr17	959416	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:959416_C_CAA:959416:0,0,0,1
chr17	959423	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:959416_C_CAA:959416:0,0,0,1
chr17	960178	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:1,2:2,3:4,0,4,1
chr17	960221	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,6:3,6:2,3,6,6
chr17	961149	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:1,3:2,4:2,1,6,1
chr17	961304	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,4:2,4:4,5,0,8
chr17	961394	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,228;MMQ=47,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	961900	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=165,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr17	961967	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=125,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:3,0:2,1:1,5,6,0
chr17	961973	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=107,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:4,1:3,2:2,7,3,0
chr17	961981	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=107,165;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:5,0:0|1:961981_T_G:961981:3,8,2,0
chr17	961983	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=29,14;MFRL=112,165;MMQ=60,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:5,0:0|1:961981_T_G:961981:2,8,2,0
chr17	962184	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr17	970251	.	TG	CA,CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32,33;MFRL=166,153,139;MMQ=60,60,60;MPOS=19,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.04,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,2:0.546,0.272:8:0,2,1:1,3,1:1,0,7,0
chr17	986898	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=117,134;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:5,0:1,0:0|1:986898_A_T:986898:4,2,0,2
chr17	986901	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,14;MFRL=117,134;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:4,0:0,0:0|1:986898_A_T:986898:4,2,0,2
chr17	986909	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,10;MFRL=126,134;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.352:6:4,0:0,0:0|1:986898_A_T:986898:3,1,0,2
chr17	986918	.	G	GGAAAGTAATACTTTTTAAGACA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=17,34;MFRL=192,76;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr17	1004061	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,0,4
chr17	1012376	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr17	1174477	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=189,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	1198931	.	C	CTAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=173,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:1198931_C_CTAGG:1198931:0,3,1,1
chr17	1198932	.	C	CCGCTATTAATGACATGTTGCAGCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=173,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:1198931_C_CTAGG:1198931:0,3,1,1
chr17	1264611	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.327:16:4,3:4,1:0,11,0,5
chr17	1265325	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,35:0.580:61:12,20:11,15:6,20,5,30
chr17	1370459	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	1370720	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	1371088	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:1371088_T_C:1371088:0,0,0,2
chr17	1371123	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:1371088_T_C:1371088:0,0,1,5
chr17	1371473	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr17	1371818	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr17	1371835	.	C	CTTGAGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	1372987	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	1374391	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:12,0:7,3:10,9,1,2
chr17	1377878	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:1377878_T_C:1377878:0,0,2,2
chr17	1377884	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:1377878_T_C:1377878:0,0,2,2
chr17	1380944	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:1380944_A_T:1380944:0,1,0,1
chr17	1380951	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1380944_A_T:1380944:0,1,0,1
chr17	1383033	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,1,1
chr17	1412455	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr17	1419853	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr17	1437594	.	CGAATA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	1456539	.	G	GTTCTCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1456539_G_GTTCTCT:1456539:0,0,0,1
chr17	1456540	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1456539_G_GTTCTCT:1456539:0,0,0,1
chr17	1461888	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.604:16:3,6:3,2:2,4,2,8
chr17	1480088	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	1493999	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	1494027	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	1519775	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	1530941	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=201,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,0:0,0:0|1:1530941_C_G:1530941:0,1,1,0
chr17	1530945	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=177,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:1530941_C_G:1530941:0,3,1,0
chr17	1530979	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,2:4,4:4,5,2,4
chr17	1549777	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:8,2:17,0:15,11,2,0
chr17	1549989	.	GTGAGAA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=261,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1549989_GTGAGAA_G:1549989:0,1,0,1
chr17	1549999	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=261,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1549989_GTGAGAA_G:1549989:0,1,0,1
chr17	1550106	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,3:6,4:12,0,7,0
chr17	1551057	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,0;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:1551057_A_AG:1551057:2,0,0,1
chr17	1551061	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=165,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:1551057_A_AG:1551057:2,0,0,1
chr17	1551065	.	TC	GA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=143,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:1551057_A_AG:1551057:3,0,0,1
chr17	1564815	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=208,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:2,2:1,4,2,0
chr17	1579471	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:2,2,2,0
chr17	1580075	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,223;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr17	1580088	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=256,189;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1580088_T_TG:1580088:0,1,0,1
chr17	1580089	.	A	AGGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=256,189;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1580088_T_TG:1580088:0,1,0,1
chr17	1582193	.	A	ATCCTCAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr17	1584377	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.266:17:7,3:6,1:2,11,0,4
chr17	1631340	.	TGAG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAG;STR;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.877:5:0,1:0,2:0,0,1,4
chr17	1635883	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.703:12:2,3:1,1:3,0,7,2
chr17	1637074	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,3:2,3:6,4,4,3
chr17	1639074	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:1,2:4,2:0,5,0,5
chr17	1640793	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:5,6:6,0:7,4,5,1
chr17	1649238	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:1,3:1,2,0,7
chr17	1649259	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr17	1649267	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	1675127	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	1675138	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	1675391	.	T	TTCTTCTTCTTC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.194:13:5,2:6,0:0|1:1675391_T_TTCTTCTTCTTC:1675391:2,9,0,2
chr17	1675395	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:6,0:0|1:1675391_T_TTCTTCTTCTTC:1675391:2,10,0,2
chr17	1675451	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	1678256	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr17	1679793	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr17	1679805	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr17	1684772	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr17	1686563	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.860:5:0,0:0,3:0,0,4,1
chr17	1687796	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr17	1690303	.	AAG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AG;STR;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	1703839	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:5,3,1,1
chr17	1704398	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,1:0,1:0,2,0,3
chr17	1707893	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.679:14:2,3:2,4:4,0,10,0
chr17	1715169	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1715169_T_C:1715169:0,0,1,0
chr17	1715171	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,36;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1715169_T_C:1715169:0,0,1,0
chr17	1715435	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr17	1731268	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,2:6,6:7,7,3,6
chr17	1748028	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,4:0,7:0,0,1,11
chr17	1748055	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=172,234;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr17	1756351	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr17	1780414	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr17	1783812	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:5,3,3,4
chr17	1791997	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=110,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,3:7,0:12,8,0,3
chr17	1792174	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.562:16:3,3:3,6:0,7,0,9
chr17	1839990	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.098:39:24,1:11,2:22,14,3,0
chr17	1933381	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=126.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,19:0,14:0,0,46,8
chr17	1937203	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=197,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr17	1942964	.	CCCGG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:8,2:7,0:11,4,1,1
chr17	1945041	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,15,7
chr17	1945201	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr17	1945460	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	1946497	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	1960974	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	1962779	.	C	CCTTCCTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:7,2:10,0:9,8,0,2
chr17	1964759	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=G;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	1968983	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr17	1985041	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:1985041_A_C:1985041:3,0,1,0
chr17	1985050	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:1985041_A_C:1985041:3,0,1,0
chr17	1989038	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.157:27:6,0:16,0:11,12,4,0
chr17	2090202	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=131,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:2090202_GCA_G:2090202:0,3,0,1
chr17	2090207	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=131,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:2090202_GCA_G:2090202:0,3,0,1
chr17	2090216	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,37;MFRL=65,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr17	2148111	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	2186222	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=181,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:2186222_A_T:2186222:0,7,0,2
chr17	2186224	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=181,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0|1:2186222_A_T:2186222:0,7,0,2
chr17	2195933	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr17	2196088	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr17	2196150	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,16:0,0,20,8
chr17	2227629	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:6,4:9,10:4,11,5,9
chr17	2232776	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=178,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:2232776_A_T:2232776:2,5,1,1
chr17	2232779	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=170,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:2232776_A_T:2232776:2,6,1,1
chr17	2232780	.	AGT	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=170,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:2232776_A_T:2232776:2,6,1,1
chr17	2232785	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=170,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:2232776_A_T:2232776:2,6,1,1
chr17	2266709	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	2268681	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr17	2270777	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr17	2276401	.	CTGA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGA;STR;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr17	2279621	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr17	2291032	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=215,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	2297571	.	G	GCACACACA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;RPA=13,17;RU=CA;STR;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.641:6:2,1:0,0:1,1,3,1
chr17	2310611	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:1,2:3,1:1,4,0,4
chr17	2318706	.	T	TTTCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2318706_T_TTTCC:2318706:0,0,0,1
chr17	2318708	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2318706_T_TTTCC:2318706:0,0,0,1
chr17	2318711	.	A	ACT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2318706_T_TTTCC:2318706:0,0,0,1
chr17	2323517	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=194,224;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:1,3,1,6
chr17	2323551	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:2323551_TC_T:2323551:2,2,0,1
chr17	2323553	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:2323551_TC_T:2323551:2,2,0,1
chr17	2573652	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:8,4:3,4:2,9,1,7
chr17	2585113	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.480:29:8,6:5,7:5,10,6,8
chr17	2595248	.	CCGCCACGCCCCCGCCCCGCCCCCGCCCCCGCCA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr17	2595291	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr17	2597259	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,28704132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:7,10,2,0
chr17	2597723	.	GCAGCGGGGACA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAGCGGGGACA;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.780:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	2598116	.	T	TGCCCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,14;MFRL=113,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.545:20:0,0:6,1:0|1:2598116_T_TGCCCCCCCCCCCCCCC:2598116:0,9,11,0
chr17	2598120	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=113,127;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:2,5:7,1:0|1:2598116_T_TGCCCCCCCCCCCCCCC:2598116:0,11,6,0
chr17	2598124	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=114,127;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:3,0:9,0:0|1:2598116_T_TGCCCCCCCCCCCCCCC:2598116:0,12,6,0
chr17	2598129	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=115,135;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:3,2:9,1:0|1:2598116_T_TGCCCCCCCCCCCCCCC:2598116:1,13,5,0
chr17	2598132	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=34,12;MFRL=122,135;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:5,0:10,1:0|1:2598116_T_TGCCCCCCCCCCCCCCC:2598116:3,13,5,0
chr17	2598136	.	CTG	C	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=115,127;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.198:23:8,2:10,0:0|1:2598116_T_TGCCCCCCCCCCCCCCC:2598116:3,16,4,0
chr17	2598627	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,17:0,0,7,20
chr17	2598639	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,7:0,13:0,0,7,17
chr17	2598864	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2598864_T_C:2598864:0,0,0,1
chr17	2598867	.	A	ACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2598864_T_C:2598864:0,0,0,1
chr17	2598872	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2598864_T_C:2598864:0,0,0,1
chr17	2599612	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	2604375	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	2605020	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:3,0:4,5,0,2
chr17	2606715	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,6,5
chr17	2607560	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr17	2651404	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	2699732	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.349:15:6,1:2,3:10,0,5,0
chr17	2699867	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=87,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.147:29:11,0:10,0:14,11,0,4
chr17	2699935	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,9:0,0,2,16
chr17	2703764	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=204,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr17	2866839	.	C	CAGGAAGAACAGCTGGAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	2867073	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	2898546	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=90,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.562:3:1,0:1,1:1,1,1,0
chr17	2901625	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,3:12,0:7,13,1,2
chr17	2908816	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=225,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:1,3,0,6
chr17	2909414	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=19,20;MFRL=185,151;MMQ=45,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=24,17;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0,2,0,1
chr17	2909428	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=198,125;MMQ=35,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:2909428_T_TA:2909428:0,2,0,1
chr17	2909432	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=138,245;MMQ=50,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:2909432_T_C:2909432:0,2,0,1
chr17	2909433	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=198,125;MMQ=35,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:2909428_T_TA:2909428:0,2,0,1
chr17	2909437	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=138,245;MMQ=50,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:2909432_T_C:2909432:0,2,0,1
chr17	2923767	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.492:49:9,13:15,10:14,11,15,9
chr17	2929286	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=89,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:8,8:9,8:13,4,10,6
chr17	2930438	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr17	2935591	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	2965945	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,184;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:3,1:0,5,1,3
chr17	2965978	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=177,189;MMQ=27,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:1,6:7,3:0,8,3,6
chr17	3030871	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:0|1:3030871_A_C:3030871:1,8,1,1
chr17	3030876	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=155,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,0:3,1:0|1:3030871_A_C:3030871:1,7,1,1
chr17	3119008	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr17	3182309	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.406:20:7,3:4,4:1,11,0,8
chr17	3194856	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=270,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr17	3195945	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=266,39;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,2,0
chr17	3336371	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,229;MMQ=57,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:23,3:15,0:18,20,0,3
chr17	3352179	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=137,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.101:66:30,5:30,0:43,17,6,0
chr17	3397588	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=115,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:8,2:19,0:15,15,1,1
chr17	3397593	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=130,51;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:11,2:20,0:16,15,1,1
chr17	3417123	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr17	3419690	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr17	3424183	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,17,2
chr17	3427442	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=190,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr17	3433543	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0|1:3433543_A_G:3433543:1,4,1,5
chr17	3433549	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0|1:3433543_A_G:3433543:1,4,1,5
chr17	3433588	.	G	GCTGTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:3433588_G_GCTGTT:3433588:0,3,0,1
chr17	3433590	.	T	TTAAAAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:3433588_G_GCTGTT:3433588:0,3,0,1
chr17	3433595	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,27;MFRL=150,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr17	3435935	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	3448066	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	3475367	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	3475405	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr17	3475564	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr17	3475601	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=233,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3475601_A_T:3475601:0,1,0,1
chr17	3475603	.	C	CATGAGGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=233,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3475601_A_T:3475601:0,1,0,1
chr17	3480396	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=192,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:4,3,6,1
chr17	3480447	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:2,1:5,4:3,5,2,3
chr17	3481111	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr17	3489249	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:1,5,1,6
chr17	3493533	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr17	3495391	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:8,1,5,1
chr17	3527281	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:2,1,6,0
chr17	3533412	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	3533697	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr17	3553655	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=226,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr17	3558417	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,5,5
chr17	3558695	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	3567461	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:3,1:0,2:4,0,3,1
chr17	3583109	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	3591822	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=203,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr17	3592740	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr17	3599112	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=34,35;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.618:9:1,3:2,3:0|1:3599112_G_GC:3599112:2,1,6,0
chr17	3599114	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=14,13;MFRL=156,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.618:9:0,0:1,1:0|1:3599112_G_GC:3599112:2,1,6,0
chr17	3599118	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=23,13;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.722:9:0,1:1,2:0|1:3599118_G_C:3599118:1,1,7,0
chr17	3599122	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=20,10;MFRL=78,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,0:0,0:0|1:3599122_T_G:3599122:1,1,8,0
chr17	3599128	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,13;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,0:1,1:0|1:3599118_G_C:3599118:3,1,6,0
chr17	3599134	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,0:2,3:0|1:3599122_T_G:3599122:3,1,7,0
chr17	3599136	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.359:9:2,0:2,2:0|1:3599112_G_GC:3599112:5,1,3,0
chr17	3618298	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	3620138	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	3627473	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	3628212	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr17	3629838	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=250,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3629838_C_T:3629838:0,3,0,1
chr17	3629840	.	AGCC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=250,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3629838_C_T:3629838:0,3,0,1
chr17	3629845	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=250,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3629838_C_T:3629838:0,3,0,1
chr17	3629847	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=250,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3629838_C_T:3629838:0,3,0,1
chr17	3629848	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=168,250;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1|0:3629838_C_T:3629838:0,1,0,3
chr17	3629867	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,359;MMQ=60,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	3631571	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3631571_C_T:3631571:0,4,0,1
chr17	3631573	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:3631573_G_C:3631573:0,3,0,2
chr17	3631576	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:3631573_G_C:3631573:0,3,0,2
chr17	3631580	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:3631571_C_T:3631571:0,4,0,1
chr17	3632952	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	3638037	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=115,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,2:1,3:2,0,5,0
chr17	3638344	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=144,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr17	3646977	.	C	CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=T;STR;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr17	3657159	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,10,5
chr17	3663628	.	A	AGCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=53,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr17	3664329	.	TTCC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr17	3665116	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr17	3665160	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr17	3717644	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=133,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:15,1:20,1:19,18,1,1
chr17	3717709	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,0:14,2:12,18,1,1
chr17	3719447	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:3,10:14,6:13,4,11,5
chr17	3719620	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr17	3721771	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:10,11,1,1
chr17	3721795	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:7,0:15,2:9,13,1,1
chr17	3728975	.	G	GTAACT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAACT;STR;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr17	3729598	.	CCTCAT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=263,251;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:1,0:0|1:3729598_CCTCAT_C:3729598:0,1,0,1
chr17	3729606	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=263,251;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3729598_CCTCAT_C:3729598:0,1,0,1
chr17	3786802	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr17	3787301	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3787301_G_T:3787301:0,1,0,1
chr17	3787302	.	AGCC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3787301_G_T:3787301:0,1,0,1
chr17	3787307	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3787301_G_T:3787301:0,1,0,1
chr17	3787593	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr17	3800995	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	3801080	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr17	3801232	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=106,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,1:6,1:1,10,4,0
chr17	3856615	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,5:3,7:7,3,7,5
chr17	3910125	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:5,1,3,0
chr17	3917890	.	G	GTTGGGAACGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	3922918	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:2,1,2,4
chr17	3923115	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr17	3926075	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,5:3,1,3,3
chr17	3935576	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:7,0:14,3:6,15,1,2
chr17	3961200	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr17	3961489	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,3:5,2:0,6,1,4
chr17	3962428	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:5,0,5,1
chr17	3962450	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,1:1,4:6,0,5,0
chr17	3966280	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	3976075	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,8:7,2:2,11,2,8
chr17	3978531	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.430:40:15,6:7,11:8,15,9,8
chr17	3980318	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=190,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr17	3981148	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,0:1,5:4,0,5,0
chr17	3981192	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=149,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:10,0:7,2:0|1:3981192_C_G:3981192:11,8,1,1
chr17	3981196	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:10,0:11,1:0|1:3981192_C_G:3981192:12,10,1,1
chr17	3985832	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr17	3985864	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=189,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr17	3989968	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,4:1,4:0,2,1,7
chr17	3991943	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr17	3994170	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=214,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr17	4005770	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr17	4007875	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr17	4012850	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr17	4027392	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	4045798	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:4045798_G_C:4045798:0,0,2,0
chr17	4045802	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:4045798_G_C:4045798:0,0,2,0
chr17	4045808	.	AT	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:4045798_G_C:4045798:0,0,2,0
chr17	4047389	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	4058168	.	CCTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=155,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:1,5,0,3
chr17	4071302	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	4074017	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:15,2:15,0:27,3,2,0
chr17	4083242	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr17	4084448	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr17	4098573	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.752:9:0,5:2,2:2,0,7,0
chr17	4100591	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	4109856	.	C	CCAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:4109856_C_CCAA:4109856:0,1,0,1
chr17	4109861	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:4109856_C_CCAA:4109856:0,2,0,1
chr17	4109863	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:4109856_C_CCAA:4109856:0,2,0,1
chr17	4109877	.	C	CTTACAGATGACTCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=37,35;MFRL=204,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr17	4120399	.	C	CCATCAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:5,2:8,0:3,10,1,1
chr17	4145774	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	4192777	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=243,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4192777_G_GA:4192777:0,1,0,1
chr17	4192781	.	CT	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=243,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4192777_G_GA:4192777:0,1,0,1
chr17	4192784	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=243,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4192777_G_GA:4192777:0,1,0,1
chr17	4192790	.	ACAGTACC	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=243,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4192777_G_GA:4192777:0,1,0,1
chr17	4192801	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=243,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4192777_G_GA:4192777:0,1,0,1
chr17	4199933	.	ATCTT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,2:5,2:8,0,4,0
chr17	4210235	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=172,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:8,1,1,1
chr17	4350182	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr17	4350367	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	4350373	.	GGT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	4351396	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	4351640	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,0,8
chr17	4416638	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=220,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr17	4416674	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=201,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr17	4436005	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,1:0,0,1,6
chr17	4437076	.	C	CTTAGATTATCAGTGTAGGAAGCAGCCCTGGCTCAAGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=127,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,1,1
chr17	4439282	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	4439313	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	4439487	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:4439487_G_T:4439487:0,0,1,0
chr17	4439497	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4439487_G_T:4439487:0,0,1,0
chr17	4439501	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4439487_G_T:4439487:0,0,1,0
chr17	4442640	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	4442783	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,2:1,0:4,2,0,2
chr17	4442978	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,14;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.349:9:3,0:1,1:3,3,0,3
chr17	4445265	.	G	GAAATCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=80,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	4448853	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:5,3:4,5:0|1:4448853_C_T:4448853:7,2,6,2
chr17	4448868	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:6,3:5,5:0|1:4448853_C_T:4448853:8,3,6,2
chr17	4457265	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=204,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.562:10:2,0:2,0:0,4,6,0
chr17	4458302	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:5,1:3,2:2,6,0,4
chr17	4458314	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=197,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,0:2,4:3,4,0,4
chr17	4495570	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr17	4497084	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,5,0
chr17	4498682	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr17	4534834	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=146,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr17	4535385	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=203,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,3,1
chr17	4535413	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=218,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,3,1
chr17	4544729	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr17	4544978	.	G	GAGA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=60.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,8:0,5:0,0,2,13
chr17	4575283	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	4578007	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr17	4578018	.	A	ACT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=152,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:4578018_A_ACT:4578018:0,2,0,1
chr17	4578019	.	G	GAGACCTCCTTCAAAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=152,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:4578018_A_ACT:4578018:0,2,0,1
chr17	4578023	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=96,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4578018_A_ACT:4578018:0,1,0,1
chr17	4579301	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=61,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:0,0:4,2:3,1,2,1
chr17	4579638	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=94,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:4,4,5,2
chr17	4580137	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,9:0,0,3,11
chr17	4580224	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr17	4586253	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=67.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,14:0,10:0,0,3,21
chr17	4594847	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	4621274	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=153,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr17	4622071	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,0:1,2:0|1:4622071_C_G:4622071:1,0,0,3
chr17	4622088	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4622071_C_G:4622071:1,0,0,1
chr17	4622551	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=203,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,0:1,3:2,0,2,1
chr17	4623456	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=56,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,2,2
chr17	4623876	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:4623876_C_CT:4623876:1,3,0,1
chr17	4623878	.	C	CCTCTGCTGCCTGCATTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:4623876_C_CT:4623876:1,3,0,1
chr17	4624360	.	G	GTGGAGATTGTAGAGAACTAGAGAACATGCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=89,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.322:5:2,0:0,1:1,3,0,1
chr17	4624364	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:4624364_G_GT:4624364:1,0,0,1
chr17	4624367	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4624364_G_GT:4624364:1,0,0,1
chr17	4624369	.	G	GTGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:4624364_G_GT:4624364:1,0,0,1
chr17	4624371	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4624364_G_GT:4624364:0,0,0,1
chr17	4638563	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.604:31:9,13:3,5:6,6,10,9
chr17	4641829	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:3,4,0,2
chr17	4642069	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr17	4642498	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.350:12:1,0:0,0:0|1:4642498_A_C:4642498:7,1,4,0
chr17	4642517	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.203:16:3,0:5,0:0|1:4642498_A_C:4642498:11,2,3,0
chr17	4642787	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	4644359	.	AG	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:22,3:18,0:0|1:4644359_AG_A:4644359:25,18,3,0
chr17	4644362	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:20,3:18,0:0|1:4644359_AG_A:4644359:25,18,3,0
chr17	4644488	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:5,2:11,0:0|1:4644488_C_T:4644488:1,15,0,2
chr17	4644491	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0|1:4644488_C_T:4644488:0,0,1,17
chr17	4644789	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,747;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	4646533	.	C	CAA,CAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34,34;MFRL=105,134,149;MMQ=60,60,40;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,15,16;RU=A;STR;TLOD=6.96,3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.352,0.215:11:0,0,0:5,4,2:3,2,6,0
chr17	4647258	.	A	ATTTTCACGATATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:2,0,0,1
chr17	4686340	.	TT	GG	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=176.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,20:0,19:0,0,18,22
chr17	4686463	.	A	ACGCCTACCTGGCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr17	4689194	.	AC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:9,4:7,4:13,5,8,1
chr17	4693342	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	4693508	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	4699947	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,17,3
chr17	4712314	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,1,2
chr17	4712757	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,5,5
chr17	4714021	.	G	GGAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAA;STR;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,3:0,0,7,2
chr17	4719297	.	C	CACCTTGAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=171,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:4719297_C_CACCTTGAA:4719297:0,4,0,1
chr17	4719299	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=171,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:4719297_C_CACCTTGAA:4719297:0,4,0,1
chr17	4719302	.	G	GCTGCAC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=171,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:4719297_C_CACCTTGAA:4719297:0,4,0,1
chr17	4719306	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=195,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:4719297_C_CACCTTGAA:4719297:0,4,0,1
chr17	4719308	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=195,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:4719297_C_CACCTTGAA:4719297:0,4,0,1
chr17	4721259	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:11,3,1,1
chr17	4721940	.	AT	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.348:10:3,3:1,0:0|1:4721940_AT_CA:4721940:2,5,3,0
chr17	4721945	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:3,0:0,0:0|1:4721940_AT_CA:4721940:1,4,2,0
chr17	4722299	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr17	4722948	.	G	GAAGGAGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	4725292	.	C	CTGCCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	4794490	.	C	CGT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.681:14:1,5:3,3:0|1:4794490_C_CGT:4794490:0,4,2,8
chr17	4794492	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,4:0.320:14:6,1:4,3:1|0:4794490_C_CGT:4794490:2,8,0,4
chr17	4794495	.	GCACACACA	GCA,G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33,33;MFRL=0,144,118;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,9,8;RU=CA;STR;TLOD=12.43,11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,9:0.380,0.570:15:0,2,5:0,4,4:0,0,2,13
chr17	4795619	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr17	4802847	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:11,2:11,2:7,16,2,2
chr17	4805881	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:26,3:20,0:30,18,3,0
chr17	4835852	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	4837952	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=281,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.925:11:1,5:0,5:0,1,5,5
chr17	4845768	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,11,10
chr17	4851487	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,11;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:4851487_G_GC:4851487:0,1,2,0
chr17	4851493	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:4851487_G_GC:4851487:2,1,2,0
chr17	4851497	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:1,0:0|1:4851487_G_GC:4851487:3,1,2,0
chr17	4851500	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,17;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,0:0|1:4851487_G_GC:4851487:4,1,2,0
chr17	4851504	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,0:2,0:0|1:4851487_G_GC:4851487:4,1,2,0
chr17	4857226	.	C	CAGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=208,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	4859161	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=197,185;MMQ=25,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:4859161_C_G:4859161:2,1,1,0
chr17	4859165	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=197,185;MMQ=25,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:2,0:0|1:4859161_C_G:4859161:2,1,1,0
chr17	4859489	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4859489_T_A:4859489:0,1,0,1
chr17	4859491	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4859489_T_A:4859489:0,1,0,1
chr17	4860182	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=35,37;MFRL=118,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:7,0:30,2:17,21,0,2
chr17	4872069	.	C	CTACT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:3,0:0|1:4872069_C_CTACT:4872069:6,5,1,1
chr17	4872073	.	G	GAGATTGAGGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:0|1:4872069_C_CTACT:4872069:6,6,1,1
chr17	4872534	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,1:1,5:2,2,2,4
chr17	4876316	.	G	GAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4876316_G_GAAA:4876316:0,0,0,1
chr17	4876318	.	A	AGGGACACCCTCATCAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4876316_G_GAAA:4876316:0,0,0,1
chr17	4877120	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr17	4881776	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,8:0,0,15,5
chr17	4882952	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr17	4883818	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr17	4885982	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	4886037	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,10,6
chr17	4891859	.	T	TAGCCTTTCCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr17	4893357	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr17	4906106	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=139,83;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,0:1,3:1,2,0,3
chr17	4906146	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=12,32;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,3:0,0:0,1,0,4
chr17	4906188	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:4906188_A_AT:4906188:1,3,0,1
chr17	4906192	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:4906188_A_AT:4906188:1,3,0,1
chr17	4906976	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:8,1:12,1:10,11,0,2
chr17	4927345	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=246,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4927345_C_T:4927345:0,1,1,0
chr17	4927356	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4927345_C_T:4927345:0,0,1,0
chr17	4937982	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr17	4996470	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.688:4:0,2:0,0:0,1,1,2
chr17	4996915	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr17	4999672	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr17	5013190	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,21;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,1:0,2,0,2
chr17	5013203	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,31;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:5013203_A_G:5013203:0,3,0,2
chr17	5013208	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:5013203_A_G:5013203:0,3,0,2
chr17	5013243	.	GAC	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,22;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5013243_GAC_G:5013243:0,0,0,1
chr17	5013246	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,22;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5013243_GAC_G:5013243:0,0,0,1
chr17	5013248	.	G	GTC	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,22;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5013243_GAC_G:5013243:0,0,0,1
chr17	5013253	.	CA	GG	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,22;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5013243_GAC_G:5013243:0,0,0,1
chr17	5013256	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,15;MFRL=0,140;MMQ=60,22;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:5013243_GAC_G:5013243:0,0,0,1
chr17	5013258	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,22;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5013243_GAC_G:5013243:0,0,0,1
chr17	5036191	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=140,125;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:15,4,3,0
chr17	5036205	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=139,127;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,8:0.272:31:10,3:12,2:0|1:5036205_A_C:5036205:17,6,5,3
chr17	5036210	.	TC	GT	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=139,125;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,9:0.278:34:11,7:12,2:0|1:5036205_A_C:5036205:17,8,6,3
chr17	5036214	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=139,125;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,9:0.272:35:12,7:11,2:0|1:5036205_A_C:5036205:16,10,6,3
chr17	5036224	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=139,105;MMQ=60,39;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,12:0.276:45:16,8:16,3:19,14,8,4
chr17	5036274	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,21:0.386:55:10,11:24,8:0|1:5036274_C_A:5036274:13,21,9,12
chr17	5036281	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=131,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,19:0.364:53:8,9:26,10:0|1:5036274_C_A:5036274:13,21,8,11
chr17	5036329	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=31,35;MFRL=148,164;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:4,3:16,3:4,16,0,6
chr17	5036714	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=157,121;MMQ=60,32;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:10,1:7,1:0|1:5036714_C_T:5036714:18,0,2,0
chr17	5036723	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=33,35;MFRL=147,120;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:15,1:11,2:0|1:5036714_C_T:5036714:28,0,3,0
chr17	5036728	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=33,32;MFRL=143,120;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:15,1:11,2:0|1:5036714_C_T:5036714:27,0,3,0
chr17	5036732	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=33,32;MFRL=140,120;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:14,1:13,1:0|1:5036714_C_T:5036714:26,1,3,0
chr17	5036740	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=34,36;MFRL=142,108;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:15,1:12,3:0|1:5036714_C_T:5036714:26,2,4,0
chr17	5036748	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=13;MBQ=28,26;MFRL=137,108;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.134:36:19,1:13,3:0|1:5036714_C_T:5036714:27,5,4,0
chr17	5036834	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=140,145;MMQ=44,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,6:0.140:45:19,3:17,3:0|1:5036834_G_A:5036834:13,26,5,1
chr17	5036838	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=13;MBQ=33,29;MFRL=142,139;MMQ=42,45;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,8:0.180:46:19,3:17,2:0|1:5036834_G_A:5036834:13,25,5,3
chr17	5036843	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=142,139;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:14,2:12,1:0|1:5036834_G_A:5036834:10,22,1,2
chr17	5036849	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=83.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,5,21
chr17	5036864	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=35,32;MFRL=142,148;MMQ=40,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:11,2:9,2:1,19,0,4
chr17	5036923	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=13;MBQ=33,29;MFRL=167,157;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:0,9,0,5
chr17	5036943	.	GGGA	G	.	.	DP=1;ECNT=13;MBQ=0,13;MFRL=0,168;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr17	5038559	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=111,75;MMQ=60,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,1:13,1:0|1:5038559_C_A:5038559:9,17,1,1
chr17	5038569	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=109,75;MMQ=60,23;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,1:11,1:0|1:5038559_C_A:5038559:8,19,1,1
chr17	5038576	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=99,75;MMQ=60,23;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,1:10,1:0|1:5038559_C_A:5038559:8,16,1,1
chr17	5038679	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=129,149;MMQ=30,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5038679_G_A:5038679:0,1,0,1
chr17	5038687	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=129,149;MMQ=30,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5038679_G_A:5038679:0,1,0,1
chr17	5038689	.	G	GCTCCCAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=129,149;MMQ=30,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5038679_G_A:5038679:0,1,0,1
chr17	5042977	.	T	TTAAGAACATGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=163,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	5042991	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5042991_C_G:5042991:0,0,0,1
chr17	5042996	.	C	CTGAGAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5042991_C_G:5042991:0,0,0,1
chr17	5044640	.	TA	T,AA,TAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32,33,32;MFRL=160,155,157,170;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,20,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=5.58,3.84,5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:25,4,2,5:0.117,0.070,0.137:36:12,0,1,3:13,4,1,2:25,0,10,1
chr17	5045630	.	T	TTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=47.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr17	5048207	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=130.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,20:0,0,8,30
chr17	5066305	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,17:0,0,5,25
chr17	5073730	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr17	5087602	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	5126674	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0|1:5126674_A_G:5126674:0,0,9,7
chr17	5126689	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,10:0,6:0|1:5126674_A_G:5126674:0,0,9,8
chr17	5268356	.	TAA	T,TA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=126,168,155;MMQ=60,60,60;MPOS=9,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=11.87,47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,7,21:0.235,0.704:30:1,2,12:1,5,9:2,0,25,3
chr17	5317543	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=209,156;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5317543_T_C:5317543:0,1,0,1
chr17	5317546	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=209,156;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5317543_T_C:5317543:0,1,0,1
chr17	5317549	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=209,156;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5317543_T_C:5317543:0,1,0,1
chr17	5329340	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,2,0
chr17	5353552	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,20965007;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:16,0:13,2:0|1:5353552_G_A:5353552:11,18,1,1
chr17	5353576	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:11,0:14,2:0|1:5353552_G_A:5353552:11,18,1,2
chr17	5353796	.	ATTGCTT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0|1:5353796_ATTGCTT_A:5353796:0,1,0,1
chr17	5353805	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5353796_ATTGCTT_A:5353796:0,0,0,1
chr17	5353811	.	TC	AA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5353796_ATTGCTT_A:5353796:0,0,0,1
chr17	5357309	.	A	ACTAACACCTTACACTAAGATTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=124,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	5357342	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=37,35;MFRL=192,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:5357342_C_CCT:5357342:0,2,0,1
chr17	5357343	.	A	AGGCTGTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=192,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:5357342_C_CCT:5357342:0,2,0,1
chr17	5357345	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=192,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:5357342_C_CCT:5357342:0,2,0,1
chr17	5357348	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,29;MFRL=192,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0|1:5357342_C_CCT:5357342:0,2,0,1
chr17	5421005	.	TC	AA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,18,0
chr17	5424129	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	5424376	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr17	5425076	.	AT	GC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.348:15:5,2:3,2:6,4,2,3
chr17	5425077	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,8,7
chr17	5984019	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.337:27:10,5:8,3:9,9,7,2
chr17	6014319	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=57,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6014319_G_T:6014319:0,2,0,1
chr17	6014321	.	C	CCATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=57,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6014319_G_T:6014319:0,2,0,1
chr17	6330109	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr17	6330153	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:3,3,4,0
chr17	6331803	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=130,174;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,1:3,2:2,2,1,3
chr17	6331836	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr17	6350727	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:0,5:6,3:4,2,6,2
chr17	6367672	.	AGGCTGAGGGGCTACAGGCTTGGCAGAGGGGCTGGGCGGGGGAACTCTG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	6371709	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=134,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:6371709_GC_TT:6371709:0,4,0,1
chr17	6371718	.	C	CTCCCCATCCTACTCCCATTGAGAACCA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=134,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr17	6371723	.	GT	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=63,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6371709_GC_TT:6371709:0,2,0,1
chr17	6373737	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.608:24:5,10:4,2:3,6,6,9
chr17	6377668	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=210,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr17	6381939	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,1,1
chr17	6387482	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr17	6483046	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr17	6493056	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	6493422	.	TGATTTC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	6515441	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:4,15,0,2
chr17	6515454	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,6:2,5:0,3,2,9
chr17	6524358	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=218,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr17	6531910	.	TC	GA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:18,2:8,0:11,16,2,0
chr17	6545702	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,31:0.516:60:9,11:20,20:2,27,6,25
chr17	6553410	.	TA	T,TAA	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,33,33;MFRL=155,158,158;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=7.04,7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,6,6:0.125,0.127:48:12,2,0:21,4,6:3,33,4,8
chr17	6553583	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,5:7,2:10,0,6,1
chr17	6555546	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr17	6590974	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,336;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:5,13,1,1
chr17	6596524	.	A	AGCCACTCCATCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	6599288	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,1:2,4:1,5,0,5
chr17	6607418	.	C	CATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	6616669	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr17	6659324	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:2,1,2,0
chr17	6661584	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:1,5:5,3:1,6,1,7
chr17	6662948	.	G	GGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=167,101;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=GT;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:2,0:5,0,2,0
chr17	6663063	.	T	TCCTCTCCTTTTCTCAGGTTGGTC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=110,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:6,2:11,0:3,17,0,2
chr17	6663666	.	C	CAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=156,130;MMQ=50,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=21,23;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:2,1:1,1:3,0,2,5
chr17	6703985	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=200,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr17	6704071	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,2:7,1:11,2,2,1
chr17	6704121	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,4:6,9:8,5,4,9
chr17	6716385	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	6718429	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:4,1,4,0
chr17	6719125	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	6899559	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr17	6899629	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr17	6900076	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr17	6900362	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:6900362_C_T:6900362:0,0,0,2
chr17	6900383	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6900362_C_T:6900362:0,0,0,1
chr17	6901925	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,14;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.123:31:10,0:14,0:0|1:6901925_T_A:6901925:5,22,4,0
chr17	6901930	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=33,14;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.123:31:10,0:15,0:0|1:6901925_T_A:6901925:5,22,4,0
chr17	6901933	.	A	AAC	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=29,23;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,1:16,0:0|1:6901925_T_A:6901925:5,21,2,0
chr17	6901938	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.108:26:9,2:13,0:0|1:6901925_T_A:6901925:3,21,2,0
chr17	6901941	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,1:12,0:0|1:6901925_T_A:6901925:2,20,2,0
chr17	6901944	.	ACT	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=27,13;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:10,0:0|1:6901925_T_A:6901925:1,18,2,0
chr17	6902179	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=105.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.940:31:1,14:0,16:1,0,11,19
chr17	6904934	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=114,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.543:32:5,10:6,7:9,6,10,7
chr17	6905920	.	AACAC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:6905920_AACAC_A:6905920:0,1,0,2
chr17	6905926	.	GCA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:6905920_AACAC_A:6905920:0,1,0,2
chr17	6905929	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:6905920_AACAC_A:6905920:0,0,0,2
chr17	6905931	.	T	TGAAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:6905920_AACAC_A:6905920:0,0,0,2
chr17	6905935	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=236,165;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6905920_AACAC_A:6905920:0,1,0,1
chr17	6909378	.	CC	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,2,1
chr17	6915401	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:1,2:2,2:4,0,4,0
chr17	6917703	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr17	6920888	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:1,1,4,1
chr17	6921028	.	G	GTGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	6921229	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,4:6,3:5,7,3,4
chr17	6927216	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=161,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	6927350	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,6:0,0,17,1
chr17	6928019	.	C	CCAG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CAG;STR;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.846:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr17	6945516	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6945516_C_T:6945516:0,0,0,1
chr17	6945519	.	G	GTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6945516_C_T:6945516:0,0,0,1
chr17	6946559	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr17	7010222	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,164;MMQ=49,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr17	7011064	.	GCACACTACACACACCGCACACGTA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACACTACACACACCGCACACGTA;STR;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.826:8:1,5:0,2:1,0,4,3
chr17	7096751	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,10;MFRL=134,138;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:7096751_T_G:7096751:4,0,1,0
chr17	7096753	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=14,20;MFRL=130,164;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,0:1,1:3,0,2,0
chr17	7096757	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=15,13;MFRL=134,138;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:7096751_T_G:7096751:4,0,1,0
chr17	7096763	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=130,138;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.253:6:0,0:5,0:0|1:7096751_T_G:7096751:5,0,1,0
chr17	7111624	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,3:2,1:0,6,0,4
chr17	7121785	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,15,0
chr17	7123240	.	T	TGGGCGTGCAGGACGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCGTGCAGGACGC;STR;TLOD=55.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,6:0,0,11,2
chr17	7124210	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:8,2:10,0:8,10,0,2
chr17	7125439	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:7,3:7,0:15,1,2,1
chr17	7127734	.	A	ACAGAACCAGGAAAGGGTCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr17	7129840	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,11:0,0,6,12
chr17	7129965	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=240,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7129965_A_T:7129965:0,2,0,1
chr17	7129970	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=240,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:7129965_A_T:7129965:0,2,0,1
chr17	7129974	.	AGA	GGA,GTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29,32;MFRL=0,240,212;MMQ=60,60,60;MPOS=12,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.13,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,1,0:0,1,1:0,0,0,3
chr17	7131259	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.139:28:9,0:12,1:7,17,4,0
chr17	7132192	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr17	7133307	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7133307_A_T:7133307:2,1,0,1
chr17	7133312	.	A	AGCGCACCCAGCCCCGTCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.276:6:1,0:2,1:0|1:7133307_A_T:7133307:4,1,0,1
chr17	7142453	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,11;MFRL=122,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.470:10:1,1:2,0:3,2,5,0
chr17	7142465	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=122,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:2,0:3,4,2,0
chr17	7145492	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,1:2,4:6,1,5,0
chr17	7150552	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=73,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,27:0.906:29:2,15:0,12:1,1,18,9
chr17	7156186	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=162.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,19:0,25:0,0,19,25
chr17	7158203	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr17	7160390	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	7165395	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr17	7187123	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr17	7192198	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=340,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=152.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,46:0.945:48:0,27:2,17:1,1,17,29
chr17	7193037	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=173,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:0,10,0,2
chr17	7193055	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr17	7193060	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.907:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr17	7193096	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7193096_G_C:7193096:0,4,0,1
chr17	7193099	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:7193096_G_C:7193096:0,4,0,1
chr17	7193102	.	C	CGAAA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7193096_G_C:7193096:0,4,0,1
chr17	7193255	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr17	7193448	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr17	7193599	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,1:13,1:12,12,0,2
chr17	7213172	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,1:13,1:1,22,0,2
chr17	7217944	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:10,6:2,4:1,11,1,9
chr17	7225425	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,343;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	7228456	.	AC	CG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=15,13;MFRL=245,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.474:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr17	7228465	.	CC	GG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=161,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.336:4:1,0:0,0:1,2,1,0
chr17	7228468	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,10;MFRL=162,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.406:3:1,0:0,0:0,2,1,0
chr17	7228469	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=18,32;MFRL=245,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,2:0,0:1,0,0,2
chr17	7230870	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=199,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:7230870_G_C:7230870:2,1,0,1
chr17	7230872	.	AG	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=199,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:7230870_G_C:7230870:2,1,0,1
chr17	7245845	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,2:2,0:0,8,0,2
chr17	7245863	.	TTG	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=169,156;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,0:0|1:7245863_TTG_T:7245863:0,5,0,2
chr17	7245867	.	TT	AC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=169,156;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:0,0:0|1:7245863_TTG_T:7245863:0,5,0,2
chr17	7245889	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=225,36;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr17	7246940	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:5,1:7,3:9,4,2,3
chr17	7249870	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=107,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.691:7:2,2:0,3:0|1:7249870_G_T:7249870:1,1,0,5
chr17	7249878	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:7249870_G_T:7249870:0,4,0,1
chr17	7250270	.	C	CCGGGACGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=188,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	7250612	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=165,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr17	7250653	.	C	CCAATAAAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:7250653_C_CCAATAAAG:7250653:0,4,0,1
chr17	7250656	.	G	GCATC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:7250653_C_CCAATAAAG:7250653:0,3,0,1
chr17	7251605	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=241,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:2,2:2,2,5,0
chr17	7256910	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:9,0:1,2:2,8,1,1
chr17	7257847	.	G	GGTGTGT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=76,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=GT;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.437:7:1,1:3,2:3,1,3,0
chr17	7258481	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,2:3,3:4,1,5,0
chr17	7259205	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,5:2,9:2,2,8,6
chr17	7286387	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=170,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,2:9,1:7,11,1,2
chr17	7290530	.	GAGCTTCTC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr17	7290533	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr17	7290787	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr17	7290821	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	7291658	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr17	7291669	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr17	7291696	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=154,95;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:4,2:6,0:8,3,1,1
chr17	7296334	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:7296334_A_G:7296334:1,7,0,2
chr17	7296336	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:7296334_A_G:7296334:1,7,0,2
chr17	7296338	.	G	GTCTGTCT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:7296334_A_G:7296334:1,7,0,2
chr17	7296340	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:3,0:0|1:7296334_A_G:7296334:1,7,0,2
chr17	7306727	.	A	G	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=83.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,31:0.474:65:18,10:16,19:8,26,9,22
chr17	7307074	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr17	7307287	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=101.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,35:0.504:69:13,18:21,14:23,11,24,11
chr17	7315363	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	7317647	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.837:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr17	7324107	.	A	AGCCTTACC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=217,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr17	7345819	.	A	AGGTAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr17	7346280	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7346280_T_A:7346280:0,0,0,1
chr17	7346282	.	GGGT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7346280_T_A:7346280:0,0,0,1
chr17	7346302	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr17	7358803	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,2:0,12:0,0,3,11
chr17	7358861	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=190,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:1,3,0,3
chr17	7365609	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=204,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr17	7369784	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:2,1:0|1:7369784_G_A:7369784:2,1,0,1
chr17	7369791	.	GGAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=158,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:7369784_G_A:7369784:2,1,0,1
chr17	7386279	.	TG	CA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=151,142;MMQ=60,53;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=174.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.970:41:0,13:0,26:1,0,23,17
chr17	7400041	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,5:0,1:0,0,3,5
chr17	7401572	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,3:5,2:1,5,0,5
chr17	7402556	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,4,12
chr17	7403942	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr17	7404209	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,7:0,8:0,0,4,11
chr17	7404991	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0,0,6,14
chr17	7405074	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	7406343	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	7411475	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=160,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr17	7411514	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:18,1,2,0
chr17	7411855	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr17	7412212	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	7412450	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:6,11,1,1
chr17	7412965	.	T	TAGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr17	7413038	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,1,6
chr17	7414958	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=215,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr17	7416683	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=178,115;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,44:0.958:45:1,21:0,14:0,1,32,12
chr17	7417086	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,14:0,13:0,0,25,17
chr17	7417349	.	GTACTCGCCCACCAGCCCCACCTACTCGCCCACCTCCCCCAAAGGCTCAACCTACTCTCCCACTTCCCCTGGT	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=112,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,20:0.142:68:9,5:2,7:15,33,10,10
chr17	7417551	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr17	7452752	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=92,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,2:5,3:5,7,3,2
chr17	7460559	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,9:0,0:0,0,9,1
chr17	7468216	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=213,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr17	7470285	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=54.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,10:0,0,9,10
chr17	7470322	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,1:11,1:12,10,1,1
chr17	7474237	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=151,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:13,1:15,1:8,20,0,2
chr17	7474277	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,4,20
chr17	7474287	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=168,72;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:9,0:12,2:0|1:7474287_A_G:7474287:2,19,1,1
chr17	7474290	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=168,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:12,2:0|1:7474287_A_G:7474287:2,20,1,1
chr17	7474297	.	G	GGGAGCAGGGTTCT	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=173,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:13,1:0|1:7474287_A_G:7474287:2,18,1,1
chr17	7477456	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=172,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:8,0,1,1
chr17	7477477	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:7,0,5,0
chr17	7483915	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=152,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.434:35:7,3:12,12:12,8,8,7
chr17	7487108	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:5,0,4,1
chr17	7496351	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.425:12:3,2:1,0:4,3,0,5
chr17	7554804	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,19;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:0,1:1,0:0|1:7554804_G_C:7554804:1,1,2,0
chr17	7554809	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.309:7:0,1:1,0:0|1:7554804_G_C:7554804:4,1,2,0
chr17	7559037	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,2,2
chr17	7577678	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=228,202;MMQ=51,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,1:0,2,0,3
chr17	7578115	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	7578645	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	7579643	.	CCCCCAGCCCTCCAGGT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=120,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCAGCCCTCCAGGT;STR;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.450:9:2,2:1,2:1,4,1,3
chr17	7579801	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:6,0,6,1
chr17	7592542	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,0:14,3:12,14,0,3
chr17	7611473	.	C	CTTTCATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=331,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	7623261	.	G	GATGCGAATTGATTGTTAAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	7646166	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr17	7664239	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:1,7:4,4:1,4,5,6
chr17	7671664	.	C	CACACAGATGTAACCATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7671664_C_CACACAGATGTAACCATT:7671664:0,2,0,1
chr17	7671668	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:7671664_C_CACACAGATGTAACCATT:7671664:0,2,0,1
chr17	7679522	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=151,213;MMQ=60,32;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr17	7679550	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=188,234;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr17	7679552	.	G	GATAAAAAGATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=188,234;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr17	7680233	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=107,99;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.176:20:5,0:11,3:4,13,2,1
chr17	7690417	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0|1:7690417_G_GT:7690417:0,0,0,1
chr17	7690419	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7690417_G_GT:7690417:0,0,0,1
chr17	7690422	.	G	GCTCCAAGGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=282,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:7690417_G_GT:7690417:0,1,0,1
chr17	7690426	.	AGC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=226,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:7690417_G_GT:7690417:0,2,0,1
chr17	7691628	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0|1:7691628_T_C:7691628:0,2,0,3
chr17	7691629	.	G	GCAGTTGCTGAGACCCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:7691628_T_C:7691628:0,4,0,1
chr17	7695427	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,2:1,5:0,8,3,4
chr17	7700712	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=94,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,2:6,6:7,3,6,3
chr17	7705089	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:0,4,0,4
chr17	7710987	.	C	CACCCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7710987_C_CACCCAA:7710987:0,0,0,1
chr17	7710989	.	A	ACCCAACCTGCCATC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7710987_C_CACCCAA:7710987:0,0,0,1
chr17	7721030	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=228,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:3,1,5,0
chr17	7721231	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr17	7726665	.	C	CAGAG,CAGAGAGAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,156,124;MMQ=60,60,60;MPOS=18,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,14,16;RU=AG;STR;TLOD=15.11,5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.576,0.332:6:0,4,1:0,0,0:0,0,6,0
chr17	7726983	.	TT	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,0:0,1:0|1:7726983_TT_AC:7726983:0,1,0,1
chr17	7726989	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7726989_C_T:7726989:0,1,0,1
chr17	7726990	.	C	CCTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7726983_TT_AC:7726983:0,1,0,1
chr17	7726991	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7726989_C_T:7726989:0,1,0,1
chr17	7726992	.	T	TGTGCCTGCTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7726983_TT_AC:7726983:0,1,0,1
chr17	7727785	.	C	CTTCTACTTGTCTCTTTTCTGGACCAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=312,238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr17	7733555	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	7733674	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:14,2:15,0:22,9,1,1
chr17	7733833	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:1,7,4,4
chr17	7755714	.	GCTGGGGCTTGGAGAGCCGCCAGCAGTGAGGGAAGGGGCTTGGGCCTAGGTGT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.550:27:2,5:4,9:10,3,10,4
chr17	7756030	.	CCA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=206,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr17	7760638	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=147,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.122:48:11,0:13,2:27,16,5,0
chr17	7788343	.	C	CCCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CCG;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	7788409	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	7793193	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=15,21;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:0,0:0|1:7793193_G_C:7793193:0,4,0,1
chr17	7793195	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:7793193_G_C:7793193:0,4,0,1
chr17	7794202	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=207,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:5,3,7,0
chr17	7800540	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:6,12,0,2
chr17	7803118	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:8,0:12,0,2,0
chr17	7803552	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:5,1,4,0
chr17	7810596	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,2,5
chr17	7811876	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=219,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,2:0,1:1,1,2,1
chr17	7811998	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,14:0,15:0,0,26,5
chr17	7814099	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,4:2,5:4,0,8,1
chr17	7827186	.	TCAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAC;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr17	7830610	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr17	7832766	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.680:13:3,7:0,2:4,0,4,5
chr17	7838386	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:15,1:9,1:6,19,1,1
chr17	7846684	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:8,8:3,6:8,3,12,2
chr17	7847837	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:2,2,1,5
chr17	7847955	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=127,124;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,2:3,4:4,4,5,1
chr17	7851659	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,312;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,2:13,0:8,13,0,2
chr17	7852528	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=195,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,1,1
chr17	7852927	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	7912802	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,3:3,0:6,1,3,0
chr17	7918103	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=162,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:8,1,2,0
chr17	7918119	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,5:5,1,7,0
chr17	7918146	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:6,1,6,0
chr17	7919473	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=18,20;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.426:10:0,0:2,2:0|1:7919473_A_C:7919473:3,3,4,0
chr17	7919478	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.217:15:3,0:8,1:0|1:7919473_A_C:7919473:7,5,3,0
chr17	7919480	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.217:15:1,1:7,0:0|1:7919473_A_C:7919473:7,5,3,0
chr17	7942434	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,3:1,0:3,0,3,0
chr17	7946067	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=35,16;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.606:11:2,0:1,0:0|1:7946067_C_G:7946067:0,4,7,0
chr17	7946071	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=110,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.573:10:2,0:2,4:0|1:7946067_C_G:7946067:0,4,6,0
chr17	7946073	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.487:12:2,0:2,0:0|1:7946067_C_G:7946067:2,4,6,0
chr17	7946078	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.365:11:3,0:3,0:0|1:7946067_C_G:7946067:2,5,4,0
chr17	7946083	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=137,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.290:11:3,0:4,0:0|1:7946067_C_G:7946067:2,6,3,0
chr17	7950791	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=220,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0,2,1,0
chr17	7951777	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=169,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:0|1:7951777_G_A:7951777:9,3,0,2
chr17	7951779	.	C	CAT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=169,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:7951777_G_A:7951777:9,3,0,2
chr17	7951819	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,7:5,2:3,6,5,4
chr17	7977105	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,3,17
chr17	7979463	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr17	8007615	.	AGGG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=196,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:8007615_AGGG_A:8007615:0,2,0,1
chr17	8007622	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=196,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:8007615_AGGG_A:8007615:0,2,0,1
chr17	8007632	.	GT	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=224,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr17	8025620	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:8025620_T_TG:8025620:0,0,2,0
chr17	8025627	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=122,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:8025620_T_TG:8025620:3,0,1,0
chr17	8027270	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	8027318	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,5:0,2:2,0,6,1
chr17	8046772	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,17:0.290:59:19,12:22,5:16,26,13,4
chr17	8048283	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:3,6,0,2
chr17	8050737	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=67,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,6:5,3:0,7,3,6
chr17	8052531	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=111,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr17	8064083	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=178,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:4,3:9,3:11,2,6,0
chr17	8064967	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:22,2:10,0:16,17,0,2
chr17	8079029	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,3:6,3,6,3
chr17	8108490	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:1,1,0,1
chr17	8110764	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:5,3,0,3
chr17	8137737	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.423:22:3,3:5,6:7,6,6,3
chr17	8137894	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=146,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:9,2:21,2:7,23,2,2
chr17	8139327	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,13,8
chr17	8141707	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=87.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,16:0,9:0,0,18,7
chr17	8151426	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,23;MFRL=242,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.522:4:0,0:0,1:0,2,0,2
chr17	8157310	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:5,5:1,3:4,3,3,5
chr17	8158273	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=104,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:2,2:1,2:2,1,5,0
chr17	8159232	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:2,6:6,6:2,6,0,13
chr17	8161149	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,2:4,8:6,2,6,4
chr17	8166378	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:1,2:9,8:1,9,1,9
chr17	8168805	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.531:13:3,0:3,7:2,4,2,5
chr17	8169006	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	8194318	.	GT	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=77,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,5:1,2:1,2,2,5
chr17	8195974	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,21;MFRL=163,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,1:1,0:0|1:8195974_C_CT:8195974:0,2,0,1
chr17	8195975	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=163,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:8195974_C_CT:8195974:0,2,0,1
chr17	8195978	.	C	CTGCCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=163,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:8195974_C_CT:8195974:0,2,0,1
chr17	8197663	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	8216383	.	TCC	GGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:5,0:0,8,2,0
chr17	8216393	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=168,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,1:0,8,2,0
chr17	8285398	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr17	8296383	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=124,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,3,1
chr17	8296751	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr17	8347554	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:9,2,2,0
chr17	8349984	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=203,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	8383894	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	8387438	.	G	GATGA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=106.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,9:0,0,20,5
chr17	8390733	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=73,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:6,2,4,1
chr17	8393900	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,1:4,4:2,8,0,5
chr17	8395894	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr17	8398577	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr17	8398624	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8398624_G_A:8398624:0,0,0,1
chr17	8398634	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8398624_G_A:8398624:0,0,0,1
chr17	8411812	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr17	8413314	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CA;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr17	8417006	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,0:1,4:0,4,0,5
chr17	8438905	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=251,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:8438905_A_T:8438905:0,1,0,1
chr17	8438908	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=251,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:8438905_A_T:8438905:0,1,0,1
chr17	8438910	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=251,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:8438905_A_T:8438905:0,1,0,1
chr17	8449767	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr17	8451744	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr17	8455532	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=234,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr17	8473154	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:1,2:9,0:3,8,0,2
chr17	8473182	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr17	8473204	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=150,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,0:3,1:0|1:8473204_G_GA:8473204:0,3,0,1
chr17	8473211	.	T	TAGCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=149,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:8473204_G_GA:8473204:0,4,0,1
chr17	8473216	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=149,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:8473204_G_GA:8473204:0,4,0,1
chr17	8644731	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=214,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr17	8647015	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:3,1:6,5:5,4,2,5
chr17	8647057	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=240,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,1:1,1:1,2,0,3
chr17	8647337	.	A	C,G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,13,21;MFRL=0,150,92;MMQ=60,60,60;MPOS=16,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.15,10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.400,0.499:7:0,0,0:0,0,2:0,0,5,2
chr17	8647339	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=92,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,0:3,0:0|1:8647339_A_C:8647339:2,2,3,0
chr17	8647345	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=49,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0|1:8647339_A_C:8647339:1,2,3,0
chr17	8647350	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:4,0:0|1:8647339_A_C:8647339:2,3,2,0
chr17	8656594	.	ACCCCATCCCTCCCCAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=147,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.504:10:3,2:1,2:0,5,2,3
chr17	8659014	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=82,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:2,2:4,0:1,7,0,2
chr17	8659680	.	TGGA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=52.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,6:5,9:6,5,8,7
chr17	8700940	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr17	8702547	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	8706834	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8706834_G_A:8706834:0,1,1,0
chr17	8706838	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8706834_G_A:8706834:0,1,1,0
chr17	8725214	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=71.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,13:0,8:0,0,6,15
chr17	8726721	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:17,0:3,2:13,9,2,0
chr17	8738575	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=230,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,0:1,3:4,0,4,0
chr17	8739821	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:5,2,5,1
chr17	8740294	.	AGGAGGG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:8740294_AGGAGGG_A:8740294:0,0,0,1
chr17	8740307	.	G	GAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8740294_AGGAGGG_A:8740294:0,0,0,1
chr17	8742830	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:3,0,6,0
chr17	8742862	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:3,7:1,2:4,0,8,2
chr17	8743118	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr17	8753004	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=83,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr17	8784149	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:3,3,1,3
chr17	8784361	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=128,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr17	8784900	.	C	CAGTA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTA;STR;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,5:7,3:8,3,7,3
chr17	8785087	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,13:0.391:34:8,6:10,6:0|1:8785087_A_C:8785087:10,11,5,8
chr17	8785092	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=123,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,12:0.419:29:8,5:9,6:0|1:8785087_A_C:8785087:9,8,4,8
chr17	8789496	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=104,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr17	8792093	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8792093_G_A:8792093:0,1,0,1
chr17	8792105	.	G	GTCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TCC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:8792093_G_A:8792093:1,1,0,1
chr17	8792116	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:8792093_G_A:8792093:1,0,0,1
chr17	8792171	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	8792371	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,0:1,3:2,0,3,0
chr17	8794002	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	8808243	.	G	GTCTC,GACCTGGAGAGGAGCTGATGTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32,35;MFRL=147,118,134;MMQ=60,60,60;MPOS=3,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,1:1,1,0:0,3,0,2
chr17	8808245	.	C	CTCCGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=141,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr17	8808321	.	T	TCCCTTCAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=257,287;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8808321_T_TCCCTTCAG:8808321:0,3,0,1
chr17	8808324	.	C	CTGAGAACCGGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=257,287;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8808321_T_TCCCTTCAG:8808321:0,3,0,1
chr17	8809159	.	T	TGTTTTGTTTTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8809159_T_TGTTTTGTTTTG:8809159:0,3,0,1
chr17	8809164	.	T	TGTTTTTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8809159_T_TGTTTTGTTTTG:8809159:0,3,0,1
chr17	9066098	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr17	9083081	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,4:3,1:5,2,4,1
chr17	9086228	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=122,155;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:6,4,5,1
chr17	9086561	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=123,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:5,8:10,3:9,6,6,6
chr17	9086676	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.417:25:5,5:6,5:7,8,5,5
chr17	9086708	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.468:28:8,6:5,6:5,10,6,7
chr17	9124463	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=185,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,3:0,2:0,3,2,3
chr17	9153861	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,5:3,3:5,4,4,4
chr17	9154078	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	9395231	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,4:5,0:4,8,3,1
chr17	9408290	.	C	CAAAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=99,67;MMQ=40,58;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=19,24;RU=A;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,1:1,0:1,0,1,3
chr17	9479048	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,5,8
chr17	9497531	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=115,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr17	9511357	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:2,1:5,1:8,0,2,0
chr17	9546551	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=116,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr17	9559656	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,5:6,0:11,1,5,0
chr17	9613458	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr17	9613467	.	G	GGCCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,33;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:9613467_G_GGCCA:9613467:1,1,0,1
chr17	9613470	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:9613467_G_GGCCA:9613467:1,1,0,1
chr17	9613472	.	G	GCCGTGATTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:9613467_G_GGCCA:9613467:1,1,0,1
chr17	9676134	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=77,147;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr17	9676148	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=132,208;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr17	9683410	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:9683410_T_C:9683410:0,2,0,1
chr17	9683412	.	G	GAGACC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:9683410_T_C:9683410:0,2,0,1
chr17	9683414	.	G	GGATTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:9683410_T_C:9683410:0,2,0,1
chr17	9765222	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr17	9783855	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,0,4
chr17	9791375	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:2,6:3,5:0,5,1,11
chr17	9792872	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,5:1,2:3,2,4,3
chr17	9801547	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:0,5,0,7
chr17	9804473	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr17	10205067	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	10209778	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.539:37:9,10:8,10:12,5,10,10
chr17	10212671	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:14,0:5,2:5,14,2,0
chr17	10215944	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:10,7:5,7:10,5,11,3
chr17	10216442	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,3:0,0,13,2
chr17	10219113	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=109,119;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:2,5:4,4:2,5,3,6
chr17	10219366	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	10222061	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=184,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:4,0,6,0
chr17	10231522	.	CTCCGTCT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	10263535	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=157,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,1:9,1:0|1:10263535_C_A:10263535:1,13,0,2
chr17	10263539	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=158,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:8,1:0|1:10263535_C_A:10263535:0,13,0,2
chr17	10267610	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr17	10298365	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,108;MMQ=60,58;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr17	10301948	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,1:6,1:1,14,1,1
chr17	10302264	.	C	CAGTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10302264_C_CAGTCA:10302264:0,2,0,1
chr17	10302268	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:10302264_C_CAGTCA:10302264:0,2,0,1
chr17	10305158	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr17	10309962	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr17	10322444	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:12,2:9,0:0,21,0,2
chr17	10347967	.	TTG	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=143,75;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,2:11,0:0|1:10347967_TTG_T:10347967:9,8,0,2
chr17	10347973	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=141,75;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,2:12,0:0|1:10347967_TTG_T:10347967:9,9,0,2
chr17	10352216	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:10,5,2,0
chr17	10357281	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr17	10358400	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:0,3,0,4
chr17	10359099	.	T	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,172;MMQ=40,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.055:52:21,2:29,0:22,28,1,1
chr17	10359782	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=131.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,18:0,0,33,3
chr17	10363308	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,163;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:24,1:25,3:24,27,2,2
chr17	10400963	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr17	10405130	.	T	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,73;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.074:57:31,0:22,3:35,18,2,2
chr17	10411322	.	GT	G,GTT	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=143,151,101;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.37,3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,5:0.105,0.161:28:9,2,3:8,1,1:3,17,5,3
chr17	10426343	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,16,1
chr17	10432079	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=204,148;MMQ=40,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,6:2,5:4,3,4,7
chr17	10432684	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=212,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10432684_C_G:10432684:1,0,0,1
chr17	10432686	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=212,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10432684_C_G:10432684:1,0,0,1
chr17	10432688	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=212,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10432684_C_G:10432684:1,0,0,1
chr17	10435007	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:18,0:18,2:21,15,0,2
chr17	10443384	.	C	CAAGA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:7,0:9,2:0|1:10443384_C_CAAGA:10443384:4,13,1,1
chr17	10443385	.	T	TGGTAATTATTATG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:0|1:10443384_C_CAAGA:10443384:4,13,1,1
chr17	10532884	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	10533595	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=60.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,4:0,0,17,0
chr17	10535216	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,1:11,1:0|1:10535216_T_TG:10535216:8,13,0,2
chr17	10535217	.	A	AGGTAGAAGAT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,1:10,1:0|1:10535216_T_TG:10535216:8,13,0,2
chr17	10535349	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr17	10535761	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr17	10541515	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,6:0,0,9,15
chr17	10541741	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=240,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr17	10542803	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr17	10543033	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.139:48:20,4:21,2:17,25,1,5
chr17	10543183	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr17	10543218	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	10543281	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr17	10544018	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr17	10544696	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=243,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,3:0,1,0,7
chr17	10546130	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=146.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,19:0,23:0,0,25,19
chr17	10548992	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr17	10549184	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr17	10550845	.	TTTTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTTTG;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	10552000	.	A	AT	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=65.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.939:28:1,17:0,8:0,1,2,25
chr17	10552014	.	TG	CA	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=148,109;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:21,0:6,1:2,25,0,2
chr17	10552021	.	ACA	TTG	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=150,134;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:21,0:3,2:2,22,0,2
chr17	10552042	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=158,163;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:14,2:3,1:0,18,0,4
chr17	10553046	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	10553571	.	G	GCA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=141,129;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:0|1:10553571_G_GCA:10553571:14,0,2,0
chr17	10553573	.	GTC	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=142,129;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,2:5,0:0|1:10553571_G_GCA:10553571:15,0,2,0
chr17	10553575	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=142,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,2:4,1:11,0,3,0
chr17	10555021	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:5,5:12,6:5,12,4,7
chr17	10555028	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=74.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,7,14
chr17	10555060	.	T	TGTTTTTA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=183,116;MMQ=43,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.268:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr17	10555062	.	TTG	T,TTCTG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=13,32,32;MFRL=207,114,116;MMQ=27,53,39;MPOS=23,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.05,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.591,0.212:4:0,1,1:0,1,0:0,1,1,2
chr17	10596306	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr17	10614051	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=199,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr17	10614520	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr17	10632499	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	11282928	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	11459012	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr17	11511412	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,9,3
chr17	11513661	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr17	11522764	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	11532657	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=202,193;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr17	11536093	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	11543520	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	11550340	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr17	11583089	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,13,2
chr17	11603218	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:3,13,0,2
chr17	11603300	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	11604598	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	11651139	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr17	11666674	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr17	11672503	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=181,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,1:5,1:4,7,0,2
chr17	11684571	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr17	11726300	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,26606766;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:3,7,1,1
chr17	11737938	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,2:0|1:11737938_G_A:11737938:3,0,4,0
chr17	11737941	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=207,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0|1:11737938_G_A:11737938:2,0,5,0
chr17	11738314	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	11786951	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=90,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.251:24:11,2:6,4:9,9,5,1
chr17	11806266	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr17	11827112	.	GC	AA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr17	11827353	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,1,6
chr17	11835321	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=76.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,17:0,6:0,0,16,7
chr17	11865110	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	11881356	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,3:5,8:6,4,5,6
chr17	11887518	.	GAA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.344:8:1,1:1,2:1,4,1,2
chr17	12569442	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=270,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:0,2:2,0,3,0
chr17	12620761	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,3,8
chr17	12626063	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=84,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr17	12626425	.	AC	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	12639427	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,2:2,3:5,0,4,1
chr17	12647490	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr17	12647691	.	CCAG	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=140,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAG;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:8,2:9,1:4,14,1,2
chr17	12663953	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,85;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,0:10,4:18,5,0,4
chr17	12798396	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,2:0,1:0,3,0,4
chr17	12812343	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=90,49;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr17	12822978	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=166,171;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr17	12822980	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=164,179;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr17	12859125	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr17	12859149	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,4,0
chr17	12860091	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=76,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr17	12887940	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:12887940_A_C:12887940:0,0,1,0
chr17	12887952	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=133,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:12887940_A_C:12887940:1,1,1,0
chr17	12887957	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=133,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:12887940_A_C:12887940:1,1,1,0
chr17	12887960	.	CAGCA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=133,209;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:12887940_A_C:12887940:1,1,1,0
chr17	12897669	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,3:9,0,8,0
chr17	12898295	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,111;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,5:3,6:4,3,8,3
chr17	12898994	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr17	12901688	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=189,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,1:1,4:3,3,5,0
chr17	12905525	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=239,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr17	12905574	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=239,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr17	12905743	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,28:0.660:42:8,13:6,15:8,6,19,9
chr17	12909046	.	A	AATC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,1:1,2,1,2
chr17	12909386	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=187,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:4,1:0,5,0,2
chr17	12914920	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,5:3,4:10,0,9,0
chr17	12917856	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.734:9:0,4:2,3:0,2,1,6
chr17	12919252	.	TTCC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=202,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12919252_TTCC_T:12919252:0,1,0,1
chr17	12919256	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=202,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12919252_TTCC_T:12919252:0,1,0,1
chr17	12920526	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:1,1:1,1:0,17,0,4
chr17	13399486	.	A	AT,ATT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=153,152,159;MMQ=60,60,60;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=48.95,35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,23,22:0.502,0.458:46:1,13,11:0,10,9:1,0,42,3
chr17	13972811	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	13977813	.	C	CTTTA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr17	14005373	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr17	14005386	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:8,0,6,0
chr17	14005647	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=203,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AT;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	14063292	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.520:29:6,6:7,9:5,9,3,12
chr17	14095550	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=140,135;MMQ=27,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=94.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,38:0.504:75:22,24:15,12:25,12,20,18
chr17	14095566	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=140,137;MMQ=51,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,18:0.325:56:24,9:13,8:19,19,14,4
chr17	14095639	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=152,144;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.158:55:24,6:22,2:14,33,0,8
chr17	14110294	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=172,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.317:30:14,5:4,4:11,10,8,1
chr17	14139107	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=246,219;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr17	14139565	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,118;MMQ=27,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.844:30:1,16:3,10:1,3,11,15
chr17	14139774	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	14673431	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=132,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr17	15134175	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr17	15142755	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,3:4,8:6,0,9,2
chr17	15143011	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr17	15162389	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,16,6
chr17	15222535	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr17	15231266	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,6:7,4:8,1,6,4
chr17	15234232	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr17	15343524	.	C	CCTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CTT;STR;TLOD=69.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,10:0,0,5,11
chr17	15406197	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=110,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.523:40:7,12:12,9:6,13,10,11
chr17	15458722	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=140,187;MMQ=40,43;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:6,2:2,7,0,6
chr17	15492481	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=169,75;MMQ=43,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,1:12,2:15,11,2,1
chr17	15496612	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,144;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:0,8:6,3:7,0,11,0
chr17	15498181	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=112,144;MMQ=60,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:6,5:6,5:3,10,6,4
chr17	15498211	.	GAAAAGATA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=174,150;MMQ=51,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,2:5,3:0,12,2,3
chr17	15508521	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=145,191;MMQ=27,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:15,4:10,2:18,7,0,6
chr17	15516036	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=124,82;MMQ=52,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:13,3:7,0:10,10,2,1
chr17	15522855	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,153;MMQ=45,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.370:49:16,7:13,10:6,25,4,14
chr17	15554640	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:17,0:7,2:9,16,1,1
chr17	15603799	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=165,168;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:4,4:8,7:1,11,0,11
chr17	15604395	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr17	15604444	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=107,138;MMQ=57,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.635:31:6,11:5,8:8,3,17,3
chr17	15604485	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=141,119;MMQ=49,51;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.228:36:16,4:12,3:18,10,3,5
chr17	15613114	.	AT	A	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=88.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,44:0.444:99:36,25:15,19:28,27,24,20
chr17	15620647	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr17	15620679	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=151,210;MMQ=57,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr17	15641449	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,35;MFRL=169,193;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:4,0:6,4:0|1:15641449_A_G:15641449:1,10,1,3
chr17	15641457	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=182,193;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:5,0:6,4:0|1:15641449_A_G:15641449:1,10,1,3
chr17	15641459	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=182,193;MMQ=60,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:5,0:6,4:0|1:15641449_A_G:15641449:1,10,1,3
chr17	15641462	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=183,193;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:5,0:7,4:0|1:15641449_A_G:15641449:1,11,1,3
chr17	15641472	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=190,193;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:5,0:7,5:0|1:15641449_A_G:15641449:2,10,1,4
chr17	15643381	.	CAA	C,CA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,35,33;MFRL=138,82,159;MMQ=60,50,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=A;STR;TLOD=3.47,7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,4:0.135,0.270:15:4,2,2:5,0,2:8,1,6,0
chr17	15643382	.	A	AC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,140;MMQ=59,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.600:18:5,6:2,4:8,0,8,2
chr17	15905190	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr17	15909728	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:3,0,2,2
chr17	15928584	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr17	15930087	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:3,5:0,5,1,6
chr17	15943910	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	15950198	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr17	15961951	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:4,3:0,5,0,3
chr17	15968143	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:9,4:4,1:12,1,2,3
chr17	15973844	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,6:2,1:4,3,3,4
chr17	16005187	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr17	16012327	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=295,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	16029412	.	C	G	.	.	DP=173;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:154,8:0.049:162:69,0:48,0:73,81,8,0
chr17	16041636	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,226;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr17	16046845	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,2:7,3:13,0,5,0
chr17	16049626	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:4,2:2,3:6,0,5,0
chr17	16056614	.	TA	T,TAA	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=31,30,32;MFRL=145,84,152;MMQ=60,60,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.38,9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:66,8,8:0.089,0.105:82:24,7,3:41,1,5:56,10,11,5
chr17	16068228	.	T	A	.	.	DP=63;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:22,4:30,0:44,8,4,0
chr17	16068278	.	A	G	.	.	DP=101;ECNT=9;MBQ=32,34;MFRL=137,211;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,4:0.050:98:36,1:54,3:0|1:16068278_A_G:16068278:46,48,4,0
chr17	16068287	.	A	T	.	.	DP=103;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=138,211;MMQ=60,31;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:97,4:0.048:101:37,1:56,3:0|1:16068278_A_G:16068278:48,49,4,0
chr17	16068340	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=157,156;MMQ=49,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,16:0.210:79:15,6:40,9:0|1:16068340_C_T:16068340:30,33,16,0
chr17	16068343	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=158,156;MMQ=49,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,16:0.207:80:15,6:44,10:0|1:16068340_C_T:16068340:30,34,16,0
chr17	16068362	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=162,153;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,16:0.210:79:15,7:44,9:0|1:16068340_C_T:16068340:34,29,16,0
chr17	16068377	.	C	G	.	.	DP=83;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=163,149;MMQ=50,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,19:0.235:83:20,9:36,9:0|1:16068340_C_T:16068340:42,22,18,1
chr17	16068383	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=163,141;MMQ=50,29;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,22:0.267:84:24,9:35,7:0|1:16068340_C_T:16068340:40,22,18,4
chr17	16068396	.	G	A	.	.	DP=100;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=162,144;MMQ=49,30;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,24:0.250:98:30,11:43,13:0|1:16068340_C_T:16068340:45,29,15,9
chr17	16068506	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=142,142;MMQ=48,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,13:0.180:76:31,5:28,8:18,45,0,13
chr17	16068545	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=155,173;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.173:44:20,2:17,5:2,35,0,7
chr17	16097870	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=126,123;MMQ=52,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.190:38:17,3:14,3:12,19,4,3
chr17	16097899	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=122,123;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,1:5,1:0|1:16097899_C_T:16097899:3,13,0,2
chr17	16097912	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=129,123;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,1:4,1:0|1:16097899_C_T:16097899:1,12,0,2
chr17	16097921	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=127,123;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:0|1:16097899_C_T:16097899:1,11,0,2
chr17	16185248	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr17	16221271	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	16229232	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,2:5,2:4,5,0,4
chr17	16248083	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,2:1,2:0,4,0,4
chr17	16251859	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr17	16256240	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr17	16323589	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.519:19:3,5:5,3:0|1:16323589_C_A:16323589:2,7,0,10
chr17	16323608	.	ATAGT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.527:13:3,1:3,6:0|1:16323589_C_A:16323589:0,6,0,7
chr17	16335191	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,4:2,0:3,4,1,3
chr17	16342813	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr17	16344314	.	A	ACT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr17	16456620	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:10,2:14,7,2,0
chr17	16612212	.	G	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=174,160;MMQ=24,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,5:0.098:59:30,2:24,3:12,42,1,4
chr17	16623497	.	GT	G,GTT	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=34,34,33;MFRL=147,171,172;MMQ=40,40,34;MPOS=13,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=7.08,6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:69,6,6:0.080,0.082:81:26,2,5:31,4,0:43,26,9,3
chr17	16640776	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=192,148;MMQ=58,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:0,1:4,3:4,0,5,0
chr17	16664647	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,216;MMQ=48,37;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.583:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr17	16744194	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,31;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr17	16745274	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,177;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.769:15:1,7:2,5:3,0,5,7
chr17	16748666	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,9:0,0,11,2
chr17	16842852	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=131,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:2,1,1,0
chr17	16843712	.	T	TCTCTTCCC,TTCA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,32,35;MFRL=144,132,140;MMQ=60,60,54;MPOS=2,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,1,0:2,0,1:0,4,0,2
chr17	16843717	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=144,140;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr17	16843728	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,35;MFRL=126,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr17	16843729	.	G	T,GGGGGCCCCAAAATTGGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33,34;MFRL=0,126,163;MMQ=60,60,60;MPOS=31,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.14,3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.546,0.286:3:0,0,1:0,2,0:0,0,0,3
chr17	16852027	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:3,2,4,1
chr17	16892312	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:17,0:12,4:0|1:16892312_A_C:16892312:14,18,0,4
chr17	16892316	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:18,0:12,4:0|1:16892312_A_C:16892312:14,18,0,4
chr17	16946073	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr17	16946343	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,3:2,7:0,8,0,10
chr17	17035036	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr17	17039561	.	CCAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CAG;STR;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.919:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr17	17045861	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr17	17050573	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr17	17122286	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr17	17122327	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr17	17127471	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr17	17163517	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	17179299	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr17	17179481	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,5,13
chr17	17184033	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr17	17184080	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	17184097	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	17184399	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr17	17184527	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=157,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:9,0:15,3:5,19,1,2
chr17	17409085	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:11,4,2,0
chr17	17409709	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	17412032	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,3,2
chr17	17412231	.	G	GGGTGAACGAGGGGGCAGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=138,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:2,2:1,0:0|1:17412231_G_GGGTGAACGAGGGGGCAGA:17412231:0,3,1,1
chr17	17412237	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=153,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:17412231_G_GGGTGAACGAGGGGGCAGA:17412231:0,2,1,1
chr17	17425631	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr17	17480195	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr17	17697093	.	CCAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=CAG;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:2,1:3,2,3,0
chr17	17717894	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	17720084	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17720084_C_A:17720084:0,1,0,1
chr17	17720085	.	A	ACTGTAGAATGGTTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17720084_C_A:17720084:0,1,0,1
chr17	17721740	.	GGT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:17721740_GGT_G:17721740:0,0,0,1
chr17	17721743	.	T	TCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17721740_GGT_G:17721740:0,0,0,1
chr17	17726764	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=204,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.608:5:0,1:0,0:2,0,3,0
chr17	17726965	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr17	17750907	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr17	17770355	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr17	17772622	.	G	GAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.685:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr17	17880877	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,7:4,7:7,0,9,5
chr17	17891368	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=149,104;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:10,0:7,3:5,12,0,3
chr17	17897739	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,36;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:1,2,0,2
chr17	17898243	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr17	17900990	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=253,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,1,4
chr17	17929730	.	T	TGTCCTCAGGAAAGCAGGGCTTTTGC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:17,2:15,0:12,26,0,2
chr17	18003648	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=46,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:6,5:3,8:4,6,9,4
chr17	18003671	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0,0,12,11
chr17	18003845	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr17	18007221	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,0:6,2:0|1:18007221_T_C:18007221:4,10,1,1
chr17	18007226	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=158,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,1:0|1:18007221_T_C:18007221:3,12,1,1
chr17	18007230	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=149,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:18007221_T_C:18007221:3,12,1,1
chr17	18007231	.	A	AGG	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=149,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:18007221_T_C:18007221:3,12,1,1
chr17	18007232	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=35,19;MFRL=149,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,1:0|1:18007221_T_C:18007221:3,12,1,1
chr17	18007237	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,18;MFRL=154,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,0:8,1:0|1:18007221_T_C:18007221:3,13,1,1
chr17	18008090	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=142,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr17	18008097	.	GTCTCAC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=142,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	18022021	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18022021_C_T:18022021:0,0,1,0
chr17	18022039	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:18022021_C_T:18022021:1,0,3,0
chr17	18024117	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=238,273;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	18024421	.	TTGGTCACCGCTGG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18024421_TTGGTCACCGCTGG_T:18024421:0,0,0,1
chr17	18024437	.	TCGCCC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18024421_TTGGTCACCGCTGG_T:18024421:0,0,0,1
chr17	18025744	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr17	18029838	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=172,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr17	18034483	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.758:6:0,0:0,0:0|1:18034483_T_A:18034483:1,0,5,0
chr17	18034485	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.866:5:0,0:0,0:0|1:18034483_T_A:18034483:0,0,5,0
chr17	18034493	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.407:8:2,1:1,1:0|1:18034483_T_A:18034483:3,2,3,0
chr17	18034497	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:3,0:2,0:0|1:18034483_T_A:18034483:4,2,3,0
chr17	18035912	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=207,138;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18035912_G_T:18035912:0,1,0,1
chr17	18035918	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=207,138;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18035912_G_T:18035912:0,1,0,1
chr17	18035922	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=207,138;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18035912_G_T:18035912:0,1,0,1
chr17	18035930	.	C	CTTCCCTAAATCTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=207,138;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18035912_G_T:18035912:0,1,0,1
chr17	18039212	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=260,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:18039212_T_TC:18039212:0,1,0,1
chr17	18039214	.	TGTGG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=260,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:18039212_T_TC:18039212:0,1,0,1
chr17	18039229	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=197,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:18039212_T_TC:18039212:0,4,0,1
chr17	18039238	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=197,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:18039212_T_TC:18039212:0,4,0,1
chr17	18042276	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:3,0:0,6:1,2,3,4
chr17	18042527	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	18042976	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr17	18043766	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr17	18045098	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=131,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:7,3:4,3:4,7,2,5
chr17	18046058	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:5,4:6,5:6,7,7,6
chr17	18046242	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=181,170;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:18046242_G_A:18046242:0,3,0,1
chr17	18046245	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=181,170;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:18046242_G_A:18046242:0,3,0,1
chr17	18046248	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=181,170;MMQ=60,57;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:18046242_G_A:18046242:0,3,0,1
chr17	18046252	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=181,170;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:18046242_G_A:18046242:0,3,0,1
chr17	18046260	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,16;MFRL=174,170;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:18046242_G_A:18046242:0,2,0,1
chr17	18047772	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=122,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr17	18049100	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=250,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr17	18051294	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:14,0,2,0
chr17	18051975	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	18052466	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr17	18054692	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.464:19:6,2:3,4:10,0,8,1
chr17	18054868	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,6:2,3:0,6,0,9
chr17	18059454	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:6,5,2,0
chr17	18062763	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=182,122;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr17	18069761	.	T	TCAAAGGTGGTGAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chr17	18077308	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=247,304;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:18077308_T_A:18077308:0,2,0,1
chr17	18077316	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=247,304;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:18077308_T_A:18077308:0,2,0,1
chr17	18135753	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr17	18139896	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr17	18141705	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=258,241;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,0:1,3:2,0,3,0
chr17	18141771	.	T	TGTATTTATTTTAG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=168,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:18141771_T_TGTATTTATTTTAG:18141771:6,1,1,1
chr17	18141775	.	G	GATACAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=167,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,0:0|1:18141771_T_TGTATTTATTTTAG:18141771:6,2,1,1
chr17	18149854	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr17	18150121	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,2:4,0:0|1:18150121_G_T:18150121:2,9,0,2
chr17	18150123	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:18150121_G_T:18150121:2,9,0,2
chr17	18150444	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr17	18151835	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	18154334	.	G	GTTACCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:18154334_G_GTTACCT:18154334:0,0,0,1
chr17	18154338	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:18154334_G_GTTACCT:18154334:0,0,0,1
chr17	18156541	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=147,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr17	18167397	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=264,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr17	18186216	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,36;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18186216_C_CAT:18186216:0,1,0,1
chr17	18186220	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18186216_C_CAT:18186216:0,1,0,1
chr17	18186222	.	T	TTATAGCATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18186216_C_CAT:18186216:0,1,0,1
chr17	18188884	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr17	18194362	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	18208334	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:2,0,4,1
chr17	18210368	.	A	AAGTGATTCTCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr17	18259294	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.460:26:7,5:7,6:8,6,4,8
chr17	18259333	.	CAT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,3:4,7:1,6,1,9
chr17	18286452	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=52,122;MMQ=27,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr17	18286469	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=122,52;MMQ=51,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:18286469_C_T:18286469:0,1,1,1
chr17	18286472	.	C	CAAAGGGGGTCTCTGGGGTTGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=122,52;MMQ=51,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:18286469_C_T:18286469:0,1,1,1
chr17	18291432	.	TCACAGC	T	.	.	DP=67;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=132,167;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,13:0.212:64:25,6:9,6:0|1:18291432_TCACAGC_T:18291432:42,9,13,0
chr17	18291456	.	C	G	.	.	DP=86;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=130,181;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,11:0.136:86:47,8:23,3:0|1:18291432_TCACAGC_T:18291432:52,23,8,3
chr17	18291470	.	C	G	.	.	DP=95;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=124,167;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,13:0.147:93:51,9:27,4:0|1:18291432_TCACAGC_T:18291432:51,29,6,7
chr17	18291544	.	A	G	.	.	DP=77;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=143,147;MMQ=52,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,23:0.313:75:21,12:25,8:0|1:18291544_A_G:18291544:18,34,17,6
chr17	18291559	.	T	C	.	.	DP=85;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=143,147;MMQ=52,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,27:0.329:83:31,14:24,11:0|1:18291544_A_G:18291544:21,35,17,10
chr17	18291618	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=129,134;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,31:0.478:65:20,17:14,14:9,25,8,23
chr17	18330592	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,162;MMQ=25,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr17	18333164	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr17	18333915	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,25;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,17:0,0,21,12
chr17	18334097	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,166;MMQ=27,37;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,1:11,1:17,6,2,0
chr17	18380065	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=172,169;MMQ=40,26;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,2:11,2:21,0,4,0
chr17	18380154	.	A	G	.	.	DP=104;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=148,150;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,13:0.133:102:40,12:49,1:61,28,10,3
chr17	18380163	.	GGA	G	.	.	DP=107;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=144,132;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GA;STR;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,8:0.086:101:36,8:50,0:57,36,5,3
chr17	18380260	.	C	A	.	.	DP=94;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=138,167;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,15:0.176:87:36,9:35,5:23,49,0,15
chr17	18380298	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=145,203;MMQ=57,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,13:0.271:50:19,5:16,8:3,34,0,13
chr17	18391123	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,14:0.191:73:26,5:32,7:7,52,2,12
chr17	18392175	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,153;MMQ=27,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:9,8:5,4:13,1,12,0
chr17	18393969	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=266,230;MMQ=21,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	18394552	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,166;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.276:34:13,4:12,5:21,4,5,4
chr17	18394706	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,162;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:14,1:6,3:0,20,0,4
chr17	18397711	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,172;MMQ=27,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,13:0.237:57:22,8:20,5:4,40,2,11
chr17	18486910	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,160;MMQ=37,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,3:15,0:0,23,0,3
chr17	18498059	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr17	18498497	.	G	GA,GAA	.	.	DP=119;ECNT=1;MBQ=24,19,17;MFRL=149,151,146;MMQ=40,50,43;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=145.48,9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,62,11:0.736,0.121:87:5,17,1:4,12,1:4,10,21,52
chr17	18541296	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	18541775	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr17	18541852	.	ACCCAC	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,5:0|1:18541852_ACCCAC_A:18541852:0,0,8,3
chr17	18541868	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:18541852_ACCCAC_A:18541852:0,0,7,3
chr17	18542074	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr17	18544520	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr17	18565409	.	A	G	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,241;MMQ=55,24;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,4:0.057:83:42,3:35,1:36,43,1,3
chr17	18584009	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,125;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:6,1,3,1
chr17	18638151	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,10:0,4:0,0,12,2
chr17	18676056	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:18676056_T_G:18676056:0,1,0,1
chr17	18676065	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=218,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,0:0|1:18676056_T_G:18676056:0,2,0,1
chr17	18676071	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,18;MFRL=277,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:0|1:18676056_T_G:18676056:0,1,0,1
chr17	18678548	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:11,7:5,6:5,11,7,6
chr17	18684487	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=126,171;MMQ=52,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr17	18700843	.	C	A	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,147;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=127.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,53:0.499:106:27,26:26,26:47,6,42,11
chr17	18702094	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,181;MMQ=27,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:8,1,8,0
chr17	18708830	.	G	GT,GTT	.	.	DP=164;ECNT=1;MBQ=31,20,20;MFRL=130,131,98;MMQ=60,60,60;MPOS=19,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=145.84,16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,72,21:0.667,0.162:115:9,22,3:6,24,9:8,14,40,53
chr17	18709002	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,219;MMQ=40,33;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr17	18769349	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	18770733	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr17	18776020	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr17	18785823	.	TA	T,TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,22,30;MFRL=154,82,92;MMQ=60,60,60;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.34,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.230,0.230:10:3,1,1:3,0,1:6,0,3,1
chr17	18793061	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr17	18793225	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,3,15
chr17	18814578	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,1:2,6:1,3,2,5
chr17	18814613	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=163,132;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr17	18814661	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	18827182	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:15,1,3,0
chr17	18827348	.	GTTGA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTGA;STR;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.579:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr17	18872337	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	18874685	.	C	CGGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGT;STR;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr17	18874720	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,6,5
chr17	18882991	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr17	18918382	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:15,0:22,2:24,14,0,2
chr17	18918530	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	18997159	.	TGGGGTAAAGCCAGAGCCGGGCCC	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,162;MMQ=37,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,18:0.333:56:12,10:11,8:15,23,0,18
chr17	19188962	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:7,1,5,2
chr17	19232160	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,3:10,2:7,13,2,3
chr17	19233033	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr17	19250679	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,3:6,1:2,7,0,4
chr17	19265952	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,6:4,5:0,5,1,10
chr17	19282182	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:6,1,3,0
chr17	19284213	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,0:16,2:5,19,0,2
chr17	19286474	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,44;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,0:10,3:14,10,1,2
chr17	19290282	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,10;MFRL=95,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:0,0:2,0:0|1:19290282_T_G:19290282:0,2,2,0
chr17	19290285	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=95,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:0,0:2,2:0|1:19290282_T_G:19290282:0,2,2,0
chr17	19290289	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,10;MFRL=95,274;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:19290282_T_G:19290282:0,2,1,0
chr17	19290291	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,18;MFRL=95,274;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:19290282_T_G:19290282:0,2,1,0
chr17	19290298	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=164,274;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:0,0:2,1:0|1:19290282_T_G:19290282:1,2,1,0
chr17	19314917	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,34,35,34;MFRL=139,147,141,144;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,32,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,15,16,17;RU=T;STR;TLOD=6.01,4.83,10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,5,4,6:0.211,0.188,0.376:19:1,3,3,3:1,2,1,1:2,2,14,1
chr17	19314936	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.395:32:5,0:11,0:13,6,13,0
chr17	19319015	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=230,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr17	19437187	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19437187_T_C:19437187:0,0,0,1
chr17	19437200	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19437187_T_C:19437187:0,0,0,1
chr17	19470007	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,139;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:7,1:16,0,2,0
chr17	19552476	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:2,8:7,2:2,7,1,9
chr17	19555816	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:6,2,3,0
chr17	19555976	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.641:26:7,8:2,8:1,8,4,13
chr17	19559623	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:5,5:4,2:7,2,5,3
chr17	19561011	.	GACTGAATT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTGAATT;STR;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,5:4,6:11,1,8,3
chr17	19606060	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19606060_CA_C:19606060:0,1,0,1
chr17	19606066	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19606060_CA_C:19606060:0,1,0,1
chr17	19608898	.	G	GACGAGTGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr17	19608910	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,15;MFRL=225,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr17	19609947	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:2,1,3,1
chr17	19610104	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,113;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:4,2:2,0:1,6,0,2
chr17	19611923	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,209;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,0,1
chr17	19642465	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19642465_C_A:19642465:0,1,0,1
chr17	19642472	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=68,157;MMQ=41,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:19642465_C_A:19642465:1,1,0,1
chr17	19642474	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=68,157;MMQ=41,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:19642465_C_A:19642465:1,1,0,1
chr17	19642478	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=0,157;MMQ=21,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19642465_C_A:19642465:1,0,0,1
chr17	19642480	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=0,157;MMQ=21,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19642465_C_A:19642465:1,0,0,1
chr17	19687307	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	19699121	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:0,7,0,2
chr17	19699358	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr17	19699605	.	CAT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=58.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,6:0,9:0,0,2,14
chr17	19702881	.	G	T	.	.	DP=83;ECNT=3;MBQ=34,14;MFRL=101,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,2:0.039:74:26,0:43,0:47,25,0,2
chr17	19702890	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:21,0:28,2:38,18,0,3
chr17	19702892	.	C	A,CA	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=33,32,33;MFRL=0,150,110;MMQ=60,60,60;MPOS=2,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.77,8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,12,9:0.182,0.610:24:2,3,4:0,8,3:2,1,8,13
chr17	19752997	.	TAA	T,TA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=154,145,149;MMQ=60,60,60;MPOS=19,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=8.21,32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,7,18:0.163,0.428:43:12,3,11:5,4,7:17,1,24,1
chr17	19813400	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=205,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr17	20000131	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,27:0.651:41:7,11:7,16:6,8,8,19
chr17	20108511	.	CC	AA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:0|1:20108511_CC_AA:20108511:7,12,0,2
chr17	20108514	.	CC	AA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:20108511_CC_AA:20108511:8,12,0,2
chr17	20140311	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=128,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,0,4
chr17	20149179	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=148,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:12,1,2,0
chr17	20209474	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr17	20217452	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20217452_TG_AA:20217452:0,1,0,1
chr17	20217458	.	T	TTCTTCATCTACACCCCAAGCGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20217452_TG_AA:20217452:0,1,0,1
chr17	20321839	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=147,170;MMQ=52,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.293:28:7,1:13,7:19,1,8,0
chr17	20321862	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=134,170;MMQ=52,33;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.189:28:7,1:12,1:21,1,6,0
chr17	20322517	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=172,134;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:20322517_A_G:20322517:0,2,0,1
chr17	20322521	.	AA	TC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=172,134;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:20322517_A_G:20322517:0,2,0,1
chr17	20322526	.	TCACTGC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=172,134;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:20322517_A_G:20322517:0,2,0,1
chr17	20322537	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=172,134;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:20322517_A_G:20322517:0,2,0,1
chr17	20353501	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,178;MMQ=60,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20353501_C_G:20353501:0,0,1,0
chr17	20353504	.	TC	AA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,178;MMQ=60,21;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20353501_C_G:20353501:0,0,1,0
chr17	20353508	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,178;MMQ=60,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20353501_C_G:20353501:0,0,1,0
chr17	20354747	.	C	CCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=212,197;MMQ=27,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr17	20358808	.	CAGG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=174,113;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:1,0:0|1:20358808_CAGG_C:20358808:0,1,0,1
chr17	20358813	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=174,113;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20358808_CAGG_C:20358808:0,1,0,1
chr17	20363780	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,163;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.544:24:0,3:9,9:0,11,0,13
chr17	20370735	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=91,132;MMQ=40,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr17	20370767	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,37;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	20370796	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:20370796_T_C:20370796:0,0,0,2
chr17	20370806	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,39;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:20370796_T_C:20370796:0,0,0,3
chr17	20370815	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:20370796_T_C:20370796:0,0,0,3
chr17	20768730	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=148,162;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:5,9,2,0
chr17	20769896	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=121,137;MMQ=53,33;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,13:0.326:41:14,6:11,7:0|1:20769896_G_T:20769896:19,9,11,2
chr17	20769899	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=121,137;MMQ=53,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,13:0.326:41:16,4:12,7:0|1:20769896_G_T:20769896:19,9,11,2
chr17	20769904	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=127,137;MMQ=53,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,11:0.285:40:18,5:10,5:0|1:20769896_G_T:20769896:17,12,9,2
chr17	20769954	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=141,141;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.341:39:10,6:14,7:0|1:20769954_T_G:20769954:7,19,7,6
chr17	20769964	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=148,140;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,12:0.342:36:11,6:12,6:0|1:20769954_T_G:20769954:6,18,6,6
chr17	20769968	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=148,140;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,12:0.361:34:7,6:12,6:0|1:20769954_T_G:20769954:4,18,6,6
chr17	20769995	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=135,141;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:3,1:8,3:0|1:20769995_C_T:20769995:3,8,0,5
chr17	20770002	.	CC	AG	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=175,154;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,2:5,3:0|1:20769995_C_T:20769995:2,6,0,6
chr17	20770017	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=175,167;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:4,3:4,2:0|1:20770017_C_T:20770017:2,8,0,7
chr17	20770042	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=183,178;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:4,3:3,5:0|1:20770017_C_T:20770017:0,7,0,9
chr17	20770088	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=233,201;MMQ=34,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr17	20906251	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:20906251_C_T:20906251:0,0,5,0
chr17	20906257	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:20906251_C_T:20906251:0,0,5,0
chr17	20907714	.	ACT	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	20907717	.	T	TCACC	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20907717_T_TCACC:20907717:0,1,0,1
chr17	20907718	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=34,33;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20907717_T_TCACC:20907717:0,1,0,1
chr17	20907722	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=32,34;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20907717_T_TCACC:20907717:0,1,0,1
chr17	20907725	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20907717_T_TCACC:20907717:0,1,0,1
chr17	20907728	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=19,32;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:20907717_T_TCACC:20907717:0,1,0,1
chr17	20907730	.	A	AAGGACG	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=26,32;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20907717_T_TCACC:20907717:0,1,0,1
chr17	20907731	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=27,33;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20907731_T_C:20907731:0,1,0,1
chr17	20907732	.	CAGAA	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=24,33;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20907731_T_C:20907731:0,1,0,1
chr17	20908325	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr17	20910364	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:0,7,0,4
chr17	20911270	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=132,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:17,0:9,2:15,12,1,1
chr17	20921492	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr17	20921522	.	CTTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr17	20924620	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=150,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr17	21087203	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21087203_C_CA:21087203:0,1,0,1
chr17	21087204	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21087203_C_CA:21087203:0,1,0,1
chr17	21087671	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:11,5:4,5:11,5,10,0
chr17	21101684	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:10,0:16,7,2,0
chr17	21147404	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr17	21201851	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=122,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:1,3,1,5
chr17	21202063	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:21202063_G_C:21202063:1,0,3,0
chr17	21202067	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,1:0|1:21202063_G_C:21202063:1,0,3,0
chr17	21202078	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:21202063_G_C:21202063:2,0,3,0
chr17	21202102	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0|1:21202063_G_C:21202063:3,0,3,0
chr17	21202123	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:2,2:0|1:21202063_G_C:21202063:5,0,2,1
chr17	21202237	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=60,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:1,3,3,4
chr17	21202272	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=119,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:2,3,2,4
chr17	21202310	.	GC	AT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=162,238;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:21202310_GC_AT:21202310:1,1,0,2
chr17	21202316	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=119,238;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:21202310_GC_AT:21202310:0,1,0,2
chr17	21202318	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=119,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:21202310_GC_AT:21202310:0,1,0,2
chr17	21203820	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:6,5:4,2:0|1:21203820_G_C:21203820:8,2,4,3
chr17	21203825	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:6,5:4,2:0|1:21203820_G_C:21203820:8,2,4,3
chr17	21203934	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:10,0:0|1:21203934_G_A:21203934:8,8,1,1
chr17	21203949	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,1:10,1:0|1:21203934_G_A:21203934:5,10,1,1
chr17	21203964	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:3,2:7,1:0|1:21203934_G_A:21203934:5,9,1,2
chr17	21203998	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,2:5,3:1,8,0,5
chr17	21204067	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr17	21204153	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,1,2
chr17	21204187	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:7,2,3,2
chr17	21204308	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,15;MFRL=100,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:5,0:3,1:0|1:21204308_G_T:21204308:3,6,0,3
chr17	21204314	.	TTG	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:0|1:21204308_G_T:21204308:2,6,0,2
chr17	21204318	.	A	ACG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:0|1:21204308_G_T:21204308:2,6,0,2
chr17	21205606	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,5:1,10:0,2,2,13
chr17	21205642	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,1:4,2:0|1:21205642_T_G:21205642:0,6,0,3
chr17	21205654	.	AT	GA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,1:4,2:0|1:21205642_T_G:21205642:0,6,0,3
chr17	21206372	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr17	21206444	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:5,5:6,1:5,7,5,1
chr17	21207649	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr17	21207813	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,2:14,1:13,18,1,2
chr17	21207909	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:0|1:21207909_G_A:21207909:0,6,1,6
chr17	21207916	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,5:0,6:0|1:21207909_G_A:21207909:0,0,0,13
chr17	21208292	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=127,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,0:2,3:4,1,3,0
chr17	21208317	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,1:1,7:5,2,5,3
chr17	21208347	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:12,1:3,3:9,6,0,4
chr17	21208349	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=129,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,5:4,2:4,8,5,2
chr17	21215434	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=148,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:3,1:10,1:7,7,3,1
chr17	21215446	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,2:11,1:10,9,2,1
chr17	21215483	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:6,2:9,1:9,7,2,1
chr17	21215637	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:5,1:0,4:0|1:21215637_G_A:21215637:0,5,1,4
chr17	21215643	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:5,1:1,4:0|1:21215637_G_A:21215637:0,6,1,4
chr17	21215671	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr17	21217547	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:6,2:1,1:0|1:21217547_T_C:21217547:3,6,0,3
chr17	21217554	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,2:2,1:0|1:21217547_T_C:21217547:3,6,0,3
chr17	21217566	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:2,4,0,3
chr17	21217586	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	21318629	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr17	21318663	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,2:1,0:4,0,3,0
chr17	21318912	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=160,90;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:12,6:14,1:13,13,4,3
chr17	21318918	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=166,90;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.356:29:7,8:11,2:12,7,4,6
chr17	21318948	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:3,2:8,0:0|1:21318948_C_T:21318948:4,8,1,1
chr17	21318951	.	CA	TG	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,2:6,0:0|1:21318948_C_T:21318948:4,8,1,1
chr17	21318952	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:1,2:5,0:2,4,1,1
chr17	21319007	.	GG	AC	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=202,181;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:3,5:4,3:3,5,2,6
chr17	21319399	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=30,35;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,4:6,1:6,4,4,1
chr17	21319407	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,0:6,3:9,5,2,1
chr17	21319473	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=34,25;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:3,8:8,5:8,5,9,5
chr17	21319519	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=150,180;MMQ=52,55;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,1:4,0:0|1:21319519_G_C:21319519:7,9,1,1
chr17	21319523	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=150,180;MMQ=52,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:7,1:0|1:21319519_G_C:21319519:8,8,1,1
chr17	21319527	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=170,180;MMQ=52,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:6,1:0|1:21319519_G_C:21319519:8,8,1,1
chr17	21319543	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=159,180;MMQ=48,50;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,0:8,3:8,6,2,2
chr17	21319560	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=152,121;MMQ=52,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:4,1:13,2:11,7,2,1
chr17	21319650	.	CGAG	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=138,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.256:41:15,5:14,5:13,18,5,5
chr17	21319682	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:8,2:10,5:5,14,2,5
chr17	21320197	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,1:3,1:0|1:21320197_G_C:21320197:4,8,1,1
chr17	21320210	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,0:5,2:0|1:21320197_G_C:21320197:5,8,2,1
chr17	21320212	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:4,5,3,3
chr17	21320365	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.369:25:8,5:7,4:2,14,2,7
chr17	21320405	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.490:8:2,2:2,2:0|1:21320405_T_A:21320405:1,3,2,2
chr17	21320418	.	G	GGAGA	.	.	DP=7;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=154,183;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0|1:21320405_T_A:21320405:2,3,2,0
chr17	21320424	.	ATTTTT	A,ATTTT	.	.	DP=7;ECNT=12;MBQ=31,23,33;MFRL=197,183,154;MMQ=60,45,60;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,4,8;RU=T;STR;TLOD=6.96,9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.400:7:0,0,1:2,1,2:0,2,4,1
chr17	21320426	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=197,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:0|1:21320426_T_A:21320426:0,2,2,1
chr17	21320429	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=12;MBQ=35,32;MFRL=256,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.674:4:0,0:1,2:0|1:21320426_T_A:21320426:0,1,2,1
chr17	21320436	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=12;MBQ=32,33;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:21320426_T_A:21320426:3,1,2,0
chr17	21320440	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=12;MBQ=37,28;MFRL=256,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,5,0
chr17	21320442	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=12;MBQ=34,23;MFRL=189,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,0:2,1:0|1:21320426_T_A:21320426:3,1,4,0
chr17	21320451	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0|1:21320426_T_A:21320426:2,1,4,0
chr17	21320480	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=27,27;MFRL=172,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.607:12:1,2:3,3:0|1:21320480_A_G:21320480:4,1,6,1
chr17	21320499	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=32,20;MFRL=172,109;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.701:16:2,5:3,6:0|1:21320480_A_G:21320480:4,1,6,5
chr17	21320529	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=16;MBQ=32,29;MFRL=168,130;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.700:28:3,7:5,12:6,2,7,13
chr17	21320545	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=16;MBQ=33,31;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:6,4:10,6:6,12,4,6
chr17	21320555	.	CA	TG	.	.	DP=27;ECNT=16;MBQ=33,31;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:3,6:3,12:5,2,4,15
chr17	21320578	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=16;MBQ=34,30;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,2:9,4:7,8,1,5
chr17	21320586	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=16;MBQ=31,32;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,2:10,2:7,8,1,3
chr17	21320595	.	CA	TG	.	.	DP=23;ECNT=16;MBQ=35,32;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,4:6,9:6,4,3,10
chr17	21320605	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=16;MBQ=31,33;MFRL=145,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:4,1:8,6:5,7,3,4
chr17	21320658	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=16;MBQ=32,33;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0|1:21320658_C_T:21320658:8,4,0,2
chr17	21320675	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=16;MBQ=30,34;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:0|1:21320658_C_T:21320658:9,2,1,1
chr17	21320681	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=16;MBQ=28,31;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,2:4,1:0|1:21320658_C_T:21320658:9,2,2,3
chr17	21320690	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=16;MBQ=31,32;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:7,2:1,3:0|1:21320658_C_T:21320658:8,2,3,3
chr17	21320699	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=16;MBQ=28,24;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:5,2:4,1:0|1:21320658_C_T:21320658:10,2,3,3
chr17	21320711	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=16;MBQ=33,34;MFRL=152,76;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:8,3:11,6,1,2
chr17	21320787	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=16;MBQ=32,31;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.469:45:12,4:11,16:10,14,11,10
chr17	21320796	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=128,81;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,28:0.592:47:9,11:10,15:0|1:21320796_C_T:21320796:8,11,14,14
chr17	21320798	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=16;MBQ=30,33;MFRL=128,80;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,27:0.583:46:9,10:10,14:0|1:21320796_C_T:21320796:8,11,13,14
chr17	21320826	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,7:0.166:46:20,6:17,1:13,26,3,4
chr17	21320853	.	CA	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:10,3:12,3:0|1:21320853_CA_C:21320853:8,14,2,4
chr17	21320855	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:9,3:12,3:0|1:21320853_CA_C:21320853:8,14,2,4
chr17	21320867	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:13,2:8,3:9,13,1,4
chr17	21320882	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=149,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:7,5:8,3:5,10,4,5
chr17	21320884	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,1:9,1:7,14,2,0
chr17	21320890	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,3:10,1:7,13,2,2
chr17	21320980	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=157,53;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:3,9:4,3:3,4,9,3
chr17	21320991	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,5:5,1:5,7,5,1
chr17	21320993	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,6:3,2:3,5,7,2
chr17	21321016	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:2,2:1,4,2,1
chr17	21321029	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:2,2:1,4,1,2
chr17	21321050	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:0|1:21321050_C_T:21321050:1,4,3,4
chr17	21321052	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:0|1:21321050_C_T:21321050:1,4,3,4
chr17	21321064	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:4,2:5,6,1,1
chr17	21321104	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=86,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:5,3:4,7:3,6,7,3
chr17	21321145	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:3,4:6,5:3,7,5,4
chr17	21321173	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=212,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:1,5:8,5:5,4,7,3
chr17	21321207	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=195,1706;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.269:23:6,4:11,1:13,4,6,0
chr17	21321250	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=170,1677;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,5:4,8:5,1,12,1
chr17	21321252	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=201,1685;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.288:19:4,2:9,3:12,2,5,0
chr17	21321360	.	T	TAA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=130,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:6,0:16,2:0|1:21321360_T_TAA:21321360:12,10,1,1
chr17	21321366	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=130,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:4,0:13,1:0|1:21321360_T_TAA:21321360:12,9,1,1
chr17	21322642	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=93,131;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,1:0|1:21322642_A_G:21322642:7,4,1,1
chr17	21322643	.	T	TCA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=93,131;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,1:0|1:21322642_A_G:21322642:7,4,1,1
chr17	21322847	.	G	T	.	.	DP=83;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,20:0.256:79:29,12:28,7:33,26,11,9
chr17	21322859	.	CTG	C	.	.	DP=96;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=110,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,14:0.168:87:38,4:28,10:38,35,4,10
chr17	21322880	.	A	C	.	.	DP=90;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=125,110;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=178.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,46:0.529:87:25,23:14,22:0|1:21322880_A_C:21322880:15,26,18,28
chr17	21322883	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=181.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,47:0.546:86:22,24:10,21:0|1:21322880_A_C:21322880:13,26,18,29
chr17	21322902	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,22:0.332:67:21,16:22,6:8,37,7,15
chr17	21322933	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.267:42:14,8:17,2:1,30,0,11
chr17	21322972	.	GT	CC	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=33,34;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:3,5:3,9:1,5,1,14
chr17	21322975	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:6,2:6,6:1,12,1,7
chr17	21323001	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=28,28;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,2:2,6:2,1,3,6
chr17	21323015	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,1:6,4:6,3,2,3
chr17	21323033	.	CG	TA	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=191,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,3:2,7:3,0,7,3
chr17	21323049	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,2:7,2:9,1,3,1
chr17	21323056	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=20,29;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:4,1:3,5:0|1:21323056_G_T:21323056:7,3,5,2
chr17	21323074	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=30,34;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,1:4,4:0|1:21323056_G_T:21323056:5,4,4,2
chr17	21323096	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:4,5:0,7:3,1,7,6
chr17	21323107	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,3:6,2:8,6,3,2
chr17	21323119	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=31,35;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:10,2:3,6:0|1:21323119_T_C:21323119:8,5,3,5
chr17	21323136	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:7,2:6,7:0|1:21323119_T_C:21323119:8,6,3,6
chr17	21323154	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.321:26:7,2:9,6:0|1:21323119_T_C:21323119:9,9,3,5
chr17	21323163	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:7,1:8,5:0|1:21323119_T_C:21323119:8,9,2,4
chr17	21323195	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:6,2:5,4:0|1:21323195_T_C:21323195:2,9,2,4
chr17	21323214	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:2,3:0|1:21323195_T_C:21323195:0,6,1,3
chr17	21323245	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=31,30;MFRL=174,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:21323245_G_A:21323245:0,3,0,1
chr17	21323249	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=12,26;MFRL=174,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.439:5:0,1:1,1:0|1:21323245_G_A:21323245:0,3,0,2
chr17	25630388	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:4,0,7,2
chr17	25909850	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.649:35:2,16:10,7:6,6,7,16
chr17	25910205	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25910205_C_T:25910205:0,1,0,1
chr17	25910208	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25910205_C_T:25910205:0,1,0,1
chr17	25910209	.	A	ACTCCATCCATGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25910205_C_T:25910205:0,1,0,1
chr17	25912828	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr17	25917810	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr17	25929036	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,2:4,8:2,7,2,8
chr17	25932940	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr17	25935063	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.438:20:3,0:3,0:6,5,0,9
chr17	25935104	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:3,4:6,5:0,10,0,9
chr17	25944235	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	25958427	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=191,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.657:16:1,1:3,1:2,3,0,11
chr17	25968091	.	C	CATTCTAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr17	25968121	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=221,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	25969440	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=131.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,16:0,23:0,0,1,38
chr17	25970723	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=175,192;MMQ=51,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,6:3,3:0,6,0,9
chr17	25974258	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.506:32:6,10:8,6:11,5,14,2
chr17	25974545	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr17	26087687	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,148;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:22,3:18,0:0|1:26087687_C_A:26087687:26,15,3,0
chr17	26087690	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=151,148;MMQ=60,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:22,3:17,0:0|1:26087687_C_A:26087687:26,15,3,0
chr17	26088337	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	26092555	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr17	26096473	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,3:2,2:5,1,5,0
chr17	26100205	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:8,9,1,1
chr17	26100321	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	26101510	.	AAG	TGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:26101510_AAG_TGT:26101510:1,2,0,1
chr17	26101515	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,26;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:26101510_AAG_TGT:26101510:1,2,0,1
chr17	26101519	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:26101510_AAG_TGT:26101510:1,2,0,1
chr17	26106150	.	TAG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:3,1:1,1:0|1:26106150_TAG_T:26106150:1,3,0,2
chr17	26106156	.	CT	GA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:26106150_TAG_T:26106150:1,4,0,2
chr17	26108040	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr17	26109030	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,15,5
chr17	26604370	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,0:11,3:7,17,1,2
chr17	26646434	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,0,14
chr17	26669245	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	26679845	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=183,182;MMQ=52,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:13,0,2,0
chr17	26679854	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=184,157;MMQ=58,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:13,1,2,0
chr17	26684283	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	26684449	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	26684984	.	C	CACCCCAAAAAAGGTTTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=230,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	26687484	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr17	26687898	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr17	26695704	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=75,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,1,4
chr17	26695832	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:2,4:3,8:4,1,9,3
chr17	26696492	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	26699367	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	26708298	.	A	AGC	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=217.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,49:0.981:49:0,24:0,22:0|1:26708298_A_AGC:26708298:0,0,25,24
chr17	26708302	.	GGT	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=220.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,26:0,23:0|1:26708298_A_AGC:26708298:0,0,26,24
chr17	26708550	.	TC	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,11,7
chr17	26727721	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=62.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,10:0,0,8,10
chr17	26729428	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	26817568	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:3,4:7,5:4,6,5,5
chr17	26818676	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr17	26820867	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:26820867_G_GGT:26820867:0,3,0,1
chr17	26820869	.	A	AGTGCCTGAGACCTTGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:26820867_G_GGT:26820867:0,3,0,1
chr17	26823497	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,536;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:5,4,2,0
chr17	26850929	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,2:0,10:0,0,12,0
chr17	26851501	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,10:0,0,18,8
chr17	26883324	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,155;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,0:3,3:2,7,0,3
chr17	26890999	.	T	TACCACCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:26890999_T_TACCACCA:26890999:1,1,0,1
chr17	26891000	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:26890999_T_TACCACCA:26890999:1,1,0,1
chr17	26891001	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:26890999_T_TACCACCA:26890999:1,1,0,1
chr17	26898463	.	A	C	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,18:0.161:88:28,2:23,1:18,52,18,0
chr17	26905320	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:9,2:2,20,0,2
chr17	26911259	.	T	C,TCTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34,29;MFRL=112,188,175;MMQ=60,60,60;MPOS=11,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,1,1:1,0,0:0,3,0,2
chr17	26911261	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:26911261_C_A:26911261:0,4,0,1
chr17	26911266	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=112,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:26911261_C_A:26911261:0,3,0,1
chr17	26911529	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr17	26911647	.	TAC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,2:9,1:17,4,3,0
chr17	26913625	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=205,172;MMQ=40,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	26940374	.	GA	AG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=151,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:4,2:4,0:0|1:26940374_GA_AG:26940374:3,5,1,1
chr17	26940378	.	G	GACAAATCAAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=160,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:26940374_GA_AG:26940374:2,6,1,1
chr17	26940379	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=160,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,0:0|1:26940374_GA_AG:26940374:2,6,1,1
chr17	26959018	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:10,0:16,2,2,0
chr17	26961175	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:26961175_C_A:26961175:0,2,0,1
chr17	26961181	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:26961175_C_A:26961175:0,2,0,1
chr17	26961183	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:26961175_C_A:26961175:0,2,0,1
chr17	26964809	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=174,116;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.441:5:1,2:1,0:3,0,1,1
chr17	27000391	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr17	27002402	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,14,3
chr17	27004703	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr17	27010854	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.505:10:4,4:1,1:3,2,3,2
chr17	27013880	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=227,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27013880_A_G:27013880:0,2,0,1
chr17	27013887	.	T	TAGTGGATCTGGTATAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=227,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27013880_A_G:27013880:0,2,0,1
chr17	27025111	.	G	GCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	27028581	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:2,3,1,1
chr17	27049858	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,134;MMQ=50,35;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:16,2:18,0:20,14,1,1
chr17	27050924	.	AAT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=122,139;MMQ=55,41;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:6,1:8,1:2,15,0,2
chr17	27050970	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=143,107;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr17	27068642	.	C	CCTTGTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=237,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:27068642_C_CCTTGTTTT:27068642:1,3,0,1
chr17	27068643	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=237,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:27068642_C_CCTTGTTTT:27068642:1,3,0,1
chr17	27074906	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,34;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:11,5,1,1
chr17	27093542	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr17	27187636	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=247,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr17	27188287	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:27188287_C_CGG:27188287:1,0,1,0
chr17	27188288	.	CTA	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,11;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27188287_C_CGG:27188287:1,0,1,0
chr17	27188297	.	AT	GA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,19;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27188287_C_CGG:27188287:0,0,1,0
chr17	27188302	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27188287_C_CGG:27188287:0,0,1,0
chr17	27188304	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27188287_C_CGG:27188287:0,0,1,0
chr17	27188310	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,24;MFRL=96,158;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr17	27207453	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr17	27211187	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr17	27224485	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.331:25:6,1:6,2:6,10,9,0
chr17	27224493	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.332:32:10,0:8,1:8,13,11,0
chr17	27224497	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.220:34:12,0:11,2:11,15,8,0
chr17	27225399	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:3,1:5,3:7,2,3,1
chr17	27225937	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr17	27228470	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=27,12;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.768:11:1,1:1,0:0|1:27228470_A_C:27228470:0,2,9,0
chr17	27228474	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=33,12;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.712:12:1,0:2,0:0|1:27228470_A_C:27228470:1,2,9,0
chr17	27228477	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=30,14;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.747:10:1,2:1,1:0|1:27228470_A_C:27228470:0,2,8,0
chr17	27228482	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,3:1,2:0|1:27228470_A_C:27228470:1,2,6,0
chr17	27228488	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=31,12;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,1:2,0:0|1:27228470_A_C:27228470:2,3,5,0
chr17	27228489	.	C	CCCCCGG	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=30,35;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,2:2,1:0|1:27228470_A_C:27228470:2,3,3,0
chr17	27228491	.	C	CCG	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:3,0:2,1:0|1:27228470_A_C:27228470:2,3,3,0
chr17	27228492	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=31,17;MFRL=143,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:1,0:0|1:27228470_A_C:27228470:2,3,2,0
chr17	27239376	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr17	27240802	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,172;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr17	27244473	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=168,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,3:7,1:2,10,1,3
chr17	27254179	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	27284566	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.567:12:1,1:4,6:0,5,1,6
chr17	27286662	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=166,282;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr17	27290969	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=107,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:3,3:4,2:4,3,4,2
chr17	27401010	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,3:2,4,3,4
chr17	27409548	.	G	GCTTCTGATGAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,96;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27409548_G_GCTTCTGATGAT:27409548:0,0,0,1
chr17	27409550	.	G	GCAGCTTAAAGAGTTCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27409548_G_GCTTCTGATGAT:27409548:0,0,0,1
chr17	27409552	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=172,96;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.663:2:0,0:0,1:0|1:27409548_G_GCTTCTGATGAT:27409548:0,1,0,1
chr17	27413908	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=70,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,3,0
chr17	27421601	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=214,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,0:0,6:3,0,5,1
chr17	27424808	.	GCAT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAT;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:9,2:8,0:12,7,2,0
chr17	27437134	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr17	27437198	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=138,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27437198_C_G:27437198:0,1,0,1
chr17	27437208	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27437198_C_G:27437198:0,0,0,1
chr17	27442561	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr17	27445576	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	27492869	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	27580872	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=225,465;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,0:2,3:2,2,3,0
chr17	27614758	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr17	27857698	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr17	27861111	.	TTTTC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,2:12,1:24,4,1,2
chr17	27898828	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:2,3,1,3
chr17	27899433	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,0:6,3:6,8,0,3
chr17	27901975	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr17	27902164	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=173,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,2:3,0:3,5,1,1
chr17	27902409	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=123,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:11,2:17,1:13,15,2,1
chr17	27904322	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	27905673	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,3:0,0,13,3
chr17	27944089	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr17	27944493	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=204,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,1:2,0,1,1
chr17	27949934	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=53.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,5:0,8:0,0,0,15
chr17	27959901	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=180,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,0:8,3:4,6,1,2
chr17	27959903	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.603:13:0,2:5,6:2,3,3,5
chr17	28029938	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,3:2,5:8,0,7,1
chr17	28120851	.	A	C	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,34:0.529:64:20,21:10,12:25,5,33,1
chr17	28320248	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,21:0,23:0,0,30,16
chr17	28323499	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=210,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr17	28378276	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.598:15:3,3:2,6:0,6,3,6
chr17	28384938	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=141,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28384938_G_C:28384938:0,1,0,1
chr17	28384943	.	G	GTTGAGAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=141,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28384938_G_C:28384938:0,1,0,1
chr17	28408070	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	28409977	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:12,0:11,2:10,13,1,1
chr17	28410124	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:0,6,1,4
chr17	28414268	.	C	CCCAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	28417376	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:4,1,4,0
chr17	28434826	.	ACTTTT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTTT;STR;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:2,1:5,0,4,0
chr17	28444254	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,3:3,3:0,6,0,7
chr17	28505024	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,8:3,5:7,0,13,0
chr17	28511978	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=175,127;MMQ=60,56;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.463:39:11,9:9,9:14,7,9,9
chr17	28538532	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr17	28549898	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr17	28656624	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28656624_T_C:28656624:0,1,0,1
chr17	28656629	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28656624_T_C:28656624:0,1,0,1
chr17	28656630	.	A	ATTCACGGTGGTAAACAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28656624_T_C:28656624:0,1,0,1
chr17	28706143	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,36;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr17	28773060	.	CTT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,35;MFRL=195,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.206:12:3,0:5,2:0,10,0,2
chr17	28773092	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=152,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr17	28778720	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=115.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,14:0,0,23,9
chr17	28811658	.	G	GT,GTT	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=28,35,36;MFRL=154,149,160;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=103.75,7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,38,7:0.822,0.105:49:3,17,3:1,17,4:1,3,39,6
chr17	28811669	.	C	G,A	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=19,19,14;MFRL=149,126,160;MMQ=60,60,60;MPOS=26,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.91,7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:43,6,7:0.130,0.094:56:12,1,0:6,0,0:30,13,13,0
chr17	28811677	.	C	A	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=19,10;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,6:0.077:64:19,0:9,0:42,16,6,0
chr17	28811834	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,34,33,34;MFRL=155,150,136,209;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,17,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.94,5.95,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:13,4,4,3:0.166,0.190,0.131:24:4,1,3,0:9,2,1,2:2,11,0,11
chr17	28889768	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,176;MMQ=40,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,4:7,0:12,0,4,0
chr17	28890203	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr17	29161242	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:14,0:16,4:15,15,0,4
chr17	29182078	.	TAAAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,144;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:3,0,1,0
chr17	29184120	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:6,8,0,2
chr17	29192700	.	ATT	A,AT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=147,143,194;MMQ=60,60,60;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.98,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,2,3:0.113,0.155:23:7,1,2:10,1,1:17,1,5,0
chr17	29206419	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,3:5,2:9,0,6,1
chr17	29311811	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:29311811_A_T:29311811:0,4,0,1
chr17	29311814	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:29311811_A_T:29311811:0,4,0,1
chr17	29486152	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=117.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,18:0,16:0,0,5,29
chr17	29496819	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,17,0
chr17	29508818	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,10:0.140:60:21,0:22,0:29,21,0,10
chr17	29508819	.	AT	A,ATT	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=31,15,25;MFRL=135,181,154;MMQ=60,60,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=5.88,15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,14:0.089,0.586:27:2,0,6:4,0,0:4,4,6,13
chr17	29527461	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:8,5,1,1
chr17	29541437	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=120.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,20:0,13:0,0,33,1
chr17	29545987	.	A	AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=254,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=84.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.966:32:0,17:1,14:1,0,28,3
chr17	29546175	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=76.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,10:0,0,0,21
chr17	29557199	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,220;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,0,2
chr17	29563075	.	GT	G,GTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,23,14;MFRL=111,134,107;MMQ=60,60,60;MPOS=24,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.79,10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,9:0.162,0.311:29:7,2,0:4,0,2:3,13,1,12
chr17	29622377	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:15,5,2,0
chr17	29647358	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.683:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr17	29653293	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	29654876	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr17	29663624	.	TT	AA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr17	29670190	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr17	29679246	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=110.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,20:0,11:0,0,33,1
chr17	29684482	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:0,12,3,0
chr17	29848460	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr17	29850691	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,1:5,4:1,7,0,5
chr17	29852092	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=163.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,33:0,19:0,0,41,12
chr17	29855661	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,3:5,7:5,3,4,6
chr17	29857264	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr17	29858832	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	29858847	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29858847_GT_G:29858847:0,1,0,1
chr17	29858851	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:29858847_GT_G:29858847:0,1,0,1
chr17	30183840	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,0:2,2:2,6,1,1
chr17	30183849	.	C	CTGTGTGTG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:3,8,1,1
chr17	30183857	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,2:0,0,2,8
chr17	30183964	.	C	CTAGAAATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30183964_C_CTAGAAATT:30183964:0,1,0,1
chr17	30183968	.	CT	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30183964_C_CTAGAAATT:30183964:0,1,0,1
chr17	30185661	.	AAGG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:2,0,5,0
chr17	30185892	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	30190348	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,6:6,2:7,1,8,0
chr17	30202475	.	C	CAATGAGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:30202475_C_CAATGAGAA:30202475:0,3,0,1
chr17	30202477	.	A	AAAGACAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:30202475_C_CAATGAGAA:30202475:0,3,0,1
chr17	30219303	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,5:7,7:5,9,8,4
chr17	30228656	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:0,5,1,1
chr17	30293149	.	CT	C,CTT	.	.	DP=119;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=137,166,181;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=23.02,12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:51,17,11:0.207,0.135:79:26,9,5:20,7,6:19,32,18,10
chr17	30302786	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=199,188;MMQ=52,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr17	30500816	.	GT	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=174,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:13,3:17,0:31,0,3,0
chr17	30509939	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr17	30509965	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:30509965_G_A:30509965:0,0,0,1
chr17	30509967	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30509965_G_A:30509965:0,0,0,1
chr17	30509970	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30509965_G_A:30509965:0,0,0,1
chr17	30509973	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30509965_G_A:30509965:0,0,0,1
chr17	30531083	.	T	TACTATACTATATG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30531083_T_TACTATACTATATG:30531083:0,0,0,1
chr17	30531086	.	C	CTCAACTCAAACTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30531083_T_TACTATACTATATG:30531083:0,0,0,1
chr17	30538333	.	A	ATTATTAATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:30538333_A_ATTATTAATT:30538333:0,4,0,1
chr17	30538334	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:30538333_A_ATTATTAATT:30538333:0,4,0,1
chr17	30538336	.	G	GTATAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:30538333_A_ATTATTAATT:30538333:0,4,0,1
chr17	30551679	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:13,2:12,13,1,1
chr17	30632274	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr17	30643361	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr17	30659006	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,15:0,6:0,0,5,16
chr17	30665005	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,9:4,2:0,7,2,9
chr17	30687522	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	30696292	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=126.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,19:0,13:0|1:30696292_C_T:30696292:0,0,23,9
chr17	30696296	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,16:0.532:30:7,11:7,5:0|1:30696292_C_T:30696292:10,4,11,5
chr17	30791503	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,14,7
chr17	30791509	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,5:5,4:7,5,7,2
chr17	30800859	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,0:10,3:12,11,1,2
chr17	30816055	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:20,0:15,3:18,17,0,3
chr17	30816537	.	G	GGGGGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:1,2:0,0:0|1:30816537_G_GGGGGC:30816537:0,1,2,0
chr17	30816543	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:1,2:0,0:0|1:30816537_G_GGGGGC:30816537:1,1,2,0
chr17	30822034	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr17	30980972	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr17	30981703	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30981703_T_TC:30981703:0,1,0,1
chr17	30981714	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=86,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:30981703_T_TC:30981703:0,2,0,1
chr17	30981715	.	T	TTAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=86,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:30981703_T_TC:30981703:0,2,0,1
chr17	31039255	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr17	31082747	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	31107845	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr17	31258686	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	31266419	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:31266419_T_C:31266419:0,0,9,1
chr17	31266438	.	A	AAAGG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGG;STR;TLOD=78.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0|1:31266419_T_C:31266419:0,0,8,10
chr17	31344746	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr17	31351121	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:31351121_A_G:31351121:0,0,2,4
chr17	31351125	.	G	GTGTCTCTTTCTAACAGAGGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.376:3:2,1:0,0:0|1:31351121_A_G:31351121:2,0,0,1
chr17	31355227	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=59.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,7:0,0,17,1
chr17	31439097	.	AAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr17	32583309	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:7,10,1,1
chr17	32612924	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32612924_C_T:32612924:0,1,0,1
chr17	32612944	.	C	CCATACCTGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32612924_C_T:32612924:0,0,0,1
chr17	32688712	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	32904480	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr17	32908064	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr17	32956286	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	32956933	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr17	32961751	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr17	32965285	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,1,8
chr17	33269648	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:7,4:5,2:4,8,1,6
chr17	33309982	.	CTTT	C,CT,CTT,CTTTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,33,35,34,33;MFRL=137,113,131,128,91;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=11,27,19,17;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.96,6.21,7.13,6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:2,3,6,5,7:0.125,0.217,0.236,0.299:23:1,2,4,4,3:1,1,1,1,3:2,0,18,3
chr17	33330150	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,5:3,10:0,5,1,14
chr17	33331575	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,7:4,0:0,9,1,6
chr17	33341711	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,205;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:5,3,2,0
chr17	33341834	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=112,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:10,7:4,6:4,10,1,13
chr17	33353332	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=101,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:7,1,4,1
chr17	33446049	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:12,4:23,0:34,3,4,0
chr17	33446058	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=153,165;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:16,1:21,1:34,4,2,0
chr17	33457471	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=212,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr17	33463568	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr17	33464712	.	CCAAA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33464712_CCAAA_C:33464712:0,0,0,1
chr17	33464718	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33464712_CCAAA_C:33464712:0,0,0,1
chr17	33464721	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33464712_CCAAA_C:33464712:0,0,0,1
chr17	33464864	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.587:15:4,4:2,5:2,4,3,6
chr17	33497331	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	33501432	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=107,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:5,1:2,5:1,6,0,8
chr17	33502937	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,2:1,8:3,0,6,4
chr17	33510656	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,0:2,3:0,3,0,3
chr17	33513649	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=17,34;MFRL=106,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr17	33513673	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33513673_T_C:33513673:0,0,0,1
chr17	33513676	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33513673_T_C:33513673:0,0,0,1
chr17	33513677	.	A	ACTCCTTTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33513673_T_C:33513673:0,0,0,1
chr17	33520263	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,132;MMQ=48,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,6:8,5:7,4,8,3
chr17	33591589	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:5,5,1,1
chr17	33591987	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=192,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,8:1,4:0,3,5,7
chr17	33592194	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.531:34:10,7:5,11:12,4,9,9
chr17	33592591	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:1,3,5,3
chr17	33592621	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=157,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:5,2,2,0
chr17	33690863	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr17	33748939	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr17	33807250	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr17	33879670	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=160,183;MMQ=52,36;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AT;STR;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr17	33879682	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AT;STR;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr17	33881718	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,8:0,10:0,0,2,17
chr17	33881734	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:3,2:5,3:0,8,2,4
chr17	33881767	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,14;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.489:10:2,1:1,0:0,5,0,5
chr17	33881769	.	TAAAAA	T,TAA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,33,20;MFRL=138,154,185;MMQ=60,60,60;MPOS=19,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,13,15;RU=A;STR;TLOD=6.50,6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.418,0.383:8:1,0,1:0,3,1:0,1,0,7
chr17	33921160	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,1,23
chr17	33954302	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	33954527	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.501:34:6,8:11,9:6,11,7,10
chr17	33968871	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr17	33998802	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=139,83;MMQ=52,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,1:8,3:6,5,1,3
chr17	34001121	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	34001139	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr17	34037420	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=197,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr17	34071852	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,1:2,4:2,0,3,2
chr17	34072921	.	C	CATCTAGCATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=123,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	34073302	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,1:10,1:0|1:34073302_T_C:34073302:8,9,0,2
chr17	34073306	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:0|1:34073302_T_C:34073302:8,8,0,2
chr17	34073311	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,1:7,1:0|1:34073302_T_C:34073302:8,6,0,2
chr17	34079752	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=143,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,3:8,1:6,6,2,2
chr17	34100327	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:7,4:9,2:7,10,4,2
chr17	34100350	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,11:0,0,7,15
chr17	34161648	.	G	GT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=120,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:17,1:16,2:13,24,0,5
chr17	34171590	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=81,93;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.487:45:10,9:12,10:7,16,11,11
chr17	34340161	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr17	34416453	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,10:0,14:0,0,24,0
chr17	34416665	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=113.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,17:0,0,10,21
chr17	34431211	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,177;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:14,8:7,4:19,2,12,0
chr17	34431403	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,147;MMQ=50,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,31:0.415:75:25,16:19,15:10,34,6,25
chr17	34431852	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=137,235;MMQ=32,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:9,1:18,2,2,0
chr17	34431884	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,12,15
chr17	34432125	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=200,182;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.470:9:1,0:2,4:0,5,0,4
chr17	34432581	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=161,120;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,15:0.326:47:18,7:14,7:0|1:34432581_T_C:34432581:29,3,14,1
chr17	34432586	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=159,120;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,15:0.302:51:22,9:14,6:0|1:34432581_T_C:34432581:31,5,13,2
chr17	34624232	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,134;MMQ=25,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:2,2,0,2
chr17	34641433	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,171;MMQ=27,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:18,2:28,2:36,10,4,0
chr17	34842521	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:3,6:10,10:9,4,11,6
chr17	34862220	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=210,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr17	34863146	.	G	GCACTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:34863146_G_GCACTGC:34863146:0,0,0,1
chr17	34863148	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34863146_G_GCACTGC:34863146:0,0,0,1
chr17	34863149	.	A	ACT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34863146_G_GCACTGC:34863146:0,0,0,1
chr17	34866546	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:5,1,3,0
chr17	34869150	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:34869150_C_A:34869150:0,0,5,0
chr17	34869155	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=183,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0|1:34869150_C_A:34869150:3,0,2,0
chr17	34884082	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,173;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:0,11,0,2
chr17	34893596	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,2:15,0:6,20,1,1
chr17	34894609	.	AT	A	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,6:0.089:71:34,3:23,2:16,49,2,4
chr17	34910761	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,103;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.113:42:17,4:20,0:0|1:34910761_G_T:34910761:6,32,0,4
chr17	34910767	.	T	TTCCTTCTTATGTTCTAGATTTGGTTTTATTCTTC	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=148,103;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:18,4:18,0:0|1:34910761_G_T:34910761:6,31,0,4
chr17	34935878	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,2:4,7:0,8,0,9
chr17	34943374	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=131,156;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:8,0:0|1:34943374_A_T:34943374:7,6,2,0
chr17	34943378	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=131,156;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:7,0:0|1:34943374_A_T:34943374:7,6,2,0
chr17	34943380	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=131,156;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:7,0:0|1:34943374_A_T:34943374:7,6,2,0
chr17	34943719	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.655:9:2,4:0,2:0,3,0,6
chr17	34943752	.	GCT	ATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	34956585	.	CCA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:6,3:10,3:6,10,2,5
chr17	35300494	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.587:7:0,0:0,2:0,3,0,4
chr17	35454175	.	GGCATAAAAACTGAT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr17	35468505	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=121,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:17,0:12,2:17,12,0,2
chr17	35468640	.	C	CTGAGTT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=35,33;MFRL=198,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:35468640_C_CTGAGTT:35468640:0,3,0,1
chr17	35468641	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=198,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1|0:35468640_C_CTGAGTT:35468640:0,3,0,1
chr17	35468643	.	A	G,AT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,34,29;MFRL=214,95,100;MMQ=60,60,60;MPOS=16,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,1:1,1,0:0,2,0,2
chr17	35468648	.	GG	AC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=198,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1|0:35468640_C_CTGAGTT:35468640:0,3,0,1
chr17	35468651	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,28;MFRL=214,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,1:1|0:35468640_C_CTGAGTT:35468640:0,2,0,1
chr17	35468654	.	TT	AG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,26;MFRL=198,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1|0:35468640_C_CTGAGTT:35468640:0,1,0,1
chr17	35468657	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=198,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1|0:35468640_C_CTGAGTT:35468640:0,1,0,1
chr17	35486486	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=227,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr17	35486495	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=240,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:35486495_A_C:35486495:0,4,0,1
chr17	35486497	.	A	ACTTCCACCAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=240,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:35486495_A_C:35486495:0,4,0,1
chr17	35538304	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,3:5,0:2,12,0,3
chr17	35549275	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr17	35550416	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:5,4:13,11:0,18,1,14
chr17	35550448	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0,0,0,21
chr17	35557289	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,3,1
chr17	35581887	.	TTATATA	T,TTATA,TTATATATA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30,29,29;MFRL=131,203,137,147;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,18,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,9,11,13;RU=TA;STR;TLOD=6.36,8.67,12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,3,4:0.186,0.302,0.372:10:1,2,1,1:0,0,2,3:1,0,9,0
chr17	35583186	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,1:6,2:9,1,3,0
chr17	35608889	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	35609746	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr17	35627766	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,17;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,1:4,0:0,11,1,2
chr17	35632979	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,9:0,4:0,0,0,14
chr17	35696804	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:35696804_G_A:35696804:0,0,0,2
chr17	35696820	.	AAAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:35696804_G_A:35696804:0,0,0,2
chr17	35696878	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=234,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr17	35733204	.	T	TGCAGATAGACACGTAGACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=203,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	35771517	.	AT	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,172;MMQ=60,42;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.120:22:13,1:6,1:4,16,0,2
chr17	35783565	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=197,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:3,6:0,1:2,1,7,0
chr17	35797763	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,0:6,2:9,1,2,0
chr17	35802737	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:1,17,0,2
chr17	35818592	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,30:0.517:58:16,17:12,13:26,2,26,4
chr17	35818740	.	TG	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,24:0.432:55:16,9:14,15:0|1:35818740_TG_T:35818740:12,19,5,19
chr17	35818742	.	TG	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,24:0.431:55:15,8:14,15:0|1:35818740_TG_T:35818740:12,19,5,19
chr17	35825459	.	TAA	T,TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28,29;MFRL=141,108,159;MMQ=60,60,60;MPOS=15,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.27,13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,7:0.183,0.442:16:2,1,5:3,1,2:6,0,9,1
chr17	35827743	.	G	GCTGTACCACCTTGGAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.375:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr17	35837135	.	G	GCATTTAGTGTTTGAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35837135_G_GCATTTAGTGTTTGAC:35837135:1,0,0,1
chr17	35837137	.	C	CCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35837135_G_GCATTTAGTGTTTGAC:35837135:1,0,0,1
chr17	35837142	.	GA	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35837135_G_GCATTTAGTGTTTGAC:35837135:1,0,0,1
chr17	35873399	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=72.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,12:0,10:0,0,9,13
chr17	35873665	.	GTAAC	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TAAC;STR;TLOD=69.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.671:25:4,8:3,7:0,8,0,17
chr17	35898342	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr17	35900738	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35900738_T_A:35900738:0,0,0,1
chr17	35900743	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35900738_T_A:35900738:0,0,0,1
chr17	35936594	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:0,6,0,4
chr17	35937731	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr17	35944539	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	35945366	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:16,0,2,0
chr17	35956263	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr17	35979746	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.284:20:4,3:8,2:11,4,5,0
chr17	35986960	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:17,0:15,4:4,29,0,4
chr17	35988672	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr17	36003275	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr17	36047275	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0|1:36047275_C_T:36047275:5,1,4,0
chr17	36047276	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,5:0.546:9:2,2:2,3:1|0:36047275_C_T:36047275:4,0,4,1
chr17	36047501	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	36058980	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	36059246	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,1:5,7:1,5,0,8
chr17	36061230	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=126,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr17	36477914	.	CA	C,CAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34,33;MFRL=175,132,164;MMQ=60,40,45;MPOS=17,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.56,7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,5:0.114,0.265:20:2,1,0:10,1,5:12,1,7,0
chr17	36478300	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,2,1
chr17	36478345	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=91,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:1,1,3,3
chr17	36478388	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.541:20:5,7:4,3:4,5,6,5
chr17	36491376	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr17	36517651	.	G	GTT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:10,3:8,0:0|1:36517651_G_GTT:36517651:5,14,1,2
chr17	36517655	.	A	AGATGT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:11,3:7,0:0|1:36517651_G_GTT:36517651:5,14,1,2
chr17	36517658	.	GGT	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:12,3:8,0:0|1:36517651_G_GTT:36517651:6,14,1,2
chr17	36619262	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,43;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:7,4,0,2
chr17	36634213	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=190,145;MMQ=27,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:0,5,1,5
chr17	36638179	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=134,143;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:7,0,6,1
chr17	36638388	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,141;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,5:5,5:3,11,2,8
chr17	36638695	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=161,177;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr17	36638715	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=20,13;MFRL=199,158;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:1,0:0|1:36638715_A_C:36638715:2,0,1,0
chr17	36638718	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=20,14;MFRL=199,158;MMQ=50,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:36638715_A_C:36638715:2,0,1,0
chr17	36638723	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,13;MFRL=199,158;MMQ=50,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:36638715_A_C:36638715:2,0,1,0
chr17	36638730	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,13;MFRL=199,158;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:36638715_A_C:36638715:2,0,1,0
chr17	36638732	.	TC	GG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,17;MFRL=206,158;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:36638715_A_C:36638715:3,0,1,0
chr17	36642473	.	CTT	C,CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=19,27,22;MFRL=195,208,194;MMQ=40,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.21,9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.237,0.468:11:1,3,1:0,0,3:0,3,0,8
chr17	36646291	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:9,10:3,1:9,4,7,4
chr17	36653940	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=102,163;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,5:8,4:11,3,9,0
chr17	36656735	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,86;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:16,0,2,0
chr17	36656939	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,151;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.502:32:8,9:8,7:6,10,1,15
chr17	36708648	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:2,1,3,2
chr17	36864223	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr17	36869409	.	A	ACCTCCCTACACTCACCCTGTCCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	36881793	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,105;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:20,0:6,3:16,12,0,3
chr17	36896746	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	36926692	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=105,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:16,0:19,2:21,14,0,2
chr17	36934124	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	36962670	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,4:7,5:2,10,1,8
chr17	36966944	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=201,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr17	36977417	.	A	AGCATGAATCTGCTTTTTATCATCACCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	36981351	.	T	TGCCCCC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.216:16:6,2:6,1:0|1:36981351_T_TGCCCCC:36981351:2,11,3,0
chr17	36981352	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.217:16:5,1:6,1:0|1:36981351_T_TGCCCCC:36981351:2,11,3,0
chr17	37006349	.	GTT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=51.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,9:0,0,16,4
chr17	37009072	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:0,6,0,5
chr17	37046638	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.360:6:0,0:3,0:3,1,2,0
chr17	37070737	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,2,17
chr17	37075129	.	C	CGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=256,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,0:1,1:0|1:37075129_C_CGG:37075129:0,1,0,1
chr17	37075130	.	T	TTTTAAAAAACA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=256,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,0:1,1:0|1:37075129_C_CGG:37075129:0,1,0,1
chr17	37075132	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=256,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37075129_C_CGG:37075129:0,1,0,1
chr17	37107905	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,2:9,0:10,15,0,2
chr17	37234111	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:6,1,2,0
chr17	37239671	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,10:0,0,15,6
chr17	37253064	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=112,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	37253316	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:10,4:3,3:0,13,2,5
chr17	37317672	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr17	37331345	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	37333804	.	TA	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:1,2,0,1
chr17	37358612	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=152,88;MMQ=52,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:27,0:22,2:0|1:37358612_G_C:37358612:29,22,1,1
chr17	37358619	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=153,88;MMQ=52,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,3:0.070:55:27,1:19,2:0|1:37358612_G_C:37358612:28,24,2,1
chr17	37358625	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=150,88;MMQ=52,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,3:0.079:49:24,1:15,2:0|1:37358612_G_C:37358612:26,20,2,1
chr17	37358634	.	CCG	C	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=159,88;MMQ=51,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:23,1:14,2:0|1:37358612_G_C:37358612:18,20,2,1
chr17	37358637	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=159,88;MMQ=51,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:23,1:14,2:0|1:37358612_G_C:37358612:18,20,2,1
chr17	37369416	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37369416_G_A:37369416:0,1,0,1
chr17	37369424	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37369416_G_A:37369416:0,1,0,1
chr17	37371519	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,5:0,0,1,8
chr17	37374223	.	G	GACTGGGCACTGAGGCGGCCACGGGGAGGGGCCAGCGTGGGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=184,118;MMQ=60,54;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.355:6:0,1:4,0:3,1,1,1
chr17	37421767	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr17	37425238	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr17	37427114	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=9,30;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.761:6:0,2:0,2:0,1,0,5
chr17	37564048	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,74;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,3:7,0:3,16,1,2
chr17	37571689	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,179;MMQ=59,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr17	37580140	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:0,2:7,1:0,8,0,3
chr17	37587534	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr17	37618577	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,0:13,2:15,12,0,2
chr17	37627688	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:16,0:7,0:0|1:37627688_C_G:37627688:12,19,5,0
chr17	37627691	.	C	CCCCCCCCCCG	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.248:36:12,5:6,6:5,20,11,0
chr17	37627693	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.123:38:12,0:8,0:0|1:37627688_C_G:37627688:13,21,4,0
chr17	37627699	.	TCT	CAG	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=126,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.112:33:14,1:12,0:0|1:37627688_C_G:37627688:7,23,3,0
chr17	37648996	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:9,2,2,0
chr17	37649030	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=34,18;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:2,0:6,0:0|1:37649030_G_C:37649030:8,1,0,5
chr17	37649033	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,18;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:4,0:6,0:0|1:37649030_G_C:37649030:9,1,0,5
chr17	37649041	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,19;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:4,0:5,0:0|1:37649041_G_C:37649041:9,2,0,4
chr17	37649044	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,10;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:4,0:6,0:0|1:37649041_G_C:37649041:9,2,0,4
chr17	37651026	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=186,263;MMQ=48,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr17	37666115	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:37666115_T_A:37666115:0,5,0,2
chr17	37666121	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:37666115_T_A:37666115:0,4,0,1
chr17	37666123	.	AG	GA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:37666115_T_A:37666115:0,4,0,1
chr17	37666128	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:37666115_T_A:37666115:0,4,0,1
chr17	37671910	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,13,0
chr17	37672067	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=122,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.089:31:19,2:10,0:11,18,0,2
chr17	37783787	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr17	37790371	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr17	37792030	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.315:16:6,0:2,1:8,3,0,5
chr17	37809739	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	37815899	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	37825928	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=120,256;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,2:6,0:6,8,1,1
chr17	37829221	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:10,1,2,0
chr17	37829570	.	CC	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	37829604	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr17	37829961	.	C	CATACTTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=190,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr17	37831035	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	37866005	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	37868715	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=215,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:1,6:0,10:0,1,4,13
chr17	37879525	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,20;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:37879525_C_T:37879525:0,3,1,1
chr17	37879530	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,20;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:37879525_C_T:37879525:0,3,1,1
chr17	37879564	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=78,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,0:5,2:4,8,1,1
chr17	37879682	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:2,1:8,1:4,9,1,1
chr17	37879762	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	37883357	.	A	ATTATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	37898543	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr17	37901960	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:3,0:7,0,2,0
chr17	37985801	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=115,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr17	38066240	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr17	38068514	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,4:0,0,11,3
chr17	38079519	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,2:4,5:4,7,3,4
chr17	38122680	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,12:0.460:26:5,6:9,5:0|1:38122680_G_T:38122680:5,9,2,10
chr17	38122686	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:4,5:7,5:0|1:38122680_G_T:38122680:4,8,2,8
chr17	38122708	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:3,4:5,3:2,7,1,6
chr17	38126911	.	AACACACAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=AC;STR;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr17	38128357	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.259:15:4,1:3,0:2,9,4,0
chr17	38128714	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=145,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr17	38128765	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr17	38129996	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,8:5,5:5,3,10,3
chr17	38130139	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:5,3:14,6:4,16,0,9
chr17	38130740	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	38137364	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.311:22:8,3:7,4:6,9,2,5
chr17	38140524	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr17	38140580	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:11,7,1,1
chr17	38145088	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=171,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr17	38146263	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=219,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr17	38146482	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=142,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.646:9:1,1:1,5:1,2,4,2
chr17	38146542	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr17	38152373	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.559:9:0,2:3,2:3,1,3,2
chr17	38153554	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=106,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr17	38153629	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	38153714	.	T	TGA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr17	38153852	.	G	GGATGAGTGTGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:38153852_G_GGATGAGTGTGT:38153852:0,1,0,1
chr17	38153855	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,15;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:38153852_G_GGATGAGTGTGT:38153852:0,1,0,1
chr17	38153860	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:38153852_G_GGATGAGTGTGT:38153852:0,0,0,1
chr17	38153862	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38153852_G_GGATGAGTGTGT:38153852:0,0,0,1
chr17	38153865	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:38153852_G_GGATGAGTGTGT:38153852:0,0,0,1
chr17	38171668	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr17	38172192	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr17	38172452	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr17	38172942	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr17	38172973	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr17	38176476	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	38178149	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr17	38178627	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,4:4,1:6,2,5,0
chr17	38179667	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr17	38183090	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,6:3,2:8,1,5,3
chr17	38188844	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=112,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:2,4:1,5:3,0,8,2
chr17	38189049	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:2,4:6,5:0|1:38189049_G_A:38189049:1,7,2,7
chr17	38189055	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:0|1:38189049_G_A:38189049:1,7,1,6
chr17	38189793	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=219,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	38192137	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr17	38243150	.	G	GGTGTTTTTCTAATTCCAAAAAAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=182,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr17	38251137	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,79;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:11,1:16,3,1,1
chr17	38252667	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,15,3
chr17	38253228	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	38287885	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.265:39:10,0:7,0:16,11,0,12
chr17	38297048	.	CGGGGCGGGGTGGGGACCGGGCGGCGAGCCGGCCG	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.213:15:1,2:7,0:0|1:38297048_CGGGGCGGGGTGGGGACCGGGCGGCGAGCCGGCCG_C:38297048:8,5,0,2
chr17	38297087	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,4:0.503:9:3,1:0,3:1|0:38297048_CGGGGCGGGGTGGGGACCGGGCGGCGAGCCGGCCG_C:38297048:0,5,0,4
chr17	38319650	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=179,283;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	38319668	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr17	38319676	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=142,179;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38319676_CC_TT:38319676:1,1,1,0
chr17	38319679	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=142,179;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38319676_CC_TT:38319676:1,1,1,0
chr17	38319682	.	GT	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=142,179;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38319676_CC_TT:38319676:1,1,1,0
chr17	38319977	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:6,4:11,8:5,12,4,8
chr17	38323212	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:38323212_CTT_C:38323212:0,4,0,1
chr17	38323226	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38323212_CTT_C:38323212:0,1,0,1
chr17	38324766	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	38325651	.	A	C	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,11:0.121:76:29,1:19,2:16,49,11,0
chr17	38325656	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=143,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,10:0.142:71:33,1:25,0:12,49,10,0
chr17	38325668	.	A	C	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,7:0.084:71:37,2:22,2:14,50,7,0
chr17	38347805	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=10,28;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.598:5:0,1:0,1:0|1:38347805_G_C:38347805:2,0,3,0
chr17	38347810	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,0:0|1:38347805_G_C:38347805:0,0,5,0
chr17	38347817	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=13,23;MFRL=167,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.523:4:0,0:0,1:0|1:38347805_G_C:38347805:2,0,2,0
chr17	38347820	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,19;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,2:0|1:38347805_G_C:38347805:0,0,4,0
chr17	38347824	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.817:3:0,0:0,3:0|1:38347805_G_C:38347805:0,0,3,0
chr17	38348353	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=104,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr17	38349127	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,5:2,3:5,1,4,4
chr17	38412726	.	T	TG	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=33,10;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.331:31:14,3:6,1:0|1:38412726_T_TG:38412726:2,19,10,0
chr17	38412732	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,10:0.287:36:16,2:8,0:0|1:38412726_T_TG:38412726:2,24,10,0
chr17	38412735	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,10:0.280:37:14,6:9,1:0|1:38412726_T_TG:38412726:4,23,10,0
chr17	38412741	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,10:0.236:44:22,4:11,2:0|1:38412726_T_TG:38412726:8,26,10,0
chr17	38430049	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,0:13,0:0|1:38430049_A_C:38430049:5,27,2,0
chr17	38430055	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.082:35:15,0:12,1:0|1:38430049_A_C:38430049:4,29,2,0
chr17	38430058	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=138,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:15,0:14,1:0|1:38430049_A_C:38430049:4,29,2,0
chr17	38430059	.	C	CCCGGGGG	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=34,12;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:16,0:14,0:0|1:38430049_A_C:38430049:4,28,2,0
chr17	38447412	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:23,0:14,2:14,24,0,2
chr17	38451739	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.391:16:4,2:2,4:1,9,0,6
chr17	38508405	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38508405_G_C:38508405:0,1,0,1
chr17	38508407	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38508405_G_C:38508405:0,1,0,1
chr17	38512197	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,4:7,5:10,0,9,0
chr17	38548371	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:8,3:11,1:12,8,0,4
chr17	38556770	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=161.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,23:0,22:0,0,28,18
chr17	38563282	.	GA	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=147,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38563282_GA_AC:38563282:0,2,0,1
chr17	38563286	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=147,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38563282_GA_AC:38563282:0,2,0,1
chr17	38563710	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr17	38569745	.	TTCA	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCA;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,2:0.045:63:32,2:24,0:39,22,1,1
chr17	38572366	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr17	38609431	.	G	GAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	38634696	.	T	TGTTTAGTCCACCACCGAGACATC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:2,1,0,1
chr17	38634929	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.339:24:7,3:9,4:3,13,4,4
chr17	38635897	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=141,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:0,0:3,2:4,0,2,0
chr17	38638747	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:3,1:0,0:0|1:38638747_G_A:38638747:0,3,0,2
chr17	38638757	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=165,206;MMQ=50,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38638747_G_A:38638747:0,2,0,1
chr17	38638761	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=165,206;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38638747_G_A:38638747:0,2,0,1
chr17	38640682	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	38715107	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:2,2:5,0,5,0
chr17	38786451	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,32:0,29:0,0,54,7
chr17	38788348	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr17	38792633	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:14,3:18,0:26,9,3,0
chr17	38798715	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.067:43:20,0:19,2:21,20,0,2
chr17	38802106	.	TA	T,AA	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=10,17,15;MFRL=159,126,197;MMQ=60,60,60;MPOS=10,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.01,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,4,7:0.101,0.094:46:5,2,1:8,0,1:1,34,2,9
chr17	38813824	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,8:0,0,8,3
chr17	38813828	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr17	38816557	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr17	38905477	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=111,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:2,6:8,3:7,3,9,0
chr17	38910811	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=183,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr17	38922718	.	TTC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr17	38925099	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr17	38938657	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.080:36:15,2:15,0:23,11,0,2
chr17	38949318	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:9,0:23,4:32,0,4,0
chr17	38950395	.	A	AGTTATGTAGTTTATGAGCTTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.486:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr17	38953540	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr17	38954687	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	38955274	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:11,7:14,11:5,20,2,16
chr17	38956095	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:0,9,0,2
chr17	38976978	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=211,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr17	38976998	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	38978462	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,26:0.410:64:20,14:17,12:17,21,11,15
chr17	38978536	.	A	C	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=64,101;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=217.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,62:0.985:63:0,30:1,32:1,0,28,34
chr17	38978797	.	G	GCTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	38990679	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=199,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:4,1,3,0
chr17	38992571	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=205,167;MMQ=53,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:38992571_T_A:38992571:0,3,0,1
chr17	38992591	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=219,167;MMQ=43,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:38992571_T_A:38992571:0,3,0,1
chr17	38992599	.	GT	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=244,205;MMQ=47,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr17	38992608	.	GT	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=268,219;MMQ=40,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	39021093	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=130,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:14,2:7,0:11,10,2,0
chr17	39021298	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=167,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39021298_A_C:39021298:0,1,0,1
chr17	39021300	.	A	ACATACTCCCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=167,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39021298_A_C:39021298:0,1,0,1
chr17	39034422	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:12,1:16,1:11,18,0,2
chr17	39038941	.	T	TTTTA	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,151;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TTTA;STR;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.308:25:7,4:10,3:1,16,0,8
chr17	39041229	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:15,0:9,4:11,13,0,4
chr17	39081546	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr17	39086293	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:8,1:9,1:9,9,0,2
chr17	39116446	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	39221769	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=166,137;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:39221769_C_T:39221769:0,2,0,1
chr17	39221771	.	G	GTTGAGGTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=11,33;MFRL=157,137;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:39221769_C_T:39221769:0,2,0,1
chr17	39221773	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=157,137;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:39221769_C_T:39221769:0,2,0,1
chr17	39221775	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=19,30;MFRL=157,137;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:0,0:0|1:39221769_C_T:39221769:0,2,0,1
chr17	39240426	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,14,7
chr17	39240790	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=342,96;MMQ=24,37;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr17	39241472	.	C	CTTACTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	39253685	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,12,3
chr17	39253749	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=0,140;MMQ=54,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=187.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,56:0.967:57:1,32:0,24:1,0,42,14
chr17	39253886	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,1,16
chr17	39254335	.	A	AT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=139.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,23:0,16:0,0,21,19
chr17	39254444	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,1,19
chr17	39257805	.	GGG	TTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=43,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.410:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr17	39258027	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=244.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,75:0.975:76:1,38:0,36:1,0,53,22
chr17	39258495	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,4,14
chr17	39261560	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr17	39261608	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:39261608_G_A:39261608:0,0,7,0
chr17	39261611	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0|1:39261608_G_A:39261608:0,0,8,0
chr17	39262814	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,232;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:39262814_C_T:39262814:0,0,0,3
chr17	39262837	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39262814_C_T:39262814:0,0,0,1
chr17	39280487	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,12:0,4:0,0,0,17
chr17	39333956	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,19,1
chr17	39334133	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,49;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,6,15
chr17	39340597	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=82.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,11:0,12:0,0,21,2
chr17	39341646	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:39341646_C_T:39341646:0,0,0,6
chr17	39341648	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:39341646_C_T:39341646:0,0,0,6
chr17	39346139	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:4,2:5,6:5,5,5,5
chr17	39346595	.	T	TGCTGTGGGTCCAGCTGCTGCCAGCCTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.564:5:0,1:2,0:2,0,2,1
chr17	39389646	.	TC	CT	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=149,116;MMQ=60,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,2:14,0:0|1:39389646_TC_CT:39389646:13,9,2,0
chr17	39389653	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=157,95;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.135:27:10,3:13,0:0|1:39389646_TC_CT:39389646:14,10,2,1
chr17	39389673	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=156,95;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:8,3:7,0:7,8,2,1
chr17	39389690	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=157,95;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:0|1:39389690_G_T:39389690:8,10,2,1
chr17	39389698	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=159,116;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:39389690_G_T:39389690:6,12,1,1
chr17	39389710	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=166,116;MMQ=60,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:5,12,0,2
chr17	39394729	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=194,166;MMQ=25,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr17	39394755	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,27;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	39405960	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr17	39406539	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=150,232;MMQ=40,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.148:45:18,1:21,5:14,25,4,2
chr17	39406567	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=174.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.978:43:0,19:0,22:0|1:39406567_C_A:39406567:0,0,23,20
chr17	39406589	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=175.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,22:0,18:0|1:39406567_C_A:39406567:0,0,26,16
chr17	39412165	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=152,204;MMQ=60,31;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:18,3:15,2:0|1:39412165_A_C:39412165:23,14,5,0
chr17	39412171	.	CT	AC	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=132,204;MMQ=60,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.130:44:17,3:17,2:0|1:39412165_A_C:39412165:25,14,5,0
chr17	39412184	.	CC	AT	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=132,194;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.098:39:15,1:17,2:0|1:39412165_A_C:39412165:20,16,3,0
chr17	39412326	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=139,166;MMQ=60,42;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,10:0.180:59:11,3:36,7:0|1:39412326_C_T:39412326:22,27,3,7
chr17	39412339	.	T	TC	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=131,158;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,5:0.109:53:13,2:34,3:0|1:39412326_C_T:39412326:23,25,1,4
chr17	39412344	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=131,158;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,5:0.105:55:12,0:34,2:0|1:39412326_C_T:39412326:23,27,1,4
chr17	39412372	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,10:0,24:0,0,13,21
chr17	39432657	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=149,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,2:15,0:19,10,2,0
chr17	39458765	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr17	39459167	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	39551859	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:12,1:7,2:3,16,1,2
chr17	39580232	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chr17	39593620	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,4:6,3:11,1,7,0
chr17	39593768	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr17	39593872	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr17	39594679	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:2,5:0,1:2,0,5,1
chr17	39595116	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,4:0,1:1,2,0,5
chr17	39595354	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=199,250;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:0,1:0|1:39595354_G_T:39595354:4,0,2,0
chr17	39595356	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=199,250;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0|1:39595354_G_T:39595354:4,0,2,0
chr17	39595390	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=4560712,191;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr17	39595661	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr17	39595671	.	CC	AT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:39595671_CC_AT:39595671:0,3,0,1
chr17	39595677	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=66,171;MMQ=57,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:39595671_CC_AT:39595671:0,2,0,1
chr17	39595682	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=66,171;MMQ=57,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:39595671_CC_AT:39595671:0,2,0,1
chr17	39595684	.	C	CCTCACAAAGAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=66,171;MMQ=57,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:39595671_CC_AT:39595671:0,2,0,1
chr17	39596393	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=91,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.499:18:1,6:8,2:0|1:39596393_C_A:39596393:7,2,8,1
chr17	39596402	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=107,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.499:20:2,6:7,3:0|1:39596393_C_A:39596393:7,3,9,1
chr17	39596538	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=91,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.640:16:1,4:2,6:3,3,2,8
chr17	39596611	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,12,2
chr17	39616288	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr17	39619388	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=232,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr17	39623098	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:3,0,4,1
chr17	39623269	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:7,5:5,10:6,6,7,9
chr17	39623615	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,11;MFRL=186,253;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:39623615_G_T:39623615:0,3,0,1
chr17	39623618	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=186,253;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:39623615_G_T:39623615:0,3,0,1
chr17	39623622	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=205,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:39623615_G_T:39623615:0,1,0,2
chr17	39636044	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,3,10
chr17	39644057	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	39645572	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr17	39646021	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:4,2,5,0
chr17	39646180	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr17	39657845	.	CT	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,18;MFRL=224,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39657845_CT_GA:39657845:1,0,1,0
chr17	39657852	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=224,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39657845_CT_GA:39657845:1,0,1,0
chr17	39659091	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=204,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,5:5,6:3,3,4,7
chr17	39659183	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,19:0.555:34:9,6:6,13:0|1:39659183_G_A:39659183:13,2,13,6
chr17	39659194	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0|1:39659183_G_A:39659183:0,0,22,7
chr17	39659529	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,4:2,6:8,0,8,2
chr17	39660005	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,2:6,6:3,7,2,7
chr17	39661366	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.512:33:9,9:7,7:9,7,11,6
chr17	39661689	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.559:39:10,11:7,10:3,14,6,16
chr17	39671045	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	39671860	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,6:1,3:1,0,4,5
chr17	39674540	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:5,0,8,0
chr17	39680380	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=184,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.487:8:2,3:2,0:3,1,2,2
chr17	39680580	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,5:0,0,10,1
chr17	39680796	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr17	39684321	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,4:1,3:0,2,0,7
chr17	39723425	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.406:10:4,2:2,1:6,0,4,0
chr17	39727843	.	A	C	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.059:53:22,1:14,0:25,25,3,0
chr17	39727858	.	A	C	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=110,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,5:0.058:72:32,1:17,0:36,31,5,0
chr17	39742807	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=172.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,25:0,27:0,0,16,37
chr17	39742973	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,301;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	39776817	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=17,28;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.186:23:4,2:3,0:6,13,2,2
chr17	39779160	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,11:0,0,26,2
chr17	39780803	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=124,182;MMQ=30,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr17	39874137	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,3:2,7:3,0,9,1
chr17	39883789	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	39884419	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr17	39888102	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr17	39888455	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=168,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,5:5,0:4,2,2,3
chr17	39912581	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	39913645	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,14,3
chr17	39914070	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,10:0,0,5,10
chr17	39923614	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr17	39925620	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=171,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	39925639	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=16,13;MFRL=171,255;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:2,1,1,0
chr17	39925640	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,10;MFRL=171,255;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:2,1,1,0
chr17	39925646	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=16,12;MFRL=137,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:0,0:1,0:3,1,1,0
chr17	39959511	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	39977862	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	39978607	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=131,116;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,0:9,2:0|1:39978607_G_A:39978607:5,14,0,2
chr17	39978610	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=131,116;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:7,1:0|1:39978607_G_A:39978607:5,14,0,2
chr17	39983644	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,20,4
chr17	39987130	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,18:0,13:0,0,14,17
chr17	39988601	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,11:0,0,12,8
chr17	40001986	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,240;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:11,0:5,2:2,16,0,2
chr17	40003693	.	A	AAAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.225:7:4,1:2,0:1,5,0,1
chr17	40024023	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr17	40024867	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=88,99;MMQ=53,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr17	40024869	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=81,175;MMQ=54,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.353:5:2,0:1,1:4,0,1,0
chr17	40024895	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr17	40025264	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=139.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,19:0,21:0,0,37,3
chr17	40025285	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=197.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,31:0,22:0,0,42,12
chr17	40025453	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr17	40025670	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,14,6
chr17	40027869	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	40028450	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,0:0,4:0,0,0,5
chr17	40028483	.	TCGTA	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40028483_TCGTA_T:40028483:0,0,0,1
chr17	40028490	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40028483_TCGTA_T:40028483:0,0,0,1
chr17	40028494	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=194,133;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40028483_TCGTA_T:40028483:0,1,0,1
chr17	40049473	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr17	40053021	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	40063650	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,0:0|1:40063650_A_C:40063650:0,0,5,0
chr17	40063653	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,0:0|1:40063650_A_C:40063650:0,0,5,0
chr17	40063657	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,0:0,0:0|1:40063650_A_C:40063650:1,0,5,0
chr17	40063664	.	AGT	CCG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.669:7:1,2:1,0:0|1:40063650_A_C:40063650:2,0,5,0
chr17	40068613	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	40087127	.	C	CAGCCACTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=149,233;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.387:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr17	40095215	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:8,2:7,3:14,1,5,0
chr17	40101578	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40101578_T_C:40101578:0,0,0,1
chr17	40101581	.	GA	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:40101578_T_C:40101578:0,0,0,1
chr17	40120851	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=237,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr17	40123829	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr17	40142198	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:40142198_G_C:40142198:4,0,1,0
chr17	40142201	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:40142198_G_C:40142198:4,0,1,0
chr17	40149344	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,28;MFRL=188,164;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:40149344_T_C:40149344:0,1,0,1
chr17	40149348	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=188,164;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40149344_T_C:40149344:0,1,0,1
chr17	40152431	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr17	40169519	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	40186413	.	G	GCTGGAGGCTGGGCTTTCAGAGTCCTTCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr17	40186437	.	A	ATAAGTTTAAAAAATTGTTTTAGCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	40186449	.	A	AATGATTGTGTTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=230,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	40259943	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,18;MFRL=92,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:2,0,2,0
chr17	40261284	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,4,2
chr17	40263950	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=62,233;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:40263950_A_C:40263950:1,5,0,2
chr17	40263952	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=62,233;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:40263950_A_C:40263950:1,5,0,2
chr17	40265583	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	40265877	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:6,6,2,0
chr17	40265944	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr17	40266642	.	G	GGCATTCTTAGAGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	40270098	.	A	AGAGCCGAAGAAACCACAGGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40270098_A_AGAGCCGAAGAAACCACAGGT:40270098:0,0,0,1
chr17	40270104	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40270098_A_AGAGCCGAAGAAACCACAGGT:40270098:0,0,0,1
chr17	40316275	.	G	GTCCTTCAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0,4,0,1
chr17	40317740	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:1,2,4,0
chr17	40359505	.	GCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=CA;STR;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.801:6:0,1:0,4:1,0,5,0
chr17	40369129	.	CCA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CA;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,1:7,2:11,4,3,0
chr17	40370396	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	40376978	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0|1:40376978_C_CT:40376978:0,0,0,1
chr17	40376982	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=156,149;MMQ=39,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40376978_C_CT:40376978:0,1,0,1
chr17	40460447	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	40475535	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=162,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,0:9,3:12,6,1,2
chr17	40481529	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,18,8
chr17	40619937	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	40639422	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr17	40642452	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr17	40642737	.	CC	TG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=168,178;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,0:3,2:1,12,0,2
chr17	40642738	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:7,0:2,1:0,9,0,2
chr17	40646331	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,1:9,1:21,2,1,1
chr17	40652857	.	T	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,75;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:19,3:33,0:23,29,2,1
chr17	40653356	.	CTTTTG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTG;STR;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.937:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr17	40689613	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	40696233	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40696233_C_G:40696233:0,0,0,1
chr17	40696245	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:40696233_C_G:40696233:0,0,0,1
chr17	40696300	.	C	CTAAATTACAGAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	40717672	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:1,2,3,4
chr17	40737117	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr17	40766899	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=110,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,0:9,2:12,9,2,0
chr17	40812797	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=93.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.936:28:0,7:1,19:0,1,2,25
chr17	40817448	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0,0,11,2
chr17	40820414	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	40822790	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=206,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,0:1,1,0,2
chr17	40824088	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.418:16:3,2:3,0:4,5,7,0
chr17	40826525	.	AAGG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	40833810	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:10,0:8,2:3,17,1,1
chr17	40847915	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:1,3,0,1
chr17	40850834	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=180,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:40850834_C_A:40850834:0,1,0,1
chr17	40850836	.	T	TTTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=180,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:40850834_C_A:40850834:0,1,0,1
chr17	40856573	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,1:6,2:8,1,3,1
chr17	40857257	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=140,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40857257_G_A:40857257:0,1,0,1
chr17	40857264	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=140,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40857257_G_A:40857257:0,1,0,1
chr17	40957794	.	A	AGGCTGTTTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,2:10,0:9,8,0,2
chr17	40959793	.	T	TAAAAGGTGTTCGTTGTGCTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:4,3,1,1
chr17	40962691	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,161;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr17	40986454	.	GGA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=GA;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:3,1:3,2:5,10,3,0
chr17	40991147	.	CA	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=136,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:15,0:18,4:0|1:40991147_CA_C:40991147:17,18,0,4
chr17	40991154	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:17,0:16,4:0|1:40991147_CA_C:40991147:18,16,0,4
chr17	40998271	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:40998271_G_T:40998271:0,2,0,1
chr17	40998273	.	T	TGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:40998271_G_T:40998271:0,2,0,1
chr17	40998274	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:40998271_G_T:40998271:0,2,0,1
chr17	40998276	.	G	GGTTTGTGCGTATTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:40998271_G_T:40998271:0,2,0,1
chr17	41002389	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:1,2,0,1
chr17	41002463	.	C	CTAAAAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr17	41003268	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,13;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.650:4:0,0:1,1:1,0,3,0
chr17	41061489	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,5:1,0:1,3,1,4
chr17	41063513	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41063513_C_CA:41063513:0,0,0,1
chr17	41063516	.	T	TGATGGACCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41063513_C_CA:41063513:0,0,0,1
chr17	41103938	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,2:0,0,1,11
chr17	41113131	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	41116153	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,1:13,1:17,7,0,2
chr17	41116234	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,2,7
chr17	41116291	.	CAGCCCT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGCCCT;STR;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr17	41116565	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=13,34;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.897:12:0,2:0,7:0,1,0,11
chr17	41121205	.	TGGG	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:0,6:3,2:3,0,5,3
chr17	41121210	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=64,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.291:11:6,0:2,3:5,3,3,0
chr17	41121217	.	G	A,GGA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,31,34;MFRL=0,137,64;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.38,25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,8:0.268,0.608:12:0,0,6:1,2,2:0,1,8,3
chr17	41121263	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,6:0,0,4,8
chr17	41122443	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	41132578	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,5,1
chr17	41150949	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr17	41154600	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr17	41154817	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=159.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,22:0,24:0,0,23,23
chr17	41164126	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr17	41165734	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr17	41170898	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	41174345	.	G	GAGGCGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41174345_G_GAGGCGC:41174345:0,0,0,1
chr17	41174347	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41174345_G_GAGGCGC:41174345:0,0,0,1
chr17	41174350	.	C	CGGCTCACTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41174345_G_GAGGCGC:41174345:0,0,0,1
chr17	41199791	.	T	TGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:41199791_T_TGA:41199791:0,4,0,1
chr17	41199794	.	T	TATTTTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:41199791_T_TGA:41199791:0,4,0,1
chr17	41199801	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=198,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr17	41209249	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=173,205;MMQ=50,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:41209249_A_G:41209249:0,4,0,1
chr17	41209251	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=173,205;MMQ=50,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:41209249_A_G:41209249:0,4,0,1
chr17	41209253	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=168,231;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr17	41219523	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=211,226;MMQ=60,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr17	41219540	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=211,222;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr17	41219551	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=204,229;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:41219551_A_G:41219551:7,2,2,0
chr17	41219554	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=204,229;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,0:0|1:41219551_A_G:41219551:7,2,2,0
chr17	41251931	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr17	41256264	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:6,2:15,0:8,13,0,2
chr17	41327791	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:8,6:6,4:10,4,9,2
chr17	41338494	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:2,8,1,1
chr17	41341877	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=217,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41341877_T_A:41341877:0,1,0,1
chr17	41341881	.	T	TAGTCTCAAAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41341877_T_A:41341877:1,1,0,1
chr17	41342709	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:14,3,0,2
chr17	41342767	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=152,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,0:10,3:8,14,1,2
chr17	41345395	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:16,3:23,0:30,11,3,0
chr17	41361881	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33,32;MFRL=66,187,152;MMQ=60,60,60;MPOS=19,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,19;RU=T;STR;TLOD=3.47,6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.354,0.369:8:1,2,1:1,0,2:2,0,6,0
chr17	41477710	.	A	C,G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,13,26;MFRL=162,143,118;MMQ=60,60,60;MPOS=26,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.13,8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,4:0.187,0.323:13:1,0,0:3,0,2:3,4,4,2
chr17	41477720	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,9;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:8,0:0|1:41477720_T_C:41477720:7,7,2,0
chr17	41477724	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,9;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:6,0:0|1:41477720_T_C:41477720:9,6,2,0
chr17	41477727	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=34,19;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:6,0:0|1:41477720_T_C:41477720:9,6,2,0
chr17	41477729	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:7,0:0|1:41477720_T_C:41477720:9,6,2,0
chr17	41561601	.	CGGAAGGA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGAAGGA;STR;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr17	41566783	.	CTCT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:5,0,6,0
chr17	41566969	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:0,7,0,7
chr17	41566984	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:5,0:0|1:41566984_A_G:41566984:0,12,0,2
chr17	41566987	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,3:5,0:0,10,0,3
chr17	41566989	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:5,0:0|1:41566984_A_G:41566984:0,11,0,2
chr17	41566998	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=179,153;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr17	41570427	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,3:4,1:4,5,2,2
chr17	41573730	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=215,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr17	41582284	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:0,6,0,6
chr17	41585657	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=119,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.509:8:3,2:0,2:3,1,3,1
chr17	41590928	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,5:3,6:0,6,0,11
chr17	41598332	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=24,18;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.726:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	41598940	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,4:1,4:2,3,4,4
chr17	41599383	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:7,5:4,1:9,2,5,1
chr17	41599690	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	41610398	.	CGG	TGG,C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29,35;MFRL=0,0,106;MMQ=60,60,60;MPOS=8,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.04,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr17	41610401	.	A	AAAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	41613691	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=207,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr17	41622507	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr17	41622740	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=200,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:1,6,2,5
chr17	41846964	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr17	41879200	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:3,7,0,2
chr17	41888365	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=181,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:41888365_A_C:41888365:2,2,0,1
chr17	41888369	.	C	CTCTGTCCTGTATCAGCTGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=181,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:41888365_A_C:41888365:2,2,0,1
chr17	41891480	.	T	TATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:41891480_T_TATA:41891480:2,2,0,1
chr17	41891481	.	G	GCATGAAATGAAGAAATCCCGTTTCCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:41891480_T_TATA:41891480:2,2,0,1
chr17	41893360	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:10,1,4,1
chr17	41894177	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:41894177_T_C:41894177:0,4,0,1
chr17	41894182	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:41894177_T_C:41894177:0,4,0,1
chr17	41894183	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:41894183_T_A:41894183:0,4,0,1
chr17	41894184	.	T	TCTGGGCAGCTGTGCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:41894183_T_A:41894183:0,4,0,1
chr17	41894190	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=143,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.340:4:2,0:0,1:0|1:41894183_T_A:41894183:0,3,0,1
chr17	41905306	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41905306_C_CCA:41905306:1,0,0,1
chr17	41905307	.	AGAGAGAT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41905306_C_CCA:41905306:1,0,0,1
chr17	41907509	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=216,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr17	41955158	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr17	41958297	.	A	AGCGGCGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=221,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr17	41959580	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	41960343	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,8:0,2:0,0,8,4
chr17	42019041	.	G	GTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr17	42030191	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=102,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr17	42083840	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,358;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	42084097	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	42085150	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,16:0,0,10,23
chr17	42085972	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,7,15
chr17	42090587	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	42113736	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=171,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:4,0:4,2:0,9,0,2
chr17	42141115	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.421:43:12,9:12,8:23,2,17,1
chr17	42156471	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr17	42157739	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr17	42158310	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr17	42159936	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.200:17:7,2:2,0:10,4,3,0
chr17	42161342	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=196,164;MMQ=55,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr17	42162602	.	G	GCTCAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=182,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:0,0:0|1:42162602_G_GCTCAAA:42162602:0,1,0,1
chr17	42162608	.	G	GACCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=182,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42162602_G_GCTCAAA:42162602:0,1,0,1
chr17	42162609	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=182,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42162602_G_GCTCAAA:42162602:0,1,0,1
chr17	42164885	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,10:0,0,8,16
chr17	42165667	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	42170181	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	42171147	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=30,12;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.686:8:1,0:1,0:0|1:42171147_A_C:42171147:0,2,6,0
chr17	42171153	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=28,12;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.686:8:1,0:1,0:0|1:42171147_A_C:42171147:0,2,6,0
chr17	42171160	.	AT	CA	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=29,12;MFRL=164,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:0,0:2,0:0|1:42171147_A_C:42171147:0,3,3,0
chr17	42171164	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=31,17;MFRL=158,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:1,0:2,0:0|1:42171147_A_C:42171147:0,4,3,0
chr17	42171167	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=31,13;MFRL=164,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:2,1:2,0:0|1:42171147_A_C:42171147:1,4,3,0
chr17	42171171	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=33,11;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,0:0|1:42171147_A_C:42171147:3,5,2,0
chr17	42171175	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=30,19;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,1:4,0:0|1:42171147_A_C:42171147:5,5,2,0
chr17	42171177	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=31,17;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:6,0:4,0:0|1:42171147_A_C:42171147:5,5,2,0
chr17	42171206	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,8,5
chr17	42188213	.	TCCACGA	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=165,34;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:42188213_TCCACGA_T:42188213:2,4,1,1
chr17	42188221	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=131,34;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:42188213_TCCACGA_T:42188213:2,2,1,1
chr17	42188233	.	G	GCACAGATA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=164,34;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:2,1:1,2:0|1:42188233_G_GCACAGATA:42188233:1,2,1,2
chr17	42188235	.	G	GGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=164,34;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,0:0|1:42188233_G_GCACAGATA:42188233:1,2,1,2
chr17	42225908	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,0:1,2:0|1:42225908_G_T:42225908:2,2,1,1
chr17	42225916	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:42225908_G_T:42225908:2,4,1,1
chr17	42225917	.	GTCACC	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:4,0:1,2:0|1:42225908_G_T:42225908:2,5,1,1
chr17	42254718	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,73;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,3:10,0:17,6,2,1
chr17	42264962	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr17	42266318	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	42273183	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,0:10,2:7,9,1,1
chr17	42284797	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,9;MFRL=203,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.353:14:8,0:0,0:0|1:42284797_T_G:42284797:4,5,5,0
chr17	42284801	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.310:16:9,0:0,0:0|1:42284797_T_G:42284797:6,5,5,0
chr17	42284807	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:11,0:1,0:0|1:42284797_T_G:42284797:7,7,3,0
chr17	42284810	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:13,0:1,0:0|1:42284797_T_G:42284797:9,7,3,0
chr17	42329004	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,1,10
chr17	42332757	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42332757_C_A:42332757:0,0,0,1
chr17	42332760	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42332757_C_A:42332757:0,0,0,1
chr17	42334950	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr17	42335685	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr17	42337976	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr17	42390099	.	C	CACG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=182,112;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:0,0:0|1:42390099_C_CACG:42390099:0,3,0,1
chr17	42390101	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=182,112;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:42390099_C_CACG:42390099:0,3,0,1
chr17	42390104	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=182,112;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:42390099_C_CACG:42390099:0,3,0,1
chr17	42390106	.	C	CACCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=182,112;MMQ=60,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42390099_C_CACG:42390099:0,2,0,1
chr17	42390110	.	C	CGGCTCCTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=182,112;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42390099_C_CACG:42390099:0,2,0,1
chr17	42392042	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:42392042_TG_T:42392042:0,0,1,0
chr17	42392058	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:42392042_TG_T:42392042:0,0,1,0
chr17	42392072	.	CT	GG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:42392042_TG_T:42392042:0,0,1,0
chr17	42392077	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:42392042_TG_T:42392042:0,0,1,0
chr17	42394182	.	CTTAGT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42394182_CTTAGT_C:42394182:0,1,0,1
chr17	42394194	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42394182_CTTAGT_C:42394182:0,1,0,1
chr17	42394914	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:3,13,0,2
chr17	42395690	.	GG	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	42400260	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=153,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,11:0.325:35:12,6:9,2:0|1:42400260_A_C:42400260:1,23,11,0
chr17	42400264	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=150,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.275:38:13,4:12,2:1,27,10,0
chr17	42400273	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=29,17;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.195:34:13,0:13,0:0|1:42400260_A_C:42400260:1,27,6,0
chr17	42400279	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=153,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.172:33:12,0:13,0:0|1:42400260_A_C:42400260:1,27,5,0
chr17	42400762	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,0:3,0:0,5,2,0
chr17	42428538	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:4,1:2,4,2,5
chr17	42454463	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:1,2:3,1,2,1
chr17	42455022	.	TGAGCCCCTG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:1,1:3,2:5,0,3,0
chr17	42461760	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:0|1:42461760_C_T:42461760:5,3,1,1
chr17	42461765	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=149,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:5,1:0|1:42461760_C_T:42461760:5,4,1,1
chr17	42461767	.	C	CATG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=149,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:42461760_C_T:42461760:5,4,1,1
chr17	42461768	.	C	CTAA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:42461760_C_T:42461760:4,4,1,1
chr17	42462676	.	C	CTGCTAAGATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=218,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:1,1:0|1:42462676_C_CTGCTAAGATT:42462676:0,1,0,1
chr17	42462678	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=218,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42462676_C_CTGCTAAGATT:42462676:0,1,0,1
chr17	42463034	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=162,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr17	42475056	.	G	C	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.067:71:29,0:26,2:48,19,0,4
chr17	42483233	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:7,0,4,0
chr17	42501692	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:2,7:8,5:4,6,8,4
chr17	42501884	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,0:1,3:0,9,0,3
chr17	42746966	.	TC	AT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,1:6,1:0,16,0,2
chr17	42746979	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=172,194;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:0,14,0,2
chr17	42746998	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=177,177;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,0:0,9,0,2
chr17	42786576	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.240:26:3,0:7,0:20,0,6,0
chr17	42786579	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:3,0:6,1:15,0,5,0
chr17	42807247	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=222,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,3,0
chr17	42824402	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:3,0,3,0
chr17	42824648	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	42847438	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=110,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:2,2:0,1:0,3,0,3
chr17	42851634	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,3:6,4:6,4,5,2
chr17	42852061	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,5:8,4:6,9,6,3
chr17	42853427	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:5,2:8,6:11,2,8,0
chr17	42854093	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=15,20;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.298:15:2,2:1,1:9,2,4,0
chr17	42854208	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:12,7:7,6:12,7,6,7
chr17	42854502	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr17	42855248	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:3,1,2,4
chr17	42855472	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=58.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,8:1,10:1,0,11,7
chr17	42857158	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:42857158_G_A:42857158:0,2,0,1
chr17	42857159	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,29;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:0,0:0|1:42857158_G_A:42857158:0,2,0,1
chr17	42925559	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,5,8
chr17	42927628	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	42929970	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,1,13
chr17	42929985	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=178,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,4:2,0:0,7,0,4
chr17	42930008	.	C	CATG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:42930008_C_CATG:42930008:0,4,0,1
chr17	42930010	.	CC	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:42930008_C_CATG:42930008:0,4,0,1
chr17	42930017	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:42930008_C_CATG:42930008:0,4,0,1
chr17	42930859	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:5,4:3,0:6,3,4,0
chr17	42932244	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,5,0
chr17	42934372	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr17	42936477	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:7,0:17,2:15,9,2,0
chr17	42945296	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,4,13
chr17	42956945	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=162,72;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:6,3,2,1
chr17	42957855	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr17	42982843	.	G	GTAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:42982843_G_GTAAC:42982843:0,4,0,1
chr17	42982844	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:42982843_G_GTAAC:42982843:0,4,0,1
chr17	42990680	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:13,0:5,2:10,9,1,1
chr17	43005608	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:6,0:14,2:12,9,1,1
chr17	43107449	.	TAC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,6:5,5:9,4,5,6
chr17	43107589	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,1,6
chr17	43163851	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=102.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,11:0,16:0,0,21,6
chr17	43171154	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.251:21:7,2:8,2:5,11,1,4
chr17	43181287	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	43192549	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr17	43198245	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43198245_T_G:43198245:0,0,1,0
chr17	43198249	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43198245_T_G:43198245:0,0,1,0
chr17	43198253	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43198245_T_G:43198245:0,0,1,0
chr17	43198259	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43198245_T_G:43198245:0,0,1,0
chr17	43198265	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,17;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43198245_T_G:43198245:0,0,1,0
chr17	43198267	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,15;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:43198245_T_G:43198245:0,1,1,0
chr17	43198270	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,15;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:43198245_T_G:43198245:0,1,1,0
chr17	43205991	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=197,210;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43205991_C_CTTT:43205991:0,1,0,1
chr17	43205992	.	C	CCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=197,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43205991_C_CTTT:43205991:0,1,0,1
chr17	43209727	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	43213772	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:1,1,2,1
chr17	43215211	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=107,69;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,0:7,3:5,12,1,2
chr17	43216450	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,1:9,1:16,4,2,0
chr17	43227766	.	T	TTTGG	.	.	DP=158;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTGG;STR;TLOD=534.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,124:0.993:124:0,57:0,60:0,0,46,78
chr17	43228673	.	CA	C,CAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,35,27;MFRL=183,150,154;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=8.05,5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,4,3:0.190,0.158:22:4,2,2:6,2,0:3,12,1,6
chr17	43311419	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=107,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:4,3,6,1
chr17	43316520	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr17	43323170	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.391:13:5,0:3,4:0|1:43323170_T_G:43323170:7,1,0,5
chr17	43323176	.	TGCTTCTGTTTAGGGGGTGGGTA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.252:18:5,0:4,0:0|1:43323170_T_G:43323170:11,3,0,4
chr17	43333785	.	AAGAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=84,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:3,3,0,6
chr17	43334649	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,2:3,1:0|1:43334649_C_A:43334649:1,3,2,3
chr17	43334653	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:0|1:43334649_C_A:43334649:1,3,2,3
chr17	43342141	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr17	43344073	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,6,17
chr17	43364293	.	C	CG	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=160.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.981:47:0,21:0,26:0,0,17,30
chr17	43473307	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,1:3,7:4,0,5,3
chr17	43480880	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=170,133;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:2,0:11,3:13,0,3,0
chr17	43507008	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr17	43530716	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,146;MMQ=51,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:4,0:14,2:19,0,2,0
chr17	43545893	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,139;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:8,3:7,12:7,8,9,6
chr17	43552537	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=169,138;MMQ=48,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,4:3,5:3,7,2,8
chr17	43552717	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,127;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:4,4,0,4
chr17	43552921	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,135;MMQ=52,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.438:39:11,6:11,11:12,10,12,5
chr17	43553150	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.454:29:6,5:9,8:1,15,0,13
chr17	43555253	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=125,120;MMQ=53,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.454:29:8,11:7,2:11,5,10,3
chr17	43861853	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,2,1
chr17	43884556	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr17	43893751	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=264,133;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	43893769	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=223,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0|1:43893769_GC_G:43893769:2,0,2,1
chr17	43893772	.	TGCCTG	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=223,79;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:0|1:43893769_GC_G:43893769:2,0,2,1
chr17	43906726	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=55,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:0,2,2,5
chr17	43906828	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr17	43907641	.	C	CAGGTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=219,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr17	43907745	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=203,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr17	43907896	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:1,5,2,3
chr17	43907966	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	43910507	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:4,3,3,2
chr17	43910653	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr17	43911036	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr17	43911352	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,1:3,5:4,1,4,2
chr17	43912159	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr17	43922942	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	43923266	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=199,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,1:1,0:1,0,1,1
chr17	43923654	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=97,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:5,1,0,2
chr17	43923732	.	CATT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=135,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:1,2,0,1
chr17	43923898	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	43924073	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=104,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:9,4:2,3:4,7,3,4
chr17	43924130	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.402:13:6,2:2,3:5,3,0,5
chr17	43924193	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:43924193_A_C:43924193:0,3,0,1
chr17	43924195	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:43924193_A_C:43924193:0,3,0,1
chr17	44039691	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:5,5:5,3:8,3,6,2
chr17	44049133	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	44049329	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:1,5,0,4
chr17	44051846	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:1,2:4,1:1,4,0,3
chr17	44055638	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:44055638_T_A:44055638:0,0,2,1
chr17	44055647	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:44055638_T_A:44055638:0,0,2,1
chr17	44060492	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,4:3,2:3,2,7,0
chr17	44060775	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:1,1,6,0
chr17	44061023	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:2,2:0,1:2,0,3,1
chr17	44061025	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr17	44061036	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=128,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,5,1
chr17	44061278	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr17	44064334	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,3:5,3:9,0,4,2
chr17	44067382	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,3:5,8:2,7,4,7
chr17	44067400	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.591:15:1,3:5,6:1,5,2,7
chr17	44067508	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	44068924	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,27:0.532:50:14,10:8,12:8,15,10,17
chr17	44071294	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,3:2,3,4,3
chr17	44073693	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,28049290;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	44073739	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=181,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr17	44073889	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=129,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:7,1:6,1:10,5,0,2
chr17	44073973	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.482:31:10,5:6,9:8,8,8,7
chr17	44076665	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.525:34:7,6:9,11:8,8,13,5
chr17	44077044	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,5,10
chr17	44091724	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,4:1,7:0,1,2,9
chr17	44108906	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,5:5,5:1,6,3,7
chr17	44110532	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,19:0.553:34:13,8:1,9:0|1:44110532_G_A:44110532:8,7,10,9
chr17	44110541	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,20:0.565:35:13,7:2,12:0|1:44110532_G_A:44110532:8,7,9,11
chr17	44110670	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=52,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,2:0,6:1,1,6,2
chr17	44110888	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,3:5,5:0,9,1,7
chr17	44111613	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:7,5:13,9:8,12,6,8
chr17	44115886	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,5:5,5:8,3,7,3
chr17	44116312	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr17	44117113	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:18,1:14,2:24,10,2,1
chr17	44117119	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=143,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:9,10:9,6:11,7,13,4
chr17	44128125	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=146,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr17	44128156	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=234,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:44128156_A_T:44128156:0,1,0,1
chr17	44128157	.	G	GTATGCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=234,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:44128156_A_T:44128156:0,1,0,1
chr17	44144162	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44144162_G_T:44144162:0,2,0,1
chr17	44144164	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44144162_G_T:44144162:0,2,0,1
chr17	44144187	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44144187_T_TG:44144187:0,0,0,1
chr17	44144188	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44144187_T_TG:44144187:0,0,0,1
chr17	44144190	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44144187_T_TG:44144187:0,0,0,1
chr17	44144993	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,6,19
chr17	44159725	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr17	44159849	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,2:5,4:4,7,2,5
chr17	44248769	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=112.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,37:0.623:59:12,16:10,21:13,9,24,13
chr17	44248814	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=106.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,36:0.626:57:11,10:10,25:9,12,13,23
chr17	44248837	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.381:50:18,7:13,11:12,19,4,15
chr17	44249199	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.311:32:12,4:10,4:13,9,8,2
chr17	44408795	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,15,0
chr17	44408965	.	C	CAAAAAT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=172,182;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.314:4:1,1:2,0:0|1:44408965_C_CAAAAAT:44408965:1,2,0,1
chr17	44408967	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=172,182;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:1,1:2,0:0|1:44408965_C_CAAAAAT:44408965:1,2,0,1
chr17	44409904	.	GT	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=149,175;MMQ=39,39;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.158:42:18,2:18,3:33,3,5,1
chr17	44410016	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=175,170;MMQ=39,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,1:10,3:0,19,0,4
chr17	44413005	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=135,160;MMQ=27,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr17	44413012	.	CC	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=149,133;MMQ=26,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr17	44413013	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=129,161;MMQ=26,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	44413022	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,26;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr17	44413041	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:44413041_A_G:44413041:0,0,0,2
chr17	44413045	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:44413041_A_G:44413041:0,0,0,2
chr17	44430254	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=218,214;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr17	44625866	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,298;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	44626347	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,155;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,24:0.569:42:10,11:8,13:7,11,17,7
chr17	44630843	.	TTCTTC	T	.	.	DP=205;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=143,144;MMQ=27,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:167,21:0.112:188:111,16:49,5:35,132,4,17
chr17	44630860	.	G	A	.	.	DP=182;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=150,93;MMQ=27,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:178,3:0.022:181:127,0:44,3:22,156,1,2
chr17	44630893	.	A	G	.	.	DP=98;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=152,155;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,29:0.323:90:48,23:13,5:1,60,0,29
chr17	44632540	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	44632734	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,198;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.121:47:19,3:23,2:11,31,2,3
chr17	44772124	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:44772124_G_T:44772124:0,0,0,1
chr17	44772125	.	G	GCCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:44772124_G_T:44772124:0,0,0,1
chr17	44782224	.	A	AGT	.	.	DP=127;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=132,136;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=104.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,33:0.288:116:47,14:34,19:25,58,12,21
chr17	44782279	.	C	G	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=158,155;MMQ=33,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,20:0.297:67:23,4:21,13:0,47,1,19
chr17	44788253	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr17	44788310	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:2,7:8,5:10,0,12,0
chr17	44950122	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=118,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.321:17:4,3:6,2:8,4,2,3
chr17	44950237	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=146,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	45016207	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=203,170;MMQ=60,37;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45016207_G_GA:45016207:0,3,0,1
chr17	45016208	.	G	GAAGATTGGGAACATTTAAAATCTAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=203,170;MMQ=60,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45016207_G_GA:45016207:0,3,0,1
chr17	45016210	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=203,170;MMQ=60,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45016207_G_GA:45016207:0,3,0,1
chr17	45016212	.	CCT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=203,170;MMQ=60,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:45016207_G_GA:45016207:0,3,0,1
chr17	45016218	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=203,170;MMQ=60,37;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:45016207_G_GA:45016207:0,3,0,1
chr17	45214523	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:12,1:8,2:0|1:45214523_A_C:45214523:8,12,3,0
chr17	45214527	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:11,1:7,2:0|1:45214523_A_C:45214523:8,12,3,0
chr17	45214558	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=142,142;MMQ=60,34;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,2:8,2:6,11,3,1
chr17	45214564	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=153,0;MMQ=60,29;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,3:9,2:7,9,2,3
chr17	45214604	.	AT	TC	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=133,175;MMQ=60,45;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:2,2:12,0:11,4,2,0
chr17	45214682	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=134,175;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,4:10,1:3,11,1,4
chr17	45214690	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=134,175;MMQ=60,45;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,2:11,0:5,13,0,2
chr17	45214699	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=148,88;MMQ=60,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:6,3:9,1:4,12,2,2
chr17	45216132	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=31,36;MFRL=141,113;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:2,0:8,3:0|1:45216132_T_G:45216132:6,5,3,0
chr17	45216141	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=32,20;MFRL=146,99;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:2,0:9,4:0|1:45216132_T_G:45216132:5,6,4,1
chr17	45216162	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=32,20;MFRL=140,112;MMQ=58,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:3,0:9,7:0|1:45216162_A_C:45216162:6,6,4,4
chr17	45216168	.	TT	CG	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=33,20;MFRL=146,111;MMQ=59,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:3,0:9,7:0|1:45216162_A_C:45216162:7,7,4,5
chr17	45216172	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=33,20;MFRL=146,112;MMQ=59,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,0:8,9:6,6,4,6
chr17	45216210	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=143,120;MMQ=60,33;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.367:28:8,3:10,7:0|1:45216210_A_G:45216210:10,8,1,9
chr17	45216216	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=143,120;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:8,3:8,7:0|1:45216210_A_G:45216210:9,7,1,9
chr17	45216231	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=32,34;MFRL=141,129;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,3:10,5:8,9,1,7
chr17	45216247	.	AT	TG	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=30,29;MFRL=134,140;MMQ=60,33;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,3:8,2:6,10,1,4
chr17	45219239	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=35,21;MFRL=137,0;MMQ=60,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:19,0:14,1:0|1:45219239_C_T:45219239:14,19,0,2
chr17	45219241	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=32,37;MFRL=137,0;MMQ=60,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:17,0:12,2:0|1:45219239_C_T:45219239:14,19,0,2
chr17	45219255	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=154,0;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:15,2:15,3:9,21,2,3
chr17	45219276	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=32,27;MFRL=141,0;MMQ=52,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:13,2:11,3:0|1:45219276_A_G:45219276:3,21,2,3
chr17	45219283	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=30,35;MFRL=146,0;MMQ=52,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:12,2:12,3:0|1:45219276_A_G:45219276:3,23,2,3
chr17	45219296	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=149,0;MMQ=52,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:8,2:9,3:1,16,2,3
chr17	45219309	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=149,41;MMQ=52,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:8,3:9,1:0|1:45219309_A_G:45219309:2,17,2,2
chr17	45219311	.	TATTTATA	T	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=154,41;MMQ=52,59;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:9,2:10,1:0|1:45219309_A_G:45219309:2,18,2,2
chr17	45221273	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=155,31;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:16,3:4,1:9,11,1,3
chr17	45221286	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=154,62;MMQ=60,58;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.204:24:8,4:9,1:5,14,1,4
chr17	45221298	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=149,62;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.223:25:10,3:9,1:0|1:45221298_A_G:45221298:6,14,1,4
chr17	45221303	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=149,62;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.241:23:7,4:7,1:0|1:45221298_A_G:45221298:5,13,1,4
chr17	45221317	.	TA	CC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=122,0;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,2:9,1:6,12,0,3
chr17	45229087	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=245,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr17	45229228	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=139,105;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,1:8,1:0|1:45229228_A_C:45229228:13,7,0,2
chr17	45229234	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=137,105;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,1:7,1:0|1:45229228_A_C:45229228:12,5,0,2
chr17	45229240	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=139,105;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,1:9,1:0|1:45229228_A_C:45229228:11,7,0,2
chr17	45229253	.	TT	GG	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=139,105;MMQ=60,42;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,1:12,1:0|1:45229253_TT_GG:45229253:15,13,0,2
chr17	45229261	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=130,105;MMQ=60,42;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,1:13,1:0|1:45229253_TT_GG:45229253:15,14,0,2
chr17	45229284	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=134,105;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:13,1:14,1:0|1:45229284_A_G:45229284:11,17,0,2
chr17	45229286	.	T	TTTTCTGAAG	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=134,105;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:13,1:14,1:0|1:45229284_A_G:45229284:11,17,0,2
chr17	45232224	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.408:3:1,1:1,0:0|1:45232224_AG_A:45232224:0,2,0,1
chr17	45232227	.	AGGTCTAAAAGG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:45232224_AG_A:45232224:0,3,0,1
chr17	45234298	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=150,126;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,0:6,6:4,8,5,1
chr17	45234303	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=33,20;MFRL=126,124;MMQ=52,50;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,1:12,1:10,10,2,1
chr17	45234331	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=28,25;MFRL=102,118;MMQ=51,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.143:27:10,0:12,2:13,10,3,1
chr17	45234343	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=10;MBQ=27,20;MFRL=148,94;MMQ=51,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.636:31:3,10:8,10:7,4,11,9
chr17	45234360	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=10;MBQ=20,34;MFRL=124,76;MMQ=52,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.679:31:1,10:7,11:4,6,9,12
chr17	45234403	.	TT	GG	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=118,134;MMQ=51,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,0:4,5:0|1:45234403_TT_GG:45234403:1,5,2,3
chr17	45234406	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=33,24;MFRL=134,94;MMQ=49,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.382:11:0,2:6,2:0|1:45234406_CA_C:45234406:2,5,1,3
chr17	45234416	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=138,137;MMQ=50,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,1:0|1:45234403_TT_GG:45234403:0,4,0,2
chr17	45234417	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=29,33;MFRL=139,143;MMQ=49,50;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,0:0|1:45234406_CA_C:45234406:0,3,0,2
chr17	45234420	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=27,32;MFRL=131,164;MMQ=50,48;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0|1:45234406_CA_C:45234406:0,2,0,2
chr17	45234707	.	T	A	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,104;MMQ=40,36;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.081:59:17,2:37,2:0|1:45234707_T_A:45234707:10,45,1,3
chr17	45234710	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,104;MMQ=40,36;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.082:59:16,1:37,2:0|1:45234707_T_A:45234707:10,45,1,3
chr17	45234760	.	CAA	C,CA	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=19,27,34;MFRL=162,167,122;MMQ=60,60,60;MPOS=29,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.26,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,3:0.180,0.157:23:0,1,2:6,1,1:0,16,0,7
chr17	45247362	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=172,0;MMQ=60,23;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:12,4:12,0:0|1:45247362_G_A:45247362:15,10,4,2
chr17	45247367	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=166,0;MMQ=60,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:15,2:13,1:0|1:45247362_G_A:45247362:17,11,2,1
chr17	45247381	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=147,0;MMQ=60,29;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:13,2:14,1:0|1:45247362_G_A:45247362:19,10,2,1
chr17	45249365	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=188,100;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.362:20:6,3:6,4:0|1:45249365_C_T:45249365:6,7,3,4
chr17	45249372	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=176,77;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:8,2:5,2:0|1:45249365_C_T:45249365:7,8,1,4
chr17	45249391	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=157,100;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,2:10,1:0|1:45249365_C_T:45249365:10,9,0,3
chr17	45266571	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:9,1:3,1:0|1:45266571_T_A:45266571:1,12,1,1
chr17	45266583	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:0|1:45266571_T_A:45266571:0,11,1,1
chr17	45291103	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,11:0,1:0,0,11,1
chr17	45369815	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:2,9,0,2
chr17	45380002	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr17	45385012	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr17	45425115	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr17	45425144	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,10,3
chr17	45438886	.	CAGTG	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,12:0,13:0,0,4,21
chr17	45438952	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr17	45479446	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr17	45623409	.	G	GGT	.	.	DP=94;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=0,145;MMQ=36,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=GT;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,3:0,3:0,1,1,11
chr17	45623441	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=132,150;MMQ=43,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.411:10:3,2:3,1:0,6,0,4
chr17	45663680	.	GTA	G,GTATA	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=159,173,138;MMQ=60,60,50;MPOS=28,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=TA;STR;TLOD=36.36,6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,18,4:0.297,0.091:53:18,9,3:13,8,1:25,6,18,4
chr17	45664573	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=130;ECNT=1;MBQ=33,34,34,27;MFRL=142,139,159,155;MMQ=60,55,39,45;MPOS=18,17,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=8.76,22.84,4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:68,9,19,11:0.077,0.171,0.084:107:34,4,9,4:28,5,10,5:57,11,33,6
chr17	45669428	.	T	TAAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,175;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=A;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:11,1:9,2:3,17,0,3
chr17	45682702	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,2:18,0:21,10,0,2
chr17	45741735	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr17	45748294	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	45754569	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	45755810	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,0,14
chr17	45774072	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.894:16:0,6:1,8:0,1,11,4
chr17	45776062	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=140,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.186:23:12,1:5,1:0|1:45776062_A_C:45776062:9,10,4,0
chr17	45776065	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.159:27:12,1:5,0:0|1:45776062_A_C:45776062:9,14,4,0
chr17	45886058	.	C	CCGTTCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0|1:45886058_C_CCGTTCT:45886058:1,2,0,1
chr17	45886063	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:45886058_C_CCGTTCT:45886058:1,2,0,1
chr17	45886065	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:45886058_C_CCGTTCT:45886058:1,2,0,1
chr17	45886066	.	C	CTA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:45886058_C_CCGTTCT:45886058:1,2,0,1
chr17	45890898	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	45892520	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,1:1,2,2,0
chr17	45892545	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr17	45893862	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,6:0,0,6,9
chr17	45894735	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr17	45894779	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=190,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:45894779_G_A:45894779:0,3,0,1
chr17	45894787	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=210,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:45894779_G_A:45894779:0,2,0,1
chr17	45896053	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	45896478	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,6,14
chr17	45897179	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:8,2:7,1:6,9,1,2
chr17	45897271	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:45897271_A_AC:45897271:1,2,0,1
chr17	45897272	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:45897271_A_AC:45897271:1,2,0,1
chr17	45897275	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:45897271_A_AC:45897271:1,2,0,1
chr17	45897531	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,0:0,0,4,2
chr17	45901807	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=236,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:45901807_T_A:45901807:1,2,0,1
chr17	45901808	.	GTC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=236,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:45901807_T_A:45901807:1,2,0,1
chr17	45905779	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	45905850	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=38,30;MFRL=186,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,9:0,6:1,0,13,2
chr17	45915423	.	GAAGGGGGGA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45915423_GAAGGGGGGA_G:45915423:0,0,0,1
chr17	45915435	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45915423_GAAGGGGGGA_G:45915423:0,0,0,1
chr17	45916725	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	46000590	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=195,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:46000590_T_G:46000590:0,1,0,1
chr17	46000591	.	C	CAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,32;MFRL=195,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:46000590_T_G:46000590:0,1,0,1
chr17	46048592	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,3,11
chr17	46048858	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	46051911	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr17	46052793	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr17	46054264	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr17	46055106	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr17	46055347	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr17	46058539	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=115,198;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:14,2:16,0:19,11,2,0
chr17	46103760	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,8:0,0,16,6
chr17	46106634	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	46114692	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr17	46129030	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:46129030_G_A:46129030:0,3,0,1
chr17	46129033	.	G	GAATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=223,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:46129030_G_A:46129030:0,1,0,1
chr17	46136966	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:4,8,1,1
chr17	46190106	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,189;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.769:7:0,4:1,1:0,1,0,6
chr17	46190819	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	46198738	.	C	CAAAA	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=32,37;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:27,1:13,1:0|1:46198738_C_CAAAA:46198738:25,16,0,2
chr17	46198742	.	C	CAG	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:26,1:13,1:0|1:46198738_C_CAAAA:46198738:28,15,0,2
chr17	46198746	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:27,1:15,1:0|1:46198738_C_CAAAA:46198738:28,15,0,2
chr17	46198749	.	GCTGTGATTTTGGAAGACCCAAAGAGGGAACCTCCACTCTTCAGTCT	G	.	.	DP=64;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=-1073741811;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:28,1:14,1:0|1:46198738_C_CAAAA:46198738:34,27,0,2
chr17	46198876	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,14:0,0,3,18
chr17	46239985	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr17	46257679	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46257679_G_T:46257679:0,1,0,1
chr17	46257681	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46257679_G_T:46257679:0,1,0,1
chr17	46257683	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:46257679_G_T:46257679:0,1,0,1
chr17	46257685	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46257679_G_T:46257679:0,0,0,1
chr17	46257687	.	A	ACTTT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46257679_G_T:46257679:0,0,0,1
chr17	46257693	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46257679_G_T:46257679:0,0,0,1
chr17	46622313	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	46673723	.	TC	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr17	46690509	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=226,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:46690509_G_C:46690509:1,0,1,0
chr17	46690514	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,12;MFRL=226,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:46690509_G_C:46690509:1,0,1,0
chr17	46799812	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,3:0,7,0,5
chr17	46805542	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:7,5,1,1
chr17	46847524	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,0:3,7:0,5,0,7
chr17	46867198	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,159;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.293:12:4,2:5,1:9,0,3,0
chr17	46868710	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,5:2,6:5,1,11,0
chr17	46874362	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.339:13:6,4:1,0:8,1,4,0
chr17	46874647	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=238,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	46879079	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=197,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	46926772	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=128.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,13:0,23:0,0,7,32
chr17	46972479	.	ATCTC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=97,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TC;STR;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:3,5:7,3,6,3
chr17	46973139	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0,0,2,7
chr17	46993370	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr17	47000110	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:5,6:1,2:6,0,8,0
chr17	47007963	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,4:3,2:1,7,3,4
chr17	47010795	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr17	47021418	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=167,196;MMQ=60,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47021418_A_C:47021418:0,3,0,1
chr17	47021428	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=161,196;MMQ=60,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47021418_A_C:47021418:0,2,0,1
chr17	47036042	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=94,126;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:8,5:5,9:9,5,8,7
chr17	47038391	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,7:0,0,0,9
chr17	47044463	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:1,1:2,1,2,0
chr17	47076551	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,13:0,19:0,0,23,9
chr17	47117384	.	CTG	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:9,2:0|1:47117384_CTG_C:47117384:8,10,0,2
chr17	47117387	.	AGGG	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:9,2:0|1:47117384_CTG_C:47117384:8,10,0,2
chr17	47117393	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=140,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:47117384_CTG_C:47117384:9,9,0,2
chr17	47117395	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=140,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:47117384_CTG_C:47117384:9,9,0,2
chr17	47117401	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=145,119;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,0:10,1:0|1:47117384_CTG_C:47117384:9,7,0,2
chr17	47120776	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=120,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,3:3,3:2,3,5,1
chr17	47120786	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=96,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,0:3,4:7,1,1,3
chr17	47122525	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr17	47123423	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.363:12:5,1:1,2:2,6,0,4
chr17	47238028	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,3,13
chr17	47241642	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr17	47243622	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,3:7,6:4,7,4,5
chr17	47243709	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0|1:47243709_AGG_A:47243709:0,0,0,1
chr17	47243715	.	A	ACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47243709_AGG_A:47243709:0,0,0,1
chr17	47293848	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,5:8,5:9,3,6,4
chr17	47390136	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=118,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.522:25:5,6:6,7:8,4,10,3
chr17	47484228	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:3,2,1,3
chr17	47587839	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.236:15:5,0:3,3:0|1:47587839_A_C:47587839:5,7,0,3
chr17	47587847	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,0:4,3:0|1:47587839_A_C:47587839:4,7,0,3
chr17	47685200	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:7,6:11,5:10,8,3,8
chr17	47688881	.	T	TAGAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=142,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=AG;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr17	47696586	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,1:3,3:10,1,1,3
chr17	47780739	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47780739_G_C:47780739:0,1,0,1
chr17	47780741	.	C	CAACGCTCATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:47780739_G_C:47780739:0,1,0,1
chr17	47783375	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=202,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr17	47783663	.	C	T	.	.	DP=115;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,48:0.427:113:30,22:32,25:33,32,29,19
chr17	47783727	.	AGAAAAGAAAAG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=163,128;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.703:9:0,1:1,4:0,2,4,3
chr17	47785064	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=217.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,29:0,35:0,0,44,20
chr17	47898618	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,188;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:9,2:11,0:22,0,0,2
chr17	47904963	.	C	CAATGCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	47915922	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=152,149;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:20,4:15,0:32,3,4,0
chr17	48051181	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:3,0:2,2:1,7,3,0
chr17	48151908	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,3,7
chr17	48153151	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:1,2:3,8,1,1
chr17	48155657	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=110,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:16,3:10,0:10,17,0,3
chr17	48157641	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:6,2,1,1
chr17	48158794	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:1,8,0,2
chr17	48165064	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	48172779	.	A	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=175.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,50:0.945:52:1,26:1,22:2,0,47,3
chr17	48172965	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,12:0.279:42:6,2:3,2:3,27,0,12
chr17	48174910	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=107,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48174910_TG_T:48174910:1,3,0,1
chr17	48174917	.	G	GCCTCAAGCTGGTAAGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=74,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:48174910_TG_T:48174910:1,2,0,1
chr17	48183468	.	T	TGGGGGGGGG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=14,9;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,17;RU=G;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.239:9:0,0:1,0:0|1:48183468_T_TGGGGGGGGG:48183468:0,7,0,2
chr17	48183477	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.328:10:1,1:4,0:0|1:48183477_C_G:48183477:0,7,0,3
chr17	48183480	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.417:12:2,0:4,1:0|1:48183477_C_G:48183477:0,7,0,5
chr17	48183483	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.441:11:3,2:2,1:0|1:48183468_T_TGGGGGGGGG:48183468:0,6,0,5
chr17	48184288	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr17	48184377	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr17	48185943	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,133;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:5,2:9,0:12,3,0,2
chr17	48193423	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,1:9,1:6,9,1,1
chr17	48212647	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr17	48220879	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=15,32;MFRL=159,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:48220879_A_C:48220879:1,0,1,0
chr17	48220885	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,32;MFRL=159,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48220879_A_C:48220879:1,0,1,0
chr17	48220887	.	CT	GG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=159,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:48220879_A_C:48220879:2,1,1,0
chr17	48220891	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=159,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:48220879_A_C:48220879:2,1,1,0
chr17	48220898	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,0;MFRL=129,216;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:48220879_A_C:48220879:3,1,1,0
chr17	48222495	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,3:7,0:11,8,2,1
chr17	48226445	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	48243504	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=141.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,21:0,20:0,0,20,26
chr17	48245180	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	48245649	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,17;MFRL=302,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,1:1,0:1,0,1,1
chr17	48246634	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.433:13:3,0:1,0:1,6,0,6
chr17	48252615	.	C	CCAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,22628629;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr17	48252804	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr17	48263021	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,2:0,0,4,12
chr17	48265426	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr17	48265495	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,16,5
chr17	48266108	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=136,54;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:14,2:0|1:48266108_C_T:48266108:12,13,1,1
chr17	48266126	.	G	GATATATCAAAATAGAGTGCAGTGGCTAC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:10,2:0|1:48266108_C_T:48266108:9,13,1,1
chr17	48266669	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=86.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,12:0,0,9,14
chr17	48269302	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr17	48269426	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr17	48270098	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:1,3:3,4:1,3,3,5
chr17	48271433	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=72.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,11:0,0,10,12
chr17	48272055	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr17	48273439	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr17	48273464	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr17	48274291	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr17	48274309	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,6:0,18:0,0,17,7
chr17	48276555	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=94,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.409:52:16,14:13,7:12,19,8,13
chr17	48277059	.	AGCCCCAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCCCCAG;STR;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.840:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	48355968	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=125,77;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:2,5,0,4
chr17	48356698	.	A	ACACACACACC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=189,168;MMQ=45,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:48356698_A_ACACACACACC:48356698:1,2,0,1
chr17	48356699	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=189,168;MMQ=45,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:48356698_A_ACACACACACC:48356698:1,2,0,1
chr17	48356702	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=189,168;MMQ=45,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:48356698_A_ACACACACACC:48356698:1,2,0,1
chr17	48356742	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48356742_T_C:48356742:0,0,0,1
chr17	48356745	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48356742_T_C:48356742:0,0,0,1
chr17	48431997	.	A	AGAAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	48433081	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=226,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr17	48445674	.	CCTGGTCAG	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=175,263;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTGGTCAG;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,1:2,0:0|1:48445674_CCTGGTCAG_C:48445674:0,3,0,1
chr17	48445699	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=263,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1|0:48445674_CCTGGTCAG_C:48445674:0,1,0,2
chr17	48452978	.	A	AAGC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGC;STR;TLOD=48.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:9,8:4,4:5,8,5,8
chr17	48453503	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:11,8,0,2
chr17	48457005	.	C	CCTTTGCCCACCATGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr17	48469724	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,5:4,5:6,2,7,3
chr17	48474501	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,3:2,7:6,0,10,0
chr17	48539997	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr17	48540960	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	48541707	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=78,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,1:3,6:0,4,3,4
chr17	48551745	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=228,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:48551745_A_AT:48551745:1,2,1,0
chr17	48551749	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=218,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:48551745_A_AT:48551745:1,3,1,0
chr17	48551752	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=218,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:48551745_A_AT:48551745:1,3,1,0
chr17	48560883	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=199,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:2,2,0,3
chr17	48561191	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.386:8:3,2:1,1:0,5,0,3
chr17	48562047	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:6,3:3,3:6,4,6,2
chr17	48613837	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=214,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr17	48625828	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr17	48628160	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,15,4
chr17	48628581	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	48629291	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr17	48629312	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr17	48631607	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr17	48633043	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr17	48652806	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0,0,11,0
chr17	48652875	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,13:0,5:0,0,14,4
chr17	48669511	.	T	TGCAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=195,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48669511_T_TGCAA:48669511:0,2,0,1
chr17	48669514	.	CTGT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=195,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48669511_T_TGCAA:48669511:0,2,0,1
chr17	48669520	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=195,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48669511_T_TGCAA:48669511:0,2,0,1
chr17	48677212	.	GG	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=217,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:48677212_GG_AC:48677212:0,3,0,1
chr17	48677216	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=222,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:48677212_GG_AC:48677212:0,3,0,1
chr17	48677220	.	G	GGCTAACACA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=222,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:48677212_GG_AC:48677212:0,3,0,1
chr17	48677225	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,32;MFRL=220,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:48677212_GG_AC:48677212:0,2,0,1
chr17	48677244	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	48678117	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.072:40:21,1:16,1:15,23,1,1
chr17	48678325	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	48693760	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr17	48742509	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=112,57;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,3:7,0:10,7,3,0
chr17	48746135	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	48746923	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr17	48750961	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=105,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0|1:48750961_C_T:48750961:7,7,1,1
chr17	48750967	.	C	CTGTCCAGCTTGCCTTGGTTTTTAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=131,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,0:4,2:0|1:48750961_C_T:48750961:7,6,1,1
chr17	48753522	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,5:2,3:0,7,0,8
chr17	48785100	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	48797210	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=67.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,4:0,0,1,18
chr17	48818549	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:16,4:11,0:12,17,4,0
chr17	48821201	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=72.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,21:0.550:38:6,7:10,11:0|1:48821201_T_C:48821201:1,16,4,17
chr17	48821207	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,19:0.555:34:6,9:8,9:0|1:48821201_T_C:48821201:1,14,2,17
chr17	48822265	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=192,218;MMQ=49,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48822265_CA_TG:48822265:0,2,0,1
chr17	48822268	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=192,218;MMQ=45,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:48822265_CA_TG:48822265:0,3,0,1
chr17	48822271	.	TA	CG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=192,218;MMQ=45,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:48822265_CA_TG:48822265:0,3,0,1
chr17	48822275	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=192,218;MMQ=45,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:48822265_CA_TG:48822265:0,3,0,1
chr17	48823815	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:2,1,5,0
chr17	48941417	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	49067718	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	49083516	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:24,3:15,0:13,27,0,3
chr17	49156880	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=161,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,2:7,0:9,3,1,1
chr17	49272536	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,178;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:14,3:16,0:23,7,3,0
chr17	49281133	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=140.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,16:0,25:0,0,33,8
chr17	49350617	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=224,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,6:3,1:5,0,6,1
chr17	49371230	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr17	49371505	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr17	49711041	.	A	ACCC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:2,5:5,4:0|1:49711041_A_ACCC:49711041:2,6,1,9
chr17	49711042	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:3,4:5,5:0|1:49711041_A_ACCC:49711041:2,6,1,9
chr17	49713205	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.585:15:5,4:1,4:5,1,5,4
chr17	51063941	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:10,11:7,1:8,9,9,3
chr17	51902252	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,14:0,5:0,0,10,9
chr17	51902492	.	A	AAAT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr17	51902527	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr17	52991026	.	CAAAA	C,CAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34,31;MFRL=0,186,132;MMQ=60,60,45;MPOS=20,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,16,21;RU=A;STR;TLOD=3.74,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.411,0.404:2:0,1,0:0,0,1:0,0,2,0
chr17	52991047	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=152,132;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:2,1,1,0
chr17	52992128	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:0,6,1,6
chr17	53007655	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	53013980	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,32:0.452:71:22,19:17,12:33,6,24,8
chr17	53024689	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:4,6,2,0
chr17	53026823	.	TAAAAG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAG;STR;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:2,2:7,0,3,0
chr17	53038082	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=381,311;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,0,4
chr17	53038783	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	53041965	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr17	53042017	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:6,5:4,2:0|1:53042017_C_G:53042017:10,1,6,1
chr17	53042023	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,6:4,2:0|1:53042017_C_G:53042017:9,1,7,1
chr17	53045962	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=158,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:0|1:53045962_C_CT:53045962:3,20,1,1
chr17	53045963	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=158,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:14,0:8,2:0|1:53045962_C_CT:53045962:3,20,1,1
chr17	53063743	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr17	53076799	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.513:37:7,11:11,8:7,11,8,11
chr17	53076817	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:11,5:6,10:7,10,3,12
chr17	53120855	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:3,0,5,0
chr17	53124546	.	C	CGT,CGTGT	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=29,22,25;MFRL=158,100,95;MMQ=60,60,60;MPOS=9,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,17,18;RU=GT;STR;TLOD=4.05,4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.295,0.278:11:2,1,2:3,2,1:0,5,0,6
chr17	53158361	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr17	53342796	.	G	GTTTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTC;STR;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,7:0,0,9,1
chr17	53392852	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,0,6
chr17	53498990	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr17	53828706	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	53844833	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr17	53844847	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr17	53851071	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,9:0,3:0|1:53851071_A_G:53851071:0,0,10,4
chr17	53851078	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0|1:53851071_A_G:53851071:0,0,10,4
chr17	53852111	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,12,3
chr17	54305319	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:3,5:0,7:1,2,3,9
chr17	54428067	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	54517855	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr17	54535163	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	54554821	.	CTT	C,CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33,18;MFRL=0,154,104;MMQ=60,60,60;MPOS=16,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=7.75,7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,4:0.465,0.447:9:0,2,1:0,2,0:0,0,7,2
chr17	54558248	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr17	54560003	.	GCAACAACCCTTCC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	54672419	.	CT	GG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=123,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.194:24:8,1:11,0:1,18,5,0
chr17	54872391	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr17	54872555	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=175,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr17	54892348	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:7,3:5,11:1,11,3,11
chr17	54921322	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,24:0.414:58:24,15:10,8:32,2,22,2
chr17	54925262	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	54925480	.	C	CATAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=AT;STR;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,1:4,2:0,5,0,5
chr17	54936131	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,2:0,4,0,3
chr17	55016354	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr17	55026912	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=152,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr17	55027096	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.067:58:30,3:23,0:26,29,3,0
chr17	55065530	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,2:7,7:9,3,7,2
chr17	55065558	.	T	TA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=98.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,13:0,21:0,0,23,12
chr17	55074482	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:3,0:6,4:0,9,0,5
chr17	55075928	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr17	55182811	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:6,1:1,2:7,1,3,0
chr17	55334563	.	A	AGGTAGATTTATTTTCTTTCTTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	55944888	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:55944888_A_C:55944888:0,2,0,1
chr17	55944894	.	CTGA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:55944888_A_C:55944888:0,2,0,1
chr17	56058187	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,2:9,1:1,14,0,3
chr17	56058198	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:1,8,0,2
chr17	56065387	.	CGGGGCCCGG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,1,0
chr17	56083934	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,8:0,0,0,14
chr17	56232459	.	TTTTG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTG;STR;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:4,2:9,0,5,0
chr17	56233034	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:3,7:9,8:9,3,11,5
chr17	56247454	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:0,3:5,3:1,4,3,4
chr17	56247575	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:5,2:8,2:10,4,2,2
chr17	56270121	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr17	56271060	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=138,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,4:3,2:7,1,6,0
chr17	56271094	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.539:22:4,6:6,5:5,5,11,1
chr17	56285629	.	A	ACATTACAAGACACC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	56290334	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,2:1,5:7,1,5,2
chr17	56293960	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.438:16:3,4:6,2:8,1,7,0
chr17	56321481	.	CACACACACACACTTCCCTTCACA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:56321481_CACACACACACACTTCCCTTCACA_C:56321481:0,2,0,1
chr17	56321507	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56321481_CACACACACACACTTCCCTTCACA_C:56321481:0,1,0,1
chr17	56324762	.	C	CCCGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=218,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:56324762_C_CCCGG:56324762:2,0,1,0
chr17	56324765	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=218,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:56324762_C_CCCGG:56324762:2,0,1,0
chr17	56324769	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=20,35;MFRL=192,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:56324762_C_CCCGG:56324762:3,0,1,0
chr17	56324774	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=178,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:56324762_C_CCCGG:56324762:3,1,1,0
chr17	56324786	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=176,208;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:56324762_C_CCCGG:56324762:3,1,1,0
chr17	56324793	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=176,208;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:56324762_C_CCCGG:56324762:3,1,1,0
chr17	56325049	.	CAGGA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=144,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr17	56327999	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:2,0:1,5:1,2,1,4
chr17	56344656	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr17	56345011	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=221,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:56345011_TC_T:56345011:2,1,0,1
chr17	56345016	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=221,138;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:56345011_TC_T:56345011:2,1,0,1
chr17	56349078	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:15,1:9,1:12,12,1,1
chr17	56383248	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=203,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:56383248_G_C:56383248:0,4,1,0
chr17	56383250	.	GC	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=203,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:56383248_G_C:56383248:0,4,1,0
chr17	56384346	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:56384346_T_A:56384346:0,2,0,1
chr17	56384347	.	G	GGGGGAGCCGAGGGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56384346_T_A:56384346:0,2,0,1
chr17	56387563	.	G	GAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	56393293	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,2:7,0:7,0,2,0
chr17	56398010	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:7,0:7,2:1,14,1,1
chr17	56544213	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr17	56569842	.	T	TGA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,18,3
chr17	56581651	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,15,9
chr17	56585872	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,18:0,14:0,0,11,22
chr17	56598213	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=52.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,9:0,0,5,14
chr17	56603242	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr17	56603770	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=231,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	56603978	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr17	56649565	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:56649565_G_T:56649565:0,2,0,1
chr17	56649572	.	C	CTTGGATGGAGTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:56649565_G_T:56649565:0,2,0,1
chr17	56654690	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr17	56693677	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:1,3,0,6
chr17	56695002	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:3,0:3,2:0|1:56695002_A_G:56695002:0,7,0,2
chr17	56695008	.	C	CTTCAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:56695002_A_G:56695002:0,7,0,2
chr17	56738856	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:12,1:14,1:12,14,0,2
chr17	56780731	.	TTTGAGGTGTTTGATAAGCATGA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.335:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr17	56798266	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	57076893	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	57089591	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,36;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57089591_C_G:57089591:0,0,1,0
chr17	57089594	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,36;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57089591_C_G:57089591:0,0,1,0
chr17	57089596	.	AC	CG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:57089591_C_G:57089591:0,0,1,0
chr17	57089600	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,36;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57089591_C_G:57089591:0,0,1,0
chr17	57089603	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57089591_C_G:57089591:0,0,1,0
chr17	57093232	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=200,293;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:57093232_T_C:57093232:0,2,0,1
chr17	57093239	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=200,293;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:57093232_T_C:57093232:0,2,0,1
chr17	57093243	.	AA	GG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=197,293;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57093232_T_C:57093232:0,1,0,1
chr17	57093247	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=19,33;MFRL=197,293;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:57093232_T_C:57093232:0,1,0,1
chr17	57094617	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr17	57138403	.	C	G	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,4:0.050:94:46,2:44,2:46,44,3,1
chr17	57141768	.	TA	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,13:0.206:62:14,4:18,5:6,43,1,12
chr17	57272277	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:18,0:14,2:1,31,0,2
chr17	57272298	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:12,1:9,2:0|1:57272298_A_G:57272298:0,21,0,3
chr17	57272301	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:11,0:9,1:0|1:57272298_A_G:57272298:0,21,0,3
chr17	57290392	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,1:12,1:17,8,2,0
chr17	57292447	.	G	GATTAGTTGAGTGGCTTGAGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr17	57311747	.	CCAA	C	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,1:9,1:29,0,2,0
chr17	57311748	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.343:30:14,2:6,8:20,0,10,0
chr17	57311756	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=164,106;MMQ=60,36;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,3:13,0:26,1,3,0
chr17	57311773	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.089:53:18,0:15,0:41,6,6,0
chr17	57466917	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	57648062	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=146,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.165:34:14,0:13,4:0|1:57648062_A_T:57648062:7,22,3,2
chr17	57648065	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=152,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.176:32:10,0:10,3:0|1:57648062_A_T:57648062:5,22,3,2
chr17	57648071	.	GG	AA,AG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,31,32;MFRL=163,153,89;MMQ=60,50,54;MPOS=30,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.60,9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,3:0.126,0.148:21:8,0,0:6,2,2:0,16,1,4
chr17	57648076	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=154,95;MMQ=60,38;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:0|1:57648062_A_T:57648062:0,17,0,2
chr17	57663596	.	TAAAA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26,30,23;MFRL=153,90,185,212;MMQ=60,39,50,60;MPOS=22,25,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,16,17;RU=A;STR;TLOD=7.27,6.91,3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,4,4,3:0.190,0.228,0.207:17:2,3,1,2:3,1,2,0:1,5,3,8
chr17	57725043	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.409:42:9,8:16,9:7,18,5,12
chr17	57733479	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr17	57743651	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,1:4,6:1,10,1,6
chr17	57743691	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=197,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:3,6,2,1
chr17	57746358	.	A	ATATGAATCTAAGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	57750982	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,17:0.401:43:11,8:14,9:19,7,15,2
chr17	57761254	.	G	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,197;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:28,0:24,3:37,15,3,0
chr17	57776232	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:9,1:9,7,0,2
chr17	57776318	.	A	ACATGATTATGTATTATGATTACATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:3,0:1,2:0,5,1,1
chr17	57889192	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:1,6,2,4
chr17	57895025	.	G	T	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=140.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,51:0.547:93:23,28:19,21:29,13,38,13
chr17	57937792	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,17;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.480:6:0,1:1,0:1,2,1,2
chr17	57944184	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=236,224;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr17	57955754	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=218,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:0,6,0,5
chr17	57958281	.	TC	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:19,2:20,0:33,6,2,0
chr17	57968226	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=150,107;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:14,0:5,2:0|1:57968226_G_T:57968226:11,9,0,2
chr17	57968230	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=150,107;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:14,0:6,2:0|1:57968226_G_T:57968226:11,9,0,2
chr17	58011498	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,167;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.498:42:11,13:10,7:19,2,18,3
chr17	58013517	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:8,1:6,5:12,4,5,1
chr17	58013986	.	TG	CA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=177,194;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,2:4,0:0,16,0,2
chr17	58014014	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:0,8,0,3
chr17	58024224	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr17	58031309	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.204:21:11,2:6,2:17,0,4,0
chr17	58037340	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=182,122;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.118:49:20,5:21,0:43,1,5,0
chr17	58147292	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,282;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:58147292_C_A:58147292:0,3,0,1
chr17	58147293	.	T	TGTCAATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=177,282;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:58147292_C_A:58147292:0,3,0,1
chr17	58149745	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,6:4,2:0,7,0,8
chr17	58156330	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr17	58232823	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	58234007	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:58234007_C_G:58234007:10,9,1,1
chr17	58234013	.	CGCTT	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=145,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:9,2:0|1:58234007_C_G:58234007:12,12,1,1
chr17	58234018	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=145,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:0|1:58234007_C_G:58234007:12,12,1,1
chr17	58234021	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=145,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:8,2:0|1:58234007_C_G:58234007:12,12,1,1
chr17	58234024	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:12,2:0|1:58234007_C_G:58234007:12,13,1,1
chr17	58234028	.	GGC	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=147,60;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,0:13,1:0|1:58234007_C_G:58234007:11,14,1,1
chr17	58289507	.	T	C	.	.	DP=134;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=145,158;MMQ=60,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:124,3:0.031:127:46,1:54,2:27,97,0,3
chr17	58289521	.	CT	C,CTT	.	.	DP=111;ECNT=3;MBQ=34,35,33;MFRL=149,139,152;MMQ=60,56,48;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.55,7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:68,6,7:0.076,0.093:81:28,1,3:38,5,3:1,67,0,13
chr17	58289533	.	A	T	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=153,164;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,6:0.066:88:35,1:46,3:1,81,0,6
chr17	58469241	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,13;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.312:7:2,0:1,0:3,2,2,0
chr17	58531611	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,1:2,4:2,2,5,0
chr17	58678112	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:6,2:18,0:20,5,2,0
chr17	58885299	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=199,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,4:0,9:1,0,11,2
chr17	58945980	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=121,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:13,0:16,4:18,12,4,0
chr17	59001879	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=157,67;MMQ=60,58;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.241:10:1,1:2,1:1,7,0,2
chr17	59469360	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:5,4,2,0
chr17	59480642	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,273;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr17	59857809	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,3,16
chr17	59878522	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr17	59947365	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:59947365_A_AT:59947365:0,2,0,1
chr17	59947368	.	TAGAAAAAG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:59947365_A_AT:59947365:0,2,0,1
chr17	59947378	.	AAGAAGTTT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:59947365_A_AT:59947365:0,2,0,1
chr17	59947387	.	CTAAGAAGTT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,35;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr17	59958580	.	A	ACACCTATTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:59958580_A_ACACCTATTC:59958580:0,1,0,1
chr17	59958581	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:59958580_A_ACACCTATTC:59958580:0,1,0,1
chr17	59967305	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	59968795	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=264,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr17	59971067	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:5,0,7,0
chr17	59974794	.	CT	C,CTT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,32,33;MFRL=156,170,35;MMQ=60,60,60;MPOS=28,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.56,8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,5,5:0.126,0.149:37:11,1,1:15,4,4:27,0,8,2
chr17	59996918	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:0|1:59996918_A_C:59996918:1,16,0,2
chr17	59996920	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:9,0:8,1:0|1:59996918_A_C:59996918:1,16,0,2
chr17	59996937	.	A	ATTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=150,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=T;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.280:12:6,0:3,3:0,9,0,3
chr17	60060236	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,2:15,2:12,18,1,3
chr17	60064587	.	G	GAAGATTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=220,189;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr17	60142423	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=15,12;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.348:17:1,0:1,0:0|1:60142423_A_C:60142423:10,1,6,0
chr17	60142429	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=11,17;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.308:19:2,0:2,0:0|1:60142423_A_C:60142423:13,0,6,0
chr17	60142434	.	TC	GG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=23,9;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.326:21:5,1:1,0:0|1:60142423_A_C:60142423:14,0,7,0
chr17	60142440	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=17,28;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.284:24:2,3:4,1:0|1:60142423_A_C:60142423:17,0,7,0
chr17	60472623	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr17	60483826	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:1,2,2,0
chr17	60491298	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,181;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.410:25:7,7:7,3:0,15,0,10
chr17	60522339	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=159,119;MMQ=40,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,0:6,2:0|1:60522339_A_T:60522339:3,13,1,1
chr17	60522341	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=159,119;MMQ=40,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,0:6,1:0|1:60522339_A_T:60522339:3,13,1,1
chr17	60600569	.	AC	A	.	.	DP=125;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,155;MMQ=57,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,12:0.108:118:57,7:46,5:17,89,0,12
chr17	60748926	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,1:5,4:5,0,5,0
chr17	60749519	.	ATCTCCC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTCCC;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:5,2:11,0:2,14,1,1
chr17	60753345	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:60753345_A_T:60753345:0,2,0,1
chr17	60753346	.	TCTGCCATCATGCCCAGA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:60753345_A_T:60753345:0,3,0,1
chr17	60753351	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=102,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:0,0:1,1:1|0:60753345_A_T:60753345:0,2,0,1
chr17	60753355	.	A	ACACCCCGTAGGTGGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=102,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:1,0:1,1:1|0:60753345_A_T:60753345:0,2,0,1
chr17	60753904	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.375:17:4,4:5,2:1,10,1,5
chr17	60759340	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0|1:60759340_A_G:60759340:0,0,2,12
chr17	60759347	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,2:0,10:0|1:60759340_A_G:60759340:0,0,2,12
chr17	60766786	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr17	60766804	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr17	60767151	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr17	60767461	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,11,6
chr17	60767953	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr17	60768243	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr17	60779025	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	60813245	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr17	61345266	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,118;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:1,11,0,2
chr17	61489123	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:61489123_T_A:61489123:0,4,0,1
chr17	61489124	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:61489123_T_A:61489123:0,4,0,1
chr17	61489128	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:61489123_T_A:61489123:0,4,0,1
chr17	61489129	.	G	GAGAAAGCTAAACGAGGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:61489123_T_A:61489123:0,4,0,1
chr17	61556298	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=83,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr17	61556527	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	61557971	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61557971_G_GTT:61557971:1,0,0,1
chr17	61557973	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61557971_G_GTT:61557971:1,0,0,1
chr17	61557977	.	GG	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61557971_G_GTT:61557971:1,0,0,1
chr17	61560763	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr17	61562553	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,2:0,2:1,0,2,2
chr17	61563994	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:10,5,1,1
chr17	61564005	.	A	ACAGCCCCGTCCACGTTACC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:10,6,1,1
chr17	61565990	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:2,5:8,0:0|1:61565990_G_C:61565990:7,3,3,2
chr17	61565998	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:1,5:6,0:0|1:61565990_G_C:61565990:6,3,3,2
chr17	61566031	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=125,90;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.171:19:5,1:11,1:9,7,2,1
chr17	61566095	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=67,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:3,5:2,11:0,5,9,7
chr17	61573761	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:8,0,5,2
chr17	61574712	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,3:4,2:0,4,1,4
chr17	61600717	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	61611423	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.839:14:1,5:0,7:0,2,2,10
chr17	61615371	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr17	61615660	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,15;MFRL=238,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:1,1:0,0:0,1,1,3
chr17	61615729	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:61615729_A_C:61615729:0,0,1,0
chr17	61615731	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61615729_A_C:61615729:0,0,1,0
chr17	61615741	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=206,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:61615741_T_G:61615741:0,1,1,0
chr17	61615750	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,11;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:61615741_T_G:61615741:1,1,1,0
chr17	61619663	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:5,4:1,5:4,2,5,4
chr17	61621805	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=191,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0,3,1,3
chr17	61622703	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	61657348	.	G	GTAGTCATCAGAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr17	61660761	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	61660889	.	CG	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=110,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,25:0.934:28:1,9:1,14:0,3,18,7
chr17	61678549	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.550:11:2,1:1,0:3,2,6,0
chr17	61683704	.	G	GGGATACTGAAAAGAAAAAAAATA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=136,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.094:40:16,1:20,0:0|1:61683704_G_GGGATACTGAAAAGAAAAAAAATA:61683704:14,23,2,1
chr17	61683706	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=136,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:17,0:20,0:0|1:61683704_G_GGGATACTGAAAAGAAAAAAAATA:61683704:14,23,2,1
chr17	61684669	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,2:9,0:15,10,2,0
chr17	61712074	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=145,74;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,0:9,3:17,1,2,1
chr17	61735366	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:61735366_A_C:61735366:0,1,0,1
chr17	61735368	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:61735366_A_C:61735366:0,1,0,1
chr17	61768597	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=135,62;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:7,12,1,1
chr17	61768651	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=170,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:0,0:1,0:1,0,0,3
chr17	61776479	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr17	61781331	.	T	C,TAGAACC	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,29,31;MFRL=0,67,119;MMQ=60,60,60;MPOS=34,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.18,136.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,32:0.078,0.900:35:0,3,12:0,0,20:0,0,19,16
chr17	61783908	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,17,0
chr17	61790917	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr17	61805607	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr17	61829989	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr17	61838259	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=283.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,84:0.977:85:1,39:0,41:0,1,34,50
chr17	61842237	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:9,0:0,2:0|1:61842237_T_C:61842237:0,9,0,2
chr17	61842239	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:0,2:0|1:61842237_T_C:61842237:0,9,0,2
chr17	61889213	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,6:0,0,9,0
chr17	61892862	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	61898109	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=177,215;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:61898109_A_G:61898109:2,0,1,0
chr17	61898111	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=177,215;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:61898109_A_G:61898109:2,0,1,0
chr17	61898135	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	61901439	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=142.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,13:0,25:0,0,21,17
chr17	61901641	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=305,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=132.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,33:0.945:34:1,15:0,15:0|1:61901641_T_C:61901641:1,0,22,11
chr17	61901657	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=305,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=141.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,36:0.949:37:1,18:0,16:0|1:61901641_T_C:61901641:1,0,23,13
chr17	61902822	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr17	61904337	.	TCCACTTCCAGTTTC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCACTTCCAGTTTC;STR;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.881:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr17	61904724	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0|1:61904724_T_C:61904724:0,0,4,0
chr17	61904728	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,4:0|1:61904724_T_C:61904724:0,0,5,0
chr17	61912261	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr17	61949529	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=137,122;MMQ=50,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,0:15,3:17,13,3,0
chr17	61949530	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=135,54;MMQ=58,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,0:15,3:19,11,1,2
chr17	61957720	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,199;MMQ=40,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:9,1:14,2,2,0
chr17	61958964	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=198,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr17	62019401	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=259,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0|1:62019401_G_GC:62019401:0,2,0,2
chr17	62019405	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,12;MFRL=259,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:62019401_G_GC:62019401:0,2,0,2
chr17	62019409	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=22,13;MFRL=259,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:62019401_G_GC:62019401:0,2,0,2
chr17	62019411	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,23;MFRL=259,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:62019401_G_GC:62019401:0,2,0,2
chr17	62019420	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=13,13;MFRL=259,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:62019401_G_GC:62019401:0,2,0,2
chr17	62022659	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr17	62036563	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:62036563_A_C:62036563:0,0,1,0
chr17	62036567	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=229,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:62036563_A_C:62036563:1,0,1,0
chr17	62036570	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=229,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:62036563_A_C:62036563:1,0,1,0
chr17	62036586	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=229,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	62042078	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr17	62043631	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=77,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.561:5:2,0:0,0:0|1:62043631_A_T:62043631:1,1,0,3
chr17	62043635	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=15,23;MFRL=153,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:0,1:0|1:62043631_A_T:62043631:1,2,0,2
chr17	62043638	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,17;MFRL=163,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:62043631_A_T:62043631:0,2,0,2
chr17	62048467	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr17	62048580	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:4,6,0,2
chr17	62048707	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	62049821	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=35,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.655:30:6,8:4,11:5,5,6,14
chr17	62080969	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,12,4
chr17	62083929	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,14:0,9:0,0,14,10
chr17	62122145	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr17	62122677	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,16,3
chr17	62130389	.	G	GCCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCT;STR;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.880:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr17	62137930	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:7,5:3,10:3,7,3,13
chr17	62145672	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=137.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,42:0.956:43:1,21:0,21:0,1,9,33
chr17	62145728	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,0,21
chr17	62152611	.	T	TAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.818:8:0,2:1,3:0,1,1,6
chr17	62156933	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=114.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,16:0,0,32,0
chr17	62158012	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr17	62158278	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr17	62158300	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr17	62232369	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62232369_AA_CC:62232369:0,0,0,1
chr17	62232372	.	C	CCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62232369_AA_CC:62232369:0,0,0,1
chr17	62232373	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62232369_AA_CC:62232369:0,0,0,1
chr17	62265838	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr17	62265895	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=142,207;MMQ=35,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr17	62401118	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr17	62406971	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=69.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,6:0,16:0,0,15,7
chr17	62463825	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0|1:62463825_T_TG:62463825:0,0,0,3
chr17	62463848	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62463825_T_TG:62463825:0,0,0,1
chr17	62476375	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=192.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,27:0,28:0,0,45,11
chr17	62479028	.	T	TA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=80.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,12:0,0,19,8
chr17	62481801	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr17	62492582	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=159.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,25:0,21:0,0,23,23
chr17	62500753	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,25:0.529:47:9,9:13,15:17,5,19,6
chr17	62501006	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,3:1,2:0,8,1,4
chr17	62503131	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:10,8:12,12:22,0,19,1
chr17	62506280	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.355:19:4,1:7,3:7,5,4,3
chr17	62518744	.	GGTAT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GTAT;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:2,0:8,0,1,1
chr17	62519097	.	CGTGTGT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=162,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=GT;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,1:0,0:0|1:62519097_CGTGTGT_C:62519097:0,3,0,1
chr17	62519108	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=119,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:62519097_CGTGTGT_C:62519097:0,2,0,1
chr17	62519113	.	TATTG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=119,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:62519097_CGTGTGT_C:62519097:0,2,0,1
chr17	62528179	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:3,4:6,4:0,9,2,7
chr17	62532640	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,7:3,5:10,0,12,0
chr17	62542504	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=98,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,4:5,3:1,5,1,6
chr17	62542543	.	A	AGCCATCTGGATGTGTACATG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	62557614	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,105;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:4,3,3,2
chr17	62587143	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.529:36:4,13:12,6:16,1,15,4
chr17	62589703	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,0:2,0:4,12,0,4
chr17	62602762	.	TA	T,TAA	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=31,32,31;MFRL=139,179,187;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.95,8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:60,5,7:0.071,0.105:72:28,2,3:28,3,4:5,55,3,9
chr17	62851861	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=177,162;MMQ=46,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.176:49:14,2:27,6:41,0,8,0
chr17	62851877	.	GT	AC,TC	.	.	DP=78;ECNT=5;MBQ=28,27,33;MFRL=170,193,160;MMQ=49,50,25;MPOS=7,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.14,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:68,4,2:0.061,0.039:74:21,0,0:47,4,2:68,0,6,0
chr17	62851881	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=165,193;MMQ=49,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,4:0.064:76:22,0:48,4:72,0,4,0
chr17	62851906	.	GG	CA	.	.	DP=117;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=152,95;MMQ=54,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,2:0.025:117:32,2:74,0:102,13,1,1
chr17	62851914	.	C	T	.	.	DP=137;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,8:0.068:129:34,4:84,4:104,17,6,2
chr17	62855003	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=16,30;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.134:32:4,2:7,1:4,24,1,3
chr17	62892873	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,236;MMQ=54,23;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,5:0.087:66:30,1:29,4:36,25,5,0
chr17	62893412	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=180,150;MMQ=57,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,8:4,3:2,7,4,7
chr17	62893457	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,8899382;MMQ=35,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,2:4,0:0,13,1,1
chr17	63014258	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=134,165;MMQ=60,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.614:6:0,0:2,3:0|1:63014258_G_A:63014258:2,0,4,0
chr17	63014260	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=134,165;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.542:7:0,0:2,2:0|1:63014258_G_A:63014258:3,0,4,0
chr17	63014262	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=138,165;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.485:8:1,0:2,3:0|1:63014258_G_A:63014258:4,0,4,0
chr17	63014266	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=134,165;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.437:9:3,0:2,3:0|1:63014258_G_A:63014258:5,0,4,0
chr17	63133804	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr17	63159300	.	AT	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.094:42:24,2:12,2:0,38,0,4
chr17	63173756	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,6:4,2:6,1,8,0
chr17	63173959	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:1,7,1,7
chr17	63189830	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:6,2:0,14,0,2
chr17	63200479	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=109,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:0,2,0,6
chr17	63685155	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,138;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:1,3:8,0:9,0,3,0
chr17	64001925	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:1,3,1,1
chr17	64023781	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr17	64024340	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr17	64024375	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,1:7,4:10,2,4,1
chr17	64025435	.	T	TTAATCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAATCA;STR;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,3:0,4,0,5
chr17	64025926	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr17	64050007	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,5:2,0:0,6,0,5
chr17	64050062	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr17	64062830	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr17	64128760	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:2,1,4,1
chr17	64173170	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:0,7,0,6
chr17	64208396	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:0,5,0,4
chr17	64216644	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:5,0,4,0
chr17	64225535	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:8,5:14,10:4,18,5,10
chr17	64298889	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=227,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:64298889_C_A:64298889:2,0,1,0
chr17	64298902	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:64298889_C_A:64298889:2,0,1,0
chr17	64298908	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=18,32;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:2,0,1,0
chr17	64298959	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,6:5,7:5,3,11,2
chr17	64684642	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr17	64735035	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	64737717	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr17	64737830	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,241;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,3:6,0:6,8,3,0
chr17	64785191	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:64785191_T_TG:64785191:0,1,0,2
chr17	64785192	.	G	GGGGCGCTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:64785191_T_TG:64785191:0,2,0,1
chr17	64800026	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:12,5,2,0
chr17	64961276	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	65026515	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=103,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,3:0,1:2,0,4,0
chr17	65041048	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65041048_T_A:65041048:0,0,0,1
chr17	65041049	.	C	CGAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65041048_T_A:65041048:0,0,0,1
chr17	65051180	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=120,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.665:13:1,3:3,5:2,2,8,1
chr17	65074354	.	G	GA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.533:35:8,3:8,14:13,3,10,9
chr17	65104666	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.678:20:2,8:4,4:2,4,7,7
chr17	65104743	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,10,10
chr17	65116491	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:9,1,7,1
chr17	65156919	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr17	65157063	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:33,2:10,1:29,14,3,0
chr17	65157277	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=198,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr17	65211949	.	CA	C,CAA	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=143,139,116;MMQ=60,60,60;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=8.22,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,5,7:0.099,0.122:53:25,1,5:15,4,2:31,10,10,2
chr17	65340620	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,19,1
chr17	65341770	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,4,0
chr17	65341976	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:4,2:11,2:4,11,1,3
chr17	65342066	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=204,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	65342074	.	T	TCAAGGAACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=196,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr17	65548540	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr17	65549847	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr17	65574283	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr17	65574420	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:65574420_A_AC:65574420:0,1,0,1
chr17	65574421	.	T	TTCTGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:65574420_A_AC:65574420:0,1,0,1
chr17	65574426	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:65574420_A_AC:65574420:0,1,0,1
chr17	65665608	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:0,4:1,8:1,0,12,0
chr17	65683398	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=230,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr17	65689053	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=137,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr17	65718798	.	TA	T	.	.	DP=72;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=118,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=134.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,54:0.968:56:1,24:1,26:0,2,3,51
chr17	65718839	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=229,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,12:1,17:0,1,0,29
chr17	65718867	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.637:14:4,2:0,7:0,5,0,9
chr17	65718874	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr17	65720346	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr17	65722841	.	T	TAGTAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=210,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr17	65722849	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	65730404	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,17,1
chr17	65732959	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr17	65733119	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,23:0.446:52:12,14:16,9:26,3,20,3
chr17	65734514	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr17	65735563	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,6:4,4:7,0,10,0
chr17	65739789	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0|1:65739789_A_G:65739789:0,0,15,8
chr17	65739797	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:4,5:6,4:0|1:65739789_A_G:65739789:7,3,6,3
chr17	65850029	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:6,10:5,3:12,0,12,1
chr17	65862693	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=135,133;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,15:0.236:66:18,6:31,9:23,28,7,8
chr17	65882457	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,17:0,13:0,0,15,18
chr17	65890364	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,246;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr17	65908163	.	AG	A	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.081:43:12,1:16,1:0|1:65908163_AG_A:65908163:28,12,2,1
chr17	65908165	.	AATAAT	A	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:11,1:16,1:0|1:65908163_AG_A:65908163:22,10,2,0
chr17	65908174	.	AATC	A	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.095:37:14,1:11,2:0|1:65908163_AG_A:65908163:26,8,2,1
chr17	65908180	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.087:40:15,1:16,2:0|1:65908163_AG_A:65908163:28,9,2,1
chr17	65908182	.	GTCT	G	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.087:40:16,1:18,2:0|1:65908163_AG_A:65908163:28,9,2,1
chr17	65919172	.	CTT	C,CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20,20;MFRL=165,148,177;MMQ=60,60,60;MPOS=29,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=3.74,4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.300,0.321:10:2,0,1:0,2,2:0,4,0,6
chr17	65944016	.	T	TTTACTCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=179,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:65944016_T_TTTACTCCC:65944016:0,1,0,1
chr17	65944021	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=179,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:0,0:0|1:65944016_T_TTTACTCCC:65944016:0,1,0,1
chr17	65955651	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr17	66036946	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=202,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:66036946_G_GT:66036946:0,2,0,1
chr17	66036949	.	G	GTCTGCAAAAACTGTGTGACGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=202,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:66036946_G_GT:66036946:0,2,0,1
chr17	66038181	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr17	66038979	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=195,162;MMQ=56,53;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:1,3:1,3:2,1,6,1
chr17	66039558	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=207,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr17	66039938	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:19,3:10,3:30,1,6,0
chr17	66250522	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,28:0.475:59:14,17:16,10:22,9,25,3
chr17	66364804	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,10:0,0,10,9
chr17	66420766	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr17	66422158	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,2:2,4:3,0,7,0
chr17	66426285	.	A	ACCAGAAG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=131,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:9,8,0,2
chr17	66429511	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	66440791	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr17	66447016	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:12,1:11,1:9,18,1,1
chr17	66453572	.	GGCCCGGGAA	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=181.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,22:0,19:0,0,0,41
chr17	66519857	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.657:18:5,5:1,7:4,2,8,4
chr17	66524987	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,24:0,21:0,0,40,5
chr17	66526027	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=134.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,19:0,27:0,0,43,7
chr17	66526316	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr17	66533979	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	66536212	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	66550887	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,58;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:6,1,4,0
chr17	66872802	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,7,12
chr17	66880081	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,0,16
chr17	66880371	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=170.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,21:0,28:0,0,49,0
chr17	66883719	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=79.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,0,23
chr17	66904031	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.416:12:1,0:1,1:2,5,0,5
chr17	66917457	.	GT	AA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,120;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,1:8,2:12,0,3,0
chr17	66918335	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=45,19;RU=T;STR;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.519:18:2,4:0,4:0|1:66918335_CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT_C:66918335:2,8,8,0
chr17	66918383	.	C	A	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,8:0.111:67:28,0:28,0:0|1:66918335_CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT_C:66918335:8,51,8,0
chr17	66925116	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	66925910	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0|1:66925910_T_C:66925910:0,0,0,17
chr17	66925923	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0|1:66925910_T_C:66925910:0,0,0,15
chr17	66938232	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr17	66938260	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	66972250	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=124.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,24:0,15:0,0,22,17
chr17	66972364	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:4,0:10,2:1,16,0,2
chr17	66986162	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr17	67023755	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0,0,9,1
chr17	67024585	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,158;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,6:1,14:1,0,20,0
chr17	67024791	.	CATGATTTTAAAAAAAATTACACTCAGAGCCTACATATTAACTTTACAGTCTCTGAAACTGTTG	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=172,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.139:26:6,3:10,0:2,21,1,2
chr17	67024799	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.931:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr17	67031369	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=107.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.946:34:1,19:0,14:1,0,25,8
chr17	67075072	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr17	67075274	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:10,0:0|1:67075274_T_C:67075274:18,3,0,2
chr17	67075276	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,1:9,0:0|1:67075274_T_C:67075274:18,3,0,2
chr17	67075277	.	A	ATAAACTT	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.117:23:11,2:9,0:0|1:67075274_T_C:67075274:18,3,0,2
chr17	67075294	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,11:0,0,27,3
chr17	67081660	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=154,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.489:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr17	67081670	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:11,0,2,0
chr17	67081732	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=270.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,80:0.988:80:0,44:0,35:0,0,56,24
chr17	67082926	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=232,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	67092948	.	TA	T,TAA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,32,30;MFRL=139,172,168;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=5.20,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,4,3:0.115,0.104:35:13,1,3:14,3,0:5,23,1,6
chr17	67099129	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,1,17
chr17	67109662	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	67109673	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	67109894	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,7:0,8:0,0,5,13
chr17	67119593	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr17	67133352	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	67144884	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	67150176	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,8,12
chr17	67150561	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	67152893	.	CAAAT	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAT;STR;TLOD=297.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.987:70:0,38:0,32:0,0,67,3
chr17	67160186	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=124.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,20:0,14:0,0,29,7
chr17	67170736	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=102.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,13:0,0,23,9
chr17	67171748	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	67178954	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=158.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,23:0,17:0,0,19,33
chr17	67178976	.	GAA	G,GA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,18,19;MFRL=0,189,125;MMQ=60,60,60;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=29.28,6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,10:0.516,0.451:22:0,0,2:0,1,3:0,0,3,19
chr17	67181540	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0|1:67181540_C_A:67181540:0,0,4,0
chr17	67181548	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0|1:67181540_C_A:67181540:0,0,3,0
chr17	67188668	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr17	67193150	.	A	AGGGAGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGAGG;STR;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.844:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr17	67211058	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr17	67212574	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	67215712	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,12:0,25:0,0,18,19
chr17	67245941	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=197.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,29:0,26:0,0,47,8
chr17	67251606	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,2:13,0:25,0,2,0
chr17	67257686	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,0:17,2:29,0,2,0
chr17	67274054	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr17	67280310	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	67282332	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr17	67287327	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	67293535	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=86.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,8:0,15:0,0,4,19
chr17	67303138	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:13,2:6,0:0,20,0,2
chr17	67512924	.	G	GTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=119.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,16:0,0,18,12
chr17	67522919	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	67532388	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr17	68130905	.	GAC	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:12,1:5,2:15,5,3,0
chr17	68175205	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=34,33;RU=T;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.710:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr17	68175917	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:12,1:11,2:21,3,3,0
chr17	70119709	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.186:33:15,0:11,2:0|1:70119709_A_C:70119709:1,26,6,0
chr17	70119713	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.193:32:14,0:10,2:0|1:70119709_A_C:70119709:1,25,6,0
chr17	70845688	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr17	70846027	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	71081078	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr17	71167812	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=227,121;MMQ=50,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:71167812_C_CT:71167812:0,4,0,1
chr17	71167817	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=227,121;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:71167812_C_CT:71167812:0,4,0,1
chr17	71167840	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=226,228;MMQ=40,36;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71167840_ACC_A:71167840:0,1,0,1
chr17	71167843	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=226,228;MMQ=40,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71167840_ACC_A:71167840:0,1,0,1
chr17	71192955	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr17	71193594	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	71195949	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr17	71196809	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=218,139;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.904:18:0,11:1,6:0,1,8,9
chr17	71196995	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	71197200	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	71198081	.	G	GGAGTAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=125,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:71198081_G_GGAGTAAA:71198081:0,2,0,1
chr17	71198083	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=125,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:71198081_G_GGAGTAAA:71198081:0,2,0,1
chr17	71201675	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr17	71203231	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=22,16;RU=A;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr17	71204484	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:8,0:11,3:13,7,2,1
chr17	71223424	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,1:0,0:0,0,1,10
chr17	71223501	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr17	71231604	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr17	71238525	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,6,15
chr17	71239000	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr17	71239016	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,6:0,0,13,6
chr17	71239157	.	A	AGATG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:71239157_A_AGATG:71239157:0,4,0,1
chr17	71239159	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:71239157_A_AGATG:71239157:0,4,0,1
chr17	71239166	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:0,0:1|0:71239157_A_AGATG:71239157:0,4,0,1
chr17	71239168	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=121,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1|0:71239157_A_AGATG:71239157:0,3,0,1
chr17	71239169	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=121,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1|0:71239157_A_AGATG:71239157:0,3,0,1
chr17	71246475	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:0,4,1,8
chr17	71248840	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,38;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:10,2:10,0:6,14,1,1
chr17	71344889	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	71346351	.	C	CCCCCCCGGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,103;MMQ=24,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.639:4:0,0:1,1:0|1:71346351_C_CCCCCCCGGG:71346351:1,0,1,2
chr17	71346353	.	A	ACTGCTGGGCCTGGCCCCCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.913:9:0,5:0,2:0|1:71346351_C_CCCCCCCGGG:71346351:0,0,6,3
chr17	71346750	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr17	71346943	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr17	71354356	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:1,4,2,5
chr17	71357810	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,5:3,2:7,2,6,1
chr17	71358045	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=191,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr17	71377098	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:4,0:2,1:0|1:71377098_T_TG:71377098:5,3,0,2
chr17	71377104	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,0:2,0:0|1:71377098_T_TG:71377098:5,3,0,2
chr17	71377107	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,1:2,1:0|1:71377098_T_TG:71377098:5,3,0,2
chr17	71377112	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.476:8:2,1:2,0:0|1:71377098_T_TG:71377098:4,0,0,4
chr17	71382166	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,2:0,2:0,2,0,4
chr17	71382747	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	71384143	.	T	TCTTCCTCACTCTGTTCCCTCTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=166,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:7,2:0,0:2,5,1,1
chr17	71386577	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,92;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,2:8,5:5,6,2,5
chr17	71394124	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	71397085	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,5:0,0,12,1
chr17	71397375	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr17	71410924	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=217,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:71410924_G_GA:71410924:0,2,0,1
chr17	71410925	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=217,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:71410924_G_GA:71410924:0,2,0,1
chr17	71410928	.	G	GAGGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=217,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:71410924_G_GA:71410924:0,2,0,1
chr17	71410932	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=245,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71410924_G_GA:71410924:0,1,0,1
chr17	71418605	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=126,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,1,1
chr17	71420035	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,0:0,4:0,0,5,0
chr17	71443696	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:6,0,8,1
chr17	71443924	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:4,2:6,3:3,7,1,4
chr17	71452020	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	71452208	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr17	71452270	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71452270_G_GC:71452270:0,1,0,1
chr17	71452271	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71452270_G_GC:71452270:0,1,0,1
chr17	71452273	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71452270_G_GC:71452270:0,1,0,1
chr17	71452277	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71452270_G_GC:71452270:0,0,0,1
chr17	71503636	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:1,4,3,2
chr17	71503724	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr17	71640299	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=172,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:1,1:1,3:0,3,0,4
chr17	72209858	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,25:0.411:61:20,12:16,12:12,24,8,17
chr17	72245986	.	CCACTGTGGGGCTCCTGGGAGACGGAGCCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACTGTGGGGCTCCTGGGAGACGGAGCCT;STR;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.858:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	72246382	.	TCTCG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,2,3
chr17	72248363	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=201,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:0,1,7,1
chr17	72281367	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr17	72283314	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=193,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:0,7,0,3
chr17	72285659	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	72285705	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=176,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	72287354	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,2:4,0:0|1:72287354_T_C:72287354:0,11,0,2
chr17	72287356	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:4,0:0|1:72287354_T_C:72287354:0,11,0,2
chr17	72305534	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,2,4
chr17	72306116	.	CCT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=54.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,5:0,0,9,4
chr17	72308447	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	72324649	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr17	72338164	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr17	72339347	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	72346736	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr17	72350412	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	72357805	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr17	72366685	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=167,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:6,2:12,2,2,0
chr17	72366695	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,13,2
chr17	72367843	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	72443192	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.251:13:3,2:5,0:1,9,1,2
chr17	72537894	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr17	72541838	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr17	72541980	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr17	72541992	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,17;MFRL=145,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,0,1
chr17	72542015	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=184,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	72588326	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr17	72590267	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=216.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,26:0,34:0,0,34,27
chr17	72608926	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr17	72615162	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=110,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.650:4:0,0:1,0:0,1,3,0
chr17	72615173	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,19;MFRL=110,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:72615173_C_G:72615173:0,1,1,0
chr17	72615181	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=110,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:72615173_C_G:72615173:2,1,1,0
chr17	72691928	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,9,6
chr17	72691941	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=152,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,1:3,2:5,8,2,1
chr17	72694705	.	G	GTGCTCGGCAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=204,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr17	72725497	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:15,0:10,2:6,19,0,2
chr17	72740355	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=211,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr17	72740409	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:9,1,2,0
chr17	72741403	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.143:24:11,1:3,0:0|1:72741403_A_C:72741403:11,10,3,0
chr17	72741405	.	CCCAG	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.108:32:15,1:5,0:0|1:72741403_A_C:72741403:16,13,3,0
chr17	72741413	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,0:7,0:0|1:72741403_A_C:72741403:15,15,2,0
chr17	72758210	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:8,8:4,9:8,4,11,6
chr17	72769694	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:0,5:5,3:4,2,6,2
chr17	72769739	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,4:3,2:5,2,4,2
chr17	72773387	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.339:15:5,2:5,2:8,2,4,1
chr17	72773638	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr17	72781812	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr17	72784871	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr17	72785078	.	AG	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=172,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:72785078_AG_CT:72785078:0,3,0,1
chr17	72785082	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=172,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:72785078_AG_CT:72785078:0,3,0,1
chr17	72787267	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr17	72791088	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=62,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.607:8:0,2:1,3:2,1,4,1
chr17	72791266	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:6,2:4,1:1,10,1,2
chr17	72791618	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr17	72838481	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr17	72845829	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,128;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr17	72846310	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr17	72850929	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:11,13,1,1
chr17	72860878	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,20;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.591:3:0,0:0,1:1,0,2,0
chr17	72861145	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,1:1,2:0,7,0,3
chr17	72862705	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,3,13
chr17	72888836	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	72889676	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,7:1,9:1,1,6,11
chr17	72929380	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=217,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr17	72937535	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=151,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:11,5:14,0:17,9,3,2
chr17	72937551	.	A	AG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=149,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:0|1:72937551_A_AG:72937551:14,9,1,1
chr17	72937554	.	A	AATTGTGGGTTT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=149,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:11,0:0|1:72937551_A_AG:72937551:13,9,1,1
chr17	72939663	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr17	72939724	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=117,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:6,0:12,3:10,8,1,2
chr17	72939803	.	C	CCCTGGTCTCTTT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:0,0:3,1:0|1:72939803_C_CCCTGGTCTCTTT:72939803:0,3,0,1
chr17	72939804	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:0,0:3,1:0|1:72939803_C_CCCTGGTCTCTTT:72939803:0,3,0,1
chr17	72943418	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=162,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr17	72947924	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,0:3,1,0,3
chr17	72948328	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,13;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:0,1:3,0:0|1:72948328_G_C:72948328:3,3,3,0
chr17	72948332	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:1,2:4,0:0|1:72948328_G_C:72948328:5,4,3,0
chr17	72948341	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:6,0:7,5,2,0
chr17	72951823	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:72951823_C_T:72951823:0,0,7,0
chr17	72951845	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,1:0,8:0|1:72951823_C_T:72951823:0,0,11,0
chr17	72955227	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr17	72957962	.	CT	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=67.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.490:45:12,8:11,13:19,4,17,5
chr17	72968589	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,0:1,0:1,0,2,0
chr17	72997364	.	T	TAGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGG;STR;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,3:1,5:1,1,7,2
chr17	72997610	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72997610_G_T:72997610:0,0,0,1
chr17	72997613	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72997610_G_T:72997610:0,0,0,1
chr17	72997616	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72997610_G_T:72997610:0,0,0,1
chr17	72997618	.	A	ACAGATTGCAGTGATTTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72997610_G_T:72997610:0,0,0,1
chr17	72998091	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr17	72999249	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.586:8:1,2:0,0:0|1:72999249_A_C:72999249:2,1,5,0
chr17	72999256	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,10;MFRL=112,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.304:11:1,0:7,0:0|1:72999249_A_C:72999249:3,5,3,0
chr17	73015707	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.687:17:3,8:2,4:5,0,11,1
chr17	73043449	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	73049296	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.485:3:0,0:1,1:0|1:73049296_A_T:73049296:0,2,0,1
chr17	73049300	.	G	GTTCATTTTATATAGTATCTCCCAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=140,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:73049296_A_T:73049296:0,1,0,1
chr17	73089706	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=211,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr17	73096951	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	73124692	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr17	73126746	.	GT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=102.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,11:0,0,5,22
chr17	73127024	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,14:0,0,24,1
chr17	73127052	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=24,13;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.282:31:5,0:6,1:14,7,10,0
chr17	73127058	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=27,13;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.341:37:8,1:7,2:11,13,13,0
chr17	73127061	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=30,10;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.355:43:9,0:16,0:12,16,15,0
chr17	73127068	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=8;MBQ=28,17;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,12:0.260:47:10,1:15,0:20,15,12,0
chr17	73127071	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=8;MBQ=32,18;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,7:0.134:56:11,0:22,0:28,21,7,0
chr17	73127075	.	T	G	.	.	DP=66;ECNT=8;MBQ=27,17;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,7:0.101:59:14,0:26,0:30,22,7,0
chr17	73127081	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=8;MBQ=33,18;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.059:64:21,0:33,0:35,26,3,0
chr17	73127683	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	73132058	.	GA	G,GAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32,32;MFRL=171,178,166;MMQ=60,60,60;MPOS=10,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.94,4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,3:0.229,0.217:16:4,2,1:5,2,2:9,0,7,0
chr17	73143574	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr17	73204530	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr17	73204535	.	CAAAAA	C,CAAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,34,35;MFRL=171,196,167;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,17,20;RU=A;STR;TLOD=6.49,3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.272,0.409:7:2,1,2:1,1,0:3,0,4,0
chr17	73208182	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,1:0,3:0,0,3,13
chr17	73208205	.	G	GTT,GTGTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20,33;MFRL=76,95,125;MMQ=50,60,57;MPOS=3,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.00,18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,8:0.270,0.631:12:0,1,2:1,2,6:0,1,2,9
chr17	73228101	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	73231638	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:3,3:5,0:7,1,3,1
chr17	73231817	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr17	73235399	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:7,2,2,0
chr17	73235594	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:4,0:0|1:73235594_T_G:73235594:11,3,0,2
chr17	73235603	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,0:4,0:0|1:73235594_T_G:73235594:13,3,0,3
chr17	73235609	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:10,1:6,0:0|1:73235594_T_G:73235594:15,4,0,3
chr17	73236198	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0|1:73236198_A_ATC:73236198:2,1,1,1
chr17	73236201	.	A	ACATT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:73236198_A_ATC:73236198:2,1,1,1
chr17	73236202	.	G	GGGGCCTGTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:73236198_A_ATC:73236198:2,1,1,1
chr17	73236204	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:73236198_A_ATC:73236198:2,1,1,1
chr17	73236605	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr17	73239739	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73239739_G_GC:73239739:0,1,0,1
chr17	73239741	.	T	TGCCCGCAGCCTCCAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73239739_G_GC:73239739:0,1,0,1
chr17	73240836	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,3,9
chr17	73242501	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr17	73242895	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr17	73242904	.	AGT	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=267,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73242904_AGT_A:73242904:0,1,0,1
chr17	73242910	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=267,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73242904_AGT_A:73242904:0,1,0,1
chr17	73242913	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=267,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:73242904_AGT_A:73242904:0,1,0,1
chr17	73242935	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	73258085	.	GGC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr17	73258479	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr17	73269588	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,1:13,1:13,5,1,1
chr17	73273501	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:6,5,1,1
chr17	73279700	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr17	73282299	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	73282636	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr17	73316679	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr17	73317644	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr17	73328773	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=141.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.955:41:0,14:1,26:1,0,27,13
chr17	73481662	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=152,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:5,8,1,1
chr17	73482110	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr17	73484753	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr17	73485033	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	73485781	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr17	73487280	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=212,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:73487280_T_C:73487280:2,4,0,2
chr17	73487283	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=243,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:73487280_T_C:73487280:2,3,0,2
chr17	73487458	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.184:19:6,3:10,0:6,10,1,2
chr17	73488794	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr17	73489220	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,2:0,8:0,0,4,9
chr17	73489567	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=216,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.904:19:1,10:0,7:0,1,13,5
chr17	73490611	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr17	73494037	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=157,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:0,0:0,2,0,2
chr17	73494963	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	73497794	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr17	73499697	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	73501752	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr17	73502993	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,43;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:11,1:14,1:20,7,1,1
chr17	73504253	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=201,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:73504253_A_C:73504253:4,0,1,0
chr17	73504258	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=201,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:73504253_A_C:73504253:4,0,1,0
chr17	73504416	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr17	73509720	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=129,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:1,2:1,1:1,2,3,0
chr17	73509894	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=165,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:1,0:10,0:0|1:73509894_C_G:73509894:1,11,0,2
chr17	73509904	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=170,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:8,0:0|1:73509894_C_G:73509894:1,11,0,2
chr17	73513185	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,6:0,0,1,9
chr17	73513413	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,81;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.282:15:3,0:7,3:0,11,4,0
chr17	73515068	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:1,0:9,2,2,0
chr17	73539631	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,1,30
chr17	73552152	.	AGCCCAGC	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=144,45;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.276:9:3,0:3,2:0|1:73552152_AGCCCAGC_A:73552152:5,2,1,1
chr17	73552164	.	TCGGCTACA	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=144,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:73552152_AGCCCAGC_A:73552152:5,0,1,1
chr17	73552175	.	CCG	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=145,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:73552152_AGCCCAGC_A:73552152:6,0,1,1
chr17	73552180	.	CCTG	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=145,45;MMQ=60,60;MPOS=-10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:4,2:0|1:73552152_AGCCCAGC_A:73552152:6,2,1,1
chr17	73552185	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,1:0,6:0,0,7,3
chr17	73554523	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	73559130	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=173,377;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,0:7,2,2,0
chr17	73560677	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=174,143;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:73560677_C_T:73560677:0,10,0,2
chr17	73560690	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=163,143;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,1:0|1:73560677_C_T:73560677:0,9,0,2
chr17	73560709	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=184,143;MMQ=60,36;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:73560677_C_T:73560677:0,4,0,1
chr17	73560713	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=184,143;MMQ=60,36;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:73560677_C_T:73560677:0,4,0,1
chr17	73565262	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0,0,15,5
chr17	73569511	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:7,3:1,0:6,2,3,0
chr17	73569666	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:1,8,1,3
chr17	73624746	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr17	73625478	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr17	73625629	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,10:0,0,1,14
chr17	73626208	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr17	73626817	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.717:12:3,5:0,4:0|1:73626817_G_A:73626817:2,1,2,7
chr17	73626829	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0|1:73626817_G_A:73626817:0,0,4,12
chr17	73626983	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,8,2
chr17	73627440	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr17	73627818	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr17	73636186	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=213,271;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	73636347	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:9,2:13,8,2,0
chr17	73658489	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,17,2
chr17	73664546	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,3:9,0:19,0,3,0
chr17	73698557	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,9:0,0,12,9
chr17	73702402	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	73720727	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=112,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:0,4:4,1:3,2,3,3
chr17	73720900	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr17	73723453	.	GC	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=66.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,13:0,10:0,0,14,9
chr17	73727475	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	73732045	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	73732522	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr17	73732810	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr17	73733315	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr17	73736598	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,19;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.634:6:0,0:1,2:1,1,0,4
chr17	73746146	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr17	73746427	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,1,8
chr17	73750727	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:17,4,1,1
chr17	73751042	.	C	CACAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr17	73752999	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=124,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:6,2:2,1:1,7,1,3
chr17	73753661	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,7:0,14:0,0,1,21
chr17	73759038	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,4,2
chr17	73759304	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr17	73760165	.	AG	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr17	73760176	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,1,0
chr17	73775052	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,15:0.315:49:12,9:20,6:18,16,9,6
chr17	73781075	.	GCC	G,GC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,12,12;MFRL=121,166,183;MMQ=60,60,60;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=C;STR;TLOD=7.63,15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,7:0.293,0.594:13:0,0,0:1,0,0:0,1,1,11
chr17	73808742	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=264,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73808742_C_A:73808742:0,1,0,1
chr17	73808746	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=264,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73808742_C_A:73808742:0,1,0,1
chr17	73808750	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=264,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73808742_C_A:73808742:0,1,0,1
chr17	73826406	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,6:0,0,11,4
chr17	73830996	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=77.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,17,6
chr17	73832384	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr17	73837142	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr17	73837203	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=72,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73837203_C_T:73837203:0,2,0,1
chr17	73837206	.	AG	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=72,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:73837203_C_T:73837203:0,2,0,1
chr17	73837209	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	73838857	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr17	73839214	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,4:0,0,12,4
chr17	73839366	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr17	73839498	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,5:0,4:0,0,10,1
chr17	73840243	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	73844748	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr17	73847613	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,17,5
chr17	73847799	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr17	73851245	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=54,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:0,0:3,0:1,3,2,0
chr17	73871911	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr17	73872948	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.731:2:0,1:0,1:0|1:73872948_A_G:73872948:0,0,0,2
chr17	73872955	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.562:3:0,1:1,0:0|1:73872948_A_G:73872948:0,1,0,2
chr17	73872969	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	73874138	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	73874684	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	73887807	.	TGCACACACACACGTGCTCACA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,19,4
chr17	73888672	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr17	73888743	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr17	73897033	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=15,15;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:1,2:1,0:0|1:73897033_A_AC:73897033:4,1,4,2
chr17	73897046	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.530:15:4,5:1,2:0|1:73897033_A_AC:73897033:4,3,4,4
chr17	73913729	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr17	73913965	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	73922941	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:16,8:9,2:10,15,1,9
chr17	73927400	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,1:3,7:0,3,1,7
chr17	73928992	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,16;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:3,0:7,0,2,0
chr17	73934130	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=129,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,2:2,0:4,1,2,0
chr17	73942976	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:6,1:0,12,0,4
chr17	73944596	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,3:2,1:1,3,0,4
chr17	73951864	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:1,8:7,3:8,0,9,2
chr17	73997474	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,5:9,0,9,1
chr17	73997637	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.184:19:9,0:7,3:1,15,1,2
chr17	73997677	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:2,2:0,7,0,2
chr17	74011224	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	74011721	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:5,1:1,4:3,5,1,4
chr17	74017492	.	CCCGCCCCTG	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=19,28;MFRL=187,27865357;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCGCCCCTG;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:0,2:1,0:4,0,1,1
chr17	74017554	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:8,2:10,2:0|1:74017554_G_T:74017554:10,11,3,1
chr17	74017573	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=139,126;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:11,0:18,2:0|1:74017554_G_T:74017554:17,12,2,1
chr17	74017677	.	G	GCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=C;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:5,1:4,2:0,9,0,5
chr17	74017700	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,3:6,1:0,10,0,4
chr17	74018650	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr17	74019572	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,148;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,3:3,4:6,4,6,1
chr17	74023107	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.356:9:2,2:2,0:6,0,3,0
chr17	74036468	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,22:0.451:49:19,11:8,11:17,10,16,6
chr17	74068513	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:5,2:3,2:1,7,0,4
chr17	74075984	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:5,2,2,2
chr17	74076127	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr17	74076583	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74076583_CA_TG:74076583:0,0,0,1
chr17	74076586	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74076583_CA_TG:74076583:0,0,0,1
chr17	74076589	.	CAGG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74076583_CA_TG:74076583:0,0,0,1
chr17	74077497	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,2,10
chr17	74079838	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,11:0,5:0,0,3,13
chr17	74080459	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,248;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:2,2,1,0
chr17	74084029	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr17	74084449	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=209,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,0:4,0,3,0
chr17	74084737	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr17	74085018	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=254,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	74085162	.	AGGT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:3,0,1,0
chr17	74086633	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	74090385	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	74094105	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr17	74136148	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:0,1:2,0:0,3,0,4
chr17	74136156	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=166,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.711:5:0,1:0,0:0|1:74136156_T_G:74136156:0,1,0,4
chr17	74136160	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.855:5:0,0:0,2:0|1:74136156_T_G:74136156:0,0,0,5
chr17	74208424	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,7:0,16:0,0,19,5
chr17	74261929	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,11:0,0,18,3
chr17	74273165	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr17	74273231	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:9,0:2,4:9,2,4,1
chr17	74275030	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr17	74276067	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr17	74276694	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:16,0,2,0
chr17	74283253	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=86.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,10:0,0,19,4
chr17	74286032	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=82,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.448:14:4,1:2,4:6,2,3,3
chr17	74286173	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,6,18
chr17	74287389	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.929:25:1,15:0,9:1,0,17,7
chr17	74288262	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=163,122;MMQ=43,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.908:24:0,9:1,11:1,1,11,11
chr17	74288564	.	CTGA	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGA;STR;TLOD=172.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,22:0,16:0,0,22,17
chr17	74300916	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=245,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,3:0,5:2,0,7,3
chr17	74307663	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:13,1:19,2:19,14,1,2
chr17	74324729	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,4:4,4:4,1,8,0
chr17	74326553	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,2:2,3:0|1:74326553_G_A:74326553:3,1,5,1
chr17	74326556	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0|1:74326553_G_A:74326553:3,1,5,1
chr17	74398325	.	CAT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	74401405	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr17	74448766	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74448766_A_C:74448766:0,0,1,0
chr17	74448776	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:74448766_A_C:74448766:0,0,1,0
chr17	74448782	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:74448766_A_C:74448766:0,0,1,0
chr17	74465243	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=137,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:3,2,5,3
chr17	74476045	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr17	74476115	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0|1:74476115_G_A:74476115:0,0,0,4
chr17	74476117	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,1:0|1:74476115_G_A:74476115:0,0,0,4
chr17	74477691	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=208,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr17	74534650	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.410:17:6,1:3,4:4,6,5,2
chr17	74539092	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr17	74559287	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,157;MMQ=52,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,5:4,1:2,9,0,6
chr17	74563653	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr17	74570408	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr17	74570675	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	74581914	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	74622565	.	C	CAGATCCTACAAAACGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	74625865	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74625865_G_C:74625865:0,0,0,1
chr17	74625871	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74625865_G_C:74625865:0,0,0,1
chr17	74625876	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74625865_G_C:74625865:0,0,0,1
chr17	74625887	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74625865_G_C:74625865:0,0,0,1
chr17	74639811	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	74684124	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	74734598	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr17	74750215	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr17	74771056	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,186;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,1:11,1:16,5,2,0
chr17	74878420	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr17	74898557	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=199,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr17	74898590	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:4,4:0,1:5,0,5,1
chr17	74898598	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:5,1,5,0
chr17	74898813	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=310,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr17	74899320	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr17	74899373	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,3:0,2:4,1,3,2
chr17	74901177	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:1,4:5,3:6,0,7,1
chr17	74902069	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr17	74920957	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	74921257	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	74922636	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	74922652	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	74922683	.	C	CTGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=183,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:74922683_C_CTGT:74922683:3,0,0,1
chr17	74922685	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=183,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:74922683_C_CTGT:74922683:3,0,0,1
chr17	74928921	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr17	74936429	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr17	74944709	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:74944709_T_C:74944709:0,0,3,3
chr17	74944714	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:74944709_T_C:74944709:1,2,2,1
chr17	75196481	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=209,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75196481_G_C:75196481:1,0,1,0
chr17	75196487	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=209,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75196481_G_C:75196481:1,0,1,0
chr17	75207954	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=187,401;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:75207954_C_A:75207954:3,0,1,0
chr17	75207959	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=187,401;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:75207954_C_A:75207954:3,0,1,0
chr17	75207966	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=187,283;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:1,2:0|1:75207954_C_A:75207954:3,0,2,0
chr17	75316497	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.592:35:8,15:6,4:5,9,6,15
chr17	75441607	.	CGT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,0:2,1:2,4,0,2
chr17	75442448	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=177,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr17	75442510	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=168,219;MMQ=50,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75442510_G_A:75442510:0,2,0,1
chr17	75442513	.	GC	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=168,219;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75442510_G_A:75442510:0,2,0,1
chr17	75478481	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	75484781	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	75485014	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=184,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr17	75488973	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=126,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr17	75489015	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:4,2,3,1
chr17	75494787	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,1:1,2:0,1,0,5
chr17	76046390	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=120,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,2:8,0:5,6,0,2
chr17	76047561	.	TAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr17	76067285	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=116,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:9,3:2,6:4,7,2,7
chr17	76071410	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,2:9,0:0,11,0,2
chr17	76093866	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=121,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:5,3,2,0
chr17	76109358	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:0,5,1,7
chr17	76109763	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:76109763_A_T:76109763:0,1,0,1
chr17	76109768	.	G	GAGCCGAATCTACCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:76109763_A_T:76109763:0,1,0,1
chr17	76114941	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.425:14:4,1:3,3:8,0,6,0
chr17	76114963	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,3:4,5:11,0,8,0
chr17	76114975	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:9,2:5,6:14,0,8,0
chr17	76115181	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:4,1:2,1:0,6,0,3
chr17	76115353	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:5,0,1,3
chr17	76117847	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=253,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:76117847_C_T:76117847:0,2,1,0
chr17	76117861	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=253,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:76117847_C_T:76117847:0,2,1,0
chr17	76120065	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=111,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.576:43:8,12:10,12:9,9,10,15
chr17	76121760	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:4,1,4,3
chr17	76121781	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=180,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:4,3,3,3
chr17	76127746	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:5,1:0,2:3,3,1,2
chr17	76129636	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:0,6,0,4
chr17	76129930	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,11:6,2:10,0,12,1
chr17	76130674	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=159,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:2,4:1,1:1,2,1,4
chr17	76130684	.	TGCGGGG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=226,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:2,1:1,0:0|1:76130684_TGCGGGG_T:76130684:0,3,0,1
chr17	76130693	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=226,80;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:76130684_TGCGGGG_T:76130684:0,2,0,1
chr17	76130699	.	GG	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=226,80;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:76130684_TGCGGGG_T:76130684:0,3,0,1
chr17	76133746	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr17	76133869	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,2,2
chr17	76134028	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr17	76134070	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,0:1,6:0|1:76134070_C_G:76134070:2,0,7,0
chr17	76134072	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,0:1,7:0|1:76134070_C_G:76134070:2,0,7,0
chr17	76134333	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,1:1,0:0,2,0,2
chr17	76134407	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	76134650	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,7:5,0:5,3,4,3
chr17	76134828	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	76134888	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	76135402	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:76135402_G_A:76135402:0,0,0,3
chr17	76135412	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:76135402_G_A:76135402:0,0,0,3
chr17	76137198	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	76142402	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr17	76143009	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,8,13
chr17	76156983	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,5:2,1:7,0,6,0
chr17	76157266	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,9,14
chr17	76157348	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=72,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:2,2,0,4
chr17	76162134	.	CC	TC,TT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33,20;MFRL=147,186,110;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.35,6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,8,3:0.446,0.199:17:1,5,3:5,2,0:1,5,2,9
chr17	76171277	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.466:19:7,2:3,5:2,8,1,8
chr17	76182771	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr17	76182772	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=125,189;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:1,0:0|1:76182772_AGG_A:76182772:3,0,1,0
chr17	76182778	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=166,189;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:76182772_AGG_A:76182772:2,0,1,0
chr17	76182781	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=33,16;MFRL=190,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,0:2,0:4,0,1,0
chr17	76182782	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=163,189;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:1,1:3,0:0|1:76182772_AGG_A:76182772:4,0,1,0
chr17	76182786	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=163,189;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.279:5:1,1:3,0:0|1:76182772_AGG_A:76182772:4,0,1,0
chr17	76182805	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:7,0,4,3
chr17	76187217	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=181,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:76187217_G_GA:76187217:0,1,0,1
chr17	76187221	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76187217_G_GA:76187217:0,0,0,1
chr17	76187223	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76187217_G_GA:76187217:0,0,0,1
chr17	76187224	.	TGTGC	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76187217_G_GA:76187217:0,0,0,1
chr17	76187239	.	GGGCCT	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76187239_GGGCCT_G:76187239:0,0,0,1
chr17	76187246	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76187239_GGGCCT_G:76187239:0,0,0,1
chr17	76188670	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=154,69;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:76188670_C_T:76188670:9,0,1,1
chr17	76188674	.	TA	CG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=154,69;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:0|1:76188670_C_T:76188670:9,2,1,1
chr17	76198716	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:2,0:6,0:0|1:76198716_C_G:76198716:9,1,0,2
chr17	76198718	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.209:12:4,0:6,1:0|1:76198716_C_G:76198716:9,1,0,2
chr17	76202215	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0,10,0,2
chr17	76210367	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr17	76212136	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,175;MMQ=40,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr17	76219783	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr17	76235012	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76235012_G_A:76235012:0,0,1,0
chr17	76235015	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76235012_G_A:76235012:0,0,1,0
chr17	76394449	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr17	76394526	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76394526_T_A:76394526:0,0,0,1
chr17	76394531	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76394526_T_A:76394526:0,0,0,1
chr17	76395421	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0|1:76395421_G_A:76395421:0,0,14,6
chr17	76395430	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.954:20:0,11:0,6:0|1:76395421_G_A:76395421:0,0,13,7
chr17	76396963	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,4,6
chr17	76399552	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr17	76400230	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76400230_G_A:76400230:0,0,0,1
chr17	76400236	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76400230_G_A:76400230:0,0,0,1
chr17	76410871	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:2,3:0,0:2,0,4,0
chr17	76411154	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,15;MFRL=71,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:3,0:0,0:1,2,0,2
chr17	76421709	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr17	76422473	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr17	76422933	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr17	76433685	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:4,0,4,0
chr17	76433839	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:5,0:11,4,0,2
chr17	76446689	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,37;MFRL=232,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr17	76451921	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,10:6,3:1,8,4,9
chr17	76451995	.	C	CAGTGATAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=40,19;MFRL=169,172;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.481:3:1,0:0,0:0|1:76451995_C_CAGTGATAGG:76451995:0,2,0,1
chr17	76451996	.	C	CACAGAGGAGCTGCCTGAGAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=169,172;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.481:3:1,0:0,0:0|1:76451995_C_CAGTGATAGG:76451995:0,2,0,1
chr17	76455250	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,115;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.183:20:11,0:5,3:5,12,3,0
chr17	76456352	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,3,4
chr17	76457805	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=202,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,1,0
chr17	76462969	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr17	76491194	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,1,4
chr17	76491211	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=179,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,5:0,3:0,2,1,7
chr17	76495050	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr17	76496361	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:10,6,2,0
chr17	76496384	.	TA	GG	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,17;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.145:25:5,0:10,0:0|1:76496384_TA_GG:76496384:11,11,3,0
chr17	76496388	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,9;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.145:25:7,0:15,0:0|1:76496384_TA_GG:76496384:11,11,3,0
chr17	76496392	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.145:25:4,0:13,0:0|1:76496384_TA_GG:76496384:11,11,3,0
chr17	76496492	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,7:0,0,13,9
chr17	76496577	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,4,13
chr17	76502734	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=209,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr17	76506607	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	76506665	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr17	76525475	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=127,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr17	76525805	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr17	76525864	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	76528591	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,4:8,4:6,6,4,4
chr17	76528831	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=74,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr17	76535759	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr17	76554114	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr17	76554147	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,15,4
chr17	76556811	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr17	76567013	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr17	76567332	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,8:0,0,14,6
chr17	76567883	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr17	76567910	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr17	76672322	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr17	76676523	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=123,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr17	76705723	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=110,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:9,7:2,2:10,1,6,3
chr17	76778160	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	76794981	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:3,3,6,2
chr17	76798548	.	TTTTTTC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTTC;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:1,3,1,1
chr17	76798643	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,17;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:76798643_C_G:76798643:1,0,0,1
chr17	76798652	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:76798643_C_G:76798643:1,0,0,1
chr17	76798653	.	C	CTCTTCTTTTTATCTCCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:76798643_C_G:76798643:1,0,0,1
chr17	76808970	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:11,2,2,0
chr17	76816199	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	76823425	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr17	76832133	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,10:3,4:7,1,13,1
chr17	76867148	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:76867148_G_T:76867148:0,4,0,1
chr17	76867150	.	T	TGGTATCAGTAAGAGACAAAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:76867148_G_T:76867148:0,4,0,1
chr17	76867185	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	76897974	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr17	77073901	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:3,2:1,3:3,1,3,3
chr17	77082482	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	77086906	.	A	AT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.078:41:16,0:21,2:34,4,3,0
chr17	77090716	.	T	TATTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=223,267;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77090716_T_TATTC:77090716:0,1,0,1
chr17	77090718	.	T	TGATG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=223,267;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77090716_T_TATTC:77090716:0,1,0,1
chr17	77090721	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=223,267;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77090716_T_TATTC:77090716:0,1,0,1
chr17	77093332	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=15,18;MFRL=61,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:1,3,1,0
chr17	77093348	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,1:2,3,2,0
chr17	77707282	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=135,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.283:22:10,0:5,5:11,5,2,4
chr17	77707513	.	G	GTGTCAGTCTGCCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr17	77709514	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=161,264;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:77709514_G_C:77709514:0,2,0,1
chr17	77709516	.	CT	AC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=161,264;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:77709514_G_C:77709514:0,2,0,1
chr17	77709519	.	T	TGAGCGAGCCAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,15;MFRL=161,264;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:77709514_G_C:77709514:0,2,0,1
chr17	77709533	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:77709533_T_C:77709533:0,1,0,1
chr17	77709543	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:77709533_T_C:77709533:0,1,0,1
chr17	77709545	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:77709533_T_C:77709533:0,1,0,1
chr17	77753265	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=115,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,2:1,0:0|1:77753265_G_T:77753265:3,2,1,1
chr17	77753268	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=143,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0|1:77753265_G_T:77753265:3,4,1,1
chr17	77757661	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.134:29:13,1:8,0:16,9,4,0
chr17	77808243	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	77809080	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,2:9,0:2,21,0,2
chr17	77809179	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=173,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:4,4,1,2
chr17	77811731	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:4,0:4,1:5,8,0,2
chr17	77922612	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:0,1:3,3:3,0,4,2
chr17	77923688	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=174,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.605:11:1,1:3,4:0,4,3,4
chr17	78012081	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:10,1:1,1:0,12,0,2
chr17	78014094	.	G	GATAAAGTATGTGTGAGTAGCCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=99,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr17	78021037	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr17	78021214	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr17	78021260	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=192,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	78022378	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr17	78024094	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:2,3,1,5
chr17	78055757	.	CT	TG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.501:34:12,7:5,7:9,8,9,8
chr17	78061317	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=209,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr17	78061353	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr17	78061776	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,14;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:78061776_T_A:78061776:0,1,1,0
chr17	78061781	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:78061776_T_A:78061776:0,1,1,0
chr17	78061784	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=67,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:78061776_T_A:78061776:0,2,1,0
chr17	78061786	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=67,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:78061776_T_A:78061776:0,2,1,0
chr17	78061789	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,18;MFRL=67,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:78061776_T_A:78061776:0,2,1,0
chr17	78061979	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:0,6,0,5
chr17	78079544	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=185,90;MMQ=60,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr17	78079750	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	78081526	.	A	AGCAGCGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,14:0.625:22:2,7:5,5:0|1:78081526_A_AGCAGCGG:78081526:4,4,8,6
chr17	78081551	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,16:0.630:25:5,8:4,7:0|1:78081526_A_AGCAGCGG:78081526:5,4,8,8
chr17	78081707	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.448:18:6,5:3,2:8,2,3,5
chr17	78082005	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr17	78083726	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:5,0,7,0
chr17	78084507	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr17	78084625	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=130,58;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,0:6,3:9,9,1,2
chr17	78084688	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,3:3,3:3,2,3,4
chr17	78084790	.	C	CTGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=157,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:78084790_C_CTGT:78084790:1,3,0,1
chr17	78084791	.	A	ACTGTGTGGCCCTGACCAGGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=157,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:78084790_C_CTGT:78084790:1,3,0,1
chr17	78086953	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=226,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,3,0
chr17	78090928	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr17	78090938	.	G	GGCACAGGAAGAGGCTGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=206,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr17	78091405	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.548:16:3,4:4,4:1,6,7,2
chr17	78114033	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=220,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr17	78118138	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78118138_G_GT:78118138:0,0,0,1
chr17	78118139	.	A	AGAATTGGCAAAGAGATATTTGTGAGCACTTGGAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78118138_G_GT:78118138:0,0,0,1
chr17	78155182	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=200,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr17	78158063	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	78166385	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.418:17:4,2:5,4:3,7,4,3
chr17	78166510	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=247,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:78166510_C_CCT:78166510:0,2,0,1
chr17	78166515	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=247,229;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:78166510_C_CCT:78166510:0,2,0,1
chr17	78175483	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr17	78176233	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr17	78178170	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,0:5,4:0|1:78178170_A_G:78178170:0,9,1,3
chr17	78178182	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:1,0:4,6:0|1:78178170_A_G:78178170:0,7,1,6
chr17	78178189	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:2,1:5,6:0|1:78178170_A_G:78178170:0,7,1,6
chr17	78178221	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:1,8,0,2
chr17	78178830	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=141,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.479:13:4,1:1,5:4,3,4,2
chr17	78181904	.	T	A,G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,14,10;MFRL=179,234,280;MMQ=60,60,60;MPOS=23,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.07,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,1,1:0.200,0.200:7:2,0,0:3,0,0:4,1,2,0
chr17	78181918	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=234,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.578:8:0,0:3,2:2,1,4,1
chr17	78187734	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr17	78196680	.	TCGAC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:78196680_TCGAC_T:78196680:1,2,0,1
chr17	78196688	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:78196680_TCGAC_T:78196680:1,2,0,1
chr17	78219065	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,5:4,10:3,5,1,14
chr17	78219100	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=71,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:3,3,0,5
chr17	78223103	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr17	78263391	.	G	GA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=122,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.221:25:9,3:8,0:17,2,3,3
chr17	78269255	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,273;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr17	78316961	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=146,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:15,3:17,0:19,14,1,2
chr17	78319295	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=175,36;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:5,7,1,1
chr17	78322142	.	C	CAGACTAAATTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:78322142_C_CAGACTAAATTA:78322142:0,0,0,1
chr17	78322145	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78322142_C_CAGACTAAATTA:78322142:0,0,0,1
chr17	78323757	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=194,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,4:1,7:0,1,0,11
chr17	78324168	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,1:10,1:12,11,0,2
chr17	78325694	.	C	CG	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.104:36:29,1:4,2:0|1:78325694_C_CG:78325694:0,33,0,3
chr17	78325695	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.104:36:29,1:4,2:0|1:78325694_C_CG:78325694:0,33,0,3
chr17	78326872	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=174,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:78326872_G_C:78326872:0,2,0,1
chr17	78326878	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=179,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:78326872_G_C:78326872:0,3,0,1
chr17	78326880	.	C	CCTATGTCGCAGTAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=179,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:78326872_G_C:78326872:0,3,0,1
chr17	78327229	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr17	78327358	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,17:0,0,24,6
chr17	78327745	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	78332219	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=173,110;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:11,0:5,3:12,4,0,3
chr17	78338198	.	CGAGT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAGT;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:9,0:6,2:11,10,1,1
chr17	78349481	.	TG	CA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=153,173;MMQ=46,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:5,0:11,0,2,0
chr17	78349490	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=154,176;MMQ=57,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:12,0,2,0
chr17	78351506	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=152.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,25:0,18:0,0,31,12
chr17	78359309	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,17,5
chr17	78360244	.	C	CTTAAAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr17	78362300	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr17	78362599	.	C	CCATCATACATCTGGGACTTCATGTAAGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr17	78388987	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,11;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:6,0:6,0:7,7,2,0
chr17	78397274	.	G	GGCCC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:0,0,1,0
chr17	78397278	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:0,0,1,0
chr17	78397285	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:0,0,1,0
chr17	78397288	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:0,0,1,0
chr17	78397292	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=124,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:1,0,1,0
chr17	78397299	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=124,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:1,0,1,0
chr17	78397303	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=124,183;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78397274_G_GGCCC:78397274:1,0,1,0
chr17	78399004	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr17	78445463	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	78446932	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr17	78449211	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	78599655	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,4:3,1:0,8,0,5
chr17	78617439	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr17	78681590	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr17	78727734	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr17	78765219	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:10,11:9,7:14,5,13,5
chr17	78797066	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr17	78829375	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,3:3,8:1,4,2,9
chr17	78854316	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:7,9:3,4:0,10,0,13
chr17	78859004	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr17	78867753	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:78867753_T_G:78867753:0,1,0,1
chr17	78867760	.	G	GGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:78867753_T_G:78867753:0,1,0,1
chr17	78882806	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr17	78896488	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,3,0
chr17	78897561	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr17	78914245	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=126,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,3:6,4:8,2,7,0
chr17	78919378	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=173,144;MMQ=40,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:78919378_C_T:78919378:4,0,1,0
chr17	78919386	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=173,144;MMQ=40,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:78919378_C_T:78919378:4,0,1,0
chr17	78919387	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=157,177;MMQ=32,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr17	78923178	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr17	78968325	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,1:12,1:23,3,2,0
chr17	78972326	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr17	79009153	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr17	79059440	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=176,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:79059440_C_A:79059440:3,2,1,1
chr17	79059442	.	C	CCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=176,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,1:2,0:0|1:79059440_C_A:79059440:3,2,1,1
chr17	79060180	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr17	79093142	.	C	CCGCGTGCCCTACCTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	79093432	.	CGGCCCCGCTCCCACAGTCACGGGCCCA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr17	79098478	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=139,43;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:0,0:6,1,1,1
chr17	79098703	.	CAGCCCAG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.182:19:5,2:7,1:3,13,3,0
chr17	79099588	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=419,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr17	79102193	.	TAGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=201,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr17	79105850	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,3:1,5:0,1,0,8
chr17	79107017	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr17	79108141	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:5,8:7,3:12,2,8,3
chr17	79164408	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	79165171	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr17	79166116	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:4,0:0,1:4,0,2,0
chr17	79166389	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr17	79172119	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,1:2,2:1,6,0,3
chr17	79173184	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr17	79173398	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr17	79173462	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=190,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,2,1
chr17	79177260	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=199,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr17	79181075	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,11;MFRL=136,0;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:79181075_T_G:79181075:0,3,0,1
chr17	79181077	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=136,0;MMQ=60,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:79181075_T_G:79181075:0,3,0,1
chr17	79181080	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=136,0;MMQ=60,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:79181075_T_G:79181075:0,3,0,1
chr17	79181089	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=189,0;MMQ=60,34;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:79181075_T_G:79181075:0,2,0,1
chr17	79182667	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	79207222	.	C	CTTCTGATCTTCCACAGCGTTGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=137,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr17	79213305	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr17	79219500	.	AATG	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATG;STR;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.473:34:8,8:9,8:8,10,8,8
chr17	79246270	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.274:14:5,3:5,0:8,2,4,0
chr17	79255912	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=224,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:6,0,4,0
chr17	79256220	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=249,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr17	79258622	.	GCAAGCGCAGCGGCAGGGC	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,12;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:6,0:7,0:18,2,0,3
chr17	79258787	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:1,7,0,5
chr17	79268562	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=176,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.645:18:3,4:3,6:6,0,10,2
chr17	79409434	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,29;MFRL=203,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr17	79414897	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=216,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr17	79414914	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	79424537	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:3,2,1,1
chr17	79425141	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,1:1,2:3,0,3,1
chr17	79425946	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=115,109;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0|1:79425946_A_G:79425946:1,2,0,1
chr17	79425952	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=115,109;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,0:0,1:0|1:79425946_A_G:79425946:1,2,0,1
chr17	79426481	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,6,1
chr17	79429918	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:9,0:17,2:14,12,1,1
chr17	79479469	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:1,5,0,8
chr17	79495519	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:2,1,2,0
chr17	79513881	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.387:10:1,2:5,2:6,0,1,3
chr17	79532449	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	79532654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,1,6
chr17	79532721	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:79532721_A_C:79532721:0,1,0,1
chr17	79532723	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79532721_A_C:79532721:0,1,0,1
chr17	79532726	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79532721_A_C:79532721:0,1,0,1
chr17	79532728	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79532721_A_C:79532721:0,1,0,1
chr17	79532732	.	C	CCTCAGAAG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=19,33;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:79532721_A_C:79532721:0,1,0,1
chr17	79532734	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=233,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79532721_A_C:79532721:0,1,0,1
chr17	79534593	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=91,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:1,0:1,3:0,2,1,3
chr17	79539213	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	79563330	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=176,216;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr17	79564199	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:3,5:1,1:4,0,4,3
chr17	79564442	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:79564442_C_T:79564442:0,2,0,1
chr17	79564448	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=267,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:79564442_C_T:79564442:0,2,0,1
chr17	79564451	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=267,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:79564442_C_T:79564442:0,2,0,1
chr17	79564454	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=267,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:79564442_C_T:79564442:0,2,0,1
chr17	79567270	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79567270_A_C:79567270:0,0,1,0
chr17	79567275	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:79567270_A_C:79567270:0,0,1,0
chr17	79571637	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:4,10:6,9:9,1,10,9
chr17	79573884	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:0,6,0,5
chr17	79589359	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr17	79596669	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:11,1,2,0
chr17	79609550	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:0,2,2,3
chr17	79611924	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	79618059	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,2:2,5:6,2,4,3
chr17	79618252	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr17	79618270	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	79638805	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=115,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:5,4:6,1:6,6,4,1
chr17	79639198	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,4:5,4:2,4,0,8
chr17	79650181	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=104,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.455:18:5,4:4,4:2,8,0,8
chr17	79650675	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:2,1,4,4
chr17	79650753	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:79650753_CG_C:79650753:1,2,1,0
chr17	79650756	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:79650753_CG_C:79650753:1,2,1,0
chr17	79650766	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:0,0:3,1:1,2,1,0
chr17	79651218	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	79657673	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,1:2,5:3,0,4,2
chr17	79660695	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=215,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr17	79667672	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.498:8:2,1:2,2:0|1:79667672_A_C:79667672:0,4,4,0
chr17	79667678	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.452:9:2,0:2,1:0|1:79667672_A_C:79667672:0,5,4,0
chr17	79667684	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:79667672_A_C:79667672:0,4,2,0
chr17	79667690	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0|1:79667672_A_C:79667672:0,4,2,0
chr17	79668226	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr17	79673973	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=171,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:3,4:9,0:5,7,2,2
chr17	79682650	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=175,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,0:2,2:4,0,3,0
chr17	79683128	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=174,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:79683128_G_A:79683128:1,1,0,1
chr17	79683131	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=174,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:79683128_G_A:79683128:1,1,0,1
chr17	79683132	.	G	GCAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,30;MFRL=174,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:79683128_G_A:79683128:1,1,0,1
chr17	79683997	.	T	TGCCTCACCCCTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.672:6:1,0:0,4:2,0,1,3
chr17	79791597	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:5,2,3,0
chr17	79791792	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr17	79803433	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,1:3,1:8,1,1,1
chr17	79803494	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,0:13,2:13,10,1,1
chr17	79803655	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:3,0:10,1,2,0
chr17	79805003	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:2,3,1,4
chr17	79813228	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,1,3
chr17	79827163	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:3,12:6,2:4,6,6,8
chr17	79846237	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79846237_T_A:79846237:0,0,0,1
chr17	79846240	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79846237_T_A:79846237:0,0,0,1
chr17	79846243	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=269,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:79846237_T_A:79846237:0,1,0,1
chr17	79846245	.	C	CATCTTTCTTCTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=269,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79846237_T_A:79846237:0,1,0,1
chr17	79857286	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=16,20;MFRL=118,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:2,0:0,2:6,1,1,1
chr17	79857295	.	C	CTGTTCCGTGGGGGAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,0:4,2:7,1,1,1
chr17	79862882	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr17	79864502	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=176,248;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:79864502_G_A:79864502:1,1,0,1
chr17	79864505	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,248;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:79864502_G_A:79864502:1,1,0,1
chr17	79870585	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr17	79872129	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr17	79890892	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79890892_C_CA:79890892:0,0,0,1
chr17	79890894	.	CTGTT	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79890892_C_CA:79890892:0,0,0,1
chr17	79890900	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79890892_C_CA:79890892:0,0,0,1
chr17	79890902	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79890892_C_CA:79890892:0,0,0,1
chr17	79890905	.	TGGGA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.689:1:0,0:0,1:0|1:79890892_C_CA:79890892:0,0,0,1
chr17	79893962	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,10,7
chr17	79894106	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=205,126;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.826:7:1,0:0,2:0,1,0,6
chr17	79898644	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=90,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,2:1,1:1,0,3,2
chr17	79911164	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=153,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.675:16:4,4:0,6:3,2,5,6
chr17	79911206	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr17	79911241	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,176;MMQ=50,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr17	79912103	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:2,2:7,4:5,4,3,4
chr17	79914661	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=68,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,2:1,1:0,2,0,3
chr17	79915609	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:79915609_A_C:79915609:1,0,1,0
chr17	79915614	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79915609_A_C:79915609:1,0,1,0
chr17	79915616	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79915609_A_C:79915609:1,0,1,0
chr17	79915863	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=191,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:1,5,0,7
chr17	79953888	.	G	GGAGAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=186,36;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:79953888_G_GGAGAA:79953888:3,3,1,1
chr17	79953889	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=186,36;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:79953888_G_GGAGAA:79953888:3,3,1,1
chr17	79953892	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=186,36;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,0:2,2:0|1:79953888_G_GGAGAA:79953888:3,3,1,1
chr17	79953981	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr17	79954544	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,201;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:2,2:0,1:2,1,2,1
chr17	79977813	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr17	79980756	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=151,51;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:1,3,1,2
chr17	79980764	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=146,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:79980764_G_T:79980764:1,3,1,1
chr17	79980766	.	A	AGCGCCCCCACCCACAGCCTG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=146,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:1,0:1,2:0|1:79980764_G_T:79980764:1,3,1,1
chr17	79990621	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:3,6,1,1
chr17	79990972	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	80008676	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr17	80014067	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80014067_T_G:80014067:1,0,1,0
chr17	80014069	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80014067_T_G:80014067:1,0,1,0
chr17	80014073	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80014067_T_G:80014067:1,0,1,0
chr17	80014079	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80014067_T_G:80014067:1,0,1,0
chr17	80014269	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=135,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.394:10:1,1:4,0:2,4,0,4
chr17	80014296	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=14,13;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,0:0,0:1,3,0,4
chr17	80016340	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	80018866	.	G	GAGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=132,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.483:2:1,1:0,0:0|1:80018866_G_GAGAA:80018866:0,1,0,1
chr17	80018868	.	G	GTCCTGGAGGAGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=132,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80018866_G_GAGAA:80018866:0,1,0,1
chr17	80019933	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:80019933_CC_TT:80019933:0,2,0,1
chr17	80019939	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:80019933_CC_TT:80019933:0,2,0,1
chr17	80020812	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,3,2
chr17	80022656	.	C	CG	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.541:35:5,11:10,7:16,0,19,0
chr17	80023023	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr17	80039028	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	80039223	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=95,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr17	80039760	.	CGGGGTGGGGAGTGGCCACTGGGAGAGGGTGGGGTGGGCAGGGCTGCGGGGAGAAGGTG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.733:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr17	80040315	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=143,259;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:80040315_C_A:80040315:2,2,0,1
chr17	80040319	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=143,259;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:80040315_C_A:80040315:2,2,0,1
chr17	80040332	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:80040332_T_TGA:80040332:0,1,0,1
chr17	80040334	.	A	AGCTACTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:80040332_T_TGA:80040332:0,1,0,1
chr17	80040607	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	80043349	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,5:0,0,5,8
chr17	80048159	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr17	80050554	.	CGG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:80050554_CGG_C:80050554:0,0,1,0
chr17	80050581	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=294,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:80050554_CGG_C:80050554:0,1,1,0
chr17	80051078	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	80053166	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:6,3:0,4:6,0,5,2
chr17	80059758	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr17	80065244	.	C	CGGGAGTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GGGAGTG;STR;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,0:0,0,4,1
chr17	80085633	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr17	80092131	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr17	80092171	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,321;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr17	80103631	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=236,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr17	80129778	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:80129778_G_C:80129778:0,2,0,1
chr17	80129783	.	T	TGATG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:80129778_G_C:80129778:0,2,0,1
chr17	80153147	.	C	CCATCTTCTAGT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=136,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:8,2:15,0:14,11,1,1
chr17	80211078	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:17,2:19,0:14,22,0,2
chr17	80280707	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=14,14;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:0,1:1,0:4,1,3,0
chr17	80280721	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=17,24;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.282:9:1,1:2,0:6,1,2,0
chr17	80280728	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,0:2,0:0|1:80280728_A_C:80280728:7,1,2,0
chr17	80280730	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,1:2,0:0|1:80280728_A_C:80280728:7,1,2,0
chr17	80282579	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:80282579_C_G:80282579:2,2,0,1
chr17	80282582	.	G	GTTTTTTTGGCAGCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,0:1,1:0|1:80282579_C_G:80282579:2,2,0,2
chr17	80320003	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr17	80352146	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=254,187;MMQ=60,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80352146_G_A:80352146:1,0,1,0
chr17	80352156	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=254,187;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80352146_G_A:80352146:1,0,1,0
chr17	80352161	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=254,187;MMQ=60,36;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80352146_G_A:80352146:1,0,1,0
chr17	80356133	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,1:12,1:7,17,0,2
chr17	80356187	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,6:4,4:7,6,5,5
chr17	80363124	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.570:10:1,0:0,0:3,1,6,0
chr17	80364392	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=53,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:3,5,1,1
chr17	80369345	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=168,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:6,0:7,7,2,1
chr17	80397484	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr17	80399177	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=330,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:80399177_G_GCC:80399177:0,1,0,1
chr17	80399180	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=330,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:80399177_G_GCC:80399177:0,1,0,1
chr17	80399182	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=330,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:80399177_G_GCC:80399177:0,1,0,1
chr17	80399645	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr17	80402296	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80402296_G_A:80402296:1,0,1,0
chr17	80402298	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80402296_G_A:80402296:1,0,1,0
chr17	80426550	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr17	80443284	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=232,152;MMQ=41,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:80443284_A_G:80443284:4,0,1,0
chr17	80443292	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=232,152;MMQ=41,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:80443284_A_G:80443284:4,0,1,0
chr17	80443296	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=227,200;MMQ=60,41;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr17	80443515	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:4,7:4,3:4,4,2,8
chr17	80544855	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	80545153	.	G	GACGTGGAAGAGCCC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=142,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.318:4:2,1:1,0:0|1:80545153_G_GACGTGGAAGAGCCC:80545153:0,3,0,1
chr17	80545156	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=253,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr17	80545157	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=142,253;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:80545153_G_GACGTGGAAGAGCCC:80545153:0,3,0,1
chr17	80545163	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=18,32;MFRL=145,253;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:80545153_G_GACGTGGAAGAGCCC:80545153:0,2,0,1
chr17	80545165	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=145,253;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:80545153_G_GACGTGGAAGAGCCC:80545153:0,2,0,1
chr17	80574532	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=65,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,6:2,4:2,3,2,8
chr17	80574609	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=185,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr17	80574615	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr17	80583230	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,2:7,1:7,1,3,0
chr17	80585033	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,3:0,0,11,1
chr17	80588763	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.550:33:6,12:7,6:9,6,14,4
chr17	80601769	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr17	80606079	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=172,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:3,3:2,2:5,0,6,0
chr17	80616306	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr17	80618760	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=212,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.693:7:1,3:0,2:2,0,5,0
chr17	80676946	.	A	ACCACCCC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCACCCC;STR;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,3:1,2:0,1,0,7
chr17	80676971	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr17	80677005	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr17	80680589	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	80684638	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr17	80685126	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,0,7
chr17	80696542	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,5,9
chr17	80698542	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr17	80698587	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=130,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,7:4,5:7,0,10,2
chr17	80706719	.	CTTG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,6:4,1:4,3,5,2
chr17	80706928	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr17	80710097	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.536:7:1,1:2,1:0,3,0,4
chr17	80724167	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,2:16,0:21,10,2,0
chr17	80755760	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr17	80789537	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,1:13,1:13,12,0,2
chr17	80789562	.	AGTAGATGGTG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,2:12,2:14,13,2,2
chr17	80828057	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,4:3,1:7,2,3,2
chr17	80828281	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=116,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:3,6:4,4:2,6,1,9
chr17	80828303	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:0,7,1,4
chr17	80858669	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr17	80869550	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,6:3,5:4,1,11,0
chr17	80869706	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=254,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.657:12:2,5:1,3:1,3,3,5
chr17	80869775	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr17	80878389	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr17	80878412	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.525:4:1,1:0,1:1,1,2,0
chr17	80884247	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:7,6:11,4:13,5,6,4
chr17	80887194	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=164,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:2,6,1,6
chr17	80887206	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:1,4,2,4
chr17	80890638	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,2:3,4:2,4,1,5
chr17	80895253	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr17	80923432	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr17	81006286	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:7,0,5,0
chr17	81006387	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.574:17:1,5:6,4:2,5,4,6
chr17	81050833	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr17	81050982	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:81050982_G_C:81050982:0,0,0,2
chr17	81051007	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0|1:81050982_G_C:81050982:0,0,0,2
chr18	180211	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=230,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr18	180387	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:5,15,0,2
chr18	192802	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=97,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:2,5:9,2:9,2,7,0
chr18	198013	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,73;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,3:13,0:22,1,2,1
chr18	204640	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:10,2:17,0:19,9,0,2
chr18	225222	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:0,0:3,1:0|1:225222_T_G:225222:3,0,0,1
chr18	225226	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:225222_T_G:225222:3,0,0,1
chr18	247928	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:14,2:13,0:8,19,1,1
chr18	252559	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,6:0,0,12,8
chr18	331733	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:7,4:3,7:5,5,5,7
chr18	331827	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr18	331843	.	T	TACCTAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr18	581201	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:9,9:5,4:0|1:581201_T_A:581201:7,7,6,9
chr18	581202	.	GTT	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=64.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,17:0.545:31:9,11:5,4:0|1:581201_T_A:581201:7,7,6,11
chr18	582022	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,9:2,5:0,6,1,13
chr18	618124	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,5:4,1:0,6,0,6
chr18	624783	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr18	624824	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,14,3
chr18	625070	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr18	645176	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr18	649879	.	CTT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.241:17:5,3:5,0:5,8,2,2
chr18	657685	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr18	658423	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr18	688463	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr18	691173	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.342:36:12,8:12,4:12,12,8,4
chr18	691384	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=198,146;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr18	693977	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:6,10:5,5:1,10,2,13
chr18	693986	.	GCT	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:3,8:5,4:1,7,2,10
chr18	694206	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:10,3:2,1:9,3,3,1
chr18	706589	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:6,4:4,8:5,5,4,9
chr18	739918	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=226,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr18	742858	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:9,5:4,9:11,2,14,0
chr18	743226	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,7:3,2:9,1,7,2
chr18	743272	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=140,126;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:15,3:17,0:17,15,0,3
chr18	743436	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=71,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:0,6:2,5:1,1,1,10
chr18	751857	.	A	AAAAAGCAAATTACTTGCCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=183,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:751857_A_AAAAAGCAAATTACTTGCCCT:751857:0,4,0,1
chr18	751862	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=183,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:751857_A_AAAAAGCAAATTACTTGCCCT:751857:0,4,0,1
chr18	751865	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=183,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:751857_A_AAAAAGCAAATTACTTGCCCT:751857:0,4,0,1
chr18	905537	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	909637	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:10,0:2,16,0,2
chr18	2547599	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr18	2585077	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,3:3,6:9,1,5,4
chr18	2589929	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:10,8:5,10:15,0,18,0
chr18	2606596	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=197,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr18	2688798	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr18	2698125	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	2718265	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.497:38:8,6:11,12:9,10,10,9
chr18	2728686	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=262,262;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,0:0,2:0,1,0,3
chr18	2729177	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,1:2,4:6,0,5,0
chr18	2738352	.	T	TAGAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGAC;STR;TLOD=64.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,3:0,0,14,1
chr18	2738580	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,13:0,0,2,15
chr18	2750204	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,6:7,6:0,13,0,12
chr18	2751475	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr18	2771516	.	G	T	.	.	DP=136;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=396.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,123:0.992:123:0,50:0,69:0,0,75,48
chr18	2771643	.	A	AT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=203,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=113.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,42:0.958:43:1,17:0,21:0,1,4,38
chr18	2777923	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=141.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.955:42:0,16:1,24:0,1,6,35
chr18	2795852	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,3:1,7:1,0,10,0
chr18	2796601	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=168,179;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:2796601_TG_CA:2796601:0,4,0,1
chr18	2796604	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=168,179;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:2796601_TG_CA:2796601:0,4,0,1
chr18	2796609	.	TG	GG,CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33,35;MFRL=172,179,162;MMQ=60,40,49;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:2,1,1:0,3,0,2
chr18	2796617	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=193,171;MMQ=50,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr18	2847730	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2847730_C_G:2847730:0,0,1,0
chr18	2847744	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:2847730_C_G:2847730:0,0,1,0
chr18	2909095	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2909095_T_TTG:2909095:0,1,0,1
chr18	2909098	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2909095_T_TTG:2909095:0,1,0,1
chr18	2909100	.	C	CATATTCCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2909095_T_TTG:2909095:0,1,0,1
chr18	2909831	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,5,17
chr18	2913431	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr18	2920482	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr18	2931225	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr18	2951424	.	G	GCCTGCCCCAAAGTCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=177,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr18	2954439	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,4,1
chr18	2982817	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,2,21
chr18	3067599	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=186,267;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr18	3075503	.	C	CAAA	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=293.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,41:0,27:0,0,26,44
chr18	3075712	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,2:4,6:4,5,4,4
chr18	3084152	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	3089522	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:5,5:2,3:4,3,6,2
chr18	3094390	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3094390_A_ACC:3094390:0,2,0,1
chr18	3094392	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3094390_A_ACC:3094390:0,2,0,1
chr18	3100051	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr18	3100429	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=127,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,2:6,5:1,6,1,6
chr18	3100517	.	C	CAAAGGGGGAGGGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=245,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr18	3112231	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=147,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:3112231_G_C:3112231:4,0,2,0
chr18	3112252	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,4:0.556:7:2,0:1,4:1|0:3112231_G_C:3112231:2,1,3,1
chr18	3120060	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr18	3126632	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:3,1,7,0
chr18	3129131	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=158,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:1,0,3,1
chr18	3134555	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=276,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr18	3168916	.	ACATCAAATTTGT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=172,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:6,0:8,9,1,1
chr18	3169070	.	C	CAAAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,310;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,15;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr18	3173816	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr18	3173873	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,0:5,4:7,1,3,1
chr18	3174018	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,2:2,3:3,5,1,4
chr18	3176017	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,3:1,2:7,2,4,1
chr18	3176040	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=128,165;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.365:17:7,4:2,1:6,5,4,2
chr18	3188664	.	TAC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:1,0:4,0,2,0
chr18	3214831	.	CC	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr18	3215230	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,1,2
chr18	3272798	.	AG	TA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=88.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,14:0,6:0,0,20,0
chr18	3272855	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=168.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,32:0,16:0,0,46,4
chr18	3272874	.	T	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=112.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,50:0.963:51:1,29:0,19:1,0,44,6
chr18	3273109	.	TC	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=149,118;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:21,0:11,2:4,28,0,3
chr18	3273153	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,0,14
chr18	3277162	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr18	3277237	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=162.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,25:0,20:0,0,37,10
chr18	3277466	.	TG	CA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=199.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,28:0,16:0,0,2,43
chr18	3277691	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr18	3452222	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=208,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,3:3,4:9,1,5,2
chr18	3457933	.	G	GAGCAGATGGTAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=233,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr18	3534175	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:7,6:4,4:11,1,8,2
chr18	3729201	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:8,6,1,1
chr18	3814360	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:3814360_T_A:3814360:0,0,0,1
chr18	3814362	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3814360_T_A:3814360:0,0,0,1
chr18	3814364	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3814360_T_A:3814360:0,0,0,1
chr18	3814369	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3814360_T_A:3814360:0,0,0,1
chr18	3814373	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3814360_T_A:3814360:0,0,0,1
chr18	3845305	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr18	5196981	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr18	5196992	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr18	5197170	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	5291358	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,38;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:10,6,0,2
chr18	5406911	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.093:51:26,1:20,3:19,28,2,2
chr18	5407839	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr18	5415946	.	GGC	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=120,34;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:16,0:18,2:34,10,1,1
chr18	5423631	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr18	5433570	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=209,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr18	5437961	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:0|1:5437961_T_TC:5437961:6,1,1,1
chr18	5437967	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:5437961_T_TC:5437961:6,1,1,1
chr18	5445337	.	C	CTGATTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5445337_C_CTGATTAA:5445337:0,1,0,1
chr18	5445342	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5445337_C_CTGATTAA:5445337:0,1,0,1
chr18	5891413	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:5891413_TC_T:5891413:3,1,1,0
chr18	5891419	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,17;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:5891413_TC_T:5891413:3,1,1,0
chr18	5956425	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr18	5956483	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=35;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	6311604	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=96,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:12,0:11,2:8,15,1,1
chr18	6837446	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr18	6870524	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.517:29:6,6:7,8:12,2,14,1
chr18	6870821	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr18	6873354	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr18	6873646	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.220:19:8,1:7,2:15,0,4,0
chr18	6896450	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr18	6898415	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=185.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,31:0,22:0,0,45,8
chr18	6912004	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr18	6912230	.	G	GGAAACCACAATATAGAATTCATTTCAAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.384:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr18	6942295	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:6942295_T_C:6942295:0,0,1,5
chr18	6942313	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=195,326;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6942295_T_C:6942295:0,2,0,1
chr18	6942315	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=195,326;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6942295_T_C:6942295:0,2,0,1
chr18	6942316	.	A	AGAGACCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=195,326;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6942295_T_C:6942295:0,2,0,1
chr18	6947143	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:7,2,3,1
chr18	6959382	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:3,3:10,8:8,5,6,5
chr18	6980457	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr18	6982443	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=142,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr18	6985468	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=233,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,2,1
chr18	6985499	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:3,1,2,1
chr18	6985506	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,4,3
chr18	6985655	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr18	6986227	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=101,166;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,3:4,4:7,4,1,6
chr18	6986248	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=98,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:6,10,0,2
chr18	6986259	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=170,95;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:5,8:3,4:2,6,5,8
chr18	6997818	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,3:3,6:2,5,3,6
chr18	6999368	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=202,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,2:0,1:0|1:6999368_C_T:6999368:2,0,5,0
chr18	6999377	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=237,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:6999368_C_T:6999368:1,0,4,0
chr18	7008591	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:4,3,2,4
chr18	7011371	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:16,0:9,2:15,11,1,1
chr18	7011480	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.155:22:8,3:11,0:7,12,2,1
chr18	7011959	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=141,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:0,1,2,1
chr18	7012041	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=197,89;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr18	7017459	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=127,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr18	7024345	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:4,8:4,6:7,1,13,2
chr18	7026040	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,33;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,0:14,2:13,10,1,1
chr18	7026187	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:1,0:3,2:0,7,0,3
chr18	7026189	.	G	GAAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=A;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:3,0:0|1:7026189_G_GAAA:7026189:0,6,0,2
chr18	7026201	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:7026189_G_GAAA:7026189:0,6,0,2
chr18	7031986	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=200,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.753:5:1,2:0,1:1,0,4,0
chr18	7032221	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr18	7034448	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=119,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:2,1,5,2
chr18	7034464	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:2,4:2,1,3,2
chr18	7035943	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr18	7038783	.	C	CCCG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCG;STR;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.882:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr18	7080135	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,0:1,5,0,5
chr18	7567775	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,13;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,0:0|1:7567775_A_C:7567775:1,0,1,0
chr18	7567779	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=13,28;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:0,0:0|1:7567775_A_C:7567775:1,0,1,0
chr18	7774104	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr18	8069868	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0,0,13,8
chr18	8244282	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,1:0,0,0,7
chr18	8248041	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,1,2
chr18	8343333	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr18	8343530	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:4,6:9,5:2,11,3,8
chr18	8379095	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr18	8380473	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr18	8387058	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,2:3,1:0|1:8387058_T_G:8387058:3,1,3,0
chr18	8387065	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:0|1:8387058_T_G:8387058:5,1,3,0
chr18	8394498	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,3:8,0:10,8,1,2
chr18	8786117	.	C	CCCCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.778:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr18	8796149	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr18	8798374	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr18	8821556	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=111,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:0,5,0,6
chr18	8829075	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr18	9105108	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:6,2:0,1:0,6,0,5
chr18	9124799	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=207,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.619:11:0,7:2,0:4,0,7,0
chr18	9182329	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=254,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,3:1,0:0|1:9182329_T_TA:9182329:1,0,3,1
chr18	9182332	.	C	CTTCAGGTAGGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=254,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0|1:9182329_T_TA:9182329:1,0,3,1
chr18	9195781	.	C	CGTCACGAATTTTGCACTTGCCGTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	9204535	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:4,5,2,5
chr18	9258280	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:6,5,0,2
chr18	9275542	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:17,2:5,0:21,2,2,0
chr18	9279688	.	TA	T,TAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,31,10;MFRL=143,172,166;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.80,5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,5,5:0.142,0.161:32:7,1,0:12,3,1:0,22,0,10
chr18	9281192	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0,11,0,2
chr18	9512985	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,6:5,2:5,1,4,4
chr18	9522606	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	9614096	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr18	9775372	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=119.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,12:0,23:0,0,11,24
chr18	9775411	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr18	9859134	.	A	AAATATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.531:13:4,3:2,3:6,0,7,0
chr18	9914385	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.211:43:8,1:8,1:6,26,0,11
chr18	9914387	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=18,11;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.403:42:6,0:5,0:6,19,0,17
chr18	10455077	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr18	10455133	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,5:0,3:0,0,0,11
chr18	10468453	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,3:5,6:4,4,4,5
chr18	10677880	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,27;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:0,1:0,1,0,4
chr18	10680104	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	10680132	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:0,3:0|1:10680132_C_T:10680132:1,0,4,0
chr18	10680142	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,1:0,2:0|1:10680132_C_T:10680132:2,0,4,1
chr18	10680163	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:2,0,2,3
chr18	10681711	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,4:10,1:8,8,2,3
chr18	10691323	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,1:11,1:8,16,2,0
chr18	11824829	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	11824880	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:11824880_T_A:11824880:0,0,5,0
chr18	11824886	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:11824880_T_A:11824880:0,0,4,0
chr18	11852612	.	GTTT	G,GT,GTT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,35,29,34;MFRL=129,164,137,157;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,19,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.60,48.69,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,5,23,3:0.154,0.671,0.119:32:0,2,8,0:1,3,9,2:0,1,5,26
chr18	11853844	.	CA	TG	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:27,1:16,2:0|1:11853844_CA_TG:11853844:12,33,1,2
chr18	11853853	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=152,76;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:23,0:11,1:0|1:11853844_CA_TG:11853844:5,32,1,1
chr18	11853957	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=204,199;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:11853957_A_G:11853957:0,3,0,1
chr18	11853959	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=204,199;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:11853957_A_G:11853957:0,3,0,1
chr18	11867297	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=232,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr18	11872174	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=152,81;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,2:0,0:3,0,2,0
chr18	11884670	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr18	11893391	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr18	12014411	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr18	12028246	.	G	GTACTCCTTAGTTAGAACCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.474:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr18	12028247	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr18	12057195	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,6,2
chr18	12057840	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12057840_C_CA:12057840:0,1,0,1
chr18	12057841	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12057840_C_CA:12057840:0,1,0,1
chr18	12057845	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12057840_C_CA:12057840:0,0,0,1
chr18	12254785	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:2,5:0,2:2,0,7,0
chr18	12263067	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	12264512	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr18	12308243	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,0:0|1:12308243_T_A:12308243:0,0,5,1
chr18	12308245	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0|1:12308243_T_A:12308243:0,0,5,1
chr18	12308377	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr18	12308793	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.606:36:7,9:7,13:5,9,9,13
chr18	12358997	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,2,13
chr18	12359920	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,9:0,16:0,0,20,6
chr18	12363950	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr18	12421442	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,6:2,0:3,0,6,0
chr18	12427411	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr18	12429313	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:5,1:2,3:5,2,5,0
chr18	12453005	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=91.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,24,1
chr18	12506437	.	A	C,T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32,29;MFRL=133,142,187;MMQ=60,60,50;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.73,5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,2:0.213,0.213:11:3,2,2:4,0,0:7,0,4,0
chr18	12506445	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=131,167;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,0:10,1,4,0
chr18	12506661	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:1,14,0,2
chr18	12512559	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,1,4
chr18	12512574	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr18	12535536	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:8,2:8,0:11,7,1,1
chr18	12546608	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=209,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:2,3:0,0:2,0,2,1
chr18	12634986	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,3:6,1,3,2
chr18	12674470	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,14;MFRL=169,191;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:3,1,1,0
chr18	12678470	.	A	AGAAGATG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:12678470_A_AGAAGATG:12678470:0,2,0,1
chr18	12678474	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:12678470_A_AGAAGATG:12678470:0,2,0,1
chr18	12678476	.	T	TTCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:12678470_A_AGAAGATG:12678470:0,2,0,1
chr18	12678479	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:12678470_A_AGAAGATG:12678470:0,2,0,1
chr18	12680595	.	CAAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=212,162;MMQ=40,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,1:2,1:3,2,2,0
chr18	12695415	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:0,4,0,9
chr18	12697337	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.141:40:20,3:13,2:17,18,1,4
chr18	12700918	.	CATAT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=AT;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,2:6,1:12,1,3,0
chr18	12703067	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,5:1,0:4,1,5,0
chr18	12703192	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.550:27:7,7:4,6:3,9,4,11
chr18	12720567	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,87;MMQ=60,35;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,2:14,0:19,4,2,0
chr18	12720768	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,169;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,0:6,2:0,16,0,2
chr18	12817106	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:6,1:9,3:15,2,2,2
chr18	12951738	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr18	12955439	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=127,183;MMQ=47,51;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.613:23:3,5:5,7:8,1,13,1
chr18	12955661	.	G	GATATGGCAGGGCACTCA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:16,2:6,0:1,23,1,1
chr18	12963146	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.740:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr18	12982760	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr18	12986802	.	G	GT,GTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,36,34;MFRL=155,149,67;MMQ=60,60,60;MPOS=24,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=8.76,4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.507,0.298:7:1,3,2:0,1,0:1,0,5,1
chr18	13008369	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr18	13008699	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.417:26:7,0:4,0:2,13,0,11
chr18	13008701	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.335:25:7,4:4,0:2,14,0,9
chr18	13018666	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=208,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:4,4:2,6:0,6,0,10
chr18	13030383	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr18	13048796	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.412:34:13,6:7,7:17,3,10,4
chr18	13049930	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,0:7,2:0,18,0,2
chr18	13049948	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,1,19
chr18	13052892	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,1:6,3:0|1:13052892_AG_A:13052892:4,5,4,0
chr18	13052895	.	TGTGA	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:3,1:6,3:0|1:13052892_AG_A:13052892:6,6,4,0
chr18	13052900	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:4,1:6,3:0|1:13052892_AG_A:13052892:6,6,4,0
chr18	13052902	.	T	TTCA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:5,1:5,3:0|1:13052892_AG_A:13052892:5,6,4,0
chr18	13055756	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=210,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr18	13072702	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.356:29:11,9:7,1:16,3,10,0
chr18	13072979	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,99;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:7,1,7,2
chr18	13096403	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr18	13099601	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.245:18:6,2:8,2:3,11,0,4
chr18	13114172	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:8,5,2,0
chr18	13124609	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,0:5,2:5,0,2,0
chr18	13645578	.	G	GAGCATTACACTATCGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=170,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:4,2,1,1
chr18	13666768	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr18	13740369	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr18	13759816	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:13759816_T_C:13759816:0,0,5,0
chr18	13759820	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:13759816_T_C:13759816:0,0,5,0
chr18	13825727	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:4,1,3,0
chr18	13825900	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:9,3:10,0:10,10,0,3
chr18	13826837	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	14105449	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,4:6,2:5,3,4,2
chr18	14132238	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,9;MFRL=148,120;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.135:27:9,0:13,0:0|1:14132238_T_G:14132238:8,16,3,0
chr18	14132243	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=145,120;MMQ=57,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.122:30:9,0:13,0:0|1:14132238_T_G:14132238:9,18,3,0
chr18	14132245	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=144,124;MMQ=57,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:8,0:13,1:5,18,5,0
chr18	14183550	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=201,192;MMQ=53,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:6,0,7,0
chr18	14183635	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=151,187;MMQ=49,26;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,4:0.066:73:32,1:35,2:0|1:14183635_C_T:14183635:49,20,4,0
chr18	14183638	.	G	C	.	.	DP=74;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=151,152;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=91.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,35:0.486:72:16,18:21,17:27,10,25,10
chr18	14183642	.	C	G	.	.	DP=75;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=147,187;MMQ=49,26;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,4:0.065:75:33,2:38,2:0|1:14183635_C_T:14183635:50,21,4,0
chr18	14183646	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=149,197;MMQ=49,28;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,5:0.076:77:32,3:38,2:0|1:14183635_C_T:14183635:51,21,5,0
chr18	14183666	.	G	T	.	.	DP=81;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=153,124;MMQ=40,26;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,7:0.092:78:30,5:39,1:39,32,2,5
chr18	14183680	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=149,138;MMQ=40,28;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,8:0.134:65:24,2:30,4:26,31,2,6
chr18	14183710	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=158,143;MMQ=40,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.272:42:12,4:19,7:6,25,0,11
chr18	14183720	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=158,164;MMQ=25,49;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.305:44:15,4:14,9:2,29,2,11
chr18	14183734	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=158,175;MMQ=60,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:6,10:14,5:3,17,1,14
chr18	14183747	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=7;MBQ=30,35;MFRL=169,181;MMQ=47,24;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.181:42:16,5:18,2:3,32,0,7
chr18	14183752	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=175,176;MMQ=47,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,6:0.156:43:15,4:20,2:0|1:14183752_C_T:14183752:4,33,0,6
chr18	14183755	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=175,176;MMQ=47,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,6:0.156:43:14,4:19,2:0|1:14183752_C_T:14183752:4,33,0,6
chr18	14183840	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=199,198;MMQ=46,29;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,2:1,5:4,2,1,6
chr18	14183954	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=185,180;MMQ=40,21;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,2:10,1:17,2,3,0
chr18	14183974	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=161,187;MMQ=47,21;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.217:30:12,4:11,2:22,2,6,0
chr18	14183978	.	TG	CA	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=157,183;MMQ=47,21;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.324:32:11,7:10,2:20,2,10,0
chr18	14184043	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=130,162;MMQ=40,21;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.073:64:35,2:24,2:42,18,0,4
chr18	14513678	.	T	G	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=148,175;MMQ=36,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,16:0.150:111:41,8:53,8:57,38,16,0
chr18	14538010	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=275.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,35:0,41:0,0,19,59
chr18	14760473	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=180,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,2:13,0:24,1,2,0
chr18	14772234	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,122;MMQ=60,33;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:15,0:20,4:14,21,0,4
chr18	14779969	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=29,34;MFRL=112,129;MMQ=52,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,30:0.817:36:3,18:3,12:4,2,19,11
chr18	14779986	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=121,112;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,8:0.213:40:17,3:15,5:21,11,5,3
chr18	14780019	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=117,122;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,18:0.316:58:14,7:20,11:0|1:14780019_G_T:14780019:18,22,8,10
chr18	14780024	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=8;MBQ=32,20;MFRL=121,123;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,18:0.314:58:15,8:21,9:0|1:14780019_G_T:14780019:17,23,7,11
chr18	14780037	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=129,123;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,13:0.316:42:12,5:17,7:10,19,5,8
chr18	14780056	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=140,207;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.130:37:13,1:20,3:6,27,1,3
chr18	14780064	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=160,156;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.142:28:8,1:13,3:4,20,0,4
chr18	14780082	.	GC	AT	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=180,122;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:4,2:0,9,0,4
chr18	14797913	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	14837168	.	GT	G	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=204,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=199.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,81:0.963:84:0,42:2,37:2,1,52,29
chr18	14842846	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,124;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,6:0.098:69:30,3:31,3:43,20,4,2
chr18	14848935	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=166,142;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=155.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,53:0.900:58:1,21:4,30:0,5,17,36
chr18	14852335	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0,0,5,3
chr18	14852496	.	AAT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.707:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	18548797	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:22,0:17,3:10,29,0,3
chr18	18571283	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=137,228;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:1,19,0,3
chr18	18963674	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=100,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:9,0:6,2:6,9,1,1
chr18	18963696	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=179,143;MMQ=52,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0,7,0,2
chr18	18963702	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=182,153;MMQ=56,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:6,1:0,2:0|1:18963702_C_T:18963702:0,6,0,3
chr18	18963705	.	CG	GC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=182,153;MMQ=56,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:6,0:0,2:0|1:18963702_C_T:18963702:0,6,0,3
chr18	18963708	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=182,158;MMQ=56,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:5,0:0,2:0|1:18963702_C_T:18963702:0,6,0,2
chr18	18983766	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr18	19057357	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=196,103;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:19057357_T_C:19057357:0,3,0,1
chr18	19057361	.	T	TTTCTTTGGCAGACCTTACCTAGTGCACTGCTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=196,103;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19057357_T_C:19057357:0,1,0,1
chr18	19065494	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr18	19085918	.	C	CACT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=119,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:19085918_C_CACT:19085918:0,3,0,1
chr18	19085921	.	A	ATGAACCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=119,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:19085918_C_CACT:19085918:0,3,0,1
chr18	19085933	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=80,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:19085933_G_A:19085933:0,2,0,1
chr18	19085939	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=80,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19085933_G_A:19085933:0,2,0,1
chr18	19100758	.	A	ATCT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=95.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,10:0,12:0,0,4,18
chr18	19110466	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,17;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,0:0|1:19110466_TG_T:19110466:0,1,1,0
chr18	19110470	.	G	GTTAAAAAGTGAAGAGCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=70,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:19110470_G_GTTAAAAAGTGAAGAGCA:19110470:2,0,0,1
chr18	19110472	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=70,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:19110470_G_GTTAAAAAGTGAAGAGCA:19110470:2,0,0,1
chr18	19110476	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr18	19110485	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,14;MFRL=209,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:19110466_TG_T:19110466:0,2,1,0
chr18	19119801	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.534:39:1,9:17,11:17,1,20,1
chr18	19119813	.	TAA	T,TA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=29,29,28;MFRL=163,152,174;MMQ=60,60,60;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=6.09,9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,4,8:0.117,0.209:37:7,2,4:15,2,4:22,3,9,3
chr18	19119974	.	GATAT	G,GAT	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=34,36,33;MFRL=154,159,170;MMQ=60,60,60;MPOS=15,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,8;RU=AT;STR;TLOD=12.28,61.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,6,21:0.139,0.474:45:9,1,11:9,5,10:0,18,3,24
chr18	19146268	.	A	AGCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0|1:19146268_A_AGCC:19146268:0,1,0,1
chr18	19146270	.	T	TGAACTCCTGGGCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19146268_A_AGCC:19146268:0,1,0,1
chr18	19192255	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=230,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr18	19282515	.	A	ATTTTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.421:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr18	19408891	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.613:21:3,7:4,5:7,1,12,1
chr18	19408950	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=134.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,20:0,18:0,0,24,14
chr18	19423003	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr18	19423963	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:3,0,2,0
chr18	19427096	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:0,6,0,5
chr18	19444661	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:5,5:5,5:1,10,2,8
chr18	19751537	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	19780527	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,1:0,0,7,0
chr18	19780858	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr18	20555219	.	T	C	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=336.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,93:0.990:93:0,55:0,38:0,0,15,78
chr18	20564800	.	TTCA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCA;STR;TLOD=155.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,15:0,19:0,0,34,2
chr18	20774356	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=152,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:6,1:0,1:4,2,1,1
chr18	20817276	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,2:2,2:0,5,0,4
chr18	20950158	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.574:10:1,3:1,1:2,2,3,3
chr18	20951310	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=157,48;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,1:22,0,2,0
chr18	20951333	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=129,119;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.125:41:18,4:17,1:33,3,5,0
chr18	20951336	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=125,125;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:20,1:20,1:0|1:20951336_G_A:20951336:37,6,2,0
chr18	20951338	.	TA	CG	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=125,125;MMQ=60,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.063:45:19,1:19,1:0|1:20951336_G_A:20951336:36,7,2,0
chr18	20951355	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,3:0.052:74:28,3:40,0:48,23,2,1
chr18	20953720	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=121,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,6:2,4:4,4,6,4
chr18	20965030	.	GCCTGAAAGAA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=229,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:20965030_GCCTGAAAGAA_G:20965030:1,1,0,1
chr18	20965044	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=229,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:20965030_GCCTGAAAGAA_G:20965030:0,1,0,1
chr18	21010717	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=143,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.391:6:0,0:2,2:0,4,0,2
chr18	21017835	.	CT	TC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,13:0.583:22:6,8:3,5:0|1:21017835_CT_TC:21017835:4,5,6,7
chr18	21017836	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,21:0.955:21:0,14:0,7:1|0:21017835_CT_TC:21017835:0,0,9,12
chr18	21033582	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	21043106	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr18	21055092	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=106.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,15:0,0,2,27
chr18	21061187	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:11,10,2,0
chr18	21083738	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.698:18:1,7:4,5:0,5,0,13
chr18	21088081	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,12:0,0,4,18
chr18	21089320	.	AAT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,0:6,2:0,15,0,2
chr18	21099215	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=175,165;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,1:0,2,0,2
chr18	21099233	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,169;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr18	21110573	.	C	CACACACACACACACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=140,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr18	21120381	.	TAAA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.244:6:3,1:2,0:4,1,1,0
chr18	21120403	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=121,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,0:7,1:8,3,2,0
chr18	21121472	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0,10,0,2
chr18	21123598	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=183,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:21123598_TG_T:21123598:0,3,0,1
chr18	21123602	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=183,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:21123598_TG_T:21123598:0,3,0,1
chr18	21123608	.	TA	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21123608_TA_AG:21123608:0,1,0,1
chr18	21123612	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21123608_TA_AG:21123608:0,1,0,1
chr18	21124834	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:6,0,8,0
chr18	21124907	.	A	AC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.462:15:2,1:3,3:3,5,1,6
chr18	21124945	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.609:36:7,14:6,8:6,8,6,16
chr18	21181116	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=126,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,2:0,0:2,0,1,2
chr18	21209982	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,36;MFRL=172,189;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:21209982_G_C:21209982:0,3,0,1
chr18	21209983	.	CGG	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:21209983_CGG_C:21209983:0,3,0,1
chr18	21209987	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=16,29;MFRL=172,189;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:21209982_G_C:21209982:0,3,0,1
chr18	21209988	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:21209983_CGG_C:21209983:0,3,0,1
chr18	21209989	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,16;MFRL=201,172;MMQ=50,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,0:0|1:21209989_C_T:21209989:0,2,0,1
chr18	21209990	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=192,189;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:21209982_G_C:21209982:0,2,0,1
chr18	21210006	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,35;MFRL=201,172;MMQ=50,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:21209989_C_T:21209989:0,2,0,1
chr18	21210010	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr18	21294117	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr18	21338276	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr18	21338474	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=27,10;MFRL=163,211;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:4,0:0|1:21338474_A_C:21338474:1,8,0,2
chr18	21338477	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=29,13;MFRL=163,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.375:11:3,1:2,0:1,6,0,4
chr18	21338481	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=14,13;MFRL=163,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:1,0:2,0:0|1:21338474_A_C:21338474:1,8,0,3
chr18	21338483	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=27,13;MFRL=145,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.589:8:0,0:2,0:1,2,0,5
chr18	21338489	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=14,13;MFRL=182,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.442:9:0,0:2,0:0|1:21338474_A_C:21338474:1,4,0,4
chr18	21338494	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=14,13;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.489:8:1,0:0,0:0|1:21338474_A_C:21338474:0,4,0,4
chr18	21338515	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr18	21390276	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:2,1,1,0
chr18	21395358	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr18	21400005	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=15,34;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=70.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.943:20:0,3:0,16:0,1,0,19
chr18	21400028	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr18	21404334	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr18	21437721	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr18	21441717	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,5:0,5:0,0,3,8
chr18	21479181	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=116,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr18	21484575	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,1:10,1:9,14,0,2
chr18	21501329	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr18	21511172	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=93.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,12:0,17:0,0,9,20
chr18	21526087	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=213.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,25:0,40:0,0,55,13
chr18	21529722	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,5:0,0,10,4
chr18	21534701	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:21534701_C_A:21534701:0,0,0,3
chr18	21534703	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:21534701_C_A:21534701:0,0,0,3
chr18	21644075	.	TTG	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.173:49:22,4:15,4:34,7,7,1
chr18	21662816	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=202,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.889:11:0,5:0,4:1,0,9,1
chr18	21663141	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	21694618	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr18	21703706	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21703706_CT_C:21703706:0,0,1,0
chr18	21703719	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:21703706_CT_C:21703706:0,0,1,0
chr18	21703723	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,16;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:21703706_CT_C:21703706:0,0,1,0
chr18	21703725	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,14;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:21703706_CT_C:21703706:0,0,1,0
chr18	21703729	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,0:0|1:21703706_CT_C:21703706:0,0,1,0
chr18	21703736	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,14;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:21703706_CT_C:21703706:2,0,1,0
chr18	21703741	.	CCC	AAA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,23;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:21703706_CT_C:21703706:3,0,1,0
chr18	21708989	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr18	21708999	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	21709025	.	A	AGTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=177,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21709025_A_AGTT:21709025:0,3,0,1
chr18	21709029	.	AGC	TAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=177,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21709025_A_AGTT:21709025:0,3,0,1
chr18	21722997	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr18	21723400	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:3,1,0,1
chr18	21736105	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,0:16,2:12,9,0,2
chr18	21739528	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=120,108;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:31,4:21,0:30,22,4,0
chr18	21745105	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=144,42;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:6,0:7,0:3,10,2,0
chr18	21751296	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=98.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,7:0,21:0,0,28,0
chr18	22008913	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,2,15
chr18	22010421	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr18	22049016	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr18	22805085	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,3:11,0:10,7,3,0
chr18	22805820	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=141,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:14,2:6,0:13,7,1,1
chr18	23615974	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=186,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr18	23845204	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=122,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:15,1:7,1:13,12,2,0
chr18	23847516	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:0,0:10,2:0|1:23847516_A_T:23847516:5,7,1,1
chr18	23847521	.	T	TGTCCATACCTTTGAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:0,0:11,2:0|1:23847516_A_T:23847516:5,7,1,1
chr18	23866349	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:5,2:4,2:3,6,1,3
chr18	23866482	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr18	23872434	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23872434_A_ACT:23872434:1,0,0,1
chr18	23872435	.	G	GAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23872434_A_ACT:23872434:1,0,0,1
chr18	23873300	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.602:38:5,11:9,11:15,0,23,0
chr18	24035654	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,5:7,0:11,2,5,0
chr18	24039489	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	24126992	.	G	GAAGGGGCTTGTTCATTATTTTGAGAGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:0,2:4,0:2,2,1,1
chr18	24127253	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:17,2:22,1:21,20,1,2
chr18	24127313	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=121.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,19,18
chr18	24442056	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr18	24445692	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,1,11
chr18	24496946	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:0,2,3,4
chr18	24628305	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:4,0,8,0
chr18	25569981	.	CAAAT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=233,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr18	25570228	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,4:0,0,5,12
chr18	25572837	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr18	25573622	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr18	25583234	.	T	TTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr18	28659724	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr18	28662790	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=198,171;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:2,2:19,0:25,0,2,0
chr18	28662793	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=202,171;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:1,3:20,1:21,0,4,0
chr18	28662813	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=176,152;MMQ=60,32;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:3,2:21,0:24,0,2,0
chr18	28666526	.	T	TTAA	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=242.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,27:0,27:0,0,36,24
chr18	28711519	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:5,0,7,2
chr18	28712686	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr18	28713843	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:3,2:6,4:7,3,3,3
chr18	28719674	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.465:30:9,11:7,2:11,5,11,3
chr18	28721882	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr18	28721913	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,9:0,3:0|1:28721913_C_T:28721913:0,0,13,0
chr18	28721922	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0|1:28721913_C_T:28721913:0,0,16,2
chr18	28723596	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,11:0,2:0,0,11,2
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chr18	28739495	.	C	CAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=36,19;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.925:25:1,3:1,4:0,2,2,21
chr18	28898201	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:3,4:7,3:8,2,7,1
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chr18	28908090	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=190,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr18	28913929	.	TTC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:1,3:3,0,4,0
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chr18	28916290	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,5:4,5:5,2,6,5
chr18	28923983	.	AT	CA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:6,12:9,8:2,13,4,16
chr18	28935375	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	28969008	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,3,9
chr18	29049018	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,5:3,3:8,0,6,2
chr18	29098323	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr18	29101230	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:0,5:4,6:2,5,1,11
chr18	29104698	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.528:53:14,12:10,16:14,11,12,16
chr18	29104714	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,28:0.547:51:11,15:12,13:10,13,12,16
chr18	29116462	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	29122847	.	G	GTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	29211163	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,22;MFRL=0,166;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr18	29237860	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=183,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr18	29238076	.	CAA	C,CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,19,19;MFRL=166,137,169;MMQ=60,60,60;MPOS=22,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.51,9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.253,0.456:11:1,0,0:1,1,1:0,3,1,7
chr18	29264182	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr18	29419462	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=221,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr18	29426669	.	A	G	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,39:0.545:71:12,20:20,17:13,19,16,23
chr18	29426868	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	29432304	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=179,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr18	29432332	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,2,2
chr18	29432367	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=130,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:2,8:1,5:2,1,5,8
chr18	29435778	.	TAAA	T,TAA,TAAAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,30,30,31;MFRL=149,158,114,143;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,20,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,15,17;RU=A;STR;TLOD=9.22,3.54,11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:13,4,4,9:0.133,0.132,0.290:30:10,2,3,3:3,2,1,5:2,11,3,14
chr18	29444811	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr18	29447468	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.492:43:8,12:12,9:5,17,4,17
chr18	29451174	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=214,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr18	29477697	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:4,1:2,7:6,0,8,0
chr18	29477770	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=122,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:9,6:8,11:12,5,12,5
chr18	29487596	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.619:27:5,7:5,9:0,10,4,13
chr18	29488407	.	GACAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=165,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAA;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,1:5,1:0,7,1,1
chr18	29489024	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:29489024_G_A:29489024:0,1,0,1
chr18	29489025	.	TGCTA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29489024_G_A:29489024:0,1,0,1
chr18	29493533	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr18	29496218	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,1:4,5:8,2,6,0
chr18	29598809	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=218,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr18	29617255	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr18	29625524	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.443:16:2,3:7,4:0|1:29625524_C_CA:29625524:9,0,7,0
chr18	29625536	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,14:0.537:26:4,6:6,8:1|0:29625524_C_CA:29625524:11,1,12,2
chr18	29672941	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	29704652	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:12,5:3,5:15,0,10,0
chr18	29708981	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr18	29770167	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:8,5:1,2:0|1:29770167_TG_T:29770167:0,9,0,7
chr18	29770196	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1|0:29770167_TG_T:29770167:0,4,0,1
chr18	29775551	.	T	TTTTTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	29784370	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:0,9,0,3
chr18	29790378	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr18	29797921	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr18	29797958	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr18	29800119	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,5,1
chr18	29848028	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,1:3,6:1,3,5,2
chr18	29850102	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr18	29890297	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.535:26:9,7:3,7:3,9,2,12
chr18	30257367	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=191,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr18	30350165	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:5,9:6,1:5,6,3,8
chr18	30672631	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=53.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr18	30950168	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr18	30977255	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr18	31241497	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:5,0,3,0
chr18	31250676	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=114,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:7,8:10,4:6,11,8,4
chr18	31312106	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr18	31314196	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:8,0,5,0
chr18	31314389	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:5,6:10,10:4,11,2,14
chr18	31314435	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.545:18:4,3:4,6:0,8,1,9
chr18	31318376	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr18	31319262	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:6,2:12,4,0,2
chr18	31325932	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=115,283;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31325932_G_T:31325932:1,0,0,1
chr18	31325935	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=115,283;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31325932_G_T:31325932:1,0,0,1
chr18	31325938	.	T	TTTCTTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=138,283;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:31325932_G_T:31325932:2,0,0,1
chr18	31325941	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=138,283;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:31325932_G_T:31325932:2,0,0,1
chr18	31523144	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=62,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,2:3,0:0,4,1,1
chr18	31673492	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,1:4,1:3,8,1,1
chr18	32431845	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,1:15,1:14,12,0,2
chr18	32459704	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:11,8:5,5:4,12,5,9
chr18	32650341	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=143,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:2,3:0,2:0,2,0,6
chr18	32720189	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr18	32822382	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,14,1
chr18	32886528	.	T	TAGTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr18	32887914	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=157,94;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.695:17:3,4:1,8:2,3,4,8
chr18	32887933	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,9:0,0,4,14
chr18	32887958	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,0:4,3:2,9,0,3
chr18	32888074	.	TA	T	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.133:32:11,2:15,2:27,1,4,0
chr18	32888089	.	AC	A	.	.	DP=55;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.120:43:19,1:16,4:35,3,5,0
chr18	32888090	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,20:0.397:50:15,7:13,10:28,2,16,4
chr18	32888332	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:4,1:8,4,2,0
chr18	32888349	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=172,138;MMQ=60,34;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:7,0:12,4:16,3,4,0
chr18	32888380	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=138,160;MMQ=47,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.279:22:4,2:9,4:13,3,6,0
chr18	32888397	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=122,140;MMQ=60,48;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.132:44:15,3:12,1:18,20,4,2
chr18	32888401	.	A	AAG	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=137,122;MMQ=40,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=112.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,46:0.941:49:0,20:2,24:3,0,22,24
chr18	32917832	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=241,43;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:32917832_A_T:32917832:0,1,1,1
chr18	32917833	.	C	CCTTTTATGAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=241,43;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:32917832_A_T:32917832:0,1,1,1
chr18	32920454	.	C	CT	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=134,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:20,2:19,0:0|1:32920454_C_CT:32920454:15,25,0,2
chr18	32920455	.	G	GTATC	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=133,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:20,2:19,0:0|1:32920454_C_CT:32920454:15,24,0,2
chr18	32920461	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=136,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,0:14,1:0|1:32920454_C_CT:32920454:11,22,0,2
chr18	32948446	.	T	TTTTA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=135,165;MMQ=59,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TTTA;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.407:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr18	32948481	.	T	TATTTATTTA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=193,135;MMQ=60,59;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr18	32948510	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr18	32954034	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:13,2:13,12,2,0
chr18	33048554	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.358:20:5,1:7,5:9,4,5,2
chr18	33058318	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=16,16;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.347:26:5,2:0,1:4,13,2,7
chr18	33077660	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.572:34:3,16:5,2:13,2,14,5
chr18	33234532	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr18	33243536	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.585:29:2,14:9,3:12,0,15,2
chr18	33269274	.	T	A	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=128.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,48:0.555:86:11,12:27,35:4,34,6,42
chr18	33282985	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:4,9:8,4:1,11,2,11
chr18	33283016	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:2,4:1,3:0,3,0,7
chr18	33552986	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,5:4,2:0,11,0,7
chr18	33611062	.	TAA	T,TA	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=20,26,13;MFRL=114,110,150;MMQ=60,60,60;MPOS=24,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.00,8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,6,8:0.161,0.263:35:10,1,1:3,3,2:11,10,4,10
chr18	33613595	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=210,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr18	33692654	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr18	33694263	.	G	A	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,3:0.037:106:36,2:65,1:23,80,0,3
chr18	33696772	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr18	33706614	.	C	G	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=356.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,99:0.990:99:0,41:0,55:0,0,56,43
chr18	33713132	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr18	33722425	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr18	33725874	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,16,3
chr18	33744677	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr18	33754700	.	G	GAAACACTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr18	33778607	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,11:0,18:0,0,21,8
chr18	33780020	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,8,12
chr18	33783030	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0,0,13,2
chr18	33785304	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	33793511	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	33795425	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr18	33799930	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=181,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr18	33828980	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=114,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:3,2:1,8,0,2
chr18	33831044	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr18	33848663	.	A	ATACAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,2,12
chr18	34174958	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	34182800	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=212,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr18	34205385	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr18	34261581	.	AG	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=74.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.556:43:5,11:14,13:2,17,0,24
chr18	34289364	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=64,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:0,6,1,7
chr18	34297753	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:7,6:1,10:7,1,13,3
chr18	34298732	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=188,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr18	34324190	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,5:1,3,1,5
chr18	34340486	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr18	34376735	.	CTG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=140,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,2:2,6:6,3,8,0
chr18	34380148	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=115,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,5:5,8:11,2,9,4
chr18	34398833	.	T	TAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,1:8,2:11,5,3,2
chr18	34424155	.	AT	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,5:0.084:69:33,2:30,3:51,13,3,2
chr18	34465512	.	T	A,TA,TTA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,32,30,32;MFRL=158,154,179,0;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,19,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.16,18.85,5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:24,2,9,3:0.075,0.306,0.125:38:12,2,3,1:11,0,3,2:19,5,11,3
chr18	34465686	.	CT	C,CTT	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,35,36;MFRL=154,158,167;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.10,4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,4,4:0.113,0.117:38:14,1,1:14,3,3:0,30,0,8
chr18	35065396	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr18	35145660	.	T	TCTCG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CTCG;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr18	35145686	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35145686_A_T:35145686:0,2,0,1
chr18	35145690	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35145686_A_T:35145686:0,2,0,1
chr18	35145693	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35145686_A_T:35145686:0,2,0,1
chr18	35145694	.	A	ATTCAAC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35145686_A_T:35145686:0,2,0,1
chr18	40503735	.	GAA	G,GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,22,24;MFRL=116,82,156;MMQ=60,60,60;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.25,10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,4:0.187,0.619:7:0,1,2:1,0,0:0,1,0,6
chr18	42456653	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.512:33:4,5:9,8:7,9,10,7
chr18	42456670	.	C	CTCTT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.527:34:4,7:10,9:7,9,9,9
chr18	42533315	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr18	43204848	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr18	43205630	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=212,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:2,3:2,1:2,2,3,1
chr18	43221341	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr18	43243679	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr18	43246850	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr18	43247001	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:10,5:1,7:9,3,5,7
chr18	43247784	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:9,6:8,6:8,9,10,2
chr18	43248504	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.428:26:9,4:6,7:0|1:43248504_T_C:43248504:1,14,1,10
chr18	43248509	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.483:27:9,6:5,7:0|1:43248504_T_C:43248504:1,13,1,12
chr18	43252786	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,11,0
chr18	43307455	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	43310187	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr18	43314401	.	G	GA,GAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32,19;MFRL=169,140,140;MMQ=60,60,60;MPOS=14,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=16.70,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,11,3:0.676,0.223:15:0,2,0:1,8,0:0,1,1,13
chr18	43316473	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:7,0:8,5:8,8,2,3
chr18	43319359	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	43405593	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,21;MFRL=147,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr18	43405595	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=13,33;MFRL=147,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.410:3:0,1:0,0:2,0,1,0
chr18	43405601	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=18,27;MFRL=184,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:4,0,1,0
chr18	43405792	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,1:0,8:0,0,1,9
chr18	43432625	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,1,8
chr18	43435738	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr18	43446734	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr18	43487911	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.288:18:5,0:6,0:8,5,5,0
chr18	43508998	.	AAGATG	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.293:5:2,0:1,1:0|1:43508998_AAGATG_A:43508998:0,4,0,1
chr18	43509005	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:43508998_AAGATG_A:43508998:0,4,0,1
chr18	43509007	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=177,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:43508998_AAGATG_A:43508998:1,3,0,1
chr18	43509011	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=177,124;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:43508998_AAGATG_A:43508998:1,3,0,1
chr18	43547127	.	TG	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=108.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,10:0,17:0,0,15,22
chr18	43572235	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=183,215;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:43572235_AC_A:43572235:0,3,0,1
chr18	43572237	.	ATGGGT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=183,215;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:43572235_AC_A:43572235:0,3,0,1
chr18	43572244	.	T	TGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=188,215;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:43572235_AC_A:43572235:0,2,0,1
chr18	43572250	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=192,215;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:43572235_AC_A:43572235:0,3,0,1
chr18	43652093	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:16,2:7,1:16,7,2,1
chr18	43652203	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr18	43665982	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr18	43666280	.	TAGTTAATATATTAATACCTTAAGA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.415:32:10,7:5,5:9,10,7,6
chr18	43666952	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=156.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,26:0,22:0,0,28,20
chr18	43667528	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=134.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,21:0,14:0,0,1,34
chr18	43668321	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr18	43669980	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,1,16
chr18	43671897	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr18	43678024	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr18	43678035	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr18	43698309	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,8:0,0,1,16
chr18	43702407	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:15,2:7,0:21,1,2,0
chr18	43703176	.	C	CA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.143:34:12,2:16,3:29,0,5,0
chr18	43703223	.	C	G	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=302.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,30:0,53:0,0,46,40
chr18	43820053	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:19,2:18,2:23,14,3,1
chr18	43833701	.	T	TCTG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTG;STR;TLOD=123.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,12:0,15:0,0,18,11
chr18	44030597	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,178;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:7,2,2,0
chr18	44063718	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr18	44064946	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=101,99;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44064946_A_C:44064946:1,1,1,0
chr18	44064953	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=82,99;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:44064946_A_C:44064946:2,1,1,0
chr18	44064958	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,14;MFRL=82,99;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:44064946_A_C:44064946:2,1,1,0
chr18	44064960	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,10;MFRL=82,99;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:44064946_A_C:44064946:2,1,1,0
chr18	44064964	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,14;MFRL=82,99;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:44064946_A_C:44064946:2,2,1,0
chr18	44109115	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=124,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.483:23:3,1:8,10:8,4,7,4
chr18	44114473	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr18	44135027	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:3,0,5,1
chr18	44135050	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,1:1,5:3,1,4,2
chr18	44171827	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr18	44174497	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=3,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44174497_CA_AG:44174497:1,2,0,1
chr18	44174499	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=127,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr18	44174501	.	C	CTAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:44174497_CA_AG:44174497:1,1,0,1
chr18	44184236	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0,11,0,2
chr18	44198347	.	C	CTTATTTTTTGATTTCTCTTATAACTTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr18	44262096	.	G	GTACTAGGCGTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,247;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr18	44272034	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	44424105	.	G	GA,GAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=17,17,17;MFRL=140,155,190;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=25.04,3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,24,3:0.739,0.111:32:0,4,0:0,2,0:0,5,1,26
chr18	44426715	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:12,2:7,0:14,5,2,0
chr18	44426877	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr18	44595809	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,5,5
chr18	44601611	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.385:32:7,7:12,5:13,7,9,3
chr18	44635048	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr18	44702718	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr18	45375111	.	T	TATTTTGCATAATAACAAAGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr18	45394653	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0|1:45394653_G_A:45394653:6,1,3,0
chr18	45394662	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:0|1:45394653_G_A:45394653:5,1,4,0
chr18	45395534	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:8,0,0,3
chr18	45395845	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,0:0,4:0,0,0,5
chr18	45556302	.	G	GAGGGTGAGAGGGCTGTTAGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=100,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr18	46284840	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr18	46284849	.	G	GAAATTTTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=193,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr18	46284856	.	T	TAAGACACAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,30;MFRL=25299,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:46284856_T_TAAGACACAA:46284856:0,1,0,1
chr18	46284858	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=25299,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:46284856_T_TAAGACACAA:46284856:0,1,0,1
chr18	46384073	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr18	46385948	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,4:3,2:1,6,3,3
chr18	46623960	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr18	46689995	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,126;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,2:6,0:0|1:46689995_G_T:46689995:9,0,2,0
chr18	46689999	.	TT	CC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=158,126;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:0|1:46689995_G_T:46689995:10,0,2,0
chr18	47014986	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.134:50:22,2:22,4:2,42,0,6
chr18	47016787	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.486:29:7,11:7,3:11,4,9,5
chr18	47091963	.	A	AGATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr18	47093790	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr18	47101988	.	T	TATTTGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	47313642	.	A	AC,AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,33,34;MFRL=143,146,133;MMQ=60,60,40;MPOS=21,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=30.64,4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,15,4:0.508,0.226:26:2,12,1:5,2,2:4,3,19,0
chr18	47317767	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr18	47320850	.	AAT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr18	47363009	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=124,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:3,0,5,1
chr18	47365527	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:11,3,2,0
chr18	47367876	.	A	AGCTCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0|1:47367876_A_AGCTCTTT:47367876:0,2,0,1
chr18	47367879	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:47367876_A_AGCTCTTT:47367876:0,2,0,1
chr18	47373466	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:1,0:6,3:7,0,3,0
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chr18	47518901	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=221,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.522:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr18	47769194	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,7;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr18	47777358	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:3,3:7,2:0,10,1,5
chr18	47787402	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=64.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,22:0.622:35:6,15:7,7:10,3,16,6
chr18	47787620	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=0,122;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:1,0:0,0:2,0,0,1
chr18	47787622	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=0,122;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr18	47802971	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr18	47803354	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,2:2,5:2,4,3,6
chr18	47810251	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=195,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,3:3,2:5,3,2,3
chr18	47810731	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr18	47813835	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:2,0,6,0
chr18	47813985	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=179,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:47813985_A_AT:47813985:2,2,0,1
chr18	47813987	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=179,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:47813985_A_AT:47813985:2,2,0,1
chr18	47902163	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=121,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,2:14,0:14,9,1,1
chr18	47908556	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,21:0,0,15,28
chr18	48190271	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr18	48190440	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr18	48241552	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=123,39;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:3,8,1,1
chr18	48326352	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=224,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr18	48326378	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr18	48331428	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=152,153;MMQ=50,36;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48331428_TG_T:48331428:2,0,1,0
chr18	48331431	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=152,153;MMQ=50,36;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48331428_TG_T:48331428:2,0,1,0
chr18	48331451	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,2:2,1:0|1:48331451_G_A:48331451:6,0,4,1
chr18	48331457	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:4,2:4,2:0|1:48331451_G_A:48331451:7,1,4,1
chr18	48444592	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.086:32:13,0:17,2:6,24,0,2
chr18	48446953	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,25:0.510:49:11,14:13,11:11,13,12,13
chr18	48584855	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.681:16:1,3:1,3:1,4,5,6
chr18	50450240	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.440:32:7,7:10,6:3,15,1,13
chr18	50451821	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr18	50589905	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:0,0:3,0:0,6,0,3
chr18	50731802	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,3:4,2:0,4,0,5
chr18	50731823	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=157,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr18	50731829	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr18	50832102	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:2,3:2,5:0,5,1,7
chr18	50929098	.	CAAT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr18	50936783	.	TA	AT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=142,126;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:7,0:11,2,3,0
chr18	50936799	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=139,126;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,3:9,0:13,2,3,0
chr18	50994408	.	GAA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,1:3,0:0|1:50994408_GAA_G:50994408:2,4,1,1
chr18	50994415	.	AA	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:3,1:2,0:0|1:50994408_GAA_G:50994408:2,3,1,1
chr18	51053218	.	T	TCACCCCAGGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CACCCCAGGC;STR;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.589:3:0,2:1,0:0,1,0,2
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chr18	51807345	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr18	51820209	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:7,6:10,6:8,9,8,4
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chr18	51880986	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:6,3:9,12:0,15,0,15
chr18	51887245	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,143;MMQ=60,31;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:1,8,0,2
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chr18	51904461	.	C	CTTTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTA;STR;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.852:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr18	51904498	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,2:3,3:2,5,6,0
chr18	51904641	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:8,2:2,2:0|1:51904641_A_G:51904641:2,9,2,2
chr18	51904644	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:8,2:3,2:0|1:51904641_A_G:51904641:2,9,2,2
chr18	52265059	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:4,2:4,4:4,5,5,1
chr18	52551469	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=179,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr18	52555398	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,2:0,12:0,0,1,13
chr18	52571741	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr18	52575002	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.971:30:0,15:0,15:0,0,20,10
chr18	52585071	.	GACACACACACAC	G,GAC,GACAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,33,32,34;MFRL=108,170,165,192;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,7,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,9,10,11;RU=AC;STR;TLOD=5.36,4.06,19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,2,7:0.157,0.171,0.464:14:0,2,1,4:2,0,1,3:3,0,10,1
chr18	52608329	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,14:0,0,8,23
chr18	53131208	.	TGA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=150,147;MMQ=59,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=GA;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:1,0:2,2:4,0,3,0
chr18	53131242	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=110,151;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.240:29:6,0:13,1:8,13,8,0
chr18	53131488	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr18	53302845	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr18	54339977	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr18	54346482	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr18	54346510	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr18	54346745	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,2:1,3:0,1,0,8
chr18	54346757	.	T	TTTTACTGA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:0|1:54346757_T_TTTTACTGA:54346757:0,6,0,2
chr18	54346764	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:54346757_T_TTTTACTGA:54346757:0,6,0,2
chr18	54348514	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=148.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,25:0,21:0,0,34,12
chr18	54348650	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=136.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,17:0,21:0,0,14,24
chr18	54354074	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=115.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,14:0,10:0|1:54354074_C_T:54354074:0,0,21,5
chr18	54354076	.	T	TTC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=115.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0|1:54354074_C_T:54354074:0,0,21,5
chr18	54354239	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,0,18
chr18	54359062	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,12:0,0,2,15
chr18	54363747	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr18	54605672	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,16;MFRL=266,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:54605672_C_T:54605672:1,0,1,0
chr18	54605677	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=132,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:54605672_C_T:54605672:3,0,1,0
chr18	54605679	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=132,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:54605672_C_T:54605672:3,0,1,0
chr18	54694151	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr18	54694452	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr18	55027212	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,9:1,3:1,0,10,2
chr18	55143589	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr18	55144024	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=255,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.722:5:1,2:0,2:0|1:55144024_GA_G:55144024:0,1,0,4
chr18	55144035	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=255,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:55144024_GA_G:55144024:0,1,0,4
chr18	55144045	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=255,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,1:0|1:55144024_GA_G:55144024:0,1,0,3
chr18	55221983	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr18	55222262	.	GTGT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55222262_GTGT_G:55222262:0,0,0,1
chr18	55222268	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55222262_GTGT_G:55222262:0,0,0,1
chr18	55238580	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,5:4,3:5,0,7,1
chr18	55240455	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr18	55240681	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=234,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr18	55247454	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:2,8,0,4
chr18	55268866	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,4:8,3:8,3,5,2
chr18	55269777	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:0,7,0,7
chr18	55278759	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:11,5:3,5:14,0,10,0
chr18	55287739	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0,0,20,0
chr18	55288879	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr18	55319444	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,3:2,6:1,4,0,9
chr18	55334295	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,2:2,8:5,0,7,3
chr18	55338656	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=237,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:5,0,4,0
chr18	55338866	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:6,2:0,8:0,6,0,10
chr18	55352436	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr18	55352470	.	TTTA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr18	55361997	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=201,258;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:55361997_T_C:55361997:0,4,0,1
chr18	55362000	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=201,258;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:55361997_T_C:55361997:0,4,0,1
chr18	55362816	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr18	55364830	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0|1:55364830_G_A:55364830:0,0,14,5
chr18	55364852	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.961:24:0,10:0,13:0|1:55364830_G_A:55364830:0,0,15,9
chr18	55983330	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,11:1,1:0,6,2,10
chr18	56009125	.	C	CTATTTCCCTGTTCTACATCATTTTTCTTCGTAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=154,135;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.639:3:0,1:2,0:0|1:56009125_C_CTATTTCCCTGTTCTACATCATTTTTCTTCGTAGT:56009125:0,2,0,1
chr18	56009130	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=190,135;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56009125_C_CTATTTCCCTGTTCTACATCATTTTTCTTCGTAGT:56009125:0,1,0,1
chr18	56024396	.	ATT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:2,1:2,1:7,0,3,0
chr18	56054616	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr18	56054629	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:56054629_G_T:56054629:3,0,1,0
chr18	56054634	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,16;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:56054629_G_T:56054629:4,0,1,0
chr18	56054637	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:56054629_G_T:56054629:3,0,1,0
chr18	56054648	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,13;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:56054629_G_T:56054629:4,0,1,0
chr18	56118493	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	56182174	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,12,2
chr18	56191351	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr18	56196420	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:5,0:20,3:11,14,0,3
chr18	56196451	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:3,3:14,5:6,11,3,5
chr18	56202059	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr18	56204387	.	ACAGTTGATGTGTCCT	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,11:0.354:32:8,2:8,9:0|1:56204387_ACAGTTGATGTGTCCT_A:56204387:15,6,7,4
chr18	56204410	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.462:24:7,1:5,9:0|1:56204387_ACAGTTGATGTGTCCT_A:56204387:9,4,7,4
chr18	56204794	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,2:5,0:0|1:56204794_C_T:56204794:4,5,1,2
chr18	56204796	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:0|1:56204794_C_T:56204794:4,5,1,2
chr18	56205481	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	56247204	.	T	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,70;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.056:69:24,3:42,0:23,43,2,1
chr18	56274514	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=52,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr18	56279025	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,1,4
chr18	56390553	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:0,9:1,5:0,1,0,14
chr18	56401723	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr18	56807308	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=164.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,17:0,29:0,0,16,30
chr18	56807339	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,12:0,0,0,27
chr18	56819930	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:6,3:7,3:2,11,2,4
chr18	56823071	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:0,6,1,6
chr18	56897710	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=142,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:4,9,0,3
chr18	56980097	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	57000303	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:5,3:4,3:8,1,6,1
chr18	57000518	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.320:19:3,3:4,2:0,13,0,6
chr18	57014713	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.498:48:14,11:10,12:18,6,20,4
chr18	57014889	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=201,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr18	57021738	.	AAC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AC;STR;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:8,7:5,1:7,6,6,2
chr18	57106695	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,1:7,1:8,0,2,0
chr18	57115133	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr18	57115203	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr18	57134152	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr18	57136869	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=181,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,0:1,3:0,1,0,4
chr18	57136902	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr18	57147351	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.250:29:15,5:7,1:18,4,7,0
chr18	57147390	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.369:44:17,10:11,6:20,8,12,4
chr18	57567638	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,4:5,3,5,2
chr18	58039644	.	CTC	GGG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:5,1:6,7,2,0
chr18	59157764	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr18	59158065	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr18	59166798	.	T	TCAC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=101,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:59166798_T_TCAC:59166798:0,3,0,1
chr18	59166799	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=101,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:59166798_T_TCAC:59166798:0,3,0,1
chr18	59166800	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=101,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:59166798_T_TCAC:59166798:0,3,0,1
chr18	59166802	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=101,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:59166798_T_TCAC:59166798:0,3,0,1
chr18	59166805	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=101,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:59166798_T_TCAC:59166798:0,3,0,1
chr18	59174817	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:0,2,1,7
chr18	59195543	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:59195543_TC_T:59195543:0,1,0,1
chr18	59195547	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:59195543_TC_T:59195543:0,1,0,1
chr18	59203707	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,3:2,5:6,2,7,1
chr18	59206197	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,10:0,2:0,0,11,2
chr18	59217504	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,5:4,6:2,8,1,10
chr18	59739962	.	TA	T,TAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,20,29;MFRL=140,144,106;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=10.55,28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,7,19:0.200,0.502:36:5,2,11:5,2,7:0,10,4,22
chr18	59750036	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,1:7,2:0,17,0,3
chr18	59751715	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:3,5:5,6:8,1,11,0
chr18	59752346	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:18,2:15,2:31,2,4,0
chr18	59777011	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:6,5:7,0:12,1,5,0
chr18	59806190	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,5:6,4:12,0,10,0
chr18	59807635	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,26:0.565:46:12,14:7,11:14,6,14,12
chr18	59824490	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,0,4
chr18	59888806	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.088:31:16,0:12,2:0|1:59888806_T_C:59888806:0,29,0,2
chr18	59888808	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.085:32:16,0:12,2:0|1:59888806_T_C:59888806:0,30,0,2
chr18	59888815	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.085:35:15,0:12,2:0|1:59888806_T_C:59888806:0,33,0,2
chr18	59894428	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr18	59942746	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:0,1:6,1:1,8,0,3
chr18	59958678	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=227,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr18	60027149	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr18	60027171	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
chr18	60027361	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr18	60028862	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:15,1:7,1:20,2,2,0
chr18	60051941	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,1:4,7:9,2,7,1
chr18	60209709	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:9,12:3,6:9,3,9,9
chr18	60212013	.	ATG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:7,3:6,4:9,5,5,3
chr18	60225865	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=72.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.490:49:18,14:7,10:21,4,21,3
chr18	60227939	.	TAATTA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.540:24:7,4:3,7:0,11,1,12
chr18	60230191	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,4:2,6:2,1,8,2
chr18	60232383	.	ATACT	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TACT;STR;TLOD=42.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.407:30:7,6:11,6:0,18,0,12
chr18	60232405	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=102.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,16:0,0,0,28
chr18	60241197	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,5:4,3:5,0,8,0
chr18	60384301	.	C	CGGG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=199,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:60384301_C_CGGG:60384301:1,1,2,0
chr18	60384305	.	T	A,C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,13,12;MFRL=215,185,201;MMQ=60,60,60;MPOS=9,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.250,0.375:5:1,0,0:1,0,0:1,1,3,0
chr18	60384308	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=215,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,0:0|1:60384308_G_C:60384308:1,1,3,0
chr18	60384311	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=215,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:60384308_G_C:60384308:1,1,3,0
chr18	60384317	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=212,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:60384301_C_CGGG:60384301:2,1,1,0
chr18	60384320	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=212,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60384301_C_CGGG:60384301:2,1,1,0
chr18	60497522	.	CA	GG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=185,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:4,0:0,7,0,2
chr18	60497565	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=182,207;MMQ=24,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr18	60562957	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=183,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr18	60572437	.	GT	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=84.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,33:0.852:38:4,15:1,18:4,1,32,1
chr18	60646317	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=123,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.098:29:8,1:16,1:9,18,1,1
chr18	61022634	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr18	61067209	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=192,186;MMQ=46,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr18	61067230	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=171,203;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,2:8,1:19,0,3,0
chr18	61154388	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr18	61160385	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr18	61160387	.	G	GTGGGGCTGCCTACAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr18	61166269	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=155,142;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.422:24:7,5:7,4:0|1:61166269_C_T:61166269:14,0,10,0
chr18	61166273	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=155,153;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.281:19:7,4:5,1:0|1:61166269_C_T:61166269:14,0,5,0
chr18	61166280	.	GTA	G,GTATATATA,GTATATATATA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=35,35,33,32;MFRL=147,0,153,177;MMQ=60,60,40,60;MPOS=26,15,2;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,9,13,14;RU=TA;STR;TLOD=5.89,9.04,6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,5,3:0.147,0.226,0.151:21:5,2,3,3:4,1,2,0:10,0,9,2
chr18	61170467	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr18	61170500	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.658:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr18	61226740	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr18	61231142	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:4,0,1,0
chr18	61231417	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:0,3,0,8
chr18	61254525	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:6,1,4,2
chr18	61261515	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0|1:61261515_T_C:61261515:2,1,4,0
chr18	61261540	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:3,3:4,6:0|1:61261515_T_C:61261515:6,1,8,1
chr18	61261565	.	C	A,G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,32,26;MFRL=137,143,141;MMQ=60,60,60;MPOS=24,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.43,20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,8:0.150,0.450:17:3,0,1:4,2,6:7,0,7,3
chr18	61271065	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:3,0,5,0
chr18	61308895	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr18	61309139	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=127,181;MMQ=40,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:2,8,2,2
chr18	61322849	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.431:26:6,7:7,4:13,2,7,4
chr18	61324033	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,149;MMQ=59,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:6,5:4,2:9,1,8,0
chr18	61325694	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:6,6:11,5:16,1,10,1
chr18	61326597	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0|1:61326597_A_C:61326597:0,0,11,1
chr18	61326602	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0|1:61326597_A_C:61326597:0,0,13,1
chr18	61326609	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0|1:61326597_A_C:61326597:0,0,13,1
chr18	61326628	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=72.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,18,4
chr18	61377644	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:0,4,0,4
chr18	61388052	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr18	61390649	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=117,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr18	61459656	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=105,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,1:7,4:7,5,4,1
chr18	61465810	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,14:0,0,22,3
chr18	61468306	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr18	61558656	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:3,3:5,3:6,2,3,3
chr18	61558878	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=167,7593933;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:61558878_C_T:61558878:0,2,1,1
chr18	61558882	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=167,7593933;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:61558878_C_T:61558878:0,2,1,1
chr18	61562690	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr18	61564513	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=126,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.612:11:1,1:3,5:1,3,0,7
chr18	61564532	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr18	61569819	.	TTTAAGTTTCTGGGGC	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.504:10:3,3:2,2:0,5,1,4
chr18	61569849	.	GTGAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGAGA;STR;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr18	61575166	.	AT	A,ATT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,33,32;MFRL=144,178,132;MMQ=60,60,60;MPOS=14,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=5.29,12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,12:0.159,0.420:28:6,3,6:6,1,3:10,2,13,3
chr18	61575188	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.131:43:18,0:9,0:24,12,7,0
chr18	61584642	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.489:35:8,9:9,7:16,2,12,5
chr18	61585145	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:3,0,2,2
chr18	61602390	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=158,76;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:7,6,2,0
chr18	61621688	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=141,123;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,0:12,2:18,9,1,1
chr18	63477317	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,18;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:1,0:1,1:2,0,0,3
chr18	63526097	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,64;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:11,4:14,0:25,1,4,0
chr18	63548184	.	AATAAAATG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,0:4,3:0,7,0,3
chr18	64172598	.	A	ATCGCTGGTATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64172598_A_ATCGCTGGTATT:64172598:0,2,0,1
chr18	64172602	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:64172598_A_ATCGCTGGTATT:64172598:0,2,0,1
chr18	64178890	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.344:47:9,11:21,4:13,18,6,10
chr18	66367726	.	TA	T,TAA	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=30,30,20;MFRL=165,183,88;MMQ=60,60,60;MPOS=25,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=17.02,10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,12,11:0.243,0.209:49:11,4,6:8,6,3:1,25,2,21
chr18	66504351	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:9,16:10,4:11,8,8,12
chr18	66504533	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:20,0:24,3:24,20,0,3
chr18	66513471	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,8:0,0,20,0
chr18	66513662	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=146.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,21:0,26:0,0,10,39
chr18	66513749	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr18	66678131	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr18	67068605	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=14,16;MFRL=125,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.516:6:0,1:1,0:1,2,0,3
chr18	67365577	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:67365577_G_A:67365577:0,0,2,1
chr18	67365585	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:67365577_G_A:67365577:0,0,2,1
chr18	67508718	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr18	67613926	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr18	67614674	.	T	TA,TAA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=165,160,100;MMQ=60,60,60;MPOS=17,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=57.45,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,26,3:0.746,0.106:34:1,11,1:4,14,2:3,2,3,26
chr18	67685007	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr18	67698011	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=223,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr18	67727003	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr18	67733234	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,0,12
chr18	67741117	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr18	67741309	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr18	67742801	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=93.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.970:27:0,12:0,14:0,0,2,25
chr18	67759549	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr18	67776970	.	GG	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr18	67809632	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.697:1:0,1:0,0:0|1:67809632_CAA_C:67809632:0,0,0,1
chr18	67809647	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:67809632_CAA_C:67809632:0,0,0,1
chr18	67812773	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr18	67812951	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=129,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:13,2:17,0:16,15,2,0
chr18	67817744	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,14,0
chr18	67818046	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,0,24
chr18	67818066	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr18	67860434	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=112,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:67860434_G_A:67860434:3,0,1,0
chr18	67860438	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=112,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:67860434_G_A:67860434:3,0,1,0
chr18	67860719	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr18	67863850	.	T	TCTC	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=155.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,24:0,11:0,0,6,29
chr18	67996334	.	G	GT	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.084:45:16,1:22,2:0|1:67996334_G_GT:67996334:21,21,1,2
chr18	67996335	.	C	CTATGATCAT	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:17,1:22,2:0|1:67996334_G_GT:67996334:22,21,1,2
chr18	70416367	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=208,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,4:1,4:1,1,1,8
chr18	70423192	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,6:2,4:4,0,10,0
chr18	70451150	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=151,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:10,2:0|1:70451150_C_A:70451150:3,10,1,1
chr18	70451155	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=152,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:9,2:0|1:70451150_C_A:70451150:3,9,1,1
chr18	70451160	.	A	AAAT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=152,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:8,2:0|1:70451150_C_A:70451150:1,8,1,1
chr18	70531961	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr18	71740912	.	C	CACACACATGCACGTGCACACACACACACA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.111:28:7,2:16,0:7,19,0,2
chr18	71749359	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=182,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr18	71803119	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:3,0:1,0:0,8,0,3
chr18	71803129	.	A	AACTCTACAGTAATTCCCTAGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=180,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr18	71920966	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr18	71930734	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,7:0,0,0,15
chr18	71930758	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr18	72103646	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr18	72103961	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,77;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:8,12,0,2
chr18	72109428	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	72167124	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:6,6:5,6:11,0,13,0
chr18	72168486	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=203,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr18	72168608	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.486:41:12,7:9,12:16,5,14,6
chr18	72173270	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=228,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:72173270_GC_G:72173270:0,3,0,4
chr18	72173278	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=240,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0|1:72173270_GC_G:72173270:0,2,0,4
chr18	72179579	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr18	72180739	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr18	72183665	.	T	TCAAGTGACTTACACAAGGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,16;MFRL=222,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:0,0:2,0:0,3,0,1
chr18	72185688	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr18	72185972	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr18	72186175	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,7,2
chr18	72226504	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr18	72226539	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
chr18	72245660	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr18	72247278	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr18	72250762	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,11,2
chr18	72493314	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,23:0.366:63:17,11:22,11:40,0,23,0
chr18	72593118	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr18	72921107	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=207,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr18	72998268	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:6,3:2,10:2,6,7,6
chr18	72998526	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,4:5,5:3,3,4,5
chr18	73001041	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.360:18:7,1:3,4:10,2,4,2
chr18	73001990	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=196,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr18	73130705	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=121,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.334:22:6,4:8,3:11,4,5,2
chr18	73139335	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=209,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr18	74090957	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr18	74091311	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:9,0:16,2:14,13,0,2
chr18	74153146	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr18	74591992	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.793:19:2,7:2,7:4,0,15,0
chr18	74611194	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr18	74622216	.	C	CTGGATAAAATGCAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74622216_C_CTGGATAAAATGCAGG:74622216:0,1,0,1
chr18	74622219	.	T	TACCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:74622216_C_CTGGATAAAATGCAGG:74622216:0,1,0,1
chr18	74637067	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr18	74680114	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr18	74680369	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	74692336	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:5,7:11,8:10,6,11,4
chr18	74702113	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.542:9:0,1:4,2:0,4,0,5
chr18	74778391	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,6:5,4:0,12,0,10
chr18	76753588	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	76754466	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr18	76754478	.	CCC	GGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=168,153;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,2,0
chr18	76757415	.	T	TAGAATAAAATCCAACTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	77102423	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:0,2:3,1:1,3,0,3
chr18	77107934	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr18	77108248	.	GAAAAA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=206,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=A;STR;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.626:11:1,2:1,1:0|1:77108248_GAAAAA_G:77108248:0,4,0,7
chr18	77108254	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=206,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.626:11:1,2:2,0:0|1:77108248_GAAAAA_G:77108248:0,4,0,7
chr18	77132755	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,2:0,5:4,0,7,0
chr18	77132793	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:4,5:4,4:8,0,8,2
chr18	77135472	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,3:5,6:0,8,0,9
chr18	77137202	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr18	77156449	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=240,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr18	77210902	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,20,1
chr18	77211195	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr18	77227678	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,3:3,4:0,3,0,7
chr18	77246978	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr18	77458037	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.375:17:7,3:2,3:1,10,1,5
chr18	77464898	.	GT	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=152,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:77464898_GT_TG:77464898:0,2,1,2
chr18	77464901	.	C	CTGACCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=156,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:77464898_GT_TG:77464898:0,3,1,1
chr18	77464902	.	GC	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=96,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:77464898_GT_TG:77464898:1,3,0,1
chr18	77470451	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,6:5,3:3,9,4,5
chr18	77663896	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr18	77694128	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr18	77703299	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,1:2,3:2,4,3,1
chr18	77703476	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:3,6,0,5
chr18	77726544	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:4,1:3,1:7,3,2,1
chr18	77728045	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr18	77730585	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr18	77794410	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=212,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr18	77797321	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr18	77798432	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=18,20;MFRL=117,221;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,1:0|1:77798432_C_A:77798432:1,0,2,0
chr18	77798434	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=23,14;MFRL=166,226;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:77798434_TC_AA:77798434:2,0,1,0
chr18	77798435	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=34,10;MFRL=117,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:77798435_C_A:77798435:1,0,1,0
chr18	77798437	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=34,10;MFRL=117,221;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:77798432_C_A:77798432:1,0,2,0
chr18	77798442	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=25,18;MFRL=166,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:77798434_TC_AA:77798434:2,0,1,0
chr18	77798447	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=32,16;MFRL=129,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:77798435_C_A:77798435:3,0,1,0
chr18	77798451	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=29,15;MFRL=129,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:77798435_C_A:77798435:3,0,1,0
chr18	77798453	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=30,15;MFRL=129,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:77798435_C_A:77798435:3,0,1,0
chr18	77798456	.	GA	TT	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=33,15;MFRL=129,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:77798435_C_A:77798435:3,0,1,0
chr18	77798461	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=187,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,1:2,1,3,0
chr18	77802269	.	A	ATTCTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:77802269_A_ATTCTTTTTT:77802269:0,4,0,1
chr18	77802272	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:77802269_A_ATTCTTTTTT:77802269:0,4,0,1
chr18	77802297	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=196,175;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr18	77805715	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:7,0,4,1
chr18	77891023	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:11,8,1,1
chr18	77926862	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:4,6:3,4:2,6,6,4
chr18	77927028	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=114,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:4,5,0,2
chr18	77927112	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr18	77935855	.	T	TAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=AC;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr19	281360	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:2,2:3,4,3,0
chr19	281376	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.706:15:2,5:2,5:0|1:281376_C_T:281376:4,0,6,5
chr19	281383	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.722:16:2,7:2,5:0|1:281376_C_T:281376:4,0,7,5
chr19	287970	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	367313	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	371396	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	372551	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr19	373618	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,2:1,4:0,3,0,6
chr19	373646	.	G	GTTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:373646_G_GTTC:373646:1,3,0,1
chr19	373648	.	G	GCTTGTGTAACAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:373646_G_GTTC:373646:1,3,0,1
chr19	373651	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:373646_G_GTTC:373646:1,3,0,1
chr19	374087	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=188,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:374087_C_CA:374087:0,4,0,1
chr19	374090	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=188,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:374087_C_CA:374087:0,4,0,1
chr19	374492	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	407254	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:3,0:2,7,1,1
chr19	419157	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	430766	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,2:7,0:7,14,2,0
chr19	438868	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:2,3,5,2
chr19	439055	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:1,6:1,2:2,0,2,7
chr19	439100	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=197,163;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:439100_G_A:439100:0,1,0,1
chr19	439102	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=197,163;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:439100_G_A:439100:0,1,0,1
chr19	439105	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=197,163;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:439100_G_A:439100:0,1,0,1
chr19	439108	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=197,163;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:439100_G_A:439100:0,1,0,1
chr19	439111	.	C	CTGAACAA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=26,35;MFRL=197,163;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:439100_G_A:439100:0,1,0,1
chr19	439113	.	G	GTCAGAAGTAGCA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=197,163;MMQ=60,44;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:439100_G_A:439100:0,1,0,1
chr19	439115	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=197,163;MMQ=60,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:439100_G_A:439100:0,1,0,1
chr19	460475	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	463810	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=179,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr19	504830	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.390:24:6,4:6,5:8,7,7,2
chr19	507450	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=250,241;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr19	519032	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:519032_T_G:519032:0,0,0,1
chr19	519053	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:519032_T_G:519032:0,0,0,1
chr19	536011	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:536011_G_GA:536011:0,0,0,1
chr19	536013	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:536011_G_GA:536011:0,0,0,1
chr19	536437	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	544212	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=74,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr19	547224	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr19	549041	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.568:26:6,2:5,12:9,2,11,4
chr19	549595	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr19	580534	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=172,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:580534_C_A:580534:0,1,0,1
chr19	580535	.	A	ATATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=172,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:580534_C_A:580534:0,1,0,1
chr19	581434	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=156,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:7,0:8,8,1,1
chr19	581448	.	C	CCTCAGTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:4,5,1,1
chr19	582253	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,6:2,7:4,3,7,6
chr19	582468	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:5,0,5,1
chr19	582505	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.379:24:7,3:8,5:8,7,8,1
chr19	582693	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=208,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:0,5,0,5
chr19	603460	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr19	603513	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=181,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,1:3,3:3,3,2,2
chr19	604988	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=239,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr19	605255	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=168,273;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr19	610243	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:7,9:4,6:8,3,10,5
chr19	613827	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=21,19;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:1,1:6,0,2,0
chr19	613879	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:8,0:7,0:0|1:613879_G_C:613879:13,4,3,0
chr19	613881	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:5,1:6,0:0|1:613879_G_C:613879:13,6,3,0
chr19	613883	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:7,0:10,0:0|1:613879_G_C:613879:13,6,3,0
chr19	613898	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,13:0,0,19,10
chr19	617195	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:617195_C_T:617195:0,0,2,1
chr19	617205	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:617195_C_T:617195:0,0,2,1
chr19	617963	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr19	618482	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:17,1:7,1:21,3,2,0
chr19	618854	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:2,1,4,0
chr19	619021	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=141.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,46:0.959:47:1,21:0,24:0,1,18,28
chr19	619574	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr19	619772	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,1,15
chr19	619913	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	623003	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,3:4,3:0,4,0,6
chr19	623083	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	624683	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,8,3
chr19	625081	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,11:0,0,15,3
chr19	629438	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=301,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	629503	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr19	633381	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=128.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,18:0,21:0,0,33,8
chr19	633529	.	G	GGCGCCGCCGCCGCCGCCGCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=57.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,7:0,0,0,13
chr19	648779	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=188,195;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr19	651754	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=122,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:2,4,2,2
chr19	652206	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,3:1,3:3,0,5,2
chr19	652238	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,4:7,1:8,4,5,0
chr19	652739	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,11,1
chr19	685985	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	726910	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=108,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr19	726985	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=30,16;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,0:0|1:726985_A_C:726985:1,2,3,0
chr19	726990	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,2:0|1:726985_A_C:726985:1,2,3,0
chr19	726994	.	GG	CC	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=133,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:1,3:0|1:726985_A_C:726985:2,2,3,0
chr19	726999	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=124,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:1,0:0|1:726985_A_C:726985:1,3,3,0
chr19	727004	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=124,188;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:1,2:0|1:726985_A_C:726985:1,3,3,0
chr19	727006	.	AG	CC	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=31,12;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:1,0:0|1:726985_A_C:726985:2,3,3,0
chr19	727544	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=121,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,3,1
chr19	731055	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:14,8:9,9:9,15,10,7
chr19	731077	.	GG	CT	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=113.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,30:0.544:55:16,15:8,13:10,15,15,15
chr19	734304	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:734304_G_A:734304:0,2,0,1
chr19	734311	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:734304_G_A:734304:0,2,0,1
chr19	734319	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:734304_G_A:734304:0,2,0,1
chr19	740560	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr19	757159	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr19	757959	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=365,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	805441	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:6,3:11,2:11,6,4,1
chr19	808473	.	C	CG	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,10;MFRL=161,158;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.204:12:5,0:3,0:0|1:808473_C_CG:808473:2,8,0,2
chr19	808474	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:3,4:7,2:2,9,1,5
chr19	808478	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,1:2,2:2,8,0,3
chr19	808481	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,13;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.372:11:4,0:1,0:0|1:808473_C_CG:808473:2,5,0,4
chr19	808488	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=22,12;MFRL=203,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.559:8:2,0:0,0:0|1:808473_C_CG:808473:1,3,0,4
chr19	808493	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=229,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.614:8:2,0:0,1:1,2,0,5
chr19	815086	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,1,2
chr19	821442	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.409:5:1,0:1,0:0|1:821442_A_C:821442:3,0,2,0
chr19	821452	.	TCTCCCC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:821442_A_C:821442:3,0,1,0
chr19	821459	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:821442_A_C:821442:2,0,1,0
chr19	827975	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=145,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	829723	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:1,4,2,3
chr19	829789	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:4,0:0,1:0|1:829789_CA_C:829789:0,4,0,1
chr19	829791	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:829789_CA_C:829789:0,4,0,1
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chr19	844077	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=192,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr19	855465	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	859831	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	869055	.	A	AGGTGAGGGGCCCCCGGAACCGCTGAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	871033	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.440:22:4,5:8,2:9,3,6,4
chr19	899567	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:11,11:6,1:3,14,4,8
chr19	901955	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:5,1:5,3:10,1,4,0
chr19	920642	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	960187	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr19	960266	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	964434	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr19	966884	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=46,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:966884_C_CT:966884:0,2,0,1
chr19	966885	.	C	CAGCCTCCTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=46,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:966884_C_CT:966884:0,2,0,1
chr19	966891	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	966966	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	968318	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=166,162;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr19	968345	.	CA	TG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,3:0,9:0,0,11,1
chr19	968358	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=172,174;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:6,2:11,1,3,0
chr19	985997	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:8,2:2,5:0,10,1,7
chr19	991196	.	CGT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0|1:991196_CGT_C:991196:0,0,7,4
chr19	991199	.	CCCAGG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0|1:991196_CGT_C:991196:0,0,7,4
chr19	991374	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.390:10:2,0:4,2:0,6,0,4
chr19	1008358	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	1008801	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=11,18;MFRL=189,156;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:1,0:0,0:0|1:1008801_C_G:1008801:2,1,2,0
chr19	1008805	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=11,18;MFRL=189,156;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:1,0:0,0:0|1:1008801_C_G:1008801:2,1,2,0
chr19	1008807	.	G	GGGCC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=189,156;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:2,1:1,0:0|1:1008801_C_G:1008801:2,1,2,0
chr19	1008812	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=187,156;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:1,1:0|1:1008801_C_G:1008801:4,1,2,0
chr19	1008821	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=173,139;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:1008801_C_G:1008801:3,1,1,0
chr19	1008832	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=27,19;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:3,0:3,3,2,0
chr19	1010396	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=204,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr19	1010691	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	1011823	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,9:0,0,5,14
chr19	1011846	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:0,7,1,5
chr19	1011999	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:4,5:2,3:0|1:1011999_A_G:1011999:6,1,7,1
chr19	1012002	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.530:15:5,5:2,3:0|1:1011999_A_G:1011999:6,1,7,1
chr19	1012440	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr19	1012611	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr19	1013148	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=149,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,1:2,1,2,0
chr19	1013347	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,3:7,8:1,10,1,10
chr19	1013373	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,2:4,6:0,8,0,9
chr19	1014537	.	ACGTGATGGGG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=172,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGTGATGGGG;STR;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.570:23:4,5:4,6:0,10,0,13
chr19	1020673	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	1031212	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=119,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,9:1,7:0,1,0,16
chr19	1032369	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,4,8
chr19	1037640	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,5:0.082:71:27,5:31,0:0|1:1037640_C_T:1037640:41,25,5,0
chr19	1037645	.	AC	A	.	.	DP=79;ECNT=13;MBQ=28,30;MFRL=124,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,6:0.085:78:31,6:32,0:0|1:1037640_C_T:1037640:41,31,5,1
chr19	1037670	.	A	G	.	.	DP=84;ECNT=13;MBQ=32,32;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,9:0.114:82:36,9:33,0:36,37,5,4
chr19	1037679	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,9:0.114:86:37,8:33,0:0|1:1037679_C_T:1037679:39,38,5,4
chr19	1037681	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=13;MBQ=29,31;MFRL=140,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,9:0.115:85:38,9:31,0:0|1:1037679_C_T:1037679:39,37,5,4
chr19	1037715	.	TG	CA	.	.	DP=63;ECNT=13;MBQ=31,33;MFRL=151,110;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,6:0.111:61:25,5:25,1:0|1:1037715_TG_CA:1037715:25,30,0,6
chr19	1037718	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=151,110;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,6:0.111:61:26,4:27,1:0|1:1037715_TG_CA:1037715:25,30,0,6
chr19	1037731	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=29,32;MFRL=160,136;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.112:47:16,3:24,1:18,24,0,5
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chr19	1037756	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=168,141;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,5:0.107:54:23,3:22,2:0|1:1037749_G_A:1037749:18,31,1,4
chr19	1037766	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:23,2:20,1:0|1:1037749_G_A:1037749:15,30,1,2
chr19	1037781	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=13;MBQ=33,29;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:25,2:18,1:0|1:1037781_C_A:1037781:18,27,1,2
chr19	1037791	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=13;MBQ=33,29;MFRL=165,161;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:27,0:17,1:0|1:1037781_C_A:1037781:19,26,1,1
chr19	1037932	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,1,15
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chr19	1043501	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,10;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.312:11:4,0:1,0:3,5,0,3
chr19	1044753	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	1044975	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=216,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,1:1,3:1,0,5,0
chr19	1048807	.	C	CA	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=162,135;MMQ=49,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.243:29:4,1:18,6:22,0,7,0
chr19	1048823	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=20,14;MFRL=144,142;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.211:41:4,0:12,2:25,7,9,0
chr19	1049012	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,10:0,13:0,0,1,23
chr19	1049165	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr19	1050874	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr19	1053677	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr19	1056018	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr19	1056425	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:2,8,0,2
chr19	1056911	.	C	CAGGGG	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=93,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.092:41:18,3:20,0:0|1:1056911_C_CAGGGG:1056911:18,20,1,2
chr19	1056912	.	C	CAA	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=93,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.092:41:18,2:20,0:0|1:1056911_C_CAGGGG:1056911:18,20,1,2
chr19	1056913	.	T	TTTAGGGATGAGGGTG	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=94,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.090:42:17,2:19,0:0|1:1056911_C_CAGGGG:1056911:18,21,1,2
chr19	1063443	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	1065018	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr19	1065197	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=92.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,20,6
chr19	1073409	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	1074064	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,13:0,13:0,0,16,11
chr19	1074252	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,14:0,0,14,12
chr19	1078101	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,1:7,5:0,12,0,6
chr19	1078129	.	GTTTTTGTT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTTGTT;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.523:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr19	1080189	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr19	1081120	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr19	1081462	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:2,3:3,0,4,0
chr19	1085877	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:11,3:4,6:11,4,7,2
chr19	1086043	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,1:1,1:0,4,0,3
chr19	1090020	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr19	1090803	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	1091949	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	1095151	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,11:0,0,22,0
chr19	1095336	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.466:49:15,10:11,11:2,24,8,15
chr19	1095352	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,22:0.588:37:6,12:6,8:0|1:1095352_C_G:1095352:4,11,1,21
chr19	1095355	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,22:0.603:36:6,11:6,5:0|1:1095352_C_G:1095352:4,10,1,21
chr19	1095430	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=190,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:10,2:5,1:0,16,0,3
chr19	1111054	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	1111588	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,135;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.106:36:13,0:15,3:18,15,0,3
chr19	1111954	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=44,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:1111954_T_C:1111954:0,2,1,0
chr19	1111960	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=44,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:1111954_T_C:1111954:1,3,1,0
chr19	1111961	.	G	GGGCCCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,10;MFRL=44,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:1111954_T_C:1111954:1,3,1,0
chr19	1119469	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:1,0:3,1:0|1:1119469_T_C:1119469:2,3,2,0
chr19	1119474	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:2,3:0|1:1119469_T_C:1119469:0,4,4,0
chr19	1119481	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.374:10:1,0:5,1:0|1:1119469_T_C:1119469:2,4,4,0
chr19	1119484	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=188,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.279:10:1,0:6,1:0|1:1119469_T_C:1119469:2,5,3,0
chr19	1147427	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1147427_G_A:1147427:0,0,0,1
chr19	1147431	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1147427_G_A:1147427:0,0,0,1
chr19	1207238	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=127,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.435:27:9,6:6,2:1,14,2,10
chr19	1219274	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.437:22:8,3:4,3:10,2,10,0
chr19	1219443	.	G	GCGGGGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGGGGGC;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.353:4:1,1:0,0:0,3,1,0
chr19	1231322	.	C	CTACATGGAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	1233706	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	1244080	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,1:5,1:7,7,2,0
chr19	1251781	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.413:20:3,5:7,3:3,9,5,3
chr19	1254122	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr19	1271274	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.532:26:6,9:6,4:8,4,7,7
chr19	1271529	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,3:7,4:5,4,4,3
chr19	1277275	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:6,7:10,2:9,7,4,5
chr19	1278665	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr19	1358572	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	1364472	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:11,2:17,1:27,1,3,0
chr19	1366422	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr19	1367238	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.092:52:23,0:23,4:0|1:1367238_G_A:1367238:17,31,0,4
chr19	1367240	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.093:52:24,0:24,4:0|1:1367238_G_A:1367238:17,31,0,4
chr19	1391235	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,10:0,0,3,23
chr19	1393148	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	1395487	.	GCGC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CGC;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:6,1:7,1:0,13,0,2
chr19	1418442	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=286,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:1418442_A_T:1418442:1,0,0,1
chr19	1418444	.	T	TTTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=286,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1418442_A_T:1418442:1,0,0,1
chr19	1418447	.	G	GTTTTATTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=286,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:1418442_A_T:1418442:1,0,0,1
chr19	1422299	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=100,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:3,4:1,5:4,0,8,1
chr19	1429037	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=171,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,0,5
chr19	1456806	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=204,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr19	1457875	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=19,34;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr19	1457897	.	GACCTT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=18,35;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:1457897_GACCTT_G:1457897:1,0,1,0
chr19	1457903	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1457897_GACCTT_G:1457897:1,0,1,0
chr19	1457907	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1457897_GACCTT_G:1457897:1,0,1,0
chr19	1466647	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	1487083	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr19	1487561	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr19	1488147	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=131,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:0,1:3,2,1,1
chr19	1489770	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.597:20:3,3:4,9:5,3,7,5
chr19	1490377	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=232,292;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	1495634	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,0:4,5:3,1,0,5
chr19	1496263	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	1496716	.	TGC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GC;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr19	1496729	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=193,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:1496729_G_T:1496729:0,2,0,1
chr19	1496734	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=193,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1496729_G_T:1496729:0,2,0,1
chr19	1497138	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:1497138_T_G:1497138:0,0,2,0
chr19	1497141	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0|1:1497138_T_G:1497138:0,0,2,0
chr19	1497147	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1497138_T_G:1497138:0,0,1,0
chr19	1497153	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1497138_T_G:1497138:0,0,1,0
chr19	1497157	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1497138_T_G:1497138:0,0,1,0
chr19	1497543	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.453:16:4,5:3,2:5,4,4,3
chr19	1506710	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=275,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:1,7:0,10:0,1,7,10
chr19	1507483	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr19	1507535	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr19	1507710	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:0,2,0,8
chr19	1555551	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=187,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,2,2
chr19	1578387	.	C	CCCGGGTTTTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	1619749	.	A	AGGGTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGTG;STR;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,1:2,3:3,0,6,0
chr19	1650134	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,2:1,2:6,0,4,0
chr19	1784890	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,5:4,4:4,3,1,8
chr19	1784944	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:2,2,0,2
chr19	1789016	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=100,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,3:0,4:2,1,2,5
chr19	1790921	.	C	CTCAAGTTGCTTCAAACGGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=127,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	1792147	.	C	CAAGAGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=171,101;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.483:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr19	1792150	.	G	GGGGT,GAACCAGCTTCCTTCGTATAACGAGGGGATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34,33;MFRL=0,177,101;MMQ=60,60,48;MPOS=3,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.76,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.405,0.396:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr19	1792152	.	G	GGGGAGGGCTGAGCCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=101,177;MMQ=48,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr19	1802117	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1802117_C_CA:1802117:0,1,0,1
chr19	1802119	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1802117_C_CA:1802117:0,1,0,1
chr19	1802405	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,21;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1802405_T_TGC:1802405:0,1,1,0
chr19	1802406	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=16,10;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:1802405_T_TGC:1802405:0,1,1,0
chr19	1802410	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=51,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1802405_T_TGC:1802405:0,2,1,0
chr19	1802414	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=51,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:1802405_T_TGC:1802405:0,2,1,0
chr19	1802419	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=51,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:1,0:0|1:1802405_T_TGC:1802405:0,2,1,0
chr19	1805887	.	C	CTGGACTGTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=151,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,2:0|1:1805887_C_CTGGACTGTA:1805887:9,4,1,1
chr19	1805889	.	G	GTAGACCTACTAAAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=151,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,1:0|1:1805887_C_CTGGACTGTA:1805887:9,4,1,1
chr19	1806210	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr19	1806242	.	G	GCAGCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=76,243;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr19	1806667	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.635:14:1,2:3,7:3,2,6,3
chr19	1810605	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,36;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,4:5,0:2,5,0,4
chr19	1817134	.	C	CCCAGATGGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCAGATGGGG;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,1:1,0,4,0
chr19	1818403	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:5,3:7,3:12,1,6,0
chr19	1818459	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=144,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.378:24:5,3:10,5:8,7,8,1
chr19	1818952	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,10,3
chr19	1819917	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.358:24:4,0:5,1:14,1,9,0
chr19	1819937	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=152,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:15,3:11,0:26,1,2,1
chr19	1825927	.	TCTC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:10,5:7,5:10,7,6,5
chr19	1848243	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr19	1854557	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=158,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr19	1905356	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:3,5:4,5:7,0,9,2
chr19	1905523	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:2,3:4,3:0,8,1,7
chr19	1908423	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=101,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:1,3:4,4:4,1,7,0
chr19	1914940	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:3,1,3,1
chr19	1915118	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr19	1924050	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr19	1924076	.	TC	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr19	1952841	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,17,4
chr19	1954126	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:1954126_C_CA:1954126:0,0,0,3
chr19	1954128	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:1954126_C_CA:1954126:0,0,0,3
chr19	1970008	.	C	CAGGGCGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	1980075	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.444:12:2,1:1,1:3,4,0,5
chr19	1987469	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	1992997	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1992997_G_C:1992997:0,0,1,0
chr19	1993000	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,10;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1992997_G_C:1992997:0,0,1,0
chr19	1993003	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,18;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:1992997_G_C:1992997:1,0,1,0
chr19	1993005	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,14;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:1992997_G_C:1992997:1,0,1,0
chr19	1993013	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1992997_G_C:1992997:1,0,1,0
chr19	1993017	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:1992997_G_C:1992997:1,0,1,0
chr19	1997438	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:6,5:3,5,2,6
chr19	1997467	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=189,116;MMQ=60,56;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,0:5,2:2,7,0,2
chr19	2037649	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=18,20;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:1,0:9,0,3,0
chr19	2037834	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,10;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.338:30:4,0:7,0:4,15,0,11
chr19	2037846	.	A	C,AC	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,34,29;MFRL=0,142,135;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=58.76,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,21,4:0.808,0.159:25:0,11,1:0,9,3:0,0,3,22
chr19	2039954	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr19	2041032	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=171,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,5:3,1:10,0,6,0
chr19	2042886	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	2043044	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,10;MFRL=193,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.413:12:4,0:3,0:7,0,5,0
chr19	2043271	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,2:1,5:0,5,0,7
chr19	2046770	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:3,1:0,10,0,2
chr19	2050823	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,2:6,5:7,6,5,2
chr19	2073466	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=114,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:5,3:2,2:2,5,0,5
chr19	2078176	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,17:0.357:48:16,6:14,10:24,7,10,7
chr19	2097365	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.203:16:9,1:4,0:0|1:2097365_A_C:2097365:0,13,3,0
chr19	2097369	.	CGGGA	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.218:15:9,1:2,1:0|1:2097365_A_C:2097365:0,12,3,0
chr19	2097375	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,1:2,1:0|1:2097365_A_C:2097365:0,10,2,0
chr19	2097380	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:2,0:0|1:2097365_A_C:2097365:0,12,2,0
chr19	2097384	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,1:2,1:0|1:2097365_A_C:2097365:1,13,2,0
chr19	2097387	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:11,0:2,1:0|1:2097365_A_C:2097365:1,12,2,0
chr19	2109019	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr19	2109071	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,3:2,3:6,2,6,0
chr19	2109812	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr19	2109988	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=127,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.534:20:4,5:5,3:2,7,2,9
chr19	2110019	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.592:12:0,4:3,3:0,5,0,7
chr19	2110108	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=117,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:1,1,4,2
chr19	2111382	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,3:4,3:1,7,4,3
chr19	2111397	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.312:11:4,2:2,1:1,7,2,1
chr19	2113301	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:8,1:1,6:6,3,6,2
chr19	2113377	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:8,0:4,3:12,0,0,3
chr19	2114175	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.255:40:15,4:15,5:19,11,5,5
chr19	2115439	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:2,1,5,0
chr19	2115493	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:3,2:3,2:5,2,2,2
chr19	2116635	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:12,2:0|1:2116635_G_A:2116635:17,0,2,0
chr19	2116649	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.636:19:1,5:4,7:0|1:2116635_G_A:2116635:7,0,11,1
chr19	2116760	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,21:0.537:39:9,14:7,7:0|1:2116760_A_G:2116760:6,12,6,15
chr19	2116764	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,20:0.525:38:11,13:7,4:0|1:2116760_A_G:2116760:6,12,6,14
chr19	2121316	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:2,3:1,5,0,8
chr19	2123328	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=106,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.277:26:11,1:8,5:11,8,2,5
chr19	2123506	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=199,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.594:3:1,2:0,0:0|1:2123506_C_T:2123506:0,1,0,2
chr19	2123515	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:2123515_C_CA:2123515:0,3,0,1
chr19	2123516	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.487:4:1,2:1,0:0|1:2123506_C_T:2123506:0,2,0,2
chr19	2123520	.	AC	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:2123515_C_CA:2123515:0,3,0,1
chr19	2123928	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr19	2129473	.	TC	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,1,2
chr19	2137870	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=128,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0,5,1,2
chr19	2206614	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=187,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr19	2206691	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=130,82;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,3:9,0:14,9,3,0
chr19	2208859	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr19	2211050	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,5:4,2:9,0,7,0
chr19	2213703	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:9,1:2,4:1,10,0,5
chr19	2220254	.	TCTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=182,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,0,1
chr19	2226719	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=172,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr19	2227495	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	2235777	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,2:12,0:19,9,0,2
chr19	2244711	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:7,2:5,0:7,5,1,1
chr19	2244903	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	2246652	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr19	2255336	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=204,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:1,1:0,10:0,1,1,11
chr19	2271282	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr19	2271323	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr19	2271577	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,8:0,1:0,0,2,7
chr19	2271741	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr19	2291501	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,0,4
chr19	2328281	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	2328534	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,137;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,0:4,3:1,10,0,3
chr19	2337377	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr19	2340046	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:3,2:2,0:0,5,0,3
chr19	2340154	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	2340235	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	2341060	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	2389954	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:2389954_G_A:2389954:0,0,0,10
chr19	2389958	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:2389954_G_A:2389954:0,0,0,10
chr19	2396711	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=196,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:2396711_C_A:2396711:0,4,0,1
chr19	2396712	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=196,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:2396711_C_A:2396711:0,4,0,1
chr19	2396714	.	G	GAGAAGGATATACA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=196,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:2396711_C_A:2396711:0,4,0,1
chr19	2396717	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=196,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:2396711_C_A:2396711:0,4,0,1
chr19	2402116	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr19	2402135	.	CG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=164,139;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr19	2405605	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2405605_G_T:2405605:0,3,0,1
chr19	2405608	.	C	CTTTAAAGGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2405605_G_T:2405605:0,3,0,1
chr19	2405641	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	2425259	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	2477654	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:1,8,0,2
chr19	2477665	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:0,2:3,1:0,4,0,3
chr19	2520716	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:2,2,1,1
chr19	2833587	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	2841663	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,1,4
chr19	2873439	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:5,6:2,3:6,1,8,1
chr19	2876334	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,4:3,1:1,11,0,5
chr19	2877212	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,327;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:0,1:3,1:4,0,2,0
chr19	2878397	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,0,14
chr19	2900915	.	GA	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=250,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr19	2900930	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr19	2901114	.	CGCCGAAGTCT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr19	2915738	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr19	2916048	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=131.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,24:0,14:0,0,30,10
chr19	2917186	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,8,13
chr19	2917612	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=103,143;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:1,16:0,12:1,0,17,11
chr19	2933480	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,11,7
chr19	2936443	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	2981487	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr19	2982047	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr19	2982293	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,153;MMQ=46,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr19	2987223	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=114,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:2987223_G_T:2987223:1,0,1,0
chr19	2987226	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=114,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2987223_G_T:2987223:1,0,1,0
chr19	2989380	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	2989801	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.494:18:6,6:3,3:3,6,3,6
chr19	2989810	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,3:4,0:3,8,1,3
chr19	2991814	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	2993918	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=201,150;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.683:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	2993946	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=17,30;MFRL=145,159;MMQ=40,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,1:0,3:1,0,6,0
chr19	2994107	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=107,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.892:11:0,9:1,1:0,1,3,7
chr19	2994814	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	2994837	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	3002487	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	3002532	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	3009788	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	3013616	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr19	3013777	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.154:27:9,0:12,0:0|1:3013777_A_C:3013777:15,8,0,4
chr19	3013787	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.219:28:8,0:8,1:0|1:3013777_A_C:3013777:12,10,0,6
chr19	3013795	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.315:22:4,0:6,1:0|1:3013777_A_C:3013777:10,5,0,7
chr19	3017967	.	C	CCTAGCTCTCCCTGACTCATCGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=145,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	3024963	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,9;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.872:6:0,0:0,1:0|1:3024963_T_G:3024963:0,0,6,0
chr19	3024966	.	C	CGGGGTGTTGCGGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.872:6:0,0:0,2:0|1:3024963_T_G:3024963:0,0,6,0
chr19	3027854	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,1:13,1:11,11,0,2
chr19	3028803	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=34,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:2,0:3,2:3,3,2,0
chr19	3053779	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.397:5:1,0:1,0:3,0,2,0
chr19	3053783	.	T	TGG,TGGGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,16,16;MFRL=179,201,148;MMQ=60,60,60;MPOS=9,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.00,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.491,0.256:5:0,0,0:0,0,0:1,0,4,0
chr19	3053790	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.784:5:1,2:0,1:1,0,4,0
chr19	3056213	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr19	3061344	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,1:1,3:0,7,0,4
chr19	3110349	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,5,11
chr19	3110361	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:2,7:2,2:0,4,2,8
chr19	3113305	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0,0,13,4
chr19	3119184	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr19	3119401	.	T	TGTCTCTCACA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.245:11:1,2:7,0:3,6,0,2
chr19	3119405	.	TG	GT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=111,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.894:8:1,0:0,7:0,1,2,5
chr19	3136692	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr19	3148819	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=207,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr19	3155902	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:6,6:4,4:4,6,5,5
chr19	3193484	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	3196122	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr19	3198777	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	3207338	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:6,3,6,3
chr19	3207348	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,14,5
chr19	3273818	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.513:4:0,1:2,1:2,0,0,2
chr19	3284819	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=122,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:1,4:3,0:4,0,3,2
chr19	3285012	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:0,4,0,7
chr19	3285042	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:1,3:2,4:0,3,0,8
chr19	3366544	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:1,1:3,0,1,0
chr19	3434413	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.525:15:5,2:2,5:1,6,3,5
chr19	3435254	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,3:1,5:0,3,0,8
chr19	3452541	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,3:4,0:9,3,3,0
chr19	3480358	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.421:19:3,1:8,6:6,5,2,6
chr19	3525964	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:3525964_C_A:3525964:1,2,0,1
chr19	3525971	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3525964_C_A:3525964:1,2,0,1
chr19	3525973	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:3525964_C_A:3525964:1,2,0,1
chr19	3526452	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	3533274	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,2:0,0,4,0
chr19	3534573	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=172,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,0:5,5:0,9,0,5
chr19	3538638	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:3538638_G_A:3538638:0,0,4,0
chr19	3538646	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0|1:3538638_G_A:3538638:0,0,5,0
chr19	3538647	.	C	CGTGGGTGCGTG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0|1:3538638_G_A:3538638:0,0,5,0
chr19	3538654	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0|1:3538638_G_A:3538638:0,0,3,0
chr19	3539132	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	3539286	.	TC	AA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,11;MFRL=155,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.338:7:3,0:1,0:0|1:3539286_TC_AA:3539286:1,4,2,0
chr19	3539289	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=155,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.338:7:3,0:0,1:0|1:3539286_TC_AA:3539286:1,4,2,0
chr19	3542758	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,1:7,1:12,3,2,0
chr19	3544703	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,28;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:11,4,1,1
chr19	3544971	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	3544985	.	CC	TT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	3546502	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=216,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:0,7,0,7
chr19	3548057	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	3548313	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	3575658	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=136,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:3,0:6,2:0|1:3575658_G_A:3575658:2,8,1,1
chr19	3575663	.	G	GCTGAATCTTACC	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=136,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,0:6,1:0|1:3575658_G_A:3575658:1,8,1,1
chr19	3575693	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=35,32;MFRL=178,136;MMQ=60,35;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr19	3575709	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=169,135;MMQ=56,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:3575709_G_A:3575709:0,4,0,1
chr19	3575715	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=169,135;MMQ=56,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:3575709_G_A:3575709:0,4,0,1
chr19	3575720	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=160,135;MMQ=51,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:3575709_G_A:3575709:0,3,0,1
chr19	3575725	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=178,135;MMQ=40,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3575709_G_A:3575709:0,1,0,1
chr19	3576278	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:5,1:3,6,2,0
chr19	3576687	.	C	CTGGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	3586452	.	G	GTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=107,9811056;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:3586452_G_GTC:3586452:3,0,1,0
chr19	3586454	.	ATGCC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=101,9811056;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:3586452_G_GTC:3586452:4,0,1,0
chr19	3589339	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr19	3600702	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=66,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,2:1,0:0,2,0,2
chr19	3619173	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:6,12,1,1
chr19	3620251	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3620251_T_TC:3620251:0,1,0,1
chr19	3620255	.	G	GAAACTCAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3620251_T_TC:3620251:0,1,0,1
chr19	3620257	.	C	CCAAGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3620251_T_TC:3620251:0,1,0,1
chr19	3620822	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=69,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	3633273	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	3641672	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:0,0:0|1:3641672_C_T:3641672:0,1,1,0
chr19	3641677	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:3641672_C_T:3641672:0,1,1,0
chr19	3643171	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=224,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:3643171_A_C:3643171:2,0,1,0
chr19	3643181	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=224,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3643171_A_C:3643171:2,0,1,0
chr19	3643187	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=224,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3643171_A_C:3643171:2,0,1,0
chr19	3645947	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=101,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.523:13:1,2:4,2:3,3,4,3
chr19	3647440	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=131,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,1,2
chr19	3656652	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=200,232;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	3660944	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=101,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:5,8:5,3:6,5,10,1
chr19	3667461	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr19	3744098	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=229,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:3744098_G_T:3744098:0,2,0,1
chr19	3744106	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=229,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:3744098_G_T:3744098:0,2,0,1
chr19	3744108	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=229,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:3744098_G_T:3744098:0,2,0,1
chr19	3783253	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3783253_A_C:3783253:0,3,0,1
chr19	3783258	.	GG	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3783253_A_C:3783253:0,2,0,1
chr19	3784757	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:2,8:1,1:3,0,6,4
chr19	3785223	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	3806162	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	3811457	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	3820305	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	3822008	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,1:4,5:4,0,6,0
chr19	3823192	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	3823237	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr19	3833797	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:3833797_G_GA:3833797:0,3,0,1
chr19	3833800	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:3833797_G_GA:3833797:0,3,0,1
chr19	3833803	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:3833797_G_GA:3833797:0,3,0,1
chr19	3833813	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	3869128	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr19	3908201	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,3:5,1:9,0,4,0
chr19	3913660	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr19	3918721	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:6,0,6,0
chr19	3959351	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	3960020	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,2,1
chr19	3963744	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:1,4,1,4
chr19	3981315	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:14,0:7,3:19,2,1,2
chr19	4024020	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,7:0,0,11,6
chr19	4028067	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr19	4028436	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	4028783	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=115,161;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:7,2,5,3
chr19	4033614	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr19	4153659	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr19	4153852	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:4153852_CAT_C:4153852:0,1,1,0
chr19	4153856	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:4153852_CAT_C:4153852:0,1,1,0
chr19	4171546	.	G	GAGTTAAAAAGTGGGGCATCCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	4174950	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr19	4177023	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,11;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:4177023_A_C:4177023:1,0,1,0
chr19	4177029	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=14,28;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:4177023_A_C:4177023:1,0,1,0
chr19	4177036	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,14;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:4177036_TC_AA:4177036:1,0,1,0
chr19	4177044	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,12;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,0:0|1:4177036_TC_AA:4177036:2,0,1,0
chr19	4177051	.	A	G,C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,28,27;MFRL=0,148,160;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.12,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,1,0:0,1,1:0,0,3,0
chr19	4177059	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:2,0:0|1:4177036_TC_AA:4177036:3,0,1,0
chr19	4180690	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	4199839	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4199839_A_C:4199839:1,0,1,0
chr19	4199848	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:4199839_A_C:4199839:1,0,1,0
chr19	4200206	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	4202793	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr19	4210017	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,14;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.649:13:2,2:2,2:2,2,6,3
chr19	4210246	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.100:42:17,3:21,0:28,10,3,1
chr19	4210283	.	G	GAGAGA	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.051:56:26,2:24,0:0|1:4210283_G_GAGAGA:4210283:36,18,1,1
chr19	4210287	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=138,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:24,2:24,0:0|1:4210283_G_GAGAGA:4210283:37,24,1,1
chr19	4210356	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,40:0.578:69:10,15:19,25:10,19,18,22
chr19	4210382	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=71.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.548:49:6,9:15,16:5,17,12,15
chr19	4210401	.	C	CA	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.410:32:7,4:12,9:4,15,3,10
chr19	4210465	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,7:2,5:0,8,0,12
chr19	4229635	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.687:7:0,1:1,3:1,1,2,3
chr19	4234856	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:3,0:1,3:0,5,0,3
chr19	4250991	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	4254308	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr19	4268543	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr19	4297968	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,4:2,1:4,0,3,2
chr19	4310201	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=149,151;MMQ=60,35;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:11,2:16,0:27,3,2,0
chr19	4310209	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=149,142;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.113:38:12,3:21,1:29,5,4,0
chr19	4311784	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.384:8:1,0:3,0:0|1:4311784_T_G:4311784:0,5,3,0
chr19	4311791	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,1:0|1:4311784_T_G:4311784:0,5,2,0
chr19	4311793	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,0:0|1:4311784_T_G:4311784:0,5,2,0
chr19	4318995	.	C	CCAGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=200,128;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:4318995_C_CCAGG:4318995:1,3,0,1
chr19	4318998	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=200,128;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:4318995_C_CCAGG:4318995:1,3,0,1
chr19	4318999	.	A	AGAGTGAAGGGGTGAGTGAGATAGAGTCAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=200,128;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:4318995_C_CCAGG:4318995:1,3,0,1
chr19	4324566	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=155,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:4324566_C_T:4324566:2,5,1,1
chr19	4324570	.	GG	TA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=162,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:4324566_C_T:4324566:2,6,1,1
chr19	4325115	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr19	4325133	.	CAAA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.433:7:1,1:0,2:2,2,2,1
chr19	4325327	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:2,4:5,1:4,4,3,2
chr19	4328860	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	4331940	.	AAAAG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAG;STR;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.476:17:1,2:5,6:4,5,5,3
chr19	4332105	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr19	4338586	.	CAGAG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=122,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=AG;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr19	4353963	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=150,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr19	4355035	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,2:4,1:2,5,0,3
chr19	4355054	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:3,5,2,0
chr19	4355203	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.535:38:7,14:8,6:12,6,7,13
chr19	4363477	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:4,6,1,4
chr19	4363960	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,4,0
chr19	4365397	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr19	4433026	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,1:3,1:4,0,3,0
chr19	4446995	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:0,2,0,3
chr19	4475606	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=206,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,1:0,1:1,2,0,2
chr19	4488926	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=121,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr19	4491476	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr19	4496198	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	4498245	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	4499632	.	AAGCTGGCCGGGGAGG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGCTGGCCGGGGAGG;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.842:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	4501931	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4501931_G_A:4501931:0,2,0,1
chr19	4501938	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,11;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:4501931_G_A:4501931:0,2,0,1
chr19	4510710	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:4510710_G_T:4510710:1,2,0,1
chr19	4510722	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:4510710_G_T:4510710:1,0,0,1
chr19	4511278	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=160,102;MMQ=40,55;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.462:24:7,6:5,5:0|1:4511278_C_T:4511278:12,1,2,9
chr19	4511281	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=102,160;MMQ=53,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,13:0.553:23:6,7:4,4:1|0:4511278_C_T:4511278:2,8,12,1
chr19	4511283	.	CA	TG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=162,102;MMQ=40,53;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:7,6:5,4:0|1:4511278_C_T:4511278:13,1,2,8
chr19	4511453	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:9,6:11,4:10,10,3,7
chr19	4511525	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=121,240;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.709:28:1,7:5,9:1,7,10,10
chr19	4511647	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=129,159;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.284:19:6,2:8,3:0|1:4511647_C_G:4511647:6,8,2,3
chr19	4511674	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=154,173;MMQ=48,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:12,2:0|1:4511647_C_G:4511647:9,12,2,0
chr19	4511677	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=152,173;MMQ=50,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:14,2:0|1:4511647_C_G:4511647:9,14,2,0
chr19	4511679	.	CA	TG	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=152,173;MMQ=50,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:0|1:4511647_C_G:4511647:9,14,2,0
chr19	4511860	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.186:46:21,1:15,7:17,21,3,5
chr19	4511889	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.152:28:20,1:4,2:12,12,1,3
chr19	4511890	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=158,245;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:16,5:7,0:10,13,3,2
chr19	4511920	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.699:20:2,10:2,3:0,6,7,7
chr19	4511955	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.679:23:3,9:4,6:3,4,9,7
chr19	4550272	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=12,29;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,2:1,1:1,2,0,3
chr19	4557056	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:5,3:6,2:7,4,4,2
chr19	4557299	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=177,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,0:0,4:1,1,1,3
chr19	4652383	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	4653044	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,4:0.111:43:26,1:13,3:0|1:4653044_G_A:4653044:15,24,3,1
chr19	4653046	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:23,0:12,2:0|1:4653044_G_A:4653044:16,24,1,1
chr19	4653370	.	C	G	.	.	DP=149;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=513.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,149:0.993:149:0,72:0,72:0,0,53,96
chr19	4653375	.	T	C	.	.	DP=140;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=123,71;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,6:0.054:127:67,0:52,6:34,87,4,2
chr19	4679778	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,9;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0|1:4679778_T_G:4679778:0,0,3,0
chr19	4679781	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:4679778_T_G:4679778:0,0,3,0
chr19	4679785	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:4679778_T_G:4679778:0,0,3,0
chr19	4679792	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=169,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:4679778_T_G:4679778:2,0,1,0
chr19	4679794	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:4679778_T_G:4679778:3,0,1,0
chr19	4697522	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:1,3:1,3:2,1,5,1
chr19	4700187	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:4,2,5,2
chr19	4706061	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	4720031	.	C	CCCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=209,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCT;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr19	4794548	.	CTT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=157,156;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.192:13:4,0:7,2:6,5,1,1
chr19	4794948	.	A	AAACCTCAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr19	4795390	.	AT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,23,33,31;MFRL=430,85,137,130;MMQ=60,60,28,48;MPOS=22,16,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,14,16,17;RU=T;STR;TLOD=4.85,3.96,11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,3,6:0.174,0.237,0.417:13:0,1,2,2:1,0,0,2:1,1,5,6
chr19	4795647	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr19	4817288	.	A	AAGG	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AGG;STR;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.320:29:8,4:12,5:20,0,7,2
chr19	4817330	.	T	G	.	.	DP=105;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,12:0.067:100:44,1:31,1:71,17,1,11
chr19	4844665	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,6:0,0,10,6
chr19	4902950	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	4911117	.	CGA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=158,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:4911117_CGA_C:4911117:0,3,0,1
chr19	4911120	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=170,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:4911117_CGA_C:4911117:0,4,0,1
chr19	4911127	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=170,76;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:4911117_CGA_C:4911117:0,4,0,1
chr19	4932993	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,3:6,1:2,13,0,4
chr19	4941456	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr19	4944555	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	4945914	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=185.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.978:44:0,19:0,23:0|1:4945914_A_C:4945914:0,0,27,17
chr19	4945917	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=183.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.978:43:0,20:0,17:0|1:4945914_A_C:4945914:0,0,26,17
chr19	4945974	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=132.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,21:0,21:0,0,17,25
chr19	4947041	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr19	4947282	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:0,10,1,1
chr19	4954300	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=129,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:4,2:6,5:0|1:4954300_C_G:4954300:11,0,7,0
chr19	4954310	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=129,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.287:26:6,2:12,5:0|1:4954300_C_G:4954300:16,3,7,0
chr19	4954679	.	G	GC	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=97.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,13:0,0,21,8
chr19	4954757	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=169,182;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.344:47:13,8:16,7:17,14,12,4
chr19	5041049	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr19	5041178	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr19	5041310	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:5041310_T_G:5041310:0,1,0,1
chr19	5041312	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:5041310_T_G:5041310:0,1,0,1
chr19	5041315	.	GT	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:5041310_T_G:5041310:0,1,0,1
chr19	5110869	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	5132051	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,4,21
chr19	5144511	.	G	GTGGAGGTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.747:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr19	5208216	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:5,1,3,0
chr19	5208236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:5,2,3,1
chr19	5210622	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,0:4,3:2,2,3,0
chr19	5210726	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:6,0:6,2:8,5,1,1
chr19	5211871	.	A	AGCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr19	5214533	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:4,6,3,3
chr19	5215474	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,3,2
chr19	5216830	.	GT	CC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr19	5222071	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0|1:5222071_G_C:5222071:2,0,5,0
chr19	5222088	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=220,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,4:1,1:0|1:5222071_G_C:5222071:1,0,6,0
chr19	5239175	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	5245939	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=176,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:3,4,0,2
chr19	5255992	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=281,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr19	5256251	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,0:3,2:0,5,0,5
chr19	5260877	.	TT	GC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:5,0:0|1:5260877_TT_GC:5260877:1,13,0,2
chr19	5260879	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,1:5,1:0|1:5260877_TT_GC:5260877:1,13,0,2
chr19	5260881	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:1,0:3,0:0|1:5260877_TT_GC:5260877:1,10,0,2
chr19	5263061	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,1,3
chr19	5265222	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr19	5455422	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr19	5456450	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr19	5591701	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:9,0,2,0
chr19	5593988	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	5600089	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:17,2:8,0:24,1,2,0
chr19	5613396	.	CAT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:3,1,6,0
chr19	5616536	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:2,5,0,2
chr19	5645444	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:6,1:7,7:4,9,1,7
chr19	5667215	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,0:6,0:0|1:5667215_G_C:5667215:1,8,2,0
chr19	5667219	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:0|1:5667215_G_C:5667215:1,8,2,0
chr19	5684775	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=256,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr19	5691496	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.182:29:10,1:14,2:21,3,0,5
chr19	5693233	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	5694349	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=198,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:1,2:2,3:4,0,4,1
chr19	5694619	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=212,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:5694619_T_G:5694619:1,0,0,1
chr19	5694630	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=204,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:5694619_T_G:5694619:2,0,0,1
chr19	5696245	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr19	5759231	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	5766243	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=34,20;MFRL=153,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:6,1:1,0:0|1:5766243_CTT_C:5766243:1,6,0,2
chr19	5766246	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=36,31;MFRL=153,122;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:1,0:0|1:5766243_CTT_C:5766243:1,6,0,2
chr19	5766277	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=173,153;MMQ=40,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:5766277_C_T:5766277:0,2,0,1
chr19	5766279	.	T	A,C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,31,28;MFRL=218,127,153;MMQ=40,40,30;MPOS=4,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,0:0,0,1:0,1,0,2
chr19	5766280	.	GGCGAAACCCC	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=140,218;MMQ=35,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	5766281	.	GC	AT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=127,153;MMQ=40,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5766277_C_T:5766277:0,1,0,1
chr19	5766282	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	5775414	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=203,128;MMQ=54,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:5775414_T_C:5775414:0,4,0,1
chr19	5775417	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=168,197;MMQ=48,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:5775417_G_T:5775417:0,4,0,1
chr19	5775419	.	TG	CG,CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,28,35;MFRL=197,128,208;MMQ=56,36,40;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:1,1,1:0,3,0,2
chr19	5775423	.	TA	AG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=128,203;MMQ=56,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr19	5775424	.	AG	GA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=146,128;MMQ=58,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:5775414_T_C:5775414:0,2,0,1
chr19	5775427	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=168,197;MMQ=48,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:5775417_G_T:5775417:0,4,0,1
chr19	5787432	.	C	CTCCCACCGTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	5866585	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	5903807	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,2:0,3:0,0,0,10
chr19	5933346	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,1,1
chr19	5994823	.	CGAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,1:2,1,5,0
chr19	6026288	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=17,19;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.352:10:0,0:0,1:1,5,1,3
chr19	6147743	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=204,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr19	6151703	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.474:34:8,11:9,5:12,6,11,5
chr19	6182901	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,2:10,0:4,18,1,1
chr19	6182914	.	C	CAGACTTTACAAACAGAGTG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=150,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,2:8,0:3,14,1,1
chr19	6187192	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	6213226	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=203,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:2,1:0,0:1,1,0,2
chr19	6214114	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,18;MFRL=140,94;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,0:1,0:0|1:6214114_G_C:6214114:0,1,0,1
chr19	6214118	.	AAG	CCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,18;MFRL=140,94;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:6214114_G_C:6214114:0,1,0,1
chr19	6214123	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,17;MFRL=140,94;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:6214114_G_C:6214114:0,1,0,1
chr19	6214126	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,18;MFRL=140,94;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:6214114_G_C:6214114:0,1,0,1
chr19	6214131	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,18;MFRL=140,94;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:6214114_G_C:6214114:0,1,0,1
chr19	6214133	.	A	ACCCCCCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,16;MFRL=140,94;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,19;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:6214114_G_C:6214114:0,1,0,1
chr19	6216537	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	6262188	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr19	6262342	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr19	6262351	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	6270525	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=213,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:0|1:6270525_G_GA:6270525:3,0,1,1
chr19	6270526	.	GCC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=213,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:0|1:6270525_G_GA:6270525:3,0,1,1
chr19	6270530	.	T	TTCTGAGAGGGGAGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=213,67;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:6270525_G_GA:6270525:3,0,0,1
chr19	6270536	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=213,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:0,1:3,0:0|1:6270525_G_GA:6270525:3,0,0,1
chr19	6306971	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr19	6333650	.	GAC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=120,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	6381565	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	6392052	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,3:3,3:1,7,0,6
chr19	6415795	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:8,8:5,10:7,6,12,6
chr19	6416839	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr19	6417855	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,7:2,2:2,4,4,5
chr19	6426457	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,42;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,2:7,0:11,9,1,1
chr19	6433695	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:2,3:10,0:3,9,1,2
chr19	6452305	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,1:3,6:4,2,7,1
chr19	6475613	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr19	6477324	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,6,6
chr19	6531171	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,6:6,4:2,9,0,10
chr19	6535080	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,2,13
chr19	6586462	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=196,188;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr19	6586498	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6586498_TA_T:6586498:0,0,0,1
chr19	6586500	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6586498_TA_T:6586498:0,0,0,1
chr19	6586504	.	TCG	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6586498_TA_T:6586498:0,0,0,1
chr19	6586509	.	AGTTAG	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6586498_TA_T:6586498:0,0,0,1
chr19	6586516	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6586498_TA_T:6586498:0,0,0,1
chr19	6679360	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr19	6679563	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	6685230	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=247,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:0,2:0,3:0,1,0,5
chr19	6686659	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	6690571	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr19	6690742	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.948:16:0,6:0,10:0|1:6690742_A_G:6690742:0,0,3,13
chr19	6690744	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0|1:6690742_A_G:6690742:0,0,3,13
chr19	6690746	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0|1:6690742_A_G:6690742:0,0,2,13
chr19	6690771	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr19	6690805	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	6693317	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	6693387	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr19	6693586	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6693586_G_T:6693586:0,0,0,1
chr19	6693588	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6693586_G_T:6693586:0,0,0,1
chr19	6693589	.	CAGGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6693586_G_T:6693586:0,0,0,1
chr19	6696496	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,4,11
chr19	6702598	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,8,10
chr19	6709622	.	T	TGGCCCCCCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:6709622_T_TGGCCCCCCCCCC:6709622:0,0,2,0
chr19	6709626	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6709622_T_TGGCCCCCCCCCC:6709622:0,0,1,0
chr19	6709630	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6709622_T_TGGCCCCCCCCCC:6709622:0,0,1,0
chr19	6709633	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:6709622_T_TGGCCCCCCCCCC:6709622:0,1,1,0
chr19	6709640	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:6709622_T_TGGCCCCCCCCCC:6709622:0,1,1,0
chr19	6710572	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr19	6710584	.	GGA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GA;STR;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	6710948	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:9,7:5,1:14,0,8,0
chr19	6718042	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,3:2,1:2,2,3,1
chr19	6718078	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,1:3,8:4,3,6,3
chr19	6731304	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr19	6732018	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,4:0,3:0,1,4,3
chr19	6732132	.	GACTCGATGATGATGTA	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=-21;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:17,3:7,0:0|1:6732132_GACTCGATGATGATGTA_G:6732132:16,14,0,3
chr19	6732152	.	CACGTTGGCCAGGACCTGCGCAGGCGGCGGGGGTGGGT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,12;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.176:28:11,1:8,0:0|1:6732132_GACTCGATGATGATGTA_G:6732132:11,12,0,5
chr19	6732982	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:2,2,1,1
chr19	6733517	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=192,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:3,1,4,1
chr19	6734131	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,2,2
chr19	6739710	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:7,7:3,6:10,0,13,0
chr19	6739934	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,4:0,4:0,3,0,8
chr19	6743634	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	6744762	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,7,9
chr19	6745105	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	6746450	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:4,4:2,4:7,0,6,2
chr19	6750204	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=195,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,1:5,3:6,0,4,0
chr19	6754188	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr19	6754774	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,19:0,9:0,0,12,16
chr19	6760974	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=117,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:4,4:8,1:6,7,0,5
chr19	6761011	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=119,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:2,7,0,2
chr19	6821733	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=216,394;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:1,0:2,0:0|1:6821733_T_G:6821733:1,3,2,0
chr19	6821739	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=216,394;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,0:3,0:0|1:6821733_T_G:6821733:1,3,2,0
chr19	6822388	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:6822388_A_G:6822388:0,0,1,0
chr19	6822394	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:6822388_A_G:6822388:0,0,1,0
chr19	6825032	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:6,1:2,4:5,3,2,4
chr19	6828040	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	6832060	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr19	6833162	.	CTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=126,149,154;MMQ=60,60,60;MPOS=18,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.06,10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,5:0.197,0.409:12:4,2,2:0,0,2:5,0,6,1
chr19	6833989	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.627:25:6,7:3,8:2,7,8,8
chr19	6847974	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,3:0,1:2,0,4,0
chr19	6848220	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	6854183	.	ACT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:6854183_ACT_A:6854183:0,3,0,1
chr19	6854189	.	GA	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6854183_ACT_A:6854183:0,1,0,1
chr19	6887736	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr19	6890458	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=15,17;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:6890458_TG_T:6890458:1,2,1,0
chr19	6890462	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=63,154;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:6890458_TG_T:6890458:2,2,1,0
chr19	6890466	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=63,154;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:6890458_TG_T:6890458:2,2,1,0
chr19	6897082	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr19	6913811	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:3,2:3,4:2,5,3,3
chr19	6913819	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,1:9,1:4,10,1,1
chr19	6913878	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr19	6921868	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:2,4,3,5
chr19	6924672	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,2:6,0,6,1
chr19	6934979	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,2:2,0:9,2,2,0
chr19	6935113	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=111,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:1,2,1,7
chr19	6935121	.	T	TAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=111,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:1,2:1,2,0,6
chr19	6937717	.	G	GAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6937717_G_GAC:6937717:0,1,0,1
chr19	6937723	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6937717_G_GAC:6937717:0,1,0,1
chr19	6939910	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,1:2,1:4,0,3,0
chr19	6940171	.	G	GAAACTGACCTCTGCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	7051637	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=148,142;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,17:0.327:53:16,5:17,11:0|1:7051637_T_G:7051637:15,21,7,10
chr19	7051643	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=139,145;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,14:0.300:48:17,4:17,9:0|1:7051637_T_G:7051637:13,21,6,8
chr19	7076573	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=164,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:9,0:4,2:0,13,1,1
chr19	7083629	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,4:10,6:12,3,8,2
chr19	7083761	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.458:44:12,10:11,10:5,19,4,16
chr19	7117487	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr19	7119640	.	C	CTTA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7119640_C_CTTA:7119640:0,4,0,1
chr19	7119642	.	CACA	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7119640_C_CTTA:7119640:0,4,0,1
chr19	7119647	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:7119640_C_CTTA:7119640:0,4,0,1
chr19	7119653	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:7119640_C_CTTA:7119640:0,2,0,1
chr19	7119656	.	CGCGCAA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr19	7119658	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	7125567	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7125567_T_G:7125567:0,1,0,1
chr19	7125568	.	T	TAATCCGATCACCTCCACATCATCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7125567_T_G:7125567:0,1,0,1
chr19	7125593	.	CCACCT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7125593_CCACCT_C:7125593:0,0,0,1
chr19	7125600	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7125593_CCACCT_C:7125593:0,0,0,1
chr19	7152999	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:7152999_C_T:7152999:0,0,0,1
chr19	7153005	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7152999_C_T:7152999:0,0,0,1
chr19	7153006	.	ACCC	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7152999_C_T:7152999:0,0,0,1
chr19	7153013	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7152999_C_T:7152999:0,0,0,1
chr19	7153016	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7152999_C_T:7152999:0,0,0,1
chr19	7163230	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=105,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:3,4,2,9
chr19	7166109	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr19	7166388	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:1,5:2,3:1,3,2,7
chr19	7170517	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=177,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:1,2:2,3:3,1,5,0
chr19	7170858	.	T	TGAACAGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	7174754	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr19	7184345	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,4:8,2:8,3,5,2
chr19	7184653	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=163,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:0|1:7184653_AG_A:7184653:1,9,1,1
chr19	7184656	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=163,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:7184653_AG_A:7184653:1,9,1,1
chr19	7504767	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:5,1:5,3:9,3,4,0
chr19	7506668	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,4:1,0:2,6,0,4
chr19	7507010	.	CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,188;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=12,5;RU=CCTT;STR;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.521:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr19	7512065	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.681:11:2,3:1,4:1,2,0,8
chr19	7512103	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=186,173;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:7512103_G_A:7512103:0,4,0,1
chr19	7512105	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=186,173;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:7512103_G_A:7512103:0,4,0,1
chr19	7512110	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=186,173;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:7512103_G_A:7512103:0,4,0,1
chr19	7512115	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=186,173;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:7512103_G_A:7512103:0,4,0,1
chr19	7516176	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,4:6,2:3,6,3,3
chr19	7516243	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=216,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr19	7518268	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr19	7521337	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=173,105;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:5,0:5,2:0|1:7521337_T_C:7521337:2,11,1,1
chr19	7521341	.	GT	TC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=174,105;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,1:0|1:7521337_T_C:7521337:1,11,1,1
chr19	7521345	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=153,160;MMQ=60,32;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:1,10,0,2
chr19	7524727	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:2,0:5,0,2,0
chr19	7524743	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr19	7534075	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	7568966	.	A	ATCTCTCTC,ATCTCTCTCTCTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33,30;MFRL=0,134,124;MMQ=60,60,40;MPOS=21,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,11,13;RU=TC;STR;TLOD=17.74,9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,3:0.596,0.334:9:0,5,2:0,0,1:0,0,9,0
chr19	7570132	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,0:6,4:9,0,4,0
chr19	7584463	.	C	CAGAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7584463_C_CAGAG:7584463:0,0,0,1
chr19	7584464	.	C	CCGCAGGGAGCTAATTCCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7584463_C_CAGAG:7584463:0,0,0,1
chr19	7585336	.	C	CACCCAGCTAGGGTGATTCTTTTTTAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:2,1,0,1
chr19	7590149	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=219,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7590149_C_G:7590149:0,3,0,1
chr19	7590152	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=219,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7590149_C_G:7590149:0,3,0,1
chr19	7592389	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=21,10;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.350:6:1,0:3,0:4,0,2,0
chr19	7592391	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=16,18;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.546:7:0,0:0,0:0|1:7592391_A_G:7592391:3,0,4,0
chr19	7592399	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,18;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:0,0:0|1:7592391_A_G:7592391:2,1,2,0
chr19	7592402	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,10;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:2,1,1,0
chr19	7594148	.	T	TATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=13954238,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:7594148_T_TATG:7594148:1,1,0,1
chr19	7594149	.	C	CGTGTATA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=13954238,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:7594148_T_TATG:7594148:1,1,0,1
chr19	7594151	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=13954238,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:7594148_T_TATG:7594148:1,1,0,1
chr19	7594159	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,27908279;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	7605247	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:7605247_CA_TG:7605247:0,0,0,1
chr19	7605252	.	G	GAGGTAGAGAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7605247_CA_TG:7605247:0,0,0,1
chr19	7607441	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=99.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,14:0,0,13,16
chr19	7607564	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr19	7615585	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr19	7616347	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0,4,2,4
chr19	7619199	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,3,10
chr19	7619239	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr19	7619647	.	GT	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	7619700	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr19	7619760	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	7620116	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr19	7621475	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,3:0,5:0,0,2,8
chr19	7621648	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,1:0,5:0,0,0,8
chr19	7622226	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr19	7625723	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	7626013	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr19	7626071	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr19	7626275	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr19	7671308	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	7672636	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr19	7680003	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,2:8,1,7,1
chr19	7680019	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.158:23:8,0:6,0:0|1:7680019_A_T:7680019:17,3,0,3
chr19	7680023	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:9,1:5,0:0|1:7680019_A_T:7680019:16,3,0,3
chr19	7680039	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.206:24:8,0:7,3:15,4,0,5
chr19	7682112	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=192,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr19	7683036	.	C	CTGGTTTATACATTCAGGTACCCCTGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=219,237;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	7684971	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=198,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:7684971_G_T:7684971:1,3,0,1
chr19	7684975	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=198,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:7684971_G_T:7684971:1,3,0,1
chr19	7684977	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=198,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:7684971_G_T:7684971:1,3,0,1
chr19	7684993	.	GG	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=107,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	7685075	.	A	AGCACAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	7685980	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=14,14;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.337:4:0,0:0,0:3,0,1,0
chr19	7685989	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.487:6:1,1:2,1:0|1:7685989_G_C:7685989:1,2,3,0
chr19	7685992	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.385:8:0,1:2,2:0|1:7685989_G_C:7685989:2,3,3,0
chr19	7687626	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,5:3,2:6,2,7,0
chr19	7688039	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:8,2,1,1
chr19	7688614	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	7691001	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:4,2,4,2
chr19	7694393	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.429:35:12,5:8,9:14,6,7,8
chr19	7697779	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:7697779_T_C:7697779:0,3,0,1
chr19	7697787	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:7697779_T_C:7697779:0,2,0,1
chr19	7698226	.	C	CTAAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,0:5,3:9,0,3,0
chr19	7710040	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr19	7710269	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr19	7711978	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=210,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr19	7712161	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr19	7712425	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.387:24:6,3:8,6:2,13,2,7
chr19	7712474	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:1,7,3,5
chr19	7712585	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,2:2,3:1,2,2,4
chr19	7712779	.	T	TAACATTTAGATCCTTTGGATCGCTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=230,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	7735089	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	7735318	.	AGATGATGAT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=GAT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	7743879	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,19:0.395:48:15,7:13,10:19,10,12,7
chr19	7744075	.	ACCC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=125,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=C;STR;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.521:10:0,1:0,2:0,5,1,4
chr19	7754194	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:1,5:7,8:3,5,2,11
chr19	7755248	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,13;MFRL=79,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:2,0,2,0
chr19	7755279	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,11;MFRL=212,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:7755279_A_C:7755279:1,2,1,0
chr19	7755285	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=205,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:7755279_A_C:7755279:2,2,1,0
chr19	7755290	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=205,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:7755279_A_C:7755279:2,2,1,0
chr19	7761812	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,4,2
chr19	7764545	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=111,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:3,3,5,0
chr19	7764741	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr19	7764772	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	7794605	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	7795694	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	7795975	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr19	7796235	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr19	7796497	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,13,2
chr19	7797072	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,20;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0|1:7797072_CCA_C:7797072:0,1,1,1
chr19	7797075	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:7797072_CCA_C:7797072:0,1,1,1
chr19	7797080	.	T	TCAGACTCTCACTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7797072_CCA_C:7797072:0,1,0,1
chr19	7797083	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7797072_CCA_C:7797072:0,1,0,1
chr19	7831147	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:7831147_T_G:7831147:0,2,0,1
chr19	7831149	.	A	ACAGAATACTAGAGAGTAAAGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:7831147_T_G:7831147:0,2,0,1
chr19	7831162	.	T	TAAGTTTTGTATATA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7831162_T_TAAGTTTTGTATATA:7831162:0,0,0,1
chr19	7831164	.	C	CATAATACTTATAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7831162_T_TAAGTTTTGTATATA:7831162:0,0,0,1
chr19	7831700	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,9:0,0,5,11
chr19	7832593	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7832593_C_T:7832593:0,1,0,1
chr19	7832601	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7832593_C_T:7832593:0,0,0,1
chr19	7833690	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr19	7833940	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	7916475	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr19	7918103	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr19	7960676	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=88,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:7960676_G_GGC:7960676:0,1,0,1
chr19	7960678	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,36;MFRL=88,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7960676_G_GGC:7960676:0,1,0,1
chr19	7960680	.	G	GCCTGTAATCCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=88,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:7960676_G_GGC:7960676:0,1,0,1
chr19	7960683	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7960676_G_GGC:7960676:0,0,0,1
chr19	7964609	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr19	7970635	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=114.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,18:0,17:0,0,26,11
chr19	7975464	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr19	7976054	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,2:0,3:2,4,3,2
chr19	7976061	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=140,170;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:5,2,0,3
chr19	7976070	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=140,169;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:3,0:4,1,1,3
chr19	7976076	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=23,29;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,3:2,1:0|1:7976076_T_G:7976076:5,0,0,5
chr19	7976083	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=20,13;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.598:8:2,1:0,0:0|1:7976076_T_G:7976076:3,0,0,5
chr19	7976116	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr19	7992693	.	G	GAGTTTGGGGTTGAGGGAGGTCGGAGACCAGCAGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=111,137;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7992693_G_GAGTTTGGGGTTGAGGGAGGTCGGAGACCAGCAGA:7992693:1,1,0,1
chr19	7992696	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=111,137;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7992693_G_GAGTTTGGGGTTGAGGGAGGTCGGAGACCAGCAGA:7992693:1,1,0,1
chr19	7992698	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=111,137;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:7992693_G_GAGTTTGGGGTTGAGGGAGGTCGGAGACCAGCAGA:7992693:1,1,0,1
chr19	7995987	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,1:6,1:15,1,2,0
chr19	7997870	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=174,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	7999121	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr19	7999874	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr19	7999997	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=110,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.246:43:16,8:14,4:22,8,12,1
chr19	8000045	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=102,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.185:26:11,0:9,3:20,2,3,1
chr19	8000052	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.481:7:0,1:2,1:2,2,1,2
chr19	8000104	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:0,3,0,4
chr19	8005904	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=12,20;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.451:5:1,1:0,0:3,0,2,0
chr19	8032680	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,7:4,2:1,6,1,8
chr19	8117869	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,3,1
chr19	8118050	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=180,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:4,2:1,0:0|1:8118050_A_C:8118050:0,5,1,1
chr19	8118052	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=180,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:4,1:0,0:0|1:8118050_A_C:8118050:0,5,1,1
chr19	8121170	.	G	GAGCAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=159,210;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:8121170_G_GAGCAAA:8121170:3,1,0,1
chr19	8121173	.	C	CGCGGAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=159,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:8121170_G_GAGCAAA:8121170:3,1,0,1
chr19	8121189	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=100,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr19	8122737	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:4,5:4,7:5,3,9,3
chr19	8122767	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,18:0,0,12,18
chr19	8137102	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	8137850	.	CGTGTGT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,34;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=GT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.413:3:0,1:1,0:2,0,1,0
chr19	8137902	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:1,1:3,4:0|1:8137902_C_T:8137902:6,0,6,0
chr19	8137908	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,3:2,3:0|1:8137902_C_T:8137902:4,0,7,0
chr19	8146013	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:2,3,1,3
chr19	8148301	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=178,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr19	8148315	.	AT	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=143,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8148315_AT_GA:8148315:1,2,0,1
chr19	8148318	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=143,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8148315_AT_GA:8148315:1,2,0,1
chr19	8148320	.	TC	GG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=143,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8148315_AT_GA:8148315:1,2,0,1
chr19	8151261	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,2,16
chr19	8156306	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:8156306_G_C:8156306:2,1,1,0
chr19	8156311	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:8156306_G_C:8156306:2,2,1,0
chr19	8156313	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:8156306_G_C:8156306:2,2,1,0
chr19	8156315	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:8156306_G_C:8156306:2,2,1,0
chr19	8162121	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=181,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr19	8167830	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	8168399	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chr19	8174650	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	8176458	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0|1:8176458_A_G:8176458:0,0,4,0
chr19	8176463	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:8176458_A_G:8176458:0,0,4,1
chr19	8181526	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,0:0,0,2,0
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chr19	8188620	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,1,1
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chr19	8190967	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=13,32;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0,3,0,1
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chr19	8191197	.	CG	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=122,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:16,0:18,2:0|1:8191192_A_C:8191192:10,27,1,1
chr19	8191238	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,1,16
chr19	8191248	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,4:0,0,1,12
chr19	8191323	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr19	8200819	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,10;MFRL=94,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:8200819_T_G:8200819:0,1,1,0
chr19	8200820	.	G	GGGGGGCGCGCCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,18;MFRL=94,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:8200819_T_G:8200819:0,1,1,0
chr19	8200824	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=94,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8200819_T_G:8200819:0,1,1,0
chr19	8200828	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=88,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:8200819_T_G:8200819:1,1,1,0
chr19	8200832	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=88,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:2,0:0,0:0|1:8200819_T_G:8200819:1,1,1,0
chr19	8201051	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:1,2:1,2:0,3,3,1
chr19	8206553	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=106,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:0,1:4,2,2,1
chr19	8206559	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=64,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:0|1:8206559_G_C:8206559:1,1,4,2
chr19	8206568	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:3,5:1,1:0|1:8206559_G_C:8206559:1,3,4,3
chr19	8206713	.	G	GACACGAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr19	8206748	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,5,7
chr19	8207070	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	8209926	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr19	8212097	.	T	TGGAGCCCGACAGGGGCAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=106,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr19	8212163	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr19	8320656	.	TGGGGCGGGGC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=190,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:0,1:2,3:3,0,4,1
chr19	8322865	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:4,2:7,0:4,9,0,2
chr19	8367525	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr19	8369043	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:1,2:0,8,0,2
chr19	8370120	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	8381595	.	CCT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr19	8386306	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:0,2,4,1
chr19	8386701	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr19	8387619	.	TAGCCTCTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:1,1:4,0,5,0
chr19	8387809	.	GGA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GA;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,1:1,4,0,4
chr19	8389723	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,2,1
chr19	8389892	.	GTCC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:5,4,2,3
chr19	8398531	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	8398641	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=129,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	8398714	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr19	8398949	.	CTCGCTGTCGCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	8429235	.	CCTGATGCTCTGCGCCGCCACCGCCGTGCTA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=155,26;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr19	8434001	.	TTCCCTGGTCATCCACTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:4,0,1,0
chr19	8436438	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr19	8467551	.	T	TATAGGTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	8495765	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr19	8495844	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr19	8528310	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=61.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,15,2
chr19	8536373	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:8536373_A_G:8536373:0,0,0,4
chr19	8536392	.	T	TGTTTGGTGGTTTTCCCTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:8536373_A_G:8536373:0,2,0,1
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chr19	8606975	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	8615516	.	C	CAAAAGAAACCCATACTCATTA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,36;MFRL=103,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:6,8,0,2
chr19	8651860	.	A	AAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=199,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	8654283	.	TA	CC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=220,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.435:5:1,0:1,0:0|1:8654283_TA_CC:8654283:1,2,2,0
chr19	8654289	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,12;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:8654283_TA_CC:8654283:2,2,1,0
chr19	8654295	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=189,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:8654295_G_C:8654295:0,2,2,0
chr19	8654297	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,23;MFRL=189,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:0|1:8654295_G_C:8654295:0,2,2,0
chr19	8654301	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,12;MFRL=189,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:8654295_G_C:8654295:0,2,2,0
chr19	8669873	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:5,2:4,8:9,0,10,1
chr19	8809100	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,1:1,3:3,1,3,2
chr19	8841558	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,22:0,13:0,0,17,18
chr19	8932847	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
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chr19	8932866	.	AG	GC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:8932862_G_GC:8932862:0,3,0,1
chr19	8932870	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:8932862_G_GC:8932862:0,3,0,1
chr19	8953922	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.829:5:0,0:0,5:0|1:8953922_C_T:8953922:0,0,2,3
chr19	8953928	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.829:5:0,0:0,4:0|1:8953922_C_T:8953922:0,0,2,3
chr19	8962448	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=238,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr19	8962461	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,201;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	8979112	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr19	8982084	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	8982146	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,2:4,3:2,2,4,1
chr19	8987133	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr19	8987218	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:4,3:0,7:3,1,8,2
chr19	8987348	.	A	AAG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AG;STR;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr19	8987387	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,0:0,0:0|1:8987387_T_G:8987387:0,0,0,1
chr19	8987391	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:8987387_T_G:8987387:0,0,0,1
chr19	8987394	.	G	GCGTCTGAGAGGTTTCCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8987387_T_G:8987387:0,0,0,1
chr19	8992929	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=129,124;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:0|1:8992929_G_A:8992929:10,1,2,0
chr19	8992933	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=21;MBQ=32,34;MFRL=129,124;MMQ=60,35;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:0|1:8992929_G_A:8992929:10,1,2,0
chr19	8992937	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=21;MBQ=34,28;MFRL=124,119;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,1:7,1:0|1:8992929_G_A:8992929:11,1,3,0
chr19	8992940	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=124,119;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:6,2:7,1:0|1:8992929_G_A:8992929:13,1,4,0
chr19	8992942	.	AC	TA	.	.	DP=19;ECNT=21;MBQ=32,29;MFRL=119,119;MMQ=60,41;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,3:8,1:0|1:8992929_G_A:8992929:13,2,4,0
chr19	8992947	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=21;MBQ=31,28;MFRL=119,119;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.235:19:7,3:7,1:0|1:8992929_G_A:8992929:13,2,4,0
chr19	8992971	.	TA	GG	.	.	DP=46;ECNT=21;MBQ=29,33;MFRL=111,119;MMQ=60,41;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:18,2:18,1:33,9,3,0
chr19	8992980	.	CT	GG	.	.	DP=59;ECNT=21;MBQ=32,36;MFRL=111,119;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.083:58:25,3:24,1:42,12,4,0
chr19	8992988	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=21;MBQ=34,32;MFRL=109,119;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,5:0.088:66:29,2:27,1:0|1:8992988_G_A:8992988:49,12,4,1
chr19	8992993	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=21;MBQ=28,34;MFRL=109,119;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,4:0.077:63:27,3:28,1:0|1:8992988_G_A:8992988:47,12,3,1
chr19	8992996	.	TG	AA	.	.	DP=67;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=111,119;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,3:0.058:67:32,3:28,0:51,13,3,0
chr19	8993017	.	G	T	.	.	DP=74;ECNT=21;MBQ=34,31;MFRL=107,82;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,3:0.054:70:34,2:28,1:51,16,2,1
chr19	8993020	.	T	C	.	.	DP=73;ECNT=21;MBQ=29,33;MFRL=107,82;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,3:0.055:70:38,2:24,1:51,16,2,1
chr19	8993033	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=21;MBQ=30,29;MFRL=107,82;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,5:0.087:65:34,3:23,1:0|1:8993033_T_G:8993033:43,17,2,3
chr19	8993036	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=107,82;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,5:0.092:62:32,3:24,1:0|1:8993033_T_G:8993033:40,17,2,3
chr19	8993041	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=21;MBQ=31,31;MFRL=107,82;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,5:0.098:59:28,4:19,1:35,19,2,3
chr19	8993048	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=21;MBQ=34,33;MFRL=106,82;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.124:46:26,4:15,1:25,16,2,3
chr19	8993081	.	AG	A	.	.	DP=34;ECNT=21;MBQ=30,32;MFRL=145,82;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:9,3:16,0:3,25,0,3
chr19	8993091	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=21;MBQ=33,28;MFRL=163,109;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,2:15,0:0|1:8993091_G_C:8993091:0,25,0,2
chr19	8993093	.	GGA	G	.	.	DP=25;ECNT=21;MBQ=34,34;MFRL=164,109;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,2:13,0:0|1:8993091_G_C:8993091:0,22,0,2
chr19	8993097	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=21;MBQ=32,33;MFRL=166,109;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,2:11,0:0|1:8993091_G_C:8993091:0,20,0,2
chr19	8993426	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=123,142;MMQ=60,32;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:7,2:21,0:16,12,0,2
chr19	8993443	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=138,142;MMQ=60,32;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:13,2:21,0:0|1:8993443_C_T:8993443:19,17,0,2
chr19	8993449	.	CA	GC	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=137,142;MMQ=60,32;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:15,2:20,0:0|1:8993443_C_T:8993443:18,19,0,2
chr19	8993452	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=130,142;MMQ=60,32;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:15,2:17,0:0|1:8993443_C_T:8993443:17,19,0,2
chr19	8994113	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=109.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,17:0,0,27,5
chr19	8994285	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.613:18:3,5:2,5:3,4,4,7
chr19	8994373	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,15:0,7:0,0,14,8
chr19	8994523	.	A	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=119,155;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:28,0:25,3:22,31,0,3
chr19	8995853	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr19	8997004	.	CT	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:8997004_CT_AG:8997004:2,1,1,0
chr19	8997013	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:8997004_CT_AG:8997004:2,1,1,0
chr19	8997189	.	T	TGGGAGA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=130,31;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGAGA;STR;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.547:18:3,2:3,5:1,7,5,5
chr19	8997343	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:7,1,3,3
chr19	8997454	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=127,39;MMQ=60,22;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:20,2:23,0:0|1:8997454_G_A:8997454:24,21,2,0
chr19	8997463	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=127,39;MMQ=60,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:25,2:25,0:0|1:8997454_G_A:8997454:29,22,2,0
chr19	8997472	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=120,39;MMQ=60,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:22,2:23,0:0|1:8997454_G_A:8997454:26,21,2,0
chr19	8997481	.	CC	AT	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=119,39;MMQ=60,22;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:19,2:22,0:0|1:8997454_G_A:8997454:24,21,2,0
chr19	8999106	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:8999106_G_GA:8999106:1,3,0,1
chr19	8999107	.	G	GGCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:8999106_G_GA:8999106:1,3,0,1
chr19	8999110	.	G	GAAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:8999106_G_GA:8999106:1,3,0,1
chr19	8999111	.	G	GAGCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:8999106_G_GA:8999106:1,3,0,1
chr19	8999373	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=22;MBQ=32,31;MFRL=147,133;MMQ=60,30;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:8,2:9,3:0|1:8999373_C_T:8999373:15,5,7,0
chr19	8999383	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=22;MBQ=32,34;MFRL=131,133;MMQ=60,34;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,9:0.294:32:8,5:14,4:0|1:8999373_C_T:8999373:16,7,9,0
chr19	8999386	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=22;MBQ=31,34;MFRL=129,133;MMQ=60,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,9:0.303:31:6,5:14,4:0|1:8999373_C_T:8999373:15,7,9,0
chr19	8999421	.	G	C	.	.	DP=60;ECNT=22;MBQ=33,33;MFRL=131,119;MMQ=52,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,11:0.200:58:15,3:30,8:0|1:8999421_G_C:8999421:33,14,5,6
chr19	8999438	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=22;MBQ=31,30;MFRL=143,106;MMQ=52,38;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,8:0.147:59:18,4:31,4:0|1:8999438_A_T:8999438:32,19,6,2
chr19	8999441	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=22;MBQ=35,30;MFRL=142,106;MMQ=52,38;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,8:0.155:56:18,4:27,4:0|1:8999438_A_T:8999438:31,17,6,2
chr19	8999443	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=22;MBQ=31,30;MFRL=142,106;MMQ=52,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,8:0.155:56:18,4:27,4:0|1:8999438_A_T:8999438:31,17,6,2
chr19	8999445	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=22;MBQ=33,30;MFRL=131,114;MMQ=52,32;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,8:0.158:55:18,2:25,4:0|1:8999421_G_C:8999421:33,14,4,4
chr19	8999446	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=22;MBQ=32,34;MFRL=125,144;MMQ=52,25;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:18,3:27,2:30,17,5,0
chr19	8999449	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=22;MBQ=34,27;MFRL=142,111;MMQ=52,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,7:0.140:55:17,3:27,4:0|1:8999438_A_T:8999438:30,18,5,2
chr19	8999453	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=22;MBQ=34,31;MFRL=127,146;MMQ=49,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,19:0.360:53:14,6:19,12:21,13,11,8
chr19	8999462	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=22;MBQ=33,30;MFRL=135,115;MMQ=60,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,9:0.192:50:14,2:20,7:0|1:8999421_G_C:8999421:25,16,3,6
chr19	8999468	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=22;MBQ=31,30;MFRL=144,115;MMQ=60,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,7:0.163:47:13,2:25,5:0|1:8999421_G_C:8999421:21,19,2,5
chr19	8999474	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=22;MBQ=30,35;MFRL=135,115;MMQ=60,33;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,9:0.189:51:14,3:25,5:0|1:8999421_G_C:8999421:21,21,2,7
chr19	8999492	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=22;MBQ=30,34;MFRL=117,114;MMQ=60,32;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:11,1:16,3:0|1:8999421_G_C:8999421:15,19,0,4
chr19	8999498	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=22;MBQ=34,32;MFRL=127,114;MMQ=60,32;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.139:34:10,1:16,2:0|1:8999421_G_C:8999421:11,19,0,4
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chr19	9002597	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=135,151;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:9,1:19,1:0|1:9002587_C_T:9002587:15,14,0,2
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chr19	9003618	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,31:0.522:59:13,13:15,16:14,14,19,12
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chr19	9009323	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=122,160;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:10,3:10,0:0|1:9009305_G_A:9009305:8,12,2,2
chr19	9009325	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=122,207;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,3:10,0:0|1:9009305_G_A:9009305:8,12,2,1
chr19	9009711	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=31,23;MFRL=151,53;MMQ=60,32;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.109:39:10,2:23,1:7,28,1,3
chr19	9009750	.	GA	TG	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=165,105;MMQ=60,32;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:4,1:15,2:0|1:9009750_GA_TG:9009750:1,19,1,4
chr19	9009761	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=166,105;MMQ=60,32;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:4,3:13,2:0|1:9009750_GA_TG:9009750:1,17,1,4
chr19	9009772	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=163,105;MMQ=60,32;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:5,3:11,2:0|1:9009750_GA_TG:9009750:1,15,1,4
chr19	9009774	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=163,105;MMQ=60,32;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:5,2:10,2:0|1:9009750_GA_TG:9009750:1,15,1,4
chr19	9009776	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=159,107;MMQ=60,31;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,2:10,2:0|1:9009750_GA_TG:9009750:1,14,0,4
chr19	9010720	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=112,0;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,3:0.073:53:18,2:31,1:0|1:9010720_A_G:9010720:17,33,1,2
chr19	9010725	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=112,0;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:18,2:31,1:0|1:9010720_A_G:9010720:17,34,1,2
chr19	9010743	.	G	GC	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=130,0;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:14,1:25,1:0|1:9010743_G_GC:9010743:7,34,1,2
chr19	9010748	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=130,0;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:14,2:23,1:0|1:9010743_G_GC:9010743:7,32,1,2
chr19	9011538	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.454:16:1,3:6,4:0,9,0,7
chr19	9012840	.	G	A	.	.	DP=96;ECNT=9;MBQ=28,28;MFRL=127,80;MMQ=60,47;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,16:0.176:94:34,7:43,9:42,36,10,6
chr19	9012905	.	T	TG	.	.	DP=69;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=113,125;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,7:0.124:62:26,2:25,4:0|1:9012905_T_TG:9012905:14,41,2,5
chr19	9012910	.	GT	G	.	.	DP=62;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=113,125;MMQ=60,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,7:0.125:62:29,1:25,5:0|1:9012905_T_TG:9012905:14,41,2,5
chr19	9012918	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=9;MBQ=34,33;MFRL=130,125;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,5:0.111:52:24,1:23,4:0|1:9012905_T_TG:9012905:9,38,0,5
chr19	9012930	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=164,125;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:16,1:18,4:0|1:9012905_T_TG:9012905:2,35,0,5
chr19	9012937	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=9;MBQ=32,34;MFRL=159,127;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.132:36:14,1:16,3:0|1:9012905_T_TG:9012905:2,30,0,4
chr19	9012947	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=164,128;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:13,2:16,3:0|1:9012905_T_TG:9012905:2,28,0,5
chr19	9012958	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=31,26;MFRL=173,128;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:9,2:12,2:0|1:9012905_T_TG:9012905:1,22,0,5
chr19	9012977	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=182,151;MMQ=60,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,1:10,0:0|1:9012905_T_TG:9012905:1,15,0,2
chr19	9014456	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,88;MMQ=60,38;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr19	9015436	.	T	TG	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=104,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,11:0.265:43:11,3:18,8:0|1:9015436_T_TG:9015436:5,27,1,10
chr19	9015437	.	TA	GT	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=108,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.064:44:13,1:21,1:0|1:9015437_TA_GT:9015437:6,36,0,2
chr19	9015438	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=107,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,11:0.278:41:10,3:13,6:0|1:9015436_T_TG:9015436:5,25,1,10
chr19	9015440	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=105,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:12,1:21,1:0|1:9015437_TA_GT:9015437:5,33,0,2
chr19	9015441	.	GGCAGA	G	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=105,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:11,1:23,1:0|1:9015437_TA_GT:9015437:5,34,0,2
chr19	9018458	.	A	T	.	.	DP=79;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=123,94;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,5:0.074:79:36,4:38,1:36,38,5,0
chr19	9018476	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=122,106;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,15:0.163:96:37,8:40,7:0|1:9018476_G_A:9018476:36,45,11,4
chr19	9018479	.	G	T	.	.	DP=97;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=122,106;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,15:0.167:94:38,8:39,7:0|1:9018476_G_A:9018476:35,44,11,4
chr19	9018508	.	T	G	.	.	DP=84;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=122,100;MMQ=60,43;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,14:0.180:81:35,8:31,6:31,36,10,4
chr19	9018539	.	CA	TG	.	.	DP=62;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=156,139;MMQ=53,46;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,2:0.051:56:23,1:27,1:24,30,1,1
chr19	9020211	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,7:0,5:0,1,0,12
chr19	9020666	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr19	9021275	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	9024758	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	9024988	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=139,189;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:13,2:20,1:0|1:9024988_C_G:9024988:7,28,0,3
chr19	9024995	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=129,189;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:9,2:16,1:0|1:9024988_C_G:9024988:3,24,0,3
chr19	9024998	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=129,189;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:9,1:16,1:0|1:9024988_C_G:9024988:3,22,0,3
chr19	9025009	.	T	TAA	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=129,189;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.179:20:3,2:11,1:0|1:9025009_T_TAA:9025009:2,15,0,3
chr19	9025010	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=129,189;MMQ=60,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.179:20:5,2:12,1:0|1:9025009_T_TAA:9025009:2,15,0,3
chr19	9025014	.	G	GGGGAATGGCAATAAGT	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=138,189;MMQ=60,46;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,1:13,1:0|1:9025009_T_TAA:9025009:2,16,0,2
chr19	9025667	.	G	GA	.	.	DP=78;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=121,76;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,10:0.148:72:34,4:27,6:0|1:9025667_G_GA:9025667:36,26,1,9
chr19	9025669	.	G	GCATA	.	.	DP=77;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=120,76;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,10:0.146:73:33,3:27,6:0|1:9025667_G_GA:9025667:36,27,1,9
chr19	9025672	.	AG	A	.	.	DP=71;ECNT=10;MBQ=31,31;MFRL=119,80;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,7:0.110:71:32,2:29,5:0|1:9025667_G_GA:9025667:36,28,0,7
chr19	9025677	.	GC	TA	.	.	DP=67;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=119,80;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,7:0.116:67:30,2:24,5:0|1:9025667_G_GA:9025667:32,28,0,7
chr19	9025683	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=122,80;MMQ=60,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,5:0.092:63:26,1:22,4:0|1:9025667_G_GA:9025667:29,29,0,5
chr19	9025685	.	T	TGAGCTG	.	.	DP=59;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=123,80;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,5:0.098:59:26,1:20,4:0|1:9025667_G_GA:9025667:26,28,0,5
chr19	9025688	.	G	GTGT	.	.	DP=60;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=123,86;MMQ=60,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,4:0.081:60:30,1:20,3:0|1:9025667_G_GA:9025667:26,30,0,4
chr19	9025692	.	GCT	G	.	.	DP=59;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=123,92;MMQ=60,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,3:0.066:59:25,1:20,2:0|1:9025667_G_GA:9025667:24,32,0,3
chr19	9025696	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=10;MBQ=31,29;MFRL=122,86;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:28,1:21,1:0|1:9025667_G_GA:9025667:20,31,0,2
chr19	9025699	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=123,86;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.054:54:26,0:18,1:0|1:9025667_G_GA:9025667:19,33,0,2
chr19	9028242	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=100,0;MMQ=60,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:13,2:12,1:0|1:9028242_T_C:9028242:14,13,0,3
chr19	9028245	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=100,59;MMQ=60,26;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,2:10,0:0|1:9028242_T_C:9028242:13,13,0,2
chr19	9028432	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=201,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,8:0,4:0,3,0,12
chr19	9043347	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr19	9045518	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr19	9045737	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:10,14,0,2
chr19	9049339	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr19	9049396	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,7,12
chr19	9056430	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=118,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,2:12,0:5,13,2,0
chr19	9061763	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,2:16,0:16,12,2,0
chr19	9061861	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:9,10,0,2
chr19	9066259	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0,0,7,14
chr19	9070194	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,19:0,6:0,0,6,19
chr19	9070402	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.966:28:0,8:0,16:0,0,10,18
chr19	9070837	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,11:0,19:0,0,18,12
chr19	9073030	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:15,0:12,3:14,14,1,2
chr19	9075346	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,27:0,10:0,0,20,17
chr19	9204470	.	A	AGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:9204470_A_AGGC:9204470:0,1,0,1
chr19	9204471	.	T	TCAAGCGATCGTCCCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:9204470_A_AGGC:9204470:0,1,0,1
chr19	9271770	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,2:7,1:9,10,2,1
chr19	9297633	.	CT	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9297633_CT_TA:9297633:0,0,0,1
chr19	9297637	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9297633_CT_TA:9297633:0,0,0,1
chr19	9297874	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.598:25:3,9:6,6:6,4,8,7
chr19	9297977	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=161,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,2:6,1:4,10,1,2
chr19	9297990	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=169,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:9297990_T_A:9297990:3,11,1,1
chr19	9297998	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=169,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:7,0:0|1:9297990_T_A:9297990:4,10,1,1
chr19	9298173	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:0|1:9298173_T_TA:9298173:4,0,2,0
chr19	9298174	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=137,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:4,2:0,1:0|1:9298173_T_TA:9298173:4,0,3,0
chr19	9298780	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:9298780_T_G:9298780:0,3,0,1
chr19	9298781	.	T	TGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:9298780_T_G:9298780:0,3,0,1
chr19	9298782	.	T	TATGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:9298780_T_G:9298780:0,3,0,1
chr19	9298799	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	9362599	.	GTGA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=204,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.327:7:1,2:3,0:0|1:9362599_GTGA_G:9362599:2,3,1,1
chr19	9362603	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=204,68;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,2:4,0:0|1:9362599_GTGA_G:9362599:2,3,1,1
chr19	9407408	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,73;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:6,5:15,0:10,11,4,1
chr19	9408228	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:9408228_A_ATT:9408228:0,3,0,1
chr19	9408231	.	A	ATATACAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:9408228_A_ATT:9408228:0,3,0,1
chr19	9413190	.	AC	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:5,14,0,2
chr19	9449149	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=75,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr19	9449337	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr19	9449347	.	AG	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:9449347_AG_TT:9449347:0,4,0,1
chr19	9449354	.	AGGGTCTGCTT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:9449347_AG_TT:9449347:0,4,0,1
chr19	9449370	.	CC	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=170,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:9449347_AG_TT:9449347:0,3,0,1
chr19	9452316	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=213,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr19	9452686	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=158,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:9452686_T_G:9452686:8,3,1,1
chr19	9452687	.	G	GGA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=162,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:0|1:9452686_T_G:9452686:9,3,1,1
chr19	9452689	.	AGT	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=162,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:6,0:0|1:9452686_T_G:9452686:11,3,1,1
chr19	9452694	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=162,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,1:6,0:0|1:9452686_T_G:9452686:11,3,1,1
chr19	9489132	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr19	9490358	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:0,4,1,4
chr19	9524185	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.567:33:8,5:6,12:6,8,9,10
chr19	9524714	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,237;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,0:10,3:16,4,3,0
chr19	9526507	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	9526523	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	9582091	.	TTAAAA	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:6,2:13,2:5,14,0,4
chr19	9582092	.	TAAAA	T,TA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,31,32;MFRL=0,156,148;MMQ=60,60,60;MPOS=22,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,5,6;RU=A;STR;TLOD=23.14,3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,3:0.822,0.139:17:0,4,1:0,9,2:0,0,3,14
chr19	9582096	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.655:12:0,4:2,3:2,2,0,8
chr19	9641625	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:5,0,5,0
chr19	9676999	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:13,2:0|1:9676999_A_T:9676999:8,19,0,2
chr19	9677003	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:13,2:0|1:9676999_A_T:9676999:7,20,0,2
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chr19	9958878	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
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chr19	10071063	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=115,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr19	10077158	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	10077193	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10077193_C_T:10077193:0,0,1,0
chr19	10077200	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,11;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10077193_C_T:10077193:0,0,1,0
chr19	10077210	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10077193_C_T:10077193:0,0,1,0
chr19	10077931	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=193,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,5,1
chr19	10077947	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:2,1,5,1
chr19	10078107	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=91,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,15:0.401:38:16,9:6,4:0|1:10078107_C_G:10078107:17,6,7,8
chr19	10078125	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=91,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,13:0.467:28:10,7:4,4:0|1:10078107_C_G:10078107:8,7,6,7
chr19	10078197	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,1:0,0:0|1:10078197_A_AG:10078197:0,3,0,1
chr19	10078198	.	C	CAAAGAAATAGTAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=171,145;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr19	10078199	.	A	ACCCACCTCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,1:0,0:0|1:10078197_A_AG:10078197:0,3,0,1
chr19	10078505	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	10078802	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=107,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:4,2,1,4
chr19	10078849	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr19	10079013	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:4,4,0,2
chr19	10079206	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=208,828;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr19	10079522	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=214,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	10080140	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,2:3,3:0,4,1,4
chr19	10080619	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:3,2,0,2
chr19	10083510	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=68,169;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.522:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr19	10084551	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:2,1,5,2
chr19	10087200	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:0,2:3,3:0,3,3,3
chr19	10089262	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,18:0.347:51:16,4:15,10:6,27,10,8
chr19	10089492	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=109,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.658:4:1,3:0,0:0|1:10089492_T_TC:10089492:1,0,3,0
chr19	10089498	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=109,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.485:6:2,0:0,0:0|1:10089492_T_TC:10089492:1,2,3,0
chr19	10089502	.	T	G,C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,19,13;MFRL=109,109,198;MMQ=60,60,60;MPOS=14,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.07,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.226,0.323:6:1,0,0:2,0,0:1,2,3,0
chr19	10089797	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,1:3,2:4,2,2,1
chr19	10090467	.	GAAA	G,GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35,35;MFRL=147,128,136;MMQ=60,55,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=A;STR;TLOD=4.73,5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.215,0.312:10:5,1,0:0,1,3:5,0,5,0
chr19	10091294	.	TCA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CA;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:1,0:3,1,2,0
chr19	10091315	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=101,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:14,5,3,0
chr19	10096679	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10096679_GG_CA:10096679:0,1,0,1
chr19	10096682	.	A	ACACAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10096679_GG_CA:10096679:0,1,0,1
chr19	10102491	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,1:15,1:9,14,1,1
chr19	10107459	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=111,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10107459_G_GAT:10107459:0,2,0,1
chr19	10107468	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=221,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:10107459_G_GAT:10107459:0,1,0,1
chr19	10107474	.	ATGG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=221,246;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:10107459_G_GAT:10107459:0,1,0,1
chr19	10108207	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10108207_T_C:10108207:0,0,0,1
chr19	10108213	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:10108207_T_C:10108207:0,1,0,1
chr19	10108215	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:10108207_T_C:10108207:0,1,0,1
chr19	10108929	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.713:5:1,1:0,2:0|1:10108929_C_T:10108929:0,1,1,3
chr19	10108931	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:10108929_C_T:10108929:1,3,0,1
chr19	10108933	.	C	CCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1|0:10108929_C_T:10108929:1,3,0,1
chr19	10112148	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:1,1,5,0
chr19	10116703	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,4:1,6:2,1,6,4
chr19	10131866	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=148,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:2,0,2,0
chr19	10160578	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	10165844	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0|1:10165844_G_A:10165844:2,1,0,1
chr19	10165854	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:10165844_G_A:10165844:1,2,0,1
chr19	10166233	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:10166233_C_T:10166233:3,0,3,1
chr19	10166243	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,2:3,2:0|1:10166233_C_T:10166233:4,0,4,1
chr19	10166253	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0|1:10166233_C_T:10166233:3,0,4,1
chr19	10169477	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=76,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr19	10169810	.	CCCT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	10200540	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	10200706	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:6,8,1,1
chr19	10200754	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=138,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,0:2,2:3,4,1,1
chr19	10217359	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:10217359_A_C:10217359:0,4,2,0
chr19	10217365	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,0:0|1:10217359_A_C:10217359:0,4,2,0
chr19	10217370	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:10217359_A_C:10217359:0,4,2,0
chr19	10218434	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,2,1
chr19	10218621	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,6:8,5:6,8,5,6
chr19	10218802	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,0:8,3:6,11,0,3
chr19	10220622	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:8,1:13,1:12,11,1,1
chr19	10221151	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,5:0,3,2,4
chr19	10222315	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	10224632	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	10225682	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=185,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr19	10226256	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.407:12:4,2:3,1:2,5,1,4
chr19	10226340	.	GTGCC	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGCC;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:2,1:3,3,1,1
chr19	10229282	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,13;MFRL=113,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:11,0:9,12,2,0
chr19	10229297	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=117,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:6,7:6,9:6,6,7,9
chr19	10229521	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:1,2:3,4:0,4,0,7
chr19	10229726	.	TGGCAGTCCTCACTCACCTCCC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCAGTCCTCACTCACCTCCC;STR;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.351:19:1,1:7,5:8,5,4,2
chr19	10251067	.	AT	TC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:10251067_AT_TC:10251067:0,4,0,1
chr19	10251074	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:10251067_AT_TC:10251067:0,4,0,1
chr19	10251076	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:10251067_AT_TC:10251067:0,3,0,1
chr19	10251080	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:10251067_AT_TC:10251067:0,2,0,1
chr19	10251084	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:0,1:0|1:10251067_AT_TC:10251067:0,2,0,1
chr19	10257245	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	10262618	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=179,236;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:10262618_T_C:10262618:0,4,0,1
chr19	10262620	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=179,236;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:10262618_T_C:10262618:0,4,0,1
chr19	10265248	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=58.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,13,4
chr19	10267077	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,10:0,0,10,4
chr19	10270746	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	10273296	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.882:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr19	10277198	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,14;MFRL=143,160;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.242:11:0,0:3,0:7,2,2,0
chr19	10305436	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.306:20:8,1:4,0:0|1:10305436_A_G:10305436:0,14,6,0
chr19	10305443	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=156,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.216:30:12,0:7,1:3,21,6,0
chr19	10305447	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.150:31:18,0:9,1:0|1:10305436_A_G:10305436:6,21,4,0
chr19	10334443	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr19	10334516	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.230:37:8,0:11,0:9,18,10,0
chr19	10334663	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr19	10362882	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=206,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,5:4,2:5,0,8,0
chr19	10370490	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,5:4,3:0,12,1,7
chr19	10370542	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=175,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr19	10385743	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	10395208	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:3,1,6,3
chr19	10398859	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:12,1:12,3:6,18,0,4
chr19	10398942	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=177,186;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:4,0:0,1:0|1:10398942_A_G:10398942:0,4,0,1
chr19	10398947	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=177,186;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:10398942_A_G:10398942:0,4,0,1
chr19	10398949	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=180,186;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:10398942_A_G:10398942:0,3,0,1
chr19	10402131	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.503:32:6,3:8,12:10,6,8,8
chr19	10403947	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,12:0.346:35:16,4:6,7:0|1:10403947_T_C:10403947:11,12,5,7
chr19	10403950	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:30,3:0.113:33:17,3:11,0:1|0:10403947_T_C:10403947:13,17,1,2
chr19	10425995	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	10426628	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:9,10:6,2:3,12,1,11
chr19	10429017	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:8,1:12,2:7,15,1,2
chr19	10429120	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:1,1,0,3
chr19	10429122	.	CC	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr19	10431799	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	10444826	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,4,4
chr19	10449665	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr19	10464138	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:6,2:4,4:8,2,4,2
chr19	10464687	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:0,2:3,1:2,2,3,0
chr19	10464811	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:2,9,1,2
chr19	10465376	.	C	CATTATCAATACCCCCTGCCCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=215,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10465376_C_CATTATCAATACCCCCTGCCCAG:10465376:0,1,0,1
chr19	10465379	.	G	GGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=215,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10465376_C_CATTATCAATACCCCCTGCCCAG:10465376:0,1,0,1
chr19	10472358	.	C	CATAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10472358_C_CATAA:10472358:0,0,0,1
chr19	10472360	.	T	TCCAACTTTACATTCTTTGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10472358_C_CATAA:10472358:0,0,0,1
chr19	10472933	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=138,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,0:2,4:3,1,3,2
chr19	10475738	.	A	ACTGATTATTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr19	10477067	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:3,2:5,6:7,2,5,3
chr19	10561261	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=128,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr19	10561273	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.351:11:3,0:1,0:5,2,4,0
chr19	10561656	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:10561656_C_G:10561656:0,0,0,1
chr19	10561657	.	G	GCTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10561656_C_G:10561656:0,0,0,1
chr19	10565646	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=115,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10565646_G_T:10565646:1,0,0,1
chr19	10565648	.	G	GTTATCTGGATCTCCCAAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.588:3:0,1:1,0:0|1:10565646_G_T:10565646:1,0,0,2
chr19	10568632	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,13;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.473:13:2,0:2,0:0|1:10568632_T_C:10568632:1,6,6,0
chr19	10568635	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.473:13:2,3:4,2:0|1:10568632_T_C:10568632:1,6,6,0
chr19	10568640	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.473:13:3,2:4,0:0|1:10568632_T_C:10568632:1,6,6,0
chr19	10568646	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:0|1:10568632_T_C:10568632:2,7,5,0
chr19	10568648	.	C	CCCCCCCCGGA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,1:3,1:0|1:10568632_T_C:10568632:2,7,5,0
chr19	10602180	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	10602619	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:13,2:3,4:10,6,5,1
chr19	10655824	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=209,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr19	10659804	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=175,91;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:8,1:1,1:0,9,0,2
chr19	10662688	.	CCG	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,2:3,0:0|1:10662688_CCG_C:10662688:0,7,0,2
chr19	10662693	.	C	CAGT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:10662688_CCG_C:10662688:0,6,0,2
chr19	10662697	.	C	CTGAGTGTGGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=130,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:10662688_CCG_C:10662688:0,4,0,1
chr19	10662699	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=130,184;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:10662688_CCG_C:10662688:0,4,0,1
chr19	10665691	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0|1:10665691_T_C:10665691:0,0,9,1
chr19	10665695	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0|1:10665691_T_C:10665691:0,0,9,1
chr19	10665912	.	C	CCCGCCCTGCCCGCAGCGCACCTGGCT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=104.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,12:0,6:0,0,8,16
chr19	10665951	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=199,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.487:20:6,3:3,4:4,6,5,5
chr19	10668383	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,4:0,13:0,0,4,14
chr19	10668953	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr19	10670312	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.279:9:1,1:4,1:5,2,0,2
chr19	10670451	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,1,3
chr19	10672490	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=166,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:6,2:5,9,0,2
chr19	10672493	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:1,7,4,4
chr19	10675564	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,2:7,4:9,1,3,3
chr19	10676343	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	10676487	.	G	GC,GCC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=37,34,34;MFRL=134,154,145;MMQ=60,60,60;MPOS=18,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=C;STR;TLOD=27.76,17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,12,9:0.523,0.404:22:1,5,1:0,7,6:1,0,10,11
chr19	10683844	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:10683844_C_T:10683844:1,3,0,1
chr19	10683855	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=186,138;MMQ=56,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:10683844_C_T:10683844:0,4,0,1
chr19	10683859	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=186,138;MMQ=56,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,0:0,1:0|1:10683844_C_T:10683844:0,4,0,1
chr19	10689691	.	C	CTTTTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,25;RU=T;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.882:5:0,3:0,0:0,0,3,2
chr19	10690557	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr19	10713322	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,1:1,1:0,3,1,2
chr19	10742390	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	10742831	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,0:16,3:8,20,1,2
chr19	10749041	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:9,2:1,12,0,2
chr19	10792063	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=181,139;MMQ=60,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10792063_C_CA:10792063:0,1,0,1
chr19	10792066	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=181,139;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10792063_C_CA:10792063:0,1,0,1
chr19	10792068	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=181,139;MMQ=60,30;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10792063_C_CA:10792063:0,1,0,1
chr19	10792073	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=181,139;MMQ=60,30;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10792063_C_CA:10792063:0,1,0,1
chr19	10792075	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=181,139;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10792063_C_CA:10792063:0,1,0,1
chr19	10799955	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,1:11,1:9,15,1,1
chr19	10883126	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr19	10906973	.	C	CACTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	10916684	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,0:0,1,1,4
chr19	10935939	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,144;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:1,11,1,1
chr19	10960851	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	10961273	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	10970558	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr19	11018874	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:11018874_C_A:11018874:0,4,0,1
chr19	11018877	.	T	TGGGAGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:11018874_C_A:11018874:0,4,0,1
chr19	11018882	.	C	CCCCAACAGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:11018874_C_A:11018874:0,4,0,1
chr19	11019941	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=191,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11019941_T_TGG:11019941:0,1,0,1
chr19	11019943	.	C	CATATAGTTGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=191,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11019941_T_TGG:11019941:0,1,0,1
chr19	11031464	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,10,3
chr19	11105560	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=135,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:4,1:10,1:8,7,1,1
chr19	11105561	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:4,1:10,1:8,7,1,1
chr19	11105608	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,8,8
chr19	11106790	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	11107133	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr19	11113902	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr19	11136215	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr19	11136857	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	11144271	.	C	CACAAGTGTCATAGCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,36;MFRL=177,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:1,1:2,0:0|1:11144271_C_CACAAGTGTCATAGCAA:11144271:0,3,0,1
chr19	11144276	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=177,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:11144271_C_CACAAGTGTCATAGCAA:11144271:0,3,0,1
chr19	11151939	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	11211099	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=229,205;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.677:4:1,2:0,1:0|1:11211099_T_C:11211099:0,1,0,3
chr19	11211102	.	ATTTCTGGTCTCAAGTGAT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=301,205;MMQ=55,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:0,1:0|1:11211099_T_C:11211099:0,2,0,3
chr19	11221454	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:11221454_T_C:11221454:0,0,0,5
chr19	11221457	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:11221454_T_C:11221454:0,2,0,3
chr19	11222186	.	C	CTTTTCTTTTCTTTCTTTTTCTTAGAGGGAGTCCCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=157,65;MMQ=60,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:5,3,1,1
chr19	11224181	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=210,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,0,2
chr19	11224491	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr19	11227480	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr19	11238807	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:0,6,0,6
chr19	11241877	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,4:3,0:5,0,2,3
chr19	11241915	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,3:2,7:7,0,11,0
chr19	11242044	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.487:27:8,6:5,7:5,9,2,11
chr19	11258593	.	AAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.340:7:2,0:2,2:4,1,0,2
chr19	11266399	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:11266399_C_A:11266399:0,2,0,1
chr19	11266420	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11266399_C_A:11266399:0,1,0,1
chr19	11280448	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=159,163;MMQ=60,36;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:11280448_C_G:11280448:3,0,1,0
chr19	11280458	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=159,163;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:11280448_C_G:11280448:3,0,1,0
chr19	11280469	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=138,163;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:11280469_T_C:11280469:2,0,1,0
chr19	11280473	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=134,163;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:11280469_T_C:11280469:3,0,1,0
chr19	11280475	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=134,163;MMQ=60,36;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:11280469_T_C:11280469:3,0,1,0
chr19	11303459	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:11303459_GC_G:11303459:0,0,2,3
chr19	11303469	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:11303459_GC_G:11303459:0,0,3,3
chr19	11304503	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:14,1:9,3:16,7,3,1
chr19	11304689	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,9;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.147:22:4,0:13,0:4,15,0,3
chr19	11304696	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.194:17:3,0:4,2:3,11,0,3
chr19	11304705	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.290:12:2,0:3,1:1,8,0,3
chr19	11310920	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr19	11311661	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,1:4,1:9,5,0,2
chr19	11311774	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr19	11312495	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,14;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11312495_T_A:11312495:0,0,1,0
chr19	11312498	.	C	CCCA	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11312495_T_A:11312495:0,0,1,0
chr19	11312500	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11312495_T_A:11312495:0,0,1,0
chr19	11312505	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11312495_T_A:11312495:0,0,1,0
chr19	11312509	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11312495_T_A:11312495:0,0,1,0
chr19	11312513	.	TC	GT	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,17;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11312495_T_A:11312495:0,0,1,0
chr19	11312517	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11312495_T_A:11312495:0,0,1,0
chr19	11312520	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,11;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11312495_T_A:11312495:0,0,1,0
chr19	11312525	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11312495_T_A:11312495:0,0,1,0
chr19	11312527	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,13;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11312495_T_A:11312495:0,0,1,0
chr19	11313234	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=168,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:3,0:7,1:0|1:11313234_T_G:11313234:1,10,2,0
chr19	11313256	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,5:0,9:0|1:11313234_T_G:11313234:0,0,4,13
chr19	11314748	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.521:40:12,8:7,12:7,12,10,11
chr19	11314782	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=149,37;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:13,2:17,0:0|1:11314782_GA_G:11314782:7,24,1,1
chr19	11314787	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=149,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:11,2:17,0:0|1:11314782_GA_G:11314782:7,22,1,1
chr19	11314789	.	GTCAA	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=148,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:10,2:16,0:0|1:11314782_GA_G:11314782:7,21,1,1
chr19	11324890	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=107,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,1:5,3:7,1,1,3
chr19	11325394	.	C	CCACACAATCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	11326629	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,6,16
chr19	11346252	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,6:4,5:4,3,6,5
chr19	11347598	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=211,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	11348098	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:3,3:0,3:3,0,7,0
chr19	11348911	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr19	11348960	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=49,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr19	11348984	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:11348984_TG_T:11348984:0,0,1,0
chr19	11348997	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11348984_TG_T:11348984:0,0,1,0
chr19	11358700	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr19	11362809	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:11,2:5,0:10,7,1,1
chr19	11364495	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	11406952	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,8:1,7:0,1,8,7
chr19	11407126	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr19	11409061	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr19	11409111	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	11409494	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr19	11409676	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=137,194;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,0:3,2:0,10,0,2
chr19	11409684	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr19	11409698	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:4,1:0,10,0,3
chr19	11411868	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr19	11417200	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr19	11417418	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:11,2:13,12,0,2
chr19	11446520	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0|1:11446520_T_G:11446520:0,2,0,1
chr19	11446523	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:11446520_T_G:11446520:0,2,0,1
chr19	11460766	.	C	CGGCAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11460766_C_CGGCAA:11460766:0,4,0,1
chr19	11460769	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11460766_C_CGGCAA:11460766:0,4,0,1
chr19	11460917	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=203,260;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:11460917_T_C:11460917:0,2,0,1
chr19	11460927	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=203,260;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11460917_T_C:11460917:0,2,0,1
chr19	11464366	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,10;MFRL=197,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,0:0|1:11464366_T_G:11464366:0,5,1,0
chr19	11464370	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=197,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,0:0|1:11464366_T_G:11464366:0,5,1,0
chr19	11464372	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,10;MFRL=197,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,0:0|1:11464366_T_G:11464366:0,5,1,0
chr19	11464379	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=186,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:11464366_T_G:11464366:0,4,1,0
chr19	11464387	.	C	CAGTGATATTCTAAAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,36;MFRL=174,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr19	11465592	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=80,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr19	11473415	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr19	11493728	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=115,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,1:0,0:0,1,2,0
chr19	11513483	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=199,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:11513483_T_A:11513483:0,4,0,1
chr19	11513488	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=199,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:11513483_T_A:11513483:0,4,0,1
chr19	11513495	.	A	ATAAATTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=199,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:11513483_T_A:11513483:0,4,0,1
chr19	11526892	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,23;MFRL=234,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:0,1:0,0:0|1:11526892_CTT_C:11526892:0,2,0,1
chr19	11526911	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=234,123;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:2,1:0,0:0|1:11526892_CTT_C:11526892:0,2,0,1
chr19	11527820	.	CTTTTTTTTTTTGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=185,229;MMQ=60,41;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr19	11541685	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=111,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,6:1,2:3,2,3,5
chr19	11541712	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr19	11548979	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.226:13:5,1:5,0:0,10,3,0
chr19	11558240	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:0,1:0,1,5,0
chr19	11558340	.	AGAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GAG;STR;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:4,1:0,2:4,0,2,2
chr19	11558702	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr19	11591546	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	11598773	.	TTTATTTAG	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=171,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:11598773_TTTATTTAG_T:11598773:0,3,0,1
chr19	11598787	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=161,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:11598773_TTTATTTAG_T:11598773:0,2,0,1
chr19	11598792	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=166,102;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:11598773_TTTATTTAG_T:11598773:0,3,0,1
chr19	11598796	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=169,102;MMQ=50,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:11598773_TTTATTTAG_T:11598773:0,4,0,1
chr19	11618282	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=137,136;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:10,4:16,0:20,6,4,0
chr19	11657877	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=204,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11657877_G_A:11657877:0,1,0,1
chr19	11657879	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=204,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11657877_G_A:11657877:0,1,0,1
chr19	11725413	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:7,7:11,9:11,8,7,9
chr19	11725431	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:9,1:22,2:17,15,1,2
chr19	11725761	.	AT	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=94,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.591:15:3,5:3,3:3,3,2,7
chr19	11727503	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:5,1,3,2
chr19	11796945	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=188,131;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,0:5,2,3,0
chr19	11878095	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.342:22:5,4:6,3:3,12,0,7
chr19	11892255	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.535:26:5,12:7,2:5,7,6,8
chr19	11918093	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:1,2:2,2,1,4
chr19	11918878	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,108;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:1,8,1,3
chr19	11941221	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=145,171;MMQ=52,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:16,11:6,6:9,13,7,10
chr19	11941256	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=151,169;MMQ=52,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:10,10:5,7:4,11,4,13
chr19	11941363	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,147;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,23:0.400:58:23,13:12,10:30,5,22,1
chr19	11941532	.	C	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,136;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.418:53:15,11:15,11:3,28,2,20
chr19	11943823	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,282;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	11978019	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=236,235;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr19	12015435	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:17,0:9,4:21,5,4,0
chr19	12024135	.	CT	C	.	.	DP=182;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:152,11:0.057:163:90,3:53,8:123,29,7,4
chr19	12024208	.	CT	C,CTT	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=33,33,21;MFRL=137,190,140;MMQ=60,60,60;MPOS=19,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=6.55,58.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,5,35:0.073,0.470:73:11,1,16:16,4,10:0,33,6,34
chr19	12128613	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,5:3,1:6,0,6,0
chr19	12154799	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=143,111;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,4:1,4:2,3,4,4
chr19	12157334	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr19	12185102	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:5,9:5,8:9,1,15,2
chr19	12186761	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,4:6,9:9,4,6,7
chr19	12187861	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,4:9,1:4,10,2,3
chr19	12246208	.	AC	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=169,217;MMQ=53,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:12246208_AC_GT:12246208:3,0,1,0
chr19	12246212	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,217;MMQ=57,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:12246208_AC_GT:12246208:4,0,1,0
chr19	12385749	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,1:0,9:0,0,9,1
chr19	12429913	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,4:10,2:7,6,2,4
chr19	12460705	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=148,386;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,1:14,1:0|1:12460705_A_G:12460705:10,19,1,1
chr19	12460708	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=148,386;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,1:14,1:0|1:12460705_A_G:12460705:10,19,1,1
chr19	12460718	.	GCA	TTC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=149,386;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,1:12,1:0|1:12460705_A_G:12460705:11,15,1,1
chr19	12461846	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,12797432;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:6,0:11,2:9,8,1,1
chr19	12503074	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=183,160;MMQ=34,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,1:4,1:0|1:12503074_G_C:12503074:0,10,0,2
chr19	12503077	.	AT	GC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=192,160;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,1:5,1:0|1:12503074_G_C:12503074:0,11,0,2
chr19	12503096	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=198,186;MMQ=40,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,3:5,3:0,13,0,6
chr19	12503538	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=169,144;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:11,4:7,6:0,18,0,10
chr19	12541532	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,20:0,8:0|1:12541532_C_A:12541532:0,0,18,10
chr19	12541541	.	C	CTG	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=141,158;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:14,8:6,3:0|1:12541532_C_A:12541532:13,7,7,5
chr19	12541542	.	CAA	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=141,158;MMQ=60,41;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:13,7:6,3:0|1:12541532_C_A:12541532:13,7,7,5
chr19	12541547	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=158,143;MMQ=41,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,20:0.618:32:8,12:4,7:0|1:12541532_C_A:12541532:7,5,14,6
chr19	12542355	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,146;MMQ=27,50;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,24:0.431:56:21,13:11,11:16,16,14,10
chr19	12542653	.	TT	GA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:14,10:10,8:11,13,10,8
chr19	12542772	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=163,161;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:8,3:1,0:0,9,0,3
chr19	12542828	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=209,256;MMQ=40,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr19	12542848	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr19	12542851	.	AT	GC,GT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,32,32;MFRL=0,211,234;MMQ=60,40,40;MPOS=7,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.77,4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.565,0.335:6:0,3,1:0,1,1:0,0,1,5
chr19	12542891	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	12543312	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=131,191;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,2:1,6:0,6,0,8
chr19	12543333	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=186,140;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr19	12543866	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,165;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,13:0.211:64:26,7:25,6:29,22,12,1
chr19	12551616	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=169,185;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,2,0
chr19	12551671	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,4:2,4:4,1,7,1
chr19	12551789	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:2,4:5,6:0,7,2,8
chr19	12574740	.	C	CAAAAAAAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=296,0;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=21,32;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.618:3:0,1:1,0:1,0,1,1
chr19	12576462	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:6,0:10,4:5,11,0,4
chr19	12576573	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr19	12577723	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,0,20
chr19	12595454	.	GC	AA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,0:11,2:13,12,0,2
chr19	12734684	.	TGGGGGGG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,1;RU=G;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:0|1:12734684_TGGGGGGG_T:12734684:1,2,0,1
chr19	12734688	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12734688_G_T:12734688:0,1,0,1
chr19	12734695	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=188,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:12734684_TGGGGGGG_T:12734684:0,3,0,1
chr19	12734700	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=188,125;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:12734684_TGGGGGGG_T:12734684:0,3,0,1
chr19	12734702	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:12734688_G_T:12734688:0,3,0,1
chr19	12738694	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,0:6,2:0|1:12738694_A_C:12738694:7,6,0,2
chr19	12738697	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:12738694_A_C:12738694:7,6,0,2
chr19	12760287	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.357:15:4,2:4,3:6,4,3,2
chr19	12763350	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.558:16:3,5:3,0:0,7,0,9
chr19	12766653	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:7,0:9,2:8,9,2,0
chr19	12768391	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.386:50:14,12:16,7:12,19,3,16
chr19	12768796	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=114,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,0:1,0,0,2
chr19	12768843	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:4,2:8,11:7,5,8,5
chr19	12772263	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr19	12774456	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:12774456_G_A:12774456:2,0,1,0
chr19	12774465	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:12774456_G_A:12774456:2,0,1,0
chr19	12780549	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,6:7,2:7,1,6,2
chr19	12781728	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr19	12787003	.	A	AAAGAGGTAGAAAGTTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr19	12802153	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,0:1,3:1,2,2,3
chr19	12814528	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,2:12,0:13,8,2,0
chr19	12856216	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=130,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:12856216_C_T:12856216:2,1,1,0
chr19	12856230	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=130,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:12856216_C_T:12856216:2,1,1,0
chr19	12874075	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,37;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:5,2:12,0:12,8,1,1
chr19	12876372	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,154;MMQ=49,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:4,0,1,0
chr19	12882052	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:9,2:8,0:8,11,1,1
chr19	12918416	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,140;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:12918416_A_T:12918416:1,6,0,2
chr19	12918425	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,140;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:12918416_A_T:12918416:1,5,0,2
chr19	12939461	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	12939792	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,2:0,3:1,3,0,6
chr19	12969291	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.482:24:6,3:5,3:6,6,4,8
chr19	12977515	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,0:5,2:9,3,2,0
chr19	12986893	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:9,7,0,2
chr19	12989396	.	G	GTTA	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=135,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:12989396_G_GTTA:12989396:8,8,1,1
chr19	12989397	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=135,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:12989396_G_GTTA:12989396:8,8,1,1
chr19	12989399	.	GGA	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=132,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:9,2:0|1:12989396_G_GTTA:12989396:9,8,1,1
chr19	12989403	.	AAGG	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:12989396_G_GTTA:12989396:9,7,1,1
chr19	12989408	.	G	GCCT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:12989396_G_GTTA:12989396:8,7,1,1
chr19	13002400	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr19	13002563	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	13003094	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=178,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.411:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	13003101	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=178,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	13008197	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,19;MFRL=160,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:5,1:0|1:13008197_G_T:13008197:2,8,1,1
chr19	13008204	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=173,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,0:5,1:0|1:13008197_G_T:13008197:1,9,1,1
chr19	13010643	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr19	13015530	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0|1:13015530_A_G:13015530:0,0,0,7
chr19	13015541	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=149,237;MMQ=60,58;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:13015530_A_G:13015530:0,4,0,1
chr19	13015547	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=158,237;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:13015530_A_G:13015530:0,3,0,1
chr19	13015553	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=198,237;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:13015530_A_G:13015530:0,2,0,1
chr19	13033461	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	13035006	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:3,2,2,1
chr19	13036038	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.342:12:7,2:1,2:2,6,1,3
chr19	13051632	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:18,3:20,0:21,18,1,2
chr19	13184021	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr19	13220676	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,0,2
chr19	13220703	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr19	13226558	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.137:26:16,0:7,3:6,17,1,2
chr19	13247292	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=168,303;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:13247292_C_T:13247292:0,3,0,1
chr19	13247305	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:13247292_C_T:13247292:0,1,0,1
chr19	13248247	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.665:4:0,1:1,1:0|1:13248247_A_C:13248247:0,1,3,0
chr19	13248250	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:1,1:1,0:0|1:13248247_A_C:13248247:1,1,3,0
chr19	13259975	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:0,22,0,2
chr19	13260225	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.702:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	13260244	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=180,130;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13260244_G_A:13260244:1,0,1,0
chr19	13260248	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=180,130;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13260244_G_A:13260244:1,0,1,0
chr19	13260252	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=180,130;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13260244_G_A:13260244:1,0,1,0
chr19	13260256	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.745:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	13323124	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	13323604	.	AC	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=112,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr19	13335432	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:5,3:5,2,4,1
chr19	13338180	.	AAAG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAG;STR;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:5,5:9,7:12,5,7,5
chr19	13339417	.	GAGAT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=174,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	13355900	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	13356150	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:1,1:4,3:0,5,0,5
chr19	13363745	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	13364012	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	13366020	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,2:13,0:5,21,1,1
chr19	13373477	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,12,0
chr19	13387837	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.419:10:2,2:4,2:5,1,4,0
chr19	13410266	.	G	GATTCAAGTGGTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	13411482	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,1,17
chr19	13414796	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	13440982	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr19	13443770	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=108,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr19	13445144	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=103,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,4:4,1,7,0
chr19	13445372	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=190,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13445372_T_C:13445372:0,1,0,1
chr19	13445375	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,30;MFRL=190,239;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:13445372_T_C:13445372:0,1,0,1
chr19	13563867	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:13563867_G_T:13563867:0,3,1,1
chr19	13563869	.	G	GACCAAGAAAAACTCAAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:13563867_G_T:13563867:0,3,1,1
chr19	13865070	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:5,3:4,4:6,3,5,3
chr19	13865275	.	AT	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	13866957	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr19	13873202	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=136,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:5,2:5,10,1,1
chr19	13885531	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.092:52:19,2:27,2:8,40,2,2
chr19	13919900	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:7,13,1,1
chr19	13928078	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:13928078_T_C:13928078:4,0,0,1
chr19	13928082	.	G	GCTTCCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:13928078_T_C:13928078:4,0,0,1
chr19	13936276	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=179,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,3:3,0:7,0,3,0
chr19	13940959	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=248,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr19	13988040	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=80,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:1,1,3,0
chr19	13988321	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13988321_C_G:13988321:1,0,0,1
chr19	13988325	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=168,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:13988321_C_G:13988321:2,0,0,1
chr19	14003896	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,6:3,5:6,3,10,1
chr19	14015711	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=155,108;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:4,8:6,3:3,7,4,7
chr19	14015815	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=156,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	14020573	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	14024336	.	C	CCT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=144,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.095:29:14,2:11,0:0|1:14024336_C_CCT:14024336:14,13,1,1
chr19	14024337	.	A	ATTG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=144,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:10,2:8,0:0|1:14024336_C_CCT:14024336:14,13,1,1
chr19	14024339	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,1:12,0:0|1:14024336_C_CCT:14024336:14,13,1,1
chr19	14031326	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:8,8:0,1:6,3,9,1
chr19	14038791	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.322:13:5,3:3,0:7,2,1,3
chr19	14048587	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:6,5:6,6:7,5,7,4
chr19	14063294	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,8:4,3:6,2,9,2
chr19	14063541	.	GT	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	14065074	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=126,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:3,2,3,0
chr19	14065488	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr19	14067111	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,15;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:3,0:3,3,2,0
chr19	14070363	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=190,361;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14070363_T_C:14070363:0,1,1,0
chr19	14070366	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=190,361;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14070363_T_C:14070363:0,1,1,0
chr19	14070371	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=190,361;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:14070363_T_C:14070363:0,1,1,0
chr19	14070779	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:12,0:0|1:14070779_T_TG:14070779:7,20,2,0
chr19	14070782	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.227:29:10,1:12,0:0|1:14070779_T_TG:14070779:2,20,7,0
chr19	14070788	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.117:28:10,1:12,0:0|1:14070779_T_TG:14070779:4,21,3,0
chr19	14076366	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=23,29;MFRL=162,158;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:2,2:3,0:3,4,0,2
chr19	14076369	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,24;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:3,2:3,0:5,1,0,4
chr19	14076372	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,23;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:3,0:5,3,0,3
chr19	14076377	.	GTC	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=197,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:2,1:6,3,0,2
chr19	14076384	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,10;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:1,0:4,2,0,3
chr19	14076389	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,23;MFRL=205,176;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,0:3,1,1,1
chr19	14139004	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,9:0,0,19,7
chr19	14139299	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=229,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14139299_G_GA:14139299:0,1,0,1
chr19	14139302	.	G	GTCTTTTTAACAGAGACTGCCACTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=229,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14139299_G_GA:14139299:0,1,0,1
chr19	14141480	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=191,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:2,1,4,1
chr19	14142616	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr19	14143096	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	14150303	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr19	14150441	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,2:8,1:10,10,1,2
chr19	14157478	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr19	14161547	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=90,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:1,5:4,0:3,3,3,2
chr19	14161745	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=212,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,0:0,2:1,1,0,2
chr19	14161794	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=194,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	14162347	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=208,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr19	14162676	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,8,2
chr19	14165598	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:0,3,1,4
chr19	14166065	.	A	AGGACAAAAGGGAAGACAGGGTTAAGATG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=108,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGACAAAAGGGAAGACAGGGTTAAGATG;STR;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.467:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr19	14201169	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,1:3,1:0|1:14201169_C_CG:14201169:0,5,2,0
chr19	14201172	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0|1:14201169_C_CG:14201169:0,5,2,0
chr19	14201177	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,0:0|1:14201169_C_CG:14201169:0,4,2,0
chr19	14201181	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=16,29;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,1:0|1:14201169_C_CG:14201169:0,4,1,0
chr19	14203882	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr19	14208085	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	14208307	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=150,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:1,1:6,6,0,2
chr19	14267378	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=206,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr19	14294288	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr19	14492219	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=263,164;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.606:11:2,0:2,5:4,0,6,1
chr19	14499357	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	14499410	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr19	14508385	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=184173,163;MMQ=44,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:2,0,9,1
chr19	14508564	.	CTGGAAG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=223,185;MMQ=30,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:1,1:1,0:0|1:14508564_CTGGAAG_C:14508564:0,2,0,1
chr19	14508572	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=223,185;MMQ=30,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:14508564_CTGGAAG_C:14508564:0,2,0,1
chr19	14508574	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=223,185;MMQ=30,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:14508564_CTGGAAG_C:14508564:0,2,0,1
chr19	14508600	.	GG	TT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14508600_GG_TT:14508600:0,0,0,1
chr19	14508605	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14508600_GG_TT:14508600:0,0,0,1
chr19	14508964	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=157.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,25:0,22:0,0,20,28
chr19	14522346	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,2:12,1:11,12,3,0
chr19	14522434	.	GCCTTA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTTA;STR;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.914:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr19	14552325	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	14561679	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.108:30:8,0:9,0:13,14,3,0
chr19	14561722	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=154.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,17:0,24:0,0,18,25
chr19	14578354	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:3,1,4,2
chr19	14580216	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,113;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:15,0:19,3:21,14,0,3
chr19	14580529	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=12,22;MFRL=189,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.350:10:0,3:3,0:5,2,3,0
chr19	14581736	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:14581736_G_T:14581736:0,2,0,1
chr19	14581742	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=208,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:14581736_G_T:14581736:0,3,0,1
chr19	14589378	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,5:2,2:4,5,5,2
chr19	14591660	.	A	AGTCTCCGAGCAGCCATGTGGGTGTTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=137,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr19	14591677	.	G	GGTTCAAGATGGCCTCACTACATGTTGGTTACCTTGGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=108,124;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	14593483	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,1:10,1:19,1,2,0
chr19	14627895	.	C	CCAGAACTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	14676172	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	14676401	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:14676401_C_T:14676401:2,0,1,0
chr19	14676421	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14676401_C_T:14676401:1,0,1,0
chr19	14694303	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,157;MMQ=52,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:8,5:3,6:2,9,2,9
chr19	14698416	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,168;MMQ=27,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr19	14740824	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:6,0,6,0
chr19	14743902	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=214,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,3,1
chr19	14744181	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	14758168	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:5,3:5,9:6,4,5,7
chr19	14769339	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,10,9
chr19	14772984	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	14779550	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr19	14804183	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	14806017	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	14806551	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr19	14826849	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr19	14827076	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,4:3,1:1,7,1,4
chr19	14829749	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,6:4,5:4,4,8,3
chr19	14847168	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=209,203;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14847168_G_T:14847168:0,1,0,1
chr19	14847174	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=209,203;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14847168_G_T:14847168:0,1,0,1
chr19	14847176	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,34;MFRL=209,203;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14847168_G_T:14847168:0,1,0,1
chr19	14847184	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=209,203;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14847168_G_T:14847168:0,1,0,1
chr19	14847187	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=209,203;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14847168_G_T:14847168:0,1,0,1
chr19	14854233	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=90,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,0:16,2:8,17,2,0
chr19	14854671	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,11;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:14854671_G_T:14854671:0,2,0,1
chr19	14854677	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,19;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:14854671_G_T:14854671:0,2,0,1
chr19	14854679	.	T	TGGCACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14854671_G_T:14854671:0,1,0,1
chr19	14856949	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr19	14857179	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:4,3:3,2:5,3,3,2
chr19	14857891	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=221,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr19	14862517	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:9,5:4,5:1,12,0,11
chr19	14862555	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.443:11:4,3:2,2:0,6,0,5
chr19	14865684	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,2,1
chr19	14865704	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr19	14866974	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr19	14867186	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr19	14875201	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:7,1,6,2
chr19	14876447	.	G	C	.	.	DP=173;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=136,136;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:160,7:0.044:167:55,1:56,2:87,73,0,7
chr19	14877947	.	A	ATCCGCAGGTTCCC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,197;MMQ=55,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,2:7,0:11,5,0,2
chr19	14910654	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.654:27:4,9:5,8:6,3,11,7
chr19	14939337	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=165,240;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:14939337_T_C:14939337:0,2,0,1
chr19	14939341	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=165,240;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:14939337_T_C:14939337:0,2,0,1
chr19	14951889	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,20:0.567:35:9,13:5,7:0|1:14951889_A_G:14951889:8,7,12,8
chr19	14951898	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=120,93;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,14:0.405:35:13,9:6,5:1|0:14951889_A_G:14951889:10,11,6,8
chr19	14952706	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AG;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,3:2,0:0,6,0,3
chr19	14992178	.	C	CTATT	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TATT;STR;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.482:18:7,7:2,2:0,9,0,9
chr19	14992249	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.233:18:7,4:6,0:0|1:14992249_A_C:14992249:1,13,0,4
chr19	14992251	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.233:18:8,1:5,0:0|1:14992249_A_C:14992249:1,13,0,4
chr19	15052983	.	T	TATC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr19	15053343	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15053343_C_G:15053343:0,0,0,1
chr19	15053351	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15053343_C_G:15053343:0,0,0,1
chr19	15072787	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr19	15075020	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	15122045	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,2,1
chr19	15124474	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr19	15131213	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	15131261	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,3:3,5:5,4,8,0
chr19	15132545	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:1,0:0,1:1,0,1,2
chr19	15132574	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr19	15164857	.	GG	AC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=155,112;MMQ=52,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15164857_GG_AC:15164857:0,1,0,1
chr19	15164860	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=155,112;MMQ=52,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15164857_GG_AC:15164857:0,1,0,1
chr19	15164863	.	TC	AT,TAGGTCCATTGCAACCTCTGCCCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31,32;MFRL=0,112,155;MMQ=60,60,52;MPOS=10,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr19	15164866	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=155,112;MMQ=52,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15164857_GG_AC:15164857:0,1,0,1
chr19	15164869	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15164857_GG_AC:15164857:0,0,0,1
chr19	15166029	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:5,2:15,0:6,14,1,1
chr19	15166162	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:1,1,3,1
chr19	15166728	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.348:7:0,0:2,0:5,0,2,0
chr19	15166997	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=204,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr19	15198024	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.490:49:10,9:15,15:11,14,13,11
chr19	15198606	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr19	15220294	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15220294_C_CTG:15220294:0,0,0,1
chr19	15220296	.	T	TCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15220294_C_CTG:15220294:0,0,0,1
chr19	15220299	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15220294_C_CTG:15220294:0,0,0,1
chr19	15222687	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	15223466	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	15226281	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=171,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	15226574	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:15226574_AGG_A:15226574:2,2,0,1
chr19	15226578	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:15226574_AGG_A:15226574:2,2,0,1
chr19	15226585	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=213,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0,3,1,0
chr19	15226590	.	AC	A,CC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,29,12;MFRL=181,150,195;MMQ=60,60,60;MPOS=2,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,0,0:0,1,0:1,3,1,1
chr19	15226611	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:3,2,2,1
chr19	15230219	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.476:32:7,5:8,9:14,3,11,4
chr19	15233631	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr19	15235932	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr19	15273221	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,3:0,0,4,1
chr19	15273231	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,4:0,0,3,2
chr19	15273248	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr19	15273381	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=230,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.916:14:0,6:0,7:0,1,3,10
chr19	15276919	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:15276919_G_A:15276919:0,0,3,4
chr19	15276923	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:15276919_G_A:15276919:0,0,3,4
chr19	15276945	.	C	CAACTAAAAGATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=141,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	15278057	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,3,3
chr19	15281386	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=108,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,3:1,0,1,3
chr19	15285272	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	15289613	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=78,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:3,0:3,3,2,0
chr19	15292366	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,15,0
chr19	15296356	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.472:6:2,1:1,0:3,0,0,3
chr19	15300069	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,4,6
chr19	15303036	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:19,0,2,0
chr19	15303225	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,7:4,6:3,7,6,9
chr19	15308280	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:4,0,4,0
chr19	15338370	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:9,1:5,11,1,1
chr19	15353805	.	G	GGAAAATGGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr19	15466240	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	15471569	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	15471856	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	15483249	.	C	CTCGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15483249_C_CTCGT:15483249:0,0,0,1
chr19	15483251	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15483249_C_CTCGT:15483249:0,0,0,1
chr19	15484202	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:2,7,0,2
chr19	15485350	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	15508130	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,3,5
chr19	15511205	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.408:13:3,3:4,2:0,8,0,5
chr19	15514778	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=134,282;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:9,2:7,0:0|1:15514778_C_T:15514778:14,4,0,2
chr19	15514782	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=134,282;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,2:6,0:0|1:15514778_C_T:15514778:14,4,0,2
chr19	15533821	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,87;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	15535086	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.186:21:5,0:12,0:16,1,0,4
chr19	15562540	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	15564390	.	C	CCCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=237,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15564390_C_CCCCA:15564390:0,1,0,1
chr19	15564396	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=237,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15564390_C_CCCCA:15564390:0,1,0,1
chr19	15570931	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=35,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,2:1,2:1,1,5,0
chr19	15587345	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.456:17:6,4:2,4:2,7,2,6
chr19	15587438	.	T	TTAAGGGCAGCCAAAGAGAAAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=255,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	15587456	.	C	CTCTTTTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15587456_C_CTCTTTTG:15587456:0,0,0,1
chr19	15587457	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15587456_C_CTCTTTTG:15587456:0,0,0,1
chr19	15651539	.	GCC	G	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=33,34;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=C;STR;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,9:0.345:27:5,7:13,2:0|1:15651539_GCC_G:15651539:9,9,4,5
chr19	15651548	.	AAT	A	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:5,7:12,2:0|1:15651539_GCC_G:15651539:8,11,4,5
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chr19	15651553	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:6,5:13,2:0|1:15651539_GCC_G:15651539:8,11,4,5
chr19	15651556	.	G	GAGC	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.296:25:5,5:13,2:0|1:15651539_GCC_G:15651539:7,11,2,5
chr19	15651560	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:4,4:10,1:0|1:15651539_GCC_G:15651539:5,11,1,4
chr19	15651562	.	CG	C	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:4,4:10,1:0|1:15651539_GCC_G:15651539:4,11,1,4
chr19	15651564	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:5,3:7,1:0|1:15651539_GCC_G:15651539:4,11,1,4
chr19	15651568	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:5,3:6,1:0|1:15651539_GCC_G:15651539:3,8,0,4
chr19	15655168	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr19	15659149	.	C	CACGGGGACACTGTCTGATGTACGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=203,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	15730498	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,4:0,11:0,0,8,9
chr19	15730641	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,0:4,2:1,7,0,2
chr19	15733203	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr19	15734674	.	C	CTTCTACTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=169,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:15734674_C_CTTCTACTT:15734674:2,1,0,1
chr19	15734676	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=169,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:15734674_C_CTTCTACTT:15734674:2,1,0,1
chr19	15734679	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=169,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:15734674_C_CTTCTACTT:15734674:2,1,0,1
chr19	15739084	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr19	15739274	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:3,1:1,1:2,2,1,1
chr19	15739315	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr19	15739935	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr19	15739992	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr19	15740220	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	15740268	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	15769253	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=179,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,1:5,6:7,2,3,4
chr19	15769270	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,2:5,6:7,5,4,4
chr19	15769449	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:5,2:2,3:3,4,2,3
chr19	15769478	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=148,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:6,2:3,1:7,2,3,0
chr19	15769529	.	GC	TT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,4:5,6:10,2,8,3
chr19	15769664	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr19	15769992	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr19	15770018	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=158,164;MMQ=27,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=72.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,18:0.792:22:1,9:2,8:0|1:15770018_T_C:15770018:3,1,16,2
chr19	15770020	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=158,164;MMQ=27,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=72.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,18:0.792:22:2,9:2,9:0|1:15770018_T_C:15770018:3,1,16,2
chr19	15770027	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=152,173;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.220:25:10,3:10,2:17,3,4,1
chr19	15784319	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	15784617	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	15788996	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,0:3,4:6,0,4,0
chr19	15789034	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr19	15789250	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:15789250_A_G:15789250:0,0,2,8
chr19	15789257	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0|1:15789250_A_G:15789250:0,0,1,6
chr19	15789282	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr19	15789302	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr19	15789311	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=168,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr19	15789316	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr19	15791132	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.608:28:3,6:5,8:6,5,8,9
chr19	15791180	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=119.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,18:0,17:0,0,15,20
chr19	15793178	.	TC	CG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,175;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,0:13,2,2,0
chr19	15795842	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,16,2
chr19	15806667	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,2:3,6:5,0,7,1
chr19	15806703	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.532:22:5,3:4,5:6,4,9,3
chr19	15807062	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=130,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:3,6:6,4:5,4,4,7
chr19	15807157	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=180,159;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,4:5,0:0|1:15807157_A_G:15807157:2,4,3,1
chr19	15807175	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:3,7:5,0:0|1:15807157_A_G:15807157:5,3,6,1
chr19	15807212	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:6,4:8,4:10,4,7,1
chr19	15807984	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr19	15838753	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr19	15839910	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	15905834	.	A	AAACT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	15905877	.	TTTCC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=192,130;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:15905877_TTTCC_T:15905877:0,2,0,1
chr19	15905886	.	TCCCTC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=212,130;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15905877_TTTCC_T:15905877:0,1,0,1
chr19	15905894	.	TTCC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=212,130;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15905877_TTTCC_T:15905877:0,1,0,1
chr19	15905905	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15905877_TTTCC_T:15905877:0,0,0,1
chr19	15990048	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr19	15997136	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=134,112;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.305:14:3,1:6,2:0,10,0,4
chr19	16000166	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=149,170;MMQ=52,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr19	16008125	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16008125_A_C:16008125:0,0,1,0
chr19	16008127	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:16008125_A_C:16008125:0,0,1,0
chr19	16008128	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16008125_A_C:16008125:0,0,1,0
chr19	16008132	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=76,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:16008125_A_C:16008125:1,1,1,0
chr19	16008137	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=76,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:16008125_A_C:16008125:1,1,1,0
chr19	16008466	.	G	GGGGAAGGACAGGCTCTCCGGGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16008466_G_GGGGAAGGACAGGCTCTCCGGGCA:16008466:1,0,0,1
chr19	16008469	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16008466_G_GGGGAAGGACAGGCTCTCCGGGCA:16008466:1,0,0,1
chr19	16024538	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,8:0,0,10,1
chr19	16024739	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr19	16024774	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	16025312	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,1:0,0,6,5
chr19	16035494	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	16035517	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr19	16038334	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr19	16038390	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	16040473	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,2,10
chr19	16060825	.	A	AGGGG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:16060825_A_AGGGG:16060825:0,4,0,1
chr19	16060826	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:16060826_G_T:16060826:0,4,0,1
chr19	16060827	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr19	16060828	.	G	GAAGACAGTA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:16060825_A_AGGGG:16060825:0,4,0,1
chr19	16060829	.	TTC	T,TACATC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30,31;MFRL=164,124,109;MMQ=60,60,60;MPOS=4,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,1,1:1,0,0:0,3,0,2
chr19	16060830	.	T	TATG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=164,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:16060826_G_T:16060826:0,3,0,1
chr19	16178587	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr19	16186772	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=192,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:0,3:8,3:8,0,6,0
chr19	16186811	.	T	TGG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=152,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.469:6:0,0:2,2:3,0,3,0
chr19	16186813	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=13,13;MFRL=100,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.650:6:0,0:0,1:2,0,4,0
chr19	16192898	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.455:26:4,5:10,5:3,11,1,11
chr19	16199996	.	GC	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=69.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:7,11:9,9:2,14,1,19
chr19	16211966	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,2:13,0:23,0,2,0
chr19	16211973	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:11,2:16,0:31,0,2,0
chr19	16211989	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:21,2:17,2:38,0,4,0
chr19	16229122	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.328:10:5,0:2,3:3,4,1,2
chr19	16232508	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:7,6:10,9:16,1,14,1
chr19	16268207	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,6:0,0,6,11
chr19	16275515	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,9,7
chr19	16275772	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr19	16280634	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr19	16283852	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=22,23;RU=AC;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.748:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	16320059	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=171,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:16320059_A_T:16320059:0,3,0,1
chr19	16320067	.	CA	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=171,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:16320059_A_T:16320059:0,3,0,1
chr19	16320075	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	16321047	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr19	16337423	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	16338532	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	16339069	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr19	16344528	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	16345099	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,13:0,0,7,16
chr19	16345320	.	C	CTCTTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr19	16435717	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=117.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,12:0,0,19,12
chr19	16436876	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr19	16472811	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=201,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:0,1:0,4,1,4
chr19	16487905	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.701:14:0,5:3,5:4,0,9,1
chr19	16513326	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:16513326_G_GC:16513326:0,4,0,1
chr19	16513330	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:16513326_G_GC:16513326:0,4,0,1
chr19	16513333	.	C	CGGGCCTGGGTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:16513326_G_GC:16513326:0,3,0,1
chr19	16514771	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:1,3:2,1:0,3,1,3
chr19	16547929	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr19	16552914	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:4,2:3,2:8,0,4,0
chr19	16593189	.	CAACAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AACAA;STR;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.878:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr19	16593203	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr19	16593415	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:1,2:2,2,3,1
chr19	16601154	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr19	16601168	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=170,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:2,1,2,2
chr19	16601194	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,2:7,4:6,2,5,1
chr19	16601327	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=115,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:11,0:11,2:5,17,1,1
chr19	16606742	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,10,5
chr19	16606766	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,12,6
chr19	16611527	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr19	16611637	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:12,2:8,0:14,6,1,1
chr19	16612208	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:7,0:10,6,2,0
chr19	16612365	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:5,2:0,8,1,4
chr19	16612368	.	ATT	A,ATTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=14,30,29;MFRL=143,139,114;MMQ=60,60,60;MPOS=22,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=T;STR;TLOD=6.37,15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,5:0.368,0.400:8:0,2,3:0,0,1:0,1,1,6
chr19	16613797	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr19	16617646	.	T	A,TA	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,32,33;MFRL=140,128,226;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.62,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,27,2:0.518,0.061:49:7,13,1:10,12,1:5,15,4,25
chr19	16628186	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=105,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:1,5,0,6
chr19	16631322	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:1,2:4,4:0,6,1,5
chr19	16631776	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=97,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr19	16636242	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,0:10,2:1,16,0,2
chr19	16664679	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.343:27:9,6:9,3:4,14,3,6
chr19	16679068	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16679068_TC_T:16679068:0,0,0,1
chr19	16679073	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16679068_TC_T:16679068:0,0,0,1
chr19	16763667	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.279:14:4,0:4,0:3,7,4,0
chr19	16797240	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	16797252	.	AC	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=285,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:16797252_AC_TT:16797252:0,1,0,1
chr19	16797254	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=285,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16797252_AC_TT:16797252:0,1,0,1
chr19	16798927	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,11:0,4:0,0,12,4
chr19	16861276	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16861276_A_T:16861276:0,0,0,1
chr19	16861281	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16861276_A_T:16861276:0,0,0,1
chr19	16861283	.	G	GAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16861276_A_T:16861276:0,0,0,1
chr19	16890361	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	16911032	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=222,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	16918399	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,1:12,1:2,17,0,2
chr19	16923494	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=206,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:5,0,3,1
chr19	16976505	.	TCCCTC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCCTC;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.512:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	16988456	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,3:0,3:0,3,2,4
chr19	16988476	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=64,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr19	17000131	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=50,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:0,3,2,3
chr19	17000930	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=144,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr19	17011950	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr19	17013547	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:14,1:15,1:21,8,1,1
chr19	17025596	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:14,1:20,1:9,25,0,2
chr19	17063109	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	17088107	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=199,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr19	17088121	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr19	17091533	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr19	17091574	.	G	GTTGAGGTAAGTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=177,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	17100438	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,11:0,5:0,0,9,11
chr19	17107825	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:0,3:2,1:3,0,4,0
chr19	17108023	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=173,190;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:6,1:3,12,1,1
chr19	17108053	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=176,186;MMQ=40,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,6:2,3:5,4,4,5
chr19	17111411	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	17113001	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr19	17120253	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	17169758	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	17170540	.	GG	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,2:0,0,0,7
chr19	17173487	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,14:0,6:0,0,12,9
chr19	17179789	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,19:0,8:0,0,21,6
chr19	17186127	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0|1:17186127_A_C:17186127:0,0,15,2
chr19	17186136	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,9:0,4:0|1:17186127_A_C:17186127:0,0,15,3
chr19	17213002	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr19	17264963	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=255,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr19	17278658	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr19	17278666	.	GATACTCGACCTGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=90,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:2,0,1,0
chr19	17278900	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr19	17283383	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	17283491	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=107,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr19	17286438	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=96,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:8,3:8,8:15,3,7,5
chr19	17291722	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=86,152;MMQ=60,58;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:1,1,1,0
chr19	17294679	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr19	17298679	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	17298724	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	17298893	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:1,3,1,4
chr19	17301863	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr19	17301880	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,1:0,8:0,0,5,4
chr19	17302056	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr19	17302112	.	ACT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	17305710	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,2:10,0:5,12,1,1
chr19	17308734	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr19	17311442	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	17313619	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:6,1,0,2
chr19	17316253	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	17316697	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	17317221	.	C	CCGCCTTCCTGCTGCATCCACCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr19	17317252	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	17321487	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:2,1,9,0
chr19	17321669	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,3:3,2:3,5,1,4
chr19	17322899	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:4,6:6,6:4,6,3,9
chr19	17326567	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	17330277	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=227,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:17330277_G_T:17330277:0,1,0,1
chr19	17330281	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=227,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:17330277_G_T:17330277:0,1,0,1
chr19	17330284	.	C	CCCTCTGCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17330277_G_T:17330277:0,0,0,1
chr19	17339193	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,116;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:7,0:6,3:0|1:17339193_C_T:17339193:0,15,0,3
chr19	17339197	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=180,116;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:0|1:17339193_C_T:17339193:0,15,0,3
chr19	17366110	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,1:3,2:4,1,3,0
chr19	17367585	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=13222638,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr19	17375175	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:0,9,0,3
chr19	17375213	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=212,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr19	17403414	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr19	17411627	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=14,13;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.440:9:0,0:1,0:4,1,4,0
chr19	17411632	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=25,10;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.487:10:0,0:3,0:4,1,5,0
chr19	17411634	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=15,13;MFRL=148,55;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,0:1,0:5,1,2,0
chr19	17411640	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,0:2,1:2,2,5,0
chr19	17411645	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,0:3,0:3,2,4,0
chr19	17411647	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=22,19;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,1:2,0:5,2,2,0
chr19	17416590	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	17424932	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,4:0,0,5,8
chr19	17424947	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:2,2:0,3:1,2,0,5
chr19	17430319	.	AAG	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.522:27:8,8:4,5:11,2,9,5
chr19	17437962	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=223,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	17439320	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr19	17441093	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,6:5,1:1,9,1,6
chr19	17443891	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=93,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:2,1,1,2
chr19	17449157	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.636:14:3,2:1,6:4,1,6,3
chr19	17449602	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,3:5,4:1,8,1,6
chr19	17449699	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=187,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:4,0,3,1
chr19	17450445	.	GG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=210,261;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr19	17452527	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:0,6,1,2
chr19	17471430	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:8,8,2,0
chr19	17471733	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=186,175;MMQ=47,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:2,1:0,5,0,1
chr19	17471746	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=189,189;MMQ=55,38;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr19	17487865	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:3,7:8,8:7,4,9,6
chr19	17514646	.	T	TGGG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=G;STR;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr19	17516400	.	A	AGCTGAAAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr19	17531339	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.191:21:5,1:6,0:7,10,4,0
chr19	17531450	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,4,12
chr19	17533126	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr19	17533165	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=127,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,1:11,1:10,14,1,1
chr19	17534693	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr19	17535546	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr19	17535658	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,1:0,0,4,2
chr19	17571766	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	17597830	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr19	17611261	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr19	17611490	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr19	17612251	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr19	17622391	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	17622614	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	17628258	.	C	CTGTTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=264,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17628258_C_CTGTTTTTT:17628258:0,1,0,1
chr19	17628261	.	C	CTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=264,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17628258_C_CTGTTTTTT:17628258:0,1,0,1
chr19	17628737	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	17631812	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:19,2:9,0:14,14,0,2
chr19	17634397	.	G	GCAGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	17643065	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,15,1
chr19	17679227	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	17679571	.	T	TTGTTTTTTTTTTTTTTGAAGTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17679571_T_TTGTTTTTTTTTTTTTTGAAGTA:17679571:0,1,0,1
chr19	17679573	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17679571_T_TTGTTTTTTTTTTTTTTGAAGTA:17679571:0,1,0,1
chr19	17679576	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17679571_T_TTGTTTTTTTTTTTTTTGAAGTA:17679571:0,1,0,1
chr19	17679597	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	17692324	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	17728502	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,15,4
chr19	17729120	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	17729148	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	17729672	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr19	17732720	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,0:5,2:4,7,1,1
chr19	17738850	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	17739976	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=230,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr19	17753824	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr19	17753866	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=173,187;MMQ=40,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr19	17756938	.	C	CAAGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=206,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:17756938_C_CAAGA:17756938:1,3,1,1
chr19	17756940	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=206,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:17756938_C_CAAGA:17756938:1,3,1,1
chr19	17763392	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,10:0,0,10,5
chr19	17766249	.	C	CAGATGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=202,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	17766253	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=226,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:17766253_AC_A:17766253:0,1,0,1
chr19	17766257	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=226,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17766253_AC_A:17766253:0,1,0,1
chr19	17766900	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=45,170;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:3,1,4,4
chr19	17766923	.	ACCT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=218,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCT;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr19	17774424	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=142,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:1,0:0|1:17774424_T_A:17774424:2,6,1,1
chr19	17774426	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=142,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:17774424_T_A:17774424:2,6,1,1
chr19	17777431	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,5:7,3:11,3,8,0
chr19	17779041	.	TGCCGCTCA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr19	17779059	.	C	CCCTGTGTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:17779059_C_CCCTGTGTA:17779059:0,2,0,1
chr19	17779061	.	C	CTCTTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:17779059_C_CCCTGTGTA:17779059:0,2,0,1
chr19	17779064	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:17779059_C_CCCTGTGTA:17779059:0,2,0,1
chr19	17830278	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:3,0,5,2
chr19	17834882	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	17835831	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=116,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,3:4,3:6,5,5,1
chr19	17881405	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,37;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:0,2:2,2,1,1
chr19	17885336	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	17886767	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,0:0|1:17886767_G_T:17886767:1,1,1,0
chr19	17886776	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:17886767_G_T:17886767:1,1,1,0
chr19	17886781	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:17886767_G_T:17886767:1,1,1,0
chr19	17887563	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,3:0,0,1,9
chr19	17888847	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	17889044	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=84,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:4,2:2,5:3,3,1,6
chr19	17892193	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,4,4
chr19	17892478	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0|1:17892478_A_G:17892478:0,0,7,1
chr19	17892495	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:0|1:17892478_A_G:17892478:2,3,5,0
chr19	17894068	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=17,14;MFRL=224,245;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:0,0:0,0:0,3,0,2
chr19	17894075	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,6:0,0:0,0,0,7
chr19	17894878	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr19	17897561	.	T	TGGAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	17898742	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	17899038	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,4:0.107:43:14,0:14,0:0|1:17899038_A_C:17899038:11,28,4,0
chr19	17899043	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=31,9;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.101:46:17,0:13,0:0|1:17899038_A_C:17899038:11,31,4,0
chr19	17899048	.	TAC	GGG	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.117:39:16,2:13,0:0|1:17899038_A_C:17899038:2,33,4,0
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chr19	17932190	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:2,4,1,1
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chr19	17940842	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	17941499	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:17941499_TGG_T:17941499:1,2,0,1
chr19	17941505	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:17941499_TGG_T:17941499:1,2,0,1
chr19	17948018	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:11,1:13,2:9,17,2,1
chr19	17951178	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,5:0,9:0,0,1,13
chr19	17952185	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	17954631	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:25,3:14,0:27,13,0,3
chr19	17954947	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	17955001	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:17955001_C_T:17955001:0,0,4,1
chr19	17955003	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:17955001_C_T:17955001:0,0,4,1
chr19	17955021	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr19	17970627	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,16,0
chr19	17973862	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,18,2
chr19	17985635	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr19	17999094	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,2,1
chr19	18001686	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.543:9:3,1:0,1:3,1,2,3
chr19	18001839	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:1,3,0,3
chr19	18047283	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr19	18053557	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.510:39:8,9:11,10:8,11,7,13
chr19	18096073	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,4,0
chr19	18108956	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,1:3,3:5,0,5,0
chr19	18170962	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,0,4
chr19	18171886	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:1,4:9,6:8,3,8,2
chr19	18172043	.	GT	G,GTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,33,33;MFRL=124,128,140;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.64,9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,6:0.231,0.414:14:4,0,3:1,2,2:4,1,2,7
chr19	18174754	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,11534628;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:8,1:6,8,0,2
chr19	18186737	.	C	CTGGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=183,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:18186737_C_CTGGTT:18186737:0,4,0,1
chr19	18186738	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=183,120;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:18186737_C_CTGGTT:18186737:0,4,0,1
chr19	18232778	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,3,11
chr19	18235352	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr19	18235424	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr19	18242675	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	18245807	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,15:0.665:22:2,10:5,4:0|1:18245807_C_T:18245807:1,6,2,13
chr19	18245813	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=73.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.954:19:0,13:0,6:0|1:18245807_C_T:18245807:0,0,2,17
chr19	18246728	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr19	18252829	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr19	18252905	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	18257875	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr19	18257909	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,208;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	18258459	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr19	18273410	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	18276856	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr19	18277206	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr19	18286611	.	C	CAGACTAATTCATGTGACTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	18304859	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,69;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:16,0:18,3:11,24,1,2
chr19	18311088	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=145,101;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,3:7,0:9,1,3,0
chr19	18311270	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:0|1:18311270_AT_A:18311270:3,21,0,2
chr19	18311272	.	GAAGGTC	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:11,2:0|1:18311270_AT_A:18311270:3,22,0,2
chr19	18322095	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr19	18324329	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:3,1:2,2:0,5,2,2
chr19	18327640	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,3:10,0:9,13,3,0
chr19	18375130	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=254,281;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr19	18377836	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,1:11,1:9,10,0,2
chr19	18420426	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=222,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr19	18420704	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=219,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,3:1,4:0,3,1,6
chr19	18423402	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.630:11:2,6:1,1:3,1,5,2
chr19	18426950	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr19	18453832	.	CGAA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.280:12:8,2:1,1:0|1:18453832_CGAA_C:18453832:0,9,0,3
chr19	18453836	.	A	AGGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.280:12:8,2:1,1:0|1:18453832_CGAA_C:18453832:0,9,0,3
chr19	18466840	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=129,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr19	18468501	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	18496989	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,1:4,1:7,1,2,0
chr19	18497024	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,4:1,3:4,1,4,3
chr19	18499780	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	18502728	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:4,1,4,1
chr19	18502835	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.490:20:6,2:4,6:3,7,6,4
chr19	18502972	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=152,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,0:3,1:0|1:18502972_G_T:18502972:5,5,1,1
chr19	18502977	.	GGACT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=172,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:6,0:2,2:0|1:18502972_G_T:18502972:4,5,1,1
chr19	18503019	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=132,10301625;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,1:0,1:1,2,0,2
chr19	18541579	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	18542701	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:6,0,3,2
chr19	18542996	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.610:13:2,5:2,3:4,1,2,6
chr19	18543054	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=37,31;MFRL=158,61;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,1,3
chr19	18543270	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:1,3:2,4:4,0,5,2
chr19	18544284	.	GGGCGGGGGCGCGTC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:0,1:3,1,2,0
chr19	18557035	.	A	AGCAGGCCACTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	18557657	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,5:6,1:3,4,3,3
chr19	18644149	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=101,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:0,3:3,0:2,2,1,2
chr19	18650278	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,4,9
chr19	18652523	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:10,1:6,1:12,6,0,3
chr19	18675854	.	G	GGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr19	18731439	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	18778445	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:4,1,5,1
chr19	18794473	.	TGGA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GGA;STR;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:4,1:7,2:15,2,3,1
chr19	18856675	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:10,1:21,1:27,4,2,0
chr19	18886431	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,0:5,3:3,4,3,0
chr19	18893811	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=245,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:2,1,1,5
chr19	18897526	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr19	18898939	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,171;MMQ=50,43;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr19	18899787	.	A	ACCCAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:18899787_A_ACCCAT:18899787:0,1,0,1
chr19	18899790	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18899787_A_ACCCAT:18899787:0,1,0,1
chr19	18899792	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18899787_A_ACCCAT:18899787:0,1,0,1
chr19	18900855	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	18956699	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr19	18971322	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr19	18979324	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr19	18990982	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	19021970	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	19032637	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,6,9
chr19	19033307	.	G	GGGCTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19033307_G_GGGCTGT:19033307:0,0,0,1
chr19	19033311	.	AG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19033307_G_GGGCTGT:19033307:1,0,0,1
chr19	19035159	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr19	19035354	.	GC	TT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr19	19037053	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,14:0,0,28,2
chr19	19037294	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr19	19042381	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:1,5,3,5
chr19	19043680	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,16;MFRL=214,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:19043680_C_CG:19043680:4,0,1,0
chr19	19043682	.	T	G,TCCCCCCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33,23;MFRL=0,177,214;MMQ=60,60,60;MPOS=10,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.250,0.625:5:0,1,0:0,0,2:0,0,5,0
chr19	19043688	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=12,12;MFRL=214,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:0,0:0|1:19043680_C_CG:19043680:4,0,1,0
chr19	19043693	.	TA	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr19	19049876	.	ACT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19049876_ACT_A:19049876:0,1,0,1
chr19	19049882	.	A	ACTTTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19049876_ACT_A:19049876:0,1,0,1
chr19	19105915	.	G	GCCCCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,10;RU=C;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr19	19105920	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=13,12;MFRL=192,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:0,0:1,1,1,0
chr19	19105926	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr19	19105930	.	AC	CG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:1,1,1,0
chr19	19129965	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,0:16,2:11,13,1,1
chr19	19137021	.	C	CCAGGTCATTGGCCACCGGAAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=209,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr19	19153762	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19153762_C_CA:19153762:0,0,0,1
chr19	19153765	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19153762_C_CA:19153762:0,0,0,1
chr19	19153767	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19153762_C_CA:19153762:0,0,0,1
chr19	19168183	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr19	19215612	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr19	19216613	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0|1:19216613_T_C:19216613:0,0,0,5
chr19	19216631	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=193,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:19216613_T_C:19216613:0,3,0,1
chr19	19216635	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=193,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:19216613_T_C:19216613:0,3,0,1
chr19	19243843	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	19291558	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.328:21:6,1:4,2:12,2,0,7
chr19	19305039	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=188,214;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr19	19345745	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,134;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:8,1,0,2
chr19	19359500	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=117,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr19	19372185	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:4,1:1,4:6,0,5,0
chr19	19377318	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:17,4:19,0:23,13,4,0
chr19	19379549	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=117,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,3:7,1:4,8,3,1
chr19	19379651	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=177,234;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr19	19380596	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=126,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.464:24:3,7:9,4:1,12,5,6
chr19	19380646	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	19380685	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr19	19381755	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr19	19387356	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=205,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr19	19387743	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,6,2
chr19	19388500	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,1:1,2:3,0,3,0
chr19	19408231	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:19408231_G_A:19408231:0,0,0,1
chr19	19408238	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19408231_G_A:19408231:0,0,0,1
chr19	19408239	.	T	TCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19408231_G_A:19408231:0,0,0,1
chr19	19408246	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19408231_G_A:19408231:0,0,0,1
chr19	19408248	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:19408231_G_A:19408231:0,0,0,1
chr19	19413292	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19413292_A_G:19413292:0,1,0,1
chr19	19413294	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19413292_A_G:19413292:0,1,0,1
chr19	19413297	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19413292_A_G:19413292:0,1,0,1
chr19	19449665	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:5,0:7,2:7,7,0,2
chr19	19451591	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,5:2,3:5,1,6,2
chr19	19453742	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	19458065	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.278:15:5,1:6,0:9,2,4,0
chr19	19466269	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	19545990	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,10:0,0,9,18
chr19	19547086	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,2:0,13:0,0,2,14
chr19	19609422	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.277:13:3,3:3,0:2,8,3,0
chr19	19613381	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	19626734	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,3:4,8:5,0,12,0
chr19	19626769	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.471:30:5,4:10,10:12,4,11,3
chr19	19626781	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.458:40:6,5:12,13:15,7,13,5
chr19	19638218	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=219,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr19	19646272	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr19	19648346	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	19651140	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=184,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr19	19653524	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:4,2:3,2:0|1:19653524_G_A:19653524:2,5,1,4
chr19	19653525	.	A	AAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:4,2:3,1:0|1:19653524_G_A:19653524:2,5,1,4
chr19	19655670	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr19	19672988	.	A	AAACCAAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=135,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:19672988_A_AAACCAAAT:19672988:0,3,0,1
chr19	19672990	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=135,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:19672988_A_AAACCAAAT:19672988:0,3,0,1
chr19	19675696	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=126,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,1:1,2:2,0,3,0
chr19	19740729	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	19746151	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr19	19749400	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	19750824	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:4,2,6,1
chr19	19751456	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr19	19756662	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:3,0:1,3:3,2,1,2
chr19	19758190	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	19770329	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr19	19789424	.	CAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=199,204;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr19	19906348	.	G	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=127,672721;MMQ=60,20;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.058:65:31,0:31,3:32,30,3,0
chr19	19976701	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,7:3,2:3,1,7,2
chr19	20003109	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,66;MMQ=60,49;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:1,7,2,4
chr19	20003576	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,151;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:12,4:10,3:5,18,0,7
chr19	20045584	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,101;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,0:11,2:7,15,1,1
chr19	20045687	.	G	GAAACCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=191,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:20045687_G_GAAACCC:20045687:0,3,0,1
chr19	20045689	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=191,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:20045687_G_GAAACCC:20045687:0,3,0,1
chr19	20045712	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=191,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20045712_C_A:20045712:0,1,0,1
chr19	20045714	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=191,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20045712_C_A:20045712:0,1,0,1
chr19	20045716	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=191,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20045712_C_A:20045712:0,1,0,1
chr19	20116963	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:4,6:5,4:1,8,3,8
chr19	20150075	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	20150247	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr19	20215982	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,176;MMQ=59,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:0,5:6,2:5,1,7,0
chr19	20308989	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:7,1:0,16,0,2
chr19	20309002	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr19	20727905	.	GG	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=142,162;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr19	20727932	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,5,4
chr19	20735196	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr19	20735272	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=117.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,18:0,0,23,12
chr19	20736677	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=40.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr19	20808515	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr19	20828106	.	C	CAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:10,2:4,4:12,2,6,0
chr19	20828410	.	A	AAAG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,6:2,6:5,1,11,2
chr19	20829218	.	A	AAC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.303:14:4,1:6,3:0,10,0,4
chr19	20844340	.	G	GAAGT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,5:5,3:0,9,2,6
chr19	21203488	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:6,0,8,1
chr19	21203552	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=113.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,17:0,17:0,0,25,9
chr19	21205531	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:5,10:7,3:10,2,11,2
chr19	21281815	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr19	21299774	.	T	TATA	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=424.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,99:0.990:99:0,49:0,47:0,0,53,46
chr19	21300142	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=197,224;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,1:2,3:1,6,0,4
chr19	21300462	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.611:29:2,4:9,13:5,6,5,13
chr19	21300964	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.409:13:2,2:4,3:2,6,1,4
chr19	21349311	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=125.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,20:0,17:0,0,4,34
chr19	21350520	.	TA	T,TAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31,33;MFRL=151,172,1819629;MMQ=60,60,60;MPOS=23,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=5.54,5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.265,0.291:11:1,0,1:3,3,2:0,5,0,6
chr19	21491951	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr19	21493246	.	C	CA	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=165,170;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.350:21:5,3:9,4:14,0,7,0
chr19	21493258	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,18:0,19:0,0,28,9
chr19	21493278	.	T	TA	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.240:44:7,5:18,3:17,17,7,3
chr19	21541806	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:1,3,2,0
chr19	21544466	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,1:4,0,4,0
chr19	21544503	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,2:3,5:6,3,6,1
chr19	21544514	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:6,4:4,4:7,3,8,1
chr19	21544714	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:0,7,0,5
chr19	21544755	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=229,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:21544755_T_TG:21544755:0,3,0,1
chr19	21544758	.	C	CGTTCTTAGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=229,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:21544755_T_TG:21544755:0,3,0,1
chr19	21544760	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=246,123;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:21544760_G_GT:21544760:0,2,0,1
chr19	21544764	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=229,123;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:21544760_G_GT:21544760:0,3,0,1
chr19	21558015	.	A	ATG,ATGTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30,30;MFRL=0,161,146;MMQ=60,60,60;MPOS=18,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=TG;STR;TLOD=26.18,8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,4:0.637,0.312:13:0,5,2:0,4,0:0,0,13,0
chr19	21558818	.	CA	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.212:26:8,2:4,3:1,20,1,4
chr19	21560141	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	21561408	.	CTTTT	C,CTTT,CTTTTT	.	.	DP=116;ECNT=3;MBQ=19,20,24,22;MFRL=121,138,117,128;MMQ=60,60,58,60;MPOS=20,22,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=19,15,18,20;RU=T;STR;TLOD=4.39,3.32,13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,3,5,16:0.070,0.139,0.435:36:2,1,3,3:3,1,1,7:3,9,8,16
chr19	21561465	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:25,5:16,0:0,43,0,5
chr19	21561508	.	TCTC	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:4,6:2,2:0,6,0,8
chr19	21587890	.	A	ATG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TG;STR;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.511:10:2,2:3,1:5,0,5,0
chr19	21587918	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.539:35:7,7:9,12:14,2,15,4
chr19	21588692	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=90,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,7:8,6:5,7,6,7
chr19	21606429	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.421:29:10,7:6,5:14,3,7,5
chr19	21608291	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:7,2:11,2,2,0
chr19	21608959	.	TAAAAG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,5:5,3:2,12,0,8
chr19	21609516	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.277:27:11,4:7,3:9,11,3,4
chr19	21688495	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=119,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:9,9:3,6:7,5,13,2
chr19	21713559	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,4:4,4:0,5,0,8
chr19	21719538	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=145,22632630;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:10,2:0|1:21719538_A_C:21719538:2,18,2,0
chr19	21719541	.	A	ATGAATG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=149,22632630;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:21719538_A_C:21719538:1,18,2,0
chr19	21910848	.	A	AGAGTTTCGGAAATCCATGCTATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.288:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr19	21926947	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,2:10,1:3,22,0,3
chr19	21927706	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=67.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,25:0.407:62:16,12:20,13:26,11,21,4
chr19	21948489	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:2,4:3,7:3,3,8,3
chr19	21950302	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.483:29:7,6:7,8:2,13,2,12
chr19	21992643	.	TGC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=201,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21992643_TGC_T:21992643:0,2,0,1
chr19	21992646	.	T	TTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=201,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21992643_TGC_T:21992643:0,2,0,1
chr19	21992651	.	T	TCTTCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=201,221;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21992643_TGC_T:21992643:0,2,0,1
chr19	22002029	.	AAAAACAACACATACACACAC	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,2:0.048:60:26,2:30,0:0|1:22002029_AAAAACAACACATACACACAC_A:22002029:9,49,0,2
chr19	22002057	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:12,2:17,0:0|1:22002029_AAAAACAACACATACACACAC_A:22002029:3,29,0,2
chr19	22002060	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,2:14,0:0|1:22002029_AAAAACAACACATACACACAC_A:22002029:3,25,0,2
chr19	22153495	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr19	22153634	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:3,4:2,3:0,5,3,5
chr19	22154954	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,12:0,0,16,6
chr19	22156092	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,1173121;MMQ=31,58;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.500:4:1,0:2,1:2,1,1,0
chr19	22156992	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,5,10
chr19	22157253	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=137,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:22,3:16,0:0|1:22157253_A_G:22157253:13,25,1,2
chr19	22157255	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=137,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:21,1:11,0:0|1:22157253_A_G:22157253:13,25,1,2
chr19	22171646	.	A	T	.	.	DP=70;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=145,98;MMQ=50,35;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,9:0.141:69:29,5:29,2:0|1:22171646_A_T:22171646:31,29,4,5
chr19	22171651	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=138,98;MMQ=50,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,9:0.149:65:25,7:28,2:0|1:22171646_A_T:22171646:27,29,4,5
chr19	22171667	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=138,93;MMQ=52,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,8:0.129:68:30,6:28,2:0|1:22171646_A_T:22171646:23,37,3,5
chr19	22171732	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,109;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.064:44:17,1:25,1:6,36,0,2
chr19	22193451	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	22235307	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr19	22235478	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.569:21:4,7:4,5:4,5,4,8
chr19	22235491	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,4,10
chr19	22235526	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr19	22235577	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr19	22255796	.	A	AT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.247:34:9,3:13,4:0,26,0,8
chr19	22256396	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,4:4,10:1,6,2,12
chr19	22605103	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,1:1,4:1,4,1,4
chr19	22605120	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr19	22846575	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=124,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:6,0:8,2,2,0
chr19	22939224	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:2,5:6,5:3,6,5,5
chr19	22940899	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,175;MMQ=60,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:5,3:6,4:12,1,7,0
chr19	22941191	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,76;MMQ=60,59;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:4,3:2,1:3,4,2,2
chr19	23542290	.	AG	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,11,6
chr19	23543834	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,179;MMQ=27,49;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,25:0.837:29:2,8:2,12:0,4,8,17
chr19	23545004	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,4:0,12:0,0,7,9
chr19	23557361	.	C	CAAAAAAAAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,141;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=21,30;RU=A;STR;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.844:16:0,2:2,9:2,0,11,3
chr19	23845038	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=114.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0|1:23845038_T_G:23845038:0,0,9,18
chr19	23845042	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=117.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,12:0,11:0|1:23845038_T_G:23845038:0,0,9,19
chr19	23845795	.	CA	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=91,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=79.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,34:0.920:37:1,10:1,21:1,2,23,11
chr19	23869684	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr19	23869941	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,3:0,0,3,9
chr19	23926332	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	23926665	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,2:3,1:4,4,1,2
chr19	23927468	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,11,11
chr19	23938360	.	AACAC	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=170,144;MMQ=42,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=AC;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr19	23938394	.	CACACACAT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:2,3:1,4,0,4
chr19	23941459	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr19	30018093	.	CCT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:30018093_CCT_C:30018093:3,0,1,0
chr19	30018099	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:30018093_CCT_C:30018093:3,0,1,0
chr19	30018369	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	30019505	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=211,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr19	30020678	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr19	30021023	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=111,260;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	30099457	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,1:0,7:1,0,8,0
chr19	30106130	.	C	CTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.325:7:3,0:2,1:0|1:30106130_C_CTT:30106130:5,0,1,1
chr19	30106139	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.274:9:3,2:4,0:1|0:30106130_C_CTT:30106130:5,2,2,0
chr19	30106298	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:1,5:7,6:2,6,2,9
chr19	30303714	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,2,11
chr19	30312976	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=125,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:1,3:4,2:1,5,1,4
chr19	30313523	.	CCTT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,7:1,2:1,4,5,4
chr19	30313603	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=173,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	30496194	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=191,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:2,10:6,8:8,0,17,1
chr19	30499977	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:6,10,1,1
chr19	30500118	.	GTGA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TGA;STR;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.678:7:2,1:0,4:1,1,4,1
chr19	30503162	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,7:6,7:11,3,13,1
chr19	31040473	.	GA	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.258:6:1,1:3,0:0,5,0,1
chr19	31769293	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,2:5,5:0,6,3,4
chr19	32899074	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=149,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,3:2,1,4,0
chr19	32954725	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:6,4:9,1:13,2,5,0
chr19	32968497	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.127:22:13,0:4,2:9,11,1,1
chr19	33072069	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33072069_G_A:33072069:0,0,1,0
chr19	33072085	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33072069_G_A:33072069:0,0,1,0
chr19	33090701	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,1:11,2:9,11,1,2
chr19	33108663	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=209,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr19	33110138	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,10;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:33110138_T_G:33110138:0,1,1,0
chr19	33110143	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,21;MFRL=189,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:33110143_AG_CC:33110143:0,2,2,0
chr19	33110148	.	TT	CC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,13;MFRL=189,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:33110143_AG_CC:33110143:0,2,2,0
chr19	33110149	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	33110152	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,10;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:1,0:1,0:0|1:33110138_T_G:33110138:1,2,1,0
chr19	33110154	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,10;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:33110138_T_G:33110138:1,2,1,0
chr19	33110157	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,17;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:1,0:1,0:0|1:33110138_T_G:33110138:1,2,1,0
chr19	33119835	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=188,270;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:33119835_TGG_T:33119835:0,3,0,1
chr19	33119856	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,270;MMQ=56,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:33119835_TGG_T:33119835:0,2,0,1
chr19	33131111	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=189,207;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:0|1:33131111_C_T:33131111:11,0,2,0
chr19	33131112	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=207,189;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,11:0.800:13:0,5:2,6:1|0:33131111_C_T:33131111:2,0,11,0
chr19	33131115	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=189,207;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:33131111_C_T:33131111:11,0,2,0
chr19	33131336	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=105.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,18:0,0,3,32
chr19	33133145	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	33133936	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	33134425	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=70.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,10,11
chr19	33134630	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:33134630_C_T:33134630:0,4,0,1
chr19	33134635	.	A	G,C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34,33;MFRL=0,162,147;MMQ=60,60,60;MPOS=19,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.53,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.625,0.250:5:0,2,0:0,2,1:0,0,0,5
chr19	33134637	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:33134630_C_T:33134630:0,4,0,1
chr19	33135288	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,1:8,1:6,12,0,2
chr19	33149768	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	33167455	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	33168036	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=58.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.956:18:0,9:0,9:0,0,7,11
chr19	33168059	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,4,9
chr19	33169172	.	T	TC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=C;STR;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.539:15:4,0:1,4:0,7,0,8
chr19	33169268	.	AA	CC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=197,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.287:11:3,2:4,0:0,8,0,3
chr19	33183291	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33183291_G_A:33183291:0,0,1,0
chr19	33183316	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:33183291_G_A:33183291:0,0,3,0
chr19	33211069	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr19	33264348	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=112.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,19:0,13:0,0,25,7
chr19	33264537	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=222,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:33264537_G_A:33264537:0,2,0,1
chr19	33264539	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=222,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:33264537_G_A:33264537:0,2,0,1
chr19	33264543	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=222,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:33264537_G_A:33264537:0,2,0,1
chr19	33321447	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=105,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.560:7:2,2:1,2:2,1,4,0
chr19	33321669	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr19	33349488	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	33353343	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:33353343_A_G:33353343:0,0,4,0
chr19	33353357	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1|0:33353343_A_G:33353343:4,0,1,1
chr19	33353547	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:33353547_G_T:33353547:0,3,0,1
chr19	33353553	.	C	CGGCAGATGACAGTCCTCTGCAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:33353547_G_T:33353547:0,4,0,1
chr19	33353580	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=179,243;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr19	33354992	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=151,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:3,1:3,2:5,2,4,0
chr19	33355513	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	33392087	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:8,0,7,0
chr19	33392398	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr19	33406442	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,4:2,6:0,5,3,7
chr19	33406484	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=185,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,1,3
chr19	33409272	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=174,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:33409272_C_CT:33409272:0,1,0,1
chr19	33409274	.	G	GAAGAGCCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=174,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33409272_C_CT:33409272:0,1,0,1
chr19	33430816	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.562:37:5,11:11,9:4,12,2,19
chr19	33439158	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:3,2:5,2,6,1
chr19	33439187	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,6:5,4:4,7,7,4
chr19	33464048	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:6,4:0,7:5,1,8,3
chr19	33464253	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=112,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.350:7:1,1:3,1:4,1,1,1
chr19	33464553	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=198,159;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0,17,0,2
chr19	33467620	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,1:2,2:1,4,2,2
chr19	33481388	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=100,160;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.455:42:13,9:9,10:20,3,15,4
chr19	33484776	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=213,172;MMQ=55,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr19	33486845	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,148;MMQ=60,37;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:4,1,7,0
chr19	33487182	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,201;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	33490462	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=156,155;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,2:14,0:24,1,3,0
chr19	33490480	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=155,166;MMQ=60,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:15,1:14,1:26,5,3,0
chr19	33490487	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=156,166;MMQ=60,31;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:20,1:15,2:29,7,3,0
chr19	33490488	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=156,158;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.520:38:10,11:8,7:16,2,15,5
chr19	33490585	.	G	A	.	.	DP=104;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=122,132;MMQ=41,33;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,9:0.095:102:44,4:46,5:41,52,2,7
chr19	33490616	.	A	T	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=125,99;MMQ=40,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,5:0.076:75:34,3:35,2:22,48,1,4
chr19	33490685	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=152,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,6:8,1:0,11,1,6
chr19	33498823	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,5:2,1:9,0,6,0
chr19	33498843	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,4:2,2:5,0,7,0
chr19	33502714	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,0:2,3:2,6,0,3
chr19	33512632	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr19	33555666	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33555666_G_C:33555666:0,0,1,0
chr19	33555670	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33555666_G_C:33555666:0,0,1,0
chr19	33579018	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	33579047	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=19,12;MFRL=135,206;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:0,0:3,0,1,0
chr19	33579049	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,14;MFRL=135,206;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:3,0,1,0
chr19	33579128	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,15,6
chr19	33581879	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr19	33584479	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr19	33585219	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=140,174;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:2,2:0,5,0,4
chr19	33585247	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=164,182;MMQ=43,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr19	33585256	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=188,145;MMQ=52,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0,6,0,2
chr19	33592301	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	33592550	.	GA	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33592550_GA_TC:33592550:0,1,0,1
chr19	33592555	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33592550_GA_TC:33592550:0,1,0,1
chr19	33592557	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:33592550_GA_TC:33592550:0,1,0,1
chr19	33597816	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr19	33602881	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr19	33605300	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,11:0,0,6,9
chr19	33605312	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr19	33620993	.	T	TCC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=75.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,14,4
chr19	33635853	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,5:0,11:0|1:33635853_G_A:33635853:0,0,6,11
chr19	33635877	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:33635853_G_A:33635853:0,0,0,8
chr19	33635887	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0|1:33635853_G_A:33635853:0,0,0,9
chr19	33638641	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=99,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:0,7,0,2
chr19	33642273	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr19	33663189	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:3,7:13,4:16,0,8,3
chr19	33663354	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.434:28:10,4:6,8:4,12,3,9
chr19	33685836	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	33687750	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,1:0,12:0,0,2,12
chr19	33696708	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	33700463	.	C	CGGCGTCATCATCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	33701598	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,14;MFRL=0,190;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33701598_A_C:33701598:0,0,1,0
chr19	33701604	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,190;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33701598_A_C:33701598:0,0,1,0
chr19	33701611	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=197,190;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:33701598_A_C:33701598:1,0,1,0
chr19	33701615	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,18;MFRL=217,190;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:33701598_A_C:33701598:1,1,1,0
chr19	33701618	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,12;MFRL=217,190;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:33701598_A_C:33701598:1,1,1,0
chr19	33701623	.	CT	GG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,17;MFRL=197,190;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:33701598_A_C:33701598:2,1,1,0
chr19	33701626	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,12;MFRL=197,190;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:33701598_A_C:33701598:2,1,1,0
chr19	33702245	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,7,8
chr19	33703321	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:3,9,0,2
chr19	33793389	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr19	33872504	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:13,2:14,9,2,0
chr19	33872928	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,92;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,2:6,0:6,7,2,0
chr19	33873605	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=208,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr19	33878198	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,4,0
chr19	33953800	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr19	33981054	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:5,1:0,9,0,2
chr19	34001838	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:34001838_G_C:34001838:1,0,1,0
chr19	34001844	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:34001838_G_C:34001838:1,0,1,0
chr19	34001847	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,17;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:34001838_G_C:34001838:1,0,1,0
chr19	34263971	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	34291283	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:4,2:3,3:8,0,5,0
chr19	34291303	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:10,3:7,5:17,0,8,0
chr19	34292261	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr19	34297937	.	CT	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=122,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:1,6,0,3
chr19	34685617	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,3:5,5:0,7,0,8
chr19	34687746	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,0,23
chr19	34706440	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:3,4:12,7:9,7,7,4
chr19	34710532	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,5:0,0,3,8
chr19	34710807	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,11:0.444:25:8,6:6,5:0|1:34710807_A_C:34710807:2,12,1,10
chr19	34710817	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,16:0.567:28:8,8:4,8:1|0:34710807_A_C:34710807:1,11,1,15
chr19	34712654	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.534:54:9,13:16,15:2,23,1,28
chr19	34717269	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	34717280	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	34791822	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr19	34811103	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:0,6,0,5
chr19	34832292	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:2,4:11,1:13,0,4,1
chr19	34838998	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,3:2,4,1,7
chr19	34843761	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=133,174;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.778:10:1,3:0,4:0,2,0,8
chr19	34859457	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.490:20:3,4:7,4:8,2,6,4
chr19	34859522	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,5:8,5:6,5,4,6
chr19	34885006	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr19	34890322	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=210,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:5,5,2,0
chr19	34919273	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,296;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	34922865	.	T	TGTATAAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.689:27:4,10:4,8:2,6,3,16
chr19	34925729	.	AT	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:19,3:17,1:30,8,2,2
chr19	34934925	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=77,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:34934925_G_C:34934925:0,2,0,1
chr19	34934932	.	A	AGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=77,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:34934925_G_C:34934925:0,2,0,1
chr19	34942872	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,17,0
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chr19	34985455	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:2,3:4,6:2,4,7,2
chr19	35250452	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:12,3,1,1
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chr19	35424504	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr19	35434238	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,8,9
chr19	35434885	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=155,94;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:9,0:0|1:35434885_A_G:35434885:9,10,1,1
chr19	35434892	.	AG	TA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=156,94;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:35434885_A_G:35434885:10,10,1,1
chr19	35435006	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,13,13
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chr19	35451742	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,11,6
chr19	35454482	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,30:0.486:62:15,17:16,12:23,9,24,6
chr19	35454604	.	AA	CG	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=163.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,19:0,0,5,32
chr19	35491326	.	A	AGCCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GCCCT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr19	35500919	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=65.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,3,18
chr19	35501313	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,2:3,0:2,11,1,1
chr19	35504627	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,11:0,17:0,0,9,22
chr19	35510504	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:1,5:6,5:1,6,0,10
chr19	35512400	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.713:19:1,8:3,5:4,1,10,4
chr19	35513746	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr19	35530617	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:3,0:2,2:0,6,1,2
chr19	35530690	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	35533550	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:0|1:35533550_A_AC:35533550:0,1,0,2
chr19	35533554	.	C	CCATCCCCCCTTCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:35533550_A_AC:35533550:0,2,0,1
chr19	35556123	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,13:0,3:0,0,14,2
chr19	35556281	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,2,16
chr19	35556300	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,2,15
chr19	35556347	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=158,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr19	35556357	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:0,2:0,1,1,2
chr19	35556640	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr19	35556659	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr19	35556715	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr19	35556729	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	35556744	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	35557260	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr19	35608148	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,5:0,13:0,0,18,1
chr19	35609972	.	GGAC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:35609972_GGAC_G:35609972:0,0,3,0
chr19	35609981	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.849:4:0,1:0,3:0|1:35609972_GGAC_G:35609972:0,0,4,0
chr19	35611853	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:2,0,10,0
chr19	35611913	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,8:0,0,10,2
chr19	35613623	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr19	35614253	.	G	GGT	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GT;STR;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.300:21:3,2:12,3:8,7,2,4
chr19	35614272	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.541:30:4,4:10,11:4,10,8,8
chr19	35614274	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.535:30:4,4:9,11:4,10,8,8
chr19	35615995	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr19	35616016	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr19	35616086	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,5:3,5:3,0,8,2
chr19	35616087	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:5,0:5,2:8,2,3,0
chr19	35616315	.	GC	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,8:6,5:6,2,9,4
chr19	35616438	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.220:16:7,1:2,0:0|1:35616438_T_G:35616438:5,8,0,3
chr19	35616443	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,11;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.262:17:5,0:2,0:0|1:35616438_T_G:35616438:5,8,0,4
chr19	35616464	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:2,6:1,1:0,4,0,7
chr19	35617122	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:10,7:7,4:16,1,8,3
chr19	35622492	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=187,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:2,3:4,1:1,5,0,4
chr19	35622646	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:35622646_A_C:35622646:0,2,2,0
chr19	35622648	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:35622646_A_C:35622646:0,2,2,0
chr19	35622652	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:35622646_A_C:35622646:0,2,2,0
chr19	35622930	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:11,1:16,1:10,17,0,2
chr19	35624890	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=184,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr19	35632165	.	TCTGGCCCCGCCTCTCCCTGGCCCCGCCTCTCCCTAGCCCCCCTCTCC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.844:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	35633503	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,3:3,7:7,2,10,0
chr19	35644855	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,28;MFRL=135,167;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.437:10:3,2:0,2:2,4,1,3
chr19	35651531	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr19	35651806	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr19	35655151	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=128.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,16:0,20:0,0,17,21
chr19	35656960	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:7,0,5,1
chr19	35660546	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=122,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.628:14:0,6:5,3:1,4,2,7
chr19	35750041	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35750041_T_TA:35750041:0,1,0,1
chr19	35750043	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=162,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35750041_T_TA:35750041:0,1,0,1
chr19	35757250	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:5,1:1,1:4,2,3,0
chr19	35758275	.	G	GGGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGA;STR;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,2:0,0,6,1
chr19	35758430	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:6,6,2,0
chr19	35800720	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	35802755	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,5:3,1:4,1,6,0
chr19	35823864	.	AGGG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0,6,0,2
chr19	35832794	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:4,2,6,2
chr19	35832930	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:35832930_T_C:35832930:0,3,0,1
chr19	35832932	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:35832930_T_C:35832930:0,3,0,1
chr19	35832944	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35832944_C_T:35832944:0,0,0,1
chr19	35832948	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35832944_C_T:35832944:0,0,0,1
chr19	35836141	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=191,219;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr19	35836718	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	35837032	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:5,2,2,1
chr19	35837428	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:0,1:2,8:2,0,10,0
chr19	35837694	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,1:0,0,1,5
chr19	35851395	.	A	AGAGTCAAATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=270,250;MMQ=39,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	35979464	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:3,3:5,0,5,0
chr19	35979862	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=228,229;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	35993661	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,3,3
chr19	35994376	.	GTT	G,TTT	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=37,33,24;MFRL=122,142,127;MMQ=60,41,40;MPOS=23,9;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=91.80,9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,23,5:0.620,0.121:37:8,14,3:0,9,1:8,1,4,24
chr19	35994384	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=127,142;MMQ=60,41;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,23:0.600:38:12,13:2,8:0|1:35994384_T_G:35994384:8,7,4,19
chr19	35994390	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=127,144;MMQ=55,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,22:0.605:36:11,14:2,8:0|1:35994384_T_G:35994384:7,7,3,19
chr19	35994466	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr19	35994481	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=182,195;MMQ=41,30;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:35994481_G_A:35994481:0,2,0,1
chr19	35994486	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=182,195;MMQ=41,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:35994481_G_A:35994481:0,2,0,1
chr19	35998502	.	T	TTGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:35998502_T_TTGA:35998502:0,3,0,1
chr19	35998505	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:35998502_T_TTGA:35998502:0,3,0,1
chr19	36015865	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,5:0,2:0,3,0,7
chr19	36017464	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36017464_CG_C:36017464:0,0,1,0
chr19	36017470	.	G	GGGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:36017464_CG_C:36017464:0,0,1,0
chr19	36017474	.	AAT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:36017464_CG_C:36017464:0,0,1,0
chr19	36033825	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:2,5:5,3:6,1,7,2
chr19	36038390	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,0:3,2:0,6,0,2
chr19	36044524	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr19	36045772	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:3,1,7,1
chr19	36048795	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	36051540	.	TTG	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,26;MFRL=107,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:2,2,1,0
chr19	36051555	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,16;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:36051555_G_T:36051555:1,0,1,0
chr19	36051565	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=36,11;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:36051555_G_T:36051555:1,0,1,0
chr19	36051568	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,17;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:36051555_G_T:36051555:1,0,1,0
chr19	36051571	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,17;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:36051555_G_T:36051555:1,0,1,0
chr19	36051572	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,16;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:36051555_G_T:36051555:1,0,1,0
chr19	36051575	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,28;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36051555_G_T:36051555:1,0,1,0
chr19	36104890	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,4:2,6:3,2,3,7
chr19	36105908	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=91,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr19	36106337	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	36113459	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,17,1
chr19	36113658	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,7:0,11:0,0,2,16
chr19	36113837	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=150,103;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:6,2,2,0
chr19	36134665	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.586:18:4,3:3,4:0,7,0,11
chr19	36135279	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,0:2,4,0,3
chr19	36135783	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=61.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,17:0.487:35:9,6:9,9:0|1:36135783_G_A:36135783:4,14,2,15
chr19	36135793	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,17:0.563:30:5,7:7,9:0|1:36135783_G_A:36135783:2,11,1,16
chr19	36142296	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.342:15:7,2:3,2:1,9,0,5
chr19	36145409	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=120,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.263:10:2,0:3,2:5,3,2,0
chr19	36149468	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:6,1:10,5,2,0
chr19	36164108	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	36207222	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:3,12,0,2
chr19	36207336	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=222,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:4,3,2,0
chr19	36211906	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:5,1:2,0:2,7,2,0
chr19	36212518	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=123,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36212518_C_T:36212518:2,0,0,1
chr19	36212521	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=123,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36212518_C_T:36212518:2,0,0,1
chr19	36213187	.	CA	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=190,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36213187_CA_GT:36213187:1,0,1,0
chr19	36213197	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:36213187_CA_GT:36213187:3,0,1,0
chr19	36214632	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=72.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,13:0,0,13,9
chr19	36214961	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr19	36215725	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	36221051	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:7,5:5,4:3,9,2,7
chr19	36223111	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,1:0,2:2,1,2,1
chr19	36228667	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr19	36228954	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,1:0,5:1,0,4,3
chr19	36234608	.	AAG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,201;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:36234608_AAG_A:36234608:0,0,1,0
chr19	36234614	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,201;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:36234608_AAG_A:36234608:0,0,1,0
chr19	36237227	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=191,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:36237227_T_A:36237227:4,0,2,0
chr19	36237245	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:3,3:2,0:0|1:36237227_T_A:36237227:5,0,4,0
chr19	36243190	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:6,6:9,5:6,10,5,6
chr19	36257853	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:5,1:12,1:7,12,0,2
chr19	36257932	.	CCT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=159,228;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr19	36258890	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=12;MBQ=29,13;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.663:4:1,0:0,1:0|1:36258890_G_C:36258890:0,1,3,0
chr19	36258896	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=12;MBQ=31,22;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.663:4:1,0:0,1:0|1:36258890_G_C:36258890:0,1,3,0
chr19	36258900	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=32,22;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,0:0,1:0|1:36258890_G_C:36258890:0,1,2,0
chr19	36258902	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=31,10;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:36258890_G_C:36258890:0,1,2,0
chr19	36258904	.	CT	GG	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=33,17;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:36258890_G_C:36258890:0,1,2,0
chr19	36258910	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=17,22;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,1:0|1:36258890_G_C:36258890:1,1,2,0
chr19	36258912	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=28,12;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:36258890_G_C:36258890:1,1,2,0
chr19	36258918	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=31,12;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:36258890_G_C:36258890:1,1,2,0
chr19	36258920	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=21,12;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:36258890_G_C:36258890:1,1,1,0
chr19	36258922	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=32,12;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:36258890_G_C:36258890:1,1,1,0
chr19	36258925	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=33,18;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:36258890_G_C:36258890:1,1,1,0
chr19	36258937	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	36269915	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.309:21:7,4:6,2:11,4,4,2
chr19	36270089	.	G	GGAAATTCACAGGGTTAATCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=233,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	36271986	.	G	GGGGCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=255,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36271986_G_GGGGCCCCCCCCCCCC:36271986:1,1,1,0
chr19	36271990	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=243,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:36271990_A_C:36271990:0,2,2,0
chr19	36271994	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=243,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:36271990_A_C:36271990:0,2,2,0
chr19	36271999	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=212,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:36271986_G_GGGGCCCCCCCCCCCC:36271986:1,2,1,0
chr19	36273230	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr19	36276403	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:2,5,0,3
chr19	36304173	.	CTGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,35;MFRL=177,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:36304173_CTGGG_C:36304173:0,4,0,1
chr19	36304190	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=177,210;MMQ=58,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0|1:36304190_A_G:36304190:0,2,0,1
chr19	36304198	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=159,210;MMQ=58,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:36304190_A_G:36304190:0,2,0,1
chr19	36304203	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=205,117;MMQ=58,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36304173_CTGGG_C:36304173:0,2,0,1
chr19	36304213	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=205,117;MMQ=58,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36304173_CTGGG_C:36304173:0,2,0,1
chr19	36304245	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=210,200;MMQ=60,56;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36304245_GG_AA:36304245:0,1,0,1
chr19	36304250	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=210,200;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36304245_GG_AA:36304245:0,1,0,1
chr19	36317556	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	36317588	.	C	CCACCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:36317588_C_CCACCAG:36317588:0,4,0,1
chr19	36317591	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:36317588_C_CCACCAG:36317588:0,4,0,1
chr19	36321910	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr19	36322718	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:36322718_G_GA:36322718:0,0,0,1
chr19	36322720	.	G	GAGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:36322718_G_GA:36322718:0,0,0,1
chr19	36333176	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr19	36333180	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=36,35;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr19	36333183	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,30;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:36333183_C_A:36333183:0,2,0,1
chr19	36333186	.	G	GGTT	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36333186_G_GGTT:36333186:0,2,0,1
chr19	36333188	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36333186_G_GGTT:36333186:0,2,0,1
chr19	36333189	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36333183_C_A:36333183:0,2,0,1
chr19	36333191	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36333183_C_A:36333183:0,2,0,1
chr19	36333192	.	GA	TG	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36333186_G_GGTT:36333186:0,2,0,1
chr19	36333193	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=206,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36333183_C_A:36333183:0,1,0,1
chr19	36333391	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=154,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:11,0:6,3:0|1:36333391_C_T:36333391:14,3,2,1
chr19	36333399	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=153,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.180:19:10,0:5,2:0|1:36333391_C_T:36333391:13,3,2,1
chr19	36333406	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=153,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.180:19:10,0:4,1:0|1:36333391_C_T:36333391:12,4,2,1
chr19	36334594	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	36339797	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=276,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:36339797_C_T:36339797:2,0,0,1
chr19	36339799	.	G	GGTAGCACT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=276,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:36339797_C_T:36339797:2,0,0,1
chr19	36339994	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=71,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:36339994_C_T:36339994:0,2,0,1
chr19	36340003	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=71,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:36339994_C_T:36339994:0,2,0,1
chr19	36340156	.	G	GTCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:36340156_G_GTCT:36340156:6,6,1,1
chr19	36340158	.	CTA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:4,0:0|1:36340156_G_GTCT:36340156:6,6,1,1
chr19	36351768	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=191,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr19	36355724	.	G	GTAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36355724_G_GTAT:36355724:0,0,0,1
chr19	36355726	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36355724_G_GTAT:36355724:0,0,0,1
chr19	36363337	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr19	36379584	.	C	CTTGCTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=114,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	36379601	.	G	GAAAAGGAAGGTGAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=117,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36379601_G_GAAAAGGAAGGTGAT:36379601:0,1,0,1
chr19	36379606	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=117,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:36379601_G_GAAAAGGAAGGTGAT:36379601:0,1,0,1
chr19	36486445	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr19	36486509	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=200,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:5,3:1,6:7,0,9,0
chr19	36486767	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.319:11:3,3:2,0:3,5,3,0
chr19	36497287	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,2:7,0:15,4,0,2
chr19	36497358	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,20,17
chr19	36515252	.	A	AGGG	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,22;MFRL=0,162;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36515252_A_AGGG:36515252:0,0,1,0
chr19	36515254	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,18;MFRL=0,162;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:36515252_A_AGGG:36515252:0,0,1,0
chr19	36515258	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=213,162;MMQ=60,58;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:36515258_A_C:36515258:1,0,1,0
chr19	36515264	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=26,34;MFRL=213,162;MMQ=60,58;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36515258_A_C:36515258:1,0,1,0
chr19	36515268	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,13;MFRL=145,162;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:36515258_A_C:36515258:3,0,1,0
chr19	36515269	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,13;MFRL=145,162;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:36515258_A_C:36515258:3,0,1,0
chr19	36515271	.	ATG	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,13;MFRL=145,162;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:36515258_A_C:36515258:3,0,1,0
chr19	36515284	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,13;MFRL=145,162;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:36515284_T_C:36515284:3,0,1,0
chr19	36515287	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,12;MFRL=145,162;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:1,0:0|1:36515284_T_C:36515284:3,0,1,0
chr19	36517655	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	36526281	.	TATA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	36558113	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	36558712	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	36564474	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	36572279	.	G	GTCATTTTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr19	36572564	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	36581263	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr19	36582270	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr19	36592596	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:3,3,1,2
chr19	36592752	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	36595892	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	36605647	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=122.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,17:0,0,22,13
chr19	36605794	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr19	36612396	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	36632151	.	G	C	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,10:0.127:80:17,2:20,3:24,46,0,10
chr19	36636644	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.337:16:4,4:6,1:9,2,5,0
chr19	36640642	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:4,6,5,1
chr19	36640829	.	T	TTGAGAATG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=211,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:1,0:0|1:36640829_T_TTGAGAATG:36640829:0,2,0,1
chr19	36640830	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=211,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:1,0:0|1:36640829_T_TTGAGAATG:36640829:0,2,0,1
chr19	36640836	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=211,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36640829_T_TTGAGAATG:36640829:0,2,0,1
chr19	36642310	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=57.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,16,0
chr19	36642561	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0|1:36642561_G_GC:36642561:0,0,0,9
chr19	36642562	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0|1:36642561_G_GC:36642561:0,0,0,9
chr19	36643432	.	CGGGGCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGGGCT;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:1,1:0,6,0,2
chr19	36673300	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=368,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	36685310	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:36685310_C_T:36685310:0,0,0,6
chr19	36685316	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:36685310_C_T:36685310:0,0,0,5
chr19	36831372	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.422:26:6,5:8,4:7,8,2,9
chr19	37038350	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=164,233;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:20,0:6,2:0|1:37038350_T_C:37038350:16,12,1,1
chr19	37038360	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=160,233;MMQ=60,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:21,0:7,2:0|1:37038350_T_C:37038350:17,14,1,1
chr19	37038365	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=160,233;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:20,0:7,1:0|1:37038350_T_C:37038350:16,13,1,1
chr19	37063218	.	C	CA,CAA	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=134,140,106;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=52.11,12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:43,30,10:0.377,0.124:83:19,11,5:19,12,3:19,24,17,23
chr19	37147330	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,18,5
chr19	37203249	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr19	37211275	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,147;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:13,0:17,3:12,19,0,3
chr19	37369345	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,134;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:26,3:21,0:21,26,0,3
chr19	37369525	.	CT	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:17,1:9,2:12,17,1,2
chr19	37369826	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=195,219;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,2:3,0:0,13,0,2
chr19	37369858	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=236,195;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0|1:37369858_G_GC:37369858:0,3,0,3
chr19	37369863	.	CC	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=236,205;MMQ=60,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:37369858_G_GC:37369858:0,3,0,2
chr19	37369866	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=236,195;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:37369858_G_GC:37369858:0,3,0,1
chr19	37416022	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=216,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,2:3,1:9,0,3,0
chr19	37441462	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.520:38:10,10:8,8:11,7,12,8
chr19	37581795	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,196;MMQ=50,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr19	37678013	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,0:11,3:10,13,0,3
chr19	37681098	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:2,5:0,0:2,1,0,5
chr19	37837999	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=162,177;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:10,2:29,0:0|1:37837999_A_G:37837999:39,0,2,0
chr19	37838003	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=160,128;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:39,2:0.070:41:12,2:20,0:1|0:37837999_A_G:37837999:37,2,2,0
chr19	37853884	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:6,0:7,0:4,11,2,0
chr19	37916859	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.191:14:5,0:4,2:5,7,0,2
chr19	37966923	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:0,1,2,6
chr19	37967214	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:8,3,5,1
chr19	38024108	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr19	38027715	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr19	38028813	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:38028813_ATT_A:38028813:0,0,0,1
chr19	38028835	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=204,202;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38028813_ATT_A:38028813:0,1,0,1
chr19	38077661	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,8:1,13:0,1,0,21
chr19	38126590	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=123,15189330;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,2:5,0:10,5,0,2
chr19	38126720	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:10,0:16,2:14,13,1,1
chr19	38135444	.	C	CAAAAAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,0:3,0,2,2
chr19	38161161	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:5,3:8,1:5,9,3,1
chr19	38189025	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=116,491;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:15,2:11,0:15,12,0,2
chr19	38190845	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr19	38229378	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.346:38:16,9:9,3:18,7,11,2
chr19	38376485	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,11:0,0,12,13
chr19	38377321	.	TTTC	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTC;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.142:18:8,1:8,1:0,16,0,2
chr19	38377409	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	38377564	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=212.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,37:0,23:0,0,38,23
chr19	38379446	.	C	T	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=341.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,100:0.991:100:0,54:0,44:0,0,35,65
chr19	38382527	.	A	AGC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:38382527_A_AGC:38382527:1,3,0,1
chr19	38382529	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:38382527_A_AGC:38382527:1,3,0,1
chr19	38382530	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=62,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0|1:38382530_C_T:38382530:0,2,0,1
chr19	38382533	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38382530_C_T:38382530:0,1,0,1
chr19	38382534	.	T	TAGAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38382530_C_T:38382530:0,1,0,1
chr19	38573068	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	38573149	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr19	38573802	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=242,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr19	38579285	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr19	38601028	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr19	38610504	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr19	38610542	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	38621473	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr19	38653097	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr19	38673126	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:1,2:7,2:7,1,4,0
chr19	38696714	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:0,2,3,0
chr19	38702878	.	T	TGG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,0:0,0:0|1:38702878_T_TGG:38702878:1,4,3,0
chr19	38702882	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:5,0:0,1:0|1:38702878_T_TGG:38702878:1,4,3,0
chr19	38702886	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=175,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:5,1:1,0:0|1:38702878_T_TGG:38702878:2,4,3,0
chr19	38702890	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:0|1:38702878_T_TGG:38702878:3,4,3,0
chr19	38709393	.	A	AATGTTGTGTCCCCTTAAATTCCTATGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,225;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	38743100	.	G	GTAATCGCCATGAAAAACAAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38743100_G_GTAATCGCCATGAAAAACAAA:38743100:0,0,0,1
chr19	38743103	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38743100_G_GTAATCGCCATGAAAAACAAA:38743100:0,0,0,1
chr19	38743105	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38743100_G_GTAATCGCCATGAAAAACAAA:38743100:0,0,0,1
chr19	38797511	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,201;MMQ=40,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,1:8,1:12,0,2,0
chr19	38798226	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:3,2:7,7:6,5,3,6
chr19	38817135	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=135,157;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38817135_A_G:38817135:1,0,1,0
chr19	38817145	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=135,157;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:38817135_A_G:38817135:2,0,1,0
chr19	38850308	.	CCAAGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=192,313;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38850308_CCAAGGG_C:38850308:0,1,0,1
chr19	38850316	.	AG	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=192,313;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38850308_CCAAGGG_C:38850308:0,1,0,1
chr19	38850321	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=192,313;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38850308_CCAAGGG_C:38850308:0,1,0,1
chr19	38866778	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=17,18;MFRL=201,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.326:10:1,0:2,0:0|1:38866778_C_G:38866778:6,1,3,0
chr19	38866781	.	TC	GC,GG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,9,9;MFRL=327,195,137;MMQ=60,60,60;MPOS=13,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.46,6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,3:0.570,0.260:10:0,1,0:1,0,0:0,1,9,0
chr19	38866785	.	TC	GG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,9;MFRL=182,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.241:14:3,0:1,0:0|1:38866778_C_G:38866778:9,2,3,0
chr19	38866790	.	TC	GG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,10;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.276:12:3,0:3,0:0|1:38866778_C_G:38866778:8,1,3,0
chr19	38866892	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=137,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,0:11,2:8,13,1,1
chr19	38882863	.	CCCT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CCT;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr19	38896204	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:5,4:4,6:4,5,7,3
chr19	38924380	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:38924380_A_C:38924380:0,0,1,0
chr19	38924385	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38924380_A_C:38924380:0,0,1,0
chr19	38924390	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38924380_A_C:38924380:0,0,1,0
chr19	38924396	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38924380_A_C:38924380:0,0,1,0
chr19	38924401	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38924380_A_C:38924380:0,1,1,0
chr19	38924405	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,13;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:38924380_A_C:38924380:0,1,1,0
chr19	38935280	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0,0,7,11
chr19	38935350	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	38939165	.	G	GGATTGGGATCAGATTTGCTCCACA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:2,5,1,1
chr19	38939189	.	C	CTCGCACAGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=124,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:2,2,0,1
chr19	38939505	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,98;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	38945851	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr19	38946182	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,5,8
chr19	38946215	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,7,9
chr19	38948356	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	38949729	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	38950947	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=70.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0,0,20,1
chr19	38953996	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr19	38954495	.	G	GATAACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:38954495_G_GATAACA:38954495:0,1,0,1
chr19	38954496	.	G	GATGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:38954495_G_GATAACA:38954495:0,1,0,1
chr19	38989658	.	CGCAGG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCAGG;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr19	38991640	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:38991640_C_G:38991640:0,4,0,1
chr19	38991645	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:38991640_C_G:38991640:0,4,0,1
chr19	38993079	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr19	38993372	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr19	38993638	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=121,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr19	38995355	.	ACCT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:3,1:4,5,2,1
chr19	38995510	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=220,134;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,1:1,3:3,4,2,2
chr19	38995864	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:38995864_A_C:38995864:0,1,1,0
chr19	38995867	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:38995864_A_C:38995864:1,2,1,0
chr19	38996607	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:38996607_G_GAC:38996607:0,3,0,1
chr19	38996609	.	G	GAAGTCCTTAAGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=174,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr19	38996610	.	GGC	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:38996607_G_GAC:38996607:0,3,0,1
chr19	38997076	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:3,2,3,1
chr19	38997459	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:6,2,1,1
chr19	38997609	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.711:18:1,3:3,9:1,4,3,10
chr19	38997635	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:2,2:3,6:0,6,1,7
chr19	39005789	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=30,10;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,0:2,0:4,1,0,2
chr19	39005793	.	G	T,C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=30,10,35;MFRL=0,134,103;MMQ=60,60,60;MPOS=21,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.63,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:1,0,1:2,0,0:3,0,0,3
chr19	39005796	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=56,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:39005796_G_T:39005796:2,2,0,1
chr19	39005799	.	AGG	CAC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=18,33;MFRL=112,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:0,1:1,0:0|1:39005796_G_T:39005796:1,2,0,1
chr19	39005804	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=23,27;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:39005796_G_T:39005796:0,2,0,1
chr19	39005818	.	TGGG	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=56,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:39005818_TGGG_T:39005818:0,2,0,1
chr19	39005822	.	G	GATGTA	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=78,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr19	39005824	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=34,27;MFRL=56,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:39005818_TGGG_T:39005818:0,2,0,1
chr19	39005829	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=34,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39005818_TGGG_T:39005818:0,1,0,1
chr19	39008192	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=199,246;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,0:3,10,2,0
chr19	39008200	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=222,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.181:18:8,0:5,0:0|1:39008200_T_A:39008200:4,11,3,0
chr19	39008205	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=215,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:8,0:5,1:4,11,3,0
chr19	39008208	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=222,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:6,0:0|1:39008200_T_A:39008200:4,11,2,0
chr19	39013771	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.381:13:4,1:2,0:1,7,5,0
chr19	39014642	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=180,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:3,1:0,5:0,3,0,7
chr19	39018280	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,5:6,3:12,1,6,2
chr19	39025676	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	39027419	.	AG	CC	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=101,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,9:0.143:61:28,3:21,1:0|1:39027419_AG_CC:39027419:9,43,9,0
chr19	39027424	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=110,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,7:0.130:56:24,1:16,3:0|1:39027419_AG_CC:39027419:8,41,7,0
chr19	39027430	.	GT	CG	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=122,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,4:0.100:48:20,0:16,3:0|1:39027419_AG_CC:39027419:5,39,4,0
chr19	39028622	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=206,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:39028622_T_G:39028622:2,1,0,1
chr19	39028627	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=303,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:39028622_T_G:39028622:1,1,0,1
chr19	39028678	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=214,130;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,0:1,1:0,2,2,0
chr19	39034322	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,1,2
chr19	39051655	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,203;MMQ=59,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr19	39061258	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=77,152;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:8,4:7,4:11,4,6,2
chr19	39077895	.	AAT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:3,0:10,4,2,0
chr19	39078487	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:1,11,0,2
chr19	39090733	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:6,5,0,2
chr19	39095981	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=251,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr19	39101840	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.236:27:8,3:9,1:0|1:39101840_A_C:39101840:5,16,6,0
chr19	39101845	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,9;MFRL=128,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.137:26:10,0:11,0:0|1:39101840_A_C:39101840:6,17,3,0
chr19	39101850	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=126,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.132:27:8,0:12,0:0|1:39101840_A_C:39101840:7,17,3,0
chr19	39102060	.	G	GACCCTTGAAGACTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=127,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	39108471	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.072:40:23,2:14,0:21,17,2,0
chr19	39138342	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:11,1,2,0
chr19	39191383	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,0,4
chr19	39191544	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	39217835	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=193,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0,12,0,2
chr19	39219125	.	C	CTTGTTCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	39221715	.	CCCATGCCCCA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.714:18:1,4:1,7:4,1,8,5
chr19	39224293	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,7:6,5:7,1,10,2
chr19	39227707	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:39227707_G_C:39227707:0,0,1,0
chr19	39227712	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:39227707_G_C:39227707:0,0,1,0
chr19	39227715	.	AT	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:39227707_G_C:39227707:0,0,1,0
chr19	39227720	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=144,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:39227707_G_C:39227707:1,0,1,0
chr19	39227726	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:39227707_G_C:39227707:4,0,1,0
chr19	39228868	.	G	GCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,1:2,2:6,2,4,0
chr19	39232525	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:3,2:0|1:39232525_T_C:39232525:2,6,1,1
chr19	39232528	.	A	ACGAACATGT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,0:4,2:0|1:39232525_T_C:39232525:2,6,1,1
chr19	39233146	.	A	G	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=138.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,55:0.491:112:31,28:25,25:33,24,37,18
chr19	39234511	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=66,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:1,1,3,0
chr19	39262459	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=227,212;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,2:10,1:17,0,3,0
chr19	39281540	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=229,225;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,7:6,4:0,12,0,11
chr19	39292615	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:13,0:13,10,3,0
chr19	39292674	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=138,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,1:8,1:11,9,0,2
chr19	39294061	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:3,2:0,0:4,0,2,0
chr19	39297007	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=178,214;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	39299362	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=100,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr19	39306425	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:4,6,1,5
chr19	39306680	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.654:4:0,0:0,1:0,1,0,3
chr19	39308138	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:19,0:7,2:16,11,0,2
chr19	39328145	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,4:8,6:6,8,3,7
chr19	39331296	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	39338125	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,6:2,2:0,4,0,8
chr19	39338142	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr19	39360720	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr19	39361658	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,6,1
chr19	39406484	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,62;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,2,0
chr19	39408533	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.199:16:7,0:6,1:4,9,3,0
chr19	39423118	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,1:16,1:7,16,0,2
chr19	39516285	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	39589548	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=252,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr19	39590853	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=108,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:3,1:1,4:3,1,1,4
chr19	39591748	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=119,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,0,3
chr19	39592215	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=203,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr19	39663602	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,1:15,1:16,14,2,0
chr19	39664720	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	39665934	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	39688815	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,12,12
chr19	39689943	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr19	39691136	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr19	39691216	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr19	39691239	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr19	39734220	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,152;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,3:6,4:8,0,7,0
chr19	39735016	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,127;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,2:3,3:10,0,5,0
chr19	39735644	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,133;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.393:31:10,6:9,6:10,9,3,9
chr19	39759401	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=133,140;MMQ=52,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,4:6,1:5,12,0,5
chr19	39760069	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	39760336	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=185,211;MMQ=43,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,4:3,0:2,3,0,4
chr19	39820127	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,2:9,0:16,4,2,0
chr19	39823854	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,218;MMQ=59,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:39823854_GC_AT:39823854:0,2,0,1
chr19	39823859	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=169,218;MMQ=59,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:39823854_GC_AT:39823854:0,2,0,1
chr19	39871286	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,3:7,5:6,8,6,2
chr19	39879620	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,1:10,1:20,10,1,1
chr19	39879816	.	G	GAAACTCTATAGCCCTTGAGCAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:11,2:11,0:5,17,0,2
chr19	39881015	.	T	TAGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,2:5,4:0,8,0,7
chr19	39881507	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.093:35:14,0:18,2:5,27,0,3
chr19	39908369	.	G	GTTTGGAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr19	39913029	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=245,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr19	39914308	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:3,0,4,1
chr19	39924129	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:7,7:6,11:8,5,14,4
chr19	39936502	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=179,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,5:3,1,3,3
chr19	39944082	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,137;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,27:0.594:45:7,9:11,17:12,6,18,9
chr19	39949764	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=98,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,1:2,1:4,1,2,0
chr19	39955705	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=23,15;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.131:35:8,0:8,2:4,26,0,5
chr19	39957030	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr19	39962276	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:3,1:15,2:11,7,2,1
chr19	39963828	.	TC	AC,CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29,33;MFRL=229,180,201;MMQ=60,60,60;MPOS=16,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.13,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:1,2,0:2,0,1:3,0,1,2
chr19	39972766	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr19	39976464	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:3,3:5,0:3,6,1,2
chr19	39976969	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=117,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:2,3,2,1
chr19	39991237	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:4,4,3,2
chr19	40006152	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=180,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,3:2,0:5,3,2,1
chr19	40093111	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr19	40095757	.	G	GGCTGGAGCA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=139,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:8,1,1,1
chr19	40096127	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	40174331	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:40174331_CA_TG:40174331:0,3,0,1
chr19	40174335	.	GC	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:40174331_CA_TG:40174331:0,3,0,1
chr19	40318086	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr19	40327312	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,12:0,0,6,20
chr19	40328327	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr19	40336849	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=215,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.407:10:3,1:0,1:5,1,4,0
chr19	40336853	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=19,13;MFRL=215,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.419:10:2,0:1,0:5,1,4,0
chr19	40360845	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=104,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:8,2:10,5:9,10,3,4
chr19	40368376	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,148;MMQ=60,46;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.252:38:12,4:14,5:19,10,5,4
chr19	40368498	.	AA	CC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,55;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,7:0,0,12,10
chr19	40373889	.	CCA	TTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,136;MMQ=51,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr19	40405847	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr19	40407901	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,153;MMQ=52,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:7,1:5,3:9,4,3,1
chr19	40408146	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,139;MMQ=55,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,34:0.477:71:23,16:14,17:19,18,18,16
chr19	40408821	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=191,202;MMQ=40,53;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,4:2,5:0,7,2,7
chr19	40408857	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=53.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,3,14
chr19	40408910	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr19	40411857	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,138;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.374:46:14,4:14,13:13,16,5,12
chr19	40419558	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:9,8:4,7:9,4,12,3
chr19	40421612	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,1,3
chr19	40440482	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=136,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.340:21:3,5:9,1:7,7,5,2
chr19	40486606	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:10,9:7,6:7,10,6,9
chr19	40540812	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.564:39:7,9:9,13:11,6,10,12
chr19	40590791	.	A	AGAAACATTTATGTGAAGCGTGCATTCAACTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	40595028	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr19	40698651	.	CCACAGA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=147,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40698651_CCACAGA_C:40698651:0,1,0,1
chr19	40698658	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=147,242;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40698651_CCACAGA_C:40698651:0,1,0,1
chr19	40719410	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr19	40721091	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,1:11,1:15,7,0,2
chr19	40739721	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr19	40739821	.	G	GATA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:2,1,0,1
chr19	40741274	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr19	40742320	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr19	40771132	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:6,7,2,0
chr19	40839664	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	40875800	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:40875800_C_G:40875800:0,0,3,1
chr19	40875810	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:40875800_C_G:40875800:0,0,4,1
chr19	40883844	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr19	40884160	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	40886223	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:7,6:9,5:14,2,8,3
chr19	40904602	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,3:7,6:8,3,8,1
chr19	40909584	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=18,12;MFRL=203,201;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:0,0:3,0,2,0
chr19	40909594	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=203,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,1:1,0:3,0,3,0
chr19	40909596	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=16,13;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:0,1:1,0:5,0,3,0
chr19	40909601	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=173,201;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,1:3,0:6,0,2,0
chr19	40909757	.	CCCG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=173,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:0|1:40909757_CCCG_C:40909757:0,6,1,1
chr19	40909765	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:0|1:40909757_CCCG_C:40909757:0,4,1,1
chr19	40929363	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:8,1:4,11,2,1
chr19	40947373	.	GGATC	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=156,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GATC;STR;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,10:8,3:8,4,11,2
chr19	40964191	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=178,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:40964191_G_T:40964191:0,4,0,1
chr19	40964216	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:40964191_G_T:40964191:1,0,0,1
chr19	40978453	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.463:28:7,5:8,7:14,1,12,1
chr19	40978638	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:10,1:8,15,2,0
chr19	40978733	.	G	GAGCTGCCCCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=238,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:1,0:2,0:0|1:40978733_G_GAGCTGCCCCA:40978733:1,2,0,1
chr19	40978735	.	G	GTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=238,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:40978733_G_GAGCTGCCCCA:40978733:1,2,0,1
chr19	41007797	.	GTC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=126,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:4,3,5,1
chr19	41010047	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr19	41019550	.	G	GGTTATACCTTCTACTTAGAATGCTCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	41034912	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=165,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.609:8:0,2:2,1:3,0,3,2
chr19	41040334	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr19	41056289	.	A	AGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	41062902	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,29;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.550:11:0,1:2,4:0,5,0,6
chr19	41073506	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.547:7:3,0:0,0:0|1:41073506_A_C:41073506:0,3,4,0
chr19	41073509	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,10;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,0:0,0:0|1:41073506_A_C:41073506:0,3,3,0
chr19	41073535	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:11,0:6,0:9,8,3,0
chr19	41083107	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=117,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.256:29:10,3:12,4:17,5,4,3
chr19	41089271	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,111;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:4,2,2,0
chr19	41099197	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:11,2:4,0:0|1:41099197_A_G:41099197:0,15,0,2
chr19	41099199	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,1:4,0:0|1:41099197_A_G:41099197:0,16,0,2
chr19	41118954	.	A	C	.	.	DP=101;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,22:0.216:92:21,1:23,0:39,31,22,0
chr19	41118960	.	A	C	.	.	DP=109;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,14:0.142:94:20,1:22,0:46,34,14,0
chr19	41123093	.	A	AG	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=75.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,13:0,9:0,0,12,10
chr19	41123162	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.245:20:8,0:7,0:0|1:41123162_A_C:41123162:6,9,0,5
chr19	41123168	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.348:17:3,2:4,0:0|1:41123162_A_C:41123162:5,6,0,6
chr19	41128619	.	A	ACCACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:41128619_A_ACCACC:41128619:0,0,0,1
chr19	41128620	.	T	TGGAATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41128619_A_ACCACC:41128619:0,0,0,1
chr19	41128622	.	C	CTCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41128619_A_ACCACC:41128619:0,0,0,1
chr19	41129008	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:2,1:0,0:0|1:41129008_TCA_T:41129008:0,3,0,1
chr19	41129011	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:41129008_TCA_T:41129008:0,3,0,1
chr19	41129015	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:41129008_TCA_T:41129008:0,3,0,1
chr19	41129017	.	CTGTT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:41129008_TCA_T:41129008:0,3,0,1
chr19	41129028	.	TA	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:41129008_TCA_T:41129008:0,3,0,1
chr19	41173751	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=131,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.389:15:2,0:5,0:0|1:41173751_T_G:41173751:6,3,0,6
chr19	41173757	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=120,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.325:15:3,0:4,0:0|1:41173751_T_G:41173751:7,3,0,5
chr19	41173865	.	TTGC	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=161,182;MMQ=53,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGC;STR;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:2,3:6,3:0|1:41173865_TTGC_T:41173865:5,3,3,3
chr19	41173880	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=161,198;MMQ=60,53;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:3,2:2,5:0|1:41173880_C_T:41173880:3,2,6,2
chr19	41173889	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=186,161;MMQ=46,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:0|1:41173865_TTGC_T:41173865:5,2,3,2
chr19	41173892	.	CTGCTGT	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=161,186;MMQ=60,46;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGCTGT;STR;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:0|1:41173880_C_T:41173880:3,2,5,2
chr19	41173895	.	CTGT	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.783:7:0,4:1,2:0|1:41173865_TTGC_T:41173865:0,1,4,2
chr19	41175996	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr19	41206208	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,3:0,0:0,0,3,1
chr19	41208404	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	41211142	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,0:5,3:9,5,1,4
chr19	41220029	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=118,171;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,3:6,5:3,9,1,7
chr19	41220364	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,1:1,3:3,4,0,4
chr19	41224243	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:41224243_T_C:41224243:0,2,0,1
chr19	41224248	.	CTCCG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:41224243_T_C:41224243:0,2,0,1
chr19	41224253	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:41224243_T_C:41224243:0,2,0,1
chr19	41224255	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41224243_T_C:41224243:0,1,0,1
chr19	41251180	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr19	41255309	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,0:5,0,3,0
chr19	41255333	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,10;MFRL=177,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,0:14,0,2,0
chr19	41255768	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=64.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.436:51:9,10:19,12:0,29,0,22
chr19	41269481	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,6:4,4:6,5,8,2
chr19	41271104	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:0,8,0,6
chr19	41281346	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr19	41283365	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.448:18:5,3:4,4:3,7,3,5
chr19	41285873	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:5,6:2,5:7,0,9,2
chr19	41312620	.	G	GCAGGCACATCTTAGA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:4,1:8,1:5,8,0,2
chr19	41312628	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=178,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:3,1:1,1:3,2,0,3
chr19	41349640	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,4:0,16:0,0,20,0
chr19	41349652	.	GC	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=153,130;MMQ=60,21;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:4,0:15,3:19,2,3,0
chr19	41349943	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,189;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:5,5:14,1:3,16,0,6
chr19	41350489	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=149,151;MMQ=55,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:8,10:12,6:14,6,14,2
chr19	41350509	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=152,145;MMQ=40,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.426:42:10,8:14,8:15,9,14,4
chr19	41350594	.	G	A	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,142;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=154.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,58:0.576:100:14,34:27,20:22,20,27,31
chr19	41352762	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,157;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:9,7:5,10:12,2,14,3
chr19	41354442	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,180;MMQ=52,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:7,3,2,0
chr19	41354712	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr19	41381840	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr19	41381868	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr19	41382607	.	AG	CA	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0|1:41382607_AG_CA:41382607:0,0,0,17
chr19	41382612	.	CG	TA	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,5:0|1:41382607_AG_CA:41382607:0,0,0,16
chr19	41382645	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,0,10
chr19	41382653	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,1,9
chr19	41382655	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,1,8
chr19	41382665	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:41382645_G_A:41382645:0,0,1,5
chr19	41383115	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,25:0.417:60:12,12:23,12:20,15,17,8
chr19	41383308	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=150,172;MMQ=59,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:6,1:2,16,0,2
chr19	41383344	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=116,166;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,7:0,5:0,1,0,12
chr19	41383378	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	41384578	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=159,210;MMQ=57,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr19	41384637	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=173,159;MMQ=53,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:6,2,2,0
chr19	41386136	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,119;MMQ=40,55;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.388:34:9,7:12,6:10,11,4,9
chr19	41386494	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=152,165;MMQ=60,39;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:8,4:6,3:0|1:41386494_A_C:41386494:4,10,2,5
chr19	41386527	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=167,190;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,3:6,1:0|1:41386494_A_C:41386494:4,7,1,4
chr19	41386544	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=137,186;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:2,2:5,1:0|1:41386494_A_C:41386494:4,4,1,3
chr19	41386547	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=137,186;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:1,2:5,1:0|1:41386494_A_C:41386494:4,4,1,3
chr19	41386584	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=191,167;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,2:4,1:0,6,1,3
chr19	41387647	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=142,195;MMQ=60,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:3,2:6,2:0|1:41387647_A_G:41387647:3,8,5,0
chr19	41387656	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=142,195;MMQ=60,36;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,2:4,1:0|1:41387647_A_G:41387647:2,7,3,0
chr19	41387669	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr19	41497381	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,131;MMQ=59,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:4,0:3,7,0,2
chr19	41518145	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:5,0,2,0
chr19	41518150	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr19	41518573	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:4,3,2,1
chr19	41518773	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=267,142;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr19	41600054	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr19	41600780	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.848:8:0,4:0,2:0,1,6,1
chr19	41631631	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,145;MMQ=57,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:9,2:8,1:1,16,0,3
chr19	41704832	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	41712065	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:6,1:5,1:2,9,0,2
chr19	41727221	.	G	GGCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=264,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41727221_G_GGCTC:41727221:0,1,0,1
chr19	41727223	.	A	ATAAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=264,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41727221_G_GGCTC:41727221:0,1,0,1
chr19	41743861	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr19	41798468	.	GAC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr19	41811730	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,17:0,23:0,0,2,39
chr19	41825794	.	C	CACCCATCACCACCACCACCACGGTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41825794_C_CACCCATCACCACCACCACCACGGTG:41825794:0,0,0,1
chr19	41825801	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41825794_C_CACCCATCACCACCACCACCACGGTG:41825794:0,0,0,1
chr19	41838206	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,5:2,0:0,2,1,4
chr19	41858908	.	C	CATACATATTGTTAATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,0:0,1:0|1:41858908_C_CATACATATTGTTAATA:41858908:0,1,0,1
chr19	41858911	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41858908_C_CATACATATTGTTAATA:41858908:0,1,0,1
chr19	41863777	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=129,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.644:17:3,4:1,5:4,2,10,1
chr19	41869468	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,4:8,6:0,13,3,7
chr19	41869487	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=211,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,3:4,3:0,7,0,6
chr19	41884338	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,1:4,1:3,6,0,2
chr19	41889423	.	A	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=123.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,33:0.558:59:6,19:15,14:0|1:41889423_A_T:41889423:22,4,25,8
chr19	41889429	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=123.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,33:0.558:59:7,19:18,13:0|1:41889423_A_T:41889423:20,6,24,9
chr19	41895839	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.243:14:6,1:4,2:6,5,1,2
chr19	41897674	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	41897688	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	41898976	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	41903671	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:4,5:5,6:0|1:41903671_A_G:41903671:10,0,8,3
chr19	41903675	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=94.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.963:24:0,11:0,12:0|1:41903671_A_G:41903671:0,0,21,3
chr19	41919944	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.314:11:2,2:4,1:7,1,3,0
chr19	41925273	.	T	TTAACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41925273_T_TTAACA:41925273:0,0,0,1
chr19	41925275	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:41925273_T_TTAACA:41925273:0,0,0,1
chr19	41928336	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=141,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr19	41928367	.	CTGGT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr19	41928745	.	T	TCAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=213,252;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:41928745_T_TCAG:41928745:0,1,0,1
chr19	41928751	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=15,28;MFRL=213,252;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:41928745_T_TCAG:41928745:0,1,0,1
chr19	41928753	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=213,252;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41928745_T_TCAG:41928745:0,1,0,1
chr19	41928867	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,3,1
chr19	41930523	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=157,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.379:11:2,0:5,1:0|1:41930523_A_AG:41930523:0,7,4,0
chr19	41930528	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=157,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.380:11:2,1:5,1:0|1:41930523_A_AG:41930523:0,7,4,0
chr19	41931454	.	A	AGGCCAGGGCCGG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:3,2:7,5:11,1,10,1
chr19	41932474	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.609:36:9,11:4,11:12,2,17,5
chr19	41932612	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.342:12:4,1:4,2:1,7,0,4
chr19	41938408	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,183;MMQ=37,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	41942375	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:6,8,2,0
chr19	41944237	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.260:20:6,3:9,1:4,11,4,1
chr19	41945837	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,10:0.305:34:10,6:11,4:0|1:41945837_T_A:41945837:9,15,5,5
chr19	41945848	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,9:0.322:29:9,6:11,2:0|1:41945837_T_A:41945837:8,12,3,6
chr19	41945904	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=106,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:0,4:4,0:1,3,0,4
chr19	41949870	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr19	42125660	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	42126448	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	42126825	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=211,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:42126825_T_G:42126825:3,0,0,1
chr19	42126827	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=211,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:42126825_T_G:42126825:3,0,0,1
chr19	42128202	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr19	42132314	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.599:18:3,7:4,4:2,5,4,7
chr19	42212753	.	A	AGCACAGAGACTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,140;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,1,0
chr19	42260569	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,111;MMQ=60,56;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.636:31:7,6:4,14:8,3,11,9
chr19	42265842	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=100,60200;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:8,1,1,1
chr19	42301936	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,165;MMQ=60,37;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr19	42314524	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:42314524_G_T:42314524:0,0,0,1
chr19	42314525	.	C	CTTCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42314524_G_T:42314524:0,0,0,1
chr19	42315387	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42315387_A_C:42315387:0,3,0,1
chr19	42315391	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:42315387_A_C:42315387:0,3,0,1
chr19	42342923	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr19	42343155	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=69,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr19	42352413	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,1:8,2:13,1,3,0
chr19	42353022	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=98,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,0:6,3:4,8,0,3
chr19	42353148	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:6,4:3,5:0|1:42353148_A_G:42353148:7,2,8,1
chr19	42353150	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:6,4:2,5:0|1:42353148_A_G:42353148:7,2,8,1
chr19	42373893	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=106,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr19	42385113	.	C	CATAAAGGTTTTCATCTTCATATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42385113_C_CATAAAGGTTTTCATCTTCATATT:42385113:0,0,0,1
chr19	42385115	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42385113_C_CATAAAGGTTTTCATCTTCATATT:42385113:0,0,0,1
chr19	42408119	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=35,11;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:0,0:6,0:0|1:42408119_T_G:42408119:0,7,2,0
chr19	42408120	.	T	TGC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:0,2:6,0:0|1:42408119_T_G:42408119:0,7,2,0
chr19	42408125	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:4,0:0|1:42408119_T_G:42408119:1,8,2,0
chr19	42408130	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=154,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:5,0:0|1:42408119_T_G:42408119:1,9,2,0
chr19	42408383	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.180:14:4,0:6,2:7,5,1,1
chr19	42410830	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,9;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.342:15:4,0:4,0:0|1:42410830_T_G:42410830:2,8,5,0
chr19	42410833	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,14;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.281:15:4,0:6,1:0|1:42410830_T_G:42410830:2,9,4,0
chr19	42410836	.	AT	CA	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.264:16:4,0:5,0:0|1:42410830_T_G:42410830:2,10,4,0
chr19	42410839	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,11;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.264:16:4,0:7,0:0|1:42410830_T_G:42410830:2,10,4,0
chr19	42410845	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=134,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:4,0:8,0:0|1:42410830_T_G:42410830:2,12,3,0
chr19	42474715	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:1,9,0,2
chr19	42489516	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,17:0,0,19,13
chr19	42506775	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	42510035	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:15,1:17,1:10,22,0,2
chr19	42569293	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42569293_G_GT:42569293:1,0,1,0
chr19	42569295	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42569293_G_GT:42569293:1,0,1,0
chr19	42603816	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.133:21:8,2:5,0:6,13,2,0
chr19	42713984	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.678:37:4,8:7,7:4,7,7,19
chr19	42731735	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=185,169;MMQ=40,31;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:42731735_C_T:42731735:0,3,0,1
chr19	42731738	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=188,172;MMQ=36,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr19	42731739	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=185,169;MMQ=40,31;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:42731735_C_T:42731735:0,3,0,1
chr19	42736267	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=263.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,28:0,46:0,0,31,43
chr19	42759046	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.305:19:7,0:3,0:0|1:42759046_G_C:42759046:4,9,6,0
chr19	42759048	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.310:19:7,0:3,0:0|1:42759046_G_C:42759046:4,9,6,0
chr19	42793951	.	TCC	GGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:1,0:3,3,2,0
chr19	42798997	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42798997_A_T:42798997:0,1,0,1
chr19	42799002	.	C	CAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42798997_A_T:42798997:0,1,0,1
chr19	42818322	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,2,1
chr19	42821858	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:4,8:4,5:6,2,10,3
chr19	42840420	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:2,2,3,0
chr19	42848764	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr19	42863230	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr19	42863381	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=102,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:3,4:6,1:3,6,2,4
chr19	42880843	.	GGGT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42880843_GGGT_G:42880843:0,0,1,0
chr19	42880848	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42880843_GGGT_G:42880843:0,0,1,0
chr19	42880851	.	G	GTACCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42880843_GGGT_G:42880843:0,0,1,0
chr19	42893236	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=206,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,1,2
chr19	42912483	.	A	AAATAGAAACACTTTTATACTGTTGGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr19	42912527	.	G	GAAGGAGGTGAAGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	42930734	.	GC	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:16,0:19,3:12,23,0,3
chr19	42938070	.	CATTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42938070_CATTGT_C:42938070:0,1,0,1
chr19	42938079	.	AC	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:42938070_CATTGT_C:42938070:0,1,0,1
chr19	43032409	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,2:6,0:9,7,2,0
chr19	43243217	.	AA	GG	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=191.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.979:44:0,20:0,21:0|1:43243217_AA_GG:43243217:0,0,14,30
chr19	43243238	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=169.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,16:0,18:0|1:43243217_AA_GG:43243217:0,0,6,32
chr19	43243248	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=155.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,14:0,18:0|1:43243217_AA_GG:43243217:0,0,3,32
chr19	43243251	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=146.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.971:33:0,14:0,17:0|1:43243217_AA_GG:43243217:0,0,2,31
chr19	43243266	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=113.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,12:0,10:0|1:43243217_AA_GG:43243217:0,0,2,25
chr19	43257377	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr19	43257439	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,1:6,5:6,3,4,2
chr19	43258373	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=50,149;MMQ=46,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:3,1,5,0
chr19	43258782	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	43268140	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=165,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.378:27:8,4:9,6:7,10,4,6
chr19	43268216	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=162,165;MMQ=49,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:10,8:11,3:10,11,6,5
chr19	43268235	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,13:0,0,13,16
chr19	43268242	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=161,159;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.553:29:7,9:5,7:6,7,7,9
chr19	43268469	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.963:24:0,14:0,9:0|1:43268469_G_C:43268469:0,0,1,23
chr19	43268489	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0|1:43268469_G_C:43268469:0,0,0,17
chr19	43268493	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=184,150;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:3,8:3,2:0|1:43268469_G_C:43268469:0,6,0,10
chr19	43371958	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:9,6:7,12:2,14,3,15
chr19	43372568	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	43382368	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=114,159;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,24:0.353:69:24,13:18,9:0|1:43382368_T_G:43382368:30,15,20,4
chr19	43382374	.	C	G	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=110,157;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,23:0.343:68:23,11:19,12:0|1:43382368_T_G:43382368:29,16,20,3
chr19	43382522	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,187;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,9:2,2:0,3,0,11
chr19	43407877	.	CA	C	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=136,138;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,30:0.579:52:5,4:8,11:5,17,1,29
chr19	43407960	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=179,167;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:4,3:6,2:0,11,0,5
chr19	43411886	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=121,72;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:13,4:16,0:18,12,3,1
chr19	43420264	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,152;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:4,9:4,9:7,1,14,4
chr19	43420449	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=102.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,27:0.484:56:16,11:9,15:0|1:43420449_G_A:43420449:18,11,16,11
chr19	43420451	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,27:0.484:56:19,10:10,15:0|1:43420449_G_A:43420449:18,11,16,11
chr19	43421767	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	43422029	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:43422029_C_CAA:43422029:0,4,0,1
chr19	43422032	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:43422029_C_CAA:43422029:0,4,0,1
chr19	43422035	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:43422029_C_CAA:43422029:0,3,0,1
chr19	43430945	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,151;MMQ=52,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:0,3,0,7
chr19	43433521	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	43433570	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=160,195;MMQ=48,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,1:4,2:6,1,2,1
chr19	43433625	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=146,189;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:4,5:11,2:13,2,7,0
chr19	43439490	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=137,148;MMQ=51,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:4,2:0,3:3,1,6,0
chr19	43439793	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=137.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,19:0,22:0,0,28,13
chr19	43439970	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.366:29:4,4:9,6:1,18,1,9
chr19	43522911	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,128;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,1:4,4:7,0,4,1
chr19	43530370	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=157,85378;MMQ=54,21;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr19	43530379	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=186,155;MMQ=21,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr19	43530390	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=186,155;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr19	43530640	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	43568850	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=178,164;MMQ=57,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr19	43586617	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr19	43586835	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr19	43674405	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	43688854	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,174;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:4,1,7,0
chr19	43699239	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,64023;MMQ=54,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:7,10,2,0
chr19	43708968	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.368:24:8,1:6,5:7,8,6,3
chr19	43708978	.	TC	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=113,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.339:24:9,2:7,3:7,9,4,4
chr19	43709072	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,166;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr19	43766383	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=147,241;MMQ=22,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	43771929	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,0:9,2:15,7,2,0
chr19	43772389	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,2:7,2:2,8,0,4
chr19	43773599	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=191,141;MMQ=60,50;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1,2,1,2
chr19	43773626	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=191,127;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:2,3,1,3
chr19	43858317	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr19	43859993	.	G	GTTTCCACATGAGTTTTGAAAGAGACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,110;MMQ=59,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr19	43860053	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr19	43860192	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,27;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	43864646	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=183,171;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43864646_G_GA:43864646:0,1,0,1
chr19	43864648	.	T	TCTCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=183,171;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43864646_G_GA:43864646:0,1,0,1
chr19	43865499	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=176,157;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:1,2,1,4
chr19	43910764	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:0,3,0,5
chr19	43920443	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr19	43922300	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,5:3,2:5,2,7,1
chr19	43983839	.	G	GCAGTTTGGGGTTTCTTGAATTTTAGATTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=40,32;MFRL=206,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.662:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	44002039	.	A	AGGCAAGCGCC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:0|1:44002039_A_AGGCAAGCGCC:44002039:0,6,1,1
chr19	44002042	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,2:5,0:0|1:44002039_A_AGGCAAGCGCC:44002039:0,6,1,1
chr19	44039275	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:1,0:0|1:44039275_G_C:44039275:5,2,2,0
chr19	44039279	.	CAGCG	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0|1:44039275_G_C:44039275:5,2,2,0
chr19	44039289	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=21,13;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.440:9:2,1:0,0:3,2,4,0
chr19	44039900	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=245,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:44039900_T_A:44039900:0,1,0,1
chr19	44039901	.	C	CAGGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=245,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44039900_T_A:44039900:0,1,0,1
chr19	44048246	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=87,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:3,4,2,0
chr19	44050195	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=100,159;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,3:7,1:8,4,3,1
chr19	44055726	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,5:4,4:8,4,8,1
chr19	44055898	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=178,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.537:7:2,1:1,1:0,3,1,3
chr19	44056106	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr19	44057851	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=121,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.100:47:20,0:16,2:33,8,0,6
chr19	44079687	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:2,2,0,7
chr19	44098903	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	44129180	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44129180_G_C:44129180:0,2,1,0
chr19	44129183	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:44129180_G_C:44129180:0,3,1,0
chr19	44129186	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,0;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:44129180_G_C:44129180:0,3,1,0
chr19	44131297	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,8:0,22:0,0,19,11
chr19	44153003	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr19	44251759	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:4,2,2,3
chr19	44252196	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,1:16,1:21,17,1,1
chr19	44254972	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	44273952	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,1:5,1:3,12,0,2
chr19	44276370	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr19	44280837	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,1,11
chr19	44306389	.	GCCCCCA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr19	44306576	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.291:11:1,1:7,1:2,6,1,2
chr19	44351050	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:1,0:3,0:5,0,1,0
chr19	44378287	.	G	GAAAACATCCAACATTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=93,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:44378287_G_GAAAACATCCAACATTCT:44378287:0,1,0,1
chr19	44378288	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=93,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:44378287_G_GAAAACATCCAACATTCT:44378287:0,1,0,1
chr19	44417575	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:10,4:6,6:12,4,6,4
chr19	44417628	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:17,2:15,1:22,10,2,1
chr19	44422982	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr19	44426265	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:4,1,3,2
chr19	44469577	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr19	44471252	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:6,1,2,6
chr19	44501717	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=209,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:44501717_T_C:44501717:0,4,0,1
chr19	44501720	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=209,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:44501717_T_C:44501717:0,4,0,1
chr19	44501724	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=209,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:44501717_T_C:44501717:0,4,0,1
chr19	44513032	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:10,0:19,2:7,23,1,1
chr19	44570393	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,9,19
chr19	44580433	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=182,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:4,0,1,0
chr19	44585159	.	T	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=206.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,37:0,26:0,0,36,27
chr19	44586076	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	44589999	.	TCTC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=88.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.963:22:0,11:0,10:0,0,6,16
chr19	44604868	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=15,12;MFRL=141,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.459:7:1,0:0,0:4,0,3,0
chr19	44604914	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,13,5
chr19	44605123	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=116.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,2,31
chr19	44605447	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:44605447_T_A:44605447:0,3,0,1
chr19	44605449	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:44605447_T_A:44605447:0,3,0,1
chr19	44605452	.	TGCC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:44605447_T_A:44605447:0,3,0,1
chr19	44612005	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,53;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=191.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,45:0.979:45:0,18:0,26:0|1:44612005_A_G:44612005:0,0,20,25
chr19	44612014	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,52;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=195.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.980:46:0,16:0,26:0|1:44612005_A_G:44612005:0,0,21,25
chr19	44620057	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,1:0,14,2,0
chr19	44620107	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:44620107_G_T:44620107:0,4,0,1
chr19	44620109	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:44620107_G_T:44620107:0,4,0,1
chr19	44620111	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:44620107_G_T:44620107:0,4,0,1
chr19	44634903	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	44680946	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,151178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,2:13,0:10,16,0,2
chr19	44741061	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	44778795	.	CG	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.593:25:3,6:7,8:0|1:44778795_CG_C:44778795:1,9,0,15
chr19	44778797	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.593:25:3,6:7,9:0|1:44778795_CG_C:44778795:1,9,0,15
chr19	44778799	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.593:25:3,6:6,8:0|1:44778795_CG_C:44778795:1,9,0,15
chr19	44832684	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.526:32:7,4:8,12:2,13,9,8
chr19	44890697	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=119,140;MMQ=60,44;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:4,5,2,2
chr19	44890801	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:5,6:6,5:0|1:44890801_T_C:44890801:8,3,7,4
chr19	44890817	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,15:0.471:32:11,7:5,8:1|0:44890801_T_C:44890801:9,8,11,4
chr19	44892333	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr19	44896487	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=84.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,14:0,9:0,0,18,6
chr19	44988611	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:4,10,0,2
chr19	44988716	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,59;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr19	45015014	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=219,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr19	45016990	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=79.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0,0,10,15
chr19	45017064	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr19	45126994	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr19	45138669	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,2:0,2:0|1:45138669_TC_T:45138669:0,0,3,1
chr19	45138671	.	TCTC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.846:4:0,1:0,2:0|1:45138669_TC_T:45138669:0,0,3,1
chr19	45150407	.	T	TGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:45150407_T_TGCA:45150407:0,0,3,0
chr19	45150410	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:45150407_T_TGCA:45150407:0,0,4,0
chr19	45157113	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,0:0,0,3,1
chr19	45164928	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr19	45206532	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	45207035	.	TTA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.479:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr19	45209238	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	45211119	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:11,5:6,4:16,1,6,3
chr19	45213695	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,0,2
chr19	45262803	.	GC	TT,GGATGCTAATTTGAAAATATAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33,34;MFRL=127,120,164;MMQ=60,60,60;MPOS=5,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.31,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.282,0.276:4:1,1,1:1,0,0:0,2,0,2
chr19	45262805	.	C	CTCTTTCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr19	45284390	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:1,3:1,4:1,2,5,2
chr19	45287745	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45287745_G_T:45287745:0,1,0,1
chr19	45287747	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45287745_G_T:45287745:0,1,0,1
chr19	45287749	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45287745_G_T:45287745:0,1,0,1
chr19	45293331	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=121,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.185:23:9,2:10,1:11,8,2,2
chr19	45296680	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=128,253;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45296680_C_G:45296680:2,0,1,0
chr19	45296683	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,253;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45296680_C_G:45296680:2,0,1,0
chr19	45316964	.	T	TGCAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	45381597	.	TGAG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAG;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:4,1:8,1:13,2,2,0
chr19	45389224	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,13,12
chr19	45395619	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.529:30:4,5:10,10:10,4,15,1
chr19	45396219	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.503:26:6,5:6,8:1,12,2,11
chr19	45404524	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,152;MMQ=48,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:15,1:17,1:15,18,0,2
chr19	45419414	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=110,147;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.349:30:9,3:8,3:4,15,9,2
chr19	45422422	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,36;MMQ=60,32;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:7,9,1,1
chr19	45422561	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=83,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr19	45445660	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=46,65;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:2,2,0,1
chr19	45445673	.	G	GTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=63,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:45445673_G_GTA:45445673:0,2,0,1
chr19	45445676	.	C	CTACTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=63,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45445673_G_GTA:45445673:0,2,0,1
chr19	45452049	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=153,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0|1:45452049_G_C:45452049:1,2,0,1
chr19	45452050	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=153,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:45452049_G_C:45452049:1,2,0,1
chr19	45452053	.	G	GGCACCCGCCAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=77,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:45452049_G_C:45452049:1,1,0,1
chr19	45452079	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	45477731	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:11,8:6,5:10,7,11,2
chr19	45477910	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr19	45488434	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,8,2
chr19	45488567	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,12,20
chr19	45491419	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=138,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:0|1:45491419_G_T:45491419:9,14,1,1
chr19	45491423	.	T	TCCTCTTTGC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:15,2:0|1:45491419_G_T:45491419:9,15,1,1
chr19	45493635	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.932:13:0,6:0,4:0,0,11,2
chr19	45494247	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr19	45536036	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr19	45537417	.	AAAAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAAT;STR;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr19	45570878	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,1,2
chr19	45571781	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=104,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.402:28:12,4:4,7:4,13,2,9
chr19	45572394	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:9,0:7,2:11,7,2,0
chr19	45659080	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=134,50;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:19,0:13,2:15,18,1,1
chr19	45663358	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,1:9,1:8,7,0,2
chr19	45667168	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=156,150;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,1:16,0:0|1:45667168_A_C:45667168:5,17,2,0
chr19	45667176	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=151,150;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:7,1:15,0:0|1:45667168_A_C:45667168:5,20,2,0
chr19	45667182	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=150,150;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:7,0:19,0:0|1:45667168_A_C:45667168:6,20,2,0
chr19	45681560	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr19	45683561	.	C	CATGATCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=188,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	45716678	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	45721596	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,1,3
chr19	45728271	.	A	AGGAAAGATTGTTGATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=239,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	45735167	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=167,104;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr19	45735184	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=104,113;MMQ=59,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr19	45769575	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:0,6,0,6
chr19	45769615	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=186,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:45769615_G_T:45769615:0,4,0,1
chr19	45769619	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=186,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:45769615_G_T:45769615:0,4,0,1
chr19	45769622	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr19	45774680	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=212,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr19	45797593	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,7:3,3:2,2,7,3
chr19	45801169	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=16,13;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:5,0:2,0:11,4,5,0
chr19	45801337	.	T	TTCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TCC;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,0:1,2,2,0
chr19	45823053	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=203,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr19	45851369	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,93;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:10,11,2,0
chr19	45854428	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	45855848	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=134,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:5,12,1,1
chr19	45856322	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=190,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr19	45856468	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.580:12:3,3:1,4:2,3,3,4
chr19	45859072	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.447:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr19	45860496	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,14;MFRL=52,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:45860496_T_A:45860496:2,0,1,0
chr19	45860500	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=103,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:45860496_T_A:45860496:3,0,1,0
chr19	45860506	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=103,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:45860496_T_A:45860496:3,0,1,0
chr19	45873670	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,9;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:45873670_T_TG:45873670:0,0,1,0
chr19	45873676	.	C	CGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:45873670_T_TG:45873670:0,0,1,0
chr19	45873678	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45873670_T_TG:45873670:0,0,1,0
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chr19	45991636	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
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chr19	46027752	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,3:1,4:4,0,5,2
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chr19	46120003	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:3,3,2,2
chr19	46121020	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=111,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:1,4,1,2
chr19	46136268	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.440:32:6,4:12,10:13,5,8,6
chr19	46137818	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,192;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.540:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr19	46141677	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr19	46141994	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:4,1:3,3:7,0,4,1
chr19	46185217	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,26:0.442:59:12,12:21,14:10,23,7,19
chr19	46191021	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr19	46191828	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0|1:46191828_C_T:46191828:0,1,0,5
chr19	46191832	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:46191828_C_T:46191828:0,4,0,1
chr19	46191834	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=37,30;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:46191828_C_T:46191828:0,4,0,1
chr19	46196634	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr19	46205050	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=52,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:5,1,2,2
chr19	46214959	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:46214959_G_C:46214959:0,0,1,0
chr19	46214964	.	G	GGGCCGCCCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46214959_G_C:46214959:0,0,1,0
chr19	46214967	.	CGG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46214959_G_C:46214959:0,0,1,0
chr19	46214975	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=90,159;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:46214959_G_C:46214959:1,0,1,0
chr19	46269076	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	46269084	.	G	GAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46269084_G_GAAC:46269084:0,1,0,1
chr19	46269085	.	T	TAAGCGCAGGAACAGAGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46269084_G_GAAC:46269084:0,1,0,1
chr19	46274972	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:3,3,5,4
chr19	46276056	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,1,2
chr19	46281745	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.657:12:0,4:3,4:4,0,7,1
chr19	46289009	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,5:6,3:2,8,2,6
chr19	46294117	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=156,198;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:4,0:0|1:46294117_T_G:46294117:7,3,2,0
chr19	46294121	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=166,198;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:5,2:4,0:0|1:46294117_T_G:46294117:7,4,2,0
chr19	46294136	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,3:5,6:9,2,7,2
chr19	46303746	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:9,1,2,0
chr19	46313825	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,16,6
chr19	46317743	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,10;MFRL=186,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.437:3:1,0:1,0:0|1:46317743_T_G:46317743:2,0,1,0
chr19	46317747	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=20,10;MFRL=186,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.437:3:1,0:1,0:0|1:46317743_T_G:46317743:2,0,1,0
chr19	46317757	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,32;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.355:4:0,0:2,1:0|1:46317743_T_G:46317743:2,1,1,0
chr19	46317761	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.355:4:1,0:1,1:0|1:46317743_T_G:46317743:2,1,1,0
chr19	46317766	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.423:3:0,0:1,1:0|1:46317743_T_G:46317743:1,1,1,0
chr19	46317768	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,12;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:46317743_T_G:46317743:0,1,1,0
chr19	46317771	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,12;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:46317743_T_G:46317743:0,1,1,0
chr19	46317778	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,13;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,0:0|1:46317743_T_G:46317743:1,1,1,0
chr19	46318769	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=103,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:1,0:0,0:0|1:46318769_T_G:46318769:0,1,3,0
chr19	46318774	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,3:0,0:0|1:46318769_T_G:46318769:0,2,3,0
chr19	46318780	.	CGAGTCCCTGTCCCA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=103,163;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:0,0:0|1:46318769_T_G:46318769:1,2,3,0
chr19	46318963	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr19	46320041	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	46326200	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr19	46326791	.	G	GGATAGGTTGTGGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=185,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:1,7,1,1
chr19	46327166	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,5:0,2:0,2,0,7
chr19	46327185	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr19	46327209	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	46329387	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	46329438	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr19	46332141	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=175,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:9,0,2,0
chr19	46332166	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:22,0,2,0
chr19	46332194	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,15:0,0,26,4
chr19	46334551	.	ACG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.819:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	46418089	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,37;MFRL=167,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	46498827	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.513:6:0,1:2,2:0|1:46498827_G_A:46498827:0,3,0,3
chr19	46498835	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=10,31;MFRL=199,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.592:5:0,1:0,1:0|1:46498827_G_A:46498827:0,2,0,3
chr19	46506781	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,1:0,1:1,1,1,1
chr19	46518720	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	46526298	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=106,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:0,1:4,2:2,3,1,2
chr19	46543249	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,8:0,0,2,16
chr19	46664168	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr19	46734022	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=113.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,19:0,15:0,0,17,18
chr19	46811857	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	46812126	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	46812336	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr19	46812655	.	GT	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=244,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46812655_GT_AA:46812655:0,1,0,1
chr19	46812660	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=203,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:46812655_GT_AA:46812655:0,2,0,1
chr19	46812662	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=203,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:46812655_GT_AA:46812655:0,2,0,1
chr19	46812670	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=203,102;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:0|1:46812655_GT_AA:46812655:0,2,0,1
chr19	46812682	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	46815662	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=183,195;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0,3,1,0
chr19	46815705	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,4:0,4:0,0,9,2
chr19	46815969	.	G	GGTGTGTGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,16;RU=GT;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	46823751	.	C	CCATACCTCGCTATGTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=138,64;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:5,2:3,0:2,6,1,1
chr19	46857257	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:8,3:4,1:5,8,2,2
chr19	46857286	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr19	46887007	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr19	46887996	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:1,0:0,0:0|1:46887996_A_C:46887996:0,2,2,0
chr19	46888002	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,1:1,0:0|1:46887996_A_C:46887996:1,2,1,0
chr19	46890504	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:3,14,0,2
chr19	46890686	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:6,1:13,1:11,8,1,1
chr19	46893238	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr19	46893465	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr19	46915863	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=142,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:0|1:46915863_GCT_G:46915863:1,2,0,1
chr19	46915870	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=19,35;MFRL=117,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:46915863_GCT_G:46915863:1,1,0,1
chr19	46915874	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=117,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:46915863_GCT_G:46915863:1,1,0,1
chr19	46915941	.	G	GCAACCTGACTCCATCATGGCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,34;MFRL=162,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr19	46971716	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:4,1:8,1,0,2
chr19	46972967	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr19	46974307	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr19	47105585	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr19	47109011	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,2:3,2:4,0,2,2
chr19	47111663	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=192,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,0:2,3:0,4,2,1
chr19	47181616	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:47181616_A_C:47181616:3,0,1,0
chr19	47181621	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:47181616_A_C:47181616:3,0,1,0
chr19	47181625	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:47181616_A_C:47181616:3,1,1,0
chr19	47184839	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47184839_T_G:47184839:0,0,1,0
chr19	47184840	.	T	TGGGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47184839_T_G:47184839:0,0,1,0
chr19	47184845	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47184839_T_G:47184839:0,0,1,0
chr19	47184851	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47184839_T_G:47184839:0,0,1,0
chr19	47193850	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,15,7
chr19	47207722	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:1,0:2,2,3,0
chr19	47207735	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=16,12;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:0,0:4,2,3,0
chr19	47223796	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=215,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:47223796_A_T:47223796:5,0,1,1
chr19	47223798	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=213,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:2,1:0|1:47223796_A_T:47223796:7,1,1,1
chr19	47223801	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=213,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:47223796_A_T:47223796:7,1,1,1
chr19	47223804	.	C	CTTTCCTTTCTCTGT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=213,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:47223796_A_T:47223796:7,1,1,1
chr19	47228985	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0|1:47228985_G_C:47228985:0,0,0,2
chr19	47228990	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:47228985_G_C:47228985:0,0,0,2
chr19	47230627	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=120,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr19	47230870	.	G	GTGGGCGGCCCTTGACTGCCACCTTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr19	47230898	.	GATAA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=129,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:47230898_GATAA_G:47230898:0,3,0,1
chr19	47230906	.	GCA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=65,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47230898_GATAA_G:47230898:0,2,0,1
chr19	47236268	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,7:0,0,13,3
chr19	47241461	.	GT	TC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,98;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:11,14,0,2
chr19	47261836	.	TAA	T,TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31,29;MFRL=123,184,137;MMQ=60,60,60;MPOS=26,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=4.90,6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.307,0.388:10:3,2,2:0,1,2:1,2,0,7
chr19	47280689	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:0,4,1,4
chr19	47281904	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,0:0,0:0|1:47281904_C_G:47281904:0,0,5,0
chr19	47281907	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:47281904_C_G:47281904:0,0,5,0
chr19	47281911	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,0:0,0:0|1:47281904_C_G:47281904:0,0,5,0
chr19	47281913	.	G	GGCCCCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,19;MFRL=1110,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,0:0,0:0|1:47281904_C_G:47281904:1,1,3,0
chr19	47287939	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:0,5:5,3:0,6,1,7
chr19	47493022	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	47503748	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=159,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:13,0:4,2:0|1:47503748_T_A:47503748:7,10,1,1
chr19	47503753	.	C	CGG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=159,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:13,0:4,2:0|1:47503748_T_A:47503748:7,10,1,1
chr19	47503754	.	TAC	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=159,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:3,2:0|1:47503748_T_A:47503748:7,10,1,1
chr19	47575780	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	47587737	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,33;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:0|1:47587737_A_G:47587737:4,8,1,1
chr19	47587743	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=168,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,0:6,1:0|1:47587737_A_G:47587737:4,7,1,1
chr19	47588488	.	A	ACCCCCCC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,12;RU=C;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.363:11:3,0:4,0:0|1:47588488_A_ACCCCCCC:47588488:0,7,4,0
chr19	47588494	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.304:11:4,2:4,0:0|1:47588488_A_ACCCCCCC:47588488:0,8,3,0
chr19	47588500	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:3,2:1,0:0|1:47588488_A_ACCCCCCC:47588488:0,5,3,0
chr19	47761543	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr19	47761646	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,14:0,0,8,14
chr19	47763573	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:5,2,3,1
chr19	47768128	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	47769839	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,15,0
chr19	47770015	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,4,18
chr19	47770032	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,5:5,6:1,8,2,9
chr19	47773786	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr19	47773973	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	47774329	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.451:27:9,4:5,8:13,2,11,1
chr19	47774447	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,15:0,0,12,18
chr19	47774665	.	TGAG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=68,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr19	47778412	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=231,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,2,3
chr19	47823484	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr19	47823871	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,16,10
chr19	47865637	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:8,0,2,0
chr19	47878858	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr19	47879613	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	47879874	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,1,4
chr19	47885180	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr19	47912323	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,1:0,0,9,0
chr19	47919825	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:4,0:8,1,2,0
chr19	47933728	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	47935352	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr19	47944710	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr19	47960162	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,31;MFRL=181,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,0:1,1:0|1:47960162_A_C:47960162:2,0,1,0
chr19	47960164	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=201,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:0,0:0|1:47960162_A_C:47960162:2,1,1,0
chr19	47960171	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=183,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:47960162_A_C:47960162:3,1,1,0
chr19	47986540	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:9,4,2,0
chr19	48025043	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=121,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:6,0:6,2:10,3,0,2
chr19	48035560	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	48047480	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:9,3,1,1
chr19	48048922	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=211,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr19	48176887	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=140,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.210:12:5,0:4,0:0|1:48176887_C_G:48176887:1,9,2,0
chr19	48176891	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=125,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:6,0:3,1:0|1:48176887_C_G:48176887:0,9,2,0
chr19	48182522	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:6,8:5,3:11,0,6,5
chr19	48182568	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:10,10:6,7:7,9,8,9
chr19	48197829	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=98,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.227:26:9,1:10,0:0|1:48197829_A_C:48197829:2,18,6,0
chr19	48197838	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=98,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.154:23:9,0:8,0:0|1:48197829_A_C:48197829:2,18,3,0
chr19	48198817	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=188,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr19	48201830	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=215,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48201830_T_A:48201830:0,1,1,0
chr19	48201834	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=215,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48201830_T_A:48201830:0,1,1,0
chr19	48201838	.	ACCCG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=215,232;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48201830_T_A:48201830:0,1,1,0
chr19	48201843	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=215,232;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48201830_T_A:48201830:0,1,1,0
chr19	48202673	.	G	GAAGAACATGGTGGCGGCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=128,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:3,5,1,1
chr19	48239557	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:4,0,2,1
chr19	48239692	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:13,10,2,0
chr19	48244045	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0,0,3,0
chr19	48250320	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=112.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,18:0,18:0,0,15,22
chr19	48253579	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,4,20
chr19	48253612	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=87,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,6:0,2:0,2,1,7
chr19	48254392	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr19	48258717	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr19	48258826	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	48260079	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr19	48282077	.	C	CGCAGCGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr19	48282172	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	48284025	.	C	CG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:2,3:6,5:3,5,2,7
chr19	48378146	.	TG	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:48378146_TG_CT:48378146:0,4,0,1
chr19	48378152	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=171,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:48378146_TG_CT:48378146:0,3,0,1
chr19	48387089	.	G	GGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48387089_G_GGC:48387089:0,4,0,1
chr19	48387092	.	ATG	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48387089_G_GGC:48387089:0,4,0,1
chr19	48387104	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48387104_G_A:48387104:0,4,0,1
chr19	48387113	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:48387104_G_A:48387104:0,4,0,1
chr19	48480191	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr19	48517600	.	T	TAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48517600_T_TAGC:48517600:0,1,0,1
chr19	48517604	.	AT	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48517600_T_TAGC:48517600:0,1,0,1
chr19	48522894	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	48523161	.	GTGT	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=19,27;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0,4,0,1
chr19	48523186	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=174,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:48523186_T_A:48523186:0,3,0,1
chr19	48523188	.	C	CAGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=174,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:48523186_T_A:48523186:0,3,0,1
chr19	48523190	.	C	CCATCTATATTAAAAGTGGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=37,35;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr19	48525379	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=122,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,6:3,2:10,0,7,1
chr19	48533888	.	C	CTTTCTTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr19	48543774	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	48544753	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,13,4
chr19	48551546	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	48558342	.	TCTCCAGAAGACCC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCCAGAAGACCC;STR;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr19	48558388	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr19	48565468	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr19	48571168	.	AA	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=175,71;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:1,3,0,1
chr19	48571181	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,32;MFRL=71,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,0:0,2:1,1,0,2
chr19	48593591	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:2,2:5,1,4,1
chr19	48598916	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,8:0,0,0,12
chr19	48598948	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=175,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr19	48601350	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr19	48601528	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,3,8
chr19	48609890	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,13;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:5,0:1,0:1,5,0,2
chr19	48613820	.	C	CGGAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48613820_C_CGGAAT:48613820:0,0,0,1
chr19	48613821	.	C	CCGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48613820_C_CGGAAT:48613820:0,0,0,1
chr19	48622483	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,3:1,6:0,1,1,9
chr19	48624625	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr19	48634319	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr19	48638837	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=194,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:48638837_C_T:48638837:2,0,1,0
chr19	48638855	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=14,12;MFRL=194,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:48638837_C_T:48638837:2,0,1,0
chr19	48639235	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	48646732	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr19	48646760	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:48646760_A_C:48646760:0,3,1,0
chr19	48646762	.	C	CGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,11;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,23;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:48646760_A_C:48646760:0,3,1,0
chr19	48646883	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr19	48660243	.	GAAGGGGCA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=137.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,16,15
chr19	48660445	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr19	48664798	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr19	48665565	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=126,117;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,1:8,1:9,10,2,0
chr19	48668709	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr19	48668958	.	G	T,C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,10,19;MFRL=0,185,182;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,0,0:0,0,0,2
chr19	48668962	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=17,10;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:48668962_G_T:48668962:0,1,0,1
chr19	48668964	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48668962_G_T:48668962:0,1,0,1
chr19	48668965	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr19	48715269	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,2:1,10:0,3,2,10
chr19	48806424	.	G	GTGCTATGTGGGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=124,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	48815341	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=144,163;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48815341_G_GA:48815341:3,1,0,1
chr19	48815342	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=144,163;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:48815341_G_GA:48815341:3,1,0,1
chr19	48830286	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,571;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,1:5,2:0,8,0,3
chr19	48832554	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.546:22:5,5:4,7:9,1,9,3
chr19	48833800	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=184,376;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	48893849	.	A	AGAGGGTCAGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr19	48918355	.	TG	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	48923101	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:4,2:6,2:1,10,0,4
chr19	48923160	.	C	CATTCCA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,36;MFRL=196,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48923160_C_CATTCCA:48923160:0,1,0,1
chr19	48923161	.	G	GCCT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=196,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48923160_C_CATTCCA:48923160:0,1,0,1
chr19	48923165	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=196,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48923160_C_CATTCCA:48923160:0,1,0,1
chr19	48923167	.	CGG	ATA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=196,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:48923160_C_CATTCCA:48923160:0,1,0,1
chr19	48923171	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48923160_C_CATTCCA:48923160:0,0,0,1
chr19	48924963	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,0:1,4:3,0,3,1
chr19	48949286	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,11:0,0,17,12
chr19	48949766	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,8,12
chr19	48950185	.	CATG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	48954571	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	49055493	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=160,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:2,2:2,2:2,3,8,0
chr19	49055503	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:5,1:3,0:5,5,3,0
chr19	49113919	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:3,3,5,2
chr19	49116076	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	49116134	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr19	49123875	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=10,18;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:0,1:0,0:0,3,0,3
chr19	49129224	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:14,0,2,0
chr19	49129453	.	C	CTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=220,252;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49129453_C_CTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCT:49129453:1,2,0,1
chr19	49129455	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=220,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:49129453_C_CTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCT:49129453:1,2,0,1
chr19	49129457	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,21;MFRL=220,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49129453_C_CTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCT:49129453:1,2,0,1
chr19	49129461	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=220,252;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49129453_C_CTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCT:49129453:1,2,0,1
chr19	49129463	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=220,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49129453_C_CTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCT:49129453:1,2,0,1
chr19	49141406	.	AAGAC	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=109.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,28:0.538:52:7,12:16,16:3,21,2,26
chr19	49141532	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	49143025	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr19	49143296	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr19	49148781	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,3:3,10:3,5,6,7
chr19	49167558	.	GCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:2,4,1,1
chr19	49207678	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=143,217;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.608:5:0,1:1,2:2,0,3,0
chr19	49208425	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=175,113;MMQ=50,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:49208425_TG_CC:49208425:0,2,0,1
chr19	49208430	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=175,113;MMQ=50,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:49208425_TG_CC:49208425:0,2,0,1
chr19	49208435	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=175,113;MMQ=50,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:49208425_TG_CC:49208425:0,2,0,1
chr19	49209282	.	G	GCTCACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,12;MFRL=264,212;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr19	49216926	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:3,4,3,2
chr19	49217305	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:1,3,1,5
chr19	49220020	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:10,7,1,1
chr19	49222160	.	CTCCCTT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:49222160_CTCCCTT_C:49222160:2,1,1,0
chr19	49222161	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,10;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1|0:49222160_CTCCCTT_C:49222160:0,1,1,0
chr19	49222164	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=130,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:2,0:0,0:1|0:49222160_CTCCCTT_C:49222160:1,1,1,0
chr19	49222167	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:49222160_CTCCCTT_C:49222160:3,1,1,0
chr19	49222170	.	A	AGGCCC,C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,13,35;MFRL=150,192,186;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,1:1,0,0:2,1,2,0
chr19	49227510	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,11,0
chr19	49230727	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=172,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,2:3,0:0|1:49230727_C_T:49230727:0,8,1,1
chr19	49230739	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=170,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:49230727_C_T:49230727:0,10,1,1
chr19	49230741	.	A	AAGAAGTTAGAAAGCAAGG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:49230727_C_T:49230727:0,10,1,1
chr19	49246866	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	49247693	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=109,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:4,10,3,0
chr19	49247786	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=101,126;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,3:2,5:4,5,3,5
chr19	49254573	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:4,3:3,5:0,7,0,9
chr19	49261368	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,7:0,0,9,10
chr19	49299799	.	C	CATGACAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	49300605	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.419:15:5,4:2,2:2,7,1,5
chr19	49303580	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=147,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:3,2:7,0:0|1:49303580_CT_C:49303580:2,9,1,1
chr19	49303582	.	CAGAGA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,2:6,0:0|1:49303580_CT_C:49303580:1,9,1,1
chr19	49318224	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	49334991	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.392:38:13,7:9,6:8,15,7,8
chr19	49340858	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:2,1:13,9:1,14,0,10
chr19	49342366	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=105,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr19	49342396	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=114,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,4:2,0:5,2,4,0
chr19	49351149	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:3,2:6,3:4,5,4,2
chr19	49355405	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:4,0,2,0
chr19	49376555	.	TG	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,1:6,1:4,11,0,2
chr19	49392982	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=219,158;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr19	49398541	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr19	49407726	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=158,62;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:49407726_G_T:49407726:2,1,1,1
chr19	49407733	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=158,62;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:49407726_G_T:49407726:0,1,1,1
chr19	49407737	.	G	GTACAAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=158,62;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:49407726_G_T:49407726:0,1,1,1
chr19	49407738	.	G	GGCCTTGTGTCCACCCTGAGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=158,62;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:49407726_G_T:49407726:0,1,1,1
chr19	49421829	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr19	49421849	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=131,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:9,0,1,1
chr19	49424354	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr19	49424381	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,9:0,0,13,5
chr19	49425125	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:49425125_G_A:49425125:3,3,1,1
chr19	49425133	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:49425125_G_A:49425125:3,3,1,1
chr19	49425772	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	49438433	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	49439529	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	49442849	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=144,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.590:8:1,2:2,3:1,2,1,4
chr19	49445679	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,4:2,5:1,3,6,3
chr19	49447748	.	GGA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:7,10:3,4:4,6,13,3
chr19	49459104	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:1,9,0,4
chr19	49464203	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,13;MFRL=138,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0,3,1,0
chr19	49464212	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,10;MFRL=119,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:49464212_T_G:49464212:0,1,1,0
chr19	49464220	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,12;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:49464212_T_G:49464212:0,2,1,0
chr19	49464225	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:49464212_T_G:49464212:0,2,1,0
chr19	49464227	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=36,17;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:49464212_T_G:49464212:0,2,1,0
chr19	49464231	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:49464212_T_G:49464212:0,2,1,0
chr19	49474215	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.461:37:12,11:8,6:12,8,9,8
chr19	49519230	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=163,137;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:5,1,4,1
chr19	49519855	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=161,140;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:6,2,2,0
chr19	49519873	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=154,161;MMQ=60,53;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,3:2,1:5,2,4,0
chr19	49519997	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,170;MMQ=49,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:1,2,0,3
chr19	49526119	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=118,166;MMQ=24,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:5,0,0,2
chr19	49526386	.	C	CAGACAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=222,201;MMQ=22,22;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49526386_C_CAGACAG:49526386:0,3,0,1
chr19	49526387	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=222,201;MMQ=22,22;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49526386_C_CAGACAG:49526386:0,3,0,1
chr19	49526389	.	G	GGGCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=222,201;MMQ=22,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:2,0:1,1:0|1:49526386_C_CAGACAG:49526386:0,3,0,1
chr19	49527128	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,215;MMQ=43,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:5,2,3,1
chr19	49527141	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=160,189;MMQ=43,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,0:5,5:7,2,4,1
chr19	49527305	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,192;MMQ=57,32;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,1:7,3:2,10,0,4
chr19	49535491	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=189,174;MMQ=47,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,0:1,3:1,2,0,3
chr19	49536514	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,141;MMQ=44,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:0,8,1,7
chr19	49540093	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	49552127	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=147,145;MMQ=52,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,0,1
chr19	49558509	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,31;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	49558573	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,32;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr19	49558667	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=171,171;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:5,1,7,0
chr19	49558678	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr19	49558690	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr19	49558729	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr19	49573438	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:6,3:5,4,2,4
chr19	49611319	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:5,3,5,0
chr19	49618457	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.340:15:7,3:3,1:8,2,3,2
chr19	49652101	.	CC	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=204,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.275:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr19	49657710	.	ACATCAT	A,ACAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,16,32;MFRL=0,212,95;MMQ=60,60,47;MPOS=9,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=CAT;STR;TLOD=3.01,7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.282,0.571:3:0,0,1:0,0,1:0,0,2,1
chr19	49661582	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr19	49714871	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49714871_GT_G:49714871:0,1,0,1
chr19	49714873	.	CCAT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49714871_GT_G:49714871:0,1,0,1
chr19	49714881	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49714871_GT_G:49714871:0,1,0,1
chr19	49797887	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,0,9
chr19	49797903	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=217,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:49797903_TG_T:49797903:0,2,0,1
chr19	49797905	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=217,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:49797903_TG_T:49797903:0,2,0,1
chr19	49797907	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=217,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:49797903_TG_T:49797903:0,2,0,1
chr19	49838891	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=119,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,9:1,5:0,1,3,12
chr19	49839015	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr19	49852087	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,22;MFRL=187,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.622:9:0,1:0,2:1,2,0,6
chr19	49925667	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:8,1:2,7:9,1,5,3
chr19	49934115	.	C	CTCACAAACACATATTAATTAGTGGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=100,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr19	49935927	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,10:0,4:0,0,6,8
chr19	49944730	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	49949589	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:9,3:8,6:14,3,7,2
chr19	49949803	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,1:5,1:2,6,1,1
chr19	49950413	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	49954896	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	49956690	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:1,3:2,0:0,3,1,3
chr19	49962892	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr19	49964977	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:3,5:4,4:4,3,6,4
chr19	49964991	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:8,1:8,7,2,1
chr19	49965131	.	GG	AC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:2,3:0,3,0,5
chr19	49965173	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.472:6:2,0:1,1:0,3,1,2
chr19	49966081	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr19	49967680	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:6,4,3,4
chr19	49967808	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=207,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:1,4,3,6
chr19	49982175	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:3,0:4,5,2,0
chr19	50028929	.	A	ACG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	50097668	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.429:7:1,0:2,0:0|1:50097668_A_G:50097668:0,4,3,0
chr19	50097672	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.429:7:2,0:2,0:0|1:50097668_A_G:50097668:0,4,3,0
chr19	50097678	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=127,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.277:8:3,0:2,1:0|1:50097668_A_G:50097668:1,5,2,0
chr19	50100183	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,4892594;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	50103287	.	C	CATTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50103287_C_CATTA:50103287:0,1,0,1
chr19	50103289	.	C	CACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50103287_C_CATTA:50103287:0,1,0,1
chr19	50103291	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:50103287_C_CATTA:50103287:0,1,0,1
chr19	50118148	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:9,5,2,0
chr19	50128096	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:8,2:2,0:8,2,2,0
chr19	50140068	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:0,2,1,2
chr19	50140092	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:1,2,2,2
chr19	50140246	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr19	50140465	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	50154904	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr19	50157995	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:2,5,2,0
chr19	50158039	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=156,126;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:3,2:3,0:1,7,0,2
chr19	50168174	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	50183040	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=14,22;MFRL=151,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.382:9:0,1:0,1:6,0,3,0
chr19	50183068	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:2,0:3,0:0|1:50183068_A_C:50183068:5,3,3,0
chr19	50183072	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:3,0:4,1:0|1:50183068_A_C:50183068:6,3,3,0
chr19	50185273	.	G	GCCTTGGCAGCAAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=177,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:9,2:6,0:0|1:50185273_G_GCCTTGGCAGCAAA:50185273:8,7,0,2
chr19	50185277	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=177,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:9,2:6,0:0|1:50185273_G_GCCTTGGCAGCAAA:50185273:8,7,0,2
chr19	50207931	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,0:0,2:2,0,3,0
chr19	50208180	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=201,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,1:1,6:0,1,4,3
chr19	50210941	.	C	CCTCTTGAAAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=214,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	50214152	.	G	GCATAAAACTGAATATTTTTTGGAAGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=177,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,0:3,2:1,6,1,1
chr19	50216118	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,5,6
chr19	50216684	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:6,0:6,2:9,4,1,1
chr19	50245050	.	A	ACTCTTGACTCAAGAGCTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	50249713	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:6,5:4,3:6,4,8,1
chr19	50265230	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:5,1,4,1
chr19	50265549	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr19	50285334	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=125,109;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,0:3,3:2,7,0,3
chr19	50298844	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:1,0:1,2:0|1:50298844_T_C:50298844:1,2,3,0
chr19	50298848	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,0:1,2:0|1:50298844_T_C:50298844:0,2,4,0
chr19	50298852	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=143,21277819;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:50298844_T_C:50298844:1,3,2,0
chr19	50298854	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,14;MFRL=136,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.326:4:1,0:1,0:1|0:50298844_T_C:50298844:0,3,1,0
chr19	50298859	.	C	CCCCCCCA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,21;MFRL=136,21277819;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,1:0|1:50298844_T_C:50298844:2,3,2,0
chr19	50304336	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr19	50304392	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	50305688	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr19	50308893	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=99.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,20:0,10:0,0,12,19
chr19	50309564	.	T	TGCTGGCACA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr19	50309601	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=182,269;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50309601_C_G:50309601:1,0,0,1
chr19	50309607	.	CA	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,13;MFRL=182,269;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:50309601_C_G:50309601:1,0,0,1
chr19	50309860	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=69.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,17,2
chr19	50312575	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,2:1,2:0,2,0,4
chr19	50314646	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:14,3:19,0:16,18,3,0
chr19	50315423	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	50315698	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr19	50315773	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	50335307	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=174,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.472:6:1,0:2,1:2,1,0,3
chr19	50338453	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,2:7,1:6,7,0,3
chr19	50358133	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:4,1,2,1
chr19	50358154	.	C	CCCCCGGGGG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=24,22;MFRL=136,141;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:4,0:2,4,2,0
chr19	50358160	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=150,129;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:3,1:0|1:50358160_T_C:50358160:0,5,3,0
chr19	50358164	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=150,129;MMQ=60,58;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:3,1:0|1:50358160_T_C:50358160:0,7,3,0
chr19	50358170	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:2,1:1,3,0,3
chr19	50358183	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr19	50361907	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:7,2:6,3:7,6,2,4
chr19	50363175	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	50368361	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=207,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,2:3,2:6,0,5,0
chr19	50369530	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=166,171;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50369530_T_G:50369530:4,0,1,0
chr19	50369537	.	T	G,C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,29,34;MFRL=228,171,159;MMQ=60,40,40;MPOS=29,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.222,0.256:5:1,1,1:2,0,0:3,0,2,0
chr19	50369544	.	ACCAC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=200,159;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr19	50369547	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=15,30;MFRL=228,171;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:1,0:0|1:50369530_T_G:50369530:3,0,1,0
chr19	50369553	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=198,171;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50369530_T_G:50369530:4,0,1,0
chr19	50375035	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:7,7:12,15:13,6,11,11
chr19	50375242	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=114,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:4,2:0,2:1,3,1,4
chr19	50376152	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:50376152_G_C:50376152:0,0,1,0
chr19	50376157	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50376152_G_C:50376152:0,0,1,0
chr19	50376159	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,18;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50376152_G_C:50376152:0,0,1,0
chr19	50376164	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50376152_G_C:50376152:0,0,1,0
chr19	50376168	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50376152_G_C:50376152:0,0,1,0
chr19	50376170	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=89,275;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:50376152_G_C:50376152:1,0,1,0
chr19	50376172	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,12;MFRL=89,275;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:50376152_G_C:50376152:1,0,1,0
chr19	50380858	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=211,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr19	50386340	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,5:5,6:2,5,3,8
chr19	50387519	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:4,0:0|1:50387519_T_G:50387519:11,3,1,1
chr19	50387522	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:10,2:4,0:0|1:50387519_T_G:50387519:11,3,1,1
chr19	50393043	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,4:3,9:0,8,2,11
chr19	50394186	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50394186_G_T:50394186:0,0,1,0
chr19	50394192	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50394186_G_T:50394186:0,0,1,0
chr19	50394204	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:50394186_G_T:50394186:2,0,1,0
chr19	50394210	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:50394186_G_T:50394186:4,0,1,0
chr19	50397658	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:10,2:10,11,1,1
chr19	50398523	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=234,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:50398523_G_C:50398523:0,2,0,1
chr19	50398525	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=234,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:50398523_G_C:50398523:0,2,0,1
chr19	50398530	.	TCC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=234,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:50398523_G_C:50398523:0,2,0,1
chr19	50398996	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	50399384	.	G	GC	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=50.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.549:35:7,8:9,10:6,10,6,13
chr19	50411395	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	50435747	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,2:4,1:2,9,0,3
chr19	50436371	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr19	50455701	.	CCTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50455701_CCTG_C:50455701:0,1,0,1
chr19	50455706	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50455701_CCTG_C:50455701:0,1,0,1
chr19	50462244	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,8,10
chr19	50463670	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=170,175;MMQ=49,43;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:5,6:8,4:5,8,3,8
chr19	50463693	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=175,169;MMQ=43,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:7,3:11,5:7,11,3,6
chr19	50463727	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=174,166;MMQ=40,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:5,5:6,8:4,8,9,4
chr19	50492860	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,9,5
chr19	50493120	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	50498604	.	GAGA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	50500922	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr19	50511108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,0,11
chr19	50511133	.	G	GATGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=190,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr19	50519231	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr19	50519249	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr19	50657786	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr19	50720793	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:50720793_C_T:50720793:0,0,4,0
chr19	50720795	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:50720793_C_T:50720793:0,0,4,0
chr19	50721048	.	G	GACTGTGGCAGAAATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=161,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50721048_G_GACTGTGGCAGAAATC:50721048:0,1,0,1
chr19	50721050	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=161,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50721048_G_GACTGTGGCAGAAATC:50721048:0,1,0,1
chr19	50726459	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,8:0,0,8,8
chr19	50727312	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=214,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,2,0
chr19	50727510	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:2,3:4,4:2,4,2,5
chr19	50728955	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=135,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr19	50729013	.	A	ATTCCTAGAAATGGAATCGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	50730047	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,4:1,3:2,0,6,1
chr19	50735340	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr19	50753952	.	G	GGAGAGTAAGTCAGATCCCCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=168,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr19	50753968	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	50754015	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	50771609	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr19	50771635	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	50775742	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr19	50779988	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.390:24:6,6:7,3:11,4,9,0
chr19	50796680	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=14,19;MFRL=1111,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr19	50796960	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=143,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr19	50805138	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.860:5:0,3:0,0:0,0,0,5
chr19	50819311	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=94,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,1:6,0:9,3,0,3
chr19	50881574	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=134,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:10,8,0,2
chr19	50881820	.	A	AAAC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=66.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,6,11
chr19	50882008	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=148,358;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:10,0:4,2:8,7,2,0
chr19	50906096	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	50909389	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr19	50909804	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:50909804_CA_C:50909804:0,3,0,1
chr19	50909807	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:50909804_CA_C:50909804:0,3,0,1
chr19	50920188	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	50922370	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	50923120	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=134,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr19	50938569	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:1,13,0,2
chr19	50939252	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:7,5,2,0
chr19	50939867	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=235,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:2,5:3,2,7,1
chr19	50951731	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr19	50957677	.	GTTTT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=37,14;MFRL=172,124;MMQ=40,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=23,19;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,0:0,0:1,2,0,1
chr19	50958708	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,14;MFRL=193,0;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:50958708_T_A:50958708:2,0,1,0
chr19	50958717	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=22,17;MFRL=211,0;MMQ=60,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:50958708_T_A:50958708:3,0,1,0
chr19	50958724	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=108,193;MMQ=50,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:1,0:2,0,2,0
chr19	50958725	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,19;MFRL=211,0;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:50958708_T_A:50958708:3,0,1,0
chr19	50958729	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=16,13;MFRL=195,106;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,0:2,0,2,0
chr19	50958734	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=13,15;MFRL=193,0;MMQ=60,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.278:5:1,0:0,0:0|1:50958708_T_A:50958708:3,1,1,0
chr19	50962062	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=205,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:0,0:1,1:1,0,2,0
chr19	50962130	.	G	GCCCCCGGCGGCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:3,0,1,0
chr19	50965272	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=120,187;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:5,3:2,2:2,6,2,3
chr19	50965328	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:50965328_T_G:50965328:0,4,0,1
chr19	50965330	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50965328_T_G:50965328:0,4,0,1
chr19	50965333	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:50965328_T_G:50965328:0,4,0,1
chr19	50969325	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	50985102	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	51015404	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=226,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr19	51016756	.	C	CTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,242;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr19	51017835	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr19	51022621	.	GC	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=158,119;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:51022621_GC_TA:51022621:0,4,0,1
chr19	51022624	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=158,119;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:51022621_GC_TA:51022621:0,4,0,1
chr19	51022633	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=156,119;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51022621_GC_TA:51022621:0,2,0,1
chr19	51022634	.	C	CAAAGAACATAAATTAACAAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=156,119;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51022621_GC_TA:51022621:0,2,0,1
chr19	51125872	.	G	GCCCCCCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=178,191;MMQ=33,57;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,13;RU=C;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0|1:51125872_G_GCCCCCCCC:51125872:1,0,3,0
chr19	51125880	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=165,208;MMQ=30,33;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:51125872_G_GCCCCCCCC:51125872:3,1,1,0
chr19	51128856	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr19	51133416	.	C	CCCAGGCTCTGGAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:2,2,1,1
chr19	51135457	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=115,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,1:1,1:4,0,3,0
chr19	51171857	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	51207289	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:51207289_C_G:51207289:0,0,1,0
chr19	51207291	.	AA	CG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:51207289_C_G:51207289:0,0,1,0
chr19	51207295	.	CA	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:51207289_C_G:51207289:0,0,1,0
chr19	51227267	.	G	GAAAACTCTTTTCAGATGACGTACAGAAGGCAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=109,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.082:38:15,2:18,0:14,22,1,1
chr19	51228802	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr19	51295439	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,1,0
chr19	51295443	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,1,0
chr19	51297944	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,1:0,2:0,2,1,2
chr19	51323317	.	G	GAAAATAAAAATTATC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=168,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:4,3,0,2
chr19	51323501	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,4,1
chr19	51323733	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,2:1,0:0,3,0,2
chr19	51323750	.	G	GTGTGTGTGCTGTGGTGGTTTATTACAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=16,33;MFRL=152,239;MMQ=54,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.478:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr19	51323767	.	T	TATCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	51326863	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:10,4:11,0:22,0,4,0
chr19	51330423	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	51358333	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	51359453	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=48,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr19	51361644	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr19	51361748	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=144,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:51361748_T_A:51361748:7,11,1,1
chr19	51361768	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=140,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:12,2:0|1:51361748_T_A:51361748:12,8,1,1
chr19	51363398	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:2,8:5,11:1,6,4,15
chr19	51377892	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=95,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr19	51378194	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51378194_G_T:51378194:0,1,0,1
chr19	51378196	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51378194_G_T:51378194:0,1,0,1
chr19	51378201	.	T	TCCTATTTGTAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51378194_G_T:51378194:0,1,0,1
chr19	51380110	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=184,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:2,4:2,4:3,2,5,3
chr19	51380364	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=201,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0,4,1,1
chr19	51412115	.	G	GGAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=220,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:51412115_G_GGAA:51412115:0,4,0,1
chr19	51412116	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=220,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:51412115_G_GGAA:51412115:0,4,0,1
chr19	51412119	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=220,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:51412115_G_GGAA:51412115:0,4,0,1
chr19	51447065	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr19	51452250	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=9,33;MFRL=106,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,21:0.904:23:0,8:0,10:0|1:51452250_T_C:51452250:0,2,14,7
chr19	51452282	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,4:0.203:20:4,0:5,0:1|0:51452250_T_C:51452250:9,7,0,4
chr19	51471218	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51471218_A_C:51471218:1,0,1,0
chr19	51471223	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:51471218_A_C:51471218:2,0,1,0
chr19	51484984	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=94,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,1:0|1:51484984_C_T:51484984:2,0,3,0
chr19	51484990	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=94,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:51484984_C_T:51484984:2,0,3,0
chr19	51485194	.	CG	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51485194_CG_TC:51485194:0,0,0,1
chr19	51485198	.	GGTA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51485194_CG_TC:51485194:0,0,0,1
chr19	51485741	.	GCCCCTCCCCACTCAGA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	51500918	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	51500924	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,9;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.643:4:0,0:1,0:0|1:51500924_A_T:51500924:1,0,3,0
chr19	51500927	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.643:4:0,0:1,0:0|1:51500924_A_T:51500924:1,0,3,0
chr19	51500928	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=20,14;MFRL=225,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.357:4:1,0:1,0:3,0,1,0
chr19	51500933	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,21;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.643:4:0,1:1,0:0|1:51500924_A_T:51500924:1,0,3,0
chr19	51500943	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,12;MFRL=0,225;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:51500924_A_T:51500924:1,0,1,0
chr19	51503524	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	51510052	.	GTCCAT	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=198,274;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.374:6:0,1:3,0:0,3,0,3
chr19	51510068	.	T	TTCCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=236,172;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr19	51510078	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr19	51518222	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	51518293	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=81,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:51518293_A_AG:51518293:1,1,0,1
chr19	51518294	.	A	ATCGAGACCATCCTGGTTACCAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=81,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:51518293_A_AG:51518293:1,1,0,1
chr19	51518297	.	A	G,T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32,27;MFRL=0,81,204;MMQ=60,60,60;MPOS=3,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.78,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,1,1:0,1,0:0,0,1,2
chr19	51518730	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,3:7,1:3,6,3,1
chr19	51525703	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	51527646	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51527646_A_T:51527646:0,0,0,1
chr19	51527647	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51527646_A_T:51527646:0,0,0,1
chr19	51527649	.	A	AGGGAACTGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51527646_A_T:51527646:0,0,0,1
chr19	51534274	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=137,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:1,0,0,3
chr19	51535460	.	T	TCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	51537903	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:3,6:0,4:1,2,4,6
chr19	51563965	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr19	51568189	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,9;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,0:0|1:51568189_T_G:51568189:2,2,2,0
chr19	51568193	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0|1:51568189_T_G:51568189:2,2,2,0
chr19	51582994	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:51582994_G_T:51582994:0,0,0,2
chr19	51583003	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:51582994_G_T:51582994:0,0,0,2
chr19	51584743	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=106.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,15:0,0,26,4
chr19	51586049	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:1,0:2,1:1,7,0,3
chr19	51629151	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=214,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:2,1,0,4
chr19	51631165	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,4:1,1:6,0,4,1
chr19	51633052	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	51633084	.	AT	GC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=0,163;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:1,2,1,0
chr19	51633097	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=0,163;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:51633097_CG_C:51633097:0,4,1,0
chr19	51633099	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,14;MFRL=0,163;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:51633097_CG_C:51633097:0,4,1,0
chr19	51633104	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=0,163;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,1,0
chr19	51647571	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51647571_C_A:51647571:1,0,0,1
chr19	51647572	.	T	TAAGGTGGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51647571_C_A:51647571:1,0,0,1
chr19	51647573	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51647571_C_A:51647571:1,0,0,1
chr19	51647577	.	G	GCCTGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51647571_C_A:51647571:1,0,0,1
chr19	51728641	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,153;MMQ=57,52;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:5,3:6,3:7,4,4,3
chr19	51742817	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=124,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,3:13,0:14,9,1,2
chr19	51768935	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:7,3,3,0
chr19	51768971	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=200,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.254:6:4,1:1,0:5,0,0,1
chr19	51825238	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr19	51835892	.	T	TG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=81.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,12:0,10:0,0,19,6
chr19	51837213	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	51837344	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr19	51840508	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:3,4,0,2
chr19	51842223	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=213,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.216:14:4,0:4,0:5,6,0,3
chr19	51845485	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	51850140	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:51850140_G_T:51850140:0,0,1,0
chr19	51850150	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:51850140_G_T:51850140:2,0,1,0
chr19	51857738	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,3:1,3:4,3,1,5
chr19	51874950	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,3:4,3:4,0,5,1
chr19	51919140	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,140;MMQ=51,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:3,1,5,0
chr19	51919263	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=145,141;MMQ=60,55;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:0|1:51919263_G_T:51919263:3,7,1,4
chr19	51919267	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=141,141;MMQ=60,55;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:8,2:4,2:0|1:51919263_G_T:51919263:3,9,1,4
chr19	51919279	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=145,114;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,2:4,1:0|1:51919263_G_T:51919263:4,8,0,3
chr19	51919434	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,1:1,1:6,0,2,0
chr19	51919507	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,5:5,6:7,3,11,0
chr19	51983959	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,13;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,0:7,0:2,11,0,2
chr19	51986637	.	C	CGACAGATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=147,133;MMQ=56,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	51986668	.	C	CCTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51986668_C_CCTT:51986668:0,0,0,1
chr19	51986670	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51986668_C_CCTT:51986668:0,0,0,1
chr19	51994851	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=178,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr19	51995025	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=159,179;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:3,0:1,0:0|1:51995025_A_C:51995025:1,3,0,2
chr19	51995030	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=159,179;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,0:1,0:0|1:51995025_A_C:51995025:1,3,0,2
chr19	51995045	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.805:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr19	51995051	.	G	GTGCCACACA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=172,187;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr19	51995164	.	G	GCAGGGGGAACAGCGGGATTAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=255,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	52000546	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=76,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr19	52003058	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	52003089	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=148,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr19	52004551	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr19	52004743	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.482:37:12,11:7,5:9,10,4,14
chr19	52004791	.	G	GC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,12:0.464:26:5,8:9,4:0|1:52004791_G_GC:52004791:6,8,5,7
chr19	52004795	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=165,115;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,13:0.467:28:5,9:10,4:0|1:52004791_G_GC:52004791:7,8,6,7
chr19	52032964	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr19	52034940	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=115,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:3,5:3,1:3,5,4,2
chr19	52034954	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=106,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.330:9:4,0:1,0:3,3,0,3
chr19	52130646	.	CACCATCCAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=120,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr19	52130881	.	C	CCTGTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=172,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52130881_C_CCTGTGCT:52130881:0,1,0,1
chr19	52130882	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=172,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52130881_C_CCTGTGCT:52130881:0,1,0,1
chr19	52132325	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=98,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.435:23:5,5:8,4:8,5,6,4
chr19	52132392	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:1,8,1,3
chr19	52133060	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=213,158;MMQ=57,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,5,0
chr19	52148617	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	52148977	.	ACACC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,157;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.823:11:1,5:1,1:2,0,9,0
chr19	52196453	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,7:4,0:4,2,6,1
chr19	52220496	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=73,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	52222994	.	A	ATATCACCACCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:52222994_A_ATATCACCACCC:52222994:1,0,0,1
chr19	52222997	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52222994_A_ATATCACCACCC:52222994:1,0,0,1
chr19	52223121	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	52223251	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	52249942	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:4,5:5,3,5,4
chr19	52272116	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,89;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,4:0.072:67:34,0:29,4:23,40,0,4
chr19	52273868	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr19	52329400	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,37;MFRL=196,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr19	52380681	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr19	52380697	.	T	TTGTGCTAGAATGTTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=105,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	52381552	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=212,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr19	52381616	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:3,2:0,2:3,0,4,1
chr19	52383510	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr19	52394835	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,0:13,3:12,15,0,3
chr19	52537129	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,733283;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,0:8,2:11,12,2,0
chr19	52538586	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=139,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,1:15,1:6,17,2,0
chr19	52618268	.	A	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,129;MMQ=60,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:30,0:19,3:27,23,0,3
chr19	52660878	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,186;MMQ=60,38;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr19	52671402	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr19	52693289	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr19	52719149	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=113,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,0:9,2:8,3,0,2
chr19	52723607	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=239,62;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52723607_C_T:52723607:0,1,0,1
chr19	52723610	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=239,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52723607_C_T:52723607:0,1,0,1
chr19	52729151	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:12,4:9,0:10,12,3,1
chr19	52772768	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr19	52773013	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr19	52786700	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=75,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:2,3:0,1:1,1,1,3
chr19	52793261	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr19	52803669	.	CTG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,10:0,3:0,0,7,6
chr19	52817574	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:52817574_T_TA:52817574:0,4,0,1
chr19	52817576	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:52817574_T_TA:52817574:0,4,0,1
chr19	52852523	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chr19	52868883	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chr19	52869022	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chr19	52869278	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,13:0,0,19,13
chr19	52869312	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.946:34:1,17:0,16:1,0,16,17
chr19	52869810	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:5,8,2,0
chr19	52877716	.	A	AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,3:10,2:3,16,0,5
chr19	52887145	.	TA	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.428:42:14,10:10,8:14,10,13,5
chr19	52887246	.	T	TCAA	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CAA;STR;TLOD=111.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,31:0.499:62:15,24:16,7:19,12,15,16
chr19	52887513	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,15262078;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:16,1:23,1:20,19,2,0
chr19	52888620	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr19	52909303	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=132,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:0,4:7,6:1,6,1,9
chr19	52909989	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr19	52920006	.	C	CTG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:7,8:3,5:3,7,3,10
chr19	52940931	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr19	52941694	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,118;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:5,1:5,4,1,1
chr19	52942495	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,5,5
chr19	52942734	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr19	53057506	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,1:12,1:20,7,1,1
chr19	53085820	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,0;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:13,0:20,2:11,22,0,2
chr19	53117809	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,1:1,0,4,2
chr19	53209962	.	G	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=156,128;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,3:0.058:67:36,3:28,0:39,25,1,2
chr19	53268810	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=150,151;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,5:5,5:6,2,7,3
chr19	53269614	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=112,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.628:24:5,8:2,7:3,6,11,4
chr19	53303527	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,12:0,0,14,11
chr19	53304694	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,194;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:15,0:28,2:22,21,1,1
chr19	53343939	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.682:14:1,3:3,5:3,1,8,2
chr19	53344701	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.516:23:5,4:6,7:6,5,4,8
chr19	53344919	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:13,6:7,7:15,5,9,4
chr19	53345447	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:3,4:2,5:0,6,0,9
chr19	53345480	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=229,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr19	53383799	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,126;MMQ=60,55;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,3:5,0:10,3,3,0
chr19	53454475	.	C	CACT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,7:0,0,6,7
chr19	53456090	.	AA	TG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,110;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,1:6,1:13,5,1,1
chr19	53613028	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=139,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.163:36:13,0:11,0:7,23,6,0
chr19	53619465	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr19	53644779	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:6,2:5,8,1,2
chr19	53645291	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,6:4,7:6,4,5,8
chr19	53651845	.	T	TTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,2:3,0,4,0
chr19	53652606	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,127;MMQ=60,36;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:25,2:19,0:23,22,0,2
chr19	53667637	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	53669653	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=193,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr19	53669669	.	A	AACCTCTTCAACTCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=212,265;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr19	53761606	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	53761740	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,109;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:7,5:1,4:4,5,2,8
chr19	53762578	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:16,3:17,0:21,12,3,0
chr19	53794956	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=210,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr19	53856349	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,17:0.335:52:10,9:22,8:11,24,6,11
chr19	53901154	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,217;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr19	53910912	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:4,0,7,0
chr19	53995004	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,122;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,20:0.400:51:10,8:17,12:17,14,7,13
chr19	54072751	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:54072751_T_C:54072751:0,3,0,1
chr19	54072753	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,17;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:54072751_T_C:54072751:0,3,0,1
chr19	54072757	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr19	54075076	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	54172527	.	GGA	TCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=179,236;MMQ=52,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:54172527_GGA_TCC:54172527:2,1,0,1
chr19	54172534	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=204,236;MMQ=52,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:54172527_GGA_TCC:54172527:2,0,0,1
chr19	54175130	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	54182147	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=169,188;MMQ=60,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:10,1,2,0
chr19	54182162	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=178,187;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,1:9,1:11,1,2,0
chr19	54182232	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,6111;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.098:39:20,1:15,2:19,17,3,0
chr19	54188219	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,18:0,0,27,1
chr19	54197633	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:3,4,2,1
chr19	54197761	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,5:3,8:5,1,7,6
chr19	54198559	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:2,5:6,13:3,5,7,11
chr19	54200922	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,5:3,6:3,4,0,11
chr19	54203199	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,140;MMQ=53,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr19	54204363	.	CA	GG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,11961;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr19	54205961	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:0,2:6,1:5,1,1,2
chr19	54211903	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,1:1,6:1,0,4,3
chr19	54224285	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,12,7
chr19	54233286	.	GG	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr19	54238305	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.712:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	54240015	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr19	54242693	.	G	GCTGACCGTGGTAATA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=104.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,7:0,0,10,15
chr19	54242761	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr19	54244721	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,148;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,5:4,9:2,5,0,14
chr19	54245706	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr19	54245744	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=173,161;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.277:27:11,5:8,2:13,7,6,1
chr19	54245788	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=160,173;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,6:5,6:8,1,4,8
chr19	54245897	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=150,146;MMQ=59,32;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,6:7,3:1,9,3,6
chr19	54254655	.	C	CTGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54254655_C_CTGCA:54254655:0,1,0,1
chr19	54254657	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54254655_C_CTGCA:54254655:0,1,0,1
chr19	54257185	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:54257185_C_G:54257185:0,0,11,1
chr19	54257190	.	AC	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0|1:54257185_C_G:54257185:0,0,10,1
chr19	54261644	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr19	54261669	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr19	54265779	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr19	54307322	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,11:0,1:0,0,4,8
chr19	54308774	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=101,135;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:54308774_G_T:54308774:0,2,0,1
chr19	54308775	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=101,135;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:54308774_G_T:54308774:0,2,0,1
chr19	54308799	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,135;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54308774_G_T:54308774:0,0,0,1
chr19	54310961	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	54313310	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=152,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:2,0:3,0:1,4,4,0
chr19	54313526	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=183,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54313526_A_AC:54313526:0,1,0,1
chr19	54313527	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=183,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54313526_A_AC:54313526:0,1,0,1
chr19	54313531	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=183,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54313526_A_AC:54313526:0,1,0,1
chr19	54314585	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr19	54327440	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	54378025	.	CTT	C,CT	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=25,32,20;MFRL=142,136,109;MMQ=60,60,40;MPOS=17,30;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,20,21;RU=T;STR;TLOD=21.21,4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,9,3:0.399,0.275:17:2,4,1:0,4,1:0,5,5,7
chr19	54378031	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:8,5:4,4:5,9,5,4
chr19	54378082	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:9,7:3,4:2,11,3,9
chr19	54378789	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=35,15;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.289:26:10,0:5,0:10,8,0,8
chr19	54378867	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=183,136;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54378867_A_G:54378867:0,1,0,1
chr19	54378870	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=183,136;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54378867_A_G:54378867:0,1,0,1
chr19	54378873	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=183,136;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54378867_A_G:54378867:0,1,0,1
chr19	54379515	.	GAT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AT;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr19	54379772	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=164,174;MMQ=50,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:54379772_C_A:54379772:0,2,0,1
chr19	54379777	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=164,174;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:54379772_C_A:54379772:0,2,0,1
chr19	54379788	.	CG	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=147,174;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54379772_C_A:54379772:0,1,0,1
chr19	54387313	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr19	54401382	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=121,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:6,0:8,2:0|1:54401382_T_G:54401382:9,7,1,1
chr19	54401389	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,16;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,1:0|1:54401382_T_G:54401382:7,7,1,1
chr19	54401390	.	A	AATGCGTT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=144,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:54401382_T_G:54401382:6,7,1,1
chr19	54401393	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:5,1:0|1:54401382_T_G:54401382:6,6,1,1
chr19	54417672	.	TC	GG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr19	54417683	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=1242443,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GC;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:54417683_T_TGC:54417683:0,1,1,0
chr19	54417690	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=1242443,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr19	54417695	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,12;MFRL=621300,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:54417683_T_TGC:54417683:1,1,1,0
chr19	54444650	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	54483311	.	CGTGT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=GT;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr19	54515524	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,39166286;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	54544177	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr19	54544189	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr19	54545390	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr19	54561493	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=265,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.648:9:0,3:3,3:3,0,5,1
chr19	54566901	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr19	54573505	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:54573505_A_AT:54573505:0,1,0,1
chr19	54573506	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:54573505_A_AT:54573505:0,1,0,1
chr19	54573513	.	CG	TT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54573505_A_AT:54573505:0,0,0,1
chr19	54598948	.	CT	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,22;MFRL=136,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54598948_CT_AA:54598948:1,0,1,0
chr19	54598951	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,13;MFRL=136,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:54598948_CT_AA:54598948:1,0,1,0
chr19	54598955	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=15,16;MFRL=136,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:54598948_CT_AA:54598948:1,0,1,0
chr19	54598959	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=37,16;MFRL=136,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:54598948_CT_AA:54598948:1,0,1,0
chr19	54603104	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.289:17:8,2:4,3:5,7,0,5
chr19	54603197	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=193,155;MMQ=40,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr19	54604194	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,2,11
chr19	54606405	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,6,3
chr19	54609027	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:2,8:0,5:0,2,2,11
chr19	54609064	.	TAAACC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr19	54609170	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0|1:54609170_A_G:54609170:0,0,8,4
chr19	54609178	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=52.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0|1:54609170_A_G:54609170:0,0,8,5
chr19	54611250	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=9,12;MFRL=217,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr19	54611255	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:54611255_T_C:54611255:0,0,2,0
chr19	54611261	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:54611255_T_C:54611255:0,0,1,0
chr19	54611287	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,5:0,3:0,0,10,0
chr19	54611560	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr19	54627039	.	GCACA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=12,33;MFRL=191,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=CA;STR;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:0,1:0,2,1,3
chr19	54627097	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	54631376	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:3,3:5,5:0|1:54631376_G_T:54631376:9,0,8,0
chr19	54631378	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,6:0,11:0|1:54631376_G_T:54631376:0,0,17,1
chr19	54631381	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:3,4:6,4:0|1:54631376_G_T:54631376:9,0,8,1
chr19	54631630	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:6,2:0,2:5,1,3,1
chr19	54631658	.	C	CCCGGG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.756:5:1,3:0,1:0|1:54631658_C_CCCGGG:54631658:0,1,4,0
chr19	54631664	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:54631658_C_CCCGGG:54631658:0,0,3,0
chr19	54631668	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:0,1:0|1:54631658_C_CCCGGG:54631658:1,0,3,0
chr19	54631672	.	GT	CC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=139,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,1:0,1:0|1:54631658_C_CCCGGG:54631658:2,0,2,0
chr19	54632352	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr19	54632423	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr19	54647078	.	T	TGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=G;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	54649671	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr19	54649849	.	C	CACAGCAGCCCAGTTGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54649849_C_CACAGCAGCCCAGTTGCA:54649849:0,1,0,1
chr19	54649853	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:54649849_C_CACAGCAGCCCAGTTGCA:54649849:0,1,0,1
chr19	54653404	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:54653404_A_T:54653404:14,3,1,1
chr19	54653413	.	AC	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=130,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:9,2:0|1:54653404_A_T:54653404:15,3,1,1
chr19	54653415	.	GCCCAGCTT	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=125,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:7,2:0|1:54653404_A_T:54653404:17,4,1,1
chr19	54653427	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=125,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:8,2:0|1:54653404_A_T:54653404:13,6,1,1
chr19	54653429	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=123,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:54653404_A_T:54653404:12,6,1,1
chr19	54657877	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr19	54666060	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0|1:54666060_T_C:54666060:0,0,0,3
chr19	54666078	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54666060_T_C:54666060:0,0,0,1
chr19	54666357	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:5,4:4,6:8,2,9,1
chr19	54667674	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	54672460	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,2,15
chr19	54684910	.	C	CGCAGGGTCCG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=150,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr19	54687334	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,0:1,4:1,0,2,2
chr19	54691225	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	54691979	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:6,3:0,1:5,1,4,0
chr19	54695163	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,7:5,5:9,1,9,3
chr19	54696292	.	CT	TT,C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,14,20;MFRL=153,176,183;MMQ=48,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.15,7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,4:0.200,0.570:7:1,0,1:0,0,1:0,1,0,6
chr19	54710514	.	T	TTATTCCTCTCCTTCTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54710514_T_TTATTCCTCTCCTTCTTC:54710514:0,0,0,1
chr19	54710517	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54710514_T_TTATTCCTCTCCTTCTTC:54710514:0,0,0,1
chr19	54711258	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,17,8
chr19	54721365	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=144,128;MMQ=27,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.743:25:2,6:2,6:0,6,1,18
chr19	54721410	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=160,167;MMQ=25,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,5:4,8:0,8,0,14
chr19	54722594	.	TG	CA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=166.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,21:0,17:0,0,18,20
chr19	54722911	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr19	54723118	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=67.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,4,15
chr19	54723310	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,16,1
chr19	54723493	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:54723493_T_C:54723493:0,0,0,6
chr19	54723495	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:54723493_T_C:54723493:0,0,0,6
chr19	54723621	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	54723848	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0|1:54723848_C_G:54723848:0,0,3,13
chr19	54723853	.	T	TCC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=73.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,6:0|1:54723848_C_G:54723848:0,0,3,14
chr19	54723856	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,6:0|1:54723848_C_G:54723848:0,0,3,12
chr19	54724443	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr19	54724457	.	TA	CG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr19	54725530	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,18,0
chr19	54725798	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	54725835	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr19	54725995	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,43;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr19	54726023	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr19	54742999	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0|1:54742999_C_A:54742999:0,0,5,16
chr19	54743004	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0|1:54742999_C_A:54742999:0,0,4,16
chr19	54743056	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr19	54746463	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,156;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,31:0.653:47:8,17:8,14:16,0,31,0
chr19	54755855	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,179;MMQ=46,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.511:8:1,1:2,3:0|1:54755855_C_T:54755855:3,1,3,1
chr19	54755860	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,183;MMQ=40,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,4:0.443:9:2,1:3,2:1|0:54755855_C_T:54755855:3,2,3,1
chr19	54755978	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=117,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.390:24:5,4:8,5:5,10,3,6
chr19	54755994	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,5,19
chr19	54756024	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr19	54756142	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:54756142_T_C:54756142:0,0,2,0
chr19	54756166	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=116,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:54756142_T_C:54756142:1,1,2,0
chr19	54756221	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=140,97;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:0,4:7,3:4,4,3,4
chr19	54756302	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=67,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.941:19:0,6:0,10:0,1,12,6
chr19	54756657	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,0:0,2:0,0,4,0
chr19	54759102	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,1:0,0:0|1:54759102_G_A:54759102:0,0,2,0
chr19	54759110	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:54759102_G_A:54759102:0,0,3,0
chr19	54778777	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,161;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:6,4:8,11:8,6,11,4
chr19	54781509	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=188,133;MMQ=40,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:2,0:1,1:0,3,0,2
chr19	54781540	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=188,139;MMQ=40,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.517:2:1,0:0,1:0|1:54781540_A_T:54781540:0,1,0,1
chr19	54781549	.	TG	CT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54781540_A_T:54781540:0,0,0,1
chr19	54781555	.	GAT	CCA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54781540_A_T:54781540:0,0,0,1
chr19	54781567	.	C	CTTTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=161,139;MMQ=52,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:54781540_A_T:54781540:1,0,0,1
chr19	54781843	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=113,145;MMQ=52,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.542:24:7,8:3,5:4,7,4,9
chr19	54782407	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.414:17:8,1:2,5:0|1:54782407_C_T:54782407:3,7,2,5
chr19	54782420	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,1:3,4:0|1:54782407_C_T:54782407:2,7,1,4
chr19	54783035	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=204,180;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr19	54783061	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=213,180;MMQ=56,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:54783061_G_GA:54783061:1,3,0,1
chr19	54783063	.	C	CCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=213,180;MMQ=56,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:54783061_G_GA:54783061:1,3,0,1
chr19	54783521	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,217;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr19	54800214	.	TT	AA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=166,178;MMQ=54,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:54800214_TT_AA:54800214:1,1,0,1
chr19	54800219	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=37,30;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54800214_TT_AA:54800214:0,1,0,1
chr19	54800222	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54800222_A_G:54800222:0,1,0,1
chr19	54800225	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54800222_A_G:54800222:0,1,0,1
chr19	54823533	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=231,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,3,3
chr19	54848090	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=139,142;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.453:20:4,3:6,5:0|1:54848090_T_A:54848090:6,5,8,1
chr19	54848095	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=153,124;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:5,2:12,2:0|1:54848090_T_A:54848090:11,6,4,0
chr19	54849014	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:6,2:11,0:0,19,0,2
chr19	54849566	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr19	54869995	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=205,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AT;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0|1:54869995_A_AAT:54869995:2,0,1,0
chr19	54870019	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0|1:54869995_A_AAT:54869995:3,0,5,0
chr19	54875791	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=159,207;MMQ=27,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr19	54876324	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=114,141;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,9:5,0:10,3,7,2
chr19	54941651	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr19	54946784	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr19	54947250	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.871:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr19	54947505	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,4,9
chr19	54962467	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr19	54965527	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	54966343	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=145,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.667:2:0,0:0,0:0|1:54966343_C_G:54966343:0,1,0,1
chr19	54966352	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54966343_C_G:54966343:0,0,0,1
chr19	54966353	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54966343_C_G:54966343:0,0,0,1
chr19	54966356	.	C	CGCCAGAGTATGTTGTAACATAGCTTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54966343_C_G:54966343:0,0,0,1
chr19	54974068	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,5:0,0,9,7
chr19	54974774	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr19	55014172	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:1,5:6,2:3,4,3,5
chr19	55019402	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr19	55019438	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	55020407	.	C	CATGCCCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=189,183;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	55044228	.	TTC	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=85.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,9:0,14:0,0,12,12
chr19	55044241	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=76,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.321:10:2,2:5,1:4,3,2,1
chr19	55044387	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr19	55049064	.	AAG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55049064_AAG_A:55049064:0,0,1,0
chr19	55049074	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=186,189;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:55049064_AAG_A:55049064:1,0,1,0
chr19	55049078	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=93,189;MMQ=57,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.439:3:1,0:1,0:0|1:55049064_AAG_A:55049064:2,0,1,0
chr19	55053911	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,0,3
chr19	55086106	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=218,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,1:3,1:4,2,0,2
chr19	55145576	.	TCCTCCCCTGCTTGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.693:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	55175218	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=22848229,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:1,0:2,0,2,0
chr19	55176535	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr19	55178035	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr19	55179071	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=150,154;MMQ=48,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.176:22:8,0:7,0:7,11,4,0
chr19	55179275	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=165,130;MMQ=40,36;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.367:22:8,6:5,1:0,14,1,7
chr19	55179342	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=170,151;MMQ=44,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.177:32:15,4:9,1:13,14,0,5
chr19	55179364	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=158,154;MMQ=30,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.946:35:1,21:0,11:0,1,18,16
chr19	55179498	.	C	CTTGCATGTATTCTAATCCAGTATGATA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=192,15781;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.241:10:3,2:4,0:1,7,0,2
chr19	55236631	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr19	55239223	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,6,13
chr19	55240928	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=0,0;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	55246731	.	C	A,T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32,31;MFRL=0,124,138;MMQ=60,60,60;MPOS=14,18;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=27.84,40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,11:0.456,0.500:20:0,5,4:0,3,7:0,0,12,8
chr19	55246741	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=117,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,3:7,6:9,6,4,5
chr19	55246909	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=156,197;MMQ=48,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:55246909_G_A:55246909:0,1,2,0
chr19	55246911	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=156,197;MMQ=48,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:55246909_G_A:55246909:0,1,2,0
chr19	55247211	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=110,208;MMQ=54,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr19	55247353	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=166,157;MMQ=52,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,4:3,1:5,2,2,3
chr19	55247364	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=211,164;MMQ=52,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:5,1,3,3
chr19	55247393	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=168,184;MMQ=52,35;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.445:14:4,4:3,2:7,1,3,3
chr19	55247614	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=120,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.558:41:9,12:9,11:3,15,3,20
chr19	55250036	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=96,171;MMQ=57,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.389:13:2,2:6,2:0|1:55250036_T_C:55250036:7,1,4,1
chr19	55250061	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=72,138;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.500:20:3,4:7,5:0|1:55250036_T_C:55250036:8,2,5,5
chr19	55253465	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=235,152;MMQ=27,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:2,1,2,0
chr19	55253521	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=171,163;MMQ=27,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.799:18:1,5:2,9:1,2,12,3
chr19	55253544	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=174,163;MMQ=51,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.461:24:6,4:7,5:0|1:55253544_A_G:55253544:9,4,9,2
chr19	55253552	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=174,166;MMQ=51,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.440:23:6,3:7,7:0|1:55253544_A_G:55253544:9,4,8,2
chr19	55253601	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.237:36:18,5:10,3:17,11,5,3
chr19	55253760	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=210,181;MMQ=40,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr19	55253779	.	C	CTCGTATGGAGAGTCACGGAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=183,148;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr19	55263802	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	55281315	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=207,111;MMQ=27,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,1,2
chr19	55281352	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=181,179;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0|1:55281352_C_G:55281352:1,1,3,0
chr19	55281368	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=181,179;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,0:0|1:55281352_C_G:55281352:1,1,3,0
chr19	55281370	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=181,178;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:55281352_C_G:55281352:1,1,2,0
chr19	55281469	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=81,179;MMQ=52,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:1,1,0,3
chr19	55282351	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr19	55284979	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:7,3,2,0
chr19	55294276	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,246;MMQ=56,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr19	55294484	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr19	55294927	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr19	55294931	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=111,140;MMQ=49,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:3,4,4,0
chr19	55294969	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,6:3,4:2,3,4,6
chr19	55295215	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=132,155;MMQ=40,57;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,28:0.598:47:8,15:9,13:9,10,7,21
chr19	55301811	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr19	55315275	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:8,0:13,7,2,0
chr19	55315307	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.423:31:10,9:8,4:13,5,8,5
chr19	55315440	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr19	55316329	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,3:8,5:8,6,6,2
chr19	55320279	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=199.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,31:0,26:0,0,39,19
chr19	55327891	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,182;MMQ=40,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:4,1,3,0
chr19	55336472	.	C	CTAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=105,131;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55336472_C_CTAAA:55336472:0,1,0,1
chr19	55336474	.	A	AAACATTAATCTACTATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=105,131;MMQ=27,27;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55336472_C_CTAAA:55336472:0,1,0,1
chr19	55341460	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=194,66;MMQ=57,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:55341460_G_A:55341460:0,1,2,0
chr19	55341473	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=163,0;MMQ=59,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:55341460_G_A:55341460:0,2,1,0
chr19	55341575	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=37,35;MFRL=148,162;MMQ=59,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:6,2:0,0:6,0,2,0
chr19	55341753	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,3,17
chr19	55346409	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	55346496	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=120,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:16,4,2,0
chr19	55346658	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=169,155;MMQ=40,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:1,1:0,2,0,3
chr19	55358655	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:5,4:8,2:8,6,2,4
chr19	55358734	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=143,157;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.282:22:11,4:5,1:5,11,2,4
chr19	55358808	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	55359272	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr19	55362719	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.402:23:7,3:6,6:3,11,3,6
chr19	55363368	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	55365599	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	55385723	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:4,0:6,4,2,1
chr19	55386890	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr19	55386920	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	55417855	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	55423488	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=93,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:4,1,1,2
chr19	55438940	.	AAAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,3,2
chr19	55439166	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:2,3,2,2
chr19	55439197	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=195,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,3:3,0:0,7,1,2
chr19	55441769	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	55445764	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	55446123	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.559:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr19	55447572	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr19	55451848	.	C	CACCTGGCCAGGCTCTCAAGGCCTCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	55481669	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,6:2,2:2,2,1,7
chr19	55494651	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=172,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:5,3:1,3:3,4,4,2
chr19	55494740	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=109,123;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,3:1,4:2,5,1,6
chr19	55494749	.	T	TGTAGTATATCCAAAGACAACCATCATTCCCCCTAAATAAATTAAAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=138,65;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.204:14:6,2:4,0:3,9,1,1
chr19	55497506	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,8:2,2:1,3,6,4
chr19	55501316	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=200,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr19	55501348	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=138,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.748:7:0,1:1,2:1,1,3,2
chr19	55501579	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=115,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr19	55501834	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,2:2,6:5,3,5,3
chr19	55501866	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=132,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:9,6:4,11:9,4,9,8
chr19	55512316	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr19	55512354	.	AC	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55512354_AC_GG:55512354:0,1,0,1
chr19	55512357	.	CC	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55512354_AC_GG:55512354:0,1,0,1
chr19	55526932	.	TTACTC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,293;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr19	55527184	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=293,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55527184_C_T:55527184:0,1,0,1
chr19	55527189	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55527184_C_T:55527184:0,0,0,1
chr19	55529933	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.879:6:0,1:0,3:0|1:55529933_A_G:55529933:0,0,6,0
chr19	55529936	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=204,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:55529933_A_G:55529933:3,0,4,0
chr19	55530035	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,12,7
chr19	55556574	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,2:9,1:8,5,1,2
chr19	55568011	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:14,5,2,0
chr19	55568264	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,0:0|1:55568264_A_AT:55568264:0,1,0,1
chr19	55568265	.	A	ATAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0|1:55568264_A_AT:55568264:0,1,0,1
chr19	55570574	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,5:0,0,1,6
chr19	55574412	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,0:0|1:55574412_G_T:55574412:0,0,0,5
chr19	55574429	.	A	AGGCGTCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:55574412_G_T:55574412:0,0,0,4
chr19	55591764	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=115,83;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:16,1,3,0
chr19	55594038	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=242,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr19	55597369	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:5,2,0,2
chr19	55598003	.	G	GGGGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,28;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.605:2:0,0:0,1:0|1:55598003_G_GGGGCC:55598003:1,0,1,0
chr19	55598011	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,32;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.605:2:0,0:0,1:0|1:55598003_G_GGGGCC:55598003:1,0,1,0
chr19	55598267	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=205,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,2,0
chr19	55604101	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,9:0.230:41:13,0:15,2:0|1:55604101_G_C:55604101:3,29,9,0
chr19	55604108	.	GG	CC	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,9:0.242:39:11,6:16,2:0|1:55604101_G_C:55604101:1,29,9,0
chr19	55604113	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=149,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:10,3:17,1:0|1:55604101_G_C:55604101:0,28,4,0
chr19	55614760	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:9,3:8,2:13,4,3,2
chr19	55645381	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:55645381_T_C:55645381:1,1,1,0
chr19	55645384	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:55645381_T_C:55645381:1,2,1,0
chr19	55648414	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	55657857	.	G	GACACTTATCAAACGACCAGATCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	55657969	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.745:2:0,0:0,2:0|1:55657969_C_CA:55657969:0,0,2,0
chr19	55657971	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.745:2:0,0:0,0:0|1:55657969_C_CA:55657969:0,0,2,0
chr19	55657975	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.745:2:0,0:0,1:0|1:55657969_C_CA:55657969:0,0,2,0
chr19	55665584	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr19	55665628	.	CTCCT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=169,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55665628_CTCCT_C:55665628:0,1,0,1
chr19	55665637	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=169,237;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55665628_CTCCT_C:55665628:0,1,0,1
chr19	55668686	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=156,90;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:5,1:10,3:5,10,3,1
chr19	55669042	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=137,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr19	55711942	.	C	CAAAATGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=203,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr19	55715500	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=129,175;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:55715500_T_TG:55715500:1,2,0,1
chr19	55715505	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=87,175;MMQ=54,30;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:55715500_T_TG:55715500:0,2,0,1
chr19	55715513	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=87,175;MMQ=54,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:55715500_T_TG:55715500:0,2,0,1
chr19	55739515	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr19	55739813	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	55739886	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55739886_A_C:55739886:0,0,1,0
chr19	55739892	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55739886_A_C:55739886:0,0,1,0
chr19	55739895	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55739886_A_C:55739886:0,0,1,0
chr19	55739904	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55739886_A_C:55739886:0,0,1,0
chr19	55741839	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=137,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:0,0:1,0,4,0
chr19	55741847	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=16,18;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:0,0:1,0:2,1,2,0
chr19	55741961	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr19	55743640	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55743640_G_T:55743640:0,0,0,1
chr19	55743641	.	T	TCAGAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55743640_G_T:55743640:0,0,0,1
chr19	55751123	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0,0,4,4
chr19	55752997	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:7,1:8,1:7,8,1,2
chr19	55776823	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr19	55785746	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55785746_A_C:55785746:0,0,1,0
chr19	55785752	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55785746_A_C:55785746:0,0,1,0
chr19	55785758	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55785746_A_C:55785746:0,0,1,0
chr19	55785760	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55785746_A_C:55785746:0,0,1,0
chr19	55795758	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	55795872	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=138,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,2:5,0:0|1:55795872_A_C:55795872:2,8,3,0
chr19	55795878	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=132,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:3,1:7,0:0|1:55795872_A_C:55795872:2,9,3,0
chr19	55795882	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=143,189;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:8,0:0|1:55795872_A_C:55795872:3,10,2,0
chr19	55795887	.	AG	CC	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=138,189;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,1:9,1:0|1:55795872_A_C:55795872:9,11,2,0
chr19	55795890	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=138,189;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:9,0:0|1:55795872_A_C:55795872:9,11,2,0
chr19	55795892	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,19;MFRL=138,189;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,1:0|1:55795872_A_C:55795872:9,11,2,0
chr19	55800789	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr19	55815894	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:5,5:4,3:7,2,8,1
chr19	55816678	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,219;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:1,5:3,1:4,1,5,1
chr19	55831576	.	AA	CC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,3:3,7:3,3,1,9
chr19	55831589	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=129,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,4:3,7:1,4,1,10
chr19	55831723	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:3,0:10,8:8,5,6,3
chr19	55832427	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.670:15:2,8:1,2:1,4,2,8
chr19	55854313	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr19	55857777	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr19	55869419	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=225,203;MMQ=60,41;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.639:6:2,0:0,3:2,0,4,0
chr19	55870600	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr19	55870998	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=149,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:8,0:19,3:0|1:55870998_G_A:55870998:7,20,1,2
chr19	55871019	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.969:29:0,8:0,21:0|1:55870998_G_A:55870998:0,0,9,20
chr19	55872191	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.401:25:8,4:7,5:8,7,3,7
chr19	55872837	.	C	CCTCTCGCTGGGTAGG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=105,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:20,2:8,0:11,17,0,2
chr19	55872864	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,6:4,4:2,7,0,10
chr19	55873852	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:2,6,2,0
chr19	55899602	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.559:34:8,11:6,8:9,6,8,11
chr19	55903158	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr19	55912946	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=170,164;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:2,2:6,4:7,2,6,0
chr19	55948880	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	55966346	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr19	55993260	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	55997751	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	56000429	.	GCC	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=C;STR;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr19	56000492	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr19	56000515	.	AC	GT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:56000515_AC_GT:56000515:0,4,0,1
chr19	56000518	.	T	TGAGAGGGTATG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:56000515_AC_GT:56000515:0,4,0,1
chr19	56001802	.	C	CCCAAGCAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr19	56004993	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	56009191	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr19	56009215	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,5,4
chr19	56011091	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr19	56011460	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,11:0,0,10,13
chr19	56012192	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=121,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.167:34:13,2:12,0:17,12,0,5
chr19	56012195	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=123,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:11,2:12,0:17,11,0,5
chr19	56012201	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=124,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,2:7,1:15,6,0,3
chr19	56012210	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.367:14:5,1:3,1:7,2,0,5
chr19	56012590	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:56012590_G_A:56012590:0,0,0,4
chr19	56012597	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:56012590_G_A:56012590:0,0,0,4
chr19	56024519	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,3:0,12:0,0,5,10
chr19	56024563	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,10:0,0,4,14
chr19	56024599	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,2:0,4:0,0,0,8
chr19	56030250	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:3,0,6,2
chr19	56030428	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:1,2:0,3,0,5
chr19	56041255	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr19	56042743	.	TGCA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCA;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.708:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	56089219	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	56090728	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	56134038	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr19	56134105	.	TTC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56134105_TTC_T:56134105:0,0,0,1
chr19	56134111	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56134105_TTC_T:56134105:0,0,0,1
chr19	56153868	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.545:7:1,0:2,2:3,0,4,0
chr19	56153898	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.653:4:0,1:1,0:0|1:56153898_A_C:56153898:1,0,3,0
chr19	56153903	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.813:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr19	56153907	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,9;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.653:4:0,0:1,0:0|1:56153898_A_C:56153898:1,0,3,0
chr19	56154518	.	GTTT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=117.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,15:0,0,6,21
chr19	56154877	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr19	56162881	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.555:31:3,2:9,6:1,12,3,15
chr19	56170751	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0|1:56170751_C_T:56170751:1,2,1,3
chr19	56170771	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=193,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,5:0,3:0|1:56170751_C_T:56170751:0,1,0,8
chr19	56171515	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,18;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,0:0|1:56171515_C_G:56171515:1,1,1,0
chr19	56171520	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,0:0|1:56171515_C_G:56171515:1,1,1,0
chr19	56172490	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:2,8,0,2
chr19	56173836	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=95,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr19	56175149	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr19	56179971	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=31,10;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.349:17:6,0:5,0:0|1:56179971_T_G:56179971:1,10,6,0
chr19	56179976	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=127,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.343:15:4,0:5,0:0|1:56179971_T_G:56179971:1,9,5,0
chr19	56179979	.	C	CCG	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=127,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.343:15:5,2:4,1:0|1:56179971_T_G:56179971:1,9,5,0
chr19	56179981	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=32,17;MFRL=123,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.365:14:4,0:4,0:0|1:56179971_T_G:56179971:1,8,5,0
chr19	56179988	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=28,18;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,1:4,1:0|1:56179971_T_G:56179971:0,8,4,0
chr19	56179993	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,1:5,1:0|1:56179971_T_G:56179971:0,8,4,0
chr19	56179998	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=29,26;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,1:4,1:0|1:56179971_T_G:56179971:0,8,3,0
chr19	56180732	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr19	56185250	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:1,6:6,3:7,1,7,2
chr19	56185262	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=108,36;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:12,2:14,6,1,1
chr19	56206311	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr19	56220245	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,8:7,2:10,2,7,3
chr19	56220444	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=117,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:0,6,1,4
chr19	56249445	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.676:19:4,9:1,4:4,2,8,5
chr19	56273136	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,8:0,0,11,3
chr19	56273155	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=153,209;MMQ=39,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:10,4:14,0:18,6,0,4
chr19	56273868	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=160,162;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:10,6:6,4:16,0,10,0
chr19	56273902	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=141,145;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,8:0.264:32:12,4:11,4:0|1:56273902_C_A:56273902:24,0,8,0
chr19	56273904	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=141,145;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,8:0.264:32:12,4:12,4:0|1:56273902_C_A:56273902:24,0,8,0
chr19	56273923	.	A	AGTGTGTGTTT	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=30,0;MFRL=133,176;MMQ=27,27;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.054:52:23,0:25,0:35,15,2,0
chr19	56297249	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=77,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:1,2,1,5
chr19	56372705	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=111,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr19	56410305	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=201,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56410305_T_A:56410305:0,1,0,1
chr19	56410308	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=201,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56410305_T_A:56410305:0,1,0,1
chr19	56410313	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=201,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:56410305_T_A:56410305:0,1,0,1
chr19	56410340	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr19	56413627	.	T	TTTTTTTTTTTATGATAAGGGGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56413627_T_TTTTTTTTTTTATGATAAGGGGA:56413627:0,0,0,1
chr19	56413629	.	C	CATCGTTTTCTACACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56413627_T_TTTTTTTTTTTATGATAAGGGGA:56413627:0,0,0,1
chr19	56419390	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=59,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:56419390_T_A:56419390:0,2,0,1
chr19	56419395	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=59,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:56419390_T_A:56419390:0,2,0,1
chr19	56419402	.	C	CACCCAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:56419390_T_A:56419390:0,2,0,1
chr19	56419404	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:56419390_T_A:56419390:0,2,0,1
chr19	56421861	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr19	56422976	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr19	56424443	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=266,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.695:21:3,2:3,13:5,1,5,10
chr19	56436263	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr19	56436467	.	GT	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=163,149;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:56436467_GT_AG:56436467:0,3,0,1
chr19	56436470	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=163,149;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:56436467_GT_AG:56436467:0,3,0,1
chr19	56436472	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=163,149;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:56436467_GT_AG:56436467:0,3,0,1
chr19	56436487	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=201,149;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr19	56464058	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr19	56473645	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	56477687	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr19	56477710	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,10,6
chr19	56477780	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr19	56487430	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0|1:56487430_G_A:56487430:0,0,13,2
chr19	56487450	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,37;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.931:13:1,11:0,1:0|1:56487430_G_A:56487430:0,1,10,2
chr19	56499337	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:56499337_C_T:56499337:0,0,0,4
chr19	56499345	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:56499337_C_T:56499337:0,0,0,3
chr19	56511216	.	CGG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56511216_CGG_C:56511216:0,2,0,1
chr19	56511220	.	T	TATGCACACACATAACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56511216_CGG_C:56511216:0,1,0,1
chr19	56538203	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr19	56544179	.	C	CATTGTTCTAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=179,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:56544179_C_CATTGTTCTAG:56544179:0,2,0,1
chr19	56544183	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=179,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:56544179_C_CATTGTTCTAG:56544179:0,2,0,1
chr19	56544189	.	CGCT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=230,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56544189_CGCT_C:56544189:0,1,0,1
chr19	56544194	.	TCCCAG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=202,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:56544189_CGCT_C:56544189:0,2,0,1
chr19	56549532	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:3,3:6,2:4,5,1,5
chr19	56552230	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr19	56561749	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr19	56565127	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=83,165;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:6,5:3,5:7,3,7,3
chr19	56565164	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,11:0,0,9,10
chr19	56565233	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr19	56599405	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	56599437	.	CTCG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr19	56614652	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr19	56691912	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=53,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:2,1:4,1:4,2,3,0
chr19	56693643	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr19	56694505	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,6:5,4:7,4,5,5
chr19	56696511	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,2:5,1:4,1,2,1
chr19	56703502	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,276;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:56703502_T_C:56703502:0,0,0,1
chr19	56703511	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,276;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56703502_T_C:56703502:0,0,0,1
chr19	56736057	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=136,136;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,3:8,2:0,15,0,5
chr19	56901293	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr19	56902976	.	A	ATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56902976_A_ATG:56902976:0,0,1,0
chr19	56902977	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56902976_A_ATG:56902976:0,0,1,0
chr19	56902985	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56902976_A_ATG:56902976:0,0,1,0
chr19	56918560	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr19	56918574	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr19	56918598	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr19	56918619	.	ATATCTT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=189,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr19	56953963	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:2,4,5,4
chr19	56973848	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr19	57029837	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=125,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:5,2,4,3
chr19	57060317	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr19	57060573	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:1,0:0,3,0,2
chr19	57062072	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr19	57066830	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr19	57132968	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=178,232;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr19	57176225	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=196,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57176225_G_C:57176225:1,0,0,1
chr19	57176227	.	CC	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=196,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57176225_G_C:57176225:1,0,0,1
chr19	57293518	.	A	AAAAAAGGGATAAGAGGCAGTGAGTAATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr19	57329286	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=208,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0|1:57329286_A_C:57329286:0,3,0,1
chr19	57329287	.	C	CCGAATATTTATTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=208,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0|1:57329286_A_C:57329286:0,3,0,1
chr19	57334261	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:57334261_C_CAG:57334261:0,3,0,2
chr19	57334262	.	T	TAGGAGATATAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:57334261_C_CAG:57334261:0,3,0,2
chr19	57646398	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:13,0:15,3:11,17,0,3
chr19	57648277	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,17:0,15:0,0,22,12
chr19	57648433	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr19	57654065	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=144,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,1:4,4:1,5,3,3
chr19	57654102	.	A	ACAGTTGTGCAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:57654102_A_ACAGTTGTGCAT:57654102:1,3,0,1
chr19	57654104	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=158,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:1,1:0,3,1,1
chr19	57654107	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:57654102_A_ACAGTTGTGCAT:57654102:1,3,0,1
chr19	57665750	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,3:4,0:6,3,2,1
chr19	57665935	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.635:6:1,2:0,1:0,2,0,4
chr19	57666840	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr19	57672241	.	C	CTTGGATGATTTAAAAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:57672241_C_CTTGGATGATTTAAAAT:57672241:0,3,0,1
chr19	57672243	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:57672241_C_CTTGGATGATTTAAAAT:57672241:0,3,0,1
chr19	57672246	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:57672241_C_CTTGGATGATTTAAAAT:57672241:0,3,0,1
chr19	57672250	.	T	TGGGCTCAAGCAATCCATGCCTGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=203,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr19	57703209	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	57742472	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr19	57742489	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0|1:57742489_C_T:57742489:0,0,1,5
chr19	57742493	.	AGGACGAGCAGGATT	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0|1:57742489_C_T:57742489:0,0,1,5
chr19	57742514	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr19	57743039	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr19	57744012	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=128,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,2:5,0:8,5,0,2
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chr19	57768897	.	CTT	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=177.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,17:0,21:0,0,18,23
chr19	57768942	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:21,1:23,2:31,14,1,2
chr19	57769143	.	CC	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=188,143;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:13,2:1,0:0,14,0,2
chr19	57769160	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,3:1,0:0,7,0,3
chr19	57769300	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,330;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57769300_T_A:57769300:0,0,0,1
chr19	57769305	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,330;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57769300_T_A:57769300:0,0,0,1
chr19	57769309	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,330;MMQ=60,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57769300_T_A:57769300:0,0,0,1
chr19	57769805	.	G	GTTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=T;STR;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,2:0,0,3,8
chr19	57769896	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr19	57769994	.	C	CTTCCA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,9,5
chr19	57770937	.	C	CAGTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:57770937_C_CAGTG:57770937:0,3,0,1
chr19	57770939	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:57770937_C_CAGTG:57770937:0,3,0,1
chr19	57770944	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	57772703	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=21,19;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,12:0.256:49:12,1:10,3:19,18,0,12
chr19	57773718	.	G	GAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.922:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr19	57795933	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.550:36:10,10:6,9:9,7,9,11
chr19	57803632	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:57803632_T_A:57803632:0,4,0,1
chr19	57803633	.	C	CGCTTTGACTTTTTTAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:57803632_T_A:57803632:0,4,0,1
chr19	57803636	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:57803632_T_A:57803632:0,4,0,1
chr19	57832089	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=190,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr19	57834963	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=164,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,5:1,0:4,0,5,0
chr19	57835242	.	C	CCCATTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=217,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr19	57835252	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	57839567	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:3,7:4,5:3,4,7,6
chr19	57839856	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=124,104;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,2:8,0:7,11,1,1
chr19	57865082	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:5,5:14,6:12,7,2,9
chr19	57868336	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,17:0,20:0,0,22,15
chr19	57883371	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr19	57889633	.	G	GTCCATGCAGTGGCCACAAGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	57901548	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	57922664	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,13,1
chr19	57929213	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,160;MMQ=54,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.449:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr19	57932533	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=139,59;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,0:0|1:57932533_A_T:57932533:13,8,1,1
chr19	57932539	.	G	GTATGTATATATCATGTGTGTTGTGTGTTGTGTGTGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=136,59;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.122:24:10,0:10,2:0|1:57932533_A_T:57932533:14,8,1,1
chr19	57954628	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,4,1
chr19	57955229	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,3:5,5:4,3,4,4
chr19	57955244	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,126;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:3,3:3,3,1,2
chr19	57956828	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,5:7,6:6,6,6,6
chr19	57985223	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.309:15:5,0:3,0:7,3,5,0
chr19	57987895	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	58002819	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,7:0,0,14,4
chr19	58003580	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,51;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,17:0,0,8,22
chr19	58003613	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,10:0,0,1,17
chr19	58004158	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr19	58089521	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=96.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,11:0,17:0,0,8,20
chr19	58101890	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,99;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,3:9,0:12,12,3,0
chr19	58118715	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr19	58231807	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=150,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr19	58281374	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr19	58291228	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr19	58324849	.	T	TCAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=196,164;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:58324849_T_TCAC:58324849:0,3,0,1
chr19	58324851	.	T	TATTAAAGTTTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=196,164;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:58324849_T_TCAC:58324849:0,3,0,1
chr19	58324868	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=330,196;MMQ=40,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58324868_C_T:58324868:0,1,0,1
chr19	58324869	.	TCG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=330,196;MMQ=40,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58324868_C_T:58324868:0,1,0,1
chr19	58326001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=109,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:3,2,4,2
chr19	58361334	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=173,158;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.308:20:9,4:5,1:14,0,6,0
chr19	58361371	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,147;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.417:29:9,9:7,2:14,3,11,1
chr19	58361549	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:8,6:9,5:2,15,0,11
chr19	58370246	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,174;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,6:7,4:11,0,10,0
chr19	58371136	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,137;MMQ=52,40;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:9,1:8,5:12,5,6,0
chr19	58419841	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=162,223;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,4:7,3:9,1,7,0
chr19	58419874	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=153,205;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.355:26:6,5:9,3:11,6,3,6
chr19	58445043	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=215,160;MMQ=49,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:58445043_C_T:58445043:3,0,1,0
chr19	58445053	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=215,160;MMQ=49,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:58445043_C_T:58445043:3,0,1,0
chr19	58445070	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=160,226;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr19	58469892	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr19	58470153	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	58483709	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr19	58483954	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=193,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr19	58485439	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:8,5:0,5:5,3,6,4
chr19	58491382	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,223;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr19	58511150	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr19	58549354	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:58549354_C_T:58549354:0,0,6,1
chr19	58549366	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:58549354_C_T:58549354:0,0,7,1
chr19	58565431	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr19	58572959	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=195,104;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.633:14:2,5:2,3:2,3,5,4
chr19	58572979	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,11,7
chr19	58579927	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	58598784	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr19	58601221	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr19	58629878	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr19	58640964	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr19	58695487	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr19	58697290	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr19	58718360	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr19	58757851	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.340:4:1,0:1,1:0|1:58757851_G_T:58757851:0,3,0,1
chr19	58757857	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58757851_G_T:58757851:0,2,0,1
chr19	58757861	.	G	GAGTATCCATTTACAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:58757851_G_T:58757851:0,2,0,1
chr19	58757865	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:58757851_G_T:58757851:0,1,0,1
chr19	58797583	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr19	58849933	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,4:10,0:8,9,1,3
chr19	58850341	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,2:3,4:4,1,6,1
chr19	58864617	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:2,1:1,0:1,2,2,0
chr19	58864724	.	T	TGC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:3,1:0|1:58864724_T_TGC:58864724:0,7,2,0
chr19	58864728	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,1:0|1:58864724_T_TGC:58864724:0,8,2,0
chr19	58864734	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:2,0:0|1:58864724_T_TGC:58864724:1,8,2,0
chr19	58864738	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:3,1:0|1:58864724_T_TGC:58864724:1,10,2,0
chr19	58864743	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,1:0|1:58864724_T_TGC:58864724:1,10,2,0
chr19	58899466	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:5,3,3,0
chr19	58906163	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,3:8,4:1,12,1,6
chr19	58906195	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:2,2:5,0:0,9,0,2
chr19	58966597	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,137;MMQ=40,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,2:15,0:15,13,1,1
chr19	58991076	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:58991076_G_A:58991076:4,4,0,2
chr19	58991078	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:58991076_G_A:58991076:4,4,0,2
chr19	58991222	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58991222_C_A:58991222:0,0,0,1
chr19	58991225	.	T	TCGCCAGGCTCCTCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58991222_C_A:58991222:0,0,0,1
chr19	58991231	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58991222_C_A:58991222:0,0,0,1
chr19	58991561	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr19	59010593	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:5,7:4,1:2,7,2,7
chr19	59010819	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=231,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr19	59022873	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr19	59025685	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.462:35:7,11:11,5:3,16,1,15
chr19	59025751	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr19	59056991	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr19	59067623	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,29:0.547:52:8,10:15,13:11,12,18,11
chr19	59068074	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:18,2:16,0:14,20,1,1
chr19	59068569	.	AAG	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.130:28:9,2:14,1:2,23,0,3
chr19	59073613	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=200,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:2,1,6,0
chr20	126310	.	ACC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=87,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=C;STR;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr20	138178	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.501:24:7,7:5,5:6,6,7,5
chr20	139362	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr20	139745	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr20	168466	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,5:2,2:7,1,7,0
chr20	168781	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,3:1,0:1,5,0,3
chr20	207889	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,4:3,2:6,0,7,0
chr20	210061	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,183;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,3:5,1:1,4,0,4
chr20	238435	.	CTGGTCT	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:2,6:6,2:3,5,3,5
chr20	238507	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:1,5,0,6
chr20	238530	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=173,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:2,2:3,1:0|1:238530_T_G:238530:1,5,0,3
chr20	238540	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:238530_T_G:238530:1,5,0,2
chr20	239664	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=146,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,3:1,4:5,2,7,0
chr20	239688	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:5,5:2,3:0|1:239688_G_A:239688:5,2,7,1
chr20	239697	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:8,5:2,5:0|1:239688_G_A:239688:7,4,9,1
chr20	256573	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr20	256727	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,4,7
chr20	256760	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.837:10:1,4:0,5:0|1:256760_G_GA:256760:0,1,3,6
chr20	256763	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,3:0,5:0|1:256760_G_GA:256760:0,1,3,6
chr20	257812	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr20	264764	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr20	270277	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,34:0.540:63:12,13:16,21:17,12,18,16
chr20	270414	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:5,0:0,10,0,2
chr20	271135	.	G	GC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=93.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,11:0,15:0,0,25,4
chr20	271225	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.940:30:1,11:0,10:0,1,13,16
chr20	278687	.	CCGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CGG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	279483	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,22:0.365:61:15,7:24,15:19,20,11,11
chr20	279786	.	C	CTTCTTCTTGTTTCTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.214:11:4,1:4,1:3,6,0,2
chr20	308976	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.597:42:7,14:8,11:10,7,13,12
chr20	334317	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	389456	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,5:6,1:3,8,2,4
chr20	391025	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:6,0,6,1
chr20	400022	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:14,4,1,1
chr20	425606	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr20	428767	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr20	467010	.	ATGAAC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:5,2:15,3,1,1
chr20	470606	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr20	476285	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr20	480602	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.729:9:0,4:1,2:0|1:480602_CA_C:480602:0,2,0,7
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chr20	741653	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.896:12:0,5:1,5:0,1,6,5
chr20	742217	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,5,0
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chr20	742331	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:8,11,0,2
chr20	744662	.	A	ACAGGTCAAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.560:14:1,3:4,5:0,6,0,8
chr20	746423	.	GTATCTGCCC	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.464:24:8,6:5,4:5,8,4,7
chr20	820143	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,4:1,6:5,1,9,1
chr20	826710	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,24:0.694:34:6,9:4,15:1,9,14,10
chr20	860437	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=99,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:4,5,0,2
chr20	861743	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr20	861757	.	G	GGGAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=110,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGAA;STR;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr20	871044	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:871044_A_C:871044:0,1,0,1
chr20	871046	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:871044_A_C:871044:0,1,0,1
chr20	871050	.	G	GCCACTGCCGTGGTATCTGCCGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:871044_A_C:871044:0,1,0,1
chr20	1099329	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr20	1212286	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:12,7:6,5:0,18,1,11
chr20	1277157	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=85,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr20	1286711	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	1291393	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=174,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.870:10:1,5:0,4:1,0,9,0
chr20	1292964	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr20	1356261	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=156.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,17:0,24:0,0,7,35
chr20	1457045	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr20	1457910	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,2,2
chr20	1538379	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	1546742	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr20	1592045	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	1616816	.	GGT	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,140;MMQ=52,45;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,20:0.415:49:14,14:15,6:17,12,15,5
chr20	1629604	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=205,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr20	1638293	.	AG	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:24,0:20,2:25,20,1,1
chr20	1876237	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	1903081	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.078:61:25,0:31,4:31,26,1,3
chr20	1918223	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:5,1:1,11,0,2
chr20	2290532	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr20	2290547	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr20	2361684	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=129.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,21:0,17:0,0,13,25
chr20	2380396	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,2,23
chr20	2397994	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:4,5,1,1
chr20	2413126	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr20	2442273	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr20	2474081	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,4:0,5:0,0,11,0
chr20	2474136	.	GA	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.108:31:16,2:10,1:22,6,3,0
chr20	2542669	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr20	2578035	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	2593006	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:0,3,1,4
chr20	2596738	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=46,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.672:7:1,4:1,1:0|1:2596738_CT_C:2596738:2,0,5,0
chr20	2596762	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=92,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.716:12:1,4:2,5:0|1:2596738_CT_C:2596738:2,1,7,2
chr20	2597716	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=131,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:5,1,6,1
chr20	2597978	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:1,7,0,7
chr20	2616556	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr20	2616679	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,2,12
chr20	2618033	.	C	CAAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,251;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2618033_C_CAAA:2618033:0,0,1,0
chr20	2618054	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=205,251;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,0:0|1:2618033_C_CAAA:2618033:1,0,1,0
chr20	2618094	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr20	2618140	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr20	2618163	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:11,6,2,0
chr20	2618308	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr20	2621913	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=106,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:12,12,0,2
chr20	2633288	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr20	2633380	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=127,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:2633380_G_A:2633380:3,3,1,2
chr20	2633404	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0|1:2633380_G_A:2633380:2,4,1,2
chr20	2633410	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0|1:2633380_G_A:2633380:2,5,0,2
chr20	2633416	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:0|1:2633380_G_A:2633380:2,7,0,2
chr20	2635012	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:1,4:3,2:3,1,7,0
chr20	2635212	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:4,4:6,5:5,6,2,7
chr20	2636218	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,3:5,2:6,5,4,1
chr20	2638492	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:2,1:0,1:2,0,3,0
chr20	2639570	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	2639580	.	C	CACTGAAGTGGAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=214,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr20	2640102	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr20	2640488	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,1:5,5:2,7,1,5
chr20	2641196	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:5,0:13,6,1,1
chr20	2644407	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,6:5,4:2,10,5,6
chr20	2644685	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,4:7,6:8,7,5,5
chr20	2644950	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:6,1:0,2:0,6,0,3
chr20	2688756	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=210,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	2736248	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=20,13;MFRL=120,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,0:3,0:0|1:2736248_T_A:2736248:1,3,3,0
chr20	2736250	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=20,14;MFRL=120,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:2,0:2,3,2,0
chr20	2736254	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=120,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,0:2,0:0|1:2736248_T_A:2736248:1,4,3,0
chr20	2736259	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=120,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:3,2:0|1:2736248_T_A:2736248:1,4,3,0
chr20	2736264	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=83,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,1:4,1:0|1:2736248_T_A:2736248:0,5,3,0
chr20	2777828	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr20	2778992	.	G	GAAATAAAATATTTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2778992_G_GAAATAAAATATTTTT:2778992:0,0,0,1
chr20	2778993	.	G	GCATTTCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2778992_G_GAAATAAAATATTTTT:2778992:0,0,0,1
chr20	2778998	.	AG	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2778992_G_GAAATAAAATATTTTT:2778992:0,0,0,1
chr20	2779257	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr20	2781060	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=161,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr20	2796007	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=89,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,1:2,5:5,2,3,3
chr20	2796133	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,3:2,2:3,1,5,1
chr20	2797570	.	T	TGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	2816396	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=105,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0|1:2816396_A_ATT:2816396:0,2,0,1
chr20	2816397	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=105,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0|1:2816396_A_ATT:2816396:0,2,0,1
chr20	2816401	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=105,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:2816396_A_ATT:2816396:0,2,0,1
chr20	2816821	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=213.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,27:0,37:0,0,52,16
chr20	2816869	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.158:50:9,0:19,0:28,14,0,8
chr20	2818801	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr20	2819726	.	C	CAAAAGTTAAATCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,299;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	2841940	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:11,0:11,0:22,6,0,2
chr20	2841955	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.180:29:10,0:10,0:18,5,0,6
chr20	2842408	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:10,2:4,1:7,7,2,1
chr20	2842665	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:14,8,0,2
chr20	2842685	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,10:0,15:0,0,15,11
chr20	2844918	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:3,5,1,1
chr20	2845130	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,4,8
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chr20	3053161	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:3053158_C_CAAAAAAT:3053158:0,3,0,1
chr20	3096118	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
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chr20	3145865	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=231,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3145861_G_GGAACAATC:3145861:0,1,0,1
chr20	3147024	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
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chr20	3176072	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=95,255;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr20	3185123	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	3193842	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=119,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.502:44:12,13:9,8:13,9,12,10
chr20	3194672	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:14,2:19,1:10,24,1,2
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chr20	3199373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=213,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr20	3204084	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=87,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr20	3209371	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.424:12:3,2:3,2:2,5,2,3
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chr20	3211064	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,4,1
chr20	3211719	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:7,4:2,5:3,7,2,7
chr20	3236015	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr20	3236941	.	G	GCATCTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=150,250;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:3236941_G_GCATCTCT:3236941:0,3,0,1
chr20	3236943	.	G	GAGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,250;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:3236941_G_GCATCTCT:3236941:0,3,0,1
chr20	3240165	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=127,53;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,1:9,1:12,10,2,0
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chr20	3240752	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=182,182;MMQ=40,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:3240742_C_T:3240742:0,6,0,2
chr20	3251275	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:0,7,0,2
chr20	3268489	.	CATAGGT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:5,2:1,0:0|1:3268489_CATAGGT_C:3268489:0,7,0,2
chr20	3268497	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:3268489_CATAGGT_C:3268489:0,6,0,2
chr20	3268498	.	AGCC	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:3268489_CATAGGT_C:3268489:0,6,0,2
chr20	3274948	.	C	CTGTATCATTTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=119,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr20	3297537	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=215,174;MMQ=40,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,1:1,0:0|1:3297537_CTTT_C:3297537:0,3,0,1
chr20	3297542	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=215,174;MMQ=40,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:3297537_CTTT_C:3297537:0,3,0,1
chr20	3298881	.	CAA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.935:13:0,7:0,5:0,1,10,2
chr20	3311430	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,0:4,0:0,14,0,3
chr20	3452162	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=177,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr20	3541633	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr20	3543183	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:0,12,1,1
chr20	3553299	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr20	3553371	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=144,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:14,3:20,0:23,13,3,0
chr20	3564772	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
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chr20	3605336	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=217,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr20	3619484	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,3:7,0:11,6,2,1
chr20	3624704	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,3:3,4:4,0,7,0
chr20	3624888	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.105:31:12,2:16,0:9,19,0,3
chr20	3640467	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr20	3641881	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	3644098	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3644098_G_T:3644098:0,2,0,1
chr20	3644100	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3644098_G_T:3644098:0,2,0,1
chr20	3644155	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	3649713	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:3649713_A_G:3649713:0,0,0,6
chr20	3649721	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:3649713_A_G:3649713:0,0,0,6
chr20	3650066	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,8:0,0,1,18
chr20	3650127	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=193,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:2,3,0,3
chr20	3653149	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.461:17:5,1:4,5:7,2,7,1
chr20	3657803	.	AT	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=53,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr20	3669386	.	G	GTGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=145,32;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:3669386_G_GTGGC:3669386:0,3,1,1
chr20	3669387	.	A	ATCTCTGCTTTCTCTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=145,32;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:3669386_G_GTGGC:3669386:0,3,1,1
chr20	3673445	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr20	3673815	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	3674821	.	GACAC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=AC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	3719469	.	A	ACTGACAAAATCCTTCAAAACTCAGGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr20	3723091	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr20	3726463	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,285;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr20	3726687	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr20	3726772	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr20	3731622	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr20	3740620	.	GCA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=150,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CA;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:3,3:1,0:3,1,2,1
chr20	3758840	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.311:10:1,0:4,0:0|1:3758840_G_C:3758840:7,0,3,0
chr20	3758842	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,11;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.285:11:1,0:5,0:0|1:3758840_G_C:3758840:8,0,3,0
chr20	3758845	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.224:11:2,0:6,0:0|1:3758840_G_C:3758840:9,0,2,0
chr20	3759200	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	3759528	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr20	3760071	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3760071_G_A:3760071:1,0,0,1
chr20	3760074	.	GC	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3760071_G_A:3760071:1,0,0,1
chr20	3760482	.	G	GACAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:3760482_G_GACAA:3760482:0,2,0,1
chr20	3760485	.	A	ACATTAAGATT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3760482_G_GACAA:3760482:0,2,0,1
chr20	3760493	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3760493_G_A:3760493:0,0,0,1
chr20	3760495	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3760493_G_A:3760493:0,0,0,1
chr20	3778433	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr20	3780857	.	T	TGGACTGGAGACCTGGTGCTAG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:3,3:8,3:8,4,9,7
chr20	3783649	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=130.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,17:0,0,13,23
chr20	3838541	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=208,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:3838541_C_G:3838541:0,2,0,1
chr20	3838547	.	C	CCCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=208,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:3838541_C_G:3838541:0,2,0,1
chr20	3838551	.	C	CTTTTGTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=201,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3838541_C_G:3838541:0,1,0,1
chr20	3838554	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=201,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:3838541_C_G:3838541:1,2,0,1
chr20	3838556	.	TC	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=201,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3838541_C_G:3838541:1,2,0,1
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chr20	4202802	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
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chr20	4706650	.	GTGTGTGC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=259,231;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:4706629_T_C:4706629:1,1,0,1
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chr20	4708778	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,10:0,11:0,1,4,19
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chr20	4854682	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:6,4:8,11:8,6,7,8
chr20	4864570	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr20	5086939	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,162;MMQ=52,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,2:5,5:6,5,3,4
chr20	5098391	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=185,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,5:5,7:0,12,0,12
chr20	5099162	.	GCCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=234,260;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr20	5099516	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,5:6,5:2,11,3,7
chr20	5100209	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr20	5107632	.	C	CGGGCG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGCG;STR;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:0,3:3,2:3,0,5,0
chr20	5294496	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=199,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:5,3:1,2:4,2,4,2
chr20	5294534	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=127,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:3,1:4,0:4,5,3,0
chr20	5548208	.	TAA	T,TA	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=15,31,15;MFRL=150,177,151;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=19.70,37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,13,25:0.258,0.534:49:1,4,5:1,5,4:0,11,7,31
chr20	5548236	.	A	AG	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:22,0:15,4:2,35,0,4
chr20	5556686	.	TAC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.347:12:3,1:3,2:0,8,0,4
chr20	5574134	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr20	5903517	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.379:35:8,6:11,6:7,15,4,9
chr20	5935385	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr20	5948706	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0|1:5948706_A_G:5948706:0,0,0,12
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chr20	5953815	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.524:23:5,5:5,7:5,6,5,7
chr20	5966839	.	C	CCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0,5,0,1
chr20	5966844	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=143,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:3,0:0,5,0,1
chr20	5966847	.	A	AGATGGATTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=140,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr20	6011882	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr20	6017765	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=119,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,4:3,9:4,4,7,6
chr20	6057831	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=128,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.139:26:10,2:13,1:14,9,2,1
chr20	6058041	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=107,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.459:7:2,0:1,3:1,3,0,3
chr20	6064635	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,5:0,0:0,0,3,2
chr20	6064839	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr20	6075510	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:7,6:7,1:10,5,7,0
chr20	6075521	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=151,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:18,1:9,2:18,9,3,0
chr20	6077501	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:2,2,2,1
chr20	6093090	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=129,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,3:6,4:11,1,6,1
chr20	6093341	.	T	TAAAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=223,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr20	6100002	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr20	6100230	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:0,5,1,4
chr20	6100241	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.466:8:4,0:0,1:0,4,0,4
chr20	6759224	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:6,6,1,1
chr20	6759706	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr20	6759721	.	TTG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:6759721_TTG_T:6759721:0,0,0,1
chr20	6759727	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6759721_TTG_T:6759721:0,0,0,1
chr20	6759731	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6759721_TTG_T:6759721:0,0,0,1
chr20	6759734	.	TA	AG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6759721_TTG_T:6759721:0,0,0,1
chr20	7967860	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,139;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:18,3:21,0:40,0,0,3
chr20	7967880	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=165,139;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:20,3:19,0:38,1,0,3
chr20	8000101	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,7:0.102:76:32,4:37,3:38,31,4,3
chr20	8113439	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:9,0:0|1:8113439_A_C:8113439:7,21,0,2
chr20	8113446	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=144,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,0:6,0:0|1:8113439_A_C:8113439:4,18,0,2
chr20	8113465	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.339:15:7,1:0,1:1,9,0,5
chr20	8626903	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=9,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.646:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr20	8639413	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr20	8639443	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr20	8703145	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,8:0,5:0,1,0,14
chr20	8705496	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr20	8713842	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr20	8731631	.	G	GGAGTGCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=165,162;MMQ=40,41;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAGTGCA;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,0:1,0:0,3,0,2
chr20	8737734	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,24:0.428:57:19,13:11,11:12,21,11,13
chr20	8741027	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.455:48:14,11:12,9:24,2,21,1
chr20	8769131	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:9,2:0|1:8769131_T_C:8769131:9,11,0,2
chr20	8769134	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.117:23:10,0:9,2:0|1:8769131_T_C:8769131:9,12,0,2
chr20	8769423	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,3:5,10:0,9,0,13
chr20	8770108	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,18,2
chr20	8770130	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,6:0,15:0,0,18,3
chr20	8770282	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:3,4:3,3:2,5,0,7
chr20	8770932	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,24:0.440:55:15,8:15,16:5,26,4,20
chr20	8773155	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:12,0,7,1
chr20	8773295	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=136.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,19:0,0,10,35
chr20	8782901	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr20	9360833	.	T	TA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.113:38:17,0:15,4:2,32,0,4
chr20	9364799	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=128,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:4,9:6,1:8,2,9,1
chr20	9368102	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:1,9:6,3:4,3,9,3
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chr20	9543688	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,0:7,3:0|1:9543681_C_T:9543681:3,7,1,2
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chr20	10030188	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.465:24:6,8:6,3:8,5,6,5
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chr20	10256252	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,4:8,3:2,9,2,5
chr20	10286773	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.420:48:13,11:14,9:21,7,9,11
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chr20	10439014	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=200,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:10439001_ATTT_A:10439001:0,1,0,1
chr20	10621923	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,37;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:2,6,2,1
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chr20	10624603	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=102,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:10624600_T_TCCATTC:10624600:1,0,0,1
chr20	10624924	.	TCACACACA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=237,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=CA;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.518:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr20	10626208	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=90,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10626208_A_T:10626208:0,2,0,1
chr20	10626209	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=90,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10626208_A_T:10626208:0,2,0,1
chr20	10633074	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=134,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.384:15:1,1:2,0:5,4,6,0
chr20	10633313	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
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chr20	11790885	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=75.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,11,8
chr20	11791094	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,3:0,3:0,3,2,4
chr20	11830180	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr20	11898940	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=231,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr20	11900450	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,68;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:12,3:19,0:16,15,3,0
chr20	12989901	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:2,2,4,2
chr20	12990044	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr20	12990057	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=166,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr20	13029764	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,1,18
chr20	13029790	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.378:13:4,4:4,0:1,7,0,5
chr20	13029862	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	13071871	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:7,7:9,10:4,12,3,14
chr20	13074235	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.291:22:6,3:9,3:0|1:13074235_G_A:13074235:4,12,2,4
chr20	13074243	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:6,2:10,2:0|1:13074235_G_A:13074235:4,13,1,3
chr20	13145150	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=196,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:13145150_A_C:13145150:0,2,0,1
chr20	13145155	.	C	CGCGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=184,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13145150_A_C:13145150:0,1,0,1
chr20	13260252	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:4,1,5,0
chr20	13260299	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:8,3,0,2
chr20	13464030	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,7:0,12:0,0,1,19
chr20	13509263	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr20	13561632	.	T	TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=10,10;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.637:6:0,0:0,0:0,2,0,4
chr20	13695464	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr20	13695680	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,25:0.439:57:10,13:22,11:11,21,10,15
chr20	13695824	.	CA	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.278:32:5,2:16,5:5,18,2,7
chr20	13698006	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=94.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,17:0,10:0,0,19,9
chr20	13747441	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,2:7,5:8,3,5,2
chr20	13750766	.	TTT	ACC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=231,283;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	13755728	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	13765942	.	CCCGCGGGG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr20	13769127	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,3:1,4:3,0,7,0
chr20	13775519	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:4,3:11,0:9,7,2,1
chr20	13775676	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=170,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:13775676_C_T:13775676:0,5,0,2
chr20	13775686	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=177,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:13775676_C_T:13775676:0,4,0,1
chr20	13775688	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=177,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:13775676_C_T:13775676:0,4,0,1
chr20	13782409	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr20	13830102	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,3:6,7:13,1,9,1
chr20	13830137	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:11,5:9,7:15,5,8,4
chr20	13845987	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,15,6
chr20	13846191	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=65,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr20	13868745	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	13971235	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:3,2:0,1:1,3,2,2
chr20	13976323	.	C	CCG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.773:2:0,0:0,2:0|1:13976323_C_CCG:13976323:0,0,2,0
chr20	13976325	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=254,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,1:0|1:13976323_C_CCG:13976323:1,0,2,0
chr20	13976329	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:0|1:13976323_C_CCG:13976323:2,0,2,0
chr20	13976334	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=159,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:13976323_C_CCG:13976323:5,0,2,0
chr20	14066168	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=227,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr20	15480308	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr20	15480548	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr20	15948338	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,52;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15948338_A_AG:15948338:0,0,0,1
chr20	15948345	.	A	ATATATATATAGCACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15948338_A_AG:15948338:0,0,0,1
chr20	15967533	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:0,1,0,9
chr20	16359356	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,3:2,3:4,0,7,0
chr20	16474864	.	TA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.451:22:6,5:6,4:12,0,9,1
chr20	16553754	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr20	16712280	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.481:46:7,16:16,6:20,4,21,1
chr20	16712719	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,2:5,0,5,0
chr20	16729016	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,2:4,8:6,1,9,1
chr20	16729048	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:5,2:9,14:11,3,10,6
chr20	16729654	.	A	AAGATG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=120,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,2:4,6,0,6
chr20	17341381	.	A	AATGGTATTAGTTTGGTGTTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,2:6,0:0,7,0,2
chr20	17436895	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr20	17474690	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=118,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.254:26:9,4:8,2:15,5,6,0
chr20	17477751	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,2:6,4:0,6,0,6
chr20	17479458	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,3:8,0:8,4,3,0
chr20	17479730	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,3:3,5:0,4,2,6
chr20	17479763	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.607:11:1,4:3,3:0,4,0,7
chr20	17492755	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr20	17594714	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr20	17595329	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr20	17596731	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	17597331	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	17597361	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr20	17597581	.	T	TTGTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	17599214	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,9,3
chr20	17600295	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:5,1,6,3
chr20	17602028	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	17674451	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr20	17948894	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr20	17949124	.	GGCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr20	17950772	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=135,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.436:28:7,6:8,6:9,7,5,7
chr20	18022171	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr20	18038119	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:18038119_G_C:18038119:0,0,2,0
chr20	18038122	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:18038119_G_C:18038119:0,0,2,0
chr20	18038127	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=100,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:18038119_G_C:18038119:1,0,2,0
chr20	18038134	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=100,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:18038119_G_C:18038119:1,0,2,0
chr20	18142668	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=118,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,25:0.411:61:18,11:18,13:20,16,15,10
chr20	18286888	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,2:6,4:10,0,6,0
chr20	18287450	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:0,6,0,5
chr20	18296072	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:18296072_T_A:18296072:0,0,4,5
chr20	18296076	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:0|1:18296072_T_A:18296072:3,3,1,2
chr20	18365753	.	TCC	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=171,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,2:1,0:0|1:18365753_TCC_T:18365753:0,3,1,1
chr20	18365756	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,18;MFRL=171,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:18365753_TCC_T:18365753:0,3,1,1
chr20	18365761	.	A	AGACATGCT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=171,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:18365753_TCC_T:18365753:0,3,1,1
chr20	18365765	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=171,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:18365753_TCC_T:18365753:0,3,1,1
chr20	18365768	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=171,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:18365753_TCC_T:18365753:0,3,1,1
chr20	18365770	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=171,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:18365753_TCC_T:18365753:0,3,1,1
chr20	18365774	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=171,48;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:18365753_TCC_T:18365753:0,3,0,1
chr20	18393275	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:3,5:8,9:8,3,9,5
chr20	18393312	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,15:0,0,15,12
chr20	18393499	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,10:0,21:0,0,7,24
chr20	18435913	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,2:7,2:7,9,3,1
chr20	18446024	.	C	A,CTA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30,36;MFRL=146,107,52;MMQ=60,60,60;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=21.03,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,2:0.666,0.216:10:0,2,1:1,5,1:0,1,2,7
chr20	18446050	.	A	ATGTGCACTTATAGC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,2:0,0,0,11
chr20	18448079	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,23,3
chr20	18460614	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr20	18460641	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.511:12:1,3:5,3:6,0,4,2
chr20	18461237	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.909:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr20	18462492	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr20	18462518	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr20	18464110	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr20	18470664	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,3:0,9:0,0,6,7
chr20	18470980	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,13:0,0,23,4
chr20	18474566	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.733:12:0,2:2,7:2,1,4,5
chr20	18477614	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr20	18477870	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr20	18496339	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:9,5:5,6:9,5,6,5
chr20	18505403	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	18505563	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:14,1:6,2:21,1,2,1
chr20	18506616	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=84.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,9:0,0,0,19
chr20	18511456	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=113.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,13:0,14:0,0,23,14
chr20	18511458	.	CT	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.262:24:6,4:6,1:8,10,3,3
chr20	18511504	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr20	18513373	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=132,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:27,4:27,0:29,28,3,1
chr20	18523864	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,14:0,17:0,0,4,27
chr20	18576912	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr20	18608945	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr20	19560555	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr20	19677598	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,1,0
chr20	19867265	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:1,0:4,2:3,2,2,0
chr20	19955585	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,1,0
chr20	20003200	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=8231227,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:20003200_CA_C:20003200:0,2,0,1
chr20	20003202	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=8231227,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:20003200_CA_C:20003200:0,2,0,1
chr20	20003206	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=8231227,168;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:20003200_CA_C:20003200:0,2,0,1
chr20	20006450	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=154,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr20	20033423	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.597:20:2,7:5,5:2,6,2,10
chr20	20036565	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,86;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,2:10,1:16,4,3,0
chr20	20037222	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr20	20037454	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,7:2,3:2,6,2,8
chr20	20071634	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:6,5:10,10:6,10,4,12
chr20	20079251	.	C	CA,CAAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33,18;MFRL=62,151,143;MMQ=60,50,60;MPOS=18,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,20,24;RU=A;STR;TLOD=4.72,20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,7:0.299,0.535:13:0,3,0:1,1,1:1,1,5,6
chr20	20123619	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=129,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.386:18:6,0:4,0:0|1:20123619_A_T:20123619:4,7,0,7
chr20	20123623	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=117,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.340:15:2,0:2,1:0|1:20123619_A_T:20123619:4,6,0,5
chr20	20139951	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr20	20140196	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr20	20150182	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr20	20152372	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr20	20152581	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr20	20168497	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr20	20243527	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=146,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr20	20243562	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,0:1,2:3,0,3,0
chr20	20269631	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr20	20377421	.	A	AC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=68.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.964:22:0,10:0,10:0,0,9,13
chr20	20601345	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	20601357	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20601357_C_A:20601357:0,1,0,1
chr20	20601360	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20601357_C_A:20601357:0,1,0,1
chr20	21106854	.	A	ACATGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:21106854_A_ACATGC:21106854:2,1,0,1
chr20	21106859	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:21106854_A_ACATGC:21106854:2,1,0,1
chr20	21117240	.	GT	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.340:23:5,3:4,1:1,14,0,8
chr20	21126194	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:9,8:8,12:14,4,15,5
chr20	21142813	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:4,3,1,7
chr20	21143189	.	TGGTA	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=210,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21143189_TGGTA_T:21143189:0,3,0,1
chr20	21143196	.	G	GCGTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=210,208;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21143189_TGGTA_T:21143189:0,3,0,1
chr20	21143197	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=210,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21143189_TGGTA_T:21143189:0,3,0,1
chr20	21143201	.	T	TGTTAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=210,208;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21143189_TGGTA_T:21143189:0,3,0,1
chr20	21143219	.	ACT	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=210,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	21186161	.	A	AG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=53.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,11,7
chr20	21227314	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	21307107	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.395:41:7,7:18,9:18,7,10,6
chr20	21312325	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:7,11:5,5:2,10,3,13
chr20	21313109	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.679:10:0,1:2,5:0,3,0,7
chr20	21314142	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=131,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:17,0:24,4:23,18,2,2
chr20	21319828	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr20	21321294	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr20	21328715	.	GT	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=102.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,17:0,17:0,0,33,3
chr20	21330114	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=107,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:5,5:7,4:6,7,2,7
chr20	21336825	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.343:30:11,3:9,7:6,14,5,5
chr20	21346441	.	TATATA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATATA;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.778:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	21362703	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr20	21362758	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr20	21367741	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=262,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr20	21377059	.	TGCC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,14;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCC;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,0:0,0:0,2,0,1
chr20	21687039	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	22562674	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.652:18:2,7:3,5:5,1,9,3
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chr20	23016970	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:4,3:3,6:2,6,1,8
chr20	23017017	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=188,91;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,5:2,4:6,2,4,5
chr20	23064810	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	23065342	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,19:0,7:0,0,12,14
chr20	23066362	.	GCGGC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23066362_GCGGC_G:23066362:0,1,0,1
chr20	23066368	.	G	GACAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23066362_GCGGC_G:23066362:0,1,0,1
chr20	23066371	.	A	ACGAGACTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:23066362_GCGGC_G:23066362:0,1,0,1
chr20	23347553	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr20	23349607	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,3:4,7:0,8,0,10
chr20	23360171	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:0,5,0,9
chr20	23375907	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr20	23401904	.	ACCCC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,8;RU=C;STR;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,0:0,0,6,1
chr20	23433317	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.528:32:3,5:12,11:8,7,7,10
chr20	23476412	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:2,2:5,1,3,0
chr20	23528536	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.411:10:2,1:3,2:1,5,0,4
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chr20	23529388	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=147,136;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:7,1,5,1
chr20	23529418	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,5:5,6:7,2,9,2
chr20	23531276	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	23546639	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,139;MMQ=60,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.589:22:2,5:6,8:2,7,5,8
chr20	23548774	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr20	23584116	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,10,2
chr20	23586184	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr20	23666690	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,217;MMQ=27,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr20	23667657	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=143,199;MMQ=60,38;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,4:3,2:9,1,5,1
chr20	23669451	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=124,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.485:20:6,2:4,5:4,6,4,6
chr20	23669630	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr20	23669636	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=168,174;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:23669636_GA_G:23669636:0,2,0,1
chr20	23669641	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=168,174;MMQ=40,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:23669636_GA_G:23669636:0,2,0,1
chr20	23728612	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=121,168;MMQ=52,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:1,4,0,2
chr20	23728628	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=158,76;MMQ=53,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:23728628_G_A:23728628:0,2,0,1
chr20	23728630	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,29;MFRL=158,76;MMQ=53,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:23728628_G_A:23728628:0,2,0,1
chr20	23728641	.	C	CTTATTA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=36,34;MFRL=172,165;MMQ=56,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:23728641_C_CTTATTA:23728641:0,2,0,1
chr20	23728643	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=172,165;MMQ=56,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:23728641_C_CTTATTA:23728641:0,2,0,1
chr20	23728644	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=172,165;MMQ=56,54;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:23728641_C_CTTATTA:23728641:0,2,0,1
chr20	23729555	.	G	GCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CA;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr20	23731560	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	23805832	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,9,5
chr20	23807028	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr20	23858334	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	23966672	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,9;MFRL=183,169;MMQ=25,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.313:10:2,0:2,0:0|1:23966672_T_G:23966672:0,7,3,0
chr20	23966674	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=183,169;MMQ=25,47;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.316:10:5,0:2,0:0|1:23966672_T_G:23966672:0,7,3,0
chr20	23966675	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=183,169;MMQ=25,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.316:10:5,0:2,0:0|1:23966672_T_G:23966672:0,7,3,0
chr20	23966677	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=183,169;MMQ=25,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.315:10:5,1:2,0:0|1:23966672_T_G:23966672:0,7,3,0
chr20	24524218	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	24524245	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	24565670	.	T	TTTGGTTTTCTGTGGGGAAGAGTGAAGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0,2,0,1
chr20	24645939	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:5,2:3,4:6,3,3,3
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chr20	25288505	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
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chr20	25657773	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr20	25829292	.	C	T	.	.	DP=98;ECNT=12;MBQ=33,27;MFRL=132,133;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,25:0.273:94:31,15:38,9:42,27,17,8
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chr20	25829342	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=12;MBQ=32,34;MFRL=140,168;MMQ=60,30;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,21:0.289:74:22,12:31,8:0|1:25829342_T_C:25829342:32,21,5,16
chr20	25829352	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=12;MBQ=29,28;MFRL=140,168;MMQ=55,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=74.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,21:0.293:73:19,11:32,9:0|1:25829342_T_C:25829342:30,22,5,16
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chr20	25829435	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=34,32;MFRL=166,182;MMQ=40,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.249:38:16,6:13,3:1,28,3,6
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chr20	25829470	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=181,187;MMQ=50,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:9,3:10,3:4,15,0,6
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chr20	26062021	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=152,147;MMQ=40,24;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,7:0.182:42:21,4:12,3:0|1:26062002_G_C:26062002:15,20,6,1
chr20	26062036	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=154,136;MMQ=40,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,9:0.233:41:16,5:13,3:0|1:26062002_G_C:26062002:11,21,5,4
chr20	26062047	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=154,135;MMQ=40,28;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,14:0.326:44:16,4:12,4:0|1:26062002_G_C:26062002:11,19,7,7
chr20	26062051	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=155,133;MMQ=40,28;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,13:0.318:42:13,3:11,6:0|1:26062002_G_C:26062002:10,19,5,8
chr20	26062057	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=134,136;MMQ=57,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,15:0.400:38:14,4:9,8:0|1:26062002_G_C:26062002:7,16,3,12
chr20	26062078	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=137,143;MMQ=60,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,20:0.457:44:13,9:7,10:0|1:26062002_G_C:26062002:7,17,5,15
chr20	26062097	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=139,147;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=73.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,19:0.590:32:8,7:4,10:0|1:26062002_G_C:26062002:3,10,5,14
chr20	26062105	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=35,33;MFRL=149,147;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.498:30:9,7:6,7:4,11,4,11
chr20	26063625	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=125,115;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:12,3:17,1:0|1:26063625_T_C:26063625:12,17,2,2
chr20	26063643	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=127,115;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:10,3:13,1:0|1:26063625_T_C:26063625:8,17,2,2
chr20	26063645	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=127,115;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:8,3:13,1:0|1:26063625_T_C:26063625:7,17,2,2
chr20	29623103	.	G	A	.	.	DP=116;ECNT=11;MBQ=34,33;MFRL=155,165;MMQ=40,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=129.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,38:0.332:115:34,13:38,20:64,13,38,0
chr20	29623110	.	TATCA	T	.	.	DP=139;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=158,154;MMQ=30,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:123,8:0.068:131:51,3:62,4:109,14,8,0
chr20	29623113	.	CA	C	.	.	DP=138;ECNT=11;MBQ=34,34;MFRL=160,155;MMQ=30,32;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:107,14:0.121:121:48,5:56,9:93,14,14,0
chr20	29623115	.	A	T	.	.	DP=141;ECNT=11;MBQ=32,31;MFRL=158,184;MMQ=30,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,20:0.148:137:51,8:61,11:101,16,20,0
chr20	29623139	.	A	G	.	.	DP=233;ECNT=11;MBQ=31,33;MFRL=152,165;MMQ=30,29;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=243.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:145,78:0.351:223:79,36:65,38:126,19,70,8
chr20	29623143	.	G	T	.	.	DP=257;ECNT=11;MBQ=33,30;MFRL=153,154;MMQ=35,29;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:245,12:0.050:257:124,4:108,8:0|1:29623143_G_T:29623143:212,33,10,2
chr20	29623147	.	C	T	.	.	DP=273;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=152,174;MMQ=36,35;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:240,30:0.108:270:114,13:106,16:197,43,28,2
chr20	29623156	.	G	A	.	.	DP=294;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=146,155;MMQ=40,29;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:256,29:0.103:285:118,14:123,15:196,60,28,1
chr20	29623159	.	A	G	.	.	DP=304;ECNT=11;MBQ=31,34;MFRL=148,140;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=124.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:248,47:0.161:295:124,22:119,25:193,55,35,12
chr20	29623164	.	T	C	.	.	DP=309;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=145,123;MMQ=40,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:295,14:0.046:309:144,8:137,6:0|1:29623143_G_T:29623143:217,78,9,5
chr20	29623179	.	A	T	.	.	DP=344;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=141,129;MMQ=40,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:325,14:0.039:339:158,7:150,7:0|1:29623143_G_T:29623143:227,98,8,6
chr20	29623209	.	G	C	.	.	DP=353;ECNT=20;MBQ=33,33;MFRL=132,141;MMQ=35,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:329,13:0.038:342:155,4:159,8:178,151,8,5
chr20	29623210	.	C	T	.	.	DP=352;ECNT=20;MBQ=33,27;MFRL=133,130;MMQ=35,26;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:306,32:0.096:338:149,11:144,21:0|1:29623210_C_T:29623210:164,142,20,12
chr20	29623214	.	C	T	.	.	DP=350;ECNT=20;MBQ=29,32;MFRL=131,130;MMQ=31,46;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:326,14:0.043:340:150,5:149,8:0|1:29623214_C_T:29623214:158,168,7,7
chr20	29623215	.	G	A	.	.	DP=352;ECNT=20;MBQ=29,32;MFRL=132,124;MMQ=35,24;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:315,16:0.050:331:150,7:150,9:145,170,12,4
chr20	29623217	.	C	T	.	.	DP=348;ECNT=20;MBQ=33,30;MFRL=131,128;MMQ=35,25;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:304,25:0.072:329:134,15:150,6:140,164,16,9
chr20	29623218	.	A	G	.	.	DP=351;ECNT=20;MBQ=31,30;MFRL=132,128;MMQ=34,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:312,23:0.070:335:140,16:154,7:146,166,9,14
chr20	29623219	.	A	G	.	.	DP=352;ECNT=20;MBQ=31,33;MFRL=131,148;MMQ=29,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:329,10:0.031:339:152,4:156,6:152,177,3,7
chr20	29623223	.	T	C	.	.	DP=354;ECNT=20;MBQ=29,33;MFRL=133,130;MMQ=27,38;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=173.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:250,80:0.243:330:118,38:108,41:112,138,32,48
chr20	29623224	.	C	A	.	.	DP=354;ECNT=20;MBQ=33,30;MFRL=134,128;MMQ=30,25;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:310,28:0.085:338:147,12:135,15:0|1:29623210_C_T:29623210:132,178,13,15
chr20	29623231	.	C	T	.	.	DP=334;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=134,95;MMQ=27,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:318,9:0.029:327:148,4:146,5:122,196,3,6
chr20	29623233	.	C	G	.	.	DP=349;ECNT=20;MBQ=33,31;MFRL=135,124;MMQ=27,24;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:340,9:0.028:349:149,4:145,5:0|1:29623214_C_T:29623214:125,215,3,6
chr20	29623248	.	AAAG	A	.	.	DP=343;ECNT=20;MBQ=31,31;MFRL=142,138;MMQ=29,27;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=340.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:216,102:0.322:318:99,47:100,52:53,163,21,81
chr20	29623249	.	AA	GT	.	.	DP=335;ECNT=20;MBQ=31,32;MFRL=134,142;MMQ=27,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:250,8:0.034:258:112,5:110,3:0|1:29623249_AA_GT:29623249:71,179,0,8
chr20	29623251	.	G	GA	.	.	DP=331;ECNT=20;MBQ=33,33;MFRL=134,133;MMQ=29,24;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:233,15:0.055:248:112,8:107,6:0|1:29623214_C_T:29623214:63,170,3,12
chr20	29623254	.	G	A	.	.	DP=338;ECNT=20;MBQ=32,31;MFRL=142,150;MMQ=29,39;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:307,29:0.089:336:147,13:141,16:0|1:29623254_G_A:29623254:71,236,5,24
chr20	29623257	.	TTG	T	.	.	DP=351;ECNT=20;MBQ=32,33;MFRL=142,151;MMQ=30,41;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:316,19:0.057:335:151,8:142,11:68,248,1,18
chr20	29623260	.	TG	CC	.	.	DP=346;ECNT=20;MBQ=31,33;MFRL=146,149;MMQ=39,29;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:331,11:0.034:342:149,7:154,4:0|1:29623249_AA_GT:29623249:68,263,0,11
chr20	29623263	.	C	T	.	.	DP=341;ECNT=20;MBQ=33,32;MFRL=147,155;MMQ=40,41;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:302,33:0.100:335:146,12:144,20:0|1:29623254_G_A:29623254:57,245,5,28
chr20	29623300	.	G	T	.	.	DP=181;ECNT=20;MBQ=34,31;MFRL=151,162;MMQ=47,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:167,12:0.068:179:72,5:89,6:15,152,1,11
chr20	29623321	.	AA	GG	.	.	DP=84;ECNT=20;MBQ=31,32;MFRL=159,157;MMQ=48,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,8:0.112:78:24,7:40,1:5,65,0,8
chr20	29623922	.	G	A	.	.	DP=143;ECNT=11;MBQ=35,31;MFRL=154,146;MMQ=23,23;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,6:0.049:136:62,2:64,4:118,12,6,0
chr20	29623943	.	C	A	.	.	DP=199;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=157,93;MMQ=33,23;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:181,7:0.040:188:77,5:101,2:156,25,5,2
chr20	29623955	.	G	A	.	.	DP=249;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=150,140;MMQ=35,23;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:227,18:0.076:245:96,9:120,9:179,48,14,4
chr20	29623957	.	C	A,G	.	.	DP=263;ECNT=11;MBQ=32,31,27;MFRL=151,157,155;MMQ=27,43,40;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=69.36,35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:190,33,22:0.131,0.088:245:80,17,10:105,14,11:137,53,53,2
chr20	29623960	.	AT	A	.	.	DP=296;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=150,165;MMQ=35,27;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=182.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:193,69:0.264:262:83,34:99,35:146,47,53,16
chr20	29623980	.	G	A	.	.	DP=339;ECNT=11;MBQ=34,30;MFRL=153,118;MMQ=40,23;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:297,29:0.090:326:139,15:154,14:220,77,9,20
chr20	29623988	.	A	G	.	.	DP=345;ECNT=11;MBQ=30,34;MFRL=147,176;MMQ=40,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:308,25:0.077:333:145,11:159,14:209,99,12,13
chr20	29624020	.	G	GT	.	.	DP=375;ECNT=11;MBQ=34,33;MFRL=138,140;MMQ=51,53;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=222.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:181,119:0.392:300:82,55:95,62:101,80,68,51
chr20	29624034	.	A	AG	.	.	DP=341;ECNT=11;MBQ=30,26;MFRL=137,144;MMQ=54,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:301,11:0.022:312:136,6:148,3:155,146,7,4
chr20	29624068	.	T	C	.	.	DP=426;ECNT=11;MBQ=30,32;MFRL=144,181;MMQ=51,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:400,13:0.033:413:192,6:200,7:184,216,13,0
chr20	29624070	.	G	A	.	.	DP=432;ECNT=11;MBQ=32,29;MFRL=147,137;MMQ=51,51;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:344,60:0.145:404:170,28:171,28:167,177,25,35
chr20	29624093	.	G	T	.	.	DP=494;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=150,182;MMQ=40,29;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:445,42:0.082:487:202,24:233,16:198,247,17,25
chr20	29624102	.	T	A	.	.	DP=487;ECNT=13;MBQ=31,32;MFRL=154,164;MMQ=40,38;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:422,50:0.105:472:197,20:216,30:187,235,18,32
chr20	29624127	.	TA	GT,GA	.	.	DP=338;ECNT=13;MBQ=31,34,35;MFRL=154,181,181;MMQ=40,40,29;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=65.15,17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:274,27,13:0.087,0.041:314:132,16,7:137,11,6:94,180,26,14
chr20	29624158	.	A	T	.	.	DP=170;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=153,159;MMQ=41,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=87.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:122,32:0.212:154:51,19:63,13:20,102,4,28
chr20	29624164	.	G	C	.	.	DP=140;ECNT=13;MBQ=33,33;MFRL=155,152;MMQ=42,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,9:0.071:139:57,6:65,2:18,112,1,8
chr20	29624166	.	G	A	.	.	DP=139;ECNT=13;MBQ=33,33;MFRL=152,160;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=203.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,56:0.413:136:34,23:41,26:10,70,8,48
chr20	29624170	.	G	A	.	.	DP=125;ECNT=13;MBQ=33,32;MFRL=155,169;MMQ=48,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:119,6:0.055:125:50,3:61,3:14,105,1,5
chr20	29624177	.	GG	AC	.	.	DP=154;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=161,171;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,25:0.189:136:47,12:54,12:12,99,2,23
chr20	29624178	.	G	C	.	.	DP=153;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=154,173;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=135.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,61:0.469:129:33,25:35,28:6,62,8,53
chr20	29624180	.	C	T	.	.	DP=158;ECNT=13;MBQ=34,30;MFRL=165,175;MMQ=60,32;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:135,18:0.117:153:59,10:68,8:11,124,3,15
chr20	29624182	.	T	C	.	.	DP=156;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=165,174;MMQ=60,29;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:144,12:0.082:156:64,6:71,5:0|1:29624182_T_C:29624182:13,131,1,11
chr20	29624191	.	T	A	.	.	DP=163;ECNT=13;MBQ=32,32;MFRL=170,179;MMQ=57,29;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:146,12:0.081:158:71,5:72,7:0|1:29624182_T_C:29624182:11,135,0,12
chr20	29624205	.	A	G	.	.	DP=166;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=173,169;MMQ=48,29;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:153,13:0.083:166:68,11:83,2:7,146,1,12
chr20	29625788	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=162,150;MMQ=43,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,27:0.564:48:10,13:11,13:18,3,22,5
chr20	29625817	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=154,154;MMQ=40,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,5:0.088:66:26,2:32,3:0|1:29625817_T_C:29625817:50,11,5,0
chr20	29625832	.	T	C	.	.	DP=105;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=164,165;MMQ=44,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,13:0.137:101:36,5:40,8:0|1:29625817_T_C:29625817:72,16,13,0
chr20	29625838	.	C	A	.	.	DP=120;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=171,175;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=242.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,72:0.690:106:10,42:22,29:29,5,65,7
chr20	29625852	.	A	G	.	.	DP=156;ECNT=9;MBQ=30,34;MFRL=156,187;MMQ=48,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:134,21:0.140:155:59,15:70,5:0|1:29625852_A_G:29625852:108,26,20,1
chr20	29625855	.	T	C	.	.	DP=172;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=156,187;MMQ=49,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:145,21:0.131:166:63,15:72,5:0|1:29625852_A_G:29625852:115,30,20,1
chr20	29625873	.	A	C	.	.	DP=225;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=154,151;MMQ=54,48;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:186,33:0.153:219:86,18:88,15:137,49,20,13
chr20	29625876	.	C	T	.	.	DP=230;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=152,160;MMQ=54,48;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=226.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:149,75:0.337:224:68,39:74,35:108,41,50,25
chr20	29625877	.	G	A	.	.	DP=231;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=150,157;MMQ=55,43;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=228.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:139,87:0.380:226:66,38:70,37:88,51,71,16
chr20	29625925	.	C	CTTG	.	.	DP=200;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=129,152;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTG;STR;TLOD=288.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,78:0.540:144:28,33:35,35:35,31,46,32
chr20	29625979	.	C	A	.	.	DP=213;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=157,153;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:168,44:0.207:212:73,19:89,23:60,108,20,24
chr20	29625984	.	TG	CC	.	.	DP=233;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=158,147;MMQ=40,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:196,28:0.128:224:84,14:99,14:69,127,10,18
chr20	29625997	.	A	T	.	.	DP=216;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=153,165;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=268.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:125,87:0.413:212:47,41:63,46:0|1:29625997_A_T:29625997:41,84,32,55
chr20	29626013	.	T	C	.	.	DP=176;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=160,158;MMQ=40,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=156.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:125,47:0.276:172:52,22:60,20:1|0:29625997_A_T:29625997:32,93,13,34
chr20	29626021	.	G	A	.	.	DP=146;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=157,161;MMQ=40,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=120.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:108,37:0.257:145:41,15:60,19:1|0:29625997_A_T:29625997:25,83,7,30
chr20	29626025	.	A	C	.	.	DP=147;ECNT=9;MBQ=32,35;MFRL=161,142;MMQ=45,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:134,6:0.043:140:60,2:74,4:0|1:29626025_A_C:29626025:28,106,1,5
chr20	29626027	.	C	T	.	.	DP=150;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=159,165;MMQ=40,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,42:0.296:143:44,18:54,23:19,82,9,33
chr20	29626029	.	G	C	.	.	DP=152;ECNT=9;MBQ=34,35;MFRL=159,142;MMQ=49,38;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:139,8:0.054:147:63,2:75,6:0|1:29626025_A_C:29626025:27,112,1,7
chr20	29628164	.	G	A	.	.	DP=107;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=134,126;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=206.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,63:0.666:94:19,35:11,24:27,4,61,2
chr20	29628167	.	C	T	.	.	DP=123;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=134,127;MMQ=45,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,18:0.163:114:58,9:35,9:83,13,15,3
chr20	29628177	.	C	T	.	.	DP=176;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=131,121;MMQ=45,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:164,12:0.073:176:95,6:64,6:0|1:29628177_C_T:29628177:136,28,9,3
chr20	29628185	.	A	G	.	.	DP=209;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=132,121;MMQ=41,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:187,12:0.065:199:105,6:81,6:0|1:29628177_C_T:29628177:155,32,9,3
chr20	29628216	.	G	C	.	.	DP=305;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=131,114;MMQ=40,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:277,21:0.071:298:151,10:121,11:193,84,13,8
chr20	29628225	.	AG	A	.	.	DP=316;ECNT=16;MBQ=30,30;MFRL=129,108;MMQ=40,45;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:278,19:0.056:297:143,10:126,9:171,107,12,7
chr20	29628226	.	G	A	.	.	DP=315;ECNT=16;MBQ=33,20;MFRL=132,119;MMQ=40,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:270,35:0.116:305:139,19:125,15:174,96,17,18
chr20	29628229	.	G	GA	.	.	DP=316;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=131,124;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:272,17:0.055:289:136,7:128,10:166,106,10,7
chr20	29628237	.	C	A	.	.	DP=310;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=131,117;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:245,49:0.167:294:111,26:119,23:132,113,33,16
chr20	29628241	.	G	C	.	.	DP=288;ECNT=16;MBQ=32,20;MFRL=130,127;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:261,15:0.058:276:119,7:132,8:0|1:29628241_G_C:29628241:131,130,10,5
chr20	29628243	.	T	C	.	.	DP=275;ECNT=16;MBQ=31,20;MFRL=131,127;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:260,15:0.058:275:116,7:129,8:0|1:29628241_G_C:29628241:126,134,10,5
chr20	29628251	.	A	G	.	.	DP=268;ECNT=16;MBQ=31,32;MFRL=131,135;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:250,12:0.048:262:112,4:120,7:115,135,4,8
chr20	29628257	.	T	C	.	.	DP=274;ECNT=16;MBQ=31,26;MFRL=133,139;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:254,20:0.076:274:106,9:117,8:0|1:29628241_G_C:29628241:105,149,10,10
chr20	29628271	.	C	T	.	.	DP=229;ECNT=16;MBQ=34,30;MFRL=140,140;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=340.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,115:0.525:219:51,55:52,56:35,69,28,87
chr20	29628273	.	A	G	.	.	DP=231;ECNT=16;MBQ=31,33;MFRL=143,139;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:216,15:0.069:231:98,6:95,8:0|1:29628241_G_C:29628241:61,155,5,10
chr20	29628274	.	TGAAGCAGGGGACATAGAA	T	.	.	DP=254;ECNT=16;MBQ=31,31;MFRL=147,140;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:238,14:0.059:252:98,6:97,8:0|1:29628241_G_C:29628241:73,165,4,10
chr20	29628335	.	A	T	.	.	DP=107;ECNT=16;MBQ=30,32;MFRL=156,166;MMQ=52,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=94.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,34:0.345:100:34,19:31,15:0|1:29628335_A_T:29628335:20,46,15,19
chr20	29628341	.	C	A	.	.	DP=88;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=147,165;MMQ=57,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=115.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,35:0.437:81:21,17:22,14:11,35,16,19
chr20	29628361	.	A	C	.	.	DP=66;ECNT=16;MBQ=32,34;MFRL=146,165;MMQ=57,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,25:0.394:64:18,9:19,15:0|1:29628335_A_T:29628335:7,32,6,19
chr20	29628415	.	T	A	.	.	DP=85;ECNT=16;MBQ=32,32;MFRL=171,156;MMQ=40,38;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,14:0.178:82:32,3:36,11:7,61,3,11
chr20	29628431	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=16;MBQ=35,30;MFRL=167,172;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=172.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,52:0.792:65:3,23:10,25:3,10,6,46
chr20	29631584	.	CAGA	C,AAGA	.	.	DP=161;ECNT=13;MBQ=34,32,31;MFRL=164,186,169;MMQ=27,27,27;MPOS=15,6;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.65,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:113,7,4:0.060,0.034:124:59,5,4:46,2,0:63,50,10,1
chr20	29631604	.	G	A	.	.	DP=171;ECNT=13;MBQ=34,32;MFRL=165,184;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:154,12:0.077:166:84,10:68,2:94,60,12,0
chr20	29631613	.	TG	CA	.	.	DP=170;ECNT=13;MBQ=31,33;MFRL=165,178;MMQ=27,26;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:157,8:0.054:165:90,4:62,4:102,55,8,0
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chr20	29631632	.	A	G	.	.	DP=143;ECNT=13;MBQ=31,37;MFRL=165,182;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:130,13:0.096:143:77,10:47,2:0|1:29631627_T_C:29631627:85,45,13,0
chr20	29631638	.	G	T	.	.	DP=138;ECNT=13;MBQ=34,32;MFRL=165,162;MMQ=27,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,5:0.043:135:72,4:46,1:87,43,5,0
chr20	29631658	.	A	G	.	.	DP=85;ECNT=13;MBQ=31,26;MFRL=153,161;MMQ=26,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,5:0.064:81:43,2:32,2:49,27,5,0
chr20	29631702	.	T	C	.	.	DP=121;ECNT=13;MBQ=30,35;MFRL=163,161;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:108,9:0.075:117:58,5:46,4:16,92,1,8
chr20	29631704	.	C	T	.	.	DP=122;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=165,135;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,19:0.163:120:52,12:43,7:9,92,8,11
chr20	29631715	.	G	T	.	.	DP=130;ECNT=13;MBQ=33,20;MFRL=170,130;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,12:0.095:129:68,8:46,4:8,109,5,7
chr20	29631725	.	T	G	.	.	DP=127;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=174,165;MMQ=57,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=382.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,105:0.831:126:14,59:6,40:4,17,5,100
chr20	29631733	.	CT	AT,AC	.	.	DP=126;ECNT=13;MBQ=33,30,28;MFRL=171,169,193;MMQ=27,27,25;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=98.89,19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:71,45,9:0.358,0.077:125:39,26,6:26,18,2:5,66,3,51
chr20	29631734	.	T	C	.	.	DP=126;ECNT=13;MBQ=32,27;MFRL=171,154;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,9:0.081:120:67,0:39,7:7,104,0,9
chr20	29632519	.	GA	G	.	.	DP=58;ECNT=12;MBQ=35,35;MFRL=162,204;MMQ=60,29;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,12:0.254:49:12,6:23,6:33,4,12,0
chr20	29632543	.	T	C	.	.	DP=112;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=172,179;MMQ=37,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,19:0.183:107:39,8:48,11:75,13,18,1
chr20	29632545	.	A	T	.	.	DP=126;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=172,176;MMQ=31,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:121,5:0.047:126:47,2:60,1:0|1:29632545_A_T:29632545:105,16,3,2
chr20	29632551	.	A	G	.	.	DP=154;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=168,174;MMQ=29,34;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:144,8:0.058:152:67,4:74,4:0|1:29632545_A_T:29632545:125,19,5,3
chr20	29632554	.	G	A	.	.	DP=177;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=167,176;MMQ=31,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:145,23:0.140:168:64,11:73,12:123,22,23,0
chr20	29632564	.	G	A	.	.	DP=281;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=140,163;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=684.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,209:0.781:267:26,84:32,118:39,19,194,15
chr20	29632569	.	CAG	C	.	.	DP=361;ECNT=12;MBQ=34,33;MFRL=152,163;MMQ=40,37;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:342,13:0.039:355:126,6:161,7:290,52,13,0
chr20	29632583	.	T	C	.	.	DP=450;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=148,159;MMQ=40,26;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:425,14:0.033:439:194,7:221,7:349,76,12,2
chr20	29632593	.	A	G	.	.	DP=528;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=143,146;MMQ=40,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=127.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:457,60:0.116:517:215,26:235,31:355,102,52,8
chr20	29632632	.	A	G	.	.	DP=577;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=135,140;MMQ=49,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:521,38:0.067:559:263,16:241,22:318,203,34,4
chr20	29632635	.	C	G	.	.	DP=587;ECNT=12;MBQ=32,33;MFRL=135,149;MMQ=49,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:546,17:0.016:563:269,7:248,10:336,210,14,3
chr20	29632638	.	C	A	.	.	DP=595;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=139,133;MMQ=43,50;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=276.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:437,129:0.225:566:216,65:204,60:262,175,78,51
chr20	29632660	.	G	T	.	.	DP=675;ECNT=17;MBQ=34,31;MFRL=144,143;MMQ=51,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=97.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:614,45:0.068:659:281,17:307,24:305,309,24,21
chr20	29632662	.	G	C,T	.	.	DP=685;ECNT=17;MBQ=34,34,31;MFRL=145,140,144;MMQ=57,27,39;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=398.57,82.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:466,140,49:0.214,0.074:655:207,64,22:228,73,27:224,242,97,92
chr20	29632664	.	G	T	.	.	DP=687;ECNT=17;MBQ=33,32;MFRL=144,121;MMQ=51,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:675,7:0.011:682:301,5:327,2:334,341,3,4
chr20	29632673	.	T	C	.	.	DP=712;ECNT=17;MBQ=32,34;MFRL=145,131;MMQ=51,27;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:691,17:0.023:708:319,6:343,10:330,361,3,14
chr20	29632674	.	T	TA	.	.	DP=716;ECNT=17;MBQ=31,31;MFRL=146,142;MMQ=49,57;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=307.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:520,161:0.232:681:232,82:267,76:250,270,74,87
chr20	29632680	.	G	A	.	.	DP=800;ECNT=17;MBQ=33,32;MFRL=144,137;MMQ=51,39;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:731,47:0.058:778:336,22:357,24:326,405,29,18
chr20	29632707	.	G	A	.	.	DP=720;ECNT=17;MBQ=33,31;MFRL=145,146;MMQ=51,49;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=246.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:571,127:0.174:698:276,56:282,68:235,336,57,70
chr20	29632709	.	C	T	.	.	DP=713;ECNT=17;MBQ=28,31;MFRL=146,149;MMQ=51,44;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=279.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:608,94:0.135:702:282,41:283,48:0|1:29632709_C_T:29632709:257,351,29,65
chr20	29632714	.	CT	AG	.	.	DP=644;ECNT=17;MBQ=33,31;MFRL=146,147;MMQ=51,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=264.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:554,85:0.134:639:252,35:261,46:0|1:29632709_C_T:29632709:226,328,26,59
chr20	29632726	.	CTATT	C	.	.	DP=565;ECNT=17;MBQ=33,34;MFRL=143,150;MMQ=51,45;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=545.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:314,161:0.340:475:146,86:151,73:107,207,44,117
chr20	29632749	.	A	G	.	.	DP=412;ECNT=17;MBQ=30,32;MFRL=148,140;MMQ=46,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:356,34:0.088:390:169,19:165,15:80,276,12,22
chr20	29632751	.	T	C	.	.	DP=394;ECNT=17;MBQ=32,35;MFRL=146,137;MMQ=46,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:330,14:0.020:344:159,8:143,6:70,260,5,9
chr20	29632759	.	G	A	.	.	DP=343;ECNT=17;MBQ=33,30;MFRL=152,161;MMQ=45,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:304,24:0.073:328:146,13:143,10:44,260,7,17
chr20	29632761	.	T	C	.	.	DP=338;ECNT=17;MBQ=31,35;MFRL=147,154;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=1099.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,281:0.881:319:19,134:17,135:4,34,39,242
chr20	29632772	.	G	A	.	.	DP=332;ECNT=17;MBQ=33,28;MFRL=156,151;MMQ=49,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:297,26:0.083:323:144,15:139,11:41,256,0,26
chr20	29632784	.	C	G	.	.	DP=316;ECNT=17;MBQ=33,33;MFRL=158,156;MMQ=51,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:284,25:0.047:309:136,10:139,15:41,243,3,22
chr20	29632792	.	C	G	.	.	DP=300;ECNT=17;MBQ=33,32;MFRL=161,151;MMQ=51,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:261,18:0.066:279:122,10:123,8:40,221,2,16
chr20	29633770	.	T	TAA	.	.	DP=17;ECNT=14;MBQ=31,30;MFRL=223,130;MMQ=60,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.551:16:3,3:4,2:0|1:29633770_T_TAA:29633770:7,0,9,0
chr20	29633794	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=14;MBQ=32,33;MFRL=176,136;MMQ=53,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=83.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,27:0.663:43:7,12:8,13:0|1:29633770_T_TAA:29633770:16,0,27,0
chr20	29633823	.	A	G	.	.	DP=147;ECNT=14;MBQ=30,34;MFRL=151,156;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,15:0.085:145:67,7:60,8:106,24,11,4
chr20	29633847	.	AT	A	.	.	DP=235;ECNT=14;MBQ=30,30;MFRL=146,150;MMQ=40,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:217,17:0.076:234:118,7:93,9:0|1:29633847_AT_A:29633847:165,52,15,2
chr20	29633849	.	GGC	G	.	.	DP=239;ECNT=14;MBQ=34,33;MFRL=146,150;MMQ=40,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:221,17:0.075:238:116,7:93,10:0|1:29633847_AT_A:29633847:167,54,15,2
chr20	29633850	.	G	C	.	.	DP=234;ECNT=14;MBQ=33,34;MFRL=143,156;MMQ=40,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:198,12:0.053:210:105,8:86,4:147,51,11,1
chr20	29633853	.	T	TTA	.	.	DP=241;ECNT=14;MBQ=31,31;MFRL=146,144;MMQ=40,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:222,18:0.078:240:118,7:94,10:0|1:29633847_AT_A:29633847:168,54,15,3
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chr20	29633861	.	A	T	.	.	DP=235;ECNT=14;MBQ=32,33;MFRL=146,142;MMQ=48,45;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:219,13:0.060:232:117,11:97,2:161,58,12,1
chr20	29633883	.	C	A	.	.	DP=286;ECNT=14;MBQ=33,29;MFRL=138,116;MMQ=51,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:265,13:0.049:278:133,8:115,5:175,90,9,4
chr20	29633887	.	G	A	.	.	DP=283;ECNT=14;MBQ=33,30;MFRL=136,151;MMQ=51,29;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:249,14:0.051:263:124,6:104,7:163,86,7,7
chr20	29633894	.	C	A	.	.	DP=282;ECNT=14;MBQ=33,32;MFRL=135,139;MMQ=51,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:237,28:0.106:265:125,12:103,15:147,90,15,13
chr20	29633900	.	AA	GA,GG	.	.	DP=312;ECNT=14;MBQ=31,34,20;MFRL=137,139,130;MMQ=51,33,36;MPOS=13,8;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=49.45,9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:263,23,6:0.081,0.022:292:131,11,6:110,11,0:157,106,15,14
chr20	29633902	.	C	A	.	.	DP=304;ECNT=14;MBQ=32,29;MFRL=138,133;MMQ=51,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:278,15:0.054:293:142,7:123,8:169,109,4,11
chr20	29633915	.	C	T	.	.	DP=301;ECNT=17;MBQ=32,31;MFRL=139,150;MMQ=51,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:273,18:0.064:291:133,10:124,8:144,129,9,9
chr20	29633916	.	G	T,A	.	.	DP=305;ECNT=17;MBQ=29,31,32;MFRL=143,132,136;MMQ=52,49,45;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=361.49,152.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:130,100,61:0.339,0.212:291:68,46,33:57,47,28:77,53,75,86
chr20	29633925	.	T	A	.	.	DP=310;ECNT=17;MBQ=32,31;MFRL=140,130;MMQ=50,31;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:306,3:0.013:309:153,3:138,0:158,148,0,3
chr20	29633927	.	C	A	.	.	DP=307;ECNT=17;MBQ=33,32;MFRL=144,131;MMQ=51,49;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=359.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:208,99:0.324:307:112,46:87,49:117,91,35,64
chr20	29633929	.	A	G	.	.	DP=312;ECNT=17;MBQ=32,33;MFRL=142,135;MMQ=51,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=393.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:204,107:0.345:311:110,46:85,51:0|1:29633929_A_G:29633929:111,93,37,70
chr20	29633938	.	A	G	.	.	DP=295;ECNT=17;MBQ=31,34;MFRL=139,151;MMQ=51,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:246,46:0.156:292:124,25:110,18:114,132,15,31
chr20	29633945	.	G	A	.	.	DP=277;ECNT=17;MBQ=33,31;MFRL=142,157;MMQ=50,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:253,22:0.082:275:132,9:103,13:109,144,10,12
chr20	29633952	.	C	T	.	.	DP=255;ECNT=17;MBQ=33,31;MFRL=144,146;MMQ=51,45;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=305.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:171,84:0.331:255:91,37:69,33:0|1:29633929_A_G:29633929:77,94,20,64
chr20	29633957	.	T	C	.	.	DP=241;ECNT=17;MBQ=31,35;MFRL=148,170;MMQ=49,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:230,10:0.045:240:119,5:99,5:87,143,3,7
chr20	29633966	.	GTTT	G,GT,GTT	.	.	DP=233;ECNT=17;MBQ=33,33,33,34;MFRL=147,162,148,161;MMQ=60,40,33,23;MPOS=13,17,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,7,8,9;RU=T;STR;TLOD=151.75,230.13,7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:46,44,73,4:0.263,0.435,0.028:167:25,20,38,1:16,19,33,2:15,31,18,103
chr20	29633983	.	A	G	.	.	DP=182;ECNT=17;MBQ=31,35;MFRL=153,161;MMQ=48,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:174,5:0.033:179:87,1:78,4:21,153,0,5
chr20	29633986	.	AT	CA,CT	.	.	DP=176;ECNT=17;MBQ=30,34,34;MFRL=149,148,186;MMQ=48,33,40;MPOS=7,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=29.02,53.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:135,12,22:0.077,0.135:169:66,7,11:64,5,10:18,117,0,34
chr20	29633994	.	A	G	.	.	DP=169;ECNT=17;MBQ=32,34;MFRL=153,199;MMQ=48,29;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:157,7:0.048:164:73,2:70,4:11,146,0,7
chr20	29634002	.	C	A	.	.	DP=161;ECNT=17;MBQ=34,32;MFRL=158,174;MMQ=46,48;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:149,7:0.045:156:73,4:72,3:6,143,2,5
chr20	29634037	.	G	A	.	.	DP=123;ECNT=17;MBQ=32,30;MFRL=181,167;MMQ=57,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=118.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,37:0.327:114:42,18:35,18:0|1:29634037_G_A:29634037:5,72,0,37
chr20	29634043	.	C	G	.	.	DP=107;ECNT=17;MBQ=33,33;MFRL=178,167;MMQ=52,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,6:0.056:105:54,3:43,3:6,93,0,6
chr20	29634049	.	G	C	.	.	DP=91;ECNT=17;MBQ=32,34;MFRL=180,177;MMQ=52,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=108.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,31:0.348:90:35,16:24,12:0|1:29634037_G_A:29634037:5,54,0,31
chr20	29965014	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:5,2,4,0
chr20	29966275	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	29977118	.	ACAGGGAAGAAGAG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=205,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	30028515	.	TGCTGACTTTGACTGTGC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=133,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.302:8:3,0:1,2:0|1:30028515_TGCTGACTTTGACTGTGC_T:30028515:1,5,1,1
chr20	30028537	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=140,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:30028515_TGCTGACTTTGACTGTGC_T:30028515:1,3,1,1
chr20	30037783	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,2,2
chr20	30155862	.	TTC	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TC;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.063:50:30,1:15,1:38,9,3,0
chr20	30156903	.	G	GT	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,2:11,0:21,7,2,1
chr20	30156909	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:17,2:19,0:25,12,2,0
chr20	30194396	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30194396_G_A:30194396:0,0,0,1
chr20	30194398	.	A	AAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30194396_G_A:30194396:0,0,0,1
chr20	30194400	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30194396_G_A:30194396:0,0,0,1
chr20	30227650	.	AG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=177,131;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:30227650_AG_CA:30227650:2,0,1,0
chr20	30227654	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=177,131;MMQ=50,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:30227650_AG_CA:30227650:2,0,1,0
chr20	30450504	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.382:16:4,2:5,3:2,8,3,3
chr20	30496370	.	T	TCGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=181,254;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.413:3:0,0:1,1:1,1,1,0
chr20	30496375	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=174,254;MMQ=60,58;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr20	30496381	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=174,254;MMQ=60,58;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:1,2,1,0
chr20	30521697	.	C	CACCTACTAAACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr20	30530909	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=138,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:30530909_A_T:30530909:0,3,0,1
chr20	30530911	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=138,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:30530909_A_T:30530909:0,3,0,1
chr20	30584710	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,6:0,3:4,1,6,3
chr20	30585240	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	30610657	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr20	30610673	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=169,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr20	30640398	.	A	AAATGGGATGGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:30640398_A_AAATGGGATGGAG:30640398:0,0,1,1
chr20	30640401	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30640398_A_AAATGGGATGGAG:30640398:0,0,0,1
chr20	30674706	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	30729488	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:3,2,1,5
chr20	30729523	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,3:0,3:5,0,3,3
chr20	30733295	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:0|1:30733295_G_A:30733295:0,8,0,4
chr20	30733317	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0|1:30733295_G_A:30733295:0,7,0,4
chr20	30753270	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,7,17
chr20	30795858	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:30795858_C_A:30795858:0,0,1,0
chr20	30795864	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30795858_C_A:30795858:0,1,1,0
chr20	30804487	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=130,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.195:34:14,0:13,6:13,15,0,6
chr20	30804535	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:7,5:5,3:4,8,1,8
chr20	30904777	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr20	30918021	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:6,12,1,1
chr20	30919183	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr20	31016119	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,6:3,5:4,3,6,5
chr20	31062457	.	GG	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=116,115;MMQ=60,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:5,1:6,4,0,2
chr20	31189411	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,6:3,1:4,0,6,1
chr20	31196486	.	A	ACGCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=269,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31196486_A_ACGCCC:31196486:0,1,0,1
chr20	31196488	.	G	GACAAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=269,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31196486_A_ACGCCC:31196486:0,1,0,1
chr20	31196493	.	AA	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=269,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31196486_A_ACGCCC:31196486:0,1,0,1
chr20	31291161	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0,0,13,8
chr20	31291919	.	GGGCA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:2,2:0,6,0,4
chr20	31292184	.	T	TATG	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=389.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,91:0.990:91:0,40:0,45:0,0,74,17
chr20	31292298	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=19,33,21,21;MFRL=178,124,150,139;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,22,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.93,3.67,22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,5,4,12:0.150,0.121,0.450:30:1,1,1,1:3,4,1,5:2,7,5,16
chr20	31294655	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,0,15
chr20	31369136	.	AC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=99,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:5,5:1,3:5,4,4,4
chr20	31374991	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:4,1:1,4:3,2,5,1
chr20	31375311	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.502:24:4,6:8,6:1,11,0,12
chr20	31381229	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=242,210;MMQ=60,32;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr20	31383353	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.503:28:2,4:11,10:3,11,4,10
chr20	31383532	.	CA	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31383532_CA_TC:31383532:0,4,0,1
chr20	31383539	.	T	TAGCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:31383532_CA_TC:31383532:0,3,0,1
chr20	31383541	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:31383532_CA_TC:31383532:0,3,0,1
chr20	31387954	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,2:8,5:10,5,4,3
chr20	31427484	.	TTTTG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTG;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:3,1:7,1,3,1
chr20	31427635	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:4,1:8,6:4,8,3,4
chr20	31446742	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:0,3:5,2:4,1,4,1
chr20	31473483	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,2,18
chr20	31480157	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr20	31480936	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=212,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr20	31480938	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=159,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr20	31480961	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:0,6:1,4:1,0,8,2
chr20	31484417	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr20	31486471	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	31573528	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,2:2,7:5,0,7,2
chr20	31573769	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=182,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr20	31577394	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=84,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:1,2:3,1,4,0
chr20	31577572	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=237,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr20	31577582	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr20	31583369	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:3,1,5,0
chr20	31583384	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:3,2,7,1
chr20	31585351	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,4:1,2:2,0,5,1
chr20	31585415	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,6:5,9:4,6,7,8
chr20	31585545	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr20	31587752	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,6:6,5:6,4,7,4
chr20	31589137	.	C	CATCTCATTGAGAACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:31589137_C_CATCTCATTGAGAACA:31589137:1,3,0,1
chr20	31589140	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:31589137_C_CATCTCATTGAGAACA:31589137:1,3,0,1
chr20	31590388	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:6,1,5,2
chr20	31590530	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,4:2,6:0,3,4,6
chr20	31592242	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:1,4,1,2
chr20	31598781	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:2,1,4,0
chr20	31603406	.	A	ATTTTTGTGAGTTGATCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=219,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr20	31604811	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr20	31606237	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	31607637	.	C	CACTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31607637_C_CACTG:31607637:0,3,0,1
chr20	31607639	.	C	CCCGGGAACGCTCCAGACT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31607637_C_CACTG:31607637:0,3,0,1
chr20	31607641	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:31607637_C_CACTG:31607637:0,3,0,1
chr20	31607654	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	31608250	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr20	31609246	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr20	31609433	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr20	31609581	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,8:0,4:0,0,4,10
chr20	31619357	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	31619578	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=191,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:1,2,2,4
chr20	31622768	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:2,4:0,0:1,1,1,3
chr20	31622839	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=152,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr20	31624368	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:1,2,0,8
chr20	31626621	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=112,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,4:0,4:3,0,8,0
chr20	31627291	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:2,4,3,2
chr20	31629911	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr20	31631100	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:9,10,1,1
chr20	31644520	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr20	31647126	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=114,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr20	31647864	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr20	31649756	.	A	AGGAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	31651583	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr20	31652292	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=83,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,7:5,6:4,5,8,5
chr20	31660710	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=191,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr20	31677474	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=185,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:31677474_A_G:31677474:0,2,0,2
chr20	31677476	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=185,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:31677474_A_G:31677474:0,2,0,2
chr20	31680352	.	C	CCAAAGTGCTAGGATTACAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr20	31683044	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:0,8,0,5
chr20	31683056	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.398:11:3,1:1,1:0,7,0,4
chr20	31688330	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=102,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:1,3,1,1
chr20	31690794	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=122,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:6,9,0,2
chr20	31763324	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=127,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:5,13,1,1
chr20	31811551	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr20	31814379	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:31814379_A_AGG:31814379:0,2,0,1
chr20	31814380	.	T	TATGTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:31814379_A_AGG:31814379:0,2,0,1
chr20	31814383	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:31814379_A_AGG:31814379:0,2,0,1
chr20	31826027	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:7,2:1,4:2,6,2,4
chr20	31826088	.	GGCAGTGACCCTGAA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0,3,0,2
chr20	31829083	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=245,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr20	31873821	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=205,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,2:1,0:3,0,1,1
chr20	31876485	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr20	31954890	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	31975090	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,9,9
chr20	32000351	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr20	32207238	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=173,185;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr20	32207267	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=179,183;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:1,0:4,1,2,0
chr20	32211754	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,10;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.146:22:6,0:8,0:6,13,0,3
chr20	32216294	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=155,136;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:17,0:10,4:5,23,1,3
chr20	32216296	.	CA	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=154,169;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:17,0:12,2:5,24,0,2
chr20	32216314	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=162,149;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.108:29:17,0:9,3:1,25,0,3
chr20	32216321	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=167,142;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:16,0:6,4:0,22,0,4
chr20	32245546	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr20	32248296	.	A	AAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	32250311	.	G	GCACACAGAGGGAAGAGCCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.405:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr20	32255748	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:11,1:2,17,0,2
chr20	32264859	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,162;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr20	32264866	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=87,148;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr20	32264876	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	32264879	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,14;MFRL=87,148;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr20	32264885	.	A	ACCCCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=16,14;MFRL=134,148;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,9;RU=C;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:0,0:0,0:2,0,1,0
chr20	32298561	.	TG	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=154,50;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:4,0:13,2:0|1:32298561_TG_CT:32298561:6,11,1,1
chr20	32298571	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:3,0:13,2:0|1:32298561_TG_CT:32298561:4,13,1,1
chr20	32298572	.	A	AGTGTCACTGC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:13,2:0|1:32298561_TG_CT:32298561:4,13,1,1
chr20	32376801	.	AG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,1:7,2:9,10,1,2
chr20	32376843	.	G	GCTTTTTTCTTTCTGCATATGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=139,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr20	32399200	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=231,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr20	32664864	.	C	CCAG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=121.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,8:0,20:0,0,24,6
chr20	32665084	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:3,6,0,5
chr20	32891200	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=99.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,8:0,20:0,0,0,28
chr20	32996689	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,3:1,1:1,8,0,4
chr20	33033065	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=37,32;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:0|1:33033065_GT_G:33033065:2,0,1,0
chr20	33033083	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,1:4,1:0|1:33033065_GT_G:33033065:4,6,3,0
chr20	33037336	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:7,9:5,6:4,8,3,12
chr20	33057954	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.367:36:9,9:14,4:7,16,3,10
chr20	33057974	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:7,4:10,4:1,16,0,9
chr20	33068563	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,1,3
chr20	33147737	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,2,11
chr20	33148861	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr20	33169495	.	AAGAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=AG;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.639:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr20	33204042	.	A	AATCCAAATTGGTCTTACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=213,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr20	33225792	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,15;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.229:20:5,0:7,0:0|1:33225792_A_AT:33225792:3,13,0,4
chr20	33225793	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=17,33;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:2,1:1,3:0|1:33225792_A_AT:33225792:3,10,0,4
chr20	33232991	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34,32,34;MFRL=178,185,172,166;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,9,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.21,5.09,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:17,2,2,4:0.102,0.103,0.171:25:7,1,1,2:9,1,1,2:17,0,8,0
chr20	33296964	.	GGTGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=GT;STR;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.854:5:0,4:0,1:0|1:33296964_GGTGT_G:33296964:0,0,5,0
chr20	33296988	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0|1:33296964_GGTGT_G:33296964:0,0,8,0
chr20	33297806	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33297806_T_G:33297806:0,0,1,0
chr20	33297810	.	G	GGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33297806_T_G:33297806:0,0,1,0
chr20	33297811	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33297806_T_G:33297806:0,0,1,0
chr20	33330495	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,77;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.071:68:28,4:35,0:13,51,3,1
chr20	33330967	.	TTGC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TGC;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:4,5,2,0
chr20	33334540	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr20	33334810	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=253,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	33338325	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:4,0:2,3:0,7,2,2
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chr20	33713975	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
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chr20	33894463	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.449:25:5,4:6,6:9,5,7,4
chr20	34023037	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=212,226;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:34023037_T_C:34023037:0,2,0,1
chr20	34023040	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=212,226;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:34023037_T_C:34023037:0,2,0,1
chr20	34023072	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:34023072_C_A:34023072:0,0,0,1
chr20	34023074	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34023072_C_A:34023072:0,0,0,1
chr20	34025756	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,5:5,3:0,8,0,8
chr20	34054729	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr20	34062710	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:3,2:2,5,2,5
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chr20	34091550	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,13;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,0:0|1:34091550_CA_TT:34091550:1,2,0,1
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chr20	35627236	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,1:7,1:6,11,0,2
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chr20	35636054	.	GG	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,34;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:35636044_GGAGTGCA_G:35636044:0,2,0,1
chr20	35636058	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=109,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35636044_GGAGTGCA_G:35636044:0,1,0,1
chr20	35636060	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=18,31;MFRL=109,169;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:35636044_GGAGTGCA_G:35636044:0,1,0,1
chr20	35695535	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=25,32,16,31;MFRL=145,129,156,202;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,11,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=6.73,15.95,12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,9,11,9:0.189,0.278,0.232:41:4,3,2,2:2,2,1,4:6,6,12,17
chr20	35738563	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,221;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:7,1:11,0,2,0
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chr20	35748024	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.455:25:3,1:10,10:14,0,11,0
chr20	35748039	.	G	GAAAGAAAAGA,GAAAGAAAAGAAAAGA	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,34,28;MFRL=0,126,101;MMQ=60,40,37;MPOS=11,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,9,10;RU=AAAGA;STR;TLOD=16.79,14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,6:0.475,0.500:11:0,1,2:0,4,4:0,0,10,1
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chr20	35783494	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:4,1,5,1
chr20	35786188	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr20	35787473	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,4:1,0:0,6,0,4
chr20	35788405	.	CAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	35807790	.	G	GCTTATAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr20	35812526	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr20	35827667	.	T	TTAGATTCTTACAAGGCAGGCACAAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=161,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr20	35827682	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	35828757	.	ATT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=78.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.962:23:0,8:1,13:1,0,21,1
chr20	35833313	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=159,37;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:35833313_C_T:35833313:2,12,1,1
chr20	35833316	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=156,37;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:0|1:35833313_C_T:35833313:2,10,1,1
chr20	35835657	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr20	35835889	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr20	35838372	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr20	35838591	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr20	35852395	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr20	35852450	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	35869619	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,13:0,0,26,0
chr20	35879680	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,2:6,6:6,3,4,4
chr20	35882822	.	G	GTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35882822_G_GTA:35882822:0,1,0,1
chr20	35882824	.	G	GTATCTATATCTAGCTATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35882822_G_GTA:35882822:0,1,0,1
chr20	35944749	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=119,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.109:43:18,0:21,4:23,16,2,2
chr20	36031097	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,3:0,0,3,11
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chr20	36361215	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=218,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:36361210_T_C:36361210:3,0,1,0
chr20	36375000	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,0:9,3:17,6,3,0
chr20	36396533	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0,8,0,2
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chr20	36488508	.	TCTCA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCA;STR;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,1:0,1,0,4
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chr20	36572578	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.305:14:6,0:2,2:0|1:36572575_G_C:36572575:1,9,4,0
chr20	36685915	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,1:0,2:4,1,3,0
chr20	36760886	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.391:18:7,2:4,4:0,11,3,4
chr20	36793501	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=136,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:3,3:5,2:6,2,5,0
chr20	36793529	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=81,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.598:20:4,5:3,7:5,3,8,4
chr20	36919896	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.509:2:0,0:1,1:0|1:36919896_A_C:36919896:0,1,0,1
chr20	36919899	.	CCAAGAGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36919896_A_C:36919896:0,1,0,1
chr20	36919912	.	CT	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=167,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:36919896_A_C:36919896:0,3,0,1
chr20	36919918	.	TG	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=174,99;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:36919896_A_C:36919896:0,4,0,1
chr20	36919921	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=174,99;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:36919896_A_C:36919896:0,4,0,1
chr20	36932551	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:7,3:7,4:13,2,6,1
chr20	36959353	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr20	36959566	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr20	37146131	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.348:18:7,4:3,1:10,2,6,0
chr20	37175137	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr20	37187110	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.276:26:10,4:9,3:3,16,0,7
chr20	37263529	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,52;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,2:0,0:0,0,0,2
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chr20	42176659	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,13;MFRL=106,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:42176653_T_G:42176653:0,1,2,0
chr20	42176661	.	T	TGCCCCGGGACC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:42176653_T_G:42176653:1,1,1,0
chr20	42176662	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,19;MFRL=129,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1|0:42176653_T_G:42176653:1,1,1,0
chr20	42176666	.	AT	CG,GG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,28,21;MFRL=106,162,151;MMQ=60,60,60;MPOS=32,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,0:0,0,1:0,1,2,0
chr20	42176670	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,13;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,0:0,0:1|0:42176653_T_G:42176653:2,1,1,0
chr20	42176672	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,13;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,0:1|0:42176653_T_G:42176653:1,1,1,0
chr20	42176677	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,13;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,0:1|0:42176653_T_G:42176653:2,1,1,0
chr20	42176920	.	T	TAATCCCCCCCTCCCCACGGTAGTTAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=92,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:2,0:0,1:0|1:42176920_T_TAATCCCCCCCTCCCCACGGTAGTTAG:42176920:1,1,0,1
chr20	42176923	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=92,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:2,0:0,1:0|1:42176920_T_TAATCCCCCCCTCCCCACGGTAGTTAG:42176920:1,1,0,1
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chr20	42195867	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=239,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:42195865_CT_C:42195865:0,2,0,1
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chr20	42199721	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=172,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:42199715_G_A:42199715:3,3,1,1
chr20	42199723	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=172,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:42199715_G_A:42199715:3,3,1,1
chr20	42199733	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:42199715_G_A:42199715:2,1,1,1
chr20	42199737	.	GT	CC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:42199715_G_A:42199715:2,1,0,1
chr20	42208522	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
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chr20	42242716	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=263,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	42249398	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=98.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,11:0,0,28,1
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chr20	42249546	.	T	G	.	.	DP=135;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=117,177;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:121,4:0.039:125:62,0:57,4:0|1:42249546_T_G:42249546:40,81,0,4
chr20	42249549	.	A	C	.	.	DP=121;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=117,177;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:117,4:0.041:121:55,0:55,4:0|1:42249546_T_G:42249546:38,79,0,4
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chr20	42264726	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	42265700	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr20	42265869	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=125,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,2:10,0:18,6,1,1
chr20	42265966	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr20	42275499	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr20	42302371	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr20	42328639	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,3:0,9:0,1,2,10
chr20	42328749	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	42683256	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=225,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr20	42694558	.	C	CCCG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCG;STR;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:2,4,2,3
chr20	42697211	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:17,0,2,0
chr20	42697651	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	42814899	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=14,10;MFRL=189,167;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:42814899_A_G:42814899:2,0,1,0
chr20	42814904	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,19;MFRL=189,167;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:42814899_A_G:42814899:2,0,1,0
chr20	42814906	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=14,13;MFRL=207,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr20	42814909	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=14,25;MFRL=189,167;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:42814899_A_G:42814899:2,0,1,0
chr20	42814919	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=14,12;MFRL=207,167;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:42814899_A_G:42814899:1,0,1,0
chr20	42814923	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=21,24;MFRL=207,167;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42814899_A_G:42814899:1,0,1,0
chr20	42814930	.	CT	GC	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=29,17;MFRL=122,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.388:6:1,0:1,0:4,0,2,0
chr20	42814931	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=15,32;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:0,2:3,0,2,0
chr20	42814934	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=16,12;MFRL=122,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.386:6:0,0:1,0:4,0,2,0
chr20	43036143	.	ACC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=202,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:43036143_ACC_A:43036143:0,2,0,1
chr20	43036146	.	A	AAAGTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=202,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:43036143_ACC_A:43036143:0,2,0,1
chr20	43036160	.	A	AT,T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,28,32;MFRL=0,173,230;MMQ=60,60,60;MPOS=4,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr20	43036161	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=115,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr20	43036163	.	C	CTTGGCACCAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=87,230;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr20	43042281	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:3,1,1,0
chr20	43043051	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr20	43043095	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,7,1
chr20	43052570	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr20	43056983	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.262:13:4,0:2,0:0|1:43056983_A_C:43056983:2,8,3,0
chr20	43056987	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,11;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.262:13:5,0:4,0:0|1:43056983_A_C:43056983:2,8,3,0
chr20	43057131	.	G	GGGGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=94,45;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:43057131_G_GGGGC:43057131:4,3,1,1
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chr20	44098311	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44098311_T_A:44098311:0,0,1,0
chr20	44098316	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44098311_T_A:44098311:0,0,1,0
chr20	44098318	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44098311_T_A:44098311:0,0,1,0
chr20	44144105	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:44144105_T_G:44144105:0,1,2,0
chr20	44144111	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:44144105_T_G:44144105:0,1,1,0
chr20	44144114	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44144105_T_G:44144105:0,1,1,0
chr20	44144119	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=52,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:44144105_T_G:44144105:1,1,1,0
chr20	44144121	.	C	CCCCCCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=52,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:44144105_T_G:44144105:1,1,1,0
chr20	44144127	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,19;MFRL=52,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:44144105_T_G:44144105:1,1,1,0
chr20	44180813	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=113,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,3:7,5:3,10,2,6
chr20	44180868	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr20	44181723	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr20	44181970	.	TTCAAAGAGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr20	44184285	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr20	44190705	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,5:4,4:8,0,7,2
chr20	44258591	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.407:5:1,1:2,0:2,1,1,1
chr20	44259490	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr20	44259673	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=113,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:3,1:6,3:3,6,0,4
chr20	44333052	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr20	44334394	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	44334588	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr20	44350931	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr20	44351095	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:11,9:6,8:5,12,5,12
chr20	44352740	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr20	44354372	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr20	44354387	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	44403112	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=145,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:5,7,1,1
chr20	44403131	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:44403131_A_T:44403131:6,7,1,1
chr20	44403133	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=145,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:0|1:44403131_A_T:44403131:6,8,1,1
chr20	44403135	.	ACC	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=145,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:0|1:44403131_A_T:44403131:6,8,1,1
chr20	44403170	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:44403170_G_A:44403170:2,4,1,1
chr20	44403171	.	G	GTGAGAATTTATATTAAAA	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:44403170_G_A:44403170:2,4,1,1
chr20	44403173	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:5,0:0|1:44403170_G_A:44403170:2,4,1,1
chr20	44417593	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:6,6:7,7:6,7,5,8
chr20	44418471	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=125,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:7,3,2,0
chr20	44418482	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,0:7,2:5,4,2,0
chr20	44419678	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=252,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr20	44424164	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr20	44429633	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=209,192,220;MMQ=60,60,60;MPOS=28,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=A;STR;TLOD=6.15,6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.300,0.468:6:0,1,1:1,1,2:1,0,5,0
chr20	44430740	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:4,3:0,4:0,4,2,6
chr20	44439646	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,5:1,4:2,4,4,5
chr20	44444242	.	GC	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=130,42;MMQ=60,33;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,0:11,2:13,8,1,1
chr20	44462766	.	CCCT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,273;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	44468982	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr20	44470648	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=180,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,3:1,0:2,2,1,2
chr20	44470735	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44470735_C_CTA:44470735:0,1,0,1
chr20	44470737	.	C	CAAAGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=19,35;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:44470735_C_CTA:44470735:0,1,0,1
chr20	44482691	.	GCTTTTATTTTC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr20	44512744	.	TAC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=AC;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.839:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr20	44513148	.	C	CATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=210,242;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:44513148_C_CATG:44513148:3,0,0,1
chr20	44513153	.	CACA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=221,242;MMQ=55,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:44513148_C_CATG:44513148:4,0,0,1
chr20	44513252	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=170,132;MMQ=40,51;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:8,3:22,1:30,0,4,0
chr20	44513280	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.075:50:17,2:28,1:31,16,3,0
chr20	44513289	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:18,3:42,0:43,22,2,1
chr20	44513522	.	GG	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	44577990	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:3,10,2,0
chr20	44578634	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,3:6,0:11,7,2,1
chr20	44578776	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,3,5
chr20	44586620	.	G	GACCTGCCCGCCTCCGCCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr20	44588109	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,11:0,5:0,0,5,11
chr20	44588766	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr20	44589630	.	C	CTGGATG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=142,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr20	44589634	.	T	TGCCTTCCTCCGACAGCACATACCCGAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr20	44590661	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	44594228	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,5,3
chr20	44596825	.	A	ATTTCCTGTTTTATATGTTCTTAAGAAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=218,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr20	44599839	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr20	44638752	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=92,188;MMQ=60,46;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:44638752_T_G:44638752:0,3,0,1
chr20	44638759	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=92,188;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:44638752_T_G:44638752:0,3,0,1
chr20	44638766	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,188;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44638752_T_G:44638752:0,0,0,1
chr20	44639511	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr20	44639583	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.252:14:9,2:1,1:0|1:44639583_C_T:44639583:5,6,1,2
chr20	44639601	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=131,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.236:15:11,2:1,1:0|1:44639583_C_T:44639583:3,9,1,2
chr20	44640959	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr20	44645010	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,5:0,7:0,0,3,11
chr20	44665889	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:6,4:0,4:4,2,8,0
chr20	44670201	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0|1:44670201_GGC_G:44670201:1,2,0,1
chr20	44670206	.	C	CTTTAATTTGGGGGCTGCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:44670201_GGC_G:44670201:1,2,0,1
chr20	44673546	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr20	44674695	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=157,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:3,0:0,2:0|1:44674695_G_C:44674695:0,3,1,1
chr20	44674698	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=157,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:44674695_G_C:44674695:0,3,0,1
chr20	44674701	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=165,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:44674695_G_C:44674695:0,4,0,1
chr20	44674704	.	A	AGTAGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=165,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:44674695_G_C:44674695:0,4,0,1
chr20	44674705	.	C	CCACAGCAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=172,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:44674695_G_C:44674695:0,3,0,1
chr20	44674708	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=172,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:44674695_G_C:44674695:0,3,0,1
chr20	44675136	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr20	44692397	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44692397_T_C:44692397:0,2,0,1
chr20	44692403	.	C	CTCCAAAAGATACCTCTTCCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:44692397_T_C:44692397:0,2,0,1
chr20	44697258	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:11,9,2,0
chr20	44985307	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,2,16
chr20	45003311	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,2:12,0:2,14,0,2
chr20	45003326	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr20	45003788	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr20	45017710	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:2,3:9,0:10,2,2,1
chr20	45113281	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,1:4,5:1,8,1,5
chr20	45113296	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.497:12:4,2:2,4:1,5,1,5
chr20	45113742	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:4,9:8,6:3,9,3,12
chr20	45315912	.	T	TGAGACAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	45338349	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:3,3,3,0
chr20	45362481	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=136,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:4,6,1,2
chr20	45607148	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=175,85;MMQ=60,23;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:8,3:11,1,2,1
chr20	45629941	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=103,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr20	45797749	.	TTC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr20	45797883	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr20	45812069	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:12,1:20,1:6,26,1,1
chr20	45839533	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=137,60;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:13,2:19,0:12,22,2,0
chr20	45856045	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr20	45915962	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,1:7,1:15,6,0,2
chr20	46266532	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.244:22:6,0:8,0:0|1:46266532_G_T:46266532:7,10,0,5
chr20	46266536	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=124,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.254:21:5,0:8,0:0|1:46266532_G_T:46266532:7,9,0,5
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chr20	47361519	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,2,1
chr20	47361708	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,2:5,1:1,7,0,3
chr20	47558334	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr20	47633016	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=198,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:47633016_CAA_C:47633016:0,1,0,1
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chr20	47693670	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:3,1:3,7,0,2
chr20	47693690	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.632:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr20	47713063	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr20	47732232	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	47739555	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr20	47739814	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,2,11
chr20	47770465	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.181:24:8,0:6,2:0|1:47770465_C_A:47770465:12,8,4,0
chr20	47770467	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.167:26:10,0:6,2:0|1:47770465_C_A:47770465:13,9,4,0
chr20	47770470	.	CT	AA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=126,138;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.109:25:10,0:8,0:0|1:47770465_C_A:47770465:13,10,2,0
chr20	47775072	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=157,200;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:1,2:5,3,0,2
chr20	47775441	.	A	AAAATAAAT	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=AAAT;STR;TLOD=107.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.971:27:0,10:0,5:0,1,21,5
chr20	47775474	.	A	AC	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=207.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,28:0,39:0,0,28,42
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chr20	47845220	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,3:0,0,10,4
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chr20	47858560	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,1:12,1:8,9,0,2
chr20	47859217	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=237.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,72:0.987:72:0,41:0,29:0,0,40,32
chr20	47859254	.	CTTTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=23,9;RU=T;STR;TLOD=165.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.979:39:0,27:0,12:0,0,9,30
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chr20	47869467	.	TGAC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47869461_AAG_A:47869461:0,0,0,1
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chr20	47882893	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr20	47892270	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,8:0,0,20,3
chr20	47989624	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=113,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,10:6,3:5,8,8,5
chr20	48124443	.	A	AAACACCGTGCCAAGGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=149,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:48124443_A_AAACACCGTGCCAAGGT:48124443:0,1,1,1
chr20	48124445	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=149,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:48124443_A_AAACACCGTGCCAAGGT:48124443:0,1,1,1
chr20	48129706	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,4:6,2:4,8,3,3
chr20	48161052	.	CCT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr20	48260203	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=116,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:2,5:9,2:1,10,2,5
chr20	48263445	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:11,0,2,1
chr20	48273299	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr20	48330030	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=201,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr20	48439582	.	A	AT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:19,2:19,1:27,12,4,0
chr20	48456238	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:4,4:6,2:0,10,0,7
chr20	48494650	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:9,2:2,2:0,11,0,4
chr20	48561893	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,13,6
chr20	48562083	.	G	GTTGGACACC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,4:0,0,0,7
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chr20	48600809	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=133,186;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.308:21:6,4:7,2:9,6,2,4
chr20	48600924	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr20	48729677	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr20	48808198	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=191,285;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr20	48809315	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48809315_G_T:48809315:0,0,0,1
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chr20	48809318	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48809315_G_T:48809315:0,0,0,1
chr20	48809322	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48809315_G_T:48809315:0,0,0,1
chr20	49191228	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,3:4,2:0,10,0,6
chr20	49194866	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr20	49195248	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr20	49196167	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr20	49196272	.	G	GGC	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.164:20:9,3:5,0:0|1:49196272_G_GGC:49196272:3,14,3,0
chr20	49196274	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.164:20:9,1:6,0:0|1:49196272_G_GGC:49196272:3,14,3,0
chr20	49196279	.	CCA	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:9,0:5,0:0|1:49196272_G_GGC:49196272:0,15,2,0
chr20	49196286	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,11;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:7,0:0|1:49196272_G_GGC:49196272:0,15,2,0
chr20	49199355	.	C	CG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:0,7,0,4
chr20	49203895	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr20	49204367	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:4,2:11,4:4,11,4,2
chr20	49214055	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr20	49219172	.	G	GGGTTGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:49219172_G_GGGTTGC:49219172:0,3,0,1
chr20	49219174	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:49219172_G_GGGTTGC:49219172:0,3,0,1
chr20	49227294	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr20	49227500	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,3:1,2:1,3,1,4
chr20	49227544	.	G	GGGCTTAGTGCCGGGCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr20	49227796	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,3:2,3:0,4,1,6
chr20	49227830	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:49227830_A_G:49227830:0,4,0,1
chr20	49227832	.	C	CTGCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:49227830_A_G:49227830:0,4,0,1
chr20	49227873	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr20	49231324	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=134,90;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,3:0.066:59:36,0:16,3:0|1:49231322_A_G:49231322:17,39,1,2
chr20	49231333	.	TG	CA,CG	.	.	DP=53;ECNT=6;MBQ=31,33,28;MFRL=153,123,136;MMQ=60,60,60;MPOS=11,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.90,70.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,3,26:0.076,0.516:50:15,0,20:6,3,6:3,18,9,20
chr20	49231338	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=142,138;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:34,0:11,2:0|1:49231322_A_G:49231322:10,35,0,2
chr20	49231348	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=142,138;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:21,0:9,2:0|1:49231322_A_G:49231322:4,28,0,2
chr20	49231412	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr20	49232427	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr20	49232667	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=211,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,1:2,0:0|1:49232667_GAA_G:49232667:0,2,0,1
chr20	49232674	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=211,113;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:49232667_GAA_G:49232667:0,2,0,1
chr20	49236478	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,1:0,3:1,0,2,2
chr20	49354351	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:6,4:2,1:7,2,5,1
chr20	49507892	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr20	49551780	.	TA	T,TAA	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=148,142,147;MMQ=60,60,60;MPOS=25,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.51,8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:51,6,8:0.087,0.114:65:26,4,4:25,1,4:11,40,2,12
chr20	49577263	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=145,149;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:4,0:1,8,0,2
chr20	49577303	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=189,70;MMQ=43,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:6,0:1,2:0|1:49577303_TG_CA:49577303:0,7,1,1
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chr20	49577312	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=189,70;MMQ=43,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:0|1:49577303_TG_CA:49577303:0,7,1,1
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chr20	50286484	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:0,2:3,1:3,0,3,0
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chr20	50342379	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,0:3,3:4,4,2,1
chr20	50342555	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	50384777	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
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chr20	50713652	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,1,2
chr20	50713991	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=107,139;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.617:14:2,0:2,0:4,1,0,9
chr20	52185814	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:0,7,0,4
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chr20	52185898	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:52185897_A_T:52185897:0,1,0,1
chr20	52185900	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52185897_A_T:52185897:0,0,0,1
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chr20	52192446	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:15,0:15,2:24,7,2,0
chr20	52611540	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:10,2:3,6:11,2,6,2
chr20	52645534	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=249,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
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chr20	52674553	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=16,18;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.336:7:0,0:2,0:0|1:52674537_A_AT:52674537:5,0,2,0
chr20	52773634	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,4,1
chr20	52774579	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=124,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr20	52774601	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:4,1,3,0
chr20	52775528	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,122;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,8:3,2:4,3,4,6
chr20	52775728	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr20	52782438	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,1,3
chr20	52786073	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:5,1,5,0
chr20	52788314	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	53092462	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.356:9:1,2:5,1:4,2,3,0
chr20	53205396	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,6:4,3:0,6,0,9
chr20	53226840	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr20	54823779	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,9,5
chr20	54959296	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:5,1:2,6:5,2,8,0
chr20	54972666	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:15,0,2,0
chr20	54974424	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr20	55012505	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,14;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.231:16:3,1:8,0:3,9,4,0
chr20	55025762	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:3,3:6,5:5,5,4,4
chr20	55025825	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:5,2:0,0:0|1:55025825_G_C:55025825:0,5,0,2
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chr20	55048496	.	T	TGAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:0,4,0,5
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chr20	55206401	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=115,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.595:23:2,6:7,6:1,8,5,9
chr20	55211581	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=186,170;MMQ=56,50;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr20	55212711	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	55800937	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=73,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,5:4,1:3,5,5,2
chr20	55909207	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=185,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.322:18:3,0:4,0:0,12,0,6
chr20	55909211	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=177,153;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.206:20:9,2:4,1:0,16,0,4
chr20	55909731	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=171,104;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:9,0,3,0
chr20	55913502	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.488:8:2,2:1,2:0,4,0,4
chr20	55929881	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,3:2,5,0,7
chr20	55982827	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=111,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr20	55982879	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=169,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr20	56078690	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:1,1:1,3,0,3
chr20	56083606	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:12,0,3,0
chr20	56089869	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=117,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:0,1:2,2:0,3,0,4
chr20	56098070	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.753:14:2,7:1,4:3,0,8,3
chr20	56137798	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=200,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:4,5:6,3:0|1:56137798_G_A:56137798:7,3,10,1
chr20	56137807	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=200,159;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:4,8:6,3:0|1:56137798_G_A:56137798:8,3,10,1
chr20	56137834	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.495:22:5,9:6,1:4,7,9,2
chr20	56138040	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:3,1:8,6:5,6,3,4
chr20	56138068	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:0,6:6,3:2,4,5,4
chr20	56179586	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr20	56182296	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.636:31:3,9:8,11:7,4,11,9
chr20	56188065	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	56190634	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=39,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,2:3,7:2,4,4,5
chr20	56190645	.	A	AGAGATCCTTGAGTCAGAAAT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=133,39;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:3,2:10,0:3,11,1,1
chr20	56190652	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=134,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:3,2:5,0:3,10,1,3
chr20	56195355	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.169:31:14,0:12,4:5,21,1,4
chr20	56227642	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=190,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0,11,0,2
chr20	56228019	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr20	56265364	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=20,16;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:56265364_G_T:56265364:2,1,1,0
chr20	56265366	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,12;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:56265366_A_C:56265366:1,1,2,0
chr20	56265370	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=22,28;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:56265366_A_C:56265366:1,1,2,0
chr20	56265381	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:56265364_G_T:56265364:2,2,1,0
chr20	56265385	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:56265364_G_T:56265364:2,2,1,0
chr20	56265389	.	G	A,C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,28,12;MFRL=0,119,119;MMQ=60,60,60;MPOS=13,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.76,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,1:0.676,0.218:6:0,2,0:0,2,0:0,0,4,2
chr20	56726107	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,9:0,0,4,17
chr20	56793546	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr20	56793899	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr20	56811400	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr20	56822236	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr20	56823395	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr20	56825826	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr20	56826934	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,12:0,0,4,25
chr20	56846580	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=84.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,14:0,0,4,23
chr20	57009796	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=164,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:1,5,0,3
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chr20	57415995	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:1,3,1,3
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chr20	57565072	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr20	57565943	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,5,5
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chr20	57570854	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,2:3,3:0,10,1,4
chr20	57576777	.	C	CTACCTTCCCCTCCCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	57609962	.	AAAC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:1,2,1,0
chr20	57610059	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.402:33:11,7:8,6:10,10,10,3
chr20	57611825	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,10;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.213:22:3,0:7,0:7,10,0,5
chr20	57611828	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=18,17;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.136:22:2,0:4,0:7,12,0,3
chr20	57612390	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,3:3,7:0,6,0,10
chr20	57613704	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.466:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr20	57617698	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:7,8:7,6:11,3,14,0
chr20	57767148	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=206,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:57767148_G_A:57767148:1,0,0,1
chr20	57767152	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=185,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57767148_G_A:57767148:2,0,0,1
chr20	57767153	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=185,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:57767148_G_A:57767148:2,0,0,1
chr20	57767156	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=185,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57767148_G_A:57767148:2,0,0,1
chr20	57781969	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,2:17,0:17,12,0,2
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chr20	57876871	.	C	CCTCCTATCTATAAGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57876862_A_T:57876862:0,0,0,1
chr20	57897543	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,13;MFRL=104,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.310:26:3,0:7,0:6,12,0,8
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chr20	58349316	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=153,0;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:9,0:11,3:0|1:58349311_G_A:58349311:17,4,2,1
chr20	58349603	.	A	ATT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58349603_A_ATT:58349603:0,0,0,1
chr20	58349604	.	G	GAATTAGAAGACACACATATGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,108;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58349603_A_ATT:58349603:0,0,0,1
chr20	58349606	.	G	GAGAATAATATTTCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,108;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58349603_A_ATT:58349603:0,0,0,1
chr20	58411441	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr20	58416667	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.660:10:2,3:1,4:0,3,0,7
chr20	58420336	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=95.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,37:0.421:88:26,19:25,17:17,34,9,28
chr20	58453225	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:58453225_G_A:58453225:0,1,0,1
chr20	58453228	.	A	ATATAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:58453225_G_A:58453225:0,1,0,1
chr20	58453229	.	G	GTACATAAAATATGAAAGTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:58453225_G_A:58453225:0,1,0,1
chr20	58466998	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:3,3:2,7:6,1,8,2
chr20	58468347	.	T	TTTGAGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	58470675	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=128,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:28,1:24,1:0|1:58470675_C_A:58470675:13,40,0,2
chr20	58470676	.	AGATTT	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=130,165;MMQ=60,60;MPOS=-1073741818;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:28,1:25,1:0|1:58470675_C_A:58470675:13,41,0,2
chr20	58497481	.	TA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.304:26:4,1:13,5:4,14,0,8
chr20	58522360	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=269,196;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:58522360_A_G:58522360:0,4,0,1
chr20	58522382	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=296,196;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:58522360_A_G:58522360:0,3,0,1
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chr20	60511728	.	CG	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
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chr20	60582772	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=194,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:60582767_G_C:60582767:0,2,0,1
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chr20	60835224	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=143,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:60835224_T_C:60835224:0,5,1,1
chr20	60835231	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=143,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:60835224_T_C:60835224:0,5,1,1
chr20	60835233	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=143,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:60835224_T_C:60835224:0,5,1,1
chr20	60835236	.	T	TCAGGATTCAAAGTAA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=143,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:60835224_T_C:60835224:0,5,1,1
chr20	60847390	.	G	GCTTGAATATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=186,238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	60848348	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:9,11:6,6:10,5,15,2
chr20	60857034	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr20	60881643	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:3,8:5,7:6,2,14,1
chr20	60882888	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=104,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr20	60886611	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:4,3:2,4:5,1,6,2
chr20	60892116	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:3,3,0,5
chr20	60892692	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,2,1
chr20	60895738	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.531:13:2,4:4,3:5,1,6,1
chr20	60902490	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	60902544	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr20	60905717	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=140,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr20	60906055	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,3,1
chr20	60908882	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr20	60908892	.	A	AGTGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GTGGG;STR;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr20	60908964	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:3,4:6,5:0|1:60908964_G_A:60908964:11,0,7,2
chr20	60908969	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:3,4:8,5:0|1:60908964_G_A:60908964:11,0,7,2
chr20	60909466	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	60909518	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=213,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr20	60913495	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:1,3:1,4:3,0,5,2
chr20	60921701	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=156,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:2,3,1,1
chr20	60921896	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:2,3:0,6:1,1,4,6
chr20	60937597	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,2,3
chr20	60963346	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.361:14:4,3:4,2:8,1,5,0
chr20	60969886	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr20	60971306	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:6,0,6,0
chr20	60971327	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:4,1,6,1
chr20	60982299	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=162,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr20	60985910	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.655:7:1,3:1,0:2,0,5,0
chr20	60990162	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=115,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:2,0:1,3:0|1:60990162_G_A:60990162:3,1,2,1
chr20	60990170	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=81,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,4:0.499:8:1,2:3,2:1|0:60990162_G_A:60990162:3,1,3,1
chr20	60990606	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:4,0,7,0
chr20	61040082	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=191,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:61040082_G_GA:61040082:0,1,0,1
chr20	61040083	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=191,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:61040082_G_GA:61040082:0,1,0,1
chr20	61040376	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61040376_A_C:61040376:0,0,1,0
chr20	61040381	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61040376_A_C:61040376:0,0,1,0
chr20	61040386	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:61040376_A_C:61040376:0,0,1,0
chr20	61040514	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr20	61041667	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=176,244;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:61041667_G_A:61041667:0,2,0,1
chr20	61041670	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=176,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:61041667_G_A:61041667:0,2,0,1
chr20	61048549	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,5:7,1:6,6,3,3
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chr20	61150928	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:0,3,1,7
chr20	61289958	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr20	61292536	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:1,1:4,7:2,3,3,5
chr20	61303004	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr20	61326636	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,1,10
chr20	61331678	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr20	61331921	.	A	ACAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:61331921_A_ACAC:61331921:0,0,0,1
chr20	61331923	.	T	TGTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:61331921_A_ACAC:61331921:0,0,0,1
chr20	61341286	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.409:25:10,5:4,5:1,14,5,5
chr20	61436129	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:61436129_T_TG:61436129:0,0,1,0
chr20	61436134	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:61436129_T_TG:61436129:0,0,1,0
chr20	61436141	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61436129_T_TG:61436129:0,0,1,0
chr20	61436145	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61436129_T_TG:61436129:0,0,1,0
chr20	61439696	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr20	61439708	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr20	61439721	.	C	CCAGCCCAAG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:61439721_C_CCAGCCCAAG:61439721:0,2,0,1
chr20	61439723	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:61439721_C_CCAGCCCAAG:61439721:0,2,0,1
chr20	61439725	.	G	GTCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:61439721_C_CCAGCCCAAG:61439721:0,2,0,1
chr20	61441035	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.845:17:2,11:0,3:0,2,10,5
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chr20	61451394	.	C	CTCTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:61451389_C_CTCGT:61451389:0,1,0,1
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chr20	61471799	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr20	61511141	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:3,8,0,2
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chr20	61524385	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,36;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr20	61526513	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,0:4,3:3,5,0,3
chr20	61527563	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:2,6:8,4:6,4,6,4
chr20	61537401	.	C	CTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr20	61588745	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr20	61595537	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr20	61597946	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,4:0,0,7,5
chr20	61598899	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr20	61833553	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	61847068	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr20	61870605	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr20	61872905	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,6:0,12:0,0,6,14
chr20	61873039	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,6:0,0,9,5
chr20	61875497	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr20	61878868	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:61878868_A_C:61878868:0,0,2,0
chr20	61878870	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:61878868_A_C:61878868:0,0,2,0
chr20	61879009	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr20	61880274	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr20	61907075	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr20	61916286	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr20	61917241	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr20	61941683	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:2,1:0,0:2,2,1,0
chr20	61943089	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,4:2,1:0,2,1,4
chr20	61943887	.	GCC	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:61943887_GCC_G:61943887:1,2,0,1
chr20	61943890	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:61943887_GCC_G:61943887:1,2,0,1
chr20	61943894	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:61943887_GCC_G:61943887:1,2,0,1
chr20	61943916	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=171,287;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr20	61945654	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr20	61946692	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr20	61948084	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:61948084_T_G:61948084:0,1,0,1
chr20	61948088	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:61948084_T_G:61948084:0,1,0,1
chr20	61948127	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:61948127_T_G:61948127:0,0,0,1
chr20	61948130	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:61948127_T_G:61948127:0,0,0,1
chr20	61950397	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=166,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr20	61951326	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr20	61952490	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr20	61953365	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr20	61957612	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=181,254;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:61957612_G_C:61957612:0,1,0,1
chr20	61957614	.	G	GAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=181,254;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61957612_G_C:61957612:0,1,0,1
chr20	61959642	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.571:10:4,1:0,3:4,0,3,3
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chr20	62198574	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=270,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
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chr20	62272793	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.655:7:2,2:0,1:0,2,0,5
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chr20	62294015	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,2:3,5:1,7,3,4
chr20	62319604	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=16,31;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.801:13:0,5:0,4:3,0,5,5
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chr20	62323006	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr20	62323293	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=178,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
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chr20	62324271	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:13,0:0|1:62324253_C_T:62324253:10,13,1,1
chr20	62324289	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:3,5:10,2:0|1:62324253_C_T:62324253:4,9,2,5
chr20	62324391	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,2,1
chr20	62325651	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=14,31;MFRL=188,300;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:62325651_A_AG:62325651:1,0,1,0
chr20	62325656	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,10;MFRL=188,300;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:62325651_A_AG:62325651:1,0,1,0
chr20	62325658	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=12,28;MFRL=300,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1|0:62325651_A_AG:62325651:1,0,1,0
chr20	62325665	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=78,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.607:3:1,1:0,0:0|1:62325651_A_AG:62325651:1,0,2,0
chr20	62328324	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=196,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr20	62332101	.	T	TTGGATTGTAAATTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=183,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:62332101_T_TTGGATTGTAAATTG:62332101:1,3,0,1
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chr20	62332638	.	A	AC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.567:21:4,5:4,6:4,5,10,2
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chr20	62669621	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=174,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:5,2:3,1:0|1:62669615_A_C:62669615:5,8,7,0
chr20	62669625	.	CGCCTT	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:9,3:7,3:0|1:62669615_A_C:62669615:13,8,6,0
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chr20	62669916	.	C	CCCGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=348,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCGGG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr20	62679807	.	C	CGCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62679807_C_CGCG:62679807:0,1,0,1
chr20	62679810	.	G	GGCTCACGCCTGTAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62679807_C_CGCG:62679807:0,1,0,1
chr20	62697751	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr20	62698188	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr20	62701092	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:4,6:5,3,5,3
chr20	62715089	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr20	62836271	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr20	62836520	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr20	62850210	.	C	CTTCTTCTTTCCTTCTTTGATCTTCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:2,0,0,1
chr20	62851020	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,13,2
chr20	62851123	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=160,139;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.148:29:10,0:14,3:15,10,0,4
chr20	62851148	.	GCA	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,139;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,0:12,4:11,10,0,4
chr20	62854778	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,0:2,3:0,3,0,3
chr20	62868043	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,2:2,6:0,5,2,6
chr20	62871232	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr20	62904542	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr21	10862947	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,28:0,18:0,0,27,20
chr21	10863087	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr21	10907137	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=189,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:2,2:1,4,0,2
chr21	10910291	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,170;MMQ=60,34;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,3:11,3:12,6,5,1
chr21	10910311	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=141,163;MMQ=60,26;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:6,2:11,2:10,8,3,1
chr21	10916293	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,161;MMQ=59,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.356:34:10,2:12,9:21,1,12,0
chr21	10916534	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=195,148;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr21	10942791	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,157;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,3:0.047:82:43,0:36,3:26,53,0,3
chr21	10944828	.	CAAG	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=167,185;MMQ=49,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:4,4:8,7:0,13,0,12
chr21	10959881	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,155;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=49.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:12,10:11,10:1,23,0,20
chr21	11049503	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=203,204;MMQ=33,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,2:9,1:5,14,2,1
chr21	11049516	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,8,13
chr21	11058119	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=153,186;MMQ=60,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:7,11:5,5:8,4,9,8
chr21	11058146	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=152,223;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:23,2:22,1:34,11,0,3
chr21	11058340	.	A	C	.	.	DP=66;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=140,188;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,3:0.059:66:35,2:28,1:0|1:11058340_A_C:11058340:16,47,0,3
chr21	11058348	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=140,188;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.069:56:27,2:20,1:0|1:11058340_A_C:11058340:10,43,0,3
chr21	11058349	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=138,152;MMQ=27,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.172:50:27,3:15,5:7,35,2,6
chr21	11058404	.	A	ACT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.920:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr21	11098674	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,5:0,0,9,6
chr21	11098813	.	A	AGAAATCGGCACCGCCCAGCGAGCGCTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=181,121;MMQ=47,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr21	14982886	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=125,152;MMQ=40,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.323:26:8,4:9,4:13,5,5,3
chr21	14982952	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,188;MMQ=52,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:15,1:10,4:12,13,2,3
chr21	14983098	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,131;MMQ=55,28;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:5,7,1,1
chr21	14992448	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=172,158;MMQ=24,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.199:38:17,4:14,3:11,20,7,0
chr21	14992475	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=171,169;MMQ=24,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,11:0.241:48:21,3:14,8:19,18,1,10
chr21	15011825	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,5:0,12:0,0,11,6
chr21	15013735	.	A	G	.	.	DP=127;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,124;MMQ=56,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=173.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,66:0.533:124:27,35:29,30:31,27,42,24
chr21	15481234	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr21	15524843	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:6,9:10,4:15,1,10,3
chr21	15558203	.	C	CAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=177,185;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr21	15558346	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:2,3,2,4
chr21	15558464	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	15561781	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=54,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr21	15596683	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,3:5,1:5,0,4,0
chr21	15596772	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,16:0,33:0,0,36,13
chr21	15596882	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,6:0,14:0,0,0,20
chr21	15747944	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,1:11,1:11,5,2,0
chr21	15748186	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr21	15755349	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=119,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,2:7,2:16,1,4,0
chr21	15884949	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.827:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	15893567	.	A	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,25:0.419:60:14,12:21,13:7,28,2,23
chr21	15893594	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,12:0,20:0,0,0,32
chr21	15966421	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:1,6,2,5
chr21	15984864	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:7,9:6,5:12,1,14,0
chr21	16015250	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.451:12:1,3:5,2:7,0,5,0
chr21	17102680	.	ACCG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CCG;STR;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.504:6:0,1:1,2:2,1,2,1
chr21	17102820	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=14,27;MFRL=114,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.877:10:0,6:0,3:0,1,1,8
chr21	17102859	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr21	17135372	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.435:13:4,3:3,3:0,7,0,6
chr21	17199289	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=168,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr21	17202780	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,21:0.414:51:18,13:11,7:28,2,16,5
chr21	17202812	.	T	C	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=107.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,34:0.474:72:21,14:16,20:30,8,24,10
chr21	17250213	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,85;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:18,3:23,0:16,26,3,0
chr21	18814237	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:18814237_A_C:18814237:0,3,0,1
chr21	18814240	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:18814237_A_C:18814237:0,3,0,1
chr21	18814242	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:18814237_A_C:18814237:0,3,0,1
chr21	18814244	.	CTGTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=88,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:18814237_A_C:18814237:0,3,0,1
chr21	18814261	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18814237_A_C:18814237:0,1,0,1
chr21	18932934	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr21	18933561	.	C	CAT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=90.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,9:0,0,21,0
chr21	18976588	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,167;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:17,2:6,0:0,23,0,2
chr21	19165942	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:0,3:8,5:0,9,0,8
chr21	19167479	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:9,5:2,2:10,2,6,1
chr21	19190427	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr21	19628809	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:5,2:10,1:14,6,3,0
chr21	19666526	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,3:0,0:0|1:19666526_C_T:19666526:3,1,3,0
chr21	19666530	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,2:1,0:0|1:19666526_C_T:19666526:3,1,3,0
chr21	19687376	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	19701421	.	GCT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=125,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.881:11:0,4:1,5:1,0,8,2
chr21	19704296	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr21	19770117	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=189,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,6:5,7:7,1,13,0
chr21	19770734	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=248,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr21	22658544	.	TTTTGTGA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTGTGA;STR;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:8,4:5,4:11,3,7,1
chr21	22664619	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:6,4:0,6:0,6,0,10
chr21	22696837	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:1,6:5,3:1,5,2,7
chr21	22696881	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr21	22840930	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	22841123	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,11:0,0,5,21
chr21	22910116	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,13:0.359:37:13,6:11,6:0|1:22910116_C_T:22910116:20,4,10,3
chr21	22910123	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,14:0.375:38:12,7:12,7:0|1:22910116_C_T:22910116:20,4,10,4
chr21	26542974	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	26959986	.	TATGA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=111,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,3:0,5:5,3,7,1
chr21	26961086	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=177,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:4,0,7,2
chr21	26965100	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr21	26966317	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,3:4,3:0,4,0,6
chr21	26973663	.	A	ATATACT	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=425.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,97:0.990:97:0,46:0,38:0,0,78,19
chr21	26976250	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,30:0.429:70:22,9:18,20:8,32,9,21
chr21	26979620	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=133,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr21	26979628	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.717:9:1,1:1,1:2,0,7,0
chr21	27066255	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=134,237;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:2,0:13,2:3,13,0,2
chr21	27074551	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,2:9,0:7,12,2,0
chr21	27078457	.	TGAGATACTG	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:7,2:9,0:0|1:27078457_TGAGATACTG_T:27078457:0,18,0,2
chr21	27078469	.	TCTCC	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:6,0:0|1:27078457_TGAGATACTG_T:27078457:0,16,0,2
chr21	27078475	.	AGGAAGTTGTT	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,1:5,0:0|1:27078457_TGAGATACTG_T:27078457:0,18,0,2
chr21	27078491	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=193,134;MMQ=60,60;MPOS=-16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:0|1:27078457_TGAGATACTG_T:27078457:0,14,0,2
chr21	27086653	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,303;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27086653_C_A:27086653:0,0,1,0
chr21	27086661	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,303;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27086653_C_A:27086653:0,0,1,0
chr21	27086705	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	27136460	.	AT	A,ATT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=147,181,161;MMQ=60,60,60;MPOS=7,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.56,3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,3:0.181,0.180:19:6,3,1:7,0,1:13,0,6,0
chr21	27136964	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:16,2:12,0:20,8,2,0
chr21	27141273	.	C	CATTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATTT;STR;TLOD=146.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,13:0,0,33,0
chr21	27326859	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=235,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:5,4:1,4:5,1,7,1
chr21	27326973	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,1:8,1:14,3,1,1
chr21	27327076	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=159,248;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:27327076_CT_C:27327076:0,3,0,1
chr21	27327092	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,248;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:27327076_CT_C:27327076:0,2,0,1
chr21	27327862	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr21	27369818	.	A	AAGAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0|1:27369818_A_AAGAG:27369818:0,2,0,1
chr21	27369820	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0|1:27369818_A_AAGAG:27369818:0,2,0,1
chr21	27945141	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=123,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:4,4:4,3:4,4,5,3
chr21	28210535	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=124,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.548:20:6,5:2,5:5,4,3,8
chr21	28210616	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	28210657	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr21	28211001	.	A	ATGTGACACTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=180,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr21	28212760	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,6:6,5:5,7,7,4
chr21	28215826	.	C	CACA	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=236.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,55:0.983:55:0,24:0,27:0|1:28215826_C_CACA:28215826:0,0,24,31
chr21	28215836	.	GC	G	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=233.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,58:0.984:58:0,25:0,31:0|1:28215826_C_CACA:28215826:0,0,21,37
chr21	28216445	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr21	28217320	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr21	28302122	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=214,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr21	28302147	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=137,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr21	28305212	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,4:4,1:5,5,4,1
chr21	28337776	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:5,13,0,2
chr21	28338425	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,3:7,4:6,3,2,5
chr21	30250615	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=247.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,73:0.987:73:0,42:0,31:0,0,40,33
chr21	30257729	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:0,3,0,5
chr21	30303388	.	GGTGT	G,GGTGTGT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33,34;MFRL=108,173,154;MMQ=60,60,60;MPOS=16,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,18;RU=GT;STR;TLOD=19.85,12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,5:0.509,0.375:14:0,6,1:1,2,4:1,0,13,0
chr21	30315681	.	T	A	.	.	DP=123;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=151.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,57:0.483:118:34,29:27,27:19,42,12,45
chr21	30318466	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,21,6
chr21	30330929	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,4:3,1:0,6,0,5
chr21	30338094	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:10,2:14,1:24,0,3,0
chr21	30338153	.	CA	C,CAA	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=32,34,29;MFRL=141,156,155;MMQ=60,60,60;MPOS=17,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=7.27,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:64,7,8:0.087,0.088:79:26,6,3:25,1,2:51,13,10,5
chr21	30338293	.	G	GC	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=138.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,19:0,0,0,36
chr21	30339120	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=153,101;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,6:5,5:1,6,4,7
chr21	30339205	.	AT	A,ATT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,32,31;MFRL=218,160,84;MMQ=60,60,60;MPOS=25,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=7.70,5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,4:0.277,0.268:15:2,2,0:5,2,3:6,1,7,1
chr21	30339234	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,0:7,5:8,2,5,0
chr21	30354610	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.621:24:4,9:4,6:7,2,12,3
chr21	30357307	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,2:5,1:0,5,0,3
chr21	30391660	.	GCGAC	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=207,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:30391660_GCGAC_G:30391660:1,2,0,1
chr21	30391666	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=207,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:30391660_GCGAC_G:30391660:1,2,0,1
chr21	30391667	.	ACC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=207,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:30391660_GCGAC_G:30391660:1,2,0,1
chr21	30391671	.	GAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.709:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	30409679	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,143;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:23,3:25,0:44,5,3,0
chr21	30410791	.	CTGAA	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,29:0.518:56:12,19:13,10:2,25,6,23
chr21	30411927	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,16;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:0,0:3,0:0,3,0,1
chr21	30414248	.	TTAGA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=236,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,2:3,0,3,0
chr21	30433911	.	A	ACAGGAGTTTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:1,13,0,2
chr21	30445774	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,5:3,2:10,0,7,0
chr21	30445948	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=186,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:2,5,0,8
chr21	30693824	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:14,2:20,2:6,28,1,3
chr21	30909644	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:6,2:18,0:6,19,2,0
chr21	30925853	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=135,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr21	30961186	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=114,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:9,7:6,7:7,8,6,8
chr21	31045511	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,3:5,1:1,11,0,4
chr21	31066436	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,209;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=25,26;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.714:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr21	31066462	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=207,209;MMQ=52,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31066462_G_A:31066462:0,1,0,1
chr21	31066466	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=207,209;MMQ=52,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31066462_G_A:31066462:0,1,0,1
chr21	31066482	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=207,209;MMQ=52,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31066462_G_A:31066462:0,1,0,1
chr21	31661732	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,1:16,1:7,21,0,2
chr21	31744127	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,7:0,0,10,8
chr21	31744474	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=124,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,3:0.054:72:32,0:35,3:43,26,1,2
chr21	31812772	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr21	31812878	.	C	CCTAGCCTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr21	31869286	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.931:26:1,10:0,15:1,0,20,5
chr21	31913981	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.940:14:0,7:0,4:0|1:31913981_AG_A:31913981:0,0,14,0
chr21	31914000	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0|1:31913981_AG_A:31913981:0,0,17,0
chr21	31988796	.	A	T	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,44:0.536:82:19,20:18,23:30,8,29,15
chr21	32119539	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:9,0:11,2:0|1:32119539_T_G:32119539:2,18,0,3
chr21	32119541	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:9,0:10,3:0|1:32119539_T_G:32119539:2,18,0,3
chr21	32201951	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.598:33:5,12:8,7:3,10,13,7
chr21	32201969	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=137.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,20:0,15:0,0,18,18
chr21	32202106	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,6:5,2:0,10,1,7
chr21	32493204	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr21	32503342	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=180,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr21	32524852	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=159,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.590:3:1,0:0,1:0,1,2,0
chr21	32525302	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr21	32526758	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:0,4:3,1:0,3,2,4
chr21	32526841	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=213,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr21	33044256	.	GGCT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCT;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.181:14:4,1:7,1:1,11,0,2
chr21	33044378	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:3,5:6,2:5,4,6,2
chr21	33044588	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:19,2:23,2:18,25,4,0
chr21	33069126	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:2,0:1,3,0,3
chr21	33074633	.	A	G	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=114.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,39:0.522:75:14,18:20,21:11,25,18,21
chr21	33355760	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr21	33371508	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=112,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,4:5,7:4,8,6,5
chr21	33371540	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:5,4:5,3:2,8,1,6
chr21	33641263	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.237:38:9,1:13,2:27,1,10,0
chr21	33642196	.	AA	GG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=228,167;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:33642196_AA_GG:33642196:0,3,0,1
chr21	33642201	.	TCA	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=228,167;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:33642196_AA_GG:33642196:0,3,0,1
chr21	33642202	.	C	CGCTTGAACCCGGAAGGTGG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=164,237;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.489:2:1,1:0,0:1|0:33642196_AA_GG:33642196:0,1,0,1
chr21	33642204	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=201,167;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:33642196_AA_GG:33642196:0,2,0,1
chr21	33642205	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,35;MFRL=201,167;MMQ=60,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:33642196_AA_GG:33642196:0,2,0,1
chr21	33642210	.	GCT	CAC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=164,167;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:33642196_AA_GG:33642196:0,1,0,1
chr21	33686771	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,2:6,1:0|1:33686771_T_C:33686771:11,0,3,0
chr21	33686775	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:5,1:6,1:0|1:33686771_T_C:33686771:12,0,2,0
chr21	33688865	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,9:4,3:4,2,8,4
chr21	33689422	.	G	GTATGAGGTGTCTGTCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	33690293	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr21	33691502	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,6,4
chr21	33691754	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,1:3,2:0,5,0,3
chr21	33694224	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=185,128;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,9:1,6:0,1,4,11
chr21	33694257	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,4:2,3:0,3,1,6
chr21	33697000	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr21	33709663	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=15,13;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,0:0,0:0|1:33709663_G_C:33709663:4,0,1,0
chr21	33709668	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,14;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:0,0:2,0:0|1:33709663_G_C:33709663:4,0,1,0
chr21	33709672	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,14;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:33709663_G_C:33709663:3,1,1,0
chr21	33709676	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,14;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:0,0:3,0:0|1:33709663_G_C:33709663:4,1,1,0
chr21	33711229	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:4,8:3,4:2,5,5,8
chr21	33713885	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,2:4,1:1,3,0,3
chr21	33719695	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,10:0,13:0,0,14,9
chr21	33721843	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr21	33726201	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr21	33726375	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:13,0:5,2:10,8,0,2
chr21	33727943	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=234,252;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:33727943_G_A:33727943:0,2,0,1
chr21	33727945	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=234,252;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:33727943_G_A:33727943:0,2,0,1
chr21	33727952	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=234,252;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:33727943_G_A:33727943:0,2,0,1
chr21	33727972	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,252;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	33730013	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=188,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr21	33730056	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr21	33735518	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=147,53;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.146:18:9,0:7,2:0|1:33735518_T_A:33735518:6,10,1,1
chr21	33735525	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=150,53;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:5,2:0|1:33735518_T_A:33735518:7,10,1,1
chr21	33735526	.	C	CATCACAAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=150,53;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:5,2:0|1:33735518_T_A:33735518:7,10,1,1
chr21	33735528	.	T	TTGTCTCTCA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=154,53;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:5,2:0|1:33735518_T_A:33735518:7,8,1,1
chr21	33738861	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:6,1,4,0
chr21	33738920	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,4:7,3:5,5,5,2
chr21	33740637	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	33740676	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr21	33740702	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:1,4:3,2,4,1
chr21	33757947	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:3,5:9,3:7,5,1,7
chr21	33765157	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	33830006	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.334:34:12,4:9,7:12,11,8,3
chr21	33974693	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr21	33979904	.	C	CAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,145;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:2,1:2,1:4,0,2,1
chr21	33982072	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,1:4,1:7,2,2,0
chr21	34127438	.	TAA	T,TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32,32;MFRL=90,208,157;MMQ=52,60,60;MPOS=32,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.59,16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,8:0.211,0.652:11:1,1,4:0,1,4:1,0,10,0
chr21	34157085	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr21	34157235	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,1:0,0,1,5
chr21	34166343	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr21	34169181	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	34169317	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.964:23:0,10:0,13:0,0,10,13
chr21	34399718	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,166;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr21	34442866	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=193,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr21	34443519	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=239,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:34443519_C_CG:34443519:0,2,1,0
chr21	34443521	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=239,230;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:34443519_C_CG:34443519:0,2,1,0
chr21	34443526	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=239,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:34443519_C_CG:34443519:0,2,1,0
chr21	34443532	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=104,230;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34443519_C_CG:34443519:0,1,1,0
chr21	34444732	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:34444732_T_C:34444732:0,4,0,1
chr21	34444737	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:34444732_T_C:34444732:0,4,0,1
chr21	34538065	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,4955450;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr21	34538093	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=268,9910900;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34538093_C_G:34538093:0,1,1,0
chr21	34538097	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=268,9910900;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34538093_C_G:34538093:0,1,1,0
chr21	34538100	.	C	CCAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=268,9910900;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34538093_C_G:34538093:0,1,1,0
chr21	34542150	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,3,10
chr21	34602807	.	TC	GG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=20,17;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.297:18:2,0:6,0:0|1:34602807_TC_GG:34602807:7,6,5,0
chr21	34602811	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.283:19:4,1:6,0:0|1:34602807_TC_GG:34602807:8,6,5,0
chr21	34602816	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,13;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:5,1:5,0:0|1:34602807_TC_GG:34602807:9,8,4,0
chr21	34602821	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.207:22:7,1:6,0:0|1:34602807_TC_GG:34602807:9,9,4,0
chr21	34617213	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr21	34617729	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr21	34624386	.	C	CATCTATCT,CATCTATCTATCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,160,165;MMQ=60,40,40;MPOS=11,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,11,12;RU=ATCT;STR;TLOD=3.29,12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.294,0.613:4:0,0,2:0,1,1:0,0,4,0
chr21	34624917	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr21	34633063	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:9,2:0|1:34633063_T_G:34633063:3,16,0,2
chr21	34633065	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:0|1:34633063_T_G:34633063:3,16,0,2
chr21	34635079	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,3:1,2:4,2,5,0
chr21	34649123	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:5,0:5,3:1,10,0,3
chr21	34666376	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=113,158;MMQ=60,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:1,3,1,2
chr21	34697264	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=102,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,1:3,3:3,1,4,0
chr21	34707808	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:6,6:1,3:6,1,7,2
chr21	34721348	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:4,7:6,4:12,0,11,0
chr21	34725075	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:13,2:21,2:26,8,4,0
chr21	34726127	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,1:2,4:0,7,0,5
chr21	34799350	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:7,8:4,8:2,9,0,16
chr21	34804966	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,5:1,5:3,0,8,2
chr21	34805197	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=23,25;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.282:11:4,2:4,1:0,8,1,2
chr21	34805240	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=193,152;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:34805240_G_T:34805240:0,3,0,1
chr21	34805243	.	AGT	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=197,152;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:34805240_G_T:34805240:0,4,0,1
chr21	34805248	.	CATGGTACA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=210,152;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:34805240_G_T:34805240:0,4,0,1
chr21	34805262	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=219,152;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:34805240_G_T:34805240:0,3,0,1
chr21	34809049	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:6,0,6,0
chr21	34823252	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,7:3,6:1,8,1,12
chr21	34837623	.	C	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,37:0.464:80:24,21:17,16:19,24,26,11
chr21	34837786	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:7,4:2,5:0,9,0,10
chr21	34861359	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,2:16,0:9,14,1,1
chr21	34871107	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr21	34871133	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=295,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr21	34878454	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,20,21;MFRL=153,176,154;MMQ=60,60,60;MPOS=26,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=T;STR;TLOD=5.06,4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.202,0.208:10:2,0,1:0,1,1:0,6,0,4
chr21	34889392	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:13,11,1,1
chr21	34893344	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr21	34894623	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=202,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:3,6:0,4:0,3,1,9
chr21	34897113	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.463:28:5,5:10,7:9,6,7,6
chr21	34897404	.	T	TCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=264,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:34897404_T_TCCC:34897404:0,1,0,1
chr21	34897407	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=264,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:34897404_T_TCCC:34897404:0,1,0,1
chr21	34900924	.	G	T,C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,11,21;MFRL=137,199,166;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.32,4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,3:0.120,0.190:18:6,0,0:5,0,2:5,8,0,5
chr21	34906807	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=182,190;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,2:13,0:16,0,2,0
chr21	34907636	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:2,1,0,1
chr21	34907647	.	A	ATAAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=197,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34907647_A_ATAAAAAT:34907647:0,1,0,1
chr21	34907653	.	A	AGCAAATGCTTTCTAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=197,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34907647_A_ATAAAAAT:34907647:0,1,0,1
chr21	34915324	.	CG	GC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=95.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,14:0,0,20,2
chr21	34923063	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:19,3:25,0:20,24,2,1
chr21	34932256	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=159,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:11,2:0|1:34932256_G_A:34932256:10,16,1,1
chr21	34932260	.	C	CCA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=157,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:12,2:0|1:34932256_G_A:34932256:10,17,1,1
chr21	34941823	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=84.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,29:0.473:62:15,20:15,8:26,7,25,4
chr21	34947856	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:8,1,6,0
chr21	34948684	.	G	GA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=147.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.973:34:0,16:0,16:0|1:34948684_G_GA:34948684:0,0,15,19
chr21	34948696	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=148.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,16:0,17:0|1:34948684_G_GA:34948684:0,0,16,19
chr21	34950609	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:6,6:5,6:11,1,10,2
chr21	34953676	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=143,78;MMQ=60,34;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.191:24:6,3:13,0:0|1:34953676_GT_G:34953676:6,14,2,2
chr21	34953687	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=147,78;MMQ=60,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:8,4:13,0:0|1:34953676_GT_G:34953676:6,16,2,2
chr21	34954602	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,2:4,4:0,4,0,6
chr21	34959776	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,28:0.564:49:8,15:13,10:18,3,22,6
chr21	34961965	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=205,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr21	34963585	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,4:5,1:1,8,0,5
chr21	34988745	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,233;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	35094878	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=89,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.217:42:14,0:14,0:14,19,9,0
chr21	35107734	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr21	35124253	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:5,10:5,9:2,8,3,16
chr21	35127735	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr21	35186302	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:18,0:15,2:7,27,0,2
chr21	35258543	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,16;MFRL=122,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.234:19:6,0:7,2:4,11,4,0
chr21	35260481	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:9,7:8,6:12,5,8,5
chr21	35279604	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,4:3,5:7,0,5,4
chr21	35284734	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=114,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:1,4,1,3
chr21	35446136	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,0,15
chr21	35467472	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=83.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,11:0,0,18,4
chr21	35468607	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:15,8,1,1
chr21	35469262	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:7,7,1,1
chr21	35469708	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=51.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,4:0,16:0,0,10,10
chr21	35469726	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=65.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,3:0,17:0,0,11,10
chr21	35470210	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0|1:35470210_T_G:35470210:0,0,8,15
chr21	35470213	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0|1:35470210_T_G:35470210:0,0,8,14
chr21	35474335	.	TGAGG	T	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,2:0.044:66:27,1:26,1:0|1:35474335_TGAGG_T:35474335:27,37,1,1
chr21	35474340	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:30,1:30,1:0|1:35474335_TGAGG_T:35474335:26,36,1,1
chr21	35475614	.	T	TA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.441:21:7,4:5,5:8,4,7,2
chr21	35742722	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,3:2,8:3,1,9,2
chr21	35742750	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.675:19:2,5:3,7:4,2,6,7
chr21	35757787	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:5,4:14,9:15,4,9,4
chr21	35757915	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:7,2:9,5:3,13,0,7
chr21	35771960	.	C	CTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,3:4,3:3,2,7,2
chr21	35896094	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=191,264;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:35896094_TC_T:35896094:0,3,0,1
chr21	35896097	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=191,264;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:35896094_TC_T:35896094:0,3,0,1
chr21	35896103	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=191,264;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:35896094_TC_T:35896094:0,3,0,1
chr21	35899059	.	A	AC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,3:3,2:5,7,1,4
chr21	36080204	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr21	36080398	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,0:3,6:1,9,1,5
chr21	36080908	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=208,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:2,1,5,1
chr21	36081909	.	T	TCTTATCTATCTCTTTCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=116,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.387:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr21	36081912	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=144,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:36081912_G_T:36081912:0,2,0,1
chr21	36081913	.	G	GTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=144,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:36081912_G_T:36081912:0,2,0,1
chr21	36193871	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr21	36206786	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=149,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:36206786_G_GA:36206786:2,1,0,1
chr21	36206787	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=149,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:36206786_G_GA:36206786:2,1,0,1
chr21	36265323	.	CT	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=160,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.141:37:17,3:12,2:1,31,0,5
chr21	36421261	.	G	GTGCCTGCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:36421261_G_GTGCCTGCC:36421261:0,4,0,1
chr21	36421263	.	G	GTACC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:36421261_G_GTGCCTGCC:36421261:0,4,0,1
chr21	37092980	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,5:3,7:3,3,8,4
chr21	37408608	.	AACGT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACGT;STR;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr21	37414194	.	C	CA,CAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,18,20;MFRL=0,165,122;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.70,6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.425,0.489:7:0,1,1:0,0,1:0,0,1,6
chr21	37417997	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:3,7:9,8:6,6,11,4
chr21	37425955	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,5,16
chr21	37425971	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,13:0,0,4,20
chr21	37429679	.	G	C	.	.	DP=171;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=519.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,159:0.994:159:0,100:0,56:0,0,84,75
chr21	37429778	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,0:4,3:0,10,0,4
chr21	37431265	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:0,3,0,9
chr21	37443156	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.899:7:0,5:0,2:0|1:37443156_T_TG:37443156:0,0,7,0
chr21	37443162	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.916:10:0,8:0,2:0|1:37443156_T_TG:37443156:0,0,10,0
chr21	37518362	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr21	37572889	.	CC	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,173;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr21	37583804	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,16,7
chr21	37586459	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.233:17:5,1:5,0:5,8,4,0
chr21	37586877	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr21	37619724	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr21	37650182	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=198,192;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr21	37650235	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=192,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr21	37653705	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr21	37653723	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=159,164;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:5,3,3,0
chr21	37653942	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,6:6,2:1,8,0,8
chr21	37660268	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr21	37660988	.	TA	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:16,0:21,3:25,16,2,1
chr21	37661041	.	A	AT	.	.	DP=101;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=60.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,40:0.435:90:16,19:34,20:30,20,18,22
chr21	37661180	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:1,5:5,7:0,6,2,10
chr21	37664554	.	CT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,23,17;MFRL=0,208,162;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.60,9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.438,0.452:5:0,0,1:0,2,0:0,0,0,5
chr21	37664571	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:0,3,0,6
chr21	37665521	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,11;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37665521_A_C:37665521:0,0,1,0
chr21	37665526	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37665521_A_C:37665521:0,0,1,0
chr21	37665530	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37665521_A_C:37665521:0,0,1,0
chr21	37665533	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,0:0|1:37665521_A_C:37665521:0,0,1,0
chr21	37706087	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=149,191;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.282:11:1,1:3,0:0,8,0,3
chr21	37706100	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=165,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,1:3,1:0,12,0,2
chr21	37711293	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,76;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:7,3:3,0:0,10,0,4
chr21	37721593	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:10,0,2,0
chr21	37728892	.	C	CTTGAA	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=181.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,47:0.551:85:22,27:16,15:25,13,36,11
chr21	37729088	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:7,5:6,10:0,13,0,15
chr21	37734540	.	CT	C	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=134,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.353:38:9,7:9,5:9,15,10,4
chr21	37749689	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:4,3,3,1
chr21	37759811	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=170,147;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:3,2:6,0:11,0,2,0
chr21	37759815	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,172;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:3,3:8,0:12,0,3,0
chr21	37775068	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:6,0:10,3,2,1
chr21	37781046	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:9,6:6,4:12,3,7,3
chr21	37781186	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:8,0:5,2:1,13,0,2
chr21	37785692	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	38081562	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0|1:38081562_T_G:38081562:0,0,0,10
chr21	38081577	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:38081562_T_G:38081562:0,0,0,8
chr21	38084773	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=127,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.281:22:6,4:10,1:14,2,5,1
chr21	38092029	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:38092029_T_C:38092029:0,0,2,0
chr21	38092039	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:38092029_T_C:38092029:0,0,2,0
chr21	38113998	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=120,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:5,1,3,0
chr21	38115825	.	C	CCTATTTCTTTGTGGAAATAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:14,2:5,0:8,11,0,2
chr21	38116955	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=249,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr21	38128780	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=118,197;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:2,0:2,1:0|1:38128780_G_A:38128780:2,6,3,0
chr21	38128782	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=118,197;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:2,1:5,1:0|1:38128780_G_A:38128780:2,6,3,0
chr21	38132172	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=135,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:1,5,1,3
chr21	38139632	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=104,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,2:0,5:1,2,2,5
chr21	38302769	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,9:0,17:0,0,7,21
chr21	38380368	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	38444863	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,11:0,10:0,0,4,20
chr21	38444881	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,6:3,6:0,8,2,10
chr21	38444890	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,4:6,1:1,10,0,5
chr21	38460488	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,10:0,0,19,6
chr21	38462614	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr21	38466203	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr21	38466261	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,18:0,16:0,0,35,0
chr21	38467616	.	C	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=219.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,43:0,23:0,0,53,15
chr21	38469017	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr21	38495185	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr21	38495213	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr21	38495270	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=83.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,13:0,0,11,13
chr21	38501467	.	T	TGTATGTATGTATGTATGTATG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.126:21:6,0:13,2:0,19,0,2
chr21	38512812	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,2:2,2:5,3,4,0
chr21	38522353	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,32,35,36;MFRL=147,156,140,165;MMQ=60,60,60,60;MPOS=1,14,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.80,6.06,10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:31,3,6,9:0.067,0.116,0.189:49:19,1,2,6:12,2,4,3:31,0,18,0
chr21	38525198	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=147.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,24:0,20:0,0,35,9
chr21	38528866	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:0|1:38528866_A_G:38528866:1,0,3,0
chr21	38528872	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0|1:38528866_A_G:38528866:0,0,5,0
chr21	38531921	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr21	38532058	.	TG	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=72.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,19:0,5:0,0,9,15
chr21	38532068	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=75.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,6:0,0,6,17
chr21	38532086	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,5,15
chr21	38533215	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:2,13,0,2
chr21	38534228	.	A	AT	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=271.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,64:0.986:64:0,18:0,40:0|1:38534228_A_AT:38534228:0,0,59,5
chr21	38534234	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=287.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,69:0.987:69:0,23:0,45:0|1:38534228_A_AT:38534228:0,0,63,6
chr21	38539745	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,5:0,10:0,0,15,0
chr21	38539836	.	T	TA	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=307.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,91:0.990:92:0,44:1,45:1,0,69,22
chr21	38544836	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,155;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,4:7,0:12,1,4,0
chr21	38563639	.	C	T	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=131.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,48:0.466:103:21,21:33,27:26,29,30,18
chr21	38564530	.	CT	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=107,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.251:30:12,3:8,4:5,18,1,6
chr21	38567912	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:8,0:12,2,2,0
chr21	38570055	.	TAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=218,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr21	38570263	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,0:13,2:10,15,1,1
chr21	38572445	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:0|1:38572445_G_A:38572445:20,0,2,0
chr21	38572448	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:14,0:8,2:0|1:38572445_G_A:38572445:22,0,2,0
chr21	38599934	.	TG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=65.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,6:0,0,9,12
chr21	38600154	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=40.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr21	38604570	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr21	38604600	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=37,28;MFRL=123,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr21	38613037	.	T	TGTATCTGTCTTTCTTGAGTGGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=157,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.666:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr21	38850640	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:7,2:6,2:0,13,1,3
chr21	38877503	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr21	38997427	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,5:5,1:6,1,6,0
chr21	39212857	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	39325234	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,19:0.741:25:3,10:3,9:0|1:39325234_C_T:39325234:4,2,6,13
chr21	39325237	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:13,0:9,3:0|1:39325234_C_T:39325234:10,12,0,3
chr21	39755893	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=137,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr21	39755921	.	A	ATCCCG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=159,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39755921_A_ATCCCG:39755921:0,1,0,1
chr21	39755923	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=159,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39755921_A_ATCCCG:39755921:0,1,0,1
chr21	39775373	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr21	40182049	.	AT	A	.	.	DP=205;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:119,11:0.069:130:54,8:57,3:23,96,4,7
chr21	40190620	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr21	40549289	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr21	40551943	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:40551943_A_G:40551943:0,0,1,4
chr21	40551944	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:40551943_A_G:40551943:0,0,1,4
chr21	40552408	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr21	40553845	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr21	40555160	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,5,2
chr21	40555351	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr21	40572072	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr21	40574191	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	40590624	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr21	40590646	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40590646_G_T:40590646:0,2,0,1
chr21	40590649	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40590646_G_T:40590646:0,2,0,1
chr21	40590650	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40590646_G_T:40590646:0,2,0,1
chr21	40597215	.	A	AAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	40636354	.	TAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=A;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr21	40642189	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,8:0,16:0,0,23,1
chr21	40642386	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr21	40646230	.	CGAGA	C,CGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33,32;MFRL=124,168,165;MMQ=60,60,60;MPOS=15,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=GA;STR;TLOD=4.76,17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.199,0.588:11:0,1,1:1,1,6:2,0,8,1
chr21	40650621	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=196.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,31:0,21:0,0,53,0
chr21	40650627	.	T	TA	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,8:0.172:48:22,6:18,1:40,0,7,1
chr21	40667611	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,158;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:7,1,2,0
chr21	40684861	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr21	40684887	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	40685135	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.751:29:3,10:3,10:7,0,22,0
chr21	40715132	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=91.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,35:0.442:79:21,18:22,15:9,35,7,28
chr21	40715175	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.397:41:10,8:14,8:0,25,0,16
chr21	40720536	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:4,1:0,0:0|1:40720536_G_GC:40720536:1,3,0,1
chr21	40720540	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:3,1:0,0:0|1:40720536_G_GC:40720536:1,3,0,1
chr21	40762660	.	TC	AA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:9,0:12,5,2,0
chr21	40777834	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,0;MFRL=165,54;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:40777834_C_CT:40777834:3,0,0,1
chr21	40777836	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=164,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:40777834_C_CT:40777834:4,0,0,1
chr21	40847249	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr21	40880881	.	CTTGAA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=101.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,14:0,0,17,6
chr21	40883671	.	G	GAGA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGA;STR;TLOD=132.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,15:0,0,12,22
chr21	40969620	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=91,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.621:14:0,2:4,6:0|1:40969620_G_A:40969620:4,1,6,3
chr21	40969621	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=109,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,5:0.374:14:3,1:6,4:1|0:40969620_G_A:40969620:6,3,4,1
chr21	40977826	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,3:0,0,11,4
chr21	40981490	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=94,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:6,2:16,0:11,11,1,1
chr21	41033313	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:0|1:41033313_G_A:41033313:6,10,1,1
chr21	41033327	.	A	ATTTAAAACATAAAAGTCAATTCTAGT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:15,0:7,2:0|1:41033313_G_A:41033313:8,14,1,1
chr21	41117310	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	41117533	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,151;MMQ=59,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr21	41137507	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,11,13
chr21	41142803	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr21	41165418	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=188,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:7,5:1,6:5,3,9,2
chr21	41165566	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=111.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,16:0,17:0,0,11,23
chr21	41270521	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=80,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr21	41270527	.	A	AGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:41270527_A_AGC:41270527:0,3,0,1
chr21	41270529	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:41270527_A_AGC:41270527:0,3,0,1
chr21	41270564	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	41434671	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=213,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr21	41450573	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr21	41496272	.	T	TAAGATA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr21	41514421	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr21	41516322	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=164,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr21	41516366	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr21	41516472	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,0:7,2:7,11,1,1
chr21	41668047	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=128,43;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.100:37:14,3:20,0:18,16,2,1
chr21	42218471	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,0:2,0:0|1:42218471_A_C:42218471:0,3,2,0
chr21	42218472	.	T	TGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,17;RU=G;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:42218471_A_C:42218471:0,3,2,0
chr21	42551840	.	AAGCATAGCCCGGGAGGG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:4,2:7,0:3,13,0,2
chr21	42553741	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,1:9,1:7,8,0,2
chr21	42554042	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.325:32:8,6:13,4:16,6,6,4
chr21	42555390	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:42555390_T_C:42555390:0,4,0,1
chr21	42555391	.	G	GTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:42555390_T_C:42555390:0,4,0,1
chr21	42598164	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.201:26:7,5:14,0:21,0,5,0
chr21	42615293	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:7,3:3,7:7,3,8,3
chr21	42622657	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,14,6
chr21	42622786	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,0:4,4:5,6,1,3
chr21	42688724	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr21	42694870	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=174,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,0:1,3:3,1,2,2
chr21	42694878	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=118,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:4,2,0,2
chr21	42718839	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=239,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr21	42762702	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=230,181;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:42762702_A_G:42762702:0,3,0,1
chr21	42762704	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=230,181;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:42762702_A_G:42762702:0,3,0,1
chr21	42767733	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr21	42771362	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr21	42775179	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=107.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,14:0,10:0|1:42775179_G_GT:42775179:0,0,16,9
chr21	42775180	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=107.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,13:0,10:0|1:42775179_G_GT:42775179:0,0,16,9
chr21	42808015	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr21	42811830	.	A	AATGGAATGGAATGAAATGGAATTAAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=119,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:2,0:0,1:0|1:42811830_A_AATGGAATGGAATGAAATGGAATTAAAT:42811830:1,1,0,1
chr21	42811833	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=119,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:42811830_A_AATGGAATGGAATGAAATGGAATTAAAT:42811830:1,1,0,1
chr21	42817354	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:4,1,4,1
chr21	42818135	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=204,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42818135_C_CAA:42818135:0,1,0,1
chr21	42818138	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=204,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42818135_C_CAA:42818135:0,1,0,1
chr21	42821265	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,0,3
chr21	42822983	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr21	42830716	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=207,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,5:1,1:0,2,1,5
chr21	42839812	.	C	CTGAGGAGG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=100,580;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:0|1:42839812_C_CTGAGGAGG:42839812:7,11,2,0
chr21	42839813	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=100,580;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:9,2:9,0:0|1:42839812_C_CTGAGGAGG:42839812:7,11,2,0
chr21	42842713	.	C	CCTAAGGCCTCGGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.760:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr21	42843960	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr21	42848560	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr21	42852311	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:0,4:0|1:42852311_G_A:42852311:2,0,5,0
chr21	42852320	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:1,1:4,1:1|0:42852311_G_A:42852311:5,0,2,0
chr21	42852497	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,21:0.425:50:14,7:13,14:25,4,16,5
chr21	42852565	.	C	CT	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=133,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.128:35:16,2:13,3:11,19,2,3
chr21	42860314	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,15;MFRL=129,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,1:0|1:42860314_G_A:42860314:2,3,1,1
chr21	42860319	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:42860314_G_A:42860314:2,3,1,1
chr21	42860532	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr21	43161481	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=180,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr21	43162200	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr21	43164232	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=179,209;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:4,1,2,3
chr21	43164322	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=179,110;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43164322_G_A:43164322:0,3,0,1
chr21	43164324	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=179,110;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:43164322_G_A:43164322:0,3,0,1
chr21	43164345	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr21	43164394	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	43221826	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.429:47:10,14:17,6:17,10,12,8
chr21	43221983	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr21	43222779	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:4,1:3,2:8,0,3,0
chr21	43230700	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:3,5,1,1
chr21	43231296	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	43236252	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr21	43242207	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,6:1,2:4,0,8,0
chr21	43246223	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr21	43255727	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr21	43258000	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,7:0,0,11,4
chr21	43259646	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=10,13;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:1,1:0,0:0|1:43259646_G_C:43259646:3,0,3,0
chr21	43259651	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,10;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.441:7:2,0:0,0:0|1:43259646_G_C:43259646:4,0,3,0
chr21	43274653	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr21	43281651	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr21	43299261	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=65.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,4,17
chr21	43299327	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr21	43309191	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0,0,16,5
chr21	43325742	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr21	43327896	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:16,2:13,3:10,19,1,4
chr21	43332605	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:43332605_T_TA:43332605:0,0,1,3
chr21	43332608	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:43332605_T_TA:43332605:0,0,1,3
chr21	43332612	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:43332605_T_TA:43332605:0,0,1,3
chr21	43338175	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=192,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,1:3,6:4,0,6,1
chr21	43338392	.	C	CTGTCTG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43338392_C_CTGTCTG:43338392:0,3,0,1
chr21	43338393	.	A	AGCTC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43338392_C_CTGTCTG:43338392:0,3,0,1
chr21	43338397	.	T	TTGCATAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43338392_C_CTGTCTG:43338392:0,3,0,1
chr21	43338400	.	CG	TG,TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32,30;MFRL=147,196,173;MMQ=60,60,60;MPOS=19,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.34,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.429,0.286:4:1,0,1:0,2,0:0,1,0,3
chr21	43338404	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43338392_C_CTGTCTG:43338392:0,3,0,1
chr21	43338933	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:1,2:9,4:9,1,4,2
chr21	43338948	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,0:11,2:11,4,2,2
chr21	43339143	.	C	CTGTG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=TG;STR;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:0|1:43339143_C_CTGTG:43339143:0,2,0,3
chr21	43339154	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:43339143_C_CTGTG:43339143:0,2,0,2
chr21	43339163	.	G	GTACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.393:3:2,1:0,0:1|0:43339143_C_CTGTG:43339143:0,2,0,1
chr21	43339165	.	A	ACCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:43339143_C_CTGTG:43339143:0,2,0,1
chr21	43342046	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=114,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,3:8,4:8,5,6,1
chr21	43362203	.	GT	AC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,4:4,1:11,1,5,0
chr21	43413171	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:12,1:15,2:11,17,2,1
chr21	43519032	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=117,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:4,2,4,1
chr21	43519369	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr21	43529642	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=116,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:2,2,2,0
chr21	43529652	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=92,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,2,0
chr21	43529819	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	43529910	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,328;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	43539523	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr21	43541342	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=78.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,8:0,0,4,18
chr21	43546489	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:11,2:3,0:13,1,1,1
chr21	43547143	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:14,0:8,3:14,8,3,0
chr21	43547237	.	A	ACCACCTTGAGGTTGCTTT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:0|1:43547237_A_ACCACCTTGAGGTTGCTTT:43547237:10,8,0,2
chr21	43547239	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:10,1:0|1:43547237_A_ACCACCTTGAGGTTGCTTT:43547237:10,8,0,2
chr21	43549794	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=132,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:2,2:0,4:1,2,5,1
chr21	43557736	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,5,8
chr21	43557775	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=83,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,1:2,0:0|1:43557775_G_GAA:43557775:0,2,0,1
chr21	43557776	.	TGC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=83,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,1:1,0:0|1:43557775_G_GAA:43557775:0,2,0,1
chr21	43704650	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr21	43766560	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,9:0,6:0,0,12,3
chr21	43767500	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr21	43770926	.	CT	C,CTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31,33;MFRL=137,156,168;MMQ=60,60,60;MPOS=6,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.58,7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,4:0.216,0.228:20:7,4,4:4,1,0:11,0,8,1
chr21	43808964	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr21	43833286	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:5,0:4,7,1,1
chr21	43836770	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=147,158;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.252:9:3,0:2,1:2,5,0,2
chr21	43836793	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=135,243;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr21	43855067	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr21	43862466	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr21	43916339	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:0,5,1,4
chr21	43938673	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,6:5,6:2,9,2,10
chr21	43955735	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,2:3,1:0,5,0,4
chr21	43959770	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,28:0.617:45:8,14:9,14:5,12,12,16
chr21	43963759	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=87,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,5:1,4:0,3,0,9
chr21	43967126	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:2,4:3,5:4,1,8,1
chr21	43983913	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:8,2:12,0:18,4,2,0
chr21	44074008	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.182:29:13,2:7,0:1,22,6,0
chr21	44107960	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:4,0,6,0
chr21	44107989	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr21	44118958	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr21	44151923	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:9,3:9,0:12,8,3,0
chr21	44152149	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=92,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:8,7:1,3:6,3,6,4
chr21	44152327	.	C	CTGCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44152327_C_CTGCA:44152327:0,0,0,1
chr21	44152329	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44152327_C_CTGCA:44152327:0,0,0,1
chr21	44152330	.	G	GCTAGCTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44152327_C_CTGCA:44152327:0,0,0,1
chr21	44163839	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,14,0
chr21	44174275	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	44180916	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.748:14:0,7:3,3:0,3,8,3
chr21	44188234	.	GAGC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=191,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AGC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:2,1,1,0
chr21	44192727	.	A	AAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44192727_A_AAAG:44192727:0,1,0,1
chr21	44192728	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44192727_A_AAAG:44192727:0,1,0,1
chr21	44195537	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=199,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:0,0:2,1:0,4,0,3
chr21	44279708	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=201,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44279708_C_T:44279708:0,1,1,0
chr21	44279711	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=201,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:44279708_C_T:44279708:0,1,1,0
chr21	44296933	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:7,1:2,1:1,9,0,2
chr21	44296977	.	CC	GG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.713:5:1,4:0,0:0|1:44296977_CC_GG:44296977:0,1,0,4
chr21	44296982	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=168,205;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0|1:44296977_CC_GG:44296977:0,1,0,2
chr21	44296985	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=233,145;MMQ=53,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr21	44299684	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr21	44324137	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,1:8,1:8,7,1,1
chr21	44437138	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:44437138_AC_A:44437138:1,3,0,1
chr21	44437141	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:44437138_AC_A:44437138:1,3,0,1
chr21	44437142	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr21	44448718	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:3,6:2,5:5,0,11,0
chr21	44475786	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:0|1:44475786_C_T:44475786:6,0,6,0
chr21	44475796	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:0|1:44475786_C_T:44475786:7,0,6,0
chr21	44476174	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:6,1:3,0:5,4,1,1
chr21	44477095	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	44485334	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=134,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:10,9,2,0
chr21	44514488	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.448:29:12,11:4,1:15,1,13,0
chr21	44514969	.	A	ATG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr21	44515504	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.408:30:7,5:10,7:15,3,11,1
chr21	44515685	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,4:8,3:5,6,1,7
chr21	44527458	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,13;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.652:6:0,1:0,0:2,0,4,0
chr21	44527669	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,8:2,6:0,4,1,13
chr21	44589920	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=C;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.577:12:0,0:3,3:0,5,1,6
chr21	44590040	.	C	CATTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=200,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:44590040_C_CATTT:44590040:0,3,0,1
chr21	44590042	.	G	GCACCCTGGCATTGATGCCTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=200,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:44590040_C_CATTT:44590040:0,3,0,1
chr21	44590059	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr21	44592404	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=217,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.597:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr21	44839654	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	44841036	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=146,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:4,2:4,3:6,3,3,2
chr21	44841052	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=103,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,1:2,4:4,1,3,2
chr21	44841091	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=149,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:4,2,4,2
chr21	45064296	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,4:8,3:0,15,0,7
chr21	45076373	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr21	45076443	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:6,2,4,3
chr21	45089877	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,7:5,2:1,8,3,6
chr21	45092095	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:13,0,2,0
chr21	45169005	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=63,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:0|1:45169005_A_G:45169005:0,4,0,4
chr21	45169046	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=210,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1|0:45169005_A_G:45169005:0,1,0,1
chr21	45170285	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr21	45172379	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=207,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr21	45175958	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:1,6,3,5
chr21	45211404	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=211,294;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45211404_T_G:45211404:0,2,0,1
chr21	45211406	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=211,294;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45211404_T_G:45211404:0,2,0,1
chr21	45211409	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=211,294;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45211404_T_G:45211404:0,2,0,1
chr21	45211413	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=211,294;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:45211404_T_G:45211404:0,2,0,1
chr21	45217495	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=131,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:8,11,0,2
chr21	45390749	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=235,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr21	45391272	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,0:3,5:7,3,5,0
chr21	45402333	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,10;MFRL=89,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:3,0:0,0:1,2,0,1
chr21	45402355	.	A	ACGGCCTTTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=137,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr21	45402356	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=192,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45402356_C_A:45402356:0,2,0,1
chr21	45402357	.	A	AAGGGAGATCTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=192,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45402356_C_A:45402356:0,2,0,1
chr21	45475842	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45475842_C_CCT:45475842:1,0,0,1
chr21	45475847	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45475842_C_CCT:45475842:1,0,0,1
chr21	45479424	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:7,1:4,16,1,1
chr21	45483487	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=138,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:4,2:7,7,2,0
chr21	45494122	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr21	45494407	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:45494407_T_C:45494407:0,3,0,1
chr21	45494409	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:45494407_T_C:45494407:0,3,0,1
chr21	45494410	.	CGGAGG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,1:1,0:0|1:45494407_T_C:45494407:0,3,0,1
chr21	45514141	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,4:0,0,1,15
chr21	45514149	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,1,16
chr21	45514168	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr21	45514188	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr21	45518500	.	A	AAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:45518500_A_AAG:45518500:0,2,0,1
chr21	45518504	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:45518500_A_AAG:45518500:0,2,0,1
chr21	45534032	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr21	45538782	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr21	45539240	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr21	45539426	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,3,11
chr21	45540143	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr21	45540207	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr21	45547736	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=154,73;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.590:3:0,1:0,1:0|1:45547736_T_TA:45547736:1,0,2,0
chr21	45547752	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,14;MFRL=154,146;MMQ=60,58;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:0,0:0|1:45547736_T_TA:45547736:3,0,1,0
chr21	45548005	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr21	45548046	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:4,0,7,0
chr21	45548530	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:45548530_G_A:45548530:0,0,0,1
chr21	45548537	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45548530_G_A:45548530:0,0,0,1
chr21	45550460	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,6,5
chr21	45561039	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,9,7
chr21	45565341	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr21	45648992	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr21	45649543	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=207,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,7:3,4:2,2,0,11
chr21	45650009	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	45651413	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	45670863	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,21;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45670863_G_T:45670863:1,0,0,1
chr21	45670864	.	G	GTGCCGAAGCTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=69,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:45670863_G_T:45670863:2,0,0,1
chr21	45670867	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=69,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:45670863_G_T:45670863:2,0,0,1
chr21	45680840	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=245,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45680840_TG_AA:45680840:0,1,0,1
chr21	45680843	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=245,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45680840_TG_AA:45680840:0,1,0,1
chr21	45680848	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=245,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45680840_TG_AA:45680840:0,1,0,1
chr21	45706033	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,0:3,0:0|1:45706033_G_C:45706033:0,6,3,0
chr21	45706037	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:3,1:0|1:45706033_G_C:45706033:0,7,3,0
chr21	45706044	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,2:4,1:0|1:45706033_G_C:45706033:0,7,3,0
chr21	45706046	.	TG	CC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:4,0:0|1:45706033_G_C:45706033:0,6,3,0
chr21	45706053	.	AGG	CCC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=158,202;MMQ=60,58;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:0|1:45706033_G_C:45706033:0,7,2,0
chr21	45712357	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.831:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	45733682	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=233,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:1,0:1,0:1,1,0,2
chr21	45733689	.	C	CCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=196,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:1,2,0,1
chr21	45733702	.	GAAGCTGTGGCCCAGA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=234,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:45733702_GAAGCTGTGGCCCAGA_G:45733702:2,1,0,1
chr21	45733721	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=245,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45733702_GAAGCTGTGGCCCAGA_G:45733702:2,0,0,1
chr21	45733911	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,5:0,0,4,10
chr21	45741854	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr21	45742115	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr21	45742822	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:1,3:1,2:2,1,2,3
chr21	45743594	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,321;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	45746214	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr21	45746225	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr21	45750248	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr21	45757637	.	T	TGTTCTTAAAATCTTCTTTGGTAAGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr21	45774657	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:12,0:15,3:5,22,0,3
chr21	45789011	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr21	45817620	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:2,1:4,1:5,1,3,0
chr21	45819248	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr21	45821794	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,3:5,5:3,6,0,8
chr21	45826434	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr21	45826744	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr21	45837790	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr21	45838421	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:15,1:12,1:10,17,1,1
chr21	45844660	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:45844660_T_A:45844660:3,0,1,0
chr21	45844662	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,15;MFRL=157,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:45844660_T_A:45844660:4,0,1,0
chr21	45844664	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=157,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:45844660_T_A:45844660:4,0,1,0
chr21	45845713	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:6,1:4,1:3,8,0,2
chr21	45845807	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	45854925	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:1,2:4,1:6,0,4,0
chr21	45860869	.	G	GAATGAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,0:0,1:0|1:45860869_G_GAATGAGA:45860869:0,0,0,1
chr21	45860871	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,0:0,1:0|1:45860869_G_GAATGAGA:45860869:0,0,0,1
chr21	45953851	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=66,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:1,1:1,0:1,1,0,2
chr21	45959097	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	45959556	.	A	ATG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=201,143;MMQ=37,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=143.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,33:0.968:34:0,14:1,15:0|1:45959556_A_ATG:45959556:1,0,18,15
chr21	45959557	.	ATC	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=15,29;MFRL=201,143;MMQ=37,57;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,33:0.968:34:0,10:0,16:0|1:45959556_A_ATG:45959556:1,0,18,15
chr21	45970718	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=116,266;MMQ=60,59;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,1,1
chr21	45970759	.	ACTTGCAGCAGACAGG	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=117,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:3,2:4,6:6,4,5,3
chr21	45970812	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:2,6:6,6:7,2,6,8
chr21	45971380	.	A	AGTGAGTGAGTGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,149;MMQ=25,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTGAGTGAGTGT;STR;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.880:14:0,6:1,3:1,0,1,12
chr21	45971426	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=133,151;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,1:1,4:0,2,0,6
chr21	45978090	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,17,6
chr21	45978128	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=152,174;MMQ=50,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:6,1:12,1:9,10,1,1
chr21	45987910	.	G	GATGGAAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=167,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:3,0:0,6,1,1
chr21	46011170	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr21	46020473	.	C	CTCAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr21	46021370	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0|1:46021370_T_C:46021370:0,0,7,11
chr21	46021390	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,7:0,7:0|1:46021370_T_C:46021370:0,0,6,10
chr21	46021934	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,5,3
chr21	46021946	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr21	46021954	.	CTG	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr21	46022051	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr21	46047418	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=106,174;MMQ=54,55;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:6,2,5,1
chr21	46057612	.	CCTGCTGTGTGCCTGT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,156;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:2,3:0,3:2,2,2,4
chr21	46057958	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,148;MMQ=52,48;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:2,8:5,2:4,4,5,5
chr21	46058229	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=17,31;MFRL=150,234;MMQ=60,56;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.312:8:1,1:2,1:4,2,0,2
chr21	46058276	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=126,77;MMQ=57,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,0:5,0:0|1:46058276_A_C:46058276:2,6,2,0
chr21	46058278	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=126,77;MMQ=57,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:2,0:6,0:0|1:46058276_A_C:46058276:2,6,2,0
chr21	46066319	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:6,1,7,0
chr21	46077797	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:46077797_T_G:46077797:3,0,1,0
chr21	46077800	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:46077797_T_G:46077797:3,0,1,0
chr21	46077812	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0|1:46077797_T_G:46077797:4,0,3,0
chr21	46078342	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46078342_T_C:46078342:0,1,0,1
chr21	46078345	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46078342_T_C:46078342:0,1,0,1
chr21	46078359	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr21	46086603	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=102,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.125:40:15,1:12,1:14,20,0,6
chr21	46228343	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=212,190;MMQ=53,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46228343_GC_G:46228343:1,0,1,0
chr21	46228346	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=212,190;MMQ=53,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46228343_GC_G:46228343:1,0,1,0
chr21	46228351	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=212,190;MMQ=53,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:46228343_GC_G:46228343:1,0,1,0
chr21	46271452	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=113.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.970:30:0,12:0,17:0|1:46271452_C_T:46271452:0,0,20,10
chr21	46271460	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:3,7:11,7:0|1:46271452_C_T:46271452:7,7,9,5
chr21	46271660	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr21	46275047	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:3,1,5,0
chr21	46276343	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr21	46281760	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:3,6,0,2
chr21	46285416	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:1,5,1,4
chr21	46314907	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,8,9
chr21	46320403	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.537:16:2,1:5,4:0,7,1,8
chr21	46328099	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,1,23
chr21	46354055	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,9:0,0,18,1
chr21	46355531	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=97,84;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:2,3,2,2
chr21	46355833	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=16,34;MFRL=182,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr21	46355864	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr21	46355883	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr21	46388947	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=160,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:24,1:19,2:43,0,3,0
chr21	46388963	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=151,96;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.057:51:24,2:18,0:0|1:46388963_T_C:46388963:44,5,1,1
chr21	46388967	.	C	CT	.	.	DP=56;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=150,96;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:26,2:20,0:0|1:46388963_T_C:46388963:45,9,1,1
chr21	46388969	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=150,96;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.051:56:29,2:19,0:0|1:46388963_T_C:46388963:45,9,1,1
chr21	46389017	.	C	A	.	.	DP=120;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=189.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,66:0.577:114:26,35:21,30:18,30,26,40
chr21	46389189	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.580:15:5,4:1,3:0,6,0,9
chr21	46389237	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=257,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:46389237_G_GC:46389237:0,2,0,1
chr21	46389239	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=257,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:46389237_G_GC:46389237:0,2,0,1
chr21	46389242	.	C	CTATG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=272,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46389237_G_GC:46389237:0,1,0,1
chr21	46389243	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=272,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46389237_G_GC:46389237:0,1,0,1
chr21	46389244	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=272,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46389237_G_GC:46389237:0,1,0,1
chr21	46393090	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.514:27:6,8:7,5:9,4,6,8
chr21	46492270	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr21	46596251	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:13,1:2,1:12,3,1,1
chr21	46596639	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,0:0,5:1,2,1,4
chr21	46602686	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=145,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr21	46603274	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:6,4,3,0
chr21	46685592	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr21	46697100	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,2:0,3:0,2,0,6
chr21	46705777	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:8,8,0,2
chr21	46895417	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:12,0:18,2:8,22,1,1
chr21	46899736	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr21	46910315	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr21	46913048	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:13,1,2,0
chr21	46914540	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=101,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr21	46917644	.	A	ATAATCCCAGCATTTTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=221,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46917644_A_ATAATCCCAGCATTTTGG:46917644:0,1,0,1
chr21	46917648	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=221,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46917644_A_ATAATCCCAGCATTTTGG:46917644:0,1,0,1
chr21	46917694	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	46918574	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr21	46924425	.	CGGCCCCCCA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCCCCCCA;STR;TLOD=109.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,14:0,0,0,27
chr21	46925149	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.272:8:3,0:3,1:0,6,2,0
chr21	46925217	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:7,0:13,2:13,9,0,2
chr21	46927370	.	TGGGAGGGCCAGGTGCTGGGGCGGGAGAGTCGGGTGCTGGGCA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:0,1:4,0,4,0
chr21	46931004	.	T	TAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AC;STR;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr21	46932328	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=193,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:1,4,1,3
chr21	46932383	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr21	46934826	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr21	46934861	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:2,1,4,1
chr21	46935074	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:3,1:1,0:0|1:46935074_AG_A:46935074:2,2,0,2
chr21	46935078	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:3,2:1,0:0|1:46935074_AG_A:46935074:2,2,0,2
chr21	46935114	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr21	46936075	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,9;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,1:7,0:5,4,0,5
chr21	46936078	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,0:5,1:5,4,0,4
chr21	46936082	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=153,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,1:4,1,0,5
chr21	46952094	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:1,6,2,5
chr21	47320377	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:8,0,6,0
chr21	47320425	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:11,6:10,6:18,3,11,1
chr21	47329352	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr21	47329388	.	GGAGAT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=210,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:47329388_GGAGAT_G:47329388:0,2,1,1
chr21	47329394	.	CAGGGAGGTAACAGGACCT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=168,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:47329388_GGAGAT_G:47329388:0,1,1,1
chr21	47329415	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=168,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:47329388_GGAGAT_G:47329388:0,1,1,1
chr21	47350796	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,5:2,2:0,2,0,7
chr21	47361666	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=106,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,1:1,2:1,4,0,4
chr21	47361737	.	T	TTCATCTTTTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	47404397	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr21	47406421	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr21	47406612	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr21	47407362	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr21	47409113	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr21	47410119	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=33,18;MFRL=137,82;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:47410119_C_G:47410119:1,1,1,0
chr21	47410122	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=34,10;MFRL=82,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:47410122_T_G:47410122:0,1,2,0
chr21	47410124	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=24,31;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:47410119_C_G:47410119:1,1,2,0
chr21	47410127	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=34,18;MFRL=82,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,1:0,1,3,0
chr21	47410132	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=30,12;MFRL=82,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:1,0:0|1:47410122_T_G:47410122:0,1,3,0
chr21	47410140	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=29,13;MFRL=82,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,0:0,1,3,0
chr21	47410147	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=27,13;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.485:4:0,0:2,0:0|1:47410147_T_C:47410147:1,1,2,0
chr21	47410149	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=20,13;MFRL=107,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,0:1,0:0|1:47410122_T_G:47410122:1,1,3,0
chr21	47410151	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=19,21;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.411:5:0,1:1,0:0|1:47410147_T_C:47410147:2,1,2,0
chr21	47410157	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=31,10;MFRL=107,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:1,1,1,0
chr21	47410626	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr21	47412751	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=222,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=108.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,16:1,13:1,0,8,21
chr21	47414259	.	TCCGTAGATCTCGG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr21	47417302	.	G	GTAGAGAGATGGATA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:8,0:7,6,1,1
chr21	47417415	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:2,5,0,2
chr21	47417432	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,1,6
chr21	47417578	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,5:4,2:5,3,6,1
chr21	47417975	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr21	47418234	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:2,1,5,0
chr21	47418728	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr21	47419012	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=107,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr21	47420565	.	AGGAGGGCGGCCGGGGAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,7:0,3:0,0,11,0
chr21	47420723	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:5,4:4,2:2,7,1,6
chr21	47420726	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,6:0,0,2,13
chr21	47420761	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:1,4,1,4
chr21	47420769	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr21	47422015	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:2,0:0|1:47422015_A_C:47422015:0,2,2,0
chr21	47422020	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:1,0:0|1:47422015_A_C:47422015:0,2,2,0
chr21	47422028	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,0:0,0:0|1:47422015_A_C:47422015:0,0,2,0
chr21	47422033	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47422015_A_C:47422015:0,0,1,0
chr21	47422412	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr21	47422712	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr21	47423133	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr21	47532400	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:11,3,2,0
chr21	47532553	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=207,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,1,3
chr21	47534063	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,0:4,2:1,7,1,1
chr21	47534078	.	TA	CG	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0|1:47534078_TA_CG:47534078:0,4,0,2
chr21	47534079	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=182,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr21	47534089	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,26;MFRL=177,124;MMQ=54,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:47534078_TA_CG:47534078:0,4,0,1
chr21	47534091	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=149,197;MMQ=54,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:47534091_A_AGG:47534091:0,4,0,1
chr21	47534093	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=35,31;MFRL=149,197;MMQ=54,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:47534091_A_AGG:47534091:0,4,0,1
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chr21	47534097	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=172,197;MMQ=48,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:47534091_A_AGG:47534091:0,3,0,1
chr21	47536836	.	CGCAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr21	47537702	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr21	47537882	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:2,2,3,0
chr21	47539790	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=104.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,21:0,11:0,0,15,18
chr21	47540573	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.372:17:5,1:5,5:0,11,1,5
chr21	47541553	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.518:48:8,12:15,12:6,17,11,14
chr21	47541986	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:1,4:1,2:1,2,0,6
chr21	47542910	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr21	47544541	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,4:0,0:4,0,2,2
chr21	47545676	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr21	47545913	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:2,4:6,7:2,6,4,7
chr21	47556793	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,5,7
chr21	47557074	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr21	47557118	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,4,1
chr21	47565569	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr21	47571383	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	47574310	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=215,244;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr21	47588472	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,2:5,0:7,2,0,2
chr21	47608710	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:3,6:8,7:5,6,6,7
chr21	47616071	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0|1:47616071_G_C:47616071:2,0,3,1
chr21	47616080	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=136,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0|1:47616071_G_C:47616071:3,0,2,1
chr21	47626769	.	C	CTCATCTTAGGTTGGCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=153,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr21	47635302	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr21	47635545	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:7,0,3,0
chr21	47635713	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:1,5,2,8
chr21	47641700	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:2,1,4,0
chr21	47647382	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr21	47647618	.	GAA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.930:10:0,1:0,3:0,0,1,9
chr21	47648729	.	CCCCGCCCCT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCCGCCCCT;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr21	47656664	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr21	47662914	.	CACACACAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr21	47664634	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr21	47665116	.	GAAGA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGA;STR;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr21	47666332	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,3:2,4:1,3,1,6
chr21	47671690	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:47671690_A_G:47671690:0,0,1,3
chr21	47671695	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=199,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0|1:47671690_A_G:47671690:0,3,0,1
chr21	47671696	.	T	TCCACTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=199,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:47671690_A_G:47671690:0,3,0,1
chr21	47674275	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,7:0,0,14,5
chr21	47674460	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=108,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,1:7,8:4,5,2,7
chr21	47676934	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,3:0,12:0,0,1,14
chr21	47676968	.	TC	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr21	47678774	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=226,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr21	47681127	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr21	47685787	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr21	47686152	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	47692798	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:0,8,0,3
chr21	47705237	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr21	47706763	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,4:4,0:8,2,4,0
chr21	47707039	.	T	TAA,TAAAAA,TAAAAAA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,30,29,28;MFRL=0,224,145,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,21,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,12,15,16;RU=A;STR;TLOD=5.97,4.03,18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,3,9:0.144,0.206,0.562:15:0,1,2,3:1,1,0,3:1,0,5,9
chr21	47707050	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=85.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.956:21:0,7:0,9:0|1:47707050_T_A:47707050:0,0,7,14
chr21	47707054	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.304:17:7,1:4,3:0|1:47707050_T_A:47707050:4,8,0,5
chr21	47711229	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,11:0,5:0,0,11,6
chr21	47716230	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr21	47717349	.	GC	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=198,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr21	47717616	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr21	47721985	.	A	ATGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=175,62;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TGG;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr21	47722391	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:11,6:8,4:16,3,9,1
chr21	47722578	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:2,6:5,1:0,7,0,8
chr21	47744037	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr21	47754541	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=152,142;MMQ=60,37;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,20:0.527:38:5,7:12,6:0|1:47754541_A_G:47754541:11,7,8,12
chr21	47754563	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=153,147;MMQ=60,43;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,25:0.524:48:5,12:12,11:0|1:47754541_A_G:47754541:12,11,9,16
chr21	47766139	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:3,3:1,4:0,4,0,8
chr21	47766154	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=79,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:1,1:0,5:0,1,0,6
chr21	47786449	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=103.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,28,1
chr21	47786494	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=210.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,37:0,25:0,0,39,25
chr21	47786895	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:9,2:3,14,1,1
chr21	47817251	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,2:3,1:4,7,2,1
chr21	47836590	.	T	TACCAGGTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:4,2:5,0:5,4,0,2
chr21	47848355	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:9,10,0,2
chr21	47850405	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:3,2:6,3:6,4,4,1
chr21	47850484	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,7:2,5:3,4,5,7
chr21	47850631	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=254,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr21	47852149	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=110,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:47852149_G_C:47852149:1,9,1,1
chr21	47852151	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0|1:47852149_G_C:47852149:0,0,2,9
chr21	47857053	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=200,290;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr21	47858272	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:8,6:9,10:6,11,4,12
chr21	47864575	.	TTTC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTC;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:1,0:0,0:0|1:47864575_TTTC_T:47864575:2,0,2,0
chr21	47864583	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:47864575_TTTC_T:47864575:2,0,2,0
chr21	47904569	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr21	47917047	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=67.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.967:25:0,10:0,13:0,0,5,20
chr21	47931245	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr21	47952176	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:20,1:15,1:2,33,1,1
chr21	47961634	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr21	47966977	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.698:18:4,7:1,5:2,3,1,12
chr21	47969826	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:1,2,1,3
chr21	47970581	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:3,7,2,5
chr21	47971539	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=143.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,19:0,22:0,0,32,9
chr21	47974851	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr21	47977448	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=199,149;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr21	47977507	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:8,3,0,2
chr21	47978321	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr21	47980570	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr21	47983657	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr21	47983680	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,8:0,2:1,0,10,0
chr21	47986633	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr21	47987443	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:3,9:8,8:4,7,7,10
chr21	47987547	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,5:2,1:0,3,1,5
chr21	48022375	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr21	48069437	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,2:9,0:24,0,2,0
chr21	48083526	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr22	16266885	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=200,188;MMQ=25,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr22	16277923	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=207,202;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,1:8,3:1,12,0,4
chr22	16287226	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,145;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,2:1,8:1,2,5,5
chr22	17073386	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:17073386_G_A:17073386:0,4,1,1
chr22	17073388	.	T	TATGATACAGA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=169,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:0|1:17073386_G_A:17073386:0,4,1,1
chr22	17264565	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,10,2
chr22	17264904	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:4,4,4,1
chr22	17265194	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:2,1,2,1
chr22	17443816	.	G	GGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=156,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:17443816_G_GGC:17443816:0,6,1,1
chr22	17443817	.	T	TCAAGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=156,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,2:3,0:0|1:17443816_G_GGC:17443816:0,6,1,1
chr22	17446914	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=118,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr22	17449340	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=176,322;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	17449368	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=222,322;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17449368_GC_G:17449368:0,1,0,1
chr22	17449373	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=222,322;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17449368_GC_G:17449368:0,1,0,1
chr22	17449375	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=222,322;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17449368_GC_G:17449368:0,1,0,1
chr22	17488751	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=178,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,0:2,0:4,0,1,0
chr22	17488823	.	C	CG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:5,9:6,9:7,5,12,6
chr22	17566206	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	17582776	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:6,0,4,0
chr22	17582788	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:3,0,6,0
chr22	17586583	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr22	17586595	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=202,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:1,3,1,3
chr22	17586609	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:17586609_GT_G:17586609:0,0,3,3
chr22	17586614	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:17586609_GT_G:17586609:0,0,3,2
chr22	17586631	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	17586715	.	ATCAC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCAC;STR;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.827:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	17590744	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=269,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr22	17600148	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr22	17619342	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:17619342_A_T:17619342:2,1,0,1
chr22	17619346	.	G	GACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:17619342_A_T:17619342:2,1,0,1
chr22	17619348	.	G	GGGGTA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,29;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:17619342_A_T:17619342:2,1,0,1
chr22	17619378	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:4,1,4,2
chr22	17623880	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,1:0,0,9,0
chr22	17629544	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=196,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr22	17630389	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	17662679	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:5,4:6,2:7,4,6,1
chr22	17662699	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:6,4:4,2:6,4,5,2
chr22	17662917	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:4,2,2,3
chr22	17669151	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	17669406	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr22	17680519	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr22	17684355	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	17688267	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	17978346	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=233,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.823:9:0,3:1,4:0|1:17978346_T_C:17978346:1,0,7,1
chr22	17978355	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=233,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,3:0,6:0|1:17978346_T_C:17978346:1,0,9,1
chr22	17978600	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=113,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:3,3:10,6:4,9,2,7
chr22	17979626	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr22	17990766	.	GGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr22	18018337	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:17,0:17,3:7,27,0,3
chr22	18027817	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr22	18029095	.	A	AGCTCCCACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr22	18029334	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=151,178;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.200:21:11,2:6,2:0|1:18029334_A_G:18029334:0,17,0,4
chr22	18029337	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=151,178;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:11,1:5,2:0|1:18029334_A_G:18029334:0,17,0,4
chr22	18032459	.	GTTTTTTTTTTTTTTT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=197,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=28,13;RU=T;STR;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:0,4:1,0,6,0
chr22	18077386	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.197:19:11,2:5,0:6,10,1,2
chr22	18082950	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.212:22:12,4:5,0:0|1:18082950_T_C:18082950:0,18,0,4
chr22	18082952	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.213:22:13,4:5,0:0|1:18082950_T_C:18082950:0,18,0,4
chr22	18083983	.	A	ACCATTCCCCACCATTCCCCTTCTTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr22	18084001	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	18165898	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33,34,34;MFRL=162,175,176,150;MMQ=60,60,60,60;MPOS=31,21,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.17,4.26,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,3,3:0.140,0.212,0.210:15:4,0,2,2:3,2,1,1:7,0,8,0
chr22	18171650	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr22	18171776	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,106;MMQ=60,59;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.106:36:19,0:13,3:21,12,3,0
chr22	18178859	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr22	18218263	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:11,0,3,0
chr22	18218464	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0|1:18218464_T_C:18218464:0,0,0,9
chr22	18218475	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:18218464_T_C:18218464:0,0,0,8
chr22	18220770	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=134,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,1:15,1:8,17,1,1
chr22	18222263	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr22	18233000	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	18370066	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=116.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,18:0,15:0,0,19,14
chr22	18385579	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,16;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:18385579_G_T:18385579:0,3,0,1
chr22	18385586	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,14;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:18385579_G_T:18385579:0,3,0,1
chr22	18385593	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,16;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:18385579_G_T:18385579:0,3,0,1
chr22	18385597	.	CC	AG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:18385579_G_T:18385579:0,3,0,1
chr22	18385600	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,13;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:18385579_G_T:18385579:0,3,0,1
chr22	18385601	.	C	CCCCAGAAGACTCTG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,35;MFRL=167,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.388:3:2,1:0,0:1|0:18385579_G_T:18385579:0,2,0,1
chr22	18385603	.	A	AGATG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=167,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.388:3:2,1:0,0:1|0:18385579_G_T:18385579:0,2,0,1
chr22	18385605	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,18;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:18385579_G_T:18385579:0,3,0,1
chr22	18609065	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=124,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr22	18613990	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	18643103	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:17,2:5,2:0,22,0,4
chr22	18643111	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,179;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.183:24:16,1:4,3:0,20,0,4
chr22	18649922	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=72,151;MMQ=39,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,3,1
chr22	18655839	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=152,199;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:9,2:0|1:18655839_A_C:18655839:12,1,2,0
chr22	18655841	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=152,199;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:0|1:18655839_A_C:18655839:12,1,2,0
chr22	18655860	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=138,152;MMQ=27,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,3:1,8:1,0,10,1
chr22	18655874	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,18;MFRL=161,139;MMQ=51,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.226:16:2,1:8,0:8,5,3,0
chr22	18656722	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,244;MMQ=27,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr22	18898339	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:6,0,6,0
chr22	18898387	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:5,0,6,0
chr22	18899016	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=183,159;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:5,7:6,7:11,0,11,3
chr22	18900669	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=44.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,9:0,0,10,3
chr22	18901090	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr22	18904349	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,162;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,4:7,2:6,2,6,0
chr22	18904466	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,151;MMQ=40,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,9:5,6:4,6,10,5
chr22	18907124	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,178;MMQ=46,51;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,4:6,5:5,2,3,6
chr22	18907192	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.632:22:5,8:2,6:6,2,5,9
chr22	18910016	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,184;MMQ=27,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr22	18918430	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=126,258;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr22	19028476	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=283,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:19028476_T_C:19028476:1,0,1,0
chr22	19028480	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=283,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19028476_T_C:19028476:1,0,1,0
chr22	19028484	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=283,221;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:19028476_T_C:19028476:1,0,1,0
chr22	19028713	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=116,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.138:24:7,1:11,1:12,9,0,3
chr22	19050635	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr22	19077049	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr22	19109753	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=168,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,3:6,2:1,14,2,3
chr22	19109764	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=171,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,1:6,3:0,10,2,3
chr22	19109812	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=214,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr22	19121872	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,2:1,0:0,3,1,1
chr22	19121886	.	G	GCTAGAGGCTAACTTTGCCACAGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=158,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr22	19126795	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=120,10168717;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:3,7,0,2
chr22	19126894	.	C	CTTCAGCCAAGCCCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr22	19130486	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=222,181;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr22	19130490	.	GA	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=178,229;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr22	19164057	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=147,132;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.208:12:3,1:5,1:0|1:19164057_T_TC:19164057:0,10,2,0
chr22	19164065	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=147,132;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,0:9,0:0|1:19164057_T_TC:19164057:1,15,2,0
chr22	19164069	.	CT	AA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,14;MFRL=140,132;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:11,0:0|1:19164057_T_TC:19164057:2,15,2,0
chr22	19178982	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	19184095	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=88,167;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,3:2,2:6,2,3,2
chr22	19184244	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr22	19187375	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,1,2
chr22	19187427	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr22	19189003	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr22	19211665	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr22	19220648	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,7:5,2:7,0,8,1
chr22	19223430	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=146,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:5,0:2,3:1,7,0,3
chr22	19226925	.	T	TCTGGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=158,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:19226925_T_TCTGGA:19226925:1,5,1,1
chr22	19226928	.	AG	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=158,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:19226925_T_TCTGGA:19226925:1,5,1,1
chr22	19241561	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:15,0:10,2:0|1:19241561_CT_C:19241561:18,10,1,1
chr22	19241563	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:14,0:11,2:0|1:19241561_CT_C:19241561:18,10,1,1
chr22	19241571	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=164,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,0:15,1:0|1:19241561_CT_C:19241561:20,10,1,1
chr22	19343902	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=181,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr22	19419093	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	19455376	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=97.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0,0,20,10
chr22	19459157	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr22	19462466	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr22	19466523	.	TCCC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=204,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.531:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr22	19467652	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,11:0,0,16,11
chr22	19468655	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:19468655_C_T:19468655:0,0,0,4
chr22	19468658	.	G	GTAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=177,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:19468655_C_T:19468655:0,3,0,1
chr22	19468664	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=177,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:19468655_C_T:19468655:0,3,0,1
chr22	19470249	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,4:7,5:8,3,7,2
chr22	19471609	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr22	19495967	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	19504318	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr22	19504470	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr22	19504485	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr22	19506456	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=108,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:3,6:7,2:4,6,1,7
chr22	19709445	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr22	19709728	.	GCCC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,10;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:19709728_GCCC_G:19709728:1,0,1,0
chr22	19709736	.	CAT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,13;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:19709728_GCCC_G:19709728:2,0,1,0
chr22	19709741	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:19709728_GCCC_G:19709728:2,0,1,0
chr22	19747082	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=194,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr22	19747322	.	CTG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19747322_CTG_C:19747322:0,0,0,1
chr22	19747325	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19747322_CTG_C:19747322:0,0,0,1
chr22	19747328	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19747322_CTG_C:19747322:0,0,0,1
chr22	19747333	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19747322_CTG_C:19747322:0,0,0,1
chr22	19776019	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	19776159	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:1,6:4,1:2,3,3,4
chr22	19794366	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	19808874	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:1,5,1,4
chr22	19840075	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=275,316;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19840075_A_AAC:19840075:0,1,0,1
chr22	19840077	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=275,316;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19840075_A_AAC:19840075:0,1,0,1
chr22	19870831	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:5,0,5,2
chr22	19885548	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	19898818	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:5,0,3,0
chr22	19898837	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr22	19898887	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:2,7:6,4:3,5,6,6
chr22	19899061	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=228,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr22	19902671	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:6,0,7,0
chr22	19905802	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	19907192	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	19920014	.	G	GTTTCTAAGGAGTGCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19920014_G_GTTTCTAAGGAGTGCA:19920014:0,0,0,1
chr22	19920018	.	AA	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19920014_G_GTTTCTAAGGAGTGCA:19920014:0,0,0,1
chr22	19950039	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	19950428	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr22	19951985	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=207,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:19951985_C_CA:19951985:1,2,0,1
chr22	19951988	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=207,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:19951985_C_CA:19951985:1,2,0,1
chr22	19954916	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr22	19956039	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.340:15:5,0:3,0:0|1:19956039_A_C:19956039:1,9,5,0
chr22	19956052	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.207:17:5,0:7,0:0|1:19956039_A_C:19956039:3,11,3,0
chr22	19959366	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.394:11:3,0:4,4:5,2,3,1
chr22	19959465	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0|1:19959465_G_A:19959465:1,3,1,2
chr22	19959473	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:19959465_G_A:19959465:1,3,1,1
chr22	19960188	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:4,0,5,1
chr22	19960606	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr22	19967479	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.393:25:9,4:5,3:10,5,4,6
chr22	20093857	.	GTC	ACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=200,248;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	20094263	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.591:13:3,1:2,5:0,5,1,7
chr22	20096314	.	G	GCGCCTACCTTGCCAGACCCTGGGCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,2:0,0,7,0
chr22	20100596	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,3,2
chr22	20101998	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr22	20102090	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr22	20104301	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,8:0,0:0,0,6,2
chr22	20104355	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.312:20:8,5:5,0:0|1:20104355_G_C:20104355:2,12,6,0
chr22	20104358	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=30,13;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.214:25:9,2:6,0:0|1:20104355_G_C:20104355:5,15,5,0
chr22	20104360	.	C	CCG	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=30,12;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.214:25:12,0:7,0:0|1:20104355_G_C:20104355:5,15,5,0
chr22	20104361	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,11;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.199:27:12,0:7,0:0|1:20104355_G_C:20104355:5,17,5,0
chr22	20104365	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=29,17;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.199:27:10,2:8,0:0|1:20104355_G_C:20104355:5,17,5,0
chr22	20104369	.	CAT	C	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=33,22;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:14,1:9,0:0|1:20104355_G_C:20104355:7,18,4,0
chr22	20128538	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:20128538_GG_AA:20128538:1,1,0,1
chr22	20128541	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:20128538_GG_AA:20128538:1,1,0,1
chr22	20128651	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	20136379	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=194,180;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:3,3,4,1
chr22	20230902	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr22	20231048	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:8,4,1,1
chr22	20255188	.	GA	CC	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=34,12;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:8,1:9,0:0|1:20255188_GA_CC:20255188:0,17,4,0
chr22	20255191	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:8,0:8,0:0|1:20255188_GA_CC:20255188:0,17,4,0
chr22	20255197	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:9,0:7,3:0|1:20255188_GA_CC:20255188:1,16,4,0
chr22	20255201	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:8,0:8,2:0|1:20255188_GA_CC:20255188:1,16,3,0
chr22	20255205	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=161,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,1:0|1:20255188_GA_CC:20255188:2,16,2,0
chr22	20255206	.	CGGTA	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=28,13;MFRL=162,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:9,0:0|1:20255188_GA_CC:20255188:2,17,2,0
chr22	20718650	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=18,18;MFRL=141,164;MMQ=45,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.220:26:4,0:6,0:5,16,0,5
chr22	20718678	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=172,138;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.301:28:9,2:10,6:2,18,1,7
chr22	20718692	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=141,175;MMQ=27,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:1,8:6,8:0,7,1,15
chr22	20755098	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr22	20760794	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:11,8,2,0
chr22	20779946	.	CG	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	20780188	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	20785939	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=162,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:20785939_G_C:20785939:4,0,1,0
chr22	20785948	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,31;MFRL=162,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:20785939_G_C:20785939:4,0,1,0
chr22	20785951	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=9,14;MFRL=162,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:20785939_G_C:20785939:4,0,1,0
chr22	20819954	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=199,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20819954_TGG_T:20819954:0,1,0,1
chr22	20819957	.	G	GTCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=199,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20819954_TGG_T:20819954:0,1,0,1
chr22	20819964	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=199,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20819954_TGG_T:20819954:0,1,0,1
chr22	20819967	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=199,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20819954_TGG_T:20819954:0,1,0,1
chr22	20819971	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=199,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20819954_TGG_T:20819954:0,1,0,1
chr22	20891545	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr22	20907303	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:8,0,2,0
chr22	20918915	.	CCAGCAG	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=109,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=CAG;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.121:22:6,1:6,1:11,9,2,0
chr22	20937433	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	20938775	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=130,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:1,1:3,2:0,5,0,3
chr22	20940794	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:6,0,2,0
chr22	21044269	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,115;MMQ=23,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:1,7,0,3
chr22	21044848	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,168;MMQ=60,56;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,5:7,5:8,5,8,2
chr22	21064356	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=150,156;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:6,3:9,2:1,14,0,5
chr22	21064387	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=179,161;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:0,9,0,4
chr22	21068659	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr22	21068706	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=174,202;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:8,1:4,12,2,0
chr22	21068878	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,22:0.401:55:16,13:17,8:16,17,6,16
chr22	21072948	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=138,82;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.114:41:24,4:12,0:30,7,3,1
chr22	21073122	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.595:35:7,8:7,13:7,7,6,15
chr22	21075537	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,1:3,5:4,1,5,1
chr22	21080721	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr22	21081964	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr22	21088146	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,147;MMQ=55,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,21:0.415:51:15,10:15,11:6,24,4,17
chr22	21096722	.	T	TTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,247;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	21106141	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=201,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr22	21107153	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,0:3,5:6,0,5,0
chr22	21138540	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,0:11,3:6,17,0,3
chr22	21140231	.	CATG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,1:3,5:6,0,6,0
chr22	21140503	.	T	TGTAAATCCAAAGAGCACACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	21153590	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:4,3:1,4:0,5,3,5
chr22	21156160	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=164,144;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:21156160_C_T:21156160:2,0,1,0
chr22	21156168	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=164,144;MMQ=50,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:21156160_C_T:21156160:2,0,1,0
chr22	21156457	.	A	AGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	21167605	.	G	GACA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:4,0,5,1
chr22	21167787	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=92,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:10,8:3,5:6,8,5,8
chr22	21213380	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,28:0.500:56:18,15:10,13:18,10,22,6
chr22	21213416	.	A	G	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,31:0.413:76:27,14:15,17:23,22,22,9
chr22	21329123	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,14:0,17:0,0,9,22
chr22	21330608	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=87,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:1,3,0,4
chr22	21331918	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=191,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,0:2,4:2,0,3,1
chr22	21331950	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,14,4
chr22	21332086	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,19;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.124:31:5,1:10,1:9,18,0,4
chr22	21332122	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,4:6,5:1,10,2,7
chr22	21332357	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:21332357_T_G:21332357:0,4,0,1
chr22	21332359	.	C	CTAGAAGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:21332357_T_G:21332357:0,4,0,1
chr22	21332361	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:21332357_T_G:21332357:0,4,0,1
chr22	21332394	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	21337266	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,2:5,7:3,3,6,3
chr22	21337415	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,4,14
chr22	21340088	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr22	21344592	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr22	21344683	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:14,0:5,2:16,3,1,1
chr22	21346485	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr22	21347142	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:7,2:13,0:9,13,1,1
chr22	21348473	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr22	21349037	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr22	21369454	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=205,173;MMQ=59,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.753:9:1,5:0,2:2,0,7,0
chr22	21372160	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,3,0
chr22	21372374	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=175,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,0,7
chr22	21372405	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr22	21372436	.	G	GATGTACTTGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=89,176;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr22	21377071	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:1,3,0,3
chr22	21377958	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:0,8,1,4
chr22	21385392	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=188,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:21385392_A_C:21385392:3,4,1,1
chr22	21385396	.	C	CTGTACGCAAAGCCTAGACAAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=188,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:21385392_A_C:21385392:3,4,1,1
chr22	21385679	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr22	21388605	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.525:21:5,5:3,6:0,10,0,11
chr22	21400282	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.491:26:8,11:5,0:6,7,9,4
chr22	21401570	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr22	21401833	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=157,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr22	21403226	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:3,1,4,1
chr22	21411405	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:6,4,1,1
chr22	21567334	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	21568205	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=155,106;MMQ=25,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0|1:21568205_T_G:21568205:0,2,1,3
chr22	21568228	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,99;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21568205_T_G:21568205:0,0,0,1
chr22	21570296	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr22	21570310	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=194,188;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,2:5,2:9,0,4,0
chr22	21570431	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=182,131;MMQ=44,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.434:25:5,5:9,2:1,13,2,9
chr22	21570436	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=181,232;MMQ=40,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,1:10,3:3,20,0,4
chr22	21576047	.	AC	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=197,131;MMQ=51,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr22	21576082	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,120;MMQ=43,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.368:20:3,7:8,0:11,2,7,0
chr22	21800444	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	21829010	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,146;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:14,8:8,6:3,19,1,13
chr22	21829480	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=194,147;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=64.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,8:0,13:0,1,7,14
chr22	21829507	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=194,158;MMQ=27,27;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.902:18:1,10:0,7:0|1:21829507_G_A:21829507:0,1,3,14
chr22	21829513	.	TTGTC	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=194,159;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=91.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,21:0.917:22:1,10:0,10:0|1:21829507_G_A:21829507:0,1,4,17
chr22	21832031	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,164;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:21832031_A_G:21832031:0,0,2,0
chr22	21832041	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:21832031_A_G:21832031:0,0,5,0
chr22	21832241	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=160,170;MMQ=25,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:6,3:8,1:0|1:21832241_C_T:21832241:1,13,0,4
chr22	21832247	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=168,170;MMQ=25,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,1:5,1:0|1:21832241_C_T:21832241:1,11,0,4
chr22	21832470	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr22	21832546	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21832546_A_C:21832546:0,0,0,1
chr22	21832549	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:21832546_A_C:21832546:0,0,0,1
chr22	21838277	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr22	21838301	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,25;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr22	21842655	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr22	21965390	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.788:8:1,0:0,2:0,1,0,7
chr22	21991049	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:21991049_C_G:21991049:2,1,0,1
chr22	21991052	.	C	CTGTGGCCTGGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:21991049_C_G:21991049:2,1,0,1
chr22	22007370	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=86,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:3,4,2,1
chr22	22007528	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:7,1,3,1
chr22	22024150	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:4,5:7,8:9,2,9,4
chr22	22024507	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,21,0
chr22	22025445	.	A	AGACCAGAGATACTTACTGTGACTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.321:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr22	22025462	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr22	22040713	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr22	22042079	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=321,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr22	22042318	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:4,0:1,6:4,2,2,4
chr22	22042440	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,0:1,3:1,3,0,3
chr22	22048770	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	22055394	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,4:7,4:6,2,6,2
chr22	22055581	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=210,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,0:0,2,0,3
chr22	22058304	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:8,1,0,2
chr22	22221516	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.709:5:1,3:0,0:0|1:22221516_C_A:22221516:1,0,3,1
chr22	22221530	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:22221516_C_A:22221516:1,0,2,1
chr22	22287964	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,7,11
chr22	22288309	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr22	22313128	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=231,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr22	22317433	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=171,187;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:22317433_T_C:22317433:0,2,0,1
chr22	22317455	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,35;MFRL=172,187;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:22317433_T_C:22317433:0,1,0,1
chr22	22317462	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=172,187;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:22317433_T_C:22317433:0,1,0,1
chr22	22317464	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=172,187;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:22317433_T_C:22317433:0,1,0,1
chr22	22317471	.	TA	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=16,31;MFRL=172,187;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:22317433_T_C:22317433:0,1,0,1
chr22	22319850	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr22	22324546	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,67;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:22324546_A_T:22324546:0,0,1,1
chr22	22324548	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,67;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:22324546_A_T:22324546:0,0,1,1
chr22	22324556	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,67;MMQ=60,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:22324546_A_T:22324546:0,0,1,1
chr22	22324558	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,67;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:22324546_A_T:22324546:0,0,1,1
chr22	22324559	.	G	GTA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,67;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:22324546_A_T:22324546:0,0,1,1
chr22	22324561	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,67;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22324546_A_T:22324546:0,0,0,1
chr22	22324565	.	G	GCTATC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,67;MMQ=60,43;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22324546_A_T:22324546:0,0,0,1
chr22	22516883	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=101,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,3:6,6:5,6,4,5
chr22	22550078	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr22	22550339	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,13:0,6:0,0,12,7
chr22	22569758	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	22599189	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,3:4,0:7,4,2,1
chr22	22673322	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:6,0:8,10,1,1
chr22	22673639	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	22676970	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,10:0,0,11,8
chr22	22697490	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,9,1
chr22	22697697	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,261;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:4,2,0,2
chr22	22707178	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr22	22707388	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,9:0,0,4,13
chr22	22707429	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr22	22707443	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr22	22707452	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr22	22707473	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,48;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,7,4
chr22	22707555	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0|1:22707555_A_G:22707555:0,0,5,7
chr22	22707557	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:22707555_A_G:22707555:0,0,5,7
chr22	22707576	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr22	22707597	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,1:0|1:22707597_A_G:22707597:0,0,0,5
chr22	22707601	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:22707597_A_G:22707597:0,0,0,4
chr22	22707608	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:22707597_A_G:22707597:0,0,1,4
chr22	22707621	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr22	22707638	.	AG	GA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0|1:22707638_AG_GA:22707638:0,0,1,2
chr22	22707646	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:22707638_AG_GA:22707638:0,0,2,3
chr22	22707782	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,44;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	22707814	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:22707814_A_G:22707814:0,0,0,3
chr22	22707820	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:22707814_A_G:22707814:0,0,0,3
chr22	22707835	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr22	22707863	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=223,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22707863_T_TG:22707863:0,1,0,1
chr22	22707865	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=223,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22707863_T_TG:22707863:0,1,0,1
chr22	22707867	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=223,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:22707863_T_TG:22707863:0,1,0,1
chr22	22712276	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,158;MMQ=50,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.469:32:7,8:9,6:7,10,7,8
chr22	22724135	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:2,4:6,7:4,4,5,6
chr22	22730280	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr22	22730504	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:7,2,2,6
chr22	22730868	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=119,163;MMQ=60,21;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:3,1:12,2:7,8,0,3
chr22	22730907	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,163;MMQ=60,21;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,0:10,2:2,13,0,3
chr22	22735736	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr22	22782191	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=149,133;MMQ=60,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:15,4:17,0:17,16,2,2
chr22	22782210	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=138,133;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:14,4:11,0:12,15,2,2
chr22	22782234	.	GG	CA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=143,133;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:11,3:8,0:10,10,1,3
chr22	22842957	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,7,12
chr22	22843727	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,39;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:0,15,1,1
chr22	22898434	.	GA	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=201,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22898434_GA_AT:22898434:0,3,0,1
chr22	22898441	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=201,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22898434_GA_AT:22898434:0,3,0,1
chr22	22899363	.	GA	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:0,3,0,5
chr22	22930770	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr22	22988720	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=130,187;MMQ=40,22;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr22	22988811	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=124,154;MMQ=52,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.316:26:3,5:14,2:14,4,0,8
chr22	22989015	.	G	GCAGCGAAGAACTCAGAGGTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,107;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	22989256	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,130;MMQ=58,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:14,8:8,6:15,7,10,4
chr22	23029374	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr22	23047226	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:5,10,1,1
chr22	23063645	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.585:22:5,6:4,7:2,7,4,9
chr22	23089826	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr22	23089857	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=109,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:4,2:3,5:0|1:23089857_G_A:23089857:7,1,7,0
chr22	23089865	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=15,32;MFRL=109,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:0,3:3,7:0|1:23089857_G_A:23089857:7,1,9,1
chr22	23089941	.	ACT	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:2,3:6,5:2,8,5,4
chr22	23089996	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,4:2,3:4,4,3,4
chr22	23090423	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=173,204;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,5:5,1:2,5,0,6
chr22	23090438	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=170,224;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,4:5,1:2,4,0,5
chr22	23101103	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:6,0,7,0
chr22	23101132	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=142,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,8:1,4:6,0,12,0
chr22	23101159	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=33,21;MFRL=88,134;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.606:26:7,8:3,8:6,4,12,4
chr22	23101216	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=156,164;MMQ=60,40;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:11,3:7,2:0|1:23101216_A_G:23101216:11,7,1,4
chr22	23101221	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=156,164;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.221:25:12,2:8,1:0|1:23101216_A_G:23101216:12,8,1,4
chr22	23101247	.	GC	AT	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=136,219;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:11,2:6,0:7,11,0,2
chr22	23101280	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=144,166;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.424:24:6,6:8,3:8,6,2,8
chr22	23101347	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,217;MMQ=40,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,2:4,2:2,9,3,1
chr22	23114239	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=199,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:4,0,3,0
chr22	23114285	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=155,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,6:6,1:9,0,4,3
chr22	23135002	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=139,87;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:8,2:11,4:13,8,4,2
chr22	23161792	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	23165242	.	A	AG	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=136.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,23:0,24:0,0,22,26
chr22	23165839	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,2,4
chr22	23223070	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:3,3:1,1:0,4,0,5
chr22	23241753	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=116,149;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,3:5,5:6,5,6,2
chr22	23241864	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,102;MMQ=34,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.456:15:5,4:3,1:0,8,3,4
chr22	23243489	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=210,189;MMQ=27,27;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,7:1,1:2,4,0,8
chr22	23247028	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=208,139;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.273:12:1,1:6,1:9,0,1,2
chr22	23247169	.	TG	GT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=119,200;MMQ=56,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:11,2:5,4:13,3,1,5
chr22	23247234	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=159,178;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:2,14,0,2
chr22	23248839	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr22	23252827	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=121,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.323:11:6,2:2,1:2,6,1,2
chr22	23260271	.	TG	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,13:0.614:21:3,4:3,9:0|1:23260271_TG_T:23260271:6,2,13,0
chr22	23260276	.	GGC	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:4,3:10,3:14,3,6,0
chr22	23260278	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=12,33;MFRL=182,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,20:0.843:24:0,6:0,11:0|1:23260271_TG_T:23260271:0,4,20,0
chr22	23263502	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:9,10:9,7:15,3,16,1
chr22	23263708	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=83,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr22	23264785	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,166;MMQ=49,48;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.472:27:6,3:8,7:13,1,13,0
chr22	23465382	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=116,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:9,0:0|1:23465382_A_AC:23465382:6,8,0,2
chr22	23465386	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:23465382_A_AC:23465382:6,9,0,2
chr22	23465388	.	C	CTAGACCT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:0|1:23465382_A_AC:23465382:6,9,0,2
chr22	23481133	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,16;MFRL=91,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.742:4:0,1:0,0:1,0,1,2
chr22	23488694	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,164;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr22	23492236	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=120,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:8,2:4,4:8,4,4,2
chr22	23501286	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:3,1,2,0
chr22	23503008	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.407:10:3,0:2,4:5,1,4,0
chr22	23503170	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:3,7:4,4:0,7,3,9
chr22	23503205	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr22	23503266	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	23503569	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	23503651	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:2,0,4,1
chr22	23603763	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=179,153;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:23603763_G_A:23603763:0,8,0,2
chr22	23603767	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=179,153;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:23603763_G_A:23603763:0,8,0,2
chr22	23603784	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr22	23603792	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=160,170;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr22	23626081	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=241,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr22	23627441	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr22	23631639	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,5:2,3:8,0,7,1
chr22	23631801	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,6:3,3:5,4,3,7
chr22	23631813	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,5:3,1:2,3,2,4
chr22	23631823	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,6:4,0:3,2,2,5
chr22	23632621	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,11:6,4:4,6,6,9
chr22	23632636	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,8:6,3:3,6,1,10
chr22	23632665	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=37,32;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:0,5,0,5
chr22	23637200	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=120,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.355:23:9,5:5,2:11,4,6,2
chr22	23653850	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=185,176;MMQ=40,33;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:6,2:9,2,2,0
chr22	23653880	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=170,165;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,5:8,3:13,1,8,0
chr22	23653975	.	T	TCCGG	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,153;MMQ=55,25;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGG;STR;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,6:0.096:70:29,2:29,4:34,30,0,6
chr22	23657735	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,116;MMQ=52,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,3:3,5:0,9,1,7
chr22	23951044	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=88,168;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:1,3,0,2
chr22	23962744	.	T	TTTC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,127;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:9,3:5,8:13,2,6,5
chr22	23967147	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,175;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:7,6:4,9:0,11,0,15
chr22	24034154	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:24034154_T_G:24034154:0,0,1,0
chr22	24034161	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:24034154_T_G:24034154:1,0,1,0
chr22	24034165	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:24034154_T_G:24034154:1,0,1,0
chr22	24034173	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:24034154_T_G:24034154:1,0,1,0
chr22	24038847	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=177.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,19:0,31:0,0,25,26
chr22	24040337	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=122,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:2,1,1,0
chr22	24096464	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.515:37:11,13:6,6:7,11,10,9
chr22	24106674	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr22	24107801	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,2:2,2:8,0,4,0
chr22	24108288	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,15:0,12:0,0,14,13
chr22	24109462	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr22	24109550	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,17:0,7:0,0,15,9
chr22	24122499	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:4,2:2,3:6,1,6,1
chr22	24123300	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	24125565	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr22	24129553	.	GGC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GC;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.650:8:1,5:2,0:0,3,0,5
chr22	24145395	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr22	24145675	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	24158899	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	24167550	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=111,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:16,1:5,1:10,11,1,1
chr22	24176959	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr22	24179445	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:4,0:1,2:1,4,0,2
chr22	24210050	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:0,3,0,3
chr22	24219927	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:12,9,0,2
chr22	24226242	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:1,3,1,3
chr22	24237463	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.449:38:9,5:11,11:12,9,9,8
chr22	24300634	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=13,32;MFRL=182,96;MMQ=27,27;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.727:4:0,2:0,1:0,1,0,3
chr22	24300660	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,37;MFRL=170,154;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,1:0,2:0|1:24300660_G_C:24300660:0,1,0,4
chr22	24300683	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=170,154;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:24300660_G_C:24300660:0,1,0,4
chr22	24300700	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=162,154;MMQ=27,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr22	24300701	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=162,154;MMQ=24,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr22	24325006	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=139,136;MMQ=24,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:2,0,2,0
chr22	24325024	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=171,163;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=53.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.712:18:2,7:2,5:1,4,7,6
chr22	24325047	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=206,163;MMQ=27,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:2,9:3,6:0,5,8,7
chr22	24376322	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr22	24377034	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	24379577	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=131,184;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.444:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr22	24459699	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=145,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:2,1:0,3,0,2
chr22	24460723	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=188,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:24460723_T_C:24460723:0,1,0,2
chr22	24460725	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=188,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:24460723_T_C:24460723:0,1,0,2
chr22	24460726	.	T	TGCTGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=188,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:24460723_T_C:24460723:0,1,0,2
chr22	24460733	.	AT	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=188,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24460723_T_C:24460723:0,1,0,1
chr22	24472270	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=181,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,3:3,1:0,6,0,5
chr22	24480503	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,1:4,5:9,2,4,2
chr22	24483750	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	24492061	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:0,5,1,3
chr22	24572034	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,1:5,3:7,0,3,1
chr22	24578987	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=242,174;MMQ=60,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24578987_T_C:24578987:2,0,1,0
chr22	24578995	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=242,174;MMQ=60,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24578987_T_C:24578987:2,0,1,0
chr22	24579454	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr22	24580924	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.552:18:4,6:3,3:1,7,2,8
chr22	24581207	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,132;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr22	24581361	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=195,272;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24581361_G_T:24581361:1,0,1,0
chr22	24581377	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=195,272;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24581361_G_T:24581361:1,0,1,0
chr22	24615851	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	24621491	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,1:2,1:3,1,1,2
chr22	24621709	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	24627309	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=239,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr22	24627410	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:1,3,1,2
chr22	24628241	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,11;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:24628241_T_G:24628241:0,2,0,1
chr22	24628243	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,11;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:24628241_T_G:24628241:0,2,0,1
chr22	24628245	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,13;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:24628241_T_G:24628241:0,2,0,1
chr22	24628250	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=14,35;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:24628241_T_G:24628241:0,1,0,1
chr22	24628253	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,10;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:24628241_T_G:24628241:0,1,0,1
chr22	24628255	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=21,12;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:24628241_T_G:24628241:0,1,0,1
chr22	24628258	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,12;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:24628241_T_G:24628241:0,1,0,1
chr22	24628260	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,10;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:24628241_T_G:24628241:0,1,0,1
chr22	24640612	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=163,182;MMQ=60,26;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:9,2:13,1:0|1:24640612_C_A:24640612:4,19,0,3
chr22	24640628	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=165,173;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,1:12,1:0|1:24640612_C_A:24640612:2,23,0,2
chr22	24709420	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=119,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.487:43:15,8:7,12:5,17,7,14
chr22	24720484	.	CAC	AGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=186,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr22	24730587	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=185,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr22	24743079	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:33,3:25,0:36,23,0,3
chr22	24759172	.	ATTACT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,8:4,3:8,0,12,1
chr22	24938908	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr22	24940128	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	24944053	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,4:0,1:0,0,2,6
chr22	24944782	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	24950950	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,2:10,0:2,17,0,2
chr22	24951086	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	24953571	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr22	25003852	.	GGC	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=148,118;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:2,1:8,2:0|1:25003852_GGC_G:25003852:10,2,2,1
chr22	25003859	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=156,118;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:4,1:10,2:0|1:25003852_GGC_G:25003852:11,3,2,1
chr22	25003922	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=152,114;MMQ=54,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.169:45:18,6:19,1:26,12,5,2
chr22	25004075	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,199;MMQ=50,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr22	25005887	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=212,197;MMQ=25,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,1:8,2:8,6,3,0
chr22	25006031	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=174,194;MMQ=25,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,1:6,3:1,12,0,4
chr22	25010670	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=197,183;MMQ=40,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:5,5:3,1:0|1:25010670_G_A:25010670:8,2,6,0
chr22	25010682	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=181,180;MMQ=40,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:5,7:6,1:0|1:25010670_G_A:25010670:9,3,8,0
chr22	25010692	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=181,180;MMQ=40,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.375:22:7,7:7,1:0|1:25010670_G_A:25010670:10,4,8,0
chr22	25010828	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=137,191;MMQ=50,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,8:0.166:52:23,6:21,2:18,26,2,6
chr22	25010979	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=163,198;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.269:20:9,4:6,1:15,0,4,1
chr22	25011027	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=154,76;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,4:0.109:43:23,3:14,1:0|1:25011027_C_T:25011027:24,15,2,2
chr22	25011031	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=155,98;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.088:43:24,1:15,1:0|1:25011027_C_T:25011027:23,17,1,2
chr22	25011033	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=155,138;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:24,1:16,1:0|1:25011027_C_T:25011027:23,17,1,1
chr22	25011106	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=144,188;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.148:29:13,1:11,2:5,20,0,4
chr22	25011145	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=159,196;MMQ=40,37;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,1:6,2:1,17,0,3
chr22	25017036	.	CG	C	.	.	DP=94;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=149,200;MMQ=60,24;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,4:0.056:86:35,1:45,3:34,48,0,4
chr22	25017055	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=149,200;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,4:0.063:76:28,1:42,3:23,49,0,4
chr22	25017066	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=149,200;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,4:0.062:77:33,1:40,3:22,51,0,4
chr22	25024040	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=184,174;MMQ=40,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,9:0.158:61:24,4:27,5:28,24,2,7
chr22	25024072	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=169,193;MMQ=40,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.146:46:19,3:20,2:0|1:25024072_G_T:25024072:24,16,2,4
chr22	25024076	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=162,193;MMQ=40,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.145:46:17,4:22,2:0|1:25024072_G_T:25024072:24,16,2,4
chr22	25119284	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr22	25119300	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=241,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr22	25120895	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=132,59;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:11,2:6,0:0|1:25120895_C_T:25120895:7,11,1,1
chr22	25120919	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=143,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:9,0:0|1:25120895_C_T:25120895:10,9,1,1
chr22	25120921	.	G	GAGAAAACCTACTT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=143,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:9,0:0|1:25120895_C_T:25120895:10,9,1,1
chr22	25124095	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=188,232;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,1,1
chr22	25151890	.	CA	C,AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34,30;MFRL=130,158,241;MMQ=60,60,60;MPOS=24,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.63,3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.254,0.281:8:2,1,1:2,1,1:0,4,0,4
chr22	25153810	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr22	25158326	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,4:0,1:4,0,5,0
chr22	25275523	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,2,5
chr22	25282765	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:25282765_T_C:25282765:0,0,0,6
chr22	25282789	.	AAGG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:25282765_T_C:25282765:0,2,0,1
chr22	25308589	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,56;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:6,0:8,6,3,0
chr22	25331540	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=101,47;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,2:6,0:0|1:25331540_C_T:25331540:16,5,1,1
chr22	25331558	.	A	ATTTCTG	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:18,2:6,0:0|1:25331540_C_T:25331540:19,5,1,1
chr22	25331561	.	A	AAT	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:18,2:6,0:0|1:25331540_C_T:25331540:19,5,1,1
chr22	25331562	.	GCT	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=111,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:18,2:6,0:0|1:25331540_C_T:25331540:19,5,1,1
chr22	25424549	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,1:9,1:8,14,2,0
chr22	25428763	.	G	GCTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=196,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr22	25428768	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr22	25436904	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=109,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,5:9,3:8,9,3,5
chr22	25437550	.	GGGCC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25437550_GGGCC_G:25437550:0,1,0,1
chr22	25437555	.	G	GTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,101;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25437550_GGGCC_G:25437550:0,1,0,1
chr22	25445405	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr22	25577846	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=161,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr22	25577866	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=185,182;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.307:8:1,0:3,2:0,6,0,2
chr22	25577883	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=187,182;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr22	25586564	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr22	25597331	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,4:0,16:0,0,14,7
chr22	25617554	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	25625554	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,6,18
chr22	25713904	.	GG	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,248;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25713904_GG_CA:25713904:0,0,1,0
chr22	25713908	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,248;MMQ=60,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25713904_GG_CA:25713904:0,0,1,0
chr22	25713933	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,248;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	25714218	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,13,12
chr22	25716068	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,7:0,0,8,7
chr22	25750814	.	C	CAGGGCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr22	25960938	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=12,32;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.528:2:0,0:0,1:0|1:25960938_C_CGG:25960938:1,0,1,0
chr22	25960941	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=12,31;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:0,0:0,1:0|1:25960938_C_CGG:25960938:2,0,1,0
chr22	25960944	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=19,30;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:0,0:0,1:0|1:25960938_C_CGG:25960938:3,0,1,0
chr22	25960952	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:25960938_C_CGG:25960938:4,0,1,0
chr22	25960954	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:2,0:1,0:0|1:25960938_C_CGG:25960938:4,0,1,0
chr22	26159129	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:2,1,3,3
chr22	26163996	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr22	26164079	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,19:0,17:0,0,21,15
chr22	26164413	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=93,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr22	26165200	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,1,1
chr22	26166842	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:13,7,2,0
chr22	26193982	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr22	26194093	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr22	26219412	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr22	26219723	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=187,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr22	26222505	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,8:3,2:0,4,3,7
chr22	26228797	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	26239906	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=201,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr22	26239938	.	T	TACAGTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	26243662	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	26247607	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr22	26270190	.	A	ACC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=139,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=C;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:4,0:4,2,3,1
chr22	26273850	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr22	26273889	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.420:15:3,4:4,2:8,1,6,0
chr22	26294513	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=167,288;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	26298728	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,3:2,1:2,6,3,1
chr22	26307118	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=188,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	26317403	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=128,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:26317403_A_G:26317403:2,5,1,1
chr22	26317410	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:26317403_A_G:26317403:2,3,1,1
chr22	26342056	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr22	26343805	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,2:0,0,7,5
chr22	26346311	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr22	26346503	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=190,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26346503_T_A:26346503:0,1,0,1
chr22	26346511	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26346503_T_A:26346503:0,2,0,1
chr22	26388304	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr22	26689017	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	26690407	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:3,5,0,5
chr22	26695077	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:0,3:3,4:0,3,1,7
chr22	26701924	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=59,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:1,1:2,0:0,4,5,0
chr22	26706885	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr22	26736661	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,36;MFRL=101,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:26736661_CCT_C:26736661:0,4,0,1
chr22	26736667	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26736661_CCT_C:26736661:0,1,0,1
chr22	26736677	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26736677_CA_C:26736677:0,1,0,1
chr22	26736679	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26736677_CA_C:26736677:0,1,0,1
chr22	26736681	.	TTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=-10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26736677_CA_C:26736677:0,1,0,1
chr22	26769464	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,0:5,0:1,12,0,5
chr22	26830478	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr22	26853980	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	26861545	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr22	26862153	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,11,5
chr22	26862309	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:1,0:2,1:0|1:26862309_TC_T:26862309:0,3,0,1
chr22	26862311	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26862309_TC_T:26862309:0,3,0,1
chr22	26862315	.	C	CTCCAGTA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=36,35;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26862309_TC_T:26862309:0,3,0,1
chr22	26862318	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26862309_TC_T:26862309:0,3,0,1
chr22	26862320	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26862309_TC_T:26862309:0,3,0,1
chr22	26862330	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:26862309_TC_T:26862309:0,3,0,1
chr22	26864658	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr22	26866950	.	CT	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=205,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	26875370	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:2,3:4,0:0,6,0,4
chr22	26882142	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr22	26886953	.	GT	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=83.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,13:0,17:0,0,31,0
chr22	26887099	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=136.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,16:0,24:0,0,6,35
chr22	26887110	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.101:28:9,1:14,1:3,23,0,2
chr22	26895061	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,4:4,1:8,3,4,1
chr22	26897816	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:5,2:12,0:14,5,2,0
chr22	26899774	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=125,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:3,1:0,8,0,2
chr22	26924149	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,4:5,2:9,4,6,0
chr22	26924312	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:1,8,1,3
chr22	26924336	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr22	26951317	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	26951341	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	27019128	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr22	27019209	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,2:4,0:12,2,1,1
chr22	28194176	.	G	GTGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	28196551	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=287,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr22	28490084	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:8,8,2,0
chr22	28501808	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:28501808_GA_G:28501808:0,1,0,1
chr22	28501814	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:28501808_GA_G:28501808:0,1,0,1
chr22	28501820	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:28501808_GA_G:28501808:0,1,0,1
chr22	28692331	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,26;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,0:1,1:1,5,0,2
chr22	29091037	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.497:34:9,11:8,5:15,2,16,1
chr22	29093052	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:29093052_AT_A:29093052:0,4,0,2
chr22	29093055	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:29093052_AT_A:29093052:0,4,0,2
chr22	29105872	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.230:24:8,3:11,1:0|1:29105872_A_G:29105872:19,0,5,0
chr22	29105875	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:7,3:11,2:0|1:29105872_A_G:29105872:18,0,5,0
chr22	29105886	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,3:12,0:25,0,3,0
chr22	29117624	.	TA	T,TAA	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=133,167,154;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.91,6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:64,6,6:0.071,0.086:76:15,2,2:41,4,3:7,57,0,12
chr22	29120925	.	GA	G,GAA	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=34,35,32;MFRL=142,130,142;MMQ=60,60,60;MPOS=31,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.88,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:55,5,4:0.080,0.073:64:23,2,2:31,3,1:17,38,4,5
chr22	29130317	.	T	TGAGG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=165,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:29130317_T_TGAGG:29130317:6,1,1,1
chr22	29130318	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=165,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:29130317_T_TGAGG:29130317:6,1,1,1
chr22	29130321	.	A	AAGAACCTGAGGAGCCTACC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=165,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:29130317_T_TGAGG:29130317:6,1,1,1
chr22	29195088	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,0:13,2:8,20,2,0
chr22	29439201	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=221,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,4,1
chr22	29439481	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:29439481_T_A:29439481:0,3,0,1
chr22	29439485	.	C	CTCACTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:29439481_T_A:29439481:0,3,0,1
chr22	29439498	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:29439498_TC_T:29439498:0,2,0,1
chr22	29439501	.	TATCTCTGTC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:29439498_TC_T:29439498:0,2,0,1
chr22	29439515	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29439498_TC_T:29439498:0,0,0,1
chr22	29440692	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=231,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:2,2:0,1:2,0,4,0
chr22	29456733	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,3:2,3:5,3,5,1
chr22	29490497	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr22	29622577	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=142,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29622577_GC_G:29622577:0,1,0,1
chr22	29622579	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=142,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29622577_GC_G:29622577:0,1,0,1
chr22	29622582	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=142,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29622577_GC_G:29622577:0,1,0,1
chr22	29626933	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,155;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:11,0:19,1,2,0
chr22	29650096	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr22	29656230	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=66,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,0:0|1:29656230_T_G:29656230:0,2,0,1
chr22	29656237	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,13;MFRL=66,212;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:29656230_T_G:29656230:0,2,0,1
chr22	29656262	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:29656230_T_G:29656230:1,1,0,1
chr22	29660067	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:5,4,2,0
chr22	29669648	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,4:2,6:6,0,10,0
chr22	29669693	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=107.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,14:0,0,22,9
chr22	29682881	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:7,3:0,1:7,0,4,0
chr22	29684659	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=140,97;MMQ=53,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:14,3:12,1:17,9,3,1
chr22	29707639	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	29711251	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	29727886	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,2:0,0,1,7
chr22	29730456	.	TC	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	29750922	.	G	GGTCTAACAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr22	29837537	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=153,145;MMQ=56,55;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:7,14:11,6:15,3,14,7
chr22	29837566	.	TTCC	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=142,148;MMQ=45,54;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=100.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,28:0.561:50:11,15:8,13:16,6,18,10
chr22	29837847	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,129;MMQ=49,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,7:0.159:48:12,4:29,3:24,17,7,0
chr22	29837884	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=131,131;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,20:0.320:63:17,7:25,12:26,17,7,13
chr22	29838203	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr22	29881884	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr22	29907353	.	T	TGGAGTGCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	29908154	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=100,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:4,5:11,6:3,12,1,10
chr22	29952016	.	CAG	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.473:34:9,9:9,7:7,11,5,11
chr22	29957321	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr22	29957911	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr22	29960458	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=178,130;MMQ=57,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:29960458_G_A:29960458:0,3,0,1
chr22	29960465	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=178,130;MMQ=57,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:29960458_G_A:29960458:0,3,0,1
chr22	29960489	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,34;MFRL=170,287;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29960489_A_G:29960489:0,1,0,1
chr22	29960493	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=170,287;MMQ=60,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29960489_A_G:29960489:0,1,0,1
chr22	29960496	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=170,287;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29960489_A_G:29960489:0,1,0,1
chr22	29960498	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=170,287;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:29960489_A_G:29960489:0,1,0,1
chr22	29960501	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,287;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29960489_A_G:29960489:0,0,0,1
chr22	29966083	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr22	30034994	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr22	30051682	.	G	T	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,6:0.052:89:39,0:36,0:39,44,0,6
chr22	30051691	.	C	A	.	.	DP=81;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,8:0.069:74:25,0:27,0:28,38,0,8
chr22	30051705	.	CTTT	C,CTT,GTTT	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=22,34,19,16;MFRL=134,152,153,127;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,17,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.71,11.63,8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,4,7,8:0.135,0.302,0.147:29:0,2,2,1:8,2,1,0:4,6,0,19
chr22	30077361	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	30123751	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=115,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,6:1,6:1,0,4,8
chr22	30124968	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr22	30125596	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr22	30125620	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	30127367	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr22	30138497	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:1,3,2,2
chr22	30163332	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr22	30163526	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,2:7,3:3,8,2,3
chr22	30184950	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:3,2:6,4:10,0,6,0
chr22	30198025	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:6,1,7,0
chr22	30202774	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=108,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:2,2,2,0
chr22	30221271	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,1:9,1:2,13,0,2
chr22	30223584	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.502:46:12,12:10,9:17,6,10,13
chr22	30229706	.	A	AGGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30229706_A_AGGAG:30229706:0,1,0,1
chr22	30229708	.	C	CCTTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30229706_A_AGGAG:30229706:0,1,0,1
chr22	30229709	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30229706_A_AGGAG:30229706:0,1,0,1
chr22	30366947	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	30367190	.	GTCTTT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTTT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	30374621	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,5:6,2:0,8,0,7
chr22	30374920	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,22:0.694:31:3,8:6,12:6,3,14,8
chr22	30384572	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:7,8:9,3:3,13,3,8
chr22	30399000	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,3:5,6:0,7,1,8
chr22	30405151	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,4:0,0,2,11
chr22	30412759	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	30413877	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.526:36:10,11:7,8:14,3,14,5
chr22	30414091	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=181,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:1,1:6,2:1,6,2,2
chr22	30418161	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr22	30419469	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:7,2:6,0:1,13,1,1
chr22	30507904	.	CT	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=140,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.184:34:10,5:14,1:0,28,0,6
chr22	30515049	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.542:46:9,16:12,9:7,14,9,16
chr22	30571979	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr22	30602930	.	T	TGCC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:30602930_T_TGCC:30602930:1,1,1,0
chr22	30602933	.	CGG	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,12;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:30602930_T_TGCC:30602930:1,1,1,0
chr22	30602934	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,13;MFRL=174,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1|0:30602930_T_TGCC:30602930:0,1,1,0
chr22	30602937	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=23,31;MFRL=112,97;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:0,0:1|0:30602930_T_TGCC:30602930:1,2,1,0
chr22	30602940	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,16;MFRL=102,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:30602930_T_TGCC:30602930:2,2,1,0
chr22	30602941	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,10;MFRL=110,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,0:1|0:30602930_T_TGCC:30602930:2,2,1,0
chr22	30602946	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=102,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0|1:30602930_T_TGCC:30602930:2,2,2,0
chr22	30602950	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=28,22;MFRL=107,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,0:1,1:0|1:30602930_T_TGCC:30602930:2,3,2,0
chr22	30603118	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,4:3,8:7,1,3,9
chr22	30659867	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	30660517	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr22	30681610	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=144,98;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:3,0:7,2:6,5,0,2
chr22	30681779	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:5,2:5,1:6,5,3,0
chr22	30681797	.	T	TCTGCCCCAGCCCTTGGTGCTCCCC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,7:0,1:0,0,11,8
chr22	30682318	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=123,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:8,0:9,3:9,8,2,1
chr22	30689437	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,35;MFRL=296,274;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr22	30691631	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr22	30733914	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,4:6,6:2,10,3,7
chr22	30735303	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30735303_G_GCA:30735303:0,1,0,1
chr22	30735304	.	AGAG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30735303_G_GCA:30735303:0,1,0,1
chr22	30735311	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30735303_G_GCA:30735303:0,1,0,1
chr22	30736147	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr22	30738161	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,18:0,10:0,0,25,3
chr22	30738737	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr22	30752696	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,7:0,1:0,0,9,0
chr22	30762795	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:30762795_T_C:30762795:0,3,0,1
chr22	30762798	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,27;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:30762795_T_C:30762795:0,3,0,1
chr22	30762802	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:30762795_T_C:30762795:0,3,0,1
chr22	30762812	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=193,141;MMQ=60,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:30762812_CA_TG:30762812:0,3,0,1
chr22	30762817	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,29;MFRL=193,141;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:30762812_CA_TG:30762812:0,3,0,1
chr22	30762842	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=193,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30762842_T_A:30762842:0,1,0,1
chr22	30762844	.	CA	GG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=193,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30762842_T_A:30762842:0,1,0,1
chr22	30762852	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=193,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30762842_T_A:30762842:0,1,0,1
chr22	30776419	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=122,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.390:34:12,6:8,7:8,13,2,11
chr22	30802444	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=123,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:7,7:4,3:3,8,0,10
chr22	30805121	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.358:29:6,3:11,7:12,7,6,4
chr22	30805296	.	G	GTCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:2,1,0,1
chr22	30812549	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr22	30822920	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	30823065	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,1:1,3:3,3,4,0
chr22	30863163	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr22	30864445	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=10,13;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,0:0,0:3,1,1,0
chr22	30864452	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=139,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:2,0:2,0:3,1,2,0
chr22	30864692	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr22	30864897	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr22	30888412	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr22	30920965	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:4,4:2,5:6,1,7,2
chr22	30921294	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	30927975	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr22	30987861	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr22	31010242	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr22	31010556	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	31011504	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:1,4,1,4
chr22	31011557	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr22	31013549	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr22	31013566	.	A	AAGTCCAAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr22	31018884	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=217,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr22	31042778	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:31042778_C_T:31042778:8,6,1,1
chr22	31042784	.	C	CCAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=134,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:9,0:5,2:0|1:31042778_C_T:31042778:7,8,1,1
chr22	31042785	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=134,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,0:5,2:0|1:31042778_C_T:31042778:7,8,1,1
chr22	31089958	.	G	GA,GAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,34,32;MFRL=146,120,122;MMQ=60,60,60;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=8.48,9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,6:0.320,0.357:17:1,1,1:2,3,3:2,4,8,3
chr22	31137372	.	G	GCCATGTCTCCTTCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr22	31137405	.	C	CCTCCGTGTCAATGTGCGCGGTGGACAGGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	31285197	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=124,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:18,2:12,0:7,23,0,2
chr22	31301734	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr22	31302125	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	31329056	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr22	31329954	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr22	31331055	.	TAGGAGTTGGCAAAGAAGGGGGTCTGCTGGGGGCGTTCCTGATCACAGCAGGTAAAGGGGGCGACCG	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.089:33:11,0:6,2:15,16,1,1
chr22	31331077	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=123,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.382:18:7,1:4,1:8,3,1,6
chr22	31331091	.	T	TTATTGG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=156,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,2:5,0:0|1:31331091_T_TTATTGG:31331091:7,8,1,1
chr22	31331092	.	C	CTAGGCTGTTTGT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=156,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:0|1:31331091_T_TTATTGG:31331091:7,8,1,1
chr22	31335724	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr22	31486779	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.408:14:4,1:4,0:2,6,6,0
chr22	31487194	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,0:0,2:1,4,1,1
chr22	31494568	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=209,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.801:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr22	31494847	.	GGGCAGTGGGGGGCGGGGCGTGATA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.723:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	31497054	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr22	31497088	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31497088_A_C:31497088:0,3,0,1
chr22	31497090	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:31497088_A_C:31497088:0,3,0,1
chr22	31501788	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr22	31524151	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=213,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,1,3
chr22	31583007	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr22	31600419	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr22	31600460	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,10,3
chr22	31658281	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr22	31664032	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,13,1
chr22	31669342	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr22	31669419	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,3:7,5:4,5,6,2
chr22	31672676	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,36;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr22	31672752	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,11,0
chr22	31685458	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr22	31687142	.	G	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=262.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,39:0,37:0,0,42,36
chr22	31687313	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=208.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,26:0,31:0,0,5,56
chr22	31724972	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr22	31843117	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	31844293	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr22	31851391	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0|1:31851391_T_G:31851391:0,5,0,1
chr22	31851392	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chr22	31851397	.	TTC	T,GTC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,33,33;MFRL=188,187,188;MMQ=60,60,60;MPOS=18,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.19,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.248,0.248:5:2,0,0:1,1,1:0,3,0,2
chr22	31851399	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:31851391_T_G:31851391:0,3,0,1
chr22	31854370	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	31854434	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr22	31854629	.	T	TTTCACGGATTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,1,1
chr22	31904170	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,7,9
chr22	31926475	.	C	CAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=24,29;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:31926475_C_CAAAAA:31926475:0,0,1,0
chr22	31926500	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=80,146;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:31926475_C_CAAAAA:31926475:0,2,1,0
chr22	31926502	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=37,13;MFRL=80,146;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:2,0:0|1:31926475_C_CAAAAA:31926475:0,2,1,0
chr22	31926725	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr22	31946168	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=152,124;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.258:10:3,1:3,0:6,2,2,0
chr22	31946176	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=134,124;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:2,1:5,1:5,3,2,0
chr22	31971172	.	A	ATCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,6,2
chr22	31998791	.	T	TCTCTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=215,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31998791_T_TCTCTC:31998791:0,1,0,1
chr22	31998793	.	A	ATTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=215,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31998791_T_TCTCTC:31998791:0,1,0,1
chr22	31998794	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=215,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31998791_T_TCTCTC:31998791:0,1,0,1
chr22	31998801	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31998791_T_TCTCTC:31998791:0,0,0,1
chr22	32002294	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr22	32081436	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.564:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr22	32097775	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,13:0,8:0,0,4,17
chr22	32100797	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=37,32;MFRL=205,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32100797_C_T:32100797:0,2,0,1
chr22	32100798	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr22	32100799	.	T	TTTTCTCA,TGAGATCAAATCTACG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33,33;MFRL=197,144,213;MMQ=60,60,60;MPOS=3,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,1:1,0,0:0,1,0,2
chr22	32100800	.	G	GGAGCCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=205,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32100797_C_T:32100797:0,2,0,1
chr22	32156807	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	32179850	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,19:0,7:0,0,24,4
chr22	32188193	.	TCC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32188193_TCC_T:32188193:0,0,0,1
chr22	32188198	.	T	TAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32188193_TCC_T:32188193:0,0,0,1
chr22	32193749	.	A	ATGCTGGGGTCTTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr22	32198862	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:5,2:3,6:1,7,0,8
chr22	32205632	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.584:27:6,9:5,6:6,5,8,8
chr22	32229891	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:11,3,1,1
chr22	32229977	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:7,7:3,5:5,5,5,7
chr22	32266546	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:6,2,4,0
chr22	32272337	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	32293685	.	C	CCCCAACCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:32293685_C_CCCCAACCCT:32293685:0,0,0,1
chr22	32293686	.	G	GGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:32293685_C_CCCCAACCCT:32293685:0,0,0,1
chr22	32330063	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=145,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:6,0:10,1,2,2
chr22	32352432	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:9,5,1,1
chr22	32463875	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,2:0,0,13,0
chr22	32478972	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr22	32480718	.	G	GAAGGAGTCGGCCCTTGGAGTGTAGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	32482127	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=168,178;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.311:8:0,2:5,0:5,1,2,0
chr22	32545637	.	AAT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AT;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:4,1:6,2:8,2,1,2
chr22	32545849	.	C	CA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=126.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,11:0,22:0,0,5,28
chr22	32589023	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,6,10
chr22	32589034	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,4:0,12:0,0,6,11
chr22	32589051	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:8,9,1,1
chr22	32589090	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=172,152;MMQ=60,39;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:6,0:2,3:4,4,3,1
chr22	32590522	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,9:0,0,0,12
chr22	32598501	.	G	GTA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32598501_G_GTA:32598501:0,1,0,1
chr22	32598502	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32598501_G_GTA:32598501:0,1,0,1
chr22	32598508	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32598501_G_GTA:32598501:0,1,0,1
chr22	32598511	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,33;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32598501_G_GTA:32598501:0,1,0,1
chr22	32598515	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32598501_G_GTA:32598501:0,1,0,1
chr22	32598517	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32598501_G_GTA:32598501:0,1,0,1
chr22	32617062	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr22	32621619	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,5:0,0,12,4
chr22	32625260	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:14,2:13,0:21,7,1,1
chr22	32626908	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=97,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.525:11:2,2:3,2:5,0,5,1
chr22	32633242	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=105,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,3:2,0:3,5,3,0
chr22	32651306	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,1:7,6:3,9,1,6
chr22	32754419	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,166;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:8,9,1,1
chr22	32813176	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=212,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.680:4:0,1:0,1:0,1,0,3
chr22	32813217	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=200,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr22	32841711	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:32841711_A_G:32841711:1,3,0,1
chr22	32841715	.	A	ATTTCAGGCAAATATCCCTAATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:32841711_A_G:32841711:1,3,0,1
chr22	32887259	.	T	TGAGACAGAAATTCAATTCATACTCTTCATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	32937740	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,3:1,7:0,3,2,8
chr22	33562887	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr22	35463225	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=100,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:3,3,1,4
chr22	35463249	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=100,169;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:3,3,1,2
chr22	35478486	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,4,4
chr22	35478529	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=88,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:3,2,1,3
chr22	35481776	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr22	35680095	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,3:1,7:0,6,0,10
chr22	35681893	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr22	35683238	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:6,0,4,0
chr22	35718087	.	C	CCA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:35718087_C_CCA:35718087:0,3,1,0
chr22	35718095	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:35718087_C_CCA:35718087:0,3,1,0
chr22	35718119	.	C	CCACAAGCAGCATTTATATCCAGGTGAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=191,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	35729416	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:22,3:19,0:30,11,3,0
chr22	35777185	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	35779051	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=0,146;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.342:7:1,0:2,2:3,2,2,0
chr22	35786003	.	GGACTTGGCTGTCT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr22	35796680	.	G	GGGCCCAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,260;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	35797333	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:6,5:5,2:6,5,4,4
chr22	35802661	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr22	35804622	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	35810052	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr22	35820341	.	C	CTCCTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr22	35820348	.	C	CTAATGAGCTGACAGCTTCACTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=104,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr22	35943025	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=169,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:6,8,2,0
chr22	35943045	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:5,1:6,8,2,0
chr22	36006923	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr22	36006961	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=123,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,2:14,0:11,11,1,1
chr22	36054572	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr22	36114047	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:1,2:0|1:36114047_C_T:36114047:0,2,0,4
chr22	36114054	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0|1:36114047_C_T:36114047:0,2,0,4
chr22	36124963	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,17;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:36124963_G_T:36124963:0,2,0,1
chr22	36124967	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36124963_G_T:36124963:0,2,0,1
chr22	36142610	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,1:10,1:12,11,1,1
chr22	36550537	.	CAAG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:6,2:4,3:8,2,4,1
chr22	36556942	.	T	TGCTCACAGCTCTG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=159,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:5,2:7,0:2,11,1,1
chr22	36556964	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr22	36587845	.	A	ACT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,1:3,6:1,4,2,5
chr22	36593628	.	A	AC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.434:21:6,2:5,5:0|1:36593628_A_AC:36593628:11,1,9,0
chr22	36593640	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:6,4:6,8:0|1:36593628_A_AC:36593628:11,1,12,0
chr22	36627454	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,2:15,1:7,18,1,2
chr22	36650890	.	T	A,C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=30,33,33;MFRL=163,148,182;MMQ=60,60,40;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.36,8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,2,3:0.110,0.147:24:4,2,3:15,0,0:17,2,5,0
chr22	36650892	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=162,181;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,2:15,0:23,2,2,0
chr22	36650895	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=159,181;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:7,3:16,0:21,2,3,0
chr22	36650906	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=148,180;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:7,3:19,0:23,4,3,0
chr22	36657596	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.515:12:2,5:2,1:5,1,5,1
chr22	36657628	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.517:21:4,7:6,3:6,4,9,2
chr22	36661149	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,18:0.546:33:2,6:12,10:0|1:36661149_A_G:36661149:12,3,16,2
chr22	36661152	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,18:0.531:34:3,6:12,12:0|1:36661149_A_G:36661149:13,3,16,2
chr22	36690113	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr22	36695173	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:36695173_C_T:36695173:0,0,0,3
chr22	36695181	.	G	GCCGGGGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=66,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0|1:36695173_C_T:36695173:0,2,0,1
chr22	36705529	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr22	36708084	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=86.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,10:0,15:0,0,19,8
chr22	36708338	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	36710183	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,17:0,0,25,6
chr22	36712472	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,17,0
chr22	36712810	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr22	36717001	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:0,4:2,0:0,4,0,4
chr22	36722534	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr22	36744886	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:36744886_GC_G:36744886:0,0,5,0
chr22	36744888	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:36744886_GC_G:36744886:0,0,5,0
chr22	36744890	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:36744886_GC_G:36744886:0,0,5,0
chr22	36745342	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:36745342_G_A:36745342:0,4,0,1
chr22	36745350	.	CACAAGA	C,CCCCTCCTCCCCAATTTACAAGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33,34;MFRL=127,162,171;MMQ=60,60,60;MPOS=4,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,0:0,0,1:0,1,0,2
chr22	36745359	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:36745342_G_A:36745342:0,1,0,1
chr22	36872750	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,5:6,2:10,0,5,2
chr22	36886359	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36886359_TG_T:36886359:0,0,0,1
chr22	36886366	.	G	GATTTAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36886359_TG_T:36886359:0,0,0,1
chr22	36886368	.	G	GAATCAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36886359_TG_T:36886359:0,0,0,1
chr22	36886371	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36886359_TG_T:36886359:0,0,0,1
chr22	36886374	.	A	AGTAAAGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=271,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36886359_TG_T:36886359:0,1,0,1
chr22	36889930	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:36889930_A_G:36889930:0,0,1,4
chr22	36889934	.	A	ACTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:36889930_A_G:36889930:1,3,0,1
chr22	36894283	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	36912724	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:3,7:5,5:5,3,8,5
chr22	36920062	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,5:3,6:0,4,2,9
chr22	36960340	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,18;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.299:14:5,1:2,1:0|1:36960340_G_C:36960340:9,1,4,0
chr22	36960345	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:1,0:0|1:36960340_G_C:36960340:10,1,2,0
chr22	36960351	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:5,0:5,0:0|1:36960340_G_C:36960340:12,1,2,0
chr22	36960931	.	GA	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=157,150;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:36960931_GA_CC:36960931:0,4,0,1
chr22	36960935	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=157,150;MMQ=60,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:36960931_GA_CC:36960931:0,4,0,1
chr22	36960957	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=224,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:0,1:0,3,0,3
chr22	36962353	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=221,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:2,1,3,0
chr22	36983404	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=201,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr22	36983428	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr22	37163329	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.660:21:3,7:3,7:3,4,9,5
chr22	37171611	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr22	37207621	.	G	GCTGCAGGGCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:4,2,1,1
chr22	37268079	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr22	37268501	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,9:0,0,7,20
chr22	37268555	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr22	37271882	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr22	37272001	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=162,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.174:20:10,3:7,0:0|1:37272001_T_TG:37272001:8,9,3,0
chr22	37272005	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,13;MFRL=162,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.174:20:10,0:7,0:0|1:37272001_T_TG:37272001:8,9,3,0
chr22	37318426	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr22	37319425	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,4,10
chr22	37328751	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=171,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,2,0
chr22	37328966	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:0,4,0,5
chr22	37331305	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:4,3,4,0
chr22	37387119	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr22	37398403	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37398403_A_G:37398403:0,0,0,1
chr22	37398406	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37398403_A_G:37398403:0,0,0,1
chr22	37415976	.	C	CAGCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37415976_C_CAGCA:37415976:0,0,0,1
chr22	37415977	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37415976_C_CAGCA:37415976:0,0,0,1
chr22	37458586	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=45,182;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,0:6,5:4,10,4,1
chr22	37482307	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.157:31:15,1:8,1:11,15,5,0
chr22	37494420	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,1:1,1:4,1,1,1
chr22	37524917	.	A	AAGAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=140,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:37524917_A_AAGAAG:37524917:0,1,0,1
chr22	37524922	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37524917_A_AAGAAG:37524917:0,1,0,1
chr22	37528362	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr22	37528576	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr22	37528606	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr22	37532514	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,3:1,0:0,1,0,4
chr22	37533786	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:3,2:3,4:0|1:37533786_C_G:37533786:2,4,1,6
chr22	37533795	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.507:12:2,1:3,5:0|1:37533786_C_G:37533786:2,4,1,5
chr22	37538882	.	A	AACATTCTACAAAGCACCATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	37578214	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:5,6:10,5:15,1,9,2
chr22	37578807	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=196,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr22	37578852	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=208,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr22	37580334	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,4:5,1:6,1,5,0
chr22	37602583	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,4:0,1:0,0,3,3
chr22	37622881	.	TGG	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=95,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.589:15:2,3:2,6:0|1:37622881_TGG_T:37622881:2,4,1,8
chr22	37622884	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=95,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:2,2:3,6:0|1:37622881_TGG_T:37622881:2,4,1,8
chr22	37622890	.	G	GTGC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=193,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:2,3:1,5:0|1:37622881_TGG_T:37622881:1,2,1,7
chr22	37627234	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.217:15:5,1:5,1:0|1:37627234_T_C:37627234:12,0,3,0
chr22	37627243	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,0:0|1:37627234_T_C:37627234:14,1,2,0
chr22	37627246	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.292:15:6,3:5,1:0|1:37627234_T_C:37627234:10,1,4,0
chr22	37627255	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:8,0:0|1:37627234_T_C:37627234:18,2,2,0
chr22	37628053	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:2,4,2,5
chr22	37628993	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,2:5,0:1,4,0,2
chr22	37640091	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,100;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,3:8,0:13,4,0,3
chr22	37678551	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,13,5
chr22	37678565	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.616:21:5,7:2,6:6,2,9,4
chr22	37691930	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=128,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr22	37695256	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,6,12
chr22	37697947	.	AC	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=195,170;MMQ=50,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,1:6,0:0|1:37697947_AC_CT:37697947:9,0,2,0
chr22	37697950	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=195,170;MMQ=50,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:0|1:37697947_AC_CT:37697947:9,0,2,0
chr22	37699197	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr22	37707962	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr22	37708004	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=139,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,4:2,5:5,0,7,2
chr22	37770357	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr22	37771876	.	CCCT	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=142,141;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CCT;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.240:10:5,1:2,1:0,8,0,2
chr22	37771905	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0,11,0,2
chr22	37771916	.	C	CCACTACTGCTACTACTA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=157,139;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,2:3,0:0|1:37771916_C_CCACTACTGCTACTACTA:37771916:0,7,0,2
chr22	37771919	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=157,139;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:37771916_C_CCACTACTGCTACTACTA:37771916:0,7,0,2
chr22	37772003	.	G	GCTGGTGCCATGTGGTCCAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	37873087	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,159;MMQ=60,58;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr22	37876411	.	C	T,CCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32,35;MFRL=0,0,151;MMQ=60,60,60;MPOS=30,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.31,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr22	37876414	.	G	GAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37876414_G_GAC:37876414:0,1,0,1
chr22	37876415	.	G	GCTCCCGAGAAGAACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37876414_G_GAC:37876414:0,1,0,1
chr22	37876894	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=154,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:37876894_A_G:37876894:1,2,0,1
chr22	37876896	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=154,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:37876894_A_G:37876894:1,2,0,1
chr22	37887467	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=171,144;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37887467_G_A:37887467:0,1,0,1
chr22	37887469	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=171,144;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37887467_G_A:37887467:0,1,0,1
chr22	37887479	.	A	AAGGGTTGCTTGAGGC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=171,144;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37887467_G_A:37887467:0,1,0,1
chr22	37887509	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37887509_A_AT:37887509:0,0,0,1
chr22	37887512	.	G	GGCCGTGGACCA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37887509_A_AT:37887509:0,0,0,1
chr22	37887517	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37887509_A_AT:37887509:0,0,0,1
chr22	37887743	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,18;MFRL=71,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:37887743_C_G:37887743:0,1,1,0
chr22	37887747	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,13;MFRL=36,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:37887743_C_G:37887743:0,2,1,0
chr22	37887751	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:37887743_C_G:37887743:1,2,1,0
chr22	37887755	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,24;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:37887743_C_G:37887743:1,2,1,0
chr22	37887758	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,12;MFRL=36,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:37887743_C_G:37887743:2,2,1,0
chr22	37887760	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=36,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:37887743_C_G:37887743:2,2,1,0
chr22	37887841	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=115,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:3,2,1,2
chr22	37888704	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:8,7,2,0
chr22	37888803	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,82;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:3,4,0,2
chr22	37888868	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr22	37893073	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=137,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:5,6,0,2
chr22	37899101	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,0:0,5:5,0,5,0
chr22	37900243	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,3:5,5:2,7,3,5
chr22	37904957	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,19,6
chr22	37964408	.	CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:2,3:4,2,2,3
chr22	37964716	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:7,2:15,0:17,7,1,1
chr22	38017736	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,1:9,1:0,14,0,2
chr22	38019456	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=179,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,2:3,0:8,9,2,0
chr22	38037119	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:3,1:0|1:38037119_A_C:38037119:0,7,3,0
chr22	38037122	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:4,1:0|1:38037119_A_C:38037119:0,7,3,0
chr22	38037124	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,0:0|1:38037119_A_C:38037119:0,7,3,0
chr22	38037128	.	CGCAGCA	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,1:3,1:0|1:38037119_A_C:38037119:0,10,3,0
chr22	38038533	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.221:22:6,2:4,0:10,7,5,0
chr22	38041015	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr22	38061520	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	38119754	.	TCAA	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=206,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=175.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.973:42:1,25:0,15:0,1,34,7
chr22	38121040	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=120,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:10,7:12,12:10,12,11,8
chr22	38130385	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.931:13:0,4:0,6:0,0,9,4
chr22	38146585	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr22	38147914	.	G	GAGCCTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:38147914_G_GAGCCTA:38147914:0,1,0,1
chr22	38147917	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38147914_G_GAGCCTA:38147914:0,1,0,1
chr22	38151100	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:5,3,4,1
chr22	38155317	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0,0,4,5
chr22	38202403	.	CG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,7:0,3:0,0,10,1
chr22	38209304	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,4:3,2:3,3,5,1
chr22	38211651	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=189,127;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,2,0
chr22	38212762	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr22	38219795	.	CT	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	38229335	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=291,263;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	38243675	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=146.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,19:0,25:0,0,25,22
chr22	38243710	.	CCCTGAACCAAGGAAGAGACTGTGACTCTTCCTTGGTTCAGGGAAGGT	C	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,5:0.059:103:14,2:29,3:58,40,1,4
chr22	38251686	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr22	38382247	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,67;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:0,0:2,2:0,3,1,1
chr22	38463968	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=138,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,0:2,2:4,0,2,0
chr22	38464024	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.506:18:3,5:5,4:4,5,4,5
chr22	38467784	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.398:23:8,6:6,3:4,10,2,7
chr22	38483155	.	T	TTCATGGGTG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCATGGGTG;STR;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:3,2:3,2:2,5,8,5
chr22	38485233	.	C	CTGTGACTTT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38485233_C_CTGTGACTTT:38485233:0,0,0,1
chr22	38485237	.	G	GAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38485233_C_CTGTGACTTT:38485233:0,0,0,1
chr22	38485239	.	CTG	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38485233_C_CTGTGACTTT:38485233:0,0,0,1
chr22	38485243	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38485233_C_CTGTGACTTT:38485233:0,0,0,1
chr22	38485247	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38485233_C_CTGTGACTTT:38485233:0,0,0,1
chr22	38485249	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38485233_C_CTGTGACTTT:38485233:0,0,0,1
chr22	38504372	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,13:0,0,3,19
chr22	38530948	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38530948_C_T:38530948:0,0,1,0
chr22	38530962	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38530948_C_T:38530948:0,0,1,0
chr22	38530969	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38530948_C_T:38530948:0,0,1,0
chr22	38530973	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38530948_C_T:38530948:0,0,1,0
chr22	38530977	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=21,27;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38530948_C_T:38530948:0,1,1,0
chr22	38530980	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:38530948_C_T:38530948:0,1,1,0
chr22	38535946	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr22	38539041	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	38564041	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=112,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:1,5,1,6
chr22	38611045	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.553:25:3,8:8,5:8,3,7,7
chr22	38611122	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:3,7,2,3
chr22	38612372	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.464:17:3,3:6,5:8,1,7,1
chr22	38612518	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:5,5:2,3:2,6,0,8
chr22	38612556	.	T	TAAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=A;STR;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,6:0,1:0,0,0,8
chr22	38617570	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:7,5:10,4:11,6,8,1
chr22	38690628	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	38694162	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=124,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:6,1:3,7,1,1
chr22	38699050	.	GAGGC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGC;STR;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr22	38875549	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr22	38878475	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:14,3:6,1:14,7,2,2
chr22	38894102	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:17,5,1,1
chr22	38948803	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.417:8:4,0:1,3:0|1:38948803_T_C:38948803:0,5,0,3
chr22	38948806	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.417:8:4,0:1,3:0|1:38948803_T_C:38948803:0,5,0,3
chr22	39001442	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39001442_G_A:39001442:0,3,0,1
chr22	39001444	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39001442_G_A:39001442:0,3,0,1
chr22	39016182	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=112,51;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:2,2,2,0
chr22	39019347	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:1,8,0,4
chr22	39022288	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:10,1:10,13,2,0
chr22	39024961	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,1,19
chr22	39035760	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr22	39041717	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=118,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:39041717_T_TA:39041717:0,1,0,1
chr22	39041718	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=118,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:39041717_T_TA:39041717:0,1,0,1
chr22	39041719	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=103,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:39041719_GT_G:39041719:0,1,0,1
chr22	39041723	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=103,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:39041719_GT_G:39041719:0,1,0,1
chr22	39041724	.	A	ACG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39041719_GT_G:39041719:0,0,0,1
chr22	39041726	.	GGGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=211,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:39041719_GT_G:39041719:0,1,0,1
chr22	39079920	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.574:12:0,1:0,2:0,5,0,7
chr22	39105019	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,2:4,0:0|1:39105019_C_CT:39105019:0,11,0,2
chr22	39105021	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:39105019_C_CT:39105019:0,11,0,2
chr22	39105022	.	TGCC	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCC;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:3,0:0|1:39105019_C_CT:39105019:0,11,0,2
chr22	39123451	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	39135454	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:0,6,1,6
chr22	39136259	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=177,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:9,1,0,2
chr22	39146438	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=106,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr22	39224248	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=208,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,2:0,0:2,0,3,0
chr22	39224318	.	T	TCAAAATAGAATGGCATCACCA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=172,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,0:2,3,1,1
chr22	39224344	.	TT	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=68,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:39224344_TT_CA:39224344:1,0,0,1
chr22	39224348	.	T	TCTGAAAATAATTTGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=68,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:39224344_TT_CA:39224344:1,0,0,1
chr22	39262177	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,14;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,0:0,0:0|1:39262177_A_C:39262177:0,0,2,0
chr22	39262188	.	AAG	CCC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,2:0,0:0|1:39262177_A_C:39262177:0,0,2,0
chr22	39262197	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=248,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39262177_A_C:39262177:1,0,1,0
chr22	39262200	.	TT	CA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,12;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:39262177_A_C:39262177:2,0,1,0
chr22	39262204	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,17;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:39262177_A_C:39262177:2,0,1,0
chr22	39262207	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,17;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:39262177_A_C:39262177:2,0,1,0
chr22	39262208	.	G	GGGCCC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,17;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:1,0:0|1:39262177_A_C:39262177:2,0,1,0
chr22	39263224	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	39355717	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.435:16:4,3:5,4:1,8,1,6
chr22	39355778	.	TTTCCTGCAGTGTTTGTCACTTGTGC	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=184,175;MMQ=60,47;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr22	39357581	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=131,158;MMQ=49,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:6,3:8,5:5,9,1,7
chr22	39357688	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=97,126;MMQ=45,53;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:39357688_T_TA:39357688:2,2,0,1
chr22	39357691	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=97,126;MMQ=45,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:39357688_T_TA:39357688:2,2,0,1
chr22	39357707	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=214,127;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39357707_T_G:39357707:1,0,0,1
chr22	39357711	.	G	GGGGTGCACCCCTGTAGTTCCAGCTAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=214,127;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39357707_T_G:39357707:1,0,0,1
chr22	39357717	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=214,127;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39357707_T_G:39357707:1,0,0,1
chr22	39381756	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	39381761	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=265,173;MMQ=45,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:39381761_T_G:39381761:0,1,1,0
chr22	39381764	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=265,173;MMQ=45,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39381761_T_G:39381761:0,1,1,0
chr22	39381766	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=265,173;MMQ=45,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39381761_T_G:39381761:0,1,1,0
chr22	39381826	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,17:0,22:0,0,27,15
chr22	39381999	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=217,144;MMQ=57,30;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:0,6:1,6:1,0,7,5
chr22	39382079	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,39;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,7,12
chr22	39387262	.	T	G,C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,9,25;MFRL=108,182,1218;MMQ=27,27,27;MPOS=19,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.63,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.357,0.286:3:0,0,0:1,0,1:0,1,2,0
chr22	39387267	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=663,182;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:1,1,1,0
chr22	39387268	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,13;MFRL=145,1218;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:39387268_G_A:39387268:1,1,1,0
chr22	39387271	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=145,1218;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:39387268_G_A:39387268:1,1,1,0
chr22	39387273	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=108,700;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0,1,2,0
chr22	39388019	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,15091;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:9,0:12,6,0,2
chr22	39388207	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=127,150;MMQ=60,34;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:6,1:0|1:39388207_G_A:39388207:4,8,0,2
chr22	39388216	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=125,150;MMQ=60,34;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,1:0|1:39388207_G_A:39388207:5,8,0,2
chr22	39388593	.	A	ATTCCTCTGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=188,15135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.130:24:10,2:8,0:0|1:39388593_A_ATTCCTCTGG:39388593:0,22,0,2
chr22	39388594	.	A	AAGCTTCATCTCAGAGGG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=188,15135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.133:22:10,2:8,0:0|1:39388593_A_ATTCCTCTGG:39388593:0,20,0,2
chr22	39410500	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr22	39411803	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,173;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:2,4,0,2
chr22	39414224	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:4,0,6,1
chr22	39417391	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,1:11,1:16,0,2,0
chr22	39418736	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr22	39419112	.	CTATT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=194,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TATT;STR;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr22	39440870	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=15,10;MFRL=166,145;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:39440870_T_G:39440870:2,0,1,0
chr22	39440873	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=20,10;MFRL=166,145;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:39440870_T_G:39440870:2,0,1,0
chr22	39440876	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=14,19;MFRL=166,145;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:39440870_T_G:39440870:2,0,1,0
chr22	39440879	.	T	C,A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,13,13;MFRL=0,145,166;MMQ=60,40,40;MPOS=15,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.499:3:0,0,0:0,0,0:0,0,3,0
chr22	39440885	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr22	39440889	.	CTGCACT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=122,145;MMQ=43,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:1,0:0|1:39440870_T_G:39440870:3,0,1,0
chr22	39441622	.	A	ATGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=190,135;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.519:2:1,1:0,0:0|1:39441622_A_ATGT:39441622:0,1,0,1
chr22	39441624	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=190,135;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39441622_A_ATGT:39441622:0,1,0,1
chr22	39441625	.	C	CTGTGAGTCCATTAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=190,135;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39441622_A_ATGT:39441622:0,1,0,1
chr22	39476857	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=20,35;MFRL=89,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:39476857_G_GGC:39476857:2,1,1,0
chr22	39476859	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=20,18;MFRL=89,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:39476859_C_G:39476859:2,1,1,0
chr22	39476863	.	T	A,C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=15,14,24;MFRL=89,89,176;MMQ=60,60,60;MPOS=28,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.286,0.429:4:0,0,1:0,0,0:0,1,3,0
chr22	39476866	.	TC	GA,AC,GC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,10,14,10;MFRL=89,89,199,152;MMQ=60,60,60,60;MPOS=31,15,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.43,3.43,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,1,1,1:0.250,0.250,0.250:4:0,0,0,0:1,0,0,0:0,1,3,0
chr22	39476867	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,14;MFRL=121,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:39476859_C_G:39476859:1,1,1,0
chr22	39476871	.	CT	GG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=20,10;MFRL=89,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:39476857_G_GGC:39476857:2,1,1,0
chr22	39476872	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=22,13;MFRL=144,89;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:1,0:1,1,1,0
chr22	39476878	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=16,20;MFRL=157,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.438:5:0,0:1,1:1|0:39476859_C_G:39476859:2,1,2,0
chr22	39482241	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:7,3:10,1:18,1,4,0
chr22	39496199	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:8,0,6,0
chr22	39496322	.	TAAC	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=130,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.375:38:13,5:8,9:11,13,2,12
chr22	39496336	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:11,4:10,9:7,14,2,11
chr22	39498038	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,4:5,5:4,5,5,4
chr22	39498435	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=116,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,2:6,0:0|1:39498435_G_A:39498435:12,2,1,1
chr22	39498444	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:8,2:10,0:0|1:39498435_G_A:39498435:13,6,1,1
chr22	39498677	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=220,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr22	39499763	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:12,3:10,11:5,17,4,10
chr22	39530132	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=18,30;MFRL=237,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr22	39530831	.	TC	AT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39530831_TC_AT:39530831:0,0,0,1
chr22	39530836	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39530831_TC_AT:39530831:0,0,0,1
chr22	39530838	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39530831_TC_AT:39530831:0,0,0,1
chr22	39530841	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39530831_TC_AT:39530831:0,0,0,1
chr22	39530843	.	TG	GA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39530831_TC_AT:39530831:0,0,0,1
chr22	39530852	.	C	CTA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39530831_TC_AT:39530831:0,0,0,1
chr22	39530853	.	ATG	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39530831_TC_AT:39530831:0,0,0,1
chr22	39537529	.	AA	GG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,125;MMQ=47,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0,11,0,2
chr22	39627932	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	39709723	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=131,9400654;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,1:11,1:8,10,1,1
chr22	39709776	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=129,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,1:6,4:4,7,2,3
chr22	39710244	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:0,9,3,3
chr22	39710664	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,2:0,4:4,0,5,1
chr22	39713105	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr22	39715140	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.497:18:6,6:2,2:1,8,1,8
chr22	39746186	.	ACCGACC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=199,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCGACC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr22	39770654	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39770654_T_G:39770654:0,0,0,1
chr22	39770656	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39770654_T_G:39770654:0,0,0,1
chr22	39812986	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=101,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr22	39884993	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.532:24:2,0:4,1:4,7,0,13
chr22	39888227	.	G	GCTTTTTTGGGGAGTGGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr22	39888247	.	G	GTGTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39888247_G_GTGTC:39888247:0,0,0,1
chr22	39888252	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39888247_G_GTGTC:39888247:0,0,0,1
chr22	39967044	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39967044_G_A:39967044:0,1,0,1
chr22	39967046	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39967044_G_A:39967044:0,1,0,1
chr22	39967050	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39967044_G_A:39967044:0,1,0,1
chr22	39967054	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39967044_G_A:39967044:0,1,0,1
chr22	39967056	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39967044_G_A:39967044:0,1,0,1
chr22	39967058	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39967044_G_A:39967044:0,1,0,1
chr22	39994105	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr22	40055896	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=189,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:1,3:4,6:1,5,0,9
chr22	40058909	.	G	GGAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr22	40059712	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:2,1:1,2,4,0
chr22	40059917	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:40059917_A_C:40059917:0,1,0,1
chr22	40059919	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40059917_A_C:40059917:0,1,0,1
chr22	40074177	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=159,95;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr22	40075341	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:40075341_C_T:40075341:0,2,0,2
chr22	40075366	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,0:0|1:40075341_C_T:40075341:0,3,0,2
chr22	40075663	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:40075663_A_C:40075663:0,0,1,0
chr22	40075668	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:40075663_A_C:40075663:0,0,1,0
chr22	40075670	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=175,286;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:40075663_A_C:40075663:0,1,1,0
chr22	40075676	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=175,286;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:40075663_A_C:40075663:0,1,1,0
chr22	40075679	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,17;MFRL=175,286;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:40075663_A_C:40075663:0,1,1,0
chr22	40161166	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40161166_A_T:40161166:0,0,1,0
chr22	40161189	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,16;MFRL=123,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:40161166_A_T:40161166:1,0,1,0
chr22	40161195	.	GT	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,0:0|1:40161166_A_T:40161166:3,0,1,0
chr22	40231796	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,76;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:4,3:4,0:8,0,2,1
chr22	40415140	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,5:4,1:4,1,5,1
chr22	40417216	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	40647187	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=120,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,2:7,0:2,11,1,1
chr22	40666326	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:40666326_T_C:40666326:0,2,0,1
chr22	40666331	.	TTTTTAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:40666326_T_C:40666326:0,2,0,1
chr22	40669648	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr22	40669693	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40669693_A_G:40669693:0,0,0,1
chr22	40669695	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40669693_A_G:40669693:0,0,0,1
chr22	40681788	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:10,8:6,6:5,12,2,13
chr22	40696633	.	C	CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.295:10:3,0:4,3:0,7,1,2
chr22	40697176	.	TGCA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCA;STR;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:1,4:3,1:1,3,3,3
chr22	40697377	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,3:4,4:1,8,2,5
chr22	40697433	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr22	40708679	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=182,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,5:1,3:0,6,1,7
chr22	40711227	.	A	AT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.517:31:8,9:7,7:14,1,13,3
chr22	40712125	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,217;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:40712125_G_A:40712125:0,3,0,1
chr22	40712130	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=137,217;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:40712125_G_A:40712125:0,3,0,1
chr22	40754826	.	GTCTC	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=116,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:6,5:6,5:10,4,7,3
chr22	40798227	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.317:39:13,6:14,6:8,19,2,10
chr22	40800518	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr22	40800544	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:2,0,2,2
chr22	40800718	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr22	40800755	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40800755_G_A:40800755:0,0,0,1
chr22	40800756	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40800755_G_A:40800755:0,0,0,1
chr22	40800758	.	C	CCCA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40800755_G_A:40800755:0,0,0,1
chr22	40800759	.	T	TTAAG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40800755_G_A:40800755:0,0,0,1
chr22	40803112	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:3,4,2,0
chr22	40803186	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:5,5:3,6:5,3,7,5
chr22	40816841	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr22	40825814	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	40827319	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:2,0,7,0
chr22	41172351	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr22	41194909	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr22	41194947	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=108,161;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.279:9:3,0:2,2:5,2,2,0
chr22	41195191	.	A	AGTGGCATGGTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr22	41244398	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	41257869	.	TC	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=149,208;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.088:43:26,3:14,0:0|1:41257869_TC_T:41257869:21,19,0,3
chr22	41257874	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=144,208;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:23,3:13,0:0|1:41257869_TC_T:41257869:21,18,0,3
chr22	41489206	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=185,258;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr22	41513727	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:8,12:8,4:11,5,7,9
chr22	41513887	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr22	41525914	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=131,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:10,2:10,0:8,12,2,0
chr22	41537234	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=136.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,18:0,21:0,0,9,30
chr22	41545906	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.126:29:14,0:8,1:0|1:41545906_A_C:41545906:4,22,3,0
chr22	41545916	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=121,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.114:32:14,0:12,0:0|1:41545906_A_C:41545906:7,22,3,0
chr22	41550954	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,114;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr22	41551039	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=144,97;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:8,3:3,1:9,2,3,1
chr22	41553481	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=245,358;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:41553481_G_C:41553481:1,2,0,1
chr22	41553504	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=123,358;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:41553481_G_C:41553481:1,1,0,1
chr22	41558813	.	C	CATAAT	.	.	DP=57;ECNT=6;MBQ=28,36;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:18,0:33,2:0|1:41558813_C_CATAAT:41558813:19,35,0,2
chr22	41558814	.	G	GT	.	.	DP=58;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.051:57:18,0:35,2:0|1:41558813_C_CATAAT:41558813:19,36,0,2
chr22	41558818	.	TGGC	T	.	.	DP=55;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:17,0:33,2:0|1:41558813_C_CATAAT:41558813:18,35,0,2
chr22	41558833	.	CC	TT	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.104:36:11,1:21,2:0|1:41558833_CC_TT:41558833:11,22,0,3
chr22	41558836	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:11,1:17,2:7,22,1,2
chr22	41558838	.	CA	TT	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:11,1:15,2:0|1:41558833_CC_TT:41558833:8,21,0,3
chr22	41566595	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:2,7,4,3
chr22	41568480	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,4:6,5:7,3,7,2
chr22	41572164	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=218,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr22	41574969	.	TGTA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTA;STR;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr22	41605635	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,0:0,3:0|1:41605635_T_C:41605635:2,0,4,0
chr22	41605639	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:0|1:41605635_T_C:41605635:2,0,4,0
chr22	41609859	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=127,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:4,1,5,1
chr22	41613303	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=198,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr22	41617160	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr22	41621714	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=231,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr22	41635425	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.252:26:12,3:6,3:13,7,4,2
chr22	41645500	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr22	41647155	.	GGAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=163,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0|1:41647155_GGAGA_G:41647155:0,3,1,1
chr22	41647160	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=163,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,2:0,0:0|1:41647155_GGAGA_G:41647155:0,3,1,1
chr22	41650368	.	CT	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:20,0:13,3:18,18,0,3
chr22	41650495	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=178,288;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:41650495_A_T:41650495:0,3,0,1
chr22	41650497	.	C	CCCG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=178,288;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:41650495_A_T:41650495:0,3,0,1
chr22	41650498	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=178,288;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:41650495_A_T:41650495:0,3,0,1
chr22	41652345	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=124,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:2,2,1,4
chr22	41652846	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=82,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,3:1,3:0,2,2,4
chr22	41657626	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,1,6
chr22	41664071	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:6,2,3,0
chr22	41739370	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=225,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr22	41742288	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,18;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:41742288_A_C:41742288:0,1,0,1
chr22	41742291	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41742288_A_C:41742288:0,0,0,1
chr22	41742293	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41742288_A_C:41742288:0,0,0,1
chr22	41742297	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,11;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:41742288_A_C:41742288:0,0,0,1
chr22	41742299	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41742288_A_C:41742288:0,0,0,1
chr22	41742306	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41742288_A_C:41742288:0,0,0,1
chr22	41744022	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr22	41745355	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr22	41747717	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr22	41752447	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:5,2:6,3:6,6,2,3
chr22	41779073	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:6,5:5,8:0,11,1,12
chr22	41863423	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.328:34:13,6:10,4:14,9,10,1
chr22	41864190	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.344:21:5,2:7,4:7,7,2,5
chr22	41864216	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:3,2:3,4:2,5,1,5
chr22	41865226	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=15,20;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.225:35:7,2:3,2:5,23,0,7
chr22	41903743	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,2,1
chr22	41912069	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=217,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41912069_T_G:41912069:0,1,0,1
chr22	41912071	.	GAGACA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=217,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41912069_T_G:41912069:0,1,0,1
chr22	41912079	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=217,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41912069_T_G:41912069:0,1,0,1
chr22	41913477	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:2,0,2,1
chr22	41914593	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:5,2:5,3,0,4
chr22	41919177	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=124,371;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:13,6,0,2
chr22	41920937	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,106;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,0:13,3:15,16,0,3
chr22	41928798	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=162,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.652:9:1,4:1,2:1,2,2,4
chr22	41939739	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,4:7,2:8,1,6,0
chr22	41969572	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	42016699	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,4:2,4:7,0,8,1
chr22	42076381	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr22	42089989	.	C	CCTTGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:42089989_C_CCTTGG:42089989:0,1,0,1
chr22	42089991	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:42089989_C_CCTTGG:42089989:0,1,0,1
chr22	42090069	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr22	42091027	.	A	AAG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=117.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,14:0,0,9,21
chr22	42109917	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr22	42139054	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr22	42139078	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,11,7
chr22	42190309	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr22	42300948	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr22	42301014	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=220,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr22	42301415	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	42301748	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,2:1,1:0,9,0,3
chr22	42321591	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=174,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,2:3,0:1,3,1,2
chr22	42341308	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:5,7:8,4:6,8,4,7
chr22	42341363	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,5:9,1:4,8,2,4
chr22	42341451	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=22,23;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr22	42373113	.	G	GAAAACATGATTTGCAAAAGACAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:1,2,1,1
chr22	42388826	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=238,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,0:0,5:0,3,0,5
chr22	42388841	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=225,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,0:0,4:0,4,0,4
chr22	42392811	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,7:1,2:2,0,9,0
chr22	42418185	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:8,0,5,0
chr22	42458827	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:5,4,1,1
chr22	42461918	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=102,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.554:16:4,5:3,4:3,4,2,7
chr22	42463689	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr22	42474138	.	C	G	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,33:0.430:77:23,13:19,19:15,29,14,19
chr22	42474676	.	A	ATTCTGC	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCTGC;STR;TLOD=58.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,16:0.360:45:13,12:15,4:18,11,10,6
chr22	42475145	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,0:11,2:9,12,0,2
chr22	42522550	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,212;MMQ=40,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,0:5,3:9,4,2,1
chr22	42524696	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=238,185;MMQ=60,22;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr22	42524781	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,3:8,0:20,0,3,0
chr22	42525798	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=156,143;MMQ=60,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:5,6,0,2
chr22	42525811	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=156,166;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.249:13:8,2:2,0:0|1:42525811_T_C:42525811:4,6,0,3
chr22	42525821	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,166;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.249:13:6,2:3,0:0|1:42525811_T_C:42525811:4,6,0,3
chr22	42526549	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=185,145;MMQ=52,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:6,3:7,0,6,1
chr22	42526561	.	GG	TC	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=185,145;MMQ=46,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:2,6:6,3:0|1:42526561_GG_TC:42526561:9,1,7,2
chr22	42526567	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=185,145;MMQ=46,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:3,5:7,3:0|1:42526561_GG_TC:42526561:9,1,7,2
chr22	42526571	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=185,145;MMQ=46,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:2,7:6,4:0|1:42526561_GG_TC:42526561:9,1,9,2
chr22	42526573	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=185,145;MMQ=46,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.542:22:3,7:7,4:0|1:42526561_GG_TC:42526561:9,1,10,2
chr22	42526580	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=182,145;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,13:0.560:23:3,9:7,4:0|1:42526561_GG_TC:42526561:9,1,11,2
chr22	42575518	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=22,32;MFRL=203,165;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,1:2,1:0|1:42575518_G_A:42575518:5,1,3,0
chr22	42575523	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=203,165;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,1:4,1:0|1:42575518_G_A:42575518:5,1,3,0
chr22	42575528	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=201,165;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,1:4,2:0|1:42575518_G_A:42575518:8,1,3,0
chr22	42575537	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=32,14;MFRL=151,165;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:7,1:5,0:0|1:42575518_G_A:42575518:11,3,3,0
chr22	42575541	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,13;MFRL=151,165;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:7,0:5,0:0|1:42575518_G_A:42575518:11,3,3,0
chr22	42575543	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=151,150;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,1:5,0:0|1:42575518_G_A:42575518:11,3,2,0
chr22	42807351	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr22	42898835	.	AC	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=125,150;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.515:35:9,8:8,10:9,8,11,7
chr22	42899151	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,19:0,24:0,0,35,8
chr22	42899223	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=131,140;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:13,0:22,2:8,27,0,2
chr22	42905165	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr22	42908870	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,6:0,8:1,0,11,3
chr22	42908897	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=147,145;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=85.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:1,11:0,14:1,0,16,10
chr22	42910611	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr22	42910676	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=135,145;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.799:23:2,14:2,3:4,0,14,5
chr22	42967235	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.927:12:0,6:0,3:0,0,2,10
chr22	42969854	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=163,152;MMQ=27,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,14:0.682:20:2,6:4,6:0|1:42969854_T_G:42969854:6,0,13,1
chr22	42969877	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=141,138;MMQ=27,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=72.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,21:0.718:29:0,10:5,5:0|1:42969854_T_G:42969854:8,0,19,2
chr22	42969917	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=28,13;MFRL=141,128;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,12:0.285:39:12,0:10,0:0|1:42969917_A_C:42969917:5,22,12,0
chr22	42969919	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=134,130;MMQ=59,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.222:38:16,4:11,4:13,17,3,5
chr22	42969920	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=28,12;MFRL=140,128;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,12:0.277:40:14,0:9,0:0|1:42969917_A_C:42969917:5,23,12,0
chr22	42969924	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=7;MBQ=28,12;MFRL=133,123;MMQ=54,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,7:0.186:39:14,2:11,0:0|1:42969917_A_C:42969917:8,24,7,0
chr22	42969930	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=31,12;MFRL=131,123;MMQ=51,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,7:0.164:44:16,0:17,0:0|1:42969917_A_C:42969917:13,24,7,0
chr22	42970115	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=182,210;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr22	42988150	.	C	CTCATCTCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,2:8,0:1,9,0,2
chr22	42993781	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,13:0,0,14,16
chr22	42993786	.	CTT	C,CT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,22,20;MFRL=158,138,141;MMQ=60,40,40;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=12.31,3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,4:0.483,0.311:14:2,2,2:1,4,0:2,1,0,11
chr22	43016034	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=214,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	43026951	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=139,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,1:14,1:12,11,0,2
chr22	43089044	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:5,2,0,3
chr22	43089055	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,4,6
chr22	43195147	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,4:2,2:3,5,2,4
chr22	43206950	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=17,35;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.870:9:0,1:0,7:0,1,1,7
chr22	43218463	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:0,4,1,6
chr22	43223095	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr22	43230140	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=185,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:4,0,5,1
chr22	43267336	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.495:12:2,1:4,2:6,0,5,1
chr22	43272085	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr22	43272830	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=228,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AG;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr22	43278162	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=110,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:4,1,4,0
chr22	43520258	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:43520258_A_C:43520258:0,0,0,4
chr22	43520263	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:43520258_A_C:43520258:0,0,0,2
chr22	43524487	.	CCT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=48.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr22	43525244	.	CGCT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=85,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCT;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:1,1,1,0
chr22	43529029	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr22	43529517	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,0:0,8:0,0,0,8
chr22	43529572	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	43533360	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,6:0,0,2,6
chr22	43555194	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr22	43564963	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=115,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr22	43568380	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.260:18:2,1:5,0:13,0,5,0
chr22	43572308	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.824:9:0,3:1,3:1,0,8,0
chr22	43576064	.	T	TCTTCTCCCAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	43625248	.	T	TCTGTTCTCTGACAGGGGAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr22	43986134	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:2,4:3,2:0,6,0,6
chr22	44011617	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	44022578	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr22	44022628	.	A	AAAGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr22	44028202	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	44062938	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,9:4,4:8,0,11,2
chr22	44079611	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:1,4:11,5:7,5,6,3
chr22	44083327	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.493:24:6,6:6,4:12,0,10,2
chr22	44151616	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,12;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.126:36:11,1:12,1:22,9,0,5
chr22	44177972	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr22	44223467	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=151,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:44223467_C_T:44223467:17,3,1,1
chr22	44223473	.	TGC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:8,0:0|1:44223467_C_T:44223467:17,3,1,1
chr22	44223476	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=151,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:44223467_C_T:44223467:15,3,1,1
chr22	44229492	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:44229492_G_C:44229492:0,0,7,0
chr22	44229508	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.884:6:0,3:0,1:0|1:44229492_G_C:44229492:0,0,6,0
chr22	44234933	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr22	44285448	.	G	GAACA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0|1:44285448_G_GAACA:44285448:1,4,1,1
chr22	44285450	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=133,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,1:1,0:0|1:44285448_G_GAACA:44285448:1,4,1,1
chr22	44324676	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr22	44324855	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,0,3
chr22	44328871	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=138,84;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:15,0:14,2:11,20,0,2
chr22	44332992	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:5,3,1,1
chr22	44333000	.	C	CCAGCTACCAAACTGCAGGGAGGCAGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:7,3,1,1
chr22	44335934	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=120,29;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,2:4,0:7,6,1,1
chr22	44341986	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=198,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.426:7:3,1:1,1:3,1,2,1
chr22	44351351	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	44364594	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,33;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr22	44368039	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr22	44368728	.	A	ATT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=153,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:6,2:3,0:9,1,2,1
chr22	44368741	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.681:17:2,6:1,5:4,1,9,3
chr22	44372069	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:7,4:10,3:2,15,2,5
chr22	44372785	.	GC	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:44372785_GC_AG:44372785:0,4,0,1
chr22	44372791	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=199,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44372785_GC_AG:44372785:0,1,0,1
chr22	44377221	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,4:4,6:10,1,9,1
chr22	44377442	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr22	44395389	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr22	44395599	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=24,16;MFRL=120,96;MMQ=50,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:44395599_T_C:44395599:0,2,1,1
chr22	44395602	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,20;MFRL=120,96;MMQ=50,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:44395599_T_C:44395599:0,2,1,1
chr22	44395611	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=120,96;MMQ=50,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:44395599_T_C:44395599:0,2,1,1
chr22	44395614	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=96,117;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:2,1:1|0:44395599_T_C:44395599:1,2,0,1
chr22	44395615	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,21;MFRL=120,96;MMQ=50,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,1:0|1:44395599_T_C:44395599:0,2,1,1
chr22	44395620	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,25;MFRL=123,107;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:44395599_T_C:44395599:0,1,0,2
chr22	44395623	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=110,117;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:44395599_T_C:44395599:0,2,0,1
chr22	44395643	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,0:0,1:1|0:44395599_T_C:44395599:0,0,0,1
chr22	44420156	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr22	44495865	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,18;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:3,1,1,0
chr22	44515806	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=186,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr22	44535904	.	G	GCTTTCTGGCTGGCTCTGTCCCTCATCCTCCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=132,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTTCTGGCTGGCTCTGTCCCTCATCCTCCA;STR;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.760:7:0,0:1,2:1,0,6,0
chr22	44559645	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	44564407	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:5,1,3,0
chr22	44594476	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,7:0,0,16,5
chr22	44645575	.	A	ATACAAGG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TACAAGG;STR;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.302:31:12,2:10,6:8,14,5,4
chr22	44645693	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr22	44681433	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,1:11,1:9,21,2,0
chr22	44761631	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr22	44892616	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	45128288	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr22	45182321	.	ATCT	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=81.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.523:42:6,9:12,13:13,7,12,10
chr22	45182565	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=18,29;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,1:1,1:0,2,1,1
chr22	45204377	.	A	ACCTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr22	45218223	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,6,5
chr22	45241303	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:2,0:0,6,0,2
chr22	45255771	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=129,162;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr22	45258324	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,2:7,4:5,5,1,5
chr22	45287188	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=127,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,1:4,1:5,5,2,0
chr22	45289504	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45289504_C_CTG:45289504:0,0,0,1
chr22	45289506	.	C	CCAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45289504_C_CTG:45289504:0,0,0,1
chr22	45289511	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45289504_C_CTG:45289504:0,0,0,1
chr22	45309653	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr22	45404497	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=197,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,5:1,0:2,2,1,4
chr22	45574493	.	C	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,137;MMQ=40,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,33:0.610:54:6,12:14,21:12,9,15,18
chr22	45579422	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=58.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr22	45580571	.	TGC	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=108.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,29:0.500:58:15,10:13,18:5,24,3,26
chr22	45593661	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,4:2,0:5,1,3,1
chr22	45595721	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,8:0,13:0,0,16,5
chr22	45598833	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr22	45599061	.	C	CCGAGATGGCGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=190,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:2,6,1,1
chr22	45603485	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.400:28:9,2:8,9:0|1:45603485_G_A:45603485:15,2,11,0
chr22	45603501	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,16:0.388:42:10,2:11,13:0|1:45603485_G_A:45603485:18,8,14,2
chr22	45603545	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=141,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,27:0.466:58:18,8:13,19:14,17,11,16
chr22	45609151	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	45622014	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr22	45622351	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr22	45723696	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=51.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,14,1
chr22	45724430	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=180,115;MMQ=60,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:45724430_T_G:45724430:0,4,0,1
chr22	45724434	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=180,115;MMQ=60,30;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:45724430_T_G:45724430:0,4,0,1
chr22	45724459	.	GCT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=214,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr22	45728632	.	C	CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=109,150;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.881:14:0,3:1,4:0,1,1,12
chr22	45736153	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr22	45741320	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,4:6,2:7,0,6,0
chr22	45748236	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=214,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr22	45748284	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr22	45749782	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=156,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.344:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr22	45755644	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr22	45779335	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=121.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,18:0,15:0,0,22,11
chr22	45779553	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr22	45779572	.	G	GCATTTCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:45779572_G_GCATTTCC:45779572:0,0,0,1
chr22	45779575	.	A	AGTGATG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45779572_G_GCATTTCC:45779572:0,0,0,1
chr22	45779577	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45779572_G_GCATTTCC:45779572:0,0,0,1
chr22	45782646	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr22	45785819	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45785819_G_T:45785819:0,1,0,1
chr22	45785823	.	GAAAT	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45785819_G_T:45785819:0,1,0,1
chr22	45785831	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:45785819_G_T:45785819:0,1,0,1
chr22	45785834	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45785819_G_T:45785819:0,0,0,1
chr22	45785837	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45785819_G_T:45785819:0,0,0,1
chr22	45794925	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr22	45809473	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,4:5,6:2,10,0,10
chr22	45809698	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=215,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr22	45810278	.	A	AC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=89.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,12:0,11:0,0,15,11
chr22	45813433	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=57.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,19,0
chr22	45813886	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=13,33;MFRL=213,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.753:10:0,3:0,4:0|1:45813886_GT_G:45813886:0,2,0,8
chr22	45813890	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=213,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.748:10:0,3:1,5:0|1:45813886_GT_G:45813886:0,2,0,8
chr22	45813919	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=213,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:45813886_GT_G:45813886:0,2,0,1
chr22	45813923	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=213,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:45813886_GT_G:45813886:0,2,0,1
chr22	45818282	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:3,0:4,5,0,2
chr22	45827020	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	45828091	.	CAA	C,CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,234,205;MMQ=60,60,60;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.88,4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.493,0.389:6:0,2,1:0,2,1:0,0,5,1
chr22	45898074	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr22	45921631	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.442:25:6,6:7,4:0,14,1,10
chr22	45927112	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:5,2:4,4:7,2,6,0
chr22	45927220	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=221,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:0,7,3,4
chr22	45928841	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45928841_G_A:45928841:0,0,1,0
chr22	45928846	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=212,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:45928841_G_A:45928841:1,0,1,0
chr22	45929577	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr22	45929614	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=206,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr22	45931087	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=113,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:7,2:8,3:10,5,2,3
chr22	45931262	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.936:14:0,4:0,3:0,0,0,14
chr22	45937061	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:4,0,4,3
chr22	45939196	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	45943011	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,6:3,5:4,1,4,7
chr22	45943126	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=189,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:45943126_G_A:45943126:0,5,1,1
chr22	45943128	.	CT	TC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=189,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:45943126_G_A:45943126:0,5,1,1
chr22	45954029	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:7,5:4,6:1,11,2,9
chr22	45972779	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr22	46085865	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46085865_G_GCC:46085865:0,1,0,1
chr22	46085868	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46085865_G_GCC:46085865:0,1,0,1
chr22	46323342	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=140,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr22	46327153	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	46447795	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.830:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr22	46505986	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr22	46508765	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr22	46509728	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=184,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:46509728_CT_C:46509728:0,2,0,1
chr22	46509730	.	CAGTGACCT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=184,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:46509728_CT_C:46509728:0,2,0,1
chr22	46644246	.	C	CCTGCACCTAAGACCTGATTAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr22	46644274	.	C	CCTGTAGTGTCATTTCTCTCTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=201,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	46655081	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,164;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:5,8,2,0
chr22	46664985	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=C;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:2,1:5,2:7,0,2,2
chr22	46668124	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=168,167;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:0|1:46668124_A_G:46668124:6,0,2,0
chr22	46668127	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=168,167;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:2,1:0|1:46668124_A_G:46668124:6,0,2,0
chr22	46704683	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:4,14,1,1
chr22	46712128	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,12;MFRL=202,247;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr22	46724558	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr22	46760105	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=231,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr22	46760320	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,4;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	46765181	.	G	GTCAGGTCGCCGAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr22	46794399	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=140,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:1,2,1,0
chr22	46794409	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=136,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:2,2,1,0
chr22	46794520	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=122,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:22,1:14,1:15,21,0,2
chr22	46858687	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=82,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:5,0,2,0
chr22	46930583	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:4,9,1,1
chr22	46931528	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:13,2:5,0:9,10,2,0
chr22	47067159	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=199,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr22	47073199	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,1:3,2:0,7,0,3
chr22	47116829	.	GC	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=125,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.134:26:10,3:12,0:13,10,1,2
chr22	47185115	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	47185265	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,145;MMQ=57,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,0:7,8:6,2,5,3
chr22	47274638	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:5,8:9,2:5,9,3,7
chr22	47308028	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=104,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:15,0:18,2:14,19,0,2
chr22	47370343	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr22	47857656	.	TTA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	47859199	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr22	48885542	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.358:31:11,3:9,7:2,18,0,11
chr22	49089283	.	ATGGG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr22	49103660	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr22	50014055	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50014055_G_C:50014055:0,0,1,0
chr22	50014064	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50014055_G_C:50014055:0,0,1,0
chr22	50014065	.	G	GGCCCCCGCGGGGCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50014055_G_C:50014055:0,0,1,0
chr22	50014369	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr22	50277883	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr22	50283781	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,304;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	50315342	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:5,2,0,2
chr22	50356274	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr22	50356302	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr22	50356555	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr22	50356850	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr22	50439626	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,2:4,5:0,6,1,6
chr22	50471620	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:2,1:2,4:5,0,6,1
chr22	50485793	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr22	50499994	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr22	50515766	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:5,0,4,0
chr22	50515808	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,4,1
chr22	50518723	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=179,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,3,1
chr22	50528496	.	C	CGGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:50528496_C_CGGTG:50528496:2,1,1,1
chr22	50528497	.	A	ACGGCG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:50528496_C_CGGTG:50528496:2,1,1,1
chr22	50528969	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:4,0:0|1:50528969_G_T:50528969:11,3,1,1
chr22	50528985	.	C	CAG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:5,0:0|1:50528969_G_T:50528969:13,2,1,1
chr22	50528986	.	C	CTGCTCGGCGTAAACACACAAAG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:4,0:0|1:50528969_G_T:50528969:13,2,1,1
chr22	50529134	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=24,34;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:1,3:0|1:50529134_T_C:50529134:0,2,0,5
chr22	50529144	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:50529144_T_C:50529144:0,4,0,1
chr22	50529146	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,30;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:1,2:0|1:50529134_T_C:50529134:0,2,0,3
chr22	50529148	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,2:0,1,0,4
chr22	50529154	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:50529144_T_C:50529144:0,4,0,1
chr22	50529166	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,23;MFRL=184,156;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50529166_C_A:50529166:0,1,0,1
chr22	50529169	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=184,156;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50529166_C_A:50529166:0,1,0,1
chr22	50552278	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:3,3:1,3,0,4
chr22	50552736	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,7,0
chr22	50553123	.	AGAGGGCGGGC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50553123_AGAGGGCGGGC_A:50553123:0,2,0,1
chr22	50553139	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50553123_AGAGGGCGGGC_A:50553123:0,1,0,1
chr22	50553143	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50553123_AGAGGGCGGGC_A:50553123:0,1,0,1
chr22	50553514	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:4,1,5,1
chr22	50555721	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=174,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:6,0:6,2:0|1:50555721_T_A:50555721:3,9,1,1
chr22	50555727	.	T	TTTGAACTAC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=170,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:0|1:50555721_T_A:50555721:3,8,1,1
chr22	50564618	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=72,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.554:11:0,2:5,4:3,2,2,4
chr22	50566781	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,3:4,6:9,0,9,0
chr22	50566835	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.463:39:12,10:9,8:14,7,15,3
chr22	50573081	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,2,2
chr22	50580699	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=185,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr22	50580711	.	A	AGCTTGTTTTTGGAATGAAGAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=205,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:50580711_A_AGCTTGTTTTTGGAATGAAGAT:50580711:0,4,0,1
chr22	50580715	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,30;MFRL=205,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:50580711_A_AGCTTGTTTTTGGAATGAAGAT:50580711:0,4,0,1
chr22	50580717	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=205,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:50580711_A_AGCTTGTTTTTGGAATGAAGAT:50580711:0,4,0,1
chr22	50585442	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,7:4,4:7,0,11,0
chr22	50588153	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=116,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:5,2:4,3,4,2
chr22	50599466	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,5:1,3,2,4
chr22	50599568	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50599568_A_C:50599568:0,0,0,1
chr22	50599571	.	CACTTA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50599568_A_C:50599568:0,0,0,1
chr22	50599975	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=275,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:50599975_A_T:50599975:0,1,0,1
chr22	50599979	.	A	AAGCACAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=275,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50599975_A_T:50599975:0,1,0,1
chr22	50599982	.	C	CTGAGGTGCGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=275,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50599975_A_T:50599975:0,1,0,1
chr22	50658053	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.516:31:9,11:6,5:8,7,11,5
chr22	50663086	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=176,187;MMQ=53,32;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr22	50663101	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=28,16;MFRL=176,168;MMQ=43,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:50663101_C_T:50663101:0,4,0,1
chr22	50663105	.	G	GCACAAGGA	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=32,34;MFRL=171,178;MMQ=43,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50663105_G_GCACAAGGA:50663105:0,4,0,1
chr22	50663106	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,27;MFRL=176,168;MMQ=43,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:50663101_C_T:50663101:0,4,0,1
chr22	50663109	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,34;MFRL=173,178;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:50663105_G_GCACAAGGA:50663105:0,3,0,1
chr22	50663111	.	A	G,T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=0,32,32;MFRL=0,190,178;MMQ=60,35,40;MPOS=4,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.12,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.546,0.286:3:0,1,1:0,1,0:0,0,0,3
chr22	50663114	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=27,27;MFRL=190,178;MMQ=35,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:50663105_G_GCACAAGGA:50663105:0,2,0,1
chr22	50663116	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=190,178;MMQ=35,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:50663105_G_GCACAAGGA:50663105:0,2,0,1
chr22	50663119	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50663105_G_GCACAAGGA:50663105:0,0,0,1
chr22	50664871	.	A	AGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:50664871_A_AGT:50664871:0,1,0,1
chr22	50664876	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:50664871_A_AGT:50664871:0,1,0,1
chr22	50666507	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:1,3:4,3:0,5,0,7
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chr22	50682067	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,14;MFRL=50,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:50682064_G_T:50682064:2,0,1,0
chr22	50682073	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,14;MFRL=50,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:50682064_G_T:50682064:2,0,1,0
chr22	50682079	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,14;MFRL=50,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:50682064_G_T:50682064:2,0,1,0
chr22	50682087	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,16;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:50682064_G_T:50682064:3,0,1,0
chr22	50685018	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:50685018_A_C:50685018:3,0,1,0
chr22	50685022	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=177,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:50685018_A_C:50685018:3,0,1,0
chr22	50695244	.	G	GCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr22	50703487	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr22	50705059	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr22	50705752	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:50705752_C_G:50705752:0,0,3,0
chr22	50705755	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:50705752_C_G:50705752:0,0,3,0
chr22	50705759	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:50705752_C_G:50705752:0,0,3,0
chr22	50708731	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=126,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr22	50714286	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.384:16:4,0:2,0:3,7,6,0
chr22	50714289	.	TG	CG,CC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,28,29;MFRL=0,174,175;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=40.79,6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,4:0.726,0.226:18:0,7,2:0,6,1:0,0,10,8
chr22	50714296	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.249:17:6,1:6,0:0|1:50714296_G_C:50714296:5,8,4,0
chr22	50714302	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,0:0|1:50714296_G_C:50714296:5,9,2,0
chr22	50714491	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr22	50715029	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,10,5
chr22	50718567	.	C	CTCTTCTAATGGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=201,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr22	50725553	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:1,2:2,0,3,0
chr22	50726070	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,18;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50726070_A_G:50726070:0,0,1,0
chr22	50726076	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50726070_A_G:50726070:0,0,1,0
chr22	50726080	.	CAGA	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50726070_A_G:50726070:0,0,1,0
chr22	50726087	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=23,12;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:50726070_A_G:50726070:0,1,1,0
chr22	50726090	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=29,26;MFRL=144,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:50726070_A_G:50726070:1,1,1,0
chr22	50726092	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=144,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:50726070_A_G:50726070:1,1,1,0
chr22	50726094	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,32;MFRL=144,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:50726070_A_G:50726070:1,1,1,0
chr22	50726097	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=32,12;MFRL=144,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:50726070_A_G:50726070:1,1,1,0
chr22	50726098	.	C	CCCA	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=144,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:50726070_A_G:50726070:1,1,1,0
chr22	50727921	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,2:4,4:5,3,3,3
chr22	50750879	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr22	50751791	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=62.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.670:28:5,12:4,5:8,1,17,2
chr22	50754052	.	TACTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr22	50754259	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=138,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50754259_C_T:50754259:0,1,0,1
chr22	50754261	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=138,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50754259_C_T:50754259:0,1,0,1
chr22	50754286	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:50754259_C_T:50754259:0,0,0,2
chr22	50754363	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:0,3:7,2:7,0,5,0
chr22	50754445	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=121,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:2,2:3,4:4,3,2,4
chr22	50754772	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,6:4,2:6,0,7,1
chr22	50756452	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,3:3,2:2,3,2,3
chr22	50757348	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,5:4,4:4,4,3,6
chr22	50757470	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=211,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:2,2,2,1
chr22	50869692	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=77,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,7:2,3:1,3,6,4
chr22	50869851	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=172,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr22	50869876	.	A	ATTCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:50869876_A_ATTCT:50869876:0,3,0,1
chr22	50869878	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:50869876_A_ATTCT:50869876:0,3,0,1
chr22	50869880	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:50869876_A_ATTCT:50869876:0,3,0,1
chr22	50876235	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=205,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,2:4,5:3,1,3,4
chr22	50876357	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,2:1,0:0,3,1,1
chr22	50876662	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.532:36:8,9:7,10:9,8,9,10
chr22	50882752	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:2,3:2,4:0,6,0,7
chr22	50885893	.	CCA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:0,3:7,6:2,5,3,6
chr22	50894849	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	50895133	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.527:15:3,1:4,6:3,4,1,7
chr22	50898669	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr22	50899895	.	C	CTCCCTTGCAGACTGGGTGAAGAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=180,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr22	50906958	.	C	CCCGCG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=217,115;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0|1:50906958_C_CCCGCG:50906958:0,1,0,1
chr22	50906959	.	A	AGCGGTTCTCCTGTCCCTGAGCCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=217,115;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0|1:50906958_C_CCCGCG:50906958:0,1,0,1
chr22	50920255	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=92,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50920255_CT_C:50920255:0,1,1,0
chr22	50920260	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=152,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:50920255_CT_C:50920255:1,1,1,0
chr22	50920265	.	G	GCCCC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=194,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,8;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:50920255_CT_C:50920255:2,1,1,0
chr22	50920270	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=194,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:50920255_CT_C:50920255:2,1,1,0
chr22	50920274	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:50920255_CT_C:50920255:2,0,1,0
chr22	50920277	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,13;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:50920255_CT_C:50920255:2,0,1,0
chr22	50920284	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,13;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:50920255_CT_C:50920255:2,0,1,0
chr22	50920292	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,35;MFRL=194,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr22	50927796	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	50928340	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr22	50944381	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=223,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,3:4,3:7,4,2,4
chr22	50946965	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr22	50954114	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=157,185;MMQ=50,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:50954114_C_T:50954114:1,1,2,0
chr22	50954117	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=15,30;MFRL=157,185;MMQ=50,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:0,1:0|1:50954114_C_T:50954114:1,1,2,0
chr22	50954124	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=139,149;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.701:4:1,0:0,1:0,1,2,1
chr22	50955829	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=117,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:6,0:13,4:9,11,4,0
chr22	50957520	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	50959538	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr22	50960101	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr22	50961169	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,3:0,0,3,5
chr22	50961854	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr22	50964153	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=119.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,20:0,15:0,0,28,8
chr22	50966197	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=161,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=23,16;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.518:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr22	50966914	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr22	50970256	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=173,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0,2,2,0
chr22	51010052	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr22	51010788	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,3:2,3:0,5,1,5
chr22	51011936	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr22	51015210	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr22	51015481	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,5:8,2:1,9,0,7
chr22	51018135	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.395:12:2,1:5,1:1,6,5,0
chr22	51020668	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.590:13:3,3:2,3:4,1,5,3
chr22	51041510	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=106,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr22	51045433	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=114,144;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:6,4:3,1:2,7,2,3
chr22	51045480	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,2:0,1:0,3,0,4
chr22	51048781	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=123,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr22	51063987	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:6,4:1,7:7,0,11,0
chr22	51064141	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.538:17:5,3:1,6:0,8,0,9
chr22	51117137	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:1,1,3,2
chr22	51117766	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,0;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:2,0:7,4,0,2
chr22	51133518	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr22	51135545	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr22	51135697	.	T	TGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=8,13;RU=G;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr22	51137094	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:3,4:8,5:8,3,7,2
chr22	51137249	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr22	51160421	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:4,3,1,1
chr22	51178062	.	G	GCTGAGTGTGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=277,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr22	51182485	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr22	51183255	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,154;MMQ=27,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:4,9:7,7:5,6,8,9
chrX	2700202	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.637:25:6,8:2,7:1,8,6,10
chrX	2715425	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chrX	2724760	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=183.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,27:0,25:0,0,26,27
chrX	2729281	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chrX	2729540	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chrX	2732356	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:0,4:1,0:1,0,5,0
chrX	2748292	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,2,22
chrX	2774478	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	2793984	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=68,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,4:1,5:2,0,1,8
chrX	2827794	.	T	TA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.516:37:13,8:4,7:16,2,13,6
chrX	2832742	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,4:8,6:11,4,7,3
chrX	2871375	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2871375_A_T:2871375:0,1,0,1
chrX	2871377	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:2871375_A_T:2871375:0,1,0,1
chrX	2928125	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.431:40:10,10:12,7:9,14,7,10
chrX	2947214	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,163;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chrX	2950998	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	2951434	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:1,3,2,1
chrX	2986061	.	CTT	C,CT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32,32;MFRL=156,140,132;MMQ=60,60,60;MPOS=10,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.86,3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,3:0.211,0.219:16:8,1,1:2,1,2:10,0,6,0
chrX	2986082	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=19,19;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.350:22:2,0:2,0:10,4,8,0
chrX	2994578	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=91,81;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,1:3,1:4,4,1,1
chrX	3002219	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:2,1:2,2:5,0,4,0
chrX	3240725	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:12,0:0|1:3240725_G_A:3240725:7,12,0,2
chrX	3240735	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,2:11,0:0|1:3240725_G_A:3240725:5,13,0,2
chrX	3241791	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=139,150;MMQ=52,52;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.431:26:7,4:6,7:8,7,3,8
chrX	3241799	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=148,155;MMQ=52,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:11,2:15,0:13,13,0,2
chrX	3241880	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=151,135;MMQ=40,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,6:4,4:6,5,7,3
chrX	3533962	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=130,145;MMQ=52,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,25:0.510:49:8,14:15,11:10,14,9,16
chrX	3539376	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.384:6:1,1:2,1:1,3,0,2
chrX	3592847	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0,0,2,16
chrX	5811406	.	TTG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=170,110;MMQ=40,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:4,2:13,0:13,9,0,2
chrX	5811807	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	6968338	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.126:49:19,2:23,2:29,14,4,2
chrX	6995463	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:5,1:16,1:5,17,2,0
chrX	7066051	.	A	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,35:0.458:77:18,15:21,19:28,14,23,12
chrX	7175199	.	TG	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,175;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:15,0,2,0
chrX	7193970	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.797:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chrX	7251998	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,0:6,2:10,2,2,0
chrX	7811179	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,176;MMQ=25,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chrX	7812155	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,191;MMQ=26,26;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:9,1:11,3:0,20,0,4
chrX	7890215	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=208,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
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chrX	8138160	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=156,164;MMQ=55,48;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,25:0.931:26:0,19:1,5:0|1:8138160_T_C:8138160:1,0,11,14
chrX	8138165	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=156,164;MMQ=55,44;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,23:0.923:24:0,15:1,4:0|1:8138160_T_C:8138160:1,0,10,13
chrX	8138170	.	CT	GC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=156,162;MMQ=55,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=60.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:0,10:1,2:0|1:8138160_T_C:8138160:1,0,3,11
chrX	8138284	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,228;MMQ=22,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,8:1,1:1,0,0,9
chrX	8501120	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0,7,1,3
chrX	8504773	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chrX	8699939	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.135:24:8,2:13,0:2,19,0,3
chrX	8700168	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,308;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	8761625	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:3,5:0,2:3,0,8,0
chrX	8763231	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=19,32;MFRL=113,172;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:0,0:0|1:8763231_C_T:8763231:1,1,0,1
chrX	8763242	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=113,172;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:8763231_C_T:8763231:1,1,0,1
chrX	8763245	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=113,172;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:8763231_C_T:8763231:1,1,0,1
chrX	8766291	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:7,7:2,8:2,7,5,10
chrX	9622450	.	T	TAGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AGA;STR;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.917:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chrX	9659766	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=98.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.966:26:0,11:0,10:0|1:9659766_G_A:9659766:0,0,5,21
chrX	9659767	.	T	TG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=98.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.966:26:0,9:0,7:0|1:9659766_G_A:9659766:0,0,5,21
chrX	9661075	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=205,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,4:2,1:7,0,5,0
chrX	9661110	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chrX	9661165	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=78.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,17:0,6:0,0,17,7
chrX	9661546	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chrX	9665368	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=193.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,36:0,21:0,0,47,11
chrX	9665481	.	G	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,28:0.372:76:31,17:16,11:18,30,12,16
chrX	9677599	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=237,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,3:1,0,6,0
chrX	9733749	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chrX	9859197	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chrX	9864595	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,2:16,0:18,12,1,1
chrX	9864642	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.089:31:14,0:15,2:13,16,2,0
chrX	9866420	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chrX	10062163	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:8,8:10,1:11,7,6,3
chrX	10095935	.	C	CG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=200,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,2:6,0:0|1:10095935_C_CG:10095935:11,0,2,0
chrX	10095936	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=200,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:0|1:10095935_C_CG:10095935:11,0,2,0
chrX	10102704	.	T	TGATTTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	10155643	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=120,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:20,2:17,0:14,23,2,0
chrX	10166198	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=271,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chrX	10417412	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:8,0:10,2:15,3,1,1
chrX	10442566	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=192,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,0,1
chrX	10491233	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=19,21;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:0,1:3,1:0,7,0,4
chrX	10535249	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:10,10,1,1
chrX	11200070	.	TAAA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:4,0:1,1:5,0,1,0
chrX	11313027	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,6:0,0,1,14
chrX	11776395	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:25,1:16,2:35,6,2,1
chrX	11778471	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=96.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,31:0.596:52:9,16:11,15:21,0,31,0
chrX	11779538	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:4,5:5,4:8,1,9,1
chrX	11786839	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=83.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,8:0,0,1,22
chrX	12157244	.	A	ATGATCAGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=213,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.483:2:0,1:1,0:0|1:12157244_A_ATGATCAGTG:12157244:0,1,0,1
chrX	12157247	.	A	AGCCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=213,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12157244_A_ATGATCAGTG:12157244:0,1,0,1
chrX	12628036	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chrX	12628049	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chrX	12633034	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chrX	12722616	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,11:0,0,2,18
chrX	12724843	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=195,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chrX	12725042	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=13,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.765:13:0,5:0,3:1,2,5,5
chrX	12828089	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.632:12:2,3:2,4:4,0,8,0
chrX	12837558	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chrX	12838934	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=55,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chrX	12939229	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,1:6,1:7,11,2,0
chrX	12994867	.	CTT	C	.	.	DP=86;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.094:62:11,5:15,1:28,28,6,0
chrX	12994874	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,4:0.051:83:37,4:42,0:49,30,4,0
chrX	12994886	.	C	G	.	.	DP=104;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,23:0.250:89:22,6:37,3:14,52,23,0
chrX	13056654	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=229,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,8:1,7:0,1,0,15
chrX	13613061	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,1:10,3:8,12,1,3
chrX	13645484	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chrX	13682314	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:8,0:17,2:10,15,2,0
chrX	13683571	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=246,204;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:13683571_G_A:13683571:0,3,0,1
chrX	13683574	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=246,204;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:13683571_G_A:13683571:0,3,0,1
chrX	13683577	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=246,204;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:13683571_G_A:13683571:0,3,0,1
chrX	13683589	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,34;MFRL=246,204;MMQ=60,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:13683589_T_C:13683589:0,3,0,1
chrX	13683591	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,34;MFRL=246,204;MMQ=60,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:13683589_T_C:13683589:0,3,0,1
chrX	13683603	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=246,204;MMQ=60,30;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:13683603_T_C:13683603:0,3,0,1
chrX	13683606	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,27;MFRL=249,204;MMQ=60,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:13683603_T_C:13683603:0,2,0,1
chrX	13683609	.	GAGGCC	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=249,204;MMQ=60,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:13683603_T_C:13683603:0,2,0,1
chrX	13732633	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,137;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.069:70:30,0:35,4:19,47,0,4
chrX	13734539	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:10,5:11,10:20,1,13,2
chrX	13737928	.	TC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:9,9:11,2:17,4,9,2
chrX	13767718	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,25:0.426:59:18,12:16,12:0,34,1,24
chrX	13771576	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,28:0.394:71:20,12:23,15:14,29,8,20
chrX	13779124	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:6,0,5,0
chrX	13787207	.	G	C	.	.	DP=99;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,11:0.115:99:37,1:28,0:64,24,0,11
chrX	13787212	.	AG	CC	.	.	DP=107;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,12:0.121:100:49,1:33,0:59,29,0,12
chrX	13787215	.	C	T	.	.	DP=109;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=136,158;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,4:0.048:102:54,2:44,2:53,45,4,0
chrX	13803960	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.323:26:7,5:10,3:6,12,1,7
chrX	14038613	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,152;MMQ=59,56;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:10,2:2,20,0,2
chrX	14549214	.	AATC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=ATC;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,3:3,0:11,1,3,0
chrX	14599539	.	A	ACAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:14599539_A_ACAC:14599539:2,1,1,1
chrX	14599540	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:14599539_A_ACAC:14599539:2,1,1,1
chrX	14708799	.	CTG	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=114,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.235:21:11,4:4,1:16,0,5,0
chrX	14863457	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,113;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:0|1:14863457_A_C:14863457:0,20,0,2
chrX	14863461	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=171,113;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:13,2:0|1:14863457_A_C:14863457:0,21,0,2
chrX	14868806	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.251:17:6,0:7,3:2,11,1,3
chrX	14930353	.	C	CT,CTT	.	.	DP=125;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=138,129,139;MMQ=60,60,60;MPOS=14,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=T;STR;TLOD=63.45,4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:66,39,4:0.358,0.045:109:34,23,1:29,15,3:44,22,24,19
chrX	15262813	.	T	TGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=188,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:0|1:15262813_T_TGG:15262813:0,2,0,2
chrX	15262814	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=188,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:15262813_T_TGG:15262813:0,2,0,2
chrX	15267107	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chrX	15301533	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chrX	15307563	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,6:3,5:10,0,11,1
chrX	15315895	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=171,171;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:11,1:1,1:0|1:15315895_T_C:15315895:0,12,0,2
chrX	15315900	.	TT	CC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=175,171;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:9,0:0,1:0|1:15315895_T_C:15315895:0,9,0,2
chrX	15332558	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,7:4,1:2,4,2,6
chrX	15333647	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:22,1:20,2:15,27,0,3
chrX	15371313	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:6,6:5,8:1,10,2,13
chrX	15408419	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=192.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,28:0,33:0,0,5,56
chrX	15498034	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chrX	15554602	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.460:20:3,3:4,4:0,11,0,9
chrX	15554625	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.560:7:0,0:3,3:0,3,0,4
chrX	15582209	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:4,5:5,8:6,5,5,8
chrX	15596143	.	C	CATAAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chrX	15607650	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chrX	15706830	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,154;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.350:38:12,7:13,6:0,25,0,13
chrX	15709201	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=215,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,3:1,5:4,0,8,0
chrX	15709241	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=173,149;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:15,0:16,2:32,0,2,0
chrX	15709454	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.451:42:13,11:10,6:0,23,0,19
chrX	15711209	.	C	T	.	.	DP=162;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=132,145;MMQ=52,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=99.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,43:0.301:144:51,24:49,19:21,80,13,30
chrX	15768381	.	A	AAGCCTCCTTTAAAAAATGCAGTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.386:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chrX	15780818	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,3:9,0:14,1,3,0
chrX	15792527	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=135.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,17:0,20:0,0,36,1
chrX	15794764	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=140,155;MMQ=59,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chrX	15794815	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,18,4
chrX	15800600	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.502:18:6,6:3,3:7,2,8,1
chrX	15817963	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=167.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,53:0.965:54:1,27:0,26:0,1,40,13
chrX	15818114	.	AT	A	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=74.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,32:0.437:73:16,17:25,14:3,38,5,27
chrX	15822013	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:14,7:7,1:0,21,0,9
chrX	15822390	.	G	GT	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.104:54:17,2:30,3:0,49,0,5
chrX	15827524	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chrX	15836648	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=124,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,4:4,2:6,4,6,0
chrX	15863648	.	G	GA	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.093:56:25,1:18,1:7,44,1,4
chrX	15863953	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=89.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,15:0,0,27,0
chrX	16189670	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=241,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,2:1,1:0,1,0,4
chrX	16657182	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:14,3:6,0:17,3,3,0
chrX	16669322	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=12,31;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:0,0:1,1:0,4,0,1
chrX	16709626	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.457:44:15,9:9,11:18,6,17,3
chrX	16711196	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=155,226;MMQ=57,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,2:3,0:10,0,2,0
chrX	16711197	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,132;MMQ=57,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:4,0:9,1,3,0
chrX	16761985	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,1:9,1:1,15,0,2
chrX	16762002	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chrX	16762053	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:16762053_T_TG:16762053:0,0,0,1
chrX	16762054	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:16762053_T_TG:16762053:0,0,0,1
chrX	16852327	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,19,0
chrX	16876980	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=142.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,20:0,22:0,0,12,32
chrX	17073092	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,6:4,5:1,8,3,8
chrX	17080492	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:6,0,4,0
chrX	17086436	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,162;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:6,0:9,2:14,1,2,0
chrX	17092152	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chrX	17157148	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chrX	17705850	.	C	CT	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=188.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,33:0,25:0,0,51,8
chrX	17710353	.	CT	C,CTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=175,148,178;MMQ=60,60,60;MPOS=11,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=10.60,10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,6:0.313,0.318:19:1,4,5:6,2,0:7,0,12,0
chrX	17744645	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:3,0:14,2:11,6,1,1
chrX	17819377	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,20:0,22:0,0,25,18
chrX	18265832	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:10,2,7,1
chrX	18275211	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.308:14:4,2:5,2:0,10,0,4
chrX	18276463	.	A	ACCCTAGACCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18276463_A_ACCCTAGACCCT:18276463:0,1,0,1
chrX	18276466	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:18276463_A_ACCCTAGACCCT:18276463:0,1,0,1
chrX	18278199	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.541:35:6,8:10,11:15,1,18,1
chrX	18284005	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	18323348	.	TA	T,TAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,21,33;MFRL=149,135,141;MMQ=60,60,60;MPOS=13,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=5.79,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,4,3:0.164,0.134:26:6,0,1:13,2,2:2,17,1,6
chrX	18343188	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:4,0:11,0:0|1:18343188_G_T:18343188:0,17,0,2
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chrX	18613588	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=173,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,0:8,2:0|1:18613582_C_T:18613582:2,13,1,1
chrX	18631213	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,133;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=A;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.862:9:0,1:2,5:2,0,5,2
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chrX	18665550	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:18665547_C_CACAGCAGTGTAAAA:18665547:0,1,0,1
chrX	18800531	.	CTT	C,CT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,20,22;MFRL=149,134,131;MMQ=60,60,60;MPOS=15,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=9.97,22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,13:0.268,0.576:23:0,1,2:3,3,8:0,3,3,17
chrX	18844012	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=170.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,23:0,25:0,0,4,44
chrX	18913252	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:10,1:8,1:6,13,1,1
chrX	18924057	.	G	GGACTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=234,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chrX	18929128	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.892:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chrX	18949741	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:12,3,0,2
chrX	18958016	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:9,3:3,4:11,1,5,2
chrX	18969308	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:10,2:14,9,1,1
chrX	19024060	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=115,40;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:6,2,0,2
chrX	19037666	.	ATT	A,AT,ATTTTTT	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=32,32,32,14;MFRL=103,191,119,125;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,13,1;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=19,17,18,23;RU=T;STR;TLOD=9.23,3.09,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,6,4,4:0.191,0.148,0.190:25:5,2,1,0:5,4,2,0:10,1,9,5
chrX	19037698	.	C	A	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,7:0.095:64:16,0:31,0:25,32,7,0
chrX	19037704	.	G	T	.	.	DP=78;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,5:0.067:74:19,1:40,0:31,38,5,0
chrX	19086800	.	GA	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.193:33:9,3:9,1:18,9,4,2
chrX	19378962	.	AAC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=56.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chrX	19380975	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.452:13:3,3:3,3:1,6,0,6
chrX	19389124	.	T	A	.	.	DP=108;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,48:0.449:107:19,21:38,26:31,28,25,23
chrX	19389184	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=15,32,21;MFRL=150,251,120;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=4.86,10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,3,6:0.092,0.188:32:7,1,1:3,2,2:2,21,3,6
chrX	19389199	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.098:37:9,2:18,1:0|1:19389199_T_A:19389199:3,31,2,1
chrX	19389202	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.099:37:12,0:18,1:0|1:19389199_T_A:19389199:3,31,2,1
chrX	19416547	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19416547_G_C:19416547:0,2,0,1
chrX	19416548	.	A	ACTCTGCAAGCCCAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19416547_G_C:19416547:0,2,0,1
chrX	19416550	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19416547_G_C:19416547:0,2,0,1
chrX	19649948	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:10,0:16,2:15,12,1,1
chrX	19688957	.	CAAAA	C,CAA,CAAA,CAAAAA	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=33,34,31,34,32;MFRL=133,140,62,146,131;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=23,24,30,19;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=15,11,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.13,4.81,12.16,6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:36,2,4,9,9:0.045,0.080,0.148,0.131:60:15,2,1,6,2:13,0,2,2,6:21,15,17,7
chrX	19758955	.	G	T	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,2:0.036:81:36,1:42,0:21,58,0,2
chrX	20156586	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,108;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:27,3:28,0:55,0,3,0
chrX	20181268	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chrX	20194298	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=130,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:12,2:15,1:25,2,3,0
chrX	20194479	.	GA	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.119:36:16,0:14,4:18,14,0,4
chrX	20204548	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:3,2:2,1:0,8,0,4
chrX	20252981	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:16,0:11,0:0|1:20252981_A_C:20252981:8,21,0,3
chrX	20253002	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=19,18;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.232:16:2,1:2,0:0|1:20252981_A_C:20252981:2,11,0,3
chrX	20284862	.	GGCGGCA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCGGCA;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	21444833	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chrX	21534509	.	A	AC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.446:22:6,4:6,6:12,0,10,0
chrX	21613200	.	GT	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.131:51:14,2:24,3:7,38,1,5
chrX	21857868	.	CTGG	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=137,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGG;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.069:63:18,1:29,3:36,23,3,1
chrX	21861434	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,36:0.569:63:11,24:16,12:0|1:21861434_A_G:21861434:5,22,11,25
chrX	21861458	.	T	TG	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=145,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:20,2:13,0:0|1:21861434_A_G:21861434:2,33,0,2
chrX	21861460	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=147,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:20,1:12,0:0|1:21861434_A_G:21861434:2,31,0,2
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chrX	23682894	.	CTC	TGT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,15;MFRL=169,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:23682888_CT_C:23682888:0,2,0,1
chrX	23682901	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:23682888_CT_C:23682888:0,3,0,1
chrX	23682903	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:23682888_CT_C:23682888:0,3,0,1
chrX	23682905	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:23682888_CT_C:23682888:0,3,0,1
chrX	23682929	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
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chrX	23689636	.	AT	TC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=119.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,10:0,0,17,11
chrX	23693084	.	ATT	A,AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30,31;MFRL=145,102,171;MMQ=60,60,60;MPOS=8,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=7.15,5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,4,4:0.142,0.142:32:9,1,1:13,3,3:23,1,6,2
chrX	23697485	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	23700473	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=76.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,20,1
chrX	23700693	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,6:4,6:0,5,0,12
chrX	23701662	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chrX	23723261	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.561:25:1,5:9,9:1,10,0,14
chrX	23723554	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.454:40:10,11:11,7:19,3,17,1
chrX	23724663	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,159;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.451:25:1,3:11,8:14,0,11,0
chrX	23724675	.	CAA	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=146,167;MMQ=50,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.155:21:1,1:8,1:9,9,2,1
chrX	23740815	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,3:0.052:74:26,3:43,0:44,27,1,2
chrX	23749160	.	AG	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chrX	23749187	.	TC	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chrX	23761122	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,278;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chrX	23761386	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chrX	23801593	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.345:41:19,7:8,6:3,24,1,13
chrX	23801702	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:4,1,5,1
chrX	23803822	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=172,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:17,2:6,1:0|1:23803822_G_A:23803822:21,2,1,2
chrX	23803830	.	A	ACTCCTCACTCCTCTGT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=172,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.095:29:20,1:6,1:0|1:23803822_G_A:23803822:22,5,1,1
chrX	23930070	.	CTTTT	C,CTTTTTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=19,19,22;MFRL=193,193,189;MMQ=60,60,50;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,18;RU=T;STR;TLOD=5.37,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,2:0.135,0.163:14:1,0,0:3,0,1:0,10,0,4
chrX	24006863	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,33;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:15,0:4,2:11,8,1,1
chrX	24084241	.	G	GT,GTT	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=34,33,33;MFRL=146,146,78;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=70.49,7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,38,7:0.686,0.120:56:6,22,2:4,10,4:2,9,9,36
chrX	24190977	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,1,21
chrX	24197294	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:18,4:16,0:28,6,4,0
chrX	24329257	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,178;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.460:26:4,6:9,5:6,8,3,9
chrX	24382024	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=168,147;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,5:5,1:1,9,0,6
chrX	24512935	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:13,1:17,2:20,10,2,1
chrX	24516925	.	CT	C,CTT	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=34,34,30;MFRL=145,142,134;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=22.09,4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:44,14,3:0.221,0.062:61:19,5,0:22,8,2:42,2,15,2
chrX	24523402	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,1:11,1:17,9,0,2
chrX	24536954	.	GCA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=CA;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chrX	24580717	.	AA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=264,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	24593453	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:0,0:3,0:0,5,0,2
chrX	24665273	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,3:7,5:1,7,0,8
chrX	24751958	.	T	C	.	.	DP=144;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=463.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,133:0.993:133:0,65:0,62:0,0,41,92
chrX	24759714	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=433,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24759714_T_A:24759714:0,1,0,1
chrX	24759716	.	C	CAAGTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=433,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24759714_T_A:24759714:0,1,0,1
chrX	24759718	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=433,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24759714_T_A:24759714:0,1,0,1
chrX	24759720	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=433,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24759714_T_A:24759714:0,1,0,1
chrX	24760276	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,1:6,4:0,8,0,6
chrX	25025549	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,0:0,2:0|1:25025549_A_G:25025549:0,2,1,1
chrX	25025556	.	C	CTGCCCTTCAGTCAGTGGCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=144,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,0:0,2:0|1:25025549_A_G:25025549:0,2,1,1
chrX	25028290	.	CGCA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:25028290_CGCA_C:25028290:0,0,2,0
chrX	25028301	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=12,30;MFRL=179,188;MMQ=48,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:0,1:0|1:25028290_CGCA_C:25028290:2,0,2,0
chrX	25028304	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=168,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:25028290_CGCA_C:25028290:3,0,1,0
chrX	26213125	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.527:38:8,14:9,6:8,10,9,11
chrX	27765399	.	AGAGGAGGAGGAGGAG	A,AGAGGAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,164,227;MMQ=60,60,59;MPOS=14,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,12;RU=GAG;STR;TLOD=6.86,7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.347,0.522:4:0,1,1:0,1,1:0,0,4,0
chrX	27765759	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.422:29:9,2:7,10:7,10,8,4
chrX	27840899	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=145,122;MMQ=54,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:31,4:13,0:1,44,0,4
chrX	27840903	.	CA	TG	.	.	DP=50;ECNT=8;MBQ=34,26;MFRL=146,117;MMQ=50,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.096:47:31,2:10,2:1,42,0,4
chrX	27840936	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=152,139;MMQ=41,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.188:19:13,3:3,0:0|1:27840936_T_G:27840936:0,16,0,3
chrX	27840938	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=152,139;MMQ=41,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:11,2:3,0:0|1:27840936_T_G:27840936:0,16,0,3
chrX	27840940	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=164,130;MMQ=41,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:11,1:2,0:0|1:27840936_T_G:27840936:0,14,0,2
chrX	27840976	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=35,36;MFRL=216,180;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:27840976_CA_C:27840976:0,3,0,1
chrX	27840989	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=212,180;MMQ=50,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:27840976_CA_C:27840976:0,2,0,1
chrX	27840992	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,22;MFRL=212,180;MMQ=50,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:27840976_CA_C:27840976:0,2,0,1
chrX	27999099	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:26,0:21,3:20,27,0,3
chrX	28807442	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,17,2
chrX	29417510	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=85.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,14:0,0,0,25
chrX	30237824	.	CT	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:17,1:13,2:27,10,2,2
chrX	30254622	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:10,14,0,2
chrX	30718876	.	A	AAAAT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAT;STR;TLOD=199.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,23:0,17:0,0,42,3
chrX	30725794	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=98.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,0,28
chrX	30726149	.	CT	C	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,6:0.074:78:32,0:33,6:64,8,4,2
chrX	30738093	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=90.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,33:0.399:83:31,17:18,15:38,12,25,8
chrX	30870800	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	30877801	.	TAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	31144920	.	GAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.707:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chrX	31165667	.	AAAAG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAG;STR;TLOD=66.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.953:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chrX	31191589	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,17:0,4:0,0,19,4
chrX	31200832	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,3:4,4:6,4,7,0
chrX	31224684	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=161.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,20:0,24:0,0,36,8
chrX	31224881	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chrX	31676096	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,12:0,0,20,6
chrX	31854782	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:5,5:1,1:6,0,5,1
chrX	31986430	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,20:0.437:46:15,12:11,8:21,5,14,6
chrX	32360138	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:0,3:1,0,5,0
chrX	32363964	.	A	AAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	32366669	.	TTAAATCAAAATTACTTTTTATTAGAAACA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=204,257;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:1,3:0,5,0,3
chrX	32408256	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,1:13,1:12,17,1,1
chrX	32472763	.	CT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34,27;MFRL=181,0,92;MMQ=60,60,60;MPOS=19,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.12,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,5:0.247,0.441:9:0,2,4:1,0,0:1,1,5,2
chrX	32490347	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:14,0:10,3:7,18,0,3
chrX	32490380	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=120,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,1:7,0:6,9,1,1
chrX	32563200	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:8,2,0,2
chrX	32659525	.	GTATATATA	G,GTA,GTATA,GTATATA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,27,25,29,28;MFRL=0,103,135,149,138;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=13,8,18,21;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=14,10,11,12,13;RU=TA;STR;TLOD=4.74,10.42,51.59,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:0,3,5,17,2:0.104,0.179,0.597,0.093:27:0,2,3,9,2:0,1,1,7,0:0,0,24,3
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chrX	35986049	.	C	CAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=AAT;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chrX	37701208	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,2:6,7:0,9,1,8
chrX	38033483	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.484:17:5,4:2,4:6,3,5,3
chrX	38160695	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,30;MFRL=149,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chrX	38169777	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,0:2,6:4,0,6,0
chrX	38240587	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,3:0.061:63:32,0:26,3:0|1:38240587_T_C:38240587:50,10,0,3
chrX	38240591	.	G	GTTGTGTATCTTTGTCTGTTTTTGATA	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=34,39;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,3:0.059:65:33,0:24,3:0|1:38240587_T_C:38240587:50,12,0,3
chrX	38280206	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chrX	38525646	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=188,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	38664816	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=112,73;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.115:41:13,0:15,4:0|1:38664816_G_T:38664816:18,19,1,3
chrX	38664817	.	CTT	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.195:28:10,3:9,2:8,15,3,2
chrX	38664818	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=112,73;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.119:41:16,0:16,4:0|1:38664816_G_T:38664816:18,19,1,3
chrX	39921503	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=149,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:13,3:21,0:20,14,3,0
chrX	39921715	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=257,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39921715_C_G:39921715:0,1,0,1
chrX	39921718	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=257,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39921715_C_G:39921715:0,1,0,1
chrX	40456961	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chrX	40460183	.	T	TAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.938:12:0,0:0,1:0,0,0,12
chrX	40514322	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=173.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.983:52:0,24:0,28:0,0,13,39
chrX	40551599	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=12,30;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:1,4:1,1:0,6,0,6
chrX	40570430	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=136,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.080:59:25,1:30,3:36,19,2,2
chrX	40588605	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:0,0:1,0:0,11,0,4
chrX	41043944	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:8,7:8,4:4,12,1,10
chrX	41070012	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=218,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chrX	41073729	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,0:12,3:23,0,3,0
chrX	41078437	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:20,0:16,4:15,21,2,2
chrX	41200677	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,3:4,1:7,0,4,0
chrX	41203667	.	G	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,4:0.070:69:42,0:23,4:6,59,0,4
chrX	41204837	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=158,143;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,2:0.044:66:37,1:26,1:0|1:41204837_G_A:41204837:2,62,0,2
chrX	41204839	.	G	T	.	.	DP=69;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=162,143;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,2:0.042:69:36,1:27,1:0|1:41204837_G_A:41204837:2,65,0,2
chrX	41204842	.	T	TG	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=161,143;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,2:0.043:68:31,1:27,1:0|1:41204837_G_A:41204837:1,65,0,2
chrX	41204845	.	CT	C	.	.	DP=64;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=164,143;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:31,1:26,1:0|1:41204837_G_A:41204837:0,62,0,2
chrX	41332721	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	41383297	.	GA	G,AA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=18,16,32;MFRL=168,192,155;MMQ=60,60,60;MPOS=26,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.05,4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,5:0.168,0.168:21:2,0,1:1,0,2:3,8,0,10
chrX	41524788	.	AATCCAAATAAAAAGTT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.898:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chrX	41530655	.	AT	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:17,1:9,3:26,3,4,0
chrX	41554814	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=114.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,20:0,11:0,0,31,0
chrX	41587849	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=244,230;MMQ=50,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41587849_C_T:41587849:0,2,0,1
chrX	41587853	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=244,230;MMQ=50,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41587849_C_T:41587849:0,2,0,1
chrX	41588754	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,142;MMQ=41,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.088:31:20,2:9,0:0,29,0,2
chrX	41588796	.	A	AC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=170,174;MMQ=57,42;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.203:12:6,2:4,0:0,10,0,2
chrX	41589234	.	TA	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.110:41:18,2:18,2:21,16,3,1
chrX	41782284	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.253:13:3,0:3,0:2,8,0,3
chrX	41782291	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=19,13;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.749:9:0,0:1,0:0,2,0,7
chrX	43552773	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	43595428	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=151.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,17:0,25:0,0,31,11
chrX	43599897	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chrX	43601142	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,12,1
chrX	43602965	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chrX	43603139	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,0:14,2:6,21,0,2
chrX	43627999	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,25:0.443:57:16,12:14,13:11,21,5,20
chrX	43741425	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.315:7:0,1:4,0:4,1,2,0
chrX	43741616	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chrX	44202890	.	G	GC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=85.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,2,23
chrX	44401408	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,7:5,3:0,9,0,10
chrX	44833841	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=207,197;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chrX	44918221	.	AT	A,ATT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=147,182,134;MMQ=60,60,60;MPOS=19,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=12.52,6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,11,6:0.266,0.154:38:9,4,4:11,6,1:20,1,15,2
chrX	44920101	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	44922049	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:18,0:24,3:0,43,0,3
chrX	44929635	.	G	GCAAAGGGAATTAGAAGATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=222,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chrX	44935877	.	CT	C,CTT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,34,28;MFRL=183,175,165;MMQ=60,60,60;MPOS=23,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=8.41,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,7,3:0.206,0.113:32:12,5,2:10,2,0:22,0,10,0
chrX	44935924	.	CTT	C,CT	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=32,33,32;MFRL=163,140,162;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=10.89,89.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,39:0.159,0.768:50:1,4,24:1,4,12:3,0,42,5
chrX	44938316	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,1:6,2:15,0,3,0
chrX	45017166	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=143,239;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chrX	45050973	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chrX	45051350	.	T	TCTATTTATAAAACTAGTTAATGAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chrX	46359728	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:13,2:0|1:46359728_A_C:46359728:11,10,1,1
chrX	46359732	.	T	TGAATATGAAG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:0|1:46359728_A_C:46359728:11,10,1,1
chrX	46387921	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	46388442	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chrX	46434357	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=211,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	46472666	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chrX	46532154	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,65;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:46532154_A_T:46532154:0,0,1,1
chrX	46532157	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,65;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:46532154_A_T:46532154:0,0,1,1
chrX	46532161	.	T	TGGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,65;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46532154_A_T:46532154:0,0,0,1
chrX	46532163	.	A	ATGCCTTCTTGGGGACTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,65;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46532154_A_T:46532154:0,0,0,1
chrX	46719598	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=144,151;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.062:45:18,0:20,2:0|1:46719598_A_C:46719598:4,39,0,2
chrX	46719604	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=144,151;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:19,0:20,2:0|1:46719598_A_C:46719598:3,37,0,2
chrX	46739090	.	AT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:13,3:15,1:28,2,4,0
chrX	46893249	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chrX	46914097	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=204,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46914097_G_A:46914097:1,0,0,1
chrX	46914099	.	T	TCATGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=204,233;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46914097_G_A:46914097:1,0,0,1
chrX	46918055	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=149,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:10,2:0|1:46918055_C_T:46918055:11,9,1,1
chrX	46918066	.	T	TTGATG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:14,0:7,2:0|1:46918055_C_T:46918055:10,11,1,1
chrX	46918068	.	C	CATGGGGTTA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:14,0:6,2:0|1:46918055_C_T:46918055:10,11,1,1
chrX	46949403	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,5:4,2:0,8,0,7
chrX	46952219	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,6:1,4:5,1,10,1
chrX	46952398	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,4:5,5:1,8,0,9
chrX	47030560	.	GGGAGGA	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=GGA;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:10,1:5,1:1,14,1,1
chrX	47039736	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=199,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:6,0:8,2:0|1:47039736_A_T:47039736:0,14,0,2
chrX	47039740	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=199,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:6,0:8,2:0|1:47039736_A_T:47039736:0,14,0,2
chrX	47041473	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:8,6,2,0
chrX	47044631	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,93;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:12,0:11,3:3,20,0,3
chrX	47057647	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,9,7
chrX	47058542	.	TGGG	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:11,2:19,0:0|1:47058542_TGGG_T:47058542:3,27,2,0
chrX	47058547	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=-1073741825;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:8,2:17,0:0|1:47058542_TGGG_T:47058542:3,25,2,0
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chrX	47061018	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=124,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=77.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,24:0.641:37:6,13:7,11:9,4,13,11
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chrX	47064990	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=136,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:14,0:10,2:4,20,0,2
chrX	47065015	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,1:6,1:1,15,0,2
chrX	47065031	.	G	GCAGGCAAAT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.241:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chrX	47065109	.	CAC	TGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=275,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47065109_CAC_TGG:47065109:0,1,0,1
chrX	47065114	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=275,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47065109_CAC_TGG:47065109:0,1,0,1
chrX	47069370	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.100:57:29,1:23,4:26,26,2,3
chrX	47086347	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chrX	47098735	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.353:27:7,0:6,0:4,12,11,0
chrX	47098746	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.193:24:8,3:7,0:5,14,5,0
chrX	47101155	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=213,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47101155_G_GTT:47101155:0,1,0,1
chrX	47101157	.	T	TAGAAGAGCTGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=213,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47101155_G_GTT:47101155:0,1,0,1
chrX	47104953	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=212,219;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:47104953_T_C:47104953:0,3,0,1
chrX	47104973	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=234,219;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:47104953_T_C:47104953:0,2,0,1
chrX	47104977	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=234,219;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:47104953_T_C:47104953:0,2,0,1
chrX	47104981	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=234,219;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:47104953_T_C:47104953:0,2,0,1
chrX	47106419	.	CAA	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:8,2:9,2:17,5,4,0
chrX	47107350	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,17;MFRL=241,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:0,0:0,0:0,1,1,2
chrX	47307771	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,1:10,7,2,0
chrX	47344218	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47344218_A_C:47344218:0,2,0,1
chrX	47344226	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47344218_A_C:47344218:0,2,0,1
chrX	47426036	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:3,0:0|1:47426036_A_C:47426036:3,1,3,0
chrX	47426045	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,1:3,1:0|1:47426036_A_C:47426036:4,3,3,0
chrX	47426049	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=135,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:4,0:0|1:47426036_A_C:47426036:4,3,2,0
chrX	47429105	.	G	GATTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=137,184;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:47429105_G_GATTTT:47429105:0,3,0,1
chrX	47429106	.	G	GGCTATTACAATAGGTGGGTAGTGGTGTCAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=137,184;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:1,0:0|1:47429105_G_GATTTT:47429105:0,3,0,1
chrX	47429131	.	G	GACTCAGAAGCTCAGTATACATTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	47444985	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:5,3:5,6:5,6,2,7
chrX	47488873	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:47488873_A_C:47488873:0,0,2,0
chrX	47488877	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,11;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:47488873_A_C:47488873:0,0,2,0
chrX	47488881	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,17;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47488873_A_C:47488873:0,0,1,0
chrX	47488884	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47488873_A_C:47488873:0,0,1,0
chrX	47488886	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47488873_A_C:47488873:0,0,1,0
chrX	47517145	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,131;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:17,0:25,3:20,23,0,3
chrX	47663200	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,160;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:10,4:8,7:8,11,9,2
chrX	47755164	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chrX	47848057	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=199,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47848057_T_TG:47848057:0,1,0,1
chrX	47848058	.	T	TCCTCTTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=199,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:47848057_T_TG:47848057:0,1,0,1
chrX	47918904	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:47918904_A_C:47918904:2,7,1,1
chrX	47918908	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=134,59;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:47918904_A_C:47918904:2,8,1,1
chrX	47918916	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=151,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:47918904_A_C:47918904:1,5,1,1
chrX	47918918	.	G	GAC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=166,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:47918904_A_C:47918904:2,5,1,1
chrX	47918919	.	T	TTA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=166,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:47918904_A_C:47918904:2,5,1,1
chrX	47919631	.	C	CTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=178,252;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chrX	47920356	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=211,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.906:19:0,8:1,9:0,1,1,17
chrX	47970682	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:29,0:23,3:30,22,1,2
chrX	47970842	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chrX	48053521	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=235.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.985:66:0,43:0,22:0,0,55,11
chrX	48053631	.	G	A	.	.	DP=166;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,98;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:159,5:0.035:164:80,0:73,5:88,71,2,3
chrX	48117907	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,128;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:14,3:24,0:40,0,3,0
chrX	48161281	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=90.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,1,24
chrX	48163229	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,163;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:1,11,0,2
chrX	48164138	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,8:0,0,15,7
chrX	48369602	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48369602_C_T:48369602:0,1,0,1
chrX	48369604	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48369602_C_T:48369602:0,1,0,1
chrX	48369607	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48369602_C_T:48369602:0,1,0,1
chrX	48369609	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=90,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:48369602_C_T:48369602:1,1,0,1
chrX	48369612	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=90,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:48369602_C_T:48369602:1,1,0,1
chrX	48417931	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:10,0,2,0
chrX	48433499	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chrX	48433529	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chrX	48457034	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=16,19;MFRL=108,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,0:0,0:0|1:48457034_A_C:48457034:0,1,1,0
chrX	48457041	.	C	CGGGGGGGGGGGGGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=175,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:1,0:0|1:48457034_A_C:48457034:1,1,1,0
chrX	48458836	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=121,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,0:9,3:10,8,2,1
chrX	48460625	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chrX	48543999	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,0:9,1:5,12,2,0
chrX	48559205	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=213,332;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chrX	48649426	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:48649426_A_AG:48649426:0,0,4,0
chrX	48649449	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:48649426_A_AG:48649426:0,0,5,0
chrX	48649456	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:48649426_A_AG:48649426:0,0,6,0
chrX	48650920	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:1,12,0,2
chrX	48675926	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chrX	48754072	.	C	A	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,4:0.052:92:42,0:45,4:0|1:48754072_C_A:48754072:44,44,0,4
chrX	48754079	.	A	C	.	.	DP=91;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,4:0.053:91:35,0:38,1:0|1:48754072_C_A:48754072:45,42,0,4
chrX	48759204	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=135,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,2:2,3,3,2
chrX	48760793	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.480:39:9,9:11,7:6,14,6,13
chrX	48814548	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=179,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,0:0,2:2,1,1,1
chrX	48814906	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,1:5,7:0,8,0,8
chrX	48820134	.	ATG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:0,20,0,2
chrX	48822604	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,1:12,1:16,3,2,0
chrX	48853826	.	G	GGGCTGGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.313:4:2,1:1,0:0|1:48853826_G_GGGCTGGT:48853826:0,3,0,1
chrX	48853830	.	A	AACATCATTTGCTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:48853826_G_GGGCTGGT:48853826:0,3,0,1
chrX	48853833	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:48853826_G_GGGCTGGT:48853826:0,3,0,1
chrX	48853852	.	A	ATAAAGCAGAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	48858653	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.176:27:7,4:12,0:0|1:48858653_A_C:48858653:3,20,4,0
chrX	48858661	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.145:26:9,1:14,0:0|1:48858653_A_C:48858653:2,21,3,0
chrX	48887951	.	TC	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:26,2:20,1:25,26,2,1
chrX	48897942	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,139;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:14,2:12,6,2,0
chrX	48898183	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chrX	48970636	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,121;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:10,0:8,5:12,6,0,5
chrX	48976245	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:48976245_C_T:48976245:0,4,0,1
chrX	48976247	.	A	AGAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=195,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:48976245_C_T:48976245:0,4,0,1
chrX	49020369	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=106,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.393:22:4,1:4,3:5,8,0,9
chrX	49020495	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=128,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:49020495_C_T:49020495:1,2,0,1
chrX	49020497	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=128,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:49020495_C_T:49020495:1,2,0,1
chrX	49020499	.	ACT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=128,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:49020495_C_T:49020495:1,2,0,1
chrX	49034584	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.325:10:1,1:4,0:3,4,3,0
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chrX	49369711	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chrX	49370511	.	A	AAAT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,166;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=AAT;STR;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.560:14:2,3:4,5:6,0,8,0
chrX	49454180	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=137,180;MMQ=50,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.689:7:1,3:0,2:0,2,1,4
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chrX	49850978	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,2:10,1:11,7,1,2
chrX	50056814	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,2,2
chrX	50056885	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:7,0:10,3,2,1
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chrX	50090858	.	ACG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50090853_AGGCC_A:50090853:0,1,0,1
chrX	50121146	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=53.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chrX	50127895	.	A	ACTGAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=197,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:50127895_A_ACTGAG:50127895:0,3,0,1
chrX	50127899	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=197,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:50127895_A_ACTGAG:50127895:0,3,0,1
chrX	50127900	.	G	GTGTGAGGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=131,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chrX	50127903	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=197,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:50127895_A_ACTGAG:50127895:0,3,0,1
chrX	50127905	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=106,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50127895_A_ACTGAG:50127895:0,2,0,1
chrX	50165615	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,32;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50165615_C_G:50165615:0,2,0,1
chrX	50165617	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,31;MFRL=192,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50165615_C_G:50165615:0,2,0,1
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chrX	50350674	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,3,2
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chrX	53106706	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=140,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:0|1:53106694_C_T:53106694:7,11,1,1
chrX	53108770	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,42;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:2,5,1,1
chrX	53108805	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=179,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chrX	53111760	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:53111760_C_A:53111760:2,1,1,0
chrX	53111770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:53111760_C_A:53111760:2,1,2,0
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chrX	53222016	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=110,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.228:25:6,0:12,0:10,9,0,6
chrX	53222021	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=115,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.213:20:6,0:3,0:9,7,0,4
chrX	53222025	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=122,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:4,2:4,0:7,6,0,4
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chrX	53222440	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=305,451;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:53222434_A_C:53222434:0,3,1,0
chrX	53222447	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,10;MFRL=254,451;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:53222434_A_C:53222434:0,4,1,0
chrX	53226311	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,301;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	53228148	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,5:0,0,13,1
chrX	53246959	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,5:3,6:8,0,8,3
chrX	53247039	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:18,1:15,2:17,16,3,0
chrX	53250190	.	C	CTTCTATTATCTAACACAATGACAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chrX	53250197	.	AAA	TCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=242,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53250197_AAA_TCT:53250197:0,1,0,1
chrX	53250203	.	C	CTTTCTTTTCTTCTCTCTTTCTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=242,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53250197_AAA_TCT:53250197:0,1,0,1
chrX	53271147	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chrX	53279897	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=184,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:53279897_A_C:53279897:0,3,1,1
chrX	53279899	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=184,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:53279897_A_C:53279897:0,3,1,1
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chrX	53448856	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,5:0.085:66:35,3:22,0:0|1:53448854_A_T:53448854:54,7,0,5
chrX	53448859	.	T	G	.	.	DP=73;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,10:0.145:70:31,7:23,2:0|1:53448854_A_T:53448854:53,7,0,10
chrX	53448866	.	T	G	.	.	DP=71;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,13:0.195:68:24,8:23,1:52,3,0,13
chrX	53448870	.	G	GCC,GC	.	.	DP=79;ECNT=8;MBQ=34,11,12;MFRL=144,201,130;MMQ=60,60,60;MPOS=11,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.36,6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:54,5,10:0.079,0.138:69:25,0,0:21,0,0:52,2,0,15
chrX	53448871	.	A	C	.	.	DP=77;ECNT=8;MBQ=30,19;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.053:71:29,0:22,1:50,18,0,3
chrX	53449568	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.504:16:4,4:3,4:2,6,2,6
chrX	53455034	.	T	A	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=112,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,3:0.049:79:36,0:37,3:35,41,2,1
chrX	53461359	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,2:5,4:0,5,0,6
chrX	53574761	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=106,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.097:46:12,0:14,2:24,17,0,5
chrX	53574763	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=106,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.130:47:16,0:13,1:24,16,0,7
chrX	53576233	.	T	TAGTTTTCTGTTTTTACCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=123,395;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:2,1:1,0:3,0,0,1
chrX	53577685	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,1:5,2:6,8,1,2
chrX	53602624	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.059:65:23,1:38,2:36,26,2,1
chrX	53607754	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,4:1,3:2,1,7,0
chrX	53621415	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:13,2:10,3:22,1,5,0
chrX	53622078	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=6210130,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:1,1,5,0
chrX	53652844	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,25:0.516:48:12,6:11,17:0|1:53652844_G_A:53652844:19,4,22,3
chrX	53652852	.	T	TGCCGGG	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCCGGG;STR;TLOD=237.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,57:0.984:57:0,22:0,20:0|1:53652844_G_A:53652844:0,0,39,18
chrX	53654500	.	GTA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=203,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TA;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:1,1:1,3,0,2
chrX	53655415	.	TAAAAAA	T,TAAAA,TAAAAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,22,32,31;MFRL=156,120,149,129;MMQ=60,60,60,60;MPOS=11,17,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=19,13,17,18;RU=A;STR;TLOD=3.59,4.27,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,2,3,6:0.098,0.170,0.269:22:5,0,1,4:6,2,2,2:9,2,7,4
chrX	53661319	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,95;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:1,16,0,2
chrX	53964588	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=109,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chrX	53966984	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chrX	53970750	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=208,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53970750_G_T:53970750:0,1,0,1
chrX	53970754	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=208,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53970750_G_T:53970750:0,1,0,1
chrX	53970757	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=208,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53970750_G_T:53970750:0,1,0,1
chrX	53970758	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=208,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53970750_G_T:53970750:0,1,0,1
chrX	53970763	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=208,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53970750_G_T:53970750:0,1,0,1
chrX	53989230	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,1:3,1:8,0,2,0
chrX	54019295	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=119,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,6:6,0:2,9,2,4
chrX	54026462	.	TTGTTAAGACAACC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chrX	54107692	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chrX	54117672	.	GAA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:3,1:10,0,2,0
chrX	54117740	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=151.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,27:0,14:0,0,25,16
chrX	54142970	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.462:37:11,13:9,4:8,12,11,6
chrX	54161859	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chrX	54177730	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=134,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,3:0.056:69:30,0:34,3:0|1:54177730_T_C:54177730:51,15,0,3
chrX	54177734	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=134,194;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.058:67:31,0:31,3:0|1:54177730_T_C:54177730:49,15,0,3
chrX	54319672	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,1:11,1:13,11,1,1
chrX	54472506	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.507:29:6,6:8,6:8,6,5,10
chrX	54481833	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,638;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:10,2,2,0
chrX	54482285	.	C	CCTGTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=116,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	54483071	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=132,158;MMQ=40,53;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chrX	54483104	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=176,132;MMQ=45,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chrX	54492350	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chrX	54495402	.	T	TTCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=253,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	54497924	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=153,29;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:3,10,1,1
chrX	54559136	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,6:0.114:59:41,5:12,1:0,53,0,6
chrX	54577566	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54577566_C_A:54577566:0,1,0,1
chrX	54577567	.	TTTCCTTA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54577566_C_A:54577566:0,1,0,1
chrX	54578490	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=194,119;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chrX	54781359	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chrX	54781530	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=102,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:4,6:7,4:3,9,6,5
chrX	54783864	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=119,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:12,1:24,0:21,20,1,1
chrX	54783866	.	T	TCTGTTTCCTTCCACTG	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:11,2:20,0:22,20,1,1
chrX	54800613	.	G	T	.	.	DP=94;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=121,141;MMQ=58,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,7:0.062:90:35,0:38,0:43,40,0,7
chrX	54800637	.	CAA	C,CA	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=29,20,20;MFRL=75,145,123;MMQ=60,60,60;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=A;STR;TLOD=5.32,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,8,9:0.251,0.362:25:4,2,1:2,2,4:3,5,1,16
chrX	54815092	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=14,26;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,1:0,1:1,4,0,3
chrX	54815101	.	TC	GG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=15,13;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:0,0:1,4,0,3
chrX	54815107	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=15,12;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,0:1,0:1,4,0,3
chrX	54840013	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,5,11
chrX	54949190	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:4,13:8,5:6,6,10,8
chrX	55020516	.	C	CCTTGGTTCTTCCTCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chrX	55047413	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chrX	55172537	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,30:0.756:39:4,16:5,14:9,0,26,4
chrX	55172572	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.077:49:23,2:22,1:36,10,2,1
chrX	55172586	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,6:0.114:59:28,4:24,2:41,12,3,3
chrX	55172596	.	C	G	.	.	DP=80;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,3:0.048:80:40,1:37,2:50,27,1,2
chrX	55172645	.	C	T	.	.	DP=107;ECNT=12;MBQ=29,32;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=258.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,83:0.792:104:13,43:8,35:11,10,41,42
chrX	55172653	.	G	A	.	.	DP=105;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,5:0.056:104:54,3:43,2:49,50,1,4
chrX	55172680	.	G	C	.	.	DP=95;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,6:0.076:90:47,4:33,2:0|1:55172680_G_C:55172680:38,46,3,3
chrX	55172685	.	A	AT	.	.	DP=89;ECNT=12;MBQ=29,33;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,6:0.077:89:45,4:32,2:0|1:55172680_G_C:55172680:38,45,3,3
chrX	55172687	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=218.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,67:0.795:84:12,37:4,29:8,9,33,34
chrX	55172688	.	TG	T	.	.	DP=88;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,6:0.078:88:45,4:34,2:0|1:55172680_G_C:55172680:39,43,3,3
chrX	55172708	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=12;MBQ=29,33;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=151.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,42:0.782:53:6,20:5,21:3,8,17,25
chrX	55172716	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=12;MBQ=33,27;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,11:0.222:52:21,6:19,5:15,26,4,7
chrX	55246965	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,13,5
chrX	55248376	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=53,164;MMQ=45,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=105.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,31:0.919:33:0,12:2,18:0,2,1,30
chrX	55249049	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=227.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.985:66:0,34:0,30:0,0,45,21
chrX	55289593	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chrX	55289635	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,2:9,0:17,8,2,0
chrX	55650285	.	C	CA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=164,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:10,1:18,0:0|1:55650285_C_CA:55650285:9,21,1,1
chrX	55650290	.	AC	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=161,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:10,2:19,0:0|1:55650285_C_CA:55650285:10,21,1,1
chrX	55753728	.	AT	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:15,0:13,3:15,14,2,1
chrX	55757744	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chrX	56291516	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chrX	56295956	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=122,94;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:9,2:3,21,0,2
chrX	56295958	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,32,30;MFRL=117,141,125;MMQ=60,60,60;MPOS=14,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=TG;STR;TLOD=9.49,6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,3:0.363,0.373:9:1,1,1:0,3,1:0,2,0,7
chrX	56296803	.	A	AGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=16,32;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,1:0,1:0|1:56296803_A_AGC:56296803:0,1,0,2
chrX	56296807	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=169,297;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56296803_A_AGC:56296803:0,1,0,1
chrX	56296808	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=37,26;MFRL=169,297;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56296803_A_AGC:56296803:0,1,0,1
chrX	56594399	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=78,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chrX	57021390	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	57474943	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chrX	57515400	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=135,97;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:19,1:17,2:6,31,0,3
chrX	57515439	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chrX	57624024	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,0:11,2:4,20,0,2
chrX	57935143	.	C	CAGGGCACCTCCCTG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,108;MMQ=27,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:2,16,0,2
chrX	63409673	.	A	ACCCCCGGCCCCCCCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:63409673_A_ACCCCCGGCCCCCCCCC:63409673:0,0,1,0
chrX	63409679	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63409673_A_ACCCCCGGCCCCCCCCC:63409673:0,0,1,0
chrX	63409687	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,31;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.525:2:0,0:0,1:0|1:63409673_A_ACCCCCGGCCCCCCCCC:63409673:1,0,1,0
chrX	63412938	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:6,10,0,2
chrX	63445073	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:7,1:5,7,1,1
chrX	63570024	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,14:0,0,0,23
chrX	63575971	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:7,0,0,2
chrX	64743681	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=223,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.484:6:1,2:2,1:0|1:64743681_C_CA:64743681:0,3,0,3
chrX	64743683	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=223,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.485:6:1,1:2,1:0|1:64743681_C_CA:64743681:0,3,0,3
chrX	64743687	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=223,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:64743681_C_CA:64743681:0,3,0,1
chrX	64748290	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=147,101;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:1,6,0,2
chrX	64748323	.	C	CATGCATGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:64748323_C_CATGCATGG:64748323:1,2,0,1
chrX	64748326	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:64748323_C_CATGCATGG:64748323:1,2,0,1
chrX	64956699	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,0;MMQ=60,34;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,5:0.059:100:46,2:48,3:50,45,4,1
chrX	65390645	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,65;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chrX	65393658	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chrX	65420609	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chrX	65428119	.	G	GAAATCATTCTGTGGTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:1,0:0,4,1,1
chrX	65478922	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chrX	65819286	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=92.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,18:0,13:0,0,28,3
chrX	66766140	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chrX	66788858	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:15,5,1,1
chrX	66941597	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	67273414	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	67412906	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chrX	67431921	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,1:5,6:10,2,4,3
chrX	67885416	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.550:36:8,7:8,12:7,9,8,12
chrX	68725640	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,204;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:5,2,4,2
chrX	68749098	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chrX	68749379	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chrX	68837190	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chrX	69080565	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	69080779	.	A	ACAAGACCACCTACAGCTCTGCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=136,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chrX	69080800	.	C	CCCAAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=172,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	69080840	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	69177079	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=171,188;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:19,0:7,2:0,26,0,2
chrX	69177094	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=173,177;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:16,1:5,1:0|1:69177094_C_T:69177094:0,21,0,2
chrX	69177096	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=174,177;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:4,1:0|1:69177094_C_T:69177094:0,22,0,2
chrX	69247667	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.102:47:11,3:30,1:27,16,2,2
chrX	69262854	.	CTCT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCT;STR;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chrX	69283668	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=242,189;MMQ=30,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69283668_T_A:69283668:0,1,0,1
chrX	69283670	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=242,189;MMQ=30,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69283668_T_A:69283668:0,1,0,1
chrX	69283673	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=242,189;MMQ=30,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69283668_T_A:69283668:0,1,0,1
chrX	69283683	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=170,242;MMQ=50,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:69283683_G_A:69283683:0,1,0,1
chrX	69283685	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=170,242;MMQ=50,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:69283683_G_A:69283683:0,1,0,1
chrX	69283741	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	69419565	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chrX	69459945	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chrX	69496228	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:3,2:6,3:7,2,6,0
chrX	69497288	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,2:0.049:59:27,0:29,2:23,34,0,2
chrX	69501707	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	69502054	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=184,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.454:16:2,3:5,4:7,2,4,3
chrX	69502478	.	CA	TG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,15:0.470:32:10,9:7,6:0|1:69502478_CA_TG:69502478:4,13,3,12
chrX	69502479	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,31:0.970:31:0,19:0,12:1|0:69502478_CA_TG:69502478:0,0,7,24
chrX	69502754	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,1785;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:2,8,2,0
chrX	69504073	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.517:29:5,7:5,6:12,2,15,0
chrX	69504078	.	TT	CG,GT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,33,28;MFRL=152,128,145;MMQ=60,60,60;MPOS=28,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.02,27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,3,13:0.102,0.425:32:8,1,7:6,2,6:12,4,15,1
chrX	69595909	.	C	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=224.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,34:0,28:0,0,47,15
chrX	69624529	.	CTTTG	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:11,0:14,2:26,4,1,1
chrX	69639698	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chrX	69644849	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:16,0:4,2:18,2,2,0
chrX	69646450	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,0:5,2:9,1,2,0
chrX	69646576	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:12,0:9,14,0,2
chrX	69713188	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,9;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.226:35:6,0:11,0:20,7,8,0
chrX	69749852	.	AT	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chrX	69844797	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,2,14
chrX	69898742	.	GAA	G,GA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,17,18;MFRL=97,149,144;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=5.76,42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,20:0.161,0.730:28:1,1,2:2,0,6:3,1,2,22
chrX	69964084	.	G	GA,GAA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=35,33,27;MFRL=136,167,175;MMQ=60,60,60;MPOS=22,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=A;STR;TLOD=39.78,5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,16,4:0.678,0.198:22:1,6,2:1,8,1:0,2,2,18
chrX	69964093	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:5,4:5,7:1,10,1,10
chrX	70093038	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chrX	70093045	.	TA	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=166,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,1,1
chrX	70148927	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.889:11:0,5:0,5:0,1,1,9
chrX	70149404	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chrX	70287925	.	C	CGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:70287925_C_CGGGG:70287925:0,0,1,0
chrX	70287926	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70287925_C_CGGGG:70287925:0,0,1,0
chrX	70316905	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:0,24,0,2
chrX	70321631	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chrX	70339498	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,6:0,1:3,0,5,2
chrX	70340738	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=150,166;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chrX	70341122	.	T	TACTTTATCTGCTTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTTTATCTGCTTC;STR;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:1,2:2,3:2,1,4,3
chrX	70341169	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chrX	70342820	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=203,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chrX	70343621	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:0,1:2,2:0,3,0,3
chrX	70344331	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=249,247;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chrX	70344763	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:4,4,2,1
chrX	70345792	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:1,3:5,0:6,0,3,0
chrX	70352417	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.506:32:8,7:6,9:6,10,2,14
chrX	70356642	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:2,1,3,1
chrX	70361651	.	C	CA,CAA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,34,28;MFRL=156,130,136;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=33.63,3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,18,3:0.565,0.117:31:3,4,2:7,14,0:10,0,15,6
chrX	70361967	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,3:0,3:3,1,5,1
chrX	70368779	.	GGAGA	G,GGA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=162,164,153;MMQ=60,60,60;MPOS=27,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,5,6;RU=GA;STR;TLOD=5.17,4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,2:0.117,0.128:20:6,2,2:9,0,0:0,16,0,4
chrX	70390007	.	GCA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=11,22;MFRL=232,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chrX	70390034	.	C	CTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=227,141;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chrX	70445407	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,11763;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chrX	70464082	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,14;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:70464082_G_C:70464082:0,1,1,0
chrX	70464087	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,10;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:70464082_G_C:70464082:0,1,1,0
chrX	70464091	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,10;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:70464082_G_C:70464082:0,1,1,0
chrX	70464093	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,14;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:70464082_G_C:70464082:0,1,1,0
chrX	70468107	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:6,4:10,0:8,9,2,2
chrX	70518246	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.417:34:15,10:5,4:19,1,14,0
chrX	70518290	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.078:62:37,4:21,0:44,14,3,1
chrX	70609368	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:8,2:14,2:21,1,4,0
chrX	70617379	.	G	GC	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:18,1:8,2:0,26,0,3
chrX	70617390	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=160,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:15,3:7,2:0,22,0,5
chrX	70617394	.	GTG	CCC,ATG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,35,29;MFRL=164,213,165;MMQ=60,41,50;MPOS=20,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.09,4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,2,2:0.100,0.100:27:16,1,0:7,0,1:0,23,0,4
chrX	70618399	.	C	CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,2:17,0:19,11,2,0
chrX	70680510	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,147;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:9,4:15,0:19,5,4,0
chrX	70775275	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,260;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,2:9,1:1,16,0,3
chrX	70784699	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=211,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chrX	70800599	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,11:0.193:60:16,9:32,2:44,5,10,1
chrX	70800604	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=155,127;MMQ=60,51;MPOS=-20;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,4:0.068:74:25,3:36,1:59,11,3,1
chrX	70800613	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,7:0.105:74:25,6:41,1:53,14,4,3
chrX	70800615	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=148,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,7:0.104:75:25,6:40,1:54,14,4,3
chrX	71351519	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	71357093	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,3,15
chrX	71357160	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	71364479	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,0,23
chrX	71380152	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,6,15
chrX	71492423	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=243,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chrX	71494366	.	C	G	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=142,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,6:0.105:64:24,1:34,5:13,45,2,4
chrX	71494383	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.098:48:13,0:31,4:2,42,1,3
chrX	71495344	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=204.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,34:0,25:0,0,50,9
chrX	71495388	.	T	TCTA	.	.	DP=94;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=358.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,83:0.989:83:0,42:0,38:0,0,46,37
chrX	71521519	.	T	TG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:7,0:0|1:71521519_T_TG:71521519:16,3,1,1
chrX	71521520	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:8,0:0|1:71521519_T_TG:71521519:16,3,1,1
chrX	71521530	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,1:6,0:0|1:71521519_T_TG:71521519:13,4,1,1
chrX	71521867	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chrX	71521894	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:7,1:10,4,1,1
chrX	71521912	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.147:23:7,0:10,1:18,2,0,3
chrX	71522638	.	TC	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=82,98;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,3:4,0:7,2,3,0
chrX	71694637	.	G	GGGAGTAACTCTACGATTTTGTT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.111:33:10,3:18,0:1,29,0,3
chrX	71715065	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:6,1:8,7,1,1
chrX	71791975	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.402:13:2,2:3,2:3,5,0,5
chrX	71804163	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=120,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,4:0.062:79:35,0:34,4:0|1:71804163_G_A:71804163:27,48,0,4
chrX	71804166	.	A	C	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=120,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,4:0.062:79:36,0:37,4:0|1:71804163_G_A:71804163:27,48,0,4
chrX	71813191	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=201,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,1:0,3,0,3
chrX	71819570	.	A	AT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:20,2:9,1:29,1,3,0
chrX	71877503	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,1:8,1:0|1:71877503_A_AC:71877503:12,4,0,2
chrX	71877504	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:0|1:71877503_A_AC:71877503:12,4,0,2
chrX	71877506	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:0|1:71877503_A_AC:71877503:12,4,0,2
chrX	72224295	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=141,145;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:2,0:0,0:4,0,5,0
chrX	72225593	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,11:0,0,0,24
chrX	72433422	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,2:8,0:16,4,2,0
chrX	72433663	.	GTCC	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=174,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TCC;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:10,0:7,2:9,8,1,1
chrX	72434344	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=154,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:3,2:7,0:0|1:72434344_A_T:72434344:4,6,1,1
chrX	72434348	.	G	GCCTGGATCGTCGTTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:72434344_A_T:72434344:3,5,1,1
chrX	73095077	.	T	G,A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=32,34,33;MFRL=161,218,191;MMQ=60,40,60;MPOS=33,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,0,0:3,1,1:0,3,0,2
chrX	73095078	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=189,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:73095078_G_A:73095078:0,4,0,1
chrX	73095080	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chrX	73095083	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=34,28;MFRL=189,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:73095078_G_A:73095078:0,4,0,1
chrX	73095098	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=205,161;MMQ=50,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,0:2,1:0|1:73095098_G_A:73095098:0,2,0,1
chrX	73095101	.	GCAGGATCTCACAC	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=29,31;MFRL=176,218;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chrX	73095102	.	CAGGA	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=35,30;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:73095102_CAGGA_C:73095102:0,1,0,1
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chrX	73744269	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:13,2:14,0:18,10,1,1
chrX	73749319	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chrX	74334588	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,6:6,5:7,4,7,4
chrX	74375871	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=191.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,34:0,22:0,0,46,12
chrX	74494470	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,4,6
chrX	74494483	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,3,9
chrX	74523367	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=224.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,31:0,30:0,0,11,50
chrX	74598903	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chrX	74651359	.	TA	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.148:43:12,2:17,2:5,32,0,6
chrX	75392858	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=185,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:15,0,2,0
chrX	75393091	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=143,132;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:20,0:11,2:0,31,0,2
chrX	75393095	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=145,132;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:18,0:11,2:0,30,0,2
chrX	75394722	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:17,3:27,1:34,12,2,2
chrX	76889227	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:16,0:15,2:3,28,0,2
chrX	76907770	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=178,67;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:76907770_T_C:76907770:9,4,1,1
chrX	76907788	.	T	TCCC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=C;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:0|1:76907770_T_C:76907770:5,5,1,1
chrX	76936949	.	AAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=146,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:1,2:5,0,2,0
chrX	77084682	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,5:0.059:88:48,0:33,4:46,37,0,5
chrX	77155209	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=254,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:77155209_TC_T:77155209:0,1,0,1
chrX	77155213	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=254,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:77155209_TC_T:77155209:0,1,0,1
chrX	77245040	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,5:7,5:7,4,4,6
chrX	77286830	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chrX	77296047	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,15,3
chrX	77298315	.	G	GGCTGGGGTGGGAGGATCAATTGAGCCCAGGAC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=167,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.148:19:9,1:7,1:0|1:77298315_G_GGCTGGGGTGGGAGGATCAATTGAGCCCAGGAC:77298315:0,17,0,2
chrX	77298317	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:0|1:77298315_G_GGCTGGGGTGGGAGGATCAATTGAGCCCAGGAC:77298315:0,16,0,2
chrX	77298857	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,10:0,0,19,5
chrX	77300966	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=116,47;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:10,1,1,1
chrX	77301117	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:0,1,1,5
chrX	77528846	.	TT	CA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=108,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.067:58:30,0:24,3:23,32,0,3
chrX	78011737	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,13,13
chrX	78012576	.	T	TA	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=16,30;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.212:39:11,1:3,4:7,24,2,6
chrX	78216146	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=137,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:21,1:19,1:23,17,1,1
chrX	78426471	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=105.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,7:0,23:0,0,27,3
chrX	78426488	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=120.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,8:0,27:0,0,28,8
chrX	78426667	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:5,9,2,0
chrX	78617053	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chrX	78617999	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=166.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,22:0,24:0,0,46,0
chrX	78618050	.	A	G	.	.	DP=114;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=400.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,108:0.991:108:0,49:0,58:0,0,86,22
chrX	78618384	.	AAG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.125:29:9,0:16,3:25,1,2,1
chrX	79282873	.	GTT	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=114,135;MMQ=46,42;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.140:28:9,1:6,1:10,14,1,3
chrX	79698700	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:15,3:17,0:17,15,3,0
chrX	79936922	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:7,12,0,2
chrX	79937084	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chrX	79937622	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:4,4:3,4:0,10,0,9
chrX	79942599	.	GTATA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=TA;STR;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:2,1:1,2:0,3,0,4
chrX	79947490	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.569:35:9,12:4,8:11,4,16,4
chrX	79989094	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chrX	79991590	.	T	TA	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.100:56:29,4:19,1:11,39,3,3
chrX	79999796	.	T	TCAC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAC;STR;TLOD=91.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,0,21
chrX	80064478	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=123,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.113:46:17,1:21,0:10,31,4,1
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chrX	82764554	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,19;MFRL=198,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:82764554_T_C:82764554:0,2,0,1
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chrX	82764560	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=221,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1|0:82764554_T_C:82764554:0,2,0,1
chrX	82764563	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=221,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:82764554_T_C:82764554:0,2,0,1
chrX	82764564	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=198,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:82764554_T_C:82764554:0,2,0,1
chrX	82764567	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:82764554_T_C:82764554:0,1,0,1
chrX	83116175	.	C	T	.	.	DP=138;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:128,5:0.044:133:63,0:61,5:72,56,0,5
chrX	83124802	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=184.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,26:0,26:0,0,51,1
chrX	83141579	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:2,8:5,5:3,4,3,10
chrX	83319457	.	TA	T,TAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31,33;MFRL=279,148,61;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=8.70,3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.457,0.329:7:1,2,0:0,2,2:0,1,0,6
chrX	83320017	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.470:49:15,12:11,11:15,11,16,7
chrX	83320182	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chrX	83351385	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,7:5,3:0,8,1,9
chrX	83357294	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chrX	83361539	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=172,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:83361539_T_A:83361539:0,3,0,1
chrX	83361547	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:83361539_T_A:83361539:0,2,0,1
chrX	83362100	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:4,0:14,2:1,17,0,2
chrX	83371222	.	T	G	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=164.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,54:0.509:106:29,35:23,19:25,27,37,17
chrX	83403148	.	CA	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=145,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.187:35:14,0:9,6:7,22,0,6
chrX	83403178	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:8,3:2,10:0,10,0,13
chrX	83442983	.	CCCG	C,CCCGCCG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33,32;MFRL=172,245,212;MMQ=60,60,60;MPOS=20,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=CCG;STR;TLOD=3.45,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.336,0.330:3:0,1,0:1,0,1:0,1,0,2
chrX	83480764	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.617:32:6,13:6,7:3,9,9,11
chrX	83588660	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=209,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chrX	84258843	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,6:0,13:0,0,18,2
chrX	84309334	.	CT	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.086:55:28,2:21,1:33,18,4,0
chrX	84349941	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.317:39:12,5:15,7:18,9,6,6
chrX	84510547	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,0:10,2:5,12,0,2
chrX	84520059	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:7,6:3,8:10,0,14,0
chrX	84520105	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,27:0.538:50:17,16:6,11:20,3,20,7
chrX	84534383	.	A	C	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=219.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,88:0.978:90:0,37:2,50:1,1,72,16
chrX	84534571	.	T	TTA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.120:22:10,1:10,1:0,20,0,2
chrX	84562118	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:5,5:9,11:12,2,16,0
chrX	85166207	.	AAT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=153,169;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:13,2:9,1:25,1,3,0
chrX	85166221	.	AAT	A,AATAT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,32,33;MFRL=153,136,121;MMQ=60,60,44;MPOS=24,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=AT;STR;TLOD=9.63,8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,6:0.171,0.237:26:10,2,4:6,2,1:16,0,9,1
chrX	85236824	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.269:30:8,2:7,5:2,20,1,7
chrX	85282415	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.480:29:8,8:7,5:14,1,14,0
chrX	85906213	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.663:19:3,9:3,3:1,5,6,7
chrX	85994683	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chrX	86071151	.	C	G	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=144.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,51:0.627:81:14,31:15,17:8,22,11,40
chrX	86869103	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,6:4,3:0,5,0,9
chrX	86869348	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=123,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chrX	86872866	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:5,0,7,0
chrX	86873117	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:14,0:14,3:17,11,1,2
chrX	86887124	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
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chrX	90692498	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=147,151;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.051:57:22,2:31,0:0|1:90692492_A_T:90692492:38,17,2,0
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chrX	100075747	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,37;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:4,1:0|1:100075741_T_G:100075741:0,10,0,2
chrX	100077193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:4,0,4,0
chrX	100098355	.	TAAG	T	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=319.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,76:0.988:76:0,34:0,42:0,0,62,14
chrX	100104490	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=214,408;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100104490_G_GC:100104490:0,1,1,0
chrX	100104494	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=214,408;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100104490_G_GC:100104490:0,1,1,0
chrX	100104497	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=214,408;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100104490_G_GC:100104490:0,1,1,0
chrX	100105008	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chrX	100105418	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chrX	100125862	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100125862_T_A:100125862:0,0,0,1
chrX	100125865	.	A	AACAGGTAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100125862_T_A:100125862:0,0,0,1
chrX	100183340	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.232:31:10,2:9,0:0|1:100183340_T_A:100183340:1,23,7,0
chrX	100183344	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,7:0.240:30:10,2:10,2:0|1:100183340_T_A:100183340:1,22,7,0
chrX	100183347	.	CAT	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=155,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.231:28:9,3:10,2:0|1:100183340_T_A:100183340:0,22,6,0
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chrX	100357485	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=167,178;MMQ=40,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.809:8:0,3:1,4:0|1:100357481_T_C:100357481:0,1,0,7
chrX	100375370	.	TA	T	.	.	DP=106;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=99,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=244.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,89:0.967:92:1,46:1,42:1,2,44,45
chrX	100375865	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=18,24;MFRL=240,161;MMQ=40,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.544:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chrX	100387337	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=94.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,10:0,0,10,18
chrX	100387548	.	T	TGCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:100387548_T_TGCA:100387548:0,3,0,1
chrX	100387549	.	TTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:100387548_T_TGCA:100387548:0,3,0,1
chrX	100387557	.	A	ACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:100387548_T_TGCA:100387548:0,3,0,1
chrX	100395663	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,17,6
chrX	100400023	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,12,0
chrX	100416623	.	A	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=253.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.986:71:0,36:0,34:0,0,3,68
chrX	100503657	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=91,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:100503657_T_TG:100503657:0,4,0,1
chrX	100503659	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=91,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:100503657_T_TG:100503657:0,4,0,1
chrX	100505617	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,7:2,2:2,5,4,5
chrX	100505881	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:6,3:0,1:0|1:100505881_C_G:100505881:3,3,2,2
chrX	100505885	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:5,3:0,1:0|1:100505881_C_G:100505881:3,3,2,2
chrX	100511098	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=75,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chrX	100514986	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:8,5:3,4:9,2,9,0
chrX	100530224	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:6,12,0,2
chrX	100530387	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=222,152;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chrX	100531204	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=209,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:5,0,3,1
chrX	100531413	.	TTCATCC	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCATCC;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.396:21:5,2:6,6:4,9,4,4
chrX	100532924	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chrX	100532985	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chrX	100604757	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chrX	100609547	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chrX	100615025	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=115,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:5,1:0,1:4,1,0,2
chrX	100615478	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chrX	100630325	.	A	AGAGTGCCTTGGAGCAGGGATTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:100630325_A_AGAGTGCCTTGGAGCAGGGATTG:100630325:0,3,0,1
chrX	100630329	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:100630325_A_AGAGTGCCTTGGAGCAGGGATTG:100630325:0,3,0,1
chrX	100630350	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100630350_C_CAT:100630350:0,1,0,1
chrX	100630352	.	T	TAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100630350_C_CAT:100630350:0,1,0,1
chrX	100652715	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:8,2:25,0:35,0,2,0
chrX	100656695	.	T	A	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,4:0.068:71:28,2:34,2:0|1:100656695_T_A:100656695:27,40,1,3
chrX	100656698	.	G	GAAGCTAGGGATTTATGCAGAT	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=140,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,4:0.071:68:29,2:34,2:0|1:100656695_T_A:100656695:26,38,1,3
chrX	100656711	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.063:61:30,2:26,1:29,29,0,3
chrX	100666921	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=20,10;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.144:47:10,0:10,1:27,12,8,0
chrX	100807909	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,3:4,4:7,4,4,3
chrX	100809670	.	G	GCA	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,7:0.103:68:22,0:17,0:34,27,0,7
chrX	100809673	.	G	GA,A,GAA,GAAA	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=33,33,32,33,33;MFRL=160,158,144,145,127;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=20,20,22,29;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=7.54,17.87,31.71,6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:3,7,17,20,7:0.128,0.257,0.414,0.136:54:1,2,9,8,3:1,2,8,5,3:2,1,23,28
chrX	101095895	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,142;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.464:37:10,9:9,8:12,8,9,8
chrX	101096364	.	G	GTGGTGGTGA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,162;MMQ=43,36;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGGTGGTGA;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:17,2:12,0:24,5,2,0
chrX	101097618	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=165,143;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:1,2:0|1:101097618_T_C:101097618:5,0,2,0
chrX	101097619	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.331:7:3,0:2,2:1|0:101097618_T_C:101097618:5,0,2,0
chrX	101141776	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chrX	101395780	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.934:11:0,5:0,3:0,0,6,5
chrX	101409254	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=107,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.179:23:3,2:7,1:5,14,0,4
chrX	101623586	.	ATGG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TGG;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.826:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	101859122	.	G	GATGTGGTGGTGCATGCCTGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	101911731	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=154,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:20,3:12,0:25,8,3,0
chrX	101913320	.	G	GTA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TA;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.088:31:18,1:11,1:27,2,2,0
chrX	101913597	.	TAA	T,TA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,30,30;MFRL=165,152,158;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=4.09,27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,14:0.138,0.484:29:3,3,9:5,0,2:4,7,4,14
chrX	102006877	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,30,33,20;MFRL=143,119,165,135;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,20,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=20,17,18,19;RU=T;STR;TLOD=4.38,3.11,7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,3,7:0.124,0.138,0.312:23:3,2,0,1:4,0,2,3:4,6,2,11
chrX	102007851	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=35,34;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:102007851_CCA_C:102007851:0,3,0,1
chrX	102007856	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:102007851_CCA_C:102007851:0,3,0,1
chrX	102007858	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=35,31;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:102007851_CCA_C:102007851:0,3,0,1
chrX	102007859	.	GA	AG	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=24,32;MFRL=205,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:102007859_GA_AG:102007859:0,2,0,2
chrX	102007860	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=17,29;MFRL=226,183;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:102007851_CCA_C:102007851:0,1,0,1
chrX	102007862	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=17,30;MFRL=205,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:102007859_GA_AG:102007859:0,2,0,2
chrX	102007867	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=34,28;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:102007859_GA_AG:102007859:0,1,0,2
chrX	102007876	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102007876_A_T:102007876:0,0,0,1
chrX	102007882	.	TGTATTTTTAGTAGA	T	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102007876_A_T:102007876:0,0,0,1
chrX	102007902	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:102007876_A_T:102007876:0,0,0,1
chrX	102007905	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=0,31;MFRL=192,226;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:102007876_A_T:102007876:1,0,0,1
chrX	102007910	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=15,31;MFRL=192,226;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:102007876_A_T:102007876:1,0,0,1
chrX	102193032	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=144,123;MMQ=58,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.475:27:8,3:4,5:0|1:102193032_A_C:102193032:0,14,12,1
chrX	102193036	.	CAGAG	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=146,123;MMQ=57,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=37.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,13:0.459:28:7,5:5,6:0|1:102193032_A_C:102193032:0,15,12,1
chrX	102193044	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=142,134;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.336:22:8,0:5,1:0|1:102193032_A_C:102193032:0,15,7,0
chrX	102193048	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=142,46;MMQ=52,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,1:5,0:0|1:102193032_A_C:102193032:0,15,4,0
chrX	102337765	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=112,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:8,0:8,3:0|1:102337765_G_A:102337765:4,13,0,3
chrX	102337770	.	A	AGTCCCCT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,38;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,0:8,3:0|1:102337765_G_A:102337765:4,15,0,3
chrX	102529131	.	C	CG	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=143,208;MMQ=50,47;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.070:54:20,1:25,1:0|1:102529131_C_CG:102529131:15,36,3,0
chrX	102529139	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=145,208;MMQ=50,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,3:0.069:55:14,0:22,0:0|1:102529131_C_CG:102529131:15,37,3,0
chrX	102529145	.	GC	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=148,208;MMQ=47,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.074:51:19,0:24,0:0|1:102529131_C_CG:102529131:12,36,3,0
chrX	102586871	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,2:9,0:13,12,2,0
chrX	102757748	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:13,1:19,2:13,21,0,3
chrX	102831445	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.068:68:42,0:22,4:10,54,3,1
chrX	102831527	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=240,184;MMQ=46,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chrX	102831537	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=242,237;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,2:1,0:0,3,0,2
chrX	102831561	.	AT	GG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=241,242;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102831561_AT_GG:102831561:0,1,0,1
chrX	102831565	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,27;MFRL=241,242;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102831561_AT_GG:102831561:0,1,0,1
chrX	102831569	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=241,242;MMQ=60,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:102831561_AT_GG:102831561:0,1,0,1
chrX	102832205	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:1,14,0,2
chrX	102931452	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:17,3:24,0:21,20,2,1
chrX	102974114	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=137,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:20,2:20,1:18,24,0,3
chrX	103219004	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,221;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:4,3:5,0,6,0
chrX	103267443	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103267443_A_T:103267443:0,0,0,1
chrX	103267444	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103267443_A_T:103267443:0,0,0,1
chrX	103268333	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,0,2
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chrX	104464346	.	C	CAGTCCTGTTACATCAGTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=63,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:2,0:3,3,1,1
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chrX	105137880	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:18,0:12,2:13,17,0,2
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chrX	105179132	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:4,0,5,0
chrX	105278333	.	TG	AA	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.059:65:31,0:29,3:32,30,0,3
chrX	105453033	.	CACACACACAAT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=231,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chrX	105453039	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=224,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:105453039_C_CAT:105453039:0,2,0,1
chrX	105453042	.	AAT	A,ACCCCTAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31,29;MFRL=231,234,216;MMQ=60,60,60;MPOS=3,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.43,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chrX	105453043	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=231,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	105453046	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=216,234;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:105453039_C_CAT:105453039:0,3,0,1
chrX	106028279	.	GT	G,GTT	.	.	DP=106;ECNT=1;MBQ=34,36,35;MFRL=149,124,134;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.12,14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:71,5,12:0.061,0.133:88:28,2,5:41,3,7:63,8,15,2
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chrX	106846480	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.159:27:15,3:6,1:21,2,3,1
chrX	106888333	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chrX	107169309	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.295:26:4,1:6,1:10,9,7,0
chrX	107225424	.	TCC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:107225424_TCC_T:107225424:0,0,0,1
chrX	107225429	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:107225424_TCC_T:107225424:0,0,0,1
chrX	107320612	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,1:12,1:4,18,0,2
chrX	107328436	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,0,27
chrX	107330842	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=168,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,2:5,4:12,0,6,0
chrX	107331894	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=140,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:7,10:6,6:12,1,17,0
chrX	107332133	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:3,5:5,3:0,9,0,10
chrX	107334783	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:3,18,0,2
chrX	107393330	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,2:1,3:4,1,5,0
chrX	107396365	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,28:0.475:59:17,16:13,11:3,28,3,25
chrX	107408816	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=327,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chrX	107415825	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chrX	107418281	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:4,2,5,0
chrX	107420287	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:1,1,0,4
chrX	107423674	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=161,183,138;MMQ=60,60,60;MPOS=26,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=AC;STR;TLOD=13.05,4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,2:0.517,0.296:8:1,1,1:0,4,1:1,0,7,0
chrX	107430391	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.639:26:8,7:1,8:5,4,8,9
chrX	107430579	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=195,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chrX	107437848	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:9,2:3,3:2,11,1,4
chrX	107455014	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,16:0,0,4,24
chrX	107463090	.	CCCATATTGTATT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=230,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chrX	107821225	.	T	C	.	.	DP=132;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,4:0.039:124:68,1:49,3:42,78,0,4
chrX	107827760	.	GT	G,GTT	.	.	DP=141;ECNT=1;MBQ=31,31,20;MFRL=126,127,117;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.70,14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:74,9,15:0.097,0.141:98:30,3,4:31,3,3:16,58,5,19
chrX	107844758	.	CTT	C,CT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=19,17,19;MFRL=159,179,176;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=5.51,11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,7:0.214,0.400:18:1,0,2:1,2,1:0,7,0,11
chrX	107845037	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=150,164;MMQ=60,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:11,3:24,1:36,1,3,1
chrX	107845039	.	AG	CA,CG	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,34,33;MFRL=151,99,164;MMQ=60,27,40;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.84,3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,2,2:0.065,0.067:42:11,2,1:24,0,1:36,2,3,1
chrX	107846123	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:15,3:21,0:36,1,3,0
chrX	107898785	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,314;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	107918007	.	C	CTT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=104,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=T;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:2,0:0,1:2,4,2,1
chrX	108887461	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,19;MFRL=122,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:1,3,0,1
chrX	108887476	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=14,12;MFRL=153,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:108887476_T_G:108887476:0,3,0,1
chrX	108887478	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=212,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chrX	108887486	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,19;MFRL=181,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:108887476_T_G:108887476:0,2,0,1
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chrX	108887489	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=216,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:108887487_A_AGTCCTCGGGTGG:108887487:0,2,0,1
chrX	108904729	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=196.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,28:0,27:0,0,52,5
chrX	108917757	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=168,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:7,8:4,7:0,11,0,15
chrX	108917773	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=172,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,4:3,4:0,12,0,8
chrX	109247416	.	GGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109247416_GGCA_G:109247416:0,1,0,1
chrX	109247423	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109247416_GGCA_G:109247416:0,1,0,1
chrX	109298553	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:18,1:15,1:16,17,2,0
chrX	109387928	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,3:0,0,9,0
chrX	109507669	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.152:28:10,0:14,4:23,1,4,0
chrX	109694562	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:13,0:13,5:16,10,0,5
chrX	109697013	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chrX	109922745	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=220,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chrX	110406205	.	GGAA	G	.	.	DP=140;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAA;STR;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,5:0.058:101:32,1:50,4:54,42,3,2
chrX	110416182	.	TTC	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:19,3:11,1:30,2,4,0
chrX	110435484	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:11,1:4,2:0,16,0,3
chrX	110492381	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	110494521	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=17,14;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.191:17:3,0:4,0:0|1:110494521_G_T:110494521:4,10,0,3
chrX	110494526	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=15,16;MFRL=103,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.194:17:5,0:2,1:3,11,1,2
chrX	110494528	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=18,10;MFRL=102,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.202:16:2,0:2,0:0|1:110494521_G_T:110494521:4,9,0,3
chrX	110494539	.	A	ACAGATACAT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=143,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:110494539_A_ACAGATACAT:110494539:0,11,0,2
chrX	110494541	.	A	ATCAATGGAATACAAT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=143,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,1:3,0:0|1:110494539_A_ACAGATACAT:110494539:0,11,0,2
chrX	110496357	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.156:22:9,3:10,0:10,9,3,0
chrX	110497423	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,2:2,2:8,0,4,0
chrX	110555959	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=112,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.144:32:12,4:16,0:4,24,2,2
chrX	110653502	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=118,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:5,13,0,2
chrX	110987985	.	C	CAAGGTCAATTCCTTCAGCAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	110995895	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=149,236;MMQ=60,50;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:6,0:8,2:14,0,2,0
chrX	110995924	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:11,4:21,1:33,1,5,0
chrX	111019954	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:21,3:12,0:24,10,3,0
chrX	111025102	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=172,82;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,1:8,0:0|1:111025102_T_C:111025102:14,0,1,1
chrX	111025105	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=172,82;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:111025102_T_C:111025102:14,0,1,1
chrX	111025113	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=171,82;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,2:7,0:0|1:111025102_T_C:111025102:16,0,1,1
chrX	111025119	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=172,82;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:0|1:111025102_T_C:111025102:16,0,1,1
chrX	111090308	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,171;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:13,0,2,0
chrX	111156051	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:111156051_G_A:111156051:0,0,0,1
chrX	111156056	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111156051_G_A:111156051:0,0,0,1
chrX	111156059	.	A	ATG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111156051_G_A:111156051:0,0,0,1
chrX	111156062	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111156051_G_A:111156051:0,0,0,1
chrX	111700512	.	ACG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=200,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:111700512_ACG_A:111700512:0,3,0,1
chrX	111700515	.	A	ACTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=200,181;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:111700512_ACG_A:111700512:0,3,0,1
chrX	112024405	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=144,142;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:0,0:0|1:112024405_T_C:112024405:0,3,0,1
chrX	112024408	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=144,142;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:112024405_T_C:112024405:0,3,0,1
chrX	112048129	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=143,143;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:0,0:0|1:112048129_CAG_C:112048129:2,1,2,0
chrX	112048135	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=143,143;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,0:0|1:112048129_CAG_C:112048129:2,1,2,0
chrX	112048139	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=143,143;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,1:1,0:0|1:112048129_CAG_C:112048129:2,1,2,0
chrX	113949844	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:113949844_A_T:113949844:0,3,0,1
chrX	113949853	.	GG	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=220,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:113949844_A_T:113949844:0,4,0,1
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chrX	114880423	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=111.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,39:0.505:77:16,20:22,18:21,17,19,20
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chrX	114880937	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chrX	115306244	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=115,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:6,6:4,6:2,8,3,9
chrX	115575989	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=253,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chrX	115584374	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:0,13,0,4
chrX	115584402	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=220,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chrX	115586700	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:1,0:6,8:0,7,0,8
chrX	117032973	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=110,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.647:32:6,15:5,6:4,7,13,8
chrX	117035704	.	AATT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ATT;STR;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:4,1:0,7:4,0,8,0
chrX	117035914	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:7,1:13,3:2,18,0,4
chrX	117053499	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,26:0.456:57:13,11:17,14:18,13,16,10
chrX	117520365	.	AAT	A	.	.	DP=258;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:124,8:0.066:132:62,4:58,4:54,70,4,4
chrX	117521338	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,37:0.474:78:15,16:26,20:23,18,24,13
chrX	117521390	.	C	A	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,35:0.507:69:17,13:16,22:10,24,10,25
chrX	117527020	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=118,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.490:31:11,12:3,3:11,5,9,6
chrX	117527945	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,3:1,3:0|1:117527945_C_G:117527945:5,0,6,0
chrX	117527965	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:2,5:2,4:0|1:117527945_C_G:117527945:5,0,11,0
chrX	117527970	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=53.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.653:21:5,6:2,8:0|1:117527945_C_G:117527945:7,0,13,1
chrX	117528056	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,40:0.612:65:13,21:12,19:13,12,21,19
chrX	117528078	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,4:0.069:69:34,4:28,0:29,36,2,2
chrX	117530912	.	GT	G,TT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,34,27;MFRL=148,157,90;MMQ=60,60,60;MPOS=11,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.27,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,5,3:0.209,0.137:24:6,2,3:10,3,0:16,0,7,1
chrX	117531099	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=104.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,14:0,16:0,0,1,30
chrX	117532516	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=65.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.602:36:6,9:8,11:0,14,0,22
chrX	117544746	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:9,0,4,0
chrX	117566782	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,32:0.439:73:17,15:23,16:19,22,20,12
chrX	117577477	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:5,6:7,7:11,1,8,5
chrX	117578555	.	ATTTCTTT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=195,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTCTTT;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chrX	117582768	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.499:30:7,10:8,5:14,1,14,1
chrX	117677651	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=188,177;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chrX	117680173	.	CAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	117727327	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:0,8,1,6
chrX	117742356	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,14:0,13:0,0,1,26
chrX	117789046	.	T	TCCCAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=238,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	117817266	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,4:3,8:0,7,0,12
chrX	117874898	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	117874953	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.241:15:7,1:5,1:9,3,3,0
chrX	117892291	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=196,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chrX	117910509	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=101,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:117910509_T_A:117910509:3,1,0,1
chrX	117910514	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=82,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:117910509_T_A:117910509:3,0,0,1
chrX	117910525	.	TGGAAGCTATGGCA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,1,0
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chrX	118227945	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:0,3,4,2
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chrX	118230595	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=60,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.436:28:5,5:10,7:10,6,8,4
chrX	118250372	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
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chrX	118284610	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,7:3,6:0,7,0,13
chrX	118370690	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,19;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.215:29:6,0:7,0:1,22,0,6
chrX	118585943	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.401:38:11,8:9,6:16,7,11,4
chrX	118602663	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,20;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.579:7:0,1:1,1:0,3,0,4
chrX	118603550	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:4,0,4,1
chrX	118603706	.	A	AG	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=145,125;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:10,1:15,2:0|1:118603706_A_AG:118603706:10,17,3,1
chrX	118603713	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=145,125;MMQ=60,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,4:0.139:34:13,2:16,2:0|1:118603706_A_AG:118603706:11,19,3,1
chrX	118603729	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=146,134;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:14,2:10,2:0|1:118603706_A_AG:118603706:13,13,3,1
chrX	118603742	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=146,130;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:14,2:11,1:0|1:118603706_A_AG:118603706:15,15,4,1
chrX	118603747	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=146,128;MMQ=60,32;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.146:32:14,2:11,2:0|1:118603706_A_AG:118603706:17,11,3,1
chrX	118603773	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=146,128;MMQ=60,32;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:20,2:11,2:20,13,2,2
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chrX	118604399	.	CT	GG	.	.	DP=58;ECNT=7;MBQ=34,35;MFRL=153,0;MMQ=60,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,5:0.103:56:21,2:28,2:0|1:118604399_CT_GG:118604399:19,32,3,2
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chrX	118604416	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=156,59;MMQ=60,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:15,0:24,2:0|1:118604399_CT_GG:118604399:13,29,1,1
chrX	118604428	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=161,59;MMQ=60,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:13,0:19,2:9,24,1,1
chrX	118604436	.	T	C,A	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=0,28,31;MFRL=0,167,59;MMQ=60,60,35;MPOS=18,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=89.55,5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,28,2:0.882,0.088:30:0,12,0:0,16,2:0,0,9,21
chrX	118604536	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,4:5,2:0,5,0,6
chrX	118604553	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,3:0,0,0,7
chrX	118605001	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=178,152;MMQ=60,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,2:8,1:0|1:118605001_G_T:118605001:1,16,0,3
chrX	118605012	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=178,158;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:6,3:9,1:0|1:118605001_G_T:118605001:1,16,0,4
chrX	118605017	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=166,158;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:7,3:8,1:0|1:118605001_G_T:118605001:1,15,0,4
chrX	118605023	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=178,158;MMQ=60,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:8,3:9,1:0|1:118605001_G_T:118605001:1,16,0,4
chrX	118679315	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=155,112;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chrX	118679331	.	GAC	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:3,0:4,2,3,1
chrX	118679573	.	TTGGG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=167,111;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:118679573_TTGGG_T:118679573:0,4,0,1
chrX	118679581	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=167,111;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:118679573_TTGGG_T:118679573:0,4,0,1
chrX	118679587	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=167,111;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:118679573_TTGGG_T:118679573:0,4,0,1
chrX	118679588	.	G	GATC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:118679588_G_GATC:118679588:0,4,0,1
chrX	118679589	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:118679588_G_GATC:118679588:0,4,0,1
chrX	118699320	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=125.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,17:0,0,10,26
chrX	118716522	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=155,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,1:7,2:14,3,2,1
chrX	118750599	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,152;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:11,0,2,0
chrX	118754064	.	CAA	C,CA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,36,35;MFRL=143,116,147;MMQ=60,60,60;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=13.06,47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,10,22:0.281,0.667:33:1,2,6:0,7,15:0,1,5,27
chrX	118767271	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:6,5:4,2:8,2,7,1
chrX	118774833	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:118774833_GG_TT:118774833:1,2,0,1
chrX	118774835	.	G	GTTCCCTAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:118774833_GG_TT:118774833:1,2,0,1
chrX	118774837	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chrX	118783881	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,2:5,3:8,5,3,2
chrX	118797416	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=91,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,0:0,4,3,0
chrX	118892888	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	118894013	.	CTC	GGG	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.097:44:14,0:21,0:0|1:118894013_CTC_GGG:118894013:19,21,4,0
chrX	118894021	.	GCCAT	G	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=152,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:15,0:20,1:0|1:118894021_GCCAT_G:118894021:20,21,3,0
chrX	118894027	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=152,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.098:39:12,0:17,0:0|1:118894021_GCCAT_G:118894021:14,22,3,0
chrX	118894034	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=146,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:11,0:16,0:0|1:118894013_CTC_GGG:118894013:12,21,4,0
chrX	118894222	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=223,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:3,2:3,5:0,7,0,7
chrX	118969075	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=216,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chrX	118974507	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:5,0,3,0
chrX	118977332	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chrX	118985598	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=128.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,19:0,18:0,0,3,34
chrX	118985629	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=193,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,1:0,8,0,5
chrX	119005705	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chrX	119054001	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chrX	119068393	.	CAA	C,CAAAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35,34;MFRL=0,201,172;MMQ=60,40,40;MPOS=26,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=25,23,28;RU=A;STR;TLOD=4.85,7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.340,0.546:6:0,1,2:0,1,2:0,0,6,0
chrX	119070411	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=176,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.360:30:7,5:11,3:1,18,1,10
chrX	119387833	.	C	CTGA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TGA;STR;TLOD=86.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.964:22:0,10:0,9:0,0,14,8
chrX	119390643	.	ATT	A,AT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=18,32,30;MFRL=159,150,100;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.86,7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,4,7:0.119,0.182:38:2,0,2:10,3,4:4,23,2,9
chrX	119394903	.	CGTTAG	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.421:29:8,5:9,7:1,16,1,11
chrX	119394904	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.961:19:0,9:0,10:0,0,1,18
chrX	119402264	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=154,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:2,2:10,5:3,9,2,5
chrX	119510144	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	119589489	.	G	GAGTTGTACCACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chrX	119669583	.	AGAAG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=150,195;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:2,1:0|1:119669583_AGAAG_A:119669583:7,0,3,0
chrX	119669592	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=150,195;MMQ=60,49;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:3,1:0|1:119669583_AGAAG_A:119669583:7,0,3,0
chrX	119738157	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.441:11:4,2:1,3:0|1:119738157_T_G:119738157:4,2,0,5
chrX	119738161	.	G	GGGCCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=36,13;MFRL=130,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.524:11:4,2:0,0:0|1:119738157_T_G:119738157:3,2,0,6
chrX	119760629	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,14:0.341:42:15,7:13,7:14,14,10,4
chrX	119760720	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.429:40:13,10:9,7:8,15,7,10
chrX	122318386	.	A	AG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=89,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=114.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,32:0.937:34:1,16:0,13:1,1,22,10
chrX	122336600	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,7:0,2:0,0,0,11
chrX	122551676	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,317;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	122616962	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=189,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:1,0:0,1:1,0,0,2
chrX	122757898	.	A	AT	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,4:0.065:74:34,3:34,0:45,25,3,1
chrX	122770087	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=246,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:122770087_C_T:122770087:0,1,0,1
chrX	122770088	.	A	ATGATTAATGAAAGAAGAATTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=230,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:122770087_C_T:122770087:0,2,0,1
chrX	122770090	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=230,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:122770087_C_T:122770087:0,2,0,1
chrX	122829800	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:13,3:17,0:31,0,3,0
chrX	123034596	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=152,135;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:24,0:20,2:0,44,0,2
chrX	123034607	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:22,1:17,2:0,39,0,3
chrX	123041043	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=183,162;MMQ=46,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.561:39:7,8:10,14:0,17,2,20
chrX	123041111	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=188,205;MMQ=46,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chrX	123171525	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:18,0:13,2:1,30,0,2
chrX	123183965	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=165,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:6,0,5,0
chrX	123184027	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:6,3:4,6:9,2,8,1
chrX	123191922	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chrX	123195035	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,12,1
chrX	123195593	.	C	CTTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=25,28;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.917:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chrX	123202318	.	C	CTATA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=TA;STR;TLOD=85.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:9,10:7,8:16,0,22,0
chrX	123538802	.	TAAACAAAC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AAAC;STR;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.724:12:2,3:1,6:3,0,9,0
chrX	123554105	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:5,11:6,9:11,0,18,2
chrX	123556121	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:9,1,2,0
chrX	123587110	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chrX	123615545	.	G	GTA,GTATA,GTATATATA,GTATATATATATA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35,33,34,34;MFRL=0,163,127,115,141;MMQ=60,60,60,50,40;MPOS=23,15,25,14;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=8,9,10,12,14;RU=TA;STR;TLOD=4.83,17.88,4.71,5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:0,2,7,2,3:0.151,0.438,0.161,0.203:14:0,1,3,1,1:0,1,3,1,2:0,0,14,0
chrX	124097587	.	A	ATTCCTGCTGGTAATCT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,234;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:4,2:13,0:5,12,0,2
chrX	125299552	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:18,1:18,2:21,16,0,3
chrX	125685455	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,2:6,1:3,8,1,2
chrX	125953932	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,6,12
chrX	125955466	.	T	TTTTAATTAGGTTTTTTGCTTTCTTA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=162,288;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chrX	125955473	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125955473_T_C:125955473:0,1,0,1
chrX	125955479	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125955473_T_C:125955473:0,1,0,1
chrX	125955480	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125955473_T_C:125955473:0,1,0,1
chrX	125955482	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125955473_T_C:125955473:0,1,0,1
chrX	125955485	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125955473_T_C:125955473:0,1,0,1
chrX	125955486	.	G	GGCCC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125955473_T_C:125955473:0,1,0,1
chrX	128615109	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:9,8,0,2
chrX	128674639	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.754:15:2,4:2,6:4,0,11,0
chrX	128710621	.	TTTTGG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128710621_TTTTGG_T:128710621:0,0,0,1
chrX	128710628	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128710621_TTTTGG_T:128710621:0,0,0,1
chrX	128782689	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,77;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:15,3:24,0:20,19,3,0
chrX	128875978	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=130,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chrX	128922113	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	128957640	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chrX	129045656	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chrX	129053250	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,2:5,0:7,6,0,2
chrX	129053541	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:129053541_G_C:129053541:0,2,0,1
chrX	129053543	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:129053541_G_C:129053541:0,2,0,1
chrX	129058737	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,5,0
chrX	129148456	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=128,99;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:5,0:7,2:5,8,0,2
chrX	129149474	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:8,1:16,1:13,12,2,0
chrX	129162901	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chrX	129173280	.	A	AGGTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129173280_A_AGGTTT:129173280:0,0,0,1
chrX	129173283	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129173280_A_AGGTTT:129173280:0,0,0,1
chrX	129186012	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,3:3,5:2,7,2,6
chrX	129190158	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,131;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:9,1:4,1:3,10,0,2
chrX	129200756	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=179,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.177:20:8,1:9,0:0|1:129200756_T_G:129200756:17,0,0,3
chrX	129200761	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=169,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.171:21:9,0:9,1:0|1:129200756_T_G:129200756:18,0,0,3
chrX	129201598	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	129208465	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=15111456,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chrX	129263437	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=126,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chrX	129265871	.	G	GTTGAAGAAAAGTTATCATTCTGTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chrX	129269980	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chrX	129279648	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=195,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chrX	129338973	.	G	C,GA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,20,33;MFRL=172,198,176;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.27,10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,2,8:0.091,0.307:25:7,0,6:6,1,1:13,2,6,4
chrX	129343603	.	GA	G	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,6:0.082:83:39,3:22,3:60,17,6,0
chrX	129354240	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:129354240_C_A:129354240:2,0,2,0
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chrX	129364571	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,3:0.051:75:39,0:33,3:33,39,1,2
chrX	129370411	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:13,3:15,1:27,4,4,0
chrX	129483209	.	CT	C,CTT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,33,28;MFRL=165,135,167;MMQ=60,60,60;MPOS=16,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.78,4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,5,5:0.115,0.129:40:12,3,0:16,2,3:28,2,8,2
chrX	129493192	.	T	TGGCG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=220,272;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:129493192_T_TGGCG:129493192:0,3,0,1
chrX	129493197	.	CATGG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=220,272;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:129493192_T_TGGCG:129493192:0,3,0,1
chrX	129493210	.	ACA	CTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=220,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chrX	129546260	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:3,3:2,1:5,1,4,0
chrX	129546778	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:7,9:10,9:5,12,3,15
chrX	129630732	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,9;MFRL=202,194;MMQ=45,36;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:0,0:3,2:1,2,0,6
chrX	129631533	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,10;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.215:23:5,0:4,0:4,14,0,5
chrX	129631539	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=19,29;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.309:14:1,2:3,1:0,10,0,4
chrX	129804002	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:11,0:6,2:15,3,0,2
chrX	130218107	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chrX	130218196	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=123,182;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:11,0:8,3:13,8,0,3
chrX	130412178	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chrX	130412788	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:130412788_C_CG:130412788:0,2,0,1
chrX	130412789	.	TTGAACC	T	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:130412789_TTGAACC_T:130412789:0,2,0,1
chrX	130412791	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=34,35;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130412788_C_CG:130412788:0,1,0,1
chrX	130412792	.	AAC	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=31,29;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130412788_C_CG:130412788:0,1,0,1
chrX	130412797	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:130412788_C_CG:130412788:0,2,0,1
chrX	130412799	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=30,31;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130412789_TTGAACC_T:130412789:0,1,0,1
chrX	130412800	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:130412788_C_CG:130412788:0,0,0,1
chrX	130412803	.	CAGA	C	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:130412789_TTGAACC_T:130412789:0,1,0,1
chrX	130412807	.	TCACA	T	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:130412789_TTGAACC_T:130412789:0,0,0,1
chrX	130412813	.	TGCCCA	T	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:130412789_TTGAACC_T:130412789:0,0,0,1
chrX	130412824	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:130412789_TTGAACC_T:130412789:0,0,0,1
chrX	130678767	.	TGGC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,201;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:8,0:9,10,3,0
chrX	131203438	.	CATATATATAT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=208,162;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=AT;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.632:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chrX	131203783	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chrX	131231257	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=221.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,35:0,27:0,0,51,11
chrX	131231430	.	TACAC	T,TAC,TACACAC	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,33,31,30;MFRL=137,156,157,145;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,26,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=AC;STR;TLOD=6.40,9.10,5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,3,4,3:0.214,0.289,0.242:13:0,0,4,2:3,3,0,0:0,3,0,10
chrX	131348510	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chrX	131842592	.	T	TAACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=294,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131842592_T_TAACC:131842592:0,1,0,1
chrX	131842595	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=294,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131842592_T_TAACC:131842592:0,1,0,1
chrX	132458372	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,30810457;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:16,2:11,0:10,17,2,0
chrX	132458578	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,18;MFRL=202,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.883:6:0,1:1,1:0,1,0,5
chrX	132548738	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chrX	132670054	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chrX	132888227	.	A	AGTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chrX	133087328	.	CT	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=246,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chrX	133511862	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:8,1:9,3:0,22,0,5
chrX	133511988	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=114.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,18:0,14:0,0,32,2
chrX	133620474	.	G	GT,GTT	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=34,35,34;MFRL=133,140,188;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=T;STR;TLOD=23.60,6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,16,5:0.357,0.124:49:11,9,1:14,6,4:23,5,20,1
chrX	133680547	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=93.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,12:0,0,17,11
chrX	133921650	.	T	TGACGGAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chrX	133921651	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chrX	133921653	.	TTTTTTTTTTTTA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:1,1:1,0:0|1:133921653_TTTTTTTTTTTTA_T:133921653:0,2,0,1
chrX	133921673	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=226,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133921653_TTTTTTTTTTTTA_T:133921653:0,1,0,1
chrX	133948733	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34,33,34;MFRL=159,164,152,172;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,12,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,15,16,18;RU=A;STR;TLOD=3.54,3.69,4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,3,3,5:0.143,0.157,0.252:20:3,0,2,2:5,3,1,3:8,1,11,0
chrX	133963412	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chrX	133988253	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chrX	134025744	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chrX	134033226	.	GT	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.088:42:20,1:16,2:5,34,0,3
chrX	134493961	.	GA	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.094:51:22,1:23,3:6,41,0,4
chrX	134494512	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:7,6:8,5:11,4,9,3
chrX	134654818	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chrX	134708007	.	CT	C,CTT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,32,20;MFRL=130,167,147;MMQ=60,60,60;MPOS=17,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=14.43,9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,9,6:0.306,0.223:29:4,3,0:4,4,4:4,10,2,13
chrX	134711244	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,46;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:14,3:17,0:13,19,3,0
chrX	134948167	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=230,214;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chrX	134986768	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=192.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.978:44:0,16:0,28:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,6,38
chrX	134986769	.	ATT	A	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=192.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.978:44:0,15:0,28:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,6,38
chrX	134986772	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=182.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,14:0,27:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,6,35
chrX	134986775	.	CCA	C	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=173.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,12:0,24:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,6,33
chrX	134986780	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=169.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,12:0,23:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,6,32
chrX	134986781	.	G	GTATGTC	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=169.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.975:38:0,9:0,23:0|1:134986768_A_G:134986768:0,0,6,32
chrX	134987631	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134987631_T_TA:134987631:0,0,0,1
chrX	134987633	.	T	TTAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134987631_T_TA:134987631:0,0,0,1
chrX	134987635	.	G	GGTAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:134987631_T_TA:134987631:0,0,0,1
chrX	134988362	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=159,253;MMQ=60,28;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,2:3,4:3,8,0,6
chrX	134988393	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=74.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0,0,2,20
chrX	134990000	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.429:47:15,15:12,5:8,19,4,16
chrX	134990944	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chrX	134993589	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chrX	135055694	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.702:14:2,5:1,5:3,1,9,1
chrX	135080623	.	C	CT,CTT	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=148,145,180;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=94.84,7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,41,7:0.742,0.120:56:2,24,4:6,14,3:8,0,47,1
chrX	135292021	.	TC	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.125:37:13,3:15,2:25,7,3,2
chrX	135292022	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,135;MMQ=27,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.977:44:1,17:0,24:0,1,29,14
chrX	135314462	.	G	GAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:135314462_G_GAT:135314462:0,3,0,1
chrX	135314465	.	CACAGAAAAGAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=202,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:135314462_G_GAT:135314462:0,3,0,1
chrX	135322440	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chrX	135323452	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=226,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=151.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,50:0.963:51:1,24:0,24:0,1,6,44
chrX	135328309	.	TA	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.106:54:21,2:25,3:14,35,2,3
chrX	135429624	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.362:17:6,3:4,2:8,3,6,0
chrX	135430539	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:25,0:35,3:31,29,0,3
chrX	135488161	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0|1:135488161_G_C:135488161:0,3,0,1
chrX	135488166	.	C	CCCCACACTTGGCTAATTTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:135488161_G_C:135488161:0,3,0,1
chrX	135488169	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:135488161_G_C:135488161:0,3,0,1
chrX	135570743	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:135570743_T_A:135570743:0,4,0,1
chrX	135570747	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:135570743_T_A:135570743:0,3,0,1
chrX	135570750	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:135570743_T_A:135570743:0,3,0,1
chrX	135741185	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chrX	135767782	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,125;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:4,0,1,0
chrX	135790932	.	G	GA	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,6:0.083:65:19,0:37,4:14,45,1,5
chrX	135861520	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:13,4:6,0:15,4,4,0
chrX	135956218	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=215,207;MMQ=51,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:8,0,2,1
chrX	135956342	.	C	G	.	.	DP=132;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=135,172;MMQ=60,39;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,17:0.140:126:55,7:54,10:72,37,12,5
chrX	135956370	.	G	A	.	.	DP=167;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=133,162;MMQ=60,37;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:139,24:0.144:163:75,13:61,8:74,65,18,6
chrX	135956408	.	A	G	.	.	DP=153;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=135,148;MMQ=52,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,26:0.181:147:66,18:53,8:61,60,17,9
chrX	135960146	.	G	GAA	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,111;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,3:0.046:84:42,3:38,0:38,43,3,0
chrX	135960230	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,111;MMQ=60,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:22,3:23,0:13,34,1,2
chrX	135960247	.	T	TA	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=157,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.106:41:20,0:17,3:11,26,1,3
chrX	135961585	.	A	AT	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,7:0.124:48:10,2:24,3:10,31,1,6
chrX	135961586	.	TG	T	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=147,138;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,12:0.219:50:13,5:24,6:0|1:135961586_TG_T:135961586:9,29,2,10
chrX	135961587	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,53;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,67:0.986:67:0,29:0,37:1|0:135961586_TG_T:135961586:0,0,20,47
chrX	137749997	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chrX	138690009	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=168,249;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:16,0:14,4:0,30,0,4
chrX	138697246	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,4,16
chrX	138698652	.	GAA	G,GA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,34,17;MFRL=148,147,129;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.14,22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,23:0.143,0.748:30:1,1,2:1,3,0:2,1,2,25
chrX	138698665	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=136.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,12:0,19:0,0,3,31
chrX	138708531	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chrX	138713463	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chrX	138724725	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,3,16
chrX	138811003	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=111.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,19:0,15:0,0,26,9
chrX	138825675	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=184.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,25:0,26:0,0,47,4
chrX	138840029	.	GA	G,GAA	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=33,35,31;MFRL=153,138,103;MMQ=60,60,60;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=7.24,10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,6,7:0.131,0.162:46:9,2,2:16,4,3:3,30,2,11
chrX	138850673	.	A	ATATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:138850673_A_ATATT:138850673:0,1,0,1
chrX	138850676	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:138850673_A_ATATT:138850673:0,1,0,1
chrX	138870304	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:8,3:19,0:26,3,3,0
chrX	138897130	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=213.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.985:60:0,32:0,28:0,0,19,41
chrX	138899005	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,34:0.449:76:18,15:24,19:28,14,24,10
chrX	138901560	.	C	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,2:0.051:56:25,2:28,0:13,41,1,1
chrX	139040477	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:0,5,0,6
chrX	139587376	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,1:12,1:7,17,2,0
chrX	140335953	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,233;MMQ=23,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chrX	140336615	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chrX	140785714	.	C	G	.	.	DP=97;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=157,164;MMQ=55,36;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,11:0.122:96:52,4:31,6:48,37,11,0
chrX	140785739	.	A	C	.	.	DP=121;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=155,151;MMQ=53,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:95,24:0.207:119:55,10:33,10:0|1:140785739_A_C:140785739:64,31,23,1
chrX	140785741	.	A	C	.	.	DP=129;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=155,139;MMQ=53,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:95,20:0.179:115:57,10:32,10:0|1:140785739_A_C:140785739:64,31,19,1
chrX	140785855	.	A	G	.	.	DP=146;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=148,133;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=214.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,76:0.546:139:31,33:30,40:14,49,22,54
chrX	140786469	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=174,178;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:10,4:4,6:0|1:140786469_C_A:140786469:16,0,11,0
chrX	140786474	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,178;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,13:0.437:30:11,7:5,6:0|1:140786469_C_A:140786469:17,0,13,0
chrX	140786618	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,167;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,19:0.299:65:26,9:19,10:16,30,0,19
chrX	140969259	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,90;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:7,8,2,0
chrX	140983031	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=16,28;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.845:8:0,3:0,4:0,1,7,0
chrX	140983064	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,7:0,0,9,4
chrX	140994096	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=95,122;MMQ=27,44;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.372:22:11,2:3,5:10,4,2,6
chrX	140994591	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,165;MMQ=49,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.597:28:5,7:3,7:5,6,7,10
chrX	140995932	.	G	GGAACTTGTA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:9,2:8,0:6,11,0,2
chrX	142121713	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=139,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0|1:142121713_A_C:142121713:3,2,3,1
chrX	142121729	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=193,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,7:0.616:11:2,4:2,3:1|0:142121713_A_C:142121713:3,1,5,2
chrX	142718336	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,1:12,1:10,10,1,1
chrX	142795697	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,1,5
chrX	142803599	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=176,164;MMQ=46,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:6,0,3,0
chrX	142967188	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=221,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:1,9:5,2:7,0,10,1
chrX	142968007	.	CTTTAT	C	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTAT;STR;TLOD=146.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,39:0.503:78:25,19:12,19:17,22,17,22
chrX	144905393	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,1,1
chrX	144906687	.	CTTTT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.282:16:5,2:4,2:10,2,1,3
chrX	144907394	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chrX	144910936	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,6,11
chrX	146342020	.	AAC	A	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,186;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AC;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,3:0.051:76:33,2:31,1:46,27,2,1
chrX	146342233	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=189,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,3:7,6:0,13,1,9
chrX	146353923	.	C	CCACACACACACACAAA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=118,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.068:40:11,0:27,2:23,15,1,1
chrX	146366330	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,166;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=85.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,34:0.516:66:16,15:14,19:1,31,1,33
chrX	147003339	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=99.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,32:0.500:64:11,13:21,19:32,0,32,0
chrX	147003564	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=309.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,83:0.988:83:0,40:0,43:0,0,9,74
chrX	147015021	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=69.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,0,20
chrX	147024558	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,2:2,6:6,0,8,0
chrX	147026330	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chrX	147106362	.	C	T	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,4:0.054:90:52,2:33,2:64,22,4,0
chrX	147891558	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chrX	148037055	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chrX	148048440	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,2:0.048:60:33,0:24,2:21,37,0,2
chrX	148055144	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chrX	148062377	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chrX	148664737	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=220,231;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chrX	148685623	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,29:0.460:63:19,14:15,14:31,3,25,4
chrX	148690256	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:9,2:15,0:23,1,2,0
chrX	148690271	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=159,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:11,3:20,0:29,4,2,1
chrX	148713285	.	GTCC	G	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCC;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.055:69:34,2:28,1:19,47,1,2
chrX	148794953	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:1,5,1,4
chrX	149014071	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:11,4:6,5:12,5,7,2
chrX	149639324	.	ACAG	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAG;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.116:23:5,1:11,1:9,12,1,1
chrX	149678381	.	A	AAGTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chrX	149826503	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,3:7,7:1,13,0,10
chrX	149881339	.	G	C	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=212.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,73:0.616:118:21,35:24,36:35,10,54,19
chrX	149887056	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chrX	149898714	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:4,2:2,4:0,6,2,5
chrX	149919126	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,2:4,0:11,0,2,0
chrX	149937404	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chrX	150156378	.	G	GGAA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=242,227;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:150156378_G_GGAA:150156378:0,4,0,1
chrX	150156381	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=242,227;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:150156378_G_GGAA:150156378:0,4,0,1
chrX	150156382	.	GAAT	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=245,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:150156382_GAAT_G:150156382:0,4,0,1
chrX	150156385	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=263,227;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:150156378_G_GGAA:150156378:0,3,0,1
chrX	150156386	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=242,227;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:150156378_G_GGAA:150156378:0,4,0,1
chrX	150156387	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=245,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:150156382_GAAT_G:150156382:0,4,0,1
chrX	150348228	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,1:0,0,10,0
chrX	150349533	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:10,3:5,6:15,0,7,2
chrX	150349557	.	CCACCACTGGCCA	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=133.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,19:0,12:0,0,26,5
chrX	150349649	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=141.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,24:0,19:0,0,25,18
chrX	150565560	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chrX	150573322	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chrX	150789334	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chrX	150789950	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=134.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,17:0,21:0,0,21,17
chrX	150840283	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:150840283_A_C:150840283:0,3,0,1
chrX	150840290	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:150840283_A_C:150840283:0,3,0,1
chrX	150840293	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=191,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:150840283_A_C:150840283:0,2,0,1
chrX	150840296	.	TTTTCTTGA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=191,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:150840283_A_C:150840283:0,2,0,1
chrX	150840742	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=105,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,27:0.520:52:17,16:7,11:19,6,19,8
chrX	150840916	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,43:0.543:78:20,15:15,21:14,21,16,27
chrX	150841144	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,4:2,5:0,6,0,9
chrX	150844471	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,37:0.591:62:12,13:12,22:17,8,21,16
chrX	150868799	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=130,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:5,7:7,8:1,12,1,14
chrX	150869267	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,15:0,0,14,15
chrX	150873651	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrX	150885736	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:13,6:8,1:18,3,6,1
chrX	150911211	.	G	GCAGTGGGTTCGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150911211_G_GCAGTGGGTTCGA:150911211:0,0,0,1
chrX	150911214	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150911211_G_GCAGTGGGTTCGA:150911211:0,0,0,1
chrX	150911512	.	GT	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,1:0,5:1,0,6,1
chrX	151092126	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chrX	151283567	.	A	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,144;MMQ=39,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=204.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,62:0.969:63:1,28:0,34:1,0,41,21
chrX	151283599	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=65,145;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=184.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,61:0.954:63:2,25:0,33:1,1,33,28
chrX	151393196	.	CA	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.089:58:23,2:27,3:49,4,5,0
chrX	151561864	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,1:12,1:18,7,2,0
chrX	151806572	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:151806572_A_C:151806572:0,0,1,0
chrX	151806578	.	CA	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:151806572_A_C:151806572:2,0,1,0
chrX	151806582	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:151806572_A_C:151806572:2,0,1,0
chrX	151817820	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=106.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,13,19
chrX	151821784	.	C	CTAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=211,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,0:0,1:0|1:151821784_C_CTAA:151821784:0,3,0,1
chrX	151821792	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=207,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:151821784_C_CTAA:151821784:0,4,0,1
chrX	151869973	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,126;MMQ=49,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.063:61:31,2:27,1:25,33,1,2
chrX	151899760	.	A	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=240.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,34:0,32:0,0,39,30
chrX	151909281	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=176.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,18:0,23:0,0,2,42
chrX	151909305	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=153,166;MMQ=53,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=116.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,37:0.951:38:0,14:1,21:0,1,0,37
chrX	151997144	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,3:0.059:66:35,2:26,1:26,37,1,2
chrX	152089039	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chrX	152225379	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chrX	152727361	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chrX	152727446	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,3:1,11:1,0,14,0
chrX	152727535	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=150.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,56:0.967:57:0,20:1,34:1,0,29,27
chrX	152728155	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=110.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,12:0,23:0,0,13,25
chrX	152752069	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=125,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,1:7,0:14,6,2,0
chrX	152752077	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.548:25:6,4:2,6:8,3,8,6
chrX	152752215	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=32,17;MFRL=147,204;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:12,0:0|1:152752215_G_C:152752215:9,20,0,2
chrX	152752219	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=30,17;MFRL=143,204;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:9,0:0|1:152752215_G_C:152752215:9,17,0,2
chrX	152752222	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=28,18;MFRL=142,204;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:7,0:0|1:152752215_G_C:152752215:7,16,0,2
chrX	152752228	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=145,204;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:7,0:0|1:152752215_G_C:152752215:6,16,0,2
chrX	152752231	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=30,12;MFRL=147,204;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:8,0:0|1:152752215_G_C:152752215:6,17,0,2
chrX	152752234	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=31,12;MFRL=149,204;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:6,0:0|1:152752215_G_C:152752215:4,17,0,2
chrX	152752243	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=30,16;MFRL=149,204;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,1:0|1:152752215_G_C:152752215:3,16,0,2
chrX	152770757	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,2:8,0:8,10,1,1
chrX	152772473	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,5:1,6:4,0,10,1
chrX	152773615	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=213,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:3,2:0,2:3,0,4,1
chrX	152807923	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,1,12
chrX	152814373	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chrX	152815089	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,9:0,0,6,16
chrX	152818435	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=104,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:5,1:0,1:4,1,2,0
chrX	152821887	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=147.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,17:0,27:0,0,9,36
chrX	152825414	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,9:0,0,4,14
chrX	152825433	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,1,8
chrX	152830322	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,14,0
chrX	152845797	.	C	CAAAAAACCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=229,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152845797_C_CAAAAAACCAA:152845797:0,1,0,1
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chrX	152954025	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
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chrX	152980991	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,14;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.300:16:4,1:5,0:7,4,5,0
chrX	152991690	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,29;MFRL=188,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:152991690_T_A:152991690:0,1,0,1
chrX	152991692	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=188,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152991690_T_A:152991690:0,1,0,1
chrX	153001534	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=75,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,1:1,1:0|1:153001534_G_C:153001534:0,2,4,0
chrX	153001539	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:0,0:5,0:0|1:153001534_G_C:153001534:3,3,3,0
chrX	153001542	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:5,0:0|1:153001534_G_C:153001534:4,3,3,0
chrX	153001546	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:4,1:0|1:153001534_G_C:153001534:4,3,2,0
chrX	153006092	.	CA	TG	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=143,121;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:16,0:25,2:22,21,2,0
chrX	153006137	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=137,121;MMQ=60,30;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:29,0:27,2:0|1:153006137_G_A:153006137:24,32,0,2
chrX	153006141	.	T	A	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=137,121;MMQ=60,30;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:25,0:25,2:0|1:153006137_G_A:153006137:23,33,0,2
chrX	153008911	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=111.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,17:0,0,15,18
chrX	153009197	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chrX	153034752	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,4,11
chrX	153037275	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chrX	153037594	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,7:0,0,20,1
chrX	153037808	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chrX	153038516	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chrX	153038661	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,23:0,12:0,0,24,11
chrX	153042548	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chrX	153043423	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=139,50;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:21,3:16,0:26,13,3,0
chrX	153048642	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,17;MFRL=203,276;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:153048642_T_A:153048642:0,4,0,1
chrX	153048647	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=247,276;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:153048642_T_A:153048642:0,1,0,1
chrX	153048657	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:153048642_T_A:153048642:0,0,2,2
chrX	153049312	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.486:29:7,6:7,8:4,11,3,11
chrX	153049403	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,9:2,3:2,1,5,7
chrX	153050498	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,152;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:12,0:1,21,0,2
chrX	153052661	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,2,6
chrX	153054665	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,2:16,0:15,16,1,1
chrX	153062853	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:6,6:8,4:13,1,7,3
chrX	153068969	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=160,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:8,2:1,0:2,8,1,1
chrX	153073752	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chrX	153129556	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chrX	153133077	.	G	GAATTAGATGGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	153137704	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:0|1:153137704_G_T:153137704:11,14,1,1
chrX	153137713	.	CG	AT	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:12,2:0|1:153137704_G_T:153137704:10,15,1,1
chrX	153137716	.	G	GCTT	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=144,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:13,2:0|1:153137704_G_T:153137704:10,16,1,1
chrX	153137717	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=144,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:12,2:0|1:153137704_G_T:153137704:10,16,1,1
chrX	153149118	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:2,1:2,5:3,1,4,2
chrX	153149708	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:153149708_G_GC:153149708:0,0,0,2
chrX	153149715	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:153149708_G_GC:153149708:0,0,0,2
chrX	153151277	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:153151277_C_G:153151277:0,0,1,1
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chrX	153191626	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:16,0:10,3:11,16,1,2
chrX	153197559	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:10,1:18,1:12,19,0,2
chrX	153200677	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,308;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chrX	153208274	.	T	TGCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.780:7:0,4:0,2:0|1:153208274_T_TGCCCCCCCCCCCCC:153208274:0,1,6,0
chrX	153208278	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,3:0,2:0|1:153208274_T_TGCCCCCCCCCCCCC:153208274:2,1,5,0
chrX	153208281	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,0:0,1:0|1:153208274_T_TGCCCCCCCCCCCCC:153208274:4,1,4,0
chrX	153210179	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,0:0,0,0,6
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chrX	153216186	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=12,18;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.276:23:3,1:1,0:17,0,6,0
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chrX	153277889	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chrX	153279822	.	TAAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=A;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.821:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chrX	153283522	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.060:65:34,3:26,0:26,36,2,1
chrX	153298049	.	G	GCGGTGTTTGGTTTTCTGTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,28;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153298049_G_GCGGTGTTTGGTTTTCTGTT:153298049:0,0,0,1
chrX	153298052	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,28;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153298049_G_GCGGTGTTTGGTTTTCTGTT:153298049:0,0,0,1
chrX	153298055	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,28;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153298049_G_GCGGTGTTTGGTTTTCTGTT:153298049:0,0,0,1
chrX	153357558	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chrX	153418672	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:153418672_G_A:153418672:0,0,0,3
chrX	153418674	.	G	GAAGGCCAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=199,176;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:153418672_G_A:153418672:0,2,0,1
chrX	153482563	.	G	C	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=185,180;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=146.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,54:0.822:65:3,18:6,36:11,0,54,0
chrX	153482589	.	A	G	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=156,136;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,6:0.083:82:26,4:47,2:76,0,6,0
chrX	153482592	.	A	G	.	.	DP=86;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=154,125;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,3:0.045:85:29,2:50,1:82,0,3,0
chrX	153533247	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:13,3:10,0:22,1,3,0
chrX	153549091	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=107,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:3,1:6,1:9,1,1,1
chrX	153577719	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:9,6:7,3:13,3,6,3
chrX	153581150	.	C	CTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,82;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,2:12,0:10,8,2,0
chrX	153582382	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,2:9,0:11,12,1,1
chrX	153590829	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:19,2:14,0:25,9,2,0
chrX	153594455	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,3:8,0:9,7,2,1
chrX	153609639	.	G	GTGAAATCCTCTTTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chrX	153631413	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:10,0:5,2:0|1:153631413_T_TA:153631413:13,2,1,1
chrX	153631416	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:8,0:5,2:0|1:153631413_T_TA:153631413:13,2,1,1
chrX	153633953	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=199.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,24:0,34:0,0,15,43
chrX	153640406	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.489:41:10,9:11,11:12,9,15,5
chrX	153642631	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,2:8,1:0,19,0,3
chrX	153648203	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=223,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chrX	153661208	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=120,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:4,0:11,3:11,4,2,1
chrX	153667108	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=95,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.404:18:3,2:6,5:7,4,6,1
chrX	153668022	.	CA	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=85.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,40:0.808:49:1,15:5,20:8,1,30,10
chrX	153668172	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=159.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,20:0,24:0,0,7,40
chrX	153694385	.	T	TGATGCGGGGGTGGC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.125:21:6,2:11,0:6,13,0,2
chrX	153699553	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,36;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:16,0:9,2:15,10,1,1
chrX	153714027	.	TG	T,TGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31,29;MFRL=137,142,172;MMQ=60,60,60;MPOS=20,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=G;STR;TLOD=3.49,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.271,0.269:8:1,2,0:3,0,2:4,0,4,0
chrX	153736689	.	G	GAGTTAGGTTGTGTCTGTGTAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=163,34;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chrX	153764217	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.069:56:24,2:27,1:18,35,1,2
chrX	153770411	.	C	CGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=G;STR;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:4,0,4,0
chrX	153881442	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.566:9:0,0:0,0:4,0,5,0
chrX	153906377	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:5,2:1,2:6,1,4,0
chrX	153906394	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=159,173;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,1:4,1:0|1:153906394_G_A:153906394:14,3,2,0
chrX	153906400	.	ACTC	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=145,173;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,1:6,1:0|1:153906394_G_A:153906394:20,4,2,0
chrX	153906407	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=32,14;MFRL=142,173;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:8,0:0|1:153906394_G_A:153906394:20,5,2,0
chrX	153906411	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=142,173;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:10,0:0|1:153906394_G_A:153906394:17,10,2,0
chrX	153994596	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=179.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,21:0,31:0,0,22,30
chrX	154001559	.	CT	C	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.367:27:4,3:6,3:9,7,7,4
chrX	154009590	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=109,172;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:12,0:0|1:154009590_T_A:154009590:16,9,0,2
chrX	154009592	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=109,172;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:12,0:0|1:154009590_T_A:154009590:16,9,0,2
chrX	154009617	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,173;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.846:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chrX	154012486	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=195,112;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:3,0:2,2:0,5,0,3
chrX	154013483	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chrX	154028217	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:154028217_T_G:154028217:0,0,0,1
chrX	154028223	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154028217_T_G:154028217:0,0,0,1
chrX	154028224	.	G	GTTCAGACTTGAAACCCAATCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154028217_T_G:154028217:0,0,0,1
chrX	154057770	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:18,2,2,0
chrX	154132237	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.109:35:18,0:11,3:19,13,0,3
chrX	154157685	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:5,2:9,1:5,10,2,1
chrX	154158222	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,3:10,0:8,6,3,0
chrX	154275788	.	A	ACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=125,317;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154275788_A_ACAC:154275788:0,1,0,1
chrX	154275789	.	T	TTAGCAAAAGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=125,317;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154275788_A_ACAC:154275788:0,1,0,1
chrX	154290190	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,17:0.359:48:11,11:20,6:11,20,10,7
chrX	154294346	.	GCA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=171,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:1,1:3,0:0|1:154294346_GCA_G:154294346:0,4,0,1
chrX	154294352	.	GACACAGGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:154294346_GCA_G:154294346:0,4,0,1
chrX	154301583	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,2:8,5:13,1,7,1
chrX	154317640	.	ATG	A	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.292:39:7,4:9,4:0,28,0,11
chrX	154490516	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chrX	154509177	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,6:4,5:11,0,11,0
chrX	154774663	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chrX	154774707	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,13,4
chrY	21154323	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0